View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF20737_low_1 (Length: 528)

Name: NF20737_low_1
Description: NF20737
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF20737_low_1
NF20737_low_1
[»] chr5 (170 HSPs)
chr5 (25-454)||(23880886-23881314)
chr5 (25-475)||(6499058-6499505)
chr5 (25-453)||(21099595-21100022)
chr5 (25-453)||(642598-643020)
chr5 (25-426)||(89339-89740)
chr5 (25-474)||(21072110-21072555)
chr5 (25-475)||(23412843-23413293)
chr5 (29-475)||(9398612-9399047)
chr5 (25-472)||(21198877-21199320)
chr5 (25-492)||(26784172-26784642)
chr5 (25-344)||(12352795-12353113)
chr5 (25-426)||(7745610-7746011)
chr5 (25-426)||(21910375-21910776)
chr5 (28-469)||(6512306-6512744)
chr5 (25-414)||(25096753-25097145)
chr5 (25-414)||(25154723-25155115)
chr5 (39-453)||(19536192-19536605)
chr5 (43-453)||(17814804-17815213)
chr5 (25-475)||(20550713-20551162)
chr5 (25-489)||(33022486-33022946)
chr5 (90-489)||(41566287-41566688)
chr5 (26-408)||(13545455-13545829)
chr5 (40-476)||(4886854-4887291)
chr5 (25-483)||(31117696-31118152)
chr5 (25-294)||(29138456-29138724)
chr5 (25-295)||(28464388-28464656)
chr5 (25-528)||(15516788-15517290)
chr5 (25-270)||(9088788-9089032)
chr5 (28-270)||(30115911-30116152)
chr5 (40-270)||(30742813-30743043)
chr5 (25-184)||(41566689-41566848)
chr5 (25-249)||(28139426-28139649)
chr5 (25-295)||(3245490-3245759)
chr5 (40-291)||(11993720-11993972)
chr5 (40-294)||(26765330-26765585)
chr5 (25-295)||(10848592-10848861)
chr5 (40-268)||(23391679-23391909)
chr5 (25-294)||(25930206-25930473)
chr5 (48-249)||(26758989-26759191)
chr5 (25-194)||(21203796-21203963)
chr5 (25-270)||(14086613-14086856)
chr5 (25-149)||(25740942-25741065)
chr5 (40-249)||(21660044-21660254)
chr5 (40-270)||(33933100-33933330)
chr5 (18-270)||(42243493-42243743)
chr5 (63-240)||(35986336-35986513)
chr5 (63-291)||(35932059-35932288)
chr5 (62-247)||(25111975-25112161)
chr5 (62-247)||(25171066-25171252)
chr5 (63-270)||(11208060-11208267)
chr5 (79-270)||(32160638-32160829)
chr5 (25-166)||(13736310-13736451)
chr5 (63-240)||(23478224-23478402)
chr5 (25-103)||(22000298-22000375)
chr5 (25-97)||(31488067-31488138)
chr5 (89-240)||(20215220-20215371)
chr5 (126-240)||(21414223-21414336)
chr5 (79-240)||(1915290-1915450)
chr5 (79-240)||(40032870-40033030)
chr5 (79-239)||(13404989-13405148)
chr5 (77-240)||(20417024-20417186)
chr5 (119-240)||(32753963-32754083)
chr5 (79-240)||(40228532-40228692)
chr5 (77-240)||(106241-106403)
chr5 (25-163)||(16607332-16607469)
chr5 (442-528)||(7745480-7745566)
chr5 (393-493)||(5430069-5430170)
chr5 (77-240)||(13523060-13523222)
chr5 (77-240)||(13533787-13533949)
chr5 (77-240)||(20624887-20625049)
chr5 (442-492)||(28464201-28464251)
chr5 (137-240)||(17446731-17446833)
chr5 (137-240)||(34062743-34062845)
chr5 (77-240)||(36095773-36095935)
chr5 (77-240)||(36097230-36097392)
chr5 (442-492)||(23391466-23391516)
chr5 (448-493)||(30743251-30743296)
chr5 (398-489)||(14086392-14086484)
chr5 (444-492)||(19536138-19536186)
chr5 (442-528)||(10848999-10849086)
chr5 (137-240)||(17457347-17457449)
chr5 (77-239)||(20168188-20168349)
chr5 (442-492)||(21660454-21660504)
chr5 (443-493)||(25930031-25930081)
chr5 (446-528)||(26759418-26759500)
chr5 (443-492)||(35931866-35931915)
chr5 (25-150)||(39799071-39799194)
chr5 (63-150)||(23488370-23488458)
chr5 (442-486)||(29138251-29138295)
chr5 (443-487)||(35986083-35986127)
chr5 (188-240)||(37406771-37406823)
chr5 (442-492)||(21910776-21910827)
chr5 (446-493)||(42243935-42243982)
chr5 (442-492)||(89289-89339)
chr5 (447-492)||(17815222-17815268)
chr5 (442-523)||(20797528-20797610)
chr5 (170-240)||(21703197-21703266)
chr5 (170-240)||(21706044-21706113)
chr5 (442-476)||(25096661-25096695)
chr5 (442-476)||(25154631-25154665)
chr5 (170-240)||(30069975-30070044)
chr5 (442-475)||(21099558-21099591)
chr5 (442-523)||(30070268-30070349)
chr5 (442-523)||(31418478-31418559)
chr5 (480-528)||(89270-89318)
chr5 (393-492)||(3245294-3245394)
chr5 (442-522)||(14447364-14447444)
chr5 (442-522)||(14457976-14458056)
chr5 (442-526)||(21703458-21703542)
chr5 (445-489)||(28139825-28139869)
chr5 (442-518)||(33933536-33933612)
chr5 (442-522)||(33952165-33952245)
chr5 (442-477)||(10754373-10754408)
chr5 (86-149)||(13692307-13692370)
chr5 (442-524)||(17447058-17447141)
chr5 (442-524)||(17457674-17457757)
chr5 (393-475)||(30115745-30115828)
chr5 (444-523)||(31448369-31448448)
chr5 (137-240)||(34052082-34052184)
chr5 (442-489)||(39362181-39362228)
chr5 (170-240)||(8521964-8522032)
chr5 (170-240)||(10754616-10754684)
chr5 (170-240)||(19464094-19464163)
chr5 (170-240)||(19478124-19478193)
chr5 (170-240)||(20797818-20797887)
chr5 (442-492)||(23478605-23478655)
chr5 (442-492)||(24926485-24926535)
chr5 (442-492)||(24983783-24983833)
chr5 (170-240)||(43043740-43043809)
chr5 (170-240)||(43621929-43621997)
chr5 (442-523)||(1109491-1109572)
chr5 (188-240)||(5290661-5290714)
chr5 (188-240)||(5301237-5301290)
chr5 (442-475)||(5301481-5301514)
chr5 (442-475)||(7032474-7032507)
chr5 (442-523)||(8521675-8521756)
chr5 (443-472)||(9089180-9089209)
chr5 (442-522)||(20551649-20551730)
chr5 (188-240)||(22559559-22559612)
chr5 (442-475)||(27203691-27203724)
chr5 (188-240)||(27622852-27622905)
chr5 (188-240)||(31418784-31418837)
chr5 (188-240)||(31448675-31448728)
chr5 (442-475)||(34771793-34771826)
chr5 (442-475)||(34782738-34782771)
chr5 (442-475)||(39352369-39352402)
chr5 (442-475)||(40390238-40390271)
chr5 (442-475)||(40400900-40400933)
chr5 (442-475)||(42394862-42394895)
chr5 (188-240)||(1109232-1109283)
chr5 (188-240)||(1121990-1122041)
chr5 (492-528)||(6499504-6499540)
chr5 (442-522)||(17606916-17606996)
chr5 (442-522)||(17617530-17617610)
chr5 (442-522)||(17718735-17718815)
chr5 (442-522)||(17729387-17729467)
chr5 (442-474)||(21517592-21517624)
chr5 (442-474)||(21519925-21519957)
chr5 (442-526)||(21706322-21706406)
chr5 (188-240)||(23392839-23392890)
chr5 (188-240)||(24926226-24926277)
chr5 (188-240)||(24983507-24983558)
chr5 (442-522)||(31348390-31348470)
chr5 (442-522)||(31359004-31359084)
chr5 (442-474)||(34051842-34051874)
chr5 (442-474)||(34062503-34062535)
chr5 (188-240)||(34782979-34783030)
chr5 (442-522)||(36687515-36687595)
chr5 (442-522)||(36698081-36698161)
chr5 (442-522)||(37778692-37778772)
[»] chr2 (151 HSPs)
chr2 (25-453)||(22454845-22455271)
chr2 (25-476)||(23595404-23595849)
chr2 (25-453)||(10009606-10010034)
chr2 (25-475)||(39037474-39037925)
chr2 (39-475)||(24376932-24377369)
chr2 (28-439)||(25189218-25189629)
chr2 (26-474)||(19540234-19540680)
chr2 (25-475)||(13963811-13964261)
chr2 (25-449)||(21537107-21537533)
chr2 (43-453)||(22187957-22188367)
chr2 (25-476)||(23184147-23184586)
chr2 (25-453)||(9015226-9015651)
chr2 (25-473)||(41121557-41122001)
chr2 (25-453)||(20568605-20569033)
chr2 (25-453)||(24850520-24850949)
chr2 (47-453)||(23234846-23235252)
chr2 (25-453)||(24575852-24576279)
chr2 (28-492)||(25828953-25829403)
chr2 (25-528)||(22317410-22317930)
chr2 (28-453)||(25037114-25037540)
chr2 (25-344)||(40782294-40782612)
chr2 (28-418)||(30666808-30667199)
chr2 (25-489)||(6573942-6574409)
chr2 (25-453)||(38781215-38781642)
chr2 (43-423)||(30621051-30621431)
chr2 (43-423)||(30623672-30624052)
chr2 (77-492)||(28140436-28140851)
chr2 (25-239)||(22258018-22258231)
chr2 (25-489)||(28711517-28711982)
chr2 (25-528)||(31800668-31801170)
chr2 (72-489)||(20151854-20152263)
chr2 (25-426)||(19114901-19115300)
chr2 (25-412)||(26618998-26619382)
chr2 (25-295)||(28550932-28551201)
chr2 (188-472)||(18376741-18377027)
chr2 (30-453)||(22271955-22272375)
chr2 (40-492)||(31967870-31968313)
chr2 (25-488)||(6392451-6392914)
chr2 (25-475)||(44880986-44881431)
chr2 (25-295)||(34321950-34322219)
chr2 (63-528)||(44840287-44840741)
chr2 (25-250)||(33074043-33074267)
chr2 (25-295)||(1587047-1587315)
chr2 (25-295)||(22776302-22776571)
chr2 (25-295)||(22781680-22781949)
chr2 (167-453)||(25041221-25041508)
chr2 (25-270)||(22802278-22802521)
chr2 (25-270)||(30557360-30557603)
chr2 (40-291)||(31327984-31328235)
chr2 (40-291)||(31334705-31334956)
chr2 (25-295)||(40331904-40332173)
chr2 (25-295)||(22785669-22785937)
chr2 (40-270)||(35744039-35744270)
chr2 (63-295)||(14581365-14581601)
chr2 (154-390)||(24779288-24779525)
chr2 (25-414)||(18430835-18431221)
chr2 (63-240)||(1083867-1084045)
chr2 (63-247)||(24814645-24814830)
chr2 (79-291)||(23392686-23392898)
chr2 (90-294)||(28701244-28701448)
chr2 (25-427)||(18702557-18702956)
chr2 (79-240)||(22755337-22755497)
chr2 (77-240)||(20646628-20646790)
chr2 (28-123)||(17963452-17963546)
chr2 (442-528)||(38631184-38631272)
chr2 (77-240)||(22774404-22774566)
chr2 (29-124)||(24779195-24779289)
chr2 (119-240)||(19498012-19498132)
chr2 (77-240)||(19313038-19313200)
chr2 (117-240)||(22779822-22779944)
chr2 (77-240)||(24275071-24275233)
chr2 (126-240)||(27978404-27978517)
chr2 (126-240)||(28064933-28065046)
chr2 (442-518)||(33074474-33074550)
chr2 (445-501)||(45086960-45087016)
chr2 (129-240)||(967524-967634)
chr2 (77-240)||(17969230-17969392)
chr2 (77-240)||(22763700-22763862)
chr2 (137-240)||(38586109-38586211)
chr2 (393-492)||(28550745-28550845)
chr2 (443-523)||(34321692-34321772)
chr2 (393-492)||(40332261-40332361)
chr2 (77-240)||(19300031-19300193)
chr2 (368-501)||(1586850-1586982)
chr2 (25-150)||(21845966-21846088)
chr2 (353-453)||(7609107-7609205)
chr2 (443-492)||(14581685-14581734)
chr2 (235-426)||(22260432-22260624)
chr2 (442-486)||(22802706-22802750)
chr2 (442-528)||(22776095-22776182)
chr2 (442-528)||(22781473-22781560)
chr2 (442-492)||(40782718-40782769)
chr2 (442-492)||(22785467-22785517)
chr2 (442-492)||(23235256-23235306)
chr2 (25-150)||(24157658-24157780)
chr2 (442-488)||(30557110-30557156)
chr2 (442-492)||(30667238-30667288)
chr2 (396-492)||(23392479-23392574)
chr2 (444-528)||(28700994-28701078)
chr2 (480-528)||(30667259-30667307)
chr2 (188-240)||(36784826-36784878)
chr2 (442-492)||(22260653-22260704)
chr2 (137-240)||(26867176-26867278)
chr2 (137-240)||(26879765-26879867)
chr2 (216-294)||(3277037-3277115)
chr2 (443-477)||(30621437-30621471)
chr2 (443-477)||(30624058-30624092)
chr2 (442-475)||(10009569-10009602)
chr2 (442-475)||(22187920-22187953)
chr2 (480-528)||(40782739-40782788)
chr2 (25-143)||(20567952-20568069)
chr2 (188-240)||(28374536-28374588)
chr2 (442-522)||(35253416-35253496)
chr2 (442-522)||(35264025-35264105)
chr2 (442-477)||(24576298-24576333)
chr2 (442-493)||(35743803-35743854)
chr2 (442-476)||(9015188-9015222)
chr2 (170-240)||(18768928-18768996)
chr2 (442-524)||(24414754-24414836)
chr2 (170-240)||(24415044-24415112)
chr2 (442-524)||(26867504-26867586)
chr2 (170-240)||(28721338-28721406)
chr2 (442-475)||(4210306-4210339)
chr2 (442-475)||(9897354-9897387)
chr2 (442-475)||(9907942-9907975)
chr2 (85-150)||(10896596-10896661)
chr2 (188-240)||(16769097-16769150)
chr2 (442-475)||(17857217-17857250)
chr2 (442-522)||(18392351-18392432)
chr2 (442-475)||(20070661-20070694)
chr2 (442-475)||(20236809-20236842)
chr2 (442-475)||(24327514-24327547)
chr2 (25-120)||(24844021-24844114)
chr2 (188-240)||(29244376-29244429)
chr2 (188-240)||(29254955-29255008)
chr2 (442-475)||(36251641-36251674)
chr2 (442-471)||(38781646-38781675)
chr2 (442-475)||(40222748-40222781)
chr2 (442-475)||(40251609-40251642)
chr2 (442-475)||(43083063-43083096)
chr2 (442-475)||(43093672-43093705)
chr2 (188-240)||(2561645-2561696)
chr2 (480-528)||(9015153-9015201)
chr2 (188-240)||(21172488-21172539)
chr2 (480-528)||(23235277-23235325)
chr2 (444-524)||(24425266-24425346)
chr2 (188-240)||(24425573-24425624)
chr2 (480-528)||(24850448-24850495)
chr2 (442-474)||(26880093-26880125)
chr2 (18-58)||(28140852-28140892)
chr2 (442-474)||(28374278-28374310)
[»] chr4 (168 HSPs)
chr4 (25-453)||(40845910-40846344)
chr4 (25-427)||(23750339-23750739)
chr4 (25-426)||(55380107-55380508)
chr4 (18-453)||(6641494-6641926)
chr4 (28-492)||(29680371-29680836)
chr4 (25-454)||(16632257-16632684)
chr4 (25-418)||(19620962-19621355)
chr4 (25-390)||(37985541-37985906)
chr4 (25-426)||(3395406-3395808)
chr4 (25-453)||(12811044-12811469)
chr4 (26-439)||(45833212-45833625)
chr4 (25-439)||(22675402-22675815)
chr4 (25-493)||(10072751-10073222)
chr4 (28-426)||(14904249-14904648)
chr4 (25-453)||(14604774-14605198)
chr4 (25-489)||(19884519-19884984)
chr4 (25-426)||(37435428-37435830)
chr4 (25-523)||(412818-413316)
chr4 (25-493)||(56034389-56034858)
chr4 (28-403)||(19666191-19666567)
chr4 (25-439)||(19911760-19912174)
chr4 (18-423)||(17247053-17247456)
chr4 (18-210)||(12600567-12600759)
chr4 (25-427)||(41114663-41115062)
chr4 (72-484)||(10692714-10693126)
chr4 (72-484)||(10906480-10906892)
chr4 (25-423)||(13576012-13576409)
chr4 (18-270)||(6517295-6517546)
chr4 (40-295)||(17398699-17398955)
chr4 (123-390)||(9140826-9141094)
chr4 (18-270)||(8105448-8105698)
chr4 (25-294)||(29121186-29121455)
chr4 (40-270)||(3105469-3105700)
chr4 (25-343)||(54679745-54680064)
chr4 (25-405)||(11915518-11915896)
chr4 (40-268)||(20977289-20977516)
chr4 (32-439)||(3483554-3483952)
chr4 (57-217)||(23123367-23123527)
chr4 (42-270)||(38513710-38513939)
chr4 (40-267)||(39419787-39420015)
chr4 (40-270)||(56533112-56533342)
chr4 (265-453)||(15139283-15139473)
chr4 (25-291)||(16853320-16853585)
chr4 (63-291)||(40860520-40860749)
chr4 (40-231)||(17700854-17701046)
chr4 (63-270)||(22190699-22190907)
chr4 (25-208)||(44397668-44397850)
chr4 (25-236)||(16848364-16848574)
chr4 (40-291)||(15475172-15475424)
chr4 (18-414)||(17540209-17540598)
chr4 (25-268)||(16939833-16940075)
chr4 (40-270)||(9751590-9751821)
chr4 (25-201)||(55731662-55731837)
chr4 (25-249)||(14154065-14154289)
chr4 (65-268)||(27188690-27188895)
chr4 (27-411)||(17787962-17788335)
chr4 (25-136)||(15014571-15014681)
chr4 (26-252)||(8685511-8685734)
chr4 (63-270)||(1672241-1672450)
chr4 (63-270)||(1674716-1674925)
chr4 (40-268)||(3499704-3499933)
chr4 (207-390)||(12601099-12601283)
chr4 (63-240)||(33378264-33378442)
chr4 (25-270)||(25651154-25651391)
chr4 (77-240)||(18007089-18007251)
chr4 (79-240)||(36210138-36210299)
chr4 (79-239)||(14778473-14778632)
chr4 (77-240)||(55651413-55651575)
chr4 (79-239)||(17993824-17993982)
chr4 (77-240)||(11535934-11536096)
chr4 (341-452)||(22089721-22089831)
chr4 (25-359)||(11901007-11901337)
chr4 (79-239)||(14710809-14710968)
chr4 (353-449)||(23123576-23123672)
chr4 (77-240)||(10300623-10300785)
chr4 (77-240)||(11515124-11515286)
chr4 (77-240)||(49001987-49002149)
chr4 (442-528)||(3395857-3395943)
chr4 (131-240)||(31266806-31266914)
chr4 (442-528)||(14571257-14571344)
chr4 (137-240)||(16317478-16317581)
chr4 (126-240)||(5873507-5873620)
chr4 (25-150)||(10661336-10661460)
chr4 (25-150)||(10875481-10875605)
chr4 (126-240)||(24713569-24713681)
chr4 (442-495)||(3486351-3486404)
chr4 (400-492)||(9751376-9751470)
chr4 (137-240)||(19581389-19581491)
chr4 (442-528)||(8105902-8105988)
chr4 (262-492)||(14833449-14833691)
chr4 (77-239)||(18774686-18774847)
chr4 (442-492)||(20977662-20977712)
chr4 (443-492)||(40860907-40860956)
chr4 (137-240)||(16305254-16305357)
chr4 (77-240)||(16819382-16819544)
chr4 (77-240)||(23509206-23509368)
chr4 (443-489)||(13575960-13576006)
chr4 (442-492)||(14604720-14604770)
chr4 (442-492)||(15474979-15475029)
chr4 (442-492)||(17700624-17700674)
chr4 (442-492)||(22191071-22191121)
chr4 (443-489)||(54680147-54680193)
chr4 (77-198)||(19242115-19242235)
chr4 (25-86)||(36470636-36470696)
chr4 (443-492)||(38514105-38514154)
chr4 (443-492)||(39419572-39419621)
chr4 (442-490)||(19620907-19620955)
chr4 (480-528)||(29680352-29680400)
chr4 (442-489)||(3105268-3105315)
chr4 (442-528)||(3499439-3499526)
chr4 (442-524)||(8182593-8182676)
chr4 (446-492)||(9141114-9141161)
chr4 (25-150)||(13890647-13890769)
chr4 (442-524)||(18077623-18077706)
chr4 (170-240)||(4987455-4987524)
chr4 (170-240)||(10909590-10909659)
chr4 (442-492)||(14904148-14904198)
chr4 (25-150)||(18773874-18773996)
chr4 (25-150)||(19889166-19889288)
chr4 (442-492)||(27188494-27188544)
chr4 (442-492)||(37435334-37435384)
chr4 (442-528)||(55732026-55732112)
chr4 (393-493)||(6517668-6517769)
chr4 (332-475)||(17398529-17398671)
chr4 (442-475)||(55380508-55380541)
chr4 (480-528)||(14604701-14604749)
chr4 (480-528)||(16632708-16632756)
chr4 (442-522)||(24640726-24640806)
chr4 (442-522)||(27657079-27657159)
chr4 (442-522)||(27667652-27667732)
chr4 (480-528)||(37435315-37435363)
chr4 (188-240)||(47152088-47152140)
chr4 (442-522)||(55744938-55745018)
chr4 (442-522)||(55755549-55755629)
chr4 (169-240)||(3370896-3370966)
chr4 (137-240)||(15207422-15207523)
chr4 (442-477)||(18752254-18752289)
chr4 (442-477)||(18762864-18762899)
chr4 (445-476)||(40846351-40846382)
chr4 (442-488)||(45833643-45833690)
chr4 (170-240)||(5022918-5022986)
chr4 (442-524)||(14835805-14835887)
chr4 (170-240)||(14836112-14836180)
chr4 (443-501)||(17247492-17247550)
chr4 (170-240)||(18077914-18077983)
chr4 (442-524)||(19581717-19581799)
chr4 (170-240)||(40454357-40454425)
chr4 (170-240)||(40470596-40470664)
chr4 (426-475)||(48371572-48371624)
chr4 (442-475)||(4948795-4948828)
chr4 (444-477)||(5023191-5023224)
chr4 (25-149)||(14357304-14357425)
chr4 (442-475)||(16256329-16256362)
chr4 (442-475)||(16266922-16266955)
chr4 (442-523)||(17198141-17198222)
chr4 (410-458)||(17540629-17540675)
chr4 (442-475)||(19944077-19944110)
chr4 (442-475)||(19954729-19954762)
chr4 (442-475)||(20648401-20648434)
chr4 (442-475)||(24027852-24027885)
chr4 (188-240)||(27814953-27815006)
chr4 (442-523)||(47151798-47151879)
chr4 (188-240)||(48371330-48371383)
chr4 (442-475)||(52704248-52704281)
chr4 (188-240)||(3390654-3390706)
chr4 (480-528)||(6641951-6641998)
chr4 (188-240)||(10695838-10695890)
chr4 (480-528)||(19620886-19620934)
[»] chr7 (195 HSPs)
chr7 (25-474)||(13018397-13018844)
chr7 (26-476)||(39284452-39284902)
chr7 (25-476)||(41842163-41842612)
chr7 (26-474)||(44466883-44467334)
chr7 (25-453)||(10883084-10883512)
chr7 (26-426)||(13302631-13303030)
chr7 (25-453)||(16316470-16316896)
chr7 (25-439)||(11792726-11793140)
chr7 (63-475)||(21695258-21695671)
chr7 (25-453)||(11319224-11319652)
chr7 (25-489)||(33691586-33692051)
chr7 (43-492)||(2913478-2913929)
chr7 (43-426)||(13137833-13138216)
chr7 (25-475)||(29935250-29935685)
chr7 (25-423)||(21692107-21692504)
chr7 (25-401)||(5000784-5001164)
chr7 (28-475)||(13730566-13731011)
chr7 (25-426)||(21283311-21283712)
chr7 (25-476)||(30025724-30026176)
chr7 (43-453)||(13879941-13880351)
chr7 (25-422)||(12366690-12367087)
chr7 (25-453)||(28408858-28409285)
chr7 (25-492)||(2499856-2500326)
chr7 (25-464)||(28622257-28622696)
chr7 (25-528)||(9069381-9069900)
chr7 (27-501)||(331465-331943)
chr7 (25-453)||(13260536-13260954)
chr7 (25-294)||(16309978-16310246)
chr7 (25-426)||(24787961-24788361)
chr7 (25-478)||(16111771-16112224)
chr7 (25-489)||(30945249-30945696)
chr7 (28-423)||(23279900-23280295)
chr7 (25-426)||(15467736-15468136)
chr7 (25-418)||(30944271-30944663)
chr7 (25-484)||(48236783-48237244)
chr7 (25-294)||(4821293-4821561)
chr7 (39-439)||(19236969-19237364)
chr7 (25-258)||(4494396-4494628)
chr7 (25-423)||(9709745-9710142)
chr7 (25-294)||(14426366-14426634)
chr7 (25-197)||(16314708-16314879)
chr7 (40-270)||(35952783-35953013)
chr7 (21-237)||(13683410-13683625)
chr7 (25-520)||(33605504-33605999)
chr7 (42-221)||(13033986-13034164)
chr7 (25-295)||(1292849-1293118)
chr7 (25-270)||(12174436-12174679)
chr7 (203-475)||(15088516-15088790)
chr7 (63-295)||(48062890-48063123)
chr7 (163-492)||(13648685-13649000)
chr7 (25-270)||(2265614-2265857)
chr7 (224-391)||(13032045-13032213)
chr7 (40-270)||(19711108-19711339)
chr7 (40-248)||(8182762-8182971)
chr7 (179-414)||(13893949-13894183)
chr7 (63-267)||(27871572-27871778)
chr7 (25-174)||(15088368-15088516)
chr7 (40-267)||(24794813-24795041)
chr7 (40-270)||(48805974-48806205)
chr7 (25-207)||(13472667-13472847)
chr7 (25-291)||(14425266-14425531)
chr7 (25-239)||(15704616-15704828)
chr7 (25-192)||(2266495-2266662)
chr7 (196-454)||(22577933-22578190)
chr7 (65-291)||(19339324-19339551)
chr7 (55-240)||(32264843-32265029)
chr7 (113-294)||(14193020-14193201)
chr7 (63-239)||(21381555-21381731)
chr7 (25-194)||(9098406-9098573)
chr7 (25-194)||(9099212-9099379)
chr7 (25-117)||(22579465-22579556)
chr7 (79-248)||(4412079-4412249)
chr7 (25-120)||(14187510-14187604)
chr7 (92-208)||(16545840-16545956)
chr7 (92-208)||(16619706-16619822)
chr7 (228-426)||(13692372-13692562)
chr7 (227-393)||(13880608-13880775)
chr7 (79-240)||(8999016-8999175)
chr7 (77-240)||(18441251-18441413)
chr7 (77-240)||(26209631-26209793)
chr7 (25-180)||(16556774-16556928)
chr7 (25-180)||(16608734-16608888)
chr7 (79-270)||(602636-602828)
chr7 (77-240)||(15216372-15216534)
chr7 (77-240)||(18419170-18419332)
chr7 (77-240)||(29590048-29590210)
chr7 (126-240)||(3476423-3476536)
chr7 (126-240)||(13682425-13682538)
chr7 (79-240)||(11087126-11087286)
chr7 (335-418)||(4494634-4494718)
chr7 (442-528)||(7339721-7339807)
chr7 (442-523)||(4821723-4821804)
chr7 (137-240)||(8933635-8933737)
chr7 (137-240)||(30049633-30049736)
chr7 (442-528)||(48805693-48805780)
chr7 (442-492)||(1293199-1293249)
chr7 (442-492)||(8183179-8183229)
chr7 (443-528)||(2265371-2265456)
chr7 (119-240)||(12734249-12734369)
chr7 (79-240)||(13174687-13174848)
chr7 (480-528)||(13137762-13137810)
chr7 (444-492)||(32264599-32264647)
chr7 (25-150)||(7488119-7488243)
chr7 (442-489)||(14426765-14426812)
chr7 (394-492)||(19339132-19339231)
chr7 (137-240)||(38593818-38593920)
chr7 (480-526)||(5000695-5000741)
chr7 (442-492)||(5826199-5826249)
chr7 (443-489)||(9709693-9709739)
chr7 (170-240)||(14745752-14745821)
chr7 (25-150)||(13172567-13172693)
chr7 (442-487)||(35952550-35952595)
chr7 (483-528)||(48800479-48800524)
chr7 (188-240)||(6044294-6044346)
chr7 (480-528)||(13880376-13880424)
chr7 (394-493)||(21381309-21381409)
chr7 (188-240)||(40054837-40054889)
chr7 (442-492)||(13692591-13692642)
chr7 (442-488)||(14193325-14193372)
chr7 (442-489)||(15468167-15468214)
chr7 (77-240)||(24882503-24882665)
chr7 (372-418)||(9098205-9098251)
chr7 (450-492)||(11319664-11319706)
chr7 (108-150)||(18056469-18056511)
chr7 (442-492)||(22577880-22577930)
chr7 (442-476)||(28409289-28409323)
chr7 (170-240)||(31116594-31116663)
chr7 (412-523)||(589621-589736)
chr7 (443-488)||(12174202-12174247)
chr7 (442-475)||(13880842-13880875)
chr7 (442-475)||(24788361-24788394)
chr7 (443-492)||(24794615-24794664)
chr7 (442-474)||(4494725-4494757)
chr7 (480-528)||(10883011-10883059)
chr7 (452-492)||(13137781-13137821)
chr7 (442-478)||(14425672-14425708)
chr7 (188-240)||(19985896-19985948)
chr7 (441-489)||(30944216-30944264)
chr7 (445-492)||(12366607-12366654)
chr7 (77-200)||(38403331-38403453)
chr7 (170-240)||(1367778-1367846)
chr7 (442-492)||(5000712-5000762)
chr7 (170-240)||(9159878-9159946)
chr7 (170-240)||(9171134-9171202)
chr7 (442-492)||(10883030-10883080)
chr7 (442-476)||(13260498-13260532)
chr7 (396-475)||(13303045-13303122)
chr7 (170-240)||(15888412-15888480)
chr7 (188-240)||(541249-541302)
chr7 (442-475)||(4212436-4212469)
chr7 (442-475)||(4223035-4223068)
chr7 (85-150)||(5035261-5035326)
chr7 (188-240)||(5685683-5685736)
chr7 (442-475)||(5685927-5685960)
chr7 (442-475)||(6867067-6867100)
chr7 (442-475)||(6877699-6877732)
chr7 (442-475)||(9098118-9098151)
chr7 (442-522)||(9160154-9160235)
chr7 (442-522)||(9170609-9170690)
chr7 (442-522)||(9171410-9171491)
chr7 (188-240)||(9433428-9433481)
chr7 (442-475)||(9433689-9433722)
chr7 (188-240)||(9444024-9444077)
chr7 (442-475)||(9444285-9444318)
chr7 (442-475)||(14745511-14745544)
chr7 (442-475)||(16316433-16316466)
chr7 (444-489)||(16542896-16542941)
chr7 (444-489)||(16622721-16622766)
chr7 (442-475)||(19236886-19236919)
chr7 (188-240)||(20989817-20989870)
chr7 (442-475)||(20990078-20990111)
chr7 (442-475)||(21002850-21002883)
chr7 (188-240)||(21003091-21003144)
chr7 (442-475)||(23264433-23264466)
chr7 (442-475)||(24930445-24930478)
chr7 (442-475)||(27871945-27871978)
chr7 (495-528)||(30026178-30026211)
chr7 (442-475)||(37344625-37344658)
chr7 (442-523)||(44280921-44281002)
chr7 (442-475)||(48062704-48062737)
chr7 (188-240)||(589378-589429)
chr7 (442-522)||(1987984-1988064)
chr7 (442-522)||(1998605-1998685)
chr7 (188-240)||(3165900-3165951)
chr7 (442-502)||(8001879-8001939)
chr7 (442-502)||(8012524-8012584)
chr7 (480-528)||(9098083-9098130)
chr7 (480-528)||(11319677-11319725)
chr7 (480-528)||(12366588-12366636)
chr7 (480-528)||(13880863-13880910)
chr7 (188-240)||(21770026-21770077)
chr7 (442-522)||(42866271-42866351)
chr7 (442-522)||(42876897-42876977)
chr7 (188-240)||(44280662-44280713)
chr7 (442-522)||(45922213-45922293)
[»] chr8 (166 HSPs)
chr8 (25-475)||(18321045-18321495)
chr8 (25-489)||(18120981-18121442)
chr8 (25-477)||(12757646-12758099)
chr8 (25-453)||(19707322-19707746)
chr8 (28-405)||(43644714-43645090)
chr8 (25-491)||(18679629-18680095)
chr8 (26-528)||(21932699-21933217)
chr8 (25-453)||(17701555-17701988)
chr8 (25-451)||(16207120-16207547)
chr8 (28-492)||(17441677-17442141)
chr8 (25-426)||(18718815-18719217)
chr8 (25-453)||(19943050-19943480)
chr8 (25-426)||(16681238-16681639)
chr8 (25-453)||(16188798-16189225)
chr8 (43-453)||(39693369-39693778)
chr8 (25-426)||(17267289-17267689)
chr8 (25-453)||(20382304-20382730)
chr8 (28-453)||(24646155-24646581)
chr8 (43-450)||(17525641-17526047)
chr8 (28-453)||(29693132-29693558)
chr8 (25-423)||(30421368-30421766)
chr8 (25-426)||(33082679-33083073)
chr8 (66-489)||(23185099-23185523)
chr8 (25-270)||(25163885-25164129)
chr8 (154-492)||(19156139-19156479)
chr8 (25-453)||(23263521-23263948)
chr8 (25-294)||(17797236-17797505)
chr8 (25-489)||(45538312-45538775)
chr8 (159-474)||(602606-602923)
chr8 (25-410)||(18685348-18685732)
chr8 (25-410)||(18730942-18731326)
chr8 (28-423)||(15336028-15336421)
chr8 (28-423)||(15425093-15425486)
chr8 (28-423)||(15516397-15516790)
chr8 (25-270)||(22673593-22673837)
chr8 (25-294)||(40845455-40845723)
chr8 (18-294)||(14989519-14989793)
chr8 (27-270)||(9320386-9320627)
chr8 (25-475)||(19956222-19956674)
chr8 (25-198)||(20255675-20255847)
chr8 (25-294)||(24551089-24551357)
chr8 (25-488)||(24832930-24833392)
chr8 (63-343)||(1237488-1237769)
chr8 (25-270)||(6407541-6407785)
chr8 (126-453)||(17914374-17914702)
chr8 (25-295)||(43639597-43639867)
chr8 (40-270)||(22662944-22663175)
chr8 (25-270)||(36105011-36105254)
chr8 (63-291)||(13430699-13430928)
chr8 (25-294)||(18151714-18151982)
chr8 (40-223)||(33560354-33560538)
chr8 (25-412)||(22461588-22461973)
chr8 (63-223)||(45292686-45292847)
chr8 (62-247)||(21540802-21540988)
chr8 (79-270)||(45567993-45568184)
chr8 (79-270)||(21288270-21288462)
chr8 (210-410)||(18722597-18722798)
chr8 (79-240)||(28903328-28903488)
chr8 (63-240)||(1745008-1745188)
chr8 (25-156)||(26832852-26832982)
chr8 (63-240)||(40003080-40003258)
chr8 (40-144)||(43773948-43774052)
chr8 (77-240)||(23271241-23271404)
chr8 (25-103)||(19156057-19156134)
chr8 (77-240)||(3843604-3843766)
chr8 (77-240)||(7018418-7018580)
chr8 (77-240)||(20259654-20259816)
chr8 (77-240)||(21046284-21046446)
chr8 (79-240)||(17519180-17519341)
chr8 (79-239)||(8031902-8032062)
chr8 (332-453)||(22745608-22745730)
chr8 (442-501)||(6407947-6408006)
chr8 (117-240)||(29379484-29379607)
chr8 (40-143)||(21298843-21298944)
chr8 (442-528)||(40845207-40845293)
chr8 (393-493)||(18151534-18151635)
chr8 (117-238)||(19461070-19461190)
chr8 (117-238)||(19558748-19558868)
chr8 (442-518)||(36105456-36105532)
chr8 (442-493)||(14989329-14989380)
chr8 (442-492)||(13430506-13430556)
chr8 (169-291)||(21300980-21301102)
chr8 (442-528)||(22663377-22663463)
chr8 (442-528)||(22674024-22674110)
chr8 (442-492)||(43640020-43640070)
chr8 (77-202)||(22135933-22136057)
chr8 (443-488)||(24551536-24551581)
chr8 (442-518)||(21288625-21288703)
chr8 (77-240)||(22211425-22211587)
chr8 (442-488)||(3598205-3598251)
chr8 (442-492)||(20382250-20382300)
chr8 (442-492)||(43774115-43774165)
chr8 (442-491)||(1745382-1745431)
chr8 (442-518)||(15335887-15335963)
chr8 (442-518)||(15424952-15425028)
chr8 (442-518)||(15516256-15516332)
chr8 (480-528)||(17701995-17702042)
chr8 (480-528)||(20382231-20382279)
chr8 (449-528)||(1237905-1237984)
chr8 (442-492)||(16681158-16681209)
chr8 (427-489)||(17797652-17797715)
chr8 (169-240)||(18153908-18153978)
chr8 (137-240)||(18158396-18158498)
chr8 (170-240)||(1750268-1750337)
chr8 (170-240)||(6318553-6318622)
chr8 (442-492)||(23263467-23263517)
chr8 (442-524)||(23269639-23269721)
chr8 (442-476)||(29693562-29693596)
chr8 (443-501)||(30421304-30421362)
chr8 (442-523)||(18158707-18158788)
chr8 (448-489)||(20255425-20255466)
chr8 (77-202)||(22167098-22167222)
chr8 (442-522)||(13596276-13596356)
chr8 (442-522)||(13688297-13688377)
chr8 (480-528)||(17267739-17267787)
chr8 (480-528)||(17441658-17441706)
chr8 (480-528)||(17914727-17914775)
chr8 (443-491)||(33560119-33560167)
chr8 (480-528)||(39693803-39693851)
chr8 (445-492)||(39693785-39693832)
chr8 (137-240)||(40213207-40213309)
chr8 (443-493)||(9320817-9320867)
chr8 (442-524)||(16747469-16747551)
chr8 (442-476)||(18154205-18154239)
chr8 (170-240)||(18769174-18769243)
chr8 (170-240)||(19225109-19225177)
chr8 (442-492)||(21301244-21301294)
chr8 (170-240)||(23457341-23457409)
chr8 (442-476)||(23469237-23469271)
chr8 (170-240)||(23469497-23469566)
chr8 (170-240)||(30314733-30314801)
chr8 (170-240)||(30325289-30325357)
chr8 (170-240)||(31215190-31215259)
chr8 (443-492)||(2811070-2811119)
chr8 (188-240)||(3220823-3220876)
chr8 (442-475)||(6151523-6151556)
chr8 (442-475)||(6161477-6161510)
chr8 (442-475)||(6318330-6318363)
chr8 (442-475)||(6576351-6576384)
chr8 (442-475)||(9856267-9856300)
chr8 (442-475)||(15780505-15780538)
chr8 (442-475)||(15791094-15791127)
chr8 (455-528)||(16189242-16189315)
chr8 (442-475)||(18449822-18449855)
chr8 (442-523)||(18768868-18768949)
chr8 (188-240)||(19128939-19128992)
chr8 (442-475)||(19129182-19129215)
chr8 (188-240)||(19139471-19139524)
chr8 (442-475)||(19139732-19139765)
chr8 (442-475)||(19225385-19225418)
chr8 (188-240)||(19429119-19429172)
chr8 (442-523)||(20160977-20161058)
chr8 (442-523)||(20196409-20196490)
chr8 (442-475)||(26111684-26111717)
chr8 (442-475)||(26121362-26121395)
chr8 (442-475)||(31215483-31215516)
chr8 (442-475)||(43248769-43248802)
chr8 (188-240)||(16747193-16747244)
chr8 (188-240)||(19418544-19418595)
chr8 (480-528)||(19943505-19943552)
chr8 (188-240)||(20161266-20161317)
chr8 (188-240)||(20196150-20196201)
chr8 (442-474)||(24646585-24646617)
chr8 (442-523)||(28903709-28903792)
chr8 (442-522)||(44481538-44481618)
chr8 (442-522)||(44492154-44492234)
[»] chr6 (165 HSPs)
chr6 (18-528)||(19085974-19086474)
chr6 (25-453)||(23284387-23284815)
chr6 (25-528)||(32544088-32544592)
chr6 (25-492)||(15302023-15302476)
chr6 (25-492)||(19623802-19624267)
chr6 (25-405)||(15987056-15987437)
chr6 (19-487)||(9717660-9718143)
chr6 (25-475)||(20112574-20113026)
chr6 (28-453)||(13601998-13602423)
chr6 (30-492)||(24116656-24117133)
chr6 (28-523)||(26972040-26972549)
chr6 (25-453)||(15531522-15531950)
chr6 (25-489)||(29917840-29918303)
chr6 (28-528)||(18435382-18435898)
chr6 (26-418)||(14100373-14100763)
chr6 (28-492)||(12715279-12715744)
chr6 (25-453)||(19470490-19470918)
chr6 (25-489)||(20730567-20731030)
chr6 (25-453)||(21624924-21625349)
chr6 (25-489)||(22801963-22802427)
chr6 (25-290)||(25593891-25594155)
chr6 (25-294)||(21234946-21235216)
chr6 (28-383)||(18378138-18378495)
chr6 (26-489)||(16265013-16265475)
chr6 (40-294)||(20487976-20488231)
chr6 (47-362)||(26943422-26943735)
chr6 (25-489)||(15954529-15954989)
chr6 (27-270)||(16335951-16336194)
chr6 (25-294)||(21618066-21618335)
chr6 (25-270)||(22076489-22076733)
chr6 (25-270)||(33352008-33352252)
chr6 (40-268)||(17316609-17316838)
chr6 (159-406)||(10640364-10640611)
chr6 (40-270)||(17381358-17381588)
chr6 (63-270)||(12423120-12423328)
chr6 (40-268)||(19482588-19482817)
chr6 (25-270)||(19833115-19833358)
chr6 (163-453)||(13435492-13435783)
chr6 (25-418)||(19688602-19688980)
chr6 (63-291)||(19066079-19066308)
chr6 (113-528)||(16877123-16877538)
chr6 (79-240)||(20635595-20635756)
chr6 (40-240)||(26589435-26589636)
chr6 (63-240)||(17608419-17608596)
chr6 (25-187)||(16915247-16915407)
chr6 (25-250)||(14051483-14051704)
chr6 (25-250)||(14070164-14070385)
chr6 (63-240)||(22386661-22386839)
chr6 (79-240)||(7586270-7586429)
chr6 (130-295)||(12348920-12349085)
chr6 (79-240)||(21128103-21128263)
chr6 (77-240)||(18826252-18826414)
chr6 (126-240)||(18834648-18834761)
chr6 (117-239)||(25675221-25675342)
chr6 (117-239)||(25735573-25735694)
chr6 (117-240)||(25686763-25686885)
chr6 (126-240)||(4292795-4292908)
chr6 (126-240)||(17745796-17745909)
chr6 (119-240)||(17741716-17741836)
chr6 (393-492)||(19065887-19065987)
chr6 (137-240)||(5845164-5845266)
chr6 (77-240)||(25518710-25518872)
chr6 (40-120)||(16876740-16876821)
chr6 (25-142)||(19625631-19625747)
chr6 (442-528)||(19832826-19832912)
chr6 (117-239)||(25679297-25679418)
chr6 (96-240)||(11235538-11235681)
chr6 (393-492)||(17608183-17608283)
chr6 (442-523)||(20635962-20636045)
chr6 (233-488)||(34451532-34451787)
chr6 (77-240)||(11205966-11206128)
chr6 (137-240)||(18925776-18925879)
chr6 (77-240)||(19289394-19289556)
chr6 (25-150)||(25930298-25930421)
chr6 (77-240)||(29765555-29765717)
chr6 (18-150)||(7811828-7811959)
chr6 (442-528)||(12423460-12423546)
chr6 (442-528)||(16336392-16336478)
chr6 (442-528)||(17381668-17381754)
chr6 (353-489)||(21235264-21235399)
chr6 (332-453)||(25597608-25597730)
chr6 (119-240)||(9933685-9933805)
chr6 (443-492)||(12349200-12349249)
chr6 (25-150)||(18172236-18172359)
chr6 (119-240)||(18555332-18555452)
chr6 (131-240)||(22308864-22308972)
chr6 (159-239)||(25722973-25723052)
chr6 (137-240)||(8653740-8653842)
chr6 (77-240)||(18498640-18498802)
chr6 (445-528)||(20487726-20487809)
chr6 (25-150)||(10704743-10704863)
chr6 (442-492)||(19483008-19483058)
chr6 (188-240)||(7751249-7751301)
chr6 (188-240)||(16123551-16123603)
chr6 (188-240)||(31572544-31572596)
chr6 (77-240)||(12953144-12953306)
chr6 (137-240)||(13913129-13913231)
chr6 (62-156)||(23296582-23296676)
chr6 (442-489)||(26589862-26589909)
chr6 (442-489)||(33351792-33351839)
chr6 (442-488)||(139232-139278)
chr6 (442-488)||(147253-147299)
chr6 (170-240)||(6158320-6158389)
chr6 (170-240)||(12827806-12827875)
chr6 (442-476)||(13435787-13435821)
chr6 (442-492)||(22387041-22387091)
chr6 (442-476)||(26943817-26943851)
chr6 (126-240)||(27166457-27166570)
chr6 (442-475)||(10640297-10640330)
chr6 (442-475)||(13602427-13602460)
chr6 (442-523)||(25986488-25986569)
chr6 (119-240)||(31931485-31931605)
chr6 (442-522)||(12716541-12716621)
chr6 (442-522)||(12727190-12727270)
chr6 (480-528)||(13435808-13435856)
chr6 (442-493)||(19470922-19470972)
chr6 (442-477)||(26044585-26044620)
chr6 (79-150)||(30451738-30451809)
chr6 (442-524)||(5845490-5845572)
chr6 (170-240)||(11147263-11147332)
chr6 (170-240)||(17042735-17042804)
chr6 (442-524)||(18925468-18925550)
chr6 (85-143)||(19875714-19875772)
chr6 (170-240)||(20029918-20029986)
chr6 (170-240)||(20062669-20062737)
chr6 (442-492)||(21128466-21128516)
chr6 (170-240)||(25787815-25787883)
chr6 (442-523)||(25788091-25788173)
chr6 (442-476)||(25800741-25800775)
chr6 (170-240)||(25986195-25986264)
chr6 (190-240)||(27384565-27384615)
chr6 (190-240)||(27474978-27475028)
chr6 (190-240)||(27504477-27504527)
chr6 (170-240)||(28251579-28251647)
chr6 (170-240)||(28356726-28356794)
chr6 (442-475)||(9112267-9112300)
chr6 (188-240)||(9112508-9112561)
chr6 (442-475)||(9122904-9122937)
chr6 (188-240)||(9123145-9123198)
chr6 (442-475)||(12855412-12855445)
chr6 (442-475)||(12865938-12865971)
chr6 (442-503)||(14051211-14051267)
chr6 (442-503)||(14069892-14069948)
chr6 (443-476)||(15987467-15987500)
chr6 (442-475)||(18726645-18726678)
chr6 (480-528)||(21625373-21625422)
chr6 (85-150)||(23006251-23006316)
chr6 (86-151)||(23231069-23231134)
chr6 (85-150)||(23782050-23782115)
chr6 (442-475)||(25597734-25597767)
chr6 (396-476)||(31572770-31572853)
chr6 (442-475)||(32961701-32961734)
chr6 (442-475)||(32972320-32972353)
chr6 (442-475)||(33199718-33199751)
chr6 (442-522)||(4631260-4631340)
chr6 (188-240)||(7375772-7375823)
chr6 (442-474)||(7751008-7751040)
chr6 (442-474)||(14100334-14100366)
chr6 (85-149)||(17445862-17445926)
chr6 (443-475)||(18378526-18378558)
chr6 (25-73)||(19951850-19951897)
chr6 (442-474)||(27384824-27384856)
chr6 (442-474)||(27475237-27475269)
chr6 (442-474)||(27504736-27504768)
chr6 (442-474)||(28251337-28251369)
[»] chr1 (158 HSPs)
chr1 (25-493)||(26701919-26702387)
chr1 (25-453)||(33256183-33256609)
chr1 (25-453)||(33276355-33276781)
chr1 (25-475)||(21028616-21029066)
chr1 (39-475)||(28492211-28492648)
chr1 (43-475)||(1577707-1578137)
chr1 (25-528)||(22153679-22154197)
chr1 (25-426)||(12284245-12284646)
chr1 (28-453)||(48704028-48704452)
chr1 (27-518)||(1900169-1900646)
chr1 (25-474)||(10757245-10757692)
chr1 (25-418)||(22201601-22201994)
chr1 (28-528)||(20954211-20954729)
chr1 (25-528)||(38282389-38282906)
chr1 (25-451)||(22600014-22600440)
chr1 (25-383)||(21191766-21192123)
chr1 (28-453)||(19717348-19717772)
chr1 (28-489)||(32785731-32786193)
chr1 (25-501)||(2834511-2834986)
chr1 (25-475)||(17024774-17025220)
chr1 (25-492)||(16235087-16235554)
chr1 (25-376)||(22464716-22465067)
chr1 (25-492)||(30892915-30893366)
chr1 (25-423)||(22427219-22427616)
chr1 (29-488)||(36134015-36134474)
chr1 (25-383)||(2266911-2267269)
chr1 (25-453)||(2268353-2268777)
chr1 (25-388)||(29215618-29215982)
chr1 (25-489)||(35039989-35040451)
chr1 (63-453)||(23036359-23036750)
chr1 (27-492)||(7309643-7310108)
chr1 (79-453)||(35401683-35402057)
chr1 (63-483)||(39200793-39201211)
chr1 (18-270)||(21702629-21702880)
chr1 (40-294)||(25448556-25448811)
chr1 (40-270)||(30572032-30572263)
chr1 (40-268)||(19215447-19215676)
chr1 (25-295)||(46088811-46089080)
chr1 (40-270)||(2327454-2327685)
chr1 (25-177)||(12624663-12624813)
chr1 (40-268)||(23024623-23024852)
chr1 (25-295)||(48570220-48570489)
chr1 (181-399)||(12613700-12613917)
chr1 (28-270)||(14263465-14263708)
chr1 (63-291)||(21135153-21135382)
chr1 (63-291)||(42284486-42284715)
chr1 (65-294)||(10250846-10251076)
chr1 (64-291)||(21121057-21121285)
chr1 (63-247)||(17370900-17371085)
chr1 (63-291)||(21984453-21984683)
chr1 (63-248)||(34255552-34255739)
chr1 (25-358)||(18896523-18896853)
chr1 (79-240)||(19170378-19170539)
chr1 (63-240)||(22655335-22655513)
chr1 (77-240)||(675445-675607)
chr1 (63-240)||(22642753-22642931)
chr1 (77-240)||(14388172-14388334)
chr1 (77-240)||(41132661-41132823)
chr1 (77-239)||(28474101-28474262)
chr1 (79-240)||(5929580-5929739)
chr1 (79-240)||(19037882-19038043)
chr1 (40-152)||(37640845-37640957)
chr1 (79-239)||(52350731-52350889)
chr1 (77-240)||(18311018-18311180)
chr1 (77-240)||(44200886-44201047)
chr1 (396-492)||(12284648-12284743)
chr1 (117-194)||(17400889-17400966)
chr1 (63-239)||(21543887-21544064)
chr1 (79-240)||(22019211-22019372)
chr1 (26-140)||(44823906-44824019)
chr1 (79-238)||(20251651-20251808)
chr1 (126-240)||(11195113-11195226)
chr1 (79-240)||(28379871-28380031)
chr1 (399-528)||(37642433-37642565)
chr1 (394-492)||(19215790-19215887)
chr1 (162-270)||(21204937-21205044)
chr1 (171-270)||(37642215-37642314)
chr1 (137-240)||(39587027-39587130)
chr1 (159-270)||(44821559-44821670)
chr1 (442-528)||(44821301-44821387)
chr1 (77-239)||(45070700-45070861)
chr1 (85-270)||(7745104-7745289)
chr1 (25-143)||(20909231-20909346)
chr1 (25-149)||(18130146-18130268)
chr1 (137-240)||(18381950-18382052)
chr1 (77-240)||(46180925-46181087)
chr1 (137-240)||(47195319-47195422)
chr1 (126-240)||(20195739-20195852)
chr1 (442-492)||(21703066-21703116)
chr1 (442-528)||(25448290-25448376)
chr1 (393-489)||(21120867-21120964)
chr1 (393-523)||(21544201-21544335)
chr1 (137-240)||(9050534-9050636)
chr1 (442-493)||(21204706-21204757)
chr1 (394-492)||(42284807-42284906)
chr1 (442-488)||(2327205-2327251)
chr1 (442-528)||(10251229-10251315)
chr1 (28-156)||(17018405-17018531)
chr1 (65-150)||(18614762-18614847)
chr1 (442-492)||(19170125-19170175)
chr1 (442-492)||(23024998-23025048)
chr1 (63-219)||(24028751-24028908)
chr1 (443-528)||(29216021-29216106)
chr1 (445-518)||(48569983-48570056)
chr1 (188-240)||(12946824-12946876)
chr1 (188-240)||(35013031-35013083)
chr1 (442-488)||(2268781-2268828)
chr1 (137-240)||(17957298-17957400)
chr1 (480-527)||(30893337-30893384)
chr1 (190-240)||(23064935-23064985)
chr1 (442-492)||(34255305-34255355)
chr1 (442-475)||(12613588-12613621)
chr1 (442-475)||(46089233-46089266)
chr1 (442-522)||(5833605-5833685)
chr1 (442-522)||(5844190-5844270)
chr1 (480-528)||(12284714-12284762)
chr1 (480-528)||(12613553-12613600)
chr1 (188-240)||(20441363-20441415)
chr1 (88-240)||(26548301-26548453)
chr1 (444-476)||(30572421-30572453)
chr1 (442-522)||(35400904-35400984)
chr1 (442-522)||(35404131-35404211)
chr1 (442-522)||(35648430-35648510)
chr1 (442-522)||(47607671-47607751)
chr1 (442-522)||(47618279-47618359)
chr1 (25-148)||(18517298-18517419)
chr1 (442-489)||(21134963-21135010)
chr1 (442-493)||(21191655-21191705)
chr1 (442-488)||(22599961-22600008)
chr1 (442-488)||(23036308-23036355)
chr1 (170-240)||(4250611-4250679)
chr1 (170-240)||(7689505-7689573)
chr1 (442-476)||(18381707-18381741)
chr1 (128-202)||(20798989-20799062)
chr1 (443-492)||(22201557-22201607)
chr1 (25-150)||(23054190-23054312)
chr1 (170-240)||(39194140-39194208)
chr1 (445-475)||(48704474-48704504)
chr1 (442-523)||(147971-148052)
chr1 (442-523)||(154046-154127)
chr1 (442-475)||(4167628-4167661)
chr1 (442-475)||(4178267-4178300)
chr1 (442-475)||(4250370-4250403)
chr1 (442-475)||(5639515-5639548)
chr1 (442-475)||(5650072-5650105)
chr1 (442-523)||(5974133-5974214)
chr1 (188-240)||(19179067-19179120)
chr1 (442-475)||(19179329-19179362)
chr1 (188-240)||(19187946-19187999)
chr1 (442-475)||(19188189-19188222)
chr1 (188-240)||(23580372-23580425)
chr1 (442-475)||(33084931-33084964)
chr1 (442-475)||(35013291-35013324)
chr1 (169-240)||(4178005-4178076)
chr1 (442-523)||(17371295-17371378)
chr1 (442-474)||(20441123-20441155)
chr1 (442-522)||(21895571-21895651)
chr1 (442-501)||(22464575-22464635)
[»] scaffold0324 (2 HSPs)
scaffold0324 (25-434)||(9778-10188)
scaffold0324 (446-476)||(10213-10243)
[»] chr3 (219 HSPs)
chr3 (25-454)||(49642670-49643099)
chr3 (29-453)||(30000501-30000925)
chr3 (25-489)||(2561010-2561475)
chr3 (25-453)||(20645975-20646405)
chr3 (28-453)||(29951347-29951772)
chr3 (25-453)||(31303208-31303636)
chr3 (29-492)||(14392861-14393337)
chr3 (25-477)||(12962971-12963422)
chr3 (25-451)||(13948158-13948584)
chr3 (25-439)||(16658541-16658956)
chr3 (25-492)||(37467155-37467606)
chr3 (25-489)||(28581928-28582408)
chr3 (28-371)||(13780575-13780918)
chr3 (25-439)||(38177566-38177980)
chr3 (25-414)||(12388821-12389209)
chr3 (25-426)||(17238858-17239259)
chr3 (25-414)||(19249361-19249749)
chr3 (25-528)||(47207527-47208033)
chr3 (43-453)||(6090572-6090982)
chr3 (25-528)||(49553325-49553826)
chr3 (25-453)||(52920230-52920655)
chr3 (25-294)||(22804092-22804359)
chr3 (26-423)||(47405362-47405757)
chr3 (85-423)||(16032406-16032743)
chr3 (25-472)||(12726121-12726567)
chr3 (25-465)||(19888842-19889280)
chr3 (18-423)||(20724903-20725306)
chr3 (25-383)||(40799695-40800054)
chr3 (28-453)||(15903022-15903449)
chr3 (50-383)||(41494847-41495179)
chr3 (28-423)||(20627372-20627766)
chr3 (25-270)||(25398348-25398592)
chr3 (25-432)||(18121552-18121949)
chr3 (25-418)||(18142696-18143081)
chr3 (25-439)||(46349769-46350180)
chr3 (63-489)||(11223422-11223848)
chr3 (25-270)||(11868090-11868335)
chr3 (28-215)||(17668230-17668417)
chr3 (33-294)||(29855237-29855499)
chr3 (25-291)||(21640689-21640954)
chr3 (25-270)||(2784887-2785130)
chr3 (25-270)||(33583052-33583295)
chr3 (25-294)||(14955250-14955517)
chr3 (25-390)||(13823900-13824256)
chr3 (25-249)||(49666519-49666742)
chr3 (40-249)||(1728129-1728339)
chr3 (28-291)||(21605726-21605988)
chr3 (40-343)||(24775554-24775857)
chr3 (25-518)||(46796222-46796704)
chr3 (40-290)||(22140599-22140850)
chr3 (25-249)||(5213399-5213622)
chr3 (25-270)||(30054310-30054554)
chr3 (57-268)||(9700131-9700343)
chr3 (40-294)||(53056796-53057052)
chr3 (25-426)||(12968130-12968528)
chr3 (18-426)||(26417616-26418019)
chr3 (25-185)||(16812035-16812194)
chr3 (40-223)||(50300068-50300251)
chr3 (25-213)||(3238515-3238703)
chr3 (63-291)||(21636742-21636971)
chr3 (18-383)||(23538146-23538508)
chr3 (218-476)||(14969341-14969601)
chr3 (79-240)||(12752743-12752904)
chr3 (79-240)||(45861695-45861856)
chr3 (63-247)||(51340869-51341054)
chr3 (28-169)||(14969192-14969332)
chr3 (63-223)||(40850835-40850996)
chr3 (79-240)||(15833281-15833440)
chr3 (79-270)||(11909117-11909310)
chr3 (79-247)||(10529222-10529389)
chr3 (79-234)||(15850884-15851039)
chr3 (63-249)||(37412463-37412650)
chr3 (63-223)||(49990119-49990280)
chr3 (77-240)||(16076999-16077161)
chr3 (126-240)||(27883502-27883615)
chr3 (63-238)||(22151104-22151280)
chr3 (25-150)||(6253242-6253365)
chr3 (117-239)||(41045657-41045778)
chr3 (79-240)||(51989146-51989307)
chr3 (77-240)||(1053779-1053941)
chr3 (77-240)||(1064208-1064370)
chr3 (77-240)||(2246437-2246599)
chr3 (117-240)||(31113989-31114111)
chr3 (63-240)||(13148124-13148302)
chr3 (77-240)||(29933561-29933724)
chr3 (77-240)||(29982715-29982878)
chr3 (137-240)||(15216343-15216445)
chr3 (399-500)||(11869262-11869364)
chr3 (442-492)||(40851197-40851247)
chr3 (442-492)||(49666271-49666321)
chr3 (159-240)||(17021982-17022063)
chr3 (393-523)||(15833576-15833710)
chr3 (137-240)||(4404402-4404504)
chr3 (137-240)||(4457045-4457147)
chr3 (137-240)||(8995959-8996061)
chr3 (137-240)||(9006511-9006613)
chr3 (137-240)||(28169211-28169313)
chr3 (137-240)||(38314828-38314931)
chr3 (126-240)||(8740130-8740243)
chr3 (77-240)||(13199245-13199409)
chr3 (126-240)||(17281436-17281549)
chr3 (442-492)||(30054097-30054147)
chr3 (443-500)||(46349692-46349749)
chr3 (137-240)||(1794485-1794589)
chr3 (25-150)||(12396889-12397015)
chr3 (442-523)||(13977956-13978039)
chr3 (442-523)||(15851173-15851256)
chr3 (137-237)||(18851698-18851797)
chr3 (137-240)||(12567273-12567375)
chr3 (137-240)||(13261676-13261778)
chr3 (442-493)||(14955695-14955746)
chr3 (442-489)||(21636538-21636585)
chr3 (445-488)||(33583502-33583545)
chr3 (445-488)||(33598122-33598165)
chr3 (443-493)||(1727880-1727930)
chr3 (442-492)||(13824286-13824336)
chr3 (442-492)||(21605519-21605569)
chr3 (442-492)||(37412860-37412910)
chr3 (442-488)||(50300455-50300501)
chr3 (442-492)||(52920659-52920709)
chr3 (442-491)||(10529567-10529616)
chr3 (159-240)||(14321685-14321765)
chr3 (427-472)||(19249288-19249333)
chr3 (119-240)||(21736222-21736342)
chr3 (444-489)||(53056586-53056631)
chr3 (137-240)||(1784073-1784177)
chr3 (117-237)||(29906186-29906305)
chr3 (117-237)||(29947351-29947470)
chr3 (117-237)||(29996505-29996624)
chr3 (448-492)||(31303649-31303693)
chr3 (480-528)||(31303664-31303712)
chr3 (480-528)||(41495249-41495297)
chr3 (480-528)||(52920680-52920728)
chr3 (188-239)||(9380660-9380711)
chr3 (170-237)||(16391620-16391686)
chr3 (25-150)||(16882110-16882233)
chr3 (442-489)||(18142641-18142688)
chr3 (442-528)||(2785333-2785419)
chr3 (170-240)||(6490352-6490421)
chr3 (170-240)||(6501006-6501075)
chr3 (442-476)||(9380400-9380434)
chr3 (442-492)||(9699935-9699985)
chr3 (170-240)||(11216724-11216793)
chr3 (442-476)||(12388729-12388763)
chr3 (25-150)||(14077564-14077686)
chr3 (442-492)||(15903453-15903503)
chr3 (126-240)||(16666130-16666243)
chr3 (442-492)||(20646409-20646459)
chr3 (442-492)||(21641119-21641169)
chr3 (170-240)||(23635873-23635942)
chr3 (442-523)||(23636150-23636232)
chr3 (353-453)||(25398184-25398282)
chr3 (443-528)||(29855664-29855749)
chr3 (480-528)||(6091007-6091055)
chr3 (442-522)||(8775116-8775196)
chr3 (442-522)||(8785701-8785781)
chr3 (188-240)||(10626944-10626996)
chr3 (188-240)||(10655266-10655318)
chr3 (480-528)||(15903474-15903522)
chr3 (480-528)||(37467577-37467625)
chr3 (442-522)||(39383150-39383230)
chr3 (442-477)||(6490108-6490143)
chr3 (442-477)||(6500762-6500797)
chr3 (188-239)||(9391206-9391257)
chr3 (190-240)||(13557756-13557807)
chr3 (442-493)||(16199666-16199716)
chr3 (442-489)||(18121479-18121526)
chr3 (170-240)||(933791-933859)
chr3 (442-476)||(4404729-4404763)
chr3 (442-492)||(6090986-6091036)
chr3 (170-240)||(7794610-7794678)
chr3 (442-476)||(9390963-9390997)
chr3 (170-240)||(9993896-9993964)
chr3 (442-524)||(11216434-11216516)
chr3 (170-240)||(12249443-12249511)
chr3 (442-492)||(13948590-13948640)
chr3 (442-492)||(17238809-17238858)
chr3 (170-240)||(19887357-19887425)
chr3 (170-240)||(24706557-24706626)
chr3 (442-492)||(41495228-41495278)
chr3 (170-240)||(48337405-48337473)
chr3 (442-475)||(4174517-4174550)
chr3 (188-240)||(4174759-4174812)
chr3 (442-475)||(6220463-6220496)
chr3 (442-475)||(11167930-11167963)
chr3 (442-475)||(13558015-13558048)
chr3 (442-475)||(16391359-16391392)
chr3 (442-475)||(16476719-16476752)
chr3 (442-475)||(16493478-16493511)
chr3 (442-491)||(17909748-17909797)
chr3 (442-475)||(18851453-18851486)
chr3 (442-475)||(19778826-19778859)
chr3 (25-124)||(20418055-20418151)
chr3 (442-475)||(20672957-20672990)
chr3 (442-475)||(20683542-20683575)
chr3 (442-475)||(23648189-23648222)
chr3 (442-475)||(23757739-23757772)
chr3 (442-475)||(25398147-25398180)
chr3 (25-150)||(27374586-27374709)
chr3 (442-523)||(29460927-29461008)
chr3 (442-523)||(29471779-29471860)
chr3 (442-475)||(37866886-37866919)
chr3 (442-475)||(37886002-37886035)
chr3 (188-240)||(39672885-39672938)
chr3 (443-476)||(40800098-40800131)
chr3 (442-474)||(1783816-1783848)
chr3 (188-240)||(9981888-9981939)
chr3 (422-489)||(10099487-10099557)
chr3 (188-240)||(11164009-11164061)
chr3 (444-476)||(12237382-12237414)
chr3 (188-240)||(12237617-12237668)
chr3 (444-476)||(12249208-12249240)
chr3 (480-528)||(16199648-16199695)
chr3 (188-240)||(17910005-17910056)
chr3 (480-528)||(19249249-19249297)
chr3 (42-142)||(22766744-22766842)
chr3 (442-478)||(24775387-24775423)
chr3 (188-240)||(29461216-29461267)
chr3 (188-240)||(29472068-29472119)
[»] scaffold0047 (4 HSPs)
scaffold0047 (25-464)||(9727-10162)
scaffold0047 (262-492)||(30283-30525)
scaffold0047 (442-524)||(32639-32721)
scaffold0047 (170-240)||(32946-33014)
[»] scaffold0084 (5 HSPs)
scaffold0084 (18-493)||(32301-32778)
scaffold0084 (25-492)||(49155-49623)
scaffold0084 (77-240)||(56824-56986)
scaffold0084 (79-221)||(464-606)
scaffold0084 (195-270)||(389-464)
[»] scaffold0004 (7 HSPs)
scaffold0004 (25-453)||(220061-220488)
scaffold0004 (42-453)||(377419-377830)
scaffold0004 (26-427)||(244172-244568)
scaffold0004 (25-270)||(211223-211465)
scaffold0004 (442-493)||(211650-211701)
scaffold0004 (442-474)||(377383-377415)
scaffold0004 (442-493)||(220492-220542)
[»] scaffold0364 (1 HSPs)
scaffold0364 (25-493)||(5831-6295)
[»] scaffold0026 (4 HSPs)
scaffold0026 (25-426)||(59839-60240)
scaffold0026 (25-492)||(7749-8201)
scaffold0026 (278-474)||(151714-151906)
scaffold0026 (442-487)||(115774-115819)
[»] scaffold0337 (2 HSPs)
scaffold0337 (25-426)||(14471-14872)
scaffold0337 (442-492)||(14916-14966)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (25-426)||(1483-1884)
scaffold0210 (442-492)||(1884-1935)
[»] scaffold0035 (6 HSPs)
scaffold0035 (27-453)||(19334-19758)
scaffold0035 (25-249)||(99270-99493)
scaffold0035 (25-156)||(29617-29746)
scaffold0035 (442-528)||(98964-99050)
scaffold0035 (442-492)||(19281-19330)
scaffold0035 (480-528)||(19262-19309)
[»] scaffold0359 (3 HSPs)
scaffold0359 (25-453)||(5552-5978)
scaffold0359 (442-492)||(5498-5548)
scaffold0359 (480-527)||(5480-5527)
[»] scaffold0771 (2 HSPs)
scaffold0771 (25-451)||(298-724)
scaffold0771 (442-492)||(730-780)
[»] scaffold0171 (2 HSPs)
scaffold0171 (18-492)||(27251-27724)
scaffold0171 (496-528)||(27232-27264)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (25-453)||(20831-21259)
[»] scaffold0290 (3 HSPs)
scaffold0290 (28-453)||(18481-18907)
scaffold0290 (442-492)||(18427-18477)
scaffold0290 (480-528)||(18408-18456)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (25-475)||(9792-10241)
[»] scaffold0083 (2 HSPs)
scaffold0083 (25-439)||(25849-26263)
scaffold0083 (441-475)||(25798-25832)
[»] scaffold0065 (2 HSPs)
scaffold0065 (25-390)||(1513-1878)
scaffold0065 (442-492)||(1958-2008)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (28-453)||(12034-12460)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (25-489)||(7528-7991)
[»] scaffold0005 (6 HSPs)
scaffold0005 (25-453)||(212180-212604)
scaffold0005 (79-239)||(61098-61257)
scaffold0005 (442-528)||(246032-246119)
scaffold0005 (262-492)||(6008-6250)
scaffold0005 (442-492)||(212608-212658)
scaffold0005 (480-528)||(212629-212677)
[»] scaffold0161 (2 HSPs)
scaffold0161 (25-423)||(9997-10395)
scaffold0161 (25-270)||(14816-15059)
[»] scaffold0146 (2 HSPs)
scaffold0146 (25-426)||(14940-15341)
scaffold0146 (442-492)||(15341-15390)
[»] scaffold0217 (4 HSPs)
scaffold0217 (25-528)||(18854-19358)
