View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5072_low_3 (Length: 463)

Name: NF5072_low_3
Description: NF5072
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5072_low_3
NF5072_low_3
[»] chr6 (129 HSPs)
chr6 (1-457)||(30676424-30676881)
chr6 (1-457)||(34963364-34963821)
chr6 (1-444)||(24422551-24422994)
chr6 (1-444)||(33861798-33862241)
chr6 (1-444)||(33864282-33864725)
chr6 (1-444)||(18334307-18334750)
chr6 (1-444)||(2290895-2291338)
chr6 (1-444)||(26924355-26924798)
chr6 (1-444)||(12742321-12742765)
chr6 (5-444)||(1540630-1541069)
chr6 (1-444)||(22782231-22782674)
chr6 (1-444)||(19858637-19859077)
chr6 (1-444)||(8055033-8055477)
chr6 (4-443)||(25688507-25688947)
chr6 (1-457)||(19847686-19848122)
chr6 (1-239)||(1598266-1598504)
chr6 (1-285)||(28289051-28289334)
chr6 (15-252)||(17377576-17377814)
chr6 (1-286)||(12942363-12942637)
chr6 (1-264)||(23992604-23992870)
chr6 (1-238)||(18914142-18914380)
chr6 (164-444)||(19005050-19005330)
chr6 (1-238)||(31630255-31630493)
chr6 (1-238)||(19005361-19005599)
chr6 (1-214)||(25535641-25535855)
chr6 (181-444)||(25656633-25656897)
chr6 (1-156)||(1879-2034)
chr6 (1-156)||(8838-8993)
chr6 (234-444)||(1595553-1595763)
chr6 (1-156)||(1598542-1598697)
chr6 (1-156)||(19847493-19847648)
chr6 (9-156)||(19005637-19005784)
chr6 (1-155)||(27557016-27557170)
chr6 (1-156)||(25688988-25689143)
chr6 (1-156)||(30676231-30676386)
chr6 (1-155)||(23415258-23415412)
chr6 (7-152)||(18914422-18914567)
chr6 (256-444)||(25754813-25755001)
chr6 (1-156)||(1598735-1598890)
chr6 (1-152)||(26924162-26924313)
chr6 (1-109)||(15892123-15892231)
chr6 (1-156)||(87-242)
chr6 (1-156)||(31630062-31630217)
chr6 (164-281)||(18913994-18914111)
chr6 (1-152)||(18914615-18914766)
chr6 (164-265)||(31630524-31630626)
chr6 (27-156)||(25689181-25689310)
chr6 (164-285)||(15875469-15875590)
chr6 (256-444)||(20556864-20557050)
chr6 (113-238)||(15875621-15875737)
chr6 (269-432)||(18456735-18456898)
chr6 (280-450)||(8227460-8227631)
chr6 (37-156)||(25737128-25737247)
chr6 (277-444)||(16448517-16448685)
chr6 (278-444)||(3852009-3852175)
chr6 (1-94)||(17883212-17883305)
chr6 (286-436)||(25644335-25644487)
chr6 (61-156)||(22981321-22981416)
chr6 (61-156)||(23806992-23807087)
chr6 (337-450)||(1561304-1561418)
chr6 (337-434)||(28496477-28496575)
chr6 (337-434)||(29808888-29808986)
chr6 (286-450)||(19303496-19303660)
chr6 (351-450)||(27333238-27333338)
chr6 (351-450)||(27393978-27394078)
chr6 (299-432)||(18461895-18462028)
chr6 (286-450)||(20076701-20076862)
chr6 (289-450)||(29060541-29060703)
chr6 (303-450)||(17287768-17287916)
chr6 (286-453)||(18409782-18409950)
chr6 (330-437)||(19652209-19652316)
chr6 (280-436)||(20109153-20109312)
chr6 (212-281)||(18937252-18937321)
chr6 (1-63)||(25737028-25737090)
chr6 (286-450)||(16496245-16496410)
chr6 (286-450)||(20360915-20361080)
chr6 (286-450)||(25629310-25629475)
chr6 (303-450)||(22780199-22780347)
chr6 (383-457)||(23992421-23992495)
chr6 (354-450)||(20638306-20638403)
chr6 (1-55)||(9031-9085)
chr6 (38-156)||(18334151-18334269)
chr6 (38-136)||(19984130-19984228)
chr6 (38-156)||(24423032-24423150)
chr6 (349-437)||(4185839-4185928)
chr6 (27-136)||(16240296-16240405)
chr6 (27-136)||(16556945-16557054)
chr6 (27-136)||(16633501-16633610)
chr6 (27-136)||(16650175-16650284)
chr6 (286-450)||(20593774-20593939)
chr6 (290-436)||(9098473-9098620)
chr6 (27-136)||(25904474-25904584)
chr6 (38-156)||(33864763-33864881)
chr6 (38-136)||(35016015-35016113)
chr6 (27-136)||(27654597-27654706)
chr6 (390-450)||(25714418-25714478)
chr6 (337-436)||(19668386-19668488)
chr6 (38-136)||(22226580-22226679)
chr6 (290-432)||(23019425-23019567)
chr6 (38-136)||(21776107-21776205)
chr6 (349-437)||(4186381-4186470)
chr6 (27-136)||(10487971-10488080)
chr6 (27-136)||(16377248-16377357)
chr6 (27-136)||(16384572-16384681)
chr6 (27-136)||(16826368-16826477)
chr6 (35-136)||(22593590-22593691)
chr6 (38-82)||(10905416-10905460)
chr6 (349-450)||(22080756-22080845)
chr6 (117-156)||(2290818-2290857)
chr6 (27-134)||(19609582-19609689)
chr6 (117-156)||(22782712-22782751)
chr6 (383-457)||(25603437-25603512)
chr6 (383-457)||(25611775-25611850)
chr6 (117-156)||(26924085-26924124)
chr6 (38-156)||(8055515-8055633)
chr6 (165-238)||(35056707-35056781)
chr6 (67-136)||(1555527-1555596)
chr6 (349-394)||(4668229-4668274)
chr6 (349-394)||(4675076-4675121)
chr6 (400-457)||(16929659-16929716)
chr6 (400-457)||(16965379-16965436)
chr6 (383-444)||(21766698-21766759)
chr6 (67-136)||(33315116-33315185)
chr6 (349-437)||(31155415-31155504)
chr6 (165-222)||(32259078-32259136)
chr6 (27-108)||(18455449-18455530)
chr6 (27-136)||(25175112-25175221)
chr6 (1-33)||(22981454-22981486)
chr6 (1-33)||(23806922-23806954)
[»] chr3 (171 HSPs)
chr3 (1-457)||(13544016-13544471)
chr3 (1-457)||(12567551-12568007)
chr3 (1-444)||(17463182-17463625)
chr3 (1-444)||(34159330-34159773)
chr3 (1-444)||(16453995-16454439)
chr3 (1-444)||(45606621-45607065)
chr3 (4-444)||(55476495-55476935)
chr3 (1-444)||(7781061-7781505)
chr3 (1-444)||(6468849-6469292)
chr3 (1-444)||(13153970-13154414)
chr3 (1-444)||(10247438-10247881)
chr3 (1-444)||(27165254-27165700)
chr3 (4-444)||(53301221-53301665)
chr3 (1-444)||(13151505-13151949)
chr3 (1-444)||(28848336-28848769)
chr3 (1-444)||(8499522-8499968)
chr3 (1-444)||(15412433-15412879)
chr3 (1-285)||(54520985-54521270)
chr3 (1-285)||(15977696-15977980)
chr3 (1-264)||(46822445-46822709)
chr3 (1-265)||(10557091-10557356)
chr3 (1-283)||(29544556-29544839)
chr3 (4-238)||(12119371-12119606)
chr3 (164-444)||(16282689-16282969)
chr3 (1-227)||(13436520-13436747)
chr3 (164-444)||(8899098-8899378)
chr3 (164-444)||(41123894-41124171)
chr3 (164-444)||(9707484-9707765)
chr3 (164-440)||(38961769-38962045)
chr3 (1-198)||(41124190-41124387)
chr3 (78-275)||(12305318-12305516)
chr3 (1-198)||(38961552-38961750)
chr3 (1-198)||(16282472-16282669)
chr3 (1-214)||(24513910-24514124)
chr3 (1-173)||(20629906-20630078)
chr3 (1-198)||(17444478-17444675)
chr3 (1-198)||(25237094-25237291)
chr3 (1-198)||(25229507-25229704)
chr3 (4-163)||(10379613-10379772)
chr3 (1-156)||(55319018-55319173)
chr3 (1-155)||(15465448-15465602)
chr3 (3-155)||(26054981-26055133)
chr3 (4-156)||(27165738-27165890)
chr3 (9-156)||(10557394-10557541)
chr3 (1-156)||(41124425-41124580)
chr3 (1-156)||(46822747-46822902)
chr3 (1-155)||(5223677-5223831)
chr3 (11-156)||(53301035-53301180)
chr3 (1-156)||(55318825-55318980)
chr3 (269-444)||(17672630-17672805)
chr3 (9-156)||(38961367-38961514)
chr3 (4-153)||(8500009-8500158)
chr3 (256-440)||(50242830-50243014)
chr3 (245-444)||(17446614-17446812)
chr3 (256-432)||(43550448-43550625)
chr3 (1-156)||(13937494-13937649)
chr3 (1-156)||(20629713-20629868)
chr3 (27-156)||(14567432-14567561)
chr3 (35-157)||(36528447-36528569)
chr3 (283-444)||(29172580-29172741)
chr3 (1-156)||(16282279-16282434)
chr3 (1-156)||(17444285-17444440)
chr3 (280-450)||(24340672-24340843)
chr3 (164-285)||(11913928-11914051)
chr3 (280-432)||(52523676-52523831)
chr3 (46-156)||(16358234-16358344)
chr3 (280-433)||(23274705-23274859)
chr3 (269-432)||(53070636-53070799)
chr3 (280-450)||(37642214-37642385)
chr3 (12-156)||(17393201-17393345)
chr3 (164-243)||(17444694-17444773)
chr3 (49-157)||(3264323-3264431)
chr3 (269-444)||(12119707-12119883)
chr3 (280-450)||(22147474-22147645)
chr3 (337-450)||(13210333-13210447)
chr3 (286-450)||(14972855-14973020)
chr3 (290-436)||(15470939-15471085)
chr3 (286-450)||(11424718-11424879)
chr3 (349-450)||(14234488-14234590)
chr3 (280-437)||(16097342-16097499)
chr3 (280-437)||(16103794-16103950)
chr3 (286-444)||(24153164-24153322)
chr3 (326-447)||(32307681-32307802)
chr3 (164-230)||(25237009-25237075)
chr3 (280-390)||(2051148-2051260)
chr3 (337-437)||(12174265-12174366)
chr3 (7-80)||(15007868-15007941)
chr3 (286-437)||(14576788-14576939)
chr3 (280-450)||(26686888-26687059)
chr3 (286-444)||(40213676-40213834)
chr3 (286-450)||(13442275-13442440)
chr3 (286-450)||(17487857-17488022)
chr3 (286-450)||(17499339-17499504)
chr3 (286-450)||(18438535-18438700)
chr3 (317-444)||(15977519-15977646)
chr3 (1-77)||(16358382-16358458)
chr3 (286-433)||(42386428-42386576)
chr3 (280-443)||(43840940-43841104)
chr3 (301-450)||(12399210-12399360)
chr3 (306-444)||(36166602-36166739)
chr3 (1-71)||(36528340-36528410)
chr3 (383-457)||(46822259-46822333)
chr3 (349-437)||(49668094-49668183)
chr3 (92-156)||(15007988-15008052)
chr3 (269-332)||(17248224-17248287)
chr3 (383-457)||(12511051-12511125)
chr3 (301-450)||(20698405-20698555)
chr3 (350-447)||(1644693-1644790)
chr3 (349-437)||(9512934-9513023)
chr3 (349-437)||(9520909-9520998)
chr3 (286-450)||(23083316-23083481)
chr3 (27-148)||(25058286-25058407)
chr3 (286-450)||(25476340-25476505)
chr3 (305-437)||(14572603-14572735)
chr3 (11-57)||(10555766-10555812)
chr3 (38-156)||(34159811-34159929)
chr3 (400-457)||(30029834-30029891)
chr3 (40-136)||(16934824-16934920)
chr3 (306-438)||(21618459-21618590)
chr3 (38-156)||(17463663-17463781)
chr3 (38-136)||(49231768-49231866)
chr3 (66-136)||(51158683-51158753)
chr3 (38-156)||(55476976-55477094)
chr3 (27-136)||(14528625-14528734)
chr3 (337-444)||(55500946-55501053)
chr3 (1-56)||(8899418-8899473)
chr3 (390-444)||(17737240-17737294)
chr3 (27-136)||(1468614-1468723)
chr3 (27-136)||(8276474-8276583)
chr3 (1-46)||(12305525-12305570)
chr3 (39-136)||(30152450-30152547)
chr3 (269-432)||(37251105-37251270)
chr3 (400-444)||(10556989-10557033)
chr3 (400-444)||(28194697-28194741)
chr3 (288-432)||(43925977-43926123)
chr3 (400-444)||(45577952-45577996)
chr3 (117-156)||(6468772-6468811)
chr3 (117-156)||(15412916-15412955)
chr3 (49-140)||(21026092-21026183)
chr3 (67-134)||(54039167-54039234)
chr3 (34-136)||(2281000-2281102)
chr3 (1-71)||(3264468-3264538)
chr3 (38-156)||(13151349-13151467)
chr3 (38-156)||(13153815-13153932)
chr3 (38-136)||(14263640-14263738)
chr3 (165-238)||(25201323-25201397)
chr3 (27-136)||(8269363-8269472)
chr3 (27-136)||(12808505-12808614)
chr3 (67-136)||(17956869-17956938)
chr3 (383-444)||(23077530-23077591)
chr3 (400-444)||(44494813-44494857)
chr3 (400-447)||(3390006-3390053)
chr3 (400-447)||(3403026-3403073)
chr3 (400-451)||(14665397-14665448)
chr3 (400-451)||(14668553-14668604)
chr3 (1-55)||(14567599-14567653)
chr3 (165-222)||(15025934-15025992)
chr3 (38-136)||(28557370-28557468)
chr3 (383-444)||(856143-856204)
chr3 (383-444)||(11298580-11298641)
chr3 (383-444)||(14878569-14878630)
chr3 (27-108)||(16979504-16979585)
chr3 (164-228)||(17044330-17044395)
chr3 (165-209)||(18700200-18700245)
chr3 (27-108)||(18889958-18890039)
chr3 (256-285)||(38311788-38311817)
chr3 (66-146)||(8023778-8023858)
chr3 (38-102)||(11833119-11833183)
chr3 (400-444)||(12496260-12496304)
chr3 (239-275)||(15977664-15977700)
chr3 (400-444)||(26196501-26196545)
[»] chr1 (88 HSPs)
chr1 (1-449)||(21840766-21841214)
chr1 (1-444)||(13988870-13989313)
chr1 (1-444)||(21923006-21923449)
chr1 (1-457)||(16361908-16362366)
chr1 (1-444)||(21474801-21475245)
chr1 (1-444)||(23593448-23593893)
chr1 (1-444)||(15859723-15860167)
chr1 (1-238)||(16274970-16275209)
chr1 (164-444)||(29776692-29776972)
chr1 (164-444)||(29298141-29298420)
chr1 (1-198)||(29776991-29777188)
chr1 (1-228)||(27161301-27161529)
chr1 (1-198)||(29298492-29298689)
chr1 (164-444)||(31612317-31612597)
chr1 (1-241)||(22122729-22122970)
chr1 (1-198)||(31612616-31612813)
chr1 (164-444)||(16275240-16275522)
chr1 (1-183)||(13227129-13227311)
chr1 (164-444)||(22122945-22123226)
chr1 (1-183)||(29535317-29535499)
chr1 (1-198)||(22050551-22050748)
chr1 (2-156)||(31612851-31613005)
chr1 (1-156)||(29298727-29298882)
chr1 (4-156)||(15859520-15859672)
chr1 (9-156)||(31613044-31613191)
chr1 (4-149)||(9044722-9044867)
chr1 (1-156)||(22122535-22122691)
chr1 (4-156)||(29777226-29777378)
chr1 (11-156)||(27161118-27161263)
chr1 (256-432)||(45574812-45574989)
chr1 (8-156)||(16274784-16274932)
chr1 (4-156)||(16401407-16401559)
chr1 (164-263)||(22050767-22050866)
chr1 (280-444)||(433016-433178)
chr1 (269-444)||(21346965-21347141)
chr1 (9-146)||(40129387-40129524)
chr1 (269-444)||(21342100-21342276)
chr1 (269-450)||(13212844-13213026)
chr1 (165-252)||(27161518-27161605)
chr1 (277-444)||(40389158-40389326)
chr1 (269-444)||(21707171-21707346)
chr1 (269-444)||(21711713-21711888)
chr1 (1-81)||(43543269-43543349)
chr1 (269-431)||(14295493-14295652)
chr1 (280-436)||(16758664-16758822)
chr1 (337-435)||(20918620-20918719)
chr1 (337-437)||(20248293-20248394)
chr1 (280-436)||(33681022-33681178)
chr1 (330-437)||(22921868-22921976)
chr1 (286-453)||(50210168-50210336)
chr1 (326-447)||(21754049-21754170)
chr1 (286-457)||(22468651-22468823)
chr1 (280-432)||(21861519-21861672)
chr1 (280-432)||(21896205-21896358)
chr1 (286-450)||(22532270-22532435)
chr1 (288-457)||(20135181-20135351)
chr1 (269-432)||(35261018-35261180)
chr1 (86-156)||(10812612-10812682)
chr1 (286-450)||(27250684-27250849)
chr1 (280-394)||(22130860-22130970)
chr1 (290-436)||(22237642-22237788)
chr1 (286-444)||(34509787-34509946)
chr1 (350-436)||(52927989-52928076)
chr1 (383-457)||(20454606-20454680)
chr1 (269-384)||(51130632-51130743)
chr1 (38-156)||(13989351-13989469)
chr1 (286-432)||(41049991-41050138)
chr1 (38-136)||(21858592-21858690)
chr1 (381-450)||(20847205-20847274)
chr1 (232-285)||(43543214-43543267)
chr1 (38-136)||(44035830-44035928)
chr1 (4-97)||(10812723-10812816)
chr1 (27-136)||(17003909-17004018)
chr1 (375-435)||(21026696-21026756)
chr1 (40-136)||(21650883-21650979)
chr1 (29-136)||(18060577-18060684)
chr1 (117-156)||(21474724-21474763)
chr1 (67-136)||(22366527-22366596)
chr1 (286-371)||(50686694-50686778)
chr1 (400-451)||(24783162-24783213)
chr1 (164-198)||(29298439-29298473)
chr1 (165-245)||(12710130-12710211)
chr1 (383-444)||(21714549-21714610)
chr1 (383-444)||(21788095-21788156)
chr1 (286-371)||(26065021-26065104)
chr1 (396-425)||(45310434-45310463)
chr1 (67-127)||(16655942-16656002)
chr1 (165-212)||(22824136-22824184)
[»] chr8 (156 HSPs)
chr8 (1-446)||(16413030-16413476)
chr8 (1-444)||(14409159-14409602)
chr8 (1-444)||(1484406-1484849)
chr8 (1-444)||(5853007-5853450)
chr8 (1-444)||(22001757-22002200)
chr8 (1-444)||(4483285-4483728)
chr8 (4-444)||(20045913-20046353)
chr8 (1-444)||(4542088-4542531)
chr8 (1-444)||(14823778-14824222)
chr8 (1-335)||(24485758-24486093)
chr8 (1-435)||(15070571-15071008)
chr8 (1-265)||(27472131-27472395)
chr8 (1-264)||(18677779-18678043)
chr8 (5-264)||(32121912-32122172)
chr8 (164-444)||(20403231-20403511)
chr8 (164-444)||(15203109-15203389)
chr8 (4-227)||(16198115-16198339)
chr8 (1-236)||(16401639-16401875)
chr8 (4-218)||(24048841-24049055)
chr8 (1-238)||(38549719-38549957)
chr8 (164-448)||(45290572-45290857)
chr8 (1-238)||(1326646-1326884)
chr8 (27-227)||(25657893-25658094)
chr8 (3-198)||(15202895-15203090)
chr8 (164-444)||(19896269-19896553)
chr8 (1-238)||(19936622-19936850)
chr8 (1-245)||(19896524-19896769)
chr8 (1-198)||(20403530-20403727)
chr8 (30-198)||(45290385-45290553)
chr8 (1-156)||(19896807-19896962)
chr8 (164-325)||(32810054-32810215)
chr8 (1-157)||(15202700-15202856)
chr8 (165-444)||(19936882-19937164)
chr8 (1-156)||(20403765-20403920)
chr8 (1-156)||(27471938-27472093)
chr8 (1-156)||(32122214-32122369)
chr8 (1-155)||(14397455-14397609)
chr8 (1-156)||(38549526-38549681)
chr8 (1-156)||(16401254-16401408)
chr8 (5-156)||(16401450-16401601)
chr8 (1-128)||(45290262-45290389)
chr8 (4-156)||(15071046-15071198)
chr8 (1-156)||(16412837-16412992)
chr8 (1-156)||(38549334-38549488)
chr8 (1-156)||(15202507-15202662)
chr8 (1-156)||(19897000-19897155)
chr8 (9-148)||(24049104-24049243)
chr8 (280-450)||(17612059-17612230)
chr8 (269-444)||(41598192-41598367)
chr8 (1-156)||(19936429-19936584)
chr8 (164-265)||(38549988-38550090)
chr8 (280-448)||(13508034-13508203)
chr8 (280-448)||(13597566-13597735)
chr8 (256-370)||(25484245-25484359)
chr8 (164-274)||(16401908-16402020)
chr8 (164-285)||(1326915-1327042)
chr8 (290-450)||(38855212-38855371)
chr8 (1-134)||(11361024-11361157)
chr8 (271-432)||(19801367-19801527)
chr8 (164-265)||(20982604-20982710)
chr8 (269-453)||(26223914-26224098)
chr8 (337-450)||(5866280-5866394)
chr8 (337-450)||(21490996-21491110)
chr8 (286-450)||(22626737-22626901)
chr8 (280-450)||(18818358-18818529)
chr8 (349-450)||(6520369-6520471)
chr8 (337-450)||(17140917-17141031)
chr8 (330-442)||(21285606-21285719)
chr8 (330-437)||(21673718-21673826)
chr8 (286-453)||(28648999-28649167)
chr8 (164-238)||(13425336-13425411)
chr8 (164-238)||(20982498-20982573)
chr8 (286-450)||(16092297-16092462)
chr8 (280-432)||(20498581-20498734)
chr8 (286-450)||(22875066-22875230)
chr8 (286-450)||(6759259-6759421)
chr8 (383-457)||(23648547-23648621)
chr8 (298-450)||(7372779-7372932)
chr8 (286-450)||(20536209-20536374)
chr8 (337-450)||(21249385-21249500)
chr8 (337-450)||(21255223-21255338)
chr8 (290-436)||(23760805-23760950)
chr8 (331-437)||(26355699-26355805)
chr8 (383-457)||(18678155-18678229)
chr8 (12-82)||(32810263-32810333)
chr8 (285-450)||(23406380-23406548)
chr8 (175-238)||(13425241-13425305)
chr8 (303-450)||(21923900-21924048)
chr8 (354-450)||(31971258-31971354)
chr8 (301-450)||(21918969-21919120)
chr8 (38-136)||(24717722-24717820)
chr8 (383-457)||(32121726-32121800)
chr8 (27-136)||(15319989-15320098)
chr8 (27-136)||(15500358-15500467)
chr8 (375-450)||(18879276-18879351)
chr8 (38-156)||(1484887-1485005)
chr8 (67-136)||(29759429-29759498)
chr8 (269-432)||(37116366-37116532)
chr8 (337-436)||(983410-983512)
chr8 (38-156)||(5852851-5852969)
chr8 (38-156)||(14409003-14409121)
chr8 (286-424)||(17439461-17439601)
chr8 (42-156)||(20045758-20045872)
chr8 (38-136)||(22007097-22007195)
chr8 (306-444)||(26219721-26219858)
chr8 (67-136)||(13663129-13663198)
chr8 (39-136)||(17150628-17150725)
chr8 (269-432)||(17266930-17267096)
chr8 (354-450)||(45131021-45131116)
chr8 (168-238)||(21513636-21513707)
chr8 (165-238)||(18815609-18815683)
chr8 (306-444)||(26225268-26225405)
chr8 (239-285)||(35026849-35026895)
chr8 (27-136)||(223305-223414)
chr8 (27-136)||(272164-272273)
chr8 (27-136)||(643576-643685)
chr8 (27-136)||(688076-688185)
chr8 (27-136)||(736928-737037)
chr8 (27-136)||(829382-829491)
chr8 (27-136)||(860823-860932)
chr8 (27-136)||(22089373-22089482)
chr8 (40-136)||(39114415-39114511)
chr8 (117-156)||(4483765-4483804)
chr8 (117-156)||(14824260-14824299)
chr8 (380-450)||(21396029-21396100)
chr8 (49-136)||(21493050-21493137)
chr8 (380-450)||(21790522-21790593)
chr8 (239-285)||(2418860-2418906)
chr8 (165-238)||(36733302-36733376)
chr8 (165-238)||(38988730-38988804)
chr8 (165-238)||(39019827-39019901)
chr8 (354-450)||(16199668-16199764)
chr8 (172-238)||(5083001-5083068)
chr8 (400-447)||(20856494-20856541)
chr8 (380-450)||(21389499-21389570)
chr8 (380-450)||(21778825-21778896)
chr8 (400-447)||(39094994-39095041)
chr8 (126-156)||(16401186-16401216)
chr8 (86-136)||(18611952-18612002)
chr8 (243-285)||(22419405-22419447)
chr8 (38-108)||(39364118-39364188)
chr8 (38-108)||(44522814-44522884)
chr8 (67-136)||(18618830-18618899)
chr8 (383-444)||(21162111-21162172)
chr8 (383-444)||(21168784-21168845)
chr8 (67-136)||(22146977-22147046)
chr8 (383-444)||(23776888-23776949)
chr8 (41-98)||(24678771-24678828)
chr8 (256-285)||(44476756-44476785)
chr8 (27-108)||(44477018-44477099)
chr8 (256-285)||(44480018-44480047)
chr8 (27-108)||(44480280-44480361)
chr8 (400-444)||(17926775-17926819)
chr8 (42-94)||(19866496-19866548)
chr8 (287-371)||(22364744-22364826)
chr8 (400-444)||(25484382-25484426)
[»] scaffold0023 (11 HSPs)
scaffold0023 (1-444)||(94415-94858)
scaffold0023 (1-446)||(17154-17600)
scaffold0023 (1-156)||(16961-17116)
scaffold0023 (289-444)||(44458-44614)
scaffold0023 (290-437)||(100388-100534)
scaffold0023 (290-437)||(40135-40281)
scaffold0023 (38-156)||(94896-95014)
scaffold0023 (371-437)||(101513-101580)
scaffold0023 (379-450)||(119876-119948)
scaffold0023 (67-136)||(154892-154961)
scaffold0023 (400-444)||(38549-38593)
[»] chr7 (149 HSPs)
chr7 (1-444)||(15376428-15376871)
chr7 (1-444)||(20384838-20385281)
chr7 (1-444)||(14948837-14949280)
chr7 (1-444)||(32125495-32125938)
chr7 (1-444)||(456325-456769)
chr7 (1-444)||(27216864-27217308)
chr7 (1-444)||(16410063-16410506)
chr7 (1-444)||(16232524-16232968)
chr7 (1-444)||(41522921-41523365)
chr7 (1-444)||(41525383-41525827)
chr7 (1-444)||(21189310-21189753)
chr7 (1-444)||(16213688-16214132)
chr7 (1-444)||(18640276-18640719)
chr7 (1-450)||(18430710-18431159)
chr7 (1-444)||(24702242-24702676)
chr7 (1-444)||(24704692-24705123)
chr7 (41-444)||(11393041-11393445)
chr7 (1-444)||(13869350-13869796)
chr7 (4-364)||(26355699-26356061)
chr7 (4-364)||(26358151-26358513)
chr7 (1-286)||(11303409-11303695)
chr7 (1-297)||(18627717-18628013)
chr7 (1-285)||(16108403-16108688)
chr7 (1-285)||(23664667-23664952)
chr7 (1-285)||(29796771-29797058)
chr7 (1-285)||(29800590-29800877)
chr7 (1-238)||(14269671-14269909)
chr7 (1-238)||(8940489-8940731)
chr7 (1-238)||(15081556-15081794)
chr7 (164-444)||(11972500-11972780)
chr7 (1-238)||(8468945-8469183)
chr7 (12-236)||(45847380-45847605)
chr7 (1-198)||(11972799-11972996)
chr7 (164-336)||(15081825-15081999)
chr7 (1-156)||(8940769-8940923)
chr7 (1-156)||(38897749-38897904)
chr7 (1-155)||(25926844-25926998)
chr7 (57-198)||(13841305-13841446)
chr7 (1-156)||(14269285-14269440)
chr7 (4-156)||(14156603-14156755)
chr7 (1-156)||(10501108-10501263)
chr7 (1-156)||(14156793-14156944)
chr7 (256-432)||(13647344-13647521)
chr7 (1-156)||(14269478-14269633)
chr7 (9-156)||(16214170-16214317)
chr7 (9-150)||(15081371-15081512)
chr7 (4-155)||(1856947-1857097)
chr7 (1-156)||(8940962-8941117)
chr7 (1-155)||(13918117-13918272)
chr7 (1-156)||(21189117-21189272)
chr7 (164-285)||(14269940-14270061)
chr7 (4-123)||(10500945-10501064)
chr7 (269-444)||(44116513-44116688)
chr7 (190-303)||(13841157-13841270)
chr7 (164-285)||(38898106-38898229)
chr7 (164-285)||(8940335-8940458)
chr7 (269-444)||(17061898-17062073)
chr7 (1-156)||(17985099-17985254)
chr7 (299-457)||(24275162-24275320)
chr7 (280-436)||(2280068-2280225)
chr7 (269-450)||(16495403-16495581)
chr7 (278-444)||(3386337-3386503)
chr7 (190-285)||(8468803-8468898)
chr7 (280-450)||(19486693-19486864)
chr7 (329-450)||(67746-67868)
chr7 (286-444)||(18456368-18456526)
chr7 (337-450)||(34200787-34200901)
chr7 (337-450)||(11996033-11996147)
chr7 (271-444)||(20110560-20110723)
chr7 (38-156)||(45847213-45847331)
chr7 (164-265)||(45847638-45847739)
chr7 (286-444)||(3564319-3564478)
chr7 (337-450)||(15754893-15755007)
chr7 (269-370)||(12756654-12756755)
chr7 (277-444)||(38898367-38898535)
chr7 (339-437)||(44014192-44014291)
chr7 (330-450)||(22072914-22073036)
chr7 (337-450)||(28505304-28505418)
chr7 (280-429)||(12255740-12255892)
chr7 (311-450)||(10063798-10063938)
chr7 (286-450)||(38227482-38227646)
chr7 (159-238)||(38897995-38898075)
chr7 (349-450)||(47831808-47831910)
chr7 (290-437)||(18005660-18005806)
chr7 (69-157)||(11310239-11310327)
chr7 (286-450)||(12698832-12698998)
chr7 (290-436)||(16219677-16219823)
chr7 (349-437)||(811149-811238)
chr7 (286-450)||(9509190-9509355)
chr7 (280-435)||(26212012-26212168)
chr7 (329-444)||(48273396-48273512)
chr7 (322-444)||(13831377-13831499)
chr7 (269-436)||(1867932-1868101)
chr7 (290-436)||(16056343-16056488)
chr7 (38-156)||(15376272-15376390)
chr7 (38-156)||(20384682-20384800)
chr7 (39-136)||(11286976-11287073)
chr7 (67-136)||(125965-126034)
chr7 (400-444)||(14932804-14932848)
chr7 (269-424)||(15008436-15008593)
chr7 (400-444)||(15356239-15356283)
chr7 (400-444)||(15360353-15360397)
chr7 (383-457)||(15211450-15211525)
chr7 (117-156)||(16410544-16410583)
chr7 (117-156)||(18628051-18628090)
chr7 (117-156)||(18640757-18640796)
chr7 (8-59)||(23461813-23461864)
chr7 (117-156)||(26355619-26355658)
chr7 (117-156)||(26358071-26358110)
chr7 (269-432)||(20220127-20220290)
chr7 (38-156)||(27217346-27217464)
chr7 (27-136)||(7822013-7822122)
chr7 (27-136)||(7829324-7829433)
chr7 (27-136)||(27102512-27102621)
chr7 (27-136)||(27109860-27109969)
chr7 (27-136)||(27175705-27175814)
chr7 (27-136)||(38784604-38784713)
chr7 (40-136)||(15951607-15951703)
chr7 (375-450)||(16386292-16386368)
chr7 (165-243)||(13745569-13745648)
chr7 (117-156)||(13869833-13869872)
chr7 (280-367)||(15113028-15113114)
chr7 (164-238)||(15119918-15119993)
chr7 (286-436)||(15143993-15144143)
chr7 (38-156)||(456807-456925)
chr7 (1-71)||(11310133-11310202)
chr7 (38-124)||(16202766-16202852)
chr7 (390-444)||(26356098-26356152)
chr7 (390-444)||(26358550-26358604)
chr7 (38-136)||(32495062-32495160)
chr7 (67-136)||(15760779-15760848)
chr7 (38-118)||(10000996-10001076)
chr7 (375-435)||(10589055-10589115)
chr7 (27-59)||(20110747-20110779)
chr7 (400-451)||(2832511-2832562)
chr7 (280-367)||(15116565-15116651)
chr7 (426-457)||(16213622-16213653)
chr7 (165-214)||(9743795-9743845)
chr7 (239-285)||(25927238-25927283)
chr7 (27-108)||(10896371-10896452)
chr7 (256-285)||(10896716-10896745)
chr7 (256-285)||(15167288-15167317)
chr7 (383-444)||(18154894-18154955)
chr7 (27-96)||(23664500-23664569)
chr7 (39-108)||(29004416-29004485)
chr7 (38-82)||(13475728-13475772)
chr7 (27-147)||(15167530-15167650)
chr7 (165-212)||(25941523-25941571)
chr7 (165-228)||(38294567-38294631)
[»] chr4 (129 HSPs)
chr4 (1-444)||(15118067-15118510)
chr4 (1-457)||(14970421-14970878)
chr4 (1-444)||(3515011-3515455)
chr4 (1-444)||(50222054-50222497)
chr4 (1-444)||(44615292-44615736)
chr4 (1-444)||(44772798-44773245)
chr4 (3-444)||(19242703-19243146)
chr4 (1-444)||(1837234-1837667)
chr4 (1-444)||(7640901-7641340)
chr4 (1-286)||(15534343-15534629)
chr4 (1-285)||(36038033-36038318)
chr4 (1-285)||(49547488-49547773)
chr4 (1-238)||(52872787-52873025)
chr4 (164-457)||(19618050-19618343)
chr4 (1-285)||(14048740-14049025)
chr4 (117-444)||(18239250-18239577)
chr4 (164-444)||(18215152-18215432)
chr4 (1-238)||(362390-362628)
chr4 (1-231)||(29267570-29267801)
chr4 (164-444)||(12185-12465)
chr4 (164-444)||(52312514-52312794)
chr4 (1-238)||(15495888-15496126)
chr4 (1-238)||(19617781-19618019)
chr4 (164-448)||(15355202-15355487)
chr4 (1-238)||(19857798-19858026)
chr4 (1-238)||(14746226-14746464)
chr4 (1-198)||(11969-12166)
chr4 (1-198)||(52312813-52313009)
chr4 (1-156)||(52872594-52872749)
chr4 (1-154)||(362668-362821)
chr4 (1-156)||(14970228-14970383)
chr4 (1-156)||(18214725-18214880)
chr4 (1-156)||(19617588-19617743)
chr4 (1-156)||(3515493-3515648)
chr4 (1-156)||(14746033-14746188)
chr4 (1-156)||(19858064-19858219)
chr4 (1-156)||(52313240-52313395)
chr4 (9-156)||(362859-363006)
chr4 (110-238)||(18214992-18215121)
chr4 (256-444)||(51463838-51464026)
chr4 (1-156)||(52313047-52313202)
chr4 (22-156)||(15495716-15495850)
chr4 (256-444)||(23803235-23803423)
chr4 (256-444)||(12610954-12611135)
chr4 (164-285)||(15496949-15497070)
chr4 (164-284)||(52873056-52873176)
chr4 (46-156)||(14185621-14185731)
chr4 (1-175)||(30147189-30147363)
chr4 (269-444)||(44102218-44102393)
chr4 (280-444)||(44928873-44929038)
chr4 (164-285)||(14746495-14746618)
chr4 (136-238)||(15355068-15355171)
chr4 (269-450)||(15367691-15367873)
chr4 (269-450)||(15402704-15402886)
chr4 (269-432)||(21815568-21815731)
chr4 (280-436)||(52243143-52243302)
chr4 (269-450)||(15371203-15371385)
chr4 (269-450)||(15373484-15373666)
chr4 (286-443)||(16377478-16377634)
chr4 (277-444)||(20149833-20150001)
chr4 (272-450)||(16223533-16223712)
chr4 (190-265)||(362268-362343)
chr4 (269-450)||(15370019-15370200)
chr4 (337-450)||(15551818-15551932)
chr4 (38-156)||(22725284-22725401)
chr4 (349-450)||(39706306-39706408)
chr4 (280-432)||(13800-13953)
chr4 (277-432)||(22353852-22354008)
chr4 (286-450)||(12902758-12902923)
chr4 (164-245)||(19857685-19857767)
chr4 (286-450)||(7088878-7089043)
chr4 (286-450)||(6899892-6900056)
chr4 (326-437)||(12774021-12774132)
chr4 (286-450)||(16270191-16270355)
chr4 (286-449)||(22636437-22636601)
chr4 (280-436)||(43198502-43198661)
chr4 (280-450)||(7798775-7798946)
chr4 (286-444)||(14038655-14038814)
chr4 (288-450)||(16239927-16240089)
chr4 (337-416)||(16596683-16596763)
chr4 (1-64)||(12778397-12778460)
chr4 (39-136)||(14951270-14951367)
chr4 (337-436)||(12288214-12288316)
chr4 (306-444)||(54798729-54798868)
chr4 (306-444)||(8574844-8574981)
chr4 (86-152)||(14745925-14745991)
chr4 (286-450)||(7893704-7893869)
chr4 (286-450)||(44052830-44052995)
chr4 (354-450)||(52873390-52873487)
chr4 (38-134)||(55377197-55377293)
chr4 (4-107)||(14185477-14185580)
chr4 (330-444)||(14280320-14280434)
chr4 (38-156)||(15117911-15118029)
chr4 (288-370)||(15464888-15464970)
chr4 (38-136)||(25120046-25120144)
chr4 (349-437)||(8846370-8846459)
chr4 (27-136)||(14995644-14995753)
chr4 (35-136)||(43281694-43281795)
chr4 (375-450)||(3096294-3096369)
chr4 (1-48)||(18214918-18214965)
chr4 (38-136)||(18293667-18293765)
chr4 (27-136)||(18247739-18247848)
chr4 (286-446)||(23374314-23374475)
chr4 (27-136)||(47357183-47357292)
chr4 (27-134)||(15287859-15287966)
chr4 (27-134)||(15294969-15295076)
chr4 (38-136)||(5683367-5683465)
chr4 (38-156)||(7640745-7640863)
chr4 (34-148)||(9198544-9198658)
chr4 (38-136)||(22355071-22355169)
chr4 (27-136)||(10643746-10643855)
chr4 (27-124)||(16731688-16731785)
chr4 (119-156)||(44772723-44772760)
chr4 (233-285)||(19857607-19857659)
chr4 (286-432)||(46640411-46640558)
chr4 (354-450)||(14053325-14053421)
chr4 (67-136)||(17146320-17146389)
chr4 (67-136)||(18168293-18168362)
chr4 (27-136)||(19020009-19020118)
chr4 (8-48)||(15489677-15489717)
chr4 (86-136)||(19698032-19698082)
chr4 (86-136)||(19708617-19708667)
chr4 (27-108)||(630280-630361)
chr4 (27-136)||(8374040-8374149)
chr4 (383-444)||(16348716-16348777)
chr4 (383-444)||(16357004-16357065)
chr4 (39-76)||(18218875-18218912)
chr4 (38-82)||(8808350-8808394)
chr4 (38-82)||(11557892-11557936)
[»] chr2 (138 HSPs)
chr2 (1-444)||(18808947-18809390)
chr2 (1-444)||(23711728-23712171)
chr2 (1-457)||(32214645-32215092)
chr2 (1-444)||(39682317-39682761)
chr2 (1-444)||(28577103-28577546)
chr2 (7-444)||(23709253-23709690)
chr2 (1-444)||(23130866-23131310)
chr2 (1-444)||(23133333-23133777)
chr2 (1-444)||(34402236-34402680)
chr2 (1-444)||(24897910-24898354)
chr2 (1-444)||(24905347-24905791)
chr2 (1-444)||(26505383-26505826)
chr2 (1-444)||(26507861-26508304)
chr2 (1-444)||(24900393-24900837)
chr2 (1-444)||(24902870-24903314)
chr2 (1-444)||(24907822-24908266)
chr2 (4-444)||(571401-571842)
chr2 (1-444)||(32039213-32039656)
chr2 (1-444)||(23135594-23136027)
chr2 (1-286)||(20261381-20261667)
chr2 (1-444)||(24529261-24529687)
chr2 (1-285)||(10684477-10684764)
chr2 (164-444)||(22105416-22105697)
chr2 (1-238)||(23706931-23707169)
chr2 (164-444)||(6725999-6726279)
chr2 (1-238)||(24918350-24918588)
chr2 (1-222)||(45027619-45027840)
chr2 (3-238)||(24642465-24642701)
chr2 (5-238)||(24671235-24671469)
chr2 (1-238)||(24681654-24681892)
chr2 (168-444)||(21154942-21155218)
chr2 (1-238)||(38967689-38967927)
chr2 (164-440)||(24367782-24368058)
chr2 (1-198)||(22105716-22105913)
chr2 (49-264)||(25616365-25616581)
chr2 (1-198)||(24368077-24368274)
chr2 (1-198)||(21154722-21154919)
chr2 (1-198)||(6726298-6726495)
chr2 (1-198)||(41523787-41523984)
chr2 (164-444)||(38967378-38967658)
chr2 (164-363)||(24642732-24642933)
chr2 (216-444)||(45029784-45030012)
chr2 (4-156)||(41523597-41523749)
chr2 (1-156)||(22105951-22106106)
chr2 (1-134)||(23931775-23931908)
chr2 (1-156)||(24529068-24529223)
chr2 (1-152)||(41523401-41523552)
chr2 (1-156)||(21154529-21154684)
chr2 (1-156)||(24368312-24368467)
chr2 (1-156)||(24918626-24918781)
chr2 (27-156)||(6726533-6726662)
chr2 (1-154)||(32214451-32214604)
chr2 (1-156)||(23709054-23709209)
chr2 (1-156)||(24681930-24682085)
chr2 (1-153)||(23931949-23932101)
chr2 (1-156)||(23706547-23706702)
chr2 (1-151)||(23706739-23706889)
chr2 (271-450)||(19671831-19672010)
chr2 (1-156)||(21154336-21154491)
chr2 (1-156)||(24671511-24671666)
chr2 (8-154)||(45027433-45027579)
chr2 (164-285)||(23707200-23707323)
chr2 (167-285)||(24671081-24671201)
chr2 (164-285)||(24918196-24918319)
chr2 (278-444)||(43137303-43137469)
chr2 (164-285)||(24681500-24681623)
chr2 (337-450)||(23071955-23072069)
chr2 (280-436)||(23708568-23708725)
chr2 (290-444)||(7679592-7679745)
chr2 (290-437)||(25175864-25176010)
chr2 (330-437)||(28405990-28406099)
chr2 (286-432)||(7688-7835)
chr2 (286-450)||(23060514-23060679)
chr2 (286-450)||(23660024-23660188)
chr2 (286-450)||(23076443-23076608)
chr2 (91-155)||(31345490-31345554)
chr2 (256-325)||(22173799-22173868)
chr2 (286-450)||(22337116-22337281)
chr2 (286-450)||(23654341-23654506)
chr2 (354-450)||(38138-38234)
chr2 (349-453)||(22134225-22134329)
chr2 (286-450)||(22731189-22731354)
chr2 (286-450)||(23285866-23286027)
chr2 (1-58)||(31345570-31345627)
chr2 (38-156)||(18809428-18809546)
chr2 (403-457)||(25616179-25616233)
chr2 (35-136)||(67339-67440)
chr2 (67-148)||(16900803-16900884)
chr2 (67-148)||(16994194-16994275)
chr2 (286-450)||(22738135-22738299)
chr2 (27-136)||(24686598-24686707)
chr2 (286-444)||(298769-298929)
chr2 (104-156)||(24642373-24642425)
chr2 (334-436)||(18786904-18787009)
chr2 (38-156)||(23711572-23711690)
chr2 (38-156)||(26505864-26505982)
chr2 (38-156)||(26508342-26508460)
chr2 (38-156)||(27920323-27920441)
chr2 (38-156)||(28577584-28577702)
chr2 (38-156)||(32039057-32039175)
chr2 (164-206)||(41524003-41524045)
chr2 (27-136)||(19887275-19887384)
chr2 (269-398)||(23791327-23791458)
chr2 (27-136)||(27261332-27261441)
chr2 (67-136)||(34823750-34823819)
chr2 (40-136)||(12727711-12727807)
chr2 (269-432)||(22413073-22413240)
chr2 (375-450)||(8946658-8946733)
chr2 (280-367)||(22459511-22459598)
chr2 (303-450)||(23103369-23103515)
chr2 (117-156)||(23131347-23131386)
chr2 (117-156)||(34402160-34402199)
chr2 (286-432)||(20520148-20520295)
chr2 (165-238)||(21368365-21368439)
chr2 (388-450)||(23040247-23040309)
chr2 (390-444)||(24643054-24643108)
chr2 (27-136)||(11232213-11232322)
chr2 (27-136)||(22514060-22514169)
chr2 (27-136)||(28776662-28776771)
chr2 (40-156)||(571883-571999)
chr2 (269-432)||(23207296-23207461)
chr2 (269-309)||(29601478-29601518)
chr2 (38-98)||(34135059-34135119)
chr2 (117-156)||(23133814-23133853)
chr2 (117-156)||(39682799-39682838)
chr2 (165-238)||(23799457-23799531)
chr2 (68-136)||(22274022-22274090)
chr2 (170-245)||(22686145-22686221)
chr2 (120-156)||(23708980-23709016)
chr2 (38-82)||(24788042-24788086)
chr2 (38-82)||(44584588-44584632)
chr2 (286-432)||(24697561-24697709)
chr2 (27-108)||(6483113-6483194)
chr2 (27-108)||(21081348-21081429)
chr2 (383-444)||(22799179-22799240)
chr2 (388-444)||(21916156-21916212)
chr2 (68-136)||(22283255-22283323)
chr2 (165-212)||(22686062-22686110)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (1-449)||(9241-9689)
[»] chr5 (118 HSPs)
chr5 (1-444)||(20909016-20909459)
chr5 (1-444)||(264483-264926)
chr5 (1-444)||(10732655-10733098)
chr5 (1-444)||(39245140-39245583)
chr5 (1-444)||(42245080-42245523)
chr5 (1-444)||(39363388-39363832)
chr5 (1-444)||(29345984-29346427)
chr5 (1-444)||(29348457-29348900)
chr5 (1-444)||(29350930-29351373)
chr5 (4-444)||(38619438-38619881)
chr5 (4-444)||(23064515-23064958)
chr5 (1-444)||(2154346-2154772)
chr5 (1-264)||(17516878-17517142)
chr5 (1-285)||(37804617-37804902)
chr5 (1-238)||(20901635-20901873)
chr5 (164-444)||(32027397-32027677)
chr5 (164-444)||(29329938-29330215)
chr5 (27-285)||(9776521-9776780)
chr5 (1-198)||(20917561-20917758)
chr5 (1-198)||(32027696-32027893)
chr5 (164-444)||(20917830-20918106)
chr5 (4-198)||(29330234-29330427)
chr5 (1-156)||(20901442-20901597)
chr5 (1-156)||(17516492-17516647)
chr5 (164-444)||(20901904-20902168)
chr5 (1-156)||(295989-296144)
chr5 (1-156)||(32028124-32028280)
chr5 (1-156)||(17516685-17516840)
chr5 (1-156)||(29330468-29330623)
chr5 (1-156)||(32028511-32028666)
chr5 (1-156)||(2154153-2154308)
chr5 (1-156)||(32028318-32028473)
chr5 (1-156)||(20917368-20917523)
chr5 (1-156)||(295796-295951)
chr5 (1-156)||(32027931-32028086)
chr5 (269-444)||(36154766-36154938)
chr5 (271-444)||(11581184-11581357)
chr5 (281-444)||(10775670-10775834)
chr5 (277-444)||(18319024-18319192)
chr5 (286-432)||(22144068-22144215)
chr5 (280-450)||(40725854-40726025)
chr5 (269-444)||(31061072-31061248)
chr5 (306-444)||(22412191-22412329)
chr5 (286-450)||(1096468-1096633)
chr5 (337-450)||(19660841-19660955)
chr5 (286-450)||(9077953-9078118)
chr5 (277-444)||(24067111-24067279)
chr5 (286-450)||(25421533-25421698)
chr5 (350-450)||(21329516-21329617)
chr5 (337-437)||(22959538-22959639)
chr5 (286-450)||(24493570-24493734)
chr5 (286-444)||(24529227-24529386)
chr5 (280-437)||(21565556-21565713)
chr5 (286-450)||(23390451-23390616)
chr5 (351-450)||(36314578-36314678)
chr5 (290-436)||(26011995-26012141)
chr5 (337-450)||(19668899-19669013)
chr5 (286-450)||(21729019-21729184)
chr5 (286-450)||(21808344-21808509)
chr5 (286-450)||(13025312-13025476)
chr5 (286-450)||(13095496-13095660)
chr5 (286-450)||(8286797-8286963)
chr5 (383-457)||(17517254-17517328)
chr5 (349-450)||(21502174-21502276)
chr5 (349-450)||(21997552-21997654)
chr5 (286-432)||(22178175-22178323)
chr5 (286-431)||(25431414-25431560)
chr5 (38-136)||(27183180-27183278)
chr5 (27-136)||(22883904-22884013)
chr5 (354-441)||(18418590-18418677)
chr5 (303-448)||(37723906-37724050)
chr5 (38-156)||(264327-264445)
chr5 (27-136)||(43444009-43444118)
chr5 (337-432)||(20026945-20027043)
chr5 (38-156)||(20909497-20909615)
chr5 (286-435)||(22075035-22075185)
chr5 (27-136)||(11903-12012)
chr5 (67-136)||(1220384-1220453)
chr5 (67-136)||(10778832-10778901)
chr5 (27-136)||(25426177-25426286)
chr5 (27-134)||(7424879-7424986)
chr5 (168-238)||(18743965-18744036)
chr5 (117-156)||(39245621-39245660)
chr5 (117-156)||(39363869-39363908)
chr5 (38-156)||(23064999-23065117)
chr5 (39-136)||(11342190-11342287)
chr5 (27-136)||(21933243-21933352)
chr5 (27-136)||(21939413-21939522)
chr5 (27-136)||(22367095-22367204)
chr5 (27-136)||(35581340-35581449)
chr5 (27-136)||(36990639-36990748)
chr5 (68-136)||(23511127-23511195)
chr5 (165-238)||(1628169-1628243)
chr5 (67-136)||(1168832-1168901)
chr5 (67-136)||(11212734-11212803)
chr5 (27-136)||(18778606-18778715)
chr5 (67-136)||(21074249-21074318)
chr5 (381-450)||(21293020-21293089)
chr5 (38-77)||(22755231-22755270)
chr5 (38-113)||(31478959-31479034)
chr5 (38-136)||(19499428-19499526)
chr5 (164-198)||(20917777-20917811)
chr5 (66-136)||(32950213-32950283)
chr5 (38-136)||(35791736-35791834)
chr5 (117-155)||(38619922-38619960)
chr5 (27-108)||(19511781-19511862)
chr5 (383-444)||(20805555-20805616)
chr5 (383-444)||(21873257-21873318)
chr5 (256-285)||(22750267-22750296)
chr5 (383-444)||(23572087-23572148)
chr5 (27-96)||(37804450-37804519)
chr5 (400-444)||(20766977-20767021)
chr5 (400-444)||(20806856-20806900)
chr5 (167-238)||(21399896-21399968)
chr5 (364-444)||(22032326-22032406)
chr5 (245-285)||(25743808-25743848)
chr5 (67-127)||(28901495-28901555)
chr5 (67-127)||(28937890-28937950)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (1-457)||(11279-11737)
scaffold0029 (383-444)||(12766-12827)
[»] scaffold0716 (2 HSPs)
scaffold0716 (1-444)||(4698-5142)
scaffold0716 (1-156)||(5180-5335)
[»] scaffold0230 (4 HSPs)
scaffold0230 (1-444)||(13951-14395)
scaffold0230 (1-239)||(23245-23484)
scaffold0230 (1-156)||(22892-23047)
scaffold0230 (70-156)||(23121-23207)
[»] scaffold0134 (2 HSPs)
scaffold0134 (1-444)||(37825-38269)
scaffold0134 (38-156)||(38307-38425)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (1-444)||(136684-137127)
scaffold0028 (1-444)||(139153-139596)
scaffold0028 (1-444)||(144091-144534)
scaffold0028 (1-444)||(134215-134658)
scaffold0028 (1-444)||(141622-142065)
scaffold0028 (349-433)||(62216-62301)
scaffold0028 (326-437)||(132672-132784)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (3-444)||(20751-21193)
[»] scaffold0444 (2 HSPs)
scaffold0444 (1-444)||(13396-13840)
scaffold0444 (116-156)||(13878-13918)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (4-444)||(40404-40844)
scaffold0044 (27-148)||(37848-37968)
scaffold0044 (116-156)||(40885-40925)
[»] scaffold0695 (1 HSPs)
scaffold0695 (1-325)||(6070-6394)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (79-449)||(10772-11142)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (1-457)||(501075-501512)
scaffold0001 (1-156)||(501550-501705)
scaffold0001 (269-444)||(85562-85738)
scaffold0001 (280-437)||(160698-160854)
scaffold0001 (38-94)||(139589-139645)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (27-444)||(38396-38816)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (1-285)||(3186-3471)
[»] scaffold0741 (4 HSPs)
scaffold0741 (1-285)||(4017-4304)
scaffold0741 (1-156)||(3824-3979)
scaffold0741 (1-152)||(3631-3782)
scaffold0741 (104-156)||(3541-3593)
[»] scaffold0317 (2 HSPs)
scaffold0317 (1-252)||(6650-6902)
scaffold0317 (9-156)||(6465-6612)
[»] scaffold0494 (3 HSPs)
scaffold0494 (1-238)||(238-476)
scaffold0494 (231-457)||(12194-12420)
scaffold0494 (164-238)||(507-582)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (46-285)||(1591-1831)
[»] scaffold0306 (4 HSPs)
scaffold0306 (19-285)||(15083-15352)
scaffold0306 (1-203)||(11054-11256)
scaffold0306 (9-156)||(10869-11016)
scaffold0306 (1-156)||(15398-15552)
[»] scaffold0149 (3 HSPs)
scaffold0149 (1-238)||(30229-30467)
scaffold0149 (1-156)||(30505-30660)
scaffold0149 (166-434)||(29946-30196)
[»] scaffold0043 (4 HSPs)
scaffold0043 (1-238)||(10001-10239)
scaffold0043 (1-156)||(10277-10432)
scaffold0043 (2-156)||(10470-10624)
scaffold0043 (164-198)||(9936-9970)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (27-285)||(53612-53873)
scaffold0022 (306-444)||(116434-116571)
scaffold0022 (269-432)||(128907-129072)
[»] scaffold1792 (3 HSPs)
scaffold1792 (1-239)||(416-655)
scaffold1792 (1-156)||(853-1008)
scaffold1792 (70-156)||(693-779)
[»] scaffold0747 (4 HSPs)
scaffold0747 (4-238)||(799-1034)
scaffold0747 (7-156)||(1075-1224)
scaffold0747 (164-285)||(645-768)
scaffold0747 (12-126)||(1225-1338)
[»] scaffold0574 (2 HSPs)
scaffold0574 (1-227)||(6682-6899)
scaffold0574 (1-156)||(6937-7092)
[»] scaffold0278 (4 HSPs)
scaffold0278 (1-192)||(7996-8187)
scaffold0278 (1-156)||(8225-8380)
scaffold0278 (5-153)||(8421-8569)
scaffold0278 (290-437)||(5657-5803)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (1-183)||(68227-68409)
scaffold0064 (382-450)||(46996-47065)
[»] scaffold0040 (3 HSPs)
scaffold0040 (1-186)||(43002-43187)
scaffold0040 (39-230)||(13379-13571)
scaffold0040 (1-156)||(43225-43380)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (65-221)||(57708-57865)
[»] scaffold1296 (2 HSPs)
scaffold1296 (1-156)||(1740-1895)
scaffold1296 (1-69)||(1634-1702)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (1-156)||(18423-18578)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (1-155)||(17947-18101)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (1-155)||(31497-31651)
[»] scaffold0436 (1 HSPs)
scaffold0436 (1-156)||(8311-8466)
[»] scaffold0711 (3 HSPs)
scaffold0711 (5-155)||(7408-7558)
scaffold0711 (8-156)||(7219-7367)
scaffold0711 (61-154)||(7079-7172)
[»] scaffold0138 (3 HSPs)
scaffold0138 (1-155)||(33465-33619)
scaffold0138 (349-436)||(12954-13042)
scaffold0138 (270-371)||(18176-18277)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (1-155)||(39626-39780)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (256-444)||(82076-82264)
scaffold0037 (280-436)||(22620-22776)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (256-444)||(110-298)
[»] scaffold0151 (2 HSPs)
scaffold0151 (1-156)||(36913-37068)
scaffold0151 (30-156)||(36749-36875)
[»] scaffold0114 (3 HSPs)
scaffold0114 (164-275)||(27962-28073)
scaffold0114 (100-198)||(28092-28190)
scaffold0114 (354-450)||(15487-15583)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (1-155)||(19803-19957)
[»] scaffold0145 (4 HSPs)
scaffold0145 (164-444)||(9753-10016)
scaffold0145 (286-450)||(38762-38926)
scaffold0145 (286-450)||(32943-33107)
scaffold0145 (166-227)||(10005-10067)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (269-444)||(158433-158608)
scaffold0003 (286-436)||(339905-340053)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (269-444)||(4301-4476)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (281-444)||(4218-4382)
[»] scaffold0513 (2 HSPs)
scaffold0513 (164-285)||(10765-10886)
scaffold0513 (152-238)||(10647-10734)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (269-444)||(16788-16963)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (280-450)||(11465-11636)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (280-450)||(38205-38376)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (256-444)||(12068-12250)
[»] scaffold0106 (5 HSPs)
scaffold0106 (164-285)||(15150-15273)
scaffold0106 (140-238)||(15030-15119)
scaffold0106 (383-444)||(15291-15352)
scaffold0106 (380-450)||(7267-7338)
scaffold0106 (354-450)||(1290-1385)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (280-432)||(20373-20524)
scaffold0031 (286-450)||(128752-128916)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (280-450)||(17976-18147)
scaffold0247 (269-440)||(2111-2283)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (279-436)||(27697-27855)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (256-444)||(1250-1439)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (269-450)||(1011-1189)
scaffold0184 (38-136)||(32118-32216)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (279-436)||(16048-16206)
scaffold0357 (279-432)||(13147-13302)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (286-450)||(3106-3270)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (176-266)||(35955-36046)
scaffold0100 (349-436)||(23901-23989)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (337-450)||(11293-11407)
scaffold0046 (337-450)||(1998-2112)
scaffold0046 (337-450)||(28415-28529)
scaffold0046 (400-450)||(4553-4603)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (269-444)||(161072-161248)
scaffold0007 (269-369)||(164573-164674)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (286-453)||(3141-3309)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (280-436)||(8481-8640)
scaffold0621 (290-450)||(6536-6695)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (337-444)||(15668-15776)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (286-442)||(39486-39642)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (269-432)||(79267-79430)
scaffold0056 (286-453)||(17170-17340)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (286-442)||(75170-75326)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (290-437)||(143-290)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (286-444)||(26020-26179)
scaffold0122 (306-444)||(44682-44821)
[»] scaffold0175 (2 HSPs)
scaffold0175 (337-450)||(34124-34238)
scaffold0175 (280-394)||(13149-13264)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (286-450)||(13212-13377)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (290-437)||(19278-19424)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (280-432)||(53498-53651)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (164-285)||(1204-1327)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (4-148)||(113317-113461)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (290-437)||(129919-130066)
scaffold0010 (286-424)||(60670-60810)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (349-450)||(6612-6714)
scaffold0333 (349-450)||(13992-14094)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (280-437)||(45742-45899)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (349-450)||(15795-15897)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (350-442)||(1091-1184)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (280-436)||(10491-10647)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (286-443)||(25904-26061)
scaffold0026 (286-450)||(39859-40023)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (349-450)||(6141-6243)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (1-71)||(75619-75689)
scaffold0042 (286-433)||(24257-24406)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (287-450)||(16114-16278)
scaffold0120 (286-450)||(32913-33076)
scaffold0120 (286-450)||(45929-46092)
scaffold0120 (390-450)||(17389-17449)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (280-450)||(51914-52085)
scaffold0011 (301-450)||(167948-168098)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (301-450)||(1018-1168)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (349-450)||(1052-1154)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (301-430)||(4545-4675)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (280-394)||(225465-225578)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (269-342)||(12039-12112)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (290-437)||(2606-2752)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (291-364)||(13092-13165)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (286-450)||(1852-2017)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (330-437)||(2805-2913)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (286-450)||(344-508)
scaffold0292 (286-450)||(3471-3636)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (280-450)||(8482-8649)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (330-437)||(14696-14804)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (286-444)||(22890-23048)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (330-436)||(10542-10649)
scaffold0078 (38-136)||(40628-40726)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (280-391)||(8008-8121)
[»] scaffold0556 (1 HSPs)
scaffold0556 (337-437)||(6826-6927)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (349-437)||(12780-12869)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (286-450)||(4850-5015)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (27-136)||(6196-6305)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (286-450)||(16555-16720)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (269-448)||(6220-6400)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (280-432)||(12587-12739)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (27-136)||(8566-8675)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (326-437)||(32112-32224)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (27-136)||(30470-30579)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (286-450)||(39914-40078)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (382-450)||(121767-121835)
scaffold0021 (8-70)||(398-460)
scaffold0021 (303-432)||(174785-174913)
scaffold0021 (337-432)||(136373-136471)
scaffold0021 (337-432)||(145081-145179)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (375-450)||(4713-4788)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (330-396)||(2217-2283)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (286-450)||(6076-6244)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (354-435)||(13513-13594)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (27-136)||(725-834)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (286-437)||(4522-4673)
scaffold0228 (286-437)||(12104-12255)
scaffold0228 (286-437)||(22056-22207)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (337-397)||(2448-2508)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (354-450)||(32068-32163)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (354-432)||(1051-1130)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (65-136)||(12519-12590)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (269-436)||(25121-25289)
scaffold0123 (166-228)||(16263-16326)
[»] scaffold0034 (4 HSPs)
scaffold0034 (330-436)||(32551-32657)
scaffold0034 (66-136)||(39965-40035)
scaffold0034 (66-136)||(45448-45518)
scaffold0034 (66-136)||(79003-79073)
[»] scaffold0686 (1 HSPs)
scaffold0686 (38-136)||(6941-7039)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (301-450)||(1953-2103)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (27-136)||(1375-1484)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (385-450)||(4888-4953)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (337-394)||(29286-29343)
scaffold0218 (337-436)||(8078-8180)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (27-136)||(110065-110174)
scaffold0035 (27-136)||(118566-118675)
[»] scaffold0327 (2 HSPs)
scaffold0327 (286-370)||(3485-3569)
scaffold0327 (400-444)||(292-336)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (38-134)||(15780-15876)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (354-444)||(11466-11557)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (269-371)||(97088-97190)
scaffold0006 (269-371)||(106366-106468)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (286-432)||(267679-267826)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (286-450)||(10381-10543)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (38-136)||(53946-54044)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (38-136)||(19911-20009)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (67-136)||(1296-1365)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (27-136)||(18205-18314)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (27-136)||(28469-28578)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (27-136)||(38375-38484)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (303-450)||(8480-8628)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (368-437)||(28806-28877)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (400-444)||(29561-29605)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (286-370)||(27912-27996)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (383-450)||(193029-193097)
scaffold0017 (400-447)||(15280-15327)
scaffold0017 (400-447)||(19802-19849)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (67-134)||(912-979)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (165-243)||(15282-15361)
[»] scaffold1753 (1 HSPs)
scaffold1753 (66-136)||(868-938)
[»] scaffold0959 (1 HSPs)
scaffold0959 (34-148)||(1219-1333)
[»] scaffold0475 (1 HSPs)
scaffold0475 (349-394)||(9136-9181)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (388-444)||(9516-9572)
scaffold0104 (400-444)||(1833-1877)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (41-136)||(8097-8192)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (401-444)||(4875-4918)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (38-77)||(53939-53978)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (286-371)||(1753-1836)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (286-424)||(38343-38483)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (286-450)||(20911-21077)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (360-432)||(51601-51672)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (383-444)||(6098-6159)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (383-444)||(23846-23907)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (383-444)||(44084-44145)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (400-444)||(162-206)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (400-444)||(36457-36501)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 367; Significance: 0; HSPs: 129)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 30676424 - 30676881
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676424 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 30676523  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30676524 aataatttatagaacttgagttatggtaaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 30676623  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattat 299  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30676624 tgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattat 30676723  T
Q  300 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgt 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  |||| |||||| || ||||| |||    
T  30676724 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgt 30676822  T
Q  399 cgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 457  Q
     |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676823 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 30676881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 34963821 - 34963364
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34963821 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 34963722  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34963721 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacatagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 34963622  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattat 299  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34963621 tgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattat 34963522  T
Q  300 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgt 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||    
T  34963521 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgt 34963423  T
Q  399 cgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 457  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963422 tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 34963364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 24422994 - 24422551
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422994 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 24422895  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24422894 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgt 24422795  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  24422794 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgta 24422695  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||     
T  24422694 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 24422596  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24422595 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24422551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 33862241 - 33861798
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33862241 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 33862142  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33862141 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgt 33862042  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  33862041 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgta 33861942  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||     
T  33861941 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 33861843  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33861842 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 33861798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 33864725 - 33864282
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864725 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 33864626  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33864625 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgt 33864526  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  33864525 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgta 33864426  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||     
T  33864425 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 33864327  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33864326 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 33864282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Original strand, 18334307 - 18334750
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334307 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 18334406  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18334407 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgt 18334506  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  18334507 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgta 18334606  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||     
T  18334607 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 18334705  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18334706 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 18334750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Original strand, 2290895 - 2291338
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2290895 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagatataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 2290994  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2290995 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgt 2291094  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  2291095 gaatacgatattgtccatgactgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgta 2291194  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||     
T  2291195 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 2291293  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2291294 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 2291338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Original strand, 26924355 - 26924798
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924355 atgaaaactagtattgattggtacagaattgttcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 26924454  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924455 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtacgtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 26924554  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  26924555 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtacatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgta 26924654  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| |||||   | ||||| |||     
T  26924655 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-attgtgttgctgtt 26924753  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26924754 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 26924798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 12742765 - 12742321
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742765 atgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 12742666  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12742665 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcaagtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 12742566  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattat 299  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  12742565 tgaatacgaccttgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgt 12742466  T
Q  300 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgt 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||    
T  12742465 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgt 12742367  T
Q  399 cgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
     |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12742366 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12742321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 444
Target Start/End: Original strand, 1540630 - 1541069
Alignment:
Q  5 aaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagg 104  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1540630 aaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagg 1540729  T
Q  105 atttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaat 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1540730 atttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaat 1540829  T
Q  205 acgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  1540830 acgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatg 1540929  T
Q  305 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgtta 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||  ||  |||| ||||||  | ||||| ||| ||||    
T  1540930 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgtta 1541028  T
Q  404 tttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  1541029 tttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatg 1541069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 22782674 - 22782231
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782674 atgaaaaatggtattaattggtacagaattggtcttaggtgtaagtaggaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 22782575  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782574 aagaatttatagaatttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 22782475  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  22782474 gaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgta 22782375  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| |||||| || ||||| |||     
T  22782374 tatgcattacttgaattatgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt 22782276  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22782275 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 22782231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Original strand, 19858637 - 19859077
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19858637 atgaaaactggtattgattggtacataattgatcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgt---ctttctaatgccgttggtttgacttcaa 19858733  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  19858734 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgctgt 19858833  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  19858834 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattgttatttgatgttgttatattgtgatataattgta 19858933  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||     
T  19858934 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 19859032  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19859033 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 19859077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 8055477 - 8055033
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8055477 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctattgccgttggtttgacttcaa 8055378  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8055377 aaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaatgtaggtcacaatgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 8055278  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  8055277 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgt 8055178  T
Q  300 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgt 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| |||||   | ||||| |||    
T  8055177 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-tttgtgttgctgt 8055079  T
Q  399 cgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
     |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8055078 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 8055033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 4 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 25688947 - 25688507
Alignment:
Q  4 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 103  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25688947 aaaactggtatttattggtaccgaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttgtaatgccgttggtttgacttcaaaag 25688848  T
Q  104 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtata-tgttgtga 202  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  25688847 gatttataaaaattgagttatggtcaaattactgcacgtaggtgacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatttttgtga 25688748  T
Q  203 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattatata 302  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  25688747 atacgatattgtccatgattgaggaagtgttatatgtataaatgatgttttaagatgttgattaccatttggtgttgttatattgtgatatgattatata 25688648  T
Q  303 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgt 401  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  ||||||| ||| ||    
T  25688647 tgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttatgttgctgttgt 25688549  T
Q  402 tatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagat 443  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  25688548 tatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagat 25688507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 19847686 - 19848122
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19847686 atgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgc----tagatttctaatgccgttggtttgacttcaa 19847781  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19847782 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 19847881  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   ||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  19847882 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg-------------------atttgatgttgttatattgtgatataattgt 19847962  T
Q  300 atatgcattacttgaattatatgtg-aataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggt-ttgcatactgcctatgttgttg 397  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| || |||  ||||||| || || | |||||| |||| |  || || |  || |  ||||||||| || |     
T  19847963 atatgcattatttgaattatatgtgaaatatttaagatattgttgaattgcaattgatatttttatgtgttgctgttgatgtaatctgcctatgctgcta 19848062  T
Q  398 tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 457  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19848063 ttgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgataatgatgt 19848122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 1598504 - 1598266
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598504 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 1598405  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598404 aaggatttatagaacttgagtcatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 1598305  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598304 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 1598266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 28289051 - 28289334
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28289051 atgaaaactggtattgattggtacataattggtctcaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 28289150  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatat-gttg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||    
T  28289151 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttg 28289250  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatat 285  Q
    |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  28289251 tga--gcgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgtcgttatat 28289334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 15 - 252
Target Start/End: Original strand, 17377576 - 17377814
Alignment:
Q  15 tgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaa 114  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17377576 tgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaagtatttatagaa 17377675  T
Q  115 cttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattg 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  17377676 cttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaaatagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattg 17377775  T
Q  214 tccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 252  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17377776 ttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 17377814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 12942637 - 12942363
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12942637 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta------------agctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 12942550  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatat-gttg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||    
T  12942549 aaggatttatagaacttgagttatggtcgaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttg 12942450  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatatt 286  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12942449 tgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 12942363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 23992870 - 23992604
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||| | ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||| ||||    
T  23992870 atgaaatccggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtcagctttctaatgttgttggtctgacgtcaa 23992771  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23992770 aacgatttatagaacttgagttatggtcaatttactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 23992671  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat---gatgttttaagatgttgat 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  23992670 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgatgttttaagatgttgat 23992604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18914380 - 18914142
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  18914380 atgaaaactggtatttattggtacataattggtcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttaactttctaatgctgttggtttaacttcaa 18914281  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18914280 aaggatgtatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 18914181  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 238  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18914180 taaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 18914142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 164 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 19005330 - 19005050
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005330 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaaatgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 19005231  T
Q  264 ttaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattatta 363  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  19005230 ttattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 19005131  T
Q  364 tatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    | ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19005130 tgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 19005050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 31630255 - 31630493
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31630255 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaatttgtaggtatagacgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaa 31630354  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31630355 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattattgcacgtatgtcacaatgaataattaaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 31630454  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 238  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  31630455 tgaatacgatattgttcatgattgataaagtgttatatg 31630493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19005599 - 19005361
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19005599 atgaaaactggtattgattggtacataattagtcttaggtgtaaacacaaaaattgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 19005500  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||    
T  19005499 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattactataggtatgtatatgtttg 19005400  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 238  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  19005399 tgaatgcgatattgttcataattgatgaaatgttatatg 19005361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25535855 - 25535641
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25535855 atgaaaactggtattgattggtagagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 25535756  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25535755 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 25535656  T
Q  200 tgaatacgatattgt 214  Q
    |||||||||||||||    
T  25535655 tgaatacgatattgt 25535641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 181 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 25656897 - 25656633
Alignment:
Q  181 tatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattg 279  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  25656897 tatatgtatgtatatatttgtgactacgatattgtccaagattgatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgttt 25656798  T
Q  280 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttg 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | || |||| ||||||||||| ||||| ||  ||||    
T  25656797 ttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 25656698  T
Q  379 catactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
     |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25656697 tatactg-ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 25656633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 1879 - 2034
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  1879 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtacacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 1978  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1979 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 2034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 8838 - 8993
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  8838 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtacacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 8937  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8938 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 8993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 234 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 1595763 - 1595553
Alignment:
Q  234 atatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattga 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1595763 atatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatccattacttgaattatatgtgaataattga 1595664  T
Q  334 gacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaag 432  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1595663 gacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 1595565  T
Q  433 ttgattaagatg 444  Q
    ||||||||||||    
T  1595564 ttgattaagatg 1595553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 1598697 - 1598542
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  1598697 atgaaaactggtattgattggtacataaatggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgacatcaa 1598598  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598597 aacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 1598542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 19847493 - 19847648
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||    
T  19847493 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcctaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattagtctgacgtcaa 19847592  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19847593 aacgatttatagaacttgagttatcgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 19847648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 19005784 - 19005637
Alignment:
Q  9 tggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 108  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  19005784 tggtattgattagtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacttcaaaacgattt 19005685  T
Q  109 atagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005684 atagaacttgagttatgttcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 19005637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 27557170 - 27557016
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||    
T  27557170 atgaaaactgctattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtctgacgttaa 27557071  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 155  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27557070 aacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaa 27557016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 25689143 - 25688988
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  25689143 atgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtcggacgtcaa 25689044  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  25689043 aaaaatttatagaacttgcgttatggtcatattactgcacgtaggtcatagtgaat 25688988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 30676231 - 30676386
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||    
T  30676231 atgaaaactggtattgaatggtacataattggtcttaggtgataagactaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttgctctgacgtcaa 30676330  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676331 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 30676386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 23415412 - 23415258
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  23415412 atgaaaactggtattgattggtacagaatttgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccattggtctgacgtcaa 23415313  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 155  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  23415312 aacaatttatagaacttgagttatggtcaagttactgcacgtaggtcactgtgaa 23415258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 18914567 - 18914422
Alignment:
Q  7 actggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||  |||||| |||    
T  18914567 actggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggaagttagctttctaataccgttggtctgaagtcaaaacgat 18914468  T
Q  107 ttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 152  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18914467 tgatagaacttgagttatggtcaaagtactgcacgtaggtcacagt 18914422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 256 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 25755001 - 25754813
Alignment:
Q  256 gatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcga 355  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  25755001 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 25754902  T
Q  356 tattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||||||| ||||| ||  |||| |||||  || ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25754901 tattattatgtcatgctgtttttgtatact-actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 25754813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 1598890 - 1598735
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||    
T  1598890 atgaaaactggtattgataggtccagaattggtcataagtgtaaacattaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtctgacgttaa 1598791  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598790 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 1598735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 26924162 - 26924313
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  26924162 atgaaaactggtattgattggtacagaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 26924261  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 152  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924262 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 26924313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 15892123 - 15892231
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15892123 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgctagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 15892222  T
Q  101 aaggattta 109  Q
    |||||||||    
T  15892223 aaggattta 15892231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 87 - 242
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  87 atgaaaactggtattgagttgtacaaaattggtcttaggtgtatacacgaaagttgaaggtatggatgttagttttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 186  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  187 aacgatttatataacttgagttatggtcaaagtactgcacgtaggtcatagtgaat 242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 31630062 - 31630217
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  31630062 atgaaatctggtattgataagtacatagttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagttatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 31630161  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  31630162 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacatgtatgtcacagcgaat 31630217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 164 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 18914111 - 18913994
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18914111 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttatgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 18914012  T
Q  264 ttaccatttgatattgtt 281  Q
    |||  ||||||| |||||    
T  18914011 ttattatttgatgttgtt 18913994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 18914766 - 18914615
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||| |||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  18914766 atgaaatctggtattgataagtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgtcgttggtctgacatcaa 18914667  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 152  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18914666 aaaaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 18914615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 164 - 265
Target Start/End: Original strand, 31630524 - 31630626
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31630524 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 31630623  T
Q  263 att 265  Q
    |||    
T  31630624 att 31630626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 27 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 25689310 - 25689181
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25689310 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtgtggatgtcagcattctaatgacgttggtctgacatcaaaacaatttatagaacttgagttatgg 25689211  T
Q  127 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25689210 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 25689181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 164 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 15875590 - 15875469
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15875590 tatgattgatgaattattatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtaaatgattaatgaaatgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 15875491  T
Q  264 ttaccatttgatattgttatat 285  Q
    |||  ||||||| |||||||||    
T  15875490 ttattatttgatgttgttatat 15875469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 256 - 444
Target Start/End: Original strand, 20556864 - 20557050
Alignment:
Q  256 gatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcga 355  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||| ||    
T  20556864 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtga--aattgagacgttgttgacttgcatttga 20556961  T
Q  356 tattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||  |||| ||  |||| ||||||  | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  20556962 tattattatgccatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatg 20557050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 113 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15875737 - 15875621
Alignment:
Q  113 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatatt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||    
T  15875737 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtaaataattgaatatgattgatgaattagtatatgt---------ttgtgaatacgatatt 15875647  T
Q  213 gtccatgattgatgaagtgttatatg 238  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  15875646 gttcatgattgatgaagtgttatatg 15875621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 18456898 - 18456735
Alignment:
Q  269 atttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatca 368  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||    
T  18456898 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 18456799  T
Q  369 tgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaag 432  Q
    || ||  |||| |||||   | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  18456798 tgctgtttttgtatact-attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18456735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 280 - 450
Target Start/End: Original strand, 8227460 - 8227631
Alignment:
Q  280 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgc 379  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| | |||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  8227460 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttttgc 8227559  T
Q  380 atactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||||||||| |||| || || |||  |||||||| |||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||    
T  8227560 atactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagttgttgaagatgttgatg 8227631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 37 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 25737247 - 25737128
Alignment:
Q  37 aggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  25737247 aggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacatgagttatggtcatattact 25737148  T
Q  137 gcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  25737147 gcatgtaggtcacagtgaat 25737128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 277 - 444
Target Start/End: Original strand, 16448517 - 16448685
Alignment:
Q  277 ttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttacattcgatattattatatcatgatg-g 374  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||| ||||| ||      
T  16448517 ttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 16448616  T
Q  375 tttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||| |||||| || ||| | ||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16448617 tttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 16448685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 444
Target Start/End: Original strand, 3852009 - 3852175
Alignment:
Q  278 tgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtt 376  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||| || ||||| ||  ||    
T  3852009 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattatcatgtcatgctgtttt 3852108  T
Q  377 tgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    || |||||   | ||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3852109 tgtatact-attgtgttgctgttgttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 3852175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 17883212 - 17883305
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttga 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  17883212 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtctttggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagcattctaatgtcgttggtttga 17883305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 286 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 25644487 - 25644335
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatact 384  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||  |||||| |||| ||| ||||||| |||||| |||||||| | ||  ||||||||||    
T  25644487 tgtgatataattgtatacgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatact 25644388  T
Q  385 gcctatgttgttgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttga 436  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  25644387 gcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25644335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 61 - 156
Target Start/End: Original strand, 22981321 - 22981416
Alignment:
Q  61 tatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22981321 tatggatgttagctttctaatgccgttggtcgggcgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 22981416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 61 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 23807087 - 23806992
Alignment:
Q  61 tatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23807087 tatggatgttagctttctaatgccgttggtcgggcgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 23806992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 337 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 1561418 - 1561304
Alignment:
Q  337 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgtt-gtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttg 435  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1561418 gttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggtttgcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 1561319  T
