View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2676_low_3 (Length: 454)

Name: NF2676_low_3
Description: NF2676
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2676_low_3
NF2676_low_3
[»] chr6 (152 HSPs)
chr6 (98-448)||(30676531-30676881)
chr6 (98-448)||(34963364-34963714)
chr6 (98-435)||(12742321-12742658)
chr6 (98-435)||(24422551-24422887)
chr6 (98-435)||(33861798-33862134)
chr6 (98-435)||(33864282-33864618)
chr6 (98-435)||(18334414-18334750)
chr6 (98-435)||(22782231-22782567)
chr6 (98-435)||(1540733-1541069)
chr6 (98-435)||(8055033-8055370)
chr6 (98-435)||(19858741-19859077)
chr6 (98-435)||(2291002-2291338)
chr6 (98-435)||(26924462-26924798)
chr6 (106-434)||(25688507-25688835)
chr6 (154-435)||(19005050-19005330)
chr6 (171-435)||(25656633-25656897)
chr6 (98-448)||(19847789-19848122)
chr6 (225-435)||(1595553-1595763)
chr6 (247-435)||(25754813-25755001)
chr6 (261-423)||(18456735-18456897)
chr6 (247-435)||(20556864-20557050)
chr6 (260-435)||(3852000-3852175)
chr6 (265-435)||(16448514-16448685)
chr6 (98-277)||(12942363-12942542)
chr6 (98-243)||(17377669-17377814)
chr6 (98-448)||(23992421-23992763)
chr6 (98-276)||(28289158-28289334)
chr6 (290-423)||(18461895-18462028)
chr6 (96-229)||(18914142-18914275)
chr6 (98-230)||(1598266-1598397)
chr6 (98-229)||(31630362-31630493)
chr6 (98-229)||(19005361-19005492)
chr6 (154-256)||(31630524-31630626)
chr6 (277-441)||(25629310-25629475)
chr6 (277-444)||(18409782-18409950)
chr6 (98-205)||(25535641-25535748)
chr6 (280-441)||(29060541-29060703)
chr6 (154-272)||(18913994-18914111)
chr6 (2-99)||(18914709-18914806)
chr6 (277-441)||(20593774-20593939)
chr6 (2-99)||(23992813-23992910)
chr6 (294-441)||(17287768-17287916)
chr6 (277-441)||(20360915-20361080)
chr6 (103-229)||(15875621-15875737)
chr6 (154-276)||(15875469-15875590)
chr6 (277-441)||(16496245-16496410)
chr6 (277-441)||(19303496-19303660)
chr6 (262-441)||(22780166-22780347)
chr6 (277-427)||(25644335-25644487)
chr6 (2-99)||(31630022-31630119)
chr6 (2-99)||(34963764-34963861)
chr6 (277-441)||(20076701-20076862)
chr6 (2-99)||(25535798-25535895)
chr6 (277-423)||(18821801-18821946)
chr6 (2-99)||(1598833-1598930)
chr6 (2-99)||(19005735-19005832)
chr6 (2-99)||(19847453-19847550)
chr6 (292-441)||(20638253-20638403)
chr6 (262-427)||(20109153-20109322)
chr6 (261-441)||(8227449-8227631)
chr6 (31-99)||(19847675-19847743)
chr6 (207-272)||(18937252-18937317)
chr6 (31-99)||(1598447-1598515)
chr6 (31-99)||(2290884-2290952)
chr6 (31-99)||(8055420-8055488)
chr6 (31-99)||(15892112-15892180)
chr6 (31-99)||(18334296-18334364)
chr6 (31-99)||(24422937-24423005)
chr6 (31-99)||(25689086-25689154)
chr6 (381-441)||(25714418-25714478)
chr6 (11-99)||(30676200-30676288)
chr6 (31-99)||(30676413-30676481)
chr6 (31-99)||(33862184-33862252)
chr6 (31-99)||(33864668-33864736)
chr6 (33-99)||(12942580-12942646)
chr6 (31-99)||(12742708-12742776)
chr6 (31-99)||(23415355-23415423)
chr6 (31-99)||(25737033-25737101)
chr6 (31-99)||(31630244-31630312)
chr6 (33-99)||(17883203-17883269)
chr6 (34-99)||(1871-1936)
chr6 (34-99)||(8830-8895)
chr6 (2-47)||(17028025-17028070)
chr6 (381-441)||(27333277-27333338)
chr6 (381-441)||(27394017-27394078)
chr6 (98-146)||(1986-2034)
chr6 (98-146)||(8945-8993)
chr6 (31-99)||(1540615-1540683)
chr6 (98-146)||(1598542-1598590)
chr6 (31-99)||(1598640-1598708)
chr6 (98-146)||(1598735-1598783)
chr6 (31-99)||(18914323-18914391)
chr6 (98-146)||(19847600-19847648)
chr6 (31-99)||(19858626-19858694)
chr6 (281-423)||(23019425-23019567)
chr6 (31-99)||(26924344-26924412)
chr6 (31-99)||(27557113-27557181)
chr6 (98-146)||(30676338-30676386)
chr6 (281-427)||(9098473-9098620)
chr6 (33-99)||(28289042-28289108)
chr6 (31-96)||(9020-9085)
chr6 (389-441)||(1561304-1561356)
chr6 (31-99)||(18914516-18914584)
chr6 (98-142)||(18914615-18914659)
chr6 (31-99)||(19005542-19005610)
chr6 (98-146)||(19005637-19005685)
chr6 (98-146)||(22981368-22981416)
chr6 (98-146)||(23806992-23807040)
chr6 (98-146)||(25689181-25689229)
chr6 (98-142)||(26924269-26924313)
chr6 (277-441)||(35245587-35245749)
chr6 (98-145)||(27557016-27557063)
chr6 (344-448)||(25603406-25603512)
chr6 (344-448)||(25611744-25611850)
chr6 (155-229)||(35056707-35056781)
chr6 (328-427)||(19668386-19668488)
chr6 (31-99)||(25688893-25688961)
chr6 (31-99)||(26924151-26924219)
chr6 (34-97)||(79-142)
chr6 (294-415)||(15041522-15041644)
chr6 (107-146)||(18334230-18334269)
chr6 (99-142)||(18914422-18914465)
chr6 (98-145)||(23415258-23415305)
chr6 (107-146)||(24423032-24423071)
chr6 (328-425)||(28496477-28496575)
chr6 (328-425)||(29808888-29808986)
chr6 (107-146)||(33864763-33864802)
chr6 (395-441)||(22080799-22080845)
chr6 (155-213)||(32259078-32259136)
chr6 (155-232)||(15875565-15875642)
chr6 (321-428)||(19652209-19652316)
chr6 (98-146)||(194-242)
chr6 (31-99)||(22782617-22782685)
chr6 (98-146)||(25688988-25689036)
chr6 (63-99)||(25689279-25689315)
chr6 (98-146)||(25737128-25737176)
chr6 (107-146)||(2290818-2290857)
chr6 (68-99)||(17377588-17377619)
chr6 (107-146)||(22782712-22782751)
chr6 (107-146)||(26924085-26924124)
chr6 (389-423)||(11185524-11185558)
chr6 (390-448)||(16929658-16929716)
chr6 (390-448)||(16965378-16965436)
chr6 (191-221)||(17883303-17883333)
chr6 (381-435)||(21766698-21766752)
chr6 (292-441)||(16920602-16920750)
chr6 (155-232)||(18914086-18914163)
chr6 (381-421)||(22831524-22831565)
chr6 (384-416)||(19790842-19790874)
chr6 (261-312)||(23076862-23076914)
chr6 (98-146)||(31630169-31630217)
chr6 (381-421)||(33443068-33443108)
[»] chr8 (167 HSPs)
chr8 (98-437)||(16413137-16413476)
chr8 (98-435)||(14409266-14409602)
chr8 (98-435)||(1484406-1484742)
chr8 (98-435)||(5853114-5853450)
chr8 (98-435)||(22001757-22002093)
chr8 (98-435)||(4483285-4483621)
chr8 (98-435)||(20046017-20046353)
chr8 (98-435)||(4542195-4542531)
chr8 (154-435)||(20403231-20403511)
chr8 (98-435)||(14823778-14824115)
chr8 (98-426)||(15070571-15070901)
chr8 (154-435)||(15203109-15203389)
chr8 (154-435)||(19896269-19896553)
chr8 (154-439)||(45290572-45290857)
chr8 (98-326)||(24485865-24486093)
chr8 (155-435)||(19936882-19937164)
chr8 (98-448)||(32121726-32122069)
chr8 (261-435)||(41598192-41598366)
chr8 (98-448)||(18677886-18678229)
chr8 (98-256)||(27472238-27472395)
chr8 (261-444)||(26223914-26224097)
chr8 (154-316)||(32810054-32810215)
chr8 (262-423)||(19801367-19801527)
chr8 (247-435)||(25484245-25484426)
chr8 (98-229)||(1326753-1326884)
chr8 (98-229)||(38549826-38549957)
chr8 (98-218)||(16198115-16198235)
chr8 (98-218)||(25657974-25658094)
chr8 (277-441)||(16092297-16092462)
chr8 (98-227)||(16401746-16401875)
chr8 (277-441)||(6759259-6759421)
chr8 (262-441)||(18818348-18818529)
chr8 (98-209)||(24048841-24048951)
chr8 (277-444)||(28648999-28649167)
chr8 (154-256)||(38549988-38550090)
chr8 (289-441)||(7372779-7372932)
chr8 (98-236)||(19896524-19896662)
chr8 (277-441)||(20536209-20536374)
chr8 (98-232)||(15203000-15203134)
chr8 (98-232)||(20403486-20403620)
chr8 (297-435)||(26219721-26219858)
chr8 (2-100)||(38549294-38549392)
chr8 (2-99)||(19897098-19897195)
chr8 (277-441)||(22875066-22875230)
chr8 (276-441)||(23406380-23406548)
chr8 (2-99)||(32810287-32810384)
chr8 (294-441)||(21923900-21924048)
chr8 (292-441)||(21918969-21919120)
chr8 (2-96)||(24049197-24049291)
chr8 (297-435)||(26225268-26225405)
chr8 (261-439)||(13508023-13508203)
chr8 (261-439)||(13597555-13597735)
chr8 (2-99)||(15202467-15202564)
chr8 (154-256)||(20982604-20982710)
chr8 (277-441)||(22626737-22626901)
chr8 (2-99)||(27471898-27471995)
chr8 (2-99)||(19936390-19936486)
chr8 (2-99)||(32122312-32122409)
chr8 (154-229)||(13425336-13425411)
chr8 (154-229)||(20982498-20982573)
chr8 (98-232)||(45290463-45290597)
chr8 (2-99)||(1326606-1326703)
chr8 (271-441)||(17612059-17612230)
chr8 (98-229)||(19936729-19936850)
chr8 (154-276)||(1326915-1327042)
chr8 (154-243)||(16401908-16401996)
chr8 (2-99)||(16412797-16412894)
chr8 (277-441)||(18879191-18879351)
chr8 (2-99)||(20403863-20403960)
chr8 (277-448)||(23648547-23648719)
chr8 (2-99)||(11361100-11361198)
chr8 (2-99)||(15071144-15071241)
chr8 (165-229)||(13425241-13425305)
chr8 (292-441)||(31971258-31971407)
chr8 (261-423)||(20498581-20498745)
chr8 (31-99)||(16401243-16401310)
chr8 (281-441)||(38855212-38855371)
chr8 (31-99)||(1484792-1484860)
chr8 (31-99)||(4542077-4542145)
chr8 (31-99)||(5852996-5853064)
chr8 (31-99)||(14409148-14409216)
chr8 (31-99)||(19896905-19896973)
chr8 (31-99)||(19936611-19936679)
chr8 (343-441)||(45131019-45131116)
chr8 (328-441)||(6520369-6520483)
chr8 (32-99)||(45290252-45290319)
chr8 (321-433)||(21285606-21285719)
chr8 (31-99)||(14397444-14397512)
chr8 (31-99)||(14824165-14824233)
chr8 (31-99)||(15070951-15071019)
chr8 (31-99)||(15202689-15202757)
chr8 (31-99)||(16198285-16198353)
chr8 (31-99)||(16413019-16413087)
chr8 (31-99)||(20045899-20045967)
chr8 (31-99)||(20403670-20403738)
chr8 (31-99)||(24485747-24485815)
chr8 (261-423)||(37116366-37116531)
chr8 (98-147)||(15202807-15202856)
chr8 (31-99)||(15202882-15202950)
chr8 (31-99)||(16401628-16401696)
chr8 (31-99)||(18677768-18677836)
chr8 (98-146)||(20403765-20403813)
chr8 (31-99)||(22002143-22002211)
chr8 (31-99)||(24049001-24049069)
chr8 (98-146)||(27472045-27472093)
chr8 (31-99)||(27472120-27472188)
chr8 (98-146)||(32122214-32122262)
chr8 (98-146)||(38549633-38549681)
chr8 (31-99)||(38549708-38549776)
chr8 (158-229)||(21513636-21513707)
chr8 (33-99)||(16401437-16401503)
chr8 (155-229)||(18815609-18815683)
chr8 (2-56)||(37609883-37609936)
chr8 (100-145)||(14397564-14397609)
chr8 (343-441)||(16199666-16199764)
chr8 (98-146)||(15071046-15071094)
chr8 (98-146)||(15202614-15202662)
chr8 (98-146)||(16401360-16401408)
chr8 (31-99)||(19896712-19896780)
chr8 (98-146)||(19896807-19896855)
chr8 (98-146)||(19897000-19897048)
chr8 (328-441)||(5866280-5866394)
chr8 (340-441)||(17140917-17141019)
chr8 (328-441)||(21490996-21491110)
chr8 (328-427)||(983410-983512)
chr8 (37-99)||(4483671-4483733)
chr8 (155-229)||(36733302-36733376)
chr8 (155-229)||(38988730-38988804)
chr8 (155-229)||(39019827-39019901)
chr8 (261-361)||(17266931-17267031)
chr8 (328-441)||(21389458-21389570)
chr8 (328-441)||(21395988-21396100)
chr8 (328-441)||(21778784-21778896)
chr8 (328-441)||(21790481-21790593)
chr8 (98-146)||(16412944-16412992)
chr8 (277-361)||(17439461-17439544)
chr8 (98-146)||(19936536-19936584)
chr8 (31-99)||(32122119-32122187)
chr8 (98-146)||(38549441-38549488)
chr8 (31-99)||(38549515-38549583)
chr8 (107-146)||(1484887-1484926)
chr8 (162-229)||(5083001-5083068)
chr8 (107-146)||(5852930-5852969)
chr8 (107-146)||(14409082-14409121)
chr8 (107-146)||(20045833-20045872)
chr8 (381-427)||(23760903-23760950)
chr8 (230-276)||(35026849-35026895)
chr8 (155-232)||(19936829-19936906)
chr8 (392-441)||(21249385-21249434)
chr8 (392-441)||(21255223-21255272)
chr8 (98-138)||(24049104-24049144)
chr8 (155-219)||(38549936-38550000)
chr8 (107-146)||(4483765-4483804)
chr8 (107-146)||(14824260-14824299)
chr8 (389-428)||(26355766-26355805)
chr8 (154-232)||(1326862-1326940)
chr8 (230-276)||(2418860-2418906)
chr8 (116-146)||(16401186-16401216)
chr8 (384-438)||(39094987-39095041)
chr8 (155-232)||(13425284-13425361)
chr8 (381-418)||(20533469-20533506)
chr8 (389-438)||(20856492-20856541)
chr8 (155-232)||(20982552-20982629)
chr8 (167-232)||(32810190-32810255)
chr8 (155-219)||(13425390-13425454)
chr8 (98-146)||(16401553-16401601)
chr8 (71-99)||(45290385-45290413)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (98-448)||(11279-11630)
scaffold0029 (33-91)||(11688-11746)
[»] chr4 (150 HSPs)
chr4 (98-448)||(14970528-14970878)
chr4 (98-435)||(3515011-3515348)
chr4 (98-435)||(15118174-15118510)
chr4 (98-435)||(44615292-44615629)
chr4 (98-435)||(19242703-19243041)
chr4 (98-435)||(50222161-50222497)
chr4 (98-435)||(44772905-44773245)
chr4 (107-435)||(18239250-18239577)
chr4 (154-448)||(19618050-19618343)
chr4 (154-435)||(18215152-18215432)
chr4 (154-435)||(12185-12465)
chr4 (154-435)||(52312514-52312794)
chr4 (98-435)||(1837341-1837667)
chr4 (154-439)||(15355202-15355487)
chr4 (98-435)||(7641008-7641340)
chr4 (247-435)||(51463838-51464026)
chr4 (247-435)||(23803235-23803423)
chr4 (261-435)||(44102218-44102392)
chr4 (98-277)||(15534343-15534522)
chr4 (247-435)||(12610954-12611135)
chr4 (261-441)||(15367691-15367872)
chr4 (261-441)||(15402704-15402885)
chr4 (98-276)||(36038033-36038211)
chr4 (261-441)||(15371203-15371384)
chr4 (261-441)||(15373484-15373665)
chr4 (271-435)||(44928873-44929038)
chr4 (261-441)||(15370019-15370199)
chr4 (263-441)||(16223533-16223712)
chr4 (261-423)||(21815569-21815731)
chr4 (101-276)||(14048740-14048915)
chr4 (265-435)||(20149833-20150004)
chr4 (98-276)||(49547595-49547773)
chr4 (98-229)||(362390-362521)
chr4 (98-229)||(52872894-52873025)
chr4 (98-229)||(19617888-19618019)
chr4 (100-229)||(18214992-18215121)
chr4 (98-229)||(15495995-15496126)
chr4 (98-229)||(14746333-14746464)
chr4 (98-222)||(29267570-29267694)
chr4 (277-435)||(14038655-14038814)
chr4 (297-435)||(54798729-54798868)
chr4 (321-435)||(14280320-14280434)
chr4 (262-441)||(7798775-7798956)
chr4 (126-229)||(15355068-15355171)
chr4 (277-434)||(16377478-16377634)
chr4 (277-441)||(7088878-7089043)
chr4 (154-276)||(15496949-15497070)
chr4 (277-441)||(12902758-12902923)
chr4 (2-99)||(18214685-18214782)
chr4 (154-275)||(52873056-52873176)
chr4 (98-229)||(19857798-19857919)
chr4 (277-440)||(22636437-22636601)
chr4 (98-232)||(12076-12210)
chr4 (266-423)||(22353852-22354010)
chr4 (2-99)||(11929-12026)
chr4 (277-441)||(7893704-7893869)
chr4 (2-99)||(52872554-52872651)
chr4 (330-441)||(52873375-52873487)
chr4 (98-232)||(52312769-52312902)
chr4 (2-96)||(52313341-52313435)
chr4 (2-99)||(3515591-3515688)
chr4 (277-441)||(16270191-16270355)
chr4 (297-435)||(8574844-8574981)
chr4 (2-99)||(12778358-12778454)
chr4 (154-276)||(14746495-14746618)
chr4 (277-441)||(44052830-44052995)
chr4 (8-99)||(19617554-19617645)
chr4 (261-423)||(13789-13953)
chr4 (277-441)||(6899892-6900056)
chr4 (2-142)||(14745857-14745991)
chr4 (279-441)||(16239927-16240089)
chr4 (277-437)||(23374314-23374475)
chr4 (261-427)||(52243132-52243302)
chr4 (2-89)||(15489630-15489717)
chr4 (154-236)||(19857685-19857767)
chr4 (2-99)||(362957-363054)
chr4 (2-99)||(14970188-14970285)
chr4 (262-427)||(43198492-43198661)
chr4 (2-99)||(19858162-19858259)
chr4 (188-256)||(362268-362336)
chr4 (357-441)||(3096294-3096379)
chr4 (31-99)||(52313145-52313213)
chr4 (98-165)||(30147189-30147256)
chr4 (31-99)||(3515398-3515466)
chr4 (31-99)||(7640890-7640958)
chr4 (31-99)||(15118056-15118124)
chr4 (31-99)||(29267744-29267812)
chr4 (31-99)||(52312952-52313020)
chr4 (31-99)||(52872776-52872844)
chr4 (33-99)||(15534572-15534638)
chr4 (279-368)||(15464888-15464977)
chr4 (31-99)||(362764-362832)
chr4 (31-99)||(1837223-1837291)
chr4 (31-99)||(14746022-14746090)
chr4 (31-99)||(14970410-14970478)
chr4 (39-99)||(19857969-19858029)
chr4 (33-99)||(362571-362637)
chr4 (33-99)||(36038261-36038327)
chr4 (333-441)||(39706299-39706408)
chr4 (33-99)||(49547479-49547545)
chr4 (2-55)||(15354999-15355052)
chr4 (98-146)||(3515493-3515541)
chr4 (98-146)||(14970335-14970383)
chr4 (98-146)||(15495802-15495850)
chr4 (31-99)||(30147306-30147374)
chr4 (31-99)||(50222043-50222111)
chr4 (98-146)||(52313240-52313288)
chr4 (98-146)||(52872701-52872749)
chr4 (31-89)||(18214907-18214965)
chr4 (317-428)||(12774021-12774132)
chr4 (30-99)||(14185526-14185595)
chr4 (34-99)||(15495880-15495945)
chr4 (98-146)||(362859-362907)
chr4 (328-427)||(12288214-12288316)
chr4 (31-99)||(14746215-14746283)
chr4 (98-146)||(18214832-18214880)
chr4 (102-146)||(19617699-19617743)
chr4 (98-146)||(19858064-19858112)
chr4 (31-99)||(44615679-44615747)
chr4 (31-99)||(44772787-44772855)
chr4 (98-146)||(52313047-52313095)
chr4 (34-97)||(22725431-22725494)
chr4 (98-144)||(362668-362714)
chr4 (33-98)||(14048969-14049034)
chr4 (381-441)||(15551818-15551879)
chr4 (261-423)||(46640394-46640558)
chr4 (290-423)||(6190481-6190616)
chr4 (98-146)||(14185621-14185669)
chr4 (98-146)||(14746140-14746188)
chr4 (31-99)||(19243091-19243159)
chr4 (224-276)||(19857607-19857659)
chr4 (98-146)||(22725353-22725401)
chr4 (261-423)||(53082090-53082254)
chr4 (107-146)||(15117990-15118029)
chr4 (33-96)||(19617772-19617835)
chr4 (343-441)||(14053323-14053421)
chr4 (381-441)||(17046488-17046549)
chr4 (155-232)||(19617998-19618075)
chr4 (109-146)||(44772723-44772760)
chr4 (381-421)||(17333298-17333338)
chr4 (107-146)||(7640824-7640863)
chr4 (262-350)||(8846465-8846553)
chr4 (154-219)||(14629428-14629493)
chr4 (155-232)||(14746443-14746520)
chr4 (155-232)||(15355150-15355227)
chr4 (155-232)||(19857742-19857819)
chr4 (177-234)||(26922388-26922445)
chr4 (155-219)||(362347-362411)
chr4 (381-428)||(8846370-8846418)
chr4 (177-229)||(26922437-26922489)
[»] scaffold0716 (4 HSPs)
scaffold0716 (98-435)||(4698-5035)
scaffold0716 (2-99)||(5278-5375)
scaffold0716 (31-99)||(5085-5153)
scaffold0716 (98-146)||(5180-5228)
[»] scaffold0023 (12 HSPs)
scaffold0023 (98-437)||(17261-17600)
scaffold0023 (98-435)||(94415-94751)
scaffold0023 (280-435)||(44458-44614)
scaffold0023 (2-99)||(16921-17018)
scaffold0023 (281-428)||(100388-100534)
scaffold0023 (31-99)||(94801-94869)
scaffold0023 (31-99)||(17143-17211)
scaffold0023 (281-428)||(40135-40281)
scaffold0023 (381-441)||(119876-119937)
scaffold0023 (107-146)||(94896-94935)
scaffold0023 (98-146)||(17068-17116)
scaffold0023 (384-435)||(38542-38593)
[»] chr3 (195 HSPs)
chr3 (98-448)||(13544016-13544364)
chr3 (98-448)||(12567551-12567900)
chr3 (98-435)||(17463182-17463518)
chr3 (98-435)||(34159330-34159666)
chr3 (98-435)||(45606728-45607065)
chr3 (98-435)||(6468956-6469292)
chr3 (98-435)||(7781168-7781505)
chr3 (98-435)||(55476495-55476831)
chr3 (98-435)||(16454103-16454439)
chr3 (98-435)||(13154077-13154414)
chr3 (98-435)||(10247545-10247881)
chr3 (98-435)||(13151612-13151949)
chr3 (98-435)||(28848443-28848769)
chr3 (154-435)||(9707484-9707765)
chr3 (154-435)||(8899098-8899378)
chr3 (98-435)||(8499522-8499861)
chr3 (98-435)||(15412433-15412772)
chr3 (154-435)||(16282689-16282969)
chr3 (154-431)||(38961769-38962045)
chr3 (154-435)||(41123894-41124171)
chr3 (98-435)||(27165254-27165593)
chr3 (98-435)||(53301325-53301665)
chr3 (236-435)||(17446614-17446812)
chr3 (98-448)||(46822259-46822602)
chr3 (247-431)||(50242830-50243014)
chr3 (261-435)||(29172566-29172741)
chr3 (261-435)||(17672630-17672804)
chr3 (98-276)||(54520985-54521163)
chr3 (98-276)||(15977696-15977873)
chr3 (261-435)||(12119708-12119883)
chr3 (98-269)||(12305315-12305486)
chr3 (261-423)||(53070637-53070799)
chr3 (247-423)||(43550448-43550625)
chr3 (98-229)||(12119475-12119606)
chr3 (98-256)||(10557091-10557249)
chr3 (98-274)||(29544663-29544839)
chr3 (308-435)||(15977519-15977646)
chr3 (98-218)||(13436520-13436640)
chr3 (277-441)||(14972855-14973020)
chr3 (277-435)||(40213676-40213834)
chr3 (328-435)||(55500946-55501053)
chr3 (297-435)||(36166602-36166739)
chr3 (98-205)||(24513910-24514017)
chr3 (98-232)||(38961660-38961794)
chr3 (260-424)||(42386428-42386594)
chr3 (277-441)||(17487857-17488022)
chr3 (277-441)||(17499339-17499504)
chr3 (98-219)||(25237063-25237184)
chr3 (277-441)||(25476340-25476505)
chr3 (262-434)||(43840940-43841114)
chr3 (2-99)||(24514067-24514164)
chr3 (262-441)||(26686888-26687069)
chr3 (297-429)||(21618459-21618590)
chr3 (2-97)||(8899418-8899513)
chr3 (98-232)||(16282579-16282714)
chr3 (261-441)||(24340661-24340843)
chr3 (2-96)||(20629673-20629767)
chr3 (98-232)||(41124146-41124280)
chr3 (277-441)||(13442275-13442440)
chr3 (2-99)||(16282239-16282336)
chr3 (277-441)||(18438535-18438700)
chr3 (277-441)||(23083316-23083481)
chr3 (2-99)||(38961319-38961416)
chr3 (2-99)||(55318785-55318882)
chr3 (292-441)||(12399210-12399360)
chr3 (292-441)||(20698405-20698555)
chr3 (10-99)||(17444253-17444342)
chr3 (98-219)||(25229476-25229597)
chr3 (277-428)||(14576788-14576939)
chr3 (336-435)||(10556989-10557088)
chr3 (277-441)||(11424718-11424879)
chr3 (277-435)||(24153164-24153322)
chr3 (340-435)||(44494813-44494908)
chr3 (102-232)||(17444589-17444719)
chr3 (154-276)||(11913928-11914051)
chr3 (3-99)||(13937455-13937551)
chr3 (2-99)||(12119328-12119425)
chr3 (341-435)||(17737240-17737337)
chr3 (261-424)||(23274705-23274870)
chr3 (296-428)||(14572603-14572735)
chr3 (2-99)||(27165836-27165933)
chr3 (2-99)||(46822845-46822942)
chr3 (154-234)||(17444694-17444773)
chr3 (262-423)||(52523666-52523831)
chr3 (5-99)||(10379718-10379812)
chr3 (2-99)||(53300985-53301082)
chr3 (98-219)||(20630013-20630138)
chr3 (2-99)||(8500104-8500201)
chr3 (10-99)||(41124523-41124612)
chr3 (11-99)||(10557492-10557580)
chr3 (261-441)||(37642203-37642385)
chr3 (262-361)||(2051138-2051238)
chr3 (314-448)||(30029834-30029968)
chr3 (261-323)||(17248225-17248287)
chr3 (328-448)||(12511051-12511172)
chr3 (31-99)||(8499911-8499979)
chr3 (31-99)||(10247427-10247495)
chr3 (31-99)||(15977923-15977991)
chr3 (31-99)||(16453984-16454052)
chr3 (31-99)||(17463568-17463636)
chr3 (31-99)||(34159716-34159784)
chr3 (31-99)||(45606610-45606678)
chr3 (98-153)||(10379613-10379668)
chr3 (328-441)||(14234488-14234602)
chr3 (154-221)||(25237009-25237075)
chr3 (271-368)||(22147474-22147571)
chr3 (30-99)||(36528353-36528422)
chr3 (33-98)||(54521214-54521279)
chr3 (31-99)||(7781050-7781118)
chr3 (31-99)||(10557299-10557367)
chr3 (31-99)||(12567950-12568018)
chr3 (31-99)||(13544414-13544482)
chr3 (31-99)||(15465545-15465613)
chr3 (281-427)||(15470939-15471085)
chr3 (31-99)||(16282461-16282529)
chr3 (31-99)||(17444467-17444535)
chr3 (31-99)||(28848325-28848393)
chr3 (31-99)||(38961541-38961609)
chr3 (31-99)||(41124330-41124398)
chr3 (31-99)||(53301207-53301275)
chr3 (317-438)||(32307681-32307802)
chr3 (31-97)||(6468838-6468904)
chr3 (33-99)||(29544547-29544613)
chr3 (31-96)||(5223777-5223842)
chr3 (31-96)||(13153959-13154024)
chr3 (262-428)||(16097342-16097509)
chr3 (262-428)||(16103794-16103960)
chr3 (31-96)||(16358371-16358436)
chr3 (2-59)||(45220361-45220418)
chr3 (386-435)||(45577947-45577996)
chr3 (34-99)||(55319010-55319075)
chr3 (98-146)||(10557394-10557442)
chr3 (31-99)||(20629895-20629963)
chr3 (31-99)||(27165643-27165711)
chr3 (98-146)||(27165738-27165786)
chr3 (31-99)||(55476881-55476949)
chr3 (328-441)||(13210333-13210447)
chr3 (98-145)||(15465448-15465495)
chr3 (31-98)||(25229648-25229715)
chr3 (31-98)||(25237235-25237302)
chr3 (381-435)||(28194697-28194752)
chr3 (37-99)||(15412822-15412884)
chr3 (98-147)||(3264382-3264431)
chr3 (31-96)||(13151494-13151559)
chr3 (98-147)||(36528447-36528496)
chr3 (261-423)||(37251106-37251270)
chr3 (98-146)||(14567513-14567561)
chr3 (98-146)||(15007988-15008036)
chr3 (98-146)||(16282386-16282434)
chr3 (98-146)||(20629820-20629868)
chr3 (31-99)||(26054968-26055036)
chr3 (98-146)||(38961466-38961514)
chr3 (98-146)||(41124425-41124473)
chr3 (31-99)||(46822652-46822720)
chr3 (98-146)||(53301132-53301180)
chr3 (98-146)||(55318932-55318980)
chr3 (17-99)||(17393299-17393382)
chr3 (98-145)||(26055086-26055133)
chr3 (328-428)||(12174265-12174366)
chr3 (30-96)||(14567587-14567653)
chr3 (31-96)||(15007893-15007961)
chr3 (155-229)||(25201323-25201397)
chr3 (98-143)||(8500009-8500054)
chr3 (279-423)||(43925977-43926123)
chr3 (31-99)||(13436690-13436758)
chr3 (98-146)||(46822747-46822795)
chr3 (98-146)||(55319125-55319173)
chr3 (98-145)||(5223677-5223724)
chr3 (107-146)||(17463663-17463702)
chr3 (107-146)||(34159811-34159850)
chr3 (107-146)||(55476976-55477015)
chr3 (384-438)||(3389999-3390053)
chr3 (52-98)||(10555766-10555812)
chr3 (33-87)||(12305525-12305579)
chr3 (155-213)||(15025934-15025992)
chr3 (381-442)||(14665397-14665458)
chr3 (154-219)||(17044330-17044395)
chr3 (337-428)||(49668091-49668183)
chr3 (98-146)||(13937601-13937649)
chr3 (98-146)||(16358296-16358344)
chr3 (98-146)||(17444392-17444440)
chr3 (107-146)||(6468772-6468811)
chr3 (68-99)||(14567432-14567463)
chr3 (107-146)||(15412916-15412955)
chr3 (384-438)||(3403019-3403073)
chr3 (199-229)||(11913867-11913897)
chr3 (384-442)||(14668553-14668611)
chr3 (381-435)||(23077537-23077591)
chr3 (337-428)||(9512934-9513026)
chr3 (337-428)||(9520909-9521001)
chr3 (155-232)||(11913876-11913953)
chr3 (155-200)||(18700200-18700245)
chr3 (156-209)||(50351664-50351717)
chr3 (155-219)||(12119585-12119649)
chr3 (381-421)||(13919350-13919390)
[»] scaffold0254 (2 HSPs)
scaffold0254 (98-435)||(20751-21088)
scaffold0254 (31-99)||(21138-21207)
[»] chr7 (179 HSPs)
chr7 (98-435)||(16232524-16232861)
chr7 (98-435)||(456325-456662)
chr7 (98-435)||(15376535-15376871)
chr7 (98-435)||(16213688-16214025)
chr7 (98-435)||(20384945-20385281)
chr7 (98-435)||(21189417-21189753)
chr7 (98-435)||(41522921-41523258)
chr7 (98-435)||(41525383-41525720)
chr7 (98-435)||(11393108-11393445)
chr7 (98-435)||(27216864-27217201)
chr7 (98-435)||(32125495-32125831)
chr7 (98-435)||(14948944-14949280)
chr7 (98-435)||(16410063-16410399)
chr7 (98-435)||(18640276-18640612)
chr7 (98-435)||(24702242-24702569)
chr7 (98-441)||(18430710-18431052)
chr7 (98-435)||(24704692-24705016)
chr7 (98-435)||(13869350-13869689)
chr7 (154-435)||(11972500-11972780)
chr7 (98-435)||(26355803-26356152)
chr7 (98-435)||(26358255-26358604)
chr7 (261-435)||(44116513-44116687)
chr7 (260-435)||(3386337-3386512)
chr7 (290-448)||(24275162-24275320)
chr7 (247-423)||(13647344-13647521)
chr7 (98-277)||(11303409-11303588)
chr7 (98-288)||(18627717-18627906)
chr7 (261-435)||(17061899-17062073)
chr7 (98-276)||(16108510-16108688)
chr7 (154-346)||(15081825-15082019)
chr7 (262-435)||(20110560-20110723)
chr7 (98-229)||(8940489-8940620)
chr7 (261-435)||(38898360-38898535)
chr7 (261-423)||(12756655-12756817)
chr7 (98-276)||(23664774-23664952)
chr7 (98-276)||(29796771-29796951)
chr7 (98-276)||(29800590-29800770)
chr7 (98-229)||(14269778-14269909)
chr7 (98-229)||(15081663-15081794)
chr7 (98-227)||(45847476-45847605)
chr7 (98-229)||(8468945-8469076)
chr7 (320-435)||(48273396-48273512)
chr7 (277-435)||(3564319-3564478)
chr7 (313-435)||(13831377-13831499)
chr7 (154-276)||(14269940-14270061)
chr7 (98-219)||(13841274-13841395)
chr7 (4-99)||(8941060-8941155)
chr7 (2-99)||(8469126-8469223)
chr7 (277-435)||(18456368-18456526)
chr7 (98-232)||(11972755-11972889)
chr7 (277-441)||(12698832-12698998)
chr7 (180-294)||(13841157-13841270)
chr7 (154-256)||(45847638-45847739)
chr7 (277-441)||(38227482-38227646)
chr7 (2-99)||(38897709-38897806)
chr7 (277-441)||(9509190-9509355)
chr7 (2-99)||(11972939-11973036)
chr7 (2-99)||(16214268-16214365)
chr7 (154-276)||(38898106-38898229)
chr7 (11-99)||(21189086-21189174)
chr7 (261-427)||(2280057-2280225)
chr7 (154-276)||(8940335-8940458)
chr7 (2-99)||(14269245-14269342)
chr7 (2-99)||(15081323-15081420)
chr7 (149-229)||(38897995-38898075)
chr7 (271-426)||(26212012-26212168)
chr7 (188-276)||(8468803-8468891)
chr7 (277-427)||(15143993-15144143)
chr7 (27-99)||(23461791-23461863)
chr7 (328-426)||(10589055-10589154)
chr7 (321-441)||(22072914-22073036)
chr7 (2-59)||(45846926-45846983)
chr7 (320-441)||(67746-67868)
chr7 (261-441)||(19486682-19486864)
chr7 (31-99)||(14269467-14269535)
chr7 (31-99)||(14269660-14269728)
chr7 (31-99)||(14948826-14948894)
chr7 (31-99)||(15376417-15376485)
chr7 (31-99)||(16232911-16232979)
chr7 (31-99)||(16410449-16410517)
chr7 (31-99)||(20384827-20384895)
chr7 (31-99)||(25926833-25926901)
chr7 (31-99)||(27217251-27217319)
chr7 (31-99)||(32125881-32125949)
chr7 (262-420)||(12255730-12255892)
chr7 (33-99)||(16108394-16108460)
chr7 (31-99)||(456712-456780)
chr7 (98-146)||(14269392-14269440)
chr7 (31-99)||(18431102-18431170)
chr7 (261-441)||(10063761-10063938)
chr7 (33-99)||(11303638-11303704)
chr7 (33-99)||(23664658-23664724)
chr7 (98-146)||(8940769-8940817)
chr7 (31-99)||(15081545-15081613)
chr7 (271-355)||(15113031-15113114)
chr7 (343-441)||(16386268-16386368)
chr7 (261-441)||(16495403-16495580)
chr7 (35-99)||(17985092-17985156)
chr7 (31-99)||(18640662-18640730)
chr7 (31-99)||(24702619-24702687)
chr7 (31-99)||(24705066-24705134)
chr7 (98-146)||(38897856-38897904)
chr7 (31-99)||(41523308-41523376)
chr7 (31-99)||(41525770-41525838)
chr7 (98-146)||(45847283-45847331)
chr7 (389-441)||(47831808-47831860)
chr7 (337-435)||(14932749-14932848)
chr7 (337-435)||(15356184-15356283)
chr7 (337-435)||(15360298-15360397)
chr7 (98-145)||(25926951-25926998)
chr7 (328-441)||(34200787-34200901)
chr7 (292-440)||(40443393-40443541)
chr7 (31-89)||(8940684-8940742)
chr7 (37-99)||(13869739-13869801)
chr7 (281-428)||(18005660-18005806)
chr7 (33-99)||(29797001-29797067)
chr7 (33-99)||(29800820-29800886)
chr7 (281-427)||(16056343-16056488)
chr7 (261-427)||(1867933-1868101)
chr7 (31-99)||(10501097-10501165)
chr7 (271-355)||(15116568-15116651)
chr7 (389-441)||(15754955-15755007)
chr7 (31-99)||(16214075-16214143)
chr7 (98-146)||(16214170-16214218)
chr7 (31-99)||(18627956-18628024)
chr7 (98-146)||(21189224-21189272)
chr7 (31-99)||(26355685-26355753)
chr7 (31-99)||(26358137-26358205)
chr7 (98-145)||(1857050-1857097)
chr7 (155-234)||(13745569-13745648)
chr7 (31-93)||(13918106-13918169)
chr7 (98-145)||(13918225-13918272)
chr7 (154-229)||(15119918-15119993)
chr7 (344-448)||(15211450-15211557)
chr7 (31-81)||(14156782-14156832)
chr7 (345-441)||(28505321-28505418)
chr7 (333-428)||(811142-811238)
chr7 (31-92)||(1856933-1856994)
chr7 (31-88)||(8940877-8940934)
chr7 (98-147)||(11310239-11310288)
chr7 (34-99)||(21189302-21189367)
chr7 (98-146)||(10501215-10501263)
chr7 (98-146)||(14156896-14156944)
chr7 (281-427)||(16219677-16219823)
chr7 (155-219)||(38294567-38294631)
chr7 (330-428)||(44014192-44014291)
chr7 (31-99)||(45847358-45847426)
chr7 (107-146)||(15376351-15376390)
chr7 (107-146)||(16410544-16410583)
chr7 (107-146)||(18628051-18628090)
chr7 (107-146)||(18640757-18640796)
chr7 (261-361)||(20220128-20220225)
chr7 (107-146)||(20384761-20384800)
chr7 (107-146)||(26355619-26355658)
chr7 (107-146)||(26358071-26358110)
chr7 (98-140)||(15081470-15081512)
chr7 (100-146)||(17985208-17985254)
chr7 (381-435)||(18154901-18154955)
chr7 (34-99)||(14156592-14156657)
chr7 (261-361)||(15008437-15008536)
chr7 (107-146)||(13869833-13869872)
chr7 (417-448)||(16213622-16213653)
chr7 (68-99)||(20110748-20110779)
chr7 (107-146)||(27217346-27217385)
chr7 (384-442)||(2832504-2832562)
chr7 (155-205)||(9743795-9743845)
chr7 (34-99)||(10500934-10500999)
chr7 (30-83)||(11310162-11310214)
chr7 (155-232)||(14269888-14269965)
chr7 (155-232)||(15081773-15081850)
chr7 (328-441)||(27847838-27847950)
chr7 (155-232)||(38898054-38898131)
chr7 (155-219)||(8468902-8468966)
chr7 (155-219)||(8940446-8940510)
chr7 (98-146)||(8940962-8941010)
chr7 (98-146)||(14156707-14156755)
chr7 (98-146)||(14269585-14269633)
chr7 (155-203)||(25941523-25941571)
chr7 (155-219)||(43747672-43747736)
[»] chr2 (174 HSPs)
chr2 (98-435)||(39682317-39682654)
chr2 (98-448)||(32214752-32215092)
chr2 (98-435)||(18808947-18809283)
chr2 (98-435)||(23711835-23712171)
chr2 (98-435)||(571401-571738)
chr2 (98-435)||(23130866-23131203)
chr2 (98-435)||(23133333-23133670)
chr2 (98-435)||(23709354-23709690)
chr2 (98-435)||(34402343-34402680)
chr2 (98-435)||(26505383-26505719)
chr2 (98-435)||(26507861-26508197)
chr2 (98-435)||(28577103-28577439)
chr2 (98-435)||(24898017-24898354)
chr2 (98-435)||(24905454-24905791)
chr2 (98-435)||(24907929-24908266)
chr2 (98-435)||(24900500-24900837)
chr2 (98-435)||(24902977-24903314)
chr2 (98-435)||(32039320-32039656)
chr2 (98-435)||(23135594-23135920)
chr2 (154-435)||(6725999-6726279)
chr2 (158-435)||(21154942-21155218)
chr2 (154-431)||(24367782-24368058)
chr2 (154-435)||(22105416-22105697)
chr2 (98-435)||(24529368-24529687)
chr2 (154-435)||(38967378-38967658)
chr2 (207-435)||(45029784-45030012)
chr2 (154-354)||(24642732-24642933)
chr2 (98-448)||(25616179-25616522)
chr2 (260-435)||(43137303-43137478)
chr2 (98-277)||(20261381-20261560)
chr2 (98-229)||(23707038-23707169)
chr2 (98-229)||(24671235-24671366)
chr2 (98-229)||(24918350-24918481)
chr2 (98-229)||(24681654-24681785)
chr2 (98-276)||(10684584-10684764)
chr2 (98-229)||(24642570-24642701)
chr2 (98-229)||(38967689-38967820)
chr2 (277-441)||(22337116-22337281)
chr2 (262-441)||(19671831-19672010)
chr2 (277-441)||(23060514-23060679)
chr2 (277-441)||(23076443-23076608)
chr2 (98-232)||(22105672-22105806)
chr2 (2-99)||(23706507-23706604)
chr2 (98-213)||(45027726-45027840)
chr2 (98-232)||(21154829-21154963)
chr2 (98-232)||(24368033-24368167)
chr2 (98-232)||(41523894-41524028)
chr2 (2-99)||(21154296-21154393)
chr2 (2-99)||(24368410-24368507)
chr2 (2-99)||(24529028-24529125)
chr2 (2-99)||(24682028-24682125)
chr2 (2-99)||(41523361-41523458)
chr2 (98-232)||(6726254-6726388)
chr2 (2-99)||(6726631-6726728)
chr2 (277-441)||(22731189-22731354)
chr2 (154-276)||(23707200-23707323)
chr2 (2-99)||(24671609-24671706)
chr2 (3-99)||(24918724-24918820)
chr2 (2-99)||(22106049-22106146)
chr2 (154-276)||(24918196-24918319)
chr2 (277-441)||(22738135-22738299)
chr2 (2-99)||(23932044-23932141)
chr2 (2-99)||(32214411-32214508)
chr2 (277-435)||(298769-298929)
chr2 (277-441)||(23285866-23286027)
chr2 (157-276)||(24671081-24671201)
chr2 (277-441)||(23660024-23660188)
chr2 (154-276)||(24681500-24681623)
chr2 (11-99)||(45027395-45027483)
chr2 (361-435)||(24643034-24643108)
chr2 (277-441)||(23654341-23654506)
chr2 (277-423)||(7688-7835)
chr2 (262-427)||(23708558-23708725)
chr2 (343-441)||(38136-38234)
chr2 (294-441)||(23103369-23103515)
chr2 (31-99)||(23135970-23136038)
chr2 (247-316)||(22173799-22173868)
chr2 (31-99)||(18809333-18809401)
chr2 (31-99)||(22105856-22105924)
chr2 (31-99)||(23711717-23711785)
chr2 (31-99)||(24368217-24368285)
chr2 (31-99)||(26508247-26508315)
chr2 (31-99)||(39682704-39682772)
chr2 (31-99)||(45027608-45027676)
chr2 (33-99)||(20261610-20261676)
chr2 (321-428)||(28405990-28406099)
chr2 (31-99)||(571788-571856)
chr2 (281-435)||(7679592-7679745)
chr2 (381-441)||(23040249-23040309)
chr2 (31-99)||(23931851-23931919)
chr2 (31-99)||(24897899-24897967)
chr2 (31-99)||(24900382-24900450)
chr2 (31-99)||(24902859-24902927)
chr2 (31-99)||(24905336-24905404)
chr2 (31-99)||(26505769-26505837)
chr2 (31-99)||(28577489-28577557)
chr2 (31-99)||(31345570-31345638)
chr2 (31-99)||(32214634-32214702)
chr2 (31-99)||(41523776-41523844)
chr2 (32-99)||(38967870-38967937)
chr2 (292-441)||(20309109-20309257)
chr2 (31-99)||(6726438-6726506)
chr2 (366-441)||(8946658-8946734)
chr2 (31-99)||(21154711-21154779)
chr2 (271-347)||(22459511-22459587)
chr2 (31-99)||(23706920-23706988)
chr2 (31-99)||(24907811-24907879)
chr2 (98-146)||(24918626-24918674)
chr2 (31-99)||(32039202-32039270)
chr2 (98-146)||(41523701-41523749)
chr2 (98-145)||(31345490-31345537)
chr2 (32-99)||(41523584-41523651)
chr2 (33-99)||(10684468-10684534)
chr2 (155-229)||(21368365-21368439)
chr2 (37-99)||(23131253-23131315)
chr2 (37-99)||(23133720-23133782)
chr2 (33-99)||(24681835-24681901)
chr2 (281-428)||(25175864-25176010)
chr2 (37-99)||(34402231-34402293)
chr2 (31-96)||(23706728-23706793)
chr2 (261-361)||(23791357-23791457)
chr2 (34-99)||(24529253-24529318)
chr2 (98-146)||(6726533-6726581)
chr2 (261-423)||(20520131-20520295)
chr2 (31-99)||(21154518-21154586)
chr2 (98-146)||(22105951-22105999)
chr2 (261-423)||(23207296-23207460)
chr2 (98-146)||(23706654-23706702)
chr2 (31-99)||(23709236-23709304)
chr2 (98-146)||(24368312-24368360)
chr2 (98-146)||(24529175-24529223)
chr2 (31-99)||(24671416-24671484)
chr2 (98-146)||(24671511-24671559)
chr2 (98-146)||(24681930-24681978)
chr2 (290-423)||(32451896-32452031)
chr2 (98-142)||(41523508-41523552)
chr2 (261-300)||(29601478-29601517)
chr2 (155-229)||(23799457-23799531)
chr2 (160-236)||(22686145-22686221)
chr2 (98-146)||(23709161-23709209)
chr2 (98-146)||(24642377-24642425)
chr2 (31-99)||(24642452-24642520)
chr2 (31-99)||(24918531-24918599)
chr2 (107-146)||(18809428-18809467)
chr2 (381-444)||(22134266-22134329)
chr2 (107-146)||(23131347-23131386)
chr2 (98-141)||(23706846-23706889)
chr2 (107-146)||(23711651-23711690)
chr2 (107-146)||(26505864-26505903)
chr2 (107-146)||(26508342-26508381)
chr2 (107-146)||(27920402-27920441)
chr2 (107-146)||(32039136-32039175)
chr2 (107-146)||(34402160-34402199)
chr2 (154-197)||(41524003-41524045)
chr2 (389-427)||(18786971-18787009)
chr2 (98-144)||(32214558-32214604)
chr2 (98-144)||(45027533-45027579)
chr2 (265-361)||(24697548-24697644)
chr2 (98-146)||(21154443-21154491)
chr2 (98-146)||(21154636-21154684)
chr2 (31-99)||(23709043-23709111)
chr2 (107-146)||(571883-571922)
chr2 (107-146)||(23133814-23133853)
chr2 (107-146)||(28577584-28577623)
chr2 (107-146)||(39682799-39682838)
chr2 (391-441)||(23072019-23072069)
chr2 (155-232)||(23707148-23707225)
chr2 (155-232)||(24642680-24642757)
chr2 (155-232)||(24918294-24918371)
chr2 (155-203)||(22686062-22686110)
chr2 (381-421)||(23287384-23287424)
chr2 (110-146)||(23708980-23709016)
chr2 (384-416)||(25961597-25961629)
chr2 (381-421)||(26392403-26392443)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (98-440)||(10772-11113)
[»] chr1 (109 HSPs)
chr1 (98-440)||(21840766-21841107)
chr1 (98-435)||(13988870-13989206)
chr1 (98-435)||(23593555-23593893)
chr1 (98-435)||(21923113-21923449)
chr1 (98-435)||(21474908-21475245)
chr1 (98-448)||(16361908-16362259)
chr1 (154-435)||(29776692-29776972)
chr1 (98-435)||(15859830-15860167)
chr1 (154-435)||(29298141-29298420)
chr1 (154-435)||(31612317-31612597)
chr1 (154-435)||(22122945-22123226)
chr1 (154-435)||(16275240-16275522)
chr1 (261-441)||(13212845-13213026)
chr1 (261-435)||(21346965-21347140)
chr1 (261-435)||(21342100-21342275)
chr1 (265-435)||(40389158-40389329)
chr1 (261-435)||(21707171-21707345)
chr1 (261-435)||(21711713-21711887)
chr1 (247-423)||(45574812-45574989)
chr1 (261-435)||(433016-433189)
chr1 (98-229)||(16275078-16275209)
chr1 (277-444)||(50210168-50210336)
chr1 (98-219)||(27161408-27161529)
chr1 (98-232)||(22050658-22050792)
chr1 (98-232)||(22122836-22122970)
chr1 (98-232)||(29776947-29777081)
chr1 (277-435)||(34509787-34509946)
chr1 (98-232)||(31612572-31612706)
chr1 (2-99)||(22050511-22050608)
chr1 (277-441)||(27250684-27250849)
chr1 (154-254)||(22050767-22050866)
chr1 (98-219)||(29298461-29298582)
chr1 (2-99)||(29298825-29298922)
chr1 (2-99)||(31613142-31613239)
chr1 (277-448)||(22468651-22468823)
chr1 (2-89)||(22122495-22122582)
chr1 (277-441)||(22532270-22532435)
chr1 (2-99)||(43543292-43543389)
chr1 (2-99)||(40129475-40129572)
chr1 (11-99)||(16274746-16274834)
chr1 (279-448)||(20135181-20135351)
chr1 (261-423)||(21896194-21896358)
chr1 (155-243)||(27161518-27161605)
chr1 (98-173)||(13227129-13227204)
chr1 (263-423)||(21861510-21861672)
chr1 (98-173)||(29535317-29535392)
chr1 (2-99)||(9044679-9044776)
chr1 (2-99)||(29777324-29777421)
chr1 (277-426)||(21026696-21026846)
chr1 (2-83)||(43630263-43630344)
chr1 (381-448)||(20454613-20454680)
chr1 (261-423)||(35261019-35261180)
chr1 (2-99)||(15859476-15859574)
chr1 (9-99)||(16401505-16401595)
chr1 (341-441)||(20847173-20847274)
chr1 (31-99)||(22122718-22122786)
chr1 (271-427)||(16758664-16758822)
chr1 (31-99)||(13989256-13989324)
chr1 (31-99)||(21841157-21841225)
chr1 (31-99)||(21922995-21923063)
chr1 (32-99)||(29298632-29298699)
chr1 (33-99)||(27161292-27161358)
chr1 (31-96)||(13227257-13227322)
chr1 (31-100)||(29535441-29535510)
chr1 (31-99)||(15859712-15859780)
chr1 (31-99)||(16274959-16275027)
chr1 (31-99)||(16362309-16362377)
chr1 (31-99)||(29777131-29777199)
chr1 (31-99)||(31612756-31612824)
chr1 (262-427)||(33681022-33681188)
chr1 (317-438)||(21754049-21754170)
chr1 (33-99)||(27161099-27161165)
chr1 (31-99)||(21474790-21474858)
chr1 (98-146)||(31612851-31612899)
chr1 (261-423)||(41049974-41050138)
chr1 (261-422)||(14295494-14295652)
chr1 (154-219)||(29298408-29298473)
chr1 (223-276)||(43543214-43543267)
chr1 (98-146)||(15859624-15859672)
chr1 (98-146)||(16274884-16274932)
chr1 (98-146)||(16401407-16401455)
chr1 (281-427)||(22237642-22237788)
chr1 (31-99)||(23593437-23593505)
chr1 (98-146)||(29298727-29298775)
chr1 (98-146)||(31613044-31613092)
chr1 (98-139)||(9044826-9044867)
chr1 (262-426)||(20918620-20918782)
chr1 (277-366)||(22354527-22354616)
chr1 (321-428)||(22921868-22921976)
chr1 (98-146)||(10812634-10812682)
chr1 (98-146)||(27161215-27161263)
chr1 (98-146)||(29777226-29777274)
chr1 (107-146)||(13989351-13989390)
chr1 (384-435)||(21714549-21714600)
chr1 (33-96)||(31612952-31613015)
chr1 (100-146)||(22122645-22122691)
chr1 (98-136)||(40129387-40129425)
chr1 (264-361)||(50686695-50686792)
chr1 (389-427)||(52928038-52928076)
chr1 (155-236)||(12710130-12710211)
chr1 (31-95)||(10812709-10812773)
chr1 (271-355)||(12271642-12271725)
chr1 (107-146)||(21474724-21474763)
chr1 (30-96)||(16401315-16401381)
chr1 (328-428)||(20248293-20248394)
chr1 (384-442)||(24783155-24783213)
chr1 (155-232)||(16275188-16275265)
chr1 (381-441)||(38801447-38801507)
chr1 (155-203)||(22824136-22824184)
[»] scaffold0230 (8 HSPs)
scaffold0230 (98-435)||(13951-14288)
scaffold0230 (98-230)||(23352-23484)
scaffold0230 (10-99)||(22860-22949)
scaffold0230 (2-81)||(20685-20764)
scaffold0230 (31-99)||(14338-14406)
scaffold0230 (98-146)||(23159-23207)
scaffold0230 (98-146)||(22999-23047)
scaffold0230 (31-75)||(23074-23118)
[»] scaffold0134 (3 HSPs)
scaffold0134 (98-435)||(37825-38162)
scaffold0134 (31-99)||(38212-38280)
scaffold0134 (107-146)||(38307-38346)
[»] scaffold0363 (2 HSPs)
scaffold0363 (98-440)||(9241-9582)
scaffold0363 (31-99)||(9632-9700)
[»] chr5 (122 HSPs)
chr5 (98-435)||(264590-264926)
chr5 (98-435)||(20909016-20909352)
chr5 (98-435)||(39363388-39363725)
chr5 (98-435)||(42245187-42245523)
chr5 (98-435)||(10732762-10733098)
chr5 (98-435)||(39245140-39245476)
chr5 (98-435)||(29345984-29346320)
chr5 (98-435)||(29348457-29348793)
chr5 (98-435)||(29350930-29351266)
chr5 (98-435)||(38619438-38619777)
chr5 (98-435)||(23064515-23064854)
chr5 (154-435)||(29329938-29330215)
chr5 (154-435)||(32027397-32027677)
chr5 (98-435)||(2154453-2154772)
chr5 (154-435)||(20917830-20918106)
chr5 (154-435)||(20901904-20902168)
chr5 (98-448)||(17516985-17517328)
chr5 (261-435)||(36154767-36154938)
chr5 (262-435)||(11581184-11581357)
chr5 (265-435)||(18319021-18319192)
chr5 (261-435)||(10775660-10775834)
chr5 (261-435)||(31061072-31061247)
chr5 (98-276)||(9776521-9776699)
chr5 (98-229)||(20901742-20901873)
chr5 (265-435)||(24067111-24067282)
chr5 (98-276)||(37804724-37804902)
chr5 (277-441)||(9077953-9078118)
chr5 (277-441)||(1096468-1096633)
chr5 (98-232)||(32027652-32027786)
chr5 (2-99)||(2154113-2154210)
chr5 (277-441)||(23390451-23390616)
chr5 (277-441)||(25421533-25421698)
chr5 (2-99)||(32028609-32028706)
chr5 (2-99)||(20917328-20917425)
chr5 (98-219)||(20917668-20917789)
chr5 (2-99)||(29330566-29330663)
chr5 (277-435)||(24529227-24529386)
chr5 (277-441)||(21729019-21729184)
chr5 (277-441)||(21808344-21808509)
chr5 (277-441)||(24493570-24493734)
chr5 (335-441)||(21997547-21997654)
chr5 (277-441)||(8286797-8286963)
chr5 (277-422)||(25431414-25431560)
chr5 (98-232)||(29330190-29330323)
chr5 (2-99)||(17516452-17516549)
chr5 (2-99)||(20901402-20901499)
chr5 (297-435)||(22412191-22412329)
chr5 (277-441)||(13025312-13025476)
chr5 (277-441)||(13095496-13095660)
chr5 (2-99)||(295756-295853)
chr5 (277-426)||(22075035-22075185)
chr5 (277-423)||(22144068-22144215)
chr5 (31-99)||(32028223-32028291)
chr5 (294-439)||(37723906-37724050)
chr5 (31-99)||(10732644-10732712)
chr5 (31-99)||(20909402-20909470)
chr5 (31-99)||(29346370-29346438)
chr5 (31-99)||(29348843-29348911)
chr5 (31-99)||(29351316-29351384)
chr5 (297-384)||(20766095-20766181)
chr5 (261-441)||(40725854-40726036)
chr5 (33-99)||(17516869-17516935)
chr5 (262-428)||(21565556-21565723)
chr5 (31-99)||(264472-264540)
chr5 (31-99)||(2154335-2154403)
chr5 (31-99)||(20917550-20917618)
chr5 (31-99)||(29330373-29330441)
chr5 (31-99)||(32027836-32027904)
chr5 (31-99)||(39245526-39245594)
chr5 (31-99)||(42245069-42245137)
chr5 (344-432)||(18418590-18418678)
chr5 (381-441)||(21329556-21329617)
chr5 (34-99)||(37804609-37804674)
chr5 (98-146)||(295903-295951)
chr5 (328-423)||(20026945-20027043)
chr5 (31-99)||(20901624-20901692)
chr5 (343-441)||(21292992-21293089)
chr5 (31-99)||(32028416-32028484)
chr5 (158-229)||(18743965-18744036)
chr5 (333-441)||(21502167-21502276)
chr5 (37-99)||(39363775-39363837)
chr5 (31-99)||(295978-296046)
chr5 (98-146)||(296096-296144)
chr5 (98-146)||(17516599-17516647)
chr5 (98-146)||(20901549-20901597)
chr5 (31-99)||(23064904-23064972)
chr5 (380-435)||(20806845-20806900)
chr5 (155-229)||(1628169-1628243)
chr5 (154-232)||(20917777-20917855)
chr5 (328-428)||(22959538-22959639)
chr5 (37-99)||(38619827-38619889)
chr5 (381-441)||(19660894-19660955)
chr5 (264-423)||(22178161-22178323)
chr5 (31-100)||(32028028-32028097)
chr5 (98-146)||(17516792-17516840)
chr5 (157-229)||(21399896-21399968)
chr5 (281-427)||(26011995-26012141)
chr5 (98-146)||(29330468-29330516)
chr5 (98-146)||(32028124-32028172)
chr5 (98-146)||(32028318-32028366)
chr5 (98-146)||(32028511-32028559)
chr5 (107-146)||(264406-264445)
chr5 (107-146)||(20909497-20909536)
chr5 (107-146)||(39245621-39245660)
chr5 (107-146)||(39363869-39363908)
chr5 (343-435)||(21873257-21873350)
chr5 (381-441)||(36314578-36314639)
chr5 (98-146)||(2154260-2154308)
chr5 (31-99)||(17516674-17516742)
chr5 (98-146)||(20917475-20917523)
chr5 (98-146)||(32027931-32027979)
chr5 (107-146)||(23064999-23065038)
chr5 (384-435)||(26704078-26704129)
chr5 (384-435)||(26973811-26973862)
chr5 (381-423)||(26740705-26740747)
chr5 (155-232)||(20901852-20901929)
chr5 (155-196)||(24067282-24067323)
chr5 (381-426)||(26732892-26732937)
chr5 (271-367)||(18356389-18356485)
chr5 (155-229)||(18743852-18743923)
chr5 (389-441)||(19668899-19668951)
chr5 (155-219)||(20198507-20198571)
[»] scaffold0444 (3 HSPs)
scaffold0444 (98-435)||(13396-13733)
scaffold0444 (31-99)||(13783-13851)
scaffold0444 (106-146)||(13878-13918)
[»] scaffold0028 (12 HSPs)
scaffold0028 (98-435)||(136684-137020)
scaffold0028 (98-435)||(139153-139489)
scaffold0028 (98-435)||(144091-144427)
scaffold0028 (98-435)||(134215-134551)
scaffold0028 (98-435)||(141622-141958)
scaffold0028 (31-99)||(134601-134669)
scaffold0028 (31-99)||(137070-137138)
scaffold0028 (31-99)||(139539-139607)
scaffold0028 (31-99)||(142008-142076)
scaffold0028 (31-99)||(144477-144545)
scaffold0028 (317-428)||(132672-132784)
scaffold0028 (338-424)||(62216-62303)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (98-435)||(40404-40740)
scaffold0044 (31-99)||(40790-40858)
scaffold0044 (106-146)||(40885-40925)
[»] scaffold0001 (6 HSPs)
scaffold0001 (98-448)||(501075-501406)
scaffold0001 (261-435)||(85563-85738)
scaffold0001 (2-99)||(501648-501745)
scaffold0001 (262-428)||(160698-160864)
scaffold0001 (98-146)||(501550-501598)
scaffold0001 (32-99)||(501455-501522)
[»] scaffold0494 (4 HSPs)
scaffold0494 (222-448)||(12194-12420)
scaffold0494 (98-229)||(345-476)
scaffold0494 (154-229)||(507-582)
scaffold0494 (11-96)||(207-292)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (98-435)||(38477-38816)
scaffold0074 (2-99)||(38330-38427)
[»] scaffold0695 (2 HSPs)
scaffold0695 (98-316)||(6070-6287)
scaffold0695 (31-99)||(6337-6405)
[»] scaffold0145 (4 HSPs)
scaffold0145 (154-435)||(9753-10016)
scaffold0145 (277-441)||(32943-33107)
scaffold0145 (277-441)||(38762-38926)
scaffold0145 (156-218)||(10005-10067)
[»] scaffold0149 (5 HSPs)
scaffold0149 (156-425)||(29946-30196)
scaffold0149 (104-229)||(30229-30354)
scaffold0149 (10-99)||(30603-30692)
scaffold0149 (31-99)||(30410-30478)
scaffold0149 (98-146)||(30505-30553)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (261-435)||(158434-158608)
scaffold0003 (277-427)||(339905-340053)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (247-435)||(82076-82264)
scaffold0037 (262-427)||(22610-22776)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (247-435)||(110-298)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (261-435)||(16788-16962)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (261-435)||(4301-4475)
[»] scaffold0422 (2 HSPs)
scaffold0422 (98-276)||(3186-3364)
scaffold0422 (33-99)||(3414-3480)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (247-435)||(12068-12250)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (98-276)||(1591-1769)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (261-423)||(79268-79430)
scaffold0056 (277-444)||(17170-17340)
[»] scaffold0741 (6 HSPs)
scaffold0741 (98-276)||(4124-4304)
scaffold0741 (31-99)||(3813-3881)
scaffold0741 (31-99)||(3620-3688)
scaffold0741 (31-99)||(4006-4074)
scaffold0741 (98-146)||(3545-3593)
scaffold0741 (103-146)||(3936-3979)
[»] scaffold0306 (7 HSPs)
scaffold0306 (98-276)||(15083-15263)
scaffold0306 (2-99)||(15496-15592)
scaffold0306 (98-188)||(11161-11251)
scaffold0306 (2-99)||(10821-10918)
scaffold0306 (31-99)||(11043-11111)
scaffold0306 (98-146)||(10968-11016)
scaffold0306 (98-146)||(15398-15446)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (247-435)||(1250-1439)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (98-276)||(53693-53873)
scaffold0022 (297-435)||(116434-116571)
scaffold0022 (261-423)||(128908-129072)
scaffold0022 (67-99)||(53611-53643)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (261-435)||(4218-4392)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (261-423)||(20364-20524)
scaffold0031 (277-441)||(128752-128916)
[»] scaffold0317 (4 HSPs)
scaffold0317 (98-243)||(6757-6902)
scaffold0317 (2-99)||(6418-6514)
scaffold0317 (31-99)||(6639-6707)
scaffold0317 (98-146)||(6564-6612)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (261-431)||(2112-2283)
scaffold0247 (261-441)||(17965-18147)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (261-435)||(161073-161248)
scaffold0007 (261-360)||(164574-164674)
[»] scaffold1792 (5 HSPs)
scaffold1792 (98-230)||(416-548)
scaffold1792 (10-99)||(951-1040)
scaffold1792 (98-146)||(693-741)
scaffold1792 (98-146)||(853-901)
scaffold1792 (31-75)||(782-826)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (277-435)||(22890-23048)
[»] scaffold0747 (6 HSPs)
scaffold0747 (98-229)||(799-930)
scaffold0747 (2-99)||(1292-1389)
scaffold0747 (154-276)||(645-768)
scaffold0747 (31-99)||(980-1048)
scaffold0747 (49-99)||(1173-1223)
scaffold0747 (98-146)||(1075-1123)
[»] scaffold0043 (8 HSPs)
scaffold0043 (98-229)||(10001-10132)
scaffold0043 (2-99)||(10568-10665)
scaffold0043 (98-146)||(10277-10325)
scaffold0043 (33-99)||(10182-10248)
scaffold0043 (33-99)||(10375-10441)
scaffold0043 (154-188)||(9936-9970)
scaffold0043 (98-146)||(10470-10518)
scaffold0043 (155-232)||(9945-10022)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (297-435)||(44682-44821)
scaffold0122 (277-435)||(26020-26179)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (277-441)||(13212-13377)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (277-441)||(3106-3270)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (271-441)||(51914-52085)
scaffold0011 (292-441)||(167948-168098)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (98-212)||(57708-57822)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (277-441)||(16555-16720)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (277-444)||(3141-3309)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (277-428)||(4522-4673)
scaffold0228 (277-428)||(12104-12255)
scaffold0228 (277-428)||(22056-22207)
[»] scaffold0114 (3 HSPs)
scaffold0114 (154-270)||(27958-28073)
scaffold0114 (98-232)||(28048-28182)
scaffold0114 (277-441)||(15420-15583)
[»] scaffold0040 (5 HSPs)
scaffold0040 (98-221)||(13448-13571)
scaffold0040 (3-99)||(43323-43419)
scaffold0040 (98-176)||(43002-43080)
scaffold0040 (31-99)||(43130-43198)
scaffold0040 (98-146)||(43225-43273)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (277-433)||(39486-39642)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (277-433)||(75170-75326)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (277-441)||(1852-2017)
[»] scaffold0513 (3 HSPs)
scaffold0513 (142-229)||(10647-10734)
scaffold0513 (154-276)||(10765-10886)
scaffold0513 (155-232)||(10713-10790)
[»] scaffold1296 (3 HSPs)
scaffold1296 (3-99)||(1838-1934)
scaffold1296 (31-99)||(1645-1713)
scaffold1296 (98-146)||(1740-1788)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (292-441)||(1018-1168)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (277-441)||(4850-5015)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (277-441)||(3471-3636)
scaffold0292 (277-441)||(344-508)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (277-441)||(32913-33076)
scaffold0120 (277-441)||(45929-46092)
scaffold0120 (278-441)||(16114-16278)
scaffold0120 (380-441)||(17388-17449)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (262-441)||(8472-8649)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (277-434)||(25904-26061)
scaffold0026 (277-441)||(39859-40023)
[»] scaffold0574 (4 HSPs)
scaffold0574 (98-218)||(6682-6792)
scaffold0574 (2-99)||(7035-7132)
scaffold0574 (31-99)||(6842-6910)
scaffold0574 (98-146)||(6937-6985)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (2-99)||(18521-18618)
scaffold0322 (98-146)||(18423-18471)
[»] scaffold0106 (5 HSPs)
scaffold0106 (154-276)||(15150-15273)
scaffold0106 (130-229)||(15030-15119)
scaffold0106 (381-435)||(15298-15352)
scaffold0106 (328-441)||(1290-1402)
scaffold0106 (328-441)||(7267-7379)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (2-95)||(414-507)
scaffold0021 (294-423)||(174785-174913)
scaffold0021 (381-441)||(121767-121827)
scaffold0021 (277-353)||(124675-124751)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (262-427)||(8481-8650)
scaffold0621 (281-441)||(6536-6695)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (261-441)||(11465-11647)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (261-441)||(38194-38376)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (166-276)||(35955-36065)
scaffold0100 (337-427)||(23898-23989)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (277-441)||(6076-6244)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (328-441)||(28415-28529)
scaffold0046 (328-441)||(11293-11407)
scaffold0046 (389-441)||(1998-2050)
scaffold0046 (389-441)||(4553-4605)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (277-378)||(3485-3586)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (261-423)||(53487-53651)
[»] scaffold0042 (3 HSPs)
scaffold0042 (277-424)||(24257-24406)
scaffold0042 (31-99)||(75608-75676)
scaffold0042 (2-32)||(43329-43359)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (294-441)||(8480-8628)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (282-355)||(13092-13165)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (261-427)||(27687-27855)
[»] scaffold0064 (3 HSPs)
scaffold0064 (98-173)||(68227-68302)
scaffold0064 (31-100)||(68351-68420)
scaffold0064 (343-441)||(46996-47093)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (292-441)||(1953-2103)
[»] scaffold0278 (7 HSPs)
scaffold0278 (2-99)||(8516-8613)
scaffold0278 (98-182)||(7996-8080)
scaffold0278 (33-99)||(8130-8196)
scaffold0278 (281-428)||(5657-5803)
scaffold0278 (98-146)||(8225-8273)
scaffold0278 (31-99)||(8323-8391)
scaffold0278 (98-143)||(8421-8466)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (277-441)||(39914-40078)
scaffold0080 (322-423)||(19883-19987)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (261-423)||(13147-13312)
scaffold0357 (261-427)||(16038-16206)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (262-390)||(13144-13274)
scaffold0175 (386-434)||(281-329)
scaffold0175 (328-441)||(34124-34238)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (261-368)||(225482-225589)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (352-441)||(4713-4803)
[»] scaffold0599 (2 HSPs)
scaffold0599 (154-276)||(1204-1327)
scaffold0599 (199-229)||(1143-1173)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (261-423)||(12587-12750)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (277-441)||(10381-10543)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (292-441)||(32068-32216)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (343-435)||(11464-11557)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (277-362)||(27911-27996)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (262-427)||(10481-10647)
[»] scaffold0503 (2 HSPs)
scaffold0503 (269-333)||(12039-12103)
scaffold0503 (363-423)||(11982-12042)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (343-426)||(13513-13596)
[»] scaffold0051 (2 HSPs)
scaffold0051 (31-99)||(31594-31662)
scaffold0051 (98-145)||(31497-31544)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (277-441)||(20911-21077)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (261-361)||(7997-8098)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (328-435)||(15668-15776)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (281-428)||(129919-130066)
scaffold0010 (261-415)||(60653-60810)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (2-50)||(107108-107156)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (333-441)||(6134-6243)
[»] scaffold0200 (2 HSPs)
scaffold0200 (33-99)||(18044-18110)
scaffold0200 (98-145)||(17947-17994)
[»] scaffold0138 (4 HSPs)
scaffold0138 (33-99)||(33562-33628)
scaffold0138 (260-350)||(18175-18265)
scaffold0138 (98-145)||(33465-33512)
scaffold0138 (328-427)||(12954-13054)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (281-428)||(19278-19424)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (261-439)||(6221-6400)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (262-428)||(45732-45899)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (389-441)||(1102-1154)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (389-441)||(6612-6664)
scaffold0333 (389-441)||(13992-14044)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (261-441)||(1012-1189)
[»] scaffold0151 (3 HSPs)
scaffold0151 (98-146)||(36827-36875)
scaffold0151 (98-146)||(37020-37068)
scaffold0151 (71-99)||(36749-36777)
[»] scaffold0117 (2 HSPs)
scaffold0117 (31-99)||(39723-39791)
scaffold0117 (98-145)||(39626-39673)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (389-441)||(15845-15897)
scaffold0020 (384-435)||(178901-178952)
[»] scaffold0535 (1 HSPs)
scaffold0535 (4-47)||(7420-7463)
[»] scaffold0123 (3 HSPs)
scaffold0123 (261-427)||(25121-25288)
scaffold0123 (156-219)||(16263-16326)
scaffold0123 (261-361)||(620-719)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (292-421)||(4545-4675)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (2-44)||(60575-60617)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (281-428)||(143-290)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (321-428)||(2805-2913)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (277-366)||(918-1006)
scaffold0395 (381-441)||(4893-4953)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (328-441)||(16283-16395)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (321-428)||(14696-14804)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (261-361)||(97089-97189)
scaffold0006 (261-361)||(106367-106467)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (341-423)||(1051-1134)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (389-433)||(1091-1135)
[»] scaffold0711 (5 HSPs)
scaffold0711 (31-99)||(7201-7269)
scaffold0711 (32-99)||(7395-7461)
scaffold0711 (98-145)||(7511-7558)
scaffold0711 (98-144)||(7126-7172)
scaffold0711 (98-146)||(7319-7367)
[»] scaffold0293 (2 HSPs)
scaffold0293 (31-99)||(19792-19860)
scaffold0293 (98-145)||(19910-19957)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (321-427)||(32551-32657)
scaffold0034 (277-423)||(51839-51985)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (281-368)||(8090-8176)
scaffold0556 (328-428)||(6826-6927)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (337-435)||(29561-29660)
[»] scaffold0174 (2 HSPs)
scaffold0174 (155-234)||(15282-15361)
scaffold0174 (161-219)||(15350-15408)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (292-378)||(6675-6761)
[»] scaffold0436 (2 HSPs)
scaffold0436 (98-146)||(8311-8359)
scaffold0436 (31-99)||(8409-8477)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (344-441)||(192997-193097)
scaffold0017 (384-438)||(15273-15327)
scaffold0017 (384-438)||(19795-19849)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (389-428)||(2713-2752)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (384-435)||(23846-23897)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (277-415)||(38343-38483)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (328-423)||(51601-51695)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (389-435)||(36457-36503)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (265-427)||(8016-8180)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (317-428)||(32112-32224)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (261-423)||(267679-267843)
scaffold0005 (154-219)||(187890-187955)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (321-427)||(10542-10649)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (389-428)||(12780-12819)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (261-361)||(1736-1835)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (389-423)||(5196-5230)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (390-428)||(28839-28877)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (261-361)||(88-188)
[»] scaffold1186 (1 HSPs)
scaffold1186 (154-219)||(313-378)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (292-441)||(1021-1169)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (381-438)||(7330-7387)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (155-211)||(66762-66818)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 327; Significance: 0; HSPs: 152)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 98 - 448
Target Start/End: Original strand, 30676531 - 30676881
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676531 tatagaacttgagttatggtaaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 30676630  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676631 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 30676730  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676731 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 30676830  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 448  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676831 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 30676881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 98 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 34963714 - 34963364
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963714 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacatagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 34963615  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963614 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 34963515  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34963514 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 34963415  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 448  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963414 aactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 34963364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 12742658 - 12742321
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742658 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcaagtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 12742559  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12742558 gaccttgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 12742459  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12742458 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 12742359  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12742358 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12742321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 24422887 - 24422551
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24422887 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatac 24422789  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24422788 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 24422689  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24422688 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 24422589  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24422588 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24422551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 33862134 - 33861798
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  33862134 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatac 33862036  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33862035 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 33861936  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33861935 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 33861836  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33861835 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 33861798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 33864618 - 33864282
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  33864618 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatac 33864520  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33864519 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 33864420  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33864419 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 33864320  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33864319 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 33864282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 18334414 - 18334750
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18334414 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatac 18334512  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  18334513 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 18334612  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18334613 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 18334712  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18334713 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 18334750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 22782567 - 22782231
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  22782567 tatagaatttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatat 22782469  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22782468 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 22782369  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782368 ttacttgaattatgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 22782269  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22782268 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 22782231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 1540733 - 1541069
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  1540733 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatac 1540831  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  1540832 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgca 1540931  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1540932 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 1541031  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  1541032 aactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatg 1541069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 8055370 - 8055033
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055370 tatagaatttgagttatggtcaaattactgaatgtaggtcacaatgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 8055271  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8055270 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 8055171  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  8055170 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacttttgtgttgctgttgttattt 8055071  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8055070 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 8055033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 19858741 - 19859077
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  19858741 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgct-gtgaatac 19858839  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19858840 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattgttatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 19858939  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19858940 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 19859039  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19859040 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 19859077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 2291002 - 2291338
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  2291002 tatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatac 2291100  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  2291101 gatattgtccatgactgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 2291200  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2291201 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 2291300  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2291301 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 2291338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 26924462 - 26924798
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26924462 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtacgtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatac 26924560  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  26924561 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtacatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 26924660  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  26924661 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttattt 26924760  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26924761 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 26924798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 106 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 25688835 - 25688507
Alignment:
Q  106 ttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 205  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25688835 ttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtgacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatttttgtgaatacgatattgt 25688736  T
Q  206 tcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttga 305  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  25688735 ccatgattgaggaagtgttatatgtataaatgatgttttaagatgttgattaccatttggtgttgttatattgtgatatgattatatatgtattacttga 25688636  T
Q  306 attatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagc 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  25688635 attatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttatgttgctgttgttatttaactaagc 25688536  T
Q  406 tgcatgagtcagtctaagttgattaagat 434  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  25688535 tgcatgagtcgatctaagttgattaagat 25688507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 154 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 19005330 - 19005050
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005330 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaaatgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 19005232  T
Q  254 attaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 353  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005231 attattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 19005132  T
Q  354 atgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19005131 atgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 19005050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 171 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 25656897 - 25656633
Alignment:
Q  171 tatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttg 270  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  25656897 tatatgtatgtatatatttgtgactacgatattgtccaagattgatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgttt 25656798  T
Q  271 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25656797 ttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 25656698  T
Q  371 tatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25656697 tatactgctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 25656633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 98 - 448
Target Start/End: Original strand, 19847789 - 19848122
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19847789 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 19847888  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||                    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19847889 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg-------------------atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 19847969  T
Q  298 ttacttgaattatatgtg-aataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttat 395  Q
    ||| |||||||||||||| |||| || |||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||  |||||||  ||||  ||| || || |||| |||||||    
T  19847970 ttatttgaattatatgtgaaatatttaagatattgttgaattgcaattgatatttttatgtgttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttat 19848069  T
Q  396 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 448  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19848070 ttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgataatgatgt 19848122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 225 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 1595763 - 1595553
Alignment:
Q  225 atatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattga 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1595763 atatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatccattacttgaattatatgtgaataattga 1595664  T
Q  325 gacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 424  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1595663 gacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 1595564  T
Q  425 tgattaagatg 435  Q
    |||||||||||    
T  1595563 tgattaagatg 1595553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 247 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 25755001 - 25754813
Alignment:
Q  247 gatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 346  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25755001 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 25754902  T
Q  347 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25754901 tattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 25754813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 261 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 18456897 - 18456735
Alignment:
Q  261 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456897 tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 18456798  T
Q  361 gctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 423  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18456797 gctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18456735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 247 - 435
Target Start/End: Original strand, 20556864 - 20557050
Alignment:
Q  247 gatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 346  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  20556864 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaa--attgagacgttgttgacttgcatttga 20556961  T
Q  347 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  20556962 tattattatgccatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatg 20557050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 260 - 435
Target Start/End: Original strand, 3852000 - 3852175
Alignment:
Q  260 ttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  3852000 ttttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattatcatgtca 3852099  T
Q  360 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3852100 tgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 3852175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 265 - 435
Target Start/End: Original strand, 16448514 - 16448685
Alignment:
Q  265 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16448514 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 16448613  T
Q  364 gtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16448614 gtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 16448685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 98 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 12942542 - 12942363
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  12942542 tatagaacttgagttatggtcgaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatac 12942443  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatatt 277  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12942442 gatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 12942363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 98 - 243
Target Start/End: Original strand, 17377669 - 17377814
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17377669 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaaatagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 17377768  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 243  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17377769 tatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 17377814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 98 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 23992763 - 23992421
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23992763 tatagaacttgagttatggtcaatttactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatac 23992665  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatat---atgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataat-tatata 293  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |    ||||      ||   ||||||| | | | |||     
T  23992664 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgatgttttaagatgttgatga----ttga-----ataagatgtgatacattgtttatg 23992574  T
Q  294 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgt 392  Q
    ||||||||||||  |||   |||||| || |||   |||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||  ||| || || |||| ||||    
T  23992573 tgcattacttgagatattattgaatatttaaga---tgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgt 23992477  T
Q  393 tatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 448  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23992476 tatttagctaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgataatgatgt 23992421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 98 - 276
Target Start/End: Original strand, 28289158 - 28289334
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||   |    
T  28289158 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtga--gc 28289255  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatat 276  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  28289256 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgtcgttatat 28289334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 290 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 18462028 - 18461895
Alignment:
Q  290 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgt 389  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18462028 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgt 18461929  T
Q  390 tgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18461928 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 96 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18914275 - 18914142
Alignment:
Q  96 tgtatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaat 195  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18914275 tgtatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtaaat 18914176  T
Q  196 acgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18914175 acgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 18914142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 98 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 1598397 - 1598266
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1598397 tatagaacttgagtcatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatac 1598299  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 230  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1598298 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 1598266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 98 - 229
Target Start/End: Original strand, 31630362 - 31630493
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31630362 tatagaacttgagttatggtcaaattattgcacgtatgtcacaatgaataattaaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 31630461  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31630462 gatattgttcatgattgataaagtgttatatg 31630493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 98 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19005492 - 19005361
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |    
T  19005492 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattactataggtatgtatatgtttgtgaatgc 19005393  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  19005392 gatattgttcataattgatgaaatgttatatg 19005361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 154 - 256
Target Start/End: Original strand, 31630524 - 31630626
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31630524 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 31630623  T
Q  254 att 256  Q
    |||    
T  31630624 att 31630626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Original strand, 25629310 - 25629475
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25629310 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatact 25629409  T
Q  377 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  25629410 gcatgtgttcctgttgtaatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 25629475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 277 - 444
Target Start/End: Original strand, 18409782 - 18409950
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  |||||| |||| |||||||||   || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18409782 tgtgatataatgttatatgtattatttgaattatgaatggatgattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatact 18409881  T
Q  377 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatg 444  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  18409882 gcctgtgttgctgttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgatg 18409950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 98 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 25535748 - 25535641
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25535748 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 25535649  T
Q  198 gatattgt 205  Q
    ||||||||    
T  25535648 gatattgt 25535641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 280 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 29060703 - 29060541
Alignment:
Q  280 gatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-c 378  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  29060703 gatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcc 29060604  T
Q  379 tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||    
T  29060603 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagctgatgaagatgatgatg 29060541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 154 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 18914111 - 18913994
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18914111 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtta-tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 18914013  T