scaffold0217 (25-294)||(22151-22419)
scaffold0217 (162-492)||(9519-9848)
scaffold0217 (442-489)||(21926-21973)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (25-486)||(89883-90343)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (25-488)||(103394-103857)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (25-270)||(2039-2280)
[»] scaffold0334 (5 HSPs)
scaffold0334 (25-237)||(7648-7858)
scaffold0334 (233-426)||(9825-10019)
scaffold0334 (480-528)||(10069-10117)
scaffold0334 (442-477)||(10048-10083)
scaffold0334 (442-475)||(19594-19627)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (25-500)||(142920-143386)
[»] scaffold0426 (2 HSPs)
scaffold0426 (25-366)||(13394-13735)
scaffold0426 (394-492)||(13818-13916)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (18-411)||(43822-44214)
scaffold0064 (442-475)||(43728-43761)
[»] scaffold0227 (1 HSPs)
scaffold0227 (25-439)||(22498-22913)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (25-412)||(40462-40846)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (18-423)||(74397-74788)
scaffold0025 (442-476)||(74835-74869)
[»] scaffold0012 (5 HSPs)
scaffold0012 (25-294)||(215517-215785)
scaffold0012 (77-239)||(7693-7855)
scaffold0012 (126-240)||(140906-141019)
scaffold0012 (117-240)||(127738-127860)
scaffold0012 (442-523)||(128065-128148)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (25-528)||(60626-61128)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (25-240)||(9730-9943)
[»] scaffold0022 (7 HSPs)
scaffold0022 (25-264)||(37225-37463)
scaffold0022 (25-264)||(135285-135523)
scaffold0022 (126-418)||(158978-159270)
scaffold0022 (307-492)||(39529-39716)
scaffold0022 (307-492)||(137589-137776)
scaffold0022 (442-474)||(159324-159356)
scaffold0022 (26-76)||(158933-158981)
[»] scaffold0193 (2 HSPs)
scaffold0193 (92-476)||(15682-16067)
scaffold0193 (25-156)||(16298-16425)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (25-426)||(1409-1807)
scaffold0040 (409-475)||(1327-1391)
[»] scaffold0056 (5 HSPs)
scaffold0056 (25-453)||(36047-36469)
scaffold0056 (63-291)||(34827-35056)
scaffold0056 (63-267)||(25712-25917)
scaffold0056 (442-492)||(25481-25531)
scaffold0056 (442-492)||(34635-34685)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (40-491)||(78189-78641)
[»] scaffold1359 (4 HSPs)
scaffold1359 (25-294)||(675-943)
scaffold1359 (108-291)||(1778-1961)
scaffold1359 (442-489)||(497-544)
scaffold1359 (442-478)||(1601-1637)
[»] scaffold0249 (2 HSPs)
scaffold0249 (25-295)||(17784-18053)
scaffold0249 (442-528)||(17560-17647)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (25-237)||(84217-84429)
scaffold0009 (25-150)||(268604-268728)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (25-426)||(5452-5849)
[»] scaffold0280 (2 HSPs)
scaffold0280 (25-270)||(2774-3018)
scaffold0280 (77-240)||(17880-18043)
[»] scaffold1331 (2 HSPs)
scaffold1331 (67-270)||(1743-1947)
scaffold1331 (442-528)||(397-483)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (40-270)||(7217-7448)
[»] scaffold1747 (1 HSPs)
scaffold1747 (25-294)||(1141-1408)
[»] scaffold1745 (1 HSPs)
scaffold1745 (25-294)||(3-270)
[»] scaffold0176 (2 HSPs)
scaffold0176 (25-294)||(8978-9246)
scaffold0176 (442-501)||(9393-9452)
[»] scaffold0439 (2 HSPs)
scaffold0439 (40-294)||(6760-7016)
scaffold0439 (442-528)||(6496-6582)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (40-268)||(559-789)
scaffold0016 (442-492)||(952-1002)
[»] scaffold0859 (1 HSPs)
scaffold0859 (25-237)||(2806-3016)
[»] scaffold0414 (3 HSPs)
scaffold0414 (25-249)||(7221-7446)
scaffold0414 (442-493)||(6962-7013)
scaffold0414 (442-524)||(2726-2808)
[»] scaffold0069 (2 HSPs)
scaffold0069 (63-240)||(5399-5576)
scaffold0069 (443-492)||(5170-5219)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (40-270)||(5646-5877)
scaffold0028 (188-240)||(14745-14798)
scaffold0028 (442-475)||(15006-15039)
[»] scaffold0471 (2 HSPs)
scaffold0471 (25-270)||(3128-3371)
scaffold0471 (442-518)||(3573-3649)
[»] scaffold0120 (8 HSPs)
scaffold0120 (187-453)||(36635-36902)
scaffold0120 (187-453)||(42103-42370)
scaffold0120 (26-143)||(36905-37021)
scaffold0120 (26-143)||(41984-42100)
scaffold0120 (442-474)||(36599-36631)
scaffold0120 (442-474)||(42374-42406)
scaffold0120 (480-528)||(36563-36610)
scaffold0120 (480-528)||(42395-42442)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (63-270)||(865-1072)
[»] scaffold0607 (1 HSPs)
scaffold0607 (25-240)||(5829-6043)
[»] scaffold0861 (3 HSPs)
scaffold0861 (168-453)||(4807-5093)
scaffold0861 (480-526)||(4736-4782)
scaffold0861 (442-492)||(4753-4803)
[»] scaffold0473 (2 HSPs)
scaffold0473 (82-267)||(2738-2923)
scaffold0473 (442-475)||(2551-2584)
[»] scaffold0247 (3 HSPs)
scaffold0247 (108-270)||(25443-25606)
scaffold0247 (108-240)||(15813-15946)
scaffold0247 (393-489)||(23388-23485)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (25-143)||(3047-3164)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (63-247)||(16814-16999)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (63-247)||(6589-6774)
[»] scaffold0045 (2 HSPs)
scaffold0045 (63-270)||(87644-87852)
scaffold0045 (443-492)||(87418-87467)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (79-270)||(38129-38319)
[»] scaffold1321 (1 HSPs)
scaffold1321 (63-247)||(1002-1187)
[»] scaffold1263 (1 HSPs)
scaffold1263 (63-247)||(1195-1380)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (27-150)||(144731-144853)
[»] scaffold0177 (2 HSPs)
scaffold0177 (63-240)||(20451-20628)
scaffold0177 (394-492)||(20214-20314)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (77-239)||(40388-40550)
scaffold0017 (77-239)||(58934-59096)
scaffold0017 (77-240)||(175376-175538)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (79-270)||(1841-2034)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (77-240)||(40554-40716)
[»] scaffold0655 (2 HSPs)
scaffold0655 (63-240)||(4976-5154)
scaffold0655 (442-489)||(8667-8714)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (160-294)||(15642-15776)
[»] scaffold0207 (2 HSPs)
scaffold0207 (79-248)||(10595-10765)
scaffold0207 (79-208)||(20496-20626)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (82-270)||(7163-7352)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (79-240)||(61608-61769)
[»] scaffold0002 (5 HSPs)
scaffold0002 (79-240)||(475324-475485)
scaffold0002 (79-240)||(481844-482005)
scaffold0002 (63-240)||(156700-156878)
scaffold0002 (137-240)||(117210-117312)
scaffold0002 (442-508)||(347415-347481)
[»] scaffold0485 (2 HSPs)
scaffold0485 (442-528)||(9163-9249)
scaffold0485 (393-453)||(9268-9326)
[»] scaffold0011 (4 HSPs)
scaffold0011 (160-270)||(164990-165100)
scaffold0011 (25-220)||(65500-65693)
scaffold0011 (25-220)||(144545-144738)
scaffold0011 (393-528)||(65214-65351)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (393-474)||(60708-60789)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (79-270)||(3939-4131)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (25-163)||(1945-2081)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (77-240)||(2046-2208)
[»] scaffold0488 (1 HSPs)
scaffold0488 (63-152)||(12057-12147)
[»] scaffold0422 (2 HSPs)
scaffold0422 (63-240)||(11620-11797)
scaffold0422 (442-492)||(11984-12034)
[»] scaffold0570 (1 HSPs)
scaffold0570 (91-247)||(1739-1895)
[»] scaffold0275 (1 HSPs)
scaffold0275 (442-518)||(8522-8598)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (25-149)||(2483-2604)
[»] scaffold0407 (2 HSPs)
scaffold0407 (77-240)||(12158-12320)
scaffold0407 (130-240)||(15989-16098)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (77-240)||(35589-35751)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (77-240)||(5347-5509)
[»] scaffold0527 (2 HSPs)
scaffold0527 (393-492)||(57-157)
scaffold0527 (393-492)||(8120-8220)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (25-163)||(462-599)
[»] scaffold0481 (1 HSPs)
scaffold0481 (77-240)||(12867-13029)
[»] scaffold0072 (2 HSPs)
scaffold0072 (137-240)||(36777-36880)
scaffold0072 (442-524)||(36470-36552)
[»] scaffold0497 (1 HSPs)
scaffold0497 (77-239)||(10331-10492)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (320-475)||(5776-5934)
scaffold0261 (442-475)||(9220-9253)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (119-240)||(15823-15943)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (159-240)||(7364-7444)
[»] scaffold1434 (2 HSPs)
scaffold1434 (332-453)||(648-768)
scaffold1434 (442-492)||(593-644)
[»] scaffold0752 (2 HSPs)
scaffold0752 (96-239)||(1276-1418)
scaffold0752 (96-239)||(1891-2033)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (79-202)||(1117-1238)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (77-240)||(770-932)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (25-150)||(31948-32074)
[»] scaffold0163 (2 HSPs)
scaffold0163 (126-240)||(29576-29689)
scaffold0163 (412-467)||(29879-29937)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (137-240)||(52145-52251)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (442-492)||(35456-35506)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (443-492)||(11631-11680)
[»] scaffold0073 (1 HSPs)
scaffold0073 (119-240)||(58395-58515)
[»] scaffold1477 (1 HSPs)
scaffold1477 (188-240)||(1703-1755)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (169-240)||(6261-6331)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (332-390)||(4916-4975)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (170-240)||(8105-8174)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (170-240)||(6928-6997)
[»] scaffold0216 (2 HSPs)
scaffold0216 (170-240)||(84-153)
scaffold0216 (442-524)||(378-460)
[»] scaffold0068 (4 HSPs)
scaffold0068 (170-240)||(7797-7866)
scaffold0068 (170-240)||(10644-10713)
scaffold0068 (442-526)||(10368-10452)
scaffold0068 (442-526)||(7504-7588)
[»] scaffold1026 (1 HSPs)
scaffold1026 (85-150)||(2847-2912)
[»] scaffold0314 (1 HSPs)
scaffold0314 (442-510)||(20540-20608)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (188-240)||(9281-9333)
[»] scaffold0105 (3 HSPs)
scaffold0105 (442-522)||(8384-8464)
scaffold0105 (442-522)||(36711-36791)
scaffold0105 (442-522)||(47345-47425)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (398-453)||(13393-13448)
[»] scaffold0272 (2 HSPs)
scaffold0272 (137-240)||(13650-13752)
scaffold0272 (442-524)||(13037-13119)
[»] scaffold0767 (1 HSPs)
scaffold0767 (442-524)||(5013-5095)
[»] scaffold1204 (1 HSPs)
scaffold1204 (442-523)||(2170-2251)
[»] scaffold0795 (1 HSPs)
scaffold0795 (442-475)||(38-71)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (442-475)||(3221-3254)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (85-150)||(19949-20014)
[»] scaffold0226 (2 HSPs)
scaffold0226 (442-523)||(18954-19035)
scaffold0226 (442-523)||(28348-28429)
[»] scaffold0178 (1 HSPs)
scaffold0178 (442-475)||(27160-27193)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (119-240)||(740-860)
scaffold0090 (119-240)||(5120-5240)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (442-523)||(34895-34976)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (442-475)||(6643-6676)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (442-475)||(408010-408043)
[»] scaffold0906 (1 HSPs)
scaffold0906 (442-474)||(4300-4332)
[»] scaffold0477 (1 HSPs)
scaffold0477 (442-522)||(5968-6048)
[»] scaffold0391 (1 HSPs)
scaffold0391 (188-240)||(2261-2312)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (442-502)||(31554-31613)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 170)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 25 - 454
Target Start/End: Original strand, 23880886 - 23881314
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  23880886 gtgaaagagacgttgtgaattgtcagcacataaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgccttatatggttattgtccta 23880984  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| |||||  ||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  23880985 tgaaggatcaatttcaaatccattcaaagtatgagggaacaatgttgcaggcagagttgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactaagtagtgga 23881084  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  23881085 gatagtggttgtacacttcgtacaattgcactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatccaatgccttcaacttcatttgaattagtcgttgcttcac 23881184  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23881185 tctcctggtcttctgcaatgctaggcgtgattaaatccattaaacaaccttttgaagctt-tagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgtt 23881283  T
Q  424 cttttgcttctaatgatgtgcttctgatgac 454  Q
    |||  |||||| |||| ||||||||||||||    
T  23881284 cttcagcttctgatgaggtgcttctgatgac 23881314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 25 - 475
Target Start/End: Original strand, 6499058 - 6499505
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  6499058 gtgaaagagacgttgtgaattaccaacacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatctttttcctgatatggttattgtccta 6499156  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6499157 tgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggatcattgttgcaggcgtagctattattcttgtcctgtagcagagacacaaactgagtagtgga 6499256  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  6499257 gatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatccgatgccttcaacttcatttgaaatagatgttgcttcac 6499356  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    |||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6499357 tctcctggtcttctgcaatactgggtgtgattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaag--tctcatcttcatatgaacttcagcttctggtgat 6499454  T
Q  424 cttttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    ||| ||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  6499455 cttctgcttctgatgaggtacttct-atgacgtcatcacttcatgagcactt 6499505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 25 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 21100022 - 21099595
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  21100022 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgattaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtccta 21099924  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||| ||| || |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21099923 tgaaggatcaatttcaaatccattctaagtatgaaggaacattgttgcaagcatagttgttatccttgtcctgtagcagagacacaaactgagtagtgga 21099824  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  21099823 ggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtaaacgttcttcaaaaggcaagcatccaatgccttcagcttcatttgaattagttgttgcttcac 21099724  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatc 424  Q
    |||| ||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||     
T  21099723 tctcttggtcttttgtaatgctaggcatgattaaatccatttaacagcctttgaagctttaagtctctgatcttctgatgaactttagcttctggtgatt 21099624  T
Q  425 ttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    ||  |||||| |||| |||||| ||||||    
T  21099623 ttcagcttctgatgaggtgcttttgatga 21099595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 25 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 643020 - 642598
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  643020 gtgaaagagacgttgtgaattgctagcacatcaaaata-gagtcatttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctaatatggtt--tgtccta 642924  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
      || |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||   ||||||||||    
T  642923 taaatgatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacattgttgcaagcatagctgttatccttgtcctgtagcagagacacaa---gagtagtgga 642827  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||| |||||    
T  642826 gatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaaacaagcatccaatgccttcaactttatttgaattagccgttgtttcac 642727  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatc 424  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  642726 tctcctgatcttctgtaatgctaggtgtgattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtctctcatcttctgatgaactgcaatttctggtgatc 642627  T
Q  425 ttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    ||  || ||| |||| |||||||||||||    
T  642626 ttcagcatctcatgaggtgcttctgatga 642598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 25 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 89740 - 89339
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  89740 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtccta 89642  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  89641 tgaaggatcaatttcaaattcattccaagtatgaaggaacattgatgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtgga 89542  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||| ||| | ||||||| |||||| || || ||| ||  || |||| |||| |||||    
T  89541 gatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaatgctcttcaaagaacaagcatgcaatgctttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcac 89442  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaa-tgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    ||| |||||||||||||| | |||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |  ||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  89441 tcttctggtcttctgcaattcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaagttttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgat 89342  T
Q  424 ctt 426  Q
    |||    
T  89341 ctt 89339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 25 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 21072555 - 21072110
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21072555 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaa--agggtcgtttga-gctt-gatcaatcaccagtgatcttttgtctgatatggttattgtccta 21072460  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  21072459 tgaaggatcaatttcaaattcatttgaagtatgaaggaacaatgctacaggcagagctgttattattgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtaga 21072360  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || | | ||  || ||||||||| |||||    
T  21072359 gatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcac 21072260  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatc 424  Q
    ||| |||||||||||||||| |  | |||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21072259 tcttctggtcttctgcaatgctgtgagtgattaaatccatagaacaaccttttaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatc 21072160  T
Q  425 ttttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact 474  Q
    ||  |||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21072159 ttcagcttctgatgagatgcttctgatgacctcatcacttcaggagcact 21072110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 25 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 23413293 - 23412843
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||    
T  23413293 gtgaaagagacgttgcgaattgccagcacatcaaaat--gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatctttttcctgatatggttattatccta 23413196  T
Q  125 c--gaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
       |||||||||||||||||| |||||| |||||   |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23413195 tatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtataagggaacattgttgcaggcatagctgttatttttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtg 23413096  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattc 322  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || | | ||  || || | |||| |||    
T  23413095 gagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaaaaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaataatcgttgcttc 23412996  T
Q  323 actctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtg 421  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |  | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23412995 actcttctggtcttctgcaatgcttggatgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtg 23412896  T
Q  422 atcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||  |||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23412895 atc--ttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 23412843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 29 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 9399047 - 9398612
Alignment:
Q  29 aagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaa 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  9399047 aagagacgttgtaaattgccagcacatcaaaata-gagtcgttcgaagctttgatcaatcgc-aatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaa 9398950  T
Q  129 ggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagata 228  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9398949 ggatcaatttcaaatccattccaagtctgagggaacaatgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagata 9398850  T
Q  229 gtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctc 328  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  9398849 gtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagtaagcattcaatgccttcaacttcatttgaattagtcgttgctccactctc 9398750  T
Q  329 ctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatctttt 428  Q
    |||          || |||| || ||| ||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||      
T  9398749 ctg----------atcttagacgagatcaaatccaatgaacaacctttgaacctttaagtctctcatcttctgatgaacttcaacttctggtgatcttga 9398660  T
Q  429 gcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||| ||| |  || |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9398659 gcttctgatgaacttgatgttgatgacgtcatcacttcaggagcactt 9398612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 25 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 21199320 - 21198877
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||| | || | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  21199320 gtgaaagagacgttgtaattttcgagcacatcaaaa--agagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatctttttcctgatatggttattgtccta 21199223  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21199222 tgaaggatcaatttcaaatccattcaaagtatgaaggaacatcgttgcaggcatagctgttatccttgtccagtagcagagacacaaactgagtagtgga 21199123  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |  ||| | | ||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||  |||     
T  21199122 ggtagtgattgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctttccaaagaacgagcatccaatgccttcaaattcatttgaattagccgttg-ctcat 21199024  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatc 424  Q
    | | ||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      
T  21199023 ttttctggtcttctgcagtactaggcgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctctcatcttctgatgaacttcagctcctggtga-- 21198926  T
Q  425 ttttgcttctaatga-tgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagca 472  Q
    | |||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21198925 tattgcttctgatgagtttgcttctgatgacgtcatcgcttcaggagca 21198877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 25 - 492
Target Start/End: Original strand, 26784172 - 26784642
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  26784172 gtgaaagagacgttgtgaattcccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctaatatagttattgtccta 26784271  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  26784272 tgaaggatcaatttcaaatccattcccagcatgtaggaacatttttgcaggcagagttgttattcttgtcttgtagcagacacacaaactgagtagtgga 26784371  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||| | | |  || | | ||  || |||| |||| |||||    
T  26784372 ggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaataagcatccagttcttccaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcac 26784471  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    |   |||||||| ||||||| || | || |||| ||||||||| ||| ||||| |||||| || |||  ||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  26784472 tgctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagcctttaaagctttaaatcttgcatctcctgctgaactacagcttctggtgat 26784571  T
Q  424 cttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcac-tttgttttcaggagcactt 492  Q
    |||  |||||| ||| |  |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  26784572 cttcagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatgacttcatgagcacttttgtcttcaggagcactt 26784642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 25 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 12353113 - 12352795
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  12353113 gtgaaagagacattgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttactgtccta 12353015  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     || ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||| ||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12353014 tgagggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacatcgttgtaggcatagttgttattcttgtcctgtagcagagacacaaactgagtagtgga 12352915  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||    
T  12352914 gatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaatgcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagccattgcttcac 12352815  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg 344  Q
     |||||| ||||||||||||    
T  12352814 cctcctgatcttctgcaatg 12352795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 25 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 7746011 - 7745610
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  7746011 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcatcaatgatcttttgcctgatatggttattgtccta 7745913  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| |||||| | |  |  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  7745912 tgaaggatcaatttcaaatccattccaattgagagggaacatagttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaaccgagtagtgga 7745813  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| || | | ||  || ||||||||| |||||    
T  7745812 ggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcac 7745713  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    ||| || ||||||| ||||| || |  | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  7745712 tcttctagtcttctccaatgcttggatgcgattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttacatctcctgatgtacttcagcttcttgtgat 7745613  T
Q  424 ctt 426  Q
    |||    
T  7745612 ctt 7745610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 25 - 426
Target Start/End: Original strand, 21910375 - 21910776
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  21910375 gtgaaagagacgttgtgaattttcagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgttcta 21910473  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21910474 tgaaggatcaatttcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgtaggcagaactgttatctttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtgga 21910573  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | | ||  || || | |||| |||||    
T  21910574 gatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaataatcgttgcttcac 21910673  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    | | |  ||||| || |||| |||| || ||||||||| |||  ||| ||||||| |||| ||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  21910674 ttttccagtcttttgtaatgcttagacgagattaaatcaattcaacagcctttgacgctttaagtcttgcatctcctgatgaactttagcttctggtgat 21910773  T
Q  424 ctt 426  Q
    |||    
T  21910774 ctt 21910776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 6512744 - 6512306
Alignment:
Q  28 aaagagacgttgtga-attgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacg 126  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |    
T  6512744 aaagagacgttgtcacattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctaatatggttattgtcctttg 6512646  T
Q  127 aaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggaga 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  6512645 aaggatcaatttcaaatccattccatgtatgtaggaacattgttgcaggcgtagctattatccttgtcgtgtagcagagacacaaactgagtagtgaaga 6512546  T
Q  227 tagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactc 326  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||   |||||||||| || | | ||  || |||| |||| |||||||    
T  6512545 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaag---ccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 6512449  T
Q  327 tcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatct 425  Q
    | |  |||||| |||||| |||| || ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||| || ||||| ||||||     
T  6512448 ttccagtcttcagcaatgcttagacgagattaaatccactgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctagtgatc- 6512350  T
Q  426 tttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcagga 469  Q
     |||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6512349 -ttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagga 6512306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 25 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 25097145 - 25096753
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaa-ataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |    
T  25097145 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacataaaagaaaagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttattgtcat 25097046  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
    | |||| |||||||| |||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||    
T  25097045 atgaagaatcaattttaaatccattccaagtctgaaggaacattgttgcaggcatagctgttattcttgtcttgttgcagagaca-aaacagagtagtgg 25096947  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaattggac---tttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgat 320  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||  |   ||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||| || | | ||||||||| | |||| |    
T  25096946 aggtagtggttgtacacttcgtacaattgtccttttttttcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgtcttcaaatccttttgaattaatcgttgct 25096847  T
Q  321 tcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagct 414  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  25096846 tcactcttctggtcttctgcaatgctaggcgtaattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctcttatcttatgatgatcttcagct 25096753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 25 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 25155115 - 25154723
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaa-ataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |    
T  25155115 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacataaaagaaaagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttattgtcat 25155016  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
    | |||| |||||||| |||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||    
T  25155015 atgaagaatcaattttaaatccattccaagtctgaaggaacattgttgcaggcatagctgttattcttgtcttgttgcagagaca-aaacagagtagtgg 25154917  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaattggac---tttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgat 320  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||  |   ||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||| || | | ||||||||| | |||| |    
T  25154916 aggtagtggttgtacacttcgtacaattgtccttttttttcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgtcttcaaatccttttgaattaatcgttgct 25154817  T
Q  321 tcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagct 414  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  25154816 tcactcttctggtcttctgcaatgctaggcgtaattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctcttatcttatgatgatcttcagct 25154723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 39 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 19536605 - 19536192
Alignment:
Q  39 gtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaattt 138  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  19536605 gtgaattgccagcacataaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcgccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcatacgaagaatcaatat 19536506  T
Q  139 caaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtac 238  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19536505 caaatccattcc-agtatgtaagaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactaagtagtggagatagtggttgtac 19536407  T
Q  239 acatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcact-ctcctggtcttc 337  Q
    || ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||| || || | ||||  ||  ||| |||| |||||| ||  |||||||     
T  19536406 acttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccaatgctttcaaatccattcaaaaaagtcgttgcttcactccttttggtcttt 19536307  T
Q  338 tgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaa 436  Q
    ||||||| || | || |||| ||||||||| ||| || ||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||| |||||| | ||||  |||||||| |    
T  19536306 tgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagcccttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttctgcttcttgcgatc--ttgcttctga 19536209  T
Q  437 tgatgtgcttctgatga 453  Q
    |||  ||||||||||||    
T  19536208 tgagatgcttctgatga 19536192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 43 - 453
Target Start/End: Original strand, 17814804 - 17815213
Alignment:
Q  43 attgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaa 142  Q
    |||| |||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  17814804 attgtcagcacataaaaaatagagtcgtttgaagttttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctctgaaggatcaatttcaaa 17814903  T
Q  143 ttcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacat 242  Q
    | ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  17814904 tccattccatgtatgtagaaacattgttgcaggcagagctgttatccttgccttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactc 17815003  T
Q  243 cgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaa 342  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||| || || | | ||   | |||| |||| |||||||| |  |||||||||||    
T  17815004 cgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgctttcaaatcctttcagaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaa 17815103  T
Q  343 tg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatg 441  Q
    || |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  |||||  ||||||| || ||||||||||||||  |||||||| ||||      
T  17815104 tgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaaatttagcttctggtgatc--ttgcttctgatgaga 17815201  T
Q  442 tgcttctgatga 453  Q
    ||||||||||||    
T  17815202 tgcttctgatga 17815213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 25 - 475
Target Start/End: Original strand, 20550713 - 20551162
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  20550713 gtgaaagagacgttgtaaatttccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcatcaatgatcttttgcctgatatggttattttccta 20550811  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattccca-gtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
     ||||||||||||||||||  ||||| |  | || |||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  20550812 tgaaggatcaatttcaaatcgattccaatttgtgaaggaacatcgttgcaggaaaagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgg 20550911  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattca 323  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || |   ||  || |||| |||| ||||    
T  20550912 aggtagtggttgtacacttcgtacaattgta-tttgtcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcttttcaaaatagtcgttgcttca 20551010  T
Q  324 ctctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtg 421  Q
    |||| || || |||||||||| |||| || ||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  20551011 ctcttctagttttctgcaatgcttagacgagattaaaaccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctgatg 20551110  T
Q  422 atcttttgcttctaatga-tgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |     ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20551111 a---gatgcttctaatgagcttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 20551162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 25 - 489
Target Start/End: Original strand, 33022486 - 33022946
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcaca-tcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  33022486 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacattcaaaat-agagtcgtctgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcct 33022584  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| | | || ||||||||  ||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||    
T  33022585 atgaaggatcaatttcaaatgcattcctattgtgaaggaacatctttgcaggcagagct----ttcttgtcttgtagcagagacaaaaacatagtagtgg 33022680  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattca 323  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||| ||||||||||||| || | | ||  || |||| |||| ||||    
T  33022681 aggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttca 33022780  T
Q  324 ctctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtga 422  Q
    || | |  ||||||||||||| ||||  | |||||||||||||| ||| |||||||||||| |  | |  ||||| |||||||||| ||  |||||||||    
T  33022781 cttttccagtcttctgcaatgcttagatgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta--tgttgcatctcctgatgaactgcaaattctggtga 33022878  T
Q  423 tcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagca 489  Q
    | ||  |||||| ||| |  ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  33022879 ttttcagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcaccacttcaaaagcactttgtcttcaggagca 33022946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 90 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 41566688 - 41566287
Alignment:
Q  90 ccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattc 189  Q
    ||||||||  |||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  41566688 ccaatgataatttgcctgatatgattattgtcctacgaatgatcaatttcaaattcattccatgcatgtaggaacattgtttcaggcagagctgttatcc 41566589  T
Q  190 ttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaat 289  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| ||| |  || ||||||||    
T  41566588 ttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatatcaacgctcttcaaagaataaacatccaat 41566489  T
Q  290 gcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagt 388  Q
    ||||| || | | ||  || |||  |||| |||||| | || ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| | | | |||||||||| ||||    
T  41566488 gccttcaaatcctttcaaaatagacgttgcttcacttttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaatagcttttgaagctttaagt 41566389  T
Q  389 ctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggag 487  Q
    ||  ||||| |||||||||| || |||||| |||||||  |||||| ||| |  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  41566388 cttgcatctcctgatgaactacaacttctgatgatcttcagcttctgatgaacttgcttctgatgacgacatcacttcaggaacactttgtcttcaggag 41566289  T
Q  488 ca 489  Q
    ||    
T  41566288 ca 41566287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 26 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 13545829 - 13545455
Alignment:
Q  26 tgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctac 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  || |||||||||||||||||     
T  13545829 tgaaagagacgttgtgaattgccagcaaatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaacattgatctttttcctgatatggttattgtcctat 13545731  T
Q  126 gaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggag 225  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||   || ||| ||||  |||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||    
T  13545730 gaaggatcaatttcaaatccattcccatagtgaagggacatcattgcaggcagagttgtttatcttgtcttgtagcagagacaaaaatagagtagtggag 13545631  T
Q  226 atagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcact 325  Q
     | |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| || | | ||  || ||||||||| |||||     
T  13545630 gtggtggttgtacacttcgtacacttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaagtagttgttgcttcac- 13545532  T
Q  326 ctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaact 408  Q
           |||||||||||| |||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||    
T  13545531 -------tcttctgcaatgcttagacgagattaagtccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 13545455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 40 - 476
Target Start/End: Original strand, 4886854 - 4887291
Alignment:
Q  40 tgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttg-atcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaattt 138  Q
    |||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4886854 tgaattgccaacacattaaaaatagagtcgtttgaagctttttatcaatcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctaagaaggatcaattt 4886953  T
Q  139 caaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtac 238  Q
    |||||  ||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  4886954 caaatgtattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 4887053  T
Q  239 acatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttct 338  Q
    || |||||||   | |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| || |   ||  || |||| |||| |  ||| | |  ||||| |    
T  4887054 acttcgtacacacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcttttcaaaatagtcgttgctatacttttccagtctttt 4887153  T
Q  339 gcaatgtt-aggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaat 437  Q
    ||||| || || |  | |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||  |  ||||  ||||||||| ||||||||||||||  |  |||||||||    
T  4887154 gcaatcttaagacaagtttaaatccattgaacaacttttgaagctttaagttgcatatct--tgatgaactgcagcttctggtgattctcagcttctaat 4887251  T
Q  438 g-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 476  Q
    | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4887252 gaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 4887291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 25 - 483
Target Start/End: Original strand, 31117696 - 31118152
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  31117696 gtgaaagggacgttgtgaattttcagcacattcaaata-gagtcgtttgaagttttgatcaaataccaatgatcttttgcctgatatggttattgtccta 31117794  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     ||| | |||||||||||| | |||||| | || ||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  31117795 tgaatgttcaatttcaaatgcgttcccattgtgaaggaacatcattgcaggcagcgctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgga 31117894  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
      |||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||  || | ||||||||||||||||| || ||| ||  ||||||| |||| |||||    
T  31117895 agtagtggatgtacacttcgtacatttgtactttgtcaacactctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaattctttcaaattagtcgttgcttcac 31117994  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtga 422  Q
    | | |  ||||||||||||| |||| || | |||||||| ||  |||||| |||||||||| |  | |  ||||| |||||||||| ||||||||| |||    
T  31117995 ttttccagtcttctgcaatgcttagacgagtttaaatccgttaaacaaccttttgaagcttta--tgttgcatctcctgatgaactgcagcttctgatga 31118092  T
Q  423 tcttttgcttctaat-gatgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttca 483  Q
     |  ||||||||| | ||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  31118093 ac--ttgcttctagtggacttgcttatgatgacgtcaccacttcaggagcactttgtcttca 31118152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 25 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 29138724 - 29138456
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  29138724 gtgaaagagacgttg--aattgccagcacattcaaaata-gagtcgttcgaagcttttgatcaatcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcc 29138628  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    || ||||||||||||||||||  ||||||| |  | || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  29138627 tatgaaggatcaatttcaaatgtattcccattgagaagaaacattgttgcaggcagagttgtttttcttgtcttgtagcagagacacaaacagagtagtg 29138528  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 294  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  | ||| || ||||||||||  || |  ||||||||||||||||    
T  29138527 gagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgacaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 29138456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 25 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 28464656 - 28464388
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  28464656 gtgaaagagacgttg--aattgtcagcacattcaaa-aagagtcgtttgaagcttttgataaatcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcct 28464560  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
    | |||||||||||||||||| | |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||| |||| ||||||| |    
T  28464559 atgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgaaggaacattgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttatagtagagacaaaaacagagtagtag 28464460  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 295  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||||||    
T  28464459 agatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttt 28464388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 25 - 528
Target Start/End: Original strand, 15516788 - 15517290
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagctttg--atcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtc 121  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  15516788 gtgaaagagacgttg--aattgccagcacattcaaaataa-agtcgtttgaagctttttaatcaatcaccaatgatcatttgcctgatatggttattgtc 15516884  T
Q  122 ctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagt 221  Q
    ||| ||| |||||||||||||| |||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  15516885 ctaagaaagatcaatttcaaatgcattcccattgagaaggaacattgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagaca-aaacagagtagt 15516983  T
Q  222 ggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgatt 321  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||  | ||| || |||| |||||  || |  |||||||||||||||| || | | |   || |||  |||| |     
T  15516984 ggaggtagtggttgtacacttcgtacaaaagtactatgccaacactctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatccttccaaaatagccgttgcta 15517083  T
Q  322 cactctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggt 420  Q
     ||| | |  ||||||||||||  |||| || | || ||||| ||| ||||| |||||||||| |||  |  |||||||||||||||| || ||||||||    
T  15517084 tacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttgaacaacttttgaagctttaag--ttgcatcttctgatgaactacaacttctggt 15517181  T
Q  421 gatcttttgcttctaat-gatgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagat 519  Q
    |||  |   ||||| ||  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||  |||||| | || || ||||||||     
T  15517182 gattctcaacttctgataaacttgcttctgatgatgtcatcacttcaggagcactttatcttcaggagcgctttatcttcaggagcagttttcttcagac 15517281  T
Q  520 gcttcaagc 528  Q
    |||| ||||    
T  15517282 gctttaagc 15517290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 270
Target Start/End: Original strand, 9088788 - 9089032
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  9088788 gtgaaagagacgttg--aattgccagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgatcatttgcctaatatggttgttgtcc 9088884  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    || |||||||| |||||||||  ||||||  |  | || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  9088885 tatgaaggatcgatttcaaatgtattccctttgagaagaaacattgttgcagacagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtg 9088984  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  9088985 gagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt 9089032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 30116152 - 30115911
Alignment:
Q  28 aaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacg 126  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||| |    
T  30116152 aaagagacgttg--aattgccagcacatttaaaatagagtcgtttgaagcttttgataaatcactaatgatcatttgcctgatatggttattgtcctatg 30116055  T
Q  127 aaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggaga 226  Q
    |||||||||||||||||   |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  30116054 aaggatcaatttcaaatgtgttcccaatgtgaaggaacattgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaga 30115955  T
Q  227 tagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    |||||||||||||  ||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  30115954 tagtggttgtacatttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt 30115911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 40 - 270
Target Start/End: Original strand, 30742813 - 30743043
Alignment:
Q  40 tgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatt 137  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  30742813 tgaattgccagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctaagaagtatcaatt 30742911  T
Q  138 tcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgta 237  Q
    |||||| |||||||| | |  |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  30742912 tcaaatgcattcccattgtaaaggaacatcgttgcaggtagagctgtttttcttgtcttgtagcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgta 30743010  T
Q  238 cacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    ||| ||||||||  | |||||||||||||||||    
T  30743011 cacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctt 30743043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 41566848 - 41566689
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || |||| ||||||||||||    
T  41566848 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgataatttccctgatatcgttattgtccta 41566749  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgt 184  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41566748 cgaatgatcaatttcaaattcattccatgtatgtaggaacattgtttcaggcagagctgt 41566689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 25 - 249
Target Start/End: Original strand, 28139426 - 28139649
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||    
T  28139426 gtgaaagagacgttg--aattgccagcacattcaaattagagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgattctttgcctgatatggttattgtcct 28139523  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
    | ||| ||||||||||||||  ||||||| |  | || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  28139524 atgaatgatcaatttcaaatgtattcccattgagaagaaacaatgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgg 28139623  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaa 249  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  28139624 agatagtggttgtacacttcgtacaa 28139649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 25 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 3245759 - 3245490
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  3245759 gtgaaagagacgttg--aattgtcagcacattcaaaata-gagtcgtttgaaacttttgataaatcaccaatgatcctttgcctaatatgtttattgtcc 3245663  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    || |||||||||||||||||| | |||||| | || || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||| ||||| ||    
T  3245662 tatgaaggatcaatttcaaatacgttcccaatgtgaagaaacattgttgcagacagagctgtttttcttgtcttgtagtagagacaaaaacagagtactg 3245563  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 295  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  ||||||| |||||||||    
T  3245562 gagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatcaaatgccttt 3245490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 40 - 291
Target Start/End: Original strand, 11993720 - 11993972
Alignment:
Q  40 tgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatt 137  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11993720 tgaattgccagcacattcaaaata-gagtcgtttcaagcttttgatcaatcaccaatgatcttttacctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatt 11993818  T
Q  138 tcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgta 237  Q
    |||||| | |||||| | || | | ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||  |||||||||||    
T  11993819 tcaaatgcgttcccaatgtgcaaggacattgttgcaggcatagctgtttttcttgttttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgta 11993918  T
Q  238 cacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 291  Q
    ||| |||||||   | |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||    
T  11993919 cacttcgtacatacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgc 11993972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Original strand, 26765330 - 26765585
Alignment:
Q  40 tgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt--gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaat 136  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  26765330 tgaattgccagcacattcaaaata-gagtcgtttgaaactttttgatcaatcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctaagaatgatcaat 26765428  T
Q  137 ttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgt 236  Q
    ||||||| |||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||  |||||||||    
T  26765429 ttcaaatgcattcccattgagaaggaacattgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagctgagaca-aaacagagtagtggaggcagtggttgt 26765527  T
Q  237 acacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 294  Q
    |||| ||||||||  | ||| | ||| |||||||  || |  ||||||||||||||||    
