View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2097_low_6 (Length: 501)

Name: NF2097_low_6
Description: NF2097
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2097_low_6
NF2097_low_6
[»] chr8 (150 HSPs)
chr8 (10-479)||(21389095-21389564)
chr8 (15-479)||(21395630-21396094)
chr8 (15-479)||(21790123-21790587)
chr8 (1-295)||(19899286-19899580)
chr8 (1-338)||(16184877-16185213)
chr8 (1-295)||(17353571-17353865)
chr8 (1-295)||(20465673-20465967)
chr8 (1-295)||(21168355-21168649)
chr8 (1-295)||(24755912-24756206)
chr8 (1-295)||(15602651-15602945)
chr8 (1-295)||(15611103-15611397)
chr8 (1-295)||(377469-377763)
chr8 (1-348)||(23776467-23776816)
chr8 (10-295)||(19983284-19983569)
chr8 (10-276)||(19976655-19976921)
chr8 (15-295)||(17926355-17926635)
chr8 (1-291)||(30642925-30643215)
chr8 (6-271)||(16409894-16410159)
chr8 (286-479)||(21778697-21778890)
chr8 (1-201)||(22010313-22010513)
chr8 (8-198)||(19259243-19259432)
chr8 (9-194)||(20856067-20856252)
chr8 (281-466)||(31971277-31971463)
chr8 (281-479)||(16199559-16199758)
chr8 (6-195)||(16860976-16861155)
chr8 (281-479)||(45130911-45131110)
chr8 (5-162)||(16411907-16412064)
chr8 (14-194)||(39094599-39094769)
chr8 (10-195)||(23834450-23834625)
chr8 (283-466)||(21918915-21919101)
chr8 (10-194)||(24433891-24434065)
chr8 (281-479)||(20536215-20536416)
chr8 (10-194)||(15532166-15532340)
chr8 (10-194)||(15538726-15538900)
chr8 (10-194)||(18619756-18619930)
chr8 (10-194)||(30308408-30308582)
chr8 (281-479)||(18879150-18879345)
chr8 (147-295)||(21161838-21161986)
chr8 (10-195)||(22028834-22029009)
chr8 (281-488)||(28648957-28649167)
chr8 (14-195)||(16231133-16231304)
chr8 (10-194)||(17828237-17828411)
chr8 (10-193)||(22113382-22113555)
chr8 (10-193)||(22134885-22135058)
chr8 (281-479)||(22626743-22626943)
chr8 (281-479)||(18818322-18818523)
chr8 (1-89)||(21161749-21161837)
chr8 (10-193)||(22166035-22166208)
chr8 (111-193)||(23846760-23846842)
chr8 (298-479)||(16092272-16092456)
chr8 (10-192)||(22045138-22045310)
chr8 (281-479)||(22875072-22875273)
chr8 (16-193)||(43252092-43252259)
chr8 (281-479)||(7372785-7372978)
chr8 (370-479)||(6520375-6520486)
chr8 (281-479)||(21923841-21924042)
chr8 (109-191)||(17055132-17055214)
chr8 (10-191)||(32598959-32599130)
chr8 (10-191)||(32605491-32605662)
chr8 (281-492)||(23648547-23648761)
chr8 (414-479)||(38855300-38855365)
chr8 (373-466)||(17140936-17141031)
chr8 (109-185)||(20527736-20527812)
chr8 (281-479)||(6759265-6759464)
chr8 (16-193)||(21972244-21972411)
chr8 (414-479)||(5866323-5866388)
chr8 (373-485)||(14409495-14409608)
chr8 (373-481)||(16413367-16413476)
chr8 (414-466)||(21491015-21491067)
chr8 (388-479)||(23406386-23406479)
chr8 (414-466)||(23760893-23760945)
chr8 (369-477)||(21285606-21285716)
chr8 (16-193)||(19277944-19278110)
chr8 (16-193)||(21976329-21976496)
chr8 (369-471)||(20498577-20498681)
chr8 (414-466)||(983455-983507)
chr8 (373-479)||(1484406-1484513)
chr8 (373-479)||(5853343-5853450)
chr8 (373-479)||(20403231-20403338)
chr8 (5-72)||(21491409-21491476)
chr8 (6-73)||(21918648-21918715)
chr8 (373-479)||(22001757-22001864)
chr8 (10-72)||(5865919-5865981)
chr8 (6-72)||(7373166-7373232)
chr8 (281-350)||(25363053-25363123)
chr8 (386-483)||(45290759-45290857)
chr8 (10-58)||(16199300-16199348)
chr8 (415-471)||(24353035-24353091)
chr8 (414-466)||(26355747-26355799)
chr8 (415-471)||(37116362-37116418)
chr8 (5-72)||(17141330-17141397)
chr8 (9-72)||(18818051-18818114)
chr8 (9-72)||(18878878-18878941)
chr8 (373-479)||(20046246-20046353)
chr8 (10-49)||(21249821-21249860)
chr8 (10-49)||(21255659-21255698)
chr8 (9-72)||(22627152-22627215)
chr8 (10-73)||(23252416-23252479)
chr8 (9-72)||(23406798-23406861)
chr8 (10-101)||(31971632-31971723)
chr8 (373-479)||(41598192-41598299)
chr8 (386-479)||(15203295-15203389)
chr8 (367-492)||(18678102-18678229)
chr8 (413-471)||(19154935-19154993)
chr8 (1-47)||(25362784-25362830)
chr8 (9-71)||(28648685-28648747)
chr8 (9-71)||(41598602-41598664)
chr8 (10-72)||(45130673-45130735)
chr8 (9-50)||(20536647-20536688)
chr8 (369-479)||(26219721-26219831)
chr8 (369-479)||(26225295-26225405)
chr8 (415-471)||(17267044-17267100)
chr8 (373-479)||(4483285-4483391)
chr8 (424-479)||(4542477-4542531)
chr8 (9-48)||(6759698-6759737)
chr8 (390-466)||(13508108-13508186)
chr8 (9-48)||(16091982-16092021)
chr8 (424-479)||(19896269-19896323)
chr8 (124-175)||(21918756-21918807)
chr8 (9-72)||(21923569-21923632)
chr8 (16-99)||(22112194-22112277)
chr8 (10-72)||(23648970-23649032)
chr8 (6-72)||(26355336-26355402)
chr8 (367-492)||(32121726-32121853)
chr8 (6-72)||(38854889-38854955)
chr8 (386-466)||(15070575-15070656)
chr8 (140-177)||(21249695-21249732)
chr8 (140-176)||(5866047-5866083)
chr8 (140-176)||(17141228-17141264)
chr8 (415-471)||(17439557-17439613)
chr8 (414-466)||(17612159-17612211)
chr8 (418-466)||(21673724-21673772)
chr8 (10-42)||(22057768-22057800)
chr8 (9-72)||(19801068-19801131)
chr8 (387-471)||(19801447-19801531)
chr8 (138-185)||(19905783-19905830)
chr8 (124-171)||(25362896-25362943)
chr8 (140-175)||(41598499-41598534)
chr8 (433-479)||(19937118-19937164)
chr8 (6-72)||(21674122-21674188)
chr8 (6-47)||(6520810-6520851)
chr8 (417-466)||(13597669-13597718)
chr8 (10-51)||(17055043-17055084)
chr8 (414-466)||(21249404-21249457)
chr8 (414-466)||(21255242-21255295)
chr8 (140-177)||(21255533-21255570)
chr8 (8-57)||(21414867-21414916)
chr8 (123-175)||(22875380-22875432)
chr8 (10-38)||(23844568-23844596)
chr8 (140-176)||(39834146-39834182)
[»] chr5 (145 HSPs)
chr5 (1-483)||(37723906-37724389)
chr5 (1-479)||(22032326-22032801)
chr5 (1-479)||(18769638-18770115)
chr5 (8-295)||(26704257-26704544)
chr5 (8-295)||(26973990-26974277)
chr5 (1-275)||(23512318-23512592)
chr5 (1-295)||(23201559-23201854)
chr5 (1-295)||(21366300-21366594)
chr5 (1-294)||(14079340-14079633)
chr5 (61-388)||(23572178-23572504)
chr5 (15-295)||(23500993-23501273)
chr5 (1-295)||(20805738-20806032)
chr5 (1-186)||(21887124-21887309)
chr5 (1-190)||(31342399-31342588)
chr5 (5-194)||(17918800-17918979)
chr5 (281-479)||(21292883-21293083)
chr5 (140-456)||(21873280-21873595)
chr5 (10-195)||(23535243-23535418)
chr5 (9-195)||(20910453-20910629)
chr5 (10-195)||(17410724-17410899)
chr5 (14-194)||(12028223-12028393)
chr5 (286-479)||(8286760-8286957)
chr5 (10-194)||(21340421-21340595)
chr5 (14-190)||(24222170-24222336)
chr5 (10-194)||(26665785-26665959)
chr5 (10-194)||(26937382-26937556)
chr5 (6-195)||(1858626-1858805)
chr5 (10-194)||(16674430-16674604)
chr5 (14-194)||(26680868-26681038)
chr5 (14-194)||(26952475-26952645)
chr5 (281-479)||(23390409-23390610)
chr5 (10-195)||(18356604-18356779)
chr5 (10-190)||(17718093-17718263)
chr5 (10-194)||(24532702-24532876)
chr5 (111-194)||(20232828-20232911)
chr5 (10-194)||(42805698-42805872)
chr5 (10-193)||(21884843-21885016)
chr5 (268-466)||(22075039-22075240)
chr5 (10-193)||(25229060-25229233)
chr5 (10-193)||(25293216-25293389)
chr5 (112-194)||(18774482-18774564)
chr5 (16-193)||(19472379-19472546)
chr5 (281-479)||(24493576-24493776)
chr5 (9-194)||(122954-123133)
chr5 (10-194)||(26742400-26742574)
chr5 (281-479)||(24529227-24529428)
chr5 (10-193)||(26172743-26172916)
chr5 (122-195)||(23451634-23451707)
chr5 (122-195)||(23463139-23463212)
chr5 (10-193)||(4036499-4036672)
chr5 (281-455)||(9077983-9078160)
chr5 (281-479)||(25421539-25421740)
chr5 (281-466)||(25431414-25431602)
chr5 (10-183)||(18784336-18784499)
chr5 (16-193)||(20296127-20296294)
chr5 (122-195)||(23458878-23458951)
chr5 (367-466)||(21729064-21729165)
chr5 (367-466)||(21808389-21808490)
chr5 (281-479)||(13025318-13025518)
chr5 (281-479)||(13095502-13095702)
chr5 (288-483)||(1096470-1096668)
chr5 (370-479)||(21329500-21329611)
chr5 (370-471)||(20026942-20027047)
chr5 (14-101)||(22760026-22760113)
chr5 (109-185)||(21295006-21295082)
chr5 (109-185)||(25535275-25535351)
chr5 (9-72)||(21871212-21871275)
chr5 (9-72)||(21875492-21875555)
chr5 (386-479)||(21997553-21997648)
chr5 (369-479)||(22412191-22412302)
chr5 (414-466)||(19660884-19660936)
chr5 (414-466)||(22959581-22959633)
chr5 (367-479)||(21502156-21502270)
chr5 (9-72)||(25431811-25431874)
chr5 (371-466)||(21565562-21565659)
chr5 (414-479)||(36314584-36314649)
chr5 (150-194)||(22757414-22757458)
chr5 (9-101)||(25421920-25422012)
chr5 (373-479)||(264819-264926)
chr5 (9-72)||(1096884-1096947)
chr5 (373-479)||(10732991-10733098)
chr5 (5-72)||(19660474-19660541)
chr5 (373-479)||(20909016-20909123)
chr5 (9-72)||(22075425-22075488)
chr5 (373-479)||(39363388-39363495)
chr5 (386-479)||(39245140-39245234)
chr5 (132-185)||(15441720-15441773)
chr5 (9-175)||(11580886-11581051)
chr5 (10-50)||(21292623-21292663)
chr5 (9-101)||(21985788-21985880)
chr5 (414-466)||(26012084-26012136)
chr5 (388-466)||(20902075-20902154)
chr5 (138-185)||(23337060-23337107)
chr5 (9-72)||(23390137-23390200)
chr5 (373-479)||(29329938-29330045)
chr5 (373-479)||(42245416-42245523)
chr5 (386-479)||(11581263-11581357)
chr5 (386-479)||(18319098-18319192)
chr5 (368-433)||(18356367-18356433)
chr5 (314-433)||(20910745-20910866)
chr5 (6-72)||(21565961-21566027)
chr5 (6-72)||(22959171-22959237)
chr5 (373-479)||(36154834-36154938)
chr5 (9-50)||(22119834-22119875)
chr5 (414-471)||(22144064-22144121)
chr5 (388-479)||(2154680-2154772)
chr5 (268-351)||(22107273-22107357)
chr5 (109-185)||(24554820-24554896)
chr5 (433-485)||(38619432-38619484)
chr5 (10-49)||(8286495-8286534)
chr5 (367-476)||(18418590-18418699)
chr5 (424-479)||(20918052-20918106)
chr5 (140-179)||(22119963-22120002)
chr5 (9-72)||(24529638-24529701)
chr5 (373-479)||(29345984-29346091)
chr5 (386-479)||(10775740-10775834)
chr5 (6-72)||(19669317-19669383)
chr5 (413-471)||(22178269-22178327)
chr5 (433-479)||(23064515-23064561)
chr5 (386-479)||(31061072-31061166)
chr5 (10-51)||(21482889-21482930)
chr5 (9-50)||(24766978-24767019)
chr5 (10-51)||(33409617-33409658)
chr5 (9-101)||(9078340-9078432)
chr5 (109-185)||(14359562-14359638)
chr5 (138-294)||(15236552-15236708)
chr5 (140-176)||(19660608-19660644)
chr5 (414-466)||(19668918-19668970)
chr5 (6-50)||(21329133-21329177)
chr5 (10-50)||(22107026-22107066)
chr5 (9-44)||(13095939-13095974)
chr5 (124-175)||(22107129-22107180)
chr5 (140-179)||(24767107-24767146)
chr5 (163-194)||(33409506-33409537)
chr5 (9-48)||(36154469-36154508)
chr5 (367-492)||(17517201-17517328)
chr5 (1-35)||(23572510-23572544)
chr5 (10-51)||(18774615-18774656)
chr5 (416-465)||(26732884-26732932)
chr5 (140-176)||(5888946-5888982)
chr5 (10-38)||(20232954-20232982)
chr5 (6-50)||(21498655-21498699)
chr5 (140-176)||(21565858-21565894)
chr5 (140-176)||(22959304-22959340)
chr5 (140-176)||(25744035-25744071)
[»] scaffold0021 (8 HSPs)
scaffold0021 (6-466)||(174786-175247)
scaffold0021 (281-394)||(124679-124793)
scaffold0021 (9-72)||(124999-125062)
scaffold0021 (416-479)||(121773-121835)
scaffold0021 (410-471)||(136414-136475)
scaffold0021 (410-471)||(145122-145183)
scaffold0021 (124-175)||(124899-124950)
scaffold0021 (6-48)||(63002-63044)
[»] chr7 (172 HSPs)
chr7 (1-479)||(17137697-17138174)
chr7 (1-388)||(12187113-12187499)
chr7 (1-295)||(9703458-9703752)
chr7 (6-351)||(18154475-18154821)
chr7 (1-276)||(11880463-11880738)
chr7 (1-291)||(12321376-12321666)
chr7 (5-338)||(24054618-24054950)
chr7 (1-295)||(14430070-14430364)
chr7 (10-351)||(19649127-19649469)
chr7 (281-479)||(27847746-27847944)
chr7 (1-203)||(10508716-10508918)
chr7 (6-201)||(2760413-2760608)
chr7 (281-479)||(40443398-40443597)
chr7 (1-156)||(15211759-15211914)
chr7 (10-195)||(11312925-11313100)
chr7 (281-479)||(12698838-12699040)
chr7 (10-195)||(15580968-15581144)
chr7 (10-195)||(12318404-12318579)
chr7 (281-479)||(9509196-9509397)
chr7 (10-195)||(15604926-15605101)
chr7 (281-466)||(16386160-16386349)
chr7 (10-195)||(9593622-9593797)
chr7 (10-195)||(9644585-9644760)
chr7 (10-195)||(13635123-13635298)
chr7 (10-195)||(48593110-48593285)
chr7 (10-194)||(6801490-6801664)
chr7 (10-194)||(26292673-26292847)
chr7 (10-193)||(13149433-13149606)
chr7 (10-195)||(11987489-11987664)
chr7 (281-479)||(18456326-18456526)
chr7 (7-192)||(42205394-42205569)
chr7 (14-190)||(9445816-9445982)
chr7 (10-193)||(15728603-15728776)
chr7 (268-466)||(26212016-26212217)
chr7 (6-101)||(3272173-3272268)
chr7 (10-203)||(18712-18895)
chr7 (281-466)||(10589059-10589246)
chr7 (112-194)||(16438780-16438862)
chr7 (10-194)||(8917704-8917878)
chr7 (10-194)||(13462039-13462213)
chr7 (10-194)||(18557249-18557423)
chr7 (10-194)||(16724285-16724459)
chr7 (10-194)||(17701299-17701473)
chr7 (15-190)||(20569255-20569420)
chr7 (111-194)||(14217192-14217275)
chr7 (16-193)||(16906860-16907027)
chr7 (16-193)||(18279683-18279850)
chr7 (298-466)||(38227501-38227671)
chr7 (298-479)||(3564294-3564478)
chr7 (10-156)||(16583550-16583686)
chr7 (16-193)||(12718948-12719115)
chr7 (16-193)||(12723859-12724026)
chr7 (16-193)||(16114521-16114688)
chr7 (16-193)||(16117674-16117841)
chr7 (16-193)||(18283646-18283813)
chr7 (369-479)||(48273396-48273508)
chr7 (16-193)||(12715144-12715311)
chr7 (414-479)||(67752-67817)
chr7 (414-479)||(28505347-28505412)
chr7 (109-185)||(11262615-11262691)
chr7 (109-185)||(11548010-11548086)
chr7 (109-185)||(11554606-11554682)
chr7 (109-185)||(12692782-12692858)
chr7 (109-185)||(14953484-14953560)
chr7 (111-191)||(16275772-16275852)
chr7 (373-466)||(13647345-13647440)
chr7 (373-482)||(24275172-24275282)
chr7 (369-466)||(2280121-2280220)
chr7 (109-185)||(14959450-14959526)
chr7 (109-185)||(25038953-25039029)
chr7 (414-466)||(34200806-34200858)
chr7 (6-101)||(12756355-12756450)
chr7 (367-485)||(16213682-16213801)
chr7 (5-72)||(16385895-16385962)
chr7 (132-183)||(35151894-35151945)
chr7 (367-466)||(16219717-16219818)
chr7 (414-479)||(16495409-16495474)
chr7 (373-479)||(17061966-17062073)
chr7 (414-479)||(47831814-47831879)
chr7 (414-466)||(811180-811232)
chr7 (9-101)||(17061601-17061693)
chr7 (414-466)||(18005666-18005718)
chr7 (414-466)||(44014198-44014250)
chr7 (373-479)||(456325-456432)
chr7 (373-479)||(11393338-11393445)
chr7 (373-479)||(11972500-11972607)
chr7 (373-479)||(14949173-14949280)
chr7 (373-479)||(15376764-15376871)
chr7 (10-101)||(15754529-15754620)
chr7 (373-479)||(16232524-16232631)
chr7 (373-479)||(16410063-16410170)
chr7 (373-479)||(18640276-18640383)
chr7 (373-479)||(20385174-20385281)
chr7 (373-479)||(21189646-21189753)
chr7 (5-72)||(28504938-28505005)
chr7 (373-479)||(32125495-32125602)
chr7 (10-101)||(40443765-40443856)
chr7 (373-479)||(41522921-41523028)
chr7 (373-479)||(41525383-41525490)
chr7 (373-479)||(24704692-24704796)
chr7 (5-50)||(26212424-26212469)
chr7 (386-485)||(13869344-13869444)
chr7 (10-50)||(27847486-27847526)
chr7 (9-101)||(38227868-38227960)
chr7 (9-72)||(9509606-9509669)
chr7 (9-72)||(12699249-12699312)
chr7 (369-479)||(18430716-18430827)
chr7 (369-479)||(22072920-22073033)
chr7 (373-479)||(24702242-24702349)
chr7 (373-479)||(27216864-27216971)
chr7 (373-479)||(44116513-44116620)
chr7 (10-72)||(11995700-11995762)
chr7 (433-479)||(13831377-13831423)
chr7 (369-466)||(16056348-16056446)
chr7 (9-50)||(2831947-2831988)
chr7 (9-50)||(9751191-9751232)
chr7 (6-71)||(18006059-18006124)
chr7 (10-47)||(34201225-34201262)
chr7 (6-50)||(810767-810811)
chr7 (414-466)||(11996076-11996128)
chr7 (410-462)||(12901347-12901399)
chr7 (127-175)||(15143795-15143843)
chr7 (140-180)||(18302489-18302529)
chr7 (6-50)||(18302617-18302661)
chr7 (424-479)||(3386337-3386391)
chr7 (9-72)||(3564005-3564068)
chr7 (415-466)||(14044766-14044817)
chr7 (415-466)||(14354796-14354847)
chr7 (368-433)||(2530139-2530205)
chr7 (414-456)||(12255842-12255884)
chr7 (433-479)||(20110560-20110606)
chr7 (6-72)||(44014591-44014657)
chr7 (6-72)||(47832225-47832291)
chr7 (10-51)||(11044-11085)
chr7 (413-466)||(1868043-1868096)
chr7 (415-456)||(14036284-14036325)
chr7 (415-456)||(14346314-14346355)
chr7 (10-51)||(16275902-16275943)
chr7 (10-51)||(35152016-35152057)
chr7 (9-50)||(39267287-39267328)
chr7 (157-194)||(39722544-39722581)
chr7 (138-186)||(4318317-4318365)
chr7 (415-471)||(20220238-20220294)
chr7 (140-176)||(28505071-28505107)
chr7 (369-479)||(38898423-38898535)
chr7 (123-175)||(44116820-44116872)
chr7 (140-179)||(2832075-2832114)
chr7 (390-466)||(10063841-10063919)
chr7 (6-37)||(14194729-14194760)
chr7 (423-466)||(15144096-15144138)
chr7 (140-179)||(39267416-39267455)
chr7 (124-175)||(40443703-40443754)
chr7 (413-456)||(48991210-48991253)
chr7 (6-72)||(68163-68229)
chr7 (413-463)||(15008547-15008597)
chr7 (408-466)||(18154885-18154942)
chr7 (135-185)||(18531531-18531581)
chr7 (140-177)||(11995800-11995837)
chr7 (9-101)||(15143677-15143770)
chr7 (10-51)||(16438688-16438729)
chr7 (126-175)||(38227795-38227844)
chr7 (138-194)||(33385-33441)
chr7 (140-176)||(68060-68096)
chr7 (138-194)||(70537-70593)
chr7 (138-194)||(74646-74702)
chr7 (140-180)||(810900-810940)
chr7 (140-176)||(9389466-9389502)
chr7 (140-176)||(9751320-9751356)
chr7 (109-185)||(14148856-14148932)
chr7 (414-466)||(15754936-15754988)
chr7 (7-47)||(16219355-16219395)
chr7 (140-176)||(34201098-34201134)
[»] chr4 (150 HSPs)
chr4 (5-400)||(15121441-15121834)
chr4 (1-295)||(13569703-13569997)
chr4 (1-348)||(15093911-15094258)
chr4 (1-295)||(12570212-12570506)
chr4 (1-295)||(44675823-44676117)
chr4 (1-295)||(23843669-23843964)
chr4 (1-295)||(16356587-16356881)
chr4 (1-294)||(16487712-16488005)
chr4 (3-249)||(15124790-15125036)
chr4 (281-479)||(17046494-17046692)
chr4 (281-479)||(14053215-14053415)
chr4 (1-145)||(16348326-16348470)
chr4 (10-195)||(36133616-36133791)
chr4 (14-194)||(11250219-11250389)
chr4 (268-466)||(12902777-12902978)
chr4 (268-479)||(7088884-7089098)
chr4 (14-190)||(16351506-16351672)
chr4 (12-192)||(19757257-19757427)
chr4 (12-192)||(19782379-19782549)
chr4 (10-195)||(1951415-1951590)
chr4 (14-194)||(15352964-15353134)
chr4 (10-186)||(16243054-16243220)
chr4 (10-194)||(26243319-26243493)
chr4 (10-194)||(17152141-17152315)
chr4 (10-194)||(18237170-18237344)
chr4 (14-190)||(25555798-25555964)
chr4 (10-194)||(45938425-45938599)
chr4 (10-193)||(2015057-2015230)
chr4 (281-479)||(22636442-22636642)
chr4 (10-194)||(23139548-23139722)
chr4 (10-193)||(18222032-18222205)
chr4 (281-479)||(44052836-44053037)
chr4 (281-466)||(16377436-16377622)
chr4 (281-466)||(23374272-23374460)
chr4 (281-479)||(16270149-16270349)
chr4 (111-192)||(16678334-16678415)
chr4 (109-193)||(9556809-9556893)
chr4 (107-190)||(3413078-3413161)
chr4 (9-194)||(9530711-9530886)
chr4 (10-195)||(43255814-43255990)
chr4 (10-190)||(18602399-18602569)
chr4 (305-479)||(7798781-7798958)
chr4 (10-181)||(18608993-18609154)
chr4 (10-193)||(28569098-28569271)
chr4 (16-193)||(4560993-4561160)
chr4 (16-193)||(33742657-33742824)
chr4 (5-194)||(27534303-27534482)
chr4 (281-479)||(14038655-14038856)
chr4 (16-193)||(5756597-5756764)
chr4 (281-479)||(16239883-16240083)
chr4 (367-479)||(52873367-52873481)
chr4 (109-185)||(23838720-23838796)
chr4 (369-479)||(54798756-54798868)
chr4 (281-479)||(7893710-7893908)
chr4 (370-466)||(12288211-12288311)
chr4 (10-191)||(14708288-14708459)
chr4 (369-471)||(13853-13957)
chr4 (414-479)||(39706337-39706402)
chr4 (414-466)||(12774027-12774079)
chr4 (109-185)||(14679249-14679325)
chr4 (109-185)||(14685458-14685534)
chr4 (414-466)||(15551837-15551889)
chr4 (373-492)||(19618223-19618343)
chr4 (109-185)||(41385488-41385564)
chr4 (111-191)||(42997195-42997275)
chr4 (414-466)||(52243245-52243297)
chr4 (369-479)||(14280320-14280431)
chr4 (373-479)||(18215325-18215432)
chr4 (369-479)||(44928926-44929038)
chr4 (386-483)||(15355389-15355487)
chr4 (410-466)||(3096313-3096368)
chr4 (9-101)||(6190821-6190913)
chr4 (1-101)||(16597033-16597133)
chr4 (109-185)||(35614226-35614301)
chr4 (373-479)||(12358-12465)
chr4 (367-479)||(6899898-6900011)
chr4 (373-479)||(15118403-15118510)
chr4 (373-479)||(23803316-23803423)
chr4 (373-479)||(44615292-44615399)
chr4 (373-479)||(44773138-44773245)
chr4 (373-479)||(51463919-51464026)
chr4 (373-479)||(52312514-52312621)
chr4 (10-72)||(14052955-14053017)
chr4 (373-485)||(3515005-3515118)
chr4 (9-175)||(21814944-21815108)
chr4 (9-175)||(21815273-21815437)
chr4 (9-175)||(21818366-21818530)
chr4 (421-466)||(43198611-43198656)
chr4 (414-466)||(8846376-8846428)
chr4 (373-492)||(14970758-14970878)
chr4 (373-479)||(1837560-1837667)
chr4 (281-360)||(3096772-3096851)
chr4 (369-485)||(8574871-8574987)
chr4 (6-73)||(12774414-12774481)
chr4 (373-479)||(18239470-18239577)
chr4 (373-479)||(19242703-19242810)
chr4 (373-479)||(50222390-50222497)
chr4 (6-72)||(7089283-7089349)
chr4 (6-72)||(12903163-12903228)
chr4 (10-72)||(15552230-15552292)
chr4 (6-72)||(16239630-16239696)
chr4 (168-294)||(16348466-16348592)
chr4 (285-350)||(17047989-17048055)
chr4 (368-433)||(43256161-43256227)
chr4 (9-71)||(44102627-44102689)
chr4 (413-471)||(46640504-46640562)
chr4 (10-51)||(3413207-3413248)
chr4 (417-466)||(6190482-6190531)
chr4 (9-50)||(14039088-14039129)
chr4 (1-50)||(17047717-17047766)
chr4 (140-180)||(22633983-22634023)
chr4 (415-471)||(53082202-53082258)
chr4 (140-179)||(3332197-3332236)
chr4 (124-175)||(7089191-7089242)
chr4 (424-479)||(7641286-7641340)
chr4 (424-479)||(12610954-12611008)
chr4 (140-179)||(13812579-13812618)
chr4 (124-175)||(17047828-17047879)
chr4 (9-72)||(22636851-22636914)
chr4 (140-179)||(24029053-24029092)
chr4 (9-47)||(13812450-13812488)
chr4 (6-72)||(39705926-39705992)
chr4 (9-47)||(44053271-44053309)
chr4 (433-479)||(44102218-44102264)
chr4 (7-72)||(3097049-3097114)
chr4 (9-50)||(7799136-7799177)
chr4 (6-47)||(13844981-13845022)
chr4 (9-50)||(24029180-24029221)
chr4 (109-181)||(12522375-12522447)
chr4 (140-180)||(12774309-12774349)
chr4 (9-45)||(16377163-16377199)
chr4 (124-175)||(3096957-3097008)
chr4 (137-176)||(15190631-15190670)
chr4 (10-101)||(18228529-18228620)
chr4 (140-179)||(20157060-20157099)
chr4 (140-175)||(44102525-44102560)
chr4 (140-175)||(44928694-44928729)
chr4 (6-72)||(8846792-8846858)
chr4 (414-448)||(16596686-16596720)
chr4 (9-46)||(15091340-15091377)
chr4 (9-50)||(20156931-20156972)
chr4 (417-466)||(22353853-22353901)
chr4 (9-50)||(22633854-22633895)
chr4 (10-51)||(42997104-42997145)
chr4 (9-50)||(44928564-44928605)
chr4 (140-176)||(8846688-8846724)
chr4 (140-176)||(15099664-15099700)
chr4 (10-38)||(17053482-17053510)
chr4 (138-194)||(17810550-17810606)
chr4 (109-185)||(35170915-35170991)
[»] chr2 (131 HSPs)
chr2 (1-479)||(40621842-40622324)
chr2 (1-456)||(22798760-22799217)
chr2 (2-294)||(23019341-23019633)
chr2 (6-294)||(23038227-23038515)
chr2 (1-295)||(25963351-25963645)
chr2 (1-290)||(45677789-45678078)
chr2 (1-295)||(21917950-21918244)
chr2 (5-351)||(22740598-22740945)
chr2 (1-295)||(37524856-37525149)
chr2 (5-351)||(22758353-22758700)
chr2 (281-479)||(20309115-20309313)
chr2 (1-294)||(24673768-24674061)
chr2 (6-228)||(23100869-23101091)
chr2 (5-146)||(22811572-22811713)
chr2 (281-466)||(38029-38215)
chr2 (20-201)||(44369952-44370133)
chr2 (225-479)||(23103254-23103509)
chr2 (268-479)||(23285872-23286082)
chr2 (14-190)||(24175093-24175259)
chr2 (281-479)||(298727-298929)
chr2 (14-201)||(24716188-24716365)
chr2 (14-194)||(40428753-40428924)
chr2 (10-194)||(22460844-22461018)
chr2 (14-190)||(24654996-24655162)
chr2 (281-479)||(22731147-22731348)
chr2 (3-193)||(21318282-21318462)
chr2 (3-193)||(21327213-21327393)
chr2 (10-195)||(24735680-24735855)
chr2 (10-194)||(23598616-23598790)
chr2 (14-190)||(24870173-24870339)
chr2 (10-194)||(23187353-23187527)
chr2 (10-193)||(19928156-19928329)
chr2 (281-479)||(22738093-22738293)
chr2 (9-194)||(18855114-18855289)
chr2 (1-94)||(24658032-24658125)
chr2 (268-466)||(23654286-23654487)
chr2 (281-466)||(23076462-23076650)
chr2 (10-193)||(61094-61267)
chr2 (109-193)||(15477883-15477967)
chr2 (286-479)||(23060520-23060716)
chr2 (16-193)||(24649636-24649803)
chr2 (111-195)||(19688501-19688585)
chr2 (281-479)||(22337122-22337323)
chr2 (281-479)||(23660030-23660230)
chr2 (10-191)||(26125484-26125655)
chr2 (16-193)||(27379092-27379259)
chr2 (16-193)||(27383138-27383305)
chr2 (16-193)||(41530669-41530836)
chr2 (109-193)||(12901255-12901339)
chr2 (373-479)||(22105416-22105524)
chr2 (119-190)||(25961287-25961358)
chr2 (16-193)||(24628138-24628305)
chr2 (10-191)||(41667230-41667401)
chr2 (132-193)||(27602076-27602137)
chr2 (373-492)||(32214972-32215092)
chr2 (369-471)||(7735-7839)
chr2 (414-479)||(7679592-7679657)
chr2 (10-146)||(27263577-27263703)
chr2 (414-466)||(25175870-25175922)
chr2 (414-466)||(28405996-28406048)
chr2 (373-479)||(571401-571508)
chr2 (10-101)||(10327218-10327309)
chr2 (373-479)||(18808947-18809054)
chr2 (373-479)||(23130866-23130973)
chr2 (373-479)||(23133333-23133440)
chr2 (373-479)||(23135594-23135701)
chr2 (373-479)||(23709583-23709690)
chr2 (373-479)||(23712064-23712171)
chr2 (373-479)||(26505383-26505490)
chr2 (373-479)||(26507861-26507968)
chr2 (9-72)||(32451570-32451633)
chr2 (373-479)||(34402573-34402680)
chr2 (373-479)||(39682317-39682424)
chr2 (386-479)||(6725999-6726093)
chr2 (413-471)||(23207292-23207350)
chr2 (6-72)||(23286267-23286333)
chr2 (7-72)||(23654049-23654114)
chr2 (388-479)||(21155126-21155218)
chr2 (163-295)||(22811708-22811839)
chr2 (9-101)||(23660410-23660502)
chr2 (337-466)||(23708589-23708720)
chr2 (10-50)||(28291944-28291984)
chr2 (10-101)||(37769-37860)
chr2 (9-72)||(298456-298519)
chr2 (373-475)||(24367782-24367885)
chr2 (109-180)||(24503402-24503473)
chr2 (9-72)||(27753992-27754055)
chr2 (10-72)||(22133859-22133921)
chr2 (410-479)||(8946664-8946732)
chr2 (9-50)||(22737821-22737862)
chr2 (414-466)||(18786952-18787004)
chr2 (414-466)||(19671850-19671902)
chr2 (10-50)||(20309533-20309573)
chr2 (415-471)||(20520243-20520299)
chr2 (414-466)||(23071998-23072050)
chr2 (373-479)||(24898246-24898354)
chr2 (373-479)||(24900729-24900837)
chr2 (373-479)||(24903206-24903314)
chr2 (373-479)||(24905683-24905791)
chr2 (373-479)||(24908158-24908266)
chr2 (6-50)||(25176281-25176325)
chr2 (414-465)||(22134256-22134306)
chr2 (9-72)||(22730874-22730937)
chr2 (424-479)||(24643054-24643108)
chr2 (373-479)||(32039549-32039656)
chr2 (424-479)||(43137303-43137357)
chr2 (413-471)||(22413186-22413244)
chr2 (433-479)||(28577103-28577149)
chr2 (433-479)||(38967378-38967424)
chr2 (433-479)||(45029966-45030012)
chr2 (422-479)||(23040247-23040303)
chr2 (19-72)||(23071614-23071667)
chr2 (417-466)||(32451981-32452030)
chr2 (415-471)||(23004763-23004819)
chr2 (140-176)||(23071733-23071769)
chr2 (388-479)||(24529595-24529687)
chr2 (415-471)||(25108902-25108958)
chr2 (367-481)||(25616190-25616306)
chr2 (138-185)||(27197172-27197219)
chr2 (124-175)||(32451685-32451736)
chr2 (140-174)||(22133986-22134020)
chr2 (13-47)||(22337557-22337591)
chr2 (415-465)||(23287384-23287433)
chr2 (163-193)||(27263552-27263582)
chr2 (9-50)||(23076879-23076920)
chr2 (416-465)||(26392403-26392451)
chr2 (140-176)||(37888-37924)
chr2 (138-194)||(10101417-10101473)
chr2 (415-471)||(23791288-23791344)
chr2 (124-172)||(27753892-27753940)
chr2 (140-176)||(31756231-31756267)
[»] chr1 (123 HSPs)
chr1 (6-351)||(21714684-21715030)
chr1 (1-295)||(42864845-42865139)
chr1 (1-295)||(22831012-22831306)
chr1 (10-492)||(22468339-22468823)
chr1 (1-413)||(21787676-21788088)
chr1 (1-294)||(21022830-21023123)
chr1 (1-295)||(6152046-6152340)
chr1 (5-295)||(18181759-18182049)
chr1 (6-196)||(3472565-3472755)
chr1 (6-181)||(22432422-22432597)
chr1 (6-194)||(8761272-8761460)
chr1 (281-456)||(38801304-38801479)
chr1 (123-295)||(20091229-20091401)
chr1 (10-195)||(21305591-21305766)
chr1 (10-194)||(45489397-45489571)
chr1 (10-195)||(36818962-36819137)
chr1 (7-195)||(17678238-17678416)
chr1 (268-466)||(27250629-27250830)
chr1 (10-195)||(24782754-24782929)
chr1 (10-195)||(16080098-16080273)
chr1 (10-195)||(19212144-19212319)
chr1 (10-191)||(20138364-20138535)
chr1 (10-195)||(33797810-33797985)
chr1 (10-194)||(12647147-12647321)
chr1 (14-190)||(33049745-33049911)
chr1 (14-194)||(45310024-45310194)
chr1 (10-193)||(23818953-23819126)
chr1 (183-350)||(48603652-48603820)
chr1 (10-194)||(18882645-18882819)
chr1 (10-194)||(46975745-46975919)
chr1 (281-488)||(50210126-50210336)
chr1 (268-466)||(21026700-21026901)
chr1 (281-479)||(34509787-34509988)
chr1 (14-194)||(18393621-18393791)
chr1 (138-295)||(22449037-22449194)
chr1 (10-193)||(20228463-20228636)
chr1 (16-193)||(52639821-52639988)
chr1 (16-193)||(16375117-16375284)
chr1 (16-193)||(21407635-21407802)
chr1 (10-191)||(21615718-21615889)
chr1 (285-479)||(22532276-22532473)
chr1 (281-411)||(22354485-22354616)
chr1 (281-492)||(20135181-20135395)
chr1 (369-471)||(21896258-21896362)
chr1 (109-185)||(21438081-21438157)
chr1 (109-185)||(23763498-23763574)
chr1 (14-101)||(3704744-3704831)
chr1 (414-479)||(14295600-14295665)
chr1 (386-466)||(20847173-20847255)
chr1 (369-471)||(21861572-21861676)
chr1 (417-492)||(20454606-20454680)
chr1 (373-483)||(21840767-21840878)
chr1 (337-471)||(35261051-35261184)
chr1 (414-472)||(22921918-22921976)
chr1 (373-466)||(45574893-45574988)
chr1 (7-72)||(22355824-22355889)
chr1 (7-72)||(22357510-22357575)
chr1 (414-466)||(16758669-16758721)
chr1 (414-466)||(20918624-20918676)
chr1 (414-466)||(21754065-21754117)
chr1 (414-466)||(33681027-33681079)
chr1 (373-479)||(13988870-13988977)
chr1 (373-479)||(21923342-21923449)
chr1 (373-479)||(23593786-23593893)
chr1 (369-479)||(31612317-31612428)
chr1 (6-72)||(27250378-27250444)
chr1 (435-492)||(16361908-16361965)
chr1 (9-101)||(433395-433487)
chr1 (5-101)||(20846867-20846963)
chr1 (369-466)||(22237647-22237746)
chr1 (415-471)||(50614167-50614223)
chr1 (415-471)||(50621995-50622051)
chr1 (414-466)||(52928019-52928071)
chr1 (9-72)||(21301179-21301242)
chr1 (373-479)||(21475138-21475245)
chr1 (6-73)||(43697776-43697843)
chr1 (369-479)||(433016-433125)
chr1 (417-471)||(16368338-16368392)
chr1 (386-479)||(22123131-22123226)
chr1 (6-72)||(22921505-22921571)
chr1 (6-71)||(52927619-52927684)
chr1 (414-466)||(20248299-20248351)
chr1 (5-101)||(21027057-21027153)
chr1 (137-177)||(21162078-21162118)
chr1 (9-101)||(22354213-22354305)
chr1 (110-185)||(19063807-19063882)
chr1 (110-185)||(19111697-19111772)
chr1 (5-48)||(20135628-20135671)
chr1 (9-72)||(22532686-22532749)
chr1 (424-479)||(29298141-29298195)
chr1 (424-479)||(29776692-29776746)
chr1 (9-72)||(34510197-34510260)
chr1 (433-479)||(13212974-13213020)
chr1 (433-479)||(21342100-21342146)
chr1 (433-479)||(21346965-21347011)
chr1 (433-479)||(21707171-21707217)
chr1 (433-479)||(21711713-21711759)
chr1 (10-72)||(21754452-21754514)
chr1 (6-72)||(33681426-33681492)
chr1 (368-433)||(33797573-33797639)
chr1 (413-471)||(41050084-41050142)
chr1 (7-72)||(20919018-20919083)
chr1 (281-360)||(22356087-22356168)
chr1 (281-360)||(22357773-22357854)
chr1 (388-479)||(16275430-16275522)
chr1 (8-72)||(20248694-20248758)
chr1 (140-176)||(20918916-20918952)
chr1 (140-180)||(21754346-21754386)
chr1 (6-50)||(22238068-22238112)
chr1 (140-175)||(433322-433357)
chr1 (138-185)||(19105040-19105087)
chr1 (416-471)||(50686626-50686681)
chr1 (433-479)||(15860121-15860167)
chr1 (415-465)||(26064959-26065009)
chr1 (140-174)||(33681325-33681359)
chr1 (10-72)||(38801044-38801106)
chr1 (413-466)||(16093933-16093986)
chr1 (138-183)||(20524987-20525032)
chr1 (1-50)||(21162167-21162216)
chr1 (138-194)||(1011001-1011057)
chr1 (10-50)||(20091116-20091156)
chr1 (140-176)||(20637164-20637200)
chr1 (123-175)||(50209967-50210019)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (1-475)||(26835-27308)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (1-479)||(1884-2361)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (1-479)||(21440-21917)
scaffold0210 (1-479)||(29332-29809)
[»] chr3 (194 HSPs)
chr3 (1-479)||(856143-856620)
chr3 (1-294)||(15060483-15060776)
chr3 (1-295)||(12496445-12496739)
chr3 (1-295)||(23077112-23077406)
chr3 (1-276)||(18383551-18383826)
chr3 (1-223)||(12173048-12173270)
chr3 (1-294)||(14878139-14878433)
chr3 (10-266)||(15877471-15877727)
chr3 (1-294)||(15051707-15052000)
chr3 (1-201)||(16369692-16369892)
chr3 (1-276)||(322798-323073)
chr3 (6-338)||(23408581-23408911)
chr3 (10-201)||(26190652-26190843)
chr3 (6-271)||(19725551-19725816)
chr3 (1-271)||(11298163-11298433)
chr3 (27-295)||(11862981-11863247)
chr3 (9-201)||(12037595-12037787)
chr3 (6-216)||(11851842-11852050)
chr3 (9-249)||(23052719-23052959)
chr3 (1-295)||(17524808-17525080)
chr3 (1-142)||(321648-321789)
chr3 (10-194)||(326818-326992)
chr3 (5-188)||(3402604-3402777)
chr3 (14-192)||(1982468-1982636)
chr3 (281-479)||(20698349-20698549)
chr3 (10-195)||(7793000-7793175)
chr3 (14-194)||(11594797-11594967)
chr3 (10-195)||(15482939-15483114)
chr3 (10-195)||(20461154-20461329)
chr3 (10-195)||(15849739-15849914)
chr3 (10-194)||(1598134-1598308)
chr3 (10-194)||(17242250-17242424)
chr3 (14-194)||(42326222-42326392)
chr3 (281-479)||(13442281-13442482)
chr3 (281-479)||(17487863-17488064)
chr3 (281-466)||(12399229-12399417)
chr3 (10-194)||(15941558-15941732)
chr3 (10-194)||(38814662-38814836)
chr3 (10-195)||(31097208-31097383)
chr3 (10-194)||(11300165-11300339)
chr3 (5-190)||(11557033-11557208)
chr3 (281-479)||(14972861-14973062)
chr3 (10-193)||(16697071-16697244)
chr3 (281-479)||(17499345-17499546)
chr3 (10-193)||(16690498-16690671)
chr3 (111-195)||(16797799-16797883)
chr3 (130-294)||(16909941-16910105)
chr3 (10-194)||(3833952-3834126)
chr3 (111-195)||(16808626-16808710)
chr3 (281-479)||(18438541-18438742)
chr3 (281-479)||(24153122-24153322)
chr3 (281-466)||(14576746-14576933)
chr3 (111-195)||(2897568-2897652)
chr3 (231-350)||(14179570-14179690)
chr3 (10-101)||(3389600-3389691)
chr3 (281-466)||(26686907-26687095)
chr3 (16-193)||(27409303-27409470)
chr3 (109-185)||(20723288-20723364)
chr3 (282-479)||(23083275-23083475)
chr3 (281-462)||(43840956-43841140)
chr3 (16-193)||(7109981-7110148)
chr3 (16-193)||(7113916-7114083)
chr3 (16-193)||(22321947-22322114)
chr3 (16-193)||(22337002-22337169)
chr3 (10-165)||(16862834-16862979)
chr3 (281-466)||(42386430-42386619)
chr3 (282-479)||(25476299-25476499)
chr3 (111-193)||(11855015-11855097)
chr3 (109-185)||(24188064-24188140)
chr3 (281-479)||(40213634-40213834)
chr3 (414-472)||(49668125-49668183)
chr3 (388-466)||(14572609-14572688)
chr3 (132-193)||(15617656-15617717)
chr3 (369-479)||(36166602-36166712)
chr3 (109-194)||(55149256-55149341)
chr3 (281-479)||(11424676-11424873)
chr3 (414-466)||(12174308-12174360)
chr3 (370-479)||(14234494-14234605)
chr3 (369-466)||(15470944-15471043)
chr3 (421-485)||(28194691-28194755)
chr3 (414-466)||(32307697-32307749)
chr3 (373-479)||(8899098-8899205)
chr3 (373-479)||(9707658-9707765)
chr3 (5-72)||(12399612-12399679)
chr3 (373-479)||(17672630-17672737)
chr3 (414-485)||(27165248-27165319)
chr3 (16-193)||(28950007-28950175)
chr3 (373-479)||(29172634-29172741)
chr3 (414-472)||(9512934-9512992)
chr3 (414-472)||(9520909-9520967)
chr3 (6-51)||(17674214-17674259)
chr3 (414-471)||(52523778-52523835)
chr3 (9-175)||(53070340-53070504)
chr3 (371-479)||(55500946-55501055)
chr3 (9-101)||(11424404-11424496)
chr3 (414-466)||(13210376-13210428)
chr3 (373-492)||(13544016-13544136)
chr3 (373-479)||(6469185-6469292)
chr3 (373-479)||(7781398-7781505)
chr3 (373-479)||(17463182-17463289)
chr3 (5-72)||(20698084-20698151)
chr3 (373-479)||(28848662-28848769)
chr3 (373-479)||(34159330-34159437)
chr3 (373-479)||(45606958-45607065)
chr3 (414-485)||(53301600-53301671)
chr3 (373-479)||(55476495-55476602)
chr3 (373-482)||(12567561-12567671)
chr3 (10-72)||(14179739-14179801)
chr3 (413-466)||(37251216-37251269)
chr3 (109-185)||(839533-839609)
chr3 (10-50)||(13209970-13210010)
chr3 (386-485)||(15412427-15412527)
chr3 (418-466)||(16097348-16097396)
chr3 (414-466)||(16103800-16103852)
chr3 (369-466)||(21618466-21618563)
chr3 (415-471)||(22110402-22110458)
chr3 (6-50)||(32308107-32308151)
chr3 (415-471)||(43925973-43926029)
chr3 (9-72)||(14973271-14973334)
chr3 (373-479)||(16454332-16454439)
chr3 (9-72)||(18438951-18439014)
chr3 (9-72)||(26687304-26687367)
chr3 (110-185)||(28350905-28350980)
chr3 (373-475)||(38961942-38962045)
chr3 (386-479)||(12119789-12119883)
chr3 (6-72)||(49389282-49389348)
chr3 (9-50)||(12340191-12340232)
chr3 (391-479)||(16282880-16282969)
chr3 (9-50)||(23083002-23083043)
chr3 (150-194)||(3389719-3389763)
chr3 (10-50)||(4588457-4588497)
chr3 (433-485)||(8499516-8499568)
chr3 (12-72)||(9513327-9513387)
chr3 (12-72)||(9521302-9521362)
chr3 (373-479)||(13151841-13151949)
chr3 (373-479)||(13154306-13154414)
chr3 (9-101)||(17247927-17248019)
chr3 (386-479)||(17737240-17737337)
chr3 (373-479)||(10247774-10247881)
chr3 (140-179)||(12340064-12340103)
chr3 (10-101)||(14572976-14573067)
chr3 (424-479)||(15977519-15977573)
chr3 (373-479)||(17446706-17446812)
chr3 (390-466)||(24340746-24340824)
chr3 (9-72)||(40213362-40213425)
chr3 (373-475)||(50242830-50242933)
chr3 (373-471)||(53070704-53070803)
chr3 (417-471)||(606378-606432)
chr3 (433-479)||(10556989-10557035)
chr3 (6-72)||(12171755-12171821)
chr3 (10-72)||(12933952-12934014)
chr3 (6-72)||(16104197-16104263)
chr3 (10-48)||(16809826-16809864)
chr3 (433-479)||(41123894-41123940)
chr3 (373-466)||(43550529-43550624)
chr3 (386-479)||(44494813-44494907)
chr3 (433-479)||(45577950-45577996)
chr3 (367-492)||(46822259-46822386)
chr3 (413-466)||(12377941-12377994)
chr3 (9-50)||(14576474-14576515)
chr3 (10-51)||(16797708-16797749)
chr3 (6-47)||(30030270-30030311)
chr3 (9-50)||(43842617-43842658)
chr3 (6-50)||(1644321-1644365)
chr3 (140-180)||(1644453-1644493)
chr3 (140-180)||(12852134-12852174)
chr3 (140-180)||(13210098-13210138)
chr3 (6-46)||(15471367-15471407)
chr3 (9-49)||(17247161-17247201)
chr3 (414-466)||(23274707-23274759)
chr3 (140-180)||(32307979-32308019)
chr3 (140-180)||(49667854-49667894)
chr3 (140-179)||(14665917-14665956)
chr3 (140-179)||(14669072-14669111)
chr3 (140-179)||(14735430-14735469)
chr3 (140-175)||(17248057-17248092)
chr3 (9-72)||(17499756-17499819)
chr3 (124-175)||(20698192-20698243)
chr3 (124-175)||(26687201-26687252)
chr3 (140-175)||(30030153-30030188)
chr3 (281-350)||(16796685-16796755)
chr3 (9-71)||(25476026-25476088)
chr3 (132-177)||(7986001-7986046)
chr3 (368-492)||(12511051-12511177)
chr3 (9-50)||(14666044-14666085)
chr3 (9-50)||(14669199-14669240)
chr3 (9-50)||(14735557-14735598)
chr3 (6-47)||(16097772-16097813)
chr3 (112-185)||(16333460-16333532)
chr3 (124-165)||(16809724-16809765)
chr3 (11-72)||(17488274-17488335)
chr3 (138-194)||(11165301-11165357)
chr3 (140-180)||(12934081-12934121)
chr3 (138-194)||(30066227-30066283)
[»] scaffold0029 (4 HSPs)
scaffold0029 (5-388)||(12857-13239)
scaffold0029 (132-193)||(61378-61439)
scaffold0029 (109-186)||(65271-65348)
scaffold0029 (373-492)||(11279-11399)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (6-351)||(36592-36938)
[»] scaffold0114 (4 HSPs)
scaffold0114 (1-479)||(7298-7775)
scaffold0114 (281-466)||(15378-15564)
scaffold0114 (10-72)||(15118-15180)
scaffold0114 (10-50)||(32918-32958)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (10-351)||(69930-70272)
scaffold0004 (10-195)||(10238-10413)
scaffold0004 (109-185)||(58161-58237)
[»] scaffold0042 (6 HSPs)
scaffold0042 (1-295)||(34544-34838)
scaffold0042 (1-223)||(41187-41409)
scaffold0042 (281-466)||(24214-24404)
scaffold0042 (10-194)||(64131-64305)
scaffold0042 (10-194)||(76015-76189)
scaffold0042 (9-72)||(23943-24006)
[»] scaffold0043 (2 HSPs)
scaffold0043 (10-295)||(18431-18716)
scaffold0043 (15-193)||(76830-76998)
[»] chr6 (162 HSPs)
chr6 (10-295)||(19863171-19863456)
chr6 (5-351)||(25641821-25642168)
chr6 (1-295)||(21739656-21739950)
chr6 (5-295)||(22432443-22432733)
chr6 (5-338)||(22438951-22439283)
chr6 (1-296)||(16523037-16523332)
chr6 (1-295)||(21834524-21834818)
chr6 (5-413)||(15041188-15041596)
chr6 (9-195)||(18180780-18180966)
chr6 (1-295)||(18907299-18907594)
chr6 (281-465)||(22831524-22831710)
chr6 (280-466)||(11185525-11185711)
chr6 (281-463)||(16920546-16920728)
chr6 (125-295)||(19873313-19873483)
chr6 (20-201)||(22059396-22059577)
chr6 (11-175)||(22405709-22405873)
chr6 (314-479)||(35245593-35245758)
chr6 (14-264)||(16924526-16924776)
chr6 (10-195)||(17804474-17804649)
chr6 (10-195)||(22429684-22429859)
chr6 (14-234)||(16964957-16965177)
chr6 (123-295)||(22334647-22334819)
chr6 (281-466)||(20360873-20361061)
chr6 (10-194)||(12496586-12496760)
chr6 (5-193)||(27567258-27567436)
chr6 (14-190)||(19790437-19790603)
chr6 (14-194)||(20907639-20907809)
chr6 (14-194)||(23657078-23657248)
chr6 (10-194)||(5616468-5616642)
chr6 (10-194)||(12706966-12707140)
chr6 (14-194)||(27553265-27553435)
chr6 (281-479)||(20638196-20638397)
chr6 (14-234)||(16929242-16929457)
chr6 (9-195)||(27415595-27415771)
chr6 (10-194)||(16741484-16741659)
chr6 (10-195)||(25766822-25766997)
chr6 (10-194)||(1644983-1645157)
chr6 (10-194)||(19663046-19663220)
chr6 (10-190)||(22592458-22592628)
chr6 (10-193)||(1587385-1587558)
chr6 (281-479)||(29060547-29060748)
chr6 (123-295)||(15894185-15894357)
chr6 (109-264)||(31164589-31164744)
chr6 (10-193)||(9481947-9482120)
chr6 (281-479)||(20593780-20593981)
chr6 (10-194)||(18955417-18955591)
chr6 (16-295)||(22863123-22863392)
chr6 (16-193)||(8244140-8244307)
chr6 (16-193)||(11567142-11567309)
chr6 (281-479)||(19303454-19303654)
chr6 (16-193)||(23395348-23395515)
chr6 (281-488)||(18409740-18409950)
chr6 (110-194)||(14472548-14472632)
chr6 (367-466)||(16496264-16496365)
chr6 (111-191)||(21702568-21702648)
chr6 (281-479)||(25629268-25629469)
chr6 (119-190)||(20803306-20803377)
chr6 (16-193)||(12618504-12618671)
chr6 (16-193)||(23990200-23990367)
chr6 (285-479)||(17287713-17287910)
chr6 (111-186)||(25135417-25135492)
chr6 (132-193)||(19870870-19870931)
chr6 (367-479)||(20076707-20076817)
chr6 (414-479)||(27333267-27333332)
chr6 (414-479)||(27394007-27394072)
chr6 (109-193)||(18917009-18917093)
chr6 (386-485)||(25656627-25656727)
chr6 (373-492)||(30676761-30676881)
chr6 (9-101)||(18821471-18821563)
chr6 (281-479)||(22780140-22780341)
chr6 (373-492)||(34963364-34963484)
chr6 (373-479)||(22782231-22782338)
chr6 (6-72)||(20637932-20637998)
chr6 (369-466)||(25644340-25644440)
chr6 (414-466)||(9098563-9098615)
chr6 (9-101)||(18409468-18409560)
chr6 (369-466)||(20109158-20109257)
chr6 (9-180)||(28496114-28496284)
chr6 (10-101)||(1561691-1561782)
chr6 (373-479)||(1595553-1595660)
chr6 (373-479)||(12742321-12742428)
chr6 (10-73)||(16920286-16920349)
chr6 (373-479)||(18334643-18334750)
chr6 (373-479)||(19005050-19005157)
chr6 (373-479)||(19858970-19859077)
chr6 (373-479)||(24422551-24422658)
chr6 (373-479)||(25754813-25754920)
chr6 (373-479)||(33861798-33861905)
chr6 (373-479)||(33864282-33864389)
chr6 (10-146)||(2684995-2685121)
chr6 (9-101)||(18457102-18457194)
chr6 (414-466)||(19652215-19652267)
chr6 (414-466)||(28496520-28496572)
chr6 (9-101)||(29808524-29808616)
chr6 (414-466)||(29808931-29808983)
chr6 (373-479)||(2291231-2291338)
chr6 (373-479)||(8055033-8055140)
chr6 (9-72)||(17287437-17287500)
chr6 (9-72)||(19303182-19303245)
chr6 (9-72)||(22779868-22779931)
chr6 (9-72)||(25611364-25611427)
chr6 (388-478)||(25688507-25688598)
chr6 (134-185)||(25928584-25928635)
chr6 (373-479)||(26924691-26924798)
chr6 (386-479)||(16448591-16448685)
chr6 (368-433)||(27415942-27416008)
chr6 (373-463)||(4185827-4185919)
chr6 (421-466)||(19668391-19668436)
chr6 (10-47)||(22831933-22831970)
chr6 (369-471)||(23019421-23019525)
chr6 (10-50)||(15894072-15894112)
chr6 (124-176)||(18821575-18821627)
chr6 (6-50)||(22334520-22334564)
chr6 (126-249)||(25611481-25611604)
chr6 (373-479)||(1540962-1541069)
chr6 (373-471)||(18456731-18456830)
chr6 (373-471)||(18461891-18461990)
chr6 (373-479)||(20556943-20557050)
chr6 (140-179)||(21939695-21939734)
chr6 (415-466)||(23076750-23076801)
chr6 (424-479)||(25714424-25714478)
chr6 (110-185)||(34369717-34369792)
chr6 (415-466)||(35008168-35008219)
chr6 (6-72)||(19652612-19652678)
chr6 (1-50)||(4667846-4667895)
chr6 (1-50)||(4674693-4674742)
chr6 (10-51)||(20803206-20803247)
chr6 (10-51)||(21702698-21702739)
chr6 (9-50)||(21939822-21939863)
chr6 (9-50)||(29060979-29061020)
chr6 (5-42)||(29096142-29096179)
chr6 (1-50)||(31155031-31155080)
chr6 (439-479)||(22080799-22080839)
chr6 (109-185)||(22331727-22331803)
chr6 (126-225)||(25603143-25603242)
chr6 (6-50)||(25644761-25644805)
chr6 (7-47)||(27332923-27332963)
chr6 (7-47)||(27393663-27393703)
chr6 (140-180)||(29808655-29808695)
chr6 (413-465)||(33443068-33443119)
chr6 (424-479)||(3852121-3852175)
chr6 (1-48)||(4185456-4185503)
chr6 (11-50)||(11185930-11185969)
chr6 (138-185)||(16372146-16372193)
chr6 (424-471)||(18821904-18821950)
chr6 (433-492)||(19848063-19848122)
chr6 (124-175)||(20360716-20360767)
chr6 (137-176)||(31155166-31155205)
chr6 (10-72)||(20360613-20360675)
chr6 (137-175)||(25629123-25629161)
chr6 (138-184)||(34298395-34298441)
chr6 (373-463)||(4186390-4186482)
chr6 (1-50)||(4189395-4189444)
chr6 (9-50)||(20594212-20594253)
chr6 (10-51)||(25135326-25135367)
chr6 (414-466)||(1561323-1561375)
chr6 (140-176)||(4185594-4185630)
chr6 (140-176)||(4667984-4668020)
chr6 (109-185)||(19808814-19808890)
chr6 (140-176)||(22080508-22080544)
chr6 (22-50)||(23019846-23019874)
chr6 (6-50)||(25956259-25956303)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (1-245)||(15642-15886)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (1-295)||(6712-7006)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (5-351)||(20117-20464)
scaffold0139 (413-463)||(38339-38389)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (5-295)||(6294-6584)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (1-295)||(1681-1975)
[»] scaffold0261 (4 HSPs)
scaffold0261 (6-276)||(1550-1820)
scaffold0261 (410-479)||(15668-15737)
scaffold0261 (5-72)||(16075-16142)
scaffold0261 (140-176)||(15973-16009)
[»] scaffold0101 (2 HSPs)
scaffold0101 (1-295)||(8591-8885)
scaffold0101 (433-479)||(1393-1439)
[»] scaffold0080 (4 HSPs)
scaffold0080 (1-295)||(18290-18584)
scaffold0080 (9-72)||(40328-40391)
scaffold0080 (281-479)||(39920-40120)
scaffold0080 (369-471)||(19885-19991)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (5-295)||(46365-46655)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (10-295)||(14863-15147)
scaffold0081 (10-295)||(23878-24162)
scaffold0081 (10-295)||(39302-39586)
[»] scaffold0031 (5 HSPs)
scaffold0031 (5-276)||(65431-65702)
scaffold0031 (10-195)||(53842-54017)
scaffold0031 (373-471)||(20430-20528)
scaffold0031 (11-61)||(20069-20119)
scaffold0031 (367-411)||(128827-128871)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (1-295)||(6050-6344)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (1-295)||(18087-18381)
[»] scaffold0023 (11 HSPs)
scaffold0023 (1-295)||(23301-23594)
scaffold0023 (1-295)||(38134-38407)
scaffold0023 (369-466)||(100394-100493)
scaffold0023 (414-466)||(119895-119947)
scaffold0023 (373-481)||(17491-17600)
scaffold0023 (369-479)||(44458-44570)
scaffold0023 (373-479)||(94415-94522)
scaffold0023 (414-466)||(101519-101571)
scaffold0023 (415-466)||(40224-40275)
scaffold0023 (7-50)||(39648-39691)
scaffold0023 (6-72)||(101811-101877)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (1-348)||(15983-16330)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (5-271)||(1722-1988)
[»] scaffold0102 (4 HSPs)
scaffold0102 (9-295)||(48102-48388)
scaffold0102 (414-466)||(19284-19336)
scaffold0102 (5-72)||(19683-19750)
scaffold0102 (140-174)||(19582-19616)
[»] scaffold0056 (5 HSPs)
scaffold0056 (5-295)||(13715-14005)
scaffold0056 (281-488)||(17128-17340)
scaffold0056 (5-72)||(78999-79066)
scaffold0056 (10-101)||(16857-16948)
scaffold0056 (424-471)||(79388-79434)
[»] scaffold1296 (1 HSPs)
scaffold1296 (1-294)||(582-875)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (2-291)||(4622-4911)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (4-295)||(3030-3321)
scaffold0158 (10-295)||(6696-6981)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (1-295)||(1084-1378)
[»] scaffold0351 (2 HSPs)
scaffold0351 (281-479)||(16289-16487)
scaffold0351 (10-72)||(16685-16747)
[»] scaffold0106 (4 HSPs)
scaffold0106 (281-479)||(1296-1494)
scaffold0106 (281-479)||(7273-7471)
scaffold0106 (417-479)||(15291-15352)
scaffold0106 (10-50)||(16086-16126)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (1-295)||(348-642)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (1-295)||(4567-4861)
[»] scaffold0149 (3 HSPs)
scaffold0149 (38-295)||(3933-4189)
scaffold0149 (38-295)||(8364-8620)
scaffold0149 (388-466)||(29949-30028)
[»] scaffold0476 (3 HSPs)
scaffold0476 (1-196)||(5872-6067)
scaffold0476 (1-196)||(7067-7262)
scaffold0476 (370-466)||(12786-12884)
[»] scaffold0297 (2 HSPs)
scaffold0297 (1-295)||(15313-15597)
scaffold0297 (1-99)||(10455-10553)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (281-466)||(51602-51787)
[»] scaffold0111 (2 HSPs)
scaffold0111 (19-295)||(32626-32901)
scaffold0111 (111-193)||(8778-8860)
[»] scaffold0761 (2 HSPs)
scaffold0761 (9-244)||(5951-6186)
scaffold0761 (388-479)||(4301-4393)
[»] scaffold0008 (4 HSPs)
scaffold0008 (6-195)||(30384-30573)
scaffold0008 (111-191)||(2157-2237)
scaffold0008 (415-466)||(14747-14798)
scaffold0008 (10-51)||(2287-2328)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (1-195)||(16755-16949)
[»] scaffold0037 (4 HSPs)
scaffold0037 (1-295)||(21203-21497)
scaffold0037 (369-466)||(22672-22771)
scaffold0037 (373-479)||(82076-82183)
scaffold0037 (140-177)||(80102-80139)
[»] scaffold0598 (2 HSPs)
scaffold0598 (281-479)||(965-1163)
scaffold0598 (10-72)||(705-767)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (12-276)||(2036-2300)
scaffold0104 (12-276)||(9718-9982)
[»] scaffold0718 (2 HSPs)
scaffold0718 (281-479)||(5044-5242)
scaffold0718 (10-72)||(4784-4846)
[»] scaffold0198 (2 HSPs)
scaffold0198 (6-181)||(26706-26881)
scaffold0198 (236-336)||(23995-24094)
[»] scaffold1895 (1 HSPs)
scaffold1895 (5-295)||(886-1155)
[»] scaffold0064 (3 HSPs)
scaffold0064 (281-479)||(47002-47200)
scaffold0064 (5-113)||(64301-64409)
scaffold0064 (12-72)||(47392-47452)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (281-466)||(10339-10524)
scaffold0456 (10-72)||(10079-10141)
[»] scaffold0427 (3 HSPs)
scaffold0427 (281-466)||(13517-13703)
scaffold0427 (10-101)||(13872-13963)
scaffold0427 (140-176)||(13808-13844)
[»] scaffold0017 (5 HSPs)
scaffold0017 (1-188)||(190915-191102)
scaffold0017 (1-195)||(192618-192812)
scaffold0017 (10-193)||(56376-56549)
scaffold0017 (14-99)||(14971-15056)
scaffold0017 (14-99)||(19493-19578)
[»] scaffold0113 (3 HSPs)
scaffold0113 (281-466)||(32087-32272)
scaffold0113 (10-50)||(32492-32532)
scaffold0113 (124-175)||(32378-32429)
[»] scaffold0079 (2 HSPs)
scaffold0079 (5-145)||(44391-44531)
scaffold0079 (168-294)||(44269-44395)
[»] scaffold0327 (2 HSPs)
scaffold0327 (3-196)||(566-749)
scaffold0327 (298-411)||(3460-3574)
[»] scaffold0358 (6 HSPs)
scaffold0358 (281-466)||(4732-4919)
scaffold0358 (281-411)||(13-143)
scaffold0358 (6-72)||(342-408)
scaffold0358 (6-72)||(5118-5184)
scaffold0358 (124-172)||(253-301)
scaffold0358 (124-172)||(5029-5077)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (9-195)||(18944-19120)
[»] scaffold1326 (1 HSPs)
scaffold1326 (1-201)||(1134-1324)
[»] scaffold0228 (7 HSPs)
scaffold0228 (10-195)||(18286-18461)
scaffold0228 (281-466)||(4528-4715)
scaffold0228 (281-466)||(12110-12297)
scaffold0228 (281-466)||(22062-22249)
scaffold0228 (9-101)||(4896-4988)
scaffold0228 (9-101)||(12478-12570)
scaffold0228 (9-101)||(22430-22522)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (5-194)||(35159-35338)
[»] scaffold0020 (3 HSPs)
scaffold0020 (7-164)||(178974-179131)
scaffold0020 (414-479)||(15826-15891)
scaffold0020 (6-50)||(15468-15512)
[»] scaffold0555 (4 HSPs)
scaffold0555 (123-295)||(773-945)
scaffold0555 (369-466)||(10543-10642)
scaffold0555 (6-72)||(10206-10272)
scaffold0555 (10-48)||(1020-1058)
[»] scaffold0346 (2 HSPs)
scaffold0346 (76-195)||(15374-15493)
scaffold0346 (5-46)||(17361-17402)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (6-195)||(608-787)
[»] scaffold0109 (5 HSPs)
scaffold0109 (6-195)||(45395-45574)
scaffold0109 (10-193)||(10956-11129)
scaffold0109 (111-194)||(7222-7305)
scaffold0109 (10-193)||(38473-38646)
scaffold0109 (10-51)||(7463-7504)
[»] scaffold0036 (2 HSPs)
scaffold0036 (10-195)||(66069-66244)
scaffold0036 (10-153)||(71210-71343)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (9-195)||(15071-15247)
scaffold0107 (368-433)||(15417-15483)
[»] scaffold1220 (1 HSPs)
scaffold1220 (6-195)||(2079-2257)
[»] scaffold0439 (2 HSPs)
scaffold0439 (5-194)||(2084-2263)
scaffold0439 (5-194)||(9944-10123)
[»] scaffold0044 (5 HSPs)
scaffold0044 (10-195)||(19465-19640)
scaffold0044 (10-195)||(13181-13356)
scaffold0044 (132-191)||(62541-62600)
scaffold0044 (373-479)||(40404-40511)
scaffold0044 (10-51)||(62671-62712)
[»] scaffold0193 (4 HSPs)
scaffold0193 (281-479)||(13218-13419)
scaffold0193 (111-191)||(9701-9781)
scaffold0193 (9-72)||(13617-13680)
scaffold0193 (10-51)||(9831-9872)
[»] scaffold0403 (2 HSPs)
scaffold0403 (281-466)||(4869-5057)
scaffold0403 (5-72)||(5254-5321)
[»] scaffold0001 (6 HSPs)
scaffold0001 (10-195)||(173567-173742)
scaffold0001 (5-194)||(422179-422359)
scaffold0001 (414-466)||(160704-160756)
scaffold0001 (386-479)||(85644-85738)
scaffold0001 (373-482)||(501085-501195)
scaffold0001 (6-72)||(161102-161168)
[»] scaffold0120 (6 HSPs)
scaffold0120 (10-194)||(19671-19845)
scaffold0120 (311-479)||(32901-33070)
scaffold0120 (311-479)||(45935-46104)
scaffold0120 (304-479)||(16120-16298)
scaffold0120 (9-72)||(32600-32663)
scaffold0120 (9-72)||(46342-46405)
[»] scaffold0070 (3 HSPs)
scaffold0070 (10-194)||(10181-10355)
scaffold0070 (304-465)||(4545-4709)
scaffold0070 (15-65)||(4947-4997)
[»] scaffold0010 (6 HSPs)
scaffold0010 (10-194)||(23494-23668)
scaffold0010 (109-185)||(242344-242420)
scaffold0010 (369-466)||(129925-130024)
scaffold0010 (410-471)||(60761-60822)
scaffold0010 (140-176)||(130221-130257)
scaffold0010 (6-50)||(130346-130390)
[»] scaffold1842 (3 HSPs)
scaffold1842 (268-466)||(949-1149)
scaffold1842 (6-72)||(698-764)
scaffold1842 (124-175)||(805-856)
[»] scaffold0011 (6 HSPs)
scaffold0011 (268-466)||(167879-168079)
scaffold0011 (281-479)||(51920-52121)
scaffold0011 (6-72)||(167628-167694)
scaffold0011 (9-72)||(52329-52392)
scaffold0011 (124-175)||(52226-52277)
scaffold0011 (124-175)||(167735-167786)
[»] scaffold1461 (1 HSPs)
scaffold1461 (10-194)||(207-381)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (14-194)||(3882-4052)
scaffold0184 (414-479)||(1118-1183)
[»] scaffold0003 (10 HSPs)
scaffold0003 (10-194)||(139988-140162)
scaffold0003 (16-195)||(96883-97052)
scaffold0003 (9-195)||(71590-71766)
scaffold0003 (281-466)||(339863-340048)
scaffold0003 (119-190)||(413803-413874)
scaffold0003 (373-479)||(158501-158608)
scaffold0003 (368-433)||(71353-71419)
scaffold0003 (9-50)||(339592-339633)
scaffold0003 (123-175)||(339705-339757)
scaffold0003 (38-86)||(413732-413780)
[»] scaffold0292 (5 HSPs)
scaffold0292 (281-479)||(3477-3678)
scaffold0292 (288-466)||(363-543)
scaffold0292 (9-99)||(732-822)
scaffold0292 (124-175)||(3784-3835)
scaffold0292 (9-72)||(3887-3950)
[»] scaffold0016 (4 HSPs)
scaffold0016 (281-479)||(1858-2059)
scaffold0016 (9-72)||(2268-2331)
scaffold0016 (10-50)||(207161-207201)
scaffold0016 (140-179)||(207289-207328)
[»] scaffold1552 (1 HSPs)
scaffold1552 (10-190)||(635-805)
[»] scaffold0490 (2 HSPs)
scaffold0490 (281-479)||(1959-2160)
scaffold0490 (10-50)||(2380-2420)
[»] scaffold0647 (2 HSPs)
scaffold0647 (286-479)||(6039-6238)
scaffold0647 (10-72)||(5763-5825)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (10-195)||(3184-3359)
[»] scaffold0013 (2 HSPs)
scaffold0013 (10-195)||(2327-2502)
scaffold0013 (110-185)||(9627-9702)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (10-194)||(24622-24796)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (10-193)||(18633-18806)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (111-195)||(228118-228202)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (285-479)||(3068-3264)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (5-194)||(6919-7098)
[»] scaffold0145 (5 HSPs)
scaffold0145 (281-479)||(32949-33149)
scaffold0145 (281-479)||(38768-38968)
scaffold0145 (388-479)||(9753-9845)
scaffold0145 (6-101)||(39147-39242)
scaffold0145 (126-175)||(39075-39124)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (9-194)||(36583-36758)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (285-488)||(3103-3309)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (281-466)||(39497-39684)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (281-466)||(75128-75315)
[»] scaffold0231 (2 HSPs)
scaffold0231 (273-479)||(22890-23098)
scaffold0231 (6-72)||(23299-23365)
[»] scaffold0122 (4 HSPs)
scaffold0122 (281-479)||(25978-26179)
scaffold0122 (369-479)||(44709-44821)
scaffold0122 (10-72)||(25707-25769)
scaffold0122 (9-50)||(33135-33176)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (109-194)||(11658-11743)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (14-194)||(191974-192144)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (119-195)||(13240-13316)
[»] scaffold0130 (3 HSPs)
scaffold0130 (111-194)||(5745-5828)
scaffold0130 (285-407)||(27911-28034)
scaffold0130 (9-102)||(28923-29016)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (111-193)||(9613-9695)
[»] scaffold0217 (3 HSPs)
scaffold0217 (284-479)||(16516-16714)
scaffold0217 (9-101)||(16240-16332)
scaffold0217 (140-175)||(16371-16406)
[»] scaffold0088 (2 HSPs)
scaffold0088 (268-466)||(20930-21132)
scaffold0088 (5-71)||(21308-21374)
[»] scaffold0309 (2 HSPs)
scaffold0309 (273-426)||(6669-6826)
scaffold0309 (10-50)||(7038-7078)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (10-186)||(18014-18180)
[»] scaffold0121 (2 HSPs)
scaffold0121 (281-479)||(8446-8643)
scaffold0121 (9-72)||(8174-8236)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (369-471)||(1047-1151)
[»] scaffold0026 (6 HSPs)
scaffold0026 (281-466)||(25916-26103)
scaffold0026 (281-479)||(39865-40065)
scaffold0026 (9-101)||(39572-39664)
scaffold0026 (9-72)||(40273-40336)
scaffold0026 (140-176)||(59273-59309)
scaffold0026 (137-173)||(40173-40209)
[»] scaffold0621 (3 HSPs)
scaffold0621 (369-466)||(8486-8585)
scaffold0621 (414-466)||(6555-6607)
scaffold0621 (6-50)||(6976-7019)
[»] scaffold0546 (3 HSPs)
scaffold0546 (10-193)||(2178-2351)
scaffold0546 (111-194)||(6002-6085)
scaffold0546 (10-51)||(5803-5844)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (109-193)||(4844-4928)
[»] scaffold1048 (1 HSPs)
scaffold1048 (14-101)||(1798-1885)
[»] scaffold0637 (1 HSPs)
scaffold0637 (111-194)||(8849-8932)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (6-77)||(36030-36101)
[»] scaffold0046 (5 HSPs)
scaffold0046 (366-479)||(28421-28536)
scaffold0046 (414-466)||(11312-11364)
scaffold0046 (414-466)||(2017-2069)
scaffold0046 (5-50)||(14916-14961)
scaffold0046 (430-466)||(4572-4608)
[»] scaffold0028 (10 HSPs)
scaffold0028 (16-193)||(58378-58545)
scaffold0028 (373-479)||(136684-136791)
scaffold0028 (373-479)||(139153-139260)
scaffold0028 (373-479)||(144091-144198)
scaffold0028 (414-462)||(62222-62270)
scaffold0028 (373-479)||(134215-134322)
scaffold0028 (373-479)||(141622-141729)
scaffold0028 (422-472)||(132672-132722)
scaffold0028 (6-72)||(133070-133136)
scaffold0028 (140-180)||(132963-133003)
[»] scaffold0371 (1 HSPs)
scaffold0371 (10-191)||(15618-15795)
[»] scaffold0628 (3 HSPs)
scaffold0628 (369-472)||(2808-2913)
scaffold0628 (7-72)||(2442-2507)
scaffold0628 (140-180)||(2573-2613)
[»] scaffold0175 (7 HSPs)
scaffold0175 (268-436)||(13141-13313)
scaffold0175 (409-466)||(34143-34200)
scaffold0175 (10-72)||(34537-34599)
scaffold0175 (9-50)||(13531-13572)
scaffold0175 (124-175)||(13406-13457)
scaffold0175 (140-174)||(34437-34471)
scaffold0175 (433-466)||(293-326)
[»] scaffold0413 (2 HSPs)
scaffold0413 (369-471)||(12583-12687)
scaffold0413 (9-72)||(15256-15319)
[»] scaffold0333 (4 HSPs)
scaffold0333 (414-479)||(6618-6683)
scaffold0333 (414-479)||(13998-14063)
scaffold0333 (6-50)||(7052-7096)
scaffold0333 (6-50)||(14432-14476)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (414-479)||(6172-6237)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (371-462)||(11447-11540)
scaffold0235 (14-72)||(11170-11228)
[»] scaffold0138 (3 HSPs)
scaffold0138 (109-185)||(29950-30026)
scaffold0138 (370-466)||(12959-13057)
scaffold0138 (6-50)||(13379-13423)
[»] scaffold0034 (5 HSPs)
scaffold0034 (111-191)||(16408-16488)
scaffold0034 (9-101)||(51525-51617)
scaffold0034 (414-466)||(32556-32608)
scaffold0034 (10-51)||(16317-16358)
scaffold0034 (417-466)||(51936-51984)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (414-477)||(1091-1154)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (373-483)||(10773-10884)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (369-485)||(38704-38822)
[»] scaffold0639 (2 HSPs)
scaffold0639 (282-479)||(8486-8682)
scaffold0639 (9-50)||(8914-8955)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (414-472)||(6826-6884)
scaffold0556 (6-72)||(7228-7294)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (6-72)||(13246-13312)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (414-479)||(1083-1148)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (369-471)||(13143-13247)
scaffold0357 (415-471)||(2676-2732)
scaffold0357 (414-466)||(16149-16201)
[»] scaffold0075 (3 HSPs)
scaffold0075 (369-471)||(53551-53655)
scaffold0075 (9-50)||(7935-7976)
scaffold0075 (140-179)||(8064-8103)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (369-479)||(116434-116544)
scaffold0022 (415-471)||(129021-129076)
scaffold0022 (417-463)||(78345-78391)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (373-492)||(12300-12420)
[»] scaffold0278 (2 HSPs)
scaffold0278 (414-466)||(5663-5715)
scaffold0278 (6-50)||(6032-6076)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (410-466)||(8119-8175)
scaffold0218 (5-72)||(28917-28984)
[»] scaffold0207 (2 HSPs)
scaffold0207 (414-466)||(2694-2746)
scaffold0207 (6-72)||(2282-2348)
[»] scaffold0142 (4 HSPs)
scaffold0142 (9-101)||(17168-17260)
scaffold0142 (373-479)||(16788-16895)
scaffold0142 (140-180)||(7541-7581)
scaffold0142 (140-175)||(17095-17130)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (414-466)||(23932-23984)
scaffold0100 (9-72)||(20529-20592)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (9-72)||(2726-2789)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (373-479)||(13396-13503)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (10-101)||(12114-12205)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (110-185)||(10464-10539)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (373-479)||(20751-20858)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (110-185)||(14284-14359)
[»] scaffold0161 (2 HSPs)
scaffold0161 (5-72)||(2082-2149)
scaffold0161 (140-176)||(2215-2251)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (373-479)||(37825-37932)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (373-485)||(4692-4805)
[»] scaffold0484 (2 HSPs)
scaffold0484 (1-50)||(1342-1391)
scaffold0484 (281-350)||(1052-1122)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (413-466)||(25126-25179)
[»] scaffold1984 (2 HSPs)
scaffold1984 (414-466)||(149-201)
scaffold1984 (140-175)||(445-480)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (10-50)||(10914-10954)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (413-484)||(6332-6401)
scaffold0420 (420-484)||(13793-13855)
[»] scaffold0125 (3 HSPs)
scaffold0125 (414-466)||(45841-45893)
scaffold0125 (5-72)||(45426-45493)
scaffold0125 (140-176)||(45561-45597)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (9-53)||(10594-10638)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (369-466)||(10547-10646)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (10-101)||(9346-9437)
[»] scaffold0395 (3 HSPs)
scaffold0395 (9-72)||(603-666)
scaffold0395 (286-426)||(881-1021)
scaffold0395 (419-479)||(4888-4947)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (424-483)||(9242-9300)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (9-72)||(17649-17712)
[»] scaffold0305 (2 HSPs)
scaffold0305 (9-72)||(20820-20883)
scaffold0305 (124-176)||(20716-20768)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (373-479)||(13951-14058)
[»] scaffold0192 (2 HSPs)
scaffold0192 (9-64)||(10335-10390)
scaffold0192 (140-180)||(10221-10261)
[»] scaffold0150 (3 HSPs)
scaffold0150 (5-72)||(32500-32567)
scaffold0150 (422-472)||(32112-32162)
scaffold0150 (140-180)||(32393-32433)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (417-471)||(565-619)
[»] scaffold0810 (1 HSPs)
scaffold0810 (6-72)||(3349-3415)
[»] scaffold0211 (3 HSPs)
scaffold0211 (10-72)||(28451-28513)
scaffold0211 (414-466)||(28818-28871)
scaffold0211 (140-180)||(28580-28620)
[»] scaffold0165 (7 HSPs)
scaffold0165 (1-50)||(3909-3958)
scaffold0165 (1-50)||(7973-8022)
scaffold0165 (369-466)||(27751-27850)
scaffold0165 (124-175)||(3795-3846)
scaffold0165 (124-175)||(7859-7910)
scaffold0165 (281-322)||(3648-3689)
scaffold0165 (281-322)||(7712-7753)
[»] scaffold0839 (2 HSPs)
scaffold0839 (1-101)||(1711-1810)
scaffold0839 (142-175)||(1850-1883)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (367-465)||(8059-8161)
[»] scaffold0503 (2 HSPs)
scaffold0503 (9-101)||(12316-12408)
scaffold0503 (424-471)||(11978-12024)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (140-180)||(24421-24461)
scaffold0124 (414-456)||(38305-38347)
scaffold0124 (10-50)||(24293-24333)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (140-179)||(340-379)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (9-72)||(18599-18662)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (386-479)||(4218-4312)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (414-456)||(11494-11536)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (413-471)||(2690-2748)
[»] scaffold2044 (1 HSPs)
scaffold2044 (9-46)||(1097-1134)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (10-79)||(6399-6468)
[»] scaffold0475 (2 HSPs)
scaffold0475 (1-50)||(9515-9564)
scaffold0475 (140-176)||(9390-9426)
[»] scaffold0221 (2 HSPs)
scaffold0221 (9-50)||(12450-12491)
scaffold0221 (140-179)||(12579-12618)
[»] scaffold0166 (2 HSPs)
scaffold0166 (9-50)||(9475-9516)
scaffold0166 (140-179)||(9604-9643)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (415-471)||(97020-97076)
scaffold0006 (415-471)||(106298-106354)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (424-479)||(110-164)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (9-72)||(321-384)
[»] scaffold0247 (1 HSPs)
scaffold0247 (390-466)||(18050-18128)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (9-48)||(10585-10624)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (135-185)||(36994-37044)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (373-479)||(12068-12169)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (132-181)||(24741-24790)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (413-466)||(103679-103732)
[»] scaffold1137 (2 HSPs)
scaffold1137 (10-46)||(1943-1979)
scaffold1137 (140-180)||(2072-2112)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (138-194)||(3648-3704)
[»] scaffold0451 (1 HSPs)
scaffold0451 (10-38)||(11454-11482)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (369-479)||(161136-161248)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 362; Significance: 0; HSPs: 150)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 479
Target Start/End: Original strand, 21389095 - 21389564
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21389095 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattatatgataacttagaatgagattgaacctggtttaactt 21389194  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgc 209  Q
    ||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21389195 agaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggtgagcagatgctctcgcttcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgc 21389294  T
Q  210 gatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttg 309  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21389295 gatctgtgtcgcatgatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagaccaatatatgaagttaattgtaatatgtgaagctgaataagatatgttg 21389394  T
Q  310 ttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21389395 ttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg 21389494  T
Q  410 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  21389495 ttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 21389564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 479
Target Start/End: Original strand, 21395630 - 21396094
Alignment:
Q  15 acttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaac 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  21395630 acttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattatatgataacttagaatgagattgaacctgggttaacttagaac 21395729  T
Q  115 aactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatct 214  Q
    |||  | ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21395730 aaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcaagcagatgctctcgcctcgcgagcacgtccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatct 21395829  T
Q  215 gtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgtt 314  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21395830 gtgtcgcatgatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttatt 21395929  T
Q  315 gattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgta 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21395930 gattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgttgta 21396029  T
Q  415 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  21396030 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 21396094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 479
Target Start/End: Original strand, 21790123 - 21790587
Alignment:
Q  15 acttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaac 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  21790123 acttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaagatgcttaataaagattatatgataacttagaatgagattgaacctgggttaacttagaac 21790222  T
Q  115 aactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatct 214  Q
    |||  | ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21790223 aaccattgttgggaatctggcttgtactcgccaaggcaagcagatgctctcgcctcgcgagcacgtccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatct 21790322  T
Q  215 gtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgtt 314  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21790323 gtgtcgcatgatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttatt 21790422  T
Q  315 gattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgta 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21790423 gattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgttgta 21790522  T
Q  415 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  21790523 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 21790587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 19899580 - 19899286
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19899580 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaatgattaaatgataacttagaatgagattgaacctg 19899481  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19899480 gtttagcttagaacaacattagttgggaatctggctagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 19899381  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    |||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  19899380 ggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatttaagaagttaactgcaatctgtgaagctg 19899286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 16185213 - 16184877
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16185213 attctgtatttttgacttttgagttgaaccatagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctg 16185114  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  16185113 gtttggcttagaacaactttagttgagaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagtta 16185014  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataa 300  Q
    |||   ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||| ||||  || |||||||||||||| |||     
T  16185013 ggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctg-atat 16184915  T
Q  301 gatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta 338  Q
    || |||||  |||||||||| | ||| | |||||||||    
T  16184914 gagatgttaatgttgattataatgtgatttaatgttta 16184877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Original strand, 17353571 - 17353865
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||  |||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||     
T  17353571 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtccctgaagatgcctattaaagattaaatgataactttgaacgagattgaaccta 17353670  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    ||||| | ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17353671 gtttaacctagaacagcttttgttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttgcagaactgagtgcaagtga 17353770  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    ||| | |||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17353771 ggatattgcgatttgtgtcgcataattcgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 17353865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Original strand, 20465673 - 20465967
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20465673 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgttaattaaagattagatgatgacttagaacgagattgaacctg 20465772  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20465773 gtttagcttagaacagctttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcggatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 20465872  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    | |    | | ||||||| || ||| || ||||| || |||||||| || | ||||| ||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||    
T  20465873 gaatgtcgtgttctgtgttgcttgaattgattagggacggacccttaggtagtaatgtgacctatataagaggttaactgcaatctgtgaagctg 20465967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Original strand, 21168355 - 21168649
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21168355 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagaagtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgataacttagaatgagattgaacctg 21168454  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  21168455 gtttagctttgaacaactttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcaagcacttcctgatctgagtgcaagtga 21168554  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    |||   |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||| | ||||   ||||||| |||||||||  || ||||||||||||||    
T  21168555 ggatgttgcgatctgtgtcgcatagtttgattagagatggacctttgggtagtaatataacctatacaagaagttaactgcaatctgtgaagctg 21168649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 24756206 - 24755912
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24756206 attctgtattttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatattaaataaagattagatgatgacttagagtgagattgaacctg 24756107  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24756106 gtttagcttagaacaactttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 24756007  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    | |   ||||| ||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| || ||||  || ||||||||||||||    
T  24756006 gaactttgcgacctgtgtcgcataacttgtttagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatataggatgttaactgcaatctgtgaagctg 24755912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Original strand, 15602651 - 15602945
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  15602651 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatttagaacaagattgaacctg 15602750  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  15602751 gtttagcttagaacaacttaagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaacttaatgcaagtta 15602850  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    | |   |||||||||| |||||| | || ||||| | |||||||||  | | ||||| ||||||| ||||| ||||  || ||||||||||||||    
T  15602851 gtatgttgcgatctgtttcgcataagttgattagggttggacccttaagtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctg 15602945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Original strand, 15611103 - 15611397
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  15611103 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatttagaacaagattgaacctg 15611202  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  15611203 gtttagcttagaacaacttaagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaacttaatgcaagtta 15611302  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    | |   |||||||||| |||||| | || ||||| | |||||||||  | | ||||| ||||||| ||||| ||||  || ||||||||||||||    
T  15611303 gtatgttgcgatctgtttcgcataagttgattagggttggacccttaagtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctg 15611397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 377763 - 377469
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  377763 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttgttaaagattaaattataacttagaatgagattgaacctg 377664  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  377663 gtttagcttagaataactttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgtctcgcgagcacttccagaactgagtgctaatga 377564  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    | |    | ||||||||| || ||| || ||||| ||||||||||| || | ||||| ||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||    
T  377563 gaatgtcgtgatctgtgttgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctg 377469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 23776467 - 23776816
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaacctt-agatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacct 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  23776467 attctgtatttttgacttttgagttgaacctttagatgtttttgagtgcctaaagatgattattaaagattaaatgataacttagaatgagattgaacct 23776566  T
Q  100 ggtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||      
T  23776567 ggtttagcttagaacaactttagttgggaatctggcttgtactcgctatcgcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactttcagaactgagtgcaagct 23776666  T
Q  200 aggaaaatgcg-atctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaat 298  Q
    |||| | |||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||| || | ||||| ||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||  |    
T  23776667 aggatattgcgaatctgtgtcgcataatttggttagagatggacacttaggtagtaatgtgacctatataagaagttaactgcaatttgtgaagctg-tt 23776765  T
Q  299 aagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattactt 348  Q
    | || |||||| |||||| ||||| ||  ||||||||| | ||||||||||    
T  23776766 atgaaatgttgatgttgaatatgatgttatataatgttatgtgcattactt 23776816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 19983569 - 19983284
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19983569 tttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaatgattaaatgataacttagaatgggattgaacctggtttagctt 19983470  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgc 209  Q
    |||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||   |||    
T  19983469 agaacaacattagttgggaatctgactagtactcgccatggtgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaaaactgagtgcaaatgaggatgttgc 19983370  T
Q  210 gatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||| | ||||| ||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  19983369 gatctgtgtcgcataatttgattagagatggaaccctgggtagtaatgtgacctatttaagaagttaactgcaatctgtgaagctg 19983284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 19976921 - 19976655
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19976921 tttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaatgattaaatgataacttagaatgggattgaacctggtttagctt 19976822  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgc 209  Q
    |||||||| |||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  19976821 agaacaacattagttgggaatctgactagtactcgcaatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatgttgc 19976722  T
Q  210 gatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagtta 276  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||| || | || | ||||| ||||||| ||||||||||    
T  19976721 gatctgtgtcgcataatttgattagagatggaaccctaggtagtaatgtgacctatttaagaagtta 19976655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 15 - 295
Target Start/End: Original strand, 17926355 - 17926635
Alignment:
Q  15 acttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaac 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  17926355 acttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatttagaacgagattgaacctggtttatcttagaac 17926454  T
Q  115 aactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatct 214  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | || |   ||||||||    
T  17926455 aacttaagttggaattatggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactcccagaactgaatgcaaattagtatgttgcgatct 17926554  T
Q  215 gtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    || |||||| | || ||||| | ||||||||| || | ||||| ||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  17926555 gtttcgcataaattgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaattgaaatctgtgaagctg 17926635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 291
Target Start/End: Original strand, 30642925 - 30643215
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  30642925 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgatgatttagaacgagattgaacctg 30643024  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  30643025 gtttagcttagaacaactttagttgaaaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctcttgcctcgcgagcacttccagaattgaatgcaagtta 30643124  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaa 291  Q
    |||   |||||||||| |||||  | || ||||| | ||||||||| || | ||||| ||||||| ||||| ||||  || ||||||||||    
T  30643125 ggatgttgcgatctgtttcgcacaaattgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgcaatctgtgaa 30643215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 6 - 271
Target Start/End: Original strand, 16409894 - 16410159
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggttta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16409894 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatttagaatgagattgaacctggttta 16409993  T
Q  106 gcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaa 205  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||| ||||| | ||||      
T  16409994 gcttagaataactttagttggaattctggcttgaactcgccatggcgagcagatgctctcgcttggcgagcaccttcagaactgaatgcaaattaggatg 16410093  T
Q  206 atgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataaga 271  Q
     ||||||||||||||||  | || ||||| | ||||||||| || | ||||| ||||||| |||||    
T  16410094 ttgcgatctgtgtcgcacaaattgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaaga 16410159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 286 - 479
Target Start/End: Original strand, 21778697 - 21778890
Alignment:
Q  286 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattga 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21778697 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattga 21778796  T
Q  386 atttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  21778797 atttgatataattatgtcatgctgttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 21778890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 22010313 - 22010513
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  22010313 attctgtatttttgactttttagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttaataaagattagatgatgatttagaacgagattgaacctg 22010412  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22010413 gtttagcttagaacaacttgagttggaaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaattga 22010512  T
Q  201 g 201  Q
    |    
T  22010513 g 22010513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 8 - 198
Target Start/End: Original strand, 19259243 - 19259432
Alignment:
Q  8 aattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagc 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19259243 aattttgacttttgagttgaaccttagatgcttt-gagtgcctaaagatgtttattaaagattaaatgatgacttagaatgagattaaacctggtttagc 19259341  T
Q  108 ttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagt 198  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19259342 ttagaacaaccttagttggaattctggcttgtattcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagt 19259432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 194
Target Start/End: Original strand, 20856067 - 20856252
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagct 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  20856067 attttgaattttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctttagatgtccattaaagattagatgatgatttaaaacaagattgaacctggtttagct 20856166  T
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20856167 tagaacaaccttagttgcaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 20856252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 281 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 31971463 - 31971277
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 380  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  31971463 taatctgtgaagatgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatga 31971364  T
Q  381 attgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||| | ||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31971363 attggaattgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 31971277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Original strand, 16199559 - 16199758
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 380  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||    
T  16199559 taatctgtgaagctgtataagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgtagatga 16199658  T
Q  381 attgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  16199659 attgaaattgatattattatgtcatgttgtttgaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 16199758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 195
Target Start/End: Original strand, 16860976 - 16861155
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggttta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||         
T  16860976 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaacaagattgaacctg----- 16861070  T
Q  106 gcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
         ||| |||  |  |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16861071 -----gaataaccatttttggaattcttgcttgtactcgccatggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 16861155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Original strand, 45130911 - 45131110
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 380  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||    
T  45130911 taatctgtgaagctgtataagatttgttgttgatgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatacctaagatgttgatga 45131010  T
Q  381 a-ttgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagat 478  Q
    | ||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||    
T  45131011 atttgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagat 45131109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 5 - 162
Target Start/End: Original strand, 16411907 - 16412064
Alignment:
Q  5 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggttt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |  ||| || ||||||||||| ||||    
T  16411907 tgtaattttgacttttgagttgaaccttaaatgtttttgagtgccttaagatgtgtattaaagattaaatgataatgtaggatcagattgaacctagttt 16412006  T
Q  105 agcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgct 162  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16412007 agcttagaacaaccttaggtggaattctggcttgaactcgccatggcgagcagatgct 16412064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 194
Target Start/End: Original strand, 39094599 - 39094769
Alignment:
Q  14 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |           ||    
T  39094599 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtgtattaaagattagaggatgacttagaacgagattgaacccg----------aaa 39094688  T
Q  114 caactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
    |||| |||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39094689 caaccttagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 39094769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 23834625 - 23834450
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| || ||  |||||||  |||| |||||||||||||||||||||            
T  23834625 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagagaatgatttagaatgagattgaacctgg-------- 23834534  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
      |||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23834533 --aacaaccttagttgagaatctggcttgtactcgcgatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 23834450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 283 - 466
Target Start/End: Original strand, 21918915 - 21919101
Alignment:
Q  283 atctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatg-tttgtatgcataagatgttgatgaa 381  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||   |||||||||| ||||    
T  21918915 atctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaattatttgaatatttaagatgttgttgaa 21919014  T
Q  382 ttgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21919015 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21919101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 24433891 - 24434065
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| || ||  ||||||   |||| ||||||  |||||||||||              
T  24433891 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagtgaatgatttagaacaagattgaacct---------- 24433980  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24433981 agaacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 24434065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 20536416 - 20536215
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||||||||| ||  |||||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||    
T  20536416 taatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 20536317  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaag 476  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||    
T  20536316 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtttctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 20536218  T
Q  477 atg 479  Q
    |||    
T  20536217 atg 20536215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 15532340 - 15532166
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |   || ||  ||||||   |||| |||||| ||||||||||||              
T  15532340 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtacctactattgattagtgaatgatttagaacgagattgaacct---------- 15532251  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15532250 agaacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatgccgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 15532166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 15538900 - 15538726
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |   || ||  ||||||   |||| ||||||  |||||||||||||            
T  15538900 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtacctactattgattagtgaatgatttagaacaagattgaacctgg-------- 15538809  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15538808 --aacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 15538726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18619930 - 18619756
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||  || ||  |||||||  |||| |||||| ||||||||||||              
T  18619930 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacct---------- 18619841  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18619840 agaacaaccttacttggaattctggcttgtactcgtcatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 18619756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 30308408 - 30308582
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||  || ||  |||||||  |||| |||||| ||||||||||||||            
T  30308408 ttttgatttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacctgg-------- 30308499  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
      |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30308500 --aacaaccttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagctaatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 30308582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Original strand, 18879150 - 18879345
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||| ||| ||||||||| |  |||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||    
T  18879150 taatctgtgaagctga-taagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 18879248  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    ||||| | ||||||| |||||||  || | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||    
T  18879249 aattgcaattgatattattatgt--tgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 18879345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 147 - 295
Target Start/End: Original strand, 21161838 - 21161986
Alignment:
Q  147 atggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggaccctt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||| ||    
T  21161838 atggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatgttgcgatctgtgtcgtatagtttgattagagatggaccttt 21161937  T
Q  247 gggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    ||| | ||||   ||||||| |||||||||  || ||||||||||||||    
T  21161938 gggtagtaatataacctatacaagaagttaactgcaatctgtgaagctg 21161986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 22029009 - 22028834
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||| || ||  |||||||  |||| ||||||  | |||||||||||            
T  22029009 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttaagtgtctactattgattagagaatgatttagaacaacattgaacctgg-------- 22028918  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
      |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22028917 --aacaaccttagttgggaatctggctagtactcgccatggcaagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 22028834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 281 - 488
Target Start/End: Original strand, 28648957 - 28649167
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||  |||  |||||   |||||||||| ||    
T  28648957 taatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtataattaagatgttgttg 28649056  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaag 476  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||    
T  28649057 acttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgct-tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 28649155  T
Q  477 atgttgaggatg 488  Q
    ||| ||| ||||    
T  28649156 atgatgatgatg 28649167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Original strand, 16231133 - 16231304
Alignment:
Q  14 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaa 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| || | || ||| || |||||||||||  |||| ||||||  |||||||||||||          ||    
T  16231133 gacttttgatttgaaccttagatgtctttgagtacccttaggtgtctactaaagattagagaatgatttagaacaagattgaacctgg----------aa 16231222  T
Q  114 caactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16231223 caaccttagttgagaatctggcttgtactcgccatggcgagaagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 16231304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 17828237 - 17828411
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  ||||||   |||| |||||| ||||||||||          ||    
T  17828237 ttttgagttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagtgaatgatttagaacgagattgaac----------tt 17828326  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
    |||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17828327 agaacatccttagttgttattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 17828411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Original strand, 22113382 - 22113555
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  |||||    |||| || ||||||||||||||||||            
T  22113382 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattaaggaatgatttggaatgagattgaacctgg-------- 22113473  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
      |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22113474 --aacaaccttagttgggaagctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 22113555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Original strand, 22134885 - 22135058
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  |||||    |||| || ||||||||||||||||||            
T  22134885 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattaaggaatgatttggaatgagattgaacctgg-------- 22134976  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
      |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22134977 --aacaaccttagttgggaagctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 22135058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 22626943 - 22626743
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| || |||| |||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||| ||  ||| ||   |||||||||| ||    
T  22626943 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatgttatacacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttg 22626844  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaaga 477  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||    
T  22626843 atttgtatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 22626745  T
Q  478 tg 479  Q
    ||    
T  22626744 tg 22626743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Original strand, 18818322 - 18818523
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   ||||||| || ||    
T  18818322 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttg 18818421  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaag 476  Q
    | ||  | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||    
T  18818422 acttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 18818520  T
Q  477 atg 479  Q
    |||    
T  18818521 atg 18818523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Original strand, 21161749 - 21161837