Q  254 attaccttttgatgttgtt 272  Q
    ||||   ||||||||||||    
T  18914012 attattatttgatgttgtt 18913994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 18914806 - 18914709
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18914806 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataagtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 18914709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 20593939 - 20593774
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    ||||||||| |  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20593939 tgtgatatattgttatacgcattacttgatttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatact 20593840  T
Q  377 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    || |||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||    
T  20593839 gcatgtgttgctgtttttatttaactgagctgcatgattcggtctaagttgatgaagatgatgatg 20593774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 23992910 - 23992813
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23992910 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatccggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 23992813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 294 - 441
Target Start/End: Original strand, 17287768 - 17287916
Alignment:
Q  294 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgt 392  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||    
T  17287768 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgttgt 17287867  T
Q  393 tatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  17287868 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 17287916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Original strand, 20360915 - 20361080
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20360915 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgct 20361014  T
Q  377 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||| |||||    
T  20361015 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgatgaaaatgatgatg 20361080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 103 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15875737 - 15875621
Alignment:
Q  103 aacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatat 202  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||    
T  15875737 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtaaataattgaatatgattgatgaattagtat----------atgtttgtgaatacgatat 15875648  T
Q  203 tgttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  15875647 tgttcatgattgatgaagtgttatatg 15875621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 154 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 15875590 - 15875469
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 253  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15875590 tatgattgatgaattattatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtaaatgattaatgaaatgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 15875492  T
Q  254 attaccttttgatgttgttatat 276  Q
    ||||   ||||||||||||||||    
T  15875491 attattatttgatgttgttatat 15875469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 16496410 - 16496245
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16496410 tgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatact 16496311  T
Q  377 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  16496310 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 16496245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Original strand, 19303496 - 19303660
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac- 375  Q
    |||||||||||  ||| | ||||||||||| |||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||     
T  19303496 tgtgatataatgttatgtacattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatact 19303594  T
Q  376 tgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||    
T  19303595 tcctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatg 19303660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 262 - 441
Target Start/End: Original strand, 22780166 - 22780347
Alignment:
Q  262 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 360  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  |   ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||     
T  22780166 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttgcgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcaa 22780265  T
Q  361 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22780266 gctgtttttgtatattgcctatgtttttgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatg 22780347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 277 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 25644487 - 25644335
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||  |||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||    
T  25644487 tgtgatataattgtatacgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatact 25644388  T
Q  377 g-ctgtgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 427  Q
    | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25644387 gcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25644335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Original strand, 31630022 - 31630119
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31630022 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttaaaatgaaatctggtattgataagtacatagttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 31630119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 34963861 - 34963764
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34963861 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgta 34963764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 20076862 - 20076701
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  |||||  || |||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  20076862 tgtgatataatgttatacgcattacttgaagtataattgaatttttaaga---tgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtttact 20076767  T
Q  377 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  20076766 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 20076701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 25535895 - 25535798
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25535895 tttttctgatttttcttttcatctttgccccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtagagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 25535798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 277 - 423
Target Start/End: Original strand, 18821801 - 18821946
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacg-ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 375  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||| | ||  ||||||||||||| | |||||| ||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  18821801 tgtgatataatg-tatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgcgtt-gatattgttatggcatgctgtttttgtatac 18821898  T
Q  376 tgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 423  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18821899 tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 1598930 - 1598833
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||  |||||||||    
T  1598930 tttttctgatttttcttttcatctctaccccgaatttgaaatgaaaactggtattgataggtccagaattggtcataagtgtaaacattaaagttgta 1598833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 19005832 - 19005735
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19005832 tttttatgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatttggtattgattagtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgta 19005735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Original strand, 19847453 - 19847550
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19847453 tttttctgatttttcttttcatctctgccccaaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcctaggtataaacacgaaagttgta 19847550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 292 - 441
Target Start/End: Original strand, 20638253 - 20638403
Alignment:
Q  292 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 390  Q
    |||||||||||||||  || | |||||| |  ||| |||| | | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  20638253 tatgcattacttgaagaatgtttgaatattaaagatgttgataaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt 20638352  T
Q  391 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||    
T  20638353 gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 20638403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 262 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 20109322 - 20109153
Alignment:
Q  262 ttgatgttgtt-atattgtgatataat--tatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 358  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |     
T  20109322 ttgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatt 20109223  T
Q  359 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 427  Q
    ||| || ||||| |||||| || |||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20109222 atgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 20109153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 261 - 441
Target Start/End: Original strand, 8227449 - 8227631
Alignment:
Q  261 tttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| |||    
T  8227449 tttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatca 8227548  T
Q  360 tgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    || || ||||| |||||| ||  ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||    
T  8227549 tgatg-ttttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagttgttgaagatgttgatg 8227631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 19847675 - 19847743
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19847675 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 19847743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 207 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 18937317 - 18937252
Alignment:
Q  207 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgtt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  18937317 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgtt 18937252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 1598515 - 1598447
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598515 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 1598447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 2290884 - 2290952
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2290884 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 2290952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 8055488 - 8055420
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055488 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 8055420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 15892112 - 15892180
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15892112 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 15892180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 18334296 - 18334364
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334296 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 18334364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 24423005 - 24422937
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24423005 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 24422937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 25689154 - 25689086
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25689154 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgta 25689086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 381 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714418
Alignment:
Q  381 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  25714478 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 25714418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 99
Target Start/End: Original strand, 30676200 - 30676288
Alignment:
Q  11 tttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| || |||||||||||||||  || || |||||||||    
T  30676200 tttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaaactggtattgaatggtacataattggtcttaggtgataagactaaagttgta 30676288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 30676413 - 30676481
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676413 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 30676481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 33862252 - 33862184
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33862252 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 33862184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 33864736 - 33864668
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864736 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 33864668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 33 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 12942646 - 12942580
Alignment:
Q  33 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12942646 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 12942580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 12742776 - 12742708
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742776 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 12742708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 23415423 - 23415355
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23415423 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaatttgtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 23415355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 25737101 - 25737033
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25737101 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattcgtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 25737033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 31630244 - 31630312
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31630244 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaatttgta 31630312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 99
Target Start/End: Original strand, 17883203 - 17883269
Alignment:
Q  33 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17883203 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtctttggtgtaaacacgaaagttgta 17883269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 99
Target Start/End: Original strand, 1871 - 1936
Alignment:
Q  34 aatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1871 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtacacacgaaagttgta 1936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 99
Target Start/End: Original strand, 8830 - 8895
Alignment:
Q  34 aatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8830 aatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtacacacgaaagttgta 8895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 47
Target Start/End: Original strand, 17028025 - 17028070
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaa 47  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17028025 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaa 17028070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 381 - 441
Target Start/End: Original strand, 27333277 - 27333338
Alignment:
Q  381 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  27333277 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 27333338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 381 - 441
Target Start/End: Original strand, 27394017 - 27394078
Alignment:
Q  381 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  27394017 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 27394078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 1986 - 2034
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1986 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 2034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 8945 - 8993
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8945 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 8993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 1540615 - 1540683
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1540615 ccgaatttgaaatgcaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 1540683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 1598590 - 1598542
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598590 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 1598542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 1598708 - 1598640
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1598708 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataaatggtcttaggtataaacacgaaagttgta 1598640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 1598783 - 1598735
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598783 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 1598735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 18914391 - 18914323
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18914391 ccgaatttgaaatgaaaactggtatttattggtacataattggtcttaggggtaaacacgaaagttgta 18914323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 19847600 - 19847648
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19847600 tatagaacttgagttatcgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 19847648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 19858626 - 19858694
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  19858626 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattgatcttaggtgtaaacacaaaagttgta 19858694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 281 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 23019567 - 23019425
Alignment:
Q  281 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 379  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| |    
T  23019567 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgctt 23019470  T
Q  380 gtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 423  Q
     |||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  23019469 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggtctaag 23019425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 26924344 - 26924412
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26924344 ccgaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacagaattgttcttaggtgtaaacacgaaagttgta 26924412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 27557181 - 27557113
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27557181 ccgaatttgaaatgaaaactgctattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgta 27557113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 30676338 - 30676386
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676338 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 30676386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 281 - 427
Target Start/End: Original strand, 9098473 - 9098620
Alignment:
Q  281 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgc- 378  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | |||    ||| || ||||||||  ||||||||||||| |||| |||||   | ||||| |||||||     
T  9098473 atataattatatatacattacatgaattatgtttgatg--ttgtgaagttgttgaaatgcatttgatattgttatatcatgaattgttttgcatactgcc 9098570  T
Q  379 tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 427  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9098571 tttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 9098620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 99
Target Start/End: Original strand, 28289042 - 28289108
Alignment:
Q  33 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  28289042 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtctcaggtgtaaacacaaaagttgta 28289108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 96
Target Start/End: Original strand, 9020 - 9085
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagtt 96  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9020 ccgaattttaaatgaaaactggtaatgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagtt 9085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 389 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 1561356 - 1561304
Alignment:
Q  389 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  1561356 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatg 1561304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 18914584 - 18914516
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||| |||| ||  ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18914584 ccgaattttaaattaatactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 18914516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 18914659 - 18914615
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagt 142  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18914659 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 18914615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 19005610 - 19005542
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  19005610 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattagtcttaggtgtaaacacaaaaattgta 19005542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 19005685 - 19005637
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005685 tatagaacttgagttatgttcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 19005637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 22981368 - 22981416
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22981368 tatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 22981416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 23807040 - 23806992
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23807040 tatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 23806992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 25689229 - 25689181
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25689229 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 25689181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 142
Target Start/End: Original strand, 26924269 - 26924313
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagt 142  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26924269 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 26924313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 35245749 - 35245587
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  35245749 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatact 35245654  T
Q  377 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    || | ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||| |||||    
T  35245653 gcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 35245587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 27557063 - 27557016
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27557063 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaa 27557016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Original strand, 25603406 - 25603512
Alignment:
Q  344 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg-attaagatgttgatg 441  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||  |||| | || ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  25603406 tgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaactaagtcgcatgagtcagtccatgttgaattaagatgttgatg 25603505  T
Q  442 atgatgt 448  Q
     ||||||    
T  25603506 ttgatgt 25603512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Original strand, 25611744 - 25611850
Alignment:
Q  344 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg-attaagatgttgatg 441  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||  |||| | || ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  25611744 tgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaactaagtcgcatgagtcagtccatgttgaattaagatgttgatg 25611843  T
Q  442 atgatgt 448  Q
     ||||||    
T  25611844 ttgatgt 25611850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 35056781 - 35056707
Alignment:
Q  155 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||| || ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  35056781 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgattatgatgttgttcatgattgatgaattattatatg 35056707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 328 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 19668488 - 19668386
Alignment:
Q  328 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 423  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||||| | |||||  || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  19668488 gttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-gcatactatctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 19668390  T
Q  424 ttga 427  Q
    ||||    
T  19668389 ttga 19668386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 25688961 - 25688893
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| || ||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25688961 ccgaatttgaaatcaaaactggtatttattggtaccgaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgta 25688893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 26924151 - 26924219
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||| | ||| |||||||||| ||||||||||    
T  26924151 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgta 26924219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 97
Target Start/End: Original strand, 79 - 142
Alignment:
Q  34 aatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttg 97  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||   || |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  79 aatttaaaatgaaaactggtattgagttgtacaaaattggtcttaggtgtatacacgaaagttg 142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 294 - 415
Target Start/End: Original strand, 15041522 - 15041644
Alignment:
Q  294 tgcattacttga-attatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttg 391  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||| || ||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||   ||| || || | || |||    
T  15041522 tgcattacttgagattttat-tgaatacttaagatgttattgaattgcatttgatattataatgtcatgctgttgttgtgatctgcctatgctactattg 15041620  T
Q  392 ttatttaactaagctgcatgagtc 415  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  15041621 ttatttaactaagttgcatgagtc 15041644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Original strand, 18334230 - 18334269
Alignment:
Q  107 tgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334230 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 18334269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 18914465 - 18914422
Alignment:
Q  99 atagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagt 142  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18914465 atagaacttgagttatggtcaaagtactgcacgtaggtcacagt 18914422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 23415305 - 23415258
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  23415305 tatagaacttgagttatggtcaagttactgcacgtaggtcactgtgaa 23415258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 24423071 - 24423032
Alignment:
Q  107 tgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24423071 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24423032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 328 - 425
Target Start/End: Original strand, 28496477 - 28496575
Alignment:
Q  328 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 425  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28496477 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 28496575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 328 - 425
Target Start/End: Original strand, 29808888 - 29808986
Alignment:
Q  328 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 425  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29808888 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29808986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 33864802 - 33864763
Alignment:
Q  107 tgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864802 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 33864763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 395 - 441
Target Start/End: Original strand, 22080799 - 22080845
Alignment:
Q  395 tttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  22080799 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatgatg 22080845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 32259136 - 32259078
Alignment:
Q  155 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgatt 213  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||    
T  32259136 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgatt 32259078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15875642 - 15875565
Alignment:
Q  155 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtat 232  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  15875642 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattattatatgtat 15875565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 321 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 19652316 - 19652209
Alignment:
Q  321 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagt 418  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  19652316 ttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggt 19652219  T
Q  419 ctaagttgat 428  Q
    ||||||||||    
T  19652218 ctaagttgat 19652209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 194 - 242
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  194 tatataacttgagttatggtcaaagtactgcacgtaggtcatagtgaat 242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 22782685 - 22782617
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| || ||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  22782685 ccgaatttgaaatgaaaaatggtattaattggtacagaattggtcttaggtgtaagtaggaaagttgta 22782617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 25689036 - 25688988
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  25689036 tatagaacttgcgttatggtcatattactgcacgtaggtcatagtgaat 25688988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 25689315 - 25689279
Alignment:
Q  63 tccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25689315 tccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 25689279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 25737176 - 25737128
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  25737176 tatagaacatgagttatggtcatattactgcatgtaggtcacagtgaat 25737128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Original strand, 2290818 - 2290857
Alignment:
Q  107 tgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2290818 tgagttaaggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 2290857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 99
Target Start/End: Original strand, 17377588 - 17377619
Alignment:
Q  68 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17377588 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 17377619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 22782751 - 22782712
Alignment:
Q  107 tgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22782751 tgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 22782712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Original strand, 26924085 - 26924124
Alignment:
Q  107 tgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26924085 tgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 26924124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 389 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 11185558 - 11185524
Alignment:
Q  389 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11185558 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11185524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 390 - 448
Target Start/End: Original strand, 16929658 - 16929716
Alignment:
Q  390 tgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 448  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  16929658 tgttaattaaccaagttgcatgagtcagtttaagatgattaagacgttgttgatgatgt 16929716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 390 - 448
Target Start/End: Original strand, 16965378 - 16965436
Alignment:
Q  390 tgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 448  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  16965378 tgttaattaaccaagttgcatgagtcagtttaagatgattaagacgttgttgatgatgt 16965436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 221
Target Start/End: Original strand, 17883303 - 17883333
Alignment:
Q  191 tgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17883303 tgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 17883333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 381 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 21766752 - 21766698
Alignment:
Q  381 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||| |||||||    
T  21766752 tgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatg 21766698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 441
Target Start/End: Original strand, 16920602 - 16920750
Alignment:
Q  292 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 390  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| | | |||||||||  |||||||||| ||||   ||||||||| | || |||||||    
T  16920602 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatggaatttgatatacttatgtcatgatgtt---gtatactgcctatgctgctgtt 16920698  T
Q  391 -gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || | |||||| |||||    
T  16920699 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtcaaagatgttgaagatgatgatg 16920750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18914163 - 18914086
Alignment:
Q  155 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtat 232  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  18914163 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 18914086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 381 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 22831565 - 22831524
Alignment:
Q  381 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 421  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22831565 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 22831524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 384 - 416
Target Start/End: Original strand, 19790842 - 19790874
Alignment:
Q  384 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtca 416  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19790842 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtca 19790874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 261 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 23076914 - 23076862
Alignment:
Q  261 tttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatat 312  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  23076914 tttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatat 23076862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 31630169 - 31630217
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  31630169 tatagaacttgagttatggtcaaattactacatgtatgtcacagcgaat 31630217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 381 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 33443108 - 33443068
Alignment:
Q  381 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 421  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  33443108 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 33443068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 320; Significance: 1e-180; HSPs: 167)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 98 - 437
Target Start/End: Original strand, 16413137 - 16413476
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413137 tatagaacttgagttatggtcaaattacttcacgtagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 16413236  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413237 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 16413336  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413337 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 16413436  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgtt 437  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16413437 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgtt 16413476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 14409266 - 14409602
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  14409266 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatac 14409364  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14409365 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 14409464  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409465 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 14409564  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14409565 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 14409602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 1484742 - 1484406
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  1484742 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatac 1484644  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1484643 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 1484544  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1484543 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 1484444  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1484443 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 1484406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 5853114 - 5853450
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5853114 tatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatac 5853212  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5853213 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 5853312  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5853313 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 5853412  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5853413 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 5853450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 22002093 - 22001757
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22002093 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacattgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatac 22001995  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  22001994 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 22001895  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22001894 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 22001795  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22001794 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 22001757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 4483621 - 4483285
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  4483621 tatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacactgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatat 4483522  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  4483521 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 4483422  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  4483421 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta-tt 4483323  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4483322 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 4483285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 20046017 - 20046353
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20046017 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcatgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaatgagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatac 20046115  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20046116 gatattttccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 20046215  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20046216 ttacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 20046315  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20046316 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 20046353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 4542195 - 4542531
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4542195 tatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcgcagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatac 4542293  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  4542294 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 4542393  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  4542394 ttacttgaactatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatcttgttgtgttgctgttgttattt 4542493  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4542494 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 4542531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 154 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 20403511 - 20403231
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403511 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 20403413  T
Q  254 attaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 353  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403412 attattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 20403313  T
Q  354 atgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20403312 atgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 20403231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 14824115 - 14823778
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  14824115 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgattaattagtatatgaatgtatatgtt-gtaaatac 14824017  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatat--gatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatg 295  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14824016 gatattatccatgattgatgaagtgttatatgtatatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatattgtgatataattgtatatg 14823917  T
Q  296 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  14823916 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgttgttgttat 14823817  T
Q  396 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    ||||||  |||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  14823816 ttaactttgctgcatgagt-ggtctaaattgattaagatg 14823778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 98 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 15070901 - 15070571
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070901 tatacaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcatagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 15070802  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgc 296  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||    
T  15070801 gatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatttatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattcagatataattgtatatgc 15070702  T
Q  297 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 395  Q
    || | ||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  15070701 atcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttat 15070602  T
Q  396 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 426  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15070601 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 154 - 435
Target Start/End: Original strand, 15203109 - 15203389
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15203109 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaataagatattatccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 15203207  T
Q  254 attaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 353  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15203208 attattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattatt 15203307  T
Q  354 atgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  15203308 atgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatg 15203389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 154 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 19896553 - 19896269
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttt-aagatgtt 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  19896553 tatgattgatgaattagtatatgtatatatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatatttttaagatgtt 19896455  T
Q  253 gattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatta- 351  Q
    |||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19896454 gattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattat 19896355  T
Q  352 --ttatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
      |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19896354 tattatgtcatgctgtttttgtataccgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 19896269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 154 - 439
Target Start/End: Original strand, 45290572 - 45290857
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290572 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 45290670  T
Q  254 attaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattat 352  Q
    ||||   ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  45290671 attattatttgacgttgttatactgtgatataattgtatctgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattggcttacatttgatattat 45290770  T
Q  353 tatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttga 439  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45290771 tatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttga 45290857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 98 - 326
Target Start/End: Original strand, 24485865 - 24486093
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24485865 tataaaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 24485964  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24485965 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttctaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 24486064  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgaga 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24486065 ttacttgaattatatgtgaataattgaga 24486093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 155 - 435
Target Start/End: Original strand, 19936882 - 19937164
Alignment:
Q  155 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaa--gatgtt 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||    
T  19936882 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgtt 19936980  T
Q  253 gattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatatta 351  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  19936981 gattatcatttgatgttgttatattgtgatataactgtatgtgcattgattgaattatttgtgagtaattgagacgttgattgacttgcatttgatctta 19937080  T
Q  352 ttatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  19937081 ttatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatg 19937164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 98 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 32122069 - 32121726
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32122069 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgcatatgtttgtgaatac 32121970  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataat-tatatatgc 296  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    ||||      ||   ||||||| | | | ||| |||    
T  32121969 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatgtatgatgttttaagatgttgatga----ttga-----ataagatgtgatacattgtttatgtgc 32121879  T
Q  297 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttat 395  Q
    |||||||||  |||   |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||  ||| || || |||| |||||||    
T  32121878 attacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttat 32121779  T
Q  396 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 448  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32121778 ttaactaagttgcatgagtcattctaagttgattaagatgttgataatgatgt 32121726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 261 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 41598366 - 41598192
Alignment:
Q  261 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41598366 tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 41598267  T
Q  361 gctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41598266 gctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 41598192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 98 - 448
Target Start/End: Original strand, 18677886 - 18678229
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  18677886 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatgtatatgtatatgtttgtgaatac 18677985  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataat-tatatatgc 296  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |    ||||      ||   ||||||| | | | ||| |||    
T  18677986 gatattatccatgattgatgaagtgttatatttatgtatgatgttttaagatgttgatga----ttga-----ataagatgtgatacattgtttatgtgc 18678076  T
Q  297 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttat 395  Q
    |||||||||  |||   |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||  ||| || || |||| |||||||    
T  18678077 attacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttat 18678176  T
Q  396 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 448  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18678177 ttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgataatgatgt 18678229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 98 - 256
Target Start/End: Original strand, 27472238 - 27472395
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27472238 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 27472337  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 256  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27472338 gatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatatgatg-tttaagatgttgatt 27472395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 261 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 26224097 - 26223914
Alignment:
Q  261 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26224097 tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattaaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 26223998  T
Q  361 gctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatg 444  Q
    ||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  26223997 gctatttttgtatattgctttattgctgttgttatttaattaagctgcatgggtcgatctaagttgattaagatgttgatgatg 26223914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 154 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 32810215 - 32810054
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32810215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttacatgtatatatgatgttttaagatgttg 32810117  T
Q  254 attaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtga 316  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32810116 attattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtga 32810054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 262 - 423
Target Start/End: Original strand, 19801367 - 19801527
Alignment:
Q  262 ttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 361  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19801367 ttgatgttgttatattgtgttataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcgtttgatattattatgtcatg 19801466  T
Q  362 ctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 423  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  19801467 ctg-ttttgtatactgttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagccggtctaag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 247 - 435
Target Start/End: Original strand, 25484245 - 25484426
Alignment:
Q  247 gatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 346  Q
    |||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25484245 gatgttgattatgatttgatgttattatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 25484344  T
Q  347 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||       | ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  25484345 tattattatgtcatgctgtttttgtatac-------tagctgttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatg 25484426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 98 - 229
Target Start/End: Original strand, 1326753 - 1326884
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  1326753 tataaaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtacatgtttgtaaatac 1326852  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1326853 gatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 1326884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 98 - 229
Target Start/End: Original strand, 38549826 - 38549957
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38549826 tatagaacttgagttatggtcaaaatactgcacgtatgtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 38549925  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  38549926 gatattgttcatgattgatgaatttttatatg 38549957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 98 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16198235 - 16198115
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16198235 tatagaacttgagttatggtccaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 16198136  T
Q  198 gatattgttcatgattgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16198135 gatattgttcatgattgatga 16198115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 98 - 218
Target Start/End: Original strand, 25657974 - 25658094
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  25657974 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaattt 25658073  T
Q  198 gatattgttcatgattgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  25658074 gatattgttcatgattgatga 25658094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Original strand, 16092297 - 16092462
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||| ||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092297 tgtgatataatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16092396  T
Q  377 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  16092397 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 16092462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 98 - 227
Target Start/End: Original strand, 16401746 - 16401875
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16401746 tataaaacttgagttatagtcagattacagcaggtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatac 16401845  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttata 227  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16401846 tatattgttcatgattgatgaagtgttata 16401875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 6759421 - 6759259
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||||||  ||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6759421 tgtgatataatgttatacgcattaattgaattatgagtgtataattgaga---tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 6759325  T
Q  377 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  6759324 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 6759259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 262 - 441
Target Start/End: Original strand, 18818348 - 18818529
Alignment:
Q  262 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 360  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18818348 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttacaattgatattattatgtcat 18818447  T
Q  361 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  18818448 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 18818529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 98 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24048951 - 24048841
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24048951 tatagaacttgagttatggtcaaattactgca-gtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 24048853  T
Q  198 gatattgttcat 209  Q
    |||||||| |||    
T  24048852 gatattgtncat 24048841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 277 - 444
Target Start/End: Original strand, 28648999 - 28649167
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  ||||  |||||||||||||||   || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28648999 tgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatact 28649098  T
Q  377 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatg 444  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  28649099 gcctatgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgatg 28649167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 154 - 256
Target Start/End: Original strand, 38549988 - 38550090
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 253  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38549988 tatgattgatgaattagtatacgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 38550087  T
Q  254 att 256  Q
    |||    
T  38550088 att 38550090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 289 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 7372932 - 7372779
Alignment:
Q  289 atatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgct 387  Q
    ||||| |||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  7372932 atataagcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct 7372833  T
Q  388 gttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  7372832 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 7372779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 98 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 19896662 - 19896524
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||     
T  19896662 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatgtgattgatgaattaggatatgaatgtatatgtttatgagtat 19896563  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatat 236  Q
    ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||||||    
T  19896562 gatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtatatat 19896524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 20536374 - 20536209
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20536374 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20536275  T
Q  377 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  20536274 gcctatgtttctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 20536209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 232
Target Start/End: Original strand, 15203000 - 15203134
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||     
T  15203000 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgaatgtatatgtttatgagtat 15203099  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtat 232  Q
    ||| || || |||||||||||| |  |||||||||    
T  15203100 gatgttatttatgattgatgaattagtatatgtat 15203134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 20403620 - 20403486
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||     
T  20403620 tatagaacttgagttattgtcatattactgcgcgtaggtcacagtgaataattaaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtat 20403521  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtat 232  Q
    ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  20403520 gatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 20403486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 297 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 26219858 - 26219721
Alignment:
Q  297 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 396  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  26219858 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactatttt-gtatactgctgtgtcgctgttgttatt 26219760  T
Q  397 taactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  26219759 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattatgatg 26219721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 100
Target Start/End: Original strand, 38549294 - 38549392
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38549294 tttttctgatttttcttttcatctctcccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtat 38549392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 19897195 - 19897098
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  19897195 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttagctgtaaatacaaaagttgta 19897098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 22875230 - 22875066
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22875230 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatact 22875132  T
Q  377 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  22875131 gcctgtgttgctgctgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatg 22875066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 276 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 23406548 - 23406380
Alignment:
Q  276 ttgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt--gttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtat 373  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23406548 ttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtat 23406449  T
Q  374 actgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  23406448 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 23406380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 32810384 - 32810287
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32810384 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctaatattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 32810287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 294 - 441
Target Start/End: Original strand, 21923900 - 21924048
Alignment:
Q  294 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgt 392  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  21923900 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgttgt 21923999  T
Q  393 tatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  21924000 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 21924048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 292 - 441
Target Start/End: Original strand, 21918969 - 21919120
Alignment:
Q  292 tatgcattacttgaattat-atgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgt 389  Q
    |||||||||||||||  || || |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  21918969 tatgcattacttgaagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgt 21919068  T
Q  390 tgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  21919069 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 21919120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 24049291 - 24049197
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagtt 96  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24049291 tttttatgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatatggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagtt 24049197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 297 - 435
Target Start/End: Original strand, 26225268 - 26225405
Alignment:
Q  297 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 396  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||    
T  26225268 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactgtttt-gtatattgttgtgtcgctgttgttatt 26225366  T
Q  397 taactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26225367 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 26225405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 261 - 439
Target Start/End: Original strand, 13508023 - 13508203
Alignment:
Q  261 tttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| |||    
T  13508023 tttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatca 13508122  T
Q  360 tgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttga 439  Q
    || || || || ||| || || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  13508123 tgatg-ttgtgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttga 13508203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 261 - 439
Target Start/End: Original strand, 13597555 - 13597735
Alignment:
Q  261 tttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||| || ||||||||||| |||    
T  13597555 tttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcgatattattatatca 13597654  T
Q  360 tgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttga 439  Q
    || || ||||| || |||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  13597655 tgatg-ttttgcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttga 13597735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Original strand, 15202467 - 15202564
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15202467 tttttctgatttttcttttcatctctaccccgaatttgaaatgaaatctggtattgatagatccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgta 15202564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 154 - 256
Target Start/End: Original strand, 20982604 - 20982710
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgt----tatatgtatatatgatgttttaagat 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  20982604 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatatatatatatatgatgttttaagat 20982703  T
Q  250 gttgatt 256  Q
    |||||||    
T  20982704 gttgatt 20982710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 22626901 - 22626737
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  ||||  ||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22626901 tgtgatataatgttatacacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 22626803  T
Q  377 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  22626802 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 22626737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Original strand, 27471898 - 27471995
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471898 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 27471995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Original strand, 19936390 - 19936486
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19936390 tttttctgatttttcttttta-ctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgta 19936486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 32122409 - 32122312
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32122409 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 32122312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 154 - 229
Target Start/End: Original strand, 13425336 - 13425411
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13425336 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 13425411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 154 - 229
Target Start/End: Original strand, 20982498 - 20982573
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20982498 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 20982573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 98 - 232
Target Start/End: Original strand, 45290463 - 45290597
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| ||     
T  45290463 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagatcatagtgaataattgaatatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtat 45290562  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtat 232  Q
    ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  45290563 gatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 45290597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Original strand, 1326606 - 1326703
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  1326606 tttttctgatttttcttttcatctttgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtacagaattggtcttaagtgtaaaaacgaaagttgta 1326703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 271 - 441
Target Start/End: Original strand, 17612059 - 17612230
Alignment:
Q  271 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 370  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||||| || |||||    
T  17612059 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttg 17612157  T
Q  371 tatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
     |||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  17612158 catactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 17612230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 98 - 229
Target Start/End: Original strand, 19936729 - 19936850
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||          |||||||||||||||||     
T  19936729 tatagaacttgaggtatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgtttatgattgatgaatta----------gtatatgtttgtgaatat 19936818  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19936819 tatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 19936850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 154 - 276
Target Start/End: Original strand, 1326915 - 1327042
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgt------tatatgtatatatgatgttttaag 247  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||      |||||||||||| |||||||| ||    
T  1326915 tatgattgatgaattggtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatatatatgtatatacgatgttttgag 1327013  T
Q  248 atgttgattaccttttgatgttgttatat 276  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  1327014 atgttgattattatttgatgttgttatat 1327042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 154 - 243
Target Start/End: Original strand, 16401908 - 16401996
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16401908 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaaatgttatatgtatatatgatgttt 16401996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Original strand, 16412797 - 16412894
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16412797 tttttctgatttttcttttcatctctgccgcgaatttgaaatgaaaattggtattgattggtacagaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 16412894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Original strand, 18879191 - 18879351
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  |||  ||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||     ||||||||||||||    
T  18879191 tgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgt-----tgtttttgtatact 18879285  T
Q  377 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  18879286 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 18879351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 20403960 - 20403863
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20403960 tttttcttatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgta 20403863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 277 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 23648719 - 23648547
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaa-ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 375  Q
    |||||||||||  | | ||||||||||||| || ||| |||||| || ||| |||||||  |||||  |||||||||||||||||| |||| |||||  |    
T  23648719 tgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttat-tgaatatttaagatgttgttgtattgcaaatgatattattatgtcatgttgttgttgtaatc 23648621  T
Q  376 tgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 448  Q
    ||| | ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23648620 tgcctatgttgctattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 23648547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 11361198 - 11361100
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttc-atctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  11361198 tttttctgattttttttttccatctctgccccgaatttgaaatgaaatctagtattgataggtgcataattggtcttaggtgtaaacacaaaacttgta 11361100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 15071241 - 15071144
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||  | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15071241 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaataaaaactggtattgatcggtaaagaattgatcttaggggtaaacacgaaagttgta 15071144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 165 - 229
Target Start/End: Original strand, 13425241 - 13425305
Alignment:
Q  165 aattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13425241 aattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 13425305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 292 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 31971407 - 31971258
Alignment:
Q  292 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 390  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  31971407 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattggaattgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgtt 31971309  T
Q  391 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  31971308 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 31971258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 261 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 20498745 - 20498581
Alignment:
Q  261 tttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  20498745 tttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatca 20498646  T
Q  360 tgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 423  Q
    ||||  ||||  |||||| || |||||||| |||||  ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  20498645 tgct-attttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 20498581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 16401243 - 16401310
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16401243 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggt-ttaggtgtaaacacgaaagttgta 16401310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 281 - 441
Target Start/End: Original strand, 38855212 - 38855371
Alignment:
Q  281 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 379  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  38855212 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 38855308  T
Q  380 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  38855309 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 38855371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 1484860 - 1484792
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484860 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 1484792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 4542077 - 4542145
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542077 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 4542145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 5852996 - 5853064
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5852996 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 5853064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 14409148 - 14409216
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409148 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 14409216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 19896973 - 19896905
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19896973 ccgaattttaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 19896905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 19936611 - 19936679
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19936611 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 19936679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 343 - 441
Target Start/End: Original strand, 45131019 - 45131116
Alignment:
Q  343 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||| |||||    
T  45131019 ttgatattattatgtcatgctgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 45131116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 328 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 6520483 - 6520369
Alignment:
Q  328 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 425  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6520483 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 6520385  T
Q  426 gattaagatgttgatg 441  Q
    |||||||||| |||||    
T  6520384 gattaagatgatgatg 6520369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 99
Target Start/End: Original strand, 45290252 - 45290319
Alignment:
Q  32 cgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45290252 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgta 45290319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 321 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 21285719 - 21285606
Alignment:
Q  321 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagt 418  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||    
T  21285719 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggt 21285621  T
Q  419 ctaagttgattaaga 433  Q
    |||||||||||||||    
T  21285620 ctaagttgattaaga 21285606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 14397444 - 14397512
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14397444 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagctgta 14397512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 14824233 - 14824165
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14824233 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 14824165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 15071019 - 15070951
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15071019 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgta 15070951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 15202689 - 15202757
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15202689 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 15202757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 16198353 - 16198285
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16198353 ccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 16198285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 16413019 - 16413087
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16413019 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgacagttgta 16413087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 20045899 - 20045967
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20045899 ccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 20045967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 20403738 - 20403670
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403738 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 20403670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 24485747 - 24485815
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24485747 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttgggtgtaaacacgaaagttgta 24485815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 261 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 37116531 - 37116366
Alignment:
Q  261 tttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  37116531 tttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatca 37116433  T
Q  360 tg--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 423  Q
    ||  ||| |||| | ||||| || |||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  37116432 tgaactg-ttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 37116366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 98 - 147
Target Start/End: Original strand, 15202807 - 15202856
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaata 147  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15202807 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaata 15202856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 15202882 - 15202950
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15202882 ccgaatttgaaacgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgta 15202950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 16401628 - 16401696
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16401628 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattgatacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 16401696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 18677768 - 18677836
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18677768 ccgaattttaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgta 18677836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 20403813 - 20403765
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403813 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20403765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 22002211 - 22002143
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22002211 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgta 22002143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 24049069 - 24049001
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24049069 ccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgta 24049001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 27472045 - 27472093
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27472045 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 27472093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 27472120 - 27472188
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27472120 ccgagtttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttagctgtaaacacgaaagttgta 27472188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 32122262 - 32122214
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32122262 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 32122214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 38549633 - 38549681
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38549633 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 38549681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 38549708 - 38549776
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  38549708 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtaaagaattggtcttaggtataaacacaaaagttgta 38549776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 158 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21513707 - 21513636
Alignment:
Q  158 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  21513707 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatg 21513636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 99
Target Start/End: Original strand, 16401437 - 16401503
Alignment:
Q  33 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16401437 gaatttgaaatgcaaactggtattgattggtacgtaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 16401503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 229
Target Start/End: Original strand, 18815609 - 18815683
Alignment:
Q  155 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  18815609 atgattgatgaattattatgtgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatg 18815683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 56
Target Start/End: Original strand, 37609883 - 37609936
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtatt 56  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37609883 tttttcttatttttcttttcatctctgccc-gaatttgaaatgaaatctggtatt 37609936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 145
Target Start/End: Original strand, 14397564 - 14397609
Alignment:
Q  100 tagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 145  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14397564 tagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 14397609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 343 - 441
Target Start/End: Original strand, 16199666 - 16199764
Alignment:
Q  343 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 440  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  | |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||| ||||    
T  16199666 ttgatattattatgtcatgttgttt--gaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 16199763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 15071094 - 15071046
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15071094 tatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 15071046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 15202614 - 15202662
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15202614 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 15202662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 16401360 - 16401408
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16401360 tatagaacttgagttatggtcaaattacagcacgtaggtcacagtgaat 16401408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 19896780 - 19896712