T  26765528 acacttcgtacaaacgtactatttcagcgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 26765585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 295
Target Start/End: Original strand, 10848592 - 10848861
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  || || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  10848592 gtgaaagagacgttg--aaatgtcagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcacaaatgatcctttgcctgatatggttattgtcc 10848688  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    || ||||||| |||||||||| | |||||| | || |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  10848689 tatgaaggattaatttcaaatgcgttcccaatgtgaataaacattgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtg 10848788  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 295  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||  | | | |||||||||||||  || |  ||||||| |||||||||    
T  10848789 gagatagtggttgtacactttgtacaaacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatctaatgccttt 10848861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 40 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 23391909 - 23391679
Alignment:
Q  40 tgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttc 139  Q
    |||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  23391909 tgaatttccagcacatccaaaatagagtcgtttgaagctttgataattcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaagcatcaatttc 23391810  T
Q  140 aaattcattcccagtatgtaggaacattg-ttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagac-acaaactgagtagtggagatagtggttgta 237  Q
    |||| | |||||| | ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||| |||||||| |||||    
T  23391809 aaatgcgttcccaatgtgtataaacattgtttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacaaaaaacagagtagtgcagatagtgattgta 23391710  T
Q  238 cacatcgtacaattggactttgtcaacgctc 268  Q
    ||| ||||||||  | ||| |||||||||||    
T  23391709 cacttcgtacaaacgaactatgtcaacgctc 23391679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 25930473 - 25930206
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||  |||| || |||||||||||||||    
T  25930473 gtgaaagagacgttg--aattgccagcacattcaaaata-gagtcgtt-gaagcttttgatcaatcaccaataattctttgcctgatatggttattgtcc 25930378  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    || ||| ||||||||||||||  |||| || |  | || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||     
T  25930377 tatgaatgatcaatttcaaatgtattcacattgagaagaaacattgttgtaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagta 25930278  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 294  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||  | ||| |||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||    
T  25930277 gagatagtggttgtacaattcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaaaaataagcatccaatgcctt 25930206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 48 - 249
Target Start/End: Original strand, 26758989 - 26759191
Alignment:
Q  48 cagcacatcaaaataagagtcgtttgaagcttt--gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattc 145  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |    
T  26758989 cagcacattaaaaatagagtcgtttgaaactttttgatcaatcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctaagaatgatcaatttcaaatgc 26759088  T
Q  146 attcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgt 245  Q
    ||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  26759089 attcctattatgaaggaatattgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagaca-aaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgt 26759187  T
Q  246 acaa 249  Q
    ||||    
T  26759188 acaa 26759191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 21203963 - 21203796
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  21203963 gtgaaagagacgttgtaaatttctagcacataaaaa--agagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgttcta 21203866  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtc 194  Q
     |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  21203865 tgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacatcgttgcaggcatagctgttatccttgtc 21203796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 25 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 14086856 - 14086613
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  14086856 gtgaaagagacgttg--aatttccaacacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgattaatcaccaatgatcatttgcctgatatggttattgtcc 14086760  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    || ||||||||||||||||||  ||| | | | || |||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  14086759 taagaaggatcaatttcaaatgaatttc-attgtgaaggaacatcgttgcaggaagagatgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtg 14086661  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    ||| ||| |||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||    
T  14086660 gaggtagcggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctt 14086613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 25 - 149
Target Start/End: Original strand, 25740942 - 25741065
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  25740942 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcatatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtccta 25741040  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattc 149  Q
     |||||||||||||||||| |||||    
T  25741041 tgaaggatcaatttcaaatccattc 25741065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 40 - 249
Target Start/End: Original strand, 21660044 - 21660254
Alignment:
Q  40 tgaattgccagcaca-tcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaattt 138  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21660044 tgaattgccagcacattcaaaat-agagtcgtttgaagctttgatgattcaccattgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaattt 21660142  T
Q  139 caaattcattcccagtatgtaggaacattg-ttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgta 237  Q
    ||||| | |||||| | || |  ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |  | ||||||||||  |||||||||||    
T  21660143 caaatgcgttcccaatgtgcataaacattgtttgcaggcagagttgttatccttgtcttgtagcagagacaaactcagagtagtggaagtagtggttgta 21660242  T
Q  238 cacatcgtacaa 249  Q
    ||| ||||||||    
T  21660243 cacttcgtacaa 21660254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 40 - 270
Target Start/End: Original strand, 33933100 - 33933330
Alignment:
Q  40 tgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatt 137  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33933100 tgaattgtcagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcgatcatcaatgatcatttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatt 33933198  T
Q  138 tcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgta 237  Q
    |||||| | |||| |   || | |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  33933199 tcaaatgctttcc-atcgtgaatgaacatcgttgcaggcaaagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgta 33933297  T
Q  238 cacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    ||| ||||||||  | ||| | |||||||||||    
T  33933298 cacttcgtacaaacgtactatatcaacgctctt 33933330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 270
Target Start/End: Original strand, 42243493 - 42243743
Alignment:
Q  18 taaaggagtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagctttga-tcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggtt 115  Q
    |||||| |||| ||||||||||  |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||| || ||||||||    
T  42243493 taaaggtgtgatagagacgttg--aattgccaacacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttaatcaatcatcaatgatcctttgcctgatatggtt 42243589  T
Q  116 attgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactg 215  Q
    ||||||  | ||| |||||||||||||| ||||||||   || |||||||| |||| ||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||| |||| |    
T  42243590 attgtctaaagaatgatcaatttcaaatgcattcccatagtgaaggaacatcgttgtaggcaaagctgtctttcttgtcttgtagcagagaca-aaacag 42243688  T
Q  216 agtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | | |||||||||||||||    
T  42243689 agtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtattttgtcaacgctctt 42243743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 63 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 35986513 - 35986336
Alignment:
Q  63 agagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagga 162  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | | ||       
T  35986513 agagtcgtttgaagctttgatctatcatcactgatcttttgcttgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccaatgtatatag 35986414  T
Q  163 acattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |  | ||||||||||  ||||||||||||||    
T  35986413 acattgttgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacaaactcagagtagtggaagtagtggttgtacac 35986336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 63 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 35932288 - 35932059
Alignment:
Q  63 agagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagg 161  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||| | || |      
T  35932288 agagtcgtttgaagcttttgatctatcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaagaatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgaata 35932189  T
Q  162 aacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtc 261  Q
    || |||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  | ||| ||||    
T  35932188 aaaattgttgcagacagagtagttatccttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtc 35932089  T
Q  262 aacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 291  Q
    ||| |||||  || |  |||||||||||||    
T  35932088 aacactctttgaagaataagcatccaatgc 35932059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 62 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 25112161 - 25111975
Alignment:
Q  62 aagagtcgtt-tgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtag 160  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || |||||||||  ||||||| |||||| | |||| ||    
T  25112161 aagagtcgttgtgaaaccttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcttatgaaggatcacattcaaatccattcctattatgaag 25112062  T
Q  161 gaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtac 247  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  25112061 gaacatttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacataaatagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtac 25111975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 62 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 25171252 - 25171066
Alignment:
Q  62 aagagtcgtt-tgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtag 160  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || |||||||||  ||||||| |||||| | |||| ||    
T  25171252 aagagtcgttgtgaaaccttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcttatgaaggatcacattcaaatccattcctattatgaag 25171153  T
Q  161 gaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtac 247  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  25171152 gaacatttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacataaatagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtac 25171066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 11208267 - 11208060
Alignment:
Q  63 agagtcgtt-tgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagg 161  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||| | |||||||| |||| || || ||||||| |||||  | | || |||    
T  11208267 agagtcgttctgaagccttgatcaatcaccaatgattttttgcctgatttggatgttgtcctatgaagaattaagttcaaatccattcttattttgaagg 11208168  T
Q  162 aacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtc 261  Q
    ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||| || | ||||||||    
T  11208167 aacatttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttatacacttcgtac-atagtactttgtc 11208069  T
Q  262 aacgctctt 270  Q
    |||||||||    
T  11208068 aacgctctt 11208060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 79 - 270
Target Start/End: Original strand, 32160638 - 32160829
Alignment:
Q  79 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcag 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| | | |   ||||||||  |||||||||    
T  32160638 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctattctaagggaacatttctgcaggcag 32160737  T
Q  179 agctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||   |  ||||||||||||||||    
T  32160738 agctgtttttcttatcttgtagcgtagacataaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacatacgttctttgtcaacgctctt 32160829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 13736451 - 13736310
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||  |||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  13736451 gtgaaagagacgttgtgaattgtcagcgcatttaaaatagagtcgtttaaagctttgatcaatcatcaatgatcttttgcctgatatggttattgtccta 13736352  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacat 166  Q
      ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||    
T  13736351 taaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacat 13736310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 63 - 240
Target Start/End: Original strand, 23478224 - 23478402
Alignment:
Q  63 agagtcgtt-tgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagg 161  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||  ||||||| |||||| |   || |||    
T  23478224 agagtcgttgtgaaaccttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctaagaaggatcacattcaaatccattcctatcttgaagg 23478323  T
Q  162 aacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||  | |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  23478324 aacatttctacaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacac 23478402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 22000375 - 22000298
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttg 103  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22000375 gtgaaagagatgttgtgaattgccagcacattaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttg 22000298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 97
Target Start/End: Original strand, 31488067 - 31488138
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgat 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31488067 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcatatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgat 31488138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 89 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20215371 - 20215220
Alignment:
Q  89 accaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttatt 188  Q
    ||||||||||||||| || || ||| | |||||||| |||||||||  ||||||| |||||| |   || |||||||||  ||||||||||||||||  |    
T  20215371 accaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgtttat 20215272  T
Q  189 cttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||    
T  20215271 cttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacac 20215220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 126 - 240
Target Start/End: Original strand, 21414223 - 21414336
Alignment:
Q  126 gaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggag 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||   || |||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  21414223 gaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggag 21414321  T
Q  226 atagtggttgtacac 240  Q
     ||||||||||||||    
T  21414322 gtagtggttgtacac 21414336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 240
Target Start/End: Original strand, 1915290 - 1915450
Alignment:
Q  79 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcag 178  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| || || ||| | |||||||| |||||||||  ||||||| |||||| |   || |||||||||  |||||||||    
T  1915290 ttgatcaaataccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcag 1915389  T
Q  179 agctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    || |||||| |||||||||||||| |||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||    
T  1915390 agttgttat-cttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacac 1915450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 40033030 - 40032870
Alignment:
Q  79 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcag 178  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| || || ||| | |||||||| |||||||||  ||||||| |||||| |   || |||||||||  |||| ||||    
T  40033030 ttgatcaaataccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaagcag 40032931  T
Q  179 agctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||    
T  40032930 agctgttat-cttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacac 40032870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 79 - 239
Target Start/End: Original strand, 13404989 - 13405148
Alignment:
Q  79 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcag 178  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| || || ||| | |||||| | |||||||||| ||||||| ||||||     || |||||||||  |||||||||    
T  13404989 ttgatcaaataccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtccaatgaaggatcaagttcaaatccattcctttcttgaaggaacatttctgcaggcag 13405088  T
Q  179 agctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtaca 239  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||| |||||| |||||||||||||    
T  13405089 agctgttat-cttgtcttgtagcgtagacacaatcagagtcgtggaggtagtggttgtaca 13405148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20417186 - 20417024
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||| || || | | | | |||||| |||||||||| ||||||||||||||     || |||||||||  |||||||    
T  20417186 ctttgatcatccaccaataatcttttgcctgatttagatgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctctcttgaaggaacatttctgcaggc 20417087  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20417086 agagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 20417024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 119 - 240
Target Start/End: Original strand, 32753963 - 32754083
Alignment:
Q  119 gtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagt 218  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||||| |   || |||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  32753963 gtcctatgaaggattaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgtt-ttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagt 32754061  T
Q  219 agtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  32754062 agtggaggtagtggttgtacac 32754083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 240
Target Start/End: Original strand, 40228532 - 40228692
Alignment:
Q  79 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcag 178  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||| || || ||| | |||||||| |||||||||  ||||||| |||||| |   || |||||||||  |||||||||    
T  40228532 ttgatcaaataccaatggtcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcag 40228631  T
Q  179 agctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||  ||||| ||||||||||||||    
T  40228632 agctgttat-cttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcatggaggtagtggttgtacac 40228692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 106403 - 106241
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | | |||||  |||||||||| ||||||||||||||||   || |||||||||  | |||||    
T  106403 ctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctacaggc 106304  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  106303 agagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagaaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 106241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 163
Target Start/End: Original strand, 16607332 - 16607469
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaa-tcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    |||||||||| |||||  ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| || || |||||||||||||    
T  16607332 gtgaaagagaagttgttgattgccatcacattaaaata-gagtcgtttgaagctt-gatcaaatcaccaatgatctgttgcctgatttggttattgtcct 16607429  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaa 163  Q
    | ||| || ||||||||||| ||||||  ||||| |||||    
T  16607430 atgaacgaacaatttcaaatccattccatgtatggaggaa 16607469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 442 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 7745566 - 7745480
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||| || | |||||||||||||| |||||||||    
T  7745566 tgcttctgatgacgtcgtcacttcaggagcacttttacttcaggagcactatgactttaggagcacttctcttcagacgcttcaagc 7745480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 393 - 493
Target Start/End: Original strand, 5430069 - 5430170
Alignment:
Q  393 catcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgt-gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcact 491  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||  ||||| ||||  | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  5430069 catctcctgatgaactgcagcttctggtgatttttaccttctgatgaacttgcttctgatgacgtcaccacttcagaagcactttgtcttcaggagcact 5430168  T
Q  492 tt 493  Q
    ||    
T  5430169 tt 5430170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Original strand, 13523060 - 13523222
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||| || || ||| | | |||||| ||| |||||| |||||||||||||| |   || ||||||| |  |||||||    
T  13523060 ctttgatcatccaccaataatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaagatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 13523159  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||||  | | || |||||||||||||||||||||    
T  13523160 agagctgtta-tcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacac 13523222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Original strand, 13533787 - 13533949
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |   || ||||||| |  |||||||    
T  13533787 ctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 13533886  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||||  | | || |||||||||||||||||||||    
T  13533887 agagctgtta-tcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggagatagtggttgtacac 13533949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20625049 - 20624887
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | | |||||  |||| ||||| ||||||||||||| ||   || |||||||||  |||||||    
T  20625049 ctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattctcatcttgaaggaacatttctgcaggc 20624950  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  20624949 atagctgtt-ttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtggtggaggtagtggttgtacac 20624887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 28464251 - 28464201
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28464251 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagcactt 28464201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 240
Target Start/End: Original strand, 17446731 - 17446833
Alignment:
Q  137 ttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgt 236  Q
    ||||||||||||||||   || |||||||||  ||||||||  |||||| | |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17446731 ttcaaattcattcccaacttgaaggaacatttctgcaggcatggctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 17446829  T
Q  237 acac 240  Q
    ||||    
T  17446830 acac 17446833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 34062845 - 34062743
Alignment:
Q  137 ttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgt 236  Q
    ||||||||||||||||   || |||||||||  ||||||||  |||||| | |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  34062845 ttcaaattcattcccaacttgaaggaacatttctgcaggcatggctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 34062747  T
Q  237 acac 240  Q
    ||||    
T  34062746 acac 34062743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 36095935 - 36095773
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | | |||||| ||||||| || |||||||||||||| |   || ||||||| | ||||||||    
T  36095935 ctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggatgtagtcctatgaaggattaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattttgcaggc 36095836  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||||  | | || |||||| ||||||||||||||    
T  36095835 agagctgtta-tcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacac 36095773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 36097392 - 36097230
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | | |||||| ||||||| || |||||||||||||| |   || ||||||| | ||||||||    
T  36097392 ctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggatgtagtcctatgaaggattaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattttgcaggc 36097293  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||||  | | || |||||| ||||||||||||||    
T  36097292 agagctgtta-tcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacac 36097230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 23391516 - 23391466
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  23391516 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgtcttcaggagcactt 23391466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 493
Target Start/End: Original strand, 30743251 - 30743296
Alignment:
Q  448 tgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcacttt 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30743251 tgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcgcttt 30743296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 398 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 14086484 - 14086392
Alignment:
Q  398 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgt-gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagca 489  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| | || |  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14086484 tctgatgaactgcagcttctggtaatttttagcttttgataaacttgcttctgatgacatcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagca 14086392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 444 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 19536186 - 19536138
Alignment:
Q  444 cttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  19536186 cttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtgttcaggagaactt 19536138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 528
Target Start/End: Original strand, 10848999 - 10849086
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt-tgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| | || || |||||||| |||| ||||    
T  10848999 tgcttttgatgatgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagcacttcagacttcaggagcagttttcttcagacgctttaagc 10849086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 240
Target Start/End: Original strand, 17457347 - 17457449
Alignment:
Q  137 ttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgt 236  Q
    ||||||||||||||||   || |||||||||  ||||||||  |||||| | |||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17457347 ttcaaattcattcccaacttgaaggaacatttctgcaggcatggctgttgt-cttgtcttgtagcgtatacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 17457445  T
Q  237 acac 240  Q
    ||||    
T  17457446 acac 17457449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 77 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 20168349 - 20168188
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |   ||  |||||| |  |||||||    
T  20168349 ctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggatgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgagggaacaattctgcaggc 20168250  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtaca 239  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  | | || |||||| |||||||||||||    
T  20168249 agagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtaca 20168188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Original strand, 21660454 - 21660504
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  21660454 tgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcactttgtcttcaggagcactt 21660504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 443 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 25930081 - 25930031
Alignment:
Q  443 gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcacttt 493  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  25930081 gcttctggtgacgtcatcacttcagaagcactttgtcttcaggagcacttt 25930031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 446 - 528
Target Start/End: Original strand, 26759418 - 26759500
Alignment:
Q  446 tctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||| | || || |||||||| |||| ||||    
T  26759418 tctgatgacgtcatcagttcaggagcactttgtcttcaggagcgctttatcttcaggagcagttttcttcagacgctttaagc 26759500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 443 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 35931915 - 35931866
Alignment:
Q  443 gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  35931915 gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgtcttcaggatcactt 35931866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 39799194 - 39799071
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtt--tgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||  |||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||     
T  39799194 gtgaaagatacgttgaggattgccaacacatcaaaa--agagtcgttgttgaagctt-gatca-tcaccaatgatctgttgcttaatttggttattgtct 39799099  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcc 150  Q
    || || ||| |||||| |||||||||||    
T  39799098 taggagggaacaatttgaaattcattcc 39799071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 150
Target Start/End: Original strand, 23488370 - 23488458
Alignment:
Q  63 agagtcgtt-tgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcc 150  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||||||  ||||||| ||||||    
T  23488370 agagtcgttgtgaaaccttgatcaatcaccaatgatcttctgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcatgttcaaatccattcc 23488458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 29138295 - 29138251
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcagga 486  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  29138295 tgcttctgatgacgtcatcactacaggagcactttgtcttcagga 29138251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 443 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 35986127 - 35986083
Alignment:
Q  443 gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggag 487  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  35986127 gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgtcttcaggag 35986083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 37406823 - 37406771
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  37406823 tcttgtcttgtagcgtagacaaaaatagagtagtggagatagtggttgtacac 37406771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Original strand, 21910776 - 21910827
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcac-tttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  21910776 tgcttctgatgacgtcatcacttcatgagcacttttgtcttcaggagcactt 21910827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 446 - 493
Target Start/End: Original strand, 42243935 - 42243982
Alignment:
Q  446 tctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcacttt 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  42243935 tctgatgacgtcatcacttcaggagcattttgtcttcaggagcgcttt 42243982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 89339 - 89289
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||    
T  89339 tgcttctgatgacgtcatcacttcagtagcactttgacttcagaagcactt 89289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 447 - 492
Target Start/End: Original strand, 17815222 - 17815268
Alignment:
Q  447 ctgatgacgtcatcacttcaggagcac-tttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  17815222 ctgatgacgtcatcacttcaggagcacttttgtcttcaggagcactt 17815268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 20797610 - 20797528
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttga-cttcagaatcacttctcttcagatgctt 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| |||||||| | |||||||  || || |||||||||||||    
T  20797610 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttcagcttcagaagcactttaagcttcagacgcagttttcttcagatgctt 20797528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Original strand, 21703197 - 21703266
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  21703197 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 21703266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Original strand, 21706044 - 21706113
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  21706044 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 21706113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 25096695 - 25096661
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 476  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25096695 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 25096661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 25154665 - 25154631
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 476  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25154665 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 25154631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Original strand, 30069975 - 30070044
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  30069975 tgcaggcatagctgttgtt-ttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 30070044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 21099591 - 21099558
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21099591 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 21099558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 523
Target Start/End: Original strand, 30070268 - 30070349
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgctt 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||||||||||| |  |||||||  || || |||||||||||||    
T  30070268 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttcagcttcaggagcactctagcttcagacacagttttcttcagatgctt 30070349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 31418559 - 31418478
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgctt 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||||||||||| |  |||||||  || || |||||||||||||    
T  31418559 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttcagcttcaggagcactctagcttcagacgcaattttcttcagatgctt 31418478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 480 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 89318 - 89270
Alignment:
Q  480 ttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  89318 ttcagtagcactttgacttcagaagcacttctcttcagacacttcaagc 89270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 3245394 - 3245294
Alignment:
Q  393 catcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgt-gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcact 491  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||     |||||| ||||  | |||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||    
T  3245394 catctcctgatgaactgcagcttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcactttagaagcactttgtcttcagaagcact 3245295  T
Q  492 t 492  Q
    |    
T  3245294 t 3245294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 522
Target Start/End: Original strand, 14447364 - 14447444
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgct 522  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||| |||  |||||| | || || ||||||||||||    
T  14447364 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcagtttagcttcaggagcagtttagcttcaggagcagttttcttcagatgct 14447444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 522
Target Start/End: Original strand, 14457976 - 14458056
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgct 522  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||| |||  |||||| | || || ||||||||||||    
T  14457976 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcagtttagcttcaggagcagtttagcttcaggagcagttttcttcagatgct 14458056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 526
Target Start/End: Original strand, 21703458 - 21703542
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaa 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||| ||||||||  |||||||  || || ||||||||||||||||    
T  21703458 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcacttcagcttcagaagcactttagcttcagacgcagttttcttcagatgcttcaa 21703542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 445 - 489
Target Start/End: Original strand, 28139825 - 28139869
Alignment:
Q  445 ttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagca 489  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  28139825 ttctgatgacgtcatcacttcaggagcagtttatcttcaggagca 28139869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 518
Target Start/End: Original strand, 33933536 - 33933612
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcaga 518  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||  |||||| | || || ||||||||    
T  33933536 tgcttctgatgacgttatcacttgaggagcactttgtctttaggaacactttttcttcaggagcagttttcttcaga 33933612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 522
Target Start/End: Original strand, 33952165 - 33952245
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgct 522  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||| |||  |||||| | || || ||||||||||||    
T  33952165 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcagtttagcttcaggagcagtttagcttcaggagcagttttcttcagatgct 33952245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 10754408 - 10754373
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttg 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10754408 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 10754373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 149
Target Start/End: Original strand, 13692307 - 13692370
Alignment:
Q  86 atcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattc 149  Q
    |||||||||||||| ||   | || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  13692307 atcaccaatgatctgttacttgatttggttattgtcctaggaaggaacaatttcaaattcattc 13692370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 524
Target Start/End: Original strand, 17447058 - 17447141
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtt-ttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttc 524  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    ||||| ||||||||  |||||||  || || ||||||||||||||    
T  17447058 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttttagcttcagaagcactttagcttcagacgcagttttcttcagatgcttc 17447141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 524
Target Start/End: Original strand, 17457674 - 17457757
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtt-ttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttc 524  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    ||||| ||||||||  |||||||  || || ||||||||||||||    
T  17457674 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttttagcttcagaagcactttagcttcagacgcagttttcttcagatgcttc 17457757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 393 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 30115828 - 30115745
Alignment:
Q  393 catcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgt-gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||     |||||| ||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30115828 catctcctgatgaactgcagcttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcatcacttcaggagcactt 30115745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 444 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 31448448 - 31448369
Alignment:
Q  444 cttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgctt 523  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||    |||||||||||| |  |||||||  || || |||||||||||||    
T  31448448 cttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttcagcttcaggagcactctagcttcagacgcagttttcttcagatgctt 31448369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 34052184 - 34052082
Alignment:
Q  137 ttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgt 236  Q
    |||||||||||| |||   || |||||||||  ||||||||  |||||| | |||||||||||||| ||||| |||  || |||||||| ||||||||||    
T  34052184 ttcaaattcatttccaacttgaaggaacatttctgcaggcatggctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaatagactagtggaggtagtggttgt 34052086  T
Q  237 acac 240  Q
    ||||    
T  34052085 acac 34052082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 39362228 - 39362181
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagca 489  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||    
T  39362228 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttagcttcaggagca 39362181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 8522032 - 8521964
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  8522032 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 8521964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 10754684 - 10754616
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  10754684 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 10754616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19464163 - 19464094
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  19464163 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggacgtagtggttgtacac 19464094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19478193 - 19478124
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  19478193 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggacgtagtggttgtacac 19478124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20797887 - 20797818
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||| ||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20797887 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgcagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 20797818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Original strand, 23478605 - 23478655
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    |||||||||| |||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||    
T  23478605 tgcttctgataacgtcatcacttcagagacactttgtcttcaggagcactt 23478655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Original strand, 24926485 - 24926535
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||   |||||||||||||    
T  24926485 tgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcactttagcttcaggagcactt 24926535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Original strand, 24983783 - 24983833
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||   |||||||||||||    
T  24983783 tgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcactttagcttcaggagcactt 24983833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Original strand, 43043740 - 43043809
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| || | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  43043740 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaagcagagtagtggaggtagtggttgtacac 43043809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Original strand, 43621929 - 43621997
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  43621929 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 43621997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 523
Target Start/End: Original strand, 1109491 - 1109572
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgctt 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||| ||||||||  |||||||  || || |||||||||||||    
T  1109491 tgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcacttcagcttcagaagcactttagcttcagacgcagttttcttcagatgctt 1109572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Original strand, 5290661 - 5290714
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaa-ctgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  5290661 tcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 5290714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Original strand, 5301237 - 5301290
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaa-ctgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  5301237 tcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 5301290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 5301481 - 5301514
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5301481 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 5301514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 7032474 - 7032507
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7032474 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 7032507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 8521756 - 8521675
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgctt 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||| ||||||||  |||||||  || || |||||||||||||    
T  8521756 tgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcacttcagcttcagaagcactttagcttcagacacagttttcttcagatgctt 8521675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 443 - 472
Target Start/End: Original strand, 9089180 - 9089209
Alignment:
Q  443 gcttctgatgacgtcatcacttcaggagca 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9089180 gcttctgatgacgtcatcacttcaggagca 9089209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 20551730 - 20551649
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttga-cttcagaatcacttctcttcagatgct 522  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||||||||||||| | |||||||  || || ||||||||||||    
T  20551730 tgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcacttcagcttcaggagcactttaagcttcagacgcagttttcttcagatgct 20551649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22559612 - 22559559
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaa-ctgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22559612 tcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 22559559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 27203724 - 27203691
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27203724 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 27203691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Original strand, 27622852 - 27622905
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaa-ctgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27622852 tcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 27622905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 31418837 - 31418784
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaa-ctgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  31418837 tcttgtcttgtagcgcagacaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 31418784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 31448728 - 31448675
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaa-ctgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  31448728 tcttgtcttgtagcgcagacaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 31448675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 34771826 - 34771793
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34771826 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 34771793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 34782771 - 34782738
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34782771 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 34782738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 39352402 - 39352369
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39352402 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 39352369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 40390271 - 40390238
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40390271 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 40390238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 40400933 - 40400900
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40400933 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 40400900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 42394895 - 42394862
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42394895 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 42394862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Original strand, 1109232 - 1109283
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  1109232 tcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 1109283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Original strand, 1121990 - 1122041
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  1121990 tcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 1122041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 492 - 528
Target Start/End: Original strand, 6499504 - 6499540
Alignment:
Q  492 ttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  6499504 ttgacttcagaaacacttcttttcagatgcttcaagc 6499540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 442 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 17606996 - 17606916
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgct 522  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||| ||   |||||| | || || ||||||||||||    
T  17606996 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcagtttagcttcaggagcagttgagcttcaggagcagttttcttcagatgct 17606916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 442 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 17617610 - 17617530
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgct 522  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||| ||   |||||| | || || ||||||||||||    
T  17617610 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcagtttagcttcaggagcagttgagcttcaggagcagttttcttcagatgct 17617530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 442 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 17718815 - 17718735
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgct 522  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||| ||   |||||| | || || ||||||||||||    
T  17718815 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcagtttagcttcaggagcagttgagcttcaggagcagttttcttcagatgct 17718735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 442 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 17729467 - 17729387
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgct 522  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||| ||   |||||| | || || ||||||||||||    
T  17729467 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcagtttagcttcaggagcagttgagcttcaggagcagttttcttcagatgct 17729387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 442 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 21517624 - 21517592
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21517624 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 21517592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 442 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 21519957 - 21519925
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21519957 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 21519925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 442 - 526
Target Start/End: Original strand, 21706322 - 21706406
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaa 526  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    ||||| ||||||||  |||||||  || || ||||||||||||||||    
T  21706322 tgcttctgatgacgtcatcactttagaggcacttcagcttcagaagcactttagcttcagacgcagttttcttcagatgcttcaa 21706406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #160
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 23392890 - 23392839
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23392890 tcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 23392839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Original strand, 24926226 - 24926277
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24926226 tcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 24926277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Original strand, 24983507 - 24983558
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24983507 tcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 24983558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 442 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 31348470 - 31348390
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgct 522  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||| ||   |||||| | || || ||||||||||||    
T  31348470 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcagtttagcttcaggagcagttgagcttcaggagcagttttcttcagatgct 31348390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 442 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 31359084 - 31359004
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgct 522  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||| ||   |||||| | || || ||||||||||||    