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatga 89  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21161749 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagaagtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgataacttagaatga 21161837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Original strand, 22166035 - 22166208
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  |||||    |||| || ||||||||||||||||||            
T  22166035 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattaaggaatgatttggaatgagattgaacctgg-------- 22166126  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
      |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  22166127 --aacaaccttagttgggaagctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcaagcacttccagaattgagtg 22166208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 111 - 193
Target Start/End: Original strand, 23846760 - 23846842
Alignment:
Q  111 gaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23846760 gaacaacctaagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 23846842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 298 - 479
Target Start/End: Original strand, 16092272 - 16092456
Alignment:
Q  298 taagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataa 396  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| ||  |||  |||||   | |||||||| ||| ||| ||||||||| |    
T  16092272 taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatta 16092371  T
Q  397 ttatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||    
T  16092372 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 16092456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 22045310 - 22045138
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  |||||||  |||| ||||||  ||| |||||||||            
T  22045310 ttttgacctttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaacaagaatgaacctgg-------- 22045219  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagt 192  Q
      |||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22045218 --aacaaccttagttgggaatctggcttgtacttgtcatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagacctgagt 22045138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 22875273 - 22875072
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaat-aagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgat 378  Q
    |||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  |||||   | |||||||| |    
T  22875273 taatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgtt 22875174  T
Q  379 gaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaag 476  Q
    || ||| ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||    
T  22875173 gacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctgtgttgctgct-gctatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaag 22875075  T
Q  477 atg 479  Q
    |||    
T  22875074 atg 22875072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 43252259 - 43252092
Alignment:
Q  16 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| || ||  || ||  |||||||  |||| |||||| ||||||||||||          ||||||    
T  43252259 cttttgagttgaaccttagattcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacct----------agaaca 43252170  T
Q  116 actttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
    || |||||||| |   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43252169 accttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 43252092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 7372978 - 7372785
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 380  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| |||||       ||||||||||||| ||  ||| ||   ||||||| || |||    
T  7372978 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataa-------gcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttga 7372886  T
Q  381 attgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaaga 477  Q
     ||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||    
T  7372885 cttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 7372787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 370 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 6520486 - 6520375
Alignment:
Q  370 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaa 467  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  6520486 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6520387  T
Q  468 atgattaagatg 479  Q
     |||||||||||    
T  6520386 ttgattaagatg 6520375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Original strand, 21923841 - 21924042
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |    |||| ||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   |||||||||| ||    
T  21923841 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgcaaaataaggttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttg 21923940  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaag 476  Q
    | ||| | ||||||| || |||||||| ||||   ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||    
T  21923941 acttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 21924039  T
Q  477 atg 479  Q
    |||    
T  21924040 atg 21924042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 191
Target Start/End: Original strand, 17055132 - 17055214
Alignment:
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgag 191  Q
    ||||||||| |||||||| |   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17055132 tagaacaaccttagttggaaagttggcttgtagtcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgag 17055214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 32599130 - 32598959
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |   || ||| ||||||   | || |  ||||||||||||||||||            
T  32599130 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtacctactaatgattagggaacgaatgggaatgagattgaacctgg-------- 32599039  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgag 191  Q
      |||||| |||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  32599038 --aacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgccttgcgagcacttccagaattgag 32598959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 32605662 - 32605491
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |   || ||| ||||||   | || |  ||||||||||||||||||            
T  32605662 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtacctactaatgattagggaacgaatgggaatgagattgaacctgg-------- 32605571  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgag 191  Q
      |||||| |||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  32605570 --aacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgccttgcgagcacttccagaattgag 32605491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 281 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 23648761 - 23648547
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||||| ||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||  |  ||| ||   |||||||||| ||    
T  23648761 taatctgttaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaagatgttgttg 23648662  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaag 476  Q
     |||| |  |||||| ||||||||||| ||||||   |  |||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||| || ||||||  ||||||||    
T  23648661 tattgcaaatgatattattatgtcatgttgttgttgtaatctgcctatgttgctatt-gttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaag 23648563  T
Q  477 atgttgaggatgatgt 492  Q
    ||||||| ||||||||    
T  23648562 atgttgatgatgatgt 23648547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 414 - 479
Target Start/End: Original strand, 38855300 - 38855365
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  38855300 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 38855365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 373 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 17141031 - 17140936
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||| ||  ||| ||||| ||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17141031 gttgatgatttacattcgatattattatgtcatgatggattgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 17140936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 20527812 - 20527736
Alignment:
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 185  Q
    ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20527812 tagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 20527736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 6759464 - 6759265
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaat-aagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgat 378  Q
    |||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || |||||| |||||  |||  |||||   | |||||||||     
T  6759464 taatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattaattgaattatgagtgtataattgagatgttgac 6759365  T
Q  379 gaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaa 475  Q
       ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||    
T  6759364 ---ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 6759269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Original strand, 21972244 - 21972411
Alignment:
Q  16 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  |||||||  |||| |||||| ||||||||||||          ||||||    
T  21972244 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacct----------agaaca 21972333  T
Q  116 actttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
    || |||||||  |   |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  21972334 accttagttgaaaagttggcctgtactcgccacggcgagcagatgctctcgccccgcgagcacttccagaattgagtg 21972411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 414 - 479
Target Start/End: Original strand, 5866323 - 5866388
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  5866323 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 5866388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 373 - 485
Target Start/End: Original strand, 14409495 - 14409608
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  14409495 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 14409592  T
Q  470 gattaagatgttgagg 485  Q
    |||||||||| |||||    
T  14409593 gattaagatgatgagg 14409608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 373 - 481
Target Start/End: Original strand, 16413367 - 16413476
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  16413367 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 16413464  T
Q  470 gattaagatgtt 481  Q
    ||||||||||||    
T  16413465 gattaagatgtt 16413476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 21491067 - 21491015
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21491067 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21491015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 388 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 23406479 - 23406386
Alignment:
Q  388 ttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||    
T  23406479 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 23406386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Original strand, 23760893 - 23760945
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23760893 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 23760945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 369 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 21285716 - 21285606
Alignment:
Q  369 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||  |||| ||||| |||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  21285716 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaa 21285617  T
Q  467 aatgattaaga 477  Q
      |||||||||    
T  21285616 gttgattaaga 21285606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Original strand, 19277944 - 19278110
Alignment:
Q  16 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaaca 115  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  |||||||  |||| |||||| ||||||||||||          ||||||    
T  19277944 cttttaagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacct----------agaaca 19278033  T
Q  116 actttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
    || |||||||| |   ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  19278034 accttagttggaaagttggcttgtact-gccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactttcagaattgagtg 19278110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Original strand, 21976329 - 21976496
Alignment:
Q  16 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| || ||  || ||  |||||||  |||| |||||| ||||||||||||          ||||||    
T  21976329 cttttgagttgaaccttagatgcctttaagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacct----------agaaca 21976418  T
Q  116 actttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
    || |||||||  |   |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  21976419 accttagttgaaaagttggcctgtactcgccacggcgagcagatgctctcgccccgcgagcacttccagaattgagtg 21976496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 369 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 20498681 - 20498577
Alignment:
Q  369 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgta--tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  20498681 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctattttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaa 20498582  T
Q  467 aatga 471  Q
     ||||    
T  20498581 gatga 20498577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Original strand, 983455 - 983507
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  983455 atactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 983507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 1484513 - 1484406
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  1484513 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 1484416  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  1484415 gattaagatg 1484406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Original strand, 5853343 - 5853450
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  5853343 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 5853440  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  5853441 gattaagatg 5853450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 20403338 - 20403231
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  20403338 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 20403241  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  20403240 gattaagatg 20403231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 21491476 - 21491409
Alignment:
Q  5 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  21491476 tgtaattttgacttttaagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 21491409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 73
Target Start/End: Original strand, 21918648 - 21918715
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattaga 73  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| || ||| |||||||    
T  21918648 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgctttggagtgcctgaacatgtctaataatgattaga 21918715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 22001864 - 22001757
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  22001864 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 22001767  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  22001766 gattaagatg 22001757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 72
Target Start/End: Original strand, 5865919 - 5865981
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  5865919 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 5865981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 7373232 - 7373166
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  7373232 gtaattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 7373166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 281 - 350
Target Start/End: Original strand, 25363053 - 25363123
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattacttga 350  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  25363053 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtggtataatgttttatgcattacttga 25363123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 386 - 483
Target Start/End: Original strand, 45290759 - 45290857
Alignment:
Q  386 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatgttg 482  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  45290759 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttg 45290856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 58
Target Start/End: Original strand, 16199300 - 16199348
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgt 58  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  16199300 ttttgacttttgagttgaaccttggatgcttttgagtgccttaacatgt 16199348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 415 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 24353091 - 24353035
Alignment:
Q  415 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatga 471  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  24353091 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatga 24353035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Original strand, 26355747 - 26355799
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  26355747 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaa 26355799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 415 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 37116418 - 37116362
Alignment:
Q  415 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatga 471  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  37116418 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatga 37116362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 17141397 - 17141330
Alignment:
Q  5 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  17141397 tgtattttttacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 17141330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Original strand, 18818051 - 18818114
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  18818051 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 18818114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Original strand, 18878878 - 18878941
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  18878878 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 18878941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Original strand, 20046246 - 20046353
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  20046246 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 20046343  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  20046344 gattaagatg 20046353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 21249860 - 21249821
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcc 49  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21249860 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcc 21249821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 21255698 - 21255659
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcc 49  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21255698 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcc 21255659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 22627215 - 22627152
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  22627215 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 22627152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 73
Target Start/End: Original strand, 23252416 - 23252479
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattaga 73  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| || |||||||||||    
T  23252416 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattaga 23252479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 23406861 - 23406798
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  23406861 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 23406798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 31971723 - 31971632
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| || ||| ||||||   | ||  ||| ||||||||||||||||    
T  31971723 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgtgtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaggatgtaggatgagattgaacctgg 31971632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 41598299 - 41598192
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||  |    
T  41598299 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 41598202  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  41598201 gattaagatg 41598192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 386 - 479
Target Start/End: Original strand, 15203295 - 15203389
Alignment:
Q  386 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||    
T  15203295 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatg 15203389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 367 - 492
Target Start/End: Original strand, 18678102 - 18678229
Alignment:
Q  367 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttg---tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtc 463  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||  ||||||| ||||||||   ||  ||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||| || |||    
T  18678102 taagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcagtc 18678200  T
Q  464 taaaatgattaagatgttgaggatgatgt 492  Q
    |||  |||||||||||||||  |||||||    
T  18678201 taagttgattaagatgttgataatgatgt 18678229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 413 - 471
Target Start/End: Original strand, 19154935 - 19154993
Alignment:
Q  413 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatga 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  19154935 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatga 19154993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Original strand, 25362784 - 25362830
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtg 47  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25362784 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtg 25362830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 71
Target Start/End: Original strand, 28648685 - 28648747
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagatta 71  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  28648685 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 28648747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 41598664 - 41598602
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagatta 71  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  41598664 attttgacttttgagttgacccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 41598602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 72
Target Start/End: Original strand, 45130673 - 45130735
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  45130673 ttttgacttttgaattgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 45130735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 20536688 - 20536647
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20536688 attttgactttcgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 20536647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 369 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 26219831 - 26219721
Alignment:
Q  369 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||| || ||  ||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26219831 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactattttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 26219734  T
Q  467 aatgattaagatg 479  Q
      |||||| ||||    
T  26219733 gttgattatgatg 26219721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 369 - 479
Target Start/End: Original strand, 26225295 - 26225405
Alignment:
Q  369 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||  ||||| ||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26225295 agatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactgttttgtatattgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 26225392  T
Q  467 aatgattaagatg 479  Q
      |||||||||||    
T  26225393 gttgattaagatg 26225405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 415 - 471
Target Start/End: Original strand, 17267044 - 17267100
Alignment:
Q  415 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatga 471  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17267044 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatga 17267100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 4483391 - 4483285
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||  |    
T  4483391 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagtt 4483295  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  4483294 gattaagatg 4483285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 424 - 479
Target Start/End: Original strand, 4542477 - 4542531
Alignment:
Q  424 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  4542477 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 4542531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 6759737 - 6759698
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgc 48  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6759737 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgc 6759698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 390 - 466
Target Start/End: Original strand, 13508108 - 13508186
Alignment:
Q  390 gatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||  ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  13508108 gatattattatatcatgatgttgtgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaa 13508186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 48
Target Start/End: Original strand, 16091982 - 16092021
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgc 48  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16091982 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgc 16092021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 424 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 19896323 - 19896269
Alignment:
Q  424 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  19896323 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 19896269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 175
Target Start/End: Original strand, 21918756 - 21918807
Alignment:
Q  124 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 175  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21918756 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 21918807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Original strand, 21923569 - 21923632
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || |||| || ||| ||||||    
T  21923569 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattag 21923632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 22112277 - 22112194
Alignment:
Q  16 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacct 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  |||||  |||||||  |||| |||||| ||||||||||||    
T  22112277 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctattattgattagagaatgatttagaacgagattgaacct 22112194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 23649032 - 23648970
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || |||| || ||| ||||||    
T  23649032 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgactgaacatgtctaataatgattag 23648970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 72
Target Start/End: Original strand, 26355336 - 26355402
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  26355336 gtaattttgacttttgagttgatccttaaatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 26355402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 32121853 - 32121726
Alignment:
Q  367 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttg---tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtc 463  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||  ||||||| ||||||||   ||  ||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||| ||  ||    
T  32121853 taagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcattc 32121755  T
Q  464 taaaatgattaagatgttgaggatgatgt 492  Q
    |||  |||||||||||||||  |||||||    
T  32121754 taagttgattaagatgttgataatgatgt 32121726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 72
Target Start/End: Original strand, 38854889 - 38854955
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  38854889 gtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 38854955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 386 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 15070656 - 15070575
Alignment:
Q  386 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15070656 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 15070575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 21249732 - 21249695
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagca 177  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21249732 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagca 21249695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 176
Target Start/End: Original strand, 5866047 - 5866083
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 176  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5866047 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc 5866083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 17141264 - 17141228
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 176  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17141264 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc 17141228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 415 - 471
Target Start/End: Original strand, 17439557 - 17439613
Alignment:
Q  415 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatga 471  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  17439557 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggactaagatga 17439613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Original strand, 17612159 - 17612211
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  17612159 atactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaa 17612211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 418 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 21673772 - 21673724
Alignment:
Q  418 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  21673772 tgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagtcggtctaa 21673724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 22057800 - 22057768
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgctttt 42  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22057800 ttttgacttttgagttgaaccttagatgctttt 22057768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Original strand, 19801068 - 19801131
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  19801068 attttgacttttgagttgatccttagatgcatatgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 19801131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 471
Target Start/End: Original strand, 19801447 - 19801531
Alignment:
Q  387 tttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatga 471  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  19801447 tttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagccggtctaagatga 19801531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 19905830 - 19905783
Alignment:
Q  138 gtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 185  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  19905830 gtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccaga 19905783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 171
Target Start/End: Original strand, 25362896 - 25362943
Alignment:
Q  124 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcg 171  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25362896 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcg 25362943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 41598534 - 41598499
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 175  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41598534 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 41598499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 433 - 479
Target Start/End: Original strand, 19937118 - 19937164
Alignment:
Q  433 ttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||    
T  19937118 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatg 19937164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 21674188 - 21674122
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  21674188 gtaattttgacttttgagttgatccttggacgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 21674122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 6520851 - 6520810
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtg 47  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  6520851 gtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtg 6520810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 417 - 466
Target Start/End: Original strand, 13597669 - 13597718
Alignment:
Q  417 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  13597669 ctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaa 13597718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 51
Target Start/End: Original strand, 17055043 - 17055084
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctt 51  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  17055043 ttttgacttttgagttgaactttagatgcctttgagtacctt 17055084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 21249457 - 21249404
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgtt-atttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21249457 atactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21249404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 21255295 - 21255242
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgtt-atttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21255295 atactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21255242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 21255570 - 21255533
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagca 177  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  21255570 actcgccatggcgagcagcggctctcgcctcgcgagca 21255533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 57
Target Start/End: Original strand, 21414867 - 21414916
Alignment:
Q  8 aattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatg 57  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  21414867 aatttttactttttagtggaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatg 21414916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #148
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 123 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 22875432 - 22875380
Alignment:
Q  123 ttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 175  Q
    |||||| |||| | || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  22875432 ttgggaatctgacctgaactcgccatgacgagcagaggctctcgcctcgcgag 22875380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 38
Target Start/End: Original strand, 23844568 - 23844596
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgc 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23844568 ttttgacttttgagttgaaccttagatgc 23844596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 39834182 - 39834146
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 176  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  39834182 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 39834146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 145)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 37724389 - 37723906
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37724389 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctg 37724290  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37724289 gtttaacttagaacaacatttgttgggaatctggctggtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 37724190  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataa 300  Q
    ||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||  |      
T  37724189 ggagattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttcggtagtattgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg-tttt 37724091  T
Q  301 gatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataatt 398  Q
    || |||||  |||||| ||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||  || |||  | ||||||||||||||| |||||||||||||     
T  37724090 gagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaatttaatttgatataatc 37723991  T
Q  399 atgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatgttga 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| | ||||||||||    
T  37723990 atgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagatgttgaagatgttga 37723906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 22032801 - 22032326
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22032801 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctg 22032702  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22032701 gtttagcttagaacaattttagttgggattctggcttgtactcgccgtggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 22032602  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataa 300  Q
    | |   || ||| ||||| || ||| || ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||     
T  22032601 gaatgttgtgatatgtgttgcttgaattgattagagatggacccttaggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg-atac 22032503  T
Q  301 gatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattat 400  Q
    || |||||  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||     
T  22032502 gagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaa-ttggtataatta- 22032405  T
Q  401 gtcatgct--gttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
     ||||| |   |||||  ||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||| ||| | ||| ||||||||||||    
T  22032404 -tcatgattgtttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 22032326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 479
Target Start/End: Original strand, 18769638 - 18770115
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18769638 attctgtatttttgacttttaagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctg 18769737  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18769738 gtttagcttagaacaattttagttaggattctggcttgtactcgccgtggcgagcagatgctctcgcgtcgcgagcacttccagaactgagcgcaagtga 18769837  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataa 300  Q
    | |    | ||||||||| || ||| || ||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||     
T  18769838 gaatgtagtgatctgtgttgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg-atat 18769936  T
Q  301 gatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattat 400  Q
    || |||||  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  18769937 gagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaa-ttggtataattat 18770035  T
Q  401 -gtca-tgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
      | | || |||||||  ||||||||||||||  ||||||||  || ||| ||||||| ||| | ||| ||||||||||||    
T  18770036 catgattgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcgaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 18770115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 8 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 26704544 - 26704257
Alignment:
Q  8 aattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagc 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26704544 aattttgacttttgagttgaaccctagatatttttgagtgcctgaagatgcttattaaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggtttaac 26704445  T
Q  108 ttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaat 207  Q
     |||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26704444 ctagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctttcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtaaggaaaat 26704345  T
Q  208 gcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  26704344 gtgatctgtgtcgcatgatttgattagggatggacccttgggtagtaatgagacatatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg 26704257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 8 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 26974277 - 26973990
Alignment:
Q  8 aattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagc 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26974277 aattttgacttttgagttgaaccctagatatttttgagtgcctgaagatgcttattaaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggtttaac 26974178  T
Q  108 ttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaat 207  Q
     |||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26974177 ctagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctttcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtaaggaaaat 26974078  T
Q  208 gcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  26974077 gtgatctgtgtcgcatgatttgattagggatggacccttgggtagtaatgagacatatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg 26973990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 23512592 - 23512318
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23512592 attctgtattttcgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgatgacttagagtgagattgaacctg 23512493  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  23512492 gtttagcttagaacaactttagttgaaaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcatgtta 23512393  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagtt 275  Q
    |||   ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| | || |  |||||||||||||||||    
T  23512392 ggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagaggtggacccttgggtagtattatgacctatataagaagtt 23512318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 23201854 - 23201559
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  23201854 attctgtacttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagattaaatgataacttataatgagattgaacctg 23201755  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  23201754 gtttagcttataacaacattagttgggaatctggcctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttttagaactgagtgcaagtga 23201655  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggaccctt-gggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    ||| | ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||    
T  23201654 ggatattgcgatctgtgtcgcataatttgtttagagatggacccttggggtagtaatgagacctatagaagaagttaactgcaatctgtgaagctg 23201559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Original strand, 21366300 - 21366594
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  21366300 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatttagaacgagattgaacctg 21366399  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
     |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  21366400 atttagcttagaacaacttaagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagtta 21366499  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    | |   |||||||||| |||||| | || ||||| | ||||||||| || | ||||| ||||||| ||||| ||||  ||  |||||||||||||    
T  21366500 gtatgttgcgatctgtttcgcataaattgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctg 21366594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 14079633 - 14079340
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14079633 attctgtatttttgacttttgagttcaaccttagatgtttttgagtgcctaaatatgttaattaatgatttaatgataacttagaatgagattgaacctg 14079534  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14079533 gtttagcttagaacaacattagttgggaatctggctagtactcgccatggcgagcaaatgctctcgcctcgcgagcacttctagaactgagtgcaagtga 14079434  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagct 294  Q
    |||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||| ||||||||||  || |||||||||||||    
T  14079433 ggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatttaagaagttaactgcaatctgtgaagct 14079340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 61 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 23572504 - 23572178
Alignment:
Q  61 attaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatg 160  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23572504 attaaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactccccatggcgagcagatg 23572405  T
Q  161 ctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgaga 260  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   || |||||  || || ||| || ||||| ||||||||||| || | ||||||||    
T  23572404 ctctcgcctcgcgcgcacttccagaactgagtgcaagtgagaatgttgtgatctaagttgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgaga 23572305  T
Q  261 cctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttg 360  Q
    ||||||||||||||||  || ||| ||||||| || ||| || |||||   ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  23572304 cctatataagaagttaactgcaatttgtgaagttg-atatgagatgtttgagttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattg 23572206  T
Q  361 tatgcataagatgttgatgaattgaatt 388  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23572205 tatacataagatgttgatgaattgaatt 23572178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 15 - 295
Target Start/End: Original strand, 23500993 - 23501273
Alignment:
Q  15 acttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaac 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  23500993 acttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcttattaaatattaaatgatagcttagaccgagattgaacctggtttagcttagaac 23501092  T
Q  115 aactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatct 214  Q
    ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |   ||||||||    
T  23501093 aacattagttgggaatcttgcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcacctcgcgagcacttccagaactgagtgaaagtgagaatgttgcgatct 23501192  T
Q  215 gtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    |||||| || | || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  23501193 gtgtcgtataagttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgcaatctgtgaagctg 23501273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 20806032 - 20805738
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  20806032 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttatatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatttagaacgagattgaacctg 20805933  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |    
T  20805932 gtttagcttagaacaacttgagttggaaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttctagaactgaatgcaaatta 20805833  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    |||   ||||||||||||||||  | || ||||| | | ||||||| || | ||||| ||||||| ||||| ||||  || ||||||||| ||||    
T  20805832 ggatgttgcgatctgtgtcgcacaaattgattagggtttgacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaggctg 20805738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 21887309 - 21887124
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  21887309 attctgtacttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattaaatgataacttagaatgagaatgaacctg 21887210  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaa 186  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21887209 ctttagcttagaacaactttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttacagaa 21887124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 31342588 - 31342399
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  31342588 attctgtgtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttatagaagattaaatgataacctagaatgagattgaacctg 31342489  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 190  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||   |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31342488 gcttagcttagaacaaccttagttggagatctgggctgaactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 31342399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 194
Target Start/End: Original strand, 17918800 - 17918979
Alignment:
Q  5 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggttt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||| ||||       
T  17918800 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctttagttgtgtattaaagattagaggatgatttagaacaagattgaaactgg--- 17918896  T
Q  105 agcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
           |||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17918897 -------aacaaccttagttggaaacctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 17918979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Original strand, 21292883 - 21293083
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 380  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||    
T  21292883 taatctgtgaagttgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatacctaagatgttgatga 21292982  T
Q  381 a-ttgaat-ttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaaga 477  Q
    | |||||| ||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||    
T  21292983 atttgaatattgatattattatgtcatactgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaaga 21293081  T
Q  478 tg 479  Q
    ||    
T  21293082 tg 21293083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 140 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 21873595 - 21873280
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  21873595 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttacagaactgagtgcaagttaggatattgagatctgtgtcgcataatttgattagagatg 21873496  T
Q  240 gacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-ta 338  Q
     ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||  || || |||||  |||||| ||||| ||| ||||||||| |     
T  21873495 aacccttgggtagtaatgtgacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg-ttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatg 21873397  T
Q  339 tgcattacttgaaga-atgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc---tgttgtatactgcctatgttgctgttt 434  Q
    |||||||||| |||| ||  ||| |||  ||||||||   |||| |||  ||||||| || | |||||||   |||||||| ||||||||| |||| |||    
T  21873396 tgcattactt-aagatattattgaatggttaagatgt---tgaaatgagattgatattatgaagtcatgctgatgttgtatcctgcctatgctgct-ttt 21873302  T
Q  435 gttatttaactaagctgcatga 456  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  21873301 gttatttaactaagttgcatga 21873280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 195
Target Start/End: Original strand, 23535243 - 23535418
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| || ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||            
T  23535243 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgatttagaacgagattgaacctgg-------- 23535334  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
      |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23535335 --aacaaccttagttgggaatctgacttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 23535418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 195
Target Start/End: Original strand, 20910453 - 20910629
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| || ||| || ||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||           
T  20910453 attttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgaattagaacaagattgaacctgg------- 20910545  T
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
       |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20910546 ---aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 20910629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 17410899 - 17410724
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || |||| |||| || ||| || ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||            
T  17410899 ttttgacttttgagttgaaccttagacgccttggagtacctttaggtgtctactaaagattagatgatgatttagaacaagattgaacctgg-------- 17410808  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
      |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17410807 --aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 17410724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 194
Target Start/End: Original strand, 12028223 - 12028393
Alignment:
Q  14 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||          ||    
T  12028223 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtctattaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctgg----------aa 12028312  T
Q  114 caactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
    |||| |||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12028313 caaccttagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 12028393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 286 - 479
Target Start/End: Original strand, 8286760 - 8286957
Alignment:
Q  286 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattg 384  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |   ||||||||||||||||||    
T  8286760 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgattatttaagatgttgatgaattg 8286859  T
Q  385 aatttgatataattatgtcatgctg----ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
     | ||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||    
T  8286860 caattgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 8286957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 21340421 - 21340595
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  ||||||   |||| |||||| ||||||||||||||            
T  21340421 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctgg-------- 21340512  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21340513 --aacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 21340595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 24222336 - 24222170
Alignment:
Q  14 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||          |||    
T  24222336 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtgtattaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctg----------gaa 24222247  T
Q  114 caactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 190  Q
    ||||  ||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24222246 caaccatagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 24222170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 26665785 - 26665959
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  ||||||   |||| |||||| ||||||||||||||            
T  26665785 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctgg-------- 26665876  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26665877 --aacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 26665959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 26937382 - 26937556
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  ||||||   |||| |||||| ||||||||||||||            
T  26937382 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctgg-------- 26937473  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26937474 --aacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 26937556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 6 - 195
Target Start/End: Original strand, 1858626 - 1858805
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggttta 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || | ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||        
T  1858626 gtaatttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatattcactaaagattagaagatgacttagaacaagattgaacctgg---- 1858721  T
Q  106 gcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
          || |||    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1858722 ------aataaccaatgttggaattctggattgtactcgccatggcgagcagatgctcttgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 1858805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 16674604 - 16674430
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  ||||||   |||| |||||| ||||||||||||||            
T  16674604 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctgg-------- 16674513  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
      |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16674512 --aacaaccttagttgggattctagcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 16674430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 26681038 - 26680868
Alignment:
Q  14 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||| ||||| ||||||  ||| |||||||||          ||    
T  26681038 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtctactaaagattagaggatgatttagaacaagaatgaacctgg----------aa 26680949  T
Q  114 caactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
    |||| |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680948 caaccttagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagacgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 26680868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 26952645 - 26952475
Alignment:
Q  14 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||| ||||| ||||||  ||| |||||||||          ||    
T  26952645 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtctactaaagattagaggatgatttagaacaagaatgaacctgg----------aa 26952556  T
Q  114 caactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
    |||| |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26952555 caaccttagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagacgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 26952475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Original strand, 23390409 - 23390610
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    ||||||||||||||   |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||    
T  23390409 taatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 23390508  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaag 476  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||| ||   |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||    
T  23390509 aattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 23390607  T
Q  477 atg 479  Q
    |||    
T  23390608 atg 23390610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 18356779 - 18356604
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||  || ||  ||||||   |||| |||||||||||||| ||||||            
T  18356779 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaagtgcctactattgattagggaatgatttagaatgagattgcacctgg-------- 18356688  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
      |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18356687 --aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 18356604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Original strand, 17718093 - 17718263
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  ||||||   |||| |||||| |||||||||| |              
T  17718093 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacat---------- 17718182  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 190  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17718183 agaacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 17718263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 24532702 - 24532876
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  |||||    |||| |||||| ||||||||||||||            
T  24532702 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattaaggaatgatttagaacgagattgaacctgg-------- 24532793  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24532794 --aacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttttagaactgagtgc 24532876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 111 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 20232911 - 20232828
Alignment:
Q  111 gaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20232911 gaacaaccttagttaggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 20232828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 42805872 - 42805698
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || || ||| ||  ||||||   |||| | |||| ||| |||||||||             
T  42805872 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcttactattgattagggaatgattcagaacgagtttgaacctga-------- 42805781  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
      |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42805780 --aacaaccttagttggaattctggcttgtactcgtcatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 42805698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Original strand, 21884843 - 21885016
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  |||||    |||| || ||||||||||||||||||            
T  21884843 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattaaggaatgatttggaatgagattgaacctgg-------- 21884934  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
      |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21884935 --aacaaccttagttgggaagctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 21885016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 268 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 22075240 - 22075039
Alignment:
Q  268 aagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatgca 366  Q
    |||| |||| || |||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||  | | |||| ||       
T  22075240 aagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 22075141  T
Q  367 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtc 463  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| ||   ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  22075140 taagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgaatgagtcggtc 22075042  T
Q  464 taa 466  Q
    |||    
T  22075041 taa 22075039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Original strand, 25229060 - 25229233
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  | |||||   ||| |||||| |||||||||||||             
T  25229060 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgtttagagattgatttagaacgagattgaacctga-------- 25229151  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
      |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25229152 --aacaaccttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 25229233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Original strand, 25293216 - 25293389
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  | |||||   ||| |||||| |||||||||||||             
T  25293216 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgtttagagattgatttagaacgagattgaacctga-------- 25293307  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
      |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25293308 --aacaaccttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 25293389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 112 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18774564 - 18774482
Alignment:
Q  112 aacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18774564 aacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgggtgc 18774482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Original strand, 19472379 - 19472546
Alignment:
Q  16 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  |||||||  |||| |||||||||||||||||||          ||||||    
T  19472379 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaatgagattgaacct----------agaaca 19472468  T
Q  116 actttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
    || |||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19472469 accttagttggaaagctggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 19472546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 24493776 - 24493576
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||  ||| ||   |||||||||| ||    
T  24493776 taatctgtgaagctatttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatcacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttg 24493677  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaaga 477  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||  |||| ||||    
T  24493676 acttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttacttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 24493578  T
Q  478 tg 479  Q
    ||    
T  24493577 tg 24493576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 194
Target Start/End: Original strand, 122954 - 123133
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagat----gcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggttt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    || ||||||| || | ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||  |||||||||||||       
T  122954 attttgacttttgagttgaaccttagatagatgcctttgagtacccttagatgtttaataaagattagaggatgttttagaacaagattgaacctgg--- 123050  T
Q  105 agcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
           ||||||  ||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  123051 -------aacaaccgtagttggaaacctggcctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtgc 123133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 26742400 - 26742574
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  |||||||| |||| |||||| |||||||| |||||            
T  26742400 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagataatgatttagaacgagattgagcctgg-------- 26742491  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
      |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  26742492 --aacaaccttagttggaaatctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgaccattttcagaactgagtgc 26742574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 24529428 - 24529227
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||||||| || |||||||||||   |||  |||||   |||||||||| ||    
T  24529428 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgttg 24529329  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaag 476  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||    
T  24529328 acttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 24529230  T
Q  477 atg 479  Q
    |||    
T  24529229 atg 24529227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 26172916 - 26172743
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  |||||    |||| || ||||||||||||||||||            
T  26172916 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattaaggaatgatttggaatgagattgaacctgg-------- 26172825  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
      |||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26172824 --aacaaccttagtagggaagctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 26172743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 122 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 23451707 - 23451634
Alignment:
Q  122 gttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23451707 gttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcaagcacttccagaactgagtgca 23451634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 122 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 23463212 - 23463139
Alignment:
Q  122 gttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23463212 gttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcaagcacttccagaactgagtgca 23463139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 4036672 - 4036499
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |   || ||  ||||||   |||| |||||| |||||||||| |||            
T  4036672 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtaactactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacttgg-------- 4036581  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
      |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4036580 --aacaaccttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagttgatgctttcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 4036499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 281 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 9078160 - 9077983
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||   |||  |||||   | |||||||| ||    
T  9078160 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgaatgtataattgagatgttgttg 9078061  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 455  Q
    | ||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9078060 acttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatg 9077983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 25421740 - 25421539
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   ||||||| || ||    
T  25421740 taatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgctgttg 25421641  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaag 476  Q
    | ||| | ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||    
T  25421640 acttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 25421542  T
Q  477 atg 479  Q
    |||    
T  25421541 atg 25421539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 281 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 25431602 - 25431414
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |    |||||||||| ||    
T  25431602 taatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaacatttaagatgttgttg 25431503  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    | ||| | ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  25431502 acttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa 25431414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 18784499 - 18784336
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  ||||||   |||| |||||| ||| |||||||||             
T  18784499 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactatcgattagggaatgatttagaacgagtttgaacctga-------- 18784408  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttcca 183  Q
      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18784407 --aacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacgtcca 18784336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 20296294 - 20296127
Alignment:
Q  16 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  |||||||  |||| |||||| ||||||||||||          ||||||    
T  20296294 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacct----------agaaca 20296205  T
Q  116 actttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
    || |||||||| |   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20296204 accttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 20296127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 23458951 - 23458878
Alignment:
Q  122 gttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  23458951 gttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcaagcacttcaagaactgagtgca 23458878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 367 - 466
Target Start/End: Original strand, 21729064 - 21729165
Alignment:
Q  367 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtc 463  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21729064 taagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21729162  T
Q  464 taa 466  Q
    |||    
T  21729163 taa 21729165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 367 - 466
Target Start/End: Original strand, 21808389 - 21808490
Alignment:
Q  367 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtc 463  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21808389 taagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21808487  T
Q  464 taa 466  Q
    |||    
T  21808488 taa 21808490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 13025518 - 13025318
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||| ||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||| | | ||||| |||||| ||  ||| ||   |||||||||| ||    
T  13025518 taatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttg 13025419  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaaga 477  Q
    | ||| ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||| ||||    
T  13025418 acttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 13025320  T
Q  478 tg 479  Q
    ||    
T  13025319 tg 13025318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 13095702 - 13095502
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||| ||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||| | | ||||| |||||| ||  ||| ||   |||||||||| ||    
T  13095702 taatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttg 13095603  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaaga 477  Q
    | ||| ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||| ||||    
T  13095602 acttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 13095504  T
Q  478 tg 479  Q
    ||    
T  13095503 tg 13095502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 288 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 1096668 - 1096470
Alignment:
Q  288 tgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaa 386  Q
    ||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||  |||  |||||   | |||||||| ||| ||| |    
T  1096668 tgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatgtgagatgttgttgatttgca 1096569  T
Q  387 tttgatataattatgtcatgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatgttga 483  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||| |   ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||    
T  1096568 tttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgttga 1096470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 370 - 479
Target Start/End: Original strand, 21329500 - 21329611
Alignment:
Q  370 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaa 467  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||  |||| | ||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  21329500 gatgttgatgacttgaattcgatattgttatattatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21329599  T
Q  468 atgattaagatg 479  Q
     |||||||||||    
T  21329600 ttgattaagatg 21329611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 370 - 471
Target Start/End: Original strand, 20026942 - 20027047
Alignment:
Q  370 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatg--ctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 465  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||  ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20026942 gatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttggatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 20027041  T
Q  466 aaatga 471  Q
    | ||||    
T  20027042 agatga 20027047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 22760113 - 22760026
Alignment:
Q  14 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctgg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||    
T  22760113 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtgtactaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctgg 22760026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 185
Target Start/End: Original strand, 21295006 - 21295082
Alignment:
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 185  Q
    ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21295006 tagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 21295082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 25535351 - 25535275
Alignment:
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 185  Q
    ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25535351 tagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 25535275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Original strand, 21871212 - 21871275
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  21871212 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttattaatgattag 21871275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Original strand, 21875492 - 21875555
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  21875492 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttattaatgattag 21875555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 386 - 479
Target Start/End: Original strand, 21997553 - 21997648
Alignment:
Q  386 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||    
T  21997553 atttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 21997648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 369 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 22412302 - 22412191
Alignment:
Q  369 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  22412302 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttatc-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaa 22412204  T
Q  467 aatgattaagatg 479  Q
      |||||||||||    
T  22412203 gttgattaagatg 22412191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Original strand, 19660884 - 19660936
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19660884 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 19660936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Original strand, 22959581 - 22959633
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22959581 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 22959633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 367 - 479
Target Start/End: Original strand, 21502156 - 21502270
Alignment:
Q  367 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgta--tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtct 464  Q
    ||||||| |||||| ||| ||| |||||  |||| |||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  21502156 taagatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtct 21502255  T
Q  465 aaaatgattaagatg 479  Q
    ||  |||||||||||    
T  21502256 aagttgattaagatg 21502270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 25431874 - 25431811
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  25431874 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttattaatgattag 25431811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 371 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 21565659 - 21565562
Alignment:
Q  371 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21565659 atgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttggatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21565562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 414 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 36314649 - 36314584
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  36314649 atactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 36314584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 150 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 22757458 - 22757414
Alignment:
Q  150 gcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22757458 gcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 22757414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 25422012 - 25421920
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctgg 101  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||   |  |||||| ||||||||| ||||||    
T  25422012 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctattaatgattaggaaagaacttaggatgagattggacctgg 25421920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Original strand, 264819 - 264926
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  264819 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 264916  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  264917 gattaagatg 264926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 1096947 - 1096884
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  1096947 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 1096884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Original strand, 10732991 - 10733098
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  10732991 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 10733088  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  10733089 gattaagatg 10733098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 72
Target Start/End: Original strand, 19660474 - 19660541
Alignment:
Q  5 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  19660474 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 19660541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 20909123 - 20909016
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  20909123 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgct-tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 20909026  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  20909025 gattaagatg 20909016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 22075488 - 22075425
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  22075488 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 22075425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 39363495 - 39363388
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  39363495 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 39363398  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  39363397 gattaagatg 39363388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 386 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 39245234 - 39245140
Alignment:
Q  386 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  39245234 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 39245140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 185
Target Start/End: Original strand, 15441720 - 15441773
Alignment:
Q  132 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 185  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15441720 tggcttgaactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 15441773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 175
Target Start/End: Original strand, 11580886 - 11581051
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggttt-agc 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||   |  |  |||||||||||||||||||| |  |      
T  11580886 attttgacttttgagttgatccttagaagcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggatagatt 11580985  T
Q  108 ttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 175  Q
    |||||| ||   |  ||| || |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11580986 ttagaataaaact--ttgagaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 11581051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 50
Target Start/End: Original strand, 21292623 - 21292663
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21292623 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 21292663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 101
Target Start/End: Original strand, 21985788 - 21985880
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctgg 101  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||   |  |  ||||||||||||||||||||    
T  21985788 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgg 21985880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Original strand, 26012084 - 26012136
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  26012084 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 26012136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 388 - 466
Target Start/End: Original strand, 20902075 - 20902154
Alignment:
Q  388 ttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20902075 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 20902154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 185
Target Start/End: Original strand, 23337060 - 23337107
Alignment:
Q  138 gtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 185  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23337060 gtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 23337107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Original strand, 23390137 - 23390200
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  23390137 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 23390200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 29330045 - 29329938
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  29330045 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29329948  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  29329947 gattaagatg 29329938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Original strand, 42245416 - 42245523
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||  |    
T  42245416 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 42245513  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  42245514 gattaagatg 42245523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 386 - 479
Target Start/End: Original strand, 11581263 - 11581357
Alignment:
Q  386 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  11581263 atttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 11581357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 386 - 479
Target Start/End: Original strand, 18319098 - 18319192
Alignment:
Q  386 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||    
T  18319098 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 18319192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 368 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 18356433 - 18356367
Alignment:
Q  368 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt-gtatactgcctatgttgctgtt 433  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  18356433 aagatgttgttgaattgaaattgatattattatatcatgctgtttgtatgctgcctatgttgctgtt 18356367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 314 - 433
Target Start/End: Original strand, 20910745 - 20910866
Alignment:
Q  314 tgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatg-tttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg-t 410  Q
    ||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| |||   ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |    
T  20910745 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatgttcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtt 20910843  T
Q  411 tgtatactgcctatgttgctgtt 433  Q
    ||||| ||| |||||||||||||    
T  20910844 tgtatgctgtctatgttgctgtt 20910866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 6 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 21566027 - 21565961
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  21566027 gtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 21565961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 6 - 72
Target Start/End: Original strand, 22959171 - 22959237
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  22959171 gtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 22959237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Original strand, 36154834 - 36154938
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  36154834 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttg----ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 36154928  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  36154929 gattaagatg 36154938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 50
Target Start/End: Original strand, 22119834 - 22119875
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22119834 attttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcct 22119875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 414 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 22144121 - 22144064
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatga 471  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  22144121 atactacctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatga 22144064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 388 - 479
Target Start/End: Original strand, 2154680 - 2154772
Alignment:
Q  388 ttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  2154680 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 2154772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 351
Target Start/End: Original strand, 22107273 - 22107357
Alignment:
Q  268 aagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgt-ttatgcattacttgaa 351  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  22107273 aagaggttaattataatctgtgaagctgtttaaggtgtgttgttgttgattatgatgtgatataatatattatgcattacttgaa 22107357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 24554896 - 24554820
Alignment:
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 185  Q
    ||||||||| ||||||||||   ||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  24554896 tagaacaacattagttgggaagttggctagtactcgcaatggcgagtagatactctcgccttacgagcacttccaga 24554820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 433 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 38619484 - 38619432
Alignment:
Q  433 ttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatgttgagg 485  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||    
T  38619484 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgagg 38619432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 49
Target Start/End: Original strand, 8286495 - 8286534
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcc 49  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8286495 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcatttgagtgcc 8286534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 367 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 18418699 - 18418590
Alignment:
Q  367 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt-gtatactgcctatgttgctgtttgtta-tttaactaagctgcatgattcggtct 464  Q
    |||||||||| ||||||| |  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||| || || ||||    
T  18418699 taagatgttg-tgaattgcaaatgatattattatgtcatgctgtttgtatactgcctatgttgatg-ttgttattttaactaagttgcacgagtcagtct 18418602  T
Q  465 aaaatgattaag 476  Q
    ||  ||||||||    
T  18418601 aagttgattaag 18418590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 424 - 479
Target Start/End: Original strand, 20918052 - 20918106
Alignment:
Q  424 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  20918052 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 20918106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 179
Target Start/End: Original strand, 22119963 - 22120002
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcact 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22119963 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcact 22120002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 24529701 - 24529638
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  24529701 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttcagtgcctgaacatgtctaataatgattag 24529638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 29346091 - 29345984
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | || ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||  |    
T  29346091 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgatgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagtt 29345994  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  29345993 gattaagatg 29345984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 386 - 479
Target Start/End: Original strand, 10775740 - 10775834
Alignment:
Q  386 atttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    ||||||||| ||||||||||||||   || |||||||| | ||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  10775740 atttgatattattatgtcatgctggttttatatactgc-tgtgtcgctgtc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 10775834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 19669383 - 19669317
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || || |||| || ||| ||||||    
T  19669383 gtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattag 19669317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 413 - 471
Target Start/End: Original strand, 22178269 - 22178327
Alignment:
Q  413 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatga 471  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  22178269 tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatga 22178327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 23064561 - 23064515
Alignment:
Q  433 ttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  23064561 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 23064515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 386 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 31061166 - 31061072
Alignment:
Q  386 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | | |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  31061166 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgttttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 31061072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 21482930 - 21482889
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctt 51  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  21482930 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctt 21482889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 50
Target Start/End: Original strand, 24766978 - 24767019
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24766978 atttcgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcct 24767019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 33409658 - 33409617
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctt 51  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  33409658 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctt 33409617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 9078432 - 9078340
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctgg 101  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||   |  |  ||||||||||||||||||||    
T  9078432 attttgacttttgagttgatctttatatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaaaatgtagaatgagattgaacctgg 9078340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 185
Target Start/End: Original strand, 14359562 - 14359638
Alignment:
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 185  Q
    ||||||||| || ||| ||| | || || ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  14359562 tagaacaacattggtttggaatttgactggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccaga 14359638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 294
Target Start/End: Original strand, 15236552 - 15236708
Alignment:
Q  138 gtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagaga 237  Q
    ||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||   |||||||  || || ||| ||||  |||||  |||||  |    
T  15236552 gtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccagaattgagtgcttttgaggaatttgagacctgagtcgtttgattggattaggaa 15236651  T
Q  238 tggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagct 294  Q
    |||| |||| || | ||||||||||||| ||||| ||||  ||| || |||||||||    
T  15236652 tggaacctttggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagct 15236708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 176
Target Start/End: Original strand, 19660608 - 19660644
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 176  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19660608 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc 19660644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 19668970 - 19668918
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  19668970 atactgtctatgttgttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaa 19668918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 50
Target Start/End: Original strand, 21329133 - 21329177
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21329133 gtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 21329177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 50
Target Start/End: Original strand, 22107026 - 22107066
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  22107026 ttttgacttttgagttgaactttagatgcgtttgagtgcct 22107066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 13095974 - 13095939
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttga 44  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13095974 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttga 13095939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 175
Target Start/End: Original strand, 22107129 - 22107180
Alignment:
Q  124 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 175  Q
    |||||||||| | || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22107129 tgggattctgacctgaactcaccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 22107180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 179
Target Start/End: Original strand, 24767107 - 24767146
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcact 179  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24767107 actcgtcatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcact 24767146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 33409537 - 33409506
Alignment:
Q  163 ctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33409537 ctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 33409506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 48
Target Start/End: Original strand, 36154469 - 36154508
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgc 48  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  36154469 attttgacttttaagttgatccttagatgcttttgagtgc 36154508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 367 - 492
Target Start/End: Original strand, 17517201 - 17517328
Alignment:
Q  367 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttg---tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtc 463  Q
    |||||||||| |||||||   |||||||  ||||||| ||||||||   ||  ||||||||| |||| || |||||| ||||||| ||||||| || |||    
T  17517201 taagatgttgttgaattgcgattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctatt-gttattaaactaagttgcatgagtcagtc 17517299  T
Q  464 taaaatgattaagatgttgaggatgatgt 492  Q
    |||  |||||||||||||||  |||||||    
T  17517300 taagttgattaagatgttgataatgatgt 17517328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 23572544 - 23572510
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttaga 35  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23572544 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttaga 23572510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 18774656 - 18774615
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctt 51  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  18774656 ttttgacttttgagttgaaccttagaagcctttgagtacctt 18774615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 416 - 465
Target Start/End: Original strand, 26732884 - 26732932
Alignment:
Q  416 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 465  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  26732884 actgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 26732932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 176
Target Start/End: Original strand, 5888946 - 5888982
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 176  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  5888946 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 5888982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 20232982 - 20232954
