View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3388R-Insertion-7 (Length: 664)

Name: NF3388R-Insertion-7
Description: NF3388R
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3388R-Insertion-7
NF3388R-Insertion-7
[»] chr5 (158 HSPs)
chr5 (9-664)||(18308255-18308910)
chr5 (12-664)||(4723633-4724286)
chr5 (9-664)||(1399861-1400514)
chr5 (9-661)||(35565270-35565922)
chr5 (13-664)||(36349886-36350517)
chr5 (13-589)||(1694859-1695437)
chr5 (9-664)||(11346704-11347358)
chr5 (9-664)||(8537949-8538600)
chr5 (9-663)||(30709594-30710244)
chr5 (9-664)||(19400358-19401012)
chr5 (382-664)||(7162-7441)
chr5 (12-664)||(1971360-1972011)
chr5 (382-664)||(8576074-8576353)
chr5 (34-664)||(3601336-3601965)
chr5 (417-664)||(6793351-6793598)
chr5 (382-664)||(19036607-19036886)
chr5 (382-664)||(27661310-27661589)
chr5 (382-664)||(28880986-28881265)
chr5 (272-664)||(38854153-38854542)
chr5 (388-664)||(541574-541847)
chr5 (12-327)||(6793035-6793351)
chr5 (388-664)||(11027772-11028045)
chr5 (451-664)||(33370649-33370862)
chr5 (120-664)||(17366398-17366947)
chr5 (454-662)||(40009525-40009733)
chr5 (13-295)||(34683485-34683769)
chr5 (114-444)||(33371169-33371500)
chr5 (208-513)||(12742818-12743137)
chr5 (496-658)||(3169605-3169766)
chr5 (119-291)||(25498375-25498547)
chr5 (485-657)||(35927470-35927642)
chr5 (120-443)||(10398006-10398330)
chr5 (208-513)||(12805636-12805955)
chr5 (107-544)||(7082336-7082774)
chr5 (12-186)||(20196551-20196726)
chr5 (59-350)||(33370938-33371227)
chr5 (491-664)||(2599214-2599387)
chr5 (115-438)||(35565492-35565816)
chr5 (115-438)||(1399967-1400288)
chr5 (9-509)||(3458940-3459439)
chr5 (12-111)||(25498631-25498730)
chr5 (155-438)||(36349987-36350272)
chr5 (382-526)||(22283704-22283845)
chr5 (554-662)||(3458833-3458941)
chr5 (208-332)||(12806168-12806291)
chr5 (9-104)||(1171743-1171838)
chr5 (115-438)||(1695010-1695335)
chr5 (581-658)||(1693382-1693459)
chr5 (287-434)||(25498398-25498547)
chr5 (370-466)||(7082793-7082889)
chr5 (9-182)||(40012094-40012265)
chr5 (9-104)||(7082828-7082923)
chr5 (388-449)||(1171725-1171786)
chr5 (9-182)||(6789-6960)
chr5 (9-182)||(8575701-8575872)
chr5 (244-308)||(25498719-25498783)
chr5 (414-514)||(18920879-18920975)
chr5 (115-438)||(18308481-18308804)
chr5 (208-332)||(12743349-12743470)
chr5 (406-514)||(17195316-17195421)
chr5 (616-664)||(7082287-7082335)
chr5 (244-308)||(35565908-35565972)
chr5 (247-302)||(6792985-6793040)
chr5 (9-104)||(1399731-1399828)
chr5 (115-432)||(4723742-4724060)
chr5 (244-308)||(1171824-1171888)
chr5 (9-182)||(19036234-19036405)
chr5 (362-434)||(25498635-25498707)
chr5 (247-302)||(1972006-1972061)
chr5 (247-302)||(19401004-19401059)
chr5 (247-302)||(20196721-20196776)
chr5 (414-558)||(25360549-25360690)
chr5 (570-664)||(12742710-12742804)
chr5 (38-104)||(22283796-22283862)
chr5 (38-104)||(27661293-27661359)
chr5 (9-104)||(1695474-1695571)
chr5 (118-182)||(3170011-3170076)
chr5 (61-163)||(22284065-22284165)
chr5 (247-295)||(1695440-1695488)
chr5 (244-308)||(7082909-7082973)
chr5 (9-182)||(27660937-27661108)
chr5 (388-432)||(34683533-34683577)
chr5 (388-444)||(40012157-40012213)
chr5 (382-435)||(1971853-1971908)
chr5 (382-435)||(3170021-3170076)
chr5 (247-302)||(3459431-3459486)
chr5 (317-438)||(6793138-6793261)
chr5 (250-301)||(11347351-11347402)
chr5 (414-514)||(36311911-36312007)
chr5 (382-435)||(40012104-40012159)
chr5 (247-302)||(40012257-40012312)
chr5 (252-302)||(6747-6797)
chr5 (252-302)||(8575659-8575709)
chr5 (38-104)||(8576057-8576123)
chr5 (252-302)||(27660895-27660945)
chr5 (38-104)||(28881216-28881282)
chr5 (362-444)||(28881529-28881611)
chr5 (252-302)||(28881629-28881679)
chr5 (252-302)||(38854796-38854846)
chr5 (247-308)||(1399814-1399875)
chr5 (118-182)||(8538175-8538239)
chr5 (118-182)||(11346930-11346994)
chr5 (575-664)||(12805528-12805617)
chr5 (251-308)||(18308896-18308953)
chr5 (362-443)||(22284110-22284191)
chr5 (252-301)||(22284210-22284259)
chr5 (9-104)||(25498766-25498863)
chr5 (9-104)||(34683351-34683448)
chr5 (388-444)||(6841-6897)
chr5 (244-300)||(4723580-4723636)
chr5 (250-302)||(11028089-11028141)
chr5 (247-295)||(34683434-34683482)
chr5 (287-438)||(34683587-34683742)
chr5 (382-435)||(3601829-3601884)
chr5 (382-435)||(19400851-19400906)
chr5 (61-115)||(25498500-25498555)
chr5 (92-163)||(25498608-25498678)
chr5 (248-295)||(36349836-36349883)
chr5 (38-104)||(7145-7211)
chr5 (388-434)||(6793084-6793130)
chr5 (362-444)||(8575727-8575809)
chr5 (414-514)||(13131044-13131140)
chr5 (252-302)||(19036192-19036242)
chr5 (252-302)||(30710236-30710286)
chr5 (12-104)||(1972050-1972143)
chr5 (118-182)||(30709819-30709883)
chr5 (380-435)||(40011838-40011895)
chr5 (118-182)||(8576064-8576127)
chr5 (384-444)||(19036282-19036342)
chr5 (250-338)||(40011939-40012026)
chr5 (362-443)||(7082982-7083065)
chr5 (117-148)||(17195316-17195347)
chr5 (362-444)||(38854695-38854778)
chr5 (276-338)||(3169857-3169918)
chr5 (112-150)||(3602096-3602134)
chr5 (248-338)||(8575940-8576029)
chr5 (115-149)||(13131034-13131068)
chr5 (38-104)||(19036590-19036656)
chr5 (366-438)||(20196549-20196623)
chr5 (362-444)||(27660963-27661045)
chr5 (248-338)||(27661176-27661265)
chr5 (287-438)||(33371345-33371499)
chr5 (112-185)||(35565988-35566062)
chr5 (17-86)||(36349768-36349838)
chr5 (59-104)||(541572-541617)
chr5 (118-170)||(3459011-3459064)
chr5 (247-300)||(3601988-3602041)
chr5 (54-95)||(10398027-10398068)
chr5 (112-173)||(20196807-20196868)
chr5 (115-148)||(36311902-36311935)
chr5 (118-182)||(38854378-38854442)
chr5 (107-182)||(1171624-1171699)
chr5 (369-436)||(1972080-1972148)
chr5 (388-438)||(7082714-7082766)
chr5 (118-182)||(22283792-22283855)
chr5 (118-182)||(27661300-27661363)
chr5 (382-444)||(34683338-34683402)
chr5 (414-442)||(40012378-40012406)
[»] chr1 (215 HSPs)
chr1 (9-662)||(13972922-13973576)
chr1 (10-664)||(14173313-14173968)
chr1 (9-661)||(36909560-36910212)
chr1 (21-664)||(6435768-6436412)
chr1 (9-656)||(49925935-49926582)
chr1 (13-664)||(23342637-23343288)
chr1 (9-664)||(24269919-24270573)
chr1 (13-664)||(35586477-35587139)
chr1 (9-664)||(17685913-17686571)
chr1 (13-664)||(35184966-35185631)
chr1 (69-630)||(37778109-37778671)
chr1 (178-664)||(38046158-38046644)
chr1 (152-664)||(41780689-41781201)
chr1 (13-664)||(35525755-35526387)
chr1 (32-544)||(40532863-40533376)
chr1 (9-664)||(12790827-12791483)
chr1 (317-661)||(49396703-49397047)
chr1 (112-660)||(13283705-13284250)
chr1 (9-664)||(42571330-42571986)
chr1 (112-658)||(17372729-17373273)
chr1 (59-658)||(3658475-3659072)
chr1 (107-664)||(18170021-18170580)
chr1 (114-657)||(24363471-24364003)
chr1 (9-663)||(49427384-49428034)
chr1 (120-664)||(18842435-18842994)
chr1 (281-661)||(17697045-17697422)
chr1 (9-664)||(39223755-39224407)
chr1 (9-664)||(51269798-51270450)
chr1 (380-664)||(35576335-35576618)
chr1 (381-664)||(21484573-21484853)
chr1 (208-663)||(5765203-5765653)
chr1 (9-664)||(29435969-29436621)
chr1 (382-660)||(19160317-19160592)
chr1 (272-664)||(13635117-13635507)
chr1 (362-664)||(39856817-39857116)
chr1 (9-662)||(47487593-47488245)
chr1 (454-664)||(48215194-48215404)
chr1 (248-664)||(29762017-29762431)
chr1 (119-664)||(27486355-27486900)
chr1 (59-664)||(45689117-45689719)
chr1 (12-664)||(49262556-49263198)
chr1 (118-664)||(44336983-44337529)
chr1 (68-664)||(27034933-27035528)
chr1 (272-664)||(44597697-44598088)
chr1 (9-638)||(46179839-46180465)
chr1 (383-664)||(48568334-48568614)
chr1 (248-661)||(30309626-30310033)
chr1 (380-664)||(41874811-41875094)
chr1 (59-662)||(50067865-50068467)
chr1 (212-664)||(16531852-16532300)
chr1 (206-647)||(16081298-16081737)
chr1 (500-662)||(49598921-49599082)
chr1 (9-269)||(49397048-49397296)
chr1 (9-173)||(38044746-38044911)
chr1 (115-438)||(13973146-13973470)
chr1 (206-428)||(16097843-16098063)
chr1 (115-438)||(24270025-24270347)
chr1 (59-534)||(29707145-29707621)
chr1 (115-438)||(37778301-37778625)
chr1 (115-438)||(14173418-14173742)
chr1 (115-438)||(36909783-36910106)
chr1 (9-182)||(22527984-22528155)
chr1 (287-438)||(35525857-35526011)
chr1 (9-338)||(48226860-48227186)
chr1 (316-441)||(49926038-49926164)
chr1 (529-614)||(13148365-13148450)
chr1 (205-340)||(21484204-21484339)
chr1 (115-444)||(13283923-13284253)
chr1 (115-438)||(24363472-24363788)
chr1 (9-182)||(19160794-19160965)
chr1 (115-236)||(49396926-49397046)
chr1 (317-438)||(35586592-35586715)
chr1 (115-415)||(41780915-41781215)
chr1 (382-487)||(22527680-22527782)
chr1 (287-438)||(35185363-35185517)
chr1 (388-449)||(18170606-18170667)
chr1 (600-664)||(16098078-16098142)
chr1 (244-308)||(36910198-36910262)
chr1 (124-374)||(38046160-38046409)
chr1 (10-182)||(49598445-49598618)
chr1 (115-438)||(6435994-6436318)
chr1 (13-80)||(37778687-37778754)
chr1 (9-163)||(13634855-13635008)
chr1 (244-302)||(24269869-24269927)
chr1 (388-449)||(18170765-18170826)
chr1 (9-152)||(48567962-48568102)
chr1 (244-308)||(17685863-17685927)
chr1 (244-308)||(41781305-41781369)
chr1 (247-302)||(13973568-13973623)
chr1 (317-438)||(23343064-23343186)
chr1 (317-438)||(40532946-40533069)
chr1 (247-302)||(46179792-46179847)
chr1 (247-302)||(49262506-49262561)
chr1 (115-443)||(17372946-17373275)
chr1 (38-104)||(19160543-19160609)
chr1 (38-104)||(22527733-22527799)
chr1 (388-434)||(49397198-49397244)
chr1 (248-338)||(49598685-49598774)
chr1 (118-182)||(29762140-29762205)
chr1 (9-104)||(35525621-35525718)
chr1 (247-300)||(38044699-38044752)
chr1 (247-308)||(39223708-39223769)
chr1 (247-308)||(49598397-49598458)
chr1 (247-295)||(37778757-37778805)
chr1 (9-104)||(41781223-41781319)
chr1 (118-181)||(44597923-44597987)
chr1 (244-308)||(49397282-49397346)
chr1 (107-177)||(18170668-18170739)
chr1 (9-100)||(18170787-18170878)
chr1 (244-311)||(18170861-18170928)
chr1 (118-176)||(27486615-27486674)
chr1 (247-302)||(30309357-30309412)
chr1 (9-72)||(38044650-38044713)
chr1 (9-182)||(41874446-41874613)
chr1 (247-302)||(46924783-46924838)
chr1 (247-302)||(47487546-47487601)
chr1 (382-435)||(47487699-47487754)
chr1 (247-302)||(48567915-48567970)
chr1 (382-435)||(51270289-51270344)
chr1 (252-302)||(13634813-13634863)
chr1 (417-516)||(14772499-14772594)
chr1 (252-302)||(19160957-19161007)
chr1 (252-302)||(29436613-29436663)
chr1 (252-302)||(29761663-29761713)
chr1 (112-185)||(35586333-35586407)
chr1 (388-434)||(38044798-38044844)
chr1 (252-302)||(39856749-39856799)
chr1 (9-99)||(46924867-46924957)
chr1 (252-302)||(49428026-49428076)
chr1 (252-302)||(50067773-50067823)
chr1 (362-444)||(50067841-50067923)
chr1 (59-104)||(13283930-13283975)
chr1 (118-182)||(30309495-30309560)
chr1 (244-300)||(42571279-42571336)
chr1 (247-300)||(45689762-45689815)
chr1 (9-104)||(49397329-49397426)
chr1 (118-182)||(49427609-49427673)
chr1 (118-182)||(51270024-51270089)
chr1 (382-432)||(3658961-3659013)
chr1 (470-558)||(19262429-19262517)
chr1 (247-295)||(27034882-27034930)
chr1 (247-295)||(35185634-35185682)
chr1 (247-295)||(35586426-35586474)
chr1 (127-182)||(44337238-44337294)
chr1 (287-366)||(49397049-49397129)
chr1 (247-302)||(12790780-12790835)
chr1 (57-104)||(24363734-24363781)
chr1 (382-435)||(29707201-29707256)
chr1 (9-104)||(39856791-39856886)
chr1 (382-435)||(49262659-49262714)
chr1 (382-435)||(50067921-50067976)
chr1 (255-302)||(51270442-51270489)
chr1 (362-444)||(13634881-13634963)
chr1 (317-441)||(17686015-17686141)
chr1 (287-340)||(21484213-21484267)
chr1 (252-302)||(22528147-22528197)
chr1 (61-99)||(37778313-37778351)
chr1 (61-99)||(38046368-38046406)
chr1 (61-99)||(41780927-41780965)
chr1 (252-302)||(48227178-48227228)
chr1 (61-99)||(49396938-49396976)
chr1 (59-104)||(17372953-17372998)
chr1 (112-192)||(17685773-17685854)
chr1 (118-182)||(29436195-29436260)
chr1 (59-104)||(29761755-29761800)
chr1 (118-182)||(29761827-29761892)
chr1 (388-445)||(48227077-48227134)
chr1 (247-295)||(23343291-23343339)
chr1 (252-300)||(27486221-27486269)
chr1 (388-444)||(29761757-29761813)
chr1 (247-295)||(35525704-35525752)
chr1 (384-438)||(38044852-38044908)
chr1 (250-338)||(41874681-41874767)
chr1 (388-444)||(48568014-48568070)
chr1 (250-302)||(49925891-49925943)
chr1 (118-176)||(21484440-21484499)
chr1 (9-72)||(23343325-23343388)
chr1 (382-435)||(30309495-30309550)
chr1 (115-194)||(35185193-35185271)
chr1 (388-438)||(41781216-41781267)
chr1 (263-302)||(41874415-41874454)
chr1 (382-435)||(45689608-45689663)
chr1 (287-340)||(5765593-5765647)
chr1 (112-150)||(15356230-15356268)
chr1 (382-438)||(18170514-18170572)
chr1 (382-438)||(18170673-18170731)
chr1 (248-338)||(19160637-19160726)
chr1 (414-444)||(27034786-27034816)
chr1 (390-444)||(49598498-49598552)
chr1 (402-442)||(3659308-3659349)
chr1 (9-104)||(12790697-12790794)
chr1 (244-293)||(14173262-14173311)
chr1 (293-350)||(14772337-14772394)
chr1 (59-99)||(16098020-16098061)
chr1 (58-99)||(18170629-18170670)
chr1 (115-204)||(23342863-23342951)
chr1 (112-149)||(24269780-24269817)
chr1 (265-302)||(29707066-29707103)
chr1 (118-170)||(35576561-35576614)
chr1 (112-141)||(49262414-49262443)
chr1 (10-104)||(14173182-14173278)
chr1 (382-444)||(17685770-17685834)
chr1 (115-182)||(17697498-17697566)
chr1 (382-440)||(17697508-17697568)
chr1 (118-182)||(19160539-19160602)
chr1 (388-444)||(19160857-19160913)
chr1 (118-182)||(22527729-22527792)
chr1 (388-444)||(22528047-22528103)
chr1 (382-435)||(27034980-27035036)
chr1 (318-350)||(31451845-31451877)
chr1 (12-72)||(35586377-35586437)
chr1 (414-442)||(39223614-39223642)
chr1 (382-432)||(42571442-42571494)
chr1 (382-432)||(46179945-46179997)
chr1 (414-442)||(46924689-46924717)
[»] chr7 (149 HSPs)
chr7 (9-661)||(48270649-48271302)
chr7 (9-664)||(21186852-21187508)
chr7 (20-661)||(46861758-46862400)
chr7 (9-652)||(30354368-30355012)
chr7 (21-664)||(36393390-36394033)
chr7 (9-663)||(28113946-28114601)
chr7 (247-664)||(43350892-43351308)
chr7 (107-664)||(21650522-21651079)
chr7 (265-661)||(41048784-41049180)
chr7 (260-661)||(48314985-48315386)
chr7 (107-664)||(15337556-15338114)
chr7 (247-661)||(42735264-42735677)
chr7 (9-429)||(20877605-20878026)
chr7 (9-664)||(39476797-39477449)
chr7 (9-664)||(34140863-34141516)
chr7 (59-664)||(30360515-30361117)
chr7 (211-664)||(1642348-1642796)
chr7 (9-664)||(17183210-17183867)
chr7 (9-662)||(18237564-18238216)
chr7 (392-664)||(21614700-21614969)
chr7 (9-664)||(40588547-40589199)
chr7 (382-664)||(20564757-20565036)
chr7 (282-664)||(17839321-17839702)
chr7 (248-664)||(2356287-2356700)
chr7 (382-664)||(10523066-10523346)
chr7 (9-664)||(41217612-41218264)
chr7 (381-662)||(47268899-47269178)
chr7 (362-664)||(20378613-20378912)
chr7 (112-437)||(21614116-21614442)
chr7 (248-662)||(48220537-48220949)
chr7 (59-664)||(45362859-45363452)
chr7 (493-664)||(28979060-28979231)
chr7 (382-578)||(9367050-9367243)
chr7 (516-664)||(26603266-26603414)
chr7 (59-336)||(21614391-21614666)
chr7 (9-514)||(26601334-26601837)
chr7 (381-569)||(2205964-2206151)
chr7 (9-186)||(10224543-10224721)
chr7 (382-537)||(13920431-13920583)
chr7 (115-438)||(46861853-46862177)
chr7 (546-664)||(13916831-13916949)
chr7 (115-438)||(21650748-21651071)
chr7 (115-438)||(28114052-28114376)
chr7 (115-436)||(21186960-21187282)
chr7 (388-526)||(17320137-17320272)
chr7 (124-438)||(30354474-30354789)
chr7 (566-664)||(42682954-42683052)
chr7 (316-438)||(48271072-48271196)
chr7 (316-433)||(36393489-36393608)
chr7 (9-338)||(34157130-34157454)
chr7 (9-182)||(17839789-17839960)
chr7 (319-444)||(21614113-21614240)
chr7 (451-558)||(28066359-28066466)
chr7 (115-269)||(43350931-43351083)
chr7 (9-163)||(13920804-13920956)
chr7 (244-308)||(10224707-10224771)
chr7 (9-182)||(20565238-20565409)
chr7 (244-302)||(39476747-39476805)
chr7 (247-308)||(26601287-26601348)
chr7 (404-496)||(34139332-34139421)
chr7 (115-236)||(41049007-41049127)
chr7 (61-182)||(10523548-10523667)
chr7 (9-104)||(20378587-20378682)
chr7 (247-302)||(21186805-21186860)
chr7 (247-302)||(30361159-30361214)
chr7 (247-302)||(48271294-48271349)
chr7 (38-104)||(13920534-13920600)
chr7 (287-438)||(20877711-20877865)
chr7 (414-508)||(3380637-3380727)
chr7 (118-182)||(40588773-40588838)
chr7 (250-302)||(9366632-9366684)
chr7 (250-302)||(20378543-20378595)
chr7 (250-302)||(30354324-30354376)
chr7 (418-558)||(150192-150328)
chr7 (361-438)||(10224536-10224615)
chr7 (287-438)||(15337564-15337718)
chr7 (382-435)||(17183706-17183761)
chr7 (444-551)||(18149638-18149745)
chr7 (247-302)||(20877558-20877613)
chr7 (244-307)||(34353267-34353330)
chr7 (247-302)||(41218256-41218311)
chr7 (444-514)||(11824841-11824911)
chr7 (252-302)||(13920948-13920998)
chr7 (252-302)||(28978717-28978767)
chr7 (252-302)||(45362767-45362817)
chr7 (252-302)||(48220258-48220308)
chr7 (59-182)||(48220350-48220471)
chr7 (9-182)||(9366676-9366848)
chr7 (118-182)||(17839548-17839612)
chr7 (115-236)||(42735486-42735606)
chr7 (118-182)||(45363170-45363235)
chr7 (115-236)||(48315043-48315163)
chr7 (252-300)||(42683058-42683106)
chr7 (388-444)||(48220352-48220408)
chr7 (362-443)||(17183926-17184009)
chr7 (382-435)||(18238055-18238110)
chr7 (255-302)||(18238208-18238255)
chr7 (255-302)||(34141508-34141555)
chr7 (248-299)||(36393332-36393383)
chr7 (38-104)||(9367033-9367099)
chr7 (392-434)||(10224623-10224665)
chr7 (38-104)||(10523297-10523363)
chr7 (362-444)||(13920848-13920930)
chr7 (61-107)||(15337838-15337884)
chr7 (252-302)||(17183859-17183909)
chr7 (112-150)||(17183969-17184007)
chr7 (252-302)||(17839952-17840002)
chr7 (362-444)||(20565301-20565383)
chr7 (252-302)||(20565401-20565451)
chr7 (112-185)||(20877465-20877539)
chr7 (61-99)||(41049019-41049057)
chr7 (252-301)||(10523712-10523761)
chr7 (118-174)||(34139390-34139446)
chr7 (9-104)||(42735663-42735760)
chr7 (60-104)||(17320136-17320180)
chr7 (388-444)||(17839852-17839908)
chr7 (382-440)||(21614442-21614502)
chr7 (119-174)||(34157032-34157087)
chr7 (388-444)||(34157347-34157403)
chr7 (354-429)||(21651111-21651186)
chr7 (382-435)||(26601440-26601495)
chr7 (251-302)||(28113903-28113954)
chr7 (382-435)||(28978980-28979035)
chr7 (382-435)||(48220406-48220461)
chr7 (618-664)||(8726381-8726427)
chr7 (112-185)||(18238282-18238356)
chr7 (38-104)||(20564987-20565053)
chr7 (388-434)||(20877657-20877703)
chr7 (287-340)||(21614544-21614598)
chr7 (382-442)||(30361246-30361308)
chr7 (404-434)||(34157032-34157062)
chr7 (252-302)||(34157446-34157496)
chr7 (247-285)||(41622741-41622779)
chr7 (61-99)||(42735498-42735536)
chr7 (61-99)||(43351033-43351071)
chr7 (370-444)||(45362843-45362917)
chr7 (112-185)||(46861612-46861686)
chr7 (115-144)||(1642545-1642574)
chr7 (115-236)||(15337768-15337888)
chr7 (9-104)||(20877475-20877572)
chr7 (61-104)||(28978986-28979031)
chr7 (387-442)||(39476656-39476713)
chr7 (112-192)||(45362669-45362750)
chr7 (118-182)||(9367040-9367103)
chr7 (388-444)||(10523611-10523667)
chr7 (118-182)||(13920530-13920593)
chr7 (274-338)||(13920628-13920691)
chr7 (414-442)||(26500410-26500438)
chr7 (414-442)||(26592275-26592303)
[»] chr2 (164 HSPs)
chr2 (9-664)||(10364187-10364843)
chr2 (60-664)||(35491635-35492239)
chr2 (9-664)||(19471179-19471840)
chr2 (9-661)||(41498644-41499297)
chr2 (38-610)||(40676954-40677527)
chr2 (21-664)||(37312057-37312701)
chr2 (9-664)||(2918923-2919571)
chr2 (9-664)||(6976838-6977492)
chr2 (12-514)||(43491600-43492103)
chr2 (244-664)||(27130295-27130715)
chr2 (112-664)||(33404015-33404564)
chr2 (317-664)||(34521543-34521890)
chr2 (382-664)||(29067729-29068008)
chr2 (380-664)||(10360123-10360405)
chr2 (9-664)||(16581822-16582477)
chr2 (381-664)||(29111158-29111438)
chr2 (382-664)||(3936991-3937270)
chr2 (382-664)||(17424789-17425068)
chr2 (382-664)||(43982856-43983135)
chr2 (388-664)||(5420469-5420742)
chr2 (381-664)||(17796033-17796310)
chr2 (272-664)||(42240913-42241305)
chr2 (206-664)||(6901966-6902436)
chr2 (382-664)||(22001834-22002113)
chr2 (391-664)||(3941737-3942007)
chr2 (381-664)||(12968226-12968508)
chr2 (381-662)||(42120014-42120294)
chr2 (9-662)||(22493273-22493925)
chr2 (248-662)||(29906584-29906998)
chr2 (454-664)||(39393891-39394101)
chr2 (272-664)||(32734647-32735039)
chr2 (511-664)||(39799895-39800048)
chr2 (451-664)||(20148118-20148331)
chr2 (206-514)||(16253605-16253910)
chr2 (13-234)||(34521300-34521520)
chr2 (522-664)||(18392033-18392179)
chr2 (536-664)||(34638966-34639093)
chr2 (115-438)||(35491861-35492184)
chr2 (211-350)||(20148444-20148582)
chr2 (221-330)||(29111468-29111577)
chr2 (115-438)||(10364293-10364618)
chr2 (418-558)||(27650391-27650527)
chr2 (317-438)||(43491877-43492000)
chr2 (115-432)||(40677037-40677355)
chr2 (9-182)||(18393832-18394003)
chr2 (115-438)||(6977062-6977386)
chr2 (248-527)||(18393486-18393766)
chr2 (124-438)||(41498750-41499065)
chr2 (316-431)||(19471297-19471414)
chr2 (9-182)||(8557279-8557450)
chr2 (21-182)||(10359764-10359923)
chr2 (9-182)||(22002315-22002486)
chr2 (414-514)||(31991896-31991992)
chr2 (546-664)||(16253476-16253594)
chr2 (115-413)||(2919047-2919345)
chr2 (9-182)||(17425270-17425441)
chr2 (9-182)||(39799424-39799595)
chr2 (115-438)||(37312151-37312475)
chr2 (62-182)||(42120495-42120613)
chr2 (416-514)||(15891609-15891703)
chr2 (247-302)||(17425433-17425488)
chr2 (244-295)||(40676886-40676937)
chr2 (247-302)||(41498597-41498652)
chr2 (247-302)||(43492098-43492153)
chr2 (414-514)||(18036122-18036218)
chr2 (115-261)||(34521519-34521664)
chr2 (606-664)||(40678763-40678821)
chr2 (9-104)||(2918793-2918890)
chr2 (247-300)||(2918876-2918929)
chr2 (16-97)||(17538505-17538586)
chr2 (247-308)||(19471132-19471193)
chr2 (9-104)||(23408400-23408497)
chr2 (38-99)||(29067964-29068025)
chr2 (118-182)||(39394117-39394182)
chr2 (9-104)||(41498514-41498611)
chr2 (244-300)||(6977486-6977542)
chr2 (247-299)||(10359705-10359757)
chr2 (247-299)||(17538451-17538503)
chr2 (600-664)||(31770363-31770427)
chr2 (318-444)||(33404439-33404567)
chr2 (247-295)||(34521249-34521297)
chr2 (320-438)||(34521402-34521520)
chr2 (250-302)||(39799380-39799432)
chr2 (287-349)||(6902374-6902437)
chr2 (247-302)||(8557232-8557287)
chr2 (382-435)||(10359858-10359913)
chr2 (247-302)||(23408359-23408414)
chr2 (247-302)||(28476149-28476204)
chr2 (247-302)||(29073688-29073743)
chr2 (16-182)||(3936624-3936789)
chr2 (272-338)||(12968116-12968181)
chr2 (38-104)||(22002064-22002130)
chr2 (388-434)||(34521348-34521394)
chr2 (252-302)||(42120658-42120708)
chr2 (252-301)||(16582470-16582519)
chr2 (9-104)||(19471049-19471146)
chr2 (9-104)||(34521166-34521263)
chr2 (9-104)||(35492275-35492372)
chr2 (252-435)||(39799665-39799849)
chr2 (388-424)||(17538550-17538586)
chr2 (384-435)||(22493767-22493819)
chr2 (247-295)||(35492241-35492289)
chr2 (9-104)||(43492139-43492235)
chr2 (9-104)||(3941967-3942062)
chr2 (382-435)||(16582316-16582371)
chr2 (382-435)||(18393842-18393897)
chr2 (255-302)||(22002478-22002525)
chr2 (255-302)||(22493917-22493964)
chr2 (9-104)||(29073601-29073696)
chr2 (382-435)||(42120505-42120560)
chr2 (389-444)||(42120558-42120613)
chr2 (38-104)||(3936974-3937040)
chr2 (252-302)||(3942054-3942104)
chr2 (38-104)||(17425019-17425085)
chr2 (362-444)||(18393895-18393977)
chr2 (61-99)||(34521614-34521652)
chr2 (412-466)||(42240815-42240869)
chr2 (38-104)||(43983086-43983152)
chr2 (59-104)||(5420699-5420744)
chr2 (255-300)||(5420788-5420833)
chr2 (117-170)||(17796036-17796088)
chr2 (112-184)||(19471039-19471112)
chr2 (9-104)||(24108222-24108319)
chr2 (115-236)||(27130369-27130489)
chr2 (255-308)||(32736726-32736779)
chr2 (118-182)||(39799785-39799849)
chr2 (115-236)||(43491676-43491796)
chr2 (509-561)||(17112399-17112451)
chr2 (118-182)||(22002060-22002123)
chr2 (388-444)||(29073588-29073644)
chr2 (115-163)||(33404237-33404284)
chr2 (112-163)||(34521156-34521208)
chr2 (382-435)||(8557385-8557440)
chr2 (111-150)||(17538357-17538396)
chr2 (61-104)||(17796040-17796083)
chr2 (38-141)||(18393825-18393927)
chr2 (247-302)||(18393995-18394050)
chr2 (247-290)||(24108305-24108348)
chr2 (8-104)||(8557149-8557247)
chr2 (272-338)||(10360014-10360079)
chr2 (206-350)||(16253768-16253912)
chr2 (362-444)||(17425333-17425415)
chr2 (62-104)||(33404244-33404286)
chr2 (362-444)||(39799450-39799532)
chr2 (112-184)||(5420861-5420934)
chr2 (387-442)||(8557138-8557195)
chr2 (115-148)||(18036113-18036146)
chr2 (115-236)||(19471494-19471614)
chr2 (9-70)||(23408306-23408367)
chr2 (112-184)||(24108212-24108285)
chr2 (65-98)||(27130443-27130476)
chr2 (115-148)||(31991887-31991920)
chr2 (112-184)||(35492309-35492382)
chr2 (118-182)||(3936981-3937044)
chr2 (388-444)||(10359804-10359860)
chr2 (118-182)||(17425015-17425078)
chr2 (388-444)||(22002378-22002434)
chr2 (382-444)||(24108209-24108273)
chr2 (274-338)||(29068053-29068116)
chr2 (60-104)||(29111388-29111432)
chr2 (283-339)||(29111807-29111863)
chr2 (414-442)||(32736853-32736881)
chr2 (414-442)||(42120779-42120807)
chr2 (118-182)||(43983082-43983145)
[»] chr8 (113 HSPs)
chr8 (9-664)||(18439847-18440503)
chr8 (22-661)||(41856538-41857179)
chr8 (9-661)||(42603463-42604113)
chr8 (12-661)||(40702369-40703020)
chr8 (128-664)||(44942751-44943289)
chr8 (246-664)||(19241952-19242370)
chr8 (246-664)||(19315136-19315554)
chr8 (112-496)||(26486847-26487232)
chr8 (382-664)||(15032253-15032532)
chr8 (59-664)||(24861349-24861951)
chr8 (12-664)||(38033483-38034133)
chr8 (380-660)||(42168885-42169164)
chr8 (272-664)||(26452331-26452722)
chr8 (382-664)||(485187-485466)
chr8 (248-664)||(2416921-2417335)
chr8 (380-664)||(43693143-43693426)
chr8 (380-662)||(33799476-33799757)
chr8 (60-662)||(28705747-28706348)
chr8 (126-664)||(40414616-40415153)
chr8 (21-664)||(40415263-40415904)
chr8 (369-664)||(41363662-41363955)
chr8 (248-664)||(34614959-34615375)
chr8 (454-664)||(41275400-41275610)
chr8 (383-662)||(43638605-43638883)
chr8 (212-664)||(31171575-31172024)
chr8 (61-307)||(37780507-37780754)
chr8 (491-664)||(26484583-26484756)
chr8 (66-274)||(28167234-28167444)
chr8 (248-664)||(3589058-3589474)
chr8 (381-664)||(16575698-16575966)
chr8 (61-336)||(16575990-16576263)
chr8 (206-437)||(16576214-16576445)
chr8 (553-664)||(22548269-22548380)
chr8 (9-520)||(22549232-22549737)
chr8 (316-437)||(18439954-18440077)
chr8 (9-182)||(2417460-2417631)
chr8 (316-438)||(28167270-28167394)
chr8 (124-438)||(42603695-42604007)
chr8 (9-331)||(43637319-43637638)
chr8 (9-182)||(15031880-15032051)
chr8 (9-182)||(44050927-44051098)
chr8 (317-438)||(41856630-41856753)
chr8 (124-438)||(40702602-40702917)
chr8 (9-152)||(41017304-41017444)
chr8 (124-444)||(26486914-26487235)
chr8 (316-431)||(37780576-37780693)
chr8 (9-182)||(484814-484985)
chr8 (244-295)||(28167443-28167494)
chr8 (9-104)||(33799306-33799401)
chr8 (247-302)||(38033433-38033488)
chr8 (118-182)||(22549311-22549376)
chr8 (247-300)||(40415910-40415963)
chr8 (250-302)||(484770-484822)
chr8 (388-444)||(2417523-2417579)
chr8 (247-295)||(41856478-41856526)
chr8 (124-236)||(41856836-41856947)
chr8 (250-302)||(42604105-42604157)
chr8 (9-104)||(41275630-41275725)
chr8 (252-302)||(15031838-15031888)
chr8 (38-104)||(15032236-15032302)
chr8 (252-302)||(22549729-22549779)
chr8 (115-192)||(28705559-28705637)
chr8 (252-302)||(41275717-41275767)
chr8 (252-302)||(44051090-44051140)
chr8 (115-236)||(19242024-19242144)
chr8 (115-236)||(19315208-19315328)
chr8 (118-182)||(24861575-24861640)
chr8 (252-301)||(24861994-24862043)
chr8 (118-182)||(26452557-26452622)
chr8 (382-440)||(16576154-16576214)
chr8 (252-300)||(26452964-26453012)
chr8 (252-300)||(28705654-28705702)
chr8 (250-302)||(40703015-40703067)
chr8 (247-302)||(18439800-18439855)
chr8 (361-440)||(28705721-28705800)
chr8 (247-302)||(33799259-33799314)
chr8 (59-338)||(42168564-42168841)
chr8 (388-443)||(43637371-43637426)
chr8 (38-104)||(485170-485236)
chr8 (362-442)||(28705555-28705637)
chr8 (362-444)||(33799332-33799414)
chr8 (112-185)||(38033340-38033414)
chr8 (118-182)||(26452812-26452877)
chr8 (9-104)||(41856395-41856492)
chr8 (388-444)||(15031932-15031988)
chr8 (387-442)||(40416000-40416056)
chr8 (252-292)||(42168472-42168512)
chr8 (263-302)||(2417623-2417662)
chr8 (115-170)||(16575909-16575963)
chr8 (61-104)||(19242094-19242137)
chr8 (61-104)||(19315278-19315321)
chr8 (382-435)||(22549576-22549631)
chr8 (557-664)||(22843424-22843531)
chr8 (60-99)||(26486917-26486956)
chr8 (382-435)||(40415755-40415810)
chr8 (115-234)||(44942945-44943063)
chr8 (362-444)||(484840-484922)
chr8 (118-152)||(2417147-2417181)
chr8 (112-181)||(18439707-18439777)
chr8 (362-444)||(24861893-24861975)
chr8 (115-185)||(40415982-40416052)
chr8 (118-148)||(42168912-42168942)
chr8 (362-442)||(43637179-43637261)
chr8 (115-236)||(18440157-18440277)
chr8 (115-148)||(31171769-31171802)
chr8 (362-443)||(41017330-41017411)
chr8 (118-182)||(485177-485240)
chr8 (393-425)||(28167412-28167444)
chr8 (9-107)||(28167477-28167577)
chr8 (382-432)||(28705805-28705857)
chr8 (414-442)||(33776051-33776079)
chr8 (388-432)||(37780710-37780754)
chr8 (9-104)||(40415949-40416045)
[»] chr3 (238 HSPs)
chr3 (9-662)||(41577918-41578571)
chr3 (9-661)||(2428500-2429153)
chr3 (9-664)||(7246104-7246760)
chr3 (39-661)||(55206467-55207090)
chr3 (9-664)||(30192548-30193204)
chr3 (9-664)||(51015287-51015943)
chr3 (21-664)||(34471641-34472285)
chr3 (9-664)||(51012840-51013487)
chr3 (59-661)||(52569012-52569614)
chr3 (21-661)||(43569923-43570564)
chr3 (9-664)||(45100028-45100674)
chr3 (21-575)||(46346177-46346732)
chr3 (9-661)||(41803915-41804568)
chr3 (13-664)||(46413878-46414543)
chr3 (21-631)||(42322955-42323565)
chr3 (12-664)||(14631455-14632108)
chr3 (12-664)||(49273409-49274066)
chr3 (107-664)||(34646918-34647476)
chr3 (125-664)||(7954213-7954754)
chr3 (115-664)||(8633024-8633568)
chr3 (107-664)||(37281462-37282021)
chr3 (107-664)||(36721039-36721598)
chr3 (178-664)||(33448878-33449348)
chr3 (115-664)||(6754214-6754763)
chr3 (9-664)||(44927473-44928126)
chr3 (115-664)||(6464005-6464554)
chr3 (9-664)||(24701828-24702480)
chr3 (118-664)||(13895532-13896079)
chr3 (59-664)||(34692896-34693499)
chr3 (288-664)||(50458541-50458900)
chr3 (382-664)||(2268424-2268703)
chr3 (389-664)||(3494966-3495238)
chr3 (382-664)||(2646806-2647085)
chr3 (382-664)||(36135018-36135296)
chr3 (272-661)||(19453046-19453435)
chr3 (382-664)||(4004017-4004296)
chr3 (416-664)||(10053236-10053480)
chr3 (9-661)||(42383064-42383714)
chr3 (9-662)||(44835043-44835694)
chr3 (9-664)||(47065697-47066349)
chr3 (382-664)||(49139984-49140263)
chr3 (382-664)||(54390452-54390731)
chr3 (9-662)||(25576147-25576798)
chr3 (382-664)||(34049737-34050016)
chr3 (9-664)||(39416503-39417157)
chr3 (382-664)||(46403013-46403292)
chr3 (112-444)||(27187543-27187876)
chr3 (248-662)||(42949813-42950227)
chr3 (443-664)||(47759879-47760100)
chr3 (12-299)||(10052942-10053230)
chr3 (193-663)||(20375623-20376090)
chr3 (248-664)||(48087345-48087761)
chr3 (248-664)||(49218530-49218945)
chr3 (382-609)||(50997453-50997677)
chr3 (248-664)||(43477067-43477482)
chr3 (388-664)||(49610499-49610772)
chr3 (275-639)||(774162-774522)
chr3 (454-664)||(51695605-51695815)
chr3 (380-662)||(53826622-53826903)
chr3 (454-661)||(42382284-42382491)
chr3 (209-546)||(18440873-18441207)
chr3 (209-546)||(19485947-19486281)
chr3 (116-641)||(25887271-25887796)
chr3 (444-664)||(27186958-27187178)
chr3 (9-182)||(19452700-19452874)
chr3 (115-438)||(2428723-2429047)
chr3 (9-150)||(55268614-55268756)
chr3 (206-349)||(8632792-8632935)
chr3 (414-664)||(14265418-14265661)
chr3 (115-438)||(41578142-41578465)
chr3 (116-438)||(34471735-34472058)
chr3 (317-438)||(7246531-7246654)
chr3 (317-438)||(49273840-49273963)
chr3 (115-438)||(51015513-51015837)
chr3 (287-438)||(14631851-14632005)
chr3 (221-510)||(15637155-15637440)
chr3 (388-466)||(37282040-37282118)
chr3 (348-446)||(55268753-55268851)
chr3 (9-182)||(4003644-4003815)
chr3 (244-350)||(7954976-7955082)
chr3 (124-438)||(41804147-41804462)
chr3 (9-182)||(11378533-11378704)
chr3 (362-466)||(36720916-36721020)
chr3 (115-399)||(7954440-7954723)
chr3 (115-438)||(42323049-42323372)
chr3 (124-438)||(52569068-52569383)
chr3 (317-439)||(8633023-8633147)
chr3 (9-182)||(36135498-36135669)
chr3 (585-664)||(15637034-15637113)
chr3 (115-426)||(43570146-43570458)
chr3 (115-438)||(46346271-46346595)
chr3 (115-438)||(46413993-46414317)
chr3 (59-182)||(2268101-2268222)
chr3 (9-152)||(43477561-43477701)
chr3 (9-182)||(34050218-34050389)
chr3 (9-104)||(34646768-34646864)
chr3 (9-182)||(50997879-50998050)
chr3 (9-182)||(54390933-54391104)
chr3 (617-664)||(11378906-11378953)
chr3 (127-438)||(34646926-34647238)
chr3 (9-104)||(36720890-36720985)
chr3 (247-302)||(49274061-49274116)
chr3 (317-438)||(55206543-55206666)
chr3 (318-438)||(10053045-10053167)
chr3 (316-444)||(27187749-27187879)
chr3 (247-301)||(34471582-34471636)
chr3 (362-466)||(34646794-34646899)
chr3 (247-308)||(42383700-42383761)
chr3 (9-182)||(2646433-2646604)
chr3 (9-182)||(3494586-3494757)
chr3 (316-438)||(30192974-30193098)
chr3 (244-308)||(34646718-34646782)
chr3 (9-103)||(42322822-42322918)
chr3 (244-308)||(45099978-45100042)
chr3 (9-182)||(49139611-49139782)
chr3 (247-302)||(14632103-14632158)
chr3 (247-302)||(39416456-39416511)
chr3 (247-302)||(52568919-52568974)
chr3 (38-104)||(2268407-2268473)
chr3 (38-104)||(4004000-4004066)
chr3 (38-104)||(36135247-36135313)
chr3 (9-163)||(46403513-46403665)
chr3 (118-182)||(49218654-49218719)
chr3 (250-302)||(34050381-34050433)
chr3 (51-107)||(34647190-34647246)
chr3 (247-295)||(42322904-42322952)
chr3 (620-664)||(46346745-46346789)
chr3 (250-302)||(46403657-46403709)
chr3 (247-295)||(46413827-46413875)
chr3 (250-302)||(49139567-49139619)
chr3 (250-302)||(54391096-54391148)
chr3 (250-302)||(55268570-55268622)
chr3 (382-435)||(13895532-13895587)
chr3 (247-302)||(19452653-19452708)
chr3 (382-435)||(24701934-24701989)
chr3 (247-302)||(44834996-44835051)
chr3 (247-302)||(47066341-47066396)
chr3 (247-302)||(49610816-49610871)
chr3 (252-302)||(2268009-2268059)
chr3 (252-302)||(2646391-2646441)
chr3 (38-104)||(3494942-3495008)
chr3 (247-301)||(7246753-7246807)
chr3 (388-434)||(10052991-10053037)
chr3 (252-302)||(11378491-11378541)
chr3 (252-302)||(13895397-13895447)
chr3 (382-438)||(19452806-19452864)
chr3 (252-302)||(24701786-24701836)
chr3 (252-302)||(34692804-34692854)
chr3 (252-302)||(49218250-49218300)
chr3 (9-82)||(51015968-51016042)
chr3 (252-302)||(51695448-51695498)
chr3 (115-236)||(7246330-7246450)
chr3 (59-104)||(37282075-37282120)
chr3 (627-664)||(42328288-42328325)
chr3 (384-435)||(44927967-44928020)
chr3 (247-300)||(46346118-46346171)
chr3 (9-104)||(51012710-51012807)
chr3 (247-295)||(41578570-41578618)
chr3 (382-435)||(11378639-11378694)
chr3 (247-302)||(25576100-25576155)
chr3 (382-435)||(25576253-25576308)
chr3 (247-302)||(41804560-41804615)
chr3 (118-176)||(43477293-43477352)
chr3 (247-302)||(43477693-43477748)
chr3 (382-435)||(44835149-44835204)
chr3 (59-163)||(49218342-49218444)
chr3 (9-104)||(49610729-49610824)
chr3 (247-302)||(50998042-50998097)
chr3 (247-302)||(51012793-51012848)
chr3 (9-104)||(51695490-51695585)
chr3 (9-72)||(52568870-52568933)
chr3 (38-104)||(2646789-2646855)
chr3 (252-302)||(3494544-3494594)
chr3 (362-444)||(3494612-3494694)
chr3 (61-107)||(7954444-7954490)
chr3 (34-104)||(8633271-8633341)
chr3 (38-104)||(34049967-34050033)
chr3 (252-302)||(36135661-36135711)
chr3 (247-301)||(36720843-36720897)
chr3 (382-438)||(37281955-37282013)
chr3 (316-370)||(45100194-45100248)
chr3 (38-104)||(49139967-49140033)
chr3 (38-104)||(50997628-50997694)
chr3 (316-433)||(51012951-51013062)
chr3 (115-192)||(53826439-53826517)
chr3 (252-302)||(53826534-53826584)
chr3 (38-104)||(54390682-54390748)
chr3 (59-104)||(27187556-27187601)
chr3 (115-236)||(30192774-30192894)
chr3 (115-236)||(51013141-51013261)
chr3 (388-444)||(2268103-2268159)
chr3 (388-444)||(4003696-4003752)
chr3 (388-444)||(11378585-11378641)
chr3 (60-104)||(33449087-33449131)
chr3 (388-444)||(43477593-43477649)
chr3 (124-236)||(45100328-45100439)
chr3 (128-204)||(55268755-55268830)
chr3 (247-302)||(2429145-2429200)
chr3 (287-441)||(6754608-6754766)
chr3 (251-302)||(10052896-10052947)
chr3 (287-350)||(25887361-25887424)
chr3 (382-435)||(34692952-34693007)
chr3 (9-72)||(43570559-43570622)
chr3 (255-302)||(44928118-44928165)
chr3 (115-185)||(47066415-47066486)
chr3 (362-444)||(2646459-2646541)
chr3 (248-338)||(2646672-2646761)
chr3 (60-104)||(13895803-13895849)
chr3 (317-437)||(33448815-33448937)
chr3 (362-444)||(34050281-34050363)
chr3 (118-148)||(44835440-44835470)
chr3 (38-104)||(46403243-46403309)
chr3 (362-444)||(46403557-46403639)
chr3 (362-444)||(49139637-49139719)
chr3 (362-444)||(54390996-54391078)
chr3 (250-300)||(55206393-55206443)
chr3 (120-237)||(8633227-8633343)
chr3 (115-148)||(25887562-25887595)
chr3 (9-100)||(34646642-34646735)
chr3 (387-442)||(44834902-44834959)
chr3 (9-104)||(45099898-45099995)
chr3 (118-170)||(47065923-47065976)
chr3 (382-434)||(55268660-55268713)
chr3 (61-98)||(55268793-55268830)
chr3 (118-182)||(2268414-2268477)
chr3 (266-302)||(4003616-4003652)
chr3 (118-182)||(4004007-4004070)
chr3 (112-152)||(10052799-10052839)
chr3 (287-339)||(15637394-15637446)
chr3 (112-152)||(19452560-19452600)
chr3 (118-182)||(34049963-34050026)
chr3 (118-182)||(36135243-36135306)
chr3 (414-442)||(42949656-42949684)
chr3 (384-438)||(45100134-45100190)
chr3 (384-435)||(47066191-47066243)
chr3 (414-442)||(47066462-47066490)
chr3 (118-182)||(49139974-49140037)
chr3 (118-182)||(54390678-54390741)
[»] chr4 (210 HSPs)
chr4 (9-664)||(34152840-34153497)
chr4 (9-664)||(22436907-22437563)
chr4 (9-664)||(21169447-21170102)
chr4 (9-664)||(34529351-34530007)
chr4 (9-664)||(49791491-49792147)
chr4 (12-661)||(957013-957663)
chr4 (9-664)||(2773005-2773661)
chr4 (9-664)||(49423312-49423969)
chr4 (21-664)||(36776086-36776730)
chr4 (13-664)||(43889060-43889710)
chr4 (110-664)||(49817299-49817855)
chr4 (279-661)||(6282149-6282531)
chr4 (279-664)||(44560006-44560391)
chr4 (265-664)||(47657167-47657566)
chr4 (110-664)||(4785080-4785633)
chr4 (9-664)||(42886259-42886931)
chr4 (9-664)||(51427747-51428403)
chr4 (206-664)||(17211262-17211718)
chr4 (107-664)||(14330347-14330905)
chr4 (382-664)||(21017109-21017388)
chr4 (9-664)||(28082234-28082885)
chr4 (382-664)||(40353705-40353984)
chr4 (382-664)||(55796739-55797018)
chr4 (281-660)||(1226159-1226537)
chr4 (9-664)||(1042747-1043397)
chr4 (107-664)||(49063975-49064534)
chr4 (382-664)||(20778800-20779080)
chr4 (381-664)||(32937833-32938113)
chr4 (248-658)||(33163339-33163749)
chr4 (211-664)||(3393300-3393748)
chr4 (115-664)||(18412591-18413137)
chr4 (382-664)||(41794494-41794773)
chr4 (8-664)||(39588925-39589578)
chr4 (382-664)||(6177247-6177526)
chr4 (384-664)||(51027699-51027978)
chr4 (382-664)||(56138906-56139185)
chr4 (9-641)||(21711549-21712179)
chr4 (382-664)||(49094741-49095020)
chr4 (381-664)||(24606748-24607028)
chr4 (380-664)||(25762594-25762877)
chr4 (9-662)||(46816082-46816732)
chr4 (244-664)||(10312268-10312683)
chr4 (446-664)||(26591678-26591896)
chr4 (276-664)||(37866402-37866791)
chr4 (379-664)||(242343-242627)
chr4 (248-662)||(31824424-31824838)
chr4 (9-664)||(45939521-45940175)
chr4 (388-664)||(11288291-11288562)
chr4 (62-664)||(20901286-20901879)
chr4 (9-613)||(27759374-27759977)
chr4 (21-302)||(49571463-49571749)
chr4 (272-664)||(9489675-9490065)
chr4 (112-437)||(24607276-24607602)
chr4 (381-664)||(31324170-31324451)
chr4 (206-539)||(49816954-49817283)
chr4 (59-337)||(24607051-24607327)
chr4 (414-664)||(13850745-13850991)
chr4 (115-438)||(43889162-43889484)
chr4 (416-664)||(13866259-13866503)
chr4 (9-338)||(241992-242320)
chr4 (59-208)||(26591516-26591670)
chr4 (115-438)||(49423418-49423743)
chr4 (115-438)||(21169673-21169997)
chr4 (124-438)||(34529457-34529772)
chr4 (115-436)||(34152949-34153271)
chr4 (13-112)||(44559845-44559944)
chr4 (316-438)||(22437333-22437457)
chr4 (206-336)||(32937678-32937809)
chr4 (9-104)||(49064588-49064683)
chr4 (388-456)||(49064563-49064631)
chr4 (115-438)||(957116-957440)
chr4 (206-349)||(32937354-32937497)
chr4 (115-438)||(36776180-36776504)
chr4 (124-438)||(49791597-49791912)
chr4 (9-182)||(56139387-56139558)
chr4 (316-438)||(49571527-49571655)
chr4 (244-312)||(4784876-4784944)
chr4 (275-336)||(20778714-20778775)
chr4 (9-182)||(6176874-6177045)
chr4 (388-464)||(14330250-14330326)
chr4 (417-514)||(17292108-17292201)
chr4 (9-182)||(21016736-21016907)
chr4 (244-308)||(21170088-21170152)
chr4 (9-182)||(49095222-49095393)
chr4 (353-438)||(26591576-26591663)
chr4 (124-438)||(2773240-2773555)
chr4 (287-438)||(42886658-42886812)
chr4 (118-236)||(47657220-47657337)
chr4 (115-236)||(44560045-44560165)
chr4 (247-300)||(49571755-49571808)
chr4 (244-300)||(241942-241998)
chr4 (244-300)||(51427697-51427753)
chr4 (9-104)||(14330198-14330293)
chr4 (247-302)||(22437555-22437610)
chr4 (247-302)||(31824198-31824253)
chr4 (247-302)||(49791444-49791499)
chr4 (9-176)||(40353332-40353497)
chr4 (388-434)||(44559893-44559939)
chr4 (59-150)||(885318-885406)
chr4 (118-182)||(9489900-9489965)
chr4 (575-664)||(21412647-21412736)
chr4 (118-182)||(39589151-39589216)
chr4 (250-302)||(6176830-6176882)
chr4 (250-302)||(21016692-21016744)
chr4 (244-312)||(42886913-42886981)
chr4 (9-107)||(49791358-49791458)
chr4 (247-302)||(956963-957018)
chr4 (247-302)||(6282013-6282068)
chr4 (247-302)||(14330151-14330206)
chr4 (382-435)||(20901339-20901394)
chr4 (247-302)||(21712171-21712226)
chr4 (414-558)||(23124490-23124630)
chr4 (247-302)||(27759969-27760024)
chr4 (287-349)||(32937353-32937416)
chr4 (247-302)||(38132630-38132685)
chr4 (287-438)||(49817304-49817458)
chr4 (252-302)||(1043389-1043439)
chr4 (38-104)||(21017092-21017158)
chr4 (247-301)||(36776027-36776081)
chr4 (59-182)||(38132727-38132848)
chr4 (252-302)||(40353290-40353340)
chr4 (38-104)||(40353688-40353754)
chr4 (252-302)||(45940167-45940217)
chr4 (252-302)||(49095385-49095435)
chr4 (8-104)||(49423182-49423280)
chr4 (59-182)||(51027374-51027495)
chr4 (38-104)||(55796969-55797035)
chr4 (388-466)||(4784978-4785058)
chr4 (9-104)||(6281930-6282027)
chr4 (9-98)||(6282060-6282149)
chr4 (118-182)||(28082460-28082524)
chr4 (9-104)||(43888926-43889023)
chr4 (255-308)||(49423273-49423326)
chr4 (252-300)||(885450-885498)
chr4 (252-300)||(9490124-9490172)
chr4 (247-295)||(14289951-14289999)
chr4 (254-302)||(28082877-28082925)
chr4 (13-150)||(37867024-37867159)
chr4 (252-300)||(47870740-47870788)
chr4 (9-182)||(55797220-55797391)
chr4 (247-302)||(2773653-2773708)
chr4 (382-435)||(39589416-39589471)
chr4 (247-302)||(46816035-46816090)
chr4 (113-162)||(1042966-1043016)
chr4 (61-99)||(44560115-44560153)
chr4 (388-426)||(49571671-49571709)
chr4 (382-438)||(51427853-51427911)
chr4 (362-444)||(56139450-56139532)
chr4 (252-302)||(56139550-56139600)
chr4 (9-104)||(22437596-22437693)
chr4 (115-148)||(31324392-31324425)
chr4 (9-104)||(34152712-34152809)
chr4 (388-441)||(51027376-51027429)
chr4 (388-432)||(242044-242088)
chr4 (388-444)||(885348-885404)
chr4 (118-182)||(21017099-21017162)
chr4 (382-440)||(24607216-24607276)
chr4 (9-182)||(25763077-25763248)
chr4 (60-104)||(32937839-32937883)
chr4 (250-302)||(34529307-34529359)
chr4 (382-432)||(38132786-38132838)
chr4 (256-308)||(49064669-49064721)
chr4 (112-200)||(49817545-49817632)
chr4 (9-104)||(51027245-51027341)
chr4 (9-101)||(4784926-4785020)
chr4 (382-435)||(21712018-21712073)
chr4 (112-163)||(24606968-24607018)
chr4 (382-435)||(27759816-27759871)
chr4 (59-182)||(37866885-37867007)
chr4 (382-435)||(37866895-37866950)
chr4 (388-443)||(38132729-38132784)
chr4 (60-99)||(47657289-47657328)
chr4 (61-104)||(49817579-49817622)
chr4 (382-444)||(51027232-51027295)
chr4 (362-444)||(6176900-6176982)
chr4 (38-104)||(6177230-6177296)
chr4 (61-99)||(6282258-6282296)
chr4 (390-438)||(14330355-14330405)
chr4 (59-104)||(18412820-18412866)
chr4 (362-444)||(21016762-21016844)
chr4 (62-104)||(24606978-24607020)
chr4 (119-176)||(32937590-32937648)
chr4 (287-340)||(32937686-32937740)
chr4 (112-185)||(36775934-36776008)
chr4 (48-104)||(37866888-37866946)
chr4 (38-104)||(41794477-41794543)
chr4 (382-438)||(49064468-49064526)
chr4 (38-104)||(49094971-49095037)
chr4 (362-444)||(49095285-49095367)
chr4 (272-338)||(51027586-51027651)
chr4 (38-104)||(56139136-56139202)
chr4 (115-148)||(3393810-3393843)
chr4 (112-141)||(20901123-20901152)
chr4 (9-104)||(21170135-21170232)
chr4 (118-163)||(32937843-32937887)
chr4 (112-184)||(34152702-34152775)
chr4 (250-295)||(43889012-43889057)
chr4 (9-104)||(45940208-45940305)
chr4 (112-141)||(51027235-51027264)
chr4 (362-440)||(885515-885595)
chr4 (414-442)||(1226898-1226926)
chr4 (59-95)||(11288528-11288564)
chr4 (287-350)||(17211656-17211720)
chr4 (369-444)||(20901120-20901196)
chr4 (124-236)||(22437142-22437253)
chr4 (362-444)||(37867202-37867286)
chr4 (118-182)||(40353695-40353758)
chr4 (362-428)||(42886990-42887058)
chr4 (115-163)||(49064581-49064628)
chr4 (118-182)||(55796965-55797028)
[»] chr6 (103 HSPs)
chr6 (9-664)||(32027181-32027837)
chr6 (9-664)||(32037240-32037896)
chr6 (9-661)||(12396779-12397432)
chr6 (152-664)||(13402533-13403045)
chr6 (9-502)||(35020790-35021284)
chr6 (115-605)||(30257238-30257729)
chr6 (244-664)||(34802685-34803105)
chr6 (109-664)||(801166-801719)
chr6 (107-448)||(4495119-4495461)
chr6 (382-664)||(11692451-11692730)
chr6 (384-664)||(14115037-14115313)
chr6 (382-664)||(27640180-27640459)
chr6 (382-664)||(6205484-6205763)
chr6 (454-664)||(29066553-29066763)
chr6 (454-664)||(29075566-29075776)
chr6 (248-652)||(35058528-35058932)
chr6 (454-664)||(29110537-29110748)
chr6 (9-281)||(13403198-13403471)
chr6 (454-664)||(29108140-29108350)
chr6 (480-664)||(22305796-22305980)
chr6 (59-361)||(14122904-14123204)
chr6 (124-438)||(12397011-12397326)
chr6 (206-340)||(23911074-23911207)
chr6 (382-526)||(24021027-24021168)
chr6 (152-281)||(13403057-13403186)
chr6 (388-526)||(2192535-2192670)
chr6 (115-448)||(30257228-30257562)
chr6 (115-413)||(13402759-13403057)
chr6 (316-438)||(13403241-13403365)
chr6 (115-438)||(32027287-32027611)
chr6 (380-534)||(3765713-3765867)
chr6 (317-438)||(35020896-35021019)
chr6 (124-438)||(32037346-32037661)
chr6 (9-182)||(27640661-27640828)
chr6 (9-182)||(6205965-6206136)
chr6 (388-466)||(30257133-30257211)
chr6 (206-516)||(34134799-34135102)
chr6 (316-413)||(13403100-13403198)
chr6 (244-308)||(7821227-7821291)
chr6 (244-308)||(32027131-32027195)
chr6 (244-308)||(32037190-32037254)
chr6 (414-535)||(17465298-17465415)
chr6 (38-104)||(2192627-2192693)
chr6 (9-163)||(35058291-35058443)
chr6 (115-438)||(4495129-4495453)
chr6 (247-302)||(13403463-13403518)
chr6 (287-435)||(14122997-14123148)
chr6 (38-104)||(24021010-24021076)
chr6 (247-300)||(12397426-12397479)
chr6 (250-302)||(6206128-6206180)
chr6 (250-302)||(11693095-11693147)
chr6 (247-302)||(35058244-35058299)
chr6 (252-302)||(2193035-2193085)
chr6 (387-444)||(14123421-14123479)
chr6 (272-346)||(29066871-29066944)
chr6 (272-346)||(29108458-29108531)
chr6 (273-346)||(29075884-29075956)
chr6 (273-346)||(29110856-29110928)
chr6 (9-182)||(11692932-11693103)
chr6 (252-300)||(24020612-24020660)
chr6 (124-236)||(35021100-35021211)
chr6 (381-438)||(801654-801713)
chr6 (252-295)||(29067148-29067191)
chr6 (252-295)||(29108735-29108778)
chr6 (362-444)||(6206028-6206110)
chr6 (61-99)||(13402771-13402809)
chr6 (115-173)||(14123415-14123473)
chr6 (38-104)||(27640410-27640476)
chr6 (61-99)||(30257512-30257550)
chr6 (388-444)||(27640723-27640779)
chr6 (250-302)||(27640820-27640872)
chr6 (250-302)||(35020746-35020798)
chr6 (61-104)||(801395-801438)
chr6 (390-435)||(35058397-35058444)
chr6 (492-558)||(2402306-2402372)
chr6 (38-104)||(6205714-6205780)
chr6 (34-80)||(7821170-7821216)
chr6 (38-104)||(11692681-11692747)
chr6 (252-302)||(13617415-13617465)
chr6 (473-551)||(18743995-18744073)
chr6 (118-163)||(801391-801435)
chr6 (362-443)||(2192936-2193017)
chr6 (66-99)||(4495141-4495174)
chr6 (34-87)||(4495524-4495577)
chr6 (112-184)||(4495604-4495677)
chr6 (115-148)||(17465289-17465322)
chr6 (362-443)||(24020680-24020761)
chr6 (118-182)||(29066779-29066844)
chr6 (118-182)||(29075792-29075857)
chr6 (118-182)||(29108366-29108431)
chr6 (118-182)||(29110764-29110829)
chr6 (274-338)||(2192721-2192784)
chr6 (382-444)||(4495616-4495680)
chr6 (388-444)||(14123146-14123202)
chr6 (416-444)||(20192534-20192562)
chr6 (416-444)||(20242092-20242120)
chr6 (416-444)||(22136076-22136104)
chr6 (416-444)||(22143429-22143457)
chr6 (287-350)||(23911146-23911209)
chr6 (118-182)||(24021017-24021080)
chr6 (118-182)||(27640406-27640469)
chr6 (414-442)||(34132140-34132168)
chr6 (388-444)||(35058343-35058399)
[»] scaffold0192 (2 HSPs)
scaffold0192 (10-662)||(17479-18123)
scaffold0192 (244-276)||(17449-17481)
[»] scaffold0176 (2 HSPs)
scaffold0176 (9-664)||(1788-2441)
scaffold0176 (255-302)||(2433-2480)
[»] scaffold0589 (3 HSPs)
scaffold0589 (380-664)||(2265-2548)
scaffold0589 (9-150)||(4798-4936)
scaffold0589 (362-444)||(4828-4910)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (451-664)||(24903-25115)
[»] scaffold0004 (4 HSPs)
scaffold0004 (542-664)||(63974-64095)
scaffold0004 (381-513)||(64098-64227)
scaffold0004 (281-336)||(64251-64306)
scaffold0004 (113-170)||(64168-64224)
[»] scaffold0031 (4 HSPs)
scaffold0031 (382-526)||(85462-85603)
scaffold0031 (38-104)||(85554-85620)
scaffold0031 (118-182)||(85550-85613)
scaffold0031 (274-338)||(85648-85711)
[»] scaffold0268 (5 HSPs)
scaffold0268 (382-526)||(14604-14745)
scaffold0268 (38-104)||(14696-14762)
scaffold0268 (254-301)||(15113-15160)
scaffold0268 (118-182)||(14947-15012)
scaffold0268 (118-182)||(14692-14755)
[»] scaffold0039 (2 HSPs)
scaffold0039 (115-236)||(108009-108131)
scaffold0039 (317-444)||(108003-108132)
[»] scaffold0861 (3 HSPs)
scaffold0861 (59-407)||(2208-2555)
scaffold0861 (246-444)||(2497-2695)
scaffold0861 (383-435)||(2445-2499)
[»] scaffold0199 (3 HSPs)
scaffold0199 (9-148)||(11319-11455)
scaffold0199 (254-300)||(11279-11325)
scaffold0199 (388-444)||(11371-11427)
[»] scaffold0859 (2 HSPs)
scaffold0859 (287-350)||(1054-1117)
scaffold0859 (115-163)||(1158-1206)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (451-558)||(5453-5560)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (471-551)||(36775-36855)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 548; Significance: 0; HSPs: 158)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 548; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 18308910 - 18308255
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  18308910 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctatattcctgctgtttaacaagtttgaattacctcattctgaggaagacaattgttgtagttagac 18308811  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgt 208  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  18308810 ttttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgggtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaatattcgaccgacattcccaattt 18308711  T
Q  209 tccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatt 308  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18308710 ttcattcaaaatattaaattcttgttaggctgggattaaatgatagtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgaaacttcaataccttcatt 18308611  T
Q  309 taaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattc 408  Q
    |||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18308610 taaaccagcttaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattc 18308511  T
Q  409 aaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctc 508  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18308510 aaaggaagacaattgttgtaggtggaaggtgcattcattccatacctaatgtcaatctactggcggaatcaaatttttgatgatatcttcagttgatctc 18308411  T
Q  509 agcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgata 608  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  18308410 agcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgata 18308311  T
Q  609 ctctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18308310 ctctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 18308255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 664
Target Start/End: Original strand, 4723633 - 4724286
Alignment:
Q  12 aataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtt 111  Q
    |||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  4723633 aatatcatcattcaaaatgctcatcgaatgctggattcctgccgtttaacaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggacgtt 4723732  T
Q  112 tgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatg-agtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttc 210  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| | |||||| | ||||||||||||    
T  4723733 tgtacctcgcaactacaacaattgtgttacctttgaatggagtaaattcaaacttgccaagcagtaagactccaatatacgaccggcgttcccaatgttc 4723832  T
Q  211 cattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcattta 310  Q
    |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4723833 cattcaaaagattaaattcttgttaggttgggattaaataatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcattta 4723932  T
Q  311 aatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaa 410  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4723933 aactggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagtcctgccgtttggcaagtttgaattaccccattcag 4724032  T
Q  411 aggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcag 510  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4724033 aggaagacaattgttgtagctgcaaggtgcattcatttggtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcag 4724132  T
Q  511 caacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatact 610  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4724133 caacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgtttttgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatact 4724232  T
Q  611 ctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  4724233 ctcccctcatcgagcgttggacgtttataccgaatgtgttccactttccttgtg 4724286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 463; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 664
Target Start/End: Original strand, 1399861 - 1400514
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| | | ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  1399861 ttgaataccatcattcaaaatgctcatcgaatgttggcttcctgccgtttaacaagtttgaattaccccattcagaggaagaaaattgttgcagttggac 1399960  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatg 207  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||| || ||||||    ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1399961 gtttgtacctcccaactacaacaattgtgttaactttgaatggggtaaattcaaacttgtcaagcat---gactccaatattcgaccgacattcccaatg 1400057  T
Q  208 ttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcat 307  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1400058 ttccattcaaaagattaaattcttgttaggctgagattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggttcattccttgacacttcaataccttcat 1400157  T
Q  308 ttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccatt 407  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  1400158 ttaaaccagcctaacaagaatttaatcctttgacaggaacaatgggaatgtcggtcgaatattagagacctatcgtttggcaagtttgaattaccccatt 1400257  T
Q  408 caaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatct 507  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1400258 aaaaggaagacaattgttgtagctggaaggtgcattcactccgtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatct 1400357  T
Q  508 cagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgat 607  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  1400358 cagcaacgtcacccgcatatggatccactggaacatgatgtgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgat 1400457  T
Q  608 actctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1400458 actctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 1400514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 35565922 - 35565270
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |||||||| | ||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  35565922 ttgaataccatcattcaaaatgcttatcgaatgttggattcctgccgtttaacaagtttgaattacctcattcaaaggaagacaattgttgcagttggac 35565823  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatg 207  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| || ||||||| | ||||| |||||||||||  |    
T  35565822 gtttataccttccaactacaataattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccattgttcgatcgacattcccatag 35565723  T
Q  208 ttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcat 307  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35565722 ttccattcaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacagtattcaagtgtcaaaagaatgaggtccattcattgacacttcaataccttcat 35565623  T
Q  308 ttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccatt 407  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| || | |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  35565622 ttaaaccggtctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgggaatgccggtcgaacattgaagtcatgtcgtttggcaagtttgaattaccccatt 35565523  T
Q  408 caaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatct 507  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  35565522 caaaggaagataattgttgtagctgaaaggtgcattcattccgcacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttctgatgatatctttagttgatct 35565423  T
Q  508 cagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgat 607  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  35565422 cagcaacgtcacccgcatatcgatccactagaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacg-tttcatcgttcgttaattccacccaagtgaatgat 35565324  T
Q  608 actctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctcctt 661  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35565323 actctcccctcgtcgagcgttagacgtttataccgaacgtgttccaccctcctt 35565270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 664
Target Start/End: Original strand, 36349886 - 36350517
Alignment:
Q  13 ataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgttt 112  Q
    ||||||| |||||||| ||| || ||||||| |||||||   ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||| |||||||    
T  36349886 ataccattattcaagatgcttattgaatgctggattcctaccgtttaacaagtttgaattaccccatttagaggaa-ataattgtagcagttggacgttt 36349984  T
Q  113 gtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttcc 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  36349985 gtaccttccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcatgactccaatgttcgaccgacattcccatagttcc 36350084  T
Q  212 attcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaa 311  Q
    ||||| || |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36350085 attcaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtccattcattgacacttcaataccttcatttaa 36350184  T
Q  312 atcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaa 411  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||| | |   ||||||||||||||||||||||||          
T  36350185 accggcctaacaagaatttaatcttttgacaagaacaatgagaatgttggtagaacattggagtcatgttgtttggcaagtttgaattacccca------ 36350278  T
Q  412 ggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagc 511  Q
         ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36350279 -----acaattgttgtagctggaaggtgcattcattcggtacctaatgacgatcttctggtggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagc 36350373  T
Q  512 aacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactc 611  Q
    ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  36350374 aacgtcacctacatatcgatccactggaacatgttgtg---------catgctcgtcacgttttcgtcgttcattaattccacccaagtgaatgatactc 36350464  T
Q  612 tccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36350465 tcccctcgtcgagcgttgaacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 36350517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 1695437 - 1694859
Alignment:
Q  13 ataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgttt 112  Q
    ||||||| |||||||| |||  | ||||||| |||||||   ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1695437 ataccattattcaagatgcttgttgaatgctggattcctaccgtttaacaagtttgaattacccaatttagaggaagacaattgttgcagttggacgttt 1695338  T
Q  113 gtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttcc 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||  |||| || ||||| ||  |||||||||||||||||  |||||    
T  1695337 gtaccttccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgcatagcagcatgactcgaacgttcgaccgacattcccatagttcc 1695238  T
Q  212 attcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaa 311  Q
    ||||| || |||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1695237 attcaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtccattcattgacacttcaataccttcatttaa 1695138  T
Q  312 atcgg-cctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaa 410  Q
    | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| | | | |||||||| ||||||||||||||| |||||     
T  1695137 accaaacctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgggaatgccgatcgaacattggtgtcatgccgtttggaaagtttgaattacccaattcag 1695038  T
Q  411 aggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcag 510  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1695037 aggaagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattcggtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcaa 1694938  T
Q  511 caacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaat 589  Q
    |||| |||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  1694937 caacgtcacccgcatatcgttccagtgaaacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgttgttcgttaat 1694859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 9 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 11347358 - 11346704
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||| ||  ||||||| |||||||| ||||| ||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  11347358 ttgaatactattgttcaagatgctcatcgcatgctggattcctgccgtttaacaagtttgaattgccccattcagaggaagacaatttttgcagttggac 11347259  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaat-tttcgaccgacattcccaat 206  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||||| ||||| |   ||||  |||||||||   ||    
T  11347258 gtttgtacctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaatttaaacctgtcaaacaacaggactcaagcatttcacccgacattc---at 11347162  T
Q  207 gtt--ccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacctt 304  Q
    |||  || || | || |||||||| |||||||    |  ||| |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  11347161 gttttcctttgaaaagattaaatttttgttaggcgtgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aatacctt 11347063  T
Q  305 catttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaa-tattggagacctcccgtttggcaagtttgaatt-acc 402  Q
    ||| |||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||   ||||| ||  |||| |  | ||| |||   |||||||| ||||||||| | |    
T  11347062 catctaaaccagcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgctcgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatc 11346963  T
Q  403 ccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagtt 502  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  | | || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11346962 tcattcaaaggaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagtt 11346866  T
Q  503 gatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtga 602  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||| |||||||    
T  11346865 gatctaagcaacttcactcgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcattaatttcacccaagtga 11346766  T
Q  603 atgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  11346765 atgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaaacgtgttccaccatccttgtg 11346704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 9 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 8538600 - 8537949
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||| | ||||||| ||| |||||||| | || |||||  | | |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||     
T  8538600 ttgaataccagcgttcaagatgcttatcgaatgttggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgcagttggaa 8538501  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaat-tttcgaccgacattcccaat 206  Q
       ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| || ||| ||| | ||||| |   ||||  |||||||||   ||    
T  8538500 ---tgtgcattccaactccaacaattgtcttacctttgaacgagatagattcaaacctgtcaaacaataggactcaagcatttcacccgacattc---at 8538407  T
Q  207 gtt--ccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacctt 304  Q
    |||  || || | || | |||||| ||||||| |  |  ||| |||||||||||||| || |||   |||||||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  8538406 gttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggtgtgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcatttcttgacactt-aatacctt 8538308  T
Q  305 catttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaa-tattggagacctcccgtttggcaagtttgaatt-acc 402  Q
    ||| |||| |  || |||||||||||||| |||| | ||||| ||   ||||| ||  |||| |  | ||| |||   |||||||| ||||||||| | |    
T  8538307 catctaaaccaacccaacaagaatttaatattttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgctcgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatc 8538208  T
Q  403 ccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagtt 502  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  | | || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8538207 tcattcaaaggaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagtt 8538111  T
Q  503 gatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtga 602  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  8538110 gatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtga 8538011  T
Q  603 atgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8538010 atgatactctcccctcgtcgagcgttgaacgtttataccgaacgtgttccaccatccttgtg 8537949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 9 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 30710244 - 30709594
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||||| || || |||||  | | | |||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||| ||     
T  30710244 ttgaataccattgttcaagatgctcatcgaatactggagtcctgccgattagcaagtttgaattgccccatccagggtaagacaattgttgcagttggaa 30710145  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaat-tttcgaccgacattcccaat 206  Q
       ||| | |||||||| |||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||| ||||| |   ||||  ||| |||||   ||    
T  30710144 ---tgtgcattccaactccaacaattatgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactcaagcatttcacccggcattc---at 30710051  T
Q  207 gtt--ccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacctt 304  Q
    |||  || || | || | |||||| |||||||    |  ||| |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  30710050 gttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcgtgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aatacctt 30709952  T
Q  305 catttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaa-tattggagacctcccgtttggcaagtttgaatt-acc 402  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||   ||||| ||  |||| |  | ||| |||   |||||||| ||||||||| | |    
T  30709951 catctaaatcagcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaaaatgaatgccgagcgaaatgctcgagtcctgttgtttggcaggtttgaattgatc 30709852  T
Q  403 ccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagtt 502  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  | | || || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30709851 tcattcaaaggaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttccggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagtt 30709755  T
Q  503 gatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtga 602  Q
    ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30709754 gatctaaccaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcattcgttaattccacccaagtga 30709655  T
Q  603 atgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgt 663  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  30709654 atgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaaacgtgttccaccatccttgt 30709594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 9 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 19401012 - 19400358
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||||||| | || |||| | | | |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||     
T  19401012 ttgaataccatcgttcaagatgcttatcgaatgttggagtcctttcgattaacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgtagttggaa 19400913  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaat-tttcgaccgacattcccaat 206  Q
       ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |   ||||| ||  |||||    |    
T  19400912 ---tgtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgccaaacaacaagactcaagcatttcgcccctcattcatgtt 19400816  T
Q  207 gttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttca 306  Q
     |||| || | || | |||||| |||||||  | |  ||| |||||| |||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  19400815 tttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatgatattcaaatgccaaggaaatgaggttcattccttgacactt-aataccttca 19400717  T
Q  307 tttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatga-gaatgtcggtcgaa-tattggagacctcc-cgtttggcaagtttgaattaccc 403  Q
    | |||| | || ||||||||||||||| |||| | ||||| ||| | |||||| || |||| |  | ||| | |   |||||||||| ||||||||||||    
T  19400716 tctaaaccagcataacaagaatttaatattttcaaaggaa-aatcatgaatgttgggcgaaatgcttgagtcatggtcgtttggcaaatttgaattaccc 19400618  T
Q  404 catt-caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagt 501  Q
    |||| || ||| ||||||||||||||||||||||  ||||  | | || || ||||||||||| | |||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  19400617 catttcagaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatattctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagt 19400521  T
Q  502 tgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtg 601  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  19400520 tgatctcaccaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgtcgttcgttaattccacccaagtg 19400421  T
Q  602 aatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  19400420 aatgacactctcccctcatcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccatccttgtg 19400358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 382 - 664
Target Start/End: Original strand, 7162 - 7441
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaa 481  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  | | || || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7162 gtttgacaaatttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaa 7258  T
Q  482 cttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcat 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  7259 cttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgt 7358  T
Q  582 tcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  7359 tcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaaacgtgttccaccatccttgtg 7441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 12 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 1972011 - 1971360
Alignment:
Q  12 aataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtt 111  Q
    |||||||  |||||||||||| |||||||| | || ||||   | | |||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||| |||| ||        
T  1972011 aataccaatattcaagaggcttatcgaatgttggagtcctcccgattaacaagtttgaattgccccatccagagtatgacaattgttgtagttggaa--- 1971915  T
Q  112 tgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactcca--attttcgaccgacattcccaatgt 208  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||| ||||| |  |||||  |||| |||||    | |    
T  1971914 tgtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacaggactcaagcattttgcaccg-cattcatgtttt 1971816  T
Q  209 tccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatt 308  Q
    ||| || | || | |||||| |||||||  | |  ||| |||||| ||||||| || |||   |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||     
T  1971815 tcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatgatattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttggcactt-aataccttcatc 1971717  T
Q  309 taaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaa-tattggagacctc-ccgtttggcaagtttgaattaccccat 406  Q
    |||| | || |||||||||||||||||||| | ||||| ||   ||| |  || |||| |  | ||| | |  || ||||||||||||||||||||||||    
T  1971716 taaaccagcataacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaaagctgggcgaaatgcttgagtcatggccatttggcaagtttgaattaccccat 1971617  T
Q  407 t-caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttga 504  Q
    | || ||| ||||||||||||||||||||||  ||||  | | || || ||||||| ||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  1971616 ttcagaggcaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccataactaatgatgattttctggcggaatcaagctgttgatgatatcttcagttga 1971520  T
Q  505 tctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaat 604  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  1971519 tctcagcaacgttacccgcatattgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccaccgaagtgaat 1971420  T
Q  605 gatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1971419 gatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaaacgtgttccaccctccttgtg 1971360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 382 - 664
Target Start/End: Original strand, 8576074 - 8576353
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaa 481  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  | | || || |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  8576074 gtttgacaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacaatcttctggcggaatcaaa 8576170  T
Q  482 cttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcat 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |    
T  8576171 cttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccaccggaacatgttgtgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcttcgt 8576270  T
Q  582 tcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  8576271 tcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaaacgtgttccaccatccttgtg 8576353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 34 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 3601965 - 3601336
Alignment:
Q  34 atcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtttgtaccttccaactacaacaat 133  Q
    ||||||||||||| |||||  | | ||||||||||||||  |||||  |||| |||||||||||||||||| || |   || | ||||||||||||||||    
T  3601965 atcgaatgctagagtcctgccgattaacaagtttgaattgtcccatctagagtaagacaattgttgcagttggaag---gtgcattccaactacaacaat 3601869  T
Q  134 tgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactcca--attttcgaccgacattcccaatgttccattcagaatattaaattct 230  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||| ||| | ||||| |  |||||   ||| |||||    | |||| || | || | |||||| |    
T  3601868 tgtcttacctttgaatggggtaaattcaaatttgccaaacaatatgactcaagcattttgccccg-cattcatgtttttcctttgaaaagaataaatttt 3601770  T
Q  231 tgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaattt 330  Q
    | ||||  | |  ||| |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | || || |||||||||    
T  3601769 tattaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aataccttcatctaaaccagcatagcaagaattt 3601671  T
Q  331 aatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaa-tattggagacctc-ccgtttggcaagtttgaattaccccatt-caaagg-aagacaattgttg 426  Q
    |||||||| | ||||| ||   ||| |  || |||| | || ||| | |  || ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  3601670 aatcttttcaaaggaaaaacatgaacgctgggcgaaatgtttgagtcatggccatttggcaagtttgaattaccccatttcagaggtaagacaattgttg 3601571  T
Q  427 tagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcata 526  Q
    ||||||||| |  | || | ||  || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3601570 tagttggaatgcacctt-actc--taactaatgacgatcttctgacggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcata 3601474  T
Q  527 tcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcg 626  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3601473 tcgaaacactggaacatgttgtgctcttaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcg 3601374  T
Q  627 ttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  3601373 ttggacgtttataccgaatatgttctaccctccttgtg 3601336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 417 - 664
Target Start/End: Original strand, 6793351 - 6793598
Alignment:
Q  417 acaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacat 516  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  6793351 acaattgttgtagctggaaggtgcattcattcagtacctaatgacgatcttctggctgaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacct 6793450  T
Q  517 cacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctcccc 616  Q
    || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  6793451 catccgcatatcgattcactagaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgtcgttcgttaattccactcaagtgaatgatactcactcc 6793550  T
Q  617 ttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    | |||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  6793551 tcgtcgagcgttaggcgtttataccgaatgtgttccatcctccttgtg 6793598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 382 - 664
Target Start/End: Original strand, 19036607 - 19036886
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaa 481  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||  | | || || |||||||||||||  |||||||||||||    
T  19036607 gtttgacaagtttgaattacctcattcaaaggaatacaaatgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaa 19036703  T
Q  482 cttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcat 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |    
T  19036704 cttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgt 19036803  T
Q  582 tcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  19036804 tcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagtgttggacgtttataccaaatgtgttccaccatccttgtg 19036886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 382 - 664
Target Start/End: Original strand, 27661310 - 27661589
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaa 481  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  | | || || |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  27661310 gtttgacaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacaatcttctggcggaatcaaa 27661406  T
Q  482 cttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcat 581  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |    
T  27661407 cttttgatgatatctttagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgt 27661506  T
Q  582 tcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  27661507 tcgttaattccacccaagtaaatgatactctcccctcgtcgagcaatggaagtttatactaaacgtgttccaccatccttgtg 27661589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 382 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 28881265 - 28880986
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaa 481  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||  | | || || |||||||||||||  |||||||||||||    
T  28881265 gtttgacaagtttgaattaccccattcaaagaaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaa 28881169  T
Q  482 cttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcat 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |    
T  28881168 cttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgt 28881069  T
Q  582 tcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || || ||||||| ||||||||    
T  28881068 tcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttgtaccaaatgttttccaccatccttgtg 28880986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 272 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 38854542 - 38854153
Alignment:
Q  272 aatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaa-tatt 370  Q
    |||||||| |||||||| |||| | ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||   ||||| ||  |||| |  |    
T  38854542 aatgaggttcattccttcacacct-aataccttcatctaaaccagcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgct 38854444  T
Q  371 ggagacctcccgtttggcaagtttgaatt-accccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctact 469  Q
     ||| | |   |||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||  | || | || ||||||||| ||| ||    
T  38854443 cgagtcatgttgtttggcaggtttgaattgatctcattcaaaggaagacaattgttgtggttggaa--tgca--ccttacctaactaatgacggtcttct 38854348  T
Q  470 ggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtca 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |    
T  38854347 ggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaaccaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgatgtgctcccaaaacatggtcgtga 38854248  T
Q  570 tgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
     ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  38854247 cgttttcgtcgttcgttaattccacccaattgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaaacgtgttccaccatccttgtg 38854153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 388 - 664
Target Start/End: Original strand, 541574 - 541847
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttg 487  Q
    |||||||||||| |||||| || || ||||||||||||| ||||||||  ||||  | | || || ||||||||||||| |||||| ||||||  | |||    
T  541574 caagtttgaattgccccatccatagtaagacaattgttgcagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcgaaatcaagttgttg 541670  T
Q  488 atgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgtta 587  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  541671 atgatatctccagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgatgtgctcccaaaacatgctcgtcccgttttcgtcgttcgtta 541770  T
Q  588 attccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  541771 attccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaaggtgttccaccctccttgtg 541847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 327
Target Start/End: Original strand, 6793035 - 6793351
Alignment:
Q  12 aataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtt 111  Q
    |||||||  |||||||| ||| |||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6793035 aataccagtattcaagatgcttatcgaatgctggattcctgccgtttaacaagtttgaattatctcattcaaaggaagacaattgttgcagttggacgtt 6793134  T
Q  112 tgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatga-gtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  | || |||||  |||||||| ||||||||  ||||    
T  6793135 tgtaccttccaactacaacaattgtgttacctttgaatgaggtaaattcaaacttaccaagcagtaggattccaaggttcgaccggcattcccatagttc 6793234  T
Q  211 cattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcattta 310  Q
     ||||| || ||||||||||| |||| || || ||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6793235 aattcaaaagattaaattctttttaggtttggtttaaatgacagtattcaactgtcaaaagaataaggtccattcattgacacttcaataccttcattta 6793334  T
Q  311 aatcggcctaacaagaa 327  Q
    || ||||||||||||||    
T  6793335 aaccggcctaacaagaa 6793351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 388 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 11028045 - 11027772
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttg 487  Q
    |||||||||||| |||||| ||  | |||||||||||||| |||||||  ||||  | | || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  11028045 caagtttgaattgccccatccagggtaagacaattgttgtggttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaactttcg 11027949  T
Q  488 atgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgtta 587  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||    
T  11027948 atgatatcttcagttgatctaaccaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatggtcgtgacgttttcgtcgttcgtta 11027849  T
Q  588 attccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  11027848 attccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaaacgtgttccaccatccttgtg 11027772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 451 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 33370862 - 33370649
Alignment:
Q  451 tacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 550  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33370862 tacctaatcatgatcttctggcggaatcagactgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 33370763  T
Q  551 tcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgtt 650  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  33370762 tcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactaaatgatattctcccctcgtcgagcgttgaacgtttatatcgaacgtatt 33370663  T
Q  651 ccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||||    
T  33370662 ccaccctccttgtg 33370649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 120 - 664
Target Start/End: Original strand, 17366398 - 17366947
Alignment:
Q  120 ccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcaga 218  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| || || ||   ||| |   |||  |||||||| | | ||||||||||| |    
T  17366398 ccaactacaacaattatcttacctctgaatgaggtaaattcaaacttgctaaacatcagctctcaagcattcacccgacatttctattgttccattcaaa 17366497  T
Q  219 atattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcc 318  Q
    | |||||||||||| ||| || || |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||     
T  17366498 acattaaattcttgctaggtttggtttaaataatggtattcaagtgtctaaagaatgaggtgcattccttgacaattcaataccttcatctaaaccagct 17366597  T
Q  319 taacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagac 418  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||  ||||  | | || || |||||||         ||||||  ||| |||||||||||    
T  17366598 taacaagaatttaatcttttgaaaggaacaatagaaatgtcgggtgaatgcttgggaactgccgtttg---------aattactgcatccaaaggaagac 17366688  T
Q  419 aattgttgtagttggaaggtgcatt--------------cattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttga 504  Q
    ||||||| |||||||||||||||||              |  ||| || ||||| ||||| | ||||| |||||| ||| ||||| ||||||| ||||||    
T  17366689 aattgttatagttggaaggtgcatttccctacctaatcacgatccttaactaatcacgatattctggcagaatcagactcttgataatatctttagttga 17366788  T
Q  505 tctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaat 604  Q
    ||||| ||||   ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||| |||||||||||||| ||| | |||    
T  17366789 tctcaacaacggtacccgcatatcaatccactagaacatgttgtgctcccaaaacatgtttgtcacattttcgtcgttcgttaattccacccaactaaat 17366888  T
Q  605 gatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||| ||| ||||  ||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  17366889 gatattcttccctcatcgagggttggacgtttatatcgaac-tattccaccctccttgtg 17366947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 454 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 40009733 - 40009525
Alignment:
Q  454 ctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 553  Q
    ||||||||||||| || | |||||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40009733 ctaatgacgatcttcttgtggaatcaagctgttgatgatgtcttcagttgatctcaacaacgttacccacatatcgatccactgtaacatgttgtgctcc 40009634  T
Q  554 caaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttcca 653  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40009633 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattcca 40009534  T
Q  654 ccctccttg 662  Q
    |||||||||    
T  40009533 ccctccttg 40009525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 295
Target Start/End: Original strand, 34683485 - 34683769
Alignment:
Q  13 ataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgttt 112  Q
    ||||||| |||| ||| | ||||| |||| | |||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||    
T  34683485 ataccattattctagatgatcatcaaatgttggatttctgccgtttaacaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgcagttgaacgttt 34683584  T
Q  113 gtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag--taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttc 210  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| | |||  | |||||||||||||     
T  34683585 gtacctcccaactacaccaattgtgttacctttgaatggggataaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatatacgaatggcattcccaatgttt 34683684  T
Q  211 cattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacactt 295  Q
    |||||| || |||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  34683685 cattcaaaagattaaattcttgttaagctgagattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaataaggtacattccttgacactt 34683769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 114 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 33371500 - 33371169
Alignment:
Q  114 taccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttcca 212  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||| | ||| || || |||||||||||  |||| | |||||| | | |||||||    
T  33371500 taccttccaactacaacaattattttacctctgaatgaggtaaattcaagcttgctaaacaccaagactccaacattcgtctgacatttctattgttcca 33371401  T
Q  213 ttcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaa 312  Q
    |||| || ||||||||| ||||||  | || |||||| ||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33371400 ttcaaaagattaaattcatgttaggcttggtttaaataatggtattcaagtgtcaaaataatgagttgcattcattgacacttcaataccttcatttaaa 33371301  T
Q  313 tcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaag 412  Q
      ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||   |||||| | ||||| || ||| | | ||||||  |||||||||||||||  ||| ||||    
T  33371300 ctggcctaacatgaatttaatcttttgaaaggaacaatagaaatgtcaggcgaatgtttgagtcgtgccgtttaacaagtttgaattacctaatttaaag 33371201  T
Q  413 gaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33371200 gaagacaattgttgtagttgaaaggtgcattc 33371169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 208 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 12743137 - 12742818
Alignment:
Q  208 ttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcat 307  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  12743137 ttccattcaaaagattaaattcttgttagacttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgacgtgcattccttgacacttcaataccttcat 12743038  T
Q  308 ttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaa-tgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattacccca- 405  Q
     |||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||  |||   | | || || ||||||  ||||||||||||||||||     
T  12743037 ctaaaccagcctaacaagaatttaatcttttgaatggaacaat-agaactgtcgggtgaaagcttgggaactgccgtttaacaagtttgaattaccccat 12742939  T
Q  406 ttcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc--------at-----tccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgat 492  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||        ||     ||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  12742938 ttcgtagtaagacaattgttgtagttggaagatgcattccctacctaatcacgatccctacctaatcacgatcttctggcggaatcagactgttgatgat 12742839  T
Q  493 atcttcagttgatctcagcaa 513  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  12742838 atcttcagttgatctcagcaa 12742818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 496 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 3169766 - 3169605
Alignment:
Q  496 ttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccact 595  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||     
T  3169766 ttcagctgatctcagcaacgtcacccgcataccgatccactggaacatgttgtgctcttaaaatatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacc 3169667  T
Q  596 caagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctc 658  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3169666 caagtgaatgatactct-ccctcgtcgagcgttagacgtttataccgaacgtgttccaccctc 3169605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 119 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 25498547 - 25498375
Alignment:
Q  119 tccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcag 217  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  25498547 tccaactgcaacaattgtctt-cctttgaatgaggtaaattcaaacttgcaaagcagcaatactccaatattcgaccgacattcccaatgttccattcaa 25498449  T
Q  218 aatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgac 291  Q
    || ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25498448 aagattaaattcttgttaggctgagattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccatttcttgac 25498375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 485 - 657
Target Start/End: Original strand, 35927470 - 35927642
Alignment:
Q  485 ttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcg 584  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  35927470 ttgatgatatctttagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaagatgatgtgctcccaaaacatgttcgtcacgttttcgtcgttcg 35927569  T
Q  585 ttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccct 657  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  35927570 ttaattccacccaactaaatgatactcttccctcgtcgagcattggacgtttataacgaacgtgttacaccct 35927642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 120 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 10398330 - 10398006
Alignment:
Q  120 ccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcaga 218  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||| ||| || |||||   ||| |   |||  |||||||| | | ||||||||||| |    
T  10398330 ccaactacaacaattgtcttacccctgaatggggtaaattcaaacttgctaaacaacatctctcaagcattcacccgacatttctattgttccattcaaa 10398231  T
Q  219 atattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcc 318  Q
    | ||||||||||||||||  | || |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |   |    
T  10398230 acattaaattcttgttaggcttggtttaaataatggcattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcattgacacttcaataccttcatctaaaccaatc 10398131  T
Q  319 taacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagac 418  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||   ||||||||  |||| |  | || || | ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10398130 taacaagaatttaatcttttgaaaggtacaatagaaatgtcgggtgaatgtctgggaactgctgtttaacaagtttgaattaccccatccaaaggaagac 10398031  T
Q  419 aattgttgtagttggaaggtgcatt 443  Q
    ||||  |||||||||||||||||||    
T  10398030 aatttgtgtagttggaaggtgcatt 10398006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 208 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 12805955 - 12805636
Alignment:
Q  208 ttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcat 307  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  12805955 ttccattcaaaagattaaattcttgttagacttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgacgtgcattccttgacacttcaataccttcat 12805856  T
Q  308 ttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaa-tgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattacccca- 405  Q
     |||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||  |||   | | || || ||||||  ||||||||||||||||||     
T  12805855 ctaaaccagcctaacaagaatttaatcttttgaatggaacaat-agaactgtcgggtgaaagcttgggaactgccgtttaacaagtttgaattaccccat 12805757  T
Q  406 ttcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc--------at-----tccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgat 492  Q
    |||  || ||||||||||||| ||||||||| |||||||        ||     ||| |||||||| ||||||| |||||  ||||| ||| ||||||||    
T  12805756 ttcgtagtaagacaattgttgcagttggaagatgcattccctacctaatcacgatccctacctaatcacgatcttctggcataatcagactgttgatgat 12805657  T
Q  493 atcttcagttgatctcagcaa 513  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  12805656 atcttcagttgatctcagcaa 12805636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 107 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 7082774 - 7082336
Alignment:
Q  107 acgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaat-tttcgaccgacattccca 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||| || ||  ||||| ||||| |   ||||  |||||||||       
T  7082774 acgtttgtaccttccaactacaaaaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgtcatacaacatgactcaagcatttcacccgacattc--- 7082678  T
Q  205 atgtt--ccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||  || || | || | |||||| |||||||  | |  ||| |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  7082677 atgttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aatacc 7082579  T
Q  303 ttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaa-tattggagacctc-ccgtttggcaagtttgaatta 400  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||   ||||| ||  |||| |  | |||  ||  |||||||||||||||||||||    
T  7082578 ttcatctaaatcagcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagttctatccgtttggcaagtttgaatta 7082479  T
Q  401 ccccatt-caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttc 498  Q
    |||| || || ||| |||| |||||||||||||||||  ||||  | | || || ||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  7082478 ccccttttcagaggtaagagaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccataactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttc 7082382  T
Q  499 agttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatg 544  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7082381 agttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatg 7082336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 20196726 - 20196551
Alignment:
Q  12 aataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtt 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||| ||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20196726 aataccagcaatcaagaggctcatcaaatgctggattcatgccgtttaacaaatttgaattaccccattcagagaaagacaattgttgcagttagacgtt 20196627  T
Q  112 tgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaat 186  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  20196626 tgtaccttccaactacaaaaaccgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaat 20196551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 59 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 33371227 - 33370938
Alignment:
Q  59 aacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaat 157  Q
    |||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||| ||||  | |   || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  33371227 aacaagtttgaattacctaatttaaaggaagacaattgttgtagttgaaag---gtgcattccaactacaacaattatcttacctttgaatgaggtaaat 33371131  T
Q  158 tcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtat 257  Q
    |||||| || ||| |||||   ||| |   |||   ||  | |   | |||| |||||| || |||||||| |||||||  | || |||||||||| |||    
T  33371130 tcaaacttgtcaaacaacagctctcaagcattcactcggaagttttattgtttcattcaaaagattaaattattgttagccttggtttaaatgatgatat 33371031  T
Q  258 tcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaat 350  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  33371030 tcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattctttgacactttaataccttcatttaaaccagcctaacaagaatttaatcttttgaaatgaacaat 33370938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 491 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 2599387 - 2599214
Alignment:
Q  491 atatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaatt 590  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| | || | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||  |||| |||||    
T  2599387 atatcatcagttaatctcagcaacgttacacacatatcgatccacggtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcttcatgtcgccgttgttcgctaatt 2599288  T
Q  591 ccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||| ||| ||||||||| |||| | | |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2599287 ccacccaactgaatgatattctctcatcgtcgaatgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtg 2599214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 115 - 438
Target Start/End: Original strand, 35565492 - 35565816
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    ||||| || ||||||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| | ||| |||| |||| |||||||| |||||||| ||||||  |    
T  35565492 acctttcagctacaacaattatctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgacatgacttcaatgttcgaccggcattcccattgttcctgt 35565590  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt-gacacttcaataccttcatttaaat 313  Q
    || || |||||||||||||||||  ||  |||||||| |||||| || ||||||  |||||     ||||| || ||||||| |||||  |||||||||     
T  35565591 caaaagattaaattcttgttagaccggt-ttaaatgaaggtattgaagtgtcaat-gaatggacctcattcttttgacacttgaatactgtcatttaaac 35565688  T
Q  314 cgg-cctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaa 411  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||| ||||| | ||||| ||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35565689 caaacctaacaagaatttaatcttttgaatggaactatgggaatgtcgatcgaacaatggagtcctgctgcttggcaagtttgaatttaccccattcaaa 35565788  T
Q  412 gg-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    || || |||||| |||||||||||||||    
T  35565789 ggtaacacaattattgtagttggaaggt 35565816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 115 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 1400288 - 1399967
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |  ||||||||| |||||| | | | | ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |    
T  1400288 accttccagctacaacaattgtctt-ccttttaatggggtaattcaaacttgccaaacgataggtctctaatattcgaccgacattcccattgttcctgt 1400190  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt-gacacttcaataccttcatttaaa- 312  Q
    || |  ||||||||||||||||  |||  |||||||| |||||| || ||||||  ||||||    ||||| || |||| || |||||| ||||||||      
T  1400189 caaaggattaaattcttgttaggctggt-ttaaatgaaggtattgaagtgtcaag-gaatgaacctcattcttttgacatttgaataccatcatttaatc 1400092  T
Q  313 tcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaa 411  Q
    || |||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||   ||  | ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  1400091 tcagcctaacaagaatttaatcttttgaatggaacattgggaatgtcggtcgaatattggag---tcatgcttgacaagtttgaatttaccccattcaaa 1399995  T
Q  412 g-gaagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    |  || ||||||||||||||||| ||||    
T  1399994 gttaacacaattgttgtagttgggaggt 1399967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 3459439 - 3458940
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    ||||||||||   ||||||||||| |||||||| | || |||||| | | |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||     
T  3459439 ttgaataccagtgttcaagaggcttatcgaatgttggagtcctgtcgattaacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgtagttgga- 3459341  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatga-gtaaattcaaacatgccaagcaacaagactcca-attttcgaccgacattcccaat 206  Q
       ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||||| ||||| |   ||||| ||  | |||    |    
T  3459340 --atgtgcattctaactacaacaattgtcttacctttgaatgaggtaaatttaaactggccaaacaacatgactcaagcatttcgccccgcgttcatgtt 3459243  T
Q  207 gttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttca 306  Q
     || | || | |||| |||||| |||||||  | |  ||| |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  3459242 ttttctttgaaaataataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattcattgacactt-aataccttca 3459144  T
Q  307 tttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatg-tcggtcgaatattggagacct-cccgtttggcaagtttgaattacccc 404  Q
    | |||| | || |||||||||||||||||||| | ||||| |||  ||| | | ||   |||| | ||| | |   |||||||||||||||||||||| |    
T  3459143 tctaaaccagcataacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaatatgaacgctgggcttaatacttgagtcatggtcgtttggcaagtttgaattacctc 3459044  T
Q  405 a-ttcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagtt 502  Q
    | |||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||  | | || || ||||||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||| ||    
T  3459043 atttcagaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgca-ccttaccctaactaatgacgatcttctagcggaatcaagctgttgatgatatcttcaatt 3458947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 25498730 - 25498631
Alignment:
Q  12 aataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtt 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25498730 aataccatcattcaagatgctcatcgaatgttggattcctgccgtttaacaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgcagttggacgtt 25498631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 155 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 36350272 - 36349987
Alignment:
Q  155 aattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatgg 254  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||| ||| |||||| || |||||   ||| || ||||||||||||||||   ||  |||||||| ||    
T  36350272 aattcaaacttgccaaacaacatgactccaatgttctaccaacattctcattgttcttgtcaaaagattaaattcttgttaggccggt-ttaaatgaagg 36350174  T
Q  255 tattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt-gacacttcaataccttcatttaaatcgg-cctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatga 352  Q
    |||| || ||||||  |||||     ||||| || ||||||| |||||| ||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||     
T  36350173 tattgaagtgtcaat-gaatggacctcattcttttgacacttgaataccatcatttaaaccaaacctaacaagaatttaatcttttgaatggaactatgg 36350075  T
Q  353 gaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    |||||||||||||| ||||||| | | | | |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  36350074 gaatgtcggtcgaacattggagtcatgctgcttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttgtagttggaaggt 36349987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 382 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 22283845 - 22283704
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaa 481  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  | |  | || |||| |||||| |  ||| |||||||||    
T  22283845 gtttgacaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaa--tgca-ccttatcctaactaaggacgattttatggtggaatcaaa 22283749  T
Q  482 cttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcata 526  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  22283748 cttttgatgatatcttaagttgatctaagcaacttcacccgcata 22283704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 554 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 3458941 - 3458833
Alignment:
Q  554 caaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttcca 653  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  3458941 caaaacatactcgtcacgttttcgtcgttctttaactcaacccaagtgaatgatactctcccctcgtcaagcgttggacatttataccgaacgtattcca 3458842  T
Q  654 ccctccttg 662  Q
    |||||||||    
T  3458841 ccctccttg 3458833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 208 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 12806291 - 12806168
Alignment:
Q  208 ttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcat 307  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12806291 ttccattctaaagattaaattcttgttaggcttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaca-gaatgaggtgcattccttgacacttcaataccttcat 12806193  T
Q  308 ttaaatcggcctaacaagaatttaa 332  Q
     |||| | |||||||||||||||||    
T  12806192 ctaaaccagcctaacaagaatttaa 12806168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 1171838 - 1171743
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1171838 ttgaataccatcattcaagatgctcatcgaatgctggagttctgccgtttaacaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgcagtt 1171743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 115 - 438
Target Start/End: Original strand, 1695010 - 1695335
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||  |  ||||||||| | |||| |  || ||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||  |    
T  1695010 accttccagctacaacaattgtctt-cctctgaattgggtaattcaaactttccaaacggcatgacaccaatgttcgatcggcattcccattgttcctgt 1695108  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc-cttgacacttcaataccttcatttaaat 313  Q
    || || |||||||||||||||| || || |||||||| |||||| || |||| || |||||     |||||  ||||||||| |||||| |||||||||     
T  1695109 caaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgaaggtattgaagtgtc-aatgaatggacctcattcttttgacacttgaataccgtcatttaaac 1695207  T
Q  314 c-ggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaa 411  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||  || ||| | | | | |  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  1695208 caaacctaacaagaatttaatcttttgaatggaactatgggaatgtcggtcgaacgttcgagtcatgctgctatgcaagtttgaatttaccccattcaaa 1695307  T
Q  412 gg-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    || || ||||||||||||||||||||||    
T  1695308 ggtaacacaattgttgtagttggaaggt 1695335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 581 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 1693459 - 1693382
Alignment:
Q  581 ttcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctc 658  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1693459 ttcgttaattccacccaagtgagtgatactctcctctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctc 1693382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 287 - 434
Target Start/End: Original strand, 25498398 - 25498547
Alignment:
Q  287 ttgacacttcaataccttcatttaaa-tcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgttt 385  Q
    |||||| || |||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||   | | | ||    
T  25498398 ttgacatttgaataccatcatttaatctcagcctaacaagaatttaatcttttgaatggaacattgggaatgtcggtcgaatattggagtattgctgctt 25498497  T
Q  386 ggcaagtttgaa-ttaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttgga 434  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25498498 tgcaagtttgaatttacctcattcaaaggaagacaattgttgcagttgga 25498547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 370 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 7082889 - 7082793
Alignment:
Q  370 tggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatct 466  Q
    ||||| ||| ||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  7082889 tggagtcctgccgtttaacaagtttgaattaccacgttcaaaggaagacaattgttgcagttggaaggtgcattcattctgtacctactgacgatct 7082793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 40012265 - 40012094
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| | || |||||    | |||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||| |||| ||     
T  40012265 ttgaataccagcattcaagaggcttatcgaatgttggagtcctgccaattaacaagtttgaattgccccatccaaagtaagacaattgttgtagttggaa 40012166  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
       ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  40012165 ---tgtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacaggactc 40012094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 7082923 - 7082828
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  ||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  7082923 ttgaataccatcattcaagatgctcatcgaatgctggagtcctgccgtttaacaagtttgaattaccacgttcaaaggaagacaattgttgcagtt 7082828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 388 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 1171786 - 1171725
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattcc 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1171786 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgcagttggaaggtgcattcattcc 1171725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 182
Target Start/End: Original strand, 6789 - 6960
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| || |||||  | | |||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||| ||     
T  6789 ttgaataccattgttcaagatgctcatcgaatgctggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccaaagtaagacaattgttgcagttgga- 6887  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
       ||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  6888 --atgtgcattccaactgcaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactc 6960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 182
Target Start/End: Original strand, 8575701 - 8575872
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||||| || || |||||  | | |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||     
T  8575701 ttgaataccattgttcaagatgctcatcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgcagttgga- 8575799  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
       ||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  8575800 --atgtgcattccaaccacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactc 8575872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 244 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 25498783 - 25498719
Alignment:
Q  244 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  25498783 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttcaataccatcatt 25498719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 414 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 18920975 - 18920879
Alignment:
Q  414 aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaa 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    | |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  18920975 aagacaattgttgtagttggaaggtgcattc----cctacctaatcacgatcttctggcggaatcaaactgttgagaatatcttcagttgatctctgcaa 18920880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 115 - 438
Target Start/End: Original strand, 18308481 - 18308804
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| |   | | ||||||| |||||||||||||| || ||||||  |    
T  18308481 accttccacctacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgggaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctgt 18308579  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt-gacacttcaataccttcatttaaat 313  Q
    || || |||||||||||||||   |||  |||||||| |||||| || | ||||  |||||     ||||| || |||| || |||||  ||||||||      
T  18308580 caaaagattaaattcttgttaagctggt-ttaaatgaaggtattgaagtttcaag-gaatggacctcattcttttgacatttgaatactatcatttaatc 18308677  T
Q  314 cg-gcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaag 412  Q
    |  |||||||||||||||||| ||||||  | || | || |||||||||||||||||||||| | |   | |||||| |||||||||  |||||||||||    
T  18308678 ccagcctaacaagaatttaatattttgaatgaaaaattgggaatgtcggtcgaatattggagtcttgttgcttggcatgtttgaatttacccattcaaag 18308777  T
Q  413 g-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  18308778 gtaagacaattgttgtagttggaaggt 18308804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 208 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 12743470 - 12743349
Alignment:
Q  208 ttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcat 307  Q
    ||||||||| || ||||||||||||  ||  | || |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  12743470 ttccattcaaaagattaaattcttg--aggcttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaca-gaatgaggtgcattccttgacacttcaatacctccat 12743374  T
Q  308 ttaaatcggcctaacaagaatttaa 332  Q
     |||| | |||||||||||||||||    
T  12743373 ctaaaccagcctaacaagaatttaa 12743349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 406 - 514
Target Start/End: Original strand, 17195316 - 17195421
Alignment:
Q  406 ttcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttga 504  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    | |||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||    
T  17195316 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaagatgcattc----cctacctaatcacgatcttctggcggaatcaaattgttgataatatctttagttga 17195411  T
Q  505 tctcagcaac 514  Q
    ||||||||||    
T  17195412 tctcagcaac 17195421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 616 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 7082335 - 7082287
Alignment:
Q  616 cttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7082335 cttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 7082287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 244 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 35565972 - 35565908
Alignment:
Q  244 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  35565972 ttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaataccatcatt 35565908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Original strand, 6792985 - 6793040
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6792985 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttcaatacc 6793040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 1399828 - 1399731
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaa-ttaccccattcagagg-aagacaattgttgcagtt 104  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  1399828 ttgaatatcatcattcaagatgctcatcgcatgctagagtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccattcaggggtaagataattgttgcagtt 1399731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 4724060 - 4723742
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    ||||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |  ||||||||| |||||| |  || ||||||||| |||||||||||||| || ||||||  |    
T  4724060 accttgcagctacaacaattgtctt-cctctgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggactccaatattcgaccgacattctcattgttcctgt 4723962  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc-cttgacacttcaataccttcatttaa-a 312  Q
    || || ||||||||||||||||     | |||||||| |||||| || |||| || |||||     |||||  |||||| || |||||| | ||||||      
T  4723961 caaaagattaaattcttgttag-gccagtttaaatgaaggtattgaagtgtc-aaggaatggacctcattcttttgacatttgaataccattatttaatc 4723864  T
Q  313 tcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaa 411  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||| | |||||| ||||||||| | | | | |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  4723863 ccaacctaacaagaatttaatcttttgaatggaacattgggaacgccggtcgtatattggagtcttactgcttggcaagtttgaatttactccattcaaa 4723764  T
Q  412 gg-aagacaattgttgtagttg 432  Q
    || || ||||||||||||||||    
T  4723763 ggtaacacaattgttgtagttg 4723742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 244 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 1171888 - 1171824
Alignment:
Q  244 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatt 308  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  1171888 ttaaatgacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtacattccttgacacttgaataccatcatt 1171824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 182
Target Start/End: Original strand, 19036234 - 19036405
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||    |   |||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||| ||     
T  19036234 ttgaataccattattcaagatgctcatcgaatactggagtcctgcaaattggcaagtttgaattgccccatccagggtaagacaattgttgcagttggaa 19036333  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
       ||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  19036334 ---tgtgcattccaaccacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactc 19036405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 362 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 25498707 - 25498635
Alignment:
Q  362 tcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttgga 434  Q
    |||||| |||||  ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25498707 tcgaatgttggattcctgccgtttaacaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgcagttgga 25498635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 1972061 - 1972006
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1972061 aatgatggtatttaactgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttcaatacc 1972006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 19401059 - 19401004
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  19401059 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 19401004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 20196776 - 20196721
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  20196776 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtacattccttgacacttaaatacc 20196721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 414 - 558
Target Start/End: Original strand, 25360549 - 25360690
Alignment:
Q  414 aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagc-a 512  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||  |||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||  | ||||||||  ||||||||| |    
T  25360549 aagacaattgttgtagttgaaaggtgcattc--tc--tacctaatcacgatcttctgacggaatcaaactgttgaaaacatcttcaggcgatctcagcaa 25360644  T
Q  513 acatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaa 558  Q
    || | ||   |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  25360645 acgtgacaaacatatcgatccacgagaacatgttgtgctgccaaaa 25360690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 570 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 12742804 - 12742710
Alignment:
Q  570 tgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||  || ||||||||| | || | | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  12742804 tgttatcgtcgttcgttaattccacctaactgaatgatattatctcatcgttgagcgttggacgtttataccgaacgtattccacccttcttgtg 12742710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 22283862 - 22283796
Alignment:
Q  38 aatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22283862 aatgctcgagtcctgttgtttgacaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagtt 22283796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 104
Target Start/End: Original strand, 27661293 - 27661359
Alignment:
Q  38 aatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  27661293 aatgctcgagtcctgttgtttgacaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagtt 27661359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Original strand, 1695474 - 1695571
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaa-ttaccccattcagagg-aagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | || ||||| |||| | |||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  1695474 ttgaataccatcattcaagatgctcatcgcatgatggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccatttagaggtaagaaaattgttgcagtt 1695571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 3170076 - 3170011
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  3170076 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactc 3170011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 22284165 - 22284065
Alignment:
Q  61 caagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattc 159  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||    ||| | || |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  22284165 caagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgcagttgga---atgtgcatttcaaccacaacaattgtgttacctttgaatgagataaattc 22284069  T
Q  160 aaac 163  Q
    ||||    
T  22284068 aaac 22284065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 1695488 - 1695440
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacactt 295  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1695488 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacactt 1695440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 244 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 7082973 - 7082909
Alignment:
Q  244 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatt 308  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  7082973 ttaaatgacggtattcaagtgtctaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaataccatcatt 7082909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 182
Target Start/End: Original strand, 27660937 - 27661108
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||||  || |||| | ||||||||| || || |||||  | | |||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||| ||     
T  27660937 ttgaataccattgttgaagatgttcatcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagggtaagacaattgttgcagttgga- 27661035  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
       ||| | |||||||  |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  27661036 --atgtgcattccaaccgcaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactc 27661108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 388 - 432
Target Start/End: Original strand, 34683533 - 34683577
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttg 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34683533 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgcagttg 34683577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 388 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 40012213 - 40012157
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40012213 caagtttgaattgccccatccaaagtaagacaattgttgtagttggaatgtgcattc 40012157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 382 - 435
Target Start/End: Original strand, 1971853 - 1971908
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaa 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1971853 gtttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 1971908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 382 - 435
Target Start/End: Original strand, 3170021 - 3170076
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaa 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3170021 gtttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 3170076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 3459486 - 3459431
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  3459486 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaagtgcattccttgacacttgaatacc 3459431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 6793261 - 6793138