Q  436 attaagatgttgatg 450  Q
     | |||||| |||||    
T  1561318 ttgaagatgatgatg 1561304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 337 - 434
Target Start/End: Original strand, 28496477 - 28496575
Alignment:
Q  337 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttg-ttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagtt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  28496477 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 28496575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 337 - 434
Target Start/End: Original strand, 29808888 - 29808986
Alignment:
Q  337 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttg-ttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagtt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  29808888 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29808986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Original strand, 19303496 - 19303660
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactg 385  Q
    |||||||||||  ||| | ||||||||||| |||   || |||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||     
T  19303496 tgtgatataatgttatgtacattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactt 19303595  T
Q  386 cctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||    
T  19303596 cctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatg 19303660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 351 - 450
Target Start/End: Original strand, 27333238 - 27333338
Alignment:
Q  351 ttcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 449  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  27333238 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 27333337  T
Q  450 g 450  Q
    |    
T  27333338 g 27333338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 351 - 450
Target Start/End: Original strand, 27393978 - 27394078
Alignment:
Q  351 ttcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 449  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  27393978 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 27394077  T
Q  450 g 450  Q
    |    
T  27394078 g 27394078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 299 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 18462028 - 18461895
Alignment:
Q  299 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttg 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| |||||   | ||||| ||    
T  18462028 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-attgtgttgctg 18461930  T
Q  398 tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaag 432  Q
    | |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  18461929 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 20076862 - 20076701
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactg 385  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  |||||  || |||   ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| || ||||  |||||    
T  20076862 tgtgatataatgttatacgcattacttgaagtataattgaatttttaaga---tgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtttactg 20076766  T
Q  386 cctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  20076765 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 20076701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 289 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 29060703 - 29060541
Alignment:
Q  289 gatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcc 387  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||    
T  29060703 gatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcc 29060604  T
Q  388 tatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||    
T  29060603 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagctgatgaagatgatgatg 29060541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 303 - 450
Target Start/End: Original strand, 17287768 - 17287916
Alignment:
Q  303 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgt 401  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||| ||    
T  17287768 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgttgt 17287867  T
Q  402 tatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  17287868 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 17287916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 286 - 453
Target Start/End: Original strand, 18409782 - 18409950
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatact 384  Q
    |||||||||||  |||||| |||| |||||||||   || || ||||||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | |||||    
T  18409782 tgtgatataatgttatatgtattatttgaattatgaatggatgattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatact 18409881  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatg 453  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  18409882 gcctgtgttgctgttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgatg 18409950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 330 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 19652316 - 19652209
Alignment:
Q  330 ttgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtc 428  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||| |||    
T  19652316 ttgagatgttgttgattg-cattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtc 19652218  T
Q  429 taagttgat 437  Q
    |||||||||    
T  19652217 taagttgat 19652209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 280 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 20109312 - 20109153
Alignment:
Q  280 ttatattgtgatataat--tatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt 377  Q
    ||||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||| || |||| |||||| |||||| ||| || |||    
T  20109312 ttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatattatgttgtttt 20109213  T
Q  378 gcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttga 436  Q
    ||||||||||||||||| || | |||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  20109212 gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 20109153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 212 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 18937321 - 18937252
Alignment:
Q  212 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgtt 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  18937321 tgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgtt 18937252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 25737090 - 25737028
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 63  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25737090 atgaaaactggtattgattggtacagaattcgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 25737028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 16496410 - 16496245
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatact 384  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | |||||    
T  16496410 tgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatact 16496311  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  16496310 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 16496245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Original strand, 20360915 - 20361080
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatact 384  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | || ||    
T  20360915 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgct 20361014  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| || ||| |||||    
T  20361015 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgatgaaaatgatgatg 20361080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Original strand, 25629310 - 25629475
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatact 384  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||    
T  25629310 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatact 25629409  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    || | ||||  ||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  25629410 gcatgtgttcctgttgtaatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 25629475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 303 - 450
Target Start/End: Original strand, 22780199 - 22780347
Alignment:
Q  303 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtcgt 401  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||| || || | ||||||||||| ||| | || ||| | ||| |||||||||| |||| ||    
T  22780199 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtttttgttgt 22780298  T
Q  402 tatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22780299 tatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatg 22780347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 383 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 23992495 - 23992421
Alignment:
Q  383 ctgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 457  Q
    ||||||||| || | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23992495 ctgcctatgctgctattgttatttagctaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgataatgatgt 23992421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 354 - 450
Target Start/End: Original strand, 20638306 - 20638403
Alignment:
Q  354 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||| |||||    
T  20638306 gatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 20638403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 9031 - 9085
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagtt 55  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9031 atgaaaactggtaatgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagtt 9085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 156
Target Start/End: Original strand, 18334151 - 18334269
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  18334151 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 18334250  T
Q  138 cacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18334251 cacgtaggtcacagtgaat 18334269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 136
Target Start/End: Original strand, 19984130 - 19984228
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||   | ||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19984130 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatgactttggtttgacctccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 19984228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 24423150 - 24423032
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  24423150 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 24423051  T
Q  138 cacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |||||||||||||||||||    
T  24423050 cacgtaggtcacagtgaat 24423032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 349 - 437
Target Start/End: Original strand, 4185839 - 4185928
Alignment:
Q  349 cattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 437  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| | |||||||||| ||| ||||||||    
T  4185839 cattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgat 4185928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 16240405 - 16240296
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||| ||||||||||||     
T  16240405 aattggacttcggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttaggacttgagttatga 16240306  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    ||||||||||    
T  16240305 tcaaattact 16240296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Original strand, 16556945 - 16557054
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||| || || ||| ||||| ||||||||||||||||     
T  16556945 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatga 16557044  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    ||||||||||    
T  16557045 tcaaattact 16557054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Original strand, 16633501 - 16633610
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||| || || ||| ||||| ||||||||||||||||     
T  16633501 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatga 16633600  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    ||||||||||    
T  16633601 tcaaattact 16633610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Original strand, 16650175 - 16650284
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| || || ||||||||||||||||     
T  16650175 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgaattttagaacttgagttatga 16650274  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    ||||||||||    
T  16650275 tcaaattact 16650284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 20593939 - 20593774
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatact 384  Q
    ||||||||| |  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | |||||    
T  20593939 tgtgatatattgttatacgcattacttgatttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatact 20593840  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    || | ||||| |||  |||||||||| || ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||    
T  20593839 gcatgtgttgctgtttttatttaactgagctgcatgattcggtctaagttgatgaagatgatgatg 20593774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 290 - 436
Target Start/End: Original strand, 9098473 - 9098620
Alignment:
Q  290 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgcatactgcc 387  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | |||    ||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||  || |||||||||||||    
T  9098473 atataattatatatacattacatgaattatgtttgatg--ttgtgaagttgttgaaatgcatttgatattgttatatcatgaattgttttgcatactgcc 9098570  T
Q  388 tatgttgttgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttga 436  Q
    | ||||| |||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  9098571 tttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 9098620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 25904584 - 25904474
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagga-tttatagaacttgagttatg 125  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| || ||| ||||||||||||||||    
T  25904584 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttttagaacttgagttatg 25904485  T
Q  126 gtcaaattact 136  Q
     ||||||||||    
T  25904484 atcaaattact 25904474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 33864881 - 33864763
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||  | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  33864881 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 33864782  T
Q  138 cacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |||||||||||||||||||    
T  33864781 cacgtaggtcacagtgaat 33864763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 136
Target Start/End: Original strand, 35016015 - 35016113
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||| |||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  35016015 ggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttgctttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 35016113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Original strand, 27654597 - 27654706
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||     
T  27654597 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 27654696  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    | ||||||||    
T  27654697 ttaaattact 27654706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 390 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714418
Alignment:
Q  390 tgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  25714478 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 25714418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 337 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 19668488 - 19668386
Alignment:
Q  337 gttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgttgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagt 433  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  || ||||||||||  |||||||| |||  |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  19668488 gttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgcatactatctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagt 19668389  T
Q  434 tga 436  Q
    |||    
T  19668388 tga 19668386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 136
Target Start/End: Original strand, 22226580 - 22226679
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagga-tttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22226580 ggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttttagaacttgagttatgatcaaattact 22226679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 23019567 - 23019425
Alignment:
Q  290 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgccta 389  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| |  |||||| |||||||| || |||| |||||| |||||||||| || |||||||||||| ||    
T  23019567 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgctta 23019469  T
Q  390 tgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaag 432  Q
    ||||| || | |||  ||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  23019468 tgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggtctaag 23019425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 136
Target Start/End: Original strand, 21776107 - 21776205
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | ||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  21776107 ggtgtaaacatgaaagttgtagataactttgttagctttctaatggctttggtttgacgccaaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 21776205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 349 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 4186470 - 4186381
Alignment:
Q  349 cattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 437  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||| || | ||| |||||||| | |||||||||| ||| ||||||||    
T  4186470 cattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgtctatgttgctgcctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgat 4186381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 10488080 - 10487971
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||     
T  10488080 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 10487981  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    ||||||||||    
T  10487980 tcaaattact 10487971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Original strand, 16377248 - 16377357
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||     
T  16377248 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 16377347  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    ||||||||||    
T  16377348 tcaaattact 16377357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Original strand, 16384572 - 16384681
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||     
T  16384572 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 16384671  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    ||||||||||    
T  16384672 tcaaattact 16384681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Original strand, 16826368 - 16826477
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||||||||  |    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||     
T  16826368 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagacaattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 16826467  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    | ||||||||    
T  16826468 ttaaattact 16826477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 136
Target Start/End: Original strand, 22593590 - 22593691
Alignment:
Q  35 ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatta 134  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||||   ||||||||||||||||||   || |||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  22593590 ttaggtgttaacataaaaattgtaggttaagatgttagctttctaatggatttagtttgacttccaaatgatttttataacttgagttatgatcaaatta 22593689  T
Q  135 ct 136  Q
    ||    
T  22593690 ct 22593691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 82
Target Start/End: Original strand, 10905416 - 10905460
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 82  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10905416 ggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttccaatg 10905460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 450
Target Start/End: Original strand, 22080756 - 22080845
Alignment:
Q  349 cattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttga 448  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||            |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||    
T  22080756 cattcgatattgttatatcatgatgttttgcatactgcctatgtt------------taactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatga 22080843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 156
Target Start/End: Original strand, 2290818 - 2290857
Alignment:
Q  117 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2290818 tgagttaaggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 2290857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 19609689 - 19609582
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || |||  |||| ||||||||||| ||||     
T  19609689 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaataatttttagaacttgagatatga 19609590  T
Q  127 tcaaatta 134  Q
    ||||||||    
T  19609589 tcaaatta 19609582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 22782751 - 22782712
Alignment:
Q  117 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22782751 tgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 22782712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 383 - 457
Target Start/End: Original strand, 25603437 - 25603512
Alignment:
Q  383 ctgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttg-attaagatgttgatgatgatgt 457  Q
    ||||||||| || ||| |||| |||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  25603437 ctgcctatgctgctgttgttaattaactaagtcgcatgagtcagtccatgttgaattaagatgttgatgttgatgt 25603512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 383 - 457
Target Start/End: Original strand, 25611775 - 25611850
Alignment:
Q  383 ctgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttg-attaagatgttgatgatgatgt 457  Q
    ||||||||| || ||| |||| |||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  25611775 ctgcctatgctgctgttgttaattaactaagtcgcatgagtcagtccatgttgaattaagatgttgatgttgatgt 25611850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 156
Target Start/End: Original strand, 26924085 - 26924124
Alignment:
Q  117 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26924085 tgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 26924124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 8055633 - 8055515
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| || || | |    ||||||| |||||||||||||    
T  8055633 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgaattttggtttatgagttaaggtcaaattactg 8055534  T
Q  138 cacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  8055533 cacataggtcacagtgaat 8055515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 35056781 - 35056707
Alignment:
Q  165 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttg-tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 238  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| || ||| |||| ||||||||||||| | |||||||    
T  35056781 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgattatgatgttgttcatgattgatgaattattatatg 35056707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 1555596 - 1555527
Alignment:
Q  67 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  1555596 tgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 1555527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 349 - 394
Target Start/End: Original strand, 4668229 - 4668274
Alignment:
Q  349 cattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttg 394  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  4668229 cattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttg 4668274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 349 - 394
Target Start/End: Original strand, 4675076 - 4675121
Alignment:
Q  349 cattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttg 394  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  4675076 cattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttg 4675121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 400 - 457
Target Start/End: Original strand, 16929659 - 16929716
Alignment:
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 457  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  16929659 gttaattaaccaagttgcatgagtcagtttaagatgattaagacgttgttgatgatgt 16929716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 400 - 457
Target Start/End: Original strand, 16965379 - 16965436
Alignment:
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 457  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  16965379 gttaattaaccaagttgcatgagtcagtttaagatgattaagacgttgttgatgatgt 16965436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 383 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 21766759 - 21766698
Alignment:
Q  383 ctgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||    
T  21766759 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatg 21766698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 136
Target Start/End: Original strand, 33315116 - 33315185
Alignment:
Q  67 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  33315116 tgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttaaaacttgagttatgatcaaattact 33315185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 437
Target Start/End: Original strand, 31155415 - 31155504
Alignment:
Q  349 cattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtc--gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 437  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||  || |||| |||   |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  31155415 cattcgatattgttatatcacgatgacttgcatactgttta-gttgctgttttgttatttaactaagttgcatgagtcaatccaagttgat 31155504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 32259136 - 32259078
Alignment:
Q  165 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttg-tgaatacgatattgtccatgatt 222  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||    
T  32259136 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgatt 32259078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 108
Target Start/End: Original strand, 18455449 - 18455530
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 108  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||| | || | |||||||||||| |||| |||||    
T  18455449 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtaggtaattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgattt 18455530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 25175221 - 25175112
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||  ||||| ||||     
T  25175221 aattggactttggtgtaaacatcaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagatattgagatatga 25175122  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    | ||||||||    
T  25175121 ttaaattact 25175112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Original strand, 22981454 - 22981486
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggt 33  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22981454 atgaaaactggtattgattggtacagaattggt 22981486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 23806954 - 23806922
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggt 33  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23806954 atgaaaactggtattgattggtacagaattggt 23806922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 354; Significance: 0; HSPs: 171)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 13544471 - 13544016
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544471 atgaaaactagtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 13544372  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544371 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaat-actgcacgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 13544273  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13544272 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgttatattgtgatataattata 13544173  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||  |||| ||| || || ||||| |||     
T  13544172 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattg-ctgtgttgctgtt 13544074  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 457  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13544073 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgataatgatgt 13544016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 12568007 - 12567551
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12568007 atgaaaactagtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 12567908  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567907 aatgatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcatgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 12567808  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12567807 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgttatattgtgatataattata 12567708  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||  |||| ||| || || ||||| |||     
T  12567707 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattg-ctgtgttgctgtt 12567609  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 457  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12567608 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgtttatgatgt 12567551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 17463625 - 17463182
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463625 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 17463526  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17463525 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgt 17463426  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  17463425 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgta 17463326  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||     
T  17463325 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 17463227  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17463226 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17463182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 34159773 - 34159330
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159773 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 34159674  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34159673 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgt 34159574  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  34159573 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgta 34159474  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||     
T  34159473 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 34159375  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34159374 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 34159330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Original strand, 16453995 - 16454439
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16453995 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 16454094  T
Q  101 aa-ggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttg 199  Q
    || ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16454095 aatggatttatagaactatagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttg 16454194  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| |    
T  16454195 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgt 16454294  T
Q  300 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgt 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||    
T  16454295 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgt 16454393  T
Q  399 cgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16454394 tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16454439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Original strand, 45606621 - 45607065
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45606621 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 45606720  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  45606721 aaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaatgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 45606820  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  45606821 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgt 45606920  T
Q  300 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgt 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||    
T  45606921 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgt 45607019  T
Q  399 cgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
     |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45607020 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 45607065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 55476935 - 55476495
Alignment:
Q  4 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 103  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476935 aaaactggtattgactggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 55476836  T
Q  104 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaa 203  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  55476835 gatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaa 55476736  T
Q  204 tacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattatatat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  55476735 tacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatat 55476636  T
Q  304 gcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgtt 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| ||| |||    
T  55476635 gcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgtt 55476537  T
Q  403 atttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  55476536 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 55476495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Original strand, 7781061 - 7781505
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781061 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtataaacgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 7781160  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7781161 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacataggtcacagtgaataattgattatgatcgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 7781260  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  7781261 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgt 7781360  T
Q  300 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgt 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||    
T  7781361 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgt 7781459  T
Q  399 cgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
     |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7781460 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 7781505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Original strand, 6468849 - 6469292
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6468849 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttggaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 6468948  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6468949 aagaatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgt 6469048  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  6469049 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgta 6469148  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||     
T  6469149 tatgcattacttcaattatatgtgactaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 6469247  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6469248 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 6469292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Original strand, 13153970 - 13154414
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13153970 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcataggtgtaaacacgaaagttttaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaa 13154069  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13154070 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgt 13154169  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  13154170 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgta 13154269  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||     
T  13154270 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 13154368  T
Q  400 gttatttaact-aagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13154369 gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 13154414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Original strand, 10247438 - 10247881
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10247438 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 10247537  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    || |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  10247538 aatgatttatagaacttgatttatactcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatgttgt 10247637  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  10247638 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgta 10247737  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | || || |||     
T  10247738 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgctgctgtt 10247836  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  10247837 gttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatg 10247881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 27165700 - 27165254
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27165700 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatggatcttagctttctaatgccgttagtttgacttcaa 27165601  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27165600 aaggatttatagaacttgagttatgatcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 27165501  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattg-ttatattgtgatataatta 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  27165500 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattg 27165401  T
Q  299 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttg- 397  Q
    |||| ||| ||||| |||||||| |||||| ||||||  ||| ||| || |||| ||||||  ||||||||| || ||||||||||| |||| ||| ||     
T  27165400 tatacgcaatacttaaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattggtatatcatgttgttttgcatactgtctatattgctgt 27165301  T
Q  398 tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27165300 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 27165254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 4 - 444
Target Start/End: Original strand, 53301221 - 53301665
Alignment:
Q  4 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 103  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53301221 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 53301320  T
Q  104 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtga 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53301321 gatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtga 53301420  T
Q  203 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattg-ttatattgtgatataattatat 301  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| |||    
T  53301421 atacgatattgtacatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccattttatgttgtttatattgtgatataattgtat 53301520  T
Q  302 atgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttg-tc 399  Q
    | | | |||||||||||||| |||||| ||||||  |||  ||| || |||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |     
T  53301521 acgtaatacttgaattatatatgaatatttgagatattgaatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgtctatgttgctgttt 53301620  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  53301621 gttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatg 53301665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Original strand, 13151505 - 13151949
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13151505 atgaaaactggtattgattggaacagaattggtcataggtgtaaacacgaaagttttaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaa 13151604  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  13151605 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaaggtatatgttgt 13151704  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  13151705 gaatacgatattgtccatgcctgatgaagtgtgatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgta 13151804  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||     
T  13151805 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 13151903  T
Q  400 gttatttaact-aagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13151904 gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 13151949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Original strand, 28848336 - 28848769
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28848336 atgaaaactggtattgattggtactgaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 28848435  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||    
T  28848436 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaatta----------gtatatgttgt 28848525  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||| ||||| ||    
T  28848526 gaatacgatattttccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatgtaattgta 28848625  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||     
T  28848626 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 28848724  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28848725 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 28848769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 8499968 - 8499522
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8499968 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagatatggaagttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 8499869  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8499868 aaggatttatagaacttgagttatggtgaaattacggaacataggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 8499769  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattg-ttatattgtgatataatta 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  8499768 tgaatacgatattgtccatgattaatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgtgatataattg 8499669  T
Q  299 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgtt 396  Q
    ||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||| ||| |||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| |||||  || ||| | |    
T  8499668 tatatgcattaattagattatctgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact-actgtgtcgct 8499570  T
Q  397 gtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8499569 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 8499522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 15412879 - 15412433
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15412879 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaa 15412780  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15412779 aaggatttatagaacttgatttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgtataattgattatgatcgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 15412680  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattg-ttatattgtgatataatta 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||     
T  15412679 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgaagttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgggatataattg 15412580  T
Q  299 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgtt 396  Q
    ||||||||| | ||  ||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| |||||  || ||| | |    
T  15412579 tatatgcatcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-actgtgtcgct 15412481  T
Q  397 gtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15412480 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 15412433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 54521270 - 54520985
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54521270 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtgggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 54521171  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatat-gttg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||    
T  54521170 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttg 54521071  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatat 285  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54521070 tgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 54520985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 15977980 - 15977696
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977980 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 15977881  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15977880 aagaatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgt 15977781  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatat 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||    
T  15977780 gaatacgatattgtccatgattgataaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttggttattatttgatgttgttatat 15977696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 46822709 - 46822445
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46822709 atgaaaagtggtattgattggtaaacaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 46822610  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  46822609 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 46822510  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgat 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46822509 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatgtatgatgttttaagatgttgat 46822445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 10557356 - 10557091
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  10557356 atgaaaactggtattgattggtaaataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttagttttacttcaa 10557257  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  10557256 aaggatttatagaacttgagttatggtcagattactgcacataggtcactgtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttg 10557157  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 265  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10557156 tgaattcgatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttgagatgttgatt 10557091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 29544556 - 29544839
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29544556 atgaaaactgttattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgatttcaa 29544655  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatat-gttg 199  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||    
T  29544656 aagaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatctatatatttg 29544755  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttat 283  Q
    | || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29544756 ttaaaatgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttat 29544839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 238
Target Start/End: Original strand, 12119371 - 12119606
Alignment:
Q  4 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 103  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12119371 aaaactggtattgatcagtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaag 12119470  T
Q  104 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtga 202  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12119471 gatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtga 12119570  T
Q  203 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 238  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  12119571 atacgatattgttcatgattgatgaagtattatatg 12119606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 164 - 444
Target Start/End: Original strand, 16282689 - 16282969
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282689 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 16282788  T
Q  264 ttaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattatta 363  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  16282789 ttattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattcaatattatta 16282888  T
Q  364 tatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    | ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16282889 tgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16282969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13436747 - 13436520
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436747 atgaaaacttgtattgattggtacataattggtcttaggtataaatacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 13436648  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  13436647 aaggatttatagaacttgagttatggtccaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatatatatgtttg 13436548  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatga 227  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13436547 tgaatacgatattgttcatgattgatga 13436520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 164 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 8899378 - 8899098
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899378 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 8899279  T
Q  264 ttaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattatta 363  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  8899278 ttatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 8899179  T
Q  364 tatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    | ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  8899178 tgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatg 8899098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 164 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 41124171 - 41123894
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41124171 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattggtgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 41124072  T
Q  264 ttaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattatta 363  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  41124071 ttattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 41123972  T
Q  364 tatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    | ||||| ||  |||| ||||||    |  |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41123971 tgtcatgctgtttttgtatactg----ttgtgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 41123894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 164 - 444
Target Start/End: Original strand, 9707484 - 9707765
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707484 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 9707583  T
Q  263 attaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattatt 362  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||    
T  9707584 attattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattatt 9707683  T
Q  363 atatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    || ||||| ||  |||| |||||| || ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9707684 atgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 9707765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 164 - 440
Target Start/End: Original strand, 38961769 - 38962045
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38961769 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgttttaagatgttgg 38961868  T
Q  264 ttaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattatta 363  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  38961869 ttattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 38961968  T
Q  364 tatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaa 440  Q
    | ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  38961969 tgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 38962045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 41124387 - 41124190
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41124387 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgatttgacttcaa 41124288  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  41124287 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaactagtatatgaatgtatatgtt 41124190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 78 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 12305516 - 12305318
Alignment:
Q  78 taatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaat 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  12305516 taatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaat 12305417  T
Q  178 tagtatatgtatgtatat-gttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgat 275  Q
    || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12305416 taatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgat 12305318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 38961552 - 38961750
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg-ccgttggtttgacttca 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  38961552 atgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagccttctaatggccgttggtttgacttca 38961651  T
Q  100 aaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38961652 aaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 38961750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 16282472 - 16282669
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16282472 atgaaaactagtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgccattggtttgacttcaa 16282571  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16282572 aaggatttatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 16282669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24514124 - 24513910
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  24514124 atgaaatctggtattgatagctccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 24514025  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24514024 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 24513925  T
Q  200 tgaatacgatattgt 214  Q
    ||||||| |||||||    
T  24513924 tgaatactatattgt 24513910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 20629906 - 20630078
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20629906 atgaaaacttgtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 20630005  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgat 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20630006 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgat 20630078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 17444478 - 17444675
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17444478 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 17444577  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 198  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17444578 aaggatttattgaacttgagttatagtcaaatttttgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 17444675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 25237291 - 25237094
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||  |||| |||||||    
T  25237291 atgaaaattggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgttggtatgaatgttaggtttctaatgccgtgtgtttaacttcaa 25237192  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25237191 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 25237094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 25229704 - 25229507
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||  |||| |||||||    
T  25229704 atgaaaattggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgttggtatgaatgttaggtttctaatgccgtgtgtttaacttcaa 25229605  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25229604 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactacacataagtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 25229507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 10379772 - 10379613
Alignment:
Q  4 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 103  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||     
T  10379772 aaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaac 10379673  T
Q  104 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 163  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10379672 aatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 10379613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 55319018 - 55319173
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  55319018 atgaaaattggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaa 55319117  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55319118 aacgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaagtcacagtgaat 55319173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 15465602 - 15465448
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  15465602 atgaaaattggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccattggtctgacgtcaa 15465503  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 155  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15465502 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 15465448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 155
Target Start/End: Original strand, 26054981 - 26055133
Alignment:
Q  3 gaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaa 102  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  26054981 gaaaattggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgcctttggtctgacgtcaaaa 26055080  T
Q  103 ggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 155  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26055081 cgatttatagaacttgagttatggtaaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 26055133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 27165890 - 27165738
Alignment:
Q  4 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 103  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||     
T  27165890 aaaactagtattgatcggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaac 27165791  T
Q  104 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27165790 gatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 27165738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 10557541 - 10557394
Alignment:
Q  9 tggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 108  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||    
T  10557541 tggtattgattggtacagaattggtcttagttgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtcggacgtcaaaacgattt 10557442  T
Q  109 atagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10557441 atagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 10557394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 41124580 - 41124425
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  41124580 atgaaaactggtattgattggtaaagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 41124481  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41124480 aacgatttatagaacttgagttatgatcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 41124425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 46822902 - 46822747
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  46822902 atgaaaactggtattgattgctacataattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 46822803  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46822802 aacgatttataaaacttgagttatcgtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 46822747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 5223831 - 5223677
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  5223831 atgaaaactggtattgattggtacagaattcgtcttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaatgccattggtctgacgtcaa 5223732  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 155  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5223731 aacgatttatagaacttgagttatgatcaaattactccacgtaggtcacagtgaa 5223677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 156
Target Start/End: Original strand, 53301035 - 53301180
Alignment:
Q  11 gtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttat 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||    
T  53301035 gtattgatcggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttat 53301134  T
Q  111 agaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53301135 agaacttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgaat 53301180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 55318825 - 55318980
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  55318825 atgaaatctggtattgataggtccagaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatggtagctttctaatgccgttggtatgacatcaa 55318924  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  55318925 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcgcagtgaat 55318980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 269 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 17672805 - 17672630
Alignment:
Q  269 atttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatca 368  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||    
T  17672805 atttgatgatgttatattgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtca 17672706  T
Q  369 tgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    || ||  |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17672705 tgctgtttttgtatactg-ctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17672630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 156
Target Start/End: Original strand, 38961367 - 38961514
Alignment:
Q  9 tggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 108  Q
    |||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||    
T  38961367 tggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgattt 38961466  T
Q  109 atagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38961467 atagaacttgagttatggtcaaattgctgcacgtaggtcacagtgaat 38961514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 8500158 - 8500009
Alignment:
Q  4 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 103  Q
    ||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||     
T  8500158 aaaactggtattgatcgatatagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatagatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaac 8500059  T
Q  104 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtg 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8500058 gatttatagaacttgagttatggtcaagttactgcacgtaggtcacagtg 8500009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 256 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 50243014 - 50242830
Alignment:
Q  256 gatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcga 355  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  50243014 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 50242915  T
Q  356 tattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaa 440  Q
    ||||||||| ||||| ||  |||| |||||  || ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  50242914 tattattatgtcatgttgtttttgtatact-actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 50242830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 245 - 444
Target Start/End: Original strand, 17446614 - 17446812
Alignment:
Q  245 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 344  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17446614 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttga 17446713  T
Q  345 tttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagat 443  Q
     || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17446714 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagttgattaagat 17446811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 256 - 432
Target Start/End: Original strand, 43550448 - 43550625
Alignment:
Q  256 gatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcga 355  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||    
T  43550448 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatacattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 43550547  T
Q  356 tattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaag 432  Q
    ||||||||| ||||| ||  |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  43550548 tattattatgtcatgttgtttttgcatactgcatatgttgctgtcattatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 43550625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 13937494 - 13937649
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  13937494 atgaaatctggtattgataggacaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 13937593  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  13937594 aacgatttatagaacttgtgttatggtcaaattactgcacgtaggccacggtgaat 13937649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 20629713 - 20629868
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||    
T  20629713 atgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttataggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacattaa 20629812  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20629813 agcgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 20629868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 27 - 156
Target Start/End: Original strand, 14567432 - 14567561
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14567432 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctaacatcaaaaggatttatagaacttgagttatag 14567531  T
Q  127 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14567532 tcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 14567561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 35 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 36528569 - 36528447
Alignment:
Q  35 ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatta 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36528569 ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacgtctaaatgaattatagaacttgagttatggtcaaatta 36528470  T
Q  135 ctgcacgtaggtcacagtgaata 157  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  36528469 ctgcacgtaggtcatagtgaata 36528447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 283 - 444
Target Start/End: Original strand, 29172580 - 29172741
Alignment:
Q  283 tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcat 381  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||    
T  29172580 tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtat 29172679  T
Q  382 actgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||| || ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29172680 actg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 29172741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 16282279 - 16282434
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||  ||| || |||  ||||    
T  16282279 atgaaatctggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatagatgttatctttttaatgttgttagtctgatgtcaa 16282378  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16282379 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 16282434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 17444285 - 17444440
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| | || ||||    
T  17444285 atgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacaggaaagttgtaagtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctaacgtcaa 17444384  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17444385 aacaatttatacaacttgagctatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 17444440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 280 - 450
Target Start/End: Original strand, 24340672 - 24340843
Alignment:
Q  280 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgc 379  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | || | ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  24340672 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttgtgc 24340771  T
Q  380 atactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||||||| ||||||| || | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  24340772 atactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 24340843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 164 - 285
Target Start/End: Original strand, 11913928 - 11914051
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||    
T  11913928 tatgattgatgaattagtatatgtatgtacatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgtt 11914027  T
Q  262 gattaccatttgatattgttatat 285  Q
    ||||| |||||||| |||||||||    
T  11914028 gattatcatttgatgttgttatat 11914051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 280 - 432
Target Start/End: Original strand, 52523676 - 52523831
Alignment:
Q  280 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggttt 377  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  || |||    
T  52523676 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgaactgtttt 52523775  T
Q  378 gcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaag 432  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  52523776 gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52523831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 46 - 156
Target Start/End: Original strand, 16358234 - 16358344
Alignment:
Q  46 cacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagg 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  16358234 cacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaacggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcgcatagg 16358333  T
Q  146 tcacagtgaat 156  Q
    ||||| |||||    
T  16358334 tcacattgaat 16358344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 280 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 23274859 - 23274705
Alignment:
Q  280 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgc 379  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | || | ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23274859 ttataatgtgatgtaattgtatattctttacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttttgc 23274760  T
Q  380 atactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagt 433  Q
    ||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23274759 atactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagt 23274705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Original strand, 53070636 - 53070799
Alignment:
Q  269 atttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatca 368  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||     
T  53070636 atttgatgttgttagattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtct 53070735  T
Q  369 tgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaag 432  Q
    || ||  |||| ||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  53070736 tgttgtttttgtatactg-ttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 280 - 450
Target Start/End: Original strand, 37642214 - 37642385
Alignment:
Q  280 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgc 379  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| | |||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  37642214 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttttgc 37642313  T
Q  380 atactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||||||||||||||| || || |||  |||||||| |||||||||| ||| |||| | | ||||||||||||    
T  37642314 atactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatg 37642385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 17393345 - 17393201
Alignment:
Q  12 tattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttata 111  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  17393345 tattgatcggtacagaattggtcttagatgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttacctttccaatggcgttggtttgactccaaaatgattttta 17393246  T
Q  112 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |||| | |||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  17393245 gaacattagttatagtcaaattactacacataggtcatagtgaat 17393201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 164 - 243
Target Start/End: Original strand, 17444694 - 17444773
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatat 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17444694 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatat 17444773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 49 - 157
Target Start/End: Original strand, 3264323 - 3264431
Alignment:
Q  49 gaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 148  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3264323 gaaagttgtaggtatggatgttagatttctaaggccgttgatttgacgtctaaatgaattatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtca 3264422  T
Q  149 cagtgaata 157  Q
    |||||||||    
T  3264423 cagtgaata 3264431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 269 - 444
Target Start/End: Original strand, 12119707 - 12119883
Alignment:
Q  269 atttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttacattcgatattattatatc 367  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||| ||    
T  12119707 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 12119806  T
Q  368 atgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||| ||  |||| |||||| || ||| | ||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12119807 atgctgtttttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12119883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 280 - 450
Target Start/End: Original strand, 22147474 - 22147645
Alignment:
Q  280 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgc 379  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| | |||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  22147474 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttttgc 22147573  T
Q  380 atactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||| ||||| |||| || || |||  |||||||| ||||||| || ||| |||| | | ||||||||||||    
T  22147574 ataccgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgactcggtccaagtcgttgaagatgttgatg 22147645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 337 - 450
Target Start/End: Original strand, 13210333 - 13210447
Alignment:
Q  337 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttg-ttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttg 435  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  13210333 gttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 13210432  T
Q  436 attaagatgttgatg 450  Q
     | |||||| |||||    
T  13210433 ttgaagatgatgatg 13210447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 14973020 - 14972855
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatact 384  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||   || |||  ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| || ||| | |||||    
T  14973020 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatatgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14972921  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  14972920 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 14972855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 290 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 15471085 - 15470939
Alignment:
Q  290 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgccta 389  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| |  |||||| |||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15471085 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgccta 15470987  T
Q  390 tgttgttgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttga 436  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  15470986 tgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 15470939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Original strand, 11424718 - 11424879
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactg 385  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||||||||||   ||||||||| |  | |||||| |||| ||||| || |||| ||||||    
T  11424718 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgcataattgaga---tgttgatttgctattgatattgttatgtcatgctgttttgtatactg 11424814  T
Q  386 cctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  11424815 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatg 11424879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 349 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 14234590 - 14234488
Alignment:
Q  349 cattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttg 447  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  14234590 cattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaagttgattaagatgatg 14234491  T
Q  448 atg 450  Q
    |||    
T  14234490 atg 14234488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 280 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 16097499 - 16097342
Alignment:
Q  280 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgc 379  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||| || ||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  16097499 ttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatgatgatgatttgc 16097401  T
Q  380 atactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 437  Q
    ||| |||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  16097400 atattgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16097342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 280 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 16103950 - 16103794
Alignment:
Q  280 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgc 379  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||| |||||  |||||||| | ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  16103950 ttataatgttatataattttatatacattaaatgaattatgtttga-tatttgagatgttgttgattg-cattcgatattgttatatcatgatgatttgc 16103853  T
Q  380 atactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 437  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  16103852 atactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16103794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 286 - 444
Target Start/End: Original strand, 24153164 - 24153322
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactg 385  Q
    |||||||| ||  ||| ||||||| ||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||     
T  24153164 tgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatacta 24153263  T
Q  386 cctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24153264 cctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24153322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 326 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 32307802 - 32307681
Alignment:
Q  326 ataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtc 424  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||    
T  32307802 ataattgagatgttgttgattg-cattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 32307704  T
Q  425 agtctaagttgattaagatgttg 447  Q
     |||||||||||| | |||||||    
T  32307703 ggtctaagttgatgatgatgttg 32307681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 164 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 25237075 - 25237009
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25237075 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 25237009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 280 - 390
Target Start/End: Original strand, 2051148 - 2051260
Alignment:
Q  280 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggttt 377  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  || |||    
T  2051148 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt 2051247  T
Q  378 gcatactgcctat 390  Q
    |||||||||||||    
T  2051248 gcatactgcctat 2051260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 337 - 437
Target Start/End: Original strand, 12174265 - 12174366
Alignment:
Q  337 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttg 435  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  12174265 gttgttgttttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 12174364  T
Q  436 at 437  Q
    ||    
T  12174365 at 12174366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 15007941 - 15007868
Alignment:
Q  7 actggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaa 80  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15007941 actggtattgattggtacaaaattggttttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaa 15007868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 286 - 437
Target Start/End: Original strand, 14576788 - 14576939
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactg 385  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || | |  ||||||    
T  14576788 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtttatactg 14576887  T
Q  386 cctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 437  Q
     |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  14576888 tctatgttgctgttgttatttaactaagttgaatgagtcggtctaagttgat 14576939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 280 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 26687059 - 26686888
Alignment:
Q  280 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 378  Q
    |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||   ||||| || ||| | |||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  26687059 ttatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatggaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 26686960  T
Q  379 catactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||| |||||    
T  26686959 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagaagatgatgatg 26686888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 286 - 444
Target Start/End: Original strand, 40213676 - 40213834
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtt-tgcatact 384  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||| |||||   || |||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| || || |||||    
T  40213676 tgtgatataatgttatacgcattacttggattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatact 40213775  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    | || ||||| ||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  40213776 g-ctgtgttgatgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatg 40213834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 13442440 - 13442275
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatact 384  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | |||||    
T  13442440 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 13442341  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  13442340 gcctatgttgccgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 13442275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 17488022 - 17487857
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatact 384  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | |||||    
T  17488022 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17487923  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    | |||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  17487922 gtctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 17487857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 17499504 - 17499339
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatact 384  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | |||||    
T  17499504 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17499405  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    | |||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  17499404 gtctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 17499339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 18438700 - 18438535
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatact 384  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||  |||   || ||||   ||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||| | |||||    
T  18438700 tgtgatataatgttatatgcattacttgagatatgaatgtataaaaaagatgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 18438601  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  18438600 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 18438535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 317 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 15977646 - 15977519
Alignment:
Q  317 tatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagtt 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | |||||   | ||||| ||| |||||||||||||| |    
T  15977646 tatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactat-tgtgttgctgttgttatttaactaagct 15977548  T
Q  416 gcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15977547 gcatgagtcggtctaagttgattaagatg 15977519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 16358382 - 16358458
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttc 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  16358382 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttttagatatagatgttagctttc 16358458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 286 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 42386576 - 42386428
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatact 384  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||| |||||| |||||||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||    
T  42386576 tgtgatataatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatact 42386477  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagt 433  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  42386476 gcctatgttgctgttgttatttaactaaactgcatgagtcggtctaagt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 280 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 43841104 - 43840940
Alignment:
Q  280 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 378  Q
    |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  43841104 ttatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 43841005  T
Q  379 catactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagat 443  Q
     |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||||    
T  43841004 tatactgtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgatgaagat 43840940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 301 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 12399360 - 12399210
Alignment:
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||     
T  12399360 tatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt 12399261  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  12399260 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 12399210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 306 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 36166739 - 36166602
Alignment:
Q  306 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatt 405  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||| | ||| | ||| ||||||    
T  36166739 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatt 36166641  T
Q  406 taactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36166640 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 36166602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 36528410 - 36528340
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtta 71  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36528410 atgaaaactggtattgataagtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtta 36528340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 383 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 46822333 - 46822259
Alignment:
Q  383 ctgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 457  Q
    ||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46822333 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgataatgatgt 46822259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 349 - 437
Target Start/End: Original strand, 49668094 - 49668183
Alignment:
Q  349 cattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 437  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  49668094 cattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 49668183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 92 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 15008052 - 15007988
Alignment:
Q  92 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15008052 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 15007988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 269 - 332
Target Start/End: Original strand, 17248224 - 17248287
Alignment:
Q  269 atttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattg 332  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17248224 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaataattg 17248287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 383 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 12511125 - 12511051
Alignment:
Q  383 ctgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 457  Q
    ||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12511125 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttgattaagatgttgataatgatgt 12511051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 301 - 450
Target Start/End: Original strand, 20698405 - 20698555
Alignment:
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||  | ||| |||| ||| || || | ||||||||||  ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||     
T  20698405 tatgcattacttgaagaatatttgaatatataagatgttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 20698504  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  20698505 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 20698555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 350 - 447
Target Start/End: Original strand, 1644693 - 1644790
Alignment:
Q  350 attcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttg 447  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| |||  |||||||||||| | |||||||    
T  1644693 attcgatattgttatataatgatgatttgcatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagcaacataagttggtctaagttgatgacgatgttg 1644790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 349 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 9513023 - 9512934
Alignment:
Q  349 cattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 437  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  9513023 cattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 9512934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 349 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 9520998 - 9520909
Alignment:
Q  349 cattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 437  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  9520998 cattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 9520909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Original strand, 23083316 - 23083481
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatact 384  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||| ||| || |  |||||| || ||| |||||||| || || | ||||||||||| ||||  || ||| | |||||    
T  23083316 tgtgatataatgttatgtgcattactagaagtaaaattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatact 23083415  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  23083416 gcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 23083481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 25058407 - 25058286
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||||||||||||||     
T  25058407 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatga 25058308  T
Q  127 tcaaattactgcacgtaggtca 148  Q
    |||||||||| ||| |||||||    
T  25058307 tcaaattactacacataggtca 25058286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Original strand, 25476340 - 25476505
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatact 384  Q
    |||||||||||  |||  ||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | |||||    
T  25476340 tgtgatataatgttatgcgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 25476439  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
     ||| ||||| ||| ||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  25476440 acctgtgttgctgttgttttttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 25476505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 305 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 14572735 - 14572603
Alignment:
Q  305 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtcgttat 404  Q
    ||||| ||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| |  || | ||||||||||| ||||| || |||| |||||| |||||||| ||| |||||    
T  14572735 cattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgtctatgttgctgttgttat 14572636  T
Q  405 ttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 437  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  14572635 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 14572603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 10555812 - 10555766
Alignment:
Q  11 gtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgt 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10555812 gtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgt 10555766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 34159929 - 34159811
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  34159929 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 34159830  T
Q  138 cacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |||||||||||||||||||    
T  34159829 cacgtaggtcacagtgaat 34159811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 400 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 30029891 - 30029834
Alignment:
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 457  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  30029891 gttattaaactaagttgcatgagtcagtctaagttgaatgagatgttgatgatgatgt 30029834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 40 - 136
Target Start/End: Original strand, 16934824 - 16934920
Alignment:
Q  40 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    |||||||| ||||||| ||||||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16934824 tgtaaacatgaaagttttaggtaattttgttagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 16934920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 306 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 21618590 - 21618459
Alignment:
Q  306 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatt 405  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||  | ||| | ||| ||||||    
T  21618590 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatt 21618492  T
Q  406 taactaagttgcatgagtcagtctaagttgatt 438  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  21618491 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 21618459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 17463781 - 17463663
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||  | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  17463781 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 17463682  T
Q  138 cacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |||||||||||||||||||    
T  17463681 cacgtaggtcacagtgaat 17463663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 49231866 - 49231768
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  49231866 ggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 49231768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 136
Target Start/End: Original strand, 51158683 - 51158753
Alignment:
Q  66 atgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  51158683 atgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 51158753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 55477094 - 55476976
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| |||||   |    |||||||||||||||||||||    
T  55477094 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttcggtttatgagttatggtcaaattactg 55476995  T
Q  138 cacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |||||||||||||||||||    
T  55476994 cacgtaggtcacagtgaat 55476976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Original strand, 14528625 - 14528734
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   |||||||||||||||||   ||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||     
T  14528625 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggatttggtttgacttccaaatgatttttagaactttagttatga 14528724  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    | ||||||||    
T  14528725 ttaaattact 14528734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 337 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 55501053 - 55500946
Alignment:
Q  337 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttg 435  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||  | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  55501053 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 55500955  T
Q  436 attaagatg 444  Q
    |||||||||    
T  55500954 attaagatg 55500946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 8899473 - 8899418
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttg 56  Q
    |||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899473 atgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttg 8899418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 390 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 17737294 - 17737240
Alignment:
Q  390 tgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17737294 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17737240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Original strand, 1468614 - 1468723
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||     
T  1468614 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 1468713  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    ||||||||||    
T  1468714 tcaaattact 1468723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Original strand, 8276474 - 8276583
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||     
T  8276474 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtcgaaatgatttttagaacttgagatatga 8276573  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    | ||||||||    
T  8276574 ttaaattact 8276583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 12305570 - 12305525
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaac 46  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12305570 atgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaac 12305525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 30152547 - 30152450
Alignment:
Q  39 gtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  30152547 gtgtaaacatgaaagttttagataattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaatttgagttatgatcaaattact 30152450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Original strand, 37251105 - 37251270
Alignment:
Q  269 atttgatattgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatc 367  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||| | |||    |||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  37251105 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttatgatg--ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 37251202  T
Q  368 atga--tggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaag 432  Q
    ||||  || |||  ||||||||||||||| || | |||  ||||||||| ||||||| || |||||||    
T  37251203 atgaactgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtctaag 37251270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 400 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 10557033 - 10556989
Alignment:
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10557033 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 10556989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 400 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 28194741 - 28194697
Alignment:
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28194741 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 28194697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 43926123 - 43925977
Alignment:
Q  288 tgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgcatactg 385  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||||| ||| ||| |  |||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  || |||   |||||    
T  43926123 tgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgttttatgtactg 43926025  T
Q  386 cctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaag 432  Q
    ||||||||| || | |||  ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  43926024 cctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 43925977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 400 - 444
Target Start/End: Original strand, 45577952 - 45577996
Alignment:
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45577952 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 45577996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 156
Target Start/End: Original strand, 6468772 - 6468811
Alignment:
Q  117 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6468772 tgagttatggtcaaattactgcacgtatgtcacagtgaat 6468811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 15412955 - 15412916
Alignment:
Q  117 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15412955 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 15412916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 21026183 - 21026092
Alignment:
Q  49 gaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcac 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||  ||| || ||| |  ||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21026183 gaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatggctttgttttgaagtcataatgatgttcagatcttgagttatgatcaaaatactgcac 21026092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 134
Target Start/End: Original strand, 54039167 - 54039234
Alignment:
Q  67 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatta 134  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  54039167 tgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgatcaaatta 54039234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 2281102 - 2281000
Alignment:
Q  34 cttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 133  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||| ||| | | ||||||||||||||  |  |||| || ||||||||||||| | |||||    
T  2281102 cttagttgtaaacatgaaagttttaggtatgtatgttacctttgtaaaggctttggtttgacttcattattatttctataacttgagttatgattaaatt 2281003  T
Q  134 act 136  Q
    |||    
T  2281002 act 2281000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 3264468 - 3264538
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtta 71  Q
    ||||||| ||||||||||  ||| | ||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  3264468 atgaaaattggtattgataagtatagaattgatcttaggtgtcttcacgaaagttgtaggtatggatgtta 3264538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 156
Target Start/End: Original strand, 13151349 - 13151467
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| || || | |    ||||||| |||||||||||||    
T  13151349 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttaaaaatgaattttggtttatgagttaaggtcaaattactg 13151448  T
Q  138 cacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  13151449 cacataggtcacagtgaat 13151467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 156
Target Start/End: Original strand, 13153815 - 13153932
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 137  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| || || | |    ||||||| |||||||||||||    
T  13153815 ggtgtacacatgaaagttgtagatattg-tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttaaaaatgaattttggtttatgagttaaggtcaaattactg 13153913  T
Q  138 cacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  13153914 cacataggtcacagtgaat 13153932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 14263738 - 14263640
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    ||||||||||  ||| |||||  ||||||||||||||||||   |   ||||||||||| ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14263738 ggtgtaaacattaaatttgtatctatggatgttagctttctttggggtttggtttgactccattatgatttctagaacttgagttatggtcaaattact 14263640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 25201397 - 25201323
Alignment:
Q  165 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttg-tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 238  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||| ||||| | |||||||    
T  25201397 atgattgatgaattattatatgaatgtatatattgatgaatatgatattgttcatgattaatgaattattatatg 25201323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Original strand, 8269363 - 8269472
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | | |||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||     
T  8269363 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggcttgggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 8269462  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    | ||||||||    
T  8269463 ttaaattact 8269472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 12808614 - 12808505
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| |||| |||| |  || ||| ||||| ||||||||||| ||||     
T  12808614 aattggtctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttagtttcaggtccaaacgatttttagaacttgagatatga 12808515  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    | ||||||||    
T  12808514 ttaaattact 12808505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 136
Target Start/End: Original strand, 17956869 - 17956938
Alignment:
Q  67 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||| || ||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  17956869 tgttagctttccaatggctttggtttgacatctaaatgatatttagaacttgagttatgatcaaattact 17956938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 383 - 444
Target Start/End: Original strand, 23077530 - 23077591
Alignment:
Q  383 ctgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||  | |||| |||||||||||    
T  23077530 ctgcctatgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtctatataagatgattaagatg 23077591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 400 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 44494857 - 44494813
Alignment:
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  44494857 gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatg 44494813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 400 - 447
Target Start/End: Original strand, 3390006 - 3390053
Alignment:
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttg 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  3390006 gttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgttg 3390053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 400 - 447
Target Start/End: Original strand, 3403026 - 3403073
Alignment:
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttg 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  3403026 gttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgttg 3403073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 400 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 14665448 - 14665397
Alignment:
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatga 451  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||| ||||||    
T  14665448 gttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatga 14665397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 400 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 14668604 - 14668553
Alignment:
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatga 451  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||| ||||||    
T  14668604 gttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatga 14668553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 14567599 - 14567653
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagtt 55  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  14567599 atgaaaactggtattggtaggtacagaattggcctttggtgtaaacatgaaagtt 14567653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 222
Target Start/End: Original strand, 15025934 - 15025992
Alignment:
Q  165 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttg-tgaatacgatattgtccatgatt 222  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||| |||||||| |||||||    
T  15025934 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgatgatgaatatgatattgttcatgatt 15025992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 28557468 - 28557370
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||   |||||||||||| |||| | ||| |||||  || ||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  28557468 ggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttcaaatggctttgatttgaagtccaaatgatatttagaacttgagttatgatcaaattact 28557370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 383 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 856204 - 856143
Alignment:
Q  383 ctgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||    
T  856204 ctgcctatgttgctattgttattcaactaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 856143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 383 - 444
Target Start/End: Original strand, 11298580 - 11298641
Alignment:
Q  383 ctgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||    
T  11298580 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatg 11298641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 383 - 444
Target Start/End: Original strand, 14878569 - 14878630
Alignment:
Q  383 ctgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||    
T  14878569 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatg 14878630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 16979585 - 16979504
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 108  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||||| || | |||||||||||| |||| |||||    
T  16979585 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgattt 16979504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17044395 - 17044330
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttg-tgaatacgatattgtccatgattgatgaa 228  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||  ||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  17044395 tatgattgatgaattattatatgaatgtatatattgacgaatatgatgttgttcatgattgatgaa 17044330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 209
Target Start/End: Original strand, 18700200 - 18700245
Alignment:
Q  165 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttg-tgaatacgat 209  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  18700200 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatacgat 18700245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 18890039 - 18889958
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 108  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||    ||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||    
T  18890039 aattggactttggtgtaaacacgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgattt 18889958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 285
Target Start/End: Original strand, 38311788 - 38311817
Alignment:
Q  256 gatgttgattaccatttgatattgttatat 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38311788 gatgttgattaccatttgatattgttatat 38311817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 66 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 8023858 - 8023778
Alignment:
Q  66 atgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggt 146  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||| |||| ||||| ||||  |||||||||| | ||| |||| || ||||||    
T  8023858 atgttagctttctaatggcttgggtttgacttaaaaatgatttctagattttgagttatgatgaaaatactacaagtaggt 8023778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 102
Target Start/End: Original strand, 11833119 - 11833183
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaa 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| || |||  |||||||| | |||||||||||| ||||    
T  11833119 ggtgtaaacatgaaagttgtagatatgggtgctagggttctaatggctttggtttgacttaaaaa 11833183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 400 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 12496304 - 12496260
Alignment:
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||    
T  12496304 gttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatg 12496260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 239 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 15977700 - 15977664
Alignment:
Q  239 tatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgat 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15977700 tatatatgatgttttaagatgttgattattatttgat 15977664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 400 - 444
Target Start/End: Original strand, 26196501 - 26196545
Alignment:
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||    
T  26196501 gttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatg 26196545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 350; Significance: 0; HSPs: 88)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 21841214 - 21840766
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21841214 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 21841115  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21841114 aatgatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcatgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 21841015  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21841014 gaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattata 21840915  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||  |||| |||||| || ||||| |||     
T  21840914 tatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt 21840816  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 449  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21840815 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 21840766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 13989313 - 13988870
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13989313 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 13989214  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13989213 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgt 13989114  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  13989113 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgta 13989014  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||     
T  13989013 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 13988915  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13988914 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 13988870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Original strand, 21923006 - 21923449
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923006 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 21923105  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21923106 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgt 21923205  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  21923206 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgta 21923305  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||     
T  21923306 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 21923404  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21923405 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21923449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 16362366 - 16361908
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16362366 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttgggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggaagttagctttctaatgcggttggtttgacttcaa 16362267  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16362266 aaggatttatagaatttaagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataatttattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 16362167  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattg-ttatattgtgatataatta 298  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  16362166 ttaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataatta 16362067  T
Q  299 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttg 397  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||  ||||||  | ||||| ||    
T  16362066 tatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttatatactg-ttgtgttgctg 16361968  T
Q  398 tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 457  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16361967 tcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 16361908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Original strand, 21474801 - 21475245
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21474801 atgaaaaccggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 21474900  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21474901 aaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactaaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 21475000  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  21475001 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgt 21475100  T
Q  300 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgt 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||    
T  21475101 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgt 21475199  T
Q  399 cgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
     |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  21475200 tgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatg 21475245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Original strand, 23593448 - 23593893
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  23593448 atgaaaactggtattgattggtgcataattagtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaa 23593547  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    ||  |||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23593548 aataatttatagaacttgcgttatagttaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 23593647  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattg-ttatattgtgatataatta 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  23593648 tgaatacgatattgtccatgattaatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataatta 23593747  T
Q  299 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttg 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| ||    
T  23593748 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg 23593846  T
Q  398 tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23593847 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 23593893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Original strand, 15859723 - 15860167
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15859723 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaa 15859822  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  15859823 aagaatttatacaacttgagttatggtcaaataactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatcttgc 15859922  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  15859923 gaatacgatattgtccatggttgatgaagtgttatatgtatatatgatgtcttaagatgttgattaccatctgatgttgttatattgtgatataattgta 15860022  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgt 398  Q
    | ||||||  ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| || ||||  |||||||||| ||||| ||  |||| |||||| || ||| | |||    
T  15860023 tgtgcattgattgaattatttgtgagtaattaagacgttgattgacttgcatttaatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgtcgctgt 15860121  T
Q  399 cgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
     |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  15860122 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatg 15860167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 16274970 - 16275209
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaa-tgccgttggtttgacttca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||    
T  16274970 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaaatgtcattggtttcacttca 16275069  T
Q  100 aaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-tt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  16275070 aaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatacgattgatgaattaatatatgtatgtatatgttt 16275169  T
Q  199 gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 238  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16275170 gtgaattcgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 16275209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 164 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 29776972 - 29776692
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29776972 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 29776873  T
Q  264 ttaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattatta 363  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  29776872 ttattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 29776773  T
Q  364 tatcatgat-ggtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    | ||||| |   |||| ||||||  | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29776772 tgtcatgttatttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 29776692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 164 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 29298420 - 29298141
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 263  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298420 tatgattgatgaattagtatatatatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 29298321  T
Q  264 ttaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattatta 363  Q
    |||  ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  29298320 ttattatttgatgttattatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 29298221  T
Q  364 tatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    | ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29298220 t-tcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 29298141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 29777188 - 29776991
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  29777188 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaatcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgggttgacttcaa 29777089  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29777088 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 29776991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 27161301 - 27161529
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27161301 atgaaaacaggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 27161400  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  27161401 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttta 27161500  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaa 228  Q
    ||||||  |||||||  ||||||||||||    
T  27161501 tgaataaaatattgttaatgattgatgaa 27161529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 29298689 - 29298492
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29298689 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaa 29298590  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29298589 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacataagtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 29298492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 164 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 31612597 - 31612317
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31612597 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgttttaagatattga 31612498  T
Q  264 ttaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattatta 363  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||| ||||||||||    
T  31612497 ttattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattatta 31612398  T
Q  364 tatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    | ||||| ||  |||| |||||   | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31612397 tgtcatgctgtttttgtatact-attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 31612317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 22122729 - 22122970
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22122729 atgaaaactggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgctagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 22122828  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||     
T  22122829 aacgatttatagaacttgggttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttta 22122928  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtat 241  Q
    ||| || ||| ||||  |||||||||||| || |||||||||    
T  22122929 tgagtatgatgttgtttatgattgatgaattggtatatgtat 22122970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 31612813 - 31612616
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  31612813 atgaaaactggtattgattggtaccgaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttcaaatgtcgttggtttgacttcaa 31612714  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31612713 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcaaagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 31612616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 164 - 444
Target Start/End: Original strand, 16275240 - 16275522
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  16275240 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttcaagatattg 16275339  T
Q  263 attaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttacattcgatattat 361  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || || | ||||||||    
T  16275340 attattatttgatgttgttatattgtgatataatggtatatgcattaattgaattttatgtgaataattgagacgttgattgacttgcaattgatattat 16275439  T
Q  362 tatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||| ||||| ||  |||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  16275440 tatgtcatgctgtttttgtatactg-ctatgtcgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatg 16275522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 13227311 - 13227129
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13227311 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttttatgtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaa 13227212  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13227211 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 13227129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 164 - 444
Target Start/End: Original strand, 22122945 - 22123226
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 263  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22122945 tatgattgatgaattggtatatgtatgtttatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatattga 22123044  T
Q  264 ttaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattatta 363  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||    
T  22123045 ttattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacattgttgacttgcatttgatattatta 22123144  T
Q  364 tatcatgat-ggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    | ||||| |   |||| ||||||  | ||||| || | | |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  22123145 tgtcatgctatttttgtatactg-ttgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagattaagatg 22123226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 29535499 - 29535317
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  29535499 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtatgtatggatgttagctttctagtgtcgttggtttgacttcaa 29535400  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 183  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29535399 aagaatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 29535317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 22050551 - 22050748
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| | |  ||||    
T  22050551 atgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcaatggtctaatgtcaa 22050650  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 198  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22050651 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 22050748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 31613005 - 31612851
Alignment:
Q  2 tgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31613005 tgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacactaaagttataggtatggatttaagctttctaatgccgttggtttgacttcaaa 31612906  T
Q  102 aggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612905 acgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 31612851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 29298882 - 29298727
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||    
T  29298882 atgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgttctgacgtcaa 29298783  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298782 aacgatttataaaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 29298727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 156
Target Start/End: Original strand, 15859520 - 15859672
Alignment:
Q  4 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 103  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||     
T  15859520 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtatacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctgacctcaaaac 15859619  T
Q  104 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15859620 tatttatagaacttgagttatgatcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15859672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 31613191 - 31613044
Alignment:
Q  9 tggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 108  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||| |||||    
T  31613191 tggtattgataggttcataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttaggtttctaataccgttggtctgacgtcaaaacgattt 31613092  T
Q  109 atagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31613091 atagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 31613044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 149
Target Start/End: Original strand, 9044722 - 9044867
Alignment:
Q  4 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 103  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||     
T  9044722 aaaactggtattgatcggtacagaattagtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagttttctaatgccgttggtctaacgtcaaaac 9044821  T
Q  104 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcac 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9044822 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcac 9044867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 22122535 - 22122691
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaa-gttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttca 99  Q
    |||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22122535 atgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacactaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggttttacttca 22122634  T
Q  100 aaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  22122635 aaacgatttgtagaacttgagttatggtcaaattactgcacatagatcacagtgaat 22122691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 29777378 - 29777226
Alignment:
Q  4 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 103  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||     
T  29777378 aaaactggtattgatcggtacagaattagtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtctgacgttaaaac 29777279  T
Q  104 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  29777278 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacaatgaat 29777226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 156
Target Start/End: Original strand, 27161118 - 27161263
Alignment:
Q  11 gtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttat 110  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||| |||||||    
T  27161118 gtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacaggaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatactgttggtctgacgtcaaaacgatttat 27161217  T
Q  111 agaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27161218 agaacttgaattatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 27161263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 256 - 432
Target Start/End: Original strand, 45574812 - 45574989
Alignment:
Q  256 gatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcga 355  Q
    |||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |     
T  45574812 gatgttgattatgatttgatgttcttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgttgacttgcatttgg 45574911  T
Q  356 tattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaag 432  Q
    ||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  45574912 tattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 45574989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 156
Target Start/End: Original strand, 16274784 - 16274932
Alignment:
Q  8 ctggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatt 107  Q
    ||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||| ||||||  |||    
T  16274784 ctggtgttgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatatcattggtctgacgtcaaaactatt 16274883  T
Q  108 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16274884 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 16274932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 16401559 - 16401407
Alignment:
Q  4 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 103  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| | || |  ||||    
T  16401559 aaaactggtattgatcggtacagaattggtcttaggtgtagacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctatttccattggtctaacgtggaaag 16401460  T
Q  104 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16401459 gatttatataacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 16401407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 164 - 263
Target Start/End: Original strand, 22050767 - 22050866
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22050767 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 22050866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 280 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 433178 - 433016
Alignment:
Q  280 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttg 378  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||| || |||||  ||||    
T  433178 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgatgtttttg 433079  T
Q  379 catactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
     |||||||||    ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  433078 tatactgcct---gtgttgccgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 433016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 269 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 21347141 - 21346965
Alignment:
Q  269 atttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttacattcgatattattatatc 367  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||| ||    
T  21347141 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 21347042  T
Q  368 atgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||| ||  |||| |||||| || |||  |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21347041 atgttgtttttgtatactg-ctgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21346965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 40129524 - 40129387
Alignment:
Q  9 tggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 108  Q
    |||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| || | |||||| |||||    
T  40129524 tggtattgataggtccagaattgatcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgtcgttggtctggcatcaaaacgattt 40129425  T
Q  109 atagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggt 146  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40129424 atagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggt 40129387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 269 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 21342276 - 21342100
Alignment:
Q  269 atttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttacattcgatattattatatc 367  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||| ||    
T  21342276 atttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 21342177  T
Q  368 atgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||| ||  |||| |||||| || |||  |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21342176 atgttgtttttgtatactg-ctgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21342100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 269 - 450
Target Start/End: Original strand, 13212844 - 13213026
Alignment:
Q  269 atttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttacattcgatattattatatc 367  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||| ||    
T  13212844 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 13212943  T
Q  368 atgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||| ||  |||| ||||||  |  || | ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  13212944 atgttgtttttgtatactg-ttgcgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 13213026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 165 - 252
Target Start/End: Original strand, 27161518 - 27161605
Alignment:
Q  165 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 252  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27161518 atgattgatgaattagtatatatatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 27161605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 277 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 40389326 - 40389158
Alignment:
Q  277 ttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttacattcgatattattatatcatgatg-g 374  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||| ||||||||||| ||||| ||      
T  40389326 ttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 40389227  T
Q  375 tttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||| ||||||  | ||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40389226 tttgtatactg-atgtgtcgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtcagtctaggttgattaagatg 40389158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 269 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 21707346 - 21707171
Alignment:
Q  269 atttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatca 368  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| | |||    
T  21707346 atttgatgatgttatattgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtca 21707247  T
Q  369 tg-atggtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||  |  |||| |||||   | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21707246 tgctttttttgtatact-attgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21707171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 269 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 21711888 - 21711713
Alignment:
Q  269 atttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatca 368  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| | |||    
T  21711888 atttgatgatgttatattgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtca 21711789  T
Q  369 tg-atggtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||  |  |||| |||||   | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21711788 tgctttttttgtatact-attgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21711713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 43543349 - 43543269
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaat 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43543349 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaat 43543269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 269 - 431
Target Start/End: Original strand, 14295493 - 14295652
Alignment:
Q  269 atttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatca 368  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14295493 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatca 14295588  T
Q  369 tgatggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaa 431  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  14295589 tgatggtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 14295652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 280 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 16758822 - 16758664
Alignment:
Q  280 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggttt 377  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||  ||  ||| |||||| |||||||||||  ||||||    
T  16758822 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaat-gttgtgatgttgttgtattgtatttgatattgttatatcatgaactggttt 16758724  T
Q  378 gcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttga 436  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16758723 gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 16758664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 337 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 20918719 - 20918620
Alignment:
Q  337 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttg 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  20918719 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20918620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 337 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 20248394 - 20248293
Alignment:
Q  337 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttg 435  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20248394 gttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 20248295  T
Q  436 at 437  Q
    ||    
T  20248294 at 20248293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 280 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 33681178 - 33681022
Alignment:
Q  280 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgc 379  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| ||||  || || ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  33681178 ttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgacgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc 33681080  T
Q  380 atactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttga 436  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33681079 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 33681022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 330 - 437
Target Start/End: Original strand, 22921868 - 22921976
Alignment:
Q  330 ttgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtc 428  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  22921868 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 22921967  T
Q  429 taagttgat 437  Q
    |||| ||||    
T  22921968 taagatgat 22921976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 286 - 453
Target Start/End: Original strand, 50210168 - 50210336
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatact 384  Q
    |||||||||||  || | ||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | |||||    
T  50210168 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 50210267  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatg 453  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  50210268 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgatg 50210336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 326 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 21754170 - 21754049
Alignment:
Q  326 ataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtc 424  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  21754170 ataattgagatgttgttgattg-catttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 21754072  T
Q  425 agtctaagttgattaagatgttg 447  Q
     |||||||||||| | |||||||    
T  21754071 ggtctaagttgatgatgatgttg 21754049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 286 - 457
Target Start/End: Original strand, 22468651 - 22468823
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggt-ttgcatact 384  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||  |||   ||||||||| ||| |||||||| || || | |||||||| || ||||| || | ||| |  ||    
T  22468651 tgtgatataatgttatgtgcattacttgagatattattgaataattaagatgttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatct 22468750  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 457  Q
    |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22468751 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgaagatgt 22468823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 280 - 432
Target Start/End: Original strand, 21861519 - 21861672
Alignment:
Q  280 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgc 379  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| |||| ||| || |||| |||||| |||||||||| || |||||    
T  21861519 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgc 21861618  T
Q  380 atactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaag 432  Q
    ||||||||||||||| || | |||  ||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  21861619 atactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaag 21861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 280 - 432
Target Start/End: Original strand, 21896205 - 21896358
Alignment:
Q  280 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgc 379  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||  |||||| |||| ||| || |||| |||||| |||||||||| || ||||     
T  21896205 ttataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgt 21896304  T
Q  380 atactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaag 432  Q
    ||||||||||||||| || | |||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  21896305 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 21896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 22532435 - 22532270
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatact 384  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||   |||||| || ||| |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | |||||    
T  22532435 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgaatatttaagatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22532336  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||    
T  22532335 gcctatgttgctgttgttatttaactaaattgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 22532270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 288 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 20135351 - 20135181
Alignment:
Q  288 tgatataattatatatgcattacttgaa-ttatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggt-ttgcatactg 385  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||| || ||| |||||| || ||| |||||||| || ||   ||||||||||| |||||||| | ||| |  |||    
T  20135351 tgatataatgttgtatgcattacttgaagttttat-tgaatacttaagatgttgttgaattgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctg 20135253  T
Q  386 cctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 457  Q
    |||||| || | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20135252 cctatgctgctattgttgtttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 20135181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Original strand, 35261018 - 35261180
Alignment:
Q  269 atttgatattgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatc 367  Q
    ||||||| |||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||   ||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  35261018 atttgatgttgttaataatgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatgtatgaatgtttgaga---tgttgatttgcatttgatattgttatatc 35261114  T
Q  368 atgatggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaag 432  Q
    ||| || |||||||||||||||||||| || | |||  ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  35261115 atgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35261180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 86 - 156
Target Start/End: Original strand, 10812612 - 10812682
Alignment:
Q  86 ttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10812612 ttggtttgacttcaaaatgatttataaaacttgagctatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 10812682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Original strand, 27250684 - 27250849
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatact 384  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | |||||    
T  27250684 tgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 27250783  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  27250784 gcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 27250849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 280 - 394
Target Start/End: Original strand, 22130860 - 22130970
Alignment:
Q  280 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgc 379  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||| |||  | || ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22130860 ttataatgttatataattgtatatgcattacatgacttaagtttg-ataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgg 22130955  T
Q  380 atactgcctatgttg 394  Q
    |||||||||||||||    
T  22130956 atactgcctatgttg 22130970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 290 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 22237788 - 22237642
Alignment:
Q  290 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgccta 389  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  22237788 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcataatgccta 22237690  T
Q  390 tgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttga 436  Q
    ||| | || | |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  22237689 tgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttga 22237642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 286 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 34509946 - 34509787
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatact 384  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||  |||   || |||||| ||| |||||||| || |||| ||||| ||||| ||||| || ||| | |||||    
T  34509946 tgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatact 34509847  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  34509846 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 34509787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 350 - 436
Target Start/End: Original strand, 52927989 - 52928076
Alignment:
Q  350 attcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttga 436  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  52927989 attcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52928076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 383 - 457
Target Start/End: Original strand, 20454606 - 20454680
Alignment:
Q  383 ctgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 457  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20454606 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgataatgt 20454680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 269 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 51130743 - 51130632
Alignment:
Q  269 atttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatca 368  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51130743 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatca 51130648  T
Q  369 tgatggtttgcatact 384  Q
    ||||||||||||||||    
T  51130647 tgatggtttgcatact 51130632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 13989469 - 13989351
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  13989469 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 13989370  T
Q  138 cacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |||||||||||||||||||    
T  13989369 cacgtaggtcacagtgaat 13989351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 286 - 432
Target Start/End: Original strand, 41049991 - 41050138
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgcatac 383  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||    |||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  |  |||  ||||    
T  41049991 tgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatga--tgttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactattttatatac 41050088  T
Q  384 tgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaag 432  Q
    ||||||||||| || |||||   |||||||| |||||||||| |||||||    
T  41050089 tgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaag 41050138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 21858690 - 21858592
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||| | | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21858690 ggtgtaaacatgaaagttttagatagttatgttagctttctaacggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 21858592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 381 - 450
Target Start/End: Original strand, 20847205 - 20847274
Alignment:
Q  381 tactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  20847205 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 20847274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 43543267 - 43543214
Alignment:
Q  232 ttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  43543267 ttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 43543214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 136
Target Start/End: Original strand, 44035830 - 44035928
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||   | ||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  44035830 ggtgtaaacatcaaagttttaggtaattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttataacttgagttatgatcaaattact 44035928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 97
Target Start/End: Original strand, 10812723 - 10812816
Alignment:
Q  4 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgactt 97  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||    ||||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  10812723 aaaactggtattgatcggtactgaattgatcttaggtgtaaacatgaaagtcgtagataattgtgttagctttccagtgcctttggtttgactt 10812816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 17004018 - 17003909
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||     
T  17004018 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 17003919  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    ||||||||||    
T  17003918 tcaaattact 17003909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 21026756 - 21026696
Alignment:
Q  375 tttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttg 435  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  21026756 tttgtatactgcctatattgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21026696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 136
Target Start/End: Original strand, 21650883 - 21650979
Alignment:
Q  40 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    |||||||| ||||||| ||||||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| || |||| |||||||| ||||||||||    
T  21650883 tgtaaacatgaaagttttaggtaattttgttagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttaaaactagagttatgatcaaattact 21650979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 136
Target Start/End: Original strand, 18060577 - 18060684
Alignment:
Q  29 ttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtc 128  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| |||||  | |||||||| |||| |     
T  18060577 ttggcctttggtgtaaacatgaaagttttaggtaattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttaaaaacttgagatatgatt 18060676  T
Q  129 aaattact 136  Q
    ||||||||    
T  18060677 aaattact 18060684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 156
Target Start/End: Original strand, 21474724 - 21474763
Alignment:
Q  117 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21474724 tgagttaaggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 21474763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 22366596 - 22366527
Alignment:
Q  67 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  22366596 tgttagctttctaatgactttggtttgacatcgaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 22366527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 286 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 50686778 - 50686694
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatga 371  Q
    |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||||||||||| |||| || ||| |||||||||||    
T  50686778 tgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgacattgttatatcatga 50686694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 400 - 451
Target Start/End: Original strand, 24783162 - 24783213
Alignment:
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatga 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||| ||||||    
T  24783162 gttatttaactaagttgcatgagtctgaataagatgattaagatgatgatga 24783213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 29298473 - 29298439
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29298473 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 29298439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 12710211 - 12710130
Alignment:
Q  165 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttg-tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat 245  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||| |||| || ||||| || | | ||||||| ||||||    
T  12710211 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcacgattgctggattattatatgaatatat 12710130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 383 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 21714610 - 21714549
Alignment:
Q  383 ctgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||||||| || | | |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  21714610 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatg 21714549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 383 - 444
Target Start/End: Original strand, 21788095 - 21788156
Alignment:
Q  383 ctgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||    
T  21788095 ctgcctatgctgctatggttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatg 21788156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 286 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 26065104 - 26065021
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatga 371  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||||||||| || ||  |||||| ||||||||||| |||| | |||| |||||||||||    
T  26065104 tgtgatatatttgtatatgtattacttgaattatatatg-atctttgagatgttgttgatttgcatt-ggtattgttatatcatga 26065021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 396 - 425
Target Start/End: Original strand, 45310434 - 45310463
Alignment:
Q  396 tgtcgttatttaactaagttgcatgagtca 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45310434 tgtcgttatttaactaagttgcatgagtca 45310463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 67 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 16656002 - 16655942
Alignment:
Q  67 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggt 127  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||    
T  16656002 tgttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggt 16655942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 212
Target Start/End: Original strand, 22824136 - 22824184
Alignment:
Q  165 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttg-tgaatacgatatt 212  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  22824136 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatatt 22824184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 348; Significance: 0; HSPs: 156)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 16413030 - 16413476
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16413030 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgacagttgtaggtatggatgttagcttgctaatgccgttggtttgacttcaa 16413129  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16413130 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaattacttcacgtagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 16413229  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattat 299  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16413230 tgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattat 16413329  T
Q  300 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgt 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| |||||| || ||||| |||    
T  16413330 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgt 16413428  T
Q  399 cgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgtt 446  Q
     |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16413429 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgtt 16413476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Original strand, 14409159 - 14409602
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409159 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 14409258  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14409259 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgt 14409358  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  14409359 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgta 14409458  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| |||||| || ||||| |||     
T  14409459 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt 14409557  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14409558 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 14409602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 1484849 - 1484406
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484849 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 1484750  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1484749 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgt 1484650  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  1484649 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgta 1484550  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||     
T  1484549 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 1484451  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1484450 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 1484406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Original strand, 5853007 - 5853450
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853007 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 5853106  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5853107 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgt 5853206  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  5853207 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgta 5853306  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||     
T  5853307 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 5853405  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5853406 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 5853450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 22002200 - 22001757
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22002200 atgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 22002101  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22002100 aagaatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacattgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgt 22002001  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  22002000 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgta 22001901  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||     
T  22001900 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 22001802  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22001801 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 22001757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 4483728 - 4483285
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4483728 atgaaaactggtatttattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaa 4483629  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  4483628 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacactgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttg 4483529  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattat 299  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| |    
T  4483528 tgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgt 4483429  T
Q  300 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgt 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||    
T  4483428 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgt 4483330  T
Q  399 cgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
     |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4483329 tgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 4483285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 4 - 444
Target Start/End: Original strand, 20045913 - 20046353
Alignment:
Q  4 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 103  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20045913 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgccgttggtttcacttcaaaag 20046012  T
Q  104 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaa 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  20046013 gatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcatgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaatgagtatatgaatgtatatgttgtgaa 20046112  T
Q  204 tacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattatatat 303  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  20046113 tacgatattttccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatat 20046212  T
Q  304 gcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgtt 402  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| ||| |||    
T  20046213 gcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgtt 20046311  T
Q  403 atttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20046312 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 20046353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Original strand, 4542088 - 4542531
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  4542088 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttcgcttgacttcaa 4542187  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4542188 aatgatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcgcagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgt 4542287  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  4542288 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgta 4542387  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| || ||   | ||||| |||     
T  4542388 tatgcattacttgaactatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtat-cttgttgtgttgctgtt 4542486  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4542487 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 4542531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 14824222 - 14823778
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14824222 atgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 14824123  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  14824122 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgattaattagtatatgaatgtatatgttgt 14824023  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtat--atatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataatta 298  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||     
T  14824022 aaatacgatattatccatgattgatgaagtgttatatgtatatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatattgtgatataattg 14823923  T
Q  299 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttg 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||||||    
T  14823922 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgttg 14823824  T
Q  398 tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    | |||||||||||  | |||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  14823823 ttgttatttaactttgctgcatgagt-ggtctaaattgattaagatg 14823778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Original strand, 24485758 - 24486093
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24485758 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttgggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 24485857  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24485858 aatgatttataaaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 24485957  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattat 299  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  24485958 tgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttctaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgt 24486057  T
Q  300 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24486058 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 24486093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 15071008 - 15070571
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  15071008 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttaaa 15070909  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15070908 aatgatttatacaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcatagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 15070809  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattg-ttatattgtgatataatta 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  |||||||||     
T  15070808 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatttatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattcagatataattg 15070709  T
Q  299 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgtt 396  Q
    ||||||||| | ||  ||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| |||||  || ||| | |    
T  15070708 tatatgcatcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-actgtgtcgct 15070610  T
Q  397 gtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttg 435  Q
    || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15070609 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 27472131 - 27472395
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  27472131 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgtcgttggtttgacttcaa 27472230  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27472231 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 27472330  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 265  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27472331 tgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatatgatg-tttaagatgttgatt 27472395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 18677779 - 18678043
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18677779 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaa 18677878  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||    
T  18677879 aagaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatgtatatgtatatgtttg 18677978  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgat 264  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  18677979 tgaatacgatattatccatgattgatgaagtgttatatttatgtatgatgttttaagatgttgat 18678043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 32122172 - 32121912
Alignment:
Q  5 aaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagg 104  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  32122172 aaactgatattgattggtacagaattgttcttaggtgtaaacacgaatgttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaatg 32122073  T
Q  105 atttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaa 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  32122072 atttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgcatatgtttgtgaa 32121973  T
Q  204 tacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgat 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32121972 tacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatgtatgatgttttaagatgttgat 32121912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 164 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 20403511 - 20403231
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403511 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 20403412  T
Q  264 ttaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattatta 363  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  20403411 ttattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 20403312  T
Q  364 tatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    | ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20403311 tgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 20403231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 164 - 444
Target Start/End: Original strand, 15203109 - 15203389
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15203109 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaataagatattatccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 15203208  T
Q  264 ttaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattatta 363  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  15203209 ttattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattatta 15203308  T
Q  364 tatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    | ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  15203309 tgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatg 15203389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16198339 - 16198115
Alignment:
Q  4 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 103  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  16198339 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttctaatgccgttggtttgactttaaaaa 16198240  T
Q  104 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtga 202  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16198239 tatttatagaacttgagttatggtccaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtga 16198140  T
Q  203 atacgatattgtccatgattgatga 227  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  16198139 atacgatattgttcatgattgatga 16198115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 16401639 - 16401875
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16401639 atgaaaactgatattgattgatacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtattgatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaa 16401738  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  16401739 aaggatttataaaacttgagttatagtcagattacagcaggtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttg 16401838  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttata 236  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16401839 tgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttata 16401875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24049055 - 24048841
Alignment:
Q  4 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  24049055 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaac 24048956  T
Q  104 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtga 202  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24048955 aatttatagaacttgagttatggtcaaattactgca-gtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtga 24048857  T
Q  203 atacgatattgtccat 218  Q
    |||||||||||| |||    
T  24048856 atacgatattgtncat 24048841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 38549719 - 38549957
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  38549719 atgaaatctggtattgattggtaaagaattggtcttaggtataaacacaaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgtcgttggtttgacttcaa 38549818  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38549819 aaagatttatagaacttgagttatggtcaaaatactgcacgtatgtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 38549918  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  38549919 tgaatacgatattgttcatgattgatgaatttttatatg 38549957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 164 - 448
Target Start/End: Original strand, 45290572 - 45290857
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290572 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 45290671  T
Q  264 ttaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttacattcgatattatt 362  Q
    |||  ||||||  |||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||    
T  45290672 ttattatttgacgttgttatactgtgatataattgtatctgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattggcttacatttgatattatt 45290771  T
Q  363 atatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttga 448  Q
    || ||||| ||  |||| ||||||  | ||| | ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45290772 atgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttga 45290857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 1326646 - 1326884
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  1326646 atgaaatctggtattgattggtacagaattggtcttaagtgtaaaaacgaaagttgtaggtatgaatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 1326745  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  1326746 aacgatttataaaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtacatgtttg 1326845  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 238  Q
    | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1326846 taaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 1326884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 27 - 227
Target Start/End: Original strand, 25657893 - 25658094
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25657893 aattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgtttgtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 25657992  T
Q  127 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  25657993 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatttgatattgttcatgattgat 25658092  T
Q  226 ga 227  Q
    ||    
T  25658093 ga 25658094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 3 - 198
Target Start/End: Original strand, 15202895 - 15203090
Alignment:
Q  3 gaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15202895 gaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaa 15202994  T
Q  103 ggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 198  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  15202995 gaatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgaatgtatatgtt 15203090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 164 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 19896553 - 19896269
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttt-aagatgttg 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  19896553 tatgattgatgaattagtatatgtatatatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatatttttaagatgttg 19896454  T
Q  263 attaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatatta-- 360  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||      
T  19896453 attattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 19896354  T
Q  361 -ttatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
     |||| ||||| ||  |||| |||| |  | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19896353 attatgtcatgctgtttttgtataccg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 19896269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 19936622 - 19936850
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  19936622 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgtcattggtttgacttcaa 19936721  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||         ||||    
T  19936722 aaggatttatagaacttgaggtatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgtttatgattgatgaattagtatatgt---------ttgt 19936812  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 238  Q
    |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19936813 gaatattatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 19936850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19896769 - 19896524
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  19896769 atgaaaactggtattgattggtagagaattggtcttaggtgtaaacacgaaaattgtaggtatgaattttaactttctagcgccgttggtttgacttcaa 19896670  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||     
T  19896669 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatgtgattgatgaattaggatatgaatgtatatgttta 19896570  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat 245  Q
    ||| || ||| ||||  |||||||||||| |  |||||||||||||    
T  19896569 tgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatatat 19896524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20403727 - 20403530
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  20403727 atgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtattaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttgaa 20403628  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20403627 aaggatttatagaacttgagttattgtcatattactgcgcgtaggtcacagtgaataattaaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 20403530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 30 - 198
Target Start/End: Original strand, 45290385 - 45290553
Alignment:
Q  30 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtca 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290385 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtca 45290484  T
Q  130 aattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 198  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||    
T  45290485 aattactgcacgtagatcatagtgaataattgaatatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtt 45290553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 19896962 - 19896807
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19896962 atgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 19896863  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19896862 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcaagtaggtcacagtgaat 19896807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 164 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 32810215 - 32810054
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32810215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttacatgtatatatgatgttttaagatgttga 32810116  T
Q  264 ttaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtga 325  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32810115 ttattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtga 32810054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 15202700 - 15202856
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  15202700 atgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgctattggtttgacttcaa 15202799  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaata 157  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15202800 aagaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaata 15202856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 165 - 444
Target Start/End: Original strand, 19936882 - 19937164
Alignment:
Q  165 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttg 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||    
T  19936882 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttg 19936981  T
Q  263 attaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttacattcgatattat 361  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || |||| ||| ||||    
T  19936982 attatcatttgatgttgttatattgtgatataactgtatgtgcattgattgaattatttgtgagtaattgagacgttgattgacttgcatttgatcttat 19937081  T
Q  362 tatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||| | ||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  19937082 tatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatg 19937164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 20403920 - 20403765
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  20403920 atgaaaactggtattgattgctacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaa 20403821  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403820 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20403765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 27471938 - 27472093
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  27471938 atgaaaactgatattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 27472037  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27472038 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 27472093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 32122369 - 32122214