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgc 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20232982 ttttgacttttgagttgaaccttagatgc 20232954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 6 - 50
Target Start/End: Original strand, 21498655 - 21498699
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  21498655 gtaattttgacctttaagttgaaccttggatgtttttgagtgcct 21498699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 21565894 - 21565858
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 176  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  21565894 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgtgagc 21565858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 176
Target Start/End: Original strand, 22959304 - 22959340
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 176  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  22959304 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 22959340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 25744071 - 25744035
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 176  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  25744071 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 25744035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 8)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 6 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 175247 - 174786
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggttta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||  ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  175247 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctggagatgcctattagagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttta 175148  T
Q  106 gcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaa 205  Q
     | ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  175147 acctagaacaacctttgttgggaatctggcttgtactcgccattgcgagcagatgctctcacctcgcgagcacttccagaaccgagtccaagtgaggaaa 175048  T
Q  206 atgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| | || || ||    
T  175047 atgcgatctgtgtcgcatgatttgattagagatggaccctttggtagtaatgagacctatataagaagttaactgaaatctgtgaagct-attatgagat 174949  T
Q  306 gttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtc 403  Q
    |||  |||||| ||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||  || |||  | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  174948 gttagtgttgaatatgacgtgatataatgtttagttgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtc 174849  T
Q  404 atgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  174848 atgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 174786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 281 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 124793 - 124679
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||   ||| | |||||||    
T  124793 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaaacgttgatg 124694  T
Q  380 aattgaatttgatat 394  Q
    ||||| | |||||||    
T  124693 aattgcaattgatat 124679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 125062 - 124999
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  125062 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 124999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121773
Alignment:
Q  416 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||    
T  121835 actgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 121773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 410 - 471
Target Start/End: Original strand, 136414 - 136475
Alignment:
Q  410 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatga 471  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  136414 ttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatga 136475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 410 - 471
Target Start/End: Original strand, 145122 - 145183
Alignment:
Q  410 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatga 471  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  145122 ttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatga 145183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 124950 - 124899
Alignment:
Q  124 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 175  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  124950 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 124899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #8
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 63044 - 63002
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgc 48  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  63044 gtaaatttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgc 63002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 172)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 479
Target Start/End: Original strand, 17137697 - 17138174
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17137697 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 17137796  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17137797 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 17137896  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataa 300  Q
    | |   || ||||||||| || ||| || ||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||     
T  17137897 gaatgttgtgatctgtgttgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg-atat 17137995  T
Q  301 gatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattat 400  Q
    || |||||  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  17137996 gagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaa-ttggtataattat 17138094  T
Q  401 -gtca-tgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
      | | || |||||||  ||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||| ||| | ||| ||||||||||||    
T  17138095 catgattgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 17138174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 12187499 - 12187113
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12187499 attctgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctg 12187400  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12187399 atttagcttagaacaattttagttgggattctggcttgtactcgccgtggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 12187300  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataa 300  Q
    | | |  | ||| | ||| || ||| || |||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||    
T  12187299 gaatatagtgatatatgttgcttgaattgattagagatggaccattaggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg-ataa 12187201  T
Q  301 gatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatt 388  Q
    || |||||   ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12187200 gagatgtttgagttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaatt 12187113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 9703752 - 9703458
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9703752 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaaggtggttattaaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctg 9703653  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9703652 gtttagcttagaacaacattagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 9703553  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    ||| | ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  9703552 ggatattgcgatccgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtattaatgtgacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg 9703458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 6 - 351
Target Start/End: Original strand, 18154475 - 18154821
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggttta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  18154475 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcttattaaagattaaatgataacttagaatgagattgaacttggttta 18154574  T
Q  106 gcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaa 205  Q
     | |||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18154575 acctagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagggaa 18154674  T
Q  206 atgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||  || || ||    
T  18154675 atgcgatctgtgtcgcatgatttgattaaagatggaccattgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaagctg-ttatgagat 18154773  T
Q  306 gttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaa 351  Q
    |||  |||||| ||||| | | |||||||||||  |||||||||||||    
T  18154774 gttaatgttgaatatgatgcgatataatgtttaattgcattacttgaa 18154821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 11880738 - 11880463
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11880738 attctgtacttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaatgattaaatgataacttagaatgagattgaacctg 11880639  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11880638 gtttagcttagaacaacattagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgtgagcacttccagaactgagtgcaagtga 11880539  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagtta 276  Q
    |||   |||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||    
T  11880538 ggatgttgcgatatgtgtcgcataatttgatttgagatggacccttgggtagtaatgtgacctatataagatgtta 11880463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 291
Target Start/End: Original strand, 12321376 - 12321666
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  12321376 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagacgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgataacctagaatgagattgaacctg 12321475  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12321476 atttagcttagaacaactttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaaatga 12321575  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaa 291  Q
    | |    |||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||| || | ||||| ||||||||||||| ||||  || ||||||||||    
T  12321576 gaatgtagcgatctgtgtcgcatgaattgattagggatggactcttaggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 12321666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 5 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 24054950 - 24054618
Alignment:
Q  5 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggttt 104  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  24054950 tgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtatattaaagattaaatgataacttagaacgagattgaacctagttt 24054851  T
Q  105 agcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaa 204  Q
    | | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |     
T  24054850 aacctagaacaacttttgttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgtcttgcgagcacttccagaactgagtgaaagtgagaat 24054751  T
Q  205 aatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagata 304  Q
    | ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||  || || |    
T  24054750 attgcgatctgtgtcgcataattcgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataaggagttaactgcaatctgtgaagctg-ttatgaga 24054652  T
Q  305 tgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta 338  Q
    ||||  |||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  24054651 tgttagtgttgattatgatgtgatatgatgttta 24054618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 14430364 - 14430070
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14430364 attctgtaattttgacttttgagttaaaccttagatgcttttgagtgccttgagatgtttattaaagattagatgatgatttagaatgagattgaacctg 14430265  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  14430264 gtttagcttagaacaacttaagttggaattttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagtta 14430165  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    | |   |||||||||| |||||| | || ||||| | ||||||||| || | ||||| ||||||| ||||| ||||  ||  |||||||||||||    
T  14430164 gtatgttgcgatctgtttcgcataaattgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctg 14430070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 351
Target Start/End: Original strand, 19649127 - 19649469
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  19649127 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaatattaaatgataacttagaatgagattgaacctggtttaacct 19649226  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgc 209  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||    
T  19649227 agaacaacctttgttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgtctcgcgagcacttccagaaccgagtgtaagtgaggatattgc 19649326  T
Q  210 gatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttg 309  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||| || ||||||||  || |||||||||||| |  ||||  |||||     
T  19649327 gatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtattgagacctaaattagaagttaactgcaatctgtgaagcag-ttaagtgatgtta 19649425  T
Q  310 ttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaa 351  Q
     |||||| ||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||    
T  19649426 gtgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaa 19649469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Original strand, 27847746 - 27847944
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27847746 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgtgataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 27847845  T
Q  381 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  27847846 attgaatttgatataattatgtcatactgttgtacactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatg 27847944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 10508716 - 10508918
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10508716 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctg 10508815  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
     |||| |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10508816 atttaacttataacaacattagttgggaatctggctggtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 10508915  T
Q  201 gga 203  Q
    |||    
T  10508916 gga 10508918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 6 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 2760608 - 2760413
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggttta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  2760608 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttaataaagattagatgatgatttagaacgagattgaacctggttta 2760509  T
Q  106 gcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgag 201  Q
    |||| ||||||||  |||||| | | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2760508 gcttcgaacaactggagttggaaatatggcttgtactcgtcatggcgagaagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaattgag 2760413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 40443597 - 40443398
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 380  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  40443597 taatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatga 40443498  T
Q  381 attgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| | ||||||    
T  40443497 attgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtttactgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagatgttgaagatg 40443398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 15211914 - 15211759
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15211914 attctgtactcttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttataaatgattaaatgataacttagaatgagattgaacctg 15211815  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagca 156  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15211814 gtttagctcagattaactttagttgggattctagcttgtactcgccatggcgagca 15211759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 11313100 - 11312925
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| || ||||||||||| ||||| || |||  |||||||||||||            
T  11313100 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgattttgaaaaagattgaacctgg-------- 11313009  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
      |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11313008 --aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgggagcacttccagaactgagtgca 11312925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 12699040 - 12698838
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||    
T  12699040 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 12698941  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctg----ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaa 475  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||    
T  12698940 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 12698842  T
Q  476 gatg 479  Q
    ||||    
T  12698841 gatg 12698838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 15581144 - 15580968
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||  |||||||||||||            
T  15581144 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtttactaaagattagaggatgttttagaacaagattgaacctgga------- 15581052  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
      |||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15581051 --aacaaccttagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaaaactgagtgca 15580968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 12318579 - 12318404
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||| | ||| ||||||  || ||||||||||            
T  12318579 ttttgacttttgagttgaacattagatgcttttgagtacctttaggtgtttactaaagattagagggtgatttagaacaaggttgaacctgg-------- 12318488  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
      |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12318487 --aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgctatggcgagcagatgctcttgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 12318404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 9509397 - 9509196
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| |||| |||| | ||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||    
T  9509397 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 9509298  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaag 476  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||    
T  9509297 aattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 9509199  T
Q  477 atg 479  Q
    |||    
T  9509198 atg 9509196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 195
Target Start/End: Original strand, 15604926 - 15605101
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||| |||||| ||||| ||||||  |||||||||||||            
T  15604926 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtttactaaatattagaggatgatttagaacaagattgaacctgg-------- 15605017  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
      |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||    
T  15605018 --aacaaccttagttgagaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctcttgcctcgtgaccacttctagaactgagtgca 15605101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 281 - 466
Target Start/End: Original strand, 16386160 - 16386349
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||  | |||||| ||   |||||||||||||    
T  16386160 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattgtttgaatatttaagatgttgatg 16386259  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    || |  | |||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16386260 aaatacaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 16386349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 9593797 - 9593622
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| || ||  |||||||  |||| |||||| ||||||||||||||            
T  9593797 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacctgg-------- 9593706  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
      ||| || |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9593705 --aacgaccttagttggaaatctggcttgtactcgccatagcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 9593622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 9644760 - 9644585
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| || ||  |||||||  |||| |||||| ||||||||||||||            
T  9644760 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacctgg-------- 9644669  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
      ||| || |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9644668 --aacgaccttagttggaaatctggcttgtactcgccatagcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 9644585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 195
Target Start/End: Original strand, 13635123 - 13635298
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | || ||| || |||| ||||||  |||| ||| ||  |||||||||||||            
T  13635123 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacccttaggtgtctactaaaaattagagaatgatttataacaagattgaacctgg-------- 13635214  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
      |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13635215 --aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgaacagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 13635298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 195
Target Start/End: Original strand, 48593110 - 48593285
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||| || ||  || |||||||||||  |||| ||||||  |||||||||||||            
T  48593110 ttttgacttttgagttgaaccttggatgtctttgagtacctttaggtgcctactaaagattagagaatgatttagaacaagattgaacctgg-------- 48593201  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
      ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48593202 --aacgaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 48593285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 6801664 - 6801490
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || |   ||||||   |||| |||||| ||||||||||||||            
T  6801664 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctacttttgattagggaatgatttagaacgagattgaacctgg-------- 6801573  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
      |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6801572 --aacaaccttagttgggattttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 6801490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 26292847 - 26292673
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  |||||||  |||| |||||||||||||||||||||            
T  26292847 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaatgagattgaacctgg-------- 26292756  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
      |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  26292755 --aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcaaatgctctcgcctcgcgagcacatccagaattgagtgc 26292673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 13149606 - 13149433
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  ||||||   |||| |||||| ||||||||||||||            
T  13149606 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctgg-------- 13149515  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
      |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13149514 --aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 13149433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 11987664 - 11987489
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  | |||||  |||| |||||| || |||||||||||            
T  11987664 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgtttagagaatgatttagaacgaaattgaacctgg-------- 11987573  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
      |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11987572 --aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcaaatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 11987489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Original strand, 18456326 - 18456526
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   |||||||||| ||    
T  18456326 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttg 18456425  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaaga 477  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  18456426 acttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctatc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 18456524  T
Q  478 tg 479  Q
    ||    
T  18456525 tg 18456526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 42205569 - 42205394
Alignment:
Q  7 taattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttag 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  || |||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||          
T  42205569 taattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgttttctatagattagaggatgatttagaacaagattgaacctg------ 42205476  T
Q  107 cttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagt 192  Q
        |||||||  ||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  42205475 ----gaacaaccatagttggaattctggcaagtacgcgccatggcgagcagttgctctcgcctcgcggacacttccagaactgagt 42205394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Original strand, 9445816 - 9445982
Alignment:
Q  14 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||  |||||||||||||          ||    
T  9445816 gacttttgagttgaaccttagatgctttcgagtagctttagatgtttactaaagattagaggttgatttagaacaagattgaacctgg----------aa 9445905  T
Q  114 caactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 190  Q
    |||| |||||||| | |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9445906 caaccttagttggaaatctggaaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 9445982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 15728776 - 15728603
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  | |||||   ||| ||||| |||||||||||||||            
T  15728776 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgtttagagattgatttagattgagattgaacctgg-------- 15728685  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
      |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15728684 --aacaaccttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 15728603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 268 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 26212217 - 26212016
Alignment:
Q  268 aagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatgca 366  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||  | | |||| ||       
T  26212217 aagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattataatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 26212118  T
Q  367 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtc 463  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  26212117 taagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgtatgagtcggtc 26212019  T
Q  464 taa 466  Q
    |||    
T  26212018 taa 26212016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 6 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 3272268 - 3272173
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||    
T  3272268 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttaataaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctgg 3272173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 203
Target Start/End: Original strand, 18712 - 18895
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  ||||||   |||| |||||| |||||||||  |||            
T  18712 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaaattgg-------- 18803  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagga 203  Q
      |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18804 --aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctcttgcctcgcgagcacttccagaactgagtgctattgagga 18895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 281 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 10589246 - 10589059
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 380  Q
    ||||||||||||||   |||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |     ||||||||| |||    
T  10589246 taatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattgcttgaagaatatttgaacattgaagatgttgttga 10589147  T
Q  381 attgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||| | ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  10589146 attgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaa 10589059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 112 - 194
Target Start/End: Original strand, 16438780 - 16438862
Alignment:
Q  112 aacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16438780 aacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttcctgaactgagtgc 16438862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 8917878 - 8917704
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||  || ||  |||||||  |||| |||||| ||||||||||||||            
T  8917878 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacctgg-------- 8917787  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
      ||| || ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8917786 --aacgaccttagtaggaattctggcttgtactcgcaatggcgagctgatgctcttgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 8917704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 13462213 - 13462039
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||  || ||  |||| ||  |||| |||||| ||||||||||| ||            
T  13462213 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgcctactattgattggagaatgatttagaacgagattgaacccgg-------- 13462122  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
      ||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13462121 --aactaccttagttggaattctggcttgtactcaccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 13462039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18557423 - 18557249
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatga-tgacttagaatgagattgaacctggtttagct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| || ||| || ||  |||| | ||| ||| |||||| ||||||||||||             
T  18557423 ttttgacttttgagttgaaccttagaggcctttgagtacctttaggtgtctactattgatt-gctgaatgatttagaacgagattgaacct--------- 18557334  T
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
     ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18557333 -agaacaaccgtagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgc 18557249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 16724285 - 16724459
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |   || ||  |||||||  |||| ||||||  |||||||||||||            
T  16724285 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtaactactattgattagagaatgatttagaacaagattgaacctgg-------- 16724376  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
      |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16724377 --aacaaccttagttggaattctggcttgaactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcactttcagaactgagtgc 16724459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 17701299 - 17701473
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |   || ||  |||||||  |||| ||||||  |||||||||||||            
T  17701299 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtaactactattgattagagaatgatttagaacaagattgaacctgg-------- 17701390  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
      |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17701391 --aacaaccttagttggaattctggcttgaactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcactttcagaactgagtgc 17701473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Original strand, 20569255 - 20569420
Alignment:
Q  15 acttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaac 114  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||| | ||||| ||||||  |||||||||||||          |||    
T  20569255 acttttgagttgaacttttgatgcttttgagtacctttagatgtctactaaagattataggatgatttagaactagattgaacctgg----------aac 20569344  T
Q  115 aactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 190  Q
    ||| |||||||  | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20569345 aaccttagttgaaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttctagaactga 20569420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 111 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 14217275 - 14217192
Alignment:
Q  111 gaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14217275 gaacaaccttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcacctcgcgagcacttccagaactgagtgc 14217192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Original strand, 16906860 - 16907027
Alignment:
Q  16 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  |||||||  |||| |||||| ||||||||||||          ||||||    
T  16906860 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacct----------agaaca 16906949  T
Q  116 actttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
    || |||||||| |   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16906950 accttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 16907027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18279850 - 18279683
Alignment:
Q  16 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  |||||||  |||| |||||| ||||||||||||          ||||||    
T  18279850 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacct----------agaaca 18279761  T
Q  116 actttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
    || |||||||| |   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18279760 accttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 18279683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 298 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 38227671 - 38227501
Alignment:
Q  298 taagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataa 396  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||| | | | ||||| |||||| ||  ||| ||   |||||||||| ||| ||| ||||||||| |    
T  38227671 taagatatgttgatgttgattaagatgtgatataatgatatgtacattaattgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatta 38227572  T
Q  397 ttatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38227571 ttatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 38227501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 298 - 479
Target Start/End: Original strand, 3564294 - 3564478
Alignment:
Q  298 taagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataa 396  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||| | ||||||| || ||||||||||||  |||  |||||   | |||||||| ||| ||  ||||||||| |    
T  3564294 taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatctaatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttacatttgatatta 3564393  T
Q  397 ttatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    |||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||    
T  3564394 ttatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 3564478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 16583686 - 16583550
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| || |||||||||||  |||| ||||||  ||||||||||||             
T  16583686 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagagaatgatttagaacaagattgaacctg--------- 16583596  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagca 156  Q
     ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16583595 -gaacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagca 16583550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 12719115 - 12718948
Alignment:
Q  16 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| || ||  || ||  |||||||  |||| |||||| ||||||||||||          ||||||    
T  12719115 cttttgagttgaaccttagatgtctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacct----------agaaca 12719026  T
Q  116 actttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
    || |||||||| |   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12719025 accttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 12718948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 12724026 - 12723859
Alignment:
Q  16 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| || ||  || ||  |||||||  |||| |||||| ||||||||||||          ||||||    
T  12724026 cttttgagttgaaccttagatgtctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacct----------agaaca 12723937  T
Q  116 actttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
    || |||||||| |   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12723936 accttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 12723859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 16114688 - 16114521
Alignment:
Q  16 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  |||||||  |||| |||||| ||||||||||||          ||||||    
T  16114688 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactatcgattagagaatgatttagaacgagattgaacct----------agaaca 16114599  T
Q  116 actttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
    || |||||||| |   |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16114598 accttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcaaatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 16114521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 16117841 - 16117674
Alignment:
Q  16 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  |||||||  |||| |||||| ||||||||||||          ||||||    
T  16117841 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactatcgattagagaatgatttagaacgagattgaacct----------agaaca 16117752  T
Q  116 actttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
    || |||||||| |   |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16117751 accttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcaaatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 16117674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18283813 - 18283646
Alignment:
Q  16 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||  || ||  |||||||  |||| |||||| ||||||||||||          ||||||    
T  18283813 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctataggtgcctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacct----------agaaca 18283724  T
Q  116 actttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
    || |||||||| |   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18283723 accttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 18283646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 369 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 48273508 - 48273396
Alignment:
Q  369 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 465  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  48273508 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtcta 48273410  T
Q  466 aaatgattaagatg 479  Q
    |  |||||||||||    
T  48273409 agttgattaagatg 48273396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 12715311 - 12715144
Alignment:
Q  16 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaaca 115  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||  || ||  |||||||  |||| |||||| ||||||||||||          ||||||    
T  12715311 cttttgagttgaaccttaaatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacct----------agaaca 12715222  T
Q  116 actttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
    || |||||||| |   |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12715221 accttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctcttgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 12715144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 414 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 67817 - 67752
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  67817 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 67752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 414 - 479
Target Start/End: Original strand, 28505347 - 28505412
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  28505347 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatg 28505412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 11262691 - 11262615
Alignment:
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 185  Q
    ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11262691 tagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 11262615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 185
Target Start/End: Original strand, 11548010 - 11548086
Alignment:
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 185  Q
    ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11548010 tagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 11548086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 185
Target Start/End: Original strand, 11554606 - 11554682
Alignment:
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 185  Q
    ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11554606 tagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 11554682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 12692858 - 12692782
Alignment:
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 185  Q
    ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12692858 tagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 12692782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 14953560 - 14953484
Alignment:
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 185  Q
    ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14953560 tagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 14953484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 111 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 16275852 - 16275772
Alignment:
Q  111 gaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgag 191  Q
    ||||||| ||||||||||   ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16275852 gaacaaccttagttgggaagttggcttgtacttgccatggcgaacagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgag 16275772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 373 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 13647440 - 13647345
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13647440 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 13647345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 373 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 24275282 - 24275172
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  24275282 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 24275185  T
Q  470 gattaagatgttg 482  Q
    |||||||||||||    
T  24275184 gattaagatgttg 24275172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 369 - 466
Target Start/End: Original strand, 2280121 - 2280220
Alignment:
Q  369 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  2280121 agatgttgttgatttgcatttgatattattatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 2280220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 109 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 14959526 - 14959450
Alignment:
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 185  Q
    ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  14959526 tagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcactttcaga 14959450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 109 - 185
Target Start/End: Original strand, 25038953 - 25039029
Alignment:
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 185  Q
    ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25038953 tagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggtgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 25039029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 34200858 - 34200806
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34200858 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 34200806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 101
Target Start/End: Original strand, 12756355 - 12756450
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||   |  |  ||||||||||||||||||||    
T  12756355 gtaattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgg 12756450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 367 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 16213801 - 16213682
Alignment:
Q  367 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtc 463  Q
    ||||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16213801 taagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16213704  T
Q  464 taaaatgattaagatgttgagg 485  Q
    |||  ||||||||||| |||||    
T  16213703 taagttgattaagatgatgagg 16213682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 72
Target Start/End: Original strand, 16385895 - 16385962
Alignment:
Q  5 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  16385895 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 16385962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 35151945 - 35151894
Alignment:
Q  132 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttcca 183  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35151945 tggcttgtactcgccatggtgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttcca 35151894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 367 - 466
Target Start/End: Original strand, 16219717 - 16219818
Alignment:
Q  367 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtct 464  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16219717 taagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtct 16219816  T
Q  465 aa 466  Q
    ||    
T  16219817 aa 16219818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 414 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 16495474 - 16495409
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  16495474 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 16495409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Original strand, 17061966 - 17062073
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatg 470  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  17061966 gttgctgacttgcatttgatattattatgtcatgctattttgtatactgctga-gttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 17062064  T
Q  471 attaagatg 479  Q
    |||||||||    
T  17062065 attaagatg 17062073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 414 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 47831879 - 47831814
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  47831879 atactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 47831814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Original strand, 811180 - 811232
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  811180 atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 811232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 101
Target Start/End: Original strand, 17061601 - 17061693
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctgg 101  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||   |  |  ||||||||||||||||||||    
T  17061601 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgg 17061693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 18005718 - 18005666
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18005718 atactgcttatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 18005666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 44014250 - 44014198
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44014250 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 44014198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 456432 - 456325
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  456432 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 456335  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  456334 gattaagatg 456325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Original strand, 11393338 - 11393445
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  11393338 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 11393435  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  11393436 gattaagatg 11393445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 11972607 - 11972500
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  11972607 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 11972510  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  11972509 gattaagatg 11972500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Original strand, 14949173 - 14949280
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  14949173 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 14949270  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  14949271 gattaagatg 14949280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Original strand, 15376764 - 15376871
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  15376764 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 15376861  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  15376862 gattaagatg 15376871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 101
Target Start/End: Original strand, 15754529 - 15754620
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctgg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||   |  |  ||||||||||||||||||||    
T  15754529 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaaagtagaatgagattgaacctgg 15754620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 16232631 - 16232524
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  16232631 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 16232534  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  16232533 gattaagatg 16232524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 16410170 - 16410063
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  16410170 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 16410073  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  16410072 gattaagatg 16410063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 18640383 - 18640276
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  18640383 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 18640286  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  18640285 gattaagatg 18640276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Original strand, 20385174 - 20385281
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  20385174 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 20385271  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  20385272 gattaagatg 20385281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Original strand, 21189646 - 21189753
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  21189646 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 21189743  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  21189744 gattaagatg 21189753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 72
Target Start/End: Original strand, 28504938 - 28505005
Alignment:
Q  5 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  28504938 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 28505005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 32125602 - 32125495
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  32125602 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 32125505  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  32125504 gattaagatg 32125495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 40443856 - 40443765
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctgg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||   |  | |||| ||||||||||||||||    
T  40443856 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatttaggatgagattgaacctgg 40443765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 41523028 - 41522921
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  41523028 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 41522931  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  41522930 gattaagatg 41522921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 41525490 - 41525383
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  41525490 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 41525393  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  41525392 gattaagatg 41525383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 24704796 - 24704692
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgat 472  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||| || | ||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  24704796 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24704699  T
Q  473 taagatg 479  Q
    |||||||    
T  24704698 taagatg 24704692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 26212469 - 26212424
Alignment:
Q  5 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26212469 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcct 26212424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 13869444 - 13869344
Alignment:
Q  386 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatgttg 482  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||    
T  13869444 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 13869347  T
Q  483 agg 485  Q
    |||    
T  13869346 agg 13869344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 50
Target Start/End: Original strand, 27847486 - 27847526
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27847486 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 27847526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 38227960 - 38227868
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctgg 101  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||   |  |  ||||||||||||||||||||    
T  38227960 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgg 38227868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 9509669 - 9509606
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  9509669 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 9509606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 12699312 - 12699249
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  12699312 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 12699249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 369 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 18430827 - 18430716
Alignment:
Q  369 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 465  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |   ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18430827 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 18430730  T
Q  466 aaatgattaagatg 479  Q
    |  |||||||||||    
T  18430729 agttgattaagatg 18430716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 369 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 22073033 - 22072920
Alignment:
Q  369 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 465  Q
    |||||||| ||| ||  |||||||||  |||| ||||||||   ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||    
T  22073033 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagtcta 22072934  T
Q  466 aaatgattaagatg 479  Q
    |  |||||||||||    
T  22072933 agttgattaagatg 22072920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 24702349 - 24702242
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  24702349 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 24702252  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  24702251 gattaagatg 24702242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 27216971 - 27216864
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||  |    
T  27216971 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagtt 27216874  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  27216873 gattaagatg 27216864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 44116620 - 44116513
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||  |    
T  44116620 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtt 44116523  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  44116522 gattaagatg 44116513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 72
Target Start/End: Original strand, 11995700 - 11995762
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  11995700 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 11995762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 13831423 - 13831377
Alignment:
Q  433 ttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  13831423 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatg 13831377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 369 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 16056446 - 16056348
Alignment:
Q  369 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt-gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||  |||| ||||| |||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  16056446 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgtttgcataatgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggtctaa 16056348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 50
Target Start/End: Original strand, 2831947 - 2831988
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2831947 attttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcct 2831988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 50
Target Start/End: Original strand, 9751191 - 9751232
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9751191 attttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcct 9751232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 18006124 - 18006059
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagatta 71  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  18006124 gtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 18006059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 34201262 - 34201225
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtg 47  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34201262 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtg 34201225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 50
Target Start/End: Original strand, 810767 - 810811
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  810767 gtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcct 810811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Original strand, 11996076 - 11996128
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  11996076 atactgcctatgttgttgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaa 11996128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 410 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 12901399 - 12901347
Alignment:
Q  410 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 462  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  12901399 ttgtatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggt 12901347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 175
Target Start/End: Original strand, 15143795 - 15143843
Alignment:
Q  127 gattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 175  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15143795 gattctgacctgtactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 15143843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 18302529 - 18302489
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactt 180  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18302529 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcactt 18302489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 18302661 - 18302617
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18302661 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcccttgagtgcct 18302617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 424 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 3386391 - 3386337
Alignment:
Q  424 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  3386391 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 3386337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Original strand, 3564005 - 3564068
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  3564005 attttgacttttgagttgattcttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 3564068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 415 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 14044817 - 14044766
Alignment:
Q  415 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  14044817 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 14044766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 415 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 14354847 - 14354796
Alignment:
Q  415 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  14354847 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 14354796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 368 - 433
Target Start/End: Original strand, 2530139 - 2530205
Alignment:
Q  368 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctatgttgctgtt 433  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||    
T  2530139 aagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttgtatgttgcctatgttgctgtt 2530205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 414 - 456
Target Start/End: Original strand, 12255842 - 12255884
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 456  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12255842 atactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatga 12255884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 20110606 - 20110560
Alignment:
Q  433 ttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  20110606 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 20110560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 44014657 - 44014591
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  44014657 gtaattttgacttttgagttgatacttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 44014591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 47832291 - 47832225
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  47832291 gtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 47832225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 51
Target Start/End: Original strand, 11044 - 11085
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctt 51  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  11044 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctt 11085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 413 - 466
Target Start/End: Original strand, 1868043 - 1868096
Alignment:
Q  413 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  1868043 tatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 1868096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 415 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 14036325 - 14036284
Alignment:
Q  415 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 456  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14036325 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatga 14036284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 415 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 14346355 - 14346314
Alignment:
Q  415 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 456  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14346355 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatga 14346314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 16275943 - 16275902
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctt 51  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16275943 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctt 16275902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 35152057 - 35152016
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctt 51  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  35152057 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctt 35152016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 50
Target Start/End: Original strand, 39267287 - 39267328
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  39267287 attttgacttttgagttgaaccttatatgcctttgagtgcct 39267328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 157 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 39722581 - 39722544
Alignment:
Q  157 gatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39722581 gatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtgc 39722544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 186
Target Start/End: Original strand, 4318317 - 4318365
Alignment:
Q  138 gtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaa 186  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  4318317 gtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccagaa 4318365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 415 - 471
Target Start/End: Original strand, 20220238 - 20220294
Alignment:
Q  415 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatga 471  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  20220238 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgtatgagtcggtctaagatga 20220294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 176
Target Start/End: Original strand, 28505071 - 28505107
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 176  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28505071 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc 28505107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 369 - 479
Target Start/End: Original strand, 38898423 - 38898535
Alignment:
Q  369 agatgttgat-gaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtct 464  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||| | ||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  38898423 agatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgc-tgtgtcgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggttt 38898520  T
Q  465 aaaatgattaagatg 479  Q
    ||  |||||||||||    
T  38898521 aagttgattaagatg 38898535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 44116872 - 44116820
Alignment:
Q  123 ttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 175  Q
    |||||| |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44116872 ttgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 44116820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 179
Target Start/End: Original strand, 2832075 - 2832114
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcact 179  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2832075 actcaccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcact 2832114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 466
Target Start/End: Original strand, 10063841 - 10063919
Alignment:
Q  390 gatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||  |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| || ||||||    
T  10063841 gatattattatatcatgatgttgtgcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaa 10063919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 14194760 - 14194729
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatg 37  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14194760 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatg 14194729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 423 - 466
Target Start/End: Original strand, 15144096 - 15144138
Alignment:
Q  423 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15144096 atgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 15144138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 179
Target Start/End: Original strand, 39267416 - 39267455
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcact 179  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  39267416 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgggagcact 39267455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 40443754 - 40443703
Alignment:
Q  124 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 175  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  40443754 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 40443703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 413 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 48991253 - 48991210
Alignment:
Q  413 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 456  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  48991253 tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatga 48991210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 68229 - 68163
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  68229 gtaattttgacttttgagttgatccttaaatgttttcgagtgcctgaatatgtctaataatgattag 68163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 413 - 463
Target Start/End: Original strand, 15008547 - 15008597
Alignment:
Q  413 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtc 463  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  15008547 tatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 15008597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 408 - 466
Target Start/End: Original strand, 18154885 - 18154942
Alignment:
Q  408 tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||  |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18154885 tgttgtaatctgcctatgttgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaa 18154942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 18531581 - 18531531
Alignment:
Q  135 cttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 185  Q
    |||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||||||    
T  18531581 cttgtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacttccaga 18531531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 177
Target Start/End: Original strand, 11995800 - 11995837
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagca 177  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  11995800 actcgccatggcaagcagaggctctcgcctcgcgagca 11995837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 101
Target Start/End: Original strand, 15143677 - 15143770
Alignment:
Q  9 attttgactttt-gagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctgg 101  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||| || ||| ||||||   |    |||||||||||||||||||||    
T  15143677 attttgactttttgagttgtaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattttagaatgagattgaacctgg 15143770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 51
Target Start/End: Original strand, 16438688 - 16438729
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctt 51  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16438688 ttttaacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctt 16438729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 38227844 - 38227795
Alignment:
Q  126 ggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 175  Q
    |||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  38227844 ggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 38227795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 138 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 33441 - 33385
Alignment:
Q  138 gtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
    ||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  33441 gtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccagaattgagtgc 33385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 68096 - 68060
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 176  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  68096 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 68060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 138 - 194
Target Start/End: Original strand, 70537 - 70593
Alignment:
Q  138 gtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
    ||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  70537 gtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccagaattgagtgc 70593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 138 - 194
Target Start/End: Original strand, 74646 - 74702
Alignment:
Q  138 gtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
    ||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  74646 gtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccagaattgagtgc 74702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 180
Target Start/End: Original strand, 810900 - 810940
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactt 180  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  810900 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtactt 810940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 176
Target Start/End: Original strand, 9389466 - 9389502
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 176  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  9389466 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 9389502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 176
Target Start/End: Original strand, 9751320 - 9751356
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 176  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  9751320 actcgccatggtgagcagaggctctcgcctcgcgagc 9751356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 109 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 14148932 - 14148856
Alignment:
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 185  Q
    ||||||||| |||||| |||   || || ||||||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||||||||||    
T  14148932 tagaacaacattagtttggaaattgactggtactcgccatggcgagtaggaactcccgcctcgcgagcacttccaga 14148856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Original strand, 15754936 - 15754988
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15754936 atactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaa 15754988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 47
Target Start/End: Original strand, 16219355 - 16219395
Alignment:
Q  7 taattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtg 47  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  16219355 taattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtg 16219395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 34201134 - 34201098
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 176  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  34201134 actcgccatggcgagcagaggctcttgcctcgcgagc 34201098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 150)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 5 - 400
Target Start/End: Original strand, 15121441 - 15121834
Alignment:
Q  5 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggttt 104  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15121441 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgatgacttagagtgagattgaacctggttt 15121540  T
Q  105 agcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |     
T  15121541 agcttagaacaactttagttgggaatctggcttgtactcgccatggtgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtgcaagtgagaac 15121640  T
Q  205 aatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagata 304  Q
      |||||||||||||| || | ||  ||||| ||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| ||| || |    
T  15121641 tttgcgatctgtgtcgaataacttgtttagacatggaccattaggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaggctg-atatgaga 15121739  T
Q  305 tgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattat 400  Q
    ||||   ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15121740 tgtttgagttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaa-ttgatataattat 15121834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 13569997 - 13569703
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13569997 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaaggtggttattaaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctg 13569898  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13569897 gtttagcttagaacaacattagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 13569798  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    ||| | ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  13569797 ggatattgcgatccgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtattaatgtgacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg 13569703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 15094258 - 15093911
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  15094258 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgataacttggaatgagattgaacctg 15094159  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  15094158 gtatagcttagaacaactttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccaaaactgagtgcaagtta 15094059  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataa 300  Q
    ||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||  ||     
T  15094058 ggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttggttagtaatgtgacctatataagaagttaactgcaatctctgaagctg-ttat 15093960  T
Q  301 gatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattactt 348  Q
    || |||||  |||||| ||||| ||| ||||||||| | ||||||||||    
T  15093959 gaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattactt 15093911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12570506 - 12570212
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12570506 attctgtatttttgacttgtgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatatttattaaagattagatgatgacttagagtgagattgaacctg 12570407  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12570406 gtttagcttagaacaactttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 12570307  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    | |   ||||| ||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| || ||||  || ||||||||||||||    
T  12570306 gaactttgcgacctgtgtcgcataacttgtttagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatataggatgttaactgcaatctgtgaagctg 12570212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 44676117 - 44675823
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44676117 attctatatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaatgattaaatgataacttagaatgagattgaacctg 44676018  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44676017 gtttagcttagaacaacattagttgggaatctggctagtactccccatggcgagcagatgctctcacctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 44675918  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    |||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | || | ||||| ||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  44675917 ggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctaggtagtaatgtgacctatttaagaagttaactgcaatctgtgaagctg 44675823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 23843964 - 23843669
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagatt-gaacct 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  23843964 attctgtacttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgttcattaatgattaaatgataacttggaatgagatttgaacct 23843865  T
Q  100 ggtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtg 199  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23843864 ggtttagcttagaacaacattagttgaaaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtg 23843765  T
Q  200 aggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    ||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||    
T  23843764 aggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtggtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctg 23843669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Original strand, 16356587 - 16356881
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  16356587 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatttagaacgagattgaacctg 16356686  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  16356687 gtttagcttagaacaacttaagctggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagtta 16356786  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    | |   |||||||||| |||||| | || ||||| | ||||||||| || | ||||| ||||||| ||||| ||||  || ||||||||||||||    
T  16356787 gtatgttgcgatctgtttcgcataagttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctg 16356881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 16487712 - 16488005
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  16487712 attctgtatttttgacttttgagttaaaccttagatgcctttgggtgcctaaagatgtttattaaagattagatgatgatttagaacgagattgaacctg 16487811  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  16487812 ttttagcttagaaccactttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagtta 16487911  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagct 294  Q
    |||   |||||||||| |||||| | || ||| | ||||||||||| || | ||||| | ||||| ||||| |||| |||  ||||||||||||    
T  16487912 ggatgttgcgatctgtttcgcataagttgatttgggatggacccttaggtagtaatgtgtcctatttaagatgttaattgagatctgtgaagct 16488005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 15124790 - 15125036
Alignment:
Q  3 tctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggt 102  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  15124790 tctgtacttttgacctttgagtcgaaccttagatatttttgagtgcctgaagatgcctattaaagattaaatgataacttagaacgagattgaacctggt 15124889  T
Q  103 ttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagg 202  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15124890 ttagcttagaacaacattagttgggaatctggcttgtactcgccatggcaagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagg 15124989  T
Q  203 aaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttggg 249  Q
    | | | |||| |||||||||| ||||  |||||| ||||||| ||||    
T  15124990 atatttcgatatgtgtcgcataatttgtttagagttggacccctggg 15125036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 17046692 - 17046494
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17046692 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtttatacattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 17046593  T
Q  381 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  17046592 attgaatttgatataattatgtcatgttgttctatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 17046494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Original strand, 14053215 - 14053415
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataag-atgttgatg 379  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  14053215 taatctgtgaagccgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatgcataagaatgttgatg 14053314  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagat 478  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||| | |||||    
T  14053315 aattgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagatgttgaagat 14053414  T
Q  479 g 479  Q
    |    
T  14053415 g 14053415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 16348326 - 16348470
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  16348326 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatatttattaaagattagatgatgatttagaacgagattgaacctg 16348425  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgc 145  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  16348426 gtttagcttagaacaacttaagctggaattctggcttgtactcgc 16348470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 195
Target Start/End: Original strand, 36133616 - 36133791
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  |  ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||            
T  36133616 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctgctaaagattagaggatgacttagaacaagattgaacctgg-------- 36133707  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
      |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36133708 --aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 36133791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 194
Target Start/End: Original strand, 11250219 - 11250389
Alignment:
Q  14 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||          ||    
T  11250219 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtttactaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctgg----------aa 11250308  T
Q  114 caactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
    |||| |||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11250309 caaccttagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 11250389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 268 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 12902978 - 12902777
Alignment:
Q  268 aagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattacttgaagaatgtttgtatgca 366  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||       
T  12902978 aagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatt 12902879  T
Q  367 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtc 463  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12902878 taagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 12902780  T
Q  464 taa 466  Q
    |||    
T  12902779 taa 12902777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 268 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 7089098 - 7088884
Alignment:
Q  268 aagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatgca 366  Q
    |||| |||| || |||||||||||| ||  |||||| |||||||| | ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||       
T  7089098 aagaggttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgttgctaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatg 7088999  T
Q  367 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtc 463  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7088998 taagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 7088900  T
Q  464 taaaatgattaagatg 479  Q
    |||  |||| ||||||    
T  7088899 taagttgatgaagatg 7088884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Original strand, 16351506 - 16351672
Alignment:
Q  14 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||          |||    
T  16351506 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtgtattaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctg----------gaa 16351595  T
Q  114 caactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 190  Q
     ||| |||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16351596 taaccttagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 16351672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 192
Target Start/End: Original strand, 19757257 - 19757427
Alignment:
Q  12 ttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttag 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| || ||  ||||||   |||| |||||| ||||||||||||||              
T  19757257 ttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctgg---------- 19757346  T
Q  112 aacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagt 192  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19757347 aacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagt 19757427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 19782549 - 19782379
Alignment:
Q  12 ttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttag 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| || ||  ||||||   |||| |||||| ||||||||||||||              
T  19782549 ttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctgg---------- 19782460  T
Q  112 aacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagt 192  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19782459 aacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagt 19782379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 195
Target Start/End: Original strand, 1951415 - 1951590
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| || ||  |||||||  |||| |||||| ||||||||||||||            
T  1951415 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacctgg-------- 1951506  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
      ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1951507 --aacgaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcttcgcgagcacttccagaactgagtgca 1951590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 194
Target Start/End: Original strand, 15352964 - 15353134
Alignment:
Q  14 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || | | ||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||          ||    
T  15352964 gacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttagttatgtattaaagatttgaggatgacttagaacaagattgaacctgg----------aa 15353053  T
Q  114 caactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
    ||||  ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15353054 caaccatagttggaaacctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 15353134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 186
Target Start/End: Original strand, 16243054 - 16243220
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  |||||||  |||| |||||||||||||||||||              
T  16243054 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctaatattgattagagaatgatttagaatgagattgaacct---------- 16243143  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaa 186  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16243144 agaacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaa 16243220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 26243319 - 26243493
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  ||||||   |||| |||||| ||||||||||||||            
T  26243319 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgaattagaacgagattgaacctgg-------- 26243410  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26243411 --aacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcaagcacttccagaactgagtgc 26243493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 17152141 - 17152315
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| || ||  |||||  ||||||   |||  |||||| ||||||||||||||            
T  17152141 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgactacctttaggtgcctattattgattagggaatgttttagaacgagattgaacctgg-------- 17152232  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17152233 --aacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgttctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 17152315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18237344 - 18237170
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  ||||| |  |||| |||||| ||||||||||||||            
T  18237344 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattatagaatgatttagaacgagattgaacctgg-------- 18237253  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
      |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18237252 --aacaaccttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 18237170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 25555964 - 25555798
Alignment:
Q  14 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaa 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||          |||    
T  25555964 gactttttagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtgtattaaagattagaggatgacttagaacaagattgaacctg----------gaa 25555875  T
Q  114 caactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 190  Q
    |||   ||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25555874 caatcatagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcacgagcacttccagaactga 25555798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 45938599 - 45938425
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | || ||| || |   ||||||   |||| |||||| ||||||||||||              
T  45938599 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacccttaggtgtctactgttgattagtgaatgatttagaacgagattgaacct---------- 45938510  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45938509 agaacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactaagtgc 45938425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 2015230 - 2015057
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  |||||||  |||| |||||||||||||||||||||            
T  2015230 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaatgagattgaacctgg-------- 2015139  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
      |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2015138 --aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggtgagcagacgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 2015057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 22636642 - 22636442
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||    
T  22636642 taatctgtgaagctgt-taagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 22636544  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaag 476  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||   ||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||    
T  22636543 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgtctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 22636445  T
Q  477 atg 479  Q
    |||    
T  22636444 atg 22636442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 23139722 - 23139548
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  || |||   |||| |||||| || |||||||||||            
T  23139722 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgactagggaatgaattagaacgatattgaacctgg-------- 23139631  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23139630 --aacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcggatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 23139548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Original strand, 18222032 - 18222205
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  ||||||   |||| |||||| ||||||||||||||            
T  18222032 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctgg-------- 18222123  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
      |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18222124 --aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 18222205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 44053037 - 44052836
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||||||||||||  |||||| || || |||||||||||| ||| ||||||||| |  |||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||    
T  44053037 taatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 44052938  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaag 476  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||  |||| |||    
T  44052937 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgatg-ttgttatttaactgagctgcatgagtcggcctaagttgatgaag 44052839  T
Q  477 atg 479  Q
    |||    
T  44052838 atg 44052836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 281 - 466
Target Start/End: Original strand, 16377436 - 16377622
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    ||||||||| |||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  |||||   | |||||||| ||    
T  16377436 taatctgtggagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttg 16377535  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt-gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    | ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16377536 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 16377622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 281 - 466
Target Start/End: Original strand, 23374272 - 23374460
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||| |||||||   |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||  | | |||| ||   |||||||||| ||    
T  23374272 taatctctgaagctttttaagatctgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttg 23374371  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  23374372 aattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgttctaa 23374460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Original strand, 16270149 - 16270349
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   |||||||||| |     
T  16270149 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgtta 16270248  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaaga 477  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||| ||||    
T  16270249 acttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaaga 16270347  T
Q  478 tg 479  Q
    ||    
T  16270348 tg 16270349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 111 - 192
Target Start/End: Original strand, 16678334 - 16678415
Alignment:
Q  111 gaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagt 192  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16678334 gaacaactttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaaaactgagt 16678415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 109 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 9556893 - 9556809
Alignment:
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9556893 tagaacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 9556809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 107 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 3413161 - 3413078
Alignment:
Q  107 cttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 190  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3413161 cttagaacaaccttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 3413078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 9530886 - 9530711
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagct 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  |||||||  |||| |||||| ||||||||||||             
T  9530886 attttgacttttgagatgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactactgattagagaatgatttagaacgagattgaacct--------- 9530796  T
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
     |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9530795 -agaacaaccttagttggaattctggcttatactcgccatggcgagatgatgctctcacctcgcgagcacttccagaactgagtgc 9530711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 195
Target Start/End: Original strand, 43255814 - 43255990
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  |||||||  |||| |||||| ||||||||||||              
T  43255814 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacct---------- 43255903  T
Q  110 agaacaactttagttgg---gattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
    |||||||| ||||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43255904 agaacaaccttagttggaaagatt--ggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgca 43255990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Original strand, 18602399 - 18602569
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||  || ||  |||||||  |||  |||||| |||||||||| |              
T  18602399 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgcctactactgattagagaatgttttagaacgagattgaacat---------- 18602488  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 190  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18602489 agaacaaccttggttggaattctagcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccaaaactga 18602569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 305 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 7798958 - 7798781
Alignment:
Q  305 tgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtc 403  Q
    ||||| |||||||||||  ||| || |||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   |||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||    
T  7798958 tgttgatgttgattatgttgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtc 7798859  T
Q  404 atgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||    
T  7798858 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 7798781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 181
Target Start/End: Original strand, 18608993 - 18609154
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||  || ||  |||||||  |||  |||||| ||||||||||          ||    
T  18608993 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgcctactactgattagagaatgttttagaacgagattgaac----------tt 18609082  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttc 181  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  18609083 agaacaaccttggttggaattctggcttgtactcgccatggcgagctggtgctctcgcctcgcgagcacttc 18609154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Original strand, 28569098 - 28569271
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  |||||    |||| || ||||||||||||||||||            
T  28569098 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattaaggaatgatttggaatgagattgaacctgg-------- 28569189  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
      |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  28569190 --aacaaccttagttgggaagctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcttcgtgagcacttccagaattgagtg 28569271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Original strand, 4560993 - 4561160
Alignment:
Q  16 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  |||||||  |||| |||||| ||||||||||          ||||||||    
T  4560993 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaac----------ttagaaca 4561082  T
Q  116 actttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
    || |||||||| |   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4561083 accttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 4561160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 33742824 - 33742657
Alignment:
Q  16 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  |||||||  |||| |||||| ||||||||||||          ||||||    
T  33742824 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacct----------agaaca 33742735  T
Q  116 actttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
    || |||||||| |   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33742734 accttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 33742657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 27534482 - 27534303
Alignment:
Q  5 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggttt 104  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| || |   || ||| ||||||   | || | |||||||||||||||||||       
T  27534482 tgtaatttcgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtacctttaggtacctactaatgattaggaaacgattgagaatgagattgaacctgg--- 27534386  T
Q  105 agcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
           |||||| |||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  27534385 -------aacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacatccagaattgagtgc 27534303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 14038856 - 14038655
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||||||||||||  ||| || ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||  |||  |||||   | |||||||| ||    
T  14038856 taatctgtgaagctgtttaacatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttg 14038757  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaag 476  Q
    | ||| ||||||||| |||||| |||| ||   ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||| |||    
T  14038756 acttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaag 14038658  T
Q  477 atg 479  Q
    |||    
T  14038657 atg 14038655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Original strand, 5756597 - 5756764
Alignment:
Q  16 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || | || ||  || ||  |||||||  |||| |||||| ||||||||||||          ||||||    
T  5756597 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacccttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacct----------agaaca 5756686  T
Q  116 actttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
    || |||||||  |   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5756687 accttagttgaaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 5756764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Original strand, 16239883 - 16240083
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    ||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||  || ||||||||| | |||||||||| ||| ||  ||| ||   |||||||||| ||    
T  16239883 taatctgcgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatatgatataatgttatttgcattacttaaagtataattgaatatttaagatgttgttg 16239982  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaaga 477  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||| ||||||| | |||||||  |||| ||||    
T  16239983 acttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctattttgct-attgttatttaattaagttgcatgagttggtctaagttgatgaaga 16240081  T
Q  478 tg 479  Q
    ||    
T  16240082 tg 16240083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 367 - 479
Target Start/End: Original strand, 52873367 - 52873481
Alignment:
Q  367 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtc 463  Q
    ||||||| || ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52873367 taagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 52873465  T
Q  464 taaaatgattaagatg 479  Q
    |||  |||| ||||||    
T  52873466 taagttgatgaagatg 52873481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 23838796 - 23838720
Alignment:
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 185  Q
    ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23838796 tagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 23838720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 369 - 479
Target Start/End: Original strand, 54798756 - 54798868
Alignment:
Q  369 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 465  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  54798756 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgtt-gttattcaactaagctgcatgagtcggtcta 54798854  T
Q  466 aaatgattaagatg 479  Q
    |  |||||||||||    
T  54798855 agttgattaagatg 54798868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 7893908 - 7893710
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| ||   ||||||| |||  |||||| | | |||||||||||||| ||  ||| ||   ||||||| || ||    
T  7893908 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctg---attatgatgtgaaataatggtatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttg 7893812  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaag 476  Q
    | ||| | ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||    
T  7893811 acttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaag 7893713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 370 - 466
Target Start/End: Original strand, 12288211 - 12288311
Alignment:
Q  370 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatg--ctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 465  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||  |||| |||||  |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12288211 gatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 12288310  T
Q  466 a 466  Q
    |    
T  12288311 a 12288311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 191
Target Start/End: Original strand, 14708288 - 14708459
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||   | ||| ||||||   | || |  ||||||||||||||||||            
T  14708288 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcccactaatgattagggaacgaatgggaatgagattgaacctgg-------- 14708379  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgag 191  Q
      |||||| |||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  14708380 --aacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcatttcctgaattgag 14708459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 369 - 471
Target Start/End: Original strand, 13853 - 13957
Alignment:
Q  369 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  13853 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 13952  T
Q  467 aatga 471  Q
     ||||    
T  13953 gatga 13957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 414 - 479
Target Start/End: Original strand, 39706337 - 39706402
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  39706337 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 39706402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 12774079 - 12774027
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12774079 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 12774027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 109 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 14679325 - 14679249
Alignment:
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 185  Q
    ||||||||| ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14679325 tagaacaacattagtagggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 14679249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 109 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 14685534 - 14685458
Alignment:
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 185  Q
    ||||||||| ||| ||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14685534 tagaacaacattatttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 14685458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 15551889 - 15551837
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15551889 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 15551837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 373 - 492
Target Start/End: Original strand, 19618223 - 19618343
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  19618223 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 19618320  T
Q  470 gattaagatgttgaggatgatgt 492  Q
    |||||||||||||| ||| ||||    
T  19618321 gattaagatgttgatgataatgt 19618343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 109 - 185
Target Start/End: Original strand, 41385488 - 41385564
Alignment:
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 185  Q
    ||||||||| ||||||||||   | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41385488 tagaacaacattagttgggaagttcgcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 41385564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 191
Target Start/End: Original strand, 42997195 - 42997275
Alignment:
Q  111 gaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgag 191  Q
    ||||||| |||||||| |   ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42997195 gaacaaccttagttggaaagttggctcgtactcgccatggcgaacagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgag 42997275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Original strand, 52243245 - 52243297
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  52243245 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 52243297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 369 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 14280431 - 14280320
Alignment:
Q  369 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 465  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14280431 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 14280334  T
Q  466 aaatgattaagatg 479  Q
    |  |||||||||||    
T  14280333 agttgattaagatg 14280320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Original strand, 18215325 - 18215432
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  18215325 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 18215422  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  18215423 gattaagatg 18215432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 369 - 479
Target Start/End: Original strand, 44928926 - 44929038
Alignment:
Q  369 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 465  Q
    |||||||  ||| ||| |||||| || ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44928926 agatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 44929024  T
Q  466 aaatgattaagatg 479  Q
    |  |||||||||||    
T  44929025 agttgattaagatg 44929038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 386 - 483
Target Start/End: Original strand, 15355389 - 15355487
Alignment:
Q  386 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatgttg 482  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  15355389 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttg 15355486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 410 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 3096368 - 3096313
Alignment:
Q  410 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3096368 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 3096313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 6190913 - 6190821
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctgg 101  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||  ||  |  ||| ||||||||||||||||    
T  6190913 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggagagaatgtaggatgagattgaacctgg 6190821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 16597133 - 16597033
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||   |  |  |||||||||||||||||||    
T  16597133 attctgtaattttgatttttgaattgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 16597034  T
Q  101 g 101  Q
    |    
T  16597033 g 16597033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 109 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 35614301 - 35614226
Alignment:
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 185  Q
    |||||||||||||||| || || || || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35614301 tagaacaactttagtttggttt-tgtctggtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 35614226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Original strand, 12358 - 12465
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  12358 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 12455  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  12456 gattaagatg 12465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 367 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 6900011 - 6899898
Alignment:
Q  367 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtct 464  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||  ||| ||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  6900011 taagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagatgcatgagtcggtct 6899913  T
Q  465 aaaatgattaagatg 479  Q
    ||  |||| ||||||    
T  6899912 aagttgatgaagatg 6899898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Original strand, 15118403 - 15118510
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  15118403 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 15118500  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  15118501 gattaagatg 15118510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Original strand, 23803316 - 23803423
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  23803316 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23803413  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  23803414 gattaagatg 23803423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 44615399 - 44615292
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgt---tgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  44615399 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 44615302  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  44615301 gattaagatg 44615292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Original strand, 44773138 - 44773245
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  44773138 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 44773235  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  44773236 gattaagatg 44773245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Original strand, 51463919 - 51464026
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  51463919 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 51464016  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  51464017 gattaagatg 51464026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 52312621 - 52312514
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  52312621 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 52312524  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  52312523 gattaagatg 52312514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 72
Target Start/End: Original strand, 14052955 - 14053017
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  14052955 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaatatgtctaataatgattag 14053017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 373 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 3515118 - 3515005
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||   ||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  3515118 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 3515021  T
Q  470 gattaagatgttgagg 485  Q
    |||||||||| |||||    
T  3515020 gattaagatgatgagg 3515005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 175
Target Start/End: Original strand, 21814944 - 21815108
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagct 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||||   |  | ||||||||| | ||||||||| |||  |    
T  21814944 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatttagaatgataatgaacctggattaatt 21815043  T
Q  109 tagaa-caactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 175  Q
     ||||  |||||   || |||  ||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  21815044 aagaatgaactt---tttggaagctgacttgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 21815108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 175
Target Start/End: Original strand, 21815273 - 21815437
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagct 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||||   || | ||||||||| | ||||||||| |||  |    
T  21815273 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtttaataatgattaggaaataatttagaatgataatgaacctggattaatt 21815372  T
Q  109 tagaa-caactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 175  Q
     ||||  |||||   || |||  ||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  21815373 aagaatgaactt---tttggaagctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 21815437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 175
Target Start/End: Original strand, 21818366 - 21818530
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagct 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||||   |  | ||||||||| | ||||||||| |||  |    
T  21818366 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatttagaatgataatgaacctggattaatt 21818465  T
Q  109 tagaa-caactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 175  Q
     ||||  |||||   || |||  ||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  21818466 aagaatgaactt---tttggaagctgacttgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 21818530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 421 - 466
Target Start/End: Original strand, 43198611 - 43198656
Alignment:
Q  421 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43198611 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 43198656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 8846428 - 8846376
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  8846428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaa 8846376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 373 - 492
Target Start/End: Original strand, 14970758 - 14970878
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||| ||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||  |    
T  14970758 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgc-tgttttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagtt 14970855  T
Q  470 gattaagatgttgaggatgatgt 492  Q
    |||||| ||||||| ||||||||    
T  14970856 gattaaaatgttgatgatgatgt 14970878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Original strand, 1837560 - 1837667
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  1837560 gttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 1837657  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  1837658 gattaagatg 1837667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 3096851 - 3096772
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttg 360  Q
    |||| ||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3096851 taatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgagatacaatgtttatgcattacttgaagaatatttg 3096772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 369 - 485
Target Start/End: Original strand, 8574871 - 8574987
Alignment:
Q  369 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8574871 agatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 8574968  T
Q  467 aatgattaagatgttgagg 485  Q
      | ||||||||| |||||    
T  8574969 gttaattaagatgatgagg 8574987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 12774481 - 12774414
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattaga 73  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| |||||||    
T  12774481 gtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaga 12774414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Original strand, 18239470 - 18239577
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  18239470 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgctgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 18239567  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  18239568 gattaagatg 18239577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 19242810 - 19242703
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  19242810 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 19242713  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  19242712 gattaagatg 19242703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Original strand, 50222390 - 50222497
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||| ||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  50222390 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataatgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 50222487  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  50222488 gattaagatg 50222497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 6 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 7089349 - 7089283
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  7089349 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcctatgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 7089283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 6 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 12903228 - 12903163
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  12903228 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgc-tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 12903163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 15552292 - 15552230
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  15552292 ttttgacttttgagttgaaccttatatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 15552230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 6 - 72
Target Start/End: Original strand, 16239630 - 16239696
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  16239630 gtaattttgacttttgagttgctccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 16239696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 294
Target Start/End: Original strand, 16348466 - 16348592
Alignment:
Q  168 ctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatat 267  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| || |   |||||||||| |||||| | || ||||| | ||||||||| || | ||||| ||||||| |    
T  16348466 ctcgcgagcatttccagaactgaatgcaagttagtatgttgcgatctgtttcgcataagttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctattt 16348565  T
Q  268 aagaagttatttgtaatctgtgaagct 294  Q
    |||| ||||  || |||||||||||||    
T  16348566 aagatgttaactgaaatctgtgaagct 16348592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 285 - 350
Target Start/End: Original strand, 17047989 - 17048055
Alignment:
Q  285 ctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattacttga 350  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  17047989 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 17048055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 368 - 433
Target Start/End: Original strand, 43256161 - 43256227
Alignment:
Q  368 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt-gtatactgcctatgttgctgtt 433  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||    
T  43256161 aagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttggtatgctgcctatgttgctgtt 43256227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 44102689 - 44102627
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagatta 71  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||    
T  44102689 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgagcatgtttaataatgatta 44102627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 413 - 471
Target Start/End: Original strand, 46640504 - 46640562
Alignment:
Q  413 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatga 471  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  46640504 tatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatga 46640562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 3413248 - 3413207
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctt 51  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3413248 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctt 3413207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 417 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 6190531 - 6190482
Alignment:
Q  417 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  6190531 ctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaa 6190482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 14039129 - 14039088
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14039129 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 14039088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 17047717 - 17047766
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  17047717 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtgcct 17047766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 180
Target Start/End: Original strand, 22633983 - 22634023
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactt 180  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22633983 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcactt 22634023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 415 - 471
Target Start/End: Original strand, 53082202 - 53082258
Alignment:
Q  415 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatga 471  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  53082202 tactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatga 53082258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 3332236 - 3332197
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcact 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3332236 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcact 3332197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 7089242 - 7089191
Alignment:
Q  124 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 175  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7089242 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 7089191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 424 - 479
Target Start/End: Original strand, 7641286 - 7641340
Alignment:
Q  424 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  7641286 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 7641340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 424 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 12611008 - 12610954
Alignment:
Q  424 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  12611008 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12610954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 179
Target Start/End: Original strand, 13812579 - 13812618
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcact 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13812579 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcact 13812618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 175
Target Start/End: Original strand, 17047828 - 17047879
Alignment:
Q  124 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 175  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17047828 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 17047879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 22636914 - 22636851
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| ||||||    
T  22636914 attttgacttctgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaagatgtctaataatgattag 22636851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 24029092 - 24029053
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcact 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24029092 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcact 24029053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 47
Target Start/End: Original strand, 13812450 - 13812488
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtg 47  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13812450 attttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtg 13812488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 72
Target Start/End: Original strand, 39705926 - 39705992
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  39705926 gtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 39705992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 44053309 - 44053271
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtg 47  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44053309 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtg 44053271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 44102264 - 44102218
Alignment:
Q  433 ttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  44102264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 44102218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 3097114 - 3097049
Alignment:
Q  7 taattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  3097114 taattttgacttttgagttaaaccttagatgttttcgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 3097049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 7799177 - 7799136
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7799177 attttgacttctgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 7799136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 6 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 13845022 - 13844981
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtg 47  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  13845022 gtaattttgacttttaagttgaaccttagatgtttttgagtg 13844981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 24029221 - 24029180
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  24029221 attttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtgcct 24029180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 12522447 - 12522375
Alignment:
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttc 181  Q
    ||||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||  || |||| ||||| |||||||||||||||    
T  12522447 tagaacaacattagttggggagttggcttgtactcgccatggaaagtagatactctcacctcgcgagcacttc 12522375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 12774349 - 12774309
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactt 180  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  12774349 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtactt 12774309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 45
Target Start/End: Original strand, 16377163 - 16377199
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgag 45  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16377163 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgag 16377199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 3097008 - 3096957
Alignment:
Q  124 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 175  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  3097008 tgggattctgacctgaactcgccaaggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 3096957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 15190670 - 15190631
Alignment:
Q  137 tgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 176  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  15190670 tgtactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 15190631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 101
Target Start/End: Original strand, 18228529 - 18228620
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctgg 101  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  ||||||   |||| |||||| ||||||||||||||    
T  18228529 ttttcacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctgg 18228620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 179
Target Start/End: Original strand, 20157060 - 20157099
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcact 179  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  20157060 actcgccatggcgtgcagaggctctcgcctcgcgagcact 20157099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 44102560 - 44102525
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 175  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44102560 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 44102525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 175
Target Start/End: Original strand, 44928694 - 44928729
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 175  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44928694 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 44928729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 8846858 - 8846792
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||| || |||| || ||| ||||||    
T  8846858 gtaattttgacttttgagttgattcttagatgtttttgagtacctgaacatgtctaataatgattag 8846792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 414 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 16596720 - 16596686
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaag 448  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16596720 atactacctatgttgctgtttgttatttaactaag 16596686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 15091377 - 15091340
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 46  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  15091377 attttgacttttgagttgatctttagatgcttttgagt 15091340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 50
Target Start/End: Original strand, 20156931 - 20156972
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  20156931 attttgacttttgagttaatccttagatgcctttgagtgcct 20156972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 417 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 22353901 - 22353853
Alignment:
Q  417 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  22353901 ctgcctatgctgctgtt-gttatttacctaagctgcatgagtcggtctaa 22353853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 50
Target Start/End: Original strand, 22633854 - 22633895
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  22633854 attttgacttttgagttgaactttagatgcccttgagtgcct 22633895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 51
Target Start/End: Original strand, 42997104 - 42997145
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctt 51  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  42997104 ttttgacttttgagttgaaacttagatgcctttgagtacctt 42997145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 50
Target Start/End: Original strand, 44928564 - 44928605
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  44928564 attttgacttttgagttgatccttatatgtttttgagtgcct 44928605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 8846724 - 8846688
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 176  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  8846724 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 8846688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 15099700 - 15099664
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 176  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  15099700 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 15099664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 17053510 - 17053482
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgc 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17053510 ttttgacttttgagttgaaccttagatgc 17053482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 138 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 17810606 - 17810550
Alignment:
Q  138 gtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
    ||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  17810606 gtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccagaattgagtgc 17810550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 109 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 35170991 - 35170915
Alignment:
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 185  Q
    ||||||||| |||||| |||   || || ||||||||||||||||| ||   |||||| ||||||||||||||||||    
T  35170991 tagaacaacattagtttggaaattgactggtactcgccatggcgagtaggaactctcgtctcgcgagcacttccaga 35170915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 131)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 479
Target Start/End: Original strand, 40621842 - 40622324
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||  |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  40621842 attctatatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgtctaaggatgcatattaaagattaaatgataacttagaacgagattgaacctg 40621941  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40621942 gtatagcttagaacaactttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 40622041  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataa 300  Q
    ||| | |||||||||| ||||||  |||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||  ||     
T  40622042 ggatattgcgatctgtttcgcatattttgtttagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg-ttat 40622140  T
Q  301 gatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtt-----tgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatata 395  Q
    || |||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||     ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40622141 gagatgtttgtgttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtactgtatacataagatgttgatgaattgaa-ttgatata 40622239  T
Q  396 attat-gtca-tgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    |||||  | | || |||||||  ||||||||| ||||  |||||||| ||| ||| ||||||| ||| | ||| ||||||||||||    
T  40622240 attatcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 40622324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 456
Target Start/End: Original strand, 22798760 - 22799217
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  22798760 attctatacttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgataacttagaacgagattgaacctg 22798859  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  22798860 gtttagcttagaacagctttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactaagtgcaagtta 22798959  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataa 300  Q
    ||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||  ||     
T  22798960 ggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagaagttaactgcaatttgtgaagctg-ttat 22799058  T
Q  301 gatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaaga-atgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataatt 398  Q
    || |||||  |||||| ||||| ||| ||||||||| | ||| |||||| |||| ||  ||| |||  |||||||||| |||| |||| ||||||| ||     
T  22799059 gaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgccttactt-aagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatg 22799157  T
Q  399 atgtcatgctgttgt----atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 456  Q
    | |||||| ||||||    || ||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  22799158 aagtcatgatgttgttgtgat-ctgcctatgctgct-attgttatttaactaagttgcatga 22799217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 294
Target Start/End: Original strand, 23019341 - 23019633
Alignment:
Q  2 ttctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctgg 101  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23019341 ttctgtatgtttgacttttgagttgaaccttcgatgtgtttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgatgacttagagtgagattgaacctgg 23019440  T
Q  102 tttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgag 201  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23019441 tctaggttagaacaactttagttgggaatctggcttgtacttgccatggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtcag 23019540  T
Q  202 gaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagct 294  Q
    || | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  23019541 gatattgcgatctgtgtcgcataatttaattagagttggacccttgggtagtaatgtgacctatataagaagttatttgcaatttgtgaagct 23019633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 6 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 23038515 - 23038227
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggttta 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23038515 gtaattttgacttttgagatgaaccttagatgttgttgagtgcctgaagatgcttattaaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttta 23038416  T
Q  106 gcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaa 205  Q
       |||||||||  | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23038415 agctagaacaaccattgttgggaatctggcttgtacccgccatggcgagcagatgctctcgcctcgtgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaa 23038316  T
Q  206 atgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagct 294  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  23038315 ttgcgatctgtgtcgcatgatttgattagagatggacccttgggtagtattgagacctatataagaagttatctgcaatctgtgaagct 23038227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Original strand, 25963351 - 25963645
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25963351 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatttagaatgagattgaacctg 25963450  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  25963451 gtttagcttagaacaacttaagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgaatgcaagtta 25963550  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    | |   |||||||||| || ||| | || ||||| | ||||||||| || | ||||| ||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  25963551 gtatgttgcgatctgtttctcataagttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaattgaaatctgtgaagctg 25963645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Original strand, 45677789 - 45678078
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45677789 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgattattaaagattagatgatgacttagagtgagattgaacctg 45677888  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  45677889 gtttagcttagaacaactttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgtgagcacttccagaactgagtgcaattga 45677988  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtga 290  Q
    | |   || |||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||| || | ||||| |||||||||| || |||| ||| |||||||||    
T  45677989 gaatgttgtgatctgtgtcgcatgagttgattagggatggactcttaggtagtaatgtgacctatataggatgttaattgcaatctgtga 45678078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Original strand, 21917950 - 21918244
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  21917950 attctgtaattttgacttttgagtttaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaactagattgaacctg 21918049  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  21918050 gtttagctttgaacaaccttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagtta 21918149  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    |||   |||||||||| |||||| | || ||||  | ||||||||| || | ||||| ||||||| ||||| ||||  || ||||||||||||||    
T  21918150 ggatgttgcgatctgtttcgcataaattgattatggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctg 21918244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 5 - 351
Target Start/End: Original strand, 22740598 - 22740945
Alignment:
Q  5 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggttt 104  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  22740598 tgtagtttggacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtatattaaagattaaatgataacttagaacgagattgaacctagttt 22740697  T
Q  105 agcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaa 204  Q
    | | ||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22740698 aacatagaacaacctttgttgggaatctggcttgaactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggat 22740797  T
Q  205 aatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagata 304  Q
    | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||| ||  || || |    
T  22740798 attgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctttgaagttg-ttatgaga 22740896  T
Q  305 tgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaa 351  Q
    ||||  |||||| ||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||    
T  22740897 tgttaatgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaa 22740945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 37525149 - 37524856
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  37525149 attctgtaattttgacttttgagttaaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatttagaacgagattgaacctg 37525050  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  37525049 gtttagcttagaacaacttaagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagtta 37524950  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    | |   |||||||||| || ||| | || ||||  | ||||||||| || | ||||| ||||||| ||||| |||| ||| | ||||||||||||    
T  37524949 gtatgttgcgatctgtttcacataagttgattaaggttggacccttaggtagtaatgtgacctat-taagatgttaattgaagtctgtgaagctg 37524856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 351
Target Start/End: Original strand, 22758353 - 22758700
Alignment:
Q  5 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggttt 104  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||  || || ||||| ||||    
T  22758353 tgtagtttggacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtatattaaagattacatgataacttagaacaagcttcaacctagttt 22758452  T
Q  105 agcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaa 204  Q
    | | ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  22758453 aacctagaacaacctttgttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgtgagcactttcagaactgagtgcaagtgaggat 22758552  T
Q  205 aatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagata 304  Q
    | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||  || ||||| ||||||||  || || |    
T  22758553 attgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaaattaactgcaatctatgaagctg-ttatgaga 22758651  T
Q  305 tgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaa 351  Q
    ||||  |||||| ||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||    
T  22758652 tgttaatgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaa 22758700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 20309313 - 20309115
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  20309313 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatga 20309214  T
Q  381 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  20309213 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 20309115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 24674061 - 24673768
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  24674061 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttaagtgccttaagatgtttattgaagattaaatgataacctagaatgagattgaacctg 24673962  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |    
T  24673961 gtttagcttagaacaacattagttgggaatctggcttgtaatcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccacaactgaatgcaagtta 24673862  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagct 294  Q
    |||   ||||||||||||||||| | || ||||| | ||||| |||  | | ||||| |||||||||| || |||| |||  ||||||||||||    
T  24673861 ggatgttgcgatctgtgtcgcataaattgattagggttggactcttaagtagtaatgtgacctatataggatgttaattgcgatctgtgaagct 24673768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 6 - 228
Target Start/End: Original strand, 23100869 - 23101091
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggttta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23100869 gtaattttgacttttgagttgaacctcagatgtttttaagtgcctgaagatgcttattaaaaattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttta 23100968  T
Q  106 gcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaa 205  Q
     | |||||||||    ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  23100969 acctagaacaaccactgttgggaatctagcttgtaatcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaaaactgagtgcaagtgaggata 23101068  T
Q  206 atgcgatctgtgtcgcatgattt 228  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  23101069 atgcgatctatgtcgcatgattt 23101091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 146
Target Start/End: Original strand, 22811572 - 22811713
Alignment:
Q  5 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggttt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  22811572 tgtaattttgacttttgagttgaaccttaggtgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatttagaacgagattgaacctggttt 22811671  T
Q  105 agcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgcc 146  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22811672 agcttagaacaaccttagttgggattctggcttgtactcgcc 22811713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 281 - 466
Target Start/End: Original strand, 38029 - 38215
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 380  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  38029 taatctctgaagctgtataagacatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgatgatga 38128  T
Q  381 attgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    || ||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38129 atcgaaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 38215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 201
Target Start/End: Original strand, 44369952 - 44370133
Alignment:
Q  20 tgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaacaactt 119  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44369952 tgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcatattaaagattagataatgatttagaacaagattgaacctggtttagcttagaacaacat 44370051  T
Q  120 tagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgag 201  Q
    ||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  44370052 taggttgaattctggcttgtacttgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcaagcacttctagaactgagtgcaattgag 44370133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 225 - 479
Target Start/End: Original strand, 23103254 - 23103509
Alignment:
Q  225 atttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaag 324  Q
    |||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||  || || |||||  |||||  | ||| |    
T  23103254 atttgattagagatggaccctttggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgt-tatgagatgttagtgttggatttgatg 23103352  T
Q  325 tgttataatgttta--tgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcc 421  Q
    || |||||||||||  ||||| |||||||  |||  || |||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  23103353 tgatataatgtttaattgcatgacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgtttgtatactgcc 23103452  T
Q  422 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  23103453 tatgttgctgttt-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 23103509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 268 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 23286082 - 23285872
Alignment:
Q  268 aagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattacttgaagaatgtttgtatgca 366  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||       
T  23286082 aagatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaagaacatttgaatatt 23285983  T
Q  367 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23285982 taagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtc-tgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 23285885  T
Q  467 aatgattaagatg 479  Q
      |||| ||||||    
T  23285884 gttgatgaagatg 23285872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 24175259 - 24175093
Alignment:
Q  14 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||          ||    
T  24175259 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtttactaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctgg----------aa 24175170  T
Q  114 caactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 190  Q
    |||| |||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24175169 caaccttagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 24175093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Original strand, 298727 - 298929
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||| |||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||  | | |||| ||   |||||||||| ||    
T  298727 taatatgtgaagctgtataagatgtgttgttattaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttg 298826  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaag 476  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  298827 aattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 298926  T
Q  477 atg 479  Q
    |||    
T  298927 atg 298929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 201
Target Start/End: Original strand, 24716188 - 24716365
Alignment:
Q  14 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaa 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||          |||    
T  24716188 gacttttgagatgaaccttagatgtttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagaggatgacttaaaacgagattgaacctg----------gaa 24716277  T
Q  114 caactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgag 201  Q
     |||    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||    
T  24716278 taaccaatgttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttctagagccgagtgcaattgag 24716365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 40428924 - 40428753
Alignment:
Q  14 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |          |||    
T  40428924 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtgtattaaagattagaggatgacttagaacgagattgaacccg----------gaa 40428835  T
Q  114 caactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccag-aactgagtgc 194  Q
    |||| |||||||| | ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40428834 caaccttagttggaaatctggcaagtacttgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaaactgagtgc 40428753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 22460844 - 22461018
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  ||||||   |||| |||||| ||||||||||||||            
T  22460844 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctgg-------- 22460935  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22460936 --aacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 22461018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Original strand, 24654996 - 24655162
Alignment:
Q  14 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||          |||    
T  24654996 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctttcgttgtgtattaaagattagaggatgacttagaacaagattgaacctg----------gaa 24655085  T
Q  114 caactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 190  Q
    ||||  ||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24655086 caaccatagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 24655162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Original strand, 22731147 - 22731348
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||   ||| |||||||||    
T  22731147 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaatatgttgatg 22731246  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaag 476  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||    
T  22731247 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaag 22731345  T
Q  477 atg 479  Q
    |||    
T  22731346 atg 22731348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 193
Target Start/End: Original strand, 21318282 - 21318462
Alignment:
Q  3 tctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggt 102  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||     
T  21318282 tctgtatttttgaccttcgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgttcagtaaagattagaggatgacttagaacaagatggaacctgg- 21318380  T
Q  103 ttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
             |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  21318381 ---------aacaaccttagttcgaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgcactcgcctcgcgagcactcccagaactaagtg 21318462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 193
Target Start/End: Original strand, 21327213 - 21327393
Alignment:
Q  3 tctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggt 102  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||     
T  21327213 tctgtatttttgaccttcgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgttcactaaagattagaggatgacttagaacaagatggaacctgg- 21327311  T
Q  103 ttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
             ||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21327312 ---------aacgaccttagttcgaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgcactcgcctcgcgagcactcccagaactgagtg 21327393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 24735855 - 24735680
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| || ||| || ||||||||||| ||||| ||| ||  |||||||||||||            
T  24735855 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttcagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgatttataacaagattgaacctgg-------- 24735764  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
      |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24735763 --aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggtgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgattgca 24735680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 23598790 - 23598616
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  |||||||  |||| |||||| ||||||||||||              
T  23598790 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagaaaatgatttagaacgagattgaacct---------- 23598701  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23598700 agaacaaccttagttggaattctggcttatactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 23598616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 24870339 - 24870173
Alignment:
Q  14 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||          |||||    
T  24870339 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtgtattaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacc----------tagaa 24870250  T
Q  114 caactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 190  Q
    ||||  ||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  24870249 caaccatagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcatgagcacttccagaactga 24870173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 23187527 - 23187353
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  ||||||   |||| |||||| ||||||||||||              
T  23187527 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagtaaatgatttagaacgagattgaacct---------- 23187438  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23187437 agaacaaccttagttggaattctggcttatactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 23187353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Original strand, 19928156 - 19928329
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  ||||||   |||| |||||| ||||||||||||||            
T  19928156 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctgg-------- 19928247  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
      |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19928248 --aacaaccttagtcgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 19928329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Original strand, 22738093 - 22738293
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||    
T  22738093 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 22738192  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaag 476  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||   ||||| ||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||    
T  22738193 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat-ttaatg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaag 22738290  T
Q  477 atg 479  Q
    |||    
T  22738291 atg 22738293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 194
Target Start/End: Original strand, 18855114 - 18855289
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| || ||  || ||  |||||||  |||| ||||||  |||||||||||             
T  18855114 attttgacttttgagttgaaccttagatgcctttaagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaacaagattgaacct--------- 18855204  T
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
     |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18855205 -agaacaaccttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcatatgctctcgcctcgtgagcacttccagaactgagtgc 18855289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 24658125 - 24658032
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattg 94  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  24658125 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaatgattaaatgataacttagaatgagattg 24658032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 268 - 466
Target Start/End: Original strand, 23654286 - 23654487
Alignment:
Q  268 aagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatgca 366  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||  |||  ||| ||       
T  23654286 aagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagtaatacttgaatatt 23654385  T
Q  367 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgt---tgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtc 463  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||   ||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23654386 taagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 23654484  T
Q  464 taa 466  Q
    |||    
T  23654485 taa 23654487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 281 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 23076650 - 23076462
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||||||||||||  |||| | ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   |||||| ||| ||    
T  23076650 taatctgtgaagctgtttaagctgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatattgttg 23076551  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    | ||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23076550 acttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 23076462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 61267 - 61094
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| || ||  || ||  | |||||   ||| |||||| ||||||||||||||            
T  61267 ttttgacttttgagttgaaccttagatacctttgagtacctttaggtgcctactattgtttagagattgatttagaacgagattgaacctgg-------- 61176  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
      |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  61175 --aacaaccttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctcccgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 61094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 109 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 15477967 - 15477883
Alignment:
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15477967 tagaacaatcttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 15477883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 286 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 23060716 - 23060520
Alignment:
Q  286 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattg 384  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||  ||   |||||||||| ||| |||    
T  23060716 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttg 23060617  T
Q  385 aatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
     | ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||    
T  23060616 caattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 23060520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 24649803 - 24649636
Alignment:
Q  16 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  |||||||  |||| |||||| ||||||||||||          ||||||    
T  24649803 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacct----------agaaca 24649714  T
Q  116 actttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
    || |||||||| |   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24649713 accttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 24649636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 111 - 195
Target Start/End: Original strand, 19688501 - 19688585
Alignment:
Q  111 gaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19688501 gaacaaccttagttggaaatctggcttgtactcgccatgacaagcagatgctctcgcatcgcgagcacttccagaactgagtgca 19688585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 22337323 - 22337122
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||| ||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  |||||   | |||||||| ||    
T  22337323 taatttgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttg 22337224  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaag 476  Q
      ||| ||||||||| |||||||||||||||| |   |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||    
T  22337223 tcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatacagcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 22337125  T
Q  477 atg 479  Q
    |||    
T  22337124 atg 22337122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 23660230 - 23660030
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||| ||| ||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||   ||| ||| ||   |||||||||| ||    
T  23660230 taatttgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgattgaatatttaagatgttgttg 23660131  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaaga 477  Q
    | ||| ||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||| |||||||||  |||| ||||    
T  23660130 atttgcatttgatattattatgtcatcctgtttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttgtttaactaagatacatgagtcggtctaagttgatgaaga 23660032  T
Q  478 tg 479  Q
    ||    
T  23660031 tg 23660030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 26125655 - 26125484
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |   || ||| ||||||   | || | |||||||||||||||||||            
T  26125655 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtacctactaatgattagggaacgaatgagaatgagattgaacctgg-------- 26125564  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgag 191  Q
      |||||| |||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  26125563 --aacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcaagcacttccagaattgag 26125484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Original strand, 27379092 - 27379259
Alignment:
Q  16 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| || ||  || ||  |||||||  |||| |||||| ||||||||||||          ||||||    
T  27379092 cttttgagttgaaccttagatgccttttagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacct----------agaaca 27379181  T
Q  116 actttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
    || |||||||| |   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27379182 accttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 27379259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Original strand, 27383138 - 27383305
Alignment:
Q  16 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| || ||  || ||  |||||||  |||| |||||| ||||||||||||          ||||||    
T  27383138 cttttgagttgaaccttagatgccttttagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacct----------agaaca 27383227  T
Q  116 actttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
    || |||||||| |   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27383228 accttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 27383305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Original strand, 41530669 - 41530836
Alignment:
Q  16 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  |||||||  |||| |||||| ||||||||||||          ||||||    
T  41530669 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacct----------agaaca 41530758  T
Q  116 actttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
    || |||||||| |   |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41530759 accttagttggaaagttggcatgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 41530836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 109 - 193
Target Start/End: Original strand, 12901255 - 12901339
Alignment:
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
    ||||||||| |||||||| |   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12901255 tagaacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 12901339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 22105524 - 22105416
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  22105524 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 22105426  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  22105425 gattaagatg 22105416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 119 - 190
Target Start/End: Original strand, 25961287 - 25961358
Alignment:
Q  119 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 190  Q
    |||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25961287 ttagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 25961358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Original strand, 24628138 - 24628305
Alignment:
Q  16 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  |||||||  |||| ||||||  |||||||||||          ||||||    
T  24628138 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaacaagattgaacct----------agaaca 24628227  T
Q  116 actttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
    || |||||||| |   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  24628228 accttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactttcagaattgagtg 24628305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 41667401 - 41667230
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |   || ||| ||||||   | || |  ||||||||||||||||||            
T  41667401 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtacctactaatgattagggaacgaatgggaatgagattgaacctgg-------- 41667310  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgag 191  Q
      |||||| |||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  41667309 --aacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcaagcacttccagaattgag 41667230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 132 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 27602137 - 27602076
Alignment:
Q  132 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27602137 tggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 27602076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 373 - 492
Target Start/End: Original strand, 32214972 - 32215092
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  32214972 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 32215069  T
Q  470 gattaagatgttgaggatgatgt 492  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  32215070 gattaagatgttgatgatgatgt 32215092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 369 - 471
Target Start/End: Original strand, 7735 - 7839
Alignment:
Q  369 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  7735 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaa 7834  T
Q  467 aatga 471  Q
     ||||    
T  7835 gatga 7839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 414 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 7679657 - 7679592
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||    
T  7679657 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 7679592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 27263703 - 27263577
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| || ||  ||||||   |||| |||||| |||||||||||||             
T  27263703 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctg--------- 27263613  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgcc 146  Q
     ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  27263612 -gaacaaccttagttggaattctggcttgtactcgcc 27263577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 25175922 - 25175870
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  25175922 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaatctgtctaa 25175870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 28406048 - 28405996
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  28406048 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 28405996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 571508 - 571401
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  571508 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 571411  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  571410 gattaagatg 571401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 10327309 - 10327218
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||||||||| | || || ||| |||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||    
T  10327309 ttttgacttttgagttgaaccttccattcttttgagtacatttaggtgtctattaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctgg 10327218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 18809054 - 18808947
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  18809054 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 18808957  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  18808956 gattaagatg 18808947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 23130973 - 23130866
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  23130973 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23130876  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  23130875 gattaagatg 23130866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 23133440 - 23133333
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  23133440 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23133343  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  23133342 gattaagatg 23133333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 23135701 - 23135594
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  23135701 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23135604  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  23135603 gattaagatg 23135594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Original strand, 23709583 - 23709690
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  23709583 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23709680  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  23709681 gattaagatg 23709690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Original strand, 23712064 - 23712171
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  23712064 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23712161  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  23712162 gattaagatg 23712171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 26505490 - 26505383
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  26505490 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 26505393  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  26505392 gattaagatg 26505383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 26507968 - 26507861
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  26507968 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 26507871  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  26507870 gattaagatg 26507861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Original strand, 32451570 - 32451633
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||    
T  32451570 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattag 32451633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Original strand, 34402573 - 34402680
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  34402573 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 34402670  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  34402671 gattaagatg 34402680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 39682424 - 39682317
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  39682424 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 39682327  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  39682326 gattaagatg 39682317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 386 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 6726093 - 6725999
Alignment:
Q  386 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  6726093 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 6725999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 413 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 23207350 - 23207292
Alignment:
Q  413 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatga 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  23207350 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatga 23207292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 23286333 - 23286267
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| || ||| ||||||    
T  23286333 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattag 23286267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 72
Target Start/End: Original strand, 23654049 - 23654114
Alignment:
Q  7 taattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| || ||| ||||||    
T  23654049 taattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgactgcctgaacatgtctaataatgattag 23654114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 388 - 479
Target Start/End: Original strand, 21155126 - 21155218
Alignment:
Q  388 ttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  21155126 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21155218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 295
Target Start/End: Original strand, 22811708 - 22811839
Alignment:
Q  163 ctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacc 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||| |  ||| | || ||||| | |||||| || || | ||||| ||||    
T  22811708 ctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagttaggatgttgcgatctgt-tttcataaattgattagtgttggacctttaggtagtaatgtgacc 22811806  T
Q  263 tatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    ||| ||||| ||||  || ||||||||||||||    
T  22811807 tatttaagatgttaagtgaaatctgtgaagctg 22811839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 23660502 - 23660410
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctgg 101  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||   |  |  ||||||||||||||||||||    
T  23660502 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgg 23660410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 337 - 466
Target Start/End: Original strand, 23708589 - 23708720
Alignment:
Q  337 tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgttt 434  Q
    |||||||||||||||  || |||| |||  | |||||| ||||| ||| | |||||||  |||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||| | |    
T  23708589 tatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctatct 23708688  T
Q  435 gttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  23708689 gttatttaactaagctgcttgagtcggtctaa 23708720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 50
Target Start/End: Original strand, 28291944 - 28291984
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28291944 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 28291984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 101
Target Start/End: Original strand, 37769 - 37860
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctgg 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||   | ||  ||| ||||||||||||||||    
T  37769 ttttgacttttgagtggaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaagatgtaggatgagattgaacctgg 37860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Original strand, 298456 - 298519
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  298456 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 298519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 24367885 - 24367782
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  24367885 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 24367788  T
Q  470 gattaa 475  Q
    ||||||    
T  24367787 gattaa 24367782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 24503473 - 24503402
Alignment:
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactt 180  Q
    ||||||||| |||||||| |   ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  24503473 tagaacaacattagttggaaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcccgagcactt 24503402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 27754055 - 27753992
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  27754055 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctcaacatgtctaataatgattag 27753992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 72
Target Start/End: Original strand, 22133859 - 22133921
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  22133859 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 22133921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 410 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 8946732 - 8946664
Alignment:
Q  410 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||    
T  8946732 ttgtatactgcctatgttgctatt-gttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 8946664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 50
Target Start/End: Original strand, 22737821 - 22737862
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22737821 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 22737862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Original strand, 18786952 - 18787004
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18786952 atactacctatgttactgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 18787004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 19671902 - 19671850
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  19671902 atactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaa 19671850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 20309573 - 20309533
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20309573 ttttgacttttgagttgaaccttatatgcttttgagtgcct 20309533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 415 - 471
Target Start/End: Original strand, 20520243 - 20520299
Alignment:
Q  415 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatga 471  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  20520243 tactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatga 20520299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Original strand, 23071998 - 23072050
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  23071998 atactgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaa 23072050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Original strand, 24898246 - 24898354
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaact-aagctgcatgattcggtctaaaa 468  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||  | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||      
T  24898246 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagt 24898343  T
Q  469 tgattaagatg 479  Q
    |||||||||||    
T  24898344 tgattaagatg 24898354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Original strand, 24900729 - 24900837
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaact-aagctgcatgattcggtctaaaa 468  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||  | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||      
T  24900729 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagt 24900826  T
Q  469 tgattaagatg 479  Q
    |||||||||||    
T  24900827 tgattaagatg 24900837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Original strand, 24903206 - 24903314
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaact-aagctgcatgattcggtctaaaa 468  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||  | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||      
T  24903206 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagt 24903303  T
Q  469 tgattaagatg 479  Q
    |||||||||||    
T  24903304 tgattaagatg 24903314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Original strand, 24905683 - 24905791
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaact-aagctgcatgattcggtctaaaa 468  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||  | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||      
T  24905683 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagt 24905780  T
Q  469 tgattaagatg 479  Q
    |||||||||||    
T  24905781 tgattaagatg 24905791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Original strand, 24908158 - 24908266
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaact-aagctgcatgattcggtctaaaa 468  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||  | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||      
T  24908158 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagt 24908255  T
Q  469 tgattaagatg 479  Q
    |||||||||||    
T  24908256 tgattaagatg 24908266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 25176325 - 25176281
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25176325 gtaattttgacctttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 25176281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 414 - 465
Target Start/End: Original strand, 22134256 - 22134306
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 465  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22134256 atactgcctatgttgctgtt-gatatttaactaagctgcatgagtcggtcta 22134306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Original strand, 22730874 - 22730937
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  22730874 attttaacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 22730937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 424 - 479
Target Start/End: Original strand, 24643054 - 24643108
Alignment:
Q  424 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  24643054 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24643108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Original strand, 32039549 - 32039656
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  |    
T  32039549 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttactgtt-gttatttaactaagctgcatgagccggtctaagtt 32039646  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  32039647 gattaagatg 32039656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 424 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 43137357 - 43137303
Alignment:
Q  424 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  43137357 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 43137303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 413 - 471
Target Start/End: Original strand, 22413186 - 22413244
Alignment:
Q  413 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatga 471  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  22413186 tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatga 22413244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 28577149 - 28577103
Alignment:
Q  433 ttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  28577149 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 28577103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 38967424 - 38967378
Alignment:
Q  433 ttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  38967424 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 38967378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 479
Target Start/End: Original strand, 45029966 - 45030012
Alignment:
Q  433 ttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  45029966 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 45030012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 422 - 479
Target Start/End: Original strand, 23040247 - 23040303
Alignment:
Q  422 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||    
T  23040247 tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 23040303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 72
Target Start/End: Original strand, 23071614 - 23071667
Alignment:
Q  19 ttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  23071614 ttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 23071667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 417 - 466
Target Start/End: Original strand, 32451981 - 32452030
Alignment:
Q  417 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  32451981 ctgcctatgttgctgtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaa 32452030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 415 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 23004819 - 23004763
Alignment:
Q  415 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatga 471  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  23004819 tactacctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatga 23004763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 176
Target Start/End: Original strand, 23071733 - 23071769
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 176  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23071733 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc 23071769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 388 - 479
Target Start/End: Original strand, 24529595 - 24529687
Alignment:
Q  388 ttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  24529595 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactga-tgtgttgttgtt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24529687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 415 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 25108958 - 25108902
Alignment:
Q  415 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatga 471  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  25108958 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaagatga 25108902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 25616306 - 25616190
Alignment:
Q  367 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttg---tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtc 463  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||  ||||||| ||||||||   ||  ||||||||| |||| || || ||||||||||| ||||||| || |||    
T  25616306 taagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctatt-gtaatttaactaagttgcatgagtcagtc 25616208  T
Q  464 taaaatgattaagatgtt 481  Q
    |||  |||||||||||||    
T  25616207 taagttgattaagatgtt 25616190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 27197219 - 27197172
Alignment:
Q  138 gtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 185  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  27197219 gtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccaga 27197172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 175
Target Start/End: Original strand, 32451685 - 32451736
Alignment:
Q  124 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 175  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  32451685 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 32451736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 174
Target Start/End: Original strand, 22133986 - 22134020
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcga 174  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22133986 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 22134020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 22337591 - 22337557
Alignment:
Q  13 tgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtg 47  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22337591 tgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtg 22337557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 415 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 23287433 - 23287384
Alignment:
Q  415 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 465  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  23287433 tactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 23287384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 27263582 - 27263552
Alignment:
Q  163 ctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27263582 ctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 27263552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 23076920 - 23076879
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23076920 attttgactattaagttgatccttagatgcttttgagtgcct 23076879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 416 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 26392451 - 26392403
Alignment:
Q  416 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 465  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  26392451 actgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 26392403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 176
Target Start/End: Original strand, 37888 - 37924
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 176  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  37888 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc 37924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 138 - 194
Target Start/End: Original strand, 10101417 - 10101473
Alignment:
Q  138 gtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
    ||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  10101417 gtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccagaattgagtgc 10101473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 415 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 23791344 - 23791288
Alignment:
Q  415 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatga 471  Q
    |||||||||||||| |||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  23791344 tactgcctatgttgttgtttgcttattaactaagctacatgagtcggtctaagatga 23791288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 124 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 27753940 - 27753892
Alignment:
Q  124 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgc 172  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  27753940 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgc 27753892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 31756267 - 31756231
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 176  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  31756267 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 31756231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 123)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 6 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 21715030 - 21714684
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggttta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21715030 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcttattaaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttta 21714931  T
Q  106 gcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaa 205  Q
     | ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21714930 acctagaacaacctttgttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaa 21714831  T
Q  206 atgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||  || || ||    
T  21714830 atgcgatctgtgtcgcatgatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg-ttatgagat 21714732  T
Q  306 gttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaa 351  Q
    |||  |||||| ||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  21714731 gttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaa 21714684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Original strand, 42864845 - 42865139
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42864845 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagttgtttattaatgattaaatgataacttagaatgagattgaacctg 42864944  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42864945 gtttagcttagaacaacattagttgggaatctggctagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 42865044  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    |||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||    
T  42865045 ggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctg 42865139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Original strand, 22831012 - 22831306
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22831012 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgatgacttagagtgagattgaacctg 22831111  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  22831112 gtttagcttagaacaactttagttgagaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttcctgaactgagtgcaattga 22831211  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    | |   ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||| ||| || | ||||| |||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  22831212 gaatgttgcgatctgtgtcgcatgacttgtttagggatggactcttaggtagtaatgtgacctatataggatgttaattgcaatctgtgaagctg 22831306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 492
Target Start/End: Original strand, 22468339 - 22468823
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  22468339 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagattaaatgataacttagaaagagattgaaccaggtttaactt 22468438  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgc 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||    
T  22468439 agaacaacattagttgggaatctggcttgtactcgacatgaagagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagggtattgc 22468538  T