Alignment:
Q  317 cctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-a 414  Q
    ||||| ||||||||||||||||||   |||| ||| ||||| ||||||||  |||||  ||| | | |||| ||||||||| ||||| |||||||||| |    
T  6793261 cctaaaaagaatttaatcttttgaattgaactatgggaatgccggtcgaaccttggaatcctactgcttggtaagtttgaatttacctcattcaaaggta 6793162  T
Q  415 agacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  6793161 acacaattgttgtagttggaaggt 6793138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 250 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 11347402 - 11347351
Alignment:
Q  250 gatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatac 301  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  11347402 gatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatac 11347351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 414 - 514
Target Start/End: Original strand, 36311911 - 36312007
Alignment:
Q  414 aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaa 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||| ||||||| ||||| |||| ||||| ||||  | ||||||||  |||||||||||    
T  36311911 aagacaattgttgtagttggaaggtg----cattccctacctaatcacgatcttctggcagaattaaactattgagaagatcttcaggcgatctcagcaa 36312006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 382 - 435
Target Start/End: Original strand, 40012104 - 40012159
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaa 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40012104 gtttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 40012159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 40012312 - 40012257
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  40012312 aatgacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 40012257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 302
Target Start/End: Original strand, 6747 - 6797
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  6747 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 6797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 302
Target Start/End: Original strand, 8575659 - 8575709
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  8575659 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 8575709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 104
Target Start/End: Original strand, 8576057 - 8576123
Alignment:
Q  38 aatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||| || || |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  8576057 aatgctcgagtcttgttgtttgacaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagtt 8576123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 302
Target Start/End: Original strand, 27660895 - 27660945
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  27660895 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 27660945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 28881282 - 28881216
Alignment:
Q  38 aatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  28881282 aatgctcgagtcctgttgtttgacaagtttgaattaccccattcaaagaaagacaattgttgtagtt 28881216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 362 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 28881611 - 28881529
Alignment:
Q  362 tcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    ||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||  | ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  28881611 tcgaatactggagtcctgccgattggcaagtttgaattgccccatccagggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 28881529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 28881679 - 28881629
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28881679 tggtattcaagtgtcaacagaatgaggtgcattccttgacacttcaatacc 28881629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 38854846 - 38854796
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  38854846 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 38854796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 308
Target Start/End: Original strand, 1399814 - 1399875
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatt 308  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  1399814 aatgatgatattcaagtgtcaaaagaatgtggtgcattccttgacacttgaataccatcatt 1399875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Original strand, 8538175 - 8538239
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  8538175 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggactc 8538239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Original strand, 11346930 - 11346994
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  11346930 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggactc 11346994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 575 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 12805617 - 12805528
Alignment:
Q  575 tcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||| ||||||||||||||  || ||||||||| | || | |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  12805617 tcgtcgttcgttaattccacctaactgaatgatattatctcatcattgagcgttggacgtttataccgaacgtattccacccttcttgtg 12805528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 251 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 18308953 - 18308896
Alignment:
Q  251 atggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatt 308  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18308953 atggtattcaagtgtcaaaagaatgagatgcattccttgacacttgaataccatcatt 18308896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 362 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 22284191 - 22284110
Alignment:
Q  362 tcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcatt 443  Q
    ||||||||||| | ||| | | |||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  22284191 tcgaatattggggtcctgctgattggcaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgcagttggaatgtgcatt 22284110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 252 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 22284259 - 22284210
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatac 301  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  22284259 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatac 22284210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Original strand, 25498766 - 25498863
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaa-ttaccccattcagagg-aagacaattgttgcagtt 104  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||| ||||| || ||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  25498766 ttgaataccatcatttaaaatgctcatcggatgctggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccattcaggggtaagataattgttgcagtt 25498863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 34683448 - 34683351
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaa-ttaccccattc-agaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| || | ||| |||| | |||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  34683448 ttgaataccatcattcaagatgttcatcgcatgctggagtgctgctgtttagcaagtttgaatttaccccattcaagagtaagataattgttgcagtt 34683351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 388 - 444
Target Start/End: Original strand, 6841 - 6897
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  6841 caagtttgaattgccccatccaaagtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 6897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 300
Target Start/End: Original strand, 4723580 - 4723636
Alignment:
Q  244 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaata 300  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  4723580 ttaaatgatggtatttaagcgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttaaata 4723636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 11028141 - 11028089
Alignment:
Q  250 gatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  11028141 gatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattctttgacacttgaatacc 11028089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 295
Target Start/End: Original strand, 34683434 - 34683482
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacactt 295  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  34683434 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaagtgcattccttgacactt 34683482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 34683742 - 34683587
Alignment:
Q  287 ttgacacttcaataccttcatttaaa-tcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgttt 385  Q
    |||||| || |||||| ||||||||  || || ||||||||||||||||||||||  | |||| || ||||| |  ||| ||||||||| ||| | | ||    
T  34683742 ttgacatttgaataccatcatttaatctcagcttaacaagaatttaatcttttgaatgaaacattgggaatgccattcgtatattggagtcctgctgctt 34683643  T
Q  386 ggcaagtttgaatt--accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||    
T  34683642 ggcaagtttgaatttatccccattcaaaggtaacacaattggtgtagttgggaggt 34683587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 382 - 435
Target Start/End: Original strand, 3601829 - 3601884
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaa 435  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3601829 gtttggcaaatttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 3601884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 382 - 435
Target Start/End: Original strand, 19400851 - 19400906
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaa 435  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19400851 gtttggcaagtttgaatttacctcattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 19400906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 61 - 115
Target Start/End: Original strand, 25498500 - 25498555
Alignment:
Q  61 caagtttgaatt-accccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtttgta 115  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25498500 caagtttgaatttacctcattcaaaggaagacaattgttgcagttggacgtttgta 25498555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 92 - 163
Target Start/End: Original strand, 25498608 - 25498678
Alignment:
Q  92 aattgttgcagttagacgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaac 163  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||    
T  25498608 aattgttgcagttggacgtttgtaacgtccaactgcaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaac 25498678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 248 - 295
Target Start/End: Original strand, 36349836 - 36349883
Alignment:
Q  248 atgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacactt 295  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36349836 atgatggtattcaagtatcaaaagaatgaggtgcattccttgacactt 36349883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 104
Target Start/End: Original strand, 7145 - 7211
Alignment:
Q  38 aatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||| || || |||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  7145 aatgctcgagtcatgttgtttgacaaatttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagtt 7211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 388 - 434
Target Start/End: Original strand, 6793084 - 6793130
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttgga 434  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6793084 caagtttgaattatctcattcaaaggaagacaattgttgcagttgga 6793130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 362 - 444
Target Start/End: Original strand, 8575727 - 8575809
Alignment:
Q  362 tcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    ||||||| ||||| ||| ||| ||  |||||||||||| |||||| || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  8575727 tcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 8575809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 414 - 514
Target Start/End: Original strand, 13131044 - 13131140
Alignment:
Q  414 aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaa 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||  || ||||| ||||||| || ||  ||||||| | ||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  13131044 aagacaattgttgtagttggaaggtgcattc--tc--tagctaatcacgatcttctagcaaaatcaaaatgttgagaatatcttcagttgatctctgcaa 13131139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 302
Target Start/End: Original strand, 19036192 - 19036242
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  19036192 tggtattcaagtgtcaacagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 19036242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 30710286 - 30710236
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  30710286 tggtattcaagtgtcaacagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 30710236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 104
Target Start/End: Original strand, 1972050 - 1972143
Alignment:
Q  12 aataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaa-ttaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||| | || ||||| |||| | |||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  1972050 aataccatcattcaagatgctgatcggatgttggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgccccatccagagtaagacaattgttgtagtt 1972143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Original strand, 30709819 - 30709883
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  30709819 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgagatcaattcaaacctgccaaacaacaggactc 30709883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 380 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 40011895 - 40011838
Alignment:
Q  380 ccgtttggcaagtttgaattacccca-ttcaaagg-aagacaattgttgtagttggaa 435  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  40011895 ccgtttgacaagtttgaattaccccatttcagaggtaagacaattgttgtagttggaa 40011838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 8576127 - 8576064
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| || ||| |||||||||||    
T  8576127 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaacaacaagactc 8576064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 384 - 444
Target Start/End: Original strand, 19036282 - 19036342
Alignment:
Q  384 ttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||  | ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19036282 ttggcaagtttgaattgccccatccagggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 19036342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 40012026 - 40011939
Alignment:
Q  250 gatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatctttt 338  Q
    |||||||||||| || |||   ||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||    
T  40012026 gatggtattcaagtgccaacgaaatgatgttcattctttgacactt-aataccttcatctaaaccagcataacaagaatttaatctttt 40011939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 362 - 443
Target Start/End: Original strand, 7082982 - 7083065
Alignment:
Q  362 tcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcatt 443  Q
    ||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||| || |||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  7082982 tcgaatattggagtcctgcagtttagcaagtttgaatttgccccattcaagggtaagataattgttgcagttggaaggtacatt 7083065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 17195347 - 17195316
Alignment:
Q  117 cttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17195347 cttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 17195316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 362 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 38854778 - 38854695
Alignment:
Q  362 tcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    ||||||| ||||| ||| ||| ||  |||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  38854778 tcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccaagggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 38854695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 276 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 3169918 - 3169857
Alignment:
Q  276 aggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatctttt 338  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3169918 aggttcattcattgacactt-aatacattcatctaaatcaacctaacaagaatttaatctttt 3169857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 112 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 3602134 - 3602096
Alignment:
Q  112 tgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatg 150  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  3602134 tgtaccttccaactacaacaattatcttacccttgaatg 3602096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 248 - 338
Target Start/End: Original strand, 8575940 - 8576029
Alignment:
Q  248 atgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatctttt 338  Q
    |||||||||||||| || || |  | |||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||| | || ||||||||||||||| ||||    
T  8575940 atgatggtattcaagtgccacagaattgaggttcaatccttgacactt-aataccttcatctaaaccagcataacaagaatttaatatttt 8576029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 13131068 - 13131034
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaat 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13131068 accttccaactacaacaattgtcttacctctgaat 13131034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 104
Target Start/End: Original strand, 19036590 - 19036656
Alignment:
Q  38 aatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||    
T  19036590 aatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaattacctcattcaaaggaatacaaatgttgtagtt 19036656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 366 - 438
Target Start/End: Original strand, 20196549 - 20196623
Alignment:
Q  366 atattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    ||||||||| ||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||    
T  20196549 atattggagtcctgctgcttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacggtttttgtagttggaaggt 20196623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 362 - 444
Target Start/End: Original strand, 27660963 - 27661045
Alignment:
Q  362 tcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    ||||||| ||||| ||| ||| ||  |||||||||||| |||||| ||  | ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  27660963 tcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 27661045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 248 - 338
Target Start/End: Original strand, 27661176 - 27661265
Alignment:
Q  248 atgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatctttt 338  Q
    |||||||||||||| || || |  | |||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||| | || ||||||||||||||| ||||    
T  27661176 atgatggtattcaagtgccacagaattgaggttcaatccttgacactt-aataccttcatctaaaccagcataacaagaatttaatatttt 27661265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 287 - 438
Target Start/End: Original strand, 33371345 - 33371499
Alignment:
Q  287 ttgacacttcaataccttcatttaaatcg-gcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgttt 385  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||   |||||| | ||||| |||||| | |   ||||    
T  33371345 ttgacacttgaataccattatttaaaccaagcctaacatgaatttaatcttttgaatggaacaatagaaatgtcagacgaatgttggagtcttggtgttt 33371444  T
Q  386 ggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
     ||||| ||||| ||||| |||||| ||| || | ||||||||||||||||||||    
T  33371445 agcaagcttgaatttacctcattcagaggtaaaataattgttgtagttggaaggt 33371499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 112 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 35566062 - 35565988
Alignment:
Q  112 tgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaa 185  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| ||| || || || ||||||||    
T  35566062 tgtaccttccaactgcaacaattatcttacctctgaatggggtaaattcaaacttgctaaacagcacgactccaa 35565988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 36349838 - 36349768
Alignment:
Q  17 catcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaa-ttaccccattcagagg 86  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| | |||||||||| |||||||||| |||||    
T  36349838 catcattcaagatgctcatcgcatgctggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccatttagagg 36349768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 104
Target Start/End: Original strand, 541572 - 541617
Alignment:
Q  59 aacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||    
T  541572 aacaagtttgaattgccccatccatagtaagacaattgttgcagtt 541617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 170
Target Start/End: Original strand, 3459011 - 3459064
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttg-aatgagtaaattcaaacatgccaa 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||| ||||||    
T  3459011 ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatgaggtaattcaaacttgccaa 3459064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 3602041 - 3601988
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaata 300  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||| ||||    
T  3602041 aatgatgatattcaaatgtcaaaagaataaggtgcattcattggcacttgaata 3601988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 10398068 - 10398027
Alignment:
Q  54 tgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaatt 95  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  10398068 tgtttaacaagtttgaattaccccatccaaaggaagacaatt 10398027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 20196868 - 20196807
Alignment:
Q  112 tgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagca 173  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||| | |||||||||| ||| |||||    
T  20196868 tgtaccttccaactgcaacaattatcttaccactgaatggggaaattcaaacttgctaagca 20196807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 36311935 - 36311902
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36311935 accttccaactacaacaattgtcttacctctgaa 36311902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Original strand, 38854378 - 38854442
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  38854378 ttccaaccacaacaattgtctt-cctttgaatgagatcaattcaaacctgccaaacaacatgactc 38854442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 107 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 1171699 - 1171624
Alignment:
Q  107 acgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||| | ||||||||||||  ||||| ||||| |||||    
T  1171699 acgtttgtaccttacaactacaacaatt-tgttacctctgaatggggtaaattcaaactggccaaacaacaggactc 1171624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 369 - 436
Target Start/End: Original strand, 1972080 - 1972148
Alignment:
Q  369 ttggagacctcccgtttggcaagtttgaatta-ccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaag 436  Q
    |||||| ||| | |||| |||||||||||||  |||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  1972080 ttggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgccccatccagagtaagacaattgttgtagttggaag 1972148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 388 - 438
Target Start/End: Original strand, 7082714 - 7082766
Alignment:
Q  388 caagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  7082714 caagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaatttttgtagttggaaggt 7082766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Original strand, 22283792 - 22283855
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  22283792 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 22283855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 27661363 - 27661300
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  27661363 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 27661300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 382 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 34683402 - 34683338
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatt-accccattcaa-aggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  34683402 gtttagcaagtttgaatttaccccattcaagagtaagataattgttgcagttggaaggtacattc 34683338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 414 - 442
Target Start/End: Original strand, 40012378 - 40012406
Alignment:
Q  414 aagacaattgttgtagttggaaggtgcat 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40012378 aagacaattgttgtagttggaaggtgcat 40012406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 511; Significance: 0; HSPs: 215)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 511; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 13973576 - 13972922
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  13973576 ttgaataccagcattcaagaggctcatcaaatgctggattcctgccgtttaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgtagttagag 13973477  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatg-agtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13973476 gtttgtaccttccaactacaacaattgttttacctttgaatgtagtaaattcaaacttgccaagcagcatgactccaatattcgaccgacattcccaatg 13973377  T
Q  208 ttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcat 307  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13973376 ttccattcaaaagattaaattcttgttagtctgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcat 13973277  T
Q  308 ttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccatt 407  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13973276 ttaaatcagcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgggaatgtcggtcgaatattggagacctgccgtttggcaagtttgaattaccccatt 13973177  T
Q  408 caaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatct 507  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13973176 caaaggaagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatcttatggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatct 13973077  T
Q  508 cagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgat 607  Q
    ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  13973076 cagcaatgtcacccgcatattgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgat 13972977  T
Q  608 actctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttg 662  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  13972976 actctcccctagtcgagtgttggacgtttatactgaacgtattccaccctccttg 13972922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 664
Target Start/End: Original strand, 14173313 - 14173968
Alignment:
Q  10 tgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacg 109  Q
    |||||| ||| |||||| |  ||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14173313 tgaatatcataattcaaaattctcatcgaatgctggattcctgccgtttaacaagtttgaattaccgcatttagaggaagacaattgttgcagttggacg 14173412  T
Q  110 tttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatg-agtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||  ||    
T  14173413 tttgtaccttccaactacaacaattgtgttacctttgaatgcagtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatgttcgaccggcattcccatagt 14173512  T
Q  209 tccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatt 308  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14173513 tccattcaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatt 14173612  T
Q  309 taaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattc 408  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||| ||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14173613 taaaccgacctaacaagaatttaatcttttgacatgaacaatggaaatgccggttgaacattagagtcctgccgtttggcaagtttgaattaccccattc 14173712  T
Q  409 aaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctc 508  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14173713 aaaggaagacaattgttgtagctggaaggtgcattcataccgtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctc 14173812  T
Q  509 agcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgata 608  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  14173813 agcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtcctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgata 14173912  T
Q  609 ctctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
     ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14173913 ttctcccctcatcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 14173968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 442; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 36910212 - 36909560
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  36910212 ttgaataccatcattcaaaatgctcatcgaatgctggattcctaccgtttaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacgattgttgcagttggac 36910113  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||  | |    
T  36910112 gtttgtaccttccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaaattgccaagcagcaggactccaatgttcgatcgacattccata-g 36910014  T
Q  208 ttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcat 307  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36910013 ttccattcaaaagattaaattcttgttaggtttgatttaaatgacagtattcaagtgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcat 36909914  T
Q  308 ttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccatt 407  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36909913 ttaaaccggcctaataagaatttaatcttttgacaggaacaatgggaatgtcggtcgaaccttggaatcctgccgtttggcaagtttgaattaccccatt 36909814  T
Q  408 caaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatct 507  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36909813 caaaggaagacaactgttgtagctggaaggtgcattcattctgtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatct 36909714  T
Q  508 cagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgat 607  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  36909713 cagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgat 36909614  T
Q  608 actctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctcctt 661  Q
     |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  36909613 gctcttccctcgtcgagcgttggacgtttacaccgaacgtattccaccctcctt 36909560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 437; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 6436412 - 6435768
Alignment:
Q  21 attcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtttgtaccttc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  6436412 attcaagaggctcatcgaatgctggattcctgccgtttaacaagtttgaattaccacattcagaggaagacaattgttgcagttggacgtttgtacctcc 6436313  T
Q  121 caactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcagaa 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |  | ||||| ||  |||||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  6436312 caactacaacaattgttttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagtaggaggactctaaaattcgaccggcattcccaatgtttcattcataa 6436213  T
Q  220 tattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcct 319  Q
     |||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||    
T  6436212 gattaaatttttgttaggctgagattaaatgatggtattcaaatgccaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatatcttcatttaaaccagcct 6436113  T
Q  320 aacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagaca 419  Q
    || ||||||||||||||||||||  |||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6436112 aataagaatttaatcttttgacataaacaatggaattgtcggtcgaatattggagacctgccgtttggcaagtttgaattacctcattcaaaggaagaca 6436013  T
Q  420 attgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcac 519  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  6436012 attgttgtagctggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcacttgatctcaacaacgtcac 6435913  T
Q  520 ccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttg 619  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  6435912 tcacatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacttgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcg 6435813  T
Q  620 tcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6435812 tcgagcgttggacgtttataccgaacgttttccaccctccttgtg 6435768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 656
Target Start/End: Original strand, 49925935 - 49926582
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||||  ||||||| || ||||| ||||| ||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  49925935 ttgaataccattgttcaagatgcacatcgcatgctggattcctgccgtttaacaagtttgaattgccccatttagaggaagacaattgttgcagtttgac 49926034  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgt 208  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  49926035 gtttgcacctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatgagtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatattcgaccgacatttccaatgt 49926134  T
Q  209 tccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatt 308  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  49926135 tccattcaaaagattaaattcttgttaggctgggattaaatgacagtatacaaatgtcaaaagaatgaggtctattcgttgacacttcaataccttcatt 49926234  T
Q  309 taaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattc 408  Q
    |||| | ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  49926235 taaaccagcacaacaataatttaatcttttgacaggaacaatgggaatgctggtcgaatattggagacctgccatttggcaagtttgaattaccccattc 49926334  T
Q  409 aaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctc 508  Q
    ||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49926335 aaaggaagacaatggttgtagctaaaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctc 49926434  T
Q  509 agcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgata 608  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |    
T  49926435 agcaacgtcacctgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcctcacgttttcgtcgttcgttaattccgcacaagtgaatgaca 49926534  T
Q  609 ctctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccc 656  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49926535 ctctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccc 49926582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 417; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 23343288 - 23342637
Alignment:
Q  13 ataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgttt 112  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  23343288 ataccattattcaagatgctcatcgaatgttggattcctgtcgtttaacaagtttgaattaccccattcaaaggaaaacaattgttgcagttggacgttt 23343189  T
Q  113 gtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttcc 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  23343188 gtacctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcacgactccaatatacgaccgacatttccaatgttcc 23343089  T
Q  212 attcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaa 311  Q
    ||| | || |||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23343088 attaaaaa-attaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtattcaggtgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatatcttcatttaa 23342990  T
Q  312 atcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaa 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23342989 atcggcctaacaagactttaatcttttgacaagaaaaatgggaatgccggtcgaatattgtagtcatgccgtttggcaagtttgaattacccaattcaaa 23342890  T
Q  412 ggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagc 511  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23342889 ggaagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattcggtacctaatgacgatcttctggaggaatcaaacttttgatgatatcttcagtttatctcagc 23342790  T
Q  512 aacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactc 611  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  23342789 aacgttacccgcatatcgatccactcgaacataatgtgctccaaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattcaacccaagtgaatgatactc 23342690  T
Q  612 tccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  23342689 tcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgtttcaccttccttgtg 23342637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 664
Target Start/End: Original strand, 24269919 - 24270573
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||||||||| | ||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||    
T  24269919 ttgaataccataattcaaaatgctcatcgaatgttggattcctgccgtttaacaagtttgaattacctcattcaaaagaagacaattgttgcagtttgac 24270018  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatg 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| | |||||| ||||||||  |    
T  24270019 gtttgtaccttccaactacaccaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatatacgaccggcattcccatag 24270118  T
Q  208 ttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcat 307  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  24270119 ttccattcaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgactgtattcaagtgtcaaaagaatgaggttcattcattgacatttcaataccttcat 24270218  T
Q  308 ttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccatt 407  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||||  | | |  |||||||||||||||||||||||||    
T  24270219 ttaaaccggcctaacaagaatttaatcttttgaaaggaacaatgggaatgccggtcaaacattgga--cgtgctatttggcaagtttgaattaccccatt 24270316  T
Q  408 caaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatct 507  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24270317 cagaggaagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattcggtacctattgatgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatct 24270416  T
Q  508 cagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgat 607  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  24270417 cagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcctaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgat 24270516  T
Q  608 actctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24270517 actctcccctcatcgagtgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 24270573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 664
Target Start/End: Original strand, 35586477 - 35587139
Alignment:
Q  13 ataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgttt 112  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35586477 ataccattatttaagatgctcatcgaatgctggattcctgccgtttaacaagtttgaattacctcattcaaaggaagacaattgttgcagttggacgttt 35586576  T
Q  113 -------------gtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatg-agtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgaca 198  Q
                 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||  || |||||  || ||||||||| |||||||||||    
T  35586577 atatcaaacgtttgtaccttccaactacaacaattgtgttacctttgaatggagtaaatttaaatttgtcaagctgcaggactccaatgttcgaccgaca 35586676  T
Q  199 ttcccaatgttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaa 298  Q
    ||||||  |||||||||| || |||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35586677 ttcccatagttccattcaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtattcaaaagtcaaaagaatgaggtccattcattgacacttcaa 35586776  T
Q  299 taccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaat 398  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||   |  ||||||||||||||||||    
T  35586777 taccttcatttaaaccggcctaacaagaacttaatcttttgacaggaacaatgagaatgccggtcgaacattggagtt-tgtcgtttggcaagtttgaat 35586875  T
Q  399 taccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttc 498  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35586876 taccccattcaaaggaa-acaactgttgtagttgaaaggtgcattcattccgtac-taatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttc 35586973  T
Q  499 agttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaa 598  Q
    | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||| |||    
T  35586974 aattgatctcagcaaggtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaa 35587073  T
Q  599 gtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35587074 gtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 35587139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 664
Target Start/End: Original strand, 17685913 - 17686571
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||   ||| ||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  17685913 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatactggagtccttccgtttaacaaatttgaattactc-attcaaaggaagacaattgttgcagttggac 17686011  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatg 207  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||   | || |||  ||||||  ||    
T  17686012 gtttgcaccttccaactacaacaattgtgttacctctgaatgaggtaaattcaaacttgccaagcatcaggactccagcgtacgtccggtattcccgttg 17686111  T
Q  208 ttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcat 307  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  17686112 ttccattcaaaagattaaattcttgttaggtttggattaaatgatggtattcaagtgtcaaaaaaatgaggtgcattccttgaaacttcaataccttcat 17686211  T
Q  308 ttaaatcg---gcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattacccc 404  Q
     |||||     |||||||| ||||||| |||||| | |||||||| | ||||| ||| || ||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||     
T  17686212 ctaaattacacgcctaacatgaatttattcttttaaaaggaacaacgggaatgccggacgtatgctggagtcctgccgtttggcaagtttgaattaccct 17686311  T
Q  405 attcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttga 504  Q
    || || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17686312 atccagaggaacacaattgttgtagctggaaggtgcattcattcgatacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttga 17686411  T
Q  505 tctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaat 604  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  17686412 tctcagctacgtcacccgcatatcgatccactggaagatgttgtgctcccaaaacatgctcttcacgttttcgtcattcgttaattcaacccaagtgaat 17686511  T
Q  605 gatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17686512 gatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttctaccctccttgtg 17686571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 35185631 - 35184966
Alignment:
Q  13 ataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgttt 112  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35185631 ataccattattcaagatgctcatcgaatgctggattcctgccgtttaacaagtttgaattaccacatttaaaggaagacaattgttgcagtttgacgttt 35185532  T
Q  113 ------------gtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacat 199  Q
                |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||    
T  35185531 ataccgacgtttgtaccttccaactacaacaattgtgtcacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaagactccaacgttcgaccaacat 35185432  T
Q  200 tcccaatgttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaat 299  Q
    |||||  |||||||||| || |||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  35185431 tcccatagttccattcaaaagattaaattattgttaggtttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgagatccattcattgacacttcaat 35185332  T
Q  300 accttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaatt 399  Q
    || |||||||||| || | |||||||||  |||| |||||||| |||||||  |||| | ||||||| ||||||| | | ||||||| ||||||||||||    
T  35185331 actttcatttaaaccgccataacaagaacataatattttgacaagaacaatcggaatcttggtcgaacattggagtcatgccgtttgacaagtttgaatt 35185232  T
Q  400 accccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttca 499  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35185231 acctcattcaaaggaagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattccgcacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttca 35185132  T
Q  500 gttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgct-cccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaa 598  Q
     ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||   ||    
T  35185131 attgatttcagcaacgtcacctgcatatcgatccactggaacatgccgtgctccccaaaacatgttcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccatcaaa 35185032  T
Q  599 gtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35185031 gtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 35184966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 69 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 37778671 - 37778109
Alignment:
Q  69 aattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgc 167  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||| |||    
T  37778671 aattactccatttagaggaagacaattgttgcagttggaagtttgtaccttccaactacaacaattgtgttacctctgaatgtggtaaattcaaacttgc 37778572  T
Q  168 caagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtca 267  Q
    |||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||| |||||    
T  37778571 caagcagcaggactccaatatacgaccgacattcccaatgttccattcaaaagattaaattcttgttaggcttggtttaaatgatggtattcaagtgtca 37778472  T
Q  268 aaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaat 367  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |  ||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||    
T  37778471 aaagaatgaggttcattccttgacacttcaataccttaatctaaaccatcctaacatgaacttaatcttttgaatggaacaataggaatgtcggtcgaat 37778372  T
Q  368 attggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatcta 467  Q
    ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  37778371 attggaatcctgccgtttggcaagtttgaattaccccattcagaggaagaaaattgttgtaggcggaaggtgcattcattcggtacctaatgacgatctt 37778272  T
Q  468 ctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgt 567  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37778271 ctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatcaactggaacatgttgttctcccaaaacatgctcgt 37778172  T
Q  568 catgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttgg 630  Q
    || ||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  37778171 cacgttttcgtcgtcctttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcaagcgttgg 37778109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 178 - 664
Target Start/End: Original strand, 38046158 - 38046644
Alignment:
Q  178 gactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgag 277  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||| || ||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38046158 gactccaatattcgaccggcattcccaatatttcattcaaaagattaaattcttgttaggctcggattaaatgacggtattcaaatgtcaaaagaatgag 38046257  T
Q  278 gtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacc 377  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||||||| | | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38046258 gtccattcgttgacattttaataccttcatttaaaccagactaacaagagtataatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacc 38046357  T
Q  378 tcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaat 477  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  38046358 tgtcgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagctaaaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatcttctggtggaat 38046457  T
Q  478 caaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcg 577  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  38046458 caaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcaccggcatattgatcgactggaacatgttgtgctcccaaaacatgcttgtcacgttttcg 38046557  T
Q  578 tcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38046558 tcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 38046644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 41781201 - 41780689
Alignment:
Q  152 gtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatga 251  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||   |||||||||||||    
T  41781201 gtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatatacgaccgacattcccaatgttccattcaaaagattaaattcttattaagctgggattaaatga 41781102  T
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatg 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41781101 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaaccggcctaacaagaatttaatcttttgacaagaacaatg 41781002  T
Q  352 agaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgt 451  Q
     |||||  ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  41781001 ggaatgctggttgaatattggagtcctgccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagctgcaaggtgcattcattccgt 41780902  T
Q  452 acctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgct 551  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  41780901 acctaatgacgaacttctggcgaaatcaaacttttgatgatatattcagttgatcttagcaacgtcacctgcatatctatctactggaacatgctgtgct 41780802  T
Q  552 cccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttc 651  Q
    ||||||| ||  |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41780801 cccaaaatatattcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatattatcctctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttc 41780702  T
Q  652 caccctccttgtg 664  Q
    |||||| ||||||    
T  41780701 cacccttcttgtg 41780689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 664
Target Start/End: Original strand, 35525755 - 35526387
Alignment:
Q  13 ataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgttt 112  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  35525755 ataccattattcaagatgctcatcgaatgctgaattcctgccgtttaacaagtttgaatcaccccattcaaaggaagacaactgttgccgttggacgttt 35525854  T
Q  113 gtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttcc 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||  |||||    
T  35525855 gtaccttccaactacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatgtttgaccgacattcccatagttcc 35525954  T
Q  212 attcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaa 311  Q
    ||||| || |||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35525955 attcaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtctattccttgacaattcaataccttcatttaa 35526054  T
Q  312 atcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaa 411  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35526055 accggactaacaagaatttaatcttttgacaggaataatgggaatgccggtcaaatattggagtcctgccgtttggaaagtttgaattaccccattcaaa 35526154  T
Q  412 ggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagc 511  Q
     ||||||  ||||||||| |  ||||||||||||||                    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35526155 agaagacctttgttgtagctataaggtgcattcatt--------------------ctagcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagc 35526234  T
Q  512 aacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactc 611  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||  ||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  35526235 aacgtcacccgcatatcgatccactgcaacattctgtgctcccaaaacatggtcgtctcgttttcgacgttcgttaattccacccaggtgaatgatactc 35526334  T
Q  612 tccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  35526335 tctcctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgcgttccaccctccctgtg 35526387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 32 - 544
Target Start/End: Original strand, 40532863 - 40533376
Alignment:
Q  32 tcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtttgtaccttccaactacaaca 131  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40532863 tcatcgaatgctggattcctgccgtttaacaagtttgaattacctcatttagaggaagacaattgttgtagttggacgtttgtaccttccaactacaaca 40532962  T
Q  132 attgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcagaatattaaattct 230  Q
    || || |||||| |||||||| ||||||||||| || |||||| || ||||||||| | |||||| ||||| ||   |||| |||| || ||||||||||    
T  40532963 atcgtgttacctctgaatgaggtaaattcaaacttgtcaagcagcacgactccaatatacgaccggcattctcataattccgttcaaaagattaaattct 40533062  T
Q  231 tgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaattt 330  Q
    |||||| || ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40533063 tgttaggtttggattaaataacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtccattcgttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctatcaagaattt 40533162  T
Q  331 aatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagt 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||     
T  40533163 aatcttttgacaggaacaatgagaatgccggtcgaacattggagtcatgccgtttgacaagtttgaattaccccagttagaggaaaacaattgttgtagc 40533262  T
Q  431 tggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcga 530  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  40533263 tggaaggtgcattcattcggtacctaatgacgatcttctggcggaattaaacttttgatgatatcttcagttgatctcggcaacgttacccgcatatcga 40533362  T
Q  531 tccactggaacatg 544  Q
    ||||||||||||||    
T  40533363 tccactggaacatg 40533376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 9 - 664
Target Start/End: Original strand, 12790827 - 12791483
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    ||||||||||| |||||||| | | |||||||| | ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  12790827 ttgaataccattattcaagatggttatcgaatgttggattcctgccgtttaacaagtttgaattaccccatttagaggaagacaattgttgcagttggac 12790926  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactcca-attttcgaccgacattcccaat 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||| | |||| ||||| ||||| | | ||||| |||||||||    |    
T  12790927 gtttgtaccttccaactccaacaattgtgttacctctgaatggggtaaattcaaacttaccaaacaacaggactcaagaatttcgcccgacattcatgtt 12791026  T
Q  207 gttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttca 306  Q
     |||| || | || | ||| || |||||||  | |  ||| ||||||||||| || || |||   ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  12791027 tttcctttgaaaagaataattttttgttaggattgctttagatgatggtatttaagtgccaatgaaatgaggttaattccttgacacttcaataccttca 12791126  T
Q  307 tttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccat 406  Q
    | |||| | |||||| |||||||||||||||| | ||||| ||   ||||||||| |||||  |   ||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12791127 tctaaaccagcctaaaaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgtcgggcgaatgctaaggacttgtcgtttggcaagtttgaattaccccat 12791226  T
Q  407 t-caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttga 504  Q
    | || ||| |||||||||||||||||||||| |  | ||   ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12791227 ttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacctta--tcc-taactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttga 12791323  T
Q  505 tctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaat 604  Q
    |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  12791324 tctcaaaaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctccaaaaaaatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaat 12791423  T
Q  605 gatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12791424 gatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctacttgtg 12791483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 317 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 49397047 - 49396703
Alignment:
Q  317 cctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaag 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49397047 cctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgggaatgtcgatcgaacattggagtcatgtcgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaag 49396948  T
Q  417 acaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacat 516  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  49396947 acaattgttgtagctggaaggtgcattcattccatacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgttgatatcttcagttgatctcagcaacgt 49396848  T
Q  517 cacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctcccc 616  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49396847 cacccgcatatcaatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgttgttcgttaattccactcaagtgaatgatactctcccc 49396748  T
Q  617 ttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctcctt 661  Q
    | ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49396747 tcgtaaatcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctcctt 49396703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 112 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 13284250 - 13283705
Alignment:
Q  112 tgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagt-aaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||| ||| || || ||  |||| ||| | || ||| ||||| || |||||    
T  13284250 tgtaccttccaactacaacaattgtcttacccttgaatggggcaaattcaaacttgctaaacagcatcactcaaatatccgtccggcattctcattgttc 13284151  T
Q  211 cattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcattta 310  Q
    |||||| || ||| | || || || |  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13284150 cattcaaaagattcagttatttttgggcttggtttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtcatttccttgacacttcaataccttcatcta 13284051  T
Q  311 aatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaa 410  Q
    || | | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||| | | || |||  |||||||||||||||||||||||    
T  13284050 aaccagtctaacaagaatttaatcgtttgaaaggaacaatgggaatgtcggacgaatattcgagtcttgccatttaacaagtttgaattaccccattcaa 13283951  T
Q  411 aggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  13283950 aggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc--tc--tacctaatcacgatcttctggcggaatcagactgttgataatatattcagttgatctcag 13283855  T
Q  511 caacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatact 610  Q
    |||| | ||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||| | |||||||||    
T  13283854 caacgttacctgcatatcgatccactagaacatgctgcgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcatcgttcgttaatttcacccaactaaatgatact 13283755  T
Q  611 ctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctcct 660  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13283754 ctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctcct 13283705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 9 - 664
Target Start/End: Original strand, 42571330 - 42571986
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    ||||||| |||||||||| | |||||||||||||| | ||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  42571330 ttgaatatcatcattcaaaatgctcatcgaatgctggtttcctgccgtttaacaagtttgaattaccccactcaaaggaagacaattgttgcagttggac 42571429  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaat-tttcgaccgacattcccaat 206  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||| | ||||| ||  ||||| ||| |||||   ||    
T  42571430 gtttgtacctctcaactacaacaattgtgttacctttgaattgggtaaattcaaacttgccaaacaatatgactcaaacatttcgtccggcattc---at 42571526  T
Q  207 gtt--ccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacctt 304  Q
    |||  || || | || | |||||| |||||||  | |  ||| |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  42571527 gttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aatacctt 42571625  T
Q  305 catttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaa-tattggagacctc-ccgtttggcaagtttgaattacc 402  Q
    ||| |||| | ||||||||||||||||||||||| | | ||| ||   ||||||||  |||| | || ||| | |  |||||||||||||||||||||||    
T  42571626 catctaaaccagcctaacaagaatttaatcttttcaaatgaaaaacatgaatgtcgagcgaaatgtttgagtcttggccgtttggcaagtttgaattacc 42571725  T
Q  403 ccatt-caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcag 500  Q
    ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||  ||||  | | || ||  |||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  42571726 ccatttcagaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccttaagtaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcag 42571822  T
Q  501 ttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagt 600  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||| ||||| |||||    
T  42571823 ttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcttcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagt 42571922  T
Q  601 gaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42571923 gaatgatactctcccctcgtcgagcattggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 42571986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 112 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 17373273 - 17372729
Alignment:
Q  112 tgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttc 210  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||| ||||||||||| ||| || || || ||||||||  |||| | |||||| | | | |||    
T  17373273 tgtaccttccaactacaataattgtctaacccctgaatgaggtaaattcaaacttgctaaacagcaggactccaacattcgtctgacatttctatttttc 17373174  T
Q  211 cattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcattta 310  Q
    |||||  || ||||||||||||||||| |  | |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17373173 cattcgaaagattaaattcttgttagacttcgtttaaataatgatattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattctttgacacttcaataccttcattta 17373074  T
Q  311 aatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaa 410  Q
    || | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||   |||||||| ||||| || ||| ||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  17373073 aaccagcctaacaagaatttaatcttgtgaaaggaacaattgaaatgtcgggcgaatgtttgagtcctgccgtttaacaagtttgaattacctcattcaa 17372974  T
Q  411 aggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  17372973 aggaagacaattgttgtagttggaaggtgcat---ttccatacctaatgacgatcttctggcgaaattaaactttcgatgatatcttcagttgatctcat 17372877  T
Q  511 caacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatact 610  Q
    |||| | || || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||  |||||||| |||| |||||||||  ||||| || ||| |    
T  17372876 caacgttacacgtatatcgatccactggaatatggtgtgctcccaaaacatgttcttcacattttcgtcgttcgctaattccacctaagtggattatatt 17372777  T
Q  611 ctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctc 658  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  17372776 ctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacatatttcaccctc 17372729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 59 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 3659072 - 3658475
Alignment:
Q  59 aacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaat 157  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||| | || ||    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  3659072 aacaagtttgaattgtcccatccagagtaagacaattgttgtacttggaa---tgtacattacaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaat 3658976  T
Q  158 tcaaacatgccaagcaacaagactccaat-tttcgaccgacattcccaatgttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggta 256  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||| |   ||||| |||||||||    | |||| || | || | |||||| |||||||  | |  ||| |||||||||    
T  3658975 tcaaacttgccaaacaacaggactcaagcatttcgcccgacattcatgtttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgccttagatgatggta 3658876  T
Q  257 ttcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaat 356  Q
    ||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||| | ||||| ||   ||||    
T  3658875 ttcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacacttcaataccttcatctaaaccatcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaat 3658776  T
Q  357 gtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccatt-caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacc 454  Q
    ||||| ||||| |||  ||| |  ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||  ||||  | | || ||||    
T  3658775 gtcgggcgaatgttgaggacttgtcgtttggcaagtttgaattaccccatttcagaggtaagacgattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctacc 3658679  T
Q  455 taatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctccc 554  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3658678 taatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacttgcatatcgatccactagaacatgttgtgctccc 3658579  T
Q  555 aaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccac 654  Q
    |||||| | |||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3658578 aaaacacgttcgtcacgtttttgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctctcctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccac 3658479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 107 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 18170580 - 18170021
Alignment:
Q  107 acgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaat-tttcgaccgacattccca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||  ||||| ||||||||||| ||  ||||| ||| | |||       
T  18170580 acgtttgtaccttccaactacaacaattgtgttacctctgaatggggtaaattcaaactggccaaacaacaagactcaaacatttcgcccggcgttcttg 18170481  T
Q  205 atgttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacctt 304  Q
     | |||| || | || | |||||| ||||||   | |  ||| |||||||||||||| || |||   |||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  18170480 cttttcctttgaaaagaataaatttttgttatgcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcatttcatgacacttcaatacctt 18170381  T
Q  305 catttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattacccc 404  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| ||| | || || ||   |||||| || |||||   |  ||| |  |||||||||||||||||||||| |    
T  18170380 catttaaaccagcctaacaagaatttaatcctttcaaagaaaaaacatgaatgttgggcgaatgcggaggacttgtcgtttggcaagtttgaattacctc 18170281  T
Q  405 attcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttga 504  Q
    || || ||||| ||||  ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18170280 atccagaggaacacaaaagttttagttggaaggtgcatgcattcggtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacctttgatgatatcttcagttga 18170181  T
Q  505 tctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaat 604  Q
     ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||    
T  18170180 gctcagcaatgtcacccgcatatcgatctactggaacatgatgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaat 18170081  T
Q  605 gatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18170080 gatactctcccctcgtcgagcgttgaacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 18170021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 114 - 657
Target Start/End: Original strand, 24363471 - 24364003
Alignment:
Q  114 taccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttcca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||| ||| || || || ||| | ||| |||| |||||||||||| |||| ||    
T  24363471 taccttccaactacaacaattgtcttatctctgaatggggtaaattcaaacttgctaaacagcaggacacaaatattcgtccgacattcccattgtttca 24363570  T
Q  213 ttcagaatattaaattcttgttaga-ttgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaa 311  Q
    |||| || |||||||| |||||||  ||||  ||||||||||||||| |  |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||     
T  24363571 ttcaaaagattaaattattgttaggcttggttttaaatgatggtattgacgtgtcaacagaatgaggtgcattccttaacacttcaataccttcatttat 24363670  T
Q  312 atcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaa 411  Q
    | | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |  |         |||||||||||||| ||||||||    
T  24363671 accagcctcacaagaatttaatcttttgaaaggaacaatgggaatgtcgggcgaatatttgagtcaac---------aagtttgaattacctcattcaaa 24363761  T
Q  412 ggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagc 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    | |||||||| ||||||| ||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  24363762 ggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc----cctacctaatcacgatcttctaacggaatcaaactcttgataatatcttcagttgctctcaac 24363857  T
Q  512 aacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactc 611  Q
    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||| || ||| ||||||||| ||| ||||||| || ||||||| ||||| ||    
T  24363858 aacgttaaccgcatatcgatccactagaacatactgtgcccccaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttcattaattctacccaagtgattgatattc 24363957  T
Q  612 tccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccct 657  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24363958 tcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccct 24364003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 9 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 49428034 - 49427384
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||| | ||||||| ||| |||||||| | || ||||   | | |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||     
T  49428034 ttgaataccagcgttcaagacgcttatcgaatgttggagtcctaccgattaacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgcagttggaa 49427935  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaat-tttcgaccgacattcccaat 206  Q
       ||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||| ||||| ||||| |   ||||  ||| |||||   ||    
T  49427934 ---tgtgcattacaactccaacaattgtcttacctttgaatgagatagattcaaacctgtcaaacaacaggactcaagcatttcccccggcattc---at 49427841  T
Q  207 gtt--ccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacctt 304  Q
    |||  || || | |||| |||||| |||||||    |  ||| |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  49427840 gttttcctttgaaaataataaatttttgttaggcgtgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aatacctt 49427742  T
Q  305 catttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaa-tattggagacctcccgtttggcaagtttgaatt-acc 402  Q
    ||| |||| | ||||||||||||||||||||||| | | ||| ||   ||||| ||  |||| |  | ||| |||   |||||||| ||||||||| | |    
T  49427741 catctaaaccagcctaacaagaatttaatcttttcaaacgaaaaacatgaatgccgagcgaaatgctcgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatc 49427642  T
Q  403 ccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagtt 502  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  | | || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49427641 tcattcaaaggaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagtt 49427545  T
Q  503 gatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtga 602  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  49427544 gatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccgcccaagtga 49427445  T
Q  603 atgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgt 663  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  49427444 atgatactctcccctcgtcgagcgttggacatttataccgaacgtgtaacaccatccttgt 49427384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 120 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 18842994 - 18842435
Alignment:
Q  120 ccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcaga 218  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||| ||| || |||||   ||| |   |||  |||||||| | | ||||||||||| |    
T  18842994 ccaactacaacaattgtcttacccctgaatggggtaaattcaaacttgctaaacaacatctctcaagcattcacccgacatttctattgttccattcaaa 18842895  T
Q  219 atattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcc 318  Q
    ||||||||||||||||||  | || ||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||| | |||    
T  18842894 atattaaattcttgttaggcttggtttagataatggtattcaagtgtcacaagaatgaggtgcattctttgacacttcaatacctttatctaaaccagcc 18842795  T
Q  319 taacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaata-ttggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaaga 417  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||  ||||  ||||| || | ||||||  |||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  18842794 taacaagaatttaatcttttgaaaggaacaatataaatgtcgggtgaatgcttggaaac-tgccgtttaacaagattgaattaccacatccaaaggaaga 18842696  T
Q  418 caattgttgtagttggaaggtgcatt--------------cattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttg 503  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||              |  ||| ||||||||  |||||| ||||||| |||| ||| ||||  |||||||||||||    
T  18842695 caattattgtagttggaaggtgcatttcactacctaatcacgatccctacctaatcccgatcttctggcgggatcagactcttgacaatatcttcagttg 18842596  T
Q  504 atctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaa 603  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| | ||    
T  18842595 atctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgccgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactaaa 18842496  T
Q  604 tgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18842495 tgatattcttccctcatcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtg 18842435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 281 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 17697422 - 17697045
Alignment:
Q  281 cattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcc 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||| | || || ||   ||||   |  |||||  || |||| |      
T  17697422 cattccttgacacttcaataccttcatctaaaccagcctaacaaaaatttaatcttttcaaagaaaaaacatgaatcatgagcgaatgatgaagacttgt 17697323  T
Q  381 cgtttggcaagtttgaattacccc-attcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatca 479  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  17697322 cgtttgacaagtttgaattacccccatttaaaggaagacaactgttgtagttggaaggtgcattcctt----acctaatcacgatcttctggcggaatca 17697227  T
Q  480 aacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtc 579  Q
     ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17697226 gactcttgataatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtc 17697127  T
Q  580 attcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctcctt 661  Q
     | | |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17697126 gtactttaactccacccaagtgaatgataccctacccttgtcgagcattggacgtttataccaaacgtgttccaccctcctt 17697045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 9 - 664
Target Start/End: Original strand, 39223755 - 39224407
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||| | || |||||  | | |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| | |   |     
T  39223755 ttgaataccagcattcaagatgcttatcgaatgttggactcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgtaatggaaa 39223854  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaat-tttcgaccgacattcccaatg 207  Q
       ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||| ||||| ||||| |   ||||  ||| |||||   |||    
T  39223855 ---tgtgcattccaactacaacaattgtcttacatttgaatgggtaaattcaaacctgtcaaacaacatgactcaagcatttcacccggcattc---atg 39223948  T
Q  208 tt--ccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttc 305  Q
    ||  || || | || | |||||| |||||||  | |  ||| |||||||||||||| || |||   || ||||| ||||||| ||||||| |||| ||||    
T  39223949 ttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaaagaggttcattcctcgacactt-aatatcttc 39224047  T
Q  306 atttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaa-tattggagacctc-ccgtttggcaagtttgaattaccc 403  Q
    || |||| | ||||||||||||||||||||||| |  |||| ||   ||||| ||  |||| |  | ||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  39224048 atctaaaccagcctaacaagaatttaatcttttcaacggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcctggccgtttggcaagtttgaattaccc 39224147  T
Q  404 catt-caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagt 501  Q
    |||| || ||| |||| |||||||||||||||||  ||||  | | || || ||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||| || |||    
T  39224148 catttcagaggtaagagaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatatttagt 39224244  T
Q  502 tgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtg 601  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  39224245 tgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcattctttaattccacccaagtg 39224344  T
Q  602 aatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39224345 aatgataccctcccctcgttgagcgttagacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 39224407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 9 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 51270450 - 51269798
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||| |||| |||| ||| |||||||| | || |||||  | | |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||  |     
T  51270450 ttgaataccaacattgaagacgcttatcgaatgttggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgcagttgaaa 51270351  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccga-cattcccaat 206  Q
       ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||| ||||||||||| ||  ||  ||| | |||||   ||    
T  51270350 ---tgtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtcaattcaaacttgccaaacaacaagactcaaacatttcacccagcattc---at 51270257  T
Q  207 gtt--ccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacctt 304  Q
    |||  || || | || | |||||| |||||||  | |  ||| |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  51270256 gttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aatacctt 51270158  T
Q  305 catttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaa-tattggagacctcccgtttggcaagtttgaatt-acc 402  Q
    ||| |||| | ||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||   ||||| ||  |||| |  | ||| |||   |||| ||| ||||||||| | |    
T  51270157 catctaaaccagcctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcctgttgtttagcaggtttgaatttatc 51270058  T
Q  403 ccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagt 501  Q
     |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||  | | || || ||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  51270057 tcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagt 51269961  T
Q  502 tgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtg 601  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||| ||    
T  51269960 tgatcccagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaactg 51269861  T
Q  602 aatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  51269860 aatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatacagaaggtgttccaccctccttgtg 51269798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 380 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 35576618 - 35576335
Alignment:
Q  380 ccgtttggcaagtttgaattaccccatt-caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaat 477  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||  ||||  | | || || ||||||||||||| ||||||||||    
T  35576618 ccgtttggcaagtttgaattacctcatttcagaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaat 35576522  T
Q  478 caaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcg 577  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35576521 caaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccaccggaacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcg 35576422  T
Q  578 tcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35576421 tcgttcgttaattccacccaagtgaatgatattctcccctcatcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 35576335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 381 - 664
Target Start/End: Original strand, 21484573 - 21484853
Alignment:
Q  381 cgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  | | || |||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  21484573 cgtttggcaagtttgaattaccatattcaaaggaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctacctaatgacgatcttctggtgaaatcaa 21484669  T
Q  481 acttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtca 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||     
T  21484670 acttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcactcgcatatcgatccactggaacatgttgtgctccaaaaacatgctcgtcacattttcgtcg 21484769  T
Q  581 ttcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  21484770 ttcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacaagtttcaccctccttgtg 21484853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 208 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 5765653 - 5765203
Alignment:
Q  208 ttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcat 307  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  5765653 ttccattcaaaagattaaattcttgttaggcttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacactttaataccttcat 5765554  T
Q  308 ttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaa-tgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccat 406  Q
     |||||| |||||| |  |||||||||||||||  |||||||| |||| || |||  |||| ||   || ||  |||||  ||||||||||||  |   |    
T  5765553 ctaaatcagcctaaaagaaatttaatcttttgaatggaacaat-agaactgccgggtgaatgtttaggaactggcgtttaacaagtttgaattttcat-t 5765456  T
Q  407 tcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatc 506  Q
    |||    |||||||||||||||||||||||||||||||    | |||||||| ||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||||| ||||||    
T  5765455 tcaggataagacaattgttgtagttggaaggtgcattc----cctacctaatcacgatcttctggcggaatcagacggttgataatatcttcatttgatc 5765360  T
Q  507 tcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatga 606  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  5765359 tcagcaacgttacccgcatatcgatccactagaacatgttctgctcccaaaacatgctcatcaagtttttgtcgttcgttaattccacccaactgaatga 5765260  T
Q  607 tactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgt 663  Q
    || ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5765259 tattcttccatcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgt 5765203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 9 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 29436621 - 29435969
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||| | ||||||| ||| |||||||| | || |||||  | | |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||     
T  29436621 ttgaataccagcgttcaagacgcttatcgaatgttggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgcagttggaa 29436522  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaat-tttcgaccgacattcccaat 206  Q
       ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| ||||| |   |||||  ||||||||   ||    
T  29436521 ---tgtgcattccaactacaacaattgttttacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaataacaggactcaagcatttcgctcgacattc---at 29436428  T
Q  207 gtt--ccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacctt 304  Q
    |||  || || | || | |||||| |||||||  | |  ||| |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  29436427 gttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaattgccaacgaaatgaggttcattcctagacactt-aatacctt 29436329  T
Q  305 catttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaa-tattggagacctcccgtttggcaagtttgaatt-acc 402  Q
    ||| |||| | |||| |||||||||||||||||| |  |||| ||   ||||| ||  |||| |  | ||| | |   |||||||| ||||||||| |      
T  29436328 catctaaaccagcctgacaagaatttaatcttttcaatggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcatgttgtttggcaggtttgaatttatt 29436229  T
Q  403 ccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagt 501  Q
     |||||||||| |||| |||||||| ||||||||  ||||  | | || || ||||||||||||| |||||  ||||||  | |||||||||||||||||    
T  29436228 tcattcaaaggtaagaaaattgttgcagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcttaatcaagttgttgatgatatcttcagt 29436132  T
Q  502 tgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtg 601  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  29436131 tgatctcagcaacgtcacccgcgtatcgatccactggaacatgctgtactcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtg 29436032  T
Q  602 aatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29436031 aatgatactctcccatcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 29435969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 382 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 19160592 - 19160317
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaa 481  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  | | || || |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  19160592 gtttgacaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacaatcttctggcggaatcaaa 19160496  T
Q  482 cttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcat 581  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||| ||||||||| |    
T  19160495 cttttgatgatatcttcaattgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgttcccaaaacatagtcgtcacgttttcgtcgt 19160396  T
Q  582 tcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctcct 660  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  19160395 tcgttaattccacccaagtgaatgatactctccccttgtcaagcgttggacgtttataccaaacgtgttccaccatcct 19160317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 272 - 664
Target Start/End: Original strand, 13635117 - 13635507
Alignment:
Q  272 aatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaa-tatt 370  Q
    |||||||| |||||||| || | | ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||   ||||| ||  |||| |  |    
T  13635117 aatgaggttcattccttcacgcct-aataccttcatctaaaccagcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgct 13635215  T
Q  371 ggagacctcccgtttggcaagtttgaatt-accccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctact 469  Q
     ||| |||   |||||||| |||| |||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||  | | || || ||||||||||||| ||    
T  13635216 cgagtcctgttgtttggcaggtttaaattgatctcattcaaaggaagacaattgttgtggttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttct 13635312  T
Q  470 ggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtca 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  13635313 ggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaaccaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatggtcgtga 13635412  T
Q  570 tgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
     ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  13635413 cgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaaacgtgttccaccatccttgtg 13635507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 362 - 664
Target Start/End: Original strand, 39856817 - 39857116
Alignment:
Q  362 tcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgac 461  Q
    |||||| |||||| ||| ||| ||  |||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||  ||||  | | || || ||||||||    
T  39856817 tcgaatgttggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgac 39856913  T
Q  462 gatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacat 561  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39856914 gatcttctggcagaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgtcgtgctcccaaaacat 39857013  T
Q  562 gctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctcctt 661  Q
    | |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  39857014 gatcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtggatgatactctcccctcgtcgagcattggacgtttataccgaacatgttccacccttctt 39857113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 9 - 662
Target Start/End: Original strand, 47487593 - 47488245
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||  | || || ||  | | |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||  |     
T  47487593 ttgaataccagcattcaagaggcttatcgaatattggagtcatgccgattaacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgtagttgaaa 47487692  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaat-tttcgaccgacattcccaat 206  Q
       ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||| ||||| |   ||||| ||  |||||    |    
T  47487693 ---tgtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacaggactcaagcatttcgccccgcattcatgtt 47487789  T
Q  207 gttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttca 306  Q
     |||| || | || | |||||| ||||||   | |  ||| |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||    
T  47487790 tttcctttgaaaagaataaatttttgttaagcttgctttagatgatggtattcaagtgccaatgaaatgaggttcattccttgacactt-aataccctca 47487888  T
Q  307 tttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaa-tattggagacctc-ccgtttggcaagtttgaattacccc 404  Q
    | |||| | || |||||||||||||||||||| | ||||| ||   ||| |  || |||| |  | ||| | |  |||||||||||||||||||||||||    
T  47487889 tctaaaccagcataacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaacgctgggcgaaatgcttgagtcatggccgtttggcaagtttgaattacccc 47487988  T
Q  405 att-caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagtt 502  Q
    ||| || ||| ||||||||||||||||||||||  ||||  | | || || ||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||| ||||||||||    
T  47487989 atttcagaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccataactaatgacgatcttctggcgaaatcaagctgttgatgacatcttcagtt 47488085  T
Q  503 gatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtga 602  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||| |||||||    
T  47488086 gatctcagcaacgttacccgcatatcgatcaactagaaaatattgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtga 47488185  T
Q  603 atgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttg 662  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47488186 atgatattctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttg 47488245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 454 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 48215404 - 48215194
Alignment:
Q  454 ctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 553  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48215404 ctaatgactatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcc 48215305  T
Q  554 caaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttcca 653  Q
     |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48215304 aaaaatatgctcgtcatgttttcgtcgttcgttaattccactcaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttcca 48215205  T
Q  654 ccctccttgtg 664  Q
    || ||||||||    
T  48215204 ccatccttgtg 48215194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 248 - 664
Target Start/End: Original strand, 29762017 - 29762431
Alignment:
Q  248 atgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaac 347  Q
    |||||||||||||| || |||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||     
T  29762017 atgatggtattcaagtgccaat-gaatgaggttcattccttgacactt-aataccttcatctaaaccagcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaa 29762114  T
Q  348 aatgagaatgtcggtcgaa-tattggagacctcccgtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    ||   ||||  ||  |||| |  | ||| |||   |||||||| ||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||  |    
T  29762115 aacatgaattccgagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa--tgcac-c 29762211  T
Q  445 attccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatg 544  Q
     | || || ||||||| ||||| |||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29762212 ttaccctaactaatgatgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatattttcagttgatctcatcaacgtcacccgtatatcgatccactggaacatg 29762311  T
Q  545 ttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaa 644  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29762312 ttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaa 29762411  T
Q  645 cgtgttccaccctccttgtg 664  Q
     |||||||||||||||||||    
T  29762412 ggtgttccaccctccttgtg 29762431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 119 - 664
Target Start/End: Original strand, 27486355 - 27486900
Alignment:
Q  119 tccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaat-tttcgaccgacattcccaatgtt--ccatt 214  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||  |||| |   |||||  ||||||||   |||||  || ||    
T  27486355 tccaactccaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacagaactcaagcatttcgctcgacattc---atgttttccttt 27486451  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatc 314  Q
     | || | |||||| |||||||  | |  ||| |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |    
T  27486452 gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaattgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aataccttcatctaaacc 27486550  T
Q  315 ggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcg-aatattggagacctcccgtttggcaagtttgaatt-accccattcaaag 412  Q
     ||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||   ||||| ||  || |||  | |||  ||   |||||||| ||||||||| | | |||| ||||    
T  27486551 agcctagcaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcggaatgcttgagttctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattaaaag 27486650  T
Q  413 g-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagc 511  Q
    | ||||||||||||||||||||||  ||||  | | || || ||||||||||||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  27486651 gtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttcaggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagc 27486747  T
Q  512 aacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactc 611  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| | ||||    
T  27486748 aacgtcacccgcatatcgatccaatggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaattaaactc 27486847  T
Q  612 tccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  27486848 tcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaaggtgatctaccctccttgtg 27486900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 59 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 45689719 - 45689117
Alignment:
Q  59 aacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaat 157  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||| |||| ||    ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  45689719 aacaagtttgaattgccccatctagagtaagacaattgttgtagttggaa---tgtgcattcctactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaat 45689623  T
Q  158 tcaaacatgccaagcaacaagactccaat-tttcgaccgacattcccaatgttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggta 256  Q
    |||||| ||| || ||||| ||||| |   ||||| ||  |||||    | |||| || | || | |||||| ||||| | || |  ||| |||||| ||    
T  45689622 tcaaacttgctaaacaacaggactcaagcatttcgccccgcattcatgtttttcctttgaaaaaaataaatttttgttcggtttgctttagatgatgata 45689523  T
Q  257 ttcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaat 356  Q
    ||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||   ||||| ||   |||     
T  45689522 ttcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aataccttcatctaaaccagcataacaagaatttaatcttttcgaaggaaaaacatgaac 45689424  T
Q  357 gtcggtcgaa-tattggagacctc-ccgtttggcaagtttgaattaccccatt-caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgta 452  Q
    || || |||| |  | ||| | |  ||||||||||||||||||||| || ||| || ||| ||||||||||||||||||||||  ||||  | | || ||    
T  45689423 gttgggcgaaatgcttgagtcatggccgtttggcaagtttgaattatccaatttcagaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttacccta 45689327  T
Q  453 cctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctc 552  Q
     |||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45689326 actaatgacgatcttatggcggaatcaagctgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatccatccactggaacatgttgtgctc 45689227  T
Q  553 ccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttcc 652  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||   ||| ||| | ||||    
T  45689226 ccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatattctccccccgtcgagcgttggacgtt--aaccaaacatattcc 45689129  T
Q  653 accctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||    
T  45689128 accctccttgtg 45689117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 664
Target Start/End: Original strand, 49262556 - 49263198
Alignment:
Q  12 aataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt-agacgt 110  Q
    |||||||  |||||||||||| |||||||||| || |||||| | | |||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||| | ||||    
T  49262556 aataccagtattcaagaggcttatcgaatgctggagtcctgtcgattaacaagtttgaattgcctcatccagagtaagacaattgttgtagttgaaacgt 49262655  T
Q  111 ttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaat-tttcgaccgacattcccaatgt 208  Q
         | |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||| ||||| |   ||||| ||  |||||    | |    
T  49262656 g----cattccaactacaagaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacaggactcaagcatttcgccccgcattcatgtttt 49262751  T
Q  209 tccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatt 308  Q
     || || | || | |||||| |||||||  | |  ||| |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||     
T  49262752 ccctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aataccttcat- 49262849  T
Q  309 taaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaa-tattggagacctc-ccgtttggcaagtttgaattaccccat 406  Q
            | |||||||||||||||||||| | ||||| ||   ||| |  || |||| |  ||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  49262850 --------cataacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaacgctgggcgaaatgctggagtcatggccgtttggcaagtttgaatcaccccat 49262941  T
Q  407 t-caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttga 504  Q
    | || ||| ||||||||||||||||||||||  ||||  | | || || ||||||| ||| | || | ||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  49262942 ttcagaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccataactaatgaagatattctagaggaatcaagatgttgatgatatcttcagttga 49263038  T
Q  505 tctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaat 604  Q
    ||||| |||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  49263039 tctcaacaacgttaccagcatatagatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcttttgttaattccactcaagtgaat 49263138  T
Q  605 gatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  49263139 gatactctcccctcgttgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctacttgtg 49263198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 118 - 664
Target Start/End: Original strand, 44336983 - 44337529
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc-caattttcgaccgacattcccaatgtt--ccat 213  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| || || |   ||||| ||| |||||   |||||  || |    
T  44336983 ttccaactgcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacatgagtcacgcatttcgcccggcattc---atgttttcctt 44337079  T
Q  214 tcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaat 313  Q
    | | || | |||||| ||||||| |  |  ||| || ||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||     
T  44337080 tgaaaagaataaatttttgttaggtgtgctttagataatggtattcaattgccaatgaaatgaggttcattccttgacactt-aataccttcatctaaac 44337178  T
Q  314 cggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaa-tattggagacctcccgtttggcaagtttgaatt-accccattcaaa 411  Q
    |  ||||||||||||||| | |||| | ||||| ||   ||||||||  |||| |  | ||| |||   |||||||| ||||||||| | | ||||||||    
T  44337179 caacctaacaagaatttagtattttcaaaggaaaaacatgaatgtcgagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaa 44337278  T
Q  412 gg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcag 510  Q
    || ||||||||||||| | ||| ||  ||||  | | || || ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  44337279 ggtaagacaattgttgcatttgaaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcatattgttgatgatatcttcagttgatctcag 44337375  T
Q  511 caacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatact 610  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||    
T  44337376 caacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatgttgtgcacccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgtgaattccacccaagtgaatgaaact 44337475  T
Q  611 ctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  44337476 ctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaaggtgttccaccatccttgtg 44337529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 68 - 664
Target Start/End: Original strand, 27034933 - 27035528
Alignment:
Q  68 gaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat--gagtaaattcaaacat 165  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||    ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||   | |||||||||||| |    
T  27034933 gaattgccccatccagagtaagacaattgttgtagttggaa---tgtgcattccaactacaataattgtcttacctttgaaatggggtaaattcaaactt 27035029  T
Q  166 gccaagcaacaagactccaat-tttcgaccgacattcccaatgtt--ccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaa 262  Q
    ||||| ||||| ||||| |   ||||  ||| |||||   |||||  || || | || | |||||| |||||||  | | |||| ||||| ||||||||     
T  27035030 gccaaacaacatgactcaagcatttcacccggcattc---atgttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgcattagatgatagtattcaag 27035126  T
Q  263 tgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggt 362  Q
    || |||   |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||| | || | ||||| ||   ||||||||      
T  27035127 tgccaacgaaatgaggtccattccttgacactt-aatacctttatttaaaccagcctaaaaagaatttaatttgttcaaaggaaaaacatgaatgtcgag 27035225  T
Q  363 cgaa-tattggagacctccc-gtttggcaagtttgaattaccccatt-caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaat 458  Q
    |||| | || ||| |||  | |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |  | ||   ||| || |||||    
T  27035226 cgaaatgtttgagtcctggctgtttggcaagtttgaattaccccatttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacctta--tcc-taactaat 27035322  T
Q  459 gacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaa 558  Q
    |||||||| |||| ||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  27035323 gacgatcttctggtggaatcaagttgttgatgatatcttaagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaatatggtgttctcccaaaa 27035422  T
Q  559 catgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctc 658  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  27035423 catactcgtcacgttttcgtcattctttaactccacccaagtgaatgatacccttccctcgtcgagcgttggacgtttataccggacgtattccaccctc 27035522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 272 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 44598088 - 44597697
Alignment:
Q  272 aatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaa-tatt 370  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||   ||||| ||  |||| |       
T  44598088 aatgaggttcattccttgacactt-aataccttcatctaaaccagcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgca 44597990  T
Q  371 ggagacctcccgtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctac 468  Q
      || |||   |||||||| ||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||| |  | || || ||||||||||||| |    
T  44597989 aaagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa--tgcactt-taccctaactaatgacgatcttc 44597893  T
Q  469 tggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtc 568  Q
     |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  44597892 cggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcatcaacgtcacccacatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatactcatc 44597793  T
Q  569 atgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44597792 acgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaaggtgttccaccctccttgtg 44597697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 638
Target Start/End: Original strand, 46179839 - 46180465
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||  ||||   | | |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||     
T  46179839 ttgaataccaacattcaagaggcttatcgaatg-tag--tcctcccgattaacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgtagttggaa 46179935  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaat-tttcgaccgacattcccaat 206  Q
       ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||| ||||| |   ||||| ||  | ||| |  |    
T  46179936 ---tgtgcatttcaactacaacaattgtcttacctttgaatgaggtaaattcaaactggccaaacaacatgactcaagcatttcgccccgcgttcacgtt 46180032  T
Q  207 gttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttca 306  Q
     |||| || | |||| | |||| |||||||  |    |||  ||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  46180033 tttcctttgaaaataatgaatttttgttaggcttactttagttgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aatactttca 46180131  T
Q  307 tttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaa-tattggagacctc-ccgtttggcaagtttgaattacccc 404  Q
    | |||| | || |||||||||||||||||||| | ||||| ||   ||| |  || |||| |  | ||| | |  |||||||||||||||||||||||||    
T  46180132 tctaaaccagcataacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaacgctgggcgaaatgcttgagtcatggccgtttggcaagtttgaattacccc 46180231  T
Q  405 att-caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagtt 502  Q
    ||| || ||| ||||||||||||||||||||||  ||||  | | || || ||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||    
T  46180232 atttcagaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcagaatcaagctgttgatgatatcttcaatt 46180328  T
Q  503 gatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactca-agtg 601  Q
    ||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||| || ||||    
T  46180329 gatctcaacaacgttacccacatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccacccagagtg 46180428  T
Q  602 aatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttat 638  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46180429 aatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttat 46180465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 383 - 664
Target Start/End: Original strand, 48568334 - 48568614
Alignment:
Q  383 tttggcaagtttgaattaccccatt-caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaa 480  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||  ||||  | | || || |||||||| |||| |||||| ||||||    
T  48568334 tttggcaagtttgagttacccaatttcagaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacaatcttctggcgaaatcaa 48568430  T
Q  481 acttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtca 580  Q
      | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  48568431 gttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcatca 48568530  T
Q  581 ttcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  48568531 ttctttaactccacccaagtgaatgatattctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaactaattccaccctccttgtg 48568614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 248 - 661
Target Start/End: Original strand, 30309626 - 30310033
Alignment:
Q  248 atgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaac 347  Q
    |||||||||||||| || |||   ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | | ||||||| ||||||||||||| | |||||     
T  30309626 atgatggtattcaagtgccaacgaaataaggttcattccttgacactt-aataccttcatctaaaccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaa 30309724  T
Q  348 aatgagaatgtcg-gtcgaatattggagacctc-ccgtttggcaagtttgaattaccccatt-caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcatt 443  Q
    ||   ||||| || ||  |||  | ||| |||  || ||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| |||||||||||||||||  ||||      
T  30309725 aacatgaatgccgagtgaaatgcttgagtcctggccatttggcaagtttgaattaccccatttcggaggtaagataattgttgtagttggaa--tgcac- 30309821  T
Q  444 cattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacat 543  Q
    | | || || ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||       |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  30309822 cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagctgttgatgatatattcagttgatctcg------tcacccgcatatcgatccactgaaacgt 30309915  T
Q  544 gttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccga 643  Q
      |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  30309916 cctgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaattccacccaagtgaatgataccctccccccgtcgagtgttggacgtttataccga 30310015  T
Q  644 acgtgttccaccctcctt 661  Q
    ||||||||||||||||||    
T  30310016 acgtgttccaccctcctt 30310033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 380 - 664
Target Start/End: Original strand, 41874811 - 41875094
Alignment:
Q  380 ccgtttggcaagtttgaattaccccatt-caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaat 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| |||  ||||  | | || || ||||| ||||||| ||||||||||    
T  41874811 ccgtttggcaagtttgaattaccccatttcagaggtaagacaattgttgtagtttgaa--tgcac-cttaccctaactaataacgatcttctggcggaat 41874907  T
Q  478 caaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcg 577  Q
    |||  |  | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  41874908 caagttgctaatgatatctttagttgatctcagcaacattacccgcatatcgatccactagaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcg 41875007  T
Q  578 tcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    || ||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||    
T  41875008 tcgttatttaactccacccaagtgaatgatactctcccctcttcgagcattggacgttgataccgaactaattccaccctccttgtg 41875094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 59 - 662
Target Start/End: Original strand, 50067865 - 50068467
Alignment:
Q  59 aacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagt-aaat 157  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||    
T  50067865 aacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgtagttggaa---tgtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggcaaat 50067961  T
Q  158 tcaaacatgccaagcaacaagactcca--attttcgaccgacattcccaatgttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggt 255  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||| |  ||||| | ||  |||||    | |||  || | || | |||||| ||||||   | | |||| ||||||||    
T  50067962 tcaaacttgccaaacaacaggactcaagcatttt-gcccctcattcatgtttttcatttgaaaagaataaatttttgttaagcttgcattagatgatggt 50068060  T
Q  256 attcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaa 355  Q
    |||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||   || ||||||||||||||| |||| | ||||| ||   |||    
T  50068061 attcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aataccttcatcaaaactagcataacaagaatttaatattttcaaaggaaaaacatgaa 50068159  T
Q  356 tgtcggtcgaa-tattggagacctc-ccgtttggcaagtttgaattaccccatt-caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgt 451  Q
     |  || |||| |  | ||| | |  ||||||| |||||||| ||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||| |  | || | ||  |    
T  50068160 cgatgggcgaaatgcttgagtcatggccgtttgacaagtttgcattaccccatttcagagctaagacaattgttgtagttggaatgcacctt-actc--t 50068256  T
Q  452 acctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgct 551  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50068257 aactaatgacgatcttctggcggaatcaagctgttgacgatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgatgtgct 50068356  T
Q  552 cccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttc 651  Q
    ||||||||||| ||||||  |||| ||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| || ||||||||| | |||    
T  50068357 cccaaaacatgttcgtcacatttttgtcgttctttaaatccacccaagtgaatgatactctccactcgtcgagtgttggaccttcataccgaacatattc 50068456  T
Q  652 caccctccttg 662  Q
    |||||||||||    
T  50068457 caccctccttg 50068467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 212 - 664
Target Start/End: Original strand, 16531852 - 16532300
Alignment:
Q  212 attcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaa 311  Q
    ||||| || ||||||||||||||||  | || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16531852 attcaaaagattaaattcttgttaggcttggtttaaatgatgatattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttcaataccttcatctaa 16531951  T
Q  312 atcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaa-tgtcggtcgaata-ttggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattca 409  Q
    |   |||||| | ||||||||||||||||  |||||||| |||| ||  ||  ||| | || | || ||   ||||  |||||||||||| ||   ||||    
T  16531952 actagcctaaaatgaatttaatcttttgaatggaacaat-agaactgctgggtgaaaagtttgggaactggtgtttaacaagtttgaatttccat-ttca 16532049  T
Q  410 aaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctca 509  Q
      | ||||||||||||||||||||||| |||||||    | |||||||| ||||||| || ||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16532050 gggtaagacaattgttgtagttggaagatgcattc----catacctaatcacgatcttctagcgaaatcagactattgataatatcttcagttgatctca 16532145  T
Q  510 gcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatac 609  Q
    ||||| | || |||||||| ||||| | || |||| | |||||||| || |||||| |||  |||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||     
T  16532146 gcaacgttacacgcatatcaatccattagagcatgctctgctcccataatatgctcatcacattttcgtcgttcgttaattccacccaacttaatgatat 16532245  T
Q  610 tctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||| |||  |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  16532246 tctctcctcatcgagcgttgtacgtttatatcgaacgtattccatcctccttgtg 16532300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 206 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 16081737 - 16081298
Alignment:
Q  206 tgttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttc 305  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||  | |  ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16081737 tgttccattcaaaagattaaatttttgttaggattgatttagatgatgacattcaagtgtcaaaagaatgaggtccattcattgacacttcaataccttc 16081638  T
Q  306 atttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatg-tcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaatt-accc 403  Q
    || |||| |  ||||| || |||||||| |||||| |||||||||  || |  | ||| |||| || | || ||  | |||| ||||||| |||| ||||    
T  16081637 atctaaaccaacctaaaaaaaatttaattttttgaaaggaacaataggacttctaggt-gaatgtttgggaactgtcatttgacaagtttaaatttaccc 16081539  T
Q  404 cattcaa-aggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagtt 502  Q
    ||||  | || |||||||||||||||| ||||||||||||||    | |||||||| ||||||| | ||| |||| ||||| || |  ||||  ||||||    
T  16081538 cattttagagtaagacaattgttgtagctggaaggtgcattc----cctacctaatcacgatcttccggcagaattaaactcttcagtatattctcagtt 16081443  T
Q  503 gatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtga 602  Q
    |||  ||||||| | || |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||  || |||    
T  16081442 gattgcagcaacgttacacgcatatcgatcaactagaacatgttgtgctccaaaaacatgctcctcatgttatcgtcgttcgttaattccacctaactga 16081343  T
Q  603 atgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgt 647  Q
    ||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16081342 atgatatcctcccctcgtcgagcgttgaacgtttataccgaacgt 16081298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 500 - 662
Target Start/End: Original strand, 49598921 - 49599082
Alignment:
Q  500 gttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaag 599  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  49598921 gttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgcttgtcacgttt-cgtcattctttaactccactcaag 49599019  T
Q  600 tgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttg 662  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49599020 tgaatgatactctcccctcgtcgagtgttgaacgtttataccgaacgtattccaccctccttg 49599082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 49397296 - 49397048
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||   ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  49397296 ttgaataccatcattcaaaatgctcatcgaatgctggattcctaccgtttaacaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgcagttggac 49397197  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatg 207  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||             || |||||| ||||||||||  |    
T  49397196 gtttgtatcttccaactccaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaag-------------atgttcgactgacattcccatag 49397110  T
Q  208 ttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaa 269  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| || |  |||||||| ||||||||| |||||||    
T  49397109 ttccattcaaaagattaaattcttgttaggtttgatttaaatgacggtattcaagtgtcaaa 49397048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 173
Target Start/End: Original strand, 38044746 - 38044911
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    ||||||| |||  ||||||| |||||||| ||| |  |||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38044746 ttgaatagcattgttcaagatgctcatcgcatgttgtattcttgccgtttaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttggac 38044845  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagca 173  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  38044846 gtttgtacctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagca 38044911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 115 - 438
Target Start/End: Original strand, 13973146 - 13973470
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| |  || | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |    
T  13973146 accttccagctacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctccaatattcgaccgacattcccattgttcctgt 13973244  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt-gacacttcaataccttcatttaaat 313  Q
    || || ||||||||||||||||  ||   |||||||| |||||| || ||||||  |||||     ||||| || |||| || |||||| ||||||||      
T  13973245 caaaagattaaattcttgttaggctgat-ttaaatgaaggtattgaagtgtcaag-gaatggacctcattcttttgacatttgaataccatcatttaatc 13973342  T
Q  314 cg-gcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaa 411  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||| | | | | |||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  13973343 ccagactaacaagaatttaatcttttgaatggaacattgggaatgtcggtcgaatattggagtcatgctgcttggcaagtttgaatttactacattcaaa 13973442  T
Q  412 gg-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    || || ||||||||||||||||||||||    
T  13973443 ggtaaaacaattgttgtagttggaaggt 13973470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 206 - 428
Target Start/End: Original strand, 16097843 - 16098063
Alignment:
Q  206 tgttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttc 305  Q
    ||||||||||| || ||| |||| |||||||  | || ||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  16097843 tgttccattcaaaagattgaattattgttaggcttggtttaaatgatggtat---agtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttcaatactttc 16097939  T
Q  306 atttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattacccca 405  Q
    || |||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||   |||||| |   ||||  | | || |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16097940 atctaaaccagcctaacaagaatttaatcttttgaaaagaacaacatgaatgttgagtgaatgcttgggaactcccgtttaacaagtttgaattacccca 16098039  T
Q  406 -ttcaaaggaagacaattgttgta 428  Q
     |||| || |||||||||||||||    
T  16098040 tttcagagtaagacaattgttgta 16098063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 115 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 24270347 - 24270025
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |  ||||||||| ||||||  | || |  |||||| || ||||| |||||||| |||||| ||    
T  24270347 accttccagctacaacaattgtctt-cctctgaatggggtaattcaaacttgccaaatagcacg--tccaatgtttgaccggcattcccattgttccttt 24270251  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt-gacacttcaataccttcatttaaat 313  Q
    || || ||||||||||||||||   ||  |||||||| |||||| |||||||||  ||||||    ||||| || ||||||| |||||  |||||||||     
T  24270250 caaaagattaaattcttgttaggccggt-ttaaatgaaggtattgaaatgtcaat-gaatgaacctcattcttttgacacttgaatacagtcatttaaac 24270153  T
Q  314 cgg-cctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaa 411  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| |||||| ||||||||| ||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24270152 caaacctaacaagaatttaatcttttgaatggaactatgggaatgccggtcgtatattggagtcctgctgcttggcaagtttgaatttaccccattcaaa 24270053  T
Q  412 gg-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    || || ||||||| ||||||||||||||    
T  24270052 ggtaacacaattggtgtagttggaaggt 24270025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 59 - 534
Target Start/End: Original strand, 29707145 - 29707621
Alignment:
Q  59 aacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaat 157  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||| |||| ||    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||    
T  29707145 aacaagtttgaattgccccatccagagtaagataattgttggagttggaa---tgtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtcaat 29707241  T
Q  158 tcaaacatgccaagcaacaagactccaat-tttcgaccgacattcccaatgtt--ccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatgg 254  Q
    |||||| ||| || ||||| ||||| |   ||||  ||| |||||   |||||  |  || | || | |||||| |||||||  | |  ||| |||||||    
T  29707242 tcaaacttgctaaacaacatgactcaagcatttcacccgccattc---atgttttcgtttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatgg 29707338  T
Q  255 tattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgaga 354  Q
    |||| || || |||  |||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||| |||| | | ||||||||||||||||||||| | ||||| ||   ||    
T  29707339 tatttaattgccaacggaatgaagttcattccttgacactt-aatacattcatctaaaccagtctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatga 29707437  T
Q  355 atgtcggtcgaa-tattggagacctc-ccgtttggcaagtttgaattaccccatt-caaagg----aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcatt 447  Q
    ||| ||  |||| |  | ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||    ||||||||||||| ||||| ||  ||||  | |     
T  29707438 atgccgagcgaaatgcttgagtcctgaccgtttggcaagtttgaattaccccatttcagaggtaagaagacaattgttgcagttgtaa--tgcac-cttg 29707534  T
Q  448 ccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatcca 534  Q
    || || || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29707535 ccctaacttatgacgatcttctagcggaatcaaacttttgatgatatctttagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatcca 29707621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 115 - 438
Target Start/End: Original strand, 37778301 - 37778625
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    |||||||  ||||||||||| |||| ||| |||||| |  ||||||||| |||||| |  || || |||||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  37778301 accttccgcctacaacaattttctt-cctctgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggattccaatattcgaccgacattcctattgttccatt 37778399  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt-gacacttcaataccttcatttaaat 313  Q
    || || ||||| ||| ||||||  |||  ||| || | |||||| || ||||||  ||||||    ||||| || ||||||| |||||| |||||||||     
T  37778400 caaaagattaagttcatgttaggatggt-ttagattaaggtattgaagtgtcaag-gaatgaacctcattcttttgacacttgaataccatcatttaaac 37778497  T
Q  314 cg-gcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaa 411  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||| ||||||||| ||| | | |||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  37778498 caagcctaacaagaatttaatcttttgaatggaacattgggaatgtcggtcgtatattggagtcctgctgcttggcaagtttgaatttaccacattcaga 37778597  T
Q  412 gg-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    || || ||||||||||||||||||||||    
T  37778598 ggtaacacaattgttgtagttggaaggt 37778625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 115 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 14173742 - 14173418
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| |  || ||||| ||| ||| |||| |||| ||| |||||   |    
T  14173742 accttccagctacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggactctaatgttcaaccggcatttccattgttcatgt 14173644  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt-gacacttcaataccttcatttaaat 313  Q
    || || |||||||||||||||| | ||  |||||||| |||||| || ||||||  |||||     ||||| || ||||||| |||||| |||||||||     
T  14173643 caaaagattaaattcttgttaggtcggt-ttaaatgaaggtattgaagtgtcaag-gaatggacctcattcttttgacacttgaataccgtcatttaaac 14173546  T
Q  314 cgg-cctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaa 411  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| |||||||| ||||||| ||| | | |||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  14173545 caaacctaacaagaatttaatcttttgaatggaactatgggaatgccggtcgaacattggagtcctgctgcttggcaagtttgaatttactgcattcaaa 14173446  T
Q  412 gg-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    || || ||||||||||||||||||||||    
T  14173445 ggtaacacaattgttgtagttggaaggt 14173418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 115 - 438
Target Start/End: Original strand, 36909783 - 36910106
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| |  || || |||||  ||||||||||||||||| ||||||  |    
T  36909783 accttccagctacaacagttgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggattccaaggttcgaccgacattcccattgttcctgt 36909881  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt-gacacttcaataccttcatttaaat 313  Q
    || || ||||||||||| ||||   ||  |||||||| |||||| || ||||||  |||||     ||||| || ||||||| |||||  ||||||||||    
T  36909882 caaaagattaaattcttattaggccggt-ttaaatgaaggtattgaagtgtcaag-gaatggacctcattcttttgacacttgaatactgtcatttaaat 36909979  T
Q  314 cgg-cctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaa 411  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||| ||||| ||||||| ||| | | ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  36909980 caaacctaacaagaatttaatcttttgaatggaactatg-gaatgtcgatcgaacattggagtcctgctgcttggcaattttgaatttaccccattcaaa 36910078  T
Q  412 gg-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    || || ||||||||||||||||||||||    
T  36910079 ggtaacacaattgttgtagttggaaggt 36910106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 22528155 - 22527984
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||| |||||| || |||||  | | |||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| ||     
T  22528155 ttgaataccattgttcaagatgctcatcaaatgctggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatctagagtaagacaattgttgcagttggaa 22528056  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
       ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  22528055 ---tgtgcattccaactacaacaattgtgttacctttgaatgagataaattcaaacctgcaaaacaacaagactc 22527984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 287 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 35526011 - 35525857
Alignment:
Q  287 ttgacacttcaataccttcatttaaatcgg-cctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgttt 385  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||| || ||||||| ||| | | ||    
T  35526011 ttgacacttgaataccgtcatttaaaccaaacctaacaagaatttaatcttttgaatggaactatgggaatgtcggtcaaacattggagtcctgctgctt 35525912  T
Q  386 ggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  35525911 ggcaagtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttgtagttggaaggt 35525857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 48227186 - 48226860
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||| | ||||||| ||| ||||||| ||  | |||||  | | |||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||| ||     
T  48227186 ttgaataccagcgttcaagacgcttatcgaatactgaagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccatagtaagacaattgttgcagttggaa 48227087  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaat-tttcgaccgacattcccaat 206  Q
       ||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||| ||||| ||||||||  ||||  ||| |||||   ||    
