View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4365-Insertion-6 (Length: 811)

Name: NF4365-Insertion-6
Description: NF4365
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4365-Insertion-6
NF4365-Insertion-6
[»] chr3 (86 HSPs)
chr3 (10-810)||(12888492-12889306)
chr3 (10-810)||(20059587-20060401)
chr3 (10-810)||(3687726-3688540)
chr3 (10-810)||(13254473-13255287)
chr3 (8-810)||(15586925-15587741)
chr3 (8-810)||(16754234-16755050)
chr3 (8-810)||(6602517-6603332)
chr3 (8-810)||(15345778-15346594)
chr3 (10-810)||(5422463-5423277)
chr3 (8-810)||(16637554-16638370)
chr3 (8-810)||(48427228-48428044)
chr3 (10-810)||(10907993-10908807)
chr3 (8-810)||(53382551-53383367)
chr3 (10-810)||(10007383-10008197)
chr3 (10-810)||(15400050-15400864)
chr3 (100-810)||(43164548-43165272)
chr3 (30-810)||(15357886-15358680)
chr3 (118-810)||(15713589-15714295)
chr3 (159-810)||(26790946-26791611)
chr3 (8-810)||(16804480-16805296)
chr3 (8-810)||(16693945-16694761)
chr3 (73-810)||(24185036-24185787)
chr3 (9-810)||(17491632-17492448)
chr3 (22-810)||(14578941-14579743)
chr3 (8-810)||(15261411-15262227)
chr3 (8-406)||(5108562-5108960)
chr3 (328-810)||(14874101-14874597)
chr3 (171-810)||(12843636-12844289)
chr3 (109-669)||(18437022-18437596)
chr3 (542-810)||(15065400-15065668)
chr3 (24-669)||(11888027-11888687)
chr3 (8-810)||(31940694-31941510)
chr3 (8-804)||(16825809-16826619)
chr3 (8-810)||(31692707-31693523)
chr3 (8-810)||(24189095-24189911)
chr3 (22-810)||(14291054-14291856)
chr3 (58-804)||(12358055-12358815)
chr3 (8-741)||(11949499-11950246)
chr3 (8-804)||(47125735-47126545)
chr3 (8-810)||(15229394-15230210)
chr3 (8-810)||(15235262-15236078)
chr3 (8-810)||(17188165-17188981)
chr3 (30-810)||(12180157-12180951)
chr3 (539-722)||(26190937-26191120)
chr3 (8-810)||(10417567-10418383)
chr3 (58-747)||(13318087-13318790)
chr3 (9-804)||(10407760-10408569)
chr3 (8-406)||(11959109-11959507)
chr3 (8-802)||(18131876-18132684)
chr3 (8-810)||(13943815-13944631)
chr3 (58-804)||(15013297-15014055)
chr3 (8-804)||(28756109-28756920)
chr3 (8-669)||(44779038-44779713)
chr3 (231-810)||(17493660-17494254)
chr3 (133-810)||(12272254-12272945)
chr3 (8-669)||(13969783-13970458)
chr3 (8-180)||(14874676-14874848)
chr3 (8-669)||(14088464-14089139)
chr3 (8-406)||(41179313-41179711)
chr3 (8-810)||(8744912-8745728)
chr3 (258-406)||(12071005-12071153)
chr3 (8-406)||(16378869-16379266)
chr3 (77-379)||(30139666-30139968)
chr3 (77-379)||(30149217-30149519)
chr3 (77-334)||(8272422-8272679)
chr3 (8-406)||(12510423-12510821)
chr3 (265-810)||(14575034-14575593)
chr3 (77-335)||(13965374-13965632)
chr3 (10-121)||(15723170-15723281)
chr3 (77-335)||(15611963-15612221)
chr3 (77-365)||(15948462-15948750)
chr3 (77-379)||(6150831-6151133)
chr3 (307-804)||(16832056-16832567)
chr3 (512-802)||(12858025-12858315)
chr3 (8-122)||(12270001-12270115)
chr3 (77-335)||(17200494-17200752)
chr3 (10-71)||(12500031-12500092)
chr3 (8-305)||(16834556-16834848)
chr3 (79-314)||(25768180-25768415)
chr3 (8-251)||(16327755-16327998)
chr3 (602-810)||(16378456-16378664)
chr3 (220-299)||(14874600-14874679)
chr3 (512-810)||(11958703-11959001)
chr3 (409-810)||(16327231-16327632)
chr3 (297-365)||(3296366-3296434)
chr3 (410-460)||(12510355-12510405)
[»] chr1 (51 HSPs)
chr1 (10-810)||(16347961-16348775)
chr1 (8-810)||(33388395-33389211)
chr1 (8-810)||(51330858-51331675)
chr1 (8-811)||(41351033-41351844)
chr1 (8-810)||(21832479-21833295)
chr1 (10-810)||(19108547-19109361)
chr1 (8-810)||(17042381-17043197)
chr1 (10-675)||(21839129-21839808)
chr1 (8-726)||(21233181-21233913)
chr1 (8-714)||(22502751-22503471)
chr1 (8-810)||(16378272-16379087)
chr1 (10-757)||(21751119-21751877)
chr1 (8-669)||(22359751-22360426)
chr1 (415-810)||(24785223-24785618)
chr1 (8-669)||(21861880-21862555)
chr1 (28-636)||(20140280-20140902)
chr1 (8-559)||(429733-430298)
chr1 (8-810)||(21742918-21743734)
chr1 (8-804)||(20854132-20854942)
chr1 (8-500)||(50618074-50618580)
chr1 (10-804)||(20833272-20834080)
chr1 (8-804)||(48425081-48425891)
chr1 (8-804)||(52987949-52988759)
chr1 (7-810)||(19856481-19857298)
chr1 (8-498)||(41310734-41311238)
chr1 (10-197)||(24792609-24792796)
chr1 (58-810)||(24096981-24097735)
chr1 (8-804)||(31537369-31538179)
chr1 (8-804)||(20296589-20297399)
chr1 (656-810)||(20081742-20081896)
chr1 (8-406)||(20937847-20938245)
chr1 (8-804)||(38910198-38911008)
chr1 (165-810)||(21739402-21740061)
chr1 (8-460)||(37679257-37679723)
chr1 (8-340)||(19660986-19661318)
chr1 (202-810)||(22016111-22016733)
chr1 (671-810)||(21842066-21842205)
chr1 (8-495)||(21953086-21953587)
chr1 (77-379)||(20829203-20829505)
chr1 (77-379)||(41215667-41215969)
chr1 (727-810)||(22496622-22496705)
chr1 (77-251)||(35930764-35930938)
chr1 (77-331)||(20527299-20527553)
chr1 (148-339)||(21200805-21200996)
chr1 (602-758)||(429575-429731)
chr1 (77-335)||(20927300-20927558)
chr1 (88-251)||(22133693-22133856)
chr1 (761-808)||(21751991-21752038)
chr1 (650-804)||(12200382-12200536)
chr1 (651-804)||(37679914-37680067)
chr1 (701-804)||(18710300-18710403)
[»] chr2 (60 HSPs)
chr2 (8-810)||(24711827-24712643)
chr2 (10-810)||(44383404-44384218)
chr2 (8-810)||(9337375-9338191)
chr2 (8-810)||(9486009-9486825)
chr2 (8-810)||(17000793-17001609)
chr2 (8-810)||(10870643-10871459)
chr2 (8-810)||(27219809-27220625)
chr2 (10-810)||(27373064-27373878)
chr2 (10-806)||(24264165-24264975)
chr2 (10-810)||(41606221-41607033)
chr2 (10-810)||(21142875-21143689)
chr2 (10-810)||(24874584-24875398)
chr2 (8-810)||(24677282-24678096)
chr2 (10-808)||(24705318-24706130)
chr2 (10-810)||(21323100-21323914)
chr2 (301-810)||(16983326-16983849)
chr2 (8-810)||(23105562-23106378)
chr2 (8-810)||(23073656-23074472)
chr2 (410-810)||(22323176-22323576)
chr2 (8-810)||(22733608-22734424)
chr2 (174-810)||(23204273-23204923)
chr2 (8-406)||(16927153-16927551)
chr2 (291-810)||(24657492-24658024)
chr2 (521-810)||(11351545-11351843)
chr2 (8-498)||(25255712-25256215)
chr2 (58-747)||(23278619-23279322)
chr2 (8-810)||(19716851-19717667)
chr2 (58-406)||(19650302-19650650)
chr2 (8-810)||(23097852-23098668)
chr2 (614-810)||(23029295-23029491)
chr2 (644-810)||(45673846-45674012)
chr2 (8-460)||(23112529-23112998)
chr2 (8-495)||(31832451-31832952)
chr2 (8-810)||(12576146-12576962)
chr2 (8-495)||(1065544-1066045)
chr2 (8-251)||(24818637-24818880)
chr2 (8-176)||(23189711-23189879)
chr2 (8-406)||(27789533-27789931)
chr2 (417-810)||(24817674-24818067)
chr2 (58-406)||(30010436-30010784)
chr2 (77-365)||(24829481-24829769)
chr2 (58-406)||(30209169-30209517)
chr2 (301-406)||(16924063-16924168)
chr2 (88-335)||(22279978-22280225)
chr2 (77-379)||(25130471-25130773)
chr2 (623-804)||(19817269-19817450)
chr2 (602-810)||(23113124-23113332)
chr2 (77-251)||(24568075-24568249)
chr2 (619-804)||(23274011-23274196)
chr2 (754-810)||(22742800-22742856)
chr2 (77-335)||(22759894-22760150)
chr2 (111-176)||(23611069-23611134)
chr2 (623-804)||(30208760-30208941)
chr2 (8-128)||(24950383-24950503)
chr2 (761-810)||(23064973-23065022)
chr2 (265-406)||(24818092-24818233)
chr2 (698-804)||(20848086-20848192)
chr2 (409-526)||(30010302-30010419)
chr2 (409-500)||(30209061-30209152)
chr2 (410-439)||(16927569-16927598)
[»] chr8 (68 HSPs)
chr8 (10-810)||(18858807-18859621)
chr8 (8-810)||(17671759-17672576)
chr8 (8-811)||(19481808-19482617)
chr8 (8-810)||(20016000-20016816)
chr8 (10-810)||(22117912-22118726)
chr8 (10-810)||(22126696-22127510)
chr8 (8-810)||(30310881-30311697)
chr8 (8-810)||(21164275-21165091)
chr8 (10-810)||(19980197-19981011)
chr8 (8-810)||(32602373-32603189)
chr8 (8-810)||(22042055-22042871)
chr8 (8-810)||(15535611-15536427)
chr8 (211-810)||(19114831-19115444)
chr8 (8-810)||(21391598-21392414)
chr8 (8-810)||(21786092-21786908)
chr8 (8-810)||(21253172-21253989)
chr8 (57-810)||(21780924-21781691)
chr8 (147-810)||(22030470-22031147)
chr8 (8-810)||(22421629-22422445)
chr8 (8-810)||(22522774-22523590)
chr8 (9-810)||(22375191-22376005)
chr8 (8-806)||(22246174-22246986)
chr8 (9-810)||(22989274-22990089)
chr8 (418-806)||(22129358-22129746)
chr8 (8-403)||(22131199-22131594)
chr8 (8-406)||(19864248-19864646)
chr8 (8-810)||(19984408-19985224)
chr8 (58-669)||(21323157-21323782)
chr8 (9-804)||(21927657-21928466)
chr8 (8-810)||(20390314-20391130)
chr8 (8-669)||(23887256-23887931)
chr8 (8-810)||(22053091-22053907)
chr8 (8-227)||(21782754-21782973)
chr8 (8-367)||(31414663-31415022)
chr8 (80-810)||(22373168-22373913)
chr8 (8-810)||(28983139-28983955)
chr8 (10-401)||(29301586-29301977)
chr8 (8-362)||(23657155-23657509)
chr8 (8-810)||(28988358-28989174)
chr8 (8-406)||(16269379-16269777)
chr8 (52-406)||(20394288-20394642)
chr8 (10-188)||(23652271-23652449)
chr8 (8-406)||(31568998-31569395)
chr8 (8-339)||(4984270-4984601)
chr8 (77-367)||(16875289-16875579)
chr8 (8-311)||(22060929-22061232)
chr8 (8-495)||(27356764-27357265)
chr8 (307-810)||(22028017-22028534)
chr8 (77-379)||(20650537-20650839)
chr8 (477-664)||(21919987-21920174)
chr8 (8-188)||(20008294-20008474)
chr8 (77-365)||(21848533-21848821)
chr8 (77-332)||(23155271-23155526)
chr8 (22-122)||(21920187-21920287)
chr8 (694-806)||(22245756-22245868)
chr8 (94-379)||(16414405-16414690)
chr8 (79-379)||(22436602-22436902)
chr8 (77-335)||(21194766-21195024)
chr8 (94-251)||(24932134-24932291)
chr8 (103-379)||(23902487-23902763)
chr8 (8-119)||(6605886-6605997)
chr8 (8-179)||(19861663-19861834)
chr8 (423-810)||(31414269-31414656)
chr8 (650-810)||(29301163-29301323)
chr8 (410-495)||(16269276-16269361)
chr8 (410-485)||(19864155-19864230)
chr8 (409-495)||(31568895-31568981)
chr8 (653-804)||(27357423-27357574)
[»] chr7 (64 HSPs)
chr7 (8-810)||(10872841-10873657)
chr7 (8-810)||(18179896-18180710)
chr7 (8-810)||(44788654-44789470)
chr7 (10-810)||(8709758-8710572)
chr7 (10-810)||(11234516-11235330)
chr7 (10-810)||(15158360-15159174)
chr7 (8-810)||(14334547-14335363)
chr7 (10-810)||(18587474-18588288)
chr7 (10-810)||(13688194-13689008)
chr7 (10-810)||(11550405-11551219)
chr7 (10-810)||(14956707-14957521)
chr7 (10-809)||(12689655-12690468)
chr7 (10-810)||(9590521-9591331)
chr7 (150-810)||(17703758-17704432)
chr7 (410-810)||(8200615-8201015)
chr7 (8-810)||(14041846-14042662)
chr7 (8-810)||(14351876-14352692)
chr7 (150-651)||(16726845-16727360)
chr7 (10-581)||(15146416-15147001)
chr7 (8-308)||(15169-15469)
chr7 (258-687)||(14149862-14150304)
chr7 (52-804)||(15626720-15627485)
chr7 (8-574)||(48812791-48813371)
chr7 (8-810)||(15099884-15100700)
chr7 (8-810)||(14261527-14262342)
chr7 (8-804)||(26092085-26092895)
chr7 (8-810)||(13675604-13676419)
chr7 (8-406)||(13023509-13023907)
chr7 (8-666)||(16069722-16070394)
chr7 (8-810)||(14139831-14140647)
chr7 (8-810)||(16947753-16948569)
chr7 (8-810)||(18051234-18052050)
chr7 (8-804)||(49154453-49155263)
chr7 (8-406)||(12458792-12459190)
chr7 (8-810)||(11385710-11386526)
chr7 (8-495)||(13966264-13966765)
chr7 (8-810)||(12204081-12204897)
chr7 (8-495)||(26116186-26116687)
chr7 (8-406)||(11300912-11301310)
chr7 (8-810)||(15342583-15343399)
chr7 (98-491)||(11770024-11770431)
chr7 (8-669)||(19614827-19615502)
chr7 (626-810)||(15146226-15146410)
chr7 (77-379)||(7826120-7826422)
chr7 (77-379)||(27105522-27105824)
chr7 (77-379)||(27172501-27172803)
chr7 (202-406)||(12799242-12799446)
chr7 (409-810)||(19149578-19149979)
chr7 (409-810)||(20748977-20749378)
chr7 (196-494)||(21754752-21755064)
chr7 (8-810)||(14283655-14284473)
chr7 (77-335)||(13379103-13379361)
chr7 (8-188)||(19149363-19149541)
chr7 (8-188)||(20748762-20748940)
chr7 (77-251)||(4442148-4442322)
chr7 (446-810)||(13023949-13024313)
chr7 (8-236)||(23503739-23503967)
chr7 (78-247)||(17925871-17926040)
chr7 (645-804)||(12459431-12459590)
chr7 (651-804)||(26115877-26116030)
chr7 (645-804)||(21755215-21755374)
chr7 (77-251)||(13458255-13458429)
chr7 (409-460)||(11300844-11300895)
chr7 (196-237)||(17143166-17143207)
[»] chr5 (54 HSPs)
chr5 (10-810)||(29473549-29474363)
chr5 (8-810)||(27665966-27666782)
chr5 (8-810)||(40710874-40711690)
chr5 (8-810)||(27520500-27521316)
chr5 (10-810)||(41772938-41773752)
chr5 (8-810)||(16358596-16359412)
chr5 (8-810)||(34568588-34569404)
chr5 (10-810)||(27612450-27613266)
chr5 (10-810)||(14997215-14998029)
chr5 (10-810)||(37288972-37289786)
chr5 (10-810)||(22136764-22137578)
chr5 (10-810)||(22330363-22331177)
chr5 (10-810)||(27682876-27683690)
chr5 (10-810)||(22350015-22350829)
chr5 (8-810)||(19772054-19772870)
chr5 (8-810)||(18781208-18782024)
chr5 (8-810)||(26736203-26737019)
chr5 (8-810)||(25428527-25429331)
chr5 (289-806)||(20802972-20803503)
chr5 (8-810)||(21336770-21337586)
chr5 (8-810)||(23473321-23474105)
chr5 (422-810)||(21882296-21882684)
chr5 (472-810)||(21342890-21343227)
chr5 (8-810)||(28892418-28893234)
chr5 (8-810)||(21561501-21562316)
chr5 (8-810)||(20777989-20778805)
chr5 (8-804)||(22464027-22464836)
chr5 (8-810)||(20823529-20824345)
chr5 (8-498)||(28921556-28922060)
chr5 (10-265)||(20801493-20801742)
chr5 (10-406)||(20465993-20466389)
chr5 (8-804)||(14884473-14885283)
chr5 (8-669)||(22233537-22234212)
chr5 (8-495)||(25850151-25850652)
chr5 (8-810)||(17266810-17267626)
chr5 (237-810)||(21983653-21984240)
chr5 (8-406)||(37541275-37541673)
chr5 (8-669)||(24796014-24796689)
chr5 (58-804)||(21409278-21410038)
chr5 (8-495)||(20344358-20344859)
chr5 (8-804)||(22504755-22505565)
chr5 (77-379)||(21935109-21935411)
chr5 (77-379)||(23507829-23508131)
chr5 (77-379)||(24583355-24583657)
chr5 (70-392)||(21676742-21677064)
chr5 (196-810)||(23563644-23564272)
chr5 (275-810)||(23078381-23078930)
chr5 (307-669)||(439-815)
chr5 (682-764)||(23525869-23525951)
chr5 (623-804)||(20311573-20311754)
chr5 (753-808)||(23460824-23460879)
chr5 (761-804)||(21631881-21631924)
chr5 (653-804)||(25850807-25850958)
chr5 (409-495)||(37541172-37541258)
[»] chr4 (54 HSPs)
chr4 (10-810)||(16234026-16234840)
chr4 (10-810)||(12478764-12479578)
chr4 (10-810)||(14301013-14301827)
chr4 (10-810)||(19775827-19776641)
chr4 (8-810)||(8388574-8389390)
chr4 (8-810)||(17092183-17092999)
chr4 (10-810)||(23957911-23958725)
chr4 (8-810)||(27713498-27714314)
chr4 (8-810)||(8050657-8051473)
chr4 (10-810)||(40475204-40476018)
chr4 (10-810)||(14682731-14683545)
chr4 (8-810)||(18224480-18225296)
chr4 (8-810)||(15144926-15145735)
chr4 (106-810)||(16250884-16251602)
chr4 (318-810)||(19634608-19635114)
chr4 (52-810)||(14161676-14162448)
chr4 (146-677)||(16352697-16353242)
chr4 (10-810)||(14696277-14697079)
chr4 (8-786)||(16218392-16219184)
chr4 (8-786)||(16221712-16222504)
chr4 (52-660)||(22631910-22632528)
chr4 (8-666)||(14848543-14849216)
chr4 (8-498)||(1646883-1647387)
chr4 (8-804)||(3262094-3262904)
chr4 (8-406)||(15001077-15001475)
chr4 (8-810)||(15072521-15073337)
chr4 (8-804)||(29450837-29451647)
chr4 (523-810)||(14188197-14188484)
chr4 (8-406)||(16149873-16150271)
chr4 (8-406)||(16154019-16154417)
chr4 (8-362)||(23443267-23443621)
chr4 (8-810)||(27902548-27903363)
chr4 (521-810)||(16069-16358)
chr4 (8-406)||(15258090-15258487)
chr4 (8-406)||(15356832-15357230)
chr4 (8-810)||(51604086-51604902)
chr4 (8-495)||(44659475-44659976)
chr4 (8-406)||(11204944-11205342)
chr4 (8-540)||(8708073-8708615)
chr4 (673-810)||(16350588-16350725)
chr4 (10-122)||(16353243-16353355)
chr4 (77-379)||(15290897-15291199)
chr4 (200-810)||(20892385-20893009)
chr4 (419-810)||(14993661-14994053)
chr4 (104-275)||(12340709-12340879)
chr4 (768-810)||(13513286-13513328)
chr4 (651-804)||(44659166-44659319)
chr4 (645-804)||(15354340-15354499)
chr4 (409-495)||(11204841-11204927)
chr4 (727-804)||(16150531-16150608)
chr4 (727-804)||(16154677-16154754)
chr4 (761-810)||(53750764-53750813)
chr4 (415-570)||(16150294-16150449)
chr4 (415-570)||(16154440-16154595)
[»] chr6 (70 HSPs)
chr6 (8-807)||(27189462-27190275)
chr6 (8-807)||(27258965-27259778)
chr6 (10-810)||(2872241-2873056)
chr6 (7-810)||(28260636-28261453)
chr6 (7-810)||(28284463-28285280)
chr6 (7-810)||(28339385-28340202)
chr6 (10-810)||(16573918-16574732)
chr6 (10-810)||(16620648-16621462)
chr6 (10-810)||(25114580-25115394)
chr6 (10-810)||(24293221-24294035)
chr6 (10-763)||(22827841-22828608)
chr6 (171-810)||(28311819-28312472)
chr6 (10-808)||(19866715-19867527)
chr6 (10-810)||(22435897-22436711)
chr6 (10-810)||(5836667-5837472)
chr6 (8-810)||(16925079-16925893)
chr6 (319-810)||(29589878-29590383)
chr6 (8-810)||(18405383-18406199)
chr6 (15-648)||(16961082-16961730)
chr6 (8-810)||(18182806-18183622)
chr6 (8-406)||(27563690-27564088)
chr6 (51-532)||(21755002-21755496)
chr6 (8-540)||(22760164-22760710)
chr6 (115-810)||(23080556-23081265)
chr6 (521-810)||(27559408-27559697)
chr6 (28-496)||(25607614-25608096)
chr6 (8-810)||(15461362-15462178)
chr6 (8-804)||(10466293-10467104)
chr6 (8-810)||(19437028-19437844)
chr6 (8-804)||(21473626-21474436)
chr6 (8-804)||(19455050-19455859)
chr6 (8-810)||(14377355-14378171)
chr6 (8-587)||(23085433-23086026)
chr6 (9-810)||(18796717-18797532)
chr6 (8-368)||(18962983-18963343)
chr6 (8-804)||(24515859-24516663)
chr6 (61-810)||(25769923-25770686)
chr6 (253-741)||(20135245-20135747)
chr6 (8-250)||(20633953-20634195)
chr6 (253-741)||(22197122-22197624)
chr6 (55-406)||(30678865-30679215)
chr6 (8-194)||(25763297-25763483)
chr6 (8-810)||(21567430-21568246)
chr6 (8-406)||(24366438-24366836)
chr6 (75-669)||(8761334-8761940)
chr6 (8-347)||(14379382-14379721)
chr6 (77-379)||(23998343-23998645)
chr6 (77-379)||(16647853-16648155)
chr6 (8-810)||(34643025-34643841)
chr6 (77-379)||(16380257-16380559)
chr6 (77-335)||(1646742-1647000)
chr6 (174-314)||(23496141-23496281)
chr6 (10-128)||(22444295-22444413)
chr6 (666-810)||(23085264-23085408)
chr6 (623-804)||(30678469-30678650)
chr6 (295-809)||(19486734-19487260)
chr6 (77-251)||(16100110-16100284)
chr6 (77-251)||(23025758-23025932)
chr6 (77-251)||(14130564-14130738)
chr6 (8-273)||(19881324-19881588)
chr6 (8-206)||(28280870-28281068)
chr6 (265-347)||(13751856-13751938)
chr6 (296-406)||(18450761-18450871)
chr6 (409-502)||(30678755-30678848)
chr6 (8-71)||(23080495-23080558)
chr6 (409-456)||(27563626-27563673)
chr6 (415-680)||(18450894-18451159)
chr6 (477-580)||(18962775-18962878)
chr6 (727-804)||(20010899-20010976)
chr6 (651-804)||(24367083-24367236)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (9-810)||(2616-3431)
scaffold0044 (9-810)||(16352-17167)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (10-810)||(9561-10375)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (10-810)||(21440-22254)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (8-810)||(40346-41162)
scaffold0109 (8-808)||(13423-14237)
[»] scaffold0028 (6 HSPs)
scaffold0028 (10-810)||(10669-11476)
scaffold0028 (10-810)||(17131-17944)
scaffold0028 (338-799)||(53248-53723)
scaffold0028 (10-342)||(45346-45678)
scaffold0028 (8-392)||(48243-48627)
scaffold0028 (551-669)||(47952-48070)
[»] scaffold0079 (4 HSPs)
scaffold0079 (10-810)||(35691-36505)
scaffold0079 (146-669)||(28407-28944)
scaffold0079 (8-707)||(2909-3622)
scaffold0079 (10-122)||(28294-28406)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (10-675)||(9133-9812)
[»] scaffold0042 (4 HSPs)
scaffold0042 (8-810)||(37117-37933)
scaffold0042 (413-810)||(25962-26359)
scaffold0042 (7-303)||(22897-23193)
scaffold0042 (307-406)||(25842-25941)
[»] scaffold0017 (5 HSPs)
scaffold0017 (8-810)||(17363-18179)
scaffold0017 (8-367)||(58208-58567)
scaffold0017 (497-810)||(195135-195448)
scaffold0017 (10-164)||(195444-195598)
scaffold0017 (409-810)||(23912-24313)
[»] scaffold0080 (5 HSPs)
scaffold0080 (8-810)||(10535-11352)
scaffold0080 (8-810)||(31075-31890)
scaffold0080 (8-810)||(36541-37356)
scaffold0080 (8-810)||(53828-54644)
scaffold0080 (132-810)||(13190-13883)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (8-810)||(20795-21611)
scaffold0081 (8-810)||(36219-37035)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (10-810)||(50642-51456)
scaffold0102 (8-810)||(41889-42705)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (14-722)||(15379-16102)
[»] scaffold0560 (2 HSPs)
scaffold0560 (41-702)||(8146-8822)
scaffold0560 (8-47)||(10914-10953)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (91-810)||(10455-11189)
[»] scaffold0149 (3 HSPs)
scaffold0149 (10-700)||(22-726)
scaffold0149 (8-406)||(5066-5464)
scaffold0149 (8-406)||(9497-9895)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (8-810)||(3625-4441)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (8-810)||(24242-25058)
scaffold0243 (319-804)||(10075-10574)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (146-794)||(11669-12331)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (8-811)||(17842-18658)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (8-810)||(3774-4590)
[»] scaffold0022 (5 HSPs)
scaffold0022 (8-809)||(40825-41638)
scaffold0022 (8-809)||(74545-75358)
scaffold0022 (410-810)||(35012-35411)
scaffold0022 (8-500)||(55948-56454)
scaffold0022 (88-379)||(8568-8859)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (13-810)||(2797-3608)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (14-650)||(27952-28589)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (22-810)||(7428-8230)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (8-810)||(103426-104234)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (8-810)||(23830-24646)
scaffold0011 (8-810)||(150762-151574)
[»] scaffold0114 (3 HSPs)
scaffold0114 (8-810)||(17646-18454)
scaffold0114 (66-810)||(39307-40065)
scaffold0114 (8-401)||(22067-22460)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (8-810)||(216717-217533)
[»] scaffold0010 (4 HSPs)
scaffold0010 (8-810)||(4107-4922)
scaffold0010 (8-804)||(44730-45540)
scaffold0010 (8-804)||(39636-40446)
scaffold0010 (582-810)||(14203-14431)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (8-810)||(13776-14592)
[»] scaffold0001 (6 HSPs)
scaffold0001 (8-810)||(495211-496027)
scaffold0001 (8-669)||(452651-453326)
scaffold0001 (8-397)||(515077-515466)
scaffold0001 (205-606)||(441078-441493)
scaffold0001 (657-810)||(441507-441660)
scaffold0001 (652-804)||(514656-514808)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (24-804)||(17085-17879)
scaffold0040 (252-810)||(111204-111776)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (8-810)||(6064-6880)
scaffold0270 (8-810)||(13194-14010)
[»] scaffold0278 (2 HSPs)
scaffold0278 (9-777)||(644-1426)
scaffold0278 (773-810)||(3521-3558)
[»] scaffold0324 (2 HSPs)
scaffold0324 (10-748)||(12573-13322)
scaffold0324 (682-810)||(1868-1996)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (338-810)||(7779-8265)
[»] scaffold0074 (3 HSPs)
scaffold0074 (8-810)||(5304-6120)
scaffold0074 (265-810)||(14571-15130)
scaffold0074 (8-254)||(11314-11560)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (8-810)||(675-1495)
[»] scaffold1459 (1 HSPs)
scaffold1459 (410-810)||(1329-1729)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (8-653)||(231-892)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (10-810)||(15276-16089)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (19-705)||(6489-7189)
[»] scaffold0647 (2 HSPs)
scaffold0647 (8-660)||(7106-7772)
scaffold0647 (59-353)||(3143-3437)
[»] scaffold0018 (5 HSPs)
scaffold0018 (8-810)||(23595-24411)
scaffold0018 (8-251)||(10611-10854)
scaffold0018 (417-810)||(9648-10041)
scaffold0018 (265-406)||(10066-10207)
scaffold0018 (8-96)||(16958-17046)
[»] scaffold0501 (2 HSPs)
scaffold0501 (325-810)||(12171-12670)
scaffold0501 (10-95)||(4389-4474)
[»] scaffold0993 (2 HSPs)
scaffold0993 (12-699)||(77-778)
scaffold0993 (602-810)||(781-989)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (146-810)||(40804-41480)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (8-636)||(8213-8855)
scaffold0120 (584-810)||(13865-14091)
scaffold0120 (77-335)||(24438-24696)
[»] scaffold0023 (6 HSPs)
scaffold0023 (11-705)||(1907-2615)
scaffold0023 (409-810)||(151687-152088)
scaffold0023 (8-332)||(151303-151627)
scaffold0023 (415-810)||(47280-47656)
scaffold0023 (743-810)||(30871-30938)
scaffold0023 (58-138)||(87011-87091)
[»] scaffold0181 (2 HSPs)
scaffold0181 (435-810)||(29225-29600)
scaffold0181 (10-406)||(29631-30026)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (8-664)||(20431-21102)
[»] scaffold0312 (2 HSPs)
scaffold0312 (8-559)||(252-817)
scaffold0312 (602-758)||(819-975)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (8-810)||(28815-29631)
scaffold0067 (8-810)||(49477-50293)
scaffold0067 (8-810)||(58511-59327)
scaffold0067 (8-810)||(64899-65715)
[»] scaffold0008 (4 HSPs)
scaffold0008 (8-406)||(84945-85343)
scaffold0008 (10-308)||(85609-85907)
scaffold0008 (67-379)||(132231-132543)
scaffold0008 (77-251)||(26029-26203)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (8-810)||(1569-2385)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (8-810)||(28582-29398)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (8-810)||(94191-95007)
scaffold0029 (8-251)||(107681-107924)
scaffold0029 (8-810)||(114752-115569)
[»] scaffold1985 (2 HSPs)
scaffold1985 (289-678)||(1-401)
scaffold1985 (8-54)||(407-453)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (8-810)||(152-967)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (8-810)||(2062-2878)
[»] scaffold0218 (3 HSPs)
scaffold0218 (325-810)||(25009-25508)
scaffold0218 (77-335)||(1738-1996)
scaffold0218 (139-266)||(26651-26778)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (8-810)||(200765-201581)
scaffold0004 (8-804)||(324897-325708)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (58-810)||(11201-11967)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (4-804)||(21488-22303)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (8-669)||(114476-115151)
[»] scaffold0358 (4 HSPs)
scaffold0358 (409-810)||(8556-8957)
scaffold0358 (8-251)||(8242-8485)
scaffold0358 (8-251)||(17438-17681)
scaffold0358 (409-722)||(17752-18065)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (8-810)||(28718-29534)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (8-810)||(250813-251629)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (46-668)||(5328-5964)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (8-810)||(69563-70379)
scaffold0034 (8-804)||(2255-3066)
[»] scaffold2004 (1 HSPs)
scaffold2004 (8-406)||(528-922)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (61-810)||(4386-5149)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (8-810)||(11021-11837)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (8-810)||(49297-50112)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (8-810)||(63816-64632)
[»] scaffold0476 (3 HSPs)
scaffold0476 (526-810)||(10509-10793)
scaffold0476 (7-810)||(842-1659)
scaffold0476 (8-155)||(10359-10506)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (8-804)||(33527-34338)
[»] scaffold0031 (4 HSPs)
scaffold0031 (10-262)||(54850-55102)
scaffold0031 (269-602)||(52430-52777)
scaffold0031 (8-350)||(109823-110165)
scaffold0031 (409-810)||(110216-110617)
[»] scaffold0035 (4 HSPs)
scaffold0035 (8-739)||(4942-5687)
scaffold0035 (58-377)||(41851-42170)
scaffold0035 (651-804)||(41411-41563)
scaffold0035 (690-804)||(5692-5806)
[»] scaffold0405 (2 HSPs)
scaffold0405 (8-401)||(693-1086)
scaffold0405 (419-810)||(5217-5609)
[»] scaffold0046 (2 HSPs)
scaffold0046 (8-579)||(79359-79944)
scaffold0046 (165-810)||(60087-60746)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (8-810)||(8759-9574)
scaffold0235 (8-810)||(18973-19788)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (8-810)||(25306-26119)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (58-810)||(21363-22129)
scaffold0058 (59-314)||(27055-27310)
[»] scaffold0309 (3 HSPs)
scaffold0309 (8-498)||(11986-12491)
scaffold0309 (8-209)||(16834-17035)
scaffold0309 (713-810)||(12637-12734)
[»] scaffold0293 (2 HSPs)
scaffold0293 (8-579)||(14661-15246)
scaffold0293 (639-810)||(15258-15429)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (8-406)||(19545-19943)
[»] scaffold1477 (1 HSPs)
scaffold1477 (8-741)||(419-1157)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (8-810)||(6943-7751)
[»] scaffold0222 (3 HSPs)
scaffold0222 (8-406)||(9254-9652)
scaffold0222 (8-810)||(784-1602)
scaffold0222 (575-804)||(20586-20815)
[»] scaffold0076 (4 HSPs)
scaffold0076 (8-401)||(54131-54524)
scaffold0076 (8-669)||(31115-31790)
scaffold0076 (77-250)||(42520-42693)
scaffold0076 (435-810)||(53720-54095)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (58-804)||(53288-54048)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (22-810)||(4386-5188)
[»] scaffold0077 (3 HSPs)
scaffold0077 (9-668)||(19073-19746)
scaffold0077 (659-806)||(57915-58062)
scaffold0077 (77-125)||(26262-26310)
[»] scaffold0348 (3 HSPs)
scaffold0348 (8-495)||(18095-18596)
scaffold0348 (121-810)||(5146-5849)
scaffold0348 (8-164)||(9831-9987)
[»] scaffold0342 (2 HSPs)
scaffold0342 (477-810)||(14563-14896)
scaffold0342 (8-406)||(14936-15334)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (8-810)||(98880-99675)
scaffold0020 (214-810)||(175390-175995)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (58-804)||(30629-31382)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (30-669)||(14421-15074)
scaffold0124 (77-365)||(5563-5850)
[»] scaffold0104 (3 HSPs)
scaffold0104 (8-406)||(24407-24805)
scaffold0104 (8-804)||(43722-44530)
scaffold0104 (602-803)||(25015-25216)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (8-809)||(5443-6258)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (10-810)||(7809-8621)
scaffold0420 (8-570)||(838-1412)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (8-810)||(262417-263233)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (58-669)||(923-1548)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (521-810)||(55767-56056)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (175-395)||(2653-2873)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (55-804)||(1237-2000)
[»] scaffold0403 (2 HSPs)
scaffold0403 (8-263)||(8565-8819)
scaffold0403 (768-810)||(14876-14918)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (55-810)||(4186-4955)
scaffold0130 (671-810)||(8076-8217)
[»] scaffold0083 (4 HSPs)
scaffold0083 (8-406)||(8749-9147)
scaffold0083 (107-406)||(6628-6927)
scaffold0083 (107-251)||(1324-1468)
scaffold0083 (435-694)||(8459-8718)
[»] scaffold1881 (2 HSPs)
scaffold1881 (614-810)||(777-973)
scaffold1881 (248-516)||(988-1270)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (8-810)||(49174-49988)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (8-404)||(16305-16701)
scaffold0266 (77-379)||(7603-7905)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (8-810)||(131-947)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (8-406)||(43109-43507)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (64-664)||(175788-176401)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (8-810)||(21042-21858)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (147-810)||(36269-36946)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (8-495)||(29125-29626)
[»] scaffold0529 (2 HSPs)
scaffold0529 (413-810)||(4698-5095)
scaffold0529 (235-368)||(4539-4672)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (8-810)||(10083-10899)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (8-404)||(51003-51399)
scaffold0026 (8-145)||(31138-31275)
scaffold0026 (179-370)||(31278-31469)
[»] scaffold0540 (2 HSPs)
scaffold0540 (627-810)||(11177-11360)
scaffold0540 (8-101)||(6351-6444)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (58-804)||(83824-84582)
scaffold0007 (8-332)||(268801-269125)
[»] scaffold1615 (1 HSPs)
scaffold1615 (289-642)||(1198-1565)
[»] scaffold1530 (1 HSPs)
scaffold1530 (235-804)||(1-584)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (663-810)||(1-148)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (8-208)||(959-1157)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (644-810)||(2560-2726)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (77-379)||(25656-25958)
[»] scaffold1602 (1 HSPs)
scaffold1602 (8-187)||(1-180)
[»] scaffold2111 (1 HSPs)
scaffold2111 (8-392)||(316-700)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (77-365)||(15170-15458)
scaffold0162 (77-365)||(10930-11218)
[»] scaffold0302 (2 HSPs)
scaffold0302 (77-379)||(473-775)
scaffold0302 (77-335)||(7415-7673)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (8-129)||(8207-8328)
[»] scaffold0053 (3 HSPs)
scaffold0053 (8-317)||(46838-47147)
scaffold0053 (8-284)||(55684-55960)
scaffold0053 (450-810)||(65595-65955)
[»] scaffold0261 (8 HSPs)
scaffold0261 (8-242)||(13215-13449)
scaffold0261 (8-242)||(21394-21628)
scaffold0261 (289-406)||(21260-21376)
scaffold0261 (289-406)||(13080-13197)
scaffold0261 (619-804)||(20831-21014)
scaffold0261 (619-810)||(12645-12834)
scaffold0261 (409-460)||(13012-13063)
scaffold0261 (409-460)||(21192-21243)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (11-284)||(37844-38117)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (77-379)||(34347-34647)
[»] scaffold0298 (2 HSPs)
scaffold0298 (8-302)||(9877-10170)
scaffold0298 (575-801)||(9533-9758)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (162-810)||(3467-4129)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (268-804)||(11260-11810)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (77-379)||(1363-1665)
[»] scaffold0052 (1 HSPs)
scaffold0052 (708-810)||(7141-7243)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (77-335)||(13411-13669)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (422-804)||(6657-7039)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (77-370)||(697-990)
[»] scaffold0146 (3 HSPs)
scaffold0146 (99-316)||(9759-9976)
scaffold0146 (99-316)||(17426-17643)
scaffold0146 (312-408)||(5787-5883)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (77-365)||(89762-90050)
scaffold0021 (167-251)||(21725-21809)
scaffold0021 (167-251)||(31301-31385)
scaffold0021 (105-250)||(7445-7590)
[»] scaffold1488 (1 HSPs)
scaffold1488 (77-247)||(677-847)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (8-100)||(23095-23187)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (77-256)||(7006-7185)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (77-251)||(1754-1928)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (645-810)||(1180-1345)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (722-810)||(8329-8417)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (409-648)||(23047-23286)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (94-244)||(16337-16487)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (77-249)||(6877-7049)
[»] scaffold1715 (1 HSPs)
scaffold1715 (8-242)||(1145-1379)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (477-669)||(16447-16640)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (729-810)||(8036-8117)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (146-335)||(423-612)
[»] scaffold0610 (2 HSPs)
scaffold0610 (146-266)||(4781-4901)
scaffold0610 (77-118)||(6932-6973)
[»] scaffold2059 (1 HSPs)
scaffold2059 (751-810)||(1066-1125)
[»] scaffold1433 (1 HSPs)
scaffold1433 (623-810)||(1608-1795)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (602-801)||(919-1118)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (422-804)||(5512-5894)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (295-401)||(126489-126595)
[»] scaffold0335 (3 HSPs)
scaffold0335 (86-251)||(7110-7275)
scaffold0335 (751-810)||(4601-4660)
scaffold0335 (420-687)||(4670-4937)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (761-810)||(424266-424315)
scaffold0003 (716-810)||(203294-203388)
[»] scaffold0241 (1 HSPs)
scaffold0241 (306-406)||(20-120)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (768-810)||(5-47)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (645-810)||(1151-1316)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (690-810)||(1112-1232)
[»] scaffold0118 (2 HSPs)
scaffold0118 (645-804)||(303-462)
scaffold0118 (409-495)||(67-153)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (717-810)||(67405-67498)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (289-379)||(23435-23525)
[»] scaffold0878 (1 HSPs)
scaffold0878 (290-379)||(4469-4558)
[»] scaffold0765 (1 HSPs)
scaffold0765 (761-810)||(6554-6603)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 663; Significance: 0; HSPs: 86)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 663; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Original strand, 12888492 - 12889306
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12888492 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctca 12888591  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12888592 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 12888691  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  12888692 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctca 12888791  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-- 407  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||       
T  12888792 agcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaatag 12888891  T
Q  408 -----------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
               || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12888892 aaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatcactgcttgatt 12888991  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12888992 ctcaatagataaagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcctct 12889091  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  12889092 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccataccactcaaag 12889191  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12889192 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttc 12889291  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||    
T  12889292 gacaaccatctctcc 12889306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 655; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 20060401 - 20059587
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20060401 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctca 20060302  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20060301 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 20060202  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  20060201 tcgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacactcggtctaacaaacttcttctca 20060102  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-- 407  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||       
T  20060101 agcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaatag 20060002  T
Q  408 -----------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
               || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20060001 aaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatcactgcttgatt 20059902  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20059901 ctcaatagataaagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcctct 20059802  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  20059801 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccataccactcaaag 20059702  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20059701 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatactagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttc 20059602  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||    
T  20059601 gacaaccatctctcc 20059587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 651; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Original strand, 3687726 - 3688540
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3687726 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctca 3687825  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3687826 aatcaatcttgctgaaaactcgtgctcccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 3687925  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||| ||     
T  3687926 tcgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttttcg 3688025  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-- 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||       
T  3688026 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaatag 3688125  T
Q  408 -----------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
               || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3688126 aaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcgcacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 3688225  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3688226 ctcaatagataaagaagccatcaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcctct 3688325  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  3688326 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactgtaaccagttcatacccaaaatcacatccataccactcaaag 3688425  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3688426 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagccggagtttc 3688525  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||    
T  3688526 gacaaccatctctcc 3688540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 647; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Original strand, 13254473 - 13255287
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13254473 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctca 13254572  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13254573 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagttgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 13254672  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  13254673 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacactcggtctaacaaacttcttctca 13254772  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-- 407  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||       
T  13254773 agcaagtcttccaactgtttcttcaacttagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaatag 13254872  T
Q  408 -----------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
               || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  13254873 aaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctgtcaatcactgcttgatt 13254972  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13254973 ctcaatagataaagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcctct 13255072  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  13255073 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccataccactcaaag 13255172  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13255173 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttc 13255272  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||    
T  13255273 gacaaccatctctcc 13255287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 645; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 15587741 - 15586925
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15587741 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccatatcgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatct 15587642  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15587641 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 15587542  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  15587541 tgtcgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttct 15587442  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  15587441 caagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaat 15587342  T
Q  408 -------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15587341 agaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatcactgcttga 15587242  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15587241 ttctcaatagataaagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcct 15587142  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  15587141 cttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtgattgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccataccattcaa 15587042  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  15587041 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagccggagtt 15586942  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  15586941 tcgacaaccatctctcc 15586925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 642; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 16755050 - 16754234
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  16755050 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 16754951  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16754950 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 16754851  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  16754850 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaacctgcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttctttt 16754751  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||     
T  16754750 ctagcaagtcctccaactgtttcttcaactcggataattctgaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccgacgtcgttccaggaacaagatcaat 16754651  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16754650 agaaaactcgacttccctctctggaggcacatcaggaatctcatccggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 16754551  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16754550 ttctcaaaagataaagaagccatcaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 16754451  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16754450 cctcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtgattgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccataccactcaa 16754351  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16754350 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacagaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtt 16754251  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  16754250 tcgacaaccatctctcc 16754234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 638; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 6602517 - 6603332
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  6602517 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttttgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 6602616  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6602617 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgctcaac 6602716  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  || |||||||||||||| |    
T  6602717 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggcctaacaaacttctttt 6602816  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  6602817 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataattctgaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaat 6602916  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6602917 agaaaactcgacttccctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggcagcctatcaatcactgcttga 6603016  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6603017 ttctccacagataaagaagccatcaatgaaaacatcaaaataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 6603116  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6603117 cttcgacggaagagaaatgtattgacttgctaaaacaattaataagaacgtgattgtactc-aaccagttcatacccagaatcacatccataccactcaa 6603215  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6603216 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtt 6603315  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    | |||||||||||||||    
T  6603316 ttgacaaccatctctcc 6603332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 637; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 15346594 - 15345778
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  15346594 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaagctggtgataacctgacct 15346495  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15346494 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 15346395  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  15346394 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacactcggtctaacaaacttcttct 15346295  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  15346294 caagcaagtcttctaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaat 15346195  T
Q  408 -------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15346194 agaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatcactgcttga 15346095  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15346094 ttctcaatagataaagtagccatcaacgaaaacatcaagataccgtcgcgtttcagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcct 15345995  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  15345994 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccttaccgctcaa 15345895  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15345894 aggtagacaaactaaatccatttcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtt 15345795  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  15345794 tcgacaaccatctctcc 15345778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 635; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 5423277 - 5422463
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5423277 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctaaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctca 5423178  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5423177 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 5423078  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||| |||    
T  5423077 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttttca 5422978  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-- 407  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||       
T  5422977 agcaagtcctccaattgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaatag 5422878  T
Q  408 -----------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
               || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5422877 aaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctagaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatcactgcttgatt 5422778  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5422777 ctcaatagatatagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcctct 5422678  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5422677 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccataccactcaaag 5422578  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  5422577 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaagacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagtcggagtttc 5422478  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||    
T  5422477 gacaaccatctctcc 5422463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 633; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 16637554 - 16638370
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16637554 cgaagggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcttcgtcttttactttaatctggtgatagcctgatct 16637653  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16637654 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 16637753  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  16637754 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttct 16637853  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  16637854 caagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaat 16637953  T
Q  408 -------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16637954 agaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctgtcaatcactgcttga 16638053  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16638054 ttctcaatagatatagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcct 16638153  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  16638154 cttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccataccactcaa 16638253  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16638254 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtt 16638353  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  16638354 tcgacaaccatctctcc 16638370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 633; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 48427228 - 48428044
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  48427228 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcttcgtcttttactttaatctggtgataacctgatct 48427327  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48427328 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 48427427  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  48427428 tgtcgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttct 48427527  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  48427528 caagcaagtcttctaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaat 48427627  T
Q  408 -------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  48427628 agaaaattcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctgtcaatcactgcttga 48427727  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48427728 ttctcaatagataaagtagccatcaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcct 48427827  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  48427828 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaataattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccataccactcaa 48427927  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48427928 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtt 48428027  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  48428028 tcgacaaccatctctcc 48428044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 631; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Original strand, 10907993 - 10908807
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10907993 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctca 10908092  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10908093 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 10908192  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  10908193 tcgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactatcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctca 10908292  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-- 407  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||       
T  10908293 agcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaatag 10908392  T
Q  408 -----------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
               || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  10908393 aaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctaccaatcactgcttgatt 10908492  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10908493 ctcaatagataaagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcctct 10908592  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  10908593 tcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccataccgctcaaag 10908692  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10908693 gtagacaaactaaatccatttcgaaatgacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttc 10908792  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||    
T  10908793 gacaaccatctctcc 10908807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 625; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 53383367 - 53382551
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  53383367 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 53383268  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53383267 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttactttgttcaac 53383168  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  53383167 ggccgataatcaatacacaaccgcatagtaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttctttt 53383068  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||     
T  53383067 caagcaaatcctccaactgtttcttcaactcagataattctgaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggtttcgttccaggaacaagatcaat 53382968  T
Q  408 -------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  53382967 agaaaactcgacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccattggtagcctatcaatcactgcttga 53382868  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53382867 ttctcaacagataaagaagccatcaaggaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgtttggtagacaaaaactctgcaccactttcct 53382768  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  53382767 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtgattgtactccaaccagttcatacccaaaatcacatccataccactcaa 53382668  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53382667 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtt 53382568  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||||| |||||||||    
T  53382567 tcgacaatcatctctcc 53382551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 623; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Original strand, 10007383 - 10008197
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10007383 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctca 10007482  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10007483 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 10007582  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  10007583 tcgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctca 10007682  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-- 407  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||       
T  10007683 agcaagtcttccaaccgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaatag 10007782  T
Q  408 -----------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
               || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  10007783 aaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctaccaatcactgcttgatt 10007882  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10007883 ctcaatagataaagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagttgcttagtagataaaaactctgcaccactttcctct 10007982  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  10007983 tcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccataccgctcaaag 10008082  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10008083 gtagacaaactaaatccatttcgaaatcgcgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttc 10008182  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||    
T  10008183 gacaaccatctctcc 10008197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 587; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 15400864 - 15400050
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15400864 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatttggtgataacctgacctca 15400765  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15400764 aatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 15400665  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
     |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||||||||     
T  15400664 tcgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaatttcttctcg 15400565  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-- 407  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||       
T  15400564 agcaaatcttccaactgtttcttcaactcggataattcggaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcccggaacaagatcaatag 15400465  T
Q  408 -----------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
               || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  15400464 aaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccacttgtagcttatcaatcactgcttgatt 15400365  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||    
T  15400364 ctcaacagataaagtagccattaacgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactcttctct 15400265  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  15400264 tcgacggaagaaaaatgcactgacttactaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaattacatccataccgctcaaag 15400165  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15400164 gcagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaaccctaagctggagtttc 15400065  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||    
T  15400064 gacaaccatctctcc 15400050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 557; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 100 - 810
Target Start/End: Original strand, 43164548 - 43165272
Alignment:
Q  100 cctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttacct 199  Q
    ||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43164548 cctgatctcaaaaaaatattgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttacct 43164647  T
Q  200 tgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaa 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||    
T  43164648 tgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 43164747  T
Q  300 cttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaaca 399  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  43164748 cttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaaca 43164847  T
Q  400 agatcaag-------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatca 485  Q
    |||||||              || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  43164848 agatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctgtcaatca 43164947  T
Q  486 ctgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcacc 585  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43164948 ctgcttgattctcaatagatatagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacc 43165047  T
Q  586 actttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacata 685  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  43165048 actttcctcttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccata 43165147  T
Q  686 ccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttag 785  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43165148 ccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttag 43165247  T
Q  786 ctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  43165248 ctggagtttcgacaaccatctctcc 43165272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 556; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 810
Target Start/End: Original strand, 15357886 - 15358680
Alignment:
Q  30 atagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaact 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  15357886 atagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcatcatctttcactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaaca 15357985  T
Q  130 cgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaacc 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||    
T  15357986 cgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagtaaccttgttcaactgtcgataatcaatacatagcc 15358085  T
Q  230 gcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgttt 329  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||  |  ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||    
T  15358086 tcatactaccatctttcttctttactagcaaaatcggcgctccccaaggtgaaatacttggtctaacaaatttcttctcgagcaaatcttccaactgttt 15358185  T
Q  330 cttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaagtc--------------ctctct 415  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||  |              ||||||    
T  15358186 cttcaactcggataattcggaagcagacatacgataaggtgccattgacaccggcttcgttcccggaacaagatcaatacaaaactcaacttctctctct 15358285  T
Q  416 ggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagcca 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15358286 ggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccacttgtagcttatcaatcactgcttgattctcaacagataaagtagcca 15358385  T
Q  516 ttaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtac 615  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  15358386 ttaacgaaaacatcaagataccatcgtgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactctcctcttcgacggaagaaaaatgcac 15358485  T
Q  616 tgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatt 715  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  15358486 tgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgcactctaactagttcatacccagaattacatccataccgctcaaaggcagacaaactaaatccatt 15358585  T
Q  716 tcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15358586 tcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 15358680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 539; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 118 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 15714295 - 15713589
Alignment:
Q  118 ttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataat 217  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15714295 ttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataat 15714196  T
Q  218 caatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtc 317  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15714195 caatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaagtc 15714096  T
Q  318 ctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag---------- 407  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||               
T  15714095 ttccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaatagaaaactca 15713996  T
Q  408 ---tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacag 503  Q
       || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15713995 acttctctctctggaggcacatcaggaatcccatctggaaaaacttcaggaaaatcacacaccaccggtaacctatcaatcactgcttgattctcaatag 15713896  T
Q  504 ataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacgga 603  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15713895 ataaagtatccattaacgaaaacatcaagatatcgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcctcttcgacgga 15713796  T
Q  604 agagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaa 703  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  15713795 agagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccataccgctcaaaggtagacaa 15713696  T
Q  704 actaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaacca 803  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15713695 actaaatccatttcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaacca 15713596  T
Q  804 tctctcc 810  Q
    |||||||    
T  15713595 tctctcc 15713589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 506; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 26791611 - 26790946
Alignment:
Q  159 atcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26791611 atcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactaac 26791512  T
Q  259 aaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagaca 358  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26791511 aaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttgatctaacaaacttcttctcaagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagaca 26791412  T
Q  359 tacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaa 444  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||              || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26791411 tacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaa 26791312  T
Q  445 aacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgt 544  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  26791311 aacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctgtcaatcaccgcttgattctcaatagataaggtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgt 26791212  T
Q  545 tccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgt 644  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26791211 tccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgt 26791112  T
Q  645 ggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaagg 744  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26791111 ggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccataccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcgaaatcacgaccaaacatagacaaagg 26791012  T
Q  745 acatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26791011 acatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagccggagtttcgacaaccatctctcc 26790946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 490; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 16805296 - 16804480
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16805296 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgtgctgaaagctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataccctgatct 16805197  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16805196 caaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttactttgttcaac 16805097  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |    
T  16805096 tgacgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcttcactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaatttctttt 16804997  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||  |||||||     
T  16804996 caagcaaatcttctaactgtttcttcaacttagccaactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggctttgttccaagaatcagatcaat 16804897  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                   ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  16804896 agaaaactcaacttccctctctagaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaagtcgcataccacttgtagcttatcaatcactgcttga 16804797  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16804796 ttctcaaaagataaagaagccatcaaaggatacatcaaaataccatcgcgttccatttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcct 16804697  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||| ||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  16804696 cttcaacggaagagaaatacactgacttggtaaaataattgatatgaacatggttgtactctaaccaattcatacccagaatcacatccataccgctcaa 16804597  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  16804596 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacagaagacatcgcaagcatacgagagaagtagtcaccaaacccttagctggagtt 16804497  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  16804496 tcgacaaccatctctcc 16804480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 16693945 - 16694761
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16693945 cgaatggcataactttatattcatagtgaccatagcgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatctttcacattaatctggtgataacctgatct 16694044  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| || |||   |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  16694045 caaatcaatcttgctgaagactttcgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattctcggaagtggatacatattcttgatagttaccttattcaac 16694144  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   |||||||||| ||||| |    
T  16694145 tgacgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaacacttagtctaacaaatttctttt 16694244  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa- 406  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||     
T  16694245 caagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagctaactcggaagcagacatacgataaggtgccatctacaccggcttcgttccaggaacaagatcaat 16694344  T
Q  407 -------------gtcctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||  ||||| ||||||||||||||| |    
T  16694345 agaaaactcaacttccctctctggaggcacatctggaatttcatctggaaaaacttcaggaaagtcgcataccacttgtagcttatcaatcactgcttaa 16694444  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  16694445 ttctcaatagataacgaagccatcaaagaaaacatcaaaataccatcgcgttccatttgcttcagctgcttagtagataagaactctgcaccactttcct 16694544  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  ||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | || || ||| |||||    
T  16694545 cttcagcggaagagaaatacattgacttgctaaaacaattgatatgaacatggttgtactctaaccaattcatacccataattaaatccaaaccgctcaa 16694644  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  16694645 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatcgcaaacatacgagagaagtagtcacagaacccttagctggagtc 16694744  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  16694745 tcgacaaccatctctcc 16694761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 473; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 73 - 810
Target Start/End: Original strand, 24185036 - 24185787
Alignment:
Q  73 tcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaa 172  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  24185036 tcatcttttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaa 24185135  T
Q  173 gtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctcc 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  24185136 gtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgtcgataatcaatacataacctcatactaccatctttcttctttactagtaaaaccggtgctcc 24185235  T
Q  273 ctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgcc 372  Q
    | |||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24185236 ccaaggtgaaacacttggtctaacaaatttcttctcaagcaaatcttccaactgtttcttcaactcagataattcggaagcagacatacgataaggtgcc 24185335  T
Q  373 atcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaagt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaatt 458  Q
    ||| | || |||||||||||||||||||||||||                ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  24185336 atcaacaccggcttcgttccaggaacaagatcaatagaaaactcaacttccctctctggaggcacatcatgaatttcatttggaaaaacttcaggaaaat 24185435  T
Q  459 cacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcag 558  Q
    | || |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  24185436 cgcataccacttgtagcttatcaatcactgcttgattctcaatagataaagaagccattaaagaaaacatcaaaataccatcacgttccatttgcttcag 24185535  T
Q  559 ctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaac 658  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||    
T  24185536 ctgcttagtagataagaactctgcaccactttcctcttcggcggaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatatgaacatggttgtactccaac 24185635  T
Q  659 cagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacata 758  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  24185636 caattcatacccagaatcacatccataccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacaacgcaaacata 24185735  T
Q  759 cgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  24185736 cgagagaagtagtcaccaaacccttagctggagtttcaacgaccatctctcc 24185787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 810
Target Start/End: Original strand, 17491632 - 17492448
Alignment:
Q  9 gaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctc 108  Q
    ||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17491632 gaaaggcataactttgtactcataatgtccataacgcgttctgaaagctgttttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctc 17491731  T
Q  109 aaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 208  Q
    ||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |    
T  17491732 aaatctatcttgctgaaaacacttgcacccactaactgatccatcaaataatcaattctcggaagtggatacctattctttattgtcaccttgttcaaat 17491831  T
Q  209 gccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctc 308  Q
    | ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |  |||||||||||||| |||||    
T  17491832 gtcgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcttcactagcaaaaccggcgctccccaaggcgaaaaacttggtctaacaaactttttctc 17491931  T
Q  309 aagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa-- 406  Q
    ||| || || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||      
T  17491932 aagtaaatcttctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaggcttcgttccaggaacaagatcaatc 17492031  T
Q  407 -------------gtcctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                   ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||  ||||  |||||||||||||||||    
T  17492032 gaaaaattcaacttccctctttggaggcacatcaggaatttcatcaggaaatacttctggaaaatcgcataccacttgtagtttatcaatcactgcttga 17492131  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17492132 ttctcaatagataaggaagccatcaaagaaaacatcaaaataccatcacgttctaactgcttcagctgcttagtagacaaaaactccgcgccactttcct 17492231  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||||||||  || || || ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  17492232 cttcagcagaagagaaatacacagatttactaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaa 17492331  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||| |||| |||||| | ||||| || |||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  17492332 aggtagacaaaccaaatcaatctcaaaatcacgatcaaacataaacaagggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaactcttcgctggagtt 17492431  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  17492432 tcgacaaccatctctcc 17492448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 14579743 - 14578941
Alignment:
Q  22 ttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgc 121  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14579743 ttatactcataatgtccataccgcattctaaaagctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgc 14579644  T
Q  122 taaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaat 221  Q
    | ||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||  |||||||||||    
T  14579643 tgaaaacacgtgcacccactaattgatccatcaaatcatcaattcttggaagtggatacctattctttatcgttaccttattcaactatcgataatcaat 14579544  T
Q  222 acacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctcc 321  Q
     || |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||| |  ||||| |||||||| ||||||||||| |||||     
T  14579543 gcataacctcatactgccatctttcttctttactaacaaaacgggcgctccccaaggcgaaacacttggtcttacaaactttttctcaagcaaatcctct 14579444  T
Q  322 aactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa--------------g 407  Q
    || ||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||                   
T  14579443 aattgtttcttcaactcagtcaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaggcttcgttccaggaacaagatcaatagaaaattcaactt 14579344  T
Q  408 tcctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataa 507  Q
     ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||  ||||| | |||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  14579343 ccctttctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttcagggaaatcgcataccacttgtagcttgtcaatcaccgctcgattctcaatagataa 14579244  T
Q  508 agaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagag 607  Q
    | | |||||||| || ||||| |  || ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||||    
T  14579243 atatgccattaaggagaacattagaattccatctcgttctaactgcttcagctgcttagtagataaaaattctgcgccactttcctcttcagcagaagag 14579144  T
Q  608 aaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaacta 707  Q
    ||||  || ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||| |    
T  14579143 aaatacaccgacttactaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccagttcatacctagaatcacatccataccactcaaaggcaaacaaacca 14579044  T
Q  708 aatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctc 807  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| | |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14579043 aatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaaaggacatcttaaacatactatagaagtagttactgaacccttagctggagtttcgacaaccatctc 14578944  T
Q  808 tcc 810  Q
    |||    
T  14578943 tcc 14578941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 15261411 - 15262227
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  15261411 cgaaaggcatcactttatattcataatgtccataacgtgttctaaaagccatcttctgcatatcttcatctttcagtttaatctagtgataacccgatct 15261510  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||    
T  15261511 caaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaattcatcaattctcggaagtggatatctattctttatcgtcactttgtttaac 15261610  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||| ||||| || |||||||    |||||  |||||||||| |    
T  15261611 tgtcgataatcaatgcacaatctcatactaccatctttcttcttaactagcaatatcggcactccccaatgtgaaacatttggtcttgcaaacttcttat 15261710  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| || || |||||||||||  ||||||| ||||     
T  15261711 caagcaagtcttctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagccgacatacggtaaggtgtcatagacacaggcttcgttcctagaacaaggtcaat 15261810  T
Q  408 -------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                 || || ||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||| || || |||||||| ||| ||| | ||||||||| |||||||    
T  15261811 cgaaaatttaacttctctttctggaggcacattaggaatttcatcaagaaaaacttctgggaaatcacacacaacctgtaacttatcaatcattgcttga 15261910  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| ||| || || ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  15261911 ttctcaatagacaaggacgccatcaaagaaaacatcaaaattccatcacgttctaattgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcgccactttctt 15262010  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||    ||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| || || |||| ||| ||||||||    
T  15262011 cttcagtagaagaaaaatacactgacttactaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccagttcacaccaaggattacatccattccactcaa 15262110  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  15262111 aggtaaacaaaccaaatcaatttcaaaatctcgaccaaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccattagctggagtt 15262210  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  15262211 tcgacaaccatctctcc 15262227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 8 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 5108960 - 5108562
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  5108960 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgacct 5108861  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5108860 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 5108761  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  5108760 tgtcgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacactcggtctaacaaacttcttct 5108661  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  5108660 caagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagatagctcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaa 5108562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 328 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 14874597 - 14874101
Alignment:
Q  328 ttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-------------tc-ctct 413  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||              || ||||    
T  14874597 ttcttcaactcagctaactcggaagctgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccaggaacaagatcaatagaaaactcaacttctctct 14874498  T
Q  414 ctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagc 513  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14874497 ctggaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaaatcgcataccacttgtagcttatcaatcactgcttgattctcaattgataaagaagc 14874398  T
Q  514 cattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgt 613  Q
    ||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||      
T  14874397 catcaaagaaaacatcaatataccatcacgttccagttgcttcagctgcttagtaaacaagaactctgcaccaatttcctcttcgactgaggagaaatac 14874298  T
Q  614 actgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatcca 713  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14874297 actgacttgctaaaataattaatatgaacatggttctactcgaaccagttcatacccagaatcacatacataccgctcaaaggtagacaaactaaatcca 14874198  T
Q  714 tttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14874197 tctcaaaatcacgaccaaacatagacaaagaacttttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 14874101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 171 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 12844289 - 12843636
Alignment:
Q  171 aagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgct 270  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||    
T  12844289 aagtggatacctattctttatcgttactttgttcaactgtcgatagtcaatgcacaacctcatactaccatctttcttcttcactaacaaaatcggcgct 12844190  T
Q  271 ccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtg 370  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||||||  |||||  |||| |||||||| |||||||    
T  12844189 ccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttatcaagcaaatcttctaattgtttcttcaactcagccaactcataagctgacatacggtaaggtg 12844090  T
Q  371 ccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaagtc--------------ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaa 456  Q
     ||| || || |||||||| || |  |||||||||| |               || |||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||    
T  12844089 tcatagacacaggcttcgtacccgatacaagatcaattgaaaattcaacttctctttctggacgcacatcaggaatttcagcaggaaaaacttctggaaa 12843990  T
Q  457 ttcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttc 556  Q
     ||||| || |||  |||| |||||||||| ||||||||||||| ||| || || || || || ||||||||||| || ||||| ||||| |  ||||||    
T  12843989 atcacatacaacctatagcttatcaatcaccgcttgattctcaatagacaaggatgctatcaaagaaaacatcaaaattccatcacgttctaactgcttc 12843890  T
Q  557 agctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactcta 656  Q
     |||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||  |  |||||||||  || ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  12843889 tgctgcttagtagacaagaattatgcgccactttcctcttcagcataagagaaatacaccgacttactaaaacaattaatatgaacatggttgtactcta 12843790  T
Q  657 accagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaaca 756  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||    
T  12843789 accagttcatacccaggattacatccataccactcaaaggtaaacaaaccaagtcaatttcaaaatcacgatcaaacataaacaaaggacatcttaaaca 12843690  T
Q  757 tacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
     || |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  12843689 cacaagagaagtagtcactgaaccattagctggagtttcaacaatcatctctcc 12843636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 109 - 669
Target Start/End: Original strand, 18437022 - 18437596
Alignment:
Q  109 aaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 208  Q
    ||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| || || || ||||| ||||    
T  18437022 aaatctatcttgctgaaaacacttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcgggagtggatacatattctttattgtcactttgttaaact 18437121  T
Q  209 gccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctc 308  Q
    | ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||||| |||||    
T  18437122 gtcgataatcaatacacaatctcatcctaccatctttcttcttcactagcaaaaccggcgctccccaaggcgaaacacttggtctaacaaactttttctc 18437221  T
Q  309 aagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa-- 406  Q
    ||| || || || || ||||| |||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || |  |||||||||||| ||||||||||||      
T  18437222 aagtaaatcttctaattgttttttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacataggcttcgttccaagaacaagatcaata 18437321  T
Q  407 ------------gtcctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgat 494  Q
                  ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||  ||||  |||||||||| |||||||    
T  18437322 gaaaattcaacttccctctctggagccacatcaggaatttcatcaggaaatacttctggaaaatcgcataccacttgtagtttatcaatcaccgcttgat 18437421  T
Q  495 tctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctc 594  Q
    |||||| |||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18437422 tctcaatagataaggaagccatcaaagaaaacattaagattccatcacgttctaactgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcctc 18437521  T
Q  595 ttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacc 669  Q
    |||  | ||||||||||  || ||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18437522 ttcagcagaagagaaatacaccgacttactaaaacaattactatgaacatggttgtactctaaccagttcatacc 18437596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 542 - 810
Target Start/End: Original strand, 15065400 - 15065668
Alignment:
Q  542 cgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaa 641  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||| |||    
T  15065400 cgttccagttgcttcagctgcttggtagataagaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatacactgactttctaaaacaattgatatgaa 15065499  T
Q  642 cgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaa 741  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15065500 catggttgtactctaaccaattcataccaagaatcacatccataccgctcaaaggtagacaaactaaatccatctcaaaatcacgaccaaacatagacaa 15065599  T
Q  742 aggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15065600 aggacatttcaaacaaacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagattcgacaaccatctctcc 15065668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 24 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 11888687 - 11888027
Alignment:
Q  24 atattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgcta 123  Q
    ||||||||| || |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11888687 atattcataatgtccataacgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcgtctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgcta 11888588  T
Q  124 aaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatac 223  Q
    || || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| ||  ||||||| ||||||||||| |    
T  11888587 aacacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggatacctattgtttatcgttactttaatcaactgtcgataatcaatgc 11888488  T
Q  224 acaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaa 323  Q
    | |||| ||| ||||| ||||||||||| |||| |||||  ||| ||||| |||||||||| |  ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||    
T  11888487 ataacctcatgctaccgtctttcttcttaactaacaaaatcggcactccccaaggtgaaacacttggtcttacaaacttcttatcaagcaaatcttctaa 11888388  T
Q  324 ctgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc-------aagtc------- 409  Q
     |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||| | ||||| | ||| || ||  ||||||| ||||||||||||||       || ||           
T  11888387 ttgtttcttcaactcggacaactcagaagccgacatatggtaaggcgtcatagacacatgcttcgtaccaggaacaagatcaatcgaaaattcaacctct 11888288  T
Q  410 ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaag 509  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  || || |||| ||||||   || | ||||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  11888287 ctttctggcggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttatgggaaatcacgcaccacttataacttatcaattactgcttgattctcaacagacaagg 11888188  T
Q  510 aagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaag-aga 608  Q
    | |  || || |||||||||||||| ||||| || || |  || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||| || |||| | |    
T  11888187 acggaatcaaagaaaacatcaagattccatcccgctctaactgtttcagctgcttagtagtcaaaaactctgctccactctcttcttcaacagaagaaaa 11888088  T
Q  609 aatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacc 669  Q
    ||| ||| || ||  |||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||| ||||    
T  11888087 aatataccgatttattaaaacaattaatatgaacatggttatactccaactagttcttacc 11888027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 31940694 - 31941510
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||  |||| || || || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || || || |||||||| ||    
T  31940694 cgaaaggcatcaccttgtattcataatgtgcatatcgtgtcctaaaggctgtcttatgcatatcctcatccttcaccttgatttgatggtaacctgacct 31940793  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||| || |||||   ||||||||||||| | |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||    
T  31940794 caagtcaatcttactgaaaacctttgcacccactaactggtccatcaagtcgtcaatcctcggaagtggatacctgttctttatcgtaactttgttcaac 31940893  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||| |||| || ||| ||||| || ||||||||||| | ||| || ||||||||| | | |||||| |   |||| ||||||||||| |    
T  31940894 tgacgatagtcaatgcacagcctcatgctaccgtccttcttctttaccaacaataccggcgctccccacgatgaaacactgtgtcttacaaacttcttat 31940993  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||     
T  31940994 caagcaagtcttccaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatgcgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcccggaacaaggtcaat 31941093  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              ||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  31941094 tgaaaattcaacctccctttctggtggcacatctggaatctcatccggaaaaacttcaggaaactcattcaccaccggtaacctgtcaatcacagcttga 31941193  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    || || |  || ||||| ||||| || |||||||| |  || |||||||| |||| |||||||| ||| |||||||  |  || ||||| ||||| || |    
T  31941194 ttttctaacgacaaagatgccatcaaagaaaacataagaattccatcgcgctccaattgcttcaactgtttagtagttaggaattctgctccactctctt 31941293  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||  |||| ||||||||||||||||| || | ||| |||| ||| ||  ||||    
T  31941294 cttccgcagaagaaaaatgcactgtcttgctaaaacaatttatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaataacatccattcccgtcaa 31941393  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     |||| ||| ||||| || | |||||| || |  |||||||||||||| || ||  | | ||| || |||||| |||| ||   ||||||||||||||||    
T  31941394 cggtaaacacactaagtcgacttcaaagtctctgccaaacatagacaacgggcaccttagacacacaagagaagtagttactagacccttagctggagtt 31941493  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || |||||||| |||||    
T  31941494 tcaacaaccatttctcc 31941510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 8 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 16826619 - 16825809
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| |||| || || || |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  16826619 cgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccaaaacgtgtcctaaaggtcgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacct 16826520  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||| || ||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| || || || || |||| |    
T  16826519 caaatcaattttactaaacacacgtgcacccactaactgatccattaaatcgtcaatcctcggaagtggatacctattctttatcgtcactttattcagc 16826420  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || || ||||| |||||||||  ||| |||||||| |||||||| || | ||| || ||||||||| | |||||||| |  ||| | ||||| ||||| |    
T  16826419 tgacggtaatctatacacaacttcatgctaccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgctccccacggtgaaacacttggtttcacaaatttcttat 16826320  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| | ||     
T  16826319 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagctaactcggacgccgacatacggtaaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaaggttaat 16826220  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||  ||| ||||| |  || | |||||| ||||||    
T  16826219 tgaaaattcaacctccctctctggtggcacatctggaatctcatcaggaaaaacttctgaaaattcattcacaaccggcaatctgttaatcacagcttga 16826120  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||| |  || ||  | ||||| || |||||||| || || ||||| | ||| |   |||||| ||| |||||||  |  ||||| || ||||| || |    
T  16826119 ttctccaatgacaagtatgccatcaaagaaaacattaaaattccatcacattctaaccgcttcaactgtttagtagttaggaactcagctccactctctt 16826020  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||| ||||| |  | ||| ||||| ||||| ||| ||||  |||| ||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||  ||||    
T  16826019 cttcagcagaagaaaaatgcatcgtcttactaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaatcacatccatacccgtcaa 16825920  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     |||| |||||| | ||| | |||||| || | |||||  |||||||| |||||  | | ||| || |||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  16825919 cggtaaacaaacaagatcgacttcaaagtctctaccaattatagacaacggacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtt 16825820  T
Q  794 tcgacaaccat 804  Q
    || ||||||||    
T  16825819 tcaacaaccat 16825809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 31693523 - 31692707
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || || |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || || |||||||| ||    
T  31693523 cgaaaggcatcaccttgtattcataatgtccatatcgtgtcctaaaagccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttgatttgatggtaacctgacct 31693424  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||| || |||||   ||||||||||||| | |||||||| |  ||||  ||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||    
T  31693423 caagtcaatcttactgaaaacctttgcacccactaactggtccatcaagtcgtcaaccctcggaagtggatacctgttctttatcgtaactttgttcaac 31693324  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||| |||| || ||| ||||| || ||||||||||| | | | |  ||||||||| | |||||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  31693323 tgacgatagtcaatgcacagcctcatgctaccgtccttcttctttaccaactatatcggcgctccccacggtgaaacactgggtcttacaaacttcttat 31693224  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||     
T  31693223 caagcaagtcttccaactgtttcgtcaattcagctaactcagaagctgacatgcgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcccggaacaaggtcaat 31693124  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              ||| ||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||| ||||||||  |||||    
T  31693123 tgaaagttcaacctccctttctggtggcacatctagaatctcatccggaaaaacttcaggaaactcattcaccaccggtaacctgtcaatcacaacttga 31693024  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    || || |  || ||||| ||||| || |||||||| |  || |||||||| |||| |||||||| ||| |||||||  |  || |||||| |||| || |    
T  31693023 ttttctaacgacaaagatgccatcaaagaaaacataagaattccatcgcgctccaattgcttcaactgtttagtagttaggaattctgcaacactctctt 31692924  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||| ||||  |||| |||||||| |||||||| || | ||| |||| ||| ||  ||||    
T  31692923 cttccgcagaagaaaaatgcaccgtcttgctaaaacaattgatatgaactcggttatactctaatcagttcatcccaaaaataacatccattcccgtcaa 31692824  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     |||| ||| ||||| || | |||||| || | ||||||||||||||| |||||  | | ||| || |||||| |||| || ||||||||||||| ||||    
T  31692823 cggtaaacacactaagtcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacacacaagagaagtagttactgaacccttagctgaagtt 31692724  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || |||||||| |||||    
T  31692723 tcaacaaccatttctcc 31692707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 24189095 - 24189911
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||| ||| ||||||||||| || ||||| || || || || || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||    
T  24189095 cgaaagacatcactttatattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggcagtcttctgcatatcctcatccttcaccttgatctgatggtaacctgacct 24189194  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||| ||||||||   ||||||||| ||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || || ||||||    
T  24189195 caagtcaatcttactaaaaacctttgcacccaccaactgatccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctttatcgtaactttattcaac 24189294  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||| || | || |||||||||||| || |||||||||| ||| || ||||||||| | ||||||||   |||||| ||||||||||| |    
T  24189295 tgacgatagtcaatgcatagcctcatactaccatcctttttctttactaacaacacaggcgctccccacggtgaaacattcggtcttacaaacttcttat 24189394  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||     
T  24189395 caagcaagtcttccaactgattcttcaattcagctaactcagaagccgacatacggtacggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaaggtcaat 24189494  T
Q  408 t----------cctctct----ggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |          |||||||    || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||| |||||||| || |||    
T  24189495 tgaaaattcaacctctctctccggtggcacatctggaatctcatcaggaaaaacttcaggaaattcattcaccactggtaacctgtcaatcacagcctga 24189594  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||| | ||| || || ||||| || ||| ||||||  || || || ||||| || ||||||  ||| || |||| ||| || ||  | ||||  || |    
T  24189595 ttctccaaagacaaggatgccatcaaagaatacatcagaattccgtcacgttctagctgcttcttctgtttcgtagtcaagaattcaactccaccctctt 24189694  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||| ||||| || | ||||||||| || || ||| ||||  |||| || |||||||| ||||| || | ||| |||| ||| ||  |||     
T  24189695 cttccgcagaagaaaaatgcaccgtcttgctaaagcagttgatatgaactcggttatattctaaccaattcattccaaaaataacatccattcccgtcag 24189794  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     |||| | ||||||| || |  |||||||| | |||||||||||| | ||||||  ||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||||||     
T  24189795 cggtaaaaaaactaagtctacctcaaaatctctaccaaacatagatataggacacctcaaacaaacgagaaaagtagtcactgaacccttagctggagtc 24189894  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || ||||||||||||||    
T  24189895 tcaacaaccatctctcc 24189911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 22 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 14291856 - 14291054
Alignment:
Q  22 ttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgc 121  Q
    |||||||||||||||||| |||| || || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||    
T  14291856 ttatattcatagtgaccaaaacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaattttgc 14291757  T
Q  122 taaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaat 221  Q
    | || || |  |||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||| || || || || |||| ||| || ||||| ||    
T  14291756 tgaacacacaagcacccactaactgatccattaaatcgtcaattctcagaagtggatacctgttctttatcgtcactttattcagctgacggtaatctat 14291657  T
Q  222 acacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctcc 321  Q
    || ||||| ||| |||||||| |||||||| || | ||| || || ||| || | |||||||| | |||||| ||||| ||||| ||||| || || |||    
T  14291656 actcaacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaacaccggtgcttcccacggtgaaacactcggtcttacaaatttcttatcaagtaaatcttcc 14291557  T
Q  322 aactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaagt------------- 408  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| | |                 
T  14291556 aactgtttctttaactcagctatctcggacgccgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccgggcacaagatcgattgaaaattcaacct 14291457  T
Q  409 -cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataa 507  Q
     ||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||  || |  ||||||||||| ||||||||||| |  || ||    
T  14291456 ccctttctggtggcacatctggaatctcatcaggaaaaacttctggaaattcattcaccaatggaaatctatcaatcacagcttgattctccaatgacaa 14291357  T
Q  508 agaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagag 607  Q
      | ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||  || ||||||| ||| ||||| ||  |||| || ||||| ||   |||     
T  14291356 gtatgccatcaaagaaaacattaagattccatcacgttctaactgcttcaattgtttagtagtcaagaactcagcttcactctcttcttcaacaagagaa 14291257  T
Q  608 aaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaacta 707  Q
    ||||| || | ||| ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||   ||| || | ||| || |    
T  14291256 aaatgcaccgtcttactaaagcaattaatatgaacatggttatactctaaccagttcatcccaaaaatcacatccatacccgacaacggcaaacatacaa 14291157  T
Q  708 aatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctc 807  Q
     ||| | |||||| || | ||||||||||||||| |||||  ||||||| || |||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  14291156 gatcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaactcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttc 14291057  T
Q  808 tcc 810  Q
    |||    
T  14291056 tcc 14291054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 58 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 12358815 - 12358055
Alignment:
Q  58 gtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaat 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||| |||| || |||||   ||||||||||||| |||||||||| |    
T  12358815 gtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtcattcttactgaaaacctttgcacccactaactgatccatcaagt 12358716  T
Q  158 tatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactag 257  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || |||| |||||| | ||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| || |     
T  12358715 catcaatcctcggaagtggatacctgttctttattgtaactttgtgcaactgacaataatcaatgcataacctcatgctaccatccttcttcttaaccat 12358616  T
Q  258 caaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagac 357  Q
    ||| || ||||||||| |||||||||| |  ||||| ||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||    
T  12358615 caacaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaacttcttatcaagctagttgtccaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgac 12358516  T
Q  358 atacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaagt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaa 443  Q
    |||||||||||||||||||  || | ||||||||| |||||||| |||| |              ||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  12358515 atacgataaggtgccatcggcaccgacttcgttcctggaacaaggtcaattgaaaattcaacctccctttctggtggcacatctggaatctcatccggaa 12358416  T
Q  444 aaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcg 543  Q
    ||||||||||||| |||  ||| ||||| | ||||||||||||  |||||||||| |  || ||| | ||||| || |||||||| |  || ||||| ||    
T  12358415 aaacttcaggaaactcattcacaaccggcaacctatcaatcacaacttgattctctaacgacaaatatgccatcaaagaaaacataagaattccatcacg 12358316  T
Q  544 ttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacg 643  Q
     ||||  ||||||| ||  || ||||| |  |||||||| ||||| || |||||    ||||| ||||| || |  |||||||||||||| ||| ||||     
T  12358315 ctccaactgcttcaactattttgtagagaggaactctgctccactctcttcttccgtagaagaaaaatgcaccgttttgctaaaacaattgatatgaact 12358216  T
Q  644 tggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaag 743  Q
     |||| |||||||||||||||||  | | ||| |||| ||||||  |||| | || ||||||||| || | |||||| || | ||||||||||||||| |    
T  12358215 cggttatactctaaccagttcatcgcaaaaataacatccatacccgtcaacgctaaacaaactaagtcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacg 12358116  T
Q  744 gacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 804  Q
    ||||  | | ||| || |||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12358115 gacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccat 12358055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 8 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 11950246 - 11949499
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    ||||||||||  | || ||||| || |||||||| || || || || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||    
T  11950246 cgaaaggcatccccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttgatctgatggtaacctgacct 11950147  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||| |||||||| | ||||||||| ||  |||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || || ||||||    
T  11950146 caagtcaatcttactaaaaacccttgcacccaccaaatgatccatcaagtcgtcaatcctcggaagtggatacctgttctttattgtaactttattcaac 11950047  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||| | ||| || | ||||||| ||||||| || |  ||||| ||||||||||| |    
T  11950046 tgacgatagtcaatgcataacctcatactaccatccttcttctttaccaacaataccgacgctccccaaggtgagacacttggtcttacaaacttcttat 11949947  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||| ||||     
T  11949946 caagcaagtcttccaactgtttcttcaattcagctaactcggaagctgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctagaacaaggtcaat 11949847  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              ||| || |  || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||| |||||||| ||||||    
T  11949846 tgaaaattcaacctccctttccgatggtacatctggaatctcatcaggaaaaacttcaggaaattcattcaccactggtaacctgtcaatcacagcttga 11949747  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    || || |  || ||| | |||||||| |||||||| |  || ||||| || ||||  ||||||| ||| |||||||  |  |||||||| ||||| || |    
T  11949746 ttttctaacgacaaatatgccattaaagaaaacataagaattccatcacgctccaactgcttcaactgtttagtagttaggaactctgctccactctctt 11949647  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||| ||||  |||| ||||| |||||||||||  | | ||| |||| ||| ||  ||||    
T  11949646 cttccgcagaagaaaaatgcaccgtcttgctaaaacaattgatatgaactcggttatactcgaaccagttcatcgcaaaaataacatccattcccatcaa 11949547  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaa 741  Q
     |||| ||||||||| || | |||||| || | |||||||||||||||    
T  11949546 cggtaaacaaactaagtcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaa 11949499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 8 - 804
Target Start/End: Original strand, 47125735 - 47126545
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||    
T  47125735 cgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacttttatctgatgataaccagacct 47125834  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtg-cacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 206  Q
    |||||||||||| ||||||| || || |||| || ||| |||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  47125835 caaatcaatcttactaaaaa-tcttggcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttcttgatcgtaactttgttcaa 47125933  T
Q  207 ctgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttc 306  Q
    ||| || ||||| |||||||  | |||||||||||| ||||||||||||| ||| || || |||||| |||||||||| |  ||||| |||||||| ||     
T  47125934 ctgacggtaatctatacacagtctcatactaccatccttcttctttactaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaacttttta 47126033  T
Q  307 tcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    || | ||  |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  47126034 tctaacagttcctccaactgtttcttcaactcagccaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggcttagttcctggaacaagatcaa 47126133  T
Q  407 gt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttg 492  Q
     |              ||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||  ||| || ||||  | ||||||||| |||||    
T  47126134 ttgaaaattcaacctccctttctggtggcacatcaggaatctcatcagggaatacttctggaaattcattcactacaggtaaaccatcaatcacagcttg 47126233  T
Q  493 attctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcc 592  Q
    ||| || |  || ||    |||||||  ||| |||||| ||||||||| ||||| |  || |||| ||| || ||||||| || |||  |  ||| |||     
T  47126234 attttctaacgacaattgtgccattagggaatacatcaggataccatcacgttcaaactgtttcatctgtttcgtagacagaagctcaacctcaccttct 47126333  T
Q  593 tcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactca 692  Q
    |||||  | |||||||||||||| | ||| ||||| || || ||| ||||  | || ||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||  |||    
T  47126334 tcttcagcagaagagaaatgtaccgtcttactaaagcagttgatatgaactcgattatactctaaccaattcataccaaaaatcacatccatacccgtca 47126433  T
Q  693 aaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagt 792  Q
    | || |||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||| | ||||||   || ||| || |||||| | || || |||||||||||||||||    
T  47126434 acggcagacaaactaaatcaattacaaaatctctaccaaacatagatataggacaccgcagacaaacaagagaagtggttactgaacccttagctggagt 47126533  T
Q  793 ttcgacaaccat 804  Q
    ||| ||||||||    
T  47126534 ttcaacaaccat 47126545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 15229394 - 15230210
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || ||||||||||| || ||||| || || || || || || |||| |||||| ||  ||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  15229394 cgaaaggcatcaccttatattcataatgtccatatcgtgtcctaaaggccgttttctacatatcttcccccttcaccttaatctgatggtaacctgacct 15229493  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||  | |||| |    
T  15229494 caaatcaattttgctgaacacgcgtgcacccactaactgatcgattaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctttatcgtcactatattcagc 15229593  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || || ||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||| || | ||| || ||||||||| |||||||||| | |||||| ||||| ||||| |    
T  15229594 tgacggtaatctatacacaacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccggcgctccccaaggtgaaactctcggtcttacaaatttcttgt 15229693  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||     
T  15229694 caagtaaatcctccaactgtttcttcaactcagctaactcagacgccgacatacggtaaggcgccatcgacacaggcttcgtacccggaacaagatcaat 15229793  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |               |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| ||||| |  ||||||||||| ||||||    
T  15229794 tgaaaattcaacctctctctctggcggtacatcgggaatctcatcaggaaaaacttctggaaattcattcacaaccggcaatctatcaatcacagcttga 15229893  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||| |  || ||  | ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |  || |||| ||| ||||| | ||| ||||| ||   ||| || |    
T  15229894 ttctccaacgacaagtatgccatcaaggaaaacattaagatcccatcacgttctaactgtttcaactgtttagtggtcaagaactcagctttactctctt 15229993  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    | ||  | ||||| |||||||| | ||| ||||||||||| ||| ||||  |||| ||||||||| ||||||| || |  || |||| ||||||  | ||    
T  15229994 cctcagcagaagaaaaatgtaccgtcttactaaaacaattgatatgaacacggttatactctaactagttcatcccaaagattacatccatacccgttaa 15230093  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     || | ||| || | ||| | ||||||||| | || |||||||||||| |||||  ||||||| || |||||| |||| |  ||||||||||||||||||    
T  15230094 cggcaaacatacaagatcaacttcaaaatctctacaaaacatagacaatggacaactcaaacaaacaagagaagtagttaatgaacccttagctggagtt 15230193  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || |||||||| |||||    
T  15230194 tcaacaaccatttctcc 15230210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 15235262 - 15236078
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || ||||||||||| || ||||| || || || || || || |||| |||||| ||  ||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  15235262 cgaaaggcatcaccttatattcataatgtccatatcgtgtcctaaaggccgttttctacatatcttcccccttcaccttaatctgatggtaacctgacct 15235361  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||  | |||| |    
T  15235362 caaatcaattttgctgaacacgcgtgcacccactaactgatcgattaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctttatcgtcactatattcagc 15235461  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || || ||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||| || | ||| || ||||||||| |||||||||| | |||||| ||||| ||||| |    
T  15235462 tgacggtaatctatacacaacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccggcgctccccaaggtgaaactctcggtcttacaaatttcttgt 15235561  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||     
T  15235562 caagtaaatcctccaactgtttcttcaactcagctaactcagacgccgacatacggtaaggcgccatcgacacaggcttcgtacccggaacaagatcaat 15235661  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |               |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| ||||| |  ||||||||||| ||||||    
T  15235662 tgaaaattcaacctctctctctggcggtacatcgggaatctcatcaggaaaaacttctggaaattcattcacaaccggcaatctatcaatcacagcttga 15235761  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||| |  || ||  | ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |  || |||| ||| ||||| | ||| ||||| ||   ||| || |    
T  15235762 ttctccaacgacaagtatgccatcaaggaaaacattaagatcccatcacgttctaactgtttcaactgtttagtggtcaagaactcagctttactctctt 15235861  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    | ||  | ||||| |||||||| | ||| ||||||||||| ||| ||||  |||| ||||||||| ||||||| || |  || |||| ||||||  | ||    
T  15235862 cctcagcagaagaaaaatgtaccgtcttactaaaacaattgatatgaacacggttatactctaactagttcatcccaaagattacatccatacccgttaa 15235961  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     || | ||| || | ||| | ||||||||| | || |||||||||||| |||||  ||||||| || |||||| |||| |  ||||||||||||||||||    
T  15235962 cggcaaacatacaagatcaacttcaaaatctctacaaaacatagacaatggacaactcaaacaaacaagagaagtagttaatgaacccttagctggagtt 15236061  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || |||||||| |||||    
T  15236062 tcaacaaccatttctcc 15236078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 17188165 - 17188981
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||| || || || || || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||    
T  17188165 cgaaaggcatcactttatattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggcagtcttctgcatatcctcatccttcaccttgatctgatggtaacctgacct 17188264  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||| ||||||||   ||||||||| ||| |||||||||| | ||| || ||||||||||||||||| ||||| || || || || ||||||    
T  17188265 caagtcaatcttactaaaaacctttgcacccaccaactgatccatcaagtcatccatcctcggaagtggatacctgttctttatcgtaactttattcaac 17188364  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    |  ||||| ||||| || | || |||||||||||| || |||||||||| ||| |  ||||||||| | |||||||| | |||||| ||||||||||| |    
T  17188365 taacgatagtcaatgcatagcctcatactaccatcctttttctttactaacaacaaaggcgctccccacggtgaaacactcggtcttacaaacttcttat 17188464  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||| | || ||||||||||| || | ||||||||| |||||||| ||||     
T  17188465 caagcaagtcttctaactgattcttcaattcagctaactcagaagccgacatatggtacggtgccatcgacaccgacttcgttcctggaacaaggtcaat 17188564  T
Q  408 t----------cctctct----ggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |          |||||||    || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||| |||| ||| ||||||||  | |||    
T  17188565 tgaaaattcaacctctctctcaggtggcacatctggaatctcatcaggaaaaacttcaggaaattcgttcaccactggtaacctgtcaatcacaacctga 17188664  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||| | ||| || || ||||| || ||| ||||||  || ||||| ||||| || ||||||| ||| || |||| ||| || ||  | ||||  || |    
T  17188665 ttctccaaagacaaggatgccatcaaagaatacatcagaattccatcacgttctagctgcttcatctgtttcgtagtcaagaattcaactccaccctctt 17188764  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||| ||||| || | ||||||||| || || ||| ||||  |||| || |||||||| ||||| |  | ||| ||||  || ||  |||     
T  17188765 cttccgcagaagaaaaatgcaccgtcttgctaaagcagttgatatgaactcggttatattctaaccaattcattctaaaaataacatctattcccgtcag 17188864  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
      ||| ||||||||| || | ||||||||| | |||||||||||| | ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  17188865 cagtaaacaaactaagtctacttcaaaatctctaccaaacatagatataggacacctcaaacaaacgagagaagtagtcactgaacccttagctggagtt 17188964  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || ||||||||||||||    
T  17188965 tcaacaaccatctctcc 17188981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 30 - 810
Target Start/End: Original strand, 12180157 - 12180951
Alignment:
Q  30 atagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaact 129  Q
    ||||||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||     
T  12180157 atagtgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaataca 12180256  T
Q  130 cgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaacc 229  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| |||||||||||  | ||||    
T  12180257 cgtgcacccactaactgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctttatcgtaactttgttcaactgacgataatcaatgaataacc 12180356  T
Q  230 gcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgttt 329  Q
     |||  ||||||| |||||||| || | ||| |||||||||||| | |||||||| | |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||    
T  12180357 tcatggtaccatcattcttcttaaccaacaatactggcgctccccacggtgaaacactcggtcttacaaatttcttatcaagtaagtcctccaactattt 12180456  T
Q  330 cttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaagt--------------cctctct 415  Q
    |||||||||||  |||||||| |  |||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |              |||||||    
T  12180457 cttcaactcagccaactcggacgtcgacatacgataaagtgctatcgacaccggcttcgttcctggaacaaggtcaattgaaaattcaacctccctctct 12180556  T
Q  416 ggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagcca 515  Q
    || ||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| || || | ||| |||||||| |||||||| || |  || ||  | ||||    
T  12180557 ggtggcacatctagaatctcatcaggaaaaacttccggaaattcattcacaactggcaacctgtcaatcacagcttgattttccaatgacaagtatgcca 12180656  T
Q  516 ttaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtac 615  Q
    | || |||||||| |  || ||||| || ||||  ||||||| ||  |||||||| |  |||||||| ||||| || |||||  | ||||| ||| | ||    
T  12180657 tcaaagaaaacataagaattccatcacgctccaactgcttcaactctttagtagataggaactctgctccactctcatcttcagcagaagaaaaaagcac 12180756  T
Q  616 tgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatt 715  Q
     |   ||||||| ||||| ||| ||||  |||| ||||||||||||||||| || |  || |||  ||||||  |||| |||| | ||||||| || | |    
T  12180757 cgttctgctaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaagataacaaccatacccgtcaacggtaaagaaactaagtcgact 12180856  T
Q  716 tcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||| || | ||||||||||||||| |||||| |   ||| || |||||| |||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  12180857 tcaaagtctctaccaaacatagacaacggacatcttggacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtgtcaacaaccatttctcc 12180951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 539 - 722
Target Start/End: Complemental strand, 26191120 - 26190937
Alignment:
Q  539 tcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataa 638  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26191120 tcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataa 26191021  T
Q  639 gaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaat 722  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26191020 gaacgtggttgtactctaaccagttcatacctagaatcacatccataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaat 26190937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 10418383 - 10417567
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| || || || ||||| || || || || || || |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| || ||    
T  10418383 cgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcgtccttcactttaatttgatggtaacccgacct 10418284  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||| |||||||||   ||||| || ||| | |||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||| || || || |||||||||    
T  10418283 caagtcaatcttactaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaaatcatcaatccgcggaagtggatatctattctttattgtaactttgttcaac 10418184  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||| || || |  || || || |||||| | || ||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  10418183 tgacgatagtcaatgcacaacctcatacttccatctttctttttcaccaataacacgggtgctccccacggcgaaacactaggtctcacaaacttcttat 10418084  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  || || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||     
T  10418083 caagcaagtcctccaactgtttctttaactcagccaattcagaagctgacatgcgatacggcgccatcgacactggtttcgttcccggaacaagatcaat 10417984  T
Q  408 -------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                 || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| || || ||||| ||||||    
T  10417983 cgagaactcaacttctctttctggtggcacatcaggaatctcgtctggaaaaacttcgggaaattcattcaccactggtagtctgtcgatcacagcttga 10417884  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||| |  || || || ||||| || |||||||| |  || ||||| |||||||  ||||||| ||| |||||||  | ||||||||| ||||| || |    
T  10417883 ttctctaacgacaatgatgccatcaaagaaaacataagaattccatctcgttccaactgcttcaactgtttagtagttagaaactctgctccactctctt 10417784  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    |||| || ||||| || || || | |||| ||||||||||||||  |||   ||| ||||||||||| ||||| || | ||| |||| ||| ||   |||    
T  10417783 cttccacagaagaaaagtgcaccgtcttgttaaaacaattaatacaaactcagttatactctaaccaattcatcccgaaaataacatccatccccaacaa 10417684  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     |||||||| ||||| || |  || ||||| | ||||||||||||||| |||||  | | ||| || |||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  10417683 cggtagacacactaagtcgacctcgaaatctctaccaaacatagacaacggacaccttagacacaccagagaagtagtcactgaacccttggctggagtt 10417584  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || |||||||| |||||    
T  10417583 tcaacaaccatttctcc 10417567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 58 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 13318790 - 13318087
Alignment:
Q  58 gtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaat 157  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  13318790 gtcttctgcatatcttcatctttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaattttactaaaaacttttgcacccaccaactgatccatcaaat 13318691  T
Q  158 tatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactag 257  Q
     |||||| ||||| |||||||| || ||||| || || || || ||||||||  |||| ||||| ||||| | || ||||||||| ||||||||||| |     
T  13318690 catcaatcctcgggagtggatatctgttctttattgtaactttattcaactgatgatagtcaatgcacaatctcacactaccatccttcttctttaccaa 13318591  T
Q  258 caaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagac 357  Q
    ||| || |||| |||| | |||||||| |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| || |  |||    
T  13318590 caacacaggcgttccccatggtgaaacactgggtcttacaaatttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcggctagctcagacgtcgac 13318491  T
Q  358 atacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaagt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaa 443  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |              ||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  13318490 atacgataaggtgccagcgacactggcttcgttcctggaacaagatcaattgagaactcaatctccctttctggtggcacatctggaatctcatccggaa 13318391  T
Q  444 aaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctc-aacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgc 542  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||| ||| ||||| || ||||||||||| |||| | ||||| ||||| || |||||||| |  || ||||| |    
T  13318390 aaacttcaggaaattcattcaccactggtaacctgtcaattacagcttgattctctaaca-acaaagatgccatcaaagaaaacataagaattccatctc 13318292  T
Q  543 gttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaac 642  Q
    ||||||  ||||||| ||| |||||||  |  |||||| | ||||| || |||||  | ||||| ||||  || | |||| |||||||||| ||| ||||    
T  13318291 gttccaactgcttcaactgtttagtagttaggaactctcctccactctcttcttccgcagaagaaaaatacaccgtcttgttaaaacaatttatatgaac 13318192  T
Q  643 gtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaa 742  Q
      |||| ||||||||||| ||||| || | ||| |||| ||||||  |||| |||||||| || | ||| |  |||||||| | |||||||||||||||     
T  13318191 tcggttatactctaaccaattcatcccaaaaataacatccatacccatcaacggtagacatacaagatcaacctcaaaatctctaccaaacatagacaac 13318092  T
Q  743 ggaca 747  Q
    |||||    
T  13318091 ggaca 13318087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 9 - 804
Target Start/End: Original strand, 10407760 - 10408569
Alignment:
Q  9 gaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctc 108  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||    
T  10407760 gaaaggcattactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacctc 10407859  T
Q  109 aaatcaatcttgctaaaaactcgt-gcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||| || |||| || | ||||| || ||| |||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||    
T  10407860 aaatcaatcttactgaaaa-tcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttcttgatcgtaactttgttcaac 10407958  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || || ||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||| || | ||| || || |||||| |||||||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  10407959 tgacggtaatctatacacagtctcatactaccatccttcttcttgaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaacttcttat 10408058  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    | | || |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || |     
T  10408059 ctaacaggtcctccaactgtttcttcaactcagctaattcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggcttagttcctggaacaaggtctat 10408158  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              ||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||  ||| || ||||  | ||||||||| ||||||    
T  10408159 tgaaaactcaacttccctctctggtggcacatcaggaatctcatcagggaatacttctggaaattcattcactacaggtaaaccatcaatcacagcttga 10408258  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    || || |  || ||    |||||||  ||| |||||| ||||||||| ||||| |  || |||| ||| || ||||||| || |||  |  ||| ||| |    
T  10408259 ttttctaacgacaattgtgccattagagaatacatcaggataccatcacgttcaaactgtttcatctgttttgtagacagaagctcaacctcaccttctt 10408358  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | |||||||||||||| | ||| ||||| || || ||| ||||  | || ||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||  ||||    
T  10408359 cttcagcagaagagaaatgtaccgtcttactaaagcagttgatatgaacccgattatactctaaccaattcataccaaaaatcacatccatacccgtcaa 10408458  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     || |||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||| | ||||||   || ||| || |||||| | || || ||||||||||||||||||    
T  10408459 cggcagacaaactaaatcaatcacaaaatctctaccaaacatagatataggacaccgcacacaaacaagagaagtggttactgaacccttagctggagtt 10408558  T
Q  794 tcgacaaccat 804  Q
    || ||||||||    
T  10408559 tcaacaaccat 10408569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 8 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 11959507 - 11959109
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || || ||||| || |||||||| || || || ||||  ||||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||| || ||    
T  11959507 cgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaagtcgtcttctgcatatcctcatccttgaccttcatctgatggtaaccagacct 11959408  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||||||||| || || ||   ||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||    
T  11959407 caaatcaatcttactgaacacctttgcactcactaactgatccatcaagtcatcaattctcggaagtggatacctattctttatcgtaactttgttcaac 11959308  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || || || ||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||| |||| ||| || ||||||||| |||||||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  11959307 tgacggtagtcaatgcacaacctcatgctaccatccttcttcttaactaacaacaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaacttcttat 11959208  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||| ||||    
T  11959207 caagcaagtcctccaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatacggtaaggtgccatcgacaccagctttgttcctggaacaaggtcaa 11959109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 8 - 802
Target Start/End: Complemental strand, 18132684 - 18131876
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || || ||||| || ||||| || || || || || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  18132684 cgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtcttttgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacct 18132585  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||| || |||||   ||||||||||||| |||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || || |||||     
T  18132584 caagtcaatcttactgaaaacctttgcacccactaactgatccatcaagtcgtcaatcctcggaagtggatacctgttcttaattgtaactttattcaat 18132485  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    |  |||||  |||| || |||| |||||||||||| ||||||||||| | ||| || ||||||||| ||||||| || |  ||||| ||||||||||| |    
T  18132484 taacgatagacaatgcataacctcatactaccatccttcttctttaccaacaatacaggcgctccccaaggtgagacacttggtcttacaaacttcttat 18132385  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||| ||||     
T  18132384 caagcaagtgttccaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaataaggtcaat 18132285  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              ||| ||||| |||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||| |||  |||||| || | ||| |||||||| ||||||    
T  18132284 tgaaaattcaacctccctttctggtggcacatttggaatctcatccgaaaaaacttcaggaaactcattcaccactggaaacctgtcaatcacagcttga 18132185  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    || || |  || ||| | ||||| |  |||||||| |  || ||||| || |||| ||| ||||  || |||||||  |  |||||||| ||||| || |    
T  18132184 ttttctaacgacaaatatgccatcatagaaaacataagaattccatcacgctccaattgattcaattgtttagtagttagcaactctgctccactctctt 18132085  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||| ||||| || | ||||||||| ||||| ||| ||||  |||| ||||||||||| ||||| |  | ||| |||| ||||||  ||||    
T  18132084 cttccgcagaagaaaaatgcaccgtcttgctaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccaattcatccaaaaaataacatccatacccgtcaa 18131985  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     |||| ||| ||||| || | |||| | || | |||||||||||||||  ||||  | | ||| || |||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  18131984 cggtaaacacactaagtcgacttcatagtctctaccaaacatagacaacagacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtt 18131885  T
Q  794 tcgacaacc 802  Q
    || ||||||    
T  18131884 tcaacaacc 18131876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 13943815 - 13944631
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || || || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||    
T  13943815 cgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatctttcaccttaatttgatggtaacctgacct 13943914  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||| || || ||   ||||||||||| | | |||||||| | |||||| |||||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||     
T  13943915 caagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatcaatcctcggaagcggatatctattcttaattgtaactttgttcaat 13944014  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| || ||||| || | ||| || || |||||| | |||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  13944015 tgacgatagtcaatgcacaacctcatactaccatcctttttcttcaccaacaacacaggtgctccccacggtgaaacactgggtctaacaaacttcttat 13944114  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||| || || ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||     
T  13944115 caagtaaatcttccaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggctttgttccgggaacaaggtcaat 13944214  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| |||  |||||| | |||| | ||||||||  ||||     
T  13944215 tgaaaactccacctccctctctggcggcacatcgggaatctcatcaggaaacacctccggaaactcattcaccactgctagcttgtcaatcacaacttgg 13944314  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    || || |  || | | | |||||||  ||| ||||||  || ||||| ||||| |  ||||||| |||||| ||||| ||||  ||  | ||||| || |    
T  13944315 ttttctaacgacagatatgccattagagaatacatcagaattccatcccgttctaactgcttcatctgctttgtagataaaatttcaactccactctctt 13944414  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||| ||||| || | |||| |||| ||||| ||| ||||  |||| ||||||||||| ||||| || | ||| |||| ||| ||  ||||    
T  13944415 cttcagcagaagaaaaatgcacagtcttgttaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccaattcatcccaaaaataacatccattcccgtcaa 13944514  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     |||||||||||||| || | ||||||||| | |||||||||||| |  |||||  |||| || || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  13944515 cggtagacaaactaagtctacttcaaaatctctaccaaacatagaaattggacacctcaagcaaactagagaagtagtcactgaacccttagctggagtt 13944614  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || |||||||| |||||    
T  13944615 tcaacaaccatttctcc 13944631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 58 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 15014055 - 15013297
Alignment:
Q  58 gtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaat 157  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| | || |||||||| || ||||| ||||||||||| || || || |||||| ||||||||  |||||||||||    
T  15014055 gtcttctgaatatcctcatctttcactctgatatggtgatagcccgatcttaaatcaatcttactgaacacacgtgcatccactaactaatccatcaaat 15013956  T
Q  158 tatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactag 257  Q
      |  || ||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| | ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |     
T  15013955 cgtggatcctcggaagtggatacctattctttattgtcactttgttcaactgccggtgatctatacacaacctcatgctaccatctttcttcttaaccaa 15013856  T
Q  258 caaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagac 357  Q
    ||| ||  |||||||| ||||||| || | |||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||||| ||| || ||||| |||    
T  15013855 caacaccagcgctccccaaggtgacacactcggtcttacaaacttcttttcaagcaaatcttctaactgctttttcaactcagctaattccgaagctgac 15013756  T
Q  358 atacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa--------------gtcctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaa 443  Q
    ||| | |||||||||||||| |  ||||| || || |||| ||||||||                ||| ||| |||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  15013755 atatggtaaggtgccatcgacataggctttgtacctggaataagatcaatcgacaattctacctccctttctagaggtacatcaggaatttcatcaggaa 15013656  T
Q  444 aaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcg 543  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    | | ||||| |||||||||||||||||| ||| |  ||  |||| || ||||||||  |||| ||||| |     
T  15013655 aaacttctggaaattcacacaccacttccaacttatcattcactgcttgattctcaatagacagggacaccatcaacgaaaacatttagattccatcact 15013556  T
Q  544 ttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacg 643  Q
        | |||||||| |||||| |||| ||| ||||| |   ||| ||| |||||  | ||||| ||| | || | ||| ||||||||||| ||| ||||     
T  15013555 cattaattgcttcaactgcttggtagtcaagaactcagtttcaccttcttcttcagcagaagaaaaacgcaccgtcttactaaaacaatttatatgaaca 15013456  T
Q  644 tggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaag 743  Q
    | |||  |||| ||  |||||||||| || ||||||| ||| |||||||| || ||| | ||||| |||| | ||||| | | ||||||||| |||||||    
T  15013455 tagttaaactccaagtagttcatacctagtatcacatccattccactcaacggcaga-atactaagtccactgcaaaa-ctctaccaaacatcgacaaag 15013358  T
Q  744 gacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 804  Q
    |||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15013357 gacacttcaagcatactagagaagtagtcaccgaacccttagctggggtttcgacaaccat 15013297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 8 - 804
Target Start/End: Original strand, 28756109 - 28756920
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||    
T  28756109 cgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacttttatctgatgataaccagacct 28756208  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtg-cacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 206  Q
    |||||||||||| ||||||| || |  |||| || ||  |||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  28756209 caaatcaatcttactaaaaa-tcttaacaccaaccaattgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttcttgatcgtaactttgttcaa 28756307  T
Q  207 ctgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccct-aaggtgaaacgcccggtctaacaaacttctt 305  Q
     || || ||||| |||||||  | |||||||||||| ||||||||||| | ||| || || ||||||  |||||||||| |  ||||| |||||||| ||    
T  28756308 ttgacggtaatctatacacagtctcatactaccatccttcttctttaccaacaacaccggtgctcccccaaggtgaaacactgggtcttacaaacttttt 28756407  T
Q  306 ctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatca 405  Q
     || | || ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  28756408 atctaacaggtcctccaactgtttcttcaactcagccaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggcttagttcctggaacaagatca 28756507  T
Q  406 agt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgctt 491  Q
    | |              ||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||  ||| || ||||  | ||||||||| ||||    
T  28756508 attgaaaattcaacctccctttctggtggcacatcaggaatctcatcagggaatacttctggaaattcattcactacaggtaaaccatcaatcacagctt 28756607  T
Q  492 gattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttc 591  Q
    |||| || |  || ||    |||||||  ||| |||||| ||||||||| ||||| |  || |||| ||| || ||||||| || |||  |  ||| |||    
T  28756608 gattttctaacgacaattgtgccattagagaatacatcaggataccatcacgttcaaactgtttcatctgttttgtagacagaagctcaacctcaccttc 28756707  T
Q  592 ctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactc 691  Q
     |||||  | |||||||||||||| | ||| ||||| || || ||| ||||  | || || |||||||| |||||||| |  || |||| ||||||  ||    
T  28756708 ttcttcagcagaagagaaatgtaccgtcttactaaagcagttgatatgaactcgattatattctaaccaattcataccaaagataacatccatacccgtc 28756807  T
Q  692 aaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggag 791  Q
    || ||||||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||| | ||||||    | ||| || |||||| | || || ||||||||||||||||    
T  28756808 aacggtagacaaactaaatcaatcacaaaatctctaccaaacatagatataggacaccgtagacaaacaagagaagtggttactgaacccttagctggag 28756907  T
Q  792 tttcgacaaccat 804  Q
    |||| ||||||||    
T  28756908 tttcaacaaccat 28756920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 669
Target Start/End: Original strand, 44779038 - 44779713
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || || || || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||    
T  44779038 cgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacct 44779137  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||| || || ||   ||||||||||| | | |||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||     
T  44779138 caagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatcaattctcggaagcggatatctattcttaattgtaactttgttcaat 44779237  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| || ||||| || | ||| || || |||||| | || ||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  44779238 tgacgatagtcaatgcacaacctcatactaccatcctttttcttcaccaacaacacaggtgctccccacggcgaaacactgggtcttacaaacttcttat 44779337  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||| || || ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||     
T  44779338 caagtaaatcttccaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggctttgttccaggaacaaggtcaat 44779437  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              ||||||||| |||||||||||||||||||| || || || || ||||| |||  |||||| | |||| | |||||||| ||||||    
T  44779438 tgaaaactccacctccctctctggcggcacatcaggaatctcatcagggaacacctccggaaactcattcaccactgctagcttgtcaatcacagcttga 44779537  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    || || |  || | | | |||||||  ||||||||||  || ||||| ||||| |  ||||||| |||||| ||||| ||||  ||  | ||| |||| |    
T  44779538 ttttctaacgacagatatgccattagagaaaacatcagaattccatcacgttctaactgcttcatctgctttgtagataaaatttcaactccattttctt 44779637  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacc 669  Q
    ||||  | ||||| ||||| || | ||| ||||||||||| ||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  44779638 cttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttactaaaacaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatacc 44779713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 231 - 810
Target Start/End: Original strand, 17493660 - 17494254
Alignment:
Q  231 catactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttc 330  Q
    |||| ||||||| |||||||| || | ||| |  ||||||||| |||||||||| |  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17493660 catagtaccatccttcttcttaaccaacaatatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcctccaactgtttc 17493759  T
Q  331 ttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaagt--------------cctctctg 416  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |              |||||||     
T  17493760 ttcaattcagctaactcggaagctgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaaggtcaattgaaaattcaacctccctctctt 17493859  T
Q  417 gaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccat 516  Q
    | |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||  ||| || || | ||| |||||||| ||||||||||| |  || ||| | |||||    
T  17493860 gtggcacatctggaatctcatcaggaaaaacctcaggaaactcattcacaactggcaacctgtcaatcacagcttgattctctagcgacaaatatgccat 17493959  T
Q  517 taatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtact 616  Q
     || |||||||| || || ||||| |  ||||  ||||||| ||| || ||||  |  || ||||| ||||| || |||||  | ||||| ||||  ||     
T  17493960 caaagaaaacattaaaatgccatcacactccaactgcttcaactgtttcgtagttaggaattctgccccactctcttcttcagcagaagaaaaatccacc 17494059  T
Q  617 gacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccattt 716  Q
    | ||||||||| ||||| ||| ||||  |||| ||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||  |||| |||| ||||||||| || | ||    
T  17494060 gtcttgctaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaataacatacatacccgtcaacggtaaacaaactaagtcgactt 17494159  T
Q  717 caaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggag-tttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||| || | ||||||||||||||| |||||| | | ||| || |||||| |||| || |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  17494160 caaagtctctaccaaacatagacaacggacatcttagacaaacaagagaattagttactgaacccttagctggagttttcaacaaccatttctcc 17494254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 133 - 810
Target Start/End: Original strand, 12272254 - 12272945
Alignment:
Q  133 gcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgca 232  Q
    |||||||||||| ||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| | | ||||||||| || |||| ||    
T  12272254 gcacccactaactgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctttatcgtaaccttgttaaacggacaataatcaatgcataacctca 12272353  T
Q  233 tactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttctt 332  Q
    | |||||||| |||||||| || | ||| |  ||||||||| ||| |||||| |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  12272354 tgctaccatccttcttcttaaccaacaatatcggcgctccccaagttgaaacactgggtcttacaaatttcttatcaagcaagtcccccaactgtttctt 12272453  T
Q  333 caactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaagt--------------cctctctgga 418  Q
    |||||||| ||||||| | || |||||||| |||||||||||||| || | ||||||||| |||||||  || | |              |||||||||     
T  12272454 caactcagctaactcgaacgccgacatacggtaaggtgccatcgacaccgacttcgttcctggaacaatgtcgattgaaaattcaacctccctctctggt 12272553  T
Q  419 ggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccatta 518  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| || || | | | |||||||| |||||||| || |  || ||  | ||||| |    
T  12272554 ggcacatctgaaatctcatcaggaaaaacttctggaaattcattcacaactggcaacatgtcaatcacagcttgattttccaatgacaagtatgccatca 12272653  T
Q  519 atgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactga 618  Q
    | |||||||| || ||  |||| || ||||  ||||||| ||| | |||||  |  ||||| || ||||| || |||||  | ||||| ||||| || |     
T  12272654 aggaaaacattaaaatttcatcacgctccaactgcttcaactgttcagtagttaggaactcagctccactctcttcttcagcagaagaaaaatgcaccgt 12272753  T
Q  619 cttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttca 718  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||  |||| ||||||||||||||||| || | ||| |||| ||||||  |||| |||| |||||||| ||| | ||||    
T  12272754 cttgctaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaattacatccatacccgtcaacggtaaacaaactagatcgacttca 12272853  T
Q  719 aaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    || || | ||||||||||||||| |||||  | | ||| || |||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  12272854 aagtctctaccaaacatagacaatggacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcc 12272945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 8 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 13970458 - 13969783
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||    
T  13970458 cgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggcagtcttctgcatgtcctcatctttcaccttgatctgatggtaacctgatct 13970359  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgt-gcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 206  Q
    ||| ||||| || ||||||| || | ||||| || ||| |||||||||  |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| || || || || |||||    
T  13970358 caagtcaattttactaaaaa-tcttcgcaccaaccaactgatccatcaggtcgtcaatcctcggaagcggatatctgttctttatcgtaactttattcaa 13970260  T
Q  207 ctgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttc 306  Q
     || || || |||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||| | ||| || ||||||||| | |||||||| |  ||||| |||||||||||     
T  13970259 ttgacggtagtcaatacataacctcatgctaccatccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgaaacacttggtcttacaaacttcttg 13970160  T
Q  307 tcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc-- 404  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||      
T  13970159 tcgagtaagtcctccaactgtttcttcaactcagcaagttcggatgccgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggtactagatcga 13970060  T
Q  405 -----aagt-------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttg 492  Q
         || |       ||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||| |||| |||  ||||||| |||||    
T  13970059 tggagaactcaacctccctttctggtggtacatctggaatctcatccggaaaaacttcaggaaactcgctcaccactggtaacctgccaatcacagcttg 13969960  T
Q  493 attctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcc 592  Q
     || || |  || ||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||| ||||| || ||||||| ||  || |||| |||||  ||  | ||||| ||     
T  13969959 gttttctaacgacaaatatgccattaaagaatacatcaaaatcccatctcgttctagctgcttcatctctttcgtagtcaaaatttcaactccactctct 13969860  T
Q  593 tcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacc 669  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||| |||| |||| ||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13969859 tcttcggcggaagaaaaatgcactgtcttgttaaagcaattgatatgaacatggttatactccaaccagttcatacc 13969783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 14874848 - 14874676
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| || || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  14874848 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataccgcgttctgaaagatgtcttctgcaaatcttcgtcttttactttaatctggtgataacctgatct 14874749  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatac 180  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14874748 caaatctatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatac 14874676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 669
Target Start/End: Original strand, 14088464 - 14089139
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||    
T  14088464 cgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggcagtcttctgcatgtcctcatctttcaccttgatctgatggtaacctgacct 14088563  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| ||||| || |||||||    |||||| || ||| |||||||||  |  |||||||||||||| ||||| || ||||| || || || || ||||||    
T  14088564 caagtcaattttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaggtcgtcaattctcggaagcggatatctgttctttatcgtaactttattcaac 14088663  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || || || ||||| || |||| ||| |||||||| ||||||||||| | ||| || ||||||||| | |||||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  14088664 tgacggtagtcaatgcataacctcatgctaccatccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgaaacacttggtcttacaaacttcttgt 14088763  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc--- 404  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||       
T  14088764 cgagtaagtcctccaactgtttcttcaactcagcaagttcggatgccgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggcaccagatcgat 14088863  T
Q  405 ----aagt-------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
        || |       ||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||   |||||| |||| |||  ||||||| |||||     
T  14088864 ggagaactcaacctccctttctggtggtacatctggaatctcatccggaaaaacttcaggaaactcgttcaccactggtaacctgccaatcacagcttgg 14088963  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    || || |  || ||| | |||||||| ||| ||||||  || ||||| ||||| || ||||||| ||  || |||| |||||  ||  | ||| |||| |    
T  14088964 ttttctaacgacaaatatgccattaaagaatacatcagaatcccatctcgttctagctgcttcatctctttcgtagtcaaaatttcaactccattttctt 14089063  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacc 669  Q
    ||||  | ||||| ||||| || | ||| ||||||||||| ||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  14089064 cttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttactaaaacaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatacc 14089139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 406
Target Start/End: Original strand, 41179313 - 41179711
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| || || || ||||| || || || || || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||    
T  41179313 cgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacct 41179412  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||| || || ||   ||||||||||| | | |||||||| | |||||| |||||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||     
T  41179413 caagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatcaatcctcggaagcggatatctattcttaattgtaactttgttcaat 41179512  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| || ||||| || | ||| || || |||||| | || ||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  41179513 tgacgatagtcaatgcacaacctcatactaccatcctttttcttcaccaacaacacaggtgctccccacggcgaaacactgggtcttacaaacttcttat 41179612  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    |||| || || ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  41179613 caagtaaatcttccaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggctttgttccgggaacaaggtcaa 41179711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 8745728 - 8744912
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || || || || |  |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||  ||    
T  8745728 cgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaagggcgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatttgatggtaacctgtcct 8745629  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||| || || ||   ||||||||||| | | |||||||| | |||||| |||||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||     
T  8745628 caagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatcaatcctcggaagcggatatctattcttaattgtaactttgttcaat 8745529  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||| ||||||| |||||| ||||| || ||||| || | ||| || || |||||| | || ||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  8745528 tgacgatagtcaatgcacaacctcatacttccatcctttttcttcaccaacaacacaggtgctccccacggcgaaacactgggtcttacaaacttcttat 8745429  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||| || || ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||     
T  8745428 caagtaaatcttccaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggctttgttccaggaacaaggtcaat 8745329  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              ||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||    || ||||| |||  | || | | |||| | |||||||| ||||||    
T  8745328 tgaaaactccacctccctttctggcggcacatcaggaatctcatcggggaaccgctccggaaactcattcgcctctgctagcttgtcaatcacagcttga 8745229  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    || || |  || | | | |||||||  ||||||||||  || ||||| ||||| |  ||||||| |||||| ||||| ||||  ||  | ||||| || |    
T  8745228 ttttctaacgacagatatgccattagagaaaacatcagaattccatcacgttctaactgcttcatctgctttgtagataaaatttcaactccactctctt 8745129  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||| ||||| || | |||| |||| ||||| ||| ||||  | || ||||||||||| ||||| || | ||| |||| ||| ||  |||     
T  8745128 cttcagcagaagaaaaatgcacagtcttgttaaagcaattgatatgaactcgattatactctaaccaattcatcccaaaaataacatccattcccgtcag 8745029  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     || | ||||||||| || | ||||||||| | |||||||||||| |  |||||  |||| || || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  8745028 cggcaaacaaactaagtctacttcaaaatctctaccaaacatagaaattggacacctcaagcaaacaagagaagtagtcactgaacccttagctggagtt 8744929  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || |||||||| |||||    
T  8744928 tcaacaaccatttctcc 8744912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 258 - 406
Target Start/End: Original strand, 12071005 - 12071153
Alignment:
Q  258 caaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagac 357  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| |  || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12071005 caaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggcctaacaaacttcttctcaaacaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagac 12071104  T
Q  358 atacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  12071105 atacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaa 12071153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 16379266 - 16378869
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || || || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||    
T  16379266 cgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatcattcaccttaatttgatggtaacctgacct 16379167  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||||||||| ||||||||   |||||||||||   | |||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||| || || || ||||||||     
T  16379166 caaatcaatcttactaaaaacctttgcacccactaggtggtccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatgcctattcttaattgtaactttgttcaat 16379067  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||| ||||||| ||| ||||  || || ||||| || | ||| || ||| ||||| | |||||||| |  |||| |||||||||||| |    
T  16379066 tgacgatagtcaatgcacaacctcatgctactgtcctttttcttcaccaacaacacaggcactccccacggtgaaacactgggtcgaacaaacttcttat 16378967  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||  ||||  |||| |||||||| ||||    
T  16378966 caagcaagt-cttcaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccagctttattcctggaacaaggtcaa 16378869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 77 - 379
Target Start/End: Original strand, 30139666 - 30139968
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||| | |||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  30139666 cctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 30139765  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaa 276  Q
    ||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| || | ||| ||||| || ||| |     
T  30139766 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgtcgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccac 30139865  T
Q  277 ggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcg 376  Q
    |||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||| |||   ||||| || |||||||| ||||| || || ||||    
T  30139866 ggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactccgatgcagacatccgatacggcgcaatcg 30139965  T
Q  377 aaa 379  Q
    |||    
T  30139966 aaa 30139968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 77 - 379
Target Start/End: Original strand, 30149217 - 30149519
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||| | |||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  30149217 cctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 30149316  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaa 276  Q
    ||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| || | ||| ||||| || ||| |     
T  30149317 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgtcgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccac 30149416  T
Q  277 ggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcg 376  Q
    |||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||| |||   ||||| || |||||||| ||||| || || ||||    
T  30149417 ggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactccgatgcagacatccgatacggcgcaatcg 30149516  T
Q  377 aaa 379  Q
    |||    
T  30149517 aaa 30149519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 77 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 8272679 - 8272422
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||| | |||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  8272679 cctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 8272580  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaa 276  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||| || |||| ||||||||| |||||||| ||||| || ||| |     
T  8272579 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactaccgataatccacacacaacctcatgcttccatatttcttcttaactagcaacactggagcaccccac 8272480  T
Q  277 ggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttca 334  Q
    |||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  8272479 ggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttca 8272422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 12510821 - 12510423
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| | ||| || || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||  || ||||| || ||    
T  12510821 cgaaaggcatcattttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaatgccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctaatggtaaccagacct 12510722  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgt-gcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 206  Q
    ||| |||||||| || |||| || | ||||| || ||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||    
T  12510721 caagtcaatcttactgaaaa-tcttagcaccaaccaactgatccatcaaatcgtcaattctcggaagcggatacctgttctttatcgtaacctttttcaa 12510623  T
Q  207 ctgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttc 306  Q
    ||| || ||||| || ||||  | |||||||||||| |||||||| || | ||| || || |||||| |||||||||| |  ||||| ||||| |||||     
T  12510622 ctgacggtaatctatgcacagtctcatactaccatccttcttcttaaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaatttctta 12510523  T
Q  307 tcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    || | || |||||||||| |||||||||| ||||  ||||  ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  12510522 tctaacaggtcctccaaccgtttcttcaattcagtcaacttagaagctgacatacggtatggtgccatcgacactggattcgttcctggaacaaggtcaa 12510423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 265 - 810
Target Start/End: Original strand, 14575034 - 14575593
Alignment:
Q  265 ggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgat 364  Q
    ||||||||| |||||||||| |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||| |    
T  14575034 ggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaatttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaattcagctaattcggaagcatacatacggt 14575133  T
Q  365 aaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaagt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttc 450  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||  |||| |              ||||||||| |||| ||| ||||||| ||| |||||||| ||    
T  14575134 aaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaaagtcaattgaaaattcaacctccctctctggtggcatatctggaatctaatcaggaaaaacctc 14575233  T
Q  451 aggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagt 550  Q
     || ||||||||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||| || |  || ||  | ||||| || |||||||| |  || ||||| || ||||      
T  14575234 tgggaattcacacacaaccggcaacctgtcaatcacagcttgattttctaatgacaagtatgccatcaaggaaaacattataattccatcacgctccaac 14575333  T
Q  551 tgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgt 650  Q
    ||||||| ||| || |||| ||| ||||| ||  |||| || |||||  | ||||| ||||| |  | ||| ||||| ||||||||| || |  |||| |    
T  14575334 tgcttcaactgtttcgtagtcaagaactcagcttcactctcttcttcagcagaagaaaaatgcatcgtcttactaaagcaattaatacgagctcggttat 14575433  T
Q  651 actctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacattt 750  Q
    | |||||||||||||| || | ||| |||| ||||||  |||| |||| ||||||||  || | |||||| || | ||||||||||||||| |||||  |    
T  14575434 aatctaaccagttcattccaaaaattacatccatacccgtcaacggtaaacaaactaggtcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacacct 14575533  T
Q  751 caaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
     | ||| || |||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  14575534 tagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcc 14575593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 77 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 13965632 - 13965374
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||| ||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||   |||||| |||| | |||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  13965632 cctttactctaatctgatgatatcctgatctcgaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 13965533  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaa 276  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| || | ||| ||||| || ||| |     
T  13965532 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccac 13965433  T
Q  277 ggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaa 335  Q
    |||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  13965432 ggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 13965374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 15723281 - 15723170
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15723281 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgtgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctca 15723182  T
Q  110 aatcaatcttgc 121  Q
    ||||||||||||    
T  15723181 aatcaatcttgc 15723170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 77 - 335
Target Start/End: Original strand, 15611963 - 15612221
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    ||||| |||| | |||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  15611963 ccttcactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctcagcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 15612062  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaa 276  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || ||||| |||||||| || | ||| ||||| || ||| |     
T  15612063 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatccttcttcttaaccaacaacactggagcaccccac 15612162  T
Q  277 ggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaa 335  Q
    |||||||| |  ||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  15612163 ggtgaaacacttggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 15612221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 77 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 15948750 - 15948462
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||| ||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||   |||||| || | | |||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  15948750 cctttactctaatctgatgatatcctaatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 15948651  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaa 276  Q
    ||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| || | ||| ||||| || ||| |     
T  15948650 ataccgattcttaatcgttactttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatacttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccac 15948551  T
Q  277 ggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgata 365  Q
    || ||||| | ||| |||| |||||  ||||||||||| || || |||||||||||||| |||   ||||| || |||||||| |||||    
T  15948550 ggcgaaacactcggcctaataaactgtttctcaagcaactcttctaactgtttcttcaattcacccaactctgatgcagacatccgata 15948462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 77 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 6151133 - 6150831
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| || | | |||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  6151133 ccttcactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 6151034  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaa 276  Q
    ||| | |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| || | ||| ||||| || ||| |     
T  6151033 atatcgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccac 6150934  T
Q  277 ggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcg 376  Q
    || ||||| | ||| || | |||||  ||||||||||| || || ||||||||||| || |||   ||||| || |||||||| ||||| | ||| ||||    
T  6150933 ggagaaacactcggcctgataaactgtttctcaagcaactcttctaactgtttctttaattcacccaactctgatgcagacatccgatacgatgcaatcg 6150834  T
Q  377 aaa 379  Q
    |||    
T  6150833 aaa 6150831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 307 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 16832567 - 16832056
Alignment:
Q  307 tcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  16832567 tcaagcaagtcttccaaccgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatacggtatggtgccatcgacaccggctttgttcccggaacaaggtcaa 16832468  T
Q  407 gt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttg 492  Q
                    ||||||||| ||||| |  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||| |||  ||||||| |||||    
T  16832467 tcgaaaactcaacctccctctctggtggcacgtatggaatctcatccggaaaaatttcaggaaattcattcaccactggtaacctgacaatcacagcttg 16832368  T
Q  493 attctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcc 592  Q
    ||| || |  || | | | |||||||| ||| ||||||| |  ||||| ||||| |  ||||||| |||||| |||| ||| |||||  | ||||  ||     
T  16832367 attttctaatgacagatatgccattaaagaatacatcaaaactccatcacgttctaactgcttcatctgcttcgtagtcaagaactcaactccaccctct 16832268  T
Q  593 tcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactca 692  Q
    |||||  | ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||| ||||  |||| ||||||||||| ||||| || | ||| || | ||| ||  |||    
T  16832267 tcttcagcagaagaaaaatgtaccgtcttactaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccaattcattccaaaaataacgtccattcccgtca 16832168  T
Q  693 aaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagt 792  Q
    | || | ||||||||| || |  |||||||| | |||||||||||| | ||||||  ||||||| || |||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  16832167 acggcaaacaaactaagtctacctcaaaatctctaccaaacatagatataggacacctcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagt 16832068  T
Q  793 ttcgacaaccat 804  Q
    ||| ||||||||    
T  16832067 ttcaacaaccat 16832056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 512 - 802
Target Start/End: Complemental strand, 12858315 - 12858025
Alignment:
Q  512 gccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaat 611  Q
    ||||| || |||||||| |||||  |||| ||||| | ||| |||||||||||||||| ||| ||||| |    |||||  || || || ||||||||||    
T  12858315 gccatcaaagaaaacattaagatctcatcacgttctaattgtttcagctgcttagtagtcaagaactcagttttacttttttcctcaacagaagagaaat 12858216  T
Q  612 gtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatc 711  Q
    |||| | ||| ||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| || |  || |||| ||||||  |||| || | ||| || | |||    
T  12858215 gtaccgtcttactaaaacaattaatatgaacacggttatactctaaccagttcatcccaaagattacatccatacccatcaacggcaaacatacaagatc 12858116  T
Q  712 catttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaacc 802  Q
     | |||||| |||| ||||||||||||||| |||||  ||||||| || |||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  12858115 aacttcaaagtcactaccaaacatagacaatggacaactcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaacc 12858025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 122
Target Start/End: Original strand, 12270001 - 12270115
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||| || || || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  12270001 cgaaaggcatcaccttatattcatagtgtccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacct 12270100  T
Q  108 caaatcaatcttgct 122  Q
    |||||||||||||||    
T  12270101 caaatcaatcttgct 12270115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 335
Target Start/End: Original strand, 17200494 - 17200752
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| || |   |||||||||||| |||||| ||||| || ||    
T  17200494 ccttcactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaaccagttgatccatcaaatcatcaatcctcgggagcgg 17200593  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaa 276  Q
    ||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| | |||||| |  || || | |||||||||||| || | ||| ||||| || ||| |     
T  17200594 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgacgataatccacacacaatcttatgcttcaatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccac 17200693  T
Q  277 ggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaa 335  Q
    || ||||| | ||| || | ||||| |||||||||||| || || ||||| ||||||||    
T  17200694 ggagaaacactcggcctgataaactgcttctcaagcaattcttctaactgcttcttcaa 17200752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 71
Target Start/End: Original strand, 12500031 - 12500092
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatc 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12500031 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttatgcatatc 12500092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 16834848 - 16834556
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || || ||| | || ||||||||||| || || || || ||||||||||||||  |||||||||| ||||| || || ||||| || ||    
T  16834848 cgaaaggcatcaccttgtatacgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatctccatccttcaccttaatttgatggtaaccagacct 16834749  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||| || ||||    |||||| || ||| |||||||||| | |||     ||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||    
T  16834748 caagtcaatcttactgaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaagtcatc-----tcggaagcggatacctgttctttattgtaactttgttcaac 16834654  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttctt 305  Q
    || || ||||| |||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| |  || || ||||||||| | |||||||| |  |||| ||||||||||||    
T  16834653 tgacggtaatctatacacaacctcaggctaccatccttcttctttaccaataacacaggcgctccccatggtgaaacactgggtcgaacaaacttctt 16834556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 79 - 314
Target Start/End: Original strand, 25768180 - 25768415
Alignment:
Q  79 ttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggat 178  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||   |||||| || | | |||||||||||| |||||| ||  |||| ||||    
T  25768180 ttcactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatgttactaaacacctctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatccttagaagcggat 25768279  T
Q  179 acctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaagg 278  Q
    | | |||||| || || || |||||||||||||||||||| | |||||| | ||| || |||||||||||||| || | ||| ||||| || ||| | ||    
T  25768280 atcgattcttaatcgtcactttgttcaactgccgataatccacacacaatctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccatgg 25768379  T
Q  279 tgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaa 314  Q
     ||||| | ||| || | ||||| ||||||||||||    
T  25768380 agaaacactcggcctgataaactgcttctcaagcaa 25768415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 16327998 - 16327755
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || || || || || |||||||| || || || ||||  || |||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| ||  |    
T  16327998 cgaaaggcatcaccttgtactcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaagtcgttttctgcatatcctcattcttcaccttaatctgatggtaaccagacat 16327899  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgt-gcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 206  Q
    ||| |||||||| ||||||| || | ||||| || ||| |||||||||| |  |||||||||| |||||||||||| ||||| ||  | ||||| |||||    
T  16327898 caagtcaatcttactaaaaa-tcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctcgaaagtggatacctgttctttatcatgaccttattcaa 16327800  T
Q  207 ctgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctt 251  Q
    ||| || ||||| || ||||  | |||||||||||| ||||||||    
T  16327799 ctgacggtaatctatgcacagtctcatactaccatccttcttctt 16327755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 602 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 16378664 - 16378456
Alignment:
Q  602 gaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagac 701  Q
    ||||| |||||||| | ||| |||||||| || ||| ||||  |||| ||||||||||| ||||| || | ||| |||| ||| ||  |||| || | ||    
T  16378664 gaagaaaaatgtaccgtcttactaaaacagttgatatgaactcggttatactctaaccaattcatcccaaaaataacatccattcccgtcaacggcaaac 16378565  T
Q  702 aaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaac 801  Q
    ||||||| || |  |||||||| | |||||||||||| |  |||||  |||| || || |||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  16378564 aaactaagtctacctcaaaatctctaccaaacatagatattggacacctcaagcaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaac 16378465  T
Q  802 catctctcc 810  Q
    ||| |||||    
T  16378464 catttctcc 16378456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 14874679 - 14874600
Alignment:
Q  220 atacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaa 299  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||    
T  14874679 atacacaatctcatgctaccatctttcttcttcactagaaaaactggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaa 14874600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 512 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 11959001 - 11958703
Alignment:
Q  512 gccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaat 611  Q
    |||||||| ||| ||||||| || ||||| ||||| || || |||| ||| || |||||||| |||||  |  ||| ||| |||||  | ||||| ||||    
T  11959001 gccattaaagaatacatcaaaattccatcacgttctagctgtttcatctgttttgtagacaagaactcaacttcaccttcttcttcagcagaagaaaaat 11958902  T
Q  612 gtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatc 711  Q
    | || | ||| ||||| || || ||| ||||  | || ||||||||||| |||||||| | ||| |||| ||||||   ||| |  | ||||||||||||    
T  11958901 gcaccgtcttactaaagcagttgatatgaactggattatactctaaccaattcataccgaaaataacatccatacccgacaacgacaaacaaactaaatc 11958802  T
Q  712 catttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
     |   |||| || | |||||||||||| | ||||||  ||||||| || |||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  11958801 aaccacaaagtctctaccaaacatagatataggacacctcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcc 11958703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 409 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 16327632 - 16327231
Alignment:
Q  409 cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaa 508  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||  ||| || |||| ||| |||||||  |||||||| || |  || |||    
T  16327632 cctctctggtggcacatcaggaatctcatcaggaaacacttctgggaactcattcactacaggtaacctgtcaatcatagcttgattttctaacgacaaa 16327533  T
Q  509 gaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagaga 608  Q
     | |||||||| ||||||||||  || || || || || |  || |||| ||| || |||||||||| |||  |  ||| ||| |||||  | ||||| |    
T  16327532 tatgccattaaagaaaacatcagaatcccgtctcgctcaaactgtttcatctgttttgtagacaaaagctcaacttcaccttcttcttcagcagaagaaa 16327433  T
Q  609 aatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaa 708  Q
    |||| || | ||| ||||| || || ||| ||||  |||| ||||||||||| ||||| || | ||| |||| ||| ||   ||| || |  ||||||||    
T  16327432 aatgcaccgtcttactaaagcagttgatatgaactcggttatactctaaccaattcatcccgaaaataacatccattcccgacaacggcaagcaaactaa 16327333  T
Q  709 atccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctct 808  Q
    ||| |   | ||||| | |||||||||||| | ||||||   |||||| || |||||| |||| || |||||||||| ||||||||| |||||||| |||    
T  16327332 atcaaccacgaaatctctaccaaacatagatataggacaccccaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagttggagtttcaacaaccatttct 16327233  T
Q  809 cc 810  Q
    ||    
T  16327232 cc 16327231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 3296434 - 3296366
Alignment:
Q  297 aaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgata 365  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||| || |||||||| |||||    
T  3296434 aaactgcttctcaagcaagtcttccaactgcttcttcaactcacacaactccgatgcagacatccgata 3296366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 410 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 12510405 - 12510355
Alignment:
Q  410 ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattca 460  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  12510405 ctctctggtggcacatcaggaatctcatcaggaaacacttctggaaattca 12510355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 659; Significance: 0; HSPs: 51)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 659; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 16348775 - 16347961
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16348775 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctca 16348676  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16348675 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 16348576  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||| ||     
T  16348575 tcgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttttcg 16348476  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-- 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||       
T  16348475 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaatag 16348376  T
Q  408 -----------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
               || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16348375 aaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcgcacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 16348276  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16348275 ctcaatagataaagaagccatcaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcctct 16348176  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16348175 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccataccactcaaag 16348076  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16348075 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttc 16347976  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||    
T  16347975 gacaaccatctctcc 16347961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 645; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 33389211 - 33388395
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33389211 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatct 33389112  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33389111 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 33389012  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  33389011 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacactcggtctaacaaactttttct 33388912  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  33388911 caagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaat 33388812  T
Q  408 -------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  33388811 agaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatcactccttga 33388712  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33388711 ttctcaatagataaagtagccatcaacgaaaacatcaagataccgtcgcgtttcagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcct 33388612  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  33388611 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccataccgctcaa 33388512  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33388511 aggtagacaaactaaatccatttcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtt 33388412  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  33388411 tcgacaaccatctctcc 33388395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 626; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 51331675 - 51330858
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  51331675 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcttcgtcttttactttaatctggtgatagcctgatct 51331576  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51331575 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 51331476  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggt-gaaacgcccggtctaacaaacttcttc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||    
T  51331475 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggttgaaacacttggtctaacaaacttcttc 51331376  T
Q  307 tcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  51331375 tcaagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaa 51331276  T
Q  407 g-------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttg 492  Q
                  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  51331275 tagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcagggaattcacacaccaccggcaacctgtcaatcactgcttg 51331176  T
Q  493 attctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcc 592  Q
     ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51331175 gttctcaacagataaagaggccatcaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcc 51331076  T
Q  593 tcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactca 692  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  51331075 tcttcgacggaaaagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccataccactca 51330976  T
Q  693 aaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagt 792  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51330975 aaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagt 51330876  T
Q  793 ttcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||||||||||||||||    
T  51330875 ttcgacaaccatctctcc 51330858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 617; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 811
Target Start/End: Complemental strand, 41351844 - 41351033
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41351844 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcctttactttaatctggtgataacctgatct 41351745  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctatt-cttgatagttaccttgttcaa 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||       |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41351744 caaatcaatcttgctgaaaactcgcgcacccactaactgatccatcaattt-------ctcggaagtggatacctatttcttgatagttaccttgttcaa 41351652  T
Q  207 ctgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttc 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||| |     
T  41351651 ctgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcctt 41351552  T
Q  307 tcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  41351551 tcgagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataattctgaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggtttcgttccaggaacaagatcaa 41351452  T
Q  407 g-------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttg 492  Q
                  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41351451 tagaaaactcgacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttg 41351352  T
Q  493 attctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcc 592  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41351351 attctcaacagataaagaagccatcaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcc 41351252  T
Q  593 tcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactca 692  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41351251 tcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtgattgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccataccactca 41351152  T
Q  693 aaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagt 792  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  41351151 aaggtaggcaaactaaatccatttcaaaatcacgactaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtaagcaccgaacccttagctggagt 41351052  T
Q  793 ttcgacaaccatctctccg 811  Q
    |||||||||||||||||||    
T  41351051 ttcgacaaccatctctccg 41351033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 609; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 21832479 - 21833295
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  21832479 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttttgaaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacct 21832578  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21832579 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctaatcttgatagttaccttgttcaac 21832678  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  21832679 tgtcgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacactcggtctaacaaacttcttct 21832778  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||     
T  21832779 caagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccagggacaagatcaat 21832878  T
Q  408 -------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21832879 agaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatcactgcttga 21832978  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21832979 ttctcaatagataaggtagccattaacaaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcct 21833078  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  21833079 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccataccgctcaa 21833178  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21833179 aggtagacaaactaaatccattttgaaatcacgaccaaacatagataaaggacatttcaaacagacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtt 21833278  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  21833279 tcgacaaccatctctcc 21833295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 564; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Original strand, 19108547 - 19109361
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  19108547 aaaggcataactttatattcatggtgaccataacgcgttctgaaagttgtcttctgcatatcttcatcttttacttttatctggtgataacctgacctca 19108646  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19108647 aatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 19108746  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
     |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| |||||||||    
T  19108747 tcgataatcaatacataacctcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaatttcttctca 19108846  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaagt- 408  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||       
T  19108847 agcaaatcttccaactgtttcttcaactcagataattcagaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccaggaacaagattaatag 19108946  T
Q  409 -------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
                 ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||  ||| | |||||||||||||||||||    
T  19108947 aaaactcgacttccctttctggaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaaatcgcataccacttgtatcttatcaatcactgcttgatt 19109046  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19109047 ctcaatagataaagaagccattaaagaaaacatcaaaataccatcgcgttccatttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcctct 19109146  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19109147 tcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtgattgtactctaaccaattcatacccagaatcacatccataccgctcaaag 19109246  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19109247 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcatgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatactagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttc 19109346  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||    
T  19109347 gacaaccatctctcc 19109361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 522; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 17043197 - 17042381
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17043197 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagatgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataccctgatct 17043098  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17043097 caaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggtagtggatacctattcttgatagttactttgttcaac 17042998  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |    
T  17042997 tgacgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaatttctttt 17042898  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa- 406  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  17042897 caagcaaatcctctaactgtttcttcaactcagctaactcggaagcaaacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccaggaacaagatcaat 17042798  T
Q  407 -------------gtcctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||  ||||| |||| ||||||||||||    
T  17042797 agaaaattcgacttccctttctggaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaagtcgcataccacttgtagcttatctatcactgcttga 17042698  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  17042697 ttctcaatagataaagaagccatcaacgaaaacatcaaaatactatcgtgttccatttgcttcagctgcttagcagataagaactctgcaccactttcct 17042598  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  17042597 cttcagcggaagagaaatacactgacttgctaaaacaattgatatgaacatggttgtactctaaccaattcatacccagaatcacatccataccgctcaa 17042498  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17042497 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatcgcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtt 17042398  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  17042397 tcgacaaccatctctcc 17042381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 512; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 675
Target Start/End: Original strand, 21839129 - 21839808
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21839129 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagttgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgacctca 21839228  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21839229 aatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 21839328  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  21839329 ccgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctca 21839428  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc----- 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||         
T  21839429 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaatag 21839528  T
Q  405 --aagtc-------ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
      || ||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  21839529 aaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacacaacttgtagcttatcaatcactgcttgatt 21839628  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21839629 ctcaatagataaggtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcctct 21839728  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaat 675  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21839729 tcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaat 21839808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 21233913 - 21233181
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21233913 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagttgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataccctgatct 21233814  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21233813 caaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 21233714  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||||| |||||||    
T  21233713 tgacgatagtcaatacacaaactcatgctaccatatttcttcttcactagcaaaactggcgttccccaaggtgaaacacttggtctaacaaatttcttct 21233614  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa- 406  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  21233613 caagcaattcttctaactgtttcttcaattcagctaactcggaagcagacatacgataagatgccatcgacaccggcttcgttccaggaacaagatcaat 21233514  T
Q  407 -------------gtcctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                   ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  21233513 agaaaactcgacttccctctctagaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaagtcgcataccacttgtagcttatcaatcactgcttga 21233414  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||||||||||    
T  21233413 ttctcaagagataaagaaaccatcaacgaaaacatcaaaataccatcgcgtttcatttgcttcagctgcatagtagatacgaactttgcaccactttcct 21233314  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  21233313 cttcagcggaagagaaatacactgacttgctaaaacaattgatatgaacatggttgtactctaaccaattcatacccagaatcacatccataccgctcaa 21233214  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacg 726  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21233213 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacg 21233181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 22503471 - 22502751
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  22503471 cgaaagacataactttatattcatagtgaccataccgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatct 22503372  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||    
T  22503371 caaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactatctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttactctattcaac 22503272  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    |  ||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||| |  ||||| |||||||||||||    
T  22503271 ttacgataatcaatacacaatctcatgctaccatttttcttcttcactagcaaaaccggcgctccccagggtgaaacactgggtcttacaaacttcttct 22503172  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc--- 404  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||       
T  22503171 caagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagctaactcagaacctgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccaagaacaagatcaat 22503072  T
Q  405 ----aagtc-------ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
        || ||       ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || || |||||  | ||| |||||||||||||||||    
T  22503071 agaaaactcaacttctctctctgaaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttcagcaaaatcgcataccacttggagcttatcaatcactgcttga 22502972  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| |||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  22502971 ttctcaatagataaggaagccatcaaggaaaaaatcaaaataccatcgcgttctagttgcttcagctgcttggtagacaagaactctgcaccactttcct 22502872  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    |||| ||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||  |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  22502871 cttcaacggaggagaaatacattgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtattccaaccagttcatacccagaatcacatccattccgctcaa 22502772  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccat 714  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  22502771 aggtagacaaactaaatccat 22502751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 16378272 - 16379087
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16378272 cgaaaggcatcactttatattcataatgtccataacgcgttctaaaagccgtcttctgcatatcctcatctttcactttaatctagtgataacctgatct 16378371  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||| | || || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||    
T  16378372 caaatcaatcttgttgaacacgcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcttggaagtggatacctattctttatcgttactttattcaac 16378471  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || || ||||||||||||||   |||||||||||||||||| || |||| ||| |  ||||||||| |||| ||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  16378472 tgtcggtaatcaatacacaatttcatactaccatctttctttttaactaacaatatcggcgctccccaaggagaaacacttggtctcacaaacttcttat 16378571  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||  ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||  |||||||||||||     
T  16378572 caagcaaatcctctaactgtttcttcaacttagccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaggcttcgttctcggaacaagatcaat 16378671  T
Q  408 ------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgat 494  Q
                || |||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||  ||| | ||||||||||||||||||    
T  16378672 cggaaatcaacttctctctatagaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttcaggaaaatcgcataccacttgtaacttatcaatcactgcttgat 16378771  T
Q  495 tctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctc 594  Q
    |||||| ||||||||| ||||| || ||||||||| | || ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||    
T  16378772 tctcaatagataaagatgccatcaaagaaaacatctaaattccatcacgttctaattgcttcagctgcttagtagacaaaaactttgctccactctcttc 16378871  T
Q  595 ttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaa 694  Q
     ||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| || ||||||    
T  16378872 ctcagcagaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccaattcatacccaggattacatccattccgctcaaa 16378971  T
Q  695 ggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagttt 794  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16378972 ggtaaacaaaccaaatcaatctcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatcttaaacaaacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagttt 16379071  T
Q  795 cgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||||||||||||||    
T  16379072 cgacaaccatctctcc 16379087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 10 - 757
Target Start/End: Original strand, 21751119 - 21751877
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  21751119 aaaggcataactttatactcataatgtccataccgcgtcctaaaagttgtcttctacatatcttcatctttcactttaatctggtgatgacccgatctca 21751218  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    |||| |||||| | ||||| | |||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  21751219 aatctatcttgttgaaaacacttgcacctactaactgatccatcaaatcatcaatcctcggaagtggatacctattctttattgttactttgttcaactg 21751318  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
     ||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||| || ||||||| |  |||||||||||||| ||||||    
T  21751319 tcgataataaatacacaacctcatgctaccatccttcttctttactaacaacacaggcgctccccaaagtgaaacacttggtctaacaaactttttctca 21751418  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc----- 404  Q
    ||||| || | ||||||||||||||||||    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || ||  ||||||||||||||||||||||         
T  21751419 agcaaatctttcaactgtttcttcaactc---caactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatag 21751515  T
Q  405 --aagtc-------ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
      || ||       || ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||  ||||  |||||||||| ||||||||    
T  21751516 aaaattcaacttctctttctggaggcacatcaagaatttcatcaggaaaaacttctggaaaatcgcataccacttgtagtttatcaatcaccgcttgatt 21751615  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||| |||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21751616 ctcaatagataaggaagccatcaaagaaaacattaagattccatcacgttctaactgcttcagctgtttagtagacaaaaactctgcgccactttcctct 21751715  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    ||    ||||||||||  || || || ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| || || |||||||||| ||||||||||||||    
T  21751716 tcagtagaagagaaatacaccgatttactaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaacgagttgatgccaagaatcacatccataccactcaaag 21751815  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacat 757  Q
    ||| |||||| | ||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  21751816 gtaaacaaaccatatcaatctcaaaattacgatcaaacatagacaaaggacatcttaaacat 21751877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 8 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 22360426 - 22359751
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  22360426 cgaaaggcataactttgtactcataatgtccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 22360327  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||| |||||| | ||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  22360326 caaatctatcttgttgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatcctcggaagtggatatctattctttattgtcaccttgttcaac 22360227  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  ||| |||||||||| ||||    
T  22360226 tgacgatagtcaatacacaatctcatgctaccatttttcttcttcactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtttaacaaactttttct 22360127  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa- 406  Q
    |||| || || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  22360126 caagtaaatcttctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagaaacaggcttcgttccaggaacaagatcaat 22360027  T
Q  407 -------------gtcctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                   ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||  ||||  |||||||||||||||||    
T  22360026 cgaaaattcaacttccctctctagaggcacatcaggaatttcatcaggaaatacttctggaaaatcgcataccacttgtagtttatcaatcactgcttga 22359927  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| | |||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22359926 ttctcaataaataaggaagccatcaaagaaaaaatcaaaataccatcacgttctaactacttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccacttttct 22359827  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacc 669  Q
    ||||  | ||||||| ||  ||||| || ||||| ||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22359826 cttcagcagaagagatatacactgatttactaaagcaaataatatgaacatggttatactctaaccagttcatacc 22359751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 415 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 24785618 - 24785223
Alignment:
Q  415 tggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagcc 514  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  24785618 tggaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaaatcgcataccacttgtagcttatcaatcactgcctgattctcaatagataaagaagcc 24785519  T
Q  515 attaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgta 614  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  24785518 atcaaagaatacatcaaaataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataagaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaataca 24785419  T
Q  615 ctgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccat 714  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  24785418 ctgatttgctaaaacaattgatatgaacatggttgtactctaaccaattcatacccataattacatccataccgctcaaaggtagacaaaccagatccat 24785319  T
Q  715 ttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  24785318 ttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggaatttcaacgaccatctctcc 24785223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 8 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 21862555 - 21861880
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21862555 cgaaaggcataactttatactcataatgtgcataccgcgttctaaaagctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatct 21862456  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||  |||||||| || || ||||||||||| ||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||    
T  21862455 caaatgtatcttgctgaacacacgtgcacccaccaactgatccatcaagtcatctattcttggaagtggatacctattctttctcgttactttgttcaac 21862356  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |  | |||||||||||| ||||    
T  21862355 tgtcgataatcaatgcacaatctcatgctaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttgttctaacaaactttttct 21862256  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc--- 404  Q
     |||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||       
T  21862255 aaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcagctaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacactgacttcgttccaggaacaagatcaat 21862156  T
Q  405 ----aagtc-------ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
        || ||       ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||  | || ||| ||| | |||||||||||||||||    
T  21862155 caaaaattcaacttctctctctggaggcacatcgggaatttcatcaggaaaaacttctggaaaatcgtatacaacctgtaacttatcaatcactgcttga 21862056  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| ||| || || ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||| ||| |    
T  21862055 ttctcaatagacaaggatgccatcaaagaaaatatcaagattccatcacgttctaattgcttcagctgcttcgtagataagaactctgcgccacattctt 21861956  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacc 669  Q
    ||||  | ||||||||||  || |||||  ||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  21861955 cttcagcagaagagaaatacaccgacttaataaaacaattaatattaacatggttgtactccaaccagttcatacc 21861880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 28 - 636
Target Start/End: Original strand, 20140280 - 20140902
Alignment:
Q  28 tcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaa 127  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  20140280 tcataatgtccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgaactcaaatcaatcttgctgaaaa 20140379  T
Q  128 ctcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaa 227  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| |||||| |||| || ||    
T  20140380 cacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcgattctcggaagtggatacctattctttattgtcactttgttcaactgacgataagcaatgcataa 20140479  T
Q  228 ccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgt 327  Q
    |  ||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||| || || |  |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||    
T  20140480 cttcatactaccgtctttcttctttaccaacaaaacgggcgctccccaaggcgagacacttggtctaacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgt 20140579  T
Q  328 ttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc-------aagtc-------ctct 413  Q
    ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || |  |||||||||||||||||||||||       || ||       ||||    
T  20140580 ttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatggacataggcttcgttccaggaacaagatcgatcgaaaattcaacttctctct 20140679  T
Q  414 ctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagc 513  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || ||| |  ||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20140680 ctggaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttctggaaaatcgcataccgcttgtagtttatcaattactgcttgattctcaatagataaggaagc 20140779  T
Q  514 cattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgt 613  Q
    ||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||  || | ||| ||||||||||||||  |  |||||||||      
T  20140780 catcaaagaaaacatcaaaataccatcacgttctaactgcttcagctgcttagtagacatgaattatgcgccactttcctcttcagcataagagaaatac 20140879  T
Q  614 actgacttgctaaaacaattaat 636  Q
    || ||||| ||||| ||||||||    
T  20140880 accgacttactaaagcaattaat 20140902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 8 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 430298 - 429733
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  430298 cgaaaggcataaccttgtactcatagtgagcataccgcgttctgaaggctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatatggtgataacctgatct 430199  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||| | |||||| || |||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  430198 caaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaagtcatcaatccttggaagttgatacctattctttattgtcaccttgttcaac 430099  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||||||||||    
T  430098 tgtcgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggcgaaacacttggtctaacaaacttcttct 429999  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc--- 404  Q
    |||| |  || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||       
T  429998 caaggagatcttctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaggcttcgttccaggaacaagatcaat 429899  T
Q  405 ----aagtc-------ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
        || ||       ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| || || |||||  ||||  |||||||||||||||||    
T  429898 cgaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaatttctggaaaatcgcataccacttgtagtttatcaatcactgcttga 429799  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagc 559  Q
    ||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||| ||  |||| |||||||  |||||||||    
T  429798 ttctcaatagataaggaagccatcaaggaaaacatcaaaatgtcatcacgttccaactgcttcagc 429733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 21743734 - 21742918
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  21743734 cgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcattcttcaccttaatctgatggtaacctgacct 21743635  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||| || ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || || || || |||| |    
T  21743634 caaatcaattttactaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcgtcaattctcggaagtggatacctattctttatcgtcactttattcagc 21743535  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || || ||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||| || | ||| || ||||||||| | |||||||| | |||||| ||||| || || |    
T  21743534 tgacggtaatctatacacaacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccggcgctccccacggtgaaacactcggtcttacaaatttattat 21743435  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc--- 404  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || | ||||||       
T  21743434 caagcaagtcctccaactatttcttcaattcagctaactcggacgccgacatacggtaaggtgccatcgacaccggcttcgttccgggcataagatcgat 21743335  T
Q  405 ----aagtc-------ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
        || ||       |||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |  ||||||||||| ||||||    
T  21743334 tgaaaattcaacctttctctctggtggcacatctggaatctcatgaggaaaaacttctggaaattcactcacaaccggaaatctatcaatcacagcttga 21743235  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||| |  || ||  | ||||| || |||||||| |  || ||||| || ||||  ||||||| ||| || |||| ||| ||||  ||  |||| || |    
T  21743234 ttctccaatgacaactatgccatcaaagaaaacattataattccatcacgctccaactgcttcaactgtttcgtagtcaagaacttagcttcactctctt 21743135  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||| ||||| || | ||| ||||| || |||||| |||  ||||| ||||||||||||||||| || | |||||||| || |||   |||    
T  21743134 cttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttactaaagcagttaatatgaaaatggttatactctaaccagttcatcccaaaaatcacatccacacccgacaa 21743035  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     || | ||| |||| ||| | |||||| || | |||||||||||||||  ||||  ||||||| || |||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  21743034 cggcaaacatactagatcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacagacaactcaaacaaacaagagacgtagttaccgaacccttagctggagtt 21742935  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || |||||||| |||||    
T  21742934 tcaacaaccatttctcc 21742918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 8 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 20854942 - 20854132
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || ||    
T  20854942 cgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaagccgtcttctgcatatcttcatccttcactttaatctgatggtaacccgacct 20854843  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||| |||||||||   ||||| || ||| | |||||||| | |||||| | |||||||||||| |||||||| || || || |||||||||    
T  20854842 caagtcaatcttactaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaagtcatcaatccgcggaagtggatatctattctttattgtaactttgttcaac 20854743  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| || |  || || || |||||| | || ||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  20854742 tgacgatagtcaatgcacaacctcatacttccatctttcttcttcaccaataacacgggtgctccccacggcgaaacactgggtctcacaaacttcttat 20854643  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc--- 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||       
T  20854642 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcggctaattcagaagctgacatgcgatacggtgccatcgacactggtttcgttcccggaacaagatcaat 20854543  T
Q  405 ----aagtc-------ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
        || ||       || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||| ||||| || ||||||    
T  20854542 cgagaactcaacttctctttctggtggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcagggaattcattcaccactggtagcctgtcaattacagcttga 20854443  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||| |  || ||||| ||||| || |||||||| |  || ||||| |||||||  ||||||| ||| |||||||  | ||||||||| ||||| ||||    
T  20854442 ttctctaacgacaaagatgccatcaaagaaaacataagaattccatctcgttccaactgcttcaactgtttagtagttagaaactctgctccactctcct 20854343  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||| || || || | |||| |||||||||| |||   ||  |||| ||||||||||| ||||| || | ||| |||| ||| ||   |||    
T  20854342 cttccgcagaagaaaagtgcaccgtcttgttaaaacaatttatacagactcggttatactctaaccaattcatcccgaaaataacatccattcccaacaa 20854243  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     |||||||| ||||| || |  |||||||| | ||||||||||||||| |||||  | ||||| || |||||| |||| || |||||||| |||||||||    
T  20854242 cggtagacacactaagtcgacctcaaaatctctaccaaacatagacaacggacaccttaaacacacaagagaagtagttactgaacccttggctggagtt 20854143  T
Q  794 tcgacaaccat 804  Q
    || ||||||||    
T  20854142 tcaacaaccat 20854132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 8 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 50618580 - 50618074
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50618580 cgaaaggcatcactttatactcataatgtccatatcgcgttctaaaagttgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatct 50618481  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||    |  |||||||||    
T  50618480 caaatcaatcttgttaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattctcggaagtggatacctattctttatcaacattttgttcaac 50618381  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    | |||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  50618380 taccgacagtcaatacacaatctcatactaccatctttcttctttactaacaaaacgtgcgctccccacggtgaaacacttggtcttacaaacttcttat 50618281  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||| ||| | |||||||| ||||||| ||| || || |||||||| || |||| ||| ||||     
T  50618280 caagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagccaactcagaaactgacatacggtaaggtgtcatagacacaggcttcgtacccggaataaggtcaat 50618181  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |               ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |  || |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  50618180 tgaaaattcaacttctctctctggaggcacatctggaatttcatcaggaaaaacttcgggaaaattgcataccacctgtaacttatcaatcactgcttga 50618081  T
Q  494 ttctcaa 500  Q
    |||||||    
T  50618080 ttctcaa 50618074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 20834080 - 20833272
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    |||||||| || || ||||| || |||||||| || || || || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||    
T  20834080 aaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctca 20833981  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    | |||||| | || |||||   ||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||| || ||||| || || || || || |||||    
T  20833980 agtcaatcatactgaaaacctttgcacccaccaactgatccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatatctgttctttattgtaactttattaaactg 20833881  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
     ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||| |  ||||| ||||||||||| |||    
T  20833880 acgatagtcaatgcacaacctcatactaccatccttcttctttactaacaacaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaacttcttatca 20833781  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaagt- 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |  || || || ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |     
T  20833780 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagcaagttcagacgccgacatacgataagatgccatcgacaccggcttcgttcccggaacaaggtcaattg 20833681  T
Q  409 -------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
                 ||||||||| || ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||  ||||||  ||| ||| |||||||| ||||||||    
T  20833680 aaaactcaacctccctctctggtggtacatctggaatctcatccgaaaaaacttcaggaaactcattcaccactagtaacctgtcaatcacagcttgatt 20833581  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
     || |  || ||||| ||||| || |||||||| |  || |||||||| ||||  ||||||| ||| ||| |||  |  || ||||| ||||| || |||    
T  20833580 ttctaacgacaaagatgccatcaaagaaaacataagaattccatcgcgctccaactgcttcaactgtttaatagttaggaattctgctccactctcttct 20833481  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    ||    ||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||| ||||  |||| ||||||||||||||||| || | ||| |||| ||| ||  |||| |    
T  20833480 tccgtagaagaaaaatgcaccgtcttgctaaaacaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaataacatccattcccgtcaacg 20833381  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    ||| ||||||||| || | |||||| || | ||||||||||||||| |||||  | | ||| || |||||| |||| |  ||||||||| ||||||||||    
T  20833380 gtaaacaaactaagtcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaagtagttaatgaacccttatctggagtttc 20833281  T
Q  796 gacaaccat 804  Q
     ||||||||    
T  20833280 aacaaccat 20833272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 8 - 804
Target Start/End: Original strand, 48425081 - 48425891
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||    
T  48425081 cgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacct 48425180  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgt-gcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 206  Q
    |||||||||||| ||||||| || | ||||| || ||| |||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  48425181 caaatcaatcttactaaaaa-tcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttcttgatcgtaactttgttcaa 48425279  T
Q  207 ctgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttc 306  Q
    ||| || ||||| |||||||  | |||||||||||| ||||||||||| | ||| || || |||||| |||||||||| |  ||||| |||||||||||     
T  48425280 ctgacggtaatctatacacagtctcatactaccatccttcttctttaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaacttctta 48425379  T
Q  307 tcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    || | || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  48425380 tctaacaggtcctccaactgtttcttcaactcagctaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggcttagttcctggaacaagatcaa 48425479  T
Q  407 gt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttg 492  Q
     |              ||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||  ||| || ||||  | ||||||||| |||||    
T  48425480 ttgaaaattcaacctccctctctggtggcacatcaggaatctcatcagggaatacttctggaaattcattcactacaggtaaaccatcaatcacagcttg 48425579  T
Q  493 attctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcc 592  Q
    ||| || |  || ||    |||||||  ||| |||||| ||||||||| ||||| |  || |||| ||| || ||||||| || |||  |  ||| |||     
T  48425580 attttctaacgacaattgtgccattagagaatacatcaggataccatcacgttcaaactgtttcatctgtttcgtagacagaagctcaacctcaccttct 48425679  T
Q  593 tcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactca 692  Q
    |||||  | |||||||||||||| | ||| ||||| || || ||| ||||  | || ||||||||||| |||||||| |  || |||| ||||||  |||    
T  48425680 tcttcagcagaagagaaatgtaccgtcttactaaagcagttgatatgaactcgattatactctaaccaattcataccaaagataacatccatacccgtca 48425779  T
Q  693 aaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagt 792  Q
    | || |||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||| | ||||||   || ||| || |||||| | || || |||||||||||||||||    
T  48425780 acggcagacaaactaaatcaatcacaaaatctctaccaaacatagatataggacaccgcagacaaacaagagaagtggttactgaacccttagctggagt 48425879  T
Q  793 ttcgacaaccat 804  Q
    ||| ||||||||    
T  48425880 ttcaacaaccat 48425891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 8 - 804
Target Start/End: Original strand, 52987949 - 52988759
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||    
T  52987949 cgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacct 52988048  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgt-gcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 206  Q
    |||||||||||| ||||||| || | ||||| || ||| |||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  52988049 caaatcaatcttactaaaaa-tcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttcttgatcgtaactttgttcaa 52988147  T
Q  207 ctgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttc 306  Q
    ||| || ||||| |||||||  | |||||||||||| ||||||||||| | ||| || || |||||| |||||||||| |  ||||| |||||||||||     
T  52988148 ctgacggtaatctatacacagtctcatactaccatccttcttctttaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaacttctta 52988247  T
Q  307 tcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    || | || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  52988248 tctaacaggtcctccaactgtttcttcaactcagctaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggcttagttcctggaacaagatcaa 52988347  T
Q  407 gt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttg 492  Q
     |              ||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||  ||| || ||||  | ||||||||| |||||    
T  52988348 ttgaaaattcaacctccctctctggtggcacatcaggaatctcatcagggaatacttctggaaattcattcactacaggtaaaccatcaatcacagcttg 52988447  T
Q  493 attctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcc 592  Q
    ||| || |  || ||    |||||||  ||| |||||| ||||||||| ||||| |  || |||| ||| || ||||||| || |||  |  ||| |||     
T  52988448 attttctaacgacaattgtgccattagagaatacatcaggataccatcacgttcaaactgtttcatctgtttcgtagacagaagctcaacctcaccttct 52988547  T
Q  593 tcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactca 692  Q
    |||||  | |||||||||||||| | ||| ||||| || || ||| ||||  | || ||||||||||| |||||||| |  || |||| ||||||  |||    
T  52988548 tcttcagcagaagagaaatgtaccgtcttactaaagcagttgatatgaactcgattatactctaaccaattcataccaaagataacatccatacccgtca 52988647  T
Q  693 aaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagt 792  Q
    | || |||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||| | ||||||   || ||| || |||||| | || || |||||||||||||||||    
T  52988648 acggcagacaaactaaatcaatcacaaaatctctaccaaacatagatataggacaccgcagacaaacaagagaagtggttactgaacccttagctggagt 52988747  T
Q  793 ttcgacaaccat 804  Q
    ||| ||||||||    
T  52988748 ttcaacaaccat 52988759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 7 - 810
Target Start/End: Original strand, 19856481 - 19857298
Alignment:
Q  7 acgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatc 106  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| || || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |    
T  19856481 acgaaaggcatcaccttatattcatagtaaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacc 19856580  T
Q  107 tcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 206  Q
    | || |||||||| || |||||   ||||||||||||  ||||||| || |  ||||||||||||||||||||||| ||||| || || || || |||||    
T  19856581 ttaagtcaatcttactgaaaacctttgcacccactaattgatccattaagtcgtcaattctcggaagtggatacctgttctttattgtaactttattcaa 19856680  T
Q  207 ctgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttc 306  Q
    |||  |||| ||||| || |||| |||| ||||||| |||||||| || | ||| || ||||||||| ||||||| || |  ||||| |||||||| ||     
T  19856681 ctgatgatagtcaatgcataacctcatagtaccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgctccccaaggtgacacacttggtcttacaaacttttta 19856780  T
Q  307 tcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||  |  || || || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||| ||||    
T  19856781 tcaagtaagtcttccaactgtttcttcaattcagcaagttcagacgccgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcttggaacaaggtcaa 19856880  T
Q  407 gt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttg 492  Q
     |               |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||| |||  ||| || || | ||| |||||||  |||||    
T  19856881 ttgaaaattcaacctctctctctggtggcacatctggaatctcatccggaaaaacatgaggaaactcattcacaactggcaacctgtcaatcatagcttg 19856980  T
Q  493 attctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcc 592  Q
    |||||| |  || ||| | ||| |||| |||||||| |  || || || || ||||  ||||||| ||| || ||||| |  |||||||| ||||| ||     
T  19856981 attctctaacgacaaatatgcctttaaagaaaacataagaattccgtcacgctccaactgcttcaactgttttgtagataggaactctgctccactctct 19857080  T
Q  593 tcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactca 692  Q
    |||||  | ||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||  |||| ||||||||| ||||||| || | |||  ||| ||||||| |||    
T  19857081 tcttcagcagaagaaaaatgcactgtcttgctaaaacaattgatatgaactcggttatactctaacaagttcatcccaaaaatatcatccataccagtca 19857180  T
Q  693 aaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagt 792  Q
    | |||| ||||||||| || | |||||| || | ||||||||||||||| |||||  | |  || || |||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  19857181 acggtaaacaaactaagtcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttaggcaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagt 19857280  T
Q  793 ttcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||| |||||||| |||||    
T  19857281 ttcaacaaccatttctcc 19857298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 8 - 498
Target Start/End: Original strand, 41310734 - 41311238
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||    
T  41310734 cgaaagacatcacgttatattcatagtgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaaccggacct 41310833  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||| | || | ||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || || || || ||||||    
T  41310834 caaatcagttttacgaaacacacgtgcacccactaactgatccattaaatcgtcaattctcggaagtggatacctattctttatcgtcactttattcaac 41310933  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    ||  | ||||| |||||||| | ||| |||||||| |||||||| || | ||| || |||||| || | |||||| | | |||||| ||||| ||||| |    
T  41310934 tgatggtaatctatacacaaactcatgctaccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgcttcccacggtgaatcactcggtcttacaaatttcttat 41311033  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| | || ||||||||| || |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |     
T  41311034 caagtaaatcctccaactgtttcttcaattaagctaactcggacgccgacatacgataaggtgccatggacaccggcttcgttccaggcacaagatcgat 41311133  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||  ||||||||||| ||||||    
T  41311134 tgaaaatttaacctccctctctggtggcacatctggaatctcatcaggaaaaacttctggaaattcactcacaaccggtaatctatcaatcacagcttga 41311233  T
Q  494 ttctc 498  Q
    |||||    
T  41311234 ttctc 41311238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 24792796 - 24792609
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24792796 aaaggcatacctttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgacctca 24792697  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttac 197  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24792696 aatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttac 24792609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 58 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 24097735 - 24096981
Alignment:
Q  58 gtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaat 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| || ||   ||||||||||||| ||||||| || |    
T  24097735 gtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtcgatcttgctgaacacctttgcacccactaactgatccattaagt 24097636  T
Q  158 tatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactag 257  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||| || || |||||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||| ||||     
T  24097635 catcaattctcggaagtggatacctgttctttatcgtaactttgttcaattgacggtaatcaatgcacaatctcatgctaccatccttcttcttaactaa 24097536  T
Q  258 caaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagac 357  Q
    ||| ||             |||||||| |  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||| |||    
T  24097535 caacac------------cggtgaaacacttggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaattcagctaacttagaagctgac 24097448  T
Q  358 atacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaagt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaa 443  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||| |              ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  24097447 atacgataaggtgccatcgacaccggctttgttcctggaacaaggtcaattgaaaattcaacctccctctctggtggcacatcaggaatctcatcaggaa 24097348  T
Q  444 aaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcg 543  Q
    | ||||  |||||||||  |||||| || | ||| |||||||  |||||||| || |  || ||| | |||||||| ||| ||||||  || ||||| ||    
T  24097347 acacttatggaaattcattcaccactggcaacctgtcaatcaaagcttgattttctaacgacaaatatgccattaaagaatacatcagaattccatcacg 24097248  T
Q  544 ttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacg 643  Q
    ||| || || |||| ||| || |||||||| |||||  |  ||| ||| |||||  | ||||| ||||| || | ||| ||||| ||||| ||| ||||     
T  24097247 ttctagctgtttcatctgtttcgtagacaagaactcaacttcaccttcttcttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttactaaagcaattgatatgaact 24097148  T
Q  644 tggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaag 743  Q
     |||| ||||||||||| ||||| |  | ||| |||| ||||||  |||| || | ||||||||| || | | |||| || | ||||||||||||||| |    
T  24097147 cggttatactctaaccaattcattctaaaaataacatccatacccgtcaacggcaaacaaactaagtcgactacaaagtctctaccaaacatagacaatg 24097048  T
Q  744 gacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||| |||| || || |||||| || | || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  24097047 gacatctcaagcaaacaagagaagtaattactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcc 24096981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 8 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 31538179 - 31537369
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||    
T  31538179 cgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacttttatctgatgataaccagacct 31538080  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgt-gcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 206  Q
    |||||| ||||| ||||| | || | ||||| || |   |||||||||| |  |||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||    
T  31538079 caaatctatcttactaaata-tcttagcaccaaccagttgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatatctgttcttgatcgtaactttgttcaa 31537981  T
Q  207 ctgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttc 306  Q
    ||| || ||||| |||||||  | |||||||||||| ||||||||||| | ||| || || |||||| |||||||||| |  ||||| |||||||||||     
T  31537980 ctgacggtaatctatacacagtctcatactaccatccttcttctttaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaacttctta 31537881  T
Q  307 tcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    || | || |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  31537880 tctaacaggtcctccaactgcttcttcaactcagctaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggcttagttcctggaacaagatcaa 31537781  T
Q  407 gt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttg 492  Q
     |              ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||  ||| || ||||  | ||||||||| |||||    
T  31537780 ttgaaaattcaacctccctctctggtggcacatcaggaatctcatcaggaaatacttctggaaattcattcactacaggtaaaccatcaatcacagcttg 31537681  T
Q  493 attctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcc 592  Q
    ||| || |  || ||    |||||||  ||| ||||||  |||||||| ||||| |  || |||| ||| || ||||||| || |||  |  ||| |||     
T  31537680 attttctaacgacaattgtgccattagagaatacatcagaataccatcacgttcaaactgtttcatctgttttgtagacagaagctcaacctcaccttct 31537581  T
Q  593 tcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactca 692  Q
    |||||  | |||||||||||||| | ||| ||||| || || ||| ||||  | || || |||||||| |||||||| |  || |||| ||||||  |||    
T  31537580 tcttcagcagaagagaaatgtaccgtcttactaaagcagttgatatgaactcgattatattctaaccaattcataccaaagataacatccatacccgtca 31537481  T
Q  693 aaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagt 792  Q
    | ||||||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||| | ||||||   || ||| || |||||| | || || |||||||||||||||||    
T  31537480 acggtagacaaactaaatcaatcacaaaatctctaccaaacatagatataggacaccgcagacaaacaagagaagtggttactgaacccttagctggagt 31537381  T
Q  793 ttcgacaaccat 804  Q
    ||| ||||||||    
T  31537380 ttcaacaaccat 31537369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 8 - 804
Target Start/End: Original strand, 20296589 - 20297399
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||    
T  20296589 cgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaaccagacct 20296688  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgt-gcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 206  Q
    |||||||||||| ||||||| || | ||||| || ||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  20296689 caaatcaatcttactaaaaa-tcttagcaccaaccaactgatccatcaaatcctcaattctcggaagcggatacctgttctttatcgtaaccttgttcaa 20296787  T
Q  207 ctgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttc 306  Q
    ||| || ||||| || ||||  | |||||||||||| |||||||| || | ||| || || |||||| |||||||||| |  ||||| ||||| |||||     
T  20296788 ctgacggtaatctatgcacagtctcatactaccatccttcttcttaaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaatttctta 20296887  T
Q  307 tcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    || | || ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||    
T  20296888 tccaacaggtcttccaactgtttcttcaactcagctaactcagaagctgacatgcggtatggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaaggtcaa 20296987  T
Q  407 gt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttg 492  Q
     |              ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||  ||| || |||| |||||||||||| |||||    
T  20296988 ttgaaaattcaacctccctctttggtggcacatcaggaatctcatcaggaaatacttttggaaattcattcactacaggtaacctatcaatcacagcttg 20297087  T
Q  493 attctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcc 592  Q
    ||| || |  || ||    |||||||  ||| ||||||  || ||||| ||||| |  || |||| ||| || ||||||||||  ||  |  ||| |||     
T  20297088 attttctaacgacaattgtgccattagagaatacatcagaattccatcacgttcaaactgtttcatctgttttgtagacaaaagttcaacttcaccttct 20297187  T
Q  593 tcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactca 692  Q
    |||||  | ||||| ||||| || | ||| ||| | || || ||| ||||  |||| ||||||||||| ||||| || |  ||||||| ||||||  |||    
T  20297188 tcttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttactatagcagttgatatgaactcggttatactctaaccaattcattccaaagatcacatccatacccgtca 20297287  T
Q  693 aaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagt 792  Q
    | || |||||||||||||| |   ||||||| | |||||||||| | | ||||||   || ||| || |||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  20297288 acggcagacaaactaaatcaaccacaaaatctctaccaaacataaatataggacaccccagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagt 20297387  T
Q  793 ttcgacaaccat 804  Q
    ||| ||||||||    
T  20297388 ttcaacaaccat 20297399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 656 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 20081896 - 20081742
Alignment:
Q  656 aaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaac 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20081896 aaccagttcatacccagaatcacatccataccactcaaaggtagacaaactaaatccatctcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaac 20081797  T
Q  756 atacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20081796 atacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 20081742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 8 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 20938245 - 20937847
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || || ||||| || |||||||| || || || || || || ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||    
T  20938245 cgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgttttctgcatatcctcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacct 20938146  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||| ||||||||   ||||||||||||| |||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || || ||||||    
T  20938145 caagtcaatcttactaaaaacctttgcacccactaactgatccatcaagtcgtcaatcctaggaagtggatacctgttctttattgtaactttattcaac 20938046  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||| || |||| |||||||||||| || |||||||| | ||| || ||||||||| ||||||| || |  ||||| ||||||||||| |    
T  20938045 tgacgatagtcaatgcataacctcatactaccatccttattctttaccaacaataccggcgctccccaaggtgagacacttggtcttacaaacttcttat 20937946  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||| ||||    
T  20937945 caagcaaatcctccaactgtttcttcaatacagctaactcggaagctaacatgcgataaggtgccatcgacaccggcttcattcctggaacaaggtcaa 20937847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 8 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 38911008 - 38910198
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || || ||||| || || |||||||| || || || || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || ||    
T  38911008 cgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgtccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcacctttatctgatgataaccagacct 38910909  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgt-gcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 206  Q
    |||||||||||| || |||| || | ||||| || ||| |||||||||| |  |||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||    
T  38910908 caaatcaatcttactgaaaa-tcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatatctgttcttgatcgtaactttgttcaa 38910810  T
Q  207 ctgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttc 306  Q
    ||| || ||||| |||||||  | |||||||||||| ||||||||||| | ||| || || |||||| |||||||||| |  ||||| |||||||||||     
T  38910809 ctgacggtaatctatacacagtctcatactaccatccttcttctttaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaacttctta 38910710  T
Q  307 tcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    || | ||  ||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  38910709 tctaacagatcctccaactgcttcttcaactcaactaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggcttagttcctggaacaagatcaa 38910610  T
Q  407 gt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttg 492  Q
     |              ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||  ||| || ||||  | ||||||||| |||||    
T  38910609 ttgaaaattcaacctccctctctggtggcacatcaggaatctcatcaggaaatacttatggaaattcattcactacaggtaaaccatcaatcacagcttg 38910510  T
Q  493 attctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcc 592  Q
    ||| || |  || ||    |||||||  ||| |||||| ||||||||| ||||| |  || |||| ||| || ||||||| || |||  |  ||| |||     
T  38910509 attttctaacgacaattgtgccattagagaatacatcaggataccatcacgttcaaactgtttcatctgtttcgtagacagaagctcaacctcaccttct 38910410  T
Q  593 tcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactca 692  Q
    |||||  | ||||||||||| || | |||  || | || || ||| ||||  | || ||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||  |||    
T  38910409 tcttcagcagaagagaaatgcaccgtcttattatagcagttgatatgaactcgattatactctaaccaattcataccaaaaatcacatccatacccgtca 38910310  T
Q  693 aaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagt 792  Q
    | || |||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||| | ||||||   || ||| || |||||| | || || |||||||||||||||||    
T  38910309 acggcagacaaactaaatcaatcacaaaatctctaccaaacatagatataggacaccgcagacaaacaagagaagtggttactgaacccttagctggagt 38910210  T
Q  793 ttcgacaaccat 804  Q
    ||| ||||||||    
T  38910209 ttcaacaaccat 38910198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 165 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 21740061 - 21739402
Alignment:
Q  165 tctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaact 264  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || || || |||| ||| || ||||| |||||||||  ||| |||||||| |||||||| || | ||| |      
T  21740061 tctcggaagtggatacctattctttatcgtcactttattcagctgacggtaatctatacacaacatcatgctaccatccttcttcttaaccaacaacatc 21739962  T
Q  265 ggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgat 364  Q
    ||||||||| | |||||||| | |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||  | |||||||| |    
T  21739961 ggcgctccccacggtgaaacactcggtcttacaaatttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaattcaactaacttggacactgacatacggt 21739862  T
Q  365 aaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc------aagt--------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttc 450  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||      || |        ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  21739861 aaggtgccatcgacaccggcttcgttccgggaacaagatcgatagaaaattcaacctccctctctggtggcacatctggaatctcatcaggaaaaacttc 21739762  T
Q  451 aggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagt 550  Q
     |||||||||  ||| ||||| |   |||||||||| ||||||||||| |  || ||  | ||||| || |||||||| |  || ||||| || |||| |    
T  21739761 cggaaattcattcacaaccggcaatttatcaatcacagcttgattctccaatgacaagtatgccatcaaagaaaacattagaattccatcacgctccaat 21739662  T
Q  551 tgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgt 650  Q
    ||||||| ||| |||||||  || ||||| ||  |||| || |||||  | ||||| |||||  | | ||| ||||| ||||||||| ||||  |||| |    
T  21739661 tgcttcaactgtttagtagttaagaactcagcttcactctcttcttcagcagaagaaaaatgcgccgtcttactaaagcaattaatatgaacacggttat 21739562  T
Q  651 actctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacattt 750  Q
    |||||||||||||||| || | ||| |||| ||||||  |||| || | ||| |||| ||| | |||||| || | ||||||||||||||| |||||  |    
T  21739561 actctaaccagttcatcccaaaaattacatccatacccgtcaacggcaaacatactagatcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaatggacaact 21739462  T
Q  751 caaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||| || ||| || |||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  21739461 caaacaaacaagaaaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcc 21739402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 8 - 460
Target Start/End: Original strand, 37679257 - 37679723
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||    
T  37679257 cgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatctttcacctttatctgatgataaccagacct 37679356  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgt-gcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 206  Q
    |||||||||||| ||||| | || | ||||| || ||  |||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  37679357 caaatcaatcttactaaata-tcttagcaccaaccaattgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttcttgatcgtaactttgttcaa 37679455  T
Q  207 ctgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttc 306  Q
    ||| || ||||| |||||||  | |||||||||||| ||||| || || | ||| || || |||||| |||||||||| |  ||||| |||||||||||     
T  37679456 ctgacggtaatctatacacagtctcatactaccatccttctttttgaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaacttctta 37679555  T
Q  307 tcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    || | || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  37679556 tctaacaggtcctccaactgtttcttcaactcagctaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggcttagttcctggaacaagatcaa 37679655  T
Q  407 gt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattca 460  Q
     |              ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  37679656 ttgaaaattcaacctccctctctggtggcacatcaggaatctcatcaggaaacacttctggaaattca 37679723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 19661318 - 19660986
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||  | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  19661318 cgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacgtgtcctagaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacct 19661219  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||| || |||||   ||||||||||||| ||||||| || |  ||||||||||||||||||||||| ||||| || || || || ||||||    
T  19661218 caagtcaatcttactgaaaacatttgcacccactaactgatccattaagtcgtcaattctcggaagtggatacctgttctttatcgtaactttattcaac 19661119  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||| || |||| |||| ||||||| |||||||| || | ||| || ||||||||| |||||||  | |  ||||| |||||||| || |    
T  19661118 tgacgatagtcaatgcataacctcatagtaccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgctccccaaggtgacgcacttggtcttacaaactttttat 19661019  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcag 340  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  19661018 caagcaagtcttccaactgtttcttcaattcag 19660986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 202 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 22016733 - 22016111
Alignment:
Q  202 ttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaact 301  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||| ||| |||||||| ||||||||||| | ||| |  ||||||||| |||||||||| |  ||||| ||||| |    
T  22016733 ttcaactgacgataatcaatgcataacctcatgctaccatccttcttctttaccaacaacatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaatt 22016634  T
Q  302 tcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaag 401  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  22016633 tcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcagttaagctaactcggacgccgacatacgataaggtgctatcgacaccggcttcgttcctggaacaag 22016534  T
Q  402 atcaagt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcact 487  Q
     |||| |              ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||  ||| || || | ||| ||||||||     
T  22016533 gtcaattgaaaattcaacgtccctctctggtggcacatctggaatctcatcaggaaaaacttatggaaattcattcacaactggcaacctgtcaatcaca 22016434  T
Q  488 gcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccac 587  Q
    |||||||| || |  || |   | ||||| || |||||||| || || ||||| || ||||  | ||||| ||  |||||||  |  ||||| || ||||    
T  22016433 gcttgattttccaatgacatgtatgccatcaaggaaaacattaaaattccatcacgctccaactccttcatctatttagtagttaggaactcagctccac 22016334  T
Q  588 tttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacatacc 687  Q
    | || |||||  | ||||| ||||| || | ||||||||| ||||| ||| ||||  |||| ||||||||||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  22016333 tatcttcttctgcagaagaaaaatgcaccgtcttgctaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaattacatccatacc 22016234  T
Q  688 actcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagct 787  Q
      |||| |||| ||||||||  || | |||||| || | ||||||||||||||| |||||  | | ||| || |||||| |||| || ||||||||||||    
T  22016233 cgtcaacggtaaacaaactaggtcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagct 22016134  T
Q  788 ggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||| |||||||| |||||    
T  22016133 ggagtttcaacaaccatttctcc 22016111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 671 - 810
Target Start/End: Original strand, 21842066 - 21842205
Alignment:
Q  671 agaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatag 770  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  21842066 agaatcacatccataccgctcaaaggcagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaatgacatttcaaacatacgagagaagtag 21842165  T
Q  771 tcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21842166 tcaccgaacccttagctggagtttcgacaacaatctctcc 21842205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 495
Target Start/End: Original strand, 21953086 - 21953587
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| || ||    
T  21953086 cgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatggtaacccgacct 21953185  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgt-gcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 206  Q
    ||| |||||||| ||||||| || | ||||| || ||| |||||||||| |  |||||||  ||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||    
T  21953186 caagtcaatcttactaaaaa-tcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattccaggaagcggatacctgttctttatcgtaactttgttcaa 21953284  T
Q  207 ctgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttc 306  Q
    ||| || |||||||| ||||  | |||||||||||| |||||||| || | ||| || || |||||| ||||||||||    ||||| ||||| |||||     
T  21953285 ctgacggtaatcaatgcacagtctcatactaccatccttcttcttaaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacattgggtcttacaaatttctta 21953384  T
Q  307 tcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    || | || ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  21953385 tctaacaggtcctccaactgtttcttcaattcagctaactccgaagctgacatacggtatggtgccatcgacaccggctttgttcctggaacaaggtcaa 21953484  T
Q  407 gt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttg 492  Q
     |              ||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||  ||| || |||| ||| |||||||| |||||    
T  21953485 ttgaaaattcaacctccctatctagtggcacatcaggaatctcatcaggaaacacttccggaaattcattcactacaggtaacctgtcaatcacagcttg 21953584  T
Q  493 att 495  Q
    |||    
T  21953585 att 21953587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 77 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 20829505 - 20829203
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||| | |||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  20829505 cctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 20829406  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaa 276  Q
    ||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| || | ||| ||||| || ||| |     
T  20829405 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgtcgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccac 20829306  T
Q  277 ggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcg 376  Q
    |||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||| |||   ||||| || |||||||| ||||| || || ||||    
T  20829305 ggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactccgatgcagacatccgatacggcgcaatcg 20829206  T
Q  377 aaa 379  Q
    |||    
T  20829205 aaa 20829203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 77 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 41215969 - 41215667
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||   ||||| || | | |||||||||||| |||||| || ||||| ||    
T  41215969 ccttcactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacttccgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagcgg 41215870  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaa 276  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| || | ||| ||| | || ||| |     
T  41215869 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactagagcaccccac 41215770  T
Q  277 ggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcg 376  Q
    || ||||| | ||| || | ||||| ||||| ||| || || || |||||||||||||||||||  ||||| || |||||||| ||||| || || ||||    
T  41215769 ggagaaacactcggcctgataaactacttcttaagtaactcttctaactgtttcttcaactcagccaactctgatgcagacatccgatacggcgcaatcg 41215670  T
Q  377 aaa 379  Q
    |||    
T  41215669 aaa 41215667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 727 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 22496705 - 22496622
Alignment:
Q  727 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22496705 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 22496622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 77 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 35930938 - 35930764
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    ||||| |||| | |||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  35930938 ccttcactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctcagcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 35930839  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctt 251  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  35930838 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttctt 35930764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 77 - 331
Target Start/End: Original strand, 20527299 - 20527553
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||   || | |  ||| | |||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  20527299 ccttcactctaatcagatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctttgtatcttctagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 20527398  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaa 276  Q
    ||||| |||||| || || || |||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| |||| ||| ||||| || ||| |     
T  20527399 ataccgattcttaatcgtcactttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccac 20527498  T
Q  277 ggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttct 331  Q
    || ||||| | ||| || | ||||| |||||||||||| || || ||||| ||||    
T  20527499 ggagaaacactcggcctgataaactgcttctcaagcaactcttctaactgcttct 20527553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 148 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 21200996 - 21200805
Alignment:
Q  148 tccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttct 247  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||||| | |||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  21200996 tccatcaaatcatcaatcctcgggagtggatatcgattcttaatcattaccttattcaactgccgataatccatacacaacctcatactaccatccttct 21200897  T
Q  248 tctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactca 339  Q
    |||| |||| ||| | ||| || ||| | || ||||| | ||| || | ||| | |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  21200896 tcttaactaacaacagtggagcacccaatggcgaaacactcggcctgataaaatgcttctcgagcaactcttccaactgtttcttcaactca 21200805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 602 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 429731 - 429575
Alignment:
Q  602 gaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagac 701  Q
    ||||||||||  || ||||| ||  ||||||||||  | || |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  429731 gaagagaaatacaccgacttactgtaacaattaatgtgcacatggttgtattccaaccaattcataccaagaatcacatccataccactcaaatgtagac 429632  T
Q  702 aaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacata 758  Q
    |||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  429631 aaaccaaatccatctcaaaatcactatcaaacatagacaaatgacatcttaaacata 429575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 335
Target Start/End: Original strand, 20927300 - 20927558
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||| ||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||| || | | |||||||||||| |||||| ||  |||||||    
T  20927300 cctttactctaatctgatgatatcctgatctcatatcaatcttgctaaacacctctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatcctttgaagtgg 20927399  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaa 276  Q
    ||| | |||||| || || || |||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || ||||| |||||||| || | ||| ||||| || ||| |     
T  20927400 atatcgattcttaatcgtcactttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatcattcttcttaaccaacaacactggagcaccccac 20927499  T
Q  277 ggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaa 335  Q
    || || || |   |||||| |||||  ||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  20927500 ggagatacacttcgtctaataaactgtttctcaagcaactcttctaactgtttcttcaa 20927558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 88 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 22133856 - 22133693
Alignment:
Q  88 atctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattct 187  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |   | ||| | || | ||||||||| || |||||  || ||||| ||||||| |||||    
T  22133856 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacatttcagtaccaaatagctgatccatcagatcatcaacccttggaagcggataccgattct 22133757  T
Q  188 tgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctt 251  Q
    | || || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  22133756 taatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttctt 22133693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 761 - 808
Target Start/End: Original strand, 21751991 - 21752038
Alignment:
Q  761 agagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctct 808  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21751991 agagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctct 21752038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 650 - 804
Target Start/End: Original strand, 12200382 - 12200536
Alignment:
Q  650 tactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatt 749  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||  |||| || ||||| |||||||| ||  ||||||| | |||||||||||| |  |||||      
T  12200382 tactctaaccaattcataccaaaaatcacatccatacccgtcaacggcagacacactaaatcaatcacaaaatctctaccaaacatagatatgggacacc 12200481  T
Q  750 tcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 804  Q
     || ||| || |||||| | || || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12200482 gcagacaaacaagagaagtggttactgaacccttagctggagtttcaacaaccat 12200536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 651 - 804
Target Start/End: Original strand, 37679914 - 37680067
Alignment:
Q  651 actctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacattt 750  Q
    |||||||||| |||||||| |  || |||| ||||||  |||| || |||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||| | ||||||       
T  37679914 actctaaccaattcataccaaagataacatccatacccgtcaacggcagacaaactaaatcaatcacaaaatctctaccaaacatagatataggacaccg 37680013  T
Q  751 caaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 804  Q
    || ||| || |||||| | || || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37680014 cagacaaacaagagaagtggttactgaacccttagctggagtttcaacaaccat 37680067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 701 - 804
Target Start/End: Original strand, 18710300 - 18710403
Alignment:
Q  701 caaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaa 800  Q
    |||||||| || | |||||| || | ||||||||||||||| |||||  | | ||| || |||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  18710300 caaactaagtcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaa 18710399  T
Q  801 ccat 804  Q
    ||||    
T  18710400 ccat 18710403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 657; Significance: 0; HSPs: 60)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 657; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 24711827 - 24712643
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24711827 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcctttactttaatctggtgataacctgatct 24711926  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24711927 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 24712026  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    |  |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  24712027 tatcgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggtgctccccaaggtgaaacactcggtctaacaaacttcttct 24712126  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  24712127 caagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgaaaccggcttcgttccaggaacaagatcaat 24712226  T
Q  408 -------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24712227 agaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 24712326  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  24712327 ttctcaatagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactctcct 24712426  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  24712427 cttcgacggaagagaaatgtactgatttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccataccactcaa 24712526  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24712527 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtt 24712626  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  24712627 tcgacaaccatctctcc 24712643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 643; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 44384218 - 44383404
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44384218 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctaatctca 44384119  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44384118 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 44384019  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  44384018 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctca 44383919  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-- 407  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||       
T  44383918 agcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaatag 44383819  T
Q  408 -----------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
               || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44383818 aaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatcactgcttgatt 44383719  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  44383718 ctcaatagatatattagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctacaccactttcctct 44383619  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  44383618 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccataccactcaaag 44383519  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44383518 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttc 44383419  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||    
T  44383418 gacaaccatctctcc 44383404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 633; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 9337375 - 9338191
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  9337375 cgaagggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcttcgtcttttactttaatctggtgatagcctgatct 9337474  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9337475 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 9337574  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  9337575 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttct 9337674  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  9337675 caagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaat 9337774  T
Q  408 -------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  9337775 agaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctgtcaatcactgcttga 9337874  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9337875 ttctcaatagatatagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcct 9337974  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  9337975 cttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccataccactcaa 9338074  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9338075 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtt 9338174  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  9338175 tcgacaaccatctctcc 9338191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 633; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 9486009 - 9486825
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  9486009 cgaagggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcttcgtcttttactttaatctggtgatagcctgatct 9486108  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9486109 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 9486208  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  9486209 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttct 9486308  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  9486309 caagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaat 9486408  T
Q  408 -------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  9486409 agaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctgtcaatcactgcttga 9486508  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9486509 ttctcaatagatatagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcct 9486608  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  9486609 cttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccataccactcaa 9486708  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9486709 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtt 9486808  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  9486809 tcgacaaccatctctcc 9486825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 633; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 17000793 - 17001609
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  17000793 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcttcgtcttttactttaatctggtgataacctgatct 17000892  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17000893 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 17000992  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  17000993 tgtcgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgcttcccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttct 17001092  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  17001093 caagcaagtcttctaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaat 17001192  T
Q  408 -------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  17001193 agaaaattcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctgtcaatcactgcttga 17001292  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17001293 ttctcaatagataaagtagccatcaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcct 17001392  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  17001393 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccataccactcaa 17001492  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17001493 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtt 17001592  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  17001593 tcgacaaccatctctcc 17001609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 629; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 10870643 - 10871459
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10870643 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatct 10870742  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10870743 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgctcccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctgttcttgatagttaccttgttcaac 10870842  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  10870843 tgtcgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttct 10870942  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  10870943 caagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaat 10871042  T
Q  408 -------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10871043 agaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcttatcaatcactgcttga 10871142  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  10871143 ttctcagtagataaagtagccattaacgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactccgcaccactttcct 10871242  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  10871243 cttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccataccgctcaa 10871342  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  10871343 aggtagacaaactaaatccatttcgaaatcacgaccaaacatagacaaacgacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagccggagtt 10871442  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  10871443 tcgacaaccatctctcc 10871459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 625; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 27219809 - 27220625
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27219809 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccatatcgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcttcgtcttttactttaatctggtgatagcctgatct 27219908  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27219909 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 27220008  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  27220009 tgtcgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttct 27220108  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  27220109 caagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaat 27220208  T
Q  408 -------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  27220209 agaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtgacctgtcaatcactgcttga 27220308  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27220309 ttctcaatagataaagtagccatcaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcct 27220408  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  27220409 cttcgacggaagagaaacgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccataccactcaa 27220508  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27220509 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtt 27220608  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  27220609 tcgacaaccatctctcc 27220625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 623; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Original strand, 27373064 - 27373878
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  27373064 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgatatcctgacctca 27373163  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27373164 aatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 27373263  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  27373264 tcgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggtgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctca 27373363  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-- 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||       
T  27373364 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaatag 27373463  T
Q  408 -----------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
               || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27373464 aaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaagaaattcacacaccaccggtaacctatcaatcactgcttgatt 27373563  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||| |||||| | |||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27373564 ctcaatagataaggtagccatcaacgaaaacatcaagataccgtcgcgtttcagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcctct 27373663  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  27373664 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccataccgctcaaag 27373763  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27373764 gtaggcaaactaaatccatttcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttc 27373863  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||    
T  27373864 gacaaccatctctcc 27373878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 619; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 806
Target Start/End: Original strand, 24264165 - 24264975
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24264165 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctca 24264264  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24264265 aatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 24264364  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  24264365 tcgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacactcggtctaacaaacttcttctca 24264464  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-- 407  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||       
T  24264465 agcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaatag 24264564  T
Q  408 -----------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
               || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24264565 aaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaaatcacacaccaccggtaacctatcaatcactgcttgatt 24264664  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  24264665 ctcaatagataaagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagatagaaactccgcaccactttcctct 24264764  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24264765 tcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccataccgctcaaag 24264864  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24264865 gtagacaaactaaatccatttcgaaatcacgaccaaacataaacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagccggagtttc 24264964  T
Q  796 gacaaccatct 806  Q
    |||||||||||    
T  24264965 gacaaccatct 24264975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 607; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 41607033 - 41606221
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41607033 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctca 41606934  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41606933 aatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 41606834  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  41606833 ccgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctca 41606734  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc----- 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||         
T  41606733 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagtagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccagggacaagatcaatag 41606634  T
Q  405 --aagtc-------ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
      || ||       ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41606633 aaaactcaacttctctctcaggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatcactgcttgatt 41606534  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  41606533 ctcaatagataaggtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactccgcaccactttcctct 41606434  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  41606433 tcgacggaagagaaatgcacagacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccataccgctcaaag 41606334  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41606333 atagacaaactaaatccatttcgaaatcacgaccaaacatagac-aaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagccggagtttc 41606235  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
    ||| |||||||||||    
T  41606234 gac-accatctctcc 41606221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 587; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 21143689 - 21142875
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21143689 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgtatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgacctca 21143590  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21143589 aatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagttgatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 21143490  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
     |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| |||||||||    
T  21143489 tcgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaatttcttctca 21143390  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-- 407  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||       
T  21143389 agcaaggcttccaactgtttcttcaactcagataattcggaagcagacataagataaggtgccatcgacaccggcttcgttccaggaactagatcaatag 21143290  T
Q  408 -----------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
               || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  21143289 aaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatttcatctgggaaaactttaggaaaatcacacaccacttgtagcttatcaatcactgcttgatt 21143190  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21143189 ctcaatagataaagaagccattaacgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcctct 21143090  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  21143089 tcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacctagaatcacatccataccgctcaaag 21142990  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  21142989 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcatcgaacccttagctggagtttc 21142890  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||    
T  21142889 gacaaccatctctcc 21142875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 579; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 24875398 - 24874584
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24875398 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctgatgataacctgacctca 24875299  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24875298 aatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaatcgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 24875199  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
     |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| |||||||||    
T  24875198 tcgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaatttcttctca 24875099  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-- 407  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||       
T  24875098 agcaaatcttccaactgtttcttcaactcagataattcggaagcaaacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccagggactagatcaatag 24874999  T
Q  408 -----------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
               || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  24874998 aaaactcaacttctctctctggaggcacatcaagaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccacttgtagcttatcaatcactgcttgatt 24874899  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  24874898 ctcaatagataaggtagccattaacgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactctcctct 24874799  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24874798 tcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaatgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccataccgctcaaag 24874699  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24874698 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttgaaacatacgagagaagtagtcaccgaaaccttagctggagtttc 24874599  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||    
T  24874598 gacaaccatctctcc 24874584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 498; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 24677282 - 24678096
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  24677282 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctatcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatct 24677381  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24677382 caaatcaatcttgctgaaatcttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttactttgttcaac 24677481  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  24677482 tgacgataatcaatacacaacctcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggtgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttct 24677581  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    ||||||| || || ||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||| ||||||||     
T  24677582 caagcaaatcttctaactgcttcttcaactcagctaactcggaagttgacatacgataaggtgcca--gacacaggcttcgttccaggaaaaagatcaat 24677679  T
Q  408 -------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                 || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||  ||||  |||||||||||||||||    
T  24677680 agaaaactcaacttctctctctggaggcacgtcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaaatcgcataccacttgtagattatcaatcactgcttga 24677779  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  24677780 ttctcaatagataaggaagccatcaaagaaaacatcaaaataccatcgtgttccagttgcttcagctgcttggtagataagaactttgcaccactttcct 24677879  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  24677880 cttcgacggaggagaaatacactgacttgctataacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccataccgctcaa 24677979  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  24677980 aggtagacaaactaaatccatctcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatctcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctgaagtt 24678079  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  24678080 tcgacaaccatctctcc 24678096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 493; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 24706130 - 24705318
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24706130 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttctttttttactttaatctggtgataacctgatctca 24706031  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24706030 aatcaatcttgctgaaaactttcgcacccactaactaatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctatttttgatagttaccttgttcaactg 24705931  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
     ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||  ||||||||    
T  24705930 tcgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcttcactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaatctcttctca 24705831  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-- 407  Q
    ||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||       
T  24705830 agcaaatcttctaactgtttcttcaactcagctaactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttctaggaacaagatcaatag 24705731  T
Q  408 -----------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
               || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || || |||||  ||||| ||||||||| ||| |||||    
T  24705730 aaaactcgacttctctctccggaggcacatcaggaatttcatctggaaaaactttaggaaaatcgcataccacttgtagcttatcaatcattgcctgatt 24705631  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  24705630 ctcaatagataaagaagccatcaacgaaaacatcaaaataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttggtagataagaactctgcaccactttcctct 24705531  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||  |||||||||||||    
T  24705530 tcgacggaagagaaatacactgacttgctaaaacaattgatatgaacatggttgtactctaaccaattcataccaagaatcatattaataccactcaaag 24705431  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  24705430 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaagggcatctcaaacatacgagagaagtagttaccaaacccttagctggagtttc 24705331  T
Q  796 gacaaccatctct 808  Q
    |||||||||||||    
T  24705330 gacaaccatctct 24705318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 479; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 21323914 - 21323100
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||    
T  21323914 aaaggcataactttatactcatagtggccataacgtgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttaccttaatctggtgataacccgatctca 21323815  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21323814 aatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatatctattcttgatagttaccttgtttaactg 21323715  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
       ||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  21323714 tttatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctca 21323615  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc----- 404  Q
    ||||  || || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||         
T  21323614 agcagatcttctaactgtttcttcaactcagctaactcggaagctgacatccgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccaggaacaagatcaatag 21323515  T
Q  405 --aagtc-------ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
      || ||       |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||  | ||| ||||||| |||||||||||    
T  21323514 aaaactcgacttctctctctggaggcacataaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaaatcgcataccacttgaagcttatcaattactgcttgatt 21323415  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||| ||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  21323414 ctcaatagataaagaagccctcaaagaaaacatcaaaataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttggtagacaagaactctgcgccactttcctct 21323315  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  21323314 tcgactgaggagaaatacactgacttgctaaaacagttcatatgaacatggttgtattgcaaccaattcatacccagaatcacatccacaccgctcaaag 21323215  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21323214 gtagacaaactaaatccatctcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttc 21323115  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||    
T  21323114 gacaaccatctctcc 21323100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 301 - 810
Target Start/End: Original strand, 16983326 - 16983849
Alignment:
Q  301 ttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaa 400  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  16983326 ttcttctcaagcaagtcttctaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaa 16983425  T
Q  401 gatcaag-------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcac 486  Q
    ||||||              || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  16983426 gatcaatagaaaattcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatccggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctgtcaatcac 16983525  T
Q  487 tgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcacca 586  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16983526 tgcttgattctcaatagataaagtagccatcaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcacca 16983625  T
Q  587 ctttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacatac 686  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  16983626 ctttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccatac 16983725  T
Q  687 cactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagc 786  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16983726 cactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagc 16983825  T
Q  787 tggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16983826 tggagtttcgacaaccatctctcc 16983849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 23106378 - 23105562
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  23106378 cgaaaggcataactttgtactcatagtgaccataccgcgttctaaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatct 23106279  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||| |||||||| ||||||  ||||||||| ||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  23106278 caaatctatcttgctgaaaacttttgcacccaccaactgatccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatacctattctttattgtcaccttgttcaac 23106179  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||| ||||| ||||    
T  23106178 tgtcgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcttcaccagcaaaacgggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacgaactttttct 23106079  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    | || || ||||| || |||||||| ||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||     
T  23106078 cgagtaaatcctctaattgtttctttaactcggcgaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaggcttcgttccaggaacaagatcaat 23105979  T
Q  408 --------------tcctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                  | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||| ||||  |||||||||| ||||||    
T  23105978 agaaaactcaacttttctctctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttccggaaaatcgcataccacctgtagtttatcaatcaccgcttga 23105879  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23105878 ttctcaatagataaggaagccatcaaagaaaacatcaaaatgccatcacgttccaactacttcagctgcttagtagacaaaaactctgcgccactttcct 23105779  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||||||||  || ||||| ||| ||||||||||  |||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||    
T  23105778 cttcatcagaagagaaatacaccgacttactataacaattaatgtgaacatggttgtattccaaccagttcatacccagaaacacatccataccgatcaa 23105679  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23105678 aggtagacaaactaaatccatctcaaaatcacgatcaaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtt 23105579  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||||||||| |||||    
T  23105578 tcgacaaccatttctcc 23105562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 23073656 - 23074472
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  23073656 cgaaaggcataactttgtattcataatggccatatcgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 23073755  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    || ||| |||||||| ||||  | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  23073756 cagatctatcttgctgaaaatacttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctttattgttactttgttcaac 23073855  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||  ||| |||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  23073856 tgtcgatagtcaatacacaacctcatgctaccatccttcttcttccctaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttct 23073955  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa- 406  Q
    ||||||| || || || |||||||||||||  | |||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || || ||||| |||||| ||||||||||||     
T  23073956 caagcaaatcttctaattgtttcttcaacttggctaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaggctttgttccaagaacaagatcaat 23074055  T
Q  407 -------------gtcctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                   ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||  ||||  |||||||||||||||||    
T  23074056 agaaaattcaacttccctctctggagacacatcaggaatttcatcaggaaatacttctggaaaatcgcataccacttgtagtttatcaatcactgcttga 23074155  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  23074156 ttctcaatagataaggaagccatcaaagaaaacatcaaaataccatcacgttctaactgcttcagctgcttggtagataaaaactttgcgccactttcct 23074255  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||||||||  || ||||| ||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  23074256 cttcagcagaagagaaatacaccgacttactataacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccaattcataccaagaattacatccataccactcaa 23074355  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23074356 aggtagacaaaccaaatcaatctcaaaatcaagatcaaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtt 23074455  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||| ||||||||||||    
T  23074456 tcgataaccatctctcc 23074472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 410 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 22323576 - 22323176
Alignment:
Q  410 ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaag 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  22323576 ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctgtcaatcactgcttgattctcaatagataagg 22323477  T
Q  510 aagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaa 609  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22323476 tagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaa 22323377  T
Q  610 atgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaa 709  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22323376 atgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacctaaaatcacatccataccactcaaaggtagacaaactaaa 22323277  T
Q  710 tccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctc 809  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22323276 tccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctc 22323177  T
Q  810 c 810  Q
    |    
T  22323176 c 22323176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 22734424 - 22733608
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  22734424 cgaaaggcataactttgtactcataatgtccataacgcgttctgaaagttgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatatggtgataacctgatct 22734325  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||| |||||| | ||||| | || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  22734324 caaatctatcttgttgaaaacacttgtacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctttattgttaccttgttcaat 22734225  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||| ||||    
T  22734224 tgtcgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcttcactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaactttttct 22734125  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc--- 404  Q
    |||| || || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||  |||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||       
T  22734124 caagtaaatcttctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagttgacatacgataaggtgtcatagacacaggcttcgttccaggaacaagatcaat 22734025  T
Q  405 ----aagtc-------ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
        || ||       ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||| ||||| || || |||||  ||||  |||||||||||| ||||    
T  22734024 cgaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatttcatcagaaaatacttctggaaaatcgcataccacttgtagtttatcaatcactggttga 22733925  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||  |||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22733924 ttctcagtagataaggaagccatcaaagaaaacatcaaaataccatcacgttcttactgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcgccactttcct 22733825  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | |||||||||   || ||||| ||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  22733824 cttcagcagaagagaaaaacaccgacttactataacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccaggtcataccaagaattacatccataccactcaa 22733725  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    || ||||||||| ||||| || | |||||||||| ||||||||||||| |||||| | | ||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  22733724 agctagacaaaccaaatcaatctgaaaatcacgatcaaacatagacaagggacatcttatacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagttggagtt 22733625  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||||||||| |||||    
T  22733624 tcgacaaccatttctcc 22733608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 174 - 810
Target Start/End: Original strand, 23204273 - 23204923
Alignment:
Q  174 tggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccc 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23204273 tggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgacgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttctttactatcaaaactggcgctccc 23204372  T
Q  274 taaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgcca 373  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23204373 taaggtgaaacacttggtctaacaaatttcttttcgagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagctaactcggaagcagacatacgataaggtgcca 23204472  T
Q  374 tcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaagt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattc 459  Q
    |||| || ||||| || ||||||||||||||||                ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||    
T  23204473 tcgacaccggctttgtcccaggaacaagatcaatagaaaactcgacttccctttctggaggcacatcaggaatttcatttggaaaaacttcaggaaagtc 23204572  T
Q  460 acacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagc 559  Q
     || |||||  ||||  ||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  23204573 gcataccacttgtagattatcaatcattgcttgattctcaatagacaaggaagccatcaaggaatacatcaagataccatcgcgttccatttgcttcaac 23204672  T
Q  560 tgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaacc 659  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  23204673 tgcttagtagataagaactctgcatcactctcctcttcagcggaagagaaatacactgacttgctaaaacaattgatatgaacatggttgtactctaacc 23204772  T
Q  660 agttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatac 759  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||  | | |||||    
T  23204773 aattcatacccagaatcacatccataccgctcaaaggtagacaaactaaatccattacaaaatcacgaccatccatagacaaaggacatcgcgagcatac 23204872  T
Q  760 gagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23204873 gagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtatcgacaaccatctctcc 23204923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 8 - 406
Target Start/End: Original strand, 16927153 - 16927551
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  16927153 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcttcgtcttttactttaatctggtgataacctgatct 16927252  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16927253 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 16927352  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  16927353 tgtcgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgcttcccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttct 16927452  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  16927453 caagcaagtcttctaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaa 16927551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 291 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 24658024 - 24657492
Alignment:
Q  291 tctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgtt 390  Q
    |||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  24658024 tctaacgaatttcttctcaagcaaatcttctaactgtttcttcaactcaactaactcggaagcagacatacg-taaggtgccatcgacaccggcttcgtt 24657926  T
Q  391 ccaggaacaagatcaagt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcc 476  Q
    ||| ||||||||||||                |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||  |||||     
T  24657925 ccacgaacaagatcaatagaaaactcaacttccctctctggaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaaatcgcataccacttgtagct 24657826  T
Q  477 tatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaa 576  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  24657825 tatcaatcactgcctgattctcaatagataaagaagccatcaaagaatacatcaaaataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataagaa 24657726  T
Q  577 ctctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatc 676  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||| |||||| | ||||||    
T  24657725 ctctgctccactttcctcttcgacggaagagaaatacactgactgactaaaacaattgatatgaacatggttgtactctacccaattcatatcaagaatc 24657626  T
Q  677 acatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccg 776  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24657625 acatccataccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatctcaaacatacgagagaagtagtcaccg 24657526  T
Q  777 aacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24657525 aacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 24657492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 521 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 11351843 - 11351545
Alignment:
Q  521 gaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgctta---------gtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaat 611  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11351843 gaaaacatcaaaataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttcagctgcttggtagataagaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaat 11351744  T
Q  612 gtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatc 711  Q
      |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  11351743 acactgacttgctaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccaattcatacccagaatcacatccatatcgctcaaaggtagacaaactaaatc 11351644  T
Q  712 catttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11351643 catttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 11351545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 8 - 498
Target Start/End: Original strand, 25255712 - 25256215
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  25255712 cgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacct 25255811  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  25255812 caaatcaattttgctgaacacacgtgcacccactaactgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctattctttatcgtaaccttgttcaac 25255911  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| || | ||| || ||||||||| | |||||||| |  ||||| ||||| ||||| |    
T  25255912 tgacgataatcaatgcataacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgctccc-acggtgaaacacttggtcttacaaatttcttat 25256010  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||| ||||||||     
T  25256011 caagcaagtcctccaactgtttcttcaattcagctaactcgggtgccgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccgagaataagatcaat 25256110  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| || || | |||||||||||| ||||||    
T  25256111 tgcaaattcaacctccctctctggtggcacatctggaatctcatcaggaaaaacttctggaaattcattcacaactggcaacctatcaatcacagcttga 25256210  T
Q  494 ttctc 498  Q
    |||||    
T  25256211 ttctc 25256215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 58 - 747
Target Start/End: Original strand, 23278619 - 23279322
Alignment:
Q  58 gtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaat 157  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||||| || || ||||||||  |||| |||||||| ||||||||   ||||||||||||| |||||||||| |    
T  23278619 gtcttctgcatatccttgtccttcaccttaatttgatggtaacctgacttcaagtcaatcttactaaaaacctttgcacccactaactgatccatcaagt 23278718  T
Q  158 tatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactag 257  Q
     |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||| |     
T  23278719 catcaatcctcggaagtggatacctgttcttgattgtaactttgttcaactgacgatagtcaatgcataacctcatactaccatccttcttctttaccaa 23278818  T
Q  258 caaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagac 357  Q
     || || |||||| |||||||||| || |  ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||    
T  23278819 taataccggcgcttcctaaggtgagacacttggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcctacaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgac 23278918  T
Q  358 atacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaagt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaa 443  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |              ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  23278919 atacgataaggtgacatcgacactggcttcgttcctggaacaaggtcaattgaaaattcaacctccctctctggtggcacatctggaatctcatcaggaa 23279018  T
Q  444 aaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcg 543  Q
    ||||||||||||| |||  ||| || || | ||| |||||||| ||||||||||| |  || ||| | ||||| || |||| |||||  || | ||| ||    
T  23279019 aaacttcaggaaactcattcacaactggcaacctgtcaatcacagcttgattctctaacgacaaatatgccatcaaagaaagcatcagaattctatcacg 23279118  T
Q  544 ttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacg 643  Q
     | ||  | ||| | ||| ||  |||| |  |||||||| |||||||| |||||    ||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||| ||||     
T  23279119 cttcaactactttaactgtttcatagataggaactctgctccactttcttcttccgtagaagaaaaatgcaccgtcttgctaaaacaattgatatgaact 23279218  T
Q  644 tggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaag 743  Q
     |||| ||||||||||||| ||| || | ||| |||| ||| ||  |||| |||| ||||||||| || | |||||| || | ||||||||||||||| |    
T  23279219 cggttatactctaaccagtccatcccaaaaataacatccattcccgtcaacggtaaacaaactaagtcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacg 23279318  T
Q  744 gaca 747  Q
    ||||    
T  23279319 gaca 23279322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 19717667 - 19716851
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || || ||||| || |||||||| || || || || || ||||| |||||||||||||||||||  || ||||| || |||||||| ||    
T  19717667 cgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttgtgcatatcctcatccttcaacttgatctgatggtaacctgacct 19717568  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| ||||||||| |||||||   ||||||||| ||| |||||||||| | |||||| ||| |||||||||| || ||||| || || || |||||||||    
T  19717567 caagtcaatcttgttaaaaacctttgcacccaccaactgatccatcaagtcatcaatcctcagaagtggatatctgttctttatcgtaactttgttcaac 19717468  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || || |||||||| ||||||| ||| ||||| || ||||||||||| | ||| ||  |||||||| | ||||| || |  ||||| ||||||||||| |    
T  19717467 tgacggtaatcaatgcacaacctcatgctaccgtccttcttctttaccaacaacacaagcgctccccacggtgagacacttggtcttacaaacttcttat 19717368  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||| ||||     
T  19717367 caagcaagtcttccaactgtttctttaattcagctaactcggaagctgacatacgataaggtgccatcgacaccgacttcgttcctggaacaaggtcaat 19717268  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              ||||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||  |||||  |||| | | |||||||| ||||||    
T  19717267 tgaaaattcgacctccctctctagtggcacatcaggaatctcattaggaaacacttctggaaattcattcaccattggtaacttgtcaatcacagcttga 19717168  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    || || |  || ||| | |||||||| ||| ||||||  || |||||  |||| ||||| || | ||| || |||||||| |||||  |  |||  || |    
T  19717167 ttttctaacgacaaatatgccattaaagaatacatcagaattccatcatgttctagttgtttgatctgtttcgtagacaagaactcaacttcaccctctt 19717068  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | || || ||||| || | ||| ||||| ||||| ||| ||||  |||| ||||||||||| ||||| || | ||| |||| ||||||  ||||    
T  19717067 cttcagcagatgaaaaatgcaccgtcttactaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccaattcattccaaaaataacatccatacccgtcaa 19716968  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     || | ||||||||| || | |||||| || | ||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  19716967 cggcaaacaaactaagtcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaatggacatctcaagcaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtt 19716868  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || |||||||| |||||    
T  19716867 tcaacaaccatttctcc 19716851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 58 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 19650650 - 19650302
Alignment:
Q  58 gtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaat 157  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||  |||| |||||||| || |||||   ||||||||||||| ||||||| || |    
T  19650650 gtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacttcaagtcaatcttactgaaaacctttgcacccactaactgatccattaagt 19650551  T
Q  158 tatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactag 257  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| || | ||| |||||||| |||||||| ||||     
T  19650550 catcaatcctcggaagtggatacctattctttatcgtaactttgttcaactgacggtaatcaatacataatctcatgctaccatccttcttcttaactaa 19650451  T
Q  258 caaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagac 357  Q
    ||| || ||||||||| |||||||||| |  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||    
T  19650450 caacaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgac 19650351  T
Q  358 atacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    |||||||||||||||||||| || | ||| ||||| |||||||| ||||    
T  19650350 atacgataaggtgccatcgacaccgactttgttcctggaacaaggtcaa 19650302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 23098668 - 23097852
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || || ||||| || ||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| ||    
T  23098668 cgaaaggcatcaccttctattcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcacctttatctgatggtatcctgacct 23098569  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||| |||||||    |||||| || ||| |||||||||| |  ||||| ||| |||| |||||||| ||||| || || || |||||||||    
T  23098568 caagtcaatcttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaatcctcagaagcggatacctgttctttatcgtcactttgttcaac 23098469  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || || || || || ||||| | ||| |||||||| ||||||||||| | ||| |  ||||||||| | || || || | |||||| |||| |||||| |    
T  23098468 tgacggtagtctatgcacaatctcatgctaccatccttcttctttaccaacaacataggcgctccccacggcgagacactcggtcttacaagcttcttat 23098369  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||  ||||| || || ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  |||||||| ||||     
T  23098368 caagcacgtcttccaactgtttcttcaattcagccaactccgatgctgacatacgatatggtgccatcgacaccggcttcgttcttggaacaaggtcaat 23098269  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              |||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||  ||| |||||||  || |||||||| || |||    
T  23098268 tgaaaactccacctccctctccggtggcacatcagggatctcatcaggaaacacctcagggaattcattcactaccggtaatctgtcaatcacagcctga 23098169  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||| |  || ||||| ||||| || ||| ||||||  || ||||| ||||| |  ||||||| ||| || |||| ||| || ||  | ||||  || |    
T  23098168 ttctccaacgacaaagatgccatcaaagaatacatcagaattccatcacgttctaactgcttcatctgtttcgtagtcaagaattcaactccaccctctt 23098069  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||| ||||  |||| ||||||| ||||||||| || | ||| |||| ||||||  ||||    
T  23098068 cttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttgctaaaacaattgatatgaacacggttatactctacccagttcattccaaaaatgacatccatacccatcaa 23097969  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     |||||||| ||||| || |   ||||||| | |||||||||||| | ||||||  ||||||| || |||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  23097968 cggtagacacactaagtcgaccacaaaatctctaccaaacatagatataggacacctcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtt 23097869  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || ||||||||||||||    
T  23097868 tcaacaaccatctctcc 23097852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 614 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 23029491 - 23029295
Alignment:
Q  614 actgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatcca 713  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23029491 actgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtattccaaccagttcatacccagaatcacatccataccgctcaaaggtagacaaactaaatcca 23029392  T
Q  714 tttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23029391 tctcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatctcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggattttcgacaaccatcactcc 23029295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 644 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 45674012 - 45673846
Alignment:
Q  644 tggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaag 743  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45674012 tggttgtactctaaccaattcatacccagaatcacatccataccgctcaaaggtagacaaactaaattcatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaa 45673913  T
Q  744 gacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45673912 gacatctcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 45673846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 460
Target Start/End: Original strand, 23112529 - 23112998
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || || || || |||| |||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||    
T  23112529 cgaaagacatcactttatattcataatgtccatatcgcgtcctaaaggccgttttctacatatcttcatctttcaccttaatctgatggtaacccgacct 23112628  T
Q  108 caaatca---atcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttc 204  Q
    |||||||   |||||||| || |  ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || || || |||    
T  23112629 caaatcatcaatcttgctgaatatgcgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctttatcgtcactttattc 23112728  T
Q  205 aactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttct 304  Q
    |  || |||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||| || | ||| || |||||  || ||| |||||| | |||||| ||||||||||    
T  23112729 agttgacgataatctatacacaacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccggcgcatcccaagttgaaacactcggtcttacaaacttct 23112828  T
Q  305 tctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc 404  Q
    | ||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||| || || |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||    
T  23112829 tatcaagtaaatcctccaattgtttcttcaactcagctaactcagacgccgacatacggtaaggcgccatcgacacaggcttcgtacccggaacaagatc 23112928  T
Q  405 aagt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattca 460  Q
    || |              ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  23112929 aattgtaaattcaacttccctctctagaggcacatcaggaatctcatcaggaaagacttctggaaattca 23112998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 495
Target Start/End: Original strand, 31832451 - 31832952
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || || || || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||    
T  31832451 cgaaaggcatcaccttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacct 31832550  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgt-gcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 206  Q
    |||||||||||| ||||||| || | ||||| || ||  |||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  31832551 caaatcaatcttactaaaaa-tcttagcaccaaccaattgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttcttgatcgtaactttgttcaa 31832649  T
Q  207 ctgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttc 306  Q
    ||| || ||||| |||||||  | |||||||||||| || |||||||| | ||| || || |||||| |||||||||| |  ||||| |||||||||||     
T  31832650 ctgacggtaatctatacacagtctcatactaccatcctttttctttaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaacttctta 31832749  T
Q  307 tcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    || | || ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  31832750 tctaacaggtcctccaactgtttcttcaactcagccaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggcttagttcctggaacaagatcaa 31832849  T
Q  407 gt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttg 492  Q
     |              |||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||||  | ||||||||| |||||    
T  31832850 ttgaaaattcaacctccctctccggtggcacatcaggaatctcatcagggaaaacttctggaaattcattcactaccggtaaaccatcaatcacagcttg 31832949  T
Q  493 att 495  Q
    |||    
T  31832950 att 31832952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 12576146 - 12576962
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || || || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  12576146 cgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatctttcaccttaatttggtggtaacctgacct 12576245  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||| || || ||   ||||||||||| | | |||||||| | |||||| |||||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||     
T  12576246 caagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatcaatcctcggaagcggatatctattcttaattgtaactttgttcaat 12576345  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| || ||||| || | ||| || || |||||| | || ||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  12576346 tgacgatagtcaatgcacaacctcatactaccatcctttttcttcaccaacaacacaggtgctccccacggcgaaacactgggtcttacaaacttcttat 12576445  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||| || || ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||| ||| ||||     
T  12576446 caagtaaatcttccaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggctttgttccaggaataaggtcaat 12576545  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              ||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || || ||||| |||  |||||| | |||| | |||||||| |||||     
T  12576546 tgaaaactccacctccctttctggcggcacatcaggaatctcatcagggaacacctccggaaactcattcaccactgctagcttgtcaatcacagcttgg 12576645  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    || || |  || | | | |||||||  ||||||||||  || ||||| ||||| |  ||||||| |||||| ||||| ||||  ||  | ||||| || |    
T  12576646 ttttctaacgacagatatgccattagagaaaacatcagaattccatcacgttctaactgcttcatctgctttgtagataaaatttcaactccactctctt 12576745  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||| ||||| || | |||| |||| ||||| ||| ||||  |||| ||||||||||| ||||| || | ||| |||| ||| ||  ||||    
T  12576746 cttcagcagaagaaaaatgcacagtcttgttaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccaattcatcccaaaaataacatccatccccgtcaa 12576845  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     |||| ||| ||||| || | ||||||||| | |||||||||||| |  |||||  |||| || || |||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  12576846 cggtaaacacactaagtctacttcaaaatctctaccaaacatagaaattggacacctcaagcaaaccagagaagtagtcattgaacccttagctggagtt 12576945  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || |||||||| |||||    
T  12576946 tcaacaaccatttctcc 12576962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 495
Target Start/End: Original strand, 1065544 - 1066045
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || ||    
T  1065544 cgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcacctttatctgatgataaccagacct 1065643  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgt-gcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 206  Q
    |||||||||||| || |||| || | ||||| || ||| |||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  1065644 caaatcaatcttactgaaaa-tcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttcttgatcgtaactttgttcaa 1065742  T
Q  207 ctgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttc 306  Q
    ||| || ||||| |||||||  | |||||||||||| ||||||||||| | ||| || || |||||| |||| ||||| |  ||||| |||||||||||     
T  1065743 ctgacggtaatctatacacagtctcatactaccatccttcttctttaccaacaacaccggtgctccccaaggcgaaacactgggtcttacaaacttctta 1065842  T
Q  307 tcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    || | || |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||| |||||    
T  1065843 tctaacaggtcctccaactgcttcttcaactcagctaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggcttagttcctggaacaacatcaa 1065942  T
Q  407 gt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttg 492  Q
     |              ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||  ||| || |||| || ||||||||| |||||    
T  1065943 ttgaaaattcaacctccctctctggtggcacatcaggaatctcttcaggaaacacttccggaaattcattcactacgggtaacccatcaatcacagcttg 1066042  T
Q  493 att 495  Q
    |||    
T  1066043 att 1066045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 24818880 - 24818637
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| |||  |||||| || || |||||||| || || || || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  24818880 cgaaaggcatcactgaatattcgtaatgtccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 24818781  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  24818780 caaatcaatcttgctgaatacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcagttcttggaagtggatacctattctttatcgttaccttattcaac 24818681  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctt 251  Q
    || ||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||    
T  24818680 tgtcgataatcaaggcataacctcatactaccatctttcttctt 24818637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Original strand, 23189711 - 23189879
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||| | ||    
T  23189711 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctagtgataacctaacct 23189810  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    ||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23189811 caagtcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaaccgatccatcaaatcatcaattctcggaagtgg 23189879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 406
Target Start/End: Original strand, 27789533 - 27789931
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || || || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||    
T  27789533 cgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatctttcaccttaatttgatggtaacctgacct 27789632  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||| || || ||   ||||||||||| | | |||||||| | |||||| |||||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||     
T  27789633 caagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatcaatcctcggaagcggatatctattcttaattgtaactttgttcaat 27789732  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| || ||||| || | ||| || || |||||| | || ||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  27789733 tgacgatagtcaatgcacaacctcatactaccatcctttttcttcaccaacaacacaggtgctccccacggcgaaacactgggtcttacaaacttcttat 27789832  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    |||| || || ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  27789833 caagtaaatcttccaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggctttgttccgggaacaaggtcaa 27789931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 417 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 24818067 - 24817674
Alignment:
Q  417 gaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccat 516  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||  | || || ||||| ||  ||| | ||||||| ||||||||||||||||| || || || |||||    
T  24818067 gaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttctaggaagtcgcacacaacttgtaacttatcaattactgcttgattctcaactgacaaggacgccat 24817968  T
Q  517 taatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtact 616  Q
     || ||||| || || || ||||| || || |  || ||||| || ||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||  |||| ||||  ||     
T  24817967 caaagaaaatattaaaattccatcacgctctaactgtttcagttgattagtagacaagaactctgctgcactctcttcttcgacaaaagaaaaatacacc 24817868  T
Q  617 gacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccattt 716  Q
    |||||  || ||||||||||  |||| |||||  |||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| | ||||||||| | |||||| ||||| || |    
T  24817867 gacttattataacaattaatgtgaacatggttacactccaaccagttcataccaagaattacatccattctactcaaaggcaaacaaaccaaatcaatct 24817768  T
Q  717 caaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||||||||| | | ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24817767 caaaatctctaccaaacatagataaaggacatcttagacacactagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatttctcc 24817674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 58 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 30010784 - 30010436
Alignment:
Q  58 gtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaat 157  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| || || || || || || || || |||||||||||| ||||||||||||    
T  30010784 gtcttctgaatatcctcatctttcactttaatctggtgatagcctaatcttaagtccattttactgaacacacgcgcacccactaacggatccatcaaat 30010685  T
Q  158 tatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactag 257  Q
      || || ||||||||||||||| ||||||| || || || || || |||||     |||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||| || |     
T  30010684 cgtcgatcctcggaagtggatacttattctttattgtcactttatttaactgttagcaatctatacataacctcatgctaccatctttcttcttaaccaa 30010585  T
Q  258 caaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagac 357  Q
     || || || |||||| |||||||||| |  ||||| ||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||    
T  30010584 taacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaattttttatcaagcaaatcttctaactgttttttcaactcagctaattcggaagctgac 30010485  T
Q  358 atacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    ||| | ||||||||||| ||||  |||||||| || |||| ||||||||    
T  30010484 atatggtaaggtgccatagaaataggcttcgtacccggaataagatcaa 30010436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 77 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 24829769 - 24829481
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||| ||| ||||||| |||||  |||||||| |||||||||| ||||| ||   |||||| |||| | |||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  24829769 cctttactctaatctgatgatattctgatctctaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 24829670  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaa 276  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| || | ||| ||||| || ||| |     
T  24829669 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccat 24829570  T
Q  277 ggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgata 365  Q
    || ||||| | |||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||| || ||||| |||   ||||| || |||||||| |||||    
T  24829569 ggcgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgatttttcaattcacccaactctgatgcagacatccgata 24829481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 58 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 30209517 - 30209169
Alignment:
Q  58 gtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaat 157  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || || || || || |||||||||||| ||||||||||||    
T  30209517 gtcttctgaatatcctcatctttcactttgatctggtgatagcctgaccttaactcaattttactgaacacacgcgcacccactaactgatccatcaaat 30209418  T
Q  158 tatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactag 257  Q
      || || ||||||||||||||| ||||||| || || || || || ||||| |  ||||| ||||| |||| ||| | ||||||||||||||| || |     
T  30209417 cttcgatcctcggaagtggatacttattctttattgtcactttatttaactgtcagtaatctatacataacctcatgcgaccatctttcttcttaaccaa 30209318  T
Q  258 caaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagac 357  Q
     || |  ||||||||| | || || || | |||||| |||||||| || |||||||| || |  ||||| || |||||||||| ||| |||||||| |||    
T  30209317 taacatcggcgctccccagggcgatacactcggtcttacaaactttttatcaagcaaatcttttaactgctttttcaactcagctaattcggaagctgac 30209218  T
Q  358 atacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    ||||| |||||||||||  |||  |||||||| || |||| ||||||||    
T  30209217 atacggtaaggtgccatataaataggcttcgtacccggaataagatcaa 30209169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 301 - 406
Target Start/End: Original strand, 16924063 - 16924168
Alignment:
Q  301 ttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaa 400  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  16924063 ttcttctcaagcaagtcttctaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggcgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaa 16924162  T
Q  401 gatcaa 406  Q
    ||||||    
T  16924163 gatcaa 16924168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 88 - 335
Target Start/End: Original strand, 22279978 - 22280225
Alignment:
Q  88 atctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattct 187  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||| | |||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||    
T  22279978 atctgatgatatccagatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 22280077  T
Q  188 tgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcc 287  Q
    | || || ||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| || | ||| ||||| || ||| | || ||||| |     
T  22280078 taatcgtcaccttgttcaattgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagccccccacggcgaaacact 22280177  T
Q  288 cggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaa 335  Q
     ||||||| ||||| ||||| |||||| || || || |||||||||||    
T  22280178 tggtctaataaactgcttctgaagcaactcttctaattgtttcttcaa 22280225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 77 - 379
Target Start/End: Original strand, 25130471 - 25130773
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||   ||||| || |   ||||||| |||| |||||| |||||||| ||    
T  25130471 ccttcactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacttccgcaccaaccagttgatccataaaatcatcaatcctcggaagcgg 25130570  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaa 276  Q
    ||||| |||||| || || |||| |||||||||||||||||| | || ||||| ||| || |||||||||||||| || | ||| ||| | || ||| |     
T  25130571 ataccgattcttaatcgtcacctagttcaactgccgataatccacactcaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactagagcaccccac 25130670  T
Q  277 ggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcg 376  Q
    || ||||| |  || |||| ||||| |||||||||||| || || ||||| |||||||| |||   ||||| || |||||||| ||||| || || ||||    
T  25130671 ggagaaacacttggcctaataaactgcttctcaagcaactcttctaactgcttcttcaattcacccaactctgatgcagacatccgatacggcgcaatcg 25130770  T
Q  377 aaa 379  Q
    |||    
T  25130771 aaa 25130773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 623 - 804
Target Start/End: Original strand, 19817269 - 19817450
Alignment:
Q  623 ctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaat 722  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||  | || |||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| || | ||| ||||| |||| | ||||||    
T  19817269 ctaaaacaattaatatgaacatagttaaattccaaccagttcatacctagtatcacatccatcccactcaacggcaaacagactaagtccactgcaaaat 19817368  T
Q  723 cacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 804  Q
    | | |||||| || ||||||||| | ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||    
T  19817369 ctctaccaaatatcgacaaaggaaacttcaagcatactagagaagtagtcaccgaacccttagccgggtttttgacaaccat 19817450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 602 - 810
Target Start/End: Original strand, 23113124 - 23113332
Alignment:
Q  602 gaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagac 701  Q
    ||||| |||||||  | ||| ||||||||||| |||  |||  |||| ||||||||||||||||| || |  || |||| ||||||  |||| || | ||    
T  23113124 gaagaaaaatgtatcgtcttactaaaacaatttatataaacacggttatactctaaccagttcatcccaaagattacatccatacccgtcaacggcaaac 23113223  T
Q  702 aaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaac 801  Q
    | |||| ||| | ||||||||| | ||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||| |||||    
T  23113224 atactagatcaacttcaaaatctctaccaaacatagacaatggacaactcaaacaaacgagagaagtagttactgaacccttagttggagtttcaacaac 23113323  T
Q  802 catctctcc 810  Q
    ||| |||||    
T  23113324 catttctcc 23113332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 24568249 - 24568075
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| || | |  |||||| |||| |||||| || |||||  |    
T  24568249 ccttcactctaatatgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaaccagctaatccattaaatcatcaatccttggaagcag 24568150  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctt 251  Q
    ||||| |||||| || || || |||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  24568149 ataccgattcttaatcgtcactttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttctt 24568075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 619 - 804
Target Start/End: Original strand, 23274011 - 23274196
Alignment:
Q  619 cttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttca 718  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||  |||| ||||||||||||| ||| || | ||| |||| ||| ||  |||| |||| ||||||||| || | ||||    
T  23274011 cttgctaaaacaattgatatgaactcggttatactctaaccagtccatcccaaaaataacatccattcccgtcaacggtaaacaaactaagtcgacttca 23274110  T
Q  719 aaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 804  Q
    || || | ||||||||||||||| |||||  | | ||| || |||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23274111 aagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccat 23274196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 754 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 22742856 - 22742800
Alignment:
Q  754 acatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22742856 acatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 22742800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22760150 - 22759894
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||||| ||||  ||   |||||| || | | |||||||||||| |||||| || ||||| ||    
T  22760150 ccttcactctaatatgatgatatcttgatctcaaatcaatcttactaagcacctctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagcgg 22760051  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaa 276  Q
     |||| |||||| || ||  | || ||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| || | ||| ||||| || ||| |     
T  22760050 gtaccgattcttaatcgtcccattcttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccat 22759951  T
Q  277 ggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaa 335  Q
    || ||||  | ||| || | ||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  22759950 ggagaaa--cacggcctgataaactgcttctcaagcaactcttccaactgcttcttcaa 22759894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 111 - 176
Target Start/End: Original strand, 23611069 - 23611134
Alignment:
Q  111 atcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23611069 atcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaaccgatccatcaaatcatcaattctcggaagtgg 23611134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 623 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 30208941 - 30208760
Alignment:
Q  623 ctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaat 722  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||  | || ||  |||||||||| || ||||||| ||| |||||||| || | ||| ||||| |||| | ||||||    
T  30208941 ctaaaacaattaatatgaacatagttaaattccaattagttcatacctagtatcacatccatcccactcaatggcaaacagactaagtccactgcaaaat 30208842  T
Q  723 cacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 804  Q
    | | | ||||||| ||||||||||| || || || || ||| || |||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  30208841 ctctatcaaacatcgacaaaggacactttaagcacactagaaaattagtcaccgaaccctttgccggggtttcgacaaccat 30208760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Original strand, 24950383 - 24950503
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || || ||||| || |||||||| || || || || || |||||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||    
T  24950383 cgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatcctttaccttaatctgatggtaacctgacct 24950482  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaac 128  Q
    ||| |||||||| ||||||||    
T  24950483 caagtcaatcttactaaaaac 24950503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 761 - 810
Target Start/End: Original strand, 23064973 - 23065022
Alignment:
Q  761 agagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23064973 agagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgataaccatctctcc 23065022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 24818233 - 24818092
Alignment:
Q  265 ggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgat 364  Q
    ||||||||| |||||||||| |  ||||| ||||||||||| |||||||| || |  || | ||||||||| || |  ||||| ||||| |||||||| |    
T  24818233 ggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaacttcttatcaagcaaatcttgtaattatttcttcaattcggccaactcagaagctgacatacggt 24818134  T
Q  365 aaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    |||| | ||| || || |||||||| || |||||||||||||    
T  24818133 aaggcgtcatagacacaggcttcgtacccggaacaagatcaa 24818092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 698 - 804
Target Start/End: Original strand, 20848086 - 20848192
Alignment:
Q  698 agacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcga 797  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||| | ||||||   || ||| || |||||| | || || |||||||||||||||||||| |    
T  20848086 agacaaactaaatcaatcacaaaatctctaccaaacatagatataggacaccgcagacaaacaagagaagtggttactgaacccttagctggagtttcaa 20848185  T
Q  798 caaccat 804  Q
    |||||||    
T  20848186 caaccat 20848192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 409 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 30010419 - 30010302
Alignment:
Q  409 cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaa 508  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||| || || |||||  | | | |||||||||| ||||||||||||| ||| ||     
T  30010419 cctctctggcggcacatcaagaatttcatcagggaaaacttctggaaactcgcataccacttgcaacttatcaatcaccgcttgattctcaatagacaag 30010320  T
Q  509 gaagccattaatgaaaac 526  Q
    || ||||| || ||||||    
T  30010319 gacgccatcaaagaaaac 30010302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 409 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 30209152 - 30209061
Alignment:
Q  409 cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaa 500  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |||||  | | | ||||||||||  ||||||||||||    
T  30209152 cctctctggcggcacatcaggaatttcatcagggaaaacttctggaaactcgcataccacttgcaacttatcaatcaccacttgattctcaa 30209061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 410 - 439
Target Start/End: Original strand, 16927569 - 16927598
Alignment:
Q  410 ctctctggaggcacatcaggaatctcatct 439  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16927569 ctctctggaggcacatcaggaatctcatct 16927598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 655; Significance: 0; HSPs: 68)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 655; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Original strand, 18858807 - 18859621
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18858807 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgtcctgaaagccgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctca 18858906  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18858907 aatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttccactg 18859006  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  18859007 ccgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctca 18859106  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-- 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||       
T  18859107 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataacttggaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttctaggaacaagatcaatag 18859206  T
Q  408 -----------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
               || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18859207 aaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacaccccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 18859306  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18859307 ctcaacagataaagaagccatcaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagttgacaaaaactctgcaccactttcctct 18859406  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  18859407 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacttccataccgctcaaag 18859506  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18859507 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttc 18859606  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||    
T  18859607 gacaaccatctctcc 18859621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 650; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 17672576 - 17671759
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  17672576 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatct 17672477  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17672476 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 17672377  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  17672376 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacactcggtctaacaaacttcttct 17672277  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttcca-ggaacaagatcaa 406  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  17672276 caagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaaggaacaagatcaa 17672177  T
Q  407 g-------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttg 492  Q
                  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17672176 tagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatcactgcttg 17672077  T
Q  493 attctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcc 592  Q
    |||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17672076 attctcaatagataaagtagccatcaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcc 17671977  T
Q  593 tcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactca 692  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  17671976 tcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccataccactca 17671877  T
Q  693 aaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagt 792  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17671876 aaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagt 17671777  T
Q  793 ttcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17671776 ttcgacaaccatctctcc 17671759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 625; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 811
Target Start/End: Complemental strand, 19482617 - 19481808
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19482617 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcctttactttaatctggtgataacctgatct 19482518  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19482517 caaatcaatcttgctgaaaactcgcgcacccactaactgatccatcaa--------ttctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 19482426  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||| | |    
T  19482425 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttccttt 19482326  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||     
T  19482325 cgagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataattctgaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggtttcgttccaggaacaagatcaat 19482226  T
Q  408 -------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19482225 agaaaactcgacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 19482126  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19482125 ttctcaacagataaagaagccatcaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcct 19482026  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19482025 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtgattgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccataccactcaa 19481926  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  19481925 aggtaggcaaactaaatccatttcaaaatcacgactaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtaagcaccgaacccttagctggagtt 19481826  T
Q  794 tcgacaaccatctctccg 811  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19481825 tcgacaaccatctctccg 19481808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 625; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 20016816 - 20016000
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||    
T  20016816 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcctttaccttaatctggtgataacctgacct 20016717  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20016716 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 20016617  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  20016616 tgtcgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccgacgctccccaaggtgaaacactcggtctaacaaacttcttct 20016517  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  20016516 caagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaat 20016417  T
Q  408 -------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  20016416 agaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaagaaattcacacaccaccggtaacctatcaatcaccgcttga 20016317  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20016316 ttctcaatagatatagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcct 20016217  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  20016216 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccataccactcaa 20016117  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20016116 aggtagacaaactaaacccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtt 20016017  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  20016016 tcgacaaccatctctcc 20016000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 619; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 22118726 - 22117912
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22118726 aaaggcataactttatattcaaagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctacatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctca 22118627  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22118626 aatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 22118527  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  22118526 ccgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctca 22118427  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-- 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||       
T  22118426 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgcgatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaatag 22118327  T
Q  408 -----------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
               || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22118326 aaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaagacttcaggaaaatcacacaccaccggtaacctatcaatcactgcttgatt 22118227  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  22118226 ctcaaaagataaagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactccgcaccactttcctct 22118127  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  22118126 tcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataaaaatgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccataccgctcagag 22118027  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22118026 gtagacaaactaaatccatttcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttc 22117927  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||    
T  22117926 gacaaccatctctcc 22117912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 619; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 22127510 - 22126696
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22127510 aaaggcataactttatattcaaagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctacatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctca 22127411  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22127410 aatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 22127311  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  22127310 ccgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctca 22127211  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-- 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||       
T  22127210 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagaaatacgataaggtgcgatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaatag 22127111  T
Q  408 -----------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
               || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22127110 aaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaagacttcaggaaaatcacacaccaccggtaacctatcaatcactgcttgatt 22127011  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22127010 ctcaaaagataaagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcctct 22126911  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||    
T  22126910 tcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccataccgctcagag 22126811  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  22126810 gtagacaaactaaatccatttcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtaatcaccgaacccttagctggagtttc 22126711  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||    
T  22126710 gacaaccatctctcc 22126696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 538; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 30311697 - 30310881
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30311697 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataccctgatct 30311598  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30311597 caaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattatcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 30311498  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| |||||||    
T  30311497 tgacgatagtcaatacacaatctcatgctatcatctttcttctttactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaatttcttct 30311398  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa- 406  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  30311397 caagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagctaactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccaggaacaagatcaat 30311298  T
Q  407 -------------gtcctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  30311297 agaaaactcaacttccctctctggaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttcgggaaagtcgcataccacttgtagcttatcaatcactgcttga 30311198  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  30311197 ttctcaatagataatgaagccatcaacgaaaacatcaaaataccatcgcgttccatttgcttcagctgcttagtagataagaactctgcaccactttcct 30311098  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  30311097 cttcagcggaagagaaatacactgacttgctaaaacaattgatatgaacatggttgtactctaaccaattcatacccagaatcacatccataccgctcaa 30310998  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  30310997 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatcgcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtc 30310898  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  30310897 tcgacaaccatctctcc 30310881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 517; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 21165091 - 21164275
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  21165091 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataccgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatct 21164992  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21164991 caaatcaatcttgctgaaaatgcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttactttgttcaac 21164892  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  21164891 tgacgataatcgatacacaacctcatactaccatctttcttcttcactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttct 21164792  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc--- 404  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||       
T  21164791 caagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagctaactcggaagctgatatacgataaggtgccatcgacaccggctccgttccaggaataagatcaat 21164692  T
Q  405 ----aagtc-------ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
        || ||       |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  21164691 agaaaactcaacttctctctctagaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaaatcgcacaccacttgtagcttatcaatcactgcttga 21164592  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21164591 ttctcaatagataaggaagccatcaaagaaaacatcaaaatatcatcgcgttccaattgcttcagctgcttagtagacaagaactctgcaccactttcct 21164492  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21164491 cttcgactgaggagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtattccaaccagttcatacccagaatcacatccataccactcaa 21164392  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  21164391 aggtagacaaactaagtccatctcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatctcaaacatacgagagaagtagtcactgaacccttagctggagtt 21164292  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  21164291 tcgacaaccatctctcc 21164275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 503; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Original strand, 19980197 - 19981011
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19980197 aaaggcataactttatattcatagtgaccatacagtgttctgaaagttgtcttctacatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctca 19980296  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19980297 aatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttactttgttcaactg 19980396  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
     || ||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  19980397 acggtaatcgatacataatctcatactaccatctttcttctttactaacaaaacgggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctca 19980496  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatca---- 405  Q
    ||||| || || ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||        
T  19980497 agcaaatcttctaaccgtttcttcaactcagctaactcggaagctgacatacgataaggtgccatcgacacgggcttcgttccaggaacaagatcattag 19980596  T
Q  406 ---agtc-------ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
       | ||       |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  19980597 aaaactcaacttctctctctggagacacatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaaatcgcataccacttgtagcttatcaatcactgcttgatt 19980696  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||| |||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19980697 ctcaatagataaggaagccatcaaggaaaacatcaaaataccatcccgttccagttgcttcagctgcttggtagacaagaactctgcaccactttcctct 19980796  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    |||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  19980797 tcgacggaggagaaatacactaacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtattccaaccagttcatacccagaatcacatccataccgctcaagg 19980896  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19980897 gtagacaaactaaatccatctcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttc 19980996  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||    
T  19980997 gacaaccatctctcc 19981011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 502; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 32602373 - 32603189
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  32602373 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatctttcaccttaatctggtgataccctgatct 32602472  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32602473 caaatcaatcttgctgaaaacttttgcaccctctaactgatccatcaaatcatcaattctcggtagtggatacctattcttgatagttactttgttcaac 32602572  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |    
T  32602573 tgacgatagtcaatacacaacctcatgctactatctttcttctttactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaatttctttt 32602672  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa- 406  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  32602673 caagcaaatcatctaactgtttcttcaactcagctaactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccaggaacaagatcaat 32602772  T
Q  407 -------------gtcctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                   ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || || |||||  | ||  |||||||||| ||||||    
T  32602773 agaaaattcgacttccctttctggaggcacatcaggaatttcatttggaaaaacttcaggaaagtcgcataccacttgaagattatcaatcacagcttga 32602872  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  32602873 ttctcaatagataaagaagccatcaacgaaaacatcaaaataccatcgcgttccatttgcttcagctgtttagtagataagaactctgcaccaccttcct 32602972  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  32602973 cttcagcggaagagaaatacactgacttgctaaaacaattgatatgaacatggttgtactctaaccaattcatacccagaatcacatccataccgctcaa 32603072  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32603073 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacaaccaaacatagacaaaggacatcgcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtt 32603172  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  32603173 tcgacaaccatctctcc 32603189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 497; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 22042055 - 22042871
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  22042055 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacacgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatct 22042154  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||   |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22042155 caaatcaatcttgctgaaaactttcgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 22042254  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |  ||||||||||| |||||||    
T  22042255 tgacgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcttcactagcaaaactggcgctccccaagttgaaacacttggtctaacaaatttcttct 22042354  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa- 406  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  22042355 caagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagctaactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccaggaacaagatcaat 22042454  T
Q  407 ---------gtcctctct----ggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
             | | |||||    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| || || |||||  ||||| | ||||||||| |||||    
T  22042455 agaaaactcgacttctctcttaggaggcacatcaggaatttcatctaaaaaaacttcaggaaaatcgcataccacttgtagcttgtcaatcactacttga 22042554  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  22042555 ttctcaatagataaagaagccaacaacgaaaacatcaaaataccatcgcgttccatttgcttcagctgcttagtagttaagaactctgcaccactttcct 22042654  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  ||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||  ||||    
T  22042655 cttcagcggaagagaaatacactaacttgctaaaacaattgatatgaacatggttgtattctaaccaattcatacctagaatcacatccataccgttcaa 22042754  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22042755 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatcgcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtt 22042854  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  22042855 tcgacaaccatctctcc 22042871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 494; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 15535611 - 15536427
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15535611 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgataactgttttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataccctgatct 15535710  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15535711 caaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttactttgttcaac 15535810  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| || || |    
T  15535811 tgacgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcttcactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaatttatttt 15535910  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa- 406  Q
    | ||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  15535911 cgagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagctaactcggaagcagacatacgatatggtgccatcgacaccggcttcgttccaggaacaagatcaat 15536010  T
Q  407 -------------gtcctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||  |||||||| ||||||||    
T  15536011 agaaaactcgacttccctttctggaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaagtcgcacaccacttgaagattatcaatcgctgcttga 15536110  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  15536111 ttctcaatagataaagaagccatcaacgaaaacatcaaaataccatcgcgttccatttgcttcagctgcttagtagataagaactctgcaccactttcct 15536210  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||| |||||    
T  15536211 cttcagcggaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccaattcgtacccaaaatcacattcataccgctcaa 15536310  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15536311 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaatatagacaaaggacaacgtaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtt 15536410  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  15536411 tcgacaaccatctctcc 15536427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 462; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 211 - 810
Target Start/End: Original strand, 19114831 - 19115444
Alignment:
Q  211 cgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  19114831 cgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaa 19114930  T
Q  311 gcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag--- 407  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||        
T  19114931 gcaagtcttctaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttctaggaacaagatcaataga 19115030  T
Q  408 ----------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattc 496  Q
              || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  19115031 aaattcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctgtcaatcactgcttgattc 19115130  T
Q  497 tcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctctt 596  Q
    |||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19115131 tcaatagatacagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcctctt 19115230  T
Q  597 cgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaagg 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  19115231 cgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccataccactcaaagg 19115330  T
Q  697 tagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcg 796  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  19115331 tagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcactgaacccttagctggagttttg 19115430  T
Q  797 acaaccatctctcc 810  Q
    ||||||||||||||    
T  19115431 acaaccatctctcc 19115444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 21392414 - 21391598
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  21392414 cgaaaggcataactttgtactcatagtgaccataccgcgctctgaaagttgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatct 21392315  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  21392314 caaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatcctcggaagtggatacctattctttattgtcaccttgttcaac 21392215  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |  |||||||||||||| ||||    
T  21392214 tgtcgatagtcaatacacaatctcatgctaccttctttcttcttcactagcaaaaccggcactccccaaggtgaaacactgggtctaacaaactttttct 21392115  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||   |||  |||||||||||||||| ||| || || |||||| ||||||||||||||||||     
T  21392114 caagcaagtcctctaattgtttcttcaactcggccaacttataagttgacatacgataaggtgtcatagacacaggcttcattccaggaacaagatcaat 21392015  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                   |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  21392014 caaaaactcaacttccctctctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttctggaaaatcgcacaccacttgtagcttatcaatcactgcttga 21391915  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21391914 ttctcaatagataaggaagccatcaaagaaaacatcaagataccatcacgttctaactgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 21391815  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    | ||  | |||||| |||  || ||||| ||| || |||||||  |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21391814 cctcagcagaagagtaatacaccgacttactataataattaatgtgaacatggttgtattccaaccagttcatacccagaatcacatccataccactcaa 21391715  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  21391714 aggtagaaaaactaaatccatctcaaaatcacgatcaaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtggtcaccgaacccttagctggagtt 21391615  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || |||||||| |||||    
T  21391614 tcaacaaccatttctcc 21391598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 21786908 - 21786092
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  21786908 cgaaaggcataactttgtactcatagtgaccataccgcgctctgaaagttgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatct 21786809  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  21786808 caaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatcctcggaagtggatacctattctttattgtcaccttgttcaac 21786709  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |  |||||||||||||| ||||    
T  21786708 tgtcgatagtcaatacacaatctcatgctaccttctttcttcttcactagcaaaaccggcactccccaaggtgaaacactgggtctaacaaactttttct 21786609  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||   |||  |||||||||||||||| ||| || || |||||| ||||||||||||||||||     
T  21786608 caagcaagtcctctaattgtttcttcaactcggccaacttataagttgacatacgataaggtgtcatagacacaggcttcattccaggaacaagatcaat 21786509  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                   |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  21786508 caaaaactcaacttccctctctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttctggaaaatcgcacaccacttgtagcttatcaatcactgcttga 21786409  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21786408 ttctcaatagataaggaagccatcaaagaaaacatcaaaataccatcacgttctaactgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 21786309  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    | ||  | |||||| |||  || ||||| ||| || |||||||  |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21786308 cctcagcagaagagtaatacaccgacttactataataattaatgtgaacatggttgtattccaaccagttcatacccagaatcacatccataccactcaa 21786209  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  21786208 aggtagaaaaactaaatccatctcaaaatcacgatcaaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtggtcaccgaacccttagctggagtt 21786109  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || |||||||| |||||    
T  21786108 tcaacaaccatttctcc 21786092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 21253172 - 21253989
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  21253172 cgaaaggcataactttgtactcatagtgaccataccgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatct 21253271  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  21253272 caaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcgaaagttgatacctattctttattgtcaccttgttcaac 21253371  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| |||||| |||| | ||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||| ||||    
T  21253372 tgtcgatagtcaataaacaatctcatgctaccatctttcttcttcacaagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaactttttct 21253471  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa- 406  Q
    | ||||| ||||| || |||||||||||||| |  |||||  |||| |||||||||||||||| ||| || ||  ||||||||||||||||||||||||     
T  21253472 cgagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcaaaagctgacatacgataaggtgtcatagacacatgcttcgttccaggaacaagatcaat 21253571  T
Q  407 -------------gtcctctctggaggcacatcaggaa-tctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttg 492  Q
                   ||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||| ||||| || || |||||  ||||  || ||||||| |||||    
T  21253572 cgaaaactcaacttccctctctggaggcacatcaggaattgtcattaggaaaaacttctggaaaatcgcataccacttgtagtttaccaatcaccgcttg 21253671  T
Q  493 attctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcc 592  Q
    |||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21253672 attctcaatagataaggaagccatcaaagaaaacatcaaaatgccatcacgttccaactgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcgccactttcc 21253771  T
Q  593 tcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactca 692  Q
    |||||  | ||||||||||  |  ||||| ||| ||||||||||  |||| |||||||| || |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  21253772 tcttcagcagaagagaaatacagcgacttactataacaattaatgtgaacatggttgtattccaaccagctcataccaagaatcacatgcataccactca 21253871  T
Q  693 aaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagt 792  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21253872 aaggtagacaaaccaaatccatctcaaaatcacgatcaaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagt 21253971  T
Q  793 ttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||| |||||    
T  21253972 ttcgacaaccatttctcc 21253989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 57 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 21781691 - 21780924
Alignment:
Q  57 tgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaa 156  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  21781691 tgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaa 21781592  T
Q  157 ttatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttacta 256  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  21781591 tcatcaatcctcggaagtggatacctattctttattgtcaccttgttcaactgtcgatagtcaatacacaatctcatgctaccttctttcttcttcacta 21781492  T
Q  257 gcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcaga 356  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||   |||  ||    
T  21781491 gcaaaaccggcactccccaaggtgaaacactgggtctaacaaactttttctcaagcaagtcctctaattgtttcttcaactcggccaacttataagttga 21781392  T
Q  357 catacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaagt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctgga 442  Q
    |||||||||||||| ||| || || |||||| ||||||||||||||||||                |||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  21781391 catacgataaggtgtcatagacacaggcttcattccaggaacaagatcaatcaaaaactcaacttccctctctggaggcacatcaggaatttcatcagga 21781292  T
Q  443 aaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgc 542  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  21781291 aaaacttctggaaaatcgcacaccacttgtagcttatcaatcactgcttgattctcaatagataaggaagccatcaaagaaaacatcaagataccatcac 21781192  T
Q  543 gttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaac 642  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||| |||  || ||||| ||| || |||||||  ||||    
T  21781191 gttctaactgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcctcagcagaagagtaatacaccgacttactataataattaatgtgaac 21781092  T
Q  643 gtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaa 742  Q
     |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  21781091 atggttgtattccaaccagttcatacccagaatcacatccataccactcaaaggtagaaaaactaaatccatctcaaaatcacgatcaaacatagacaaa 21780992  T
Q  743 ggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||| | ||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  21780991 ggacatcttaaacacacaagagaagtggtcaccgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcc 21780924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 147 - 810
Target Start/End: Original strand, 22030470 - 22031147
Alignment:
Q  147 atccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttc 246  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  22030470 atccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgacgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttc 22030569  T
Q  247 ttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataact 346  Q
    ||| | ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| || ||||||||||| || || ||| ||||||||||||||| |||||    
T  22030570 ttcatcactagaaaaacgggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaatttattctcaagcaaatcttctaaccgtttcttcaactcagctaact 22030669  T
Q  347 cggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag------------tcctctct--ggaggcacatcaggaat 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||             | ||||||  ||||||| |||||||||    
T  22030670 cggaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcgaggaacaagatcaatagaaaactcgacttctctcttaggaggcatatcaggaat 22030769  T
Q  433 ctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaag 532  Q
     |||||||||| |||||||||||| || || |||||   |||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||     
T  22030770 ttcatctggaagaacttcaggaaagtcgcataccacttatagcttgtcaatcattgcttgattctcaatagataaagaagccatcaaagaaaacatcaaa 22030869  T
Q  533 ataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaat 632  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  22030870 ataccatcgcgttccatttgcttcagctgcttagtagataaaaactatgcaccactttcctcctcagcggaagagaaacacactgacttgctaaaacaat 22030969  T
Q  633 taataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaa 732  Q
    | ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22030970 tgatatgaacatggttgtactctaaccaattcatacccagaattacatccataccgcttaaatgtagacaaactaaatccatttcgaaatcatgaccaaa 22031069  T
Q  733 catagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22031070 catagacaaaggacatcgcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagttggagtttcgacaaccatctctcc 22031147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 22422445 - 22421629
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22422445 cgaaaggcatcactttatattcataatgtccataacgcgttctgaatgctatcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatct 22422346  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || || || || ||||||    
T  22422345 caagtcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtgaatacctattctttatcgtcactttattcaac 22422246  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||||||||| |  || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||| |||||||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  22422245 tgtcgatagtcaatacacaatcttatgctaccatctttcttcttaaccagcaataccggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaacttcttat 22422146  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc--- 404  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||| ||||  |||||||| ||||||| ||| || ||  |||||||||| |||||||||||       
T  22422145 caagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagccaactcagaagtcgacatacggtaaggtgtcatagacacaagcttcgttcccggaacaagatcaat 22422046  T
Q  405 ----aagtc-------ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
        || ||       || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |   || ||||| |||||||||||||||||    
T  22422045 cgaaaattcaacttctctttctggaggcacattaggaatttcatctggaaaaacttctggaaaatcacatatagcctgtagcttatcaatcactgcttga 22421946  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| ||| || || | ||| || ||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||    
T  22421945 ttctcaatagacaaggatgacatcaaagaaaacatcaaaattccatcacgttccaattgcttcagctgcttagtagacaagaactctgcgccacttacct 22421846  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||||||||  || ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| || ||||| |||| ||||||||||||    
T  22421845 cttcagcagaagagaaatacaccgacttactaaaacaattaatatgaacatggttgtacactaactagttcatgccaagaattacatccataccactcaa 22421746  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22421745 aggtaaacaaaccaagtcaatttcaaaatcacgatcaaacatagataaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtt 22421646  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  22421645 tcgacaaccatctctcc 22421629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 22522774 - 22523590
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| || | |||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  22522774 cgaaaggcatcactttatactcataatgtcgataacgtgttctaaaagccgttttctgcatatcttcatctttcactttattctggtgataacccgatct 22522873  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  22522874 caaatcaatcttgctaaacacacgagcacccactaactgatccatcaagtcatcaattcttggaagtggatacctgttctttatcgttactttgttcaac 22522973  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||||||||| || || | ||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  22522974 tgtcgataatcaatgcataatctcatgctaccatccttcttcttaactagcaatactggcgctcgccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttat 22523073  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    ||||||| || || || ||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||| | ||||||| ||| || || ||||||||||| |||||||| ||||     
T  22523074 caagcaaatcttctaattgtttcttcaactcagccaactcagaagctgacatatggtaaggtgtcatagacacaggcttcgttcccggaacaaggtcaat 22523173  T
Q  408 -------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                 || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||  ||||| || |||||||| |||||    
T  22523174 cgaaaattcaacttctctttctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttctggaaaatcacatacaacttgtagcttaccaatcactacttga 22523273  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| | ||| | ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| | |||||| |    
T  22523274 ttctcaatagacaaagacgccatcaaagaaaacatcaaaattccatcacattctaattgcttcagctgcttggtagacaagaactttgcgctactttctt 22523373  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||||||||  ||  |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||    
T  22523374 cttcagcagaagagaaatacaccaacttactaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccagttcataccaaggattacatccataccactcaa 22523473  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22523474 aggtaaacaaaccaaatcaatttcaaaatcaagaccaaacatagaaaaagaacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtt 22523573  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  22523574 tcgacaaccatctctcc 22523590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 9 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 22376005 - 22375191
Alignment:
Q  9 gaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctc 108  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  22376005 gaaaggcatcactttatattaataatgtccataacgtgttctaaaagccgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctgttgataacccgatctc 22375906  T
Q  109 aaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 208  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  22375905 aaatcaatcttgctgaatacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcttggaagtggatatctattctttatcgttactttattcaact 22375806  T
Q  209 gccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctc 308  Q
      ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||  |  ||||| ||||||||||| ||    
T  22375805 atcgataatcaatacacaatctcatactaccatctttcttcttaactagcaataccggcgctccccaaggtgaaatacttggtcttacaaacttcttatc 22375706  T
Q  309 aagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc---- 404  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||  |||||| ||| || || |||||||| || ||||  |||||        
T  22375705 aagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagccaactcagaagccgacatacggcaaggtgtcatagacacaggcttcgtacccggaattagatcaatc 22375606  T
Q  405 ---aagtc-------ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgat 494  Q
       || ||       || ||| |||||||||||||||| ||||   |||||||||| || || |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  22375605 gaaaattcaacttctctttctagaggcacatcaggaatttcattaagaaaaacttctgggaaatcacacacaacctgtaacttatcaatcactgcttgat 22375506  T
Q  495 tctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctc 594  Q
    |||||||||| || || ||||| || ||||||||||| || || || ||||| | ||| ||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  22375505 tctcaacagacaaggacgccatcaaagaaaacatcaaaattccttcacgttctaattgattcagctacttagtagacaagaattctgcgccactttcctc 22375406  T
Q  595 ttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaa 694  Q
     ||| | ||||| ||||  || ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| |||||||||    
T  22375405 gtcggcagaagaaaaatacaccgacttactaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccagttcataccaaggattacatccattccactcaaa 22375306  T
Q  695 ggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagttt 794  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  22375305 ggtaaacaaaccaaatcaatttcaaaatctctaccaaacatagacaaaggacatcttaaacacacg-gagaagtagtcaccgaacccttagttggagttt 22375207  T
Q  795 cgacaaccatctctcc 810  Q
    |||| |||||||||||    
T  22375206 cgacgaccatctctcc 22375191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 8 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 22246986 - 22246174
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22246986 cgaaaggcatcactttatattcataatgtccataacttgttctaaaagcggtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatct 22246887  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||     
T  22246886 caaatcaatcttgctgaacacacgtgcacccactaactgatccatcaaagcatcaattcttggaagtggatacccattctttatcgttaccttattcaat 22246787  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||| |  ||||| |||||| |||| |    
T  22246786 tgtcgataatcaatacacaacctcatactaccatctttcttcttaactagcaataccggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaacatcttat 22246687  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaaga----- 402  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||  || || ||||  |||||||| ||||||| ||| || ||  ||||||| || | || ||||         
T  22246686 caagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagccaaatcagaagttgacatacggtaaggtgtcatagacacatgcttcgtacccgaaataagatcaat 22246587  T
Q  403 -------tcaagtcctctctg--gaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
           |||| | |||| ||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||| |||   |||||||||| || |||    
T  22246586 cgaaaattcaacttctctttgtagaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttctggaaaatcacatacaacctgtaatttatcaatcaccgcctga 22246487  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  22246486 ttctcaacagacaaggatgccatcaaagaaaacatcaaaattccatcacgttctaattgcttcagctgcttagtagacaagaattatgcaccactttcct 22246387  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||| ||||  |  ||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||| |||  |||||||    
T  22246386 cttcagcagaagaaaaatacatcgacttactaaaacaactaatatgaacatggttgtactctaaccaattcataccaaggattacatccatttcactcaa 22246287  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||| |||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22246286 aggtaaacaaaccaaattaatttcaaaatctcgaccaaacatagacaaaggacatattaagcacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtt 22246187  T
Q  794 tcgacaaccatct 806  Q
    |||||||||||||    
T  22246186 tcgacaaccatct 22246174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 9 - 810
Target Start/End: Original strand, 22989274 - 22990089
Alignment:
Q  9 gaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctc 108  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22989274 gaaaggcatcactttatattcataatacccataacgcgttctgaaagctgtattctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctc 22989373  T
Q  109 aaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 208  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| |||||||| |||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||     
T  22989374 aaatcaatcttgctaaacacacttgcagccactaactgatccatcaagtcatcaattattggaagtggatacctattctttatcgttactttattcaacc 22989473  T
Q  209 gccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctc 308  Q
    | ||||||||||| || ||   ||| ||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| || |||||||||| |  ||||| |||||| |||| ||    
T  22989474 gtcgataatcaatgcataatatcatgctaccatctttcttcttaactagcaatatcggcgcttcccaaggtgaaacacttggtcttacaaacatcttatc 22989573  T
Q  309 aagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaa-------- 400  Q
    ||| || || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||  |||||||| |||| || ||| || || |||||||| || |||||||            
T  22989574 aagtaaatcttctaaatgtttcttcaactcggccaactcagaagtcgacatacggtaagttgtcatagacacaggcttcgtacccggaacaatgtcaatc 22989673  T
Q  401 ga----tcaagtcctctct--ggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgat 494  Q
    ||    |||| | |||| |  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || || || ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  22989674 gaaaattcaacttctctttatggaggcacatcaggaatttcatcaggaaagacctctggaaaatcgcatacaacctgtagcttatcaatcactgcttgat 22989773  T
Q  495 tctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctc 594  Q
    |||||| ||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||    
T  22989774 tctcaatagacaaggacgccatcaaagaaaacatcaagattccatcacgttctaattgcttcagctgcttagtagacaagaactatgcgtcactttcctc 22989873  T
Q  595 ttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaa 694  Q
    |||  | ||||||||||  || ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||    
T  22989874 ttcagcagaagagaaatacaccgacttactaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccagttcataccaaggattacatccataccactcaaa 22989973  T
Q  695 ggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagttt 794  Q
    |||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22989974 ggtaaacaaaccaagtcaatttcaaaatcacgaccaaacatagacaagggacatcttaaacatacaagagaagtagtcaccgaacccttcgctggagttt 22990073  T
Q  795 cgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||||||||||||||    
T  22990074 cgacaaccatctctcc 22990089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 418 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 22129746 - 22129358
Alignment:
Q  418 aggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccatt 517  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||  ||||  |||| |||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||     
T  22129746 aggcacatcaggaatttcatctgggaaaacttccggaaagtcgcataccacttgtagattatctatcattgcttgattttcaatagataaggaagccatc 22129647  T
Q  518 aatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactg 617  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||    
T  22129646 aacgaaaacatcaaaataccatcgcgttccatttgcttcagctgcttagtagataagaattctgcaccactttcctcttcagcggaagagaaatacactg 22129547  T
Q  618 acttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttc 717  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22129546 acttgctaaaacaattgatatgaacatggttgtactctaaccaattcatacccagaatcacatccataccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttc 22129447  T
Q  718 aaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatct 806  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22129446 aaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatcgcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatct 22129358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 8 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 22131594 - 22131199
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||    
T  22131594 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccgtaatgcgttcttaaagctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataccctgttct 22131495  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22131494 caaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 22131395  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || | ||| ||||||||||| | ||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||| || ||||| |    
T  22131394 tgacaatagtcaatacacaatctcatgccaccgtctttcttcttcactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacgaatttctttt 22131295  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagat 403  Q
    ||||||| || || || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  22131294 caagcaaatcttctaattgtttcttcaactcggctaactcggaagcagacatacggtaaggtgccatcgacaccggcttcgttccaggaacaagat 22131199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 8 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 19864646 - 19864248
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  19864646 cgaaaggcataactttctactcatagtgaccataccgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatattttactttaatctggtgataacctgatct 19864547  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||| |||||||| |||| |   |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  19864546 caaatctatcttgctgaaaaatttagcacccactaactgatccatcaaatcatcaatcctcggaagtggatacctattctttattgtcaccttgttcaac 19864447  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    |  ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||| ||||    
T  19864446 tttcgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcttcactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaactcttggtctaacaaactttttct 19864347  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    || |||||||||| || | |||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  19864346 catgcaagtcctctaattatttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgatagggtgtcatagacacaggcttcgttccaggaacaagatcaa 19864248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 19984408 - 19985224
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||| || || || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  19984408 cgaaaggcatcaccttttattcataatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacct 19984507  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||| || || || || ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || || |||| |    
T  19984508 caaatcaattttactgaacacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcagaagtggatacctattctttatcgtcactttattcagc 19984607  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || || ||||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||| || ||||| || || |||||| |||||||||| |  ||||| ||||| ||||| |    
T  19984608 tgacggtaatctatacataacctcatgctaccatcattcttcttaaccagcaataccggtgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaatttcttat 19984707  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||  |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||     
T  19984708 caagcaagtcctccaactgtttcttcaattcagctaactcggacgccgacatacagtaaggtgccatcgacaccggcttcgttccgggaacaagatcaat 19984807  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| || || |  |||||||||||  |||||    
T  19984808 tgaaaattcaacctccctctctggtggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttctggaaattcattcacaactggcaatctatcaatcacaacttga 19984907  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||| |  || ||  | |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||| ||| ||||||| ||| ||||| ||  |||| || |    
T  19984908 ttctccaacgacaagtatgccattaaggaaaacattaagattccatcacgttctaactgcttcaactgtttagtagtcaagaactcagcttcactctctt 19985007  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    | ||  | || || |||||||  | ||| ||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||| || || |  || |||| ||||    ||||    
T  19985008 cctcagcagacgaaaaatgtatcgtcttactaaaacaattaatatgaacacggttatactctaaccagtttatcccaaagattacatccatattcgtcaa 19985107  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     |  | ||| |||| ||| | |||||| || | ||||||||||||||| |||||  ||||||| || |||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  19985108 cgacaaacatactagatcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaatggacaactcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtt 19985207  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || |||||||| |||||    
T  19985208 tcaacaaccatttctcc 19985224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 58 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 21323782 - 21323157
Alignment:
Q  58 gtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaat 157  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |    
T  21323782 gtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaacttttgcacccactaactgatccatcaagt 21323683  T
Q  158 tatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactag 257  Q
      ||||| ||||||||||||||||||||||| || || || || |||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |     
T  21323682 cgtcaatcctcggaagtggatacctattctttattgtaactttattcaactgacgatagtcaatacataacctcatactaccatccttcttctttaccaa 21323583  T
Q  258 caaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagac 357  Q
    ||| || ||||||||| ||||||| || |  ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||    
T  21323582 caataccggcgctccccaaggtgagacacttggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcttccaactgtttcttcaattcagctaactcggaagctgac 21323483  T
Q  358 atacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaagt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaa 443  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||  |||||||| |||| |              ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  21323482 atacggtaaggtgccatcgacaccggcttcgttcatggaacaaggtcaattgaaaattcaacctccctctctggtggcacatctggaatctcatcaggaa 21323383  T
Q  444 aaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcg 543  Q
    ||||||| |||||||||  ||| ||||| | |||||||||||| |||||||| || |  || ||||| ||||| || |||||||| |  || ||||||||    
T  21323382 aaacttctggaaattcattcacaaccggcaacctatcaatcacagcttgattttctaacgacaaagatgccatcaaggaaaacataagaattccatcgcg 21323283  T
Q  544 ttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacg 643  Q
     ||||  | ||||| ||| || ||||| |  || ||||| ||||| || |||||  | ||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||| | ||     
T  21323282 ctccaactacttcaactgtttcgtagataggaattctgctccactctcttcttccgcagaagaaaaatgcaccgtcttgctaaaacaattgatatggaca 21323183  T
Q  644 tggttgtactctaaccagttcatacc 669  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21323182 tggttatactccaaccagttcatacc 21323157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 9 - 804
Target Start/End: Original strand, 21927657 - 21928466
Alignment:
Q  9 gaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctc 108  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || |  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||| |||    
T  21927657 gaaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacgtgtcctaaaggtcgtcttctgcatatgctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctc 21927756  T
Q  109 aaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 208  Q
    |||||||| || || || || || |||||||||||| ||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || || |||| ||    
T  21927757 aaatcaattttactgaacacacgagcacccactaactgatccattaagtcgtcaattctcggaagtggatacctattctttatcatcactttattcagct 21927856  T
Q  209 gccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctc 308  Q
    | || ||||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||| || | ||| || || |||||  |||||||||| | |||||| ||||| ||||| ||    
T  21927857 gacggtaatctatacataacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccggtgctccacaaggtgaaacactcggtcttacaaatttcttatc 21927956  T
Q  309 aagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaagt 408  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||| |    
T  21927957 aagtaagtcctccaactgtttcttcaatttagctaactcggacgccgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttctgggaacaagatcaatt 21928056  T
Q  409 --------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgat 494  Q
                  ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||  ||| ||||| |  ||||||||||| |||||||    
T  21928057 gaaaatttaacctccctctctggtggcacatcaggaatctcattaggaaaaacttctggaaattcattcacaaccggaaatctatcaatcacagcttgat 21928156  T
Q  495 tctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctc 594  Q
    |||| |  || ||  | ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| |  ||||||| ||| ||||||| ||| ||||| ||  |||| || ||    
T  21928157 tctccaatgacaagtatgccatcaaagaaaacattaaaatcccatcacgttctaactgcttcaactgtttagtagtcaagaactcagcttcactctcttc 21928256  T
Q  595 ttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaa 694  Q
     ||  | | ||  |||||||| | ||| ||||| ||||||||| ||||  |||| ||||||| ||||||||| || | ||| | || ||||||  ||||     
T  21928257 ctcagcagtagcaaaatgtaccgtcttactaaagcaattaatatgaacacggttatactctatccagttcatcccaaaaattatatccatacccgtcaac 21928356  T
Q  695 ggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagttt 794  Q
    || | ||| |||| ||| | |||||| || | ||||||||||||||| | |||  ||||||| || |||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  21928357 ggcaaacatactagatcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacgcacagctcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagttt 21928456  T
Q  795 cgacaaccat 804  Q
    | ||||||||    
T  21928457 caacaaccat 21928466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 20390314 - 20391130
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||| ||| ||||||||||  || || ||||| || || || || || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| || ||    
T  20390314 cgaaagacatcactttatatttgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggccgttttctgcatatcttcatcttttactttaatctgatggtaacccgacct 20390413  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || || || || || ||||||    
T  20390414 caaatcaatcttgctaaacacacgtgaacccactaactgatccataaaatcatcaattctcggaagtggatacctattatttatcgtcactttattcaac 20390513  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || || ||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||| || | ||| || ||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||| |    
T  20390514 tgacggtaaactatacacaacctcatgctaccatctttcttcttaaccaacaacaccggcgctccccaaggtgaaacactcggtcttacaaacttcttgt 20390613  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||| || || |||||||||||||||||||||| |||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| ||  || |||| || |||||||||||||     
T  20390614 caagtaaatcttccaactgtttcttcaactcagctaactcagacaccgacatacggtaaggcgccatcgacaccagcatcgtacccggaacaagatcaat 20390713  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              ||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||| |  ||| || || |   |||||||||| | ||||    
T  20390714 tgaaaattcaacttccctctctggcggcacatcagggatctcatcatgaaaaacttctggaaatttattcacaactggcaatatatcaatcacagtttga 20390813  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||| || || ||  | |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||   ||| || |    
T  20390814 ttctccactgaaaagtatgccattaaagaaaacattaagatcccatcacgttctaattgcttcagctgtttagtagtcaagaactcagctttactctctt 20390913  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    | ||  | ||||| ||||| |  | ||| |||||| |||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| || |  || |||| ||||||  ||||    
T  20390914 cctcagcagaagaaaaatgcatcgtcttactaaaataattgatatgaacatggttatactccaaccagttcatcccaaagattacatccatacccatcaa 20391013  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     || | ||| || | ||| | ||||||||| | |||||||||||||||  ||||  ||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  20391014 cggcaaacatacaagatcaacttcaaaatctctaccaaacatagacaacagacaactcaaacaaacgagagaagtagttactgaacccttagctggagtt 20391113  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || |||||||| |||||    
T  20391114 tcaacaaccatttctcc 20391130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 8 - 669
Target Start/End: Original strand, 23887256 - 23887931
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| |||  ||| || || || |||||||| || || || || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  | ||    
T  23887256 cgaaaggcatcactgaatactcgtaatgtccataacgtgtcctaaaggccgtcttatgcatatcctcgtctttcactttaatctggtgataacccaacct 23887355  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||    
T  23887356 caaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactaatccatcaaatcatcaattcttcgaagtggatacctattctttatcgttactttattcaac 23887455  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||  ||| ||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||| |    
T  23887456 tgtcgataatcaatgcataacctcatgctaccatctttcttcttaactaacaaaatcggcactccccaaggtgaaacactcggtcttacaaacttcttat 23887555  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgt-tccaggaacaagatcaa 406  Q
    ||||||| || ||  |||||||||||||| |||  ||||| |||||  ||||||| ||||| | ||| || ||  ||||| |  ||||||| ||||||||    
T  23887556 caagcaaatcttcttactgtttcttcaacgcagccaactcagaagccaacatacggtaaggagtcatagacacatgcttcatacccaggaa-aagatcaa 23887654  T
Q  407 gt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttg 492  Q
     |              ||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||  | | | ||||||| ||||||||    
T  23887655 ttgaaatttcgacttccctttctggcggaatatcaggaatctcatcaggaaaaacttctgggaattcacaaacaactcgcaacttatcaattactgcttg 23887754  T
Q  493 attctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcc 592  Q
    |||||| ||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||| || || |  || ||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||     
T  23887755 attctccacagacaaggacgccatcaaagaaaacatcaagattccatcacgatctaactgattcagctgcttagtagttaagaactctgctccactttct 23887854  T
Q  593 tcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacc 669  Q
    |||||    ||||| |||| ||  | |||  |||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||||||||||    
T  23887855 tcttcagtagaagaaaaatatatcggcttattaaaacaattaatatgaacatggttatactttaactagttcatacc 23887931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 22053091 - 22053907
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || |  ||||| || ||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || ||    
T  22053091 cgaaaggcatcacctggtattcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaaccagacct 22053190  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| ||||||||  | ||||    |||||| || | | |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||    
T  22053191 caagtcaatcttattgaaaatctttgcaccaaccagctgatccatcaagtcatcaattctcggaagcggatacctgttctttattgtaactttgttcaac 22053290  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||| ||||||| ||| ||||| || ||||||||||| | ||| || ||||||||| | ||||||||    ||||||||||||||||| |    
T  22053291 tgacgatagtcaatgcacaacctcatgctaccgtccttcttctttaccaacaacacaggcgctccc-acggtgaaacattgggtctaacaaacttcttat 22053389  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||     
T  22053390 caagctagtcctccaactgtttcttcaattcagctaactcagaagatgacatacgataaggtgccatcgacatcggcttcgttcctgggacaaggtcaat 22053489  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccacc-ggtagcctatcaatcactgcttg 492  Q
    |              ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||  ||| ||| |||| |||||||||||  |||||    
T  22053490 tgaaaattcaacctccctctctggtggcacatcaggaatctcatcaggaaacacttctggaaattcattcacaaccgggtaacctatcaatcatagcttg 22053589  T
Q  493 attctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcc 592  Q
    ||| || ||||||||| ||| ||| |  ||| ||||||| || || || ||||| || || |||| ||| || |||||||||| |||     ||| |||     
T  22053590 attttctacagataaataagtcatcagagaatacatcaaaatcccgtcccgttctagctgtttcatctgttttgtagacaaaagctcaatttcaccttct 22053689  T
Q  593 tcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactca 692  Q
    |||||  | ||||| ||||| |  | ||| ||||| ||||| ||| ||||  |||| ||||||||||| ||||| || | ||| |||| ||||||  |||    
T  22053690 tcttcagcagaagaaaaatgcatcgtcttactaaagcaattgatatgaacccggttatactctaaccaattcattccaaaaataacatccatacccgtca 22053789  T
Q  693 aaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagt 792  Q
    | |||| |||||||||||| |   |||| || | ||||||||||||   ||||||  ||| ||| || |||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  22053790 acggtaaacaaactaaatcaaccacaaagtctctaccaaacatagatgtaggacacctcagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagt 22053889  T
Q  793 ttcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||| |||||||| |||||    
T  22053890 ttcaacaaccatttctcc 22053907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 8 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21782973 - 21782754
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  21782973 cgaaaggcataactttgtactcatagtgaccataccgcgctctgaaagttgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatct 21782874  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  21782873 caaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatcctcggaagtggatacctattctttattgtcaccttgttcaac 21782774  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaa 227  Q
    || ||||| |||||||||||    
T  21782773 tgtcgatagtcaatacacaa 21782754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 8 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 31415022 - 31414663
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || || ||||| || |||||||| || || || || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  31415022 cgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacct 31414923  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| ||||||||||| || ||   ||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||    
T  31414922 caagtcaatcttgctgaacacctttgcacccactaactgatccattaagtcatcaattctcggaagtggatacctattctttatcgtaactttgttcaac 31414823  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || || |||| ||| || ||   ||| |||||||| |||||||| |||| ||| || ||| ||||| |||||||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  31414822 tgacggtaattaatgcataatttcatgctaccatccttcttcttaactaacaacaccggcactccccaaggtgaaacacttggtcttacaaacttcttat 31414723  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataag 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  31414722 caagcaagtcctccaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatacgataag 31414663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 80 - 810
Target Start/End: Original strand, 22373168 - 22373913
Alignment:
Q  80 tcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggata 179  Q
    |||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  22373168 tcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgctgaacacacgagcacccactaactgatccattaaatcatcaattcttggaagtggata 22373267  T
Q  180 cctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggt 279  Q
     |||||||| || || || || |||||||| || ||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||| || | ||| ||  |||||||| |||||    
T  22373268 tctattctttatcgtcactttattcaactgacggtaatctatacacaacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccagcgctccccaaggt 22373367  T
Q  280 gaaacgcccggtctaacaaactt-cttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaa 378  Q
    ||||| | |||||| | ||| || | | ||||| || ||||||||||||||| |||| || | |||||| || ||  ||||||| ||||||||||||||     
T  22373368 gaaacactcggtcttataaatttccctatcaagtaaatcctccaactgtttcatcaattcggctaactcagacgccaacatacggtaaggtgccatcgac 22373467  T
Q  379 actggcttcgttccaggaacaagatcaagt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacaca 464  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||| |              ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||  ||    
T  22373468 agcggcttcgttccgggaacaagatcaattgaaaattcaacctccctctctggtggcacatcatgaatctcatcaggaaaaacatctggaaattcattca 22373567  T
Q  465 ccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgctt 564  Q
    |  |||| |  |||| ||||| |||||||||||| |  || ||  | ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||| ||  ||    
T  22373568 cagccggcaatctattaatcattgcttgattctccaacgacaagtatgccatcaaagagaacattaagattccatcacgttctaaatgcttcaactattt 22373667  T
Q  565 agtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttc 664  Q
    ||||| ||| ||||| ||  |||| || || ||  | ||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||    
T  22373668 agtagtcaagaactcggcttcactctcttcctcagcagaagaaaaatgtaccgtcttactaaaacaattaatatgaacacggttatactctaaccagttc 22373767  T
Q  665 atacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagag 764  Q
    || || |  || |||| ||||||  || | || | ||| || | ||| | |||||| || | | ||||||||||||| |||||  ||||||| || ||||    
T  22373768 atcccaaagattacatccatacctgtcgatggcaaacatacaagatcaacttcaaagtctctatcaaacatagacaatggacaactcaaacaaacaagag 22373867  T
Q  765 aaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    || |||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  22373868 aagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcc 22373913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 28983139 - 28983955
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||    
T  28983139 cgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacttttatctgatgataaccagccct 28983238  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtg-cacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 206  Q
    |||||||||||| || |||| || || |||| || ||| |||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  28983239 caaatcaatcttactgaaaa-tcttggcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttcttgatcgtaactttgttcaa 28983337  T
Q  207 ctgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttc 306  Q
    ||| || ||||| ||||| |  | |||||||||||| ||||||||||| | ||| || || |||||| |||||||||| |  ||||| ||||| |||||     
T  28983338 ctgacggtaatctatacaaagtctcatactaccatccttcttctttaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaatttctta 28983437  T
Q  307 tcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    || | || ||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  28983438 tctaacaggtcctccaattgtttcttcaactcagccaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggcttagttcctggaacaagatcaa 28983537  T
Q  407 gt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttg 492  Q
     |              ||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||  ||| || ||||  | ||||| ||| |||||    
T  28983538 ttgagaattcaacctccctctctggtggcacatcaggaatttcatcagggaaaacttctggaaactcattcactacaggtaaaccatcaaccacagcttg 28983637  T
Q  493 attctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcc 592  Q
    ||| || |  || ||    |||||||  ||| |||||| ||||||||| ||||| |  || |||| ||| || ||||||| || |||  |  ||| |||     
T  28983638 attttctaacgacaattgtgccattagagaatacatcaggataccatcacgttcaaactgtttcatctgtttcgtagacagaagctcaacctcaccttct 28983737  T
Q  593 tcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactca 692  Q
    |||||  | |||||||||||||| | ||| ||||| || || ||| ||||  | || ||||||||||| |||||||| |  || |||| ||||||  |||    
T  28983738 tcttcagcagaagagaaatgtaccgtcttactaaagcagttgatatgaactcgattatactctaaccaattcataccaaagataacatccatacccgtca 28983837  T
Q  693 aaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagt 792  Q
    | || |||||||| || || ||  ||||||| | |||||||||||| | ||||||   || ||| || |||||| | || || |||||||||||||||||    
T  28983838 acggcagacaaaccaagtcaatcacaaaatctctaccaaacatagatataggacaccgcagacaaacaagagaagtggttactgaacccttagctggagt 28983937  T
Q  793 ttcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||| |||||||| |||||    
T  28983938 ttcaacaaccatttctcc 28983955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 10 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 29301977 - 29301586
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||| || ||||    
T  29301977 aaaggcatcaccttatactcataatgcccataacgtgttctgaatgccgtcttctgcatattctcatctttcaccttaatctagtgataacccgacctca 29301878  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    | ||||| || || || || ||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||    
T  29301877 agtcaattttactgaacacacgtgcacccactaactgatccatcagatcatcaatcctcggaagcggatacctgttctttatcgtaactttgttcaactg 29301778  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
     || ||||| || ||||| | ||| |||||||| || |||||||||| ||| || || |||||| |||||||||| |  || || ||||| ||||| |||    
T  29301777 acggtaatcgatgcacaatctcatgctaccatcctttttctttactaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacacttggccttacaaatttcttatca 29301678  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaag 401  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| | |||||| || || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||    
T  29301677 agtaagtcctccaactgtttcttcaactcggctaactcagacgccgacatacggtaaggagccatcgacacaggctttgtacccggaacaag 29301586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 362
Target Start/End: Original strand, 23657155 - 23657509
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||    
T  23657155 cgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctgatggtaacctgacct 23657254  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| ||||||||||| ||||||  |||||| || ||| ||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||     
T  23657255 caagtcaatcttgctgaaaacttttgcacctacgaactgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctttatcgtaactttgttcaat 23657354  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||||||||| || || | ||| |||||||| |||||||| |||| ||| ||  |||||||| |||||||||| |  ||||| ||||| ||||| |    
T  23657355 tgacgataatcaatgcataatctcatgctaccatccttcttcttaactaacaacaccagcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaatttcttat 23657454  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacg 362  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  23657455 caagcaagtcctcaaattgttttttcaattcagctaactcggaagctgacatacg 23657509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 28988358 - 28989174
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||    
T  28988358 cgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacttttatctgatgataaccagccct 28988457  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtg-cacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 206  Q
    |||||||||||| || |||| || || |||| || ||| |||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  28988458 caaatcaatcttactgaaaa-tcttggcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttcttgatcgtaactttgttcaa 28988556  T
Q  207 ctgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttc 306  Q
    ||| || ||||| ||||| |  | |||||||||||| ||||||||||| | ||| || || |||||| |||||||||| |  ||||| ||||| |||||     
T  28988557 ctgacggtaatctatacaaagtctcatactaccatccttcttctttaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaatttctta 28988656  T
Q  307 tcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    || | || ||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  28988657 tctaacaggtcctccaattgtttcttcaactcagccaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggcttagttcctggaacaagatcaa 28988756  T
Q  407 gt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttg 492  Q
     |              ||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||  ||| || ||||  | ||||| ||| |||||    
T  28988757 ttgagaattcaacctccctctctggtggcacatcaggaatttcatcagggaaaacttctggaaactcattcactacaggtaaaccatcaaccacagcttg 28988856  T
Q  493 attctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcc 592  Q
    ||| || |  || ||    |||||||  ||| |||||| ||||||||| ||||| |  || |||| ||| || ||||||| || |||  |  ||| |||     
T  28988857 attttctaacgacaattgtgccattagagaatacatcaggataccatcacgttcaaactgtttcatctgtttcgtagacagaagctcaacctcaccttct 28988956  T
Q  593 tcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactca 692  Q
    |||||  | |||||||||||||| | ||| ||||| || || ||| ||||  | || ||||||||||| |||||||| |  || |||| ||||||  |||    
T  28988957 tcttcagcagaagagaaatgtaccgtcttactaaagcagttgatatgaactcgattatactctaaccaattcataccaaagataacatccatacccgtca 28989056  T
Q  693 aaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagt 792  Q
    | || |||||||| || || ||  ||||||| | |||||||||||| | ||||||   || ||| || |||||| | || || |||||||||||||||||    
T  28989057 acggcagacaaaccaagtcaatcacaaaatctctaccaaacatagatataggacaccgcagacaaacaagagaagtggttactgaacccttagctggagt 28989156  T
Q  793 ttcgacaaccatctctcc 810  Q
     || |||||||| |||||    
T  28989157 atcaacaaccatttctcc 28989174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 16269777 - 16269379
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||  || ||    
T  16269777 cgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatgataactagacct 16269678  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgt-gcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 206  Q
    |||||||||||| ||||||| || | ||||| || ||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  16269677 caaatcaatcttactaaaaa-tcttagcaccaaccaactgatccatcaaatcgtcaattctcggaagcggatacctgttctttatcgtaaccttgttcaa 16269579  T
Q  207 ctgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttc 306  Q
    ||| || ||||| || ||||  | |||||||||||| |||||||| || | ||| || || |||||| |||||||||| |  ||||| ||||| |||||     
T  16269578 ctgacggtaatctatgcacagtctcatactaccatccttcttcttaaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaatttctta 16269479  T
Q  307 tcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    || | || ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||    
T  16269478 tccaacaggtcttccaactgtttcttcaactcagctaactcagaagttgacatacggtatggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaaggtcaa 16269379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 52 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 20394642 - 20394288
Alignment:
Q  52 aaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatcca 151  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  20394642 aaagccgtcttctacatatcttcatccttcagtttaatctgatgatagcccgatctcaaatcaatcttaataaacacacgtgcacccactaactgatcca 20394543  T
Q  152 tcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctt 251  Q
    |||||| ||| |||||  ||||||||| ||||||||| || || || |||||||| ||||| ||||| |||  ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  20394542 tcaaatcatcgattcttagaagtggatccctattctttattgtcactttgttcaattgccggtaatctataaccaacctcatgctaccatctttcttctt 20394443  T
Q  252 tactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaa 351  Q
     || | ||| || | ||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||  |||||| ||| ||  ||    
T  20394442 aaccaacaacaccgacgctccccaaggtgaaacactcggtcttacaaacttcttatcaagcaaatcctctaactatttcttacactcagctaattcaaaa 20394343  T
Q  352 gcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    |  |||||||||||||||||||| || ||  ||||||| ||  ||||||||||||    
T  20394342 gtcgacatacgataaggtgccatagacacaagcttcgtacccagaacaagatcaa 20394288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Original strand, 23652271 - 23652449
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    |||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  23652271 aaaggcataactttgtactcataatgtccataacgcgttctgaaacctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctta 23652370  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattctt 188  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  23652371 aatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcagaagtagatacctattctt 23652449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 31569395 - 31568998
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || || || || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||    
T  31569395 cgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatttgatggtaac-tgacct 31569297  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||| || || ||   ||||||||||| | | |||||||| | |||||| |||||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||     
T  31569296 caagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatcaatcctcggaagcggatatctattcttaattgtaactttgttcaat 31569197  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| || ||||| || | ||| || || |||||| | || ||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  31569196 tgacgatagtcaatgcacaacctcatactaccatcctttttcttcaccaacaacacaggtgctccccacggcgaaacactgggtcttacaaacttcttat 31569097  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  31569096 caagtaagtcttccaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggctttgttccaggaacaaggtcaa 31568998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 8 - 339
Target Start/End: Original strand, 4984270 - 4984601
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||    
T  4984270 cgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatgataaccagacct 4984369  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgt-gcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 206  Q
    |||||||||||| ||||||| || | ||||| || ||| |||||||||| |  |||||||| ||||| |||||| | |||||||| || || ||||||||    
T  4984370 caaatcaatcttactaaaaa-tcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacttgttcttgatcgtaactttgttcaa 4984468  T
Q  207 ctgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttc 306  Q
    ||| || ||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||| || | ||| || || |||||| |||||||||| |  ||||| |||||||||||     
T  4984469 ctgacggtaatctatacacagtctcatactaccatccttcttcttgaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaacttctta 4984568  T
Q  307 tcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactca 339  Q
    || | || |||||||||||||||||||||||||    
T  4984569 tccaacaggtcctccaactgtttcttcaactca 4984601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 77 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 16875579 - 16875289
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||| | |||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  16875579 cctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 16875480  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaa 276  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||| |     
T  16875479 ataccaattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccagcaacactggagcaccccac 16875380  T
Q  277 ggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataag 367  Q
    |||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||| |||   ||||| || |||||||| |||||||    
T  16875379 ggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactccgatgcagacatccgataag 16875289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 22061232 - 22060929
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||||| || || || || ||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  22061232 cgaaaggcatcaccttgtattcataatgaccatatcgtgtcctaaaggccttcttctgcatttcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacct 22061133  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||| || ||||||  ||||||||| ||| ||| ||| || | |||||| || |||||||||||||| ||||| || || || |||||||||    
T  22061132 caagtcaatcttactgaaaacttttgcacccaccaactgattcattaagtcatcaatcctgggaagtggatacctgttctttatcgtaactttgttcaac 22061033  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||||||||| ||||||| ||| ||||| || ||||||||||| | ||| || ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  22061032 tgacgataatcaatgcacaacctcatgctaccgtccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccaaggtgaaacactgggtctaacaaacttcttat 22060933  T
Q  308 caag 311  Q
    ||||    
T  22060932 caag 22060929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 495
Target Start/End: Original strand, 27356764 - 27357265
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || || ||||| || |||||||| || || || || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |  ||||| |||||    
T  27356764 cgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatagtaaccagatct 27356863  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgt-gcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 206  Q
    ||| |||||||| ||||||| || | ||||| || ||| |||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |  || ||||||||    
T  27356864 caagtcaatcttactaaaaa-tcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttctttatcgaaactttgttcaa 27356962  T
Q  207 ctgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttc 306  Q
    ||| || ||||| || ||||| | |||||||||||| |||||||| || | ||| || || |||||| |||||||||| |  ||||| ||||| |||||     
T  27356963 ctgacggtaatctatgcacaatctcatactaccatccttcttcttaaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaatttctta 27357062  T
Q  307 tcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    || | || |||||| |||||||||||||| | || |||||| ||||| |||||||| || ||| | ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  27357063 tctaacaggtcctcaaactgtttcttcaatttagctaactcagaagctgacatacggtatggttctatcgacactggcttcgttcctggaacaaggtcaa 27357162  T
Q  407 gt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttg 492  Q
     |              ||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||| || |||| || | ||||||| |||||    
T  27357163 ttgaaaattcaacctccctctatggtggcacataaggaatctcatcaggaaaaacttctgaaaattcatacactacaggtaaccaaacaatcacagcttg 27357262  T
Q  493 att 495  Q
    |||    
T  27357263 att 27357265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 307 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 22028534 - 22028017
Alignment:
Q  307 tcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||    
T  22028534 tcaagcaagtcctccaactgtttcttcaattcagctaactcagacgctgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcccggaacaaggtcaa 22028435  T
Q  407 gt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttg 492  Q
     |              ||||||| | || ||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||| ||||||||  ||||    
T  22028434 ttgagaactcaacctccctctctagtggtacatttggaatctcatccagaaaaacttcaggaaattcattcaccactggtaacctgtcaatcacaacttg 22028335  T
Q  493 attctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcc 592  Q
     || || |  || ||| | |||||||| |||  |||||  || ||||| ||||| ||||| |||| ||| || |||||||| |||||  |  |||  ||     
T  22028334 gttttctaacgacaaatatgccattaaagaatgcatcagaattccatcacgttctagttgtttcatctgtttcgtagacaagaactccacttcaccctct 22028235  T
Q  593 tcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactca 692  Q
    ||||| || ||||| ||||| || | ||| ||||||||||| ||| ||||  |||| ||||||||||| ||||| || | ||| |||| ||||||  |||    
T  22028234 tcttcaacagaagaaaaatgcaccgtcttactaaaacaatttatatgaactcggttatactctaaccaattcatcccaaaaataacattcatacccgtca 22028135  T
Q  693 aaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagt 792  Q
    | || | ||| ||||| || |  |||||||| | ||||||||||||||| |||||  | ||||| || |||||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  22028134 acggcaaacatactaagtcgacctcaaaatctctaccaaacatagacaatggacaccttaaacaaacaagagaagtagttactaaacccttagctggagt 22028035  T
Q  793 ttcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||| |||||||| |||||    
T  22028034 ttcaacaaccatttctcc 22028017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 77 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 20650839 - 20650537
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||| ||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| ||||   |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  20650839 cctttactctaatttgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagttgatccatcaaatcatcaatcctcggaagtgg 20650740  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaa 276  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| || | ||| ||||| || ||| |     
T  20650739 ataccgattcttaattgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccac 20650640  T
Q  277 ggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcg 376  Q
    || ||| | |  || || | |||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||   ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||    
T  20650639 ggagaagcacaaggcctgataaacttcttctcaagcaactcttctaactgtttcttcaattcatccaactctgatgcagacatccgatacggtgcaatcg 20650540  T
Q  377 aaa 379  Q
    |||    
T  20650539 aaa 20650537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 477 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 21920174 - 21919987
Alignment:
Q  477 tatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaa 576  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  21920174 tatcaatcactgcttgattctcaatagataaggaagccatcaaagaaaacatcaaaataccgtcacgttctaactgcttcagctgcttagtagacaaaaa 21920075  T
Q  577 ctctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttc 664  Q
    |||||| ||||||||||||||  | ||| ||||||  || ||||| ||||||||||||||  |||| ||||| || || |||||||||    
T  21920074 ctctgcgccactttcctcttcagcagaaaagaaatacaccgacttactaaaacaattaatgtgaacatggttctattccaaccagttc 21919987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 20008474 - 20008294
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || ||||||||||| || ||||| || || || || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  20008474 cgaaaggcatcaccttatattcataatgtccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatctttcaccttaatctgatggtaacctgagct 20008375  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattctt 188  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20008374 caaatcaatcttactgaacacgcgtgcacccactaattgatccattaaatcatcaattctcggaagtggatatctattctt 20008294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 77 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 21848821 - 21848533
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||| | |||||||||||| |||||| || |||| |||    
T  21848821 cctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaaatgg 21848722  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaa 276  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||| || |||||||||||||| || | ||| ||| | || ||| |     
T  21848721 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacataacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactagagcaccccac 21848622  T
Q  277 ggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgata 365  Q
    || ||||| |  ||||| | ||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||| |||   ||||| || |||||||| |||||    
T  21848621 ggcgaaacacttggtctgataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactctgatgcagacatccgata 21848533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 77 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 23155526 - 23155271
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||| || | | |||||||||||| |||||| ||| |||| ||    
T  23155526 ccttcactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacttctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatcctcagaagcgg 23155427  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaa 276  Q
    ||||| |||||| || || |||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| |  | ||| ||||| || ||| |     
T  23155426 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccaataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaacaacaacactggagcaccccac 23155327  T
Q  277 ggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttctt 332  Q
    || ||||| | ||| || | ||||| |||||||||||| || || |||||||||||    
T  23155326 ggagaaacactcggcctgataaactacttctcaagcaattcttctaactgtttctt 23155271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 21920287 - 21920187
Alignment:
Q  22 ttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgc 121  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  21920287 ttatactcataatgtccataacgcgttctaaaagctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatctatcttgc 21920188  T
Q  122 t 122  Q
    |    
T  21920187 t 21920187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 694 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 22245868 - 22245756
Alignment:
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||| |||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22245868 aggtaaacaaaccaaattaatttcaaaatctcgaccaaacatagacaaaggacatattaagcacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtt 22245769  T
Q  794 tcgacaaccatct 806  Q
    |||||||||||||    
T  22245768 tcgacaaccatct 22245756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 94 - 379
Target Start/End: Original strand, 16414405 - 16414690
Alignment:
Q  94 tgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatag 193  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| || | | |||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||| || |    
T  16414405 tgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcg 16414504  T
Q  194 ttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtct 293  Q
    | || |||||||||||||||||||| | ||||| || ||| || |||||||||||||| || | ||| | ||| || ||| | || ||||  | ||||||    
T  16414505 tcactttgttcaactgccgataatccacacacatcctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacattggagcaccccacggagaaatactcggtct 16414604  T
Q  294 aacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaa 379  Q
     | ||||| |||||||||||| || || ||||||| ||| || |||   ||||| || |||||||| ||||| || || |||||||    
T  16414605 gataaactgcttctcaagcaattcttctaactgttccttaaattcacccaactctgatgcagacattcgatacggcgcaatcgaaa 16414690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 79 - 379
Target Start/End: Original strand, 22436602 - 22436902
Alignment:
Q  79 ttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggat 178  Q
    |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| || | | |||||||||||| |||||| |||  ||| ||||    
T  22436602 ttcactctaatatgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaaccagccgatccatcaaatcatcaatcctcataagcggat 22436701  T
Q  179 acctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaagg 278  Q
    ||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||  | | |||||||||||| || | ||| ||||| || ||| | ||    
T  22436702 accgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgtttctatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccacgg 22436801  T
Q  279 tgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaa 378  Q
     ||||| | ||  || | ||||| |||||||||||| || || ||||| |||||||| |||   ||||| || |||||||| ||||| || || ||||||    
T  22436802 agaaacactcgccctgataaactacttctcaagcaactcttctaactgcttcttcaattcaccgaactccgatgcagacatccgatacggcgcaatcgaa 22436901  T
Q  379 a 379  Q
    |    
T  22436902 a 22436902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 21195024 - 21194766
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||||||| || | || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||   |||||| || | | ||||||| |||| |||||| ||| |||| ||    
T  21195024 ccttcactctattatgatgatatcctgatctgaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaaccagctgatccattaaatcatcaatcctcagaagcgg 21194925  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaa 276  Q
    ||||| |||||| || || |||||||||||||| || ||||| | |||||||| ||  || |||||||||||||| || | ||| ||||| || ||| |     
T  21194924 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgtcggtaatccacacacaacctcacgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccac 21194825  T
Q  277 ggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaa 335  Q
    || ||||| | ||| || | ||||| |||||||||||| || || ||||| ||||||||    
T  21194824 ggagaaacactcggcctgataaactgcttctcaagcaattcttctaactgcttcttcaa 21194766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 94 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 24932291 - 24932134
Alignment:
Q  94 tgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatag 193  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| || | | |||||||||||| ||||||  | ||||||||||||| ||| || || |    
T  24932291 tgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccgaccagctgatccatcaaatcatcaatcattggaagtggataccgatttttaatcg 24932192  T
Q  194 ttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctt 251  Q
    | || ||||||||||||| |||||| | |||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  24932191 tcactttgttcaactgccaataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttctt 24932134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 379
Target Start/End: Original strand, 23902487 - 23902763
Alignment:
Q  103 gatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgt 202  Q
    ||||||||||||||||| || || |||   ||||| || | | ||||||| |||| |||||| ||| |||| ||||||  |||||| || || |||||||    
T  23902487 gatctcaaatcaatcttactgaacacttccgcaccaaccagctgatccattaaatcatcaatcctcagaagcggatactgattcttaatcgtcaccttgt 23902586  T
Q  203 tcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaactt 302  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| ||| || ||||| |||||||| || | ||| | |||  | ||| | || ||||  | | ||||||  ||||     
T  23902587 tcaactgccgataatccacacacaacctcatgctcccatccttcttcttaaccaacaacattggaacaccccacggagaaaaactcagtctaatgaactg 23902686  T
Q  303 cttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaa 379  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||| |||   ||||| || |||||||| ||||| || || |||||||    
T  23902687 cttctcaagcaactcttccaactgcttcttcaattcacccaactctgatgcagacatccgatacggcgcaatcgaaa 23902763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 119
Target Start/End: Original strand, 6605886 - 6605997
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || ||    
T  6605886 cgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcacctttatctgatgataaccagacct 6605985  T
Q  108 caaatcaatctt 119  Q
    ||||||||||||    
T  6605986 caaatcaatctt 6605997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 179
Target Start/End: Original strand, 19861663 - 19861834
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || || || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  19861663 cgaagggcattaccttatactcataatgtccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacct 19861762  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggata 179  Q
    ||||| ||| |   | || || ||  ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  19861763 caaattaatttacatgaacacacgaccacccactaactgatccattaaatcatcaattctcggaagtcgata 19861834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 423 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 31414656 - 31414269
Alignment:
Q  423 catcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatga 522  Q
    ||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||  |||||| || | |||||||||| | |||||||| || |  || ||| | |||||||| ||    
T  31414656 catcagggatctcatcagggaacacttctggaaattcattcaccactggcaacctatcaatctcagcttgattttctaacgacaaatatgccattaaaga 31414557  T
Q  523 aaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttg 622  Q
    | ||||||  || ||||| ||||| || |  |||| ||| || |||||||| |||||  |  ||| ||| ||||   | ||||| ||||| || | |||     
T  31414556 atacatcagaattccatcacgttctagctatttcatctgtttcgtagacaagaactcaacttcaccttcttctttagcagaagaaaaatgcaccgtctta 31414457  T
Q  623 ctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaat 722  Q
    ||||| ||||| ||| ||||  |||| ||||||||||| ||||| || | ||| |||| |||||   |||| |  | ||||||||| ||   | |||| |    
T  31414456 ctaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccaattcattccaaaaataacatccatactcgtcaacgacaaacaaactaagtcggctacaaagt 31414357  T
Q  723 cacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    | | ||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  31414356 ctctaccaaacatagacaatggacatctcaagcaaactagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcc 31414269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 650 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 29301323 - 29301163
Alignment:
Q  650 tactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatt 749  Q
    ||||||||||||||||| || | ||| |||| ||||||    || || | |||||||||||| |   |||| || | ||||||||||||||| |||||      
T  29301323 tactctaaccagttcatcccaaaaattacatccatacccgataacggcaaacaaactaaatcaaccacaaagtctctaccaaacatagacaacggacaac 29301224  T
Q  750 tcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||| ||| || |||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  29301223 tcagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcc 29301163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 410 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 16269361 - 16269276
Alignment:
Q  410 ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||  ||| || |||| ||| ||||||||  |||||||    
T  16269361 ctctctggtggcacatcaggaatctcatcaggaaatacttctggaaattcattcactacaggtaacctgtcaatcacaacttgatt 16269276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 410 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 19864230 - 19864155
Alignment:
Q  410 ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatca 485  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||  ||||  |||||||||    
T  19864230 ctctctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttctggaaaatcgcataccacttgtagtttatcaatca 19864155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 409 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 31568981 - 31568895
Alignment:
Q  409 cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || || || || ||||| |||  |||||||| |||| | |||||||| ||||||||    
T  31568981 cctctctggcggcacatcaggaatctcatcagggaacacctccggaaactcattcaccaccgctagcttgtcaatcacagcttgatt 31568895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 653 - 804
Target Start/End: Original strand, 27357423 - 27357574
Alignment:
Q  653 tctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttca 752  Q
    |||||||| ||||| || | ||| |||| ||||||   ||| || |||||||||||||| |   ||||||| | |||||||||||| | ||||||   ||    
T  27357423 tctaaccaattcattccaaaaataacatccatacccgacaacggcagacaaactaaatcaaccacaaaatctctaccaaacatagatataggacacccca 27357522  T
Q  753 aacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 804  Q
     ||| || |||||| | || || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27357523 gacaaacaagagaagtggttactgaacccttagctggagtttcaacaaccat 27357574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 653; Significance: 0; HSPs: 64)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 653; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 10872841 - 10873657
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  10872841 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatct 10872940  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10872941 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 10873040  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  10873041 tgtcgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttct 10873140  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  10873141 caagcaagtcttccaactgtttcttcaactcaaataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaat 10873240  T
Q  408 -------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10873241 agaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcagggaattcacacaccaccggtaacctatcaatcactgcttga 10873340  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10873341 ttctcaatagataaagaagccatcaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcct 10873440  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  10873441 cttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccataccactcaa 10873540  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10873541 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtt 10873640  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  10873641 tcgacaaccatctctcc 10873657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 650; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 18179896 - 18180710
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18179896 cgaaaggcataactttatattcgtagtggccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcctttactttaatctggtgataacctgatct 18179995  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18179996 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctctgaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 18180095  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  18180096 tgccgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttct 18180195  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  18180196 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagtagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaat 18180295  T
Q  408 -------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18180296 agaaaactcgacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgctcga 18180395  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18180396 ttctcgacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaa--ctctgcaccactttcct 18180493  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18180494 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattgatgagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccataccactcaa 18180593  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18180594 gggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtt 18180693  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  18180694 tcgacaaccatctctcc 18180710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 633; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 44789470 - 44788654
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  44789470 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcttcgtcttttactttaatctggtgacaacctgatct 44789371  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44789370 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 44789271  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  44789270 tgtcgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttct 44789171  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  44789170 caagcaagtcttctaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaat 44789071  T
Q  408 -------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  44789070 agaaaattcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctgtcaatcactgcttga 44788971  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44788970 ttctcaatagataaagtagccatcaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcct 44788871  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  44788870 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccataccactcaa 44788771  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44788770 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtt 44788671  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  44788670 tcgacaaccatctctcc 44788654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 627; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Original strand, 8709758 - 8710572
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  8709758 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcctttaccttaatctggtgatatcctgacctca 8709857  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8709858 aatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 8709957  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
     |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  8709958 tcgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacactcggtctaacaaacttcttctca 8710057  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-- 407  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||       
T  8710058 agcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccgacttcgttccaggaacaagatcaatag 8710157  T
Q  408 -----------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
               || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8710158 aaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatcactgcttgatt 8710257  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8710258 ctcaatagataaagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcctct 8710357  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  8710358 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccataccgctcaaag 8710457  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8710458 gtagacaaactaaatccatttcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttc 8710557  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||    
T  8710558 gacaaccatctctcc 8710572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 627; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 11235330 - 11234516
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11235330 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgtgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgacctca 11235231  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11235230 aatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 11235131  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
     |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  11235130 tcgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctca 11235031  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-- 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||       
T  11235030 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaatag 11234931  T
Q  408 -----------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
               || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||    
T  11234930 aaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccacttgtagcttatcaaccactgcttgatt 11234831  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11234830 ctcaacagataaagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcctct 11234731  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  11234730 tcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccataccgctcaaag 11234631  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11234630 gtagacaaactaaatccatttcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttc 11234531  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||    
T  11234530 gacaaccatctctcc 11234516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 627; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 15159174 - 15158360
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15159174 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctca 15159075  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15159074 aatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 15158975  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  15158974 ccgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctca 15158875  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-- 407  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||       
T  15158874 agcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggctttgttccagggacaagatcaatag 15158775  T
Q  408 -----------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
               || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15158774 aaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatcactgcttgatt 15158675  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  15158674 ctcaatagataaagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactccgcaccactttcctct 15158575  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  15158574 tcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccataccgctcaaag 15158475  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15158474 gtagacaaactaaatccattttgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagccggagtttc 15158375  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||    
T  15158374 gacaaccatctctcc 15158360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 625; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 14334547 - 14335363
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||    
T  14334547 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttttgaaagctgtcttctgcatatcctcatcctttaccttaatctggtgataacctgacct 14334646  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14334647 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 14334746  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || |||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  14334747 tgtcgataatcaatacatagcctcatactaccgtctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacactcggtctaacaaacttcttct 14334846  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  14334847 caagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaat 14334946  T
Q  408 -------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                 || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  14334947 agaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatcgggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatcaccgcttga 14335046  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14335047 ttctcaatagatatagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcct 14335146  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  14335147 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccataccactcaa 14335246  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14335247 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtt 14335346  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  14335347 tcgacaaccatctctcc 14335363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 619; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 18588288 - 18587474
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18588288 aaaggcataactttattttcatagtgaccataacgcgttctgaaagttgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgatatcctgacctca 18588189  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18588188 aatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 18588089  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
     |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  18588088 tcgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacactcggtttaacaaacttcttctca 18587989  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-- 407  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||       
T  18587988 agcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaatag 18587889  T
Q  408 -----------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
               || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18587888 aaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccatcggtaacctatcaatcactgcttgatt 18587789  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18587788 ctcaatagataaagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcctct 18587689  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18587688 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtgattgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccataccactcaaag 18587589  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18587588 gtagacaaactaaatccatttcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttc 18587489  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||    
T  18587488 gacaaccatctctcc 18587474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 615; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Original strand, 13688194 - 13689008
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  13688194 aaaggcataactttatattcatagggaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctagtgataacctgacctca 13688293  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13688294 aatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 13688393  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  13688394 tcgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctca 13688493  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-- 407  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||       
T  13688494 agcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccagggacaagatcaatag 13688593  T
Q  408 -----------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
               || |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13688594 aaaactcaacttctctctctggagacacatcaagaatctcatttggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatcactgcttgatt 13688693  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  13688694 ctcaatagataaagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactccgcaccactttcctct 13688793  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  13688794 tcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccataccgctcaaag 13688893  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13688894 gtagacaaactaaatccatttcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttc 13688993  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||    
T  13688994 gacaaccatctctcc 13689008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 544; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 11551219 - 11550405
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11551219 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctaaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgacctca 11551120  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11551119 aatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcttggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 11551020  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
     |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| |||||||||    
T  11551019 tcgataatcaatacataacctcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaatttcttctca 11550920  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa--- 406  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||       
T  11550919 agcaaatcttccaactgtttcttcaactcagataattcggaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccaggaacaagatcaatag 11550820  T
Q  407 -----------gtcctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
                 ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  11550819 aaaactcaacttccctctctggaggcacatcaagaatttcatctggaaaaacatcaggaaaatcgcataccacttgtagcttatcaatcactgcttgatt 11550720  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  11550719 ctcaatagataaagaagccattaaagaaaacatcaaaataccatcacgttccatttgcttcagctgcttagtagataagaactctgcaccactttcctct 11550620  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    ||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  11550619 tcggcggaagaggaatacactgacttgctaaaacaattaatatgaacatggttgtactccaaccaattcatacccagaatcacatccataccgctcaaag 11550520  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11550519 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacaacgcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttc 11550420  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||    
T  11550419 gacaaccatctctcc 11550405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 532; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Original strand, 14956707 - 14957521
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  14956707 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatattttcatcttttactttaatttggtgataacctgacctca 14956806  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14956807 aatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 14956906  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
     |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| |||||||||    
T  14956907 tcgataatcaatacataacctcatactaccatctttcttctttactagtaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaatttcttctca 14957006  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa--- 406  Q
    ||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||       
T  14957007 agcaaatcttccaactgtttcttcagctcagataattcggaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccaggaacaagatcaatag 14957106  T
Q  407 -----------gtcctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
                 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  14957107 aaaactcaacttccctctctggaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaaatcgcataccacttgtagcttatcaatcactgcttgatt 14957206  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  14957207 ctcaatagataaagaagccattaaagaaaacatcaaaataccatcacgttccatttgcttcagctgcttagtagataagaactctgcaccactttcctct 14957306  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  14957307 tcggcggaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatatgaacatggttgtactccaaccaattcatacccaaaatcacatccataccgctcaaag 14957406  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14957407 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacaacgcaaacatacgagagaagtagtcactgaacccttagctggagtttc 14957506  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
     || |||||||||||    
T  14957507 aacgaccatctctcc 14957521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 510; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 809
Target Start/End: Original strand, 12689655 - 12690468
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12689655 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctcagagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgacctca 12689754  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12689755 aatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttactttgttcaactg 12689854  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
     |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |  |||| |||||| |||||||||    
T  12689855 tcgataatcaatacataacctcatactaccatctttcttctttactagtaaaactggcgctccccaaggtgaaacacttggtcgaacaaatttcttctca 12689954  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaaga------- 402  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||           
T  12689955 agcaaatcttccaactgtttcttcaactcagataattcggaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgtgccaggaacaagattaatag 12690054  T
Q  403 -----tcaagt--cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
         |||| |  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| || || |||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  12690055 aaaactcaacttccctctctggaggcacatccggaatttcatctggataaacttcgggaaaatcgcataccacttgtagcttatcaatcactgcttgatt 12690154  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||    
T  12690155 ctcaatagataaagacgccattaaagaaaacatcaaaataccatcacgttccatttgcttcagctgcttagtagataagaactctgcaccacattcttct 12690254  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12690255 tcggcggaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatatgaacatgcttgtactccaaccaattcatacccagaatcacatccataccactcaaag 12690354  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12690355 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacaacgcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttc 12690454  T
Q  796 gacaaccatctctc 809  Q
     || ||||||||||    
T  12690455 aacgaccatctctc 12690468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 483; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Original strand, 9590521 - 9591331
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9590521 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgacctca 9590620  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||| |||| |  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9590621 aatcaatcttgctgaaaaattttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcagaagtggatacctatacttgatagttaccttgttcaactg 9590720  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
     ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||| ||| ||||| ||     
T  9590721 acgatagtcaatacacaacctcatgctaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaataaatttcttttcg 9590820  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa--- 406  Q
    ||||| || || || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||       
T  9590821 agcaaatcttctaattgtttcttcaactcagctaacacggaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccaggaacaagatcaatag 9590920  T
Q  407 -----------gtcctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
                 |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||  ||||| |||||||||| ||||||||    
T  9590921 aaaactcgacttccctctctggaggcacatccggaatttcatctggaaaaacttcaggaaagtcgcataccacttgtagcttatcaatcaccgcttgatt 9591020  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||| ||||||||||| ||| || ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  9591021 ctcaatagataaagaagtcatcaaagaatacatcaaaataccatcgcgttccatttgcttcagctgcttagtagataagaactctgcaccactttcctct 9591120  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    ||  ||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  9591121 tcagcggaagagaaatacattgacttgctaaaacaattgatatgtacatggttgtactctaaccaattcatacctagaatcacatccataccgctcaaag 9591220  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9591221 gt----aaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagataaaggacatctcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttc 9591316  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||    
T  9591317 gacaaccatctctcc 9591331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 150 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 17704432 - 17703758
Alignment:
Q  150 catcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttc 249  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  17704432 catcaaatcatcaattctcagaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgacgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttc 17704333  T
Q  250 tttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcgg 349  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||| || |  ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  17704332 ttcactagcaaaactggcgctccccaaggtgacacacttggtctaacaaatttcttttcaagcaaatcttctaactgtctcttcaactcagctaactcgg 17704233  T
Q  350 aagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaagt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctc 435  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||                ||||||||||||||||||||| || ||    
T  17704232 atgcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcccggaacaagatcaatagaaaactcgacttccctctctggaggcacatcaggtatttc 17704133  T
Q  436 atctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagata 535  Q
     ||| |||||||||||||||| ||  | |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  17704132 gtctagaaaaacttcaggaaagtcggaaaccacttgtagcttatcaatcactgcttgattctcaatagataaagaagccatcaacgaaaacatcaaaata 17704033  T
Q  536 ccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaa 635  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |    
T  17704032 ccatcgcgttccatttgcttcagcttcttagtagataagaactctgcaccactttcctcttcagcggaagagaaatacactgacttgctaaaacaattga 17703933  T
Q  636 taagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacat 735  Q
    || |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17703932 tatgaacatggttgtattctaaccaattcatacccagaatcacatccataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacat 17703833  T
Q  736 agacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17703832 agacaaaggacatcgcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttaactggagtttcgacaaccatctctcc 17703758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 410 - 810
Target Start/End: Original strand, 8200615 - 8201015
Alignment:
Q  410 ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaag 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8200615 ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctgtcaatcactgcttgattctcaatagataaag 8200714  T
Q  510 aagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaa 609  Q
     |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8200715 tagccatcaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaa 8200814  T
Q  610 atgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaa 709  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8200815 atgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccataccactcaaaggtagacaaactaaa 8200914  T
Q  710 tccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctc 809  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8200915 tccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctc 8201014  T
Q  810 c 810  Q
    |    
T  8201015 c 8201015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 14041846 - 14042662
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14041846 cgaaaggcatcactttgtactcataatgtccataacgcgttctaaaagctgtcttctccatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatct 14041945  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||     
T  14041946 caagtcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaagttctcaattcttggaagtggacacctattctttatcgttactttgttcaat 14042045  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  14042046 tgtcgatagtcaatgcacaatctcatactaccatctttcttctttactagcaataccggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaacttcttat 14042145  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc--- 404  Q
    ||||||| ||||| |  ||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| || || | ||| ||||| |||||||||||       
T  14042146 caagcaaatcctctagttgtttcttcaactcagccaactcagaagctgacatacggtaaggtgtcatagacacagactttgttcccggaacaagatcaat 14042245  T
Q  405 ----aagtc-------ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
        || ||       || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  14042246 cgaaaattcaacttctctttctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttctggaaaatcacataccacctgtagcttatcaatcactgcttga 14042345  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| ||| || |||||||| || ||||||||||| || | ||| || || | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  14042346 ttctcaatagacaaggaagccatcaaagaaaacatcaaaattctatcacgatctaattgcttcagctgcttagtagacaagaactctgcgccactttctt 14042445  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||||||||  || ||||| |||||| |||||||  |||| |||||||| |||||||||||||| |   | || |||| ||||||||| ||    
T  14042446 cttcagcagaagagaaatacaccgacttactaaaaaaattaatgtgaacatggttgtattctaaccagttcatgctagggattacatccataccactaaa 14042545  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||| |||||| || || |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |  |||| || |||||| |||||||  ||||||||||| |||||    
T  14042546 aggtaaacaaaccaagtcaatttcaaaatcatgatcaaacatagacaaaggacatcttgaacacacaagagaagtagtcacaaaacccttagcttgagtt 14042645  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  14042646 tcgacaaccatctctcc 14042662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 14351876 - 14352692
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14351876 cgaaaggcatcactttgtactcataatgtccataacgcgttctaaaagctgtcttctccatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatct 14351975  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||     
T  14351976 caagtcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaagttctcaattcttggaagtggacacctattctttatcgttactttgttcaat 14352075  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  14352076 tgtcgatagtcaatgcacaatctcatactaccatctttcttctttactagcaataccggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaacttcttat 14352175  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc--- 404  Q
    ||||||| ||||| |  ||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| || || | ||| ||||| |||||||||||       
T  14352176 caagcaaatcctctagttgtttcttcaactcagccaactcagaagctgacatacggtaaggtgtcatagacacagactttgttcccggaacaagatcaat 14352275  T
Q  405 ----aagtc-------ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
        || ||       || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  14352276 cgaaaattcaacttctctttctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttctggaaaatcacataccacctgtagcttatcaatcactgcttga 14352375  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| ||| || |||||||| || ||||||||||| || | ||| || || | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  14352376 ttctcaatagacaaggaagccatcaaagaaaacatcaaaattctatcacgatctaattgcttcagctgcttagtagacaagaactctgcgccactttctt 14352475  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||||||||  || ||||| |||||| |||||||  |||| |||||||| |||||||||||||| |   | || |||| ||||||||| ||    
T  14352476 cttcagcagaagagaaatacaccgacttactaaaaaaattaatgtgaacatggttgtattctaaccagttcatgctagggattacatccataccactaaa 14352575  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||| |||||| || || |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |  |||| || |||||| |||||||  ||||||||||| |||||    
T  14352576 aggtaaacaaaccaagtcaatttcaaaatcatgatcaaacatagacaaaggacatcttgaacacacaagagaagtagtcacaaaacccttagcttgagtt 14352675  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  14352676 tcgacaaccatctctcc 14352692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 150 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 16727360 - 16726845
Alignment:
Q  150 catcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttc 249  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  16727360 catcaaatcatcaattctcagaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgacgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttc 16727261  T
Q  250 tttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcgg 349  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||| || |  ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  16727260 ttcactagcaaaactggcgctccccaaggtgacacacttggtctaacaaatttcttttcaagcaaatcttctaactgtctcttcaactcagctaactcgg 16727161  T
Q  350 aagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa--------------gtcctctctggaggcacatcaggaatctc 435  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||                ||||||||||||||||||||| || ||    
T  16727160 atgcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcccggaacaagatcaatagaaaactcgacttccctctctggaggcacatcaggtatttc 16727061  T
Q  436 atctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagata 535  Q
     ||| |||||||||||||||| ||  | |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  16727060 gtctagaaaaacttcaggaaagtcggaaaccacttgtagcttatcaatcactgcttgattctcaatagataaagaagccatcaacgaaaacatcaaaata 16726961  T
Q  536 ccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaa 635  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |    
T  16726960 ccatcgcgttccatttgcttcagcttcttagtagataagaactctgcaccactttcctcttcagcggaagagaaatacactgacttgctaaaacaattga 16726861  T
Q  636 taagaacgtggttgta 651  Q
    || |||| ||||||||    
T  16726860 tatgaacatggttgta 16726845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 10 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 15147001 - 15146416
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    ||||||||||||||||| || || || ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15147001 aaaggcataactttatactcgtaatgtccatatcgcgttttaaaagccgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctca 15146902  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  15146901 aatctatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattcttggaagtggatacctattcttcatagttactttattcaactg 15146802  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
     ||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| || |||||| |||||||||| |  ||| |||||||||| ||||||    
T  15146801 acgataatcaatgcataacctcatactaccgtctttcttcttcactaacaaaacaggtgctccccaaggtgaaacacttggtataacaaactttttctca 15146702  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc----- 404  Q
    ||||| || || ||||||||||| ||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||| |||  | ||  ||||||||||||||||||||||         
T  15146701 agcaaatcttctaactgtttctttaactcagctaactcagaagttgacatacgataaggtgtcataaacacaagcttcgttccaggaacaagatcaatcg 15146602  T
Q  405 --aagtc-------ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
      || ||       || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||  ||||  |||||||||||||||||||    
T  15146601 aaaattcaacttctctttctggaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttctggaaaatcacataccacttgtagtttatcaatcactgcttgatt 15146502  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctg 581  Q
    ||||| ||| || |||||||| |  ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15146501 ctcaatagacaaggaagccatcacggaaaaaattaaaataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctg 15146416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 8 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 15469 - 15169
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15469 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgacct 15370  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15369 caaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcctcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 15270  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||||||| | | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| |||||||    
T  15269 tgacgatagtcaatacactatctcatgctaccatctttcttcttcactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaatttcttct 15170  T
Q  308 c 308  Q
    |    
T  15169 c 15169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 258 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 14150304 - 14149862
Alignment:
Q  258 caaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagac 357  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14150304 caaaactggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaatttcttctcaagcaaatcttctaattgtttcttcaactcagctaactcggaagcagac 14150205  T
Q  358 atacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaagt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaa 443  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||                ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  14150204 atacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccaagaacaagatcaatagaaaactcgacttccctctctagaggcacatcaggaatttcatctggaa 14150105  T
Q  444 aaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcg 543  Q
    || |||||||||| || || |||||  || || ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||    
T  14150104 aa-cttcaggaaagtcgcataccacttgttgcttatcaattaccgcttgattctcaatagataaagaagccatcaaagaatacatcaaaataccatcgcg 14150006  T
Q  544 ttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacg 643  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||| |||      
T  14150005 ctccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcctcttcagcggaagagaaatacactcacttgctaaaacaattgatatgaaaa 14149906  T
Q  644 tggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacatacc 687  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  14149905 tggttgtactctaaccaattcatacccagaatcacatccatacc 14149862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 52 - 804
Target Start/End: Original strand, 15626720 - 15627485
Alignment:
Q  52 aaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatcca 151  Q
    ||||| ||||||| | |||| ||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  15626720 aaagccgtcttcttcgtatcttcatctttcagtttaatctggtgatagcccgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatcca 15626819  T
Q  152 tcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctt 251  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || || |  || ||||||||| |||||| ||| || |||| ||| |||||||||||||| ||    
T  15626820 tcaaatcatcaattcttggaagtggatacctattctttatcgtcattttattcaactgctgataattaatgcataacctcatgctaccatctttcttttt 15626919  T
Q  252 tactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaa 351  Q
     || | ||| || || |||||  |||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||  |||||  ||    
T  15626920 aaccaacaacaccggtgctcctcaaggtgaaacactcggtcttacaaacttcttatcaagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagccaactcataa 15627019  T
Q  352 gcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa--------------gtcctctctggaggcacatcaggaatctcat 437  Q
    || |||||||| |||||   ||| || || |||||||| || |||||||||||||                ||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  15627020 gccgacatacggtaaggcatcatagacacaggcttcgtacccggaacaagatcaatcgaaaattaaacttccctctctggcggcacattagggatctcat 15627119  T
Q  438 ctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagatacc 537  Q
    | |||||||||||  |||| ||| |||| ||  | | | ||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||  |    
T  15627120 caggaaaaacttctagaaactcatacacaactcg-aacttatcaattactgcttgattctcaacagacaaggacgccatcaaagaaaacatcaagatttc 15627218  T
Q  538 atcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaata 637  Q
    ||| || || |   ||||||||||||||||||  || ||||| || ||||| || |||||  | ||||| ||||  || |||||  ||||||||||||||    
T  15627219 atcacgctctaacagcttcagctgcttagtagttaagaactccgctccactctcttcttccgcagaagaaaaatacaccgacttattaaaacaattaata 15627318  T
Q  638 agaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatag 737  Q
     |||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||| ||| ||||||||| | | |||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |    
T  15627319 tgaacatggttatactccaaccagttcataccaaggattacatccattccactcaaatgcaaacaaactaaatcaatttcaaagtctcgaccaaacatcg 15627418  T
Q  738 acaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 804  Q
     ||||| |||  | | ||| || | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15627419 gcaaagaacaccttagacacactaaagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgaaaaccat 15627485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 8 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 48813371 - 48812791
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| |||  |||||| || || |||||||| || || || | |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48813371 cgaaaggcatcactgaatattcgtaatgtccataacgtgtcctaaaggttgtcttctgcatatcctcgtctttcactttaatttggtgataacctgatct 48813272  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||| || ||||| || ||||||    
T  48813271 caaatcaatcttgctaaacacacgtgcgcccactaactgatccatcaaatcatcaattcttggaagtggataccaatactttatcgttactttattcaac 48813172  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||| |||||||||| | || ||| ||||||||||| |    
T  48813171 tgtcgataatcaatacataacctcatgctaccatctttcttcttaacaagtaacaccggcgctccccaaggtgaaacactcgatcttacaaacttcttat 48813072  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||  | ||| || || |||||||| || |||||||||||||     
T  48813071 caagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagccaactcagaagccgacatacggtaagaagtcatagacacaggcttcgtacccggaacaagatcaat 48812972  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||  | | | ||||||| |||||||||    
T  48812971 tgaaaattcaacttccctttctggcggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttctggaaattcacacacaactcgcaacttatcaattactgcttga 48812872  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaa 574  Q
    ||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| || ||||| || || |  ||||||||||||||| ||| ||||    
T  48812871 ttctcaacagacaaggacgccatcaaagaaaacatcaaaattccatcacgctctaactgcttcagctgcttactagtcaaa 48812791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 15100700 - 15099884
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || |||||||  || |||||||| || || || || |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  15100700 cgaaaggcatcaccttatatttgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggtcgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacct 15100601  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||| ||||| || || || |||||||||||| ||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  15100600 caaatcaattttgctgaatacacgagcacccactaactgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctattctttatcgtaaccttgttcaac 15100501  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||||||||| || |||| ||| || ||||| |||||||| || | ||| || ||||||||| | |||||||| |  ||||| ||||| ||||| |    
T  15100500 tgacgataatcaatgcataacctcatgctgccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgctccccacggtgaaacacttggtcttacaaatttcttat 15100401  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||     
T  15100400 caagcaagtcctccaattgtttcttcaattcagctaactcggacgccgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaaggtcaat 15100301  T
Q  408 t----------cctc----tctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |          ||||    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| || || | | | |||||||| ||||||    
T  15100300 tgaaaattcaacctctctttctggtggcacatctggaatctcatcaggaaaaacttctggaaattcattcacaactggcaacttgtcaatcacagcttga 15100201  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    || || |  || ||  | ||||| || ||||||||||  || ||||| || ||||  ||||||| ||| |||||||| |  ||||| || ||||| || |    
T  15100200 ttttccaatgacaagtatgccatcaaagaaaacatcagaattccatcacgctccaactgcttcaactgtttagtagataggaactcagctccactctctt 15100101  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||| ||||| || | |||| |||| ||||| ||| ||||  |||| ||||||||| ||||||| || | |||||||| ||||||  ||||    
T  15100100 cttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttgttaaagcaattgatatgaactcggttatactctaactagttcatcccaaaaatcacatccatacccgtcaa 15100001  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     |||| ||||||||  || | |||||| || | |||||||||||||||  ||||  | | ||| || |||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  15100000 cggtaaacaaactaggtcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacagacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtt 15099901  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || |||||||| |||||    
T  15099900 tcaacaaccatttctcc 15099884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 14262342 - 14261527
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||||||  | || || || ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||    
T  14262342 cgaaaggcatcaccttatattcataatgaccatattgtgtcctaaaggccatcttctgcatatcctcatccttcaccttaatatgatggtaacctgacct 14262243  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| || || || |||||||||||| ||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||| || || || || |||| |    
T  14262242 caaatcaatcttgctgaacacacgagcacccactaactgatccattaaatcatcaaacctcggaagtggatacctattctttatcgtcactttattcagc 14262143  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || |  ||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||| || | ||| || ||||||||| | |||||||| |  ||||| ||||| ||||| |    
T  14262142 tgacagtaatctatacacaacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgctccccacggtgaaacacttggtcttacaaatttcttat 14262043  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |     
T  14262042 caagcaagtcctccaactgtttcttcaattcagctaactcggacgccgacatacggtaaggtgccatcgacaccggcttcgttccaggcacaagatcgat 14261943  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |  ||||||||||| ||||||    