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  32122369 atgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaa 32122270  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32122269 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 32122214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 14397455 - 14397609
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14397455 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagctgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 14397554  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 155  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14397555 aatgatttgtagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 14397609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 38549526 - 38549681
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  38549526 atgaaaactggtattgattggtacagaattgatcttaggtataaacacggaagttgtaggtatggatgttagctttttaattccgttggtttgacttcaa 38549625  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38549626 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 38549681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 16401254 - 16401408
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16401254 atgaaatctggtattgataggtccagaattggt-ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacgtcaa 16401352  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16401353 aaagatttatagaacttgagttatggtcaaattacagcacgtaggtcacagtgaat 16401408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 156
Target Start/End: Original strand, 16401450 - 16401601
Alignment:
Q  5 aaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagg 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |    
T  16401450 aaactggtattgattggtacgtaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttccaacgccgttggtttgacttcaaaatg 16401549  T
Q  105 atttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||    
T  16401550 atttatagaacttgagttatggtcaaattacagcacgtatgccacaatgaat 16401601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 45290262 - 45290389
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290262 atgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 45290361  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtc 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290362 aaggatttatagaacttgagttatggtc 45290389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 15071198 - 15071046
Alignment:
Q  4 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 103  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||     
T  15071198 aaaactggtattgatcggtaaagaattgatcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaa 15071099  T
Q  104 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15071098 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 15071046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 16412837 - 16412992
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||    
T  16412837 atgaaaattggtattgattggtacagaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtctgatgtcaa 16412936  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16412937 aaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactatacgtaggtcacagtgaat 16412992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 38549334 - 38549488
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  38549334 atgaaatctggtattgataggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtatgtatggatgttagctttctaatgtcgttggtatgacgtcaa 38549433  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38549434 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagg-cacagtgaat 38549488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 15202507 - 15202662
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  15202507 atgaaatctggtattgatagatccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtctgacgtcaa 15202606  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15202607 aaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 15202662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 19897155 - 19897000
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  19897155 atgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttagctgtaaatacaaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgccgttggtctgacgtcaa 19897056  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19897055 aaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 19897000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 24049243 - 24049104
Alignment:
Q  9 tggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 108  Q
    |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||    
T  24049243 tggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgattt 24049144  T
Q  109 atagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 148  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24049143 ataaaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 24049104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 280 - 450
Target Start/End: Original strand, 17612059 - 17612230
Alignment:
Q  280 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgc 379  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| | |||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  17612059 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttttgc 17612158  T
Q  380 atactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  17612159 atactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 17612230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 269 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 41598367 - 41598192
Alignment:
Q  269 atttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatca 368  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||    
T  41598367 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 41598268  T
Q  369 tgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    || ||  |||| |||||  || ||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41598267 tgctgtttttgtatact-actgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 41598192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 19936429 - 19936584
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| || | | ||    
T  19936429 atgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtagctatggatattagctttctaattccgttggtctggcgttaa 19936528  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19936529 aacgatttatagaacttgagttatgctcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 19936584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 164 - 265
Target Start/End: Original strand, 38549988 - 38550090
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 262  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38549988 tatgattgatgaattagtatacgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 38550087  T
Q  263 att 265  Q
    |||    
T  38550088 att 38550090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 280 - 448
Target Start/End: Original strand, 13508034 - 13508203
Alignment:
Q  280 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgc 379  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | || | ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  13508034 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttgtgc 13508133  T
Q  380 atactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttga 448  Q
    ||| ||||||||||| || | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  13508134 atattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttga 13508203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 280 - 448
Target Start/End: Original strand, 13597566 - 13597735
Alignment:
Q  280 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgc 379  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| | || | ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13597566 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttttgc 13597665  T
Q  380 atactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttga 448  Q
    || |||| ||||||| || | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  13597666 attctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttga 13597735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 256 - 370
Target Start/End: Original strand, 25484245 - 25484359
Alignment:
Q  256 gatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcga 355  Q
    |||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  25484245 gatgttgattatgatttgatgttattatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 25484344  T
Q  356 tattattatatcatg 370  Q
    ||||||||| |||||    
T  25484345 tattattatgtcatg 25484359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 164 - 274
Target Start/End: Original strand, 16401908 - 16402020
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgtt 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |   ||||||    
T  16401908 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaaatgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgtt 16402007  T
Q  262 gattaccatttga 274  Q
    ||||| |||||||    
T  16402008 gattatcatttga 16402020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 164 - 285
Target Start/End: Original strand, 1326915 - 1327042
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgt------tatatgtatatatgatgttttaaga 257  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||| |||||||| |||    
T  1326915 tatgattgatgaattggtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatatatatgtatatacgatgttttgaga 1327014  T
Q  258 tgttgattaccatttgatattgttatat 285  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||    
T  1327015 tgttgattattatttgatgttgttatat 1327042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 290 - 450
Target Start/End: Original strand, 38855212 - 38855371
Alignment:
Q  290 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgccta 389  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38855212 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgccta 38855309  T
Q  390 tgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||||| || | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  38855310 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 38855371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 11361157 - 11361024
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||    
T  11361157 atgaaatctagtattgataggtgcataattggtcttaggtgtaaacacaaaacttgtaggtatggatgttagctttctaatactgttggtctgacgtcaa 11361058  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaatta 134  Q
    || |||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  11361057 aacgatttatagaacttaagttatagttaaatta 11361024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 271 - 432
Target Start/End: Original strand, 19801367 - 19801527
Alignment:
Q  271 ttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatg 370  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||| |||||    
T  19801367 ttgatgttgttatattgtgttataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcgtttgatattattatgtcatg 19801466  T
Q  371 atggtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaag 432  Q
     || |||| ||||||  | ||||| | | |||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  19801467 ctgttttgtatactg-ttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagccggtctaag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 164 - 265
Target Start/End: Original strand, 20982604 - 20982710
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgt----tatatgtatatatgatgttttaagat 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  20982604 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatatatatatatatgatgttttaagat 20982703  T
Q  259 gttgatt 265  Q
    |||||||    
T  20982704 gttgatt 20982710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 269 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 26224098 - 26223914
Alignment:
Q  269 atttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatca 368  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||| |||    
T  26224098 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattaaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 26223999  T
Q  369 tgat-ggtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatg 453  Q
    || |   |||| ||| || || | ||| ||| ||||||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  26223998 tgctatttttgtatattg-ctttattgctgttgttatttaattaagctgcatgggtcgatctaagttgattaagatgttgatgatg 26223914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 337 - 450
Target Start/End: Original strand, 5866280 - 5866394
Alignment:
Q  337 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttg 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  5866280 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 5866379  T
Q  436 attaagatgttgatg 450  Q
     | |||||| |||||    
T  5866380 ttgaagatgatgatg 5866394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 337 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 21491110 - 21490996
Alignment:
Q  337 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttg 435  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  21491110 gttgttgatttacattcaatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21491011  T
Q  436 attaagatgttgatg 450  Q
     | |||||| |||||    
T  21491010 ttgaagatgatgatg 21490996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 22626901 - 22626737
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactg 385  Q
    |||||||||||  ||||  ||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||    
T  22626901 tgtgatataatgttatacacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactg 22626802  T
Q  386 cctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  22626801 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 22626737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 280 - 450
Target Start/End: Original strand, 18818358 - 18818529
Alignment:
Q  280 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 378  Q
    |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||| ||||| | ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  18818358 ttatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttg 18818457  T
Q  379 catactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
     ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  18818458 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 18818529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 349 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 6520471 - 6520369
Alignment:
Q  349 cattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttg 447  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  6520471 cattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 6520372  T
Q  448 atg 450  Q
    |||    
T  6520371 atg 6520369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 337 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 17141031 - 17140917
Alignment:
Q  337 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttg 435  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  17141031 gttgatgatttacattcgatattattatgtcatgatggattgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 17140932  T
Q  436 attaagatgttgatg 450  Q
     | |||||| |||||    
T  17140931 ttgaagatgatgatg 17140917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 330 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 21285719 - 21285606
Alignment:
Q  330 ttgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtc 428  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||| |||    
T  21285719 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtc 21285620  T
Q  429 taagttgattaaga 442  Q
    ||||||||||||||    
T  21285619 taagttgattaaga 21285606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 330 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 21673826 - 21673718
Alignment:
Q  330 ttgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtc 428  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||| |||    
T  21673826 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcataatgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagtcggtc 21673727  T
Q  429 taagttgat 437  Q
    |||||||||    
T  21673726 taagttgat 21673718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 286 - 453
Target Start/End: Original strand, 28648999 - 28649167
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatact 384  Q
    |||||||||||  ||||  |||||||||||||||   || |||||| ||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | |||||    
T  28648999 tgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatact 28649098  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatg 453  Q
    |||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  28649099 gcctatgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgatg 28649167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 238
Target Start/End: Original strand, 13425336 - 13425411
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13425336 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 13425411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 238
Target Start/End: Original strand, 20982498 - 20982573
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20982498 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 20982573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Original strand, 16092297 - 16092462
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatact 384  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||| ||||||   || ||| |||||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | |||||    
T  16092297 tgtgatataatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16092396  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  16092397 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 16092462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 280 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 20498734 - 20498581
Alignment:
Q  280 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgc 379  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| |||| ||| || |||| |||||| |||||||||| |  ||| |    
T  20498734 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctattttac 20498635  T
Q  380 atactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaag 432  Q
    ||||||||||||||| || | |||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  20498634 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 20498581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 22875230 - 22875066
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactg 385  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||    
T  22875230 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactg 22875131  T
Q  386 cctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||| ||||| ||  | |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  22875130 cctgtgttgctgctgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatg 22875066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 6759421 - 6759259
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatact 384  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||||||  ||| ||||||||||   |||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | |||||    
T  6759421 tgtgatataatgttatacgcattaattgaattatgagtgtataattgaga---tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 6759325  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  6759324 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 6759259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 383 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 23648621 - 23648547
Alignment:
Q  383 ctgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 457  Q
    |||||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23648621 ctgcctatgttgctattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 23648547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 298 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 7372932 - 7372779
Alignment:
Q  298 atatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgtt 396  Q
    ||||| |||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |    
T  7372932 atataagcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct 7372833  T
Q  397 gtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  7372832 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 7372779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 20536374 - 20536209
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatact 384  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | |||||    
T  20536374 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20536275  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  20536274 gcctatgtttctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 20536209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 337 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 21249500 - 21249385
Alignment:
Q  337 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttg--ttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagtt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||   | |  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  21249500 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgaattgcatactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 21249401  T
Q  435 gattaagatgttgatg 450  Q
    | | |||||| |||||    
T  21249400 gttgaagatgatgatg 21249385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 337 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 21255338 - 21255223
Alignment:
Q  337 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttg--ttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagtt 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||   | |  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  21255338 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgaattgcatactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 21255239  T
Q  435 gattaagatgttgatg 450  Q
    | | |||||| |||||    
T  21255238 gttgaagatgatgatg 21255223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 290 - 436
Target Start/End: Original strand, 23760805 - 23760950
Alignment:
Q  290 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgccta 389  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  23760805 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgaattcaatattgttatatcatgatgatttacatactgccta 23760902  T
Q  390 tgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttga 436  Q
    ||||| || | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  23760903 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 23760950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 331 - 437
Target Start/End: Original strand, 26355699 - 26355805
Alignment:
Q  331 tgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtct 429  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  26355699 tgagatgttgttgattg-cattcgatattgttatatcgtgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtct 26355797  T
Q  430 aagttgat 437  Q
    ||||||||    
T  26355798 aagttgat 26355805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 383 - 457
Target Start/End: Original strand, 18678155 - 18678229
Alignment:
Q  383 ctgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 457  Q
    ||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18678155 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgataatgatgt 18678229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 32810333 - 32810263
Alignment:
Q  12 tattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 82  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32810333 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttgtaatg 32810263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 285 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 23406548 - 23406380
Alignment:
Q  285 ttgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt--gttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcat 381  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |  ||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | ||    
T  23406548 ttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtat 23406449  T
Q  382 actgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  23406448 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 23406380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 175 - 238
Target Start/End: Original strand, 13425241 - 13425305
Alignment:
Q  175 aattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 238  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13425241 aattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 13425305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 303 - 450
Target Start/End: Original strand, 21923900 - 21924048
Alignment:
Q  303 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtcgt 401  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| || || | |||||||| || ||||| || ||| | | ||||||||||||| ||| ||    
T  21923900 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgttgt 21923999  T
Q  402 tatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  21924000 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 21924048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 354 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 31971354 - 31971258
Alignment:
Q  354 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  31971354 gatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 31971258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 301 - 450
Target Start/End: Original strand, 21918969 - 21919120
Alignment:
Q  301 tatgcattacttgaattat-atgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgt 398  Q
    |||||||||||||||  || || |||||| || ||| |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||    
T  21918969 tatgcattacttgaagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgt 21919068  T
Q  399 cgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
     |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  21919069 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 21919120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 136
Target Start/End: Original strand, 24717722 - 24717820
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||   ||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  24717722 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattatgttagatttctaatgcctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 24717820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 383 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 32121800 - 32121726
Alignment:
Q  383 ctgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 457  Q
    ||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32121800 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttgattaagatgttgataatgatgt 32121726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Original strand, 15319989 - 15320098
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||     
T  15319989 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataactatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatga 15320088  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    ||||||||||    
T  15320089 tcaaattact 15320098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Original strand, 15500358 - 15500467
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||     
T  15500358 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataactatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatga 15500457  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    ||||||||||    
T  15500458 tcaaattact 15500467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Original strand, 18879276 - 18879351
Alignment:
Q  375 tttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  18879276 tttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 18879351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 1485005 - 1484887
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  1485005 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 1484906  T
Q  138 cacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |||||||||||||||||||    
T  1484905 cacgtaggtcacagtgaat 1484887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 29759498 - 29759429
Alignment:
Q  67 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  29759498 tgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 29759429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 37116532 - 37116366
Alignment:
Q  269 atttgatattgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatc 367  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||| |  |||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  37116532 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 37116434  T
Q  368 atga--tggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaag 432  Q
    ||||  || |||   |||||||||||||| || | |||  ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  37116433 atgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 37116366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 337 - 436
Target Start/End: Original strand, 983410 - 983512
Alignment:
Q  337 gttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagt 433  Q
    |||||||| || |||| || ||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  983410 gttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaacttgtttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 983509  T
Q  434 tga 436  Q
    |||    
T  983510 tga 983512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 156
Target Start/End: Original strand, 5852851 - 5852969
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||  | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  5852851 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 5852950  T
Q  138 cacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5852951 cacgtaggtcacagtgaat 5852969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 156
Target Start/End: Original strand, 14409003 - 14409121
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||  | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  14409003 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 14409102  T
Q  138 cacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14409103 cacgtaggtcacagtgaat 14409121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 286 - 424
Target Start/End: Original strand, 17439461 - 17439601
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgcatac 383  Q
    ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||| |  |||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  || |||   |||    
T  17439461 tgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtac 17439559  T
Q  384 tgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtc 424  Q
    |||||||||||||| | |||  ||||||||| ||||||||||    
T  17439560 tgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtc 17439601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 156
Target Start/End: Original strand, 20045758 - 20045872
Alignment:
Q  42 taaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacg 141  Q
    |||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||||||    
T  20045758 taaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacg 20045857  T
Q  142 taggtcacagtgaat 156  Q
    |||||||||||||||    
T  20045858 taggtcacagtgaat 20045872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 136
Target Start/End: Original strand, 22007097 - 22007195
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22007097 ggtgtaaacatgaaagttatagataattttgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 22007195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 306 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 26219858 - 26219721
Alignment:
Q  306 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatt 405  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||  |  |||| ||||||| | ||| | ||| ||||||    
T  26219858 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactattttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatt 26219760  T
Q  406 taactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  26219759 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattatgatg 26219721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 136
Target Start/End: Original strand, 13663129 - 13663198
Alignment:
Q  67 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  13663129 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 13663198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 136
Target Start/End: Original strand, 17150628 - 17150725
Alignment:
Q  39 gtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    ||||||||| |||||||| || ||   ||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  17150628 gtgtaaacatgaaagttgcagataattatgttagctttctaatggctttggttggacttccaaatgatttttagaacttgagttatgattaaattact 17150725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Original strand, 17266930 - 17267096
Alignment:
Q  269 atttgatattgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatc 367  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| ||| |  |||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  17266930 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacaagaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 17267028  T
Q  368 atga--tggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaag 432  Q
    ||||   | |||   ||||||||||||||||| | |||  ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  17267029 atgaaccgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 17267096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 354 - 450
Target Start/End: Original strand, 45131021 - 45131116
Alignment:
Q  354 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| || | |||||| |||||    
T  45131021 gatattattatgtcatgctg-tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 45131116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21513707 - 21513636
Alignment:
Q  168 attgatgaattagtatatgtatgtatatgttg-tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 238  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  21513707 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatg 21513636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 165 - 238
Target Start/End: Original strand, 18815609 - 18815683
Alignment:
Q  165 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttg-tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 238  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  18815609 atgattgatgaattattatgtgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatg 18815683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 306 - 444
Target Start/End: Original strand, 26225268 - 26225405
Alignment:
Q  306 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatt 405  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||| ||  ||| ||||||||||| ||||  || |||| ||| ||  | ||| | ||| ||||||    
T  26225268 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactgttttgtatattgt-tgtgtcgctgttgttatt 26225366  T
Q  406 taactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26225367 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 26225405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 239 - 285
Target Start/End: Original strand, 35026849 - 35026895
Alignment:
Q  239 tatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  35026849 tatatatgatgttttaagatgttgattatcgtttgatattgttatat 35026895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Original strand, 223305 - 223414
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||     
T  223305 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 223404  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    | ||||||||    
T  223405 ttaaattact 223414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Original strand, 272164 - 272273
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||     
T  272164 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 272263  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    ||||||||||    
T  272264 tcaaattact 272273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 643685 - 643576
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||     
T  643685 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 643586  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    ||||||||||    
T  643585 tcaaattact 643576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Original strand, 688076 - 688185
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||     
T  688076 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 688175  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    | ||||||||    
T  688176 ttaaattact 688185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Original strand, 736928 - 737037
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||     
T  736928 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 737027  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    | ||||||||    
T  737028 ttaaattact 737037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 829491 - 829382
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||     
T  829491 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 829392  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    ||||||||||    
T  829391 tcaaattact 829382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Original strand, 860823 - 860932
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||     
T  860823 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 860922  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    | ||||||||    
T  860923 ttaaattact 860932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Original strand, 22089373 - 22089482
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||| |  |||||||||||||||     
T  22089373 aattggcctttggtttaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatattaagaacttgagttatga 22089472  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    ||||||||||    
T  22089473 tcaaattact 22089482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 39114511 - 39114415
Alignment:
Q  40 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||   ||||||| ||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  39114511 tgtaaacatgaaagttttagataattatgttagttttctaatggctttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatgatcagattact 39114415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 4483804 - 4483765
Alignment:
Q  117 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4483804 tgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 4483765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 14824299 - 14824260
Alignment:
Q  117 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14824299 tgagttatggtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaat 14824260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 380 - 450
Target Start/End: Original strand, 21396029 - 21396100
Alignment:
Q  380 atactgcctatgttgttgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||| || | |||||| |||||    
T  21396029 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 21396100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 136
Target Start/End: Original strand, 21493050 - 21493137
Alignment:
Q  49 gaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||   |||| |||||| |||||||    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  21493050 gaaagttgaagatatggatgttagctttcatttgccattggttggacttcatttagatttatagaacttgagttatgatcaaaatact 21493137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 380 - 450
Target Start/End: Original strand, 21790522 - 21790593
Alignment:
Q  380 atactgcctatgttgttgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||| || | |||||| |||||    
T  21790522 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 21790593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 285
Target Start/End: Original strand, 2418860 - 2418906
Alignment:
Q  239 tatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatat 285  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  2418860 tatatatgatgtttcaagatgttgattatcgtttgatattgttatat 2418906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 238
Target Start/End: Original strand, 36733302 - 36733376
Alignment:
Q  165 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttg-tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 238  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||| ||| || | ||||||||||||||| |||||||    
T  36733302 atgattgatgatttattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtttttcatgattgatgaagtattatatg 36733376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 38988804 - 38988730
Alignment:
Q  165 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttg-tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 238  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||  ||| ||||||||||||| | |||||||    
T  38988804 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgatgttcatgattgatgaattattatatg 38988730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 39019901 - 39019827
Alignment:
Q  165 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttg-tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 238  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||  ||| ||||||||||||| | |||||||    
T  39019901 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgatgttcatgattgatgaattattatatg 39019827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 354 - 450
Target Start/End: Original strand, 16199668 - 16199764
Alignment:
Q  354 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||||||||||| ||||| || |||| |||||| |||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||| || | |||||| |||||    
T  16199668 gatattattatgtcatgttg-tttgaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 16199764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 238
Target Start/End: Original strand, 5083001 - 5083068
Alignment:
Q  172 atgaattagtatatgtatgtatatgttg-tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 238  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||| | |||||||    
T  5083001 atgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatg 5083068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 400 - 447
Target Start/End: Original strand, 20856494 - 20856541
Alignment:
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttg 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  20856494 gttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgttg 20856541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 380 - 450
Target Start/End: Original strand, 21389499 - 21389570
Alignment:
Q  380 atactgcctatgttgttgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||| || | |||||| |||||    
T  21389499 atactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 21389570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 380 - 450
Target Start/End: Original strand, 21778825 - 21778896
Alignment:
Q  380 atactgcctatgttgttgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||| || | |||||| |||||    
T  21778825 atactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 21778896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 400 - 447
Target Start/End: Original strand, 39094994 - 39095041
Alignment:
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttg 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  39094994 gttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgttg 39095041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 156
Target Start/End: Original strand, 16401186 - 16401216
Alignment:
Q  126 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16401186 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 16401216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 86 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 18612002 - 18611952
Alignment:
Q  86 ttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18612002 ttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 18611952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 243 - 285
Target Start/End: Original strand, 22419405 - 22419447
Alignment:
Q  243 tatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  22419405 tatgatgttttaagatgttgattatcgtttgaaattgttatat 22419447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 39364188 - 39364118
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 108  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  39364188 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgattt 39364118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 108
Target Start/End: Original strand, 44522814 - 44522884
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 108  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  44522814 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgattt 44522884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 18618899 - 18618830
Alignment:
Q  67 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| | || ||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  18618899 tgttagctttctaatggctttggtttgccgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 18618830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 383 - 444
Target Start/End: Original strand, 21162111 - 21162172
Alignment:
Q  383 ctgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||    
T  21162111 ctgcctatgctgttattattatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatg 21162172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 383 - 444
Target Start/End: Original strand, 21168784 - 21168845
Alignment:
Q  383 ctgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||    
T  21168784 ctgcctatgctgttattattatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatg 21168845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 22147046 - 22146977
Alignment:
Q  67 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    ||||||||||||  || | |||||||||| || |||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22147046 tgttagctttcttttggctttggtttgacgtccaaataatttttagaacttgagttatgatcaaattact 22146977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 383 - 444
Target Start/End: Original strand, 23776888 - 23776949
Alignment:
Q  383 ctgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||    
T  23776888 ctgcctatgctgctatagttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatg 23776949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 98
Target Start/End: Original strand, 24678771 - 24678828
Alignment:
Q  41 gtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttc 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||   |||||||||||||    
T  24678771 gtaaacatgaaagttgtaggtatggaagttaaatttctaatgaatttggtttgacttc 24678828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 44476785 - 44476756
Alignment:
Q  256 gatgttgattaccatttgatattgttatat 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44476785 gatgttgattaccatttgatattgttatat 44476756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 44477099 - 44477018
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 108  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||    
T  44477099 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgattt 44477018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 44480047 - 44480018
Alignment:
Q  256 gatgttgattaccatttgatattgttatat 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44480047 gatgttgattaccatttgatattgttatat 44480018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 44480361 - 44480280
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 108  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||    
T  44480361 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgattt 44480280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 400 - 444
Target Start/End: Original strand, 17926775 - 17926819
Alignment:
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||    
T  17926775 gttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatg 17926819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 42 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 19866548 - 19866496
Alignment:
Q  42 taaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttga 94  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||| | |||||||||    
T  19866548 taaacatgaaagttgtaggtatgaaagttagatttctaatggctttggtttga 19866496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 287 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 22364826 - 22364744
Alignment:
Q  287 gtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatga 371  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||||||||||| | || |||||| |||||||||||    
T  22364826 gtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgattttc-tttgatattgttatatcatga 22364744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 400 - 444
Target Start/End: Original strand, 25484382 - 25484426
Alignment:
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  25484382 gttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatg 25484426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 345; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 94858 - 94415
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94858 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 94759  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  94758 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgt 94659  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  94658 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgta 94559  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||     
T  94558 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 94460  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  94459 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 94415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 17154 - 17600
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17154 atgaaaacttgtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatttttgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 17253  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17254 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatagttgaatatgatcgatgaattagtatatgtatgtatatgcttg 17353  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattat 299  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  17354 tgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgtcatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatactgtgatataattat 17453  T
Q  300 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgt 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| |||||| || ||||| | |    
T  17454 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctat 17552  T
Q  399 cgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgtt 446  Q
     |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17553 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgtt 17600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 16961 - 17116
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||    
T  16961 atgaaaactggtattgattggtacagaatttgtgttaggggataacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgatatcaa 17060  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  17061 aaaggtttatagaacttgagttatgatcaaattaatgcacgtaggtcatagtgaat 17116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 289 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 44614 - 44458
Alignment:
Q  289 gatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg--gtttgcatactgc 386  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||   |||| ||||||     
T  44614 gatataattctatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactg- 44516  T
Q  387 ctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
     | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44515 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 44458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 290 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 100534 - 100388
Alignment:
Q  290 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgccta 389  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  || |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  100534 atataattgtatatacattatatgaattat--gttaatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgatttgcatactgccta 100437  T
Q  390 tgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 437  Q
    ||||| || | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  100436 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 100388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 290 - 437
Target Start/End: Original strand, 40135 - 40281
Alignment:
Q  290 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgccta 389  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  40135 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcctactgccta 40232  T
Q  390 tgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 437  Q
    ||||| || |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40233 tgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 40281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 95014 - 94896
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  95014 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 94915  T
Q  138 cacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |||||||||||||||||||    
T  94914 cacgtaggtcacagtgaat 94896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 101580 - 101513
Alignment:
Q  371 atggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  101580 atggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgat 101513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #9
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 379 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 119948 - 119876
Alignment:
Q  379 catactgcctatgttgttgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  119948 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 119876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #10
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 136
Target Start/End: Original strand, 154892 - 154961
Alignment:
Q  67 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||  || |||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  154892 tgttagctttataatgacgttggtttgaggtccaaatcatttttagaacttgagttatgatcaaattact 154961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 400 - 444
Target Start/End: Original strand, 38549 - 38593
Alignment:
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  38549 gttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgattaagatg 38593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 341; Significance: 0; HSPs: 149)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Original strand, 15376428 - 15376871
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376428 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 15376527  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15376528 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgt 15376627  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  15376628 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgta 15376727  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||     
T  15376728 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 15376826  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15376827 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 15376871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Original strand, 20384838 - 20385281
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20384838 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 20384937  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20384938 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgt 20385037  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  20385038 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgta 20385137  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||     
T  20385138 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 20385236  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20385237 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 20385281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Original strand, 14948837 - 14949280
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14948837 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 14948936  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14948937 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgt 14949036  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  14949037 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgta 14949136  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||     
T  14949137 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 14949235  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14949236 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 14949280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 32125938 - 32125495
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32125938 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaataccgttggtttgacttcaa 32125839  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32125838 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgt 32125739  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  32125738 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgta 32125639  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||     
T  32125638 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 32125540  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32125539 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 32125495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 456769 - 456325
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456769 atgaaaaccggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 456670  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  456669 aaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 456570  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  456569 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgt 456470  T
Q  300 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgt 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||    
T  456469 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgt 456371  T
Q  399 cgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
     |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  456370 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 456325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 27217308 - 27216864
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27217308 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 27217209  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27217208 aaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 27217109  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  27217108 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgt 27217009  T
Q  300 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgt 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||    
T  27217008 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgt 27216910  T
Q  399 cgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
     |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  27216909 tgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatg 27216864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 16410506 - 16410063
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410506 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 16410407  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16410406 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatcaatgtatatgttgt 16410307  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| | |||||||||| ||    
T  16410306 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactatgatataattgta 16410207  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||     
T  16410206 tatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 16410108  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16410107 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16410063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 16232968 - 16232524
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16232968 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgaattcaa 16232869  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16232868 aaggatttatagaatttgagttattgtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 16232769  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  16232768 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgt 16232669  T
Q  300 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgt 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||    
T  16232668 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgt 16232570  T
Q  399 cgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
     |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16232569 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16232524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 41523365 - 41522921
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523365 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacataaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 41523266  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41523265 aaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 41523166  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  41523165 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgt 41523066  T
Q  300 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgt 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||    
T  41523065 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgt 41522967  T
Q  399 cgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
     |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41522966 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 41522921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 41525827 - 41525383
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525827 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacataaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 41525728  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41525727 aaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 41525628  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  41525627 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgt 41525528  T
Q  300 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgt 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||    
T  41525527 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgt 41525429  T
Q  399 cgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
     |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41525428 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 41525383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Original strand, 21189310 - 21189753
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21189310 atgaaaactggtatttattggtacagagttggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatgaatgttagctttttaatgccgttggtttgacttcaa 21189409  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||    
T  21189410 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatagtttgt 21189509  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  21189510 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgta 21189609  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||     
T  21189610 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 21189708  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21189709 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21189753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 16214132 - 16213688
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16214132 atgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttacgtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 16214033  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16214032 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaatgactgcacgtaggtcacagtgaataattgaataagattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 16213933  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattat 299  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  16213932 tgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttcatatgttgattaccatttgatgttgttatgttgtgatataattat 16213833  T
Q  300 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgt 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||| ||||||||||| ||||| ||  |||| |||||| || ||||| |||    
T  16213832 atatgcattacttgaattatatgtgaataattaagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgttgctgt 16213734  T
Q  399 cgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
     |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16213733 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16213688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 18640719 - 18640276
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18640719 atgaaaactgatattgattggcacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttataatgccgttggtttgacttcaa 18640620  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  18640619 aaggatttatagaacttgatttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattactatatgaatgtatatgttgt 18640520  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| ||    
T  18640519 gaatacgatattttccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattattttatgttgttatattgtgatataattgta 18640420  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||     
T  18640419 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 18640321  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18640320 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 18640276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 18431159 - 18430710
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18431159 atgaaaactggtattgattggtacagaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatcttaggtttctaatgccgttggtttgacttcaa 18431060  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18431059 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtagaacatagtgaataattgaatctgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgt 18430960  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  18430959 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgta 18430860  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||  |||  ||||||  | ||||| |||     
T  18430859 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactg-ttgtgttgctgtt 18430761  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  18430760 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 18430710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 24702676 - 24702242
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702676 atgaaaactggtattggttggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaggttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 24702577  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||         ||||    
T  24702576 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattcatgaattagtatatgt---------ttgt 24702486  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  24702485 gaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgta 24702386  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||     
T  24702385 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 24702287  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24702286 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24702242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 24705123 - 24704692
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24705123 atgaaaactggtattggttggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaggttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 24705024  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||         ||||    
T  24705023 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattcatgaattagtatatgt---------ttgt 24704933  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  24704932 gaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgta 24704833  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtcg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| || || |  |||| ||||||  | ||||| ||| |    
T  24704832 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgtt--tttgtatactg-ttgtgttgctgttg 24704736  T
Q  401 ttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24704735 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24704692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 41 - 444
Target Start/End: Original strand, 11393041 - 11393445
Alignment:
Q  41 gtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcac 140  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  11393041 gtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaac 11393140  T
Q  141 gtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 239  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393141 gtaggtcatagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 11393240  T
Q  240 atatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393241 atatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt 11393340  T
Q  340 gttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgatt 438  Q
    ||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  11393341 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 11393439  T
Q  439 aagatg 444  Q
    ||||||    
T  11393440 aagatg 11393445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 13869796 - 13869350
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13869796 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaa 13869697  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13869696 aaggatttatagaacttgagttatggttaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 13869597  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattg-ttatattgtgatataatta 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||     
T  13869596 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgggatataattg 13869497  T
Q  299 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgtt 396  Q
    ||||||||| | ||  ||||| | |||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| |||||  || ||| | |    
T  13869496 tatatgcatcaattagattatctttgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-actgtgtcgct 13869398  T
Q  397 gtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13869397 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 13869350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 4 - 364
Target Start/End: Original strand, 26355699 - 26356061
Alignment:
Q  4 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 103  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26355699 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttatgtgttaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaag 26355798  T
Q  104 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaa 203  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  26355799 gatttatagaacttgagttatagtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgattaattagtatatgaatgtatatgttgtaaa 26355898  T
Q  204 tacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg--tatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattatat 301  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| |||    
T  26355899 tacgatattgtccataattgatgaagtgttatatgtatatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatattgtgatataattgtat 26355998  T
Q  302 atgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattat 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  26355999 atgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 26356061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 4 - 364
Target Start/End: Original strand, 26358151 - 26358513
Alignment:
Q  4 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 103  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26358151 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttatgtgttaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaag 26358250  T
Q  104 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaa 203  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  26358251 gatttatagaacttgagttatagtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgattaattagtatatgaatgtatatgttgtaaa 26358350  T
Q  204 tacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg--tatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattatat 301  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| |||    
T  26358351 tacgatattgtccataattgatgaagtgttatatgtatatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatattgtgatataattgtat 26358450  T
Q  302 atgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattat 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  26358451 atgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 26358513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 11303695 - 11303409
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11303695 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 11303596  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatat-gttg 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||    
T  11303595 aaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttg 11303496  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatatt 286  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11303495 tgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 11303409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 18628013 - 18627717
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18628013 atgaaaactgatattgattggcacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 18627914  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  18627913 aaggatttatagaacttgatttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgt 18627814  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataatt 297  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18627813 gaatacgatattttccgtgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattagtatttgatcttgttatattgtgatataatt 18627717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 16108403 - 16108688
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16108403 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgctgttggtttgacttcaa 16108502  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatat-gttg 199  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||    
T  16108503 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtacgtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttg 16108602  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatat 285  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  16108603 tgaatacaatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccgtttgatgttgttatat 16108688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 23664667 - 23664952
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23664667 atgaaaaatggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 23664766  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatat-gttg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||    
T  23664767 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattattgcatgtaggtcacagtgaagaattgttgatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttg 23664866  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatat 285  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  23664867 tgaatacgatattgtcaatgattgatgaaaggttatatgtatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 23664952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 29797058 - 29796771
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29797058 atgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 29796959  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatat-gttg 199  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||    
T  29796958 aagaatttatagaacttgagctatggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttg 29796859  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg--tatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatat 285  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  29796858 tgaatacgatattgtcaatgattgatgaagggttatatgtatatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 29796771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 29800877 - 29800590
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29800877 atgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 29800778  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatat-gttg 199  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||    
T  29800777 aagaatttatagaacttgagctatggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttg 29800678  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg--tatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatat 285  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  29800677 tgaatacgatattgtcaatgattgatgaagggttatatgtatatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 29800590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 14269671 - 14269909
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  14269671 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggttcgacttcaa 14269770  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14269771 aaggatttatagaaattgagttatggtcaaatttttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 14269870  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 238  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14269871 tgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 14269909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 8940731 - 8940489
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacac----gaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgact 96  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8940731 atgaaaactgctattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 8940632  T
Q  97 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8940631 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 8940532  T
Q  197 -ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 238  Q
     |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8940531 tttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 8940489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 15081556 - 15081794
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15081556 atgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 15081655  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15081656 aagaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtctaagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 15081755  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 238  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15081756 tgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 15081794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 164 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 11972780 - 11972500
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11972780 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgcccatgattgatgaagtgttacatgtatatatgatgttttaagatattga 11972681  T
Q  264 ttaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattatta 363  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  11972680 ttattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 11972581  T
Q  364 tatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    | ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11972580 tgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 11972500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 8469183 - 8468945
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  8469183 atgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatagatgttagttttctaatgacgttggtttgacttcaa 8469084  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  8469083 aaggatttatagaacttgagttatgatcaaattactgcatgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttt 8468984  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  8468983 tgaatacgatattgttcatgattgatgaaatgttatatg 8468945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 45847380 - 45847605
Alignment:
Q  12 tattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttata 111  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  45847380 tattgattggtacaaaattggtcttaggtataaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaactctgttagtttgacttcaaaatgatttata 45847479  T
Q  112 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgt-tgtgaatacgata 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45847480 gaacttgagttatggtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattggtatatgtatgtatatgtctgtgaatacgata 45847579  T
Q  211 ttgtccatgattgatgaagtgttata 236  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  45847580 ttgttcatgattgatgaagtgttata 45847605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 11972996 - 11972799
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972996 atgaaatctggtattgataggtccagaatttgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 11972897  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  11972896 aaggatctatagaacttgagttatagtcaaattactgtacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgcatatgtt 11972799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 164 - 336
Target Start/End: Original strand, 15081825 - 15081999
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgtt 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||    
T  15081825 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgtt 15081924  T
Q  262 gattaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 336  Q
    |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15081925 gattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagac 15081999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 8940923 - 8940769
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  8940923 atgaaaactggtattgattgatacataattggtcttaggtgtaaacaa-aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaa 8940825  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8940824 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 8940769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 38897749 - 38897904
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38897749 atgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaactcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacgtcaa 38897848  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38897849 aaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 38897904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 25926844 - 25926998
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  25926844 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttctaatgccattggtctgacgtcaa 25926943  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 155  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25926944 aaagagttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 25926998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 57 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 13841446 - 13841305
Alignment:
Q  57 taggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13841446 taggtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 13841347  T
Q  157 aattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13841346 aattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 13841305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 14269285 - 14269440
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||    
T  14269285 atgaaatctggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtttgatgtcaa 14269384  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14269385 aacgatttatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14269440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 156
Target Start/End: Original strand, 14156603 - 14156755
Alignment:
Q  4 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 103  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14156603 aaaactggtattgatcggtacagaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 14156702  T
Q  104 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  14156703 gatttatagaacttgacttatgatcaaattaccgcatgtaggtcacagtgaat 14156755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 10501108 - 10501263
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  10501108 atgaaaactggtattgattgatacagagttggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgtcgttggtttgacttcaa 10501207  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  10501208 atggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgaaggtcatagtgaat 10501263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 14156793 - 14156944
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14156793 atgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggt----acactaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 14156888  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14156889 aaggatttatagaacgtgagttatgttcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14156944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 256 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 13647521 - 13647344
Alignment:
Q  256 gatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcga 355  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||    
T  13647521 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 13647422  T
Q  356 tattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaag 432  Q
    ||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  13647421 tattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 13647344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 14269478 - 14269633
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  14269478 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgcctttggtatgacgtcaa 14269577  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||  ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  14269578 aaaaatttatagaacttgagttatcatcaaattattgcacgcaggtcagagtgaat 14269633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 16214317 - 16214170
Alignment:
Q  9 tggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 108  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  16214317 tggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaggttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgacgtcaaaaagattt 16214218  T
Q  109 atagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16214217 atagaacttgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 16214170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 150
Target Start/End: Original strand, 15081371 - 15081512
Alignment:
Q  9 tggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 108  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  15081371 tggtattgataggtccataattggtcttagaagtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgattt 15081470  T
Q  109 atagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaca 150  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15081471 atagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcaca 15081512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Original strand, 1856947 - 1857097
Alignment:
Q  4 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 103  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||     
T  1856947 aaaactggtattgattggtaccgaattggtcttaggtgtaaacacgaa-gttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcattggtctgacgtcaaaac 1857045  T
Q  104 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 155  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1857046 gatttatataacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 1857097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 8941117 - 8940962
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  8941117 atgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgaagtcaa 8941018  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  8941017 aatgatttatagaacttgagttatgctcaaactactgcacataggtcgcagtgaat 8940962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 13918117 - 13918272
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtctt-aggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||| |||    
T  13918117 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtctttaggtgtaaacacgaaaactgtaggtatgaatgttagctttctaattccattggtctgacgtca 13918216  T
Q  100 aaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 155  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13918217 aaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaa 13918272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 21189117 - 21189272
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  21189117 atgaaatctggtattgataggtcaacaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttttaatgccgttggtctgacgtcaa 21189216  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21189217 aacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcagagtgaat 21189272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 164 - 285
Target Start/End: Original strand, 14269940 - 14270061
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 263  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14269940 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 14270039  T
Q  264 ttaccatttgatattgttatat 285  Q
    |||  ||||||| |||||||||    
T  14270040 ttattatttgatgttgttatat 14270061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 123
Target Start/End: Original strand, 10500945 - 10501064
Alignment:
Q  4 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 103  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10500945 aaaactggtattgatcggtacagaattggtcttaggtgataacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 10501044  T
Q  104 gatttatagaacttgagtta 123  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  10501045 gatttatagaacttgagtta 10501064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 269 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 44116688 - 44116513
Alignment:
Q  269 atttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatca 368  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||    
T  44116688 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 44116589  T
Q  369 tgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    || ||  |||| |||||| || ||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44116588 tgttgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 44116513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 190 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 13841270 - 13841157
Alignment:
Q  190 gtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtg 289  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  13841270 gtatatgttttgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtg 13841171  T
Q  290 atataattatatat 303  Q
    |||||||| |||||    
T  13841170 atataattgtatat 13841157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 164 - 285
Target Start/End: Original strand, 38898106 - 38898229
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgtt 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||    