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19896780 ccgaattttaaatgaaaactggtattgattggtagagaattggtcttaggtgtaaacacgaaaattgta 19896712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 19896855 - 19896807
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19896855 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcaagtaggtcacagtgaat 19896807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 19897048 - 19897000
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19897048 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 19897000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 441
Target Start/End: Original strand, 5866280 - 5866394
Alignment:
Q  328 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 425  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  5866280 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 5866378  T
Q  426 gattaagatgttgatg 441  Q
    | | |||||| |||||    
T  5866379 gttgaagatgatgatg 5866394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 17141019 - 17140917
Alignment:
Q  340 catttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgtt 437  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  || | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |    
T  17141019 cattcgatattattatgtcatgatggatt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 17140921  T
Q  438 gatg 441  Q
    ||||    
T  17140920 gatg 17140917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 21491110 - 21490996
Alignment:
Q  328 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 425  Q
    |||||||| || ||||  |||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21491110 gttgttgatttacattcaatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 21491012  T
Q  426 gattaagatgttgatg 441  Q
    | | |||||| |||||    
T  21491011 gttgaagatgatgatg 21490996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 328 - 427
Target Start/End: Original strand, 983410 - 983512
Alignment:
Q  328 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt-tttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 424  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||| |||||   || |||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  983410 gttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaacttgtttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 983509  T
Q  425 tga 427  Q
    |||    
T  983510 tga 983512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 37 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 4483733 - 4483671
Alignment:
Q  37 ttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4483733 ttgaaatgaaaactggtatttattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgta 4483671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 229
Target Start/End: Original strand, 36733302 - 36733376
Alignment:
Q  155 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  36733302 atgattgatgatttattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtttttcatgattgatgaagtattatatg 36733376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 38988804 - 38988730
Alignment:
Q  155 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| |||  ||||||||||||||||| | |||||||    
T  38988804 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgatgttcatgattgatgaattattatatg 38988730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 39019901 - 39019827
Alignment:
Q  155 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| |||  ||||||||||||||||| | |||||||    
T  39019901 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgatgttcatgattgatgaattattatatg 39019827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 361
Target Start/End: Original strand, 17266931 - 17267031
Alignment:
Q  261 tttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  17266931 tttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacaagaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatca 17267029  T
Q  360 tg 361  Q
    ||    
T  17267030 tg 17267031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 328 - 441
Target Start/End: Original strand, 21389458 - 21389570
Alignment:
Q  328 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 425  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  21389458 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 21389554  T
Q  426 gattaagatgttgatg 441  Q
    | | |||||| |||||    
T  21389555 gttgaagatgatgatg 21389570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 328 - 441
Target Start/End: Original strand, 21395988 - 21396100
Alignment:
Q  328 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 425  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  21395988 gttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 21396084  T
Q  426 gattaagatgttgatg 441  Q
    | | |||||| |||||    
T  21396085 gttgaagatgatgatg 21396100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 328 - 441
Target Start/End: Original strand, 21778784 - 21778896
Alignment:
Q  328 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 425  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  21778784 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 21778880  T
Q  426 gattaagatgttgatg 441  Q
    | | |||||| |||||    
T  21778881 gttgaagatgatgatg 21778896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 328 - 441
Target Start/End: Original strand, 21790481 - 21790593
Alignment:
Q  328 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 425  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  21790481 gttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 21790577  T
Q  426 gattaagatgttgatg 441  Q
    | | |||||| |||||    
T  21790578 gttgaagatgatgatg 21790593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 16412944 - 16412992
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16412944 tatagaacttgagttatggtcaaattactatacgtaggtcacagtgaat 16412992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 361
Target Start/End: Original strand, 17439461 - 17439544
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 361  Q
    ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  17439461 tgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatg 17439544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 19936536 - 19936584
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19936536 tatagaacttgagttatgctcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 19936584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 32122187 - 32122119
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  32122187 ccgaatttgaaatgtaaactgatattgattggtacagaattgttcttaggtgtaaacacgaatgttgta 32122119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 38549441 - 38549488
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38549441 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagg-cacagtgaat 38549488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 38549515 - 38549583
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  38549515 ccgaatttaaaatgaaaactggtattgattggtacagaattgatcttaggtataaacacggaagttgta 38549583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 1484926 - 1484887
Alignment:
Q  107 tgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484926 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 1484887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 162 - 229
Target Start/End: Original strand, 5083001 - 5083068
Alignment:
Q  162 atgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  5083001 atgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatg 5083068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Original strand, 5852930 - 5852969
Alignment:
Q  107 tgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5852930 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 5852969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #144
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Original strand, 14409082 - 14409121
Alignment:
Q  107 tgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409082 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14409121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #145
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Original strand, 20045833 - 20045872
Alignment:
Q  107 tgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20045833 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20045872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #146
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 381 - 427
Target Start/End: Original strand, 23760903 - 23760950
Alignment:
Q  381 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 427  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23760903 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 23760950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #147
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 276
Target Start/End: Original strand, 35026849 - 35026895
Alignment:
Q  230 tatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatat 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  35026849 tatatatgatgttttaagatgttgattatcgtttgatattgttatat 35026895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #148
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 232
Target Start/End: Original strand, 19936829 - 19936906
Alignment:
Q  155 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtat 232  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  19936829 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgttcatgattgatgaattagtatatgtat 19936906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #149
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 392 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 21249434 - 21249385
Alignment:
Q  392 ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  21249434 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 21249385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #150
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 392 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 21255272 - 21255223
Alignment:
Q  392 ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  21255272 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 21255223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #151
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 24049144 - 24049104
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtca 138  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24049144 tataaaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 24049104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #152
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 219
Target Start/End: Original strand, 38549936 - 38550000
Alignment:
Q  155 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 219  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  38549936 atgattgatgaatttttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 38550000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #153
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 4483804 - 4483765
Alignment:
Q  107 tgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4483804 tgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 4483765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #154
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 14824299 - 14824260
Alignment:
Q  107 tgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14824299 tgagttatggtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaat 14824260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #155
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 428
Target Start/End: Original strand, 26355766 - 26355805
Alignment:
Q  389 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 428  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26355766 ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 26355805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 232
Target Start/End: Original strand, 1326862 - 1326940
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtat 232  Q
    ||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || | | ||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  1326862 tatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgcttttgtttatgattgatgaattggtatatgtat 1326940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 276
Target Start/End: Original strand, 2418860 - 2418906
Alignment:
Q  230 tatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatat 276  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  2418860 tatatatgatgtttcaagatgttgattatcgtttgatattgttatat 2418906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 146
Target Start/End: Original strand, 16401186 - 16401216
Alignment:
Q  116 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16401186 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 16401216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #159
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 384 - 438
Target Start/End: Original strand, 39094987 - 39095041
Alignment:
Q  384 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttg 438  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  39094987 tgcttttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgttg 39095041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #160
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 232
Target Start/End: Original strand, 13425284 - 13425361
Alignment:
Q  155 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtat 232  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  13425284 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 13425361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 381 - 418
Target Start/End: Original strand, 20533469 - 20533506
Alignment:
Q  381 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagt 418  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20533469 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcagt 20533506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 389 - 438
Target Start/End: Original strand, 20856492 - 20856541
Alignment:
Q  389 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttg 438  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  20856492 ttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgttg 20856541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 232
Target Start/End: Original strand, 20982552 - 20982629
Alignment:
Q  155 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtat 232  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  20982552 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 20982629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 32810255 - 32810190
Alignment:
Q  167 ttagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtat 232  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  32810255 ttagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 32810190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 155 - 219
Target Start/End: Original strand, 13425390 - 13425454
Alignment:
Q  155 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 219  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  13425390 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 13425454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 16401553 - 16401601
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||| |||||    
T  16401553 tatagaacttgagttatggtcaaattacagcacgtatgccacaatgaat 16401601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 71 - 99
Target Start/End: Original strand, 45290385 - 45290413
Alignment:
Q  71 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290385 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 45290413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 98 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 11630 - 11279
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11630 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagttaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 11531  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11530 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgattttgttatattgtgatataattatatatgc 11431  T
Q  297 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 396  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11430 attacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 11331  T
Q  397 taactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 448  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  11330 taactaagttgcatgagtcggtctaatttgattaagatgttgatgataatgt 11279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 11746 - 11688
Alignment:
Q  33 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacga 91  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11746 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacga 11688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 150)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 98 - 448
Target Start/End: Original strand, 14970528 - 14970878
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14970528 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatac 14970627  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14970628 gatattgttcataattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgta 14970727  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  14970728 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgctgttttgctgttgttattt 14970827  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 448  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14970828 aactaagctgcatgagttggtctaagttgattaaaatgttgatgatgatgt 14970878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 3515348 - 3515011
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  3515348 tatagaacttgagctatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattattatatgtatgtatatttttgtgaatac 3515249  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3515248 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 3515149  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3515148 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgtttttt 3515049  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3515048 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 3515011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 15118174 - 15118510
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15118174 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatac 15118272  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15118273 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 15118372  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15118373 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 15118472  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15118473 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 15118510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 44615629 - 44615292
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44615629 tatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatac 44615530  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  44615529 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 44615430  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44615429 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 44615330  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44615329 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 44615292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 19243041 - 19242703
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19243041 tatagaacttgagttatggttaaattactgaacgtaggtcatagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 19242942  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgc 296  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19242941 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttggagttgtttatattgtgatataattatatatgc 19242842  T
Q  297 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  19242841 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatt 19242742  T
Q  397 taactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19242741 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 19242703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 50222161 - 50222497
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  50222161 tatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatac 50222259  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  50222260 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatattgttatactgtgatataattgtatatgca 50222359  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  50222360 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataatgttgtgttgctgttgttattt 50222459  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50222460 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 50222497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 44772905 - 44773245
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  44772905 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatacgaatgtatatgtt-gtgaatac 44773003  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatat----gatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatata 293  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    ||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44773004 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatatatgatattttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtata 44773103  T
Q  294 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgtt 393  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44773104 tgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtt 44773203  T
Q  394 atttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44773204 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 44773245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 107 - 435
Target Start/End: Original strand, 18239250 - 18239577
Alignment:
Q  107 tgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||     
T  18239250 tgagttattgtcaaattacttcacgtaggtcacagtgaatttttgaatatgattgatgaatgagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtc 18239348  T
Q  207 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18239349 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaa 18239448  T
Q  307 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagct 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  18239449 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgctgctgttgttatttaactaagct 18239548  T
Q  407 gcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18239549 gcatgagtcggtctaagttgattaagatg 18239577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 154 - 448
Target Start/End: Original strand, 19618050 - 19618343
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 253  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19618050 tatgattgatgaattggtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 19618148  T
Q  254 attaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 353  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19618149 attaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattataggtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 19618248  T
Q  354 atgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 448  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19618249 atgtcatgatgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgataatgt 19618343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 154 - 435
Target Start/End: Original strand, 18215152 - 18215432
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215152 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 18215250  T
Q  254 attaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 353  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215251 attatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 18215350  T
Q  354 atgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18215351 atgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 18215432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 154 - 435
Target Start/End: Original strand, 12185 - 12465
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12185 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 12283  T
Q  254 attaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 353  Q
    ||||   || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12284 attattattggatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 12383  T
Q  354 atgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12384 atgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 154 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 52312794 - 52312514
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312794 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattaatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 52312696  T
Q  254 attaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 353  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312695 attattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 52312596  T
Q  354 atgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52312595 atgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 52312514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 1837341 - 1837667
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||| ||    
T  1837341 tatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgt-----------tgtgaaaac 1837429  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  1837430 gatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttataatgtgatataatcgtatatgca 1837529  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1837530 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 1837629  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1837630 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 1837667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 154 - 439
Target Start/End: Original strand, 15355202 - 15355487
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355202 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaaatgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 15355300  T
Q  254 attaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattat 352  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15355301 attattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattat 15355400  T
Q  353 tatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttga 439  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15355401 tatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttga 15355487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 7641008 - 7641340
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  7641008 tatagaacttgagttatagttaaattactgcctgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaatgagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatac 7641106  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatat------gatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattata 291  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||      ||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7641107 gatatttttcatgattgatgaagtgttatatatatatatatatatgatattttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgta 7641206  T
Q  292 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttg 391  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||          |||||||||||||    
T  7641207 tatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt----------tgtgttgctgttg 7641296  T
Q  392 ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7641297 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 7641340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 247 - 435
Target Start/End: Original strand, 51463838 - 51464026
Alignment:
Q  247 gatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 346  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51463838 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 51463937  T
Q  347 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51463938 tattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 51464026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 247 - 435
Target Start/End: Original strand, 23803235 - 23803423
Alignment:
Q  247 gatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 346  Q
    |||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23803235 gatgttgattatgattttatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttgttgatttgcatttga 23803334  T
Q  347 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23803335 tattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 23803423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 261 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 44102392 - 44102218
Alignment:
Q  261 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 360  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44102392 tttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcat 44102293  T
Q  361 gctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44102292 gctgtttttgtatactactgtgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 44102218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 98 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 15534522 - 15534343
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  15534522 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatac 15534423  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatatt 277  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15534422 gatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 15534343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 247 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 12611135 - 12610954
Alignment:
Q  247 gatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 346  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12611135 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 12611036  T
Q  347 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12611035 tattattatgtcatgctgtttttgt-------tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12610954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 261 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 15367872 - 15367691
Alignment:
Q  261 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15367872 tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtca 15367773  T
Q  360 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  15367772 tgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 15367691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 261 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 15402885 - 15402704
Alignment:
Q  261 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15402885 tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtca 15402786  T
Q  360 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  15402785 tgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 15402704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 98 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 36038211 - 36038033
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  36038211 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaagatatgtatgtatatatttgtgaatac 36038112  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatat 276  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36038111 gatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 36038033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 261 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 15371384 - 15371203
Alignment:
Q  261 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15371384 tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtca 15371285  T
Q  360 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  15371284 tgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 15371203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 261 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 15373665 - 15373484
Alignment:
Q  261 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15373665 tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtca 15373566  T
Q  360 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  15373565 tgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 15373484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 271 - 435
Target Start/End: Original strand, 44928873 - 44929038
Alignment:
Q  271 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44928873 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttg 44928972  T
Q  371 tatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44928973 tatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 44929038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 261 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 15370199 - 15370019
Alignment:
Q  261 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15370199 tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgt-agttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtca 15370101  T
Q  360 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  15370100 tgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 15370019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 263 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 16223712 - 16223533
Alignment:
Q  263 tgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatg 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16223712 tgatgttgttatattgtgatataattgtatatgggttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcattagatattattatgtcatg 16223613  T
Q  362 ctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  16223612 ctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 16223533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 261 - 423
Target Start/End: Original strand, 21815569 - 21815731
Alignment:
Q  261 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 360  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21815569 tttgatgttgttatattatgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcat 21815668  T
Q  361 gctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 423  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  21815669 gctgtttttgtatacagttgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaag 21815731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 101 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 14048915 - 14048740
Alignment:
Q  101 agaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgat 200  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14048915 agaacttgtgttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgataaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgat 14048816  T
Q  201 attgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatat 276  Q
    |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14048815 attgtcaatgattgatgaggtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 14048740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 265 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 20150004 - 20149833
Alignment:
Q  265 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20150004 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 20149905  T
Q  364 gtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20149904 gtttttgtatactgatgtgtcgctgttgttattttatcaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 20149833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 98 - 276
Target Start/End: Original strand, 49547595 - 49547773
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  49547595 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaagaattatttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatac 49547694  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatat 276  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  49547695 gatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatctatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgttatat 49547773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 98 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 362521 - 362390
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  362521 tatagaacttgatttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 362422  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  362421 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 362390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 98 - 229
Target Start/End: Original strand, 52872894 - 52873025
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52872894 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 52872993  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52872994 gatattgttcatgattgatgatgtgttatatg 52873025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 98 - 229
Target Start/End: Original strand, 19617888 - 19618019
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19617888 tatagaagttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 19617987  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19617988 tatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 19618019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 100 - 229
Target Start/End: Original strand, 18214992 - 18215121
Alignment:
Q  100 tagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacga 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18214992 tagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttattaatacga 18215091  T
Q  200 tattgttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215092 tattgttcatgattgatgaagtgttatatg 18215121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 98 - 229
Target Start/End: Original strand, 15495995 - 15496126
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  15495995 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaagtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttctgaatac 15496094  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15496095 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 15496126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 98 - 229
Target Start/End: Original strand, 14746333 - 14746464
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14746333 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattaaatatgattgatgaattagtatatatatgtatatgtttgtgaatac 14746432  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
     ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  14746433 tattatgttcatgattgatgaagtgttatatg 14746464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 98 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 29267694 - 29267570
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29267694 tatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgcgaatac 29267595  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtg 222  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  29267594 gatattgtccatgattgatgaagtg 29267570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 277 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 14038814 - 14038655
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| |||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  14038814 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatact 14038715  T
Q  377 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14038714 gcatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 14038655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 297 - 435
Target Start/End: Original strand, 54798729 - 54798868
Alignment:
Q  297 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttat 395  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54798729 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttat 54798828  T
Q  396 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54798829 tcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 54798868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 321 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 14280434 - 14280320
Alignment:
Q  321 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtct 420  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14280434 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 14280335  T
Q  421 aagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||    
T  14280334 aagttgattaagatg 14280320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 262 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 7798956 - 7798775
Alignment:
Q  262 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 360  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7798956 ttgatgttgattatgttgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtcat 7798857  T
Q  361 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  7798856 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 7798775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 126 - 229
Target Start/End: Original strand, 15355068 - 15355171
Alignment:
Q  126 tgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgtta 225  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355068 tgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatatatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgtta 15355167  T
Q  226 tatg 229  Q
    ||||    
T  15355168 tatg 15355171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 277 - 434
Target Start/End: Original strand, 16377478 - 16377634
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16377478 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg--tttgtatact 16377575  T
Q  377 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagat 434  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  16377576 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 16377634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 7089043 - 7088878
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7089043 tgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatgtaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 7088944  T
Q  377 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  7088943 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 7088878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 154 - 276
Target Start/End: Original strand, 15496949 - 15497070
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 253  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15496949 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtt-gtgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 15497047  T
Q  254 attaccttttgatgttgttatat 276  Q
    ||||   ||||||||||||||||    
T  15497048 attattatttgatgttgttatat 15497070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 12902923 - 12902758
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902923 tgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12902824  T
Q  377 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  12902823 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 12902758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Original strand, 18214685 - 18214782
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18214685 tttttctgatttttcttttcatctctgccccaaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 18214782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 154 - 275
Target Start/End: Original strand, 52873056 - 52873176
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 253  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52873056 tatgattgatgaattaatatacgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 52873154  T
Q  254 attaccttttgatgttgttata 275  Q
    ||||   |||||||||||||||    
T  52873155 attattatttgatgttgttata 52873176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 98 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19857919 - 19857798
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||    
T  19857919 tatagaacttgatttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat----------atgtttgtgaatac 19857830  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19857829 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 19857798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 277 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 22636601 - 22636437
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22636601 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaact 22636502  T
Q  377 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 440  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  22636501 gtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 22636437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 232
Target Start/End: Original strand, 12076 - 12210
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||     
T  12076 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgtgtat 12175  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtat 232  Q
     || ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  12176 tatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 12210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 266 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 22354010 - 22353852
Alignment:
Q  266 tgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt 365  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||| |||    
T  22354010 tgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgtaattgatattgttatgtcatgttgt 22353911  T
Q  366 ttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 423  Q
    |  |  |  ||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22353910 tgctacaatctgcctatgctgctgttgttatttacctaagctgcatgagtcggtctaag 22353852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Original strand, 11929 - 12026
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11929 tttttctgatttttctttttatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 12026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 7893869 - 7893704
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    ||||| |||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7893869 tgtgaaataatggtatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 7893770  T
Q  377 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||    
T  7893769 gcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagatgatgatg 7893704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Original strand, 52872554 - 52872651
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52872554 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 52872651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 330 - 441
Target Start/End: Original strand, 52873375 - 52873487
Alignment:
Q  330 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 428  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  52873375 tgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 52873474  T
Q  429 taagatgttgatg 441  Q
     |||||| |||||    
T  52873475 gaagatgatgatg 52873487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 98 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 52312902 - 52312769
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||     
T  52312902 tatagaacttgagttatagtcaa-ttactgcacgcaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtat 52312804  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtat 232  Q
    ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  52312803 gatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 52312769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 52313435 - 52313341
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagtt 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52313435 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaagaattgatcttaggtgtaaacacgaaagtt 52313341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 3515688 - 3515591
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3515688 tttttctgatttttcttttcatctctaccctgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggcgtaaacacgaaagttgta 3515591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Original strand, 16270191 - 16270355
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16270191 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 16270289  T
Q  377 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    | || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  16270290 gcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatg 16270355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 297 - 435
Target Start/End: Original strand, 8574844 - 8574981
Alignment:
Q  297 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 396  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8574844 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgttgtgtcgctgttgttatt 8574942  T
Q  397 taactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  8574943 taactaagctgcatgagtcggtctaagttaattaagatg 8574981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Original strand, 12778358 - 12778454
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12778358 tttttctgatttt-cttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 12778454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 154 - 276
Target Start/End: Original strand, 14746495 - 14746618
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||    
T  14746495 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgt 14746593  T
Q  252 tgattaccttttgatgttgttatat 276  Q
    |||||| | ||||||||||||||||    
T  14746594 tgattatcatttgatgttgttatat 14746618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 44052995 - 44052830
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  |||  ||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44052995 tgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 44052896  T
Q  377 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    | || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||    
T  44052895 gcctatgttgatgttgttatttaactgagctgcatgagtcggcctaagttgatgaagatgatgatg 44052830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 99
Target Start/End: Original strand, 19617554 - 19617645
Alignment:
Q  8 tgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19617554 tgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtacataattggtcttaggtgtagacacgaaagttgta 19617645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 261 - 423
Target Start/End: Original strand, 13789 - 13953
Alignment:
Q  261 tttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  13789 tttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatca 13888  T
Q  360 tgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 423  Q
    || || ||||| |||||| || |||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  13889 tgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 6900056 - 6899892
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||    
T  6900056 tgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgtttt-gtatact 6899958  T
Q  377 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    || | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  6899957 gcctatgttgctattgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 6899892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 142
Target Start/End: Original strand, 14745857 - 14745991
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtata 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||  ||||      | | ||||    
T  14745857 tttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatttggtattgataggtccagaattggtctgacgtcaaaac------gatttata 14745950  T
Q  102 gaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagt 142  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14745951 gcacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 14745991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 279 - 441
Target Start/End: Original strand, 16239927 - 16240089
Alignment:
Q  279 tgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg- 377  Q
    |||||||||  ||| |||||||||| || ||||  |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  16239927 tgatataatgttatttgcattacttaaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgc 16240025  T
Q  378 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    || | ||||| ||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| |||||| |||||    
T  16240026 ctattttgctattgttatttaattaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 16240089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 277 - 437
Target Start/End: Original strand, 23374314 - 23374475
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  23374314 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatact 23374413  T
Q  377 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgtt 437  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||    
T  23374414 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgttctaagttgttgaagatgtt 23374475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 261 - 427
Target Start/End: Original strand, 52243132 - 52243302
Alignment:
Q  261 tttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| |||    
T  52243132 tttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgagatgttgttgaatttcatttgatattgttatatca 52243231  T
Q  360 tg--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 427  Q
    ||  |||  |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52243232 tgaactg-atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52243302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 89
Target Start/End: Original strand, 15489630 - 15489717
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacac 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||    
T  15489630 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaagtctggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacac 15489717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 19857767 - 19857685
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatat 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  19857767 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtattttatatatatat 19857685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 363054 - 362957
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  363054 tttttatgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatgtggtattgatttgtatagaattggtcttaggtgtaaacccgaaagttgta 362957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Original strand, 14970188 - 14970285
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || || |||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  14970188 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaaactggtattgatttgtacacaattggtcttaggtgataacacaaaagttgta 14970285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 262 - 427
Target Start/End: Original strand, 43198492 - 43198661
Alignment:
Q  262 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 360  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||  |||| ||||    
T  43198492 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttatatcat 43198591  T
Q  361 g-ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 427  Q
    |  |  ||||| ||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43198592 gaattgttttgcatattgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 43198661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 19858259 - 19858162
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  19858259 tttttctaatttttcttttcatctctaccccgaatttgaaatgaaaaatggtattgattggtacagaattggtcttaggtgcaaacacaaaagttgta 19858162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 188 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 362336 - 362268
Alignment:
Q  188 ttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 256  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  362336 ttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 362268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 357 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 3096379 - 3096294
Alignment:
Q  357 tcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  3096379 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 3096294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 52313213 - 52313145
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  52313213 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattgatcttaggtgtaaacacaaaagttgta 52313145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 98 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 30147256 - 30147189
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatga 165  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30147256 tatagaacttgagttatggtcaaattactacacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatga 30147189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 3515466 - 3515398
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3515466 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgatcggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgta 3515398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 7640890 - 7640958
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7640890 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 7640958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 15118056 - 15118124
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118056 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 15118124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 29267812 - 29267744
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29267812 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 29267744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 52313020 - 52312952
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52313020 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 52312952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 52872776 - 52872844
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52872776 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 52872844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 33 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 15534638 - 15534572
Alignment:
Q  33 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15534638 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 15534572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 279 - 368
Target Start/End: Original strand, 15464888 - 15464977
Alignment:
Q  279 tgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 368  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  15464888 tgatataattgtatatgcaatacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctatttt 15464977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 362832 - 362764
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  362832 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacactaaagttgta 362764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 1837223 - 1837291
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1837223 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgta 1837291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 14746022 - 14746090
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14746022 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgta 14746090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 14970410 - 14970478
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14970410 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 14970478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 39 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 19858029 - 19857969
Alignment:
Q  39 gaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19858029 gaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 19857969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 362637 - 362571
Alignment:
Q  33 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  362637 gaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacaaaattagtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 362571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 36038327 - 36038261
Alignment:
Q  33 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36038327 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggccttaggtgtaaacacgaaagttgta 36038261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 333 - 441
Target Start/End: Original strand, 39706299 - 39706408
Alignment:
Q  333 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatta 430  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39706299 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 39706397  T
Q  431 agatgttgatg 441  Q
    ||||| |||||    
T  39706398 agatgatgatg 39706408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 99
Target Start/End: Original strand, 49547479 - 49547545
Alignment:
Q  33 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49547479 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaatttgta 49547545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 55
Target Start/End: Original strand, 15354999 - 15355052
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtat 55  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15354999 tttttctgatttttctttccatctctgccccgaatttgaaatgaaaactggtat 15355052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 3515541 - 3515493
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3515541 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 3515493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 14970335 - 14970383
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14970335 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14970383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 15495802 - 15495850
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15495802 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15495850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 30147374 - 30147306
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30147374 ccgaatttgaaatgaaaaatggaattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgta 30147306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 50222043 - 50222111
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  50222043 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagatgta 50222111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 52313288 - 52313240
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52313288 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 52313240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 52872701 - 52872749
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52872701 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 52872749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 89
Target Start/End: Original strand, 18214907 - 18214965
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacac 89  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  18214907 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacac 18214965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 12774132 - 12774021
Alignment:
Q  317 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 414  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12774132 ataattgagatgttgttga-ttgtattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 12774035  T
Q  415 cagtctaagttgat 428  Q
    | ||||||||||||    
T  12774034 cggtctaagttgat 12774021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 14185595 - 14185526
Alignment:
Q  30 cccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  14185595 cccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgttaacatgaaagttgta 14185526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 99
Target Start/End: Original strand, 15495880 - 15495945
Alignment:
Q  34 aatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15495880 aatttggaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgta 15495945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 362907 - 362859
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  362907 tatagaatttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 362859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 328 - 427
Target Start/End: Original strand, 12288214 - 12288316
Alignment:
Q  328 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 423  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||| ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12288214 gttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 12288312  T
Q  424 ttga 427  Q
    ||||    
T  12288313 ttga 12288316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 14746215 - 14746283
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  14746215 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttcggtgtaaggacgaaagttgta 14746283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 18214832 - 18214880
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18214832 tatagaacttgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 18214880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 102 - 146
Target Start/End: Original strand, 19617699 - 19617743
Alignment:
Q  102 gaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19617699 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 19617743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 19858112 - 19858064
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19858112 tatagaacttgagttatggtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaat 19858064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 44615747 - 44615679
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  44615747 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaatttgta 44615679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 44772787 - 44772855
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| || |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44772787 ccgaattttaaatgaaaactggtatttattggtagagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 44772855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 52313095 - 52313047
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52313095 tatagaacttgatttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 52313047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 97
Target Start/End: Original strand, 22725431 - 22725494
Alignment:
Q  34 aatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttg 97  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  22725431 aatttgaaatgaaaactgatattgataggtacagaattggtctttggtgtaaacatgaaagttg 22725494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 98 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 362714 - 362668
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtga 144  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  362714 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtga 362668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 14049034 - 14048969
Alignment:
Q  33 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgt 98  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  14049034 gaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacataattggttttaggtgtaaacatgaaagttgt 14048969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 381 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 15551879 - 15551818
Alignment:
Q  381 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  15551879 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 15551818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 423
Target Start/End: Original strand, 46640394 - 46640558
Alignment:
Q  261 tttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||    |||||| ||| |||| || ||||||||||| |||| |||    
T  46640394 tttgatgttgttaatgatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatga--tgttgagatgttattgattttcatttgatattgttatatca 46640491  T
Q  360 tg--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 423  Q
    ||  ||| |||| ||||||| || |||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  46640492 tgaactg-ttttatatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 46640558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 6190616 - 6190481
Alignment:
Q  290 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacg-ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgct 387  Q
    |||| |||||||||||| | ||  ||||||||||||| | |||||  ||| |||| |||||| |||||||||||| |||||| || |||| | |||||||    
T  6190616 tatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttcgcttacatt-gatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgct 6190518  T
Q  388 gtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 423  Q
    ||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6190517 gtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 14185669 - 14185621
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  14185669 tatagaacttgagttatggtcaaattattgaacgtaggtcacagtgaat 14185621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 14746140 - 14746188
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  14746140 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagatcatagtgaat 14746188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 19243159 - 19243091
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| || |||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  19243159 ccgaatttgaaacgaaaactggtattgattggtacagaattagtcttaggtataaacaagaaagttgta 19243091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 19857659 - 19857607
Alignment:
Q  224 tatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatat 276  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  19857659 tatatatatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 19857607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 22725353 - 22725401
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22725353 tataggacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacactgaat 22725401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 423
Target Start/End: Original strand, 53082090 - 53082254
Alignment:
Q  261 tttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| |||    
T  53082090 tttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatca 53082187  T
Q  360 tg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 423  Q
    ||  ||| |||| | |||||| | |||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  53082188 tgaactg-ttttatgtactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 53082254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Original strand, 15117990 - 15118029
Alignment:
Q  107 tgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15117990 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15118029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 96
Target Start/End: Original strand, 19617772 - 19617835
Alignment:
Q  33 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagtt 96  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| || | |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  19617772 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagagttggtcttaggtgttaacacaaaagtt 19617835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 343 - 441
Target Start/End: Original strand, 14053323 - 14053421
Alignment:
Q  343 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 440  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || || || || |||||||||||||||| ||||||||||  |||||| || | |||||| ||||    
T  14053323 ttgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagatgttgaagatgatgat 14053420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 381 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 17046549 - 17046488
Alignment:
Q  381 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||| |||||    
T  17046549 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 17046488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 232
Target Start/End: Original strand, 19617998 - 19618075
Alignment:
Q  155 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtat 232  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  19617998 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattggtatatgtat 19618075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 109 - 146
Target Start/End: Original strand, 44772723 - 44772760
Alignment:
Q  109 agttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44772723 agttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 44772760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 381 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 17333338 - 17333298
Alignment:
Q  381 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 421  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  17333338 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcagtcta 17333298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Original strand, 7640824 - 7640863
Alignment:
Q  107 tgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7640824 tgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 7640863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 8846553 - 8846465
Alignment:
Q  262 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 350  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  8846553 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatatt 8846465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 14629493 - 14629428
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 219  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||||||||  |||||| ||| | |||||| |||||||||    
T  14629493 tatgattgatgaagtattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgtcgttcattattgatgaa 14629428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 232
Target Start/End: Original strand, 14746443 - 14746520
Alignment:
Q  155 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtat 232  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  14746443 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 14746520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 232
Target Start/End: Original strand, 15355150 - 15355227
Alignment:
Q  155 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtat 232  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  15355150 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 15355227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 19857819 - 19857742
Alignment:
Q  155 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtat 232  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  19857819 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 19857742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 234
Target Start/End: Original strand, 26922388 - 26922445
Alignment:
Q  177 tatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatat 234  Q
    ||||||||||||  |||||| ||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  26922388 tatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgactgatgaattattatatgtatat 26922445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 155 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 362411 - 362347
Alignment:
Q  155 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 219  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  362411 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 362347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 381 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 8846418 - 8846370
Alignment:
Q  381 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 428  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  8846418 tgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgat 8846370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 177 - 229
Target Start/End: Original strand, 26922437 - 26922489
Alignment:
Q  177 tatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
    ||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  26922437 tatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatg 26922489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 4)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 5035 - 4698
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5035 tatagaacttgagttatagtcaaattacagcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 4936  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4935 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgttgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 4836  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4835 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 4736  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  4735 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaggatg 4698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 5375 - 5278
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5375 tttttctgatttttctattcatctctgccccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgta 5278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 5153 - 5085
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5153 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 5085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 5228 - 5180
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5228 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 5180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 12)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 98 - 437
Target Start/End: Original strand, 17261 - 17600
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17261 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatagttgaatatgatcgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatac 17360  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17361 gatattgttcatgattgatgaagtgtcatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatactgtgatataattatatatgca 17460  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17461 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctattgttattt 17560  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgtt 437  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17561 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgtt 17600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 94751 - 94415
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  94751 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatac 94653  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  94652 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 94553  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  94552 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 94453  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  94452 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 94415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 280 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 44614 - 44458
Alignment:
Q  280 gatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgc 378  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  44614 gatataattctatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgt 44515  T
Q  379 tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44514 tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 44458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Original strand, 16921 - 17018
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||| || ||||| |  |||||||||||||||    
T  16921 tttttctgatttttcttttcatctctgccccaaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaatttgtgttaggggataacacgaaagttgta 17018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 281 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 100534 - 100388
Alignment:
Q  281 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 379  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  || |||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  100534 atataattgtatatacattatatgaattat--gttaatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgattt-gcatactgcct 100438  T
Q  380 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 428  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  100437 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 100388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 94869 - 94801
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94869 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 94801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 17143 - 17211
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17143 ccgaatttgaaatgaaaacttgtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 17211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 281 - 428
Target Start/End: Original strand, 40135 - 40281
Alignment:
Q  281 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 379  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |  |||||| |    
T  40135 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcctactgcct 40231  T
Q  380 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 428  Q
     ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40232 atgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 40281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #9
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 381 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 119937 - 119876
Alignment:
Q  381 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  119937 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 119876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #10
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 94935 - 94896
Alignment:
Q  107 tgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94935 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 94896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 17068 - 17116
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  17068 tatagaacttgagttatgatcaaattaatgcacgtaggtcatagtgaat 17116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 384 - 435
Target Start/End: Original strand, 38542 - 38593
Alignment:
Q  384 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  38542 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgattaagatg 38593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 195)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 98 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 13544364 - 13544016
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13544364 tatagaacttgagttatagtcaaat-actgcacgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatac 13544267  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544266 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 13544167  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13544166 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgctgtgttgctgttgttattt 13544067  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 448  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13544066 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgataatgatgt 13544016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 98 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 12567900 - 12567551
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12567900 tatagaacttgagttatagtcaaattacttcatgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatac 12567802  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567801 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 12567702  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12567701 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgctgtgttgctgttgttattt 12567602  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 448  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12567601 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgtttatgatgt 12567551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 17463518 - 17463182