T  48227086 ---tgtgcattcaaactccaacaattgtcttacctttgaatgagatagattcaaacctgtcaaacaacaggactccaacatttcacccggcattc---at 48226993  T
Q  207 gtt--ccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacctt 304  Q
    |||  || || | || | |||||| ||||||||   |  |||||||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  48226992 gttttcctttgaaaagaataaatttttgttagacgtgctttaaatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aatacctt 48226894  T
Q  305 catttaaatcggcctaacaagaatttaatctttt 338  Q
    ||| ||||   |||||||||||||||||||||||    
T  48226893 catctaaactagcctaacaagaatttaatctttt 48226860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 316 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 49926164 - 49926038
Alignment:
Q  316 gcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaagg-a 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||  | |||||||||| |    
T  49926164 gcctaacaagaatttaatcttttgaatggaacattggaaatgtcggtcgaatattggagtcctgctgcttggcaagtttgaatttactcattcaaaggta 49926065  T
Q  415 agacaattgttgtagttggaaggtgca 441  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||    
T  49926064 acacaattgttgtagttgggaggtgca 49926038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 529 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 13148450 - 13148365
Alignment:
Q  529 gatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctcc 614  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13148450 gatccactggaacatgttgtgctctcaaaacatgttcttcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcc 13148365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 205 - 340
Target Start/End: Original strand, 21484204 - 21484339
Alignment:
Q  205 atgttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacctt 304  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| | || |||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||    
T  21484204 atgttccattcaaaagattaaattcttgttagactcggtttaaatgagggtattgaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacactttattgcctt 21484303  T
Q  305 catttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttga 340  Q
    ||| |||| |  ||||||| |||||| || ||||||    
T  21484304 catctaaaccaacctaacatgaatttgattttttga 21484339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 115 - 444
Target Start/End: Original strand, 13283923 - 13284253
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| ||  ||    |||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||| ||    
T  13283923 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgttaaatggcaagactcgaatattcgtccgacattcccattgttccttt 13284021  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt-gacacttcaataccttcatttaaat 313  Q
    || |  ||||||||||||||||| |||  ||| |||| |||||| || ||||||   |||||  || |||| || |||| || |||||| |||||||||     
T  13284022 caaacgattaaattcttgttagactggt-ttagatgaaggtattgaagtgtcaaggaaatgacctc-attcttttgacatttgaataccatcatttaaac 13284119  T
Q  314 cg-gcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaatta-ccccattcaaa 411  Q
    |  ||| || || || | ||||||||||  ||||||||||||||| ||| || ||||| |||   | | |||| |||||||||||||  ||||||||||     
T  13284120 caagcccaaaaataactgaatcttttgaatggaacaatgagaatgccggacggatatttgagtgatgctgtttagcaagtttgaatttgccccattcaag 13284219  T
Q  412 gg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13284220 ggtaagacaattgttgtagttggaaggtacattc 13284253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 115 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 24363788 - 24363472
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||           ||||| ||| |||| |||||||||||| |||||| ||    
T  24363788 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgtt---------gactcaaatattcgcccgacattcccattgttccttt 24363699  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcc-ttgacacttcaataccttcatttaaat 313  Q
    || || ||||||||||||| ||  ||| || |||||| |||||| || ||| ||  |||||     |||||  ||||||| |||||||| |||||||||     
T  24363698 caaaagattaaattcttgtgaggctggtat-aaatgaaggtattgaagtgttaag-gaatgcacctcattctgttgacacgtcaataccatcatttaaaa 24363601  T
Q  314 cg--gcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaa 410  Q
    |   ||||||||| |||||||||||||||  | ||||||| ||||||||| |||||||| | | ||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  24363600 ccaagcctaacaataatttaatcttttgaatgaaacaatgggaatgtcggacgaatatttgtgtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccattcag 24363501  T
Q  411 ag-gaagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24363500 agataagacaattgttgtagttggaaggt 24363472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 19160965 - 19160794
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| || |||||  | | |||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||| ||     
T  19160965 ttgaataccattgttcaagatgctcatcgaatgctggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagggtaagacaattgttgcagttgga- 19160867  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
       ||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  19160866 --atgtgcattccaaccacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactc 19160794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 115 - 236
Target Start/End: Original strand, 49396926 - 49397046
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| | ||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||  |    
T  49396926 accttccagctacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgacatgactccaatgttcgatcgacattcccattgttcctgt 49397024  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttag 236  Q
    || || ||||||||||||||||    
T  49397025 caaaagattaaattcttgttag 49397046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 317 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 35586715 - 35586592
Alignment:
Q  317 cctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-a 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||| | | ||| ||| ||| || |||| ||||||||||| |    
T  35586715 cctaacaagaatttaatcttttgaatggaactatgggaatgtcggtcgaacattggagtcctgcagcttgacaaatttaaatttactccattcaaaggta 35586616  T
Q  415 agacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  35586615 acacaattgttgtagttggaaggt 35586592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 115 - 415
Target Start/End: Original strand, 41780915 - 41781215
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    ||||| || |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| |  || ||||||||| ||| |||  |||||||| |||||   |    
T  41780915 accttgcagctacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggactccaatattcaaccagcattcccattgttcttgt 41781013  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt-gacacttcaataccttcatttaaat 313  Q
    || || ||||||||||||||||   ||  |||||||| |||||| || ||||||  |||||     ||||| || |||| || |||||| ||||||||      
T  41781014 caaaagattaaattcttgttaggccggt-ttaaatgaaggtattgaagtgtcaag-gaatggacctcattcttttgacatttgaataccatcatttaatc 41781111  T
Q  314 cg-gcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaa 411  Q
    |  || ||| ||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||| ||||||||| ||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41781112 ccagcttaataagaatttaatcttttgaatggaacattgggaatgtcggtcgtatattggagtcctgctgcttggcaagtttgaatttaccccattcaaa 41781211  T
Q  412 ggaa 415  Q
    ||||    
T  41781212 ggaa 41781215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 382 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 22527782 - 22527680
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaa 481  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  | | || || ||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  22527782 gtttgacaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaa--tgca-ccttaccctaactaatgatgatcttctggcgaaatcaaa 22527686  T
Q  482 cttttg 487  Q
    ||||||    
T  22527685 cttttg 22527680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 287 - 438
Target Start/End: Original strand, 35185363 - 35185517
Alignment:
Q  287 ttgacacttcaataccttcatttaaatcgg-cctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgttt 385  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| |   |||||||| |||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||||||  |||||| | | | | ||    
T  35185363 ttgacacttgaataccatcatttaaaccaaacctaacaataatttaatcttttgaatggaactatgggaatgttggtcgaacgttggagtcttgctgctt 35185462  T
Q  386 ggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  35185463 ggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtgacacaattgttgtagttggaaggt 35185517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 388 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 18170667 - 18170606
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattcc 449  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18170667 caagtttgaattacctcattcaaagaaagacaattgttgttgttggaaggtgcattcattcc 18170606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 600 - 664
Target Start/End: Original strand, 16098078 - 16098142
Alignment:
Q  600 tgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16098078 tgaatgatattctcccatcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtg 16098142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 244 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 36910262 - 36910198
Alignment:
Q  244 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  36910262 ttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaataccatcatt 36910198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 38046409 - 38046160
Alignment:
Q  124 ctacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcagaatatt 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| | ||| | ||||||| |||||||||||||| || ||||||  ||| || |||    
T  38046409 ctacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgacaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctgtcaaaagatt 38046311  T
Q  224 aaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc-cttgacacttcaataccttcatttaaatcg-gcctaa 321  Q
    | | ||||||||| |  || |||||||| |||||| ||||||| || |||||     |||||  |||||| || |||||| ||||||||  || ||||||    
T  38046310 atactcttgttag-tctggtttaaatgaaggtattaaaatgtc-aacgaatggacctcattcttttgacatttgaataccgtcatttaatccgagcctaa 38046213  T
Q  322 caagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggag 374  Q
    |||||||||||||||||||  | || | || ||||| ||||||||||||||||    
T  38046212 caagaatttaatcttttgaatgaaatattgggaatgccggtcgaatattggag 38046160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Original strand, 49598445 - 49598618
Alignment:
Q  10 tgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | || || ||  | | ||| |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||| ||      
T  49598445 tgaataccatcattcaagaggcttatcgaatgttggagtcatgccgattaacgagtttgaattgcctcatccagagtaagacaattgttgtagttgga-- 49598542  T
Q  110 tttgtaccttccaactacaacaa---ttgtcttacctttgaatga-gtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
      ||| | |||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||| |||||    
T  49598543 -atgtgcattccaactacaacaattgttgtcttacctttgaatgaggtaaattcaaactggccaaacaacatgactc 49598618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 438
Target Start/End: Original strand, 6435994 - 6436318
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||| |  || | ||||||| ||||||||||| | ||| ||||    |    
T  6435994 accttccagctacaacaattgtctt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctccaatattcgaccgacaattccattgtttatgt 6436092  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt-gacacttcaataccttcatttaaa- 312  Q
    || || ||||||||||| ||||  |||  |||||||| | |||| || ||||||  |||||     ||||| || | || || |||||| ||||||||      
T  6436093 caaaagattaaattcttattaggctggt-ttaaatgaagatattgaagtgtcaag-gaatggacctcattcttttggcatttgaataccatcatttaatc 6436190  T
Q  313 tcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaa 411  Q
    || ||||||||| ||||||||||| |||  | |||| || ||||| ||||||||| || ||| |||||   |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6436191 tcagcctaacaaaaatttaatcttatgaatgaaacattgggaatgccggtcgaattttagagtcctcctacttggcaagtttgaatttaccccattcaaa 6436290  T
Q  412 gg-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||    
T  6436291 ggtaaaacaattgttgtagttgggaggt 6436318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 37778754 - 37778687
Alignment:
Q  13 ataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccatt 80  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  37778754 ataccattattcaagaggctcatcgaatgctggattcctgccgtttaacaagtttgaattaccccatt 37778687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 163
Target Start/End: Original strand, 13634855 - 13635008
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    ||||||||||   ||||||||||| ||||||| || || |||||  | | |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||     
T  13634855 ttgaataccagtgttcaagaggcttatcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgcagttgga- 13634953  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaac-aattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaac 163  Q
       ||| | ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  13634954 --atgtgcattccaaccacaacaaattgtgttacctttgaatgagataaattcaaac 13635008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 244 - 302
Target Start/End: Original strand, 24269869 - 24269927
Alignment:
Q  244 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  24269869 ttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 24269927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 388 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 18170826 - 18170765
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattcc 449  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  18170826 caagtttgaattacctcattcaaagaaagacaattgttgctgttggaaggtgcattcattcc 18170765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 152
Target Start/End: Original strand, 48567962 - 48568102
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| || ||||| | || || ||  | | |||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||| |||| ||     
T  48567962 ttgaataccagcattcaagatgcttattgaatgttggagtcatgccgattaacaagtttgaattgccccatctagagcaagacaattgttgtagttggaa 48568061  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag 152  Q
       ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48568062 ---tgtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag 48568102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 244 - 308
Target Start/End: Original strand, 17685863 - 17685927
Alignment:
Q  244 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatt 308  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  17685863 ttaaatgatggtaatcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaataccatcatt 17685927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 244 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 41781369 - 41781305
Alignment:
Q  244 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||    
T  41781369 ttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccatgacacttgaataccatcatt 41781305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 13973623 - 13973568
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  13973623 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 13973568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 438
Target Start/End: Original strand, 23343064 - 23343186
Alignment:
Q  317 cctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-a 414  Q
    ||||||||||||||||| |||| |  |||||| ||  ||||||||||| ||||||||| | | | | |||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  23343064 cctaacaagaatttaattttttaat-ggaacattggaaatgtcggtcgtatattggagtcgtgctgcttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggta 23343162  T
Q  415 agacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    | ||||||||||||||||| ||||    
T  23343163 acacaattgttgtagttgggaggt 23343186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 40533069 - 40532946
Alignment:
Q  317 cctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-a 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||| |||||| ||||||||| | | | | ||| |||||||||| ||||| |||||| ||| |    
T  40533069 cctaacaagaatttaatcttttgaacggaattatgagaatgccggtcgtatattggagtcgtgctgcttgacaagtttgaatttacctcattcagaggta 40532970  T
Q  415 agacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    | || |||||||||||||||||||    
T  40532969 acacgattgttgtagttggaaggt 40532946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Original strand, 46179792 - 46179847
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  46179792 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 46179847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Original strand, 49262506 - 49262561
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49262506 aatgatgttattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttcaatacc 49262561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 443
Target Start/End: Original strand, 17372946 - 17373275
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||  || |  || ||||| ||  |||| |||||||| | | |||||| ||    
T  17372946 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgttaaacggcaggactcaaacattcgcccgacatttcaattgttccttt 17373044  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc-cttgacacttcaataccttcatttaaat 313  Q
    || || ||||||||||||||||  | || |||||||| |||||| || |||| ||||||||     |||||  ||||||||| |||| | | |||||||     
T  17373045 cacaagattaaattcttgttaggct-ggtttaaatgaaggtattgaagtgtc-aaagaatgcacctcattcttttgacacttgaatatcattatttaaa- 17373141  T
Q  314 cg--gcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaa 410  Q
    ||  | |||||||||||||||||||| ||  |||| |||   |||||| | ||||| |||||| ||| | |||| ||||||||||| ||||| ||||||     
T  17373142 cgaagtctaacaagaatttaatctttcgaatggaaaaatagaaatgtcagacgaatgttggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttacctcattcag 17373241  T
Q  411 agg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcatt 443  Q
     ||  |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  17373242 gggttagacaattattgtagttggaaggtacatt 17373275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 19160609 - 19160543
Alignment:
Q  38 aatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  19160609 aatgctcgagtcctgttgtttgacaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagtt 19160543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 22527799 - 22527733
Alignment:
Q  38 aatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22527799 aatgctcgagtcctgttgtttgacaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagtt 22527733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 388 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 49397244 - 49397198
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttgga 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49397244 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgcagttgga 49397198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 338
Target Start/End: Original strand, 49598685 - 49598774
Alignment:
Q  248 atgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatctttt 338  Q
    |||||||||||||| || |||   |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  49598685 atgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttaacactt-aataccttcatttaaaccagcataacaagaatttaatctttt 49598774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 29762205 - 29762140
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  29762205 ttccaacttcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggactc 29762140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 35525718 - 35525621
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaa-ttaccccattcagagg-aagacaattgttgcagtt 104  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  35525718 ttgaatatcatcattcaagatgctcatcgcatgctggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccattcaggggtaagataattgttgcagtt 35525621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 300
Target Start/End: Original strand, 38044699 - 38044752
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaata 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  38044699 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaata 38044752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 39223769 - 39223708
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatt 308  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  39223769 aatgctggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaataccatcatt 39223708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 308
Target Start/End: Original strand, 49598397 - 49598458
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatt 308  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||    
T  49598397 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacatgaataccatcatt 49598458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 37778805 - 37778757
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacactt 295  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37778805 aatgatggtattcaactgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacactt 37778757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 41781319 - 41781223
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagagg-aagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||| ||||    
T  41781319 ttgaataccatcattcaaaatgctcatcgaatgttggattcgtgccgtttaacaagtttgaattaccccgttcaaaggtaacacaattgttgtagtt 41781223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 181
Target Start/End: Original strand, 44597923 - 44597987
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagact 181  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  44597923 ttccaacttcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggact 44597987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 244 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 49397346 - 49397282
Alignment:
Q  244 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatt 308  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  49397346 ttaaatgatggtattcaagtatcaaaagaacgaggtgcattccttgacacttgaataccatcatt 49397282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 18170739 - 18170668
Alignment:
Q  107 acgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaa 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||  ||||| ||||||    
T  18170739 acgtttgtaccttccaactacaacaattgtgttacctctgaatggggtaaattcaaactggccaaacaacaa 18170668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 18170878 - 18170787
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgc 100  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||| || ||||    || ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  18170878 ttgaataccatcatttaagatgttcatcgaatgctggagtccttccatttaacaagtttgaattacctcattcaaagaaagacaattgttgc 18170787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 18170928 - 18170861
Alignment:
Q  244 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaa 311  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  18170928 ttaaatgacgatattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattctttgacacttgaataccatcatttaa 18170861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 27486674 - 27486615
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaaca 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  27486674 ttccaactacaacaattgtcttaccttttaatgagataaattcaaacctgccaaacaaca 27486615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Original strand, 30309357 - 30309412
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  30309357 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaacgaggtgcattccttgacacttgaatacc 30309412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 38044713 - 38044650
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaatt 72  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  38044713 ttgaataccatcattcaagatgctcatcagatgctagagtcctgttgtttagcaagtttgaatt 38044650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 182
Target Start/End: Original strand, 41874446 - 41874613
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||| | || || ||  | | |||||||||||||| |||||    ||| ||||||||||||| ||||  |     
T  41874446 ttgaataccagcattcaagatgcttatcgaatgttggagtcatgccgattaacaagtttgaattgcccca----gagcaagacaattgttgtagttgaaa 41874541  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
       ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  41874542 ---tgtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggagcaaattcaaacttgctaaacaacatgactc 41874613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Original strand, 46924783 - 46924838
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  46924783 aatgatgatattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 46924838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Original strand, 47487546 - 47487601
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  47487546 aatgacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 47487601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 382 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 47487754 - 47487699
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaa 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47487754 gtttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 47487699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Original strand, 48567915 - 48567970
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  48567915 aatgatagtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 48567970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 382 - 435
Target Start/End: Original strand, 51270289 - 51270344
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaa 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51270289 gtttggcaagtttgaattgaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 51270344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 302
Target Start/End: Original strand, 13634813 - 13634863
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  13634813 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 13634863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 417 - 516
Target Start/End: Original strand, 14772499 - 14772594
Alignment:
Q  417 acaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacat 516  Q
    |||||| ||||||||||||||||    |||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||  | ||||||| |||||||| |||||||    
T  14772499 acaattcttgtagttggaaggtg----cattccctacctaatcacgatcttctggcagaatcaaactgttgagaacatcttcaattgatctctgcaacat 14772594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 19161007 - 19160957
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  19161007 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 19160957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 29436663 - 29436613
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  29436663 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 29436613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 302
Target Start/End: Original strand, 29761663 - 29761713
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  29761663 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 29761713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 185
Target Start/End: Original strand, 35586333 - 35586407
Alignment:
Q  112 tgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaa 185  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  35586333 tgtaccttccaactgcaacaattatcttacccttgaatggagaaaattcaaacttgctaaacaacaagactccaa 35586407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 388 - 434
Target Start/End: Original strand, 38044798 - 38044844
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttgga 434  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  38044798 caagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttgga 38044844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 302
Target Start/End: Original strand, 39856749 - 39856799
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  39856749 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 39856799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 99
Target Start/End: Original strand, 46924867 - 46924957
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttg 99  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||| | || |||||  | | |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  46924867 ttgaataccagcattcaagatgcttatcgaatgttggactcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttg 46924957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 49428076 - 49428026
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  49428076 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 49428026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 302
Target Start/End: Original strand, 50067773 - 50067823
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  50067773 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 50067823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 362 - 444
Target Start/End: Original strand, 50067841 - 50067923
Alignment:
Q  362 tcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    |||||| |||||| ||| ||| ||  |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50067841 tcgaatgttggagtcctgccggttaacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgtagttggaatgtgcattc 50067923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 13283975 - 13283930
Alignment:
Q  59 aacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  13283975 aacaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagtt 13283930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Original strand, 30309495 - 30309560
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  30309495 ttccaactacaacaattgtcttacctgtgaatggggtaaattcaaacctgccaaacaacatgactc 30309560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 244 - 300
Target Start/End: Original strand, 42571279 - 42571336
Alignment:
Q  244 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcc-ttgacacttcaata 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  42571279 ttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctttgacacttgaata 42571336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 45689815 - 45689762
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaata 300  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  45689815 aatgatgatattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaata 45689762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Original strand, 49397329 - 49397426
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaa-ttaccccattcagag-gaagacaattgttgcagtt 104  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  49397329 ttgaataccatcatttaaaatgctcatcgcatgctggagtcctgctgtttgacaagtttgaatttaccccattcagagataagataattgttgcagtt 49397426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Original strand, 49427609 - 49427673
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  49427609 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggactc 49427673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Original strand, 51270024 - 51270089
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  51270024 ttccaacttcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgctaaacaacaggactc 51270089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 382 - 432
Target Start/End: Original strand, 3658961 - 3659013
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttg 432  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3658961 gtttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttg 3659013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 470 - 558
Target Start/End: Original strand, 19262429 - 19262517
Alignment:
Q  470 ggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaa 558  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| | ||   ||||| ||||| | |||||||| |||||| ||||||    
T  19262429 ggcggaatcaaactgttgagaatatcttcagttgatctcagcaacgtgacaaacatattgatcctcgggaacatgatgtgctgccaaaa 19262517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 295
Target Start/End: Original strand, 27034882 - 27034930
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacactt 295  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  27034882 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattctttgacactt 27034930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 35185682 - 35185634
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacactt 295  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35185682 aatgatgatattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacactt 35185634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 295
Target Start/End: Original strand, 35586426 - 35586474
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacactt 295  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35586426 aatgatggtatttaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacactt 35586474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 44337294 - 44337238
Alignment:
Q  127 caacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  44337294 caacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggactc 44337238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 366
Target Start/End: Original strand, 49397049 - 49397129
Alignment:
Q  287 ttgacacttcaataccttcatttaaatcgg-cctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaa 366  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||| ||||||    
T  49397049 ttgacacttgaataccgtcatttaaatcaaacctaacaagaatttaatcttttgaatggaactatgggaatgtcagtcgaa 49397129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Original strand, 12790780 - 12790835
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  12790780 aatgatcgtattcaagtgtcaaaagaatgagttgcattccttgacacttgaatacc 12790835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 57 - 104
Target Start/End: Original strand, 24363734 - 24363781
Alignment:
Q  57 tcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  24363734 tcaacaagtttgaattacctcattcaaaggaagacaattgttgtagtt 24363781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 382 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 29707256 - 29707201
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaa 435  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29707256 gtttagcaagtttgaattgaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 29707201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Original strand, 39856791 - 39856886
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||||||| | ||||||| ||| |||||||| | || |||||  | | |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  39856791 ttgaataccagcgttcaagacgcttatcgaatgttggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgtagtt 39856886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 382 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 49262714 - 49262659
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaa 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  49262714 gtttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattcttgtagttggaa 49262659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 382 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 50067976 - 50067921
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatta-ccccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaa 435  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50067976 gtttggcaagtttgaatttgccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 50067921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #152
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 255 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 51270489 - 51270442
Alignment:
Q  255 tattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  51270489 tattcaagtgtcaaaagaatgaggttcattccttgacacttgaatacc 51270442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 362 - 444
Target Start/End: Original strand, 13634881 - 13634963
Alignment:
Q  362 tcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    ||||||| ||||| ||| ||| ||  |||||||||||| |||||| || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  13634881 tcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 13634963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #154
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 17686141 - 17686015
Alignment:
Q  317 cctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-a 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||  ||| || |   ||||| |||   | |||||||||||||||| ||| |||||| ||| |    
T  17686141 cctaacaagaatttaatcttttgaatggaacaacgggaataccggacgtacgctggagtcctgatgcttggcaagtttgaatttacctcattcagaggta 17686042  T
Q  415 agacaattgttgtagttggaaggtgca 441  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  17686041 acacaattgttgtagttggaaggtgca 17686015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #155
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 21484267 - 21484213
Alignment:
Q  287 ttgacacttcaataccttcatttaaatcg-gcctaacaagaatttaatcttttga 340  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  21484267 ttgacacttcaataccctcatttaaaccgagtctaacaagaatttaatcttttga 21484213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #156
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 22528197 - 22528147
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  22528197 tggtattcaagtgtcacaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 22528147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #157
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 37778351 - 37778313
Alignment:
Q  61 caagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37778351 caagtttgaattaccccattcagaggaagaaaattgttg 37778313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #158
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 99
Target Start/End: Original strand, 38046368 - 38046406
Alignment:
Q  61 caagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttg 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38046368 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttg 38046406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #159
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 41780965 - 41780927
Alignment:
Q  61 caagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttg 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41780965 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttg 41780927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #160
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 48227228 - 48227178
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  48227228 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcatttcttgacacttgaatacc 48227178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #161
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 49396976 - 49396938
Alignment:
Q  61 caagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttg 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49396976 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttg 49396938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #162
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 17372998 - 17372953
Alignment:
Q  59 aacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  17372998 aacaagtttgaattacctcattcaaaggaagacaattgttgtagtt 17372953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #163
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 192
Target Start/End: Original strand, 17685773 - 17685854
Alignment:
Q  112 tgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcga 192  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||| ||| || || ||  |||||||| |||||    
T  17685773 tgtaccttccaactacaacaattatcttacctctgaatgggataaattcaaacttgctaaacagcagaactccaatgttcga 17685854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #164
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Original strand, 29436195 - 29436260
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatg-agtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  29436195 ttccaactgcaacaattttcttacctttgaatgaaataaattcaaacctgccaaacaacatgactc 29436260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #165
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 104
Target Start/End: Original strand, 29761755 - 29761800
Alignment:
Q  59 aacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  29761755 aacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgcagtt 29761800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #166
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Original strand, 29761827 - 29761892
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||| |||||    
T  29761827 ttccaactgccacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaagcctgccaaacaacaggactc 29761892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #167
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 388 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 48227134 - 48227077
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattca 445  Q
    |||||||||||| |||||| || || ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  48227134 caagtttgaattgccccatccatagtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattca 48227077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #168
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 23343339 - 23343291
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacactt 295  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  23343339 aatgatggtattcaagtgtcaaaagactgagctgcattccttgacactt 23343291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #169
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 252 - 300
Target Start/End: Original strand, 27486221 - 27486269
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaata 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  27486221 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattctttgacacttgaata 27486269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #170
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 388 - 444
Target Start/End: Original strand, 29761757 - 29761813
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    |||||||||||| |||||| || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  29761757 caagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 29761813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #171
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 295
Target Start/End: Original strand, 35525704 - 35525752
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacactt 295  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  35525704 aatgatgatattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcattgacactt 35525752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #172
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 384 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 38044908 - 38044852
Alignment:
Q  384 ttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  38044908 ttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttgtagttgggaggt 38044852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #173
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 338
Target Start/End: Original strand, 41874681 - 41874767
Alignment:
Q  250 gatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatctttt 338  Q
    |||||||||||| || |||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||  |||||||| |||||| ||||||    
T  41874681 gatggtattcaagtgccaacgaaatgaggtccattccttgacactt-aataccttcgtctaaatcatcctaacaa-aatttattctttt 41874767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #174
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 388 - 444
Target Start/End: Original strand, 48568014 - 48568070
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    |||||||||||| ||||||  | || |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48568014 caagtttgaattgccccatctagagcaagacaattgttgtagttggaatgtgcattc 48568070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #175
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Original strand, 49925891 - 49925943
Alignment:
Q  250 gatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  49925891 gatggtattcaagtttcaaaagaatgaggtgcatttcttgacacttgaatacc 49925943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #176
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 176
Target Start/End: Original strand, 21484440 - 21484499
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatga-gtaaattcaaacatgccaagcaaca 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||  |||||| |||||    
T  21484440 ttccaactacaacaattgtcttacctttaaatgaggcaaattcaaaattgccaaacaaca 21484499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #177
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Original strand, 23343325 - 23343388
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaatt 72  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| || ||||| |||| | ||||||||||||    
T  23343325 ttgaataccatcattcaagatgttcatcgcatgctggagtcctgctgtttagcaagtttgaatt 23343388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #178
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 382 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 30309550 - 30309495
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaa 435  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  30309550 gtttggcaggtttgaatttaccccattcacaggtaagacaattgttgtagttggaa 30309495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #179
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 194
Target Start/End: Original strand, 35185193 - 35185271
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgacc 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| || ||| |  || ||||||||| |||||||    
T  35185193 accttccagctacaacaattgtctt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacggcatgactccaatgttcgacc 35185271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #180
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 388 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 41781267 - 41781216
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  41781267 caagtttgaattaccccgttcaaaggtaacacaattgttgtagttgggaggt 41781216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #181
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 263 - 302
Target Start/End: Original strand, 41874415 - 41874454
Alignment:
Q  263 tgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  41874415 tgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 41874454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #182
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 382 - 435
Target Start/End: Original strand, 45689608 - 45689663
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaa 435  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  45689608 gtttagcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagtaggaa 45689663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #183
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 287 - 340
Target Start/End: Original strand, 5765593 - 5765647
Alignment:
Q  287 ttgacacttcaataccttcatttaaatcg-gcctaacaagaatttaatcttttga 340  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  5765593 ttgacacttgaataccatcatttaaaccaagcctaacaagaatttaatcttttga 5765647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #184
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 112 - 150
Target Start/End: Original strand, 15356230 - 15356268
Alignment:
Q  112 tgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatg 150  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  15356230 tgtaccttccaactacaacaattatcttacccttgaatg 15356268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #185
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 382 - 438
Target Start/End: Original strand, 18170514 - 18170572
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  18170514 gtttggccagtttgaatttaccccattcagaggtaacacaattgttgtagttggaaggt 18170572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #186
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 382 - 438
Target Start/End: Original strand, 18170673 - 18170731
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  18170673 gtttggccagtttgaatttaccccattcagaggtaacacaattgttgtagttggaaggt 18170731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #187
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 248 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 19160726 - 19160637
Alignment:
Q  248 atgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatctttt 338  Q
    |||||||||||||| || || |  | |||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||| | || ||||||||||||||| ||||    
T  19160726 atgatggtattcaagtgccacagaattgaggttcaatccttgacactt-aataccttcatctaaaccagcataacaagaatttaatatttt 19160637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #188
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 414 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 27034816 - 27034786
Alignment:
Q  414 aagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27034816 aagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 27034786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #189
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 390 - 444
Target Start/End: Original strand, 49598498 - 49598552
Alignment:
Q  390 agtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    |||||||||| || ||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49598498 agtttgaattgcctcatccagagtaagacaattgttgtagttggaatgtgcattc 49598552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #190
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 402 - 442
Target Start/End: Original strand, 3659308 - 3659349
Alignment:
Q  402 cccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcat 442  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3659308 cccattcaagggcaagacaattgttgtagttggaaggtgcat 3659349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #191
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 12790794 - 12790697
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaa-ttaccccattcagagg-aagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||||| ||||||||||| | | |||| ||| | || ||||| |||| | |||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  12790794 ttgaatacgatcattcaagatgttgatcgtatgttggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccatttagaggtaagataattgttgcagtt 12790697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #192
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 293
Target Start/End: Original strand, 14173262 - 14173311
Alignment:
Q  244 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacac 293  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  14173262 ttaaatgatgatattcatgtgtcaaaagaatgagatgcattccttgacac 14173311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #193
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 14772394 - 14772337
Alignment:
Q  293 cttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaat 350  Q
    |||||||||| |||| |||| |   ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14772394 cttcaataccatcatctaaaccaaactaacaagaatttaatcttttgaaaggaacaat 14772337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #194
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 99
Target Start/End: Original strand, 16098020 - 16098061
Alignment:
Q  59 aacaagtttgaattacccca-ttcagaggaagacaattgttg 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  16098020 aacaagtttgaattaccccatttcagagtaagacaattgttg 16098061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #195
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 18170670 - 18170629
Alignment:
Q  58 caacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttg 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  18170670 caacaagtttgaattacctcattcaaagaaagacaattgttg 18170629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #196
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 204
Target Start/End: Original strand, 23342863 - 23342951
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattccca 204  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |  ||||||||| |||||| |  || |||| |||| |||||||| ||||||||    
T  23342863 accttccagctacaacaattgtctt-cctttgaattgggtaattcaaacttgccaaacggcatgactacaatattcgaccggcattccca 23342951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #197
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 149
Target Start/End: Original strand, 24269780 - 24269817
Alignment:
Q  112 tgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat 149  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  24269780 tgtaccttccaacttcaacaattatcttacctttgaat 24269817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #198
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 302
Target Start/End: Original strand, 29707066 - 29707103
Alignment:
Q  265 tcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  29707066 tcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 29707103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #199
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 170
Target Start/End: Original strand, 35576561 - 35576614
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttg-aatgagtaaattcaaacatgccaa 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||| ||||||    
T  35576561 ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatgaggtaattcaaacttgccaa 35576614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #200
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 141
Target Start/End: Original strand, 49262414 - 49262443
Alignment:
Q  112 tgtaccttccaactacaacaattgtcttac 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49262414 tgtaccttccaactacaacaattgtcttac 49262443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #201
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 14173278 - 14173182
Alignment:
Q  10 tgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaa-ttaccccattcagagg-aagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||| ||||||| || | |||||||| ||||| || ||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||| || ||||  ||||||||||||    
T  14173278 tgaatatcatcatttaaaatgctcatcgcatgctggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccattcaggggtaagatgattgttgcagtt 14173182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #202
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 382 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 17685834 - 17685770
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  17685834 gtttagcaagtttgaatttatcccattcagaggtaagataattgttgtagttggaaggtacattc 17685770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #203
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 17697566 - 17697498
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| | |||||||||||  ||||| ||||| |||||    
T  17697566 accttccaactacaacaattgtcttgcccctgaatgggataaattcaaactcgccaaacaacatgactc 17697498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #204
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 382 - 440
Target Start/End: Original strand, 17697508 - 17697568
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgc 440  Q
    ||||||| |||||||||| | ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  17697508 gtttggcgagtttgaatttatcccattcaggggcaagacaattgttgtagttggaaggtgc 17697568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #205
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Original strand, 19160539 - 19160602
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  19160539 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 19160602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #206
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 388 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 19160913 - 19160857
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    |||||||||||| |||||| ||  | ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19160913 caagtttgaattgccccatccagggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 19160857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #207
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Original strand, 22527729 - 22527792
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  22527729 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 22527792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #208
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 388 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 22528103 - 22528047
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    |||||||||||| ||||||  | || ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  22528103 caagtttgaattgccccatctagagtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 22528047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #209
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 382 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 27035036 - 27034980
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatt-accccatt-caaagg-aagacaattgttgtagttggaa 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  27035036 gtttggcaagtttgaatttaccccatttcaaaggtaagacaattattgtagttggaa 27034980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #210
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 318 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 31451877 - 31451845
Alignment:
Q  318 ctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaat 350  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31451877 ctaacaagaatttaatcttttgaaaggaacaat 31451845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #211
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 12 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 35586437 - 35586377
Alignment:
Q  12 aataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaatt 72  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||||| | ||||||||||||    
T  35586437 aataccatcattcaagatgctcatcgcatgttggagtcttgttgtttagcaagtttgaatt 35586377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #212
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 414 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 39223642 - 39223614
Alignment:
Q  414 aagacaattgttgtagttggaaggtgcat 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39223642 aagacaattgttgtagttggaaggtgcat 39223614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #213
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 382 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 42571494 - 42571442
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-aagacaattgttgtagttg 432  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  42571494 gtttggcaagtttgaatttacccaattcaaaggtaacacaattgttgtagttg 42571442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #214
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 382 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 46179997 - 46179945
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttg 432  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46179997 gtttggccagtttgaatttacctcattcaaaggtaagacaattgttgtagttg 46179945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #215
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 414 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 46924717 - 46924689
Alignment:
Q  414 aagacaattgttgtagttggaaggtgcat 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46924717 aagacaattgttgtagttggaaggtgcat 46924689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 498; Significance: 0; HSPs: 149)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 498; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 48271302 - 48270649
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48271302 ttgaataccaacattcaagaggctcatcgaatgctggattcctgctgtttaacaaatttgaatcaccccattcagaggaagacaattgttgcagctagac 48271203  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| || ||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  48271202 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcatgactctaatattcgaccgatattcccaatg 48271103  T
Q  208 ttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcat 307  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48271102 ttccattcaaaatattaaattcttgttaggctgggattacatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgatgtccattccttgacacttcaataccttcat 48271003  T
Q  308 ttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccatt 407  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  48271002 ttaaaccagcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgttcatcgaatatttgagacctgccgtctggcaagtttgaattaccccatt 48270903  T
Q  408 caaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatct 507  Q
     |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48270902 aaaagaaagacaattgttgtagttggaatgtgcattcattccgtacctaacgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatct 48270803  T
Q  508 cagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgat 607  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48270802 cagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccactcaagtgaatgat 48270703  T
Q  608 actctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctcctt 661  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48270702 actctcccctcgtcgagcgttggacgtctataccgaacgtgttccaccctcctt 48270649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 469; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 664
Target Start/End: Original strand, 21186852 - 21187508
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  21186852 ttgaataccagcattcaagaggctcatcgaatgctggattcctgccgtttaacaagtttgaattaccccattcaaaggaagataattgttgcagttagac 21186951  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatg 207  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  21186952 gtttgtaacttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttcccaagcagcaggactccaatattcgaccggcattcccaatg 21187051  T
Q  208 ttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcat 307  Q
     |||||||| || ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21187052 atccattcaaaagattaaattcttgttaggctgagattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacattcat 21187151  T
Q  308 ttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccatt 407  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  21187152 ttaaaccagcctaacaagaatttaatcttttgacgggaacaatgggaatgccggtcgaatatttgagacctgccgtttgacaagtttgaattacctcatt 21187251  T
Q  408 caaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatct 507  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21187252 caaaggaagacaattattgtagctgaaaggtgcattcattcagtacctaatgacgatcttctgacggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatct 21187351  T
Q  508 cagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgat 607  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  21187352 cagcaacgtcacccgcatatcgatccactagaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcaatcgttaattctacccaagtgaatgat 21187451  T
Q  608 actctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21187452 actctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgtttcaccctccttgtg 21187508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 467; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 661
Target Start/End: Original strand, 46861758 - 46862400
Alignment:
Q  20 cattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtttgtacctt 119  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  46861758 cattcaacaggctcatcgaatgttagattcatgctgtttaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagatgcttgtacctt 46861857  T
Q  120 ccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcaga 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  46861858 ccaactgcaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaactttccaagcagcaggactccaatattcgaccgacattcccaatgttccattcaaa 46861957  T
Q  219 atattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcc 318  Q
    | ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  46861958 agattaaattcttgttaggctgagattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccatttcttgacacttcaataccttcatttaaaccagcc 46862057  T
Q  319 taacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagac 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46862058 taacaagaatttaatcttttgacaggagcaatgagaatgccggtcgaatattggagacatgccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaagaagac 46862157  T
Q  419 aattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatca 518  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||    
T  46862158 aattgttgtatctggaaggtgcattcattccgtaccttatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatcatatcttcagttaatctcagcaacgtca 46862257  T
Q  519 cccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctcccctt 618  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  46862258 ctcgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacaagctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccatccaagtgaatgatactctcccctc 46862357  T
Q  619 gtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctcctt 661  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46862358 gtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctcctt 46862400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 429; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 652
Target Start/End: Original strand, 30354368 - 30355012
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||||  ||||||| || ||||  ||| | |||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  30354368 ttgaataccattgttcaagatgcacatcacatgttggattcctgctgtttaataagtttgaattgccccattcagagaaagacaattgttgcagttggac 30354467  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatg 207  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30354468 gtttgtacctcccaactacaacaactgtgttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatattcgaccgacattcccaatg 30354567  T
Q  208 ttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcat 307  Q
    ||| ||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30354568 ttctattcaaaagattaaatttttgttaggttgggattaaatgacggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcgttgacacttcaataccttcat 30354667  T
Q  308 ttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccatt 407  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30354668 ttaaaccagcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacagtggaaatgccggtcgaatattggagacctgccgtttggcaagtttgaattacctcatt 30354767  T
Q  408 caaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatct 507  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30354768 caaaggaagacaattgttgtagctaaaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatcttttggcagaatcaaacttttgatgatatcttcagctgatct 30354867  T
Q  508 cagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgat 607  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  30354868 cagcaacgtcatccacatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgat 30354967  T
Q  608 actctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttcc 652  Q
    || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30354968 acgctcccctcgtcgaacgttggacgtttataccgaacgtgttcc 30355012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 425; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 664
Target Start/End: Original strand, 36393390 - 36394033
Alignment:
Q  21 attcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtttgtaccttc 120  Q
    |||||||| ||| |||||||| | |||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |    
T  36393390 attcaagatgcttatcgaatgttggatttctgccgtttaacaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgcagttggacgtttgtaactcc 36393489  T
Q  121 caactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcagaa 219  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||    | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  36393490 caactccaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagatgtaggactccaatattcgaccgacattcccagtgttccattcaaaa 36393589  T
Q  220 tattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcct 319  Q
     ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  36393590 gattaaattcttgttaggctgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaaccagcct 36393689  T
Q  320 aacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagaca 419  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36393690 aacaagaatttaatcttt-gacagaaacaacgggaatgccggtcaaatattggaaacctgtcgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagaca 36393788  T
Q  420 attgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcac 519  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36393789 attgtcgtagctggaaggtgcattcattcagtacctaatgaagatcttatggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcac 36393888  T
Q  520 ccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttg 619  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |    
T  36393889 ccgcatatcgatccactggaacatattgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacacaagtgaatgatattctcccctcg 36393988  T
Q  620 tcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36393989 tcgagtgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 36394033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 663
Target Start/End: Original strand, 28113946 - 28114601
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| ||| |||| |  |||||||   || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  28113946 ttgaataccattattcaagatgcttatcaaatgttgaattcctgccatttaacaagtttgaattaccccatttagaggaagacaattgttgcagttggac 28114045  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatg 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||  |    
T  28114046 gtttgtaccttccaactccaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcaacatgactccaatgttcgaccggcattctcatag 28114145  T
Q  208 ttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcat 307  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  28114146 ttccattcaaaagattaaattcttgttaggtttgatttaaatgactgtattcaagtgtcaaaagaatgaggtcaattcattgacacttcaatacattcat 28114245  T
Q  308 ttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccatt 407  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| | | |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  28114246 ttaaaccggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgggaatgccggtcgaacattggagtcgtgccgtttggaaagtttgaattaccacatt 28114345  T
Q  408 caaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatct 507  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||  || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28114346 caaaggaagacaattgttgtagctggaaggtgcatttattcggtacctaatgacaatcttttgacagaatcaaatttttgatgatatcttcagttgatct 28114445  T
Q  508 cagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgat 607  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  28114446 cagcaacgtcacccacatttcgatccattggaacatgttgtgctcctaaaacatgctcgtcatgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgat 28114545  T
Q  608 actctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgt 663  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28114546 actctcccctcgtcgggcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgt 28114601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 247 - 664
Target Start/End: Original strand, 43350892 - 43351308
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaa 346  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43350892 aatgatgatattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattctttgacacttcaataccttcatttaaaccagcctaacaagaatttaatcttttgacaggaa 43350991  T
Q  347 caatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcat 446  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43350992 caatggaaatgtcggtcgaatattggagacctgccgtttggcaagtttgaattacctcattcaaaggaagacaattgttgtagctggaaggtgcattcat 43351091  T
Q  447 tccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgtt 546  Q
    || ||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43351092 tctgtacctaatgacgatcttctggtggaatcagacatttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcaccc-catatcgatccactggaacatgtt 43351190  T
Q  547 gtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacg 646  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  43351191 gtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcatcgagcgttggacgtttatactgaacg 43351290  T
Q  647 tgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||||||||    
T  43351291 tgttccaccctccttgtg 43351308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 107 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 21651079 - 21650522
Alignment:
Q  107 acgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaa 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||| ||     
T  21651079 acgtttgtaccttccaactacaacaattgtgttacctctgaatgggataaattcaaacttgccaagcagcaggactcaaatattcgaccgacattctcat 21650980  T
Q  206 tgttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttc 305  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  21650979 tgttccattcaaaagattaaattcttgttaggttgggattaaattatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtacattctttgacagttcaataccttc 21650880  T
Q  306 atttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattacccca 405  Q
    |||||||  |||||||||| |||| ||||| |||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |    
T  21650879 atttaaactggcctaacaaaaattgaatctcttgaaagaaacaatgggaatgtcggttgaatattggagtcctgctgtttggcaagtttgaattaccc-a 21650781  T
Q  406 ttcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgat 505  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||| ||||||| |||||  ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  21650780 ttcaaaggaagacaattgttgtagctggtaggttcattcattcggtaactaatgatgatcttatggcggaatcagactgttgataatatcttcagttgat 21650681  T
Q  506 ctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatg 605  Q
    ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||| | ||| ||||||    
T  21650680 ctcagcaacgttacccacatatcgatccactggaacatgttgtgatcccataacatgctcgtcacattttcgtcgttcgttaattcctcccaactgaatg 21650581  T
Q  606 atactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21650580 atactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataatgaacgtgttccaccctccttgtg 21650522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 265 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 41049180 - 41048784
Alignment:
Q  265 tcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcg 364  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41049180 tcaaaagaatgcggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaaccgacctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgggaatgtcggtcg 41049081  T
Q  365 aatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgat 464  Q
    |||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41049080 aatattagagacttgccgttttgcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagctggaaggtgcattcatttcgtacctaatgacgat 41048981  T
Q  465 ctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgct 564  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41048980 cttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgct 41048881  T
Q  565 cgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctcctt 661  Q
    ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41048880 cgtcgcgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcacctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccatcctcctt 41048784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 260 - 661
Target Start/End: Original strand, 48314985 - 48315386
Alignment:
Q  260 aaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtc 359  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  48314985 aaatgtcaaaagaatgaggttcattccttgacacttcaataccttcatttaaaccagcctaacaagaatttaatcttttgataggaacaatgggaatgcc 48315084  T
Q  360 ggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatg 459  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48315085 ggtcgaatattggagacctgccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaatgaagacaatcgttgtagctggaaggtgcattcattccgtacctaatg 48315184  T
Q  460 acgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaac 559  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48315185 acgatcttatggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatctactggaacatgttgtgctcccaaaac 48315284  T
Q  560 atgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctcc 659  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48315285 atgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatgctctcctctcgttgagcgttggacgtttataccaaacgtgttccaccctcc 48315384  T
Q  660 tt 661  Q
    ||    
T  48315385 tt 48315386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 107 - 664
Target Start/End: Original strand, 15337556 - 15338114
Alignment:
Q  107 acgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||| || || ||||||||| | || | |||  | | |     
T  15337556 acgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctctgaatgaggtaaatttaaacttgccaaacagcaggactccaatatacgtctgacgcttctag 15337655  T
Q  206 tgttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttc 305  Q
    ||||| ||||| ||  |||||||||||||||  | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  15337656 tgttcaattcaaaagtttaaattcttgttaggcttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtacattccttgacacttcaaaaccttc 15337755  T
Q  306 atttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattacccca 405  Q
    || |||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||   |||| || ||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  15337756 atctaaaccggcctaacatgaatttaatcttttgaatggaaaaatagaaatgccgatcgaatactggagacatgtcgtttggcaagtttgaattacccca 15337855  T
Q  406 ttcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgat 505  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| || || |||||||||||||||    
T  15337856 ttcaaaggaagacaattgttttagttagaaggtgcattcattccatacctaatgacgatcttctggcggaatcagactgtttataatatcttcagttgat 15337955  T
Q  506 ctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatg 605  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||    
T  15337956 ctcagcaacgttacccgcatatcgatccactgaaacatgttgtgctcccaaaacatgctcatcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaactgaatg 15338055  T
Q  606 atactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15338056 atactctcccctcgttgagcgttgaacatttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 15338114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 247 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 42735677 - 42735264
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaa 346  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42735677 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtccattctttgacacttcaataccttcatttaaaccggcctaacaagaatttaatcttttgacgggaa 42735578  T
Q  347 caatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcat 446  Q
    |||||||||||   |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42735577 caatgagaatgctagtcgaaaattggagtccttccgtttggcaagtttgaattaccacattcaaaggaagacaattgttgtagctggaaggtgcattcat 42735478  T
Q  447 tccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgtt 546  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  42735477 tcggtacctaatgacgatcttcttgcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgattcactagaatatgtt 42735378  T
Q  547 gtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacg 646  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  42735377 gtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgataatcttccc-catcgagcgttggacgtttataccgaacg 42735279  T
Q  647 tgttccaccctcctt 661  Q
    |||||||||||||||    
T  42735278 tgttccaccctcctt 42735264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 9 - 429
Target Start/End: Original strand, 20877605 - 20878026
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    ||||||||| | |||||||| ||| |||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  20877605 ttgaataccgttattcaagatgcttatcgaatgctggattcatgccgtttaacaagtttgaattacccaatttagaggaagacaattgttgcagttggac 20877704  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| | ||||||||||| ||||||||| || |||||||   | || ||| ||||||||  |    
T  20877705 gtttgtaccttccaactacaacaattgtgttacctctgcatggggtaaattcaaacttgccaagcagcacgactccagcgtacgtccggcattcccatag 20877804  T
Q  208 ttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcat 307  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| || || ||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20877805 ttccattcaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgatggtattgaagtgtcaaaaaaatgaggtgcattccttgacacttcaataccttcat 20877904  T
Q  308 ttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccatt 407  Q
     |||| | |||||||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| || |   ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  20877905 ctaaacctgcctaacatgaatttaatcttttaaaaggaacaatgggaatgtcggacgtacgctggagtcctgccgtttggcaagtttgaattaccccatc 20878004  T
Q  408 caaaggaagacaattgttgtag 429  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  20878005 caaaggaacacaattgttgtag 20878026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 9 - 664
Target Start/End: Original strand, 39476797 - 39477449
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||| | || ||||   | | |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||     
T  39476797 ttgaataccaacattcaagatgcttatcgaatgttggagtcctaccgattaacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgtagttggaa 39476896  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatga-gtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaat-tttcgaccgacattcccaat 206  Q
       ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| || || ||||  ||  ||||  ||| | |||   ||    
T  39476897 ---tgtgcattccaactataacaattgtcttacctttgaatgatgtaaattcaaacttgtcaaacagcaggactaaaacatttcacccggctttc---at 39476990  T
Q  207 gtt--ccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacctt 304  Q
    |||  || || | || || ||||| ||||||| || |  ||| |||||||||||||| || ||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  39476991 gttttcctttgaaaagat-aaatttttgttaggtttgctttagatgatggtattcaagtgccaacaaaatgaggttcattccttgacactt-aatacctt 39477088  T
Q  305 catttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaa-tattggagacctc-ccgtttggcaagtttgaattacc 402  Q
    ||| |||| | |||||| |||||||||||||||| | ||||| ||   ||||| ||  |||| |  | ||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  39477089 catctaaaccagcctaaaaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcctggccgtttggcaagtttgaattacc 39477188  T
Q  403 ccatt-caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcag 500  Q
    ||||| ||  || |||| |||||||||||||||||  ||||  | | || || ||||||||||||| |||||||||||||  | || |||||||||| ||    
T  39477189 ccatttcagcggtaagataattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttaatgatatctttag 39477285  T
Q  501 ttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagt 600  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  39477286 ttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcgttctttaattccacccaagt 39477385  T
Q  601 gaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39477386 gaatgatatcctcccctcgtcgagcgttggacgtttatactgaacgtgttccaccctccttgtg 39477449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 9 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 34141516 - 34140863
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||| | ||||||| | | |||||||||| || ||||   | | |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||     
T  34141516 ttgaataccagcgttcaagacgtttatcgaatgctggagtcctaccgattaacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgcagttggaa 34141417  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatg-agtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaat-tttcgaccgacattcccaat 206  Q
       ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| | ||||| ||||| | | ||||| ||  | |||    |    
T  34141416 ---tgtgcatttcaactacaacaattgtcttacctttgaatggagtaaattcaaactggcctaacaacaggactcaagtatttcgccccgcgttcatgtt 34141320  T
Q  207 gttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttca 306  Q
     |||| || | || | |||||| |||||||| | |  ||| |||||||||||||| || ||| | |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  34141319 tttcctttgaaaagaataaatttttgttagacttgctttagatgatggtattcaagtgccaacaaaatgaggttcattgcttgacactt-aataccttca 34141221  T
Q  307 tttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctc-ccgtttggcaagtttgaattacccca 405  Q
    | |||| | || |||||||||||||||||||| | ||||| ||   ||| |  ||   |||  | ||| | |  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  34141220 tctaaaccagcataacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaacgctggcgaaatgcttgagtcatggccgtttgacaagtttgaattacccca 34141121  T
Q  406 -ttcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttg 503  Q
     |||| ||| |||| |||||||| ||||||||  ||||  | | || || |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34141120 attcagaggtaagagaattgttgcagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttatggcgaaatcaaacttttgatgatatcttcagttg 34141024  T
Q  504 atctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaa 603  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| || ||||||||||| ||| ||||    
T  34141023 atctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgtccgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaaatgaa 34140924  T
Q  604 tgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  34140923 tgatactctcccctcgtcgagcgttggatgtttataccgaaattgttccaccctccttgtg 34140863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 59 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 30361117 - 30360515
Alignment:
Q  59 aacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaat 157  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||   || ||    ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  30361117 aacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgttcttggaa---tgggcattccaactacaacaattgtcttacctttgaattgggtaaat 30361021  T
Q  158 tcaaacatgccaagcaacaagactccaat-tttcgaccgacattcccaatgttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggta 256  Q
    |||||   ||||| ||||| ||||| |   ||||| |||||||||    | ||||  | | || | |||||| ||||||   | |  ||| |||||||||    
T  30361020 tcaaattcgccaaacaacaggactcaagcatttcgcccgacattcatgtttttcctatgaaaagaataaatttttgttatgcttgctttagatgatggta 30360921  T
Q  257 ttcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaat 356  Q
    ||||| || |||   |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||   ||||    
T  30360920 ttcaagtgccaacgaaatgaggttcattcctttacacttcaataccttcatctaaaccagcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaat 30360821  T
Q  357 gtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccatt-caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcatt-ccgtac 453  Q
    || || ||||| |||  ||| |  ||||||||||||||||||||||| ||| || | | |||||||| ||| |||||||||  ||||  |||| || ||     
T  30360820 gttgggcgaatgttgaggacttgtcgtttggcaagtttgaattacccaatttcagatgtaagacaatagttatagttggaa--tgca--cattaccctaa 30360725  T
Q  454 ctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 553  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  30360724 ctaatgacgatcttctggcggaatcaaactttttatgatatcttcagttgatctcagcaacg-cacccgcatatcaatccactagaacatgttgtgctcc 30360626  T
Q  554 caaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttcca 653  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  30360625 caaaacatgctcgttacgttttcgtcgttttttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttgtacatttataccgaacgtattcca 30360526  T
Q  654 ccctccttgtg 664  Q
    |||||||||||    
T  30360525 ccctccttgtg 30360515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 211 - 664
Target Start/End: Original strand, 1642348 - 1642796
Alignment:
Q  211 cattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcattta 310  Q
    |||||| || |||||||| |||||||  | || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||    
T  1642348 cattcaaaagattaaatttttgttaggcttggtttaaatgatggtattcgagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttcaatacttttatcta 1642447  T
Q  311 aatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaa-tgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattca 409  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||  |||   | | || ||  |||||  |||||||||||| |||  ||||    
T  1642448 aacgagcctaacaagaatttaatcttttgaatggaacaat-agaactgtcgggtgaaagcttgggaactgtcgtttaacaagtttgaatt-cccatttca 1642545  T
Q  410 aaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctca 509  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||    | |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  1642546 aggtaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc----cctacctaatcacgatcttctggcggaatcaaactgttgataatatcttcagttgatctca 1642641  T
Q  510 gcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatac 609  Q
     |||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||| ||| | |||||||     
T  1642642 acaacgttacacgcatatcgatccacttgaacatgttgtgctcccaaaacatgctcctcacgttttcatcgttcgttaattccacccaactaaatgatat 1642741  T
Q  610 tctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  1642742 tctcccctcgtcgagtgttgaacgtttatatcaaacgtattccaccctccttgtg 1642796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 9 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 17183867 - 17183210
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||| | ||||||| | | |||||||||| || |||||  | | |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||     
T  17183867 ttgaataccagcgttcaagaagattatcgaatgctggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgcagttagaa 17183768  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactcca--attttcgaccgacattcccaa 205  Q
       ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||| ||||| |  |||||    || |||||        
T  17183767 ---tgtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacaggactcaagcattttgcctcg-cattcatgt 17183672  T
Q  206 tgttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttc 305  Q
    | |||| || | |||| |||| | |||||||  | |  ||| |||||||||||||| || ||    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  17183671 ttttcctttgaaaataataaacttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaccgaaatgaggttcattccttgacactt-aataccttc 17183573  T
Q  306 atttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaa-tattggagacctc-ccgtttggcaagtttgaattaccc 403  Q
    || |||| | || ||||||||||||||| |||| | ||||| ||   |||    || |||| |  | ||| | |  ||||||||||||||||||||||||    
T  17183572 atctaaaccagcataacaagaatttaatattttcaaaggaaaaacatgaacactggacgaaatgcttgagtcatggccgtttggcaagtttgaattaccc 17183473  T
Q  404 catt-caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcat-tcattccgtacctaatgacgat---ctactggcggaatcaaacttttgatgatatctt 497  Q
    |||| || ||| ||||||||||||| ||||||||  ||||  |||  || || |||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17183472 catttcagaggtaagacaattgttgcagttggaa--tgcacctca--ccctaactaatgacgatgatcttctggcagaatcaaacttttgatgatatctt 17183377  T
Q  498 cagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactca 597  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  17183376 cagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgcttccaaaacatgttcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccaccca 17183277  T
Q  598 agtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  17183276 agtgaatgatattcttccctcgtcgagtgttggacgtttataccaaacgtgttacaccctccttgtg 17183210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 9 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 18238216 - 18237564
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||||| | || ||||| || | |||||||||||||| ||| || ||||| | ||||||||||| |||| ||     
T  18238216 ttgaataccaacattcaagaggcttattgaatgttggagtcctgctgattaacaagtttgaattgcccaatccagagtaggacaattgttgtagttggaa 18238117  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaat-tttcgaccgacattcccaat 206  Q
       ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||| ||||| ||||| |   ||||| |   | |||    |    
T  18238116 ---tgtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaactagccaaacaacaggactcaagcatttcgcctcgcgttcatgtt 18238020  T
Q  207 gttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttca 306  Q
     |||| || | |||  |||||| |||||||  |    ||| |||||| ||||||| || |||   |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  18238019 tttcctttgaaaattataaatttttgttaggctttctttagatgatgatattcaagtgccaacgaaatgaggttcattcgttgacactt-aataccttca 18237921  T
Q  307 tttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatg-tcggtcgaatattggagacctc-ccgtttggcaagtttgaattacccc 404  Q
    | |||| | || |||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||| | | || | |||  | ||| | |  ||||||||||||||||| |||||||    
T  18237920 tctaaaccagcataacaagaatttaatcttttgaaaggaaaaatatgaacgatgggccaaatgcttgagtcatggccgtttggcaagtttgagttacccc 18237821  T
Q  405 a-ttcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagtt 502  Q
    | |||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||  | | || || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18237820 aattcagaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaactgttgatgatatcttcagtt 18237724  T
Q  503 gatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtga 602  Q
    |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||    
T  18237723 gatctcagcaacgttacccgcataccgatccactggaacatgatgtgctcccaaaatatgctcgtcatgttttcgtcgttctttaactccacccaagtga 18237624  T
Q  603 atgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttg 662  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  18237623 atgatcctctccccttgtcgagcgttagacgtttataccgaacgtattccaccatccttg 18237564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 392 - 664
Target Start/End: Original strand, 21614700 - 21614969
Alignment:
Q  392 tttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatga 491  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||| |||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  21614700 tttgaattacctcattcaaaggaagacaattgttgtagttgaaaggtgcatt---tccctacctaatcacgaacttctggcggaatcaaaattttgatga 21614796  T
Q  492 tatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattc 591  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  21614797 tatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactagaacatgatgtgctcccaaaacatgctcgtcgcgttttcgtcgttcgttaattc 21614896  T
Q  592 cactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21614897 cacccaaatgaatgatactcttccctcgtcgagcgttgaacgtttatatcgaacgtgttccaccctccttgtg 21614969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 9 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 40589199 - 40588547
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| || |||||    | |||||||||||||| || ||| ||||| |||||| ||||||||||| ||     
T  40589199 ttgaataccagcgttcaagacgcttatcgaatgctggagtcctgccaattaacaagtttgaattgcctcatccagagtaagacagttgttgcagttggaa 40589100  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaat-tttcgaccgacattcccaat 206  Q
       ||| | |||||||| |||   |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||| ||||| | | |||||  ||||||||   ||    
T  40589099 ---tgtgcattccaacttcaaattttgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgtcaaacaacaggactcaagtatttcgctcgacattc---at 40589006  T
Q  207 gtt--ccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacctt 304  Q
    |||  || || | || | |||||| |||||||  | |  ||| |||||| ||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  40589005 gttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatgatattcaattgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aatacctt 40588907  T
Q  305 catttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaa-tattggagacctcccgtttggcaagtttgaatt-acc 402  Q
    ||| |||| | |||||||| |||||||||||||| | ||||| |||  ||||| ||  |||| |  | ||| |||   |||||||| ||||||||| | |    
T  40588906 catctaaaccagcctaacatgaatttaatcttttcaaaggaaaaatatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatc 40588807  T
Q  403 ccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagt 501  Q
     |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||  | | || |  ||||||||||||| ||||| |||||||  | |||||||||||||||||    
T  40588806 tcattcaaaggtaagacaattgttgcagttggaa--tgcac-cttaccctgactaatgacgatcttctggccgaatcaagttgttgatgatatcttcagt 40588710  T
Q  502 tgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtg 601  Q
    |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |    
T  40588709 tgatctcaacaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcatcatgttttcgtcgttcgttaattccacccaagcg 40588610  T
Q  602 aatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40588609 aatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaaggtgttccaccctccttgtg 40588547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 382 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 20565036 - 20564757
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaa 481  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||  | | || || |||||||||||||  |||||||||||||    
T  20565036 gtttgacaagtttgaattacctcattcaaaggaatacaaatgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaa 20564940  T
Q  482 cttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcat 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |    
T  20564939 cttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgt 20564840  T
Q  582 tcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  20564839 tcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagtgttggacgtttataccaaatgtgttccaccatccttgtg 20564757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 282 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 17839702 - 17839321
Alignment:
Q  282 attccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaa-tattggagacctcc 380  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||   ||||| ||  |||| |  | ||| |||      
T  17839702 attccttgacactt-aataccttcatctaaaccagcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgctcgagtcctgt 17839604  T
Q  381 cgtttggcaagtttgaatt-accccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctact-ggcggaatc 478  Q
     |||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  | | || || |||||||||||||  | |||||||||    
T  17839603 tgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatctttttggcggaatc 17839507  T
Q  479 aaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgt 578  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17839506 aaacttttgatgatatcttcaattgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgt 17839407  T
Q  579 cattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||    
T  17839406 cgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcatcgagcgttggacgtttattccaaacgtcttccaccatccttgtg 17839321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 248 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 2356700 - 2356287
Alignment:
Q  248 atgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaac 347  Q
    |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||| |||| | |||||     
T  2356700 atgatggtattcaagtgccaatgaaatgaggttcattccttgtcactttaatacattcatctaaaccagcctaacaagaatttaattttttcaaaggaaa 2356601  T
Q  348 aatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcat 446  Q
    ||   |||||  || |||||  ||| |||||  ||||| ||||||||||||| ||   |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||       
T  2356600 aaaatgaatgatgggcgaatgctggggacctggcgtttagcaagtttgaatttccat-ttcagaggtaagacaattgttgtagttggaagatgcatt--- 2356505  T
Q  447 tccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgtt 546  Q
    ||| |||||||| ||| |||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||| ||||||||| |    
T  2356504 tccctacctaatcacggtcttatagcggaatcaaatttttgatgatatcttcagttgatctcaacaacgttactcgcatatcgatccattggaacatgct 2356405  T
Q  547 gtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacg 646  Q
    || ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  2356404 gttctcccaaaacatgctcgtcacatttttgtcgttcgttaattccatccaagtgaatgatactctcccctcttcgagcgttggatgtttataccgaacg 2356305  T
Q  647 tgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2356304 tgttccaccctccttgtg 2356287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 382 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 10523346 - 10523066
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaa 481  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||  | | || || ||||||||||| | | ||||||||||||    
T  10523346 gtttgacaagtttgaattaccacattcaaaggaagacaattgttgtagttggaa--tacac-cttaccctaactaatgacgattttcaggcggaatcaaa 10523250  T
Q  482 cttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaa-catgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtca 580  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  10523249 cttttgatgatatattcagttgatctaagaaacttcacccgcatatcgatccacaagaaacatgtggtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcg 10523150  T
Q  581 ttcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  10523149 ttcgttaattccaacaaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaaacgtgttccaccatccttgtg 10523066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 41218264 - 41217612
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||| | || || ||  | | ||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||     
T  41218264 ttgaataccagcattcaagatgcttatcgaatgttggagtcatgccgattaacaagtttaaattgccccatccagagcaagacaattgttgtagttggaa 41218165  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagt-aaattcaaacatgccaagcaacaagactccaat-tttcgaccgacattcccaat 206  Q
       ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||| |||||||||||| ||||| |   ||||  ||| |||||   ||    
T  41218164 ---tgtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatgggccaaatttaaacttgccaagcaacatgactcaagcatttcccccgtcattc---at 41218071  T
Q  207 gtt--ccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacctt 304  Q
    |||  || || | || | |||||| |||||||  | |  ||| |||||||||||||| || |||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41218070 gttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggtccattccttgacactt-aatacctt 41217972  T
Q  305 catttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaa-tattggagacctc-ccgtttggcaagtttgaattacc 402  Q
    ||| |||| | ||||||||| |||||| |||||| | ||||| ||   |||||  |  |||| |  | ||| ||   || ||||| ||||||||||||||    
T  41217971 catctaaaccagcctaacaaaaatttattcttttcaaaggaa-aacatgaatgctgagcgaaatgcttgagtccaggccctttggtaagtttgaattacc 41217873  T
Q  403 ccat-tcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcag 500  Q
    |||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||  ||||  | | || || ||||||||||||| |||| ||||||||  | ||||||||||||||||    
T  41217872 ccatatcagaggtaagacaattgctgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggtggaatcaagttgttgatgatatcttcag 41217776  T
Q  501 ttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagt 600  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||| ||| |||| ||||| |||||    
T  41217775 ttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcttcactttttcgtcgttctttaactccacccaagt 41217676  T
Q  601 gaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  41217675 gaatgatactctcccctcgtcgagcgttgaatttttataccgaactaattccaccctccttgtg 41217612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 381 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 47269178 - 47268899
Alignment:
Q  381 cgtttggcaagtttgaattaccccatt-caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatc 478  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  |||||||||||||||||  ||||| | | || ||  ||||||||||||  ||||||||||    
T  47269178 cgtttggcaagtttgaattaccccatttcacaggtaagctaattgttgtagttggaa--tgcat-cttaccctaattaatgacgatcttttggcggaatc 47269082  T
Q  479 aaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgt 578  Q
    ||| | |||||||||| || |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47269081 aaattgttgatgatatttttagttaatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgt 47268982  T
Q  579 cattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttg 662  Q
    | ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  47268981 cgttctttaactccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgctggacgtttata-cgaacgtattccaccctccttg 47268899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 362 - 664
Target Start/End: Original strand, 20378613 - 20378912
Alignment:
Q  362 tcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgac 461  Q
    |||||| |||||| ||| ||| ||  |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |  | || | ||  || |||||||     
T  20378613 tcgaatgttggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagaggaagacaattgttgtagttggaatgcacctt-actc--taactaatgat 20378709  T
Q  462 gatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacat 561  Q
    ||||| |||||||||||||  | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20378710 gatcttctggcggaatcaagttgttaattatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatctgtccactggaacatgttgtgctcccaaaacat 20378809  T
Q  562 gctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctcctt 661  Q
    | |||||| ||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||| || | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20378810 gttcgtcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgataccctcccctcgttgtgcattggacgtttataccgaacgtattccaccctcctt 20378909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 112 - 437
Target Start/End: Original strand, 21614116 - 21614442
Alignment:
Q  112 tgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttc 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||| ||| || || || ||||||||  | || |||||||||||| |||||    
T  21614116 tgtaccttccacctacaacaattatcatacctttgaatggggtaaattcaaacttgctaaacagcaggactccaacatgcgtccgacattcccattgttc 21614215  T
Q  211 cattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcattta 310  Q
    |||||| || |||||||| ||||||  || || | |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21614216 cattcaaaagattaaattattgttaagtttggttcaaatgacgatattcaagtgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcattta 21614315  T
Q  311 aatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaa 410  Q
    || |||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||   ||||||||  |||| || ||| | | ||||||  |||||||||||||||||||  |     
T  21614316 aaccggcataacaagaatttgatctcttgaaaggaacaatagaaatgtcggatgaatgtttgagtcttgccgtttaacaagtttgaattaccccatctag 21614415  T
Q  411 aggaagacaattgttgtagttggaagg 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  21614416 aggaagacaattgttgtagttggaagg 21614442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 248 - 662
Target Start/End: Original strand, 48220537 - 48220949
Alignment:
Q  248 atgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaac 347  Q
    |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||| | |||||     
T  48220537 atgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aataccttcatctaaaccagcataacaagaatttaatcttttcaaaggaaa 48220635  T
Q  348 aatgagaatgtcggtcgaa-tattggagacctc-ccgtttggcaagtttgaattaccccatt-caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcatt 443  Q
    ||   ||| || || |||| |  | ||| | |  ||||||| ||||||||||||| |||||| || ||  |||| |||||||||||||||||  ||||      
T  48220636 aacatgaacgttggacgaaatgcttgagtcatggccgtttgacaagtttgaattagcccatttcagagctaagataattgttgtagttggaa--tgcac- 48220732  T
Q  444 cattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacat 543  Q
    | | || || |||||||||||||  ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  48220733 cttaccctaactaatgacgatcttatggtggaatcaagctgttgatgatatcttcagttgatctcagcaccgtcacctgcatattgatccactggaacat 48220832  T
Q  544 gttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccga 643  Q
    | |||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48220833 gctgtgctcccaa--catgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccaccaaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccga 48220930  T
Q  644 acgtgttccaccctccttg 662  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  48220931 acgtattccaccctccttg 48220949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 59 - 664
Target Start/End: Original strand, 45362859 - 45363452
Alignment:
Q  59 aacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaat 157  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||| ||    ||| | ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  45362859 aacaagtttgaattgcccaatccagagtaagacaattgttgcagttggaa---tgtgcattctaactgcaacaattgtcttacctttaaatgagataaat 45362955  T
Q  158 tcaaacatgccaagcaacaagactccaat-tttcgaccgacattcccaatgtt--ccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatgg 254  Q
    |||||| ||  || ||||| ||||| ||  |||||  ||||||||   |||||  || || | || | |||||| |||||||  | |  ||| |||||||    
T  45362956 tcaaacttgttaaacaacaggactcaaacatttcgctcgacattc---atgttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatgg 45363052  T
Q  255 tattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgaga 354  Q
    ||||||| || |||   ||||||||  |||||||||||||| ||||||||| | |||| | |||||||||||||| |||||||| | ||||| ||   ||    
T  45363053 tattcaagtgccaacgaaatgaggttgattccttgacactt-aataccttcttctaaaccagcctaacaagaattcaatcttttcaaaggaaaaacatga 45363151  T
Q  355 atgtcggtcgaa-tattggagacctcccgtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgt 451  Q
    ||| ||  |||| |  | ||| |||   ||||| || ||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||  | | || |    
T  45363152 atgccgagcgaaatgcttgagtcctgttgtttgacaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgcagttggaa--tgcac-cttaccct 45363248  T
Q  452 acctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgct 551  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |         ||||||||||||||||||| ||||||    
T  45363249 aactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgt---------atcgatccactggaacatgatgtgct 45363339  T
Q  552 cccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttc 651  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  45363340 cccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcatttgttaattccacccaagtgaatgaaactctctgctcgtcgagcgttggacgtttatactgaaggtgttc 45363439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 493 - 664
Target Start/End: Original strand, 28979060 - 28979231
Alignment:
Q  493 atcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattcc 592  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||| |    
T  28979060 atcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcacgtttttgtcgctcgttaatttc 28979159  T
Q  593 actcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28979160 acccaagtgaatgatactctcctctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 28979231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 382 - 578
Target Start/End: Original strand, 9367050 - 9367243
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaa 481  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||  | | || || |||||||||||||  |||||||||||||    
T  9367050 gtttgacaagtttgaattacctcattcaaaggaatacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaa 9367146  T
Q  482 cttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgt 578  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  9367147 cttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgt 9367243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 516 - 664
Target Start/End: Original strand, 26603266 - 26603414
Alignment:
Q  516 tcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccc 615  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  26603266 tcacccacatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgctctttaattccacccaagtgaatgataccctccc 26603365  T
Q  616 cttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26603366 ttcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtg 26603414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 59 - 336
Target Start/End: Original strand, 21614391 - 21614666
Alignment:
Q  59 aacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaat 157  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| || |   | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21614391 aacaagtttgaattaccccatctagaggaagacaattgttgtagttggaag---gcaccttccaactacaacaattatcttacctttgaatgaggtaaat 21614487  T
Q  158 tcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtat 257  Q
    |||||| || ||| |||||    || |   |||  | |  | |   | |||| |||||| || ||||||||||||||||  | || ||||||||||||||    
T  21614488 tcaaacttgtcaaacaacagctatcaagcattcatctggaagttttattgtttcattcaaaagattaaattcttgttaggcttggtttaaatgatggtat 21614587  T
Q  258 tcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatctt 336  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  21614588 tcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttcaataccttcatttaaaccagcctaacaagaatttaatctt 21614666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 514
Target Start/End: Original strand, 26601334 - 26601837
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| | || ||||     | |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||     
T  26601334 ttgaataccatcattcaagatgcttatcgaatgttggagtccttccaattaacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgtagttggaa 26601433  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaatt-ttcgaccgacattcccaat 206  Q
       ||| | |||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||| ||||| ||||| |    |||| ||  |||||    |    
T  26601434 ---tgtgcattccaagtacaacaattgtcttaccttttaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacaggactcaagcggttcgccccgcattcatgtt 26601530  T
Q  207 gttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttca 306  Q
     |||  || | || | |||||| |||||||  | |  ||| |||||||||||||| || |||   |||||| | |||||||||||||||||||||||| |    
T  26601531 tttcttttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgagattcattccttgacacttcaataccttaa 26601630  T
Q  307 tttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattacccca- 405  Q
    | |||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||   |||||| || ||||| |||  ||| |  |||||| ||||||||||||||||||     
T  26601631 tataaaccagcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgttgggcgaatgttgaggacttttcgtttgacaagtttgaattaccccat 26601730  T
Q  406 ttcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttga 504  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||||||||  ||||  | | || || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26601731 ttcagaggtaagataattgttgtagttggaa--tgca-ccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaactattgatgatatcttcagttga 26601827  T
Q  505 tctcagcaac 514  Q
    ||||| ||||    
T  26601828 tctcaacaac 26601837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 381 - 569
Target Start/End: Original strand, 2205964 - 2206151
Alignment:
Q  381 cgtttggcaagtttgaattaccccatt-caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatc 478  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |  | ||   ||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  2205964 cgtttgacaagtttgaattaccccatttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacctta--tcc-taactaatgacgatcttctggcggaatc 2206060  T
Q  479 aaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtca 569  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2206061 aagctgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatattgtgctcccaaaacatgctcgtca 2206151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 10224721 - 10224543
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    ||||||||||||||| || | | |||| ||||||| |||||||   ||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  10224721 ttgaataccatcattgaaaatgttcattgaatgctggattccttccgtttaacaaatttgaattaccccatttaaaggaagacaattgttgcagttggac 10224622  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaat 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  10224621 gtttgtaccttccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaat 10224543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 382 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 13920583 - 13920431
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaa 481  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | | || || |||||||||||||  ||||| |||||||    
T  13920583 gtttgacaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaa--tgcat-cttaccctaactaatgacgatcttatggcgaaatcaaa 13920487  T
Q  482 cttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactg 537  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13920486 tttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacctgcatatcgatccactg 13920431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 115 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 46862177 - 46861853
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| | |||||||| |  ||||||||| |||||| |  || | ||||||| |||||||| ||||| || || |||  |    
T  46862177 accttccagatacaacaattgtctt-cttttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcatgtctccaatattcgaccggcattctcattgctcctgt 46862079  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt-gacacttcaataccttcatttaaa- 312  Q
    || || ||||||||||||||||  |||  |||||||| |||||| || |||||| | |  ||  || |||| || |||| || |||||| ||||||||      
T  46862078 caaaagattaaattcttgttaggctggt-ttaaatgaaggtattgaagtgtcaagaaatggacctc-attcttttgacatttgaataccatcatttaatc 46861981  T
Q  313 tcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaa 411  Q
    || |||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||| ||| | | |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  46861980 tcagcctaacaagaatttaatcttttgaatggaacattgggaatgtcggtcgaatattggagtcctgctgcttggaaagtttgaatttaccccattcaaa 46861881  T
Q  412 gg-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||    
T  46861880 ggtaagacaattgttgcagttggaaggt 46861853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 546 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 13916949 - 13916831
Alignment:
Q  546 tgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaac 645  Q
    ||||||||||||||||| || |||  |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  13916949 tgtgctcccaaaacatggtcatcacatttttgtcattcgttaattcaacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaaat 13916850  T
Q  646 gtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  13916849 gtgttccaccatccttgtg 13916831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 115 - 438
Target Start/End: Original strand, 21650748 - 21651071
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||| || || ||||||||| ||| ||||||||||||| |||| | ||    
T  21650748 acctaccagctacaacaattgtctt-cctttgaatgggtaa-ttcaaacttgccaaacagcaggactccaatattcaaccgacattcccattgtttcttt 21650845  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt-gacacttcaataccttcatttaaat 313  Q
    ||  | ||| |||| |||||||    |  |||||||| |||||| || ||||||| |||||     ||||| || ||||||| |||||| | ||||||      
T  21650846 caagagattcaatttttgttaggccagt-ttaaatgaaggtattgaactgtcaaa-gaatgtacctcattcttttgacacttgaataccataatttaatc 21650943  T
Q  314 cgg-cctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaa 411  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | | |||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  21650944 ccaacctaacaagaatttaatcttttgaatggaacaatgagaatgtcggtcgaatatttgagtcctgctgcttggcaagtttgaatttatcccattcaga 21651043  T
Q  412 gg-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    || || ||||||||||||||||||||||    
T  21651044 ggtaacacaattgttgtagttggaaggt 21651071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 115 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 28114376 - 28114052
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| | |||| |  || ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||  |    
T  28114376 accttccagctacaacaattgtctt-cctttgaatgtggtaattcaaactttccaaacggcacgactccaatgttcgaccggcattcccattgttcctgt 28114278  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt-gacacttcaataccttcatttaaat 313  Q
    || || ||||||||||||||||   ||  ||||||||  ||||| || ||||||   | |||  || |||| || ||||||| |||||  ||||||||||    
T  28114277 caaaagattaaattcttgttaggccggt-ttaaatgaatgtattgaagtgtcaatgaattgacctc-attcttttgacacttgaatacagtcatttaaat 28114180  T
Q  314 cgg-cctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaa 411  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| | |   | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28114179 caaacctaacaagaatttaatcttttgaatggaactatgagaatgccggtcgaacattggagtcatgttgcttggcaagtttgaatttaccccattcaaa 28114080  T
Q  412 gg-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    || || |||||||||| |||||||||||    
T  28114079 ggtaacacaattgttggagttggaaggt 28114052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 115 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 21187282 - 21186960
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    ||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||| || ||| |  || | ||| ||| |||||||| |||||||| ||||||  |    
T  21187282 acctttcagctacaataattgtctt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacggcaggtctcaaatattcgaccggcattcccattgttcccgt 21187184  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt-gacacttcaataccttcatttaaa- 312  Q
    || || ||||||||||||||||  |||  ||||||||  ||||| || ||||||  |||||     ||||| || |||| || |||||| ||||||||      
T  21187183 caaaagattaaattcttgttaggctggt-ttaaatgaatgtattgaagtgtcaag-gaatggacctcattcttttgacatttgaataccatcatttaatc 21187086  T
Q  313 tcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaa 411  Q
    || |||||||||||||||||||||||||  ||| || || ||||| |||||||||||||||| ||| | | |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  21187085 tcagcctaacaagaatttaatcttttgaatggatcattgggaatgccggtcgaatattggagtcctgctgcttgggaagtttgaatttaccccattcaaa 21186986  T
Q  412 gg-aagacaattgttgtagttggaag 436  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  21186985 ggtaagacaattgttgtagttggaag 21186960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 388 - 526
Target Start/End: Original strand, 17320137 - 17320272
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttg 487  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||  | | || || ||||||||||| |  |||| ||||||||||||||    
T  17320137 caagtttgaattaccccatttaaaggaagacaattgttgtagttggaa--tgca-ccttaccctaactaatgacgattttatggcagaatcaaacttttg 17320233  T
Q  488 atgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcata 526  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  17320234 atgatatcttaagttgatctaagcaacttcaaccgcata 17320272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 124 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 30354789 - 30354474
Alignment:
Q  124 ctacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcagaatatt 223  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||| |  || | ||||||| |||||||| |||| ||| ||||||  ||| || |||    
T  30354789 ctacaacaattgtctt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctccaatattcgaccggcatttccactgttcctgtcaaaagatt 30354691  T
Q  224 aaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt-gacacttcaataccttcatttaaatcgg-cctaa 321  Q
    |||||||||||||  |||  |||||||| |||||| || ||||||  |||||     ||||| || |||| || |||||| ||||||||  |   |||||    
T  30354690 aaattcttgttaggctggt-ttaaatgaaggtattgaagtgtcaac-gaatggacctcattcttttgacatttgaataccgtcatttaatcccaacctaa 30354593  T
Q  322 caagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-aagaca 419  Q
    ||| |||||||||||||||   ||||| || |||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||    
T  30354592 caaaaatttaatcttttgaatagaacattgggaatgtcggtcgaatattggagtcctgctgcttggcaagtttgaatttacctcattcaaaggtaacaca 30354493  T
Q  420 attgttgtagttggaaggt 438  Q
     ||||||||||||| ||||    
T  30354492 gttgttgtagttgggaggt 30354474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 566 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 42683052 - 42682954
Alignment:
Q  566 gtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42683052 gtcacgttttcgttgttcgttaattccaccaaagtgaatgatattctcccctcgtcgttcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 42682954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 316 - 438
Target Start/End: Original strand, 48271072 - 48271196
Alignment:
Q  316 gcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg- 413  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||| || |||| ||||||||||||| ||| | | | | |||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  48271072 gcctaacaagaatttaatattttgaatggaacattgggaatatcggtcgaatattagagtcatgctgcttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggt 48271171  T
Q  414 aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  48271172 aagacaattgttgtagttggaaggt 48271196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 316 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 36393608 - 36393489
Alignment:
Q  316 gcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg- 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |   |||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  36393608 gcctaacaagaatttaatcttttgaatggaacactgggaatgtcggtcgaatattggagtcctacatcttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggt 36393509  T
Q  414 aagacaattgttgtagttgg 433  Q
    || |||||||||| ||||||    
T  36393508 aacacaattgttggagttgg 36393489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 34157454 - 34157130
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||||||| | || |||||   || |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||     
T  34157454 ttgaataccattgttcaagatgctcatcgaatgttggagtcctgcgatt-aacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgcagttggaa 34157356  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaat-tttcgaccgacattcccaat 206  Q
       ||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||| || ||| ||||||||||| |   ||||  ||| |||||   ||    
T  34157355 ---tgtgcattccaactacaacaatt-tgttacctttgaatgagatagattcaaacttgtcaaacaacaagactcaagcatttcacccggcattc---at 34157263  T
Q  207 gtt--ccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacctt 304  Q
    |||  || || | || | |||||| |||||||    |  ||| |||||||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  34157262 gttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcgtgctttagatgatggtattcaagtgtcaacgaaatgaggttcattccttgacattt-aatacctt 34157164  T
Q  305 catttaaatcggcctaacaagaatttaatctttt 338  Q
    ||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  34157163 catctaaaccagcctaacaagaatttaatctttt 34157130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 17839960 - 17839789
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||||  ||||||| | |||||||||||| || |||||  | | |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||     
T  17839960 ttgaataccattgttcaagatgttcatcgaatgctggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgcagttgga- 17839862  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
       ||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| || ||| ||||| |||||    
T  17839861 --atgtgcattccaactccaacaattgtgttacctttgaatgagatagattcaaacctgtcaaacaacaggactc 17839789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 319 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 21614240 - 21614113
Alignment:
Q  319 taacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-aag 416  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| || || |||||| ||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |    
T  21614240 taacaataatttaatcttttgaatggaacaatgggaatgtcggacgcatgttggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccattcaaaggtatg 21614141  T
Q  417 acaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    | ||||||||||| |||||||| |||||    
T  21614140 ataattgttgtaggtggaaggtacattc 21614113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 451 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 28066466 - 28066359
Alignment:
Q  451 tacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 550  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||| | ||   ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28066466 tacctaatcacgatgttctggcggaatcaaacttttgagaatatcttcagacgatctcagcaacgtgacaaacatatcgatccacaggaacatgttgtgc 28066367  T
Q  551 tcccaaaa 558  Q
    | ||||||    
T  28066366 tgccaaaa 28066359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 115 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 43351083 - 43350931
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||| |  || | ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||  |    
T  43351083 accttccagctacaacaattgtctt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctccaatattcgaccgacatttccattgttcctgt 43350985  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaa 269  Q
    || || ||||||||||||||||  | || |||||||| |||||| || |||||||    
T  43350984 caaaagattaaattcttgttaggct-ggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaa 43350931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 13920956 - 13920804
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    ||||||||||   ||||||||||| ||||||| || || |||||  | | |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||     
T  13920956 ttgaataccagtgttcaagaggcttatcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgcagttgga- 13920858  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaac 163  Q
       ||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  13920857 --atgtgcattccaactccaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaac 13920804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 244 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 10224771 - 10224707
Alignment:
Q  244 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  10224771 ttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaataccatcatt 10224707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 20565409 - 20565238
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||  | |   |||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||| ||     
T  20565409 ttgaataccattattcaagatgctcatcgaatactggagtcctgcagattggcaagtttgaattgccccatccagggtaagacaattgttgcagttggaa 20565310  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
       ||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  20565309 ---tgtgcattccaaccacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactc 20565238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 244 - 302
Target Start/End: Original strand, 39476747 - 39476805
Alignment:
Q  244 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  39476747 ttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtacattccttgacacttgaatacc 39476805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 247 - 308
Target Start/End: Original strand, 26601287 - 26601348
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatt 308  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  26601287 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaataccatcatt 26601348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 404 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 34139421 - 34139332
Alignment:
Q  404 cattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatct 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  | | || || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34139421 cattcaaaggaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcagaatcaaacttttgatgatatct 34139332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 236
Target Start/End: Original strand, 41049007 - 41049127
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| ||| || |  |||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |    
T  41049007 accttccagctacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgcaaaacggcaagtctctaatattcgaccgacattcccattgttcctgt 41049105  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttag 236  Q
    || || ||||||||||||||||    
T  41049106 caaaagattaaattcttgttag 41049127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 61 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 10523667 - 10523548
Alignment:
Q  61 caagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattc 159  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||    ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  10523667 caagtttaaattgccccatccagagtaagacaattgttgcagttggaa---tgtgcattccaactacaacaattgtgttacctttgaatgtgataaattc 10523571  T
Q  160 aaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    |||| ||| || ||||| |||||    
T  10523570 aaacctgcaaaacaacaggactc 10523548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Original strand, 20378587 - 20378682
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||||||| | || |||||  | | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  20378587 ttgaataccatcgttcaagatgcttatcgaatgttggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagaggaagacaattgttgtagtt 20378682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Original strand, 21186805 - 21186860
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  21186805 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggttcattccttgacacttgaatacc 21186860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 30361214 - 30361159
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  30361214 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 30361159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 48271349 - 48271294
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  48271349 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 48271294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 13920600 - 13920534
Alignment:
Q  38 aatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  13920600 aatgctcgagtcctgttgtttgacaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagtt 13920534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 287 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 20877865 - 20877711
Alignment:
Q  287 ttgacacttcaataccttcatttaaatcgg-cctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgttt 385  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| || |   ||||| | | | | ||    
T  20877865 ttgacacttcaataccatcatttaaaccaaacctaacaagaatttaatcttttgaatggaactatgggaatgccggacgtacgctggagtcgtgctgctt 20877766  T
Q  386 ggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  20877765 ggcaagtttgaatttaccccatgcagaggtaacacaattgttgtagttggaaggt 20877711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 414 - 508
Target Start/End: Original strand, 3380637 - 3380727
Alignment:
Q  414 aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctc 508  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||    | |||||||| ||||||| ||||| |||||||| | ||||  ||||||||||||||||||    
T  3380637 aagacaattgttgtcgttggaaggtgcattc----cctacctaatcacgatcttctggcagaatcaaattgttgagaatatcttcagttgatctc 3380727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Original strand, 40588773 - 40588838
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  40588773 ttccaactgcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggactc 40588838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Original strand, 9366632 - 9366684
Alignment:
Q  250 gatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  9366632 gatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 9366684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Original strand, 20378543 - 20378595
Alignment:
Q  250 gatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  20378543 gatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 20378595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Original strand, 30354324 - 30354376
Alignment:
Q  250 gatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  30354324 gatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 30354376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 418 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 150328 - 150192
Alignment:
Q  418 caattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatc 517  Q
    |||||||||||||||||||||||    ||||| |||||||| ||||||| || || |||||||| | ||||  ||||||||||  ||||||| |||| |     
T  150328 caattgttgtagttggaaggtgc----attccctacctaatcacgatcttctagcagaatcaaattgttgagaatatcttcaggcgatctcaacaacgtg 150233  T
Q  518 acccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaa 558  Q
    ||    |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  150232 acaaatatatcgatccacgggaacatgatgtgctgccaaaa 150192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 438
Target Start/End: Original strand, 10224536 - 10224615
Alignment:
Q  361 gtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    |||| ||||||||| ||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  10224536 gtcgtatattggagtcctgctgcttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttgtagttggaaggt 10224615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 15337718 - 15337564
Alignment:
Q  287 ttgacacttcaataccttcatttaaatcg-gcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaat-gtcggtcgaatattggagacctcccgtt 384  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||   ||||| | ||||  ||| | || ||||||||| ||| | |||    
T  15337718 ttgacacttgaataccatcatttaaaccaagcctaacaagaatttaaacttttgaattgaacact-agaagcgtcagacgtatattggagtcctgctgtt 15337620  T
Q  385 tggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15337619 tggcaagtttaaatttacctcattcagaggtaagacaattgttgtagttggaaggt 15337564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 382 - 435
Target Start/End: Original strand, 17183706 - 17183761
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaa 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17183706 gtttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 17183761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 444 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 18149745 - 18149638
Alignment:
Q  444 cattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacat 543  Q
    |||||| |||||||  ||||||| |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||| | |    || |||||||||| |||||||    
T  18149745 cattccctacctaaatacgatcttctggcgcaatcaaactgttgagaatatcttcagttgatctctgcaacttgaaaaacaaatcgatccacgggaacat 18149646  T
Q  544 gttgtgct 551  Q
    ||||||||    
T  18149645 gttgtgct 18149638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Original strand, 20877558 - 20877613
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  20877558 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacatttgaatacc 20877613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 34353330 - 34353267
Alignment:
Q  244 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcat 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||| |||||| ||||    
T  34353330 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaataagatgcatttcttgacacttgaataccatcat 34353267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 41218311 - 41218256
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  41218311 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcatttcttgacacttgaatacc 41218256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 444 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 11824911 - 11824841
Alignment:
Q  444 cattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaac 514  Q
    |||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  11824911 cattccctacctaatcacgatcttctagcggaatcaaactgttgaaaatatcttcagttgatctctgcaac 11824841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 13920998 - 13920948
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  13920998 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 13920948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 302
Target Start/End: Original strand, 28978717 - 28978767
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  28978717 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggttcattccttgacacttgaatacc 28978767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 302
Target Start/End: Original strand, 45362767 - 45362817
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  45362767 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 45362817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 302
Target Start/End: Original strand, 48220258 - 48220308
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  48220258 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 48220308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 182
Target Start/End: Original strand, 48220350 - 48220471
Alignment:
Q  59 aacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaat 157  Q
    |||||||||||||| | |||| || || ||||||||||||| |||| ||    ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||    
T  48220350 aacaagtttgaattgctccatccaaagtaagacaattgttgtagttggaa---tgtgcattccaactacaacaattgtctcacctttgaatggggcaaat 48220446  T
Q  158 tcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||    
T  48220447 tcaaacttgccaaacaataagactc 48220471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 182
Target Start/End: Original strand, 9366676 - 9366848
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattc-agaggaagacaattgttgcagttaga 107  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| || || || ||  | | |||||||||||||| |||||| | || | |||||||||||||||||| ||    
T  9366676 ttgaataccattgtccaagatgctcatcgaatactggagtcttgccgattaacaagtttgaattgccccataccagggtaagacaattgttgcagttgga 9366775  T
Q  108 cgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
        ||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  9366776 a---tgtgcattccaaccacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactc 9366848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Original strand, 17839548 - 17839612
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  17839548 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggactc 17839612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 236
Target Start/End: Original strand, 42735486 - 42735606
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| |   | ||||||||||||||||   ||||| || ||||||  |    
T  42735486 accttccagctacaacaattgtctt-cctttgaatgtggtaattcaaacttgccaaacggaaggactccaattttcgactagcattctcattgttcccgt 42735584  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttag 236  Q
    || || ||||||||||||||||    
T  42735585 caaaagattaaattcttgttag 42735606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 45363235 - 45363170
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  45363235 ttccaactgcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgtcaaacaacaggactc 45363170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 48315163 - 48315043
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| | |||||||| |  ||||||||| |||||| |  || | ||||||| |||||||| |||||||| ||||||  |    
T  48315163 accttccagctacaacgattgtctt-catttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctccaatattcgaccggcattcccattgttcctat 48315065  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttag 236  Q
    || || ||||||||||||||||    
T  48315064 caaaagattaaattcttgttag 48315043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 42683106 - 42683058
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaata 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  42683106 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaata 42683058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 388 - 444
Target Start/End: Original strand, 48220352 - 48220408
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    |||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48220352 caagtttgaattgctccatccaaagtaagacaattgttgtagttggaatgtgcattc 48220408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 362 - 443
Target Start/End: Original strand, 17183926 - 17184009
Alignment:
Q  362 tcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaatta-ccccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcatt 443  Q
    ||||||| ||||| ||| | | || |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17183926 tcgaatactggagtcctgctggttagcaagtttgaatttgccccattcaaaggcaagacaattgttgtagttggaaggtacatt 17184009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 382 - 435
Target Start/End: Original strand, 18238055 - 18238110
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaa 435  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18238055 gtttggctagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 18238110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 255 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 18238255 - 18238208
Alignment:
Q  255 tattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  18238255 tattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 18238208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 255 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 34141555 - 34141508
Alignment:
Q  255 tattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  34141555 tattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 34141508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 248 - 299
Target Start/End: Original strand, 36393332 - 36393383
Alignment:
Q  248 atgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaat 299  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  36393332 atgatggtattcaagtgtcaaaagaataaggtgcattcctggacacttcaat 36393383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 104
Target Start/End: Original strand, 9367033 - 9367099
Alignment:
Q  38 aatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  9367033 aatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaattacctcattcaaaggaatacaattgttgtagtt 9367099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 392 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 10224665 - 10224623
Alignment:
Q  392 tttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttgga 434  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  10224665 tttgaattaccccatttaaaggaagacaattgttgcagttgga 10224623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 10523363 - 10523297
Alignment:
Q  38 aatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||| || |||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  10523363 aatgcttgagtccttttgtttgacaagtttgaattaccacattcaaaggaagacaattgttgtagtt 10523297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 362 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 13920930 - 13920848
Alignment:
Q  362 tcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    ||||||| ||||| ||| ||| ||  |||||||||||| |||||| || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  13920930 tcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 13920848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 107
Target Start/End: Original strand, 15337838 - 15337884
Alignment:
Q  61 caagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttaga 107  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  15337838 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttttagttaga 15337884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 17183909 - 17183859
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  17183909 tggtattcaagtgtgaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 17183859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 17184007 - 17183969
Alignment:
Q  112 tgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17184007 tgtaccttccaactacaacaattgtcttgcctttgaatg 17183969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 17840002 - 17839952
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  17840002 tggtattcaagtttcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 17839952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 362 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 20565383 - 20565301
Alignment:
Q  362 tcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    ||||||| ||||| ||| | | |||||||||||||||| |||||| ||  | ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  20565383 tcgaatactggagtcctgcagattggcaagtttgaattgccccatccagggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 20565301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 20565451 - 20565401
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  20565451 tggtattcaagtgtcaacagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 20565401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 185
Target Start/End: Original strand, 20877465 - 20877539
Alignment:
Q  112 tgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatga-gtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaa 185  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||| ||| || || || ||||||||    
T  20877465 tgtaccttccaactacaacaattatcttacctctaaatgaggtaaattcaaacttgctaaacagcaggactccaa 20877539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 41049057 - 41049019
Alignment:
Q  61 caagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttg 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41049057 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttg 41049019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 10523761 - 10523712
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatac 301  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  10523761 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattacttgacacttgaatac 10523712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 174
Target Start/End: Original strand, 34139390 - 34139446
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaa 174  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  34139390 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgagataaattcaaacctgtcaagcaa 34139446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Original strand, 42735663 - 42735760
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaa-ttaccccattc-agaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||   |||||||||| ||||||||||| || | |||| |||||||||||||    
T  42735663 ttgaataccatcattcaagatgctcatcgcatgctggagtcatgctgttttgcaagtttgaatttaccccattcaagggtaagataattgttgcagtt 42735760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 104
Target Start/End: Original strand, 17320136 - 17320180
Alignment:
Q  60 acaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  17320136 acaagtttgaattaccccatttaaaggaagacaattgttgtagtt 17320180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 388 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 17839908 - 17839852
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    |||||||||||| |||||| || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  17839908 caagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 17839852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 382 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 21614502 - 21614442
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgc 440  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  21614502 gtttgacaagtttgaatttacctcattcaaaggtaagataattgttgtagttggaaggtgc 21614442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 174
Target Start/End: Original strand, 34157032 - 34157087
Alignment:
Q  119 tccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaa 174  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  34157032 tccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgagataaattcaaacctgtcaagcaa 34157087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 388 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 34157403 - 34157347
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    |||||||||||| |||||| || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  34157403 caagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 34157347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 354 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 21651186 - 21651111
Alignment:
Q  354 aatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtag 429  Q
    ||||||| ||||||  || || ||| ||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  21651186 aatgtcgatcgaatgctgaagtcctaccgttttacaaatttgaattacctcattcaaaggaagacaattattgtag 21651111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 382 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 26601495 - 26601440
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaa 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  26601495 gtttggcaagtttgaatttaccccattaaaaggtaagacaattgttgtacttggaa 26601440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 302
Target Start/End: Original strand, 28113903 - 28113954
Alignment:
Q  251 atggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||    
T  28113903 atggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattatttgacacttgaatacc 28113954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 382 - 435
Target Start/End: Original strand, 28978980 - 28979035
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaattacccca-ttcaaagg-aagacaattgttgtagttggaa 435  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  28978980 gtttggcaagtttgaattaccccatttcagaggtaagacaattgttgcagttggaa 28979035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 382 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 48220461 - 48220406
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatta-ccccattcaaagga-agacaattgttgtagttggaa 435  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  48220461 gtttggcaagtttgaatttgccccattcaaaggtgagacaattgttgtagttggaa 48220406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 618 - 664
Target Start/End: Original strand, 8726381 - 8726427
Alignment:
Q  618 tgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  8726381 tgtcgaacgatggacgtttataccgaacttattccaccctccttgtg 8726427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 112 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 18238356 - 18238282
Alignment:
Q  112 tgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaa 185  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| | | |||||||||| ||| ||||| || ||||||||    
T  18238356 tgtaccttccaactgcaacaattatcttaccattgaatggggcaaattcaaacttgctaagcagcaggactccaa 18238282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 20565053 - 20564987
Alignment:
Q  38 aatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||    
T  20565053 aatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaattacctcattcaaaggaatacaaatgttgtagtt 20564987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 388 - 434
Target Start/End: Original strand, 20877657 - 20877703
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttgga 434  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  20877657 caagtttgaattacccaatttagaggaagacaattgttgcagttgga 20877703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 287 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 21614598 - 21614544
Alignment:
Q  287 ttgacacttcaataccttcatttaaatcg-gcctaacaagaatttaatcttttga 340  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  21614598 ttgacacttgaataccatcatttaaaccaagcctaacaagaatttaatcttttga 21614544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 382 - 442
Target Start/End: Original strand, 30361246 - 30361308
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatta-ccccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcat 442  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30361246 gtttagcaagtttgaatttgccccattcaggggcaagacaattgttgtagttggaaggtgcat 30361308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 404 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 34157062 - 34157032
Alignment:
Q  404 cattcaaaggaagacaattgttgtagttgga 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34157062 cattcaaaggaagacaattgttgtagttgga 34157032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 252 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 34157496 - 34157446
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||    
T  34157496 tggtattcaagtgtcaaaagaataaggtgcattccttaacacttgaatacc 34157446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 41622779 - 41622741
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc 285  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  41622779 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc 41622741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 61 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 42735536 - 42735498
Alignment:
Q  61 caagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttg 99  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  42735536 caagtttgaattaccacattcaaaggaagacaattgttg 42735498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 61 - 99
Target Start/End: Original strand, 43351033 - 43351071
Alignment:
Q  61 caagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttg 99  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  43351033 caagtttgaattacctcattcaaaggaagacaattgttg 43351071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 370 - 444
Target Start/End: Original strand, 45362843 - 45362917
Alignment:
Q  370 tggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    ||||||||| ||| ||  |||||||||||| ||| || || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  45362843 tggagacctgccgattaacaagtttgaattgcccaatccagagtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 45362917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 112 - 185
Target Start/End: Original strand, 46861612 - 46861686
Alignment:
Q  112 tgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa-tgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaa 185  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||  |||| || | |||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  46861612 tgtaccttccaactgcaacaattatcttaccactgaattgggcaaattcaaacttgctaagcagcaagactccaa 46861686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 1642574 - 1642545
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctt 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1642574 accttccaactacaacaattgtcttacctt 1642545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 15337888 - 15337768
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| | ||| | ||||| | ||||| || |||| | | | |||||||    
T  15337888 accttctaactaaaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgacatgtctccagtattcgatcggcatttctatttttccatt 15337790  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttag 236  Q
    || || ||||||||| ||||||    
T  15337789 caaaagattaaattcatgttag 15337768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 20877572 - 20877475
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaa-ttaccccattcagagg-aagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| ||| | || ||||| |||| | |||||||||| ||||| |||| ||||| |||| |||||||| ||||    
T  20877572 ttgaataccatcattcaagatgctgatcgtatgttggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttacctcatttagaggtaagataattgttgtagtt 20877475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 104
Target Start/End: Original strand, 28978986 - 28979031
Alignment:
Q  61 caagtttgaattacccca-ttcagagg-aagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  28978986 caagtttgaattaccccatttcagaggtaagacaattgttgcagtt 28979031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 387 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 39476713 - 39476656
Alignment:
Q  387 gcaagtttgaatta-ccccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcat 442  Q
    |||||||||||||  |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39476713 gcaagtttgaatttgccccattcaggggcaagacaattgttgtagttggaaggtgcat 39476656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 192
Target Start/End: Original strand, 45362669 - 45362750
Alignment:
Q  112 tgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatga-gtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcga 192  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||  ||||||| | |||||||||| ||| || || |||||||||||| |||||    
T  45362669 tgtaccttccaactgcaacaatcatcttaccactgaatgaggcaaattcaaacttgctaaccagcaagactccaatattcga 45362750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 9367103 - 9367040
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  9367103 ttccaactacaacaattgtatt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 9367040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 388 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 10523667 - 10523611
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    ||||||| |||| |||||| || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  10523667 caagtttaaattgccccatccagagtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 10523611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Original strand, 13920530 - 13920593
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  13920530 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 13920593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 274 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 13920691 - 13920628
Alignment:
Q  274 tgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatctttt 338  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||| | || ||||||||||||||| ||||    
T  13920691 tgaggttcaatccttgacactt-aataccttcatctaaaccagcataacaagaatttaatatttt 13920628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 414 - 442
Target Start/End: Original strand, 26500410 - 26500438
Alignment:
Q  414 aagacaattgttgtagttggaaggtgcat 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26500410 aagacaattgttgtagttggaaggtgcat 26500438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 414 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 26592303 - 26592275
Alignment:
Q  414 aagacaattgttgtagttggaaggtgcat 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26592303 aagacaattgttgtagttggaaggtgcat 26592275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 498; Significance: 0; HSPs: 164)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 498; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 664
Target Start/End: Original strand, 10364187 - 10364843
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||| ||||||| | | |||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  10364187 ttgaataccaacattcaaaatgttcatcgaatgctggattcctgccgtttaacaagtttgaattaccccatttagagaaagacaattgttgcagttagac 10364286  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaa-ttcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  10364287 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggaaaattcaaacttgccaagcagcatgactccaatattcgactggcattcccaatg 10364386  T
Q  208 ttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcat 307  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10364387 ttccattcaaaagattaaattcttgttaggctgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggttcattccttgacacttcaataccttcat 10364486  T
Q  308 ttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacct-cccgtttggcaagtttgaattaccccat 406  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10364487 ttaaatcagcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgccggtcgaatattggagacctgcccgtttggcaagtttgaattaccccat 10364586  T
Q  407 tcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatc 506  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10364587 ttaaaggaagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattcc-tacgtaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatc 10364685  T
Q  507 tcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatga 606  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  10364686 tcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatga 10364785  T
Q  607 tactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10364786 tactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 10364843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 482; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 60 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 35492239 - 35491635
Alignment:
Q  60 acaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaatt 158  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  35492239 acaagtttgaattaccaaattcagaggaagacaattgttgcagttggacgtttgtacctcccaactacaacaattgtcttacctttgaatgtggtaaatt 35492140  T
Q  159 caaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtatt 258  Q
    ||||| ||||||||| || ||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  35492139 caaacttgccaagcagcaggactcaaatattcgatcggcattcccaatgttccattcaaaagattaaattcttgttaggc-gggattaaatgatggtatt 35492041  T
Q  259 caaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgt 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  35492040 caaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaaccggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgggaatgc 35491941  T
Q  359 cggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaat 458  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35491940 cggtcgaatattggagacctgccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattccgtacctaat 35491841  T
Q  459 gacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaa 558  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35491840 gacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaa 35491741  T
Q  559 catgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctc 658  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35491740 catgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctc 35491641  T
Q  659 cttgtg 664  Q
    ||||||    
T  35491640 cttgtg 35491635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 454; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 664
Target Start/End: Original strand, 19471179 - 19471840
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19471179 ttgaataccatcattcaaaatgctcatcgaatgctggaatcctgccgtttaacaagtttgaattactccattcagaggaagacaattgttgcagttggac 19471278  T
Q  109 gtttgtaccttcc-----aactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcc 202  Q
    |||||||||| ||     ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| |||| |    
T  19471279 gtttgtacctcccaacgtaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatattcgaccggcatttc 19471378  T
Q  203 caatgttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19471379 caatgttccattcaaaagattaaattcttgttaggctgggattaaatgatggtattcaaatggcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 19471478  T
Q  303 ttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattacc 402  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||    
T  19471479 ttcatttaaaccagcctaacaagaatttaatcttttgaaaggaacaatgggaatgctggtcgaatattggagccctgccatttgacaagtttgaattacc 19471578  T
Q  403 ccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagtt 502  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19471579 caattcagaggaagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagtt 19471678  T
Q  503 gatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtga 602  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  19471679 gatcttagcaacgtcacccgcatatcgatacactggaacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtga 19471778  T
Q  603 atgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19471779 atgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 19471840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 454; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 661
Target Start/End: Original strand, 41498644 - 41499297
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||||  ||||||| || ||||| ||||| ||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  41498644 ttgaataccattgttcaagatgcacatcgcatgctggattcctgccgtttaacaagtttgaattgccccattcagaggaagacaattgttgtagttggac 41498743  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatg 207  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  41498744 gtttgtacctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacttgtcaagcagcaagactccaatattcgaccagcattcccaatg 41498843  T
Q  208 ttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcat 307  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||  || |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41498844 ttccattcaaaagattaaattcttgttaggctgtgattaaataatggtactcaaatgccaaaagaatgaggtccattcgttgacacttcaataccttcat 41498943  T
Q  308 ttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccatt 407  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  41498944 ttaaatcagcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgggaatgtcggtcgaatattggagacctgtcgtttggcaagtttgaattacctcatt 41499043  T
Q  408 caaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatct 507  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41499044 caaaggaagacaattgttgtagctaaaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatct 41499143  T
Q  508 cagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgat 607  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || || ||||||    
T  41499144 cagcaacgtcaccctcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaggttaatgat 41499243  T
Q  608 actctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctcctt 661  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41499244 actctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctcctt 41499297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 610
Target Start/End: Original strand, 40676954 - 40677527
Alignment:
Q  38 aatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtttgtaccttccaactacaacaattgtc 137  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||     
T  40676954 aatgctggattcctgtcgtttaacaagttggaattacctcattcaaatgaagacaattgttgcagttggacgtttgtacctctcaactacaacaattgtg 40677053  T
Q  138 ttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcagaatattaaattcttgttag 236  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  40677054 ttacccttgaatgtggtaaattcaaacttgccaagcagcaagactccaatatacgaccgacattcccaatgttccattcaaaagattaaattcttgttag 40677153  T
Q  237 attgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatctt 336  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40677154 gctgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaaccggcctaacaagaatttaatctt 40677253  T
Q  337 ttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaag 436  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||    
T  40677254 ttgacaggaacaatgggaatgtcggtcgaacattggagtcctgccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaatacaattggtgtagctgcaag 40677353  T
Q  437 gtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccact 536  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40677354 gtgcattcattccgtacctaatgacgatcttctagcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccact 40677453  T
Q  537 ggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatact 610  Q
     |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  40677454 agaacatgtcgtgctcccagaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtggatgatact 40677527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 664
Target Start/End: Original strand, 37312057 - 37312701
Alignment:
Q  21 attcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtttgtaccttc 120  Q
    |||||||| ||| ||| |||| | ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37312057 attcaagatgcttatcaaatgttggattcctgccgtttaacaagtttgaattaccccatttagaggaaaacaattgttgcagttggacgtttgtaccttc 37312156  T
Q  121 caactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcagaa 219  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |  |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||| ||    
T  37312157 caactataacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttttcaagcagcatgactccaatgttcgaccgacattcccatagttcaattcaaaa 37312256  T
Q  220 tattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcct 319  Q
     ||||| ||| |||||| ||  | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37312257 gattaatttcctgttaggtttagtttaaatgacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtccatttactgacacttcaataccttcatttaaaccggcct 37312356  T
Q  320 aacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagaca 419  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  37312357 aacaagaatttaatcttttgagaggaacaatgggaatgtcggtcgaacattgtagtcatgccgtttggcaagtttgaattaccccattcataggaagtca 37312456  T
Q  420 attgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcac 519  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37312457 attgttgtagctgtaaggtgcattcattcggtacctaatgacgatcttctggcagaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcac 37312556  T
Q  520 ccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttg 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |    
T  37312557 ccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgataatctcccctcg 37312656  T
Q  620 tcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37312657 tcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccatcctccttgtg 37312701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 664
Target Start/End: Original strand, 2918923 - 2919571
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    ||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||   |||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  2918923 ttgaatatcatcattcaaaatgctcatcgaatgctgga---ctgccgtttaacaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgcagttgggc 2919019  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatg 207  Q
    |||||||||||||||| ||||     || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||  ||||| ||  |    
T  2919020 gtttgtaccttccaaccacaa-----gtgttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgccaagcagtaagactccaatgttcgaccagcattctcatag 2919114  T
Q  208 ttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcat 307  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2919115 ttccattcaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtattcaagcgtcaaaagaatgaggtccattcattgacacttcaataccttcat 2919214  T
Q  308 ttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccatt 407  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||  || ||||||| | |  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  2919215 ttaaaccggtctaacaagaatttactcttttgacacgatcaatgagaatgtcggttaaacattggagtcatgtcgtttggcaagtttgaattaccacatt 2919314  T
Q  408 caaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatct 507  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2919315 caaaggaagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatcttttggcggaatcaaacttttaatgatatcttcagttgatct 2919414  T
Q  508 cagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgat 607  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  2919415 cagcaacgtcacccgcatatcgatctactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgat 2919514  T
Q  608 actctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2919515 actctcccctcatcgagcgttggacgtttatacagaacgtgttccaccctccttgtg 2919571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 6977492 - 6976838
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    ||||||| |||||||||| | | |||||||||| |  ||||||   ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  6977492 ttgaatatcatcattcaaaatgttcatcgaatgttgaattcctaccgtttaacaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgcagttggac 6977393  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatg 207  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |  || |||||||||||  |    
T  6977392 gtttgtaccttccaactcaaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatatatgatcgacattcccacag 6977293  T
Q  208 ttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcat 307  Q
     |||||| | || |||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  6977292 ctccatttaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggttcattcattgacacttcaataccttcat 6977193  T
Q  308 ttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccatt 407  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||| ||||| | |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6977192 ttaaaccggcctaacaagaatttaatattttgaaaggattaatgggaatgccagtcgaacattggagtcctgccgtttggcaagtttgaattaccccatt 6977093  T
Q  408 caaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatct 507  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6977092 cagaggaagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattcggtacctaatgacgatcttctcgcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatct 6976993  T
Q  508 cagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgat 607  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  6976992 cagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaatttcacccaagtgaatgat 6976893  T
Q  608 actctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    || ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6976892 acact--cctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacatgttccaccctccttgtg 6976838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 43492103 - 43491600
Alignment:
Q  12 aataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtt 111  Q
    |||||||  |||||||| ||| |||||||||| |||| |||  ||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||| ||||||    
T  43492103 aataccagtattcaagatgcttatcgaatgctggatttctgccgtttaacaagtttgaattacctcattcaaagaaagacaattattgcagttggacgtt 43492004  T
Q  112 tgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttc 210  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  43492003 tgtacctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatattcgaccggcattcccaatgttc 43491904  T
Q  211 cattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcattta 310  Q
    |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43491903 cattcaaaagattaaattcttgttaggttgggattaaatgatggtattcaaatgtgaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcattta 43491804  T
Q  311 aatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaa 410  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43491803 aatcagcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacagtgggaattccggtcaaatattggagatctgccgtttggcaagtttgaattaccccattcaa 43491704  T
Q  411 aggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcag 510  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43491703 aggaaggcaattgttgtagttggaaggtgcattctttccgtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcag 43491604  T
Q  511 caac 514  Q
    ||||    
T  43491603 caac 43491600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 244 - 664
Target Start/End: Original strand, 27130295 - 27130715
Alignment:
Q  244 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacag 343  Q
    |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  27130295 ttaaatgacggtattcaagtgttaaaagaatgaggtctattcattgacacttcaataccttcatttaaaccggcctaagaagaacttaatcttttgacag 27130394  T
Q  344 gaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcatt 443  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||| | |  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  27130395 gaacaatgggaatgccggtcgaacattggagtcatgtcatttggcaaatttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttttagctggaaggtgcatt 27130494  T
Q  444 cattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacat 543  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27130495 cattcggtacctaatgactatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacat 27130594  T
Q  544 gttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccga 643  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  27130595 gttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatattctcccctcgttgagcgttggacgtttataccga 27130694  T
Q  644 acgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  27130695 atgtgttccaccctccttgtg 27130715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 112 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 33404564 - 33404015
Alignment:
Q  112 tgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttc 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||| || || || ||||| ||  || | |||||||| | | |||||    
T  33404564 tgtaccttccaaatacaacaattgtcttacctctgaattgggtaaattcaaacttgctaaacatcaggactcaaacatttgtccgacatttctattgttc 33404465  T
Q  211 cattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcattta 310  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| | || |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33404464 cattcaaaagattaaattcttgttagacttggtttaaataatgatattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttcaataccttcattta 33404365  T
Q  311 aatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaa 410  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||| ||| | ||| || ||| ||| ||||||   |||||||||||||| |||||||    
T  33404364 aaccggcctaacaagaatttaatcttttgaaaggaacaatagaaatgccggacaaatgtttgagtcctgccgtttaaaaagtttgaattacctcattcaa 33404265  T
Q  411 aggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    | |||||||| ||||||| ||||||  |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  33404264 aggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc----cctacctaatcacgatcttctggcgacatcagactgttgataatatcttcagttgatctcag 33404169  T
Q  511 caacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatact 610  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  33404168 caacgttacccgcatatcgatccactggaacatcttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacacaactgaatgatact 33404069  T
Q  611 ctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
     | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  33404068 attccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctctttgtg 33404015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 317 - 664
Target Start/End: Original strand, 34521543 - 34521890
Alignment:
Q  317 cctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaag 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34521543 cctaacaagaatttaatcttttgacaagaacaatgggaatgccaatcgaatattggagtcctaccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaag 34521642  T
Q  417 acaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacat 516  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  34521643 acaattgttgtagctggaaggtgcattcattcggtacctaatgacgatcttatgagggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcaacaacgt 34521742  T
Q  517 cacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctcccc 616  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34521743 cacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccc 34521842  T
Q  617 ttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34521843 tcgttgagcgtttgacgtttataccgaacgtgtttcaccctccttgtg 34521890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 382 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 29068008 - 29067729
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaa 481  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  | | || || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29068008 gtttgacaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagctggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaa 29067912  T
Q  482 cttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcat 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  29067911 cttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatggtcgtcacattttcgtcat 29067812  T
Q  582 tcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  29067811 tcgttaattgcacccaagtgaatgatattctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaaacgtgttccaccatccttgtg 29067729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 380 - 664
Target Start/End: Original strand, 10360123 - 10360405
Alignment:
Q  380 ccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatc 478  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||  ||||  | | || || ||||||||||||| |||||||||||    
T  10360123 ccgtttggcaagtttgaattaccccattttgaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatc 10360219  T
Q  479 aaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgt 578  Q
    || || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  10360220 aagctgttgatgaaatcttcagttgatctcagcaacattacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcat 10360319  T
Q  579 cattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10360320 cgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatacagaacgtgttccaccctccttgtg 10360405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 9 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 16582477 - 16581822
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||| | | |||||||  || ||||||||||  | ||||| || | |||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||     
T  16582477 ttgaatactagcgttcaagacacttatcgaatgctgaagtcctgctgattaacaagtttgaattgccccatccagagtaagataattgttgcagttggaa 16582378  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgac-cgacattcccaat 206  Q
       ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||||| |||||| ||||| ||||| ||  ||  || || |||||   ||    
T  16582377 ---tgtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtcagttcaaacttgccaaacaacatgactcaaacatttcactcggcattc---at 16582284  T
Q  207 gtt--ccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacctt 304  Q
    |||  || || | || | |||||| |||||||  | |  ||| |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  16582283 gttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaattgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aatacctt 16582185  T
Q  305 catttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaa-tattggagacctc-ccgtttggcaagtttgaattacc 402  Q
    ||| |||| |   ||||||||||||||||||||| | ||||| ||   ||||| ||  |||| || | ||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  16582184 catctaaaccattctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatacttgagtcctggccgtttggcaagtttgaattacc 16582085  T
Q  403 ccatt-caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcag 500  Q
    ||||| || ||| ||| ||||||||| ||||||||  ||||  | | || || ||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16582084 ccatttcagaggtaagccaattgttgcagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgaagatcttctagcggaatcaagcttttgatgatatcttcag 16581988  T
Q  501 ttgatctcagcaacatcacccgcatatc--gatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaa 598  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||  ||||||||||||| |||    
T  16581987 ttgatctcagcaacgtcacccgcatatctcgatccaatggaacatgatgtgctcccaaaacatgctcgacacattttcgtcgctcgttaattccacccaa 16581888  T
Q  599 gtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16581887 gtgaatgatactctcccctcgtcgagcattggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 16581822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 381 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 29111438 - 29111158
Alignment:
Q  381 cgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaa 480  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |  | || |||||| ||||| | | |||||||||| ||    
T  29111438 cgtttgacaagtttgaattaccacattcaaaggaagataattgttgtagttggaa--tgcactt-taccctacctagtgacgttattctggcggaattaa 29111342  T
Q  481 acttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtca 580  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  29111341 atttttgatgatatcttcggttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcg 29111242  T
Q  581 ttcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29111241 ttcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatactgaacgtgttccaccctccttgtg 29111158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 382 - 664
Target Start/End: Original strand, 3936991 - 3937270
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaa 481  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||  | | || || |||||||||||||  |||||||||||||    
T  3936991 gtttgacaagtttgaattacctcattcaaaggaatacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaa 3937087  T
Q  482 cttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcat 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |    
T  3937088 cttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgt 3937187  T
Q  582 tcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  3937188 tcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagtgttggacgtttataccaaatgtgttccaccatccttgtg 3937270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 382 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 17425068 - 17424789
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaa 481  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  | | || || |||||||||||||  |||||||||||||    
T  17425068 gtttgacaagtttgaattacctcattcaaaggaagacaaatgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaa 17424972  T
Q  482 cttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcat 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |    
T  17424971 cttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactagaacatgttgtgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgt 17424872  T
Q  582 tcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  17424871 tcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagtgttggacgtttataccaaatgtgttccaccatccttgtg 17424789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 382 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 43983135 - 43982856
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaa 481  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||  | | || || |||||||||||||  |||||||||||||    
T  43983135 gtttgacaagtttgaattacctcattcaaaggaatacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaa 43983039  T
Q  482 cttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcat 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |    
T  43983038 cttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgt 43982939  T
Q  582 tcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  43982938 tcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagtgttggacgtttataccaaatgtgttccaccatccttgtg 43982856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 388 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 5420742 - 5420469
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttg 487  Q
    |||||||||||| |||||| || || ||||||||||||| ||||||||  ||||  | | || || ||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  5420742 caagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgcagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttcaggtggaatcaaacttttg 5420646  T
Q  488 atgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgtta 587  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  5420645 atgatatcttcagttgatatcagcaacgtcacccgcatatcgatccattggaacatgctgtgctcacaaaacatgttcgtcacgttttcgtcgttcgtta 5420546  T
Q  588 attccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5420545 attccactcaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatatcgaacgtgttccaccctccttgtg 5420469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 381 - 664
Target Start/End: Original strand, 17796033 - 17796310
Alignment:
Q  381 cgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaa 480  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||   ||| ||||||||||||| || ||| ||||| |||    
T  17796033 cgtttggcaagtttgaattacctcattcaaaggaagacaattgttgtagttggaagacacatt---tccctacctaatgacgagcttctgacggaaccaa 17796129  T
Q  481 acttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtca 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||| |||||||||     
T  17796130 acttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactagaacatgt---gctcccaaaacatgctcttcacgttttcgtcg 17796226  T
Q  581 ttcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  17796227 ttcgttaattccacccaactgaatgatactctccactcgtcgagcgttggatgtttatacttaacgtgttccaccctccctgtg 17796310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 272 - 664
Target Start/End: Original strand, 42240913 - 42241305
Alignment:
Q  272 aatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaa-tatt 370  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| | || || ||   ||||| ||  |||| |  |    
T  42240913 aatgaggttcattccttgtcactt-aataccttcatctaaaccagcctaacaagaatttaatcttttcaaagaaaaaacatgaatgccgagcgaaatgct 42241011  T
Q  371 ggagacctc-ccgtttggcaagtttgaattaccccatt-caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatcta 467  Q
     ||| |||  ||||||| ||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||  ||||  | | || || |||||||||||||     
T  42241012 tgagtcctggccgtttgacaagtttgaattacctcatttcagaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatctt 42241108  T
Q  468 ctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgt 567  Q
     |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42241109 atggcagaatcaaacttttggtgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatcaactgaaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgt 42241208  T
Q  568 catgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    || ||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  42241209 cacgttttcgttgttctttaattccacccaagtgaatgataccctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaatgtgtttcaccctccttgtg 42241305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 206 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 6902436 - 6901966
Alignment:
Q  206 tgttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttc 305  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||||  | |  |||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6902436 tgttccgttcaaaagattaaattcttgttaggctcgacttaaatgagggtattgaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttcaataccttc 6902337  T
Q  306 atttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtc-ggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattacccc 404  Q
    || |||| | | |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||  || ||  ||||  |  ||||||  ||||| || |||||||||| ||      
T  6902336 atctaaaccagactaacaagaatttaatcttttgaattgaacaat-agaacttccgggtgaatgcttcagacctgacgtttagccagtttgaatttccat 6902238  T
Q  405 attcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc-----------at--tccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatga 491  Q
     ||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||           ||  ||| |||||||| | ||||| || ||||||||| ||| ||||| |    
T  6902237 -ttcagggtcagacaattgttgtagttggaaggtgcattccctacctaatcatgatccctacctaatcatgatcttctcgcggaatcagactgttgataa 6902139  T
Q  492 tatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattc 591  Q
    |||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  6902138 tatcttcagttgatctcaacaacgttactcgcatatcgattcactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattc 6902039  T
Q  592 cactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  6902038 cacccaactgaatgatattctcccctcgtcgagcgttggacgtttatgccgaatgtgttcaaccctccttgtg 6901966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 382 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 22002113 - 22001834
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaa 481  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  | | |  || |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  22002113 gtttgacaagtttgaattacctcattcaaaggaagacaattgttgtagttggaa--tgcaa-cttacaataactaatgacaatcttctggcggaatcaaa 22002017  T
Q  482 cttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcat 581  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||| |    
T  22002016 cttttgatgatatcttaagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccattggaacatgctgagctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgt 22001917  T
Q  582 tcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  22001916 tcgttaattcctcccaagtgaatgatattctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaaacgtgttctaccatccttgtg 22001834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 391 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 3942007 - 3941737
Alignment:
Q  391 gtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatg 490  Q
    ||||||||| |||||| || || ||||||||||||| ||||||||  ||||  | | || || ||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||    
T  3942007 gtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgaagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatg 3941911  T
Q  491 atatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaatt 590  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  3941910 atatcttcagttgatctcatcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgatgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaatt 3941811  T
Q  591 ccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  3941810 ccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatactgaaggtgttccaccctccttgtg 3941737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 381 - 664
Target Start/End: Original strand, 12968226 - 12968508
Alignment:
Q  381 cgtttggcaagtttgaattaccccatt-caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatc 478  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||  |||||  | | || || ||||||||||||| |||| ||||||    
T  12968226 cgtttggcaagtttgaattaccccatttcagaggtaagacaattgttgtagttgga--gtgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggaggaatc 12968322  T
Q  479 aaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgt 578  Q
    ||  | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  12968323 aagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccaatggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtaacgttttcgt 12968422  T
Q  579 cattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    | ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12968423 cgttctttaactccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcattggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtg 12968508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 381 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 42120294 - 42120014
Alignment:
Q  381 cgtttggcaagtttgaattaccccatt-caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatc 478  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||  ||||  | | || || ||||||||||||| |||||||||||    
T  42120294 cgtttgacaagtttgaattaccccatttcagaggtaagacaatcgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatc 42120198  T
Q  479 aaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgt 578  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  42120197 aagctgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacccacatatcaatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgt 42120098  T
Q  579 cattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttg 662  Q
    | ||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42120097 cgttctttaactccgcccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacatttataccgaacgtattccaccctccttg 42120014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 22493925 - 22493273
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||| | ||||||| ||| ||| |||| | || |||||  | | |||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||| |||| ||     
T  22493925 ttgaataccagcgttcaagacgcttatcaaatgttggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatctagagtaagacaattgttgtagttggaa 22493826  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaag-caacaagactccaat-tttcgaccgacattcccaat 206  Q
       ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||  ||||| ||||| |   ||||| ||  |||||    |    
T  22493825 ---tgtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatgggaaaattcaaacttgccaacacaacatgactcaagcatttcgccccgcattcatgtt 22493729  T
Q  207 gttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttca 306  Q
     |||  || | || | ||| || |||||||  | |  ||| |||||||||||||| |  |||   |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22493728 tttcatttgaaaagaataattttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagttccaatgaaatgaggttcattccttgacactt-aataccttca 22493630  T
Q  307 tttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcg-aatattggagacct-cccgtttggcaagtttgaattacccc 404  Q
    | |||| | || ||||||||||||||| |||| | ||||| ||   ||| |  || || |||    ||| | |  |||||||||||||||||||||||||    
T  22493629 tctaaaccagcataacaagaatttaatattttcaaaggaaaaacatgaacgctgggcgaaatgcctgagtcatggccgtttggcaagtttgaattacccc 22493530  T
Q  405 a-ttca-aaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagtt 502  Q
    | |||| ||| |||||| |||||||||||||||  |||| || | || || ||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| ||||    
T  22493529 atttcagaagtaagacagttgttgtagttggaa--tgca-tcttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatctttagtt 22493433  T
Q  503 gatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtga 602  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||| ||||| |||||||    
T  22493432 gatctcaggaacgttacccgcatatcaatccactggaacattctgtactcccaaaacatgctcgtcacgttttcgccgttctttaactccacccaagtga 22493333  T
Q  603 atgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttg 662  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22493332 atgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttg 22493273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 248 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 29906998 - 29906584
Alignment:
Q  248 atgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaac 347  Q
    |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||| | |||||     
T  29906998 atgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aataccttcatctaaaccagcataacaagaatttaatcttttcaaaggaaa 29906900  T
Q  348 aatgagaatgtcggtcgaa-tattggagacctc-ccgtttggcaagtttgaattaccccatt-caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcatt 443  Q
    ||   ||| |  || |||| |  | ||| | |  |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||  ||||      
T  29906899 aacatgaacgctgggcgaaatgcttgagtcatggccgtttggcaagtttgaattaccccatttcagaggtaagacagttgttgtagttggaa--tgcac- 29906803  T
Q  444 cattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacat 543  Q
    | | || || ||||||  ||||| ||||| |||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  29906802 cttaccctaactaatgctgatcttctggcagaatcaagttgttgatgatattttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacat 29906703  T
Q  544 gttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccga 643  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  29906702 gttgtgctcccaaaacatgtttgtcacgttttcgtcgttctttaacttcacccaagtgaatgatactctccccacgtcgagcgttggacgtttataccga 29906603  T
Q  644 acgtgttccaccctccttg 662  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  29906602 acgtattccaccctccttg 29906584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 454 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 39394101 - 39393891
Alignment:
Q  454 ctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 553  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39394101 ctaatgacgatcttctgacggaatcaagttgttaatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactagaacatgttgtgctcc 39394002  T
Q  554 caaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttcca 653  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  39394001 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttgattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaaggtgttaca 39393902  T
Q  654 ccctccttgtg 664  Q
    |||||||||||    
T  39393901 ccctccttgtg 39393891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 272 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 32735039 - 32734647
Alignment:
Q  272 aatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaa-tatt 370  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |  |||||||| |||||||| |||| | ||||| ||   ||||| ||  |||| |  |    
T  32735039 aatgaggtccattccttgacactt-aataccttaatctaaaccaacctaacaataatttaatattttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgct 32734941  T
Q  371 ggagacctc-ccgtttggcaagtttgaattaccccattcaa-agg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatcta 467  Q
     ||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||  | ||| |||||  |||||||||||||||  ||||  | | || || |||||||| ||||     
T  32734940 tgagtcctggccgtttggcaagtttgaattatcccattttagaggtaagactgttgttgtagttggaa--tgcac-cttaccttaactaatgactatctt 32734844  T
Q  468 ctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgt 567  Q
     |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32734843 ttggcggaatcaagctgttgatgatatcttcagttgatatcaacaacgttacccgcatatcgatccactgtaacatgttgtgctcccaaaacatgcttgt 32734744  T
Q  568 catgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||  |||||||  ||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  32734743 cacattttcgtagttctttaactccacccaagtgaatgataccctcccctcgtcgagcgttgaacgtttataccaaacgtattccaccctccttgtg 32734647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 511 - 664
Target Start/End: Original strand, 39799895 - 39800048
Alignment:
Q  511 caacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatact 610  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39799895 caacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatggtcgtgacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatact 39799994  T
Q  611 ctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  39799995 ctccccttgtcgagcgttggacgtttataccaaacgtgttccaccatccttgtg 39800048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 451 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 20148331 - 20148118
Alignment:
Q  451 tacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 550  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||  |||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20148331 tacctaatcacgatcttctggcggaatcagactgttgaaaatatcttcagctaatctcagcaacgttacccgcatatcgatctactggaacatgttgtgc 20148232  T
Q  551 tcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgtt 650  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| | ||| | ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||    
T  20148231 tcctaaaacatgctagtcatgttttcgtcgttctttaattccccccaactaaatgatattctcccctcgttgagcgttggacgtttataccgaacatatt 20148132  T
Q  651 ccaccctccttgtg 664  Q
     |||||||||||||    
T  20148131 tcaccctccttgtg 20148118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 206 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 16253910 - 16253605
Alignment:
Q  206 tgttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttc 305  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16253910 tgttccattcaaaagattaaattcttgttaggcttggtttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttcaataccttc 16253811  T
Q  306 atttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaa-tgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattacccc 404  Q
    || |||  | | |||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||| || |||  |||   | | || ||  |||||  ||||||||||||||| |    
T  16253810 atctaagccagtctaacaagaatttaatattttgaatggaacaat-agaactgccgggtgaaagcttgggaactatcgtttaacaagtttgaattacctc 16253712  T
Q  405 a-ttcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttg 503  Q
    | |||| || ||||||||||||||||||||||||||     ||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||| | ||| ||||||| |||||    
T  16253711 atttcagagtaagacaattgttgtagttggaaggtg----tattccctacctaatcacgatcttctggtggaatcaaactgtcgataatatctttagttg 16253616  T
Q  504 atctcagcaac 514  Q
    |||||||||||    
T  16253615 atctcagcaac 16253605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 234
Target Start/End: Original strand, 34521300 - 34521520
Alignment:
Q  13 ataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgttt 112  Q
    ||||||| |||||||| | |||||  ||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||     
T  34521300 ataccattattcaagatgatcatcacatgctggattcctgccgtttaacaagtttgaattaccccattcaaatgaagacaattgttgcagttggacgtta 34521399  T
Q  113 gtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatga-gtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttcc 211  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| || |||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  34521400 gtacctcccaactacaacaattatgttacctttgaatgaggtaaattgaaacttgccaagcagcaggactccaa-tatcgaccgacatt-ccaatgttcc 34521497  T
Q  212 attcagaatattaaattcttgtt 234  Q
    ||||| || ||||||||||||||    
T  34521498 attcaaaagattaaattcttgtt 34521520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 522 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 18392179 - 18392033
Alignment:
Q  522 gcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtc 621  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||    
T  18392179 gcatatcgatccactggaacatgatgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtaaatgatactctcccctcgtc 18392080  T
Q  622 gagcgttggacgtttataccg----aacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
     ||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||    
T  18392079 aagcgttggacgtttataccgaacgaacgtattccaccctccttgtg 18392033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 536 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 34639093 - 34638966
Alignment:
Q  536 tggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtt 635  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  34639093 tggaacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgttgagcgttggacgtt 34638994  T
Q  636 tataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  34638993 tataccgaaggtgttcca-cctccttgtg 34638966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 115 - 438
Target Start/End: Original strand, 35491861 - 35492184
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| |  || | ||||||| |||||||| |||||||| ||||||  |    
T  35491861 accttccagctacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctccaatattcgaccggcattcccattgttcctgt 35491959  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt-gacacttcaataccttcatttaaat 313  Q
    || || ||||||||||||||||   ||  |||||||| |||||| || ||||||  |||||     ||||| || |||| || |||||| ||||||||      
T  35491960 caaaagattaaattcttgttaggccggt-ttaaatgaaggtattgaagtgtcaag-gaatggacctcattcttttgacatttgaataccatcatttaatc 35492057  T
Q  314 cggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaag 412  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||| || ||||||||| ||| ||| | | |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  35492058 ccgcctaacaagaatttaatcttttgaatggaacattgggaatgccgatcgaatatttgagtcctgctgcttggcaagtttgaatttaccacattcaaag 35492157  T
Q  413 g-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||    
T  35492158 gtaagacaattgttgtagttgggaggt 35492184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 211 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 20148582 - 20148444
Alignment:
Q  211 cattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcattta 310  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||  | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20148582 cattcaaaagattaaattctttttaggcttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttcaata-cttcattta 20148484  T
Q  311 aatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaat 350  Q
    ||   |||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  20148483 aacaagcctaacaagaatttaatattttgaaaggaacaat 20148444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 221 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 29111577 - 29111468
Alignment:
Q  221 attaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggccta 320  Q
    ||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||    
T  29111577 attaaattcttgttaggcttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgtattccttgacacttaaataccttcatttaaaccagccta 29111478  T
Q  321 acaagaattt 330  Q
    ||||||||||    
T  29111477 acaagaattt 29111468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 115 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 10364618 - 10364293
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaa-caagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 213  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |  ||||||||| |||||| |   || | ||||||| |||||||| ||||| || ||||||      
T  10364618 accttccagctacaacaattgtctt-cctttaaatggggtaattcaaacttgccaaacgggcaggtctccaatattcgaccggcattctcattgttcctg 10364520  T
Q  214 tcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt-gacacttcaataccttcatttaaa 312  Q
    ||| || ||||||||||||||||  ||   |||||||| |||||| || ||||||  ||||||    ||||| || |||| || |||||| ||||||||     
T  10364519 tcaaaagattaaattcttgttaggctgat-ttaaatgaaggtattgaagtgtcaag-gaatgaacctcattcttttgacatttgaataccatcatttaat 10364422  T
Q  313 tcg-gcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaa 410  Q
     |  |||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||| | |||||||||||||| | | | | |||||||||||||| || ||||||||||    
T  10364421 cccagcctaacaagaatttaatcttttgaatggaacattgggaatgccagtcgaatattggagtcatgctgcttggcaagtttgaattttccccattcaa 10364322  T
Q  411 agg-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10364321 aggtaagacaattgttgtagttggaaggt 10364293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 418 - 558
Target Start/End: Original strand, 27650391 - 27650527
Alignment:
Q  418 caattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatc 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    | |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |     
T  27650391 caattgttgtagttggaaggtgcattc----cctacctaatcacgatcttctggcggaatcaaactgttgagaatatcttcagttgatctcagcaacgtg 27650486  T
Q  518 acccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaa 558  Q
    ||   ||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||    
T  27650487 acaaacatatcgatccacggtaacatgttgtgttgccaaaa 27650527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 317 - 438
Target Start/End: Original strand, 43491877 - 43492000
Alignment:
Q  317 cctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-a 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||| |||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  43491877 cctaacaagaatttaatcttttgaatggaacattgggaatgccggtcgaatattggagtcctgctgcttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggta 43491976  T
Q  415 agacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    | ||||||||||||||||| ||||    
T  43491977 acacaattgttgtagttgggaggt 43492000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 115 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 40677355 - 40677037
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    ||||| || ||||| ||||||| || |||||||||| |  ||||||||| |||||| |  || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |    
T  40677355 accttgcagctacaccaattgtatt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggactccaatgttcgaccgacattcccattgttcctgt 40677257  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt-gacacttcaataccttcatttaaat 313  Q
    || || ||||||||||||||||   ||  |||||||| |||||| || ||||||  |||||     ||||| || |||| || |||||| ||||||||      
T  40677256 caaaagattaaattcttgttaggccggt-ttaaatgaaggtattgaagtgtcaag-gaatggacctcattcttttgacatttgaataccatcatttaatc 40677159  T
Q  314 cg-gcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaa 411  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||| ||||||||| | | | | |||||||||||||| ||||| |||||||     
T  40677158 ccagcctaacaagaatttaatcttttgaatggaacattgggaatgtcggtcgtatattggagtcttgctgcttggcaagtttgaatttaccacattcaag 40677059  T
Q  412 gg-aagacaattgttgtagttg 432  Q
    || || ||||||||||||||||    
T  40677058 ggtaacacaattgttgtagttg 40677037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 18394003 - 18393832
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| | || |||||  | | |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||     
T  18394003 ttgaataccagcattcaagaggcttatcgaatgttggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgtagttgga- 18393905  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
       |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  18393904 --atgtgaattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 18393832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 115 - 438
Target Start/End: Original strand, 6977062 - 6977386
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |  ||||||||| |||||| |  || ||||||||| |||||| | |||||||| |  ||| ||    
T  6977062 accttccagctacaacaattgtctt-cctctgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggactccaatgttcgactggcattcccattaatccttt 6977160  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt-gacacttcaataccttcatttaaat 313  Q
    || |||||||||||||||||||   ||  |||||||| |||||| || ||||||  ||||||    ||||| || ||||||| |||||| |||||||||     
T  6977161 caaaatattaaattcttgttaggccggt-ttaaatgaaggtattgaagtgtcaat-gaatgaacctcattcttttgacacttgaataccgtcatttaaac 6977258  T
Q  314 cgg-cctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaa 411  Q
    |   |||||||||||||||||||||| |  ||| |  || |||||||| ||  ||||||||| ||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6977259 caaacctaacaagaatttaatcttttaaatggagctgtgggaatgtcgatcatatattggagtcctgctgcttggcaagtttgaatttaccccattcaaa 6977358  T
Q  412 gg-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    || || |||||||||  |||||||||||    
T  6977359 ggtaacacaattgtttgagttggaaggt 6977386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 248 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 18393766 - 18393486
Alignment:
Q  248 atgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaac 347  Q
    |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||     
T  18393766 atgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aataccttcatctaaaccagcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaa 18393668  T
Q  348 aatgagaatgtcggtcg-aatattggagacct-cccgtttggcaagtttgaattacccca--ttcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcat 442  Q
    ||   ||||| ||  || |||| | ||| |||   ||||||||||||||||||||||||   |||| ||| ||||||||| ||||||||||||  ||||     
T  18393667 aacatgaatgccgagcgaaatacttgagtcctagtcgtttggcaagtttgaattaccccnatttcagaggtaagacaatttttgtagttggaa--tgca- 18393571  T
Q  443 tcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatat 527  Q
     | | || |  ||||||||||||| ||||| |||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  18393570 ccttaccctcactaatgacgatcttctggcagaatcaagttgtttatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacacgcatat 18393486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 124 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 41499065 - 41498750
Alignment:
Q  124 ctacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcagaatatt 223  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||| | ||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||| || |||    
T  41499065 ctacaacaattgtctt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgccaaacgacaggtctccaatattcgaccgacattcccattgttcctgtcaaaagatt 41498967  T
Q  224 aaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc-cttgacacttcaataccttcatttaa-atcggcctaa 321  Q
    |||||||||||||  | |  |||||||| |||||| || |||| || |||||     |||||  ||| || || | |||| | ||||||   | ||||||    
T  41498966 aaattcttgttaggct-gatttaaatgaaggtattgaagtgtc-aacgaatggacctcattcttttggcatttgagtaccattatttaatcacagcctaa 41498869  T
Q  322 caagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-aagaca 419  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| || |||||  ||||||||||||||| | | | | ||| |||||||||| ||| |||||||||||| || |||    
T  41498868 caagaatttaatcttttgaatggaacattgggaatgctggtcgaatattggagtcttgctgcttgacaagtttgaatttatcccattcaaaggtaacaca 41498769  T
Q  420 attgttgtagttggaaggt 438  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  41498768 attgttgtagttgggaggt 41498750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 316 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 19471414 - 19471297
Alignment:
Q  316 gcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg- 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||  |||| |||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  19471414 gcctaacaagaatttaatcttttgaatggaacattggaaatgccggtcgaatattggagtcctgctgcttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggt 19471315  T
Q  414 aagacaattgttgtagtt 431  Q
    || |||||||||||||||    
T  19471314 aacacaattgttgtagtt 19471297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 182
Target Start/End: Original strand, 8557279 - 8557450
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||| | || |||||  | | ||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||| | ||  |     
T  8557279 ttgaataccaacattcaagatgcttatcgaatgttggactcctgccgattaacaagtttgatttgccccatccagagtaagacaattgttgtacttgaaa 8557378  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
       ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  8557379 ---tgtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatgggataaattcaaacctgccaaacaacatgactc 8557450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 182
Target Start/End: Original strand, 10359764 - 10359923
Alignment:
Q  21 attcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtttgtaccttc 120  Q
    |||||||||||| |||||||| | || || ||  | | |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||    | | | |||    
T  10359764 attcaagaggcttatcgaatgttggagtcatgccgattaacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgtagttcgaa---tatgcattc 10359860  T
Q  121 caactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  10359861 caactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacatgactc 10359923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 22002486 - 22002315
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||||| || || |||||  | | |||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||| ||     
T  22002486 ttgaataccattgttcaagatgctcatcgaatactggagtcctgcagattaacaagtttgaattgccccatccagggtaagacaattgttgcagttgga- 22002388  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
       ||| | ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  22002387 --atgtgcattccaatcacaacaattgtgttacctttgaatgagataaattcaaacctgcaaaacaacatgactc 22002315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 414 - 514
Target Start/End: Original strand, 31991896 - 31991992
Alignment:
Q  414 aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaa 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    | |||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  31991896 aagacaattgttgtagttggaaggtgcattc----cctacctaatcacgatcttctggcggaatcaaattgttgagaatatcttcagttgatctctgcaa 31991991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 546 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 16253594 - 16253476
Alignment:
Q  546 tgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaac 645  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| ||| |||||||||| ||| | ||||||| |||||| | ||  || ||||| ||||||||||||||    
T  16253594 tgtgctcccaaaacatgctgctcacgttatcgtcgttctttaattccacccaacttaatgatattctcccatcgttaagtgttgggcgtttataccgaac 16253495  T
Q  646 gtgttccaccctccttgtg 664  Q
    || ||||||||||||||||    
T  16253494 gtattccaccctccttgtg 16253476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 115 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 2919345 - 2919047
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| | ||| ||||||||| ||  |||||||||| || || ||   |    
T  2919345 accttccagctacaacaattgtctt-cctttgaatgtggtaattcaaacttgccaaacgacatgactccaatgtttaaccgacattctcattgatcgtgt 2919247  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt-gacacttcaataccttcatttaaat 313  Q
    || || | |||||||||||||||  ||  |||||||| |||||| || ||||||  |||||     ||||| || ||| ||| |||||| |||||||||     
T  2919246 caaaagagtaaattcttgttagaccggt-ttaaatgaaggtattgaagtgtcaat-gaatggacctcattcttttgacgcttgaataccgtcatttaaac 2919149  T
Q  314 cgg-cctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaa 411  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||  ||||||| ||||||| | | | | |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  2919148 caaacctaacaagaatttaatcttttgaatggaactatgagaatgctggtcgaacattggagtcttactgcttggcaagtttgaatttacctcattcaaa 2919049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 17425441 - 17425270
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| || || |||||  | | |||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||| ||     
T  17425441 ttgaataccattgtccaagatgctcatcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagggtaagacaattgttgcagttgga- 17425343  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
       ||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  17425342 --atgtgcattccaaccacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactc 17425270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 182
Target Start/End: Original strand, 39799424 - 39799595
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| || || |||||  | | |||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||| ||     
T  39799424 ttgaataccattgtccaagatgctcatcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagggtaagacaattgttgcagttgga- 39799522  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
       ||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  39799523 --atgtgcattccaaccacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactc 39799595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 37312475 - 37312151
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    ||||| || |||||||||||| ||| ||| |||||| |  ||||||||| |||||| |  || |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||  |    
T  37312475 accttacagctacaacaattgactt-cctatgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcatgactacaatgttcgaccgacattcccattgttcctct 37312377  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt-gacacttcaataccttcatttaaa- 312  Q
    || || ||||||||||||||||   ||  |||||||| |||||| || |||||  | |  ||  || |||| || ||||||| |||||| |||||||||     
T  37312376 caaaagattaaattcttgttaggccggt-ttaaatgaaggtattgaagtgtcagtaaatggacctc-attcttttgacacttgaataccgtcatttaaac 37312279  T
Q  313 tcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaa 411  Q
    |   ||||||| ||| ||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||| ||||||| | | | | |||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  37312278 taaacctaacaggaaattaatcttttgaattgaactatgggaatgtcggtcgaacattggagtcatgctgcttgaaaagtttgaatttaccccattcaaa 37312179  T
Q  412 gg-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    || || ||||||||| ||||||||||||    
T  37312178 ggtaacacaattgttatagttggaaggt 37312151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 62 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 42120613 - 42120495
Alignment:
Q  62 aagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattca 160  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||    
T  42120613 aagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgtagttggaa---tgtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggaaaattca 42120517  T
Q  161 aacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    ||| |||||| ||||| |||||    
T  42120516 aacttgccaaacaacatgactc 42120495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 416 - 514
Target Start/End: Original strand, 15891609 - 15891703
Alignment:
Q  416 gacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaac 514  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    | |||||||| ||||| | || ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  15891609 gacaattgttgtagttggaaggtgcattc----cctacctaatcacgatattctagcggaatcaaactgttgagaatatcttcagttgatctccgcaac 15891703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 17425488 - 17425433
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  17425488 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 17425433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 295
Target Start/End: Original strand, 40676886 - 40676937
Alignment:
Q  244 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacactt 295  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40676886 ttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacactt 40676937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Original strand, 41498597 - 41498652
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  41498597 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 41498652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 43492153 - 43492098
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43492153 aatgatggtattcaagtgtcaaaataatgaggtgcattccttgacacttcaatacc 43492098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 414 - 514
Target Start/End: Original strand, 18036122 - 18036218
Alignment:
Q  414 aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaa 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||  |||| || |||||||||| ||||    
T  18036122 aagacaattgttgtagttggaaggtgcat---ttcc-tacctaatcacgatcttctggcggaatcaaattgttgagaatatttttagttgatctctgcaa 18036217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 34521664 - 34521519
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| |   | ||||||||| |||||  | |||||||| |||||   |    
T  34521664 accttccagctacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggtaggactccaatattcgattggcattcccattgttcttgt 34521566  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaa 261  Q
    || || |||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||    
T  34521565 caaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtattcaa 34521519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 606 - 664
Target Start/End: Original strand, 40678763 - 40678821
Alignment:
Q  606 atactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40678763 atactctcccttcgtcgagtgttggacgtttataccgaacgcgttccaccctccttgtg 40678821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 2918890 - 2918793
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaa-ttaccccattcagagg-aagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | || || ||||||| | |||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  2918890 ttgaataccatcattcaagatgctcatcgcatggtggaatcatgttgtttagcaagtttgaatttaccccattcaggggcaagataattgttgcagtt 2918793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 300
Target Start/End: Original strand, 2918876 - 2918929
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaata 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  2918876 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaata 2918929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 97
Target Start/End: Original strand, 17538505 - 17538586
Alignment:
Q  16 ccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgt 97  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||| |  ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17538505 ccattattcaagatgcttatcgaatgttgaatttctgtcgtttaacaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgt 17538586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 308
Target Start/End: Original strand, 19471132 - 19471193
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatt 308  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  19471132 aatgatgatattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaataccatcatt 19471193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Original strand, 23408400 - 23408497
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaa-ttaccccattca-gaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||| || ||||||||| | | |||| |||||||||||||    
T  23408400 ttgaataccatcattgaagatgctcatcgcatgctagagtcctgctgtttaacaagtttgaattttccccattcatgggtaagataattgttgcagtt 23408497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 29068025 - 29067964
Alignment:
Q  38 aatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttg 99  Q
    |||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29068025 aatgctcgagtcctgttgtttgacaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttg 29067964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Original strand, 39394117 - 39394182
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  39394117 ttccaactgcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacatgtcaaacaacatgactc 39394182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 41498611 - 41498514
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaa-ttaccccattcagagg-aagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| | |||||||||| || |||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  41498611 ttgaataccatcattcaagatgctcatcggatgctggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagataattgttgcagtt 41498514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 244 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 6977542 - 6977486
Alignment:
Q  244 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaata 300  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  6977542 ttaaatgatagtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaata 6977486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 299
Target Start/End: Original strand, 10359705 - 10359757
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaat 299  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  10359705 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaataaggtgcattccttgacacttcaat 10359757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 299
Target Start/End: Original strand, 17538451 - 17538503
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaat 299  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  17538451 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgagatgcattccttgacacttcaat 17538503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 600 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 31770427 - 31770363
Alignment:
Q  600 tgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||    
T  31770427 tgaatgatactctcccctcgtcgaacgttggacgtttataccgaacatattacatcctccttgtg 31770363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 318 - 444
Target Start/End: Original strand, 33404439 - 33404567
Alignment:
Q  318 ctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-aa 415  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||   |||||||| | ||| || ||| |||   |||| ||||||||||| |||||| ||||| ||| ||    
T  33404439 ctaacaagaatttaatcttttgaatggaacaatagaaatgtcggacaaatgtttgagtcctgatgtttagcaagtttgaatttacccaattcagaggtaa 33404538  T
Q  416 gacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  33404539 gacaattgttgtatttggaaggtacattc 33404567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 295
Target Start/End: Original strand, 34521249 - 34521297
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacactt 295  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34521249 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacactt 34521297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 320 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 34521520 - 34521402
Alignment:
Q  320 aacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-aaga 417  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||| ||||||||| ||| | | ||||||||||| || ||||| |||||||||| || |    
T  34521520 aacaagaatttaatcttttgaatggaacattg-gaatgtcggtcg-atattggagtcctgctgcttggcaagtttcaatttacctcattcaaaggtaaca 34521423  T
Q  418 caattgttgtagttggaaggt 438  Q
     ||||||||||||||| ||||    
T  34521422 taattgttgtagttgggaggt 34521402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Original strand, 39799380 - 39799432
Alignment:
Q  250 gatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  39799380 gatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 39799432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 349
Target Start/End: Original strand, 6902374 - 6902437
Alignment:
Q  287 ttgacacttcaataccttcatttaaatcg-gcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaa 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  6902374 ttgacacttcaataccctcatttaagtcgagcctaacaagaatttaatcttttgaacggaacaa 6902437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Original strand, 8557232 - 8557287
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  8557232 aatgatggtattcaattgtcaaaagaatgaggcgcattccttgacacttgaatacc 8557287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 382 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 10359913 - 10359858
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaa 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10359913 gtttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 10359858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 23408414 - 23408359
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  23408414 aatgatggtattcaagtgtcaaaataatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 23408359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 28476204 - 28476149
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  28476204 aatgctggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 28476149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 29073743 - 29073688
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  29073743 aatgctggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 29073688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 182
Target Start/End: Original strand, 3936624 - 3936789
Alignment:
Q  16 ccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccat-tcagaggaagacaattgttgcagttagacgtttgt 114  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| || || |||||  | | |||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||||||||||||| ||    |||    
T  3936624 ccatcgttcaagatgctcatcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatcgcagggtaagacaattgttgcagttgga---atgt 3936720  T
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
     | ||||||| ||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  3936721 gcattccaaccacaacaattctgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactc 3936789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 338
Target Start/End: Original strand, 12968116 - 12968181
Alignment:
Q  272 aatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatctttt 338  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||    
T  12968116 aatgaggttcattccttgacactt-aataccttcatctaaattagcataacaagaatttaatctttt 12968181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 22002130 - 22002064
Alignment:
Q  38 aatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22002130 aatgctcgagtcctgttgtttgacaagtttgaattacctcattcaaaggaagacaattgttgtagtt 22002064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 388 - 434
Target Start/End: Original strand, 34521348 - 34521394
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttgga 434  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  34521348 caagtttgaattaccccattcaaatgaagacaattgttgcagttgga 34521394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 42120708 - 42120658
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  42120708 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 42120658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 252 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 16582519 - 16582470
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatac 301  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16582519 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatac 16582470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 19471146 - 19471049
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaa-ttaccccattcagagg-aagacaattgttgcagtt 104  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||| ||||| || |||||||||| | |||||||||| |||| |||||||| || |||| |||||||||||||    
T  19471146 ttgaatatcatcattcaagatgatcatcgcatgctggagtcctgttgtttagcaagtttgaatttactccattcaggggtaagataattgttgcagtt 19471049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 34521263 - 34521166
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaa-ttaccccattc-agaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| | |||||||||| ||||| ||||| || | |||| |||||||||||||    
T  34521263 ttgaataccatcattcaagatgctcatcgcatgctcgagtcctgctgtttagcaagtttgaatttacctcattcaagggtaagataattgttgcagtt 34521166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Original strand, 35492275 - 35492372
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaa-ttaccccattcagagg-aagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| || || ||||||| | |||||||||| || |||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  35492275 ttgaataccatcattcaagatgcttatcggatgctggagtcttgttgtttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagataattgttgcagtt 35492372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 252 - 435
Target Start/End: Original strand, 39799665 - 39799849
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatg 351  Q
    |||||||||| || |||   |||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||      
T  39799665 tggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttcacactt-aatacctacatctaaaccagcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaaca 39799763  T
Q  352 agaatgtcggtcgaa-tattggagacctcccgtttggcaagtttgaatt-accccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaa 435  Q
     ||||| ||  |||| |  | ||| |||   |||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39799764 tgaatgccgagcgaaatgctcgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggaagacaattgttgtggttggaa 39799849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 388 - 424
Target Start/End: Original strand, 17538550 - 17538586
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgt 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17538550 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgt 17538586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 384 - 435
Target Start/End: Original strand, 22493767 - 22493819
Alignment:
Q  384 ttggcaagtttgaattaccccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaa 435  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22493767 ttggcaagtttgaattttcccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 22493819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 35492289 - 35492241
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacactt 295  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  35492289 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcaatccttgacactt 35492241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Original strand, 43492139 - 43492235
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattca-gaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| | ||||||| ||||  ||||| || ||| |||| |||||||||||||    
T  43492139 ttgaataccatcattcaagatgctcatcggatgctggagtcctgctgtttagcaagtttaaattttcccatccaggagtaagataattgttgcagtt 43492235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 3942062 - 3941967
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||||||| | ||||||| ||| |||||||| | || |||||| | | |||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  3942062 ttgaataccagcgttcaagacgcttatcgaatgttggagtcctgtcgattaacatgtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgaagtt 3941967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 382 - 435
Target Start/End: Original strand, 16582316 - 16582371
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaa 435  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16582316 gtttggcaagtttgaactgaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 16582371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 382 - 435
Target Start/End: Original strand, 18393842 - 18393897
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaa 435  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18393842 gtttgacaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 18393897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 255 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 22002525 - 22002478
Alignment:
Q  255 tattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  22002525 tattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 22002478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 255 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 22493964 - 22493917
Alignment:
Q  255 tattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  22493964 tattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 22493917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 29073696 - 29073601
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    ||||||||||   ||||||||||| ||| |||||| || || ||  | | |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  29073696 ttgaataccagtgttcaagaggcttatcaaatgctggagtcttgccgattaacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgcagtt 29073601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 382 - 435
Target Start/End: Original strand, 42120505 - 42120560
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatta-ccccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaa 435  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42120505 gtttggcaagtttgaattttccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 42120560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 389 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 42120613 - 42120558
Alignment:
Q  389 aagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    ||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42120613 aagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgtagttggaatgtgcattc 42120558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 104
Target Start/End: Original strand, 3936974 - 3937040
Alignment:
Q  38 aatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  3936974 aatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaattacctcattcaaaggaatacaattgttgtagtt 3937040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 3942104 - 3942054
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  3942104 tggtattcaagtctcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 3942054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 17425085 - 17425019
Alignment:
Q  38 aatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  17425085 aatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaattacctcattcaaaggaagacaaatgttgtagtt 17425019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 362 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 18393977 - 18393895
Alignment:
Q  362 tcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    |||||| |||||| ||| ||| ||  |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  18393977 tcgaatgttggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgtagttggaatgtgaattc 18393895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 99
Target Start/End: Original strand, 34521614 - 34521652
Alignment:
Q  61 caagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttg 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34521614 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttg 34521652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 412 - 466
Target Start/End: Original strand, 42240815 - 42240869
Alignment:
Q  412 ggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatct 466  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  42240815 ggaagacaattaatgttgttggaaggtgcattcattctgtacctactgacgatct 42240869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 43983152 - 43983086
Alignment:
Q  38 aatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  43983152 aatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaattacctcattcaaaggaatacaattgttgtagtt 43983086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 5420744 - 5420699
Alignment:
Q  59 aacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  5420744 aacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgcagtt 5420699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 5420833 - 5420788
Alignment:
Q  255 tattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaata 300  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5420833 tattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaata 5420788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 17796088 - 17796036
Alignment:
Q  117 cttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaa 170  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  17796088 cttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgccaa 17796036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 184
Target Start/End: Original strand, 19471039 - 19471112
Alignment:
Q  112 tgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactcca 184  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||| ||| || ||||| |||||||    
T  19471039 tgtaccttccaactgcaacaattatcttacccctgaatggagtaaattcaaacttgctaaacaacaggactcca 19471112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 24108319 - 24108222
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaa-ttaccccattc-agaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| | || || ||||| |||| | |||||||||| ||||||||||| || | |||| |||||||||||||    
T  24108319 ttgaataccatcattcaagatgctgatcgagtactggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccattcaagggtaagataattgttgcagtt 24108222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27130489 - 27130369
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |  ||||||||  ||||||   ||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||  |    
T  27130489 accttccagctaaaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaatttgccaaatgacatgactccaatgttcgaccggcattcccattgttcctgt 27130391  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttag 236  Q