Q  210 gatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttg 309  Q
    ||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||| | || |||||||| |  |||  | || || |||||||||||||||  |||||| || ||    
T  22468539 gatatgtgtcgcataattcgattagagatggacccttgggtagtattgagaccttttgaagttggtaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgctg 22468638  T
Q  310 ttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc- 407  Q
     || | ||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||   ||  ||| ||   |||||||||| ||||||| | ||||||| || |||||||||     
T  22468639 atg-taattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgagatattattgaataattaagatgttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgct 22468737  T
Q  408 --tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatgttgaggatgatgt 492  Q
      |||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| || ||||||  ||||||||||||||| || |||||    
T  22468738 gttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgaagatgt 22468823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 413
Target Start/End: Original strand, 21787676 - 21788088
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21787676 attctgtatttttgacttgtgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttaataaagattatatgataacttagaatgagattgaacctg 21787775  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21787776 gtttagcttataacaacattagttgggaatctggctcgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactttcagaactgagtgcaagtga 21787875  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataa 300  Q
    | ||  ||||| ||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||  || ||||| || |||||  ||     
T  21787876 gaaatttgcgacctgtgtcgcataacttgtttagagatggacccttgggtagtaatgtaacctatataagaagttaactgcaatctatgcagctg-ttat 21787974  T
Q  301 gatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaaga-atgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataatt 398  Q
    || |||||| |||||||||||| ||  ||||||||| | |||||||||| |||| ||  ||| |||  |||||||||| |||| |||| ||||||| |      
T  21787975 gaaatgttgatgttgattatgatgttatataatgttatgtgcattactt-aagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattacg 21788073  T
Q  399 atgtcatgctgttgt 413  Q
    | |||||||||||||    
T  21788074 aagtcatgctgttgt 21788088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 21023123 - 21022830
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21023123 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttaaatgcttttgagtgccaaaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 21023024  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  21023023 gtttagcttagaacaaccttagttgggattctggctcgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactcagtactagtga 21022924  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagct 294  Q
    | |    | ||||||||| || |||||| ||||  ||||||||||| || | ||||| ||||||||||||| ||||  || |||||||||||||    
T  21022923 gaatgtcgtgatctgtgttgcttgatttgattaaggatggacccttaggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagct 21022830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 6152340 - 6152046
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||    
T  6152340 attctgtatttttgacctttgagttgaaccttagttgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattaaatgataacttagaataggattgaacctg 6152241  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |    
T  6152240 gtttagcttagaacaattttagttgggattctggcttgtactcgccgtggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcatgtta 6152141  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    |||   ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||| || | ||||| |||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  6152140 ggatgttgcgatctgtgtcgcatgaattgattagggatggactcttaggtagtaatgtgacctatataggatgttaattgcaatctgtgaagctg 6152046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 295
Target Start/End: Original strand, 18181759 - 18182049
Alignment:
Q  5 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggttt 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  18181759 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaatgattagatgatgacttagaacgggattgaacctggttt 18181858  T
Q  105 agcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  18181859 agcttagaacaactttagttggaattctggcttgtactcgctatggcgagcagatgctctcgccttgcgagcacttccagaactgagtgcaagttaggat 18181958  T
Q  205 aatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
      ||||||||||||||||| | || ||||| ||||||| ||| || | ||||| ||| | ||||||||||||  || || |||||||||||    
T  18181959 gttgcgatctgtgtcgcataaattgattagggatggactcttaggtagtaatgtgacttgtataagaagttaactgcaaactgtgaagctg 18182049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 6 - 196
Target Start/End: Original strand, 3472565 - 3472755
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggttta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3472565 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgctataagatgtttattaaagattagatgatgatttagaatgagattgaacctggttta 3472664  T
Q  106 gcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaa 196  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3472665 gcttagaacaacttaagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaa 3472755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 6 - 181
Target Start/End: Original strand, 22432422 - 22432597
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggttta 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  22432422 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaacaagattgaatctggttta 22432521  T
Q  106 gcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttc 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22432522 gcttagaacaactttagttgggattctggcctgtcctcgccatggcgagcagatgctttcgcctcgcgagcacttc 22432597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 6 - 194
Target Start/End: Original strand, 8761272 - 8761460
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggttta 105  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||| |||    
T  8761272 gtaatttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctttagacgtgtattaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctggatta 8761371  T
Q  106 gcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8761372 gcttagaacaactttagttgaaaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgaacacttccagaactgagtgc 8761460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 281 - 456
Target Start/End: Original strand, 38801304 - 38801479
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 380  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| ||||||||||    
T  38801304 taatttgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattacgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatatataatatgttgatga 38801403  T
Q  381 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 456  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38801404 attgaatttgatataattatgtcttgctgttgcacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 38801479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 123 - 295
Target Start/End: Original strand, 20091229 - 20091401
Alignment:
Q  123 ttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcgca 222  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  20091229 ttgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagatgttctcacctcgcgagcacttccagaactgagtgcaaatgaggatattgcgatctgtgtcgca 20091328  T
Q  223 tgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    | |||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  20091329 taatttgatttgagatggacccttgggtagtaatgagacctatttaagaagttaactgcaatctgtgaagctg 20091401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 21305766 - 21305591
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||| ||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||            
T  21305766 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtttactaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctgg-------- 21305675  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
      |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21305674 --aacaaccttagttgggaatctggcttgtacttgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 21305591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 45489397 - 45489571
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||             
T  45489397 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtttactaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctg--------- 45489487  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
     ||||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45489488 -gaacaaccttagttggaaatctggcgagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 45489571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 195
Target Start/End: Original strand, 36818962 - 36819137
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||  |||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||            
T  36818962 ttttgacttttgagttgaaccttaaatgcctttgagtacctttaggtgcctattaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctgg-------- 36819053  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
      |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36819054 --aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 36819137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 195
Target Start/End: Original strand, 17678238 - 17678416
Alignment:
Q  7 taattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttag 106  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||         
T  17678238 taatttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgttcactaaagattagatgatgatttagaacaagatggaacctgg----- 17678332  T
Q  107 cttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
         || |||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17678333 -----aataaccattgttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 17678416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 268 - 466
Target Start/End: Original strand, 27250629 - 27250830
Alignment:
Q  268 aagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatgca 366  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||       
T  27250629 aagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatt 27250728  T
Q  367 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtc 463  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27250729 taagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 27250827  T
Q  464 taa 466  Q
    |||    
T  27250828 taa 27250830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 195
Target Start/End: Original strand, 24782754 - 24782929
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||            
T  24782754 ttttaacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtttactaatgattagaggatgagttagaacaagattgaacctgg-------- 24782845  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
      |||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24782846 --aacaaccttagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttctagaactgagtgca 24782929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 195
Target Start/End: Original strand, 16080098 - 16080273
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||| || ||| || || |||||||| ||||  ||||||  |||||||||||||            
T  16080098 ttttgacttttgagttgaacattggatgcctttgagtacctttaggtgtctactatagattagaggatgttttagaacaagattgaacctgg-------- 16080189  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
      |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16080190 --aacagccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 16080273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 19212319 - 19212144
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| || ||  |||||||  |||| |||||| ||||||||||||||            
T  19212319 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagagaatgaattagaacgagattgaacctgg-------- 19212228  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
      |||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19212227 --aacaaccttagttgagaatctggcttgtactcaccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaaaactgagtgca 19212144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 20138535 - 20138364
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| || ||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||               
T  20138535 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagaggatgatttagaatgagattgaaccc---------- 20138446  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgag 191  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20138445 agaacaaccttagttgggaatctgacttgtactcgtcatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgag 20138364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 33797985 - 33797810
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  |||||||  |||| ||||||  |||||||||||||            
T  33797985 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaacaagattgaacctgg-------- 33797894  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
      |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33797893 --aacaaccttagttgggaatttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 33797810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 12647321 - 12647147
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  |||||    |||| |||||| |||||||||| |||            
T  12647321 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattaaggaatgatttagaacgagattgaacttgg-------- 12647230  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12647229 --aacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 12647147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Original strand, 33049745 - 33049911
Alignment:
Q  14 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaa 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||          |||    
T  33049745 gactttttagttgaaccttagatgcttttgagtacccttagatgtttactaaagattagaggatgatttagaataagattgaacctg----------gaa 33049834  T
Q  114 caactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 190  Q
    |||| |||||||| | ||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33049835 caaccttagttggaaatctggcaagtaatcgccatggcaagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 33049911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 194
Target Start/End: Original strand, 45310024 - 45310194
Alignment:
Q  14 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaa 113  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||          ||    
T  45310024 gacttttgagttgaactttagatgcttttgagtacctttagatgtctactaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctgg----------aa 45310113  T
Q  114 caactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
    ||||  ||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45310114 caaccgtagttggaaacctggcctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactttcagaactgagtgc 45310194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Original strand, 23818953 - 23819126
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||  || ||  |||||||  |||| |||||| ||||||||||||||            
T  23818953 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacctgg-------- 23819044  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
      ||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23819045 --aacgaccttagtaggaattctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 23819126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 183 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 48603820 - 48603652
Alignment:
Q  183 agaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgta 282  Q
    |||||||||||||||| ||||   |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| | || | || || |||||||||||||||||| || ||    
T  48603820 agaactgagtgcaagttaggatgttgcgatctgtgttgcatgaattgattagagatggacccctaggtagtattgtgacctatataagaagttaattata 48603721  T
Q  283 atctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattacttga 350  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  48603720 atctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 48603652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18882819 - 18882645
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  ||||||   |||| |||||| ||||||||||||||            
T  18882819 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctgg-------- 18882728  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
      |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18882727 --aacaaccttagttgggattttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctcttgcctcgcgagcacttcaagaactgagtgc 18882645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 46975919 - 46975745
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||  || ||  ||||||   |||| |||||| ||||||||||||||            
T  46975919 tttttacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacttttaggtgcctactattgattagtgaatgatttagaacgagattgaacctgg-------- 46975828  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
      |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46975827 --aacaaccttagttgggattctttcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 46975745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 281 - 488
Target Start/End: Original strand, 50210126 - 50210336
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||  | ||||||||||||  |||  ||||| | | |||||||| ||    
T  50210126 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttg 50210225  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaag 476  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||    
T  50210226 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 50210324  T
Q  477 atgttgaggatg 488  Q
    ||| ||| ||||    
T  50210325 atgatgatgatg 50210336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 268 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 21026901 - 21026700
Alignment:
Q  268 aagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatgca 366  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||  | | |||| ||       
T  21026901 aagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 21026802  T
Q  367 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtc 463  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||| ||| |||||||||   ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21026801 taagatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21026703  T
Q  464 taa 466  Q
    |||    
T  21026702 taa 21026700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 34509988 - 34509787
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||||||| || |||||||||||   |||  |||||   |||||||||| ||    
T  34509988 taatctttgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgttg 34509889  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaag 476  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||    
T  34509888 acttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 34509790  T
Q  477 atg 479  Q
    |||    
T  34509789 atg 34509787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 194
Target Start/End: Original strand, 18393621 - 18393791
Alignment:
Q  14 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaa 113  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||          |||    
T  18393621 gacttttgagttgaactttagatgcttttgagtacctttagatgtctactaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctg----------gaa 18393710  T
Q  114 caactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
    ||||  ||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  18393711 caaccgtagttggaaacctggcctgtactcgccatggcgagcagttgctctcgcctcgcgagcacttatagaacggagtgc 18393791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 138 - 295
Target Start/End: Original strand, 22449037 - 22449194
Alignment:
Q  138 gtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagaga 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |   || |||||| || || ||| || |||||  |    
T  22449037 gtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaaatgagaatgttgtgatctgagttgcttgaattgattaggaa 22449136  T
Q  238 tggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    ||||||||| || | ||||| ||| ||||||||| ||||  || ||||||||||||||    
T  22449137 tggacccttaggtagtaatgtgacatatataagatgttaactgcaatctgtgaagctg 22449194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Original strand, 20228463 - 20228636
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||| || ||  || ||  ||||| |  |||| |||||||||||||||||||||            
T  20228463 ttttgacttttgagatgaaccttagatgcctttgagtatctttaggtgcctactattgattaaagaatgatttagaatgagattgaacctgg-------- 20228554  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
      |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  20228555 --aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcaaatgctctcgcctcgcgagcacatccagaattgagtg 20228636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 52639988 - 52639821
Alignment:
Q  16 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  |||||||  |||| |||||||||||||||||||          ||||||    
T  52639988 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaatgagattgaacct----------agaaca 52639899  T
Q  116 actttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
    || |||||||| |   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52639898 accttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 52639821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Original strand, 16375117 - 16375284
Alignment:
Q  16 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  |||||||  |||| |||||| ||||||||||||          ||||||    
T  16375117 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacct----------agaaca 16375206  T
Q  116 actttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
    || |||||||| |   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16375207 accttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 16375284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 21407802 - 21407635
Alignment:
Q  16 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  |||||||  |||| |||||| ||||||||||||          ||||||    
T  21407802 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacct----------agaaca 21407713  T
Q  116 actttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
    || |||||||| |   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21407712 accttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 21407635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 21615889 - 21615718
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |   || ||| ||||||   | || | |||||||||||||||||||            
T  21615889 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtacctactaatgattagggaacgaatgagaatgagattgaacctgg-------- 21615798  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgag 191  Q
      |||||| |||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21615797 --aacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgag 21615718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 285 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 22532473 - 22532276
Alignment:
Q  285 ctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaatt 383  Q
    |||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||  |||  || ||   |||||||||| ||||||    
T  22532473 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgaatatttaagatgttgttgaatt 22532374  T
Q  384 gaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    | | | ||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| | |||||||  |||| ||||||    
T  22532373 gcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaaattgcatgagttggtctaagttgatgaagatg 22532276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 281 - 411
Target Start/End: Original strand, 22354485 - 22354616
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||    
T  22354485 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatacattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 22354584  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt 411  Q
    ||||| | |||||||  |||||||||||||||    
T  22354585 aattgcaattgatatttttatgtcatgctgtt 22354616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 281 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 20135395 - 20135181
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||| |||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||  |  ||| || | |||||||||| ||    
T  20135395 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttcattatgatatgatataatgttgtatgcattacttgaagttttattgaatacttaagatgttgttg 20135296  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaag 476  Q
    ||||| |  |||||| ||||||||||| ||||||   |  ||||||||| |||| || ||| |||||||||| ||||||| || ||||||  ||||||||    
T  20135295 aattgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttgtttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaag 20135197  T
Q  477 atgttgaggatgatgt 492  Q
    ||||||| ||||||||    
T  20135196 atgttgatgatgatgt 20135181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 369 - 471
Target Start/End: Original strand, 21896258 - 21896362
Alignment:
Q  369 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  21896258 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaa 21896357  T
Q  467 aatga 471  Q
     ||||    
T  21896358 gatga 21896362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 21438157 - 21438081
Alignment:
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 185  Q
    ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21438157 tagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 21438081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 23763574 - 23763498
Alignment:
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 185  Q
    ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23763574 tagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 23763498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 101
Target Start/End: Original strand, 3704744 - 3704831
Alignment:
Q  14 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctgg 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||    
T  3704744 gacttttgagttgatccttagatgcttttgagtacctttagttgtgtattaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctgg 3704831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 414 - 479
Target Start/End: Original strand, 14295600 - 14295665
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  14295600 atactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaatgttgaagatg 14295665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 386 - 466
Target Start/End: Original strand, 20847173 - 20847255
Alignment:
Q  386 atttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||||| |||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20847173 atttgatatatttatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 20847255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 369 - 471
Target Start/End: Original strand, 21861572 - 21861676
Alignment:
Q  369 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21861572 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaa 21861671  T
Q  467 aatga 471  Q
     ||||    
T  21861672 gatga 21861676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 417 - 492
Target Start/End: Original strand, 20454606 - 20454680
Alignment:
Q  417 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatgttgaggatgatgt 492  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||    
T  20454606 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgataatgt 20454680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 373 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 21840878 - 21840767
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  21840878 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 21840781  T
Q  470 gattaagatgttga 483  Q
    ||||||||||||||    
T  21840780 gattaagatgttga 21840767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 337 - 471
Target Start/End: Original strand, 35261051 - 35261184
Alignment:
Q  337 tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgttt 434  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||||||||||   ||| |||||||||  |||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  35261051 tatgcattacttgaattatgtatgaatgtttgagatgttgat---ttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgttt 35261147  T
Q  435 gttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatga 471  Q
    |||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  35261148 gtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatga 35261184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 414 - 472
Target Start/End: Original strand, 22921918 - 22921976
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgat 472  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22921918 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 22921976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 373 - 466
Target Start/End: Original strand, 45574893 - 45574988
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||| ||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45574893 gttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 45574988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 72
Target Start/End: Original strand, 22355824 - 22355889
Alignment:
Q  7 taattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  22355824 taattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 22355889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 72
Target Start/End: Original strand, 22357510 - 22357575
Alignment:
Q  7 taattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  22357510 taattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 22357575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 16758721 - 16758669
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  16758721 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 16758669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 20918676 - 20918624
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20918676 atactgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 20918624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 21754117 - 21754065
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21754117 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21754065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 33681079 - 33681027
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  33681079 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 33681027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 13988977 - 13988870
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  13988977 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 13988880  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  13988879 gattaagatg 13988870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Original strand, 21923342 - 21923449
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  21923342 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 21923439  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  21923440 gattaagatg 21923449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Original strand, 23593786 - 23593893
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  23593786 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23593883  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  23593884 gattaagatg 23593893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 369 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 31612428 - 31612317
Alignment:
Q  369 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 465  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31612428 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 31612331  T
Q  466 aaatgattaagatg 479  Q
    |  |||||||||||    
T  31612330 agttgattaagatg 31612317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 72
Target Start/End: Original strand, 27250378 - 27250444
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  27250378 gtaatattgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 27250444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 435 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 16361965 - 16361908
Alignment:
Q  435 gttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatgttgaggatgatgt 492  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  16361965 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgt 16361908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 433487 - 433395
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctgg 101  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || |||| |||||| ||||||   |  |  ||||||||||||||||||||    
T  433487 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctattaatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgg 433395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 101
Target Start/End: Original strand, 20846867 - 20846963
Alignment:
Q  5 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctgg 101  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||| | |  |  ||| ||||||||||||||||    
T  20846867 tgtaattttgacctttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggtaagaatgtaggatgagattgaacctgg 20846963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 369 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 22237746 - 22237647
Alignment:
Q  369 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  22237746 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcataatgcctatgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaa 22237647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 415 - 471
Target Start/End: Original strand, 50614167 - 50614223
Alignment:
Q  415 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatga 471  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  50614167 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatga 50614223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 415 - 471
Target Start/End: Original strand, 50621995 - 50622051
Alignment:
Q  415 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatga 471  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  50621995 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatga 50622051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Original strand, 52928019 - 52928071
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  52928019 atactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 52928071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Original strand, 21301179 - 21301242
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  21301179 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 21301242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Original strand, 21475138 - 21475245
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||  |    
T  21475138 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagtt 21475235  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  21475236 gattaagatg 21475245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 43697843 - 43697776
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattaga 73  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||| | |||||||    
T  43697843 gtaattttgacttttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctatttatgattaga 43697776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 369 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 433125 - 433016
Alignment:
Q  369 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 465  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||| || ||||   ||||||||||| ||||||     |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  433125 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgatgtttttgtatactgcctgtgttgc----cgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 433030  T
Q  466 aaatgattaagatg 479  Q
    |  |||||||||||    
T  433029 agttgattaagatg 433016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 417 - 471
Target Start/End: Original strand, 16368338 - 16368392
Alignment:
Q  417 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatga 471  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16368338 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatga 16368392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 386 - 479
Target Start/End: Original strand, 22123131 - 22123226
Alignment:
Q  386 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||    
T  22123131 atttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgt-tgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagattaagatg 22123226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 6 - 72
Target Start/End: Original strand, 22921505 - 22921571
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  22921505 gtaattttgacctttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 22921571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 71
Target Start/End: Original strand, 52927619 - 52927684
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagatta 71  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| |||||    
T  52927619 gtaattttgacttttgagttgacccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatta 52927684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 20248351 - 20248299
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  20248351 atactgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaa 20248299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 21027153 - 21027057
Alignment:
Q  5 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctgg 101  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||| || ||| |||||| | |  |  ||| ||||||||||||||||    
T  21027153 tgtaattttgacctttgagttgatccttagatgcttttgagtgcttgaacatgtctaataatgattaggtaagaatgtaggatgagattgaacctgg 21027057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 21162118 - 21162078
Alignment:
Q  137 tgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagca 177  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21162118 tgtactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagca 21162078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 101
Target Start/End: Original strand, 22354213 - 22354305
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctgg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || |||| |  ||| ||||||   || || ||| ||||||||||||||||    
T  22354213 attttgacttttgagttgaaccttatatgcttttgagtgcttgaacatgtcttataatgattaggaaataacgtaggatgagattgaacctgg 22354305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 19063882 - 19063807
Alignment:
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 185  Q
    |||||||| |||||| ||||  || || ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  19063882 agaacaacattagtttggatattgactggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccaga 19063807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 19111772 - 19111697
Alignment:
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 185  Q
    |||||||| |||||| ||||  || || ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  19111772 agaacaacattagtttggatattgactggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccaga 19111697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 20135671 - 20135628
Alignment:
Q  5 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgc 48  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  20135671 tgtaattttgacttttgagtttatccttagatgcttttgagtgc 20135628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 22532749 - 22532686
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  22532749 attttgacttttgatttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 22532686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 424 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 29298195 - 29298141
Alignment:
Q  424 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  29298195 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 29298141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 424 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 29776746 - 29776692
Alignment:
Q  424 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  29776746 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 29776692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 34510260 - 34510197
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  34510260 attttgacttttgagttgattcttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 34510197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 479
Target Start/End: Original strand, 13212974 - 13213020
Alignment:
Q  433 ttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  13212974 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 13213020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 21342146 - 21342100
Alignment:
Q  433 ttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  21342146 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21342100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 21347011 - 21346965
Alignment:
Q  433 ttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  21347011 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21346965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 21707217 - 21707171
Alignment:
Q  433 ttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  21707217 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21707171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 21711759 - 21711713
Alignment:
Q  433 ttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  21711759 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21711713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 21754514 - 21754452
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  21754514 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 21754452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 33681492 - 33681426
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| || |||| || ||| ||||||    
T  33681492 gtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagttcctgaatatgtctaataatgattag 33681426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 368 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 33797639 - 33797573
Alignment:
Q  368 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctatgttgctgtt 433  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||    
T  33797639 aagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttgtatgctgcatatgttgctgtt 33797573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 413 - 471
Target Start/End: Original strand, 41050084 - 41050142
Alignment:
Q  413 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatga 471  Q
    ||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  41050084 tatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaagatga 41050142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 20919083 - 20919018
Alignment:
Q  7 taattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  20919083 taattttgacctttgagttgatccttacatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 20919018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 281 - 360
Target Start/End: Original strand, 22356087 - 22356168
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttg-ttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttg 360  Q
    ||||||||||||||   |||||| ||||| || |||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22356087 taatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttg 22356168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 281 - 360
Target Start/End: Original strand, 22357773 - 22357854
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttg-ttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttg 360  Q
    ||||||||||||||   |||||| ||||| || |||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22357773 taatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttg 22357854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 388 - 479
Target Start/End: Original strand, 16275430 - 16275522
Alignment:
Q  388 ttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||| || |||| |||||||||  |||||||||||    
T  16275430 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgtcgttgtt-gttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatg 16275522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 20248758 - 20248694
Alignment:
Q  8 aattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  20248758 aattttgacttttgagttgatccatagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 20248694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 20918952 - 20918916
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 176  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20918952 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc 20918916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 21754386 - 21754346
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactt 180  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  21754386 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtactt 21754346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 22238112 - 22238068
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  22238112 gtaattttgacttttgagttgatccttagatatttttgagtgcct 22238068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 433357 - 433322
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 175  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  433357 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 433322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 19105087 - 19105040
Alignment:
Q  138 gtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 185  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  19105087 gtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccaga 19105040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 416 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 50686681 - 50686626
Alignment:
Q  416 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatga 471  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  50686681 actgcctatgttgccgtttgtttattaactaaactgcatgagtcggtctaagatga 50686626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 433 - 479
Target Start/End: Original strand, 15860121 - 15860167
Alignment:
Q  433 ttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||    
T  15860121 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatg 15860167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 415 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 26065009 - 26064959
Alignment:
Q  415 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 465  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | ||||||    
T  26065009 tactgcctatgttgctgtttgtttatcaactaagctgcatgagttggtcta 26064959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 33681359 - 33681325
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcga 174  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33681359 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 33681325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 72
Target Start/End: Original strand, 38801044 - 38801106
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  38801044 ttttgacttttgagttgaactttagatgtctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 38801106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 413 - 466
Target Start/End: Original strand, 16093933 - 16093986
Alignment:
Q  413 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| | ||||||| |||||||||    
T  16093933 tatactgcctatgttgctatttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaa 16093986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 183
Target Start/End: Original strand, 20524987 - 20525032
Alignment:
Q  138 gtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttcca 183  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||    
T  20524987 gtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttcca 20525032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 21162216 - 21162167
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21162216 attctgtgtttttgacttttgagatgacccttaaatgcttttgagtgcct 21162167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 138 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 1011057 - 1011001
Alignment:
Q  138 gtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
    ||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  1011057 gtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccagaattgagtgc 1011001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 50
Target Start/End: Original strand, 20091116 - 20091156
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  20091116 ttttgacttttgagttaaaccttagatgcctttgattgcct 20091156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 20637200 - 20637164
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 176  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  20637200 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 20637164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 123 - 175
Target Start/End: Original strand, 50209967 - 50210019
Alignment:
Q  123 ttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 175  Q
    |||| |||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  50209967 ttggaattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 50210019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 27308 - 26835
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  27308 attctgtattttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcatattaaagattaaatgataacttagaacgagatttaacctg 27209  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  27208 gtatagcttagaacaactttagttggaattctggcttgtattcgccatggcgagcagatgctcttgcctcgcaagcatttccagaactgagtgcaagtga 27109  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataa 300  Q
    ||| | |||||||||| ||| ||  |||  ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||  ||     
T  27108 ggatattgcgatctgtttcgaatattttgtttagagatggacccttgggtagtaatgagacatatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg-ttat 27010  T
Q  301 gatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattat 400  Q
    || |||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27009 gagatgtttgtgttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaa-ttgatataattat 26911  T
Q  401 -gtca-tgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaa 475  Q
      | | || |||||||  ||||||||| ||||  |||||||||||| ||| ||||||| ||| | ||| ||||||||    
T  26910 catgattgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttatttaaccaagatgcatgagtcgatataagatgattaa 26835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 2361 - 1884
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||| ||||||||||||||    
T  2361 attctgtatttttgacctttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattaaatgagaacctagactgagattgaacctg 2262  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2261 gtttagcttagaacaattttagttgggattctggcttgtactcgccgtggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttcgagaactgagtgcaagtga 2162  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataa 300  Q
    | |   |  ||||||||| || ||| || ||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||     
T  2161 gaatgttatgatctgtgttgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg-atat 2063  T
Q  301 gatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattat 400  Q
    || |||||   ||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  2062 gagatgtttgcgttggatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatacataagatgttgatgaattgaa-ttggtataattat 1964  T
Q  401 -gtca-tgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
      | | || |||||||  ||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||| ||| | ||| ||||||||||||    
T  1963 catgattgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 1884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 479
Target Start/End: Original strand, 21440 - 21917
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||    
T  21440 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcatagtaaagattaaatgataacttagaacgagattgaatctg 21539  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21540 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 21639  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataa 300  Q
    | |   || ||||||||| || ||| ||  |||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||  ||     
T  21640 gaatgttgtgatctgtgttgcttgaattggttagggatggacccttaggtagtaatgagacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctg-ttat 21738  T
Q  301 gatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattat 400  Q
    || |||||  ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  21739 gagatgtttgtgttgattaagatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaa-ttggtataattat 21837  T
Q  401 -gtca-tgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
      | | || |||||||  ||||||||| ||||  |||||||||||| ||| ||||||| ||| | ||| ||||||||||||    
T  21838 catgattgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 21917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 479
Target Start/End: Original strand, 29332 - 29809
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||    
T  29332 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcatagtaaagattaaatgataacttagaacgagattgaatctg 29431  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29432 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 29531  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataa 300  Q
    | |   || ||||||||| || ||| ||  |||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||  ||     
T  29532 gaatgttgtgatctgtgttgcttgaattggttagggatggacccttaggtagtaatgagacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctg-ttat 29630  T
Q  301 gatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattat 400  Q
    || |||||  ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  29631 gagatgtttgtgttgattaagatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaa-ttggtataattat 29729  T
Q  401 -gtca-tgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
      | | || |||||||  ||||||||| ||||  |||||||||||| ||| ||||||| ||| | ||| ||||||||||||    
T  29730 catgattgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 29809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 194)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 856620 - 856143
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  856620 attctgtatttttgactttttagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctg 856521  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  856520 ttttagcttagaacaattttagttggtattctggcttgtactcgctttggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 856421  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataa 300  Q
    | |   || ||||||||| || ||| || ||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||  |||     
T  856420 gaatgttgtgatctgtgttgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagct-tatat 856322  T
Q  301 gatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattat 400  Q
    || |||||  ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  856321 gagatgtttgtgtcgaatatgatgtattataatgtttatgtattacttgaagattaattgtatacataagatgttgttgaattgaa-ttggtataattat 856223  T
Q  401 -gtca-tgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
      | | || |||||||  ||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||| ||| | ||| ||||||||||||    
T  856222 catgattgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaactaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 856143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 15060776 - 15060483
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15060776 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctg 15060677  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  15060676 gtttagcttagaacaaccttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaggactgattgcaagtta 15060577  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagct 294  Q
    |||   ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || | || || ||||||||||||| | ||  || |||||||||||||    
T  15060576 ggatgttgcgatctgtgtcgcatgaattgattagggatggacccttaggtagtattgtgacctatataagatggtaactgcaatctgtgaagct 15060483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12496739 - 12496445
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  12496739 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatttagaacgagattgaacctg 12496640  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  12496639 gtttagcttagaacaacttaagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagtta 12496540  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    | |   |||||||||| |||||| | || ||||| | ||||||||| || | ||||| ||||||| ||||| ||||  || ||||||||||||||    
T  12496539 gtatgttgcgatctgtttcgcataagttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctg 12496445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Original strand, 23077112 - 23077406
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||     
T  23077112 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttggatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacacagagtgagattgaaccta 23077211  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||    
T  23077212 gtttagcttagaacaacttaggttggaattctagcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaaccgatttcaattga 23077311  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    |||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||   |||||| ||||||||||    
T  23077312 ggattttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttaggtagtaatgagacctatatgagaagtttactgtaatttgtgaagctg 23077406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 18383551 - 18383826
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18383551 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatttagaatgagattgaacctg 18383650  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  18383651 gtttagcttagaacaacttaagttggaattttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttcaagaactgaatgcaagtta 18383750  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagtta 276  Q
    | |   |||||||||| |||||| | || ||||| | ||||||||| || | ||||| ||||||| ||||| ||||    
T  18383751 gtatgttgcgatctgtttcgcataaattgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgtta 18383826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12173270 - 12173048
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12173270 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 12173171  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  12173170 gtttagcttagaacaactttagttggtattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagtta 12173071  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcat 223  Q
    |||   ||| |||||||||||||    
T  12173070 ggatgttgctatctgtgtcgcat 12173048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 14878139 - 14878433
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14878139 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttatatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgatgacttagagtgagattgaacctg 14878238  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||    
T  14878239 gtttagcttagaataactttagttggaattctggctcgtactcgccatggcgagcagatgttctcgcctcgagagcacttccagaaccgagtgcgattga 14878338  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatgga-cccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagct 294  Q
    ||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| | || | ||||| ||| ||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  14878339 ggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggaccccctaggtagtaatgtgacttatataagaagttaactgcaatctgtgaagct 14878433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 266
Target Start/End: Original strand, 15877471 - 15877727
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||| | |    
T  15877471 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagattaaatgataacttaggacgagattgaacctggtttaacct 15877570  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgc 209  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  15877571 agaacaacctttgttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatattgc 15877670  T
Q  210 gatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctata 266  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  15877671 gatcagtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctata 15877727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 15052000 - 15051707
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  15052000 attctgtaattttaacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattaaattataacttagaatgagattgaacctg 15051901  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    | ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |    
T  15051900 gattagcttagaacaaccttagtcggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttctaggactgaatgcaagtta 15051801  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagct 294  Q
    |||   || |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || | || || ||||||||||||| ||||  || ||| |||||||||    
T  15051800 ggatgttgtgatctgtgtcgcatgaattgattagggatggacccttaggtagtattgtgacctatataagatgttaactgcaatttgtgaagct 15051707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16369892 - 16369692
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  16369892 attctgtaattttgacctttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcataaagatgtttattaaagattaaatgataacttagaataagattgaacctg 16369793  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16369792 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctttcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 16369693  T
Q  201 g 201  Q
    |    
T  16369692 g 16369692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 323073 - 322798
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  323073 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcgttaagatgtttattaaagattagatgatgatttagaacgagattgaacctg 322974  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  322973 gtttagcttagaacaacttaagttggaattctggcttgtactcaccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactaaatgcaagtta 322874  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagtta 276  Q
    | |   |||||||| | |||||| | || ||||| | ||||||||| || | ||||| ||||||| ||||| ||||    
T  322873 gtatgttgcgatctatttcgcataaattgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgtta 322798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 6 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 23408911 - 23408581
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggttta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23408911 gtaattttgacttttgagttgaaccttagata-ttatgagtgcctgaagatgcctattaaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttta 23408813  T
Q  106 gcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaa 205  Q
     | |||||||||  | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  23408812 acctagaacaaccattgttgggaatcttgcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaacttagtgcaagtgaggata 23408713  T
Q  206 atgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatat 305  Q
     ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | || ||  |||||| | ||||||||  || ||||||||||||||  || || ||    
T  23408712 ttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtattgttacctattttagaagttaactgcaatctgtgaagctg-ttatgagat 23408614  T
Q  306 gttgttgttgattatgaagtgttataatgttta 338  Q
    |||  |||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  23408613 gttagtgttgaatatgatgtgatataatgttta 23408581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 201
Target Start/End: Original strand, 26190652 - 26190843
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26190652 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagataagatgctgacttagaacaagattgaacctggtttagctt 26190751  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgag 201  Q
    | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26190752 ataacaacttgagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaattgag 26190843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 6 - 271
Target Start/End: Original strand, 19725551 - 19725816
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggttta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  19725551 gtaattttgacttttgagttgaaccttaaatgcttttgtgtgccttaagatgttgaataaagattagatgatgatctagaacgagattgaacctggttta 19725650  T
Q  106 gcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaa 205  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||      
T  19725651 gcttagaacaaccttagttgggattctgacttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgaatacaagttaggatg 19725750  T
Q  206 atgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataaga 271  Q
     |||||||||| |||||| | || ||||| | ||||||||| || | ||||| |||| || |||||    
T  19725751 ttgcgatctgtttcgcataaattgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacccatttaaga 19725816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 11298163 - 11298433
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||    
T  11298163 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctttagatgtttattaaagattagatgctgatttagaacaagattgaacctg 11298262  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |    
T  11298263 gtttagcttagaacaacttgagttggaaatctggcttgtactcgccatggcgatcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgaatgcaattta 11298362  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataaga 271  Q
    | |   |||||||||| || ||| |||| ||||| | ||||||||| || | ||||| ||||||| |||||    
T  11298363 gtatgttgcgatctgtttctcataatttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaaga 11298433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 27 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 11863247 - 11862981
Alignment:
Q  27 aaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaacaactttagttgg 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  11863247 aaccttagatgcttttgagtgccttaagat-tttattaaagattagatgatgatttagaacgagattgaacctggtt-agcttagaactactttagttgg 11863150  T
Q  127 gattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcgcatgat 226  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| || ||||||||||| ||||   |||||||||| ||| || |     
T  11863149 aattctggcttgaactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgtaagtacttccaaaattgagtgcaagttaggatgttgcgatctgtttcgtataaa 11863050  T
Q  227 ttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    || |||||   ||||||||| || | ||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  11863049 ttgattaggattggacccttaggtattaatgtgacctatttaagatgttatttgaaatctgtgaagctg 11862981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Original strand, 12037595 - 12037787
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagct 108  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12037595 attttgacatgtgagttaaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcatattaaagattagatgaagacttagaatgagattgaacctggttaagct 12037694  T
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgag 201  Q
    | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12037695 ttgaacaacattagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagccgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaattgag 12037787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 6 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 11852050 - 11851842
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggttta 105  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |    
T  11852050 gtaattttaacttttcagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagat-tttattaaagattagatgatgatttagaacgagattgaacctggtt-a 11851953  T
Q  106 gcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaa 205  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||      
T  11851952 gcttataacaactttagttggaattctggcttgaactcgccatggcgatcagatgctctcgcctcgtaagcacttccagaactaagtgcaagttaggatg 11851853  T
Q  206 atgcgatctgt 216  Q
     ||||||||||    
T  11851852 ttgcgatctgt 11851842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 249
Target Start/End: Original strand, 23052719 - 23052959
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagct 108  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  23052719 attttgacctgtgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgatgatgcatattaaatattagatggagacttagaatgagattgaaactagttaagct 23052818  T
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatg 208  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||   |     
T  23052819 tagaacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttgcagaattgaatgcaagtgaggatgtta 23052918  T
Q  209 cgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttggg 249  Q
    ||| ||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||    
T  23052919 cgacctgtgtcgcataacttgattagagatggacccctggg 23052959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Original strand, 17524808 - 17525080
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  17524808 attcagtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaaggtggttattaaagattaaatgataaattagaatgagattgaacctg 17524907  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    |||||| ||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||                      |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17524908 gtttagtttaaaacaacattagtagggaatctggcttgtacttgc----------------------ctcgcgagcacttccaaaactgagtgcaagtga 17524985  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    ||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  17524986 ggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg 17525080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 321648 - 321789
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  321648 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaaggttaaatgataacttagaatgagattgaacctg 321747  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtact 142  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||    
T  321748 gtttagcttagaacaacattagttgggaatctagcctgtact 321789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 326818 - 326992
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| || ||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||            
T  326818 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctgg-------- 326909  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
      |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  326910 --aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 326992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 5 - 188
Target Start/End: Original strand, 3402604 - 3402777
Alignment:
Q  5 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggttt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||        
T  3402604 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctttagttgtgtattaaagattagaggatgacttagaacaagattgaacctg---- 3402699  T
Q  105 agcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaact 188  Q
          |||||||  ||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3402700 ------gaacaaccgtagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaact 3402777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 192
Target Start/End: Original strand, 1982468 - 1982636
Alignment:
Q  14 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||          ||    
T  1982468 gacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtacctttagatgtttactaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctgg----------aa 1982557  T
Q  114 caactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagt 192  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1982558 caaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcaaatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagt 1982636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Original strand, 20698349 - 20698549
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 380  Q
    |||||||||||||||   ||||| |||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||    
T  20698349 taatctgtgaagctgttcaagatgtgttgaagttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatataagatgttgatga 20698448  T
Q  381 attgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaaga 477  Q
    |||| | ||||||| |||| |||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||    
T  20698449 attgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 20698547  T
Q  478 tg 479  Q
    ||    
T  20698548 tg 20698549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 195
Target Start/End: Original strand, 7793000 - 7793175
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| || ||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||            
T  7793000 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctgg-------- 7793091  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
      |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7793092 --aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctcttgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 7793175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 194
Target Start/End: Original strand, 11594797 - 11594967
Alignment:
Q  14 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||          ||    
T  11594797 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtttactaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctgg----------aa 11594886  T
Q  114 caactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
    |||| |||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11594887 caaccttagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 11594967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 15483114 - 15482939
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| || |||||||||||  |||| ||||||  |||||||||||||            
T  15483114 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagagaatgatttagaacaagattgaacctgg-------- 15483023  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
      |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15483022 --aacaaccttagtttggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 15482939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 195
Target Start/End: Original strand, 20461154 - 20461329
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| || ||||||| ||| ||||| ||||||  |||||||||||||            
T  20461154 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagatcagaggatgatttagaacaagattgaacctgg-------- 20461245  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
      |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20461246 --aacaaccttagttaggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 20461329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 195
Target Start/End: Original strand, 15849739 - 15849914
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||| ||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||            
T  15849739 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactaatgattagaggatgatttagaacaagattgaacctgg-------- 15849830  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
      |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15849831 --aacaaccttggttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 15849914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 1598134 - 1598308
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||  || ||  ||||||   |||| |||||| ||||||||||||              
T  1598134 ttttgacttttgagttgaaccttagatacttttgagtacctttaggtgcctactattgattagtgaatgatttagaacgagattgaacct---------- 1598223  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598224 agaacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 1598308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 17242424 - 17242250
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  ||||||   |||| |||||| ||||||||||||||            
T  17242424 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctgg-------- 17242333  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17242332 --aacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 17242250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 42326392 - 42326222
Alignment:
Q  14 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||          ||    
T  42326392 gacttttgagttgaaccttagaagcttttgagtacctttcgatgtttactaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctgg----------aa 42326303  T
Q  114 caactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
    |||| |||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42326302 caaccttagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 42326222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 13442482 - 13442281
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||    
T  13442482 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 13442383  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaag 476  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||    
T  13442382 aattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgccg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 13442284  T
Q  477 atg 479  Q
    |||    
T  13442283 atg 13442281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 17488064 - 17487863
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    ||||||||||| |||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||    
T  17488064 taatctgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 17487965  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaag 476  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||   |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||    
T  17487964 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 17487866  T
Q  477 atg 479  Q
    |||    
T  17487865 atg 17487863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 281 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 12399417 - 12399229
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgt-ttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||  | | |||| ||   |||||||||| ||    
T  12399417 taatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttg 12399318  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12399317 aattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 12399229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 15941558 - 15941732
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| || ||  ||||||   |||| |||||| ||||||||||||              
T  15941558 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagtgaatgatttagaacgagattgaacct---------- 15941647  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15941648 agaacaaccgtagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 15941732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 38814836 - 38814662
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  ||||||   | || |||||| ||||||||||||||            
T  38814836 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaaggatttagaacgagattgaacctgg-------- 38814745  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38814744 --aacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 38814662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 195
Target Start/End: Original strand, 31097208 - 31097383
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || |||||||||||  |||| ||||||  |||||||||||||            
T  31097208 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactaaagattagagaatgatttagaacaagattgaacctgg-------- 31097299  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
      ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31097300 --aacgaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctaccgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 31097383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 11300165 - 11300339
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  |||||||  |||| |||||||||||||||||||||            
T  11300165 ttttgacttttgaattgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaatgagattgaacctgg-------- 11300256  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
      |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  11300257 --aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacatccagaattgagtgc 11300339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 190
Target Start/End: Original strand, 11557033 - 11557208
Alignment:
Q  5 tgtaattttg-acttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtt 103  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||        
T  11557033 tgtaattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacccatagatgtttattaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacct---- 11557128  T
Q  104 tagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 190  Q
           || |||| |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11557129 -------gagcaaccttagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcatatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 11557208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 14973062 - 14972861
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||  |||  |||||  || |||||||| ||    
T  14973062 taatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatatgagatgttgttg 14972963  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaag 476  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||    
T  14972962 atttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 14972864  T
Q  477 atg 479  Q
    |||    
T  14972863 atg 14972861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 16697244 - 16697071
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || |||  |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||            
T  16697244 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgactactaacaattagaggatgatttagaatgagactgaacctgg-------- 16697153  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
      |||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16697152 --aacaaccttagttggaaagctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaagtgagtg 16697071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 17499546 - 17499345
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||| |||||| |||  |||||| ||||| |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||    
T  17499546 taatttgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 17499447  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaag 476  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||   |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||    
T  17499446 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 17499348  T
Q  477 atg 479  Q
    |||    
T  17499347 atg 17499345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 16690671 - 16690498
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||| ||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||            
T  16690671 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgactactaacgattaggggatgatttagaatgagactgaacctgg-------- 16690580  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
      |||||| |||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16690579 --aacaaccttagttggaaagctggcttttactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaagtgagtg 16690498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 111 - 195
Target Start/End: Original strand, 16797799 - 16797883
Alignment:
Q  111 gaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16797799 gaacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 16797883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 130 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16910105 - 16909941
Alignment:
Q  130 tctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcgcatgattta 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |      ||||||||| || ||| ||     
T  16910105 tctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttctagaactgagtgcaagtgagaatgtcatgatctgtgttgcttgaattg 16910006  T
Q  230 attagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagct 294  Q
    ||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||| |||| ||||  || |||||||||||||    
T  16910005 attagggatggacccttaggtagtaatgtgacctatacaagatgttaactgcaatctgtgaagct 16909941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 3834126 - 3833952
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| || ||  || ||  ||||||   |||| |||||| ||||||||||||              
T  3834126 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacct---------- 3834037  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  3834036 agaacaaccttggttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagatttgagtgc 3833952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 111 - 195
Target Start/End: Original strand, 16808626 - 16808710
Alignment:
Q  111 gaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16808626 gaacaaccttagttgggaagctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 16808710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 18438742 - 18438541
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||   |||  |||||  | ||||||||| ||    
T  18438742 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttatatgcattacttgagatatgaatgtataaaaaagatgttgttg 18438643  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaag 476  Q
    | ||| ||||||||| ||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||| |||    
T  18438642 acttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaag 18438544  T
Q  477 atg 479  Q
    |||    
T  18438543 atg 18438541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Original strand, 24153122 - 24153322
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||| ||||| | ||||||| |||||| ||  ||| ||   |||||||||| ||    
T  24153122 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttg 24153221  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaaga 477  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  24153222 acttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactacctatgttgctatc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 24153320  T
Q  478 tg 479  Q
    ||    
T  24153321 tg 24153322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 281 - 466
Target Start/End: Original strand, 14576746 - 14576933
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||||||||| ||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||  ||| ||   |||||||||| ||    
T  14576746 taatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttg 14576845  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctgttg--tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    | ||| | ||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  14576846 acttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtttatactgtctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgaatgagtcggtctaa 14576933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 111 - 195
Target Start/End: Original strand, 2897568 - 2897652
Alignment:
Q  111 gaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2897568 gaacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgacatgacgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaacttagtgca 2897652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 231 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 14179690 - 14179570
Alignment:
Q  231 ttagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttat 330  Q
    |||||||||||||| |||| | || || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| |||    
T  14179690 ttagagatggacccctgggtagtattgtgacctatataagaagttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatat 14179591  T
Q  331 aatg-tttatgcattacttga 350  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  14179590 aatgttttatgcattacttga 14179570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 101
Target Start/End: Original strand, 3389600 - 3389691
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||    
T  3389600 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctttagttgtgtattaaagattagaggatgacatagaacaagattgaacctgg 3389691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 281 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 26687095 - 26686907
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  | | ||   ||||||| || ||    
T  26687095 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatggaatatttaagatgatgttg 26686996  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    | ||| | ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26686995 acttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 26686907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Original strand, 27409303 - 27409470
Alignment:
Q  16 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  |||||||  |||| |||||| ||||||||||||          ||||||    
T  27409303 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacct----------agaaca 27409392  T
Q  116 actttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
    || |||||||| |   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27409393 accttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 27409470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 109 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 20723364 - 20723288
Alignment:
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 185  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20723364 tagaacaacattagttgggaagctggcttgtactcgccatggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 20723288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 282 - 479
Target Start/End: Original strand, 23083275 - 23083475
Alignment:
Q  282 aatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 380  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||| |||| |   ||| ||   |||||||||| |||    
T  23083275 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattactagaagtaaaattgaatatttaagatgttgttga 23083374  T
Q  381 attgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaaga 477  Q
     ||| | ||||||| |||||||||| |||||   ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||    
T  23083375 cttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 23083473  T
Q  478 tg 479  Q
    ||    
T  23083474 tg 23083475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 281 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 43841140 - 43840956
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   ||||||| || ||    
T  43841140 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttg 43841041  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 462  Q
    | ||| | ||||||| ||||||||||||||   |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43841040 acttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 43840956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 7110148 - 7109981
Alignment:
Q  16 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||   | ||  |||||||  |||| |||||| ||||||||||||          ||||||    
T  7110148 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcccactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacct----------agaaca 7110059  T
Q  116 actttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
    || |||||||| |   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7110058 accttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 7109981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 7114083 - 7113916
Alignment:
Q  16 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||   | ||  |||||||  |||| |||||| ||||||||||||          ||||||    
T  7114083 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcccactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacct----------agaaca 7113994  T
Q  116 actttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
    || |||||||| |   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7113993 accttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 7113916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22322114 - 22321947
Alignment:
Q  16 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| || ||| || ||  |||||||  |||| |||||| ||||||||||||          ||||||    
T  22322114 cttttgagttgaaccttagatgtctttgagtacctttaggtgtctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacct----------agaaca 22322025  T
Q  116 actttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
    || |||||||| |   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  22322024 accttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaaaattgagtg 22321947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22337169 - 22337002
Alignment:
Q  16 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| || ||  || ||  |||||||  |||| |||||| ||||||||||||          ||||||    
T  22337169 cttttgagttgaaccttagatgtctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacct----------agaaca 22337080  T
Q  116 actttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
    || |||||||| |   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22337079 accttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 22337002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 165
Target Start/End: Original strand, 16862834 - 16862979
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||             
T  16862834 ttttaacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgactactaatgattagagaatgatttagaatgagattgaacctg--------- 16862924  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctc 165  Q
     ||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16862925 -gaacaaccttagttggggatttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctc 16862979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 281 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 42386619 - 42386430
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaat-aagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgat 378  Q
    |||||||||||||||  | ||||| | ||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||  |||  || ||   | |||||||| |    
T  42386619 taatctgtgaagctgttttaagatgttttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatatttgagatgttgtt 42386520  T
Q  379 gaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    || ||| |||||||||  |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  42386519 gacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaaactgcatgagtcggtctaa 42386430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 282 - 479
Target Start/End: Original strand, 25476299 - 25476499
Alignment:
Q  282 aatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 380  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||| || |||| |||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||  |||  ||||| | | |||||||| |||    
T  25476299 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatgttatgcgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttga 25476398  T
Q  381 attgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaaga 477  Q
     ||| ||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||  |||| ||||    
T  25476399 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctg-ttgttttttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaaga 25476497  T
Q  478 tg 479  Q
    ||    
T  25476498 tg 25476499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 111 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 11855097 - 11855015
Alignment:
Q  111 gaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
    |||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  11855097 gaacaaccatagttgggaagctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcacctcgcgagcaaatccagaactgagtg 11855015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 24188140 - 24188064
Alignment:
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 185  Q
    ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24188140 tagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 24188064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Original strand, 40213634 - 40213834
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||||| ||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||| |  |||  |||||   | |||||||| ||    
T  40213634 taatctgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttggattatgaatgtataattgagatgttgttg 40213733  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaag 476  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||    
T  40213734 acttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactgc-tgtgttgatgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaag 40213831  T
Q  477 atg 479  Q
    |||    
T  40213832 atg 40213834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 414 - 472
Target Start/End: Original strand, 49668125 - 49668183
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgat 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  49668125 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 49668183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 388 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 14572688 - 14572609
Alignment:
Q  388 ttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14572688 ttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 14572609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 15617717 - 15617656
Alignment:
Q  132 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15617717 tggcttgtactcgccacggcgagcagatgctcttgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 15617656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 369 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 36166712 - 36166602
Alignment:
Q  369 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36166712 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 36166615  T
Q  467 aatgattaagatg 479  Q
      |||||||||||    
T  36166614 gttgattaagatg 36166602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 109 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 55149341 - 55149256
Alignment:
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
    ||||||||| ||||||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  55149341 tagaacaacattagttgggaagttggattgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagatttgagtgc 55149256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Original strand, 11424676 - 11424873