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  17463518 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatac 17463420  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17463419 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 17463320  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17463319 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 17463220  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17463219 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17463182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 34159666 - 34159330
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  34159666 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatac 34159568  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  34159567 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 34159468  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34159467 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 34159368  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34159367 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 34159330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 45606728 - 45607065
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45606728 tatagaatttgagttatggtcaaattactgaatgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 45606827  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45606828 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 45606927  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45606928 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 45607027  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45607028 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 45607065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 6468956 - 6469292
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  6468956 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatac 6469054  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6469055 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 6469154  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6469155 ttacttcaattatatgtgactaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 6469254  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6469255 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 6469292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 7781168 - 7781505
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781168 tatagaacttgagttatggtcaaattactgaacataggtcacagtgaataattgattatgatcgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 7781267  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7781268 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 7781367  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7781368 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 7781467  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7781468 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 7781505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 55476831 - 55476495
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  55476831 tatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatac 55476733  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  55476732 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 55476633  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  55476632 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 55476533  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  55476532 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 55476495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 16454103 - 16454439
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16454103 tatagaactatagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatac 16454201  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  16454202 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 16454301  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16454302 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 16454401  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16454402 aactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16454439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 13154077 - 13154414
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  13154077 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatac 13154175  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  13154176 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 13154275  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13154276 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 13154375  T
Q  398 aact-aagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13154376 aactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 13154414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 10247545 - 10247881
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  10247545 tatagaacttgatttatactcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatac 10247643  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10247644 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 10247743  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  10247744 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgctgctgttgttattt 10247843  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  10247844 aactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatg 10247881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 13151612 - 13151949
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  13151612 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaaggtatatgtt-gtgaatac 13151710  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  13151711 gatattgtccatgcctgatgaagtgtgatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 13151810  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13151811 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 13151910  T
Q  398 aact-aagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13151911 aactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 13151949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 28848443 - 28848769
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||    
T  28848443 tatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgt-----------tgtgaatac 28848531  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  28848532 gatattttccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgca 28848631  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28848632 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 28848731  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28848732 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 28848769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 154 - 435
Target Start/End: Original strand, 9707484 - 9707765
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707484 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 9707583  T
Q  254 attaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 353  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9707584 attattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattatt 9707683  T
Q  354 atgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9707684 atgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 9707765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 154 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 8899378 - 8899098
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899378 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 8899280  T
Q  254 attaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 353  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899279 attatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 8899180  T
Q  354 atgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  8899179 atgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatg 8899098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 8499861 - 8499522
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8499861 tatagaacttgagttatggtgaaattacggaacataggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 8499762  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgc 296  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  8499761 gatattgtccatgattaatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgc 8499662  T
Q  297 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 395  Q
    |||| ||  ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  8499661 attaattagattatctgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttat 8499562  T
Q  396 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8499561 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 8499522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 15412772 - 15412433
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15412772 tatagaacttgatttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgtataattgattatgatcgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 15412673  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgc 296  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  15412672 gatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgaagttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgggatataattgtatatgc 15412573  T
Q  297 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 395  Q
    || | ||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  15412572 atcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttat 15412473  T
Q  396 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15412472 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 15412433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 154 - 435
Target Start/End: Original strand, 16282689 - 16282969
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282689 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 16282787  T
Q  254 attaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 353  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16282788 attattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattcaatattatt 16282887  T
Q  354 atgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16282888 atgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16282969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 154 - 431
Target Start/End: Original strand, 38961769 - 38962045
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961769 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgttttaagatgttg 38961867  T
Q  254 attaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 353  Q
     |||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961868 gttattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 38961967  T
Q  354 atgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaa 431  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38961968 atgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 38962045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 154 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 41124171 - 41123894
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41124171 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattggtgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 41124073  T
Q  254 attaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 353  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41124072 attattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 41123973  T
Q  354 atgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41123972 atgtcatgctgtttttgtatactgttgtgt---tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 41123894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 27165593 - 27165254
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27165593 tatagaacttgagttatgatcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 27165494  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgc 296  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  27165493 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgc 27165394  T
Q  297 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgtta 394  Q
    | ||||| |||||||| |||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||  ||| ||||| || ||||| |||||| || | |||||| ||||||    
T  27165393 aatacttaaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattggtatatcatgttg-ttttgcatactgtctatattgctgtttgtta 27165295  T
Q  395 tttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27165294 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 27165254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 53301325 - 53301665
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53301325 tatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 53301424  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgc 296  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||| |     
T  53301425 gatattgtacatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccattttatgttgtttatattgtgatataattgtatacgt 53301524  T
Q  297 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgtt 393  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||  |||  |||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  53301525 aatacttgaattatatatgaatatttgagatattgaatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgtctatgttgctgtttgtt 53301623  T
Q  394 atttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  53301624 atttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatg 53301665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 236 - 435
Target Start/End: Original strand, 17446614 - 17446812
Alignment:
Q  236 tgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 335  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17446614 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttga 17446713  T
Q  336 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17446714 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagttgattaagatg 17446812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 98 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 46822602 - 46822259
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46822602 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 46822503  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataat-tatatatgc 296  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    ||||      ||   ||||||| | | | ||| |||    
T  46822502 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatgtatgatgttttaagatgttgatga----ttga-----ataagatgtgatacattgtttatgtgc 46822412  T
Q  297 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttat 395  Q
    |||||||||  |||   |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||  ||||  ||| || || |||| |||||||    
T  46822411 attacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttat 46822312  T
Q  396 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 448  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46822311 ttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgataatgatgt 46822259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 247 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 50243014 - 50242830
Alignment:
Q  247 gatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 346  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50243014 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 50242915  T
Q  347 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaa 431  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50242914 tattattatgtcatgttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 50242830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 261 - 435
Target Start/End: Original strand, 29172566 - 29172741
Alignment:
Q  261 tttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29172566 tttgatgttgatagtattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 29172665  T
Q  360 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29172666 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 29172741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 261 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 17672804 - 17672630
Alignment:
Q  261 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 360  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17672804 tttgatgatgttatattgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcat 17672705  T
Q  361 gctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17672704 gctgtttttgtatactgctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17672630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 98 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 54521163 - 54520985
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  54521163 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatac 54521064  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatat 276  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54521063 gatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 54520985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 98 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 15977873 - 15977696
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  15977873 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatac 15977775  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatat 276  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||    
T  15977774 gatattgtccatgattgataaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttggttattatttgatgttgttatat 15977696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 261 - 435
Target Start/End: Original strand, 12119708 - 12119883
Alignment:
Q  261 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12119708 tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtca 12119807  T
Q  360 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12119808 tgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12119883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 98 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 12305486 - 12305315
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  12305486 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatac 12305387  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgtt 269  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12305386 gatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgtt 12305315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 261 - 423
Target Start/End: Original strand, 53070637 - 53070799
Alignment:
Q  261 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 360  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  53070637 tttgatgttgttagattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtctt 53070736  T
Q  361 gctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 423  Q
    | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53070737 gttgtttttgtatactgttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 247 - 423
Target Start/End: Original strand, 43550448 - 43550625
Alignment:
Q  247 gatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 346  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43550448 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatacattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 43550547  T
Q  347 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 423  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43550548 tattattatgtcatgttgtttttgcatactgcatatgttgctgtcattatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 43550625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 98 - 229
Target Start/End: Original strand, 12119475 - 12119606
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12119475 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 12119574  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12119575 gatattgttcatgattgatgaagtattatatg 12119606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 98 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 10557249 - 10557091
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  10557249 tatagaacttgagttatggtcagattactgcacataggtcactgtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaattc 10557150  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 256  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10557149 gatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttgagatgttgatt 10557091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 98 - 274
Target Start/End: Original strand, 29544663 - 29544839
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| || |     
T  29544663 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatctatatatttgttaaaat 29544762  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttat 274  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29544763 gatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttat 29544839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 308 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 15977646 - 15977519
Alignment:
Q  308 tatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctg 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977646 tatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctg 15977547  T
Q  408 catgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  15977546 catgagtcggtctaagttgattaagatg 15977519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 98 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13436640 - 13436520
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13436640 tatagaacttgagttatggtccaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatatatatgtttgtgaatac 13436541  T
Q  198 gatattgttcatgattgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  13436540 gatattgttcatgattgatga 13436520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 14973020 - 14972855
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||   || |||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14973020 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatatgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14972921  T
Q  377 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  14972920 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 14972855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 277 - 435
Target Start/End: Original strand, 40213676 - 40213834
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||| |||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  40213676 tgtgatataatgttatacgcattacttggattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatact 40213775  T
Q  377 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  40213776 gctgtgttgatgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatg 40213834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 328 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 55501053 - 55500946
Alignment:
Q  328 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  55501053 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 55500954  T
Q  428 ttaagatg 435  Q
    ||||||||    
T  55500953 ttaagatg 55500946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 297 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 36166739 - 36166602
Alignment:
Q  297 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 396  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  36166739 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgctgtgtcgctgttgttatt 36166641  T
Q  397 taactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36166640 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 36166602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 98 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 24514017 - 24513910
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24514017 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 24513918  T
Q  198 gatattgt 205  Q
     |||||||    
T  24513917 tatattgt 24513910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 98 - 232
Target Start/End: Original strand, 38961660 - 38961794
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||     
T  38961660 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtat 38961759  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtat 232  Q
    ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  38961760 gatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 38961794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 260 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 42386594 - 42386428
Alignment:
Q  260 ttttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 358  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42386594 ttttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtc 42386495  T
Q  359 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 424  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  42386494 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaaactgcatgagtcggtctaagt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 17488022 - 17487857
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17488022 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17487923  T
Q  377 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  17487922 gtctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 17487857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 17499504 - 17499339
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17499504 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17499405  T
Q  377 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  17499404 gtctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 17499339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 98 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 25237184 - 25237063
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||     
T  25237184 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtat 25237085  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaa 219  Q
    ||| ||||| ||||||||||||    
T  25237084 gatgttgtttatgattgatgaa 25237063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Original strand, 25476340 - 25476505
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  |||  ||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25476340 tgtgatataatgttatgcgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 25476439  T
Q  377 -gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
      |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  25476440 acctgtgttgctgttgttttttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 25476505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 262 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 43841114 - 43840940
Alignment:
Q  262 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 360  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43841114 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcat 43841015  T
Q  361 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagat 434  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  43841014 gctgtttttgtatactgtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgatgaagat 43840940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 24514164 - 24514067
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24514164 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgatagctccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 24514067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 262 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 26687069 - 26686888
Alignment:
Q  262 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 360  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||   ||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26687069 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatggaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcat 26686970  T
Q  361 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||    
T  26686969 gctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagaagatgatgatg 26686888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 297 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 21618590 - 21618459
Alignment:
Q  297 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 396  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21618590 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgttgtgtcgctgttgttatt 21618492  T
Q  397 taactaagctgcatgagtcagtctaagttgatt 429  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21618491 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 21618459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 8899513 - 8899418
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttg 97  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899513 tttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttg 8899418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 98 - 232
Target Start/End: Original strand, 16282579 - 16282714
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||     
T  16282579 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtat 16282678  T
Q  198 gatattg-ttcatgattgatgaagtgttatatgtat 232  Q
    ||| ||| || |||||||||||| |  |||||||||    
T  16282679 gatgttgttttatgattgatgaattagtatatgtat 16282714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 261 - 441
Target Start/End: Original strand, 24340661 - 24340843
Alignment:
Q  261 tttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| |||    
T  24340661 tttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatca 24340760  T
Q  360 tgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    || || || || ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  24340761 tgatg-ttgtgcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 24340843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 96
Target Start/End: Original strand, 20629673 - 20629767
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagtt 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20629673 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagtt 20629767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 41124280 - 41124146
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||     
T  41124280 tatagaacttgagttatagtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaactagtatatgaatgtatatgtttatgagtat 41124181  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtat 232  Q
    ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  41124180 gatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 41124146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 13442440 - 13442275
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13442440 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 13442341  T
Q  377 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  13442340 gcctatgttgccgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 13442275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Original strand, 16282239 - 16282336
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282239 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttaaaatgaaatctggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 16282336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 18438700 - 18438535
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||  |||   || ||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18438700 tgtgatataatgttatatgcattacttgagatatgaatgtataaaaaagatgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 18438601  T
Q  377 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  18438600 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 18438535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Original strand, 23083316 - 23083481
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||| ||| || |  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23083316 tgtgatataatgttatgtgcattactagaagtaaaattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatact 23083415  T
Q  377 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  23083416 gcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 23083481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Original strand, 38961319 - 38961416
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961319 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatatggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 38961416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Original strand, 55318785 - 55318882
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  55318785 tttttctgatttttcttttcatctctgccccaaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 55318882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 292 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 12399360 - 12399210
Alignment:
Q  292 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 390  Q
    ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  12399360 tatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt 12399261  T
Q  391 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  12399260 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 12399210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 292 - 441
Target Start/End: Original strand, 20698405 - 20698555
Alignment:
Q  292 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 390  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||  | ||| |||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  20698405 tatgcattacttgaagaatatttgaatatataagatgttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 20698504  T
Q  391 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  20698505 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 20698555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 99
Target Start/End: Original strand, 17444253 - 17444342
Alignment:
Q  10 atttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17444253 atttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacaggaaagttgta 17444342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 98 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 25229597 - 25229476
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||     
T  25229597 tatagaacttgagttatagtcaaattactacacataagtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtat 25229498  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaa 219  Q
    ||| ||||| ||||||||||||    
T  25229497 gatgttgtttatgattgatgaa 25229476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 277 - 428
Target Start/End: Original strand, 14576788 - 14576939
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  14576788 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtt-tatact 14576886  T
Q  377 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 428  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  14576887 gtctatgttgctgttgttatttaactaagttgaatgagtcggtctaagttgat 14576939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 336 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 10557088 - 10556989
Alignment:
Q  336 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10557088 cttgcatttgatattattatgtcatgccgtttttgtatgctgatgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 10556989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Original strand, 11424718 - 11424879
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||||||||||   |||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  11424718 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgcataattgaga---tgttgatttgctattgatattgttatgtcatgctgtttt-gtatact 11424813  T
Q  377 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  11424814 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatg 11424879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 277 - 435
Target Start/End: Original strand, 24153164 - 24153322
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||| ||  ||| ||||||| ||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24153164 tgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 24153262  T
Q  377 -gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
      || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24153263 acctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24153322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 340 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 44494908 - 44494813
Alignment:
Q  340 catttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  44494908 catttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatg 44494813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 102 - 232
Target Start/End: Original strand, 17444589 - 17444719
Alignment:
Q  102 gaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgata 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||     
T  17444589 gaacttgagttatagtcaaatttttgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatg 17444688  T
Q  202 ttgttcatgattgatgaagtgttatatgtat 232  Q
    ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  17444689 ttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 17444719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 154 - 276
Target Start/End: Original strand, 11913928 - 11914051
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||    
T  11913928 tatgattgatgaattagtatatgtatgtacatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgt 11914026  T
Q  252 tgattaccttttgatgttgttatat 276  Q
    |||||| | ||||||||||||||||    
T  11914027 tgattatcatttgatgttgttatat 11914051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 99
Target Start/End: Original strand, 13937455 - 13937551
Alignment:
Q  3 ttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13937455 ttttctgatttttcttttcatctttgccctgaatttgaaatgaaatctggtattgataggacaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 13937551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Original strand, 12119328 - 12119425
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12119328 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaataaaaactggtattgatcagtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 12119425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 341 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 17737337 - 17737240
Alignment:
Q  341 atttgatattattatgtcatgctgtttttgta---tactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17737337 atttgatattattatgtcatgctgttgttgtagtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17737240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 261 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 23274870 - 23274705
Alignment:
Q  261 tttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| |||    
T  23274870 tttgatgttgtttataatgtgatgtaattgtatattctttacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatca 23274771  T
Q  360 tgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 424  Q
    || || ||||| |||||| || |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23274770 tgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagt 23274705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 296 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 14572735 - 14572603
Alignment:
Q  296 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgtta 394  Q
    ||||| ||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  14572735 cattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgtctatgttgctgttgtta 14572637  T
Q  395 tttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 428  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14572636 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 14572603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 27165933 - 27165836
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27165933 tttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaataaaaactagtattgatcggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 27165836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 46822942 - 46822845
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46822942 tttttctgatttttcttttcatctgtgccccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgctacataattggtcttaggtgtaaacacggaagttgta 46822845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 154 - 234
Target Start/End: Original strand, 17444694 - 17444773
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatat 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17444694 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatat 17444773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 262 - 423
Target Start/End: Original strand, 52523666 - 52523831
Alignment:
Q  262 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 360  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||    
T  52523666 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 52523765  T
Q  361 g--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 423  Q
    |  ||| ||||| |||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52523766 gaactg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52523831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 10379812 - 10379718
Alignment:
Q  5 ttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10379812 ttctgatttttcttttcatctctgccccgaatatgaaataaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 10379718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Original strand, 53300985 - 53301082
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |  |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53300985 tttttctgatttttcttttcatctttgccccgaatttgaaataaaaacaagtattgatcggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 53301082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 98 - 219
Target Start/End: Original strand, 20630013 - 20630138
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgat----tgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtga 193  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| |  ||| || |||||||||||| |||    
T  20630013 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgattgatgaagtgttatctgaatgtatatgtttatga 20630112  T
Q  194 atacgatattgttcatgattgatgaa 219  Q
     || ||| ||||| ||||||||||||    
T  20630113 gtatgatgttgtttatgattgatgaa 20630138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 8500201 - 8500104
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |  | |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8500201 tttttctgatttttcttttcatctcttccccgaatttgaaataaaaactggtattgatcgatatagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgta 8500104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 41124612 - 41124523
Alignment:
Q  10 atttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41124612 atttttctttttatctctgccccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaaagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgta 41124523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 10557580 - 10557492
Alignment:
Q  11 tttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  10557580 tttttcttttcatctctgccccgaatttgaaacgaaatatggtattgattggtacagaattggtcttagttgtaaacacaaaagttgta 10557492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 261 - 441
Target Start/End: Original strand, 37642203 - 37642385
Alignment:
Q  261 tttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| |||    
T  37642203 tttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatca 37642302  T
Q  360 tgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    || |||||| | ||||||| | |||||||| |  |||  ||||||||||||||||||| ||| |||| | | ||||||||||||    
T  37642303 tgatgtttt-gcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatg 37642385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 262 - 361
Target Start/End: Original strand, 2051138 - 2051238
Alignment:
Q  262 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 360  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  2051138 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 2051237  T
Q  361 g 361  Q
    |    
T  2051238 g 2051238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 314 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 30029968 - 30029834
Alignment:
Q  314 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 412  Q
    |||||| || ||||||||| || |||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||  ||| || || |||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  30029968 tgaatatttaagacgttgt-gaattgcaaatgatattcttatgtcatgctgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttattaaactaagttgcatga 30029870  T
Q  413 gtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 448  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  30029869 gtcagtctaagttgaatgagatgttgatgatgatgt 30029834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 261 - 323
Target Start/End: Original strand, 17248225 - 17248287
Alignment:
Q  261 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattg 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17248225 tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaataattg 17248287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 328 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 12511172 - 12511051
Alignment:
Q  328 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 426  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||  ||||  |||| | || |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  12511172 gttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttg 12511073  T
Q  427 attaagatgttgatgatgatgt 448  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  12511072 attaagatgttgataatgatgt 12511051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 8499979 - 8499911
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8499979 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 8499911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 10247427 - 10247495
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10247427 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 10247495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 15977991 - 15977923
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977991 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 15977923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 16453984 - 16454052
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16453984 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 16454052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 17463636 - 17463568
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463636 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 17463568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 34159784 - 34159716
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159784 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 34159716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 45606610 - 45606678
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45606610 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 45606678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 98 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 10379668 - 10379613
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 153  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10379668 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 10379613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 328 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 14234602 - 14234488
Alignment:
Q  328 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 425  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14234602 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaagtt 14234504  T
Q  426 gattaagatgttgatg 441  Q
    |||||||||| |||||    
T  14234503 gattaagatgatgatg 14234488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 154 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 25237075 - 25237009
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25237075 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 25237009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 271 - 368
Target Start/End: Original strand, 22147474 - 22147571
Alignment:
Q  271 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 368  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  22147474 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt 22147571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 36528422 - 36528353
Alignment:
Q  30 cccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36528422 cccgaatttgaaatgaaaactggtattgataagtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgta 36528353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 54521279 - 54521214
Alignment:
Q  33 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54521279 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgt 54521214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 7781050 - 7781118
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7781050 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgta 7781118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 10557367 - 10557299
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10557367 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaaataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 10557299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 12568018 - 12567950
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12568018 ccgaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 12567950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 13544482 - 13544414
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544482 ccgaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 13544414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 15465613 - 15465545
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15465613 ccgaatttgaaatgaaaattggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 15465545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 281 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 15471085 - 15470939
Alignment:
Q  281 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 379  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| |  |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  15471085 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 15470988  T
Q  380 gtgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 427  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15470987 atgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 15470939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 16282461 - 16282529
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282461 ccgaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 16282529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 17444467 - 17444535
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17444467 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgta 17444535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 28848325 - 28848393
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28848325 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtactgaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 28848393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 38961541 - 38961609
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961541 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 38961609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 41124398 - 41124330
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41124398 ccgaatgtgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 41124330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 53301207 - 53301275
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53301207 ccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 53301275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 317 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 32307802 - 32307681
Alignment:
Q  317 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 414  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32307802 ataattgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 32307705  T
Q  415 cagtctaagttgattaagatgttg 438  Q
    | |||||||||||| | |||||||    
T  32307704 cggtctaagttgatgatgatgttg 32307681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 97
Target Start/End: Original strand, 6468838 - 6468904
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttg 97  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6468838 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttg 6468904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 99
Target Start/End: Original strand, 29544547 - 29544613
Alignment:
Q  33 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29544547 gaatttgaaatgaaaactgttattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 29544613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 5223842 - 5223777
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagtt 96  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5223842 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattcgtcttaggtgtaaacacgaaagtt 5223777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 96
Target Start/End: Original strand, 13153959 - 13154024
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagtt 96  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13153959 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcataggtgtaaacacgaaagtt 13154024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 262 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 16097509 - 16097342
Alignment:
Q  262 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 360  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| | ||    
T  16097509 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatgat 16097411  T
Q  361 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 428  Q
    | || ||| | ||| ||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16097410 gatgattt-gcatattgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16097342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 262 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 16103960 - 16103794
Alignment:
Q  262 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 360  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||  |||||||| | ||| || |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||    
T  16103960 ttgatgttgtttataatgttatataattttatatacattaaatgaattatgtttga-tatttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcat 16103863  T
Q  361 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 428  Q
    | || ||| | ||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16103862 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16103794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 96
Target Start/End: Original strand, 16358371 - 16358436
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagtt 96  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16358371 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagtt 16358436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 59
Target Start/End: Original strand, 45220361 - 45220418
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgat 59  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  45220361 tttttcttatttttcttttcatctctgcccagaatttgaaatgaaatatggtattgat 45220418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 386 - 435
Target Start/End: Original strand, 45577947 - 45577996
Alignment:
Q  386 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45577947 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 45577996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 99
Target Start/End: Original strand, 55319010 - 55319075
Alignment:
Q  34 aatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55319010 aatttgaaatgaaaattggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 55319075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 10557442 - 10557394
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10557442 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 10557394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 20629895 - 20629963
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20629895 ccgaatttgaaatgaaaacttgtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgta 20629963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 27165711 - 27165643
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27165711 ccgattttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggggtaaacacgaaagttgta 27165643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 27165786 - 27165738
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27165786 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 27165738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 55476949 - 55476881
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476949 ccgaatttgaaattaaaactggtattgactggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 55476881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 328 - 441
Target Start/End: Original strand, 13210333 - 13210447
Alignment:
Q  328 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 425  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13210333 gttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 13210431  T
Q  426 gattaagatgttgatg 441  Q
    | | |||||| |||||    
T  13210432 gttgaagatgatgatg 13210447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 15465495 - 15465448
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15465495 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 15465448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 25229715 - 25229648
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgt 98  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25229715 ccgaatttgaaatgaaaattggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgt 25229648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 25237302 - 25237235
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgt 98  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25237302 ccgaatttgaaatgaaaattggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgt 25237235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 381 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 28194752 - 28194697
Alignment:
Q  381 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28194752 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 28194697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 15412884 - 15412822
Alignment:
Q  37 ttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15412884 ttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgta 15412822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 147
Target Start/End: Original strand, 3264382 - 3264431
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaata 147  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3264382 tatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaata 3264431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 96
Target Start/End: Original strand, 13151494 - 13151559
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagtt 96  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13151494 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggaacagaattggtcataggtgtaaacacgaaagtt 13151559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 36528496 - 36528447
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaata 147  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36528496 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaata 36528447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 423
Target Start/End: Original strand, 37251106 - 37251270
Alignment:
Q  261 tttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||| | |||    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  37251106 tttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttatgatg--ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatca 37251203  T
Q  360 tg--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 423  Q
    ||  ||| |||| ||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  37251204 tgaactg-ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtctaag 37251270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 14567513 - 14567561
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14567513 tatagaacttgagttatagtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 14567561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 15008036 - 15007988
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15008036 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 15007988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 16282386 - 16282434
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16282386 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 16282434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 20629820 - 20629868
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20629820 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 20629868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 26054968 - 26055036
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26054968 ccgaatttgaaaggaaaattggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgta 26055036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 38961466 - 38961514
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38961466 tatagaacttgagttatggtcaaattgctgcacgtaggtcacagtgaat 38961514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 41124473 - 41124425
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41124473 tatagaacttgagttatgatcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 41124425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 46822720 - 46822652
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46822720 ccgattttgaaatgaaaagtggtattgattggtaaacaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 46822652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 53301132 - 53301180
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53301132 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgaat 53301180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 55318932 - 55318980
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  55318932 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcgcagtgaat 55318980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 17393382 - 17393299
Alignment:
Q  17 ttttcatctctgcccc-gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||  ||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  17393382 ttttcatctctgcccccgaatttcaaatgaactcttctattgatcggtacagaattggtcttagatgtaaacacaaaagttgta 17393299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 145
Target Start/End: Original strand, 26055086 - 26055133
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 145  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  26055086 tatagaacttgagttatggtaaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 26055133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 328 - 428
Target Start/End: Original strand, 12174265 - 12174366
Alignment:
Q  328 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 425  Q
    |||||||  ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12174265 gttgttgttttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 12174363  T
Q  426 gat 428  Q
    |||    
T  12174364 gat 12174366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 96
Target Start/End: Original strand, 14567587 - 14567653
Alignment:
Q  30 cccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagtt 96  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  14567587 cccgaatttgaaatgaaaactggtattggtaggtacagaattggcctttggtgtaaacatgaaagtt 14567653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 31 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 15007961 - 15007893
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaat---ctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagtt 96  Q
    |||||||||||||||||    ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15007961 ccgaatttgaaatgaaaagtactggtattgattggtacaaaattggttttaggtgtaaacacgaaagtt 15007893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25201397 - 25201323
Alignment:
Q  155 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  |||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  25201397 atgattgatgaattattatatgaatgtatatattgatgaatatgatattgttcatgattaatgaattattatatg 25201323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 8500054 - 8500009
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtg 143  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8500054 tatagaacttgagttatggtcaagttactgcacgtaggtcacagtg 8500009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 279 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 43926123 - 43925977
Alignment:
Q  279 tgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat--gctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||||| ||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||  |||| |||| | ||||    
T  43926123 tgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctg-ttttatgtact 43926026  T
Q  377 g-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 423  Q
    | || |||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  43926025 gcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 43925977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 13436758 - 13436690
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||| ||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  13436758 ccgagtttgaaatgaaaacttgtattgattggtacataattggtcttaggtataaatacgaaagttgta 13436690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 46822795 - 46822747
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46822795 tataaaacttgagttatcgtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 46822747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 55319125 - 55319173
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55319125 tatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaagtcacagtgaat 55319173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 5223724 - 5223677
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 145  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5223724 tatagaacttgagttatgatcaaattactccacgtaggtcacagtgaa 5223677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 17463702 - 17463663
Alignment:
Q  107 tgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463702 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 17463663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 34159850 - 34159811
Alignment:
Q  107 tgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159850 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 34159811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 55477015 - 55476976
Alignment:
Q  107 tgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55477015 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 55476976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 384 - 438
Target Start/End: Original strand, 3389999 - 3390053
Alignment:
Q  384 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttg 438  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  3389999 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgttg 3390053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 10555812 - 10555766
Alignment:
Q  52 gtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgt 98  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10555812 gtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgt 10555766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 12305579 - 12305525
Alignment:
Q  33 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaac 87  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  12305579 gaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaac 12305525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 213
Target Start/End: Original strand, 15025934 - 15025992
Alignment:
Q  155 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgatt 213  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||    
T  15025934 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgatgatgaatatgatattgttcatgatt 15025992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 381 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 14665458 - 14665397
Alignment:
Q  381 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatga 442  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||| ||||||    
T  14665458 tgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatga 14665397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 154 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 17044395 - 17044330
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 219  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||   ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  17044395 tatgattgatgaattattatatgaatgtatatattgacgaatatgatgttgttcatgattgatgaa 17044330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 337 - 428
Target Start/End: Original strand, 49668091 - 49668183
Alignment:
Q  337 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 428  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  49668091 ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 49668183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 13937601 - 13937649
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  13937601 tatagaacttgtgttatggtcaaattactgcacgtaggccacggtgaat 13937649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 16358296 - 16358344
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  16358296 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcgcataggtcacattgaat 16358344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 17444392 - 17444440
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17444392 tatacaacttgagctatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 17444440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Original strand, 6468772 - 6468811
Alignment:
Q  107 tgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6468772 tgagttatggtcaaattactgcacgtatgtcacagtgaat 6468811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 99
Target Start/End: Original strand, 14567432 - 14567463
Alignment:
Q  68 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14567432 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 14567463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 15412955 - 15412916
Alignment:
Q  107 tgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15412955 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 15412916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 384 - 438
Target Start/End: Original strand, 3403019 - 3403073
Alignment:
Q  384 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttg 438  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  3403019 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgttg 3403073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 229
Target Start/End: Original strand, 11913867 - 11913897
Alignment:
Q  199 atattgttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11913867 atattgttcatgattgatgaagtgttatatg 11913897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 384 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 14668611 - 14668553
Alignment:
Q  384 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatga 442  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||| ||||||    
T  14668611 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatga 14668553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 381 - 435
Target Start/End: Original strand, 23077537 - 23077591
Alignment:
Q  381 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  | |||| |||||||||||    
T  23077537 tgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtctatataagatgattaagatg 23077591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 337 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 9513026 - 9512934
Alignment:
Q  337 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 428  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  9513026 ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 9512934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 337 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 9521001 - 9520909
Alignment:
Q  337 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 428  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  9521001 ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 9520909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 232
Target Start/End: Original strand, 11913876 - 11913953
Alignment:
Q  155 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtat 232  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  11913876 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 11913953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 200
Target Start/End: Original strand, 18700200 - 18700245
Alignment:
Q  155 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgat 200  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  18700200 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatacgat 18700245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 209
Target Start/End: Original strand, 50351664 - 50351717
Alignment:
Q  156 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcat 209  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| ||||||||    
T  50351664 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcat 50351717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 155 - 219
Target Start/End: Original strand, 12119585 - 12119649
Alignment:
Q  155 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 219  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||| ||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  12119585 atgattgatgaagtattatatgaatgtatatatttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 12119649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 381 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 13919390 - 13919350
Alignment:
Q  381 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 421  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  13919390 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 13919350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 2)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 21088 - 20751
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21088 tatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 20989  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20988 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 20889  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20888 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 20789  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20788 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 20751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 21207 - 21138
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaat-gaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21207 ccgaatttgaaatagaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgta 21138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 179)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 16232861 - 16232524
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232861 tatagaatttgagttattgtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 16232762  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16232761 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 16232662  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16232661 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 16232562  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16232561 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16232524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 456662 - 456325
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456662 tatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 456563  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  456562 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 456463  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  456462 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 456363  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  456362 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 456325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 15376535 - 15376871
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15376535 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatac 15376633  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15376634 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 15376733  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15376734 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 15376833  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15376834 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 15376871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 16214025 - 16213688
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16214025 tatagaacttgagttatggtcaaatgactgcacgtaggtcacagtgaataattgaataagattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 16213926  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16213925 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttcatatgttgattaccatttgatgttgttatgttgtgatataattatatatgca 16213826  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16213825 ttacttgaattatatgtgaataattaagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 16213726  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16213725 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16213688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 20384945 - 20385281
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20384945 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatac 20385043  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20385044 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 20385143  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20385144 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 20385243  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20385244 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 20385281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 21189417 - 21189753
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  21189417 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtata-gtttgtgaatac 21189515  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21189516 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 21189615  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21189616 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 21189715  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21189716 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21189753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 41523258 - 41522921
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523258 tatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 41523159  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41523158 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 41523059  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41523058 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 41522959  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41522958 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 41522921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 41525720 - 41525383
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525720 tatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 41525621  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41525620 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 41525521  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41525520 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 41525421  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41525420 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 41525383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 11393108 - 11393445
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393108 tatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcatagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 11393207  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11393208 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 11393307  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11393308 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 11393407  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11393408 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 11393445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 27217201 - 27216864
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27217201 tatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 27217102  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27217101 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 27217002  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27217001 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 27216902  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  27216901 aactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatg 27216864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 32125831 - 32125495
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  32125831 tatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatac 32125733  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32125732 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 32125633  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32125632 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 32125533  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32125532 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 32125495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 14948944 - 14949280
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  14948944 tatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatac 14949042  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  14949043 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 14949142  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14949143 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 14949242  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14949243 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 14949280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 16410399 - 16410063
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  16410399 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatcaatgtatatgtt-gtgaatac 16410301  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| | |||||||||| |||||| |    
T  16410300 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactatgatataattgtatatgta 16410201  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16410200 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 16410101  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16410100 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16410063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 18640612 - 18640276
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18640612 tatagaacttgatttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattactatatgaatgtatatgtt-gtgaatac 18640514  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18640513 gatattttccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattattttatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 18640414  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18640413 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 18640314  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18640313 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 18640276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 24702569 - 24702242
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||          ||||||||||    