T  14261942 tgaaaattcaacctccctctctggtggcacatctggaatctcatcaggaaaaacttctggaaattcactcacaaccggcaatctatcaatcacagcttga 14261843  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||| |  || ||  | ||||| || |||||||| |  ||  |||| ||||| |  ||||||| ||| || |||| ||| ||||| ||  | || || |    
T  14261842 ttctccaatgacaagtacgccatcaaagaaaacattagaatttcatcacgttctaactgcttcaactgttttgtagtcaagaactcagcttcgctctctt 14261743  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    | ||  | ||||| ||||| || | ||| ||||| ||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||   |||    
T  14261742 cctcagcagaagaaaaatgcaccgtcttactaaagcaattaatatgaatacggttatactctaaccagttcatcccaaaaatcacatccatacccgacaa 14261643  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     || ||||| |||| ||| | ||| || || | ||||||||||||||| |||||  ||||||| || |||||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  14261642 cggcagacatactagatcgacttc-aattctctaccaaacatagacaatggacaactcaaacaaacaagagaagtagttactaaacccttagctggagtt 14261544  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || |||||||| |||||    
T  14261543 tcaacaaccatttctcc 14261527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 8 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 26092895 - 26092085
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||    
T  26092895 cgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacct 26092796  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgt-gcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 206  Q
    |||||||||||| ||||||| || | ||||| || ||| |||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  26092795 caaatcaatcttactaaaaa-tcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttcttgatcgtaactttgttcaa 26092697  T
Q  207 ctgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttc 306  Q
    ||| || ||||| |||||||  | |||||||||||| ||||||||||| | ||| || || |||||| |||||||||| |  ||||| |||||||||||     
T  26092696 ctgacggtaatctatacacagtctcatactaccatccttcttctttaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaacttctta 26092597  T
Q  307 tcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    || | || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  26092596 tctaacaggtcctccaactgtttcttcaactcagctaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggcttagttcctggaacaagatcaa 26092497  T
Q  407 gt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttg 492  Q
     |              ||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||  ||| || ||||  | ||||||||| |||||    
T  26092496 ttgaaaattcaacctccctctctggtggcacatcaggaatctcatcagggaatacttctggaaattcattcactacaggtaaaccatcaatcacagcttg 26092397  T
Q  493 attctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcc 592  Q
    ||| || |  || ||    |||||||  ||| |||||| ||||||||| ||||| |  || |||| ||| || ||||||| || |||  |  ||| |||     
T  26092396 attttctaacgacaattgtgccattagagaatacatcaggataccatcacgttcaaactgtttcatctgtttcgtagacagaagctcaacctcaccttct 26092297  T
Q  593 tcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactca 692  Q
    |||||  | |||||||||||||| | ||| ||||| || || ||| ||||  | || ||||||||||| |||||||| |  || |||| ||||||  |||    
T  26092296 tcttcagcagaagagaaatgtaccgtcttactaaagcagttgatatgaactcgattatactctaaccaattcataccaaagataacatccatacccgtca 26092197  T
Q  693 aaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagt 792  Q
    | || |||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||| | ||||||   || ||| || |||||| | || || |||||||||||||||||    
T  26092196 acggcagacaaactaaatcaatcacaaaatctctaccaaacatagatataggacaccgcagacaaacaagagaagtggttactgaacccttagctggagt 26092097  T
Q  793 ttcgacaaccat 804  Q
    ||| ||||||||    
T  26092096 ttcaacaaccat 26092085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 13675604 - 13676419
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || || ||||| || || ||||| || || || || || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  13675604 cgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctccatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacct 13675703  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| ||||||||| | |||||   ||||||||||||| ||||||| |  | |||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||    
T  13675704 caagtcaatcttgttgaaaacctttgcacccactaactgatccattatgtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctttattgtaactttgttcaac 13675803  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||| || || | ||| ||| | ||||||||||| || | ||| |  || |||||| |||||||||| |   |||| ||||||||||| |    
T  13675804 tgacgatagtcaatgcataatctcatgctatcgtctttcttcttaaccaacaacatcggtgctccccaaggtgaaacacttagtcttacaaacttcttat 13675903  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||| ||||     
T  13675904 caagcaagtcctccaactgtttctttaattcagctaactcagaagctgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctagaacaaggtcaat 13676003  T
Q  408 t-------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgat 494  Q
    |             |||||||||  ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||  ||| |  || | ||| |||||||  |||||||    
T  13676004 taaaattcaacctccctctctggtagcacatctggaatctcgtccggaaaaacttcaggaaactcattcacaattggcaacctgtcaatcagagcttgat 13676103  T
Q  495 tctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctc 594  Q
    |||| |  || ||| | ||||| || |||||||| |  || ||||| || ||||  |||||||  || ||||||| ||  |||||||| ||||| || ||    
T  13676104 tctctaacgacaaatatgccatcaaagaaaacataagaattccatcacgctccaactgcttcaattgtttagtagtcaggaactctgctccactctcttc 13676203  T
Q  595 ttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaa 694  Q
    |||  | ||||| ||||| || | ||||||||| ||||| ||| ||||  |||| ||||||||||||||||| || | ||| |||| ||| ||  ||||     
T  13676204 ttccgcagaagaaaaatgcaccgtcttgctaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaataacatccattcccgtcaac 13676303  T
Q  695 ggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagttt 794  Q
    |||| ||| ||||| || | |||||| || | ||||||||||||||| |||||  | | ||| || |||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  13676304 ggtaaacacactaagtcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagttt 13676403  T
Q  795 cgacaaccatctctcc 810  Q
    | |||||||| |||||    
T  13676404 caacaaccatttctcc 13676419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 8 - 406
Target Start/End: Original strand, 13023509 - 13023907
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || || ||||| || |||||||| || || || || || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||    
T  13023509 cgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatcattcacctttatctgatggtaaccagacct 13023608  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||||||||| ||    |||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || || || |||||||||    
T  13023609 caagtcaatcttgctaaacaccttcgcacccaccaattgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatatctattctttatcgtaactttgttcaac 13023708  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || || |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||| || || |||||| |||||||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  13023709 tgacggtaatcaatgcacaacctcatactaccatccttcttctttaccaacaacaccggagctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaacttcttat 13023808  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||  ||||||| ||||    
T  13023809 caagcaagtcctccaattgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatacggtaaggtgccatcgacaccggcttcgttcctagaacaaggtcaa 13023907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 8 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 16070394 - 16069722
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || ||||||||||| || ||||| || || || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  16070394 cgaaaggcatcaccttatattcataatgtccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacct 16070295  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||| || ||||  || || |||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||| || || || || |||| |    
T  16070294 caaatcaattttactaagcacacgagcacccactaactggtccatcaagtcatcaattctcggaagtggatacttgttctttatcgtcactttattcagc 16070195  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || || ||||| |||||||||| | |||||| ||| |||||||| || | ||| || ||||||||| | |||||||| |  ||||| ||||| ||||| |    
T  16070194 tgacggtaatctatacacaacctcgtactactatccttcttcttaaccaacaataccggcgctccccacggtgaaacacttggtcttacaaatttcttat 16070095  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||     
T  16070094 caagcaaatcctccaactgtttcttctacttagctaactcggacgccgacatacgataaggtgccatcgacatcggcttcgttcctggaacaaggtcaat 16069995  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| || || |  ||||||||||| ||||||    
T  16069994 tgaaaattcaacctccctctctggtggcacatctggaatctcatcaggaaaaacttctggaaattcattcacaactggcaatctatcaatcacagcttga 16069895  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||| |  || ||  | |||||||| ||||||||||  || ||||| || ||||  ||||||| ||| ||| |||  |  ||||| || ||||| || |    
T  16069894 ttctccaatgacaagtatgccattaaagaaaacatcagaattccatcacgctccaactgcttcaactgtttattagttaggaactcagctccactctctt 16069795  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcat 666  Q
    ||||  | ||||| ||||| || | ||| ||||| ||||||||| ||||   ||| ||||||||||| |||||    
T  16069794 cttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttactaaagcaattaatatgaactcagttatactctaaccaattcat 16069722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 14139831 - 14140647
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || || || || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||    
T  14139831 cgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacct 14139930  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| ||||| || ||||||||   ||||||||| | | | |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||     
T  14139931 caagtcaatattactaaaaacctttgcacccaccagctggtccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatacctattcttaattgtaactttgttcaat 14140030  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||| ||||||| ||| ||||| || || |||||||| | ||| || ||||||||| | |||||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  14140031 tgacgatagtcaatgcacaacctcatgctaccttcctttttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgaaacactgggtcttacaaacttcttat 14140130  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa- 406  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| || || || |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||     
T  14140131 caagcaagtcttccaactgtttcttcaattcagctaattcagatgctgacatatgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaaggtcaat 14140230  T
Q  407 -------------gtcctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                   ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| || || || || |||  ||||||  ||| ||| |||||||| ||||||    
T  14140231 cgaaaactccacctccctctctggtggcacatcaggaatctcattaggaaacacctccgggaactcattcaccacatgtaacctgtcaatcacagcttga 14140330  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    || || |  || | | | |||||||  ||| ||||||| || ||||| ||||| |  ||||||| |||||| |||  ||| |||||  | ||||  || |    
T  14140331 ttttctaacgacagatatgccattagagaatacatcaaaattccatcacgttctaactgcttcatctgctttgtattcaagaactcaactccaccctctt 14140430  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||| |||||||| | ||| |||||||| || ||| ||||  |||| ||||||||||| ||||| || | ||| |||| ||| ||  ||||    
T  14140431 cttcagcagaagaaaaatgtaccgtcttactaaaacagttgatatgaactcggttatactctaaccatttcatcccaaaaataacatccattcccgtcaa 14140530  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     || | ||| ||||| || |  |||||||| | |||||||||||| | ||||||  ||||||| || |||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  14140531 cggcaaacagactaagtctacctcaaaatctctaccaaacatagatataggacacctcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtt 14140630  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || |||||||| |||||    
T  14140631 tcaacaaccatttctcc 14140647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 16948569 - 16947753
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || || ||||| || || ||||| || || || || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||    
T  16948569 cgaaaggcatcaccttttattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacct 16948470  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| ||||||||||| || ||   ||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||  | || || ||||||    
T  16948469 caagtcaatcttgctgaacacctttgcacccactaactgatccattaagtcatcaattctcgggagtggatacctattctttatcataactttattcaac 16948370  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || || |||||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||| |||| ||| ||  |||||||| |||||||||  |  ||||| ||||||||||| |    
T  16948369 tgacggtaatcaatgcacaatctcatgctaccatccttcttcttaactaacaacaccagcgctccccaaggtgaaaaacttggtcttacaaacttcttat 16948270  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||     
T  16948269 caagcaggtcttccaactgtttcttcaatttagctaactcagaagctgacatacgataaggtgccatcgacaccggctttgttcctggaacaaggtcaat 16948170  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||  ||||||  | | | | |||||||| ||||||    
T  16948169 tgaaaattcaacctccctctctggtggcacatcagaaatctcatcaggaaacacttctggaaattcattcaccactagcaacttgtcaatcacagcttga 16948070  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    || || |  || ||    |||||||| ||| ||||||  || ||||| ||||| || || |||| ||  || |||||||| | ||   |  ||| ||| |    
T  16948069 ttttctaacgacaagtttgccattaaagaatacatcagaattccatcacgttctagctgtttcatctattttgtagacaagagctaaacttcaccttctt 16947970  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||| ||||| || | ||| ||||| ||||| ||| ||||  |||| ||||||||||| ||||| || | ||| |||| ||||||  ||||    
T  16947969 cttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttactaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccaattcattccaaaaataacatccatacccgtcaa 16947870  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     || |  |||||||| || | | |||| || | ||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  16947869 cggcaagcaaactaagtcgactacaaagtctctaccaaacatagacaatggacatctcaagcaaactagagaagtagttactgaacccttagctggagtt 16947770  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || |||||||| |||||    
T  16947769 tcaacaaccatttctcc 16947753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 18052050 - 18051234
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || || || || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||    
T  18052050 cgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacct 18051951  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||| || || ||   ||||||||||| | | |||||||| | |||||| |||||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||     
T  18051950 caagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatcaatcctcggaagcggatatctattcttaattgtaactttgttcaat 18051851  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| || ||||| || | ||| || || |||||| | || ||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  18051850 tgacgatagtcaatgcacaacctcatactaccatcctttttcttcaccaacaacacaggtgctccccacggcgaaacactgggtcttacaaacttcttat 18051751  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||| || || ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || |||| |||||| || ||||| |||||||||||||| ||||     
T  18051750 caagtaaatcttccaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatacggtacggtgtcatcgacaccggctttgttccaggaacaaggtcaat 18051651  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              ||||||||| |||||||||||||||||||| || || || || ||||| |||  |||||| | |||| | |||||||| ||||||    
T  18051650 tgaaaactccacctccctctctggcggcacatcaggaatctcatcagggaacacctctggaaactcattcaccactgctagcttgtcaatcacagcttga 18051551  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    || || |  || | | | |||||||  ||||||||||  || ||||| ||||| |  ||||||| |||||| ||||| ||||  ||  | ||||| || |    
T  18051550 ttttctaacgacagatatgccattagagaaaacatcagaattccatcacgttctaactgcttcatctgctttgtagataaaatttcaactccactctctt 18051451  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||| ||||| || | |||| |||| ||||| ||| ||||  |||| ||||||||||| ||||| || | ||| |||| ||| ||  ||||    
T  18051450 cttcagcagaagaaaaatgcacagtcttgttaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccaattcatcccaaaaataacatccatccccgtcaa 18051351  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     |||| ||| |||||||| | ||||||||| | |||||||||||| |  |||||  |||| || || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  18051350 cggtaaacacactaaatctacttcaaaatctctaccaaacatagaaattggacacctcaagcaaaccagagaagtagtcactgaacccttagctggagtt 18051251  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || |||||||| |||||    
T  18051250 tcaacaaccatttctcc 18051234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 8 - 804
Target Start/End: Original strand, 49154453 - 49155263
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||    
T  49154453 cgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacct 49154552  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgt-gcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 206  Q
    |||||||||||| ||||| | || | ||||| || ||| |||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  49154553 caaatcaatcttactaaata-tcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttcttgatcgtaactttgttcaa 49154651  T
Q  207 ctgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttc 306  Q
    ||| || ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| | ||| || || |||||| |||||||||| |  ||||| ||||| || ||     
T  49154652 ctgacggtaatctatacacaatctcatactaccatccttcttctttaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaatttttta 49154751  T
Q  307 tcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    || | || ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  49154752 tctaacaggtcctccaactgtttcttcaactcagccaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggcttagttcctggaacaagatcaa 49154851  T
Q  407 gt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttg 492  Q
     |              ||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||  ||| || ||||  | ||||| ||| |||||    
T  49154852 ttgagaattcaacctccctctctggtggcacatcaggaatctcatcagggaatacttctggaaattcattcactacaggtaaaccatcaaccacagcttg 49154951  T
Q  493 attctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcc 592  Q
    ||| || |  || ||    |||||||  ||| |||||| ||||||||| ||||| |  || |||| ||| || ||||||| || |||  |  ||| |||     
T  49154952 attttctaacgacaactgtgccattagagaatacatcaggataccatcacgttcaaactgtttcatctgtttcgtagacagaagctcaacctcaccttct 49155051  T
Q  593 tcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactca 692  Q
    |||||  | |||||||||||||| | ||| ||||| || || ||| ||||  | || ||||||||||| |||||||| | ||| |||| ||||||  |||    
T  49155052 tcttcagcagaagagaaatgtaccgtcttactaaagcagttgatatgaactcgattatactctaaccaattcataccaaaaataacatccatacccgtca 49155151  T
Q  693 aaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagt 792  Q
    | || || ||||| ||||| ||  ||||||| | |||||||||||| |  |||||   || ||| || |||||| | || || |||||||||||||||||    
T  49155152 acggcaggcaaaccaaatcaatcacaaaatctctaccaaacatagatatgggacaccgcagacaaacaagagaagtggttactgaacccttagctggagt 49155251  T
Q  793 ttcgacaaccat 804  Q
    ||| ||||||||    
T  49155252 ttcaacaaccat 49155263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 406
Target Start/End: Original strand, 12458792 - 12459190
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||    
T  12458792 cgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgttctaaaggccgtcttctgcatatcctcatctttcacctttatctgatggtaaccagacct 12458891  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||| ||||| || || |||   ||||| |||||| ||||||| |  | |||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||    
T  12458892 caaatcgatcttactgaacactttcgcacctactaactgatccattaggtcatcaatcctcggaagcggatacctgttctttattgtaactttgttcaac 12458991  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || || |||||||| ||||  | |||||||||||| |||||||| || | ||| || ||||||||  |||||||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  12458992 tgacggtaatcaatgcacagtctcatactaccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgctcctcaaggtgaaacacttggtcttacaaacttcttat 12459091  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||| |||||||| ||||    
T  12459092 caagcaagtcttccaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatacgaaaaggtgccatcgacaccggcttcattcctggaacaaggtcaa 12459190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 11386526 - 11385710
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || || ||||| || |||||| |||| || || ||  | |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||    
T  11386526 cgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccacaacgtgtcctaaagtccgtcttctgcatatcttcatccttcacctttatctgatggtaacctgacct 11386427  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||| |||||||    |||||| || ||| |||||||||| |  ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||    
T  11386426 caagtcaatcttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaatcctcggaagcggatacctgttctttatcgtaactttgttcaac 11386327  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || || || || || ||||| | ||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||| | || || || | |||| | ||||||||||| |    
T  11386326 tgacggtagtctatgcacaatctcatgctaccatccttcttctttaccagcaacacaggcgctccccacggcgagacactcggttttacaaacttcttat 11386227  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||| || || ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||     
T  11386226 caaacaagtcttccaactgtttcttcaattcagccaactccgatgctgacatacgatatggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaaggtcaat 11386127  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              |||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||  ||| |||||||  || |||||||| || |||    
T  11386126 tgaaaactctacctccctctccggtggcacatcagggatctcatcaggaaacacctcagggaattcattcactaccggtaatctgtcaatcacagcctga 11386027  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||| |  || ||||| ||||| || ||| ||||||  || ||||| ||||| |  |||||||  || || |||| ||| || ||  | ||||  || |    
T  11386026 ttctccaacgacaaagatgccatcaaagaatacatcagaattccatcacgttctaactgcttcatatgtttcgtagtcaagaattcaactccaccctctt 11385927  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||| ||||| || | ||||||||| || || |||  |||  |||| ||||||||||| ||||| || | ||| |||| ||| ||  ||||    
T  11385926 cttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttgctaaagcagttgatattaactcggttatactctaaccaattcatcccaaaaataacatccattcccgtcaa 11385827  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     || | ||||||||| || |  |||||||| | |||||||||||| | ||||||  ||||||| || |||||| ||||  | ||||||||||||||||||    
T  11385826 cggcaaacaaactaagtctacctcaaaatctctaccaaacatagatataggacacctcaaacaaacaagagaagtagttcctgaacccttagctggagtt 11385727  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || ||||||||||||||    
T  11385726 tcaacaaccatctctcc 11385710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 13966765 - 13966264
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || || || |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||    
T  13966765 cgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggtcgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaaccagatct 13966666  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||||||||| ||||||| |   ||||| || ||| |||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||    
T  13966665 caaatcaatcttactaaaaattttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttctttatcgtgactttgttcaac 13966566  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || || ||||| || ||||  | |||||||||||| |||||||| || |  || || || |||||| |||||||||| |  ||||| ||||| ||||| |    
T  13966565 tgacggtaatctatgcacagtctcatactaccatccttcttcttaaccaataacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaatttcttat 13966466  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    | | || ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||     
T  13966465 ctaacaggtcctccaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatacggtatggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaaggtcaat 13966366  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||  ||| || |||| ||| |||||||| ||||||    
T  13966365 tgaaaattcaacctccctctctggtggcacatcaggaatctcatcaggaaatacttttggaaattcattcactacaggtaacctgtcaatcacagcttga 13966266  T
Q  494 tt 495  Q
    ||    
T  13966265 tt 13966264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 12204897 - 12204081
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||  | || || || || ||||||||||| |||| |||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  12204897 cgaaaggcatcaccttatattcataatgtccatatcgtatcctaaaggccgttttctgcatatcttcatacttcaccttaatctgatggtaacctgacct 12204798  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||| ||||| || || | ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || || || |||| |    
T  12204797 caaatcaattttgctgaacacgcatgcacccactaactgatccattaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctttatcgtcactttattcagc 12204698  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || || ||||| || ||||||| ||| |||||||| ||||| ||  | | ||| || ||||||||| | |||||||| | | |||| ||||| ||||| |    
T  12204697 tgacggtaatctatgcacaacctcatgctaccatccttctttttatccaacaataccggcgctccccatggtgaaacactccgtcttacaaatttcttat 12204598  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||  || ||| || || |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||     
T  12204597 caagtaaatcctccaactgtttcttcaactcaactagctcagacgctgacatacggtaaggcgccatcgacacaggcttcgtacccggaacaagatcaat 12204498  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||   ||||||||  ||| ||||| |   |||||||||| ||||||    
T  12204497 tgaaaattcaacctccctctctggcggcacatcaagaatctcatcaggaaagacttatagaaattcattcacaaccggcaatatatcaatcacagcttga 12204398  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||| |  || ||  | ||||| || |||||||| ||||  ||||| ||||| |  || |||| ||| ||||| | ||| ||||| ||   ||| || |    
T  12204397 ttctctaacgacaagtatgccatcaaagaaaacattaagaccccatcacgttctaactgtttcaactgtttagtggtcaagaactcagctttactctctt 12204298  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    | ||  | ||||| ||| |||  | ||| ||||||||||| ||| ||||  |||| ||||||||||||||||| || |  || |||| ||||||  | ||    
T  12204297 cctcatcagaagaaaaaagtatcgtcttactaaaacaattgatatgaacacggttatactctaaccagttcatcccaaagattacatccatacccgttaa 12204198  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
      | | ||| || | |||   ||||||||| | ||||||||||||||| |||||  ||||||| || |||||| |||| |  |||||||||||| |||||    
T  12204197 cagcaaacacacaagatcatcttcaaaatctctaccaaacatagacaatggacaactcaaacaaacaagagaagtagttattgaacccttagctagagtt 12204098  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || |||||||| |||||    
T  12204097 tcaacaaccatttctcc 12204081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 8 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 26116687 - 26116186
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| || || || ||||||||| | || || || || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || ||    
T  26116687 cgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataatgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcacctttatctgatgataaccagacct 26116588  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgt-gcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 206  Q
    |||||||||||| || |||| || | ||||| || ||| |||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  26116587 caaatcaatcttactgaaaa-tcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttcttgatcgtaactttgttcaa 26116489  T
Q  207 ctgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttc 306  Q
    ||| || | ||  |||||||| | |||||||||||| |||||||| || | ||| || || |||||| |||||||||| |  ||||| |||||||||||     
T  26116488 ctgacggtgatatatacacaatctcatactaccatccttcttcttgaccaacaanaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaacttctta 26116389  T
Q  307 tcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    || | || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  26116388 tctaacaggtcctccaactgtttcttcaactcagctaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggcttagttcctggaacaaggtcaa 26116289  T
Q  407 gt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttg 492  Q
     |              ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||  ||| || |||| || ||||||||| |||||    
T  26116288 ttgaaaattcaacctccctttctggtggcacatcaggaatctcatcaggaaacacttccggaaattcattcactacaggtaacccatcaatcacagcttg 26116189  T
Q  493 att 495  Q
    |||    
T  26116188 att 26116186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 11301310 - 11300912
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| || ||    
T  11301310 cgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatggtaaccagacct 11301211  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgt-gcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 206  Q
    |||||||||||| ||||| | || | ||||| || ||| |||||||||| |  |||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||    
T  11301210 caaatcaatcttactaaata-tcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatatctgttcttgatcgtaactttgttcaa 11301112  T
Q  207 ctgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttc 306  Q
    ||| || ||||| |||||||  | |||||||||||| ||||||||||| | ||| || || |||||| |||||||||| |  ||||| |||||||||||     
T  11301111 ctgacggtaatctatacacagtctcatactaccatccttcttctttaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaacttctta 11301012  T
Q  307 tcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    |  | || ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  11301011 tataacaggtcctccaactgtttcttcaactcagccaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggcttagttcctggaacaagatcaa 11300912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 15342583 - 15343399
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || || ||||| || ||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || ||    
T  15342583 cgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaaccagacct 15342682  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||| || ||||    |||||| || ||| |||||||||| | || ||| |||| ||| |||||||| ||||| || || || |||||||||    
T  15342683 caagtcaatcttactgaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaagtcataaatcctcgaaagcggatacctgttctttattgtaactttgttcaac 15342782  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || || ||||  |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| | ||| || ||||||||| | |||||||| |  |||| |||||||||||| |    
T  15342783 tgacggtaatatatacacaacctcatgctaccatccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgaaacactgggtcaaacaaacttcttat 15342882  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa- 406  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||| || || |||||||| || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||     
T  15342883 caagcaagtcttccaactttttcttcaattcagctaactcagaggctgacatacggtacggtgccatcgacatcggctttgttcccggaacaaggtcaat 15342982  T
Q  407 -------------gtcctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                   ||| ||| | ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||| |||||||| || |||    
T  15342983 ggaaaactcaacctccctttcttgtggcacgtctggaatctcatccggaaaaacttcaggaaattcattcaccactggtaacctgtcaatcacagcctga 15343082  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    || || |  || ||| | |||||||| ||| ||||||  || |||||  |||| |  ||||||| ||| || |||| ||| |||||  | ||||  || |    
T  15343083 ttttctaacgacaaatatgccattaaagaatacatcagaattccatcatgttctaactgcttcatctgtttcgtagtcaagaactcaactccaccctctt 15343182  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||| ||||   ||| ||||||||||| ||||| || | ||| |  | ||| ||  ||||    
T  15343183 cttcagcagaagaaaaatgtaccgtcttactaaagcaattgatatgaactctgttatactctaaccaattcattccaaaaataatgtccattcccgtcaa 15343282  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     || | ||||||||| || |  |||||||| | |||||||||||| | ||||||  ||||||| || |||||| |||| ||   ||||||||||||||||    
T  15343283 cggcaaacaaactaagtctacctcaaaatctctaccaaacatagatataggacacctcaaacaaacaagagaagtagttactttacccttagctggagtt 15343382  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || |||||||| |||||    
T  15343383 tcaacaaccatttctcc 15343399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 98 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 11770431 - 11770024
Alignment:
Q  98 aacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttac 197  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  11770431 aacccgatctcaaattaatcttgctaaacacacgagcacccactaactgatccatcaagtcatcaattcttggaagtggatacctattctttatcgttac 11770332  T
Q  198 cttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaaca 297  Q
     ||||||||||| ||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||| | |||||||| |  ||||| |||    
T  11770331 tttgttcaactgtcgataatcaatgcataacctcatgctaccatctttcttcttaactagcaatatcggcgctccccacggtgaaacacttggtcttaca 11770232  T
Q  298 aacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaa 397  Q
    ||| | || |||||||| || || || |||||||||  |||||  ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || || |||||||| || ||||    
T  11770231 aacattttatcaagcaaatcttctaattgtttcttctgctcagccaactcagaagccgacatacgataaggtgtcatagacacaggcttcgtacccggaa 11770132  T
Q  398 caagatc-------aagtc-------ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaat 483  Q
    |||| ||       || ||       || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||| ||||| |||||||    
T  11770131 caaggtcaatcgaaaattcaacttctctttctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttctggaaaatcgcatacaacctgtagcttatcaat 11770032  T
Q  484 cactgctt 491  Q
    ||||||||    
T  11770031 cactgctt 11770024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 669
Target Start/End: Original strand, 19614827 - 19615502
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||    
T  19614827 cgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggcagtcttctgcatgtcctcatctttcaccttgatctgatggtaacctgacct 19614926  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| ||||| || |||||||    |||||| || ||| |||||||||  |  |||||||||||||| ||||| || ||||| || || || || ||||||    
T  19614927 caagtcaattttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaggtcgtcaattctcggaagcggatatctgttctttatcgtaactttattcaac 19615026  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || || || ||||| || |||| ||| |||||||| ||||||||||| | ||| || ||||||||| | |||||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  19615027 tgacggtagtcaatgcataacctcatgctaccatccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgaaacacttggtcttacaaacttcttgt 19615126  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc--- 404  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||       
T  19615127 cgagtaagtcctccaactgtttcttcaactcagcaagttcggatgccgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggtactagatcgat 19615226  T
Q  405 ----aagt-------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
        || |       ||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||   |||||| |||| |||  ||||||| |||||     
T  19615227 ggagaactcaacctccctttctggtggtacatctggaatctcatccggaaaaacttcaggaaactcgttcaccactggtaacctgccaatcacagcttgg 19615326  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    || || |  || ||| | |||||||| ||| ||||||  || ||||| ||||| || ||||||| ||  || |||| |||||  ||  | ||| |||| |    
T  19615327 ttttctaacgacaaatatgccattaaagaatacatcagaatcccatctcgttctagctgcttcatctctttcgtagtcaaaatttcaactccattttctt 19615426  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacc 669  Q
    ||||  | ||||| ||||| || | ||| ||||||||||| ||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  19615427 cttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttactaaaacaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatacc 19615502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 626 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 15146410 - 15146226
Alignment:
Q  626 aaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcac 725  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||| |||||| | ||| || |||||||||     
T  15146410 aaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaactattacatccataccactcaaaggtaaacaaaccatatcaatctcaaaatcaa 15146311  T
Q  726 gaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15146310 gatcaaacatagataaaggacatttcgaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 15146226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 77 - 379
Target Start/End: Original strand, 7826120 - 7826422
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||| | |||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  7826120 cctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 7826219  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaa 276  Q
    ||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| || | ||| ||||| || ||| |     
T  7826220 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgtcgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccac 7826319  T
Q  277 ggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcg 376  Q
    |||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||| |||   ||||| || |||||||| ||||| || || ||||    
T  7826320 ggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactccgatgcagacatccgatacggcgcaatcg 7826419  T
Q  377 aaa 379  Q
    |||    
T  7826420 aaa 7826422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 77 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 27105824 - 27105522
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||| | |||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  27105824 cctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 27105725  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaa 276  Q
    ||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| || | ||| ||||| || ||| |     
T  27105724 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgtcgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccac 27105625  T
Q  277 ggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcg 376  Q
    |||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||| |||   ||||| || |||||||| ||||| || || ||||    
T  27105624 ggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactccgatgcagacatccgatacggcgcaatcg 27105525  T
Q  377 aaa 379  Q
    |||    
T  27105524 aaa 27105522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 77 - 379
Target Start/End: Original strand, 27172501 - 27172803
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||| | |||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  27172501 cctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 27172600  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaa 276  Q
    ||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| || | ||| ||||| || ||| |     
T  27172601 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgtcgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccac 27172700  T
Q  277 ggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcg 376  Q
    |||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||| |||   ||||| || |||||||| ||||| || || ||||    
T  27172701 ggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactccgatgcagacatccgatacggcgcaatcg 27172800  T
Q  377 aaa 379  Q
    |||    
T  27172801 aaa 27172803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 202 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 12799446 - 12799242
Alignment:
Q  202 ttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaact 301  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||  || |||||||| |||||||| || | ||| || ||||||||| |||||||||| | |||||| ||||| |    
T  12799446 ttcaactgacggtaatctatacataacctaatgctaccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgctccccaaggtgaaacactcggtcttacaaatt 12799347  T
Q  302 tcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaag 401  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  12799346 tcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagctaactcggacgccgacatacggtaaggtgccatcgataccggcttcgttcctggaacaag 12799247  T
Q  402 atcaa 406  Q
     ||||    
T  12799246 gtcaa 12799242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 409 - 810
Target Start/End: Original strand, 19149578 - 19149979
Alignment:
Q  409 cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaa 508  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| || || |  |||||||||||  |||||||||| |  |||||     
T  19149578 cctctctggtggcacatctggaatctcatcaggaaaaacttctggaaattcactcacaactggcaatctatcaatcacaacttgattctccaatgataag 19149677  T
Q  509 gaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagaga 608  Q
     | ||||| || |||||||| |  || ||||| ||||| |  ||||||| ||| || |||| ||| ||||| ||  |||| || |||||  | ||||| |    
T  19149678 tacgccatcaaggaaaacattagaattccatcacgttctaactgcttcaactgtttcgtagtcaagaactcagcttcactctcttcttcagcagaagaaa 19149777  T
Q  609 aatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaa 708  Q
    ||||||  | ||| ||||| ||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| || | ||| |||| ||||||  ||||||| | ||| ||||     
T  19149778 aatgtatcgtcttactaaagcaattaatatgaacacggttatactctaaccagttcatcccaaaaattacatccatacccgtcaaaggcaaacatactag 19149877  T
Q  709 atccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctct 808  Q
    ||  | |||||| || | ||||||||||||||| |||||  ||||||| || |||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  19149878 attgacttcaaagtctctaccaaacatagacaatggacaactcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttct 19149977  T
Q  809 cc 810  Q
    ||    
T  19149978 cc 19149979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 409 - 810
Target Start/End: Original strand, 20748977 - 20749378
Alignment:
Q  409 cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaa 508  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| || || |  |||||||||||  |||||||||| |  |||||     
T  20748977 cctctctggtggcacatctggaatctcatcaggaaaaacttctggaaattcactcacaactggcaatctatcaatcacaacttgattctccaatgataag 20749076  T
Q  509 gaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagaga 608  Q
     | ||||| || |||||||| |  || ||||| ||||| |  ||||||| ||| || |||| ||| ||||| ||  |||| || |||||  | ||||| |    
T  20749077 tacgccatcaaggaaaacattagaattccatcacgttctaactgcttcaactgtttcgtagtcaagaactcagcttcactctcttcttcagcagaagaaa 20749176  T
Q  609 aatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaa 708  Q
    ||||||  | ||| ||||| ||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| || | ||| |||| ||||||  ||||||| | ||| ||||     
T  20749177 aatgtatcgtcttactaaagcaattaatatgaacacggttatactctaaccagttcatcccaaaaattacatccatacccgtcaaaggcaaacatactag 20749276  T
Q  709 atccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctct 808  Q
    ||  | |||||| || | ||||||||||||||| |||||  ||||||| || |||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  20749277 attgacttcaaagtctctaccaaacatagacaatggacaactcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttct 20749376  T
Q  809 cc 810  Q
    ||    
T  20749377 cc 20749378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 196 - 494
Target Start/End: Original strand, 21754752 - 21755064
Alignment:
Q  196 accttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaa 295  Q
    ||||| |||||||| || ||||| || ||||| | |||||||||||| |||||||| || | ||| || || |||||| |||||||||| |  ||||| |    
T  21754752 accttattcaactgacggtaatctatgcacaatctcatactaccatccttcttcttaaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtctta 21754851  T
Q  296 caaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccagg 395  Q
    |||| ||||| || | || ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  21754852 caaatttcttatccaacaggtcttccaactgtttcttcaactcagctaactcagaagctgacatacggtatggtgccatcgacaccggcttcgttccggg 21754951  T
Q  396 aacaagatcaagt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatca 481  Q
    |||||| |||| |              |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| || |||| | |||||    
T  21754952 aacaaggtcaattgaaaattcaatctccctctctggtagcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttctggaaattcattcactacaggtaacatatca 21755051  T
Q  482 atcactgcttgat 494  Q
    ||||| |||||||    
T  21755052 atcacagcttgat 21755064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 14284473 - 14283655
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || |||||||| || |||| |||||| || || || || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||  | ||    
T  14284473 cgaaaggcatcaccttatattcgtaatgacaataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcacctttatctgatggtaaccatacct 14284374  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| || || || |||||||    |||||  || ||| |||||||||| |   ||||  ||||||| |||||||| ||||| || |  || |||||||||    
T  14284373 caagtcgatattactaaaaatctttgcacaaaccaactgatccatcaagtcgccaatcttcggaagcggatacctgttctttatcgcaactttgttcaac 14284274  T
Q  208 tgccgataatcaatacaca--accgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttctt 305  Q
    || || ||||| |||||||  | | ||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||  |||||||| | ||||| || | |||||| |||||||||||    
T  14284273 tgacggtaatctatacacacaatctcatgctaccatccttcttctttaccaacaacacaagcgctccccacggtgagacactcggtcttacaaacttctt 14284174  T
Q  306 ctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatca 405  Q
     ||||| || || || |||||||||||||  ||||  ||||| || || |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||    
T  14284173 atcaagtaaatcttctaactgtttcttcagttcagccaactcagatgctgacatacggtatggtgccatcgacaccggctttgttcctggaacaaggtca 14284074  T
Q  406 a--------------gtcctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgctt 491  Q
    |                ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |  ||  ||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  14284073 atcgaaaactccacctccctctctggtggcacatcaggaatctcatcaggaaacatctccagaaattcattcaccaccggtaacctgtcaatcacagctt 14283974  T
Q  492 gattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttc 591  Q
    |||| || |  || || || ||||| || ||| ||||||  || ||||| ||||| |  |||||||  || || |||| ||| |||||  | ||||  ||    
T  14283973 gattttccaacgacaaggatgccatcaaagaatacatcagaattccatcacgttcaaactgcttcatatgtttcgtagtcaagaactcaactccaccctc 14283874  T
Q  592 ctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactc 691  Q
     |||||  | ||||| ||||| || | ||| ||||| ||  | ||| ||||  |||| ||||||||||| ||||| || | ||| |||| ||| ||  ||    
T  14283873 ttcttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttactaaagcagctgatatgaactcggttatactctaaccaattcatcccaaaaataacatccattcccgtc 14283774  T
Q  692 aaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggag 791  Q
    || || | ||||||||| || |  |||||||| | |||||||||||| | ||||||  ||||||| || |||||| |||| || |||||||| ||| |||    
T  14283773 aacggcaaacaaactaagtctacctcaaaatctctaccaaacatagatataggacacctcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttggctagag 14283674  T
Q  792 tttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||| |||||||| |||||    
T  14283673 tttcaacaaccatttctcc 14283655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 77 - 335
Target Start/End: Original strand, 13379103 - 13379361
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| || | | |||||||||||| |||||| || ||||| ||    
T  13379103 ccttcactctgatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagagg 13379202  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaa 276  Q
    |||   |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| || | ||| ||||| || ||| |     
T  13379203 ataaagattcttaatagtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatccttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccac 13379302  T
Q  277 ggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaa 335  Q
    || ||||| | ||| || | ||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  13379303 ggagaaacactcggcctgataaactgcttctcaagcaactcttccaactgcttcttcaa 13379361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 188
Target Start/End: Original strand, 19149363 - 19149541
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || || || || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||   | |||||||| ||    
T  19149363 cgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccgtaacgtgtcctaaaggccgtcttctgca-atcctcatccttcaccttaatcttagg-taacctgacct 19149460  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattctt 188  Q
    ||||||||| || ||||| |  ||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19149461 caaatcaattttactaaacatacgtgcacccactaaccgatccattaaatcgtcaattcttggaagtggatacctattctt 19149541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 188
Target Start/End: Original strand, 20748762 - 20748940
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || || || || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||   | |||||||| ||    
T  20748762 cgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccgtaacgtgtcctaaaggccgtcttctgca-atcctcatccttcaccttaatcttagg-taacctgacct 20748859  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattctt 188  Q
    ||||||||| || ||||| |  ||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20748860 caaatcaattttactaaacatacgtgcacccactaaccgatccattaaatcgtcaattcttggaagtggatacctattctt 20748940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 77 - 251
Target Start/End: Original strand, 4442148 - 4442322
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||   ||||| || | | |||||||||||| |||||| |||||||| ||    
T  4442148 cctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacttccgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatcctcggaagcgg 4442247  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctt 251  Q
    ||||| |||||| || || ||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  4442248 ataccgattcttaatcgtcaccttcttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttctt 4442322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 446 - 810
Target Start/End: Original strand, 13023949 - 13024313
Alignment:
Q  446 acttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgtt 545  Q
    ||||| |||||||||  ||| ||||||| ||| |||||||| |||||||| || || || ||| |||||||||| ||| ||||||  || ||||| ||||    
T  13023949 acttctggaaattcattcacaaccggtaacctgtcaatcacagcttgattttctacggagaaataagccattaaagaatacatcagaattccatcccgtt 13024048  T
Q  546 ccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtg 645  Q
    | || || |||| ||| || |||||||| |||||  |  ||| ||| ||||   | ||||| ||||| || | ||| ||||| || || ||| ||||  |    
T  13024049 ctagctgtttcatctgtttcgtagacaagaactcaacttcaccttcttcttaagcagaagaaaaatgcaccgtcttactaaagcagttgatatgaactcg 13024148  T
Q  646 gttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaagga 745  Q
     || ||||||||||| |||||||| | ||| |||| ||||||  |||| |||||||| ||||| || |    |||||| | ||||||||||||||| |||    
T  13024149 attatactctaaccaattcataccaaaaataacatccatacccgtcaacggtagacacactaagtcgaccaaaaaatccctaccaaacatagacaacgga 13024248  T
Q  746 catttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||  |||| || || |||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  13024249 cacctcaagcaaactagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcc 13024313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23503967 - 23503739
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || || || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||    
T  23503967 cgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatctttcaccttaatttgatggtaacctgacct 23503868  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||| || || ||   ||||||||||| | | |||||||| | |||||| |||||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||     
T  23503867 caagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatcaatcctcggaagcggatatctattcttaattgtaactttgttcaat 23503768  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatact 236  Q
    || ||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  23503767 tgacgatagtcaatgcacaacctcatact 23503739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 78 - 247
Target Start/End: Original strand, 17925871 - 17926040
Alignment:
Q  78 cttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgga 177  Q
    ||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||| || ||||| |||    |||| || | | ||||| |||||| |||||| |||||||| |||    
T  17925871 cttcactctaatctgatgatatcttgatctcaaatcaattttactaaatacttccacaccaaccagctgatccctcaaatcatcaatcctcggaagcgga 17925970  T
Q  178 tacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttct 247  Q
    |||  |||||| || || ||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||| || ||||| ||||    
T  17925971 tactgattcttaatcgtcaccttgttcaactaccgataatccacacacaacctcatgcttccatccttct 17926040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 645 - 804
Target Start/End: Original strand, 12459431 - 12459590
Alignment:
Q  645 ggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaagg 744  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || | ||| |||| ||||||  |||| |||| |||||||||||| |   |||| || | |||||||||||| || ||    
T  12459431 ggttatactctaaccaattcattccaaaaataacatccatacccgtcaacggtaaacaaactaaatcaaccacaaagtctctaccaaacatagataacgg 12459530  T
Q  745 acatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 804  Q
    |||  | ||||| || |||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12459531 acaccttaaacagacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccat 12459590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 651 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 26116030 - 26115877
Alignment:
Q  651 actctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacattt 750  Q
    |||||||||| |||||||| |  || |||| ||||||  |||| || |||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||| | ||||||       
T  26116030 actctaaccaattcataccaaagataacatccatacccgtcaacggcagacaaactaaatcaatcacaaaatctctaccaaacatagatataggacaccg 26115931  T
Q  751 caaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 804  Q
    || ||| || |||||| | || || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26115930 cagacaaacaagagaagtggttactgaacccttagctggagtttcaacaaccat 26115877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 645 - 804
Target Start/End: Original strand, 21755215 - 21755374
Alignment:
Q  645 ggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaagg 744  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || | |||||||| ||||||   ||| || |||||||||||||| |   | ||||| | |||||||||||| | |||    
T  21755215 ggttatactctaaccaattcatcccaaaaatcacatccatacccgacaacggcagacaaactaaatcaaccacgaaatctctaccaaacatagatatagg 21755314  T
Q  745 acatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 804  Q
    |||  ||| ||| || |||||| | || || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21755315 acacctcagacaaacaagagaagtggttactgaacccttagctggagtttcaacaaccat 21755374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 251
Target Start/End: Original strand, 13458255 - 13458429
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||||||| ||||||  ||||| |||||||| ||||||||||| || || |||   ||||| || |   | |||||||||| |||||| ||  |||| ||    
T  13458255 ccttcactctaatctaatgatatcctgatctgaaatcaatcttactgaacacttccgcaccaaccagttggtccatcaaatcatcaatcctttgaagcgg 13458354  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctt 251  Q
    ||| | |||||| || ||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||| ||  |||| ||||||||    
T  13458355 atatcgattcttaatcgttgccttgtttaactgccgataatccacacacaacctcatgctttcatccttcttctt 13458429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 409 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 11300895 - 11300844
Alignment:
Q  409 cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattca 460  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||    
T  11300895 cctctctggtggcacatcaggaatctcatcagggaatacttctggaaattca 11300844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17143207 - 17143166
Alignment:
Q  196 accttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatacta 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  17143207 accttattcaactgccgataatccatacacaacctcatacta 17143166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 643; Significance: 0; HSPs: 54)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 643; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 29474363 - 29473549
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29474363 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatctccatcctttactttaatctggtgataacctgacctca 29474264  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29474263 aatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 29474164  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  29474163 ccgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaactggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctca 29474064  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-- 407  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||       
T  29474063 agcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaatag 29473964  T
Q  408 -----------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
               || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29473963 aaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatcactgcttgatt 29473864  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29473863 ctcaatagataaagtagccattaacgaaaacatcaagatatcgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcctct 29473764  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  29473763 tcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccataccgctcaaag 29473664  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29473663 gtagacaaactaaatccatttcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttc 29473564  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
    ||||||||| |||||    
T  29473563 gacaaccatttctcc 29473549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 641; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 27666782 - 27665966
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  27666782 cgaaaggcaaaactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacctgatct 27666683  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27666682 caaatctatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattctcgaaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 27666583  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  27666582 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttct 27666483  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  27666482 caagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaat 27666383  T
Q  408 -------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27666382 agaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatcactgcttga 27666283  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27666282 ttctcaatagatatagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcct 27666183  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  27666182 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccataccactcaa 27666083  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  27666082 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagtcggagtt 27665983  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  27665982 tcgacaaccatctctcc 27665966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 641; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 40710874 - 40711690
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  40710874 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcttcgtcttttactttaatctggtgatagcctgatct 40710973  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40710974 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 40711073  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  40711074 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttct 40711173  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  40711174 caagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaat 40711273  T
Q  408 -------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  40711274 agaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccgggaacctgtcaatcactgcttga 40711373  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40711374 ttctcaatagataaagtagccatcaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcct 40711473  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  40711474 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccataccactcaa 40711573  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40711574 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtt 40711673  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  40711674 tcgacaaccatctctcc 40711690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 637; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 27520500 - 27521316
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  27520500 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcctcatcctttactttaatctggtgataacctgacct 27520599  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27520600 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 27520699  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  27520700 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttct 27520799  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  27520800 caagcaagtcttctaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccaggaacaagatcaat 27520899  T
Q  408 -------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27520900 agaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctgtcaatcactgcttga 27520999  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27521000 ttctcaatagataaagtagccatcaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcgccactttcct 27521099  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  27521100 cttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccataccactcaa 27521199  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27521200 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtt 27521299  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  27521300 tcgacaaccatctctcc 27521316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 635; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Original strand, 41772938 - 41773752
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41772938 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctca 41773037  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41773038 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 41773137  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  41773138 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttttttactaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacactcggtctaacaaacttcttctca 41773237  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-- 407  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||       
T  41773238 agcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaatag 41773337  T
Q  408 -----------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
               || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  41773338 aaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctgtcaatcactgcttgatt 41773437  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41773438 ctcaatagataaggtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcctct 41773537  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  41773538 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccataccactcaaag 41773637  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41773638 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcgcgaccaaacatagacaaagtacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttc 41773737  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||    
T  41773738 gacaaccatctctcc 41773752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 633; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 16358596 - 16359412
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16358596 cgaagggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcttcgtcttttactttaatctggtgatagcctgatct 16358695  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16358696 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 16358795  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  16358796 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttct 16358895  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  16358896 caagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaat 16358995  T
Q  408 -------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16358996 agaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctgtcaatcactgcttga 16359095  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16359096 ttctcaatagatatagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcct 16359195  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  16359196 cttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccataccactcaa 16359295  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16359296 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtt 16359395  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  16359396 tcgacaaccatctctcc 16359412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 633; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 34568588 - 34569404
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  34568588 cgaagggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcttcgtcttttactttaatctggtgatagcctgatct 34568687  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34568688 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 34568787  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  34568788 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttct 34568887  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  34568888 caagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaat 34568987  T
Q  408 -------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  34568988 agaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctgtcaatcactgcttga 34569087  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34569088 ttctcaatagatatagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcct 34569187  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  34569188 cttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccataccactcaa 34569287  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34569288 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtt 34569387  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  34569388 tcgacaaccatctctcc 34569404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 623; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Original strand, 27612450 - 27613266
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27612450 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctca 27612549  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27612550 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctggtccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctatttttgatagttaccttgttcaactg 27612649  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  27612650 tcgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctca 27612749  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-- 407  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||       
T  27612750 agcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcattccaggaacaagatcaatag 27612849  T
Q  408 -------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  27612850 aaaactcaacttctctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatcaccgcttga 27612949  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27612950 ttctcaatagatatagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcct 27613049  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  27613050 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccataccactcaa 27613149  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  27613150 gggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagccggagtt 27613249  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  27613250 tcgacaaccatctctcc 27613266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 619; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 14998029 - 14997215
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14998029 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctca 14997930  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14997929 aatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 14997830  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  14997829 ccgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctca 14997730  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-- 407  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||       
T  14997729 agcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccagggacaagatcaatag 14997630  T
Q  408 -----------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
               || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14997629 aaaactcaacttctctctcaggaggcacatcagaaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatcactgcttgatt 14997530  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  14997529 ctcaatagataaggtagccattaacgaaaacatcaagatactgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactccgcaccactttcctct 14997430  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  14997429 tcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccataccgctcaaag 14997330  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14997329 gtagacaaactaaatccatttcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagccggagtttc 14997230  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||    
T  14997229 gacaaccatctctcc 14997215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 619; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 37289786 - 37288972
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37289786 aaaggcataactttatattcataatgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctca 37289687  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  37289686 aatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttactttattcaactg 37289587  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  37289586 tcgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggtgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctca 37289487  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-- 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||       
T  37289486 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccagggacaagatcaatag 37289387  T
Q  408 -----------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
               || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37289386 aaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaaatcacacaccaccggtaacctatcaatcactgcttgatt 37289287  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  37289286 ctcaaaagataaagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctacaccactttcctct 37289187  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  37289186 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccataccgctcaaag 37289087  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37289086 gtagacaaactaaatccatttcgaaatcacgaccaaacaaagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttc 37288987  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||    
T  37288986 gacaaccatctctcc 37288972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 615; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Original strand, 22136764 - 22137578
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22136764 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgtcctgaaagccgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctca 22136863  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22136864 aatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 22136963  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| |||||||||    
T  22136964 ccgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaatttcttctca 22137063  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-- 407  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||       
T  22137064 agcaaatcttccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgacatcggcttcgttccaggaacaagatcaatag 22137163  T
Q  408 -----------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
               || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  22137164 aaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacacaacttgtagcttatcaatcactgcttgatt 22137263  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22137264 ctcaatagataaagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttggtagataaaaactctgcaccactttcctct 22137363  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  22137364 tcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccataccgctcaaag 22137463  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22137464 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacataaacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttc 22137563  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||    
T  22137564 gacaaccatctctcc 22137578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 615; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 22331177 - 22330363
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22331177 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctca 22331078  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22331077 aatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaaatg 22330978  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  22330977 ccgataatcaatacataactgcatactaccatctttcttgtttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctca 22330878  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-- 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||       
T  22330877 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaatag 22330778  T
Q  408 -----------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
               || ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  22330777 aaaactcaacttctctctctggaggcacatctggaatctcacccggaaaaacttcaggaaattcacacaccacaggtaacctattaatcactgcttgatt 22330678  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||  |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22330677 ctcagtagataaggtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcctct 22330578  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22330577 tcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccataccgctcaaag 22330478  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22330477 gtagacaaactaaatccatttcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttc 22330378  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||    
T  22330377 gacaaccatctctcc 22330363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 615; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 27683690 - 27682876
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27683690 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctca 27683591  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27683590 aatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 27683491  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  27683490 ccgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctca 27683391  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-- 407  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||       
T  27683390 agcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaaggacaagatcaatag 27683291  T
Q  408 -----------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
               || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27683290 aaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatcactgcttgatt 27683191  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  27683190 ctcaatagataaagtagccattaacgaaaacatcaagataccgttgcgttccagttccttcagctgcttagtagataaaaactccgcaccactttcctct 27683091  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  27683090 tcgacggaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaacagttcatacccagaatcacatccataccgctcaaag 27682991  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27682990 gtagacacactaaatccatttcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttc 27682891  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||    
T  27682890 gacaaccatctctcc 27682876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 611; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Original strand, 22350015 - 22350829
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22350015 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacctgacctca 22350114  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22350115 aatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaaatggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 22350214  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
     |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| |||||||||    
T  22350215 tcgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaatttcttctca 22350314  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-- 407  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||       
T  22350315 agcaaatcttccaactgtttcttcaactcagataattcggaagcagacatacgatatggtgccatcgacaccggcttcgttccaggaacaagatcaatag 22350414  T
Q  408 -----------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
               || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22350415 aaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 22350514  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  22350515 ctcaatagataaggtagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactctcctct 22350614  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22350615 tcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaaaaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccataccgctcaaag 22350714  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22350715 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcgcgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagataagtagtcaccgaacccttagctggagtttc 22350814  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||    
T  22350815 gacaaccatctctcc 22350829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 609; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 19772054 - 19772870
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||| | ||    
T  19772054 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgatatcctcacct 19772153  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19772154 caaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactagttgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 19772253  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  19772254 tgccgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccagcgctccccaaggtgaaacactcggtctaacaaacttcttct 19772353  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  19772354 caagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaat 19772453  T
Q  408 -------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19772454 agaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatcactgcttga 19772553  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19772554 ttctcaatagatatagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcaactgcttagtagataaaaactctgcaccactttcct 19772653  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  19772654 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaggatcacatccataccgctcaa 19772753  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  19772754 aggtagacaaactaaatccatttcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagccggagtt 19772853  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  19772854 tcgacaaccatctctcc 19772870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 514; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 18781208 - 18782024
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18781208 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataccctgatct 18781307  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18781308 caaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccattaaatcatcaattctcggaggtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 18781407  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| |  ||||||||||| |||||||    
T  18781408 tgtcgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcttcactagcaaaactggtgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaatttcttct 18781507  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa- 406  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||     
T  18781508 caagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagctaactcggaagcagacatacgataaggtgccatggacaccggcttcgttccaggaacaagatcaat 18781607  T
Q  407 -------------gtcctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                   |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  || |||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  18781608 agaaaactcgacttccctctctggaggaacatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaagttgcataccacttgtagcttatcaatcactgcttga 18781707  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  18781708 ttctcaatagataaggaagccataaacgaaaacatcaaaataccatcgcgttccatttgcttcagctgcttagtagataagaactctgcaccactttcct 18781807  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18781808 cttcagcggaagagaaatacactgacttgctaaaacaattgatatgaacatggttgtactctaaccaattcatacccagaatcacatccataccgctcaa 18781907  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  18781908 aggtagacaaacttaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatcgcaaacatacgagagaagtagtcacggaacccttagctggagtt 18782007  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || ||||||||||||||    
T  18782008 tcaacaaccatctctcc 18782024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 26737019 - 26736203
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26737019 cgaaaggcatcactttatattcatattgtccataacgtgttctaaaagttgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatct 26736920  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||    
T  26736919 caaatcaatcttgctaaatacatgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacatattctttatcgttactttgttcaac 26736820  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||| |||||||||| |   |||| |||||||| || |    
T  26736819 tgtcgataatcaatacacaatctcatactaccatctttctccttcactagcaataccggcgctccccaaggtgaaacacttagtcttacaaactttttat 26736720  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc--- 404  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||  ||||| |||||||| ||||||| ||| || || |||||||||||  ||||||||||       
T  26736719 caagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagccaacttagaagctgacatacggtaaggtgtcatagacacaggcttcgttcccagaacaagatcaat 26736620  T
Q  405 ----aagtc-------ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
        || ||       || ||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||    
T  26736619 cgaaaattcaacttctctttctagaggcacatcgggaatttcatcaggaaaaacttctgggaaatcacacacaacctgtaacttatcaatcactgcttga 26736520  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| ||| || || ||||| || ||||||||||| || ||| | ||||| | |||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||||||    
T  26736519 ttctcaatagacaaggatgccatcaaagaaaacatcaaaattccaccacgttctaattgcttcagctgcttcatagacaaaaattttgcgccactttcct 26736420  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||||||||  || ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||    
T  26736419 cttcagcagaagagaaatacaccgacttactaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccagttcattccaaggatcacatccataccactcaa 26736320  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  26736319 aggtaaacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaaaggacatcttaaacatacaagagaagtagtcaccaaacccttagttggagtt 26736220  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  26736219 tcgacaaccatctctcc 26736203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 25428527 - 25429331
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  25428527 cgaaaggcataactttgtattcatagtggccataccgcgttctgaaagttgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 25428626  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    || ||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  25428627 cagatctatcttgctgaaaacacttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctttattgttaccttgttcaac 25428726  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||| |||||  ||||||||| |||||||||| |  |||||||| ||||| ||||    
T  25428727 tgtcgataatcaatacacaacctcatgctaccatccttcttcttcactaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaaccaactttttct 25428826  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc--- 404  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||| ||| |  ||||| ||||  |||||||||||||||| ||| || ||  ||||||||| ||||||||||||       
T  25428827 caagcaaatcctctaattgtttcttcagctcggccaactcagaagttgacatacgataaggtgtcatagacacatgcttcgttctaggaacaagatcaat 25428926  T
Q  405 ----aagtc-------ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
        || ||       ||||||||||||||||||            ||||| ||||| ||||| || || |||||  ||||  |||||||||||||||||    
T  25428927 cgaaaattcaacttctctctctggaggcacatca------------ggaaatacttctggaaaatcgcataccacttgtagtttatcaatcactgcttga 25429014  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25429015 ttctcaatagataaggaagccatcaaagaaaacatcaaaataccatcacgttctaactgcttcagctgcttggtagacaaaaactctgcgccactttcct 25429114  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||||||||  ||||| || ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  25429115 cttcagcagaagagaaatacactgatttactaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaa 25429214  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25429215 aggtagacaaaccaaatcaatctcaaaatcacgatcaaacatagacaagggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtt 25429314  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  25429315 tcgacaaccatctctcc 25429331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 289 - 806
Target Start/End: Original strand, 20802972 - 20803503
Alignment:
Q  289 ggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcg 388  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  20802972 ggtctaacaaaattattctcaagcaaatcttctaattgtttcttcaactcagctagctcggaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcg 20803071  T
Q  389 ttccaggaacaagatcaag-------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtag 474  Q
    ||||||||||||||||||              || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || || ||  ||||    
T  20803072 ttccaggaacaagatcaacagaaaactcgacttctctctctggaggcacatcaggaatttcatctggaaatacttcaggaaaatcgcatactacttgtag 20803171  T
Q  475 cctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaa 574  Q
    | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  20803172 cttatcaatcactgcttgattctcgatagataaagaagccatcaaagaaaacatcaagataccttcgcgttccagttgcttcagctgcttggtagataag 20803271  T
Q  575 aactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaa 674  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  20803272 aactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatacactgacttgctaaagcaattgatatgaacatggttgtactctaaccacttcataccaagaa 20803371  T
Q  675 tcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcac 774  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20803372 tcacatccataccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcac 20803471  T
Q  775 cgaacccttagctggagtttcgacaaccatct 806  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20803472 caaacccttagctggagtttcgacaaccatct 20803503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 21337586 - 21336770
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||    
T  21337586 cgaaaggcatcactttatattcataatatccataacgtgttctaaaagctgtattctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgacct 21337487  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||||| |||| |||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| ||| |||||    
T  21337486 caaatcaatcttgctaaacacacatgcacccaataactgatccatcaagtcatcaattcttggaattggatacctattctttatcgttactttggtcaac 21337387  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||||||||| ||||| | ||| ||||||| ||||||||| || ||||| |  ||||||||| ||||||||||    ||||| ||||||||||| |    
T  21337386 tgtcgataatcaatgcacaatctcatgctaccatttttcttcttaaccagcaatataggcgctccccaaggtgaaacatttggtcttacaaacttcttat 21337287  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    ||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| || || |||||||| || |||||||| ||||     
T  21337286 caagcaaatcttctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacggtaaggtgtcatagacacaggcttcgtacccggaacaaggtcaat 21337187  T
Q  408 tc--------------ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |               || |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| || ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  21337186 tgaaaattcaacttctctttctggaggcacatcaggaatttcatcaagaaaaacttctggaaaatcacatacaacctgtagcttatcaatcactgtttga 21337087  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||  |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  21337086 ttctcaacagacaaggacgccatcaaagaaaacatcaaaatttcatcacgttctaattgcttcagctgcttagtagacaagaactctgcgccactttctt 21336987  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||| ||||  || ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||||||||    
T  21336986 cttcagcagaagaaaaatacaccgacttactaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccagttcataccaaggattacatccattccactcaa 21336887  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||| |||| | || || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||  ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  21336886 aggtaaacaatccaagtcaatttcaaaatcgcgaccaaacatagacaaaagacatcttaaacacacacgagaagtagtcaccaaacccttaactggagtt 21336787  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  21336786 tcgacaaccatctctcc 21336770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 23473321 - 23474105
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||| || |||||| | |||||    
T  23473321 cgaaaggcatcactttatattcataatgtccataacgtgttctaaaagccgtcttctacatatcttcatctttcactttaatttgatgataaaccgatct 23473420  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||     
T  23473421 caaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattcttggaagtggatacctattctttatcgttactttgttcaat 23473520  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||||||||| || || | ||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| | |||||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  23473521 tgtcgataatcaatgcataatctcatgctaccatctttcttcttaactagcaataccggcgctccccacggtgaaacacttggtcttacaaacttcttat 23473620  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||| || || || |||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| || || |||||||| || |||||||| |||      
T  23473621 caagtaaatcttctaactgtttcttcaactcagccaactcagaagctgacatacggtaaggtgtcatagacacaggcttcgtacctggaacaaggtca-- 23473718  T
Q  408 tcctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataa 507  Q
                    |||   ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||    
T  23473719 ----------------atcgaaaatttcatcaggaaaaacttctggaaaatcacatacaacctgtagcttatcgatcactgcttgattctcaatagacaa 23473802  T
Q  508 agaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagag 607  Q
     || ||| | || ||||||||||  || ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||  | |||||     
T  23473803 ggacgccgtcaaagaaaacatcataattccatcacgttctaattgcttcagctgcttagtagacaagaattctgcaccactttcttcttcagcagaagaa 23473902  T
Q  608 aaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaacta 707  Q
    ||||  || ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || || || | ||| ||||||||||||| |||||| |    
T  23473903 aaatacaccgacttactaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccagttcataccaaggattacgtccattccactcaaaggtaaacaaacca 23474002  T
Q  708 aatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctc 807  Q
    | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  || | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23474003 agtcaatttcaaaatctcgaccaaacatagacaaaggacatctttaatacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctc 23474102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 257; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 422 - 810
Target Start/End: Original strand, 21882296 - 21882684
Alignment:
Q  422 acatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatg 521  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||  || |    
T  21882296 acatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaaatcgcataccacttgtagcttatcaatcattgcttgattctcaatagataaggaagccaacaaag 21882395  T
Q  522 aaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgactt 621  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||  || |||||    
T  21882396 aaaacatcaaaataccatcacgttccagttgcttcagctgcttggtagacaagaactctgcaccactttcctcctagacggaggagaaatacaccgactt 21882495  T
Q  622 gctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaa 721  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21882496 gctaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccaattcataccaagaatcacatccataccgcttaaaggtagacaaactaaatccatctcaaaa 21882595  T
Q  722 tcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21882596 tcacgaccaaacatagacaaaggacatctcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 21882684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 472 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 21343227 - 21342890
Alignment:
Q  472 tagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagac 571  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  21343227 tagcttatcaatcactgcttgattctcct-agataaagaagccattaacgaaaacattaaaataccatcgcgttccatttgcttcagctgcttagtagat 21343129  T
Q  572 aaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcataccca 671  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21343128 aagaactctgcaccactttcctcttcaacggaatagaaataaactgacttgctaaaacaattgatatgaacatggttgtactctaaccaattcataccca 21343029  T
Q  672 gaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagt 771  Q
    ||||||||| ||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  21343028 gaatcacatccataccgttcaatggtatacaaactaaatccatttcaaaatcacgatcaaacatagacaaaggacatcgcaaacatacgagagaagtagt 21342929  T
Q  772 caccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342928 caccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 21342890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 28893234 - 28892418
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || ||    
T  28893234 cgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaagccgtcttctgcatatcttcatccttcactttaatctgatggtaacccgacct 28893135  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||   ||||| || ||| | |||||||| | |||||| | |||||||||||| |||||||| || || || |||||||||    
T  28893134 caagtcaatcttgctaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaagtcatcaatccgcggaagtggatatctattctttattgtaactttgttcaac 28893035  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| || |  || || ||||||||| | || ||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  28893034 tgacgatagtcaatgcacaacctcatacttccatctttcttcttcaccaataacacgggcgctccccacggcgaaacactgggtcttacaaacttcttgt 28892935  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa- 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  || || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||     
T  28892934 caagcaagtcctccaactgtttctttaactcagccaattcagaagctgacatgcgatacggcgccatcgatactggtttcgttcccggaacaagatcaat 28892835  T
Q  407 -------------gtcctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                   ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| || || ||||| ||||||    
T  28892834 cgagaactcaacttccctttctggtggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcattcaccactggtagtctgtcgatcacagcttga 28892735  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||| |  || || || ||||| || |||||||| |  || ||||| |||||||  ||||||| ||| |||||||  | ||||||||| ||||| || |    
T  28892734 ttctctaacgacaatgatgccatcaaagaaaacataagaattccatctcgttccaactgcttcaactgtttagtagttagaaactctgctccactctctt 28892635  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    |||| || ||||| || || || | |||| ||||||||||||||   ||  |||| ||||||||||| ||||| || |  || |||| ||| ||   |||    
T  28892634 cttccacagaagaaaagtgcaccgtcttgttaaaacaattaatacagactcggttatactctaaccaattcatcccgaagatgacatccatccccaacaa 28892535  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     |||||||| ||||| || | ||||||||| | ||||||||||||||| |||||  | | ||| || |||||| |||| || |||||||| |||||||||    
T  28892534 cggtagacacactaagtcgacttcaaaatctctaccaaacatagacaacggacaccttagacacaccagagaagtagttactgaacccttggctggagtt 28892435  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || |||||||| |||||    
T  28892434 tcaacaaccatttctcc 28892418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 21562316 - 21561501
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| || ||||| || || || || || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  21562316 cgaaagacatcactttatattcataatgtccatatcgtgtcctaaaggccgttttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtggtaacccgacct 21562217  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||| |||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| || || || || ||||||    
T  21562216 caaatcaatcttgctgaacacgcgtgcacc-actaactgatccattaaaccatcaattctcggaagtggatacctattctttatcgtcactttattcaac 21562118  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || || ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| || | ||| ||  |||||||| |||||||||  |  ||||| ||||||||||| |    
T  21562117 tgacggtaatctatacacaacctcatgctaccatctttcttcttaaccaacaacacctgcgctccccaaggtgaaatacttggtcttacaaacttcttat 21562018  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||| || || |||||||| |||||  ||||||| || |||||||| ||  ||||||||||||     
T  21562017 caagtaaatcctccaactgtttcttcaactcagctacctcagaggccgacatacggtaaggctccatcgacacaggcttcgtacccagaacaagatcaat 21561918  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              |||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| |||||||  ||||||||||| ||||||    
T  21561917 tgaaaattcaacttccctctctggctgcacatgaggaatctcatcaggaaaaacttctggaaattcattcacaaccggtaatctatcaatcacagcttga 21561818  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||| || || ||  | |||||||| |||||||| |||||  |||   |||| | |||||||| ||| ||||||| ||| ||||| ||   ||| || |    
T  21561817 ttctccaccgacaagtatgccattaaagaaaacattaagatctcattaggttctaattgcttcaactgtttagtagtcaagaactcagctttactctctt 21561718  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    | ||  | ||||| ||||| || |  || ||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| || |  || |||| || |||  ||||    
T  21561717 cctcagcagaagaaaaatgcaccgttttactaaaacaattgatatgaacatggttatactccaaccagttcatcccaaagattacatccacacccgtcaa 21561618  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     || | ||| |||| ||| | ||||||||| | ||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  21561617 tggcaaacatactagatcaacttcaaaatctctaccaaacatagacaatggacaactcaaacaaacgagagaagtagttactgaacccttagctggagtt 21561518  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || |||||||| |||||    
T  21561517 tcaacaaccatttctcc 21561501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 20777989 - 20778805
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||    
T  20777989 cgaaaggcatcactttgtattcgtaatgtccatatcgtgttctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatttgatggtaacccgacct 20778088  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||| |||||||||   ||||| || ||| | |||||||| |  ||||| | ||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  20778089 caagtcaatcttactaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaagtcgtcaatccgcgggagtggatacctattctttattgtaaccttgttcaac 20778188  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |  || || ||||||||| | || ||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  20778189 tgacgatagtcaatgcacaacctcatacttccatctttcttctttaccaataacacgggcgctccccacggcgaaacactaggtctcacaaacttcttat 20778288  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc--- 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  || || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | |||| ||| |||||||||||       
T  20778289 caagcaagtcctccaactgtttctttaactcagccaattcagaagctgacatgcgatacggcgccatcgacactagtttcgctcccggaacaagatcaat 20778388  T
Q  405 ----aagtc-------ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
        || ||       || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||| ||||| || ||||| ||  |||||    
T  20778389 cgagaactcaacttctctttctggtggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcgtgaaattcattcaccactggtagtctgtcaattacaacttga 20778488  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||| |  || || || ||||| || |||||||| |  || ||||| |||||||  ||||||| ||| |||||||  | ||||| ||| ||||| || |    
T  20778489 ttctctaacgacaatgatgccatcaacgaaaacataagaattccatctcgttccaactgcttcaactgtttagtagttagaaactgtgctccactctctt 20778588  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||| || || || | |||| ||||||||||||||   ||  |||| ||||||||||| ||||| || | ||| |||| ||| ||   |||    
T  20778589 cttccgcagaagaaaagtgcaccgtcttgttaaaacaattaatacagactcggttatactctaaccaattcatcccgaaaataacatccatccccaacaa 20778688  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     |||||||| ||||| || |  |||||||| | ||||||||||||||| |||||  | ||||| || |||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  20778689 cggtagacacactaagtcgacctcaaaatctctaccaaacatagacaacggacaccttaaacacacaagagaagtagtcactgaacccttggctggagtt 20778788  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || |||||||| |||||    
T  20778789 tcaacaaccatttctcc 20778805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 8 - 804
Target Start/End: Original strand, 22464027 - 22464836
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| || ||    
T  22464027 cgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcactttaatttgatggtaacccgacct 22464126  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||  |||||||| |||||||||   ||||| || ||| | |||||||| | |||||| | |||||||||||| |||||||| || || || |||||||||    
T  22464127 caggtcaatcttactaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaagtcatcaatccgcggaagtggatatctattctttattgtaactttgttcaac 22464226  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| || |  || || ||||||||| | || |||||    ||||| ||||||||||| |    
T  22464227 tgacgatagtcaatgcacaacctcatactaccatccttcttcttcaccaataacacaggcgctccccacggcgaaacattgggtcttacaaacttcttat 22464326  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc--- 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||       
T  22464327 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcggctaattcagaagcggacatacgatacggtgccatcgacactggtttcgttcccagaacaagatcaat 22464426  T
Q  405 ----aagtc-------ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
        || ||       || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||| ||||| ||  |||||    
T  22464427 cgagaactcaacttctctttctggtggcacatcagggatctcatctggaaaaacttcagggaattcattcaccactggtagcct-tcaattaccacttga 22464525  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||| |  || ||||| ||||| || |||||||| |  ||  |||| |||||||  |||||||  || |||||||  | ||||||||| ||||| ||||    
T  22464526 ttctctaacgacaaagatgccatcaaagaaaacataagaatttcatcccgttccaactgcttcaattgtttagtagttagaaactctgctccactctcct 22464625  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||| || || || | |||| |||||||||| |||   ||  |||||||||||||||| ||||| || | ||| |||| ||| ||   |||    
T  22464626 cttccgcagaagaaaagtgcaccgtcttgttaaaacaatttatacagactcggttgtactctaaccaattcatcccgaaaataacatccattcccaacaa 22464725  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     |||||||| ||||| || |  |||||||| | ||||||||||||||| |||||  | ||||| || |||||| |||| || |||||||| |||||||||    
T  22464726 cggtagacatactaagtcgacctcaaaatctctaccaaacatagacaacggacaccttaaacacacaagagaagtagttactgaacccttggctggagtt 22464825  T
Q  794 tcgacaaccat 804  Q
    || ||||||||    
T  22464826 tcaacaaccat 22464836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 20823529 - 20824345
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||| || ||    
T  20823529 cgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaagccgtcttctgcatatcttcgtctttcactttaatttgatggtaacccgacct 20823628  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||| |||||||||   ||||| || ||| | |||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||| || || || |||||||||    
T  20823629 caagtcaatcttactaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaaatcatcaatccgcggaagtggatatctattctttattgtaactttgttcaac 20823728  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||| || || | ||| || || |||||| | || ||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  20823729 tgacgatagtcaatgcacaacctcatactcccatctttctttttcaccaacaacacgggtgctccccacggcgaaacactaggtctcacaaacttcttat 20823828  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  || || ||||| ||||| || || || ||||| || | ||| |||||||| |||||||||||||     
T  20823829 caagcaagtcctccaactgtttctttaactcagccaattcagaagctgacatgcggtacggcgccattgatattggtttcgttcctggaacaagatcaat 20823928  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |               || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| || || ||||| ||||||    
T  20823929 tgagaattcaacttctctttctggtggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcgggaaattcattcaccactggtagtctgtcgatcacagcttga 20824028  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||| |  || ||||| ||||| || |||||||| |  || ||||| || ||||  ||||||| ||| |||||||  | ||||||||| ||||| || |    
T  20824029 ttctctaacgacaaagatgccatcaaagaaaacataagaattccatctcgctccaactgcttcaactgtttagtagttagaaactctgctccactctctt 20824128  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    |||| || ||||| || || || | |||| ||||||||||||||   ||  |||| ||||||||||| ||||| || | ||| |||| ||| ||   |||    
T  20824129 cttccacagaagaaaagtgcaccgtcttgttaaaacaattaatacagactcggttatactctaaccaattcatcccgaaaataacatccatccccaacaa 20824228  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     |||||||| |||||||| |  || ||||| | ||||||||||||||| |||||  | ||||| || |||||| |||| || |||||||| |||||||||    
T  20824229 cggtagacacactaaatcgacctcgaaatctctaccaaacatagacaacggacaccttaaacacaccagagaagtagttactgaacccttggctggagtt 20824328  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || |||||||| |||||    
T  20824329 tcaacaaccatttctcc 20824345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 8 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 28922060 - 28921556
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || ||    
T  28922060 cgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaagccgtcttctgcatatcttcatccttcactttaatctgatggtaacccgacct 28921961  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||   ||||| || ||| | |||||||| | |||||| | |||||||||||| |||||||| || || || |||||||||    
T  28921960 caagtcaatcttgctaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaagtcatcaatccgcggaagtggatatctattctttattgtaactttgttcaac 28921861  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| || |  || || ||||||||| | || ||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  28921860 tgacgatagtcaatgcacaacctcatacttccatctttcttcttcaccaataacacgggcgctccccacggcgaaacactgggtcttacaaacttcttgt 28921761  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa- 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  || || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||     
T  28921760 caagcaagtcctccaactgtttctttaactcagccaattcagaagctgacatgcgatacggcgccatcgatactggtttcgttcccggaacaagatcaat 28921661  T
Q  407 -------------gtcctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                   ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| || || ||||| ||||||    
T  28921660 cgagaactcaacttccctttctggtggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcattcaccactggtagtctgtcgatcacagcttga 28921561  T
Q  494 ttctc 498  Q
    |||||    
T  28921560 ttctc 28921556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Original strand, 20801493 - 20801742
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20801493 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataccctgatctca 20801592  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||       |||| |||||||||||    
T  20801593 aatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatgaaatcatcaattctcggaagaggatacctattc------attactttgttcaactg 20801686  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactg 265  Q
     |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20801687 acgataatcgatacataacctcatactaccatctttcttctttactaacaaaactg 20801742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 20466389 - 20465993
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    |||||||| |||  |||||| || || |||||||| || || || || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20466389 aaaggcatcactgaatattcgtaatgtccataacgtgtcctaaaggccgtcttttgcatatcctcgtctttcactttaatctggtgataacctgatctta 20466290  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||  || ||||||||    
T  20466289 aatcaatcttgctaaacacacgtgcacccagtaactgatccatcaaatcatcaattcttggaagtggatacttattctttattgttagtttattcaactg 20466190  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
     ||||||| ||| || |||| ||| |||||||||||||| || |||| ||| |||||||||| | |||||||||| | |||| | ||||||||||| |||    
T  20466189 tcgataataaatgcataacctcatgctaccatctttcttattaactaacaatactggcgctcgccaaggtgaaacactcggttttacaaacttcttatca 20466090  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    || || || || |||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| | ||| || || |||||||| || | |||||||||||    
T  20466089 agtaaatcgtctaactgtttcttcaactcagccaactcagaagccgacatacggtaaggagtcatagacacaggcttcgtacccgaaacaagatcaa 20465993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 8 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 14885283 - 14884473
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||    
T  14885283 cgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatcctttacctttatctgatgataaccagacct 14885184  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtg-cacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 206  Q
    |||||||||||| || |||| || || |||| || ||| |||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  14885183 caaatcaatcttactgaaaa-tcttggcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttcttgatcgtaactttgttcaa 14885085  T
Q  207 ctgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttc 306  Q
    ||| || ||||| || || |  | |||||||||||| ||||||||||| | ||| || || |||||| |||||||||| |  ||||| |||||||||||     
T  14885084 ctgacggtaatctatgcaaagtctcatactaccatccttcttctttaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaacttctta 14884985  T
Q  307 tcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    || |  | ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  14884984 tctaataggtcctccaactgtttcttcaactcagccaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggcttagttcctggaacaagatcaa 14884885  T
Q  407 gt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttg 492  Q
     |              ||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||  ||| || ||||  | ||||| ||| |||||    
T  14884884 ttgagaactcaacctccctctctggtggcacatcaggaatctcatcagggaatacttctggaaattcattcactacaggtaaaccatcaaccacagcttg 14884785  T
Q  493 attctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcc 592  Q
    ||| || |  || ||    |||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||| |  || |||| ||| || ||||||| || |||  |  ||| |||     
T  14884784 attttctaacgacaattgtgccattaaagaatacatcaggataccatcacgttcaaactgtttcatctgtttcgtagacagaagctcaacctcaccttct 14884685  T
Q  593 tcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactca 692  Q
    ||||| || |||||||||||||| | ||| ||||| || || ||| ||||  | || || |||||||| |||||||| |  || |||| ||||||  |||    
T  14884684 tcttcaacagaagagaaatgtaccgtcttactaaagcagttgatatgaacccgattatattctaaccaattcataccaaagataacatccatacccgtca 14884585  T
Q  693 aaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagt 792  Q
    | || |||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||| | ||||||   || ||| || |||||| | || || |||||||||||||||||    
T  14884584 acggaagacaaactaaatcaatcacaaaatctctaccaaacatagatataggacaccgcagacaaacaagagaagtggttactgaacccttagctggagt 14884485  T
Q  793 ttcgacaaccat 804  Q
    ||| ||||||||    
T  14884484 ttcaacaaccat 14884473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 8 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 22234212 - 22233537
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||  || || || || |||||| |||||||||||||| |||| |||||||| || |||||| | ||    
T  22234212 cgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacatgtcctaaaggccgtcttcggcatatcctcatccatcaccttaatctgatggtaacctaacct 22234113  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||| || ||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || || || || |||| |    
T  22234112 caaatcaattttactaaacacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcggaagtggatacctattctttatcgtcactttattcagc 22234013  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
     | || |  || ||||| |||| ||| |||||||| |||||||| || | ||| || ||||||||| | |||||||| | |||||| ||||| ||||| |    
T  22234012 ggacggttgtctatacataacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccggcgctccccatggtgaaacactcggtcttacaaatttcttat 22233913  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||| || | |||| |||| |||||||| || |     
T  22233912 caagtaaatcctccaactgtttcttcaattcagctaactcggacgccgacatacgataaggtgtcatcgacaccgacttcattccgggaacaaggtctat 22233813  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              ||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| ||||| |  |||||||||||  ||||     
T  22233812 tgaaaattcaacttccctctctggtggtacatccggaatctcatcaggaaaaacttccggaaattcattcacaaccggcaaactatcaatcacaacttgg 22233713  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||| |  |||||  | ||||| || |||||||| |  || ||||| ||||| |  ||||||| ||| || |||| ||| ||||| ||  |||| || |    
T  22233712 ttctccatcgataagtacgccatcaaggaaaacattagaattccatcacgttctaactgcttcaactgtttcgtagtcaagaactcagcttcactctctt 22233613  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacc 669  Q
    ||||  | ||||| ||||| || | ||| ||||| ||||||||| |||| ||||| || || ||||||||||||||    
T  22233612 cttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttactaaagcaattaatatgaacatggttatattccaaccagttcatacc 22233537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 8 - 495
Target Start/End: Original strand, 25850151 - 25850652
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||    
T  25850151 cgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacct 25850250  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||||||||| ||||||| |   ||||| || ||| |||||||||| |  |||||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||    
T  25850251 caaatcaatcttactaaaaattttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctcggaagcggatatctgttctttatcgtaaccttgttcaac 25850350  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || || ||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||| || | ||| || || |||||| |||||||||| |  ||||| ||||| ||||| |    
T  25850351 tgacggtaatctatacacaatctcatactaccatccttcttcttgaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaatttcttat 25850450  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    | | || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||     
T  25850451 ccaacaggtcctccaactgtttcttcaactcagctaactcagaagctgacatacggtatggtgccatcgacaccggcttagttcctggaacaaggtcaat 25850550  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||  ||| || |||| ||| |||||||| ||||||    
T  25850551 tgaaaattcaacctccctctctggtggcacatcaggaatctcatcaggaaatacttatggaaattcattcactacaggtaacctgtcaatcacagcttga 25850650  T
Q  494 tt 495  Q
    ||    
T  25850651 tt 25850652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 17267626 - 17266810
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || || || || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||    
T  17267626 cgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatctttcaccttaatttgatggtaacctgacct 17267527  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||| || || ||   ||||||||||| | | |||||||| | |||||| |||||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||     
T  17267526 caagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatcaatcctcggaagcggatatctattcttaattgtaactttgttcaat 17267427  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| || ||||| || | ||| |  ||||||||| | |||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  17267426 tgacgatagtcaatgcacaacctcatactaccatcctttttcttcaccaacaacataggcgctccccacggtgaaacactgggtctaacaaacttcttat 17267327  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||     
T  17267326 caagcaaatcttccaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggctttgttccgggaacaaggtcaat 17267227  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              ||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || || ||||| |||  |||||| | |||  | |||| ||| |||||     
T  17267226 tgaaaactccacctccctctctggtggcacatcgggaatctcatcagggaacacctccggaaactcattcaccactgctagtttgtcaaacacagcttgg 17267127  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    || ||    || | | | |||||||  ||| ||||||  || ||||| |||||||  |||||||  ||||| |||  |||||||||  |  |||| || |    
T  17267126 ttttctgacgacagatatgccattagagaatacatcagaattccatcacgttccaactgcttcatttgcttcgtattcaaaaactcaacttcactctctt 17267027  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||| ||||||| |||||||| | ||| |||||||| || ||| ||||   ||| ||||||||||| ||||| || | ||| |||| ||| ||  ||||    
T  17267026 cttcggcggaagaaaaatgtaccgtcttactaaaacagttgatatgaactcagttatactctaaccaattcatcccaaaaataacatccattcccgtcaa 17266927  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     || | ||||||||| || | ||||||||| | |||||||||||| |  |||||  |||| || || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  17266926 cggcaaacaaactaagtctacttcaaaatctctaccaaacatagaaattggacacctcaagcaaacaagagaagtagtcactgaacccttagctggagtt 17266827  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || |||||||| |||||    
T  17266826 tcaacaaccatttctcc 17266810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 237 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 21984240 - 21983653
Alignment:
Q  237 accatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaac 336  Q
    ||||||||||||||| || | ||| || ||||||||| |||||||||| | |||||| |||| |||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  21984240 accatctttcttcttaaccaacaacaccggcgctccccaaggtgaaacactcggtcttacaatcttcttatcaagtaaatcctccaattgtttcttcaac 21984141  T
Q  337 tcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaagt--------------cctctctggaggca 422  Q
    |||| ||||||  | |  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |              ||||||||  ||||    
T  21984140 tcagctaactcatacgttgacatacggtaaggtgccatcgacactggcttcgtacccggaacaagatcaattgaaaattcaacttccctctctgacggca 21984041  T
Q  423 catcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatga 522  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| ||||  |  ||||||||||  ||||||||||| || || ||  | |||||||| ||    
T  21984040 catcaggaatctcatcaggaaaaacttctggaaattcattcacaaccgccaatctatcaatcatagcttgattctccaccgacaagtatgccattaaaga 21983941  T
Q  523 aaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttg 622  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||   ||  || || ||  | ||||| ||||| || | |||     
T  21983940 aaacattaagatcccatcacgttctaattgcttcagctgtttagtagtcaagaactcagctttaccctcttcctcagcagaagaaaaatgcaccgtctta 21983841  T
Q  623 ctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaat 722  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| || |  || |||| ||||||  |||| || | ||| |||| ||| | ||||||||    
T  21983840 ctaaaacaattgatatgaacatggttatactccaaccagttcatcccaaagattacatccatacccgtcaacggcaaacatactagatcaacttcaaaat 21983741  T
Q  723 cacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    | | |||||||||| |||| |||||  ||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  21983740 ctctaccaaacataaacaatggacaactcaaacaaacgagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcc 21983653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 37541673 - 37541275
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||    
T  37541673 cgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacct 37541574  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgt-gcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 206  Q
    |||||||||||| ||||||| || | ||||| || ||  |||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  37541573 caaatcaatcttactaaaaa-tcttagcaccaaccaattgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttcttgatcgtaactttgttcaa 37541475  T
Q  207 ctgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttc 306  Q
    ||| || ||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||| || | ||| || || |||||| |||||||||| |  ||||| |||||||||||     
T  37541474 ctgacggtaatctatacacagtctcatactaccatccttcttcttgaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaacttctta 37541375  T
Q  307 tcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    || | || ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  37541374 tctaacaggtcctccaactgtttcttcaactcagccaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggcttagttcctggaacaagatcaa 37541275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 8 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 24796689 - 24796014
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||    
T  24796689 cgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatctttcacctttatctgatgataaccagacct 24796590  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtg-cacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 206  Q
    |||||||||||| || |||| || || |||| || ||| |||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  24796589 caaatcaatcttactgaaaa-tcttggcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttcttgatcgtaactttgttcaa 24796491  T
Q  207 ctgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttc 306  Q
    ||| || ||||| || || |  | |||||||||||| ||||||||||||| ||| || || |||||| |||||||||| |  ||||| |||||||||||     
T  24796490 ctgacggtaatctatgcaaagtctcatactaccatccttcttctttactaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaacttctta 24796391  T
Q  307 tcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    || | || ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  24796390 tctaacaggtcctccaactgtttcttcaactcagccaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggcttagttcctggaacaagatcaa 24796291  T
Q  407 gt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttg 492  Q
     |              ||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||  ||| || ||||  | ||||||||| |||||    
T  24796290 ttgagaactcaacctccctctctggtggcacatcaggaatctcatcagggaatacttctggaaattcattcactacaggtaaaccatcaatcacagcttg 24796191  T
Q  493 attctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcc 592  Q
    ||| || |  || ||    |||||||  ||| |||||| ||||||||| ||||| |  ||||||| ||| || ||||  || |||||||| ||||| ||     
T  24796190 attttctaacgacaattgtgccattagagaatacatcaggataccatcacgttcaaactgcttcaactgttttgtagttaagaactctgctccactctct 24796091  T
Q  593 tcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacc 669  Q
    || ||  | ||||| ||||| || | |||| | || ||||| ||| |||| ||| | ||||| ||||||||||||||    
T  24796090 tcctccgcagaagaaaaatgcaccgtcttgtttaagcaattgatatgaacatgggtatactccaaccagttcatacc 24796014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 58 - 804
Target Start/End: Original strand, 21409278 - 21410038
Alignment:
Q  58 gtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaat 157  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||  |||| || ||||| || || || || || |||||||  ||| ||||||||||||    
T  21409278 gtcttctgaatatcctcatctttcactttgatatggtgatagccccatcttaagtcaattttactgaacacacgcgcacccatcaactgatccatcaaat 21409377  T
Q  158 tatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactag 257  Q
      || || |||||| ||||||| |||||||| || || || || ||||||| ||| ||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||| || |     
T  21409378 cgtcgatcctcggaggtggatatctattctttattgtcactttattcaacttccggtaatctatacataacctcatgctaccatctttcttcttaaccaa 21409477  T
Q  258 caaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagac 357  Q
     || || | | ||||| |||| || || | |||||| |||||||| || |||||||| || || ||||| || |||||| ||| ||| |||||||| |||    
T  21409478 taacaccgacactccccaaggcgatacactcggtcttacaaactttttatcaagcaaatcttctaactgctttttcaacccagctaattcggaagctgac 21409577  T
Q  358 atacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaagt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaa 443  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || |||| ||| ||||                ||||||||| |||||||||||||| |||||  |||    
T  21409578 atacggtaaggtgccatagaaacaggtttcgtacccggaataagttcaatagaaaattctacttccctctctggtggcacatcaggaatttcatcaagaa 21409677  T
Q  444 aaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcg 543  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |  ||  |||| || |||||||||  ||| ||||| ||    
T  21409678 aaacttctggaaattcacacaccacttgtaacttatcaatcaccgcttgattctcaacagacagggactccatcaacgaaaacatctggattccatcccg 21409777  T
Q  544 ttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacg 643  Q
        |  || |||| ||||||||||| ||| ||||| |   | | ||| |||||| | ||||| ||| | || | ||| | |||||| |||||| ||||     
T  21409778 cattaactgtttcaactgcttagtagtcaagaactcagtttctccttcttcttcggcagaagaaaaacgcaccgtctttcgaaaacatttaatatgaaca 21409877  T
Q  644 tggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaag 743  Q
     ||||  | || |||||||||||||| || || |||| ||| ||| |||| || | ||| ||||| |||| | ||||||| | |||||||||  ||||||    
T  21409878 aggttaaattccaaccagttcatacctagtattacatccatcccagtcaacggcaaacagactaagtccactgcaaaatctctaccaaacatcaacaaag 21409977  T
Q  744 gacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 804  Q
    |||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  21409978 gacacttcaagcatactagagaactagtcaccgaagccttagccggggtttcgacaaccat 21410038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 495
Target Start/End: Original strand, 20344358 - 20344859
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||    
T  20344358 cgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacct 20344457  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgt-gcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 206  Q
    ||| |||||||||||||||| || | ||||| || ||| |||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||    
T  20344458 caagtcaatcttgctaaaaa-tcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttctttatcgtgactttgttcaa 20344556  T
Q  207 ctgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttc 306  Q
    ||| || ||||| || || |  | |||||||||||| |||||||| || |  || || ||  ||||| |||||||||| |  ||||| ||||| |||||     
T  20344557 ctgacggtaatctatgcatagtctcatactaccatccttcttcttaaccaataacaccggtcctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaatttctta 20344656  T
Q  307 tcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    || | || |||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||| | |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||    
T  20344657 tctaacaggtcctccaactgcttcttcaattcagctaactcagaaactgacatacggtatggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaaggtcaa 20344756  T
Q  407 gt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttg 492  Q
     |              ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||  ||| || |||| || ||||||||| |||||    
T  20344757 ttgaaaattcaacctccctctctggtggcacatcaggaatctcatcaggaaatacttctggaaattcattcactacaggtaacccatcaatcacagcttg 20344856  T
Q  493 att 495  Q
    |||    
T  20344857 att 20344859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 804
Target Start/End: Original strand, 22504755 - 22505565
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| || || || |||||||| || || || || ||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||    
T  22504755 cgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccatcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacct 22504854  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||| || ||||  |  ||||| || ||| ||| |||||| | |||||||||  |||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||    
T  22504855 caagtcaatcttactgaaaatcctagcaccaaccaactgattcatcaagtcatcaattctatgaagcggatacctgttctttatcgtaaccttgttcaac 22504954  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || || |||||||| ||||  | |||||||||||| |||||||| || | ||| ||||  |||||| |||||||||| |  ||||| ||||| ||||| |    
T  22504955 tgacggtaatcaatgcacagtctcatactaccatccttcttcttaaccaacaacactgatgctccccaaggtgaaacactaggtcttacaaatttcttat 22505054  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    | | || ||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||  |||| || ||||     
T  22505055 ccaacaggtcttccaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatacggtatggtgccatcgacaccggcttcgttcctagaacgaggtcaat 22505154  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||  ||| || |||| ||| |||||||| ||||||    
T  22505155 tgaaaattcaacctccctctctggtggcacatcaggaatctcatcacgaaatacttctggaaattcatgcactacaggtaacctgtcaatcacagcttga 22505254  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    || || |  || ||    |||||||  ||| ||||||  || ||||| ||||| |  || |||| ||| || ||||| | || |||  |  ||| ||| |    
T  22505255 ttttctaacgacaattgtgccattagagaatacatcagaattccatcacgttcaaactgtttcatctgttttgtagatagaagctcaacctcaccttctt 22505354  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    |||| || ||||| ||||| | || ||| ||| | || || ||| ||||  |||| ||||||||||| ||||| || | |||||||| ||||||  ||||    
T  22505355 cttcaacagaagaaaaatgcattgtcttactatagcagttgatatgaactcggttatactctaaccaattcattccaaaaatcacatccatacccgtcaa 22505454  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     |||| ||||||||||||||   ||||||| | |  ||||||||| | ||||||   || ||| || |||||| |||| |  ||||||||||||||||||    
T  22505455 cggtaaacaaactaaatccaccacaaaatctctatgaaacatagatataggacaccccagacaaacaagagaagtagttattgaacccttagctggagtt 22505554  T
Q  794 tcgacaaccat 804  Q
    || ||||||||    
T  22505555 tcaacaaccat 22505565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 77 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 21935411 - 21935109
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||| | |||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  21935411 cctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 21935312  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaa 276  Q
    ||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| || | ||| ||||| || ||| |     
T  21935311 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgtcgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccac 21935212  T
Q  277 ggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcg 376  Q
    |||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||| |||   ||||| || |||||||| ||||| || || ||||    
T  21935211 ggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactccgatgcagacatccgatacggcgcaatcg 21935112  T
Q  377 aaa 379  Q
    |||    
T  21935111 aaa 21935109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 77 - 379
Target Start/End: Original strand, 23507829 - 23508131
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||| | |||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  23507829 cctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 23507928  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaa 276  Q
    ||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| || | ||| ||||| || ||| |     
T  23507929 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgtcgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccac 23508028  T
Q  277 ggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcg 376  Q
    |||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||| |||   ||||| || |||||||| ||||| || || ||||    
T  23508029 ggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactccgatgcagacatccgatacggcgcaatcg 23508128  T
Q  377 aaa 379  Q
    |||    
T  23508129 aaa 23508131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 77 - 379
Target Start/End: Original strand, 24583355 - 24583657
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||| | |||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  24583355 cctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 24583454  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaa 276  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| || | ||| ||||| || ||| |     
T  24583455 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccac 24583554  T
Q  277 ggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcg 376  Q
    |||||||| | |||||||| |||||  ||||||||||| || |||||||| |||||||| |||   ||||| || |||||||| ||||| || || ||||    
T  24583555 ggtgaaacactcggtctaataaactgtttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactccgatgcagacatccgatacggcgcaatcg 24583654  T
Q  377 aaa 379  Q
    |||    
T  24583655 aaa 24583657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 70 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 21677064 - 21676742
Alignment:
Q  70 tcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcg 169  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||    |||||| || ||| |||||||||  |  ||||||||||    
T  21677064 tcctcatctttcaccttgatctgatggtaacctgacctcaagtcaattttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaggtcgtcaattctcg 21676965  T
Q  170 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgc 269  Q
    |||| ||||| |||||||| |  || || || |||||||| || || ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||    
T  21676964 gaagcggatatctattctttaccgtaactttattcaactgacggtagtcaatgcataacctcatactaccatctttcttctttaccaacaacacaggcgc 21676865  T
Q  270 tccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggt 369  Q
    |||| | |||| ||| |  ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||  |  ||||| || ||||||| |||||||    
T  21676864 tccccacggtggaacacttggtcttacaaacttcttgtcgagcaagtcctctaactgtttcttcaactcagcaagttcggatgccgacatacaataaggt 21676765  T
Q  370 gccatcgaaactggcttcgttcc 392  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  21676764 gccatcgacaccggcttcgttcc 21676742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 196 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 23564272 - 23563644
Alignment:
Q  196 accttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaa 295  Q
    ||||| |||||||| || ||||| || || |||| |||  ||||||| |||||||| || | ||| || |||||| || | |||||||| |   |||| |    
T  23564272 accttattcaactgtcggtaatcgatgcataacctcatggtaccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgcttcccatggtgaaacactttgtctta 23564173  T
Q  296 caaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccagg 395  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  23564172 caaatttcttatcaagcaagacctccaactatttcttcaactccgctaactcggacgccgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctgg 23564073  T
Q  396 aacaagatcaagt----------cctc----tctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatca 481  Q
    || ||| |||| |          ||||    ||| | |||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||| |||  ||| || || | ||| |||    
T  23564072 aataaggtcaattgaaaattcaacctctctttctagtggcacatctggaatcttatcaggaaaaacatcaggaaactcattcacaactggcaacctgtca 23563973  T
Q  482 atcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctg 581  Q
    |||||  |||| ||||| |  || ||| | | ||| || |||||||| |  || ||||| || ||||  ||||||| ||| |||||||| |  |||||||    
T  23563972 atcacaacttggttctctaacgaaaaatatgtcatcaaagaaaacataagaattccatcacgctccaactgcttcaactgtttagtagatagcaactctg 23563873  T
Q  582 caccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacata 681  Q
    | ||||| || |||||    ||||| ||||| || | ||||||||| ||||| ||| ||||  |||| ||||||||||||||||| || | ||| ||||     
T  23563872 ctccactctcttcttctgtagaagaaaaatgcaccgtcttgctaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaataacatc 23563773  T
Q  682 cataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaaccc 781  Q
    ||||||  |||| |||| ||||||||| || | |||||| || | ||||||||||||||| | |||  | | ||| || |||||| |||| || ||||||    
T  23563772 catacccgtcaatggtaaacaaactaagtcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacgtacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaaccc 23563673  T
Q  782 ttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  23563672 ttagctggagtttcaacaaccatttctcc 23563644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 275 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 23078930 - 23078381
Alignment:
Q  275 aaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccat 374  Q
    |||||||||| |  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  23078930 aaggtgaaacacttggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatacggtaaggtgccat 23078831  T
Q  375 cgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaagt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattca 460  Q
    ||| || ||||||||||| |||| ||| |||| |              ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||    
T  23078830 cgacaccggcttcgttcctggaataaggtcaattgaaaattccacctccctttctggtggcacatcaggaatctcatcaggaaacacttctgaaaattca 23078731  T
Q  461 cacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagct 560  Q
      |||||| || | ||| ||||||||  ||||||| || |  || ||| | |||||||| ||| ||||||  ||  | || ||||| || || |||| ||    
T  23078730 ttcaccacaggcaacctgtcaatcacaacttgattttctaacgacaaatatgccattaaagaatacatcagaatttcgtctcgttctagctgtttcatct 23078631  T
Q  561 gcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaacca 660  Q
    | || |||||||| |||||  |  ||| ||| |||||  | ||||| ||||| || | ||| ||||| || || ||  ||||  |||| |||||||||||    
T  23078630 gtttcgtagacaagaactcaacttcaccttcttcttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttactaaagcagttcatgtgaactcggttatactctaacca 23078531  T
Q  661 gttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacg 760  Q
     ||||| || | ||| |||| ||||||   ||| || | ||||| || ||| | | |||| || | ||||||||||||||| |||||| |||| || ||     
T  23078530 attcatcccaaaaataacatccatacccgacaacggcaaacaaattagatcaactacaaagtctctaccaaacatagacaatggacatctcaagcaaact 23078431  T
Q  761 agagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  23078430 agagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcc 23078381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 307 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 815 - 439
Alignment:
Q  307 tcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||| ||||    
T  815 tcaagcaagtcctccaactttttcttcaactcagctaactcggacgccgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttccttcctggaacaaggtcaa 716  T
Q  407 gt----------cctctct----ggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttg 492  Q
     |          |||||||    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||| ||||| | ||| ||||||||  ||||    
T  715 ttgaaaattcaacctctctctccggtggcacatctggaatctcatctggaaaaacttcagggatttcattcacaaccggcaacctgtcaatcacaacttg 616  T
Q  493 attctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcc 592  Q
    ||| || |  || ||||| ||||| || |||||||| |  || |||||||| ||||  ||||||| ||| || ||||| |  |||||| | ||||| ||     
T  615 attttctaacgacaaagatgccatcaaggaaaacataagaattccatcgcgctccaactgcttcaactgttttgtagataggaactctactccactctct 516  T
Q  593 tcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacc 669  Q
    |||||  | ||||| ||||| || | ||||||||| ||||| ||| | || ||||| ||||| |||| |||||||||    
T  515 tcttccgcagaagaaaaatgcaccgtcttgctaaagcaattgatatggacatggttatactccaaccggttcatacc 439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 682 - 764
Target Start/End: Original strand, 23525869 - 23525951
Alignment:
Q  682 cataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagag 764  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23525869 cataccgctcaaaggtagacaaactaaatccatctcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagag 23525951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 623 - 804
Target Start/End: Original strand, 20311573 - 20311754
Alignment:
Q  623 ctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaat 722  Q
    ||||||||||| ||| |||| | |||  |||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |  | ||| ||||| |||| | ||||||    
T  20311573 ctaaaacaattgatatgaacatagttaaactccaaccagttcatacctagtatcacatccataccactcaacgacaaacagactaagtccactgcaaaat 20311672  T
Q  723 cacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 804  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  20311673 ctctaccaaacatcgacaaaggacacttcaagcatactagagaagtagtcaccgaacccttagttggggtttcgacaaccat 20311754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 753 - 808
Target Start/End: Original strand, 23460824 - 23460879
Alignment:
Q  753 aacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctct 808  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23460824 aacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctct 23460879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 761 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 21631924 - 21631881
Alignment:
Q  761 agagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 804  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21631924 agagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 21631881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 653 - 804
Target Start/End: Original strand, 25850807 - 25850958
Alignment:
Q  653 tctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttca 752  Q
    |||||||| ||||| || | ||| |||| ||||||  |||| || |||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||| | ||||||   ||    
T  25850807 tctaaccaattcattccaaaaataacattcatacccgtcaacggcagacaaactaaatcaatcacaaaatctctaccaaacatagatataggacaccgca 25850906  T
Q  753 aacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 804  Q
     ||| || |||||| | || || ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  25850907 gacaaacaagagaagtggttactgaacctttagctggagtttcaacaaccat 25850958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 409 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 37541258 - 37541172
Alignment:
Q  409 cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||  ||| || ||||  | ||||||||| ||||||||    
T  37541258 cctctctggtggcacatcaggaatctcatcagggaatacttctggaaattcattcactacaggtaaaccatcaatcacagcttgatt 37541172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 643; Significance: 0; HSPs: 54)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 643; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 16234840 - 16234026
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16234840 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcctttactttaatctggtgataacctgacctca 16234741  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16234740 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 16234641  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  16234640 tcgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctca 16234541  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-- 407  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||       
T  16234540 agcaagtcttctaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaatag 16234441  T
Q  408 -----------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
               || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16234440 aaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctgtcaatcactgcttgatt 16234341  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||| ||||| || || |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16234340 ctcaatagatatagtaggcattagcgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcctct 16234241  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16234240 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccataccactcaaag 16234141  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16234140 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttc 16234041  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||    
T  16234040 gacaaccatctctcc 16234026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 639; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Original strand, 12478764 - 12479578
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  12478764 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcctttactttaatctggtgataacccgatctca 12478863  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12478864 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 12478963  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||| |||    
T  12478964 tcgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttttca 12479063  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-- 407  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||       
T  12479064 agcaagtcttctaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtaccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaatag 12479163  T
Q  408 -----------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
               || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  12479164 aaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctgtcaatcactgcttgatt 12479263  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12479264 ctcaatagataaagtagccatcaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcctct 12479363  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  12479364 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccataccactcaaag 12479463  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12479464 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttc 12479563  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||    
T  12479564 gacaaccatctctcc 12479578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 635; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 14301827 - 14301013
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14301827 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagttgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgacctca 14301728  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14301727 aatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 14301628  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  14301627 ccgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctca 14301528  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-- 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||       
T  14301527 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaatag 14301428  T
Q  408 -----------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
               || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14301427 aaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatcactgcttgatt 14301328  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  14301327 ctcagtagataaagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactccgcaccactttcctct 14301228  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  14301227 tcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccataccgctcaaag 14301128  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14301127 gtagacaaactaaatccatttcgaaatcacgaccaaatatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttc 14301028  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||    
T  14301027 gacaaccatctctcc 14301013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 635; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 19776641 - 19775827
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  19776641 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcctttactttaatctggtgataacccgatctca 19776542  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19776541 aatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 19776442  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  19776441 tcgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctca 19776342  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-- 407  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||       
T  19776341 agcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaatag 19776242  T
Q  408 -----------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
               || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19776241 aaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatcactgcttgatt 19776142  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19776141 ctcaatagatatagtagccattaacgaaaacatcaagatactgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcctct 19776042  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  19776041 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccataccactcaaag 19775942  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19775941 gtagacaaactaaatccatttcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatatgagagaagtagtcaccgaacccttagccggagtttc 19775842  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||    
T  19775841 gacaaccatctctcc 19775827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 633; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 8388574 - 8389390
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  8388574 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcttcgtcttttactttaatctggtgataacctgacct 8388673  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8388674 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 8388773  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  8388774 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttct 8388873  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  8388874 caagcaagtcttctaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaat 8388973  T
Q  408 -------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8388974 agaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatcactgcttga 8389073  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8389074 ttctcaatagataaagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcct 8389173  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  8389174 cttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcattcccaaaatcacatccataccactcaa 8389273  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8389274 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagtgaagtagtcaccgaacccttagctggagtt 8389373  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  8389374 tcgacaaccatctctcc 8389390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 633; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 17092999 - 17092183
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  17092999 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcttcgtcttttactttaatctggtgataacctgatct 17092900  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17092899 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagttgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 17092800  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  17092799 tgtcgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttct 17092700  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  17092699 caagcaagtcttctaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaat 17092600  T
Q  408 -------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  17092599 agaaaattcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctgtcaatcactgcttga 17092500  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17092499 ttctcaatagataaagtagccatcaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcct 17092400  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  17092399 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccataccactcaa 17092300  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17092299 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtt 17092200  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  17092199 tcgacaaccatctctcc 17092183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 631; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Original strand, 23957911 - 23958725
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  23957911 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgatatcctgacctca 23958010  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23958011 aatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 23958110  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
     |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  23958111 tcgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacactcggtctaacaaacttcttctca 23958210  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-- 407  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||       
T  23958211 agcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaatag 23958310  T
Q  408 -----------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
               || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23958311 aaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaccctatcaatcactgcttgatt 23958410  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23958411 ctcaatagataaagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcctct 23958510  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23958511 tcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccataccgctcaaag 23958610  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23958611 gtagacaaactaaatccatttcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttc 23958710  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||    
T  23958711 gacaaccatctctcc 23958725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 621; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 27713498 - 27714314
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  27713498 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacct 27713597  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27713598 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgacccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 27713697  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  27713698 tgtcgataatcaatacataacctcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacactcggtctaacaaacttcttct 27713797  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||     
T  27713798 caagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccagggacaagatcaat 27713897  T
Q  408 -------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27713898 agaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatcactgcttga 27713997  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27713998 ttctcaatagataaggtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcct 27714097  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  27714098 cttcgacggaagagaaatatactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccataccgctcaa 27714197  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  27714198 aggtagacaaactaaatccatttcgaaatcacgaccaaacatagacaaaagacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagccggagtt 27714297  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  27714298 tcgacaaccatctctcc 27714314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 617; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 8051473 - 8050657
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  8051473 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcctttactttaatctggtgataacctgacct 8051374  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8051373 caaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 8051274  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||| ||||| |  |||||||||||||||||||    
T  8051273 tgtcgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcactccccaaggcgaaacacttggtctaacaaacttcttct 8051174  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  8051173 caagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaat 8051074  T
Q  408 -------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8051073 agaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatcactgcttga 8050974  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8050973 ttctcagtagataaagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgtgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcct 8050874  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  8050873 cttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccataccgctcaa 8050774  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8050773 aggtagacaaactaaatccatttcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggaaatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtt 8050674  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  8050673 tcgacaaccatctctcc 8050657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 603; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Original strand, 40475204 - 40476018
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40475204 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgggttctgaaagctgtcttatgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctca 40475303  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40475304 aatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 40475403  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  40475404 ccgataatcaatacataaccgcatactaccatccttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctca 40475503  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-- 407  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||       
T  40475504 agcaaatcttccaacagtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccagggacaagatcaatag 40475603  T
Q  408 -----------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
               || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  40475604 aaaactcgacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatccctgcttgatt 40475703  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
     |||| |||||| | || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  40475704 atcaatagataaggtagtcattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagatacaaactctgcaccactttcctct 40475803  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  40475804 tcgacggaagagaaatgcactgacttgctataacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccataccgctcaaag 40475903  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40475904 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttc 40476003  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
    ||| |||||||||||    
T  40476004 gaccaccatctctcc 40476018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 524; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Original strand, 14682731 - 14683545
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14682731 aaaggcataaccttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcgtcatcttttactttaatctggtgataacctgacctca 14682830  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
     |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14682831 gatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 14682930  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
     |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| |||||||||    
T  14682931 tcgataatcaatacataacctcatactaccatctttcttctttactagtaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaatttcttctca 14683030  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa--- 406  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||       
T  14683031 agcaaatcttccaactgtttcttcgactcagataattcggaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccaggaacaagatcaatag 14683130  T
Q  407 -----------gtcctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
                 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || || |||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  14683131 aaaactcaacttccctctctggaggcacatcaggaatttcatctggaaaaactttaggaaaatcgcataccacttgtagcttatcaatcactgcttgatt 14683230  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  14683231 ctcaatagataaagaagccattaaagaaaacatcaaaataccatcacgttccatttgcttcagctgcttagtagataagaactctgcaccactttcctct 14683330  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    ||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||  |||||||    
T  14683331 tcggcggaagagaaatacactgacatgctaaaacaattaatatgaacatggttgtactccaaccaattcattcccagaatcacatccatactgctcaaag 14683430  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14683431 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacaacgcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttc 14683530  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
     || |||||||||||    
T  14683531 aacgaccatctctcc 14683545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 514; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 18225296 - 18224480
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18225296 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataccctgatct 18225197  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18225196 caaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 18225097  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| |||||||    
T  18225096 tgacgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcttgactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaatttcttct 18224997  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
      ||||| || || ||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||     
T  18224996 tgagcaaatcttctaactgttttgtcaactcagctaactcgaaagcagacatacgataaggtgccatcgataccaacttcgttccaggaacaagatcaat 18224897  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                   ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  18224896 agaaaactcaacttccctctctggaggcacattaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaagtcgcataccacttgtagcttatcaatcactgcttga 18224797  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  18224796 ttctcaatagataaagaagccatcaacgaaaacatcaaaataccatcgcgttccatttgcttcagctgcttagtagataagaactctgcaccactttcct 18224697  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||| |||||    
T  18224696 cttcaacggaagagaaatacactgacttgctaaaacaattgttatgaacatggttgtactctaaccaattcatacccaaaataacatccataccgctcaa 18224597  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18224596 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatcgcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtt 18224497  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  18224496 tcgacaaccatctctcc 18224480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 446; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 15145735 - 15144926
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||| |||||    
T  15145735 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctagtgataacccgatct 15145636  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15145635 caaatcaatgttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaa--------ttctcggaagtggatacctattcttgatagttactttgttcaac 15145544  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || |||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  15145543 tgacgataatcgatacataatctcatactaccatctttcttcttcactaacaaaaaaggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttct 15145444  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||| ||||| ||||||||||||     
T  15145443 caagcaagtcttctaactgtttcttcaactcagctaactcggaagctgacatacgataaggtgccatagacaccggcttcattccaagaacaagatcaat 15145344  T
Q  408 -------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                 || |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  | |||||  ||||| ||||||||||||  |||    
T  15145343 agaaaacttaacttctctctctagaggtacatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaaatcgtataccacttgtagcttatcaatcactgtgtga 15145244  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcacc-actttcc 592  Q
    ||||||| |||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  15145243 ttctcaatagataaggacgccatcaaggaaaacatcaaaataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttggtagacaagaactctgcacctactttcc 15145144  T
Q  593 tcttcgacggaagagaaatgtactgacttg-ctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactc 691  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||| || |||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||     
T  15145143 tcttcgacggaggagaaatacactgacttgactaaaacaattaatgtgaacatggttgtattccaaccagtttatacccaga-tcacatccataccgctt 15145045  T
Q  692 aaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggag 791  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15145044 aaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagacgtagtcaccgaacccttagctggag 15144945  T
Q  792 tttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||||    
T  15144944 tttcgacaaccatctctcc 15144926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 424; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 106 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 16251602 - 16250884
Alignment:
Q  106 ctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttca 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16251602 ctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatacatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttca 16251503  T
Q  206 actgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttctt 305  Q
    |||| ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  16251502 actgacgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcttcactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaatttctt 16251403  T
Q  306 ctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatca 405  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  16251402 ctcaagcaaatcttctaactgtttcttcaattcagctaactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgacacctgcttcgttccaggaacaagatca 16251303  T
Q  406 agt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgctt 491  Q
    |                |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||  ||||| ||||||||||||||     
T  16251302 atagaaaactcgacttccctctctggaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaagtcgcataccacttgtagcttatcaatcactgcta 16251203  T
Q  492 gattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttc 591  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||  || |||||||||||||||||    
T  16251202 gattctcaatagataaagaggccatcaacaaaaacatcaaaataccatcacgttccatttgcttcagctatttagtagttaagaactctgcaccactttc 16251103  T
Q  592 ctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactc 691  Q
    ||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||    
T  16251102 ctcttcagcggaagagaaatacactgacttgctaaaacaattgatatgaacatggttgtactctaaccaatttatacccagaatcacatccataccgctc 16251003  T
Q  692 aaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggag 791  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16251002 aaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatcgcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggag 16250903  T
Q  792 tttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16250902 tttcgacaaccatctctcc 16250884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 318 - 810
Target Start/End: Original strand, 19634608 - 19635114
Alignment:
Q  318 ctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag---------- 407  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||               
T  19634608 ctccgactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaatagaaaactca 19634707  T
Q  408 ---tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacag 503  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19634708 acttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatcactgcttgattctcaatag 19634807  T
Q  504 ataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacgga 603  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19634808 ataaagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactttgcaccactttcctcttcgacgga 19634907  T
Q  604 agagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaa 703  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  19634908 agagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccataccgctcaaaggtagacaa 19635007  T
Q  704 actaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaacca 803  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19635008 actaaatccatttcaaaatcacgaccgaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaacca 19635107  T
Q  804 tctctcc 810  Q
    |||||||    
T  19635108 tctctcc 19635114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 52 - 810
Target Start/End: Original strand, 14161676 - 14162448
Alignment:
Q  52 aaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatcca 151  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||||||    
T  14161676 aaagccgtcttctgtatatcttcattctttactctaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgttgaacacgcgtgcacccactaactgatcca 14161775  T
Q  152 tcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctt 251  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  14161776 tcaaatcatcaattcttggaagtggatacctattctgtatcgttaccttgttcaactgtcgataatcaatacacagtctcatactaccatctttcttctt 14161875  T
Q  252 tactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaa 351  Q
     |||| ||| |||||||||||| |||| ||||| |  ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||  |||    
T  14161876 gactaacaacactggcgctccccaaggagaaacacttggtctcacaaatttcttgtcaagcaaatcctccaactgtttcttcaattcagctaacttagaa 14161975  T
Q  352 gcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaagt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcat 437  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |  ||||||||||| | || |||||| | |              ||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  14161976 gcagacatacgataaggtgtcatagatataggcttcgttcccgaaataagatcgattgaaaactaaacttccctttctggaggtacatcaggaatttcat 14162075  T
Q  438 ctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagatacc 537  Q
      ||||||||||| ||||| || || ||||||  || | |||||||||| ||||||||||||| ||| || || ||||| || ||||||||||| || ||    
T  14162076 tgggaaaaacttctggaaaatcgcataccacctataacttatcaatcaccgcttgattctcaatagacaaggatgccatcaaggaaaacatcaaaattcc 14162175  T
Q  538 atcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaata 637  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | || ||||| ||||| || || |||||    || |||||||||||||||||||||    
T  14162176 atcacgttctagttgcttcagttgcttggtagacaagaactctactccgctttcttcttcaacagaggagaaggacaccgacttgctaaaacaattaata 14162275  T
Q  638 agaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatag 737  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  14162276 agaacatggttgtactctaaccagttcatgccaagaatcacatccattccactcaaaggtaaacaaactaaatccatttcaaaatcacgatcatacatag 14162375  T
Q  738 acaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||||||||  | ||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14162376 acaaaggacaccttaaacacacaagagaagtagttaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatttctcc 14162448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 146 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 16353242 - 16352697
Alignment:
Q  146 gatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatcttt 245  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  16353242 gatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttactttattcaactgatgataatcgatacataacctcatactaccatcttt 16353143  T
Q  246 cttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataac 345  Q
     |||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||| ||||    
T  16353142 tttctttactaacaaaacgggcgctcctcaaggtgaaaaacttggtctaacaaacttcttctcaagcaaatcttctaattgtttattcaactcagttaac 16353043  T
Q  346 tcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatca-------agtc-------ctctctggaggcacatcaggaa 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||       | ||       ||||||||||||||||||||||    
T  16353042 tcggaagcagacatacgataaggtgccatcgacactggcttcgttccaggaacaagatcattagaaaactcgacttctctctctggaggcacatcaggaa 16352943  T
Q  432 tctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaa 531  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||  | |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16352942 tttcatctggaaaaacttcaggaaaatcggataccacttgtagcttatcaatcactgcttgattctcaatagataaagaagccatcaaagaaaacatcaa 16352843  T
Q  532 gataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaa 631  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16352842 aataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaagaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatacactgacttgctaaaacaa 16352743  T
Q  632 ttaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatca 677  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  16352742 ttaatatgaacatggttgtactctaaccaattcataccaagaatca 16352697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Original strand, 14696277 - 14697079
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    |||||||| |||  ||||| ||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  14696277 aaaggcatcactgaatattaataatgtccataacgcgttctaaaggccgtcttctgcatatccttatctttcactttaatttggtgttaacccgatctca 14696376  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||| || ||||| |||||||||||    
T  14696377 aatcaatcttgctaaacacacgtacacccactaactgatccataaaatcatcaattcttggaagtagatacatattctttatcgttactttgttcaactg 14696476  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
     ||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||| |  ||||| ||||||||||| |||    
T  14696477 tcgataatcaatgcataacctcatgctaccatctttcttcttaactagcaatactggcgctccccacggtgaaacacttggtcttacaaacttcttatca 14696576  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa--- 406  Q
    || || || || ||||||||||||||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| || || |||||||| || |||||||| ||||       
T  14696577 agtaaatcttctaactgtttcttcaactcaaccaactcagaagccgacatacggtaaggtgtcatagacacaggcttcgtacccggaacaaggtcaatcg 14696676  T
Q  407 -----------gtcctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
                 ||| ||||||||||||||||||            |||||||| || || |||||||| ||| ||| | | |||||||||||||||||    
T  14696677 aaaattcaacttccctttctggaggcacatcagga------------aaaacttctgggaaatcacacacaacctgtaacttctcaatcactgcttgatt 14696764  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||||||| || || ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| || || | ||| ||||||||||||    
T  14696765 ctcaacagacaaggacgccatcaaagaaaacatcaaaattccatcacgttctaattgcttcagctgcttagtagaaaagaattttgcgccactttcctct 14696864  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    ||  | ||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||||||||||    
T  14696865 tcagcagaagaaaaatacactgacttactaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccagttcataccaaggattacatccattccactcaaag 14696964  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | || || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14696965 gtaaacaaactaaatcaatttcaaaatctcgaccaaacatagacaagggacatcttaagcacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttc 14697064  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||    
T  14697065 gacaaccatctctcc 14697079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 8 - 786
Target Start/End: Original strand, 16218392 - 16219184
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||    
T  16218392 cgaagggcatcactttatattcataatgtccataacgtgttctaaaagctgtcttctgcatatcctcatctttcactttaatctggtgataacccgacct 16218491  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  16218492 caagtcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactaatccattaagtcatcaattctcggaagtggatacctattctttatcgttactttgttcaac 16218591  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    |  ||||||||||| || || | ||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||  |||||||||| |  ||||| | ||||||||| |    
T  16218592 tatcgataatcaatgcataatctcatgctaccatctttcttcttaactagcaataccggtgctccacaaggtgaaacacttggtcttataaacttcttat 16218691  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc--- 404  Q
     ||| || || || ||||| ||||||||||||   |||||  |||| |||||||| ||||||| ||| || || |||||||| || ||||| |||||       
T  16218692 gaagtaaatcttctaactgcttcttcaactcaaccaactcataagctgacatacggtaaggtgtcatagacacaggcttcgtacccggaaccagatcaat 16218791  T
Q  405 ----aagtc-------ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
        || ||       || ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||  |||| ||||| || ||| || || |||||||||||||||||    
T  16218792 cgaaaattcaacttatctttctggaggcacatcaagaatttcatcaggaaaaacttctagaaaatcacatacaacctgtggcttatcaatcactgcttga 16218891  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| ||| || || ||||| ||  |||||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  16218892 ttctcaatagacaaggacgccatcaaaaaaaacatcaaaattccatcacgttctaattgcttcagctgcttgatagacaagaactctgcgccactttcct 16218991  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||||||||  || ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||||||||    
T  16218992 cttcagcagaagagaaatacaccgacttactaaaccaattaatatgaacatggttgtactctaaccagttcataccaaggattacatccattccactcaa 16219091  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagc 786  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||| |||| |  |||||||||||    
T  16219092 aggtaaacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagttattgaacccttagc 16219184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 8 - 786
Target Start/End: Original strand, 16221712 - 16222504
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||    
T  16221712 cgaagggcatcactttatattcataatgtccataacgtgttctaaaagctgtcttctgcatatcctcatctttcactttaatctggtgataacccgacct 16221811  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  16221812 caagtcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactaatccattaagtcatcaattctcggaagtggatacctattctttatcgttactttgttcaac 16221911  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    |  ||||||||||| || || | ||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||  |||||||||| |  ||||| | ||||||||| |    
T  16221912 tatcgataatcaatgcataatctcatgctaccatctttcttcttaactagcaataccggtgctccacaaggtgaaacacttggtcttataaacttcttat 16222011  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc--- 404  Q
     ||| || || || ||||| ||||||||||||   |||||  |||| |||||||| ||||||| ||| || || |||||||| || ||||| |||||       
T  16222012 gaagtaaatcttctaactgcttcttcaactcaaccaactcataagctgacatacggtaaggtgtcatagacacaggcttcgtacccggaaccagatcaat 16222111  T
Q  405 ----aagtc-------ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
        || ||       || ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||  |||| ||||| || ||| || || |||||||||||||||||    
T  16222112 cgaaaattcaacttatctttctggaggcacatcaagaatttcatcaggaaaaacttctagaaaatcacatacaacctgtggcttatcaatcactgcttga 16222211  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| ||| || || ||||| ||  |||||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  16222212 ttctcaatagacaaggacgccatcaaaaaaaacatcaaaattccatcacgttctaattgcttcagctgcttgatagacaagaactctgcgccactttcct 16222311  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||||||||  || ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||||||||    
T  16222312 cttcagcagaagagaaatacaccgacttactaaaccaattaatatgaacatggttgtactctaaccagttcataccaaggattacatccattccactcaa 16222411  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagc 786  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||| |||| |  |||||||||||    
T  16222412 aggtaaacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagttattgaacccttagc 16222504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 52 - 660
Target Start/End: Original strand, 22631910 - 22632528
Alignment:
Q  52 aaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatcca 151  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  22631910 aaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacacttgcacccactaactgatcca 22632009  T
Q  152 tcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctt 251  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||     |||||||||||||    
T  22632010 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctttattgtcaccttgttcaactgtcgatagtcaatacacaatctcat----gcatctttcttctt 22632105  T
Q  252 tactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaa 351  Q
     |||| |||||| | | ||||| |||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||||||| |  ||||| |||    
T  22632106 cactaacaaaaccgacactccccaaggtgaaacacttggtctaacaaactttttctcaagtaaatcttctaactgtttcttcaactcggccaactcagaa 22632205  T
Q  352 gcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa--------------gtcctctctggaggcacatcaggaatctcat 437  Q
    || |||||||||||||||| ||| || |  |||||| ||||||||||||||||||                ||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  22632206 gctgacatacgataaggtgtcatagacataggcttcattccaggaacaagatcaatcgaaaactcaacttccctctctggaggcacattagaaatttcat 22632305  T
Q  438 ctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagatacc 537  Q
    | ||||| ||||| ||||| || || |||||  ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||| |||||    
T  22632306 caggaaatacttctggaaaatcgcataccacttgtagtttatcaatcactgcttgattctcaatagataaggaagccatcaacgaaaacatcaaaatacc 22632405  T
Q  538 atcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaata 637  Q
    ||| ||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||  || || || |||||||||||||||    
T  22632406 atcacgttctaactgcttcaactgcttagtagacaaaaactctgcgccactttcctcttcagcagaagagaaatacaccgatttactaaaacaattaata 22632505  T
Q  638 agaacgtggttgtactctaacca 660  Q
     |||| ||||| ||||| |||||    
T  22632506 tgaacatggttatactccaacca 22632528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 8 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 14849216 - 14848543
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  14849216 cgaaaggcatctctttatattcataatgtccataacgcgttctaaaagccgtcttctgcatatcttcatctctcactttaatttggtgataacccgatct 14849117  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||||| ||||||||| || || |||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||    
T  14849116 caaatcaaccttgctaaatacacgcgcacccactaactgatccatcaagtcatcaatttttggaagtggatatctattctttatcgttactttattcaac 14849017  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| || |||||||| |  |||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||    
T  14849016 tgtcgataatcaatgcataacctcatgctaccatctttctttttaactagcaatatcggcgctccctaaggtgaaacacttggtcttacaaacttcttct 14848917  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc--- 404  Q
    |||| || || || || | |||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| || || ||||| ||  | |||| ||||||       
T  14848916 caagtaaatcttctaattatttcttcaactcggccaactcagaagccgacatacggtaaggtgtcatagacacaggctttgtatccggaataagatcaat 14848817  T
Q  405 ----aagtc-------ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcact-gcttg 492  Q
        || ||       || |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||| || |||  || | |||||||||||  ||||    
T  14848816 cgaaaattcaacttctctttctggaggcacatcaggaatttcattaggaaaaacttctggaaaatcacatacaacctttaacttatcaatcactcccttg 14848717  T
Q  493 attctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcc 592  Q
    ||||||||| || || || ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |  | ||| |||||||||    
T  14848716 attctcaacggacaaggatgccatcaaagaaaacatcaaaattccatcacgttctaattgcttcagctgcttagtagacaagagttttgcgccactttcc 14848617  T
Q  593 tcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcat 666  Q
    |||||  | ||||| ||||  || || ||  ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  14848616 tcttcagcagaagaaaaatacaccgatttaataaaataattaatatgaacatggttgtactctaaccagttcat 14848543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 8 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 1647387 - 1646883
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || || ||||| || |||||||| || || || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||    
T  1647387 cgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgagtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatttgatggtaacctgacct 1647288  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| ||||| || |||||||||  |||||| || ||| | |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| || || || || |||||     
T  1647287 caagtcaattttactaaaaacttttgcacctaccaactggtccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatacctattctttattgtaactttattcaat 1647188  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || || |||||| | ||||| || |  ||||| ||||||||||| |    
T  1647187 tgacgatagtcaatgcacaacctcatactaccatctttcttctttactaacaacacaggtgctccccacggtgagacactgggtcttacaaacttcttgt 1647088  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa- 406  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  || || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||     
T  1647087 caagcaaatcctccaactgtttcttcaactcagccaattcagaagctgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcccgggacaagatcaat 1646988  T
Q  407 -------------gtcctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                   ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||| ||||| || ||||||    
T  1646987 cgagaactcaacttccctttctggcggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcattcaccactggtaacctgtcaattacagcttga 1646888  T
Q  494 ttctc 498  Q
    |||||    
T  1646887 ttctc 1646883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 8 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 3262904 - 3262094
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||    
T  3262904 cgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacct 3262805  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgt-gcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 206  Q
    |||||||||||| ||||||| || | ||||| || ||| |||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  3262804 caaatcaatcttactaaaaa-tcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttcttgatcgtaactttgttcaa 3262706  T
Q  207 ctgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttc 306  Q
    ||| || ||||| |||||||  | |||||||||||| ||||||||||| | ||| || || |||||| |||||||||| |  ||||| |||||||||||     
T  3262705 ctgacggtaatctatacacagtctcatactaccatccttcttctttaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaacttctta 3262606  T
Q  307 tcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    || | || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  3262605 tctaacaggtcctccaactgtttcttcaactcagctaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggcttagttcctggaacaagatcaa 3262506  T
Q  407 gt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttg 492  Q
     |              ||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||  ||| || ||||  | ||||||||| |||||    
T  3262505 ttgaaaattcaacctccctctctggtggcacatcaggaatctcatcagggaatacttctggaaattcattcactacaggtaaaccatcaatcacagcttg 3262406  T
Q  493 attctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcc 592  Q
    ||| || |  || ||    |||||||  ||| |||||| ||||||||| ||||| |  || |||| ||| || ||||||| || |||  |  ||| |||     
T  3262405 attttctaacgacaattgtgccattagagaatacatcaggataccatcacgttcaaactgtttcatctgtttcgtagacagaagctcaacctcaccttct 3262306  T
Q  593 tcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactca 692  Q
    |||||  | |||||||||||||| | ||| ||||| || || ||| ||||  | || ||||||||||| |||||||| |  || |||| ||||||  |||    
T  3262305 tcttcagcagaagagaaatgtaccgtcttactaaagcagttgatatgaactcgattatactctaaccaattcataccaaagataacatccatacccgtca 3262206  T
Q  693 aaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagt 792  Q
    | || |||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||| | ||||||   || ||| || |||||| | || || |||||||||||||||||    
T  3262205 acggcagacaaactaaatcaatcacaaaatctctaccaaacatagatataggacaccgcagacaaacaagagaagtggttactgaacccttagctggagt 3262106  T
Q  793 ttcgacaaccat 804  Q
    ||| ||||||||    
T  3262105 ttcaacaaccat 3262094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 8 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 15001475 - 15001077
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||  || || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  15001475 cgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacatgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacct 15001376  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||| || ||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| || || || || ||||||    
T  15001375 caaatcaattttactaaacacacgtgcacccactaactgatccattaaatcgtcaatcctcggaagtggatacctattctttatcgtcactttattcaac 15001276  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || || ||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||| || | ||| || ||| ||||  | |||||||| |  ||||| ||||| ||||| |    
T  15001275 tgacggtaatctatacacaacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccggcactcctcacggtgaaacacttggtcttacaaatttcttgt 15001176  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||  ||||||| ||||    
T  15001175 caagcaagttctccaactgtttcttcaactcagctaactcggacgccgacatacgataaggtgccttcgacaccggcttcgttcctagaacaaggtcaa 15001077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 15072521 - 15073337
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || ||||||||||| || ||||| || || || || || || || ||| |||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||    
T  15072521 cgaaaggcatcaccttatattcataatgtccatatcgtgtcctaaaggccgttttttgcgtatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacct 15072620  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||| ||||| || || || |||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| || ||||| || || || || |||| |    
T  15072621 caaatcaattttgctgaacacacgagcacccactaactgatccattaaatcatcaattatcggaagtggatatctgttctttatcgtcactttattcagc 15072720  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || || ||| | |||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |  || || | ||||||| |||||||||| | |||||| ||||| ||||| |    
T  15072721 tgacggtaacctatacacaacctcatactgccatcattcttcttaaccaataataccgacgctccccaaggtgaaacactcggtcttacaaatttcttat 15072820  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa- 406  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||     
T  15072821 caagtaaatcctccaactgtttcttcaattcagctaactcggacgctgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccggggacaagatcaat 15072920  T
Q  407 -------------gtcctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                   |||| |||| || | ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| ||||  |  ||||||||||| |||||     
T  15072921 cgaaaattcaacctccctccctggtggtatatcgggaatctcatcaggaaaaacttctggaaattcattcacaaccgacaatctatcaatcacagcttgc 15073020  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||| |  || ||  | ||||| || |||||||| ||||| ||||| | ||| |  ||||||| ||| ||| ||| ||| ||||| ||  |||| || |    
T  15073021 ttctccaacgacaagaatgccatcaaagaaaacattaagattccatcacattctaactgcttcaactgtttattagtcaagaactcggcttcactctctt 15073120  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    | ||  | ||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| || |  || |||| ||||||  ||||    
T  15073121 cctcagcagaagaaaaatgtaccgtcttactaaaacaattaatatgaacacggttatactctaaccagttcatcccaaagattacatccatacccgtcaa 15073220  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     || ||||| || | ||| | |||||| || | |||||||||||||||||||||  ||||||  || |||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  15073221 cggcagacatacaagatcaacttcaaagtctctaccaaacatagacaaaggacaactcaaactgacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtt 15073320  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || |||||||| |||||    
T  15073321 tcaacaaccatttctcc 15073337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 8 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 29451647 - 29450837
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||    
T  29451647 cgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacct 29451548  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgt-gcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 206  Q
    |||||||||||| || |||| || | ||||| || ||| |||||||||| |  |||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||    
T  29451547 caaatcaatcttactgaaaa-tcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatatctgttcttgatcgtaaccttgttcaa 29451449  T
Q  207 ctgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttc 306  Q
    ||| || ||||| ||||| |  | |||||||||||| |||||||| || | ||| || || |||||| |||||||||| |  ||||| |||||||||||     
T  29451448 ctgacggtaatctatacatagtctcatactaccatccttcttcttgaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaacttctta 29451349  T
Q  307 tcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    || | || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||| |||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  29451348 tctaacaggtcctccaactgtttcttcaactcagctaactcagaagctgacatacggtacggtgtcatcgacaccggctttgttcctggaacaagatcaa 29451249  T
Q  407 gt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttg 492  Q
     |              || |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||  ||| || |||| || ||||||||| |||||    
T  29451248 ttgaaaattcaacctcccgctctggtggcacatcaggaatctcatcaggaaacacttccggaaattcattcactacaggtaacccatcaatcacagcttg 29451149  T
Q  493 attctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcc 592  Q
    ||| || |  || ||    |||||||  ||| ||||||| || ||||| ||||| |  || |||| ||| || ||||||| || |||  |  ||| |||     
T  29451148 attttctaacgacaattgtgccattagagaatacatcaaaattccatcacgttcaaactgtttcatctgttttgtagacagaagctcaacttcaccttct 29451049  T
Q  593 tcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactca 692  Q
    || ||  | ||||| |||||||| | ||| ||||| || || ||| ||||  | || ||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||  |||    
T  29451048 tcctcagcagaagaaaaatgtaccgtcttactaaagcagttgatatgaacccgattatactctaaccaattcataccaaaaatcacatccatacccgtca 29450949  T
Q  693 aaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagt 792  Q
    | || |||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||| | ||||||   || ||| || |||||| | || || |||||||||||||||||    
T  29450948 acggcagacaaactaaatcaatcacaaaatctctaccaaacatagatataggacaccgcagacaaacaagagaagtggttactgaacccttagctggagt 29450849  T
Q  793 ttcgacaaccat 804  Q
    ||| ||||||||    
T  29450848 ttcaacaaccat 29450837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 523 - 810
Target Start/End: Original strand, 14188197 - 14188484
Alignment:
Q  523 aaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttg 622  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| |||||  | || ||| |    || || |||    
T  14188197 aaacatcaaaattccatctcgttctagttgcttcagctgcttagtagacaagaactccactccactttcttcttcagcagaggaggaggacaccgaattg 14188296  T
Q  623 ctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaat 722  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14188297 ctaaaacagttgataagaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaatcacattcattccactcaaaggtaaacaaactaaatccatttcaaaat 14188396  T
Q  723 cacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14188397 cacgatcaaacaaagacaaaggacatctcaaacatacgagagaagtagtaaccgaacctttagctggagtttcgacaaccatctctcc 14188484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 8 - 406
Target Start/End: Original strand, 16149873 - 16150271
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || || ||||| || |||||||| || || || || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  16149873 cgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctggtggtaacctgacct 16149972  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||| || |||||   ||||||||||||| ||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || || ||||||    
T  16149973 caagtcaatcttactgaaaacctttgcacccactaactgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctttattgtaactttattcaac 16150072  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||||||||| ||||||| |||| ||||||| || ||||| || | ||| |||| ||||||| |||||||||| |  ||||| ||||| ||||| |    
T  16150073 tgacgataatcaatgcacaacctcatagtaccatccttattcttaaccaacaacactgacgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaaattcttat 16150172  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |  ||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||    
T  16150173 caagcaagtcctccaactatttcttcaattcagcaagttcggatgccgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaaggtcaa 16150271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 8 - 406
Target Start/End: Original strand, 16154019 - 16154417
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || || ||||| || |||||||| || || || || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  16154019 cgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctggtggtaacctgacct 16154118  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||| || |||||   ||||||||||||| ||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || || ||||||    
T  16154119 caagtcaatcttactgaaaacctttgcacccactaactgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctttattgtaactttattcaac 16154218  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||||||||| ||||||| |||| ||||||| || ||||| || | ||| |||| ||||||| |||||||||| |  ||||| ||||| ||||| |    
T  16154219 tgacgataatcaatgcacaacctcatagtaccatccttattcttaaccaacaacactgacgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaaattcttat 16154318  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |  ||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||    
T  16154319 caagcaagtcctccaactatttcttcaattcagcaagttcggatgccgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaaggtcaa 16154417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 8 - 362
Target Start/End: Original strand, 23443267 - 23443621
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||    
T  23443267 cgaaaggcatcactttatactcataatgtccataacgtgttctaaaagttgtcttatgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccaatct 23443366  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||| |||| || | ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||    
T  23443367 caaatcaatcttggtaaacacacatgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattctcggaagtggatacatattctttatcgttactttgttcaac 23443466  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    |  ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||| |  ||||||||  ||||||||||    ||||| |||||||| || |    
T  23443467 tatcgatagtcaatacacaatctcatactaccatctttcttcttaattagcaatatcggcgctcctcaaggtgaaacatttggtcttacaaactttttat 23443566  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacg 362  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  23443567 caagcaaatcttctaactgtttcttcaattcagccaactcagaagctgacatacg 23443621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 27902548 - 27903363
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| ||    
T  27902548 cgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcactttaatttgatggtaacctgacct 27902647  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| ||||| || |||||||||  |||||| || |   | |||||||| | |||||| |||||||||||||| || ||||| || || || |||||||||    
T  27902648 caagtcaattttactaaaaacttttgcacctaccatttggtccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatatctgttctttattgtaactttgttcaac 27902747  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||| | ||| ||  |||||||| |    ||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  27902748 tgacgatagtcaatgcacaatctcatactaccatccttcttctttaccaacaacacaagcgctccccacaacgaaacactgggtcttacaaacttcttat 27902847  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa- 406  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| |||| ||||||||     
T  27902848 caagcaagtcct-caactgtttcttcaactcggctaattcagaagctgacatgcgatatggtgccatcgacaccggtttcgttcccggaataagatcaat 27902946  T
Q  407 -------------gtcctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                   ||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||| ||||| || ||||||    
T  27902947 cgagaactcaacttccctttttggtggcacatcaggaatctcatccggaaaaacttcaggaaattcattcaccacgggtaacctgtcaattacagcttga 27903046  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||| |  || ||||| ||||| || |||||||| |  ||  |||| ||| |||  ||||||| ||| |||||||  |  |||||||| ||||| |  |    
T  27903047 ttctctaacgacaaagatgccatcaaagaaaacataagaatttcatctcgtcccaactgcttcaactgtttagtagttaggaactctgctccactctttt 27903146  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||| ||||| || | |||| | |||||||| |||  |||  |||| ||||||||||| ||||| || | ||| |||| ||| ||  ||||    
T  27903147 cttccgcagaagaaaaatgcaccgtcttgttgaaacaatttatataaactcggttatactctaaccaattcatccctaaaataacattcattcccatcaa 27903246  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     |||||||| ||||| || |  |||||||| | ||||||||||||||| |||||  | ||||| || |||||| |||| || |||||||| |||||||||    
T  27903247 cggtagacacactaagtcgacctcaaaatctctaccaaacatagacaacggacaccttaaacaaactagagaagtagttactgaacccttggctggagtt 27903346  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || || ||||| |||||    
T  27903347 tcaacgaccatttctcc 27903363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 521 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 16358 - 16069
Alignment:
Q  521 gaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgact 620  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  | |||| |||||  || ||||    
T  16358 gaaaacatcaaaataccatcacgttctaactgcttcagctgtttagtagacaaaaactttgcgccactttcctcttcagcagaagggaaatacaccgact 16259  T
Q  621 tgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaa 720  Q
    | ||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||  ||    
T  16258 tactaaaacaattaatgtgaacatggttgtactttaaccagttcataccaaggattacatccataccactcaaaggtaaacaaaccaaatcaatttagaa 16159  T
Q  721 atcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16158 atcacgatcaaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 16069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 8 - 406
Target Start/End: Original strand, 15258090 - 15258487
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || || ||||||||||||| |||||||||||| || ||||| || |||||||| ||    
T  15258090 cgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatattctcatccttcaccttgatctgatggtaacctgacct 15258189  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||||||||| || || |||||||||||| |||| || || | |||||| |||| |||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||    
T  15258190 caagtcaatcttgctaaacacacgagcacccactaactgatcgattaa-tcatcaatcctcgaaagtggatacctgttctttatcgtaaccttattcaac 15258288  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || || |||||||| || |||| ||| ||||| || |||||||| || ||||| || | ||||||| |||||||| | |  ||||| ||||| ||||| |    
T  15258289 tgtcggtaatcaatgcataacctcatgctaccgtccttcttcttaaccagcaacaccgacgctccccaaggtgaatcacttggtcttacaaatttcttat 15258388  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||    
T  15258389 cgagcaagtcctccaacagtttcttcaattcagctaactcggaagctgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaaggtcaa 15258487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 8 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 15357230 - 15356832
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  15357230 cgaaaggcatcaccttgtattcatagtgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacct 15357131  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
     || ||||||||||| |||||   ||||||||||||| ||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||    
T  15357130 taagtcaatcttgctgaaaacctttgcacccactaactgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctttatcgtaactttgttcaac 15357031  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || |||||||| || || || | |||  ||||||| |||||||| || | ||| |  ||||||||| | ||| |||| |  ||||| ||||| ||||| |    
T  15357030 tgacgataatcgatgcataatctcatggtaccatccttcttcttaaccaacaatatcggcgctccccacggtaaaacacttggtcttacaaatttcttat 15356931  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||    
T  15356930 caagcaagtcttccaattgtttcttcaactcagccaactcggacgccgacatacgataaggtgccattgacaccggcttcgttcctggaacaaggtcaa 15356832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 51604902 - 51604086
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||    
T  51604902 cgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaagccgtcttctgcatatcttcatctttcaccttaatttgatggtaacctgacct 51604803  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||| || || ||   ||||||||||| | | |||||||| | |||||| |||||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||     
T  51604802 caagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatcaatcctcggaagcggatatctattcttaattgtaactttgttcaat 51604703  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| || ||||| || | ||| || || |||||| | || |||||||  ||||| ||||||||||| |    
T  51604702 tgacgatagtcaatgcacaacctcatactaccatcctttttcttcaccaacaacacaggtgctccccacggcgaaacgctgggtcttacaaacttcttat 51604603  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||| || || ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||     
T  51604602 caagtaaatcttccaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggctttgttccgggaacaaggtcaat 51604503  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              ||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || || ||||| |||  |||||| | |||| | |||||||| |||||     
T  51604502 tgaaaactccacctccctttctggcggcacatcaggaatctcatcagggaacacctccggaaactcattcaccactgctagcttgtcaatcacagcttgg 51604403  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    || || |  || | | | |||||||  ||||||||||  || ||||| ||||| | |||||||| |||||| ||||| ||||  ||  | ||||| || |    
T  51604402 ttttctaacgacagatatgccattagagaaaacatcagaattccatcacgttctaattgcttcatctgctttgtagataaaatttcaactccactctctt 51604303  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||| ||||| || | |||| |||| ||||| ||| ||||  |||| ||||||||||| ||||| || | ||| |||| ||| ||  |||     
T  51604302 cttcagcagaagaaaaatgcacagtcttgttaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccaattcatcccaaaaataacatccattcccgtcag 51604203  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     || | ||||||||| || | ||||||||| | |||||||||||| |  |||||  |||| || || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  51604202 cggcaaacaaactaagtctacttcaaaatctctaccaaacatagaaattggacacctcaagcaaacaagagaagtagtcactgaacccttagctggagtt 51604103  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || |||||||| |||||    
T  51604102 tcaacaaccatttctcc 51604086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 44659976 - 44659475
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||    
T  44659976 cgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcacctttatctgatgataacctgacct 44659877  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgt-gcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 206  Q
    |||||||||||| || |||| || | ||||| || ||| |||||||||| |  |||||||| || || ||||| || |||||||| || |||||||||||    
T  44659876 caaatcaatcttactgaaaa-tcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctagggagcggatatctgttcttgatcgtaaccttgttcaa 44659778  T
Q  207 ctgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttc 306  Q
    ||| || ||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||| || | ||| || || |||||| |||||||||| |   |||| |||||||||||     
T  44659777 ctgacggtaatctatacacagtctcatactaccatccttcttcttgaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgagtcttacaaacttctta 44659678  T
Q  307 tcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    || | || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  44659677 tctaacaggtcctccaactgtttcttcaactcagctaactcagaagctgacatatggtacggtgccatcgacaccggcttagttcctggaacaaggtcaa 44659578  T
Q  407 gt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttg 492  Q
     |              ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||  ||| || |||| || ||||||||| |||||    
T  44659577 ttgaaaattcaacttccctctctggtggcacatcaggaatctcatcaggaaacacttccggaaattcattcactacaggtaacccatcaatcacagcttg 44659478  T
Q  493 att 495  Q
    |||    
T  44659477 att 44659475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 11205342 - 11204944
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||    
T  11205342 cgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacct 11205243  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgt-gcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 206  Q
    ||| |||||||||||||| | || | ||||| || ||  |||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  11205242 caagtcaatcttgctaaaga-tcttagcaccaaccaattgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttctttatcgtaaccttgttcaa 11205144  T
Q  207 ctgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttc 306  Q
    ||| || ||||| || ||||  | |||||||||||| |||||||| || | ||| || || |||||| |||||||||| |  ||||| ||||| |||||     
T  11205143 ctgacggtaatctatgcacagtctcatactaccatccttcttcttaaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaatttctta 11205044  T
Q  307 tcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    || | || |||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||    
T  11205043 tctaacaggtcctccaactgcttctttaattcagctaactcagaagctgacatacggtatggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaagctcaa 11204944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 540
Target Start/End: Original strand, 8708073 - 8708615
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| |||  |||||| || || ||||| || || || || || || |||| |||||| ||||| || |||||||| || || ||||| || ||    
T  8708073 cgaaaggcatcactgaatattcgtaatgtccatatcgtgtgctaaaggccgttttctacatatcttcatcttttactttaatatgatggtaacccgacct 8708172  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||    || ||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || || || ||||||    
T  8708173 caaatc----ttactaaacacgcgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctttatcgtcactttattcaac 8708268  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || || ||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||| || | ||| || || |||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||| |    
T  8708269 tgacggtaatctatacacaacctcacgctaccatctttcttcttaaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactcggtcttacaaacttcttat 8708368  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||| | || ||| || || |||||||  ||||| | |||||| |  ||||||||  | ||||||||||| |     
T  8708369 caagtaaatcctccaactgtttcttcaactctgctagctcagatgctgacatacagtaaggcgtcatcgacataggcttcgtatctggaacaagatcgat 8708468  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              ||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |  |  | |||||||||||| || ||     
T  8708469 tgaaaattcaacttccctctttggcggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttctggaaattcacacacaattgacaacctatcaatcacagcctgg 8708568  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatc 540  Q
    ||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  8708569 ttctctacagacaagtacgccattaaagaaaacattaagatcccatc 8708615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 673 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 16350725 - 16350588
Alignment:
Q  673 aatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtc 772  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16350725 aatcacatccataccgctcaaaggtagacaaactagatccatttcgaaatcacgaccagacatagacaaaggacatctcaaacatacgagagaagtagtc 16350626  T
Q  773 accgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16350625 accgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 16350588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 16353355 - 16353243
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16353355 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctca 16353256  T
Q  110 aatcaatcttgct 122  Q
    |||||||||||||    
T  16353255 aatcaatcttgct 16353243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 77 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 15291199 - 15290897
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||| | |||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  15291199 cctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 15291100  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaa 276  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| || | ||| | ||| || ||| |     
T  15291099 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgcagataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacattggagcaccccac 15291000  T
Q  277 ggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcg 376  Q
    |||||| | | |||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||| |||   ||||| || |||||||| ||||| || || ||||    
T  15290999 ggtgaaccactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactctgatgcagacatccgatacggcgcaatcg 15290900  T
Q  377 aaa 379  Q
    |||    
T  15290899 aaa 15290897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 200 - 810
Target Start/End: Original strand, 20892385 - 20893009
Alignment:
Q  200 tgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaa 299  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||  | |||||||||||| |||||||| || | ||| || || |||||| |||||||||| |  ||||| |||||    
T  20892385 tgttcaactgacggtaatcaatgcacagtctcatactaccatccttcttcttaaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaa 20892484  T
Q  300 cttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaaca 399  Q
    |||||| || | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||    
T  20892485 cttcttatccaacaagtccttcaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatacggtatggtgccatcgacaccggctttgttcctggaaca 20892584  T
Q  400 agatcaagt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatca 485  Q
    || |||| |              ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||  || || |||  ||| || |||| |||  ||||||    
T  20892585 aggtcaattgaaaattcaacctccctctctggtggcacatcaggaatctcatcaggaaacacttttgggaactcattcactacaggtaacctgccaatca 20892684  T
Q  486 ctgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcacc 585  Q
    | |||||||| || || |||||| ||||||| |  ||| ||||||  || || || ||||| |  || |||| ||| || |||||||||| |||  |  |    
T  20892685 cagcttgattttctacggataaataagccatcagagaatacatcagaatcccgtcccgttcaaactgtttcatctgttttgtagacaaaagctcaacctc 20892784  T
Q  586 actttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacata 685  Q
    || ||| |||||  | ||||| ||||| || | ||| ||||| || || ||| ||||  |||| ||||||||||||||||| || | ||| |||| ||||    
T  20892785 accttcttcttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttactaaagcagttgatatgaactcggttatactctaaccagttcattccaaaaataacatccata 20892884  T
Q  686 ccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttag 785  Q
    ||   ||| || |  ||||||| ||| |   ||||||| | |||||||||||| | |||| |   |||||| || |||||| |||| || ||||||||||    
T  20892885 cccgacaacggcaagcaaactagatcaaccacaaaatctctaccaaacatagatataggataccccaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttag 20892984  T
Q  786 ctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||| |||||||| |||||    
T  20892985 ctggagtttcaacaaccatttctcc 20893009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 419 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 14994053 - 14993661
Alignment:
Q  419 ggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccatta 518  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |  ||  ||||| | |||||||||||| ||||||||||| |  || ||  | ||||| |    
T  14994053 ggcacatctggaatctcatcaggaaaaacttctggaaatttattcataaccggcaacctatcaatcacagcttgattctccaatgacaagaatgccatca 14993954  T
Q  519 atg-aaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactg 617  Q
    | | ||||||| |  || ||||| || ||||  ||||||| ||| |||||||  |  || || || |||||  | ||||   | ||||| ||||| || |    
T  14993953 aggaaaaacattagaattccatcacgctccaactgcttcaactgtttagtagttaggaattcagctccactcacttctttagcagaagaaaaatgcaccg 14993854  T
Q  618 acttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttc 717  Q
     ||| ||||| ||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||  |||| |||| |||||| |  || | |||    
T  14993853 tcttactaaagcaattaatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaatcacatgcatacccgtcaacggtaaacaaacaaggtcgacttc 14993754  T
Q  718 aaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||  | | ||||||||||||||| |||||  | | ||| || |||||| |||| |  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  14993753 aaagcctccaccaaacatagacaacggacaacttagacaaacaagagaagtagttagtgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcc 14993661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 12340879 - 12340709
Alignment:
Q  104 atctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgtt 203  Q
    |||| ||||||||||| || || |||  |||||| || ||  |||||||||||| |||||| ||||| || ||||||| ||| || || || ||||||||    
T  12340879 atcttaaatcaatcttactgaacacttctgcaccaaccaattgatccatcaaatcatcaatcctcgggagcggataccaattgttaatcgtcaccttgtt 12340780  T
Q  204 caactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctcccta 275  Q
    ||| ||| ||||||| | |||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||| ||||| || |||||    
T  12340779 caaatgctgataatccacacacaacctcatac-accatccttcttcttaactaacaacactggagcacccta 12340709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 768 - 810
Target Start/End: Original strand, 13513286 - 13513328
Alignment:
Q  768 tagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13513286 tagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 13513328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 651 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 44659319 - 44659166
Alignment:
Q  651 actctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacattt 750  Q
    |||||||||| |||||||| |  || |||| ||||||  |||| || |||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||| | ||||||       
T  44659319 actctaaccaattcataccaaagataacatccatacccgtcaacggcagacaaactaaatcaatcacaaaatctctaccaaacatagatataggacaccg 44659220  T
Q  751 caaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 804  Q
    || ||| || |||||| | || || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44659219 cagacaaacaagagaagtggttactgaacccttagctggagtttcaacaaccat 44659166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 645 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 15354499 - 15354340
Alignment:
Q  645 ggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaagg 744  Q
    |||| |||||||| |||||||| || | ||| |||| ||||||  |||| |||| ||||||||| || | || ||| || | |||||||||||||||  |    
T  15354499 ggttatactctaatcagttcatcccaaaaataacatccatacccgtcaacggtaaacaaactaagtcgactttaaagtctctaccaaacatagacaacag 15354400  T
Q  745 acatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 804  Q
    |||| | | ||| || |||||| |||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  15354399 acatcttagacaaacaagagaagtagttactgaacccgtagctggagtttcaacaaccat 15354340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 409 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 11204927 - 11204841
Alignment:
Q  409 cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||  ||| || |||| ||| || ||||| ||||||||    
T  11204927 cctctctggtggcacatcagaaatctcatcaggaaatacttctggaaattcattcactacaggtaacctgtccatcacagcttgatt 11204841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 727 - 804
Target Start/End: Original strand, 16150531 - 16150608
Alignment:
Q  727 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 804  Q
    ||||||||||||||| |||||  | | ||| || |||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16150531 accaaacatagacaacggacaccttagacacacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccat 16150608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 727 - 804
Target Start/End: Original strand, 16154677 - 16154754
Alignment:
Q  727 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 804  Q
    ||||||||||||||| |||||  | | ||| || |||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16154677 accaaacatagacaacggacaccttagacacacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccat 16154754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 761 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 53750813 - 53750764
Alignment:
Q  761 agagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  53750813 agagaagtagtcactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcc 53750764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 415 - 570
Target Start/End: Original strand, 16150294 - 16150449
Alignment:
Q  415 tggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagcc 514  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||   ||| || |||| ||| ||||| || |||||||| || |  || ||| | |||    
T  16150294 tggtggcacatctggaatctcatcaggaaaaacttcaggaaactcgttcacaactggtaacctgtcaattaccgcttgattttctaacgacaaatatgcc 16150393  T
Q  515 attaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtaga 570  Q
    ||||| ||| ||| ||  || ||||| ||||| || ||||||| ||| ||||||||    
T  16150394 attaaagaatacaccagaattccatcacgttctagctgcttcatctgtttagtaga 16150449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 415 - 570
Target Start/End: Original strand, 16154440 - 16154595
Alignment:
Q  415 tggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagcc 514  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||   ||| || |||| ||| ||||| || |||||||| || |  || ||| | |||    
T  16154440 tggtggcacatctggaatctcatcaggaaaaacttcaggaaactcgttcacaactggtaacctgtcaattaccgcttgattttctaacgacaaatatgcc 16154539  T
Q  515 attaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtaga 570  Q
    ||||| ||| ||| ||  || ||||| ||||| || ||||||| ||| ||||||||    
T  16154540 attaaagaatacaccagaattccatcacgttctagctgcttcatctgtttagtaga 16154595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 638; Significance: 0; HSPs: 70)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 638; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 807
Target Start/End: Original strand, 27189462 - 27190275
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||    
T  27189462 cgaaaggcataactttgtattcgtagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttaccttaatctggtgataacccgatct 27189561  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27189562 caaatcaatcttgctgaaaacttgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 27189661  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  27189662 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttctttt 27189761  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||     
T  27189762 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataattctgaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggtttcgttccagggacaagatcaat 27189861  T
Q  408 -------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                 || || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27189862 agaaaactcgacttctctttctgggggtacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 27189961  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27189962 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 27190061  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27190062 cttcgacagaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtgattgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccataccactcaa 27190161  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27190162 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaatatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtt 27190261  T
Q  794 tcgacaaccatctc 807  Q
    ||||||||||||||    
T  27190262 tcgacaaccatctc 27190275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 638; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 27259778 - 27258965
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||    
T  27259778 cgaaaggcataactttgtattcgtagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttaccttaatctggtgataacccgatct 27259679  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27259678 caaatcaatcttgctgaaaacttgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 27259579  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  27259578 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttctttt 27259479  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||     
T  27259478 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataattctgaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggtttcgttccagggacaagatcaat 27259379  T
Q  408 -------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                 || || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27259378 agaaaactcgacttctctttctgggggtacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 27259279  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27259278 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 27259179  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27259178 cttcgacagaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtgattgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccataccactcaa 27259079  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27259078 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaatatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtt 27258979  T
Q  794 tcgacaaccatctc 807  Q
    ||||||||||||||    
T  27258978 tcgacaaccatctc 27258965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 628; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 2873056 - 2872241
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  2873056 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacccgacctca 2872957  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2872956 aatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 2872857  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  2872856 ccgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggtgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctca 2872757  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-- 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||       
T  2872756 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaatag 2872657  T
Q  408 -----------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
               || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2872656 aaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaaatcacacaccaccggtaacctatcaatcactgcttgatt 2872557  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaa-ctctgcaccactttcctc 594  Q
    ||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  2872556 ctcaaaagataacgtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttctagttgcttcagctgcttagtagataaaaaactctgcaccactttcctc 2872457  T
Q  595 ttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaa 694  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  2872456 ttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccataccgctcaaa 2872357  T
Q  695 ggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagttt 794  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2872356 ggtagacaaactaaatccatttcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagttt 2872257  T
Q  795 cgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||||||||||||||    
T  2872256 cgacaaccatctctcc 2872241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 626; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 28261453 - 28260636
Alignment:
Q  7 acgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatc 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  28261453 acgaaaggcataactttgtattcatagtgaccatagcgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatc 28261354  T
Q  107 tcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 206  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28261353 tcaaatcaatcttgctgaaaacttgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttactttgttcaa 28261254  T
Q  207 ctgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttc 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||     
T  28261253 ctgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttt 28261154  T
Q  307 tcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  28261153 tcaagcaagtcctccaactgttccttcaactcagataattctgaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggtttcgttccaggaacaagatcaa 28261054  T
Q  407 g-------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttg 492  Q
                  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28261053 tagaaaactcgacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaagacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcattgcttg 28260954  T
Q  493 attctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcc 592  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28260953 attctcaacagataaagaagccatcaaggaaaacatcaagatatcatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcc 28260854  T
Q  593 tcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactca 692  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  28260853 tcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtgattgtactttaaccagttcatacccaaaatcacatccataccactca 28260754  T
Q  693 aaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagt 792  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28260753 aaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagt 28260654  T
Q  793 ttcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||||||||||||||||    
T  28260653 ttcgacaaccatctctcc 28260636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 626; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 810
Target Start/End: Original strand, 28284463 - 28285280
Alignment:
Q  7 acgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatc 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  28284463 acgaaaggcataactttgtattcatagtgaccatagcgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatc 28284562  T
Q  107 tcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 206  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28284563 tcaaatcaatcttgctgaaaacttgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttactttgttcaa 28284662  T
Q  207 ctgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttc 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||     
T  28284663 ctgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttt 28284762  T
Q  307 tcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  28284763 tcaagcaagtcctccaactgttccttcaactcagataattctgaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggtttcgttccaggaacaagatcaa 28284862  T
Q  407 g-------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttg 492  Q
                  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28284863 tagaaaactcgacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaagacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcattgcttg 28284962  T
Q  493 attctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcc 592  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28284963 attctcaacagataaagaagccatcaaggaaaacatcaagatatcatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcc 28285062  T
Q  593 tcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactca 692  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  28285063 tcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtgattgtactttaaccagttcatacccaaaatcacatccataccactca 28285162  T
Q  693 aaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagt 792  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28285163 aaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagt 28285262  T
Q  793 ttcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||||||||||||||||    
T  28285263 ttcgacaaccatctctcc 28285280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 626; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 28340202 - 28339385
Alignment:
Q  7 acgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatc 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  28340202 acgaaaggcataactttgtattcatagtgaccatagcgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatc 28340103  T
Q  107 tcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 206  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28340102 tcaaatcaatcttgctgaaaacttgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttactttgttcaa 28340003  T
Q  207 ctgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttc 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||     
T  28340002 ctgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttt 28339903  T
Q  307 tcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  28339902 tcaagcaagtcctccaactgttccttcaactcagataattctgaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggtttcgttccaggaacaagatcaa 28339803  T
Q  407 g-------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttg 492  Q
                  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28339802 tagaaaactcgacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaagacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcattgcttg 28339703  T
Q  493 attctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcc 592  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28339702 attctcaacagataaagaagccatcaaggaaaacatcaagatatcatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcc 28339603  T
Q  593 tcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactca 692  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  28339602 tcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtgattgtactttaaccagttcatacccaaaatcacatccataccactca 28339503  T
Q  693 aaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagt 792  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28339502 aaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagt 28339403  T
Q  793 ttcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||||||||||||||||    
T  28339402 ttcgacaaccatctctcc 28339385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 595; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Original strand, 16573918 - 16574732
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16573918 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgatatcctgacctca 16574017  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16574018 aatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 16574117  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
     ||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16574118 tcgataattaatacatagcctcatactaccatctttcttcttgactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacactcggtctaacaaacttcttctca 16574217  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-- 407  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||       
T  16574218 agcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaaacagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaatag 16574317  T
Q  408 -----------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
               || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16574318 aaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatcactgcttgatt 16574417  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||| |||||||  |||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  16574418 ctcaatagataaattagccatcaacgaaaacatcaagataccgtcgcgtttcagttgcttcagctgcttagtagataaaaactccgcaccactttcctct 16574517  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  16574518 tcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataaggacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccataccgctcaaag 16574617  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16574618 gtaggcaaactaaatccatttcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttc 16574717  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||    
T  16574718 gacaaccatctctcc 16574732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 595; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 16621462 - 16620648
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16621462 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgatatcctgacctca 16621363  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16621362 aatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 16621263  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
     ||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16621262 tcgataattaatacatagcctcatactaccatctttcttcttgactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacactcggtctaacaaacttcttctca 16621163  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-- 407  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||       
T  16621162 agcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaaacagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaatag 16621063  T
Q  408 -----------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
               || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16621062 aaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatcactgcttgatt 16620963  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||| |||||||  |||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  16620962 ctcaatagataaattagccatcaacgaaaacatcaagataccgtcgcgtttcagttgcttcagctgcttagtagataaaaactccgcaccactttcctct 16620863  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  16620862 tcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataaggacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccataccgctcaaag 16620763  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16620762 gtaggcaaactaaatccatttcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttc 16620663  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||    
T  16620662 gacaaccatctctcc 16620648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 587; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Original strand, 25114580 - 25115394
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||  | ||    
T  25114580 aaaggcataactttatattcacagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcaacctttactttaatctgatgataacctggcccca 25114679  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25114680 aatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 25114779  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
     || ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| |||||||||    
T  25114780 tcggtaatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaatttcttctca 25114879  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-- 407  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||       
T  25114880 agcaagtcttccaactgtttcttcaattcagataattcggaagcagacatacgatatggtgccattgacaccggcttcgttccaggaacaagatcaatag 25114979  T
Q  408 -----------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
               || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25114980 aaaactcgacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatccggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 25115079  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||     
T  25115080 ctcaatagataaggaagccatcaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtggataaaaactttgcaccactttcctcc 25115179  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  25115180 tcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccataccactcaagg 25115279  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25115280 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttc 25115379  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
    ||||| |||||||||    
T  25115380 gacaatcatctctcc 25115394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 579; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 24294035 - 24293221
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  24294035 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacacgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgatatcctgacctca 24293936  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24293935 aatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaacta 24293836  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
     |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  24293835 tcgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctca 24293736  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-- 407  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||       
T  24293735 agcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccagggacaagatcaatag 24293636  T
Q  408 -----------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
               || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  24293635 aaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatccggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctgtcaatcactgcttgatt 24293536  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  24293535 ctcaatagataaggtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcacgttccagttgcatcagctgcttagtagataaaaactccgcaccactttcctct 24293436  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24293435 tcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaactaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccataccgctcaaag 24293336  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24293335 gtagacaaactaaatccattttgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttc 24293236  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||    
T  24293235 gacaaccatctctcc 24293221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 544; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 22828608 - 22827841
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22828608 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatctttatcttttactttaatctggtgataacctgacctca 22828509  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22828508 aatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttattcaactg 22828409  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
     |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||| |  ||||||||||| |||||||||    
T  22828408 tcgataatcaatacataacctcatactaccatctttcttctttactagcaaaatcggcgttccccaaggtgaaacacttggtctaacaaatttcttctca 22828309  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc----- 404  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||         
T  22828308 agcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataattcggaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccaggaacaagatcaatag 22828209  T
Q  405 --aagtc-------ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
      || ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  22828208 aaaactcgacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattccaacaccacttgtagcttatcaatcactgcttgatt 22828109  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  22828108 ctcaatagataaagtagccattaacgaaaacatcaagatatcatcgcgttccagttgcttcacctgcttagtagataaaaactcttcaccactttcctct 22828009  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22828008 tcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaagcaattcatacccagaatcacatccataccgctcaaag 22827909  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgaga 763  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22827908 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgaga 22827841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 514; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 171 - 810
Target Start/End: Original strand, 28311819 - 28312472
Alignment:
Q  171 aagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgct 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28311819 aagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgct 28311918  T
Q  271 ccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtg 370  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  28311919 ccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcttctaactgtttcttcaactcagataattctgaagcagacatacgataaggtg 28312018  T
Q  371 ccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaa 456  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||              || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28312019 ccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaatagaaaactcgacttctctctccggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaa 28312118  T
Q  457 ttcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttc 556  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28312119 atcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccatcaaggaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttc 28312218  T
Q  557 agctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactcta 656  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28312219 agctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtgattgtactcta 28312318  T
Q  657 accagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaaca 756  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28312319 accagttcatacccaaaatcacatccataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaaaa 28312418  T
Q  757 tacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28312419 tacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 28312472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 509; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 808
Target Start/End: Original strand, 19866715 - 19867527
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |    
T  19866715 aaaggcataactttatattcatagtgaccataccgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctcgtgataacctgatctta 19866814  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19866815 aatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttactttgttcaactg 19866914  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
     |||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  19866915 acgataatcgatacataatctcatactaccatctttcttcttcactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctca 19867014  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-- 407  Q
    ||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||       
T  19867015 agcaaatcttctaactgtttcttcaactcagctaactcggaagctgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccaagaacaagatcaatag 19867114  T
Q  408 -----------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
               || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  19867115 aaaactcaacttctctctcttgaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaaatcgcataccacctgtagcttatcaatcaccgcttgatt 19867214  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||| |||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  19867215 ctcaatagataaggaagccatcaaggaaaacatcaaaataccatcgcgttctagttgtttcagctgcttggtagacaagaactctacaccactttcctct 19867314  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19867315 tcgacggaggagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtattccaaccagttcatacccagaatcacatccataccgctcaaag 19867414  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19867415 gtagacaaactaaatccatctcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttc 19867514  T
Q  796 gacaaccatctct 808  Q
    |||||||||||||    
T  19867515 gacaaccatctct 19867527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 455; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Original strand, 22435897 - 22436711
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22435897 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacacgttttgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctca 22435996  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  22435997 aatcaatcttgctgaaaacacatgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattattgatagttactttgtttaactg 22436096  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
     |||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||| |||||||||||||||    
T  22436097 acgataatcgatacataatctcatactaccatctttcttcttcactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctgacaaacttcttctca 22436196  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-- 407  Q
    ||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||  ||||||||||||||||||||||||       
T  22436197 agcaaatcttctaactgtttcttcaactcagctaactcggaagctgacatacgataacgtgtcatagacacatgcttcgttccaggaacaagatcaacag 22436296  T
Q  408 -----------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
               || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  22436297 aaaactcaacttctctctctggaggcacattaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaaatcgcataccacttgtagcttatcaatcactgcttgatt 22436396  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
     |||| |||||| | |||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22436397 ttcaatagataaggtagccatcaaggaaaacatcaaaataccatcacgttccagttgcttcagctgcttggtagacaagaactctgcaccactttcctct 22436496  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||   ||||||||||||||    
T  22436497 tcgacgaaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccaattcataccaagaatgacgcccataccactcaaag 22436596  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    | |  ||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22436597 gcaagcaaaccatatcaatctcaaaatcacgaccaaacatagacaaagaacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttc 22436696  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||    
T  22436697 gacaaccatctctcc 22436711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 5837472 - 5836667
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5837472 aaaggcataactttgtactcatagtgaccataacgcgttctgaaagcggtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctca 5837373  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||| |||||    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5837372 aatcaatcttgctgaaaacaaaagcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttactttgttcaactg 5837273  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
     |||||||| ||||| || | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  5837272 acgataatcgatacataatctcataaaaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccccaaggcgaaacacttggtctaacaaacttcttctca 5837173  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-- 407  Q
    ||||| || || |||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| || |||||||| | |||||       
T  5837172 agcaaatcttctaactgtttcttcaactc---------ggaagcagacatacgataaggtgccatcgacatcggcttagtcccaggaactaaatcaatag 5837082  T
Q  408 -----------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
               || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| ||||| |||||  | ||| |||||||||| ||||||||    
T  5837081 aaaattcaacttctctctcaggaggcacatcgggaatttcgtctgggaacacttcaggaaagtcacataccacttgaagcttatcaatcaccgcttgatt 5836982  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  5836981 ctcaacagataaagtagccatcaaagaaaacatcaaaataccatcgcgttccagttgcttcagctgtttagtagataagaattctgcaccactttcctct 5836882  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||  |||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||| |||| |||||| |||||||    
T  5836881 tcgactgaagagaaatacactgacttgctagcacaattaatatgaacatgattgtactctaaccaattcctaccaagaataacatccataccgctcaaag 5836782  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  5836781 ggagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagaaaaaggacatttcaaacatactagagtggtagttaccgaacccttagctggagtttc 5836682  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||    
T  5836681 gacaaccatctctcc 5836667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 16925893 - 16925079
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||    
T  16925893 cgaacggcataacattatattcatagtgaccataccgcgttctgaaagctgtcttctacatatcttcatctttcactttaatctggtgataaccttacct 16925794  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16925793 caaatcaatcttgctaaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcg-aagtagatacctattcttgatagttaccttgttcaac 16925695  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||||| ||| | ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||| ||| ||| |||    
T  16925694 tgacgatagtcaatacgcaatctcatgcttccatctttcttcttaactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaaaaaatttcatct 16925595  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaaga----- 402  Q
    ||| ||  || || || |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||          
T  16925594 caaccagatcttctaattgtttcttcaactcggctaactcggaaacagacatacgataaggtgccatggacaccggtttcgttccaggaacaagtcaata 16925495  T
Q  403 ------tcaagtc--ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgat 494  Q
          |||| |   |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||  ||||| | ||||| || |||||||    
T  16925494 gaaaactcaacttgtctctctagaggcacattaggaatttcatctggaaaaacttcgggaaagtcgcataccacttgtagcttgtcaattaccgcttgat 16925395  T
Q  495 tctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctc 594  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  16925394 tctcaatagataaagaagccatcaaagaatacatcaaaataccatcgcgctacatttgcttcagctgcttagtagataagaactctgcaccactttcctc 16925295  T
Q  595 ttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaa 694  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| || || || | |||||||||||||    
T  16925294 ttcgatggaagagaaatacactgacttgctaaaacaattgatatgaacatggttgtactctaaccaattcataccaaggatgacgtccataccactcaaa 16925195  T
Q  695 ggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagttt 794  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16925194 ggcaaacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagaaaaaggacatctcaaacatacgagagaagtagtcaccgatcccttagctggagttt 16925095  T
Q  795 cgacaaccatctctcc 810  Q
    |||| |||||||||||    
T  16925094 cgacgaccatctctcc 16925079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 319 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 29590383 - 29589878
Alignment:
Q  319 tccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag----------- 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||                
T  29590383 tccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaatagaaaactcaa 29590284  T
Q  408 --tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacaga 504  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  29590283 cttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctgtcaatcactgcttgattctcaataga 29590184  T
Q  505 taaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaa 604  Q
    || || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29590183 tatagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaa 29590084  T
Q  605 gagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaa 704  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29590083 gagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccataccactcaaaggtagacaaa 29589984  T
Q  705 ctaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 804  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29589983 ctaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 29589884  T
Q  805 ctctcc 810  Q
    ||||||    
T  29589883 ctctcc 29589878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 18406199 - 18405383
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  18406199 cgaacggcatcaccttatactcataatgtccataatacgttctgaaggctgtcttctgcatatcttaatctttcactttaatctggtgatgacccgatct 18406100  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  18406099 caaatctatcttgctgaaaacacttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaggtggatacctattctttattgttaccttgttcaac 18406000  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||| || |  |||||||||||||| ||||    
T  18405999 tgtcgataatcaatacacaacctcatgctaccatccttcttcttcactaacaaaaccggcgctccccaaggtgatacacttggtctaacaaactttttct 18405900  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatca-- 405  Q
    |||| || || || || | |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||      
T  18405899 caagtaaatcttctaattatttcttcaactcagctaactctgaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaggcttcgttccaggaacaagatcagt 18405800  T
Q  406 ----------agt--cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
              | |  ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||| |  || |||||  ||||  |||||||||||||||||    
T  18405799 cgaaaatttaacttccctctctggaggcacattaggaatttcatcaggaaaaacttctggaaaattgcataccacttgtagtttatcaatcactgcttga 18405700  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  18405699 ttctcaatagataaggaagccattaaagaaaacatcagaataccatcacgttctaactgcttcagctgcttggtagacaaaaactttgcgccactttcct 18405600  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||||||||  ||||| || ||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  18405599 cttcagcagaagagaaatacactgatttactaaaacaagtaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaa 18405500  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||| |||||||| ||||  ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18405499 aggcagacaaaccaaattaatttcaaaatcacaatcaaacatagacaagggacatctcaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtt 18405400  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  18405399 tcgacaaccatctctcc 18405383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 15 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 16961730 - 16961082
Alignment:
Q  15 cataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatca 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16961730 cataactttatattcatagtgaccataccgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgacctcaaatca 16961631  T
Q  115 atcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgat 214  Q
    |||||||||||||||   ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  16961630 atcttgctaaaaactttcgcaccgactaactgatccatcaaatcatcaattcttggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactaacgat 16961531  T
Q  215 aatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaa 314  Q
    | ||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||     
T  16961530 agtcaatacacaatctcaggctaccatctttcttcttaactagcaaaacaggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaatttcttctcgagcag 16961431  T
Q  315 gtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc-------aag 407  Q
     || || || |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||       ||     
T  16961430 atcttctaattgtttcttcaactcggctaactcgaaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccagtcacaagatcaatagaaaac 16961331  T
Q  408 tc-------ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaa 500  Q
    ||       |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| || || |||||  ||||| | ||||| || |||| ||||||||    
T  16961330 tcaacttatctctctggtggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttcgagaaagtcgcataccacttgtagcttgtcaattaccgcttaattctcaa 16961231  T
Q  501 cagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgac 600  Q
     |||||||||| ||||  | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  16961230 tagataaagaatccatcgaagaaaacatcaatataccatcacgttccagttgcttcagctgcttagtagataagaactctgcaccactttcctcttcgac 16961131  T
Q  601 ggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaatta-ataagaacgtggtt 648  Q
     || |||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  16961130 tgaggagaaatacactgacttgctaaaactattagataagaacatggtt 16961082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 18183622 - 18182806
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||    
T  18183622 cgaaaggcatcactttatattcataatgtccataacgcgtgctaaaagacgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataaccggacct 18183523  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  18183522 caaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatgcatcaagtcatcaattctcggaagtggatacctattctttatcgttaccttattcaac 18183423  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    |  |||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||  | |||||| | |||||||| |  ||||| | ||||||||| |    
T  18183422 tatcgataatcaatacacaatgtcatgctaccatctttcttcttaactaacaataccagagctccccacggtgaaacacttggtcttataaacttcttat 18183323  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc--- 404  Q
    |||| || || || ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| | ||||||| ||| || || |||||||  || |||||||||||       
T  18183322 caagtaaatcttctaactgtttcttcaactcagctaactcagaagccgacatatggtaaggtgtcatagacacaggcttcgaacccggaacaagatcaat 18183223  T
Q  405 ----aagtc-------ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
        || ||       || ||||| |||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| || ||||||||  ||| | ||| |||||||||||||    
T  18183222 cgaaaactccacttctctttctggtggcacatcaggaatttcatcagaaaaaatttcaggaaaatcgcacaccacttgtaacttattaatcactgcttga 18183123  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||| | | ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  18183122 ttctcaatagataaagatgccattaaagaaaacatcaaaattccatcacgtcctaattgcttcagctacttagtagacaagaactctgctccactttctt 18183023  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||| || |  |||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||| ||| |||| |||    
T  18183022 cttcagcagaagaaaagtacactgacttactaaaataattaatatgaacatggttgtactctaaccaattcataccaaggattacatccattccacacaa 18182923  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||| |||||    ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18182922 aggtaaacaaaacgtatcaatttcaaaatctcgaccaagcatagacaaatgacatcttaaacaaacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtt 18182823  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||| |||||||||||    
T  18182822 tcgactaccatctctcc 18182806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 8 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 27564088 - 27563690
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  27564088 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgccttctgcatatcttcatcttttactttaatttggtgataacctgatct 27563989  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  27563988 taaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagtaactttgttcaac 27563889  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||||||||| | | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| |||||||    
T  27563888 tgacgatagtcaatacacaatctcctgctaccatctttcttcttcactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaatttcttct 27563789  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    ||||||| || || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  27563788 caagcaattcttctaactatttcttcaactcagctaactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcattccaggaacaagatcaa 27563690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 252; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 51 - 532
Target Start/End: Original strand, 21755002 - 21755496
Alignment:
Q  51 gaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatcc 150  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||   ||||||||||||| |||||    
T  21755002 gaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacaaatgcacccactaactgatcc 21755101  T
Q  151 atcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttct 250  Q
    ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  21755102 atcaagtcatcaatcctcggaagtggatacctattcttgatagttac-ttgttcaactgacgataatcgatacataatctcatactaccatctttcttct 21755200  T
Q  251 ttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcgga 350  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21755201 ttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagctaactcgga 21755300  T
Q  351 agcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc-------aagtc-------ctctctggaggcacatcaggaatctca 436  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||       || ||       ||||||||||||||||||||||| |||    
T  21755301 agtagacatacgataaggtgtcatcgacaccggcttcgttccaggaacaagatcaatagaaaactcgacttctctctctggaggcacatcaggaatttca 21755400  T
Q  437 tctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaag 532  Q
    | ||| |||||||||||||| || || |||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  21755401 tatgggaaaacttcaggaaagtcgcataccacttgtagcttatcaatcactgcctgattctcaatagataaggaagccatcaaagaaaacatcaag 21755496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 8 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 22760710 - 22760164
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  22760710 cgaaaggcataactttatactcataatgtccataacgcgttctgaaagctgtcttgtgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatct 22760611  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  22760610 caaatcaatcttgctgacaacacgtgcacccactaactaatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctttattgttacattgttcaac 22760511  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |   ||||||||||||| ||||    
T  22760510 tgttgataatcaatacacaacctcatgctaccatctttcttcttcactagcaaaacgggcgctccccaaggcgaaacacttagtctaacaaactttttct 22760411  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa- 406  Q
    |||| || || || || | |||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||     
T  22760410 caagtaaatcttctaattatttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaggcttcgttccaggaacaagatcaat 22760311  T
Q  407 -------------gtcctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                   ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||  ||||  |||||||||||| ||||    
T  22760310 cgaaaattcaacttccctctttggaggcacatcaggaatttcatcaggaaatacttctggaaaatcgcataccacttgtagtttatcaatcactgtttga 22760211  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatc 540  Q
    ||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  22760210 ttctcaatagataaggaagccatcaaggaaaacatcaaaataccatc 22760164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 115 - 810
Target Start/End: Original strand, 23080556 - 23081265
Alignment:
Q  115 atcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgat 214  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||| ||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||||    
T  23080556 atcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattcttggaagtgaatatctattctttatcgttactttattcaactgtcgat 23080655  T
Q  215 aatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaa 314  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||| |||||||||| |  |||||||||||||| || ||||||||    
T  23080656 aatcaatgcacaatctcatactaccatctttcttcttaaccagcaatacatgcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaactttttatcaagcaa 23080755  T
Q  315 gtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag------- 407  Q
     || || |||||||||||||||||||  || |  ||||| |||||||| ||||||| ||| || ||  |||||||||| |||| ||||||||            
T  23080756 atcttctaactgtttcttcaactcagccaaattagaagctgacatacggtaaggtgtcatagacacatgcttcgttcccggaataagatcaatcgaaaac 23080855  T
Q  408 ------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaa 500  Q
          || || |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||| | || || |||||  ||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  23080856 tcaacttctctttctggaggcacatcaggaatttcatcaagaaaaacttctggataatcgcataccacttgtaacttatcaatcattgcttgattctcaa 23080955  T
Q  501 cagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgac 600  Q
     ||| || || ||||||||  |||||||||| || ||||| ||||| | |||||||| |||||| |||||| |||| | ||| ||||||||||||||       
T  23080956 tagacaaggacgccattaaataaaacatcaaaattccatcacgttctaattgcttcaactgcttggtagaccaaaattttgcgccactttcctcttcaga 23081055  T
Q  601 ggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtaga 700  Q
     ||||||||||  || ||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||| ||||||||| |    
T  23081056 agaagagaaatacaccgacttactaaaacaattaatatgaacatgattgtactctaaccagttcataccaaggattacatccataccaatcaaaggtaaa 23081155  T
Q  701 caaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaa 800  Q
    ||||| || || |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23081156 caaaccaagtcaatttcataatcacgatcaaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcactgaacccttagctggagtttcgacaa 23081255  T
Q  801 ccatctctcc 810  Q
    ||||||||||    
T  23081256 ccatctctcc 23081265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 521 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 27559697 - 27559408
Alignment:
Q  521 gaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgact 620  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  27559697 gaaaacatcaaaataccatcgcgttccagttgcttcacctgcttagtagataagaactttgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatacactgact 27559598  T
Q  621 tgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaa 720  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27559597 tgctaaaacaattgatatgaacatggttgtactctaaccaattcatacccagaatcacatccataccgctcaaaagtagacaaactaaatccatttcaaa 27559498  T
Q  721 atcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27559497 atcacgaccaaacatagacaaaggacatctcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 27559408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 28 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 25608096 - 25607614
Alignment:
Q  28 tcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaa 127  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  25608096 tcataatgtccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatgtcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaa 25607997  T
Q  128 ctcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaa 227  Q
    | | ||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  25607996 cacatgcacccactaactgatccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatacctattctttatagtcaccttgttcaattgtcgataatcaatacacaa 25607897  T
Q  228 ccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgt 327  Q
    ||  || ||||||||||||||||| |||| |||||| || |||| | |||| ||||| |  ||||||||||||||||| ||||| || || || || |||    
T  25607896 ccttatgctaccatctttcttcttcactaacaaaacaggtgctctccaaggcgaaacacttggtctaacaaacttcttttcaagtaaatcttctaattgt 25607797  T
Q  328 ttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc-------aagtc-------ctct 413  Q
    ||||||||||| |  ||||| ||| | |||||||||||||||| ||| || || |||||||||||| ||||||||||       || ||       ||||    
T  25607796 ttcttcaactctgccaactcagaacctgacatacgataaggtgtcatagacacaggcttcgttccaagaacaagatcaatcgaaaattcaacttctctct 25607697  T
Q  414 ctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattc 496  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||  ||||||||||| ||||||||    
T  25607696 ccggaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaaatcgcacaccacttgtagtttatcaatcactacttgattc 25607614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 15461362 - 15462178
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || ||||||||||| || || ||||| || ||    
T  15461362 cgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgttctaaaggccgtcttttgcatatcttcgtctttcactttaatttgatggtaacccgacct 15461461  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||   ||||| || ||| | |||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||    
T  15461462 caagtcaatcttgctaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaaatcatcaatccgcggaagtggatatctattcttgattgtaactttgttcaac 15461561  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    |||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| || |  || || ||||||||| | || ||||| |  ||||| |||||||| || |    
T  15461562 tgccgatagtcaatgcacaacctcatacttccatctttcttcttcaccaataacacgggcgctccccacggcgaaacacttggtctcacaaactttttat 15461661  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa- 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||     
T  15461662 caagcaagtcctccaactgtttctttaactcagccaactcagaagctgacatgcgatacggcgccatcgacactggtttcgttcccggaacaagatcaat 15461761  T
Q  407 -------------gtcctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                   ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| || || || || ||||||    
T  15461762 cgagaactcaacttccctttctggtggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcgggaaattcattcaccactggtagtctgtcgattacagcttga 15461861  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||| |  || ||||| ||||| || |||||||| | ||| ||||| |||||||  ||||||| ||| |||||||  | ||||||||| ||||| || |    
T  15461862 ttctctaacgacaaagatgccatcaaagaaaacataaggattccatctcgttccaactgcttcaactgtttagtagttagaaactctgctccactctctt 15461961  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    |||| |  ||||| ||||| || | |||| ||||||||||||||  |||  |||| || |||||||| ||||| || |  || |||| ||| ||   |||    
T  15461962 cttccatagaagaaaaatgcaccgtcttgttaaaacaattaatacaaactcggttatattctaaccaattcatcccgaagataacatccatccccaacaa 15462061  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     |||||||| ||||| || |  |||||||| | |||||||||||| || |||||  | | ||| || |||||| |||| || |||||||| |||||||||    
T  15462062 cggtagacacactaagtcgacctcaaaatctctaccaaacatagataacggacaccttagacacaccagagaagtagttactgaacccttggctggagtt 15462161  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || |||||||| |||||    
T  15462162 tcaacaaccatttctcc 15462178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 8 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 10467104 - 10466293
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||  || || || || || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| || ||    
T  10467104 cgaaaggcatcactttgtattcgtaatgactttatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatggtaaccagacct 10467005  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||| || || ||   ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |  || || |||||||||    
T  10467004 caagtcaatcttactgaacacctttgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattctcggaagtggatacctgttctttactgtaactttgttcaac 10466905  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || || |||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||| |||| ||| || ||||||||| |||||||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  10466904 tgacggtaatcaatgcacaacctcatgctaccatccttcttcttaactaacaacaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaacttcttat 10466805  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||     
T  10466804 caagcaagtcctccaactgtttcttcaattcagctaactcggaagctgacatacggtaaggtgccatcgacaccggctttgttcctggaacaagttcaat 10466705  T
Q  408 t---------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttg 492  Q
    |               | | ||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||  ||| ||  ||| |||||||||||| |||||    
T  10466704 tgaaaattcaacttcccttttctggtggcgcatcaggaatctcatcaggaaacacttctgaaaattcattcacaactagtaacctatcaatcacagcttg 10466605  T
Q  493 attctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcc 592  Q
    ||| || || |||||| | ||||| |  ||| ||||||| || ||||| |||||||| || |||| ||| || |||||||| |||||  |  ||| |||     
T  10466604 attttctacggataaataggccatcagagaatacatcaaaattccatcacgttccagctgtttcatctgttttgtagacaagaactcaacttcaccttct 10466505  T
Q  593 tcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactca 692  Q
    |||||  | ||||| ||||| || | ||| ||||| || || ||| ||||  |||| ||||||||||| || || || | ||| |||| ||||||  |||    
T  10466504 tcttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttactaaagcagttgatatgaactcggttatactctaaccaatttatcccaaaaataacatccatacccgtca 10466405  T
Q  693 aaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagt 792  Q
    | |||| |||||||||||| |   |||| || | |||||||||||| ||  ||||  | ||||| || |||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  10466404 acggtaaacaaactaaatcaaccacaaagtccctaccaaacatagataacagacaccttaaacagacaagagaagtagttactgaacccttagctggagt 10466305  T
Q  793 ttcgacaaccat 804  Q
    ||| ||||||||    
T  10466304 ttcaacaaccat 10466293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 19437028 - 19437844
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || || ||||| || || ||||| || || || || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||    
T  19437028 cgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcatccttcaccttgatctgatggtaacctgacct 19437127  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||| ||||||||   ||||||||| ||| |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||| ||||| || || || || ||||||    
T  19437128 caagtcaatcttactaaaaacctctgcacccaccaactgatccatcaagtcataaatcctcggaagtggatacctgttctttattgtaactttattcaac 19437227  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||||||||| ||| ||| ||| ||| | || || |||||||| | ||| || ||||||||| | ||||| || |  ||| | |||||||| || |    
T  19437228 tgacgataatcaatgcacgacctcatgctatcgtcctttttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgagacacttggttttacaaacttattat 19437327  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||| ||||     
T  19437328 caagcaagtcttccaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatgcgataaggtgtcatcgacaccggcttcgttcccggaacaaggtcaat 19437427  T
Q  408 t----------cctc----tctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |          ||||    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  19437428 taaaaattcaacctctctttctggtggcacatctggaatctcatccggaaaaacttcaggaaactcattcaccaccggtaacctgtcaatcacagcttga 19437527  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    || || |  || || || ||||| || |||||||| |  || |||||||| ||||  ||||||| ||| |||||||  |  || | ||| ||||  || |    
T  19437528 ttttctaacgacaaggatgccatcaaagaaaacataagaattccatcgcgctccaactgcttcaactgtttagtagttaggaattttgctccaccctctt 19437627  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    |||| || ||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||| ||||  |||| ||||||||| ||||||| || | ||| |||| ||||||| ||||    
T  19437628 cttccacagaagaaaaatgcaccgtcttgctaaaacaattgatatgaactcggttatactctaacaagttcatcccaaaaataacatccataccagtcaa 19437727  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||| | ||||||||| || | |||||| || | | |||||||| |||| |||||  | | ||| || |||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  19437728 aggaaaacaaactaagtcgacttcaaagtctctaacaaacataaacaacggacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtt 19437827  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || |||||||| |||||    
T  19437828 tcaacaaccatttctcc 19437844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 8 - 804
Target Start/End: Original strand, 21473626 - 21474436
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||| ||| || ||||| ||||| || ||||| || || || || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||    
T  21473626 cgaaagacatcaccttatactcataatgtccatatcgtgtcctaaaggccgttttctgcatatcctcatccttcactttaatctgatggtaacctgacct 21473725  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||| ||| | || || || |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||| |||||| ||||| | ||||| || || || || ||||||    
T  21473726 caaatcaattttgttgaacacacgagcacccactaactgattcattaaatcatcaattctaggaagtcgatacatgttctttatcgtcactttattcaac 21473825  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || || ||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||| || | ||| || ||||||||| | |||||||| | |||||| ||||| ||||| |    
T  21473826 tgacggtaatctatacacaacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccggcgctccccacggtgaaacactcggtcttacaaatttcttat 21473925  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
     ||| || |||||||||| |||||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||     
T  21473926 aaagtaaatcctccaactatttcttcaactccgctaactcggacgccgacatacggtaaggtgccatcgacaccggcttcgttctaggaacaagatcaat 21474025  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| ||||| |  |||||||||||  |||||    
T  21474026 tgcaaattcaacctccctctctggtggcacatcagggatctcatcaggaaaaacttccggaaattcattcacaaccggcaatctatcaatcacaacttga 21474125  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||| |  || ||| | ||||| || |||||||| |||||  |||| ||||| || ||||||| ||  ||||||| ||| |||||  |  ||| ||| |    
T  21474126 ttctccaacgacaaatatgccatcaaggaaaacattaagatctcatcacgttctagctgcttcatctatttagtagtcaacaactcaacttcaccttctt 21474225  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    | ||  | ||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| || |  || |||| ||||||  ||||    
T  21474226 cctcagcagaagaaaaatgtaccgtcttactaaaacaattaatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaagattacatccatacccgtcaa 21474325  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     |  | ||| || | ||| | |||||| || | ||||||||||||||| |||||  ||||||| ||  ||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  21474326 cgacaaacatacaagatcaacttcaaagtctctaccaaacatagacaatggacaactcaaacaaacatgagaagtagttactgaacccttagctggagtt 21474425  T
Q  794 tcgacaaccat 804  Q
    || ||||||||    
T  21474426 tcaacaaccat 21474436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 8 - 804
Target Start/End: Original strand, 19455050 - 19455859
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||| ||| || || ||||| || |||||||| || || || || || ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  19455050 cgaaagacatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctacatatcttcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacct 19455149  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| | |||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||| || | |||||| |||||| |||||| ||| ||| | || || || |||||||||    
T  19455150 caagtaaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaagtcatcaatcctcgga-gtggattcctgttcgttatcgtaactttgttcaac 19455248  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||| || |||| |||| ||||||| |||||||| || | ||| || ||||||||  |||||||||| |  ||||| ||||| ||||| |    
T  19455249 tgacgatagtcaatgcataacctcatagtaccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgctcctcaaggtgaaacacttggtcttacaaaattcttat 19455348  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||  | ||||| ||||| |||||||| ||||     
T  19455349 caagcaagtcctccaaatgtttcttcaattcagctaactcggaagctgacatacggtaaggtgtcatcgacgccggctttgttcctggaacaaggtcaat 19455448  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              ||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||| || |||| ||| || ||||| ||||||    
T  19455449 tgaaaattcaacctccctctttggtggcacatctggaatctcatccggaaaaacttcaggaaactcattcacaactggtaacctgtcgatcacagcttga 19455548  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||| |  || ||||| ||||| || |||||||| |  || ||||| || ||||  ||||||| ||| |||||||| |  |||||||| ||||| || |    
T  19455549 ttctctaacgacaaagatgccatcaaagaaaacataagaattccatcacgctccaactgcttcaactgtttagtagataggaactctgctccactctctt 19455648  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    |||     ||||| ||||| || | ||||||||| ||||| ||| ||||  |||| ||||||||||||||||| || | ||| |||| ||||||  ||||    
T  19455649 cttaagaagaagaaaaatgcaccgtcttgctaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaataacatccatacccgtcaa 19455748  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     |||| ||||||||| || | |||||| || | ||||||||||||||| | |||  | | ||| || |||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  19455749 cggtaaacaaactaagtcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacgaacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtt 19455848  T
Q  794 tcgacaaccat 804  Q
    || ||||||||    
T  19455849 tcaacaaccat 19455859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 14378171 - 14377355
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || || ||||| || |||||||| || || || || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  14378171 cgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatttgatggtaacctgatct 14378072  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||| || |||||   ||||||||||||| |||||| ||| | || ||| || |||||||||||||| ||||| || || || || ||||||    
T  14378071 caattcaatcttactgaaaacctttgcacccactaactgatccaacaagtcataaatcctaggaagtggatacctgttctttattgtaactttattcaac 14377972  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    |  ||||||| ||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||| | ||| || ||||||||| | ||||| || |  ||||| ||||||||||| |    
T  14377971 taacgataataaatgcacaacctcatactaccgtccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgagacacttggtcttacaaacttcttat 14377872  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||     
T  14377871 caagcaagtcctccaactgtttcttcaattcagctaactcggaagctgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcccggaacaaggtcaat 14377772  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||  ||||||||| | ||  ||||||||  || ||    
T  14377771 tgaaaattcaacctccctctctggtggcacatcagaaatctcatcaggaaacacttctggaaaatcattcaccaccggcaacccgtcaatcacaactcga 14377672  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    || || |  || ||| | |||||||| ||| ||||||  || ||||| ||||| ||||| |||| ||| || |||||||| |||||  |  |||  || |    
T  14377671 ttttctaacgacaaatatgccattaaagaatacatcagaattccatcacgttctagttgtttcatctgtttcgtagacaagaactcaacttcaccctctt 14377572  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||| ||||| || | ||| ||||| || || ||| ||||  |||| ||||||||| ||||||| || | ||| |||| ||||||  ||||    
T  14377571 cttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttactaaagcagttgatatgaactcggttatactctaactagttcattccaaaaataacatccatacccatcaa 14377472  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     |  | ||||||||| || | ||| || || | |||||||||||||||  ||||  | | ||| || |||||| |||  ||  ||||||| |||||||||    
T  14377471 cgacaaacaaactaagtcgacttcgaagtctctaccaaacatagacaacagacaccttagacaaacaagagaagtagctactaaaccctttgctggagtt 14377372  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || |||||||| |||||    
T  14377371 tcaacaaccatttctcc 14377355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 8 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 23086026 - 23085433
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| || |||||||| || || || || |||||||  ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| || ||    
T  23086026 cgaaaggcatcactgaatattcataatgtccataacgtgtcctaaaggccgtcttctagatatcttcatcttttactttaatctgatggtaacccgacct 23085927  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||| ||||| | |||||||||||| || ||||| || ||||||    
T  23085926 caagtcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcgtcaattcttggaagggaatacctattctttatcgttactttattcaac 23085827  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || |||||| |||| || |||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  23085826 tgtcgataaccaatgcataacctcatacttccatctttcttcttgactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaacttcttat 23085727  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc--- 404  Q
    ||||||| |  || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| || || |||||||| || |||||||||||       
T  23085726 caagcaaatattctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagccgacatacggtaaggtgtcatagacacaggcttcgtacctggaacaagatcaat 23085627  T
Q  405 ----aagtc-------ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
        || ||       || ||||| ||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| ||  ||| | |||| ||||||||||||    
T  23085626 cgaaaattcaacttctctttctggcggcgcatcaggaatctcatcagagaaaacttcaggaaaatcacacacaacttgtaacttatctatcactgcttga 23085527  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccac 587  Q
    ||||||||||| || || ||||| |  ||||||||||| || ||||| || || |  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  23085526 ttctcaacagacaaggacgccatcagagaaaacatcaaaattccatcacgctctaactgtttcagctgcttagtagacaagaactctgctccac 23085433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 9 - 810
Target Start/End: Original strand, 18796717 - 18797532
Alignment:
Q  9 gaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctc 108  Q
    ||||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||    
T  18796717 gaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggcagtcttctgcatatcctcatccttcaccttgatctgatggtagcctgacctc 18796816  T
Q  109 aaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 208  Q
    || ||||| || |||||||    |||||| || ||| |||||||||| |  ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || |||||||    
T  18796817 aagtcaattttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaatcctcggaagcggatacctgttctttatcgtaactttattcaact 18796916  T
Q  209 gccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctc 308  Q
      ||||| ||||| || | || |||||||| ||| ||||||||||| | ||| || ||||||||| | |||||||| | |||||| || |||||||| ||    
T  18796917 aacgatagtcaatgcatagcctcatactactatccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgaaacactcggtcttacgaacttcttatc 18797016  T
Q  309 aagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaagt 408  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |    
T  18797017 aagcaagtcttccaattgtttcttcaattcagcaaactcagatgctgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaaggtcaatt 18797116  T
Q  409 --------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgat 494  Q
                  ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||   ||||| |||| | | |||||||| || ||||    
T  18797117 gaaaattcaacttccctttttggtggcacatcaggaatctcatctggaaacacctcaggaaaatcatttaccactggtaacttgtcaatcacagcctgat 18797216  T
Q  495 tctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctc 594  Q
    |||| |  ||||| || ||||| |||||  ||||||  || ||||| ||||| || ||||||| ||| || |||| |||||| ||  | ||||  || ||    
T  18797217 tctctaacgataaggatgccatcaatgagtacatcagaattccatcacgttctagctgcttcatctgtttcgtagtcaaaaattcaactccaccctcttc 18797316  T
Q  595 ttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaa 694  Q
    |||  | ||||| ||||| |||| ||||||||| || || ||| ||||  |||| ||||||||||| ||||| || | ||| |||| ||||||  |||      
T  18797317 ttcagcagaagaaaaatgcactgtcttgctaaagcagtttatatgaactcggttatactctaaccaattcatcccaaaaataacatccatacccgtcagc 18797416  T
Q  695 ggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagttt 794  Q
    |||| ||| ||||| || |  |||||||| | |||||||||||| | |||| |  ||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  18797417 ggtaaacacactaagtctacctcaaaatccctaccaaacatagatataggaaacctcaaacaaacaagagaagtagtcactgaacccttagctagagttt 18797516  T
Q  795 cgacaaccatctctcc 810  Q
    | ||||||||||||||    
T  18797517 caacaaccatctctcc 18797532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 8 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 18963343 - 18962983
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| |||  |||||| || || |||||||| || || ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  18963343 cgaaaggcatcactgaatattcgtaatgtccataacgtgtcctaaaagtcgtcttctgcatatcgtcatctttcactttaatctggtgatagcccgatct 18963244  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || || || || ||||||    
T  18963243 caaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatacatcaaatcatcaattcttggaagtggatacctattctttatcgtcactttattcaac 18963144  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| || | ||| || ||| ||||| || ||||||| | |||||| ||||||||||| |    
T  18963143 tgtcgataatcaatacataacctcatgctaccatctttcttcttaaccaacaacaccggctctccccaacgtgaaacactcggtcttacaaacttcttat 18963044  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataagg 368  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  18963043 caagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagccaactcagaagccgacatacggtaagg 18962983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 8 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 24516663 - 24515859
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||    
T  24516663 cgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaagccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacct 24516564  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||| ||||||||   ||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || || ||||||    
T  24516563 caagtcaatcttactaaaaacctttgcacccactaactgatccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctttattgtaactttattcaac 24516464  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| |||||       | |||||||||||| ||||||||||| | ||| || ||||||||| ||||| | || |  ||||| ||||||||||| |    
T  24516463 tgacgatagtcaat------gctcatactaccatccttcttctttaccaacaacaccggcgctccccaaggttagacacttggtcttacaaacttcttat 24516370  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||| |||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||     
T  24516369 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagcaagttcgaaagccgacatacgataaggtgctatcgacaccggcttcgttcctggaacaaggtcaat 24516270  T
Q  408 t----------cctctct----ggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |          |||||||    || ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||| |||||||  || |||    
T  24516269 tgaaaattcaacctctctctccggtggcacatctagaatctcatcaggaaaaacttcaggaaattcattcaccactggtaacctgtcaatcagagcgtga 24516170  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||| |  || ||| | ||||| || ||||||||||  ||  | || || ||||  ||||| | ||| |||||||  |  || | ||| ||||| || |    
T  24516169 ttctctaacgacaaatatgccatcaaagaaaacatcagaattacgtcacgctccaactgctttaactgtttagtagttaggaattttgctccactctctt 24516070  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||| ||||  |||| ||||||||||||||||| || | ||| |  | ||| ||  ||||    
T  24516069 cttccgcagaagaaaaatgcaccgtcttgctaaaacaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaataatgtccattcccgtcaa 24515970  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     |||| ||| |||| ||| | |||||| || | ||||||||||||||| |||||  | | ||| || |||||| |||| |  |||| |||| ||||||||    
T  24515969 cggtaaacacactagatcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaagtagttaatgaacacttaactggagtt 24515870  T
Q  794 tcgacaaccat 804  Q
    || ||||||||    
T  24515869 tcaacaaccat 24515859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 61 - 810
Target Start/End: Original strand, 25769923 - 25770686
Alignment:
Q  61 ttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattat 160  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||| ||||||| |||| ||    
T  25769923 ttctgcatatcctcatcattcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgctgaatacacgagcacccactaactgatccattaaatcat 25770022  T
Q  161 caattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaa 260  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || || || || |||||||| || ||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||| || | |||    
T  25770023 caattctcggaagtggatacctgttctttatcgtcactttattcaactgacggtaatctatacacaacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaa 25770122  T
Q  261 aactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacata 360  Q
     || ||||||||| | |||||||| | |||||| ||||| ||||| ||||| |  || |||||||| ||||||||||| | ||||||  | || ||||||    
T  25770123 taccggcgctccccacggtgaaacactcggtcttacaaatttcttatcaagtacatcatccaactgcttcttcaactccgctaactcaaacgccgacata 25770222  T
Q  361 cgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaagt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaa 446  Q
    ||||||||| ||||  | || ||||||||||||||||| ||||||| |              ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  25770223 cgataaggtaccattaacaccggcttcgttccaggaactagatcaattgcaaattcaacctccctctctggtggcacatcagggatctcatcaggaaaaa 25770322  T
Q  447 cttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttc 546  Q
    |||| |||||||||  | |  |||| |  ||||| ||||| ||||||||||| |  || ||| | || || || |||||||||||||| ||||  |||||    
T  25770323 cttccggaaattcattcgcatccggcaatctatccatcacagcttgattctccaatgacaaatatgctatcaaggaaaacatcaagattccatatcgttc 25770422  T
Q  547 cagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtgg 646  Q
     |  ||||||| ||  ||||||| ||| || ||  |  |||| || || ||  | ||||| ||||||| || ||| |||||| |||||||| ||||  ||    
T  25770423 taactgcttcaactatttagtagtcaataagtcaacttcactctcttcctcagcagaagaaaaatgtattgtcttactaaaataattaatatgaacacgg 25770522  T
Q  647 ttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggac 746  Q
    || ||||||||||||||||| || |  || |||| ||||||  |||| || | ||| || |  || | |||||| || | ||||||||||||||| ||||    
T  25770523 ttatactctaaccagttcatcccaaagattacatccatacccgtcaatggcaaacatacaaggtcaacttcaaagtctctaccaaacatagacaatggac 25770622  T
Q  747 atttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |  ||||||| || |||||| |||| |  |||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||    
T  25770623 aactcaaacaaacaagagaagtagtgattgaaccctttgctggagattcaacaaccatttctcc 25770686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 253 - 741
Target Start/End: Original strand, 20135245 - 20135747
Alignment:
Q  253 actagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaag 352  Q
    |||||||| || ||||||||| | |||||||| |  ||||| ||||||||||| || || || || || |||||||||||||||||||  |||||   ||    
T  20135245 actagcaataccggcgctccccacggtgaaacacttggtcttacaaacttcttatctagtaaatcttctaactgtttcttcaactcagccaactcatgag 20135344  T
Q  353 cagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaagt----------cctc----tctggaggcacatcaggaatctcatc 438  Q
    | |||||||| ||||||| ||| || || |||||||| || |||||||||||||            ||||    |||||||||||||||||||| |||||    
T  20135345 ccgacatacggtaaggtgtcatagacacaggcttcgtacccggaacaagatcaataaaaaattcaacctcactttctggaggcacatcaggaatttcatc 20135444  T
Q  439 tggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagatacca 538  Q
     ||||||||| | ||||| ||||| || ||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||    
T  20135445 aggaaaaactgctggaaaatcacatacaacctgtaacttatcaatcactgcttgattctcaatagacaaagacgccatcaaggaaaacatcaaaattcca 20135544  T
Q  539 tcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataa 638  Q
    ||  |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  |  |||| || |  |||||||| |||||||||||||||     
T  20135545 tcatgttctaattgcttcagctgcttagtagacaagaactctgctccactttcttcttcagcaaaagaaaagtacactgacttactaaaacaattaatat 20135644  T
Q  639 gaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacataga 738  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||||| || || |||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  20135645 gaacatggttgtactctaactagtccataccaaggattacatccattccactcaaaggtaaacaaaccaaatcaatttcaaaatctcggccaaacataga 20135744  T
Q  739 caa 741  Q
    |||    
T  20135745 caa 20135747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 8 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 20634195 - 20633953
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| |||||    
T  20634195 cgaaaggcataactttgtactcataatgtccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttctactttaatctggtgataaccagatct 20634096  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  20634095 caaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctttattgtcaccttgttcaac 20633996  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttct 250  Q
    || ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||| |||||    
T  20633995 tgtcgatagtcaatacacaatctcatgctaccatcttacttct 20633953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 253 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 22197624 - 22197122
Alignment:
Q  253 actagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaag 352  Q
    |||||||| || ||||||||| | |||||||| |  ||||| ||||||||||| || || || || || |||||||||||||||||||  |||||   ||    
T  22197624 actagcaataccggcgctccccacggtgaaacacttggtcttacaaacttcttatctagtaaatcttctaactgtttcttcaactcagccaactcatgag 22197525  T
Q  353 cagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaagt----------cctc----tctggaggcacatcaggaatctcatc 438  Q
    | |||||||| ||||||| ||| || || |||||||| || |||||||||||||            ||||    |||||||||||||||||||| |||||    
T  22197524 ccgacatacggtaaggtgtcatagacacaggcttcgtacccggaacaagatcaataaaaaattcaacctcactttctggaggcacatcaggaatttcatc 22197425  T
Q  439 tggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagatacca 538  Q
     ||||||||| | ||||| ||||| || ||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||    
T  22197424 aggaaaaactgctggaaaatcacatacaacctgtaacttatcaatcactgcttgattctcaatagacaaagacgccatcaaggaaaacatcaaaattcca 22197325  T
Q  539 tcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataa 638  Q
    ||  |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  |  |||| || |  |||||||| |||||||||||||||     
T  22197324 tcatgttctaattgcttcagctgcttagtagacaagaactctgctccactttcttcttcagcaaaagaaaagtacactgacttactaaaacaattaatat 22197225  T
Q  639 gaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacataga 738  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||||| || || |||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  22197224 gaacatggttgtactctaactagtccataccaaggattacatccattccactcaaaggtaaacaaaccaaatcaatttcaaaatctcggccaaacataga 22197125  T
Q  739 caa 741  Q
    |||    
T  22197124 caa 22197122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 55 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 30679215 - 30678865
Alignment:
Q  55 gctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatca 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||    
T  30679215 gctgtcttctgcatatcctcatccgtcactttaatctgatgatagcctgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgtacccactaactgatccatca 30679116  T
Q  155 aattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttac 254  Q
    ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||    
T  30679115 aatcatcaattcttggaagtagatacctattctttattgtcactttgttcaactgccggtaatctatacacaaccttatgctaccatctttcttcttaac 30679016  T
Q  255 tagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagca 354  Q
    || | || | ||||||||| ||||||| || | |||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||  ||| || |||||     
T  30679015 taac-aacccggcgctccccaaggtgagacactcggtcttataaacttcttatcaagcaaatcttccaactgctttttcaactcatctaattcagaagcc 30678917  T
Q  355 gacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    |||||||  ||| | ||||| || ||  |||| || || |||||||||||||    
T  30678916 gacatacagtaaagcgccatagacacatgctttgtacccggaacaagatcaa 30678865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 25763483 - 25763297
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||  |||||||||||||||||||    
T  25763483 cgaaaggcataactttatactcatagtggccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttacttttttctggtgataacctgatct 25763384  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 194  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25763383 caaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagt 25763297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 21568246 - 21567430
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||| | || || || || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||    
T  21568246 cgaaagacatcactttgtattcgtaatgaccataaagtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcacctttatctgatggtaacctgacct 21568147  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||| |||||||    |||||| |  ||  |||||||||| |  ||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || |||||||||    
T  21568146 caagtcaatcttactaaaaatctttgcaccaaacaattgatccatcaagtcgtcaatcctcggcagcggatacctgttctttatcgtcactttgttcaac 21568047  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    |  || || || || ||||| | ||| |||||||| ||||||| ||| | ||| || ||||||||| | ||||| || | |||||| ||||||||||| |    
T  21568046 taacggtagtctatgcacaatctcatgctaccatccttcttctctaccaacaatacaggcgctccccacggtgagacactcggtcttacaaacttcttat 21567947  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa- 406  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||| || || ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||     
T  21567946 caagcaagtcttccaactgtttcttcaattcagccaactcagatgctgacatacgatatggcgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaaggtcaat 21567847  T
Q  407 -------------gtcctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                   ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||  |||||| |||| ||| |||||||| || |||    
T  21567846 cgagaactccacctccctctctggtggcacatccggaatctcatcaggaaacacctccggaaattcattcaccactggtaacctgtcaatcacagcctga 21567747  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||| |  || ||||| ||||| || ||| ||||||  || ||||| ||||  |  ||||||| |||||| || | ||| || ||  | ||||  || |    
T  21567746 ttctccaatgacaaagatgccatcaaagaatacatcagaattccatcacgttttaactgcttcatctgcttcgtggtcaagaattcaactccaccctctt 21567647  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||| ||||| || | ||| ||||| ||||| ||| ||||  |||| ||||||||| ||||||| || | ||| |||| ||||||  ||||    
T  21567646 cttccgcagaagaaaaatgcaccgtcttactaaagcaattgatatgaactcggttatactctaactagttcattccaaaaatgacatccatacccgtcaa 21567547  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     |||||||| ||||| || |   ||||||| | |||||||||||| | ||||||  ||||||| || |||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  21567546 cggtagacacactaagtcgaccacaaaatctctaccaaacatagatataggacacctcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtt 21567447  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || ||||||||||||||    
T  21567446 tcaacaaccatctctcc 21567430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 406
Target Start/End: Original strand, 24366438 - 24366836
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||    
T  24366438 cgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttttgcatatcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacct 24366537  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgt-gcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 206  Q
    |||||||||||| || |||| || | ||||| || ||| |||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  24366538 caaatcaatcttactgaaaa-tcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttcttgatcgtaactttgttcaa 24366636  T
Q  207 ctgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttc 306  Q
    ||| || ||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||| || | ||| || || |||||| |||||||||| |  ||||| |||||||||||     
T  24366637 ctgacggtaatctatacacaatctcatactaccatccttcttcttgaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactaggtcttacaaacttctta 24366736  T
Q  307 tcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    || | || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||  ||||||| ||||    
T  24366737 tctaacaggtcctccaactgtttcttcaactcagctaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggcttagttccttgaacaaggtcaa 24366836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 75 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 8761940 - 8761334
Alignment:
Q  75 atccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagt 174  Q
    ||||||||  |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||   |||||||||||| ||||||| || | |||||| |||||||||    
T  8761940 atccttcaacttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttgctgaaaactttcgcacccactaactgatccattaagtcatcaatcctcggaagt 8761841  T
Q  175 ggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccct 274  Q
    |||||| | ||||| || ||  | ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| | ||| || |||||||||     
T  8761840 ggatacttgttctttattgtacctttgttcaactgacgatagtcaatacacaacctcatactaccattcttcttctttaccaacaataccggcgctcccc 8761741  T
Q  275 aaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccat 374  Q
    |||| || || |  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  8761740 aaggcgagacacttggtcttacaaacttcttatcaagtaagtcctccaactgtttcttcaactcagcaagttcggatgccgacatacgatatggtgccat 8761641  T
Q  375 cgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaagt----------cc----tctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattca 460  Q
    ||| || ||||||||||| || ||||| |||| |          ||    |||| || |||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| |||    
T  8761640 cgacaccggcttcgttcctgggacaaggtcaattgaaaattcaacctctttctccggtggcacatctggaatctcatcggg--aaacttcaggaaactca 8761543  T
Q  461 cacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagct 560  Q
      |||||| |||| ||| ||||| || |||||||| || |  || ||| | |||||||| |||||||| |  || ||||| || ||||  ||||||| ||    
T  8761542 ttcaccactggtaacctgtcaattacagcttgattttctaacgacaaatatgccattaaagaaaacataagaattccatcacgctccaactgcttcaact 8761443  T
Q  561 gcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaacca 660  Q
    | |||||||  || |||||||| ||||| || ||||   | ||||| || || || | ||||||||| ||||| ||| | || ||||| ||||| |||||    
T  8761442 gtttagtagttaagaactctgctccactctcttctttcgcagaagaaaattgcaccgtcttgctaaagcaattgatatggacatggttatactccaacca 8761343  T
Q  661 gttcatacc 669  Q
    |||||||||    
T  8761342 gttcatacc 8761334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14379721 - 14379382
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || || ||||| || |||||||| || || || || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  14379721 cgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatttgatggtaacctgatct 14379622  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||| || |||||   ||||||||||||| |||||| ||| | || ||| || |||||||||||||| ||||| || || || || ||||||    
T  14379621 caattcaatcttactgaaaacctttgcacccactaactgatccaacaagtcataaatcctaggaagtggatacctgttctttattgtaactttattcaac 14379522  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    |  ||||||| ||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||| | ||| || ||||||||| | ||||| || |  ||||| ||||||||||| |    
T  14379521 taacgataataaatgcacaacctcatactaccgtccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgagacacttggtcttacaaacttcttat 14379422  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactc 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  14379421 caagcaagtcctccaactgtttcttcaattcagctaactc 14379382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 77 - 379
Target Start/End: Original strand, 23998343 - 23998645
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||| | |||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  23998343 cctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttgctaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 23998442  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaa 276  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||| || | ||| ||||| || ||| |     
T  23998443 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccatacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccac 23998542  T
Q  277 ggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcg 376  Q
    |||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||| |||   ||||| || |||||||| ||||| || || ||||    
T  23998543 ggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactccgatgcagacatccgatacggcgcaatcg 23998642  T
Q  377 aaa 379  Q
    |||    
T  23998643 aaa 23998645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 77 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 16648155 - 16647853
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||| | |||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  16648155 cctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctttgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 16648056  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaa 276  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||| || | ||| ||||| || ||| |     
T  16648055 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccatacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccac 16647956  T
Q  277 ggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcg 376  Q
    |||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||| |||   ||||| || |||||||| ||||| || || ||||    
T  16647955 ggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactctgatgcagacatccgatacggcgcaatcg 16647856  T
Q  377 aaa 379  Q
    |||    
T  16647855 aaa 16647853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 34643841 - 34643025
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || || ||||||||||| || ||||| ||||| || || || || |||||||| ||    
T  34643841 cgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggcagtcttctgcatgtcttcatctttcaccttgatttgatggtaacctgacct 34643742  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtg-cacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 206  Q
    ||| ||||| || ||||||| || || |||| || ||| |||||||||| |  |||||||||||||| ||||| || ||||| || || || || |||||    
T  34643741 caagtcaattttactaaaaa-tcttggcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctcggaagaggatatctgttctttatcgtaactttattcaa 34643643  T
Q  207 ctgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttc 306  Q
    ||| || || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||| || ||||||||| | ||||| || |  ||||| |||||||||||     
T  34643642 ctgacggtagtcaatacacaacctcatactaccatccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgagacacttggtcttacaaacttcttg 34643543  T
Q  307 tcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    || || || |||||||||||||| || |||||||  |  || || || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||    
T  34643542 tcgagtaaatcctccaactgtttttttaactcagcaagttcagatgccgacatacgataaggtgccatcgataccggcttcgttcctggtactagatcaa 34643443  T
Q  407 --------------gtcctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttg 492  Q
                    ||||||||| || ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||| |||| ||| || ||||| |||||    
T  34643442 tggagaactcaacctccctctctggtggtacatatggaatctcatccggaaaaacttcaggaaactcattcaccactggtaacctgtcgatcacagcttg 34643343  T
Q  493 attctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcc 592  Q
     || || |  || ||| | ||||| |  ||| ||||||  || || || ||||| |||||||||| ||  || ||||  |||| |||  | ||||| ||     
T  34643342 gttttccaacgacaaatatgccatcagagaatacatcagaatcccgtctcgttctagttgcttcatctctttcgtagttaaaatctcaactccactctct 34643243  T
Q  593 tcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactca 692  Q
    |||||  | ||||| |||||||| | |||  |||| || || ||| ||||  |||| ||||||||||| ||||| || |  || |||| ||| ||  |||    
T  34643242 tcttcagcagaagaaaaatgtacagtcttattaaagcagttgatatgaactcggttatactctaaccaattcatcccaaatataacatccatccccgtca 34643143  T
Q  693 aaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagt 792  Q
    ||||||  |||||||  || | ||||||||| | |||||||||||| | ||||||| ||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  34643142 aaggtaagcaaactaggtctacttcaaaatccctaccaaacatagatataggacatctcaaacaaacaagagaagtagtcactgaacccttagccggagt 34643043  T
Q  793 ttcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||| || ||||| |||||    
T  34643042 ttcaacgaccatttctcc 34643025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 77 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 16380559 - 16380257
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||| | |||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  16380559 cctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 16380460  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaa 276  Q
    ||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| || | ||| ||||| || ||| |     
T  16380459 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgtcgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccac 16380360  T
Q  277 ggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcg 376  Q
    |||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||| |||   ||||| || |||||||| ||||| || || ||||    
T  16380359 ggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactccgatgcagacatccgatacggcgcaatcg 16380260  T
Q  377 aaa 379  Q
    |||    
T  16380259 aaa 16380257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 77 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 1647000 - 1646742
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    ||||| |||| | |||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  1647000 ccttcactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctcagcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 1646901  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaa 276  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || ||||| |||||||| || | ||| ||||| || ||| |     
T  1646900 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatccttcttcttaaccaacaacactggagcaccccac 1646801  T
Q  277 ggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaa 335  Q
    |||||||| |  ||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  1646800 ggtgaaacacttggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaa 1646742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 174 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 23496281 - 23496141
Alignment:
Q  174 tggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccc 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23496281 tggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgacgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttctttactatcaaaactggcgctccc 23496182  T
Q  274 taaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaa 314  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || |||||    
T  23496181 taaggtgaaacacttggtctaacaaatttcttttcgagcaa 23496141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 128
Target Start/End: Original strand, 22444295 - 22444413
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22444295 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacacgttatgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctca 22444394  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaac 128  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  22444395 aatcaatcttgctgaaaac 22444413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 666 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 23085408 - 23085264
Alignment:
Q  666 tacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagaga 765  Q
    |||| ||||| |||| ||| ||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| | ||||| || |||||    
T  23085408 taccaagaattacatccattccactcaaaggcaaacaaaccaaatcaatttcaaaatctctaccaaacatagataaaggacatcttaaacacactagaga 23085309  T
Q  766 aatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23085308 agtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatttctcc 23085264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 623 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 30678650 - 30678469
Alignment:
Q  623 ctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaat 722  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||| ||| ||||||||||| | ||| |||||||| | |||||| |    
T  30678650 ctaaaacaattaatgtgaacatggttatactccaaccaattcataccaagtattacatccattccactcaaaggaaaacagactaaatcaacttcaaagt 30678551  T
Q  723 cacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 804  Q
    | ||||||||||| ||||| | ||| |||| ||| || |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30678550 ctcgaccaaacatcgacaacgaacacttcagacacactagagaagtagtaaccaaacccttagctggagtttcgacaaccat 30678469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 295 - 809
Target Start/End: Complemental strand, 19487260 - 19486734
Alignment:
Q  295 acaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccag 394  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||   |||||| || |  |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |    
T  19487260 acaaacttcttatcaagtaaatcctccaactgtttcttcaactcttctaactcagacgttgacatacggtaaggcgccatcgacacaggcttcgtacccg 19487161  T
Q  395 gaacaagatcaagt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatc 480  Q
    |||||||||||| |              ||||  ||  |||||||||| ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||| |  || ||||||||    
T  19487160 gaacaagatcaattgaaaattcaacttccctcattgctggcacatcagaaatttcatcaggaaaaacttatggaaattcacacacaattggcagcctatc 19487061  T
Q  481 aatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactct 580  Q
    |||||  ||||| || || ||||  ||| | | |||||| |||||||| ||||| | ||| ||||| |  ||||||||||| ||||||| ||| || ||     
T  19487060 aatcatagcttggttttctacagccaaatatgtcattaaagaaaacattaagatcctatcacgttctaactgcttcagctgtttagtagtcaagaaatca 19486961  T
Q  581 gcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacat 680  Q
    ||   ||| || || ||  | ||||| ||||| |  | ||| ||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| || |  || ||||    
T  19486960 gctttactatcttcctcagcagaagaaaaatgcatcgtcttactaaaacaattcatatgaacatggttatactccaaccagttcatcccaaagattacat 19486861  T
Q  681 acataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacc 780  Q
     ||||||  ||  ||| | ||| |||| ||| | ||||||||| | |||||||||||||||  ||||  ||||||| || |||||| |||| ||  ||||    
T  19486860 ccatacccgtc--aggcaaacatactagatcaacttcaaaatctctaccaaacatagacaacagacaactcaaacaaacaagagaagtagttactaaacc 19486763  T
Q  781 cttagctggagtttcgacaaccatctctc 809  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  19486762 cttagctggagtttcaacaaccatttctc 19486734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 251
Target Start/End: Original strand, 16100110 - 16100284
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| ||||   |||||||||||| |||||| || || |||||    
T  16100110 ccttcactataatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagttgatccatcaaatcatcaatccttggtagtgg 16100209  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctt 251  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||  |  |||||||||||||    
T  16100210 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacgcaacctcatggtttcatctttcttctt 16100284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 77 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 23025932 - 23025758
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||||||| ||||||| ||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||     |||| || | | |||||||||||| |||||| |||||||| ||    
T  23025932 ccttcactctaatctgatgatatcttgacctcaaatcaatcttactaaacacctccacaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatcctcggaagcgg 23025833  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctt 251  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||| || ||||||||||||||    
T  23025832 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacaaaacctcatgcttccatctttcttctt 23025758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 251
Target Start/End: Original strand, 14130564 - 14130738
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||||||| ||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||   ||||| || | | |||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  14130564 ccttcactctaatctgatgatatcttgacctcaaatcaatcttgctaaacacttccgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 14130663  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctt 251  Q
    ||||| ||| || || || || |||||||||||||||||||| | | |||||| ||| || | ||| ||||||||    
T  14130664 ataccgatttttaatcgtcactttgttcaactgccgataatccacaaacaacctcatgcttcaatcattcttctt 14130738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 273
Target Start/End: Original strand, 19881324 - 19881588
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || |||||||  || |||||||| || || || || || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||    
T  19881324 cgaaaggcatcaccttatatttgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggcagtcttctgcatgtcttcatctttcaccttgatctgatggtaacctgacct 19881423  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| ||||| || |||||||    |||||| || ||| |||||||||| |  ||||| |||||||| ||||| ||||| || || || || || ||||||    
T  19881424 caagtcaattttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaatcctcggaagcggatatctatt-tttatcgtaactttattcaac 19881522  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccc 273  Q
    || || || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||| | ||| || |||||||||    
T  19881523 tgacggtagtcaatgcataacctcatactaccatccttcttctttaccaacaacacaggcgctccc 19881588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 28281068 - 28280870
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||    
T  28281068 cgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatctttcaccttaatttgatggtaacctgacct 28280969  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 206  Q
    ||| |||||||| || || ||   |||||| || | | | |||||||| | |||||| |||||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||    
T  28280968 caagtcaatcttactgaacacctttgcacctaccagctggtccatcaagtcatcaatcctcggaagcggatatctattcttaattgtaactttgttcaa 28280870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 13751938 - 13751856
Alignment:
Q  265 ggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactc 347  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  13751938 ggcgctccccaaggtgaaacactcggtcttacaaacttcttatcaagtaaatcttccaactgtttcttcaactctgctaactc 13751856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 296 - 406
Target Start/End: Original strand, 18450761 - 18450871
Alignment:
Q  296 caaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccagg 395  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | || ||    
T  18450761 caaacttcttatcaagcaaatcctctaagtgctttttcaactcagctaattcggaagctgacatacggtaaggtgccatagaaacaggtttcatacccgg 18450860  T
Q  396 aacaagatcaa 406  Q
    || ||||||||    
T  18450861 aataagatcaa 18450871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 409 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 30678848 - 30678755
Alignment:
Q  409 cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaaca 502  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||  | | | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  30678848 cctctccggcggaacatcaggaatctcatcaagaaaaacttctggaaattcgcacacaacttgcaacttatcaattactgcttgattctcaaca 30678755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 71
Target Start/End: Original strand, 23080495 - 23080558
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatc 71  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  23080495 cgaaagacatcactttatattcataatgtccataacgcgttctaaaatccgtcttctgcatatc 23080558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 409 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 27563673 - 27563626
Alignment:
Q  409 cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaa 456  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  27563673 cctctctggaggcacatctggaatttcgtctggaaaaacttcaggaaa 27563626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 415 - 680
Target Start/End: Original strand, 18450894 - 18451159
Alignment:
Q  415 tggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagcc 514  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||| |||||||||    | | |||||||||| |||| |||||| | ||| | ||  |||    
T  18450894 tggcggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttctagaaattaacacaccactttcaacttatcaatcaccgctttattctctatagacagagtcgcc 18450993  T
Q  515 attaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgta 614  Q
    || ||||||||||||  ||| |||||| |    |  || |||| ||||||||||| ||| ||||| |   | | ||| |||||| | ||||| ||| |||    
T  18450994 atcaatgaaaacatctggattccatcgtgcattaactgtttcaactgcttagtagtcaagaactcagtttctccttcttcttcggcagaagaaaaacgta 18451093  T
Q  615 ctgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacat 680  Q
    | | | | ||||||||||||||| |||| | |||  |||| |||||||||||||| || |||||||    
T  18451094 ccgtcattctaaaacaattaatatgaacatagttaaactccaaccagttcatacctagtatcacat 18451159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 477 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 18962878 - 18962775
Alignment:
Q  477 tatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaa 576  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||  || || ||||| || |||||||||||||| ||||| |  || |  |||| |||||||||||||| ||| ||    
T  18962878 tatcaattactacttgattctcaacagtcaaggacgccatcaaagaaaacatcaagattccatcacactctaactgctccagctgcttagtagtcaagaa 18962779  T
Q  577 ctct 580  Q
    ||||    
T  18962778 ctct 18962775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 727 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 20010976 - 20010899
Alignment:
Q  727 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 804  Q
    |||||| |||||||| |||||  | ||||| || |||||| |||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20010976 accaaaaatagacaacggacaccttaaacacacaagagaagtagttactgaacccttggctggagtttcaacaaccat 20010899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 651 - 804
Target Start/End: Original strand, 24367083 - 24367236
Alignment:
Q  651 actctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacattt 750  Q
    |||||||||| |||||||| |  || |||| ||||||  | || || |||||||||||||| ||  ||||||| | |||||| ||||| | ||||||       
T  24367083 actctaaccaattcataccaaagataacatccatacccgtgaacggcagacaaactaaatcaatcacaaaatctctaccaaagatagatataggacaccg 24367182  T
Q  751 caaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 804  Q
    || ||| || |||||| | || || ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  24367183 cagacaaacaagagaagtggttactgaatccttagctggagtttcaacaaccat 24367236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 620; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 620; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 810
Target Start/End: Original strand, 2616 - 3431
Alignment:
Q  9 gaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2616 gaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaaactgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgacctc 2715  T
Q  109 aaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 208  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2716 aaatcaatcttgctaaaaacacgttcacccactaactaatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 2815  T
Q  209 gccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctc 308  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  2816 gccgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctc 2915  T
Q  309 aagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag- 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||      
T  2916 aagcaagtcctccaactgtttcttcaattcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgagactggctttgttccaggaacaagatcaata 3015  T
Q  408 ------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgat 494  Q
                || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3016 gaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatatggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatcactgcttgat 3115  T
Q  495 tctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctc 594  Q
    |||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  3116 tctcagtagataaagtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaacttcgcaccactttcctc 3215  T
Q  595 ttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaa 694  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  3216 ttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccataccgctcaaa 3315  T
Q  695 ggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagttt 794  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  3316 ggtagacaaactaaatccatttcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcatcgaacccttagctggagttt 3415  T
Q  795 cgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||||||||||||||    
T  3416 cgacaaccatctctcc 3431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 485; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 810
Target Start/End: Original strand, 16352 - 17167
Alignment:
Q  9 gaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16352 gaaaggcataactttatattcatagtgaccacaacgcgttctgaaaactgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgacctc 16451  T
Q  109 aaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 208  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16452 aaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 16551  T
Q  209 gccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctc 308  Q
    | ||||| ||||||||||| | ||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||||||||    
T  16552 gacgatagtcaatacacaatctcatgcttccatctttcttcttcactaccaaaactggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaatttcttctc 16651  T
Q  309 aagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa-- 406  Q
     ||||  || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||      
T  16652 gagcagatcttcaaactgtttcttcaactcagctaactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccaggaacaagatcaata 16751  T
Q  407 ------------gtcctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgat 494  Q
                  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||  ||||| ||||| ||| | ||||||    
T  16752 gaaaactcgacttccctctctggaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttcgggaaagtcgcataccactcgtagcttatcagtcattccttgat 16851  T
Q  495 tctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctc 594  Q
    |||||| ||||||| ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  16852 tctcaatagataaataagccatcaaagaatacatcaaaataccatcgcattccatttgcttcagctgcttagtagataagaactctgcaccactttcctc 16951  T
Q  595 ttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaa 694  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  16952 ttcgacggaagagaagtacactgacttgctaaaacaattgatatgaacacggttgtactctaaccaattcatacccagaatcacatccataccgctcaaa 17051  T
Q  695 ggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagttt 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  17052 ggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgactaaacatagataaagggcatcttaaacatacgagagaagtagtcatcgaacccttagctggagttt 17151  T
Q  795 cgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||||||||||||||    
T  17152 cgacaaccatctctcc 17167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 611; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 611; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Original strand, 9561 - 10375
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9561 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacctgacctca 9660  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9661 aatcaatcttgctgaaaacacgtgtacccactaactgatccatcagatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 9760  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
     || ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| |||||||||    
T  9761 tcggtaatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaatttcttctca 9860  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-- 407  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||       
T  9861 agcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataattcggaagcagacatacgatatggttccatcgacaccggcttcgttccaggaacaagatcaatag 9960  T
Q  408 -----tc-------ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
         ||       |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9961 aaaactcgacttatctctctagaggcacatcaggaatctcatccggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 10060  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10061 ctcaatagataaagaagccatcaatgaaaacatcaagataccatcgcgtcccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcctct 10160  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10161 tcgagggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataaaaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccataccactcaaag 10260  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10261 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttc 10360  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||    
T  10361 gacaaccatctctcc 10375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 607; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 607; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Original strand, 21440 - 22254
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  21440 aaaggcataactttatattcatagtaaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatctctccatcctttactttaatctggtgatatcctgacctca 21539  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21540 aatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 21639  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
     |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  21640 tcgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacactcggtctaacaaacttcttctca 21739  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-- 407  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||       
T  21740 agcaagtcttccaactgtttcttcaactcagataactcagaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaatag 21839  T
Q  408 -----------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
               || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21840 aaaactcaacttctctctctggaggcacattaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtaacctatcaatcactgcttgatt 21939  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  21940 ctcaatagataaagtagccatcaacgaaaacatcaagataccgtcgcgtttcagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttccttt 22039  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22040 tcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccataccactcaaag 22139  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22140 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttc 22239  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||    
T  22240 gacaaccatctctcc 22254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 589; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 589; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 40346 - 41162
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  40346 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttttgaaagctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctagtgataccctgatct 40445  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40446 caaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcagttctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 40545  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| |||||||    
T  40546 tgtcgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactagcaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaatttcttct 40645  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  40646 caagcaagtcttccaactatttcttcaactcagatagttcggaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccaggaacaagatcaat 40745  T
Q  408 -------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  40746 agaaaactcgacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccacttgtagcttatcaatcactgcttga 40845  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40846 ttcttaacagacaaagtagccattaacgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcctagtagataaaaactctgcaccactttcct 40945  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  40946 cttcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaatttataagaatgtggttgtactctaaccagttcatacccaaaatcacatccataccgctcaa 41045  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41046 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtt 41145  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  41146 tcgacaaccatctctcc 41162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 488; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 14237 - 13423
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| || |||||    
T  14237 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctatcttctgcatatcatcatctttcactttaatctagtgataccccgatct 14138  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14137 caaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 14038  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    ||  |||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |    
T  14037 tgatgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcttcactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaatttctttt 13938  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa- 406  Q
    ||||||| || || || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||     
T  13937 caagcaaatcttctaattgtttcttcaactcagctaactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgtcccaggaacaagatcaat 13838  T
Q  407 -------------gtcctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                   ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| || || |||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  13837 agaaaactcgacttccctctctggaggcacataaggaatttcatttggaaaaacttcaggaaagtcgcataccacttgtagcttatcaatcactgcttga 13738  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  13737 ttctcaatagataacgaagccatcaaagaaaacatcaaaataccatcgcgttccatttgcttcagctgcttagtagataagaattctgcaccactttcct 13638  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| | |||||    
T  13637 cttcagcggaagagaaatacactgacttgctaaaacaatttatatgaacatggttgtactctaaccaattcatacccaaaatcacatccataacgctcaa 13538  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13537 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaccattgataaaggacatcgcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtt 13438  T
Q  794 tcgacaaccatctct 808  Q
    |||||||||||||||    
T  13437 tcgacaaccatctct 13423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 587; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 587; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Original strand, 10669 - 11476
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10669 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagtcgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacctgacctca 10768  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10769 aatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcttggaagtcgatacctattcttgatagttaccttgttcaattg 10868  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
     |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |  ||||||||||| |||||||||    
T  10869 tcgataatcaatacataacctcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccagcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaatttcttctca 10968  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-- 407  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||       
T  10969 agcaaatcttccaactgtttcttcaactcagataattcggaagcggacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccaggaacaagatcaatct 11068  T
Q  408 -----tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaac 501  Q
         || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  11069 cgacttctctctctggaggcaca-caggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccacttgtagcttatctatcactacttgattctcaac 11167  T
Q  502 agataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacg 601  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11168 agataaagaagccatcaacgaaaacatcaagataccatcgcgttccagtcgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactctcctcttcgacg 11267  T
Q  602 gaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagac 701  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  11268 gaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccataccgctcaaaggtagac 11367  T
Q  702 aaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaac 801  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11368 aaaccaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaac 11467  T
Q  802 catctctcc 810  Q
    |||||||||    
T  11468 catctctcc 11476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 571; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Original strand, 17131 - 17944
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17131 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacctgacctca 17230  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17231 aatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcttggaagtcgatacctattcttgatagttaccttgttcaattg 17330  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
     |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| |||||||||    
T  17331 tcgataatcaatacataacctcatactaccatctttcttctttactagcaacaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaatttcttctca 17430  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-- 407  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||       
T  17431 agcaaatcttccaactgtttcttcaactcagataattcggaagcggacatatgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccaggaacaagatcaatag 17530  T
Q  408 -----------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
               || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||    
T  17531 aaaactcgacttctctctctggaggcaca-caggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccacttgtagcttatctatcactacttgatt 17629  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  17630 ctcaacagataaagaagccatcaacgaaaacatcaagataccatcgcattccagtcgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactctcctct 17729  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  17730 tcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatccataccgctcaaag 17829  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17830 gtagacaaaccaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttc 17929  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||    
T  17930 gacaaccatctctcc 17944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 338 - 799
Target Start/End: Original strand, 53248 - 53723
Alignment:
Q  338 cagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-------------tc-ctctctggaggcac 423  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||              || |||||| |||||||    
T  53248 cagataattcgaaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccaagaacaagatcaatagaaaactcgacttctctctctagaggcac 53347  T
Q  424 atcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaa 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||    
T  53348 atcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccactggtagcttatcaatcaccgcttgattctcaatagataaagaagccatcaacgaa 53447  T
Q  524 aacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgc 623  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53448 aacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactttgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgcactgacttgc 53547  T
Q  624 taaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatc 723  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  53548 taaaacaattaataagaacgtggttgtactccaaccagttcatacccagaatcacatccataccgctcaaaggtagacaaaccaaatccatttcaaaatc 53647  T
Q  724 acgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgaca 799  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53648 acgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgaca 53723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 10 - 342
Target Start/End: Original strand, 45346 - 45678
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  45346 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcctttaccttaatctggtgataacctgacctca 45445  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  45446 aatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcgtcaattcttggaagcggatacctattcttgatagttaccttgttcacctg 45545  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
     |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  45546 tcgataatcaatacatagcctcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacactcggtctaacaaatttcttctca 45645  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagat 342  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  45646 agcaaatcttccaactgtttcttcaactcagat 45678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 48627 - 48243
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||    
T  48627 cgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtgctaaaggcagtcttctgcatgtcctcatctttcaccttgatctgatggtaacctgacct 48528  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| ||||| || |||||||    |||||| || ||| |||||||||  |  |||||||||||||| ||||| |||||||| |  || || || ||||||    
T  48527 caagtcaattttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaggtcgtcaattctcggaagcggatatctattctttactgtaactttattcaac 48428  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || || || ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||| | |||||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  48427 tgacggtagtcaatgcataacctcatactaccatctttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgaaacacttggtcttacaaacttcttgt 48328  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttcc 392  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||   |  ||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  48327 cgagcaagtcctctaactgtttcttcaactcaacaagttcggatgccgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcc 48243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 551 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 48070 - 47952
Alignment:
Q  551 tgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgt 650  Q
    ||||||| ||| |||||||  || |||||||| ||||| || |||||    ||||| ||||| || | ||| ||||||||||| ||| ||||  |||| |    
T  48070 tgcttcaactgtttagtagttaagaactctgctccactctcttcttccgtagaagaaaaatgcaccgtcttactaaaacaattgatatgaactcggttat 47971  T
Q  651 actctaaccagttcatacc 669  Q
    |||||||||||||||||||    
T  47970 actctaaccagttcatacc 47952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 544; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 544; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Original strand, 35691 - 36505
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35691 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgacctca 35790  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35791 aatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttactttgttcaactg 35890  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
     |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  35891 acgataatcgatacataacctcatactaccatctttcttctttactaacaaaactggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctca 35990  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa--- 406  Q
    ||||| || || || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||       
T  35991 agcaattcttctaattgtttcttcaactcagctaactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccaggaacaagatcaatag 36090  T
Q  407 -----------gtcctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
                | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  || |||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  36091 aaaactcgacttttctctttggaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaaattgcataccacttgtagcttatcaatcactgcttgatt 36190  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  36191 ctcaatagataaagaagccatgaaggaaaacatcacattaccatcgcgttccagttgcttcagctgcttggtaaacaagaactctgcaccactttcctct 36290  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  36291 tcgacggaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccaattcataccaagaatcacatccataccgctcaaag 36390  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36391 gtagacaaactagatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatctcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttc 36490  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||    
T  36491 gacaaccatctctcc 36505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #2
Raw Score: 314; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 146 - 669
Target Start/End: Original strand, 28407 - 28944
Alignment:
Q  146 gatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatcttt 245  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  28407 gatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttactttattcaactgatgataatcgatacataacctcatactaccatcttt 28506  T
Q  246 cttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataac 345  Q
     |||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||| ||||    
T  28507 tttctttactaacaaaacgggcgctcctcaaggtgaaaaacttggtctaacaaacttcttctcaagcaaatcttctaattgtttattcaactcagttaac 28606  T
Q  346 tcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatca-------agtc-------ctctctggaggcacatcaggaa 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||       | ||       ||||||||||||||||||||||    
T  28607 tcggaagcagacatacgataaggtgccatcgacactggcttcgttccaggaacaagatcattagaaaactcgacttctctctctggaggcacatcaggaa 28706  T
Q  432 tctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaa 531  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||  | |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  28707 tttcatctggaaaaacttcaggaaaatcggataccacttgtagcttatcaatcactgcttgattctcaatagataaagaagccatcaaagaaaacatcaa 28806  T
Q  532 gataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaa 631  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  28807 aataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaagaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatacactgacttgctaaaacaa 28906  T
Q  632 ttaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacc 669  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  28907 ttaatatgaacatggttgtactctaaccaattcatacc 28944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 8 - 707
Target Start/End: Original strand, 2909 - 3622
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||||||||| || || ||||| |  || || || |  ||||||||||||||||||||||||   |||||||| || |||||||| ||    
T  2909 cgaaaggcatcactttatattcgtaatgtccatatcatgtcctaaaggtcgtcttctgcatatcctcatccttcgacttaatctgatggtaacctgacct 3008  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||| || ||||| || ||||||||||||||| ||||||| || | ||||||  |||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||    
T  3009 caaatcaattttactaaacacacgtgcacccactaactgatccattaagtcatcaatcgtcggaagtggatacctgttctttatcgtaactttgttcaac 3108  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||||||||| || | || |||  ||||||| |||||||| || | ||| || ||||||||| |||||||||| |  ||||| ||||| ||||| |    
T  3109 tgacgataatcaatgcatagcctcatggtaccatccttcttcttaaccaacaataccggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaatttcttat 3208  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||  ||||||| ||||     
T  3209 caagcaagtcctccaactgtttcttcaattcagctaactcgaaagctgacatacggtaaggtgccatcgacaccggcttcgttcctagaacaagctcaat 3308  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| | ||  |  || |||||||| ||||||    
T  3309 tgaaaattcaacctccctctctggtggcacatctggaatctcatcaggaaaaacttctggaaattcaatcacaaacgacaaactgtcaatcacagcttga 3408  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||| | ||| ||  | ||||| || |||||||| |  || ||||| || ||||  ||||||| ||| |||||||  |  ||||| || ||||| || |    
T  3409 ttctccaaagacaagtatgccatcaaagaaaacataagaattccatcacgctccaactgcttcaactgtttagtagttaggaactcagctccactctctt 3508  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||| ||||| || | |||||||||  |||| ||| ||||  |||| ||||||||||||||||| || | ||| |||| ||||||  ||||    
T  3509 cttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttgctaaagtaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaattacatccatacccgtcaa 3608  T
Q  694 aggtagacaaacta 707  Q
     |||| ||||||||    
T  3609 cggtaaacaaacta 3622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 122
Target Start/End: Original strand, 28294 - 28406
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28294 aaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctca 28393  T
Q  110 aatcaatcttgct 122  Q
    |||||||||||||    
T  28394 aatcaatcttgct 28406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 512; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 512; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 675
Target Start/End: Original strand, 9133 - 9812
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9133 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagttgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgacctca 9232  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9233 aatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 9332  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  9333 ccgataatcaatacataaccgcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctca 9432  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc----- 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||         
T  9433 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgagaccggcttcgttccaggaacaagatcaatag 9532  T
Q  405 --aagtc-------ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
      || ||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  9533 aaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacacaacttgtagcttatcaatcactgcttgatt 9632  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9633 ctcaatagataaggtagccattaacgaaaacatcaagataccgtcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcctct 9732  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaat 675  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9733 tcgacggaagagaaatgcactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaat 9812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 489; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 489; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 37933 - 37117
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  37933 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataccgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatct 37834  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37833 caaatcaatcttgctgaaaacatgtgcacccactaactaatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttactttgttcaac 37734  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| ||||| |||| |  |||| ||||||||||||||    
T  37733 tgacgataatcgatacacaacctcatacaaccatctttcttcttcacgaacaaaaccggcgctccccaaggtaaaacacttggtcgaacaaacttcttct 37634  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||     
T  37633 caagcaaatcttctaactgtttcttcaactgagctaactcggaagctgacatacgataaggtgccatcgacatcggcttcgttccaggtacaagatcaat 37534  T
Q  408 -------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                 || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  37533 agaaaactcgacttctctctctggaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaaatcgcataccacttgtagcttatcaatcactgcttga 37434  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| | | || |||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37433 ttctcaatacaaaaggaaggcatcaaagaaaacatcaaaataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaagaactctgcaccactttcct 37334  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  37333 cttcgactgaggagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtattccaaccagttcatacccagaatcacatccataccgctcaa 37234  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37233 aggtagacaaactaagtccatcttgaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatatcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtt 37134  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  37133 tcgacaaccatctctcc 37117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 413 - 810
Target Start/End: Original strand, 25962 - 26359
Alignment:
Q  413 tctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaag 512  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||| || || |||||||| ||  ||| | ||||| | |||||||||||||| |||||||| || |    
T  25962 tctggcggcacatcaagaatctcattaggaaaaacttctgggaaatcacacacaacttgtaacttatcatttactgcttgattctccacagataaggacg 26061  T
Q  513 ccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatg 612  Q
    |||| || |||| ||||||||| ||||| || || |  ||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||| || ||||  || ||||| ||||     
T  26062 ccatcaaagaaagcatcaagattccatcacgctctaactgctttagctgcttagtagtcaaaaactccgccccactctcttctttaacagaagaaaaata 26161  T
Q  613 tactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatcc 712  Q
    ||| |||||  |||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||| ||| ||||||||||| | |||||| |||||     
T  26162 taccgacttattaaaacaattaatatgaacatggttatactccaaccagttcataccaaggattacatccattccactcaaaggcaaacaaaccaaatca 26261  T
Q  713 atttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||||||||| | | ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26262 atttcaaagtctcgaccaaacatagataaaggacatcttagacacactagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatttctcc 26359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 303
Target Start/End: Original strand, 22897 - 23193
Alignment:
Q  7 acgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatc 106  Q
    ||||||||||| ||   |||||| || || |||||||| || || || || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||    
T  22897 acgaaaggcatcaccgaatattcgtaatgtccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcgtctttcactttaatctggtggtagcccgatc 22996  T
Q  107 tcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 206  Q
    ||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||    
T  22997 tcaaatcaatcttgctaaacagacattcacccactaactgatccatcaaatcatctattcttggaagtggatacctattctttatcgttactttattcaa 23096  T
Q  207 ctgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttc 303  Q
    ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||    
T  23097 ctgtcgataatctatacacaacctcatactaccatctttcttcttaactaacaataccggcgctccccaaggtgaaacactcggtcttacaaacttc 23193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 307 - 406
Target Start/End: Original strand, 25842 - 25941
Alignment:
Q  307 tcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    |||||||| || || || ||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| | ||| || || |||||||| || |||||||||||||    
T  25842 tcaagcaaatcttctaattgtttcttcaactcagccaactcagaagccgacatacggtaaggcgtcatagacacaggcttcgtacccggaacaagatcaa 25941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 485; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 485; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 18179 - 17363
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18179 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgtactgaaagatatcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacatgatct 18080  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18079 caaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggtagtggatacctatttttgatagttactttgttcaac 17980  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    ||  | |||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||| ||| |||||||    
T  17979 tgatggtaatcaatacacaatctcatgctaccatctatcttcttcactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaaaaaatttcttct 17880  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    || | || || || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  17879 caggaaaatcttctaactgtttcttcaactcagctaactcggaagtagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccaggaacaagatcaat 17780  T
Q  408 -------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||||  ||||  ||||||||||||| |||    
T  17779 agaaaactcgacttctctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaagaaaatcgcataccacttgtagtttatcaatcactgcctga 17680  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| || |||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  17679 ttctcaataggtaaagaagccatcaaagaatacatcaaaataccatcgcgttccaattgcttcagcttcttagtagataagaactctgcaccactttcct 17580  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| | |||||    
T  17579 cttcgacggaagagaaatatactgacttgctaaaacaattgatatgaacatggttgtactctaaccaattcataccaagaatcacatccatatcgctcaa 17480  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17479 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagataaaggacatctcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtt 17380  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  17379 tcgacaaccatctctcc 17363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 8 - 367
Target Start/End: Original strand, 58208 - 58567
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||    
T  58208 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataccgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgacct 58307  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  58308 caaatcaatcttgctaaaaacttttgcacccactaattgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 58407  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  ||||||||||| ||||| |    
T  58408 tgacgatagtcaatgcacaatctcatgctaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaatacttggtctaacaaatttctttt 58507  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataag 367  Q
    | ||||| || || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  58508 cgagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagctaactaggaagcagacatacgataag 58567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 497 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 195448 - 195135
Alignment:
Q  497 tcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctctt 596  Q
    |||| |||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  195448 tcaatagataatgaagccatcaaggaaaacatgaaaataccatcgcgttctaattgcttcagctgcttggtagacaagaactctgcaccactttcctctt 195349  T
Q  597 cgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaagg 696  Q
    |||| || |||||||  ||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||| |  || |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  195348 cgactgaggagaaatacactgacttgctgaaacaattaatgtgaacatggttgtattgcaatcagttcatacccagaatcacatccacaccgctcaaagg 195249  T
Q  697 tagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcg 796  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  195248 tagagaaactaaatccatctcgaaatcacgtccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcg 195149  T
Q  797 acaaccatctctcc 810  Q
    ||||| ||||||||    
T  195148 acaactatctctcc 195135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 195598 - 195444
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||| |||||||    
T  195598 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcttcatcatttatcttaatctggtgataacccgatctca 195499  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaat 164  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  195498 aatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaat 195444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 409 - 810
Target Start/End: Original strand, 23912 - 24313
Alignment:
Q  409 cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaa 508  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||  | | | |||||||||| ||||||||||||| | | |      
T  23912 cctctctggcggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttatggaaattcacacatcacttgcaacttatcaatcaccgcttgattctcaatatacagg 24011  T
Q  509 gaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagaga 608  Q
    || ||||| || |||||||||  ||| ||||||||    |  || |||| ||||||||||| ||| ||||| |   | | ||| |||||| | ||||| |    
T  24012 gacgccatcaaagaaaacatctggattccatcgcgaattaactgtttcaactgcttagtagtcaagaactcagtttctccttcttcttcggcagaagaaa 24111  T
Q  609 aatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaa 708  Q
    || | || | ||| ||||| ||||||||| |||| |||||  |||| |||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| |  | ||| ||||     
T  24112 aacgcaccgtctttctaaagcaattaatatgaacatggttaaactccaaccagttcatacctagtatcacatccatcccactcaacgacaaacagactag 24211  T
Q  709 atccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctct 808  Q
     |||| | ||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  24212 gtccactacaaaatctctaccaaacatcgacaaaggacacttcaggcatactagagaagtagtcactgaacccttagccggggtttcgacaaccatttct 24311  T
Q  809 cc 810  Q
    ||    
T  24312 cc 24313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 477; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 477; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 11352 - 10535
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11352 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagttgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataccctgatct 11253  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11252 caaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 11153  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgc--tccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttctt 305  Q
    || ||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |    ||||||||| |||||    
T  11152 tgacgatagtcaatacacaatctcaggctaccatctttcttctttactagcaaaactggcgcgctccccaaggtgaaacacttt-tctaacaaatttctt 11054  T
Q  306 ctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatca 405  Q
     |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||    
T  11053 ttcaagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagctaacttggaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgtcccaggagcaagatca 10954  T
Q  406 agt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgctt 491  Q
    |                |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||  ||||| |||| ||||||||||    
T  10953 atagaaaactcgacttccctctctggaggcacatcaggaatttcatccggaaaaacttcaggaaagtcgcataccacttgtagcttatccatcactgctt 10854  T
Q  492 gattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttc 591  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| || || | ||||||||||||    
T  10853 gattctcaatagataacgaagccatcaaagaaaacatcaaaataccatcgcgttccatttgcttcatctacttagtagataagaattttgcaccactttc 10754  T
Q  592 ctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactc 691  Q
    ||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||    
T  10753 ctcttcagcggaagagaaatacactgacttgctaaaacaatttatatgaacatggttgtactctaaccaattcatacccataatcacatccataccgctc 10654  T
Q  692 aaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggag 791  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10653 aaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagttaaaggacatctcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggag 10554  T
Q  792 tttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||||    
T  10553 tttcgacaaccatctctcc 10535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 477; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 31075 - 31890
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  31075 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttgatctggtgataacctaatct 31174  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  31175 caaattaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcatatctcggaagtggatacctattcttgatagttactttgttcaat 31274  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || |||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||| | |||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  31275 tgacgataatcgatacataatctcatactaccatctttcttctgtactaataaaaccggcgctccccatggtgaaacacttggtctaacaaacttcttct 31374  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||     
T  31375 caagcaaatcttctaactgtttcttcaactcacctaactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccagctttgttccaggaacaagatcaat 31474  T
Q  408 -------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                 || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  31475 agaaaactcgacttctctctctggaggcatatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaagtcacataccacttgtagcttatcaatcactgcttga 31574  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31575 ttctcaatagataaggaagccatcaaagaaaacatcaaaataccatcgcgttccagtcgcatcagctgcttagtagacaagaactctgcaccactttcct 31674  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||||| || ||||||   ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||| |||||    
T  31675 cttcgacagaggagaaaac-acttacttgctaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccaattcatacctagaatcacatccaaaccgctcaa 31773  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  31774 aggtagacaaactaaatccatatcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagttaccgaacccttagctggagtt 31873  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  31874 tcgacaaccatctctcc 31890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 473; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 36541 - 37356
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  36541 cgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttgatctggtgataacctaatct 36640  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  36641 caaattaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaaatctcggaagtggatacctattcttgatagttactttgttcaat 36740  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || |||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||| | |||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  36741 tgacgataatcgatacataatctcatactaccatctttcttctgtactaataaaaccggcgctccccatggtgaaacacttggtctaacaaacttcttct 36840  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||     
T  36841 caagcaaatcttctaactgtttcttcaactcacctaactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccagctttgttccaggaacaagatcaat 36940  T
Q  408 -------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                 || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  36941 agaaaactcgacttctctctctggaggcatatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaagtcacataccacttgtagcttatcaatcactgcttga 37040  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37041 ttctcaatagataaggaagccatcaaagaaaacatcaaaataccatcgcgttccagtcgcatcagctgcttagtagacaagaactctgcaccactttcct 37140  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||||| || ||||||   ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||| |||||    
T  37141 cttcgacagaggagaaaac-acttacttgctaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccaattcatacctagaatcacatccaaaccgctcaa 37239  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  37240 aggtagacaaactaaatccatatcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacataagagagaagtagtaacagaacccttagctggagtt 37339  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  37340 tcgacaaccatctctcc 37356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 53828 - 54644
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  53828 cgaaaggcataactttgtactcatagggaccataccgtgttcagaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatct 53927  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  53928 caaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatcctcggaagtggatacctattctttattgtcaccttgttcaac 54027  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| |||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |  |||||||||||||| ||||    
T  54028 tgtcgatagtcaatacacaatgtcatgctaccatctttcttctttactagcaaaacgggcgctcccctaggtgaaacacgtggtctaacaaactttttct 54127  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc--- 404  Q
    | ||||| ||||| || | |||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||       
T  54128 cgagcaaatcctctaattttttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaggcttcgttccaggaacaagatcaat 54227  T
Q  405 ----aagtc-------ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
        || ||       |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  ||||  |||||||| ||||||||    
T  54228 agaaaattcaacttctctctctagaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttttggaaaatcgcataccacttgtagtttatcaatcgctgcttga 54327  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| |||||| |||||||| || ||||||| |||||| ||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54328 ttctcaatagataacgaagccatcaaagaaaacaacaagattccatcacgttctaactgcttcaactgcttagtagacaaaaactctgcgccactttcct 54427  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||||||||  || ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  54428 cttcagcagaagagaaatacaccgacttactaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccagttcatgccaagaatcacatccataccactcaa 54527  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  54528 aggtaaacaaactaaatccatctcaaaatcacgatcaaacatagaaaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtt 54627  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||||||||| |||||    
T  54628 tcgacaaccatttctcc 54644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 132 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 13883 - 13190
Alignment:
Q  132 tgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgc 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  13883 tgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgacgatagtcaatacacaatctc 13784  T
Q  232 atactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgc--tccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgttt 329  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |    ||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||    
T  13783 atgctaccatctttcttctttactagcaaaactggcgcgctccccaaggtgaaacacttt-tctaacaaatttcttttcaagcaaatcttctaactgttt 13685  T
Q  330 cttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaagt--------------cctctct 415  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||                |||||||    
T  13684 cttcaactcagctaacttggaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccaggatctagatcaatagaaaactcgacttccctctct 13585  T
Q  416 ggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagcca 515  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  13584 ggaggcacatcaggaatttcatccggaaaaacttcaggaaagtcgcataccacttgtagcttatccatcactgcttgattctcaatagataacgaagcca 13485  T
Q  516 ttaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtac 615  Q
    | || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| || || | ||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||    
T  13484 tcaaagaaaacatcaaaataccatcgcgttccatttgcttcatctacttagtagataagaattttgcaccactttcctcttcagcggaagagaaatacac 13385  T
Q  616 tgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatt 715  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13384 tgacttgctaaaacaatttatatgaacatggttgtactctaaccaattcatacccataatcacatccataccgctcaaaggtagacaaactaaatccatt 13285  T
Q  716 tcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13284 tcaaaatcacgaccaaacatagttaaaggacatcgcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 13190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 465; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 465; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 20795 - 21611
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    ||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  20795 cgaaaggcatatctttgtactcatagtgaccataccgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatct 20894  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||| |||||||| ||||||  |  |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||     
T  20895 caaatctatcttgctgaaaacttttcaacccactaactgatccatcaaatcattaattctcggaagtggatacctattctttattgtcaccttgttcaat 20994  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    |||||||||||||| ||||    
T  20995 tgtcgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcttcactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacagttggtctaacaaactttttct 21094  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
     ||| || || || || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||     
T  21095 taagaaaatcttctaattgtttcttcaactcagctaactcggaagctgacatacgataaggtgccatcgacgccggcttcgttccaggaacaagatcaat 21194  T
Q  408 -------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                 || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  21195 agaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaaatcgcataccacttgtagcttatcaatcactgcttga 21294  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  21295 ttctcaatagataaagaagccatcaaagaaaacatcaatataccatcgcgttcctgttgcttcagctgcttggtagacaagaactctgcaccactttcct 21394  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  21395 cttcgacggaggagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtattccaaccagttcatacgcagaatcacatccataccgctcaa 21494  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  21495 aggtagacaaactaaatccatctcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggaaatttcaaacatacgagataagtagtcaccgaacccttagctggagtt 21594  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  21595 tcgacaaccatctctcc 21611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 457; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 36219 - 37035
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  36219 cgaaaggcataactttatactcatagtgaccataccgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatct 36318  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||| |||||||| ||||||  |  |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||     
T  36319 caaatctatcttgctgaaaacttttcaacccactaactgatccatcaaatcattaattctcggaagtggatacctattctttattgtcaccttgttcaat 36418  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    |||||||||||||| ||||    
T  36419 tgtcgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcttcactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacagttggtctaacaaactttttct 36518  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
     ||| || || || || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||  | ||| ||||||||||||||||||     
T  36519 taagaaaatcttctaattgtttcttcaactcagctaactcggaagctgacatacgataaggtaccatagacacaagattcattccaggaacaagatcaat 36618  T
Q  408 -------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                 || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  36619 agaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaaatcgcataccacttgtagcttatcaatcactgcttga 36718  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  36719 ttctcaatagataaagaagccatcaaagaaaacatcaatataccatcgcgttcctgttgcttcagctgcttggtagacaagaactctgcaccactttcct 36818  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  36819 cttcgacggaggagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtattccaaccagttcatacgcagaatcacatccataccgctcaa 36918  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  36919 aggtagacaaactaaatccatctcgaaatcacgaccaaacatagacaaaggaaatttcaaacatacgagataagtagtcaccgaacccttagctggagtt 37018  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  37019 tcgacaaccatctctcc 37035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 464; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 464; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 51456 - 50642
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||    
T  51456 aaaggcatgactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttaccttaatctggtgataacccgatctca 51357  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  51356 aatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttactttgttcaacta 51257  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
     |||||||| ||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||| | ||||||||    |||||||||||||||||||||    
T  51256 acgataatcgatacataatctcatactaccgtctttcttcttcactaacaaaaccggcgctccccatggtgaaacaattggtctaacaaacttcttctca 51157  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa--- 406  Q
    ||||| || || || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||| ||||       
T  51156 agcaaatcttctaattgtttcttcaactcagctaactcggaagctgacatacgataaggtgccatcaacaccggcttctttccaggaacaaggtcaatag 51057  T
Q  407 -----------gtcctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
               |  |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  51056 ataactcaactgctctctcctgaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacatcaggaaaatcgcataccacttgtagcttatcaatcactgcttgatt 50957  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||| ||| || |||||||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50956 ctcaatagacaaggaagccatcaaggaaaacatcacaataccatcgcgttctagttgcttcagctgcttagtagacaagaactctgcaccactttcctct 50857  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  50856 tcgactgaggagaaatacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtattttaaccagttcatacccataatcacatccataccgctcaaag 50757  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50756 gtagacaaactaaatccatctcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatatgagagaagtagtcactgaacccttagctggagtttc 50657  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||    
T  50656 gacaaccatctctcc 50642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 41889 - 42705
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  41889 cgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacgtgtcctaaaggccgtattctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacct 41988  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||| || ||||| || || |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || || || || ||||||    
T  41989 caaatcaattttactaaacacacgagcacccactaactgatccattaaatcatcaattctcggaagtggatacctgttcttaatcgtcactttattcaac 42088  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || || ||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||| || | ||| || ||||||||| |||| ||||| |  ||||| ||||| ||||| |    
T  42089 tgacggtaatctatacacaacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgctccccaaggcgaaacacttggtcttacaaatttcttat 42188  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || | |||||||||  ||||||| ||||     
T  42189 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagctaactcggaagctgacatacggtaaggtgccatcgacaccgacttcgttcctagaacaaggtcaat 42288  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||  ||| ||||| |  || |||||| | ||||||    
T  42289 tgaaaattcaacctccctctctggtggcacatctggaatctcatcaggaaacacttctggaaattcattcacaaccggcaatctgtcaatcgcagcttga 42388  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||| |  || ||| | ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| |  ||||||| ||| || |||||||| | |||  |  ||| ||| |    
T  42389 ttctctaacgacaaatatgccatcaaggaaaacattaaaattccatcacgttctaactgcttcaactgtttcgtagacaagagctcaacttcaccttctt 42488  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||    |||||  |||| || | ||| ||||| ||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| || | ||| |||| ||||||  ||||    
T  42489 cttcagtagaagaataatgcaccggcttactaaagcaattaatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaattacatccatacctgtcaa 42588  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     |||| ||||||||| || | |||||| || | ||||||||||||||| |||||  | | ||| || |||||| |||| |  ||||||||||||||||||    
T  42589 tggtaaacaaactaagtcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaagtagttattgaacccttagctggagtt 42688  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || |||||||| |||||    
T  42689 tcaacaaccatttctcc 42705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 445; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 445; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 722
Target Start/End: Complemental strand, 16102 - 15379
Alignment:
Q  14 gcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttc-actttaatctggtgataacctgatctcaaat 112  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16102 gcataaccttatattcataatgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatctttttactttaatctggtgataacctgatctcaaat 16003  T
Q  113 caatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccg 212  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16002 caatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgtcg 15903  T
Q  213 ataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagc 312  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  15902 ataatcaatacataacctcatactaccatctttcttctttactagcaaaattggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaatttcttctcaagc 15803  T
Q  313 aagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa------ 406  Q
    || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||          
T  15802 aaatcttccaactgtttcttcaactctgataattcggaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccaggaacaagatcaacagaaa 15703  T
Q  407 --------gtcctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctc 498  Q
              |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||  ||||| ||||||| || |||||||||||    
T  15702 actcaacttacctctctggaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaaatcgcataccacttgtagcttatcaattaccgcttgattctc 15603  T
Q  499 aacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcg 598  Q
    || ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  15602 aatagataaagaagccatcaaagaatacatcaaaataccatcacgttccagttgcttcagctgcttggtagataagaactctgcaccactttcctcttcg 15503  T
Q  599 acggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggta 698  Q
    ||| |||||||||  || |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  15502 acgaaagagaaatacaccgacttgctaaaacagttaatatgaacatggttgtactctaaccaattcatacctagaatcacatccataccgctcaaaggta 15403  T
Q  699 gacaaactaaatccatttcaaaat 722  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  15402 gacaaactaaatccatttcgaaat 15379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 413; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 41 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 8822 - 8146
Alignment:
Q  41 aacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccac 140  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  8822 aacgcgttctgaaagatgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccac 8723  T
Q  141 taacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactacca 240  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || | || ||||||||||    
T  8722 taactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggattcctattcttgatagttaccttcttcaattgtcgataatcattccatagcctcatactacca 8623  T
Q  241 tctttcttctttactagc-aaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactca 339  Q
    |||||||||||||||||| |||||  | |||||| |||||||||| |  ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  8622 tctttcttctttactagcaaaaaccagtgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaatttcttctcaaacaagtcttccaactgtttcttcaactca 8523  T
Q  340 gataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc-------aagtc-------ctctctggaggcacat 425  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||       || ||       ||||||||| ||||||    
T  8522 gataattcgaaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgtcccaggaactagatcaatagaaaactcaacttctctctctggacgcacat 8423  T
Q  426 caggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaa 525  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  8422 caggaatttcatctgggaaaacttcaggaaaatcacacaccacttgtagcttatcaatcactgcttgattctcaatagacaaagaagccattaatgaaaa 8323  T
Q  526 catcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgcta 625  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  8322 catcaagataccatcgcgttccagtttcttcagctgcttagtagataaaaactctgcaccactttcctcttcaacgaaagagaaatgcactgacttgcta 8223  T
Q  626 aaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagaca 702  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8222 aaacaatgaataagaacgtggttgtactctaaccaattcatacccagaatcacatccataccactcaaaggtagaca 8146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 10953 - 10914
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgt 47  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10953 cgaaaggcataactttatactcatagtgaccataacgcgt 10914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 411; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 91 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 11189 - 10455
Alignment:
Q  91 tggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttga 190  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  11189 tggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacatgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctgttcttaa 11090  T
Q  191 tagttacctt-gttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccg 289  Q
    ||||||| || |||||||||  | ||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |    
T  11089 tagttacttttgttcaactgatgttaatcgatacacaatctcatgctaccatctttcttcttcactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaacacttg 10990  T
Q  290 gtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgt 389  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |  ||||||||    
T  10989 gtctaacaaactttttctcgagcaaatcttctaactgattcttcaacacagctaactcggaagcagacatacgataagttttcatcgacatcggcttcgt 10890  T
Q  390 tccaggaacaagatcaag-------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagc 475  Q
    |||||||||||||||||              || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| || || |||||| |||||    
T  10889 tccaggaacaagatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcatgaatttcatctggaaaaacatcaggaaaatcgcataccacctgtagc 10790  T
Q  476 ctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaa 575  Q
     ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  10789 ttatcaatcactgcctgattctcaatagataaagaagccatcaaagaaaacatcaatataccatcgcgttccagttgcttcagcttcttagtagacaaga 10690  T
Q  576 actctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaat 675  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10689 actctgcaccactttcctcttcgacagaggagaaatacactgacttgctaaaacaactaatatgaacatgattgtactctaaccaattcatacccagaat 10590  T
Q  676 cacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcacc 775  Q
     |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  10589 tacatccataccgctcaaaggtagacaaactaaatccatctcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagttacc 10490  T
Q  776 gaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10489 gaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 10455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 393; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 700
Target Start/End: Original strand, 22 - 726
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22 aaaggcataactttatatacatagtgaccataccgtgttctgaaatctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctca 121  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||    
T  122 aatcaatcttgctgaaaacgcgtgcacccacaaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagtcacattgttcaagtg 221  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
     |||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||| |||||||||||||    
T  222 acgataatcgatacataatctcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaaaaaacttcttctca 321  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaaga------- 402  Q
    ||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||           
T  322 agcaaatcttctaactgtttcttcaactcagctaactcggaagctgacatacgctaaggtgccatcaacaccggcttcgttccaggaacaagattaatag 421  T
Q  403 -----tcaagt--cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
         |||| |   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||| ||||||| |||| ||||||    
T  422 aaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaattcgcataccacttgtagcttatcaattactgtttgatt 521  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||| |||||| |||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  522 ctcaatagataaggaagccatcagggaaaacatcaaaataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttggtagacaagaactctgcaccactttcctct 621  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  622 tcgactgaggagaaattcactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtattccaaccagttcatacccagaatcacatccataccgctcaaag 721  T
Q  696 gtaga 700  Q
    |||||    
T  722 gtaga 726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 8 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 5464 - 5066
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||||||||| || || || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  5464 cgaaatgcatcaccttatattcatagtgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacct 5365  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| || || || |||||||||||  ||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||    
T  5364 caaatcaatcttgctgaatacacgagcacccactaattgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctttatcgtaaccttgttcaac 5265  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| || | ||| || ||||||||| |||||||||| |  ||||| ||||| ||||| |    
T  5264 tgacgataatcaatgcaaaacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaatttcttat 5165  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||    
T  5164 caagcaagtcctccaattgtttcttcaacttagccaactcggaagctgacatacgctaaggtaccatcgacaccggcttcgttcctggaacaaggtcaa 5066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 8 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 9895 - 9497
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||||||||| || || || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  9895 cgaaatgcatcaccttatattcatagtgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacct 9796  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| || || || |||||||||||  ||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||    
T  9795 caaatcaatcttgctgaatacacgagcacccactaattgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctttatcgtaaccttgttcaac 9696  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| || | ||| || ||||||||| |||||||||| |  ||||| ||||| ||||| |    
T  9695 tgacgataatcaatgcaaaacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaatttcttat 9596  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||    
T  9595 caagcaagtcctccaattgtttcttcaacttagccaactcggaagctgacatacgctaaggtaccatcgacaccggcttcgttcctggaacaaggtcaa 9497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 381; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 3625 - 4441
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3625 cgaaaggcataactttatactcataatgtccatactgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatct 3724  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    || ||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  3725 cagatctatcttgctgaaaacacttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcgaaagtggatacctattctttattgttactttgttcaac 3824  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||| || |||| || | |||||||||| |  |||||||||||||| ||||    
T  3825 tgtcgataatcaatacacaacctcatgctaccatccttcttctttactaacaacacaggcgttcgccaaggtgaaacacttggtctaacaaactttttct 3924  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaaga----- 402  Q
    ||||||| || || || |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||         
T  3925 caagcaaatcttctaattgtttcttcaactccgctaactctgaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaggcttcgttccaggaacaagattaat 4024  T
Q  403 -------tcaagt--cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
           |||| |   ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||| ||||| |||||  ||||  |||||||||| ||||||    
T  4025 agaaaattcaacttctctctctggaggcacatcaggaatctcattaggaaaaacttatggaaaatcacataccacttgtagtttatcaatcaccgcttga 4124  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||  |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  4125 ttctcaatagataaggaagccatcaaagaaaacatcaagattccatcatgttctaactgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgtgccactttcct 4224  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||||||||  || ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||  | || |||||||||| ||||||||||||    
T  4225 cttcagcagaagagaaatacaccgacttactaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccaatttttgccaagaatcacattcataccactcaa 4324  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||| |||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  4325 aggtaaacaaaccaaatcgatctcaaaatcacgatcaaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagatggagtt 4424  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  4425 tcgacaaccatctctcc 4441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 365; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 25058 - 24242
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25058 cgaaaggcatcactttatattcatattgtccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcatcatctttcactttaatctggtgataacccgatct 24959  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||    
T  24958 caagtcaatcttgctgaaaacacttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattatcggaagtggatacctattctttatcgttattttgttcaac 24859  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||| |  ||||| |||||||| ||||    
T  24858 tgtcgatagtcaatacacaatctcatgctaccatccttcttctttactaacaagacaggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaactttttct 24759  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc--- 404  Q
    | ||||| || || |  ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||| || || |||||||| || |||||||||||       
T  24758 cgagcaaatcttctatttgtttcttcaacttagctaactcggaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaggcttcgtacccggaacaagatcaat 24659  T
Q  405 ----aagtc-------ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
        || ||       |||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||  ||||| || || |||||  ||||  |||||||||| ||||||    
T  24658 cgaaaattcaacttctctctctagaggcacatcaagaatttcatcaggaaaaacttatggaaaatcgcataccacttgtagtttatcaatcaccgcttga 24559  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| ||| || |||||||| || |||| |||||| || ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24558 ttctcaatagacaaggaagccatcaaagaaatcatcaaaattccatcacgttctaactgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccacttttct 24459  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||||||||  || || || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  24458 cttcagcagaagagaaatacaccgatttactaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccagttcatgccaagaatcacatccataccactcaa 24359  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||| |||||| ||||| ||   |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24358 aggtaaacaaaccaaatcaatcctaaaatcacgatcaaacatagacaaaggacatctcaaacgcacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtt 24259  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  24258 tcgacaaccatctctcc 24242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 319 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 10574 - 10075
Alignment:
Q  319 tccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaagt---------- 408  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |              
T  10574 tccaactgtttcttcaactcagctaactcggaagctgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaaggtcaattgaaaattcaa 10475  T
Q  409 ----cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacaga 504  Q
        ||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||  |||||  ||||  || |||||||| ||||||||||| |  ||    
T  10474 cctccctttctggtggtacatctggaatctcgtccggaaaaacttcaggaaactcattcaccattggtaaactgtcaatcacagcttgattctctaacga 10375  T
Q  505 taaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaa 604  Q
     ||| |  ||||| | |||||||| |  || ||||| || ||||  ||||||| ||| |||||||  |  |||||||| ||||| || |||||  |  ||    
T  10374 caaatatcccattgaagaaaacataagaattccatcacgctccaactgcttcaactgtttagtagttaggaactctgctccactctcttcttccgcaaaa 10275  T
Q  605 gagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaa 704  Q
    || ||||| || | ||||||||||||||| ||| ||||  |||| ||||||||||||||||| || | ||| |||| ||||||  |||| |||| |||||    
T  10274 gaaaaatgcaccgtcttgctaaaacaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaataacatccatacccgtcaacggtaaacaaa 10175  T
Q  705 ctaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 804  Q
    |||| || | |||||| || | || |||||||||||| |||||| | | ||| || |||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10174 ctaagtcgacttcaaagtctctactaaacatagacaacggacatcttagacaaactagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccat 10075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 360; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 146 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 12331 - 11669
Alignment:
Q  146 gatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatcttt 245  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  12331 gatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgacgatagtcaatacacaatctcatgctaccatcttt 12232  T
Q  246 cttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataac 345  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||||||  ||||    
T  12231 cttctttactagcaaaactagcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaatttcttctcgagcaaatcttctaattgtttcttcaactcatctaac 12132  T
Q  346 tcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaagt--------------cctctctggaggcacatcaggaa 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||                |||||||||||||||||| ||||    
T  12131 tcggaagcagacatacgataaggtgtcatcgacaccagcttcgttccagggacaagatcaatagaaaactcgacttccctctctggaggcacatccggaa 12032  T
Q  432 tctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaa 531  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |   | |||||  ||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  12031 tttcatctggaaaaacttcaggaaagttgaataccacttgtagcttatcaattaccgcttgattctcaatagataaagaagccatcaaagaatacatcaa 11932  T
Q  532 gataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaa 631  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  11931 aataccatcgcgttccagttacttcagctgcttagtagataagaactctacaccactttcctcttcgacagaagagaaatacactgacttgctaaaacaa 11832  T
Q  632 ttaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaa 731  Q
    || ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  11831 ttgatatgaacatggttgtactctaaccaattcatacccataatcacatccataccgctcaagggtagacaaactaaattcatttcaaaatcacgactaa 11732  T
Q  732 acatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagttt 794  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  11731 acatagataaaggacatctcaaacatacgagacaagtagtcaccgaacccttagctggagttt 11669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 358; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 811
Target Start/End: Original strand, 17842 - 18658
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17842 cgaaaggcatcaccttatactcataatgtccataccgcgttctaaaagttgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatct 17941  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||| ||||||| ||| |||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  17942 caaatctatcttgctgaaaacacgt-cacccaccaactgatccatcaagtcatcaattattggaagtggatacctattctttattgttactttgttcaac 18040  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || |||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||| |||||||||| |  |||||||||||||| ||||    
T  18041 tgtcgataatcaataaacaatctcatgctaccatctttcttcttcactaacaaaacgggtgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaactttttct 18140  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    ||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||| |||||  ||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||| ||||||||     
T  18141 caagcaaatcttctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctaacatacgataaggtgtcatagacacaggcttcgttccaggaataagatcaat 18240  T
Q  408 -------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                 || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |||| || || |||||  ||||  |||||||||||||||||    
T  18241 agaaaattcaacttctctctctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttatagaaaatcgcataccacttgtagtttatcaatcactgcttga 18340  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18341 ttctcaatagataaggaagccatcaaagaaaacatcaaaattccatcacgttctaactacttcagctgcttagtagacaaaaactctgcgccactttcct 18440  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||||||||  || ||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||    
T  18441 cttcagcagaagagaaatacaccgacttactaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaaggattacatccataccactcaa 18540  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18541 aggtaaacaaaccaaatcaatttcaaaatcacaatcaaacatagacaaaggacatcttaaacacacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtt 18640  T
Q  794 tcgacaaccatctctccg 811  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18641 tcgacaaccatctctccg 18658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 357; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 3774 - 4590
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3774 cgaaaggcatcactttatattcatagtgtccataacgcgttctaaaagctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatatggtgataacccgatct 3873  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||    
T  3874 caaatctatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattcttggaagtggatacctattttttatcgttactttgttcaac 3973  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    | || ||| |||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||| ||||    
T  3974 taccaatagtcaatgtacaatctcatactaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaactttttct 4073  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc--- 404  Q
    ||||||| || || || |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||| |||||||||||       
T  4074 caagcaaatcttctaattgtttcttcaactcagctaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaagcttcgttcccggaacaagatcaat 4173  T
Q  405 ----aagtc-------ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
        || ||       || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || || |||||| | ||| |||||||||| ||||||    
T  4174 cgaaaattcaacttctctttctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttatggaaaatcgcataccacctgaagcttatcaatcaccgcttga 4273  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| ||| || |||||||| || ||||||||||| ||  |||| ||||| | |||||||||||| |||||||| || |||||||| | ||||||||    
T  4274 ttctcaatagacaaggaagccatcaaagaaaacatcaaaatttcatcacgttctaattgcttcagctgtttagtagataagaactctgcgcaactttcct 4373  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||||||||  || ||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||  | ||||| |||| |||||||| |||    
T  4374 cttcagcagaagagaaatacaccgacttactaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcatgacaagaattacatccataccacacaa 4473  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| | | ||||| || || ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  4474 aggtaaacaaaccaaatcaatttcaaaatcatgatcaaacatagacaaaggacttcttaaacacacaagggaagtagtcaccgaaccctcagctggagtt 4573  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  4574 tcgacaaccatctctcc 4590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 349; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 809
Target Start/End: Original strand, 40825 - 41638
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40825 cgaaaggcatcactttatactcataatgtccatatcgcattctaaaagctgtcttctgcatatctttatctttcactttaatctggtgataacccgatct 40924  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  40925 caaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcagttcttggaagtggatacctattctttattgttactttgttcaac 41024  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  41025 tgtcgatagtcaatacacaatctcgtactaccatctttcttcttaactagaaaaattggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaacttcttat 41124  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    ||||||| || || || ||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||  | ||||||| ||| || || ||||||||||| |||| || |||||     
T  41125 caagcaaatcttctaagtgtttcttcaactcagccaactcagaagctgacat--ggtaaggtgtcatagacacaggcttcgttcccggaataaaatcaat 41222  T
Q  408 -------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                 || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  41223 cgaaaattcaacttctctttctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaacacttctggaaaatcgcataccacctgtaacttataaatcactgcttga 41322  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  41323 ttctcaatagacaaagatgccatcaaagaaaacatcaagattccatcacattctaattgcttcagctgcttagtagacaagaactctgcgccactttcct 41422  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||||||||  || ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||| | || || |||| ||||||||||||    
T  41423 cttcagcagaagagaaatacaccgacttactaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaacaaattcatatcaaggattacatccataccactcaa 41522  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41523 aggtaaacaaactaagtcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaaaggacatcttaaacacacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtt 41622  T
Q  794 tcgacaaccatctctc 809  Q
    | ||||||||||||||    
T  41623 ttgacaaccatctctc 41638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 809
Target Start/End: Original strand, 74545 - 75358
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  74545 cgaaaggcatcactttatactcataatgtccatatcgcattctaaaagctgtcttctgcatatctttatctttcactttaatctggtgataacccgatct 74644  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  74645 caaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcagttcttggaagtggatacctattctttattgttactttgttcaac 74744  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  74745 tgtcgatagtcaatacacaatctcgtactaccatctttcttcttaactagaaaaattggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaacttcttat 74844  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    ||||||| || || || ||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||  | ||||||| ||| || || ||||||||||| |||| || |||||     
T  74845 caagcaaatcttctaagtgtttcttcaactcagccaactcagaagctgacat--ggtaaggtgtcatagacacaggcttcgttcccggaataaaatcaat 74942  T
Q  408 -------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                 || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  74943 cgaaaattcaacttctctttctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaacacttctggaaaatcgcataccacctgtaacttataaatcactgcttga 75042  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  75043 ttctcaatagacaaagatgccatcaaagaaaacatcaagattccatcacattctaattgcttcagctgcttagtagacaagaactctgcgccactttcct 75142  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||||||||  || ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||| | || || |||| ||||||||||||    
T  75143 cttcagcagaagagaaatacaccgacttactaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaacaaattcatatcaaggattacatccataccactcaa 75242  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  75243 aggtaaacaaactaagtcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaaaggacatcttaaacacacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtt 75342  T
Q  794 tcgacaaccatctctc 809  Q
    | ||||||||||||||    
T  75343 ttgacaaccatctctc 75358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 410 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 35411 - 35012
Alignment:
Q  410 ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaag 509  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  | |||||  ||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| |    
T  35411 ctctctagaggtacatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaaatcgtataccacttgtagcttatcaatcactgtgtgattctcaatagataagg 35312  T
Q  510 aagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaa 609  Q
    | ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35311 acgccatcaaggaaaacatcaaaataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttggtagacaagaactctgcaccactttcctcttcgacggaggagaa 35212  T
Q  610 atgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaa 709  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  35211 atacactgacttgctaaaacaattaatgtgaacatggttgtattccaaccagtttatacccag-atcacatccataccgcttaaaggtagacaaactaaa 35113  T
Q  710 tccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctc 809  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35112 tccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagacgtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctc 35013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 8 - 500
Target Start/End: Original strand, 55948 - 56454
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  55948 cgaaaggcatcactttatactcataatgtccatatcgcgttctaaaagttgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatct 56047  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||    |  |||||||||    
T  56048 caaatcaatcttgttaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattctcggaagtggatacctattctttatcaacattttgttcaac 56147  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    | |||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  56148 taccgacagtcaatacacaatctcatactaccatctttcttctttactaacaaaacgtgcgctccccacggtgaaacacttggtcttacaaacttcttat 56247  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||| ||| | |||||||| ||||||| ||| || || |||||||| || |||| ||| ||||     
T  56248 caagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagccaactcagaaactgacatacggtaaggtgtcatagacacaggcttcgtacccggaataaggtcaat 56347  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |               ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |  || |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  56348 tgaaaattcaacttctctctctggaggcacatctggaatttcatcaggaaaaacttcgggaaaattgcataccacctgtaacttatcaatcactgcttga 56447  T
Q  494 ttctcaa 500  Q
    |||||||    
T  56448 ttctcaa 56454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 88 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 8859 - 8568
Alignment:
Q  88 atctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattct 187  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    ||||| |||| | |||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||    
T  8859 atctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctcagcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattct 8760  T
Q  188 tgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcc 287  Q
    | ||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| |||| ||| ||||| || ||| | || ||||| |     
T  8759 taatagtcaaattgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgctcccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccacggcgaaacact 8660  T
Q  288 cggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaa 379  Q
     ||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||| |||   ||||| || |||||||| ||||| || || |||||||    
T  8659 tggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactctgatgcagacatccgatacggcgcaatcgaaa 8568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 344; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 810
Target Start/End: Original strand, 2797 - 3608
Alignment:
Q  13 ggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaat 112  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2797 ggcatcactttttattcatagtgtccatatcgcgttctaaaaggtgtcttctggatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaat 2896  T
Q  113 caatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccg 212  Q
    | |||||| | ||||| |||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  2897 ctatcttgatgaaaacacgtgcatccactaactgatccatcaagtcatcaattcatggaagtggatacctattctttatcgttactttgttcaactgccg 2996  T
Q  213 ataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagc 312  Q
    | | ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||    
T  2997 acagtcaatacacaatctcatactaccatcttacttctttactatcaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaactttttctcaagc 3096  T
Q  313 aagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag----- 407  Q
    || ||||| |  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||| ||| || |  ||| |||||||  ||||||||||||          
T  3097 aaatcctctagttgtttcttcaactcagctaactcagaagctgacatatgataaggtgtcatagacataggcgtcgttcccagaacaagatcaatcgaaa 3196  T
Q  408 --------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctc 498  Q
            || || ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||  ||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  3197 attcaacttctctttctagaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttctggaaaatcgcataccacttgtagtttatcaatcactacttgattctc 3296  T
Q  499 aacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcg 598  Q
    || ||| || |||||||| || ||||||||||| || ||||  ||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||     
T  3297 aatagacaaggaagccatcaaagaaaacatcaaaattccataacgttctaactgcttcagctgtttagtagataaaaactctgcgccactttcctcttcc 3396  T
Q  599 acggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggta 698  Q
     | ||||||||||  || ||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  3397 gcagaagagaaatacaccgacttactaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccataccactcaaaggta 3496  T
Q  699 gacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgac 798  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  3497 gacaaaccaaatcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaaatagttaccgaaaccttagctgcagtttcgac 3596  T
Q  799 aaccatctctcc 810  Q
    ||||||||||||    
T  3597 aaccatctctcc 3608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 343; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 28589 - 27952
Alignment:
Q  14 gcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatc 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28589 gcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatc 28490  T
Q  114 aatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccga 213  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||              ||   |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  28489 aatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccattaaattt-------------gttagtacctattcttgatagttactttgttcaactgacga 28403  T
Q  214 taatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagca 313  Q
    ||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  28402 taattgatacataacctcatactaccatctttcttctttactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacactcggtctaacaaacttcttctcaagca 28303  T
Q  314 agtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag------ 407  Q
    | || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||           
T  28302 aatcttctaactgtttcttcaactcagctaactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttagttccatgaacaagatcaatagaaaa 28203  T
Q  408 -------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctca 499  Q
           || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28202 ctcgacttctctctctagaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaaatcgcataccacttgtagcttatcaatcactgcttgattctca 28103  T
Q  500 acagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcga 599  Q
    | ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |    
T  28102 atagataaagaagccatcaaagaaaacatcaaaataccatcgcgtttcagttgcttcagctgcttggtagataagaactctgcaccactttcctcttcta 28003  T
Q  600 cggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgt 650  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  28002 cggaagagaaatacactgacttgctaaaacaattaatatgaacatggttgt 27952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 339; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 810
Target Start/End: Original strand, 7428 - 8230
Alignment:
Q  22 ttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgc 121  Q
    ||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  7428 ttatactcataatgtccataccacgttctgaacgctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaagtcaatcttgc 7527  T
Q  122 taaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaat 221  Q
    | |||||    |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||     
T  7528 tgaaaacattagcacccactaactgatccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatacctattctttatcgttactttgttcaactgtcgatagtcaac 7627  T
Q  222 acacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctcc 321  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||||||| |||||||| || |||||     
T  7628 acacaacctcatgctaccatctttcctcttcactaacaaaacgggcgctccccaaggtgaaacacttcgtctaacaaactttttctcaagtaaatcctct 7727  T
Q  322 aactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-------------t 408  Q
    || |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||              |    
T  7728 aattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaggcttcgttccaggaacaagatcaatagaaaattcaactt 7827  T
Q  409 c-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataa 507  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||  ||||  ||||  ||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  7828 ctctctctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttctggaaaatcgcatgccacttgtagtttatcaatcattgtttgattctcaatagataa 7927  T
Q  508 agaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagag 607  Q
     |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |  ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||    
T  7928 ggaagccatcaaagaaaacatcaaaataccatcacgttctaactgcttcagctgcttaattgacaaaaactctgcgccactttcctcttcagcagaagag 8027  T
Q  608 aaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaacta 707  Q
    ||||  || || || ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||| |    
T  8028 aaatacacagaattactaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatccatagcactcaacggtagacaaacca 8127  T
Q  708 aatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctc 807  Q
    |||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8128 aatgaatctcaaaatcacgatcaaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctc 8227  T
Q  808 tcc 810  Q
    |||    
T  8228 tcc 8230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 332; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 103426 - 104234
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  103426 cgaaaggcatcactttatactcatagtgtccataacgcgttctaaaatccatcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgatct 103525  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||        ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  103526 caaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaattgatccatcaa--------ttctcggaagtggatacctattctttatcgttactttgttcaac 103617  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    |  ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||| |||||||||| |  ||||| |||||||| || |    
T  103618 tatcgataatcaatgcacaatctcatactaccatctttcttcttaactagcaatatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaactttttat 103717  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||| || || || |||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| || || |||||||| || |||||||| ||||     
T  103718 caagtaaatcttctaactgtttcttcaactcagccaactcagaagctgacatacggtaaggtgtcatagacacaggcttcgtacccggaacaaggtcaat 103817  T
Q  408 -------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                 || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||| ||| | ||||||||||  |||||    
T  103818 cgaaaattcaacttctctttctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttctggaaaatcgcataccacctgtaacttatcaatcacctcttga 103917  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| ||| || || ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  103918 ttctcaatagacaaggatgccatcaaagaaaacatcaaaattccatcacgttctaattgcttcagctgcttggtagacaaaaactctgcgccactttcct 104017  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||||||||  || ||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||| ||||||||    
T  104018 cttcagcagaagagaaatacaccgacttgctaaaacaagtaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcatacccatgattacatccatgccactcaa 104117  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  104118 aggtaaacaaaccaagtcaatttcaaaatcacgatcaaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagttacctaacccttagctggagtt 104217  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  104218 tcgacaaccatctctcc 104234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 325; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 24646 - 23830
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24646 cgaaaggcatcactttatattcataatgtccataacgcgttctaaaagccgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatct 24547  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||| || |  |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||    
T  24546 caaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaattgatccattaagtcgtcaattcttggaagtggatacctattctttatcgttactttattcaac 24447  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| | |||||||| |  ||||| ||||||| ||| |    
T  24446 tgtcaataatcaatgcacaatatcatactaccatctttcttctttactagcaatatcggcgctccccacggtgaaacacttggtcttacaaactacttat 24347  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||| || || || || |||||||||| |||||  ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| || || |||||||| || |||||||| ||||     
T  24346 caagaaaatcttctaattgtttcttcatctcagccaactcagaagctgacatacggtaaggtgtcatagacacaggcttcgtacccggaacaaggtcaat 24247  T
Q  408 -------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                 || || ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||  ||||||| ||  ||| | ||||||||| ||||||     
T  24246 cgaaaattcaacttctctttctagaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttctgggaaaccacacacaacttgtaacttatcaatcattgcttgt 24147  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||  |||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  24146 ttctcaacagacaaggacgccatcaaagaaaacatcaaaatttcatcacgttctaattgcttcagctgcttggtagacaagaactctgcgccactttcct 24047  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||||||||    
T  24046 cttcagcagaagaaaaatataccgacttactaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccagttcataccaaggattacatccattccactcaa 23947  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23946 aggtaaacaaaccaaatcaatttcaaaatctcgaccaaacatagacaaagaacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtt 23847  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  23846 tcgacaaccatctctcc 23830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 150762 - 151574
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |  || || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  150762 cgaaaggcatcactttatattcatagtgtccatatcatgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacct 150861  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||    
T  150862 caagtcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctttattgtaactttgttcaac 150961  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||| || |||| |||| ||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||| |||||||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  150962 tgacgatagtcaatgcataacctcatagtaccatccttcttcttaaccagcaataccggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaacttcttat 151061  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||| || |    |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||     
T  151062 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagcaagttcggacgccg----acgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaaggtcaat 151157  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||| || || | ||| |||||||| ||||||    
T  151158 tgaaaattcaacctccctctctggtggcacatctggaatctcatccggaaaaacttcaggaaactcattcacaactggcaacctgtcaatcacagcttga 151257  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    || || |  || ||| | ||||| || | |||||| ||||| ||||| || ||||  ||||||| ||| || ||||| |  |||||||| ||||| || |    
T  151258 ttttctaacgacaaatatgccatcaaaggaaacattaagattccatcacgctccaactgcttcaactgtttcgtagataggaactctgctccactctctt 151357  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||| ||||  |||| ||||||||||||||||| || | ||| |||| ||||||  ||||    
T  151358 cttccgcagaagaaaaatgcaccgtcttgctaaaacaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaataacatccatacccgtcaa 151457  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
      ||| ||||||||| || | |||||  || | ||||||||||||||| |||||| | | ||| || |||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  151458 ctgtaaacaaactaagtcgacttcaatgtctctaccaaacatagacaacggacatcttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtt 151557  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || |||||||| |||||    
T  151558 tcaacaaccatttctcc 151574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 319; Significance: 1e-179; HSPs: 3)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 18454 - 17646
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||| |||||| |||||||||||||||    
T  18454 cgaaaggcataactttgtactcatagtgatcataccgcgttctgaaagttgtcttctgcatatcttcatcttttactataatctagtgataacctgatct 18355  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||| |||||||| ||||||  ||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  18354 caaatctatcttgctgaaaacttttgcactcactaactgatccatcaaatcatcaatcctcagaagtggatacctattctttattgtcaccttgttcaac 18255  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||| |  |||||||||||||| ||||    
T  18254 tgtcgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcttcactagcaaaaccggcgctctccaaggtgaaacacttggtctaacaaactttttct 18155  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa- 406  Q
    | ||||| ||||| || |||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||||| || ||| || |  ||||||||||  |||| ||||||||     
T  18154 cgagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataagatgtcatagacataggcttcgttcgtggaagaagatcaat 18055  T
Q  407 -------------gtcctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                   |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||  ||||  |||| ||||| ||||||    
T  18054 cgaaaactcaacttccctctctggaggcacatcaggaatttcatcgggaaaaacttctggaaaatcgcacaccacttgtagtttatctatcaccgcttga 17955  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    |  |||| |||||| ||||||||  | ||||||||||| || ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17954 t--tcaatagataaggaagccatcgaagaaaacatcaaaatgccatcacgttccaactgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcgccactttcct 17857  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||  |||| |||     ||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  17856 cttcagcagaagagaaatacactgacttactataacaattaatgtgaacatgg-----ctccaaccagttcataccaataatcacatccataccactcaa 17762  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    |||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||| || |||||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  17761 aggtaagcaaactaaatccatctcaaaatcacgatcaaacatagac-aaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcagcgagcccttagctggagtt 17663  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||||||||| |||||    
T  17662 tcgacaaccatttctcc 17646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 66 - 810
Target Start/End: Original strand, 39307 - 40065
Alignment:
Q  66 catatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaatt 165  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||  ||||||||| ||| | ||||| || | ||||||     
T  39307 catatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcgatcttactaaaaacttttgcacccaccaactggtccatgaagtcatcaatc 39406  T
Q  166 ctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactg 265  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||| || ||||| ||||| ||||||| | | ||||| || ||||||||||| | ||| ||      
T  39407 ctcggaagtggatacctgttctttatcgtaactttgttcaattgacgatagtcaatgcacaacctcgtgctaccgtccttcttctttaccaacaacacaa 39506  T
Q  266 gcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgata 365  Q
    |||||||| |  ||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| || || |||||||||||    
T  39507 gcgctccccacagtgaaacactgggtctaacaaacttcttatcaagcaagtcttccaactgtttcttcaattcagctaactcagatgctgacatacgata 39606  T
Q  366 aggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc-------aagt-------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttca 451  Q
     ||||||||||| || | ||||||||| |||||||| ||       || |       ||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  39607 tggtgccatcgacaccgacttcgttcctggaacaaggtcgatggagaactcaacctccctctctggtggcacatctggaatctcatcctgaaaaacttca 39706  T
Q  452 ggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagtt 551  Q
    |||||||||  |||||| |||| |||||||||||| |||||||| || |  || |||   |||||||| ||| ||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  39707 ggaaattcattcaccactggtaacctatcaatcacagcttgattttctaacgacaaatttgccattaaagaatacatcaaaattccatcacgttctagtt 39806  T
Q  552 gcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgta 651  Q
    | |||| ||| || |||||||| |||||  || |||  || |||||  ||||||| ||||| || | ||| ||||| ||||| ||| ||||  |||| ||    
T  39807 gtttcatctgtttcgtagacaagaactccacatcaccctcttcttcatcggaagaaaaatgcaccgtcttactaaagcaatttatatgaactcggttata 39906  T
Q  652 ctctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttc 751  Q
    ||||||||| ||||| || | | | |||| ||||||  |||| |||||||| ||||| || |   ||||||| | ||||||||||||||| |||||  |     
T  39907 ctctaaccaattcattccaaaactaacatccatacctgtcaacggtagacacactaagtcgaccacaaaatctctaccaaacatagacaacggacacctt 40006  T
Q  752 aaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||| || |||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  40007 aaacagacaagagaagtagttactaaacccttggctggagtttcaacaaccatttctcc 40065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 8 - 401
Target Start/End: Original strand, 22067 - 22460
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || || || ||||| |||||||| || || || || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||    
T  22067 cgaaaggcatcaccttgtactcataatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacct 22166  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| || ||||| |||||||||  | ||||||| ||| | |||||||| | |||||| |||||||||||||| || ||||| || || || |||||||||    
T  22167 caagtcgatcttactaaaaactttttcacccaccaactggtccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatatctgttctttatcgtaactttgttcaac 22266  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    ||  |||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||  | ||| || ||||||||| | |||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  22267 tgatgataatcaatgcacaacctcatgctaccatccttcttctttaacaacaacacaggcgctccccacggtgaaacactgggtctaacaaacttcttat 22366  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaag 401  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  22367 caagcaagtcttccaactgtttcttcaattcagctaactcagatgctgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaag 22460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 317; Significance: 1e-178; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 217533 - 216717
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  217533 cgaaaggcatcactttatattcataatgtccataacgtgttctaaaggacgtcttctgcatatcctcgtctttcactttaatctggtgataacccgatct 217434  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || || || ||||||||     
T  217433 caaatcaatcttgcaaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcttggaagtggatacctattctttatcgtcactttgttcaat 217334  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||| ||||| | |||||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  217333 tgtcgataatcaatacacaatctcatactaccatctttcttcttaactagcaatatcggcactccccacggtgaaacacttggtcttacaaacttcttat 217234  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||| || || || |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||| | ||||||| |||  | || |||||||| || |||| ||||||||     
T  217233 caagtaaatcttctaactgtttcttcaactcagccaactcagaagcatacatatggtaaggtgtcataaacacaggcttcgtacccggaataagatcaat 217134  T
Q  408 t----------cctctct----ggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
               | |||||    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||   | ||||||||||| ||| ||| | ||||||||| |||||||    
T  217133 cgaaaattcaacttctctttttggaggcacatcaggaatctcattaggaaaaacttataggaattcacacacaacctgtaacttatcaatcattgcttga 217034  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||||||| || || ||| | || ||||||||||| || ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||     
T  217033 ttctcaacagacaaggacgccgtcaaagaaaacatcaaaatcccatcgcgttctaattgtttcagctgcttagtagacaagaattttgcgccactttccg 216934  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||| ||||  || ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||||||||    
T  216933 cttcagcagaagaaaaatacaccgacttactaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccagttcataccaaggattacatccattccactcaa 216834  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||| |||||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  216833 aggtaaacaaaccaaatcaattttaaaatctcgaccaatcatagacaaaggacatctgaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtt 216734  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || ||||||||||||||    
T  216733 tctacaaccatctctcc 216717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 317; Significance: 1e-178; HSPs: 4)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 4107 - 4922
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| || | |||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4107 cgaaagacatcactttatattcataatgtctataacgtgttctaaaagccgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatct 4206  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
     ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||  | ||||||    
T  4207 taaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccacaaaatgatccatcaaatcatcaattcttggaagcggatacctattctttatcgttactctattcaac 4306  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| |   |||||||| | |||||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  4307 tgtcgataatcaatacacaatctcatactaccatctttcttcttaacaagcaatatcagcgctccccacggtgaaacacttggtcttacaaacttcttat 4406  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagat---- 403  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| || || |||||||| || |||||||| |        
T  4407 caagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagccaactcagaagccgacatacggtaaggtgtcatagacacaggcttcgtacc-ggaacaaggttaat 4505  T
Q  404 --------caagtcctct--ctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
            ||| | ||||  || ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  4506 cgaaaattcaacttctctttctagagacacatcaggaatttcatcaggaaaaacttcagggaaatcacacacaacctgtaacttattaatcactgcttga 4605  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||||||| ||  | ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |    
T  4606 ttctcaacagacaagaacgccatcaaagaaaacatcaaaattccatcgcgttctaattgcttcagctgcttagtagacaagaattctgctccactctctt 4705  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    |||||   ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||    
T  4706 cttcggtagaagaaaaatatactgacttactaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccagttcatacccaggattacatccattccactcaa 4805  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||| | ||||| || |||||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  4806 aggtaaacaaactaagtcaatttcaaactcttgaccaaacaaagacaaaggacatgttaaacacacaagagaagtagttactaaacccttagctggagtt 4905  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  4906 tcgacaaccatctctcc 4922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 8 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 45540 - 44730
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || || ||||| || |||||||| || || || || ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  45540 cgaaaggcatcaccttttattcttaatgaccatatcgtgtcctaaaggccatcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacct 45441  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||| ||||||||   ||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||     
T  45440 caagtcaatcttactaaaaacctttgcacccactaactgatccatcaagtcatcaatcctcggaagcggatatctattcttaattgtaactttgttcaat 45341  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||| | ||| || ||||||||| ||||||| || |  ||||| ||||||||||| |    
T  45340 tgacgatagtcaatgcacaacctcatactaccatcctttttctttaccaacaataccggcgctccccaaggtgagacacttggtcttacaaacttcttat 45241  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||     
T  45240 caagcaagtcttccaactgcttctttaattcagctaactcggaagctaacatacgataaagtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaaggtcaat 45141  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              ||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||| || || | ||| ||||||||  |||||    
T  45140 tgaaaattcaacctccctttctggtggcacatctggaatctcatccggaaaaacttcaggaaactcattcacaactggcaacctgtcaatcacaacttga 45041  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||| |  || ||| | |||||||| |||||||| |  || ||||| || ||||  ||||||| ||| || ||||  |  |||||||| ||||| || |    
T  45040 ttctctaacgacaaatatgccattaaagaaaacataagaattccatcacgctccaactgcttcaactgtttcgtagttaggaactctgctccactctctt 44941  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||    ||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||| ||||  |||| ||||||||| ||||||| || | ||| |||| ||||||  ||||    
T  44940 cttccgtagaagaaaaatgcaccgtcttgctaaaacaattgatatgaactcggttatactctaactagttcatcccaaaaataacatccatacctgtcaa 44841  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     |||| ||||||||| || | |||||| || | ||||||||||||||| |||||  | | ||| || |||||| |||| || |||||||||| |||||||    
T  44840 cggtaaacaaactaagtcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagttggagtt 44741  T
Q  794 tcgacaaccat 804  Q
    || ||||||||    
T  44740 tcaacaaccat 44730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 8 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 40446 - 39636
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||    
T  40446 cgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacttttatctgatgataaccagacct 40347  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgt-gcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 206  Q
    |||||||||||| ||||| | || | ||||| || ||| |||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  40346 caaatcaatcttactaaata-tcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttcttgatcgtaactttgttcaa 40248  T
Q  207 ctgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttc 306  Q
    ||| || ||||| |||||||  | |||||||||||| ||||||||||| | ||| || || |||||| |||||||||| |  ||||| |||||||||||     
T  40247 ctgacggtaatctatacacagtctcatactaccatccttcttctttaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaacttctta 40148  T
Q  307 tcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    || | || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  40147 tctaacaggtcctccaactgtttcttcaactcagctaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggcttagttcctggaacaagatcaa 40048  T
Q  407 gt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttg 492  Q
     |              ||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||  ||| || ||||  | ||||||||| |||||    
T  40047 ttgaaaattcaacctccctctctggtggcacatcaggaatctcatcagggaatacttctggaaattcattcactacaggtaaaccatcaatcacagcttg 39948  T
Q  493 attctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcc 592  Q
    ||| || |  || ||    |||||||  ||| |||||| ||||||||| ||||| |  || |||| ||| || ||||||| || |||  |  ||| |||     
T  39947 attttctaacgacaattgtgccattagagaatacatcaggataccatcacgttcaaactgtttcatctgttttgtagacagaagctcaacctcaccttct 39848  T
Q  593 tcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactca 692  Q
    |||||  | |||||||||||||| | ||| ||||| || || ||| ||||  | || ||||||||||| |||||||| |  || |||| ||||||  |||    
T  39847 tcttcagcagaagagaaatgtaccgtcttactaaagcagttgatatgaactcgattatactctaaccaattcataccaaagataacatccatacccgtca 39748  T
Q  693 aaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagt 792  Q
    | || |||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||| | ||||||   || ||| || |||||| | || || |||||||||||||||||    
T  39747 acggcagacaaactaaatcaatcacaaaatctctaccaaacatagatataggacaccgcagacaaacaagagaagtggttactgaacccttagctggagt 39648  T
Q  793 ttcgacaaccat 804  Q
    ||| ||||||||    
T  39647 ttcaacaaccat 39636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 582 - 810
Target Start/End: Original strand, 14203 - 14431
Alignment:
Q  582 caccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacata 681  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  14203 caccactttcctcttcagcggaagaaaaatacactgacttgctaaaacaattgatatgaacatggttgtactctaaccaattcatacccagaatcacatc 14302  T
Q  682 cataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaaccc 781  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14303 cataccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatcgcaaaaatacgagagaagtagtcaccgaaccc 14402  T
Q  782 ttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14403 ttagctggagtttcgacaaccatctctcc 14431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 14592 - 13776
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14592 cgaaaggcatcactttatattcataatgtccataacgtgttctaaaagcagtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatct 14493  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||| |||||||||||  ||||||| || ||||| || |||||     
T  14492 caaatcaatcttgctgaacacacgtgcacccactaactgatccataaaatcattaattcttggaagtggatatttattctttatcgttactttattcaag 14393  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||| | | |||||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  14392 tgtcgataatcaatgcataacctcatgctaccatctttcttcttaactagcaatatcggcgctctccacggtgaaacacttggtcttacaaacttcttat 14293  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc--- 404  Q
    |||| || || || |||| ||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| || || |||||||| ||||||||||||||       
T  14292 caagtaaatcttctaactttttcttcaactcagccaactcagaagccgacatacggtaaggtgtcatagacacaggcttcgtaccaggaacaagatcaat 14193  T
Q  405 ----aagtc-------ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
        || ||       || |||||||||||||| | ||| ||||  |||||||||   || || |||||||| ||| ||| | ||||||||| |||||||    
T  14192 cgaaaattcaacttctctttctggaggcacatcggaaatttcataaggaaaaactaatgggaaatcacacacaacctgtaacttatcaatcattgcttga 14093  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||||||| ||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||    
T  14092 ttctcaacagacaagaatgccatcaaagaaaacatcaaaattccatcacgttctaatagcttcagctgcttagtagacaagaattatgcgccactttcct 13993  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||||||||    
T  13992 cttcagcagaagaaaaatacactgacttactaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccagttcataccaaggattacatccattccactcaa 13893  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| | || || || |||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  13892 aggtaaacaaactaaatcaattttaaaatctcgaccaaacatagacaatggacatcttaatcacacaagagaagtagtcaccgaactcttagctggagtt 13793  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  13792 tcgacaaccatctctcc 13776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 6)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 495211 - 496027
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  495211 cgaaaggcatcactttatattcataatgtccataacgtgttctaaaagccgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatcaggtgataaccagatct 495310  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  495311 caaataaatattgctaaacacacgtgaacccactaactgatccatcaagtcatcaattcttggaagtggatacctattctttatcgttactttgttcaac 495410  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| | |||| ||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  495411 tgtcgataatcaatgcataatctcatactaccatctttcttcttaactagcaataccggcgctccccacggtgcaacacttggtcttacaaacttcttat 495510  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    ||||||| || || || | ||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| || || | ||| || || |||| ||||||||     
T  495511 caagcaaatcatctaaatatttcttcaactcagccaactcagaagctgacatacggtaaggtgtcatagacacagacttagtacccggaaaaagatcaat 495610  T
Q  408 -------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                 || || ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || |||  || | ||||||||| |||||||    
T  495611 cgaaaattcaacttctctttctagaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttctggaaaatcgcatacaacctataacttatcaatcaatgcttga 495710  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |    
T  495711 ttctcaacggacaaggacgccatcaaagaaaacatcaaaattccatcacgttctaattgcttcagctgcttggtagacaagaactctgcgccactttcat 495810  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||    ||||| ||||  || ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||||||||    
T  495811 cttcagaagaagaaaaataaaccgacttactaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccagttcataccaaggattacatccattccactcaa 495910  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||| |||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  495911 aggtaaacaaaccaaatcaatttaaaaatctcgaccaaacatagacaaagaacatcttaaaaacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtt 496010  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||    
T  496011 tcgacaaccatctctcc 496027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 8 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 453326 - 452651
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||  | || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||    
T  453326 cgaaaggcatcactttatattcatagtgtccatatcgtgtcttaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacccgacct 453227  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||| ||||| || || |  |||||||||||| ||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||| || || || || |||| |    
T  453226 caaatcaattttgctgaatacactagcacccactaactgatccattaaatcatcgatcctcggaagtggatacctattctttatcgtcactttattcagc 453127  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || || ||||| ||||| |||| | | |||||||| |||||||| || ||||| |  ||| ||||| | |||||||| | || ||| ||||| ||||| |    
T  453126 tgacggtaatctatacataacctcgtgctaccatccttcttcttaaccagcaatatcggcactccccacggtgaaacactcgatcttacaaatttcttat 453027  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||     
T  453026 caagcaagtcctctaactgtttcttcaactcagctaactcggacgccgacaaacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaaggtcaat 452927  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||  ||| ||||| |  ||||||||||| ||||||    
T  452926 tgataattcaacttccctctctggtggcacatctggaatctcatcaggaaaaacttccgaaaattcattcacaaccggcaaactatcaatcacagcttga 452827  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||| |  || ||| | ||||| || ||||| || |  || ||||| || ||||  ||||||| ||| |||||||  |  ||||| || ||||| || |    
T  452826 ttctccaacgacaaatatgccatcaaagaaaatattagaattccatcacgctccaactgcttcaactgtttagtagttaggaactcagctccactctctt 452727  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacc 669  Q
    ||||  | ||||| || |  || | ||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  452726 cttcagcagaagaaaagtacaccgtcttactaaaacaattaatatgaacatggttatactccaaccagttcatacc 452651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 515466 - 515077
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| || || || |||||||| || || || || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| || ||    
T  515466 cgaaaggcatcactttgtaatcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatggtaaccagacct 515367  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgt-gcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 206  Q
    ||| |||||||| ||||||| || | ||||| || ||| |||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||    
T  515366 caagtcaatcttactaaaaa-tcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcatcaattctaggaagcggatacctattctttatcgtaaccttgttcaa 515268  T
Q  207 ctgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttc 306  Q
    ||| || ||||| || ||||  | |||||||||||| |||||||| || | ||| || || |||||| |||||||||| |  ||||| ||||| |||||     
T  515267 ctgacggtaatctatgcacagtctcatactaccatccttcttcttaaccaacaacaccggtgctccccaaggtgaaacactgggtcttacaaatttctta 515168  T
Q  307 tcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaa 397  Q
    || | || ||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  515167 tccaacaggtcttccaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatacggtatggtgccatcgacaccggctttgttcctggaa 515077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 205 - 606
Target Start/End: Original strand, 441078 - 441493
Alignment:
Q  205 aactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttct 304  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| || |||||||||| |  ||||| ||||||||||    
T  441078 aactgtcgataatcaatacacaacctcatactaccatctttcttcttaactagcaataccggcgctacccaaggtgaaacacttggtcttacaaacttct 441177  T
Q  305 tctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc 404  Q
    | ||||| || || || |||| ||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||| | | ||| || ||  ||||||| || |||||||||||    
T  441178 tatcaagtaaatcttctaactatttcttcaactcagccaactcagaagccgacatacggtaatgcgtcatagacacatgcttcgtacccggaacaagatc 441277  T
Q  405 -------aagtc-------ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgct 490  Q
           || ||       || ||| | |||||||||||||| | ||| ||||||||||| || || || ||||| ||| ||| | ||||||| ||||||    
T  441278 aatcgaaaattcaacttctctttctaggggcacatcaggaattttatcaggaaaaacttctgggaagtcgcacacaacctgtaacttatcaattactgct 441377  T
Q  491 tgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccacttt 590  Q
    |||||||||||||| || || ||||  || ||||| ||||| || |||||  | || |  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  441378 tgattctcaacagacaaggacgccaccaaagaaaatatcaaaattccatcatgctctaactgtttcagctgcttagtagacaagaactctgctccactct 441477  T
Q  591 cctcttcgacggaaga 606  Q
    | |||||||| |||||    
T  441478 cttcttcgacagaaga 441493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 657 - 810
Target Start/End: Original strand, 441507 - 441660
Alignment:
Q  657 accagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaaca 756  Q
    |||| |||||||| ||||| |||| ||| |||||| |||| | |||||| ||||| || | |||||| | |||||||||||| ||||||||| | | |||    
T  441507 accaattcataccaagaattacatccattccactctaaggcaaacaaaccaaatcaatctaaaaatctctaccaaacatagataaaggacatcttagaca 441606  T
Q  757 tacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
     || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  441607 cactagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatttctcc 441660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #6
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 652 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 514808 - 514656
Alignment:
Q  652 ctctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttc 751  Q
    ||||||||| ||||| || | |||||||| ||||||  |||| |||| |||||||||||| |   ||||||| | |||||||||||| | ||||||   |    
T  514808 ctctaaccaattcattccaaaaatcacatccatacccgtcaacggtaaacaaactaaatcaaccacaaaatctctaccaaacatagatataggacacccc 514709  T
Q  752 aaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 804  Q
    | ||| || |||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  514708 agacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccat 514656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 24 - 804
Target Start/End: Original strand, 17085 - 17879
Alignment:
Q  24 atattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgcta 123  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  17085 atattcataatgtccataacgtgttctaaaagttgtcttctgcatatcctcgtctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaattaatcttacta 17184  T
Q  124 aaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatac 223  Q
    || || ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||     
T  17185 aacacacgtgcacccactaattgatccatcaaatcatcaattcttggaagtggatacctattctttatcgttactttattcaactgtcgataatcaataa 17284  T
Q  224 acaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaa 323  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||| || || |||||| | |||||||| |  ||||| ||||||||||| ||||| || || || |     
T  17285 acaatctcatactaccatctttcttcttaactaacaataccggtgctccccacggtgaaacacttggtcttacaaacttcttatcaagaaaatcttctag 17384  T
Q  324 ctgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc-------aagtc------- 409  Q
    ||| ||||||||||||   ||||  ||||| |||||||| ||||| | |||  | || |||||||| || |||||||||||       || ||           
T  17385 ctgcttcttcaactcaatcaactaagaagccgacatacggtaaggagtcataaacacaggcttcgtacccggaacaagatcaatcgaaaattcaactact 17484  T
Q  410 ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaag 509  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  17485 ctttctggaggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttctggaaaatcacatacaacctgtaacttatcaatcactgcttgattctcaacagacaagg 17584  T
Q  510 aagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaa 609  Q
    | ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |    ||||| ||    
T  17585 atgccatcaaagaaaacatcaaaattccatcgcgttctaattgcttcagctacttagtagacaaaaactctgctccactttcttctacagtagaagaaaa 17684  T
Q  610 atgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaa 709  Q
    ||  || |||||   ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  17685 atacaccgacttaacaaaacaattaatatgaacatgattgtactctaaccagttcataccaaggattacatccattccactcaaaggtaaacaaaccaaa 17784  T
Q  710 tccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 804  Q
    || |||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17785 tcaatttcaaagtctcgaccaaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccaaacccttagctggagtttcgacaaccat 17879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 252 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 111776 - 111204
Alignment:
Q  252 tactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaa 351  Q
    ||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||||||||  ||||| |||    
T  111776 tactaacaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaactttttctcaagcaaatcttctaattgtttcttcaactcagccaactcagaa 111677  T
Q  352 gcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcat 437  Q
    || |||||||| ||||||| ||| || || ||||||||||| |||||||||||||              || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  111676 gctgacatacggtaaggtgtcatagacacaggcttcgttcctggaacaagatcaatcgaaaactcaacttctctttctggaggcacatcaggaatttcat 111577  T
Q  438 ctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagatacc 537  Q
      ||||||||||| ||||| || || |||||| ||||  ||||||||| | |||||||||||| ||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||    
T  111576 taggaaaaacttctggaaaatcgcataccacctgtagtttatcaatcattacttgattctcaatagacaatgatgccatcaaggaaaacattaagattcc 111477  T
Q  538 atcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaata 637  Q
    ||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  | ||||||||||  || ||||| |||||||||||||||    
T  111476 atcacgttctaactgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcgccactttccttttcagcagaagagaaatacaccgacttactaaaacaattaata 111377  T
Q  638 agaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatag 737  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||| ||||||||     
T  111376 tgaacatggttgtactctaaccagttcatgccaagaatcacatccataccactcaaaggtaaacaaaccaagtcaatttcaaaatcacgatcaaacataa 111277  T
Q  738 acaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||||| ||| | ||||| || |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  111276 acaaagggcatcttaaacacacaagagaagtagtcaacaaacccttagctggagtttcgacaaccatcactcc 111204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 6064 - 6880
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6064 cgaaagacatcactttatattcataatgtccataacgcattctaaaagtcgtcttctgcatatcctgatctttcactttaatctggtgataacccgatct 6163  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  6164 caaatcaatcttgctaaacacacgtgcactcactaactgatccaacaagtcatcaattcttggaagtggatacctattctttatcgttactttgttcaac 6263  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    |   |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||| ||| |||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  6264 tattgatagtcaatacacaatctcatactaccatctttcttcttaactagaaataccggcgctccccaagttgaaacacttggtcttacaaacttcttat 6363  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    ||||||| || || || |||||||| |||||||  | ||| ||||| |||||| | ||||||| |||  | || |||||||| || |||| ||| ||||     
T  6364 caagcaaatcttctaaatgtttctttaactcagccagctcagaagctgacatatggtaaggtgtcataaacacaggcttcgtacccggaataaggtcaat 6463  T
Q  408 -------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                 || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||| ||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  6464 cgaaaattcaacttctctttctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacatctagaaaatcacataccacctgtaacttatcaatcactgcttga 6563  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    |||||||||||  | ||  |||| || |||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| || |||||||  ||||||||||    
T  6564 ttctcaacagaagaggacaccatcaaagaaaacattaaaattccatcacgttctaattgcttcagctgcttggtagataagaactctgtgccactttcct 6663  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||||||||  || ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||||||||    
T  6664 cttcagcagaagagaaatacaccgacttactaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccagttcataccaaggattacatccattccactcaa 6763  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  6764 aggtaaacaaaccaagtcaatttcaaaatctcgaccaaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccaaacccttagctggagtt 6863  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||||||||| |||||    
T  6864 tcgacaaccatttctcc 6880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 13194 - 14010
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13194 cgaaagacatcactttatattcataatgtccataacgcattctaaaagtcgtcttctgcatatcctgatctttcactttaatctggtgataacccgatct 13293  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  13294 caaatcaatcttgctaaacacacgtgcactcactaactgatccaacaagtcatcaattcttggaagtggatacctattctttatcgttactttgttcaac 13393  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    |   |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||| ||| |||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  13394 tattgatagtcaatacacaatctcatactaccatctttcttcttaactagaaataccggcgctccccaagttgaaacacttggtcttacaaacttcttat 13493  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    ||||||| || || || |||||||| |||||||  | ||| ||||| |||||| | ||||||| |||  | || |||||||| || |||| ||| ||||     
T  13494 caagcaaatcttctaaatgtttctttaactcagccagctcagaagctgacatatggtaaggtgtcataaacacaggcttcgtacccggaataaggtcaat 13593  T
Q  408 -------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                 || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||| ||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  13594 cgaaaattcaacttctctttctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacatctagaaaatcacataccacctgtaacttatcaatcactgcttga 13693  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    |||||||||||  | ||  |||| || |||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| || |||||||  ||||||||||    
T  13694 ttctcaacagaagaggacaccatcaaagaaaacattaaaattccatcacgttctaattgcttcagctgcttggtagataagaactctgtgccactttcct 13793  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||||||||  || ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||||||||    
T  13794 cttcagcagaagagaaatacaccgacttactaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccagttcataccaaggattacatccattccactcaa 13893  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  13894 aggtaaacaaaccaagtcaatttcaaaatctcgaccaaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccaaacccttagctggagtt 13993  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||||||||| |||||    
T  13994 tcgacaaccatttctcc 14010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 2)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 9 - 777
Target Start/End: Original strand, 644 - 1426
Alignment:
Q  9 gaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctc 108  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| || |||||  || |||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  644 gaaaggcattaccttatactcataatgtccatactgcattctaaaagctgtcttctggacatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctc 743  T
Q  109 aaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 208  Q
    ||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||| ||    
T  744 aaatctatcttgcggaaaacacgtgcactcactaactgatccatcaagttatcaattctcggaagtggatacctattctttattgttactttattcagct 843  T
Q  209 gccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctc 308  Q
    | ||||| ||||||||||| | ||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |  |||||||||||||| |||||    
T  844 gtcgatagtcaatacacaatctcatgctactatcattcttctttactaacaaaactggcgctcctcaaggtgaaacacttggtctaacaaactttttctc 943  T
Q  309 aagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc---- 404  Q
    |||||| || || || |||||||||||||| |  ||||| |||||  ||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||        
T  944 aagcaaatcttctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctaacatacgataaggtgtcatagacacaggcttcgttccaggaacaagatcaata 1043  T
Q  405 ---aagtc-------ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgat 494  Q
       || ||       |||||  |||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| || || |||||  ||||  |||||||| |||||||||    
T  1044 gaaaattcaacttctctctcaagaggcacatcaggaatttcattaggaaaaacttctggaaaatcgcataccacttgtagtttatcaatcgctgcttgat 1143  T
Q  495 tctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctc 594  Q
    |||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  1144 tctcaatagataaggaagccatcaaagaaaacatcaagattccatcacgttctaactgcttcaactgcttagtagacaaaaactctacgccactttcctc 1243  T
Q  595 ttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaa 694  Q
    |||  | ||||||||||  ||  |||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||    
T  1244 ttcagcagaagagaaatacaccaacttactaaaacaattaatatggacatggttgtactctaaccagttcatgccaagaatcacatccgtaccactcaaa 1343  T
Q  695 ggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccga 777  Q
    |||| |||||| ||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||  | |||||| ||||||||||    
T  1344 ggtaaacaaaccaaatcaatctcaaaatcacgatcaagcatagacaaaggacatcttaaacacgcaagagaagtagtcaccga 1426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 773 - 810
Target Start/End: Original strand, 3521 - 3558
Alignment:
Q  773 accgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3521 accgaacccttagctagagtttcgacaaccatctctcc 3558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 2)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 10 - 748
Target Start/End: Complemental strand, 13322 - 12573
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  13322 aaaggcataactttgtactcatagtgaccataccgtgttctgaaagttgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggagataacccgatctca 13223  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    |||| ||  | || ||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||    
T  13222 aatctattcttctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattcttggaagtggatacttattctttatcgttactttgttcaactg 13123  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
    | |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||| |  ||||| |||||||| ||  ||    
T  13122 cggataatcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcttaactagcaaaaccggcgctccccaacgtgaaacacttggtcttacaaactttttacca 13023  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaaga------- 402  Q
    ||||| || || || |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||  || || || ||||||||||| |||||||||           
T  13022 agcaaatcttctaattgtttcttcaactcagctaactcagaagctgacatacgataaggtgttatagacacaggcttcgttcccggaacaagatcaatcg 12923  T
Q  403 -----tcaagtcctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattct 497  Q
         |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||  ||||  |||||||| ||||||||||||    
T  12922 aaaattcaacttctctctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttctggaaagtcgcatactacttgtagtttatcaatcgctgcttgattct 12823  T
Q  498 caacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttc 597  Q
    |||  ||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  12822 caattgataaggacgccatcaaggaaaacatcaagattccatcacgttctaactgcttcagctgcttagtaga-tagaactctgcaccactttcctcttc 12724  T
Q  598 gacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggt 697  Q
      | ||||||||||  ||  | || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||| | || ||||||||||||||||    
T  12723 agcagaagagaaatacaccaatttactaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccagtgcatgccaagaattatatccataccactcaaaggt 12624  T
Q  698 agacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacat 748  Q
    |  ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  12623 aagcaaaccaaatcaatttcaaaattacgatcaaacatagacaaaggacat 12573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 682 - 810
Target Start/End: Original strand, 1868 - 1996
Alignment:
Q  682 cataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaaccc 781  Q
    |||||| |||||||||| |||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  1868 cataccgctcaaaggtaaacaaaccatatcaatctcaaaatcacgatcaaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaaccc 1967  T
Q  782 ttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1968 ttagctggagtttcgacaaccatctctcc 1996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 338 - 810
Target Start/End: Original strand, 7779 - 8265
Alignment:
Q  338 cagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaagt--------------cctctctggaggcac 423  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||                ||||| |||||||||    
T  7779 cagataattcggaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgtttcaggaacaagatcaatagagaactcaacttccctctttggaggcac 7878  T
Q  424 atcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaa 523  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  7879 atcaggaatttcatctgggaaaacttcaggaaaatcgcataccacttgtagcttatcaatcactgcttgattctcaatagataaagaagccattaaagaa 7978  T
Q  524 aacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgc 623  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  7979 aacatcaaaataccatcacgttccatttgcttcagctgcttagtagataagaactctgcaccactatcctcttcggcggaagagaaatacactgacttgc 8078  T
Q  624 taaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatc 723  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8079 taaaacaattaatatgaacatggttgtactccaaccaattcatacccagaatcacatccataccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatc 8178  T
Q  724 acgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8179 acgaccaaacatagacaacggacaatgcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 8265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 3)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 5304 - 6120
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| |||  |||||||||  | |||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||    
T  5304 cgaaaggcatcactgaatattcataaagcccataacgtgttctaaaggccgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacccaatct 5403  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  5404 caaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccaacaaatcatcaattataggaagtggatacctattctttatcgttactttgttcaac 5503  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    |  ||||||||||| || |||| ||| |||||||| ||||||||  ||||||| || ||||||||| | |||||||| |  ||||| |||||||||||||    
T  5504 tatcgataatcaatgcataacctcatgctaccatccttcttcttatctagcaataccggcgctccccacggtgaaacacttggtcttacaaacttcttct 5603  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||| || || || || ||||| ||||||||||  ||||| ||| | |||||||| ||||| | ||| || |  |||||||| || ||||||| |||||     
T  5604 caagtaaatcttctaattgttttttcaactcagccaactcagaaactgacatacggtaaggcgtcatagacagaggcttcgtacccggaacaatatcaat 5703  T
Q  408 -------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttc-aggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttg 492  Q
                 || || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||| ||| | | | ||||||||||||||||    
T  5704 cgaaaattcaacttctctttctagcggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttttaggaaat-cacacacaacctgcaacttatcaatcactgcttg 5802  T
Q  493 attctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcc 592  Q
    |||||||||||| || || ||||| || | ||||||||  || ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||     
T  5803 attctcaacagacaaggacgccatcaacgtaaacatcagaattccatcacgttctaattgcttcagctgcttagtagataagaactctgctccactttct 5902  T
Q  593 tcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactca 692  Q
    ||||| || ||||| ||||  || ||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||    
T  5903 tcttcaaccgaagaaaaatacaccgacttactaaaacaattaatatgaacgttgttgcactctaaccagttcatacccaggattacatccattccactca 6002  T
Q  693 aaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagt 792  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6003 aaggtaaacaaaccaaatcaatttcaacatctcgaccaaacattgacaaaggacatcttaaacacacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagt 6102  T
Q  793 ttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||| |||||||||    
T  6103 ttcgacaatcatctctcc 6120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 265 - 810
Target Start/End: Original strand, 14571 - 15130
Alignment:
Q  265 ggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgat 364  Q
    ||||||||| ||||||| || |  ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  14571 ggcgctccccaaggtgagacacttggtcttacaaacttcttatcaagcaaatcctccaactgtttcttcaattcagctaactcggaagctgacatacgat 14670  T
Q  365 aaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaagt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttc 450  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||| |||| |              ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14671 aaggtgccatcgacaccagcttcgttcctggaacaaggtcaattgaaaattcaacctccctctctagtggcacatcaggaatctcatcaggaaacacttc 14770  T
Q  451 aggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagt 550  Q
      ||||||||  |||||  || | ||| ||||||||  ||||||| || |  || ||| | |||||| | ||| |||| |  || ||||| ||||| |||    
T  14771 tagaaattcattcaccattggcaacctgtcaatcacaacttgattttctaacgacaaatatgccatttaagaatacataagaattccatcacgttctagt 14870  T
Q  551 tgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgt 650  Q
    || |||| ||| || |||||||| |||||  |  |||  || |||||  | ||||| ||||| || | ||| ||||| ||||| ||| ||||  |||| |    
T  14871 tgtttcatctgtttcgtagacaagaactcaacttcaccctcttcttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttactaaagcaattgatatgaactcggttat 14970  T
Q  651 actctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacattt 750  Q
    |||||||||| ||||| || | ||| |||| ||||||  |||| || | ||||||||| || | ||||||||| | || |||||||||||| |||||  |    
T  14971 actctaaccaattcattccaaaaataacatccatacccatcaacggcaaacaaactaagtcgacttcaaaatctctacgaaacatagacaatggacacct 15070  T
Q  751 caaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
     | ||| || |||||| ||||  | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  15071 tagacaaactagagaagtagttgctgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcc 15130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 254
Target Start/End: Original strand, 11314 - 11560
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || || ||||| || || ||||| || || || || || |||||||||||||||| ||||||||| |||||| | || |||||||| ||    
T  11314 cgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctaatccttcaccttaatcagatggtaacctgacct 11413  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||| ||||||||   ||||||||| ||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||| | ||||| || || || || |||||     
T  11414 caagtcaatcttactaaaaacctttgcacccaccaactgatccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatacatgttctttatcgtaactttattcaat 11513  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttac 254  Q
    || | ||||||||| ||||||| ||| ||||| || |||||||||||    
T  11514 tgacaataatcaatgcacaacctcatgctaccgtccttcttctttac 11560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 285; Significance: 1e-159; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 1495 - 675
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||    
T  1495 cgaaaggcataactttgtactcataatggccatactgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatatggtgataacccgatct 1396  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||| | |||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| |||    
T  1395 caaagctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccataaaatcatcaatcctcggaagtggataccttttctttattgtcaccttgtttaac 1296  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccat----ctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttc 303  Q
    || ||||| |||||||||||   ||| |||||||    |||||||||| |||||||||||  |||||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||     
T  1295 tgtcgatagtcaatacacaatatcatgctaccatatatctttcttcttcactagcaaaaccagcgctccccaaggcgaaacacttggtctaacaaacttt 1196  T
Q  304 ttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagat 403  Q
    |||||||| |  || || || |||||||||||||| |  |||||  ||||  ||||||||||||||| ||| || || ||||| ||||||||||||||||    
T  1195 ttctcaagtagatcttctaattgtttcttcaactcggccaactcataagctaacatacgataaggtgtcatagacacaggctttgttccaggaacaagat 1096  T
Q  404 caagt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgc 489  Q
    |||                ||||||| ||||||||| |||| | ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||  ||||  |||||||||||||    
T  1095 caatcgaaaactcaacttccctctctagaggcacattaggactttcatcaggaaaaacttctggaaaatcgcataccacttgtagtttatcaatcactgc 996  T
Q  490 ttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactt 589  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||| | | ||||||    
T  995 ttgattctcaatagataaggaagccatcaaggaaaacatcaaaatgccatcacgttctaactgcttcagctgctttgtagataaaaacttttcgccactt 896  T
Q  590 tcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccac 689  Q
    ||||||||    ||||||||||  || ||||| ||| ||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  895 tcctcttcagtagaagagaaatacaccgacttactataacaattaatgtgaacatggatgtactctaaccagttcatacccataatcacatccataccac 796  T
Q  690 tcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctgg 789  Q
     |||||||| |||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| || || ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  795 ccaaaggtaaacaaaccatatcaatctcaaaatcacgatcaaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagtgaagtagtcacagaacccttagctgg 696  T
Q  790 agtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  695 agtttcgacaaccatttctcc 675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1459 (Bit Score: 277; Significance: 1e-154; HSPs: 1)
Name: scaffold1459
Description:

Target: scaffold1459; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 410 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 1729 - 1329
Alignment:
Q  410 ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaag 509  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||| |||||||||| || |||||||| | ||||||||    
T  1729 ctctctggaggtacatcagcaatttcatctggaaaaacttcaggaaagtcacataccacttgtagcttatcaatcaccgcctgattctcgatagataaag 1630  T
Q  510 aagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaa 609  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  1629 aagccatcaacgaaaacatcaaaataccatcgcgttgcagttgcttcagctgcttagtagatagaaactctacaccactttcctcttcgatggaagagaa 1530  T
Q  610 atgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaa 709  Q
    ||  |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  1529 atacactgacttgctaaaacaattgatatgaacatggttgtactgtaaccaattcatacccagaatcacatccataccgctcaaaggtagacaaactaaa 1430  T
Q  710 tccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctc 809  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1429 tccatctcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctc 1330  T
Q  810 c 810  Q
    |    
T  1329 c 1329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 8 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 892 - 231
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  892 cgaacggcatcaccttatactcataatgtccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatct 793  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  792 caaatcaatcttgctgaaaacacgttcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcttggaagtggatacctattctttattgttaccttattcaac 693  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || || |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||||| ||||    
T  692 tgtcggtaatcaatacacaacctcatgctaccatccttcttcttcactaacaaaaccggcgctccccaaggcgaaacacttggtctaacaaactttttct 593  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa- 406  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || || |||||| ||||||||||||||||||     
T  592 caagcaaatcctctaattgtttcttcaactcgtccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaggcttcattccaggaacaagatcaat 493  T
Q  407 -------------gtcctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                   |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||  ||||  ||||  ||||||||||||||||     
T  492 agcaaattcaacttccctctctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaatacttctggaaaatcgcatgccacttgtagtttatcaatcactgcttgg 393  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagac--aaaaactctgcaccactttc 591  Q
    ||||||| |||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  392 ttctcaatagataaggaggccatcaaagaaaacatcaaaataccattgcgttctagttgcttcagctgcttggtagacaaaaaaactctgcgccactttc 293  T
Q  592 ctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtact 653  Q
    ||||||  | ||||||||||  || ||||| ||| ||||||||||  |||| ||||||||||    
T  292 ctcttcagcagaagagaaatacaccgacttactataacaattaatgtgaacatggttgtact 231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 275; Significance: 1e-153; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 16089 - 15276
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    |||||||| |||  ||| ||||| || ||||||||  |||| |||||  |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16089 aaaggcatcactgaatactcataatgtccataacgttttctaaaagccatcttctgcatatcctcgtcttttactttaatctggtgataacctgatctca 15990  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||| || ||  ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || || || ||||||||    
T  15989 aatcaatcttgctgaacacatgtgcacccactaactaatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctttattgtcactttattcaactg 15890  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||| ||| |  ||||| ||||||||||| |||    
T  15889 tcgataatcaatacacaacctcatactagcatctttcttcttaactagcaataccggcgctccccaaggtggaacacttggtctcacaaacttcttatca 15790  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc----- 404  Q
    ||||| || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| | ||| || || ||||||||||| |||||||||||         
T  15789 agcaaatcttctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacggtaaggcgtcatagacacaggcttcgttcccggaacaagatcaatcg 15690  T
Q  405 --aagtc-------ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
      || ||       || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||||   ||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  15689 aaaattcaacttctctttctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttctggaaaattacacgtaacttgtagcttatcaatcactgcttgatt 15590  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
    ||||||||| || || |||| |||  ||||||| |  ||  |||| || || |  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||    
T  15589 ctcaacagacaaggacgcca-taaaaaaaacattagaatttcatcacgctctaactgtttcagctgcttagtagacaagaactctgctccactctcttct 15491  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||||||| || ||||||||||  |||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||    
T  15490 tcgacagaagaaaaatacactgacttgttataacaattaatgtgaacatggttatactccaaccagttcataccaagaattacatccattccactcaaag 15391  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    | | |||||| ||||| || |||||||  | |||||||||||| |||||| || | ||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15390 gcaaacaaaccaaatcaatctcaaaatatctaccaaacatagataaaggatatcttaaacacactaaagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttc 15291  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
    ||||||||| |||||    
T  15290 gacaaccatttctcc 15276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 19 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 7189 - 6489
Alignment:
Q  19 actttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatct 118  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7189 actttatactcataatgtccataacgcgttctaaaagttgtcttctgcatatctccatctttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatct 7090  T
Q  119 tgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatc 218  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  7089 tgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcgtcaattcttggaagtggatacctattctttatcgtcactttgtttaactgtcgataatc 6990  T
Q  219 aatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcc 318  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| | |||||||| |  ||||| ||||||||||| ||||| || ||     
T  6989 aatacacaatctcatactgccatctttcttcttcactaacaaaacgggcgctccccacggtgaaacacttggtcttacaaacttcttatcaagaaaatct 6890  T
Q  319 tccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc-------aagtc-- 409  Q
    || || |||||||||||||||   ||||| ||||| |||||||  ||||||| ||| || || ||||||||||| |||||||| ||       || ||      
T  6889 tctaattgtttcttcaactcaaccaactcagaagctgacatacagtaaggtgtcatagacacaggcttcgttcccggaacaaggtcaatcgagaactcaa 6790  T
Q  410 -----ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacaga 504  Q
         || ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||    
T  6789 cttctctttctagaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttctggaaaatcgcataccacctgtaacttatcaatcactgcttgattctcaataga 6690  T
Q  505 taaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaa 604  Q
     || || |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||  | |||    
T  6689 caaggatgccattaaagaaaacatcaaaattccatcacgttctaactgcttcagctgcttagtagataagaactctacgccactttcctcttcagcagaa 6590  T
Q  605 gagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaa 704  Q
    |||||||  || ||||| || |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  6589 gagaaatacaccgacttacttaaacaattaatatgaacatggttgtactataaccagttcataccaaggattacatccataccactcaaaggtaaacaaa 6490  T
Q  705 c 705  Q
    |    
T  6489 c 6489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 2)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 8 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 7772 - 7106
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7772 cgaaaggcataactttgtactcataatgtccataacccgttctgaaagcagtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatct 7673  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||| |||||||| |||||   ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  7672 caaatctatcttgctgaaaacatttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcttgaaagtggatacctattctttattgtcaccttgttcaac 7573  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |  ||||||||||| |||||||    
T  7572 tgtcgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaatacttggtctaacaaatttcttct 7473  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa- 406  Q
    ||||||  || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||| ||  || || ||||||||||||||||||| |||||     
T  7472 caagcagatcttctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcacagacacaggcttcgttccaggaacaatatcaat 7373  T
Q  407 -------------gtcctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                   |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||  ||||   ||||||||||||||||    
T  7372 cgaaaattcaacttccctctctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaatacttctggaaaatcgcataccacttgtagttgatcaatcactgcttga 7273  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  7272 ttctcaatagataaggaagccatcaaagaaaacatcaaaataccatcacgttctaactgcttcagctgcttagtagacaaaaattctccgccactttcct 7173  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaacca 660  Q
    ||||  | ||||||||||  || ||||| ||| ||||||| ||  |||| ||||||||||| |||||    
T  7172 cttcagcagaagagaaatacaccgacttactagaacaattcatgtgaacatggttgtactccaacca 7106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 59 - 353
Target Start/End: Original strand, 3143 - 3437
Alignment:
Q  59 tcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaatt 158  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||     
T  3143 tcttctgcatatcctcatctttcactttaatctggtgatagcccgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaattgatccatcaaatc 3242  T
Q  159 atcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagc 258  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||| || | |    
T  3243 atcaattcttggaagtgggtacctattctttatcgtcactttattcaactgccgataatcaatacataacctcatgctaccgtctttcttcttaaccaac 3342  T
Q  259 aaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagc 353  Q
    || || |||| |||| |||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||  ||||| |||||    
T  3343 aacacgggcgttccccaaggtgaaacactcggtcttacaaacttcttatcaagcaaatcttctaactgtttcttcaattcagccaactcagaagc 3437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 265; Significance: 1e-147; HSPs: 5)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 24411 - 23595
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| |||  ||||| |||||| | |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||||  ||||    
T  24411 cgaaaggcatcactgaatatttatagtgtcaataacgtgttctaaaagttgtcttctgcatatcctcgtcttttactttaatctagtgataacccaatct 24312  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  24311 caagtcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattctcggaagtggatacctattctttatcgttaccttattcaac 24212  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || |||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||| |||||||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  24211 tgtcgataatcaatacataatctcatgctaccatctttcttcttaactagcaataccggtgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaacttcttat 24112  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc--- 404  Q
    ||||||| || || || ||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| || || ||||||  ||| |||||||||||       
T  24111 caagcaaatcttctaattgtttcttcaattcagctaactcagaagccgacatacggtaaggtgtcatagacacaggcttcaatcccggaacaagatcaat 24012  T
Q  405 ----aagtc-------ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
        || ||       |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| || ||||| ||  ||||| ||||||| |||| ||      
T  24011 cgaaaattcaatttctctctctggcggcacatcaggaatctcatcaggaaagacttatggaaaatcgcacacaacttgtagcttatcaattactgttttg 23912  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| ||| || || || || ||||||||||| || ||  |||| || || |  || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |    
T  23911 ttctcaatagacaaggacgctatcaatgaaaacattaaaatttcatcacgctctaactggttcagctgcttagttgacaagaactctgctccactctctt 23812  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
     |||||| ||||| ||||  || |||||| || ||||||||||  |||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||    
T  23811 attcgacagaagaaaaatacaccgacttgttataacaattaatgtgaacatggttatactccaaccagttcataccaagaattacatccattccactcaa 23712  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
    ||| | |||||| ||||| || |||||||| | |||||||||||| ||| ||||| | ||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  23711 aggcaaacaaaccaaatcaatctcaaaatctctaccaaacatagataaatgacatcttaaacacacaagagaagtagtcgccgaacccttagctggagtt 23612  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||||||||| |||||    
T  23611 tcgacaaccatttctcc 23595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 10854 - 10611
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| |||  |||||| || || |||||||| || || || || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  10854 cgaaaggcatcactgaatattcgtaatgtccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacccgatct 10755  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  10754 caaatcaatcttgctgaatacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcagttcttggaagtggatacctattctttatcgttaccttattcaac 10655  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctt 251  Q
    || ||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||    
T  10654 tgtcgataatcaaggcataacctcatactaccatctttcttctt 10611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 417 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 10041 - 9648
Alignment:
Q  417 gaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccat 516  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||  | || || ||||| ||  ||| | ||||||| ||||||||||||||||| || || || |||||    
T  10041 gaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttctaggaagtcgcacacaacttgtaacttatcaattactgcttgattctcaactgacaaggacgccat 9942  T
Q  517 taatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtact 616  Q
     || ||||| || || || ||||| || || |  || ||||| || ||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||  |||| ||||  ||     
T  9941 caaagaaaatattaaaattccatcacgctctaactgtttcagttgattagtagacaagaactctgctgcactctcttcttcgacaaaagaaaaatacacc 9842  T
Q  617 gacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccattt 716  Q
    |||||  || ||||||||||  |||| |||||  |||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| | ||||||||| | |||||| ||||| || |    
T  9841 gacttattataacaattaatgtgaacatggttacactccaaccagttcataccaagaattacatccattctactcaaaggcaaacaaaccaaatcaatct 9742  T
Q  717 caaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||||||||| | | ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9741 caaaatctctaccaaacatagataaaggacatcttagacacactagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatttctcc 9648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 10207 - 10066
Alignment:
Q  265 ggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgat 364  Q
    ||||||||| |||||||||| |  ||||| ||||||||||| |||||||| || |  || | ||||||||| || |  ||||| ||||| |||||||| |    
T  10207 ggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaacttcttatcaagcaaatcttgtaattatttcttcaattcggccaactcagaagctgacatacggt 10108  T
Q  365 aaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    |||| | ||| || || |||||||| || |||||||||||||    
T  10107 aaggcgtcatagacacaggcttcgtacccggaacaagatcaa 10066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 17046 - 16958
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtga 96  Q
    |||||||||| |||  |||||| || || |||||||| || || || || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  17046 cgaaaggcatcactgaatattcgtaatgtccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtga 16958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 2)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 325 - 810
Target Start/End: Original strand, 12171 - 12670
Alignment:
Q  325 tgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-------------tc-c 410  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||  | ||||||||||||||||||||||              || |    
T  12171 tgtttcttcaactcagctaactcggaagctgacatacgataaggttccatagacacaagtttcgttccaggaacaagatcaatagaaaactcaacttctc 12270  T
Q  411 tctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaaga 510  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| |     
T  12271 tctctggaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaaatcgcataccacttgtagcttatcaatcactgcttgattttcaatagataaggt 12370  T
Q  511 agccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaa 610  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  12371 agccatcaaggaaaacatcaaaataccatcgcgttctagttgcttcagctgcttggtagacaagaactctgcaccactttcctctttgacggaggagaaa 12470  T
Q  611 tgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaat 710  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||| || | ||||||||||||||| |  ||||| | ||    
T  12471 tacactgacttgctaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccaattcagaccaagaatgacgtccataccactcaaaggcaagcaaaccatat 12570  T
Q  711 ccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12571 caatctcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 12670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 95
Target Start/End: Original strand, 4389 - 4474
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtg 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  4389 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttttgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttaccttaatctggtg 4474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 262; Significance: 1e-145; HSPs: 2)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 12 - 699
Target Start/End: Original strand, 77 - 778
Alignment:
Q  12 aggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaa 111  Q
    ||||| ||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  77 aggcaaaactttatactcataatgtccataccgcgttctaaaagccgtcttctgcatatcttcatccttcactttaatctagtgataacccgatctcaaa 176  T
Q  112 tcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgcc 211  Q
    || |||||| | ||||| || |||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |    
T  177 tctatcttgttgaaaacacgcgcacccactaacggatccatcaagtcatcaattcttggaagtggatacctattctttatagttacttttttcaactgac 276  T
Q  212 gataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaag 311  Q
     ||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  277 aataatcaatgcataatctcatactaccatctttcttctttactagcaacacgggtgctccccaaggcgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaag 376  T
Q  312 caagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc------- 404  Q
     || || || || ||||||||||||||||  ||||| ||||  |||||| ||||||||  ||| || || | |||||||||||||||||||||           
T  377 aaaatcttctaattgtttcttcaactcagccaactcagaagttgacatatgataaggtttcatagacacagtcttcgttccaggaacaagatcaatagaa 476  T
Q  405 aagtc-------ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattct 497  Q
    || ||       || |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||| |  || |||||| ||| | ||| ||||| |||||||||||    
T  477 aattcaacttctctttctggaggcacatcaggaatttcatcaagaaaaacttctggaaacttgcataccacctgtaacttataaatcattgcttgattct 576  T
Q  498 caacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttc 597  Q
    ||| |||||| |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||     
T  577 caatagataatgaagccatcagagaaaacatcaaaattccatcacgttctaactgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcgccactctcctcttt 676  T
Q  598 gacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggt 697  Q
      | ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||| ||    
T  677 agcagaagagaaatacactgacttactaaaacaattaatgtgaacatagttgtactctaaccagttcataccaaggattacatccataccactcaaacgt 776  T
Q  698 ag 699  Q
    ||    
T  777 ag 778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 602 - 810
Target Start/End: Original strand, 781 - 989
Alignment:
Q  602 gaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagac 701  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||| ||| ||    
T  781 gaagagaaatacactgacttactaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaaggattacatccataccactcaaacgtaaac 880  T
Q  702 aaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaac 801  Q
    |||| || || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  881 aaaccaattcaatctcaaaatcacgatcaaacatagacaaaggacactttaagcatacgacagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaac 980  T
Q  802 catctctcc 810  Q
    |||||||||    
T  981 catctctcc 989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 146 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 41480 - 40804
Alignment:
Q  146 gatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatcttt 245  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||  |||||| |||    
T  41480 gatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctttatggtcaccttgttcaactgtcgatagtcaatacacaatctcatgataccattttt 41381  T
Q  246 cttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataac 345  Q
    |||||| |||| || ||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |  |||    
T  41380 cttcttcactaacagaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaactttttctcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaac 41281  T
Q  346 tcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-------------tc-ctctctggaggcacatcaggaa 431  Q
    || ||||| |||||||||||||||| ||| || ||  ||||||||||||||||||||||||              || || |||||||||||||||||||    
T  41280 tcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacatgcttcgttccaggaacaagatcaatagaaaattcaacttctctatctggaggcacatcaggaa 41181  T
Q  432 tctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaa 531  Q
    | ||||| |||||||| || ||||| || || |||||  ||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||    
T  41180 tttcatcaggaaaaacctctggaaaatcgcataccacttgtagtttatcgatcactgcttgattctcaatagataaggaagccatcaaagaaaacatcaa 41081  T
Q  532 gataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaa 631  Q
     |||||||| ||||| |  | |||||  || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  | ||||||||||  || ||||| ||||||||     
T  41080 aataccatcacgttctaactacttcaaatgtttagtagacaaaaactttgcgccactttcctcttcagcagaagagaaatacaccgacttactaaaacat 40981  T
Q  632 ttaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaa 731  Q
    |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||| |||||| | ||| || ||||||||| || |||    
T  40980 ttaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattaaatccataccactcaaaggtaaacaaaccatatcaatctcaaaatcaggatcaa 40881  T
Q  732 acatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||||  ||||||||| | ||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40880 acatag--aaaggacatattaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagttggagtttcgacaaccatctctcc 40804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 252; Significance: 1e-139; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 8 - 636
Target Start/End: Original strand, 8213 - 8855
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8213 cgaacggcatcaccttatactcataatctccataacgcgttctgaaaactgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatct 8312  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || || || ||||||    
T  8313 caaatctatcttgctgaaaacacttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctttattgtcactttattcaac 8412  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||| || ||| ||||||||| |||||||||  |  |||||||||||||| ||||    
T  8413 tgtcgataatcaatacacaacctcatgctaccatccttcttcttcactaacagaaccggcgctccccaaggtgaaagacttggtctaacaaactttttct 8512  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa- 406  Q
    ||||||| ||||  || |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || |  |||||||||||||||||||||||||     
T  8513 caagcaaatcctttaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacataggcttcgttccaggaacaagatcaat 8612  T
Q  407 -------------gtcctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                   ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||  ||||  |||||||||||||||||    
T  8613 agaaaattcaacttccctctctggtggcacatcaggaatttcatcaggaaatacttctggaaaatcgcataccacttgtaggttatcaatcactgcttga 8712  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||| |||||| |||||||| || |||||||| |  |||||||| | ||  |  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8713 ttctcaatagataaggaagccatcaaagaaaacattagaataccatcacattttaactgcttcagctgcttggtagacaaaaactctgcgccactttcct 8812  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaat 636  Q
    ||||  | ||||||||||  ||||| || ||||||||||||||    
T  8813 cttcagcagaagagaaatacactgatttactaaaacaattaat 8855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 584 - 810
Target Start/End: Original strand, 13865 - 14091
Alignment:
Q  584 ccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacataca 683  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||  || ||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  13865 ccactttcctcttcaacagaagagaaatacaccgacttactaaaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaagaattacatcca 13964  T
Q  684 taccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaaccctt 783  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| |||||||||| |||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  13965 taccactcaaaggtagacaaaccaaatcaatctcaaagtcacgatcaaaaatagacaaagaacatcttaaacatacaagagaagtagtcaccgaaccctt 14064  T
Q  784 agctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  14065 agctggagtttcgacaaccatctctcc 14091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 77 - 335
Target Start/End: Original strand, 24438 - 24696
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||   |||||| || |   |||||||||||| |||||| || ||||| ||    
T  24438 ccttcactctaatctgatgatatcctgatcttaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaaccagttgatccatcaaatcatcaatccttggaagcgg 24537  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaa 276  Q
    ||||| |||||| || || |||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| || | ||| ||||| || ||| |     
T  24538 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgaaaatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccac 24637  T
Q  277 ggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaa 335  Q
    || ||||| | | | || | ||||| |||||||||||| || || ||||| ||||||||    
T  24638 ggagaaacactcagcctgataaactgcttctcaagcaactcttctaactgcttcttcaa 24696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 6)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 2615 - 1907
Alignment:
Q  11 aaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaa 110  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  2615 aaggcatcactttatactcataatgtccataacgcgttctaaaagccgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatatggtgataaccggatctcaa 2516  T
Q  111 atcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgc 210  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||     
T  2515 atcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaattcatccatcaagtcatcaattctcggaagtggatacctattctttatcgttactttgttcaactgt 2416  T
Q  211 cgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaa 310  Q
    ||||||||||| || || | ||| ||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||| |||||||||| |   |||| ||||||||||| ||||    
T  2415 cgataatcaatgcataatctcatgctaccatctttcttcttaactagcaatatcggcgctccccaaggtgaaacacttcgtcttacaaacttcttatcaa 2316  T
Q  311 gcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc------ 404  Q
    | || || || |||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||| | ||||||| ||| || || || ||||| || ||||| |||||          
T  2315 gtaaatcttctaactgtttcttcaactcagccaactcagaagccgacatatggtaaggtgtcatagacacagggttcgtacccggaaccagatcaatcga 2216  T
Q  405 -aagtc-------ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattc 496  Q
     || ||       || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||   ||||| ||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2215 aaattcaacttctctttctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaactcttggaaaatcacatacgacctgtagcttatcaatcactgcttgattc 2116  T
Q  497 tcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctctt 596  Q
    ||||  || || || ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| || ||||||||  |||| || ||||    
T  2115 tcaatcgacaaggacgccatcaaagaaaacatcaaaataccatcacgttctaattgcttcagctgtttagtagataagaactctgcgtcactgtcttctt 2016  T
Q  597 cgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaagg 696  Q
    |  | ||||| ||||  || ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||| |||||||||||||||    
T  2015 cagcagaagaaaaatacaccgacttactaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccaattcataccctggattacatccataccactcaaagg 1916  T
Q  697 tagacaaac 705  Q
     | ||||||    
T  1915 gaaacaaac 1907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 409 - 810
Target Start/End: Original strand, 151687 - 152088
Alignment:
Q  409 cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaa 508  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||  |  |  |||||||||| ||||||||||||| ||||||     
T  151687 cctctctgaaggcacatccggaatttcatcaggaaaaacttctggaaaatcacataccacttggggtttatcaatcaccgcttgattctcaatagataag 151786  T
Q  509 gaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagaga 608  Q
    |||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||| ||    
T  151787 gaagccatcaaggaaaacatcaaaatgccatcacgttccaactgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcgccactttcctcttcagcagaagcga 151886  T
Q  609 aatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaa 708  Q
    |||  || ||||| ||| ||||||||||  |||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  151887 aatacaccgacttactataacaattaatgtgaacatggttgtattccaaccagttcataccaagaatcacatccataccactaaaaggtaaacaaaccaa 151986  T
Q  709 atccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctct 808  Q
    ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  151987 atcaatctcaaaatcacgatcaaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatttct 152086  T
Q  809 cc 810  Q
    ||    
T  152087 cc 152088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 151303 - 151627
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  151303 cgaaaggcataactttgtactcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataaccagatct 151402  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  151403 caaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatcctcggaagtggatacctattctttattgtcaccttgttcaac 151502  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || | ||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||| || |||| ||||  |  |||||||||||||| ||||    
T  151503 tgtcaatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcttcaccagcaaaaccggcgctacccaaggcgaaatacttggtctaacaaactttttct 151602  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttctt 332  Q
    |||| || || || || ||||||||    
T  151603 caagtaaatcttctaattgtttctt 151627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 415 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 47656 - 47280
Alignment:
Q  415 tggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagcc 514  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || ||  ||||  ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  47656 tggaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttatggaaaatcgcatgccacttgtagtttatcaatcactgcttgattctcaatagataagcaagcc 47557  T
Q  515 attaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgta 614  Q
    || || |||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||  |    
T  47556 atcaaagaaaacattaagattccatcacgttctaactgcttcagctgcttagtagactaaaactctgcgccactttcctcttcagcagaagagaaataca 47457  T
Q  615 ctgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccat 714  Q
     |||||| ||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||                  ||||| |||||||||||||||| ||||| ||    
T  47456 ttgacttactaaaacaattaatgtgaacatgattgtactctaaccagttca------------------taccattcaaaggtagacaaaccaaatcaat 47375  T
Q  715 ttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||  | ||||| || |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47374 ttcaaaatcacgatcaaacatagacaaaagacaccttaaacacacaagagaagtagtcaccgaa-ccttagatggagtttcgacaaccatctctcc 47280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 743 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 30938 - 30871
Alignment:
Q  743 ggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30938 ggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 30871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 58 - 138
Target Start/End: Original strand, 87011 - 87091
Alignment:
Q  58 gtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcaccc 138  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || || |||||||||    
T  87011 gtcttctgaatatcctcatctttcactttgatctggtgatagcccgatcttaaatcaatcttactgaacacacgtgcaccc 87091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 2)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 435 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 29600 - 29225
Alignment:
Q  435 catctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagat 534  Q
    |||||||||||||||||||||| || || |||||  ||||| ||||||  || ||||||||||||| ||| || |||||||| || ||||||||||| ||    
T  29600 catctggaaaaacttcaggaaagtcgcataccacttgtagcttatcaactaccgcttgattctcaatagacaaggaagccatcaaagaaaacatcaaaat 29501  T
Q  535 accatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaatta 634  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||     
T  29500 accatcgcgctccagtttcttcagctgcttagtagataagaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatacactgacttgctaaaacaattg 29401  T
Q  635 ataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaaca 734  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29400 atatgaacatggttgtactctaaccaattcatatccagaatcacatccataccgctcaaatgtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaaca 29301  T
Q  735 tagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29300 tagataaaggacatctcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 29225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 10 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 30026 - 29631
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  30026 aaaggcataactttatattcatagtgaccatatcgggttttgaaagctgtcttctacatgtcttcatcttttactttaatctggtgataacccgatctca 29927  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||     
T  29926 aatcaatcttgctgaaaacttgtgcacccactatctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatactaactttgttcaacta 29827  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
     ||||| ||||||||| | | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||  |  |||||||| || |||||||||    
T  29826 acgatagtcaatacacgatctcatgctaccatctttcttcttcactagcaaaactggcactccccaaggagaaatacttggtctaacgaa-ttcttctca 29728  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    ||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||    
T  29727 agcaaatcttctaactgtttcttcaactcaactaactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgacaccgatttcgttccaggaacaagatcaa 29631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 8 - 664
Target Start/End: Original strand, 20431 - 21102
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20431 cgaacggcatcaccttatactcataatgtccataccgcgttctgaaagttgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctgttgataacctgatct 20530  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||| || || || |||||||||    
T  20531 caagtcaatcttgctgaaaacactagcacccactaactgatccattaagtcatcaattcttggaagtggatacctattctttattgtcactttgttcaac 20630  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||| ||||    
T  20631 tgtcgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcttcactaacaagattggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaactttttct 20730  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc--- 404  Q
    | ||||| || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| | |||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||||||||||       
T  20731 cgagcaaatcttctaagtgtttcttcaactcggccaactcagaagctggcatacgataaggtgtcatagacgcaggcttcgttccaggaacaagatcaat 20830  T
Q  405 ----aagtc-------ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
        || ||       ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || || |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20831 agaaaattcaacttctctctctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttatggaaaatcgcataccacctgtagcttatcaatcactgcttga 20930  T
Q  494 ttctcaacagataaagaa-gccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcc 592  Q
    ||||||| |||||| |||  |||| || ||||||||||| ||||| ||  ||||||  || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  20931 ttctcaatagataaggaaccccatcaaagaaaacatcaaaataccgtcatgttccaactgtttcagctgcttagtagacaaaaattttgcgccactttcc 21030  T
Q  593 tcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttc 664  Q
    | |||    ||||||||||  || ||||| |||||||||||||||  ||| ||||| ||||| |||||||||    
T  21031 tattcagtagaagagaaatacaccgacttactaaaacaattaatataaacatggttatactccaaccagttc 21102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0312 (Bit Score: 230; Significance: 1e-126; HSPs: 2)
Name: scaffold0312
Description:

Target: scaffold0312; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 8 - 559
Target Start/End: Original strand, 252 - 817
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  252 cgaaaggcataaccttgtactcatagtgagcataccgcgttctgaaggctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatatggtgataacctgatct 351  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||| | |||||| || |||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  352 caaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaagtcatcaatccttggaagttgatacctattctttattgtcaccttgttcaac 451  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||||||||||    
T  452 tgtcgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggcgaaacacttggtctaacaaacttcttct 551  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc--- 404  Q
    |||| |  || || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||       
T  552 caaggagatcttctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaggcttcgttccaggaacaagatcaat 651  T
Q  405 ----aagtc-------ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
        || ||       ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| || || |||||  ||||  |||||||||||||||||    
T  652 cgaaaactcaacttctctctctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaatttctggaaaatcgcataccacttgtagtttatcaatcactgcttga 751  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagc 559  Q
    ||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||| ||  |||| |||||||  |||||||||    
T  752 ttctcaatagataaggaagccatcaaggaaaacatcaaaatgtcatcacgttccaactgcttcagc 817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0312; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 602 - 758
Target Start/End: Original strand, 819 - 975
Alignment:
Q  602 gaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagac 701  Q
    ||||||||||  || ||||| ||  ||||||||||  | || |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  819 gaagagaaatacaccgacttactgtaacaattaatgtgcacatggttgtattccaaccaattcataccaagaatcacatccataccactcaaatgtagac 918  T
Q  702 aaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacata 758  Q
    |||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  919 aaaccaaatccatctcaaaatcactatcaaacatagacaaatgacatcttaaacata 975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 28815 - 29631
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  28815 cgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacct 28914  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||| ||| | || || || |||||||||||| ||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28915 caaatcaattttgttgaatacacgagcacccactaactgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 29014  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    |||||||||||||| || |||  |||  | ||||| |||||||| || | ||| || ||||||||| | |||||||| |  ||||| ||||| ||||| |    
T  29015 tgccgataatcaatgcataacgtcatgttgccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgctccccacggtgaaacacttggtcttacaaatttcttat 29114  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||     
T  29115 caagcaagtcctccaactgtttcttcaattcagctaactcggacgccgacatacgataaggtgccatcgacactggcttcgttcctagaacaaggtcaat 29214  T
Q  408 t----------cctc----tctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |          ||||    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| || || | | | |||||||| ||||||    
T  29215 tgaaaattcaacctctctttctggtggcacatctggaatctcatcaggaaaaacttctggaaattcattcacaactggcaacttgtcaatcacagcttga 29314  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    || || |  || ||  | ||||| || ||||||||||  || ||||| || ||||  ||||||| ||| |||||||| |  ||||| || ||||| || |    
T  29315 ttttccaatgacaagtatgccatcaaagaaaacatcagaattccatcacgctccaactgcttcaactgtttagtagataggaactcagctccactctctt 29414  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||| ||||| |  | |||| |||| ||||| ||| ||||  |||| ||||||||||||||||| || | |||||| | ||||||  ||||    
T  29415 cttcagcagaagaaaaatgcatcgtcttgttaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaatcacctccatacccgtcaa 29514  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     |||| |||| |||  || | |||||| || | ||||||||||||||| |||||  | | ||| || |||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  29515 cggtaaacaagctaggtcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaatggacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtt 29614  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || |||||||| |||||    
T  29615 tcaacaaccatttctcc 29631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 50293 - 49477
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || || || || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||    
T  50293 cgaaaggcatcactttgtattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaatgccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacct 50194  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| || ||||| |||||||||  ||||| ||| ||| | |||||||| | |||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || || ||||||    
T  50193 caagtcgatcttactaaaaacttttgcactcaccaactggtccatcaagtcatcaatcctcggtagtggatacctgttctttattgtaactttattcaac 50094  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    |  ||||| || || ||||| | ||| |||||||| |||||||| || | ||| || ||||||||| | |||||||| |  ||||| || |||||||| |    
T  50093 taacgatagtcgatgcacaatctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaacacaggcgctccccatggtgaaacacttggtcttacgaacttcttat 49994  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| || || |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||| |||||||| ||||     
T  49993 caagcaagtcttccaactgtttcttcaactctgctaactcagacgccgacatacgataaggtgacatcgacaccagcttcgttcctggaacaaggtcaat 49894  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              | | ||||| || |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||  |||||| |||| ||| || ||||| ||||||    
T  49893 tgaaaattcaacttccttttctggtggtacatcaggaatctcatccagaaagacttcaggaaattcattcaccactggtaacctgtctatcacagcttga 49794  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||| |  || ||| | ||||| || ||| ||||||| || ||||| ||||| || | ||||| ||| || |||||||| |||||  |  ||| ||| |    
T  49793 ttctctaacgacaaacatgccatcaaagaatacatcaaaattccatcacgttctagctacttcatctgtttcgtagacaagaactcaacttcaccttctt 49694  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||  ||||| || | ||| ||||| ||||| ||| ||||  |||| ||||||||||| ||||| || | |||  ||| ||||||  ||||    
T  49693 cttcagcagaagcaaaatgcaccgtcttactaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccaattcattccaaaaatagcatccatacccgtcaa 49594  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     |||||||| ||||| || |  |||||||| | ||||||||||||||| |||||  | ||||| || |||||| |||| || |||||||| |||||||||    
T  49593 tggtagacacactaagtcgacctcaaaatctctaccaaacatagacaacggacaccttaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttggctggagtt 49494  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || ||| |||| |||||    
T  49493 tcaacagccatttctcc 49477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 59327 - 58511
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || || || || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||    
T  59327 cgaaaggcatcactttgtattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacct 59228  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| || ||||| |||||||||  ||||| ||| ||| | |||||||| | |||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || || ||||||    
T  59227 caagtcgatcttactaaaaacttttgcactcaccaactggtccatcaagtcatcaatcctcggtagtggatacctgttctttattgtaactttattcaac 59128  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    |  ||||| || || ||||| | ||| |||||||| |||||||| || | ||| || ||||||||| | |||||||| |  ||||| || |||||||| |    
T  59127 taacgatagtcgatgcacaatctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaacacaggcgctccccatggtgaaacacttggtcttacgaacttcttat 59028  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| || || |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||| |||||||| ||||     
T  59027 caagcaagtcttccaactgtttcttcaactctgctaactcagacgccgacatacgataaggtgacatcgacaccagcttcgttcctggaacaaggtcaat 58928  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              | | ||||| || |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||  |||||| |||| ||| || ||||| ||||||    
T  58927 tgaaaattcaacttccttttctggtggtacatcaggaatctcatccagaaagacttcaggaaattcattcaccactggtaacctgtctatcacagcttga 58828  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||| |  || ||| | ||||| || ||| ||||||| || ||||| ||||| || | ||||| ||| || |||||||| |||||  |  ||| ||| |    
T  58827 ttctctaacgacaaacatgccatcaaagaatacatcaaaattccatcacgttctagctacttcatctgtttcgtagacaagaactcaacttcaccttctt 58728  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||  ||||| || | ||| ||||| ||||| ||| ||||  |||| ||||||||||| ||||| || | |||  ||| ||||||  ||||    
T  58727 cttcagcagaagcaaaatgcaccgtcttactaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccaattcattccaaaaatagcatccatacccgtcaa 58628  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     |||||||| ||||| || |  |||||||| | ||||||||||||||| |||||  | ||||| || |||||| |||| || |||||||| |||||||||    
T  58627 tggtagacacactaagtcgacctcaaaatctctaccaaacatagacaacggacaccttaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttggctggagtt 58528  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || ||| |||| |||||    
T  58527 tcaacagccatttctcc 58511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 65715 - 64899
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || || || || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||    
T  65715 cgaaaggcatcactttgtattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaatgccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacct 65616  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| || ||||| |||||||||  ||||| ||| ||| | |||||||| | |||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || || ||||||    
T  65615 caagtcgatcttactaaaaacttttgcactcaccaactggtccatcaagtcatcaatcctcggtagtggatacctgttctttattgtaactttattcaac 65516  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    |  ||||| || || ||||| | ||| |||||||| |||||||| || | ||| || ||||||||| | |||||||| |  ||||| || |||||||| |    
T  65515 taacgatagtcgatgcacaatctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaacacaggcgctccccatggtgaaacacttggtcttacgaacttcttat 65416  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| || || |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||| |||||||| ||||     
T  65415 caagcaagtcttccaactgtttcttcaactctgctaactcagacgccgacatacgataaggtgacatcgacaccagcttcgttcctggaacaaggtcaat 65316  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              | | ||||| || |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||  |||||| |||| ||| || ||||| ||||||    
T  65315 tgaaaattcaacttccttttctggtggtacatcaggaatctcatccagaaagacttcaggaaattcattcaccactggtaacctgtctatcacagcttga 65216  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||| |  || ||| | ||||| || ||| ||||||| || ||||| ||||| || | ||||| ||| || |||||||| |||||  |  ||| ||| |    
T  65215 ttctctaacgacaaacatgccatcaaagaatacatcaaaattccatcacgttctagctacttcatctgtttcgtagacaagaactcaacttcaccttctt 65116  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||  ||||| || | ||| ||||| ||||| ||| ||||  |||| ||||||||||| ||||| || | |||  ||| ||||||  ||||    
T  65115 cttcagcagaagcaaaatgcaccgtcttactaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccaattcattccaaaaatagcatccatacccgtcaa 65016  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     |||||||| ||||| || |  |||||||| | ||||||||||||||| |||||  | ||||| || |||||| |||| || |||||||| |||||||||    
T  65015 tggtagacacactaagtcgacctcaaaatctctaccaaacatagacaacggacaccttaaacaaacaagagaagtagttactgaaccctttgctggagtt 64916  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || ||| |||| |||||    
T  64915 tcaacagccatttctcc 64899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 4)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 8 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 85343 - 84945
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  85343 cgaaaggcataactttgtactcatagtgaccataccgtgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataaccttatct 85244  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||| |||||||| ||||||  || |||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  85243 caaatctatcttgctgaaaacttttgtacccactaactgatccatcaaatcatcaatcctcgtaagtggatacctattctttattgtcaccttgttcaac 85144  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||| |||||||||||||    
T  85143 tgtcgatagtcaatacacaatctcattctaccatctttcttctttactagcaaaaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctgacaaacttcttct 85044  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    | ||||| ||||| || | |||||||||||| |  | ||| ||||| |||||||||||||||| ||| || ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  85043 cgagcaaatcctctaattttttcttcaactctgtcatctcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacatgcttcgttccaggaacaagatcaa 84945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 10 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 85907 - 85609
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  85907 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctca 85808  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  85807 aatcaatcttactgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcgtaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaacta 85708  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctc 308  Q
     ||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  85707 tcgatagtcaatacacaatctcttactaccatctttcttcttcactaccaataccggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctc 85609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 132543 - 132231
Alignment:
Q  67 atatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattc 166  Q
    ||||| ||| |||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| || | | |||||||||||| |||||| |    
T  132543 atatcttcagcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatcc 132444  T
Q  167 tcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactgg 266  Q
    | ||||||||||||| |||||| || |  || |||||||||||||||||||| | |||||||| | |||| |||||||||||||| || | ||| |||||    
T  132443 ttggaagtggataccgattcttaatcgccactttgttcaactgccgataatccacacacaacctcgtacttccatctttcttcttaaccaacaacactgg 132344  T
Q  267 cgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataa 366  Q
     || ||| | || ||||  |  ||||||| |||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||   ||||| || |||||||| |||||     
T  132343 agcaccccatggcgaaaaacgtggtctaataaactgtttctcaagcaactcttccaactgtttcttcaattcacccaactctgatgcagacatccgatac 132244  T
Q  367 ggtgccatcgaaa 379  Q
    || || |||||||    
T  132243 ggcgcaatcgaaa 132231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 251
Target Start/End: Original strand, 26029 - 26203
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| || |   ||| |||||||| |||||| || ||||||||    
T  26029 ccttcactctaatcggatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaacaagatgatacatcaaatcatcaatccttggaagtgg 26128  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctt 251  Q
    ||||| |||||| || || ||  |||||||||| |||||||| | |||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  26129 ataccgattcttaatcgtcacaatgttcaactgacgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttctt 26203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 210; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 2385 - 1569
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||| || || || || |  || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  2385 cgaaaggcattactttatattcataatgtccatatcgtgtcctaaaggtcgttttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacct 2286  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||| ||| | || || |  |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || || || || ||||||    
T  2285 caaatcaattttgttgaatacacaagcacccactaactgatccattaaatcatcaattctcggaagtggatacctgttctttatcgtaactttattcaac 2186  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || |||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||| || |  || |||||||||||| | ||| |||| | |||||| ||||| ||||| |    
T  2185 tgacgataatctatacacaacctcatgctaccatccttcttcttaaccaaaaatactggcgctccccacggttaaacactcggtcttacaaatttcttat 2086  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||| |||||||     
T  2085 caagtaagtcctccaactgtttcttcaactccgctaactcggacgccgacatacgataaagtgccatcgacaccggattcgttccaggaactagatcaat 1986  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| ||||| |  |||||||||||  |||||    
T  1985 tgcaaattcaacctccctctctggtggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttccggaaattcattcacaaccggcaatctatcaatcacaacttga 1886  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||| |  || ||  | | ||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| |||||  |  ||| ||| |    
T  1885 ttctccaacgacaagtatgtcatcaaggaaaacattaagattccatcacgttccaattgcttcatctgtttagtagtcaacaactcaacttcaccttctt 1786  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    | ||  | ||||| |||||||  | ||| ||||||||||||||| ||||  |||| || |||||||| ||||| || |  || |||| ||||||  ||||    
T  1785 cctccgcagaagaaaaatgtatcgtcttactaaaacaattaatatgaacacggttatattctaaccaattcatcccaaagattacatccatacccgtcaa 1686  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     || | ||| || | ||| | |||||| || | ||||||||||||||| |||||  ||||||| || |||||| || | || ||||||||||||||||||    
T  1685 cggcaaacatacaagatcaacttcaaagtctctaccaaacatagacaatggacaactcaaacaaacaagagaagtaattactgaacccttagctggagtt 1586  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || |||||||| |||||    
T  1585 tcaacaaccatttctcc 1569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 210; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 29398 - 28582
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||| || || || || |  || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  29398 cgaaaggcattactttatattcataatgtccatatcgtgtcctaaaggtcgttttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacct 29299  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||| ||| | || || |  |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || || || || ||||||    
T  29298 caaatcaattttgttgaatacacaagcacccactaactgatccattaaatcatcaattctcggaagtggatacctgttctttatcgtaactttattcaac 29199  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || |||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||| || |  || |||||||||||| | ||| |||| | |||||| ||||| ||||| |    
T  29198 tgacgataatctatacacaacctcatgctaccatccttcttcttaaccaaaaatactggcgctccccacggttaaacactcggtcttacaaatttcttat 29099  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||| |||||||     
T  29098 caagtaagtcctccaactgtttcttcaactccgctaactcggacgccgacatacgataaagtgccatcgacaccggattcgttccaggaactagatcaat 28999  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| ||||| |  |||||||||||  |||||    
T  28998 tgcaaattcaacctccctctctggtggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttccggaaattcattcacaaccggcaatctatcaatcacaacttga 28899  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||| |  || ||  | | ||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| |||||  |  ||| ||| |    
T  28898 ttctccaacgacaagtatgtcatcaaggaaaacattaagattccatcacgttccaattgcttcatctgtttagtagtcaacaactcaacttcaccttctt 28799  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    | ||  | ||||| |||||||  | ||| ||||||||||||||| ||||  |||| || |||||||| ||||| || |  || |||| ||||||  ||||    
T  28798 cctccgcagaagaaaaatgtatcgtcttactaaaacaattaatatgaacacggttatattctaaccaattcatcccaaagattacatccatacccgtcaa 28699  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     || | ||| || | ||| | |||||| || | ||||||||||||||| |||||  ||||||| || |||||| || | || ||||||||||||||||||    
T  28698 cggcaaacatacaagatcaacttcaaagtctctaccaaacatagacaatggacaactcaaacaaacaagagaagtaattactgaacccttagctggagtt 28599  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || |||||||| |||||    
T  28598 tcaacaaccatttctcc 28582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 95007 - 94191
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || ||    
T  95007 cgaaaggcatcactttgtattcgtagtgaccatatcgtgtcctaaaagccgtcttctgcatatcttcatccttcactttaatctgatggtaacccgacct 94908  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||   ||||| || ||| | |||||||| | |||||| | |||||||||||| |||||||| || || || |||||||||    
T  94907 caagtcaatcttgctaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaagtcatcaatccgcggaagtggatatctattctttattgtaactttgttcaac 94808  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |  || || ||||| ||| | || ||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  94807 tgacgatagtcaatgcacaacctcatacttccatctttcttctttaccaataacacgggcgccccccacggcgaaacactgggtcttacaaacttcttgt 94708  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc--- 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  || || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||       
T  94707 caagcaagtcctccaactgtttctttaactcagccaattcagaagctgacatgcgatacggcgccatcgacactggtttcgttcccggaacaagatcaat 94608  T
Q  405 ----aagtc-------ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
        || ||       || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| || || ||||| ||||||    
T  94607 cgagaattcaacttctctttctggtggcacgtcaggaatctaatctggaaaaacttcaggaaattcattcaccactggtagtctgtcgatcacagcttga 94508  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||| |  || || || ||||| || |||||||| |  || ||||| |||||||  ||||||| ||| |||||||  | ||||||||| ||||| || |    
T  94507 ttctctaacgacaatgatgccatcaaagaaaacataagaattccatctcgttccaactgcttcaactgtttagtagttagaaactctgccccactctctt 94408  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    |||| || ||||| || || || | |||| ||||||||||||||   ||  |||| || |||||||| ||||| || | ||| |||| ||| ||   |||    
T  94407 cttccacagaagaaaagtgcaccgtcttgttaaaacaattaatacagactcggttatattctaaccaattcatcccgaaaataacatccatccccaacaa 94308  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     |||||||| |||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||| |||||  | | ||| || |||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  94307 cggtagacacactaaatcgacttcaaaatctctaccaaacatagacaacggacaccttagacacaccagagaagtagttactgaacccttagctggagtt 94208  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || |||||||| |||||    
T  94207 tcaacaaccatttctcc 94191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 8 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 107924 - 107681
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  107924 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctatcttctacatatcctcatcttttactttaatctggtgataacctgatct 107825  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  107824 caaatcaatcttgctgaaaactcttgcacccactaactgatccatcaaatcatccattctcggaagtggatacctattcttgatagttatcttgttcaac 107725  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctt 251  Q
    || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  107724 tgtcgataattaatacataaccgcatactaccatctttcttctt 107681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 114752 - 115569
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| || |||||||| |     
T  114752 cgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggcagtcttctgcatgtcttcatctttcaccttgatctgatggtaacctgacca 114851  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| ||||| || |||||||    |||||| || ||| |||||||||  |  |||||||||||||| ||||| || ||||| || || || || ||||||    
T  114852 caagtcaattttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaggtcgtcaattctcggaagaggatatctgttctttatcgtaactttattcaac 114951  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaagg-tgaaacgcccggtctaacaaacttcttc 306  Q
    ||  | || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||| || ||||||||| | || |||||| |  | ||| |||||||||||     
T  114952 tgatggtagtcaatacacaacctcatactaccatccttcttctttgccagcaacacaggcgctccccacgggtgaaacacttgctcttacaaacttcttg 115051  T
Q  307 tcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc-- 404  Q
    || || |||||||| ||||| |||||||||||||  |  ||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  || || |||||      
T  115052 tcgagtaagtcctctaactgattcttcaactcagcaagttcggatgccgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcttggtactagatcga 115151  T
Q  405 -----aagt-------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttg 492  Q
         || |       ||| ||||| || ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||    ||||| |||| | | || ||||| |||||    
T  115152 tggagaactcaacctccctttctggtggtacatctggaatctcatccgaaaaaacttcaggaaactcgttaaccactggtaacttgtcgatcacagcttg 115251  T
Q  493 attctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcc 592  Q
     || || |  || ||| | |||||||  ||| ||||||  || ||||| ||||| || ||||||| ||  || ||||| |||| |||  | ||||| ||     
T  115252 gttttctaaggacaaacatgccattagagaatacatcagaatcccatctcgttctagctgcttcatctctttcgtagataaaatctcaactccactctct 115351  T
Q  593 tcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactca 692  Q
    |||||| | ||||| ||||| || | |||| | || || || ||| ||||  |||| ||||||||||| ||||| || |  || |||| ||| ||  |||    
T  115352 tcttcggcagaagaaaaatgcacggtcttgttgaagcagttgatatgaactcggttatactctaaccaattcatcccaaatataacatccatccccgtca 115451  T
Q  693 aaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagt 792  Q
      ||||  ||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||| | ||||||| ||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  115452 gtggtaagcaaactaaatctacttcaaaatccctaccaaacatagatataggacatatcaaacaaacaagagaagtagtcactgaacccttagctggagt 115551  T
Q  793 ttcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||| || ||||| |||||    
T  115552 ttcaacgaccatttctcc 115569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1985 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold1985
Description:

Target: scaffold1985; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 289 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 401 - 1
Alignment:
Q  289 ggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcg 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  401 ggtctaacaaacttcttctcaagcaaatcttctaattgtttcttcaactcaactaactcagaagctgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcg 302  T
Q  389 ttccaggaacaagatcaag-------tc----ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcct 477  Q
    ||| ||||||||||||||        ||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||  ||||| |    
T  301 ttctaggaacaagatcaatagaaaactcaactctctctggaggcacatcaggaatttcatctggaaaaacttcaggaaaatcgcataccacttgtagctt 202  T
Q  478 atcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaac 577  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||    
T  201 atcaatcactgcttgattctcaatagataatgaagtcattaaagaaaacatcaatataccatctcgttccatttgcttcagctgcttagtagatatgaac 102  T
Q  578 tctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatca 677  Q
    ||||||||||||||||||||| | || |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  101 tctgcaccactttcctcttcgtctgatgagaaatacactgacttgctaaaacaattaatatgaacatggttgtactccaaccaattcatacccagaatca 2  T
Q  678 c 678  Q
    |    
T  1 c 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1985; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 453 - 407
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaa 54  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  453 cgaaaggcataactttatattaatagtgaccataccgtgttctgaaa 407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 967 - 152
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || |||||||| || || ||||| || || || || |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  967 cgaaaggcatcaccttatattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggtcgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacct 868  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||||| ||||||| || |  ||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||    
T  867 caagtcaatcttgctgaaacctt-tgcacccactaactgatccattaagtcgtcaatcctcggaagtggatacctgttctttatcgtaactttgttcaac 769  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||||| |||||| || | |||  ||||||| |||||||| || | ||| |  ||||||||| |||||||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  768 tgacgataataaatacataatctcatggtaccatccttcttcttaaccaacaacatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaacttcttat 669  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||     
T  668 caagcaagtcctccaactgtttcttcaattcagctaactcggaagctgacatacgataaggtgccattgacaccggcttcgttcctggaacaaggtcaat 569  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||  ||| || || | ||| | |||||| ||||||    
T  568 tgaaaattcaacctccctctctggtggcacatctggaatctcatcaggaaaaacctcaggaaactcattcacaactggcaacctgttaatcacagcttga 469  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    || || | ||| ||  | ||||| || ||||||||||  || ||||| || ||||  ||||||| ||| |||||||| |  ||||| || ||||| || |    
T  468 ttttccaaagacaagtatgccatcaaggaaaacatcagaattccatcacgctccaactgcttcaactgtttagtagataggaactccgctccactctctt 369  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||| ||||| || |  |||||||| ||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||| || | |||||||| ||||||  ||||    
T  368 cttcagcagaagaaaaatgcaccgttttgctaaagcaattaatatgaactcggttataccctaaccagttcatcccaaaaatcacatccatacccgtcaa 269  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     |||| ||||||||| || | |||||| || | ||||||||||||||| | |||| | | ||| || |||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  268 cggtaaacaaactaagtcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacgtacatcttatacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtt 169  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || |||||||| |||||    
T  168 tcaacaaccatttctcc 152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 2062 - 2878
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||    
T  2062 cgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaaccagacct 2161  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||| || ||||| || ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || || || || ||||||    
T  2162 caaatcaattttactaaacacacgtgcacccactaattgatccattaaatcgtcaattctcggaagtggatacctattctttatcgtcactttattcaac 2261  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || || ||||  |||||||||| ||| |||||||| |||||||| || | ||| || ||||||||| | |||||||| | |||||| ||||| ||||| |    
T  2262 tgacggtaatatatacacaacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgctccccacggtgaaacactcggtcttacaaatttcttat 2361  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||| |     
T  2362 caagcaaatcctccaactgtttcttcaattcagctaactcagacgccgacgtacggtaaggtgccatcgacaccggcttcgttccgggcacatgatcgat 2461  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              ||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||||||| || ||| || || |  ||||||||||| ||||||    
T  2462 tgaaaattcaacctccctctctggtggcacatctagaatctcatcaggaaaagcttctggaaatttacccacaactggcaatctatcaatcacagcttga 2561  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||| |  || ||| | ||||| || |||||||| |  || ||||| || ||||  | ||||| ||| || |||| ||| ||||| ||  |||| || |    
T  2562 ttctccaacgacaaatacgccatcaaggaaaacattagaattccatcacgctccaactacttcaactgtttcgtagtcaagaactcagcttcactctctt 2661  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  ||||||| ||||| || | ||| ||||| ||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| || | ||| ||||  |||||  ||||    
T  2662 cttcagcggaagaaaaatgcaccgtcttactaaagcaattaatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaattacatctatacccgtcaa 2761  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     || | ||| |||| ||| | |||||| || | ||||||||||||||| |||||  ||||||| || |||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  2762 cggcaaacatactagatcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaatggacaactcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtt 2861  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || |||||||| |||||    
T  2862 tcaacaaccatttctcc 2878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 205; Significance: 1e-111; HSPs: 3)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 325 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 25508 - 25009
Alignment:
Q  325 tgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaagt--------------cc 410  Q
    |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||                ||    
T  25508 tgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacggtaaggtgtcatagacacaggcttcgttccaggaacaagatcaatcgaaaactcaacttccc 25409  T
Q  411 tctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaaga 510  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |  || |||||  ||||  ||||||| || ||||||||||||| |||||| ||    
T  25408 tctctggaggtacatcaggaatttcatcaggaaatacttctggaaaattgcataccacttgtagtttatcaattaccgcttgattctcaatagataagga 25309  T
Q  511 agccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaa 610  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||    
T  25308 agccatcaaggaaaacatcaaaatgccatcacattccaactgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcgccactttcctcttcagcagaagagaaa 25209  T
Q  611 tgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaat 710  Q
    |  || ||||| ||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25208 tacaccgacttactataacaattaatgtgaacatggttgtactctaactagttcatacccagaatcacatccataccactcaaaggtaaacaaactaaat 25109  T
Q  711 ccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25108 ccatctcaaaatcacgatcaaacatagataaaggacatcttaaacacacaagagatgtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatttctcc 25009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 77 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 1996 - 1738
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||  |||||| || | | |||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  1996 ccttcactctaatttgatgatatcccgatctcaaatcaatcttactaaacacttctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 1897  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaa 276  Q
    ||||| |||||| || || || |||||||||| ||||||||| | |||||||  ||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||| |     
T  1896 ataccgattcttaatcgtcactttgttcaactaccgataatccacacacaacatcatgctcccatctttcttcttaaccagcaatactggagcaccccac 1797  T
Q  277 ggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaa 335  Q
    |||||||| |  ||||||| ||||| |||||||||||| || || |||| |||||||||    
T  1796 ggtgaaacacttggtctaataaactacttctcaagcaactcttctaactatttcttcaa 1738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 139 - 266
Target Start/End: Original strand, 26651 - 26778
Alignment:
Q  139 actaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactac 238  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||| |||| ||| || |    
T  26651 actaactgatccatcaaataatcaatcctcggaagcggataccaattctttatagtcaccatgttcaactgccgataatccacacataacctcatgcttc 26750  T
Q  239 catctttcttctttactagcaaaactgg 266  Q
    |||| |||||||| |||| ||| |||||    
T  26751 catccttcttcttaactaacaacactgg 26778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 201581 - 200765
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| |||  |||||| || || ||||| || || || || || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| || ||    
T  201581 cgaaaggcatcactgaatattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggccgttttctgcatatcttcatcttttactttaatctgatggtaacccgacct 201482  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || || || || || ||||||    
T  201481 caaatcaatcttgctaaacactcgtgtacccactaactgatccattaaatcatcaattctcggaagtggatacctattttttatcgtcactttattcaac 201382  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || || ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| || | ||| || ||||||||| |||||||||| | |||||| ||||| ||||| |    
T  201381 tgacggtaatctatacacaacctcatgctaccatctttcttcttaaccaacaacaccggcgctccccaaggtgaaacactcggtcttacaaaattcttat 201282  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    || | || ||| ||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||| |     
T  201281 caggtaaatccaccaactgtttcttcaactctgataactcagacgctgacatacggtaaggcgccatcgacacaggctttgtacccggaacaagatcgat 201182  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              ||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |  || | ||||||||||||  | ||     
T  201181 tgaaaactcaacttccctctctggcggcacatcaggaatttcatcatgaaaaacttctggaaattcacacacaattggcaacctatcaatcacaacctgg 201082  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  | ||||||||| ||||||| ||| |||||  |   ||| || |    
T  201081 ttctctacagacaagtatgccattaaagaaaacattaagatcccatcacgttctaactacttcagctgtttagtagtcaagaactcaactttactctctt 200982  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    | ||  | ||||| ||||| || | ||| ||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| || |  || |||| ||||||  ||||    
T  200981 cctccgcagaagaaaaatgcaccgtcttactaaaacaattgatatgaacatggttatactccaaccagttcatcccaaagattacatccatacccgtcaa 200882  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     || | ||| |||| ||| | ||||||||| | |||||||||||||||  ||||  ||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  200881 cggcaaacatactagatcaacttcaaaatctctaccaaacatagacaacagacaaatcaaacaaacgagagaagtagttactgaacccttagctggagtt 200782  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || |||||||| |||||    
T  200781 tcaacaaccatttctcc 200765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 8 - 804
Target Start/End: Original strand, 324897 - 325708
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || || ||||| || |||||||| || || || || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  324897 cgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacct 324996  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
     || |||||||| ||||||||    |||||||||||| |||||||||| |  ||||| ||||||||||||||| | ||||| || || || || ||||||    
T  324997 taagtcaatcttactaaaaaccttcgcacccactaactgatccatcaagtcgtcaatcctcggaagtggatacttgttctttattgtaactttattcaac 325096  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    |  ||||| ||||| ||||||| ||| ||||| || ||||||||||| | ||| || ||||||||| ||||||| || |  ||||| |||||||| || |    
T  325097 taacgatagtcaatgcacaacctcatgctaccgtccttcttctttaccaacaataccggcgctccccaaggtgagacacttggtcttacaaactttttat 325196  T
Q  308 caagcaagtcctcc-aactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||  | ||||||||||| | |||||| ||||    
T  325197 caagcaagtcttccaaaccgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatgcgatacgttgccatcgacgccggcttcgttcccgtaacaaggtcaa 325296  T
Q  407 gt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttg 492  Q
     |              ||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  325297 ttgaaaactaaacctccctctctggtggtacatctggaatctcatccggaaaaacttcaggaaattcattcaccaccggtaacctgtcaatcacagcttg 325396  T
Q  493 attctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcc 592  Q
    |||||| |  || ||| | ||||| || |||||||| |  || |||||||| ||||  ||||||| ||| |||||||  |  || ||||| ||||| ||     
T  325397 attctctaacgacaaatatgccatcaaagaaaacataagaattccatcgcgctccaactgcttcaactgtttagtagttaggaattctgctccactctct 325496  T
Q  593 tcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactca 692  Q
    |||||  | ||||| ||||| || | ||| |||||| |||| ||| ||||  |||| ||||||||||||||||| || | ||| |||| ||| ||  |||    
T  325497 tcttccgcagaagaaaaatgcaccgtctttctaaaataattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaataacatccattcccgtca 325596  T
Q  693 aaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagt 792  Q
    | |||| ||| ||||| || | |||||| || | |||||||||||||||  ||||| | | ||| || |||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  325597 acggtaaacacactaagtcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacagacatcttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagt 325696  T
Q  793 ttcgacaaccat 804  Q
    ||| ||||||||    
T  325697 ttcaacaaccat 325708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 200; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 58 - 810
Target Start/End: Original strand, 11201 - 11967
Alignment:
Q  58 gtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaat 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||| ||||||| ||||    
T  11201 gtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgctgaacacacgagcacccactaactgatccattaaat 11300  T
Q  158 tatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactag 257  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||| || || || || || | ||| || ||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||       
T  11301 cgtcaattctcggaagtggatacctattctttatcgtcactttatttagctgacggtaatctatacacaacctcatgctaccatccttcttcttaaccga 11400  T
Q  258 caaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagac 357  Q
    ||| || || |||||| | |||||||| | |||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| || |||    
T  11401 caataccggtgctccccacggtgaaacactcggtcttacaaatttcttatcaagtaaatcctcgaactgtttcttcaattcagctaactcggacgccgac 11500  T
Q  358 atacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaagt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaa 443  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || | |              ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  11501 atacggtaaggtgccatcgacaccggcttcgttccgggaacaaggtcgattgaaaattcaacctccctctctggtggcacatctggaatctcatcaggaa 11600  T
Q  444 aaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcg 543  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||| |  || ||  | ||||| || |||||||| || || ||||| ||    
T  11601 aaacttctggaaattcactcacaaccggtaatctatcaatcacagcttgattctccaatgacaagtatgccatcaaagaaaacattaaaatcccatcacg 11700  T
Q  544 ttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacg 643  Q
    ||| |  ||||||| ||| ||||||| ||| ||||| ||  |||| || || ||  | ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||||||| ||||     
T  11701 ttctaactgcttcaactgtttagtagtcaagaactcagcttcactctcttcctcagcagaagaaaaatgtaccgtcttactaaagcaattaatatgaaca 11800  T
Q  644 tggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaag 743  Q
     |||| ||||||||||||||||| || | ||| |||| ||||||  |||| || | |||||| | ||| |  ||||| |  | ||||||||||||||| |    
T  11801 cggttatactctaaccagttcatcccaaaaattacatccatacccgtcaacggcaaacaaacaagatcaacctcaaagtatctaccaaacatagacaacg 11900  T
Q  744 gacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||  ||||||| || |||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  11901 gacaactcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcc 11967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 198; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 22303 - 21488
Alignment:
Q  4 aacacgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctg 103  Q
    |||||||||||||| |||  |||||  || || || ||||| || || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |    
T  22303 aacacgaaaggcatcactgaatatttgtaatgtccgtaacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctgatgatagctcg 22204  T
Q  104 atctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgtt 203  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || || |||||    
T  22203 atctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcgattcttggaagtggataactattctttattgtcactttgtt 22104  T
Q  204 caactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttc 303  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||| | |||| | |||||||||    
T  22103 caacttccggtaatctatacacaacctcatgctaccatctttcttcttaacgagcaacactggcgctccccaaggtgaaacactcggtattacaaacttc 22004  T
Q  304 ttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagat 403  Q
    || |||||||| || ||||| |  || |||||||||| ||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||  ||| |||||    
T  22003 ttatcaagcaaatcttccaaattctttttcaactcagctaattcagaagccgacatacggtaaggcgccattgacacaggcttcgtacc-cgaaaaagat 21905  T
Q  404 caa--------------gtcctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgc 489  Q
    |||                ||| ||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||  |||| ||  | | | ||||||| || ||    
T  21904 caataaaaaattcaacttccctttccagcggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacttctggaatttcgtacacaacttgcaacttatcaattaccgc 21805  T
Q  490 ttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactt 589  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||   || ||||| ||  | |  ||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||  ||||     
T  21804 ttgattctcaatagacaaagacgccatcaaagaaaacatcggaattccatcacgcgctaactgcttaagctgcttagtagtcaagaactcagcttcactc 21705  T
Q  590 tcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggtt-gtac-tctaaccagttcatacccagaatcacatacatacc 687  Q
    || |||||  | ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||  ||| |||||  ||| || || ||| ||||||| || || | || ||| ||    
T  21704 tcttcttcagcagaagaaaaatgtaccgtcttactaaaacagttaatataaacatggttattacatccaagcagctcataccaagtattagatccattcc 21605  T
Q  688 actcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagct 787  Q
    ||||||||| | |||||||||||| | |||||| || ||||||||||| || || ||||| |||| ||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  21604 actcaaaggcaaacaaactaaatcaacttcaaagtctcgaccaaacatcgagaacggacacttcagacacactagagaagtagtcaccgaacccttagct 21505  T
Q  788 ggagtttcgacaaccat 804  Q
    |||||||||||||||||    
T  21504 ggagtttcgacaaccat 21488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 8 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 115151 - 114476
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| |||  |||||| || || |||||||| || || || ||  ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  115151 cgaaaggcatcactcaatattcgtaatgtccataacgtgtcctaaaggccatcttctggatatcctcgtctttcactttaatctggtgataacccgatct 115052  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||    
T  115051 caaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattcttggaagtggatacctattctttatcgttactttattcaac 114952  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||| || | || |||| |||||||||| | |||||| ||||||||||| |    
T  114951 tgtcgataatcaatgcataacctcatgctaccatctttcttcttaactaacaataccgacgatccccaaggtgaaacactcggtcttacaaacttcttat 114852  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa- 406  Q
    |||| || || || || ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| || |||||  | ||  ||||||| || |||||||||||||     
T  114851 caagtaaatcttctaattgtttcttcaactcagccaactcagaagccgacatacgatatggcgccataaacacaagcttcgtacccggaacaagatcaat 114752  T
Q  407 -------------gtcctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                   |||||| || ||||||||||| |||||||  |||||||||||  ||||||| || || ||  | | | ||||||| |||||||||    
T  114751 caaaaattcaacttccctctccggcggcacatcagggatctcattaggaaaaacttctagaaattcgcatacaactcgcaacttatcaattactgcttga 114652  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||||||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||||| ||||||||  ||  |||| || |    
T  114651 ttctcaacagacaaggacgccatcaaagaaaacatcaagattccatcacgctctaactgcttcagctgcttagtagtcaaaaacttagcttcactctctt 114552  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacc 669  Q
    ||||  | ||||| ||||| || | ||| |||||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  114551 cttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttactaaaacaattaatataaacatggttatactccaaccagttcatacc 114476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 190; Significance: 1e-102; HSPs: 4)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 409 - 810
Target Start/End: Original strand, 8556 - 8957
Alignment:
Q  409 cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaa 508  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||  ||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||     
T  8556 cctctctagaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttctggaaaatcgcataccacttgtagtttatcaatcaccgcttgattctcaatagataag 8655  T
Q  509 gaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagaga 608  Q
    |||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||  | ||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | |||||||    
T  8656 gaagccatcaaagaaaacatcaaaatgccatcacgttccaactacttcgactgcttagtagacaaaaaatctgcgccactttcctcttcagcagaagaga 8755  T
Q  609 aatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaa 708  Q
    |||  || ||||| ||| ||||||||||  |||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  8756 aatacaccgacttactataacaattaatgtgaacatggttgtattccaaccagttcataccaagaatcacatccataccactcaaaggtaaacaaactaa 8855  T
Q  709 atccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctct 808  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  8856 atccatctcaaaatcacaatcaaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcactgaacccttggctggagtttcgacaaccatttct 8955  T
Q  809 cc 810  Q
    ||    
T  8956 cc 8957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 8 - 251
Target Start/End: Original strand, 8242 - 8485
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8242 cgaaaggcataactttgtactcatagtgaccatactgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatct 8341  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| || |  ||||||||||||    
T  8342 caaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaattgatccatcaaatcatcaatcctcgaaagtggatacctattctttattgacaccttgttcaac 8441  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctt 251  Q
    || ||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  8442 tgtcgatagtcaatacataatctcatactaccatctttcttctt 8485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 8 - 251
Target Start/End: Original strand, 17438 - 17681
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17438 cgaaaggcataactttgtactcatagtgaccatactgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatct 17537  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| || |  ||||||||||||    
T  17538 caaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaattgatccatcaaatcatcaatcctcgaaagtggatacctattctttattgacaccttgttcaac 17637  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctt 251  Q
    || ||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  17638 tgtcgatagtcaatacataatctcatactaccatctttcttctt 17681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 409 - 722
Target Start/End: Original strand, 17752 - 18065
Alignment:
Q  409 cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaa 508  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||  ||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||     
T  17752 cctctctagaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttctggaaaatcgcataccacttgtagtttatcaatcaccgcttgattctcaatagataag 17851  T
Q  509 gaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagaga 608  Q
    |||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||  | ||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | |||||||    
T  17852 gaagccatcaaagaaaacatcaaaatgccatcacgttccaactacttcgactgcttagtagacaaaaaatctgcgccactttcctcttcagcagaagaga 17951  T
Q  609 aatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaa 708  Q
    |||  || ||||| ||| ||||||||||  |||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  17952 aatacaccgacttactataacaattaatgtgaacatggttgtattccaaccagttcataccaagaatcacatccataccactcaaaggtaaacaaactaa 18051  T
Q  709 atccatttcaaaat 722  Q
    |||||| |||||||    
T  18052 atccatctcaaaat 18065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 28718 - 29534
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| || ||||| || || || || |  || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  28718 cgaaaggcatcaccttatactcataatgtccatatcgtgtcctaaaggtcgttttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacct 28817  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| ||||| || || || || ||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || || || || |||| |    
T  28818 caagtcaattttactgaacacgcgtgcacccactaactgatctattaaatcatcaattctcggaagtggatatctattctttatcgtcactttattcagc 28917  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || || ||||| |||||||| | ||| |||||| | |||||||| |||| ||| || ||||||||| |||||||||| | |||||| ||||| ||||| |    
T  28918 tgacggtaatctatacacaatctcatgctaccacccttcttcttaactaacaataccggcgctccccaaggtgaaacactcggtcttacaaatttcttat 29017  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    | || || |||||||||||||||||||| || | |||||||||  | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||     
T  29018 ccagtaaatcctccaactgtttcttcaattcggctaactcggacaccgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccgggaacaagatcaat 29117  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||  ||| || || |  ||||||||||| ||||||    
T  29118 tgcaaattcaacctccctctttggtggcacatcaggaatctcatcaggaaaaactattggaaattcattcacaacaggcaatctatcaatcacagcttga 29217  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||| |  || ||  | ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||| ||| ||||||| ||| ||||| ||  |||| || |    
T  29218 ttctctaacgacaagtatgccatcaaggaaaacatcaagattccatcacgttctaactgcttcaactgtttagtagtcaagaactcagcttcactctctt 29317  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    | || ||  |||| ||||||||   ||| ||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| || |  || |||| ||||||  ||||    
T  29318 cctcaacataagaaaaatgtaccatcttactaaaacaattaatatgaacacggttatactctaaccagttcatcccaaagattacatccatacccgtcaa 29417  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     || | ||| || | ||| |  ||||| || | ||||||||||||||| |||||  ||||||| || || ||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  29418 cggcaaacatacaagatcaacctcaaagtctctaccaaacatagacaatggacaactcaaacaaacaagtgaagtagttactgaacccttagctggagtt 29517  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || |||||||| |||||    
T  29518 tcaacaaccatttctcc 29534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 250813 - 251629
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || || ||||| || |||||||| || || || || || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||| || ||    
T  250813 cgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatattctcatccttcaccttaatctgatggtaaccagacct 250912  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| ||||||||||| || ||   ||||||||| ||  ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||    
T  250913 caagtcaatcttgctgaacacctttgcacccaccaattgatccattaagtcatcaattctcggaagtggatacctattctttatcgtaactttgttcaac 251012  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || || |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||| || ||||||||| ||||||| || |  ||||| ||||||||||| |    
T  251013 tgacggtaatcaatgcacaacctcatactaccatccttcttctttaccaacaataccggcgctccccaaggtgagacacttggtcttacaaacttcttat 251112  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||| ||| ||||     
T  251113 caagcaagtcctccaactgtttctttaattcagctaactcagaagctgacatacgataaggtgccatcgacaccggctttgttcctggaataaggtcaat 251212  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||  |||||| || | ||| ||||||||  |||||    
T  251213 tgaaaattcaacctccctctctggtggcacatcaggaatctcatcaggaaacacttctggaaattcattcaccacaggcaacctgtcaatcacaacttga 251312  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    || || |  || ||| | |||||||| ||| ||||||  || || || ||||| || || |||| ||| || |||||||| |||||  |  ||| ||| |    
T  251313 ttttctaacgacaaatatgccattaaagaatacatcagaatcccgtcacgttctagctgtttcatctgtttcgtagacaagaactcaacttcaccttctt 251412  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    |||   | ||||| ||||| || | ||| ||||| || || ||  ||||  |||| ||||||||||| ||||| || | ||| |||| ||||||   |||    
T  251413 ctttagcagaagaaaaatgcaccgtcttactaaagcagtttatttgaactcggttatactctaaccaattcatcccaaaaataacatccatacccgacaa 251512  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     || | |||||||| ||| | | |||| || | ||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  251513 cggcaaacaaactagatcgactacaaagtctctaccaaacatagacaatggacatctcaagcaaactagagaagtagttactgaacccttagctggagtt 251612  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || |||||||| |||||    
T  251613 tcaacaaccatttctcc 251629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 46 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 5964 - 5328
Alignment:
Q  46 gttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaaca 145  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||     
T  5964 gttctaaaagccgtcttttgcatattgtcgtccttcactttaatctggtgataacccgatctcaagtcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaact 5865  T
Q  146 gatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatcttt 245  Q
    | |||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| || |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  5864 ggtccatcaagtcgtcaattcttggaagtggatacctattctttatcgttactttattcaattgtcgataatcaatacataacctcatgctaccatcttt 5765  T
Q  246 cttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataac 345  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||| ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||||||    |||    
T  5764 cttcttaactaacaaaacgggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaacttcttatccagcaaatcttctaattgtttcttcaactcgaccaac 5665  T
Q  346 tcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc-------aagtc-------ctctctggaggcacatcaggaa 431  Q
    || ||||| |||||||| ||||||| ||| || || ||||| ||||| |||||||||||       || ||       || ||||| |||||||||||||    
T  5664 tcagaagccgacatacggtaaggtgtcatagacacaggctttgttcctggaacaagatcaatcgaaaattcgacttctctttctggcggcacatcaggaa 5565  T
Q  432 tctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaa 531  Q
    ||||||| || |||||||| ||||| ||| |||| ||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| ||  ||||||| ||    
T  5564 tctcatcagggaaaacttctggaaaatcaaacacaacttgtagcttatcaattactgcttgattctcaacagacaaggacgccatcaaataaaacattaa 5465  T
Q  532 gataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaa 631  Q
      | ||||| || ||||  |  |||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||  || ||||| ||| |||||    
T  5464 acttccatcacgctccaactctttcagctagttagtagacaagaactctgctccactatcttcttcgacagaagaaaaatacaccgacttactataacaa 5365  T
Q  632 ttaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatac 668  Q
    | |||  |||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  5364 tgaatgtgaacatggttatactccaaccagttcatac 5328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 182; Significance: 6e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 69563 - 70379
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || || ||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| ||    
T  69563 cgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaagccgtcttctgcatatcttcatccttcactttaatttgatggtaacctgacct 69662  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| ||||| || |||||||||  |||||| || ||  | |||||||| | |||||| |||||||||||||| || ||||| || || || |||||||||    
T  69663 caagtcaattttactaaaaacttttgcacctaccaattggtccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatatctgttctttattgtaactttgttcaac 69762  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||| | ||| || ||||||||| | || ||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  69763 tgacgatagtcaatgcacaatctcatactaccatccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggcgaaacactaggtcttacaaacttcttat 69862  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa- 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |  |||||||| |||||||||||||     
T  69863 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcggctaattcagaagctgacatgcgataaggtgccatcgacaccgatttcgttcccggaacaagatcaat 69962  T
Q  407 -------------gtcctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                   ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||| ||||| |  ||||||    
T  69963 cgagaactcaacttccctttctggtggcacatcaggaatctcatccggaaaaacttcaggaaattcattcaccactggtaacctgtcaattatagcttga 70062  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||  |  || ||||| ||||| || |||||||| |  || ||||| ||| |||  ||||||| ||| |||||||  |  |||||||| ||||| || |    
T  70063 ttctttaacgacaaagatgccatcaaagaaaacataagaattccatctcgtcccaactgcttcaactgtttagtagttaggaactctgctccactctctt 70162  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||| ||||| ||   |||| | |||||||| |||  |||  |||| ||||||||||| ||||| || | ||| |||||||| ||  ||||    
T  70163 cttccgcagaagacaaatgcaccatcttgttgaaacaatttatataaactcggttatactctaaccaattcatcccaaaaataacatacattcccatcaa 70262  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     |||||||| ||||| || |  |||||||| | ||||||||||||||| |||||  | ||||| || |||||| |||| || |||||||| ||| |||||    
T  70263 cggtagacacactaagtcgacctcaaaatctctaccaaacatagacaacggacaccttaaacaaactagagaagtagttactgaacccttggctagagtt 70362  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || ||||| || |||||    
T  70363 tcaacaacaatttctcc 70379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 8 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 3066 - 2255
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || || ||||| || || ||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  3066 cgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaagccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacct 2967  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| ||||||||||| |||||   ||||||||||||| ||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| || || || || || ||||||||     
T  2966 caagtcaatcttgctgaaaacctttgcacccactaactgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttatttattgtaactttgttcaat 2867  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||| || |||| ||| |||   || |||||||| || | ||| |  | ||||||| | |||||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  2866 tgacgatagtcaatgcataacctcatgctattgtccttcttcttaaccaacaacatcgacgctccccacggtgaaacactgggtcttacaaacttcttat 2767  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||     
T  2766 cgagcaagtcctccaactgtttcttcaattcagctaactcgaaagctgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttagttcctggaacaaggtcaat 2667  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              || |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||| || |||| ||||||||||||  |||||    
T  2666 tgaaaattcaacctcccgctctggtggtacatctggaatctcatccggaaaaacttcaggaaactcattcactactggtaacctatcaatcacaacttga 2567  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    || || |  || ||| | ||||| || |||||||| |  || ||||| || ||||  | ||||| ||| |||||||| |  ||||| || ||||| || |    
T  2566 ttttctaacgacaaatatgccatcaaagaaaacataagaattccatcacgctccaactacttcaactgtttagtagataggaactccgctccactctctt 2467  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatac-ccagaatcacatacataccactca 692  Q
    ||||  |  |||| ||||| || | ||||||||| ||||| ||| ||||  |||| ||||||||||||||||| | | | ||| |||| |||| |  |||    
T  2466 cttccgcaaaagaaaaatgcaccgtcttgctaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatcctcaaaaataacatccatagcggtca 2367  T
Q  693 aaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagt 792  Q
    |  ||| ||||||||| || | |||||| || | ||||||||||||||| | |||| | | ||| || |||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  2366 acagtaaacaaactaagtcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacgaacatcttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagt 2267  T
Q  793 ttcgacaaccat 804  Q
    ||| ||||||||    
T  2266 ttcaacaaccat 2255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2004 (Bit Score: 181; Significance: 2e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold2004
Description:

Target: scaffold2004; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 8 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 922 - 528
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||   || |  |||    
T  922 cgaaaggcatcactttatattcatagtgaccataccgcgttctaaaagctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatcttctgc--actt--tct 827  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||    
T  826 caaatctatcttgctgaaaacacttgcacccactaactaatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctttattgttacttttttcaac 727  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||| | |||||||| |  |||||||||||||| ||||    
T  726 tgtcgataatcaatacacaacctcatgctaccatccttcttctttactaacaacacaggcgctccccatggtgaaacacttggtctaacaaactttttct 627  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    ||||||| || || || |||||||||||||| |  ||||| |||||  ||||||||||||||| ||| || || | |||||||| ||||||||||||||    
T  626 caagcaaatcttctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctaacatacgataaggtgtcatagacacagccttcgttctaggaacaagatcaa 528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 181; Significance: 2e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 61 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 5149 - 4386
Alignment:
Q  61 ttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattat 160  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| |  || || || || |||||||||||| ||||||| |||| ||    
T  5149 ttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaaatcaatttgtctgaacacacgagcacccactaactgatccattaaatcat 5050  T
Q  161 caattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaa 260  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || || || || |||| ||| || ||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||| || | |||    
T  5049 caattctcggaagtggatatctattctttatcgtcactttattcagctgacggtaatctatacacaatctcatactaccatccttcttcttaaccaacaa 4950  T
Q  261 aactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacata 360  Q
     || || |||||| |||||||||| | |||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||| ||||||||| || ||||||    
T  4949 tacaggggctccccaaggtgaaacactcggtcttacaaatttcttatcaagtaaatcctccaattgtttctttaattcagctaactcggacgccgacata 4850  T
Q  361 cgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaagt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaa 446  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |              ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  4849 cgagaaggtgccatcgacactggcttcattcccggaacaagatcaattgaaaattcaacctccctctctggtggaacatcaggaatctcatcaggaaaaa 4750  T
Q  447 cttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttc 546  Q
    |||| ||||||| |  ||| ||||| |  ||||||||||| |  |||||||| |  || ||  | ||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  4749 cttctggaaattgattcacaaccggaaatctatcaatcacagactgattctctaacgacaagtatgccatcaaagaaaacattaagatcccatcacgttc 4650  T
Q  547 cagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtgg 646  Q
     |  | ||||||||||||||||| ||| ||||| ||   |||||| || ||  | |||||||||||||| | ||| |||||||| || ||| ||||  ||    
T  4649 taactacttcagctgcttagtagtcaagaactcagctttactttcttcctcagcagaagagaaatgtaccgtcttactaaaacagttgatatgaacacgg 4550  T
Q  647 ttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggac 746  Q
    || || |||||||||||||| || || || |||| || |||  |||| || | ||| || | ||| | |||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  4549 ttatattctaaccagttcatcccaaggattacatccaaacccgtcaacggcaaacatacaagatcaacttcaaagtctctaccaaacatagacaaaggac 4450  T
Q  747 atttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |  ||||||| || | |||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  4449 aactcaaacaaacaaaagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcc 4386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 178; Significance: 1e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 11021 - 11837
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || || || || ||  | || || || ||||||||||| |  || |||||||||||||| || ||||| || ||    
T  11021 cgaaaggcatcactttatattcataatgcccgtatcgtgtcttaaaggccgttttctgcatatctttttctttcactttaatctgatggtaacccgacct 11120  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| ||||||||| | || || ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || || || ||||||    
T  11121 caagtcaatcttgttgaacacgcgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctttattgtcactttattcaac 11220  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    ||  | ||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||| || | ||| || ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  11221 tgaaggtaatctatacacaatctcatgctaccatctttcttcttaaccaacaacaccggcgctccccaaggtgaaacgctcggtcttacaaacttcttat 11320  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||| || || |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||| ||||||||     
T  11321 caagtaaatcctccaactgtttcttcaactcagctagctcagacgccgacatacggtaaggcgccatcgacacaggcttcgtacccggaataagatcaat 11420  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||  ||| ||||| |  ||||||||||| || |||    
T  11421 tgaaaattcaacttccctctctggcggcacatcaggaatctcatcaggaaaaacctctggaaattcattcacaaccggcaatctatcaatcacagcctga 11520  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||| |  || ||  | | ||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| |  ||||| ||||| ||||||| ||| |||||  |   ||| || |    
T  11521 ttctccaatgacaagtatgtcatcaaggaaaagattaagatcccatcacgttctaactgctttagctgtttagtagtcaagaactcaactttactctctt 11620  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    | ||  |  |||| ||||| |||| ||| |||||||| || ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| || | ||| |||| ||||||   |||    
T  11621 cctcagcaaaagaaaaatgcactgtcttactaaaacagttgatatgaacatggttatactccaaccagttcatcccaaaaattacatccatacccgacaa 11720  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
      | | ||| || | ||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||| |||| |  ||||||||||||||||||    
T  11721 cagcaaacatacaagatcaacttcaaaatctctaccaaacatagacaaaggacaactcaaacaaacaagagaagtagttattgaacccttagctggagtt 11820  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || |||||||| |||||    
T  11821 tcaacaaccatttctcc 11837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 178; Significance: 1e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 49297 - 50112
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  49297 cgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacct 49396  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||| ||||| || || || |||||||||||| ||||||| |||  ||| || ||| |||||||||||||| |||| || || || || ||||||    
T  49397 caaatcaattttgctgaatacacgagcacccactaactgatccattaaaccatcgatcctcagaagtggatacctaatctttatcgtcactttattcaac 49496  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    |  || ||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| || | ||| || ||||||||| |||||||||| |  ||||| || || ||||| |    
T  49497 taacggtaatcaatacataacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttac-aatttcttat 49595  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||     
T  49596 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagctaactcggacgctgacatacggtaaggtgccatcgatatcggcttcgttcctggaacaaggtcaat 49695  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              ||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| ||||| |  || |||||||| ||||||    
T  49696 tgaaaattcaacctccctttctggtggcacatctggaatctcatcaggaaaaacttctggaaattcattcacaaccggcaatctgtcaatcacagcttga 49795  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||| |  || |   | ||||| || |||||||| |  || ||||| ||||| |  | ||| | ||| |||||||  |  ||||| ||  |||| || |    
T  49796 ttctccaatgacaggtatgccatcaaagaaaacattagaattccatcacgttctaactacttgaactgtttagtagttaggaactcagcttcactctctt 49895  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||| ||||| || | ||| ||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| || | ||| |||| ||||||  ||||    
T  49896 cttccgcagaagaaaaatgcaccgtcttactaaagcaattgatatgaacttggttatactctaaccatttcatcccaaaaattacatccatacccgtcaa 49995  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     ||||  ||||| | ||| | |||||| || | ||||||||||||||| |||||  | | ||| || |||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  49996 cggtaagcaaacaagatcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaacttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtt 50095  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || ||||| || |||||    
T  50096 tcaacaacaatttctcc 50112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 174; Significance: 3e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 64632 - 63816
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||| ||||| || |||||||| || |||||||| || || || || |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||    
T  64632 cgaacggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggacgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaaccggacct 64533  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| || || || ||| |||||||| |||| || |||  |||||| |||| |||||||||||||||||| || || || || |||| |    
T  64532 caaatcaatcttgctgaacacacgagcatccactaactgatcaattaaaccatcaatcctcgtaagtggatacctattctttatcgtcactttattcagc 64433  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || || ||||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||| || | ||| || | ||||||| |||||||||| |  ||| | ||||| ||||| |    
T  64432 tgacggtaatctatacataacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccgacgctccccaaggtgaaacacttggtgttacaaatttcttat 64333  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||     
T  64332 caagcaagtccttcaactgtttcttcaactcagctaactcggacgccgacatacggtaaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaaggtcaat 64233  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              ||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||  ||| ||||| |  || |||||||| ||||||    
T  64232 tgaaaattcaacctccctctctggtggcacatctggaatctgatcaggaaaaacttctggaaattcattcacaaccggcaatctgtcaatcacagcttga 64133  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||| |  || ||  | ||||| || |||||||| |  || ||||| || ||||  ||||||| ||| |||||||  || ||||| ||  |||| || |    
T  64132 ttctccaatgacaagtatgccatcaaagaaaacattagaattccatcacgctccaactgcttcaactgtttagtagttaagaactcagcttcactctctt 64033  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||    ||||| ||||| |  | ||| ||||| ||||| ||| ||||  |||| ||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||   |||    
T  64032 cttcagtagaagaaaaatgcatcgtcttactaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaatcacatccatacccaacaa 63933  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     || | ||| |||| ||| | |||||| || | ||||||||||||||| |||||  ||||||| || |||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  63932 cggcaaacatactagatcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaactcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtt 63833  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || |||||||| |||||    
T  63832 tcaacaaccatttctcc 63816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 173; Significance: 1e-92; HSPs: 3)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 526 - 810
Target Start/End: Original strand, 10509 - 10793
Alignment:
Q  526 catcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgcta 625  Q
    |||||| || |||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||  | ||||||||||  |||||||| |||    
T  10509 catcaaaattccatcaggttccaactgcttcagctgcttagtagacaaaaactctacgctactttcctcttccgcagaagagaaatacactgacttacta 10608  T
Q  626 aaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcac 725  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  10609 aaacaattaatgtgaacatggttgtactctaaccagttcataccaaggattacatccattccactcaaaggtaaacaaactaaatcaatttcaaaatcac 10708  T
Q  726 gaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10709 gaccaaacatagacaatggacatctcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 10793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 1659 - 842
Alignment:
Q  7 acgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatc 106  Q
    ||||||| ||| || |||||||| || |||||||| || || || || || |||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || || ||||| |    
T  1659 acgaaagacatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggcagtcttctgcatatccttatccttcaccttgatctgatggtagcctgacc 1560  T
Q  107 tcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 206  Q
    |||| |||||||| || ||||| |  |||||||||| | |||||||||| | |||||| ||||| || ||||  || ||||| || || || || |||||    
T  1559 tcaagtcaatcttactgaaaaccctcgcacccactagctgatccatcaagtcatcaatcctcgggagcggatgtctgttctttattgtaactttattcaa 1460  T
Q  207 ctgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttc 306  Q
    ||| ||||| ||||| || | || |||||| ||||| ||||||||||| | ||| || ||||||||| | |||||||| | |||||| |||||||||||     
T  1459 ctgacgatattcaatgcatagcctcatacttccatccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgaaacactcggtcttacaaacttctta 1360  T
Q  307 tcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||    
T  1359 tcaagcaagtcttccaactgattcttcaattcagccaactcagatgctgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaaggtcaa 1260  T
Q  407 gt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttg 492  Q
     |              ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  ||||  |||| | | ||||| || || ||    
T  1259 ttgaaaattcaacttccctttctggcagcacatcaggaatctcatctggaaacacctcaggaaaatcacttaccattggtaacttgtcaattacagcctg 1160  T
Q  493 attctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcc 592  Q
    |||||| |  || || || ||||| || ||  ||||||  || ||||| ||||| || ||||||| ||| || |||| ||| || ||  | ||||  ||     
T  1159 attctccaacgacaacgatgccatcaaggagtacatcagaattccatcacgttctagctgcttcatctgtttcgtagtcaagaattcaactccaccctct 1060  T
Q  593 tcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactca 692  Q
    |||||  | ||||| ||||| |||| |||||||||  | || ||| ||||  |||| ||||||||||| ||||| || | ||| |||| ||| ||  |||    
T  1059 tcttcagcagaagaaaaatgcactgtcttgctaaagtagtttatatgaactcggttatactctaaccaattcatcccaaaaatgacatccattcccgtca 960  T
Q  693 aaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagt 792  Q
    | |||||||||||||| || |  |||||||| | |||||||||||| | ||||||  ||||||| || || ||| ||||||| ||||||||||||| |||    
T  959 acggtagacaaactaagtctacctcaaaatccctaccaaacatagatagaggacacctcaaacaaacaagggaagtagtcactgaacccttagctgaagt 860  T
Q  793 ttcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  859 ttcaacaaccatctctcc 842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 10359 - 10506
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10359 cgaaaggcatcaccttatactcataatgaccatcccgcgttctaaaagctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgatct 10458  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaa 155  Q
    |||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  10459 caaatctatcttgctgaaaacacatgcacccactaactgatccatcaa 10506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 173; Significance: 1e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 8 - 804
Target Start/End: Original strand, 33527 - 34338
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || |||||||| || || ||||| || || || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  33527 cgaaaggcatcaccttatattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacattaatctgatggtaacctgacct 33626  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttga-tagttaccttgttcaa 206  Q
    ||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||  ||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||| | | || |||||||||||    
T  33627 caagtcaatcttgttaaacacacgtgcacccactaattgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctttaatggtaaccttgttcaa 33726  T
Q  207 ctgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttc 306  Q
    ||| ||||||||||| || |||| ||  |||||||| |||||||| || | ||| ||||||||| || | |||||||| |  ||||| ||||| |||||     
T  33727 ctgacgataatcaatgcataacctcaagctaccatccttcttcttaaccaacaacactggcgcttcccacggtgaaacacttggtcttacaaatttctta 33826  T
Q  307 tcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||    
T  33827 tcaagcaagtcctccaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatacgataaggtgccatcgacaccggattcgttcctggaacaaggtcaa 33926  T
Q  407 gt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttg 492  Q
     |              ||| ||||| ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| |||||||||  ||  |  || | ||| |||||||| |||||    
T  33927 ttgaaaattcaacctccctttctggtggcacatctcgaatttcatcaggaaacacttctggaaattcattcataattggcaacctttcaatcaccgcttg 34026  T
Q  493 attctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcc 592  Q
    ||| ||||  || ||  | ||||| || ||||||||||  || ||||| |||||||  ||||||| ||| |||||||| |  ||||| || ||||| ||     
T  34027 attttcaaatgacaagtatgccatcaaagaaaacatcagaattccatcacgttccaactgcttcaactgtttagtagataggaactccgctccactctct 34126  T
Q  593 tcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactca 692  Q
    |||||    ||||| ||||| || | |||||||||  |||| ||| ||||  | |||||||||||||||||||| || | ||| |||| ||||||  |||    
T  34127 tcttcagtagaagaaaaatgcaccgtcttgctaaagtaattgatatgaactcgattgtactctaaccagttcatcccaaaaattacatccatacccgtca 34226  T
Q  693 aaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagt 792  Q
    | | || ||||||||  || | |||||| ||   ||||||||||||||| |||||  | | ||| || ||||||||||  || ||||||||||||||| |    
T  34227 acgataaacaaactaggtcgacttcaaagtctttaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaaatagctactgaacccttagctggaat 34326  T
Q  793 ttcgacaaccat 804  Q
    ||| ||||||||    
T  34327 ttcaacaaccat 34338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 173; Significance: 1e-92; HSPs: 4)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 55102 - 54850
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  55102 aaaggcataactttatattcatagtgaccatatcgtgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggttataacctgatctca 55003  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  55002 aatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcttggaagtggatatctattcttgatagttactttgttcaactg 54903  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaa 262  Q
     || ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  54902 acggtaatcaatacataatctcatactaccatctttcttcttcactaacaaaa 54850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 269 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 52777 - 52430
Alignment:
Q  269 ctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataagg 368  Q
    ||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  52777 ctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaattcttctaactgtttcttcaactcagctaactcggaagctgacatacgataagg 52678  T
Q  369 tgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag-------------tc-ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcagga 454  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||||||              || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  52677 tgccatagacacaggcttcgttccaggaacaagatcaatagaaaactcaacttctctctctggaggcacatcagtaatttcatctggaaaaacttcagga 52578  T
Q  455 aattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgct 554  Q
    || || || |||||  ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  52577 aaatcgcataccacttgtaccttatcaatcactgcttgattctcaatagataaggaagccatcgaggaaaacatcaacataccatcgcgttccagctgct 52478  T
Q  555 tcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacgg 602  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  52477 tcagctgcttggtagacaagaactctacaccactttcctcttcgacgg 52430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 350
Target Start/End: Original strand, 109823 - 110165
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||    
T  109823 cgaaaggcatcaccttatattcataatgaccatatcgtgtcctaaaagccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaaccagacct 109922  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||| || ||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||| ||||||||    
T  109923 caaatcaattttactaaacacacgtgcacccactaactgatccattaaatcgtcaattctcggaagcggatacctgttctttatcgtaaccatgttcaac 110022  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    |  ||||||||||| || |||| | | || ||||| |||||||| || |  || || ||||||||| | | |||||| |  ||||| ||||| ||||| |    
T  110023 ttacgataatcaatgcataacctcgtgctgccatccttcttcttaacaaataacaccggcgctccccacgatgaaacacttggtcttacaaatttcttat 110122  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcgga 350  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| || | |||||||||    
T  110123 caagcaactcctccaattgtttcttcaattcggctaactcgga 110165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 409 - 810
Target Start/End: Original strand, 110216 - 110617
Alignment:
Q  409 cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaa 508  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||  || || | ||| |||||||| |||||||| || |  || ||     
T  110216 cctctctggtggcacatctggaatctcatcgggaaaaacttctggaaattcattcatgactggcaacctgtcaatcacagcttgattttccaatgacaag 110315  T
Q  509 gaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagaga 608  Q
     | ||||| || |||||||| |  || ||||| || ||||  ||||||| ||| |||||||| |  ||||| || ||||| || |||||  | ||||| |    
T  110316 tatgccatcaaagaaaacattagaattccatcacgctccaactgcttcaactgtttagtagataggaactcggctccactctcttcttctgcagaagaaa 110415  T
Q  609 aatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaa 708  Q
    |||| || | ||||||||| ||||| ||| ||||  |||| ||||||||||||||||| || | ||| |||| ||||||  ||||||||| ||||||||     
T  110416 aatgcaccgtcttgctaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaattacatccatacccgtcaaaggtaaacaaactag 110515  T
Q  709 atccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctct 808  Q
     |  | |||||| || | ||||||||||||||| |||||  | | ||| || |||||| |||| || ||||||||||| |||||||  |||||||| |||    
T  110516 gttgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagccggagttttaacaaccatttct 110615  T
Q  809 cc 810  Q
    ||    
T  110616 cc 110617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 171; Significance: 2e-91; HSPs: 4)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 8 - 739
Target Start/End: Original strand, 4942 - 5687
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |  || || || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  4942 cgaaaggcatcaccttatattcatagtaaccataacgtgacctaaaggccgtcttcggcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacct 5041  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||    
T  5042 caagtcaattttactaaacacacgtgcacccactaattgatccattaaatcgtcaattctcggaagtggatacctgttctttatcgtaaccttattcaac 5141  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || || |||||||| || |||| |||  ||||||| |||||||| || | ||| ||  |||||||| |||||||||| |   |||| ||||||||||| |    
T  5142 tgtcggtaatcaatgcataacctcatggtaccatcattcttcttaaccaacaacaccagcgctccccaaggtgaaacactttgtcttacaaacttcttat 5241  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |  ||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||     
T  5242 caagcaagtcctccaactatttcttcaattcagcaagttcggacgccgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaaggtcaat 5341  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |               |||||  | |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||  ||| || || | | |||||||||| ||||||    
T  5342 tgaaaattcaacctcactctcaagtggcacatctggaatctcatcaggaaaaacctcaggaaactcattcacaactggcaacatatcaatcacagcttga 5441  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||| |  || ||| | ||||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||  ||||||| ||| || ||||| |  ||||| || ||||| || |    
T  5442 ttctctaacgacaaatatgccatcaaagaaaacattaagattccatcccgctccaactgcttcaactgtttcgtagataggaactccgctccactctctt 5541  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||    ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| ||| ||||  |||| ||||||||||| ||||| || | ||| |||| ||||||  ||||    
T  5542 cttccgtagaagaaaaatgcactgtcttgctaaagcaattgatatgaacccggttatactctaaccaattcatcccaaaaataacatccatacccgtcaa 5641  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagac 739  Q
     |||| ||||||||| || | |||||| || | |||||||||||||    
T  5642 cggtaaacaaactaagtcgacttcaaagtctctaccaaacatagac 5687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 58 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 42170 - 41851
Alignment:
Q  58 gtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaat 157  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||    || ||   ||||||||||||| ||||||||||||    
T  42170 gtcttctgaatatccccatctttcactttgatctggtgatagcctgatcttaagtcaatcttaaagaacacaaatgcacccactaactgatccatcaaat 42071  T
Q  158 tatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactag 257  Q
      || || ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||| || |     
T  42070 cgtcgatcctcagaagtggatacctattctttattgtcactttgttcaactgccggtaatctatacacaacttcatgctaccatctttcttcttaaccaa 41971  T
Q  258 caaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagac 357  Q
    ||| || | ||||||| ||||||| || | || ||| ||||||||||| || | ||| || || ||||  || |||||||||| ||| || ||||| |||    
T  41970 caacaccgacgctccccaaggtgacacactcgatctcacaaacttcttatccaacaaatcgtctaactactttttcaactcagctaattccgaagctgac 41871  T
Q  358 atacgataaggtgccatcga 377  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  41870 atacggtaaggtgccatcga 41851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 651 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 41563 - 41411
Alignment:
Q  651 actctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacattt 750  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||| || | ||| ||||| |||| | |||||||   ||||||||| ||||| ||| | ||    
T  41563 actccaaccagttcatgcctagtatcacatccatcccactcaacggcaaacagactaagtccactacaaaatctataccaaacatcgacaa-ggatactt 41465  T
Q  751 caaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 804  Q
    ||| ||||  | |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  41464 caagcataataaagaagtagtcaccgaacccttagccgaagtttcgacaaccat 41411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 690 - 804
Target Start/End: Original strand, 5692 - 5806
Alignment:
Q  690 tcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctgg 789  Q
    |||| |||| ||||||||| || | |||||| || | ||||||||||||||| |||||| | | ||| || |||||| |||| || |||||| |||||||    
T  5692 tcaacggtaaacaaactaagtcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacatcttagacaaacaagagaagtagttactgaacccatagctgg 5791  T
Q  790 agtttcgacaaccat 804  Q
    |||||| ||||||||    
T  5792 agtttcaacaaccat 5806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 170; Significance: 8e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 8 - 401
Target Start/End: Original strand, 693 - 1086
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  693 cgaatggcatcaccttatattcataatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacct 792  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||| |||| |||||||| || || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || || || || ||||||    
T  793 caaaccaattttgctaaacacacgagcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagttgatacctattctttatcgtcactttattcaac 892  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || |  ||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||| || | ||| || ||||||||| | ||||||||   |||||| ||||| ||||| |    
T  893 tgacattaatctatacacaacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccggcgctccccacggtgaaacattcggtcttacaaatttcttat 992  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaag 401  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  993 caagtaaatcctccaactgtttcttcaactcagctaactcggacattgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccgggaacaag 1086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 419 - 810
Target Start/End: Original strand, 5217 - 5609
Alignment:
Q  419 ggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccatta 518  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||  |||  | || |  |||||||| || ||||||||||| |  || ||  | ||||| |    
T  5217 ggcacatcaggaatctcatcaggaaaaagttctggaaattcattcacagctggaaatctatcaattacagcttgattctccaacgacaagtacgccatca 5316  T
Q  519 atgaaaacatcaagatacca-tcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactg 617  Q
    | |||||||| ||||| ||| || ||||| |  ||||||| ||| ||||||| ||| ||||| ||  | || || ||||| || ||||| |||||||| |    
T  5317 aggaaaacattaagatcccaatcacgttctaactgcttcaactgtttagtaggcaagaactcagcttcgctctcttcttcaacagaagaaaaatgtaccg 5416  T
Q  618 acttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttc 717  Q
     ||| ||||| ||||||||| ||||  |||| ||||||||||| ||||| || | ||| |||| ||| ||   ||| || | ||| |||| ||  | |||    
T  5417 tcttactaaagcaattaatatgaacacggttatactctaaccaattcatcccaaaaattacatccatgcccgacaacggcaaacatactagattgacttc 5516  T
Q  718 aaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||| || | ||||||||||||||| |||||  ||||||| |  |||||| |||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  5517 aaagtctctaccaaacatagacaacggacaagtcaaacaaataagagaagtagttactaaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcc 5609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 170; Significance: 8e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 8 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 79944 - 79359
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||    
T  79944 cgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacct 79845  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||| || ||||    |||||| || ||| |||||||||| | |||||| |||| |||||||||||| ||||| || || || |||||||||    
T  79844 caagtcaatcttactgaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaagtcatcaatcctcgaaagtggatacctgttctttatggtaactttgttcaac 79745  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||| ||||| | ||| |||||||| ||||||||||| | ||| || ||||||||| | |||||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  79744 tgacgatagtcaatgcacaatctcattctaccatccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgaaacactgggtcttacaaacttcttat 79645  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc--- 404  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| || || || |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||       
T  79644 caagcaagtcttccaactgtttcttcaattcagctaattcagatgctgacatacgataatgtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaaggtcgat 79545  T
Q  405 ----aagt-------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
        || |       ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  79544 ggagaactcaacctccctctctggtggcacatctggaatctcatccggaaaaacttcaggaaattcattcaccactggtaacctatcaatcacagcttga 79445  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactc 579  Q
    || || |  || ||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||| ||||| ||||| |||| ||| || ||||||||||||||    
T  79444 ttttctaatgacaaatatgccattaaagaatacatcaaaattccatcacgttctagttgtttcatctgtttcgtagacaaaaactc 79359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 165 - 810
Target Start/End: Original strand, 60087 - 60746
Alignment:
Q  165 tctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaact 264  Q
    ||||||||||||||| || ||||| || || || || |||| ||| |  ||||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||| || | ||| ||     
T  60087 tctcggaagtggatatctgttctttatcgtcactttattcagctgacagtaatctatacataacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaatacc 60186  T
Q  265 ggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgat 364  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||| ||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||    
T  60187 ggcgctccccaaggtgaaacactcggtcttacaaatttcttatctagtaaatcctccaactgtttcttcaattcagctaactcggacgccgacatacgat 60286  T
Q  365 aaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaagt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttc 450  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| | |              ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  60287 aaggtgccatcgacaccggcttcgttccgggcacaagatcgattgaaaattcaacctccctctctggtggcacataaggaatctcatcaggaaaaacttc 60386  T
Q  451 aggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagt 550  Q
     |||||||||  ||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||| || |||||||| || || ||||| || || |      
T  60387 cggaaattcattcacaaccggcaatctatcaatcactgcttgattctcaaaagataagtatgccatcaaagaaaacattaaaatcccatcacgctctaaa 60486  T
Q  551 tgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgt 650  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||| ||||| ||  ||||||| |||||  | ||||| ||||| || | ||| ||||| ||||||||| ||||  |||| |    
T  60487 tgcttcaactgtttagtagtcaagaactcagcttcactttcttcttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttactaaagcaattaatatgaacacggttat 60586  T
Q  651 actctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacattt 750  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||| ||||||   ||| || | ||| |||| ||| | |||||| || | ||||||||||||||| |||||  |    
T  60587 actctaaccagttcatcccaaaaatcacatccatacccgacaacggcaaacatactagatcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaact 60686  T
Q  751 caaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||| || |||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  60687 caaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcc 60746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 169; Significance: 3e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 9574 - 8759
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || || ||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||    
T  9574 cgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaagccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacct 9475  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| ||||| |  | ||||||   ||||||||||| | ||||| |||| | |||||| ||| ||||||||||||| ||||| || || || || ||||||    
T  9474 caagtcaatttaacaaaaaacctttgcacccactagctgatccgtcaagtcatcaatcctcagaagtggatacctgttctttattgtaactttattcaac 9375  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||| ||||||  |||||||||||| | ||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||| || |  ||||| ||||||||||| |    
T  9374 tgacgatagtcaatgcacaacttcatactaccatcctccttctttaccaacaaaaccggcgctccccaaggtgagacacttggtcttacaaacttcttat 9275  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||  |  | ||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||  ||||     
T  9274 caagcaagtcttccaaccgtttcttcaactcagcaagttaggacgccgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaacgtcaat 9175  T
Q  408 t----------cctctct----ggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |          |||||||    || |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||  ||| ||| |||||||| ||||||    
T  9174 tgaaaattcaacctctctctccggtggcacatctggaatctcgtcaggaaaaacttcaggaaattcattcaccactagtaacctgtcaatcacagcttga 9075  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||| |  || ||| | |||||||| ||| ||||||  |  ||||| ||||| ||||| |||| ||| || |||||||| |||||  |  |||  || |    
T  9074 ttctctaacgacaaatatgccattaaagaatacatcagaaatccatcacgttctagttgtttcatctgtttcgtagacaagaactcaacttcaccctctt 8975  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    |||| || ||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||  |||| ||||||||| |||| || || | ||| || | ||| ||  ||||    
T  8974 cttcaacagaaga-aaatgcactgtcttgctaaaacaattgatatgaacccggttatactctaactagtttatcccaaaaataacgtccattcctgtcaa 8876  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     |||| ||| |||| ||| | |||||| || | ||||||||||||||| |||||  | | ||| || |||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  8875 cggtaaacacactagatcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacacacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtt 8776  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || |||||||| |||||    
T  8775 tcaacaaccatttctcc 8759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 19788 - 18973
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || || ||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||    
T  19788 cgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaagccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacct 19689  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| ||||| |  | ||||||   ||||||||||| | ||||| |||| | |||||| ||| ||||||||||||| ||||| || || || || ||||||    
T  19688 caagtcaatttaacaaaaaacctttgcacccactagctgatccgtcaagtcatcaatcctcagaagtggatacctgttctttattgtaactttattcaac 19589  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||| ||||||  |||||||||||| | ||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||| || |  ||||| ||||||||||| |    
T  19588 tgacgatagtcaatgcacaacttcatactaccatcctccttctttaccaacaaaaccggcgctccccaaggtgagacacttggtcttacaaacttcttat 19489  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||  |  | ||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||  ||||     
T  19488 caagcaagtcttccaaccgtttcttcaactcagcaagttaggacgccgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaacgtcaat 19389  T
Q  408 t----------cctctct----ggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |          |||||||    || |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||  ||| ||| |||||||| ||||||    
T  19388 tgaaaattcaacctctctctccggtggcacatctggaatctcgtcaggaaaaacttcaggaaattcattcaccactagtaacctgtcaatcacagcttga 19289  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||| |  || ||| | |||||||| ||| ||||||  |  ||||| ||||| ||||| |||| ||| || |||||||| |||||  |  |||  || |    
T  19288 ttctctaacgacaaatatgccattaaagaatacatcagaaatccatcacgttctagttgtttcatctgtttcgtagacaagaactcaacttcaccctctt 19189  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    |||| || ||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||  |||| ||||||||| |||| || || | ||| || | ||| ||  ||||    
T  19188 cttcaacagaaga-aaatgcactgtcttgctaaaacaattgatatgaacccggttatactctaactagtttatcccaaaaataacgtccattcctgtcaa 19090  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     |||| ||| |||| ||| | |||||| || | ||||||||||||||| |||||  | | ||| || |||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  19089 cggtaaacacactagatcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacacacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtt 18990  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || |||||||| |||||    
T  18989 tcaacaaccatttctcc 18973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 168; Significance: 1e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 25306 - 26119
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||  | || || || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || ||    
T  25306 cgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatattgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatttgatggtaaccagacct 25405  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| ||||| || |||||||||  ||||||||| ||| | |||||||| | ||||| ||||||||||||||| || ||||| || || || |||||||||    
T  25406 caagtcaattttactaaaaacttttgcacccaccaactggtccatcaagtcatcaaatctcggaagtggatatctgttctttattgtaactttgttcaac 25505  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||   ||||||||| | ||| || ||||||||| | || ||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  25506 tgacgatagtcaatgcacaatctcatactaccatc---cttctttaccaacaacacaggcgctccccatggcgaaacactgggtcttacaaacttcttat 25602  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa- 406  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||     
T  25603 catgcaagtcctccaactgtttcttcaactcggataattcagaagctgacatgcgatacggtgccatcgacaccggtttcgttcccggaacaagatcaat 25702  T
Q  407 -------------gtcctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                   ||| |  ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||  ||||| || ||||||    
T  25703 cgagaactcaacttcccttttcggtagcacatcaggaatctcatccggaaaaacttcagggaattcattcaccactggtagcccgtcaattacagcttga 25802  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||| |  || ||||| ||||| || |||||||| |  || ||||| |||||||  ||||||| ||| |||||||  | ||||||||| ||||| |  |    
T  25803 ttctctaacgacaaagatgccatcaaagaaaacataagaattccatctcgttccaactgcttcaactgtttagtagttagaaactctgctccactatgtt 25902  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||    ||||| || || || | |||| |||||||||| |||  |||  |||| ||||||||||| ||||| || | ||| |||| ||| ||  ||||    
T  25903 cttccgaagaagaaaagtgcaccgtcttgttaaaacaatttatacaaactcggttatactctaaccaattcatcccgaaaataacatccattcccatcaa 26002  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     |||||||| ||||| || |  |||||||| | ||||||||||||||| |||||  | ||||| || |||||| |||| || |||||||| |||||||||    
T  26003 cggtagacacactaagtcgacctcaaaatctctaccaaacatagacaacggacaccttaaacaaactagagaagtagttactgaacccttggctggagtt 26102  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || |||||||| |||||    
T  26103 tcaacaaccatttctcc 26119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 168; Significance: 1e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 58 - 810
Target Start/End: Original strand, 21363 - 22129
Alignment:
Q  58 gtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaat 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||  ||||||||| |   |||||| ||| |    
T  21363 gtcttctgcatatcctcatccttcactttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaacttttgcacccaccacttgatccaccaagt 21462  T
Q  158 tatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactag 257  Q
      ||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||| || ||||||||||| |     
T  21463 cgtcaatcctcggaagtggatacctgttctttatcgtaactttgttcaactgacgataatcaatgcacaacctcatgctaccgtccttcttctttaccaa 21562  T
Q  258 caaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagac 357  Q
    ||| || ||||||||| | |||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || || |||    
T  21563 caacacaggcgctccccacggtgaaacactaggtctaacaaacttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaattcagctaactcagacgctgac 21662  T
Q  358 atacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaagt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaa 443  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||| ||||| |||||||| |||| |              ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  21663 atacgataaggtgccatcaacaccggctttgttcctggaacaaggtcaattgaaaattcaacctccctatctggtggcacatcaggaatctcatcaggaa 21762  T
Q  444 aaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcg 543  Q
    | ||||| |||||||||  ||||||| | | | | |||||||  |||||||| || |  || ||| | |||||||| ||| |||| |  || ||||| ||    
T  21763 acacttctggaaattcattcaccaccagcaacttgtcaatcaaagcttgattttctaacgacaaacatgccattaaagaatacataagaattccatcacg 21862  T
Q  544 ttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacg 643  Q
     || ||||| |||| ||| || |||||||| |||||  |  |||  || |||||  | ||||| ||||| || | ||| ||||| ||||| ||| ||||     
T  21863 atctagttgtttcatctgtttcgtagacaagaactcaacttcaccctcttcttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttactaaagcaattgatatgaact 21962  T
Q  644 tggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaag 743  Q
     |||| ||||||||||| ||||| || | ||| |||| ||||||  |||  || | |||||||||||| |  |||||||| | ||||||||||||||| |    
T  21963 cggttatactctaaccaattcattccaaaaataacatccatacccgtcagcggcaaacaaactaaatcgacctcaaaatctctaccaaacatagacaatg 22062  T
Q  744 gacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||  | | ||| || |||||| |||| || |||| |||||||  |||||| |||||||| |||||    
T  22063 gacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacacttagctaaagtttcaacaaccatttctcc 22129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 59 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 27310 - 27055
Alignment:
Q  59 tcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaatt 158  Q
    ||||||| || |||||||| |||| ||| ||| ||||||| || ||||| || ||||| || || || || ||||||||||||||| ||| ||||||||     
T  27310 tcttctgaatgtcctcatctttcagtttgatccggtgatagcccgatcttaagtcaattttactgaacacacgtgcacccactaactgatacatcaaatc 27211  T
Q  159 atcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagc 258  Q
    ||  || ||||||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||| || || |      
T  27210 attgatcctcggaagtggatacctattctttattgtcactttattcaactgccggtaatctatacataacctcatgctaccatctttctttttaaccaat 27111  T
Q  259 aaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaa 314  Q
    || || ||||||||| |||| || || | ||| || ||||||||||| ||||||||    
T  27110 aacaccggcgctccccaaggcgacacactcggccttacaaacttcttatcaagcaa 27055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 167; Significance: 5e-89; HSPs: 3)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 8 - 498
Target Start/End: Original strand, 11986 - 12491
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  11986 cgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacct 12085  T
Q  108 caaat-caatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 206  Q
    ||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| || || || || ||||     
T  12086 caaattcaattttactaaacacacgtgcacccactaattgatccattaaatcgtcaattctcggaagtggatacctgttctttatcgtcactttattcag 12185  T
Q  207 ctgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttc 306  Q
     ||  | ||||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||| || | ||| || ||||||||| | |||||||| |||||||| | ||| |||||     
T  12186 ttgttggtaatctatacataacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccggcgctccccatggtgaaacacccggtcttataaatttctta 12285  T
Q  307 tcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| |    
T  12286 tcaaggaaatcctccaactgtttcttcaattcagctaactcggacgcagacatacggtaaggtgccatcgacaccggcttcgttccgggcacaagatcga 12385  T
Q  407 gt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttg 492  Q
     |              ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||| |  |||||||||||  ||||    
T  12386 ttgaaaattcaacctccctctctggtggcacatctggaatctcatcaggaaaaacttctggaaattcattcaccaccggcaatctatcaatcacatcttg 12485  T
Q  493 attctc 498  Q
    ||||||    
T  12486 attctc 12491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Original strand, 16834 - 17035
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16834 cgaaaggcataactttgtactcataatgaccataccgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcacctttcactttaatctggtgataacctgatct 16933  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  16934 caaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatcctcggaagtggatacctattctttattgtcaccttgttcaac 17033  T
Q  208 tg 209  Q
    ||    
T  17034 tg 17035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 713 - 810
Target Start/End: Original strand, 12637 - 12734
Alignment:
Q  713 atttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||| |||||  | ||||| || |||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  12637 atttcaaagtctctaccaaacatagacaatggacaacttaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcc 12734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 167; Significance: 5e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 8 - 579
Target Start/End: Original strand, 14661 - 15246
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14661 cgaaaggcatcactttatattcataatgtccataacgtgttctaaaagtcgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatcgggtgataacctgatct 14760  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||  || |||||||| || |||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| || || || || ||||      
T  14761 caaattgatgttgctaaacacacgtgtacccactaactgatccatcaagtcatcaattcttggaagtggatacctattctttatcgtcactttattcact 14860  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || || |||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| || ||  | ||||||   |||||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  14861 tgacggtaatcaatgcataacctcatgctaccatctttcttcttaactagtaataccagtgctccccgcggtgaaacacttggtcttacaaacttcttat 14960  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa- 406  Q
    |||| || || || |||||||||||||||||||  || || ||||| |||||||| |||||||  || ||  | |||||| | || |||| ||||||||     
T  14961 caagtaaatcttctaactgtttcttcaactcagccaaatcagaagccgacatacggtaaggtgtaatggacgcaggcttcatacctggaataagatcaat 15060  T
Q  407 -------------gtcctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                   ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||| ||| | |||||||||||||||||    
T  15061 cgaaaattcaacttccctttctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttctggaaaatcacatacaacctgtaacttatcaatcactgcttga 15160  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactc 579  Q
    |||||||| || || || | ||| || |||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15161 ttctcaacggacaaggatgtcatcaaagaaaacataaaaattccatcacgttctaattgcttcagctgcttggtagacaaaaactc 15246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 639 - 810
Target Start/End: Original strand, 15258 - 15429
Alignment:
Q  639 gaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacataga 738  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||| | ||||    
T  15258 gaacatggttgtactctaaccagttcataccaaggattacatccattccactcaaaggtaaacaaaccaaatcaatttcaaaatctcgaccaatcgtaga 15357  T
Q  739 caaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||| | ||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15358 caaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagttggagtttcgacaaccatctctcc 15429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 167; Significance: 5e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 8 - 406
Target Start/End: Original strand, 19545 - 19943
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  19545 cgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacct 19644  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||| || || || |||||||||||  ||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||| || || || || |||| |    
T  19645 caaatcaatcttgctgaacacacgagcacccactaattgatccattagatcatcaatcctcggaagtggatacctattctttatcgtcactttattcagc 19744  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || || ||||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||| || | ||| || ||||||||| | |||||||| | |||||| ||||| ||||| |    
T  19745 tgacggtaatctatacataacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccggcgctccccacggtgaaacactcggtcttacaaatttcttat 19844  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||| || |||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||    
T  19845 caagcaagtcttccaactgtttcttcaactcagctaactcggacaccgacatacggtatggtgccattgacaccggcttcgttcctggaacaaggtcaa 19943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477 (Bit Score: 165; Significance: 8e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold1477
Description:

Target: scaffold1477; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 8 - 741
Target Start/End: Original strand, 419 - 1157
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || || || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||| ||    
T  419 cgaaaggcatcactttgtattcttaatgtccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaagctgacct 518  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| ||||||||||| |||||   ||||||||||||| ||||||| || |  ||||| ||||||||||||||||  ||||| || || || |||||||||    
T  519 caagtcaatcttgctgaaaacctttgcacccactaactgatccattaagtcgtcaatcctcggaagtggatacccgttctttattgtaactttgttcaac 618  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||| || |||| |||| ||||||| |||||||| || | ||| |  |||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  619 tgacgatagtcaatgcataacctcatagtaccatccttcttcttaaccaacaatatcggcgctccctaaggtgaaacacttggtcttacaaacttcttat 718  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||     
T  719 caagcaagtcctccaactgtttcttcaattcagctaactcggaagctgacatacgataacgtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaaggtcaat 818  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              ||| ||||| ||||||||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||||  ||| || |||| ||| |||||||| ||||||    
T  819 tgaaaattcaaccaccctttctggtggcacatctagaatctcatcaggaaacacttctggaaattcattcacaactggtaacctgtcaatcacagcttga 918  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||| |  || ||| | ||||| || |||||||| |  || ||||| |         ||| || ||| |||||||| |  |||||||| ||||| || |    
T  919 ttctctaacgacaaatatgccatcaaggaaaacataagaattccatcac---------gctccaactgtttagtagataggaactctgctccactctctt 1009  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||| ||||| || | ||||||||| ||||| ||| ||||  | || ||||||||| ||||||| || | ||| |||| ||||||  ||||    
T  1010 cttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttgctaaagcaattgatatgaactcgattatactctaactagttcatcccaaaaataacatccatacccgtcaa 1109  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaa 741  Q
     |||| ||||||||| || | |||||| || | |||||||||||||||    
T  1110 cggtaaacaaactaagtcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaa 1157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 165; Significance: 8e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 6943 - 7751
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||    
T  6943 cgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctgatggtaacctgacct 7042  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||||||||| |  || || || |||||||||||| ||||||||||        | ||||||||||||||||| ||||| || || || || ||||||    
T  7043 caaatcaatcttacggaatacacgagcacccactaaccgatccatcaa--------tcctcggaagtggatacctgttctttatcgtaactttattcaac 7134  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||  | || ||||| |||| ||| |||||||| |||||||| || | ||| || ||||||||| |||||||||| |  | ||| ||||| ||||| |    
T  7135 tgacggaagtctatacataacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgctccccaaggtgaaacacttgatcttacaaatttcttat 7234  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||     
T  7235 caagcaagttctccaactgtttcttcaactcagctaactcggacgccgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaaggtcaat 7334  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              ||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||  ||| || || | ||| | |||||| ||||||    
T  7335 tgaaaattcaacctccctctctggtggtacatcgggaatctcatcaggaaaaacttctgaaaattcattcacaactggcaacctgttaatcacagcttga 7434  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    || || |  || ||  | ||||| || |||||||| |  || ||||| ||||| |||||||||| ||  || |||||||| |||||  |  |||  || |    
T  7435 ttttctaacgacaagtatgccatcaaagaaaacatgagaattccatcacgttctagttgcttcatctatttcgtagacaagaactcaacttcaccctctt 7534  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||| ||||| |  | ||| ||||| ||||| ||| ||||  |||| ||||||||||||||||| || | ||| |||| ||||||  ||||    
T  7535 cttcagcagaagaaaaatgcatcgtcttactaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaattacatccatacccgtcaa 7634  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     |||| |||||| | ||| | |||||| || | ||||||||||||||| |||||  | | ||| || |||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  7635 cggtaaacaaacaagatcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaagtaattaccgaacccttagctggagtt 7734  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || |||||||| |||||    
T  7735 tcaacaaccatttctcc 7751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 163; Significance: 1e-86; HSPs: 3)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 8 - 406
Target Start/End: Original strand, 9254 - 9652
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||| ||| || || ||||| || |||||||| || || || || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  9254 cgaaagacatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcgtccttcaccttaatttgatggtaacctgatct 9353  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||| ||||||||   |||| |||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || || ||||||    
T  9354 caagtcaatcttactaaaaacctttgcatccactaactgatccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctttattgtaactttattcaac 9453  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||| | ||| || ||||||||| ||||||| || |  ||||| ||||||||||| |    
T  9454 tgacgataatcaatgcataacctcatactaccatccttcttctttaccaacaataccggcgctccccaaggtgagacacttggtcttacaaacttcttat 9553  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  | || ||||||||||| |||||||| ||||    
T  9554 caagcaagtcttccaactgtttcttcaattcagctaactcggaagctgacatacgataaggtgccataaacaccggcttcgttcctggaacaaggtcaa 9652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 1602 - 784
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || || || ||||||| ||||||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||    
T  1602 cgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttcttcatatcctcatcctttaccttaatctgatggtaacctgacct 1503  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||| |||||||||  ||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||| || ||||| || || || |||||||||    
T  1502 caagtcaatcttactaaaaacttttgcacccaccaactgatccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatatctgttctttatcgtaactttgttcaac 1403  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||| ||||    ||| ||||| || ||||||||||| | ||| |  ||||||||| | || || || |  ||||| ||||||||||| |    
T  1402 tgacgatagtcaatgcacagggtcatgctaccgtccttcttctttaccaacaacataggcgctccccacggcgagacacttggtcttacaaacttcttat 1303  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||     
T  1302 caagcaagtcctccaactgtttcttcaattcagctaactcagacgctgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcccggaacaaggtcaat 1203  T
Q  408 t----------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgctt 491  Q
    |                 |||||| | |||||||| | ||||||||| ||||| ||||| |||||||||  |||||| || | ||| ||||| |  ||||    
T  1202 tgagaactcaacctctctctctcttgtggcacatctgaaatctcatcaggaaacacttctggaaattcattcaccactggcaacctgtcaattatagctt 1103  T
Q  492 gattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttc 591  Q
    |||| || |  || ||| | |||||||| ||| |||| |  || ||||| ||||| ||||| |||| ||| || |||||||| |||||  |  |||  ||    
T  1102 gattttctaacgacaaatacgccattaaagaatacatgagaattccatcacgttctagttgtttcatctgtttcgtagacaagaactcaacttcaccctc 1003  T
Q  592 ctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactc 691  Q
     |||||    ||||| ||||| ||    || ||||| ||||| ||| ||||  |||| ||||||||||| ||||| || | ||| |||| ||||||  ||    
T  1002 ttcttcagtagaagaaaaatgcaccatattactaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccaattcattccaaaaataacatccatacccgtc 903  T
Q  692 aaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggag 791  Q
    || || | || |||||| || | |||||| || | || |||||||||||| |||||||| ||||| || |||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  902 aacggaaaaccaactaagtcgacttcaaagtctctactaaacatagacaacggacattttaaacacacaagagaagtagttactgaacccttagctggag 803  T
Q  792 tttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||| |||||||| |||||    
T  802 tttcaacaaccatttctcc 784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 575 - 804
Target Start/End: Original strand, 20586 - 20815
Alignment:
Q  575 aactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaa 674  Q
    |||||||| |||||||| | |||  | ||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||  |||| ||||||||| ||||||| || | ||    
T  20586 aactctgctccactttcttgttccgcagaagaaaaatgcactgtcttgctaaaacaattgatatgaactcggttatactctaactagttcatcccaaaaa 20685  T
Q  675 tcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcac 774  Q
    | |||| ||| ||  |||| |||| ||||||||| || | |||||| || | ||||||||||||||| |||||  | | ||| || |||||| |||| ||    
T  20686 taacatccattcccgtcaacggtaaacaaactaagtcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacaacttagacaaacaagagaagtagttac 20785  T
Q  775 cgaacccttagctggagtttcgacaaccat 804  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20786 tgaacccttagctggagtttcaacaaccat 20815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 162; Significance: 5e-86; HSPs: 4)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 8 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 54524 - 54131
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || || ||||| || || ||||| || || || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  54524 cgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacct 54425  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||| || || ||   ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || || || |||||||||    
T  54424 caagtcaatcttactgaacacctttgcacccactatctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatatctattctttatcgtaactttgttcaac 54325  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||| | ||| || ||||||||| ||||  |||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  54324 tgacgataatcaatgcacaacctcatactaccgtccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccaaggcaaaacacttggtcttacaaacttcttat 54225  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaag 401  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||    
T  54224 caagcaggtcttccaactgtttcctcaattcagctaactcggaagctgacatacgataaggtgccatcgacaccggcatcgttcccggaacaag 54131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 8 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 31790 - 31115
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||    
T  31790 cgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggcagtcttctgcatgtcctcatctttcaccttgatctgatggtaacctgacct 31691  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| ||||| || |||||||    |||||| || ||| |||||||||  |  |||||||||||||||||||| || ||||| || || || || ||||||    
T  31690 caagtcaattttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcatgtcgtcaattctcggaagtggatatcttttctttattgtaactttattcaac 31591  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || || || ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||| | |||||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  31590 tgacggtagtcaatgcataacctcatactaccatctttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgaaacacttggtcttacaaacttcttgt 31491  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
      ||||||||||| |||||||||||||||||||  |  ||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||     
T  31490 tgagcaagtcctctaactgtttcttcaactcagcaagttcggatgccgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttagttcctggaacaaggtcaat 31391  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |               |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||  ||| || |||| |||||||| ||| |||||     
T  31390 tgaaaattcaacctctctctctggtggcacatcaggaatctcatcaggaaacacatcagggaattcattcactacaggtaacctatcaaccacagcttgg 31291  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    || || |  || ||| | |||||||| ||| ||||||  || ||||| | ||| || ||||||| ||  || |||| |||||  ||  | ||| |||| |    
T  31290 ttttctaacgacaaatatgccattaaagaatacatcagaatcccatctctttctagctgcttcatctctttcgtagtcaaaatttcaactccattttctt 31191  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacc 669  Q
    ||||  | ||||| ||||| || | ||| ||||||||||| ||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  31190 cttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttactaaaacaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatacc 31115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 77 - 250
Target Start/End: Original strand, 42520 - 42693
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||| | |||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  42520 cctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctatgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 42619  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttct 250  Q
    ||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||    
T  42620 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactggcgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttct 42693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 435 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 54095 - 53720
Alignment:
Q  435 catctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagat 534  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||  |||||| |  | ||| |||||||| |||||||| || |  || ||| | |||||| | ||| ||||||  ||    
T  54095 catcaggaaacacttctggaaattcattcaccactgacaacctgtcaatcacagcttgattttctaacgacaaatatgccatttaagaatacatcagaat 53996  T
Q  535 accatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaatta 634  Q
     ||||| ||||| ||||| |||| ||| || |||||||| |||||  |  |||| || |||||  | ||||| ||||| || | ||| ||||| |||||     
T  53995 tccatcacgttctagttgtttcatctgtttcgtagacaagaactcaacttcactctcttcttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttactaaagcaattg 53896  T
Q  635 ataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaaca 734  Q
    ||| ||||  |||| ||||||||| | ||||| || | ||| |||| ||||||  |||| || | ||||||||| || | |||||| || | ||||||||    
T  53895 atatgaactcggttatactctaactaattcattccaaaaataacatccatacccgtcaacggcaaacaaactaagtcgacttcaaagtctctaccaaaca 53796  T
Q  735 tagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||||| |||||| |||| || || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  53795 tagacaatggacatctcaagcaaacaagagaagtagtcactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcc 53720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 162; Significance: 5e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 58 - 804
Target Start/End: Original strand, 53288 - 54048
Alignment:
Q  58 gtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaat 157  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||   ||||||||||||  |||||||||| |    
T  53288 gtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaacctttgcacccactaattgatccatcaagt 53387  T
Q  158 tatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactag 257  Q
     |||||| || | ||||||||| || ||||| || || || || |||||||| | ||| ||||| || |||| ||| ||||| || ||||||||||| |     
T  53388 catcaatcctagaaagtggatatctgttctttattgtaactttattcaactgacaatagtcaatgcataacctcatgctaccgtccttcttctttaccaa 53487  T
Q  258 caaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagac 357  Q
    ||| || ||||||||| | |||||||| |  ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||    
T  53488 caacacaggcgctccccacggtgaaacactaggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcttccaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgac 53587  T
Q  358 atacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaagt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaa 443  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||| |||| |              ||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  53588 atgcgataaggtgccatcgacaccggcttcattcccggaacaaggtcaattgaaaattcaacctccctttctggtggtacatctggaatctcatcaggaa 53687  T
Q  444 aaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcg 543  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||| ||| ||||||||  ||||||| || |  || ||||| ||||| || |||||||| |  || ||||||||    
T  53688 aaacttcaggaaattcattcaccactggtaacctgtcaatcacatcttgattttctaacgacaaagatgccatcaaagaaaacataagaattccatcgcg 53787  T
Q  544 ttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacg 643  Q
     ||||  ||||||| ||| |||||||  |  || ||||| ||||| || |||||  | ||||| ||||| || | ||||||||||||||  ||| ||||     
T  53788 ctccaactgcttcaactgtttagtagttaggaattctgctccactatcttcttccgcagaagaaaaatgcaccgtcttgctaaaacaatagatatgaact 53887  T
Q  644 tggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaag 743  Q
     |||| ||||||||| ||||||| || | ||| |||| ||| ||  |||| |||| ||| ||||| || | || ||| || | ||||||||||||||| |    
T  53888 cggttatactctaactagttcatcccaaaaataacatccattcccgtcaacggtaaacacactaagtcgacttaaaagtctctaccaaacatagacaacg 53987  T
Q  744 gacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 804  Q
    ||||  | | ||| || |||||| |||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53988 gacaccttagacacacaagagaagtagttaatgaacccttagctggagtttcaacaaccat 54048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 160; Significance: 8e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 22 - 810
Target Start/End: Original strand, 4386 - 5188
Alignment:
Q  22 ttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgc 121  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || |    
T  4386 ttatattcataatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctgatggtaaccggacctcaaatcaattttac 4485  T
Q  122 taaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaat 221  Q
    |||| ||  |||||||||| ||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| || || || || || | ||| || ||||| ||    
T  4486 taaacacaggtgcacccacaaactgatccattaaatcgtcaattctcggaagtggatacctgttctttatcgtcactttatttagctgacggtaatctat 4585  T
Q  222 acacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctcc 321  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| || |  || || ||||||||| | |||||||| | |||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  4586 acacaacctcatgctaccatctttcttcttaaccaataataccggcgctccccacggtgaaacactcggtcttacaaatttcttatcaagtaaatcctcc 4685  T
Q  322 aactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaagt------------- 408  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| | |                 
T  4686 aactgtttcttcaagtcagctaactcagacgccgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttccgggcacaagatcgattgaaaattcaacct 4785  T
Q  409 -cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataa 507  Q
     ||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||  |||||||||  ||| ||||| |  || |||||||| ||||||||||| |  || ||    
T  4786 ccctctctggtggcacatctagaatctcatcaggaaaaacttatggaaattcattcacaaccggcaatctgtcaatcacagcttgattctccaatgacaa 4885  T
Q  508 agaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagag 607  Q
      | ||||| || |||||||| |  || ||||| ||  |||  | ||||| ||  |||||||  || ||||| ||  |||| || |||||  | |||||     
T  4886 gtatgccatcaaagaaaacattagaattccatcacgccccaactacttcaactatttagtagttaagaactcagcttcactctcttcttcagcagaagaa 4985  T
Q  608 aaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaacta 707  Q
    ||||| || | ||| ||||| ||| | ||  ||||  |||| ||||||||||||||||| || | ||| |||| ||||||  |||| |||| |||||| |    
T  4986 aaatgcaccgtcttactaaagcaaatgatgtgaacacggttatactctaaccagttcatcccaaaaattacatccatacccgtcaacggtaaacaaacaa 5085  T
Q  708 aatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctc 807  Q
     ||| | |||||| || | ||||||||| ||||| |||||  | | ||| || ||||||||||| || ||| ||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  5086 gatcgacttcaaagtctctaccaaacattgacaacggacaacttagacaaacaagagaaatagttactgaaacctcagctggagtttcaacaaccatttc 5185  T
Q  808 tcc 810  Q
    |||    
T  5186 tcc 5188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 159; Significance: 3e-84; HSPs: 3)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 9 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 19746 - 19073
Alignment:
Q  9 gaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctc 108  Q
    ||||||||| || |||||||| || || ||||| || || || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||    
T  19746 gaaaggcatcaccttatattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacccgacctc 19647  T
Q  109 aaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 208  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||| || |  ||||| ||| ||||||||||||| ||||| || || || || |||||||    
T  19646 aaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccattaagtcgtcaatcctcagaagtggatacctgttctttattgtaactttattcaact 19547  T
Q  209 gccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctc 308  Q
    | | ||| ||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||| |||| ||||| |  ||||| ||||||||||| ||    
T  19546 gacaatagtcaatgcataacctcatgctaccatccttcttcttaaccagcaataccggcgctccccaaggcgaaacacttggtcttacaaacttcttatc 19447  T
Q  309 aagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaagt 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||||  | || ||||||||||| |||||||| |||| |    
T  19446 aagcaagtcctccaactgtttcttcaattcagctaactcggaagctgacatacgttaatgtgccatttacaccggcttcgttcctggaacaaggtcaatt 19347  T
Q  409 --------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgat 494  Q
                  ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||  ||| || || | ||| |||||||| |||||||    
T  19346 gaaaattcaacctccctctctggtggcacatctggaatctcatcaggaaaaacctcaggaaactcattcacaactggcaacctgtcaatcacagcttgat 19247  T
Q  495 tctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctc 594  Q
    |||| |  || ||| | || || || |||||||| || || | ||| |  ||||  ||||||| ||| || |||||||  |||||||| ||||| || ||    
T  19246 tctctaacgacaaatatgctatcaaagaaaacattaaaattctatcacactccaactgcttcaactgtttcgtagacaggaactctgctccactctcttc 19147  T
Q  595 ttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatac 668  Q
    |||  | ||||| ||||| || | ||||||||| ||||| ||| ||||  |||| |||| |||||| |||||||    
T  19146 ttcagcagaagaaaaatgcaccgtcttgctaaagcaattgatatgaactcggttatactgtaaccaattcatac 19073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 659 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 58062 - 57915
Alignment:
Q  659 cagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacata 758  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||| || |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  58062 cagttcataccaaggatcacatccattccgctcaaaggtaaacaaaccaaatcaatttcaaaatctcgaccaaacatagacaaaggacatcttaaacaca 57963  T
Q  759 cgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatct 806  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57962 caagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatct 57915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 26310 - 26262
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaa 125  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  26310 ccttcactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaa 26262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 158; Significance: 1e-83; HSPs: 3)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 8 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 18596 - 18095
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||    
T  18596 cgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgttctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacct 18497  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| || ||||| |||||||||  ||||||||| ||  | |||||||| | |||||| |||||| |||||||||| ||||| || || || |||||||||    
T  18496 caagtcgatcttactaaaaacttttgcacccaccaattggtccatcaagtcatcaatcctcggatgtggatacctgttctttatcgtaactttgttcaac 18397  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||| | ||| || ||||||||| | |||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  18396 tgacgataatcaatgcacaacctcatgctaccatccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgaaacactgggtctaacaaacttcttat 18297  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc--- 404  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||       
T  18296 caagcaagtcttccaactgtttcttcaattcagctaactcagatgctgacatacaataagttgccatcgacaccggcttcgttcctgggacaaggtcgat 18197  T
Q  405 ----aagt-------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
        || |       ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||| |||| ||| ||||||||  |||||    
T  18196 ggagaactcaacctccctctctggtggcacatctggaatctcatccggaaatacttcaggaaattcattcaccactggtaacctgtcaatcacaacttga 18097  T
Q  494 tt 495  Q
    ||    
T  18096 tt 18095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 121 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 5849 - 5146
Alignment:
Q  121 ctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaa 220  Q
    |||||||||  ||||||||| ||| | |||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||| ||||    
T  5849 ctaaaaacttttgcacccaccaactggtccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctttatcgtaactttgttcaactgacgatagtcaa 5750  T
Q  221 tacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctc 320  Q
    | ||||||| ||| ||||| || ||||||||||| | ||| || || |||||| | |||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  5749 tgcacaacctcatgctaccgtccttcttctttacaaacaacacaggtgctccccacggtgaaacactgggtctaacaaacttcttatcaagcaagtcttc 5650  T
Q  321 caactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc-------aagt----- 408  Q
    | ||||||||||||| |||| |||||| || || ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||       || |         
T  5649 cgactgtttcttcaattcagctaactcagatgctgacatacgatatggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaaggtcgatggagaactcaacc 5550  T
Q  409 --cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagata 506  Q
      ||||||||| |||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||  |||||| | || ||| |||||||| |||||||| || |  || |    
T  5549 tccctctctggtggcacatctggaatctcacccgaaaaaacttcaggaaattcattcaccactgataacctgtcaatcacagcttgattttctaatgaca 5450  T
Q  507 aagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaaga 606  Q
    || | |||||||| ||| ||||||| || ||||| ||||| ||||| |||| ||| || |||||||| |||||  |  |||| || |||||  | |||||    
T  5449 aatatgccattaaagaatacatcaaaattccatcacgttcaagttgtttcatctgtttcgtagacaagaactccacttcactctcttcttcagcagaaga 5350  T
Q  607 gaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaact 706  Q
     ||||| || | ||| ||||| ||| | ||| ||||  |||| ||||||||||| ||||| || | ||| |||| ||||||  |||| |||||||| |||    
T  5349 aaaatgcaccgtcttactaaagcaactgatatgaactcggttatactctaaccaattcattccaaaaataacatccatacccgtcaacggtagacacact 5250  T
Q  707 aaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatct 806  Q
    || || |   ||||||| | ||||||||||||||| |||||  | ||| | || |||||| |||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  5249 aagtcgaccacaaaatctctaccaaacatagacaacggacaccttaaagagacaagagaagtagttactgaacccttggctggagtttcaacaaccattt 5150  T
Q  807 ctcc 810  Q
    ||||    
T  5149 ctcc 5146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 9987 - 9831
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||    
T  9987 cgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacct 9888  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaat 164  Q
    ||| || ||||| |||||||||  ||||||||| ||| | |||||||| | ||||||    
T  9887 caagtcgatcttactaaaaacttttgcacccaccaactggtccatcaagtcatcaat 9831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 158; Significance: 1e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 477 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 14896 - 14563
Alignment:
Q  477 tatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaa 576  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||    
T  14896 tatcaatcactgcttaattctcaacagacaaggacgccatcaaagaaaacattaaaattccatcacgttctaattgcttcagctgcttagtagacaagaa 14797  T
Q  577 ctctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatc 676  Q
     | ||| ||||||||||||||  | ||||| ||||  ||  |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || || ||     
T  14796 ttatgcgccactttcctcttcagcagaagaaaaatacaccaacttactaaaacaattaatatgaacatggttgtactctaaccagttcattccaaggatt 14697  T
Q  677 acatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccg 776  Q
    || | ||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| | || |||||| |||||||||    
T  14696 acttccattccactcaaaggtaaacaaaccaaatcaatttcaaaatctcgaccaaacatagacaaaggacatcttaaatacacaagagaagtagtcaccg 14597  T
Q  777 aacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14596 aacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 14563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 8 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 15334 - 14936
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    ||||||| || |||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||| |||||    
T  15334 cgaaaggaatcactttatattcataatgtctataacaagttctaaaagccgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatccgatgataacccgatct 15235  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||| || ||||||    
T  15234 caaagcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattcttggaagtgtatacctattctttattgttactttcttcaac 15135  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
     | ||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||| | |||||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  15134 cgtcgataatcaatgcataacctcatgctaccatctttcttcttaactaacaataccggcgctccccacggtgaaacacttggtcttacaaacttcttat 15035  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
     ||| || || || |||| |||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| || || |||||||| || | || ||||||||    
T  15034 taagtaaatcttctaactatttcttcaactccgccaactcagaagctgacatacggtaaggtgtcatagacacaggcttcgtacccgaaataagatcaa 14936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 157; Significance: 5e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 99675 - 98880
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || || ||||| || || ||||| || || || || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||    
T  99675 cgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcatccttcaccttgatctgatggtaacctgacct 99576  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||| ||||||||   ||||||||| ||| ||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || || ||||||    
T  99575 caattcaatcttactaaaaacctttgcacccaccaactgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctttattgtaactttattcaac 99476  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||||||||| ||||||| ||| ||||| || ||||||||||| | ||| || || |||||| | ||||| || |  ||||| ||||| ||||| |    
T  99475 tgacgataatcaatgcacaacctcatgctaccgtccttcttctttaccaacaacacaggtgctccccacggtgagacacttggtcttacaaaattcttat 99376  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||||     
T  99375 caagcaagtcttccaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatgcgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcccggagcaaggtcaa- 99277  T
Q  408 tcctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataa 507  Q
           || |  | || |     ||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||| |||| | | |||| ||| |||| ||| || |  || ||    
T  99276 ------ttgaaaactcaacctccctctcatccggaaaaacttcaggaaactcattcaccactggtaacatgtcaaacacagcttaattttctaacgacaa 99183  T
Q  508 agaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagag 607  Q
     || ||||| || |||||||| |  || |||| ||| ||||  | ||||| ||| |||||||  |  || ||||| ||||| || |||||  | |||||     
T  99182 ggatgccatcaaagaaaacataagaattccattgcgctccaactacttcaactgtttagtagttaggaattctgctccactctcttcttccgcagaagaa 99083  T
Q  608 aaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaacta 707  Q
    ||||| || | ||||||||||||||| ||| ||||  |||| ||||||||||||||||| || | ||| |||| ||||||  |||| || | ||||||||    
T  99082 aaatgcaccgtcttgctaaaacaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaataacatccatacccgtcaacggcaaacaaacta 98983  T
Q  708 aatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctc 807  Q
    | || | |||||| || | ||||||||||||||| | |||  | | ||| || |||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  98982 agtcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacgaacaccttagacacacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttc 98883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 214 - 810
Target Start/End: Original strand, 175390 - 175995
Alignment:
Q  214 taatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagca 313  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||| || | ||| || ||||||||  |||||||||| | |||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  175390 taatctatacacaacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccggcgctcctcaaggtgaaacactcggtcttacaaatttcttatcaagta 175489  T
Q  314 agtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaagt----- 408  Q
    | |||||     |||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||| |         
T  175490 aatcctc-----gtttcttcaattcagctaactcggatgccgacatacgttaaggtgccatcgacaccggcttcgttccgggatcaagatcaattgaaaa 175584  T
Q  409 ---------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctca 499  Q
              |||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||| || || |  ||||||||||| |||||||||||     
T  175585 ttcaacctctctctctggtggcacatcaagaatcttatcaggaaaaacttctggaaattcatacacaactggcaatctatcaatcacagcttgattctcc 175684  T
Q  500 acagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcga 599  Q
    |  || ||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |  | ||||| ||| ||||||| ||| |||||  |  |||| || ||  |      
T  175685 aatgacaagtatgccatcaaagaaaacatcaaaattccatcacgttctaactacttcaactgtttagtagtcaagaactcaacttcactctcttccccag 175784  T
Q  600 cggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtag 699  Q
    | ||||| |||||||  | ||| ||||||||||| ||| ||||  | || | ||||||||||||||| || |  || |||| ||||||  |||| || |     
T  175785 cagaagaaaaatgtatcgtcttactaaaacaattgatatgaacacgattattctctaaccagttcatcccaaagattacatccatacccgtcaacggcaa 175884  T
Q  700 acaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgaca 799  Q
    ||| || | ||| | ||||||||| | ||||||||||||||| |||||  ||||||| || |||||| |||| |  |||||||||||||||||||| |||    
T  175885 acatacaagatcgacttcaaaatctctaccaaacatagacaatggacaactcaaacaaacaagagaagtagttagtgaacccttagctggagtttcaaca 175984  T
Q  800 accatctctcc 810  Q
    ||||| |||||    
T  175985 accatttctcc 175995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 156; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 58 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 31382 - 30629
Alignment:
Q  58 gtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaat 157  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| || || ||   ||||||||||||| |||||||||| |    
T  31382 gtcttctgcatatcctcatctttcacctttatctgatggtaaccagacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactaactgatccatcaagt 31283  T
Q  158 tatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactag 257  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||| || || || |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| || |     
T  31282 catcaattctcggaagtggatacctattctttatcgtaactttgttaaattgacggtaatcaatgcacaacctcatactaccatccttcttcttaaccaa 31183  T
Q  258 caaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagac 357  Q
    ||| || ||||||||| |||||||||| |  ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||  |||    
T  31182 caacaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaacttgttatcaagcaaatcctccaactgtttcttcaattcagctaactcataagttgac 31083  T
Q  358 atacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaagt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaa 443  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||  ||||||| |||| |              ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  31082 atacggtatggtgccatcgacaccggctttgttcctagaacaaggtcaattgaaaattcaacttccctctctggtggcacatcaggaatctcatcaggaa 30983  T
Q  444 aaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcg 543  Q
    | ||||| | ||||||   |||||| || | ||| |||||||| ||||| || || || |||||| ||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||    
T  30982 acacttctgaaaattctttcaccactggcaacctgtcaatcacagcttggttttctacggataaataagccatcagagaaaacatcaaaattccatcacg 30883  T
Q  544 ttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacg 643  Q
    ||| || || |||| ||| || |||||||| |||||  |  ||| ||| |||||  | ||||| |||||||| | ||| ||||| || || ||| ||||     
T  30882 ttctagctgtttcatctgttttgtagacaagaactcaacttcaccttcttcttcagcagaagaaaaatgtaccgtcttactaaagcatttgatatgaact 30783  T
Q  644 tggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaag 743  Q
     |||| ||||||||||| ||||| || | |||       |||||   ||| || | |||||||||||| |   |||| || | ||||||||||||||| |    
T  30782 cggttatactctaaccaattcattccaaaaat-------atacccgacaacggcaaacaaactaaatcaaccacaaagtctctaccaaacatagacaacg 30690  T
Q  744 gacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 804  Q
    ||||  ||||||| || |||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30689 gacaactcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccat 30629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 155; Significance: 7e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 30 - 669
Target Start/End: Original strand, 14421 - 15074
Alignment:
Q  30 atagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaact 129  Q
    ||||||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||     
T  14421 atagtgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaacaca 14520  T
Q  130 cgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaacc 229  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  14521 cgtgcacccactaactgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctttatcgtaactttgttcaactgacgataatcaatgcataacc 14620  T
Q  230 gcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgttt 329  Q
     |||  ||||||| |||||||| || | ||| |||||||||||| | |||||||| |  ||| | ||||| || || |||||||||| ||||||||||||    
T  14621 tcatggtaccatccttcttcttaaccaacaatactggcgctccccacggtgaaacacttggtattacaaatttattatcaagcaagttctccaactgttt 14720  T
Q  330 cttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaagt--------------cctctct 415  Q
    |||||| ||||  |  ||||| || | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |              |||||||    
T  14721 cttcaattcagcaagttcggacgccggcatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaaggtcaattgaaaattcaacctccctctct 14820  T
Q  416 ggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagcca 515  Q
    || |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||  ||| || || | | |||||||||| ||||||||||| |  || ||| | ||||    
T  14821 ggtggcacatctggaatctcatcaggaaaaacctcaggaaactcattcacaactggcaacatatcaatcacagcttgattctctaacgacaaatatgcca 14920  T
Q  516 ttaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtac 615  Q
    | || |||||||| |  || ||||| |  ||||  ||||||| |||||||||||| |  |||||  | ||||| || |||||  | ||||| |||||||     
T  14921 tcaaagaaaacataagaattccatcacactccaactgcttcaactgcttagtagataggaactccactccactctcttcttccgcagaagaaaaatgtaa 15020  T
Q  616 tgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacc 669  Q
     | ||| ||||| ||||| ||| | || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15021 cgtcttactaaagcaattgatatggacatggttatactccaaccagttcatacc 15074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 77 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 5850 - 5563
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||| | |||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  5850 cctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 5751  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaa 276  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || ||||| |||||||| || | ||| ||||| || ||| |     
T  5750 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatccttcttcttaaccaacaacactggagcaccc-ac 5652  T
Q  277 ggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgata 365  Q
    |||||||| |  ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||   ||||| || |||||||| |||||    
T  5651 ggtgaaacacttggtctaataaactgcttctcaagcaactcctccaactgattcttcaattcacccaactctgatgcagacatccgata 5563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 155; Significance: 7e-82; HSPs: 3)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 8 - 406
Target Start/End: Original strand, 24407 - 24805
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || || ||||| || || ||||| || || || || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||    
T  24407 cgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcgtcatccttcaccttaatctggtggtaacttgacct 24506  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||| || || || | ||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||| |||    
T  24507 caagtcaatcttactgaacacccttgcacccactaactgatccattaagtcatcaattctcggaagtggatacctattctttatcgtaactttgtttaac 24606  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || |  |||||||| || || | ||| |||||||| |||||||| |||| ||| || ||||||||| |||||||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  24607 tgacagtaatcaatgcataatctcatgctaccatccttcttcttgactaacaacaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaacttcttat 24706  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  24707 caagcaagtcctccaactgtttcttcaattcagctaattcagaagctgacatacgataaggtgccatcgacatcggctttgttcctggaacaaggtcaa 24805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 8 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 44530 - 43722
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||    
T  44530 cgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctccatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacccgacct 44431  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||| || || || || || |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| || || || || |||| |    
T  44430 caaatcaattttactgaacacacgagcacccactaactgatccatcaaatcgtcaattctcggaagtggatacctgttctttatcgtcactttattcagc 44331  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || || ||||| ||||| |||| ||  |||||||| |||||||| || | ||| |  ||||||||| | ||| |||| | |||||| ||||||||||| |    
T  44330 tgacggtaatctatacataacctcacgctaccatccttcttcttaaccaacaatatcggcgctccccacggttaaacactcggtcttacaaacttcttat 44231  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaaga----- 402  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| || ||||||||| | || ||||||         
T  44230 caagtaaatcctccaactggttcttcaattcagctaactcggacgccgacatacgataatgtgccatcgacaccggcttcgttacgggcacaagatgatt 44131  T
Q  403 ------tcaa--gtcctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgat 494  Q
          ||||    ||||||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||| || | | ||||||| ||| ||||| |  ||||||||||| |||||||    
T  44130 gaaaattcaacctccctctctggtggtacatctggaatcttatcaggaaaaaatt-atggaattcactcacaaccggcaatctatcaatcacagcttgat 44032  T
Q  495 tctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctc 594  Q
    |||| |  ||  |  |  |||| || |||||||| |  || ||||| ||||| |  |||||||  || || |||| ||| ||||| ||  |||| || |     
T  44031 tctctaatgactagtattccatcaaagaaaacattagaattccatcacgttctaactgcttcaattgtttcgtagtcaagaactcagcttcactctcttt 43932  T
Q  595 ttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaa 694  Q
    ||| || ||||| ||||| |||| ||| |||||  |||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| || | ||| |||| ||||||  ||||     
T  43931 ttcaacagaagaaaaatgcactgtcttactaaagaaattaatatgaacacggttatactctaaccagttcatcccaaaaattacattcatacccgtcaat 43832  T
Q  695 ggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagttt 794  Q
    || | ||| |||| ||| | |||||| |  | ||||||||||||||| |||||  ||||||| || |||||| |||| ||  ||||||||||||||||||    
T  43831 ggcaaacatactagatcgagttcaaagtatctaccaaacatagacaatggacaactcaaacaaacaagagaagtagttactaaacccttagctggagttt 43732  T
Q  795 cgacaaccat 804  Q
    | ||||||||    
T  43731 caacaaccat 43722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 602 - 803
Target Start/End: Original strand, 25015 - 25216
Alignment:
Q  602 gaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagac 701  Q
    ||||| ||||| || | ||| ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||  |||||||||||||| || || |||| ||| ||  |||| |||| ||    
T  25015 gaagaaaaatgcacggtcttactaaagcaattaatatgaacatggttatacttcaaccagttcataccaaggattacatccattcccgtcaacggtaaac 25114  T
Q  702 aaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaac 801  Q
    |||| || |  |  |||||||| | |||| |||||||||| |||||  ||||||| || | |||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  25115 aaaccaagttaacctcaaaatctctaccatacatagacaacggacaactcaaacaaaccaaagaagtagttatcgaacccttagctcgagtttcgacaac 25214  T
Q  802 ca 803  Q
    ||    
T  25215 ca 25216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 153; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 8 - 809
Target Start/End: Complemental strand, 6258 - 5443
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || |||||||  || || || || || ||||||||||| || ||||||||| | || ||||| || ||||| || ||    
T  6258 cgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatttcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatgtcttcatccttcccctttatctgatggtaaccagacct 6159  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| || ||||| |||||||    |||||| || ||| |||||||||| |  ||||| ||| |||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||    
T  6158 caagtcgatcttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaatcctcagaagcggatacctgttctttatcgtaaccttgttcaac 6059  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || || |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  6058 tgacggtaatcaatgcacaacctcatactaccatccttcttctttactagtaacaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaacttcttat 5959  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||| ||||     
T  5958 caagcaagtcctccaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaataaggtcaat 5859  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||  |||||| || | ||| ||| ||||  |||||    
T  5858 tgaaaattcaacctccctttctggtggcacatcaggaatctcatcaggaaacacttctggaaattcattcaccacaggcaacctgtcattcacaacttga 5759  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    || || |  || ||| | |||||||| ||| ||||||  || ||||| ||||  || || |||| ||  || |||||||| |||||  |  ||| ||| |    
T  5758 ttttctaacgacaaatatgccattaaagaatacatcagaattccatcacgttttagctgtttcatctatttcgtagacaagaactcaacttcaccttctt 5659  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||| ||||| |  | ||| || || || || ||| ||||  |||| ||||||||||| ||||| || | ||| |||| |||||    |||    
T  5658 cttcagcagaagaaaaatgcatcgtcttactgaagcagttgatatgaactcggttatactctaaccaattcatcccaaaaataacatccatacgcgacaa 5559  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     || | |||||||||||| |   ||||||| | |||||||||| |||| |||||  |||| || || |||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  5558 cggcaaacaaactaaatcaaccacaaaatctctaccaaacataaacaatggacacctcaagcaaactagagaagtagttactgaacccttagctggagtt 5459  T
Q  794 tcgacaaccatctctc 809  Q
    || |||||||| ||||    
T  5458 tcaacaaccatttctc 5443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 152; Significance: 5e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 810
Target Start/End: Original strand, 7809 - 8621
Alignment:
Q  10 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctca 109  Q
    |||||||| || || ||||| || |||||||| || || || || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||    
T  7809 aaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctca 7908  T
Q  110 aatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 209  Q
    | ||||| || |||||||    ||| |  || ||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || || ||||||||    
T  7909 agtcaatattactaaaaaactttgctc--accaactgatccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctttatcgtaactttattcaactg 8006  T
Q  210 ccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctca 309  Q
     ||||||||||| |||||||  || ||||| || ||||||||||| | ||| || ||||||||| |  ||||||| |  ||||||||||||||||| |||    
T  8007 acgataatcaatgcacaaccttatgctaccgtccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacagtgaaacactgggtctaacaaacttcttatca 8106  T
Q  310 agcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc----- 404  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |||  |||||| || || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||         
T  8107 agcaagtcttcaaactgtttcttcaattcaactaactcagatgctgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaaggtcgatgg 8206  T
Q  405 --aagt-------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
      || |       ||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||| ||||| || ||||||||    
T  8207 agaactcaacctccctctctggtggcacatatggaatctcatcaggaaaaacttcaggaaattcattcaccactggtaacctgtcaattacagcttgatt 8306  T
Q  496 ctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctct 595  Q
     || |  || ||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||| ||||| ||||| |||| ||| || ||||| || ||||   |  |||  || |||    
T  8307 ttctaacgacaaatatgccattaaagaatacatcaaaattccatcacgttctagttgtttcatctgtttcgtagataagaacttaacttcaccctcttct 8406  T
Q  596 tcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaag 695  Q
    ||  | ||||| ||||| || | ||| ||||| ||||| ||| ||||  |||| ||||||||||| ||||| || | ||| |||| |||||   |||| |    
T  8407 tcagcagaagaaaaatgcaccgtcttactaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccaattcatcccaaaaataacatccatacacgtcaacg 8506  T
Q  696 gtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttc 795  Q
    | | ||| ||||| || |  |||||||| | ||||||||||||||| |||||  | | ||| || |||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  8507 gcaaacatactaagtcgacctcaaaatctctaccaaacatagacaatggacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttc 8606  T
Q  796 gacaaccatctctcc 810  Q
     |||||||| |||||    
T  8607 aacaaccatttctcc 8621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 570
Target Start/End: Original strand, 838 - 1412
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || || ||||| || |||||||| || || || || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||    
T  838 cgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacct 937  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| ||||| || |||||||    ||| |  || ||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || || ||||||    
T  938 caagtcaatattactaaaaaactttgctc--accaactgatccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctttatcgtaactttattcaac 1035  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||||||||| |||||||  || ||||| || ||||||||||| | ||| || ||||||||| | |||||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  1036 tgacgataatcaatgcacaaccttatgctaccgtccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgaaacactgggtcttacaaacttcttat 1135  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc--- 404  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||       
T  1136 caagcaagtcttctaactgtttcttcaattcagctaactcagatgctgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaaggtcgat 1235  T
Q  405 ----aagt-------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
        || |       ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||  |||| || ||||||    
T  1236 ggagaactcaacctccctctctggtggcacatatggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcattcaccactggtaacctgccaattacagcttga 1335  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtaga 570  Q
    || || |  || ||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||| ||||| ||||| |||| ||| || |||||    
T  1336 ttttctaacgacaaatatgccattaaagaatacatcaaaattccatcacgttctagttgtttcatctgtttcgtaga 1412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 150; Significance: 7e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 262417 - 263233
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || || ||||| || ||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || ||    
T  262417 cgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaaccagacct 262516  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||| || ||||    |||||| || ||| |||||||||| | || ||| |||| ||| |||||||| ||||| || || || |||||||||    
T  262517 caagtcaatcttactgaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaagtcataaatcctcgaaagcggatacctgttctttattgtaactttgttcaac 262616  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || || ||||  |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| | ||| || ||||||||| | |||||||| |  |||| |||||||||||| |    
T  262617 tgacggtaatatatacacaacctcatgctaccatccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgaaacactgggtcaaacaaacttcttat 262716  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa- 406  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||| || || |||||||| || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||     
T  262717 caagcaagtcttccaactttttcttcaattcagctaactcagaggctgacatacggtacggtgccatcgacatcggctttgttcccggaacaaggtcaat 262816  T
Q  407 -------------gtcctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                   ||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||| |||||||| || |||    
T  262817 ggaaaactcaacctccctgtctggtggcacgtctggaatctcatccggaaaaacttcaggaaattcattcaccactggtaacctgtcaatcacagcctga 262916  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    || || |  || ||| | |||||||| ||| ||||||  || ||||| ||||| |  ||||||| ||| || |||| ||| |||||  | ||||  || |    
T  262917 ttttctaacgacaaatatgccattaaagaatacatcagaattccatcacgttctaactgcttcatctgtttcgtagtcaagaactcaactccaccctctt 263016  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||| ||||  |||| ||||||||||| ||||| || | ||| || | ||| ||  ||||    
T  263017 cttcagcagaagaaaaatgtaccgtcttactaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccaattcattccaaaaataacgtccattcccgtcaa 263116  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     || | ||||||||| || |  |||||||| | |||||||||||| | ||||||  ||||||| || |||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  263117 cggcaaacaaactaagtctacctcaaaatctctaccaaacatagatataggacacctcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtt 263216  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || |||||||| |||||    
T  263217 tcaacaaccatttctcc 263233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 147; Significance: 4e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 58 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 1548 - 923
Alignment:
Q  58 gtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaat 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||| | || || ||||||||| || ||||||| ||||    
T  1548 gtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttactatacacacgagcacccactgactgatccattaaat 1449  T
Q  158 tatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactag 257  Q
     |||||| ||||||| ||||||||| ||||| || || || || || ||||| ||||||| ||| || |||| |||  ||||||| |||||||| || |     
T  1448 catcaatcctcggaaatggatacctgttctttatcgtcactttatttaactgacgataataaatgcataacctcatggtaccatccttcttcttaaccaa 1349  T
Q  258 caaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagac 357  Q
    ||| || ||||||||| |||||||||| |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| || |||    
T  1348 caataccggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaatttcttatcaagcaagtcctccaactgtttcttcaattcaactaactcggacgccgac 1249  T
Q  358 atacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaagt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaa 443  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |              ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  1248 atacgctaaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggaacaaggtcaattgaaaattcaacctccctctctggtggcacatctggaatctcatcaggaa 1149  T
Q  444 aaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcg 543  Q
    ||||||| |||||||||  ||| || || | ||| ||||||||  ||||||| || |  || ||  | ||||| || ||| |||| |  || ||||| ||    
T  1148 aaacttctggaaattcattcacaactggcaacctgtcaatcaccacttgattttccaatgacaagtatgccatcaaagaagacattagaattccatcacg 1049  T
Q  544 ttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacg 643  Q
     ||||| ||||||| ||| |||||||| |  ||||| || ||||| || |||||  | ||||| ||||| || | ||||| ||| ||||| ||| ||||     
T  1048 ctccagctgcttcaactgtttagtagataggaactccgctccactctcttcttccgcagaagaaaaatgcaccgtcttgcaaaagcaattgatatgaact 949  T
Q  644 tggttgtactctaaccagttcatacc 669  Q
     |||| ||||||||||||||||||||    
T  948 cggttatactctaaccagttcatacc 923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 146; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 521 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 56056 - 55767
Alignment:
Q  521 gaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgact 620  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  | |||| |||||  || ||||    
T  56056 gaaaacatcaaaataccatcacgttctaactgcttcagctgtttagtagacaaaaactttgcgccactttcctcttcagcagaagggaaatacaccgact 55957  T
Q  621 tgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaa 720  Q
    | ||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||  ||    
T  55956 tactaaaacaattaatgtgaacatggttgtactttaaccagttcataccaaggattacatccataccactcaaaggtaaacaaaccaaatcaatttagaa 55857  T
Q  721 atcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | || || || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55856 atcacgatcaaacatagacaaaggacatcttaatcacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 55767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 145; Significance: 7e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 175 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 2873 - 2653
Alignment:
Q  175 ggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccct 274  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||     
T  2873 ggatacctattcttgatagttactttgttcaactgacgataatcaatacacaacctcatactaccatctttcttctttacttacaaaaccggcgctcccc 2774  T
Q  275 aaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccat 374  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  2773 aaggtgaaacacttggtctaacaaacttcttctcaagcaaatcttctaactgtttcttcaacttagctaactcggaagctgacatacgataacgtgccat 2674  T
Q  375 cgaaactggcttcgttccagg 395  Q
    ||| || ||||||||||||||    
T  2673 cgacaccggcttcgttccagg 2653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 145; Significance: 7e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 55 - 804
Target Start/End: Original strand, 1237 - 2000
Alignment:
Q  55 gctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatca 154  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||||||||| |||||||||    
T  1237 gctgtcttatgaatatcctcatctttcactttgatctggtgatggcccgatcttaaatcaatcttactgaacacacgtgcacccactaactgatccatca 1336  T
Q  155 aattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttac 254  Q
    |||| || || ||||||||||||||||| |  || || || || |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||    
T  1337 aattgtcgatcctcggaagtggatacctgtaatttattgtcactttgttcaactgccgataatctatacaaaacctcatgctaccatctttcttcttaac 1436  T
Q  255 tagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagca 354  Q
     | ||| |||| ||||||| ||||||| || | |||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| || |||||||||| ||| |  |||||     
T  1437 caacaacactgacgctccccaaggtgacacactcggtcttacaaacttcttatccagcaaatcttctaactgctttttcaactcagttaatttcgaagct 1536  T
Q  355 gacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa--------------gtcctctctggaggcacatcaggaatctcatctg 440  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||||| || |||| |||||| |               || ||||||| || ||||||||||| || || |    
T  1537 gacatacggtaaggtgccatcgacacaggcttcgtacctggaataagatctatagaaaattctactttcatctctggcggtacatcaggaatttcgtcag 1636  T
Q  441 gaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatc 540  Q
    | |||||||| | |||||||||||||||  | | | |||||||||||||||||||||| | ||| |  || |||||||| |||||||||  ||| |||||    
T  1637 ggaaaacttctgaaaattcacacaccacttgcaacttatcaatcactgcttgattctctatagacagggacgccattaacgaaaacatctggattccatc 1736  T
Q  541 gcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataaga 640  Q
     |     |  ||||||| || ||| |||| ||| |||||     ||| ||| |||||  | ||||| ||  | |  | ||| ||||||||||| ||| ||    
T  1737 actcattaactgcttcaactacttggtagtcaagaactcaatttcaccttcttcttcagcagaagaaaagcgcatagtcttactaaaacaattgatatga 1836  T
Q  641 acgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagaca 740  Q
    || | |||  |||| |||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||| || || |  || ||||| | || | ||||||| | ||||||||| ||||    
T  1837 acatagttaaactccaaccagtttatacctagtatcacatccatcccactgaatggcaagcagactaagttcactgcaaaatctctaccaaacatcgaca 1936  T
Q  741 aaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 804  Q
    ||||||| ||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1937 aaggacacttcaagcatactaaagaagtagtcaccgaacccttagctggggtttcgacaaccat 2000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 144; Significance: 3e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 8 - 263
Target Start/End: Original strand, 8565 - 8819
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  8565 cgaaaggcataactttgtactcatagtgaccataacgcgttatgaaagatgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatct 8664  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||| ||||||||  |||||  ||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||| || || ||||| ||||||    
T  8665 caaatctatcttgct-gaaacttttgcacccactaactgatccatcaagtcatcaatcctcggaagtgaatacctattctttattgtcacctttttcaac 8763  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaac 263  Q
    || ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8764 tgtcgatagtcaatacacaatctcatgctaccatctttcttcttcactagcaaaac 8819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 768 - 810
Target Start/End: Original strand, 14876 - 14918
Alignment:
Q  768 tagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14876 tagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatttctcc 14918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 143; Significance: 1e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 55 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 4955 - 4186
Alignment:
Q  55 gctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatca 154  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| | || |||||| | ||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |    
T  4955 gctgttttctgcatatcttcatccttcaccttaatcagatggtaacctaacctcaaataaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatta 4856  T
Q  155 aattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttac 254  Q
    ||| |||||||||| |||||||||| |||||||| || || || || ||||  || || ||||| || ||||||| |||  |||||||||||||||| ||    
T  4855 aatcatcaattctcagaagtggatatctattctttatcgtcactttattcagttgacggtaatctatgcacaacctcatgataccatctttcttcttaac 4756  T
Q  255 tagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagca 354  Q
     | ||| |  |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||  || ||     
T  4755 caacaatatcggcgctccctaaggtgaaacactcggtcttacaaatttcttatcaagtaaatcctccaactgtttcttcaactcagctagcttagacgcc 4656  T
Q  355 gacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaagt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctg 440  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||  |||||||||||| |              ||| ||||| ||||||||||||||||||||      
T  4655 gacatacggtaaggcgccatcgacacaggcttcgtacccagaacaagatcaattgaaaattcaacttccctttctggcggcacatcaggaatctcatcat 4556  T
Q  441 gaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatc 540  Q
    |||||||||| |||||||||  ||| | ||  |  ||||||||||| | ||||||||| |  || ||  | ||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  4555 gaaaaacttctggaaattcattcacaatcgacaatctatcaatcacagtttgattctctaacgaaaagtatgccatcaaagaaaacattaagatcccatc 4456  T
Q  541 gcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataaga 640  Q
     ||||| |  |  |||| ||| ||||||| ||| ||||| ||   ||| || || ||  | ||||| || ||||| | ||| ||||||||||| ||| ||    
T  4455 acgttctaagtatttcaactgtttagtagtcaagaactcagctttactctcttcctctgcagaagaaaagtgtaccgtcttactaaaacaattgatatga 4356  T
Q  641 acgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagaca 740  Q
    ||  |||| ||||||||||||||||| || | ||| |||| ||||||  | || |||| ||| ||||  || | |||| | || | ||||||||||||||    
T  4355 acacggttatactctaaccagttcatcccaaaaattacatccataccctttaacggtaaacatactatttctacttcatattctctaccaaacatagaca 4256  T
Q  741 aaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |  ||||| | ||||| || ||| || |||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  4255 attgacatcttaaacaaacaagataagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcc 4186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 671 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 8217 - 8076
Alignment:
Q  671 agaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacga--gagaaat 768  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||  ||||| |    
T  8217 agaatcacatccataccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaagaacatcgcaaacatacgagagagaagt 8118  T
Q  769 agtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8117 agtcaccgaacgtttagctggagtttcgacaaccatctctcc 8076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 143; Significance: 1e-74; HSPs: 4)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 8 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 9147 - 8749
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| || |||||||| || || ||||| ||||||| ||||||| | || ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  9147 cgaaaggcatcactgaatattcataatgtccataacgtgtcctaaaagccgtcttctccatatccccgtctttcaccttaatctggtgataacccgatct 9048  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||    
T  9047 caaatcaatcttgctaaacacgcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatctatccttggaagtggatacctattctttatcgttactttactcaac 8948  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| || |  || |  || |||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||| |    
T  8947 tgtcgatagtcaatgcataacctcatactaccatctttcttcttaaccaaaaatatcggggctccccaaggtgaaacactcggtcttacaaacttcttat 8848  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
      || || || || ||||||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||||||  || || || |||||||| || |||||||||||||    
T  8847 tgagtaaatcttctaactgtttcttcaactcggtcaactcagaagccgacatacggtaaggtgttatagacacaggcttcgtacccggaacaagatcaa 8749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 107 - 406
Target Start/End: Original strand, 6628 - 6927
Alignment:
Q  107 tcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 206  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||| || ||||| ||  ||||    
T  6628 tcaaatcaatcttgctaaacacgcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatctatccttggaagtggatacctattctttatcgttactttactcaa 6727  T
Q  207 ctgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttc 306  Q
    ||| ||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| || |  || |  ||| ||||| |||||||||| | |||| | |||||||||||     
T  6728 ctgtcgatagtcaatgcataacctcatactaccatctttcttcttaaccaaaaatatcggcactccccaaggtgaaacactcggtgttacaaacttctta 6827  T
Q  307 tcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    |  || || || || ||||||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| || || |||||||| || |||||||||||||    
T  6828 ttgagtaaatcttctaactgtttcttcaactcggtcaactcagaagccgacatacggtaaggtgtcatagacacaggcttcgtacccggaacaagatcaa 6927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 107 - 251
Target Start/End: Original strand, 1324 - 1468
Alignment:
Q  107 tcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 206  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||| || ||||| ||  ||||    
T  1324 tcaaatcaatcttgctaaacacgcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatctatccttggaagtggatacctattctttatcgttactttactcaa 1423  T
Q  207 ctgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctt 251  Q
    ||| ||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  1424 ctgtcgatagtcaatgcataacctcatactaccatctttcttctt 1468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 435 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 8718 - 8459
Alignment:
Q  435 catctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagat 534  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| |   | | | ||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||   ||    
T  8718 catcaggaaaaacttctggaaattcacacacaattcgcaacttatcaattaccgcttgattctcaacagacaaagacgccatcaaagaaaacatcggaat 8619  T
Q  535 accatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaatta 634  Q
     | ||| ||  | |  ||| | |||||||| |||| ||| ||||| ||  |||| || |||||    |||||  ||||||| | ||| ||||||||| ||    
T  8618 tctatcacgcgctaactgccttagctgcttggtagtcaagaactcagcttcactctcttcttcagtagaagaataatgtaccgtcttactaaaacaacta 8519  T
Q  635 ataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaa 694  Q
    ||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||| ||| |||||||||    
T  8518 atatgaacatggttatactccaaccagttcataccaagtattacatccattccactcaaa 8459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1881 (Bit Score: 137; Significance: 4e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold1881
Description:

Target: scaffold1881; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 614 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 973 - 777
Alignment:
Q  614 actgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatcca 713  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  973 actgacttgctgaaacaattgatatgaacatggttgcactctaaccaattcatacccagaatcacatccataccgctcaaaggtagacaaactaaatcca 874  T
Q  714 tttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  873 tttcaaaatcacgaccaaacatatataaaggacatttctatcatacgagagaagtagttacctaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1881; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 248 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 1270 - 988
Alignment:
Q  248 tctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactc 347  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||  |||||    
T  1270 tcttcactagcaaaactggcgctccccaaggtgaaacacttggtctaacaaatttcttttcaagcaaatcttctaactgtttcttcaactcagtcaactc 1171  T
Q  348 ggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa--------------gtcctctctggaggcacatcaggaatc 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||| |||||                ||| | ||||||||||||||||||     
T  1170 ggaagcagacatacgataaggtgccatcaacaccggcttcgttccagggacaaaatcaatagaaaactcgacttccctttttggaggcacatcaggaatt 1071  T
Q  434 tcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccat 516  Q
    |||||||| |||||||||||||| || || |||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  1070 tcatctgggaaaacttcaggaaagtcgcataccacttgtagcttatcaatcattgcttgattctcaatagataaggaagccat 988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 135; Significance: 6e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 49988 - 49174
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||| || || || || |  || ||||||||||||||||| ||||| |||||||  || |||||||| ||    
T  49988 cgaaaggcatcaccttatattcataatgaccatatcgtgtcctaaagggcgtattctgcatatcctcatcattcaccttaatctaatggtaacctgacct 49889  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||||||||  || || || |||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||| |||| ||||||| ||||| || || || || |||| |    
T  49888 caaatcaatcttgcagaacacacgagcacccactaactgatccatgaaatcgtcaattctcgaaagtagatacctgttctttatcgtcactttattcagc 49789  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || || ||||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||| || | ||| || ||||||||| |   |||||| | |||||| ||||| ||||| |    
T  49788 tgacggtaatctatacataacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccggcgctcccca--ctgaaacactcggtcttacaaatttcttat 49691  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||     
T  49690 caagcaaatcctccaactgtttcttcaattcggctaactcggacgccgacatacggtaaggtgccatcgacaccggctttgttccgggcacaagatcaat 49591  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              |||||  || |||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |  ||||||||||| ||||||    
T  49590 tgaaaattcaacctccctcttcggtggcacatttggaatctcatcaggaaaaacttctggaaattcactcacaaccggcaatctatcaatcacagcttga 49491  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    ||||| |  || ||  | ||||| || |||||||| |  ||  |||| | ||| |  ||||||| ||| || |||| ||| ||||| |   | || || |    
T  49490 ttctccaatgacaagtacgccatcaaggaaaacattagaatttcatcactttctaactgcttcaactgtttcgtagtcaataactcagtttcgctctctt 49391  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    | ||  | ||||| ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| || | ||| |||| ||||||   |||    
T  49390 cctcagcagaagaaaaatgcactgtcttactaaagcaattaatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaattacatccatacccgacaa 49291  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     || | | | |||| ||| | |||||| || | |||||||||||||||  ||||  ||||||| || |||||| |||| || |||||||||||| || ||    
T  49290 cggcaaatatactagatcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacagacaactcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagcttgattt 49191  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || |||||||| |||||    
T  49190 tcaacaaccatttctcc 49174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 133; Significance: 1e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 404
Target Start/End: Original strand, 16305 - 16701
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  16305 cgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcaaatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacct 16404  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||| ||| || ||||| || |  |||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||| || || || || |||| |    
T  16405 caaataaattttactaaacacacaagcacccactaactgatccattaaatcgtcaattctcggaactggatacctgttctttatcgtcactttattcagc 16504  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || || ||||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||| || | ||| || ||||||||| | |||||||| | |||||| ||||  ||||| |    
T  16505 tgacggtaatctatacataacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccggcgctccccacggtgaaacactcggtcttacaactttcttat 16604  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc 404  Q
    | || || |||||||||||||||||||| |||| || ||| |  || |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  16605 ccagtaaatcctccaactgtttcttcaattcagctagctcaggcgccgacatacggtaaggtgccatcgacaccggcttcgttccgggcacaagatc 16701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 77 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 7905 - 7603
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||| ||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||   |||||| || |   |||||||||||| |||||| |  ||||||||    
T  7905 cctttactctaatctgatgatatcctgacctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaaccagttgatccatcaaatcatcaatccgtggaagtgg 7806  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaa 276  Q
    ||| | |||||| || || ||||||||||||||  ||||||| | |||||||| |||| | |||||||||||||| || | ||| || || || ||| |     
T  7805 atatcgattcttaatcgtcaccttgttcaactgttgataatccacacacaacctcatatttccatctttcttcttaaccaacaatacgggagcaccccac 7706  T
Q  277 ggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcg 376  Q
    |||||||| |  || |||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||   ||||| || |||||||| ||||| || || ||||    
T  7705 ggtgaaacacttggcctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgtttcttcaattcacccaactctgatgcagacatccgatacggcgcaatcg 7606  T
Q  377 aaa 379  Q
    |||    
T  7605 aaa 7603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 131; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 947 - 131
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| || || || |||||||| || || || || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| || ||    
T  947 cgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatggtaaccagacct 848  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgt-gcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 206  Q
    ||| |||||||| ||||||| || | ||||| || ||| |||||||||| |  ||||| ||||||||  ||||||  ||||| || || || ||||||||    
T  847 caagtcaatcttactaaaaa-tcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaatcctcggaagcagataccggttctttatcgtaactttgttcaa 749  T
Q  207 ctgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttc 306  Q
    ||  || |||||||| ||||  | |||||||||||| |||||||| || | ||| || ||||||||| | |||||||| |  ||||| |||||||||||     
T  748 ctaacggtaatcaatgcacagtctcatactaccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgctccccagggtgaaacactgggtcttacaaacttctta 649  T
Q  307 tcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||| ||| |||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| || |    
T  648 tctaacaagtcctccaactgtttcttcaattcagctaactcataagctgacgtacggtatggtgctatcgacaccggctttgttcctggaacaaggtcta 549  T
Q  407 gt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttg 492  Q
     |              ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||  |||||| || | ||| |||||||| |||||    
T  548 ttgaaaattcaacctccctctctggtggcacatcaggaatctcatcaggaaacacttctggaaattcattcaccacaggcaacctgtcaatcacggcttg 449  T
Q  493 attctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcc 592  Q
    ||| || |  || ||| | |||||||| ||| ||||||  || || || ||||| || || |||| ||| || ||||||||||| ||  |  ||| |||     
T  448 attttctaacgacaaatatgccattaaagaatacatcagaatcccgtcccgttctagctgtttcatctgtttcgtagacaaaaattcaacttcaccttct 349  T
Q  593 tcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactca 692  Q
    |||||  | ||||| |||||||| | ||| ||||| || || ||| ||||  |||| ||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||   ||    
T  348 tcttcagcagaagaaaaatgtaccgtcttactaaagcagttgatatgaactcggttatactctaaccaattcataccaaaaatcacattcatacccgaca 249  T
Q  693 aaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagt 792  Q
    | || | ||||||||||||||   |||| || | | |||||||||| | ||||||   |||||| || |||||| |||| ||  ||||||||| ||||||    
T  248 acggcaaacaaactaaatccaccacaaagtccctaacaaacatagatataggacaccccaaacaaacaagagaagtagttactaaacccttagttggagt 149  T
Q  793 ttcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||| |||||||| |||||    
T  148 ttcaacaaccatttctcc 131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 131; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 406
Target Start/End: Original strand, 43109 - 43507
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || || ||||| || |||||||| || || || || ||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||    
T  43109 cgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccctcttctgcataccctcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacct 43208  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||| || |||||   ||||||||||||| |||||||||| |  ||||| |||| |||||||||||| ||||| || || || || ||||||    
T  43209 caagtcaatcttactgaaaacctttgcacccactaactgatccatcaagtcgtcaatcctcgaaagtggatacctgttctttattgtaactttattcaac 43308  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||| || |||| ||| ||||  || ||||||||||| | ||| ||   ||||||| ||||||| || |  ||||| ||||| ||||| |    
T  43309 tgacgatagtcaatgcataacctcatgctactgtccttcttctttaccaacaataccaacgctccccaaggtgagacacttggtcttacaaaattcttat 43408  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa 406  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||    
T  43409 caagcaagtcttccaactgtttcttcaattcagctaactcggaagctgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcccggaacaaggtcaa 43507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 127; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 64 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 176401 - 175788
Alignment:
Q  64 tgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaa 163  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||  || ||||| || |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  176401 tgcatatcttcatcttttactttaatctaatggtaacccgacctcaaatcaatcatgctaaacacgcgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaa 176302  T
Q  164 ttctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaac 263  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| || |  || || ||||  || |  ||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||| || | ||| ||    
T  176301 ttcgcggaagtggatacctattctttatcgccactttattcaggtgacagtaatctatacacaacctcatgctaccatttttcttcttaaccaacaacac 176202  T
Q  264 tggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacga 363  Q
     | ||||||| |||||||||| | || ||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||| || || ||||||||     
T  176201 cgacgctccc-aaggtgaaacactcgatcttacaaactttttatcaagtaaatcctccaactgtttcttcaactctgctaactcagacgctgacatacgg 176103  T
Q  364 taaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc-------aagtc-------ctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaactt 449  Q
    ||||  || ||||| || |||||||| || |||||||||||       || ||       || ||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  176102 taagacgctatcgacacaggcttcgtacccggaacaagatcaatggaaaattcaacttctctttctgatggcacatcaggaatctcatcagaaaaaactt 176003  T
Q  450 caggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccag 549  Q
      || || |||||||| || |||| | ||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |  ||||||||||| || |||||  | || |     
T  176002 ttgggaaatcacacacaactggtaacttatcaattactgcttgattctcaacagacaaggacgccatcagagaaaacatcaaaattccatcatgctctaa 175903  T
Q  550 ttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttg 649  Q
     |  |||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||| || ||||| || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||  | |||| |||||     
T  175902 ctatttcagctgcttagtagtcaagaaccctgctccactctcttcttcaacagaagaaaaatataccgacttactaaaacaattataatgaacatggtta 175803  T
Q  650 tactctaaccagttc 664  Q
    ||||  |||||||||    
T  175802 tacttcaaccagttc 175788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 122; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Original strand, 21042 - 21858
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    ||||| |||| || |||||||| ||||||||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||  || |||||||| ||    
T  21042 cgaaaagcatcaccttatattcgtagtgaccatatcgtgtcctaaaggcagtcttctgcatgtcctcatctttcaccttaatctaatggtaacctgacct 21141  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| ||||| || |||||||    |||||| || ||| | |||||||| | ||||||||||||||| ||||| || ||||| || || || || ||||||    
T  21142 caagtcaattttactaaaaatctttgcaccaaccaactggtccatcaagtcatcaattctcggaagcggatatctgttctttatcgtaactttattcaac 21241  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||| || | || |||||||||||| ||||||||||| | ||| || ||||||||| | |||||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  21242 tgacgatagtcaatgcatagcctcatactaccatccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgaaacacttggtcttacaaacttcttgt 21341  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    | || || ||| |||||||||||||||||||||  |  ||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||     
T  21342 cgagaaaatccaccaactgtttcttcaactcagcaagttcggatgctgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcctggtacaaggtcaat 21441  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |               || ||||| || || || ||||||||||| | ||||||||||||||| |||  |||||| |||| ||| |||||||| |||||     
T  21442 tgaaaattcaatctctctttctggtggtacgtctggaatctcatccgaaaaaacttcaggaaactcattcaccactggtaacctgtcaatcacagcttgg 21541  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    || || |  || ||| | |||||||| ||| ||||||  || ||||| ||||| || ||||||| ||  || ||||  ||||| ||  | ||||  || |    
T  21542 ttttctaacgacaaacatgccattaaggaatacatcagaattccatcacgttctagctgcttcatctctttcgtagtaaaaaattcaactccaccctctt 21641  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||| ||||| || | |||| |||| || || ||| ||||  |||| ||||||||||| || || || | ||| |||| ||| ||  |||     
T  21642 cttcagcagaagaaaaatgcacggtcttgttaaagcagttgatatgaactcggttatactctaaccaattaatcccaaaaataacatccattcccgtcag 21741  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     |||| ||||||||| || |  |||||||| | ||| |||||||| | ||||||  ||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  21742 cggtaaacaaactaagtctacctcaaaatccctaccgaacatagatataggacacctcaaacaaacaagagaagtagtcactgaacccttagctggagtt 21841  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || || ||||| |||||    
T  21842 tcaacgaccatttctcc 21858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 147 - 810
Target Start/End: Original strand, 36269 - 36946
Alignment:
Q  147 atccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttc 246  Q
    |||||| || || ||||| ||| ||||||||||||| || || || || ||||| ||||| || | ||||||||| || |||| ||| |||||||| |||    
T  36269 atccattaagttgtcaatcctcagaagtggatacctgttgtttatcgtaaccttattcaattgacaataatcaatgcataacctcatgctaccatccttc 36368  T
Q  247 ttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataact 346  Q
    ||||| || | |||||  ||||||||| |||||||||| |  ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |  |    
T  36369 ttcttaaccaacaaaatcggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaacttcttatcaagcaagttctccaactgtttcttcaattcagcaagtt 36468  T
Q  347 cggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaagt--------------cctctctggaggcacatcaggaat 432  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||| |||| |              ||||||||| |||||||| |||||    
T  36469 cggacgccgacatacgataaggtgccatcgacacaggcttcgttcctagaacaaggtcaattgaaaattcaacctccctctctggtggcacatctggaat 36568  T
Q  433 ctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaag 532  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||  ||| || || | |||| ||||||| ||||||||||| |  || ||| | ||||| || |||||||| ||     
T  36569 ctcatcaggaaaaacttcaggaaactcattcacaactggcaacctagcaatcacagcttgattctctaacgacaaatatgccatcaaagaaaacattaaa 36668  T
Q  533 ataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaat 632  Q
    || ||||| || ||||  ||||||| ||| ||  |||| |  ||||| || ||||| || |||||  | ||||| |||||  | | |||||||||  |||    
T  36669 attccatcacgctccaactgcttcaactgtttcatagataggaactcagctccactctcttcttcagcagaagaaaaatgcgccgtcttgctaaagaaat 36768  T
Q  633 taataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaa 732  Q
    | ||| ||||  | || |||||||| |||||||| || | |||  ||| ||||||  |||| |||| ||||||||| || | |||||| || | ||||||    
T  36769 tgatatgaactcgattatactctaaacagttcatcccaaaaatatcatccatacccgtcaacggtaaacaaactaagtcgacttcaaagtctctaccaaa 36868  T
Q  733 catagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||||||| |||||  | | ||| || |||||| |||| |  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  36869 catagacaacggacaccttagacaaacaagagaagtagttattgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcc 36946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 495
Target Start/End: Original strand, 29125 - 29626
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| || || || |||||||| || || || || ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||  | ||    
T  29125 cgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccatcttctgcatatcctcatccttcacttttatctgatggtaaccaaacct 29224  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||| || ||||  |  ||||| || ||  ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||||    
T  29225 caagtcaatcttactgaaaatcctagcaccaaccaattgatccatcaaatcgtcaattctcggaagcggatacctgttctttatcgtaaccttattcaac 29324  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || || ||||| || ||||  | |||||||||||| |||||||| || | ||| || || || ||| |||||||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  29325 tgacggtaatctatgcacagtctcatactaccatccttcttcttaaccaacaacaccggtgccccccaaggtgaaacactgggtcttacaaacttcttat 29424  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaag 407  Q
    | | || ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||     
T  29425 ccaacaggtcctccaactgtttcttcaaatcagctaactcagaagctgacatacggtatggtgccatcgacaccggcttcgttcctgtaacaagatcaat 29524  T
Q  408 t--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
    |              ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||  ||| ||  ||| ||| |||||||| ||||||    
T  29525 tgaaaattcaatctccctctctggtggcacatcaggaatctcatcaggaaacacttctggaaattcattcactacaagtaacctgtcaatcacagcttga 29624  T
Q  494 tt 495  Q
    ||    
T  29625 tt 29626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 118; Significance: 9e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 413 - 810
Target Start/End: Original strand, 4698 - 5095
Alignment:
Q  413 tctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaag 512  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||  | ||||||||||| |   | | | ||||||| | |||||||||||| | ||| || || |    
T  4698 tctggcggcacatcaggaatctcgttaggaaaaacttctaggaattcacacacaattcgcaacttatcaattaatgcttgattctccatagacaaggacg 4797  T
Q  513 ccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatg 612  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||| || || |  | ||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||| || |||||  | ||||| ||||     
T  4798 ccatgaaagaaaacatcaagattccatcacgctctaactacttcagctgcttagtagtcaataactttgctccactctcttcttcagcagaagaaaaata 4897  T
Q  613 tactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatcc 712  Q
    ||| |||||  | |||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||| ||| ||||||||||  | ||||||||||||     
T  4898 taccgacttattgaaacaattaatatgaacatggttatactccaaccagttcataccaaggattacatccattccactcaaagacaaacaaactaaatca 4997  T
Q  713 atttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||||||  | | ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  4998 atttcaaagtctcgaccaaacatcgacaaaggacaccttagacacactagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacgaccatatctcc 5095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 235 - 368
Target Start/End: Original strand, 4539 - 4672
Alignment:
Q  235 ctaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttca 334  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||| | |||||| || |||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  4539 ctaccatctttcttcttaactagtaacaccggcgctccccaaggtgaaacactcggtcttacgaactccttatcaagcaaatcctctaactgtttcttca 4638  T
Q  335 actcagataactcggaagcagacatacgataagg 368  Q
    ||||||  ||||| ||||| ||||| || |||||    
T  4639 actcagccaactcagaagccgacatgcggtaagg 4672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 118; Significance: 9e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 10899 - 10083
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || || || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||| || ||    
T  10899 cgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcacctttatctgatggtaaccagacct 10800  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| || ||||| |||||||    |||||| || ||| |||||||||| | ||||||  || ||||  ||||||| ||||| || || || |||||||||    
T  10799 caagtcgatcttactaaaaatatttgcaccaaccaactgatccatcaagtcatcaatcttcagaagcagatacctgttctttattgtaactttgttcaac 10700  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || || ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||| | ||| || | ||||||| | ||| | || | |||||| ||||||||||| |    
T  10699 tgacggtaatctatacacaatctcatgctaccatctttcttctttaccaacaacacagtcgctccccacggtaagacactcggtcttacaaacttcttat 10600  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa- 406  Q
    |||| || || || |||||||||||||  ||||  ||||| || || |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||     
T  10599 caagtaaatcttctaactgtttcttcagttcagccaactcagatgctgacatacggtatggtgccatcgacaccggctttgttcccggaacaaggtcaat 10500  T
Q  407 -------------gtcctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttga 493  Q
                   ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||  |||||| |||| ||| |||||||| ||||||    
T  10499 cgaaaactccacctccctctctaggggcacatcaggaatctcatcaggaaacacctccggaaactcattcaccactggtaacctgtcaatcacagcttga 10400  T
Q  494 ttctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcct 593  Q
    || || |  || || || ||||| || ||| ||||||| || ||||| ||||| |  ||||||| ||| || |||| ||| |||||  | ||||  || |    
T  10399 ttttccaacgacaaggatgccatcaaggaatacatcaaaattccatcacgttctaactgcttcatctgtttcgtagtcaagaactcaactccaccctctt 10300  T
Q  594 cttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaa 693  Q
    ||||  | ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||| ||||  |||| ||||||||||| ||||| |  | ||| || | ||| ||  ||||    
T  10299 cttcagcagaagaaaaatgtaccgtcttactaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccaattcattcaaaaaataacgtccattcccgtcaa 10200  T
Q  694 aggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtt 793  Q
     || | ||||||||| || |  |||||||| | |||||||||||| | ||||||  ||||||| || |||||| |||| || | ||||||||||||||||    
T  10199 cggcaaacaaactaagtctacctcaaaatctctaccaaacatagatataggacacctcaaacaaacaagagaagtagttactgtacccttagctggagtt 10100  T
Q  794 tcgacaaccatctctcc 810  Q
    || |||||||| |||||    
T  10099 tcaacaaccatttctcc 10083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 117; Significance: 4e-59; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 404
Target Start/End: Original strand, 51003 - 51399
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||| || || || || || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  51003 cgaaaggcatcaccttatattcataatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttcggcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacct 51102  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||||||||| || ||||| ||  | |||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||||| || || || || |||| |    
T  51103 caaatcaattttactaaatacaagagcacccactaactgatccattaaatcttcaattctcgaaagtggatacctattctttatcgtcactttcttcagc 51202  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || || ||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||| |  | ||| || ||||||||| |  ||||||| | || ||| ||| | ||||| |    
T  51203 tgacggtaatctatacacaacctcatgctaccatccttcttcttaaacaacaataccggcgctccccacagtgaaacactcgatcttacatatttcttat 51302  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc 404  Q
    |||| || || || || ||||||||||| | || |||||| || || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  || ||||||||    
T  51303 caagtaaatcttcaaattgtttcttcaatttagctaactcagacgccgacatacgataaggtgccatcgacaccggctttgttctgggcacaagatc 51399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 145
Target Start/End: Original strand, 31138 - 31275
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||    
T  31138 cgaaaggcataactttatattcatagtggccataccgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataactcgatct 31237  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaaca 145  Q
    || ||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  31238 cagatctatcttgctgaaaacacttgcacccactaaca 31275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 179 - 370
Target Start/End: Original strand, 31278 - 31469
Alignment:
Q  179 acctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaagg 278  Q
    |||||||||| || || | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||    
T  31278 acctattctttattgtcatcttgttcaactgtcgataatcaatacacaacctcatgctaccatccttcttcttcactaacaaaaccggcgctccccaagg 31377  T
Q  279 tgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtg 370  Q
     ||||  |  ||||||| |||||| ||||||||||| || || || ||||||||||| || |  ||||| ||||| || | |||||||||||    
T  31378 cgaaaaacttggtctaaaaaactttttctcaagcaaatcttctaattgtttcttcaattcggccaactctgaagctgataaacgataaggtg 31469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 116; Significance: 1e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 627 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 11360 - 11177
Alignment:
Q  627 aacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacg 726  Q
    ||||||||||  |||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  11360 aacaattaatgtgaacatggttgtattccaaccagttcataccaagaatcacatccataccactgaaaggtagacaaaccaaatccatctcaaaatcacg 11261  T
Q  727 accaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    | |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11260 atcaaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatttctcc 11177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 6444 - 6351
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacc 101  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6444 cgaaaggcaaaactttgtactcatagtgaccataccgcgttctgaaagttgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacc 6351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 114; Significance: 2e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 58 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 84582 - 83824
Alignment:
Q  58 gtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaat 157  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| || |||||||| ||||| ||  | || || || ||||||||||||  |||||||||||    
T  84582 gtcttctgaatatcctcatctttcactttgatccggtgatagcccgatctcaagtcaattttattgaacacacgcgcacccactaact-atccatcaaat 84484  T
Q  158 tatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactag 257  Q
      | ||| ||||||||| ||||||||||||| || || || || |||||||||| |||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||| || |     
T  84483 cgttaatcctcggaagtcgatacctattctttattgtcactttattcaactgcctataatctatacataacctcatgctaccatctttcttcttaaccaa 84384  T
Q  258 caaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagac 357  Q
     || || ||||||||| ||||  | || |  || || ||||||||||| |||| ||| || || ||||| || |||||||||| ||| |||||||| |||    
T  84383 taacaccggcgctccccaaggcaacacacttggccttacaaacttcttatcaaacaaatcttctaactgctttttcaactcagctaattcggaagctgac 84284  T
Q  358 atacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaa--------------gtcctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaa 443  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||                ||||||||| ||||||| |||||| |||| ||| |    
T  84283 atacggtaaggtgtcatagaaacaggtttcgtacccggaataagatcaatagaaaattctacttccctctctggtggcacattaggaatttcatttgg-a 84185  T
Q  444 aaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcg 543  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||  | | | |||||||||| | ||||||||||| ||| || || ||||| || |||||||||  ||| |||| |||    
T  84184 aaacttctggaaactcgcacaccacttgcaacatatcaatcaccgattgattctcaatagacaaggatgccatcaaagaaaacatctggattccattgcg 84085  T
Q  544 ttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacg 643  Q
        |  || |||| ||||||||||| ||| ||||| |   | | ||| |||||||| ||||| ||| | |||| ||| ||||||||||||||  ||||     
T  84084 cattaactgtttcaactgcttagtagtcaagaactcagtttctccttcttcttcgacagaagaaaaacgcactgtctttctaaaacaattaatgtgaaca 83985  T
Q  644 tggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaag 743  Q
    | |||  |||  ||||||||||| || ||  |||||| ||| ||||| || || |  || ||||| |||| | ||||||| | ||||||||| |||||||    
T  83984 tagttaaacttcaaccagttcattcctagtttcacatccatcccacttaacggcaagcagactaagtccactgcaaaatctctaccaaacatcgacaaag 83885  T
Q  744 gacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 804  Q
    |||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||    
T  83884 gacacttcaagcatactagagaagtagtcaccgaatccttagccggggtttcgataaccat 83824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Original strand, 268801 - 269125
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || |||||| | || || || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||    
T  268801 cgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccacatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatttgatggtaacccgacct 268900  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||| |||||||||   ||||| || ||| | |||||||| | |||||| | ||| ||||||||||||||||| || || || |||||||||    
T  268901 caagtcaatcttactaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaagtcatcaatccgcgggagtggatacctattctttattgtaactttgttcaac 269000  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || ||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| || |  || || || |||||| | || ||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  269001 tgacgatagtcaatgcacaacctcatacttccatctttcttcttcaccaataacacgggtgctccccacggcgaaacactaggtctcacaaacttcttat 269100  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttctt 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  269101 caagcaagtcctccaactgtttctt 269125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1615 (Bit Score: 113; Significance: 9e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold1615
Description:

Target: scaffold1615; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 289 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 1565 - 1198
Alignment:
Q  289 ggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcg 388  Q
    ||||||||||| || | ||||||||| ||||| || |||||||||||||| |  ||||| |||   |||||||||||||||| ||| || || |||||||    
T  1565 ggtctaacaaaattttactcaagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaacttgacatacgataaggtgtcatagacacaggcttcg 1466  T
Q  389 ttccaggaacaagatcaagt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtag 474  Q
    ||||||| |||||||||  |              | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||  ||||    
T  1465 ttccaggtacaagatcatttgaaaactcaacttccatctctggaggcacatcaggaatttcatcaggaaaaacttctggaaaatcgcataccacttgtag 1366  T
Q  475 cctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaa 574  Q
      |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |  |||||||||| |||||||||||||    
T  1365 tttatcaatcactgcttgattctcaatagataaggaagccatcaaagaaaacatcaaaataccatcacgttctaactgcttcagctacttagtagacaaa 1266  T
Q  575 aactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaac 642  Q
    |||||||| |||||||||||||   | ||||||||||  || ||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  1265 aactctgcgccactttcctctttagcagaagagaaatacaccgacttactaaaacaaataatatgaac 1198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1530 (Bit Score: 113; Significance: 9e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold1530
Description:

Target: scaffold1530; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 235 - 804
Target Start/End: Original strand, 1 - 584
Alignment:
Q  235 ctaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttca 334  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||| || ||||||||| ||||||| || |  ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1 ctaccatccttcttctttaccaacaataccggcgctccccaaggtgagacacttggtcttacaaacttcttatcaagcaagtcttccaactgtttcttca 100  T
Q  335 actcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaagt--------------cctctctggagg 420  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |              ||| ||||| ||    
T  101 actcagctaactcggaagctgacatgcgataaggtgtcatcgacaccggcttcgttcctggaacaagttcaattgaaaattcaacctccctttctggtgg 200  T
Q  421 cacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaat 520  Q
     ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||  ||| |  || | ||| ||||| || |||||||| || |  || ||| | ||||| ||     
T  201 tacatctggaatctcgtccggaaaaacttcaggaaactcattcacaattggcaacctgtcaattacagcttgattttctaacgacaaatatgccatcaaa 300  T
Q  521 gaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgact 620  Q
    |||||||| |  || ||||| || ||||  ||||||| ||| || ||| | |  |||||||| ||||| || |||||  | ||||| ||||| || | ||    
T  301 gaaaacataagaattccatcacgctccaactgcttcaactgtttcgtacataggaactctgctccactctcttcttccgcagaagaaaaatgcaccgtct 400  T
Q  621 tgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaa 720  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||  |||| ||||||||||||||||| || | ||| |||| ||||||  |||| |||| ||||||||| || | ||||||    
T  401 tgctaaagcaattgatatgaacccggttatactctaaccagttcatcccaaaaataacatccatacctgtcaacggtaaacaaactaagtcgacttcaaa 500  T
Q  721 atcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 804  Q
     || | ||||||||||||||| |||||  | | ||| || |||||| |||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  501 gtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagatggagtttcaacaaccat 584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 112; Significance: 3e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 663 - 810
Target Start/End: Original strand, 1 - 148
Alignment:
Q  663 tcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgag 762  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  1 tcatacccagaatcacatccataccgctcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcatgaccaaacatagataaaggacatctcaaacatacgag 100  T
Q  763 agaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  101 agaagtagtcaccaaacccttagctgaagtttcgacgaccatctctcc 148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 110; Significance: 5e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 208
Target Start/End: Original strand, 959 - 1157
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||  |||||    
T  959 cgaacggcatcaccttatactcataatggccataccgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataac--gatct 1056  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||| |||||||| ||||||  ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  1057 caaatctatcttgctgaaaacttttgcacccaccaactgatccatcaaatcatcaatactcggaagtggatacctattcttgattgtcaccttgttcaac 1156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 107; Significance: 3e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 644 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 2726 - 2560
Alignment:
Q  644 tggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaag 743  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  2726 tggttgtattccaaccagttcataccaagaatcacatccataccactcaaaggtaaacaaaccaaatctatctcaaaatcacgatcaaacatagacaaag 2627  T
Q  744 gacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2626 gacatcttaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatgtctcc 2560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 107; Significance: 3e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 77 - 379
Target Start/End: Original strand, 25656 - 25958
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||| | |||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  25656 cctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 25755  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaa 276  Q
    ||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| || | ||| ||||| || ||| |     
T  25756 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgtcgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccac 25855  T
Q  277 ggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcg 376  Q
    |||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||| |||   ||||| || |||||||| ||||| || || ||||    
T  25856 ggtgaaacactcggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgattcttcaattcacccaactccgatgcagacatccgatacggcgcaatcg 25955  T
Q  377 aaa 379  Q
    |||    
T  25956 aaa 25958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1602 (Bit Score: 104; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold1602
Description:

Target: scaffold1602; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 180 - 1
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  180 cgaacggcatcacgttatactcataatgtccataacacgttctaaaagctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatct 81  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattct 187  Q
    ||| ||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  80 caagtcaatcttgctgaacacgcgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattcttggaagtggatacctattct 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2111 (Bit Score: 101; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold2111
Description:

Target: scaffold2111; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 700 - 316
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || |||||||| || |||||||| || || || || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |  || ||||| || ||    
T  700 cgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatttcatggtaacccgacct 601  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| |||||||| |||||||||  |||||| || ||| |||||||||  |  ||| |||||||||| ||||| || ||||| || || || || ||||      
T  600 caagtcaatcttactaaaaacttttgcaccaaccaactgatccatcaggtcgtcagttctcggaagcggatatctgttctttatcgtaactttattcagt 501  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || || || ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||| || ||||||||| | |||||||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  500 tgacggtagtcaatgcacaacctcatactaccatccttcttctttaccaacaacacaggcgctccccacggtgaaacacttggtcttacaaacttcttgt 401  T
Q  308 caagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttcc 392  Q
    | || || ||||| |||| |||||| ||||| |  | |||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  400 cgagtaaatcctctaactatttctttaactctgcaagctcggatgccgacatacgataaggtgccatcgacaccggcttcgttcc 316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 101; Significance: 1e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 77 - 365
Target Start/End: Original strand, 15170 - 15458
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||| | |||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  15170 cctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 15269  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaa 276  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| || | ||| ||||| |||| | |     
T  15270 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatacttccatctttcttcttaaccaacaacactggagctctccac 15369  T
Q  277 ggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgata 365  Q
    |||||||  |  ||||||| |||||  ||||||||||| || || |||||||||||||| |||   ||||| || |||||||| |||||    
T  15370 ggtgaaatacttggtctaataaactgtttctcaagcaactcttctaactgtttcttcaattcacccaactctgatgcagacatccgata 15458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 77 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 11218 - 10930
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||   || ||| || |   |||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  11218 ccttcactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactgaacacctctgaaccaaccagttgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 11119  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaa 276  Q
    ||||| |||||| || || || |||||||| ||||||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| || | ||| ||| | || ||| |     
T  11118 ataccgattcttaatcgtcactttgttcaagtgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaacaacactagagcaccccac 11019  T
Q  277 ggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgata 365  Q
    || ||||| |  ||||||| ||||| ||||||||  || || || |||||||||||||| |||   ||||| || |||||||| |||||    
T  11018 ggcgaaacacttggtctaataaactgcttctcaaataactcttctaactgtttcttcaattcacccaactctgatgcagacatccgata 10930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 99; Significance: 2e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 77 - 379
Target Start/End: Original strand, 473 - 775
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| || | |||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  473 cctttactctaatctggtgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaaccagcagatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 572  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaa 276  Q
    ||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| |||| ||| ||||| || ||| |     
T  573 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgacgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccac 672  T
Q  277 ggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcg 376  Q
    || ||||| |  ||||||| ||  | |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||   ||||| || |||||||| | |||||| || ||||    
T  673 ggcgaaacacttggtctaataagttgcttctcaagcaactcttccaactgtttcttcaattcacccaactctgatgcagacatccaataaggcgcaatcg 772  T
Q  377 aaa 379  Q
    |||    
T  773 aaa 775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 77 - 335
Target Start/End: Original strand, 7415 - 7673
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| || | | ||||||||| || |||||| || ||||||||    
T  7415 cctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctatgcaccaaccagctgatccatcatatcatcaatccttggaagtgg 7514  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaa 276  Q
    ||||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| |||| ||| ||||| || ||| |     
T  7515 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgacgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaactaacaacactggagcaccccac 7614  T
Q  277 ggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaa 335  Q
    || ||||| |  ||||||| ||  | |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  7615 ggcgaaacacttggtctaataagttgcttctcaagcaactcttccaactgtttcttcaa 7673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 98; Significance: 8e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 129
Target Start/End: Original strand, 8207 - 8328
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  8207 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataaagcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatccttcactttaatatggtgataccctgatct 8306  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaact 129  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  8307 caaatcaatcttgctgaaaact 8328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 98; Significance: 8e-48; HSPs: 3)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 47147 - 46838
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || || || ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||    
T  47147 cgaaaggcatcaccttatattcataatgaccataacgtgtcctaaaggccatcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaaccggacct 47048  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    | ||||||| || ||||| || ||||||||||||| | ||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||| || || || || |||| |    
T  47047 ccaatcaattttactaaacacacgtgcacccactagctgatccattaaatcgttaattctcggaagtggatacctattctttatcgtcactttattcagc 46948  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttct 307  Q
    || || |||||  |||| |||| ||| |||||||| |||||||| || | ||| || ||| ||||| | |||||||| |  ||||| ||||| ||||| |    
T  46947 tgacggtaatctgtacataacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaataccggcactccccacggtgaaacacttggtcttacaaatttcttat 46848  T
Q  308 caagcaagtc 317  Q
    ||||||||||    
T  46847 caagcaagtc 46838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 55960 - 55684
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || || |  |||||||||||||| ||||||||||| | ||| || || |||||||| ||    
T  55960 cgaaaggcatcaatttgtattcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggtcgtcttctgcatatcttcatccttcacctgaatttgatggtaacctgacct 55861  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    ||| ||||||||  | ||||    |||||| || ||| | |||||||| |  ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||  | || ||||| |||    
T  55860 caagtcaatcttattgaaaatctttgcaccgaccaactggtccatcaagtcgtcaatcctcggaagcggatatctgttctttatcataactttgtttaac 55761  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaac 284  Q
    || || |||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||| | ||  || ||||||||| | ||||||||    
T  55760 tgacggtaatcaatgcacaacctcatgctaccatccttcttctttaccaacagcacaggcgctccccacggtgaaac 55684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 450 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 65955 - 65595
Alignment:
Q  450 caggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccag 549  Q
    |||||||||||  |||||| |||| ||| |||||||| || ||||| || |  || ||| | |||||||| ||| ||||||  || ||||| ||||| ||    
T  65955 caggaaattcattcaccactggtaacctgtcaatcacagcctgattttctaacgacaaatatgccattaaagaatacatcagaattccatcacgttctag 65856  T
Q  550 ttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttg 649  Q
    ||| |||| ||| || || ||||| |||||  |  |||  || |||||  | ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||| ||||  | ||     
T  65855 ttgtttcatctgttttgttgacaagaactccacttcaccctcttcttcagcagaagaaaaatgtaccgtcttactaaagcaattgatatgaactcgatta 65756  T
Q  650 tactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatt 749  Q
    ||||||||||| ||||| || | ||| |||| ||||||  |||| || | ||| ||||| || | ||||||||| | ||||||||| || | ||||||      
T  65755 tactctaaccaattcattccaaaaataacatccatacccgtcaacggcaaacatactaagtcaacttcaaaatctctaccaaacatggatataggacacc 65656  T
Q  750 tcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    | ||||| || |||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  65655 ttaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcc 65595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 95; Significance: 5e-46; HSPs: 8)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 13449 - 13215
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || |||||||| || || ||||| |  || || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  13449 cgaaaggcatcaccttatattcgtaatgtccatatcatgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacattaatctgatggtaacctgacct 13350  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||||||||  ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||    
T  13349 caaatcaatcttgctaaacacacgagcacccactaaatgatccatgaagttatcaatcctcggaagtggatacctgttctttatcgtaaccttattcaac 13250  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatc 242  Q
    || ||||||||||| || |||| ||  ||||||||    
T  13249 tgacgataatcaatgcataacctcaggctaccatc 13215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21628 - 21394
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || |||||||| || || ||||| |  || || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  21628 cgaaaggcatcaccttatattcgtaatgtccatatcatgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacattaatctgatggtaacctgacct 21529  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||||||||  ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||    
T  21528 caaatcaatcttgctaaacacacgagcacccactaaatgatccatgaagttatcaatcctcggaagtggatacctgttctttatcgtaaccttattcaac 21429  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatc 242  Q
    || ||||||||||| || |||| ||  ||||||||    
T  21428 tgacgataatcaatgcataacctcaggctaccatc 21394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 289 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 21376 - 21260
Alignment:
Q  289 ggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcg 388  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  21376 ggtcttacaaatttcttatcaagcaagacctccaactgtttcttcaattcagctaactcggaagc-gacatacggtaaggtgccatcgacaccggcttcg 21278  T
Q  389 ttccaggaacaagatcaa 406  Q
    |||| |||||||| ||||    
T  21277 ttcctggaacaaggtcaa 21260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #4
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 289 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 13197 - 13080
Alignment:
Q  289 ggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcg 388  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  13197 ggtcttacaaatttcttatcaagcaagacctccaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatacggtatggtgccatcgacaccggcttcg 13098  T
Q  389 ttccaggaacaagatcaa 406  Q
    |||| |||||||| ||||    
T  13097 ttcctggaacaaggtcaa 13080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 619 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 21014 - 20831
Alignment:
Q  619 cttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttca 718  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||  |||| ||||||||||||||||| || | |||||||| ||    ||  || |||| ||||||||  || | ||||    
T  21014 cttgctaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaatcacatccaagagac--aacggtaaacaaactaggtcgacttca 20917  T
Q  719 aaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 804  Q
    || || | ||||||||||||||| |||||  | | ||| || |||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20916 aagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccat 20831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #6
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 619 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 12834 - 12645
Alignment:
Q  619 cttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttca 718  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||  |||| ||||||||||||||||| || | |||||||| ||    ||  || |||| ||||||||  || | ||||    
T  12834 cttgctaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaatcacatccaagagac--aacggtaaacaaactaggtcgacttca 12737  T
Q  719 aaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    || || | ||||||||||||||| |||||  | | ||| || |||||| |||| || |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  12736 aagtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagttggagtttcaacaaccatttctcc 12645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 409 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 13063 - 13012
Alignment:
Q  409 cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattca 460  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  13063 cctctctggtggcacatctggaatctcattaggaaaaacttctggaaattca 13012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 409 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 21243 - 21192
Alignment:
Q  409 cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattca 460  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  21243 cctctctggtggcacatctggaatctcattaggaaaaacttctggaaattca 21192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 94; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 284
Target Start/End: Original strand, 37844 - 38117
Alignment:
Q  11 aaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatctcaa 110  Q
    ||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||    
T  37844 aaggcatcaccttgtattcgtaatgaccataacgtgttctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaa 37943  T
Q  111 atcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgc 210  Q
     |||||||| || |||||   ||||||||||||  ||||||| || | |||||| |||| |||||||||||| ||||| || || || |||||||||||     
T  37944 gtcaatcttactgaaaacctttgcacccactaattgatccattaagtcatcaatcctcgaaagtggatacctgttctttattgtaactttgttcaactga 38043  T
Q  211 cgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaac 284  Q
    ||||||||||| || |||| |||| ||||||| |||||||| || | ||| || |||| |||| ||||||||||    
T  38044 cgataatcaatgcataacctcatagtaccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgttccccaaggtgaaac 38117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 92; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 77 - 379
Target Start/End: Original strand, 34347 - 34647
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| || | | |||||||||||| |||||| ||||||||||     
T  34347 cctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccgaccagctgatccatcaaatcatcaatcctcggaagtgc 34446  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaa 276  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||| ||||| || | ||| ||||| || ||| |     
T  34447 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatacttccatcttttttcttaaccaacaacactggagcaccccac 34546  T
Q  277 ggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcg 376  Q
    || ||||| | |||||||| ||||| ||  |||||||| || ||||||||||||||||| |||   ||||| || |||||||| ||||| || || ||||    
T  34547 ggagaaacactcggtctaataaactgct--tcaagcaactcttccaactgtttcttcaattcacccaactcagatgcagacatccgatacggcgcaatcg 34644  T
Q  377 aaa 379  Q
    |||    
T  34645 aaa 34647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 91; Significance: 1e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 10170 - 9877
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| || |||||||| || |||||||| || || |  || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||    
T  10170 cgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcccaaaggccgtcttctgcatatcctcatctttcaccttaatctgatggta-cctgacct 10072  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 207  Q
     || ||||||||||| |||||   ||||||||||||| ||||||| || |  ||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||    
T  10071 taagtcaatcttgctgaaaacctttgcacccactaactgatccattaagtcgtcaatcctcggaagtggatacctgttctttatcgtaactttgttcaac 9972  T
Q  208 tgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaactt 302  Q
    || ||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| || | ||| || ||||||||| |||||||||| |  ||||| ||||||||    
T  9971 tgacgataatcaatgcataacctcatgctaccatccttcttcttaaccaacaacaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaaactt 9877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 575 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 9758 - 9533
Alignment:
Q  575 aactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaa 674  Q
    |||||||| |||||||| |||||  | ||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||| ||||  |||| || |||||||||||||| |  | ||    
T  9758 aactctgctccactttcttcttccgcagaagaaaaatgcaccgtcttgctaaaacaattgatatgaactcggttatattctaaccagttcatccaaaaaa 9659  T
Q  675 tcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcac 774  Q
    | |||| ||| ||  |||| |||| ||||||||| || | || ||  || | ||||||||||||||| |||||  | | ||| || |||||| |||| ||    
T  9658 taacatccat-cccgtcaacggtaaacaaactaagtcgactttaatgtctctaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaagtagttac 9560  T
Q  775 cgaacccttagctggagtttcgacaac 801  Q
     |||||||||||||||||||| |||||    
T  9559 tgaacccttagctggagtttcaacaac 9533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 91; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 162 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 4129 - 3467
Alignment:
Q  162 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaa 261  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||| || || || || |||||||| || || ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||     
T  4129 aattctcggaagcggatatctgttctttatcgtaactttattcaactgacggtagtcaatgcacaacctcatactaccatccttcttctttaccaacaac 4030  T
Q  262 actggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatac 361  Q
    || ||||||||| | |||||||| |  ||||| ||||||||||| || || |  || || |||||||||||||||||||  |  ||||| || |||||||    
T  4029 acaggcgctccccacggtgaaacacttggtcttacaaacttcttgtcgagtagatcttctaactgtttcttcaactcagcaagttcggatgccgacatac 3930  T
Q  362 gataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatc-------aagt-------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaac 447  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||| || || |||||       || |       ||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  3929 gataaggtgtcatcgacaccggcttcgttcctggtactagatcgatggagaactcaacctccctctctggtggtacgtctggaatttcatctggaaaaac 3830  T
Q  448 ttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttcc 547  Q
    |||||| || |||  |||||| |||| ||| || ||||| ||||| || || |  || ||| | |||||||  ||| ||||||  || || || |||||     
T  3829 ttcagggaactcattcaccactggtaacctgtcgatcacagcttggttttctaacgacaaacatgccattagagaatacatcagaatcccgtctcgttct 3730  T
Q  548 agttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggt 647  Q
    || ||||||| ||  || ||||| |||| |||  | ||||| || |||||  | ||||| ||||| || | ||||||||| || || ||| ||||   ||    
T  3729 agctgcttcatctctttcgtagataaaatctcgactccactctcttcttcagcagaagaaaaatgcacggtcttgctaaagcagttgatatgaactcagt 3630  T
Q  648 tgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggaca 747  Q
    | ||||||||||| ||||| || |  ||||||| ||| ||  |||  ||||  |||||||| || | ||||||||| | |||||||||||| | ||||||    
T  3629 tatactctaaccaattcatcccaaatatcacatccatccctgtcagtggtaagcaaactaagtctacttcaaaatccctaccaaacatagatataggaca 3530  T
Q  748 tttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    | ||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  3529 tctcaaacaaacaagagaagtagtcactgaacccttagctggagtttcaacgaccatttctcc 3467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 88; Significance: 7e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 268 - 804
Target Start/End: Original strand, 11260 - 11810
Alignment:
Q  268 gctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataag 367  Q
    |||||| |||||||||| |  ||||| ||||||||||| || | || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |    
T  11260 gctccccaaggtgaaacactaggtcttacaaacttcttatctaacaggtcctccaactgtttcttcaactcagctaactcagaagctgacatacggtacg 11359  T
Q  368 gtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaagt--------------cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcagg 453  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||| |              ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  11360 gtgccatcgacaccggcttagttcccggaacaaggtcaattgaaaattcaacctccctctctagtggcacatcaggaatctcatcaggaaacacttccgg 11459  T
Q  454 aaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgc 553  Q
    |||||||  ||| || |||| || ||||||||| |||||||| || |  || ||    |||||||  ||| ||||||  || ||||| ||||| |  ||     
T  11460 aaattcattcactacaggtaacccatcaatcacagcttgattttctaacgacaattgtgccattagagaatacatcagaattccatcacgttcaaactgt 11559  T
Q  554 ttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtact 653  Q
    |||| ||| || ||||||| || |||  |  ||| ||| || ||  | |||||||||||||| | ||| ||||| || || ||| ||||  | || ||||    
T  11560 ttcatctgttttgtagacagaagctcaacctcaccttcttcctcagcagaagagaaatgtaccgtcttactaaagcagttgatatgaacccgattatact 11659  T
Q  654 ctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaa 753  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||| ||||||  |||| || |||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||| | ||||||   ||     
T  11660 ctaaccaattcataccaaaaatcacatccatacccgtcaacggcagacaaactaaatcaatcacaaaatctctaccaaacatagatataggacaccgcag 11759  T
Q  754 acatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 804  Q
    ||| || |||||| | || || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11760 acaaacaagagaagtggttactgaacccttagctggagtttcaacaaccat 11810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 87; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 77 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 1665 - 1363
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||| |  ||||||||||||| ||||| ||   |||||| || ||| |||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  1665 ccttcactctaatctgatgatatcctaacttcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaaccaactgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 1566  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaa 276  Q
    ||||| |||||| || || || |||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| || | ||| ||| | || ||| |     
T  1565 ataccgattcttaatcgtcactttgttcaactgccgataatccacacacaacctcattcttccatctttcttcttaaccaacaacactagagcaccccac 1466  T
Q  277 ggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcg 376  Q
    || ||||| |  ||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||   ||||| || ||||||||  |||| || |||||||    
T  1465 ggcgaaacacttggtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgtttcttcaattcacccaactctgatgcagacatctgatacggcgccatcg 1366  T
Q  377 aaa 379  Q
    |||    
T  1365 aaa 1363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 87; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 708 - 810
Target Start/End: Original strand, 7141 - 7243
Alignment:
Q  708 aatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctc 807  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7141 aatccatttcaaaatcacgaccaatctcagacaaaggacatttcaaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctc 7240  T
Q  808 tcc 810  Q
    |||    
T  7241 tcc 7243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 83; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 77 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 13669 - 13411
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||   |||||| |||| | |||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  13669 ccttcactgtaatctgatgatatcctgatctcaattcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 13570  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaa 276  Q
    ||||  |||||| || || || |||||||||||||||||||| | ||| |||| ||| || | |||||||||||| || | ||| ||||| || ||| |     
T  13569 atactcattcttaatcgtcactttgttcaactgccgataatccacacataacctcatgcttctatctttcttcttaaccaacaacactggagcaccccac 13470  T
Q  277 ggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaa 335  Q
    |||||||| |  ||||||| ||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  13469 ggtgaaacacttggtctaataaactgcttctcaagcaactcttctaactgtttcttcaa 13411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 75; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 422 - 804
Target Start/End: Original strand, 6657 - 7039
Alignment:
Q  422 acatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatg 521  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||| |||||||| |||||||| || |  || ||| | || ||||| |    
T  6657 acatctggaatctcatccggaaaaacttcaggaaattcattcaccactggtaacctgtcaatcaccgcttgattttctaacgacaaatatgcgattaaag 6756  T
Q  522 aaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgactt 621  Q
    || ||||||  || ||||| || ||||  ||||||| ||| |||||||| |  ||||||   ||||| || |||||  |  |||| ||||| || | |||    
T  6757 aatacatcagaattccatcacgctccaactgcttcaactgtttagtagataggaactctattccactctcttcttccgcaaaagaaaaatgcaccgtctt 6856  T
Q  622 gctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaa 721  Q
    |||||||||||| ||| ||||  |||| ||||||||||||||||| || | ||| |||| ||| ||  |||| |||| ||| ||||| || | || |||     
T  6857 gctaaaacaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaataacatccattcccgtcaacggtaaacacactaagtcgactttaaag 6956  T
Q  722 tcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 804  Q
    || | ||||||||||||||| |||||  | | ||| || |||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6957 tctctaccaaacatagacaacggacaccttagacacacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccat 7039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 74; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 77 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 990 - 697
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||  |||||| || | | |||||||||||| |||||| |||||||| ||    
T  990 ccttcactctaatctgatgatatcccgatctcaaatcaatcttactaaacacttctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatcctcggaagcgg 891  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaa 276  Q
    ||||| |||||| || || |||||||||||||  |||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| || |  || ||||| || ||| |     
T  890 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactatcgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaaccaataacactggagcaccccac 791  T
Q  277 ggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtg 370  Q
    || || || | ||| || | ||||| ||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||   ||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  790 ggagatacactcggcctgataaactgcttttcaagcaactcttccaactgcttcttcaattcacccaactctgatgcagacatccgatacggtg 697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 74; Significance: 2e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 99 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 9976 - 9759
Alignment:
Q  99 acctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttacc 198  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||  ||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||    
T  9976 acctgacctcaagtcaatcttactaaacacacgagcacccactaagtgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctttatcgtaacc 9877  T
Q  199 ttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaa 298  Q
    || |||||||| ||||||||||| || |||| ||| ||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||| |||||||||| |  ||||| ||||    
T  9876 ttattcaactgacgataatcaatgcataacctcatgctaccgtccttcttcttaaccagcaacaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaa 9777  T
Q  299 acttcttctcaagcaagt 316  Q
    | ||||| ||||| ||||    
T  9776 atttcttatcaagtaagt 9759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 99 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 17643 - 17426
Alignment:
Q  99 acctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttacc 198  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||  ||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||    
T  17643 acctgacctcaagtcaatcttactaaacacacgagcacccactaagtgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctttatcgtaacc 17544  T
Q  199 ttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaa 298  Q
    || |||||||| ||||||||||| || |||| ||| ||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||| |||||||||| |  ||||| ||||    
T  17543 ttattcaactgacgataatcaatgcataacctcatgctaccgtccttcttcttaaccagcaacaccggcgctccccaaggtgaaacacttggtcttacaa 17444  T
Q  299 acttcttctcaagcaagt 316  Q
    | ||||| ||||| ||||    
T  17443 atttcttatcaagtaagt 17426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 312 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 5883 - 5787
Alignment:
Q  312 caagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatcaagt 408  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  5883 caagtcctccaactgtttcttcaattcagctaactcgaaagctgacatacggtaaggtgccatcgacaccggcttcgctcctggaacaaggtcaagt 5787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 73; Significance: 6e-33; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 77 - 365
Target Start/End: Original strand, 89762 - 90050
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||   ||||| || | | ||||||| |||| |||||| || ||||||||    
T  89762 ccttcactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacttccgcaccaaccagctgatccatgaaatcatcaatccttggaagtgg 89861  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttactagcaaaactggcgctccctaa 276  Q
    ||||| |||||| || || || || |||||| |||||||||| | |||||||| |||  | |||||||||||||| || | ||| ||||| || ||| |     
T  89862 ataccgattcttaatcgtcactttattcaacagccgataatccacacacaacctcatggttccatctttcttcttaaccaacaatactggagcaccccac 89961  T
Q  277 ggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgata 365  Q
    || ||||| | ||| || | ||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||   ||||| || |||||||| |||||    
T  89962 ggagaaacactcggcctgataaactgcttctcaagcaactcttccaactatttcttcaattcacccaactctgatgcagacatccgata 90050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 21809 - 21725
Alignment:
Q  167 tcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctt 251  Q
    ||||||| ||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  21809 tcggaagcggataccgattcttaattgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttctt 21725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 31385 - 31301
Alignment:
Q  167 tcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctt 251  Q
    ||||||| ||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  31385 tcggaagcggataccgattcttaattgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttctt 31301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 250
Target Start/End: Original strand, 7445 - 7590
Alignment:
Q  105 tctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttc 204  Q
    |||||||||||| |||||||| ||   || ||| || | | |||||||||||| |||| | || ||||| ||||| | |||||| || || |||||||||    
T  7445 tctcaaatcaattttgctaaacacctctgtaccaaccagctgatccatcaaatcatcagtccttggaagcggatatcgattcttaatcgtcaccttgttc 7544  T
Q  205 aactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttct 250  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||| || |||| ||||||||    
T  7545 aactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatatttcttct 7590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1488 (Bit Score: 71; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1488
Description:

Target: scaffold1488; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 77 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 847 - 677
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |   ||||| || ||| |||||||||||| |||||| |||||||  ||    
T  847 ccttcactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacatttccgcaccaaccaactgatccatcaaatcatcaatcctcggaatcgg 748  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttct 247  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || ||||||||||    
T  747 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttct 677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 69; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 23187 - 23095
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataac 100  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  23187 cgaaaggcataactttgtactcatagtgaccataacgcgttctgaacgctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataac 23095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 68; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 77 - 256
Target Start/End: Original strand, 7006 - 7185
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| || | | |||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  7006 cctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatcctctgaagtgg 7105  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctttacta 256  Q
    ||||| ||| || || || ||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||| ||||    
T  7106 ataccgatttttaatcgtcaccttgttcaattgccgataatccacacacaacctcatgcttccatctttcttcttaacta 7185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 77 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 1928 - 1754
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| || ||| |||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  1928 cctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttgctaaacacctctgcaccaaccaactgatccatcaaatcatcaatccttggaagtgg 1829  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctt 251  Q
    ||||| |||| | || || || |||||||||| ||||||||| | |||||||| ||| || |||| |||||||||    
T  1828 ataccgattcataatcgtcactttgttcaactaccgataatccagacacaacctcatgcttccatatttcttctt 1754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 645 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 1345 - 1180
Alignment:
Q  645 ggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaagg 744  Q
    |||| ||||||||||||||||| || | ||| |||| ||||||  |||| |||| ||||||||| |||| |||||| || | ||||||||||||||| ||    
T  1345 ggttatactctaaccagttcatcccaaaaataacatccatacccgtcaacggtaaacaaactaagtccacttcaaagtctctaccaaacatagacaacgg 1246  T
Q  745 acatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||| | | ||| || |||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  1245 acatcttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcc 1180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 61; Significance: 9e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 722 - 810
Target Start/End: Original strand, 8329 - 8417
Alignment:
Q  722 tcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  8329 tcacgatcaaacatagacaaaggacatctcaaacacacaagagaagtagtcaccgaacccttaactggagtttcgacaaccatttctcc 8417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 60; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 409 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 23286 - 23047
Alignment:
Q  409 cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaa 508  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||  |||||||||||||| |  || ||||||||||||||  | || ||||| ||||| |||    
T  23286 cctctctggcggcacatcaggaatttcatcagggaaaacttatggaaattcacacacaattggcagcctatcaatcacatcctggttctctacagacaaa 23187  T
Q  509 gaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagaga 608  Q
     | |||||||| |||||||| ||||| ||||| | ||| || ||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||   ||| || || ||  | ||||| |    
T  23186 tatgccattaaagaaaacattaagatcccatcacattctagctgcttcagctgtttagtagtcaagaactcagctttactctcttcctcagcagaagaaa 23087  T
Q  609 aatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggtt 648  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||| ||| |||| |||||    
T  23086 aatgcactgtcttactaaaacaattgatatgaacatggtt 23047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 94 - 244
Target Start/End: Original strand, 16337 - 16487
Alignment:
Q  94 tgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatag 193  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||   ||||| || | | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| || |    
T  16337 tgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacttccgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatcctcggaagtggataccgattcttaatcg 16436  T
Q  194 ttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctt 244  Q
    | |||||||||||||  |||||||| | |||||||| ||| || |||||||    
T  16437 tcaccttgttcaactaacgataatccacacacaacctcatgcttccatctt 16487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 77 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 7049 - 6877
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtgg 176  Q
    |||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||   ||||| || | |  ||||||||||  |||||| |||||||| ||    
T  7049 ccttcactctaatatgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacttccgcaccaaccagctaatccatcaaaccatcaatcctcggaagcgg 6950  T
Q  177 atacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttc 249  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||| || ||||| ||||||    
T  6949 ataccgattcttaatcgtcaccttgttcgactgccgataatccacacacaacctcatgctcccatccttcttc 6877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1715 (Bit Score: 56; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1715
Description:

Target: scaffold1715; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 1145 - 1379
Alignment:
Q  8 cgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatctggtgataacctgatct 107  Q
    |||||||||| ||||| || || || |||||||| || || || || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||    
T  1145 cgaaaggcattactttgtactcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgaatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaaccagacct 1244  T
Q  108 caaatcaatcttgctaaaaactcgt-gcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 206  Q
    ||| || ||||| ||||||| || | ||||| || ||| |||||||||| |  ||||| |||||||| |||||  | ||||| || || |||||||||||    
T  1245 caagtcgatcttactaaaaa-tcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaatcctcggaagcggatatatgttctttatcgtaaccttgttcaa 1343  T
Q  207 ctgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatc 242  Q
    ||| || |||||||| ||||  | ||||||||||||    
T  1344 ctgacggtaatcaatgcacagtctcatactaccatc 1379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 477 - 669
Target Start/End: Original strand, 16447 - 16640
Alignment:
Q  477 tatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaa 576  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||| || || |  || |||||||||||||||| ||||||    
T  16447 tatcaattactgcttgattatcaacagacaaggacgccatcaaagaaaacatcaagattccatcacgctctaactgtttcagctgcttagtagtcaaaaa 16546  T
Q  577 ctctgcaccactttcctcttcgacggaag-agaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacc 669  Q
    |||||| ||||| || ||||   | |||| | |||| ||| || ||  |||||||||||||| |||| || || ||||| ||||||||||||||    
T  16547 ctctgctccactctcttcttaagcagaagaaaaaatataccgatttattaaaacaattaatatgaacatgattatactccaaccagttcatacc 16640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 729 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 8117 - 8036
Alignment:
Q  729 caaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8117 caaacatagacaaaggacatcttaaacacacaagagaagttttcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 8036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 146 - 335
Target Start/End: Original strand, 423 - 612
Alignment:
Q  146 gatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatcttt 245  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||||| || |||||| || ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || ||||| ||    
T  423 gatccatcaaatcatcaatcttcggaagtggattccgattcttaatcgttactttgttcaactgccgataatccacacacaacctcatgctcccatcctt 522  T
Q  246 cttctttactagcaaaactggcgctccctaaggtgaaacgcccggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaa 335  Q
    |||||| || | ||| ||||| || ||| | || |||||   ||| || | ||||| |||||| ||||| || || ||||||||||||||    
T  523 cttcttaaccaacaacactggagcaccccatggagaaacaatcggcctgataaactgcttctctagcaactcttctaactgtttcttcaa 612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 53; Significance: 5e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 146 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 4901 - 4781
Alignment:
Q  146 gatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatcttt 245  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||  |||||| |||||| || || |||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||| || ||||||||    
T  4901 gatccatcaaatcatcaatcctcggaagcagataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactgccaataatccacacacaacctcatgcttccatcttt 4802  T
Q  246 cttctttactagcaaaactgg 266  Q
    |||||| || | |||||||||    
T  4801 cttcttaacgaacaaaactgg 4781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 6973 - 6932
Alignment:
Q  77 ccttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatct 118  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  6973 ccttcactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatct 6932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2059 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold2059
Description:

Target: scaffold2059; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 751 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 1125 - 1066
Alignment:
Q  751 caaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1125 caaacatacgagagaagtagtcaccgaacccttagctagagtttcgacaaccatctctcc 1066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1433 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1433
Description:

Target: scaffold1433; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 623 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 1795 - 1608
Alignment:
Q  623 ctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaat 722  Q
    ||||| ||||| ||| ||||  |||| ||||||||||||||||| || | ||| |||| ||||||  |||| |||| |||||| | ||| | |||||| |    
T  1795 ctaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaattacatccatacccgtcaacggtaaacaaacaagatcgacttcaaagt 1696  T
Q  723 cacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    | | ||||||||||||||| |||||  | | ||| || |||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  1695 ctctaccaaacatagacaacggacaccttagacaaacaagagaagtaattaccgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcc 1608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 48; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 602 - 801
Target Start/End: Original strand, 919 - 1118
Alignment:
Q  602 gaagagaaatgtactgacttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagac 701  Q
    ||||| ||||| || | ||||||||| ||||| ||| ||||  |||| ||||||||||||||||| || | ||| |||| ||||||  |||| |||| ||    
T  919 gaagaaaaatgcaccgtcttgctaaagcaattgatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaataacatccatacccgtcaacggtaaac 1018  T
Q  702 aaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaac 801  Q
    ||||||| || | |||||| || | |||||||||||||||  ||||  | | ||| || |||||| |||| || ||||||||| |||||||||| |||||    
T  1019 aaactaagtcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacagacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttaactggagtttcaacaac 1118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 422 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 5894 - 5512
Alignment:
Q  422 acatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaatg 521  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||| |||||||| |||||||| || |  || ||| | | |||||| |    
T  5894 acatccggaatctcatccagaaaaacttcaggaaattcattcaccactggtaacctgtcaatcacagcttgattttctaacgacaaatatgtcattaaag 5795  T
Q  522 aaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgactt 621  Q
    ||||||| |  || ||||  || ||||  ||||||| ||  || ||||  |  |||||||| ||||| || |||||  | ||||| ||||| || | ||     
T  5794 aaaacataagaattccatgacgctccaactgcttcaactattttgtagttaggaactctgctccactctcttcttccgcagaagaaaaatgcaccgtctg 5695  T
Q  622 gctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaa 721  Q
    ||||||  || | ||| ||||  |||| ||||||||||||||||| || | ||| | || ||||||  |||| |||| ||| ||||| || | || |||     
T  5694 gctaaagaaactgatatgaactcggttatactctaaccagttcatcccaaaaataatatccatacccgtcaacggtaaacagactaagtcgactttaaag 5595  T
Q  722 tcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 804  Q
    || | |||||||||||||||  ||||  | | ||| || |||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5594 tctctaccaaacatagacaacagacaccttagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccat 5512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 295 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 126595 - 126489
Alignment:
Q  295 acaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccag 394  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||| |    
T  126595 acaaactttttctcgagcaaatcctctaattgtttcttcaactcggccaactcagaagctgacatacgataaggtgtcatagacacaggcttcgttccgg 126496  T
Q  395 gaacaag 401  Q
    |||||||    
T  126495 gaacaag 126489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 46; Significance: 8e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 86 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 7275 - 7110
Alignment:
Q  86 taatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaactcgtgcacccactaacagatccatcaaattatcaattctcggaagtggatacctatt 185  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||   |||||| || | | |||||||||||| || ||| || ||||| ||||||| |||    
T  7275 taatctgatgatatcctgatcttaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaaccagctgatccatcaaatcataaatccttggaagcggataccgatt 7176  T
Q  186 cttgatagttaccttgttcaactgccgataatcaatacacaaccgcatactaccatctttcttctt 251  Q
    ||| || || || |||||||||||||||||||| | ||    || |||||| ||||||||||||||    
T  7175 cttaattgtcactttgttcaactgccgataatccacacttctcctcatacttccatctttcttctt 7110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 751 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 4660 - 4601
Alignment:
Q  751 caaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  4660 caaacatactagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcc 4601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 420 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 4937 - 4670
Alignment:
Q  420 gcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgattctcaacagataaagaagccattaa 519  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||  ||| ||||| |  ||||||||||| ||||||||||| |  || ||  | ||||  ||    
T  4937 gcacatctggaatctcatcaggaaaaacttctagaaattcattcacaaccggcaatctatcaatcacagcttgattctccaacgacaagtacgccaacaa 4838  T
Q  520 tgaaaacatcaagataccatcgcgttccagttgcttcagctgcttagtagacaaaaactctgcaccactttcctcttcgacggaagagaaatgtactgac 619  Q
     |||||||| || || ||||| || || |  ||||||| ||| || |||| ||  ||||| ||  |||| || || ||  | ||||| |||||||  | |    
T  4837 agaaaacattaaaatcccatcacgctctacctgcttcaactgtttcgtagtcacgaactcagcttcactctcttcctcagcagaagaaaaatgtatcgtc 4738  T
Q  620 ttgctaaaacaattaataagaacgtggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacatacc 687  Q
    || ||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| || | ||| |||| ||||||    
T  4737 ttactaaaacaattaatatgaacacggttatactctaaccagttcatcccaaaaattacatccatacc 4670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 46; Significance: 8e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 761 - 810
Target Start/End: Original strand, 424266 - 424315
Alignment:
Q  761 agagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  424266 agagaagtagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 424315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 716 - 810
Target Start/End: Original strand, 203294 - 203388
Alignment:
Q  716 tcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||| | |||||||||||| | ||||||  ||||||| || |||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  203294 tcaaaatctctaccaaacatagatataggacacctcaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcc 203388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 306 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 120 - 20
Alignment:
Q  306 ctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaactggcttcgttccaggaacaagatca 405  Q
    |||||| || || ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||    
T  120 ctcaagtaaatcttccaactgtttcttcaattcagctaactcagaagctgacatacggtacggtgccatcgacaccggctttgttccgggaacaaggtca 21  T
Q  406 a 406  Q
    |    
T  20 a 20  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 768 - 810
Target Start/End: Original strand, 5 - 47
Alignment:
Q  768 tagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5 tagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 47  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 645 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 1316 - 1151
Alignment:
Q  645 ggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaagg 744  Q
    |||| ||||||||||||||||| || | ||| |||| ||| |   |||| |||| ||| ||||| || | |||||| || | ||||||||||||||| ||    
T  1316 ggttatactctaaccagttcatcccaaaaataacatccattctcgtcaacggtaaacacactaagtcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacgg 1217  T
Q  745 acatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||  | | ||| || |||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  1216 acaccttagacacacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcc 1151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 690 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 1232 - 1112
Alignment:
Q  690 tcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctgg 789  Q
    |||| |||| ||||||||| || | |||||| || | ||||||||||||||| |||||| | | | | || |||||| |||| || ||||||||||||||    
T  1232 tcaacggtaaacaaactaagtcgacttcaaagtctctaccaaacatagacaacggacatcttagaaaaacaagagaagtagttactgaacccttagctgg 1133  T
Q  790 agtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||| |||||||| |||||    
T  1132 agtttcaacaaccatttctcc 1112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 645 - 804
Target Start/End: Original strand, 303 - 462
Alignment:
Q  645 ggttgtactctaaccagttcatacccagaatcacatacataccactcaaaggtagacaaactaaatccatttcaaaatcacgaccaaacatagacaaagg 744  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || | |||||| | ||||||  |||| |||| |||||||||||| |   ||||||| | |||||||||||| | |||    
T  303 ggttatactctaaccaattcattccaaaaatcacctccatacccgtcaacggtaaacaaactaaatcaaccacaaaatctctaccaaacatagatatagg 402  T
Q  745 acatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccat 804  Q
    |||   || ||| || |||||| |||| || |||||||||||||||||||| || |||||    
T  403 acaccccagacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacgaccat 462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 409 - 495
Target Start/End: Original strand, 67 - 153
Alignment:
Q  409 cctctctggaggcacatcaggaatctcatctggaaaaacttcaggaaattcacacaccaccggtagcctatcaatcactgcttgatt 495  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||  ||| || |||| ||| |||||||| ||||||||    
T  67 cctctctggtggcacatcaggaatctcatcaggaaacacttctgggaactcattcactacaggtaacctgtcaatcacagcttgatt 153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 717 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 67498 - 67405
Alignment:
Q  717 caaaatcacgaccaaacatagacaaaggacatttcaaacatacgagagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    ||||||| | |||||||||||| | ||||||   |||||| || |||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  67498 caaaatctctaccaaacatagatataggacaccccaaacaaacaagagaagtagttactgaacccttagctggagtttcaacaaccatttctcc 67405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 289 - 379
Target Start/End: Original strand, 23435 - 23525
Alignment:
Q  289 ggtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaa 379  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||   ||||| || |||||||| ||||| || || |||||||    
T  23435 ggtctaataaactgcttctcaagcaactcctccaactgattcttcaattcacccaactctgatgcagacatccgatacggcgcaatcgaaa 23525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0878 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0878
Description:

Target: scaffold0878; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 379
Target Start/End: Original strand, 4469 - 4558
Alignment:
Q  290 gtctaacaaacttcttctcaagcaagtcctccaactgtttcttcaactcagataactcggaagcagacatacgataaggtgccatcgaaa 379  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||   ||||| || |||||||| ||||| || || |||||||    
T  4469 gtctaataaactgcttctcaagcaactcttccaactgtttcttcaattcacccaactctgatgcagacatccgatacggcgcaatcgaaa 4558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0765 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0765
Description:

Target: scaffold0765; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 761 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 6603 - 6554
Alignment:
Q  761 agagaaatagtcaccgaacccttagctggagtttcgacaaccatctctcc 810  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  6603 agagaagtagtcactgaacccttagccggagtttcaacaaccatttctcc 6554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University