T  31359084 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcagtttagcttcaggagcagttgagcttcaggagcagttttcttcagatgct 31359004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 442 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 34051874 - 34051842
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34051874 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 34051842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 442 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 34062535 - 34062503
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34062535 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 34062503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 34783030 - 34782979
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  34783030 tcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 34782979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 442 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 36687595 - 36687515
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgct 522  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||| ||   |||||| | || || ||||||||||||    
T  36687595 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcagtttagcttcaggagcagttgagcttcaggagcagttttcttcagatgct 36687515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 442 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 36698161 - 36698081
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgct 522  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||| ||   |||||| | || || ||||||||||||    
T  36698161 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcagtttagcttcaggagcagttgagcttcaggagcagttttcttcagatgct 36698081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #170
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 442 - 522
Target Start/End: Original strand, 37778692 - 37778772
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgct 522  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||| ||   |||||| | || || ||||||||||||    
T  37778692 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcagtttagcttcaggagcagttgagcttcaggagcagttttcttcagatgct 37778772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 151)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 25 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 22455271 - 22454845
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||    
T  22455271 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataa-agtc--ttgaagttttgatcaatcaccaataatcttttgcctgacatggttattgtccta 22455175  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22455174 tgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacattgttgcaggcataaatgttattcttgtcatgtagcagagacacaaactgagtagtgga 22455075  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  22455074 ggtactggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcttttcaaaaagcaagcatccaatgccttcaacttcatttgaattaactgttgcttcac 22454975  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22454974 tcttctggtcttctgcaatgttgggcgtgattaaatccattgaacacccttttgaagctttaagtctctcatcttctgaagaacttcagcttctggtgat 22454875  T
Q  424 cttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    |||  |||||| |||| |||||||||||||    
T  22454874 cttcagcttctgatgaggtgcttctgatga 22454845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 25 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 23595849 - 23595404
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  23595849 gtgaaagagacgttataaattgccagcacatcaaaa--agagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtccta 23595752  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||    
T  23595751 tgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacattgttgcaggcatagctgttaatcttgtcctgtagcagagacacaaactgagtagagga 23595652  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  | | | | |||| |||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||    
T  23595651 ggtagtggttctacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct--tcagagaacaagaatccaatgccttcaaattcatttgaattagtcgttgcttcac 23595554  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatc 424  Q
    ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  23595553 tcttctggtcttctgcaatgctaggtgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaattctttcatcttctgatgatcttcagcttctggtgaac 23595454  T
Q  425 ttttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 476  Q
      |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23595453 --ttgcttctgatgaggtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 23595404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 25 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 10010034 - 10009606
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10010034 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 10009935  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10009934 cgaaggatcaatttcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtgga 10009835  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| |||| ||| | |||||||||||||| || || | | ||  || ||||||||| |||||    
T  10009834 gatagtggttgtacatttcgtacaattgtactatgtcaacgttcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcac 10009735  T
Q  325 t-ctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtga 422  Q
    | ||| ||||||| ||||||| || | || |||| ||||||||| ||| || ||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10009734 tcctcttggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagcccttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtga 10009635  T
Q  423 tcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    |||||  ||||| ||||  ||||||||||||    
T  10009634 tcttt--cttctgatgagatgcttctgatga 10009606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 25 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 39037925 - 39037474
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39037925 gtgaaagagacgttgtgaattgtcagcaaatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcgccaatgatcttttgtctgatatggttattgtccta 39037827  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     ||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39037826 tgaacgatcaatttcaaattcattctaagtatgaaggaacatcgttgcaggcatagctgttatccttgtcatgtagcagagacacaaactgagtagtgga 39037727  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||    
T  39037726 ggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatctaatgccttcaacttcatttgaattagccgttgcttcac 39037627  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    | ||||  |||||||||||| |||| || ||| ||||||| || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||    
T  39037626 tttcctaatcttctgcaatgcttagacgagatcaaatccaatgaacaacctttgaagttttaagtctctcatcttctgatcaactttaacttccggtgat 39037527  T
Q  424 cttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||  |||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39037526 cttcagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 39037474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 39 - 475
Target Start/End: Original strand, 24376932 - 24377369
Alignment:
Q  39 gtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaattt 138  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24376932 gtgatttgccagcacatcaaaata-gagtcgcttgaagctttgatcaatcaccaatgatctttttcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaattt 24377030  T
Q  139 caaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtac 238  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24377031 caaatccattccaagtatgaaggaacattattgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtac 24377130  T
Q  239 acatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttct 338  Q
    || ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  | ||   | ||  || |||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  24377131 acttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctctcaaaacctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttct 24377230  T
Q  339 gcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaat 437  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  24377231 gcaatgctaggcgtgattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaacttcagcttctggtgatctttagcttctgat 24377330  T
Q  438 g-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    | |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24377331 gaactttcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 24377369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 439
Target Start/End: Original strand, 25189218 - 25189629
Alignment:
Q  28 aaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacga 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  25189218 aaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagattttatcaatcaccaatgatattttgcctgatatggttattgtcctatga 25189316  T
Q  128 aggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagat 227  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||  |||||||||| |||||||||||| |    
T  25189317 aggatcaatttcaaatccattccaagtatgaatgaacattgttgcaggcatagctgttatccttgtccagtagtagagacacaaattgagtagtggaggt 25189416  T
Q  228 agtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactct 327  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  25189417 agtggttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagaatccaatgccttcaacttcatttgaattagtcattgcttcactct 25189516  T
Q  328 cctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaac-ttcagcttctggtgatctt 426  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| || |||||| |||||||||    
T  25189517 cctggtcttctgcaatgctaggtgtgattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtctctcatcttctaataaacttttagcttcaggtgatctt 25189616  T
Q  427 ttgcttctaatga 439  Q
      |||||| ||||    
T  25189617 cagcttctgatga 25189629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 26 - 474
Target Start/End: Original strand, 19540234 - 19540680
Alignment:
Q  26 tgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctac 125  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||  | |||||||||||||| ||     
T  19540234 tgaaagaaacgttgtgaattggcagcacatcaaaa-aagagtcgtttgaagctttgattaatcactagtgatcttttgcttgatatggttattgtcttat 19540332  T
Q  126 gaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggag 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19540333 gaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgagggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgccttgtagcagagacacaaactgagtagtggag 19540432  T
Q  226 atagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcact 325  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||| ||   | || ||| |||  |||| ||||||    
T  19540433 atagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctctttaaagaacaagcatccaataccttcaaaacctttcgaaatagccgttgcttcact 19540532  T
Q  326 ctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatc 424  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||  | |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  19540533 ctcctagtcttctgcaatgcttagatgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcatgatgaacttcagcttctggtgatc 19540632  T
Q  425 ttttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact 474  Q
      |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19540633 --ttgcttctgatgaggtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact 19540680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 25 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 13964261 - 13963811
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||     
T  13964261 gtgaaagagacgttgtgaattgtcagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaacgatcttttgcctgatatggttcttgtcctc 13964163  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
      ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13964162 taaaggatcaatttcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcggagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtgga 13964063  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || ||| ||  || |||| |||| |||||    
T  13964062 gatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcac 13963963  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    |||    ||||||| ||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||  ||||||| |||||    
T  13963962 tctttcagtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaaatcttgcatctactgatgaactagagcttctagtgat 13963863  T
Q  424 cttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    ||||  ||||| | | |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13963862 ctttaacttctgaggaacttgcttctgatgacgt-atcacttcaggagcactt 13963811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 25 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 21537533 - 21537107
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||     
T  21537533 gtgaaagagacgttgtgaattgccaggacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctg 21537435  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc--agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
     |||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||| ||||| |||   |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  21537434 tgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgagggaacaatgttgtaggggaagagctgttattcttgtcttgtagcaaagacacaaactgagtagtg 21537335  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattc 322  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||   | ||  || |||| |||| |||    
T  21537334 gagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatccaatgcctccaaaacctttcaaaatagtcgttgcttc 21537235  T
Q  323 actctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtg 421  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||  || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||| ||||| |||    
T  21537234 actcttctggtcttctgcaatgtttaaacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcatcttctagtg 21537135  T
Q  422 atcttttgcttctaatgatgtgcttctg 449  Q
    ||||||  ||||| |||| |||||||||    
T  21537134 atctttaacttctgatgaggtgcttctg 21537107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 43 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 22188367 - 22187957
Alignment:
Q  43 attgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaa 142  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22188367 attgtcagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaa 22188269  T
Q  143 ttcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacat 242  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22188268 tccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 22188169  T
Q  243 cgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaa 342  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || |  |||  || ||||||||| ||||||||    |||||||||||    
T  22188168 cgtacaattatactttgttaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatctattcaaaatagttgttgcttcactctttcagtcttctgcaa 22188069  T
Q  343 t-gttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatg 441  Q
    |  |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||      
T  22188068 tacttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatgtcctgatgaacttcaacttctggtgatcttcagcttctgatgaga 22187969  T
Q  442 tgcttctgatga 453  Q
    ||||||||||||    
T  22187968 tgcttctgatga 22187957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 25 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 23184586 - 23184147
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  23184586 gtgaaagagacgttataaattgccagcacatcaaaa--agagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtccta 23184489  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||    
T  23184488 tgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacattgttgcaggcatagctgttaatcttgtcctgtagcagagacacaaactgagtagagga 23184389  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| | | | ||   || |||||||||||| || ||||||||||||||| | || |||||    
T  23184388 ggtagtggttctacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct-tcagagaa--cagaatccaatgccttcaaattcatttgaattagtcg-tgcttcac 23184293  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatc 424  Q
    ||| |||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  23184292 tcttctggtcttctgc-atgctaggtgtgatt-aatcctttgaacaacctttgaagctt-aattct-tcatcttctgatgatcttcagcttctggtgaac 23184197  T
Q  425 ttttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 476  Q
      |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23184196 --ttgcttctgatgaggtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 23184147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 25 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 9015651 - 9015226
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  9015651 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagttttgatcaatcaccaatgatcttttgcatgatagggttattgtccta 9015553  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||    
T  9015552 tgaaggatcaatttcaaatccattcccagtatgtatgaacattgttgcaggcggagctgttctccttgtcttatagcagagatacaaactgagtagtgga 9015453  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| || || | | ||  || ||||||||| |||||    
T  9015452 gatagtggttgtacac--cgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgtttcac 9015355  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    ||| |  ||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||| || |||||| |||    
T  9015354 tcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttagtttctgg-gat 9015256  T
Q  424 cttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    ||| ||||||| ||||  || |||||||||    
T  9015255 cttctgcttctgatgagttgtttctgatga 9015226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 25 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 41122001 - 41121557
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||| ||    
T  41122001 gtgaaagagacgttgtgaattgctagtacaccaaaa--agagtcgtttgaagctttgatcaatcacgaatgatctttttcctgatatggttattgtcata 41121904  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41121903 tgaaggatcaatttcaaatccatttcaagtatgaaggaacatcgttacaggcatagctgttattcttgtcctgtagcagagacacaaacagagtagtgga 41121804  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | |||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||  |||||||||||| || | | |||||||||||  ||| |||||    
T  41121803 ggtagtggttgtacatttcgcacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagagcaataatccaatgccttcaaatccttttgaattagtctttgcttcac 41121704  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatc 424  Q
    ||  |   |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| || |||| || |||||||||| ||||||||||||||||      
T  41121703 tcatccaatcttctgcaatgctaggcgtgattaaatcctttgaacagcctttgaagctttaattctcacagcttctgatgatcttcagcttctggtga-- 41121606  T
Q  425 ttttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcac 473  Q
    | |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41121605 tgttgcttctgatgaggtgcatctgatgacgtcatcacttcaggagcac 41121557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 25 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 20569033 - 20568605
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  20569033 gtgaaagagacgttgtgaattttcagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcgccaatgatcttttgcctgatatggttattggccta 20568935  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||     
T  20568934 tgaaggatgaatttcaaatttgttcccagtatgtaggaacattgttgtaagcagagttgttattcttgtcttatagcagatacacaaactgagtagtggg 20568835  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | | ||  || | ||||||| |||||    
T  20568834 gatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaattgttgttgcttcac 20568735  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    ||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||| | ||| ||||| |||||| ||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  20568734 tcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccatggaacagcctttaaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacagcttctggtgat 20568635  T
Q  424 cttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    |||   ||||| ||||  ||||||||||||    
T  20568634 cttgaacttcttatgagatgcttctgatga 20568605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 25 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 24850949 - 24850520
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||||     
T  24850949 gtgaaagagacgttgtgaattgcaagcacatcaaaata-gagtcgttttaagctttgatcaatcaccaatgatattttgcttgatatggtgattgtcctt 24850851  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
      ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  24850850 taaaggatcaatttcaaatccattccaagtatggaggaacattgttgcaggcaaagctgttattcttgtcttgtagcagagacacacactgagtagtgga 24850751  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
      |||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || | | ||  || || | |||| |||||    
T  24850750 tgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttgaaatcctttcaaaatattcgttgcttcac 24850651  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtga 422  Q
    ||| ||||||||| ||||||  ||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||  ||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  24850650 tcttctggtcttcagcaatgcgtagacgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgtacttcagcatctggtga 24850551  T
Q  423 tcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  24850550 tctttagcttctgatgaggtgcttctgatga 24850520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 47 - 453
Target Start/End: Original strand, 23234846 - 23235252
Alignment:
Q  47 ccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattca 146  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  23234846 ccagcacatcaaaata-gagttgtttgaagctttgatcaatcaccaataatcttttgcctgatatggttattgtcctctgaaggatcaatttcaaatcca 23234944  T
Q  147 ttcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgta 246  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23234945 ttgccagtatgtaggaacattgttgcaggcggaactgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgta 23235044  T
Q  247 caattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-t 345  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||| |  |||||||||||||||| || ||| ||  || |||| |||| || ||||| |  ||||||||||||| |    
T  23235045 caattgtactttgtcaacactcttcaaagaataagcatccaatgccttcaaattctttcaaaatagtcgttgctttactcttccagtcttctgcaatgct 23235144  T
Q  346 taggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgct 445  Q
    ||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  |||||  |||||||||  ||||||||||||| ||  |||||| ||||  ||||    
T  23235145 tagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatctcatgatgaactagagcttctggtgattttcagcttctgatgagatgct 23235244  T
Q  446 tctgatga 453  Q
    ||||||||    
T  23235245 tctgatga 23235252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 25 - 453
Target Start/End: Original strand, 24575852 - 24576279
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||     
T  24575852 gtgaaagagacgttgttgatttccagaacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatctttttccggatatggttattgtcctt 24575950  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  24575951 tgaaggatcaatttcaaatccattcccagtatgtgggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactaagtagtgga 24576050  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  | ||| || ||||||||||||| | | ||  || ||||||||| |||||    
T  24576051 ggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaactctcttcaacgaacaaacaaccaatgcctttaaatcctttcaaaatagttgttgcttcac 24576150  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtga-ttaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtga 422  Q
    | | |  ||||||||||||| ||||  | || |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  24576151 ttttccagtcttctgcaatgcttagatgagatttaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtattgcatctcctaatgaactttagcttctggtga 24576250  T
Q  423 tcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    ||  |||||| | ||||| ||||||||||||    
T  24576251 tc--ttgcttatgatgatatgcttctgatga 24576279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 28 - 492
Target Start/End: Original strand, 25828953 - 25829403
Alignment:
Q  28 aaagagacgttgtga-attgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacg 126  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||  |    
T  25828953 aaagagacgttgtcacattgccaacacatcaaaata-gattcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatgattattgtcctctg 25829051  T
Q  127 aaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggaga 226  Q
    |||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  25829052 aaggatcaattttaaatccattccatgtatgtaggaacattgttgcatgcagagttgttatccttgtcttgcagcagagacacaaaatgagtagtggaga 25829151  T
Q  227 tagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactc 326  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | | ||  || |||| |||| |||||||    
T  25829152 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 25829251  T
Q  327 tcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatct 425  Q
    | |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  25829252 ttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttgaagctctaagtcttgcatctcctgatgaactttagcttctggtgatct 25829351  T
Q  426 tttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcac-tttgttttcaggagcactt 492  Q
                    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  25829352 ----------------tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttttgtcttcaggagcactt 25829403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 25 - 528
Target Start/End: Original strand, 22317410 - 22317930
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  22317410 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaaactttgatcaatcaccaatgatctttttcctgatatggttattgtccta 22317508  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | ||||||| |||||||    
T  22317509 tgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacattgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgcagcagagataaaaactgaatagtgga 22317608  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatt-tgaattagttgttgattca 323  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||| | | ||   || |||| |||| ||||    
T  22317609 ggtagtggttgtatacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctttaaatcctttcaaaaatagtcgttgcttca 22317708  T
Q  324 ctctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtga 422  Q
    |||| || ||||| ||||||| ||||  | ||||||||||| || | | |||||||||||| ||||||  |||||  ||||||| |  ||||||||||||    
T  22317709 ctcttctagtcttatgcaatgcttagatgagattaaatccaatgaaaagcctttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaaatagagcttctggtga 22317808  T
Q  423 tcttttgcttctaatg---------atg-------tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatca 506  Q
    | ||  |||||| |||         |||       ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||    
T  22317809 ttttcagcttctgatgtacttgcttatgatgaacttgcttatgatgacgtcaccacttcaggagcactttgtcttcagtagcactttgacttcaggagca 22317908  T
Q  507 cttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
     ||||||||||| |||| ||||    
T  22317909 gttctcttcagacgctttaagc 22317930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 28 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 25037540 - 25037114
Alignment:
Q  28 aaagagacgttgtga-attgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacg 126  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||       
T  25037540 aaagagacgttgtcacattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatctttttcctgatatggttattgtactctt 25037442  T
Q  127 aaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggaga 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25037441 aaggatcaatttcaaatccattccatgtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggaga 25037342  T
Q  227 tagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactc 326  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || ||| | ||| |||||||||| || || | | ||  ||||||| |||   ||||||    
T  25037341 tagtggttgtacacttcgaacaattgtactttgtcaacgcttttcaaagaacaaacatccaatgctttcaaatcctttcaaattagtcgttacatcactc 25037242  T
Q  327 tcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatct 425  Q
    | |  ||||||||||||| || | |  |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  25037241 ttccagtcttctgcaatgcttcgacaagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatct 25037142  T
Q  426 tttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    |  |||||| ||||  ||||||||||||    
T  25037141 tcagcttctgatgagatgcttctgatga 25037114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 25 - 344
Target Start/End: Original strand, 40782294 - 40782612
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  40782294 gtgaaagagacgttgtgaattgccaacacatcaaaata-gagtcgtttgaatctttgatcaatcatcaatgatcttttgcctgatatggttattgtccta 40782392  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  40782393 tgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggtagagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactaagtattgga 40782492  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||| || || | | ||  || |||| |||| |||||    
T  40782493 gatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcac 40782592  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg 344  Q
    ||  |||||||| |||||||    
T  40782593 tcctctggtcttttgcaatg 40782612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 28 - 418
Target Start/End: Original strand, 30666808 - 30667199
Alignment:
Q  28 aaagagacgttgtga-attgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacg 126  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||| |||  |    
T  30666808 aaagagacgttgtcacattgccagcacatcaaaata-gagttgttcgaagctttggtcaatcaccaatgatctttttcctgaaatggttattgacctctg 30666906  T
Q  127 aaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggaga 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30666907 aaggatcaatttcaaatccattctatgtatgtaggaacattgttgcaggcagcgctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggaga 30667006  T
Q  227 tagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactc 326  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | | ||  || |||| |||| |||| ||    
T  30667007 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagatcaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcattc 30667106  T
Q  327 tcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctg 418  Q
    | |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  ||||| |||||||||| || ||||||    
T  30667107 ttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaattcttgcatctcctgatgaactacaacttctg 30667199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 25 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 6574409 - 6573942
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  6574409 gtgaaagagacgttgtgaattgccaacacattcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcct 6574311  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagac-acaaactgagtagtg 222  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||    
T  6574310 atgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatctttgcaggcagagctgtttttcttgttttgtagcagagacaaaaaacagagtagtg 6574211  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaa-ttggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgatt 321  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||  || | ||| ||||||||||||| || | | ||  || |||| |||| ||    
T  6574210 gaggtagtggttgtacacttcgtacaatttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgctt 6574111  T
Q  322 cactctcctggtcttctgcaatg--ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctgg 419  Q
    |||| | |  |||||||||||||  |||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||| |  | |  |||||||||||||||| || ||||| |    
T  6574110 cacttttccagtcttctgcaatgcattagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagcttta--tgttgcatcttctgatgaactgcaacttctag 6574013  T
Q  420 tgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagca 489  Q
    |||| ||  |||||| ||| |  |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  6574012 tgattttcagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcactactttaggagcactttgtcttcagaagca 6573942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 25 - 453
Target Start/End: Original strand, 38781215 - 38781642
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  38781215 gtgatagagacgttgtgaattgacagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctgatatgattattgtccta 38781313  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaact-gagtagtgg 223  Q
     |||||||||||||||||| |||||||| | || ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||    
T  38781314 tgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaagggacatcgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaaatagagtagtgg 38781413  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattca 323  Q
    |  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||| ||| ||||||||| || | | ||  || ||||||||| ||||    
T  38781414 atgtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaatcattcaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttca 38781513  T
Q  324 ctctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtga 422  Q
    || | |  ||||||| || || |||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||    || ||||||||||    
T  38781514 cttttccagtcttctacattgtttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatcctctgatga--gacatcttctggtga 38781611  T
Q  423 tcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    ||||  |||||| ||||  ||||||||||||    
T  38781612 tcttcagcttctgatgagatgcttctgatga 38781642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 43 - 423
Target Start/End: Original strand, 30621051 - 30621431
Alignment:
Q  43 attgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaa 142  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  30621051 attgctagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatctttttcctcatatggttagtgtcctatgaaggatcaatttcaaa 30621149  T
Q  143 ttcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacat 242  Q
    | |||||   |||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  30621150 tccattctatgtatgtaggaacattgttgcaggcaacgctgttatcattgtgttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttttacactt 30621249  T
Q  243 cgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaa 342  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||| || | | ||  || |||| | || |||||||| |  |||||||||||    
T  30621250 cgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagatcaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgctgcttcactcttccagtcttctgcaa 30621349  T
Q  343 tg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    || |||  || |||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||  ||||| |||||| ||| || ||||| |||||    
T  30621350 tgcttacacgagattaaatccattgaacaacctttgaacctttaattcttgcatctcctgatgcactacaacttctagtgat 30621431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 43 - 423
Target Start/End: Original strand, 30623672 - 30624052
Alignment:
Q  43 attgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaa 142  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  30623672 attgctagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatctttttcctcatatggttagtgtcctatgaaggatcaatttcaaa 30623770  T
Q  143 ttcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacat 242  Q
    | |||||   |||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  30623771 tccattctatgtatgtaggaacattgttgcaggcaacgctgttatcattgtgttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttttacactt 30623870  T
Q  243 cgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaa 342  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||| || | | ||  || |||| | || |||||||| |  |||||||||||    
T  30623871 cgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagatcaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgctgcttcactcttccagtcttctgcaa 30623970  T
Q  343 tg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    || |||  || |||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||  ||||| |||||| ||| || ||||| |||||    
T  30623971 tgcttacacgagattaaatccattgaacaacctttgaacctttaattcttgcatctcctgatgcactacaacttctagtgat 30624052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 77 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 28140851 - 28140436
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28140851 ctttgatcaatcaacaatgatcttttgcctgatatggttattgttctatgaaggatcaatttcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 28140752  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaa 276  Q
    |||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |    
T  28140751 agagctattatccttgccttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtgatggtacactttgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaaga 28140652  T
Q  277 gcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctt 375  Q
     |||||||||||||  || || | | ||  || ||||||||| |||||||   || |||| ||||||| || | || |||| ||||||||| ||||||||    
T  28140651 acaagcatccaatgttttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactccaatgatcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctt 28140552  T
Q  376 tgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcac- 473  Q
    ||||| || ||||||  ||||| | |||||||||||||||||| |||     ||||||| ||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  28140551 tgaagttttaagtcttgcatctcccgatgaacttcagcttctgatga---gatgcttctgatgaacttgcttttgatgacgtcatcacttcaggagcact 28140455  T
Q  474 tttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||  |||||||||||||    
T  28140454 tttgacttcaggagcactt 28140436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Original strand, 22258018 - 22258231
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  22258018 gtgaaagagacgttgtgatttgccagcatatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgctcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtccta 22258116  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22258117 tgaagaatcaatttcaaatccattcctagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtgga 22258216  T
Q  225 gatagtggttgtaca 239  Q
    |||||||||||||||    
T  22258217 gatagtggttgtaca 22258231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 25 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 28711982 - 28711517
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  28711982 gtgaaagagacgttgtaaattgtcagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatagttattgtcct 28711884  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||    
T  28711883 atgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcattgcaggcagagctgtttttcttgtcttttagcagagacaaaaacagagtagtgg 28711784  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattca 323  Q
    || |||||||||||||| ||||||||  | ||||| |||||||||||  || | ||||||||||||||||| || |||||| ||| |||| |||| || |    
T  28711783 aggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttttcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaattcattcgaaatagtcgttgcttta 28711684  T
Q  324 ctctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtga 422  Q
    || | |  ||||||||||||  |||| |  | || ||||||||  ||| | |||||||| | |||  |  ||||   | ||||||| |||||||||||||    
T  28711683 cttttccagtcttctgcaatctttagacaaggttgaatccattaaacagcttttgaagccttaag--ttgcatcccattatgaactgcagcttctggtga 28711586  T
Q  423 tctttt-gcttctaat-gatgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagca 489  Q
    | |||| |||||| ||  |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28711585 ttttttggcttctgataaacttgcttctgatgacgtcaccacttcaggagcactttgtcttcaggagca 28711517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 25 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 31801170 - 31800668
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  31801170 gtgaaagagacgttg--aattgccagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcc 31801074  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    || ||| |||||||||||||| |||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  31801073 taagaatgatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtg 31800974  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattc 322  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||  || | ||| |||||||||| || || | | ||  || ||||||||| |||    
T  31800973 gagatagtggttgtacacttcgtacaaatgtactttgtcaacgctctttgaagatcaaacatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgtttc 31800874  T
Q  323 actctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtg 421  Q
    ||| | |  ||||||||||||   ||| || | ||  ||||| |   || | |||||||||| |||  |  ||||   ||||||||| ||| ||||||||    
T  31800873 acttttccagtcttctgcaataaatagacgagtttggatccactaagcagcttttgaagctttaag--ttgcatcccatgatgaactgcagtttctggtg 31800776  T
Q  422 atcttttgcttctaat-gatgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatg 520  Q
    ||  ||||||||| ||  |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| | || || |||||||| |    
T  31800775 attatttgcttctgataaacttgcttctgatgacgccatcacttcaggagcactttgtcttcaggagcactttatcttcaggagcagttttcttcagacg 31800676  T
Q  521 cttcaagc 528  Q
    ||| ||||    
T  31800675 ctttaagc 31800668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 72 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 20152263 - 20151854
Alignment:
Q  72 tgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttg 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||  |||    
T  20152263 tgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctgatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatctttg 20152164  T
Q  172 caggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctta 271  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||         |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  20152163 caggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagag---------tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttt 20152073  T
Q  272 aaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtaca 370  Q
     || | ||||||||||||||||| || | | ||  || ||   |||| |||||| | |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||    
T  20152072 gaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaactaaccgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaaca 20151973  T
Q  371 acctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcagga 469  Q
    || |||||||||| || | |  ||||| ||||||| || |||||||||||||| ||  |||||| ||| |  || ||||||||||||||  | |||||||    
T  20151972 acttttgaagctttaa-tgttgcatctcctgatgagctgcagcttctggtgattttcagcttctgatgaacttgtttctgatgacgtcactatttcagga 20151874  T
Q  470 gcactttgttttcaggagca 489  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  20151873 gcactttgtcttcaggagca 20151854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 426
Target Start/End: Original strand, 19114901 - 19115300
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgt-gaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaa-tcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  19114901 gtgaaagagacgttgtcgaattgccagcacatcaaaa--agagacgtttgaagctt-gatcaaatcaccaatgatcttttgcctaatttggttattgtcc 19114997  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaa-ctgagtagt 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| | | ||  ||||||||| | |||||||    
T  19114998 tacgaaggatcaatttcaaattcatttcaagtatggaggaacattgatgcaggcatagctgttgttcttgtcctattgc--agacacaaatcagagtagt 19115095  T
Q  222 ggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgatt 321  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||| ||||  ||  |  | ||||||| || ||| |  | ||| |||||||||||||| ||    
T  19115096 ggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacactctccaacgaataggcatccactggcttcacatccatctgaattagttgttgctt 19115195  T
Q  322 cactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtg 421  Q
    || ||| |  ||||||||||||  |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||| |||||||  ||| ||    
T  19115196 cattcttccagtcttctgcaatagtaggcgagattaaattctttgaacaacctttgaagcttcaattctttcagcttctgatgatcttcagcacctgatg 19115295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 26619382 - 26618998
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaa-tcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||  || || || ||||||||||    
T  26619382 gtgaaagagacattgttgattgccaacacatcaaaa--agagtcgtttaaagctt-gatcaaatcaccaatgatctttttcctgatttgattattgtcct 26619286  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| || |||||||| ||||||| |||||||| | | || || ||| |||| |||||||||    
T  26619285 atgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatggaggaacactgatgcaggcatagctgttgttcttgtcctattgcagacaca-aaacagagtagtgg 26619187  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattca 323  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||| |||  ||| |  |||||| ||||||||| || ||| |||||| ||||||||| ||||    
T  26619186 agatagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgttctccaaagaataagcattcaatgccttcaaattcttttgaaatagttgttgcttca 26619087  T
Q  324 ctctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcag 412  Q
     ||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| || ||| ||| |||||| ||| ||||||    
T  26619086 ttcttccagtcttctgcaatgataggcgtgattaaatcatttgaacaacctttgaagcttcaattctttcagcttctgttgatcttcag 26618998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 28551201 - 28550932
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  28551201 gtgaaagagacgttg--aattgccagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgatcctttgtctgatacggttattgtcc 28551105  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    || |||||||||| ||||||| | |||||| | || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  28551104 tatgaaggatcaaattcaaatgcgttcccaatgtgaagaaacattgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtg 28551005  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 295  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||||||    
T  28551004 gagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttt 28550932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 188 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 18377027 - 18376741
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatcca 287  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  18377027 tcttgtcctgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcca 18376928  T
Q  288 atgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaa 386  Q
    ||||||| || | | ||  || |||| ||||||||||| |     |||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  18376927 atgccttcaaatcctttcaaaatagtagttgattcactattaaaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaa 18376828  T
Q  387 gtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagca 472  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18376827 gtctctcatcttcaaatgaacttcaacttctggtgatcttctgcttctgatgaacttacttctgatgacgtcatcacttcaggagca 18376741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 453
Target Start/End: Original strand, 22271955 - 22272375
Alignment:
Q  30 agagacgttgt-gaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaa-tcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacga 127  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||    
T  22271955 agagacgttgttgattttccagcacatcaaaa--agagtcgtttgaacctt-gatcaaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttattgtcctatga 22272051  T
Q  128 aggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaa-ctgagtagtggaga 226  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| || |||||||| |||||||||||||||| | | ||  ||||||||| |  |||||||||||    
T  22272052 aggatcaatttcaaattcattccaagtctggaggaacactggtgcaggcatagctgttattcttgtcctattgc--agacacaaatcacagtagtggaga 22272149  T
Q  227 tagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctct-taaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcact 325  Q
    |||||||||||||| || |||||||   |||| ||||| ||||  ||  ||  |||||||||||||||| || | |||||||||||||  ||| |||| |    
T  22272150 tagtggttgtacacttcttacaattttcctttttcaactctctccaacgaaaaaagcatccaatgccttcaaatccatttgaattagtcattgcttcatt 22272249  T
Q  326 ctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatct 425  Q
    || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||| |||||||||||| ||  || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |    
T  22272250 cttccagtcttctgcaatgatagacgtgattaaatcatttgaacaacctttgaaactccaattctctcagcttctgatgatcttcagcttctggtga--t 22272347  T
Q  426 tttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
     |||||||| |||| ||| |||||||||    
T  22272348 gttgcttctgatgaggtgtttctgatga 22272375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 40 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 31968313 - 31967870
Alignment:
Q  40 tgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatt 137  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| || |    
T  31968313 tgaattgccagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggattaaat 31968215  T
Q  138 tcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgta 237  Q
    |||||| | ||| || | || || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  31968214 tcaaatgcgttctcaatgtgaagaaacattgttgcaggcagagttgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgta 31968115  T
Q  238 cacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttc 337  Q
    ||| ||||||||  | | | |||||||||||||  || |  ||||||||||||| ||| |         || ||||||||| |  ||| | |  ||||||    
T  31968114 cacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcatttca---------aaatagttgttgctatacttttccagtcttc 31968024  T
Q  338 tgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaat 437  Q
    |||||| ||| ||| | || ||||| |   ||||| ||||| |||| |||  |  |||||||||||||||| ||||||||||||||      ||||| ||    
T  31968023 tgcaattttatgcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaggctttaag--ttgcatcttctgatgaactgcagcttctggtgattcacaacttcttat 31967926  T
Q  438 g-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    | |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31967925 gaacttgcttctgatgatgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagcactt 31967870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 25 - 488
Target Start/End: Original strand, 6392451 - 6392914
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  6392451 gtgaaagagacgttg--aattgccaacacattcaaaataa-agtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgatcatttgcctaatatggttgttgtcc 6392547  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  6392548 taagaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctatttttcttgtcttgtagcagagaca-aaacagagtagtg 6392646  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctc-ttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgatt 321  Q
    ||| |||||||||  ||| ||||||||  | ||||||||||||||| ||  |  | |||||||||||||| || || | | ||  || |||| |||| ||    
T  6392647 gaggtagtggttgcgcacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaaatagtcgttgctt 6392746  T
Q  322 cactctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatc-cattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctgg 419  Q
    |||| | |  ||||||||||||  |||| || | || |||| ||||  ||| | |||||||| | |||     |||| ||||||||||| || ||| |||    
T  6392747 cacttttccagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcacattaaacagcttttgaagccttaag--atgcatcctctgatgaactgcaacttatgg 6392844  T
Q  420 tgatcttttgcttctaat-gatgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagc 488  Q
    |||| ||| |||||| ||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6392845 tgatttttagcttctgataaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagc 6392914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 25 - 475
Target Start/End: Original strand, 44880986 - 44881431
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaa-tcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    |||||||||||||| |  |||| |||||||| ||||  ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| |    
T  44880986 gtgaaagagacgttattgattgtcagcacattaaaa--agagtcgtttgaagcct-gatcaaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttattgtctt 44881082  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaa-ctgagtagtg 222  Q
    | ||| |||||||||||||| |||| | ||| || ||||||| || |||| ||| ||||||| ||||| || | | ||  | ||||||  | ||||||||    
T  44881083 atgaatgatcaatttcaaatccattacaagtctggaggaacactggtgcatgcatagctgttgttcttttcctattgc--atacacaattcagagtagtg 44881180  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattc 322  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||| ||||  || ||  || ||||||||||||| ||   |||||||||||| || || |||    
T  44881181 gagatagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaactctctccaacaaaaaaacatccaatgccttcaaacccatttgaattagctgctgcttc 44881280  T
Q  323 actctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtga 422  Q
    | ||| |  ||||||||||||| ||| ||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||| || | ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  44881281 attcttccagtcttctgcaatgatagacgtgattaagtcatttgaacagcctttgaagcttcaattatctcagcttctgatgatcttcagcttttggtga 44881380  T