T  38898106 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgtt 38898205  T
Q  262 gattaccatttgatattgttatat 285  Q
    ||||| |||||||| |||||||||    
T  38898206 gattatcatttgatgttgttatat 38898229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 164 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 8940458 - 8940335
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgtt 261  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||    
T  8940458 tatgattgatgaattagtatatttatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgtt 8940359  T
Q  262 gattaccatttgatattgttatat 285  Q
    ||||| |||||||| |||||||||    
T  8940358 gattatcatttgatgttgttatat 8940335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 269 - 444
Target Start/End: Original strand, 17061898 - 17062073
Alignment:
Q  269 atttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatca 368  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||| |||    
T  17061898 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgctgacttgcatttgatattattatgtca 17061997  T
Q  369 tgatggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    || |  |||| |||||| ||  |||| || | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17061998 tgctattttgtatactg-ctgagttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17062073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 17985099 - 17985254
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||  |||||||||| | |||    
T  17985099 atgaaatctggtattgatcggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtaaggatgttaaatttctaatggagttggtttgattccaa 17985198  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || ||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  17985199 aatgatatttagaacttgagttatagtcaaattactacacgtaggtcatagtgaat 17985254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 299 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 24275320 - 24275162
Alignment:
Q  299 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttg 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| |||||| || ||||| ||    
T  24275320 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg 24275222  T
Q  398 tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 457  Q
    | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  24275221 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgttgattatgt 24275162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 280 - 436
Target Start/End: Original strand, 2280068 - 2280225
Alignment:
Q  280 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgc 379  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  2280068 ttataatgtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatcatgctgttttgc 2280167  T
Q  380 atactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttga 436  Q
    |||||||||||||||||| | |||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  2280168 atactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 2280225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 269 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 16495581 - 16495403
Alignment:
Q  269 atttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatca 368  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16495581 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatca 16495486  T
Q  369 tgatggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||| || | |||||| |||||    
T  16495485 tgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 16495403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 278 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 3386503 - 3386337
Alignment:
Q  278 tgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtt 376  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| || ||||| ||  ||    
T  3386503 tgttatattgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatcatgtcatgctgtttt 3386404  T
Q  377 tgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    || |||||   | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3386403 tgtatact-attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 3386337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 190 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 8468898 - 8468803
Alignment:
Q  190 gtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatat 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  8468898 gtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttatgatgttgattattatttgatgttgttatat 8468803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 280 - 450
Target Start/End: Original strand, 19486693 - 19486864
Alignment:
Q  280 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgc 379  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||| | |||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  19486693 ttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttttgc 19486792  T
Q  380 atactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||||||||||||||| || || |||  |||||||| |||||||||| ||| |||| | | ||||||||||||    
T  19486793 atactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatg 19486864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 329 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 67868 - 67746
Alignment:
Q  329 attgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagt 427  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||| ||    
T  67868 attgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 67769  T
Q  428 ctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  67768 ctaagttgattaagatgatgatg 67746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 286 - 444
Target Start/End: Original strand, 18456368 - 18456526
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactg 385  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||    
T  18456368 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactg 18456467  T
Q  386 cctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18456468 cctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 18456526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 337 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 34200901 - 34200787
Alignment:
Q  337 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttg 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  34200901 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 34200802  T
Q  436 attaagatgttgatg 450  Q
     | |||||| |||||    
T  34200801 ttgaagatgatgatg 34200787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 337 - 450
Target Start/End: Original strand, 11996033 - 11996147
Alignment:
Q  337 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttg 435  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  11996033 gttgttgatttacattcaatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttg 11996132  T
Q  436 attaagatgttgatg 450  Q
     | |||||| |||||    
T  11996133 ttgaagatgatgatg 11996147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 271 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 20110723 - 20110560
Alignment:
Q  271 ttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatg 370  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||| |||||    
T  20110723 ttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatg 20110624  T
Q  371 atggtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
     || |||          | | | | ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20110623 ctgtttt----------tgtatagctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 20110560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 156
Target Start/End: Original strand, 45847213 - 45847331
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45847213 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttaactttctaatgtcgttggtatgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 45847312  T
Q  138 cacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |||||||||||||||||||    
T  45847313 cacgtaggtcacagtgaat 45847331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 164 - 265
Target Start/End: Original strand, 45847638 - 45847739
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 262  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45847638 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatatgatg-tttaagatgttg 45847736  T
Q  263 att 265  Q
    |||    
T  45847737 att 45847739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 286 - 444
Target Start/End: Original strand, 3564319 - 3564478
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatact 384  Q
    |||||| ||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | |||||    
T  3564319 tgtgatctaatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 3564418  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  3564419 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 3564478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 337 - 450
Target Start/End: Original strand, 15754893 - 15755007
Alignment:
Q  337 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgtt-gtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttg 435  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15754893 gttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggtttgcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 15754992  T
Q  436 attaagatgttgatg 450  Q
     | |||||| |||||    
T  15754993 ttgaagatgatgatg 15755007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 269 - 370
Target Start/End: Original strand, 12756654 - 12756755
Alignment:
Q  269 atttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatca 368  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||| |||    
T  12756654 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtca 12756753  T
Q  369 tg 370  Q
    ||    
T  12756754 tg 12756755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 277 - 444
Target Start/End: Original strand, 38898367 - 38898535
Alignment:
Q  277 ttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttacattcgatattattatatcatgatg-g 374  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| || |||| ||||||||||| ||||| ||      
T  38898367 ttgttatactgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 38898466  T
Q  375 tttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||  |||||| || ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  38898467 tttatatactg-ctgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 38898535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 339 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 44014291 - 44014192
Alignment:
Q  339 tgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 437  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  44014291 tgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 44014192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 330 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 22073036 - 22072914
Alignment:
Q  330 ttgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcagt 427  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  22073036 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagt 22072937  T
Q  428 ctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  22072936 ctaagttgattaagatgatgatg 22072914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 337 - 450
Target Start/End: Original strand, 28505304 - 28505418
Alignment:
Q  337 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttg 435  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  28505304 gttgctgatttatatccgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 28505403  T
Q  436 attaagatgttgatg 450  Q
    || |||||| |||||    
T  28505404 atgaagatgatgatg 28505418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 280 - 429
Target Start/End: Original strand, 12255740 - 12255892
Alignment:
Q  280 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggttt 377  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||  |||||| ||||| || || |||| |||||| |||||||||||  || |||    
T  12255740 ttataatgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgtagaatttcatttgatattgttatatcatgaattgattt 12255839  T
Q  378 gcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtct 429  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  12255840 gcatactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 311 - 450
Target Start/End: Original strand, 10063798 - 10063938
Alignment:
Q  311 ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaac 409  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||   ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| || | |||| |||||    
T  10063798 ttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgtgttcgatattattatatcatgatgttgtgcataccgcctatgttgctgattgttaattaac 10063897  T
Q  410 taagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||    
T  10063898 taagttgcatgagtcagtctaagtcgttgaaggtgttgatg 10063938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 38227646 - 38227482
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactg 385  Q
    ||||||||||| |||| | ||||| ||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||    
T  38227646 tgtgatataatgatatgtacattaattgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactg 38227547  T
Q  386 cctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||    
T  38227546 cctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagatgaagatgatgatg 38227482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 238
Target Start/End: Original strand, 38897995 - 38898075
Alignment:
Q  159 ttgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38897995 ttgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 38898075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 349 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 47831910 - 47831808
Alignment:
Q  349 cattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttg 447  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  47831910 cattcgatattgttatatcatgatgatatgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 47831811  T
Q  448 atg 450  Q
    |||    
T  47831810 atg 47831808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 290 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 18005806 - 18005660
Alignment:
Q  290 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgccta 389  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||    
T  18005806 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttccatactgctta 18005709  T
Q  390 tgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 437  Q
    ||||| || | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  18005708 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18005660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 69 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 11310327 - 11310239
Alignment:
Q  69 ttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaata 157  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11310327 ttagctttctaatgccattggtttgacgtctaaatgaattatataacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcagagtgaata 11310239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 12698998 - 12698832
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgg--tttgcatac 383  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || || | ||||||||||| ||||| ||   |||| ||||    
T  12698998 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatac 12698899  T
Q  384 tgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  12698898 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 12698832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 290 - 436
Target Start/End: Original strand, 16219677 - 16219823
Alignment:
Q  290 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgccta 389  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| |  || ||| |||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16219677 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttaagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgccta 16219775  T
Q  390 tgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttga 436  Q
    |||||||| | |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  16219776 tgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttga 16219823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 349 - 437
Target Start/End: Original strand, 811149 - 811238
Alignment:
Q  349 cattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttg-ttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 437  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  811149 cattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 811238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 9509355 - 9509190
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggt-ttgcatact 384  Q
    ||||||||| |  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || || | ||||||||||| ||||| || | ||| |||||    
T  9509355 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatact 9509256  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  9509255 gcctatgttactgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 9509190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 280 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 26212168 - 26212012
Alignment:
Q  280 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 378  Q
    ||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  26212168 ttataatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttg 26212069  T
Q  379 catactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttg 435  Q
     ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  26212068 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttg 26212012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 329 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 48273512 - 48273396
Alignment:
Q  329 attgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagt 427  Q
    ||||||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  48273512 attgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggt 48273413  T
Q  428 ctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||||||    
T  48273412 ctaagttgattaagatg 48273396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 322 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 13831499 - 13831377
Alignment:
Q  322 gtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatg 420  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||| ||||| || ||| | ||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13831499 gtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgttgtttttgtatactaccg-tgttgttgttgttatttaactaagctgcatg 13831401  T
Q  421 agtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||| |||||| ||||||||||||    
T  13831400 agtcggtctaaattgattaagatg 13831377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 269 - 436
Target Start/End: Original strand, 1867932 - 1868101
Alignment:
Q  269 atttgatattgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatc 367  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||    
T  1867932 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttcatttgcatt-gatattgttatatc 1868029  T
Q  368 atga--tggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttga 436  Q
    ||||  || |||  |||||||||||||||||| | |||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  1868030 atgagctgttttatatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 1868101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 290 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 16056488 - 16056343
Alignment:
Q  290 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgccta 389  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| |  |||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||| || |||||||| || |||    
T  16056488 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttg-tttgcataatgtcta 16056391  T
Q  390 tgttgttgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttga 436  Q
    ||||| |||  |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  16056390 tgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggtctaagttga 16056343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 156
Target Start/End: Original strand, 15376272 - 15376390
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  15376272 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 15376371  T
Q  138 cacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |||||||||||||||||||    
T  15376372 cacgtaggtcacagtgaat 15376390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 156
Target Start/End: Original strand, 20384682 - 20384800
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  20384682 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 20384781  T
Q  138 cacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |||||||||||||||||||    
T  20384782 cacgtaggtcacagtgaat 20384800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 39 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 11287073 - 11286976
Alignment:
Q  39 gtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  11287073 gtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgtcttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 11286976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 126034 - 125965
Alignment:
Q  67 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  126034 tgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgagttttagaacttgagttatgatcaaattact 125965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 400 - 444
Target Start/End: Original strand, 14932804 - 14932848
Alignment:
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14932804 gttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 14932848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 424
Target Start/End: Original strand, 15008436 - 15008593
Alignment:
Q  269 atttgatattgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatc 367  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||  ||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  15008436 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatg-atgtttgaggtgttgttgatttgcatt-gatattgttatatc 15008533  T
Q  368 atga--tggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtc 424  Q
    ||||  || |||  ||||| |||||||||||| | |||  ||||||||| ||||||||||    
T  15008534 atgaactgttttatatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtc 15008593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 400 - 444
Target Start/End: Original strand, 15356239 - 15356283
Alignment:
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15356239 gttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 15356283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 400 - 444
Target Start/End: Original strand, 15360353 - 15360397
Alignment:
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15360353 gttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 15360397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 383 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 15211525 - 15211450
Alignment:
Q  383 ctgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttg-attaagatgttgatgatgatgt 457  Q
    ||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  15211525 ctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatgagtcagtccatgttgaattaagatgttgatgttgatgt 15211450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 16410583 - 16410544
Alignment:
Q  117 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410583 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 16410544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 18628090 - 18628051
Alignment:
Q  117 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18628090 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 18628051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 18640796 - 18640757
Alignment:
Q  117 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640796 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 18640757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 59
Target Start/End: Original strand, 23461813 - 23461864
Alignment:
Q  8 ctggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 59  Q
    ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23461813 ctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 23461864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 156
Target Start/End: Original strand, 26355619 - 26355658
Alignment:
Q  117 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26355619 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 26355658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 156
Target Start/End: Original strand, 26358071 - 26358110
Alignment:
Q  117 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26358071 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 26358110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Original strand, 20220127 - 20220290
Alignment:
Q  269 atttgatattgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatc 367  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||  ||||||   ||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  20220127 atttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgaga---tgttgatttgcatttgatattgttatatc 20220222  T
Q  368 atga--tggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaag 432  Q
    ||||  || |||   ||||||||||||||||| | |||  ||||||||| || ||||||| |||||||    
T  20220223 atgaactgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgtatgagtcggtctaag 20220290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 27217464 - 27217346
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||  | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    ||||||||||||||||||||     
T  27217464 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattacta 27217365  T
Q  138 cacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27217364 cacgtaggtcacagtgaat 27217346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 7822122 - 7822013
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||     
T  7822122 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 7822023  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    ||||||||||    
T  7822022 tcaaattact 7822013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 7829433 - 7829324
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||     
T  7829433 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 7829334  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    ||||||||||    
T  7829333 tcaaattact 7829324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Original strand, 27102512 - 27102621
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||     
T  27102512 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 27102611  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    ||||||||||    
T  27102612 tcaaattact 27102621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Original strand, 27109860 - 27109969
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||     
T  27109860 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 27109959  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    ||||||||||    
T  27109960 tcaaattact 27109969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 27175814 - 27175705
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||     
T  27175814 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 27175715  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    ||||||||||    
T  27175714 tcaaattact 27175705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Original strand, 38784604 - 38784713
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||     
T  38784604 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 38784703  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    ||||||||||    
T  38784704 tcaaattact 38784713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 136
Target Start/End: Original strand, 15951607 - 15951703
Alignment:
Q  40 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    |||||||||||||||| ||| ||    || ||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  15951607 tgtaaacacgaaagttttagataattttggtagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgattaaattact 15951703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Original strand, 16386292 - 16386368
Alignment:
Q  375 tttgcatactgcctatgttgttgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  16386292 tttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 16386368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 243
Target Start/End: Original strand, 13745569 - 13745648
Alignment:
Q  165 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttg-tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatat 243  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||| ||||| | ||||||| ||||    
T  13745569 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattaatgaattattatatgaatat 13745648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 13869872 - 13869833
Alignment:
Q  117 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13869872 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 13869833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 15113114 - 15113028
Alignment:
Q  280 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatc 367  Q
    ||||| |||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||| || |||| |||||| |||||||    
T  15113114 ttataatgtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaat-attgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 15113028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 238
Target Start/End: Original strand, 15119918 - 15119993
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttg-tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 238  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||| | |||||||    
T  15119918 tatgatttatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatg 15119993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 286 - 436
Target Start/End: Original strand, 15143993 - 15144143
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggt-ttgcatact 384  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||||| ||||||   || ||| |||||| |||||||  || |||| |||||||| ||||| || || | |||||||||    
T  15143993 tgtgatatgatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatacttgagatgttgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgttattgcatact 15144092  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttga 436  Q
    |   |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  15144093 gag-atgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 15144143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 456925 - 456807
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| ||| |||| ||||| |||| || || | |    ||||||| |||||||||||||    
T  456925 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccaatggcgtcggttggacttgaaaatgaattttggtttatgagttaaggtcaaattactg 456826  T
Q  138 cacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  456825 cacgtaggtcacattgaat 456807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 11310202 - 11310133
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtta 71  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||| |||||||    
T  11310202 atgaaaactg-tattgataagtacataattggtcttaggtgttttcacaaaagttgtaggtatagatgtta 11310133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 124
Target Start/End: Original strand, 16202766 - 16202852
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 124  Q
    ||||||||||  |||||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||  | ||||| ||||| |||||||||    
T  16202766 ggtgtaaacataaaagttgtaggtagtgatgttagatttctaatggctttggttttacttcatgatgatttctagaatttgagttat 16202852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 444
Target Start/End: Original strand, 26356098 - 26356152
Alignment:
Q  390 tgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26356098 tgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaagatg 26356152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 444
Target Start/End: Original strand, 26358550 - 26358604
Alignment:
Q  390 tgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26358550 tgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaagatg 26358604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 136
Target Start/End: Original strand, 32495062 - 32495160
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||   | |||| |||||||||| | |||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  32495062 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttatctttctaatggctttggtttgatgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcatattact 32495160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 136
Target Start/End: Original strand, 15760779 - 15760848
Alignment:
Q  67 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  15760779 tgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 15760848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 118
Target Start/End: Original strand, 10000996 - 10001076
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttg 118  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||    
T  10000996 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatgactttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttg 10001076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 375 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 10589115 - 10589055
Alignment:
Q  375 tttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttg 435  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  10589115 tttgtatactgcatatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttg 10589055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 20110779 - 20110747
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 59  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110779 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 20110747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 400 - 451
Target Start/End: Original strand, 2832511 - 2832562
Alignment:
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatga 451  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||| ||||||    
T  2832511 gttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatga 2832562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 15116651 - 15116565
Alignment:
Q  280 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatc 367  Q
    ||||| |||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||| || || | |||||| |||||||    
T  15116651 ttataatgtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaat-attgagatgttgatgacttgcaattgatattgttatatc 15116565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 426 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 16213653 - 16213622
Alignment:
Q  426 gtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16213653 gtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 16213622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 214
Target Start/End: Original strand, 9743795 - 9743845
Alignment:
Q  165 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttg-tgaatacgatattgt 214  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  9743795 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatattgt 9743845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 239 - 285
Target Start/End: Original strand, 25927238 - 25927283
Alignment:
Q  239 tatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatat 285  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25927238 tatatatgatgttt-aagttgttgattatcatttgatattgttatat 25927283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 108
Target Start/End: Original strand, 10896371 - 10896452
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 108  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||    
T  10896371 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgattt 10896452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 285
Target Start/End: Original strand, 10896716 - 10896745
Alignment:
Q  256 gatgttgattaccatttgatattgttatat 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10896716 gatgttgattaccatttgatattgttatat 10896745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 15167317 - 15167288
Alignment:
Q  256 gatgttgattaccatttgatattgttatat 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15167317 gatgttgattaccatttgatattgttatat 15167288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 383 - 444
Target Start/End: Original strand, 18154894 - 18154955
Alignment:
Q  383 ctgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||| | | |||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  18154894 ctgcctatgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatg 18154955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 96
Target Start/End: Original strand, 23664500 - 23664569
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgact 96  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | || ||||||||    
T  23664500 aattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttagtttgact 23664569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 29004485 - 29004416
Alignment:
Q  39 gtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 108  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  29004485 gtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgattt 29004416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 82
Target Start/End: Original strand, 13475728 - 13475772
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 82  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  13475728 ggtgtaaacacaaaggttgtaggtatgtatgttagctttccaatg 13475772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 27 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 15167650 - 15167530
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||||| |||| || || |||   ||||||||||     
T  15167650 aattggactttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatga 15167551  T
Q  127 tcaaattactgcacgtaggtc 147  Q
    | ||| |||| || |||||||    
T  15167550 tgaaaatactccaagtaggtc 15167530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25941571 - 25941523
Alignment:
Q  165 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttg-tgaatacgatatt 212  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  25941571 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatatt 25941523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 38294631 - 38294567
Alignment:
Q  165 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaa 228  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||||||| | ||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  38294631 atgattgatgaattattctatgaatgtatatgttggcgaatatgatgttgttcatgattgatgaa 38294567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 341; Significance: 0; HSPs: 129)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Original strand, 15118067 - 15118510
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118067 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 15118166  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15118167 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgt 15118266  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  15118267 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgta 15118366  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||     
T  15118367 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 15118465  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15118466 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 15118510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 14970421 - 14970878
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14970421 atgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 14970520  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  14970521 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttg 14970620  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattat 299  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14970621 tgaatacgatattgttcataattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattat 14970720  T
Q  300 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgt 398  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||| || || | ||| |||    
T  14970721 atatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatattg-ctgttttgctgt 14970819  T
Q  399 cgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 457  Q
     |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14970820 tgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaaaatgttgatgatgatgt 14970878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 3515455 - 3515011
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3515455 atgaaaactggtattgatcggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 3515356  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtata-tgttg 199  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||    
T  3515355 aatgatttatagaacttgagctatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattattatatgtatgtatatttttg 3515256  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattat 299  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3515255 tgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattat 3515156  T
Q  300 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgt 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| || || ||  |||| |||||| || ||||| |||    
T  3515155 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgt 3515057  T
Q  399 cgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
     ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3515056 tgttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 3515011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Original strand, 50222054 - 50222497
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50222054 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagatgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 50222153  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50222154 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgt 50222253  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  50222254 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatattgttatactgtgatataattgta 50222353  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||| ||  | ||||| |||     
T  50222354 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataatg-ttgtgttgctgtt 50222452  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50222453 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 50222497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 44615736 - 44615292
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615736 atgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaatttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 44615637  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  44615636 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 44615537  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| |    
T  44615536 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgt 44615437  T
Q  300 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgt 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||    
T  44615436 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactg-ttgtgttgctgt 44615338  T
Q  399 cgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
     |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44615337 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 44615292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Original strand, 44772798 - 44773245
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44772798 atgaaaactggtatttattggtagagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 44772897  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  44772898 aaagatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatacgaatgtatatgttgt 44772997  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg----tatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44772998 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatatatgatattttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataat 44773097  T
Q  297 tatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgt 395  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | |||||     
T  44773098 tgtatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgc 44773196  T
Q  396 tgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44773197 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 44773245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 3 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 19243146 - 19242703
Alignment:
Q  3 gaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  19243146 gaaaactggtattgattggtacagaattagtcttaggtataaacaagaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaa 19243047  T
Q  103 ggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtg 201  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19243046 cgatttatagaacttgagttatggttaaattactgaacgtaggtcatagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtg 19242947  T
Q  202 aatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattg-ttatattgtgatataattata 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||    
T  19242946 aatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttggagttgtttatattgtgatataattata 19242847  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||| | |||     
T  19242846 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgtt 19242748  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19242747 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 19242703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Original strand, 1837234 - 1837667
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1837234 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttaaa 1837333  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||    
T  1837334 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaatta----------gtatatgttgt 1837423  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||  ||    
T  1837424 gaaaacgatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttataatgtgatataatcgta 1837523  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||     
T  1837524 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 1837622  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1837623 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 1837667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Original strand, 7640901 - 7641340
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  7640901 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccattggtttcacttcaa 7641000  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  7641001 aaggatttatagaacttgagttatagttaaattactgcctgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaatgagtatatgaatgtatatgttgt 7641100  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgt------tatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatata 294  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||      ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  7641101 gaatacgatatttttcatgattgatgaagtgttatatatatatatatatatgatattttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatata 7641200  T
Q  295 attatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttg 394  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || |||          | |||||    
T  7641201 attgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt----------tgtgttg 7641290  T
Q  395 ttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
     ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7641291 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 7641340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 15534629 - 15534343
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15534629 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 15534530  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatat-gttg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||    
T  15534529 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttg 15534430  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatatt 286  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15534429 tgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 15534343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 36038318 - 36038033
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36038318 atgaaaactggtattgattggtacagaattggccttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtttgacttcaa 36038219  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatat-gttg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||    
T  36038218 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaagatatgtatgtatatatttg 36038119  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatat 285  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36038118 tgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 36038033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 49547488 - 49547773
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49547488 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaatttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 49547587  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatat-gttg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||    
T  49547588 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaagaattatttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttg 49547687  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatat 285  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  49547688 tgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatctatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgttatat 49547773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 52872787 - 52873025
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52872787 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgctagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 52872886  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  52872887 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 52872986  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 238  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  52872987 tgaatacgatattgttcatgattgatgatgtgttatatg 52873025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 164 - 457
Target Start/End: Original strand, 19618050 - 19618343
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 263  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19618050 tatgattgatgaattggtatatgtatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 19618149  T
Q  264 ttaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattatta 363  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  19618150 ttaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattataggtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 19618249  T
Q  364 tatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 457  Q
    | ||||||||  |||| |||||| || ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19618250 tgtcatgatgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgataatgt 19618343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 14049025 - 14048740
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14049025 atgaaaactagtattgattggtacataattggttttaggtgtaaacatgaaagttgtgggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 14048926  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||    
T  14048925 aaggatttacagaacttgtgttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgataaattaatatatgtatgtatatgtttg 14048826  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatat 285  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14048825 tgaatacgatattgtcaatgattgatgaggtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 14048740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 117 - 444
Target Start/End: Original strand, 18239250 - 18239577
Alignment:
Q  117 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtcc 216  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18239250 tgagttattgtcaaattacttcacgtaggtcacagtgaatttttgaatatgattgatgaatgagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtcc 18239349  T
Q  217 atgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  18239350 atgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaat 18239449  T
Q  317 tatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagtt 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | || || ||| |||||||||||||| |    
T  18239450 tatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgctgctgttgttatttaactaagct 18239548  T
Q  416 gcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18239549 gcatgagtcggtctaagttgattaagatg 18239577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 164 - 444
Target Start/End: Original strand, 18215152 - 18215432
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215152 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 18215251  T
Q  264 ttaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattatta 363  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  18215252 ttatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 18215351  T
Q  364 tatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    | ||||| ||  |||| |||||| || ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18215352 tgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 18215432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 362628 - 362390
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  362628 atgaaaactggtattgattgatacaaaattagtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttagtttgacttcaa 362529  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  362528 aacgatttatagaacttgatttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 362429  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 238  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  362428 tgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 362390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29267801 - 29267570
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29267801 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctattgccgttggtttgacttcaa 29267702  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29267701 aaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 29267602  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtg 231  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29267601 cgaatacgatattgtccatgattgatgaagtg 29267570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 164 - 444
Target Start/End: Original strand, 12185 - 12465
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12185 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 12284  T
Q  264 ttaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattatta 363  Q
    |||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  12285 ttattattggatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 12384  T
Q  364 tatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    | ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12385 tgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 164 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 52312794 - 52312514
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312794 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattaatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 52312695  T
Q  264 ttaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattatta 363  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  52312694 ttattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 52312595  T
Q  364 tatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    | ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52312594 tgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 52312514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 15495888 - 15496126
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |    
T  15495888 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttaaattcga 15495987  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||     
T  15495988 aaggttttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaagtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttc 15496087  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 238  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15496088 tgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 15496126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 19617781 - 19618019
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  19617781 atgaaaactggtattgattggtacagagttggtcttaggtgttaacacaaaagttataggtatggatgttagctttctaatgctgttggtgtgacttcaa 19617880  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19617881 aaggatttatagaagttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 19617980  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 238  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19617981 tgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 19618019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 164 - 448
Target Start/End: Original strand, 15355202 - 15355487
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355202 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaaatgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 15355301  T
Q  264 ttaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttacattcgatattatt 362  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||    
T  15355302 ttattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatt 15355401  T
Q  363 atatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttga 448  Q
    || ||||| ||  |||| |||||| || ||| | ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15355402 atgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttga 15355487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19858026 - 19857798
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19858026 atgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 19857927  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||    
T  19857926 aataatttatagaacttgatttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgt---------ttgt 19857836  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 238  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19857835 gaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 19857798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 14746226 - 14746464
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  14746226 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttcggtgtaaggacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgactttaa 14746325  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  14746326 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattaaatatgattgatgaattagtatatatatgtatatgtttg 14746425  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 238  Q
    ||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  14746426 tgaatactattatgttcatgattgatgaagtgttatatg 14746464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 11969 - 12166
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11969 atgaaatctggtattgataggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatcaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 12068  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12069 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 12166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 52313009 - 52312813
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52313009 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggttttacttcaa 52312910  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52312909 aaggatttatagaacttgagttatagtc-aattactgcacgcaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 52312813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 52872594 - 52872749
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||    
T  52872594 atgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattctgttggtctgacgtcaa 52872693  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52872694 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 52872749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 362821 - 362668
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  362821 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacatcaa 362722  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtga 154  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  362721 aaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtga 362668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 14970228 - 14970383
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  14970228 atgaaaactggtattgatttgtacacaattggtcttaggtgataacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaa 14970327  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14970328 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14970383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 18214725 - 18214880
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  18214725 atgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaa 18214824  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18214825 aacgatttatagaacttgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 18214880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 19617588 - 19617743
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||    
T  19617588 atgaaatctggtattgattggtacataattggtcttaggtgtagacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctaacgccaa 19617687  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19617688 aatgatttattgaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 19617743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 3515648 - 3515493
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  3515648 atgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggcgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctcacgtcaa 3515549  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3515548 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 3515493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 14746033 - 14746188
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  14746033 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 14746132  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  14746133 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagatcatagtgaat 14746188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 19858219 - 19858064
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  19858219 atgaaaaatggtattgattggtacagaattggtcttaggtgcaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 19858120  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19858119 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaat 19858064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 52313395 - 52313240
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| |||  | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  52313395 atgaaatctggtattgataggtcaagaattgatcttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaa 52313296  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52313295 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 52313240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 363006 - 362859
Alignment:
Q  9 tggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 108  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||    
T  363006 tggtattgatttgtatagaattggtcttaggtgtaaacccgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaaagattt 362907  T
Q  109 atagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  362906 atagaatttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 362859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 110 - 238
Target Start/End: Original strand, 18214992 - 18215121
Alignment:
Q  110 tagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacga 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  18214992 tagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttattaatacga 18215091  T
Q  209 tattgtccatgattgatgaagtgttatatg 238  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18215092 tattgttcatgattgatgaagtgttatatg 18215121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 256 - 444
Target Start/End: Original strand, 51463838 - 51464026
Alignment:
Q  256 gatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcga 355  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  51463838 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 51463937  T
Q  356 tattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||||||| ||||| ||  |||| |||||  || ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51463938 tattattatgtcatgctgtttttgtatact-actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 51464026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 52313202 - 52313047
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  52313202 atgaaatctggtattgataggtccagaattgatcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgcctttggtatgacgtcaa 52313103  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52313102 aacgatttatagaacttgatttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 52313047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 156
Target Start/End: Original strand, 15495716 - 15495850
Alignment:
Q  22 tacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagt 121  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  15495716 tacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagt 15495815  T
Q  122 tatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15495816 tatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15495850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 256 - 444
Target Start/End: Original strand, 23803235 - 23803423
Alignment:
Q  256 gatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcga 355  Q
    |||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||    
T  23803235 gatgttgattatgattttatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttgttgatttgcatttga 23803334  T
Q  356 tattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||||||| ||||| ||  |||| |||||  || ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23803335 tattattatgtcatgctgtttttgtatact-actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 23803423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 256 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 12611135 - 12610954
Alignment:
Q  256 gatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcga 355  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  12611135 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 12611036  T
Q  356 tattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||||||| ||||| || |||      ||  | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12611035 tattattatgtcatgctgtttt------tg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12610954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 164 - 285
Target Start/End: Original strand, 15496949 - 15497070
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15496949 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 15497048  T
Q  264 ttaccatttgatattgttatat 285  Q
    |||  ||||||| |||||||||    
T  15497049 ttattatttgatgttgttatat 15497070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 164 - 284
Target Start/End: Original strand, 52873056 - 52873176
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 263  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52873056 tatgattgatgaattaatatacgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 52873155  T
Q  264 ttaccatttgatattgttata 284  Q
    |||  ||||||| ||||||||    
T  52873156 ttattatttgatgttgttata 52873176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 46 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 14185731 - 14185621
Alignment:
Q  46 cacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagg 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  14185731 cacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacgtcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattattgaacgtagg 14185632  T
Q  146 tcacagtgaat 156  Q
    |||||||||||    
T  14185631 tcacagtgaat 14185621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 30147363 - 30147189
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |  ||   |||| | ||||| ||||  |||    
T  30147363 atgaaaaatggaattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaagtatggatataaaattaaaaatgacattggtatgacaacaa 30147264  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatga 175  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30147263 aaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatga 30147189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 269 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 44102393 - 44102218
Alignment:
Q  269 atttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatca 368  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||| |||    
T  44102393 atttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtca 44102294  T
Q  369 tgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    || ||  |||| |||||  || |||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44102293 tgctgtttttgtatact-actgtgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 44102218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 280 - 444
Target Start/End: Original strand, 44928873 - 44929038
Alignment:
Q  280 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttg 378  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||| || |||||||| ||||| ||  ||||    
T  44928873 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttg 44928972  T
Q  379 catactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
     ||||||| | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44928973 tatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 44929038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 164 - 285
Target Start/End: Original strand, 14746495 - 14746618
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgtt 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||    
T  14746495 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgcgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgtt 14746594  T
Q  262 gattaccatttgatattgttatat 285  Q
    ||||| |||||||| |||||||||    
T  14746595 gattatcatttgatgttgttatat 14746618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 136 - 238
Target Start/End: Original strand, 15355068 - 15355171
Alignment:
Q  136 tgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgtta 234  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15355068 tgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatatatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgtta 15355167  T
Q  235 tatg 238  Q
    ||||    
T  15355168 tatg 15355171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 269 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 15367873 - 15367691
Alignment:
Q  269 atttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttacattcgatattattatatc 367  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||| ||    
T  15367873 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 15367774  T
Q  368 atgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||| ||  |||| ||||||  | ||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  15367773 atgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 15367691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 269 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 15402886 - 15402704
Alignment:
Q  269 atttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttacattcgatattattatatc 367  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||| ||    
T  15402886 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 15402787  T
Q  368 atgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||| ||  |||| ||||||  | ||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  15402786 atgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 15402704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Original strand, 21815568 - 21815731
Alignment:
Q  269 atttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatca 368  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||| |||    
T  21815568 atttgatgttgttatattatgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtca 21815667  T
Q  369 tgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaag 432  Q
    || ||  |||| |||| |  | ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  21815668 tgctgtttttgtatacag-ttgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaag 21815731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 280 - 436
Target Start/End: Original strand, 52243143 - 52243302
Alignment:
Q  280 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggttt 377  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| |||||||| || |||| |||||| |||||||||||  || |||    
T  52243143 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgagatgttgttgaatttcatttgatattgttatatcatgaactgattt 52243242  T
Q  378 gcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttga 436  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  52243243 gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52243302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 269 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 15371385 - 15371203
Alignment:
Q  269 atttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttacattcgatattattatatc 367  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||| ||||||||||| ||    
T  15371385 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtc 15371286  T
Q  368 atgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||| ||  |||| ||||||  | ||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  15371285 atgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 15371203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 269 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 15373666 - 15373484
Alignment:
Q  269 atttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttacattcgatattattatatc 367  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||| ||||||||||| ||    
T  15373666 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtc 15373567  T
Q  368 atgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||| ||  |||| ||||||  | ||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  15373566 atgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 15373484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 286 - 443
Target Start/End: Original strand, 16377478 - 16377634
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactg 385  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||    
T  16377478 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-tttgtatactg 16377576  T
Q  386 cctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagat 443  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  16377577 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 16377634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 277 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 20150001 - 20149833
Alignment:
Q  277 ttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttacattcgatattattatatcatgatg-g 374  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||| ||||||||||| ||||| ||      
T  20150001 ttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 20149902  T
Q  375 tttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||| ||||||  | ||| | ||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20149901 tttgtatactg-atgtgtcgctgttgttattttatcaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 20149833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 272 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 16223712 - 16223533
Alignment:
Q  272 tgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttacattcgatattattatatcatg 370  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||| |||||    
T  16223712 tgatgttgttatattgtgatataattgtatatgggttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcattagatattattatgtcatg 16223613  T
Q  371 atg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
     ||  |||| ||||||  | ||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  16223612 ctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 16223533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 190 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 362343 - 362268
Alignment:
Q  190 gtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 265  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  362343 gtatatgttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 362268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 269 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 15370200 - 15370019
Alignment:
Q  269 atttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttacattcgatattattatatc 367  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||| ||    
T  15370200 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgt-agttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 15370102  T
Q  368 atgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||| ||  |||| ||||||  | ||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  15370101 atgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 15370019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 337 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 15551932 - 15551818
Alignment:
Q  337 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttg 435  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15551932 gttgttgatttaccttcgatattattatatcatgatggattgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15551833  T
Q  436 attaagatgttgatg 450  Q
     | |||||| |||||    
T  15551832 ttgaagatgatgatg 15551818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 38 - 156
Target Start/End: Original strand, 22725284 - 22725401
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22725284 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttctaat-ccgttggtttgacatcaaaatgatttataggacttgagttatggtcaaattactg 22725382  T
Q  138 cacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  22725383 cacgtaggtcacactgaat 22725401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 349 - 450
Target Start/End: Original strand, 39706306 - 39706408
Alignment:
Q  349 cattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttg 447  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  39706306 cattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 39706405  T
Q  448 atg 450  Q
    |||    
T  39706406 atg 39706408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 280 - 432
Target Start/End: Original strand, 13800 - 13953
Alignment:
Q  280 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgc 379  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||| || |||| |||||| |||||||||| || |||||    
T  13800 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgc 13899  T
Q  380 atactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaag 432  Q
    ||||||||||||||| || | |||  ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  13900 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 277 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 22354008 - 22353852
Alignment:
Q  277 ttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggt- 375  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | | |||||| |||| ||||| || |     
T  22354008 ttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgtaattgatattgttatgtcatgttgttg 22353909  T
Q  376 ttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaag 432  Q
     | ||  ||||||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  22353908 ctacaatctgcctatgctgctgttgttatttacctaagctgcatgagtcggtctaag 22353852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 12902923 - 12902758
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatact 384  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| | ||||||||||| ||||| || ||| | |||||    
T  12902923 tgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12902824  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  12902823 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 12902758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 164 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19857767 - 19857685
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  19857767 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtattttatatatatat 19857685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 7089043 - 7088878
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatact 384  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | |||||    
T  7089043 tgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatgtaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 7088944  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  7088943 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 7088878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 6900056 - 6899892
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactg 385  Q
    |||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| || |||| |||||||||||   ||| || |||| ||||||    
T  6900056 tgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgttttgtatactg 6899957  T
Q  386 cctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  6899956 cctatgttgctattgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 6899892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 326 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 12774132 - 12774021
Alignment:
Q  326 ataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtc 424  Q
    |||||||||| ||||||||||   |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||    
T  12774132 ataattgagatgttgttgattgt-attcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 12774034  T
Q  425 agtctaagttgat 437  Q
     ||||||||||||    
T  12774033 ggtctaagttgat 12774021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Original strand, 16270191 - 16270355
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactg 385  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||| | || |||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||    
T  16270191 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactg 16270290  T
Q  386 cctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||||||||| | | ||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  16270291 cctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatg 16270355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 286 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 22636601 - 22636437
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatact 384  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | | |||    
T  22636601 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaact 22636502  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 449  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  22636501 gtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 22636437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 280 - 436
Target Start/End: Original strand, 43198502 - 43198661
Alignment:
Q  280 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggttt 377  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||| || |||| |||||  |||||||||||  || |||    
T  43198502 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttatatcatgaattgtttt 43198601  T
Q  378 gcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttga 436  Q
    ||||| || |||||||| || | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  43198602 gcatattgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 43198661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 280 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 7798946 - 7798775
Alignment:
Q  280 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 378  Q
    |||| |||||||| |||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||| ||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  7798946 ttatgttgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 7798847  T
Q  379 catactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
     ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  7798846 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 7798775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 286 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 14038814 - 14038655
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatact 384  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| |||   || |||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||  |||| || ||| | |||||    
T  14038814 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatact 14038715  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    || | ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14038714 gcatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 14038655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 288 - 450
Target Start/End: Original strand, 16239927 - 16240089
Alignment:
Q  288 tgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcc 387  Q
    |||||||||  ||| |||||||||| || ||||  |||||| || ||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  16239927 tgatataatgttatttgcattacttaaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcc 16240026  T
Q  388 tatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||| ||| | | ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||    
T  16240027 tattttgctattgttatttaattaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 16240089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 337 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 16596763 - 16596683
Alignment:
Q  337 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttg 416  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  16596763 gttgatgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagttg 16596683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Original strand, 12778397 - 12778460
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatg 64  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12778397 atgaaatctggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatg 12778460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 14951367 - 14951270
Alignment:
Q  39 gtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  14951367 gtgtaaacatgaaagttgtagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 14951270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 337 - 436
Target Start/End: Original strand, 12288214 - 12288316
Alignment:
Q  337 gttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgttgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagt 433  Q
    |||||||| || |||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  12288214 gttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 12288313  T
Q  434 tga 436  Q
    |||    
T  12288314 tga 12288316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 306 - 444
Target Start/End: Original strand, 54798729 - 54798868
Alignment:
Q  306 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtcgttat 404  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| ||| |||||    
T  54798729 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttat 54798828  T
Q  405 ttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54798829 tcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 54798868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 306 - 444
Target Start/End: Original strand, 8574844 - 8574981
Alignment:
Q  306 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatt 405  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||  | ||| | ||| ||||||    
T  8574844 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatt 8574942  T
Q  406 taactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  8574943 taactaagctgcatgagtcggtctaagttaattaagatg 8574981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 86 - 152
Target Start/End: Original strand, 14745925 - 14745991
Alignment:
Q  86 ttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 152  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14745925 ttggtctgacgtcaaaacgatttatagcacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 14745991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 7893869 - 7893704
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatact 384  Q
    ||||| |||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | |||||    
T  7893869 tgtgaaataatggtatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 7893770  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||||||||| | | |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||    
T  7893769 gcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagatgatgatg 7893704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 44052995 - 44052830
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatact 384  Q
    |||||||||||  |||  ||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | |||||    
T  44052995 tgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 44052896  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||| | |||||||||| |||||| |||||    
T  44052895 gcctatgttgatgttgttatttaactgagctgcatgagtcggcctaagttgatgaagatgatgatg 44052830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 354 - 450
Target Start/End: Original strand, 52873390 - 52873487
Alignment:
Q  354 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  52873390 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 52873487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 134
Target Start/End: Original strand, 55377197 - 55377293
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatta 134  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  55377197 ggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatta 55377293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 14185580 - 14185477
Alignment:
Q  4 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 103  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |  ||||||||||| | || | ||||| |||||| ||||     
T  14185580 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgttaacatgaaagttgtagataagtgtgttagctttccagtggctttggtgtgacttgaaaat 14185481  T
Q  104 gatt 107  Q
    ||||    
T  14185480 gatt 14185477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 330 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 14280434 - 14280320
Alignment:
Q  330 ttgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtc 428  Q
    |||||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||  ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  14280434 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccg-tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 14280336  T
Q  429 taagttgattaagatg 444  Q
    ||||||||||||||||    
T  14280335 taagttgattaagatg 14280320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 156
Target Start/End: Original strand, 15117911 - 15118029
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  15117911 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 15118010  T
Q  138 cacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |||||||||||||||||||    
T  15118011 cacgtaggtcacagtgaat 15118029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 288 - 370
Target Start/End: Original strand, 15464888 - 15464970
Alignment:
Q  288 tgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatg 370  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  15464888 tgatataattgtatatgcaatacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatg 15464970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 136
Target Start/End: Original strand, 25120046 - 25120144
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||   | ||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  25120046 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 25120144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 349 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 8846459 - 8846370
Alignment:
Q  349 cattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 437  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| || || |||| ||||||||||||    
T  8846459 cattcgatattgttatctcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgat 8846370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 14995753 - 14995644
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||||||||||||||     
T  14995753 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatgtcgttggtttgaggtctaaatgatttttagaacttgagttatga 14995654  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    ||||||||||    
T  14995653 tcaaattact 14995644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 136
Target Start/End: Original strand, 43281694 - 43281795
Alignment:
Q  35 ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatta 134  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||   |||||||||||||||||| |  |||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  43281694 ttaggtgttaacatgaaaattgtaggttaagatgttagctttctaatggctatggttttacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatta 43281793  T
Q  135 ct 136  Q
    ||    
T  43281794 ct 43281795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 3096369 - 3096294
Alignment:
Q  375 tttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  3096369 tttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 3096294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 18214918 - 18214965
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacac 48  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18214918 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacac 18214965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 136
Target Start/End: Original strand, 18293667 - 18293765
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||| ||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18293667 ggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagatttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 18293765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 18247848 - 18247739
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||     
T  18247848 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 18247749  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    | ||||||||    
T  18247748 ttaaattact 18247739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 286 - 446
Target Start/End: Original strand, 23374314 - 23374475
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatact 384  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| || || | |||||  |||| ||||| || ||| | |||||    
T  23374314 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatact 23374413  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgtt 446  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| | ||||||||    
T  23374414 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgttctaagttgttgaagatgtt 23374475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 47357292 - 47357183
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||     
T  47357292 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggccttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagatatga 47357193  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    | ||||||||    
T  47357192 ttaaattact 47357183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 134
Target Start/End: Original strand, 15287859 - 15287966
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||     
T  15287859 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 15287958  T
Q  127 tcaaatta 134  Q
    ||||||||    
T  15287959 tcaaatta 15287966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 134
Target Start/End: Original strand, 15294969 - 15295076
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||     
T  15294969 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 15295068  T
Q  127 tcaaatta 134  Q
    ||||||||    
T  15295069 tcaaatta 15295076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 136
Target Start/End: Original strand, 5683367 - 5683465
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||    ||||||||||| ||||   |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  5683367 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattttgttagctttccaatggttttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 5683465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 156
Target Start/End: Original strand, 7640745 - 7640863
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| |||||   |    ||||||||||| |||||||||    
T  7640745 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttcggtttatgagttatggttaaattactg 7640844  T
Q  138 cacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |||||||||||||||||||    
T  7640845 cacgtaggtcacagtgaat 7640863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 9198658 - 9198544
Alignment:
Q  34 cttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 133  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||  |||||||||||  |||||||||   ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  9198658 cttagttgtaaacatgaaagttttatatatggatgttatatttctaatggatttggtcttacttcaaaatgatttctacaacttgatttatggtcaaatt 9198559  T
Q  134 actgcacgtaggtca 148  Q
    | | |||||| ||||    
T  9198558 aatacacgtatgtca 9198544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 136
Target Start/End: Original strand, 22355071 - 22355169
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  22355071 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 22355169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 10643855 - 10643746
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||||   |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||     
T  10643855 aattggactttggtgcaaacatgaaagttgtagataattatgttagctttctaatggttttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagatatga 10643756  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    | ||||||||    
T  10643755 ttaaattact 10643746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 16731785 - 16731688
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 124  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||    
T  16731785 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctctctaatggctttggtttgacttccaaatgattttttgaacttgagttat 16731688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 156
Target Start/End: Original strand, 44772723 - 44772760
Alignment:
Q  119 agttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44772723 agttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 44772760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 19857659 - 19857607
Alignment:
Q  233 tatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatat 285  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  19857659 tatatatatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 19857607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 286 - 432
Target Start/End: Original strand, 46640411 - 46640558
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgcatac 383  Q
    |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||    |||||| ||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||  || |||  ||||    
T  46640411 tgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatga--tgttgagatgttattgattttcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatac 46640508  T
Q  384 tgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaag 432  Q
    || |||||||| || | |||  ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  46640509 tgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 46640558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 354 - 450
Target Start/End: Original strand, 14053325 - 14053421
Alignment:
Q  354 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||| || | |||||| |||||    
T  14053325 gatattattatgtcatgctg-tttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagatgttgaagatgatgatg 14053421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 136
Target Start/End: Original strand, 17146320 - 17146389
Alignment:
Q  67 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  17146320 tgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 17146389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 18168362 - 18168293
Alignment:
Q  67 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  18168362 tgttagctttctaatggcgttgatttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgattaaattact 18168293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 19020118 - 19020009
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    ||||||||||||||||   |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||     
T  19020118 aattggactttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggttttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 19020019  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    | ||||||||    
T  19020018 ttaaattact 19020009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 48
Target Start/End: Original strand, 15489677 - 15489717
Alignment:
Q  8 ctggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacac 48  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  15489677 ctggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacac 15489717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 86 - 136
Target Start/End: Original strand, 19698032 - 19698082
Alignment:
Q  86 ttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19698032 ttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 19698082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 86 - 136
Target Start/End: Original strand, 19708617 - 19708667
Alignment:
Q  86 ttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19708617 ttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 19708667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 108
Target Start/End: Original strand, 630280 - 630361
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 108  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||    
T  630280 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgattt 630361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 8374149 - 8374040
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    ||||| |||||||||| | ||| ||| || || ||| ||||| ||||||||||| ||||     
T  8374149 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttaactttctaatggctttgattttacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 8374050  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    | ||||||||    
T  8374049 ttaaattact 8374040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 383 - 444
Target Start/End: Original strand, 16348716 - 16348777
Alignment:
Q  383 ctgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||    
T  16348716 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatg 16348777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 383 - 444
Target Start/End: Original strand, 16357004 - 16357065
Alignment:
Q  383 ctgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||    
T  16357004 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatg 16357065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 76
Target Start/End: Original strand, 18218875 - 18218912
Alignment:
Q  39 gtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagcttt 76  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  18218875 gtgtaaacatgaaagttgtaggtatgaatgttagcttt 18218912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 8808394 - 8808350
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 82  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  8808394 ggtgtaaacatgaaaattgtaggtatggatgttatctttccaatg 8808350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 11557936 - 11557892
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 82  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11557936 ggtgtaaacattcaagttgtaggtatggatgttagctttccaatg 11557892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 341; Significance: 0; HSPs: 138)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 18809390 - 18808947
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809390 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 18809291  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18809290 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgt 18809191  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  18809190 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgta 18809091  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||     
T  18809090 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 18808992  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18808991 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 18808947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Original strand, 23711728 - 23712171
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23711728 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 23711827  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23711828 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgt 23711927  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  23711928 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgta 23712027  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||     
T  23712028 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 23712126  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23712127 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 23712171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 32214645 - 32215092
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32214645 atgaaaactggtattgattggtacaaaattgttcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaa 32214744  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||    
T  32214745 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgt---------ttgt 32214835  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32214836 gtatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattata 32214935  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| |||||| || |||||||||     
T  32214936 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgttgtt 32215034  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 457  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32215035 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 32215092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 39682761 - 39682317
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682761 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 39682662  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39682661 aaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 39682562  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  39682561 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgt 39682462  T
Q  300 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgt 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||    
T  39682461 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgt 39682363  T
Q  399 cgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
     |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39682362 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 39682317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 28577546 - 28577103
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28577546 atgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 28577447  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28577446 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgt 28577347  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  28577346 gaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgta 28577247  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||| ||  |||| ||||||  |  |||| |||     
T  28577246 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttggcttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactg-ttgcgttgctgtt 28577148  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28577147 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 28577103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 444
Target Start/End: Original strand, 23709253 - 23709690
Alignment:
Q  7 actggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23709253 actggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgcagttggtttgacttcaaaaggat 23709352  T
Q  107 ttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatac 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23709353 ttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaagaattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatac 23709452  T
Q  207 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgca 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23709453 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 23709552  T
Q  307 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatt 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| ||| ||||||    
T  23709553 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatt 23709651  T
Q  406 taactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23709652 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 23709690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 23131310 - 23130866
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23131310 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaa 23131211  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  23131210 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttg 23131111  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattat 299  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| |    
T  23131110 tgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgt 23131011  T
Q  300 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgt 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||    
T  23131010 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgt 23130912  T
Q  399 cgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
     |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23130911 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 23130866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 23133777 - 23133333
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23133777 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaa 23133678  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  23133677 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttg 23133578  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattat 299  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| |    
T  23133577 tgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgt 23133478  T
Q  300 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgt 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||    
T  23133477 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgt 23133379  T
Q  399 cgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
     |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23133378 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 23133333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Original strand, 34402236 - 34402680
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34402236 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaa 34402335  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  34402336 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttg 34402435  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattat 299  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| |    
T  34402436 tgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgt 34402535  T
Q  300 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgt 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||    
T  34402536 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgt 34402634  T
Q  399 cgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
     |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34402635 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 34402680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Original strand, 24897910 - 24898354
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24897910 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaa 24898009  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24898010 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgt 24898109  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  24898110 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgta 24898209  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||     
T  24898210 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 24898308  T
Q  400 gttatttaact-aagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24898309 gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24898354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Original strand, 24905347 - 24905791
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24905347 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaa 24905446  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24905447 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgt 24905546  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  24905547 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgta 24905646  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||     
T  24905647 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 24905745  T
Q  400 gttatttaact-aagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24905746 gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24905791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 26505826 - 26505383
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505826 atgaaaactggtattgattggtacagaattgatcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 26505727  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26505726 aagaatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgt 26505627  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  26505626 gaatacgatattttccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgta 26505527  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgat-ggtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| |   |||| |||||| || ||||| |||     
T  26505526 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ctgtgttgctgtt 26505428  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26505427 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 26505383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 26508304 - 26507861
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26508304 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaa 26508205  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26508204 aagaatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgt 26508105  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  26508104 gaatacgatattttccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgta 26508005  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgat-ggtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| |   |||| |||||| || ||||| |||     
T  26508004 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactg-ctgtgttgctgtt 26507906  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26507905 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 26507861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Original strand, 24900393 - 24900837
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24900393 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaa 24900492  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  24900493 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatttatatgttgt 24900592  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  24900593 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgta 24900692  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||     
T  24900693 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 24900791  T
Q  400 gttatttaact-aagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24900792 gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24900837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Original strand, 24902870 - 24903314
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24902870 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaa 24902969  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  24902970 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatttatatgttgt 24903069  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  24903070 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgta 24903169  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||     
T  24903170 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 24903268  T
Q  400 gttatttaact-aagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24903269 gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24903314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Original strand, 24907822 - 24908266
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24907822 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacatgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaa 24907921  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24907922 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgt 24908021  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  24908022 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgta 24908121  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||     
T  24908122 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 24908220  T
Q  400 gttatttaact-aagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24908221 gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24908266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 4 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 571842 - 571401
Alignment:
Q  4 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  571842 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacgtcaaaag 571743  T
Q  104 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtga 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  571742 gatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtga 571643  T
Q  203 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattatata 302  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  571642 atacgatattgtccatgattaatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtata 571543  T
Q  303 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgt 401  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| ||| ||    
T  571542 tgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgt 571444  T
Q  402 tatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  571443 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 571401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Original strand, 32039213 - 32039656
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32039213 atgaaaactggtattgattggtaaaggattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaattttagctttctattgccgttggtttgacttcaa 32039312  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32039313 aaggatttatagaatttaagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 32039412  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  32039413 gaatctgatattgtccatgatcgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgta 32039512  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||  |||     
T  32039513 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttactgtt 32039611  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  32039612 gttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttgattaagatg 32039656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 23136027 - 23135594
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23136027 atgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatcccgttggtttgacttcaa 23135928  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||    
T  23135927 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat----------atgttgt 23135838  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||| ||    
T  23135837 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgctgattatcatttgatgttgttatactgtgatgtaattgta 23135738  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||     
T  23135737 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 23135639  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23135638 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 23135594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 20261667 - 20261381
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20261667 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 20261568  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatat-gttg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||    
T  20261567 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttg 20261468  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatatt 286  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20261467 tgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 20261381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Original strand, 24529261 - 24529687
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529261 atgaaaacttgtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttacctttctaatgccgttggtttgacttcaa 24529360  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24529361 aaggatttatagcacttgagatatggtgaaattactaaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 24529460  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||                   ||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  24529461 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtgtatatgatg-------------------atttgatgttgttatattgtgatataattgt 24529541  T
Q  300 atatgcattacttgaattatatgtg-aataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttg 397  Q
    |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| | || || | ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||||||    
T  24529542 atatgcattatttgaattatatatgaaataattgagacgttgttaacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-atgtgttgttg 24529640  T
Q  398 tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    | |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24529641 ttgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24529687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 10684477 - 10684764
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10684477 atgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 10684576  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatat-gttg 199  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||    
T  10684577 aaggatttatagaacttgagctatggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttg 10684676  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg--tatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatat 285  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  10684677 tgaatacgatattgtcaatgattgatgaagggttatatgtatatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 10684764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 164 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 22105697 - 22105416
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105697 tatgattgatgaattagtatatgtatgtaaatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 22105598  T
Q  264 ttaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattatta 363  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||    
T  22105597 ttataatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattatta 22105498  T
Q  364 tatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    | ||||| ||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22105497 tgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 22105416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 23706931 - 23707169
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23706931 atgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaa 23707030  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23707031 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 23707130  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 238  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23707131 tgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 23707169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 164 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 6726279 - 6725999
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726279 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 6726180  T
Q  264 ttaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattatta 363  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  6726179 ttattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattatta 6726080  T
Q  364 tatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    | ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6726079 tgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 6725999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24918588 - 24918350
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24918588 atgaaaactgatattgattggtagagaattggtcttaagtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaa 24918489  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24918488 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 24918389  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 238  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24918388 tgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 24918350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 45027619 - 45027840
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45027619 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaa 45027718  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45027719 aaggatttatagaacttgaattatagtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgt 45027818  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgatt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  45027819 gaatacgatattgtccatgatt 45027840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 238
Target Start/End: Original strand, 24642465 - 24642701
Alignment:
Q  3 gaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24642465 gaaaactggtattgattggtacagaattgctcttaggtgtaaacccaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaa 24642564  T
Q  103 ggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtg 201  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24642565 ggatttatagaacttaagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtg 24642664  T
Q  202 aatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 238  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24642665 aatactatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 24642701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 5 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24671469 - 24671235
Alignment:
Q  5 aaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagg 104  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24671469 aaactggtatttattggtacagaattggtcttaggtgtaaaaacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgttgttggtttgacttcaaaagg 24671370  T
Q  105 atttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaa 203  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24671369 atttatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaa 24671270  T
Q  204 tacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 238  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24671269 tactatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 24671235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24681892 - 24681654
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |    
T  24681892 atgaaaactggtattggttggtacagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggttgggcttcca 24681793  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24681792 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 24681693  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 238  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24681692 tgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 24681654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 168 - 444
Target Start/End: Original strand, 21154942 - 21155218
Alignment:
Q  168 attgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattac 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21154942 attgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattat 21155041  T
Q  268 catttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatc 367  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||| ||    
T  21155042 tatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtc 21155141  T
Q  368 atgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||| ||  |||| ||||||  | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21155142 atgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21155218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 38967927 - 38967689
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  38967927 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaatacgaaagttgtagatatggatgttaggtttctaatgtcgttggtttgacttcaa 38967828  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38967827 aagtatttatagaacttgagttatagtgaaattactgcacgcagctcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 38967728  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 238  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  38967727 tgaatactatattgttcatgattgttgaagtgttatatg 38967689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 164 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 24368058 - 24367782
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24368058 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattttccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgttttaagatgttgg 24367959  T
Q  264 ttaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattatta 363  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  24367958 ttattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 24367859  T
Q  364 tatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaa 440  Q
    | ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  24367858 tgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 24367782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22105913 - 22105716
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105913 atgaaaactggtattgattggtgcagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 22105814  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 198  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22105813 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 22105716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 49 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 25616581 - 25616365
Alignment:
Q  49 gaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  25616581 gaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatcgtcaaattacttcacgtaggtca 25616482  T
Q  149 cagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatga 247  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25616481 caatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatgtatga 25616382  T
Q  248 tgttttaagatgttgat 264  Q
    |||||||||||||||||    
T  25616381 tgttttaagatgttgat 25616365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 24368274 - 24368077
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24368274 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 24368175  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 198  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24368174 aatgatttatagaacttgagttatagttaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 24368077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 21154722 - 21154919
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21154722 atgaaaactggtattgattggtacagaatttgtcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 21154821  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 198  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21154822 aatgatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 21154919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 6726495 - 6726298
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6726495 atgaaaactggtattgattgatacataagtggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 6726396  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  6726395 aaggatttatagaacttaagttatagtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgaatgtatatgtt 6726298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 41523787 - 41523984
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  41523787 atgaaaactggtattgattggtacagaattagtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaacgtcgttggtttgacttcaa 41523886  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  41523887 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatacgaatgtatatgtt 41523984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 164 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 38967658 - 38967378
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38967658 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtcttaagatgttga 38967559  T
Q  264 ttaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttacattcgatattatt 362  Q
    |||  ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||| |||||||||    
T  38967558 ttattatttgatgttg-tatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattatt 38967460  T
Q  363 atatcatgat-ggtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    || ||||| |   |||| ||| ||  | ||| | ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38967459 atttcatgctatttttgtatattg-ttgtgtcgatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 38967378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 164 - 363
Target Start/End: Original strand, 24642732 - 24642933
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgtt 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||    
T  24642732 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgcgaatacgatattgtacatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgtt 24642831  T
Q  262 gattaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattat 361  Q
    |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  24642832 gattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattat 24642931  T
Q  362 ta 363  Q
    ||    
T  24642932 ta 24642933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 216 - 444
Target Start/End: Original strand, 45029784 - 45030012
Alignment:
Q  216 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  45029784 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgatgattattatttcatgttgttatattgtgatataaatgtatatgcattacttgaa 45029883  T
Q  316 ttatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagt 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||| ||  | ||||||||| ||||||||||||||     
T  45029884 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattg-ttgtgttgttgttgttatttaactaagc 45029982  T
Q  415 tgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45029983 tgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 45030012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 156
Target Start/End: Original strand, 41523597 - 41523749
Alignment:
Q  4 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 103  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  41523597 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaggttgtaggtatggatgttatctttataatgcccttggtttgacttcaaaat 41523696  T
Q  104 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523697 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 41523749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 22106106 - 22105951
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  22106106 atgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaa 22106007  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22106006 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 22105951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 23931908 - 23931775
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23931908 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtattgatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 23931809  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaatta 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23931808 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaatta 23931775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 24529068 - 24529223
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  24529068 atgaaatctggtattgataggtccttaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgacgtcaa 24529167  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24529168 aatgatttatagaacttgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 41523401 - 41523552
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  41523401 atgaaatctggtattgataggtccataattggtcttacgtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 41523500  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 152  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523501 aaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 41523552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 21154529 - 21154684
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  21154529 atgaaaactggtattgattgttatagaattggtcctaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaa 21154628  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21154629 aacgatttatagaatttgagttacggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaat 21154684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 24368467 - 24368312
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  24368467 atgaaatctggtattgataggtcaatagttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaa 24368368  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24368367 aacgatttatagaacttaagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24368312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 24918781 - 24918626
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  24918781 atgaaatctggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaataccgttggtctgacgtcaa 24918682  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24918681 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24918626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 27 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 6726662 - 6726533
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6726662 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 6726563  T
Q  127 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6726562 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 6726533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 32214451 - 32214604
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||    
T  32214451 atgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgctctgacgtcaa 32214550  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtga 154  Q
    ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32214551 aacaatttatagaacttaagttatggtcaaattacagcacgtaggtcacagtga 32214604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 23709054 - 23709209
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  23709054 atgaaaactggtattgattggcacagaattcgtcctaggtgtaaacacgtaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgccgttggtctgacgtcaa 23709153  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  23709154 aacgatttatagaacttgagttatggtctaattactgcacataggtcacagtgaat 23709209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 24682085 - 24681930
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||    
T  24682085 atgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtgtggatgttagcattctaatgccgttagtctgacatcaa 24681986  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24681985 aaagatttatagagcttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24681930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 23932101 - 23931949
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||    
T  23932101 atgaaagctggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatttcgttggtctgacgtcaa 23932002  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtg 153  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  23932001 aacgatttatagaactttagttatggtcaatttacttcacttaggtcacagtg 23931949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 23706547 - 23706702
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |  ||||    
T  23706547 atgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatggtgttggttctatgtcaa 23706646  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23706647 aacaatttatagaacttgagttatggtcaagttactgcacgtaggtcacagtgaat 23706702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 23706739 - 23706889
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  23706739 atgaaaacggctattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttatagttatggatgttacctttctaatgccgtaggtctgacgtcaa 23706838  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacag 151  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23706839 aacgaattatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaagtcacag 23706889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 271 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 19672010 - 19671831
Alignment:
Q  271 ttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatg 370  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | || | ||||||||||||||||||||    
T  19672010 ttgatgttgttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaat-attgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatg 19671912  T
Q  371 atggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  19671911 atgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 19671831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 21154336 - 21154491
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||| || |||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  21154336 atgaaatctagtattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaa 21154435  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21154436 aatgatttatagaacttgacttttagtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 21154491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 24671666 - 24671511
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||| |||||||||||  || || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||    
T  24671666 atgaaatctggtattgatatgtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtgtggatgttagctttctaatgccatttatttgacatcaa 24671567  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24671566 aaatatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 24671511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 154
Target Start/End: Original strand, 45027433 - 45027579
Alignment:
Q  8 ctggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatt 107  Q
    ||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||    
T  45027433 ctggtgttgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttcgaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatt 45027532  T
Q  108 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtga 154  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45027533 tatagaactttagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtga 45027579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 164 - 285
Target Start/End: Original strand, 23707200 - 23707323
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgtt 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||    
T  23707200 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgtt 23707299  T
Q  262 gattaccatttgatattgttatat 285  Q
    ||||| |||||||| |||||||||    
T  23707300 gattatcatttgatgttgttatat 23707323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 167 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 24671201 - 24671081
Alignment:
Q  167 gattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgat 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |   |||||||||    
T  24671201 gattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgat 24671102  T
Q  265 taccatttgatattgttatat 285  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  24671101 tatcatttgatattgttatat 24671081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 164 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 24918319 - 24918196
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||    
T  24918319 tatgattgatgaattagtatatgtatgcatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgtt 24918220  T
Q  262 gattaccatttgatattgttatat 285  Q
    ||||| |||||||| |||||||||    
T  24918219 gattatcatttgatgttgttatat 24918196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 278 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 43137469 - 43137303
Alignment:
Q  278 tgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtt 376  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  ||    
T  43137469 tgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt 43137370  T
Q  377 tgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    || ||| |  || ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43137369 tgtata-ttactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 43137303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 164 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 24681623 - 24681500
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgtt 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |   ||||||    
T  24681623 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtattagatgtatatatgatgtttaagttgatgtt 24681524  T
Q  262 gattaccatttgatattgttatat 285  Q
    ||| | |||||||| |||||||||    
T  24681523 gatcatcatttgatgttgttatat 24681500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 337 - 450
Target Start/End: Original strand, 23071955 - 23072069
Alignment:
Q  337 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttg 435  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  23071955 gttgctgatttatattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttg 23072054  T
Q  436 attaagatgttgatg 450  Q
     | |||||| |||||    
T  23072055 ttgaagatgatgatg 23072069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 280 - 436
Target Start/End: Original strand, 23708568 - 23708725
Alignment:
Q  280 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgc 379  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| || | |||||| || | |||||| |||||||||| || |||||    
T  23708568 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcatgttgttttgc 23708667  T
Q  380 atactgcctatgttgttgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttga 436  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  23708668 atactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaagttga 23708725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 290 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 7679745 - 7679592
Alignment:
Q  290 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgccta 389  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| |  ||  || |||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7679745 atataattatatatacattacatgaattatgtttga-tgtttatgatgttgatgacttacatt-gatattgttatatcatgatgatttgcatactgccta 7679648  T
Q  390 tgttgttgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7679647 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 7679592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 290 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 25176010 - 25175864
Alignment:
Q  290 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgccta 389  Q
    |||||||||||||| | |||  ||||||||  ||  ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25176010 atataattatatatacgttatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgccta 25175913  T
Q  390 tgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 437  Q
    ||||| || | |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  25175912 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaatctgtctaagttgat 25175864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 330 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 28406099 - 28405990
Alignment:
Q  330 ttgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcagt 427  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28406099 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggt 28406000  T
Q  428 ctaagttgat 437  Q
    ||||||||||    
T  28405999 ctaagttgat 28405990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 286 - 432
Target Start/End: Original strand, 7688 - 7835
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactg 385  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| |||| ||| || |||| |||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  7688 tgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactg 7787  T
Q  386 cctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaag 432  Q
    ||||||||| || | |||  ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  7788 cctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaag 7835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 23060679 - 23060514
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatact 384  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | |||||    
T  23060679 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 23060580  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  23060579 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 23060514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 23660188 - 23660024
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactg 385  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   |||||| || ||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||  || || | ||||||    
T  23660188 tgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgattgaatatttaagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctgtttcgtatactg 23660089  T
Q  386 cctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  23660088 cctatgttgctgttgttgtttaactaagatacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 23660024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 23076608 - 23076443
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatact 384  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || |||  ||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | |||||    
T  23076608 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23076509  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||    
T  23076508 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtggatgaagatgatgatg 23076443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 91 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 31345554 - 31345490
Alignment:
Q  91 ttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 155  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31345554 ttgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 31345490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 256 - 325
Target Start/End: Original strand, 22173799 - 22173868
Alignment:
Q  256 gatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtga 325  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22173799 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtga 22173868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 22337281 - 22337116
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgc-atact 384  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||  || |||| ||||||||||| ||||| || |||   ||||     
T  22337281 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatataca 22337182  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  22337181 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 22337116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Original strand, 23654341 - 23654506
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgg-tttgcatact 384  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| | |||  |||||| || ||| |||| ||| || || | ||||||||||| ||||||||  |||| || ||    
T  23654341 tgtgatataatgttttatgcattacttgagtaatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgct 23654440  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  23654441 gcctatgctgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 23654506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 354 - 450
Target Start/End: Original strand, 38138 - 38234
Alignment:
Q  354 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  38138 gatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 38234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 349 - 453
Target Start/End: Original strand, 22134225 - 22134329
Alignment:
Q  349 cattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttga 448  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||| ||||| | |||| | |||| |||    
T  22134225 cattcgatattgttatattatgatgatttgcatactgcctatgttgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatga 22134324  T
Q  449 tgatg 453  Q
    |||||    
T  22134325 tgatg 22134329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Original strand, 22731189 - 22731354
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatact 384  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || | | |||| ||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | | |||    
T  22731189 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaatatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaact 22731288  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  22731289 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatg 22731354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 23286027 - 23285866
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactg 385  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||  | || |||||| || ||| |||| ||| || || | ||||||||||| || || |  |||| ||||||    
T  23286027 tgtgatataatgttttatgcattacttgaagaacatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtc-tgtt--tttgtatactg 23285931  T
Q  386 cctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  23285930 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 23285866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 31345627 - 31345570
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31345627 atgaaaactggtattgattggtacagaattgatcttaggtgtaaacacgaaagttgta 31345570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 18809546 - 18809428
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  18809546 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 18809447  T
Q  138 cacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18809446 cacgtaggtcacagtgaat 18809428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 403 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 25616233 - 25616179
Alignment:
Q  403 atttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  25616233 atttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttaataatgatgt 25616179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 67440 - 67339
Alignment:
Q  35 ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatta 134  Q
    |||| ||| |||| |||| ||||||||   |||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  67440 ttagttgttaacatgaaaattgtaggttaagatgttagatttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatta 67341  T
Q  135 ct 136  Q
    ||    
T  67340 ct 67339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 16900884 - 16900803
Alignment:
Q  67 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 148  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  16900884 tgttagctttctaatgactttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacgtgggtca 16900803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 16994275 - 16994194
Alignment:
Q  67 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 148  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  16994275 tgttagctttctaatgactttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacgtgggtca 16994194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Original strand, 22738135 - 22738299
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatact 384  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | | |||    
T  22738135 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaact 22738234  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||||| ||  ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  22738235 gcctat-ttaatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgatg 22738299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Original strand, 24686598 - 24686707
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||| ||||||     
T  24686598 aattggtctttggtgtaaacatgaaagttttagataattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgcgttatga 24686697  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    ||||||||||    
T  24686698 tcaaattact 24686707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 286 - 444
Target Start/End: Original strand, 298769 - 298929
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatact 384  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| || || | |||||  |||| ||||| || ||| | |||||    
T  298769 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatact 298868  T
Q  385 gcctatgttgttgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  298869 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 298929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 104 - 156
Target Start/End: Original strand, 24642373 - 24642425
Alignment:
Q  104 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  24642373 gatttatagaacttgagttatggtcaaataactacacgtaggtcacagtgaat 24642425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 334 - 436
Target Start/End: Original strand, 18786904 - 18787009
Alignment:
Q  334 gacgttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtcta 430  Q
    ||||||||||| || |||| || ||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||  || | |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  18786904 gacgttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaactggtttgcatactacctatgttactgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 18787003  T
Q  431 agttga 436  Q
    ||||||    
T  18787004 agttga 18787009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 156
Target Start/End: Original strand, 23711572 - 23711690
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||  | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  23711572 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 23711671  T
Q  138 cacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |||||||||||||||||||    
T  23711672 cacgtaggtcacagtgaat 23711690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 26505982 - 26505864
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||  | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  26505982 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 26505883  T
Q  138 cacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |||||||||||||||||||    
T  26505882 cacgtaggtcacagtgaat 26505864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 26508460 - 26508342
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||  | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  26508460 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 26508361  T
Q  138 cacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |||||||||||||||||||    
T  26508360 cacgtaggtcacagtgaat 26508342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 156
Target Start/End: Original strand, 27920323 - 27920441
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||  | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  27920323 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 27920422  T
Q  138 cacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27920423 cacgtaggtcacagtgaat 27920441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 28577702 - 28577584
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  28577702 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 28577603  T
Q  138 cacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  28577602 cacgtaggtcacaatgaat 28577584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 156
Target Start/End: Original strand, 32039057 - 32039175
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||  | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  32039057 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 32039156  T
Q  138 cacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |||||||||||||||||||    
T  32039157 cacgtaggtcacagtgaat 32039175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 206
Target Start/End: Original strand, 41524003 - 41524045
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatac 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41524003 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatac 41524045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Original strand, 19887275 - 19887384
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||     
T  19887275 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 19887374  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    | ||||||||    
T  19887375 ttaaattact 19887384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 23791458 - 23791327
Alignment:
Q  269 atttgatattgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatc 367  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||  |||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  23791458 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatat-aatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatttttatatc 23791360  T
Q  368 atga--tggtttgcatactgcctatgttgttgt 398  Q
    ||||  || |||   ||||||||||||||||||    
T  23791359 atgaactgttttatgtactgcctatgttgttgt 23791327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 27261441 - 27261332
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||| || ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||  |||| || |||||||||||||     
T  27261441 aattggcctttggtgtaaacatgaaaattttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaataatttttataacttgagttatga 27261342  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    ||||||||||    
T  27261341 tcaaattact 27261332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 34823819 - 34823750
Alignment:
Q  67 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  34823819 tgttagctttctaatgacgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 34823750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 40 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 12727807 - 12727711
Alignment:
Q  40 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    |||||||| ||||||| ||||||    |||||||||||||||| | |||| ||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  12727807 tgtaaacatgaaagttttaggtaattttgttagctttctaatggccttgggttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 12727711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Original strand, 22413073 - 22413240
Alignment:
Q  269 atttgatattgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatat--tattata 365  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||| | |||    |||||| ||||||||||| |||| |||||  | |||||    
T  22413073 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttatgatg--ttgagatgttgttgatttgcatttgatatattgttata 22413170  T
Q  366 tcatga--tggtttgcatactgcctatgttgttgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaag 432  Q
    ||||||  || |||  |||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  22413171 tcatgagctgttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22413240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 8946733 - 8946658
Alignment:
Q  375 tttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||| ||||||||||||||| | | ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  8946733 tttgtatactgcctatgttgctattgttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 8946658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 367
Target Start/End: Original strand, 22459511 - 22459598
Alignment:
Q  280 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatc 367  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||| || |||| ||| || |||||||    
T  22459511 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgagttatatgtgaatatttgagatgttgatgactttcatttgatgttgttatatc 22459598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 450
Target Start/End: Original strand, 23103369 - 23103515
Alignment:
Q  303 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtcgtt 402  Q
    ||||| |||||||||||   ||||| ||||||| |||| ||| ||  ||| ||||| || || ||||| || |||| ||||||||||||||| |||  ||    
T  23103369 tgcatgacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctg-tttgtatactgcctatgttgctgttttt 23103467  T
Q  403 atttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| || | |||||| |||||    
T  23103468 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 23103515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 23131386 - 23131347
Alignment:
Q  117 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23131386 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 23131347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 156
Target Start/End: Original strand, 34402160 - 34402199
Alignment:
Q  117 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402160 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 34402199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 286 - 432
Target Start/End: Original strand, 20520148 - 20520295
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgcatac 383  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  || |||   |||    
T  20520148 tgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgttttatgtac 20520245  T
Q  384 tgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaag 432  Q
    ||| ||||||| || | |||  ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  20520246 tgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 20520295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 165 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21368439 - 21368365
Alignment:
Q  165 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttg-tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 238  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||| | |||||||    
T  21368439 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatg 21368365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 388 - 450
Target Start/End: Original strand, 23040247 - 23040309
Alignment:
Q  388 tatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  23040247 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 23040309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 390 - 444
Target Start/End: Original strand, 24643054 - 24643108
Alignment:
Q  390 tgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24643054 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24643108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Original strand, 11232213 - 11232322
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||     
T  11232213 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 11232312  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    ||||||||||    
T  11232313 tcaaattact 11232322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Original strand, 22514060 - 22514169
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||     
T  22514060 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 22514159  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    ||||||||||    
T  22514160 tcaaattact 22514169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Original strand, 28776662 - 28776771
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||     
T  28776662 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 28776761  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    ||||||||||    
T  28776762 tcaaattact 28776771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 571999 - 571883
Alignment:
Q  40 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgca 139  Q
    |||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| || || | |    ||||||| |||||||||||||||    
T  571999 tgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgaattttggtttatgagttaaggtcaaattactgca 571900  T
Q  140 cgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |||||||||||||||||    
T  571899 cgtaggtcacagtgaat 571883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 23207461 - 23207296
Alignment:
Q  269 atttgatattgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatc 367  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||| | | |||  |||||| || |||||||| |||| |||||| |||||||    
T  23207461 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttat-aatg-ttgagatgtcgttgatttgcatttgatattgttatatc 23207364  T
Q  368 atga--tggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaag 432  Q
    ||||  || |||  ||||||||||||||| || | |||  ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  23207363 atgaactgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23207296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 29601518 - 29601478
Alignment:
Q  269 atttgatattgttatattgtgatataattatatatgcatta 309  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29601518 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcatta 29601478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 98
Target Start/End: Original strand, 34135059 - 34135119
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttc 98  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  34135059 ggtgtacacatgaaagttgtaggtatggaagttagctttctaattgctttggtttgacttc 34135119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 23133853 - 23133814
Alignment:
Q  117 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23133853 tgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 23133814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 39682838 - 39682799
Alignment:
Q  117 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682838 tgagttaaggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 39682799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23799531 - 23799457
Alignment:
Q  165 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttg-tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 238  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||| || | ||||||||||||| | |||||||    
T  23799531 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgttgaatatgatgttattcatgattgatgaattattatatg 23799457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 22274090 - 22274022
Alignment:
Q  68 gttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  || ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  22274090 gttagctttctaatggccttggtttgatgtctaaatgatttttaaaacttgagttatgatcaaattact 22274022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22686221 - 22686145
Alignment:
Q  170 tgatgaattagtatatgtatgtatatgttg-tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatat 245  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||| || | ||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  22686221 tgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtttttcatgattgatgaattattatatgaatatat 22686145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 156
Target Start/End: Original strand, 23708980 - 23709016
Alignment:
Q  120 gttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23708980 gttatggtcaaattactgcacttaggtcacagtgaat 23709016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 24788086 - 24788042
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 82  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  24788086 ggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttatctttccaatg 24788042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 82
Target Start/End: Original strand, 44584588 - 44584632
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 82  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  44584588 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgtatgttagctttccaatg 44584632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 286 - 432
Target Start/End: Original strand, 24697561 - 24697709
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgcatac 383  Q
    |||||||||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||   |||||| |||||||| || |||| |||||| |||||||||||  || ||    |||    
T  24697561 tgtgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatatgaagt-ttgagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactgtttgatgtac 24697659  T
Q  384 tgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaag 432  Q
    |||||| ||||||| | |||  ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  24697660 tgcctacgttgttgtttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaag 24697709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 6483194 - 6483113
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 108  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  6483194 aattggcctttggtgtaaacataaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttcaaaatgattt 6483113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 108
Target Start/End: Original strand, 21081348 - 21081429
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 108  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||||| || | |||||||||||| |||| |||||    
T  21081348 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttctagtggctttggtttgacttaaaaatgattt 21081429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 383 - 444
Target Start/End: Original strand, 22799179 - 22799240
Alignment:
Q  383 ctgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||    
T  22799179 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatg 22799240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 388 - 444
Target Start/End: Original strand, 21916156 - 21916212
Alignment:
Q  388 tatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |  ||| |||||||||||    
T  21916156 tatgttgtttttgttatttaactaagttgcatgagtctatacaagatgattaagatg 21916212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 68 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 22283323 - 22283255
Alignment:
Q  68 gttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  || ||| ||||| ||  |||||||||||| ||||||||||    
T  22283323 gttagctttctaatggccttggtttgatgtctaaatgatttttaatacttgagttatgatcaaattact 22283255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22686110 - 22686062
Alignment:
Q  165 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttg-tgaatacgatatt 212  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  22686110 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatatt 22686062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 338; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 9689 - 9241
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9689 atgaaaactggtatttattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctctctaatgccgttggtttgacttcaa 9590  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9589 aatgatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 9490  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9489 gaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatttgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattata 9390  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||  |||  ||||||  | ||||| |||     
T  9389 tatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactg-ttgtgttgctgtt 9291  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 449  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9290 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 9241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 333; Significance: 0; HSPs: 118)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 20909459 - 20909016
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909459 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 20909360  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20909359 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgt 20909260  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  20909259 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgta 20909160  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| | |     
T  20909159 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctttt 20909061  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20909060 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 20909016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Original strand, 264483 - 264926
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  264483 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaa 264582  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  264583 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattaaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgt 264682  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  264683 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgta 264782  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||     
T  264783 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 264881  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  264882 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 264926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Original strand, 10732655 - 10733098
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10732655 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 10732754  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10732755 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgt 10732854  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  ||||||||||| ||    
T  10732855 gaatacgattttgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatacggtgatataattgta 10732954  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||     
T  10732955 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 10733053  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10733054 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 10733098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 39245583 - 39245140
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245583 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttatgtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 39245484  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39245483 aaggatttatagaacttgatttatagttaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgt 39245384  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  39245383 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatgtaattgta 39245284  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||     
T  39245283 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgggacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 39245185  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39245184 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 39245140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Original strand, 42245080 - 42245523
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42245080 atgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaa 42245179  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    | ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42245180 atggatttatagaactatagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgt 42245279  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  42245280 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgta 42245379  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||     
T  42245380 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgtt 42245478  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42245479 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 42245523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 39363832 - 39363388
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  39363832 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttgatttgacttcaa 39363733  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  39363732 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacactgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttg 39363633  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattat 299  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| |    
T  39363632 tgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgt 39363533  T
Q  300 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgt 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||    
T  39363532 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgt 39363434  T
Q  399 cgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
     |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39363433 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 39363388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 29346427 - 29345984
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29346427 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 29346328  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    || |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  29346327 aatgatttatagaacttgatttatactcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatgttgt 29346228  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  29346227 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgta 29346128  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | || || |||     
T  29346127 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgatgctgtt 29346029  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  29346028 gttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatg 29345984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 29348900 - 29348457
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29348900 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcaaatgccgttggtttgacttcaa 29348801  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    || |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  29348800 aatgatttatagaacttgatttatactcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatgttgt 29348701  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  29348700 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgta 29348601  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | || || |||     
T  29348600 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgatgctgtt 29348502  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
     ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  29348501 cttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatg 29348457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 29351373 - 29350930