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||  |||| |||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  || ||   | ||||||||||     
T  11424676 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgaagttgtttatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgcataattgagatgttgat- 11424774  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaaga 477  Q
      |||   |||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||  |||| ||||    
T  11424775 --ttgctattgatattgttatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaaga 11424871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Original strand, 12174308 - 12174360
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12174308 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 12174360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 370 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 14234605 - 14234494
Alignment:
Q  370 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaa 467  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||     
T  14234605 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaag 14234506  T
Q  468 atgattaagatg 479  Q
     |||||||||||    
T  14234505 ttgattaagatg 14234494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 369 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 15471043 - 15470944
Alignment:
Q  369 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15471043 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 15470944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 421 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 28194755 - 28194691
Alignment:
Q  421 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatgttgagg 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||    
T  28194755 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgagg 28194691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 32307749 - 32307697
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32307749 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 32307697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 8899205 - 8899098
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  8899205 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaatt 8899108  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  8899107 gattaagatg 8899098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Original strand, 9707658 - 9707765
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  9707658 gttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 9707755  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  9707756 gattaagatg 9707765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 12399679 - 12399612
Alignment:
Q  5 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  12399679 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 12399612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 17672737 - 17672630
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  17672737 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 17672640  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  17672639 gattaagatg 17672630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 414 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 27165319 - 27165248
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatgttgagg 485  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||    
T  27165319 atactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgagg 27165248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 28950175 - 28950007
Alignment:
Q  16 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  |||||||  |||| |||||| ||||||||||||          ||||||    
T  28950175 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacct----------agaaca 28950086  T
Q  116 actttagttgggattct-ggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
    || |||||| |||   | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  28950085 accttagtttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgccccgtgagcacttccagaattgagtg 28950007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Original strand, 29172634 - 29172741
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  29172634 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29172731  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  29172732 gattaagatg 29172741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 414 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 9512992 - 9512934
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgat 472  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  9512992 atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 9512934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 414 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 9520967 - 9520909
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgat 472  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  9520967 atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 9520909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 51
Target Start/End: Original strand, 17674214 - 17674259
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctt 51  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17674214 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctt 17674259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 414 - 471
Target Start/End: Original strand, 52523778 - 52523835
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatga 471  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  52523778 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatga 52523835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 175
Target Start/End: Original strand, 53070340 - 53070504
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagct 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||   |  |  |||||||||||||||||||| |||  |    
T  53070340 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggattaatt 53070439  T
Q  109 tagaa-caactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 175  Q
     ||||  |||||   || |||  ||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  53070440 aagaatgaactt---tttggaagctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 53070504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 371 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 55501055 - 55500946
Alignment:
Q  371 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaa 467  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  55501055 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 55500958  T
Q  468 atgattaagatg 479  Q
     |||||||||||    
T  55500957 ttgattaagatg 55500946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 101
Target Start/End: Original strand, 11424404 - 11424496
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctgg 101  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||   || |  ||||||||||||||||||||    
T  11424404 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaataatgtagaatgagattgaacctgg 11424496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Original strand, 13210376 - 13210428
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13210376 atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 13210428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 13544136 - 13544016
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  13544136 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 13544039  T
Q  470 gattaagatgttgaggatgatgt 492  Q
    ||||||||||||||  |||||||    
T  13544038 gattaagatgttgataatgatgt 13544016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Original strand, 6469185 - 6469292
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  6469185 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 6469282  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  6469283 gattaagatg 6469292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Original strand, 7781398 - 7781505
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  7781398 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 7781495  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  7781496 gattaagatg 7781505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 17463289 - 17463182
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  17463289 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 17463192  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  17463191 gattaagatg 17463182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 72
Target Start/End: Original strand, 20698084 - 20698151
Alignment:
Q  5 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| || ||| ||||||    
T  20698084 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattag 20698151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Original strand, 28848662 - 28848769
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  28848662 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 28848759  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  28848760 gattaagatg 28848769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 34159437 - 34159330
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  34159437 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 34159340  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  34159339 gattaagatg 34159330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Original strand, 45606958 - 45607065
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  45606958 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 45607055  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  45607056 gattaagatg 45607065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 414 - 485
Target Start/End: Original strand, 53301600 - 53301671
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatgttgagg 485  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||  ||||||||||| |||||    
T  53301600 atactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatgagg 53301671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 55476602 - 55476495
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  55476602 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 55476505  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  55476504 gattaagatg 55476495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 373 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 12567671 - 12567561
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  12567671 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 12567574  T
Q  470 gattaagatgttg 482  Q
    |||||||||||||    
T  12567573 gattaagatgttg 12567561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 14179801 - 14179739
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  14179801 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 14179739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 413 - 466
Target Start/End: Original strand, 37251216 - 37251269
Alignment:
Q  413 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  37251216 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtctaa 37251269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 839609 - 839533
Alignment:
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 185  Q
    ||||||||| |||||||||    || |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  839609 tagaacaacattagttggggagttgacttgaactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 839533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 50
Target Start/End: Original strand, 13209970 - 13210010
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13209970 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 13210010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 15412527 - 15412427
Alignment:
Q  386 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatgttg 482  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||    
T  15412527 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 15412430  T
Q  483 agg 485  Q
    |||    
T  15412429 agg 15412427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 418 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 16097396 - 16097348
Alignment:
Q  418 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16097396 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 16097348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 16103852 - 16103800
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  16103852 atactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaa 16103800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 369 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 21618563 - 21618466
Alignment:
Q  369 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21618563 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21618466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 415 - 471
Target Start/End: Original strand, 22110402 - 22110458
Alignment:
Q  415 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatga 471  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  22110402 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatga 22110458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 32308151 - 32308107
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32308151 gtaattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 32308107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 415 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 43926029 - 43925973
Alignment:
Q  415 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatga 471  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  43926029 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatga 43925973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 14973334 - 14973271
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  14973334 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 14973271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Original strand, 16454332 - 16454439
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||  |    
T  16454332 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 16454429  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  16454430 gattaagatg 16454439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 18439014 - 18438951
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  18439014 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 18438951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 26687367 - 26687304
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  26687367 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctaaacatgtctaataatgattag 26687304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 185
Target Start/End: Original strand, 28350905 - 28350980
Alignment:
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 185  Q
    |||||||| |||||||||    ||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28350905 agaacaacattagttggggagttggcttcaactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 28350980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 475
Target Start/End: Original strand, 38961942 - 38962045
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  38961942 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 38962039  T
Q  470 gattaa 475  Q
    ||||||    
T  38962040 gattaa 38962045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 386 - 479
Target Start/End: Original strand, 12119789 - 12119883
Alignment:
Q  386 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | ||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  12119789 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12119883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 6 - 72
Target Start/End: Original strand, 49389282 - 49389348
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  49389282 gtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 49389348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 12340232 - 12340191
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12340232 attttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcct 12340191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 391 - 479
Target Start/End: Original strand, 16282880 - 16282969
Alignment:
Q  391 atataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    |||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  16282880 atattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16282969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 50
Target Start/End: Original strand, 23083002 - 23083043
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23083002 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 23083043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 194
Target Start/End: Original strand, 3389719 - 3389763
Alignment:
Q  150 gcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  3389719 gcgagcagatgctctcgccttgcgagcacttccagaactaagtgc 3389763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 50
Target Start/End: Original strand, 4588457 - 4588497
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4588457 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcct 4588497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 433 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 8499568 - 8499516
Alignment:
Q  433 ttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatgttgagg 485  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||    
T  8499568 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgagg 8499516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 9513387 - 9513327
Alignment:
Q  12 ttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  9513387 ttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 9513327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 9521362 - 9521302
Alignment:
Q  12 ttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  9521362 ttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 9521302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Original strand, 13151841 - 13151949
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaact-aagctgcatgattcggtctaaaa 468  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||  | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||      
T  13151841 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagt 13151938  T
Q  469 tgattaagatg 479  Q
    |||||||||||    
T  13151939 tgattaagatg 13151949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Original strand, 13154306 - 13154414
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaact-aagctgcatgattcggtctaaaa 468  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||  | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||      
T  13154306 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagt 13154403  T
Q  469 tgattaagatg 479  Q
    |||||||||||    
T  13154404 tgattaagatg 13154414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 101
Target Start/End: Original strand, 17247927 - 17248019
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctgg 101  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||   |  |  ||||||||||||||||||||    
T  17247927 attttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgg 17248019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 386 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 17737337 - 17737240
Alignment:
Q  386 atttgatataattatgtcatgctgttgt------atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||      ||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  17737337 atttgatattattatgtcatgctgttgttgtagtatattgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17737240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Original strand, 10247774 - 10247881
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | || ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||  |    
T  10247774 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgctgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagtt 10247871  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  10247872 gattaagatg 10247881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 12340103 - 12340064
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcact 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12340103 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcact 12340064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 14573067 - 14572976
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctgg 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| || ||| ||||||   |  |  ||||||||||||||||||||    
T  14573067 ttttgacttttgagttgatccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgg 14572976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 424 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 15977573 - 15977519
Alignment:
Q  424 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  15977573 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 15977519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Original strand, 17446706 - 17446812
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||  |    
T  17446706 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagtt 17446802  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  17446803 gattaagatg 17446812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 390 - 466
Target Start/End: Original strand, 24340746 - 24340824
Alignment:
Q  390 gatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  24340746 gatattattatatcatgatgttgtgcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaa 24340824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Original strand, 40213362 - 40213425
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  40213362 attttgacttttgagttgatcattagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 40213425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 373 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 50242933 - 50242830
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  50242933 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 50242836  T
Q  470 gattaa 475  Q
    ||||||    
T  50242835 gattaa 50242830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 373 - 471
Target Start/End: Original strand, 53070704 - 53070803
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||| || ||||   ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  53070704 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgttgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 53070801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 417 - 471
Target Start/End: Original strand, 606378 - 606432
Alignment:
Q  417 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatga 471  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  606378 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtataagatga 606432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 10557035 - 10556989
Alignment:
Q  433 ttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  10557035 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 10556989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 72
Target Start/End: Original strand, 12171755 - 12171821
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  12171755 gtaattttgactttttagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 12171821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 72
Target Start/End: Original strand, 12933952 - 12934014
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  12933952 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 12934014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 16104263 - 16104197
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  16104263 gtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttctgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 16104197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 16809864 - 16809826
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgc 48  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16809864 ttttgacttttgagttgaaccttaaatgcttttgagtgc 16809826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 41123940 - 41123894
Alignment:
Q  433 ttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  41123940 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 41123894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 466
Target Start/End: Original strand, 43550529 - 43550624
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |   ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43550529 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgcatactgcatatgttgctgtca-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 43550624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 386 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 44494907 - 44494813
Alignment:
Q  386 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||   ||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||    
T  44494907 atttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatg 44494813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 479
Target Start/End: Original strand, 45577950 - 45577996
Alignment:
Q  433 ttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  45577950 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 45577996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 46822386 - 46822259
Alignment:
Q  367 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttg---tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtc 463  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||  ||||||| || |||||   ||  ||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||| || |||    
T  46822386 taagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcagtc 46822288  T
Q  464 taaaatgattaagatgttgaggatgatgt 492  Q
    |||  |||||||||||||||  |||||||    
T  46822287 taagttgattaagatgttgataatgatgt 46822259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 413 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 12377994 - 12377941
Alignment:
Q  413 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||| |||||||||    
T  12377994 tatactgcctatgttgctgtttgtctattaactaagctgtatgagtcggtctaa 12377941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 50
Target Start/End: Original strand, 14576474 - 14576515
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  14576474 attttgacttttgagttgatccttagatgcctttgagtgcct 14576515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 51
Target Start/End: Original strand, 16797708 - 16797749
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctt 51  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16797708 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctt 16797749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 6 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 30030311 - 30030270
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtg 47  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30030311 gtaaatttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtg 30030270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 43842658 - 43842617
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43842658 attttgactttttagttgatccttagatgcttttgagtgcct 43842617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 50
Target Start/End: Original strand, 1644321 - 1644365
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  1644321 gtaattttgacttttgagttgatccttggatgtttttgagtgcct 1644365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 180
Target Start/End: Original strand, 1644453 - 1644493
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactt 180  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  1644453 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtactt 1644493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 180
Target Start/End: Original strand, 12852134 - 12852174
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactt 180  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  12852134 actcgccatggcgagcagaggctcttgcctcgcgagcactt 12852174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 180
Target Start/End: Original strand, 13210098 - 13210138
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactt 180  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  13210098 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcactt 13210138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 15471407 - 15471367
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 46  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15471407 gtaattttgacctttgagttgaaccttagatgtttttgagt 15471367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 49
Target Start/End: Original strand, 17247161 - 17247201
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcc 49  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  17247161 attttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcc 17247201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 23274759 - 23274707
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| || ||||||    
T  23274759 atactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaa 23274707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 32308019 - 32307979
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactt 180  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  32308019 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtactt 32307979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 180
Target Start/End: Original strand, 49667854 - 49667894
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactt 180  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  49667854 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtactt 49667894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 14665956 - 14665917
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcact 179  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14665956 actcgcaatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcact 14665917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 14669111 - 14669072
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcact 179  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  14669111 actcgccatggcgagcagaggctctcacctcgcgagcact 14669072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 14735469 - 14735430
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcact 179  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14735469 actcgcaatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcact 14735430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 175
Target Start/End: Original strand, 17248057 - 17248092
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 175  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17248057 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 17248092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 17499819 - 17499756
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  17499819 attttgacttttgagatgatccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 17499756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 175
Target Start/End: Original strand, 20698192 - 20698243
Alignment:
Q  124 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 175  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  20698192 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 20698243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 26687252 - 26687201
Alignment:
Q  124 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 175  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  26687252 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 26687201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 30030188 - 30030153
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 175  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30030188 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 30030153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 281 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16796755 - 16796685
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttga 350  Q
    |||| ||||||| ||  |||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  16796755 taatatgtgaagttgtttaagatgtgttgtttttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 16796685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 71
Target Start/End: Original strand, 25476026 - 25476088
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagatta 71  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| || |||| || ||| |||||    
T  25476026 attttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtacctgaacatgtctaataatgatta 25476088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 7986046 - 7986001
Alignment:
Q  132 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagca 177  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  7986046 tggcttgaactcgccatggcgagtaggtactctcgcctcgcgagca 7986001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 368 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 12511177 - 12511051
Alignment:
Q  368 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttg---tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtct 464  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||  ||||||| || |||||   ||  ||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||| ||  |||    
T  12511177 aagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcattct 12511079  T
Q  465 aaaatgattaagatgttgaggatgatgt 492  Q
    ||  |||||||||||||||  |||||||    
T  12511078 aagttgattaagatgttgataatgatgt 12511051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 14666085 - 14666044
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  14666085 attttgacttttgagttgaaccttagatgtcgttgagtgcct 14666044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 14669240 - 14669199
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  14669240 attttgacttttgagttgaaccttagatgtcgttgagtgcct 14669199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 14735598 - 14735557
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  14735598 attttgacttttgagttgaaccttagatgtcgttgagtgcct 14735557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 16097813 - 16097772
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtg 47  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  16097813 gtaattttgacttttgagttgatccttaaatgtttttgagtg 16097772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 16333532 - 16333460
Alignment:
Q  112 aacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 185  Q
    |||||||||||||  | ||||| || ||||||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||    
T  16333532 aacaactttagttttg-ttctgtctggtactcgccatggcgagtaggaaccctcgcctcgcgagcacttccaga 16333460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 16809765 - 16809724
Alignment:
Q  124 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctc 165  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  16809765 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagatgctctc 16809724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 17488335 - 17488274
Alignment:
Q  11 tttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  17488335 tttgacttttgagatgatccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 17488274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 138 - 194
Target Start/End: Original strand, 11165301 - 11165357
Alignment:
Q  138 gtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
    ||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  11165301 gtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccagaattgagtgc 11165357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 180
Target Start/End: Original strand, 12934081 - 12934121
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactt 180  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  12934081 actcgccatggcgagcagagactctcgcctcgcgagtactt 12934121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 138 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 30066283 - 30066227
Alignment:
Q  138 gtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
    ||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  30066283 gtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccagaattgagtgc 30066227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 4)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 5 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 13239 - 12857
Alignment:
Q  5 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggttt 104  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  13239 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattaaatgataacatagaatgagattgaacctggttt 13140  T
Q  105 agcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaa 204  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |     
T  13139 agcttagaataactttagttgggattatggctcgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaaatgagaat 13040  T
Q  205 aatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagata 304  Q
      || ||| || || || ||| || ||||  ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||| |||| || |    
T  13039 gttgtgatatgagttgcttgaattgattatggatggacccttaggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatttgtgaagct-aatatgaga 12941  T
Q  305 tgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatt 388  Q
    |||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12940 tgttggagttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaatt 12857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 132 - 193
Target Start/End: Original strand, 61378 - 61439
Alignment:
Q  132 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  61378 tggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 61439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 109 - 186
Target Start/End: Original strand, 65271 - 65348
Alignment:
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaa 186  Q
    ||||||||| |||||||| |   ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65271 tagaacaaccttagttggaaagttggcttgtattcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaa 65348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 373 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 11399 - 11279
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||  |    
T  11399 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaattt 11302  T
Q  470 gattaagatgttgaggatgatgt 492  Q
    |||||||||||||| ||| ||||    
T  11301 gattaagatgttgatgataatgt 11279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 6 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 36938 - 36592
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggttta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36938 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcttattaaagattatatgataacttagaatgagattgaacctggttta 36839  T
Q  106 gcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaa 205  Q
     ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36838 acttagaacaacctttgttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttctagaactgagtgcaagtgaggaaa 36739  T
Q  206 atgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatat 305  Q
    || ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||  || || ||    
T  36738 atacgatctgtgtcgcatgatttgtttagagaaggacccttgggtagtaatgagacctatttaagaagttaactgcaatctgtgaagctg-ttatgagat 36640  T
Q  306 gttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaa 351  Q
    |||  |||||| ||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  36639 gttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaa 36592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 4)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 7775 - 7298
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  7775 attctgtatttttgacctttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattaaatgataacttagactgagattgaacctg 7676  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7675 gtttagcttggaacaattttagttgggattctggcttggactcgccgtggcgagcaaatgctctcgcctcgcgagcacttccaaaactgagtgcaagtga 7576  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataa 300  Q
    | |    | ||| ||| | || ||| || ||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||| ||| |||     
T  7575 gaatgtagtgatttgtattgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctatgaaactg-atat 7477  T
Q  301 gatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattat 400  Q
    || |||||   ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7476 gagatgtttgcgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaatttg-tataattat 7378  T
Q  401 -gtca-tgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
      | | || |||||||  ||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||| ||| | ||| ||||||||||||    
T  7377 catgattgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgatttaagatgattaagatg 7298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 281 - 466
Target Start/End: Original strand, 15378 - 15564
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 380  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  15378 taatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatatttatgcattacttgaagaatatttttatacataagatgttgatga 15477  T
Q  381 attgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15478 attgaaattgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgct-cttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaa 15564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 72
Target Start/End: Original strand, 15118 - 15180
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||    
T  15118 ttttgacttttaagttgaaccgtagatgcttttgagtgccttaatatgtctaataatgattag 15180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 50
Target Start/End: Original strand, 32918 - 32958
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32918 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgaatgcct 32958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 70272 - 69930
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |    
T  70272 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtatattaaagattaaatgataacttagaacgagattgaacctggtttaacct 70173  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgc 209  Q
    |||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  70172 agaacagcctttgttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatattgc 70073  T
Q  210 gatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttg 309  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||  || || |||||     
T  70072 gatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg-ttatgagatgtta 69974  T
Q  310 ttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaa 351  Q
     |||||| ||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||    
T  69973 gtgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaa 69930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 195
Target Start/End: Original strand, 10238 - 10413
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| || ||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||            
T  10238 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctgg-------- 10329  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
      |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  10330 --aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttcaagaaatgagtgca 10413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 185
Target Start/End: Original strand, 58161 - 58237
Alignment:
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 185  Q
    ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  58161 tagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 58237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 6)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Original strand, 34544 - 34838
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34544 attctgtatttttgacttgtgagttgaaccttagatgtttttgagtgccttaagattttttttaaagattagatgatgacttagagtgagattgaacctg 34643  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34644 gtttagcttagaacaactttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 34743  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    | | | ||||| || |||| ||| | ||  ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||    
T  34744 gaacattgcgacctttgtcacataacttgtttagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctg 34838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 41187 - 41409
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  41187 attctgtatttttgacttgtgagttgaaccttagatgattttgagtgcctaaagatatttattaaagattagatgatgacttagagtgagattgaaccta 41286  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  41287 gtttagcttagaacaactttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctttcacctcgtgagcacttttagaactgagtgcaagtga 41386  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcat 223  Q
    | |   |||||||||||||||||    
T  41387 gaactttgcgatctgtgtcgcat 41409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 281 - 466
Target Start/End: Original strand, 24214 - 24404
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttga-ttatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgat 378  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||   ||||||||||||    
T  24214 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat 24313  T
Q  379 gaattgaatttgatataattatgtcatgctg----ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||| | |||||||  |||||||||||||    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24314 gaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 24404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 64305 - 64131
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  ||||||   | || |||||| ||||||||| ||||            
T  64305 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcgtactattgattagggaaggatttagaacgagattgaaactgg-------- 64214  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  64213 --aacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 64131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 76189 - 76015
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| || ||  || ||  ||||||   | || |||||| ||||||||||||||            
T  76189 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtaactttaggtgcctactattgattagggaaggatttagaacgagattgaacctgg-------- 76098  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
      |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  76097 --aacaaccttagttaggattttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 76015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #6
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Original strand, 23943 - 24006
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  23943 attttgacttttgagttgatccttagattcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 24006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 198; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 18716 - 18431
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18716 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggtttagctt 18617  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgc 209  Q
    |||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  18616 agaacatcattagtttggaatctggcttgtactcgccatggcgagcaaatgctctcgcctcacgagcgcttccagaactgagtgcaagtgaggatattgc 18517  T
Q  210 gatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  18516 gatatgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg 18431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 193
Target Start/End: Original strand, 76830 - 76998
Alignment:
Q  15 acttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaac 114  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  |||||||  ||||  | ||||||||||||||||||          |||    
T  76830 acttctgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatctggaatgagattgaacctgg----------aac 76919  T
Q  115 aactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
    ||| || |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  76920 aaccttcgttgggaagctggcttgtactcgccatggcaagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 76998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 162)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 19863456 - 19863171
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |    
T  19863456 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagattaaatgataacttagaatgagattgaaccttgtttaacct 19863357  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgc 209  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  19863356 agaacaacctttgttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtaaggatattgc 19863257  T
Q  210 gatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  19863256 gatctgtgtcacatcatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg 19863171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 5 - 351
Target Start/End: Original strand, 25641821 - 25642168
Alignment:
Q  5 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggttt 104  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  25641821 tgtagtttggacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtatattaaagattaaatgataacttagaacgagattgaacctagttt 25641920  T
Q  105 agcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaa 204  Q
    | | ||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25641921 aacatagaacaacctttgttgggaatctggcttgaactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggat 25642020  T
Q  205 aatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagata 304  Q
    | ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||| ||  || || |    
T  25642021 attgcgaactgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctttgaagttg-ttatgaga 25642119  T
Q  305 tgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaa 351  Q
    ||||  |||||| ||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||    
T  25642120 tgttaatgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaa 25642168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Original strand, 21739656 - 21739950
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21739656 attctgtttttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttactaaagattagatgatgacttagagtgagattgaacctg 21739755  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  21739756 gtttagcttagaacaacattagttgggaatctggcttgtactcgccatggtgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtacaattga 21739855  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    | |   ||||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||| ||| || | ||||| |||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  21739856 gaatgttgcgatctgtgtcacatgagttgtttagggatggactcttaggtagtaatgtgacctatataggatgttaattgcaatctgtgaagctg 21739950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 22432733 - 22432443
Alignment:
Q  5 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggttt 104  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  22432733 tgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcatgaagatgtatattaaagattaaatgataacttagaacgagattgaacctagttt 22432634  T
Q  105 agcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaa 204  Q
    | | | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  22432633 aaccttgaacaacttttgttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagttagtat 22432534  T
Q  205 aatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    | ||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||    
T  22432533 attgcgatctgtgtctcattatttgatttgagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactacaatctgtgaagctg 22432443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 22439283 - 22438951
Alignment:
Q  5 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggttt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||| ||||    
T  22439283 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtatattaaagcttaaatgataacttataacgagattgaacctagttt 22439184  T
Q  105 agcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaa 204  Q
    | | |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |     
T  22439183 aacctagaacaacttttgtagggaatctggcttgtactcgccatagcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccacaactgagtgcaagtgagaat 22439084  T
Q  205 aatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagata 304  Q
    | ||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||  || || |    
T  22439083 attgcgatctgtgtcgcataattcgatttgagatggacccttgggtagtaatgagatctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg-ttatgaga 22438985  T
Q  305 tgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta 338  Q
    ||||  |||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  22438984 tgttagtgttgattatgatgtgatataaagttta 22438951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 296
Target Start/End: Original strand, 16523037 - 16523332
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||    
T  16523037 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagcgccttaagatgtttattaaagattagataatgatttagaacgagattgaatctg 16523136  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  16523137 gtttagcttagaacaacttaagttggaattctagcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagtta 16523236  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctga 296  Q
    | |   |||||||||| |||||| | || ||||| | |||| |||| || | ||||| ||||||| ||||| ||||  ||  ||||||||||||||    
T  16523237 gtatgttgcgatctgtttcgcataaattgattagggttggatccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctga 16523332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Original strand, 21834524 - 21834818
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  21834524 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaaaatgtttattaaagattagatgatgatttagaacgagattgaacctg 21834623  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  21834624 atttagcttagaacaactttagttggaattctggcttgtaatcaccatggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagtta 21834723  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    |||   |||||||||| |||||| | || ||||| |||||||||||  | | ||||  ||||||| ||||| ||||  || ||||||||||||||    
T  21834724 ggatgttgcgatctgtttcgcataaattgattagggatggacccttcagtagtaatctgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctg 21834818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 413
Target Start/End: Original strand, 15041188 - 15041596
Alignment:
Q  5 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggttt 104  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  15041188 tgtaattttgacttttgagttataccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtttaataaaggttagatgataacttagaatgagattgaacctggatt 15041287  T
Q  105 agcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaa 204  Q
    | | |||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||       
T  15041288 aacctagaacaactattgttgggaatctgacttgtactcgccatgacgagcagatgctctcgcctcgcaaccacttccagaattgagtgcaagtgagttt 15041387  T
Q  205 aatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagata 304  Q
    || ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||   | || ||||  |  ||||||| ||||||  ||||||     
T  15041388 aacgcgatctgtatcgcatgttttgattagagatggacccctgggtagtaatgagacctaatgatgatgttagatacaatctgtaaagctgtttaagatg 15041487  T
Q  305 tgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgt-ttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtc 403  Q
    ||||| || | |||| ||  || | |||||| | ||||||||||| ||| | | ||| || | |||||||||  ||||||| ||||||||| || |||||    
T  15041488 tgttgatgataattaagatttggtttaatgtatgtgcattacttg-agattttattgaatacttaagatgttattgaattgcatttgatattataatgtc 15041586  T
Q  404 atgctgttgt 413  Q
    ||||||||||    
T  15041587 atgctgttgt 15041596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 18180966 - 18180780
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagct 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||     
T  18180966 attttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagaggatgatttagaatgagagtgaacctggtttagca 18180867  T
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18180866 tagaacaacttgagttggaaatctggcttgtactcgccatggagagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgaatgca 18180780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 18907594 - 18907299
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgact-tagaatgagattgaacct 99  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||    
T  18907594 attctgtattttttacctttgagttgaaccttagatgtttttgagtaccttcagatgtgtattaaagattaactgataaccctagaatgagattgaacct 18907495  T
Q  100 ggtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtg 199  Q
    || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  18907494 ggcttagcttagaacaactttagttggaaatctggcttgatttcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaacagagtgcaaatg 18907395  T
Q  200 aggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    || |   ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || | ||||| ||||||| ||||| ||||  || ||| ||||||||||    
T  18907394 agaatgttgcgatctgtgtcgcatgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgcaatatgtgaagctg 18907299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 281 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 22831710 - 22831524
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgca--taagatgttgat 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  22831710 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgat 22831611  T
Q  379 gaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 465  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22831610 gaattgaatttgatatgattatgtcatgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 22831524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 280 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 11185711 - 11185525
Alignment:
Q  280 gtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  11185711 gtaatctgtgaagatgaataagatatgttgttgctgattatgaagtgttataaagtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacaaaagatgctgatg 11185612  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11185611 aattgaatttgatataattatgtcatgttgttgtacactgcacatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 11185525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 281 - 463
Target Start/End: Original strand, 16920546 - 16920728
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 380  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  16920546 taatctatgaagctgaataagataagttgttgttgattatgatgtggtataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatga 16920645  T
Q  381 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtc 463  Q
    || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16920646 atggaatttgatatacttatgtcatgatgttgtatactgcctatgctgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16920728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 125 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 19873483 - 19873313
Alignment:
Q  125 gggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcgcatg 224  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||     
T  19873483 gggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtaaggatattgcgatctgtgtcgcatc 19873384  T
Q  225 atttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  19873383 attttattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg 19873313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 201
Target Start/End: Original strand, 22059396 - 22059577
Alignment:
Q  20 tgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaacaactt 119  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22059396 tgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcatattaaagattagataatgatttagaacaagattgaacctggtttagcttagaacaacat 22059495  T
Q  120 tagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgag 201  Q
    ||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  22059496 taggttgaattctggcttgtacttgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcaagcacttctagaactgagtgcaattgag 22059577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 175
Target Start/End: Original strand, 22405709 - 22405873
Alignment:
Q  11 tttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  22405709 tttgacttttgagttgaaccttagatgctttagagtgccttgagatgtttaataaagattggatgatgatttagaacgagattgaaccttgtttagctta 22405808  T
Q  111 gaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 175  Q
    ||||||||| || ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22405809 gaacaacttgagatggaaatctgggttgtactcgccatggcgagcagatgctttcgcctcgcgag 22405873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 314 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 35245758 - 35245593
Alignment:
Q  314 tgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt 413  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  35245758 tgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt 35245659  T
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  35245658 atactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 35245593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 264
Target Start/End: Original strand, 16924526 - 16924776
Alignment:
Q  14 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaa 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||| |||||| | |||||| |||||| |  |||||| |||||| ||| | |||||    
T  16924526 gactttttagttgaaccttagatgcctttgagttcctgaagatgcttaataaagaattgatgataacttaggacaagattggacctggattaacctagaa 16924625  T
Q  114 caactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatc 213  Q
     ||     ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  16924626 taatcaatgttggaagtctggcctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagtttaatgcgatc 16924725  T
Q  214 tgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagaccta 264  Q
    ||||||||||| ||| |||||   ||||||| |||| | ||||||||||||    
T  16924726 tgtgtcgcatgctttgattaggagtggacccctgggtagtaatgagaccta 16924776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 17804649 - 17804474
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| || ||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||            
T  17804649 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctgg-------- 17804558  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
      |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17804557 --aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 17804474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 195
Target Start/End: Original strand, 22429684 - 22429859
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| || ||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||            
T  22429684 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttctgagtgcctttaggtgtctactaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctgg-------- 22429775  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
      |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22429776 --aacaaccttagctgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 22429859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 234
Target Start/End: Original strand, 16964957 - 16965177
Alignment:
Q  14 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||| |||||| | || ||| |||||| | ||||||| |||||| ||| | |||||    
T  16964957 gacttttgagttgaaccttagatggctttgagtgcctgaagatgcttaataaagaattgaagataacttaggacgagattggacctggattaacctagaa 16965056  T
Q  114 caactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatc 213  Q
    |||     ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||   |||| ||||    
T  16965057 caatcaatgttggaagtctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcacgagcacttccagaacttagtgcaagtgagtttaatgtgatc 16965156  T
Q  214 tgtgtcgcatgatttaattag 234  Q
    ||||||||||| ||| |||||    
T  16965157 tgtgtcgcatgctttgattag 16965177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 123 - 295
Target Start/End: Original strand, 22334647 - 22334819
Alignment:
Q  123 ttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcgca 222  Q
    ||||||||||| | |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22334647 ttgggattctgacctaaactcgccatggtgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagtgaggatattgcgatctgtgtcgca 22334746  T
Q  223 tgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    | |||| ||||||| ||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||    
T  22334747 taatttgattagagttggacccctgggtagcaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtaaagctg 22334819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 281 - 466
Target Start/End: Original strand, 20360873 - 20361061
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||    
T  20360873 taatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 20360972  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  20360973 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgctgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaa 20361061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 12496760 - 12496586
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  |||||  ||||||   |||| |||||| ||||||||||||||            
T  12496760 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcatttgagtacctttaggtgcctattattgattagggaatgaattagaacgagattgaacctgg-------- 12496669  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12496668 --aacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtgc 12496586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 193
Target Start/End: Original strand, 27567258 - 27567436
Alignment:
Q  5 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggttt 104  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||       
T  27567258 tgtattttggacgtttgagttgaaccttatatgcttttgagtacctttagatgtttactaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctgg--- 27567354  T
Q  105 agcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
           |||||| |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27567355 -------aacaaccttagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 27567436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Original strand, 19790437 - 19790603
Alignment:
Q  14 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaa 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||          |||    
T  19790437 gactttttagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtgtattaaagattagaggatgacttagaacaagattgaacctg----------gaa 19790526  T
Q  114 caactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 190  Q
    ||||  ||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19790527 caaccatagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctcttgcctcgcgagcacttccagaactga 19790603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 194
Target Start/End: Original strand, 20907639 - 20907809
Alignment:
Q  14 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||          ||||    
T  20907639 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgaatacctttagatgtgtattatagattagaggatgacttagaacaagattgaacct----------agaa 20907728  T
Q  114 caactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
    ||||  ||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20907729 caaccatagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcacgagcacttccagaactgagtgc 20907809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 194
Target Start/End: Original strand, 23657078 - 23657248
Alignment:
Q  14 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaa 113  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| || | ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||          ||    
T  23657078 gacttttgagttgaactttagatgcttttgagtacctttagatgtctacttaagattagatgatgatttagaacaagattgaacctgg----------aa 23657167  T
Q  114 caactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
    ||||  ||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23657168 caaccgtagttggaaacctggcctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 23657248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 5616468 - 5616642
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  ||||| |  |||| |||||| ||||||||||||||            
T  5616468 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattatagaatgatttagaacgagattgaacctgg-------- 5616559  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
      |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5616560 --aacaaccttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 5616642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 12707140 - 12706966
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| || ||  |||||||  |||  |||||| || |||||||||||            
T  12707140 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagagaatgttttagaacgaaattgaacctgg-------- 12707049  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
      |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12707048 --aacaaccttagttgggaatctggcttgtacttgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 12706966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 194
Target Start/End: Original strand, 27553265 - 27553435
Alignment:
Q  14 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaa 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||          ||    
T  27553265 gacttttgagttgaaccttggatgtttttgagtacctttagatgtttactaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctgg----------aa 27553354  T
Q  114 caactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
    |||| |||||||| | ||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27553355 caaccttagttggaaatctggcaagtacacaccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 27553435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Original strand, 20638196 - 20638397
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||     
T  20638196 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaagaatgtttgaatattaaagatgttgata 20638295  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaag 476  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||| |||    
T  20638296 aattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgaag 20638394  T
Q  477 atg 479  Q
    |||    
T  20638395 atg 20638397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 234
Target Start/End: Original strand, 16929242 - 16929457
Alignment:
Q  14 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaa 113  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||| ||| |||||| | |||||| |||| | ||||||||| |||||| ||| | |||||    
T  16929242 gacttttgagttaaaccttagatgcctt-gagtgcctgaagatgcttaataaagaattgatgataacttgggatgagattggacctggattaacctagaa 16929340  T
Q  114 caactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatc 213  Q
    ||| |   ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    |||   |||||||||    
T  16929341 caattaatgttggaagtctggcctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactttgaaaactgagtgc----gagtttaatgcgatc 16929436  T
Q  214 tgtgtcgcatgatttaattag 234  Q
    ||||||||||| ||| |||||    
T  16929437 tgtgtcgcatgctttgattag 16929457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 195
Target Start/End: Original strand, 27415595 - 27415771
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| || ||| || || | |||||| ||| | ||||||  |||||||||||||           
T  27415595 attttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtacctttaggtgtctactagatattagaggattaattagaacaagattgaacctgg------- 27415687  T
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
       |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27415688 ---aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcggatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtgca 27415771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 16741659 - 16741484
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || | | || ||  |||||||  |||| |||||| ||||||||||||||            
T  16741659 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtatctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacctgg-------- 16741568  T
Q  110 agaacaactttag-ttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
      |||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16741567 --aacaaccttaggttggaaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 16741484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 195
Target Start/End: Original strand, 25766822 - 25766997
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | || ||| || ||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||            
T  25766822 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtaccattaggtgtctactaaagattagaggatgttttagaataagattgaacctgg-------- 25766913  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
      |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||| ||||    
T  25766914 --aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcacgagccattctagaactgattgca 25766997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 1645157 - 1644983
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||  || ||  |||||||  |||| |||||||||||||||||||||            
T  1645157 ttttgacttttgagttgaaccttatatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaatgagattgaacctgg-------- 1645066  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
      |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  1645065 --aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcaaatgctctcgcctcgcgagcacatccagaattgagtgc 1644983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 19663220 - 19663046
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  ||||||   |||| |||||| ||||||||||||||            
T  19663220 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctgg-------- 19663129  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
      |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19663128 --aacaacctttgttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctatcgcctcgcgagcacttccaaaactgagtgc 19663046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Original strand, 22592458 - 22592628
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||| ||||||  ||||| |||||| ||||||| ||||||            
T  22592458 ttttgacatttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactaatgattaggggatgatttagaacgagattgtacctgg-------- 22592549  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 190  Q
      |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22592550 --aacaaccttagttgaaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 22592628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Original strand, 1587385 - 1587558
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  | |||||   ||| ||||| |||||||||||||||            
T  1587385 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgtttagagattgatttagattgagattgaacctgg-------- 1587476  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
      |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1587477 --aacaaccttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 1587558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 29060748 - 29060547
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| | | ||||||||| | |||||||||||||  |||  ||||| | | |||||||| ||    
T  29060748 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgagatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttg 29060649  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaag 476  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||    
T  29060648 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagctgatgaag 29060550  T
Q  477 atg 479  Q
    |||    
T  29060549 atg 29060547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 295
Target Start/End: Original strand, 15894185 - 15894357
Alignment:
Q  123 ttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcgca 222  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||  ||||||||||    
T  15894185 ttgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagagtctctcacctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaactttgcgtcctgtgtcgca 15894284  T
Q  223 tgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    | | ||  ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| || ||||  |  ||||||||||||||    
T  15894285 taacttgtttagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatataggatgttaactacaatctgtgaagctg 15894357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 109 - 264
Target Start/End: Original strand, 31164589 - 31164744
Alignment:
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatg 208  Q
    ||||||||| ||  ||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||   ||||    
T  31164589 tagaacaacctttattgggaacctggcttgtactcgccatggtgagcatatgcccttgcctcgcgagtacttccagaattgagtgcaagtgagtttaatg 31164688  T
Q  209 cgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagaccta 264  Q
    ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| | || |||||||||    
T  31164689 cgacctgtgtcgcatgttttgattagagatggacccctgggtagtagtgagaccta 31164744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Original strand, 9481947 - 9482120
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  |||||||  |||| |||||||||||||||||||||            
T  9481947 ttttgagttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaatgagattgaacctgg-------- 9482038  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
      |||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9482039 --aacaaccttagttgggaacctggcttgtacttgccatgacgagcatatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 9482120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 20593981 - 20593780
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| |||| |||| || |||||||||||   ||| ||||||   | |||||||| ||    
T  20593981 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatattgttatacgcattacttgatttatgattgtataattgagatgttgttg 20593882  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaag 476  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||    
T  20593881 acttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgttt-ttatttaactgagctgcatgattcggtctaagttgatgaag 20593783  T
Q  477 atg 479  Q
    |||    
T  20593782 atg 20593780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 18955417 - 18955591
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  |||||||  |||| | |||||||||||||||||||            
T  18955417 ttttgatttttgaattgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgattgagaatgagattgaacctgg-------- 18955508  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
      |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  18955509 --aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatgacgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttctcgaattgagtgc 18955591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 22863392 - 22863123
Alignment:
Q  16 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  |||||||  |||| |||||| ||||||||||||          ||||||    
T  22863392 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacct----------agaaca 22863303  T
Q  116 actttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctg 215  Q
    || |||||||| |   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||  || || |||    
T  22863302 accttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtgcttttgaggaatttgagacctg 22863203  T
Q  216 tgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
     ||||  |||||  |||||  ||||| | || || | ||||||||||||| ||||| ||||  ||| || ||||||||||    
T  22863202 agtcgtttgattggattaggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctg 22863123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 8244307 - 8244140
Alignment:
Q  16 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  |||||||  |||| |||||| ||||||||||||          ||||||    
T  8244307 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacct----------agaaca 8244218  T
Q  116 actttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
    || |||||||| |   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8244217 accttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 8244140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 11567309 - 11567142
Alignment:
Q  16 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  |||||||  |||| |||||| ||||||||||||          ||||||    
T  11567309 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacct----------agaaca 11567220  T
Q  116 actttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
    || |||||||| |   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11567219 accttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 11567142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Original strand, 19303454 - 19303654
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||||||||||||   ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | | |||||||||||  |||  |||||   | |||||||| ||    
T  19303454 taatctgtgaagctgttgaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtacattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttg 19303553  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaaga 477  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  19303554 acttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatacttcctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaaga 19303652  T
Q  478 tg 479  Q
    ||    
T  19303653 tg 19303654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 23395515 - 23395348
Alignment:
Q  16 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  |||||||  |||| |||||| ||||||||||||          ||||||    
T  23395515 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacct----------agaaca 23395426  T
Q  116 actttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
    || |||||||| |   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23395425 accttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 23395348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 281 - 488
Target Start/End: Original strand, 18409740 - 18409950
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||| |||||  |||  || |||  | |||||||| ||    
T  18409740 taatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgtattatttgaattatgaatggatgattgagatgttgttg 18409839  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaag 476  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||| |||    
T  18409840 acttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctg-ttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 18409938  T
Q  477 atgttgaggatg 488  Q
    ||| ||| ||||    
T  18409939 atgatgatgatg 18409950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 110 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 14472632 - 14472548
Alignment:
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  14472632 agaacaaccttagttgggaatttggcttgtactcgccatggcgagcatatgctctcgcctcgcgagcacatccagaattgagtgc 14472548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 367 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 16496365 - 16496264
Alignment:
Q  367 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtc 463  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16496365 taagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16496267  T
Q  464 taa 466  Q
    |||    
T  16496266 taa 16496264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 111 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 21702648 - 21702568
Alignment:
Q  111 gaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgag 191  Q
    ||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21702648 gaacaaccttagttggaaatttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgag 21702568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Original strand, 25629268 - 25629469
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  |||||   | |||||||| ||    
T  25629268 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttg 25629367  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaag 476  Q
    | ||| |||||||||  |||||||||||||||   ||||||||| | |||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||    
T  25629368 acttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttcctg-ttgtaatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 25629466  T
Q  477 atg 479  Q
    |||    
T  25629467 atg 25629469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 119 - 190
Target Start/End: Original strand, 20803306 - 20803377
Alignment:
Q  119 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 190  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20803306 ttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccataactga 20803377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Original strand, 12618504 - 12618671
Alignment:
Q  16 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  |||||||  |||| |||||| ||||||||||||          ||||||    
T  12618504 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacct----------agaaca 12618593  T
Q  116 actttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
    || |||||||| |   |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12618594 accttagttggaaagttggcttgtactcgccacggtgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 12618671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 23990367 - 23990200
Alignment:
Q  16 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  |||||||  |||| |||||| ||||||||||||          ||||||    
T  23990367 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacct----------agaaca 23990278  T
Q  116 actttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
    || |||||||| |   |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23990277 accttagttggaaagttggcttgtactcgccacgacgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 23990200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 285 - 479
Target Start/End: Original strand, 17287713 - 17287910
Alignment:
Q  285 ctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaatt 383  Q
    |||||||||||  |||||| |||||  ||||||||||   ||  |||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   ||||||| || ||| ||    
T  17287713 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgaggttgattatgttatgacataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgactt 17287812  T
Q  384 gaatttgatataattatgtcatgctgt---tgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    | | ||||||| |||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  17287813 gcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17287910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 111 - 186
Target Start/End: Original strand, 25135417 - 25135492
Alignment:
Q  111 gaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaa 186  Q
    ||||||| |||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25135417 gaacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaa 25135492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 132 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 19870931 - 19870870
Alignment:
Q  132 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19870931 tggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 19870870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 367 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 20076817 - 20076707
Alignment:
Q  367 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtct 464  Q
    ||||||||||||   ||| ||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20076817 taagatgttgat---ttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtct 20076722  T
Q  465 aaaatgattaagatg 479  Q
    ||  |||| ||||||    
T  20076721 aagttgatgaagatg 20076707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 414 - 479
Target Start/End: Original strand, 27333267 - 27333332
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  27333267 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 27333332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 414 - 479
Target Start/End: Original strand, 27394007 - 27394072
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  27394007 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 27394072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 193
Target Start/End: Original strand, 18917009 - 18917093
Alignment:
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
    ||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  18917009 tagaacaaccttagttggaaatttggcttgtactcgccacggcgagcagatgttctcgcctcgcgagcacttctagaattgagtg 18917093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 386 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 25656727 - 25656627
Alignment:
Q  386 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatgttg 482  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||    
T  25656727 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 25656630  T
Q  483 agg 485  Q
    |||    
T  25656629 agg 25656627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 373 - 492
Target Start/End: Original strand, 30676761 - 30676881
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  30676761 gttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 30676858  T
Q  470 gattaagatgttgaggatgatgt 492  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  30676859 gattaagatgttgatgatgatgt 30676881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 101
Target Start/End: Original strand, 18821471 - 18821563
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||  ||  |  ||| ||||||||||||||||    
T  18821471 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggagagaatgtaggatgagattgaacctgg 18821563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Original strand, 22780140 - 22780341
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| |||||||||   |||||||||||||| ||  ||| ||   ||||||| || ||    
T  22780140 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttgcgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttg 22780239  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaag 476  Q
    | ||| | ||||||| ||||||||| ||||   ||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||| |||    
T  22780240 acttgcaattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtttttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaag 22780338  T
Q  477 atg 479  Q
    |||    
T  22780339 atg 22780341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 373 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 34963484 - 34963364
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||  |    
T  34963484 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 34963387  T
Q  470 gattaagatgttgaggatgatgt 492  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  34963386 gattaagatgttgatgatgatgt 34963364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 22782338 - 22782231
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  22782338 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 22782241  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  22782240 gattaagatg 22782231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 72
Target Start/End: Original strand, 20637932 - 20637998
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  20637932 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 20637998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 369 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 25644440 - 25644340
Alignment:
Q  369 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 465  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||  |||| ||| |||||| |   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25644440 agatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 25644341  T
Q  466 a 466  Q
    |    
T  25644340 a 25644340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Original strand, 9098563 - 9098615
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9098563 atactgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 9098615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 101
Target Start/End: Original strand, 18409468 - 18409560
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctgg 101  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||   |  |  ||||||||||||||||||||    
T  18409468 attttgacctttgagttgatccttagatgcttttgagtgccttaacatgtctattaatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgg 18409560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 369 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 20109257 - 20109158
Alignment:
Q  369 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| | ||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  20109257 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatattatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 20109158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 180
Target Start/End: Original strand, 28496114 - 28496284
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagct 108  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||||  |  |  ||||||||||||||||||||     ||    
T  28496114 attttaacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagact 28496213  T
Q  109 tagaa--caactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactt 180  Q
    |||||   |||||   ||| || |||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  28496214 tagaatgaaactt---ttgagaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtactt 28496284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 1561782 - 1561691
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctgg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||   |  |  ||||||||||||||||||||    
T  1561782 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaaagtagaatgagattgaacctgg 1561691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 1595660 - 1595553
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||  |    
T  1595660 gttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 1595563  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  1595562 gattaagatg 1595553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 12742428 - 12742321
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  12742428 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 12742331  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  12742330 gattaagatg 12742321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 73
Target Start/End: Original strand, 16920286 - 16920349
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattaga 73  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||||    
T  16920286 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaatatgtctaataatgattaga 16920349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Original strand, 18334643 - 18334750
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  18334643 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 18334740  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  18334741 gattaagatg 18334750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 19005157 - 19005050
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  19005157 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 19005060  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  19005059 gattaagatg 19005050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Original strand, 19858970 - 19859077
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  19858970 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 19859067  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  19859068 gattaagatg 19859077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 24422658 - 24422551
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  24422658 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 24422561  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  24422560 gattaagatg 24422551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 25754920 - 25754813
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  25754920 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 25754823  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  25754822 gattaagatg 25754813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 33861905 - 33861798
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  33861905 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 33861808  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  33861807 gattaagatg 33861798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 33864389 - 33864282
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  33864389 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 33864292  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  33864291 gattaagatg 33864282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 146
Target Start/End: Original strand, 2684995 - 2685121
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  ||||||   |||| |||||| |||||||||||||             
T  2684995 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctg--------- 2685085  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgcc 146  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2685086 -gaacaaccttagttgggattctggcttgtactcgcc 2685121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 18457194 - 18457102
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctgg 101  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||   |  |  ||||||||||||||||||||    
T  18457194 attttaacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgg 18457102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 19652267 - 19652215
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  19652267 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaa 19652215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Original strand, 28496520 - 28496572
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28496520 atactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 28496572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 101
Target Start/End: Original strand, 29808524 - 29808616
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctgg 101  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||||  |  |  ||||||||||||||||||||    
T  29808524 attttaacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatgagattgaacctgg 29808616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Original strand, 29808931 - 29808983
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29808931 atactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 29808983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Original strand, 2291231 - 2291338