    || || ||||| ||||| ||||    
T  27130390 caaaagattaagttcttcttag 27130369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 32736779 - 32736726
Alignment:
Q  255 tattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatt 308  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||    
T  32736779 tattcaagtgtcaaaagaatgaggtgtattccttgacacttgaataccatcatt 32736726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 39799849 - 39799785
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  39799849 ttccaaccacaacaattgtctt-cctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggactc 39799785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 236
Target Start/End: Original strand, 43491676 - 43491796
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| |  ||   ||||||| || |||||  ||||||| ||||||  |    
T  43491676 accttccaactacaacaattgcctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcagatctccaatatttgaccggaattcccactgttcctgt 43491774  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttag 236  Q
    || || ||||||||||||||||    
T  43491775 caaaagattaaattcttgttag 43491796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 509 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 17112451 - 17112399
Alignment:
Q  509 agcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacat 561  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  17112451 agcaacgtcacccgcatatcaatccattagaacatattgtgctcccaaaacat 17112399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Original strand, 22002060 - 22002123
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  22002060 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 22002123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 388 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 29073644 - 29073588
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    |||||||||||| |||||| || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  29073644 caagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 29073588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 163
Target Start/End: Original strand, 33404237 - 33404284
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaac 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  33404237 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgaggtaattcaaac 33404284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 163
Target Start/End: Original strand, 34521156 - 34521208
Alignment:
Q  112 tgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatga-gtaaattcaaac 163  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  34521156 tgtaccttccaactgcaacaattatcttacccttgaatgaggtaaattcaaac 34521208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 382 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 8557440 - 8557385
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaa 435  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8557440 gtttggcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 8557385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 150
Target Start/End: Original strand, 17538357 - 17538396
Alignment:
Q  111 ttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatg 150  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  17538357 ttgtaccttccaactgcaacaattgtcttacccttgaatg 17538396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 104
Target Start/End: Original strand, 17796040 - 17796083
Alignment:
Q  61 caagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  17796040 caagtttgaattacctcattcaaaggaagacaattgttgtagtt 17796083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 141
Target Start/End: Original strand, 18393825 - 18393927
Alignment:
Q  38 aatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaa-ttaccccattcagagg-aagacaattgttgcagttagacgtttgtaccttccaactacaacaattg 135  Q
    |||||| || ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||    |  || ||||||||||||||||||    
T  18393825 aatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttgga---attcacattccaactacaacaattg 18393921  T
Q  136 tcttac 141  Q
    ||||||    
T  18393922 tcttac 18393927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 18394050 - 18393995
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  18394050 aatgacggtattcaagtatcaaaagaataaggtgcattccttgacacttgaatacc 18393995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 290
Target Start/End: Original strand, 24108305 - 24108348
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttga 290  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24108305 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgagggacattccttga 24108348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 8 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 8557247 - 8557149
Alignment:
Q  8 attgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaa-ttaccccattcagagg-aagacaattgttgcagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||| | | |||| ||| | || ||||| || | | |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  8557247 attgaataccatcattcaagatgttgatcgtatggtggactcctgctgcttagcaagtttgaatttaccccattcaggggcaagacaattgttgtagtt 8557149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 272 - 338
Target Start/End: Original strand, 10360014 - 10360079
Alignment:
Q  272 aatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatctttt 338  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||   || ||||||||||||||||||||    
T  10360014 aatgaggttcattccttgacactt-attaccttcatctaaactagcataacaagaatttaatctttt 10360079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 350
Target Start/End: Original strand, 16253768 - 16253912
Alignment:
Q  206 tgttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt-gacacttcaatacctt 304  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||| |||| |||||| || ||||||  |||||     ||||| || |||| || |||||| |    
T  16253768 tgttccattcaaaatattaaattcttgttagactggc-ttagatgaaggtattgaagtgtcaag-gaatgcacctcattcttttgacatttgaataccat 16253865  T
Q  305 catttaaatcg-gcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaat 350  Q
    |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16253866 catttaaaccaagcctaacaagaatttaatcttttgaatggaacaat 16253912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 362 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 17425415 - 17425333
Alignment:
Q  362 tcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    ||||||| ||||| ||| ||| ||  |||||||||||| |||||| ||  | ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  17425415 tcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 17425333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 62 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 33404286 - 33404244
Alignment:
Q  62 aagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  33404286 aagtttgaattacctcattcaaaggaagacaattgttgtagtt 33404244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 362 - 444
Target Start/End: Original strand, 39799450 - 39799532
Alignment:
Q  362 tcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    ||||||| ||||| ||| ||| ||  |||||||||||| |||||| ||  | ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  39799450 tcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 39799532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 5420934 - 5420861
Alignment:
Q  112 tgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatga-gtaaattcaaacatgccaagcaacaagactcca 184  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||| ||| || || || |||||||    
T  5420934 tgtaccttccaactgcaacaattgtcttgcctctgaatgaggcaaattcaaacttgctaaccagcaggactcca 5420861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 387 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 8557195 - 8557138
Alignment:
Q  387 gcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcat 442  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8557195 gcaagtttgaatttaccccattcaggggcaagacaattgttgtagttggaagatgcat 8557138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 18036146 - 18036113
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18036146 accttccaactacaacaattgtcttacctctgaa 18036113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 19471614 - 19471494
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||  |  ||||||||| || |||    || | ||||||| |||||||  |||||||| |||||| ||    
T  19471614 accttccagctacaacaattgtctt-cctctgaattgggtaattcaaacttgtcaaatggcagggctccaatattcgaccagcattcccattgttccttt 19471516  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttag 236  Q
    || || ||||||||||||||||    
T  19471515 caaaagattaaattcttgttag 19471494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 23408367 - 23408306
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaa 70  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||||  ||| ||||||||||||    
T  23408367 ttgaataccattattcaagatgctcatcacatgctggattcctgccgtttaacaagtttgaa 23408306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 184
Target Start/End: Original strand, 24108212 - 24108285
Alignment:
Q  112 tgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactcca 184  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||| ||| || || || |||||||    
T  24108212 tgtaccttccaactgcaacaattatcttacccttgaatggggtaaattcaaacttgctaaacagcaggactcca 24108285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 98
Target Start/End: Original strand, 27130443 - 27130476
Alignment:
Q  65 tttgaattaccccattcagaggaagacaattgtt 98  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27130443 tttgaattaccccattcaaaggaagacaattgtt 27130476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 31991920 - 31991887
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31991920 accttccaactacaacaattgtcttacctctgaa 31991887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #153
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 35492382 - 35492309
Alignment:
Q  112 tgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactcca 184  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| | | |||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  35492382 tgtaccttccaactgcaacaattatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgctaaacaacaagactcca 35492309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 3937044 - 3936981
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  3937044 ttccaactacaacaattgtatt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 3936981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 388 - 444
Target Start/End: Original strand, 10359804 - 10359860
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  10359804 caagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgtagttcgaatatgcattc 10359860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Original strand, 17425015 - 17425078
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  17425015 ttccaactacaacatttgtctt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 17425078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 388 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 22002434 - 22002378
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    |||||||||||| |||||| ||  | ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  22002434 caagtttgaattgccccatccagggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 22002378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 382 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 24108273 - 24108209
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  24108273 gtttagcaagtttgaatttaccccattcaagggtaagataattgttgcagttggaaggtacattc 24108209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 274 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 29068116 - 29068053
Alignment:
Q  274 tgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatctttt 338  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||| | || ||||||||||||||| ||||    
T  29068116 tgaggttcaatccttgacactt-aataccttcatctaaaccagcataacaagaatttaatatttt 29068053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #160
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 60 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 29111432 - 29111388
Alignment:
Q  60 acaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  29111432 acaagtttgaattaccacattcaaaggaagataattgttgtagtt 29111388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 283 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 29111863 - 29111807
Alignment:
Q  283 ttccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttg 339  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||| | |||||||| |||||||| ||||||    
T  29111863 ttccttgacacttcaatacaatcatctaaaccagcctaacatgaatttaaccttttg 29111807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 414 - 442
Target Start/End: Original strand, 32736853 - 32736881
Alignment:
Q  414 aagacaattgttgtagttggaaggtgcat 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32736853 aagacaattgttgtagttggaaggtgcat 32736881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 414 - 442
Target Start/End: Original strand, 42120779 - 42120807
Alignment:
Q  414 aagacaattgttgtagttggaaggtgcat 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42120779 aagacaattgttgtagttggaaggtgcat 42120807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Original strand, 43983082 - 43983145
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  43983082 ttccaactacaacaattgtatt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 43983145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 485; Significance: 0; HSPs: 113)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 485; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 664
Target Start/End: Original strand, 18439847 - 18440503
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18439847 ttgaataccaacattcaagaggctcatcgaatgttggattcctgctgtttaacaagtttgaattaccccattcagagaaagacaattgttgcagttagac 18439946  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatg 207  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  18439947 gtttgtgccttccaactacaacaattgtcttatctttgaatgaggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactctaatattcgaccgacattcacaatg 18440046  T
Q  208 ttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcat 307  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18440047 ttccattcaaaagattaaattcttgttaggctgtgattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcat 18440146  T
Q  308 ttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccatt 407  Q
    |||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  18440147 ttaaactagcctaacaataatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctgccgtttggaaaatttgaattaccccatt 18440246  T
Q  408 caaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatct 507  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18440247 caaaggaagataattgttgtagctggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatcttctcgcgtaatcaaacttttgatgatatcttcagtttatct 18440346  T
Q  508 cagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgat 607  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| || ||||||||||||    
T  18440347 cagcaacgtcaccctcatatcgatccactggaacatgttgtgctcctaaaacatgctcgtcacgttttcatcgttcgttaattctacccaagtgaatgat 18440446  T
Q  608 actctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18440447 actctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 18440503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 661
Target Start/End: Original strand, 41856538 - 41857179
Alignment:
Q  22 ttcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtttgtaccttcc 121  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  41856538 ttcaagatgcacatcgcatgctggat-cctgccgtttaacaagtttgaattaccccattcataggaagacaattgttgcagttggacgtttgtacctccc 41856636  T
Q  122 aactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcagaat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||| || ||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||     
T  41856637 aactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttaccaagcagcaggactctaatattcaaccggcattcccaatgttccattcaaaag 41856736  T
Q  221 attaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaa--taccttcatttaaatcggcc 318  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  41856737 attaaattcttgttaggttgggattaaatgacggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcgttgacacttcaaaataccttcatttaaatcagcc 41856836  T
Q  319 taacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagac 418  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41856837 taacaataatttaatcttttgacaggaacaatgggaatgtcggtcgaatattggagacctgccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagac 41856936  T
Q  419 aattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatca 518  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41856937 aattgttgtagctaaaaggtgcattcatttcgtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtca 41857036  T
Q  519 cccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctcccctt 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||     
T  41857037 cccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaatatgctcgtcacattttcgtcgttcgttaattccacccaagttaatgatactctcccctc 41857136  T
Q  619 gtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctcctt 661  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41857137 gtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctcctt 41857179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 42604113 - 42603463
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||||  ||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  42604113 ttgaataccattgttcaagatgcacatcgcatgctggattcctgtcgtttaacaagtttgaattgtcccattcaaaggaagacaattgttgcagttggac 42604014  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatg 207  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  42604013 gtttgtacctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatattcaaccgacatttccaatg 42603914  T
Q  208 ttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcat 307  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  42603913 ttccgttcaaaagattaaattcttgttaggttgggattaaatgacggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcgttgatccttcaataccttcat 42603814  T
Q  308 ttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccatt 407  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  42603813 ttaaaccagcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacagtgggaatgccggtcgaatattggagacct---gtttggcaagtttgaattaccccatt 42603717  T
Q  408 caaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatct 507  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |    
T  42603716 caaaggaagacaattgttgtagctaaaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatcttttggcggaatcaaacttttgatgatatattcggttgattt 42603617  T
Q  508 cagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgat 607  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  42603616 cagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgatgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgat 42603517  T
Q  608 actctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctcctt 661  Q
    || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42603516 accctcccctcgtcgagcattggacgtttataccgaacgtgttccgccctcctt 42603463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 40703020 - 40702369
Alignment:
Q  12 aataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtt 111  Q
    ||||||||  || |||| || ||||| ||||| ||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||    
T  40703020 aataccattgtttaagatgcacatcgcatgctggattcctgccgtttaacaagtttgaattgccccattcagaggaagacaattgttgaaattggacgtt 40702921  T
Q  112 tgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttc 210  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||     
T  40702920 tgtacctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaactttccaagcaacatgactccaatattcgaccggcattcccaatgtta 40702821  T
Q  211 cattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcattta 310  Q
    |||||| |  ||||||||||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40702820 cattcaaaggattaaattctctttaggctgggattaaatgacggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcgttgacacttcaataccttcattta 40702721  T
Q  311 aatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaa 410  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40702720 aaccagcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgggaatgtcggtcgaatattggagacctgccgtttggcaagtttgaattaccccattcaa 40702621  T
Q  411 aggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatga-cgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctca 509  Q
    ||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40702620 aggaagacaattgttgtagctaaaatgtgcattcattccgtacctaatgaccgatcttttggcggaatcaaacttttgatgatatattcagttgatctca 40702521  T
Q  510 gcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatac 609  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  40702520 gcaacgtcatccgcatatcgatccactggaacatgttttgttcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatat 40702421  T
Q  610 tctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctcctt 661  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  40702420 tctcccttcgtcgaacgttggacgtttatactgaacgtgttccactctcctt 40702369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 128 - 664
Target Start/End: Original strand, 44942751 - 44943289
Alignment:
Q  128 aacaattgtcttacctttgaatg-agtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgtt-ccattcagaatattaa 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| | ||  ||| |||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||| || |||||    
T  44942751 aacaattgtcttacctttgaatggagtaaattcaaatttgccaagtagcacaacttcaatattcgaccagcattctcaatgtttccattcaaaagattaa 44942850  T
Q  226 attcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaag 325  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  44942851 attgttgttaggctgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaaacagccgaacaag 44942950  T
Q  326 aatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgtt 425  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||   |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  44942951 aatttaatcttttgacaggagcaatgggaatgccgtctgaatattggagacctgtcgtttggcaagtttgaattatctcattcaaacgaagacaattgtt 44943050  T
Q  426 gtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcat 525  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44943051 gtagctggaaggtgcatacattccgtacctaatgacaatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcat 44943150  T
Q  526 atcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagc 625  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44943151 atcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagc 44943250  T
Q  626 gttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  44943251 gttggacgtttatatcgaacgtgttacaccatccttgtg 44943289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 246 - 664
Target Start/End: Original strand, 19241952 - 19242370
Alignment:
Q  246 aaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacagga 345  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19241952 aaatgacggtattcaagtttcaaaagaatgaggttcatttattgacacttcaatacattcatataaaccggcctaacaagaagttaatcttttgacagga 19242051  T
Q  346 acaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattca 445  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||   | |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19242052 acaatgggaatgtcggtcgaacattggagttatgccgtttggcaagtttgaactaccccattcagagaaagacaattgttgtagttggaaggtgcattca 19242151  T
Q  446 ttccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgt 545  Q
    ||| |||||||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19242152 ttcggtacctaatgacaatcttctcgtagaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatcttagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgt 19242251  T
Q  546 tgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaac 645  Q
    |||  ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19242252 tgtattcccaaaacatgctcgtcacgtttttgtcgttccttaattacacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaac 19242351  T
Q  646 gtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19242352 gtgttccaccctccttgtg 19242370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 246 - 664
Target Start/End: Original strand, 19315136 - 19315554
Alignment:
Q  246 aaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacagga 345  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19315136 aaatgacggtattcaagtttcaaaagaatgaggttcatttattgacacttcaatacattcatataaaccggcctaacaagaagttaatcttttgacagga 19315235  T
Q  346 acaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattca 445  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||   | |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19315236 acaatgggaatgtcggtcgaacattggagttatgccgtttggcaagtttgaactaccccattcagagaaagacaattgttgtagttggaaggtgcattca 19315335  T
Q  446 ttccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgt 545  Q
    ||| |||||||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19315336 ttcggtacctaatgacaatcttctcgtagaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatcttagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgt 19315435  T
Q  546 tgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaac 645  Q
    |||  ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19315436 tgtattcccaaaacatgctcgtcacgtttttgtcgttccttaattacacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaac 19315535  T
Q  646 gtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19315536 gtgttccaccctccttgtg 19315554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 112 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 26487232 - 26486847
Alignment:
Q  112 tgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttc 210  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  26487232 tgtaccttccaactgcaacatttatcttacctttgaattgggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatattcgacaggcattcccaatgttc 26487133  T
Q  211 cattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcattta 310  Q
    |||||| || |||||||| |||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  26487132 cattcaaaagattaaattattgttaggctaggattaaatgacggtattcaaatgtcaaaataatgaggtccattctttgaaacttcaataccttcattta 26487033  T
Q  311 aatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaa 410  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  26487032 aaccagcctaacaagaatttaatcttttgacaagaacaatgggaataccggtcgaatattggagacctgccgtttgacaagtttgaattacctcattcaa 26486933  T
Q  411 aggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatct 496  Q
    ||||||||||||||||||| |   || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  26486932 aggaagacaattgttgtagctaagagatgcattcattccgtacctaatgacgatcttctgacggaatcaagctgttgatgatatct 26486847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 382 - 664
Target Start/End: Original strand, 15032253 - 15032532
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaa 481  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  | | || || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15032253 gtttgacaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaaatgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaa 15032349  T
Q  482 cttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcat 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  15032350 cttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgt 15032449  T
Q  582 tcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  15032450 tcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaaacgtgttccaccatacttgtg 15032532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 59 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 24861951 - 24861349
Alignment:
Q  59 aacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaat 157  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24861951 aacaagtttgaattgccccatccagagtaagaaaattgttgcagttggaa---tgtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagataaat 24861855  T
Q  158 tcaaacatgccaagcaacaagactccaat-tttcgaccgacattcccaatgtt--ccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatgg 254  Q
    |||||| | |||| ||||| ||||| |   |||||  || |||||   |||||  || || | || | |||||| |||||||  | |  ||| |||||||    
T  24861854 tcaaaccttccaaacaacaggactcaagcatttcgctcgccattc---atgttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatgg 24861758  T
Q  255 tattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgaga 354  Q
    ||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||   ||    
T  24861757 tattcaattgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aataccttcatctaaaccagcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatga 24861659  T
Q  355 atgtcggtcgaa-tattggagacctcccgtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgt 451  Q
    ||| ||  |||| |  | ||| | |   |||||||| ||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||| || |||||  ||||  | | || |    
T  24861658 atgccgagcgaaatgcttgagtcatgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgcagatggaa--tgcac-cttaccct 24861562  T
Q  452 acctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgct 551  Q
    | ||||||||||||| ||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  24861561 aactaatgacgatcttctggcagaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcaatccaattgaacatgttgtgct 24861462  T
Q  552 cccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttc 651  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24861461 cccaaaacatgctcgtcacattttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgatactctccccccgtcgagcgttggacgtttataccgaaggtgttc 24861362  T
Q  652 caccctccttgtg 664  Q
    |||||||||||||    
T  24861361 caccctccttgtg 24861349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 664
Target Start/End: Original strand, 38033483 - 38034133
Alignment:
Q  12 aataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtt 111  Q
    ||||||||  ||||||| ||| |||||||| | || |||| | | | |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||        
T  38033483 aataccatttttcaagatgcttatcgaatgttggagtcctttcgattaacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgtagttggaa--- 38033579  T
Q  112 tgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatg-agtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaat-tttcgaccgacattcccaatgtt 209  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||| ||||| ||  ||||| |   |||||    | ||    
T  38033580 tgtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatgtagtaaattcaaacttaccaaacaacaggactcaaacatttcgtctcgcattcatgttttt 38033679  T
Q  210 ccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcattt 309  Q
    || || | || | |||||| |||||||  |    |||||||||| ||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  38033680 cctttgaaaagaataaatt-ttgttaggcttactttaaatgatgatattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aataccttcatct 38033777  T
Q  310 aaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaa-tattggagacctc-ccgtttggcaagtttgaattaccccatt 407  Q
    ||| | || ||| |||||||||||||||| | ||||| ||   ||| |  || |||| |  | ||| | |  ||||||  |||||||||||||||| |||    
T  38033778 aaaccagcataataagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaacgctgggcgaaatgcttgagtcatggccgtttatcaagtttgaattacccaatt 38033877  T
Q  408 -caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgat 505  Q
     || ||| ||||||||||||||||||||||  ||||  | | || || ||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  38033878 tcagaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttccggcggaatcaagctattgatgatatcttcagttgat 38033974  T
Q  506 ctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatg 605  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  38033975 ctcagcaacgttacccgcatatcgatccactagaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaggtgaatg 38034074  T
Q  606 atactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38034075 atactctcccctcgtagagcgttgaacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 38034133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 380 - 660
Target Start/End: Original strand, 42168885 - 42169164
Alignment:
Q  380 ccgtttggcaagtttgaattaccccatt-caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaat 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||    ||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  42168885 ccgtttggcaagtttgaattaccccatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcatcttatcc-taactaatgacgatcttctggcggaat 42168981  T
Q  478 caaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcg 577  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42168982 caagctgttgatgatatcttcagttgatctctgcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcg 42169081  T
Q  578 tcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctcct 660  Q
    |  |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42169082 ttgttcgttaattccacccaagggaatgatactttcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgcgttccaccctcct 42169164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 272 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 26452722 - 26452331
Alignment:
Q  272 aatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaa-tatt 370  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||    |||||||  |||| | ||    
T  26452722 aatgaggtccatttcttgacactt-aataccttcatctaaactagcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacataaatgtcgagcgaaatgtt 26452624  T
Q  371 ggagacctcccgtttggcaagtttgaatt-accccattcaaaggaa-gacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctac 468  Q
     ||| |||   |||||||| ||||||||| | | |||||||||| | ||||||||||| ||||||||  | ||  | | || || ||||||||||||| |    
T  26452623 tgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtatgacaattgttgcagttggaa--tacac-cttaccctaactaatgacgatcttc 26452527  T
Q  469 tggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtc 568  Q
    | ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26452526 tagcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtc 26452427  T
Q  569 atgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    | ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26452426 acgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaaggtgttccaccctccttgtg 26452331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 382 - 664
Target Start/End: Original strand, 485187 - 485466
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaa 481  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||  | | || || |||||||||||||  |||||||||||||    
T  485187 gtttgacaagtttgaattacctcattcaaaggaatacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaa 485283  T
Q  482 cttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcat 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |    
T  485284 cttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcatccgcatatcgatccactagaacatgctgtgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgt 485383  T
Q  582 tcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  485384 tcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagtgttggacgtttataccaaatgtgttccaccatccttgtg 485466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 248 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 2417335 - 2416921
Alignment:
Q  248 atgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaac 347  Q
    |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||     
T  2417335 atgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aataccttcatctaaaccagcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaa 2417237  T
Q  348 aatgagaatgtcggtcgaa-tattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattca 445  Q
    ||   ||||| ||  |||| |  | ||| |||   |||||||| |||| | ||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||  |     
T  2417236 aacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcctattgtttggcaggtttaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa--tgcac-ct 2417140  T
Q  446 ttccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgt 545  Q
    | || || ||||||||||||| |||| ||||||||  | |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  2417139 taccctaactaatgacgatcttctggtggaatcaagttgttgatgatatcttcggttgatctcatcaacgtcacctgcatatcgatcaactggaacatgt 2417040  T
Q  546 tgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaac 645  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||     
T  2417039 tgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgaaactctccccttgtcgaatgttggacgtttataccgaag 2416940  T
Q  646 gtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||||||||||||||||    
T  2416939 gtgttccaccctccttgtg 2416921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 380 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 43693426 - 43693143
Alignment:
Q  380 ccgtttggcaagtttgaattaccccatt-caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaat 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||  ||||  | | || || ||||||||||||| |||| |||||    
T  43693426 ccgtttggcaagtttgaattaccccatttcagaggtaagaaaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggaggaat 43693330  T
Q  478 caaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcg 577  Q
    |||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43693329 caagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcg 43693230  T
Q  578 tcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    || ||| |||||||||| ||| |||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43693229 tcgttctttaattccacccaaatgaatgatatcctcccctcgccgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 43693143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 380 - 662
Target Start/End: Original strand, 33799476 - 33799757
Alignment:
Q  380 ccgtttggcaagtttgaattaccccatt-caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaat 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||  ||||  | | || || ||||||||||||| ||||||||||    
T  33799476 ccgtttggcaagtttgaattaccccatttcagaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaat 33799572  T
Q  478 caaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcg 577  Q
    |||  | |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33799573 caagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttatccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcg 33799672  T
Q  578 tcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttg 662  Q
    || ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  33799673 tcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataacgaacatattccaccctccttg 33799757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 60 - 662
Target Start/End: Original strand, 28705747 - 28706348
Alignment:
Q  60 acaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaa-tt 158  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||    ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||    
T  28705747 acaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgtagttggaa---tgtgcttttcaactacaacaattgtcttacctttgaatggggaaaatt 28705843  T
Q  159 caaacatgccaagcaacaagactccaat-tttcgaccgacattcccaatgttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtat 257  Q
    ||||| || ||| ||||| ||||| |   ||||| || ||||||    | |||| || | || | |||||| |||||||  | |  ||| ||||||||||    
T  28705844 caaacttgtcaaacaacaggactcaagcatttcgccccacattcgtgtttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtat 28705943  T
Q  258 tcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatg 357  Q
    |||| || |||   |||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||| | || ||| || ||||||||||||| | ||||| ||   ||| |    
T  28705944 tcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacattt-aataccttcatctaaaccagcataaaaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaacg 28706042  T
Q  358 tcggtcgaa-tattggagacctc-ccgtttggcaagtttgaattaccccatt-ca-aaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtac 453  Q
    | || |||| |  | ||| | |  |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||  ||||  | | || ||     
T  28706043 ttgggcgaaatgcttgagtcattgccgtttggcaagtttgaattaccccatttcacaagtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaa 28706139  T
Q  454 ctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 553  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  28706140 ctaatgacaatcttctggcggaatcaagcggttgatgatatcttcagttgatctcaacaacgttacacgcatatcgatccactaaaacatgttgtgctcc 28706239  T
Q  554 caaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttcca 653  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28706240 caaaacatgctcgtcacgttttcgttgttctttaactccactcaagtgaatgatattctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattcca 28706339  T
Q  654 ccctccttg 662  Q
    |||||||||    
T  28706340 ccctccttg 28706348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 126 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 40415153 - 40414616
Alignment:
Q  126 acaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaat--tttcgaccgacattcccaatgtt--ccattcagaat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||  ||||  |||||||||   |||||  || || | ||     
T  40415153 acaacaattgtcttacctttgaatagggtaaattcaaacctgccaaacaacaggactc-aatcatttcacccgacattc---atgttttcctttgaaaag 40415058  T
Q  221 attaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggccta 320  Q
    | |||||| |||||||  | |  ||| |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | || ||    
T  40415057 aataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aataccttcatctaaaccagcata 40414959  T
Q  321 acaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaa-tattggagacctc-ccgtttggcaagtttgaattaccccatt-caaagg-aag 416  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||   ||||| ||  |||| |  | ||| |||  |||||||  ||||||||||||||||||| || ||| |||    
T  40414958 acaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcctggccgtttgataagtttgaattaccccatttcagaggtaag 40414859  T
Q  417 acaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacat 516  Q
    | |||||||||||||||||  ||||  | | || |  ||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40414858 agaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccct--ctaatgacgatcttctggtggaatcaagctgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgt 40414764  T
Q  517 cacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctcccc 616  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  40414763 cacccgcatatcaatcaactgaaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaattccacccaagtgaatgataccctcccc 40414664  T
Q  617 ttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40414663 tcgtcgagtgttagacgtttataccgaacgtgttccaccttccttgtg 40414616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 40415904 - 40415263
Alignment:
Q  21 attcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtttgtaccttc 120  Q
    |||||||| ||| |||||||| | || |||||  | | |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| | || ||    ||| | |||    
T  40415904 attcaagatgcttatcgaatgttggactcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgtacttggaa---tgtgcattc 40415808  T
Q  121 caactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgac-cgacattcccaatgttc--cattca 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||  |||| ||  ||  || || |||||   |||||   | || |    
T  40415807 caactacaacaattgtcttacctttgaatagggtaaattcaaacctgccaaacaacatcactcaaacatttcactcggcattc---atgtttttctttga 40415711  T
Q  217 gaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcgg 316  Q
     || | |||||| |||| ||  | |  ||| |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | |    
T  40415710 aaagaataaatttttgtaaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattctttgacactt-aataccttcatctaaaccag 40415612  T
Q  317 cctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaa-tattggagacctc-ccgtttggcaagtttgaattaccccatt-caaagg 413  Q
     ||||||||||||||||||||| | ||||| ||   ||||| ||  |||| |  |  ||   |  |||||||| ||||||||||||||||||| || |||    
T  40415611 tctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttaagttatggccgtttggtaagtttgaattaccccatttcatagg 40415512  T
Q  414 -aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagca 512  Q
     |||| |||||||||||||| ||  ||||  | | || || ||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  40415511 taagagaattgttgtagttgaaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctgacggaatcaagctgttgatgatatcttaagttgatctcaaca 40415415  T
Q  513 acatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactct 612  Q
    || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||    
T  40415414 acgtcacctgcatatcgatccacgggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaattccacccaagtgaatgataccct 40415315  T
Q  613 ccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40415314 cccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 40415263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 369 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 41363955 - 41363662
Alignment:
Q  369 ttggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccc-cattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatcta 467  Q
    |||||| ||| | |||| |||||||||||||  || ||| || || ||||||||||||||||||||||  ||||  | | || || |||||||||||||     
T  41363955 ttggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgcctcatccagagaaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatctt 41363859  T
Q  468 ctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgt 567  Q
    |||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41363858 ctggaggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtaacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgt 41363759  T
Q  568 catgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41363758 cacattttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttagacgtgtataccgaacgtgttccaccctccttgtg 41363662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 248 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 34615375 - 34614959
Alignment:
Q  248 atgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaac 347  Q
    |||||||||||||| || |||   |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| | | |||     
T  34615375 atgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattcctttacactt-aataccttcatctaaatcagcataacaagaatttaatcttttcaaatgaaa 34615277  T
Q  348 aatgagaatgtcggtcgaa-tattggagacctcc-cgtttggcaagtttgaattaccccattcaa-agg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcatt 443  Q
    ||   ||| || || |||| |  | ||| | |   |||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||  ||||      
T  34615276 aacatgaacgttgggcgaaatgcttgagtcatggtcgtttgtcaagtttgaattaccccatttaagaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac- 34615180  T
Q  444 cattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacat 543  Q
    | | || || ||||| || |||| |||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||    
T  34615179 cttaccctaactaattactatcttctggtggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcaatccactggatcat 34615080  T
Q  544 gttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccga 643  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34615079 gttgtgctcccaaaacatgttcgtcacgttttcgtcgttcgttaatttcacccaagtgaatgatactttcccctcgtcgagcgttggacgtttataccga 34614980  T
Q  644 acgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  34614979 acgtgttccaccctccttgtg 34614959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 454 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 41275610 - 41275400
Alignment:
Q  454 ctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 553  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  41275610 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccattggaacatgttgtgctct 41275511  T
Q  554 caaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttcca 653  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  41275510 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgtttgacgtttataccgaaggtgttcca 41275411  T
Q  654 ccctccttgtg 664  Q
    |||||||||||    
T  41275410 ccctccttgtg 41275400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 383 - 662
Target Start/End: Original strand, 43638605 - 43638883
Alignment:
Q  383 tttggcaagtttgaattaccccatt-caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||  ||||  | | || || ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  43638605 tttggcaagtttgaattaccccatttcagaggtaagacaattattgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcgaaatcaa 43638701  T
Q  481 acttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtca 580  Q
      | |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||     
T  43638702 gttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacgcgcatatcgatgcactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgtcg 43638801  T
Q  581 ttcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttg 662  Q
    ||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43638802 ttctttaactccacccaagtgaaggatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttg 43638883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 212 - 664
Target Start/End: Original strand, 31171575 - 31172024
Alignment:
Q  212 attcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaa 311  Q
    ||||| || |||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||   ||||  ||    
T  31171575 attcaaaagattaaattcttgttagtttggt-ttagatgatggtattgaactatcaaaagaatgaggtgcattccgtgacacttcaatatgatcatccaa 31171673  T
Q  312 atcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtc-ggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccatt-ca 409  Q
    | |   ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  || ||  ||||  | |||| ||   ||||  ||||||||||||| | |||| ||    
T  31171674 accaaactaacaagaatttaatcttttgaaaggaacaat-agaacttccgggtgaatgcttgagaactgttgtttaacaagtttgaattatctcatttca 31171772  T
Q  410 aagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctc 508  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    | |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  31171773 gaggtaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc----catacctaatcacgatcttctggcggaatcaaactgttgataatattttcagttgatctc 31171868  T
Q  509 agcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgata 608  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| | |||||| |||||| |  ||| ||| | |||||||  ||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  31171869 agcaacgtcacccacatatcgatccacggtaacatgctgtgcttctgaaaaatgtttgtcatgtcgtcgtcgttcattaattccacccaactgaatgata 31171968  T
Q  609 ctctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
     |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31171969 ttctcccatcgtcgaacgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtg 31172024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 61 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 37780754 - 37780507
Alignment:
Q  61 caagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattc 159  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | | |||||||| |||||| |||| |||||||| | |||||||    
T  37780754 caagtttgaattgcccaattcagaggaagacaattgttgcagttgaacgtttctacttcctaactacaaaaattgtgttacatttgaatggggtaaattc 37780655  T
Q  160 aaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattc 259  Q
    |||  ||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  37780654 aaatttgccaagcagcaggactccaatattcgaccggcattctcaatgttccattcaaaagaataaattcttgttaggctgggattaaatgatggtattc 37780555  T
Q  260 aaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcat 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  37780554 aaatgtcaaaagaatgaggtccattcgttgacactttaataccttcat 37780507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 491 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 26484756 - 26484583
Alignment:
Q  491 atatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaatt 590  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  26484756 atatcttcagttgatctcagcaatgttatgcgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaatt 26484657  T
Q  591 ccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26484656 ccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 26484583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 66 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 28167444 - 28167234
Alignment:
Q  66 ttgaattaccccattcagaggaagacaattgtt-gcagttagacgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaac 163  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  28167444 ttgaattacctcattcaaaggaagacaattgtttgcagttggacgtttgtaccttccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaac 28167345  T
Q  164 atgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaat 263  Q
     ||||||||| || ||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  28167344 ttgccaagcagcaggactccaatatacgaccagcattcccaatgttccattcaaaagattaaattcttgttaggctgggattaaatgatggtattcaaat 28167245  T
Q  264 gtcaaaagaat 274  Q
    |||||||||||    
T  28167244 gtcaaaagaat 28167234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 248 - 664
Target Start/End: Original strand, 3589058 - 3589474
Alignment:
Q  248 atgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaac 347  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||  ||| || | |    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3589058 atgatggtattgaagtttcaaaagaatgatgttcattccgtgacacttcaataccaacatctacaccaaaataacaagaatttaatcttttgaaaggaac 3589157  T
Q  348 aatgagaatgtc-ggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaa---agg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcat 442  Q
    ||  ||||| || ||  ||||  | |||| ||   |||| |||||||||||||| | ||||  |   ||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3589158 aac-agaatttccgggtgaatgcttgagaactgttgtttagcaagtttgaattatctcatttcagagaggtaagacaattgttgtagtttgaaggtgcat 3589256  T
Q  443 tcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaaca 542  Q
    ||    | |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||  | || ||||||||||||||||||||||    
T  3589257 tc----cctacctaatcacgatcttctggcggaatcaaactgttgataatgtcttcagttgatctcaacaatgttacacgcatatcgatccactggaaca 3589352  T
Q  543 tgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccg 642  Q
    |  |||||||||||||||||| | ||| ||| ||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||| | | | | |||| |||||||||||||    
T  3589353 tcctgtgctcccaaaacatgcccatcacgttatcgtcgttcattaattccacccaactgaatgatattctcccatagacaatcgtttgacgtttataccg 3589452  T
Q  643 aacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  3589453 aacgtattccaccctccttgtg 3589474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 381 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 16575966 - 16575698
Alignment:
Q  381 cgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaa 480  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| | |||||| |||| || |||||||||||||    
T  16575966 cgtttggcaagtatgaattacctcattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcatt---tccctgcctaatcacgaacttctggcggaatcaa 16575870  T
Q  481 acttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtca 580  Q
    |||| ||  || ||            ||| |||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||      
T  16575869 acttctggcgaaat------------tcaacaacattacgcgcgtatcgatgcactggaacatgttgtggtcccaaaacatgctcatcccgttttcgttg 16575782  T
Q  581 ttcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16575781 ttcgttaattccacccaactgaatgaaactctcctctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtg 16575698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 61 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 16576263 - 16575990
Alignment:
Q  61 caagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattc 159  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |   | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  16576263 caagtttggattaccccatccagaggaagacaattgttgtagttggaag---gcaccttccaactacaacaattatcttacctttgaatgaggtaaattc 16576167  T
Q  160 aaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattc 259  Q
    |||| |||||| ||| |    || | | |||  |||| | |   | |||| |||||| ||  |||||||||||||||  | || ||||||| ||||||||    
T  16576166 aaacttgccaaacaatagctatcaagtattcacccgaaagttttattgtttcattcaaaagtttaaattcttgttaggcttggtttaaatggtggtattc 16576067  T
Q  260 aaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatctt 336  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  16576066 aagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttcaataccttcatttaaaccagcctaacaagaatttaatctt 16575990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 206 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 16576445 - 16576214
Alignment:
Q  206 tgttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttc 305  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||  | || ||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  16576445 tgttccattcaaaagattaaattcttgttaggcttggtttatataatggtattcaagtgtcaaaagaacgaggtgaattccttgacacttgaataccttc 16576346  T
Q  306 atttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattacccca 405  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||| | || ||| ||   |||||  | ||||| || ||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  16576345 atttaaatcggcctaagaagaatttaaccttttaaaagaaacgatagaaatgttaggcgaatgtttgagtcctgccgtttagcaagtttggattacccca 16576246  T
Q  406 ttcaaaggaagacaattgttgtagttggaagg 437  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  16576245 tccagaggaagacaattgttgtagttggaagg 16576214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 553 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 22548380 - 22548269
Alignment:
Q  553 ccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttcc 652  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  22548380 ccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcatttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatatcgaatgtgttcc 22548281  T
Q  653 accctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||    
T  22548280 accctccttgtg 22548269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 22549737 - 22549232
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||| | |||||||  || |||||||||| || |||||  | | |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||     
T  22549737 ttgaataccagcgttcaagacacttatcgaatgctggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgcagttggaa 22549638  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaat-tttcgaccgacattcccaat 206  Q
       ||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||| |||||| || || ||||| ||  ||||  ||| |||||   ||    
T  22549637 ---tgtgcattccaactgcaacaattgtcttacctttaaatggggtcaattcaaacttgccaaacagcaggactcaaacatttcacccggcattc---at 22549544  T
Q  207 gtt--ccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacctt 304  Q
    |||  || || | || | |||||| |||||||  | |  ||| |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  22549543 gttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aatacctt 22549445  T
Q  305 catttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcg-aatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttacc 402  Q
    ||| |||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||   |||||  |  || |||  | ||| |||   |||||||| ||||||| ||| |    
T  22549444 catctaaaccagcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgctgagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatc 22549345  T
Q  403 ccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagt 501  Q
     |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  | ||  | | || || ||||||||||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  22549344 tcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa--taca-ccttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaa---gttgatgatatcttcagt 22549251  T
Q  502 tgatctcagcaacatcacc 520  Q
    |||| |||||||| |||||    
T  22549250 tgatgtcagcaacgtcacc 22549232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 316 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 18440077 - 18439954
Alignment:
Q  316 gcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaag-g 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||| ||| ||| | | |||||||||||||| ||||| |||||||||      
T  18440077 gcctaacaagaatttaatcttttgaatggaacattgtgaatgtcggtcgaatattagagtcctgctgcttggcaagtttgaatttacctcattcaaagat 18439978  T
Q  414 aagacaattgttgtagttggaagg 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  18439977 aagacaattgttgtagttggaagg 18439954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 2417631 - 2417460
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||||  ||||||| || ||||| ||| | ||||| ||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  2417631 ttgaataccattgttcaagatgcacatcgcatgttggattcatgccgtttaacaagtttgaattgccccattcagaggaagacaattgttgcagttgga- 2417533  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
       ||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || ||| ||||| |||||    
T  2417532 --atgtgcattccaactgccacaattgtcttacctttgaatgagataaattaaaacttgtcaaacaacaggactc 2417460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 316 - 438
Target Start/End: Original strand, 28167270 - 28167394
Alignment:
Q  316 gcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg- 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||  ||||| ||||||||| ||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  28167270 gcctaacaagaatttaatcttttgaatggaacattgggaatgctggtcgtatattggagtcctgctgcttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggt 28167369  T
Q  414 aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  28167370 aacacaattgttgtagttggaaggt 28167394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 124 - 438
Target Start/End: Original strand, 42603695 - 42604007
Alignment:
Q  124 ctacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcagaatatt 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| ||||||   ||| | ||||||| |||||||| |||||||| ||||||  ||| || |||    
T  42603695 ctacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaa---acaggtctccaatattcgaccggcattcccactgttcctgtcaaaagatt 42603790  T
Q  224 aaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt-gacacttcaataccttcatttaaatcgg-cctaa 321  Q
    |||||||||||||  |||  |||||||| |||||| ||   ||||  |||||     ||||| || |||| || |||||| ||||||||  |   |||||    
T  42603791 aaattcttgttaggctggt-ttaaatgaaggtattgaaggatcaac-gaatggacctcattcttttgacatttgaataccgtcatttaatcccaacctaa 42603888  T
Q  322 caagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-aagaca 419  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||    
T  42603889 caagaatttaatcttttgaacggaacattggaaatgtcggttgaatattggagtcctgctgcttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaacaca 42603988  T
Q  420 attgttgtagttggaaggt 438  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  42603989 attgttgtagttgggaggt 42604007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 331
Target Start/End: Original strand, 43637319 - 43637638
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    ||||||| || ||||||||||||| |||||||| | || | |||| | | |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||     
T  43637319 ttgaatatcagcattcaagaggcttatcgaatgttggagttctgtcgattaacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgtagttgga- 43637417  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatg-agtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaa-ttttcgaccgacattcccaat 206  Q
       ||| | || |||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||  ||||  ||| |||||   ||    
T  43637418 --atgtgcatttcaactataacaattgccttacctttgaatgcggtaaattcaaacctgccaaacaacaagactcaaacatttcacccggcattc---at 43637512  T
Q  207 g--ttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacctt 304  Q
    |  |||| || | || | |||||| |||||||  | |  ||| |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  43637513 gttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattcattgacactt-aatacctt 43637611  T
Q  305 catttaaatcggcctaacaagaattta 331  Q
    ||| |||| | ||||||||||||||||    
T  43637612 catctaaaccagcctaacaagaattta 43637638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 182
Target Start/End: Original strand, 15031880 - 15032051
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| || |||||  | | |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||     
T  15031880 ttgaataccattgttcaagatgctcattgaatgctggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgcagttgga- 15031978  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
       ||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  15031979 --atgtgcattccaactgcaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacacgactc 15032051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 44051098 - 44050927
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| || | ||| || | |||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||  |     
T  44051098 ttgaataccagcgttcaagacgcttatcgaatgctggagttctgctgattaacaagtttgaattgcccaatccagagtaagacaattgttgcagttgaa- 44051000  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
       ||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  44050999 --atgtgcattccaactgccacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgtcaaacaacaagactc 44050927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 317 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 41856753 - 41856630
Alignment:
Q  317 cctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-a 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||| |||| ||||||| ||| ||| | | |||| ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  41856753 cctaacaagaatttaatcttttgaatggaacattgggaatgccggttgaatattagagtcctgctgcttggtaagtttgaatttaccccattcaaaggta 41856654  T
Q  415 agacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  41856653 agacaattgttgtagttgggaggt 41856630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 124 - 438
Target Start/End: Original strand, 40702602 - 40702917
Alignment:
Q  124 ctacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcagaatatt 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| |  || | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||| || |||    
T  40702602 ctacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctccaatattcgaccgacattcccattgttcctgtcaaaagatt 40702700  T
Q  224 aaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc-cttgacacttcaataccttcatttaa-atcggcctaa 321  Q
    |||||||||||||  | || |||||||| |||||| || |||| || |||||     |||||  |||||| || |||||| ||||||||   | ||||||    
T  40702701 aaattcttgttaggct-ggtttaaatgaaggtattgaagtgtc-aacgaatggacctcattcttttgacatttgaataccgtcatttaatcccagcctaa 40702798  T
Q  322 caagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-aagaca 419  Q
      ||||||||||| |||||  | |||| || ||||| |||||||||||||||| | |   | |||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||    
T  40702799 agagaatttaatcctttgaatgtaacattgggaatgccggtcgaatattggagtcatgttgcttggaaagtttgaatttaccccattcaaaggtaacaca 40702898  T
Q  420 attgttgtagttggaaggt 438  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  40702899 attgttgtagttgggaggt 40702917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 152
Target Start/End: Original strand, 41017304 - 41017444
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||| | ||||||| ||| |||||||| | || |||||  | | |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||     
T  41017304 ttgaataccagcgttcaagacgcttatcgaatgttggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgcagtttga- 41017402  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag 152  Q
       ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41017403 --atgtgcatttcaactacaacaattgtcttacctttgaatgag 41017444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 124 - 444
Target Start/End: Original strand, 26486914 - 26487235
Alignment:
Q  124 ctacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcagaatatt 223  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| || ||| |  || | ||||||| ||||||||  ||||||| |||||   ||| || |||    
T  26486914 ctacaacaattgtctt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacggcaggtctccaatattcgaccggtattcccattgttcttgtcaaaagatt 26487012  T
Q  224 aaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt-gacacttcaataccttcatttaaatcg-gcctaa 321  Q
    |||||||||||||  |||  |||||||| |||||| || | ||||| |||||     ||||  || |||| || |||||| ||||||||  |  ||||||    
T  26487013 aaattcttgttaggctggt-ttaaatgaaggtattgaagtttcaaa-gaatggacctcattattttgacatttgaataccgtcatttaatcctagcctaa 26487110  T
Q  322 caagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-aagaca 419  Q
    ||| |||||||||||||||  |||||| || ||||| | |||||||||||||| ||| | | |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |    
T  26487111 caataatttaatcttttgaatggaacattgggaatgcctgtcgaatattggagtcctgctgcttggcaagtttgaatttacccaattcaaaggtaagata 26487210  T
Q  420 attgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||    
T  26487211 aatgttgcagttggaaggtacattc 26487235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 316 - 431
Target Start/End: Original strand, 37780576 - 37780693
Alignment:
Q  316 gcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaa-gg 413  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| | | ||||||| |||||| |||||||||||||| |     
T  37780576 gcctaacaagaatttattcttttgaatggaacattgagaatgccggtcgaatattggagtcctgctgcttggcaaatttgaatttaccccattcaaatgt 37780675  T
Q  414 aagacaattgttgtagtt 431  Q
    || |||||| ||||||||    
T  37780676 aacacaatttttgtagtt 37780693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 182
Target Start/End: Original strand, 484814 - 484985
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| || || |||||  | | |||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||| ||     
T  484814 ttgaataccattgtccaagatgctcatcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagggtaagacaattgttgcagttgga- 484912  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
       ||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  484913 --atgtgcattccaaccacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactc 484985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 28167494 - 28167443
Alignment:
Q  244 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacactt 295  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28167494 ttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacactt 28167443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Original strand, 33799306 - 33799401
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| | || |||||  | | |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  33799306 ttgaataccagcattcaagaggcttatcgaatgttggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgtagtt 33799401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Original strand, 38033433 - 38033488
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  38033433 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacactttaatacc 38033488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Original strand, 22549311 - 22549376
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  22549311 ttccaacttcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggactc 22549376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 40415963 - 40415910
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaata 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  40415963 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaata 40415910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Original strand, 484770 - 484822
Alignment:
Q  250 gatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  484770 gatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 484822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 388 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 2417579 - 2417523
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  2417579 caagtttgaattgccccattcagaggaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 2417523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 295
Target Start/End: Original strand, 41856478 - 41856526
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacactt 295  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41856478 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacactt 41856526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 41856947 - 41856836
Alignment:
Q  124 ctacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcagaatatt 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| |  || | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||| || |||    
T  41856947 ctacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctccaatattcgaccgacattcccattgttcctgtcaaaagatt 41856849  T
Q  224 aaattcttgttag 236  Q
    ||||| |||||||    
T  41856848 aaattattgttag 41856836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 42604157 - 42604105
Alignment:
Q  250 gatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  42604157 gatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 42604105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 41275725 - 41275630
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||||||| | ||||||| ||| ||||||| ||||| ||||| || | |||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  41275725 ttgaataccagcgttcaagacgcttatcgaatactagagtcctgctgattaacaagtttgaattgcctcatccagagtaagacaattattgcagtt 41275630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 302
Target Start/End: Original strand, 15031838 - 15031888
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  15031838 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 15031888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 104
Target Start/End: Original strand, 15032236 - 15032302
Alignment:
Q  38 aatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  15032236 aatgctcgagtcctgttgtttgacaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaaatgttgtagtt 15032302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 22549779 - 22549729
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  22549779 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 22549729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 192
Target Start/End: Original strand, 28705559 - 28705637
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcga 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||| | | |||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  28705559 accttccaactacaacaattgtcttgcccttgaatggggcaaattcaaacttgctaagcagcaagactccaatattcga 28705637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 41275767 - 41275717
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  41275767 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 41275717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 44051140 - 44051090
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  44051140 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 44051090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 19242144 - 19242024
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | |||||| |  | ||||||| |||||| |  ||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |    
T  19242144 accttccaactacaacaattgtctttc-tctgaatggggtagttcaaacttgccaaacggcataactccaatgttcgaccgacattcccattgttcctgt 19242046  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttag 236  Q
    || || ||||| ||||||||||    
T  19242045 caaaagattaacttcttgttag 19242024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 19315328 - 19315208
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | |||||| |  | ||||||| |||||| |  ||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |    
T  19315328 accttccaactacaacaattgtctttc-tctgaatggggtagttcaaacttgccaaacggcataactccaatgttcgaccgacattcccattgttcctgt 19315230  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttag 236  Q
    || || ||||| ||||||||||    
T  19315229 caaaagattaacttcttgttag 19315208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Original strand, 24861575 - 24861640
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  24861575 ttccatctgcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacatgactc 24861640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 252 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 24862043 - 24861994
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatac 301  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  24862043 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatac 24861994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Original strand, 26452557 - 26452622
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  26452557 ttccaactgcaacaattgtcatacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggactc 26452622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 382 - 440
Target Start/End: Original strand, 16576154 - 16576214
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgc 440  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  16576154 gtttggcaagtttgaatttacctcattcaaaggtaagataattgttgtagttggaaggtgc 16576214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 26453012 - 26452964
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaata 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  26453012 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaata 26452964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 300
Target Start/End: Original strand, 28705654 - 28705702
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaata 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  28705654 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaata 28705702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 40703067 - 40703015
Alignment:
Q  250 gatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  40703067 gatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcattgacacttaaatacc 40703015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Original strand, 18439800 - 18439855
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||    
T  18439800 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtacattatttgacacttgaatacc 18439855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 361 - 440
Target Start/End: Original strand, 28705721 - 28705800
Alignment:
Q  361 gtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgc 440  Q
    ||||||| |||||| ||| ||| ||  |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  28705721 gtcgaatgttggagtcctgccgatttacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgtagttggaatgtgc 28705800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Original strand, 33799259 - 33799314
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  33799259 aatgacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttaacacttgaatacc 33799314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 59 - 338
Target Start/End: Original strand, 42168564 - 42168841
Alignment:
Q  59 aacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaat 157  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| |     ||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||| | || |     
T  42168564 aacaagtttgaattgccccatctagagtaagacaattgttgcagttggga---tgtgcattccaactacaacaattgtcctaccttcgaatggggtacag 42168660  T
Q  158 tcaaacatgccaagcaacaagactccaat-tttcgaccgacattcccaatgttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggta 256  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||| |   ||||| ||  |||||    | |||| || | |||| |||||| ||| |||  | |  ||| |||||||||    
T  42168661 tcaaacttgccaaacaacaggactcaagcatttcgccccgcattcatgtttttcctttgaaaataataaatttttggtaggcttgctttagatgatggta 42168760  T
Q  257 ttcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatctttt 338  Q
    ||||| || |||   |||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||    
T  42168761 ttcaagtgccaacgaaatgaggttcattcattgccactt-aataccttcatctaaaccagcataacaagaatttaatctttt 42168841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 388 - 443
Target Start/End: Original strand, 43637371 - 43637426
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcatt 443  Q
    |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43637371 caagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgtagttggaatgtgcatt 43637426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 104
Target Start/End: Original strand, 485170 - 485236
Alignment:
Q  38 aatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  485170 aatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaattacctcattcaaaggaatacaattgttgtagtt 485236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 362 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 28705637 - 28705555
Alignment:
Q  362 tcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaatta-ccccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcat 442  Q
    ||||||||||||| | | | | || |||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28705637 tcgaatattggagtcttgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcaagggcaagacaattgttgtagttggaaggtgcat 28705555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 362 - 444
Target Start/End: Original strand, 33799332 - 33799414
Alignment:
Q  362 tcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    |||||| |||||| ||| ||| ||  |||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  33799332 tcgaatgttggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgtagttgaaatgtgcattc 33799414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 185
Target Start/End: Original strand, 38033340 - 38033414
Alignment:
Q  112 tgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatga-gtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaa 185  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| || | |||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  38033340 tgtaccttccaactgcaacaattatcttacccttgaaggaggcaaattcaaacttgctaaacaacaagactccaa 38033414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 26452877 - 26452812
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  26452877 ttccaactgcaacaattgtcttaccttttaatgagataaattcaaacctgtcaaacaacatgactc 26452812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 41856492 - 41856395
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaa-ttaccccattcagagg-aagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||  ||||| || |||||||||| | |||||||||| || |||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  41856492 ttgaataccatcattcaatatactcatcagatgctggagtcctgttgtttagcaagtttgaattttccccattcagtggtaagataattgttgcagtt 41856395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 388 - 444
Target Start/End: Original strand, 15031932 - 15031988
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    |||||||||||| |||||| || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  15031932 caagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 15031988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 387 - 442
Target Start/End: Original strand, 40416000 - 40416056
Alignment:
Q  387 gcaagtttgaattaccccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcat 442  Q
    ||||||||||||| ||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40416000 gcaagtttgaatttcccaattcaggggcaagacaattgttgtagttggaaggtgcat 40416056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 252 - 292
Target Start/End: Original strand, 42168472 - 42168512
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgaca 292  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42168472 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgaca 42168512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 263 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 2417662 - 2417623
Alignment:
Q  263 tgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  2417662 tgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 2417623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 170
Target Start/End: Original strand, 16575909 - 16575963
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaa 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| || ||||||    
T  16575909 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgaggtaattcatacttgccaa 16575963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 104
Target Start/End: Original strand, 19242094 - 19242137
Alignment:
Q  61 caagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  19242094 caagtttgaactaccccattcagagaaagacaattgttgtagtt 19242137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 104
Target Start/End: Original strand, 19315278 - 19315321
Alignment:
Q  61 caagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  19315278 caagtttgaactaccccattcagagaaagacaattgttgtagtt 19315321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 382 - 435
Target Start/End: Original strand, 22549576 - 22549631
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaa 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22549576 gtttggcaagtttgaattgaccccatttaaaggtaagacaattgttgcagttggaa 22549631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 557 - 664
Target Start/End: Original strand, 22843424 - 22843531
Alignment:
Q  557 aacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccc 656  Q
    ||||||||| ||| ||  ||||| |||||||| |||| |||| |||| | || |||||| | ||| | || |||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  22843424 aacatgctcctcaagtcgtcgtccttcgttaactccaatcaactgaacgttattctcccatcgtcaaacgatggacgttcataccaaacgtattccaccc 22843523  T
Q  657 tccttgtg 664  Q
    ||||||||    
T  22843524 tccttgtg 22843531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 26486956 - 26486917
Alignment:
Q  60 acaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttg 99  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  26486956 acaagtttgaattacctcattcaaaggaagacaattgttg 26486917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 382 - 435
Target Start/End: Original strand, 40415755 - 40415810
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaa 435  Q
    |||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40415755 gtttggcaggtttgaatttaccctattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 40415810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 44943063 - 44942945
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||| |||||| | ||| | ||||||| |||   || |||||||| || |||  |    
T  44943063 accttccagctacaacaattgtctt-cgtttgaatgagataattcaaacttgccaaacgacaggtctccaatattcagacggcattcccattgctcctgt 44942965  T
Q  215 cagaatattaaattcttgtt 234  Q
    || || ||||||||||||||    
T  44942964 caaaagattaaattcttgtt 44942945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 362 - 444
Target Start/End: Original strand, 484840 - 484922
Alignment:
Q  362 tcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    ||||||| ||||| ||| ||| ||  |||||||||||| |||||| ||  | ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  484840 tcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 484922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 152
Target Start/End: Original strand, 2417147 - 2417181
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag 152  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2417147 ttccaacttcaacaattgtcttacctttgaatgag 2417181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 112 - 181
Target Start/End: Original strand, 18439707 - 18439777
Alignment:
Q  112 tgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagact 181  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| | | |||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  18439707 tgtaccttccaactacaacaattatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgctaagcagcaagact 18439777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 362 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 24861975 - 24861893
Alignment:
Q  362 tcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    |||||| |||||| ||| ||| ||  |||||||||||| |||||| || || |||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  24861975 tcgaatgttggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagagtaagaaaattgttgcagttggaatgtgcattc 24861893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 40416052 - 40415982
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaa 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||  | |||||||||| ||| ||||| || ||||||||    
T  40416052 accttccaactacaacaattgtcttgcccctgaattgggaaattcaaacttgctaagcagcaggactccaa 40415982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 42168942 - 42168912
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42168942 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 42168912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 362 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 43637261 - 43637179
Alignment:
Q  362 tcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccc-cattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcat 442  Q
    ||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||  || | ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43637261 tcgaatattggagtcctgcagtttagcaagtttgaatttgccactttcaggggcaagacaattgttgtagttggaaggtgcat 43637179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 18440277 - 18440157
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||  | |||| |  || | ||||||| |||||||||||||| || ||||||  |    
T  18440277 accttccagctacaacaattatctt-cctttgaatggggtaattcaaattttccaaacggcaggtctccaatattcgaccgacattctcattgttcctgt 18440179  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttag 236  Q
    || || |||||||| |||||||    
T  18440178 caaaagattaaattattgttag 18440157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 31171802 - 31171769
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31171802 accttccaactacaacaattgtcttacctctgaa 31171769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 362 - 443
Target Start/End: Original strand, 41017330 - 41017411
Alignment:
Q  362 tcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcatt 443  Q
    |||||| |||||| ||| ||| ||  |||||||||||| |||||| || || ||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  41017330 tcgaatgttggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgcagtttgaatgtgcatt 41017411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 485240 - 485177
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  485240 ttccaactacaacaattgtatt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 485177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 393 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 28167444 - 28167412
Alignment:
Q  393 ttgaattaccccattcaaaggaagacaattgtt 425  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28167444 ttgaattacctcattcaaaggaagacaattgtt 28167412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 9 - 107
Target Start/End: Original strand, 28167477 - 28167577
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaatt-accccattcagagg-aagacaattgttgcagttag 106  Q
    ||||||||||||||| || | | |||||  ||||| || ||||  | || |||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  28167477 ttgaataccatcatttaaaatgttcatcacatgctggagtcctactatttaacaagtttgaatttaccccattcaggggtaagataattgttgcagttag 28167576  T
Q  107 a 107  Q
    |    
T  28167577 a 28167577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 382 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 28705857 - 28705805
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatta-ccccattcaaagg-aagacaattgttgtagttg 432  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28705857 gtttgacaagtttgaattttccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttg 28705805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 414 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 33776079 - 33776051
Alignment:
Q  414 aagacaattgttgtagttggaaggtgcat 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33776079 aagacaattgttgtagttggaaggtgcat 33776051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 388 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 37780754 - 37780710
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttg 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  37780754 caagtttgaattgcccaattcagaggaagacaattgttgcagttg 37780710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Original strand, 40415949 - 40416045
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagagg-aagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||| ||| | || ||||| || | | |||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||| ||||    
T  40415949 ttgaataccatcattcaagatgttgatcgtatgttggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttcccaattcaggggcaagacaattgttgtagtt 40416045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 475; Significance: 0; HSPs: 238)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 475; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 41578571 - 41577918
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||     
T  41578571 ttgaatcccagcattcaagaggctcatcgaatgctggattcctgccgtttaacaagtttgaattaccccattcagaggaacacaattgttgcagttcgag 41578472  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| || |||| ||||||    
T  41578471 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatattcgatcggcatttccaatg 41578372  T
Q  208 ttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcat 307  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41578371 ttccattcaaaagattaaattcttgttaggctgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattctttgacacttcaataccttcat 41578272  T
Q  308 ttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccatt 407  Q
    ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41578271 ttaaaccagcctaacaagaatttaatattttgacaggaataatgaga-tgttggtcgaatattggagacctgccgtttggcaagtttgaattaccacatt 41578173  T
Q  408 caaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatct 507  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41578172 caaaggaagacaattgttgtagctgaaaggtgcattcattccgtacctaatgatgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatct 41578073  T
Q  508 cagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgat 607  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  41578072 cagcaacgtcactcgcatattgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgat 41577973  T
Q  608 actctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttg 662  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41577972 actctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttg 41577918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 2429153 - 2428500
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2429153 ttgaataccagcattcaagaggctcatcgcatgctggattcctgccgtttaacaagtttaaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttggac 2429054  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  | |||||||  | ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  2429053 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaatttaccaagcagtaggactccaatattcgaccggcattcccaatg 2428954  T
Q  208 ttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcat 307  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2428953 ttccattcaaaagattaaattcttgttaggctgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcat 2428854  T
Q  308 ttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccatt 407  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2428853 ttaaaccagcctaacaagaatttaatcttttgacatgaacaatgggaatgtcggtcgaatattggagacctgccgtttggcaagtttgaattaccccatt 2428754  T
Q  408 caaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatct 507  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2428753 caaaggaacacaattgttgtagctgaaaggtgcattcattatgtacctaatgacgatcttctagcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatct 2428654  T
Q  508 cagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgat 607  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  2428653 cagcaacgtcacccgcatatcgatccactagaaaatgttgtgctcccaaaacatgttcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgat 2428554  T
Q  608 actctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctcctt 661  Q
    | | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2428553 attatcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctcctt 2428500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 457; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 7246760 - 7246104
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  7246760 ttgaatactagcattcaagaggctcaacgaatgctggatttctgccgtttaacaagtttgaattaccccattcagtggaagacaattgttgctgttagac 7246661  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  7246660 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgcgaagcagcaggactccaatattcgaccggcattcccaatg 7246561  T
Q  208 ttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcat 307  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7246560 ttccattcaaaaaattaaattcttgttagggtgggattaaatgatgatattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttaacacttcaataccttcat 7246461  T
Q  308 ttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccatt 407  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  7246460 ttaaatcagcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgggaatgccggtcgaatattggagacctgccatttggcaagtttgaattaccccatt 7246361  T
Q  408 caaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatct 507  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7246360 caaaggaagacaatcgttgtagctggaaggtgcatttattccatacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatct 7246261  T
Q  508 cagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgat 607  Q
     |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  7246260 aagcaacgtcacccgcatatcgatacactggaacatgttataatcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtcaatgat 7246161  T
Q  608 actctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  7246160 attctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaatgtgttccactcttcttgtg 7246104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 39 - 661
Target Start/End: Original strand, 55206467 - 55207090
Alignment:
Q  39 atgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtttgtaccttccaactacaacaattgtct 138  Q
    ||||| ||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  55206467 atgctggattcctgccgtttaacaagtttgaattgccccattcagaggaagacaattgctgcagttggatgtttgtacctcccaactacaacaattgtgt 55206566  T
Q  139 tacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcagaatattaaattcttgttaga 237  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||| ||  |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||     
T  55206567 taccttttaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcagaactccaatattcgactgccattcccaatgttccattcaaatgattaaattcttgttagg 55206666  T
Q  238 ttgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttt 337  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  55206667 ttgggattaaatgacggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcgttgacacttcaataccttcatttaaaccagcctaacaagaatttaatcttt 55206766  T
Q  338 tgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaagg 437  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||    
T  55206767 tgacaggaacaatgagaatgccggtcgaatattagagacctgccgtttgacaagtttgtattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagctaaaagg 55206866  T
Q  438 tgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactg 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  55206867 tgcattcattccgtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactg 55206966  T
Q  538 gaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgttta 637  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  55206967 gaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcacctcgtcgagcattggacgttta 55207066  T
Q  638 taccgaacgtgttccaccctcctt 661  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  55207067 taccgaacgtgtttcaccctcctt 55207090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 433; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 30193204 - 30192548
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||||||||||| | | |||| ||||||| ||||| ||| ||| || |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||    
T  30193204 ttgaataccatcattcaaaatgttcattgaatgctggattcttgtcgtttaagaagtatgaattaccccattcaaaagaagacaattgttgcagttggac 30193105  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatg 207  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  30193104 gtttgtacctcccaactccaacaattgtgttacatttgaatgtggtaaattcaaacttgccaagcaacaggactccaatatacgaccgacattcccaatg 30193005  T
Q  208 ttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcat 307  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||  || |||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30193004 ttccattcaaaagattaaattattgttaggctgtgattaaatgatgatatttaaatgtcaaacgaataaggtccattccttgacacttcaataccttcat 30192905  T
Q  308 ttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccatt 407  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  30192904 ttaaaccggcctaacaagaatttaatcctttgataggaacaatgagaatgtcggtcagatattggactcctgccgtttggcaagtttgaaatacctcatt 30192805  T
Q  408 caaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatct 507  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30192804 caaaggaagaaaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatct 30192705  T
Q  508 cagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgat 607  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  30192704 cagcaacgtcacccgcatatcgatccactagaacatgatgtactcccaaaacatgctagacacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgat 30192605  T
Q  608 actctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30192604 actctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 30192548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 433; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 51015943 - 51015287
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | || |||||  ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||    
T  51015943 ttgaataccatcattcaagatgctcatcgcatgttggagtcctgccgtttaacaagtttgaattaccccattcaaatgaagacaattgttgcagttggac 51015844  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatg 207  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  51015843 gtttgtacctcccaactccaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaatttgccaagcagcaggactccaatatacgaccggcattcccaatg 51015744  T
Q  208 ttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcat 307  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| || || |||||||| |||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51015743 ttccattcaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtatttaagtgtgaaaagaatgaggttcattccttgacacttcaataccttcat 51015644  T
Q  308 ttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccatt 407  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  51015643 ttaaaccggactaacaagaatttaatcttttgacagggacaatgggaatgcgggtcgaatattggagtcctgccgtttggcaagttcgaattaccccatt 51015544  T
Q  408 caaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatct 507  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51015543 caaagaaagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattcggtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatct 51015444  T
Q  508 cagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgat 607  Q
    ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  51015443 cagcaacgtttcccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgat 51015344  T
Q  608 actctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51015343 acactcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 51015287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 429; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 664
Target Start/End: Original strand, 34471641 - 34472285
Alignment:
Q  21 attcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtttgtaccttc 120  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  34471641 attcaagatgcttatcgaatgctggattcctgccgtttaacaagtttgaatcaccccattcaaaggaagacaattgttgcaattggacgtttgtaccttc 34471740  T
Q  121 caactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcagaa 219  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||| | ||    
T  34471741 caactacaacaattgtgtttcctttgaatggggtaaattcaaacttgtcaagcaacatgactccaatgttcgaccgacattctcatagttccattgaaaa 34471840  T
Q  220 tattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcct 319  Q
     |||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  34471841 gattaaattcttgttaggttttgtttaaatgacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtccattcattgacacttcaatacattcatttaaaccggcct 34471940  T
Q  320 aacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagaca 419  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34471941 aacaagaacttaatcttttgacaggaacaatgggaatgtcggtcgaacattggagtcatgccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagaca 34472040  T
Q  420 attgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcac 519  Q
    ||| |||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34472041 atttttgtagctggaaggaacattcattcggtacctaatgacgatcttctggcggaataaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcac 34472140  T
Q  520 ccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttg 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  34472141 ccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcg 34472240  T
Q  620 tcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34472241 tagagcgttggacgtttataccgaatgtgttccaccctccttgtg 34472285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 424; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 664
Target Start/End: Original strand, 51012840 - 51013487
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||||  ||||||| || ||||  ||||| ||||| ||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  51012840 ttgaataccattgttcaagatgcacatcacatgctggattcttgccgtttaacaaatttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcacttggac 51012939  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatg 207  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||        | ||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  51012940 gtttgtacgtcccaactacaacaattgtgttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgc--------aggactccaatattcgaccggcattccgaatg 51013031  T
Q  208 ttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcat 307  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||  || |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51013032 ttccattcaaaaaattaaattcttgttaggctgagattaaatgacg-tattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcgttgacacttcaataccttcat 51013130  T
Q  308 ttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccatt 407  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51013131 ttaaatcagcctaacaaaaatttaatcttttgacaagaacaataggaatgccggtcgaatattggagacctgccgtttggcaagtttgaattaccccatt 51013230  T
Q  408 caaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatct 507  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51013231 caaaggaagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatct 51013330  T
Q  508 cagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgat 607  Q
     |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  51013331 tagcaacgtcacccgcatatcgatacactggaacatgttgtgttcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgat 51013430  T
Q  608 actctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51013431 actctcccctcgttgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 51013487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 59 - 661
Target Start/End: Original strand, 52569012 - 52569614
Alignment:
Q  59 aacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaat 157  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  52569012 aacaagtttgaattacctcattcagaggaagacaattgttgcagttggacgtttgtacctcccaactacaacaattgtcttacctgtgaatgaggtaaat 52569111  T
Q  158 tcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtat 257  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||    
T  52569112 tcaaacttgccaagcagcaggactccaatattcgttcggcattcccaatgttccattcaaaagattaaattcttgttaggctgggattaaatgactgtat 52569211  T
Q  258 tcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatg 357  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52569212 tcaaatgtcaaaagaacgaggtccattcgttgacacttcaataccttcatttaaaccagcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgggaatg 52569311  T
Q  358 tcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaa 457  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||    
T  52569312 ccgatcgaatattggagacctgccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagctaaaaggtgcattcattccgcacctaa 52569411  T
Q  458 tgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaa 557  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  52569412 tgacgatcttctggcggaatcaaactcttgatgatatcttcagttgatctcagcaatgtcacccgcatatcgattcaccggaacatgttgtgctcccaaa 52569511  T
Q  558 acatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccct 657  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  52569512 acatgctcgtca-cttttcgtcgttcgttaattccacccaagcgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaatgtgttccaccat 52569610  T
Q  658 cctt 661  Q
    ||||    
T  52569611 cctt 52569614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 43570564 - 43569923
Alignment:
Q  21 attcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtttgtaccttc 120  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |    
T  43570564 attcaagatgctcatcgcatgctggattcttgccgtttaacaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgcagttggacgtttgtatctcc 43570465  T
Q  121 caactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcagaa 219  Q
    ||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||  | || ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  43570464 caacagcaacaattgtcttgcctttgaatgaggtaaattcaaacttgccaattagcaggactccaatatacgaccggcattcccaatgttccattcaaaa 43570365  T
Q  220 tattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcct 319  Q
     |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||    
T  43570364 gattaaattgttgttggactgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggttcattccttgacacttcaatactttcatttaaacaagcct 43570265  T
Q  320 aacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagaca 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43570264 aacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgggaatgccagtcgaatattggagacgtgccgtttggcaagtttgaattacctcattcaaaggaagaca 43570165  T
Q  420 attgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcac 519  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||    
T  43570164 attgttgtagctggaaggtgcagtcattccgtacataaagacgatcttctggcgaaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaacgttac 43570065  T
Q  520 ccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttg 619  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |    
T  43570064 ccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttagttccacccaagtaaatgatactctcccctcg 43569965  T
Q  620 tcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctcctt 661  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43569964 tcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctcctt 43569923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 414; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 664
Target Start/End: Original strand, 45100028 - 45100674
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  45100028 ttgaataccatcattaaaaatgctcatcgaatgctggattcctgccgtttaacaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgcagttggac 45100127  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatg 207  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||          || | ||||||||||||||||||    
T  45100128 gtttgtacctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgccaagcaa----------atatacgaccgacattcccaatg 45100217  T
Q  208 ttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcat 307  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  45100218 ttccattcaaaagattaaattcttgttaggctgggattaaatgacgatattcaagtgtcaaaagaatgaggtccattcattgacacttcaatacctttat 45100317  T
Q  308 ttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccatt 407  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45100318 ttaaaccggcctaataagaatttaatcttttgacaggaacaatgggaatgtcggtcgaacattggattcctgccgtttggcaagtttgaattaccccatt 45100417  T
Q  408 caaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatct 507  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |  || |||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45100418 caaagaaagacaattgtagtagctaaaaagtgcattcattcagtacctaatgacgatattatggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatct 45100517  T
Q  508 cagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgat 607  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  45100518 cagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacatttttgtcgttctttaactccacccaagtgaatgat 45100617  T
Q  608 actctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45100618 actctcccttcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 45100674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 575
Target Start/End: Original strand, 46346177 - 46346732
Alignment:
Q  21 attcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtttgtaccttc 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46346177 attcaaaaggctcatcgaatgctgaatttctgccgtttaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttggacgtttgtaccttc 46346276  T
Q  121 caactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcagaa 219  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| || ||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||    
T  46346277 caactccaacaattgtcttacctttgaatgaggtaaattcaaacttaccaagcagcatgactccaatatttgatcggcattcccaatgttccattcaaaa 46346376  T
Q  220 tattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcct 319  Q
     ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46346377 gattaaattcttgttaggctgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaacgaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaaccggcct 46346476  T
Q  320 aacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagaca 419  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46346477 aacaagaatttaatcgtttgacaggaacaatgagaatgccggtcgaatattggagacctgccgtttggcaagtttgaattacccaattcaaaggaagaca 46346576  T
Q  420 attgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcac 519  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46346577 attgttgtagctggaaggtgcattcattccgtacataatgacaatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcac 46346676  T
Q  520 ccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgtttt 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  46346677 ccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccagaacatgctcgtcacgtttt 46346732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 41804568 - 41803915
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||||  ||||||| || ||||| ||||| |||| |||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||| |||| |||    
T  41804568 ttgaataccattgttcaagatgcacatcgcatgctggatttctgccgtttaacaagtttgaattgccccattcagaggaaaacaac-gttggagttggac 41804470  T
Q  109 gtttgta-ccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaat 206  Q
    ||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||  | ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  41804469 gtttgaaacctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgtcaagcagtaggactccaatattcgaccggcattcccaat 41804370  T
Q  207 gttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttca 306  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41804369 gttccattcaaaagattaaattcttgttaagttggggttaaatgacggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcgttgacacttcaataccttca 41804270  T
Q  307 tttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccat 406  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41804269 tttaaaccagcctaacaagaatttaatcttttaacagaaacaatgggaatgtcggtcgaatattggagaccttccgtttggcaagtttgaattaccccat 41804170  T
Q  407 tcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatc 506  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  41804169 tcaaaggaagacaattgttgtagctaaaaagtgcattcattccgtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgattatatcttcatttgatc 41804070  T
Q  507 tcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatga 606  Q
    ||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  41804069 tcatcaacgtcactctcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatga 41803970  T
Q  607 tactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctcctt 661  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41803969 tactctcccctcgtcgagcgttgaacgtttataccgaacgtgttccaccctcctt 41803915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 664
Target Start/End: Original strand, 46413878 - 46414543
Alignment:
Q  13 ataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgttt 112  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||| | ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  46413878 ataccattattcaagatgcttatcgaatgttggattcctgccgtttaacaagtttgaattaccccattcaaatgaagacaattgttgcagttggacgttt 46413977  T
Q  113 -------------gtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgaca 198  Q
                 ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||  ||| |||| |||||||||||    
T  46413978 ataccgaacgtttgtaccttacaactacaacaattgtgttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgcaaagcagcagaacttcaatgttcgaccgaca 46414077  T
Q  199 ttcccaatgttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaa 298  Q
    ||||||  |||||||| | || |||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  46414078 ttcccatagttccatttaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcatcgacacttcaa 46414177  T
Q  299 taccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaat 398  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||     
T  46414178 taccttcatttaaaccggcctaacaagaacttaatcttttgacaggaacaatgggaatgtcggtcgaacattggagtcatgccgtttggcaagtttgaac 46414277  T
Q  399 taccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttc 498  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  46414278 taccacattcaaaggaagacaattgttgtagctagaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatctta 46414377  T
Q  499 agttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaa 598  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||    
T  46414378 agttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactagaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaa 46414477  T
Q  599 gtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46414478 gtgaatgatactctccactcgtcgagcgttggatgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 46414543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 631
Target Start/End: Original strand, 42322955 - 42323565
Alignment:
Q  21 attcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtttgtaccttc 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42322955 attcaagatgctcatcgaatgctagattcctgccgtttaacaagtttgaattaccccatttagaggaagacaattgttgcagttggacgtttgtaccttc 42323054  T
Q  121 caactacaacaattgtcttacctttgaatg-agtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcagaa 219  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| ||    
T  42323055 caactccaacaattgtgttacctttgaatggagtaaattcaaacttgccaagcagcatgactccaatgttcgaccggcattcccatagttccattcaaaa 42323154  T
Q  220 tattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcct 319  Q
     |||||||| ||||||| || || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42323155 gattaaattattgttaggtttggtttaaatgacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtacattcattgacacttcaataccttcatttaaaccggcct 42323254  T
Q  320 aacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagaca 419  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||| | |  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42323255 aacaaaaatttaat-ttttgacagtaacaatgggaatgccggtcgaacattggagtcatgtcgtttgccaagtttgaattaccccattcagaggaagaca 42323353  T
Q  420 attgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcac 519  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42323354 attgttgtagctggaaggtgcattcattcagtacctaatgacgatcttccagtggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcac 42323453  T
Q  520 ccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttg 619  Q
    | |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  42323454 cagcatatcgatccactgaaacattttgagctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcg 42323553  T
Q  620 tcgagcgttgga 631  Q
    || |||||||||    
T  42323554 tcaagcgttgga 42323565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 14632108 - 14631455
Alignment:
Q  12 aataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtt 111  Q
    |||||||  |||||||| | | |||||||||| |||||||   ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   || ||||||    
T  14632108 aataccagtattcaagatgtttatcgaatgctggattccttccgtttaacaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtttttggacgtt 14632009  T
Q  112 tgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttc 210  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||  ||||    
T  14632008 tataccttccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacatgccaagcagcaggactccaatgttcgacctacattcccatagttc 14631909  T
Q  211 cattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcattta 310  Q
    |||||| || |||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  14631908 cattcaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtattcaagtgtcaaaagaaccaggtccattcattgacacttcaattacttcattta 14631809  T
Q  311 aatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaa 410  Q
    || ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||| ||||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14631808 aaccggcctaacaaaaacttaatcttttgataggaacaatgggaatgccggtagaacattggagtcatgtcgtttggcaagtttgaattaccccgttcaa 14631709  T
Q  411 aggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcag 510  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  14631708 aggaagacagttgttgtagctggatggtgcattcattcggtacctaatgacgatcttctggcagaatcaaacttttgatgatatctttagttgatctcaa 14631609  T
Q  511 caacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatact 610  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14631608 caacgtcacccgcatatcaatccactggaacatgttttgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgttgttcgttaattccacccaagtgaatgatact 14631509  T
Q  611 ctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14631508 ctttactcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 14631455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 49274066 - 49273409
Alignment:
Q  12 aataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtt 111  Q
    |||||||  |||||||| | | |||||||| | ||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||    
T  49274066 aataccagtattcaagatgtttatcgaatgttggattcctgtcgattaacaagtttgaattacctcattcaaaggaagacaattgttgcagttggatgtt 49273967  T
Q  112 tgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||  |||     
T  49273966 tgtaccttccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatgttcgaccgacattctcatagttt 49273867  T
Q  211 cattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatga----tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttca 306  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||     ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  49273866 cattcaaaatattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtcggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtccattcattgacactttaataccttca 49273767  T
Q  307 tttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccat 406  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||| | | || | ||||| |||||||||||| |||    
T  49273766 tttaaaccggcctaacaagaacttaatcttttgacatgaacaatgggaatgtcagtcgaacattggagtcatgccatatggcatgtttgaattaccacat 49273667  T
Q  407 tcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatc 506  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49273666 tcaaaggaagacaattgtggtagctggaaggtgcgttcattcaggacctaatgacgatattctggaagaatcaaacttttgatgatatattcagttgatc 49273567  T
Q  507 tcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatga 606  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  49273566 tcagcaacgtcacccacatattgatcaactggaacatgttgtgctcccagaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcattaattccacccaagtgaatga 49273467  T
Q  607 tactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49273466 tactctgccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaatgtgttccaccctccttgtg 49273409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 107 - 664