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29351373 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcaaatgccgttggtttgacttcaa 29351274  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    || |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  29351273 aatgatttatagaacttgatttatactcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatgttgt 29351174  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  29351173 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgta 29351074  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | || || |||     
T  29351073 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgatgctgtt 29350975  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
     ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  29350974 cttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatg 29350930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 4 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 38619881 - 38619438
Alignment:
Q  4 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38619881 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttctagtgccgttggtttgacttcaaaag 38619782  T
Q  104 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtga 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38619781 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtga 38619682  T
Q  203 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattg-ttatattgtgatataattatat 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||  |||||||| |||    
T  38619681 atacgatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattggaatataattgtat 38619582  T
Q  302 atgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||| | ||  ||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| |||||  || ||| |||||     
T  38619581 atgcatcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-actgtgtcgttgtt 38619483  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38619482 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 38619438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 4 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 23064958 - 23064515
Alignment:
Q  4 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 103  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  23064958 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatataaacacgaaagttgtaggtatggatgtcagctttctagtgccgttcgtttgacttcaaaag 23064859  T
Q  104 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtga 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23064858 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataatttattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtga 23064759  T
Q  203 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattg-ttatattgtgatataattatat 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||    
T  23064758 atacgatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatattatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgggatataattgtat 23064659  T
Q  302 atgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||| | ||  ||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||  ||||| ||  |||| |||||  || ||| |||||     
T  23064658 atgcatcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaggtcatgctgtttttgtatact-actgtgtcgttgtt 23064560  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23064559 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 23064515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Original strand, 2154346 - 2154772
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154346 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtatgaatattagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 2154445  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2154446 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 2154545  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattat 299  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   ||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  2154546 tgaatacgatactgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg-------------------atttgatgttgttatattgtgatataattgt 2154626  T
Q  300 atatgcattacttgaattatatgtg-aataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttg 397  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || | ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |     
T  2154627 atatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgcta 2154725  T
Q  398 tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2154726 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 2154772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 17516878 - 17517142
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17516878 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 17516977  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17516978 aaggatttatagaacttgagttatcgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 17517077  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgat 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17517078 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatgtatgatgttttaagatgttgat 17517142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 37804617 - 37804902
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37804617 atgaaaactggcattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 37804716  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatat-gttg 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||    
T  37804717 aaggatttataaaacttgagttatggtcaaattaatgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttg 37804816  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatat 285  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||    
T  37804817 tgaatacgatattgtcaatgattaatgaagcgttatatgtatatatgatgttttaagatgttaattagaatttgatgttgttatat 37804902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 20901635 - 20901873
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20901635 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaa 20901734  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20901735 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcactgtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 20901834  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 238  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20901835 tgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 20901873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 164 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 32027677 - 32027397
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32027677 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 32027578  T
Q  264 ttaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattatta 363  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||    
T  32027577 ttattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattatta 32027478  T
Q  364 tatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    | ||||| ||  |||| ||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  32027477 tgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatg 32027397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 164 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 29330215 - 29329938
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  29330215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaga---tga 29330119  T
Q  264 ttaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattatta 363  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  29330118 ttattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 29330019  T
Q  364 tatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    | ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29330018 tgtcatgttgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 29329938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 27 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 9776780 - 9776521
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9776780 aattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattatgttagctttctaataccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagctatgg 9776681  T
Q  127 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatat-gttgtgaatacgatattgtccatgattgat 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  9776680 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattggt 9776581  T
Q  226 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatat 285  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  9776580 gaagggttatatgtatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 9776521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 20917561 - 20917758
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20917561 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 20917660  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20917661 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaagtcacggtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 20917758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 32027893 - 32027696
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32027893 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaa 32027794  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32027793 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcactgtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 32027696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 164 - 444
Target Start/End: Original strand, 20917830 - 20918106
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20917830 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatcttgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 20917929  T
Q  264 ttaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattatta 363  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    || ||  ||||||||     
T  20917930 ttattatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgctttacttgaattagatgtgaataattgagacgttgttg----actttttatattattt 20918025  T
Q  364 tatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    | ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20918026 tgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 20918106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 29330427 - 29330234
Alignment:
Q  4 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 103  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  29330427 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgctgttggtttgatttcaaaag 29330328  T
Q  104 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 198  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29330327 gatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaa-aattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 29330234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 20901442 - 20901597
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  20901442 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaacgttgtaggtatggatgtcagctttctaatgccgttggtctgacgtcaa 20901541  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20901542 aacgatttatagaactttagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20901597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 17516492 - 17516647
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  17516492 atgaaaaccggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaa 17516591  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17516592 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 17516647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 164 - 444
Target Start/End: Original strand, 20901904 - 20902168
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 
T  20901904 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg------------- 20901990  T
Q  263 attaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtg-aataattgagacgttgttgatttacattcgatattat 361  Q
          ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || | ||||||||    
T  20901991 ------atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattat 20902084  T
Q  362 tatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttg-attaagatg 444  Q
    ||| ||||| ||  |||| |||||| || ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  20902085 tatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaattaagatg 20902168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 295989 - 296144
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  295989 atgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtatacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtctgacgtcaa 296088  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  296089 aacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacactgaat 296144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 32028280 - 32028124
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgg-tttgacttca 99  Q
    |||||| ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  32028280 atgaaatctggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggttttgacgtca 32028181  T
Q  100 aaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32028180 aaacgatttatagagcttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 32028124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 17516685 - 17516840
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  17516685 atgaaaaatggtattgattggcacagaattggtcctaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 17516784  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  17516785 aaagatttatagaacttgagttatcgtcgaattactgcacataggtcacagtgaat 17516840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 29330623 - 29330468
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  29330623 atgaaatctggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaaggccgttggtctgacgtcaa 29330524  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29330523 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattaatgcacgtatgtcacagtgaat 29330468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 32028666 - 32028511
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||    
T  32028666 atgaaatctggtattgataggtcaaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatatcgttggtctgacatcaa 32028567  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32028566 aacgatttatagagcttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 32028511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 2154153 - 2154308
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||    
T  2154153 atgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttttaatgtcgttggtctgacgtcaa 2154252  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  2154253 aacgatttatagaacttaagttatagtcaaattactgcacgtatgtcacggtgaat 2154308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 32028473 - 32028318
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||    
T  32028473 atgaaaactggtattgattggtacagaattggttttaggtgaaaacacgaaagttgtaggtatatatgttagctttctagtgctgttggtctgacgtcaa 32028374  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32028373 aacaatttatagagcttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 32028318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 20917368 - 20917523
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||| | ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  20917368 atgaaatcaggtattgataggtccataattgatcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgctggtctgacgtcaa 20917467  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  20917468 aatcatttataaaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacaatgaat 20917523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 295796 - 295951
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||| |||||||||||  || |  ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||    
T  295796 atgaaatctggtattgataagtccggaataggtcttaggtgtaaccatgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttgatctgacatcaa 295895  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  295896 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 295951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 32028086 - 32027931
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||    
T  32028086 atgaaaattgttattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaaattgtatttatggatgttagctttctaatgccattggtcggacgtcaa 32027987  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  32027986 aacgatttatagagcttgagttatggtcaaattactgcacgtaagtcacaatgaat 32027931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 269 - 444
Target Start/End: Original strand, 36154766 - 36154938
Alignment:
Q  269 atttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatca 368  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||    
T  36154766 atttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 36154865  T
Q  369 tgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    || ||  |||| |||||||   || |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36154866 tgctgtttttgtatactgc---tg-tgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 36154938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 271 - 444
Target Start/End: Original strand, 11581184 - 11581357
Alignment:
Q  271 ttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatg 370  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||| |||||    
T  11581184 ttgatgttgttatattgtgatataattgtatatacattacttgaattatacgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatg 11581283  T
Q  371 atg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
     ||  |||| ||||||  | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11581284 ttgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 11581357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 281 - 444
Target Start/End: Original strand, 10775670 - 10775834
Alignment:
Q  281 tatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgc 379  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||| ||||| ||||||      
T  10775670 tatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggtttta 10775769  T
Q  380 -atactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
     ||||||| | ||| | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10775770 tatactgc-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 10775834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 277 - 444
Target Start/End: Original strand, 18319024 - 18319192
Alignment:
Q  277 ttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttacattcgatattattatatcatgatg-g 374  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||| ||||| ||      
T  18319024 ttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 18319123  T
Q  375 tttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||| |||||| || ||| | ||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  18319124 tttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 18319192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 286 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 22144215 - 22144068
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactg 385  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||| || | |||||| |||||||||| || ||||||||||     
T  22144215 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatgttgttttgcatacta 22144116  T
Q  386 cctatgttgttgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaag 432  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  22144115 cctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22144068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 280 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 40726025 - 40725854
Alignment:
Q  280 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgc 379  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| | |||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  40726025 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgctttgc 40725926  T
Q  380 atactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||||||||| |||| || || |||  |||||||| |||||||||| ||| |||| | | ||||||||||||    
T  40725925 atactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatg 40725854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 269 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 31061248 - 31061072
Alignment:
Q  269 atttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttacattcgatattattatatc 367  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||| |||| || |||| ||||||||||| ||    
T  31061248 atttgatgttgttatattgtgatataattttatatgcattaattaaattatttgtgaataattgatacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 31061149  T
Q  368 atgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||| ||  |||| |||||  || | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31061148 atgctgtttttgtatact-actgttttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 31061072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 306 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 22412329 - 22412191
Alignment:
Q  306 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatt 405  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  22412329 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttatcgttatt 22412230  T
Q  406 taactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  22412229 taactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatg 22412191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 1096633 - 1096468
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatact 384  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||   || |||  ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| | ||| || ||| |||||||    
T  1096633 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatgtgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatact 1096534  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
     ||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  1096533 acctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgttgatg 1096468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 337 - 450
Target Start/End: Original strand, 19660841 - 19660955
Alignment:
Q  337 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttg 435  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  19660841 gttgttgatttatattcgatatcattatatcaagatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 19660940  T
Q  436 attaagatgttgatg 450  Q
     | |||||| |||||    
T  19660941 ttgaagatgatgatg 19660955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 9078118 - 9077953
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatact 384  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | |||||    
T  9078118 tgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatact 9078019  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  9078018 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgatgaagatgatgatg 9077953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 277 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 24067279 - 24067111
Alignment:
Q  277 ttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttacattcgatattattatatcatgatg-g 374  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||| ||||||||||| ||||| ||      
T  24067279 ttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtt 24067180  T
Q  375 tttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||| ||||||  | ||| | ||| |||||||||| ||| |||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  24067179 tttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaaccaagctgcattggtcggtctaagttgattaagatg 24067111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 25421698 - 25421533
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatact 384  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | |||||    
T  25421698 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 25421599  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  25421598 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 25421533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 350 - 450
Target Start/End: Original strand, 21329516 - 21329617
Alignment:
Q  350 attcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttga 448  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  21329516 attcgatattgttatattatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21329615  T
Q  449 tg 450  Q
    ||    
T  21329616 tg 21329617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 337 - 437
Target Start/End: Original strand, 22959538 - 22959639
Alignment:
Q  337 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttg 435  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  22959538 gttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 22959637  T
Q  436 at 437  Q
    ||    
T  22959638 at 22959639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 24493734 - 24493570
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactg 385  Q
    |||||||||||  ||| ||||| ||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||    
T  24493734 tgtgatataatgttatgtgcatcacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactg 24493635  T
Q  386 cctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||||||||| | | |||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  24493634 cctatgttgctattgttacttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 24493570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 286 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 24529386 - 24529227
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatact 384  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||  |||   || |||||| ||| |||||||| || |||| ||||| ||||| ||||| || ||| | |||||    
T  24529386 tgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatact 24529287  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  24529286 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 24529227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 280 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 21565713 - 21565556
Alignment:
Q  280 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgc 379  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||| | |||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||     
T  21565713 ttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgaaatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgg 21565615  T
Q  380 atactgcctatgttg-ttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 437  Q
    ||||||||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  21565614 atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21565556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Original strand, 23390451 - 23390616
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatact 384  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | |||||    
T  23390451 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 23390550  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    | |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  23390551 gtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 23390616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 351 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 36314678 - 36314578
Alignment:
Q  351 ttcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 449  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||| ||||||| || | |||||| ||||    
T  36314678 ttcgatattattatatcatgatggtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 36314579  T
Q  450 g 450  Q
    |    
T  36314578 g 36314578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 290 - 436
Target Start/End: Original strand, 26011995 - 26012141
Alignment:
Q  290 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgccta 389  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| |  |||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  26011995 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgttgattcacatttgatattgttatatcatgttgctttgcatactgccta 26012093  T
Q  390 tgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttga 436  Q
    ||||| || | |||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  26012094 tgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 26012141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 337 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 19669013 - 19668899
Alignment:
Q  337 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttg 435  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||    
T  19669013 gttgttgatttgcattcgatattgttatatcacgatgatttgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttg 19668914  T
Q  436 attaagatgttgatg 450  Q
    || | |||| |||||    
T  19668913 atgatgatgatgatg 19668899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Original strand, 21729019 - 21729184
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatact 384  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | |||||    
T  21729019 tgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatact 21729118  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  21729119 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 21729184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Original strand, 21808344 - 21808509
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatact 384  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | |||||    
T  21808344 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatact 21808443  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  21808444 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 21808509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 13025476 - 13025312
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactg 385  Q
    |||||||||||  ||| | ||||| ||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| || |||| ||||| | ||| ||||| || |||| ||||||    
T  13025476 tgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactg 13025377  T
Q  386 cctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||||||||| | | |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  13025376 cctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 13025312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 13095660 - 13095496
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactg 385  Q
    |||||||||||  ||| | ||||| ||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| || |||| ||||| | ||| ||||| || |||| ||||||    
T  13095660 tgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactg 13095561  T
Q  386 cctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||||||||| | | |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  13095560 cctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 13095496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Original strand, 8286797 - 8286963
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt--gcatac 383  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  || | ||| || || ||| |||| ||| || || | ||||||||||| ||||| || |||  | ||||    
T  8286797 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgattatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatac 8286896  T
Q  384 tgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  8286897 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 8286963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 383 - 457
Target Start/End: Original strand, 17517254 - 17517328
Alignment:
Q  383 ctgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 457  Q
    ||||||||| || | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17517254 ctgcctatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgataatgatgt 17517328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 349 - 450
Target Start/End: Original strand, 21502174 - 21502276
Alignment:
Q  349 cattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttg 447  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||  |||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  21502174 cattcgatattgttatatcatgctgatttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21502273  T
Q  448 atg 450  Q
    |||    
T  21502274 atg 21502276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 349 - 450
Target Start/End: Original strand, 21997552 - 21997654
Alignment:
Q  349 cattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttg 447  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||    
T  21997552 catttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 21997651  T
Q  448 atg 450  Q
    |||    
T  21997652 atg 21997654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 286 - 432
Target Start/End: Original strand, 22178175 - 22178323
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgcatac 383  Q
    |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||||||||||| |||| |||||| | |||||||||  || |||  ||||    
T  22178175 tgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgttttatatac 22178273  T
Q  384 tgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaag 432  Q
    |||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  22178274 tgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22178323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 286 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 25431560 - 25431414
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatact 384  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||| | || ||| |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | |||||    
T  25431560 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaacatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 25431461  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaa 431  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  25431460 gcctatgttgctgttgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa 25431414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 136
Target Start/End: Original strand, 27183180 - 27183278
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  27183180 ggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 27183278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Original strand, 22883904 - 22884013
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||   ||||||||||||||||| | |||||||||| |  ||| ||||| ||||||||||||||||     
T  22883904 aattggccttgggtgtaaacatgaaagttttaggtaattatgttagctttctaatggctttggtttgacgttcaaatgatttttagaacttgagttatga 22884003  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    ||||||||||    
T  22884004 tcaaattact 22884013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 354 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 18418677 - 18418590
Alignment:
Q  354 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtcgttattt-aactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaag 441  Q
    ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18418677 gatattattatgtcatgctg-tttgtatactgcctatgttgatgttgttattttaactaagttgcacgagtcagtctaagttgattaag 18418590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 303 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 37724050 - 37723906
Alignment:
Q  303 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtc-gt 401  Q
    |||||||||||||||||   ||||| ||||||| |||| ||| ||  ||| ||||| || || ||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||| ||    
T  37724050 tgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaatttaatttgatataatcatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtctgt 37723953  T
Q  402 tatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttga 448  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  37723952 tatttaactaagctgcatgagtcagtctaagatgttgaagatgttga 37723906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 156
Target Start/End: Original strand, 264327 - 264445
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||  | |||||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  264327 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtgccgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 264426  T
Q  138 cacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |||||||||||||||||||    
T  264427 cacgtaggtcacagtgaat 264445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Original strand, 43444009 - 43444118
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||     
T  43444009 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataactttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatga 43444108  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    | ||||||||    
T  43444109 ttaaattact 43444118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 337 - 432
Target Start/End: Original strand, 20026945 - 20027043
Alignment:
Q  337 gttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgttgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaag 432  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  20026945 gttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttggatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20027043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 20909615 - 20909497
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||  | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  20909615 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 20909516  T
Q  138 cacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |||||||||||||||||||    
T  20909515 cacgtaggtcacagtgaat 20909497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 286 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 22075185 - 22075035
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatact 384  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | |||||    
T  22075185 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatact 22075086  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttg 435  Q
     ||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  22075085 tcctatgttgctgttgttatttaactaagctgaatgagtcggtctaagttg 22075035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 12012 - 11903
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||     
T  12012 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 11913  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    | ||||||||    
T  11912 ttaaattact 11903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 136
Target Start/End: Original strand, 1220384 - 1220453
Alignment:
Q  67 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  1220384 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 1220453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 136
Target Start/End: Original strand, 10778832 - 10778901
Alignment:
Q  67 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  10778832 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 10778901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 25426286 - 25426177
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||     
T  25426286 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 25426187  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    | ||||||||    
T  25426186 ttaaattact 25426177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 7424986 - 7424879
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||     
T  7424986 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 7424887  T
Q  127 tcaaatta 134  Q
    ||||||||    
T  7424886 tcaaatta 7424879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18744036 - 18743965
Alignment:
Q  168 attgatgaattagtatatgtatgtatatgttg-tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 238  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  18744036 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatg 18743965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 39245660 - 39245621
Alignment:
Q  117 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245660 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 39245621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 39363908 - 39363869
Alignment:
Q  117 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363908 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 39363869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 23065117 - 23064999
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| |||||   |    |||||||||||| ||||||||    
T  23065117 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttcggtttatgagttatggtccaattactg 23065018  T
Q  138 cacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |||||||||||||||||||    
T  23065017 cacgtaggtcacagtgaat 23064999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 11342287 - 11342190
Alignment:
Q  39 gtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  11342287 gtgtaaacatgaaagttgtagataattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 11342190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Original strand, 21933243 - 21933352
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||     
T  21933243 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 21933342  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    ||||||||||    
T  21933343 tcaaattact 21933352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Original strand, 21939413 - 21939522
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||     
T  21939413 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 21939512  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    ||||||||||    
T  21939513 tcaaattact 21939522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Original strand, 22367095 - 22367204
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| || |||||||| ||||     
T  22367095 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttaaaacttgagatatga 22367194  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    | ||||||||    
T  22367195 ttaaattact 22367204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 35581449 - 35581340
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||     
T  35581449 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 35581350  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    ||||||||||    
T  35581349 tcaaattact 35581340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Original strand, 36990639 - 36990748
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||     
T  36990639 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 36990738  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    ||||||||||    
T  36990739 tcaaattact 36990748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 23511195 - 23511127
Alignment:
Q  68 gttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  23511195 gttagctttttaatggctttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 23511127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 238
Target Start/End: Original strand, 1628169 - 1628243
Alignment:
Q  165 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttg-tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 238  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||  |||||||||||||| |||||||    
T  1628169 atgattgatgaactattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttaatgattgatgaagtattatatg 1628243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 136
Target Start/End: Original strand, 1168832 - 1168901
Alignment:
Q  67 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||||| | | |||||||||||| ||||||||||    
T  1168832 tgttagctttctaatggctttggtttggcttccaaatgattttttggacttgagttatgatcaaattact 1168901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 136
Target Start/End: Original strand, 11212734 - 11212803
Alignment:
Q  67 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||| || || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  11212734 tgttagctttcttatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 11212803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Original strand, 18778606 - 18778715
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    |||||| ||||||||| | ||||||| || || ||| ||||| ||||||||||| ||||     
T  18778606 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagatttctaatggctttggttttacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 18778705  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    | ||||||||    
T  18778706 ttaaattact 18778715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 136
Target Start/End: Original strand, 21074249 - 21074318
Alignment:
Q  67 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  21074249 tgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 21074318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 381 - 450
Target Start/End: Original strand, 21293020 - 21293089
Alignment:
Q  381 tactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||| || | |||||| |||||    
T  21293020 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatg 21293089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 22755270 - 22755231
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttc 77  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22755270 ggtgtaaacatgaaagttgtagatatggatgttagctttc 22755231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 31479034 - 31478959
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttataga 113  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  31479034 ggtgtaaacatgaaagttttagataaagatgttagctttataatgactttggtttgacttaaaaagaatttttaga 31478959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 19499526 - 19499428
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||  | |||||||||| || ||| || || ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  19499526 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatagctttggtttgacgtccaaatgagttttagaacttgagatatgattaaattact 19499428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 198
Target Start/End: Original strand, 20917777 - 20917811
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20917777 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 20917811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 66 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 32950283 - 32950213
Alignment:
Q  66 atgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| || |||  |||| |||||  ||||||||| ||||||||||    
T  32950283 atgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaataatttttagaatgtgagttatgatcaaattact 32950213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 136
Target Start/End: Original strand, 35791736 - 35791834
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| |  |||  |||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  35791736 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatgactttggtttgacgttcaaataatttttagaacttgagatatgattaaattact 35791834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 38619960 - 38619922
Alignment:
Q  117 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 155  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  38619960 tgagttatggtccaattactgcacgtaggtcacaatgaa 38619922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 19511862 - 19511781
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 108  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||    
T  19511862 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgattt 19511781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 383 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 20805616 - 20805555
Alignment:
Q  383 ctgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||    
T  20805616 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatg 20805555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 383 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 21873318 - 21873257
Alignment:
Q  383 ctgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||    
T  21873318 ctgcctatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatg 21873257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 22750296 - 22750267
Alignment:
Q  256 gatgttgattaccatttgatattgttatat 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22750296 gatgttgattaccatttgatattgttatat 22750267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 383 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 23572148 - 23572087
Alignment:
Q  383 ctgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||    
T  23572148 ctgcctatgctgttattgttattgaactaagttgcatgagtccatataagatgattaagatg 23572087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 96
Target Start/End: Original strand, 37804450 - 37804519
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgact 96  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||  | ||||||||||| |||| | || ||||||||    
T  37804450 aattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataatgttgttagctttccaatggctttagtttgact 37804519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 400 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 20767021 - 20766977
Alignment:
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||    
T  20767021 gttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatg 20766977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 400 - 444
Target Start/End: Original strand, 20806856 - 20806900
Alignment:
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  20806856 gttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatg 20806900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 238
Target Start/End: Original strand, 21399896 - 21399968
Alignment:
Q  167 gattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 238  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| |||| |||| |||||||| | |||||||    
T  21399896 gattgatgaattattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgttgttcatggttgatgaattattatatg 21399968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 364 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 22032406 - 22032326
Alignment:
Q  364 tatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||||||| ||||| |  |||||||||||| | | |||||| ||| ||||||||||||||  | |||| |||||||||||    
T  22032406 tatcatgattgtttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 22032326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 245 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 25743848 - 25743808
Alignment:
Q  245 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatat 285  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  25743848 tgatgttttaagttgttgattactacttgatattgttatat 25743808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 67 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 28901555 - 28901495
Alignment:
Q  67 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggt 127  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||    
T  28901555 tgttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggt 28901495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 67 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 28937950 - 28937890
Alignment:
Q  67 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggt 127  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||    
T  28937950 tgttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggt 28937890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 332; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 11737 - 11279
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  11737 atgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgatacttgtaggtatggatgttagctttctattgccgttgggttgacttcaa 11638  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11637 aatgatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagttaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 11538  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatata-tgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataatta 298  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11537 tgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgattttgttatattgtgatataatta 11438  T
Q  299 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttg 397  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| |||||| || ||||| ||    
T  11437 tatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg 11339  T
Q  398 tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 457  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  11338 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaatttgattaagatgttgatgataatgt 11279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 383 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 12827 - 12766
Alignment:
Q  383 ctgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||    
T  12827 ctgcctatgctgttattgttattgaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatg 12766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 330; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 5142 - 4698
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  5142 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccaatggtttgacttcaa 5043  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5042 aatgatttatagaacttgagttatagtcaaattacagcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 4943  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattat 299  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4942 tgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgttgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattat 4843  T
Q  300 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgt 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| |||||| || ||||| |||    
T  4842 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgttgctgt 4744  T
Q  399 cgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
     |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  4743 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaggatg 4698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 5335 - 5180
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  5335 atgaaaactgatattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagttttcttatgccgttggtctgacgtcaa 5236  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5235 aacgatatatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 5180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 330; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 14395 - 13951
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14395 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaacgttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 14296  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14295 aaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 14196  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  14195 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgt 14096  T
Q  300 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgt 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||    
T  14095 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgt 13997  T
Q  399 cgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
     |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13996 tgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 13951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 23245 - 23484
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || | |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23245 atgaaaactggtatttattgatatagaattagtctaaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatagatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 23344  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23345 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 23444  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23445 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 23484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 22892 - 23047
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22892 atgaaatctggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaa 22991  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22992 aacgatttatagaacatgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 23047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #4
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 70 - 156
Target Start/End: Original strand, 23121 - 23207
Alignment:
Q  70 tagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23121 tagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 23207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 330; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 38269 - 37825
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38269 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 38170  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38169 aaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 38070  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  38069 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgt 37970  T
Q  300 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgt 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||    
T  37969 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgt 37871  T
Q  399 cgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
     |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37870 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 37825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 38425 - 38307
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 137  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  38425 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 38326  T
Q  138 cacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |||||||||||||||||||    
T  38325 cacgtaggtcacagtgaat 38307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 329; Significance: 0; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 137127 - 136684
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  137127 atgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 137028  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  137027 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgt 136928  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  136927 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgta 136828  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||     
T  136827 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactg-ttgtgttgctgtt 136729  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  136728 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 136684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 139596 - 139153
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  139596 atgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 139497  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  139496 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgt 139397  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  139396 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgta 139297  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||     
T  139296 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactg-ttgtgttgctgtt 139198  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  139197 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 139153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 144534 - 144091
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144534 atgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 144435  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  144434 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgt 144335  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  144334 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgta 144235  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||     
T  144234 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactg-ttgtgttgctgtt 144136  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  144135 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 144091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 134658 - 134215
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  134658 atgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 134559  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  134558 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgt 134459  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  134458 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgta 134359  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||     
T  134358 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactg-ttgtgttgctgtt 134260  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  134259 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatg 134215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 142065 - 141622
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  142065 atgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 141966  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  141965 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgt 141866  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  141865 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgta 141766  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||     
T  141765 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactg-ttgtgttgctgtt 141667  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  141666 gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatg 141622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 62301 - 62216
Alignment:
Q  349 cattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagt 433  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| || | ||| |||||||||| |||||||||| || |||||    
T  62301 cattcgatattattataccatgatgtttttcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtttaagt 62216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 326 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 132784 - 132672
Alignment:
Q  326 ataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagt 423  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| | ||||||| || | |||||||| ||||| |||||||||    
T  132784 ataattgagacgttgatgatt-acattcgatattgttgtatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagt 132686  T
Q  424 cagtctaagttgat 437  Q
    | ||||||| ||||    
T  132685 cggtctaagatgat 132672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 328; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 21193 - 20751
Alignment:
Q  3 gaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21193 gaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaa 21094  T
Q  103 ggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21093 ggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtg 20994  T
Q  202 aatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattatat 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  20993 aatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtat 20894  T
Q  302 atgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| ||| |    
T  20893 atgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttg 20795  T
Q  401 ttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20794 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 20751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 2)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 13840 - 13396
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13840 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtataaatgttatctttctaatgccgttggtttgacttcaa 13741  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13740 aaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 13641  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||| ||||| |    
T  13640 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttacatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatgtaattgt 13541  T
Q  300 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgt 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| |||    
T  13540 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgt 13442  T
Q  399 cgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
     |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13441 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 13396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 13918 - 13878
Alignment:
Q  116 ttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13918 ttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 13878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 4 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 40844 - 40404
Alignment:
Q  4 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 103  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40844 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagatataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 40745  T
Q  104 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaa 203  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40744 gatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgtgaa 40645  T
Q  204 tacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattatatat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  40644 tacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgaagttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatat 40545  T
Q  304 gcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgtt 402  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||  ||  |||| ||||||  | ||||| ||| |||    
T  40544 gcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgtt 40446  T
Q  403 atttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  40445 atttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatg 40404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 37968 - 37848
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   |||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||     
T  37968 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttcaaatggctttggtttgacttccaaatgattt-tagaacttgagttatga 37870  T
Q  127 tcaaattactgcacgtaggtca 148  Q
    |||||||||| ||| |||||||    
T  37869 tcaaattactacacataggtca 37848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 40925 - 40885
Alignment:
Q  116 ttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40925 ttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 40885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 1)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 6394 - 6070
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6394 atgaaaactggtattcattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 6295  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6294 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttgt 6195  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattata 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||  |    
T  6194 gaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatttaattgca 6095  T
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtga 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  6094 tatgcattacttgaattatatgtga 6070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 79 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 11142 - 10772
Alignment:
Q  79 aatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaatt 178  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11142 aatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcatgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaatt 11043  T
Q  179 agtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatatt 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11042 agtatatgtatgtatatgttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgtt 10943  T
Q  279 gttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gttt 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||  |||    
T  10942 gttatattgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttt 10843  T
Q  378 gcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 449  Q
    | |||||| || ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10842 gtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 10772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 501512 - 501075
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501512 atgaaaagtgatattgattgttacagaattggtcttatgtgtaaacacgaaagttgtagg-atagatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 501414  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-g 199  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   |||||||||||| |    
T  501413 aatgatttatagaacttgagttatgatcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatg-------------------tatgtatatgtttg 501333  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattat 299  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  501332 tgaatacgatattgttcatgattgatgatgtgttatatgtatatataatgttttaagatgttgattactatttgatgttgttatattgtgatataattat 501233  T
Q  300 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgt 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||| || || ||||| |||    
T  501232 atatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattg-ctgtgttgctgt 501134  T
Q  399 cgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 457  Q
     |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  501133 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgttgattatgt 501075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 501705 - 501550
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| |||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  501705 atgaaatctggtattgataggtcaagaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaa 501606  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501605 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 501550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 269 - 444
Target Start/End: Original strand, 85562 - 85738
Alignment:
Q  269 atttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttacattcgatattattatatc 367  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| || |||| ||||||||||| ||    
T  85562 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattcagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 85661  T
Q  368 atgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||| ||  |||| ||||||  | ||| | ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  85662 atgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatg 85738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 280 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 160854 - 160698
Alignment:
Q  280 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgc 379  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||  ||||| ||| |||| | ||| || |||| | ||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  160854 ttataatgttatataattgtatatatattacatgacttatgtttga-tatttgacatgttgttgattg-catttgatattgttatatcatgatgatttgc 160757  T
Q  380 atactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 437  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  160756 atactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 160698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 94
Target Start/End: Original strand, 139589 - 139645
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttga 94  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||    
T  139589 ggtgtaaacatgaaagtcgtaggtatgaaagttagctttctaatggctttggtttga 139645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 27 - 444
Target Start/End: Original strand, 38396 - 38816
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  38396 aattgatcttagggctaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaatttgagttatgt 38495  T
Q  127 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 225  Q
    ||||||||||| | ||  |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38496 tcaaattactgtatgtttgtcatattgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 38595  T
Q  226 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtg 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |     
T  38596 gaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgcaatacttgaattatatata 38695  T
Q  325 aataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagt 423  Q
    |||| ||||||  ||| ||| || |||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||| |||||||||    
T  38696 aatatttgagatattgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagt 38795  T
Q  424 cagtctaagttgattaagatg 444  Q
      |||||||||||||||||||    
T  38796 aggtctaagttgattaagatg 38816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 3471 - 3186
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3471 atgaaaactggtattgattgttacataattgttcttagttgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 3372  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  3371 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttg 3272  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatat 285  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3271 tgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtagatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 3186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 4)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 4017 - 4304
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4017 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcataggtgtaaacatgaaaggtgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 4116  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4117 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtgggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 4216  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatattgttatat 285  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  4217 tgaatattatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 4304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 3824 - 3979
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||    
T  3824 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtggaaacacgaaagttgtaggtattgatgttagctttctaattccgttggtctgatgtcaa 3923  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3924 aacgatttatgaaacttgagttatgatcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 3979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 3631 - 3782
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  3631 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagctgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgaggtcaa 3730  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 152  Q
    || |||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  3731 aacgatttatgtaacttgagttatgctcaaattactgaacgtaggtcacagt 3782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 104 - 156
Target Start/End: Original strand, 3541 - 3593
Alignment:
Q  104 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  3541 gatttatagaacttgagttatggtcaaaatactgcacgtaggtcactgtgaat 3593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Original strand, 6650 - 6902
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  6650 atgaaaattggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttccaatgccgttggtccgacgtcaa 6749  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6750 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 6849  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 252  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6850 tgaatactatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 6902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 156
Target Start/End: Original strand, 6465 - 6612
Alignment:
Q  9 tggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 108  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  6465 tggtattgataggtccagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccgttggtctgacgtcaaaatgattt 6564  T
Q  109 atagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6565 atagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 6612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 3)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 238 - 476
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  238 atgaaaactggtattgattggtacataaatggtcttaggtgtaaacaagaaagttataggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 337  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  338 aaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 437  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 238  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  438 tgaatacgatattgttcatgattgataaagtgttatatg 476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 231 - 457
Target Start/End: Original strand, 12194 - 12420
Alignment:
Q  231 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataat 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12194 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattaaatgtgaataat 12293  T
Q  331 tgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtct 429  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||| | ||||| ||  |||| || ||| || ||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  12294 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattctg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtct 12392  T
Q  430 aagttgattaagatgttgatgatgatgt 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12393 aagttgattaagatgttgatgatgatgt 12420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 238
Target Start/End: Original strand, 507 - 582
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  507 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 46 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 1831 - 1591
Alignment:
Q  46 cacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagg 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1831 cacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagg 1732  T
Q  146 tcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatat-gttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatata 244  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1731 tcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatttatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatata 1632  T
Q  245 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatattgttatat 285  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1631 tgattttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 1591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 4)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 15352 - 15083
Alignment:
Q  19 tggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttg 118  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  15352 tggtacagatttggtcttaggtgtaaccacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgctggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttg 15253  T
Q  119 agttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtcca 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15252 agttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatttatatgtttgtgaatactatattgtcca 15153  T
Q  218 tgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatattgttatat 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  15152 tgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 15083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 11054 - 11256
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  11054 atgaaaattggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttccaatgccgttggtccgacgtcaa 11153  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11154 aacgatttatagtacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 11253  T
Q  201 gaa 203  Q
    |||    
T  11254 gaa 11256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 156
Target Start/End: Original strand, 10869 - 11016
Alignment:
Q  9 tggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattt 108  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  10869 tggtattgataggtccagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccgttggtctgacgtcaaaatgattt 10968  T
Q  109 atagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10969 atagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 11016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 15552 - 15398
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||| |||||||| || ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  15552 atgaaatctggtattaataggtccagaattggtcttag-tgtaaacacgaaagttgtaggtatggacgttagctttctaatgtcgttggtctgacatcaa 15454  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15453 aacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 3)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 30467 - 30229
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  30467 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttcggtgtaaacattaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtttcacttcaa 30368  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30367 aaggatttgtagtacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 30268  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 238  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30267 tgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 30229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 30660 - 30505
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||    
T  30660 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttccaatgccattggtgtgacgtcaa 30561  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30560 aacgatttataaaactttagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 30505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 166 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 30196 - 29946
Alignment:
Q  166 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgat 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   
T  30196 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg--------------- 30112  T
Q  265 taccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattat 364  Q
        ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  30111 ----atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgaattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacacttgatattattat 30016  T
Q  365 atcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagtt 434  Q
     ||||| ||  |||| ||||||  | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  30015 gtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 4)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 10239 - 10001
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10239 atgaaaactagtattgattggtacagtgttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctattgccgttggtttgacttcaa 10140  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  10139 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattatttcatgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtgtgtatatgtttg 10040  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 238  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10039 tgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 10001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 10432 - 10277
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  10432 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttatgtgtcaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgccgttggtctgacatcaa 10333  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10332 aacgatttatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 10277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 10624 - 10470
Alignment:
Q  2 tgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaa 101  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  10624 tgaaatctggtattgataggtccataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtctgacgtcaaa 10525  T
Q  102 aggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  10524 aagatttatagaacttgcgttatggtcaaattactgcatgtaggtcacaatgaat 10470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 9970 - 9936
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9970 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 9936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 27 - 285
Target Start/End: Original strand, 53612 - 53873
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  53612 aattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacgtcaaagggatttatagaacttgagatatgg 53711  T
Q  127 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgat 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  53712 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgataaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatattatattgttcatgattgat 53811  T
Q  226 gaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatattgttatat 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  53812 gaagtgttatatgtatatatgatgtttaagtagatgttgattatcatttgatgttgttatat 53873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 306 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 116571 - 116434
Alignment:
Q  306 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatt 405  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||| || |||| ||||| ||||| ||||| || |||| ||||||  | ||| | ||| ||||||    
T  116571 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatt 116473  T
Q  406 taactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  116472 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 116434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Original strand, 128907 - 129072
Alignment:
Q  269 atttgatattgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatc 367  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| ||| |  |||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  128907 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatccattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 129005  T
Q  368 atga--tggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaag 432  Q
    ||||  || |||   |||||||||||||| || | |||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  129006 atgaattgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 129072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 3)
Name: scaffold1792
Description:

Target: scaffold1792; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 655 - 416
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || | |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  655 atgaaaactggtatttattgatatagaattagtctaaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatagatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 556  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 199  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  555 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtaagtatatgtttg 456  T
Q  200 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  455 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 1008 - 853
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  1008 atgaaatctggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaa 909  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  908 aacgatttatagaacttgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 70 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 779 - 693
Alignment:
Q  70 tagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  779 tagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 4)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1034 - 799
Alignment:
Q  4 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 103  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1034 aaaactggtattgattggtacagcattcgtcttaggagtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaat 935  T
Q  104 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtga 202  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  934 tatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaatttgtatatgtatgtatatgtttgtga 835  T
Q  203 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 238  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  834 atactatattgttcatgattgatgaagttttatatg 799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 1224 - 1075
Alignment:
Q  7 actggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||| |||    
T  1224 actggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtctgatgtcaaaaagat 1125  T
Q  107 ttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  1124 ttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgcaggtcatagtgaat 1075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 164 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 768 - 645
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgtt 261  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||    
T  768 tatgattgattaattagtatatgtatgtatatgttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgtt 669  T
Q  262 gattaccatttgatattgttatat 285  Q
    ||||| |||||||| |||||||||    
T  668 gattatcatttgatgttgttatat 645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #4
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 1338 - 1225
Alignment:
Q  12 tattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttata 111  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||| ||||||||    
T  1338 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttct-atgccgttggtctgacgtctaaacgatttata 1240  T
Q  112 gaacttgagttatgg 126  Q
    |||||||||||||||    
T  1239 gaacttgagttatgg 1225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 183; Significance: 8e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 6899 - 6682
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6899 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 6800  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||    
T  6799 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgt---------ttgt 6709  T
Q  201 gaatacgatattgtccatgattgatga 227  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||    
T  6708 gaatacgatattgttcatgattgatga 6682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 7092 - 6937
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  7092 atgaaaattgctattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgacgtcaa 6993  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6992 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 6937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 4)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 8187 - 7996
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8187 atgaaaactggtattgattagtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaa 8088  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgta 192  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8087 aaggatttatagaatttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgta 7996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 8380 - 8225
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  8380 atgaaaactggtattgattggtacataactggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaatccccttggtttgacgtcaa 8281  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8280 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 8225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 5 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 8569 - 8421
Alignment:
Q  5 aaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| |    
T  8569 aaactggtattgattggtacataattggtcttacgtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaattccattggtatgacgtcaaaaag 8470  T
Q  105 atttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtg 153  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8469 atttatacaacttgagttatggtgaaattactgcacgtaggtcacagtg 8421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #4
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 290 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 5803 - 5657
Alignment:
Q  290 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgccta 389  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  5803 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttcatactgccta 5706  T
Q  390 tgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 437  Q