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  2291231 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 2291328  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  2291329 gattaagatg 2291338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 8055140 - 8055033
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  8055140 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacttt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 8055043  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  8055042 gattaagatg 8055033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Original strand, 17287437 - 17287500
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  17287437 attttgacttttgagttgacccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 17287500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Original strand, 19303182 - 19303245
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  19303182 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 19303245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Original strand, 22779868 - 22779931
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  22779868 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 22779931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Original strand, 25611364 - 25611427
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  25611364 attttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 25611427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 388 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 25688598 - 25688507
Alignment:
Q  388 ttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagat 478  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||    
T  25688598 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagat 25688507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 25928635 - 25928584
Alignment:
Q  134 gcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 185  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25928635 gcttgaactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 25928584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Original strand, 26924691 - 26924798
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  26924691 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 26924788  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  26924789 gattaagatg 26924798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 386 - 479
Target Start/End: Original strand, 16448591 - 16448685
Alignment:
Q  386 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||    
T  16448591 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 16448685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 368 - 433
Target Start/End: Original strand, 27415942 - 27416008
Alignment:
Q  368 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctatgttgctgtt 433  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  27415942 aagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctgtttgtatgctgcctatgttgctgtt 27416008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 373 - 463
Target Start/End: Original strand, 4185827 - 4185919
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtc 463  Q
    |||||||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  4185827 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtc 4185919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 421 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 19668436 - 19668391
Alignment:
Q  421 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  19668436 ctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 19668391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 22831970 - 22831933
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtg 47  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22831970 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtg 22831933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 369 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 23019525 - 23019421
Alignment:
Q  369 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||  |||| ||||| |||| |  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||    
T  23019525 agatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggtctaa 23019426  T
Q  467 aatga 471  Q
     ||||    
T  23019425 gatga 23019421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 50
Target Start/End: Original strand, 15894072 - 15894112
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15894072 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcct 15894112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 176
Target Start/End: Original strand, 18821575 - 18821627
Alignment:
Q  124 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 176  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18821575 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc 18821627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 50
Target Start/End: Original strand, 22334520 - 22334564
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22334520 gtaaatttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcct 22334564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 249
Target Start/End: Original strand, 25611481 - 25611604
Alignment:
Q  126 ggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca-agtgaggaaaatgcgatctgtgtcgcatg 224  Q
    |||||||| | || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||   || ||||| |||||||  |||||| |  ||||||||||||||||||    
T  25611481 ggattctgacctgaactcgccatggagagcagaggctctcgcctcgcgagctagtctagaacagagtgcattgtgagg-acttgcgatctgtgtcgcatg 25611579  T
Q  225 atttaattagagatggacccttggg 249  Q
    | ||| |||||| || ||| |||||    
T  25611580 agttacttagagttgaacctttggg 25611604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Original strand, 1540962 - 1541069
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||  |    
T  1540962 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagtt 1541059  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  1541060 gattaagatg 1541069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 373 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 18456830 - 18456731
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  18456830 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 18456733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 373 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 18461990 - 18461891
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  18461990 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 18461893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Original strand, 20556943 - 20557050
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||  |    
T  20556943 gttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagtt 20557040  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  20557041 gattaagatg 20557050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 21939734 - 21939695
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcact 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21939734 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcact 21939695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 415 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 23076801 - 23076750
Alignment:
Q  415 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  23076801 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 23076750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 424 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714424
Alignment:
Q  424 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  25714478 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 25714424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 185
Target Start/End: Original strand, 34369717 - 34369792
Alignment:
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 185  Q
    |||||||| |||||| | | | || |||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||    
T  34369717 agaacaacattagtttgtaatttgacttgtactcgccatggcgagtatgtactctcgcctcgcgagcacttccaga 34369792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 415 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 35008219 - 35008168
Alignment:
Q  415 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  35008219 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 35008168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 19652678 - 19652612
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  19652678 gtaattttgacttttgagttgatccttaaatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 19652612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 4667846 - 4667895
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  4667846 attctgtgtttttgacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcct 4667895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 4674693 - 4674742
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  4674693 attctgtgtttttgacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcct 4674742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 51
Target Start/End: Original strand, 20803206 - 20803247
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctt 51  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  20803206 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctt 20803247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 21702739 - 21702698
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctt 51  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  21702739 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctt 21702698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 21939863 - 21939822
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21939863 attttgacttttgagttgaaccttagatgcccttgagtgcct 21939822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 29061020 - 29060979
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29061020 atttcgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 29060979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 42
Target Start/End: Original strand, 29096142 - 29096179
Alignment:
Q  5 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgctttt 42  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29096142 tgtaattttgacttctgagttgaaccttagatgctttt 29096179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 31155031 - 31155080
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  31155031 attctgtttttttgacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcct 31155080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 439 - 479
Target Start/End: Original strand, 22080799 - 22080839
Alignment:
Q  439 tttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  22080799 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatg 22080839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 22331803 - 22331727
Alignment:
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 185  Q
    ||||||||| |||||| |||   || || ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  22331803 tagaacaacgttagtttggaaattgactggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccaga 22331727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 225
Target Start/End: Original strand, 25603143 - 25603242
Alignment:
Q  126 ggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca-agtgaggaaaatgcgatctgtgtcgcatg 224  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||   || ||||| |||||||  |||||| |  ||||||||||||||||||    
T  25603143 ggattctgacttgaactcaccatggcgagcagaggctctcgcctcgtgagctagtctagaacagagtgcattgtgagg-acttgcgatctgtgtcgcatg 25603241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 25644805 - 25644761
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25644805 gtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 25644761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #137
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 47
Target Start/End: Original strand, 27332923 - 27332963
Alignment:
Q  7 taattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtg 47  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27332923 taattttgacctttaagttgaaccttagatgcttttgagtg 27332963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #138
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 47
Target Start/End: Original strand, 27393663 - 27393703
Alignment:
Q  7 taattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtg 47  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27393663 taattttgacctttaagttgaaccttagatgcttttgagtg 27393703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #139
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 180
Target Start/End: Original strand, 29808655 - 29808695
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactt 180  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  29808655 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtactt 29808695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #140
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 413 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 33443119 - 33443068
Alignment:
Q  413 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 465  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  33443119 tatactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 33443068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 424 - 479
Target Start/End: Original strand, 3852121 - 3852175
Alignment:
Q  424 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  3852121 tgttgctgtt-gttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 3852175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 4185456 - 4185503
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgc 48  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  4185456 attctgtgtttttgacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgc 4185503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #143
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 11185969 - 11185930
Alignment:
Q  11 tttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11185969 tttgatttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcct 11185930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #144
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 16372193 - 16372146
Alignment:
Q  138 gtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 185  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  16372193 gtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccaga 16372146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #145
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 424 - 471
Target Start/End: Original strand, 18821904 - 18821950
Alignment:
Q  424 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatga 471  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18821904 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatga 18821950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #146
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 433 - 492
Target Start/End: Original strand, 19848063 - 19848122
Alignment:
Q  433 ttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatgttgaggatgatgt 492  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || ||||||  |||||||||||||||  |||||||    
T  19848063 ttgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgataatgatgt 19848122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #147
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 175
Target Start/End: Original strand, 20360716 - 20360767
Alignment:
Q  124 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 175  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  20360716 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagctgaggctctcgcctcgcgag 20360767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #148
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 176
Target Start/End: Original strand, 31155166 - 31155205
Alignment:
Q  137 tgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 176  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31155166 tgtactctccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc 31155205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 72
Target Start/End: Original strand, 20360613 - 20360675
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  20360613 ttttgacttttcagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 20360675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #150
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 175
Target Start/End: Original strand, 25629123 - 25629161
Alignment:
Q  137 tgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 175  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25629123 tgtactcgccgtggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 25629161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 138 - 184
Target Start/End: Original strand, 34298395 - 34298441
Alignment:
Q  138 gtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccag 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  34298395 gtactcgccatggcgagtagataatctcgcctcgcaagcacttccag 34298441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 4186482 - 4186390
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtc 463  Q
    |||||||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||||||  |||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  4186482 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgtctatgttgctgcctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtc 4186390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #153
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 4189444 - 4189395
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    |||||||  |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  4189444 attctgtgttttttacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcct 4189395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #154
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 20594253 - 20594212
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  20594253 atttttacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcct 20594212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 51
Target Start/End: Original strand, 25135326 - 25135367
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctt 51  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  25135326 ttttgacttttgagttgaaccttagaagcctttgagtacctt 25135367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 1561375 - 1561323
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  1561375 atactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaa 1561323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 176
Target Start/End: Original strand, 4185594 - 4185630
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 176  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  4185594 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 4185630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 176
Target Start/End: Original strand, 4667984 - 4668020
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 176  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  4667984 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 4668020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 109 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 19808890 - 19808814
Alignment:
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 185  Q
    ||||||||| || ||| ||| | || || ||||||||||||||||| ||   |||||||||| ||||||||||||||    
T  19808890 tagaacaacattggtttggaatttgactggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcacgagcacttccaga 19808814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #160
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 176
Target Start/End: Original strand, 22080508 - 22080544
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 176  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  22080508 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 22080544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 22 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 23019874 - 23019846
Alignment:
Q  22 agttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23019874 agttgaaccttagatgcttttgagtgcct 23019846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 6 - 50
Target Start/End: Original strand, 25956259 - 25956303
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  25956259 gtaattttgacttttaagttgaatcttagatatttttgagtgcct 25956303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15886 - 15642
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15886 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaaggtggttattaaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctg 15787  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15786 gtttagcttagaacaacattagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 15687  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggaccct 245  Q
    ||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  15686 ggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggaccct 15642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Original strand, 6712 - 7006
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6712 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagataataaataaagattagatgatgacttagagtgagattgaacctg 6811  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6812 gtttagcttagaacaactttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaattga 6911  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    | |   ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || | ||||| ||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||    
T  6912 gaatgttgcgatctgtgtcgcatgagttgattagggatgggcccttaggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctg 7006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 5 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 20464 - 20117
Alignment:
Q  5 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggttt 104  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20464 tgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctggagatgcctattaaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttt 20365  T
Q  105 agcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaa 204  Q
    | | ||||||||| || ||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20364 aacctagaacaacctttgttgggaatctgagttgtactcgtcatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggat 20265  T
Q  205 aatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagata 304  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||  || || |    
T  20264 aatgtaatctgtgtcgcatgatttgattagggatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaacctgtgaagctg-ttatgaga 20166  T
Q  305 tgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaa 351  Q
    ||||  |||||| ||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  20165 tgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaa 20117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 413 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 38389 - 38339
Alignment:
Q  413 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtc 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  38389 tatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 6584 - 6294
Alignment:
Q  5 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggttt 104  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6584 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagttcctaaatttgtttattaaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttt 6485  T
Q  105 agcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  6484 agcttagaacaactttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctctcctcgcgagcacttccagaactgtgtgcaagtgaggat 6385  T
Q  205 aatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
      ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||| | ||| || ||||||| |||||||||  || ||||||||||||||    
T  6384 gttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggatccctgggtagtaaagaaacctatacaagaagttaactgcaatctgtgaagctg 6294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 1975 - 1681
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  1975 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatttagaacgagattgaacctg 1876  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  1875 gtttagcttagaacaacttaagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagtta 1776  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    | |   |||||||||| | |||| | || ||||| | ||||||||| || | ||||| ||||||| ||||| ||||  ||  |||||||||||||    
T  1775 gtatgttgcgatctgttttgcataaattgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctg 1681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 4)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 6 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 1820 - 1550
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggttta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||||| |    
T  1820 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtttattaaagattaaaggataacttagaaagacattgaacctggttaa 1721  T
Q  106 gcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaa 205  Q
     | ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1720 acctagaacaacctttgttgggagtctggcttgtactcgtcatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggata 1621  T
Q  206 atgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagtta 276  Q
     ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  1620 ttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtattgagacctatataagaagtta 1550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 410 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 15737 - 15668
Alignment:
Q  410 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||    
T  15737 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatg 15668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 16142 - 16075
Alignment:
Q  5 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  16142 tgtaattttgactttagagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaatatgtctaataatgattag 16075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 16009 - 15973
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 176  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16009 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc 15973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Original strand, 8591 - 8885
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||  |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||     
T  8591 attcggtatttttgacctttgagttgaaccttagatgtttttgagtccctgaagatgcctattaaagattaaatgataacttagaacgagattgaaccta 8690  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    ||||| | ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8691 gtttaacctagaacaacatttgttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 8790  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    ||| | ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8791 ggatattgcgacctgtgtcgcataattcgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgtaatctgtgaagctg 8885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 433 - 479
Target Start/End: Original strand, 1393 - 1439
Alignment:
Q  433 ttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  1393 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 1439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 4)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Original strand, 18290 - 18584
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18290 attctgcattttttacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctaaagatgtttattaaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctg 18389  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18390 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 18489  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    | |    | | ||||||| || | | || ||| | ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  18490 gaatgtcgtgttctgtgttgcttcaattgatttgggatggacccttaggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg 18584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 40391 - 40328
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  40391 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttattaatgattag 40328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 40120 - 39920
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    ||||||||||||||   || ||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  |   ||   |||||||||  ||    
T  40120 taatctgtgaagctctttatgatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcaaatatttaagatgttattg 40021  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaaga 477  Q
    |  || ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| | |||||||  |||| ||||    
T  40020 acatgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagttggtctaagttgatgaaga 39922  T
Q  478 tg 479  Q
    ||    
T  39921 tg 39920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 369 - 471
Target Start/End: Original strand, 19885 - 19991
Alignment:
Q  369 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatg--ctgttgtata--ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtct 464  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||  |||| |||||  ||||| ||||  |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||    
T  19885 agatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcggtct 19984  T
Q  465 aaaatga 471  Q
    || ||||    
T  19985 aagatga 19991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 295
Target Start/End: Original strand, 46365 - 46655
Alignment:
Q  5 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggttt 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  46365 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgatgacttagagtgagattgaacttggttt 46464  T
Q  105 agcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaa 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  46465 agcttagaacaactttagttaggaatctggcttgtactcgccatggtgaccaaatgctctctcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagttaggat 46564  T
Q  205 aatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
      ||||||||||||||||| | || ||||| ||||||| ||| || | ||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  46565 gttgcgatctgtgtcgcataaattgattagggatggactcttaggtagtaatgtgacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg 46655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 15147 - 14863
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15147 tttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagataagatgataacttagac-gagattgaacctggtttagctt 15049  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgc 209  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  15048 agaacaactttagatgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgccagtgaggatactgc 14949  T
Q  210 gatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
     ||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||| | |||||| ||||||| |||||||||  || ||||||||||||||    
T  14948 aatctgtgtcgcataatttgattagagatggactcctgggtagtaatgaaacctatacaagaagttaactgcaatctgtgaagctg 14863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 24162 - 23878
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  24162 tttttacttttgagttaaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgataacttagac-gagattgaacctggtttagctt 24064  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgc 209  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  24063 agaacaactttagttgggagtctggcttgtactttccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgccagtgaggatactgc 23964  T
Q  210 gatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
     ||||||||||||| |||| || |||||||||| | |||| | |||||| ||||||| |||||||||  || ||||||||||||||    
T  23963 aatctgtgtcgcataatttgataagagatggacacctgggtagtaatgaaacctatacaagaagttaactgcaatctgtgaagctg 23878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 39586 - 39302
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  39586 tttttacttttgagttaaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgataacttagac-gagattgaacctggtttagctt 39488  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgc 209  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  39487 agaacaactttagttgggagtctggcttgtactttccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgccagtgaggatactgc 39388  T
Q  210 gatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
     ||||||||||||| |||| || |||||||||| | |||| | |||||| ||||||| |||||||||  || ||||||||||||||    
T  39387 aatctgtgtcgcataatttgataagagatggacacctgggtagtaatgaaacctatacaagaagttaactgcaatctgtgaagctg 39302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 5)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 276
Target Start/End: Original strand, 65431 - 65702
Alignment:
Q  5 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggttt 104  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  65431 tgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatatttattaaagattaaatgataacttagaacaagattgaacctggttt 65530  T
Q  105 agcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaa 204  Q
    | | ||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  65531 aacctagaacaacctttgttggggatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgtgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggat 65630  T
Q  205 aatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagtta 276  Q
    | |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  65631 attgcgatctttgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagtta 65702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 54017 - 53842
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| || ||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||            
T  54017 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctgg-------- 53926  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
      |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53925 --aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 53842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 373 - 471
Target Start/End: Original strand, 20430 - 20528
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatg 470  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  20430 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactga-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 20527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 61
Target Start/End: Original strand, 20069 - 20119
Alignment:
Q  11 tttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgttta 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  20069 tttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagttcctgaacatgttta 20119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 128871 - 128827
Alignment:
Q  367 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt 411  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  128871 taagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 128827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 183; Significance: 9e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Original strand, 6050 - 6344
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  6050 attctgtacttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttcagatgtttattaaagattagatgatgatttagaatgagattgaacttg 6149  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  6150 gtttagcttagaacaacttaagttggaattttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagtta 6249  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    ||| | |||||| ||| |||||| | || ||||| | ||||||||| || | ||||| ||||||| ||||| ||||  || ||| ||||||||||    
T  6250 ggatattgcgatttgtttcgcataagttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatatgtgaagctg 6344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 183; Significance: 9e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Original strand, 18087 - 18381
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||  ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18087 attctataattttgactttagagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaataatttaatgataacttagaatgaaattgaacctg 18186  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18187 gtttagcttagaataacattagttgggaatctggctagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 18286  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    ||| | |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||| ||||||||||  |  ||||||||||||||    
T  18287 ggatattgcgatttgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatttaagaagttaactacaatctgtgaagctg 18381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 183; Significance: 9e-99; HSPs: 11)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Original strand, 23301 - 23594
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23301 attctgtacttttgacttttgagttgaaccatagatattttttagtacctaaagatgtttattaaagattagatgatgacttagagtgagattgaacctg 23400  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23401 gtttagcttagaacaactttagttgggaatctggcttgttctcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttctagaactgagtgcaagtga 23500  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    | |   |||||||| |||||||| |||| ||||  | |||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  23501 gaactttgcgatctttgtcgcataatttgattaatgttggacccttgggtagtaatgtgacctata-aagaagttagttgcaatctgtgaagctg 23594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Original strand, 38134 - 38407
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |     
T  38134 attctgtacttttgacttttgagttgaaccatatatgtttttgagtacctaaagatgtttattaaagattacatgatgacttagagtgagattgaacata 38233  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||                     |||||||||||||| |||||||||||    
T  38234 gtttagcttagaacaactttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcga---------------------gcacttccagaactaagtgcaagtga 38312  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    | |   ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  38313 gaactttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagttggacccttgggtagtaatgtgacctatataagaagttagttgcaatctgtgaagctg 38407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 369 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 100493 - 100394
Alignment:
Q  369 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||| ||| ||| ||| ||||| ||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  100493 agatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 100394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 119947 - 119895
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  119947 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 119895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 373 - 481
Target Start/End: Original strand, 17491 - 17600
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  17491 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 17588  T
Q  470 gattaagatgtt 481  Q
    ||||||||||||    
T  17589 gattaagatgtt 17600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 369 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 44570 - 44458
Alignment:
Q  369 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt----gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtct 464  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44570 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtct 44473  T
Q  465 aaaatgattaagatg 479  Q
    ||  |||||||||||    
T  44472 aagttgattaagatg 44458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 94522 - 94415
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  94522 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 94425  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  94424 gattaagatg 94415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 101571 - 101519
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  101571 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaa 101519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #9
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 415 - 466
Target Start/End: Original strand, 40224 - 40275
Alignment:
Q  415 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  40224 tactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagtctaa 40275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #10
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 50
Target Start/End: Original strand, 39648 - 39691
Alignment:
Q  7 taattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  39648 taattttgacttttgagttgatccttagatgttttcgagtgcct 39691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 101877 - 101811
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  101877 gtaatttttacttttgagttgatccttagaagtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 101811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 15983 - 16330
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||| |    
T  15983 attctgtattttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattaaatgatagtttagaatgagattgaaccag 16082  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16083 gtttagcttagaacaacattggtagggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgccctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtgcaagtga 16182  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataa 300  Q
    ||    ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||  ||     
T  16183 ggttgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagaggtggacccttgggtagtaatatgacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg-ttat 16281  T
Q  301 gatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattactt 348  Q
    || |||||  |||||| ||||| ||| ||||||||| | ||||||||||    
T  16282 gaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattactt 16330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 271
Target Start/End: Original strand, 1722 - 1988
Alignment:
Q  5 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggttt 104  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  1722 tgtaattttgacctttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtgtattaaagattagatgatgatttagaacgagattgaacctggttt 1821  T
Q  105 agcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |     
T  1822 agcttagaacaactttagttggaattctagcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaaatgagaat 1921  T
Q  205 aatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataaga 271  Q
      || |||||||||||||||| |  ||||| | ||||||||| || | ||||| ||||||| |||||    
T  1922 gttgtgatctgtgtcgcatgaatcgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaaga 1988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 4)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 9 - 295
Target Start/End: Original strand, 48102 - 48388
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagct 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |     
T  48102 attttgacttttgagatgaaccttagatgtttttgagtgtctgaagatgtatattaaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggtttaacc 48201  T
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatg 208  Q
    |||||||||  | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||    
T  48202 tagaacaaccattgttaggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtaagaatattg 48301  T
Q  209 cgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||    
T  48302 cgatctgtgtcacataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaaatgcaatatgtgaagctg 48388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 19336 - 19284
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19336 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 19284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 19750 - 19683
Alignment:
Q  5 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  19750 tgtaattttgacttctgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 19683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 19616 - 19582
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcga 174  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19616 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 19582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 5)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 295
Target Start/End: Original strand, 13715 - 14005
Alignment:
Q  5 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggttt 104  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  13715 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagaggtttttgagtgcctaaagatatttattaaagattagatgatgacttatagtgagattgaacctggttt 13814  T
Q  105 agcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaa 204  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  13815 agcttagaccaactttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagaac 13914  T
Q  205 aatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
      ||||| ||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||| | |||   |||||||||| || ||||  || ||||||||||||||    
T  13915 tttgcgacctgtgtcgcataacttatttagagaaggacccttgggtagtaaaatgacctatataggatgttaactgaaatctgtgaagctg 14005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 281 - 488
Target Start/End: Original strand, 17128 - 17340
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttat-gcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||||| ||||||  |||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||  |||  ||||| | | |||||||| ||    
T  17128 taatctgtaaagctgtttaagacgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttg 17227  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt-----gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgatta 474  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |    
T  17228 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 17326  T
Q  475 agatgttgaggatg 488  Q
    ||||| ||| ||||    
T  17327 agatgatgatgatg 17340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 72
Target Start/End: Original strand, 78999 - 79066
Alignment:
Q  5 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||| ||||||    
T  78999 tgtaattctgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcatgaacatgtttaataatgattag 79066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 101
Target Start/End: Original strand, 16857 - 16948
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctgg 101  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||   |  |  ||||||||||||||||||||    
T  16857 ttttgactttcgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgg 16948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 424 - 471
Target Start/End: Original strand, 79388 - 79434
Alignment:
Q  424 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatga 471  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  79388 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatga 79434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 875 - 582
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  875 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctaatgatgtttattaaagattagatgatgatttagaacgagattgaacctg 776  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  775 gtttagtttagaacaacttgagttggaaatctggcttgtactcgccatggtgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagtta 676  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagct 294  Q
    |||   |||||||||| |||||| | || ||| | ||||||||||| || | ||||| ||||||| ||||| |||| |||  ||||||||||||    
T  675 ggatgttgcgatctgtttcgcataagttgatttgggatggacccttaggtagtaatgcgacctatttaagatgttaattgagatctgtgaagct 582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 4911 - 4622
Alignment:
Q  2 ttctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  4911 ttctgtaattttgacttttgagttgaaccttaaatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaacaagattgaacctgg 4812  T
Q  102 tttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgag 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4811 tttagcttagaacaactttatttgggattctagcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagttcaagtgag 4712  T
Q  202 gaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaa 291  Q
     |   || || |||||| |  ||| || |||||  ||||| | || || | || |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  4711 aatgttgtgaactgtgttgtttgaattgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctatataagaagttaactgtaaactgtgaa 4622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 3321 - 3030
Alignment:
Q  4 ctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtt 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  3321 ctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattaaatgataacctagaatgagattgcacctggtt 3222  T
Q  104 tagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgagga 203  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  3221 tagcttagaacaacttaagttggaattctggcttgtacttgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagatagga 3122  T
Q  204 aaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
       || |||||||||||||| | || ||||| | ||||| ||| || | || || |||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  3121 tgttgtgatctgtgtcgcataaattgattagggttggactcttaggtagtagtgtgacctatataggatgttaattgcaatctgtgaagctg 3030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 6981 - 6696
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6981 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattaaatgataacctagaatgagattgcacctggtttagctt 6882  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgc 209  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||   ||     
T  6881 agaacaacttaagttggaattctggcttgtactttccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagataggatgttgt 6782  T
Q  210 gatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    |||||||||||||| | || ||||| | ||||| ||| || | || || |||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  6781 gatctgtgtcgcataaattgattagggttggactcttaggtagtagtgtgacctatataggatgttaattgcaatctgtgaagctg 6696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 1378 - 1084
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1378 attctataattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtctattaaagattagatgatgatttagaatgagattgaacctg 1279  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
     |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |    
T  1278 atttagcttagaacaacttgagttggaaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgttctcgcctcgcgagcacttctagaactgaatgcaaatta 1179  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    |||   ||||||||||||||||  | || ||||| | |||||||||  | | ||||| ||||||| ||||| ||||  || ||||||||| ||||    
T  1178 ggatgttgcgatctgtgtcgcacaaattgattagggttggacccttaagtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaggctg 1084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 16487 - 16289
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16487 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataatatgttgatga 16388  T
Q  381 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  16387 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 16289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 16747 - 16685
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  16747 ttttgacttttaagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 16685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 4)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 1494 - 1296
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 380  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1494 taatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 1395  T
Q  381 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  1394 attgaatttgatataattatgtcatgatgttgtacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 1296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 7471 - 7273
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 380  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7471 taatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 7372  T
Q  381 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  7371 attgaatttgatataattatttcatgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 7273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 417 - 479
Target Start/End: Original strand, 15291 - 15352
Alignment:
Q  417 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||    
T  15291 ctgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatg 15352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 16126 - 16086
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  16126 ttttgacttttgaattgaaccatagatgcttttgagtgcct 16086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 163; Significance: 8e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 642 - 348
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  642 attctgtatttttgacttttgagttgaaccctagatgcttttgagtgcataaagatgtttattaatggttagacgatgacttagaacgagattgaacctg 543  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| |    
T  542 gtttagcttagaacaactttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagtagatgctctctcctcgcaagcacttctagaactgagtgcaagtta 443  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    ||| | |  |||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| || | ||||| ||||||  ||||| ||||   | ||||||||||||||    
T  442 ggatatttggatctgtgtcgcataaattgattagggatggacccttaggtagtaatgtgacctaattaagatgttaacggaaatctgtgaagctg 348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 163; Significance: 8e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Original strand, 4567 - 4861
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  4567 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatatttttgaatgcctaaagatgtttattaaagattagatgatgacttagagtgagattgaaccgg 4666  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||    
T  4667 gtttagcttagaacaactttagttggaattctggcttgtactcgtcatggtgagaagatgctctcgcctcgcgagcatttccaaaaccgagtgcaattga 4766  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    ||| | |||||| |||||||||| |||| || |||| ||||| |||||| |  | |  |||||||||||||||||   || ||||||||||||||    
T  4767 ggacattgcgatttgtgtcgcataatttgatcagaggtggactcttgggtagcattatgacctatataagaagtttactgcaatctgtgaagctg 4861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 3)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 38 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 4189 - 3933
Alignment:
Q  38 cttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaacaactttagttgggattctggctt 137  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  4189 cttttgagtgcctaaagatgtttattaatgattaaatgatagcttagaatgagattgaacctggtttagcttagaacaacattagttgggaatctagctt 4090  T
Q  138 gtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagaga 237  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  4089 gtactcgccatggcgagtaaatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatgttgcgatctgtatcgcat-atttgattagaga 3991  T
Q  238 tggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  3990 tggacccttgggtagtaatgtgacctatataagatattaattgcaatctgtgaagctg 3933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 38 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 8620 - 8364
Alignment:
Q  38 cttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaacaactttagttgggattctggctt 137  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  8620 cttttgagtgcctaaagatgtttattaatgattaaatgatagcttagaatgagattgaacctggtttagcttagaacaacattagttgggaatctagctt 8521  T
Q  138 gtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagaga 237  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  8520 gtactcgccatggcgagtaaatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatgttgcgatctgtatcgcat-atttgattagaga 8422  T
Q  238 tggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  8421 tggacccttgggtagtaatgtgacctatataagatattaattgcaatctgtgaagctg 8364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 388 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 30028 - 29949
Alignment:
Q  388 ttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30028 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 29949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 160; Significance: 5e-85; HSPs: 3)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 6067 - 5872
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  6067 attctgtgtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaacaagattgaacctg 5968  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaa 196  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  5967 gtttagcttcgaacaaccttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccataactgaatgcaa 5872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 7262 - 7067
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  7262 attctgtgtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaacaagattgaacctg 7163  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaa 196  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  7162 gtttagctttgaacaactttagttgtaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccataactgaatgcaa 7067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 370 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 12884 - 12786
Alignment:
Q  370 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  12884 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatattgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaa 12786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Original strand, 15313 - 15597
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||     
T  15313 attctgtattttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcttaaagatgtctattaaagattaaatgataacttagaacgagattgaacct- 15411  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
             ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  15412 ---------agaacaacttttgttgggaatctggcttgtactcgccatggcaagcagatgctctcgcctcgcgatcacttctagaacttagtgcaagtga 15502  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    ||| | || |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  15503 ggatattgtgatctgtgtcgcttaatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg 15597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 10455 - 10553
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacct 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||    
T  10455 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcttgaagatgcctattaaagattaaatgaaaacttagaacgagattgaacct 10553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 281 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 51787 - 51602
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  51787 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgaatatgaagtgttataatgtttatgcatttcttgaaggatatttgtatacataagatgttgatga 51688  T
Q  381 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51687 attgaatttgttataattatgtcatgatgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 51602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 153; Significance: 7e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 32901 - 32626
Alignment:
Q  19 ttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaacaact 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32901 ttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagattaaatgataacttagaacgagattgaacctggtttagcttagaacaaca 32802  T
Q  119 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgt 218  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  32801 ttagttgggaatctggcttgtactcgacatgttgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggatatcgcgatctgtgt 32702  T
Q  219 cgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    ||||| ||||  |||||| ||||||| |||| | ||| | ||||| | ||| | |||| ||| ||||||||||||||    
T  32701 cgcataatttgtttagagttggacccctgggtagtaaagtgacct-tttaaaatgttaattgcaatctgtgaagctg 32626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 111 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 8860 - 8778
Alignment:
Q  111 gaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
    ||||||| |||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8860 gaacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 8778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 152; Significance: 3e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 244
Target Start/End: Original strand, 5951 - 6186
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagct 108  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  5951 attttgacctgtgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcatattaaagattagatgaagacttagattgagattgaacctggttaagct 6050  T
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatg 208  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||    
T  6051 tagaacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgaatgcaagtgaggatgttg 6150  T
Q  209 cgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggaccc 244  Q
    |||  |||||||||| | || |||||||||||||||    
T  6151 cgacttgtgtcgcataacttgattagagatggaccc 6186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 388 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 4393 - 4301
Alignment:
Q  388 ttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  4393 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 4301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 4)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 195
Target Start/End: Original strand, 30384 - 30573
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggttta 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  30384 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatctttaataaagattagatgatgatttagaacgagattgaacctggttta 30483  T
Q  106 gcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
    |||||||||||||  |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30484 gcttagaacaactggagttggaaatctggcttatactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttacagaactgagtgca 30573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 111 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 2237 - 2157
Alignment:
Q  111 gaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgag 191  Q
    ||||||| |||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2237 gaacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgag 2157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 415 - 466
Target Start/End: Original strand, 14747 - 14798
Alignment:
Q  415 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  14747 tactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggtctaa 14798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 2328 - 2287
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctt 51  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  2328 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtacctt 2287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 16755 - 16949
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  16755 attctgtgtttttgacttttgagttgaagcttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaatattagatgatgacttagaacaagattgaacttg 16854  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16855 gtttagcttagaacaaccttagttgggaatctggcatgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttcaagaaccgagtgca 16949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 4)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Original strand, 21203 - 21497
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||| |  ||| |||||||||||||||    
T  21203 attctatattttttacttttgagttgaaccttagatgttttttagtaccttaagatgtgtattaaggattaaatgataatgtaggatgagattgaacctg 21302  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  21303 gtttagcttagagcaaccttagttggaattctggcttgtactcgccgtggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaagtta 21402  T
Q  201 ggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    |||   |||||||||| |||||| | || ||||| ||||||||||| || | ||||| ||||||| ||||| ||||  || ||| ||||||||||    
T  21403 ggatgttgcgatctgtttcgcataaattgattagggatggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatttgtgaagctg 21497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 369 - 466
Target Start/End: Original strand, 22672 - 22771
Alignment:
Q  369 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22672 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 22771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 82183 - 82076
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||  |    
T  82183 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagtt 82086  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  82085 gattaagatg 82076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 177
Target Start/End: Original strand, 80102 - 80139
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagca 177  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  80102 actcgacatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagca 80139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 143; Significance: 7e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Original strand, 965 - 1163
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 380  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  965 taatctgtgaagctgtataaaatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatga 1064  T
Q  381 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  1065 attgaaattgatataattatgtcatgatgttgtatactgcctatgttgatgtttattaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 1163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 72
Target Start/End: Original strand, 705 - 767
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  705 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaatatgtctaataatgattag 767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 2300 - 2036
Alignment:
Q  12 ttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttag 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  2300 ttgacttttgagttgaaccttagatgcttttaagtgccttaagatgtttaataaagattagatgatgatttaaaacgagattgaacctggtttatcttag 2201  T
Q  112 aacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcga 211  Q
    |||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||  |||   |||||    
T  2200 aacaacttgagttggaaatctgacttgtactcgccatggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccataactgaatacaagttgggatgttgcga 2101  T
Q  212 tctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagtta 276  Q
    ||||| |||||  | || ||||||| ||||||||| || | ||||| ||||||| ||||| ||||    
T  2100 tctgtttcgcacaaattgattagagttggacccttagggagtaatgtgacctatttaagatgtta 2036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 9982 - 9718
Alignment:
Q  12 ttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttag 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  9982 ttgacttttgagttgaaccttagatgcttttaagtgccttaagatgtttaataaagattagatgatgatttaaaacgagattgaacctggtttatcttag 9883  T
Q  112 aacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcga 211  Q
    |||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||  |||   |||||    
T  9882 aacaacttgagttggaaatctgacttgtactcgccatggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccataactgaatacaagttgggatgttgcga 9783  T
Q  212 tctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagtta 276  Q
    ||||| |||||  | || ||||||| ||||||||| || | ||||| ||||||| ||||| ||||    
T  9782 tctgtttcgcacaaattgattagagttggacccttagggagtaatgtgacctatttaagatgtta 9718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Original strand, 5044 - 5242
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 380  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5044 taatatgtgaaactgaataaaatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtttatacattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 5143  T
Q  381 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  5144 attgaatttgatataattatgtcatgatgttgtataatacctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 5242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 72
Target Start/End: Original strand, 4784 - 4846
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  4784 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 4846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 6 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 26881 - 26706
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggttta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26881 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcttattaaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctggttta 26782  T
Q  106 gcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttc 181  Q
     | |||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26781 acctagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttc 26706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 236 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 24094 - 23995
Alignment:
Q  236 gatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgt 335  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||  ||||| |||||  |||||| ||||| ||| ||||||||    
T  24094 gatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg-ttaagagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgt 23996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1895 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold1895
Description:

Target: scaffold1895; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 295
Target Start/End: Original strand, 886 - 1155
Alignment:
Q  5 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggttt 104  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  886 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagattaaatgataacttagaatgagattgaacctagttt 985  T
Q  105 agcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaa 204  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||                     |||||||||||||||||||||||||||||     
T  986 agcttagaacaacattagttgggaatctggctagtactcgccatggcga---------------------gcacttccagaactgagtgcaagtgaggat 1064  T
Q  205 aatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| | ||||  ||||||||||||||||||  || |||| |||||||||    
T  1065 attgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggatccttgggtagtaatatgacctatataagaagttaactgcaatcagtgaagctg 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 47200 - 47002
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 380  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  47200 taatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgtttatgatgtgatataatgtttatgcattacttggagaatatttgtatacataagatgttgatga 47101  T
Q  381 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  47100 attgaaattgatattattatgtcatgctgctgtaaactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttgaagatg 47002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 113
Target Start/End: Original strand, 64301 - 64409
Alignment:
Q  5 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggttt 104  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  64301 tgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattaaatgataacatagaatgagattgaacctggttt 64400  T
Q  105 agcttagaa 113  Q
    |||||||||    
T  64401 agcttagaa 64409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 47452 - 47392
Alignment:
Q  12 ttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| || ||| ||||||    
T  47452 ttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgtctgaatatgtctaataatgattag 47392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 126; Significance: 9e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 281 - 466
Target Start/End: Original strand, 10339 - 10524
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 380  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||    
T  10339 taatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacttaagatgttgttga 10438  T
Q  381 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  10439 attgaaattgatattattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaa 10524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 72
Target Start/End: Original strand, 10079 - 10141
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  10079 ttttgacttttgaattgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 10141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 125; Significance: 4e-64; HSPs: 3)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 281 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 13703 - 13517
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 380  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13703 taatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 13604  T
Q  381 attgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    || ||| ||||||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13603 atcgaaattgatattatcatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 13517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 13963 - 13872
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctgg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||   | ||  ||| ||||||||||||||||    
T  13963 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaggatgtagcatgagattgaacctgg 13872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 13844 - 13808
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 176  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  13844 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc 13808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 5)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 190915 - 191102
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  190915 attctgtgtttttgacttttgagttcaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttagaaatgattaaatgataacttagaatgagattgaacctg 191014  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaact 188  Q
    ||||| | ||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  191015 gtttaacctagaacaaaatttgttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaact 191102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 192618 - 192812
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  192618 attctgtgtttttgacttttgagttcaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttagaaatgattaaatgataacttagattgagattgaacctg 192717  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
    ||||| | ||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  192718 gtttaacctagaacaaactttgttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagtacttccagatctaagtgca 192812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 56549 - 56376
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| || ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||            
T  56549 ttttgacttttaagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagaggatgatttagaatgagattgaacctgg-------- 56458  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
      |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56457 --aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 56376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 99
Target Start/End: Original strand, 14971 - 15056
Alignment:
Q  14 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacct 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||    
T  14971 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtgtattaaagattagagaaagacttagaacgagattgaacct 15056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #5
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 99
Target Start/End: Original strand, 19493 - 19578
Alignment:
Q  14 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacct 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||    
T  19493 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtgtattaaagattagagaaagacttagaacgagattgaacct 19578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 123; Significance: 6e-63; HSPs: 3)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 281 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 32272 - 32087
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 380  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  32272 taatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatga 32173  T
Q  381 attgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32172 attgaaattgatattattatgtcatgttgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 32087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 32532 - 32492
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32532 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 32492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 32429 - 32378
Alignment:
Q  124 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 175  Q
    |||||||||| |||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  32429 tgggattctgacttgaacttgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 32378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 44531 - 44391
Alignment:
Q  5 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggttt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  44531 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatatttattaaagattagatgatgatttagaacgagattgaacctggttt 44432  T
Q  105 agcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgc 145  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  44431 agcttagaacaacttaagctggaattctggcttgtactcgc 44391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 44395 - 44269
Alignment:
Q  168 ctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatat 267  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| || |   |||||||| | |||||| | || ||||| | ||||||||| || | ||||| ||||||| |    
T  44395 ctcgcgagcatttccagaactgaatgcaagttagtatgttgcgatctttttcgcataagttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctattt 44296  T
Q  268 aagaagttatttgtaatctgtgaagct 294  Q
    |||| ||||  || |||||||||||||    
T  44295 aagatgttaactgaaatctgtgaagct 44269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 749 - 566
Alignment:
Q  3 tctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggt 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||      
T  749 tctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttaataaagattagatgatgacttagaacaagattgaacctg-- 652  T
Q  103 ttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaa 196  Q
            ||| |||  | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  651 --------gaataaccattgttggaattctagcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgaatgcaa 566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 298 - 411
Target Start/End: Original strand, 3460 - 3574
Alignment:
Q  298 taagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataa 396  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  |||||   | |||||||| ||| ||| ||||||||| |    
T  3460 taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatatta 3559  T
Q  397 ttatgtcatgctgtt 411  Q
    |||||||||||||||    
T  3560 ttatgtcatgctgtt 3574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 111; Significance: 8e-56; HSPs: 6)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 281 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 4919 - 4732
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 380  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  4919 taatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgccttacttgaagaatatttgtatacataagattttgatga 4820  T
Q  381 attgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||| | ||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4819 attgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 4732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 281 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 143 - 13
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 380  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  143 taatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgccttacttgaagaatatttgtatacataagattttgatga 44  T
Q  381 attgaatttgatataattatgtcatgctgtt 411  Q
    |||| | ||||| || |||||||||||||||    
T  43 attgcaattgatgtatttatgtcatgctgtt 13  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 408 - 342
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  408 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 5184 - 5118
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  5184 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 5118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 301 - 253
Alignment:
Q  124 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgc 172  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  301 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgc 253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 5077 - 5029
Alignment:
Q  124 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgc 172  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5077 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgc 5029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 195
Target Start/End: Original strand, 18944 - 19120
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagct 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||            
T  18944 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctttagatgttcactaaagattagatgatgacttagaacaagattgaacctg-------- 19035  T
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
      ||| |||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19036 --gaataaccattgttggaattctggcttgtactcgccatggcgagaagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 19120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1326 (Bit Score: 106; Significance: 8e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold1326
Description:

Target: scaffold1326; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 1134 - 1324
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||        
T  1134 attctgtagttttgacttgtgagttgaactttagatgcttttgagtgcctttagatgtttattaaagattagatgttgacttagaacaagattgaa---- 1229  T
Q  101 gtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtga 200  Q
          ||| ||| |||  | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1230 ------cttggaataaccattgttggaattctggcttgtactcgccatagcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactaagtgcaagtga 1323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 7)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 195
Target Start/End: Original strand, 18286 - 18461
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  |||| ||||||  |||||||||||              
T  18286 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctttaggtgtctattaaagattagagaatgatttagaacaagattgaacct---------- 18375  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18376 agaacaaccttatttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 18461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 281 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 4715 - 4528
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  |||||   | |||||||| ||    
T  4715 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttg 4616  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||   || |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  4615 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaa 4528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 281 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 12297 - 12110
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  |||||   | |||||||| ||    
T  12297 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttg 12198  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||   || |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  12197 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaa 12110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 281 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 22249 - 22062
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  |||||   | |||||||| ||    
T  22249 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttg 22150  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||   || |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  22149 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaa 22062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #5
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 4988 - 4896
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctgg 101  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||||  |  |  ||||||||||||||||||||    
T  4988 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatgagattgaacctgg 4896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #6
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 12570 - 12478
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctgg 101  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||||  |  |  ||||||||||||||||||||    
T  12570 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatgagattgaacctgg 12478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #7
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 22522 - 22430
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctgg 101  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||||  |  |  ||||||||||||||||||||    
T  22522 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatgagattgaacctgg 22430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 194
Target Start/End: Original strand, 35159 - 35338
Alignment:
Q  5 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggttt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||        
T  35159 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtataataaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctg---- 35254  T
Q  105 agcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
          ||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35255 ------gaacaaccttagttggaaacctggcttgtactcgccatggcgaggagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 35338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 179131 - 178974
Alignment:
Q  7 taattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttag 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||     
T  179131 taattttgacttttgagttggaccttagatgtttttcagtgcctgaagatgcttattaaagattaaatgataacttagaataagattgaacctggtttaa 179032  T
Q  107 cttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctct 164  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  179031 cttagaacaaccattgttgggaatctggcttgtactcgccatggctagcagatgctct 178974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 414 - 479
Target Start/End: Original strand, 15826 - 15891
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  15826 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 15891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 50
Target Start/End: Original strand, 15468 - 15512
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15468 gtaattttaacttttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 15512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 101; Significance: 8e-50; HSPs: 4)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 123 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 945 - 773
Alignment:
Q  123 ttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcgca 222  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||    
T  945 ttgggattctgccctgaactcgccatggcgagcagatgttctcgcctcgtgagcacttccagaactgagtgtaaatgaggatattgcgatctgtgtcgca 846  T
Q  223 tgatttaattagagatggacccttgggcaataatgagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 295  Q
    | |||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  845 taatttgattagagatggacccttcggtagtaatgagacctatttaagaagttaactgcaatctgtgaagctg 773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 369 - 466
Target Start/End: Original strand, 10543 - 10642
Alignment:
Q  369 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  10543 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaa 10642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 72
Target Start/End: Original strand, 10206 - 10272
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  10206 gtaattttgacctttgagatgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 10272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 1058 - 1020
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgc 48  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  1058 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtgc 1020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 15493 - 15374
Alignment:
Q  76 atgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 175  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15493 atgacttagaacaagattgaacctggtttagcttagaacaactttagttgaaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 15394  T
Q  176 cacttccagaactgagtgca 195  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  15393 cactttcagaactgagtgca 15374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 46
Target Start/End: Original strand, 17361 - 17402
Alignment:
Q  5 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17361 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 17402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 787 - 608
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggttta 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||         
T  787 gtaatttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgttcactaaagattagaggatgacttagaacaagattgaacctga---- 692  T
Q  106 gcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
          || |||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  691 ------aataaccattgttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 5)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 45574 - 45395
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggttta 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||         
T  45574 gtaatttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgttcactaaagattagaggatgacttagaacaagattgaacctga---- 45479  T
Q  106 gcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
          || |||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45478 ------aataaccattgttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 45395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Original strand, 10956 - 11129
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||| ||||||   | || |  ||||||||||||||||||            
T  10956 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactaatgattagggaacgaatgggaatgagattgaacctgg-------- 11047  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
      |||||| |||||||| |   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  11048 --aacaaccttagttggaaagttggcttgtactcaccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaaaattgagtg 11129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 111 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 7305 - 7222
Alignment:
Q  111 gaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
    |||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7305 gaacaaccgtagttggaattttggcttgtactcgctttggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 7222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Original strand, 38473 - 38646
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||| ||||||   | || |  |||||||||||||||||             
T  38473 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactaatgattagggaacgaatgggaatgagattgaacctga-------- 38564  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
      |||||| |||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  38565 --aacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccatggcgagcagatcctctcgcctcgtgagcacttcaagaattgagtg 38646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 7504 - 7463
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctt 51  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  7504 ttttgacttttgagttgaaccttggatgcctttgagtacctt 7463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 195
Target Start/End: Original strand, 66069 - 66244
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| || || |||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||            
T  66069 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctaatatagattagaggatgatttagaacaagattgaacctgg-------- 66160  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
      |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  66161 --aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 66244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Original strand, 71210 - 71343
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| || || |||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||             
T  71210 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctaatatagattagaggatgatttagaacaagattgaacctg--------- 71300  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcga 153  Q
     ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  71301 -gaacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcga 71343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 96; Significance: 7e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 195
Target Start/End: Original strand, 15071 - 15247
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagct 108  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| || ||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||           
T  15071 attttcacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgaattagaacaagattgaacctgg------- 15163  T
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
       |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15164 ---aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcaccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 15247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 368 - 433
Target Start/End: Original strand, 15417 - 15483
Alignment:
Q  368 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctatgttgctgtt 433  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  15417 aagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtatgctgcctatgttgatgtt 15483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1220 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold1220
Description:

Target: scaffold1220; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 2257 - 2079
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggttta 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||        
T  2257 gtaatttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgttcattaaagattagaggatgacttagaacaagattgaacccgg---- 2162  T
Q  106 gcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
          || |||  | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2161 ------aataaccattgttggaat-ctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 2079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 194
Target Start/End: Original strand, 2084 - 2263
Alignment:
Q  5 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggttt 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||        
T  2084 tgtaattttgacttttgcgttgaaccttagatgcttttgagtacctttagttgtgtattaaagattagaggatgacttagtacaagattgaacctg---- 2179  T
Q  105 agcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
          |||||||  ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2180 ------gaacaaccgtagttggaaacctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgc 2263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 194
Target Start/End: Original strand, 9944 - 10123
Alignment:
Q  5 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggttt 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||        
T  9944 tgtaattttgacttttgcgttgaaccttagatgcttttgagtacctttagttgtgtattaaagattagaggatgacttagtacaagattgaacctg---- 10039  T
Q  105 agcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
          |||||||  ||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10040 ------gaacaaccgtagttggaaacttggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgc 10123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 5)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 19640 - 19465
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| || ||| || |||||||||||  |||| ||||||  |||||||||||||            
T  19640 ttttgacttttgagttgaaccttagatacctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagagaatgatttagaacaagattgaacctgg-------- 19549  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
      |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19548 --aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 19465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 13356 - 13181
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| | || || ||| || |||||||||||  |||| ||||||  |||||||||||||            
T  13356 ttttgacttttgagttgaaccatagatacctttgagtacgtttaggtgtctactaaagattagagaatgatttagaacaagattgaacctgg-------- 13265  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
      |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13264 --aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaaccgagtgca 13181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 132 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 62600 - 62541
Alignment:
Q  132 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgag 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  62600 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagtacttccagaattgag 62541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 40511 - 40404
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||  |    
T  40511 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagtt 40414  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  40413 gattaagatg 40404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 62712 - 62671
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctt 51  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  62712 ttttgacttttgagttaaaccttagatgcctttgagtacctt 62671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 4)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 13419 - 13218
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||    
T  13419 taatttgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 13320  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaag 476  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||| |||    
T  13319 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaag 13221  T
Q  477 atg 479  Q
    |||    