Q  423 tcttttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
      | |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44881381 --tgttgcttctgatgaggtgcttctgatgacgtcagcacttcaggagcactt 44881431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 34322219 - 34321950
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  34322219 gtgaaagagacgttg--aattgccagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcc 34322123  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    || ||||||||||||||||||  || |||| |  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||  ||||||||    
T  34322122 taagaaggatcaatttcaaatgtatacccattgagaaggaacattgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagaaacaaaaatagagtagtg 34322023  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 295  Q
     ||||||||||||||||| || |||||  | ||| |||||||||||||  || |  ||| |||||||||||||    
T  34322022 aagatagtggttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagaatccaatgccttt 34321950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 63 - 528
Target Start/End: Original strand, 44840287 - 44840741
Alignment:
Q  63 agagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagg 161  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| | || |      
T  44840287 agagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgaata 44840386  T
Q  162 aacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtc 261  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| ||||    
T  44840387 aacattgttgcaggcagagctggtatccttgtcttatagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtc 44840486  T
Q  262 aacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatc 361  Q
    |||||||||  || |  |||||||||||||||     ||||    || |||| ||||    ||| |    |||| ||||||||||||||| | || ||||    
T  44840487 aacgctctttgaagaataagcatccaatgcct-----ttca----aaatagtcgttgccatactttttcagtct-ctgcaatgttaggcgagtttgaatc 44840576  T
Q  362 cattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgt-gcttctgatgacgtcatc 460  Q
    | |   ||| | |||||||||| ||||  |  ||||  ||||||||| ||||||||| |||   ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  44840577 cttgaaacagcttttgaagctttaagttgc--atctcttgatgaactgcagcttctgatgaa--tttgcttctgatgatcttgcttctgatgacgtcatc 44840672  T
Q  461 acttcaggagcactttgttttcaggagcactt-tgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| | || || |||||||| |||| ||||    
T  44840673 acttcaggagcactttgtcttcaggagcacttcagacttcaggagcagttttcttcagacgctttaagc 44840741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Original strand, 33074043 - 33074267
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||    
T  33074043 gtgaaagagacgttg--aattgccagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgattctttgcctgatatggttattgtcc 33074139  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    || |||| |||||||||||||  ||||||| |  | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  33074140 taagaagaatcaatttcaaatgtattcccactgagaagaaacattgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtg 33074239  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaat 250  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  33074240 gagatagtggttgtacacttcgtacaat 33074267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 25 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 1587315 - 1587047
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||||||||    
T  1587315 gtgaaagagacgttg--aattgccaacacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgatcctttgcttgatatgattattgtcc 1587219  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    || ||||||||||||||||||  |||| || |  | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  1587218 tatgaaggatcaatttcaaatgtattctcattgagaagaaacattgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagaca-aaacagagtagtg 1587120  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 295  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |   ||||||||||||||||    
T  1587119 gagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattagcatccaatgccttt 1587047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 25 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 22776571 - 22776302
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagctttga-tcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||    
T  22776571 gtgaaagagacgttg--aatttccagcacattcaaaata-gagtcgttcgaagcttttaatcaatcaccaatgatcctttgcccgatatggttattgtcc 22776475  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    || |||||||||||||||||| | |||| | | || |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||    
T  22776474 tatgaaggatcaatttcaaatgcgttccaaatgtgaataaacattgttgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtactg 22776375  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 295  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||||||    
T  22776374 gagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttt 22776302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 25 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 22781949 - 22781680
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagctttga-tcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||    
T  22781949 gtgaaagagacgttg--aatttccagcacattcaaaata-gagtcgttcgaagcttttaatcaatcaccaatgatcctttgcccgatatggttattgtcc 22781853  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    || |||||||||||||||||| | |||| | | || |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||    
T  22781852 tatgaaggatcaatttcaaatgcgttccaaatgtgaataaacattgttgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtactg 22781753  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 295  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||||||    
T  22781752 gagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttt 22781680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 167 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 25041508 - 25041221
Alignment:
Q  167 tgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgc 266  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  25041508 tgttgcaggcagagttgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgaacaattgtactttgtcaacgc 25041409  T
Q  267 tcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccatt 365  Q
    | || ||| | ||| |||||||||| || || | | ||  ||||||| |||   ||||||| |  ||||||||||||| || | |  |||| ||||||||    
T  25041408 ttttcaaagaacaaacatccaatgctttcaaatcctttcaaattagtcgttacatcactcttccagtcttctgcaatgcttcgacaagattgaatccatt 25041309  T
Q  366 gtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    | |||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||| || ||||||||||||||  |||||| ||||  ||||||||||||    
T  25041308 gaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatga 25041221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 25 - 270
Target Start/End: Original strand, 22802278 - 22802521
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||||||||    
T  22802278 gtgaaagagacgttg--aattgccagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgatcctttgcgtgatatgattattgtcc 22802374  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    || |||| ||||| ||||||| |||||||| |  | |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  22802375 taagaagaatcaagttcaaatgcattcccattgagaaggaacattgttgcagacagagctatttttcttgtcttgtagcagagaca-aaacagagtagtg 22802473  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| |||||    
T  22802474 gaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaactctctt 22802521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 25 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 30557603 - 30557360
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagctttga-tcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||    
T  30557603 gtgaaagagacgttg--aattgccagcacattcaaaata-gagttgtttgaagcttttaatcaatcaccaatgatcatttgcctgatatggttgttgtcc 30557507  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    || |||||||||||||||||| | |||||| | || ||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||    
T  30557506 taagaaggatcaatttcaaatgctttcccattgtgaaggaacatcattgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcagagaca-aaatagagtagtg 30557408  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||    
T  30557407 gaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctt 30557360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 40 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 31328235 - 31327984
Alignment:
Q  40 tgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatt 137  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||| || || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  31328235 tgaattgccagcacattcaaaata-gagtcgtttgaaacttttgatcaatcactaatgatcctttgcctgatttggttattgtcctatgaaggatcaatt 31328137  T
Q  138 tcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgta 237  Q
    |||||    |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  31328136 tcaaacgtgttcccaatgtgtaggaacattgttgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgta 31328038  T
Q  238 cacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 291  Q
    ||| |||| | |    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||    
T  31328037 cacttcgttcgaacatactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgc 31327984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 40 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 31334956 - 31334705
Alignment:
Q  40 tgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatt 137  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||| || || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  31334956 tgaattgccagcacattcaaaata-gagtcgtttgaaacttttgatcaatcactaatgatcctttgcctgatttggttattgtcctatgaaggatcaatt 31334858  T
Q  138 tcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgta 237  Q
    |||||    |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  31334857 tcaaacgtgttcccaatgtgtaggaacattgttgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgta 31334759  T
Q  238 cacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 291  Q
    ||| |||| | |    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||    
T  31334758 cacttcgttcgaacatactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgc 31334705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 295
Target Start/End: Original strand, 40331904 - 40332173
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  40331904 gtgaaagagacgttg--aaatgccaacacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcacaaatgatcctttgcctgatatggttattgtcc 40332000  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    || ||||||||||||| |||| | |||| | | || |  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||| ||||| ||    
T  40332001 tatgaaggatcaattttaaatgcgttccaaatgtgaataaacattgttgcaggcagagctgttatccgtgtcttgtagcagagacaaaaacagagtaatg 40332100  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 295  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||||||    
T  40332101 gagttagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttt 40332173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 25 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 22785937 - 22785669
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| || |||||||| ||||||    
T  22785937 gtgaaagagacgttg--aattgccagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgatccattgcctgatatggtttttgtcc 22785841  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    || |||| ||||||||||||| | |||||| | || |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| | | || ||||||||    
T  22785840 tatgaagcatcaatttcaaatgcgttcccaatgtg-ataaacattgttgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagtagagataaagacagagtagtg 22785742  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 295  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||  | ||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||||||    
T  22785741 gagatagtggttatacactttgtacaaaagtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttt 22785669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 40 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 35744270 - 35744039
Alignment:
Q  40 tgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatt 137  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||| ||  ||||||||    
T  35744270 tgaattggcagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgatcatttgcctgatatagttattgtcctaagagtgatcaatt 35744172  T
Q  138 tcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgta 237  Q
    |||||| |||||| | |  | |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35744171 tcaaatgcattcctattgagaaggaacattgttgcagacagagctgtttttcttgttttatagcagagacaaaaactgagtagtggagatagtagttgta 35744072  T
Q  238 cacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    ||  ||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  35744071 catttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt 35744039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 63 - 295
Target Start/End: Original strand, 14581365 - 14581601
Alignment:
Q  63 agagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaattt---caaattcattcccagtatgt 158  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||| | ||| || | ||     
T  14581365 agagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgatcatttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttattcaaatgcgttcacaatgtga 14581464  T
Q  159 aggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggacttt 258  Q
    |  |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| || | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |    
T  14581465 ataaacattattgcaggcagaactgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaatcagagaagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactat 14581564  T
Q  259 gtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 295  Q
    ||||||||||||  || |  |||||||||||||||||    
T  14581565 gtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttt 14581601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 154 - 390
Target Start/End: Original strand, 24779288 - 24779525
Alignment:
Q  154 tatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattgg 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||     
T  24779288 tatgtaggaacattgttgcaggcagagctattatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttatacacttcatacaattgt 24779387  T
Q  254 actttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgt 352  Q
    ||| ||||||| ||||| ||| | ||| ||||| |||| || || | | ||  || |||| |||| |||||||  |||||||| | ||||| || | ||     
T  24779388 actatgtcaacactcttcaaagaacaaacatccgatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcctctggtctttttcaatgcttggacga 24779487  T
Q  353 gattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtct 390  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  24779488 gattgaatccattgaacaacctttgaagcttcaagtct 24779525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 18431221 - 18430835
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaa-tcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||| || || |||||||||||||    
T  18431221 gtgaaagagacgttgttgattgtcagcacatcaaaa--agagtcgtttgaagctt-gatcaaatcaccaatgatttgttgcctgatttggttattgtcct 18431125  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaa-ctgagtagtg 222  Q
    | ||| |||||||||||||| |||||| |||||| | ||| |  | |  ||||| | ||||| |||||||  | ||||  ||||||||| | ||||||||    
T  18431124 atgaatgatcaatttcaaatccattccaagtatggaagaataccggtataggcacaactgttgttcttgtactatagc--agacacaaatcagagtagtg 18431027  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattc 322  Q
    ||| | |||||||||||| |||||| ||||   |||  ||||| | |  ||| |  |||||| ||||||||| || ||| ||||||||||  |||| |||    
T  18431026 gaggtcgtggttgtacacttcgtactattgtcgttttccaacgttttccaaagaataagcattcaatgccttcaaattcttttgaattagccgttgcttc 18430927  T
Q  323 actctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagct 414  Q
    |  || || ||||||||||||| |||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  18430926 atgcttctagtcttctgcaatgataggcgtgattaaaacatttgaacaacctttgaagctttaattctttcagcttctgatgatcttcagct 18430835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 63 - 240
Target Start/End: Original strand, 1083867 - 1084045
Alignment:
Q  63 agagtcgtt-tgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagg 161  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||  ||||||| |||||| | | || |||    
T  1083867 agagtcgttgtgaagccttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctattctgaagg 1083966  T
Q  162 aacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  1083967 aacatttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggtcgtacac 1084045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 63 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 24814830 - 24814645
Alignment:
Q  63 agagtcgtt-tgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagg 161  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| || || ||| | |||||||| |||||||||  ||||||| |||||| | | || |||    
T  24814830 agagtcgttgtgaaaccttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctattctgaagg 24814731  T
Q  162 aacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtac 247  Q
    ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | || | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24814730 aacatttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagaaaaaagcggagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtac 24814645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 79 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 23392898 - 23392686
Alignment:
Q  79 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcag 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||  ||||||| |||| | | | || |||||||||  |||||||||    
T  23392898 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccatttctattctgaaggaacatttctgcaggcag 23392799  T
Q  179 agctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagc 278  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||||| |    ||||| ||||  |||||||||||||| ||||||| ||| |||  ||||||||||||  | |||     
T  23392798 agctgttatcattgtcttgtagcagagacaaacttagagtaatggaagtagtggttgtacacttcgtacagttgtactaggtcaacgctctttgagaaga 23392699  T
Q  279 aagcatccaatgc 291  Q
    |||||||||||||    
T  23392698 aagcatccaatgc 23392686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 90 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 28701448 - 28701244
Alignment:
Q  90 ccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattc 189  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||| | || |||||||| |||||| | ||| || || |||    
T  28701448 ccaatgatcttttgcctgatatagttattgtcccatgaaggatcaatttcaaatctattcccattgtgaaggaacatcgttgcaagtagaactatttttc 28701349  T
Q  190 ttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaat 289  Q
    |||||||||||| | |||| ||||  |||||||||| || ||||||||||| ||||||||    ||||||||||||| |||  || | ||||||||||||    
T  28701348 ttgtcttgtagcagggacaaaaacaaagtagtggaggtaatggttgtacacttcgtacaaacttactttgtcaacgccctttgaagaacaagcatccaat 28701249  T
Q  290 gcctt 294  Q
    |||||    
T  28701248 gcctt 28701244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 427
Target Start/End: Original strand, 18702557 - 18702956
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaa-tcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||  |||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||| | |||||| || | ||||||||| |    
T  18702557 gtgaaagagacgttgttgattgctagcacataaaaa--agagtcatttgaag-tttgatcaaatcatcaatgatttgttgtctgatttagttattgtctt 18702653  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaact-gagtagtg 222  Q
    | |||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||| |    || ||||| | ||||| |||||||  | | ||  | ||||||| | ||||||||    
T  18702654 atgaaggagcaatttcaaatccattccaagtatggaggaatacaagtgtaggcacaactgttgttcttgtactattgc--atacacaaaatagagtagtg 18702751  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattc 322  Q
    |||||||| |||| | || |||||||||||  ||||  ||||| |||  ||| || ||||||| |||||||| || ||| ||||||||||  |||  |||    
T  18702752 gagatagttgttgcatacttcgtacaattgtccttttccaacgttctccaaagagtaagcatctaatgccttcaaattcttttgaattagccgttacttc 18702851  T
Q  323 actctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtga 422  Q
    |  || || |||||||| |||| ||| |||||||||| |  ||| |||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||| ||||| || ||| |||    
T  18702852 atgcttctagtcttctgtaatgatagacgtgattaaaacatttgaacaacctttgaagcttcaattctttcagcttctgatgatcttcaactcctgatga 18702951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 79 - 240
Target Start/End: Original strand, 22755337 - 22755497
Alignment:
Q  79 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcag 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||||| ||||||| |||||| |   || |||||||||  ||||| |||    
T  22755337 ttgatcagtcaccaatgatcttttgtctgatttggatattgtcatatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcagacag 22755436  T
Q  179 agctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||  ||||||| ||||||    
T  22755437 agctgttatacttgtcttgtagcgcagaca-aaacagagtagtggaagtagtggtcgtacac 22755497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20646790 - 20646628
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |   || ||||||||| ||||||||    
T  20646790 ctttgatcatccaccagtaatcttttgccttatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttttgcaggc 20646691  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||    
T  20646690 agagctgtt-ttcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacac 20646628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 17963546 - 17963452
Alignment:
Q  28 aaagagacgttgtga-attgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  17963546 aaagagacgttgtcacattgccagcacatcaaat--agagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcct 17963452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 442 - 528
Target Start/End: Original strand, 38631184 - 38631272
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcac-tttgttttcaggagcactt-tgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  38631184 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttttgtcttcaggagcacttctgtcttcaggagcacttctcttcagatgcttcaagc 38631272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Original strand, 22774404 - 22774566
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |   || |||||||||  |||||||    
T  22774404 ctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggc 22774503  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22774504 agagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacac 22774566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 124
Target Start/End: Original strand, 24779195 - 24779289
Alignment:
Q  29 aagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||  | ||||| |||||||||||    
T  24779195 aagagacgttgtgaattgtcagcacatcaaaata-gagtcgtttgatgctttgatcgatcaccaattatcttttgcatgatatgattattgtccta 24779289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 119 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19498132 - 19498012
Alignment:
Q  119 gtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagt 218  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| |   |  |||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  19498132 gtcctatgaaggatcaagttcaaattcattcctatcttaaaggaacatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagagtagacacaaacagagt 19498034  T
Q  219 agtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  19498033 agtggaggtagtggttgtacac 19498012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19313200 - 19313038
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | | |||||| |||||||||| |||||||||||| | |   || ||||||| |  |||||||    
T  19313200 ctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggatgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcatttctatcttgaaggaacaattctgcaggc 19313101  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||  | |||| |||||||||||||||||||||    
T  19313100 agagctgttat-cttgtcttgtagcgtagacacactcagagttgtggagatagtggttgtacac 19313038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 117 - 240
Target Start/End: Original strand, 22779822 - 22779944
Alignment:
Q  117 ttgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactga 216  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |   || |||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||  ||    
T  22779822 ttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaataga 22779920  T
Q  217 gtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  22779921 gtagtggaggtagtggttgtacac 22779944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Original strand, 24275071 - 24275233
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | | |||||| || ||||||| |||||||||||||| |   || |||||||||  |||||||    
T  24275071 ctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgacggatcaaattcaaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggc 24275170  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||| | |||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24275171 agagctgttgt-cttgtcttgtagcatagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 24275233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 27978517 - 27978404
Alignment:
Q  126 gaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggag 225  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||   || |||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  27978517 gaagaatcaacttcaaattcattctcatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggag 27978419  T
Q  226 atagtggttgtacac 240  Q
     ||||||||||||||    
T  27978418 gtagtggttgtacac 27978404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 28065046 - 28064933
Alignment:
Q  126 gaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggag 225  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||   || |||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  28065046 gaagaatcaacttcaaattcattctcatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggag 28064948  T
Q  226 atagtggttgtacac 240  Q
     ||||||||||||||    
T  28064947 gtagtggttgtacac 28064933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 442 - 518
Target Start/End: Original strand, 33074474 - 33074550
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcaga 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| | || || ||||||||    
T  33074474 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagcactttatcttcaggagcaattttcttcaga 33074550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 445 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 45087016 - 45086960
Alignment:
Q  445 ttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcag 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  45087016 ttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagcactttgtcttcag 45086960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 129 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 967634 - 967524
Alignment:
Q  129 ggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagata 228  Q
    ||||||| |||||||||||||| |   || |||||||||  |||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||    
T  967634 ggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggta 967536  T
Q  229 gtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||||    
T  967535 gtggttgtacac 967524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 17969392 - 17969230
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | | |||||| ||||||| || |||||||||||||| |   || |||||||||  |||||||    
T  17969392 ctttgatcatccaccattaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggattaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggc 17969293  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||  ||||||||||||||    
T  17969292 agagctgttgtt-ttgtcttgtagcgtagacaaaaatagagtagtggatgtagtggttgtacac 17969230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Original strand, 22763700 - 22763862
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||| || || ||| | || ||||| || ||||||| ||||||| |||||| |   || |||||||||  ||||||     
T  22763700 ctttgatcatccaccaataatcttttgcctgatttggatgttctcctatgacggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggt 22763799  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22763800 agagctggtgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 22763862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 137 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 38586211 - 38586109
Alignment:
Q  137 ttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgt 236  Q
    ||||||||||||||||   || |||||||||  |||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  38586211 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttttagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 38586113  T
Q  237 acac 240  Q
    ||||    
T  38586112 acac 38586109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 393 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 28550845 - 28550745
Alignment:
Q  393 catcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgt-gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcact 491  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||     |||||| ||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28550845 catctcctgatgaactgcagcttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttatgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagcact 28550746  T
Q  492 t 492  Q
    |    
T  28550745 t 28550745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 443 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 34321772 - 34321692
Alignment:
Q  443 gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgctt 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||| | || || |||||||| ||||    
T  34321772 gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagcgctttatcttcaggagcagttttcttcagacgctt 34321692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 393 - 492
Target Start/End: Original strand, 40332261 - 40332361
Alignment:
Q  393 catcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgt-gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcact 491  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||     |||||| ||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40332261 catctcctgatgaactgcagcttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttatgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagcact 40332360  T
Q  492 t 492  Q
    |    
T  40332361 t 40332361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19300193 - 19300031
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | | |||||| ||||||| || |||||||||||||| |   || ||||||| |  |||||||    
T  19300193 ctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggatgtagtcctatgaaggataaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 19300094  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||  | |||| |||||| ||||||||||||||    
T  19300093 agagctgttat-cttgtctggtagcgtagacacactcagagttgtggaggtagtggttgtacac 19300031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 368 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 1586982 - 1586850
Alignment:
Q  368 acaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgt-gcttctgatgacgtcatcacttca 466  Q
    ||||| |||||||||| |||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||  |  |||||| ||||  | | ||||||||||||||||||||||    
T  1586982 acaacttttgaagctttaagt-tc-catctcctgatgaactccagcttctggtgattctcagcttctgatgaacttgtttctgatgacgtcatcacttca 1586885  T
Q  467 ggagcactttgttttcaggagcactttgacttcag 501  Q
     ||||||||| | |||||||||| ||| |||||||    
T  1586884 tgagcactttatcttcaggagcattttaacttcag 1586850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 150
Target Start/End: Original strand, 21845966 - 21846088
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtt--tgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||   ||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||| |||  | || ||||||||||||    
T  21845966 gtgaaagagacgttgttgatttccagcacatcaaaa---gagtcgttgttgaagctt-gat-aatcaccaatgatctgttgcttgatttggttattgtcc 21846060  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcc 150  Q
    || || ||| ||||||||||||||||||    
T  21846061 taggagggaacaatttcaaattcattcc 21846088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 353 - 453
Target Start/End: Original strand, 7609107 - 7609205
Alignment:
Q  353 gattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatg 452  Q
    |||| ||||||||| ||| || ||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||  |||||||||||    
T  7609107 gattgaatccattgaacagcccttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttagcttctggtgatc--ttgcttctgatgagatgcttctgatg 7609204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 443 - 492
Target Start/End: Original strand, 14581685 - 14581734
Alignment:
Q  443 gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  14581685 gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtctttaggagcactt 14581734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 235 - 426
Target Start/End: Original strand, 22260432 - 22260624
Alignment:
Q  235 gtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtc 334  Q
    |||||| || |||||||| ||| |||||| |||||| ||| | |||||||||| | |||| || | | |   || || |||||| |||||| | |  |||    
T  22260432 gtacacttcttacaattgtactatgtcaaagctcttcaaagaacaagcatccagttccttcaaatccttccaaaatatttgttgcttcacttttccagtc 22260531  T
Q  335 ttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatctt 426  Q
    |||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||  ||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  22260532 ttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgacgctttaagtcttgcatctcctgatgagctttaacttctggtgatctt 22260624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 486
Target Start/End: Original strand, 22802706 - 22802750
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcagga 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22802706 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcagga 22802750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 22776182 - 22776095
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt-tgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||| | || || |||||||| |||| ||||    
T  22776182 tgcttctaatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagtacttcagacttcaggagcagttttcttcagacgctttaagc 22776095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 22781560 - 22781473
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt-tgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||| | || || |||||||| |||| ||||    
T  22781560 tgcttctaatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagtacttcagacttcaggagcagttttcttcagacgctttaagc 22781473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Original strand, 40782718 - 40782769
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttg-ttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  40782718 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgactttcaggagcactt 40782769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 22785517 - 22785467
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  22785517 tgcttctgatgatgtcatcacttcaagagcactttgtcttcaggagcactt 22785467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Original strand, 23235256 - 23235306
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  23235256 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgacttcaagagcactt 23235306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 150
Target Start/End: Original strand, 24157658 - 24157780
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtt--tgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||   ||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||| |||| | || ||||||||||||    
T  24157658 gtgaaagagacgttgttgattgtcagcacatcaaaa---gagtcgttgttgaagctt-gat-aatcatcaatgatctgttgtttgatttggttattgtcc 24157752  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcc 150  Q
    || ||  || ||||||||||||||||||    
T  24157753 taggagagaacaatttcaaattcattcc 24157780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 30557156 - 30557110
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagc 488  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  30557156 tgcttctgatgacgtcatcaattcaggagcactttgtcttcaggagc 30557110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Original strand, 30667238 - 30667288
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  30667238 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgacttcgggagcactt 30667288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 396 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 23392574 - 23392479
Alignment:
Q  396 cttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatga--tgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||| |||| |||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||    
T  23392574 cttctgatgaactt--gcttctgatgaacttt-gcttctgatgaattttgcttctgatgacgtcatcactttagaggcactttgtcttcaggagcactt 23392479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 444 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 28701078 - 28700994
Alignment:
Q  444 cttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||| | || || |||||||| |||| ||||    
T  28701078 cttctgatgatgtcaccacttcaggagcactttgtcttcaggagcgctttatcttcaggagcagttttcttcagacgctttaagc 28700994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 480 - 528
Target Start/End: Original strand, 30667259 - 30667307
Alignment:
Q  480 ttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  30667259 ttcaggagcactttgacttcgggagcacttctcttcagatgcttcaagc 30667307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 36784878 - 36784826
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  36784878 tcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 36784826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Original strand, 22260653 - 22260704
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagca-ctttgttttcaggagcactt 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  22260653 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcatttttgtcttcaggagcactt 22260704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 240
Target Start/End: Original strand, 26867176 - 26867278
Alignment:
Q  137 ttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgt 236  Q
    ||||||||||||||||   || ||||||| |  |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26867176 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgt 26867274  T
Q  237 acac 240  Q
    ||||    
T  26867275 acac 26867278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 240
Target Start/End: Original strand, 26879765 - 26879867
Alignment:
Q  137 ttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgt 236  Q
    ||||||||||||||||   || ||||||| |  |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26879765 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgt 26879863  T
Q  237 acac 240  Q
    ||||    
T  26879864 acac 26879867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 294
Target Start/End: Original strand, 3277037 - 3277115
Alignment:
Q  216 agtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| | |||||||||||  || |  ||||||||||||||||    
T  3277037 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatatcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 3277115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 443 - 477
Target Start/End: Original strand, 30621437 - 30621471
Alignment:
Q  443 gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttg 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30621437 gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttg 30621471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 443 - 477
Target Start/End: Original strand, 30624058 - 30624092
Alignment:
Q  443 gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttg 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30624058 gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttg 30624092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 10009602 - 10009569
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10009602 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 10009569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 22187953 - 22187920
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22187953 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 22187920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 480 - 528
Target Start/End: Original strand, 40782739 - 40782788
Alignment:
Q  480 ttcaggagcactttgactt-cagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  40782739 ttcaggagcactttgactttcaggagcacttctcttcagatgcttcaagc 40782788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 143
Target Start/End: Original strand, 20567952 - 20568069
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtt--tgaagctttgatcaa-tcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtc 121  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||   ||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||| |||  | || |||||||||||    
T  20567952 gtgaatgagacgttgttgattgccaacacatcaaaa---gagtcgttgttgaagctt-gatcaaatcaccaatgatctgttgctttatttggttattgtc 20568047  T
Q  122 ctacgaaggatcaatttcaaat 143  Q
    ||| |||||| |||||| ||||    
T  20568048 ctaagaaggaacaattttaaat 20568069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 28374588 - 28374536
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28374588 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 28374536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 522
Target Start/End: Original strand, 35253416 - 35253496
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgct 522  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||| |||  |||||| | || || ||||||||||||    
T  35253416 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcagtttagcttcaggagcagtttagcttcaggagcagttttcttcagatgct 35253496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 522
Target Start/End: Original strand, 35264025 - 35264105
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgct 522  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||| |||  |||||| | || || ||||||||||||    
T  35264025 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcagtttagcttcaggagcagtttagcttcaggagcagttttcttcagatgct 35264105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 477
Target Start/End: Original strand, 24576298 - 24576333
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttg 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24576298 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 24576333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 35743854 - 35743803
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcacttt 493  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  35743854 tgcttctgatgacatcatcactttaagagcactttgtcttcaggagcgcttt 35743803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 9015222 - 9015188
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 476  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9015222 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggatcacttt 9015188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18768996 - 18768928
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18768996 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 18768928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 24414836 - 24414754
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttc 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||| ||||||||  |||||||  || || ||||||||||||||    
T  24414836 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcacttcagcttcagaagcactttagcttcagacgcagttttcttcagatgcttc 24414754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 24415112 - 24415044
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24415112 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 24415044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 524
Target Start/End: Original strand, 26867504 - 26867586
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttc 524  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||     ||||| ||||||||  |||||||  || || ||||||||||||||    
T  26867504 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactccagcttcagaagcactttagcttcagacgcagttttcttcagatgcttc 26867586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 28721406 - 28721338
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28721406 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 28721338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 4210306 - 4210339
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4210306 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcactt 4210339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 9897387 - 9897354
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9897387 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 9897354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 9907975 - 9907942
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9907975 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 9907942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 10896661 - 10896596
Alignment:
Q  85 aatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcc 150  Q
    ||||||||||||| | |||  | || |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  10896661 aatcaccaatgatatgttgcttgatttggttattgtcctaggatggaacaatttcaaattcattcc 10896596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Original strand, 16769097 - 16769150
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaa-ctgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16769097 tcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 16769150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 17857250 - 17857217
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17857250 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 17857217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 18392432 - 18392351
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttga-cttcagaatcacttctcttcagatgct 522  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||| ||| | |||||| | || || ||||||||||||    
T  18392432 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcagtttagcttcaggagcagttttagcttcaggagcagttttcttcagatgct 18392351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 20070694 - 20070661
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20070694 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 20070661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 20236809 - 20236842
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20236809 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 20236842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 24327547 - 24327514
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24327547 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 24327514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 120
Target Start/End: Original strand, 24844021 - 24844114
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatc-aatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgt 120  Q
    |||||||||| |||||  ||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||  | || ||||||||||    
T  24844021 gtgaaagagatgttgttgatttccagcacatcaaa--aagagtcgtttgaagc-ttgatcaaatgaccaatgattttttgcttgatttggttattgt 24844114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Original strand, 29244376 - 29244429
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaa-ctgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  29244376 tcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 29244429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Original strand, 29254955 - 29255008
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaa-ctgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  29254955 tcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 29255008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 36251674 - 36251641
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36251674 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 36251641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 471
Target Start/End: Original strand, 38781646 - 38781675
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagc 471  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38781646 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagc 38781675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 40222748 - 40222781
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40222748 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 40222781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 40251609 - 40251642
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40251609 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 40251642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 43083063 - 43083096
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43083063 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 43083096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 43093672 - 43093705
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43093672 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 43093705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Original strand, 2561645 - 2561696
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  2561645 tcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 2561696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #143
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 480 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 9015201 - 9015153
Alignment:
Q  480 ttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    ||||||| |||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  9015201 ttcaggatcacttttacttcaagagcacttctcttcagatgcttcaagc 9015153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #144
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 21172539 - 21172488
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  21172539 tcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 21172488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #145
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 480 - 528
Target Start/End: Original strand, 23235277 - 23235325
Alignment:
Q  480 ttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||| ||||    
T  23235277 ttcaggagcactttgacttcaagagcacttctcttcagacgctttaagc 23235325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #146
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 444 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 24425346 - 24425266
Alignment:
Q  444 cttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttc 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||| ||||||||  |||||||  || || ||||||||||||||    
T  24425346 cttctgatgacgtcatcacttcagaggcacttcagcttcagaagcactttagcttcagacgcagttttcttcagatgcttc 24425266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #147
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 24425624 - 24425573
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24425624 tcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 24425573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #148
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 480 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 24850495 - 24850448
Alignment:
Q  480 ttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  24850495 ttcaggagcactt-gacttcaggagcacttttcttcagatgcttcaagc 24850448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 442 - 474
Target Start/End: Original strand, 26880093 - 26880125
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26880093 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 26880125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 28140892 - 28140852
Alignment:
Q  18 taaaggagtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaa 58  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  28140892 taaaggtgtgaaagagacgttgtgaattgtcagcatatcaa 28140852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 442 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 28374310 - 28374278
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28374310 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 28374278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 265; Significance: 1e-147; HSPs: 168)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 25 - 453
Target Start/End: Original strand, 40845910 - 40846344
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggtta------tt 118  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||      ||    