T  24702569 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattcatgaattagtatatgt----------ttgtgaatac 24702480  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24702479 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 24702380  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24702379 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 24702280  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24702279 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24702242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 98 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 18431052 - 18430710
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18431052 tatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtagaacatagtgaataattgaatctgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatac 18430954  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  18430953 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 18430854  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  18430853 ttacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgttgtgttgctgttgttattt 18430754  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  18430753 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 18430710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 24705016 - 24704692
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||          ||||||||||    
T  24705016 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattcatgaattagtatatgt----------ttgtgaatac 24704927  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24704926 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 24704827  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24704826 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc---ttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 24704730  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24704729 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24704692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 13869689 - 13869350
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13869689 tatagaacttgagttatggttaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 13869590  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgc 296  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  13869589 gatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgggatataattgtatatgc 13869490  T
Q  297 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 395  Q
    || | ||  ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  13869489 atcaattagattatctttgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttat 13869390  T
Q  396 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13869389 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 13869350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 154 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 11972780 - 11972500
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  11972780 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgcccatgattgatgaagtgttacatgtatatatgatgttttaagatattg 11972682  T
Q  254 attaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 353  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972681 attattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 11972582  T
Q  354 atgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11972581 atgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 11972500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 26355803 - 26356152
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  26355803 tatagaacttgagttatagtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgattaattagtatatgaatgtatatgtt-gtaaatac 26355901  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtata--tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatg 295  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26355902 gatattgtccataattgatgaagtgttatatgtatatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatattgtgatataattgtatatg 26356001  T
Q  296 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac-----------tgctgtgtt 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||           || ||||||    
T  26356002 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgttgtgtttatgttgtgtt 26356101  T
Q  385 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26356102 gttgttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaagatg 26356152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 26358255 - 26358604
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  26358255 tatagaacttgagttatagtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgattaattagtatatgaatgtatatgtt-gtaaatac 26358353  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtata--tatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatg 295  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26358354 gatattgtccataattgatgaagtgttatatgtatatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatattgtgatataattgtatatg 26358453  T
Q  296 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac-----------tgctgtgtt 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||           || ||||||    
T  26358454 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgttgtgtttatgttgtgtt 26358553  T
Q  385 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26358554 gttgttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaagatg 26358604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 261 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 44116687 - 44116513
Alignment:
Q  261 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44116687 tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 44116588  T
Q  361 gctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44116587 gttgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 44116513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 260 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 3386512 - 3386337
Alignment:
Q  260 ttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3386512 ttttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatcatgtca 3386413  T
Q  360 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3386412 tgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 3386337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 290 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 24275320 - 24275162
Alignment:
Q  290 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgt 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24275320 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgt 24275221  T
Q  390 tgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  24275220 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgttgattatgt 24275162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 247 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 13647521 - 13647344
Alignment:
Q  247 gatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 346  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13647521 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 13647422  T
Q  347 tattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 423  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13647421 tattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 13647344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 98 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 11303588 - 11303409
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  11303588 tatagaatttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatac 11303489  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatatt 277  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11303488 gatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 11303409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 98 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 18627906 - 18627717
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  18627906 tatagaacttgatttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattattatatgaatgtatatg-ttgtgaatac 18627808  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataatt 288  Q
    |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||    
T  18627807 gatattttccgtgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattagtatttgatcttgttatattgtgatataatt 18627717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 261 - 435
Target Start/End: Original strand, 17061899 - 17062073
Alignment:
Q  261 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17061899 tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgctgacttgcatttgatattattatgtcat 17061998  T
Q  361 gctgtttttgtatactgctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17061999 gct-attttgtatactgctgagttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17062073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 98 - 276
Target Start/End: Original strand, 16108510 - 16108688
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  16108510 tatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtacgtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatac 16108609  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatat 276  Q
     |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16108610 aatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccgtttgatgttgttatat 16108688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 154 - 346
Target Start/End: Original strand, 15081825 - 15082019
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaa--gatgt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||    
T  15081825 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgt 15081923  T
Q  252 tgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttga 346  Q
    ||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  15081924 tgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttga 15082019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 262 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 20110723 - 20110560
Alignment:
Q  262 ttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110723 ttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatg 20110624  T
Q  362 ctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20110623 ctgtttttgtata----------gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 20110560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 98 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8940620 - 8940489
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8940620 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 8940521  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8940520 tatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 8940489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 261 - 435
Target Start/End: Original strand, 38898360 - 38898535
Alignment:
Q  261 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38898360 tttgacgttgttatactgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtca 38898459  T
Q  360 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  38898460 tgctgtttttatatactgctgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 38898535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 261 - 423
Target Start/End: Original strand, 12756655 - 12756817
Alignment:
Q  261 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12756655 tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcat 12756754  T
Q  361 gctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 423  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||    
T  12756755 gttgtttttgtatattgttgtgttgctgttgttatttaactaaactgctcgagtcggtctaag 12756817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 98 - 276
Target Start/End: Original strand, 23664774 - 23664952
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  23664774 tatagaacttgagttatggtcaaattattgcatgtaggtcacagtgaagaattgttgatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatac 23664873  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatat 276  Q
    ||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  23664874 gatattgtcaatgattgatgaaaggttatatgtatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 23664952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 98 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 29796951 - 29796771
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  29796951 tatagaacttgagctatggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatac 29796852  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtat--atatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatat 276  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  29796851 gatattgtcaatgattgatgaagggttatatgtatatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 29796771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 98 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 29800770 - 29800590
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  29800770 tatagaacttgagctatggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatac 29800671  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtat--atatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatat 276  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  29800670 gatattgtcaatgattgatgaagggttatatgtatatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 29800590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 98 - 229
Target Start/End: Original strand, 14269778 - 14269909
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14269778 tatagaaattgagttatggtcaaatttttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 14269877  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14269878 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 14269909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 98 - 229
Target Start/End: Original strand, 15081663 - 15081794
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15081663 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtctaagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 15081762  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15081763 tatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 15081794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 98 - 227
Target Start/End: Original strand, 45847476 - 45847605
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  45847476 tatagaacttgagttatggtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattggtatatgtatgtatatgtctgtgaatac 45847575  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttata 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45847576 gatattgttcatgattgatgaagtgttata 45847605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 98 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8469076 - 8468945
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8469076 tatagaacttgagttatgatcaaattactgcatgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttttgaatac 8468977  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8468976 gatattgttcatgattgatgaaatgttatatg 8468945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 320 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 48273512 - 48273396
Alignment:
Q  320 attgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagt 418  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  48273512 attgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggt 48273413  T
Q  419 ctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||    
T  48273412 ctaagttgattaagatg 48273396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 277 - 435
Target Start/End: Original strand, 3564319 - 3564478
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||| ||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3564319 tgtgatctaatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 3564418  T
Q  377 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  3564419 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 3564478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 313 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 13831499 - 13831377
Alignment:
Q  313 gtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13831499 gtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgttgtttttgtatactaccgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatga 13831400  T
Q  413 gtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    ||| |||||| ||||||||||||    
T  13831399 gtcggtctaaattgattaagatg 13831377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 154 - 276
Target Start/End: Original strand, 14269940 - 14270061
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 253  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14269940 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 14270038  T
Q  254 attaccttttgatgttgttatat 276  Q
    ||||   ||||||||||||||||    
T  14270039 attattatttgatgttgttatat 14270061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 98 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13841395 - 13841274
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||     
T  13841395 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtat 13841296  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaa 219  Q
    ||| ||||| ||||||||||||    
T  13841295 gatgttgtttatgattgatgaa 13841274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 8941155 - 8941060
Alignment:
Q  4 tttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8941155 tttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 8941060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 8469223 - 8469126
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8469223 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgta 8469126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 277 - 435
Target Start/End: Original strand, 18456368 - 18456526
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  18456368 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatact 18456466  T
Q  377 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    | || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18456467 gcctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 18456526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11972889 - 11972755
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||     
T  11972889 tatagaacttgagttatagtcaaattactgtacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgcatatgtttatgagtat 11972790  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtat 232  Q
    ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  11972789 gatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 11972755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 12698998 - 12698832
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatac 375  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12698998 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatac 12698899  T
Q  376 tgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  12698898 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 12698832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 180 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13841270 - 13841157
Alignment:
Q  180 gtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgt 279  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  13841270 gtatatgttt-tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgt 13841172  T
Q  280 gatataattatatat 294  Q
    ||||||||| |||||    
T  13841171 gatataattgtatat 13841157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 154 - 256
Target Start/End: Original strand, 45847638 - 45847739
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 253  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45847638 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatatgatg-tttaagatgttg 45847736  T
Q  254 att 256  Q
    |||    
T  45847737 att 45847739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 38227646 - 38227482
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    ||||||||||| |||| | ||||| ||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38227646 tgtgatataatgatatgtacattaattgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 38227548  T
Q  377 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||    
T  38227547 gcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagatgaagatgatgatg 38227482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Original strand, 38897709 - 38897806
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38897709 tttttctgatttttcttttcatctctgccccaaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaactcgaaagttgta 38897806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 9509355 - 9509190
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    ||||||||| |  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9509355 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatact 9509256  T
Q  377 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  9509255 gcctatgttactgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 9509190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 11973036 - 11972939
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11973036 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaacttaaaatgaaatctggtattgataggtccagaatttgtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 11972939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 16214365 - 16214268
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  16214365 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatttggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaggttgta 16214268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 154 - 276
Target Start/End: Original strand, 38898106 - 38898229
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||    
T  38898106 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgt 38898204  T
Q  252 tgattaccttttgatgttgttatat 276  Q
    |||||| | ||||||||||||||||    
T  38898205 tgattatcatttgatgttgttatat 38898229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 99
Target Start/End: Original strand, 21189086 - 21189174
Alignment:
Q  11 tttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189086 tttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaacaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 21189174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 261 - 427
Target Start/End: Original strand, 2280057 - 2280225
Alignment:
Q  261 tttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  2280057 tttgatgttgtttataatgtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatca 2280156  T
Q  360 tgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 427  Q
    ||||| ||||| |||||| || ||||| || |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2280157 tgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 2280225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 154 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 8940458 - 8940335
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgt 251  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||    
T  8940458 tatgattgatgaattagtatatttatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgt 8940360  T
Q  252 tgattaccttttgatgttgttatat 276  Q
    |||||| | ||||||||||||||||    
T  8940359 tgattatcatttgatgttgttatat 8940335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Original strand, 14269245 - 14269342
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14269245 tttttctgatttttcttttcatctctgccctgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgta 14269342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Original strand, 15081323 - 15081420
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  15081323 tttttctgatttttcttttcatctatgccccgaatttgaaatgaaatatggtattgataggtccataattggtcttagaagtaaacacgaaagttgta 15081420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 149 - 229
Target Start/End: Original strand, 38897995 - 38898075
Alignment:
Q  149 ttgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38897995 ttgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 38898075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 271 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 26212168 - 26212012
Alignment:
Q  271 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 370  Q
    ||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  26212168 ttataatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttg 26212069  T
Q  371 tatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 426  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  26212068 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttg 26212012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 188 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 8468891 - 8468803
Alignment:
Q  188 ttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatat 276  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  8468891 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttatgatgttgattattatttgatgttgttatat 8468803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 277 - 427
Target Start/End: Original strand, 15143993 - 15144143
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||||| ||||||   || ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||    
T  15143993 tgtgatatgatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatacttgagatgttgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgttattgcatact 15144092  T
Q  377 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 427  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15144093 gagatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 15144143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 99
Target Start/End: Original strand, 23461791 - 23461863
Alignment:
Q  27 tgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23461791 tgccccgaatttgaaatgaagtctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 23461863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 328 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 10589154 - 10589055
Alignment:
Q  328 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 426  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  10589154 gttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttg 10589055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 321 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 22073036 - 22072914
Alignment:
Q  321 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagt 418  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22073036 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagt 22072937  T
Q  419 ctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  22072936 ctaagttgattaagatgatgatg 22072914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 59
Target Start/End: Original strand, 45846926 - 45846983
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgat 59  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45846926 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgat 45846983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 320 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 67868 - 67746
Alignment:
Q  320 attgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcag 417  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  67868 attgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 67770  T
Q  418 tctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  67769 tctaagttgattaagatgatgatg 67746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 261 - 441
Target Start/End: Original strand, 19486682 - 19486864
Alignment:
Q  261 tttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| |||    
T  19486682 tttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatca 19486781  T
Q  360 tgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    || |||||| | ||||||| | |||||||| |  |||  ||||||||||||||||||| ||| |||| | | ||||||||||||    
T  19486782 tgatgtttt-gcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatg 19486864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 14269467 - 14269535
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14269467 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 14269535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 14269660 - 14269728
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14269660 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 14269728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 14948826 - 14948894
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14948826 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 14948894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 15376417 - 15376485
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376417 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 15376485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 16232979 - 16232911
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232979 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 16232911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 16410517 - 16410449
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410517 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 16410449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 20384827 - 20384895
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20384827 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 20384895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 25926833 - 25926901
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25926833 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 25926901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 27217319 - 27217251
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27217319 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 27217251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 32125949 - 32125881
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125949 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 32125881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 262 - 420
Target Start/End: Original strand, 12255730 - 12255892
Alignment:
Q  262 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 360  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||  |||||| ||||| || || ||||||||||| |||| ||||    
T  12255730 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgtagaatttcatttgatattgttatatcat 12255829  T
Q  361 g-ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtct 420  Q
    |  |   |||| |||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12255830 gaattgatttgcatactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 33 - 99
Target Start/End: Original strand, 16108394 - 16108460
Alignment:
Q  33 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16108394 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 16108460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 456780 - 456712
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456780 ccgaatttgaaatgaaaaccggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 456712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 14269392 - 14269440
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14269392 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14269440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 18431170 - 18431102
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18431170 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 18431102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 261 - 441
Target Start/End: Original strand, 10063761 - 10063938
Alignment:
Q  261 tttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||      |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||  || ||||||||||| |||    
T  10063761 tttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgt-----ttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgtgttcgatattattatatca 10063855  T
Q  360 tgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    || || || || |||| | || |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||    
T  10063856 tgatg-ttgtgcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagtcgttgaaggtgttgatg 10063938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 11303704 - 11303638
Alignment:
Q  33 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11303704 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttagatgtaaacacgaaagttgta 11303638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 99
Target Start/End: Original strand, 23664658 - 23664724
Alignment:
Q  33 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23664658 gaatttgaaatgaaaaatggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 23664724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 8940817 - 8940769
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8940817 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 8940769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 15081545 - 15081613
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15081545 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgta 15081613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 271 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 15113114 - 15113031
Alignment:
Q  271 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 355  Q
    ||||| |||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  15113114 ttataatgtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaat-attgagatgttgatgacttgcatttgatattgttat 15113031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 343 - 441
Target Start/End: Original strand, 16386268 - 16386368
Alignment:
Q  343 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 440  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| | ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||    
T  16386268 ttgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 16386367  T
Q  441 g 441  Q
    |    
T  16386368 g 16386368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 261 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 16495580 - 16495403
Alignment:
Q  261 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 360  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||  | || ||||||||   |||||||| || |||| ||||||||||| ||||    
T  16495580 tttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctg-ataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcat 16495485  T
Q  361 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    | ||  |||| |||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||| |||||    
T  16495484 gatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 16495403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 99
Target Start/End: Original strand, 17985092 - 17985156
Alignment:
Q  35 atttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17985092 atttcaaatgaaatctggtattgatcggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgta 17985156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 18640730 - 18640662
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640730 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggcacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 18640662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 24702687 - 24702619
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24702687 ccgaatttgaaatgaaaactggtattggttggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaggttgta 24702619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 24705134 - 24705066
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24705134 ccgaatttgaaatgaaaactggtattggttggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaggttgta 24705066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 38897856 - 38897904
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38897856 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 38897904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 41523376 - 41523308
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  41523376 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacataaaagttgta 41523308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 41525838 - 41525770
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  41525838 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacataaaagttgta 41525770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 45847283 - 45847331
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45847283 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 45847331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 389 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 47831860 - 47831808
Alignment:
Q  389 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  47831860 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 47831808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 337 - 435
Target Start/End: Original strand, 14932749 - 14932848
Alignment:
Q  337 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||  || | | || | || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14932749 ttgcaattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 14932848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 337 - 435
Target Start/End: Original strand, 15356184 - 15356283
Alignment:
Q  337 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||  || | | || | || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15356184 ttgcaattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 15356283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 337 - 435
Target Start/End: Original strand, 15360298 - 15360397
Alignment:
Q  337 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||  || | | || | || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15360298 ttgcaattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 15360397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 145
Target Start/End: Original strand, 25926951 - 25926998
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25926951 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 25926998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 328 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 34200901 - 34200787
Alignment:
Q  328 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 425  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34200901 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 34200803  T
Q  426 gattaagatgttgatg 441  Q
    | | |||||| |||||    
T  34200802 gttgaagatgatgatg 34200787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 292 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 40443541 - 40443393
Alignment:
Q  292 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 390  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||  || |||||| | ||||||||||    
T  40443541 tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctgttt--gtttactgcgtatgttgctgtt 40443444  T
Q  391 -gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 440  Q
     ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || | |||||| ||||    
T  40443443 tgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 40443393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 8940742 - 8940684
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacac 89  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8940742 ccgaatttgaaatgaaaactgctattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacac 8940684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 13869801 - 13869739
Alignment:
Q  37 ttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13869801 ttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgta 13869739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 281 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 18005806 - 18005660
Alignment:
Q  281 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctg 380  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||   ||||||||     
T  18005806 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttcc-atactgctt 18005710  T
Q  381 -tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 428  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18005709 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18005660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 29797067 - 29797001
Alignment:
Q  33 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | | || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29797067 gaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgta 29797001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 29800886 - 29800820
Alignment:
Q  33 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | | || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29800886 gaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgta 29800820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 16056488 - 16056343
Alignment:
Q  281 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 379  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||  | ||| || ||    
T  16056488 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttt--gcataatgtct 16056392  T
Q  380 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 427  Q
     |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  16056391 atgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggtctaagttga 16056343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 427
Target Start/End: Original strand, 1867933 - 1868101
Alignment:
Q  261 tttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| |||||| | ||||| |||||||| |||| |||    
T  1867933 tttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttcatttgca-ttgatattgttatatca 1868030  T
Q  360 t--gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 427  Q
    |  |||| |||| ||||||| || ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1868031 tgagctg-ttttatatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 1868101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 10501097 - 10501165
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | | || | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10501097 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagagttggtcttaggtgtaaacacaaaagttgta 10501165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 271 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 15116651 - 15116568
Alignment:
Q  271 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 355  Q
    ||||| |||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  15116651 ttataatgtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaat-attgagatgttgatgacttgcaattgatattgttat 15116568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 389 - 441
Target Start/End: Original strand, 15754955 - 15755007
Alignment:
Q  389 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  15754955 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatg 15755007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 16214143 - 16214075
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | | || ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16214143 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttacgtgtaaacacaaaagttgta 16214075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 16214218 - 16214170
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16214218 tatagaacttgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 16214170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 18628024 - 18627956
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18628024 ccgaatttaaaatgaaaactgatattgattggcacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 18627956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 21189224 - 21189272
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21189224 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcagagtgaat 21189272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 26355685 - 26355753
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  26355685 ccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttatgtgttaacacgaaagttgta 26355753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 26358137 - 26358205
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  26358137 ccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttatgtgttaacacgaaagttgta 26358205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 145
Target Start/End: Original strand, 1857050 - 1857097
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 145  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1857050 tatataacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 1857097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 234
Target Start/End: Original strand, 13745569 - 13745648
Alignment:
Q  155 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatat 234  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||||| | ||||||| ||||    
T  13745569 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattaatgaattattatatgaatat 13745648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 93
Target Start/End: Original strand, 13918106 - 13918169
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtc-ttaggtgtaaacacgaaa 93  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  13918106 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtctttaggtgtaaacacgaaa 13918169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 145
Target Start/End: Original strand, 13918225 - 13918272
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13918225 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaa 13918272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 229
Target Start/End: Original strand, 15119918 - 15119993
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  15119918 tatgatttatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatg 15119993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 15211557 - 15211450
Alignment:
Q  344 tgatattattatgtcatgctgtttttgt-atactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg-attaagatgttgat 440  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||| || |||| | || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  15211557 tgatattgttatgtcatgatgttgttgtgattctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatgagtcagtccatgttgaattaagatgttgat 15211458  T
Q  441 gatgatgt 448  Q
    | ||||||    
T  15211457 gttgatgt 15211450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 31 - 81
Target Start/End: Original strand, 14156782 - 14156832
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggt 81  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  14156782 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggt 14156832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 441
Target Start/End: Original strand, 28505321 - 28505418
Alignment:
Q  345 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||    
T  28505321 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatg 28505418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 333 - 428
Target Start/End: Original strand, 811142 - 811238
Alignment:
Q  333 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 428  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  811142 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 811238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 92
Target Start/End: Original strand, 1856933 - 1856994
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaa 92  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  1856933 ccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtaccgaattggtcttaggtgtaaacacgaa 1856994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 8940934 - 8940877
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaaca 88  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||    
T  8940934 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacataattggtcttaggtgtaaaca 8940877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 11310288 - 11310239
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaata 147  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11310288 tatataacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcagagtgaata 11310239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 99
Target Start/End: Original strand, 21189302 - 21189367
Alignment:
Q  34 aatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21189302 aatttgaaatgaaaactggtatttattggtacagagttggtcttaggtgtaaacaagaaagttgta 21189367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 10501215 - 10501263
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  10501215 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgaaggtcatagtgaat 10501263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 14156896 - 14156944
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14156896 tatagaacgtgagttatgttcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14156944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 427
Target Start/End: Original strand, 16219677 - 16219823
Alignment:
Q  281 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 379  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| |  || ||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  16219677 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttaagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 16219774  T
Q  380 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 427  Q
     ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  16219775 atgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttga 16219823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 38294631 - 38294567
Alignment:
Q  155 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 219  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  38294631 atgattgatgaattattctatgaatgtatatgttggcgaatatgatgttgttcatgattgatgaa 38294567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 44014291 - 44014192
Alignment:
Q  330 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 427  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44014291 tgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 44014193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 45847358 - 45847426
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||  |  ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  45847358 ccgaatttgaaatgaaaaataatattgattggtacaaaattggtcttaggtataaacacaaaagttgta 45847426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Original strand, 15376351 - 15376390
Alignment:
Q  107 tgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376351 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15376390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 16410583 - 16410544
Alignment:
Q  107 tgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410583 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 16410544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 18628090 - 18628051
Alignment:
Q  107 tgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18628090 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 18628051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 18640796 - 18640757
Alignment:
Q  107 tgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640796 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 18640757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 361
Target Start/End: Original strand, 20220128 - 20220225
Alignment:
Q  261 tttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||  ||||||   |||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  20220128 tttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgaga---tgttgatttgcatttgatattgttatatca 20220223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Original strand, 20384761 - 20384800
Alignment:
Q  107 tgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20384761 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20384800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Original strand, 26355619 - 26355658
Alignment:
Q  107 tgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26355619 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 26355658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Original strand, 26358071 - 26358110
Alignment:
Q  107 tgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26358071 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 26358110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 140
Target Start/End: Original strand, 15081470 - 15081512
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcaca 140  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  15081470 tatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcaca 15081512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 146
Target Start/End: Original strand, 17985208 - 17985254
Alignment:
Q  100 tagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  17985208 tagaacttgagttatagtcaaattactacacgtaggtcatagtgaat 17985254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 381 - 435
Target Start/End: Original strand, 18154901 - 18154955
Alignment:
Q  381 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  18154901 tgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatg 18154955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 99
Target Start/End: Original strand, 14156592 - 14156657
Alignment:
Q  34 aatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  14156592 aatttgaaacaaaaactggtattgatcggtacagaattggtcttaggtgataacacgaaagttgta 14156657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 261 - 361
Target Start/End: Original strand, 15008437 - 15008536
Alignment:
Q  261 tttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||  |||||||| ||||| |||||||| |||| |||    
T  15008437 tttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatg-atgtttgaggtgttgttgatttgca-ttgatattgttatatca 15008534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 13869872 - 13869833
Alignment:
Q  107 tgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13869872 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 13869833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 417 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 16213653 - 16213622
Alignment:
Q  417 gtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 448  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16213653 gtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 16213622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 20110779 - 20110748
Alignment:
Q  68 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110779 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 20110748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 27217385 - 27217346
Alignment:
Q  107 tgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27217385 tgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 27217346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 384 - 442
Target Start/End: Original strand, 2832504 - 2832562
Alignment:
Q  384 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatga 442  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||| ||||||    
T  2832504 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatga 2832562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 205
Target Start/End: Original strand, 9743795 - 9743845
Alignment:
Q  155 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 205  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||||||||    
T  9743795 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatattgt 9743845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 99
Target Start/End: Original strand, 10500934 - 10500999
Alignment:
Q  34 aatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  10500934 aatttgaaacaaaaactggtattgatcggtacagaattggtcttaggtgataacatgaaagttgta 10500999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 11310214 - 11310162
Alignment:
Q  30 cccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgt 83  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| || || ||||||||||||||||    
T  11310214 cccgaatttgaaatgaaaactg-tattgataagtacataattggtcttaggtgt 11310162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 232
Target Start/End: Original strand, 14269888 - 14269965
Alignment:
Q  155 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtat 232  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  14269888 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattaatatatgtat 14269965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 232
Target Start/End: Original strand, 15081773 - 15081850
Alignment:
Q  155 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtat 232  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  15081773 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 15081850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 441
Target Start/End: Original strand, 27847838 - 27847950
Alignment:
Q  328 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 425  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||   ||| ||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||| |    
T  27847838 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatactgtt---gtacactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgaatcggtctaagat 27847934  T
Q  426 gattaagatgttgatg 441  Q
    | | |||||| |||||    
T  27847935 gttgaagatgatgatg 27847950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 232
Target Start/End: Original strand, 38898054 - 38898131
Alignment:
Q  155 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtat 232  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  38898054 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 38898131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #173
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 155 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 8468966 - 8468902
Alignment:
Q  155 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 219  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  8468966 atgattgatgaaatgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 8468902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #174
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 155 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 8940510 - 8940446
Alignment:
Q  155 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 219  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  8940510 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 8940446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #175
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 8941010 - 8940962
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  8941010 tatagaacttgagttatgctcaaactactgcacataggtcgcagtgaat 8940962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #176
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 14156707 - 14156755
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  14156707 tatagaacttgacttatgatcaaattaccgcatgtaggtcacagtgaat 14156755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #177
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 14269585 - 14269633
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  14269585 tatagaacttgagttatcatcaaattattgcacgcaggtcagagtgaat 14269633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #178
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 155 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 25941571 - 25941523
Alignment:
Q  155 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||||||    
T  25941571 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatatt 25941523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #179
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 155 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 43747736 - 43747672
Alignment:
Q  155 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 219  Q
    |||||||||||| || |||||| | |||||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  43747736 atgattgatgaagtattatatgaaagtatatgttgatgaatatgatgttgttcataattgatgaa 43747672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 174)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 39682654 - 39682317
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682654 tatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 39682555  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39682554 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 39682455  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39682454 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 39682355  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39682354 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 39682317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 98 - 448
Target Start/End: Original strand, 32214752 - 32215092
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||| ||||    
T  32214752 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat----------atgtttgtgtatac 32214841  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32214842 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 32214941  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32214942 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttattt 32215041  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 448  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32215042 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 32215092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 18809283 - 18808947
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18809283 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatac 18809185  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18809184 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 18809085  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18809084 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 18808985  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18808984 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 18808947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 23711835 - 23712171
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  23711835 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatac 23711933  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23711934 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 23712033  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23712034 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 23712133  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23712134 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 23712171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 571738 - 571401
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571738 tatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 571639  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  571638 gatattgtccatgattaatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 571539  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  571538 ttacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 571439  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  571438 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 571401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 23131203 - 23130866
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  23131203 tatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatat 23131104  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  23131103 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 23131004  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23131003 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 23130904  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23130903 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 23130866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 23133670 - 23133333
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  23133670 tatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatat 23133571  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  23133570 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 23133471  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23133470 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 23133371  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23133370 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 23133333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 23709354 - 23709690
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  23709354 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaagaattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatac 23709452  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23709453 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 23709552  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23709553 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 23709652  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23709653 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 23709690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 34402343 - 34402680
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  34402343 tatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatat 34402442  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  34402443 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 34402542  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34402543 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 34402642  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34402643 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 34402680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 26505719 - 26505383
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  26505719 tatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatac 26505621  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  26505620 gatattttccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 26505521  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505520 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 26505421  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26505420 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 26505383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 26508197 - 26507861
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  26508197 tatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatac 26508099  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  26508098 gatattttccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 26507999  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26507998 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 26507899  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26507898 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 26507861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 28577439 - 28577103
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28577439 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatac 28577341  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28577340 aatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 28577241  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  28577240 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttggcttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgttgcgttgctgttgttattt 28577141  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28577140 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 28577103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 24898017 - 24898354
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24898017 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatac 24898115  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  24898116 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 24898215  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24898216 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 24898315  T
Q  398 aact-aagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24898316 aactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24898354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 24905454 - 24905791
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24905454 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatac 24905552  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  24905553 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 24905652  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24905653 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 24905752  T
Q  398 aact-aagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24905753 aactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24905791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 24907929 - 24908266
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24907929 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatac 24908027  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  24908028 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 24908127  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24908128 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 24908227  T
Q  398 aact-aagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24908228 aactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24908266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 24900500 - 24900837
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  24900500 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatttatatgtt-gtgaatac 24900598  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  24900599 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 24900698  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24900699 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 24900798  T
Q  398 aact-aagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24900799 aactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24900837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 24902977 - 24903314
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  24902977 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatttatatgtt-gtgaatac 24903075  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  24903076 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 24903175  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24903176 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 24903275  T
Q  398 aact-aagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24903276 aactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24903314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 32039320 - 32039656
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  32039320 tatagaatttaagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatct 32039418  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32039419 gatattgtccatgatcgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 32039518  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  32039519 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttactgttgttattt 32039618  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  32039619 aactaagctgcatgagccggtctaagttgattaagatg 32039656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 23135920 - 23135594
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||    
T  23135920 tatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgt-----------tgtgaatac 23135832  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  23135831 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgctgattatcatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgca 23135732  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23135731 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 23135632  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23135631 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 23135594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 154 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 6726279 - 6725999
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726279 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 6726181  T
Q  254 attaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 353  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6726180 attattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattatt 6726081  T
Q  354 atgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6726080 atgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 6725999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 158 - 435
Target Start/End: Original strand, 21154942 - 21155218
Alignment:
Q  158 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatta 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21154942 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatta 21155040  T
Q  258 ccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgt 357  Q
       |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21155041 ttatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgt 21155140  T
Q  358 catgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21155141 catgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21155218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 154 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 24368058 - 24367782
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24368058 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattttccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgttttaagatgttg 24367960  T
Q  254 attaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 353  Q
     |||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367959 gttattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 24367860  T
Q  354 atgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaa 431  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24367859 atgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 24367782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 154 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 22105697 - 22105416
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105697 tatgattgatgaattagtatatgtatgtaaatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 22105599  T
Q  254 attaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 353  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22105598 attataatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattatt 22105499  T
Q  354 atgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22105498 atgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 22105416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 24529368 - 24529687
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529368 tatagcacttgagatatggtgaaattactaaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 24529467  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||                   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24529468 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtgtatatgatgattt-------------------gatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 24529548  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaa-taattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 396  Q
    ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  24529549 ttatttgaattatatatgaaataattgagacgttgttaacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgatgtgttgttgttgttatt 24529648  T
Q  397 taactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24529649 taactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24529687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 154 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 38967658 - 38967378
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 253  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38967658 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtcttaagatgttg 38967560  T
Q  254 attaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattat 352  Q
    ||||   ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  38967559 attattatttgatgttgt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattat 38967461  T
Q  353 tatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    ||| ||||||| |||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38967460 tatttcatgctatttttgtatattgttgtgtcgatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 38967378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 207 - 435
Target Start/End: Original strand, 45029784 - 45030012
Alignment:
Q  207 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  45029784 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgatgattattatttcatgttgttatattgtgatataaatgtatatgcattacttgaa 45029883  T
Q  307 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagct 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45029884 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgttgtgttgttgttgttatttaactaagct 45029983  T
Q  407 gcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45029984 gcatgagtcggtctaagttgattaagatg 45030012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 154 - 354
Target Start/End: Original strand, 24642732 - 24642933
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaa--gatgt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||    
T  24642732 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtacatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgt 24642830  T
Q  252 tgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatta 351  Q
    ||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642831 tgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatta 24642930  T
Q  352 tta 354  Q
    |||    
T  24642931 tta 24642933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 98 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 25616522 - 25616179
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25616522 tatagaacttgagttatcgtcaaattacttcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 25616423  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataatta-tatatgc 296  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    ||||      ||   ||||||| | | | ||| |||    
T  25616422 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatgtatgatgttttaagatgttgatga----ttga-----ataagatgtgatacattgattatgtgc 25616332  T
Q  297 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttat 395  Q
    |||||||||  |||   |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||  ||| || || |||| |||| ||    
T  25616331 attacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgtaat 25616232  T
Q  396 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 448  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  25616231 ttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttaataatgatgt 25616179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 260 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 43137478 - 43137303
Alignment:
Q  260 ttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43137478 ttttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 43137379  T
Q  360 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43137378 tgttgtttttgtatattactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 43137303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 98 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 20261560 - 20261381
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  20261560 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatac 20261461  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatatt 277  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20261460 gatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 20261381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 98 - 229
Target Start/End: Original strand, 23707038 - 23707169
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23707038 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 23707137  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23707138 tatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 23707169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 98 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24671366 - 24671235
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24671366 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 24671267  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24671266 tatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 24671235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 98 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24918481 - 24918350
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24918481 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 24918382  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24918381 tatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 24918350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 98 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24681785 - 24681654
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24681785 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 24681686  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24681685 tatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 24681654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 98 - 276
Target Start/End: Original strand, 10684584 - 10684764
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  10684584 tatagaacttgagctatggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatac 10684683  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg--tatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatat 276  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  10684684 gatattgtcaatgattgatgaagggttatatgtatatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 10684764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 98 - 229
Target Start/End: Original strand, 24642570 - 24642701
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642570 tatagaacttaagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 24642669  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642670 tatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 24642701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 98 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 38967820 - 38967689
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38967820 tatagaacttgagttatagtgaaattactgcacgcagctcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 38967721  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38967720 tatattgttcatgattgttgaagtgttatatg 38967689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 22337281 - 22337116
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  22337281 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatataca 22337182  T
Q  377 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  22337181 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 22337116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 262 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 19672010 - 19671831
Alignment:
Q  262 ttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 361  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| || ||||||||||| |||||    
T  19672010 ttgatgttgttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaat-attgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatg 19671912  T
Q  362 ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
     || ||||| |||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  19671911 atg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 19671831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 23060679 - 23060514
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23060679 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 23060580  T