Target Start/End: Original strand, 34646918 - 34647476
Alignment:
Q  107 acgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaa 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| || ||| ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||     
T  34646918 acgtttgtaccttccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgtcaaacaacatgactccaatgtttaaccgacattcccat 34647017  T
Q  206 tgttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttc 305  Q
     |||| ||||| || |||||||| ||||||| || || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34647018 agttctattcaaaagattaaatttttgttaggtttggtttaaatgacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtccattcattgacacttcaataccttc 34647117  T
Q  306 atttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattacccca 405  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |   ||||  |||||| |||||||| ||    
T  34647118 atttaaaccgccctaacaagaatttaatctttcgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaacattggagtcgtgttgtttaacaagttcgaattaccaca 34647217  T
Q  406 ttcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgat 505  Q
    |||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34647218 ttcagaggaagacaattgttgcagctagaaggtgcattcattcggtacctaatgacgatcttctagcgtaatcaaacttttgatgatatcttcagttgat 34647317  T
Q  506 ctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatg 605  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  34647318 ctcagcaacgtcacccgcatatcaatccactggaacatgttgtgctcccgaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatg 34647417  T
Q  606 atactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34647418 atactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatactgaacgtgttccaccctccttgtg 34647476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 125 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 7954754 - 7954213
Alignment:
Q  125 tacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcagaatatt 223  Q
    |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| |||||| || |||||||||||  ||||| |  | || | | ||||||||||| ||  ||    
T  7954754 tacaacaattttcttacccctgaatagggtaaattcaaacttgccaaacagcaagactccaacattcgatccgcgtttctattgttccattcaaaagttt 7954655  T
Q  224 aaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaaca 323  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||    
T  7954654 aaattcttgttaggctgagattaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgattaccatcatttaaaccggcctaaca 7954555  T
Q  324 agaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattg 423  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||   ||||||| |||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7954554 agaatttaatcttttgaaaggaacaatagaaatgtcgatcgaatgttggagtcttgccgtttggcaagtttgaattacctcattcaaaggaagacaattg 7954455  T
Q  424 ttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgc 523  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  7954454 ttgtagttagaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatcttctagcggaatcagattgttgataatatcttcagttgatcttagcaactttacccgc 7954355  T
Q  524 atatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactct-ccccttgtcg 622  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| ||| | |||||||| || |||||  |||    
T  7954354 atatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgtcgtttgttaattccacccaactaaatgataccctccccctcatcg 7954255  T
Q  623 agcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  7954254 agtgttggacgtttatgccgaacgtattccaccctccttgtg 7954213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 115 - 664
Target Start/End: Original strand, 8633024 - 8633568
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||| || |||| ||| ||||||||    
T  8633024 accttccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaagactccaacattcgatcggcatttccattgttccat 8633123  T
Q  214 tcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaat 313  Q
    ||| ||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||     
T  8633124 tcaaaagtttaaattcttgttaggtttggattaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcaatcattgacacttcaatacctttatttaaac 8633223  T
Q  314 cggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaagg 413  Q
     || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||   |||| || ||||||  ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  8633224 tggtctaacaaaaatttaatcttttgaaaggaacaatagaaatgccgatcgaatgctggagtcctgccgtttgacaagtttgaattacctcattcaaagg 8633323  T
Q  414 aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaa 513  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||| || |||    
T  8633324 aagacaattgttgtagttgg--ggtg----cattcggtacctaatgacgatcttctggcggaatcagactgttgataatatcttcagatgatcgcaacaa 8633417  T
Q  514 catcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctc 613  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||  |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  8633418 cgttacccgcatatcgatccactggaacacgttgtcatcccaaaaaatattcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgatactctc 8633517  T
Q  614 cccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  8633518 ccctcgtcgagcgttggatgtttataccaaacgtattccaccctccttgtg 8633568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 107 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 37282021 - 37281462
Alignment:
Q  107 acgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaat-tttcgaccgacattccca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||  ||||| ||||| ||||| |   ||||| ||| |||||       
T  37282021 acgtttgtaccttccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaactggccaaacaacaggactcaagcatttcgcccggcattcatg 37281922  T
Q  205 atgttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacctt 304  Q
     | |||| || | |||| |||||| ||||||   | |  ||| |||||||||||||| || ||| | |||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  37281921 tttttcctttgaaaataataaatttttgttatgcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacaaaatgaggttcatttcttgacatttcaatacctt 37281822  T
Q  305 catttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattacccc 404  Q
    ||| |||||| || |||||| ||||||||||||| | ||||| |||  ||||||||| |||||  ||  ||| |  |||||| ||||||||||||||| |    
T  37281821 catctaaatcagcttaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaatatgaatgtcgggcgaatgctgatgacttgtcgtttgacaagtttgaattacctc 37281722  T
Q  405 attcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttga 504  Q
    || || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  37281721 atccataggaacacaattgttgtagtttgaaggtgcattcattcggtacctaatgacgatcttctggcggaattaaacttttgatgatatcttccgttga 37281622  T
Q  505 tctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaat 604  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  37281621 tctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactgaaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaattccacccaagtgaat 37281522  T
Q  605 gatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  37281521 gataccctaccctcgtcgagtgttggacgtttataccgaacgtgttccatcatccttgtg 37281462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 107 - 664
Target Start/End: Original strand, 36721039 - 36721598
Alignment:
Q  107 acgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaat-tttcgaccgacattccca 204  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |   |||| ||||| ||||| |   ||||| |||||||||       
T  36721039 acgtttgtacctttcaactacaacaattgtcttacctttgaatgaggtaaattcaatctgcccaaacaacaggactcaagcatttcgcccgacattcatg 36721138  T
Q  205 atgttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacctt 304  Q
     | || | || | || | |||||| ||||||   | |  ||| |||||||||||||| || | |   |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36721139 ttttttctttgaaaagaataaatttttgttatgcttgctttagatgatggtattcaagtgccgacgaaatgaggttcattccttgacacttcaatacctt 36721238  T
Q  305 catttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattacccc 404  Q
    ||| |||| | || |||||||||||||||||||| | ||||| ||   |||||  || |||||  ||  ||| |  |||||||| ||||||||||||| |    
T  36721239 catctaaaccagcttaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgatgggcgaatgctgaggacttgtcgtttggctagtttgaattacctc 36721338  T
Q  405 attcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttga 504  Q
    || || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36721339 atccagaggaacacaattgttgtaggtggaaggtgcattcattcgataccaaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttga 36721438  T
Q  505 tctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaat 604  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  36721439 tctcagcaacgtcaccagcatatcgatccactagaacatgttgtgctcccaaacattgctcgtcacgttttcgtcgttcgtttattccaatcaagtgaat 36721538  T
Q  605 gatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36721539 gatactctcctctcgtcgagcgttggacatttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 36721598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 178 - 664
Target Start/End: Original strand, 33448878 - 33449348
Alignment:
Q  178 gactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgag 277  Q
    ||||||||  |||| |||||||| | | ||||||||||| || |||||||| |||||||  | || ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  33448878 gactccaacattcgtccgacatttctattgttccattcaaaagattaaattgttgttaggattggtttagatgatggtattcaagtgtcaaaagaataag 33448977  T
Q  278 gtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacc 377  Q
    |||||||  |||||||||||||||  |||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| | ||||| || ||| ||    
T  33448978 gtccatttattgacacttcaatactgtcatctaaatcaacctaacaacaatttaatcttttgaaaggaacaatggaaatgtctgacgaatgtttgagtcc 33449077  T
Q  378 tcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaat 477  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  33449078 tgccgtttgacaagtttgaattaccccatccagaggaaaacaattgttgtagttggaaggtg----cattccctacctaattacgatcttctggcggaat 33449173  T
Q  478 caaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcg 577  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  33449174 caaactttggatgatatcttcagttgatctca------------gcatatcgatccactggaacatgatgtgctcccaaaacatgttcttcacgttttcg 33449261  T
Q  578 tcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  33449262 tcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgtttgacgtttatatcgaacgtatttcaccctccttgtg 33449348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 115 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 6754763 - 6754214
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaa-tgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttcca 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  ||| || | ||||||||| | ||| || || || ||||| ||  |||  |||||||  | | |||||||    
T  6754763 accttcaaactacaacaattgtcttacctccgaaatgtggtaaattcaatcttgctaaacagcaggactcaaacattcatccgacatctctattgttcca 6754664  T
Q  213 ttcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaa 312  Q
    |||| || |||||||| |||||||  | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  6754663 ttcaaaagattaaattattgttaggcttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggttcattccttaacacttcaatacattcatctaaa 6754564  T
Q  313 tcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccatt-caaa 411  Q
     | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||| |  |||| || || | ||  |||||  |||||||||||||||||||| || |    
T  6754563 ccagcctaacaagaatttaatcttttgaaaggaacaataggcatgtctggtgaatgtttgaaaactgtcgtttaacaagtttgaattaccccatttcaga 6754464  T
Q  412 ggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagc 511  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||   ||| ||| |||| ||||||| || || |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  6754463 gtaagacagttgttgtagttggaaggtgcatt---tccctacataatcacgatcttctagcagaatcagactgttgataatatcttcagttgatctcagc 6754367  T
Q  512 aacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactc 611  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||| ||    
T  6754366 aacgttacccgcatatcgatcaactagaacatgttgtactcccaaaacatgatcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaacttaatgatattc 6754267  T
Q  612 tccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  6754266 tcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccaccctctttgtg 6754214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 44928126 - 44927473
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||| | ||||||| ||| |||||||| | || ||||   | | |||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||     
T  44928126 ttgaataccagcgttcaagatgcttatcgaatgttggagtccttccgattaacaagtttgaactgccccatccagagtaagacaattgttgcagttggaa 44928027  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaat-tttcgaccgacattcccaat 206  Q
       ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||  ||| |||||   ||    
T  44928026 ---tgtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtcaattcaaacttgccaagcaacaggactcaaacatttcacccggcattc---at 44927933  T
Q  207 gtt--ccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacctt 304  Q
    |||  || || | || | |||||| |||||||  | |  ||| |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  44927932 gttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aatacatt 44927834  T
Q  305 catttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaa-tattggagacctc-ccgtttggcaagtttgaattacc 402  Q
    ||| |||| |  ||||||||||||||||| |||| | ||||| ||   ||||| ||  |||| |  | ||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  44927833 catctaaaccatcctaacaagaatttaatattttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcctgaccgtttggcaagtttgaattacc 44927734  T
Q  403 ccattca--aaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcag 500  Q
    |||||    | | ||||||||||||| ||||||||  ||||  | | || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44927733 ccattttttaggtaagacaattgttgcagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcag 44927637  T
Q  501 ttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagt 600  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  44927636 ttgatctcaacaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagt 44927537  T
Q  601 gaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44927536 gaatgatattctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 44927473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 115 - 664
Target Start/End: Original strand, 6464005 - 6464554
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaat--gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttcca 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||||| | | || | ||| ||||| ||  |||  |||||||  | | |||||||    
T  6464005 accttcaaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaaattcaaactttctaaacgacatgactcaaacattcatccgacatctctattgttcca 6464104  T
Q  213 ttcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaa 312  Q
    |||| || |||||||| |||||||  | || |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  6464105 ttcaaaagattaaattattgttaggcttggtttaaatgatggtattcaagtgacaaaagaatgaggttcattccttaacactttaataccttcatctaaa 6464204  T
Q  313 tcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccatt-caaa 411  Q
       |||||| |||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||  |||| || || | || | ||||  |||||||||||||||||||| || |    
T  6464205 ctagcctaaaaagaatttaatcttttgaaaggaacaatagaaatgtcggatgaatgttagaaaactgctgtttaacaagtttgaattaccccatttcaga 6464304  T
Q  412 ggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagc 511  Q
    | |||| | |||||||||||||||||||||||   ||| ||  |||| ||||||| || || |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  6464305 gtaagagagttgttgtagttggaaggtgcatt---tccctatataatcacgatcttcttgcagaatcagactgttgataatatcttcagttgatctcagc 6464401  T
Q  512 aacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactc 611  Q
    ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||| ||    
T  6464402 aacgttacccacatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgattgtcacgttttcgtcgttcattaattccacccaactgaatgatattc 6464501  T
Q  612 tccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  6464502 tcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaaacgtattccaccctctttgtg 6464554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 9 - 664
Target Start/End: Original strand, 24701828 - 24702480
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||| | || |||| ||| || ||||||| || |||||  | | |||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||     
T  24701828 ttgaataccagcgttgaagacgcttattgaatgctggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagagtaagataattgttgcagttggaa 24701927  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaat-tttcgaccgacattcccaat 206  Q
       ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||  ||||| |   ||||  ||| |||||   ||    
T  24701928 ---tgtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacctgactcaagcatttcacccggcattc---at 24702021  T
Q  207 gtt--ccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacctt 304  Q
    |||  || || | || | |||||| ||||||| |  |  ||| |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  24702022 gttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggtgtgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aatacctt 24702120  T
Q  305 catttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaa-tattggagacctc-ccgtttggcaagtttgaattacc 402  Q
    ||| |||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||   ||||| ||  |||| |  | ||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  24702121 catctaaaccagcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcctggccgtttggcaagtttgaattacc 24702220  T
Q  403 ccatt-caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcag 500  Q
    ||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||  ||||  | | || || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24702221 ccatttcagaggtaagacaattgttgcagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagcttttgatgatatcttcag 24702317  T
Q  501 ttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagt 600  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  24702318 ttgatctcaacaacgtcacctgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgtccgtcacgttttcgtcgttcg-taattccacccaagt 24702416  T
Q  601 gaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702417 gaatgatattctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 24702480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 118 - 664
Target Start/End: Original strand, 13895532 - 13896079
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaat-tttcgaccgacattcccaatgtt--ccat 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||| ||||| ||||| ||  ||||  ||| |||||   |||||  || |    
T  13895532 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtcaattcaaacttgccaaacaacaggactcaaacatttcacccggcattc---atgttttcctt 13895628  T
Q  214 tcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaat 313  Q
    | | || | |||||| |||||||  | |  ||| |||||||||||||| || |||   ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||     
T  13895629 tgaaaaaaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaattgccaacgaaatgaagttcattccttgacactt-aataccttcatctaaac 13895727  T
Q  314 cggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaa-tattggagacctc-ccgtttggcaagtttgaattaccccatt-caa 410  Q
    | ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||   ||||| ||  |||| |  | ||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  13895728 cagcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcctggccgtttgacaagtttgaattaccccatttcag 13895827  T
Q  411 agg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctca 509  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||  ||||  | | || || ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13895828 aggtaagacaattgttgcagttggaa--tgcac-cttaccttaactaatgacgatcttctagcggaatcaagcttttgatgatatcttcagttgatctca 13895924  T
Q  510 gcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatac 609  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13895925 gcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgctcgttaattccacccaagtgaatgatac 13896024  T
Q  610 tctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13896025 tctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 13896079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 59 - 664
Target Start/End: Original strand, 34692896 - 34693499
Alignment:
Q  59 aacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaat 157  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||    ||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||| | | |||    
T  34692896 aacaagtttgaattgccccatccagaggaagacaattgttgcagttggaa---tgtgcattccaactccaacaattgtcttacctgtgaatggggtcaat 34692992  T
Q  158 tcaaacatgccaagcaacaagactccaat-tttcgaccgacattcccaatgtt--ccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatgg 254  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||| ||  ||||  ||| |||||   |||||  || || | || | |||||| ||||||     |  ||| |||||||    
T  34692993 tcaaacttgccaaacaacaggactcaaacatttcacccggcattc---atgttttcctttgaaaagaataaatttttgttaagcgtgctttagatgatgg 34693089  T
Q  255 tattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgaga 354  Q
    ||||||| |  |||   |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||| | ||||| ||   ||    
T  34693090 tattcaagtaccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aataccttcatataaaccagtctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatga 34693188  T
Q  355 atgtcggtcgaa-tattggagacctc-ccgtttggcaagtttgaattaccccatt-caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccg 450  Q
    ||||||  |||| |  | ||| | |  |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||  ||||  | | ||     
T  34693189 atgtcgcgcgaaatgcttgagtcttggccgtttggcaagtttgaattaccccatttcagaggtaagacaattgttgcagttggaa--tgcac-cttaccc 34693285  T
Q  451 tacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 550  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34693286 taactaatgacgatcttctggcggaatcaaagttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 34693385  T
Q  551 tcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgtt 650  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  34693386 tcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgatactcaaccctcgtcgagcgttggacgtttatactgaaggtgtt 34693485  T
Q  651 ccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||||    
T  34693486 ccaccctccttgtg 34693499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 288 - 664
Target Start/End: Original strand, 50458541 - 50458900
Alignment:
Q  288 tgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttgg 387  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||     
T  50458541 tgacacttctataccttcatttaaaccggcctaacaaaaatttaatcttttgacaggaacaatgcgaatgtcggtcgaatattggagtcctgccgtttgc 50458640  T
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttg 487  Q
    ||||||||  |                 |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  50458641 caagtttgttt-----------------gacaattgttgtagctggaaggtgcattcgttcggtacctaatgacgatcttcaggcggaatcaaacttttg 50458723  T
Q  488 atgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgtta 587  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||      
T  50458724 atgatatcttcagtttatctcaacaacgtcacccgcatatctatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcaagttttcgtcgttcgtag 50458823  T
Q  588 attccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||| ||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  50458824 attccacccaattaaacgatactctcccctcgtcgagcgttggacacttatatcgaccgtgtcccaccctccttgtg 50458900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 382 - 664
Target Start/End: Original strand, 2268424 - 2268703
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaa 481  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  | | || || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2268424 gtttgacaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaa 2268520  T
Q  482 cttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcat 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |    
T  2268521 cttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatctactggaacatgatgtgctcccaaaacatgcccgtcacgttttcgtcgt 2268620  T
Q  582 tcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  2268621 tcgttaattccatccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaaacttgttccaccatccttgtg 2268703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 389 - 664
Target Start/End: Original strand, 3494966 - 3495238
Alignment:
Q  389 aagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttga 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  | | || || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  3494966 aagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcagaatcaaacttttga 3495062  T
Q  489 tgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaa 588  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  3495063 tgatatcttaagttgatctaaacaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgttcgttaa 3495162  T
Q  589 ttccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  3495163 ttccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatatcaaacgtgttccaccatccttgtg 3495238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 382 - 664
Target Start/End: Original strand, 2646806 - 2647085
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaa 481  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||  | | || || ||||||||||||| || |||||||||||    
T  2646806 gtttgacaggtttgaattaccccattcaaatgaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctagcggaatcaaa 2646902  T
Q  482 cttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcat 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |    
T  2646903 cttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgt 2647002  T
Q  582 tcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  2647003 tcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccatcgtcgagcgttggacgtttataccaaacgtgttccaccatccttgtg 2647085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 382 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 36135296 - 36135018
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaa 481  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | | |  || |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  36135296 gtttgacaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaa--tgcat-cttactctaactaatgacaatcttctggcggaatcaaa 36135200  T
Q  482 cttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcat 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  36135199 cttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatctactgaaacatgatgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgt 36135100  T
Q  582 tcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  36135099 tcgttaattccacccaagtgaatgatact-tcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaaacgtgttccaccatccttgtg 36135018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 272 - 661
Target Start/End: Original strand, 19453046 - 19453435
Alignment:
Q  272 aatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaa-tatt 370  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||   ||||||||  |||| |  |    
T  19453046 aatgaggttcattctttgacactt-aataccttcatctaaaccagcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgtcgagcgaaatgct 19453144  T
Q  371 ggagacctc-ccgtttggcaagtttgaattaccccatt-caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatcta 467  Q
     ||| | |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||  ||||  | | || || ||||||| |||||     
T  19453145 tgagtcatggccgtttgacaagtttgaattaccccatttcagaggtaagagaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgatgatctt 19453241  T
Q  468 ctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgt 567  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19453242 ctggtggaatcaaacttttgatgatatctttagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccattggaacatgttgtgctcccataacatgctcgt 19453341  T
Q  568 catgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctcctt 661  Q
    || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19453342 cacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcattggacgtttatatcgaacgtgttccaccctcctt 19453435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 382 - 664
Target Start/End: Original strand, 4004017 - 4004296
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaa 481  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | || | ||  || ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  4004017 gtttgacaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaatgcacctt-actc--taactaatgacgatcttctggcagaatcaaa 4004113  T
Q  482 cttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcat 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |    
T  4004114 cttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcacgtttttgtcgt 4004213  T
Q  582 tcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  4004214 tcgttaattccacccacgtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttgaatgtttataccaaacgtgttccaccatccttgtg 4004296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 416 - 664
Target Start/End: Original strand, 10053236 - 10053480
Alignment:
Q  416 gacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaaca 515  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  10053236 gacaattgttgtagctggaaggtgcattcattcagtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatat-ttcagttgatctcagcaacg 10053334  T
Q  516 tcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccc 615  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  10053335 tcacccgcatatcgatccactggaacatgt---gctcccaaaacatgctcatcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaattgaatgatactctccc 10053431  T
Q  616 cttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  10053432 ctcgtcgagcgttggacatttataccgaatgtattccaccctccttgtg 10053480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 9 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 42383714 - 42383064
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||    | |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||     
T  42383714 ttgaataccatcattcaagaggcttatcgaatgttggagtcctgccaattaacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgtagttggaa 42383615  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaat-tttcgaccgacattcccaat 206  Q
       ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| |||||| ||||| ||||| |   ||||  ||| |||||   ||    
T  42383614 ---tgtgcattccaactacaacaattgtcttatctttgaattggataaattcaaacttgccaaacaacaggactcaagcatttcacccggcattc---at 42383521  T
Q  207 gtt--ccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacctt 304  Q
    |||  || || | || | ||||||  |||||   | |  |||||||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  42383520 gttttcctttgaaaagaataaatttgtgttacgcttgctttaaatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aatacctt 42383422  T
Q  305 catttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcg-gtcgaatattggagacctc-ccgtttggcaagtttgaattacc 402  Q
    ||| ||||   ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||   ||||| || ||  ||| || ||| | |  |||||||||||||||||||||||    
T  42383421 catctaaacaagcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagtgaaatgtttgagtcatggccgtttggcaagtttgaattacc 42383322  T
Q  403 ccattcaa-agg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcag 500  Q
    |||||  | ||| |||||||||||||||||||||| |  | ||   |||  || |||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  42383321 ccattttagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttg--tcccaac-taatgacgatcttctggcggaatcaacttgttgatgatatcttcag 42383225  T
Q  501 ttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagt 600  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||| |||||    
T  42383224 ttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgatgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagt 42383125  T
Q  601 gaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctcctt 661  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  42383124 gaatgatactctcccctcgtcgagtgttggaagtttatactgaacgtagtccaccctcctt 42383064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 9 - 662
Target Start/End: Original strand, 44835043 - 44835694
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||||||| | || |||||  | | ||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||| |||| ||     
T  44835043 ttgaataccatcgttcaagatgcttatcgaatgttggagtcctgcggattaacgagtttgaattgccccatctagagtaagacaattgttgtagttggaa 44835142  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaat-tttcgaccgacattcccaat 206  Q
       ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||| ||||| ||||| ||  ||||| ||| |||||   ||    
T  44835143 ---tgtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttaccaaacaacaggactcaaacatttcgcccggcattc---at 44835236  T
Q  207 gtt--ccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacctt 304  Q
    |||  || || | || | |||||| |||||||  | |  ||| |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  44835237 gttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aatacctt 44835335  T
Q  305 catttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaa-tattggagacctc-ccgtttggcaagtttgaattacc 402  Q
    ||| |||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||   ||||| ||  |||| |  | ||| |||  ||||||| |||||||||||||||    
T  44835336 catctaaaccagcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaagtgcttgagtcctggccgtttgacaagtttgaattacc 44835435  T
Q  403 ccatt-caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcag 500  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||  | | || || ||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||| |||||    
T  44835436 ccatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctgacggaatcaagctgttgatgatattttcag 44835532  T
Q  501 ttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagt 600  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||| ||| |    
T  44835533 ttgatctcaacaaccttacccgcatatccatccactggaacattctatgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccacccaaat 44835632  T
Q  601 gaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttg 662  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  44835633 gaatgatactctcccctcgtcgaacgttgaatgtttatatcgaacgtattccaccctccttg 44835694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 9 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 47066349 - 47065697
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||| | || |||||  | | |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||  ||     
T  47066349 ttgaataccaacattcaagatgcttatcgaatgttggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgtagtcggaa 47066250  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaat-tttcgaccgacattcccaatg 207  Q
       ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |   ||||| ||  |||||    |     
T  47066249 ---tgtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatgggtaaatttaaacatgccaa-caacaggactcaagcatttcgtcccgcattcatgctt 47066154  T
Q  208 ttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcat 307  Q
    |||| || | || | |||||| ||| |||  | |  ||| |||||| ||||||| || |||   || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  47066153 ttcctttgaaaagaataaatttttggtaggcttgctttagatgatgatattcaagtgccaacgaaacgaggttcattccttgacactt-aataccttcat 47066055  T
Q  308 ttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaa-tattggagacctc-ccgtttggcaagtttgaattacccca 405  Q
     |||| | || |||||||||||||||||||| | ||||| |||  ||| |  || |||| |  | |||   |  ||||||||||||||||||||||| ||    
T  47066054 ctaaaccagcataacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaatatgaacgctggacgaaatgctcgagttatggccgtttggcaagtttgaattacctca 47065955  T
Q  406 tt-caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttg 503  Q
    || || ||| ||||||||||||||||||||||  ||||  | | || || ||||||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||||||||    
T  47065954 tttcagaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttaatgatatcttcagttg 47065858  T
Q  504 atctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaa 603  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||| |||| ||||| ||||||||    
T  47065857 atctcagcaacgttacccgcatatcgatccactagaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcctcgttctttaactccacccaagtgaa 47065758  T
Q  604 tgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  47065757 tgatactctcccctcgtcaagcgttggacgtttatactgaacgtattccaccctccttgtg 47065697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 382 - 664
Target Start/End: Original strand, 49139984 - 49140263
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaa 481  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||  | | || || |||||||||||||  |||||||||||||    
T  49139984 gtttgacaagtttgaattacctcattcaaaggaatacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaa 49140080  T
Q  482 cttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcat 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |    
T  49140081 cttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgt 49140180  T
Q  582 tcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  49140181 tcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagtgttggacgtttataccaaatgtgttccaccatccttgtg 49140263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 382 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 54390731 - 54390452
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaa 481  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||  | | || || |||||||||||||  |||||||||||||    
T  54390731 gtttgacaagtttgaattacctcattcaaaggaatacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaa 54390635  T
Q  482 cttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcat 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |    
T  54390634 cttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgt 54390535  T
Q  582 tcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  54390534 tcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagtgttggacgtttataccaaatgtgttccaccatccttgtg 54390452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 9 - 662
Target Start/End: Original strand, 25576147 - 25576798
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| | || || ||  | | |||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||| |||| ||     
T  25576147 ttgaataccagcattcaagaggcttatcgaatgttggagtcatgccgattaacaagtttgaattgcccaatccagagtaagacaattgttgtagttggaa 25576246  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaat-tttcgaccgacattcccaat 206  Q
       ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||| ||||| ||||| |   ||||| ||    |||    |    
T  25576247 ---tgtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaactggccaaacaacaggactcaagcatttcgccccgtgttcatgtt 25576343  T
Q  207 gttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttca 306  Q
     |||| || | || | |||||| |||||||  | |  ||| |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  25576344 tttccttttaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaattgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aataccttca 25576442  T
Q  307 tttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaa-tattggagacctc-ccgtttggcaagtttgaattacccc 404  Q
    | |||| | || |||||||||||||||||||| | ||||| ||   ||| |  || |||| |  | ||| | |  |||||||||||||||||||||||||    
T  25576443 tctaaaccagcataacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaacgctgggcgaaatgcttgagtcatggccgtttggcaagtttgaattacccc 25576542  T
Q  405 att-caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagtt 502  Q
    ||| || ||| ||||||||||||||||||||||  ||||  | | || ||  |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  25576543 atttcagaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaaataatgacgatcttctgacggaatcaagctattgatgatatcttcagtt 25576639  T
Q  503 gatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtga 602  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||| |||||||    
T  25576640 gatctcagcaacgttacccgcatatcgatcca-tggaacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtga 25576738  T
Q  603 atgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttg 662  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25576739 atgataatctcccctcgtcgagcgttggatgtttataccgaacgtattccaccctccttg 25576798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 382 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 34050016 - 34049737
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaa 481  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||  | | || || |||||||||||||  |||||||||||||    
T  34050016 gtttgacaagtttgaattacctcattcaaaggaatacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaa 34049920  T
Q  482 cttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcat 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |    
T  34049919 cttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgt 34049820  T
Q  582 tcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  34049819 tcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagtgttgaacgtttataccaaatgtgttccaccatccttgtg 34049737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 9 - 664
Target Start/End: Original strand, 39416503 - 39417157
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||| |||| | ||  | || || | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||  |     
T  39416503 ttgaataccagcattcaagatgcttatcaaatgttggagacatgctgattaacaagtttgaattaccccatccagagcaagacaattgttgtagttgaaa 39416602  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagt-aaattcaaacatgccaagcaacaagactccaat-tttcgaccgacattcccaat 206  Q
       ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||| | |||| ||||| ||||| ||  ||||  ||  |||||   ||    
T  39416603 ---tgtgcattccaactacaacaattatcttacctttgaatggggcaaattcaaacttcccaaacaacatgactcaaacatttcaccccgcattc---at 39416696  T
Q  207 gtt--ccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacctt 304  Q
    |||  || || | || | |||||| |||||||  | |  ||| |||||||||||||| || |||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39416697 gttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggtccattccttgacactt-aatacctt 39416795  T
Q  305 catttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatat--tggagacctc-ccgtttggcaagtttgaattac 401  Q
    ||| |||| | ||||| ||| |||||| |||||| | ||||| ||    ||||  |  |||| ||  | ||| |||  |||||||||||||||||||||     
T  39416796 catctaaaccagcctagcaaaaatttattcttttcaaaggaaaaacattaatgctgagcgaaaatgcttgagtcctggccgtttggcaagtttgaattat 39416895  T
Q  402 cccattcaa-agg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttca 499  Q
    ||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||  ||||  | | || || ||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  39416896 cccattttagaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcgaaatcaagctattgatgatatcttca 39416992  T
Q  500 gttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaag 599  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||| ||||| ||||    
T  39416993 gttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcatcacgttttcgtcgttctttaactccacccaag 39417092  T
Q  600 tgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  39417093 tgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaactaattccaccctccttgtg 39417157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 382 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 46403292 - 46403013
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaa 481  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||  | | || || |||||||||||||  |||||||||||||    
T  46403292 gtttgacaagtttgaattacctcattcaaaggaatacaaatgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaa 46403196  T
Q  482 cttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcat 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |    
T  46403195 cttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgt 46403096  T
Q  582 tcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  46403095 tcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagtgttggacgtttataccaaatgtgttccaccatccttgtg 46403013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 112 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 27187876 - 27187543
Alignment:
Q  112 tgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||  | || ||||| ||| || | |||||||| | | |||||    
T  27187876 tgtaccttccaactacaacaattgtcttacctctgaatgaggtaaattcaaacttgctaaatagcaggactcaaatattagtccgacatttctattgttc 27187777  T
Q  211 cattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcattta 310  Q
    |||||  || ||||||||||||||||  | ||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27187776 cattccaaagattaaattcttgttaggcttggtataaataatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttcaataccttcattta 27187677  T
Q  311 aatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaa 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||   |||||||| ||||| || ||| ||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  27187676 aatcggcctaacaagaatttaatctttagaaatgaacaatagaaatgtcgggcgaatgtttgagtcctgccgtttaacaagtttgaattacctcattcaa 27187577  T
Q  411 aggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  27187576 aggaagacaattgttgtagttgcaatgtgcattc 27187543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 248 - 662
Target Start/End: Original strand, 42949813 - 42950227
Alignment:
Q  248 atgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaac 347  Q
    |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||| | |||||     
T  42949813 atgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aataccttcatctaaaccagcctagcaagaatttaatcttttcaaaggaaa 42949911  T
Q  348 aatgagaatgtcggtcgaa-tattggagacctcc-cgtttggcaagtttgaattaccccatt-caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcatt 443  Q
    |||   ||||  |  |||| |  | ||| |||   |||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||  ||||      
T  42949912 aatataaatgctgagcgaaatgcttgagtcctaggcgtttggcaagtttgaattatcccatttcagaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac- 42950008  T
Q  444 cattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacat 543  Q
    | | || || ||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  42950009 cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtaaaccgcatatcgatccactggaacat 42950108  T
Q  544 gttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccga 643  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  42950109 gttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcattctttaactccatccaagtgaatgatactcttccctcgtcgagcgttggacatttataccga 42950208  T
Q  644 acgtgttccaccctccttg 662  Q
    |||| ||||||||| ||||    
T  42950209 acgtattccacccttcttg 42950227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 443 - 664
Target Start/End: Original strand, 47759879 - 47760100
Alignment:
Q  443 tcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaaca 542  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  47759879 tcattcggtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatctttagttgatctcagcaacgtcacccgtacatcgatccactggaaca 47759978  T
Q  543 tgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccg 642  Q
    || |||| |||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  47759979 tgctgtgttcccaaaacatgtttgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaggtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatacgg 47760078  T
Q  643 aacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  47760079 aacgtgttccaccctccttgtg 47760100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 299
Target Start/End: Original strand, 10052942 - 10053230
Alignment:
Q  12 aataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtt 111  Q
    |||||||  |||||||| ||| || ||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10052942 aataccagtattcaagatgcttattgaatgctggattcctgccgtttaacaagtttgaattacccaattcaaaggaagacaattgttgcagttggacgtt 10053041  T
Q  112 tgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||  | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||   |||    
T  10053042 tgtaccttccaactacaacaattttgttacctttcaataggataaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatgttcgaccgacattcccataattc 10053141  T
Q  211 cattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaat 299  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10053142 cattcaaaagattaaattcttgttagatttggtttaaatgacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtccattcattgacacttcaat 10053230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 193 - 663
Target Start/End: Original strand, 20375623 - 20376090
Alignment:
Q  193 ccgacattcccaatgttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgaca 292  Q
    |||||||| | | ||| ||||||| || |||||||| |||||||| | |  |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20375623 ccgacatttctattgtaccattcaaaagattaaattattgttagacttgatttaaatgataatattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgaca 20375722  T
Q  293 cttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagt 392  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||| |||  |||   | | || || ||||||  |||||    
T  20375723 cttcaataccttcatctaaaccagcctaacaagtatttaatcttttgaaaggaacaataaaaatgccgggtgaaagcttgggaactgccgtttaacaagt 20375822  T
Q  393 ttgaattaccccatt-caaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatga 491  Q
    |||||||| |||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||    | |||||||| ||||| |  ||||||||||||||  ||| |      
T  20375823 ttgaattaacccatttcagagtaagacaatttttgtagttggaaggtgcattc----cctacctaatcacgatattttggcggaatcaaacagttgttat 20375918  T
Q  492 tatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattc 591  Q
    |||||| | |||||||||||||| | || |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||| ||||| ||| |||||||    
T  20375919 tatcttaaattgatctcagcaacgttacacgcatatcgatctacttgaacatgttgtgctctcaaaacatactcctcacgttatcgtcgttctttaattc 20376018  T
Q  592 cactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgt 663  Q
    ||| ||| ||||||||| |||||| | ||||||| || |||||||||||||||| | ||||| | |||||||    
T  20376019 cacccaactgaatgatattctcccatcgtcgagcattagacgtttataccgaacatattccatcttccttgt 20376090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 248 - 664
Target Start/End: Original strand, 48087345 - 48087761
Alignment:
Q  248 atgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaac 347  Q
    |||||||||||||| || |||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||| |||||| |||||| | || ||     
T  48087345 atgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggtccattccttgacactt-aataccttcatctaaaccagcctaacaaaaatttattcttttcaaagaaaa 48087443  T
Q  348 aatgagaatgtcggtcgaa-tattggagacctc-ccgtttggcaagtttgaattaccccattcaa-agg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcatt 443  Q
    ||   |||||  |  |||| |  | ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||  ||||      
T  48087444 aacatgaatgctgagcgaaatgcttgagtcctggccgtttggcaagtttgaattaccccattttagaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac- 48087540  T
Q  444 cattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacat 543  Q
    | | || ||  |||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||    
T  48087541 cttaccctaattaatgacgatcttctggtggaatcaagctgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaatat 48087640  T
Q  544 gttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccga 643  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48087641 gttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccacccaggtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccga 48087740  T
Q  644 acgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||   ||||||| ||||||||    
T  48087741 actaattccaccatccttgtg 48087761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 248 - 664
Target Start/End: Original strand, 49218530 - 49218945
Alignment:
Q  248 atgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaac 347  Q
    |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| | | |||     
T  49218530 atgatggtattcaattgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aataccttcatctaaaccagcctaacaagaatttaatcttttcaaaagaaa 49218628  T
Q  348 aatgagaatgtcggtcgaa-tattggagacctcccgtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    ||   ||||| ||  |||| |  | ||| |||   ||||| || ||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||| |     
T  49218629 aacatgaatgccgagcgaaatgctcgagtcctgttgtttgacatgtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgcagttggaa--tgcactt 49218726  T
Q  445 attccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatg 544  Q
     | || || ||||||||||||| |||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49218727 -taccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgataatatcttcagttgatctcagcaacgtcactcgcatatcgatccactggaacatg 49218825  T
Q  545 ttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaa 644  Q
    ||| |||||||||||||| |||||| ||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  49218826 ttgcgctcccaaaacatgttcgtcacgttttcgccgtttgttaattccacccaagtgaatgatattctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaaa 49218925  T
Q  645 cgtgttccaccctccttgtg 664  Q
     |||||||||||||||||||    
T  49218926 ggtgttccaccctccttgtg 49218945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 382 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 50997677 - 50997453
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaa 481  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||  | | || || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50997677 gtttgacaagtttgaattaccccattcaaaagaatacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaa 50997581  T
Q  482 cttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcat 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  50997580 cttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatcaactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgt 50997481  T
Q  582 tcgttaattccactcaagtgaatgatac 609  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50997480 tcgttaattccactcaagtgaatgatac 50997453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 248 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 43477482 - 43477067
Alignment:
Q  248 atgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaac 347  Q
    |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| | || ||     
T  43477482 atgatggtattcaagtgacaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aataccttcatctaaaccagcctaacaagaatttaatcttttcaaagaaaa 43477384  T
Q  348 aatgagaatgtcggtcgaa-tattggagacctcccgtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    ||   ||||| ||  |||| |  | ||  |||   |||||||| ||||||||| | | |||||||||| |||||| |||||| ||||||||  ||||  |    
T  43477383 aacatgaatgccgagcgaaatgcttgactcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacagttgttgaagttggaa--tgca--c 43477288  T
Q  445 att-ccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacat 543  Q
    ||| || ||  |||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43477287 attaccctaattaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcggttgatctcatcaacgtcacctgcatatcgatccactggaacat 43477188  T
Q  544 gttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccga 643  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  43477187 gctgtgctcccaaaacatgttcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaa 43477088  T
Q  644 acgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  43477087 aggtgttccaccctccttgtg 43477067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 388 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 49610772 - 49610499
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttg 487  Q
    ||||||||||||  ||||| || || ||||||||||||| ||||||||  ||||  | | || || ||||||||||||| |||||||||||||  | |||    
T  49610772 caagtttgaattgtcccatccagagtaagacaattgttgcagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttg 49610676  T
Q  488 atgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgtta 587  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||    
T  49610675 atgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgacccactggaacatactgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgtttgtta 49610576  T
Q  588 attccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  49610575 attccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatatcgaaggtgttccaccctccttgtg 49610499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 275 - 639
Target Start/End: Original strand, 774162 - 774522
Alignment:
Q  275 gaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggag 374  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| | | ||| ||   |||||| || ||||| |||| |    
T  774162 gaggttcattccttgacacttcaataccttcatctaaaccagcctaacaagaatttaatcttttcaaaagaaaaacatgaatgttgggcgaatgttgggg 774261  T
Q  375 acctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcg 473  Q
    ||||  | ||| ||||||||||||| ||   |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    | |||||||| ||||||| |||| |    
T  774262 acctggcatttagcaagtttgaatttccat-ttcagaggtaagacaattgttgcagttggaaggtgcattc----cctacctaatcacgatcttctggtg 774356  T
Q  474 gaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgtt 573  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| || ||| |||    
T  774357 gaatcagactcttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgcagtgctccgaaaacatgttcttcacgtt 774456  T
Q  574 ttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttata 639  Q
    ||| || |||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  774457 ttcatcgttcgttaattccatccaactgaatgatattctcccgtcgtcgagcgttggacgtttata 774522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 454 - 664
Target Start/End: Original strand, 51695605 - 51695815
Alignment:
Q  454 ctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 553  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51695605 ctaatgatgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgatgtgctcc 51695704  T
Q  554 caaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttcca 653  Q
    |||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51695705 caaaacatgctcgtcacgtattcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaacttttccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaaggtgttcca 51695804  T
Q  654 ccctccttgtg 664  Q
    |||||||||||    
T  51695805 ccctccttgtg 51695815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 380 - 662
Target Start/End: Original strand, 53826622 - 53826903
Alignment:
Q  380 ccgtttggcaagtttgaattaccccatt-caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaat 477  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||  ||||  | | || || ||||||||||||| ||||||||||    
T  53826622 ccgtttgacaagtttgaattaccccatttcagaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaat 53826718  T
Q  478 caaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcg 577  Q
    |||  | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||    
T  53826719 caagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacatgcatatcgatccattggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcatcacattttcg 53826818  T
Q  578 tcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttg 662  Q
    || ||| |||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53826819 tcgttctttaactctacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcattggacgtttataccgaacgtattccaccctccttg 53826903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 454 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 42382491 - 42382284
Alignment:
Q  454 ctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 553  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42382491 ctaatgacgatcttctggcggaatcaacttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgatgtgctcc 42382392  T
Q  554 caaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttcca 653  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  42382391 caaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagtgttggacgtttatactgaacgtagtcca 42382292  T
Q  654 ccctcctt 661  Q
    ||||||||    
T  42382291 ccctcctt 42382284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 209 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 18441207 - 18440873
Alignment:
Q  209 tccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatt 308  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||  | || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||     
T  18441207 tccattcaaaagattaaactcttgttaggcttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaaaataatgaggtgcatcccttgacacttcaataccttcatc 18441108  T
Q  309 taaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaa-tgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattacccca-t 406  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    |||  |||   | | || |  ||||||  |||| ||||||||||| | |    
T  18441107 taaaccaacctaacaagaatttaatcttttgaaaggaacaat-agaaccaccgggtgaaggcttgggaacggccgtttaacaagcttgaattacccaatt 18441009  T
Q  407 tcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatc 506  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18441008 tcagagtaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc--tc--tacctaatcacgatcttctggtggaatcaaactgttgataatatcttcagttgatc 18440913  T
Q  507 tcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgtt 546  Q
    |||||||| | || | ||||||||||||||||||||||||    
T  18440912 tcagcaacgttacacacatatcgatccactggaacatgtt 18440873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 209 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 19486281 - 19485947
Alignment:
Q  209 tccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatt 308  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||  | || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||     
T  19486281 tccattcaaaagattaaactcttgttaggcttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaaaataatgaggtgcatcccttgacacttcaataccttcatc 19486182  T
Q  309 taaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaa-tgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattacccca-t 406  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    |||  |||   | | || |  ||||||  |||| ||||||||||| | |    
T  19486181 taaaccaacctaacaagaatttaatcttttgaaaggaacaat-agaaccaccgggtgaaggcttgggaacggccgtttaacaagcttgaattacccaatt 19486083  T
Q  407 tcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatc 506  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19486082 tcagagtaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc--tc--tacctaatcacgatcttctggtggaatcaaactgttgataatatcttcagttgatc 19485987  T
Q  507 tcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgtt 546  Q
    |||||||| | || | ||||||||||||||||||||||||    
T  19485986 tcagcaacgttacacacatatcgatccactggaacatgtt 19485947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 116 - 641
Target Start/End: Original strand, 25887271 - 25887796
Alignment:
Q  116 ccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa-tgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| || | ||||  ||| ||  |||  |||  | | | | ||||||||    
T  25887271 ccttccaactacaacaattatcttacctttgaaatgaggtaaattcaaacttgctaaacgacaactctcaaacattcacccggaagttctattgttccat 25887370  T
Q  214 tcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaat 313  Q
    ||| || |||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||     
T  25887371 tcaaaagattaaattcttgttagtttggt-ttagatgatggtattgaagtgtcaaaagaatgaggtgcatttcttgacacttcaatactttcatataaac 25887469  T
Q  314 cggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattacccca-ttcaaag 412  Q
    |   ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |  |||  ||||  | | || ||  | | | |||||||||||||| |||| |||| ||    
T  25887470 caaactaacaagaatttaatcttttgaaaggaacaataaaacttccgggtgaatgcttggga-ctgtcatatagcaagtttgaattatcccatttcatag 25887568  T
Q  413 g-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagc 511  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||  |||| ||||| | || ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||| |    
T  25887569 gtaagacaattgttgtagttggaaggtgcattccctaccta-ataatcacgatattctagcggaatcaaactgtggagaatatcttcagttgatctcaac 25887667  T
Q  512 aacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactc 611  Q
    ||| |  | | ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||  |  ||||| || ||||||||||| ||| ||| ||||| ||    
T  25887668 aacgttccacacatat-gatccacgagaacatgttgtgctcccaaaacatggtcctcacatcctcgtcgtttgttaattccacccaactgagtgatattc 25887766  T
Q  612 tccccttgtcgagcgttggacgtttatacc 641  Q
    |||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  25887767 tcccatcgtcgaacgttggacgtttatacc 25887796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 444 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 27187178 - 27186958
Alignment:
Q  444 cattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacat 543  Q
    |||||| |||||||| ||||| |  ||||||||||| | | ||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27187178 cattccctacctaatcacgatattatggcggaatcagattgttgataatatctttagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccaatggaacat 27187079  T
Q  544 gttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccga 643  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||   ||||| |||||| |||||||  |    
T  27187078 gttgtgctcccaaaacatgttcgtcatgttttcgtcgttcgttaattccacccaactaaatgatattctcccctctacgagcattggacatttatactaa 27186979  T
Q  644 acgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  27186978 acgtattccaccctccttgtg 27186958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 182
Target Start/End: Original strand, 19452700 - 19452874
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||||  ||||||| || ||||  ||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||  | |||    
T  19452700 ttgaataccattgttcaagatgcacatcacatgctggattcctgccgtttaacaagtttgaattacatctttcagaggaagacaattgttgcaaatggac 19452799  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  19452800 gtttgtacctcccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacaggactc 19452874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 115 - 438
Target Start/End: Original strand, 2428723 - 2429047
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    ||||| || ||||||||||||| || |||||||||| |  ||||||||| |||||| |  || | ||||||| ||||||||||||||||| |||||   |    
T  2428723 acctttcagctacaacaattgtgtt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctccaatattcgaccgacattcccattgttcatgt 2428821  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt-gacacttcaataccttcatttaaat 313  Q
    || || ||||||||||||||||  |||  |||||||| |||||| || ||||||  |||||     ||||| || |||| || |||||| ||||||||      
T  2428822 caaaagattaaattcttgttaggctggt-ttaaatgaaggtattgaagtgtcaag-gaatggacctcattcttttgacatttgaataccatcatttaatc 2428919  T
Q  314 cg-gcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaa 411  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||| |||||||||||||||| ||| | | |||| || |||||| ||||||||||||||    
T  2428920 ccagcctaacaagaatttaatcttttgaatggaacattgggaatgccggtcgaatattggagtcctactgcttggtaaatttgaatttaccccattcaaa 2429019  T
Q  412 gg-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  2429020 ggtaagacaattgttgtagttggaaggt 2429047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 150
Target Start/End: Original strand, 55268614 - 55268756
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaatta-ccccattcagaggaagacaattgttgcagttaga 107  Q
    |||||||||||| ||  ||| |||||||| |||   || |||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  55268614 ttgaataccatcgttgcagatgctcatcggatgtcggagtcctgttgtttagcaagtttgaatttgccccattcagaggaagacaattgttgcagttgga 55268713  T
Q  108 cgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatg 150  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  55268714 tgtttgtacctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatg 55268756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 206 - 349
Target Start/End: Original strand, 8632792 - 8632935
Alignment:
Q  206 tgttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttc 305  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |  | |||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  8632792 tgttccaatcaaaatattaaattcttgttagactttgtttaaatgagggtattgaagtgtcaaaagaatgaggtacattccttgacacttcaatattttc 8632891  T
Q  306 atttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaa 349  Q
    || |||| | |||||||  ||||||||||||||||  |||||||    
T  8632892 atctaaaccagcctaacctgaatttaatcttttgaatggaacaa 8632935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 414 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 14265661 - 14265418
Alignment:
Q  414 aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaa 513  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||    | |||||||| ||||||| | |||||||||||||| | ||  ||||||| |||| ||||||| ||    
T  14265661 aagacaattgatgtagttggaaagtgcaatc----cctacctaatcacgatcttcaggcggaatcaaactctggagaatatctttagttaatctcagtaa 14265566  T
Q  514 catcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctc 613  Q
    | | || | || |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||| |   ||||| ||| |||||| ||  ||| ||||||||| || |    
T  14265565 cgttacacacaaatcgatccacggtaacatgttgtggtcccaaaacatgttcgtcacg---tcgtcgttccttaatttcatccaactgaatgatattcac 14265469  T
Q  614 cccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    || | ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  14265468 ccatcgtcgaacgttggatgtttataccgaacgtattccaccttccttgtg 14265418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 115 - 438
Target Start/End: Original strand, 41578142 - 41578465
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    ||||| || |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| |  || | ||||||| ||||||| |||| | || | ||||  |    
T  41578142 acctttcagctacaacaattgtctt-cctttgaatgtggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctccaatattcgaccaacat-ctcattattcctgt 41578239  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt-gacacttcaataccttcatttaaat 313  Q
    || |||||||||||||||||||  |||  |||||||| |||||| || ||||||| |||||     ||||| || |||| || |||||| ||||||||      
T  41578240 caaaatattaaattcttgttaggctggt-ttaaatgaaggtattgaagtgtcaaa-gaatggacctcattcttttgacatttgaataccatcatttaatc 41578337  T
Q  314 cg-gcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaa 411  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||  |||| || ||||||||||||| ||| | | |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  41578338 ccagcctaacaagaatttaatcttttgaatggaacattggaaatgccgatcgaatattggagtcctgctgcttggcaagtttgaatttacctcattcaaa 41578437  T
Q  412 gg-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  41578438 ggtaagacaattgttgtagttggaaggt 41578465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 116 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 34472058 - 34471735
Alignment:
Q  116 ccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattc 215  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| |  || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  34472058 ccttccagctacaaaaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcatgactccaatgttcgaccgacattcccattgttcctgtc 34471960  T
Q  216 agaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt-gacacttcaataccttcatttaaatc 314  Q
    | || ||||| ||||||||||   ||  ||||||||  ||||| || ||||||  |||||     ||||| || ||||||| |||||| |||||||||      
T  34471959 aaaagattaagttcttgttaggccggt-ttaaatgaatgtattgaagtgtcaat-gaatggacctcattcttttgacacttgaataccgtcatttaaaca 34471862  T
Q  315 gg-cctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaag 412  Q
       |||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |   | ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  34471861 aaacctaacaagaatttaatcttttcaatggaactatgagaatgtcggtcgaacattggagtcatgttgcttgacaagtttgaatttaccccattcaaag 34471762  T
Q  413 g-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    | || ||||||||||||||||||||||    
T  34471761 gaaacacaattgttgtagttggaaggt 34471735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 317 - 438
Target Start/End: Original strand, 7246531 - 7246654
Alignment:
Q  317 cctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-a 414  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||| || ||||| |||||||||||||||| ||| | | || ||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  7246531 cctaacaagaatttaattttttgaatggaacattgggaatgccggtcgaatattggagtcctgctgcttcgcaagtttgaatttaccccattcaaaggta 7246630  T
Q  415 agacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  7246631 agacaattgttgtagttggaaggt 7246654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 317 - 438
Target Start/End: Original strand, 49273840 - 49273963
Alignment:
Q  317 cctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-a 414  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  | ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  49273840 cctaacaagaatttaatattttgaatgaaactatgagaatgtcggtcgaacattggagtcctgctgcttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggta 49273939  T
Q  415 agacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  49273940 acacaattgttgtagttggaaggt 49273963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 115 - 438
Target Start/End: Original strand, 51015513 - 51015837
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |  ||||| ||| |||||| |  || ||||||||| |||||||  |||||||| ||| ||  |    
T  51015513 accttccagctacaacaattgtctttc-tttgaatggggtaattcgaacttgccaaacggcaggactccaatattcgacccgcattcccattgtccctgt 51015611  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttg-acacttcaataccttcatttaaat 313  Q
    || || |||||||||||||||| |  || |||||||| |||||| || ||||||  ||||||    ||||| ||  |||||| |||||| |||||||||     
T  51015612 caaaagattaaattcttgttag-tccggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaag-gaatgaacctcattcttttcacacttaaataccgtcatttaaac 51015709  T
Q  314 cgg-cctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaa 411  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| ||||||||| ||| | | ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  51015710 caaacctaacaagaatttaatcttttgaatggaacattgggaatgccggtcgtatattggagtcctgctgcttggcaaatttgaatttaccccattcaaa 51015809  T
Q  412 gg-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    || || |||||||||| |||||| ||||    
T  51015810 ggtaacacaattgttggagttgggaggt 51015837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 287 - 438
Target Start/End: Original strand, 14631851 - 14632005
Alignment:
Q  287 ttgacacttcaataccttcatttaaatcgg-cctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgttt 385  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| ||||||| ||||||| ||| | | ||    
T  14631851 ttgacacttgaataccgtcatttaaaccaaacctaacaagaatttaatcttttgaatggaactatgggaatgtaggtcgaacattggagtcctgctgctt 14631950  T
Q  386 ggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  14631951 ggcatgtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttgtagttggaaggt 14632005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 221 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 15637440 - 15637155
Alignment:
Q  221 attaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggccta 320  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  ||| |   |||    
T  15637440 attaaattcttgttagtttggt-ttagatgatggtattgaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttcaatacgatcatcaaaaccaaacta 15637342  T
Q  321 acaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaa-tgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattacccca-ttcaaaggaagac 418  Q
    || |||| |||||||||||| |||||| || |||| ||||||  ||||  | |||| ||  || ||   |||||||||||||| || |||| || |||||    
T  15637341 actagaacttaatcttttgaaaggaac-attagaactgtcgggtgaatgcttgagaactgtcgcttaataagtttgaattacctcatttcagagtaagac 15637243  T
Q  419 aattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcag 510  Q
    |||||||||||||||||||||     ||||| |||| ||| ||||||| |  ||  ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15637242 aattgttgtagttggaaggtg----aattccctaccgaattacgatcttccagcaaaatcaaaatattgataatatcttcagttgatctcag 15637155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 388 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 37282118 - 37282040
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatct 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  37282118 caagtttgaattaccccattcaaaggaaaacaattgttgcagttggaaggtgcattcattccgtacctactaacgatct 37282040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 348 - 446
Target Start/End: Original strand, 55268753 - 55268851
Alignment:
Q  348 aatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcat 446  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||    
T  55268753 aatgggaatgccggtcgaatattggagacctgtcgtttggcaagtttgaattacctcattcaaaggaagacaattgttatagctaaaaggtgcattcat 55268851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 182
Target Start/End: Original strand, 4003644 - 4003815
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| || |||||  | | |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||     
T  4003644 ttgaataccattgttcaagatgctcatcgaatgctggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgcagttggaa 4003743  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
       ||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| || ||| ||||| |||||    
T  4003744 ---tgtgcattccaactccaacaattgtgttacctttgaatgagatagattcaaacctgtcaaacaacatgactc 4003815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 244 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 7955082 - 7954976
Alignment:
Q  244 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacag 343  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||| ||||||||| ||||||  |    
T  7955082 ttaaataatagtattcaagtgtcaaaagaatgaggtacattccttgacacttcaatacctttatttaaaccagcgtaacatgaatttaatattttgaatg 7954983  T
Q  344 gaacaat 350  Q
    |||||||    
T  7954982 gaacaat 7954976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 124 - 438
Target Start/End: Original strand, 41804147 - 41804462
Alignment:
Q  124 ctacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcagaatatt 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| |   | | ||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | | || |||    
T  41804147 ctacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggaaggtctccaatattcgaccgacattcccattgtttctgttaaaagatt 41804245  T
Q  224 aaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt-gacacttcaataccttcatttaaatcggcct-aa 321  Q
    |||||||||||||  |||  |||||||| |||||| || ||||||  |||||     ||||| || |||| || |||||| ||||||||  |   || ||    
T  41804246 aaattcttgttaggctggt-ttaaatgaaggtattgaagtgtcaac-gaatggacctcattcttttgacatttgaataccgtcatttaaccccaacttaa 41804343  T
Q  322 caagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-aagaca 419  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| || ||||| |||||||||||||||| ||| | | ||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||    
T  41804344 caagaatttaatcttttgaatggaacattgggaatgccggtcgaatattggagtcctactgcttgacaagtttgaatttaccccattcaaaggtaacaca 41804443  T
Q  420 attgttgtagttggaaggt 438  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  41804444 attgttgtagttgggaggt 41804462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 182
Target Start/End: Original strand, 11378533 - 11378704
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||| | ||||||| ||| ||||||| || || |||||  | | |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||     
T  11378533 ttgaataccagcgttcaagacgcttatcgaattctggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgcagttgga- 11378631  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
       ||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  11378632 --atgtgcattccaactccaacaattgtcttgcctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacaggactc 11378704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 362 - 466
Target Start/End: Original strand, 36720916 - 36721020
Alignment:
Q  362 tcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgac 461  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  36720916 tcgaatgttggagtcctgccgtttaacaagtttgaattacctcattcaaaggaagacaattgttgcagttgaaaggtgaattcatttcgtacctactgac 36721015  T
Q  462 gatct 466  Q
     ||||    
T  36721016 aatct 36721020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 399
Target Start/End: Original strand, 7954440 - 7954723
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||| |  |||||||||||  ||||| ||||||| | | |||||| ||    
T  7954440 accttctaactacaacaattgtctt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgccaaacggcaagactccaacattcgatcgacatttctattgttccttt 7954538  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc-cttgacacttcaataccttcatttaa-a 312  Q
    || || ||||||||||||||||    || ||||||||||||| |||| |||| || |||||     |||||  ||||||||| |||||| ||||||||      
T  7954539 caaaagattaaattcttgttag-gccggtttaaatgatggtaatcaagtgtc-aaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccatcatttaatc 7954636  T
Q  313 tcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcgg-tcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaatt 399  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||   ||| |||||| |||||| | | | ||||||||||||||||||    
T  7954637 tcagcctaacaagaatttaaacttttgaatggaacaat-agaaacgcggatcgaatgttggagtcttgctgtttggcaagtttgaatt 7954723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 42323372 - 42323049
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |  ||||||||| || ||| | ||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||| |  |    
T  42323372 accttccagctacaacaattgtctt-cctctgaatggggtaattcaaacttggcaaacgacatgactccaatgttcgaccggcattcccattgttactgt 42323274  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt-gacacttcaataccttcatttaaat 313  Q
    || || |||||||| |||||||   ||  |||||||| |||||| || ||||||  |||||     ||||| || ||||||| |||||| |||||||||     
T  42323273 caaaa-attaaatttttgttaggccggt-ttaaatgaaggtattgaagtgtcaat-gaatgtacctcattcttttgacacttgaataccgtcatttaaac 42323177  T
Q  314 cgg-cctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaa 411  Q
    |   |||||||| |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| |||||||| ||||||| | | | | |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  42323176 caaacctaacaataatttaatcttttgaatggaactatgggaatgccggtcgaacattggagtcatgctgcttggcaagtttgaatttactccattcaaa 42323077  T
Q  412 gg-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    || || |||||||||| |||||||||||    
T  42323076 ggtaacacaattgttggagttggaaggt 42323049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 124 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 52569383 - 52569068
Alignment:
Q  124 ctacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcagaatatt 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| |  || | ||||||| ||||| || |||||||| ||||||  ||| || |||    
T  52569383 ctacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctccaatattcgatcggcattcccattgttcctgtcaaaagatt 52569285  T
Q  224 aaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt-gacacttcaataccttcatttaaatcg-gcctaa 321  Q
    |||||||||||||  |||  |||||||| |||||| || ||||||  |||||     | ||| || |||| || |||||  ||||||||  |  ||||||    
T  52569284 aaattcttgttaggctggt-ttaaatgaaggtattgaagtgtcaac-gaatggacctcgttcttttgacatttgaatacagtcatttaatcccagcctaa 52569187  T
Q  322 caagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-aagaca 419  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| || ||||| ||  |||||||||||| ||| | | |||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||    
T  52569186 caagaatttaatcttttgaatggaacattgggaatgccgaacgaatattggagtcctgctgcttggcaagtttgaatttacctcattcacaggtaagaca 52569087  T
Q  420 attgttgtagttggaaggt 438  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  52569086 attgttgtagttgggaggt 52569068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 317 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 8633147 - 8633023
Alignment:
Q  317 cctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-a 414  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||||||  |||| || |||||| |||||| | | | | |||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  8633147 cctaacaagaatttaaacttttgaatggaacaatggaaatgccgatcgaatgttggagtcttgctgcttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggta 8633048  T
Q  415 agacaattgttgtagttggaaggtg 439  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  8633047 acacaattgttgtagttggaaggtg 8633023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 36135669 - 36135498
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| || | |||  | | |||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||  |     
T  36135669 ttgaataccattgttcaagatgctcatcgaatgctggagttctgccgattaacaagtttgaattgcctcatccagagtaagacaattgttgcagttgaa- 36135571  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
       ||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||    
T  36135570 --atgtgcattccaactccaacaattgtgttacctttgaatgagatagattcaaacctgtcaaacaacaagactc 36135498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 585 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 15637113 - 15637034
Alignment:
Q  585 ttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15637113 ttaattccacccaactgaatgatattctcccatcgtcgagtgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtg 15637034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 115 - 426
Target Start/End: Original strand, 43570146 - 43570458
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||| |  || | ||||||| |||||| | |||||||| ||||||  |    
T  43570146 accttccagctacaacaattgtctt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgccaaacggcacgtctccaatattcgactggcattcccattgttcctgt 43570244  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc-cttgacacttcaataccttcatttaa-a 312  Q
    || || ||||||||||||||||  |  | ||||||||  ||||| || |||| || ||||||    |||||  |||||| || |||||| ||||||||      
T  43570245 caaaagattaaattcttgttaggct-tgtttaaatgaaagtattgaagtgtc-aaggaatgaacctcattcttttgacatttgaataccatcatttaatc 43570342  T
Q  313 tcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaa 411  Q
     | | | ||||| |||||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| ||||||||| ||| |   |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  43570343 ccagtccaacaacaatttaatcttttgaatggaacattgggaatgccggtcgtatattggagtcctgctaattggcaagtttgaatttacctcattcaaa 43570442  T
Q  412 gg-aagacaattgttg 426  Q
    || |||||||||||||    
T  43570443 ggcaagacaattgttg 43570458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 115 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 46346595 - 46346271
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |  ||||||||| |||||| |  || | ||||||| |||||||| ||||| || ||||||  |    
T  46346595 accttccagctacaacaattgtctt-cctttgaattgggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctccaatattcgaccggcattctcattgttcctgt 46346497  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt-gacacttcaataccttcatttaaat 313  Q
    || |  ||||||||||||||||   ||  |||||||| |||||| || ||||||  |||||     ||||| || |||| || |||||| ||||||||      
T  46346496 caaacgattaaattcttgttaggccggt-ttaaatgaaggtattgaagtgtcaag-gaatggacctcattcgtttgacatttgaataccatcatttaatc 46346399  T
Q  314 cg-gcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaa 411  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||| || || |||||||||| | | | | |||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  46346398 ccagcctaacaagaatttaatcttttgaatggaacattgggaatgccgatcaaatattggagtcatgctgcttggtaagtttgaatttacctcattcaaa 46346299  T
Q  412 gg-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||    
T  46346298 ggtaagacaattgttggagttggaaggt 46346271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 115 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 46414317 - 46413993
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |  | ||||||| |||||| |  || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |    
T  46414317 accttctagctacaacaattgtctt-cctttgaatgtggtagttcaaacttgccaaacggcatgactccaatgttcgaccgacattcccattgttcctgt 46414219  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt-gacacttcaataccttcatttaaat 313  Q
    || || ||||| ||||||||||   ||  |||||||| |||||| || |||| |  |||||     ||||| || |||| || |||||| |||||||||     
T  46414218 caaaagattaagttcttgttaggccggt-ttaaatgaaggtattgaagtgtcgat-gaatggacctcattcttttgacatttgaataccgtcatttaaac 46414121  T
Q  314 cgg-cctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaa 411  Q
    |   |||||||||||||||||||||| |  ||||| ||| |||||||||||||| |||| ||  || | | || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  46414120 caaacctaacaagaatttaatcttttaaatggaactatgggaatgtcggtcgaacattgaagttctgctgctttgcaagtttgaatttacctcattcaaa 46414021  T
Q  412 gg-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    || || |||||||||||||||| |||||    
T  46414020 ggtaacacaattgttgtagttgtaaggt 46413993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 59 - 182
Target Start/End: Original strand, 2268101 - 2268222
Alignment:
Q  59 aacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaat 157  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||    ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||    
T  2268101 aacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgcagttgga---atgtgcattccaactacgacaattgtcttacctttgaatgggataaat 2268197  T
Q  158 tcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    |||||| ||| || ||||| |||||    
T  2268198 tcaaacctgcaaaacaacaggactc 2268222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 43477701 - 43477561
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| || |||||  | | |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||     
T  43477701 ttgaataccagcgttcaagacgcttatcgaatgctggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgcagttgga- 43477603  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag 152  Q
       ||| | |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  43477602 --atgtgcattccaactgccacagttgtcttacctttgaatgag 43477561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 34050389 - 34050218
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| || || |||||  | | |||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||| ||     
T  34050389 ttgaataccattgtccaagatgctcatcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagggtaagacaattgttgcagttgga- 34050291  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
       ||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  34050290 --atgtgcattccaaccacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactc 34050218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Original strand, 34646768 - 34646864
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaatta-ccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||||||||||||||||| | |  ||||||| | ||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34646768 ttgaataccatcattcaagatgtttttcgaatgttggattcctgccgtttaacaagtttgaattacccccatttagaggaagacaattgttgcagtt 34646864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 50998050 - 50997879
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    ||||||||||   ||||||| ||| |||||||||| || |||||  | | |||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||| ||||||| ||     
T  50998050 ttgaataccagtgttcaagacgcttatcgaatgctggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatctagagtaagacaattgctgcagttggaa 50997951  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
       ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  50997950 ---tgtgcattccaactccaacaattgtcttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactc 50997879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 54391104 - 54390933
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| || || |||||  | | |||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||| ||     
T  54391104 ttgaataccattgtccaagatgctcatcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagggtaagacaattgttgcagttgga- 54391006  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
       ||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  54391005 --atgtgcattccaaccacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactc 54390933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 617 - 664
Target Start/End: Original strand, 11378906 - 11378953
Alignment:
Q  617 ttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11378906 ttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 11378953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 34647238 - 34646926
Alignment:
Q  127 caacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcagaatattaaa 226  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |  ||||| ||| ||  || ||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||  ||  || ||||||    
T  34647238 caacaattgtctt-cctctgaatgtggtaattcgaacttgttaaacaacacgactccaatgttcgaccgacattctcattgttcctgtcgaaagattaaa 34647140  T
Q  227 ttcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt-gacacttcaataccttcatttaaatcgg-cctaacaa 324  Q
    ||||||||||   ||  |||||||| |||||| || ||||||  |||||     ||||| || ||||||| |||||| ||||||||| |   ||||||||    
T  34647139 ttcttgttagggcggt-ttaaatgaaggtattgaagtgtcaat-gaatggacctcattcttttgacacttgaataccgtcatttaaaccaaacctaacaa 34647042  T
Q  325 gaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaatt 422  Q
     |||||||||||||||   |||| ||| ||||||||||  || ||||||| | |   ||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  34647041 aaatttaatcttttgaatagaactatgggaatgtcggttaaacattggagtcatgttgtttgacaagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaatt 34646942  T
Q  423 gttgtagttggaaggt 438  Q
    ||||||||||||||||    
T  34646941 gttgtagttggaaggt 34646926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Original strand, 36720890 - 36720985
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||||| || |||||||| ||| |||||||| | || |||||  ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  36720890 ttgaatacaattattcaagatgcttatcgaatgttggagtcctgccgtttaacaagtttgaattacctcattcaaaggaagacaattgttgcagtt 36720985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 49274116 - 49274061
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49274116 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttcaatacc 49274061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 317 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 55206666 - 55206543
Alignment:
Q  317 cctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-a 414  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||| || ||||| | ||||||||||||||  || | | |||||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  55206666 cctaacaagaatttaatcatttgaatggaacattgggaatggcagtcgaatattggagttctgctgcttggcaagtttgaatttaccccattaaaaggta 55206567  T
Q  415 agacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    | ||||||||||||||||| ||||    
T  55206566 acacaattgttgtagttgggaggt 55206543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 318 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 10053167 - 10053045
Alignment:
Q  318 ctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-aa 415  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||  ||| |||||||||||||| ||||||| ||| | | |||||||||||||| ||| || ||| ||||| ||    
T  10053167 ctaacaagaatttaatcttttgaatggaattatgggaatgtcggtcgaacattggagtcctgctgcttggcaagtttgaatttatcctattgaaaggtaa 10053068  T
Q  416 gacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
     | ||||||||||||||||||||    
T  10053067 caaaattgttgtagttggaaggt 10053045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 316 - 444
Target Start/End: Original strand, 27187749 - 27187879
Alignment:
Q  316 gcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg- 413  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||   |||||||| | |||||| ||| ||| |  ||| ||||||||||| ||||| |||||| |||     
T  27187749 gcctaacaagaatttaatctttggaatggaacaatagaaatgtcggactaatatttgagtcctgctatttagcaagtttgaatttacctcattcagaggt 27187848  T
Q  414 aagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27187849 aagacaattgttgtagttggaaggtacattc 27187879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 247 - 301
Target Start/End: Original strand, 34471582 - 34471636
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatac 301  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34471582 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttcaatac 34471636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 362 - 466
Target Start/End: Original strand, 34646794 - 34646899
Alignment:
Q  362 tcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattacccc-attcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatga 460  Q
    |||||| |||||  ||| ||||||  ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  34646794 tcgaatgttggattcctgccgtttaacaagtttgaattacccccatttagaggaagacaattgttgcagttggaaggtgcattcattctgcacctactga 34646893  T
Q  461 cgatct 466  Q
     |||||    
T  34646894 ggatct 34646899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 247 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 42383761 - 42383700
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatt 308  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  42383761 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaataccatcatt 42383700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 182
Target Start/End: Original strand, 2646433 - 2646604
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| || || |||||  | | |||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||| ||     
T  2646433 ttgaataccattgtccaagatgctcatcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagggcaagacaattgttgcagttgga- 2646531  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
       ||| | |||||||  |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  2646532 --atgtgcattccaaccccaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacatgactc 2646604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 182
Target Start/End: Original strand, 3494586 - 3494757
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||||  ||||||| | ||||||||| || || |||||  | | | |||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||| ||     
T  3494586 ttgaataccattgttcaagatgatcatcgaatactggagtcctgccgattagcaagtttgaattgccccatccagggtaagacaattgttgcagttgga- 3494684  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
       ||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  3494685 --atgtgcattccaacaacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacttgcaaaacaacatgactc 3494757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 316 - 438
Target Start/End: Original strand, 30192974 - 30193098
Alignment:
Q  316 gcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaa-gg 413  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  |||||| || |||||||||||| ||||||||| |||   | |||||||||||||| ||||| |||||||| |     
T  30192974 gcctaacaataatttaatcttttgaatggaacattgggaatgtcggtcgtatattggagtcctgttgcttggcaagtttgaatttaccacattcaaatgt 30193073  T
Q  414 aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    || |||||||||| |||||| ||||    
T  30193074 aacacaattgttggagttgggaggt 30193098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 244 - 308
Target Start/End: Original strand, 34646718 - 34646782
Alignment:
Q  244 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  34646718 ttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcgttgacacttgaataccatcatt 34646782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 42322918 - 42322822
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaa-ttaccccattcagagg-aagacaattgttgcagt 103  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || || |||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  42322918 ttgaataccatcattcaagatgctcatcgcatgctggagtcgtgctgtttaacaagtttgaatttaccccatttagaggtaagaaaattgttgcagt 42322822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 244 - 308
Target Start/End: Original strand, 45099978 - 45100042
Alignment:
Q  244 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatt 308  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  45099978 ttaaatgattgtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaataccatcatt 45100042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 182
Target Start/End: Original strand, 49139611 - 49139782
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||||  |  |||| ||||||||||| || || |||||  | | |||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||| ||     
T  49139611 ttgaataccattgtctaagatgctcatcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagggtaagacaattgttgcagttgga- 49139709  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
       ||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  49139710 --atgtgcattccaaccacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactc 49139782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 14632158 - 14632103
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  14632158 aatgatggtattcaattgtcaaaagaatggggtgcattccttgacacttcaatacc 14632103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Original strand, 39416456 - 39416511
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  39416456 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 39416511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Original strand, 52568919 - 52568974
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  52568919 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 52568974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 104
Target Start/End: Original strand, 2268407 - 2268473
Alignment:
Q  38 aatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  2268407 aatgctcgagtcctgttgtttgacaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagtt 2268473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 104
Target Start/End: Original strand, 4004000 - 4004066
Alignment:
Q  38 aatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  4004000 aatgctcgagtcctgttgtttgacaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagtt 4004066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 36135313 - 36135247
Alignment:
Q  38 aatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  36135313 aatgctcgagtcctgttgtttgacaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagtt 36135247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 46403665 - 46403513
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| || || |||||  | | |||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||| ||     
T  46403665 ttgaataccattgtccaagatgctcatcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagggtaagacaattgttgcagttgga- 46403567  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaac 163  Q
       ||| | |||||||  |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  46403566 --atgtgcattccaacctcaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaac 46403513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 49218719 - 49218654
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  49218719 ttccaactgcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacatgtcaaacaacaggactc 49218654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 34050433 - 34050381
Alignment:
Q  250 gatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  34050433 gatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 34050381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 51 - 107
Target Start/End: Original strand, 34647190 - 34647246
Alignment:
Q  51 tgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttaga 107  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34647190 tgttgtttaacaagttcgaattaccacattcagaggaagacaattgttgcagctaga 34647246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 295
Target Start/End: Original strand, 42322904 - 42322952
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacactt 295  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42322904 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacactt 42322952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 620 - 664
Target Start/End: Original strand, 46346745 - 46346789
Alignment:
Q  620 tcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46346745 tcgagcgttggacgtttatacggaacgtgttccaccctccttgtg 46346789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 46403709 - 46403657
Alignment:
Q  250 gatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  46403709 gatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 46403657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 295
Target Start/End: Original strand, 46413827 - 46413875
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacactt 295  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46413827 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacactt 46413875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Original strand, 49139567 - 49139619
Alignment:
Q  250 gatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  49139567 gatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 49139619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 54391148 - 54391096
Alignment:
Q  250 gatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  54391148 gatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 54391096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Original strand, 55268570 - 55268622
Alignment:
Q  250 gatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  55268570 gatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 55268622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 382 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 13895587 - 13895532
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaa 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13895587 gtttggcaagtttgaattgaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 13895532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Original strand, 19452653 - 19452708
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  19452653 aatgatggtattaaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 19452708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 382 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 24701989 - 24701934
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaa 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24701989 gtttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 24701934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Original strand, 44834996 - 44835051
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  44834996 aatgatgatattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 44835051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 47066396 - 47066341
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  47066396 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttcacacttgaatacc 47066341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 49610871 - 49610816
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  49610871 aatgctggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 49610816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 302
Target Start/End: Original strand, 2268009 - 2268059
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  2268009 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 2268059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 302
Target Start/End: Original strand, 2646391 - 2646441
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  2646391 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 2646441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 104
Target Start/End: Original strand, 3494942 - 3495008
Alignment:
Q  38 aatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||| || ||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  3494942 aatgctcgagtcctgttgtttgaaaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagtt 3495008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 7246807 - 7246753
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatac 301  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  7246807 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacagttgaatac 7246753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 388 - 434
Target Start/End: Original strand, 10052991 - 10053037
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttgga 434  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10052991 caagtttgaattacccaattcaaaggaagacaattgttgcagttgga 10053037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 302
Target Start/End: Original strand, 11378491 - 11378541
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  11378491 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 11378541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 302
Target Start/End: Original strand, 13895397 - 13895447
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  13895397 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 13895447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 382 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 19452864 - 19452806
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  19452864 gtttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttgggaggt 19452806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 302
Target Start/End: Original strand, 24701786 - 24701836
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  24701786 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 24701836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 302
Target Start/End: Original strand, 34692804 - 34692854
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  34692804 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 34692854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 302
Target Start/End: Original strand, 49218250 - 49218300
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  49218250 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 49218300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 82
Target Start/End: Original strand, 51015968 - 51016042
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaa-ttaccccattca 82  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  51015968 ttgaataccatcattcaagatgctcatcgcatgctggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccattca 51016042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 302
Target Start/End: Original strand, 51695448 - 51695498
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  51695448 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 51695498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 236
Target Start/End: Original strand, 7246330 - 7246450
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |  ||||||||| ||||||    || | ||||||| |||||||| |||||||| ||||||  |    
T  7246330 accttccagctacaacgattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaatggcaggtctccaatattcgaccggcattcccattgttcctgt 7246428  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttag 236  Q
    || || ||||||||||||||||    
T  7246429 caaaagattaaattcttgttag 7246450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 37282120 - 37282075
Alignment:
Q  59 aacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  37282120 aacaagtttgaattaccccattcaaaggaaaacaattgttgcagtt 37282075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 627 - 664
Target Start/End: Original strand, 42328288 - 42328325
Alignment:
Q  627 ttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42328288 ttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 42328325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 384 - 435
Target Start/End: Original strand, 44927967 - 44928020
Alignment:
Q  384 ttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaa 435  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44927967 ttggcaagtttgaattgaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 44928020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 300
Target Start/End: Original strand, 46346118 - 46346171
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaata 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  46346118 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcattgacacttgaata 46346171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 51012807 - 51012710
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaa-ttaccccattcagagg-aagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| | |||||||||| || |||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  51012807 ttgaatgccatcattcaagatgctcatcggatgctggagtcctgctgtttagcaagtttgaattttccccattcagtggtaagataattgttgcagtt 51012710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 41578618 - 41578570
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacactt 295  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  41578618 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcattgacactt 41578570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 382 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 11378694 - 11378639
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaa 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  11378694 gtttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggcaagacaattgttggagttggaa 11378639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Original strand, 25576100 - 25576155
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  25576100 aatgatgatattcaagtgtcaaaagattgaggtgcattccttgacacttgaatacc 25576155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 382 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 25576308 - 25576253
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaa 435  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25576308 gtttggccagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 25576253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 41804615 - 41804560
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  41804615 aatgacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggagcattccttgacacttgaatacc 41804560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 176
Target Start/End: Original strand, 43477293 - 43477352
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaaca 176  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  43477293 ttccaacttcaacaactgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaaca 43477352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 43477748 - 43477693
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  43477748 aatgctggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgagacttgaatacc 43477693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 382 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 44835204 - 44835149
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaa 435  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44835204 gtttggtaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 44835149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 59 - 163
Target Start/End: Original strand, 49218342 - 49218444
Alignment:
Q  59 aacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaat 157  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| || ||    ||| | |||||||| |||||||| |||||| |||||||| | |||||    
T  49218342 aacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgcacttgga---atgttcattccaactccaacaattatcttacatttgaatgtgataaat 49218438  T
Q  158 tcaaac 163  Q
    ||||||    
T  49218439 tcaaac 49218444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 49610824 - 49610729
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||||||| | ||||||| ||| |||| ||||| || |||||  | | ||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  49610824 ttgaataccagcgttcaagacgcttatcggatgctggagtcctgccgattaacaagtttgaattgtcccatccagagtaagacaattgttgcagtt 49610729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 50998097 - 50998042
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  50998097 aatgttggtattcaagtgtcaaaataatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 50998042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Original strand, 51012793 - 51012848
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  51012793 aatgatggcattcaagtgtcaaaagaacgaggtgcattccttgacacttgaatacc 51012848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Original strand, 51695490 - 51695585
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||||||| | |||||||  || |||||||||| || |||||  | |||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||| ||||||||    
T  51695490 ttgaataccagcgttcaagacacttatcgaatgctggagtcctgccgatcaacaagtttgaattgccccatcgagagtaagacaattattgcagtt 51695585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 52568933 - 52568870
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaatt 72  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||||| | ||||||||||||    
T  52568933 ttgaataccatcattcaagatgctcatcgaatgttggagtcatgttgtttagcaagtttgaatt 52568870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 104
Target Start/End: Original strand, 2646789 - 2646855
Alignment:
Q  38 aatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||| || ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  2646789 aatgctcgagtcctgttgtttgacaggtttgaattaccccattcaaatgaagacaattgttgtagtt 2646855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 302
Target Start/End: Original strand, 3494544 - 3494594
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  3494544 tggtattcaagtgtcaacagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 3494594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 362 - 444
Target Start/End: Original strand, 3494612 - 3494694
Alignment:
Q  362 tcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    ||||||| ||||| ||| ||| || ||||||||||||| |||||| ||  | ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  3494612 tcgaatactggagtcctgccgattagcaagtttgaattgccccatccagggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 3494694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 7954490 - 7954444
Alignment:
Q  61 caagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttaga 107  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  7954490 caagtttgaattacctcattcaaaggaagacaattgttgtagttaga 7954444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 104
Target Start/End: Original strand, 8633271 - 8633341
Alignment:
Q  34 atcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||||||| || |||||  |||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  8633271 atcgaatgctggagtcctgccgtttgacaagtttgaattacctcattcaaaggaagacaattgttgtagtt 8633341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 34050033 - 34049967
Alignment:
Q  38 aatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  34050033 aatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaattacctcattcaaaggaatacaattgttgtagtt 34049967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 36135711 - 36135661
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  36135711 tggtattcaagtgtcaaaagaatgagctgcattccttgacacttgaatacc 36135661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 301
Target Start/End: Original strand, 36720843 - 36720897
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatac 301  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  36720843 aatgatgatatttaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatac 36720897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 382 - 438
Target Start/End: Original strand, 37281955 - 37282013
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  37281955 gtttggccagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttgtagttggaaggt 37282013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 45100248 - 45100194
Alignment:
Q  316 gcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatatt 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||| |||||    
T  45100248 gcctaacaagaatttaatcttttgaatggaacattgggaatgtcggtcgtatatt 45100194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 104
Target Start/End: Original strand, 49139967 - 49140033
Alignment:
Q  38 aatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  49139967 aatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaattacctcattcaaaggaatacaattgttgtagtt 49140033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 50997694 - 50997628
Alignment:
Q  38 aatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||    
T  50997694 aatgctcgagtcctgttgtttgacaagtttgaattaccccattcaaaagaatacaattgttgtagtt 50997628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 51013062 - 51012951
Alignment:
Q  316 gcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg- 413  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||| |  ||||| |||||||||||||||| |||        ||||||||||| ||||| ||||||||||     
T  51013062 gcctaacaagaatttaattttttgaatggaacattcggaatgccggtcgaatattggagtcct--------gcaagtttgaatttacctcattcaaaggt 51012971  T
Q  414 aagacaattgttgtagttgg 433  Q
    || |||||||||||||||||    
T  51012970 aacacaattgttgtagttgg 51012951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 192
Target Start/End: Original strand, 53826439 - 53826517
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcga 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | | ||| |||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  53826439 accttccaactacaacaattgtcttacccatgaatggggcaaactcaaacttgctaagcagcaagactccaatattcga 53826517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 302
Target Start/End: Original strand, 53826534 - 53826584
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  53826534 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattacttgacacttgaatacc 53826584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 54390748 - 54390682
Alignment:
Q  38 aatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  54390748 aatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaattacctcattcaaaggaatacaattgttgtagtt 54390682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 27187601 - 27187556
Alignment:
Q  59 aacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  27187601 aacaagtttgaattacctcattcaaaggaagacaattgttgtagtt 27187556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 236
Target Start/End: Original strand, 30192774 - 30192894
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  | ||||||| |||||| |  || || |||||| |  ||||||||||| || ||||||  |    
T  30192774 accttccaactacaacaattttctt-cctttgaatgaggtatttcaaacttgccaaacggcaggagtccaatatctgaccgacattctcattgttcctat 30192872  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttag 236  Q
    || |  ||||||||||||||||    
T  30192873 caaaggattaaattcttgttag 30192894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 51013261 - 51013141
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| |  || | ||||||| |||||||| |||||| | |||||   |    
T  51013261 accttccagctacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctccaatattcgaccggcattcctattgttcttgt 51013163  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttag 236  Q
    || || |||||||| |||||||    
T  51013162 caaaagattaaatttttgttag 51013141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 388 - 444
Target Start/End: Original strand, 2268103 - 2268159
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    |||||||||||| |||||| || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  2268103 caagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 2268159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 388 - 444
Target Start/End: Original strand, 4003696 - 4003752
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    |||||||||||| |||||| || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  4003696 caagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 4003752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 388 - 444
Target Start/End: Original strand, 11378585 - 11378641
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    |||||||||||| |||||| || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  11378585 caagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 11378641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 104
Target Start/End: Original strand, 33449087 - 33449131
Alignment:
Q  60 acaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  33449087 acaagtttgaattaccccatccagaggaaaacaattgttgtagtt 33449131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 388 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 43477649 - 43477593