T  40845910 gtgaaagagacgttgttaattgtcagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttacctgatatggttattgttatt 40846008  T
Q  119 gtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagt 218  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  40846009 gtcctatgaaagatcaatttcaaatccattccaagtatgagggaacaatgttgcaggcggagctgttattcttgtcttgtagcagagatacaaactgagt 40846108  T
Q  219 agtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttg 318  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  40846109 agtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatccaatgctttcaacttcatttgaattagtcgttg 40846208  T
Q  319 attcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttct 417  Q
     |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  40846209 cttcactttcctggtcttctgcaatgctaggcgtgattaaatccattgaacagccttttgaagctttaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttcc 40846308  T
Q  418 ggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    |||||||||  |||||| ||||  ||||||||||||    
T  40846309 ggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatga 40846344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 25 - 427
Target Start/End: Original strand, 23750339 - 23750739
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  23750339 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcatgatatggttattgtccta 23750437  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23750438 tgaaggatcaatttaaaattcattccaagtatgaaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtgga 23750537  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt-aaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattca 323  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||   |||| ||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||    
T  23750538 gataatggttgtacacttcgtacaattgtactttg---acgcacttcataaaaacaagcatcaaatgcctttaacttcatttgaagcagtcgttgcttca 23750634  T
Q  324 ctctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtga 422  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  23750635 ctctcctggtcttctgcagtgctaggcgtgattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtta 23750734  T
Q  423 tcttt 427  Q
    |||||    
T  23750735 tcttt 23750739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 25 - 426
Target Start/End: Original strand, 55380107 - 55380508
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  55380107 gtgaaagagacgttgtgaattgttagcacataaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtccta 55380205  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  55380206 tgaaggatcaatttcaaattcattccaagtatgaaggaacattgttgcaggcagagctgttattattgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtgga 55380305  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || | | ||  || ||||||||| |||||    
T  55380306 gatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcac 55380405  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||  ||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  55380406 tcttctggtcttctgcaatgttaggcatgattaaatccattgaacagccttttgaagctttaagtcttgcatctcctaatgaacttcagcttctgatgat 55380505  T
Q  424 ctt 426  Q
    |||    
T  55380506 ctt 55380508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 18 - 453
Target Start/End: Original strand, 6641494 - 6641926
Alignment:
Q  18 taaaggagtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttat 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  6641494 taaaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaa-aagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttat 6641592  T
Q  118 tgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgag 217  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||||| | |||| |||||| |||| |||    
T  6641593 tgtcctatgaagaatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacatcgttgcaggcatatctgttattcttgtcctatagcagagacataaacagag 6641692  T
Q  218 tagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgtt 317  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||| ||| |||||||| || | | ||||||||||  |||    
T  6641693 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagtatcaaatgccttcaaatccttttgaattagccgtt 6641792  T
Q  318 gattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttct 417  Q
    | |||||||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6641793 gtttcactcttctgatcttctacaatgctaggcatgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaaatctctcatcttctgatgaaattcagcttct 6641892  T
Q  418 ggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    |||||  | |||||||| |||| |||||||||||||    
T  6641893 ggtga--tattgcttctgatgaggtgcttctgatga 6641926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 28 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 29680836 - 29680371
Alignment:
Q  28 aaagagacgttgtga-attgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacg 126  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |    
T  29680836 aaagagacgttgtcacattgccaacacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctaatatggttattgtcctctg 29680738  T
Q  127 aaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggaga 226  Q
    |||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  29680737 aaggatcaattttaaatccattccatgtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacacatactgagtagtggaga 29680638  T
Q  227 tagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactc 326  Q
    || || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || | | ||  || |||| |||| |||||||    
T  29680637 taatgattgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 29680538  T
Q  327 tcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatct 425  Q
    | |  ||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||| | ||||  |||||||||||||||    
T  29680537 ttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacctttggagctttaagtcttgcatctcctggtaaactagagcttctggtgatct 29680438  T
Q  426 tttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    |  |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  29680437 tcagcttctgatgagatgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgacttcaggaacactt 29680371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 25 - 454
Target Start/End: Original strand, 16632257 - 16632684
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||     
T  16632257 gtgaaagagacgttgtgaactgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcatcaatgatcttttgcctaatatcgttattgtcctc 16632355  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||    
T  16632356 tgaaggatcaatttcaaatccattccatgtatgtaggaacattgttgcagacagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgattggtgga 16632455  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||| || |   ||  || |||| ||||||||||    
T  16632456 ggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagaatccaatgccttcaaatcttttcaaaatagtcgttgattcac 16632555  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    ||| |  ||||||||||||| |||  || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  16632556 tcttccagtcttctgcaatgcttatacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttagcttctagtgat 16632655  T
Q  424 cttttgcttctaatgatgtgcttctgatgac 454  Q
    |  |||||||| ||||  ||||| |||||||    
T  16632656 c--ttgcttctgatgagatgcttttgatgac 16632684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 25 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 19621355 - 19620962
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  19621355 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcata 19621257  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  19621256 tgaagaatcaatttcaaatccattcccagtatgtaggaaaattgttgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgaatagtgga 19621157  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||| || || | | ||  || |||| |||| |||||    
T  19621156 gatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcatagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcac 19621057  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctg 418  Q
    |   |||||||| ||||||| || | || |||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19621056 ttctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaactcttgcatctcctgatgaacttcagcttctg 19620962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 37985906 - 37985541
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  37985906 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatagttattgtccta 37985808  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37985807 tgaaggatcaatttcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccttgtcctgtagcagagacacaaactgagtagtgga 37985708  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | | ||  || ||||||||| |||||    
T  37985707 gatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcac 37985608  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtct 390  Q
    | |    ||||||||| ||| ||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  37985607 tttttcagtcttctgcgatgcttagatgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtct 37985541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 25 - 426
Target Start/End: Original strand, 3395406 - 3395808
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||| |||||||||||    
T  3395406 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatccttagcctgatatgattattgtccta 3395505  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3395506 tgaaggatcaatttcaaatccattccatgtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtgga 3395605  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | | |||||||||||| || || | | ||  || |||| |||| |||||    
T  3395606 gatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaactagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcac 3395705  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    | |    || |||||||||| |||| ||  ||| ||||||||| ||||| ||||||| || ||||||  ||||| ||||||||||  ||||||| |||||    
T  3395706 tttttcagttttctgcaatgcttagacgatatttaatccattgaacaacttttgaagatttaagtcttgcatctcctgatgaactatagcttctagtgat 3395805  T
Q  424 ctt 426  Q
    |||    
T  3395806 ctt 3395808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 25 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 12811469 - 12811044
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||     
T  12811469 gtgaaagagacgttgtgaatttccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaaagtttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatgtttattgtcctt 12811371  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     ||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12811370 tgaatgatcaatttcaaatccattccttgtatgtaggaacattgttgcaggctgagttgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtgga 12811271  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| || | | ||  || |||| |||| |||||    
T  12811270 gatagtggttgtacacttcgtacaattttactttgtcaacgctattagaa---caagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcac 12811174  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    |||    ||||||||||||| |||| ||  | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| || |||||||  |||||||||||||    
T  12811173 tctttcagtcttctgcaatgcttagacgaaactaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctaatgaactagagcttctggtgat 12811074  T
Q  424 cttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    ||| | || || ||||  ||||||||||||    
T  12811073 cttctactactgatgagatgcttctgatga 12811044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 26 - 439
Target Start/End: Original strand, 45833212 - 45833625
Alignment:
Q  26 tgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctac 125  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||     
T  45833212 tgaaagagacgttgtgaattgtcatcatatcaaaata-gagtcatttgaagctttgttcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgttctat 45833310  T
Q  126 gaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggag 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||  |||| |||||||||||    
T  45833311 gaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagttgtttttcttgttttgtagcagagaccaaaacagagtagtggag 45833410  T
Q  226 atagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcact 325  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| || || | | ||  || |||  |||| || |||    
T  45833411 atagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaaaaagcatccaatgcattcaaatactttcaaaatagaagttgcttaact 45833510  T
Q  326 ctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatc 424  Q
    || |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  45833511 cttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatc 45833610  T
Q  425 ttttgcttctaatga 439  Q
    ||| |||||| ||||    
T  45833611 tttagcttctgatga 45833625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 25 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 22675815 - 22675402
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  22675815 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcatcaatgatcttttgcctgatatggttattgtccta 22675717  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagac-acaaactgagtagtgg 223  Q
     |||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  22675716 tgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacattgttgtaggcagagctatttttcttgtcttgtagcagagacaaaaaactgagtagtgg 22675617  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattca 323  Q
    || |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||  || | |||||||| |||||||| || | | ||  || |||| |||| ||||    
T  22675616 aggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttca 22675517  T
Q  324 ctctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtga 422  Q
    || | || ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||| |  | |  ||||| || ||||||| |||||||||| ||    
T  22675516 cttttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta--tgttgcatctcctaatgaactgcagcttctgggga 22675419  T
Q  423 tcttttgcttctaatga 439  Q
    | |||||||||| ||||    
T  22675418 ttttttgcttctgatga 22675402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 25 - 493
Target Start/End: Original strand, 10072751 - 10073222
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcaca-tcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10072751 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacattcaaaat-agaatcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctgatatggttattgtcct 10072849  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||  ||||||| || |||||| |||||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||    
T  10072850 atgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatctttgcaggtagggctgtttttcttgtcttatagcagagacaaaaacatagtagtgg 10072949  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattca 323  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||  || | ||||| ||||||||||| || | | ||  || |||  |||| ||||    
T  10072950 agatagtggttgtacacttcgtacatttgtactttgtcaacgctctttgaataacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaactagcagttgcttca 10073049  T
Q  324 ctctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtga 422  Q
    || | |  ||||||||| ||| |||  || ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||| | ||||||||| |    
T  10073050 cttttccagtcttctgctatgcttaaacgagattaaatcca-tgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactactgcttctggtaa 10073148  T
Q  423 tcttttgcttctaatgatgt---gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcacttt 493  Q
    | ||  ||||||  |||| |   |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10073149 ttttcagcttctggtgattttcagcttctgatgacatcaccacttcaggagcactttgtcttcaggagcacttt 10073222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 28 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 14904648 - 14904249
Alignment:
Q  28 aaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacga 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  14904648 aaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctacga 14904549  T
Q  128 aggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagat 227  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  14904548 aggatcaatttcaaatccattccatgtatgtaggaacattgttgcaggcaaagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtggtggagat 14904449  T
Q  228 agtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactct 327  Q
    | |||||||  || ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  |||||||||||| ||| || | | ||  || | |  |||| |||||| |    
T  14904448 aatggttgtttacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgtcttcaaatcctttcaaaatggacgttgcttcacttt 14904349  T
Q  328 cctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatctt 426  Q
     |  |||||||||||||  ||| || |||||||||| ||| | | | |||||||||| | ||||  ||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  14904348 tccagtcttctgcaatgcctagacgagattaaatcctttgaatagcttttgaagctttaggtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgatctt 14904249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 25 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 14605198 - 14604774
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  14605198 gtgaaagagacgttgtgaattgtcagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatctttttcctgatatggttattgtccta 14605100  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| |||||| | | || ||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||    
T  14605099 tgaaggatcaatttcaaatccattccaattgtgaaggaacattg---caggcagagctgtttttcttgtcttgtagcatagacaaaaacagagtagtgga 14605003  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcattt-gaattagttgttgattca 323  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || | | |||  || ||||||||| ||||    
T  14605002 ggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatccttttaaaaatagttgttgcttca 14604903  T
Q  324 ctctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtga 422  Q
    |||| || ||||||||||||| |||| || |||| ||||||| | | | |||||||||||| ||||||   |||| |||||||| || |||||||| |||    
T  14604902 ctcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccatagaatagcctttgaagctttaagtcttggatctcctgatgaagtttagcttctgatga 14604803  T
Q  423 tcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    ||  |||||||| ||||  ||||||||||||    
T  14604802 tc--ttgcttctgatgagatgcttctgatga 14604774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 25 - 489
Target Start/End: Original strand, 19884519 - 19884984
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  19884519 gtgaaagagacgttgtgaatttccagcgcattcaaaata-gagtcgtttgaagttttgatcaatcaccaatgatcttt-gcctgatatggttattgtcct 19884616  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||| | || ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||    
T  19884617 atgaaggatcaatttcaaatgcatttccattgtgaaggaacatctttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagattagtgg 19884716  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattca 323  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| || | | ||  || |||| |||| ||||    
T  19884717 agatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttca 19884816  T
Q  324 ctctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtga 422  Q
    || | |  ||||||||||||| |||| || ||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  19884817 cttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcca-tgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacagcttctggtga 19884915  T
Q  423 tcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcac-ttcaggagcactttgttttcaggagca 489  Q
    |  |  |||||| ||| |  ||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19884916 ttgtcagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcgccactttcaagagcactttgtcttcaggagca 19884984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 25 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 37435830 - 37435428
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaatt-gccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  37435830 gtgaaagagacgttatgaatttgccagcatgtcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcct 37435732  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| | |  |  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||    
T  37435731 atgaaggatcaatttcaaatccattccaattgagagggaacatagttgcaggcagagctgtttttcttgtcttatagcagagacaaaaacaaagtagtgg 37435632  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattca 323  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||  || | ||||||||||||||||| || | | ||  || |||| |||| ||||    
T  37435631 aggtagtggttgtacacttcgtacaatagtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttca 37435532  T
Q  324 ctctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtga 422  Q
    |||| |   |||||||||||| || | || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37435531 ctcttccaatcttctgcaatgcttggacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtga 37435432  T
Q  423 tctt 426  Q
    ||||    
T  37435431 tctt 37435428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 25 - 523
Target Start/End: Original strand, 412818 - 413316
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||    
T  412818 gtgaaagagacattgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttactgttcta 412916  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacaca-aactgagtagtgg 223  Q
     |||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||  ||||| | ||| |||||||||    
T  412917 tgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcagaactgtttttcttgttttgtagcaaagacaaagaacagagtagtgg 413016  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattca 323  Q
    ||  ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||  || | ||| ||| ||||||||| || | | ||  ||||||  |||| ||||    
T  413017 aggcagtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacattcaatgccttcaaatcctttcaaattagccgttgcttca 413116  T
Q  324 ctctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtga 422  Q
    || | |  ||||||||||||| |||| || |||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||  |   |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  413117 cttttcgagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaag--ttgaatctcctgatgaactgcagcttctggtga 413214  T
Q  423 tcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgc 521  Q
    | ||  |||||| ||| |  |||||||||||||||||  |||||| || |||||||| ||||||||| ||||| |||||| | || || |||||||| ||    
T  413215 ttttcagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcactacttcatgaacactttgtcttcaggagcgctttgtcttcaggagcagttttcttcagacgc 413314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 25 - 493
Target Start/End: Original strand, 56034389 - 56034858
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaatt-gccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  56034389 gtgaaagagacgttgtgaatttgtcagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgatcttttgcttgatatggttattgtcc 56034487  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    || ||| |||||||||||||| |||||| | |  |  ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| | |||||||||    
T  56034488 tatgaaagatcaatttcaaatccattccaattgagagggaacatagttgtaggcagagctgttatccttgtcttgtagtagagacacatattgagtagtg 56034587  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattc 322  Q
    |||||||| ||||||||  |   ||||||| |||||||||||||||||  || | ||| ||||||||||||| || ||  ||  || |||| |||| |||    
T  56034588 gagatagtagttgtacattttagacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaattatttcaaaatagtcgttgcttc 56034687  T
Q  323 actctcctggtcttctgcaatgttagg-cgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtg 421  Q
    ||||| |  ||||||||||||| | || || |||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  56034688 actcttccagtcttctgcaatgcttggacgagattaaatccattgaacagtctttgaagctttaagtcttgcatcttctgatgaacttcagcttctggtg 56034787  T
Q  422 atcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcacttt 493  Q
    |||  |||||||| ||| |  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||   ||||||| ||||||    
T  56034788 atc--ttgcttctgatgaacttgcttctgattacgtcatcacttcagaagcacttttacttcaggatcacttt 56034858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 28 - 403
Target Start/End: Original strand, 19666191 - 19666567
Alignment:
Q  28 aaagagacgttgtgaa-ttgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacg 126  Q
    ||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |    
T  19666191 aaagagacgttgtcacgttgccaccacatcaaaata-gagttgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctctg 19666289  T
Q  127 aaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggaga 226  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19666290 aagaatcaatttcaaatccattccatgtatgtaggaacattgttgcaggcaaagctattatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggaga 19666389  T
Q  227 tagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactc 326  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | |||| || |||||| || || | | ||  || |||| |||| |||||||    
T  19666390 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaactctcttcaaagaacaagtattcaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 19666489  T
Q  327 tcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgat 403  Q
    | |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||  ||||| |||||    
T  19666490 ttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaataacctttcaagctttaagtcttgcatctcctgat 19666567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 25 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 19912174 - 19911760
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||| | ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  19912174 gtgaaataaacgttgtgaattgtcaacacataaaaataagagtcgt--ggagctttgatcaatcaccaattatcttttgcctgatatggttattgtccta 19912077  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  19912076 tgaatgatcaatttcaaatccattcccagtatataggaacattgttgcaagtagagctgttattcttgtcttgtagcagaggcacaaactgagtagtgga 19911977  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctc-ttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattca 323  Q
    | |||||||||||||| | ||||||||  ||| ||||||||||| || ||| |  ||||||||||||| || || | | ||  || |||| |||| ||||    
T  19911976 ggtagtggttgtacactttgtacaattatactatgtcaacgctctttcaaagaataagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttca 19911877  T
Q  324 ctctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtga 422  Q
    ||   |||||||| ||||||| || | || |||| |||| |||| ||||||||| |||||| ||||||  ||||| |||||||||| || |||||| |||    
T  19911876 ctgctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatctattgaacaacctttaaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctgatga 19911777  T
Q  423 tcttttgcttctaatga 439  Q
    ||||  |||||| ||||    
T  19911776 tcttcagcttctgatga 19911760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 423
Target Start/End: Original strand, 17247053 - 17247456
Alignment:
Q  18 taaaggagtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttat 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17247053 taaaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttat 17247151  T
Q  118 tgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagac-acaaactga 216  Q
    ||||||  |||||||||||||||||| |||||||| | || || |||||  |||| |||||||||||| |||||| |||||||  ||||| | |||| ||    
T  17247152 tgtcctttgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaagtaacatctttgctggcagagctgtttttcttgccttgtagtagagacaaaaaacaga 17247251  T
Q  217 gtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgt 316  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||  || | ||| ||| ||||||||| || | | ||  ||||||| ||    
T  17247252 gtagtggaggcagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgttctttgaagaacaaacattcaatgccttcaaatcctttcaaattagtcgt 17247351  T
Q  317 tgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagctt 415  Q
    || |||||| |||   |||||||||||| |||| || |||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||    |||||| |||||||||| ||||||    
T  17247352 tgcttcactttcc-aatcttctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaag--attcatctcctgatgaactgcagctt 17247448  T
Q  416 ctggtgat 423  Q
    ||||||||    
T  17247449 ctggtgat 17247456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 12600567 - 12600759
Alignment:
Q  18 taaaggagtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttat 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  12600567 taaaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagttttgatcaatcaacaatgatcttttgcctgatatggttat 12600666  T
Q  118 tgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacaca 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  12600667 tgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccagcatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacaca 12600759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 41115062 - 41114663
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaa-tcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  41115062 gtgagagagacgttgttgattgccagcacatcaaaa--agagtcgtttgaagctt-gatcaaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttattgtcct 41114966  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaa-ctgagtagtg 222  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||| | ||  | ||||||| | |||| |||    
T  41114965 atgaaggatcaatttcaaatccattccaagtctggaggaacactggtgcaggcatagctgttgttcttgtcttattgc--atacacaaatcagagtggtg 41114868  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattc 322  Q
    || |||||||||||||||  ||||||||||  |||| ||||| ||||  || ||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||  |||| |||    
T  41114867 gaaatagtggttgtacacgacgtacaattgtcctttttcaactctctccaacaaaaaagcatccaatgccttcaaattcatttgaaatagccgttgcttc 41114768  T
Q  323 actctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtga 422  Q
    | ||| || ||||| |||||||  |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||    
T  41114767 attcttctagtcttttgcaatgacaggcttgattaaatcaattgaacaacctttgaagcttcaattctctcagcttctgatgatcttcagctcctgatga 41114668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 72 - 484
Target Start/End: Original strand, 10692714 - 10693126
Alignment:
Q  72 tgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttg 171  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||   |||||| | || |||||||||||||    
T  10692714 tgaaactttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaatgatcaatttcaaatgggttcccattgtgaaggaacattgttg 10692813  T
Q  172 caggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctta 271  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||  | ||||||| |||||||||     
T  10692814 caggcatagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaaacgtactttgtaaacgctcttt 10692913  T
Q  272 aaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgtaca 370  Q
     || | ||||||||||||||||| || | | ||  || ||||||||| |||||| | |  ||||||||||||  |||| || | || ||||| ||  |||    
T  10692914 gaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaaca 10693013  T
Q  371 acctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcagga 469  Q
    || |||||||||| |||  |  ||||| |||||||||| ||||||||||||||  |  |||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10693014 acttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacagcttctggtgattctcagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagga 10693111  T
Q  470 gcactttgttttcag 484  Q
    ||||||||| |||||    
T  10693112 gcactttgtcttcag 10693126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 72 - 484
Target Start/End: Original strand, 10906480 - 10906892
Alignment:
Q  72 tgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttg 171  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||   |||||| | || |||||||||||||    
T  10906480 tgaaactttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaatgatcaatttcaaatgggttcccattgtgaaggaacattgttg 10906579  T
Q  172 caggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctta 271  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||  | ||||||| |||||||||     
T  10906580 caggcatagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaaacgtactttgtaaacgctcttt 10906679  T
Q  272 aaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgtaca 370  Q
     || | ||||||||||||||||| || | | ||  || ||||||||| |||||| | |  ||||||||||||  |||| || | || ||||| ||  |||    
T  10906680 gaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaaca 10906779  T
Q  371 acctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcagga 469  Q
    || |||||||||| |||  |  ||||| |||||||||| ||||||||||||||  |  |||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10906780 acttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacagcttctggtgattctcagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagga 10906877  T
Q  470 gcactttgttttcag 484  Q
    ||||||||| |||||    
T  10906878 gcactttgtcttcag 10906892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 25 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 13576409 - 13576012
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  13576409 gtgaaagagatgttgtgaattgccagtacattcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctggtatggttattgtcct 13576311  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
    | ||||||| |||||||||| |||||||| | || |  |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||    
T  13576310 atgaaggatgaatttcaaatgcattcccattgtgaataaacatcattgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagcagtgg 13576211  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattca 323  Q
    |  |||||||| ||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||  || | |||||||| |||||||| || | | ||  || |||  |||| ||||    
T  13576210 atgtagtggttttacacttcgtacagttgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatctaatgccttcaaatcctttcaaactaggcgttgcttca 13576111  T
Q  324 ctctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtga 422  Q
    |||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||  ||||||||||| |  | |  ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  13576110 ctcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaggctttgaagcttta--tgttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtga 13576013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 270
Target Start/End: Original strand, 6517295 - 6517546
Alignment:
Q  18 taaaggagtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggtt 115  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  6517295 taaaggtgtgaaagagacgttg--aattgccagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgatcatttgcctgatatggtt 6517391  T
Q  116 attgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactg 215  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |    
T  6517392 attgccctaagaaggatcaatttcaaatgtattcccattgggaaggaacattgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacag 6517491  T
Q  216 agtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  6517492 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt 6517546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 40 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 17398955 - 17398699
Alignment:
Q  40 tgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatt 137  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17398955 tgaattgccagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgatcatttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatt 17398857  T
Q  138 tcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgta 237  Q
    |||||| |||||||| | || |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  17398856 tcaaatgcattcccaatgtgaataaacattgttgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagttagtggttgta 17398757  T
Q  238 cacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 295  Q
    ||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||||||    
T  17398756 cacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttt 17398699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 123 - 390
Target Start/End: Original strand, 9140826 - 9141094
Alignment:
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  9140826 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagaaacattgttgcaggcagagctgttatccttgtcttatagcagagacacaaactgagtagtg 9140925  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattc 322  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | | ||  || |||| |||| ||     
T  9140926 aagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttt 9141025  T
Q  323 actctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtct 390  Q
    ||| | |  ||||||| ||||| |||| || |||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  9141026 acttttccagtcttctacaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacccttgaagctttaagtct 9141094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 270
Target Start/End: Original strand, 8105448 - 8105698
Alignment:
Q  18 taaaggagtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggtt 115  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  8105448 taaaggtgtgaaagagacgttg--aattgccaacacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgatcctttgcctgatatggtt 8105544  T
Q  116 attgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactg 215  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||| |    
T  8105545 attgtcctaagaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctgtttttcttatcttgtagcagagaca-aaacag 8105643  T
Q  216 agtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||||||    
T  8105644 agtagtggaggtagtggttgtacatttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctt 8105698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 25 - 294
Target Start/End: Original strand, 29121186 - 29121455
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  29121186 gtgaaagagacgttg--aattgccagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgttcttttgcctgatatggttattgtcc 29121282  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgt-tattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagt 221  Q
    || ||||| |||||||||||| ||||| || | || |||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||| | |||||| |||| |||||||    
T  29121283 taagaagggtcaatttcaaatgcattctcattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagttgtgttttcttgtcttgtaacagagacaaaaacagagtagt 29121382  T
Q  222 ggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 294  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||    
T  29121383 ggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcatccagtgcctt 29121455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 40 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 3105700 - 3105469
Alignment:
Q  40 tgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatt 137  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3105700 tgaattgccagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgatcctttgtctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatt 3105602  T
Q  138 tcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgta 237  Q
    ||||||   |||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  3105601 tcaaatgtgttcccaatatgaataaacattgttgcaggcagagctgttatccttgccttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgta 3105502  T
Q  238 cacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    ||| ||||||||    ||| |||||||||||||    
T  3105501 cacttcgtacaaacatactatgtcaacgctctt 3105469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 343
Target Start/End: Original strand, 54679745 - 54680064
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  54679745 gtgaaagagacgttg--aattgcctgcacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatagttattgtcc 54679841  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagac--acaaactgagtag 220  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||| | ||| |||| |||||||||| |||| |||||  | |||| ||||||    
T  54679842 tatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattatgaaggaacatcgttgcagacggagttgtttttcttgtcttttagcagagacaaaaaaacagagtag 54679941  T
Q  221 tggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgat 320  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| ||||||  || | ||| ||||||||||||| || | | ||  || ||||||||| |    
T  54679942 tggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgct 54680041  T
Q  321 tcactctcctggtcttctgcaat 343  Q
    ||||| | |  ||||||||||||    
T  54680042 tcacttttccagtcttctgcaat 54680064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 25 - 405
Target Start/End: Original strand, 11915518 - 11915896
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11915518 gtgaaagagatgttgttgattgccagcaaatcaaaaga-gagtcgtttgaaactagattaaatcaccaatgatcttttgcctaatatggttattgtccta 11915616  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||  ||||||||||||| |||||| | |||| |||||||  | |||||||| || |||| |||||||||| | |  || ||| |||| ||||||||||    
T  11915617 tgaataatcaatttcaaatccattccaattatgaaggaacaccggtgcaggcatagttgttgttcttgtcttattgtagacaca-aaacagagtagtgga 11915715  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |   |||||||||||| | |||||||||  ||||  |||||||||| ||| |  |||||||||||||||| || | |||||||| |||| |||| |||||    
T  11915716 ggcggtggttgtacactttgtacaattgtccttttccaacgctcttcaaagaataagcatccaatgccttcaaatccatttgaaatagtcgttgcttcac 11915815  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatga 405  Q
    |||  | ||||||||||||| | ||||||||||||||  |||  || |||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  11915816 tcttttagtcttctgcaatgatgggcgtgattaaatcatttgagcagcctttgaagcttcaattctctcagcttctgatga 11915896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 40 - 268
Target Start/End: Original strand, 20977289 - 20977516
Alignment:
Q  40 tgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttc 139  Q
    ||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20977289 tgaattgccagcacatccaaa--atagtcgtttgaagctttgataattcaccattgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttc 20977386  T
Q  140 aaattcattcccagtatgtaggaacattgtt-gcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtac 238  Q
    ||||   |||||| | ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  20977387 aaatgtgttcccaatgtgtataaacattgtttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtac 20977486  T
Q  239 acatcgtacaattggactttgtcaacgctc 268  Q
    || ||||||||  | ||| |||||||||||    
T  20977487 acttcgtacaaacgcactatgtcaacgctc 20977516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 32 - 439
Target Start/End: Original strand, 3483554 - 3483952
Alignment:
Q  32 agacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaagga 131  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  3483554 agacgttgtgaattgacaacatatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaagga 3483652  T
Q  132 tcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtg 231  Q
    ||||||||||||  ||||||| | || |||||||  |||||| ||| | || || ||||||| ||||||| |||||| |||| |||         |||||    
T  3483653 tcaatttcaaatgtattcccattgtgaaggaacaacgttgcaagcaaaactatttttcttgttttgtagcagagacaaaaacagag---------tagtg 3483743  T
Q  232 gttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctg 331  Q
    ||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||  || |  |||||||||||||||| || | | ||  || |||| |||| |||||| | |      
T  3483744 gttgtgcgcttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttcca 3483843  T
Q  332 gtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgc 430  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| | |   |||||||||| ||||||  |||||  | |||||||  | ||||||||||||||  ||    
T  3483844 gtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaatagtttttgaagctttaagtcttgcatctcttaatgaactataacttctggtgatcttcagc 3483943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 57 - 217
Target Start/End: Original strand, 23123367 - 23123527
Alignment:
Q  57 aaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtat 156  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  23123367 aaaaaaagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggtaattgtcctctgaaggatcaatttcaaattcattccatgtat 23123466  T
Q  157 gtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgag 217  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23123467 gtaggaacattgttgtaggaggagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgag 23123527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 42 - 270
Target Start/End: Original strand, 38513710 - 38513939
Alignment:
Q  42 aattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaa 141  Q
    ||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  38513710 aattgtcagcacatccaaaatagagtcgtttgaagctttgataattcaccattgatcctttgtctgatatggttattgtcgtatgaaggatcaatttcaa 38513809  T
Q  142 attcattcccagtatgtaggaacattg-ttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    || | |||||| | ||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||| |||||||| |  ||||||||||||||    
T  38513810 atgcgttcccaatgtgtataaacattgtttgcaggcagagctgtttttctcgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgaaagtagtggttgtacac 38513909  T
Q  241 atcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
     ||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  38513910 ttcgtacaatcgtactatgtcaacgctctt 38513939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 40 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 39420015 - 39419787
Alignment:
Q  40 tgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttc 139  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||| | |||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39420015 tgaattgccagcacatccaaaatagagtcatttgaagctttgataattcaccattgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttc 39419916  T
Q  140 aaattcattcccagtatgtaggaacattg-ttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtac 238  Q
    |||| | |||||| | || |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||  ||||||||||||    
T  39419915 aaatgcgttcccaatgtgcataaacattgtttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtaatggaagtagtggttgtac 39419816  T
Q  239 acatcgtacaattggactttgtcaacgct 267  Q
    || ||||||||  | ||| ||||||||||    
T  39419815 acttcgtacaaacgtactatgtcaacgct 39419787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 40 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 56533342 - 56533112
Alignment:
Q  40 tgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaattt 138  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||  || |||||||||||||||||   |||||||||||    
T  56533342 tgaattgccagcacattcaaattagagtcgtttgaagcttttgatcaatcatcaatgatcattttcctgatatggttattgtcctaaacaggatcaattt 56533243  T
Q  139 caaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtac 238  Q
    |||||  |||| || | || |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  56533242 caaatgtattctcattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctgtttttattgtcttgtagcagagaca-aaacagagtagtggaagtagtggttgtac 56533144  T
Q  239 acatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    || ||||||||  | |||||||||||||||||    
T  56533143 acttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctt 56533112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 265 - 453
Target Start/End: Original strand, 15139283 - 15139473
Alignment:
Q  265 gctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatcca 363  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||    
T  15139283 gctcttcaaaaagcaagcatccaatgccttcaacttcatttgaattagtcgttgcttcactctcctggtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatcca 15139382  T
Q  364 ttgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaac-ttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    ||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||| | || |||||||| ||||    
T  15139383 ttgaacaacctttgaatctttaagtctatcatcttctgatgaacttttagcttctggtgatcttcagcttctgacgaggtgcttctaatga 15139473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 25 - 291
Target Start/End: Original strand, 16853320 - 16853585
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  16853320 gtgaaagagacgttg--aattgccagcatattcaaaata-gagtcgtttgaagtttttgaacaatcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcc 16853416  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    |  ||||||||||||||||||   |||| | |  | |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  16853417 tttgaaggatcaatttcaaatgtgttcctaatgagaaggaacatcgttgcaggcagagttgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtg 16853516  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 291  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||  || |||||||||||||||||  |  | ||||||||||||||    
T  16853517 gaggtagtggttgtacacttcatacagatgtactttgtcaacgctctttgaggaacaagcatccaatgc 16853585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 63 - 291
Target Start/End: Original strand, 40860520 - 40860749
Alignment:
Q  63 agagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagg 161  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||| | || |      
T  40860520 agagtcgtttgaagcttttgatctatcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgttctatgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgaata 40860619  T
Q  162 aacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtc 261  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||  | ||| ||||    
T  40860620 aacattgttgcagtcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacatcatacaaacgtactatgtc 40860719  T
Q  262 aacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 291  Q
    |||||||||  || |  |||||||||||||    
T  40860720 aacgctctttgaagaataagcatccaatgc 40860749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 40 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17701046 - 17700854
Alignment:
Q  40 tgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttc 139  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17701046 tgaattgccagcacatccaaaatagagtcgtttgaagctttgataattcaccattgatctttttcctgatatggttattgtcctatgaaggatcactttc 17700947  T
Q  140 aaattcattcccagtatgtaggaacattg-ttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtg 231  Q
    |||| | |||||| | ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  17700946 aaatgcgttcccaatgtgtataaacattgtttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtg 17700854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Original strand, 22190699 - 22190907
Alignment:
Q  63 agagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagg 161  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||| | || |      
T  22190699 agagtcgtttgaagcttttgatctatcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaaagatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgaata 22190798  T
Q  162 aacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  | ||| ||||    
T  22190799 aacattgttgcaggcagagctgttatctttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtc 22190898  T
Q  262 aacgctctt 270  Q
    |||||||||    
T  22190899 aacgctctt 22190907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 208
Target Start/End: Original strand, 44397668 - 44397850
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44397668 gtgaaagagagattgtgaattgccaacacattaaaata-gagtcgttggaagctttgatcaatcgccaatgatcttttgcctaatatggttattgtccta 44397766  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagaca 208  Q
     ||| ||| || ||||||| |||||||| | |  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  44397767 tgaatgattaaattcaaatccattcccattctaaaggaacatcgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagaca 44397850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 236
Target Start/End: Original strand, 16848364 - 16848574
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||| |    
T  16848364 gtgaaagagacgttg--aattgccagcatattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgatcctttgcttgatatggttattgttc 16848460  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    || |||||||||||||||||| | |||||| |  | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||    
T  16848461 tatgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgagaaggaacatcgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtaggagagacaaaaacagagtagtg 16848560  T
Q  223 gagatagtggttgt 236  Q
    ||| ||||||||||    
T  16848561 gaggtagtggttgt 16848574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 40 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 15475424 - 15475172
Alignment:
Q  40 tgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttc 139  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15475424 tgaattgccagcacatccaaaatagagtcgtttgaagctttgatgattcaccattgatcttttgcctgatatggttattgtcctacgaaggatcaatttc 15475325  T
Q  140 aaattcattcccagtatgtaggaacattg-ttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtac 238  Q
    |||| |  ||||| | || |  ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |  | ||||||||||  || |||||||||    
T  15475324 aaatcctatcccaatgtgcataaacattgtttgtaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacaaactcagagtagtggaagtattggttgtac 15475225  T
Q  239 acatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 291  Q
    || ||||| ||  | ||| |||||||||||||  |  || |||||||||||||    