Q  377 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  23060579 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 23060514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 23076608 - 23076443
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076608 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23076509  T
Q  377 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||    
T  23076508 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtggatgaagatgatgatg 23076443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 98 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22105806 - 22105672
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||     
T  22105806 tatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtat 22105707  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtat 232  Q
    ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  22105706 gatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 22105672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Original strand, 23706507 - 23706604
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23706507 tttttctgatttttcttttcatctctggcccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 23706604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 98 - 213
Target Start/End: Original strand, 45027726 - 45027840
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  45027726 tatagaacttgaattatagtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatac 45027824  T
Q  198 gatattgttcatgatt 213  Q
    |||||||| |||||||    
T  45027825 gatattgtccatgatt 45027840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 232
Target Start/End: Original strand, 21154829 - 21154963
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||     
T  21154829 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtat 21154928  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtat 232  Q
    ||| ||||| || ||||||||| |  |||||||||    
T  21154929 gatgttgtttataattgatgaattagtatatgtat 21154963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 24368167 - 24368033
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||     
T  24368167 tatagaacttgagttatagttaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtat 24368068  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtat 232  Q
     || ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  24368067 catgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 24368033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 232
Target Start/End: Original strand, 41523894 - 41524028
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||     
T  41523894 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatacgaatgtatatgtttatgagtat 41523993  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtat 232  Q
    ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  41523994 gatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 41524028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Original strand, 21154296 - 21154393
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21154296 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctagtattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 21154393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 24368507 - 24368410
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24368507 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaatagttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 24368410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Original strand, 24529028 - 24529125
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529028 tttttctgatttttcttttcatctttgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccttaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 24529125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 24682125 - 24682028
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24682125 tttttctgatttttcttttcatctctcccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgta 24682028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Original strand, 41523361 - 41523458
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41523361 tttttctgattttttttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccataattggtcttacgtgtaaacacgaaagttgta 41523458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 98 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 6726388 - 6726254
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||     
T  6726388 tatagaacttaagttatagtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgaatgtatatgtttatgagtat 6726289  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtat 232  Q
    ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  6726288 gatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 6726254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 6726728 - 6726631
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726728 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctcatattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 6726631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Original strand, 22731189 - 22731354
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || | | |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22731189 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaatatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaact 22731288  T
Q  377 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  22731289 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatg 22731354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 154 - 276
Target Start/End: Original strand, 23707200 - 23707323
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||    
T  23707200 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgt 23707298  T
Q  252 tgattaccttttgatgttgttatat 276  Q
    |||||| | ||||||||||||||||    
T  23707299 tgattatcatttgatgttgttatat 23707323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 24671706 - 24671609
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24671706 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttggaatgaaatctggtattgatatgtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgta 24671609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 24918820 - 24918724
Alignment:
Q  3 ttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24918820 ttttcggatttttcttttcatctctgccctgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 24918724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 22106146 - 22106049
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22106146 tttttctgatttttattttcatctctgccccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgta 22106049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 154 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 24918319 - 24918196
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||    
T  24918319 tatgattgatgaattagtatatgtatgcatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgt 24918221  T
Q  252 tgattaccttttgatgttgttatat 276  Q
    |||||| | ||||||||||||||||    
T  24918220 tgattatcatttgatgttgttatat 24918196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Original strand, 22738135 - 22738299
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22738135 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaact 22738234  T
Q  377 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    ||    ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  22738235 gcctatttaatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgatg 22738299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 23932141 - 23932044
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23932141 tttttctgatttttcttttcatctctgccctgaatttgaaatgaaagctggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 23932044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Original strand, 32214411 - 32214508
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  32214411 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttaaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgataacacgaaagttgta 32214508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 277 - 435
Target Start/End: Original strand, 298769 - 298929
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  298769 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatact 298868  T
Q  377 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  298869 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 298929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 23286027 - 23285866
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||  | || |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||    ||||||||||||||    
T  23286027 tgtgatataatgttttatgcattacttgaagaacatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtc----tgtttttgtatact 23285932  T
Q  377 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  23285931 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 23285866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 157 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 24671201 - 24671081
Alignment:
Q  157 gattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |   ||||||||    
T  24671201 gattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgtttaagttgatgttga 24671103  T
Q  255 ttaccttttgatgttgttatat 276  Q
    ||| | |||||| |||||||||    
T  24671102 ttatcatttgatattgttatat 24671081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 23660188 - 23660024
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   |||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  23660188 tgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgattgaatatttaagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctg-tttcgtatact 23660090  T
Q  377 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    | || ||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  23660089 gcctatgttgctgttgttgtttaactaagatacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 23660024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 154 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 24681623 - 24681500
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |   |||||    
T  24681623 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtattagatgtatatatgatgtttaagttgatgt 24681525  T
Q  252 tgattaccttttgatgttgttatat 276  Q
    |||| | | ||||||||||||||||    
T  24681524 tgatcatcatttgatgttgttatat 24681500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 99
Target Start/End: Original strand, 45027395 - 45027483
Alignment:
Q  11 tttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45027395 tttttcttttcatctctgccccaaatttgaaatggaatctggtgttgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgta 45027483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 361 - 435
Target Start/End: Original strand, 24643034 - 24643108
Alignment:
Q  361 gctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24643034 gctgtttttgtatactgatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24643108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Original strand, 23654341 - 23654506
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| | |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  23654341 tgtgatataatgttttatgcattacttgagtaatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgct 23654440  T
Q  377 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    || | || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  23654441 gcctatgctgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 23654506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 277 - 423
Target Start/End: Original strand, 7688 - 7835
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||    
T  7688 tgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatact 7786  T
Q  377 g-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 423  Q
    | || |||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7787 gcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaag 7835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 262 - 427
Target Start/End: Original strand, 23708558 - 23708725
Alignment:
Q  262 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 360  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| || | ||| ||||| |||||||| |||| ||||    
T  23708558 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcat 23708657  T
Q  361 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 427  Q
    | || ||||| |||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  23708658 gttg-ttttgcatactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaagttga 23708725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 343 - 441
Target Start/End: Original strand, 38136 - 38234
Alignment:
Q  343 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  38136 ttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 38234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 294 - 441
Target Start/End: Original strand, 23103369 - 23103515
Alignment:
Q  294 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgt 392  Q
    ||||| |||||||||||   ||||| ||||||| |||| ||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||| |    
T  23103369 tgcatgacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgctgtttt 23103466  T
Q  393 tatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||| |||||    
T  23103467 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 23103515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 23136038 - 23135970
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23136038 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 23135970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 247 - 316
Target Start/End: Original strand, 22173799 - 22173868
Alignment:
Q  247 gatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtga 316  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22173799 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtga 22173868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 18809401 - 18809333
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809401 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 18809333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 22105924 - 22105856
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105924 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtgcagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 22105856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 23711717 - 23711785
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23711717 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 23711785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 24368285 - 24368217
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24368285 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 24368217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 26508315 - 26508247
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26508315 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 26508247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 39682772 - 39682704
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682772 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 39682704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 45027608 - 45027676
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45027608 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 45027676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 33 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 20261676 - 20261610
Alignment:
Q  33 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20261676 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 20261610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 321 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 28406099 - 28405990
Alignment:
Q  321 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagt 418  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||    
T  28406099 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggt 28406000  T
Q  419 ctaagttgat 428  Q
    ||||||||||    
T  28405999 ctaagttgat 28405990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 571856 - 571788
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571856 ccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 571788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 281 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 7679745 - 7679592
Alignment:
Q  281 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 379  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| |  ||  || |||| |||||| |||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  7679745 atataattatatatacattacatgaattatgtttga-tgtttatgatgttgatgacttacatt-gatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 7679649  T
Q  380 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7679648 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 7679592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 381 - 441
Target Start/End: Original strand, 23040249 - 23040309
Alignment:
Q  381 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  23040249 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 23040309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 23931919 - 23931851
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23931919 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacactaaagttgta 23931851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 24897899 - 24897967
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24897899 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgta 24897967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 24900382 - 24900450
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24900382 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgta 24900450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 24902859 - 24902927
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24902859 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgta 24902927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 24905336 - 24905404
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24905336 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgta 24905404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 26505837 - 26505769
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26505837 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattgatcttaggtgtaaacacgaaagttgta 26505769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 28577557 - 28577489
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28577557 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 28577489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 31345638 - 31345570
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31345638 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattgatcttaggtgtaaacacgaaagttgta 31345570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 32214634 - 32214702
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  32214634 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattgttcttaggtgtaaacacaaaagttgta 32214702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 41523776 - 41523844
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41523776 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattagtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 41523844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 38967937 - 38967870
Alignment:
Q  32 cgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38967937 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaatacgaaagttgta 38967870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 292 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 20309257 - 20309109
Alignment:
Q  292 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 390  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | ||||||| ||    
T  20309257 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctatt 20309161  T
Q  391 -gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||| |||||    
T  20309160 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 20309109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 6726506 - 6726438
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | | || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726506 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacataagtggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 6726438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 366 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 8946734 - 8946658
Alignment:
Q  366 ttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  8946734 ttttgtatactgcctatgttgctattgttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 8946658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 21154711 - 21154779
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  21154711 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaatttgtcttaggggtaaacacgaaagttgta 21154779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 271 - 347
Target Start/End: Original strand, 22459511 - 22459587
Alignment:
Q  271 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgat 347  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||    
T  22459511 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgagttatatgtgaatatttgagatgttgatgactttcatttgat 22459587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 23706920 - 23706988
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23706920 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgta 23706988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 24907811 - 24907879
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24907811 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacatgaaagttgta 24907879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 24918674 - 24918626
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24918674 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24918626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 32039202 - 32039270
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32039202 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaaaggattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 32039270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 41523701 - 41523749
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523701 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 41523749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 31345537 - 31345490
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31345537 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 31345490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 99
Target Start/End: Original strand, 41523584 - 41523651
Alignment:
Q  32 cgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41523584 cgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaggttgta 41523651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 99
Target Start/End: Original strand, 10684468 - 10684534
Alignment:
Q  33 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | | || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10684468 gaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgta 10684534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21368439 - 21368365
Alignment:
Q  155 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  21368439 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatg 21368365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 23131315 - 23131253
Alignment:
Q  37 ttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23131315 ttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgta 23131253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 23133782 - 23133720
Alignment:
Q  37 ttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23133782 ttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgta 23133720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 24681901 - 24681835
Alignment:
Q  33 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24681901 gaatttgaaatgaaaactggtattggttggtacagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgta 24681835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 281 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 25176010 - 25175864
Alignment:
Q  281 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 379  Q
    |||||||||||||| | |||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  25176010 atataattatatatacgttatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 25175914  T
Q  380 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 428  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  25175913 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaatctgtctaagttgat 25175864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 99
Target Start/End: Original strand, 34402231 - 34402293
Alignment:
Q  37 ttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34402231 ttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgta 34402293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 96
Target Start/End: Original strand, 23706728 - 23706793
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagtt 96  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23706728 ccgaatttgaaatgaaaacggctattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagtt 23706793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 23791457 - 23791357
Alignment:
Q  261 tttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  23791457 tttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatat-aatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatttttatatca 23791359  T
Q  360 tg 361  Q
    ||    
T  23791358 tg 23791357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 99
Target Start/End: Original strand, 24529253 - 24529318
Alignment:
Q  34 aatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24529253 aatttaaaatgaaaacttgtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgta 24529318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 6726581 - 6726533
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6726581 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 6726533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 423
Target Start/End: Original strand, 20520131 - 20520295
Alignment:
Q  261 tttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    |||||||| |||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| |||    
T  20520131 tttgatgtcgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgca-ttgatattgttatatca 20520228  T
Q  360 tg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 423  Q
    ||  ||| |||| | |||||| | |||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  20520229 tgaactg-ttttatgtactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 20520295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 21154518 - 21154586
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | |  | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21154518 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgttatagaattggtcctaggtgtaaacacgaaagttgta 21154586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 22105999 - 22105951
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22105999 tatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 22105951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 23207460 - 23207296
Alignment:
Q  261 tttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||| | | |||  |||||| || ||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  23207460 tttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttat-aatg-ttgagatgtcgttgatttgcatttgatattgttatatca 23207363  T
Q  360 tg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 423  Q
    ||  |||||||  |||||||| | |||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  23207362 tgaactgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23207296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 23706654 - 23706702
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23706654 tatagaacttgagttatggtcaagttactgcacgtaggtcacagtgaat 23706702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 23709236 - 23709304
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23709236 ccgaatttgaaataaatactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgta 23709304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 24368360 - 24368312
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24368360 tatagaacttaagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24368312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 24529175 - 24529223
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24529175 tatagaacttgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 24671484 - 24671416
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||| || |||||||| || ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24671484 ccgaatttgaaatgcaaactggtatttattggtacagaattggtcttaggtgtaaaaacgaaagttgta 24671416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 24671559 - 24671511
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24671559 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 24671511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 24681978 - 24681930
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24681978 tatagagcttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24681930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 290 - 423
Target Start/End: Original strand, 32451896 - 32452031
Alignment:
Q  290 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacg-ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgct 387  Q
    |||| |||||||||||| | ||  ||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||| || |||| | |||||||    
T  32451896 tatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgcatt-gatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgct 32451994  T
Q  388 gtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 423  Q
    ||| | | |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  32451995 gtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 32452031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 142
Target Start/End: Original strand, 41523508 - 41523552
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagt 142  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41523508 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagt 41523552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 29601517 - 29601478
Alignment:
Q  261 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcatta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29601517 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcatta 29601478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23799531 - 23799457
Alignment:
Q  155 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| || ||||||||||||||| | |||||||    
T  23799531 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgttgaatatgatgttattcatgattgatgaattattatatg 23799457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22686221 - 22686145
Alignment:
Q  160 tgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatat 236  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| || ||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  22686221 tgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtttttcatgattgatgaattattatatgaatatat 22686145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 23709161 - 23709209
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  23709161 tatagaacttgagttatggtctaattactgcacataggtcacagtgaat 23709209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #141
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 24642377 - 24642425
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  24642377 tatagaacttgagttatggtcaaataactacacgtaggtcacagtgaat 24642425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #142
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 24642452 - 24642520
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  24642452 ccgaatttgaaaagaaaactggtattgattggtacagaattgctcttaggtgtaaacccaaaagttgta 24642520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #143
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 24918599 - 24918531
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  24918599 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtagagaattggtcttaagtgtaaacatgaaagttgta 24918531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #144
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 18809467 - 18809428
Alignment:
Q  107 tgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809467 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 18809428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #145
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 381 - 444
Target Start/End: Original strand, 22134266 - 22134329
Alignment:
Q  381 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatg 444  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| | |||| ||||||||    
T  22134266 tgttgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatgatgatg 22134329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #146
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 23131386 - 23131347
Alignment:
Q  107 tgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23131386 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 23131347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #147
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 141
Target Start/End: Original strand, 23706846 - 23706889
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacag 141  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  23706846 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaagtcacag 23706889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #148
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Original strand, 23711651 - 23711690
Alignment:
Q  107 tgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23711651 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 23711690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #149
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 26505903 - 26505864
Alignment:
Q  107 tgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505903 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 26505864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #150
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 26508381 - 26508342
Alignment:
Q  107 tgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26508381 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 26508342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #151
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Original strand, 27920402 - 27920441
Alignment:
Q  107 tgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27920402 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 27920441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #152
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Original strand, 32039136 - 32039175
Alignment:
Q  107 tgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32039136 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 32039175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #153
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Original strand, 34402160 - 34402199
Alignment:
Q  107 tgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402160 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 34402199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #154
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 197
Target Start/End: Original strand, 41524003 - 41524045
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41524003 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatac 41524045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #155
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 389 - 427
Target Start/End: Original strand, 18786971 - 18787009
Alignment:
Q  389 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18786971 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 18787009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #156
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 144
Target Start/End: Original strand, 32214558 - 32214604
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtga 144  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32214558 tatagaacttaagttatggtcaaattacagcacgtaggtcacagtga 32214604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #157
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 144
Target Start/End: Original strand, 45027533 - 45027579
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtga 144  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45027533 tatagaactttagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtga 45027579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #158
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 265 - 361
Target Start/End: Original strand, 24697548 - 24697644
Alignment:
Q  265 atgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 361  Q
    ||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||   |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  24697548 atgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatatgaagt-ttgagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatg 24697644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #159
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 21154443 - 21154491
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21154443 tatagaacttgacttttagtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 21154491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #160
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 21154636 - 21154684
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21154636 tatagaatttgagttacggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaat 21154684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #161
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 23709043 - 23709111
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  23709043 ccgattttgaaatgaaaactggtattgattggcacagaattcgtcctaggtgtaaacacgtaagttgta 23709111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #162
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 571922 - 571883
Alignment:
Q  107 tgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571922 tgagttaaggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 571883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #163
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 23133853 - 23133814
Alignment:
Q  107 tgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23133853 tgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 23133814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #164
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 28577623 - 28577584
Alignment:
Q  107 tgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28577623 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 28577584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #165
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 39682838 - 39682799
Alignment:
Q  107 tgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682838 tgagttaaggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 39682799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #166
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 391 - 441
Target Start/End: Original strand, 23072019 - 23072069
Alignment:
Q  391 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||| |||||    
T  23072019 gttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatgatgatg 23072069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #167
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 232
Target Start/End: Original strand, 23707148 - 23707225
Alignment:
Q  155 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtat 232  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  23707148 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 23707225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #168
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 232
Target Start/End: Original strand, 24642680 - 24642757
Alignment:
Q  155 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtat 232  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  24642680 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 24642757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #169
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 24918371 - 24918294
Alignment:
Q  155 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtat 232  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  24918371 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 24918294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #170
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 155 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 22686110 - 22686062
Alignment:
Q  155 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||||||    
T  22686110 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatatt 22686062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #171
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 381 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 23287424 - 23287384
Alignment:
Q  381 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 421  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  23287424 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 23287384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #172
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 110 - 146
Target Start/End: Original strand, 23708980 - 23709016
Alignment:
Q  110 gttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23708980 gttatggtcaaattactgcacttaggtcacagtgaat 23709016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #173
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 384 - 416
Target Start/End: Original strand, 25961597 - 25961629
Alignment:
Q  384 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtca 416  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25961597 tgctgttgttatttaactaagttgcatgagtca 25961629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #174
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 381 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 26392443 - 26392403
Alignment:
Q  381 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 421  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  26392443 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 26392403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 98 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 11113 - 10772
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  11113 tatagaacttgagttatagtcaaattacttcatgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatat 11015  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11014 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 10915  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10914 ttacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 10815  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 440  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10814 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 10772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 109)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 98 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 21841107 - 21840766
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  21841107 tatagaacttgagttatagtcaaattacttcatgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatat 21841009  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21841008 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 21840909  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21840908 ttacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 21840809  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 440  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21840808 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 21840766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 13989206 - 13988870
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  13989206 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatac 13989108  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13989107 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 13989008  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13989007 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 13988908  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13988907 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 13988870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 23593555 - 23593893
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23593555 tatagaacttgcgttatagttaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 23593654  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgc 296  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23593655 gatattgtccatgattaatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgc 23593754  T
Q  297 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23593755 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatt 23593854  T
Q  397 taactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23593855 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 23593893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 21923113 - 21923449
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  21923113 tatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatac 21923211  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21923212 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 21923311  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21923312 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 21923411  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21923412 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21923449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 21474908 - 21475245
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21474908 tatagaatttgagttatggtcaaattactaaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 21475007  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21475008 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 21475107  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21475108 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 21475207  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  21475208 aactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatg 21475245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 98 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 16362259 - 16361908
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16362259 tatagaatttaagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataatttattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgttaatac 16362160  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgc 296  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16362159 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgc 16362060  T
Q  297 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 396  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  16362059 attacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttatatactgttgtgttgctgtcgttatt 16361960  T
Q  397 taactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 448  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16361959 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 16361908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 154 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 29776972 - 29776692
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29776972 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 29776874  T
Q  254 attaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 353  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29776873 attattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 29776774  T
Q  354 atgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29776773 atgtcatgttatttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 29776692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 15859830 - 15860167
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||    
T  15859830 tatacaacttgagttatggtcaaataactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatctt-gcgaatac 15859928  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  15859929 gatattgtccatggttgatgaagtgttatatgtatatatgatgtcttaagatgttgattaccatctgatgttgttatattgtgatataattgtatgtgca 15860028  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 396  Q
    ||  ||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15860029 ttgattgaattatttgtgagtaattaagacgttgattgacttgcatttaatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatt 15860128  T
Q  397 taactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  15860129 taactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatg 15860167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 154 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 29298420 - 29298141
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298420 tatgattgatgaattagtatatatatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 29298322  T
Q  254 attaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 353  Q
    ||||   ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298321 attattatttgatgttattatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 29298222  T
Q  354 atgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29298221 at-tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 29298141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 154 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 31612597 - 31612317
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31612597 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgttttaagatattg 31612499  T
Q  254 attaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 353  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31612498 attattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattatt 31612399  T
Q  354 atgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31612398 atgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 31612317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 154 - 435
Target Start/End: Original strand, 22122945 - 22123226
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 253  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22122945 tatgattgatgaattggtatatgtatgtttatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatattg 22123043  T
Q  254 attaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 353  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22123044 attattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacattgttgacttgcatttgatattatt 22123143  T
Q  354 atgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  22123144 atgtcatgctatttttgtatactgttgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagattaagatg 22123226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 154 - 435
Target Start/End: Original strand, 16275240 - 16275522
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  16275240 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttcaagatattg 16275339  T
Q  254 attaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattat 352  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  16275340 attattatttgatgttgttatattgtgatataatggtatatgcattaattgaattttatgtgaataattgagacgttgattgacttgcaattgatattat 16275439  T
Q  353 tatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  16275440 tatgtcatgctgtttttgtatactgctatgtcgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatg 16275522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 261 - 441
Target Start/End: Original strand, 13212845 - 13213026
Alignment:
Q  261 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13212845 tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtca 13212944  T
Q  360 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    || ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  13212945 tgttgtttttgtatactgttgcgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 13213026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 261 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 21347140 - 21346965
Alignment:
Q  261 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21347140 tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtca 21347041  T
Q  360 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    || |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21347040 tgttgtttttgtatactgctgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21346965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 261 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 21342275 - 21342100
Alignment:
Q  261 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342275 tttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtca 21342176  T
Q  360 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    || |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21342175 tgttgtttttgtatactgctgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21342100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 265 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 40389329 - 40389158
Alignment:
Q  265 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40389329 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 40389230  T
Q  364 gtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40389229 gtttttgtatactgatgtgtcgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtcagtctaggttgattaagatg 40389158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 261 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 21707345 - 21707171
Alignment:
Q  261 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 360  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21707345 tttgatgatgttatattgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcat 21707246  T
Q  361 gctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    ||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21707245 gctttttttgtatactattgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21707171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 261 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 21711887 - 21711713
Alignment:
Q  261 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 360  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21711887 tttgatgatgttatattgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcat 21711788  T
Q  361 gctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    ||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21711787 gctttttttgtatactattgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21711713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 247 - 423
Target Start/End: Original strand, 45574812 - 45574989
Alignment:
Q  247 gatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 346  Q
    |||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45574812 gatgttgattatgatttgatgttcttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgttgacttgcatttgg 45574911  T
Q  347 tattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 423  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45574912 tattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 45574989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 261 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 433189 - 433016
Alignment:
Q  261 tttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  433189 tttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtct 433090  T
Q  360 tgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  433089 tgatgtttttgtatactgcctgtgttgc---cgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 433016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 98 - 229
Target Start/End: Original strand, 16275078 - 16275209
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  16275078 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatacgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaattc 16275177  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16275178 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 16275209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 277 - 444
Target Start/End: Original strand, 50210168 - 50210336
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  || | ||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50210168 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 50210267  T
Q  377 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatg 444  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  50210268 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgatg 50210336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 98 - 219
Target Start/End: Original strand, 27161408 - 27161529
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  27161408 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttatgaataa 27161507  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaa 219  Q
     |||||||| ||||||||||||    
T  27161508 aatattgttaatgattgatgaa 27161529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 98 - 232
Target Start/End: Original strand, 22050658 - 22050792
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||     
T  22050658 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtat 22050757  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtat 232  Q
    ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  22050758 gatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 22050792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 98 - 232
Target Start/End: Original strand, 22122836 - 22122970
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||     
T  22122836 tatagaacttgggttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtat 22122935  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtat 232  Q
    ||| ||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  22122936 gatgttgtttatgattgatgaattggtatatgtat 22122970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 98 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29777081 - 29776947
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||     
T  29777081 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtat 29776982  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtat 232  Q
    ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  29776981 gatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 29776947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 277 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 34509946 - 34509787
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||  |||   || |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34509946 tgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatact 34509847  T
Q  377 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  34509846 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 34509787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 98 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31612706 - 31612572
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||     
T  31612706 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcaaagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatcagtat 31612607  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtat 232  Q
    ||||||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  31612606 gatattgtttatgattgatgaattagtatatgtat 31612572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Original strand, 22050511 - 22050608
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22050511 tttttctgatttttcttttcatctctgccccaaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 22050608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Original strand, 27250684 - 27250849
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27250684 tgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 27250783  T
Q  377 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  27250784 gcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 27250849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 154 - 254
Target Start/End: Original strand, 22050767 - 22050866
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22050767 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 22050865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 29298582 - 29298461
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||     
T  29298582 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacataagtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtat 29298483  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaa 219  Q
    ||| ||||| ||||||||||||    
T  29298482 gatgttgtttatgattgatgaa 29298461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 29298922 - 29298825
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298922 tttttatgatttttcttttcatctctgcaccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 29298825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 31613239 - 31613142
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31613239 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatatggtattgataggttcataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 31613142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 277 - 448
Target Start/End: Original strand, 22468651 - 22468823
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||  |||   ||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||  ||    
T  22468651 tgtgatataatgttatgtgcattacttgagatattattgaataattaagatgttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatct 22468750  T
Q  377 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 448  Q
    || | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22468751 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgaagatgt 22468823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 89
Target Start/End: Original strand, 22122495 - 22122582
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacac 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22122495 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacac 22122582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 22532435 - 22532270
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||   |||||| || ||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22532435 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgaatatttaagatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22532336  T
Q  377 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    | || |||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||| |||||| |||||    
T  22532335 gcctatgttgctgttgttatttaactaaattgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 22532270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 43543389 - 43543292
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43543389 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 43543292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 40129572 - 40129475
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  40129572 tttttatgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatatggtattgataggtccagaattgatcttaggtgtaaacactaaagttgta 40129475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 99
Target Start/End: Original strand, 16274746 - 16274834
Alignment:
Q  11 tttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16274746 tttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatggaatctggtgttgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 16274834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 279 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 20135351 - 20135181
Alignment:
Q  279 tgatataattatatatgcattacttgaa-ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 377  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||| || ||| |||||| || ||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||| |||||  |||    
T  20135351 tgatataatgttgtatgcattacttgaagttttat-tgaatacttaagatgttgttgaattgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctg 20135253  T
Q  378 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 448  Q
    | | || |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20135252 cctatgctgctattgttgtttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 20135181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 261 - 423
Target Start/End: Original strand, 21896194 - 21896358
Alignment:
Q  261 tttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  21896194 tttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatca 21896293  T
Q  360 tgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 423  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  21896294 tgctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 21896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 155 - 243
Target Start/End: Original strand, 27161518 - 27161605
Alignment:
Q  155 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 243  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27161518 atgattgatgaattagtatatatatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 27161605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 98 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 13227204 - 13227129
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 173  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13227204 tatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 13227129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 263 - 423
Target Start/End: Original strand, 21861510 - 21861672
Alignment:
Q  263 tgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 361  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  21861510 tgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatg 21861609  T
Q  362 ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 423  Q
    ||| ||||| |||||| || |||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  21861610 ctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaag 21861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 98 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 29535392 - 29535317
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 173  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29535392 tatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 29535317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Original strand, 9044679 - 9044776
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9044679 tttttctgttttttcttttcatctctgccccaaatttgaaataaaaactggtattgatcggtacagaattagtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 9044776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 29777421 - 29777324
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  29777421 tttttctgatttttcttttcatctctgccctgaatttgaaataaaaactggtattgatcggtacagaattagtcttaggtgtaaacacaaaagttgta 29777324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 277 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 21026846 - 21026696
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||  ||| ||||||||| |||||||||||    
T  21026846 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatact 21026747  T
Q  377 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 426  Q
    || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21026746 gcctatattgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21026696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 83
Target Start/End: Original strand, 43630263 - 43630344
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgt 83  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||| ||||||    
T  43630263 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatatggtattgattggtacagaattggtctcaggtgt 43630344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 381 - 448
Target Start/End: Original strand, 20454613 - 20454680
Alignment:
Q  381 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 448  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20454613 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgataatgt 20454680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 261 - 423
Target Start/End: Original strand, 35261019 - 35261180
Alignment:
Q  261 tttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||   |||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  35261019 tttgatgttgttaataatgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatgtatgaatgtttgaga---tgttgatttgcatttgatattgttatatca 35261115  T
Q  360 tgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 423  Q
    ||||| ||||| |||||| || |||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  35261116 tgctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35261180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Original strand, 15859476 - 15859574
Alignment:
Q  2 tttttctgatttt-tcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15859476 tttttctgattttttcttttcatctctatcccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtatacacgaaagttgta 15859574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 16401595 - 16401505
Alignment:
Q  9 gatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  16401595 gatttttcttttcatctctgctccgaatttgaaataaaaactggtattgatcggtacagaattggtcttaggtgtagacacaaaagttgta 16401505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 341 - 441
Target Start/End: Original strand, 20847173 - 20847274
Alignment:
Q  341 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttga 439  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||    
T  20847173 atttgatatatttatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 20847272  T
Q  440 tg 441  Q
    ||    
T  20847273 tg 20847274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 22122718 - 22122786
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22122718 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgta 22122786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 271 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 16758822 - 16758664
Alignment:
Q  271 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttt 368  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||  ||| |||||||||| |||| |||||  |||  ||    
T  16758822 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaat-gttgtgatgttgttgtattgtatttgatattgttatatcatgaactg-gtt 16758725  T
Q  369 tgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 427  Q
    || |||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  16758724 tgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 16758664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 13989324 - 13989256
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13989324 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 13989256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 21841225 - 21841157
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21841225 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 21841157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 21922995 - 21923063
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21922995 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 21923063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 29298699 - 29298632
Alignment:
Q  32 cgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298699 cgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 29298632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 33 - 99
Target Start/End: Original strand, 27161292 - 27161358
Alignment:
Q  33 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27161292 gaatttgaaatgaaaacaggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 27161358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 13227322 - 13227257
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagtt 96  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13227322 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagtt 13227257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 29535510 - 29535441
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtat 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29535510 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtat 29535441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 15859712 - 15859780
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15859712 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgta 15859780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 16274959 - 16275027
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16274959 ccgaattggaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 16275027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 16362377 - 16362309
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16362377 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttgggtgtaaacacgaaagttgta 16362309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 29777199 - 29777131
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29777199 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaatcacgaaagttgta 29777131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 31612824 - 31612756
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612824 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtaccgaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 31612756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 262 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 33681188 - 33681022
Alignment:
Q  262 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 360  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| ||||  |||||||||| |||||| |||| ||||    
T  33681188 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgacgacttgcattcgatattgttatatcat 33681090  T
Q  361 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 427  Q
    | || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  33681089 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 33681022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 317 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 21754170 - 21754049
Alignment:
Q  317 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 414  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21754170 ataattgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 21754073  T
Q  415 cagtctaagttgattaagatgttg 438  Q
    | |||||||||||| | |||||||    
T  21754072 cggtctaagttgatgatgatgttg 21754049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 99
Target Start/End: Original strand, 27161099 - 27161165
Alignment:
Q  33 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27161099 gaatttgaaatggaatatagtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacaggaaagttgta 27161165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 21474790 - 21474858
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21474790 ccgaatatgaaatgaaaaccggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 21474858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 31612899 - 31612851
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612899 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 31612851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 261 - 423
Target Start/End: Original strand, 41049974 - 41050138
Alignment:
Q  261 tttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  41049974 tttgacgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatga--tgttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatca 41050071  T
Q  360 tgctgt-ttttgtatactg-ctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 423  Q
    ||   | |||| ||||||| || |||||||||| |||   ||||||||||||||||||| |||||||    
T  41050072 tgaactattttatatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaag 41050138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 422
Target Start/End: Original strand, 14295494 - 14295652
Alignment:
Q  261 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 360  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||    
T  14295494 tttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcat 14295589  T
Q  361 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaa 422  Q
    | || ||| | ||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14295590 gatggttt-gcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 14295652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 29298473 - 29298408
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  29298473 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 29298408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 43543267 - 43543214
Alignment:
Q  223 ttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatat 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  43543267 ttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 43543214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 15859624 - 15859672
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15859624 tatagaacttgagttatgatcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15859672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 16274884 - 16274932
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16274884 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 16274932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 16401455 - 16401407
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16401455 tatataacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 16401407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 281 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 22237788 - 22237642
Alignment:
Q  281 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 379  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||| |    
T  22237788 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcct 22237691  T
Q  380 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 427  Q
     ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  22237690 atgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttga 22237642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 23593437 - 23593505
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  23593437 ccgagtttgaaatgaaaactggtattgattggtgcataattagtcttaggtgtaaacaagaaagttgta 23593505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 29298775 - 29298727
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298775 tataaaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 29298727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 31613092 - 31613044
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31613092 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 31613044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 139
Target Start/End: Original strand, 9044826 - 9044867
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcac 139  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9044826 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcac 9044867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 262 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 20918782 - 20918620
Alignment:
Q  262 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 360  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||    
T  20918782 ttgatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcat 20918687  T
Q  361 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 426  Q
    | || ||| | ||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20918686 gatggttt-gcatactgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20918620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 366
Target Start/End: Original strand, 22354527 - 22354616
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 366  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  22354527 tgtgatataatgttatatacattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtt 22354616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 428
Target Start/End: Original strand, 22921868 - 22921976
Alignment:
Q  321 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagt 418  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22921868 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 22921966  T
Q  419 ctaagttgat 428  Q
    ||||| ||||    
T  22921967 ctaagatgat 22921976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 10812634 - 10812682
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10812634 tataaaacttgagctatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 10812682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 27161215 - 27161263
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27161215 tatagaacttgaattatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 27161263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 29777274 - 29777226
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  29777274 tatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacaatgaat 29777226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 13989390 - 13989351
Alignment:
Q  107 tgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13989390 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 13989351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 384 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 21714600 - 21714549
Alignment:
Q  384 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  21714600 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatg 21714549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 31613015 - 31612952
Alignment:
Q  33 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagtt 96  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31613015 gaatttgaactgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacactaaagtt 31612952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 146
Target Start/End: Original strand, 22122645 - 22122691
Alignment:
Q  100 tagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  22122645 tagaacttgagttatggtcaaattactgcacatagatcacagtgaat 22122691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 40129425 - 40129387
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggt 136  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40129425 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggt 40129387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 50686792 - 50686695
Alignment:
Q  264 gatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 361  Q
    |||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| |||||||| |||||||||| ||| |||| |||||    
T  50686792 gatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgacattgttatatcatg 50686695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 389 - 427
Target Start/End: Original strand, 52928038 - 52928076
Alignment:
Q  389 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52928038 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52928076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12710211 - 12710130
Alignment:
Q  155 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatat 236  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| ||||||| ||||| || | | ||||||| ||||||    
T  12710211 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcacgattgctggattattatatgaatatat 12710130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 95
Target Start/End: Original strand, 10812709 - 10812773
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagt 95  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |  ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  10812709 ccgaatttgaaattaaaactggtattgatcggtactgaattgatcttaggtgtaaacatgaaagt 10812773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 271 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 12271725 - 12271642