    ||||| || | ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  5705 tgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 5657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 68409 - 68227
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  68409 atgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttatgtgtaaacacgaaagttgtatgtatggatgttagctttctagtgccattggtttgacttcaa 68310  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  68309 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 68227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 382 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 47065 - 46996
Alignment:
Q  382 actgcctatgttgttgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||| ||||||| || | |||||| |||||    
T  47065 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 46996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 158; Significance: 7e-84; HSPs: 3)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 43187 - 43002
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43187 atgaaaactggtattgattggtacatttttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 43088  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatg 186  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43087 aagggtttatagaacttgagttatagtcaaattagtgcacgtaggtcacagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatg 43002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 39 - 230
Target Start/End: Original strand, 13379 - 13571
Alignment:
Q  39 gtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgc 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  13379 gtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagcttactagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaacttgagttatggtcaaattactga 13478  T
Q  139 acgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 230  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13479 acgtaggtcacaatgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagt 13571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 43380 - 43225
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  43380 atgaaatctggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 43281  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43280 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 43225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 65 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 57865 - 57708
Alignment:
Q  65 gatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaat 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  57865 gatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatacttgaat 57766  T
Q  165 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgat 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  57765 atgagtgataaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgat 57708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 1895 - 1740
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1895 atgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 1796  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1795 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 1740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 1702 - 1634
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgt 69  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1702 atgaaaattggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgt 1634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 18578 - 18423
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||    
T  18578 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcattggtctgacgtcaa 18479  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18478 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 18423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 123; Significance: 5e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 18101 - 17947
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||    
T  18101 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccattggtctgacgtcaa 18002  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 155  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18001 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgaa 17947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 123; Significance: 5e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 31651 - 31497
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  31651 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtattaatgttagctttctaatgccattggtctgacgtcaa 31552  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 155  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31551 aacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 31497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0436
Description:

Target: scaffold0436; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 8466 - 8311
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  8466 atgaaaactgatattgattggtatagaattgctcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgctattggtttgacttcaa 8367  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  8366 aaggatttatagaacttgagttatggtaaaattactgcacgttggtcacagtgaat 8311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0711
Description:

Target: scaffold0711; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 155
Target Start/End: Original strand, 7408 - 7558
Alignment:
Q  5 aaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagg 104  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |    
T  7408 aaactggtattgattggtacagaattggtcttgggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtctgacatcaaaatg 7507  T
Q  105 atttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7508 atttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaa 7558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 156
Target Start/End: Original strand, 7219 - 7367
Alignment:
Q  8 ctggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatt 107  Q
    |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||||| |||| ||||||  |||    
T  7219 ctggtattgattggtaaagaatatgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttatccttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatt 7318  T
Q  108 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7319 tataaaacttgagttatggtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaat 7367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 61 - 154
Target Start/End: Original strand, 7079 - 7172
Alignment:
Q  61 tatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtga 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7079 tatggatgttagctttctaatgccgttgctctgccgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtga 7172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 33619 - 33465
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| | ||    
T  33619 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgtcgttggtctgacgtaaa 33520  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 155  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33519 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacggtgaa 33465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 349 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 13042 - 12954
Alignment:
Q  349 cattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttga 436  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||    
T  13042 cattcgatattgttatatcatgctgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 12954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 270 - 371
Target Start/End: Original strand, 18176 - 18277
Alignment:
Q  270 tttgatattgttat-attgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatca 368  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||||||||||| |||| |||||| | ||||||    
T  18176 tttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatca 18274  T
Q  369 tga 371  Q
    |||    
T  18275 tga 18277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 39780 - 39626
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||    
T  39780 atgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagttatggatgttagctttctaatgccattggtctaacgtcaa 39681  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 155  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  39680 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattattacacgtaggtcacagtgaa 39626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 256 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 82264 - 82076
Alignment:
Q  256 gatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcga 355  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  82264 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 82165  T
Q  356 tattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||||||| ||||| ||  |||| |||||  || ||||| ||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  82164 tattattatgtcatgctgtttttgtatact-actgtgttgctgttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaagatg 82076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 280 - 436
Target Start/End: Original strand, 22620 - 22776
Alignment:
Q  280 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgc 379  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  22620 ttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc 22718  T
Q  380 atactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttga 436  Q
    |||||| |||||| | || | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  22719 atactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 22776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 106; Significance: 7e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 256 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 298 - 110
Alignment:
Q  256 gatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcga 355  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  298 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 199  T
Q  356 tattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||||||| ||||| ||  |||| |||||   | ||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  198 tattattatgtcatgttgtttttgtatact-attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatg 110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 36913 - 37068
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    |||||||||  |||||||||| | | |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  36913 atgaaaactaatattgattggaaaaaaattagtcatagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaa 37012  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  37013 aaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagatcatagtgaat 37068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 30 - 156
Target Start/End: Original strand, 36749 - 36875
Alignment:
Q  30 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtca 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36749 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttaactttctaatgttgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtca 36848  T
Q  130 aattactgcacgtaggtcacagtgaat 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  36849 aattactgcacgtaggtcacagtgaat 36875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 3)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 164 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 28073 - 27962
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28073 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 27974  T
Q  264 ttaccatttgat 275  Q
    |||  |||||||    
T  27973 ttattatttgat 27962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 100 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 28190 - 28092
Alignment:
Q  100 aaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28190 aaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt 28092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 354 - 450
Target Start/End: Original strand, 15487 - 15583
Alignment:
Q  354 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  15487 gatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctcttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatg 15583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 19803 - 19957
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  19803 atgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacgcaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtctgacgtcaa 19902  T
Q  101 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 155  Q
    || || ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  19903 aacgaattatataacttgagttatcgtcaaattactacacgtaggtcatagtgaa 19957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 4)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 164 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 10016 - 9753
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 262  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||                    
T  10016 tatgattgatgagttagtatatgtatgtataagtttgtgaatacgatattgtacatgattgatgaagtgttatatgtatatatg---------------- 9933  T
Q  263 attaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtg-aataattgagacgttgttgatttacattcgatattat 361  Q
       || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || | ||||||||    
T  9932 ---acgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattat 9836  T
Q  362 tatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||| ||||  ||  |||| ||||||  | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9835 tatgtcattctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 9753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 38926 - 38762
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactg 385  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||| |||| |||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||    
T  38926 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactg 38827  T
Q  386 cctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||||||||| | | ||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||    
T  38826 cctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgactcggtctaagttgatgaagatgatgatg 38762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 33107 - 32943
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactg 385  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||| | || |||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||    
T  33107 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactg 33008  T
Q  386 cctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||||||||| | | ||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  33007 cctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatg 32943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 166 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 10067 - 10005
Alignment:
Q  166 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatga 227  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||| ||||  |||||||||||    
T  10067 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtacgatgttgtttatgattgatga 10005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 101; Significance: 7e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 269 - 444
Target Start/End: Original strand, 158433 - 158608
Alignment:
Q  269 atttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatca 368  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||    
T  158433 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 158532  T
Q  369 tgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    || ||  |||| ||||||  | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  158533 tgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 158608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 286 - 436
Target Start/End: Original strand, 339905 - 340053
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactg 385  Q
    |||||||||||  ||||  |||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||| ||  ||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||    
T  339905 tgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttg-atttgatattattatgtcatgttgttttgtatactg 340003  T
Q  386 cctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttga 436  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  340004 cctatgttgttgt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 340053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 269 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 4476 - 4301
Alignment:
Q  269 atttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatca 368  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||    
T  4476 atttgatgatgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgattaattgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtca 4377  T
Q  369 tgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    || ||  |||| |||||  || ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4376 tgttgtttttgtatact-actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 4301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 281 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 4382 - 4218
Alignment:
Q  281 tatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttacattcgatattattatatcatgatgg-tttg 378  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  4382 tatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttg 4283  T
Q  379 catactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
     |||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4282 tatactg-ctgtgtcgctgtcgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 4218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 164 - 285
Target Start/End: Original strand, 10765 - 10886
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10765 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatactgtccataattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaaatgttga 10864  T
Q  264 ttaccatttgatattgttatat 285  Q
     ||  ||||||| |||||||||    
T  10865 gtattatttgatgttgttatat 10886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 152 - 238
Target Start/End: Original strand, 10647 - 10734
Alignment:
Q  152 tgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10647 tgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 10734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 269 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 16963 - 16788
Alignment:
Q  269 atttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatca 368  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||    
T  16963 atttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 16864  T
Q  369 tgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    || ||  |||| |||||  || ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16863 tgttgtttttgtatact-actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 280 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 11636 - 11465
Alignment:
Q  280 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgc 379  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| | |||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  11636 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttttgc 11537  T
Q  380 atactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||||||||||||||| || | |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||    
T  11536 atactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatg 11465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 280 - 450
Target Start/End: Original strand, 38205 - 38376
Alignment:
Q  280 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgc 379  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| | |||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  38205 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttttgc 38304  T
Q  380 atactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||||||||||||||| || | |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||    
T  38305 atactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatg 38376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 256 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 12250 - 12068
Alignment:
Q  256 gatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcga 355  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||    
T  12250 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 12151  T
Q  356 tattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||||||| ||||| || ||| | |||||| || ||||| ||      |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12150 tattattatgtcatgctgttttagtatactg-ctgtgttgctg------tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 5)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 164 - 285
Target Start/End: Original strand, 15150 - 15273
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgtt 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||    
T  15150 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgcgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgtt 15249  T
Q  262 gattaccatttgatattgttatat 285  Q
    ||||| |||||||| |||||||||    
T  15250 gattatcatttgatgttgttatat 15273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 140 - 238
Target Start/End: Original strand, 15030 - 15119
Alignment:
Q  140 cgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatg 238  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  15030 cgtaggtcatagtgaataattgaatatgattaatgaattagtatatgt---------ttgtgaatactatattgttcataattgatgaagtgttatatg 15119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 383 - 444
Target Start/End: Original strand, 15291 - 15352
Alignment:
Q  383 ctgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15291 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatg 15352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 380 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 7338 - 7267
Alignment:
Q  380 atactgcctatgttgttgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||| || | |||||| |||||    
T  7338 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 7267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 354 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 1385 - 1290
Alignment:
Q  354 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||||| ||||| ||||||||  ||| | ||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||| || | |||||| |||||    
T  1385 gatataattatgtcatgatg--ttgtacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 1290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 280 - 432
Target Start/End: Original strand, 20373 - 20524
Alignment:
Q  280 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgc 379  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||||     
T  20373 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgt 20472  T
Q  380 atactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaag 432  Q
    ||||||  | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  20473 atactg-atgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 128916 - 128752
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactg 385  Q
    |||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || |||   |  |     
T  128916 tgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttttttt 128817  T
Q  386 cctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
      | ||||| | | ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||    
T  128816 tttttgttgcttttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaatttgattaagatgatgatg 128752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 280 - 450
Target Start/End: Original strand, 17976 - 18147
Alignment:
Q  280 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgc 379  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | || | ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  17976 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttgtgc 18075  T
Q  380 atactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||| ||| ||||||| || | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  18076 ataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 18147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 269 - 440
Target Start/End: Original strand, 2111 - 2283
Alignment:
Q  269 atttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt-gttgatttacattcgatattattatatc 367  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||| || |||| ||||||||||| ||    
T  2111 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttaattgacttgcatttgatattattatgtc 2210  T
Q  368 atgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaa 440  Q
    ||| ||  |||| ||||||  | ||| | ||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  2211 atgttgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcaagagtcggtctaagttgattaa 2283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 279 - 436
Target Start/End: Original strand, 27697 - 27855
Alignment:
Q  279 gttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttg 378  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||    
T  27697 gttataatgtgatataattgtatatgcattactagaattatatgtgaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatgctgttttg 27796  T
Q  379 catactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttga 436  Q
    |||||| |||||||||||| | |||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  27797 catactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 27855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 256 - 444
Target Start/End: Original strand, 1250 - 1439
Alignment:
Q  256 gatgttgattaccatttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttacattcg 354  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||| |    
T  1250 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttg 1349  T
Q  355 atattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||| ||||| ||  |||| ||||| | | |||| |||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1350 atattattatgtcatgctgtttttgtatact-catgtgttattgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 1439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 269 - 450
Target Start/End: Original strand, 1011 - 1189
Alignment:
Q  269 atttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatca 368  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1011 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatca 1106  T
Q  369 tgatggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||| || | |||||| |||||    
T  1107 tgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 1189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 136
Target Start/End: Original strand, 32118 - 32216
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||   | ||||||||||||||| | ||||||| || || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  32118 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 32216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 279 - 436
Target Start/End: Original strand, 16048 - 16206
Alignment:
Q  279 gttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttg 378  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||  |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||    
T  16048 gttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatgttgttttg 16147  T
Q  379 catactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttga 436  Q
    |||||| |||||||||||| | |||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  16148 catactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 16206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 279 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 13302 - 13147
Alignment:
Q  279 gttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattg-agacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt 377  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||  ||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||| || |||    
T  13302 gttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatggtttcagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt 13203  T
Q  378 gcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaag 432  Q
    |||||||||||||||||||| | |||  ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  13202 gcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Original strand, 3106 - 3270
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactg 385  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||    
T  3106 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactg 3205  T
Q  386 cctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  3206 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 3270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 176 - 266
Target Start/End: Original strand, 35955 - 36046
Alignment:
Q  176 attagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatg-aagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatta 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35955 attagtatatgtatgtatatgttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatta 36046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 349 - 436
Target Start/End: Original strand, 23901 - 23989
Alignment:
Q  349 cattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttga 436  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  23901 cattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttga 23989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 79; Significance: 9e-37; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 337 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 11407 - 11293
Alignment:
Q  337 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttg 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  11407 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 11308  T
Q  436 attaagatgttgatg 450  Q
     | |||||| |||||    
T  11307 ttgaagatgatgatg 11293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 337 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 2112 - 1998
Alignment:
Q  337 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatg-ttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttg 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  2112 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 2013  T
Q  436 attaagatgttgatg 450  Q
     | |||||| |||||    
T  2012 ttgaagatgatgatg 1998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 337 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 28529 - 28415
Alignment:
Q  337 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttg 435  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  28529 gttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 28430  T
Q  436 attaagatgttgatg 450  Q
    || |||||| |||||    
T  28429 atgaagatgatgatg 28415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 400 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 4603 - 4553
Alignment:
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  4603 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 4553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 269 - 444
Target Start/End: Original strand, 161072 - 161248
Alignment:
Q  269 atttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttacattcgatattattatatc 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| || |||| ||||||||||| ||    
T  161072 atttgatattgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 161171  T
Q  368 atgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    || |||  |||| |||||| || ||| | ||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  161172 attatgtttttgtatactg-ctgtgtcgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttggttaagatg 161248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 269 - 369
Target Start/End: Original strand, 164573 - 164674
Alignment:
Q  269 atttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttacattcgatattattatatc 367  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| || |||| ||||||||||| ||    
T  164573 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 164672  T
Q  368 at 369  Q
    ||    
T  164673 at 164674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 286 - 453
Target Start/End: Original strand, 3141 - 3309
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatact 384  Q
    |||||||||||  || | ||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||| | |||||    
T  3141 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaattacatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 3240  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatg 453  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  3241 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgatg 3309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 280 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 8640 - 8481
Alignment:
Q  280 ttatattgtgatataat--tatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt 377  Q
    ||||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||| || |||| |||||| |||||||||| || |||    
T  8640 ttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt 8541  T
Q  378 gcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttga 436  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  8540 gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 290 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 6695 - 6536
Alignment:
Q  290 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgccta 389  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6695 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgccta 6598  T
Q  390 tgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||||| || | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||| |||||    
T  6597 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgatg 6536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 337 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 15776 - 15668
Alignment:
Q  337 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttg 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  15776 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttg 15677  T
Q  436 attaagatg 444  Q
    |||||||||    
T  15676 attaagatg 15668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 286 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 39642 - 39486
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactg 385  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||    
T  39642 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactg 39543  T
Q  386 cctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaaga 442  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  39542 cctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 39486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 269 - 432
Target Start/End: Original strand, 79267 - 79430
Alignment:
Q  269 atttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatca 368  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  79267 atttgatgttgttatattgtgatatacttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgaaattattatgtca 79366  T
Q  369 tgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaag 432  Q
    || ||  |||  |||||| |  ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  79367 tgctgtttttatatactgtc-gtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 286 - 453
Target Start/End: Original strand, 17170 - 17340
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt---gcata 382  Q
    |||||||||||  || | ||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || |||   | |||    
T  17170 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtata 17269  T
Q  383 ctgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatg 453  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  17270 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgatg 17340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 286 - 442
Target Start/End: Original strand, 75170 - 75326
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactg 385  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||    
T  75170 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactg 75269  T
Q  386 cctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaaga 442  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  75270 cctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 75326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 290 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 290 - 143
Alignment:
Q  290 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgccta 389  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  290 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgccta 192  T
Q  390 tgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 437  Q
    |||||||| | ||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  191 tgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgat 143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 286 - 444
Target Start/End: Original strand, 26020 - 26179
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatact 384  Q
    |||||||||||  || | ||||||||||||||||   || ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | |||||    
T  26020 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 26119  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  26120 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 306 - 444
Target Start/End: Original strand, 44682 - 44821
Alignment:
Q  306 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtcgttat 404  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||| ||||| ||| |||||    
T  44682 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttat 44781  T
Q  405 ttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44782 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 44821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 337 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 34238 - 34124
Alignment:
Q  337 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttg 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  34238 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttg 34139  T
Q  436 attaagatgttgatg 450  Q
     | |||||| |||||    
T  34138 ttgaagatgatgatg 34124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 13264 - 13149
Alignment:
Q  280 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttg 378  Q
    |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||| || || | ||||||||||| ||||| ||  ||||    
T  13264 ttatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 13165  T
Q  379 catactgcctatgttg 394  Q
     |||||||||||||||    
T  13164 tatactgcctatgttg 13149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 13377 - 13212
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatact 384  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | |||||    
T  13377 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13278  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  13277 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatg 13212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 290 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 19424 - 19278
Alignment:
Q  290 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgccta 389  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19424 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgccta 19327  T
Q  390 tgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 437  Q
    ||||| || | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  19326 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 19278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 280 - 432
Target Start/End: Original strand, 53498 - 53651
Alignment:
Q  280 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgc 379  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||| || |||| |||||| |||||||||| || |||||    
T  53498 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgc 53597  T
Q  380 atactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaag 432  Q
    ||||||||||||||| || | |||  ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  53598 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaag 53651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 69; Significance: 9e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 164 - 285
Target Start/End: Original strand, 1204 - 1327
Alignment:
Q  164 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgtt 261  Q
    ||||||| || |||||||||||| || || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||    
T  1204 tatgattaataaattagtatatgaatataaatgttgagaataagatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgtt 1303  T
Q  262 gattaccatttgatattgttatat 285  Q
    ||||| |||||||| |||||||||    
T  1304 gattatcatttgatgttgttatat 1327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 69; Significance: 9e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 113461 - 113317
Alignment:
Q  4 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 103  Q
    ||||||||||||||| ||| |  | |||| ||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||     
T  113461 aaaactggtattgatcggtgcggatttggcctttgatgtaaacatggaagttgtaggtatggatgttacatttctaatgacgttggtttgactccaaaat 113362  T
Q  104 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 148  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  113361 gagttttagaacttgagttatggtcaaattactaaacgtaggtca 113317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 69; Significance: 9e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 290 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 130066 - 129919
Alignment:
Q  290 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgccta 389  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  130066 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgccta 129968  T
Q  390 tgttgttgt-cgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 437  Q
    ||||| |||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  129967 tgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgat 129919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 286 - 424
Target Start/End: Original strand, 60670 - 60810
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgcatac 383  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||  || |||| ||||    
T  60670 tgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatattggtatatcatgagctgttttgtatac 60768  T
Q  384 tgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtc 424  Q
    ||||||||||| || | |||  ||||||||| ||||||||||    
T  60769 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtc 60810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 349 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 6714 - 6612
Alignment:
Q  349 cattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttg 447  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  6714 cattcgatattgttatatcatcatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 6615  T
Q  448 atg 450  Q
    |||    
T  6614 atg 6612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 349 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 14094 - 13992
Alignment:
Q  349 cattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttg 447  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  14094 cattcgatattgttatatcatcatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 13995  T
Q  448 atg 450  Q
    |||    
T  13994 atg 13992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 280 - 437
Target Start/End: Original strand, 45742 - 45899
Alignment:
Q  280 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgc 379  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||| ||| || |||||||| | ||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  45742 ttataatgttatataattgtatatacatcacatgaattatgtttga-taattgagatgttgatgacttacattcgatattgttatatcatgatgatttgc 45840  T
Q  380 atactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 437  Q
    ||||||||||| ||  || | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  45841 atactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 45899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 349 - 450
Target Start/End: Original strand, 15795 - 15897
Alignment:
Q  349 cattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttg 447  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  15795 cattcgatattgttatatcatcatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 15894  T
Q  448 atg 450  Q
    |||    
T  15895 atg 15897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 350 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 1184 - 1091
Alignment:
Q  350 attcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaaga 442  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  1184 attcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 1091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 280 - 436
Target Start/End: Original strand, 10491 - 10647
Alignment:
Q  280 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgc 379  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  10491 ttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc 10589  T
Q  380 atactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttga 436  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  10590 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttga 10647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 286 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 26061 - 25904
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactg 385  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||| ||||  |||||| |||||| |||||| | || |||| ||||||||||| |||||||  |||| ||||||    
T  26061 tgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactg 25962  T
Q  386 cctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagat 443  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||    
T  25961 cctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgatgaagat 25904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 40023 - 39859
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactg 385  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||| ||||  |||||| |||||| |||||| | || |||| ||||||||||| |||||||  |||| ||||||    
T  40023 tgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactg 39924  T
Q  386 cctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||| | |||||||  |||||||||||| |||||| |||||    
T  39923 cctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 39859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 349 - 450
Target Start/End: Original strand, 6141 - 6243
Alignment:
Q  349 cattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttg 447  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  6141 cattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 6240  T
Q  448 atg 450  Q
    |||    
T  6241 atg 6243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 75619 - 75689
Alignment:
Q  1 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtta 71  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75619 atgaaaactagtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtta 75689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 286 - 433
Target Start/End: Original strand, 24257 - 24406
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgg--tttgcatac 383  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || || | |||||| |||| ||||| ||   |||| ||||    
T  24257 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatac 24356  T
Q  384 tgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagt 433  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  24357 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 287 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 16278 - 16114
Alignment:
Q  287 gtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactg 385  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||   || ||| |||||| | |||||  || |||| |||||||| ||||| || || ||| | ||||||    
T  16278 gtgatataatgttatatgcattacttgagttatgaatgtatacttgagatgatgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactg 16179  T
Q  386 cctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  16178 cctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 16114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Original strand, 32913 - 33076
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactg 385  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||| ||| ||||  |||||| || ||| |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || |||| ||||||    
T  32913 tgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataa-tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactg 33011  T
Q  386 cctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||| ||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  33012 cctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 33076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 46092 - 45929
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactg 385  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||| ||| ||||  |||||| || ||| |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || |||| ||||||    
T  46092 tgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataa-tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactg 45994  T
Q  386 cctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||| ||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  45993 cctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 45929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 390 - 450
Target Start/End: Original strand, 17389 - 17449
Alignment:
Q  390 tgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  17389 tgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 17449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 280 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 52085 - 51914
Alignment:
Q  280 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 378  Q
    |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  52085 ttatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 51986  T
Q  379 catactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
     ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  51985 tatattgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 51914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 301 - 450
Target Start/End: Original strand, 167948 - 168098
Alignment:
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| || || | ||||||||||| ||||| |  ||| | |||||||||||||||||||     
T  167948 tatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgtt 168047  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  168048 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 168098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 301 - 450
Target Start/End: Original strand, 1018 - 1168
Alignment:
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| || || | ||||||||||| ||||| |  ||| | |||||||||||||||||||     
T  1018 tatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgtt 1117  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  1118 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 1168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 349 - 450
Target Start/End: Original strand, 1052 - 1154
Alignment:
Q  349 cattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttg 447  Q
    |||||||| || ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  1052 cattcgatgttgttatatcatgatgatctgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 1151  T
Q  448 atg 450  Q
    |||    
T  1152 atg 1154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 301 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 4675 - 4545
Alignment:
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggt-ttgcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||| ||| |||||||| ||||| || || | |||||||||||||||| ||||||     
T  4675 tatgcattacttgaagtataaatgaatatttaagatgttgttgaattatatttgatattatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgctgttgtt 4576  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtcta 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4575 gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 280 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 225578 - 225465
Alignment:
Q  280 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgc 379  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||| | || |||||    
T  225578 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattattatatcacgctgttttgc 225480  T
Q  380 atactgcctatgttg 394  Q
    |||||| ||||||||    
T  225479 atactgactatgttg 225465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 269 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12112 - 12039
Alignment:
Q  269 atttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12112 atttgatactgttatattgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgaggcgttgtt 12039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 290 - 437
Target Start/End: Original strand, 2606 - 2752
Alignment:
Q  290 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgccta 389  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  2606 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcaatattgttataacatgatgatttacatactgccta 2703  T
Q  390 tgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 437  Q
    ||||| || | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  2704 tgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 2752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 291 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 13165 - 13092
Alignment:
Q  291 tataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattat 364  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  13165 tataattatatatgcattacttcaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 13092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 2017 - 1852
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatact 384  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | |||||    
T  2017 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 1918  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    | |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  1917 gtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 1852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 330 - 437
Target Start/End: Original strand, 2805 - 2913
Alignment:
Q  330 ttgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtc 428  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | || | |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  2805 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 2904  T
Q  429 taagttgat 437  Q
    |||| ||||    
T  2905 taagatgat 2913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 508 - 344
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactg 385  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||   ||||| || ||| |||||||| || || | ||||||||||  ||||| |  |||| ||||||    
T  508 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcgaatatttaagatgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgctattttgtatactg 409  T
Q  386 cctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||    
T  408 cctatgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgataaagatgatgatg 344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 3636 - 3471
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatact 384  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | |||||    
T  3636 tgtgatataatgttatttgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 3537  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||||||||| | | |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  3536 gcctatgttgctttagttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 3471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 280 - 450
Target Start/End: Original strand, 8482 - 8649
Alignment:
Q  280 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgc 379  Q
    |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||| || || | ||||||||||| ||||| || |||      
T  8482 ttatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 8581  T
Q  380 atactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||||||||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  8582 atactgcctatgttgct---gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 8649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 330 - 437
Target Start/End: Original strand, 14696 - 14804
Alignment:
Q  330 ttgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtc 428  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||| || | |||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  14696 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattactatatcatgatgattttcttactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggtc 14795  T
Q  429 taagttgat 437  Q
    |||||||||    
T  14796 taagttgat 14804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 286 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 23048 - 22890
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatact 384  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | |||||    
T  23048 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22949  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |  | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22948 gg-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 22890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 330 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 10649 - 10542
Alignment:
Q  330 ttgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtc 428  Q
    |||||| |||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||| |||||||||| |||    
T  10649 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggtc 10550  T
Q  429 taagttga 436  Q
    ||||||||    
T  10549 taagttga 10542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 40726 - 40628
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||   | ||||||||||||||| | ||||||| || || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  40726 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 40628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 280 - 391
Target Start/End: Original strand, 8008 - 8121
Alignment:
Q  280 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggttt 377  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  || ||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||  || |||    
T  8008 ttataatgtgatataattttatatacattacttgaattatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcatgagctgattt 8107  T
Q  378 gcatactgcctatg 391  Q
    ||||||||||||||    
T  8108 gcatactgcctatg 8121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 337 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 6927 - 6826
Alignment:
Q  337 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttg 435  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||    
T  6927 gttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagatg 6828  T
Q  436 at 437  Q
    ||    
T  6827 at 6826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 349 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 12869 - 12780
Alignment:
Q  349 cattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 437  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  12869 cattcgatattgttatatcatgatgatttgcatattgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 5015 - 4850
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatact 384  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | |||||    
T  5015 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatacttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatact 4916  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  4915 gcctatgttgctgttgttatttaactaatctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 4850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Original strand, 6196 - 6305
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||     
T  6196 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttatagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttctaaatgatttttagaacttgagttatga 6295  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    ||||||||||    
T  6296 tcaaattact 6305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Original strand, 16555 - 16720
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatact 384  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| |||||| | |||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | |||||    
T  16555 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatact 16654  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    || | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  16655 gcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatg 16720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 269 - 448
Target Start/End: Original strand, 6220 - 6400
Alignment:
Q  269 atttgatattgttat-attgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatc 367  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||||||||||| |||| |||||| | |||||    
T  6220 atttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatc 6318  T
Q  368 atga--tggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttga 448  Q
    ||||  || |||  ||||||||||||||| || | |||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||    
T  6319 atgagctgttttatatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaagatga--aagatgttga 6400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 280 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 12739 - 12587
Alignment:
Q  280 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgc 379  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| | | || |||||| |||| ||| || |||| |||||| |||||||||| || |||||    
T  12739 ttataatgtgatataattgtatatacattact-gaattatatataagtatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgc 12641  T
Q  380 atactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaag 432  Q
    ||||||||||||||| || | |||  ||||||||| | |||||||| |||||||    
T  12640 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 8675 - 8566
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||     
T  8675 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttctagatgatttttagaacttgagttatga 8576  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    ||||||||||    
T  8575 tcaaattact 8566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 326 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 32224 - 32112
Alignment:
Q  326 ataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagt 423  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| | |||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||    
T  32224 ataattgagacgttgatgatt-acattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagt 32126  T
Q  424 cagtctaagttgat 437  Q
    | ||||||| ||||    
T  32125 cggtctaagatgat 32112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 30579 - 30470
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||     
T  30579 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatga 30480  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    ||||||||||    
T  30479 tcaaattact 30470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 40078 - 39914
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactg 385  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||    |||| || ||| ||| ||||  | |||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||    
T  40078 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcaaatatttaagatgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactg 39979  T
Q  386 cctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||||||||| | | ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| |||||| |||||    
T  39978 cctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 39914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 382 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121767
Alignment:
Q  382 actgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  121835 actgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 121767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 460 - 398
Alignment:
Q  8 ctggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtt 70  Q
    ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  460 ctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagtcgtacgtatggatgtt 398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 174913 - 174785
Alignment:
Q  303 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtc-gt 401  Q
    |||||||||||||||||   ||||| ||||||| |||||||| ||  ||| ||||| || || ||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||  ||    
T  174913 tgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgt 174816  T
Q  402 tatttaactaagttgcatgagtcagtctaag 432  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  174815 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 174785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 337 - 432
Target Start/End: Original strand, 136373 - 136471
Alignment:
Q  337 gttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgttgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaag 432  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  || ||||  |||||||||||| | |||  |||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  136373 gttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 136471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 337 - 432
Target Start/End: Original strand, 145081 - 145179
Alignment:
Q  337 gttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgttgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaag 432  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  || ||||  |||||||||||| | |||  |||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  145081 gttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 145179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 4788 - 4713
Alignment:
Q  375 tttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  4788 tttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 4713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 330 - 396
Target Start/End: Original strand, 2217 - 2283
Alignment:
Q  330 ttgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgtt 396  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2217 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgtt 2283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Original strand, 6076 - 6244
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatact 384  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || || | |||||||| || ||||| || ||| | |||||    
T  6076 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatact 6175  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgtt---atttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
     ||||||||||||| |||   ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  6176 acctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 354 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 13594 - 13513
Alignment:
Q  354 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttg 435  Q
    |||||||| || ||||| || |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  13594 gatattatcatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 13513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 834 - 725
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||   | ||||||||||||||| | ||||| |||| || ||| ||||| ||||||||||||||||     
T  834 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattacgttagctttctaatggctttggtctgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatga 735  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    ||||||||||    
T  734 tcaaattact 725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 286 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 4673 - 4522
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatact 384  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||  |||||    
T  4673 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatact 4574  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 437  Q
    || | ||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  4573 gcttgtgttgctgttgttatttaactaag-cgcatgagtcggtctaagttgat 4522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 286 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 12255 - 12104
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatact 384  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||  |||||    
T  12255 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatact 12156  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 437  Q
    || | ||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  12155 gcttgtgttgctgttgttatttaactaag-cgcatgagtcggtctaagttgat 12104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 286 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 22207 - 22056
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatact 384  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||  |||||    
T  22207 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatact 22108  T
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 437  Q
    || | ||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  22107 gcttgtgttgctgttgttatttaactaag-cgcatgagtcggtctaagttgat 22056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 337 - 397
Target Start/End: Original strand, 2448 - 2508
Alignment:
Q  337 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttg 397  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  2448 gttgctgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatacggtctaagttgttg 2508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 32163 - 32068
Alignment:
Q  354 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  32163 gatattattatgtcatgttg-tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 32068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 1130 - 1051
Alignment:
Q  354 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaag 432  Q
    |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  1130 gatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 65 - 136
Target Start/End: Original strand, 12519 - 12590
Alignment:
Q  65 gatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  12519 gatgttagctttctaatggctttgggttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 12590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 269 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 25289 - 25121
Alignment:
Q  269 atttgatattgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatca 368  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| ||| |  |||||| ||||||||||| |||| |||||  ||||||||    
T  25289 atttgatgttgtaataatgtgatatatttgtatatacattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatatcgttatatca 25192  T
Q  369 tga--tggtttgcatactgcctatgttgttgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttga 436  Q
    |||  || |||  ||||||||||||||| |||  |||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  25191 tgagctgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 166 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16326 - 16263
Alignment:
Q  166 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttg-tgaatacgatattgtccatgattgatgaa 228  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  16326 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaa 16263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 4)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 330 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 32657 - 32551
Alignment:
Q  330 ttgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtc 428  Q
    |||||| ||||||||||  |||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| || | |||  ||||||||| |||||||||| |||    
T  32657 ttgagatgttgttgattg-catttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 32559  T
Q  429 taagttga 436  Q
    ||||||||    
T  32558 taagttga 32551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 66 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 40035 - 39965
Alignment:
Q  66 atgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  40035 atgtcagctttctaatggctttggttttacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 39965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 66 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 45518 - 45448
Alignment:
Q  66 atgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  45518 atgttagctttctaatggctttggttttacttccaaataatttttagaacttgagttatgatcaaattact 45448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 66 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 79073 - 79003
Alignment:
Q  66 atgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  79073 atgttagctttctaattgctttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 79003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 136
Target Start/End: Original strand, 6941 - 7039
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  6941 ggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 7039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 301 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 2103 - 1953
Alignment:
Q  301 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtc 399  Q
    |||||||||||||||| || | |||||| || ||| |||||||| || || | ||||| ||||| ||||| || ||| | ||||||||||||| | |||     
T  2103 tatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgtt 2004  T
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| ||||||| || | |||||| |||||    
T  2003 gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 1953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 1484 - 1375
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| || || ||||||||||||||||     
T  1484 aattggccttcggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgagttttagaacttgagttatga 1385  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    ||||||||||    
T  1384 tcaaattact 1375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 385 - 450
Target Start/End: Original strand, 4888 - 4953
Alignment:
Q  385 gcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||    
T  4888 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 4953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 337 - 394
Target Start/End: Original strand, 29286 - 29343
Alignment:
Q  337 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttg 394  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  29286 gttgctgatttacattcgatattattatatcatgatagtttgaatactacctatgttg 29343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 337 - 436
Target Start/End: Original strand, 8078 - 8180
Alignment:
Q  337 gttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgttgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagt 433  Q
    |||||||||||  ||| |||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||  |||  ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  8078 gttgttgatttgtatttgatattgttatatcatgaactggtttgtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 8177  T
Q  434 tga 436  Q
    |||    
T  8178 tga 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Original strand, 110065 - 110174
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   | ||||||||||||||| | ||| |||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||     
T  110065 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattacgttagctttctaatggctttgatttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatga 110164  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    ||||||||||    
T  110165 tcaaattact 110174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Original strand, 118566 - 118675
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   | ||||||||||||||| | ||| |||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||     
T  118566 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattacgttagctttctaatggctttgatttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatga 118665  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    ||||||||||    
T  118666 tcaaattact 118675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 286 - 370
Target Start/End: Original strand, 3485 - 3569
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatg 370  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||| |||||    
T  3485 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 3569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 400 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 336 - 292
Alignment:
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||    
T  336 gttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatg 292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 15876 - 15780
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatta 134  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||   | ||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  15876 ggtgtaaacatgaaagttttagataattaagttagatttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatta 15780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 354 - 444
Target Start/End: Original strand, 11466 - 11557
Alignment:
Q  354 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||||| | ||||||    
T  11466 gatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgttgaagatg 11557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 97190 - 97088
Alignment:
Q  269 atttgatattgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatc 367  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||| |  |||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  97190 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 97092  T
Q  368 atga 371  Q
    ||||    
T  97091 atga 97088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 106468 - 106366
Alignment:
Q  269 atttgatattgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatc 367  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||| |  |||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  106468 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 106370  T
Q  368 atga 371  Q
    ||||    
T  106369 atga 106366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 286 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 267826 - 267679
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgcatac 383  Q
    |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||    ||||||  |||||||||| |||| |||||| |||||||||||  || |||  ||||    
T  267826 tgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg--ttgagatattgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatac 267729  T
Q  384 tgcctatgttgttgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaag 432  Q
    ||| ||||||| |||  |||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  267728 tgcatatgttgatgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 267679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Original strand, 10381 - 10543
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactg 385  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || ||| || ||| |||||||| ||  | | ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||    
T  10381 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacttaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg--ttgtatactg 10477  T
Q  386 cctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    ||||||||| || | |||| ||||||| | |||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  10478 cctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 10543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 54044 - 53946
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||   |||||| |||||||||| | ||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  54044 ggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttaactttctaatggctttggtttgactttcaaatgatttttagaacttgagttatgattaaattact 53946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 136
Target Start/End: Original strand, 19911 - 20009
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||   |||||||||||| |||| | |||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19911 ggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttccaatggctttggtttgaagtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 20009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 136
Target Start/End: Original strand, 1296 - 1365
Alignment:
Q  67 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  1296 tgttagctttctaatggttttggtttgatttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 1365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 18314 - 18205
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||  || ||| ||||| || |||||||||||||     
T  18314 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggctttggtttgaggtccaaatgatttttataacttgagttatga 18215  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    ||||||||||    
T  18214 tcaaattact 18205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 28578 - 28469
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    | |||| ||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| || |||||||||||||     
T  28578 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataatttttttagttttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttataacttgagttatga 28479  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    ||||||||||    
T  28478 tcaaattact 28469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 38484 - 38375
Alignment:
Q  27 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 126  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||     
T  38484 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 38385  T
Q  127 tcaaattact 136  Q
    ||||||||||    
T  38384 tcaaattact 38375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 303 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 8628 - 8480
Alignment:
Q  303 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtcgt 401  Q
    ||||||||||||| || |  |||||  || ||| |||||||| || || | ||||||||||| ||||  || ||| | ||||| ||||||||| | | ||    
T  8628 tgcattacttgaagtacacttgaatgtttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctattgt 8529  T
Q  402 tatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  8528 tatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 8480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 437
Target Start/End: Original strand, 28806 - 28877
Alignment:
Q  368 atgatggtttgcatactgcctatgttgttgtc--gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 437  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||   ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  28806 atgatgatttgcatactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 28877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 400 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 29605 - 29561
Alignment:
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29605 gttatttaactaagtcacatgagtcagtctaagttgattaagatg 29561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 286 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 27996 - 27912
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatg 370  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||| || |||| ||||||||||| |||||    
T  27996 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 27912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 383 - 450
Target Start/End: Original strand, 193029 - 193097
Alignment:
Q  383 ctgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttg-attaagatgttgatg 450  Q
    ||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  193029 ctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatgagtcagtccatgttgaattaagatgttgatg 193097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 400 - 447
Target Start/End: Original strand, 15280 - 15327
Alignment:
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttg 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  15280 gttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgttg 15327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 400 - 447
Target Start/End: Original strand, 19802 - 19849
Alignment:
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttg 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  19802 gttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgttg 19849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 979 - 912
Alignment:
Q  67 tgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatta 134  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| || ||||||| ||||| ||||||||    
T  979 tgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttataacttgaattatgatcaaatta 912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 15361 - 15282
Alignment:
Q  165 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttg-tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatat 243  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  15361 atgattgatgaattattatttgaatgtatatgtcgatgaatatgatattgttcatgattgatgaattattatatgaatat 15282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1753 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1753
Description:

Target: scaffold1753; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 938 - 868
Alignment:
Q  66 atgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| |  ||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  938 atgttagctttctaatggctttggtttgacgtgcaaatgatttttagaacctgagttatgatcaaattact 868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0959 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0959
Description:

Target: scaffold0959; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 1333 - 1219
Alignment:
Q  34 cttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 133  Q
    ||||| ||||||||  |||||| ||  |||||||||||  |||||||||   ||||| | ||||||||| | ||| || ||||||| |||||||||||||    
T  1333 cttagatgtaaacataaaagttttatatatggatgttatatttctaatggatttggtctcacttcaaaatgttttctaaaacttgatttatggtcaaatt 1234  T
Q  134 actgcacgtaggtca 148  Q
    ||| ||| |||||||    
T  1233 actacacataggtca 1219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 349 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 9181 - 9136
Alignment:
Q  349 cattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttg 394  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9181 cattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttg 9136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 388 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 9572 - 9516
Alignment:
Q  388 tatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||    
T  9572 tatgttgttattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatg 9516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 400 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 1877 - 1833
Alignment:
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||    
T  1877 gttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatg 1833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 136
Target Start/End: Original strand, 8097 - 8192
Alignment:
Q  41 gtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 136  Q
    ||||||| |||||||||||  |   ||||||||| ||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  8097 gtaaacatgaaagttgtagacaattatgttagctatctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 8192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 401 - 444
Target Start/End: Original strand, 4875 - 4918
Alignment:
Q  401 ttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  4875 ttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgattaagatg 4918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 53978 - 53939
Alignment:
Q  38 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttc 77  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53978 ggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggacgttagctttc 53939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 286 - 371
Target Start/End: Original strand, 1753 - 1836
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatga 371  Q
    |||||||||| | |||||||||||| | |||||||| |||    |||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  1753 tgtgatataaatgtatatgcattacataaattatatatgatg--ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatga 1836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 286 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 38483 - 38343
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgcatac 383  Q
    |||||||||  | |||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| |||||||| || |||| |||||| | |||||||||  || |||  ||||    
T  38483 tgtgatatatatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgtcatatcatgagctgttttatatac 38385  T
Q  384 tgcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtc 424  Q
    ||||||||||| || | |||  ||||||||| ||||||||||    
T  38384 tgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtc 38343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 286 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 21077 - 20911
Alignment:
Q  286 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatact 384  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||| |  | || ||||||  | ||| |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| ||||| |    
T  21077 tgtgatataatgttttatgcattacttgtagaacatttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatatt 20978  T
Q  385 gcctatgttgttg-tcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 450  Q
    |||||||||| || | |||| ||||||||| |  ||||||| |||||||| | | ||||||||||||    
T  20977 gcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtctaagtcgttgaagatgttgatg 20911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 51672 - 51601
Alignment:
Q  360 attatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaag 432  Q
    ||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  51672 attatgtcatgatg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 51601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 383 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 6159 - 6098
Alignment:
Q  383 ctgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||||||| || | | |||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  6159 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcaatataagatgattaagatg 6098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 383 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 23907 - 23846
Alignment:
Q  383 ctgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||||||| || | | |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  23907 ctgcctatggtgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatg 23846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 383 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 44145 - 44084
Alignment:
Q  383 ctgcctatgttgttgtcgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    ||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||    
T  44145 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatg 44084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 400 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 206 - 162
Alignment:
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||    
T  206 gttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatg 162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 400 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 36501 - 36457
Alignment:
Q  400 gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 444  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  36501 gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatg 36457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University