T  15475224 acttcgtataaacgtactatgtcaacgctctttgaggagtaagcatccaatgc 15475172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 414
Target Start/End: Original strand, 17540209 - 17540598
Alignment:
Q  18 taaaggagtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaa-tcaccaatgatcttttgtctaatatggtta 116  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||||    
T  17540209 taaaggtgtgaaagagacgttg--aattgtcagcacatcaaaa--agagtcgtttgaaactt-gatcaaatcaccaatgatcttatgcctgatttggtta 17540303  T
Q  117 ttgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactga 216  Q
    || ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| || |||||||| || |||| |||||||| | | || || ||| |||| ||    
T  17540304 ttatcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatggaggaacactggtgcaggcatagttgttgttcttgtcctattgcagacaca-aaacaga 17540402  T
Q  217 gtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgt 316  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||| ||||| ||||  ||  |  | ||||||| || ||| |  | ||| ||||||||||||    
T  17540403 gtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacactctccaacgaataggcatccactggcttcacatccatctgaattagttgt 17540502  T
Q  317 tgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagct 414  Q
    || |||| |||    ||||| ||||||| |||||| |||||||||  ||| ||| ||  |||||||| || ||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  17540503 tgcttcattctttcagtcttttgcaatgataggcgagattaaatcatttgaacagcc--tgaagcttcaattctttcaacttctgatgatcttcagct 17540598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 268
Target Start/End: Original strand, 16939833 - 16940075
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    ||||||||||||||   |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||     
T  16939833 gtgaaagagacgtta--aatttccagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgattctttgcctgatatggttattgtct 16939929  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||| |  | || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||| ||||  || ||||    
T  16939930 tacgaaggatcaatttcaaatgtatttccattgagaagaaacattgtagcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagtagggacaaaaacatagcagtg 16940029  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctc 268  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||    
T  16940030 gagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctc 16940075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 40 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 9751821 - 9751590
Alignment:
Q  40 tgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttc 139  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9751821 tgaattgccagcacatccaaaatagagtcgttagaagcttttataaatcaccattgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttc 9751722  T
Q  140 aaattcattcccagtatgtaggaacattg-ttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtac 238  Q
    ||||   |||||| | || |  ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  9751721 aaatgtgttcccaatgtgcataaacattgtttgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtac 9751622  T
Q  239 acatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    || |||| |||    ||| |||||||||||||    
T  9751621 acttcgtgcaaacatactatgtcaacgctctt 9751590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 25 - 201
Target Start/End: Original strand, 55731662 - 55731837
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||    
T  55731662 gtgaaagagacgttg--aattgccagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgatcctttgcatgatatggttattgtcc 55731758  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagc 201  Q
    || ||| |||||||||||||| |||||||| |  | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  55731759 taagaaagatcaatttcaaatgcattcccattgagaatgaacattgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagc 55731837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 14154289 - 14154065
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaa-ttgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| || |||||  | |||||||    
T  14154289 gtgaaatagacgttgtgaaattgtcagcgcatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaataattctttgcctgatatgaatgttgtcct 14154191  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
    | ||| ||||||||| |||| ||||||   | || |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||| |||||| |||| |||||||||    
T  14154190 atgaaagatcaatttgaaatccattcctgttgtgaaggaacattgttgcaggcagagctatttttcttctcttatagcagagacaaaaacagagtagtgg 14154091  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaa 249  Q
    |||  |||||||||||| ||||||||    
T  14154090 agaaggtggttgtacacttcgtacaa 14154065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 65 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 27188895 - 27188690
Alignment:
Q  65 agtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaac 164  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||   |||||| | |||| ||||    
T  27188895 agtcgtttgaagctttgataattcaccattgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaattttaaatgtgttcccaatgtgtatgaac 27188796  T
Q  165 attg-ttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagac-acaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtca 262  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  | ||| |||||    
T  27188795 attgtttgcaggcagagatgttattcttgtcttgtagcagagacaaaaaacagagtagtgcagatagtggttatacacttcgtacaaacgcactatgtca 27188696  T
Q  263 acgctc 268  Q
    ||||||    
T  27188695 acgctc 27188690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 27 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 17788335 - 17787962
Alignment:
Q  27 gaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaa-tcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctac 125  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||| ||     
T  17788335 gaaagagacgttgttaattgtcaacacatcaaaa--agagtcgtttgaagctt-gatcaaatcaccaatgatcttttgcctgattttgttattgtcgtat 17788239  T
Q  126 gaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaact-gagtagtgga 224  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||  | |||||||| | ||||| ||||||  |  ||||  ||||| ||| | ||||||||||    
T  17788238 gaaggatcaatttcaaatccactccaagtatggaggaacaccggtgcaggcacaactgttgttcttg--tactagc--agacaaaaaatagagtagtgga 17788143  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgt-caacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattca 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||| |||  ||| |  ||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||  |||         
T  17788142 gatagtggttgtacacatcgtacaattgtcctttttccaacgttctccaaagaataagcatctaatgcctttaaattcctttgaaatagtcattg----- 17788048  T
Q  324 ctctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttca 411  Q
      || || ||||||||||||| || |||||||||||||  ||| ||| |||||||||||| || ||| ||| ||||| |||| |||||    
T  17788047 --cttctagtcttctgcaatgataagcgtgattaaatcatttgaacagcctttgaagcttcaattctttcagcttctaatgatcttca 17787962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 15014681 - 15014571
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  15014681 gtgaaagagacgttgtgaatttccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtccta 15014583  T
Q  125 cgaaggatcaat 136  Q
     |||||||||||    
T  15014582 tgaaggatcaat 15014571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 8685734 - 8685511
Alignment:
Q  26 tgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaa-tcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  8685734 tgaaagagacgttgttgattgccagcatatcaaaa--agagtcgtttgaagctt-gatcaaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttattgtccta 8685638  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaa-ctgagtagtgg 223  Q
     ||||||| |||||||||| |||| | ||| || ||||||| || |||| |||  |||||| |||||||| | | ||  ||||||||| | |||||||||    
T  8685637 tgaaggattaatttcaaatccatttcaagtctggaggaacactggtgcatgcatggctgttgttcttgtcctattgc--agacacaaatcagagtagtgg 8685540  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaattg 252  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8685539 agatagtggttgtacacttcgtacaattg 8685511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Original strand, 1672241 - 1672450
Alignment:
Q  63 agagtcgtt-tgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagg 161  Q
    ||||||||| ||||||||| || | |||||| |||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| | ||||      
T  1672241 agagtcgttctgaagctttcataattcaccattgatcttttgcctgatttggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgtata 1672340  T
Q  162 aacattgtt-gcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgt 260  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | | |||||    
T  1672341 aacattatttgcagacagagctgttattcttgttttgtagcgtagacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtattttgt 1672440  T
Q  261 caacgctctt 270  Q
    ||||| ||||    
T  1672441 caacgttctt 1672450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Original strand, 1674716 - 1674925
Alignment:
Q  63 agagtcgtt-tgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagg 161  Q
    ||||||||| ||||||||| || | |||||| |||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| | ||||      
T  1674716 agagtcgttctgaagctttcataattcaccattgatcttttgcctgatttggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgtata 1674815  T
Q  162 aacattgtt-gcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgt 260  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | | |||||    
T  1674816 aacattatttgcagacagagctgttattcttgttttgtagcgtagacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtattttgt 1674915  T
Q  261 caacgctctt 270  Q
    ||||| ||||    
T  1674916 caacgttctt 1674925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 40 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 3499933 - 3499704
Alignment:
Q  40 tgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttc 139  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||| | ||| |  ||||| |||| || ||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  3499933 tgaattgccagcacatccaaaatagagtcgttttaagctttgataattcatcgttgatcctttgcctgatatggttatttttctatgaaggatcaatttc 3499834  T
Q  140 aaattcattcccagtatgtaggaacattg-ttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtac 238  Q
    |||| | |||||| | ||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |  | ||||||| ||  ||||||||||||    
T  3499833 aaatgcgttcccaatgtgtataaacattgtttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtaacagagacaaactcagagtagtagaagtagtggttgtac 3499734  T
Q  239 acatcgtacaattggactttgtcaacgctc 268  Q
    || |||||||| || ||| |||||||||||    
T  3499733 acttcgtacaaatgtactatgtcaacgctc 3499704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 207 - 390
Target Start/End: Original strand, 12601099 - 12601283
Alignment:
Q  207 cacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | | ||      
T  12601099 cacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttca 12601198  T
Q  307 aattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtct 390  Q
    || |||| ||||||||||| | |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||    
T  12601199 aaatagtcgttgattcactattcaagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgacgctttaagtct 12601283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 63 - 240
Target Start/End: Original strand, 33378264 - 33378442
Alignment:
Q  63 agagtcgtt-tgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagg 161  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||| | |||||||| |||| ||||  ||||||| |||||| |   || |||    
T  33378264 agagtcgttgtgaaactttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaagaatcacgttcaaatccattcctatcttgaagg 33378363  T
Q  162 aacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  33378364 aacatttctgcaggtagaactgtttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 33378442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 25651391 - 25651154
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||      | | |||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  25651391 gtgaaagagacgttg--aattgtcagcacattcaaaata-gagtcgtttgaaacttt------tgatcaatgatcctttgcctgatatggttattgtcct 25651301  T
Q  124 acgaaggatcaatttc-aaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    | ||| |||||||||| |||| |||||| | |  | ||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  25651300 atgaaagatcaatttcaaaatacattccaattgagaaggaacatctttgcaggccgagctgtttttcttgtcttgtagcagagaca-aaacagagtagtg 25651202  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    ||| |||||||||||||| | ||||||  | |||  ||||||||||||    
T  25651201 gaggtagtggttgtacactttgtacaaacgtactacgtcaacgctctt 25651154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18007251 - 18007089
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |   || ||||||||| ||||||||    
T  18007251 ctttgatcatccaccagtaatcttttgccttatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttttgcaggc 18007152  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||    
T  18007151 agagctgtt-ttcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacac 18007089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 79 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 36210299 - 36210138
Alignment:
Q  79 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcag 178  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| || || ||| | |||||||| |||||||||  ||||||| |||||| |   || |||||||||  |||||||||    
T  36210299 ttgatcaaataccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacattcaaatccattcctatcttgaaggaacatttatgcaggcag 36210200  T
Q  179 agctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||    
T  36210199 agctgtttatcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacac 36210138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 79 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 14778632 - 14778473
Alignment:
Q  79 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcag 178  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| || || ||| | |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||     || |||||||||  |||||||||    
T  14778632 ttgatcaaataccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctttcttgaaggaacatttctgcaggcag 14778533  T
Q  179 agctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtaca 239  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||| |||||| |||||||||||||    
T  14778532 agctgttat-cttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtaca 14778473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Original strand, 55651413 - 55651575
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |   || |||||||||  |||||||    
T  55651413 ctttgatcatccaccagtaatcttttgactgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaaattcaaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggc 55651512  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  55651513 agagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 55651575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 79 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 17993982 - 17993824
Alignment:
Q  79 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcag 178  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || || ||| | |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |   || ||| |||||  |||||||||    
T  17993982 ttgatcaat-accaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctaacttgaagggacatttctgcaggcag 17993884  T
Q  179 agctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtaca 239  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||| | |||| |||||| |||||||||||||    
T  17993883 agctattat-cttgtcttgtagcgtagacacaagcagagttgtggaggtagtggttgtaca 17993824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Original strand, 11535934 - 11536096
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | | |||||  |||| ||||| ||||||||||||||||   || |||||||||  |||||||    
T  11535934 ctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggc 11536033  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11536034 agagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 11536096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 341 - 452
Target Start/End: Original strand, 22089721 - 22089831
Alignment:
Q  341 aatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgat 440  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||| ||||     
T  22089721 aatgttaggcgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctt-aattctttcatcttctgatgatctttagcttctggtgatcttcaacttctgatgag 22089819  T
Q  441 gtgcttctgatg 452  Q
    || |||||||||    
T  22089820 gtacttctgatg 22089831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 359
Target Start/End: Original strand, 11901007 - 11901337
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaa-tcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| || || |||||||||||||    
T  11901007 gtgaaagagacgatgttgattgccagcaaataaaaa--agagtcgtttgaag-tttgatcaaatcaccaatgatctgttgcctgatttggttattgtcct 11901103  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
    | || | ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |    || ||||| | ||||| ||||||  |  |||| || ||| | || || |||||     
T  11901104 atgaggtatcaatttcaaatccattccaagtatggaggaaaaccagtgtaggcacaactgttgttcttg--tactagcagacacaaatacagattagtgt 11901201  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattca 323  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||  ||||   |||| |||  | | |  |||||||||||||||| ||  || ||||||||||| |||| ||||    
T  11901202 agatagtgattgtacacttcgtacaattgtccttttctaacgttctccagagaataagcatccaatgccttcaaaatcttttgaattagtcgttgcttca 11901301  T
Q  324 ctctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaa 359  Q
       | || |||||||||||||  |||||| ||||||    
T  11901302 tgtttctagtcttctgcaatgacaggcgttattaaa 11901337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 79 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 14710968 - 14710809
Alignment:
Q  79 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcag 178  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| || || ||| | |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||     || |||||||||  |  ||||||    
T  14710968 ttgatcaaataccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctttcttgaaggaacatttctataggcag 14710869  T
Q  179 agctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtaca 239  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||| |||||| |||||||||||||    
T  14710868 agctgttat-cttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtaca 14710809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 353 - 449
Target Start/End: Original strand, 23123576 - 23123672
Alignment:
Q  353 gattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctg 449  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||    
T  23123576 gattaaattcattgaacaatctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatcttctgcttctgatgagatgcttctg 23123672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Original strand, 10300623 - 10300785
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | | |||||  |||| ||||| ||||||||||||||||   || |||||||||  |||||||    
T  10300623 ctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggc 10300722  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  10300723 agagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagataaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 10300785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Original strand, 11515124 - 11515286
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | | |||||  |||| ||||| ||||||||||||| ||   || |||||||||  |||||||    
T  11515124 ctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattctcatcttgaaggaacatttctgcaggc 11515223  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11515224 agagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 11515286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 49002149 - 49001987
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | | |||||  ||||||| || |||||||||||||| |   || |||||||||  |||||||    
T  49002149 ctttgatcatccaccattaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctgtgaaggattaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggc 49002050  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  49002049 agagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 49001987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 442 - 528
Target Start/End: Original strand, 3395857 - 3395943
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||| ||||    
T  3395857 tgcttctgatgacgtcatcactttaggagcactttatcttcatgagcactttgacttcaggagcagttctcttcagacgctttaagc 3395943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 131 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 31266914 - 31266806
Alignment:
Q  131 atcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagt 230  Q
    ||||| ||||||||||||||||   || |||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||| ||||    
T  31266914 atcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaagaacagagtagtggaggtagt 31266816  T
Q  231 ggttgtacac 240  Q
    ||||||||||    
T  31266815 ggttgtacac 31266806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 442 - 528
Target Start/End: Original strand, 14571257 - 14571344
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt-tgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| | || || |||||||| |||| ||||    
T  14571257 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagcacttcagacttcaggagcagttttcttcagacgctttaagc 14571344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 137 - 240
Target Start/End: Original strand, 16317478 - 16317581
Alignment:
Q  137 ttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgt 236  Q
    ||||||||||||||||   || |||||||||  ||||||||  |||||| ||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16317478 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcatggctgtttttcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 16317577  T
Q  237 acac 240  Q
    ||||    
T  16317578 acac 16317581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 240
Target Start/End: Original strand, 5873507 - 5873620
Alignment:
Q  126 gaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggag 225  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||   || |||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||    
T  5873507 gaagaatcaacttcaatttcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacaaagtagtggag 5873605  T
Q  226 atagtggttgtacac 240  Q
     ||||||||||||||    
T  5873606 gtagtggttgtacac 5873620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 10661460 - 10661336
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatc-aatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||  | || || |||||||| |    
T  10661460 gtgaaagagacgttgttgattgctagcacatcaaaa-aagagtcgtttgaagc-ttgatcaaatcaccaatgatctgttgcttgatttgcttattgtcat 10661363  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcc 150  Q
      |||||| ||||||||||| ||||||    
T  10661362 gtgaaggaacaatttcaaatccattcc 10661336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 10875605 - 10875481
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatc-aatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||  | || || |||||||| |    
T  10875605 gtgaaagagacgttgttgattgctagcacatcaaaa-aagagtcgtttgaagc-ttgatcaaatcaccaatgatctgttgcttgatttgcttattgtcat 10875508  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcc 150  Q
      |||||| ||||||||||| ||||||    
T  10875507 gtgaaggaacaatttcaaatccattcc 10875481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 240
Target Start/End: Original strand, 24713569 - 24713681
Alignment:
Q  126 gaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggag 225  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||   || |||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||    
T  24713569 gaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgtt-gtcttgtcttgtagc-gtgacaaaaacagagtagtggag 24713666  T
Q  226 atagtggttgtacac 240  Q
     ||||||||||||||    
T  24713667 gtagtggttgtacac 24713681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 442 - 495
Target Start/End: Original strand, 3486351 - 3486404
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttga 495  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  3486351 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagcagtttga 3486404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 400 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 9751470 - 9751376
Alignment:
Q  400 tgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatga--tgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||| ||||||||||||||   | |||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  9751470 tgatgaactgcagcttctggtgatacatagcttctgatgaactttgcttctgatgacgtcatcacttcataagcactttgtcttcaggagcactt 9751376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 240
Target Start/End: Original strand, 19581389 - 19581491
Alignment:
Q  137 ttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgt 236  Q
    ||||||||||||||||   || |||||||||  ||||||||  |||||| ||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19581389 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcatggctgtt-ttcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 19581487  T
Q  237 acac 240  Q
    ||||    
T  19581488 acac 19581491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 528
Target Start/End: Original strand, 8105902 - 8105988
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||| | || || |||||||| |||| ||||    
T  8105902 tgcttctgatgacatcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagcgctttatcttcaggagcagttttcttcagacgctttaagc 8105988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 262 - 492
Target Start/End: Original strand, 14833449 - 14833691
Alignment:
Q  262 aacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaat 360  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||| || || | | ||  || |||| |||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||| |||    
T  14833449 aacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaat 14833548  T
Q  361 ccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg------atg----tgcttctga 450  Q
    | |||| ||| |||||||||||| ||||||  ||||| |||||||| | || ||||||| ||||||  |||||| |||      |||    |||||||||    
T  14833549 ctattgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaattacaacttctggagatcttcagcttctgatgcttcttatgaacctgcttctga 14833648  T
Q  451 tgacgtcatcacttcaggagcac-tttgttttcaggagcactt 492  Q
    |||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  14833649 tgactttatcacttcaggagcacttttgtcttcaggagcactt 14833691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 18774847 - 18774686
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |   || ||||||| |  |||||||    
T  18774847 ctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattatgcaggc 18774748  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtaca 239  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||||    | || ||||||||||||||||||||    
T  18774747 agagctgtta-tcttgtcttgtagcgaggacacacttagggtcgtggagatagtggttgtaca 18774686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Original strand, 20977662 - 20977712
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  20977662 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgtcttcaggagcactt 20977712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 443 - 492
Target Start/End: Original strand, 40860907 - 40860956
Alignment:
Q  443 gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  40860907 gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgtcttcaggagcactt 40860956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 240
Target Start/End: Original strand, 16305254 - 16305357
Alignment:
Q  137 ttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgt 236  Q
    ||||||||||||| ||   || |||||||||  ||||||||  | |||| ||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16305254 ttcaaattcattctcatcttgaaggaacatttctgcaggcatggttgtttttcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 16305353  T
Q  237 acac 240  Q
    ||||    
T  16305354 acac 16305357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16819544 - 16819382
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |   ||| |||||| |  |||||||    
T  16819544 ctttgatcatccaccattaatcttttgcctgatttggatgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgtgggaacaattctgcaggc 16819445  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   ||||||  | | || |||||| ||||||||||||||    
T  16819444 agagctgtta-tcttgtcttgtagcaaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacac 16819382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Original strand, 23509206 - 23509368
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | | |||||| ||||||| || |||||||||||||| |   || ||||||| |  |||||||    
T  23509206 ctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggattaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 23509305  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||||  | | || |||||| ||||||||||||||    
T  23509306 agagctgtta-tcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacac 23509368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 443 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 13576006 - 13575960
Alignment:
Q  443 gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagca 489  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13576006 gcttctgatgacgtcaccacttcaggagcactttgtcttcaggagca 13575960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 14604770 - 14604720
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  14604770 tgcttctgatgacgtcattacttcaggagcactttgacttcaggagcactt 14604720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 15475029 - 15474979
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  15475029 tgcttctgatgacgtcatcacttcataagcactttgtcttcaggagcactt 15474979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 17700674 - 17700624
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  17700674 tgcttctgatgacgtcatcactttagaagcactttgtcttcaggagcactt 17700624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Original strand, 22191071 - 22191121
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  22191071 tgcttctgatgacgtcatcacttcatgagcactttgtctttaggagcactt 22191121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 443 - 489
Target Start/End: Original strand, 54680147 - 54680193
Alignment:
Q  443 gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagca 489  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54680147 gcttctgatgacgtcaccacttcaggagcactttgtcttcaggagca 54680193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 198
Target Start/End: Original strand, 19242115 - 19242235
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||  || || ||| | |||||||| ||| |||||| ||||||| |||||| |   || |||||||||  |||||||    
T  19242115 ctttgatcatttaccaatgatctttttcctgatttggatgttgtcctatgaatgatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggc 19242214  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgt 198  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  19242215 agagctgtta-tcttgtcttgt 19242235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 86
Target Start/End: Original strand, 36470636 - 36470696
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaa 86  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  36470636 gtgaaagagacgctgtgaattgacagcacatcaaaat-tgtgtcgtttgaagctttgatcaa 36470696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 443 - 492
Target Start/End: Original strand, 38514105 - 38514154
Alignment:
Q  443 gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  38514105 gcttctgatgacatcatcacttcagaagcactttgtcttcaggagcactt 38514154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 443 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 39419621 - 39419572
Alignment:
Q  443 gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  39419621 gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgtctttaggagcactt 39419572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 19620955 - 19620907
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcac 490  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  19620955 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggatcactttgacttcaggagcac 19620907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 480 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 29680400 - 29680352
Alignment:
Q  480 ttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  29680400 ttcaggagcactttgacttcaggaacacttctcttcagatacttcaagc 29680352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 3105315 - 3105268
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagca 489  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  3105315 tgcttttgatgacgtcatcacttcaggagcaccttgtcttcaggagca 3105268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 3499526 - 3499439
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt-tgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||   ||||||||  || || ||||||||||||| ||||    
T  3499526 tgcttctgatgacatcatcacttcagaagcactttgtcttcaggtgcacttcaaacttcagacgcagttttcttcagatgctttaagc 3499439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 8182676 - 8182593
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttga-cttcagaatcacttctcttcagatgcttc 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| |||||||| | |||||||  || || ||||||||||||||    
T  8182676 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttcagcttcagaagcactttaagcttcagacgcagttttcttcagatgcttc 8182593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 446 - 492
Target Start/End: Original strand, 9141114 - 9141161
Alignment:
Q  446 tctgatgacgtcatcacttcaggagcac-tttgttttcaggagcactt 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  9141114 tctgatgacgtcatcacttcaggagcacttttgtcttcaggagcactt 9141161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 150
Target Start/End: Original strand, 13890647 - 13890769
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgttt-gaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    |||||||| |||||| | |||| |||||||||||||  |||||||||  ||||||| ||  ||||||||||||||| |||  | || |||||||||| ||    
T  13890647 gtgaaagatacgttgaggattgtcagcacatcaaaa--agagtcgttgagaagctt-gag-aatcaccaatgatctgttgcttgatttggttattgttct 13890742  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcc 150  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||    
T  13890743 atgaaggaacaatttcaaattcattcc 13890769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 18077706 - 18077623
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttga-cttcagaatcacttctcttcagatgcttc 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| |||||||| | |||||||  || || ||||||||||||||    
T  18077706 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttcagcttcagaagcactttaagcttcagacgcagttttcttcagatgcttc 18077623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Original strand, 4987455 - 4987524
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  4987455 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 4987524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Original strand, 10909590 - 10909659
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  10909590 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 10909659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 14904198 - 14904148
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  14904198 tgcttctgaagacgtcatcacttcaatagcactttgtcttcaggagcactt 14904148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 150
Target Start/End: Original strand, 18773874 - 18773996
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtt--tgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||   ||||||||  |||| |||| || ||||||||||||| | |||| | || |||||||||| |    
T  18773874 gtgaaagagacgttgttgattgccagcacagcaaaa---gagtcgttgttgaatcttt-at-aatcaccaatgatttgttgtttgatttggttattgtac 18773968  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcc 150  Q
    || || ||| ||||||||||||||||||    
T  18773969 taggagggaacaatttcaaattcattcc 18773996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 19889288 - 19889166
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtt--tgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||   ||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||| | |||  | || |||||||||||     
T  19889288 gtgaaagagacattgttgattgccagcacatcaaaa---gagtcgttgttgaagctt-gat-aatcaccaatgatatgttgcttgatttggttattgtct 19889194  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcc 150  Q
    || || ||| ||||||||||||||||||    
T  19889193 taggagggaacaatttcaaattcattcc 19889166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 27188544 - 27188494
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  27188544 tgcttctgatgacgtcaacacttcagaagcactttgtcttcagaagcactt 27188494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 37435384 - 37435334
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||    
T  37435384 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactattacttcaggagcactt 37435334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 528
Target Start/End: Original strand, 55732026 - 55732112
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||  |||||| | || || |||||||| |||| ||||    
T  55732026 tgcttctgatggcatcatcacttcaggagcactttatcttcaggagcgctttatcttcaggagcagttttcttcagacgctttaagc 55732112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 393 - 493
Target Start/End: Original strand, 6517668 - 6517769
Alignment:
Q  393 catcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgt-gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcact 491  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||||||  |  |||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||| ||    
T  6517668 catctcctgatgaactacaacttctggtgattctcagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaagagcactatatcttcaggagcgct 6517767  T
Q  492 tt 493  Q
    ||    
T  6517768 tt 6517769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 332 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 17398671 - 17398529
Alignment:
Q  332 gtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgct 431  Q
    |||||||||||| ||||||| | || ||||| |   ||||| |||||||||| ||||  |  |||| |||||||||  ||||||||||||||   | |||    
T  17398671 gtcttctgcaattttaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaagttgc--atctcctgatgaaccgcagcttctggtgattcatagct 17398574  T
Q  432 tctaatgatgt-gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    ||| ||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17398573 tctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaagagcactt 17398529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 55380508 - 55380541
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55380508 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 55380541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 480 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 14604749 - 14604701
Alignment:
Q  480 ttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||    
T  14604749 ttcaggagcactttgacttcaggagcacttctcttcagacgtttcaagc 14604701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 480 - 528
Target Start/End: Original strand, 16632708 - 16632756
Alignment:
Q  480 ttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    ||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  16632708 ttcagaagcactttgactttaggagcacttctcttcagatgcttcaagc 16632756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 522
Target Start/End: Original strand, 24640726 - 24640806
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgct 522  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||| |||  |||||| | || || ||||||||||||    
T  24640726 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcagtttagcttcaggagcagtttagcttcaggagcagttttcttcagatgct 24640806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 522
Target Start/End: Original strand, 27657079 - 27657159
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgct 522  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||| |||  |||||| | || || ||||||||||||    
T  27657079 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcagtttagcttcaggagcagtttagcttcaggagcagttttcttcagatgct 27657159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 522
Target Start/End: Original strand, 27667652 - 27667732
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgct 522  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||| |||  |||||| | || || ||||||||||||    
T  27667652 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcagtttagcttcaggagcagtttagcttcaggagcagttttcttcagatgct 27667732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 480 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 37435363 - 37435315
Alignment:
Q  480 ttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    |||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  37435363 ttcaggagcactattacttcaggagcacttctcttcagatgcttcaagc 37435315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 47152140 - 47152088
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  47152140 tcttgtcttgtagcgtagataaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 47152088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 55745018 - 55744938
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgct 522  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||| |||  |||||| | || || ||||||||||||    
T  55745018 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcagtttagcttcaggagcagtttagcttcaggagcagttttcttcagatgct 55744938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 55755629 - 55755549
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgct 522  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||| |||  |||||| | || || ||||||||||||    
T  55755629 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcagtttagcttcaggagcagtttagcttcaggagcagttttcttcagatgct 55755549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 240
Target Start/End: Original strand, 3370896 - 3370966
Alignment:
Q  169 ttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  3370896 ttgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtggtggaggtagtggttgtacac 3370966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15207523 - 15207422
Alignment:
Q  137 ttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgt 236  Q
    ||||||||||||||||   || ||||||| |  |||||||| | ||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15207523 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaattctgcaggcataactgttgt-cttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgt 15207426  T
Q  237 acac 240  Q
    ||||    
T  15207425 acac 15207422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 18752289 - 18752254
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttg 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18752289 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 18752254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 18762899 - 18762864
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttg 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18762899 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 18762864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 445 - 476
Target Start/End: Original strand, 40846351 - 40846382
Alignment:
Q  445 ttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 476  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40846351 ttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 40846382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 488
Target Start/End: Original strand, 45833643 - 45833690
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcac-tttgttttcaggagc 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  45833643 tgcttctgatgacgtcatcacttcaagagcacttttgtcttcaggagc 45833690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Original strand, 5022918 - 5022986
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  5022918 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 5022986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 14835887 - 14835805
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttc 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | | ||| ||||||||  |||||||  || || ||||||||||||||    
T  14835887 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcacttcatctgcagaagcactttagcttcagacgcagttttcttcagatgcttc 14835805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 14836180 - 14836112
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14836180 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 14836112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 443 - 501
Target Start/End: Original strand, 17247492 - 17247550
Alignment:
Q  443 gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcag 501  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||| |||| ||||| ||||||    
T  17247492 gcttctgatgacatcaccacttcaggagcactttatcttcaagagcgctttgtcttcag 17247550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18077983 - 18077914
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  18077983 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagaggagtggaggtagtggttgtacac 18077914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 524
Target Start/End: Original strand, 19581717 - 19581799
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttc 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||| ||||||||  |||||||  || || ||||||||||||||    
T  19581717 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcacttcagcttcagaagcactttagcttcagacgcagttttcttcagatgcttc 19581799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 40454425 - 40454357
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  40454425 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 40454357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 40470664 - 40470596
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  40470664 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 40470596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 426 - 475
Target Start/End: Original strand, 48371572 - 48371624
Alignment:
Q  426 tttgcttctaatga---tgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    ||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48371572 tttgcttctaatgaccttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 48371624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 4948795 - 4948828
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4948795 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 4948828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 477
Target Start/End: Original strand, 5023191 - 5023224
Alignment:
Q  444 cttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttg 477  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5023191 cttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 5023224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 14357425 - 14357304
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgttt--gaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||| |||||  |||||||| |||||||||   ||||| |||  ||||||| ||||| | ||||||||||| |||  | || ||||||||||||    
T  14357425 gtgaaagagaggttgttgattgccagaacatcaaaa---gagtcatttttgaagctt-gatca-taaccaatgatctgttgcttgatttggttattgtcc 14357331  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattc 149  Q
    || || ||| |||||||||||||||||    
T  14357330 taggagggaacaatttcaaattcattc 14357304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 16256329 - 16256362
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16256329 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcactt 16256362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 16266922 - 16266955
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16266922 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcactt 16266955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 17198222 - 17198141
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgctt 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||| ||||||||  |||||||  || || |||||||||||||    
T  17198222 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcacttcagcttcagaagcactttagcttcagacacagttttcttcagatgctt 17198141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 410 - 458
Target Start/End: Original strand, 17540629 - 17540675
Alignment:
Q  410 cagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtca 458  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  17540629 cagcttctggtgatctt--gcttctgatgaggtgcttctgatgacgtca 17540675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 19944110 - 19944077
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19944110 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 19944077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 19954762 - 19954729
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19954762 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 19954729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 20648434 - 20648401
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20648434 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 20648401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 24027885 - 24027852
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24027885 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 24027852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 27815006 - 27814953
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaa-ctgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27815006 tcttgtcttgtagcgtagacataaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 27814953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 47151879 - 47151798
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgctt 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||| ||||||||  |||||||  || || |||||||||||||    
T  47151879 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcacttcagcttcagaagcactttagcttcagacgcagttttcttcagatgctt 47151798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Original strand, 48371330 - 48371383
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaa-ctgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  48371330 tcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 48371383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 52704248 - 52704281
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52704248 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 52704281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Original strand, 3390654 - 3390706
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||||||||||  |||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  3390654 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtggtggaggtagtggttgtacac 3390706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 480 - 528
Target Start/End: Original strand, 6641951 - 6641998
Alignment:
Q  480 ttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  6641951 ttcaggagcactt-gacttcagaagcacatttcttcagatgcttcaagc 6641998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Original strand, 10695838 - 10695890
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  10695838 tcttgtcttgtagcgtagaaaaaaacagggtagtggaggtagtggttgtacac 10695890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 480 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 19620934 - 19620886
Alignment:
Q  480 ttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||    
T  19620934 ttcaggatcactttgacttcaggagcacgtctcttcagatgctttaagc 19620886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 195)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 25 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 13018844 - 13018397
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||    
T  13018844 gtgaaagagactttgtaaattgacagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcttgatttggttattgtccta 13018746  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  13018745 tgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaaaattgttgcagtcgtagctgttattcttgtcctgtagcacagacacaaactgagtagtgga 13018646  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||| || |||| |||| |||||    
T  13018645 gatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaatccagcatccaatgccttcaacttcatttaaaatagtcgttgcttcac 13018546  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    |||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||  |||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  13018545 tctcctagtcttctgcaatactgggcgtgattaaatccattgaacagccttttgaagctttaag--tctcgtcttcatatgaacttcagcttctggtgat 13018448  T
Q  424 cttttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact 474  Q