Alignment:
Q  271 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 355  Q
    ||||| |||||||||||| |||||  ||||||| | ||||| || |||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  12271725 ttataatgtgatataattgtatatatattactttagttatacgtaaata-ttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttat 12271642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Original strand, 21474724 - 21474763
Alignment:
Q  107 tgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21474724 tgagttaaggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 21474763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 16401381 - 16401315
Alignment:
Q  30 cccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagtt 96  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||  ||  ||||||||| |||||||    
T  16401381 cccgaatttgaaatgaaaactggtattggtcggtacaaaattggcatttagtgtaaacatgaaagtt 16401315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 328 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 20248394 - 20248293
Alignment:
Q  328 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 425  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  20248394 gttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 20248296  T
Q  426 gat 428  Q
    |||    
T  20248295 gat 20248293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 384 - 442
Target Start/End: Original strand, 24783155 - 24783213
Alignment:
Q  384 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatga 442  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||| |  |||| ||||||||||| ||||||    
T  24783155 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagatgattaagatgatgatga 24783213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 232
Target Start/End: Original strand, 16275188 - 16275265
Alignment:
Q  155 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtat 232  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  16275188 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 16275265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 381 - 441
Target Start/End: Original strand, 38801447 - 38801507
Alignment:
Q  381 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||| |||||    
T  38801447 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagatgttgaagatgatgatg 38801507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 155 - 203
Target Start/End: Original strand, 22824136 - 22824184
Alignment:
Q  155 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 203  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||||||    
T  22824136 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatatt 22824184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 8)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 14288 - 13951
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14288 tatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 14189  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14188 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 14089  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14088 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 13989  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13988 atctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 13951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 98 - 230
Target Start/End: Original strand, 23352 - 23484
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23352 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 23451  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 230  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23452 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 23484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 99
Target Start/End: Original strand, 22860 - 22949
Alignment:
Q  10 atttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22860 atttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgta 22949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 81
Target Start/End: Original strand, 20685 - 20764
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggt 81  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  20685 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaattggaaatgaaatctgatattgattggtacagaattggtcttaggt 20764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 14406 - 14338
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14406 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaacgttgta 14338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #6
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 23159 - 23207
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23159 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 23207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 22999 - 23047
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22999 tatagaacatgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 23047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #8
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 75
Target Start/End: Original strand, 23074 - 23118
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtc 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  23074 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtacaaaattggtc 23118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 3)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 38162 - 37825
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38162 tatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 38063  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38062 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 37963  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37962 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 37863  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37862 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 37825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 38280 - 38212
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38280 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 38212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 38346 - 38307
Alignment:
Q  107 tgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38346 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 38307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 2)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 98 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 9582 - 9241
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  9582 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatat 9484  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9483 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatttgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 9384  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  9383 ttacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgttgtgttgctgttgttattt 9284  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 440  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9283 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 9241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 9700 - 9632
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9700 ccgaatttgaaatgaaaactggtatttattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 9632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 122)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 264590 - 264926
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  264590 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattaaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatac 264688  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  264689 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 264788  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  264789 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 264888  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  264889 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 264926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 20909352 - 20909016
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20909352 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatac 20909254  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  20909253 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 20909154  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  20909153 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgcttttgttattt 20909054  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20909053 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 20909016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 39363725 - 39363388
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  39363725 tatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacactgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatat 39363626  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  39363625 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 39363526  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39363525 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 39363426  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39363425 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 39363388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 42245187 - 42245523
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  42245187 tatagaactatagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatac 42245285  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  42245286 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 42245385  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42245386 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 42245485  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42245486 aactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 42245523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 10732762 - 10733098
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  10732762 tatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatac 10732860  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  10732861 gattttgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatacggtgatataattgtatatgca 10732960  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10732961 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 10733060  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10733061 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 10733098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 39245476 - 39245140
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  39245476 tatagaacttgatttatagttaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatac 39245378  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  39245377 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgca 39245278  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39245277 ttacttgaattatatgtgaataattgggacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 39245178  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39245177 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 39245140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 29346320 - 29345984
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  29346320 tatagaacttgatttatactcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatac 29346222  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29346221 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 29346122  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  29346121 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgatgctgttgttattt 29346022  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  29346021 aactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatg 29345984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 29348793 - 29348457
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  29348793 tatagaacttgatttatactcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatac 29348695  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29348694 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 29348595  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  29348594 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgatgctgttcttattt 29348495  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  29348494 aactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatg 29348457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 29351266 - 29350930
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  29351266 tatagaacttgatttatactcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatac 29351168  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29351167 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 29351068  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  29351067 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgatgctgttcttattt 29350968  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  29350967 aactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatg 29350930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 38619777 - 38619438
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38619777 tatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 38619678  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgc 296  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||    
T  38619677 gatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattggaatataattgtatatgc 38619578  T
Q  297 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 395  Q
    || | ||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  38619577 atcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgttgttgttat 38619478  T
Q  396 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38619477 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 38619438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 23064854 - 23064515
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23064854 tatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataatttattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 23064755  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgc 296  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  23064754 gatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatattatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgggatataattgtatatgc 23064655  T
Q  297 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 395  Q
    || | ||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  23064654 atcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaggtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgttgttgttat 23064555  T
Q  396 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23064554 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 23064515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 154 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 29330215 - 29329938
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  29330215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgatt 29330117  T
Q  254 attaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 353  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29330116 atta---tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 29330020  T
Q  354 atgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29330019 atgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 29329938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 154 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 32027677 - 32027397
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32027677 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 32027579  T
Q  254 attaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 353  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32027578 attattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattatt 32027479  T
Q  354 atgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  32027478 atgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatg 32027397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 2154453 - 2154772
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154453 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 2154552  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||                   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2154553 gatactgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgattt-------------------gatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 2154633  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaa-taattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 396  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  2154634 ttatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctattgttatt 2154733  T
Q  397 taactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2154734 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 2154772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 154 - 435
Target Start/End: Original strand, 20917830 - 20918106
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20917830 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatcttgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 20917928  T
Q  254 attaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 353  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    ||| ||||||||    
T  20917929 attattatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgctttacttgaattagatgtgaataattgagacgttgttgact----ttttatattatt 20918024  T
Q  354 atgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20918025 ttgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 20918106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 154 - 435
Target Start/End: Original strand, 20901904 - 20902168
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||             
T  20901904 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgattt--------- 20901994  T
Q  254 attaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaa-taattgagacgttgttgacttgcatttgatattat 352  Q
              ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20901995 ----------gatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattat 20902084  T
Q  353 tatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg-attaagatg 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  20902085 tatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaattaagatg 20902168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 98 - 448
Target Start/End: Original strand, 17516985 - 17517328
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17516985 tatagaacttgagttatcgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 17517084  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataat-tatatatgc 296  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    ||||      ||   ||||||| | | | ||| |||    
T  17517085 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatgtatgatgttttaagatgttgatga----ttga-----ataagatgtgatacattgtttatgtgc 17517175  T
Q  297 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttat 395  Q
    |||||||||  |||   |||||| || ||| |||||||| ||||  |||||||| ||||||| |||||||  ||||  ||| || || |||| |||||||    
T  17517176 attacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcgattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttat 17517275  T
Q  396 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 448  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17517276 taaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgataatgatgt 17517328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 261 - 435
Target Start/End: Original strand, 36154767 - 36154938
Alignment:
Q  261 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 360  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36154767 tttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 36154866  T
Q  361 gctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36154867 gctgtttttgtatactgctgtgt---tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 36154938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 262 - 435
Target Start/End: Original strand, 11581184 - 11581357
Alignment:
Q  262 ttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11581184 ttgatgttgttatattgtgatataattgtatatacattacttgaattatacgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatg 11581283  T
Q  362 ctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11581284 ttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 11581357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 265 - 435
Target Start/End: Original strand, 18319021 - 18319192
Alignment:
Q  265 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18319021 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 18319120  T
Q  364 gtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  18319121 gtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 18319192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 261 - 435
Target Start/End: Original strand, 10775660 - 10775834
Alignment:
Q  261 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10775660 tttgatgttgt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtca 10775758  T
Q  360 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10775759 tgctggttttatatactgctgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 10775834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 261 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 31061247 - 31061072
Alignment:
Q  261 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31061247 tttgatgttgttatattgtgatataattttatatgcattaattaaattatttgtgaataattgatacgttgattgacttgcatttgatattattatgtca 31061148  T
Q  360 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31061147 tgctgtttttgtatactactgttttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 31061072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 98 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 9776699 - 9776521
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  9776699 tatagaacttgagctatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatac 9776600  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatat 276  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  9776599 gatattgtcaatgattggtgaagggttatatgtatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 9776521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 98 - 229
Target Start/End: Original strand, 20901742 - 20901873
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20901742 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcactgtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 20901841  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20901842 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 20901873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 265 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 24067282 - 24067111
Alignment:
Q  265 atgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24067282 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgtt 24067183  T
Q  364 gtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  24067182 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaaccaagctgcattggtcggtctaagttgattaagatg 24067111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 98 - 276
Target Start/End: Original strand, 37804724 - 37804902
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  37804724 tataaaacttgagttatggtcaaattaatgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatac 37804823  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatat 276  Q
    ||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||    
T  37804824 gatattgtcaatgattaatgaagcgttatatgtatatatgatgttttaagatgttaattagaatttgatgttgttatat 37804902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 9078118 - 9077953
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9078118 tgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatact 9078019  T
Q  377 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  9078018 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgatgaagatgatgatg 9077953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 1096633 - 1096468
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||   || |||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  1096633 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatgtgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatact 1096534  T
Q  377 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  1096533 acctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgttgatg 1096468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 98 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 32027786 - 32027652
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||     
T  32027786 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcactgtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtat 32027687  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtat 232  Q
    ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  32027686 gatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 32027652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Original strand, 2154113 - 2154210
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154113 tttttctgatttttcttttcatctctgccccaaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 2154210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Original strand, 23390451 - 23390616
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23390451 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 23390550  T
Q  377 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  23390551 gtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 23390616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 25421698 - 25421533
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25421698 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 25421599  T
Q  377 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  25421598 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 25421533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 32028706 - 32028609
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32028706 tttttctgatttttcttttcatctctgccctgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 32028609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Original strand, 20917328 - 20917425
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20917328 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatcaggtattgataggtccataattgatcttaggtgtaaacacgaaagttgta 20917425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 219
Target Start/End: Original strand, 20917668 - 20917789
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||     
T  20917668 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaagtcacggtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtat 20917767  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaa 219  Q
    ||| ||||| ||||||||||||    
T  20917768 gatgttgtttatgattgatgaa 20917789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 29330663 - 29330566
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29330663 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgta 29330566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 277 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 24529386 - 24529227
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||  |||   || |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24529386 tgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatact 24529287  T
Q  377 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  24529286 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 24529227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Original strand, 21729019 - 21729184
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21729019 tgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatact 21729118  T
Q  377 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  21729119 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 21729184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Original strand, 21808344 - 21808509
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21808344 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatact 21808443  T
Q  377 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  21808444 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 21808509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 24493734 - 24493570
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  ||| ||||| ||||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24493734 tgtgatataatgttatgtgcatcacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 24493636  T
Q  377 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    | || ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  24493635 gcctatgttgctattgttacttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 24493570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 335 - 441
Target Start/End: Original strand, 21997547 - 21997654
Alignment:
Q  335 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaaga 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  21997547 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 21997646  T
Q  434 tgttgatg 441  Q
    || |||||    
T  21997647 tgatgatg 21997654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Original strand, 8286797 - 8286963
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt-gtatac 375  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  || | ||| || || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8286797 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgattatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatac 8286896  T
Q  376 tgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  8286897 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 8286963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 277 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 25431560 - 25431414
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||| | || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25431560 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaacatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 25431461  T
Q  377 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaa 422  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  25431460 gcctatgttgctgttgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa 25431414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 98 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29330323 - 29330190
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||     
T  29330323 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaa-aattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttacgagtat 29330225  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtat 232  Q
    ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  29330224 gatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 29330190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Original strand, 17516452 - 17516549
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17516452 ttttcctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaaaccggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 17516549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Original strand, 20901402 - 20901499
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20901402 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaacgttgta 20901499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 297 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 22412329 - 22412191
Alignment:
Q  297 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttat 395  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| | | |||||    
T  22412329 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttatcgttat 22412231  T
Q  396 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  22412230 ttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatg 22412191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 13025476 - 13025312
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  ||| | ||||| ||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  13025476 tgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgtttt-gtatact 13025378  T
Q  377 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    || | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  13025377 gcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 13025312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 13095660 - 13095496
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  ||| | ||||| ||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  13095660 tgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgtttt-gtatact 13095562  T
Q  377 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    || | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  13095561 gcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 13095496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Original strand, 295756 - 295853
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  295756 tttttctgatttttcttttcatctctgtcccgaatttgaaatgaaatctggtattgataagtccggaataggtcttaggtgtaaccatgaaagttgta 295853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 277 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 22075185 - 22075035
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22075185 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatact 22075086  T
Q  377 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 426  Q
     | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  22075085 tcctatgttgctgttgttatttaactaagctgaatgagtcggtctaagttg 22075035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 277 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 22144215 - 22144068
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| |||||| | |||||    
T  22144215 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatgttgtttt-gcatact 22144117  T
Q  377 gc-tgtgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 423  Q
     | | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22144116 acctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22144068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 32028291 - 32028223
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32028291 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 32028223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 294 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 37724050 - 37723906
Alignment:
Q  294 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgt-tg 391  Q
    |||||||||||||||||   ||||| ||||||| |||| ||| ||  ||||||||| || |||||||||||||   ||||||||| | ||||||||| ||    
T  37724050 tgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaatttaatttgatataatcatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtctg 37723954  T
Q  392 ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttga 439  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  37723953 ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagatgttgaagatgttga 37723906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 10732644 - 10732712
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10732644 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 10732712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 20909470 - 20909402
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909470 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 20909402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 29346438 - 29346370
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29346438 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 29346370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 29348911 - 29348843
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29348911 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 29348843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 29351384 - 29351316
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29351384 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 29351316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 297 - 384
Target Start/End: Original strand, 20766095 - 20766181
Alignment:
Q  297 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgtt 384  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  20766095 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgttgtgtt 20766181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 261 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 40726036 - 40725854
Alignment:
Q  261 tttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| |||    
T  40726036 tttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatca 40725937  T
Q  360 tgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    || ||  |||| |||||| ||  ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||| ||| |||| | | ||||||||||||    
T  40725936 tgatg-ctttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatg 40725854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 33 - 99
Target Start/End: Original strand, 17516869 - 17516935
Alignment:
Q  33 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17516869 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 17516935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 262 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 21565723 - 21565556
Alignment:
Q  262 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 360  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||| | |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  21565723 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgaaatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 21565625  T
Q  361 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 428  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21565624 gatgatttgg-atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21565556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 264472 - 264540
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  264472 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgta 264540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 2154335 - 2154403
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2154335 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacactaaagttgta 2154403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 20917550 - 20917618
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20917550 ccgaattcgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 20917618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 29330441 - 29330373
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29330441 ccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 29330373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 32027904 - 32027836
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32027904 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgta 32027836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 39245594 - 39245526
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39245594 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttatgtgtaaacacgaaagttgta 39245526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 42245069 - 42245137
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245069 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 42245137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 344 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 18418678 - 18418590
Alignment:
Q  344 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttattt-aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaag 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  18418678 tgatattattatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgatgttgttattttaactaagttgcacgagtcagtctaagttgattaag 18418590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 381 - 441
Target Start/End: Original strand, 21329556 - 21329617
Alignment:
Q  381 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  21329556 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 21329617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 99
Target Start/End: Original strand, 37804609 - 37804674
Alignment:
Q  34 aatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37804609 aatttgaaatgaaaactggcattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 37804674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 295903 - 295951
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  295903 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 295951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 328 - 423
Target Start/End: Original strand, 20026945 - 20027043
Alignment:
Q  328 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 423  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20026945 gttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttgg-atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20027043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 20901624 - 20901692
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20901624 ccgattttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgta 20901692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 343 - 441
Target Start/End: Original strand, 21292992 - 21293089
Alignment:
Q  343 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || | |||||| |||||    
T  21292992 ttgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatg 21293089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 32028484 - 32028416
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  32028484 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggttttaggtgaaaacacgaaagttgta 32028416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 158 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18744036 - 18743965
Alignment:
Q  158 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  18744036 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatg 18743965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 333 - 441
Target Start/End: Original strand, 21502167 - 21502276
Alignment:
Q  333 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatta 430  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||   ||||||| | |||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21502167 tgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttac-atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 21502265  T
Q  431 agatgttgatg 441  Q
    ||||| |||||    
T  21502266 agatgatgatg 21502276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 39363837 - 39363775
Alignment:
Q  37 ttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39363837 ttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgta 39363775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 295978 - 296046
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  295978 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtatacacaaaagttgta 296046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 296096 - 296144
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  296096 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacactgaat 296144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 17516599 - 17516647
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17516599 tatagaacttgagttatggtcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 17516647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 20901549 - 20901597
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20901549 tatagaactttagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20901597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 23064972 - 23064904
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  23064972 ccgaatttgaaattaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatataaacacgaaagttgta 23064904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 380 - 435
Target Start/End: Original strand, 20806845 - 20806900
Alignment:
Q  380 gtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  20806845 gtgtcgctgttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatg 20806900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 229
Target Start/End: Original strand, 1628169 - 1628243
Alignment:
Q  155 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||||||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  1628169 atgattgatgaactattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttaatgattgatgaagtattatatg 1628243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 154 - 232
Target Start/End: Original strand, 20917777 - 20917855
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtat 232  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  20917777 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtattatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 20917855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 328 - 428
Target Start/End: Original strand, 22959538 - 22959639
Alignment:
Q  328 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 425  Q
    |||||||| |||||||  ||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22959538 gttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 22959636  T
Q  426 gat 428  Q
    |||    
T  22959637 gat 22959639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 37 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 38619889 - 38619827
Alignment:
Q  37 ttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38619889 ttgaaataaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgta 38619827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 381 - 441
Target Start/End: Original strand, 19660894 - 19660955
Alignment:
Q  381 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  19660894 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 19660955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 423
Target Start/End: Original strand, 22178161 - 22178323
Alignment:
Q  264 gatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat-- 360  Q
    |||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| |||||||| |||||||||||||| | || ||||      
T  22178161 gatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatga 22178259  T
Q  361 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 423  Q
    |||| |||| ||||||| || ||||| || |||||  ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  22178260 gctg-ttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22178323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 32028097 - 32028028
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtat 100  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  32028097 ccgaatttgaaatgaaaattgttattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaaattgtat 32028028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 17516792 - 17516840
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  17516792 tatagaacttgagttatcgtcgaattactgcacataggtcacagtgaat 17516840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 229
Target Start/End: Original strand, 21399896 - 21399968
Alignment:
Q  157 gattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| ||||||||| |||||||| | |||||||    
T  21399896 gattgatgaattattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgttgttcatggttgatgaattattatatg 21399968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 427
Target Start/End: Original strand, 26011995 - 26012141
Alignment:
Q  281 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 379  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| |  |||||| |||||||| |  ||||||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  26011995 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgttgattcacatttgatattgttatatcatgttgcttt-gcatactgcct 26012092  T
Q  380 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 427  Q
     |||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26012093 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 26012141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 29330516 - 29330468
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29330516 tatagaacttgagttatggtcaaattaatgcacgtatgtcacagtgaat 29330468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 32028172 - 32028124
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32028172 tatagagcttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 32028124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 32028366 - 32028318
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32028366 tatagagcttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 32028318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 32028559 - 32028511
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32028559 tatagagcttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 32028511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Original strand, 264406 - 264445
Alignment:
Q  107 tgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  264406 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 264445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 20909536 - 20909497
Alignment:
Q  107 tgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909536 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20909497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 39245660 - 39245621
Alignment:
Q  107 tgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245660 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 39245621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 39363908 - 39363869
Alignment:
Q  107 tgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363908 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 39363869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 343 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 21873350 - 21873257
Alignment:
Q  343 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||| | ||||||||| | |||||| |||| | || |||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||| |||||||    
T  21873350 ttgatattatgaagtcatgctgatgttgtatcctgcctatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatg 21873257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 381 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 36314639 - 36314578
Alignment:
Q  381 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||| |||||    
T  36314639 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 36314578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 2154260 - 2154308
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  2154260 tatagaacttaagttatagtcaaattactgcacgtatgtcacggtgaat 2154308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 17516674 - 17516742
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||| ||| ||||||||  |||||||||| ||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17516674 ccgatttttaaatgaaaaatggtattgattggcacagaattggtcctaggtgtaaacacgaaagttgta 17516742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 20917475 - 20917523
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  20917475 tataaaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacaatgaat 20917523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 32027979 - 32027931
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  32027979 tatagagcttgagttatggtcaaattactgcacgtaagtcacaatgaat 32027931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 23065038 - 23064999
Alignment:
Q  107 tgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23065038 tgagttatggtccaattactgcacgtaggtcacagtgaat 23064999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 384 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 26704129 - 26704078
Alignment:
Q  384 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  26704129 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatg 26704078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 384 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 26973862 - 26973811
Alignment:
Q  384 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  26973862 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatg 26973811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 381 - 423
Target Start/End: Original strand, 26740705 - 26740747
Alignment:
Q  381 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 423  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  26740705 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 26740747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 232
Target Start/End: Original strand, 20901852 - 20901929
Alignment:
Q  155 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtat 232  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  20901852 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 20901929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 24067323 - 24067282
Alignment:
Q  155 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaata 196  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  24067323 atgattgatgaattattatatgaatgtatatgtttatgaata 24067282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 381 - 426
Target Start/End: Original strand, 26732892 - 26732937
Alignment:
Q  381 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 426  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26732892 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgttg 26732937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 271 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 18356485 - 18356389
Alignment:
Q  271 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt 367  Q
    ||||| |||||||||||  | |||||||||||| |   |||| |||||| |  ||| |||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  18356485 ttataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaaatatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatatcatgctgttt 18356389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 155 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18743923 - 18743852
Alignment:
Q  155 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||||||  |||||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||    
T  18743923 atgattgatgaagtattatatgaatgtatatgttaatgaatatga---tgttcatgattgatgaattattatatg 18743852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 389 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 19668951 - 19668899
Alignment:
Q  389 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| | |||| |||||    
T  19668951 ttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatgatgatg 19668899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 155 - 219
Target Start/End: Original strand, 20198507 - 20198571
Alignment:
Q  155 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 219  Q
    |||||||||||| || |||||| | |||||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  20198507 atgattgatgaagtattatatgaaggtatatgttaatgaatatgatgttgttcataattgatgaa 20198571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 3)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 13733 - 13396
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13733 tatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 13634  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  13633 gatattgtccatgattgatgaagtgttacatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgca 13534  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13533 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 13434  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13433 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 13396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 13851 - 13783
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13851 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgta 13783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 13918 - 13878
Alignment:
Q  106 ttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13918 ttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 13878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 12)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 137020 - 136684
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  137020 tatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatac 136922  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  136921 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 136822  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  136821 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 136722  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  136721 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 136684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 139489 - 139153
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  139489 tatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatac 139391  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  139390 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 139291  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  139290 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 139191  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  139190 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 139153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 144427 - 144091
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  144427 tatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatac 144329  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  144328 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 144229  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  144228 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 144129  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  144128 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 144091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 134551 - 134215
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  134551 tatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatac 134453  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  134452 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 134353  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  134352 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 134253  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  134252 aactaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatg 134215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 141958 - 141622
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  141958 tatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatac 141860  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  141859 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 141760  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  141759 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 141660  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  141659 aactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatg 141622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 134669 - 134601
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  134669 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgta 134601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 137138 - 137070
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  137138 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgta 137070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #8
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 139607 - 139539
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  139607 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgta 139539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #9
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 142076 - 142008
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  142076 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgta 142008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #10
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 144545 - 144477
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  144545 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgta 144477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #11
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 317 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 132784 - 132672
Alignment:
Q  317 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 414  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| || | ||||| || ||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  132784 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttgtatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagt 132686  T
Q  415 cagtctaagttgat 428  Q
    | ||||||| ||||    
T  132685 cggtctaagatgat 132672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 338 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 62303 - 62216
Alignment:
Q  338 tgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 424  Q
    |||||| |||||||||||  |||| |||||||  ||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  62303 tgcattcgatattattataccatgatgtttttc-atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtttaagt 62216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 270; Significance: 1e-150; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 40740 - 40404
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  40740 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatac 40642  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  40641 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgaagttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 40542  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40541 ttacttgaattttatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 40442  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  40441 aactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatg 40404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 40858 - 40790
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40858 ccgaatttgaaattaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 40790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 40925 - 40885
Alignment:
Q  106 ttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40925 ttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 40885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 6)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 98 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 501406 - 501075
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   |||||||||||||||||||||    
T  501406 tatagaacttgagttatgatcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatg-------------------tatgtatatgtttgtgaatac 501326  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501325 gatattgttcatgattgatgatgtgttatatgtatatataatgttttaagatgttgattactatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 501226  T
Q  298 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  501225 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgctgtgttgctgttgttattt 501126  T
Q  398 aactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 448  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  501125 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgttgattatgt 501075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 261 - 435
Target Start/End: Original strand, 85563 - 85738
Alignment:
Q  261 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  85563 tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattcagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtca 85662  T
Q  360 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  85663 tgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatg 85738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 501745 - 501648
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  501745 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaagaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 501648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 262 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 160864 - 160698
Alignment:
Q  262 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 360  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||  ||||| ||| |||| | ||| || |||| | |||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  160864 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatatattacatgacttatgtttga-tatttgacatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcat 160767  T
Q  361 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 428  Q
    | || ||| | ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  160766 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 160698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 501598 - 501550
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501598 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 501550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #6
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 501522 - 501455
Alignment:
Q  32 cgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| | | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  501522 cgaatttgaaatgaaaagtgatattgattgttacagaattggtcttatgtgtaaacacgaaagttgta 501455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 4)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 222 - 448
Target Start/End: Original strand, 12194 - 12420
Alignment:
Q  222 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataat 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12194 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattaaatgtgaataat 12293  T
Q  322 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  12294 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattctgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtcta 12393  T
Q  422 agttgattaagatgttgatgatgatgt 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  12394 agttgattaagatgttgatgatgatgt 12420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 98 - 229
Target Start/End: Original strand, 345 - 476
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  345 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 444  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  445 gatattgttcatgattgataaagtgttatatg 476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 154 - 229
Target Start/End: Original strand, 507 - 582
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  507 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #4
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Original strand, 207 - 292
Alignment:
Q  11 tttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagtt 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||| |||||||    
T  207 tttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataaatggtcttaggtgtaaacaagaaagtt 292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 98 - 435
Target Start/End: Original strand, 38477 - 38816
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||| | ||  |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38477 tatagaatttgagttatgttcaaattactgtatgtttgtcatattgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 38576  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgc 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  38577 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgc 38676  T
Q  297 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgtta 394  Q
    | |||||||||||||| | |||| ||||||  ||| |||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||| || |||||||| ||||||    
T  38677 aatacttgaattatatataaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgtctatgttgctgtttgtta 38775  T
Q  395 tttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  38776 tttaactaaggtgcatgagtaggtctaagttgattaagatg 38816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Original strand, 38330 - 38427
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||  ||  | ||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  38330 tttttctgatttctcttttcatctctgccccgaatttgaaataaaaattagtattgatccgtaaagaattgatcttagggctaaacacgaaagttgta 38427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 175; Significance: 5e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 98 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 6287 - 6070
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  6287 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatac 6189  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 297  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  6188 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatttaattgcatatgca 6089  T
Q  298 ttacttgaattatatgtga 316  Q
    |||||||||||||||||||    
T  6088 ttacttgaattatatgtga 6070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 6405 - 6337
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6405 ccgaatttgaaatgaaaactggtattcattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 6337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 4)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 154 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 10016 - 9753
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||             
T  10016 tatgattgatgagttagtatatgtatgtataagtttgtgaatacgatattgtacatgattgatgaagtgttatatgtatatatgacgattt--------- 9926  T
Q  254 attaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaa-taattgagacgttgttgacttgcatttgatattat 352  Q
              ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9925 ----------gatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattat 9836  T
Q  353 tatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9835 tatgtcattctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 9753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 33107 - 32943
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33107 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 33009  T
Q  377 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    | || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  33008 gcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatg 32943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 38926 - 38762
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38926 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 38828  T
Q  377 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    | || ||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||    
T  38827 gcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgactcggtctaagttgatgaagatgatgatg 38762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 10067 - 10005
Alignment:
Q  156 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatga 218  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  10067 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtacgatgttgtttatgattgatga 10005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 168; Significance: 7e-90; HSPs: 5)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 156 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 30196 - 29946
Alignment:
Q  156 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgat 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||               
T  30196 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgattt----------- 30108  T
Q  256 taccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 355  Q
            ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  30107 --------gatgttgttatattgtgatataattgtatatgaattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacacttgatattattat 30016  T
Q  356 gtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 425  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30015 gtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 104 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 30354 - 30229
Alignment:
Q  104 acttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 203  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30354 acttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 30255  T
Q  204 gttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  30254 gttcatgattgatgaagtgttatatg 30229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 30692 - 30603
Alignment:
Q  10 atttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30692 atttttcttttcatctctgctccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 30603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 30478 - 30410
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  30478 ccgattttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttcggtgtaaacattaaagttgta 30410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 30553 - 30505
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30553 tataaaactttagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 30505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 163; Significance: 7e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 261 - 435
Target Start/End: Original strand, 158434 - 158608
Alignment:
Q  261 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  158434 tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 158533  T
Q  361 gctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  158534 gctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 158608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 277 - 427
Target Start/End: Original strand, 339905 - 340053
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  ||||  |||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  339905 tgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttg-atttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 340002  T
Q  377 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 427  Q
    || | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  340003 gcctatgttgttgt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 340053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 247 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 82264 - 82076
Alignment:
Q  247 gatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 346  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  82264 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 82165  T
Q  347 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  82164 tattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaagatg 82076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 262 - 427
Target Start/End: Original strand, 22610 - 22776
Alignment:
Q  262 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 360  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  22610 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 22708  T
Q  361 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 427  Q
    | || ||| | |||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22709 gatgattt-gcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 22776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 153; Significance: 6e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 247 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 298 - 110
Alignment:
Q  247 gatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 346  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  298 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 199  T
Q  347 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  198 tattattatgtcatgttgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatg 110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 261 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 16962 - 16788
Alignment:
Q  261 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 360  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16962 tttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 16863  T
Q  361 gctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16862 gttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 261 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 4475 - 4301
Alignment:
Q  261 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 360  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  4475 tttgatgatgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgattaattgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtcat 4376  T
Q  361 gctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4375 gttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 4301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 143; Significance: 6e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 98 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 3364 - 3186
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3364 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatac 3265  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatat 276  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3264 gatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtagatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 3186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 3480 - 3414
Alignment:
Q  33 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | | || ||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  3480 gaatttgaaatgaaaactggtattgattgttacataattgttcttagttgtaaacacgaaagttgta 3414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 247 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 12250 - 12068
Alignment:
Q  247 gatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 346  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12250 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 12151  T
Q  347 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12150 tattattatgtcatgctgttttagtatactgctgtgttgctg------tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 98 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 1769 - 1591
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  1769 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatttatatatttgtgaatac 1670  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttgatgttgttatat 276  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1669 gatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgattttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 1591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 261 - 423
Target Start/End: Original strand, 79268 - 79430
Alignment:
Q  261 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  79268 tttgatgttgttatattgtgatatacttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgaaattattatgtcat 79367  T
Q  361 gctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 423  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  79368 gctgtttttatatactgtcgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 277 - 444
Target Start/End: Original strand, 17170 - 17340
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg--tttttgtata 374  Q
    |||||||||||  || | ||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17170 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtata 17269  T
Q  375 ctg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatg 444  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  17270 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgatg 17340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 6)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 98 - 276
Target Start/End: Original strand, 4124 - 4304
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4124 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtgggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatat 4223  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccttttgatgttgttatat 276  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  4224 tatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 4304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 3813 - 3881
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3813 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtggaaacacgaaagttgta 3881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 3620 - 3688
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  3620 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagctgtaaacatgaaagttgta 3688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 4006 - 4074
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  4006 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcataggtgtaaacatgaaaggtgta 4074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 3545 - 3593
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  3545 tatagaacttgagttatggtcaaaatactgcacgtaggtcactgtgaat 3593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #6
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 103 - 146
Target Start/End: Original strand, 3936 - 3979
Alignment:
Q  103 aacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3936 aacttgagttatgatcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 3979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 7)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 98 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 15263 - 15083
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15263 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatttatatgtttgtgaatac 15164  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccttttgatgttgttatat 276  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  15163 tatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 15083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 15592 - 15496
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15592 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattaataggtccagaattggtctta-gtgtaaacacgaaagttgta 15496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 98 - 188
Target Start/End: Original strand, 11161 - 11251
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 188  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11161 tatagtacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 11251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #4
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Original strand, 10821 - 10918
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccg-aatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10821 tttttctgaatttt-ttttcatctccgccccggaatttgaaatgaaatgtggtattgataggtccagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgta 10918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 11043 - 11111
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11043 ccgaatttgaaatgaaaattggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 11111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #6
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 10968 - 11016
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 11016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #7
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 15446 - 15398
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15446 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 247 - 435
Target Start/End: Original strand, 1250 - 1439
Alignment:
Q  247 gatgttgattaccttttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttg 345  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  1250 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttg 1349  T
Q  346 atattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1350 atattattatgtcatgctgtttttgtatactcatgtgttattgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 1439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 98 - 276
Target Start/End: Original strand, 53693 - 53873