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    |||||||||||| |||||| || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  43477649 caagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 43477593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 45100439 - 45100328
Alignment:
Q  124 ctacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcagaatatt 223  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||| |  ||||||||| |||||| |  || || |||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||| || |||    
T  45100439 ctactacaattgtctttc-tttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggaatccaatgttcgaccgacattcccattgttcctgtcaaaagatt 45100341  T
Q  224 aaattcttgttag 236  Q
    |||||||| ||||    
T  45100340 aaattcttattag 45100328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 128 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 55268830 - 55268755
Alignment:
Q  128 aacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattccca 204  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||| | ||| | ||||||| |||||||| ||||||||    
T  55268830 aacaattgtctt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgccaaacgacaggtctccaatattcgaccggcattccca 55268755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 2429200 - 2429145
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  2429200 aatgatgatattcaaggctcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 2429145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 441
Target Start/End: Original strand, 6754608 - 6754766
Alignment:
Q  287 ttgacacttcaataccttcatttaaatcg-gcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaat-gagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtt 384  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||  |||| || ||| ||| | |||    
T  6754608 ttgacacttgaataccatcatttaaaccaagcctaacaataatttaatcttttgaatggaacaatagag-atgtcggatgaatgtttgagtcctgctgtt 6754706  T
Q  385 tggcaagtttgaa-ttacccca-ttcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgca 441  Q
    | ||||| ||||| ||||| || |||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  6754707 tagcaagattgaatttaccacatttcggaggtaagacaattgttgtagtttgaaggtgca 6754766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 302
Target Start/End: Original strand, 10052896 - 10052947
Alignment:
Q  251 atggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  10052896 atggtattcaggtgtcaaaagaacgagatgcattccttgacacttcaatacc 10052947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #201
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 25887424 - 25887361
Alignment:
Q  287 ttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaat 350  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| |   |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  25887424 ttgacacttcaataccatcatctaaaccaaactaacaagaatttaatcttttgaatggaacaat 25887361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #202
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 382 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 34693007 - 34692952
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaa 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  34693007 gtttggcaagtttgaattgaccccattcacaggtaagacaattgttggagttggaa 34692952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #203
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Original strand, 43570559 - 43570622
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaatt 72  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || || |||| | ||||||||||||    
T  43570559 ttgaataccatcattcaagatgctcatcgcatgctggagtcatgctgtttagcaagtttgaatt 43570622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #204
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 44928165 - 44928118
Alignment:
Q  255 tattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  44928165 tattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctcgacacttgaatacc 44928118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #205
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 47066486 - 47066415
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaa 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| | | |||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  47066486 accttccaactacaacaattgtcttgcccctgaatagggcaaattcaaacttgcgaagcagcaagactccaa 47066415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #206
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 362 - 444
Target Start/End: Original strand, 2646459 - 2646541
Alignment:
Q  362 tcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    ||||||| ||||| ||| ||| ||  |||||||||||| |||||| ||  | ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  2646459 tcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagggcaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 2646541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #207
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 248 - 338
Target Start/End: Original strand, 2646672 - 2646761
Alignment:
Q  248 atgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatctttt 338  Q
    |||||||||||||| || || |  | |||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||| | || ||||||||||||||| ||||    
T  2646672 atgatggtattcaagtgccacagaattgaggttcaatccttgacactt-aataccttcatctaaaccagcataacaagaatttaatatttt 2646761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #208
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 104
Target Start/End: Original strand, 13895803 - 13895849
Alignment:
Q  60 acaagtttgaattacccca-ttcagagg-aagacaattgttgcagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  13895803 acaagtttgaattaccccatttcagaggtaagacaattgttgcagtt 13895849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #209
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 317 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 33448937 - 33448815
Alignment:
Q  317 cctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-a 414  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||||   |||||||| ||||| |||||| ||  | ||||  | ||| |||| ||||||||||||  || |    
T  33448937 cctaacaacaatttaatcttttgaatggaacaatagaaatgtcggacgaatgttggagtccggcagttttacgagtgtgaatttaccccattcaggggta 33448838  T
Q  415 agacaattgttgtagttggaagg 437  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  33448837 agataattgttgtagttggaagg 33448815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #210
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 362 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 34050363 - 34050281
Alignment:
Q  362 tcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    ||||||| ||||| ||| ||| ||  |||||||||||| |||||| ||  | ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  34050363 tcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 34050281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #211
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 44835470 - 44835440
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44835470 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 44835440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #212
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 46403309 - 46403243
Alignment:
Q  38 aatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||    
T  46403309 aatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaattacctcattcaaaggaatacaaatgttgtagtt 46403243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #213
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 362 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 46403639 - 46403557
Alignment:
Q  362 tcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    ||||||| ||||| ||| ||| ||  |||||||||||| |||||| ||  | ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  46403639 tcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 46403557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #214
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 362 - 444
Target Start/End: Original strand, 49139637 - 49139719
Alignment:
Q  362 tcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    ||||||| ||||| ||| ||| ||  |||||||||||| |||||| ||  | ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  49139637 tcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 49139719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #215
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 362 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 54391078 - 54390996
Alignment:
Q  362 tcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    ||||||| ||||| ||| ||| ||  |||||||||||| |||||| ||  | ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  54391078 tcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 54390996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #216
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 250 - 300
Target Start/End: Original strand, 55206393 - 55206443
Alignment:
Q  250 gatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaata 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||    
T  55206393 gatggtattcaagtgtcaaaagaatgagatgcattccttgtcacttgaata 55206443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #217
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 8633343 - 8633227
Alignment:
Q  120 ccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcagaa 219  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| || ||| |  || |||||||   ||||| || |||| | | |||||| |||| ||    
T  8633343 ccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacggcaggactccagcattcgatcggcatttctattgttcctttcaaaa 8633245  T
Q  220 tattaaattcttgttaga 237  Q
     |||||||| ||||||||    
T  8633244 gattaaatttttgttaga 8633227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #218
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 25887595 - 25887562
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25887595 accttccaactacaacaattgtcttacctatgaa 25887562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #219
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 34646735 - 34646642
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaa-ttaccccattcagagg-aagacaattgttgc 100  Q
    ||||||||||||||| || | || |||||||| || || ||||| |||| | |||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  34646735 ttgaataccatcatttaaaatgcgcatcgaatactggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccatttagaggtaagataattgttgc 34646642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #220
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 387 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 44834959 - 44834902
Alignment:
Q  387 gcaagtttgaatta-ccccattcaa-aggaagacaattgttgtagttggaaggtgcat 442  Q
    |||||||||||||  |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44834959 gcaagtttgaatttgccccattcaggagcaagacaattgttgtagttggaaggtgcat 44834902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #221
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 45099995 - 45099898
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaa-ttaccccattcagagg-aagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||||| |||||| || | |||||||| ||||| || ||||| |||| | |||||||||| ||| ||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  45099995 ttgaatacaatcatttaaaatgctcatcgcatgctggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttatcccattcaggggtaagataattgttgcagtt 45099898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #222
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 170
Target Start/End: Original strand, 47065923 - 47065976
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttg-aatgagtaaattcaaacatgccaa 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||| ||||||    
T  47065923 ttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatgaggtaattcaaacttgccaa 47065976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #223
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 382 - 434
Target Start/End: Original strand, 55268660 - 55268713
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatta-ccccattcaaaggaagacaattgttgtagttgga 434  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  55268660 gtttagcaagtttgaatttgccccattcagaggaagacaattgttgcagttgga 55268713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #224
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 98
Target Start/End: Original strand, 55268793 - 55268830
Alignment:
Q  61 caagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgtt 98  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  55268793 caagtttgaattacctcattcaaaggaagacaattgtt 55268830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #225
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 2268477 - 2268414
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  2268477 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 2268414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #226
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 266 - 302
Target Start/End: Original strand, 4003616 - 4003652
Alignment:
Q  266 caaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  4003616 caaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 4003652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #227
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 4004070 - 4004007
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  4004070 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 4004007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #228
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 112 - 152
Target Start/End: Original strand, 10052799 - 10052839
Alignment:
Q  112 tgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag 152  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  10052799 tgtaccttccaactgcaacaattatcttacccttgaatgag 10052839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #229
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 287 - 339
Target Start/End: Original strand, 15637394 - 15637446
Alignment:
Q  287 ttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttg 339  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| |   ||||||||||||||||||||||    
T  15637394 ttgacacttcaataccatcatctaaaccaaactaacaagaatttaatcttttg 15637446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #230
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 112 - 152
Target Start/End: Original strand, 19452560 - 19452600
Alignment:
Q  112 tgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag 152  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  19452560 tgtaccttccaactacaacaattatcttaccactgaatgag 19452600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #231
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Original strand, 34049963 - 34050026
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  34049963 ttccaactacaacaattgtatt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 34050026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #232
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Original strand, 36135243 - 36135306
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  36135243 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 36135306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #233
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 414 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 42949684 - 42949656
Alignment:
Q  414 aagacaattgttgtagttggaaggtgcat 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42949684 aagacaattgttgtagttggaaggtgcat 42949656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #234
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 384 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 45100190 - 45100134
Alignment:
Q  384 ttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  45100190 ttggcaagtttgaatttacctcattcaaaggtaacacaattgttgtagttgggaggt 45100134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #235
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 384 - 435
Target Start/End: Original strand, 47066191 - 47066243
Alignment:
Q  384 ttggcaagtttgaattaccccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaa 435  Q
    |||||| |||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47066191 ttggcatgtttaaatttacccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 47066243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #236
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 414 - 442
Target Start/End: Original strand, 47066462 - 47066490
Alignment:
Q  414 aagacaattgttgtagttggaaggtgcat 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47066462 aagacaattgttgtagttggaaggtgcat 47066490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #237
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 49140037 - 49139974
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  49140037 ttccaactacaacaattgtatt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 49139974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #238
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Original strand, 54390678 - 54390741
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  54390678 ttccaactacaacaattgtatt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 54390741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 470; Significance: 0; HSPs: 210)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 664
Target Start/End: Original strand, 34152840 - 34153497
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaaga-caattgttgcagttaga 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||    
T  34152840 ttgaataccatcattcaagatgctcatcgcatgttggattcctgtcgtttaacaagtttgaattaccccattcaaaggaagatcaattgttgcagttgga 34152939  T
Q  108 cgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaat 206  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| | | |||||||||||||||    
T  34152940 cgtttgtatcttccaacaacaacaattgtcttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatatacaaccgacattcccaat 34153039  T
Q  207 gttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttca 306  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34153040 gttccattcaaaagattaaattgttgttaggctgagattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccgttccttgacacttcaataccttca 34153139  T
Q  307 tttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccat 406  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  34153140 tttaaaccagcctaacaagaatttaatcttttgacgggaacaatgggaatgtcggtcgaatattggagacatgccgtttggcaagtttgaattaccccat 34153239  T
Q  407 tcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatc 506  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34153240 tcaaaggaagacaactgttgtagctggaaggtgcattcattccgtacataatgacgatcttctggcagaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatc 34153339  T
Q  507 tcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatga 606  Q
    ||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  34153340 tcaccaacgtcatccgcatattgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgatcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatga 34153439  T
Q  607 tactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34153440 tactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 34153497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 457; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 22437563 - 22436907
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  22437563 ttgaataccattgttcaagatgctcatcgcatgctggattcctgtcgtttaacaagtttgaattacccaattcagatgaagacaattgttgcagttggac 22437464  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatg 207  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  22437463 gtttgtacctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatattcgaccggcattcccattg 22437364  T
Q  208 ttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcat 307  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22437363 ttccattcaaaagattaaattcttgttaggctgggattaaatgacggtattcaaatgacaaaattctgaggtccattcgttgacacttcaataccttcat 22437264  T
Q  308 ttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccatt 407  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22437263 ttaaaccagcctaacaagaatttaatcttttgacaagaacaatgggaatgccggtcgaatattggagacctgccgtttggcaagtttgaattaccccatt 22437164  T
Q  408 caaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatct 507  Q
      |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22437163 tgaaggaagacaattgttgtagctaaaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatcttccggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatct 22437064  T
Q  508 cagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgat 607  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22437063 cagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcatcgttcgttaattccacccaagtgaatgat 22436964  T
Q  608 actctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22436963 actctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 22436907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 449; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 21170102 - 21169447
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||  ||| || ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  21170102 ttgaataccatcattcaaaatgctcatcgaatgctggattcctgccgtttaagaagtttgaattaccc-attcaaaggaaaacaattgttgcagttggac 21170004  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  21170003 gtttgtaccttccaactacaacaattgtgttacctttgaatgaggtaaatttaaactttccaagcagcaggactccaatatacgaccggcattcccaatg 21169904  T
Q  208 ttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcat 307  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21169903 ttccattcaaaagattaaattcttgttaggcggggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggttcattccttgacacttcaataccttcat 21169804  T
Q  308 ttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccatt 407  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21169803 ttaaaccggcctaacaagaatttaatcttttgacatgaacaatgggaatgccggtcgaatattggagtcctgccgtttggcaagtttgaattaccccatt 21169704  T
Q  408 caaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatct 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21169703 caaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaatttttgatgatatcttcagttgatct 21169604  T
Q  508 cagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgat 607  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  || ||| || | ||||||||| || ||||||||||||    
T  21169603 cagcaacgtcacctgcatatcgatccactggtacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcgcgtattcatcgtccgttaattcgacccaagtgaatgat 21169504  T
Q  608 actctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21169503 actctcccctcgtcgagcgttggatgtttatatcgaacgtgttccaccctccttgtg 21169447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 445; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 664
Target Start/End: Original strand, 34529351 - 34530007
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  34529351 ttgaataccattgttcaagatgctcatcgcatgctagattcatgccgtttaacaagtttgaattgccccattcagaggaagacaattgttgtagttggac 34529450  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatg 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  34529451 gtttgtaccttccaactccaacaattgtgttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatattcgatcgacattcccaatg 34529550  T
Q  208 ttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcat 307  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34529551 ttccattcaaaagattaaattcttgttaggctgggattaaatgacggtattgaaatgtcaaaagaatgaggtccattcgttgacacttcaataccttcat 34529650  T
Q  308 ttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccatt 407  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  34529651 ttaaaccagcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgggaatgctgttcgaatattggagtcctgccgtttggcatgtttgaattaccccatt 34529750  T
Q  408 caaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatct 507  Q
    |||||||| ||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34529751 caaaggaatacaattgttgtagctttaatgtgcattcattccgtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatct 34529850  T
Q  508 cagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgat 607  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||     
T  34529851 cagcaacgtcacctgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaaaatgctcgtcacattttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaa 34529950  T
Q  608 actctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  34529951 actctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaaggtgttccacccttcttgtg 34530007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 441; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 664
Target Start/End: Original strand, 49791491 - 49792147
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||||  ||||||| || ||||| ||||| |||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  49791491 ttgaataccattgttcaagatgcacatcgcatgctggatttctgccgtttaacaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgcagttggac 49791590  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatg 207  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  49791591 gtttgtacctcccaactacaacaattggcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcatgactccaatattcgatcggcattcccaatg 49791690  T
Q  208 ttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcat 307  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  49791691 ttccattcaaaagattaaattcttgttaggctgtgattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcgttgacactacaataccttcat 49791790  T
Q  308 ttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccatt 407  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49791791 ttaaaccagcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgggaatgccggtcgaatattggagacctgccgtttgacaagtttgaattaccccatt 49791890  T
Q  408 caaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatct 507  Q
     ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  49791891 taaaggaagacaattgttgtagctaaaaggtgcattcattccgtacctaatgatgatcttttggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatct 49791990  T
Q  508 cagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgat 607  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  49791991 cagcaacgttacctgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcattcgttaattccacccaagtgaataat 49792090  T
Q  608 actctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49792091 actctcccatcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 49792147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 435; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 661
Target Start/End: Original strand, 957013 - 957663
Alignment:
Q  12 aataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtt 111  Q
    |||||||  |||||||| ||| ||| |||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  957013 aataccagtattcaagatgcttatcaaatgctggattcctgccgtttaacaagtttgaattaccccattcaaaggatgacaattgttgcagttggacgtt 957112  T
Q  112 tgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttc 210  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||  ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  957113 tgtacctcccaactacaaaaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacttgtaaagcagcaggactccaatattcgaccgacattcccaatgttc 957212  T
Q  211 cattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcattta 310  Q
    |||||| || ||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  957213 cattcaaaagattaaattcttgttaggctgtgattaaatgatggtgttcaaatgtcaaaagaatgaggttcattccttgacacttcaatacctttattta 957312  T
Q  311 aatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaa 410  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  957313 aactagcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgggaatgccggtcgaatattggagacctgccgtttggcaagtttcaattaccccattcaa 957412  T
Q  411 aggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcag 510  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  957413 aggaagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatctttagttgatctcag 957512  T
Q  511 caacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatact 610  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||     
T  957513 caacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcctaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatacg 957612  T
Q  611 ctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctcctt 661  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||    
T  957613 ctcccctcgtcgagcgttggacatttatacagaacatattccaccctcctt 957663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 2773661 - 2773005
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||||  ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2773661 ttgaataccattgttcaagatgcacatcgcatgctggattcttgccgtttaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttggac 2773562  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatg 207  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| || ||||||||| |||||||  || ||||||||    
T  2773561 gtttgtacctcccaactacaacaattgtcttacctttgaatgaggtaaatttaaacttgccaagcatcatgactccaatattcgaccagcactcccaatg 2773462  T
Q  208 ttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcat 307  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2773461 ttccattcaaaagattaaattcttgttaggctgggattaaatggcggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcgttgacacttcaataccttcat 2773362  T
Q  308 ttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccatt 407  Q
    ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2773361 ttaaaccaacctaacaagaatttaatcttttgacaggaataatgggaatgccggtcgaatattggagaactgccgtttgacaagtttgaattaccccatt 2773262  T
Q  408 caaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatct 507  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||    
T  2773261 caaaggaagacaattgttgtagctaaaaggtgcattcattccgtacctgatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatggtatcttcagttgatct 2773162  T
Q  508 cagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgat 607  Q
    ||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  2773161 caataacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgat 2773062  T
Q  608 actctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  2773061 actctcccctcgtagagcgttggacgtttataacgaacgtgttccaccatccttgtg 2773005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 664
Target Start/End: Original strand, 49423312 - 49423969
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  49423312 ttgaataccgtcattcaaaatgctcattgaatgctggattcctgctgtttaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgtagttggac 49423411  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatg 207  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |  || ||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  49423412 gtttgtaccttcaaactacaacaattgtgttacctttgaatgtggtaaattcaaacttgccaaacggcacgactccaatgttcgaccgacattcccatag 49423511  T
Q  208 ttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcat 307  Q
    || |||||| || |||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49423512 tttcattcaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcat 49423611  T
Q  308 ttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccatt 407  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  49423612 ttaaaccggcctaacaagaatttaatcttttgacaagaacaatgggaatgtcggtcgaagattggagtcctgccgtttgacaaatttgaattaccccatt 49423711  T
Q  408 caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatc 506  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49423712 caaaggtaacacaattgttgtagctggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatcttatggcagaatcaaacttttgatgatttcttcagttgatc 49423811  T
Q  507 tcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatga 606  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  49423812 tcagcaacgtcacccgcatatcgatccacttgaacatgccgtgctcccagaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccatccaagtgaatga 49423911  T
Q  607 tactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49423912 taatctcccctcgtcgagcgctggacatttataccgaacatgttccaccctccttgtg 49423969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 664
Target Start/End: Original strand, 36776086 - 36776730
Alignment:
Q  21 attcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtttgtaccttc 120  Q
    |||||||| | | |||||||| | ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  36776086 attcaagatgtttatcgaatgttggattcctgccgtttaacaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgtttcagttggacatttgtaccttc 36776185  T
Q  121 caactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcagaa 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||  || |||  | || ||||| ||| || ||| | ||||||||  |||||||||| ||    
T  36776186 caactacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaatttgtcaattagcaggactctaatgtttgactggcattcccatagttccattcaaaa 36776285  T
Q  220 tattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcct 319  Q
     |||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  36776286 gattaaattcttgttaggttttgtttaaatgacggtattcaagtgtcaaatgaatgaggttcattcattgacacttcaataccttcatttaaaccggtct 36776385  T
Q  320 aacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagaca 419  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36776386 aacaagaacttaatcttttgacaagaacaatgggaatgtcggtcgaacattggagtcatgccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagaca 36776485  T
Q  420 attgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcac 519  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  36776486 attgttgtagctggaaggtgcattcattcggtacctaatgacgatctttcagcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcaacaacgtcac 36776585  T
Q  520 ccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttg 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |    
T  36776586 ccgcatatcgatccactggaacatgccgtgctcccaaaccatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattctacccaagtgaataatactctcccctcg 36776685  T
Q  620 tcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36776686 tcgagcgttggacatttatacctaacgtgttccaccctccttgtg 36776730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 664
Target Start/End: Original strand, 43889060 - 43889710
Alignment:
Q  13 ataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgttt 112  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  43889060 ataccattattcaagatgctcatcgaatgttggattcatgtcgtttaacatgtttgaattaccccattcagaggaagaaaattgttgcagttgaacgttt 43889159  T
Q  113 gtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttcc 211  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  | ||||||||| | |||||||||||||||  |||||    
T  43889160 gtaccttccaactccaacaatcgtgttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgccaagcagtaggactccaatatacgaccgacattcccatagttcc 43889259  T
Q  212 attcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt-gacacttcaataccttcattta 310  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||| |||||  |||||  ||| |||| || ||| ||| |||||| |||||||    
T  43889260 attcaaaagattaaattcttgatagatttggtttaaatgacggtattcaaacgtcaat-gaatg--gtc-attcttttgacgcttgaataccgtcattta 43889355  T
Q  311 aatcggc-ctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattca 409  Q
    || |    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43889356 aaccaaatctatcaagaatttaatcttttgacatgaacaatgggaatgtcgttcgaacattggagtcctgtcgtttggcaagtttgaattaccccattta 43889455  T
Q  410 aaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctca 509  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43889456 gaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattcggtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgattatatcttcagttgatctca 43889555  T
Q  510 gcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatac 609  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43889556 acaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgatgtgctcccaaaacatgttcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatac 43889655  T
Q  610 tctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43889656 tctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 43889710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 110 - 664
Target Start/End: Original strand, 49817299 - 49817855
Alignment:
Q  110 tttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||| |||||| || || |||| |||| |||||||    || | | |||    
T  49817299 tttgtaccttccaactacaacaattgtcttacccctgaatggggtaaattcaaacttgccaaacagcatgactacaatgttcgaccagtgtttctattgt 49817398  T
Q  209 tccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatt 308  Q
    |||||||  ||  |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||    
T  49817399 tccattcgaaagtttaaattcttgttaggctgagattaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaataccatcttt 49817498  T
Q  309 taaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatg--agaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccat 406  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||   | ||||||| ||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  49817499 taaatcggccta-caagaatttaatcttttgaaaggaacaatataaaaatgtcgatcgaatactggagtcctgctgtttggcaagtttgaattaccccat 49817597  T
Q  407 tcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatc 506  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  49817598 tcaaatgaagacaattgttgtagttgaaaggtacattcattccgtacctaatgacgatcttctggcggaatcagactgttgataatatcttcagttgatc 49817697  T
Q  507 tcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatga 606  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||     
T  49817698 tcagcaacgttacccgcatatcgatccactagaacatgatgtgctcccaaaacatgctcgtaacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactgaatgt 49817797  T
Q  607 tactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49817798 tactctcccctcgtagagcgttggacgtttatactgaacgtgttccaccctccttgtg 49817855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 279 - 661
Target Start/End: Original strand, 6282149 - 6282531
Alignment:
Q  279 tccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacct 378  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  6282149 tccattcgtttacacttcaataccttcatttaaaccagcctaacaagaatttaatcttttgacatgaacaatgaaaatgtcagtcgaatattgaagacct 6282248  T
Q  379 cccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatc 478  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  6282249 gccgtttggcaagcttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagctaaaaggtgcattcattccgtaactaatgacgatcttctggcagaatc 6282348  T
Q  479 aaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgt 578  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6282349 aaacttttgatgatatcttcagttgatcttagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgt 6282448  T
Q  579 cattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctcctt 661  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6282449 cattcgttaattccacccaagtgaatgatactctctccttgtcgagtgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctcctt 6282531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 279 - 664
Target Start/End: Original strand, 44560006 - 44560391
Alignment:
Q  279 tccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44560006 tccattccttgacacttcaataccttcatttaaaccagcctaacaagaatttaatcttttgacaagaacaatgggaatgtcggtcgaatattggagacct 44560105  T
Q  379 cccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatc 478  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | ||||    
T  44560106 gccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatcttaaggagaaatc 44560205  T
Q  479 aaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgt 578  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  44560206 aaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcaatacactggaacatgctttgctcccaaaacatgcttgtcacgttttcgt 44560305  T
Q  579 cattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    | |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44560306 cgttcgttaattccatccaagtgaatgatattctcccctcgtcgagcgttggacgtttatactgaacgtgttccaccctccttgtg 44560391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 265 - 664
Target Start/End: Original strand, 47657167 - 47657566
Alignment:
Q  265 tcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcg 364  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47657167 tcaaaagaatgaggtccattccttaacacttcaataccttcatttaaacctgcctaacaaaaatttaattttttgacaggaacaatgggaatgtcggtcg 47657266  T
Q  365 aatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgat 464  Q
    || ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  47657267 aacattggagtcctgccgtttgacaagtttgaattacctcattcaaaggaagacaattgttgtagctggaatgtgcattcattcgatacctaatgacgat 47657366  T
Q  465 ctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgct 564  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47657367 cttctggtggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaatatgct 47657466  T
Q  565 cgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47657467 cgtcacgttttggtcgttcgttaattccatccaagtgaatgatactctcccatcgtcgagcgttggatgtttataccgaacgtgttccacccaccttgtg 47657566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 110 - 664
Target Start/End: Original strand, 4785080 - 4785633
Alignment:
Q  110 tttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgt 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||  | ||||||| || |||||||   | ||  ||||||||||| |||    
T  4785080 tttgtatcttccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaatttaccaagcagcaggactccagcgtacgtacgacattcccattgt 4785179  T
Q  209 tccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatt 308  Q
    |||||||| |||  ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  4785180 tccattcaaaat--taaattcctgttaggctgggattaaatgatggtattcaagtgttaaaagaatgaggtgcattccttgacacttcaataccttcatc 4785277  T
Q  309 taaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattc 408  Q
    |||| | | |||||| ||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||| || ||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  4785278 taaacctgtctaacatgaatttaatattttgaaagaaacaatgggaatgtcggacgtatgctggagtcctgccgtttggcaagtttgaattaccccatct 4785377  T
Q  409 aaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctc 508  Q
    | ||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||    
T  4785378 agaggaacacaattgttgtagctgaaagatgcattcattcggtacctaatgacgatcttgtggcggaatcaaactgttgataatatcttcagttgatatc 4785477  T
Q  509 agcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgata 608  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||     
T  4785478 agcaacgttccccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgttcttcacgtttttgtcgttcgttaattccaccaaagtgaatgatg 4785577  T
Q  609 ctctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4785578 ctctcccctcgtcaagggtttgacgtttataccgaatgtgttccaccctccttgtg 4785633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 9 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 42886931 - 42886259
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||| | || || ||  ||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||| |||    
T  42886931 ttgaataccatcatttaaaatgctcatcgaatgttggagtcatgccgtttaataagtttgaattacctcattcaaaggaagacaaccgttgcagttggac 42886832  T
Q  109 gttt-------------gtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgacc 194  Q
    ||||             ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||| |||||| || || |||||||   | || ||    
T  42886831 gtttatactgaacgtttgtaccttccaactccaacaattgtgttacctctgaatggggtaaattcaaacttgccaaacagcatgactccagcatacgtcc 42886732  T
Q  195 gacattcccaatgttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacact 294  Q
    | || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  42886731 ggcactcccattgttccattcaaaagattaaattcttgttaggtttagtttaaatgacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtatattccttgacact 42886632  T
Q  295 tcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagttt 394  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||| || ||  ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  42886631 tcaataccttcatctaaacccgcctaacatgaatttaatcttttgaaaggaataatggtaatgtcggacgtatgctggagtcctgccgtttggtaagttt 42886532  T
Q  395 gaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatat 494  Q
     ||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||| |||| | || ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  42886531 aaattaccccatccagaggaatacaattgttgtagctggaaggtacattaaatcggtacctaatgatgatcttctggcggaatcagactgttgataatat 42886432  T
Q  495 cttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccac 594  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  42886431 cttcagttgatctcagcaacgttacccgcgtatcgatccactagaaaatgttgtgctctcaaagcatgctcgtcatgttttcgtcgttggttaattccac 42886332  T
Q  595 tcaagtgaatga---tactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
     |||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42886331 ccaagtgaatgatagtactctcccctcgtcgagcgttggaagtttataacgaacgtgttccaccctccttgtg 42886259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 9 - 664
Target Start/End: Original strand, 51427747 - 51428403
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    ||||||| |||||||||| | | |||| ||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  51427747 ttgaatatcatcattcaaaatgttcattgaatgctcgattcctgtcgtttaacaaatttgaattaccccattaaaaggaagacaattgttgcagttggac 51427846  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaat-tttcgaccgacattcccaat 206  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||| ||||| |   ||||| |||||||||   ||    
T  51427847 gtttgtacctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacaggactcaagcatttcgcccgacattc---at 51427943  T
Q  207 gtt--ccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacctt 304  Q
    |||  || || | |||| |||||| |||||||  | |  ||| |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  51427944 gttttcctttgaaaataataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aatacctt 51428042  T
Q  305 catttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaa-tattggagacctc-ccgtttggcaagtttgaattacc 402  Q
    ||| |||| | | ||||||||||||||||||||| | ||||| ||   ||||| || ||||| |  | ||| |||  ||||||| |||||||||||||||    
T  51428043 catctaaaccagactaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgatcgaaatgcttgagtcctggccgtttgccaagtttgaattacc 51428142  T
Q  403 ccatt-caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcag 500  Q
    ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||  ||||  | | || || ||||||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  51428143 ccatttcagaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttcttgcggaatcaagctgttgatgatatcttcag 51428239  T
Q  501 ttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagt 600  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  51428240 ttgatctcaacaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaactccacacaagt 51428339  T
Q  601 gaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51428340 gaatgatactctcccctcgttgagcgttgaacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 51428403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 206 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 17211718 - 17211262
Alignment:
Q  206 tgttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttc 305  Q
    ||||||||||| || ||| |||| |||||||  | |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17211718 tgttccattcaaaagatttaattattgttaggcttgatttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttt 17211619  T
Q  306 atttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattacccca 405  Q
    || |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||  ||||  | |||| || | ||||  ||||||||||||||| ||    
T  17211618 atctaaaccagcctaacaagaatttaatcttttgaaaggaacaataggaatgtcgggtgaatgattgagaactgcagtttaacaagtttgaattacctca 17211519  T
Q  406 tt-caaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttga 504  Q
    || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||   ||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||    
T  17211518 tttcagagtaagacaattgttgtagttggaagatgcatt---tccctacctaatcacgatcttctggcggaatcagactgttgataatatctttagttga 17211422  T
Q  505 tctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaat 604  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| |||||| |||||    
T  17211421 tctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgtttttatcgttcgttaattcgactcaaatgaat 17211322  T
Q  605 gatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17211321 gatattcttccctcgtcgaacgttggacgtttataccgaacgtattccaccctccttgtg 17211262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 107 - 664
Target Start/End: Original strand, 14330347 - 14330905
Alignment:
Q  107 acgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaat-tttcgaccgacattccca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  | ||| ||| | ||||| |   ||||| |||||||||       
T  14330347 acgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgaggttaattcaaactggtcaaacaataggactcaagcatttcgcccgacattcatg 14330446  T
Q  205 atgttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacctt 304  Q
     | |||| || | || | || ||| |||||||  | || ||| |||||||||||||| || |||   |||||||| |||||| |||||||||||||| ||    
T  14330447 tttttcctttgaaaagaatatatttttgttagggttggtttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccctgacacttcaatacttt 14330546  T
Q  305 catttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattacccc 404  Q
    ||| |||| | ||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||   |||||  || |||||  || |||| |  ||||||  ||||||||||||||||    
T  14330547 catctaaaccagcctaacaagagtttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgatgggcgaatgctgaagacttgtcgtttgataagtttgaattacccc 14330646  T
Q  405 att-caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagtt 502  Q
    ||| || ||| ||||||||||||||||||||||  ||||  | | || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14330647 atttcagaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccttaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagtt 14330743  T
Q  503 gatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtga 602  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  14330744 gatctcagcaacgttacccgcatatcgatccattggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaattccacccaagtga 14330843  T
Q  603 atgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14330844 atgataccctcccctcgtcgagtgttggacgtttataccgaaagtgttccaccctccttgtg 14330905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 382 - 664
Target Start/End: Original strand, 21017109 - 21017388
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaa 481  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  | | || || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21017109 gtttgacaagtttgaattacctcattcaaaggaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaa 21017205  T
Q  482 cttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcat 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |    
T  21017206 cttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgt 21017305  T
Q  582 tcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  21017306 tcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaaacgtgttccaccatccttgtg 21017388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 9 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 28082885 - 28082234
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||| | ||||||| | | |||||||||| || |||||  | | |||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||| ||     
T  28082885 ttgaataccagcgttcaagacgtttatcgaatgctggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccacagtaagacaattgttgcagttggaa 28082786  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaat-tttcgaccgacattcccaat 206  Q
       ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||| ||||| ||||| |   ||||  |||||||||   ||    
T  28082785 ---tgtgcattccaactccaacaattgtcttacctttgaatgagatagattcaaacctgtcaaacaacaggactcaagcatttcacccgacattc---at 28082692  T
Q  207 gt--tccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacctt 304  Q
    ||  ||| || | || | |||||| |||||||    |  ||  |||||||||||||| || |||   ||||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  28082691 gtcttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcgtgctttggatgatggtattcaagtgccaacgaaatgatgttcattccttgacactt-aatacctt 28082593  T
Q  305 catttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaa-tattggagacctcccgtttggcaagtttgaatt-acc 402  Q
    ||| |||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||   ||||| ||  |||| |  | ||| |||   |||||||| ||||||||| | |    
T  28082592 catctaaaccagcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgctcgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatc 28082493  T
Q  403 ccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagtt 502  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  | | || || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28082492 tcattcaaaggaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaatttttgatgatatcttcagtt 28082396  T
Q  503 gatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtga 602  Q
    ||||| || ||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  28082395 gatctaagtaacttcacctgcatattgatccactgaaacatgatgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtga 28082296  T
Q  603 atgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  28082295 atgatactctcccctcatcgagcgttggacgtttataccaaacgtgttccaccatccttgtg 28082234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 382 - 664
Target Start/End: Original strand, 40353705 - 40353984
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaa 481  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  | | || || |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  40353705 gtttgacaggtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacaatcttctggcggaatcaaa 40353801  T
Q  482 cttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcat 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |    
T  40353802 cttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgt 40353901  T
Q  582 tcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  40353902 tcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaaacgtgttccaccatccttgtg 40353984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 382 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 55797018 - 55796739
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaa 481  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  | | || || |||||||||||||  |||||||||||||    
T  55797018 gtttgacaagtttgaattagcccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaa 55796922  T
Q  482 cttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcat 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |    
T  55796921 cttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgt 55796822  T
Q  582 tcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  55796821 tcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaaacgtgttccaccatccttgtg 55796739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 281 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 1226537 - 1226159
Alignment:
Q  281 cattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcc 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||| | || || ||    |||||||| |||||  ||  ||| |      
T  1226537 cattccttgacacttcaataccttcatctaaaccagcctaacaaaaatttaatcttttcaaagaaaaaacattaatgtcgggcgaatgctgaggacttgt 1226438  T
Q  381 cgtttggcaagtttgaattaccccattca--aaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatc 478  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||||||||||||||  ||||  | | || || ||||||||||||| |||||||||||    
T  1226437 cgtttggcaagtttgaattaccccatttatgaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatc 1226341  T
Q  479 aaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgt 578  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  1226340 aaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactagaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgt 1226241  T
Q  579 cattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctcct 660  Q
    | ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  1226240 cgttctttaattccacacaagtgaatgataccctcccctcgtcgagcgttggacgtttatagcaaacgtattccaccctcct 1226159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 9 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 1043397 - 1042747
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| || |||||  | | |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||     
T  1043397 ttgaataccaacgttcaagacgcttatcgaatgctggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgcagttggaa 1043298  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactcca-attttcgaccgacattcccaat 206  Q
       ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||| ||||| | | |||||  ||||||||   ||    
T  1043297 ---tgtgcattccaactgcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgtcaaacaacaggactcaagaatttcgctcgacattc---at 1043204  T
Q  207 gtt--ccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacctt 304  Q
    |||  || || | || | |||||| |||||||  | |  ||| |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  1043203 gttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgatttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aatacctt 1043105  T
Q  305 catttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaa-tattggagacctcccgtttggcaagtttgaatt-acc 402  Q
    ||| |||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||   ||||| ||  |||| |  | ||| | |   |||||||   |||||||| | |    
T  1043104 catctaaaccagcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcatgttgtttggccgatttgaatttatc 1043005  T
Q  403 ccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagt 501  Q
     |||||||||| ||||||||||||| |||||||| || | ||    || || ||||||||||||| |||||||||||||  | ||||| |||||||||||    
T  1043004 tcattcaaaggtaagacaattgttgcagttggaatgtacctta---ccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgattatatcttcagt 1042908  T
Q  502 tgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtg 601  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  1042907 tgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatgttcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtg 1042808  T
Q  602 aatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||    
T  1042807 aatgaaactctcccctcgtctagcgttggacgtttatac--aaggcgttccaccctccttgtg 1042747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 107 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 49064534 - 49063975
Alignment:
Q  107 acgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaat-tttcgaccgacattccca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||| |   ||||  |||||||||       
T  49064534 acgtttgtaccttccaactacaacaattgtgttacctttgaatgagataaattcaaacttgccaaacaacaggactcaagcgtttcacccgacattc--- 49064438  T
Q  205 atgtt--ccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||  || || | || | |||||| |||||||  | |  ||| ||||||||||| || || |||   |||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  49064437 atgttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtatttaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgaaactt-aatacc 49064339  T
Q  303 ttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatga-gaatgtcggtcgaa-tattggagacctc-ccgtttggcaagtttgaatt 399  Q
     |||| |||| |  ||||| ||||||||||| |||| | ||||| ||  | ||||| ||  |||| |  | ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  49064338 atcatctaaaccaacctaataagaatttaatattttcaaaggaaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcctggccgtttggcaagtttgaatt 49064239  T
Q  400 accccattcaa-agg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatctt 497  Q
    |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||  ||||  | | || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49064238 accccatttaagaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatctt 49064142  T
Q  498 cagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactca 597  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||    
T  49064141 cagttgatctaagcaacgtcacccgcatatcgatccacggaaacatgttgtgctccaaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaattccaccca 49064042  T
Q  598 agtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49064041 agtgaatgacaccctcccctcgtcgagtgttggacgtttataccgaacgtgttccactctccttgtg 49063975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 382 - 664
Target Start/End: Original strand, 20778800 - 20779080
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaattaccc-cattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaa 480  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||  | | || ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  20778800 gtttggcaagtttgaatttgcctcattcaaaggaagacaattgttgtggttggaa--tgcac-cttaccctacctaatgacgatcttttggcggaatcaa 20778896  T
Q  481 acttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtca 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  20778897 acttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgaaacccgcatatcgatccattggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcg 20778996  T
Q  581 ttcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20778997 ttcgttaattccacccaaatgaatgatactctcccctcgtagagcgttggacgtttataccgaacgtgttccacccttcttgtg 20779080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 381 - 664
Target Start/End: Original strand, 32937833 - 32938113
Alignment:
Q  381 cgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaa 480  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  | | || || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  32937833 cgtttgacaagtttgaattacctcattcaaaggaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctatctaatgacgatcttctggcggaatcaa 32937929  T
Q  481 acttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtca 580  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  32937930 atttttgatgatatcttcagttgatctcaacaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccgaaacatgctcgtcacgttttcgtcg 32938029  T
Q  581 ttcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32938030 ttcgttaattccacccaactgaatgatattctcccttcgtcgagtgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 32938113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 248 - 658
Target Start/End: Original strand, 33163339 - 33163749
Alignment:
Q  248 atgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaac 347  Q
    |||||||||||||| || |||   ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||     
T  33163339 atgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggtttattccttgacactt-aataccttcatctaaatcagcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaa 33163437  T
Q  348 aatgagaatgtcggtcgaa-tattggagacctc-ccgtttggcaagtttgaattaccccattcaa-agg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcatt 443  Q
    ||   ||||||||  |||| | || ||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||  ||||      
T  33163438 aacatgaatgtcgagcgaaatgtttgagtcctggccgtttggcaagtttgaaataccccatttaagaggcaagacaattgttgtagttggaa--tgcac- 33163534  T
Q  444 cattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacat 543  Q
    | | || || ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  33163535 cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagctgttgatgatatcttcagttgatctcaacaacgttacccacatatcgatccactggaacat 33163634  T
Q  544 gttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccga 643  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  33163635 gttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgttactctcccctcgttgagcgttggacgtttataccga 33163734  T
Q  644 acgtgttccaccctc 658  Q
    |||| ||||||||||    
T  33163735 acgtattccaccctc 33163749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 211 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 3393748 - 3393300
Alignment:
Q  211 cattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcattta 310  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3393748 cattcaaaagattaaattcttgttagacttggtttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaattaaatgcattccttgacacttcaataccttcatcta 3393649  T
Q  311 aatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaa-tgtcggtcgaata-ttggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattc 408  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| | ||||   ||||| || |   ||||  |||||||||||| |||  |||    
T  3393648 aatgagcctaacaagaatttaatcttttgaatggaacaat-agaactgtcagccgaaagcttggaaac-tgttgtttaacaagtttgaatt-cccatttc 3393552  T
Q  409 aaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctc 508  Q
    |  | || |||| |||||||||||||||||||||||    | |||||||| | ||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  3393551 agggtaatacaaatgttgtagttggaaggtgcattc----cctacctaatcatgatcttctggcggaatcagactgttgataatatcttcagttgatctc 3393456  T
Q  509 agcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgata 608  Q
    |||||| | ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||    
T  3393455 agcaacgttacatgcatatcgatccactagaacatgttgtgctcccaaaacatgctcctcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactaaatgata 3393356  T
Q  609 ctctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
     |||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  3393355 atctcccatcctcgagcgttggacgtttatatcgaacgtattccaccctccttgtg 3393300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 115 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 18413137 - 18412591
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaa--tgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttcca 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |  |||||||||||| ||| || ||||||  ||| ||| |||  |||  | |   | |||||||    
T  18413137 accttccaactacaacaattatcttacctctgaaattaggtaaattcaaacttgctaaacaacaactctcaaatattcacccggaagttttattgttcca 18413038  T
Q  213 ttcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaa 312  Q
    |||| || |||||||| ||||||| ||||  || || |||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  18413037 ttcaaaagattaaatttttgttagcttgg--tttaaagatgataatcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgagactgcaataccttcatctaaa 18412940  T
Q  313 tcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaa-tgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccatt-caa 410  Q
     |   ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||  |||| || |  | || ||||||  |||||||||||||||||||| ||     
T  18412939 ccaagctaacaataatttaatcttttgaaaggaaaaat-agaactgtcgggtgaatgtttggaaactgccgtttaacaagtttgaattaccccatttcag 18412841  T
Q  411 aggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcag 510  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    | |||||||| ||||||| ||||| |||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||    
T  18412840 agtaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc----cctacctaatcacgatcttctggcagaatcaaattgttgataatatattcagttgatctcag 18412745  T
Q  511 caacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatact 610  Q
    |||| | || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||| ||||||||||  || ||||||||| |    
T  18412744 caacgttacacgcatatcgatccactgaaacatggtgtgctcccaaaacatgctcctcacgttatcgtcgttcattaattccaccgaactgaatgatatt 18412645  T
Q  611 ctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    || || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  18412644 cttccatcgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtattccacccttcttgtg 18412591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 382 - 664
Target Start/End: Original strand, 41794494 - 41794773
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaa 481  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||  | | || || |||||||||||||  |||||||||||||    
T  41794494 gtttgacaagtttgaattacctcattcaaaggaatacaaatgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaa 41794590  T
Q  482 cttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcat 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |    
T  41794591 cttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgt 41794690  T
Q  582 tcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  41794691 tcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagtgttggacgtttataccaaatgtgttccaccatccttgtg 41794773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 8 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 39589578 - 39588925
Alignment:
Q  8 attgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttaga 107  Q
    ||||||||||| | || |||| ||| |||||||||| || ||||   | | |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||  |    
T  39589578 attgaataccagcgttgaagacgcttatcgaatgctggagtcctaccggttaacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgcagttgaa 39589479  T
Q  108 cgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgac-cgacattcccaa 205  Q
        ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||| ||||||||||| ||  ||  || ||||||||   |    
T  39589478 a---tgtgcattccaacttcaacaattgtcttacctttgaatggggtcaattcaaacttgccaaacaacaagactcaaacatttcacacgacattc---a 39589385  T
Q  206 tgtt--ccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacct 303  Q
    ||||  || || | || | |||||| |||||||  | |  ||| |||||||||||||| || |||   ||| | || ||||||||||||||| |||||||    
T  39589384 tgttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaattatgttcattccttgacactt-aatacct 39589286  T
Q  304 tcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcg-gtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaatt-ac 401  Q
    |||| |||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||   ||||| || ||  |||  | ||| |||   |||||||| ||||||||| |     
T  39589285 tcatctaaaccagcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagtgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttat 39589186  T
Q  402 cccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcag 500  Q
    | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||  | | ||  | ||||||||||||| || ||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  39589185 ctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa--tgcac-cttaccccaactaatgacgatcttctagcggaatcaagttgttgatgatatcttcag 39589089  T
Q  501 ttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagt 600  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| |||||    
T  39589088 ttgatctcagcaacgtcatccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcacattttcgtcgtttgttaattccacccaagt 39588989  T
Q  601 gaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  39588988 gaatgaaactctccccccgtcgagcgttggacgtttatactgaaggtgttccaccctccttgtg 39588925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 382 - 664
Target Start/End: Original strand, 6177247 - 6177526
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaa 481  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||  | | || || |||||||||||||  |||||||||||||    
T  6177247 gtttgacaagtttgaattacctcattcaaaggaatacaaatgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaa 6177343  T
Q  482 cttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcat 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |    
T  6177344 cttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgt 6177443  T
Q  582 tcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  6177444 tcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagtgttggacgtttataccaaatgtgttccaccatccttgtg 6177526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 384 - 664
Target Start/End: Original strand, 51027699 - 51027978
Alignment:
Q  384 ttggcaagtttgaattaccccatt-caaaggaa-gacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaa 481  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||  |||||  | | || || |||||||||||||  ||| ||||||||     
T  51027699 ttggcaagtttgaattaccccatttcagaggtacgacaattgttgtagttgga--gtgcac-cttaccctaactaatgacgatcttatggtggaatcaag 51027795  T
Q  482 cttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcat 581  Q
     | ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  51027796 ttgttgatgatatcttcagttgatctcaacaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgt 51027895  T
Q  582 tcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51027896 tcgttaattccacccaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccactctccttgtg 51027978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 382 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 56139185 - 56138906
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaa 481  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||  | | || || |||||||||||||  |||||||||||||    
T  56139185 gtttgacaagtttgaattacctcattcaaaggaatacaaatgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaa 56139089  T
Q  482 cttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcat 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |    
T  56139088 cttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgt 56138989  T
Q  582 tcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  56138988 tcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagtgttggacgtttataccaaatgtgttccaccatccttgtg 56138906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 9 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 21712179 - 21711549
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||| | || | |||  | | |||||||||||||| ||| || ||||| |||| |||||||| | ||  |     
T  21712179 ttgaataccagcattcaagatgcttatcgaatgttggacttctgccgattaacaagtttgaattgccctatccagagtaagataattgttgtacttgaaa 21712080  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaat-tttcgaccgacattcccaat 206  Q
       ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||  |||| |   ||||  |||||||||   ||    
T  21712079 ---tgtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatgaggtaaattcaaacgtgccaaacaacagtactcaagcatttcacccgacattc---at 21711986  T
Q  207 gtt--ccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacctt 304  Q
    |||  || || | || | |||||| |||||||  | |  ||| |||||||||||||| || |||   |||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  21711985 gttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgagattcattccttgacactt-aatacctt 21711887  T
Q  305 catttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaa-tattggagacctc-ccgtttggcaagtttgaattacc 402  Q
    ||| ||||||  |||||||| ||||||||||||| | ||||| ||   ||||| ||  |||| |  | ||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  21711886 catctaaatcaccctaacaaaaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcctggccgtttggcaagtttgaattacc 21711787  T
Q  403 ccatt-caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcag 500  Q
    ||||| || ||| |||| |||||||||||||||||  ||||  | | || || ||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| ||    
T  21711786 ccatttcagaggtaagagaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatctttag 21711690  T
Q  501 ttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagt 600  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  21711689 ttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaattccacccaagt 21711590  T
Q  601 gaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttatacc 641  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  21711589 gaatgataccctcccctcgtcgagcgttagatgtttatacc 21711549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 382 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 49095020 - 49094741
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaa 481  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||  | | || || |||||||||||||  |||||||||||||    
T  49095020 gtttgacaagtttgaattacctcattcaaaggaatacaaatgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaa 49094924  T
Q  482 cttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcat 581  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |    
T  49094923 cttttgacgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatggtcgtcacgtttttgtcgt 49094824  T
Q  582 tcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  49094823 tcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagtgttggacgtttataccaaatgtgttccaccatccttgtg 49094741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 381 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 24607028 - 24606748
Alignment:
Q  381 cgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaa 480  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |   | |||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  24607028 cgtttggaaagtttgaattacctcattcaaaggaagacaattgttgtagttggaatgtacattta---cctacctaatcacgatcttctggcggaatcag 24606932  T
Q  481 acttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtca 580  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||     
T  24606931 actcttgataatatcttcagttgatctcagcaacgttacccacatatcaatccacgggaacatgatgtgctcccaatacatgctcgtcacgttttcgtcg 24606832  T
Q  581 ttcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||| || ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24606831 ttcgttaattctacccaactgaataatactctccgcttgtcgagcgttggacatttatatcgaacgtgttccaccctccttgtg 24606748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 380 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 25762877 - 25762594
Alignment:
Q  380 ccgtttggcaagtttgaattaccccattcaa-agg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaat 477  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| ||||||||  ||||  | | || || ||||||||||||| ||||||||||    
T  25762877 ccgtttgacaagtttgaattaccccattttagaggtaagacaattgttgcagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaat 25762781  T
Q  478 caaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcg 577  Q
    |||  | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  25762780 caagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccaccagaacatgttgtgctcccaaaacatgttcgtcacgttttcg 25762681  T
Q  578 tcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25762680 tcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaatgtgttccaccctccttgtg 25762594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 662
Target Start/End: Original strand, 46816082 - 46816732
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||||| | ||||| ||  | | |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||     
T  46816082 ttgaataccaacattgaagaggcttatcgaatgttggattcttgccgattaacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgtagttggaa 46816181  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaat-tttcgaccgacattcccaat 206  Q
       ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||| |   ||||  ||| || ||   ||    
T  46816182 ---tgtgcattctaactacaacaattgtcttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgcgaaacaacaagactcaagcatttcacccggcaatc---at 46816275  T
Q  207 gtt--ccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacctt 304  Q
    |||  || || | || | |||||| |||||||  | |  ||| |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||| ||||||| | ||||||||    
T  46816276 gttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattctttgacacct-aatacctt 46816374  T
Q  305 catttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatga-gaatgtcggtcgaa-tattggagacctc-ccgtttggcaagtttgaattac 401  Q
    ||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||| | || || ||  | ||||| ||  |||| |  | ||| | |  ||||||||||||||||||||||    
T  46816375 catctaaaccggcctaacaaaaatttaaccttttcaaagaaaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcttggccgtttggcaagtttgaattac 46816474  T
Q  402 cccat-tcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttca 499  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||  | | || || ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  46816475 cccatctcagaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttgccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagctattgatgatatcttca 46816571  T
Q  500 gttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaag 599  Q
      |||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| ||||| ||||    
T  46816572 --tgatctcaacaacgttacctgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgtttttgtcgttctttaactccacccaag 46816669  T
Q  600 tgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttg 662  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  46816670 tgaatgataccctcccctcgtcgagcattggacgtgtatactgaacgtattccaccctccttg 46816732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 244 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 10312683 - 10312268
Alignment:
Q  244 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacag 343  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||  |||||||||||||||  |    
T  10312683 ttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttcaataccttcatctaaaccagcctaacataaatttaatcttttgaatg 10312584  T
Q  344 gaacaatgagaa-tgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgca 441  Q
    ||||||| |||| |||| |  |||| || | || ||  ||| |  |||||||||||| ||  |||  | || ||||||||||||||||||||||||||      
T  10312583 gaacaat-agaactgtcaggtgaatgtttgggaactagcgtataacaagtttgaatttcc--attttagggtaagacaattgttgtagttggaaggtg-- 10312489  T
Q  442 ttcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaac 541  Q
       ||||| |||||||| ||||||| |  ||||||| | | | ||||| ||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  10312488 --aattccctacctaatcacgatcttccagcggaattagattgttgataatatcttcagttgatcttaacaacgttacccgcatatcgatccactggaac 10312391  T
Q  542 atgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttatacc 641  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||| |||||| | |||||| |||| | |||||||||    
T  10312390 atgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaactaaatgatattctcccatcgtcgagtgttgtatgtttatacc 10312291  T
Q  642 gaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||| | |||||| |||||||||    
T  10312290 gaacatattccacactccttgtg 10312268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 446 - 664
Target Start/End: Original strand, 26591678 - 26591896
Alignment:
Q  446 ttccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgt 545  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26591678 ttccgtacctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatcttagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgt 26591777  T
Q  546 tgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaac 645  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  26591778 tgtgctcccaaaatatgttcgtcacgtttttgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatatcgaac 26591877  T
Q  646 gtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||||||||||||||||    
T  26591878 gtgttccaccctccttgtg 26591896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 276 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 37866791 - 37866402
Alignment:
Q  276 aggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaa-tattggag 374  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||   ||||| ||  |||| |  | |||    
T  37866791 aggttcattccttgacactt-aataccttcatctaaaccagcctaacaataatttaatattttcacaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgag 37866693  T
Q  375 acctc-ccgtttggcaagtttgaattaccccatt-caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactgg 471  Q
     |||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| | ||||| ||||||||  ||||  | | || || ||||||||||||| || |    
T  37866692 tcctggccgtttggcaagtttgaattaccccatttcagaggtaagacgactgttgcagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctag 37866596  T
Q  472 cggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctccc-aaaacatgctcgtcat 570  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  37866595 cggaatcaagatattgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccgaaaacatgctcatcac 37866496  T
Q  571 gttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  37866495 gttttcgtcgctcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggatgtttataccgaatgtgttccacccttcttgtg 37866402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 379 - 664
Target Start/End: Original strand, 242343 - 242627
Alignment:
Q  379 cccgtttggcaagtttgaattaccccatt-caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaa 476  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||||| |  | ||  ||   || ||||||||||||| |||||||||    
T  242343 cccgtttggcaagtttgaattaccctatttcagaggtaagacaattgttatagttggaatgcaccttactt---taactaatgacgatcttctggcggaa 242439  T
Q  477 tcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttc 576  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  242440 tcaagctgttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgatgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttc 242539  T
Q  577 gtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
     || ||| |||| |||||  ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  242540 atcgttctttaactccacctaagtgaatgatgctctcccctcgtcgagtgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 242627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 248 - 662
Target Start/End: Original strand, 31824424 - 31824838
Alignment:
Q  248 atgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaac 347  Q
    |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | || |||||||| ||||||||||| | |||||     
T  31824424 atgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aataccttcatctaaaccagcataacaagattttaatcttttcaaaggaaa 31824522  T
Q  348 aatgagaatgtcggtcgaa-tattggagacctc-ccgtttggcaagtttgaattaccccatt-caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcatt 443  Q
    ||   ||| || || |||| |  | |||   |  ||||||||||||||| |||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||||  ||||      
T  31824523 aacatgaacgttgggcgaaatgcttgagtaatggccgtttggcaagtttaaattaccctatttcaaatgtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac- 31824619  T
Q  444 cattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacat 543  Q
    | | || || ||||||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||| ||||||    
T  31824620 cttaccctaactaatgacgatcttctagcggaatcaagctgttgatgatatcttcagttgatctaagcaacgttacccgcatattgatccactagaacat 31824719  T
Q  544 gttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccga 643  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31824720 gttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatattctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccga 31824819  T
Q  644 acgtgttccaccctccttg 662  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  31824820 acgtattccaccctccttg 31824838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 9 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 45940175 - 45939521
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||| | ||||||| ||| |||||||| | || || ||  | | |||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||| |      
T  45940175 ttgaataccagcgttcaagacgcttatcgaatgatggagtcatgccgattaacaagtttgaattgctccatccagagtaagacaattgttgcagttggga 45940076  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaat-tttcgaccgacattcccaat 206  Q
       ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| ||||| ||||| |   ||||| ||  |||||    |    
T  45940075 ---tgtgcattccaactacaacaattgtcttaccttcgaatgaggtaaagtcaaacttgccaaacaacaggactcaagcatttcgccccgcattcatgtt 45939979  T
Q  207 gttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttca 306  Q
     |||| || | || | |||||| |||||||| | |  ||| ||| |||||||||| || |||   ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  45939978 tttcctttgaaaagaataaatt-ttgttagacttgctttagatggtggtattcaagtgccaatgaaatgatgttcattccttgacactt-aataccttca 45939881  T
Q  307 tttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaa-tattggagacctcc-cgtttggcaagtttgaattacccc 404  Q
    | |||| | || |||||||||||||||||||| | ||||| ||   ||| || || | || |  | ||| | |   ||||||||||||||||||||||||    
T  45939880 tctaaaccagcataacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaacgttgggcaaaatgcttgagtcatggtcgtttggcaagtttgaattacccc 45939781  T
Q  405 att-caaagg-aagacaatt-gttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagt 501  Q
    ||| || ||| ||||||||| |||||||||||||  ||||  | | || || |||||||||||||  |||  |||||||  | |||||||||||||||||    
T  45939780 atttcagaggtaagacaattagttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttatggaagaatcaagttgttgatgatatcttcagt 45939684  T
Q  502 tgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtg 601  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  45939683 tgatctcagcaacgttactcgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacattatcgtcgttcgttaattccacccaagtg 45939584  T
Q  602 aatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45939583 aatgataatctcctctcgtcgagcgttgaacgtttatatcgaacgtgttccaccctccttgtg 45939521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 388 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 11288562 - 11288291
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttg 487  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    | ||| |||| ||||||| ||  | |||||||| || ||    
T  11288562 caagtttgaattacctcattcaaaggaagacaattatggtagttggaaggtgcattc----cctacttaatcacgatcttctaacagaatcaaa-ttgtg 11288468  T
Q  488 atgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgtta 587  Q
    || |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  11288467 ataatatcttcagttgatctcagcaacgttactcgcatatcgatccactggaacatgatgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgtta 11288368  T
Q  588 attccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||| ||| | ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  11288367 attccacccaactaaatgatattctcccctcgtcgaccgttggacgtttatacggaacgtattccaccctccttgtg 11288291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 62 - 664
Target Start/End: Original strand, 20901286 - 20901879
Alignment:
Q  62 aagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattca 160  Q
    ||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||| ||    | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  20901286 aagtttgaattgcctcatccagagtaagacaattgttgtagttggaa---tctgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattca 20901382  T
Q  161 aacatgccaagcaacaagactccaat-tttcgaccgacattcccaatgttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattc 259  Q
    ||| |||||| ||||| ||||| |   ||||| ||  |||||    | |||| || | |||| |||||| |||||||  | |  ||| ||||||||||||    
T  20901383 aacttgccaaacaacatgactcaagcatttcgtcccgcattcatgtttttcctttgaaaataataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattc 20901482  T
Q  260 aaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtc 359  Q
    || || |||   |||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||   ||| |      
T  20901483 aagtgccaacgaaatgaggttcattccttggcactt-actaccttcatctaaaccagcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaacgct 20901581  T
Q  360 ggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccatt-caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaa 457  Q
     | ||||      |  |   |||||||| |||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||  ||||  | | || || ||||    
T  20901582 aggcgaa------acgctggccgtttggaaagtttgaattacctcatttcagaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaa 20901672  T
Q  458 tgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaa 557  Q
    ||||||||| | || ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  20901673 tgacgatcttcaggtggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcagcagtgttacccgcatatcgatccactagaacatgctgtgctcccaaa 20901772  T
Q  558 acatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccct 657  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20901773 acatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtgaatgatattctccactcgtcgaacgttggacgtttataccgaacgtgttctaccct 20901872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 27759977 - 27759374
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| | || |||||  | | |||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||| ||||  |     
T  27759977 ttgaataccaacattcaagaggcttatcgaatgttggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagagtaggacaattgttgtagttgaaa 27759878  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaat-tttcgaccgacattcccaat 206  Q
       ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||| ||||| ||||| |   ||||| ||  | |||    |    
T  27759877 ---tgtgcattccaactacagcaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaactggccaaacaacaggactcaagcatttcgccccgcgttcatgtt 27759781  T
Q  207 gttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttca 306  Q
     |||| || | || | |||||| || ||||  | |  ||| |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27759780 tttcctttgaaaagaataaatttttattaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aataccttca 27759682  T
Q  307 tttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaa-tattggagacctc-ccgtttggcaagtttgaattacccc 404  Q
    | |||| | || |||||||||||||||||||| | ||||| ||   ||| |  || |||| |  | ||| | |  |||||||||||||||||||||||||    
T  27759681 tctaaaccagcataacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaacgctgggcgaaatgcttgagtcatagccgtttggcaagtttgaattacccc 27759582  T
Q  405 att-caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagtt 502  Q
    ||| || ||| ||||||||||||||||||| ||  ||||  | | || || ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  27759581 atttcagaggtaagacaattgttgtagttgaaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagctgttgatgatatcttcagtt 27759485  T
Q  503 gatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtga 602  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||| |||||||    
T  27759484 gatctcagcaacgttactcgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtga 27759385  T
Q  603 atgatactctc 613  Q
    |||||||||||    
T  27759384 atgatactctc 27759374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 49571749 - 49571463
Alignment:
Q  21 attcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtttgtaccttc 120  Q
    |||||||| ||| ||| |||||| |||||||   ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  49571749 attcaagatgctaatcaaatgctggattcctaccgtttaacaagtttgaattacctcattcaaaggaagacaattgttgcagtgtgacgtttgtacctcc 49571650  T
Q  121 caactacaacaattgtcttacctttgaatga-gtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttc----cattc 215  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    |  ||    
T  49571649 caactgcaacaattgtcttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgccaagcagcatgactccaatattcgaccgacattcccattgttcctgtctgtc 49571550  T
Q  216 agaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    | || ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  49571549 aaaagattaaattcttcttaggctgggattaaataatggtattcaaatatcaaaagaatgaggtacatttcttgacacttcaatacc 49571463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 272 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 9490065 - 9489675
Alignment:
Q  272 aatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcg-gtcgaatatt 370  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||| |  ||||||||||||||||| |||| | ||||| ||   |||||||| ||  |||  |    
T  9490065 aatgaggttcattccttgacacttta-taccttcatataaaccaacctaacaagaatttaattttttcaaaggaaaaacatgaatgtcgagtgaaatgct 9489967  T
Q  371 ggagacctcccgtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctac 468  Q
     ||| |||   |||||||| ||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||| |  | || || ||||||||||||| |    
T  9489966 tgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgcagttggaa--tgcactt-taccctaactaatgacgatcttc 9489870  T
Q  469 tggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtc 568  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  9489869 tggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagttgatctcaataacgtcacccgcatatcaatccactggaacatgctgtgctcc-aaaacatgctcgtc 9489771  T
Q  569 atgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |  |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  9489770 acattttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatactgaaggtgttccaccctccttgtg 9489675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 112 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 24607602 - 24607276
Alignment:
Q  112 tgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||||||  |||  |||| || |||| ||   || | |||||||| | | |||||    
T  24607602 tgtaccttccaactacaacaattatcttacccctgaatggggtaaattcaaagttgctgagcagcaggacttcagcatttgtccgacatttctattgttc 24607503  T
Q  211 cattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcattta 310  Q
    |||||| || ||||||||| |||||| || || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24607502 cattcaaaagattaaattcatgttaggtttggtttaaataatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtccgttccttgacactttaataccttcattta 24607403  T
Q  311 aatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaa 410  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||   |||||||| ||||| |||||| ||| ||||||  |||||||||||||| |||| ||     
T  24607402 aaccggccaaacaagaatttaatcttttgaaaagaacaatagaaatgtcggacgaatgttggagtcctgccgtttaacaagtttgaattactccatccag 24607303  T
Q  411 aggaagacaattgttgtagttggaagg 437  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  24607302 aggaggacaattgttgtagttggaagg 24607276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 381 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 31324451 - 31324170
Alignment:
Q  381 cgtttggcaagtttgaattaccccatt-caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatc 478  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    | |||||||| | ||||| || ||||||||    
T  31324451 cgtttagcaagtttgaattatctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc----cctacctaatcatgatcttctagcggaatc 31324356  T
Q  479 aaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgt 578  Q
    ||||| ||||  || ||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  | ||    
T  31324355 aaactgttgagaatgtcttcagttgatctcagcaactttacacacatatcgatccacggtaacatgttgtgctccaaaaacatgctcgtcacgtcattgt 31324256  T
Q  579 cattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    | |||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||| | ||||| |||||||||||||||| |||| | ||||| |||| |||||    
T  31324255 cgttcgttaattccacccaactgaataatattctcccatcgtcgaacgttggacgtttatactgaacctattccatcctcattgtg 31324170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 206 - 539
Target Start/End: Original strand, 49816954 - 49817283
Alignment:
Q  206 tgttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttc 305  Q
    |||| |||||| || |||||| ||||||||| || || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  49816954 tgtttcattcaaaagattaaaatcttgttaggtttggtttgaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttcaataccttc 49817053  T
Q  306 atttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtc--ggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccc 403  Q
    ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||  |||||||| ||||  ||  || |||||  | |||||||  |||||  ||||||||||||  ||    
T  49817054 atttaaaccagcctaacatgaattttatcttttgaatggaacaat-agaacttccgggccgaatgctagagacctagcgtttaacaagtttgaatt-tcc 49817151  T
Q  404 cattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttg 503  Q
      ||||  | ||||||||| ||||||||||||||||    |||||| |||||||| |||||||  |||| |||||| ||| ||||| ||||||||| |||    
T  49817152 atttcagggtaagacaattattgtagttggaaggtg----cattccctacctaatcacgatcttttggcagaatcagactgttgataatatcttcatttg 49817247  T
Q  504 atctcagcaacatcacccgcatatcgatccactgga 539  Q
    |||||| |||| | || |||||||||||||||||||    
T  49817248 atctcatcaacgttacacgcatatcgatccactgga 49817283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 59 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 24607327 - 24607051
Alignment:
Q  59 aacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaat 157  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| || |   | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24607327 aacaagtttgaattactccatccagaggaggacaattgttgtagttggaag---gcaccttccaactaaaacaattatcttacctttgaatgaggtaaat 24607231  T
Q  158 tcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtat 257  Q
    |||||| |||||| ||||||   || |   |||  |||| | |   | |||| |||||| || ||||||||||||||||  | || ||||||||||||||    
T  24607230 tcaaacttgccaaacaacaactatcaagcattcacccgaaagttttattgtttcattcaaaagattaaattcttgttaggcttggtttaaatgatggtat 24607131  T
Q  258 tcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttt 337  Q
    ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  24607130 tcaagagtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttcaataccttcatttaaaccagcctaacaagaatttaatcttt 24607051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 414 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 13850991 - 13850745
Alignment:
Q  414 aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaa 513  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||    | |||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  13850991 aagataattgttgtagttggaaggtgcattc----cctacctaatcacggtcttctggcggaatcaaactgttgagaatatctttagttgatctcagcaa 13850896  T
Q  514 catcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctc 613  Q
      | ||   ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||| || ||||||| ||  ||| ||||||||| ||||    
T  13850895 tgttacatacatatcgatccacggtaacatgttgtgctcccaaaacatgttcgtcacgtcgtcgtcgtttgttaatttcatccaactgaatgatattctc 13850796  T
Q  614 cccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    || | ||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13850795 ccatcgtcaaacgttggacgtttataccaaacgtattccaccctccttgtg 13850745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 115 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 43889484 - 43889162
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |  ||||||||| |||||| | ||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||   |    
T  43889484 accttccaactacaacaattgtctt-cctctaaatggggtaattcaaacttgccaaacgacaggactccaatgttcgaacgacattcccattgttcatgt 43889386  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatc 314  Q
    || || |||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||  |||||||||||||   |||||| |||||  || |||||| ||||||||| |    
T  43889385 caaaagattaaattcttgatagatttggtttaaatgacggtattcaagcgtcaaaagaatga---ccattcattgacgtttgaataccgtcatttaaacc 43889289  T
Q  315 -ggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaag 412  Q
        ||| |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||| | | |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  43889288 aaatctatcaagaatttaatcttttgaatggaactatgggaatgtcggtcgtatattggagtcctactgcttggcaagtttgaatttacctcattcaaag 43889189  T
Q  413 g-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    | || || ||||||| |||||||||||    
T  43889188 gtaacacgattgttggagttggaaggt 43889162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 416 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 13866503 - 13866259
Alignment:
Q  416 gacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaaca 515  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    | |||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||     
T  13866503 gacaattgttgtagttgaaaggtgcattc----cctacctaatcacggtcttctggcggaatcaaactgttgagaatatcttcagttgatctcagcaacg 13866408  T
Q  516 tcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccc 615  Q
    | ||   |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||| || ||||||||||  ||| ||||||||| ||||||    
T  13866407 ttacatacatatcaatccacggtaacatgttgtgctcccaaaacatgttcgtcacgtcgtcgtcgtttgttaattccatccaactgaatgatattctccc 13866308  T
Q  616 cttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
     | ||| |  |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  13866307 atcgtcaaatgttggacgtttataccaaacgcattccaccctccttgtg 13866259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 338
Target Start/End: Original strand, 241992 - 242320
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    ||||||| |||| ||||| | |||||||||||||| |||| |||  ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||  ||    
T  241992 ttgaatatcatctttcaaaatgctcatcgaatgctggatttctgccgtttaacaagtttgaattacccaattcaaaggaagacagttgttgcagttgaac 242091  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactcca--attttcgaccgacattcccaat 206  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |  ||||| | ||||||||    ||    
T  242092 gtttgtacctccgaactacaacaattgtgttacctttgaaggggtaatttcaaacttgccaaacaacatgactcaagcatttt-gtccgacatt---tat 242187  T
Q  207 g--ttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacctt 304  Q
    |  || | || | || | |||||| |||||||| | |  ||| |||||||||| ||| || |||   |||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  242188 gtttttctttgaaaagaataaatttttgttagacttgttttagatgatggtatccaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aatacctt 242286  T
Q  305 catttaaatcggcctaacaagaatttaatctttt 338  Q
    ||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  242287 catctaaaccagcctaacaagaatttaatctttt 242320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 59 - 208
Target Start/End: Original strand, 26591516 - 26591670
Alignment:
Q  59 aacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac----gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagt 153  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  26591516 aacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgcagttagacgtttgtttgtacctcccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggt 26591615  T
Q  154 aaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgt 208  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  26591616 aaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatattcgaccggcattcccaatgt 26591670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 115 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 49423743 - 49423418
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||  || ||| |  || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||   |    
T  49423743 accttccagctacaacaattgtgttacctttgaatggggtaattcaaatttgtcaaacggcaggactccaatcttcgaccgacattcccattgttcttgt 49423644  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt-gacacttcaataccttcatttaaat 313  Q
    || || ||||||||||||||||   ||  |||||||| |||||| || ||||||  |||||     ||||| || ||||||| |||||| |||||||||     
T  49423643 caaaagattaaattcttgttaggccggt-ttaaatgaaggtattgaagtgtcaag-gaatggacctcattcttttgacacttgaataccgtcatttaaac 49423546  T
Q  314 cgg-cctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaa 411  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||  | ||| ||| |||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  49423545 caaacctaacaagaatttaatcttttgaatgaaactatgggaatgtcggtcgaacattggagtcgtgccgtttggcaagtttgaatttaccacattcaaa 49423446  T
Q  412 gg-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    || || ||||||||||||||| ||||||    
T  49423445 ggtaacacaattgttgtagtttgaaggt 49423418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 115 - 438
Target Start/End: Original strand, 21169673 - 21169997
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| |  || ||||||||| |||||||| |||||||| |||||   |    
T  21169673 accttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggactccaatattcgaccggcattcccattgttcatgt 21169771  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt-gacacttcaataccttcatttaaat 313  Q
    || || ||||||||||||||||   ||  |||||||| |||||| || ||||||  ||||||    ||||| || |||| || |||||| ||||||||      
T  21169772 caaaagattaaattcttgttaggccggt-ttaaatgaaggtattgaagtgtcaag-gaatgaacctcattcttttgacatttgaataccatcatttaatc 21169869  T
Q  314 cg-gcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaa 411  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| ||||||||| ||| | | |||| |||||| || ||||| ||||||||    
T  21169870 cccgcctaacaagaatttaatcttttgaatggaacattgggaatgccggtcgtatattggagtcctgctgcttggaaagtttaaatttacctcattcaaa 21169969  T
Q  412 gg-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    || || ||||||||||||||||||||||    
T  21169970 ggtaacacaattgttgtagttggaaggt 21169997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 124 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 34529772 - 34529457
Alignment:
Q  124 ctacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcagaatatt 223  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |  |||||||||||||||| |  || ||||||||| ||||| |  |||||||| ||||||  ||| || |||    
T  34529772 ctacaacaattgtatt-cctttgaatggggtaattcaaacatgccaaacggcaggactccaatattcgaacagcattcccattgttcctgtcaaaagatt 34529674  T
Q  224 aaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt-gacacttcaataccttcatttaaatcg-gcctaa 321  Q
    |||||||||||||  |||  |||||||| |||||| || ||||||  |||||     ||||| || |||| ||||||||| ||||||||  |  ||||||    
T  34529673 aaattcttgttaggctggt-ttaaatgaaggtattgaagtgtcaac-gaatggacctcattcttttgacatttcaataccgtcatttaatcccagcctaa 34529576  T
Q  322 caagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-aagaca 419  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| || |||||||| ||||||||||||| ||| | | |||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||    
T  34529575 caagaatttaatcttttgaatggaacattgggaatgtcgatcgaatattggagtcctgctgcttggcaagtttgaatttacctcattcaaaggtaacaca 34529476  T
Q  420 attgttgtagttggaaggt 438  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  34529475 attgttggagttggaaggt 34529457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 115 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 34153271 - 34152949
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| |  || | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |    
T  34153271 accttccagctacaacagttgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcatgtctccaatattcgaccgacattcccattgttcccgt 34153173  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt-gacacttcaataccttcatttaaa- 312  Q
    || || ||||||||||||||||  |||  |||||||| |||||| || ||||||   |  ||  || |||| || |||| || |||||| ||||||||      
T  34153172 caaaagattaaattcttgttaggctggt-ttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaacggacctc-attcttttgacatttgaataccatcatttaatc 34153075  T
Q  313 tcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaa 411  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||  |||||| || |||||||||| | ||||||||| ||| | | |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  34153074 tcagcctaacaacaatttaatcttttgaatggaacattgggaatgtcggttgtatattggagtcctgctgcttggcaagtttgaatttacctcattcaaa 34152975  T
Q  412 gg-aagacaattgttgtagttggaag 436  Q
    || |||||||||||||| ||||||||    
T  34152974 ggtaagacaattgttgttgttggaag 34152949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 112
Target Start/End: Original strand, 44559845 - 44559944
Alignment:
Q  13 ataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgttt 112  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44559845 ataccattattcaagatgctcatcgcatgctggattcctgttgtttaacaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgcagttggacgttt 44559944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 316 - 438
Target Start/End: Original strand, 22437333 - 22437457
Alignment:
Q  316 gcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg- 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  22437333 gcctaacaagaatttaatcttttgaatggaacaatgggaatgccggtcgaatattggagtcctgctgcttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggt 22437432  T
Q  414 aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    || ||||||||||||||||| ||||    
T  22437433 aacacaattgttgtagttgggaggt 22437457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 206 - 336
Target Start/End: Original strand, 32937678 - 32937809
Alignment:
Q  206 tgttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc-tt 304  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  32937678 tgtttcattcaaaagattaaattcttgttaggctgggtttaaatgatggtatttaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttcaataccttt 32937777  T
Q  305 catttaaatcggcctaacaagaatttaatctt 336  Q
     ||||||| | ||| || ||||||||||||||    
T  32937778 aatttaaaccagccgaataagaatttaatctt 32937809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 49064683 - 49064588
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  49064683 ttgaataccatcattcaagatgctcatcaaatgctggactcctgtcgtttaacaagtttgaattacctcattcaaaggaagacaattgttgcagtt 49064588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 388 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 49064631 - 49064563
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtaccta 456  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49064631 caagtttgaattacctcattcaaaggaagacaattgttgcagttggaaggtgcattcattccgtaccta 49064563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 115 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 957440 - 957116
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  |||| |||| |||||| |  || | ||||||| |||||||| |||||||| ||||||  |    
T  957440 accttccagctacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattgaaacttgccaaacggcaggtctccaatattcgaccggcattcccattgttcctgt 957342  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt-gacacttcaataccttcatttaaat 313  Q
    || || ||||||||||||||||  | |  |||||| | |||||| || ||||||  ||||||    ||||| || |||| || || ||| ||||||||      
T  957341 caaaagattaaattcttgttaggctagt-ttaaataaaggtattgaagtgtcaag-gaatgaacctcattcttttgacatttgaacaccatcatttaatc 957244  T
Q  314 -cggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaa 411  Q
     | |||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||| ||| | | ||  |||||||||| ||| ||||||||||    
T  957243 acagcctaacaagaatttaatcttttgaatggaacattgggaatgtcggtcgaatattggagtcctgctgctttacaagtttgaatttatcccattcaaa 957144  T
Q  412 gg-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    || || |||||| |||||||||| ||||    
T  957143 ggtaacacaatttttgtagttgggaggt 957116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 206 - 349
Target Start/End: Original strand, 32937354 - 32937497
Alignment:
Q  206 tgttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttc 305  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||  | || |||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  32937354 tgttcctttcaaaatattaaattcttgttaggctcggtttaaatgagggtattgaagtgtcaaaagaatgaggtacattccttgacacttcaatacctcc 32937453  T
Q  306 atttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaa 349  Q
    || |||| | || ||| |  || ||||||||||||  |||||||    
T  32937454 atctaaaccagcttaatataaaattaatcttttgaatggaacaa 32937497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 115 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 36776504 - 36776180
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| |  || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||   |    
T  36776504 accttccagctacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcatgactccaatgttcgaccgacattcccattgttcttgt 36776406  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc-cttgacacttcaataccttcatttaaa- 312  Q
    || || ||||| |||||||||||   || |||||||| |||||| || |||| || ||||||    |||||  ||||||||| |||||| |||||||||     
T  36776405 caaaagattaagttcttgttaga-ccggtttaaatgaaggtattgaagtgtc-aatgaatgaacctcattcatttgacacttgaataccgtcatttaaac 36776308  T
Q  313 tcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaa 411  Q
        ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| | ||| || ||| ||| ||| |   ||| ||| |||||| ||| ||||||||||    
T  36776307 aaaacctaacaagaatttaatcttttgaatggaactatgggaatgccagtcaaacattagagtcctgctaattgacaaatttgaatttatcccattcaaa 36776208  T
Q  412 gg-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    || || ||||||||||||||||||||||    
T  36776207 ggtaacacaattgttgtagttggaaggt 36776180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 124 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 49791912 - 49791597
Alignment:
Q  124 ctacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcagaatatt 223  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |  ||||||||| || ||| |  || | ||||||| |||||||| |||||||| ||||||  ||| || |||    
T  49791912 ctacaacaattgtctt-cctttaaatggggtaattcaaacttgtcaaacggcaggtctccaatattcgaccggcattcccattgttcctgtcaaaagatt 49791814  T
Q  224 aaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt-gacacttcaataccttcatttaaat-cggcctaa 321  Q
    |||||||||||||  |||  |||||||| ||||||  | ||||||  |||||     ||||| || |||| || |||||| ||||||||   | ||||||    
T  49791813 aaattcttgttaggctggt-ttaaatgaaggtattgtagtgtcaac-gaatggacctcattcttttgacatttgaataccatcatttaatcacagcctaa 49791716  T
Q  322 caagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-aagaca 419  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| || ||||| || ||||||||||||| | | | | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  49791715 caagaatttaatcttttgaatggaacattgggaatgccgatcgaatattggagtcatgctgcttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagcca 49791616  T
Q  420 attgttgtagttggaaggt 438  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  49791615 attgttgtagttgggaggt 49791597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 56139558 - 56139387
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||| | ||||||| ||| |||||||| | || |||||  | | |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||     
T  56139558 ttgaataccagcgttcaagacgcttatcgaatgttggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgcagttgga- 56139460  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
       ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  56139459 --atgtgcattccaactacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactc 56139387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 316 - 438
Target Start/End: Original strand, 49571527 - 49571655
Alignment:
Q  316 gcctaacaagaatttaatcttttgaca----ggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaa 410  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||| | | | | |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  49571527 gcctaagaagaatttaatcttttgacagacaggaacaatgggaatgtcggtcgaatattggagtcatgctgcttggcaagtttgaatttacctcattcaa 49571626  T
Q  411 agg-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  49571627 aggtaagacaattgttgcagttgggaggt 49571655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 244 - 312
Target Start/End: Original strand, 4784876 - 4784944
Alignment:
Q  244 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaa 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  4784876 ttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaataccatcatttaaa 4784944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 336
Target Start/End: Original strand, 20778714 - 20778775
Alignment:
Q  275 gaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatctt 336  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  20778714 gaggtgcattccttgacacttcaataccttcatttaaaccagcctaacaagaatttaatctt 20778775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 182
Target Start/End: Original strand, 6176874 - 6177045
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| || || |||||  | | |||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||| ||     
T  6176874 ttgaataccattgtccaagatgctcatcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagggtaagacaattgttgcagttgga- 6176972  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
       ||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  6176973 --atgtgcattccaaccacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactc 6177045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 388 - 464
Target Start/End: Original strand, 14330250 - 14330326
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgat 464  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| || |||||||    
T  14330250 caagtttgaattacctcattcaaaggaagacaattgttacagttggaaggtgcatttgttccgtacttactgacgat 14330326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 417 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 17292201 - 17292108
Alignment:
Q  417 acaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaac 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    | ||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  17292201 acaattgttgtagttggaaggtgcattc----cctacataatcacgatcttctggcggaatcaaactgttgagaatatcttcagttgatctctgcaac 17292108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 182
Target Start/End: Original strand, 21016736 - 21016907
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| || || |||||  | | |||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||| ||     
T  21016736 ttgaataccattgtccaagatgctcatcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagggtaagacaattgttgcagttggaa 21016835  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
       ||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  21016836 ---tgtgcattccaaccacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactc 21016907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 244 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 21170152 - 21170088
Alignment:
Q  244 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  21170152 ttaaatgatggtattcaactgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaataccatcatt 21170088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 49095393 - 49095222
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    ||||||||||   ||||||||||| ||||||| || || |||||  | | |||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||| ||     
T  49095393 ttgaataccagtgttcaagaggcttatcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagggtaagacaattgttgcagttgga- 49095295  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
       ||| | |||||||  |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  49095294 --atgtgcattccaaccccaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaagactc 49095222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 353 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 26591663 - 26591576
Alignment:
Q  353 gaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  26591663 gaatgccggtcgaatattggagtcctgctgcttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttgggaggt 26591576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 124 - 438
Target Start/End: Original strand, 2773240 - 2773555
Alignment:
Q  124 ctacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcagaatatt 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| || ||| |  ||   ||||||| |||||||| |||||||| | ||||  ||| || |||    
T  2773240 ctacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaacggcagttctccaatattcgaccggcattcccattattcctgtcaaaagatt 2773338  T
Q  224 aaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt-gacacttcaataccttcatttaaatcg-gcctaa 321  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||| |||||| || ||||||  |||||     ||||| || |||| || ||||||  |||||||  |  ||||||    
T  2773339 aaattcttgttaggttggt-ttaaatgaaggtattgaagtgtcaac-gaatggacctcattcttttgacatttgaataccgccatttaatcccagcctaa 2773436  T
Q  322 caagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-aagaca 419  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| || || ||  ||||||||||||||| | |   | ||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||    
T  2773437 caagaatttaatcttttgaatggaacattgggagtgctggtcgaatattggagtcatgatgcttggcaagtttaaatttacctcattcaaaggtaagaca 2773536  T
Q  420 attgttgtagttggaaggt 438  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  2773537 attgttgtagttgggaggt 2773555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 287 - 438
Target Start/End: Original strand, 42886658 - 42886812
Alignment:
Q  287 ttgacacttcaataccttcatttaaa-tcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgttt 385  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || || ||| || ||  ||||| | | | ||||    
T  42886658 ttgacacttgaataccgtcatttaaactaaacctaacaagaatttaatcttttgaatggaacaatgggagtgccggacgtatgctggagtcatgctgttt 42886757  T
Q  386 ggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  42886758 ggcaagtttgaatttaccccattcagaggtaacacaattgttggagttggaaggt 42886812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 118 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 47657337 - 47657220
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcag 217  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| || ||| |  || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||     
T  47657337 ttccagctacaacaattgtctt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacggcaggactccaatgttcgaccgacattcccattgttcctgtcaa 47657239  T
Q  218 aatattaaattcttgttag 236  Q
    || |||||||| |||||||    
T  47657238 aaaattaaatttttgttag 47657220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 44560165 - 44560045
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| |  || | ||||||| ||||||||||||||||| |||||   |    
T  44560165 accttccagctacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctccaatattcgaccgacattcccattgttcttgt 44560067  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttag 236  Q