T  13220 atg 13218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 111 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 9781 - 9701
Alignment:
Q  111 gaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgag 191  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9781 gaacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctcttgcctcgcgagcacttccagaactgag 9701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 13680 - 13617
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  13680 attttgacttttgagttgatccttatatgcttttgagtgcctgaaaatgtctaataatgattag 13617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 9872 - 9831
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctt 51  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  9872 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctt 9831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 281 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 5057 - 4869
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||  | | |||| || | |||||||||| ||    
T  5057 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatacttaagatgttgttg 4958  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  4957 aattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaatctgcatgagtcggtctaa 4869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 5321 - 5254
Alignment:
Q  5 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||| ||||||    
T  5321 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcatgaagatgtctaataatgattag 5254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 91; Significance: 7e-44; HSPs: 6)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 173742 - 173567
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| || ||| || ||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||            
T  173742 ttttgactttttagttgaaccttagatgtctttgagtacctttaggtgtctactaatgattagaggatgatttataatgagattgaacctgg-------- 173651  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
      |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  173650 --aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccataactgagtgca 173567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 194
Target Start/End: Original strand, 422179 - 422359
Alignment:
Q  5 tgtaattttga-cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtt 103  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||       
T  422179 tgtaattttgaacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgttaaataaagattagaggatgacttagaacaagattgaacctg--- 422275  T
Q  104 tagcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
           ||||||   ||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  422276 -------gaacaaacatagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcagctcgcgagcacttccagaacagagtgc 422359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 160756 - 160704
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  160756 atactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 160704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 386 - 479
Target Start/End: Original strand, 85644 - 85738
Alignment:
Q  386 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  85644 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatg 85738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 373 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 501195 - 501085
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  501195 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 501098  T
Q  470 gattaagatgttg 482  Q
    |||||||||||||    
T  501097 gattaagatgttg 501085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 6 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 161168 - 161102
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  161168 gtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 161102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 6)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 19671 - 19845
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || || ||| || |||||||||||  |||| ||||||  |||||||||||||            
T  19671 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacatttaggtgtctactaaagattagagaatgatttagaacaagattgaacctgg-------- 19762  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
      |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19763 --aacaaccttagttgggaatctggcttgtacttgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 19845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 311 - 479
Target Start/End: Original strand, 32901 - 33070
Alignment:
Q  311 tgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg 409  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||  | | ||   |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  32901 tgttgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataat-gaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctg 32999  T
Q  410 --ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
      ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||    
T  33000 ttttgtatactgcctgtgttgctg-ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 33070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 311 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 46104 - 45935
Alignment:
Q  311 tgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg 409  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||  | | ||   |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  46104 tgttgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataat-gaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctg 46006  T
Q  410 --ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
      ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||    
T  46005 ttttgtatactgcctgtgttgctg-ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 45935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 304 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 16298 - 16120
Alignment:
Q  304 atgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgt 402  Q
    |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||   |||  ||||| | | ||||| || ||  ||| ||||||||| || || |    
T  16298 atgttgatgttgatcatgacgtgatataatgttatatgcattacttgagttatgaatgtatacttgagatgatgttggcttgcatttgatattatgatat 16199  T
Q  403 catgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    | |||||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||    
T  16198 cttgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 16120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Original strand, 32600 - 32663
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||| || ||| ||||||    
T  32600 attttgacttttgagtcgaaccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattag 32663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #6
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 46405 - 46342
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||| || ||| ||||||    
T  46405 attttgacttttgagtcgaaccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattag 46342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 10355 - 10181
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  ||||||   |||| |||||| ||||||||||||||            
T  10355 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctgg-------- 10264  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10263 --aacaaccttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 10181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 304 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 4709 - 4545
Alignment:
Q  304 atgttgttgttgattatgaagtgttataatgt-ttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgt 402  Q
    |||||| ||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||   || ||   |||||||||| ||||||  ||||||||| || || |    
T  4709 atgttgatgttgatcatgatgtgatataatgtattatgcattacttgaagtataaatgaatatttaagatgttgttgaattatatttgatattatgatat 4610  T
Q  403 catgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 465  Q
    | ||||| |||   |||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  4609 cttgctgctgttgcatactgcctatgctgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 4997 - 4947
Alignment:
Q  15 acttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaa 65  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  4997 acttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaacatgtctattaa 4947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 6)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 23668 - 23494
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| || ||  |||||||  |||| |||||||||||||||||||||            
T  23668 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactactgattagagaatgatttagaatgagattgaacctgg-------- 23577  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
      |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23576 --aacaaccttagttgagaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccataactgagtgc 23494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 242420 - 242344
Alignment:
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 185  Q
    ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  242420 tagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 242344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 369 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 130024 - 129925
Alignment:
Q  369 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  130024 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa 129925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 410 - 471
Target Start/End: Original strand, 60761 - 60822
Alignment:
Q  410 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatga 471  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  60761 ttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatga 60822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 130257 - 130221
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 176  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  130257 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc 130221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 130390 - 130346
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  130390 gtaattttgacttttgagttgatcctttgatgtttttgagtgcct 130346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 268 - 466
Target Start/End: Original strand, 949 - 1149
Alignment:
Q  268 aagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcat 367  Q
    |||| |||| || |||||| ||||||||  |||||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||   |    
T  949 aagaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaataatatttgaatattt 1048  T
Q  368 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc---tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtct 464  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||   | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1049 aagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 1147  T
Q  465 aa 466  Q
    ||    
T  1148 aa 1149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 72
Target Start/End: Original strand, 698 - 764
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  698 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 175
Target Start/End: Original strand, 805 - 856
Alignment:
Q  124 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 175  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  805 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 6)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 268 - 466
Target Start/End: Original strand, 167879 - 168079
Alignment:
Q  268 aagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcat 367  Q
    |||| |||| || |||||| ||||||||  |||||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||   |    
T  167879 aagaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaataatatttgaatattt 167978  T
Q  368 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc---tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtct 464  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||   | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  167979 aagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 168077  T
Q  465 aa 466  Q
    ||    
T  168078 aa 168079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 52121 - 51920
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| ||| |||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   ||||||| || ||    
T  52121 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtagattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttg 52022  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaag 476  Q
    | ||| | ||||||| ||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||    
T  52021 acttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 51923  T
Q  477 atg 479  Q
    |||    
T  51922 atg 51920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 72
Target Start/End: Original strand, 167628 - 167694
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  167628 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 167694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 52392 - 52329
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  52392 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 52329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 52277 - 52226
Alignment:
Q  124 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 175  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  52277 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 52226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 175
Target Start/End: Original strand, 167735 - 167786
Alignment:
Q  124 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 175  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  167735 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 167786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1461 (Bit Score: 86; Significance: 7e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold1461
Description:

Target: scaffold1461; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 381 - 207
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| || ||  |||||||  |||  ||||||  |||||||||||||            
T  381 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagagaatgttttagaacaagattgaacctgg-------- 290  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
      |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  289 --aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 86; Significance: 7e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 194
Target Start/End: Original strand, 3882 - 4052
Alignment:
Q  14 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaa 113  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||          ||    
T  3882 gacttttgagttgaactttagatgcttttgagtacctttagatgtctactaaagattagaggatgatttagaacaagattgaacctgg----------aa 3971  T
Q  114 caactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
    ||||  ||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3972 caaccgtagttggaaacctggcctgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 4052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 414 - 479
Target Start/End: Original strand, 1118 - 1183
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  1118 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 1183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 86; Significance: 7e-41; HSPs: 10)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 140162 - 139988
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  |||||||  |||| |||||| ||||||||||||              
T  140162 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacct---------- 140073  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  140072 agaacaaccttagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcatatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 139988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 97052 - 96883
Alignment:
Q  16 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaaca 115  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| || ||| || ||| ||||||| ||||  ||||||  ||| |||||||||          ||||    
T  97052 cttttgagttgaacctcagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaacgattagaggatgttttagaacaagaatgaacctgg----------aaca 96963  T
Q  116 actttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  96962 accttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 96883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 71766 - 71590
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| || ||| || || | |||||| ||| | ||||||  |||||||||||||           
T  71766 attttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtacctttaggtgtctactagatattagaggattaattagaacaagattgaacctgg------- 71674  T
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
       |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  71673 ---aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtgca 71590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 281 - 466
Target Start/End: Original strand, 339863 - 340048
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||  |||  ||||| | | |||||||| ||    
T  339863 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttg 339962  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  339963 acttg-atttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgttg--tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 340048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #5
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 119 - 190
Target Start/End: Original strand, 413803 - 413874
Alignment:
Q  119 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 190  Q
    |||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  413803 ttagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 413874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Original strand, 158501 - 158608
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  158501 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 158598  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  158599 gattaagatg 158608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #7
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 368 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 71419 - 71353
Alignment:
Q  368 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctatgttgctgtt 433  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  71419 aagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctgtttgtatgctgcctatgttgctgtt 71353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #8
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 50
Target Start/End: Original strand, 339592 - 339633
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  339592 attttgacttttgagttgatccttaaatgcttttgagtgcct 339633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #9
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 123 - 175
Target Start/End: Original strand, 339705 - 339757
Alignment:
Q  123 ttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 175  Q
    |||||| |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  339705 ttgggaatctgacatgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 339757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #10
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 86
Target Start/End: Original strand, 413732 - 413780
Alignment:
Q  38 cttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaa 86  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  413732 cttttgagtacctttagatgtttactaaagattagaggatgatttagaa 413780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 5)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 3678 - 3477
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||    
T  3678 taatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatttgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 3579  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaag 476  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||| |||    
T  3578 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-ttagttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaag 3480  T
Q  477 atg 479  Q
    |||    
T  3479 atg 3477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 288 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 543 - 363
Alignment:
Q  288 tgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattgaa 386  Q
    ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  | | ||   |||||||||| ||| ||  |    
T  543 tgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcgaatatttaagatgttgttgacttcca 444  T
Q  387 tttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
     ||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  443 attgatattattacgtcatgctattttgtatactgcctatgttattgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 822 - 732
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacct 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||||  |  |  ||||||||||||||||||    
T  822 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatgagattgaacct 732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 3835 - 3784
Alignment:
Q  124 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 175  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  3835 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 3784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 3950 - 3887
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || || |||| || ||| ||||||    
T  3950 attttgacttttgagttgatctttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattag 3887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 4)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 2059 - 1858
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    ||||||||||||||   |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||    
T  2059 taatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 1960  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaag 476  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||| ||   |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||    
T  1959 aattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 1861  T
Q  477 atg 479  Q
    |||    
T  1860 atg 1858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 2331 - 2268
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  2331 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 2268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 50
Target Start/End: Original strand, 207161 - 207201
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  207161 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcct 207201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 179
Target Start/End: Original strand, 207289 - 207328
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcact 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  207289 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcact 207328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1552 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold1552
Description:

Target: scaffold1552; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 805 - 635
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||  || ||  |||||||  |||  |||||||||||||||||          ||    
T  805 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgttttagaatgagattgaac----------tt 716  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 190  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  715 agaacaacctttgttggaattctggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactga 635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 2160 - 1959
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||   |||||||||| ||    
T  2160 taatatgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgagatataatgttttatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttg 2061  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaag 476  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||| ||   ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||    
T  2060 aattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctg-ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 1962  T
Q  477 atg 479  Q
    |||    
T  1961 atg 1959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 2420 - 2380
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2420 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcct 2380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 286 - 479
Target Start/End: Original strand, 6039 - 6238
Alignment:
Q  286 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattg 384  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||   ||||||||||||||||||    
T  6039 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattg 6138  T
Q  385 aatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgt--ttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
     | ||||||| || |||||||||||   ||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||    
T  6139 caattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactacctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 6238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 72
Target Start/End: Original strand, 5763 - 5825
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  5763 tttttacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 5825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 195
Target Start/End: Original strand, 3184 - 3359
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| || ||| || ||  |||||||  |||| |||||| |||||||||| |||            
T  3184 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctatgagtacctttaggtgtctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacttgg-------- 3275  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
      || ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3276 --aagaaccttagttggaaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 3359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 195
Target Start/End: Original strand, 2327 - 2502
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | || | || ||  || |||||||||||  |||| ||||||  |||||||||||              
T  2327 ttttgacttttgagttgaaccttagatacatttgaataccattaggtgactaataaagattagagaatgatttagaaaaagattgaacct---------- 2416  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2417 agaacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtgca 2502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 9702 - 9627
Alignment:
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 185  Q
    |||||||| |||||||||    |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9702 agaacaacattagttggggagttggcctgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 9627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 24622 - 24796
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| || ||  |||||||  |  | |||||| ||||||||||||||            
T  24622 ttttaacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagagaactatttagaacgagattgaacctgg-------- 24713  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
      |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24714 --aacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagacgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 24796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18806 - 18633
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  |||||||  |||| |||||||||||||||||||||            
T  18806 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaatgagattgaacctgg-------- 18715  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
      |||||| |||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18714 --aacaaccttagttgggaatctggcttgaactcgctaaggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 18633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 111 - 195
Target Start/End: Original strand, 228118 - 228202
Alignment:
Q  111 gaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  228118 gaacaaccttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 228202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 285 - 479
Target Start/End: Original strand, 3068 - 3264
Alignment:
Q  285 ctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaatt 383  Q
    |||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||  |||  |||||   | |||||||| ||| ||    
T  3068 ctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgactt 3167  T
Q  384 gaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    | ||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||    
T  3168 gcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 3264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 194
Target Start/End: Original strand, 6919 - 7098
Alignment:
Q  5 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggttt 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  || |||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||        
T  6919 tgtaattttgactttcgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtttgctatagattagaggatgatttagaacaagattgaacctg---- 7014  T
Q  105 agcttagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
          ||| |||  | | ||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7015 ------gaataaccatggatggaaatctggcaagtactcgccatggcgagcagatgctcttgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 7098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 5)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 33149 - 32949
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   |||||||||| |     
T  33149 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgtta 33050  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaaga 477  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||| ||||    
T  33049 acttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaaga 32951  T
Q  478 tg 479  Q
    ||    
T  32950 tg 32949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 38968 - 38768
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   |||||||||| |     
T  38968 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttt 38869  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaaga 477  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||| ||||    
T  38868 atttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaattaagctgcatgactcggtctaagttgatgaaga 38770  T
Q  478 tg 479  Q
    ||    
T  38769 tg 38768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 388 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 9845 - 9753
Alignment:
Q  388 ttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    ||||||| |||||||||| |||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  9845 ttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 9753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 39242 - 39147
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctgg 101  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||   |  |  ||||||||||||||||||||    
T  39242 gtaattttgactttgaagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgg 39147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 39124 - 39075
Alignment:
Q  126 ggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 175  Q
    |||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  39124 ggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 39075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 36758 - 36583
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  |||||||  ||||  ||||| | ||||||||||             
T  36758 attttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatctagaacgggattgaacct--------- 36668  T
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
     |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36667 -agaacaacctaagttggaattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttctagaactgagtgc 36583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 285 - 488
Target Start/End: Original strand, 3103 - 3309
Alignment:
Q  285 ctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttat-gcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaatt 383  Q
    |||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||  |||  ||||| | | |||||||| ||||||    
T  3103 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaatt 3202  T
Q  384 gaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatgt 480  Q
      ||||||||| ||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||     
T  3203 acatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 3301  T
Q  481 tgaggatg 488  Q
    ||| ||||    
T  3302 tgatgatg 3309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 281 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 39684 - 39497
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||  |||  |||||   | |||||||| ||    
T  39684 taatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttg 39585  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39584 acttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 39497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 281 - 466
Target Start/End: Original strand, 75128 - 75315
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||  |||  |||||   | |||||||| ||    
T  75128 taatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttg 75227  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  75228 acttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 75315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 273 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 23098 - 22890
Alignment:
Q  273 gttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 371  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||| || ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   |||||    
T  23098 gttatttataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 22999  T
Q  372 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaa 468  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  22998 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgg-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 22901  T
Q  469 tgattaagatg 479  Q
    |||||||||||    
T  22900 tgattaagatg 22890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 6 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 23365 - 23299
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  23365 gtaattttgacttttgagttgatccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 23299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 4)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Original strand, 25978 - 26179
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttat-gcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||  |||  ||||| | | ||| |||| ||    
T  25978 taatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagacgttgttg 26077  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaag 476  Q
    ||||  ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||    
T  26078 aattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 26176  T
Q  477 atg 479  Q
    |||    
T  26177 atg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 369 - 479
Target Start/End: Original strand, 44709 - 44821
Alignment:
Q  369 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtcta 465  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||    
T  44709 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 44807  T
Q  466 aaatgattaagatg 479  Q
    |  |||||||||||    
T  44808 agttgattaagatg 44821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 72
Target Start/End: Original strand, 25707 - 25769
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  25707 ttttgacttttgagttgatccttagatggttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 25769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 50
Target Start/End: Original strand, 33135 - 33176
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  33135 attttcacttttgagttgatccttagatgcttctgagtgcct 33176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 109 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 11743 - 11658
Alignment:
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11743 tagaacaaccttagttggggatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccataactgagtgc 11658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 194
Target Start/End: Original strand, 191974 - 192144
Alignment:
Q  14 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||          |||    
T  191974 gacttttgagttgaaccttagatgttttcgagtacctttagatgtgtattaaagattagagaatgacttagaacaagattgaacctg----------gaa 192063  T
Q  114 caactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
    ||||     |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  192064 caaccagtattggaattctggcttgtactcgccgtggcgagctgatgctctcgcctcgtgagcacttccagaattgagtgc 192144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 69; Significance: 9e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 119 - 195
Target Start/End: Original strand, 13240 - 13316
Alignment:
Q  119 ttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 195  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13240 ttagttgggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctctcctcgcgagcacttccagaactgagtgca 13316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 3)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 111 - 194
Target Start/End: Original strand, 5745 - 5828
Alignment:
Q  111 gaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5745 gaacaaccttagttggaattccggcttgtactcgccatggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 5828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 28034 - 27911
Alignment:
Q  285 ctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaatt 383  Q
    |||||||| ||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||  |||  |||||   | |||||||| ||| ||    
T  28034 ctgtgaagttgtttaagatttgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgactt 27935  T
Q  384 gaatttgatataattatgtcatgc 407  Q
    | ||||||||| ||||||||||||    
T  27934 gcatttgatattattatgtcatgc 27911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 29016 - 28923
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggt 102  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| || |||| || ||| ||||||   |  |  |||||||||||||||||||||    
T  29016 attttgacttttgagtagatccttagatgcttttgagttcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggt 28923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 111 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 9695 - 9613
Alignment:
Q  111 gaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9695 gaacaaccttagttgggaatctggcttgtactcaccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 9613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 284 - 479
Target Start/End: Original strand, 16516 - 16714
Alignment:
Q  284 tctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaat 382  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  ||||| | | ||||| || ||| |    
T  16516 tctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgctgttgact 16615  T
Q  383 tgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    |  ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  16616 tccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatg 16714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 101
Target Start/End: Original strand, 16240 - 16332
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctgg 101  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||   |  | |||||||||||||||||||||    
T  16240 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatttagaatgagattgaacctgg 16332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 175
Target Start/End: Original strand, 16371 - 16406
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 175  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16371 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 16406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 268 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 21132 - 20930
Alignment:
Q  268 aagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatgca 366  Q
    |||| |||| || ||| |||||||||||  |||||| ||||| || ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||  |||| ||  |    
T  21132 aagatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgctgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgtagaacatttgaatata 21033  T
Q  367 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtc 463  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| ||   ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||| ||||||    
T  21032 taagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtc 20933  T
Q  464 taa 466  Q
    |||    
T  20932 taa 20930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 21374 - 21308
Alignment:
Q  5 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagatta 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||| || ||| |||||    
T  21374 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgttttttagtgcctgaacatgtctaataatgatta 21308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 64; Significance: 9e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 273 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 6826 - 6669
Alignment:
Q  273 gttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataaga 371  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||   |||||    
T  6826 gttatttataatctgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaataatgtttgaatatttaaga 6727  T
Q  372 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgt 426  Q
    ||||| |||||||   ||||||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||||    
T  6726 tgttgttgaattgctattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgt 6669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 7078 - 7038
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7078 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcct 7038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 186
Target Start/End: Original strand, 18014 - 18180
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||  ||||||   |||| |||||| ||||||||||||||            
T  18014 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagggaatgatttagaacgagattgaacctgg-------- 18105  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaa 186  Q
      |||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18106 --aacaaccttagttaggaatctggcttgtactcgctatggcgagctgatgctctcacctcgcgagcacttccagaa 18180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Original strand, 8446 - 8643
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   ||||||| || ||    
T  8446 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttg 8545  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaaga 477  Q
    | ||| | ||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||    
T  8546 acttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgatactgcctatgttgctgtt----atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 8641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Original strand, 8174 - 8236
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  8174 attttgacttttgagttgatcctt-gatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 8236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 369 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 1151 - 1047
Alignment:
Q  369 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||||||| | | |||||||||  |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1151 agatgttgatgattcgtatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 1052  T
Q  467 aatga 471  Q
     ||||    
T  1051 gatga 1047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 6)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 281 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 26103 - 25916
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta-tgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   | |||||||| |     
T  26103 taatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgttt 26004  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  26003 acttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagcttcatgagtcggtctaa 25916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 281 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 40065 - 39865
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta-tgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatg 379  Q
    |||| ||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||   | |||||||| |     
T  40065 taatttgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgttt 39966  T
Q  380 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaaga 477  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| | |||||||  |||| ||||    
T  39965 acttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagcttcatgagttggtctaagttgatgaaga 39867  T
Q  478 tg 479  Q
    ||    
T  39866 tg 39865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 101
Target Start/End: Original strand, 39572 - 39664
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctgg 101  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||| |||||| ||||||   |  |  ||||||||||||||||||||    
T  39572 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtacctgaacatgtctattaatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgg 39664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 40336 - 40273
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  40336 attttgacttttgagttgatccgtagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 40273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 176
Target Start/End: Original strand, 59273 - 59309
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 176  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  59273 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc 59309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 137 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 40209 - 40173
Alignment:
Q  137 tgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcg 173  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  40209 tgtactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcg 40173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 369 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 8585 - 8486
Alignment:
Q  369 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| |||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8585 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 8486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 6607 - 6555
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6607 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 6555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 6 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 7019 - 6976
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  7019 gtaattttgacttttgagttgatcctttgatg-ttttgagtgcct 6976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 2351 - 2178
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||| ||||||   | || |  ||||||||||||||||||            
T  2351 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactaatgattagggaacgaatgggaatgagattgaacctgg-------- 2260  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
      |||||| |||||||| |   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  2259 --aacaaccttagttggaaagttggcttgtactcaccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaaaattgagtg 2178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 111 - 194
Target Start/End: Original strand, 6002 - 6085
Alignment:
Q  111 gaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
    |||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6002 gaacaaccgtagttggaattttggcttgtactcgctttggcgagctgatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 6085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 51
Target Start/End: Original strand, 5803 - 5844
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctt 51  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  5803 ttttgacttttgagttgaaccttggatgcctttgagtacctt 5844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 109 - 193
Target Start/End: Original strand, 4844 - 4928
Alignment:
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
    ||||||||| |||||||| |   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4844 tagaacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgagtg 4928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1048 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1048
Description:

Target: scaffold1048; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 1885 - 1798
Alignment:
Q  14 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||  |||||||||||||    
T  1885 gacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtacctttagatgtttattaaagattagaggaggatttagaacaagattgaacctgg 1798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0637
Description:

Target: scaffold0637; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 111 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 8932 - 8849
Alignment:
Q  111 gaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8932 gaacaaccttagttggaaatctggcaagtactcgccatggcgaggagatgctctcgcctcgcgagcatttccagaactgagtgc 8849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 77
Target Start/End: Original strand, 36030 - 36101
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgat 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  36030 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcttattaaagattaaatgat 36101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 5)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 366 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 28536 - 28421
Alignment:
Q  366 ataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 462  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  28536 ataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 28438  T
Q  463 ctaaaatgattaagatg 479  Q
    ||||  |||| ||||||    
T  28437 ctaagttgatgaagatg 28421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 11364 - 11312
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11364 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 11312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 2069 - 2017
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2069 atactgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 2017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 14961 - 14916
Alignment:
Q  5 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  14961 tgtaattttgactttagagttgatccttagatgctttggagtgcct 14916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 430 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 4608 - 4572
Alignment:
Q  430 tgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4608 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 4572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 10)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Original strand, 58378 - 58545
Alignment:
Q  16 cttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagcttagaaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| || ||  || ||  |||||||  |||| |||||| ||||||||||||          ||||||    
T  58378 cttttgagttgaaccttagatgtctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacct----------agaaca 58467  T
Q  116 actttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtg 193  Q
    || |||||||| |   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  58468 accttagttggaaagttggcttgtactcgccacggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttctagaattgagtg 58545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 136791 - 136684
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgt---tgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  136791 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 136694  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  136693 gattaagatg 136684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 139260 - 139153
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgt---tgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  139260 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 139163  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  139162 gattaagatg 139153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 144198 - 144091
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgt---tgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  144198 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 144101  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  144100 gattaagatg 144091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 414 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 62270 - 62222
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 462  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  62270 atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggt 62222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 134322 - 134215
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgt---tgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||   |    
T  134322 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgtt 134225  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  134224 gattaagatg 134215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 141729 - 141622
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgt---tgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||  |    
T  141729 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 141632  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  141631 gattaagatg 141622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #8
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 422 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 132722 - 132672
Alignment:
Q  422 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgat 472  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  132722 tatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgat 132672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #9
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 6 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 133136 - 133070
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  133136 gtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 133070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #10
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 133003 - 132963
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactt 180  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  133003 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtactt 132963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 15795 - 15618
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctggtttagctt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  || ||| ||||||   | || | ||||||||| |||    | || | | |    
T  15795 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactaatgattagggaacgaatgagaatgagaatga----gattgaacct 15700  T
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgag 191  Q
      |||||| |||||||| |   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15699 gaaacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgcaatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaattgag 15618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 369 - 472
Target Start/End: Original strand, 2808 - 2913
Alignment:
Q  369 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2808 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 2907  T
Q  467 aatgat 472  Q
     |||||    
T  2908 gatgat 2913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 72
Target Start/End: Original strand, 2442 - 2507
Alignment:
Q  7 taattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||| || |||| || ||| ||||||    
T  2442 taattttgacttttgggatgatccttagatgcttttgagtacctgaacatgtctaataatgattag 2507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 180
Target Start/End: Original strand, 2573 - 2613
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactt 180  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  2573 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtactt 2613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 7)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 268 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 13313 - 13141
Alignment:
Q  268 aagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgca 366  Q
    |||| |||| || ||||||||||| |||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||       
T  13313 aagatgttaattataatctgtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatt 13214  T
Q  367 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgt 436  Q
    ||||||| || ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  13213 taagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtttgt 13141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 409 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 34200 - 34143
Alignment:
Q  409 gttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  34200 gttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaa 34143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 34599 - 34537
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  34599 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 34537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 13572 - 13531
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13572 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 13531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 13457 - 13406
Alignment:
Q  124 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 175  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  13457 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 13406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 34471 - 34437
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcga 174  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34471 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcga 34437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 326 - 293
Alignment:
Q  433 ttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  326 ttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaa 293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 369 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 12687 - 12583
Alignment:
Q  369 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  12687 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaa 12588  T
Q  467 aatga 471  Q
     ||||    
T  12587 gatga 12583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Original strand, 15256 - 15319
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||    
T  15256 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaatatgtttaataatgattag 15319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 4)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 414 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 6683 - 6618
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  6683 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 6618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 414 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 14063 - 13998
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  14063 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 13998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 7096 - 7052
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7096 gtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 7052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 14476 - 14432
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14476 gtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 14432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 414 - 479
Target Start/End: Original strand, 6172 - 6237
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  6172 atactgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 6237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 371 - 462
Target Start/End: Original strand, 11447 - 11540
Alignment:
Q  371 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 462  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||   ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11447 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 11540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 72
Target Start/End: Original strand, 11170 - 11228
Alignment:
Q  14 gacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  11170 gacttttgagttgaaccttagattcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 11228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 109 - 185
Target Start/End: Original strand, 29950 - 30026
Alignment:
Q  109 tagaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 185  Q
    ||||||||| ||| ||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29950 tagaacaacattatttgggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 30026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 370 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 13057 - 12959
Alignment:
Q  370 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  13057 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa 12959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 13423 - 13379
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13423 gtaattttgacctttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 13379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 5)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 191
Target Start/End: Original strand, 16408 - 16488
Alignment:
Q  111 gaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgag 191  Q
    ||||||| |||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  16408 gaacaaccttagttggaaagttggcttgtactcgccatggcgagcagatgcactcgcctcgcaagcacttccagaattgag 16488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 101
Target Start/End: Original strand, 51525 - 51617
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctgg 101  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||  ||  |  ||| ||||||||||||||||    
T  51525 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggagagaatgtaggatgagattgaacctgg 51617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 32608 - 32556
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  32608 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 32556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 51
Target Start/End: Original strand, 16317 - 16358
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctt 51  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  16317 ttttgacttttgagttaaaccttagatgcctttgagtacctt 16358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 417 - 466
Target Start/End: Original strand, 51936 - 51984
Alignment:
Q  417 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  51936 ctgcctatgt-gctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaa 51984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 414 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 1154 - 1091
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaaga 477  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  1154 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 1091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 373 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 10884 - 10773
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  10884 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 10787  T
Q  470 gattaagatgttga 483  Q
    ||||||||||||||    
T  10786 gattaagatgttga 10773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 369 - 485
Target Start/End: Original strand, 38704 - 38822
Alignment:
Q  369 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||  |||| ||||| |||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  38704 agatattgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtctaa 38803  T
Q  467 aatgattaagatgttgagg 485  Q
      ||||||||||| |||||    
T  38804 gttgattaagatgatgagg 38822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 282 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 8682 - 8486
Alignment:
Q  282 aatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatga 380  Q
    ||||||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||| ||    ||||||| | |||||||||||||| |   ||| |||  |||||||||| |||    
T  8682 aatctgtgaagctgtttaggatgtgttgatgttgattatgatgt----taatgttatgtgcattacttgaagtacacttgaatgtttaagatgttgttga 8587  T
Q  381 attgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaaga 477  Q
     ||| | ||||||| |||||||||| |||||   ||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||| ||||    
T  8586 cttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 8488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 8955 - 8914
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8955 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcct 8914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 414 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 6884 - 6826
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgat 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  6884 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagatgat 6826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 6 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 7294 - 7228
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  7294 gtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 7228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 72
Target Start/End: Original strand, 13246 - 13312
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  13246 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 13312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 414 - 479
Target Start/End: Original strand, 1083 - 1148
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  1083 atactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 1148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 369 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 13247 - 13143
Alignment:
Q  369 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||  |||| |||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  13247 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 13148  T
Q  467 aatga 471  Q
     ||||    
T  13147 gatga 13143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 415 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 2732 - 2676
Alignment:
Q  415 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatga 471  Q
    |||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  2732 tactgcctatgttgttgcttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatga 2676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Original strand, 16149 - 16201
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16149 atactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 16201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 369 - 471
Target Start/End: Original strand, 53551 - 53655
Alignment:
Q  369 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||    
T  53551 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaa 53650  T
Q  467 aatga 471  Q
     ||||    
T  53651 gatga 53655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 50
Target Start/End: Original strand, 7935 - 7976
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7935 attttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcct 7976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 179
Target Start/End: Original strand, 8064 - 8103
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcact 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8064 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcact 8103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 369 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 116544 - 116434
Alignment:
Q  369 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  116544 agatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 116447  T
Q  467 aatgattaagatg 479  Q
      |||||||||||    
T  116446 gttgattaagatg 116434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 415 - 471
Target Start/End: Original strand, 129021 - 129076
Alignment:
Q  415 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatga 471  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  129021 tactgcctatgttgctgtttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatga 129076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 417 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 78391 - 78345
Alignment:
Q  417 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtc 463  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  78391 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 78345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 492
Target Start/End: Original strand, 12300 - 12420
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||   |||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||  |    
T  12300 gttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattctgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtctaagtt 12397  T
Q  470 gattaagatgttgaggatgatgt 492  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  12398 gattaagatgttgatgatgatgt 12420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 5715 - 5663
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  5715 atactgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcggtctaa 5663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 6076 - 6032
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  6076 gtaattttgactttttagttgatccttagatgtttttgagtgcct 6032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 410 - 466
Target Start/End: Original strand, 8119 - 8175
Alignment:
Q  410 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  8119 ttgtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaa 8175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 72
Target Start/End: Original strand, 28917 - 28984
Alignment:
Q  5 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  28917 tgtaattttgacttttgggttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 28984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Original strand, 2694 - 2746
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2694 atactgcctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 2746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 72
Target Start/End: Original strand, 2282 - 2348
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  2282 gtaattttgacttttgagttgatccttaaatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 2348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 4)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 17260 - 17168
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctgg 101  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||   |  |  ||||||||||||||||||||    
T  17260 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgg 17168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 16895 - 16788
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  16895 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 16798  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  16797 gattaagatg 16788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 180
Target Start/End: Original strand, 7541 - 7581
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactt 180  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  7541 actcgccatggcaagcagaggctctcgcctcgcgagcactt 7581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 17130 - 17095
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 175  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17130 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 17095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Original strand, 23932 - 23984
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  23932 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaa 23984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 20592 - 20529
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  20592 attttgacttctgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 20529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Original strand, 2726 - 2789
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  2726 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 2789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 13503 - 13396
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  13503 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 13406  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  13405 gattaagatg 13396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 12205 - 12114
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctgg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| || ||  |||||||  |||| |||||| ||||||||||||||    
T  12205 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagagaatgatttagaacgagattgaacctgg 12114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 10539 - 10464
Alignment:
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 185  Q
    |||||||| |||||||||    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10539 agaacaacattagttggggagttggcttgaactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 10464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 20858 - 20751
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  20858 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 20761  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  20760 gattaagatg 20751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 185
Target Start/End: Original strand, 14284 - 14359
Alignment:
Q  110 agaacaactttagttgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 185  Q
    |||||||| |||||||||    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14284 agaacaacattagttggggagttggcttgaactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccaga 14359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 72
Target Start/End: Original strand, 2082 - 2149
Alignment:
Q  5 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  2082 tgtaattttgactgttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 2149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 176
Target Start/End: Original strand, 2215 - 2251
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 176  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2215 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc 2251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 37932 - 37825
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  37932 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 37835  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  37834 gattaagatg 37825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 373 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 4805 - 4692
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  4805 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 4708  T
Q  470 gattaagatgttgagg 485  Q
    ||||| |||| |||||    
T  4707 gattaggatgatgagg 4692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 1391 - 1342
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1391 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcct 1342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 281 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 1122 - 1052
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattacttga 350  Q
    |||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  1122 taatctgtgaagatgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 1052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 413 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 25179 - 25126
Alignment:
Q  413 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  25179 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 25126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 201 - 149
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  201 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaa 149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 480 - 445
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 175  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  480 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 50
Target Start/End: Original strand, 10914 - 10954
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10914 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 10954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 413 - 484
Target Start/End: Original strand, 6332 - 6401
Alignment:
Q  413 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatgttgag 484  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||    
T  6332 tatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaagatga--aagatgttgag 6401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 420 - 484
Target Start/End: Original strand, 13793 - 13855
Alignment:
Q  420 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatgttgag 484  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||    
T  13793 cctatgttgttgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtctaagatga--aagatgttgag 13855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 3)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Original strand, 45841 - 45893
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45841 atactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 45893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 72
Target Start/End: Original strand, 45426 - 45493
Alignment:
Q  5 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  45426 tgtaatttttacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaatatgtctaataatgattag 45493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 176
Target Start/End: Original strand, 45561 - 45597
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 176  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  45561 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 45597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 10638 - 10594
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaa 53  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10638 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgccttaa 10594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 369 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 10646 - 10547
Alignment:
Q  369 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  10646 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggtctaa 10547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 101
Target Start/End: Original strand, 9346 - 9437
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctgg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||| || ||| |||||||  |||| ||||||  |||||||||||||    
T  9346 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctataggtgtctactaatgattagagaatgatttagaacaagattgaacctgg 9437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Original strand, 603 - 666
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  603 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 286 - 426
Target Start/End: Original strand, 881 - 1021
Alignment:
Q  286 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatgcataagatgttgatgaattg 384  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||| ||||| || ||| ||||||||| | |||||||||||||  ||| ||| ||   | |||| ||| ||| |||    
T  881 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtcgattacgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgattgaatatttgagattttgttgacttg 980  T
Q  385 aatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgt 426  Q
     ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  981 catt-gatattattatgccatgctgttgtatactgcctatgt 1021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 419 - 479
Target Start/End: Original strand, 4888 - 4947
Alignment:
Q  419 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||  |||| ||||||    
T  4888 gcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatg 4947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 424 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 9300 - 9242
Alignment:
Q  424 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatgttga 483  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  9300 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttga 9242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Original strand, 17649 - 17712
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  17649 attttgacttttgagttaaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 17712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 20883 - 20820
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  20883 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 20820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 20768 - 20716
Alignment:
Q  124 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 176  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  20768 tgggattctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc 20716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 14058 - 13951
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||  |    
T  14058 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagtt 13961  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  13960 gattaagatg 13951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 10390 - 10335
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttatta 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||    
T  10390 attttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctaaacatgtctatta 10335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 10261 - 10221
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactt 180  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10261 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcactt 10221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 32567 - 32500
Alignment:
Q  5 tgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  32567 tgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 32500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 32162 - 32112
Alignment:
Q  422 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgat 472  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  32162 tatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgat 32112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 32433 - 32393
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactt 180  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  32433 actcgccatggcgagcagaggctctcacctcgcgagtactt 32393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 417 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 619 - 565
Alignment:
Q  417 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatga 471  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  619 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatga 565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0810 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0810
Description:

Target: scaffold0810; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 6 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 3415 - 3349
Alignment:
Q  6 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  3415 gtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 3349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 3)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 72
Target Start/End: Original strand, 28451 - 28513
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  28451 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 28513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Original strand, 28818 - 28871
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtt-tgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  28818 atactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaa 28871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 180
Target Start/End: Original strand, 28580 - 28620
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactt 180  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  28580 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtactt 28620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 7)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 3958 - 3909
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  3958 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgactttgagtgcct 3909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 8022 - 7973
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  8022 attctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgactttgagtgcct 7973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 369 - 466
Target Start/End: Original strand, 27751 - 27850
Alignment:
Q  369 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||||| ||| ||  |||||||||  |||| |||||||||| |  ||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  27751 agatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 27850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 3846 - 3795
Alignment:
Q  124 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 175  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  3846 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgtctcgcgag 3795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 7910 - 7859
Alignment:
Q  124 tgggattctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 175  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  7910 tgggattctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgtctcgcgag 7859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 3689 - 3648
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatga 322  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  3689 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatga 3648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 7753 - 7712
Alignment:
Q  281 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatga 322  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  7753 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatga 7712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0839 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0839
Description:

Target: scaffold0839; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Original strand, 1711 - 1810
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||   |  |  |||||||||||||||||||    
T  1711 attctgtgattttgacttttgagttgatccttagatg-ttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 1809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0839; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 175
Target Start/End: Original strand, 1850 - 1883
Alignment:
Q  142 tcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 175  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1850 tcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 1883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 465
Target Start/End: Original strand, 8059 - 8161
Alignment:
Q  367 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatg--ctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggt 462  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| |||||  |||  ||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||  |||||    
T  8059 taagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcatgagctgatttgcatactgcctatgctgctatttgttatttaattaagctgcatgcgtcggt 8158  T
Q  463 cta 465  Q
    |||    
T  8159 cta 8161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 12408 - 12316
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgacttagaatgagattgaacctgg 101  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||||   |  |  ||||||||||||||||||||    
T  12408 attttgacttttgaattgatccttagatgcttttgagtgtctgaatatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgg 12316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 424 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 12024 - 11978
Alignment:
Q  424 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatga 471  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  12024 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatga 11978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 180
Target Start/End: Original strand, 24421 - 24461
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactt 180  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24421 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcactt 24461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 414 - 456
Target Start/End: Original strand, 38305 - 38347
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 456  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  38305 atactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatga 38347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 50
Target Start/End: Original strand, 24293 - 24333
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  24293 ttttgacttttgagtttaaccttagatgcccttgagtgcct 24333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 379 - 340
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcact 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  379 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcact 340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Original strand, 18599 - 18662
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  18599 attttgacttttgagatgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 18662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 386 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 4312 - 4218
Alignment:
Q  386 atttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    ||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| | ||| |||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  4312 atttgatattattatgtcatgctggttttgtatactgc-tgtgtcgctgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 4218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 414 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 11536 - 11494
Alignment:
Q  414 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 456  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  11536 atactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatga 11494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 413 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 2748 - 2690
Alignment:
Q  413 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatga 471  Q
    ||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  2748 tatactgcctatgttgctgtttgtctattgactaagctgcatgagtcggtctaagatga 2690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2044 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold2044
Description:

Target: scaffold2044; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 46
Target Start/End: Original strand, 1097 - 1134
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 46  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1097 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 1134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 6468 - 6399
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatga 79  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| || ||| || || |||||||| |||||    
T  6468 ttttgacttttgagttgaaccttagacgcctttgagtacctttaggtgtctactacagattagaggatga 6399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 9564 - 9515
Alignment:
Q  1 attctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  9564 attctgtgtttttgacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcct 9515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 9426 - 9390
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagc 176  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  9426 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 9390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 50
Target Start/End: Original strand, 12450 - 12491
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  12450 attttgacttttgagatgaaccttagatgcctttgagtgcct 12491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 179
Target Start/End: Original strand, 12579 - 12618
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcact 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  12579 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcaagcact 12618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 50
Target Start/End: Original strand, 9475 - 9516
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 50  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9475 atttcgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcct 9516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 179
Target Start/End: Original strand, 9604 - 9643
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcact 179  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9604 actcgtcatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcact 9643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 415 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 97076 - 97020
Alignment:
Q  415 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatga 471  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  97076 tactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaagatga 97020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 415 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 106354 - 106298
Alignment:
Q  415 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatga 471  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  106354 tactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaagatga 106298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 424 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 164 - 110
Alignment:
Q  424 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaatgattaagatg 479  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||    
T  164 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatg 110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 384 - 321
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattag 72  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||    
T  384 attttgacttttgagttgatccttatatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattag 321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 466
Target Start/End: Original strand, 18050 - 18128
Alignment:
Q  390 gatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||  ||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  18050 gatattattatatcatgatgttgtgcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaa 18128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 10624 - 10585
Alignment:
Q  9 attttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgc 48  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10624 attttgacctttgagttgatccttagatgcttttgagtgc 10585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 37044 - 36994
Alignment:
Q  135 cttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccaga 185  Q
    |||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  37044 cttgtactcgccttggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccaga 36994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 12169 - 12068
Alignment:
Q  373 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaaaat 469  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||  |    
T  12169 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttagtatactgc-tgtgttgctgttt-------aactaagctgcatgagtcggtctaagtt 12078  T
Q  470 gattaagatg 479  Q
    ||||||||||    
T  12077 gattaagatg 12068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 181
Target Start/End: Original strand, 24741 - 24790
Alignment:
Q  132 tggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttc 181  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||| |||||||    
T  24741 tggcttgtactcgccatggtgagtaggtactctcgcctcgcgggcacttc 24790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 413 - 466
Target Start/End: Original strand, 103679 - 103732
Alignment:
Q  413 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtctaa 466  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| | |||||||||    
T  103679 tatactacctatgttgctgtttatttattaactaagctgcattagtcggtctaa 103732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 2)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 46
Target Start/End: Original strand, 1943 - 1979
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 46  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  1943 ttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagt 1979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 180
Target Start/End: Original strand, 2072 - 2112
Alignment:
Q  140 actcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcactt 180  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  2072 actcgccatggcaagcagaggctctcgcctcgcgagtactt 2112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 138 - 194
Target Start/End: Original strand, 3648 - 3704
Alignment:
Q  138 gtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgagcacttccagaactgagtgc 194  Q
    ||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  3648 gtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacatccagaattgagtgc 3704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0451 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0451
Description:

Target: scaffold0451; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 38
Target Start/End: Original strand, 11454 - 11482
Alignment:
Q  10 ttttgacttttgagttgaaccttagatgc 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11454 ttttgacttttgagttgaaccttagatgc 11482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 369 - 479
Target Start/End: Original strand, 161136 - 161248
Alignment:
Q  369 agatgttgat-gaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgattcggtct 464  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||  ||||   ||||||||| | ||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  161136 agatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcattatgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gatatttaactaagctgcatgagtcggtct 161233  T
Q  465 aaaatgattaagatg 479  Q
    ||  || ||||||||    
T  161234 aagttggttaagatg 161248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University