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  53693 tatagaacttgagatatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgataaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatat 53792  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccttttgatgttgttatat 276  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  53793 tatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagtagatgttgattatcatttgatgttgttatat 53873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 297 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 116571 - 116434
Alignment:
Q  297 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 396  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  116571 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgtttt-gtatactgttgtgtcgctgttgttatt 116473  T
Q  397 taactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  116472 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 116434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 423
Target Start/End: Original strand, 128908 - 129072
Alignment:
Q  261 tttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  128908 tttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatccattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatca 129006  T
Q  360 tg-ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 423  Q
    ||  |  |||| | ||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  129007 tgaattgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 129072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 67 - 99
Target Start/End: Original strand, 53611 - 53643
Alignment:
Q  67 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  53611 aaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgta 53643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 261 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 4392 - 4218
Alignment:
Q  261 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4392 tttgatgttgt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtca 4294  T
Q  360 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4293 tgctggttttgtatactgctgtgtcgctgtcgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 4218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 131; Significance: 9e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 261 - 423
Target Start/End: Original strand, 20364 - 20524
Alignment:
Q  261 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 360  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20364 tttgatgtt-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 20462  T
Q  361 gctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 423  Q
    | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20463 gttg-ttttgtatactgatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 128916 - 128752
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |    
T  128916 tgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttttttt 128817  T
Q  377 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
      | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||| |||||    
T  128816 tttttgttgcttttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaatttgattaagatgatgatg 128752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 4)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 98 - 243
Target Start/End: Original strand, 6757 - 6902
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6757 tatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 6856  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 243  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6857 tatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 6902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Original strand, 6418 - 6514
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6418 tttttctgaatttt-ttttcatctccgccccgaatttgaaatgaaatgtggtattgataggtccagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgta 6514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 6639 - 6707
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6639 ccgaatttgaaatgaaaattggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 6707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 6564 - 6612
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6564 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 6612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 261 - 431
Target Start/End: Original strand, 2112 - 2283
Alignment:
Q  261 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2112 tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttaattgacttgcatttgatattattatgtca 2211  T
Q  360 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaa 431  Q
    || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  2212 tgttgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcaagagtcggtctaagttgattaa 2283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 261 - 441
Target Start/End: Original strand, 17965 - 18147
Alignment:
Q  261 tttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| |||    
T  17965 tttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatca 18064  T
Q  360 tgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    || || || || ||| ||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  18065 tgatg-ttgtgcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatg 18147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 261 - 435
Target Start/End: Original strand, 161073 - 161248
Alignment:
Q  261 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  161073 tttgatattgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtca 161172  T
Q  360 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  161173 ttatgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttggttaagatg 161248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 261 - 360
Target Start/End: Original strand, 164574 - 164674
Alignment:
Q  261 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  164574 tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtca 164673  T
Q  360 t 360  Q
    |    
T  164674 t 164674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 5)
Name: scaffold1792
Description:

Target: scaffold1792; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 98 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 548 - 416
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  548 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtaagtatatgtttgtgaatac 449  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 230  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  448 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 1040 - 951
Alignment:
Q  10 atttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1040 atttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgta 951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 741 - 693
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  741 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 901 - 853
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  901 tatagaacttgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 826 - 782
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtc 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  826 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgattggtacaaaattggtc 782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 277 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 23048 - 22890
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23048 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22949  T
Q  377 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22948 ggtgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 22890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 6)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 98 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 930 - 799
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  930 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaatttgtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 831  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  830 tatattgttcatgattgatgaagttttatatg 799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 1389 - 1292
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1389 tttttctgatttttcatttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctcatattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 1292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 154 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 768 - 645
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgt 251  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||    
T  768 tatgattgattaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgt 670  T
Q  252 tgattaccttttgatgttgttatat 276  Q
    |||||| | ||||||||||||||||    
T  669 tgattatcatttgatgttgttatat 645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 1048 - 980
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  1048 ccgaatttgaaataaaaactggtattgattggtacagcattcgtcttaggagtaaacacgaaagttgta 980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 1223 - 1173
Alignment:
Q  49 ctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1223 ctggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgta 1173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 1123 - 1075
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  1123 tatagaacttgagttatggtcaaattactacacgcaggtcatagtgaat 1075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 8)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 98 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 10132 - 10001
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10132 tatagaacttgagttatggtcaaattatttcatgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtgtgtatatgtttgtgaatac 10033  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10032 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 10001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 10665 - 10568
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10665 tttttcttatttttcttttcatgtttgccccaaatttgaactgaaatctggtattgataggtccataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 10568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 10325 - 10277
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10325 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 10277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 10248 - 10182
Alignment:
Q  33 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10248 gaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacagtgttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 10182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 10441 - 10375
Alignment:
Q  33 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  10441 gaatttaaaatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttatgtgtcaacacgaaagttgta 10375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 9970 - 9936
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9970 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 9936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #7
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 10518 - 10470
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  10518 tatagaacttgcgttatggtcaaattactgcatgtaggtcacaatgaat 10470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 10022 - 9945
Alignment:
Q  155 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtat 232  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  10022 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 9945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 297 - 435
Target Start/End: Original strand, 44682 - 44821
Alignment:
Q  297 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttat 395  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44682 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttat 44781  T
Q  396 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44782 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 44821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 277 - 435
Target Start/End: Original strand, 26020 - 26179
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  || | ||||||||||||||||   || ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26020 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 26119  T
Q  377 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  26120 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 13377 - 13212
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13377 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13278  T
Q  377 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  13277 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatg 13212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Original strand, 3106 - 3270
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  3106 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatact 3204  T
Q  377 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  3205 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 3270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 96; Significance: 7e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 271 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 52085 - 51914
Alignment:
Q  271 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 370  Q
    |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52085 ttatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 51986  T
Q  371 tatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  51985 tatattgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 51914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 292 - 441
Target Start/End: Original strand, 167948 - 168098
Alignment:
Q  292 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt 390  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||    
T  167948 tatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgtt 168047  T
Q  391 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  168048 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 168098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 98 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 57822 - 57708
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57822 tataaaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatacttgaatatgagtgataaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 57723  T
Q  198 gatattgttcatgat 212  Q
    |||||||||||||||    
T  57722 gatattgttcatgat 57708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Original strand, 16555 - 16720
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16555 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatact 16654  T
Q  377 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  16655 gcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatg 16720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 277 - 444
Target Start/End: Original strand, 3141 - 3309
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  || | ||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3141 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaattacatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 3240  T
Q  377 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatg 444  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  3241 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgatg 3309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 277 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 4673 - 4522
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4673 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatact 4574  T
Q  377 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 428  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  4573 gcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgat 4522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 277 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 12255 - 12104
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12255 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatact 12156  T
Q  377 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 428  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  12155 gcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgat 12104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 277 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 22207 - 22056
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22207 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatact 22108  T
Q  377 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 428  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  22107 gcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgat 22056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 154 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 28073 - 27958
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28073 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 27975  T
Q  254 attaccttttgatgttg 270  Q
    ||||   ||||||||||    
T  27974 attattatttgatgttg 27958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 98 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 28182 - 28048
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||     
T  28182 tatagaacttgagttatagtcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtat 28083  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtat 232  Q
    ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  28082 gatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 28048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Original strand, 15420 - 15583
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |  |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  15420 tgtgatataat-atttatgcattacttgaagaatatttttatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 15517  T
Q  377 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    || | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  15518 gcctatgttgctcttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatg 15583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 5)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 98 - 221
Target Start/End: Original strand, 13448 - 13571
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  13448 tataaaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacaatgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatat 13547  T
Q  198 gatattgttcatgattgatgaagt 221  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  13548 gatattgtccatgattgatgaagt 13571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 43419 - 43323
Alignment:
Q  3 ttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43419 ttttttgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgta 43323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 98 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 43080 - 43002
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatg 176  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43080 tatagaacttgagttatagtcaaattagtgcacgtaggtcacagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatg 43002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 43198 - 43130
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43198 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacatttttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 43130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #5
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 43273 - 43225
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43273 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 43225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 277 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 39642 - 39486
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39642 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 39544  T
Q  377 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaaga 433  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  39543 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 39486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 277 - 433
Target Start/End: Original strand, 75170 - 75326
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  75170 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 75268  T
Q  377 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaaga 433  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  75269 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 75326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 2017 - 1852
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2017 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 1918  T
Q  377 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  1917 gtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 1852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 142 - 229
Target Start/End: Original strand, 10647 - 10734
Alignment:
Q  142 tgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10647 tgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 10734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 154 - 276
Target Start/End: Original strand, 10765 - 10886
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttg 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10765 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatactgtccataattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaaatgttg 10863  T
Q  254 attaccttttgatgttgttatat 276  Q
    | ||   ||||||||||||||||    
T  10864 agtattatttgatgttgttatat 10886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 232
Target Start/End: Original strand, 10713 - 10790
Alignment:
Q  155 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtat 232  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  10713 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattagtatatgtat 10790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 1934 - 1838
Alignment:
Q  3 ttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1934 ttttctgatttttcttttcatctctgccctgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgta 1838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 1713 - 1645
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1713 ccgaatttgaaatgaaaattggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 1645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 1788 - 1740
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1788 tatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 1740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 292 - 441
Target Start/End: Original strand, 1018 - 1168
Alignment:
Q  292 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt 390  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||    
T  1018 tatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgtt 1117  T
Q  391 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  1118 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 1168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 5015 - 4850
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5015 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatacttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatact 4916  T
Q  377 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  4915 gcctatgttgctgttgttatttaactaatctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 4850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 3636 - 3471
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3636 tgtgatataatgttatttgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 3537  T
Q  377 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    | || ||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  3536 gcctatgttgctttagttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 3471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 508 - 344
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||   ||||| || ||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  508 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcgaatatttaagatgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgctatttt-gtatact 410  T
Q  377 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    || | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||    
T  409 gcctatgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgataaagatgatgatg 344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Original strand, 32913 - 33076
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||| ||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32913 tgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataa-tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 33010  T
Q  377 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  33011 gcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 33076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 46092 - 45929
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||| ||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46092 tgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataa-tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 45995  T
Q  377 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  45994 gcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 45929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 278 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 16278 - 16114
Alignment:
Q  278 gtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 377  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||   || ||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  16278 gtgatataatgttatatgcattacttgagttatgaatgtatacttgagatgatgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactg 16179  T
Q  378 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  16178 cctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 16114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 380 - 441
Target Start/End: Original strand, 17388 - 17449
Alignment:
Q  380 gtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  17388 gtgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 17449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 262 - 441
Target Start/End: Original strand, 8472 - 8649
Alignment:
Q  262 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 360  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8472 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcat 8571  T
Q  361 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  8572 gctgtttttg-atactgcctatgttgc---tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 8649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 79; Significance: 9e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 277 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 26061 - 25904
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||| ||||  |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  26061 tgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgat-attttgtatact 25963  T
Q  377 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagat 434  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  25962 gcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgatgaagat 25904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 40023 - 39859
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||| ||||  |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  40023 tgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgat-attttgtatact 39925  T
Q  377 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||| |||||    
T  39924 gcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 39859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 4)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 98 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 6792 - 6682
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||    
T  6792 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat----------atgtttgtgaatac 6703  T
Q  198 gatattgttcatgattgatga 218  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  6702 gatattgttcatgattgatga 6682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 7132 - 7035
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  || ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7132 tttttctgatttttcttttcatctctgtcccgaatatgaaatgaaaattgctattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 7035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 6910 - 6842
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6910 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 6842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 6985 - 6937
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6985 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 6937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 18618 - 18521
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18618 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgta 18521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 18471 - 18423
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18471 tatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 18423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 5)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 154 - 276
Target Start/End: Original strand, 15150 - 15273
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||    
T  15150 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgt 15248  T
Q  252 tgattaccttttgatgttgttatat 276  Q
    |||||| | ||||||||||||||||    
T  15249 tgattatcatttgatgttgttatat 15273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 130 - 229
Target Start/End: Original strand, 15030 - 15119
Alignment:
Q  130 cgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||          |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15030 cgtaggtcatagtgaataattgaatatgattaatgaattagtat----------atgtttgtgaatactatattgttcataattgatgaagtgttatatg 15119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 381 - 435
Target Start/End: Original strand, 15298 - 15352
Alignment:
Q  381 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15298 tgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatg 15352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 328 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 1402 - 1290
Alignment:
Q  328 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 425  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  1402 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatgtt---gtacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 1306  T
Q  426 gattaagatgttgatg 441  Q
    | | |||||| |||||    
T  1305 gttgaagatgatgatg 1290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 328 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 7379 - 7267
Alignment:
Q  328 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 425  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||   ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  7379 gttgatgaattgaatttgatataattatttcatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 7283  T
Q  426 gattaagatgttgatg 441  Q
    | | |||||| |||||    
T  7282 gttgaagatgatgatg 7267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 507 - 414
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagt 95  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  507 tttttctcatttttcttttcatctatgccccgaatttgaaataaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagt 414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 294 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 174913 - 174785
Alignment:
Q  294 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttg 391  Q
    |||||||||||||||||   ||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||   |||||||||| || |||||||| |||    
T  174913 tgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttg 174817  T
Q  392 ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 423  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  174816 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 174785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 381 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 121827 - 121767
Alignment:
Q  381 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  121827 tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 121767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 124751 - 124675
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 353  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || | |||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  124751 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaaacgttgatgaattgcaattgatattatt 124675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 262 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 8650 - 8481
Alignment:
Q  262 ttgatgttgtt-atattgtgatataat--tatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 358  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  8650 ttgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 8551  T
Q  359 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 427  Q
    |||||| ||||| |||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8550 atgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 281 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 6695 - 6536
Alignment:
Q  281 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 379  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  6695 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 6599  T
Q  380 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||    
T  6598 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgatg 6536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 261 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 11647 - 11465
Alignment:
Q  261 tttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| |||    
T  11647 tttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatca 11548  T
Q  360 tgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    || || ||||| |||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||    
T  11547 tgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatg 11465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 261 - 441
Target Start/End: Original strand, 38194 - 38376
Alignment:
Q  261 tttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| |||    
T  38194 tttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatca 38293  T
Q  360 tgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    || || ||||| |||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||    
T  38294 tgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatg 38376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 166 - 276
Target Start/End: Original strand, 35955 - 36065
Alignment:
Q  166 attagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa-gtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccttttg 264  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  35955 attagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatatgatattgtccatgattgatgaaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattttttg 36053  T
Q  265 atgttgttatat 276  Q
    ||||| ||||||    
T  36054 atgttcttatat 36065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 337 - 427
Target Start/End: Original strand, 23898 - 23989
Alignment:
Q  337 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 427  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  23898 ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttga 23989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Original strand, 6076 - 6244
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6076 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatact 6175  T
Q  377 gc---tg-tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
     |   || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  6176 acctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 328 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 28529 - 28415
Alignment:
Q  328 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 426  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28529 gttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 28430  T
Q  427 attaagatgttgatg 441  Q
    || |||||| |||||    
T  28429 atgaagatgatgatg 28415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 328 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 11407 - 11293
Alignment:
Q  328 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 425  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11407 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 11309  T
Q  426 gattaagatgttgatg 441  Q
    | | |||||| |||||    
T  11308 gttgaagatgatgatg 11293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 2050 - 1998
Alignment:
Q  389 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  2050 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 1998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 4605 - 4553
Alignment:
Q  389 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  4605 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 4553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 277 - 378
Target Start/End: Original strand, 3485 - 3586
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3485 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 3584  T
Q  377 gc 378  Q
    ||    
T  3585 gc 3586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 261 - 423
Target Start/End: Original strand, 53487 - 53651
Alignment:
Q  261 tttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  53487 tttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatca 53586  T
Q  360 tgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 423  Q
    || || ||||| |||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53587 tgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaag 53651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 277 - 424
Target Start/End: Original strand, 24257 - 24406
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatac 375  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  24257 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatac 24356  T
Q  376 tgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 424  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24357 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 75608 - 75676
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75608 ccgaatttgaaatgaaaactagtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 75676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 32
Target Start/End: Original strand, 43329 - 43359
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgcccc 32  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43329 tttttctgatttttcttttcatctctgcccc 43359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 294 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 8628 - 8480
Alignment:
Q  294 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-gctgtgttgctgttgt 392  Q
    ||||||||||||| || |  |||||  || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||| ||||    
T  8628 tgcattacttgaagtacacttgaatgtttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctattgt 8529  T
Q  393 tatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  8528 tatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 8480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 282 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 13165 - 13092
Alignment:
Q  282 tataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 355  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13165 tataattatatatgcattacttcaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 13092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 261 - 427
Target Start/End: Original strand, 27687 - 27855
Alignment:
Q  261 tttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| |||    
T  27687 tttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattactagaattatatgtgaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatca 27786  T
Q  360 tgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 427  Q
    ||||||||| | ||||| | | ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27787 tgctgtttt-gcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 27855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 3)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 98 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 68302 - 68227
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 173  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  68302 tatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 68227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 31 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 68420 - 68351
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtat 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  68420 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttatgtgtaaacacgaaagttgtat 68351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 343 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 47093 - 46996
Alignment:
Q  343 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 440  Q
    |||||||||||||||||||||| |   ||| ||||| | ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| || | |||||| ||||    
T  47093 ttgatattattatgtcatgctgct---gtaaactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 46997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 292 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 2103 - 1953
Alignment:
Q  292 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt 390  Q
    |||||||||||||||| || | |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||| || ||| ||||||    
T  2103 tatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgtt 2004  T
Q  391 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||| |||||    
T  2003 gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 1953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 7)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 8613 - 8516
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  8613 tttttctaatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatggaaactggtattgattggtacataattggtcttacgtgtaaacacaaaagttgta 8516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 98 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 8080 - 7996
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgta 182  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8080 tatagaatttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgta 7996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 8196 - 8130
Alignment:
Q  33 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8196 gaatttgaaatgaaaactggtattgattagtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 8130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 281 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 5803 - 5657
Alignment:
Q  281 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 379  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||  ||||||| |    
T  5803 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttc-atactgcct 5707  T
Q  380 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 428  Q
     |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5706 atgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 5657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 8273 - 8225
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8273 tatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 8225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #6
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 8391 - 8323
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8391 ccgaatgtgaaatgaaaactggtattgattggtacataactggtcttaggtgtaaacacaaaagttgta 8323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #7
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 98 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 8466 - 8421
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtg 143  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  8466 tatacaacttgagttatggtgaaattactgcacgtaggtcacagtg 8421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 40078 - 39914
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||    |||| || ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  40078 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcaaatatttaagatgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 39980  T
Q  377 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    || | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||    
T  39979 gcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 39914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 322 - 423
Target Start/End: Original strand, 19883 - 19987
Alignment:
Q  322 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcag 417  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||| |||| ||||||| || |||||||| |||||  |||| ||||||||||||||| |    
T  19883 tgagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcgg 19981  T
Q  418 tctaag 423  Q
    ||||||    
T  19982 tctaag 19987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 261 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 13312 - 13147
Alignment:
Q  261 tttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaat-aattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 358  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||   || ||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  13312 tttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatggtttcagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 13213  T
Q  359 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 423  Q
    |||||| ||||| |||||| || ||||| || |||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  13212 atgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 261 - 427
Target Start/End: Original strand, 16038 - 16206
Alignment:
Q  261 tttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||  |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| |||    
T  16038 tttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatca 16137  T
Q  360 tgctgtttttgtatact-gctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 427  Q
    || || ||||| |||||  || ||||| || |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16138 tgttg-ttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 16206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 262 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 13274 - 13144
Alignment:
Q  262 ttgatgttg-ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 360  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13274 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcat 13175  T
Q  361 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt 390  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  13174 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 13144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 386 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 329 - 281
Alignment:
Q  386 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagat 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  329 ctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagat 281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 328 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 34238 - 34124
Alignment:
Q  328 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 425  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  34238 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagtt 34140  T
Q  426 gattaagatgttgatg 441  Q
    | | |||||| |||||    
T  34139 gttgaagatgatgatg 34124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 261 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 225589 - 225482
Alignment:
Q  261 tttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  225589 tttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattattatatca 225491  T
Q  360 tgctgtttt 368  Q
     ||||||||    
T  225490 cgctgtttt 225482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 352 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 4803 - 4713
Alignment:
Q  352 ttatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  4803 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 4713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 154 - 276
Target Start/End: Original strand, 1204 - 1327
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgt 251  Q
    ||||||| || |||||||||||| || || ||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||    
T  1204 tatgattaataaattagtatatgaatataaatgtt-gagaataagatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgt 1302  T
Q  252 tgattaccttttgatgttgttatat 276  Q
    |||||| | ||||||||||||||||    
T  1303 tgattatcatttgatgttgttatat 1327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 229
Target Start/End: Original strand, 1143 - 1173
Alignment:
Q  199 atattgttcatgattgatgaagtgttatatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1143 atattgttcatgattgatgaagtgttatatg 1173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 261 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 12750 - 12587
Alignment:
Q  261 tttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| | | || |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  12750 tttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattact-gaattatatataagtatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatca 12652  T
Q  360 tgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 423  Q
    ||||| ||||| |||||| || |||||||| |||||  ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  12651 tgctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Original strand, 10381 - 10543
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || ||| || ||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  10381 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacttaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg---ttgtatact 10476  T
Q  377 g-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    | || |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  10477 gcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 10543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 292 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 32216 - 32068
Alignment:
Q  292 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 390  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||  || |||||| | ||||||||||    
T  32216 tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttt--gtttactgcctatgttgctgtt 32119  T
Q  391 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  32118 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 32068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 343 - 435
Target Start/End: Original strand, 11464 - 11557
Alignment:
Q  343 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||    
T  11464 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgttgaagatg 11557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 277 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 27996 - 27911
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 362  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27996 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 27911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 262 - 427
Target Start/End: Original strand, 10481 - 10647
Alignment:
Q  262 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 360  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  10481 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 10579  T
Q  361 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 427  Q
    | || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  10580 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttga 10647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 269 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 12103 - 12039
Alignment:
Q  269 tgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 333  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12103 tgttatattgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgaggcgttgtt 12039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 363 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 12042 - 11982
Alignment:
Q  363 tgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 423  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12042 tgttttggtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 343 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 13596 - 13513
Alignment:
Q  343 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 426  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13596 ttgatattatcatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 13513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 31662 - 31594
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31662 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 31594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 31544 - 31497
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 145  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  31544 tatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 31497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 277 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 21077 - 20911
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 376  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||| |  | || ||||||  | ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  21077 tgtgatataatgttttatgcattacttgtagaacatttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatatt 20978  T
Q  377 g-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    | || |||||||| |||||| |||||||||||  ||||||| |||||||| | | ||||||||||||    
T  20977 gcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtctaagtcgttgaagatgttgatg 20911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 261 - 361
Target Start/End: Original strand, 7997 - 8098
Alignment:
Q  261 tttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  || ||| |||||||| || |||||||||||||||| |||    
T  7997 tttgatgttgtttataatgtgatataattttatatacattacttgaattatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatca 8096  T
Q  360 tg 361  Q
    ||    
T  8097 tg 8098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 328 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 15776 - 15668
Alignment:
Q  328 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 425  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15776 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagtt 15678  T
Q  426 gattaagatg 435  Q
    ||||||||||    
T  15677 gattaagatg 15668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 281 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 130066 - 129919
Alignment:
Q  281 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 379  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  130066 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 129969  T
Q  380 gtgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 428  Q
     ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  129968 atgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgat 129919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 261 - 415
Target Start/End: Original strand, 60653 - 60810
Alignment:
Q  261 tttgatgttgttatat-tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    |||||||||||||  | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||  ||| |||    
T  60653 tttgatgttgttaattatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgca-ttgatattggtatatca 60751  T
Q  360 t--gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtc 415  Q
    |  |||| |||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  60752 tgagctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtc 60810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 107156 - 107108
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatct 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  107156 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaatct 107108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 333 - 441
Target Start/End: Original strand, 6134 - 6243
Alignment:
Q  333 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatta 430  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6134 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 6232  T
Q  431 agatgttgatg 441  Q
    ||||| |||||    
T  6233 agatgatgatg 6243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 18110 - 18044
Alignment:
Q  33 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18110 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgta 18044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 17994 - 17947
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17994 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgaa 17947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 4)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 33628 - 33562
Alignment:
Q  33 gaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33628 gaatttgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgta 33562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 350
Target Start/End: Original strand, 18175 - 18265
Alignment:
Q  260 ttttgatgttgttat-attgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 350  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  18175 ttttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatt 18265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 33512 - 33465
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 145  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33512 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacggtgaa 33465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 328 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 13054 - 12954
Alignment:
Q  328 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 425  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||| | ||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  13054 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 12956  T
Q  426 ga 427  Q
    ||    
T  12955 ga 12954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 281 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 19424 - 19278
Alignment:
Q  281 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 379  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  19424 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 19328  T
Q  380 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 428  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19327 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 19278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 261 - 439
Target Start/End: Original strand, 6221 - 6400
Alignment:
Q  261 tttgatgttgttat-attgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| |||||||| |||||||||||||| | || |||    
T  6221 tttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatca 6319  T
Q  360 t--gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttga 439  Q
    |  |||| |||| ||||||| || |||||||| |||||  ||||||||| |||||||||| ||||||| |||  ||||||||||    
T  6320 tgagctg-ttttatatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaagatga--aagatgttga 6400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 262 - 428
Target Start/End: Original strand, 45732 - 45899
Alignment:
Q  262 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 360  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| ||| || |||||||| | ||| ||||||||| |||| |||||| |||| |||||| |||| ||||    
T  45732 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacatcacatgaattatgtttga-taattgagatgttgatgacttacattcgatattgttatatcat 45830  T
Q  361 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 428  Q
    | || ||| | ||||||| | | || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45831 gatgattt-gcatactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 45899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 389 - 441
Target Start/End: Original strand, 1102 - 1154
Alignment:
Q  389 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  1102 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 1154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 389 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 6664 - 6612
Alignment:
Q  389 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  6664 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 6612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 389 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 14044 - 13992
Alignment:
Q  389 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  14044 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 13992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 261 - 441
Target Start/End: Original strand, 1012 - 1189
Alignment:
Q  261 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 360  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||  | || ||||||||   |||||||| || |||| ||||||||||| ||||    
T  1012 tttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctg-ataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcat 1107  T
Q  361 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    | ||  |||| |||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||| |||||    
T  1108 gatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 1189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 36827 - 36875
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36827 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 36875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 37020 - 37068
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  37020 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagatcatagtgaat 37068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 71 - 99
Target Start/End: Original strand, 36749 - 36777
Alignment:
Q  71 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36749 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 36777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 39791 - 39723
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39791 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgta 39723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 39673 - 39626
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  39673 tatagaacttgagttatggtcaaattattacacgtaggtcacagtgaa 39626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 389 - 441
Target Start/End: Original strand, 15845 - 15897
Alignment:
Q  389 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  15845 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 15897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 384 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 178952 - 178901
Alignment:
Q  384 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  178952 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatg 178901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0535 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0535
Description:

Target: scaffold0535; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 7463 - 7420
Alignment:
Q  4 tttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaa 47  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7463 tttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatgaaa 7420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 261 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 25288 - 25121
Alignment:
Q  261 tttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 360  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| ||| |  |||||| |||||||| ||||||| |||||  |||| ||||    
T  25288 tttgatgttgtaataatgtgatatatttgtatatacattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatatcgttatatcat 25191  T
Q  361 g--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 427  Q
    |  |||||||  |||||||| | |||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25190 gagctgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16326 - 16263
Alignment:
Q  156 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 219  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  16326 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaa 16263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 719 - 620
Alignment:
Q  261 tttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| |||    
T  719 tttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatca 622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 292 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 4675 - 4545
Alignment:
Q  292 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 390  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||  |||||||||||| || || ||||| | ||| ||||||| | || || ||||    
T  4675 tatgcattacttgaagtataaatgaatatttaagatgttgttgaattatatttgatattatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgctgttgtt 4576  T
Q  391 gttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 421  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  4575 gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 60617 - 60575
Alignment:
Q  2 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatg 44  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  60617 tttttctgatttttcttttcatctctgccccgaatttgaaatg 60575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 290 - 143
Alignment:
Q  281 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 379  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  290 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 193  T
Q  380 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 428  Q
     ||||| |||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  192 atgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgat 143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 428
Target Start/End: Original strand, 2805 - 2913
Alignment:
Q  321 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagt 418  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2805 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 2903  T
Q  419 ctaagttgat 428  Q
    ||||| ||||    
T  2904 ctaagatgat 2913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 366
Target Start/End: Original strand, 918 - 1006
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 366  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||   |||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  918 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgattgaatatttgagattttgttgacttgca-ttgatattattatgccatgctgtt 1006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 381 - 441
Target Start/End: Original strand, 4893 - 4953
Alignment:
Q  381 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||| |||||    
T  4893 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 4953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 328 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 16395 - 16283
Alignment:
Q  328 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 425  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  16395 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 16299  T
Q  426 gattaagatgttgatg 441  Q
    | | |||||| |||||    
T  16298 gttgaagatgatgatg 16283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 428
Target Start/End: Original strand, 14696 - 14804
Alignment:
Q  321 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagt 418  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||| || |||| | |||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||    
T  14696 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattactatatcatgatgattttct-tactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggt 14794  T
Q  419 ctaagttgat 428  Q
    ||||||||||    
T  14795 ctaagttgat 14804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 97189 - 97089
Alignment:
Q  261 tttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  97189 tttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatca 97091  T
Q  360 tg 361  Q
    ||    
T  97090 tg 97089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 106467 - 106367
Alignment:
Q  261 tttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  106467 tttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatca 106369  T
Q  360 tg 361  Q
    ||    
T  106368 tg 106367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 341 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 1134 - 1051
Alignment:
Q  341 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 423  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1134 atttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 389 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 1135 - 1091
Alignment:
Q  389 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaaga 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1135 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 1091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 5)
Name: scaffold0711
Description:

Target: scaffold0711; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 7201 - 7269
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  7201 ccgaatttgaaatgcaatctggtattgattggtaaagaatatgtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 7269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 99
Target Start/End: Original strand, 7395 - 7461
Alignment:
Q  32 cgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  7395 cgaatttgaaatgaaa-ctggtattgattggtacagaattggtcttgggtgtaaacacaaaagttgta 7461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 145
Target Start/End: Original strand, 7511 - 7558
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7511 tatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaa 7558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 98 - 144
Target Start/End: Original strand, 7126 - 7172
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtga 144  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7126 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtga 7172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Original strand, 7319 - 7367
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7319 tataaaacttgagttatggtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaat 7367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Original strand, 19792 - 19860
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  19792 ccgaatttgaaatgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacgcaaaagttgta 19860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 145
Target Start/End: Original strand, 19910 - 19957
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 145  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  19910 tatataacttgagttatcgtcaaattactacacgtaggtcatagtgaa 19957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 321 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 32657 - 32551
Alignment:
Q  321 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagt 418  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||| | |||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||    
T  32657 ttgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggt 32560  T
Q  419 ctaagttga 427  Q
    |||||||||    
T  32559 ctaagttga 32551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 423
Target Start/End: Original strand, 51839 - 51985
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacg-ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 375  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||| | ||  ||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||| || |    
T  51839 tgtgatataatg-tatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgcatt-gatattattatgtcttgctatttttgaatgc 51936  T
Q  376 tg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 423  Q
    || || || ||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51937 tgcctatg-tgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 51985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 8176 - 8090
Alignment:
Q  281 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 368  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  8176 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt 8090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 328 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 6927 - 6826
Alignment:
Q  328 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 425  Q
    |||||||| |||||||  ||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |    
T  6927 gttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagat 6829  T
Q  426 gat 428  Q
    |||    
T  6828 gat 6826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 337 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 29660 - 29561
Alignment:
Q  337 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||  || | | || | || ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29660 ttgcaattgatattattatgtcatgctattattgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcacatgagtcagtctaagttgattaagatg 29561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15361 - 15282
Alignment:
Q  155 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatat 234  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  15361 atgattgatgaattattatttgaatgtatatgtcgatgaatatgatattgttcatgattgatgaattattatatgaatat 15282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15408 - 15350
Alignment:
Q  161 gatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 219  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| || |||||||||||||||    
T  15408 gatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttattcatgattgatgaa 15350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 292 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 6761 - 6675
Alignment:
Q  292 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc 378  Q
    |||||||||||||||| || | |||||| || ||| |||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  6761 tatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgctattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgc 6675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0436
Description:

Target: scaffold0436; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 8359 - 8311
Alignment:
Q  98 tatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 146  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  8359 tatagaacttgagttatggtaaaattactgcacgttggtcacagtgaat 8311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 8477 - 8409
Alignment:
Q  31 ccgaatttgaaatgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 99  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  8477 ccgaatttgaaatgaaaactgatattgattggtatagaattgctcttaggtgtaaacatgaaagttgta 8409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 441
Target Start/End: Original strand, 192997 - 193097
Alignment:
Q  344 tgatattattatgtcatgctgtttttgt-atactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg-attaagatgttgat 440  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||| || |||| | || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  192997 tgatattgttatgtcatgatgttgttgtgattctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatgagtcagtccatgttgaattaagatgttgat 193096  T
Q  441 g 441  Q
    |    
T  193097 g 193097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 384 - 438
Target Start/End: Original strand, 15273 - 15327
Alignment:
Q  384 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttg 438  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  15273 tgcttttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgttg 15327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 384 - 438
Target Start/End: Original strand, 19795 - 19849
Alignment:
Q  384 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttg 438  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  19795 tgcttttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgttg 19849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 389 - 428
Target Start/End: Original strand, 2713 - 2752
Alignment:
Q  389 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2713 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 2752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 384 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 23897 - 23846
Alignment:
Q  384 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  23897 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatg 23846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 277 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 38483 - 38343
Alignment:
Q  277 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat--gctgtttttgtata 374  Q
    |||||||||  | |||||||||||| |||||||||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||| | || ||||  |||| |||| ||||    
T  38483 tgtgatatatatgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgtcatatcatgagctg-ttttatata 38386  T
Q  375 ctg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtc 415  Q
    ||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  38385 ctgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtc 38343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 328 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 51695 - 51601
Alignment:
Q  328 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 423  Q
    |||| ||| ||| ||||| ||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51695 gttgatgaattgaatttgttataattatgtcatgatgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 51601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 389 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 36503 - 36457
Alignment:
Q  389 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 435  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  36503 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatg 36457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 265 - 427
Target Start/End: Original strand, 8016 - 8180
Alignment:
Q  265 atgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg-- 361  Q
    |||||||| ||| ||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||    ||| || |||||||| ||| |||||||||| |||| |||||      
T  8016 atgttgttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgatg--ttgtgatgttgttgatttgtatttgatattgttatatcatgaa 8113  T
Q  362 ctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 427  Q
    ||| ||| ||||||||| | |||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8114 ctggttt-gtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 317 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 32224 - 32112
Alignment:
Q  317 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 414  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||  ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  32224 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagt 32126  T
Q  415 cagtctaagttgat 428  Q
    | ||||||| ||||    
T  32125 cggtctaagatgat 32112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 261 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 267843 - 267679
Alignment:
Q  261 tttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||    ||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  267843 tttgatggtgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatga--tgttgagatattgttgatttgcatttgatattgttatatca 267746  T
Q  360 tg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 423  Q
    ||  ||| |||| |||||||| | ||||| || |||||  ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  267745 tgaactg-ttttatatactgcatatgttgatgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 267679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 219
Target Start/End: Original strand, 187890 - 187955
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 219  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||||||||  |||||| ||| | |||||| |||||||||    
T  187890 tatgattgatgaagtattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgtcgttcattattgatgaa 187955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 10649 - 10542
Alignment:
Q  321 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagt 418  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||  |||||||||||||| ||    
T  10649 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggt 10551  T
Q  419 ctaagttga 427  Q
    |||||||||    
T  10550 ctaagttga 10542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 12819 - 12780
Alignment:
Q  389 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 428  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12819 ttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 361
Target Start/End: Original strand, 1736 - 1835
Alignment:
Q  261 tttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||| | |||||||||||| | |||||||| |||    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  1736 tttgacgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacataaattatatatgatg--ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatca 1833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 389 - 423
Target Start/End: Original strand, 5196 - 5230
Alignment:
Q  389 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5196 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 5230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 390 - 428
Target Start/End: Original strand, 28839 - 28877
Alignment:
Q  390 tgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 428  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28839 tgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 28877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 188 - 88
Alignment:
Q  261 tttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 359  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||| | |||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||||| ||||||| |||| |||    
T  188 tttgatgttgttaataatgttatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgcatctgatattgttatatca 90  T
Q  360 tg 361  Q
    ||    
T  89 tg 88  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1186 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1186
Description:

Target: scaffold1186; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 378 - 313
Alignment:
Q  154 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaa 219  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||||||||  |||||| ||| | |||||| |||||||||    
T  378 tatgattgatgaagtattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgtcgttcattattgatgaa 313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 441
Target Start/End: Original strand, 1021 - 1169
Alignment:
Q  292 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 390  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||| ||||    
T  1021 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatataattatgtcatgatgtt---gtatactgcctatgttgatgtt 1117  T
Q  391 g-ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 441  Q
      ||| |||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||| |||||    
T  1118 tattaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 381 - 438
Target Start/End: Original strand, 7330 - 7387
Alignment:
Q  381 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttg 438  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||| | | ||||||||||    
T  7330 tgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtcattataagattaataagatgttg 7387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 155 - 211
Target Start/End: Original strand, 66762 - 66818
Alignment:
Q  155 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatga 211  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| ||||||||||    
T  66762 atgaatgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatga 66818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University