    || || ||||||||||||||||    
T  44560066 caaaagattaaattcttgttag 44560045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 247 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 49571808 - 49571755
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaata 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49571808 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttcaata 49571755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 244 - 300
Target Start/End: Original strand, 241942 - 241998
Alignment:
Q  244 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaata 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  241942 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtgcattctttgacacttgaata 241998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 244 - 300
Target Start/End: Original strand, 51427697 - 51427753
Alignment:
Q  244 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaata 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  51427697 ttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaata 51427753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Original strand, 14330198 - 14330293
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || || |   ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  14330198 ttgaataccattattcaagatgcttatcgaatgctggagtcttaccgtttaacaagtttgaattacctcattcaaaggaagacaattgttacagtt 14330293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 22437610 - 22437555
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  22437610 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 22437555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Original strand, 31824198 - 31824253
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  31824198 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 31824253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Original strand, 49791444 - 49791499
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  49791444 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 49791499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 176
Target Start/End: Original strand, 40353332 - 40353497
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    ||||||||||   ||||||||||| ||||||| || || |||||  | | |||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||| |||||||| ||     
T  40353332 ttgaataccagtgttcaagaggcttatcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaatttccccatccagggtaagacaatttttgcagttgga- 40353430  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaaca 176  Q
       ||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| || |||||    
T  40353431 --atgtgcattccaaccacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaaca 40353497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 388 - 434
Target Start/End: Original strand, 44559893 - 44559939
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttgga 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44559893 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgcagttgga 44559939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 885406 - 885318
Alignment:
Q  59 aacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatg 150  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||| |||| ||    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  885406 aacaagtttgaattgctccatccagagtaagacaattgttgtagttggaa---tgtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatg 885318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Original strand, 9489900 - 9489965
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  9489900 ttccaactgcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggactc 9489965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 575 - 664
Target Start/End: Original strand, 21412647 - 21412736
Alignment:
Q  575 tcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||| |||||||||||||  ||| | ||||||| |||||||| || || | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  21412647 tcgtcgttcgttaattccatccaactaaatgatattctcccctcgttgaacattggacgtttataccggacgtattccaccctccttgtg 21412736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Original strand, 39589151 - 39589216
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  39589151 ttccaacttcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggactc 39589216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Original strand, 6176830 - 6176882
Alignment:
Q  250 gatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  6176830 gatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 6176882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Original strand, 21016692 - 21016744
Alignment:
Q  250 gatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  21016692 gatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 21016744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 244 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 42886981 - 42886913
Alignment:
Q  244 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaa 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||| |||||| |||||||||    
T  42886981 ttaaatgatggtattcaagtgtcagaagaatgaggtgcatttcttaacacttgaataccatcatttaaa 42886913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 49791458 - 49791358
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaa-ttaccccattcag-aggaagacaattgttgcagttag 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||  |||| | |||||||| ||||||    
T  49791458 ttgaataccatcattcaagatgctcatcggatgctggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccattcagtgggaatataattgttggagttag 49791359  T
Q  107 a 107  Q
    |    
T  49791358 a 49791358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Original strand, 956963 - 957018
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  956963 aatgatgatattcaagtgtcaaaagaatgatgtgcattccttgacacttcaatacc 957018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Original strand, 6282013 - 6282068
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  6282013 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcattgacacttgaatacc 6282068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Original strand, 14330151 - 14330206
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  14330151 aatgatggtattcaagtgtcaaaataatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 14330206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 382 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 20901394 - 20901339
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaa 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20901394 gtttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 20901339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 21712226 - 21712171
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  21712226 aatgacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 21712171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 414 - 558
Target Start/End: Original strand, 23124490 - 23124630
Alignment:
Q  414 aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaa 513  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    |||||| |||||||| || |||| |||||| ||||||| | ||||  ||||||| |   |||||||||||    
T  23124490 aagacaattgttgtagttgaaaggtg----cattccctacctaatcacaatcttctggcgaaatcaaattgttgagaatatctttaagcgatctcagcaa 23124585  T
Q  514 catcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaa 558  Q
    | | ||   |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  23124586 cgtgacaaacatatcgatccacgagaacatgttgtgctaccaaaa 23124630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 27760024 - 27759969
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  27760024 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacatttgaatacc 27759969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 32937416 - 32937353
Alignment:
Q  287 ttgacacttcaataccttcatttaaatcg-gcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaa 349  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  32937416 ttgacacttcaataccctcatttaaaccgagcctaacaagaatttaatattttgaaaggaacaa 32937353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Original strand, 38132630 - 38132685
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  38132630 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgatgtgcattccttgacacttgaatacc 38132685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 49817458 - 49817304
Alignment:
Q  287 ttgacacttcaataccttcatttaaa-tcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtc-ggtcgaatattggagacctcccgtt 384  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||  || ||||||||||||||||| |||| ||  |||||||| ||||   | ||||||| |||| || | | | |||    
T  49817458 ttgacacttgaataccatcatttaatctcagcctaacaagaatttaaactttcgaatggaacaat-agaaacactggtcgaacattgtagtcatgctgtt 49817360  T
Q  385 tggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  49817359 tggcaagtttgaatttaccccattcaggggtaagacaattgttgtagttggaaggt 49817304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 1043439 - 1043389
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  1043439 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 1043389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 104
Target Start/End: Original strand, 21017092 - 21017158
Alignment:
Q  38 aatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  21017092 aatgctcgagtcctgttgtttgacaagtttgaattacctcattcaaaggaagacaattgttgtagtt 21017158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 301
Target Start/End: Original strand, 36776027 - 36776081
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatac 301  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  36776027 aatgatggtgttcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattctttgacacttcaatac 36776081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 182
Target Start/End: Original strand, 38132727 - 38132848
Alignment:
Q  59 aacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaat 157  Q
    |||||||||||||| |||||| || || ||||||| ||||| |||| ||    ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  38132727 aacaagtttgaattgccccatccatagcaagacaactgttgtagttggaa---tgtgcatttcaactacaacaattgtcttacctttgaatggggcaaat 38132823  T
Q  158 tcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||    
T  38132824 tcaaacttgccaaacaacatgactc 38132848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 302
Target Start/End: Original strand, 40353290 - 40353340
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  40353290 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 40353340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 104
Target Start/End: Original strand, 40353688 - 40353754
Alignment:
Q  38 aatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||| || ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  40353688 aatgctcgagtcctgttgtttgacaggtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagtt 40353754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 45940217 - 45940167
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  45940217 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 45940167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 49095435 - 49095385
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  49095435 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 49095385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 49423280 - 49423182
Alignment:
Q  8 attgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaa-ttaccccattcagagg-aagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||||| | |||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||| |||||    
T  49423280 attgaatatcctcattcaagatgctcatcgcatgctggagtcctgttgtttatcaagtttgaatttaccccattcaggggtaagataattgttacagtt 49423182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 182
Target Start/End: Original strand, 51027374 - 51027495
Alignment:
Q  59 aacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaat 157  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||    ||| |  || || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  51027374 aacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgtagttggaa---tgtgcactctaattacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaat 51027470  T
Q  158 tcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    |||||| ||| || ||||| |||||    
T  51027471 tcaaacttgcaaaacaacaggactc 51027495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 55797035 - 55796969
Alignment:
Q  38 aatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  55797035 aatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaattagcccattcaaaggaagacaattgttgtagtt 55796969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 388 - 466
Target Start/End: Original strand, 4784978 - 4785058
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaa--gacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatct 466  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  4784978 caagtttgaatcaccccattcaaagaaaaagacaattgttgcacttggaagatgcattcatttcgtacctactgatgatct 4785058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 6282027 - 6281930
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaa-ttaccccattcagagg-aagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || || |||| | |||||||||| || |||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  6282027 ttgaataccatcattcaagatgctcatcggatgctggagtcttgctgtttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagataattgttgcagtt 6281930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 98
Target Start/End: Original strand, 6282060 - 6282149
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgtt 98  Q
    |||||||||||  ||||||| || |||||  |||| ||||||||  ||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  6282060 ttgaataccattgttcaagatgcacatcgcgtgctggattcctgccgtttaacaagtttgaattgtctcattcagaggaagacaattgtt 6282149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Original strand, 28082460 - 28082524
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  28082460 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacaggactc 28082524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 43889023 - 43888926
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaa-ttaccccattcagagg-aagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| | || || || |||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  43889023 ttgaataccatctttcaagatgctcatcgcatgttggagtcttgctgtttaacaagtttgaatttaccccatttagaggtaagataattgttgcagtt 43888926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 255 - 308
Target Start/End: Original strand, 49423273 - 49423326
Alignment:
Q  255 tattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatt 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  49423273 tattcaattgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaataccgtcatt 49423326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 885498 - 885450
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaata 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  885498 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaata 885450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 9490172 - 9490124
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaata 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  9490172 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaata 9490124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 295
Target Start/End: Original strand, 14289951 - 14289999
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacactt 295  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  14289951 aatgatggtattcaagtgtcaaaataatgaggtgcattccttgacactt 14289999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 28082925 - 28082877
Alignment:
Q  254 gtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  28082925 gtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 28082877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 37867159 - 37867024
Alignment:
Q  13 ataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaatt-accccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtt 111  Q
    |||||| | ||||||| ||| ||||||| || || ||||| || | | |||||||||||| |||||||  |||| |||| |||| |||||||| ||        
T  37867159 ataccagcgttcaagatgctgatcgaatactggagtcctgctggttagcaagtttgaattgaccccatcaagagtaagagaattattgcagttggaa--- 37867063  T
Q  112 tgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatg 150  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37867062 tgtacattccaactgcaacaattgtcttacctttgaatg 37867024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 47870788 - 47870740
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaata 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  47870788 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaata 47870740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 55797391 - 55797220
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    ||||||||||   ||||||||||| ||||||| || || |||||  | | |  ||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||| ||     
T  55797391 ttgaataccagtgttcaagaggcttatcgaatactggagtcctgccgattagtaagtttgaattgccccatccagggtaagacaattgttgcagttggaa 55797292  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
       |||   ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  55797291 ---tgtgaattccaaccacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactc 55797220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 2773708 - 2773653
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  2773708 aatgttggtattcaactgtaaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 2773653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 382 - 435
Target Start/End: Original strand, 39589416 - 39589471
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaa 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  39589416 gtttggcaagtttgaattgaccccattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaa 39589471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Original strand, 46816035 - 46816090
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  46816035 aatgacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccatgacacttgaatacc 46816090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 162
Target Start/End: Original strand, 1042966 - 1043016
Alignment:
Q  113 gtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaa 162  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1042966 gtacattccaactgcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaa 1043016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 99
Target Start/End: Original strand, 44560115 - 44560153
Alignment:
Q  61 caagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttg 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44560115 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttg 44560153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 388 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 49571709 - 49571671
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttg 426  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49571709 caagtttgaattacctcattcaaaggaagacaattgttg 49571671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 382 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 51427911 - 51427853
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  51427911 gtttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttgtagttgggaggt 51427853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 362 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 56139532 - 56139450
Alignment:
Q  362 tcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    |||||| |||||| ||| ||| ||  |||||||||||| |||||| || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  56139532 tcgaatgttggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 56139450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 56139600 - 56139550
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  56139600 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattctttgacacttgaatacc 56139550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Original strand, 22437596 - 22437693
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaa-ttaccccattcagagg-aagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || ||||| |||| | |||||||||| || | |||||||| || |||| |||||||||||||    
T  22437596 ttgaataccatcattcaagatgctcatcggaggctggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgctccattcagtggtaagataattgttgcagtt 22437693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 148
Target Start/End: Original strand, 31324392 - 31324425
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31324392 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 31324425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 34152809 - 34152712
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaa-ttaccccattc-agaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| || || || |||| | |||||||||| ||||||||||| || | |||| |||||||||||||    
T  34152809 ttgaataccatcattcaagatgttcatcgcatgctggagtcatgctgtttagcaagtttgaatttaccccattcaagggtaagataattgttgcagtt 34152712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 388 - 441
Target Start/End: Original strand, 51027376 - 51027429
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgca 441  Q
    |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  51027376 caagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgtagttggaatgtgca 51027429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 388 - 432
Target Start/End: Original strand, 242044 - 242088
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttg 432  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  242044 caagtttgaattacccaattcaaaggaagacagttgttgcagttg 242088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 388 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 885404 - 885348
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    |||||||||||| | |||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  885404 caagtttgaattgctccatccagagtaagacaattgttgtagttggaatgtgcattc 885348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 21017162 - 21017099
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  21017162 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 21017099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 382 - 440
Target Start/End: Original strand, 24607216 - 24607276
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgc 440  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  24607216 gtttggcaagtttgaatttacctcattcaaaggtaagataattgttttagttggaaggtgc 24607276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 25763248 - 25763077
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||| | | ||||||| ||| |||||||||| || || ||  | | |||||||||||||| ||| || ||||| | || ||||||||||||| |      
T  25763248 ttgaatacgagcgttcaagacgcttatcgaatgctggagtcatgccgattaacaagtttgaattgcccaatccagagtaggataattgttgcagttggga 25763149  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
       ||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||| || ||| |||||||||||    
T  25763148 ---tgtgcattccaactccaacaattgtcttaccttcgaatggggtaaagtcaaacttgtcaaacaacaagactc 25763077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 104
Target Start/End: Original strand, 32937839 - 32937883
Alignment:
Q  60 acaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  32937839 acaagtttgaattacctcattcaaaggaagacaattgttgtagtt 32937883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Original strand, 34529307 - 34529359
Alignment:
Q  250 gatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||    
T  34529307 gatggtattcaagtgtcaaaagaatgatgtgcattccttaacacttgaatacc 34529359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 382 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 38132838 - 38132786
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatta-ccccattcaaagg-aagacaattgttgtagttg 432  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38132838 gtttggcaagtttgaatttgccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttg 38132786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 256 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 49064721 - 49064669
Alignment:
Q  256 attcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatt 308  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  49064721 attcaagtgccaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaataccatcatt 49064669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 49817632 - 49817545
Alignment:
Q  112 tgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacatt 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |  ||||||||| |||||| || || ||||||| | ||||| |||||||    
T  49817632 tgtacctttcaactacaacaattgtctt-catttgaatggggtaattcaaacttgccaaacagcaggactccagtattcgatcgacatt 49817545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 51027341 - 51027245
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaa-ttaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||  ||| | || || ||||||| | |||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  51027341 ttgaataccatcattcaagatgctgatcagatgtttgagtcatgttgtttagcaagtttgaatttgccccatccagagtaagacaattgttgtagtt 51027245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 101
Target Start/End: Original strand, 4784926 - 4785020
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattc--agaggaagacaattgttgca 101  Q
    ||||||||||||||| || | | |||||||||| | || || ||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||  |||||||||||||||    
T  4784926 ttgaataccatcatttaaaatgttcatcgaatgttggagtcatgtcgtttaacaagtttgaatcaccccattcaaagaaaaagacaattgttgca 4785020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #166
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 382 - 435
Target Start/End: Original strand, 21712018 - 21712073
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaa 435  Q
    |||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21712018 gtttggcacgtttgaatttacctcattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 21712073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #167
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 163
Target Start/End: Original strand, 24606968 - 24607018
Alignment:
Q  112 tgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaac 163  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  24606968 tgtacattccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgaggtaattcaaac 24607018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #168
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 382 - 435
Target Start/End: Original strand, 27759816 - 27759871
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaa 435  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  27759816 gtttggccagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgctgtagttggaa 27759871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #169
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 37867007 - 37866885
Alignment:
Q  59 aacaagtttgaatt-accccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaa 156  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||| |||| |||| |||||||| ||    ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||    
T  37867007 aacaagtttgaattgaccccatcaagagtaagagaattattgcagttggaa---tgtgcattccaactgcaacaattgtcttacctttgaatggggtcaa 37866911  T
Q  157 ttcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    ||||||| || ||| ||||| |||||    
T  37866910 ttcaaacttgtcaaacaacaggactc 37866885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #170
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 382 - 435
Target Start/End: Original strand, 37866895 - 37866950
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaa 435  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  37866895 gtttgacaagtttgaattgaccccattcaaaggtaagacaattgttgcagttggaa 37866950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #171
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 388 - 443
Target Start/End: Original strand, 38132729 - 38132784
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcatt 443  Q
    |||||||||||| |||||| || || ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  38132729 caagtttgaattgccccatccatagcaagacaactgttgtagttggaatgtgcatt 38132784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #172
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 99
Target Start/End: Original strand, 47657289 - 47657328
Alignment:
Q  60 acaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttg 99  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  47657289 acaagtttgaattacctcattcaaaggaagacaattgttg 47657328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #173
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 104
Target Start/End: Original strand, 49817579 - 49817622
Alignment:
Q  61 caagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  49817579 caagtttgaattaccccattcaaatgaagacaattgttgtagtt 49817622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #174
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 382 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 51027295 - 51027232
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatta-ccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| || || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51027295 gtttagcaagtttgaatttgccccatccagagtaagacaattgttgtagttggaaggtacattc 51027232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #175
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 362 - 444
Target Start/End: Original strand, 6176900 - 6176982
Alignment:
Q  362 tcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    ||||||| ||||| ||| ||| ||  |||||||||||| |||||| ||  | ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  6176900 tcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 6176982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #176
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 104
Target Start/End: Original strand, 6177230 - 6177296
Alignment:
Q  38 aatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||    
T  6177230 aatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaattacctcattcaaaggaatacaaatgttgtagtt 6177296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #177
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 61 - 99
Target Start/End: Original strand, 6282258 - 6282296
Alignment:
Q  61 caagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttg 99  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6282258 caagcttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttg 6282296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #178
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 390 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 14330405 - 14330355
Alignment:
Q  390 agtttgaattaccc-cattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14330405 agtttgaattaacctcattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaaggt 14330355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #179
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 59 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 18412866 - 18412820
Alignment:
Q  59 aacaagtttgaattacccca-ttcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  18412866 aacaagtttgaattaccccatttcagagtaagacaattgttgtagtt 18412820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #180
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 362 - 444
Target Start/End: Original strand, 21016762 - 21016844
Alignment:
Q  362 tcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    ||||||| ||||| ||| ||| ||  |||||||||||| |||||| ||  | ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  21016762 tcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 21016844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #181
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 62 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 24607020 - 24606978
Alignment:
Q  62 aagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  24607020 aagtttgaattacctcattcaaaggaagacaattgttgtagtt 24606978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #182
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 119 - 176
Target Start/End: Original strand, 32937590 - 32937648
Alignment:
Q  119 tccaactacaacaattgtcttacctttgaatga-gtaaattcaaacatgccaagcaaca 176  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||| |||||| |||||    
T  32937590 tccaactacaacaattatcttaccgttgaatgaggcaaattcaaacttgccaaacaaca 32937648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #183
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 287 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 32937740 - 32937686
Alignment:
Q  287 ttgacacttcaataccttcatttaaatcg-gcctaacaagaatttaatcttttga 340  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  32937740 ttgacacttaaataccatcatttaaacccagcctaacaagaatttaatcttttga 32937686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #184
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 112 - 185
Target Start/End: Original strand, 36775934 - 36776008
Alignment:
Q  112 tgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatga-gtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaa 185  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||| ||| || || || ||||||||    
T  36775934 tgtaccttccaactgcaacaattatcttacccttgaatgaggcaaattcaaacttgctaaacagcaggactccaa 36776008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #185
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 48 - 104
Target Start/End: Original strand, 37866888 - 37866946
Alignment:
Q  48 tcctgttgttcaacaagtttgaatt-accccattcagagg-aagacaattgttgcagtt 104  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  37866888 tcctgttgtttgacaagtttgaattgaccccattcaaaggtaagacaattgttgcagtt 37866946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #186
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 104
Target Start/End: Original strand, 41794477 - 41794543
Alignment:
Q  38 aatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||    
T  41794477 aatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaattacctcattcaaaggaatacaaatgttgtagtt 41794543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #187
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 382 - 438
Target Start/End: Original strand, 49064468 - 49064526
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    |||||||||||||||||| | | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  49064468 gtttggcaagtttgaatttatctcattcaaaggtaacacaattgttgtagttggaaggt 49064526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #188
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 49095037 - 49094971
Alignment:
Q  38 aatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||    
T  49095037 aatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaattacctcattcaaaggaatacaaatgttgtagtt 49094971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #189
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 362 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 49095367 - 49095285
Alignment:
Q  362 tcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    ||||||| ||||| ||| ||| ||  |||||||||||| |||||| ||  | ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  49095367 tcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 49095285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #190
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 272 - 338
Target Start/End: Original strand, 51027586 - 51027651
Alignment:
Q  272 aatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatctttt 338  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||    
T  51027586 aatgaggttcattctttggcactt-aataccttcatctaaaccagcataacaagaatttaatctttt 51027651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #191
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 56139202 - 56139136
Alignment:
Q  38 aatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||    
T  56139202 aatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaattacctcattcaaaggaatacaaatgttgtagtt 56139136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #192
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 3393843 - 3393810
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 148  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3393843 accttcaaactacaacaattgtcttacctttgaa 3393810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #193
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 141
Target Start/End: Original strand, 20901123 - 20901152
Alignment:
Q  112 tgtaccttccaactacaacaattgtcttac 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20901123 tgtaccttccaactacaacaattgtcttac 20901152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #194
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Original strand, 21170135 - 21170232
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaa-ttaccccattc-agaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||| ||||| || ||||| |||| | |||||||||| || |||||||| || | |||| |||||||||||||    
T  21170135 ttgaataccatcatttaaaatgctcatcgcatgctggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgccccattcaagggtaagataattgttgcagtt 21170232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #195
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 32937887 - 32937843
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaac 163  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  32937887 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgaggtaattcaaac 32937843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #196
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 184
Target Start/End: Original strand, 34152702 - 34152775
Alignment:
Q  112 tgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactcca 184  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||| ||| || || || |||||||    
T  34152702 tgtaccttccaactgcaacaattatcttacccttgaatggggtaaattcaaacttgctaaacagcatgactcca 34152775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #197
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Original strand, 43889012 - 43889057
Alignment:
Q  250 gatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacactt 295  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  43889012 gatggtattcaagtgtcaaaagaatgagatgcattccttggcactt 43889057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #198
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Original strand, 45940208 - 45940305
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaa-ttaccccattcagagg-aagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||||||| | ||||||| ||| ||||||| ||||| ||||| || | | |||||||||| || |||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  45940208 ttgaataccagcgttcaagatgctgatcgaatactagagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagataattgttgcagtt 45940305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #199
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 141
Target Start/End: Original strand, 51027235 - 51027264
Alignment:
Q  112 tgtaccttccaactacaacaattgtcttac 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51027235 tgtaccttccaactacaacaattgtcttac 51027264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #200
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 362 - 440
Target Start/End: Original strand, 885515 - 885595
Alignment:
Q  362 tcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaatta-ccccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgc 440  Q
    ||||||||||||| ||| | | || |||||||||||||  ||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  885515 tcgaatattggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccatttagaggcaaggcaattgttgtagttggaaggtgc 885595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #201
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 414 - 442
Target Start/End: Original strand, 1226898 - 1226926
Alignment:
Q  414 aagacaattgttgtagttggaaggtgcat 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1226898 aagacaattgttgtagttggaaggtgcat 1226926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #202
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 59 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 11288564 - 11288528
Alignment:
Q  59 aacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaatt 95  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  11288564 aacaagtttgaattacctcattcaaaggaagacaatt 11288528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #203
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 287 - 350
Target Start/End: Original strand, 17211656 - 17211720
Alignment:
Q  287 ttgacacttcaataccttcatttaaatc-ggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaat 350  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||    
T  17211656 ttgacacttgaataccatcatttaaatcaagcctaacaataattaaatcttttgaatggaacaat 17211720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #204
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 369 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 20901196 - 20901120
Alignment:
Q  369 ttggagacctcccgtttggcaagtttgaatta-ccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    |||||| ||| | |||| |||||||||||||  ||||||  | || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20901196 ttggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgccccatctagagtaagacaattgttgtagttggaaggtacattc 20901120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #205
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 124 - 236
Target Start/End: Original strand, 22437142 - 22437253
Alignment:
Q  124 ctacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcagaatatt 223  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  ||||||||| |||||| |  || | ||||||| |||||||| |||||||| |||||   ||| || |||    
T  22437142 ctacaacaattgtctt-ccttcaaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaggtctccaatattcgaccggcattcccattgttcttgtcaaaagatt 22437240  T
Q  224 aaattcttgttag 236  Q
    |||||||||||||    
T  22437241 aaattcttgttag 22437253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #206
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 362 - 444
Target Start/End: Original strand, 37867202 - 37867286
Alignment:
Q  362 tcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaatta-ccccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    ||||||| ||||| ||| | |||| |||||||||||||  |||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  37867202 tcgaatactggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgccccattcaatggtaagataattgttgcagttggaaggtacattc 37867286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #207
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 40353758 - 40353695
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  40353758 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacctgtcaaacaacaggactc 40353695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #208
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 362 - 428
Target Start/End: Original strand, 42886990 - 42887058
Alignment:
Q  362 tcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-aagacaattgttgta 428  Q
    ||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  42886990 tcgaatattggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccattcagaggtaagataattgttgta 42887058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #209
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 163
Target Start/End: Original strand, 49064581 - 49064628
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaac 163  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  49064581 accttccaactgcaacaattgtctt-cctttgaatgaggtaattcaaac 49064628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #210
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Original strand, 55796965 - 55797028
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  55796965 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgggctaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 55797028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 453; Significance: 0; HSPs: 103)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 453; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 664
Target Start/End: Original strand, 32027181 - 32027837
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||  ||    
T  32027181 ttgaataccatcattcgaaatgctcatcgaatgctggattcctgccgtttaacaagtttgaattaccccattcaaaggaagacagttgttgcacttgaac 32027280  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  32027281 gtttgtaccttccaactacaacaattatgttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgtcaagcaacatgactccaatgttcgaccgacattcccatag 32027380  T
Q  208 ttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcat 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  32027381 ttccattcaaaatattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggttcattcattggcacttcaataccttcat 32027480  T
Q  308 ttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccatt 407  Q
    || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  32027481 tttaactggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgggaatgccggtcgaacattggagtcctgccgtttggcatgtttgaattaccccatt 32027580  T
Q  408 caaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatct 507  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32027581 caaaggaagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatct 32027680  T
Q  508 cagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgat 607  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32027681 cagcaacgtcacccgcatatcaatccactagaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcattcgttaattccacccaagtgaatgat 32027780  T
Q  608 actctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32027781 actctcccctcgtcgaatgttggacgtttataccgaacgtgttcaaccctccttgtg 32027837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 433; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 664
Target Start/End: Original strand, 32037240 - 32037896
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||  ||    
T  32037240 ttgaataccatcattcgaaatgctcatcgaatgctggattcctgccgtttaacaagtttgaattaccccattcaaaggaagacagttgttgcacttgaac 32037339  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  32037340 gtttgtaccttccaactacaacaattatgttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgtcaagcaacatgactccaatgttcgaccgacattcccatag 32037439  T
Q  208 ttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcat 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  32037440 ttccattcaaaatattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggttcattcattggcacttcaataccttcat 32037539  T
Q  308 ttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccatt 407  Q
    || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  32037540 tttaactggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgggaatgccggtcgaacattggagtcctgccgtttggcatgtttgaattaccccatt 32037639  T
Q  408 caaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatct 507  Q
    |||||||||||||||||||||| |  || ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32037640 caaaggaagacaattgttgtagctttaatgtgcatttattccttacctaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatct 32037739  T
Q  508 cagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgat 607  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32037740 cagcaacgtcacccgcatatcaatccactagaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcattcgttaattccacccaagtgaatgat 32037839  T
Q  608 actctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32037840 actctcccctcgtcgaatgttggacgtttataccgaacgtgttcaaccctccttgtg 32037896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 12397432 - 12396779
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    ||||||| |||  ||||||| || ||||  ||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||     
T  12397432 ttgaatatcattgttcaagatgcacatcacatgctggatttctgtagtttaacaagtttgaattaccccatttagaggaagataattgttgcagttggat 12397333  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatg 207  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  12397332 gtttgtacctcccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatattcgaccggcattcccaatg 12397233  T
Q  208 ttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcat 307  Q
     |||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12397232 atccattcaaaagattaaattcttgttaggctgggattaaataacggtattcaaatgtcaaaagaatgatgtccattcgttgacacttcaataccttcat 12397133  T
Q  308 ttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccatt 407  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  12397132 ttaaaccagcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgggaatgtcggtcgaatattggagacctgccgtttgacaagtttgaattacctcatt 12397033  T
Q  408 caaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatct 507  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||    
T  12397032 caaaggaagacaattgttgtagctaaaaggtgcattcattctgtacctaatgacgatcttttggcggaatcaagttgttgatgatatcttcagtagatct 12396933  T
Q  508 cagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgat 607  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  12396932 cagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcgttcgttaattccacccaattgaatgat 12396833  T
Q  608 actctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctcctt 661  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12396832 actctcccctcgtcgagtgttagacgtttataccgaacgtgctccaccctcctt 12396779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 13403045 - 13402533
Alignment:
Q  152 gtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatga 251  Q
    |||||||||||| || |||||| || ||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||  || |||||||| |    
T  13403045 gtaaattcaaacttgtcaagcagcaggactccaatattcgaccaacattctcaatgttctattcaaaagattaaattcttgttaggctgtgattaaataa 13402946  T
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatg 351  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13402945 tggtattcaaatgtcaaaataatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaaccggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatg 13402846  T
Q  352 agaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgt 451  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13402845 ggaatgccggtcgaaaattggagacctgtcgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattccgt 13402746  T
Q  452 acctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgct 551  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13402745 acctaatgacgatcttctggcggaatcaaatttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgggct 13402646  T
Q  552 cccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttc 651  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  13402645 cccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcgttaattccactcaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacatttatacagaacgtgttc 13402546  T
Q  652 caccctccttgtg 664  Q
    |||||||||||||    
T  13402545 caccctccttgtg 13402533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 502
Target Start/End: Original strand, 35020790 - 35021284
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||||  ||||||| || ||||| ||||| ||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  35020790 ttgaataccattgttcaagatgcacatcgcatgctggattcctgccgtttaacaagtttgaattgccccattctgaggaagacaattgttgcagttggac 35020889  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatg 207  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| || |||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  35020890 gtttgtacctcccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgacaagcagcaggactccaatattcgaccggcattcccaatg 35020989  T
Q  208 ttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcat 307  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35020990 ttccattcaaaagattaaattcttgttaggttgggattaaattacggtattcaaatgtcaaaagaaagaggtccattcgttgacacttcaataccttcat 35021089  T
Q  308 ttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccatt 407  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35021090 ttaaaccagcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgggaatgccggtcgaatattggagacctgccgtttgacaagtttgaattaccccatt 35021189  T
Q  408 caaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagtt 502  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35021190 caaaggaagacaattgttgtagctaaaaggtgcattcattccgtacttaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagtt 35021284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 115 - 605
Target Start/End: Original strand, 30257238 - 30257729
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 213  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| || ||||||||  ||||||     
T  30257238 accttctagctacaacaattgtgttatctttgaatagggtaaattcaaacttgccaagcagcatgactccaatgttcgatcggcattcccatagttccac 30257337  T
Q  214 tcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaat 313  Q
    ||| || |||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  30257338 tcaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgacggtattcaagtgtcaaaaaaatgaggttcattcattgacacttcaataccttcatttaaac 30257437  T
Q  314 cggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaagg 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  30257438 cggcctaacaagaatttaatcttttgaaaggaacaatgggaatgccggtcgaacattggagtcatgccgtttggcaagtttgaattaccccatttagagg 30257537  T
Q  414 aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaa 513  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30257538 aagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattcggtacctaatgacgatcttctagcggaatcaaacttttgatgatatcttcaattgatctcagcaa 30257637  T
Q  514 catcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatg 605  Q
    | |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||    
T  30257638 cgtcacccacatatcgatccactagaacatgatgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttctttaattccacccaactgaatg 30257729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 244 - 664
Target Start/End: Original strand, 34802685 - 34803105
Alignment:
Q  244 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacag 343  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  34802685 ttaaataatggtattcaagtgtcaaatgaatgaggtgcattctttgacacttcaataccttcatttaaaccggcctaacaagaatttaatcttttgacaa 34802784  T
Q  344 gaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcatt 443  Q
     |||||||  |||| |||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||| | |||||    
T  34802785 aaacaatggtaatgccggtcgaacattagagtcctgccgtttggcaagtttgaattaccacattcaaaggaagacaatttttgtagctcgaaagcgcatt 34802884  T
Q  444 cattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacat 543  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  34802885 cattccttacctaatgacgatcttttggcgaaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatttactggaacat 34802984  T
Q  544 gttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccga 643  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34802985 gttgtgctccctgaacatgctcatcacgttttcgtcgttcgttaattccacccaagtcaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccga 34803084  T
Q  644 acgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  34803085 acgtgttccaccctccttgtg 34803105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 109 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 801719 - 801166
Alignment:
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaat-tttcgaccgacattcccaat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  || || | ||| ||||| |   ||||| ||| |||||   ||    
T  801719 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaactggcaaaacgacaggactcaagcatttcgcccggcattc---at 801623  T
Q  207 gtt--ccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacctt 304  Q
    |||  || || | || |  |||||||||||||  | || ||| || | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |    
T  801622 gttttcctttgaaaagaa-aaattcttgttaggcttggtttagataacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcctcgacacttcaataccgt 801524  T
Q  305 catttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaa-tattggagacctc-ccgtttggcaagtttgaattacc 402  Q
    ||| |||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||   ||||| ||  |||| |  | ||| | |  |||||| ||||||||||||||||    
T  801523 catctaaaccagcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcttggccgtttcgcaagtttgaattacc 801424  T
Q  403 ccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagtt 502  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  | | || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  801423 tcattcaaaggaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagtt 801327  T
Q  503 gatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtga 602  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||| || || |||||||    
T  801326 gatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgttctttaactctacccaagtga 801227  T
Q  603 atgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  801226 atgacac-ctcccctcgtcgagctttggacgtttataccaaacgtattccaccctccttgtg 801166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 107 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 4495461 - 4495119
Alignment:
Q  107 acgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaa 205  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| | | ||||||||| ||||||||| || ||||||||| | | || | ||||||||     
T  4495461 acgtttgtaccttcaaactacaacaattgtgttacctctgaatggggtcaattcaaacttgccaagcagcaggactccaatatacaacgg-cattcccat 4495363  T
Q  206 tgttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttc 305  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4495362 agttccattcaaaatattaaattcttgttagatttggtttaaatgacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggttcattccttgacacttcaataccttc 4495263  T
Q  306 atttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttg-acaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattacccc 404  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||| || ||||||||||||    
T  4495262 atttaaaccggcctaacaagaatttaatcttttgaaaaggaacaatggaaatgtcggtcgaacattggagtccaaccgtttggccagattgaattacccc 4495163  T
Q  405 attcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattc 448  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4495162 attcaaaggaagacaattgttgtagctggaaggtgcattcattc 4495119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 382 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 11692730 - 11692451
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaa 481  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||  | | || || |||||||||||||  |||||||||||||    
T  11692730 gtttgacaagtttgaattacctcattcaaaggaatacaaatgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaa 11692634  T
Q  482 cttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcat 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |    
T  11692633 cttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgcttccaaaacatgttcgtcacgttttcgtcgt 11692534  T
Q  582 tcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  11692533 tcgttaattccacccaactgaatgatactctccccttgtcgagtgttggacgtttataccaaatgtgttccaccatccttgtg 11692451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 384 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 14115313 - 14115037
Alignment:
Q  384 ttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaact 483  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    | |||||||| || |||| ||||| |||||| |||    
T  14115313 ttggcaagtttgaattaccctatttaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc----cctacctaatcactatcttctggcagaatcagact 14115218  T
Q  484 tttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattc 583  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||    
T  14115217 cttgatgatatcttcagttgatctcaacaacgttacccgcatattgatccactggaacatgttgtgctcccagaacatgctcgtcacgttttcgtcgttc 14115118  T
Q  584 gttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
     ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  14115117 tttacttccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttatactgaacgttttgcaccctccttgtg 14115037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 382 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 27640459 - 27640180
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaa 481  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  | | || || |||||||||||||  |||||||||||||    
T  27640459 gtttgacaagtttgaattacctcattcaaaggaagacaaatgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaa 27640363  T
Q  482 cttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcat 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |    
T  27640362 cttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgcttccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgt 27640263  T
Q  582 tcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  27640262 tcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaaatgtgttccaccatccttgtg 27640180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 382 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 6205763 - 6205484
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaa 481  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||  | | || || |||||||||||||  |||||||||||||    
T  6205763 gtttgacaagtttgaattacctcattcaaaggaatacaaatgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttgtggcggaatcaaa 6205667  T
Q  482 cttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcat 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |    
T  6205666 cttttgatgatatcttcagttgatctaagcaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcccaaaacatggtcgtcacgttttcgtcgt 6205567  T
Q  582 tcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  6205566 tcgttaattccacccaactgaatgatactctcccctcgtcgagtgttggacgtttataccaaatgtgttccaccatccttgtg 6205484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 454 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 29066763 - 29066553
Alignment:
Q  454 ctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29066763 ctaatgacgatctactggcggaatcaagttgttgatcatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcc 29066664  T
Q  554 caaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttcca 653  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29066663 caaaacatgctcttcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaaggtgttcca 29066564  T
Q  654 ccctccttgtg 664  Q
    |||||||||||    
T  29066563 ccctccttgtg 29066553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 454 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 29075776 - 29075566
Alignment:
Q  454 ctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 553  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29075776 ctaatgacgatctgctggcggaatcaagttgttgatcatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcc 29075677  T
Q  554 caaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttcca 653  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29075676 caaaacatgctcttcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaaggtgttcca 29075577  T
Q  654 ccctccttgtg 664  Q
    |||||||||||    
T  29075576 ccctccttgtg 29075566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 248 - 652
Target Start/End: Original strand, 35058528 - 35058932
Alignment:
Q  248 atgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaac 347  Q
    |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||| | |||||     
T  35058528 atgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aataccttcatctaaaccagcataacaagaatttaatcttttcaaaggaaa 35058626  T
Q  348 aatgagaatgtcggtcgaa-tattggagacctc-ccgtttggcaagtttgaattaccccattcaa-agg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcatt 443  Q
    ||   ||||||||  |||| |  | ||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||  | ||| |||||||||||||||||||||| || | ||    
T  35058627 aacatgaatgtcgagcgaaatgctagagccctggccgtttggcaagtttgaattacccaatttgagaggtaagacaattgttgtagttggaatgtacctt 35058726  T
Q  444 cattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacat 543  Q
        || || ||||||||||||| || | ||||| ||  | ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  35058727 a---ccctaactaatgacgatcttcttgtggaattaagatgttgatgatatctttagttgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactggaacat 35058823  T
Q  544 gttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccga 643  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  35058824 gttgtgctcccaaaacatgctcgtaacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataacga 35058923  T
Q  644 acgtgttcc 652  Q
    |||| ||||    
T  35058924 acgtattcc 35058932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 454 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 29110748 - 29110537
Alignment:
Q  454 ctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 553  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29110748 ctaatgacgatctgctggcggaatcaagttgttgatcatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcc 29110649  T
Q  554 caaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttcca 653  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29110648 caaaacatgctcttcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccgaaggtgttcca 29110549  T
Q  654 ccc-tccttgtg 664  Q
    ||| ||||||||    
T  29110548 cccatccttgtg 29110537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 13403471 - 13403198
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||  |||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||    
T  13403471 ttgaataccaacattcaagacgctcatcgaatactgaatttttgtcgtttaacaagtttgaattaccccattcagagaaagacgattgttgcaattggac 13403372  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatg 207  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||| || ||||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  13403371 atttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgtcaagcagcaggactccaatattcgaccagcattctcaatg 13403272  T
Q  208 ttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtcc 281  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13403271 ttctattcaaaagattaaattcttgttaggctgtgattaaataatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtcc 13403198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 454 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 29108350 - 29108140
Alignment:
Q  454 ctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcc 553  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29108350 ctaatgacgatcttctggcggaatcaagttgttgatcatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgctgtgctcc 29108251  T
Q  554 caaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttcca 653  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  29108250 caaaacatgctcttcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaagtgaatgaaactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccacaggtgttcca 29108151  T
Q  654 ccctccttgtg 664  Q
    |||||||||||    
T  29108150 ccctccttgtg 29108140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 480 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 22305980 - 22305796
Alignment:
Q  480 aacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtc 579  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  22305980 aacttttgatgatatcttcagttgatctaaccaacttcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatggtcgtgacgttttcgtc 22305881  T
Q  580 attcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22305880 gttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgtcgagcgttggacgtttataccaaacgtgttccaccatccttgtg 22305796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 59 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 14123204 - 14122904
Alignment:
Q  59 aacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaat 157  Q
    ||||||||| |||| |||||| || || ||||||||||||| ||||  |    ||| | |||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||    
T  14123204 aacaagtttaaattgccccatccatagtaagacaattgttgtagttgaaa---tgtgcattccaactacaaaaattgtcttacctttaaatggggtaaat 14123108  T
Q  158 tcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtat 257  Q
    |||||| || |||||| |||||||||| | | || ||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||  |  | ||||||||||||||    
T  14123107 tcaaacttggcaagcagcaagactccagtatccgtccggcattcccattgttccattcaaaagattaaattcatgttaggctttgtttaaatgatggtat 14123008  T
Q  258 tcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatg 357  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  14123007 tcaagtgtcaaaagaataaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaacaagcctaacaaaaatttaatcttttgaaaggaacaatgggaatg 14122908  T
Q  358 tcgg 361  Q
    ||||    
T  14122907 tcgg 14122904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 124 - 438
Target Start/End: Original strand, 12397011 - 12397326
Alignment:
Q  124 ctacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcagaatatt 223  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| || ||| |  || | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||| || |||    
T  12397011 ctacaacaattgtctt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacggcaggtctccaatattcgaccgacattcccattgttcctgtcaaaagatt 12397109  T
Q  224 aaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt-gacacttcaataccttcatttaaatcg-gcctaa 321  Q
    |||||||||||||  |||  |||||||| |||||| || ||||||  |||||     ||||| || |||| || |||||| | ||||||  |  ||||||    
T  12397110 aaattcttgttaggctggt-ttaaatgaaggtattgaagtgtcaac-gaatggacatcattcttttgacatttgaataccgttatttaatcccagcctaa 12397207  T
Q  322 caagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-aagaca 419  Q
    |||||||||||||||||||  ||| || || ||||| |||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  12397208 caagaatttaatcttttgaatggatcattgggaatgccggtcgaatattggagtcctgctgcttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagaca 12397307  T
Q  420 attgttgtagttggaaggt 438  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  12397308 attgttgtagttgggaggt 12397326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 206 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 23911207 - 23911074
Alignment:
Q  206 tgttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttc 305  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||  | || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23911207 tgttccattcaaaagattaaattcttgttaggcttggtttaaatgatggtatt-aagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttcaataccttc 23911109  T
Q  306 atttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttga 340  Q
    || |||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  23911108 atctaaaccaacctaacaagaatttaatcttttga 23911074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 382 - 526
Target Start/End: Original strand, 24021027 - 24021168
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaa 481  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  | | || || ||||||||||| |  |||||||||||||    
T  24021027 gtttgacaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaa--tgca-ccttaccctaactaatgacgattttatggcggaatcaaa 24021123  T
Q  482 cttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcata 526  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  24021124 cttttgatgatatcttaagttgatctaagcaacttcacccgcata 24021168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 152 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 13403186 - 13403057
Alignment:
Q  152 gtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatga 251  Q
    |||||||||||| || |||||| || ||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||  || |||||||| |    
T  13403186 gtaaattcaaacttgtcaagcagcaggactccaatattcgaccaacattctcaatgttctattcaaaagattaaattcttgttaggctgtgattaaataa 13403087  T
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtcc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13403086 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtcc 13403057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 388 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 2192670 - 2192535
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttg 487  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  | | || || ||||||||||| |  ||||||||||||| |||||    
T  2192670 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaa--tgca-ccttaccctaactaatgacgattttatggcggaatcaaaattttg 2192574  T
Q  488 atgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcata 526  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  2192573 atgatatcttaagttgatctaagcaacttcacccgcata 2192535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 115 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 30257562 - 30257228
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| | |||| |  ||||||||| |||||| |  || ||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||    
T  30257562 accttccagctacaacaattgtctt-cctctaaatggggtaattcaaacttgccaaacggcatgactccaatgttcgaccggcattcccattgttccttt 30257464  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt-gacacttcaataccttcatttaaat 313  Q
    || || ||||||||||||||||   ||  |||||||| |||||| || ||||||  ||||||    ||||  || ||||||| |||||| |||||||||     
T  30257463 caaaagattaaattcttgttaggccggt-ttaaatgaaggtattgaagtgtcaat-gaatgaacctcatttttttgacacttgaataccgtcatttaaac 30257366  T
Q  314 cgg-cctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaa 411  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || ||||| ||||||| | | | | |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  30257365 caaacctaacaagaatttaatcttttgagtggaactatgggaatgccgatcgaacattggagtcatgctgcttggcaagtttgaatttaccctattcaaa 30257266  T
Q  412 g-gaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattc 448  Q
    |  || ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  30257265 gataacacaattgttgtagctagaaggtgcattcattc 30257228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 115 - 413
Target Start/End: Original strand, 13402759 - 13403057
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| | ||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||  |    
T  13402759 accttccagctacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgacaggtctccaattttcgaccggcattcccattgttcctgt 13402857  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaat-gaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaa-a 312  Q
    || || ||||||||||||||||    || |||||||| |||||| || |||| || |||| ||  ||  |   |||||| || |||||| | ||||||      
T  13402858 caaaagattaaattcttgttag-gccggtttaaatgaaggtattgaagtgtc-aaggaatggacctcattattttgacatttgaataccattatttaatc 13402955  T
Q  313 tcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaa 411  Q
     | |||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | | ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  13402956 acagcctaacaagaatttaatcttttgaatagaacattgagaatgttggtcgaatattggagtcctgctgcttgacaagtttgaatttaccccattcaaa 13403055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 316 - 438
Target Start/End: Original strand, 13403241 - 13403365
Alignment:
Q  316 gcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg- 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||| | | ||| |||||||||| ||||||||||||||||     
T  13403241 gcctaacaagaatttaatcttttgaatagaacattgagaatgctggtcgaatattggagtcctgctgcttgacaagtttgaatttaccccattcaaaggt 13403340  T
Q  414 aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  13403341 aagacaattgttgtagttggaaggt 13403365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 115 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 32027611 - 32027287
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||| |  || ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||  |    
T  32027611 accttccagctacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacatgccaaacggcaggactccaatgttcgaccggcattcccattgttcctgt 32027513  T
Q  215 cagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc-cttgacacttcaataccttcatttaaat 313  Q
    || || ||||||||||||||||     | | |||||| |||||| || || | || ||||||    |||||  ||||||||| |||||| |||||||||     
T  32027512 caaaagattaaattcttgttag-gccagttaaaatgaaggtattgaagtg-ccaatgaatgaacctcattcttttgacacttgaataccgtcatttaaac 32027415  T
Q  314 c-ggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaa 411  Q
    |   ||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||| |||||||||||||| ||||||| | |   | ||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  32027414 caaacctaacaagaatttaatattttgaatggaactatgggaatgtcggtcgaacattggagtcatgttgcttgacaagtttgaatttacctcattcaaa 32027315  T
Q  412 gg-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    || || | ||||||||||||||||||||    
T  32027314 ggtaacataattgttgtagttggaaggt 32027287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 380 - 534
Target Start/End: Original strand, 3765713 - 3765867
Alignment:
Q  380 ccgtttggcaagtttgaattaccccattcaa-agg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaat 477  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| ||||||||  ||||  | | || || ||||||| ||||| |||| |||||    
T  3765713 ccgtttggcaagtttgaattaccccatttgagaggtaagacaattgttgcagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgatgatcttctggtggaat 3765809  T
Q  478 c-aaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatcca 534  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3765810 ttaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacgtcacccgcatatcgatcca 3765867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 317 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 35021019 - 35020896
Alignment:
Q  317 cctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-a 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||| |||||||||||||||| ||| | | ||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  35021019 cctaacaagaatttaatcttttgaatggaacattgggaatgccggtcgaatattggagtcctgctgcttgtcaagtttgaatttaccccattcaaaggta 35020920  T
Q  415 agacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    | ||||||||||||||||| ||||    
T  35020919 acacaattgttgtagttgggaggt 35020896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 124 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 32037661 - 32037346
Alignment:
Q  124 ctacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcagaatatt 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||| |  || ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||  ||| || |||    
T  32037661 ctacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacatgccaaacggcaggactccaatgttcgaccggcattcccattgttcctgtcaaaagatt 32037563  T
Q  224 aaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattc-cttgacacttcaataccttcatttaaatc-ggcctaa 321  Q
    |||||||||||||     | | |||||| |||||| || || | || ||||||    |||||  ||||||||| |||||| ||||||||| |   |||||    
T  32037562 aaattcttgttag-gccagttaaaatgaaggtattgaagtg-ccaatgaatgaacctcattcttttgacacttgaataccgtcatttaaaccaaacctaa 32037465  T
Q  322 caagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-aagaca 419  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||| ||| |||||||||||||| ||||||| | |   | ||| |||||||||| ||||| |||||||||| || | |    
T  32037464 caagaatttaatattttgaatggaactatgggaatgtcggtcgaacattggagtcatgttgcttgacaagtttgaatttacctcattcaaaggtaacata 32037365  T
Q  420 attgttgtagttggaaggt 438  Q
    |||||||||||||||||||    
T  32037364 attgttgtagttggaaggt 32037346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 27640828 - 27640661
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||      |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||     
T  27640828 ttgaataccattattcaagatgctcatcgaatactagagtcctgcct---aacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgcagttgga- 27640733  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
       ||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  27640732 --atgtgcattccaaccacaacaattgtgttacctttgaatgagataattcaaacctgcaaaacaacaggactc 27640661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 6206136 - 6205965
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| || || |||||  | | |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||     
T  6206136 ttgaataccattgtccaagatgctcatcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgcagttgga- 6206038  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
       ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  6206037 --atgtgcattccaactacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactc 6205965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 388 - 466
Target Start/End: Original strand, 30257133 - 30257211
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatct 466  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  30257133 caagtttgaattacctcatttaaagaaagacaattgttgtagtttgaaggtgcattcattccgtacctaccgacgatct 30257211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 206 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 34135102 - 34134799
Alignment:
Q  206 tgttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttc 305  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||   ||||||||||||| |||    
T  34135102 tgttcctttcagaagattaaattcttgtaagtttggt-ttagatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgatgtgtattctgcgacacttcaatacattc 34135004  T
Q  306 atttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattacccca 405  Q
    ||  |||    || ||||| |||||||| || ||| ||||||||| | | | ||||  ||||  | | || ||   |||| ||||||||||||||  |||    
T  34135003 atcaaaa----ccaaacaaaaatttaatattgtgaaaggaacaataaaactttcgggtgaatgcttgggaactgttgtttagcaagtttgaattattcca 34134908  T
Q  406 tt-caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttg 503  Q
    || || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    | |||||||| |||||||  | ||||||||||||| ||||  || ||||||||||    
T  34134907 tttcagaggtaagacaattgttgtagttgaaaggtgcattc----cctacctaatcacgatcttttagcggaatcaaactgttgagaatttcttcagttg 34134812  T
Q  504 atctcagcaacat 516  Q
    ||||| |||||||    
T  34134811 atctctgcaacat 34134799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 316 - 413
Target Start/End: Original strand, 13403100 - 13403198
Alignment:
Q  316 gcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | | ||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  13403100 gcctaacaagaatttaatcttttgaatagaacattgagaatgttggtcgaatattggagtcctgctgcttgacaagtttgaatttaccccattcaaagg 13403198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 244 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 7821291 - 7821227
Alignment:
Q  244 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  7821291 ttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaataccatcatt 7821227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 244 - 308
Target Start/End: Original strand, 32027131 - 32027195
Alignment:
Q  244 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  32027131 ttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaataccatcatt 32027195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 244 - 308
Target Start/End: Original strand, 32037190 - 32037254
Alignment:
Q  244 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatt 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  32037190 ttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaataccatcatt 32037254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 414 - 535
Target Start/End: Original strand, 17465298 - 17465415
Alignment:
Q  414 aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaa 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  |||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  17465298 aagacaattgttgtagttggaaggtgtattc--tc--tacctaatcacgatcttttggcggaatcaaactgttgagaatatcttcagttgatctctgcaa 17465393  T
Q  514 catcacccgcatatcgatccac 535  Q
    | | ||   |||||||||||||    
T  17465394 cgtgacaaacatatcgatccac 17465415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 2192693 - 2192627
Alignment:
Q  38 aatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  2192693 aatgctcgagtcctgttgttcgacaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagtt 2192627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 163
Target Start/End: Original strand, 35058291 - 35058443
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||| || ||  |   |||||||||||||| || ||| ||||| |||||| |||||| |||| ||     
T  35058291 ttgaataccagcattcaagatgcttatcgaatgttagagtcttgccgagtaacaagtttgaattgcctcatccagagtaagacatttgttgtagttggaa 35058390  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaac 163  Q
       ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  35058391 ---tgtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaac 35058443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 438
Target Start/End: Original strand, 4495129 - 4495453
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccatt 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||| |  ||||| |     ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  4495129 accttccagctacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaatctggccaaacggttggactccaatgttcgaccgacatttccattgttccttt 4495227  T
Q  215 -cagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattcctt-gacacttcaataccttcatttaaa 312  Q
     || || ||||||||||||||||   ||  |||||||| |||||| || ||||||  ||||||    ||||| || ||||||| |||||| |||||||||    
T  4495228 tcaaaagattaaattcttgttaggccggt-ttaaatgaaggtattgaagtgtcaag-gaatgaacctcattcttttgacacttgaataccgtcatttaaa 4495325  T
Q  313 tcggc-ctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaatt-accccattcaa 410  Q
     |    |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||| ||||| | || | ||||||||| ||| | | |||||||||||||||| ||||||||||     
T  4495326 ccaaatctaacaagaatttaatattttgaatggaactatgggaatg-ccgttgtatattggagtcctgctgcttggcaagtttgaattgaccccattcag 4495424  T
Q  411 agg-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    ||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  4495425 aggtaacacaattgttgtagtttgaaggt 4495453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 13403518 - 13403463
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  13403518 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 13403463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 435
Target Start/End: Original strand, 14122997 - 14123148
Alignment:
Q  287 ttgacacttcaataccttcatttaaatcg-gcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgttt 385  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||| || ||| ||||| | | | | ||    
T  14122997 ttgacacttgaataccatcatttaaacaaagcctaacatgaatttaatcttttgaatggaacaatgggaatgccggacggatactggagtcttgctgctt 14123096  T
Q  386 ggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaa 435  Q
    | |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  14123097 gccaagtttgaatttaccccatttaaaggtaagacaatttttgtagttggaa 14123148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 104
Target Start/End: Original strand, 24021010 - 24021076
Alignment:
Q  38 aatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  24021010 aatgctcgagtcctgttgtttgacaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagtt 24021076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 12397479 - 12397426
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaata 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  12397479 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaata 12397426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 6206180 - 6206128
Alignment:
Q  250 gatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  6206180 gatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 6206128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 11693147 - 11693095
Alignment:
Q  250 gatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  11693147 gatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 11693095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Original strand, 35058244 - 35058299
Alignment:
Q  247 aatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  35058244 aatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgatgtgcattccttgacacttgaatacc 35058299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 2193085 - 2193035
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  2193085 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 2193035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 444
Target Start/End: Original strand, 14123421 - 14123479
Alignment:
Q  387 gcaagtttgaattaccccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14123421 gcaagtttgaatttgcccattcagaggcaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 14123479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 29066944 - 29066871
Alignment:
Q  272 aatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaa 346  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||| | |||||    
T  29066944 aatgaggttcattccttgacactt-aataccttcatctaaaccagcctaacaaaaatttaatcttttcaaaggaa 29066871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 29108531 - 29108458
Alignment:
Q  272 aatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaa 346  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||| | |||||    
T  29108531 aatgaggttcattccttgacactt-aataccttcatctaaaccagcctaacaaaaatttaatcttttcaaaggaa 29108458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 273 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 29075956 - 29075884
Alignment:
Q  273 atgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaa 346  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||| | |||||    
T  29075956 atgaggttcattccttgacactt-aataccttcatctaaaccagcctaacaaaaatttaatcttttcaaaggaa 29075884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 273 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 29110928 - 29110856
Alignment:
Q  273 atgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaa 346  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||| | |||||    
T  29110928 atgaggttcattccttgacactt-aataccttcatctaaaccagcctaacaaaaatttaatcttttcaaaggaa 29110856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 11693103 - 11692932
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||||  | ||||| |||||| |||| || || |||||  | | |||||||||||||| |||||| ||  | ||| |||||||||||||| ||     
T  11693103 ttgaataccattgtccaagatgctcattgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccattgtaagtcaattgttgcagttggaa 11693004  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
       ||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  11693003 ---tgtgcattccaaccacaacaattgtgttacctttgaatgggataaattcaaacctgcaaaacaacaggactc 11692932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 300
Target Start/End: Original strand, 24020612 - 24020660
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaata 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  24020612 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaata 24020660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 35021211 - 35021100
Alignment:
Q  124 ctacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccattcagaatatt 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| || ||| |  || | ||||||| |||||||| |||||||| ||||||  ||| || |||    
T  35021211 ctacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaacggcaggtctccaatattcgaccggcattcccattgttcctgtcaaaagatt 35021113  T
Q  224 aaattcttgttag 236  Q
    |||||||||||||    
T  35021112 aaattcttgttag 35021100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 381 - 438
Target Start/End: Original strand, 801654 - 801713
Alignment:
Q  381 cgtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggt 438  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  801654 cgttttgccagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaaggt 801713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 252 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 29067191 - 29067148
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacactt 295  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29067191 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacactt 29067148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 252 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 29108778 - 29108735
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacactt 295  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29108778 tggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacactt 29108735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 362 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 6206110 - 6206028
Alignment:
Q  362 tcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    ||||||| ||||| ||| ||| ||  |||||||||||| |||||| || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  6206110 tcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 6206028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 13402809 - 13402771
Alignment:
Q  61 caagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttg 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13402809 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttg 13402771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 14123473 - 14123415
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagca 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||| ||| |||||    
T  14123473 accttccaactacaacaattgtcttgcctctgaatgggcaaattcaaacttgctaagca 14123415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 27640476 - 27640410
Alignment:
Q  38 aatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  27640476 aatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaattacctcattcaaaggaagacaaatgttgtagtt 27640410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 99
Target Start/End: Original strand, 30257512 - 30257550
Alignment:
Q  61 caagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttg 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30257512 caagtttgaattaccccatttagaggaagacaattgttg 30257550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 388 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 27640779 - 27640723
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    |||||||||||| |||||| || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  27640779 caagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 27640723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 27640872 - 27640820
Alignment:
Q  250 gatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  27640872 gatggtattcaagtgtgaaaagaatgaggtgcatttcttgacacttgaatacc 27640820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 302
Target Start/End: Original strand, 35020746 - 35020798
Alignment:
Q  250 gatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  35020746 gatggtattcaagtgttaaaagaatgaggtgcattccttgacgcttgaatacc 35020798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 801438 - 801395
Alignment:
Q  61 caagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  801438 caagtttgaattacctcattcaaaggaagacaattgttgtagtt 801395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 35058444 - 35058397
Alignment:
Q  390 agtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaa 435  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35058444 agtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 35058397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 492 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 2402372 - 2402306
Alignment:
Q  492 tatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaa 558  Q
    |||||||||  |||||||||||| | ||   ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  2402372 tatcttcaggcgatctcagcaacgtgacaaacatatcgatccacaggaacatgttgtgctgccaaaa 2402306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 6205780 - 6205714
Alignment:
Q  38 aatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||    
T  6205780 aatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaattacctcattcaaaggaatacaaatgttgtagtt 6205714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 34 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 7821216 - 7821170
Alignment:
Q  34 atcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccatt 80  Q
    |||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  7821216 atcgaatgctggagtcctgtcgtttaacaagtttgaattaccccatt 7821170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 11692747 - 11692681
Alignment:
Q  38 aatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||    
T  11692747 aatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaattacctcattcaaaggaatacaaatgttgtagtt 11692681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 252 - 302
Target Start/End: Original strand, 13617415 - 13617465
Alignment:
Q  252 tggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    |||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||    
T  13617415 tggtattcaagtgtcaaaagaatggagtgcattccttgacacttgaatacc 13617465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 473 - 551
Target Start/End: Original strand, 18743995 - 18744073
Alignment:
Q  473 ggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgct 551  Q
    ||||||||||| | ||  ||||||||||  |||||||||||||| ||   |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  18743995 ggaatcaaactgtcgagaatatcttcagacgatctcagcaacatgacaaacatatcgatccacgagaacatgttgtgct 18744073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 163
Target Start/End: Original strand, 801391 - 801435
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaac 163  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  801391 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgaggtaattcaaac 801435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 362 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 2193017 - 2192936
Alignment:
Q  362 tcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcatt 443  Q
    ||||||||||| | ||| | | || ||||||||||||| |||||| || || ||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  2193017 tcgaatattggggtcctgctgattagcaagtttgaattgccccatccagagtaagacaatttttgcagttggaatgtgcatt 2192936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 4495174 - 4495141
Alignment:
Q  66 ttgaattaccccattcagaggaagacaattgttg 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4495174 ttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttg 4495141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 4495577 - 4495524
Alignment:
Q  34 atcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagagga 87  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  4495577 atcgaatgctggattcctgccgtttaacaagttttaattaccccattcaaagga 4495524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 4495677 - 4495604
Alignment:
Q  112 tgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactcca 184  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||| || || || |||||||    
T  4495677 tgtaccttccaactgcaataattgtcttacctctgaatggggtaaattcaaacttgctaaacagcatgactcca 4495604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 17465322 - 17465289
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17465322 accttccaactacaacaattgtcttacctctgaa 17465289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 362 - 443
Target Start/End: Original strand, 24020680 - 24020761
Alignment:
Q  362 tcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcatt 443  Q
    ||||||||||| | ||| | | || ||||||||||||| |||||| ||  | ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  24020680 tcgaatattggggtcctgctgattagcaagtttgaattgccccatccagcgtaagacaattgttgcagttggaatgtgcatt 24020761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Original strand, 29066779 - 29066844
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  29066779 ttccaactgcaacaattttcttatctttgaatgatataaattcaaacctgccaaacaacatgactc 29066844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Original strand, 29075792 - 29075857
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  29075792 ttccaactgcaacaattttcttatcgttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacatgactc 29075857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Original strand, 29108366 - 29108431
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  29108366 ttccaactgcaacaattttcttatcgttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacatgactc 29108431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Original strand, 29110764 - 29110829
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  29110764 ttccaactgcaacaattttcttatcgttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaacatgactc 29110829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 274 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 2192784 - 2192721
Alignment:
Q  274 tgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatctttt 338  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||| | || ||||||||||||||| ||||    
T  2192784 tgaggttcaatccttgacactt-aataccttcatctaaaccagcataacaagaatttaatatttt 2192721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 382 - 444
Target Start/End: Original strand, 4495616 - 4495680
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  4495616 gtttagcaagtttgaatttaccccattcagaggtaagacaattattgcagttggaaggtacattc 4495680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 388 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 14123202 - 14123146
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    ||||||| |||| |||||| || || ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  14123202 caagtttaaattgccccatccatagtaagacaattgttgtagttgaaatgtgcattc 14123146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 416 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 20192562 - 20192534
Alignment:
Q  416 gacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20192562 gacaattgttgtagttggaaggtgcattc 20192534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 416 - 444
Target Start/End: Original strand, 20242092 - 20242120
Alignment:
Q  416 gacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20242092 gacaattgttgtagttggaaggtgcattc 20242120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 416 - 444
Target Start/End: Original strand, 22136076 - 22136104
Alignment:
Q  416 gacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22136076 gacaattgttgtagttggaaggtgcattc 22136104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 416 - 444
Target Start/End: Original strand, 22143429 - 22143457
Alignment:
Q  416 gacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22143429 gacaattgttgtagttggaaggtgcattc 22143457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 287 - 350
Target Start/End: Original strand, 23911146 - 23911209
Alignment:
Q  287 ttgacacttcaataccttcatttaaatcg-gcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaat 350  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  23911146 ttgacactt-aataccatcatttaaaccaagcctaacaagaatttaatcttttgaatggaacaat 23911209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 24021080 - 24021017
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  24021080 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 24021017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Original strand, 27640406 - 27640469
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  27640406 ttccaactacaacatttgtctt-cctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 27640469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 414 - 442
Target Start/End: Original strand, 34132140 - 34132168
Alignment:
Q  414 aagacaattgttgtagttggaaggtgcat 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34132140 aagacaattgttgtagttggaaggtgcat 34132168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 388 - 444
Target Start/End: Original strand, 35058343 - 35058399
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    |||||||||||| || ||| || || |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  35058343 caagtttgaattgcctcatccagagtaagacatttgttgtagttggaatgtgcattc 35058399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 2)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 10 - 662
Target Start/End: Original strand, 17479 - 18123
Alignment:
Q  10 tgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacg 109  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||| ||||    
T  17479 tgaataccatcattcaaaatgctcattgaatgctagattcctgccgtttaacaagtttgaattacc--------aggaagacaattgttgcagttggacg 17570  T
Q  110 tttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactccaat-tttcgaccgacattcccaatg 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||| |||| | |||| ||||| ||||  |   ||||| ||| |||||   |||    
T  17571 tttgtacctcccaactacaacaattgtgttacttttgaatggggtaaatttaaactttccaaacaacatgacttaagcatttcgcccggcattc---atg 17667  T
Q  208 tt--ccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttc 305  Q
    ||  || || | || | |||||| |||||||  | |  ||| |||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  17668 ttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgacactt-aataccttc 17766  T
Q  306 atttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaa-tattggagacctc-ccgtttggcaagtttgaattaccc 403  Q
    || |||| | |||||||||||||||||| |||  | ||||| ||   ||||| ||  |||| |  | ||| |||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  17767 atctaaaccagcctaacaagaatttaatttttccaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcctaaccgtttggcaagtttgaattatcc 17866  T
Q  404 catt-caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagt 501  Q
    |||| || ||| ||||||||||||||||||| ||  ||||  | | || || ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  17867 catttcagaggtaagacaattgttgtagttgaaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttctggcggaatcaagctgttgatgatatcttcagt 17963  T
Q  502 tgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtg 601  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||| ||||| ||||||    
T  17964 tgatctcagcaacgttacccgcatatcgatccactataacatgttgtgctcccaaaacatgctcatcacgttttcgtcgttctttaactccacccaagtg 18063  T
Q  602 aatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttg 662  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18064 aatgatactct-ccctcgtcgagtgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttg 18123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 244 - 276
Target Start/End: Original strand, 17449 - 17481
Alignment:
Q  244 ttaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatga 276  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17449 ttaaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatga 17481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 184; Significance: 3e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 9 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 2441 - 1788
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||| | ||||||| | | |||||||||| || ||||   | | |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||     
T  2441 ttgaataccagcgttcaagacgtttatcgaatgctggagtcctaccgattaacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgcagttggaa 2342  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatg-agtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaat-tttcgaccgacattcccaat 206  Q
       ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| | ||||| ||||| | | ||||| ||  | |||    |    
T  2341 ---tgtgcatttcaactacaacaattgtcttacctttgaatggagtaaattcaaactggcctaacaacaggactcaagtatttcgccccgcgttcatgtt 2245  T
Q  207 gttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttca 306  Q
     |||| || | || | |||||| |||||||| | |  ||| |||||||||||||| || ||| | |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  2244 tttcctttgaaaagaataaatttttgttagacttgctttagatgatggtattcaagtgccaacaaaatgaggttcattgcttgacactt-aataccttca 2146  T
Q  307 tttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctc-ccgtttggcaagtttgaattacccca 405  Q
    | |||| | || |||||||||||||||||||| | ||||| ||   ||| |  ||   |||  | ||| | |  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  2145 tctaaaccagcataacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaacgctggcgaaatgcttgagtcatggccgtttgacaagtttgaattacccca 2046  T
Q  406 -ttcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttg 503  Q
     |||| ||| |||| |||||||| ||||||||  ||||  | | || || |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2045 attcagaggtaagagaattgttgcagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttatggcgaaatcaaacttttgatgatatcttcagttg 1949  T
Q  504 atctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaa 603  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| || ||||||||||| ||| ||||    
T  1948 atctcagcaacgtcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgtccgtcacgttttcgtcgtttgttaattccacccaaatgaa 1849  T
Q  604 tgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  1848 tgatactctcccctcgtcgagcgttggatgtttataccgaaattgttccaccctccttgtg 1788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 255 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 2480 - 2433
Alignment:
Q  255 tattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatacc 302  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  2480 tattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaatacc 2433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 168; Significance: 1e-89; HSPs: 3)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 380 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 2548 - 2265
Alignment:
Q  380 ccgtttggcaagtttgaattaccccatt-caaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaat 477  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||  ||||  | | || || |||||||||||||  |||||||||    
T  2548 ccgtttggtaattttgaattaccccatttcagaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcac-cttaccctaactaatgacgatcttttggcggaat 2452  T
Q  478 caaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcg 577  Q
    ||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2451 caagctgttgatgatatcttcaattgatctcatcaacgttacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcg 2352  T
Q  578 tcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2351 tcgttcgttaattccacccaagtgaatgatactctcccctcgttgagcgttggacgtttataccgaacgtgttccaccctccttgtg 2265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 4936 - 4798
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    |||||||||| | |||||||  || |||||||| | || |||||  | | |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||        
T  4936 ttgaataccagcgttcaagacacttatcgaatgttggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgcagtt---g 4840  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatg 150  Q
    |  ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4839 ggatgtgcattccaactacaacaattgtcttaccttagaatg 4798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 362 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 4910 - 4828
Alignment:
Q  362 tcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    |||||| |||||| ||| ||| ||  |||||||||||| |||||| || || ||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  4910 tcgaatgttggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgcagttgggatgtgcattc 4828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 102; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 451 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 25115 - 24903
Alignment:
Q  451 tacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 550  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||| | ||||||||||||||||| |||||  | | ||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  25115 tacctaatcacgatctattggcgcaatcagactcttg-taatatcttcagttgatcttagcaatgttatccgcaaatagatccactagaacatgttgtgc 25017  T
Q  551 tcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttataccgaacgtgtt 650  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||| ||    
T  25016 tcccaaaacatgctcgtcacattttcgttgttcgttaattccacccaactgaatgctactctcccctcctcgagcgttgtacgtctataccgaacgtatt 24917  T
Q  651 ccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||||||||||    
T  24916 ccaccctccttgtg 24903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 4)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 542 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 64095 - 63974
Alignment:
Q  542 atgttgtgctcccaaaacatgctcgtcatgttttcgtcattcgttaattccactcaagtgaatgatactctccccttgtcgagcgttggacgtttatacc 641  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  64095 atgttgtgctcccaaaacatgctcgtcacgttttcgtcgttcattgattccactcaactgaatgatactct-cccttgtcgagcgttggacatttatacc 63997  T
Q  642 gaacgtgttccaccctccttgtg 664  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  63996 gaacgtgctccaccctccttgtg 63974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 381 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 64227 - 64098
Alignment:
Q  381 cgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaa 480  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||    || |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  64227 cgtttggcaagtttgaattacttcattcaaaggaagacaattgttgtagttggaatgtacctta---ccctacctaatgacgatcttctggtggaatcaa 64131  T
Q  481 acttttgatgatatcttcagttgatctcagcaa 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  64130 acttttgatgatatcttcagttgatctcagcaa 64098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 281 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 64306 - 64251
Alignment:
Q  281 cattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatctt 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  64306 cattccttgacacttcaataccttcattgaaatcagcctaacaagaatttaatctt 64251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 170
Target Start/End: Original strand, 64168 - 64224
Alignment:
Q  113 gtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaa 170  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||| ||||||    
T  64168 gtacattccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgaagtaattcaaacttgccaa 64224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 4)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 382 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 85603 - 85462
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcattccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaaa 481  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  | | || || ||||||||||| |  |||| ||||||||    
T  85603 gtttgacaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaa--tgca-ccttaccctaactaatgacgattttatggctgaatcaaa 85507  T
Q  482 cttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcata 526  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  85506 cttttgatgatatcttaagttgatctaagcaacttcacccgcata 85462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 85620 - 85554
Alignment:
Q  38 aatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  85620 aatgctcgagtcctgttgtttgacaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagtt 85554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Original strand, 85550 - 85613
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  85550 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 85613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 274 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 85711 - 85648
Alignment:
Q  274 tgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatctttt 338  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||| | || ||||||||||||||| ||||    
T  85711 tgaggttcaatccttgacactt-aataccttcatctaaaccagcataacaagaatttaatatttt 85648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0268 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 5)
Name: scaffold0268
Description:

Target: scaffold0268; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 382 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 14745 - 14604
Alignment:
Q  382 gtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcatt-ccgtacctaatgacgatctactggcggaatcaa 480  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  | || || || |||| ||||||||  |||||| ||||     
T  14745 gtttgacaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaa--tgca--cgttaccctaactaacgacgatcttatggcggtatcat 14650  T
Q  481 acttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcata 526  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  14649 acttttgatgaaatcttaagttgatctaagcaacttcacccacata 14604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0268; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 14762 - 14696
Alignment:
Q  38 aatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagtt 104  Q
    |||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  14762 aatgctcgagtcctgttgtttgacaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagtt 14696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0268; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 15160 - 15113
Alignment:
Q  254 gtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaatac 301  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  15160 gtattcaagtgtcaacagaatgaggtgcattccttgacacttgaatac 15113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0268; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 15012 - 14947
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgag-taaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  15012 ttccaaccacaacaattgtgttacctttgaatgggttaaattcaaacctgcaaaacaacaggactc 14947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0268; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Original strand, 14692 - 14755
Alignment:
Q  118 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaacatgccaagcaacaagactc 182  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  14692 ttccaactacaacaattgtctt-cctttgaatggggtaattcaaacttgtcaaacaacaggactc 14755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 115 - 236
Target Start/End: Original strand, 108009 - 108131
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatga-gtaaattcaaacatgccaagcaacaagactccaattttcgaccgacattcccaatgttccat 213  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||| |||| | | | | ||||||||    
T  108009 accttccaactacaacaattatcttacctttaaatgaagtaaattcaaacttgctaagcagcaagactccaatattcgtccgagacttctactgttccat 108108  T
Q  214 tcagaatattaaattcttgttag 236  Q
    ||| |||||||||||| ||||||    
T  108109 tcaaaatattaaattcctgttag 108131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 317 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 108132 - 108003
Alignment:
Q  317 cctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaa-tgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg- 413  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||  |||||| | |||| | |||| |||||||||||| | | | | || ||||||||||||| ||  |||| |||||     
T  108132 cctaacaggaatttaatattttgaatggaacagt-agaagtctcggacgaatattggagtcttgctgcttagcaagtttgaatttacttcatttaaaggt 108034  T
Q  414 aagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  108033 aagataattgttgtagttggaaggtgcattc 108003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0861
Description:

Target: scaffold0861; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 59 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 2555 - 2208
Alignment:
Q  59 aacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagacgtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaat-gagtaaat 157  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||| | || ||    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  2555 aacaagtttgaattgccccatcaagagtaagacaattgttgtacttggaa---tgtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaat 2459  T
Q  158 tcaaacatgccaagcaacaagactcca-attttcgaccgacattcccaatgttccattcagaatattaaattcttgttagattgggattaaatgatggta 256  Q
    |||||| ||||||  |||||||||| |   ||||| ||| |||||    | |||| || | || | |||||| |||||||  |    ||| |||||||||    
T  2458 tcaaacttgccaaaaaacaagactcaagcatttcgcccggcattcatgtttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggctttctttagatgatggta 2359  T
Q  257 ttcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaatgagaat 356  Q
    ||||| || |||   |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | || |  ||||||||||||||||| |||| | | ||| ||   ||||    
T  2358 ttcaagtgccaacgaaatgaggttcattccttgatacttcaataccttcatctgaaccatcctaacaagaatttaatattttcaaacgaaaaacatgaat 2259  T
Q  357 gtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccatt 407  Q
    ||||| |||||  ||  ||  |  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  2258 gtcgggcgaatgctgaggaattttcgtttggaaagtttgaattaccccatt 2208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 2695 - 2497
Alignment:
Q  246 aaatgatggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacagga 345  Q
    ||||||| |||| ||| || |||  |||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||     | ||||||||||||| |||||||  |||    
T  2695 aaatgatagtatccaagtgccaacggaatgaggtctagaccttgacacctcaataccttcatttaaacgatgccaacaagaatttaaccttttgaatgga 2596  T
Q  346 acaatgagaatgtcggtcgaatattggagacctcccgtttggcaagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    ||||    | | |||| ||||| |||||| ||| ||| ||  |||||||||||| ||||||  | || ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  2595 acaaaagcactttcgggcgaatgttggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatcaagagtaagacaattgttgtacttggaatgtgcattc 2497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 383 - 435
Target Start/End: Original strand, 2445 - 2499
Alignment:
Q  383 tttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaa 435  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2445 tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 2499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 148
Target Start/End: Original strand, 11319 - 11455
Alignment:
Q  9 ttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatgctagattcctgttgttcaacaagtttgaattaccccattcagaggaagacaattgttgcagttagac 108  Q
    ||||||| || | ||||||| ||| |||||||||| || |||||  | | |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||     
T  11319 ttgaatatcagcgttcaagacgcttatcgaatgctggagtcctgccgattaacaagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgcagttgga- 11417  T
Q  109 gtttgtaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaa 148  Q
       ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11418 --atgtgcattccaactccaacaattgtcttacctttgaa 11455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 300
Target Start/End: Original strand, 11279 - 11325
Alignment:
Q  254 gtattcaaatgtcaaaagaatgaggtccattccttgacacttcaata 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  11279 gtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattccttgacacttgaata 11325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 388 - 444
Target Start/End: Original strand, 11371 - 11427
Alignment:
Q  388 caagtttgaattaccccattcaaaggaagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 444  Q
    |||||||||||| |||||| || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  11371 caagtttgaattgccccatccagagtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattc 11427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0859
Description:

Target: scaffold0859; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 350
Target Start/End: Original strand, 1054 - 1117
Alignment:
Q  287 ttgacacttcaataccttcatttaaatcggcctaacaagaatttaatcttttgacaggaacaat 350  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  1054 ttgacacttcaataccttcatctaaatcaaactaacaagaatttaatcttttgaatggaacaat 1117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 1206 - 1158
Alignment:
Q  115 accttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgagtaaattcaaac 163  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||    
T  1206 accttcaaactacaacaattgtcttacctctgaaatggtaaattcaaac 1158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 451 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 5560 - 5453
Alignment:
Q  451 tacctaatgacgatctactggcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgc 550  Q
    ||||||||  |||||| |||||| ||||||||| ||||  ||||||||||  ||||||| |||| | ||   ||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  5560 tacctaatctcgatcttctggcgaaatcaaactgttgagaatatcttcaggcgatctcaacaacgtgacaaacatattgatccatgggaacatgttgtgc 5461  T
Q  551 tcccaaaa 558  Q
    | ||||||    
T  5460 tgccaaaa 5453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 471 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 36855 - 36775
Alignment:
Q  471 gcggaatcaaacttttgatgatatcttcagttgatctcagcaacatcacccgcatatcgatccactggaacatgttgtgct 551  Q
    ||||||| ||||| ||||  ||||||||||  ||||||| |||| | ||  |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  36855 gcggaattaaactcttgagaatatcttcaggcgatctcaacaacgtgacaagcatatcgatccacgggaacatgatgtgct 36775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University