    ||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13018447 cttctgcttctgatgaggtgcttctgaagacgtcatcacttcaggagcact 13018397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 26 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 39284902 - 39284452
Alignment:
Q  26 tgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctac 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||     
T  39284902 tgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaatac-agtcgtttgaaacttttatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgttctat 39284804  T
Q  126 gaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggag 225  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  39284803 gaaggatcaatttcaaatccgttccaagtatgaaggaacaatgttgcaggcatagctgttatctttgtcctgtagtagagacacaaactgagtagtggag 39284704  T
Q  226 atagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcact 325  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  39284703 gtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccaatgccttcaaattcatttgaattagtcgttgtttcact 39284604  T
Q  326 ctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatct 425  Q
    || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39284603 cttctggtcttcagcaatgctaggcgtgattaaatcctttgaacagcctttgaagctttgattctctcatcttctgatgatcttcagcttctggtgatct 39284504  T
Q  426 tttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 476  Q
    |  |||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39284503 tcagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagtacttt 39284452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 25 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 41842612 - 41842163
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  41842612 gtgaaagagacgttgtgaatatccaacacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattatccta 41842514  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  41842513 tgaaggatcaatttcaaatccattccaagtataaaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtgca 41842414  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  41842413 ggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactctgtcaacgcactttaaaaaacaagtatccaatgtcttcaacttcatttgaattagtcgttgcttcac 41842314  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    ||||||| |||| |||| || |||| || ||| ||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41842313 tctcctgatcttatgcagtgcttagacgagatcaaatcaaatgaacaacctttgaagctt-aagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 41842215  T
Q  424 cttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 476  Q
    |  ||||| |||||| || | ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  41842214 c--ttgctactaatgaatttacttctgatgatttcatcacttcaggagcacttt 41842163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 26 - 474
Target Start/End: Original strand, 44466883 - 44467334
Alignment:
Q  26 tgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctac 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  44466883 tgaaagagacgttgtgaattgccaacacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctaatatggttattgtcctat 44466981  T
Q  126 gaaggatcaatttcaaattcattcccagta-tgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | |  || |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  44466982 gaaggatcaatttcaaatccattccaatttgtgaaggaacatcgttgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgga 44467081  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| || | | ||  || |||| |||| |||||    
T  44467082 ggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcac 44467181  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtga 422  Q
    ||| || ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  44467182 tcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttttggtga 44467281  T
Q  423 tcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact 474  Q
    ||||  |||||| ||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44467282 tcttcagcttctgatgaacttgcttctgatggcgtcatcacttcaggagcact 44467334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 25 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 10883512 - 10883084
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  10883512 gtgaaagagacgttgtgaattgccaacacatcaaaata-gagtcgtttgaagcttttattaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtccta 10883414  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10883413 tgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagatctgttattcttgtcttgtagcagagacgcaaactgagtagtgga 10883314  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||| || | | ||  || |||| |||| |||||    
T  10883313 ggtagtgattgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaggcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcac 10883214  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    ||| |  |||||||| |||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  10883213 tcttccagtcttctgaaatgattagacgagattaaatccattgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatctcctgatgaactacagcttctggtgat 10883114  T
Q  424 cttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    |||  |||||| |||   ||||||||||||    
T  10883113 cttcagcttctgatgggatgcttctgatga 10883084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 26 - 426
Target Start/End: Original strand, 13302631 - 13303030
Alignment:
Q  26 tgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctac 125  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||     
T  13302631 tgaaagagacgttgtgaattgtcagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctat 13302729  T
Q  126 gaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggag 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  13302730 gaaggatcaatttcaaatccattcc-agtatgtaggaacattgttgcaggcaaagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggtg 13302828  T
Q  226 atagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcact 325  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| || | | ||  || |||| |||| ||||||    
T  13302829 atagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcact 13302928  T
Q  326 ctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatc 424  Q
    || || ||||||| ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  13302929 cttctagtcttctacaatgcttagacgatattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctaatgaactacagcttctggtgatc 13303028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 25 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 16316896 - 16316470
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16316896 gtgagagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataa-agtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtccta 16316798  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     ||| ||| |||||||||| |||||| |||||   |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16316797 agaatgattaatttcaaatccattccaagtataagggaacattgttgcaggaagagctgctgttcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtgga 16316698  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||| || | | ||  || ||| ||||| |||||    
T  16316697 gatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatttcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatggcttcaaatcctttcaaaatagctgttgcttcac 16316598  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaa-tgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    ||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  16316597 tcttctggtcttctgcaattcttagacgtgattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatcccctgatgaacttcaacttctggtgat 16316498  T
Q  424 cttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    |  |||||||| ||||  ||||||||||||    
T  16316497 c--ttgcttctgatgagatgcttctgatga 16316470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 25 - 439
Target Start/End: Original strand, 11792726 - 11793140
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  11792726 gtgaaagagacgttgtgaatttccatcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtccta 11792824  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     ||||||||||||||| || |||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  11792825 tgaaggatcaatttcatatccattcaaagtatgaaggaacattgttgcaggcaaagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactaagtggtgga 11792924  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||| || || | | ||  || |||| |||| |||||    
T  11792925 gatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgctttcaaatgctttcaaaatagtcgttgcttcac 11793024  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    |||  |||||||  |||||| |||| || |||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11793025 tcttatggtctttcgcaatgcttagacgagattaagtccattgaacaacctttaaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgat 11793124  T
Q  424 cttttgcttctaatga 439  Q
    |||| |||||| ||||    
T  11793125 ctttagcttctgatga 11793140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 63 - 475
Target Start/End: Original strand, 21695258 - 21695671
Alignment:
Q  63 agagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagga 162  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  21695258 agagtcgtttga-gcttttatcaatcaccaataatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaagga 21695356  T
Q  163 acattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtca 262  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  21695357 acaatgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagttgaggtactggttgtacacttcgtacaattgtactttgtca 21695456  T
Q  263 acgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatc 361  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||| || |   |||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  21695457 acgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcattttgaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatc 21695556  T
Q  362 cattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatc 460  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |  ||||| |||||||||||||    
T  21695557 cattgaacaacttttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaacttcagcttctggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttatgatgacgtcatc 21695656  T
Q  461 acttcaggagcactt 475  Q
    |||||| ||||||||    
T  21695657 acttcaagagcactt 21695671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 25 - 453
Target Start/End: Original strand, 11319224 - 11319652
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  11319224 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcata 11319322  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  11319323 tgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcaggactgttatccttgtcttgtagtagagacacaaactgagtagtgga 11319422  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || || | | ||  || ||||||||  |||||    
T  11319423 gatagtggttgtacacttcgtgcaattgtaatttgtcaacgctcttcaaaaaacacgcatccaatgcattcaaatcctttcaaaatagttgttacttcac 11319522  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    |||    ||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||  |||||| || || |||||||||||    
T  11319523 tctttcagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacatcctttgaagcttgaagtcttgcatctcttgatgacctacaacttctggtgat 11319622  T
Q  424 cttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    |||  |||||| ||||  ||||||||||||    
T  11319623 cttcagcttctgatgagatgcttctgatga 11319652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 25 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 33692051 - 33691586
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||| |    
T  33692051 gtgaaagagacgttgtgaattgccaacacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcatcaatggtcttttgcctgatatggttattgtccca 33691953  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  33691952 tgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgga 33691853  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | |||||||| || |||||||| ||| ||  || |||| |||| |||||    
T  33691852 ggtagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatctaacgcctttaaattctttcaaaatagtcgttgcttcac 33691753  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    ||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||  ||| |||||||||||| | ||||  ||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  33691752 tcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccatttaacagcctttgaagctttatgtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgat 33691653  T
Q  424 cttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagca 489  Q
     ||   ||||||||| |  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33691652 tttcaacttctaatgaacttgcttctgataacgtcaccacttcaggagcactttgtcttcaggagca 33691586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 43 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 2913929 - 2913478
Alignment:
Q  43 attgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaa 142  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2913929 attgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctctgaaggatcaatttcaaa 2913831  T
Q  143 ttcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacat 242  Q
    | ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2913830 tccattccatgtatgtaggatcattgttgcaggcagagttgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 2913731  T
Q  243 cgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaa 342  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | | ||  || |||| |||| | |||| | || ||||||||||     
T  2913730 cgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgctccacttttctagtcttctgcat 2913631  T
Q  343 tg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-at 440  Q
    || ||||  | |||||||| ||||| ||| ||||||||| || ||||||  ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||   ||||| ||| |     
T  2913630 tgtttagatgagattaaattcattgaacagcctttgaagatttaagtcttgcatctcctgatgaactacagtttctggtgatcttcatcttctgatgaac 2913531  T
Q  441 gtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcac-tttgttttcaggagcactt 492  Q
     ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  2913530 ttgcttttgatgacgtcattacttcaggagcacttttgtcttcaggagcactt 2913478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 43 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 13138216 - 13137833
Alignment:
Q  43 attgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaa 142  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  13138216 attgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgtaggatcaatttcaaa 13138118  T
Q  143 ttcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacat 242  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  13138117 tccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacataaactgagtaatggagatagtggttgtacactt 13138018  T
Q  243 cgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaa 342  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || |   ||  || ||||||||| ||||||||    |||||||||||    
T  13138017 cgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcttttcaaaatagttgttgcttcactctttcagtcttctgcaa 13137918  T
Q  343 tg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatctt 426  Q
    || |||| || ||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||  ||||| || |||||||  ||||||||||||||||    
T  13137917 tgcttagacgagattaaatccattgattaacctttgaagctttaagtcttgcatctccttatgaactagagcttctggtgatctt 13137833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 25 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 29935685 - 29935250
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||            || ||||||||||||    
T  29935685 gtgaaagagacattgtgaattgccagcacttcaaaa-aagagtcgtttgaagttttgatcaattaccaatgat------------atagttattgtccta 29935599  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     ||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  29935598 tgaaggattaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactaagtagtgga 29935499  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || | | ||  || |||| |||| |||||    
T  29935498 gatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcac 29935399  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatc 424  Q
    ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||| ||||||||||||  || ||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  29935398 tcttctggtcttctgcaatgttaagtgtgattaaatatattgaacaacctttgaaattttaagtcttgcatctcctgatgaactttagcttctggtgatc 29935299  T
Q  425 ttttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
      |||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29935298 --ttgcttctgatgagatgcttctgatgacatcatcacttcaggagcactt 29935250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 25 - 423
Target Start/End: Original strand, 21692107 - 21692504
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  21692107 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgttc-aagctttgatcaatcaccgatgatcttttgcctgatatggttattgtccta 21692204  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21692205 tgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacaatgttgcaggcagagatgttatacttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtgga 21692304  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | | ||  ||  ||| |||| |||||    
T  21692305 ggtagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaacagtcgttgcttcac 21692404  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||  | |||||||  ||||| | ||| |||||||||| ||||||  ||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  21692405 tcttctggtcttctgcaatgcttagaagagattaaaatcattgaataacttttgaagctttaagtcttgcatctcctaatgaacttcagcttctgatgat 21692504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 25 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 5001164 - 5000784
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgtt-gtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||     
T  5001164 gtgaaagagacgtttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtctgaagcttttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatgattattgtca 5001065  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  5001064 tatgaaagatcaatttcaaattcattcctagtatgtaggaacattgttgcaggcaaagttgttattcttgtcttgtagtagagacacaaactgagtagtg 5000965  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattc 322  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||| ||| | ||||||| |||||| || || | | ||  || |||| |||| |||    
T  5000964 gagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgttcttcaaagaacaagcattcaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttc 5000865  T
Q  323 ac-tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 401  Q
    || |||| ||||||| ||||||| || |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||  |||||||||    
T  5000864 acttctcttggtcttttgcaatgcttgggcgagattgaatccattgaacaacctttgaagctctaagtcttgcatcttctg 5000784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 28 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 13731011 - 13730566
Alignment:
Q  28 aaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacga 127  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||| ||    
T  13731011 aaagagacgttgtgaattgacagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatggtcttttgcttgatatggttattgtcctatga 13730913  T
Q  128 aggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagat 227  Q
    | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  13730912 aagatcaatttaaaatccattcccagtatgtaggaacatcgttgcaagcagagctattatccttgtcttgtaacagagacacaaactgagtagtggagat 13730813  T
Q  228 agtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactct 327  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || |   ||  || |||  |||| ||||||||    
T  13730812 aatggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgcattcaaatcttttcaaaatagccgttgcttcactct 13730713  T
Q  328 cctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatctt 426  Q
      | ||||| ||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||| ||| ||| ||||| || |||        
T  13730712 tttagtcttatgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagccttgcatctcctggtgagctttagcttatgatga---g 13730616  T
Q  427 ttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
     ||||||||||| |  || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13730615 atgcttctaatgaacttgtttatgatgacgtcatcacttcaggagcactt 13730566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 25 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 21283712 - 21283311
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  21283712 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataa-agtcgtttgaagctttgatcaatctccaatgatcttttgcctgatatggttattgtccta 21283614  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||| ||||||||||||| |||||| | |  |  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||    
T  21283613 tgaagaatcaatttcaaatccattccaattgagaggggacatagttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagtagagacaaaaacagagtagtgga 21283514  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| || | | ||  || | |  |||| || ||    
T  21283513 ggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaataacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatggacgttgctttac 21283414  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    ||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  21283413 tcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatatcctgatgaacttcaacttctggtgat 21283314  T
Q  424 ctt 426  Q
    |||    
T  21283313 ctt 21283311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 25 - 476
Target Start/End: Original strand, 30025724 - 30026176
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |     
T  30025724 gtgaaagagacgttgtgaatttccagtacatcaaaata-gagttgtttgaagctttgatcaatcaccaacgatcttttgcctgatatggttatagtcatc 30025822  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| |||||  | | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  30025823 tgaaggatcaatttcaaatccattctaattgtgaaggaacattgttgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtaga 30025922  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcattt-gaattagttgttgattca 323  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| || ||| |||  || |||  |||| ||||    
T  30025923 gatattggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatcgaatgccttcaa-ttcttttcaaaatagccgttgcttca 30026021  T
Q  324 ctctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtga 422  Q
    ||||    ||||||||| ||| |||  || || |||||||||||  || | |||||||||| ||||||  |||||  |||||||||  ||||||||||||    
T  30026022 ctctttcagtcttctgcgatgcttatacgagactaaatccattgaccagcgtttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaactagagcttctggtga 30026121  T
Q  423 tcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 476  Q
    ||||  |||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30026122 tcttcagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 30026176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 43 - 453
Target Start/End: Original strand, 13879941 - 13880351
Alignment:
Q  43 attgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaa 142  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13879941 attgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagttttgatcaatcaccaataatctttttcctgatatggttattgtcctctgaaggatcaatttcaaa 13880039  T
Q  143 ttcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacat 242  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13880040 tccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcggagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaagtgagtagtggagatagtggttgtacactt 13880139  T
Q  243 cgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaa 342  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |  ||||||| |||||||| || | | ||  || |||| |||| |||||||  |  |||||||||||    
T  13880140 cgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatctaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcgtcgagtcttctgcaa 13880239  T
Q  343 tg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatg 441  Q
    || |||| || |||||| ||||||| ||| |||||||||||| | ||||  ||  | ||||||||||  |||||||  |||||||  |||||| ||||      
T  13880240 tgcttagacgagattaagtccattgaacagcctttgaagctttatgtcttgcaattcctgatgaactagagcttctcatgatcttcagcttctgatgaga 13880339  T
Q  442 tgcttctgatga 453  Q
    ||||||||||||    
T  13880340 tgcttctgatga 13880351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 25 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 12367087 - 12366690
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  12367087 gtgaaatagacgttgtgaattgtcagtacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgattaatcaccaaagatcttttgccagatatggttattgtccta 12366989  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  12366988 tgaacgatcaatttcaaatccattccaagtatgtaggaacattgttgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcagagacacagactgattagtgga 12366889  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||  |||||||||| || || | | ||  || ||||||||| |||||    
T  12366888 ggtagtggttgtatacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacagacatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcac 12366789  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtga 422  Q
    |||||  ||||||||||||| |||  || |||||||||||||| ||| || ||||||||| |||| |  || || ||||||||||||||||||||||||    
T  12366788 tctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttctggtga 12366690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 25 - 453
Target Start/End: Original strand, 28408858 - 28409285
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||     
T  28408858 gtgaaagagacattgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaataatcttttgtctgatatggttattgtcctc 28408956  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
      ||||||||||||||||| |||||| | |  |  ||||||| |||||| |||||| || | ||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||    
T  28408957 taaaggatcaatttcaaatccattccaattgagagggaacatcgttgcatgcagagttgcttttcttgtcttgtagtagagacaaaaacagagtagtgga 28409056  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||| ||||||||||||| || | | ||  || || |||||| |||||    
T  28409057 ggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaataattgttgcttcac 28409156  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    ||| || ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||  |||||  |||||||||| ||||||||||||     
T  28409157 tcttctagtcttctgcaatgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagccttatgtcttgcatctcttgatgaactttagcttctggtga- 28409255  T
Q  424 cttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    || |||||||| ||||  ||||||||||||    
T  28409256 ctgttgcttctgatgagatgcttctgatga 28409285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 25 - 492
Target Start/End: Original strand, 2499856 - 2500326
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||    
T  2499856 gtgaaagagacattgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgatcattttcctgatatggttattgtcct 2499954  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
       || |||||||||||||| |||||| | | |  |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2499955 ctaaatgatcaatttcaaatccattccaattgtaaaggaacatcgttgtaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtgg 2500054  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattca 323  Q
    ||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||    ||||||||||||| || || | | ||  || ||||||||| ||||    
T  2500055 agaaagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaactctcttcaaaggataagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttca 2500154  T
Q  324 ctctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtga 422  Q
    |||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||  ||||| ||||  |||   ||||||||||||    
T  2500155 ctcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgaaaaacaagagcttctggtga 2500254  T
Q  423 tcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcac-tttgttttcaggagcactt 492  Q
    || |  |||||| ||| |  ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  2500255 tcctcagcttctgatgaacttgcttatgatgacgtcatcacttcatgagcacttttgtcttcaggagcactt 2500326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 25 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 28622696 - 28622257
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28622696 gtgaaagagatgttgtgaatttccagcacattcaaaata-gagtcgtttgaaactttgatcaatcaccaatgatcttttgtctgatatggttattgtcct 28622598  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
    | ||| |||||||||||||| |||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||| |    
T  28622597 atgaatgatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagaagtag 28622498  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattca 323  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||  |||| ||| ||||||||||||| || | | ||  ||||||  |||| ||||    
T  28622497 aggtagtggttgtacacctcgtacaattgtactttgtcaacgccctttgaaaaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaattagccgttgcttca 28622398  T
Q  324 ctctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtga 422  Q
    || | || || |||||||||| |||| || |||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||  |  ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  28622397 cttttctagtattctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtga 28622300  T
Q  423 tcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcactt 464  Q
    | ||| |||| | ||| |  ||||||||||||||||| |||||    
T  28622299 tttttagcttatgatgaacttgcttctgatgacgtcaccactt 28622257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 25 - 528
Target Start/End: Original strand, 9069381 - 9069900
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||  |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  9069381 gtgaaagagacaatgtgaattgccaacatatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaacgatcttttgcctgatatggttattgtccta 9069479  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
      ||||||||| ||||||| |||||||| | || ||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  9069480 taaaggatcaaattcaaatccattcccattgtgaaggaacatcattgcaggcagagatgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaactgagtagtgga 9069579  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| |  || | ||||||| |||||||||||| | | ||  || |||| |||| |||||    
T  9069580 ggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctccttgaagaacaagcatacaatgcctttaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcac 9069679  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    ||| |  ||||||||||||| |||| ||  ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |  ||||| |||||||| |  |||||||||||||    
T  9069680 tcttccagtcttctgcaatgcttagacgatattaaatcccttgaacaacctttgaagctttaagttttgcatctcctgatgaaatagagcttctggtgat 9069779  T
Q  424 cttttgcttctaatga---tg-------------tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcac 507  Q
     ||  |||||| ||||   ||             ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||     
T  9069780 tttcagcttctgatgaacttgtttctgataaacttgcttctgatgacgtcaccacttcagaagcactttgtcttcaggagcactttgacttcaggagcag 9069879  T
Q  508 ttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    ||||||| ||| |||| ||||    
T  9069880 ttctctttagacgctttaagc 9069900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 27 - 501
Target Start/End: Original strand, 331465 - 331943
Alignment:
Q  27 gaaagagacgttgtgaa-ttgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctac 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||  |||||||     
T  331465 gaaagagacgttgtgaaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatattttgcctgatttggttgatgtcctat 331563  T
Q  126 gaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggag 225  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  331564 gaaggatcaatttgaaaaccattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgtgtagtggag 331663  T
Q  226 atagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatt-tgaattagttgttgattcac 324  Q
     |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| || |  ||  |||||||||||||||| |  | | ||   || ||| ||||| |||||    
T  331664 gtagtggttgtacacttcgtacatttgtactttgtcaacgcttttgagcaa-taagcatccaatgccttcagatcctttcaaaaatagctgttgcttcac 331762  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    ||| |  ||||||||||||| || | ||   || |||||||   |||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  331763 tcttccagtcttctgcaatgcttggacgaccttgaatccataaaacaacctttgaagctttaagtc-cgcatctcctgatggacttcagcttctggtgat 331861  T
Q  424 cttttgcttctaatga---tgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcact-ttgacttcag 501  Q
    |||  |||||| ||||   | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  331862 cttcagcttctgatgaacttttgcttctgatgacgtcatcactttaggagcagtttgtcttcaggagcactcttgacttcag 331943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 25 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 13260954 - 13260536
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  13260954 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaata-gattcttttgaagctttgatcattcaccaatgatctttttcctgatatggttattgtccta 13260856  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  13260855 tgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacattgttgcaggcagaggcattattcttgtcttgtagcagagacacaaactgggtagtgga 13260756  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||| ||||||  || | ||||||||||||||       |||||  ||| ||||||||| || ||    
T  13260755 gatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatctcaatgctcttccaagaacaagcatccaatgc------tttcataagaa-tagttgttgctttac 13260663  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    ||  ||||||||| |||||| || | || |||||||||||||  |||  ||||| ||||| ||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  13260662 tcctctggtcttccgcaatgcttggacgagattaaatccatt-aacagtctttggagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttagcttctggtgat 13260564  T
Q  424 cttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    |  |||||||||||||  ||||| ||||||    
T  13260563 c--ttgcttctaatgagatgcttatgatga 13260536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 25 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16310246 - 16309978
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  16310246 gtgagagagacgttgtgaatttccatcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcttgatatggttattgtccta 16310148  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| |||||| |||||   ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  16310147 agaaggatcaatttcaaatccattccaagtataagggaacattgttgcagacagagttgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtgta 16310048  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 294  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  16310047 gatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgcctt 16309978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 25 - 426
Target Start/End: Original strand, 24787961 - 24788361
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||    
T  24787961 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatg-tattttgcctgatatggttattgtccta 24788058  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| |||||| | |  |  ||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||    
T  24788059 tgaaggatcaatttcaaatgcattccaatttagagggaacatcgttgtaggcagagctatttttcttgtcttgtagtagagacaaaaacagagtagtgga 24788158  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||  || | |||||| |||||||||| || | | ||  || || | |||| |||||    
T  24788159 ggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaattctctttgaagaacaagcacccaatgccttcaaatcctttcaaaatattcgttgcttcac 24788258  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||  |  |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  24788259 tcttctagtcttctgcaatgcttagatgatattaaatctattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctaatgaacttcagcttctggtgat 24788358  T
Q  424 ctt 426  Q
    |||    
T  24788359 ctt 24788361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 25 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 16112224 - 16111771
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattg-ccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  16112224 gtgaaagagacattgtgaattttccagtacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcatcaatgatcttttgcctgatatggttaatgtcct 16112126  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  16112125 atgaaggatcaatttcaaatgcattcccattatgaaggaacatcgttgcaggcagagctgttttccttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgg 16112026  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattca 323  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| || ||| |   ||  ||| |||| ||||    
T  16112025 agatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaatttcttccaaaaaagtcgttgcttca 16111926  T
Q  324 ctctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtga 422  Q
    || |    |||||||||| |  |||| || | || |||||||   ||||| |||||||||| |||  |  |||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  16111925 ctttttccgtcttctgcactctttagacgaggttgaatccataaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatcctctgatcaactgcagcttctggtga 16111828  T
Q  423 tcttttgcttctaat-gatgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgt 478  Q
    | |||  ||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16111827 tttttatcttctaataaacttgcttctgatgacgtcatcacttcacgagcactttgt 16111771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 25 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 30945696 - 30945249
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  30945696 gtgaaagagacattgtgaattgccaacacattcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatagttattgtcct 30945598  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||| | ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||    
T  30945597 atgaaggatcaatttcaaatgcattcccattctgagggaacattgttgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagctgagacaaaaacaaagtagtgg 30945498  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattca 323  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |  | ||||||||||||||||| || | | ||  || ||||||||| ||||    
T  30945497 aggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaggaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttca 30945398  T
Q  324 ctctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtga 422  Q
    || | |   |||||| ||||  |||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||  |  ||||| |||||||||| ||||||||| |||    
T  30945397 cttttccaatcttctacaatacttagacgagattaaatccgttgaacaacctttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcagcttctgatga 30945300  T
Q  423 tcttttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagca 489  Q
     ||                ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30945299 act----------------tgcttctgatgacgtcaccacttcaggagcactttgtcttcaggagca 30945249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 28 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 23280295 - 23279900
Alignment:
Q  28 aaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacga 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  23280295 aaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaaactttgatcaatcagcaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatga 23280197  T
Q  128 aggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagac-acaaactgagtagtggaga 226  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||    
T  23280196 aggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatctttgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaaacagagtagtggaga 23280097  T
Q  227 tagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactc 326  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| || | | ||  || |||  |||| | ||||     
T  23280096 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaactagccgttgctccactt 23279997  T
Q  327 tcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    | |  ||||||| ||||| |||| |  ||||||||||| || | | |||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  23279996 ttccagtcttctacaatgcttagacaagattaaatcca-tgaatagcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgat 23279900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 25 - 426
Target Start/End: Original strand, 15467736 - 15468136
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  || ||||||| ||| |||||    
T  15467736 gtgaaaaagacgttgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttta-caatcaccaatgatctttttcctgatatggtcattatccta 15467833  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     ||||| |||||||||||| |||||||| | || |||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||| |  | ||||||||||    
T  15467834 tgaaggctcaatttcaaatccattcccattttgaaggaacatcgttgcaggtaaagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaattcagagtagtgga 15467933  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| || | | ||| || |||| ||||||||||    
T  15467934 ggtaatggttgtacacctcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttttaaaatagtcgttgattcac 15468033  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    ||| |  |||||||||| ||  ||| || ||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||  |||||||||| ||    
T  15468034 tcttccagtcttctgcattgcctagacgagattaaatctattgaacaccctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtaat 15468133  T
Q  424 ctt 426  Q
    |||    
T  15468134 ctt 15468136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 25 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 30944663 - 30944271
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| |||||||||||    
T  30944663 gtgaaagatacattgtgaattgccagcgcattcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccagtgatcttttgcctgatatagttattgtcct 30944565  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||| | ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  30944564 atgaaggatcaatttcaaatgcatttccattgtgagggaacattgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgg 30944465  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattca 323  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||  || |  |||||||||||||||| || | | ||  || ||||||||| ||||    
T  30944464 aggtagtggttgtacacttcgtacaattgtattttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttca 30944365  T
Q  324 ctctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctg 418  Q
    || | |   |||||||||||  |||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||  |  ||||| |||||||||| |||||||||    
T  30944364 cttttccaatcttctgcaatacttagacgagattaaatccgttgaacaacctttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcagcttctg 30944271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 25 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 48237244 - 48236783
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  48237244 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatattttgcctgatatggttattgtcct 48237146  T
Q  124 ac--gaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagt 221  Q
    |   ||||| |||||||||||| |||||| | | || ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||    
T  48237145 atatgaagggtcaatttcaaatgcattcctattgtgaaggaacatctttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacaaagtagt 48237046  T
Q  222 ggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgatt 321  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || |  |||||||  ||||||| || | | ||  || | || |||| ||    
T  48237045 ggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatctgatgccttcaaatcctttcaaacttgtcgttgctt 48236946  T
Q  322 cactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggt 420  Q
    |||  |    ||||| ||||||| |||| || |||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||  |  ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  48236945 caccttttcagtcttatgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcagcttctggt 48236848  T
Q  421 gatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcag 484  Q
    ||| ||  |||||| ||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  48236847 gattttcagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcaccacttcaggagtactttgtcttcag 48236783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 25 - 294
Target Start/End: Original strand, 4821293 - 4821561
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  4821293 gtgaaagagacattgtgaattgccagcacaatcaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatattttgcctgatatggttattgtccta 4821391  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     ||||||||||||||||||   |||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  4821392 tgaaggatcaatttcaaatgtgttcccattgtgaaggaacattgttgtaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgga 4821491  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 294  Q
    | |||||||||||||| ||||||||  | ||||| |||||||||||  || | |||||||||||||||||    
T  4821492 ggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttttcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctt 4821561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 39 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 19237364 - 19236969
Alignment:
Q  39 gtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaattt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  19237364 gtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttggagctt-gatcaatcacca-tgatcttttgcctgatttggttattgtcctatgaaggatcaattt 19237268  T
Q  139 caaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtac 238  Q
    ||||| ||||||  || || |||||||| |||||||||| || |||||| ||||| |||  ||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  19237267 caaatgcattccttgtctggaggaacatcgttgcaggcatagttgttatccttgttttgatgc--agacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtac 19237170  T
Q  239 acatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttct 338  Q
    || ||||| ||||| | |||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| || | | ||  || |||  |||| |||||||| ||||||||||    
T  19237169 acttcgtataattgtagtttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaagtagccgttgcttcactcttctggtcttct 19237070  T
Q  339 gcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg 438  Q
    |||||| ||| || |||||||||| ||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||| | | |||||||| ||  |||||||  |||||| |||    
T  19237069 gcaatgctagacgagattaaatcctttgaacagcctttgaagctttaactctctcatcttctggtaatcttcagctcctaatgatcttcagcttctgatg 19236970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 25 - 258
Target Start/End: Original strand, 4494396 - 4494628
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  4494396 gtgaaagagacgttgtgaattgccaacacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatctttttcctgatatggttattgtccta 4494494  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| |||||| | | || ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||    
T  4494495 tgaaggatcaatttcaaatccattccaattgtgaaggaaaatcgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaagagagtagtgga 4494594  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggacttt 258  Q
    | ||| |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  4494595 ggtagcggttgtacacttcgtacaattgtacttt 4494628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 25 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 9710142 - 9709745
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  9710142 gtgaaagagatgttgtgaattgccagtacattcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctggtatggttattgtcct 9710044  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
    | ||||||| |||||||||| |||||||| | || |  |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||    
T  9710043 atgaaggatgaatttcaaatgcattcccattgtgaataaacatcattgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagcagtgg 9709944  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattca 323  Q
    |  |||||||| ||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||  || | |||||||| |||||||| || | | ||  || |||  |||| ||||    
T  9709943 atgtagtggttttacacttcgtacagttgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatctaatgccttcaaatcctttcaaactaggcgttgcttca 9709844  T
Q  324 ctctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtga 422  Q
    |||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||  ||||||||||| |  | |  ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  9709843 ctcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaggctttgaagcttta--tgttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtga 9709746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 25 - 294
Target Start/End: Original strand, 14426366 - 14426634
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  14426366 gtgaaagagacgttgtgaatttccagcacattcaaata-gagtcgtttgaaactttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtccta 14426464  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     ||| || |||||||||||   |||||| | || |||||||| |||||||||| |||| || ||||| ||||||||  |||||| |||| ||||||||||    
T  14426465 ggaatgaacaatttcaaatgtgttcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcaaagctatttttcttatcttgtagtagagacaaaaacagagtagtgga 14426564  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 294  Q
    | |||||||||||||| | ||||||  | |||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||    
T  14426565 ggtagtggttgtacacttagtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctt 14426634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 25 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16314879 - 16314708
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  16314879 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgttttaagctttgatcaatgaccaatgatcttttgcctgacatggttattgtccta 16314781  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttg 197  Q
     |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16314780 tgaaggatcaatttcaaatccattcccaatatgtaggaatattgttgcaggcagagctgttatccttgtcttg 16314708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 40 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 35953013 - 35952783
Alignment:
Q  40 tgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaattt 138  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||| |||||||||    
T  35953013 tgaattgccagcacattcaaaataa-agtcatttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatgattattgtcataagaatgatcaattt 35952915  T
Q  139 caaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtac 238  Q
    |||||  ||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  35952914 caaatgtattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagtagagacaaaaacagagtaatggaggtagtggttgtac 35952815  T
Q  239 acatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    || ||||||||  | |||||||||||||||||    
T  35952814 acttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctt 35952783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 237
Target Start/End: Original strand, 13683410 - 13683625
Alignment:
Q  21 aggagtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||  ||||| |||||||| || ||||||| |||||    
T  13683410 aggagtgaaagagacgttgtgaatttccaacacatcaaaata-gagtcgtttgaagattttatcaattgccaataatcttttgcctgatatggtcattgt 13683508  T
Q  121 cctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtag 220  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||| |||| ||    
T  13683509 cctatgaaggatcaatttcaaatccattcctagtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttttccttgtcttgtagcagagacacaaaatgagcag 13683608  T
Q  221 tggagatagtggttgta 237  Q
    || |  |||||||||||    
T  13683609 tgcaagtagtggttgta 13683625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 520
Target Start/End: Original strand, 33605504 - 33605999
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| | ||    
T  33605504 gtgaaagacacgttgtgaattgccagtacattcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgattttttgcctgatatggttatttttct 33605602  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
    | ||| |||||||||||||| |||||| | |  | || ||||| ||||||| || ||||||| || |||||||||||| |||||| ||||  |||||||     
T  33605603 aagaatgatcaatttcaaatgcattcc-attgcgaagaaacatcgttgcagacaaagctgtttttgttgtcttgtagcagagacaaaaacatagtagtga 33605701  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattca 323  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| || | | ||  || ||||  ||| ||||    
T  33605702 aggtagtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcattgcttca 33605801  T
Q  324 ctctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtg 421  Q
     | | |  ||| |||||| || |||| || |||||||||| ||| | | || |||||||||| |  | |  ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  33605802 attttccagtcatctgcattgcttagacgagattaaatccgttgaaaagccttttgaagcttta--tgttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtg 33605899  T
Q  422 atcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatg 520  Q
    || ||  |||||| ||| ||  | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||  |||| |||||| | || || ||||||||||    
T  33605900 attttcagcttctgatgaattcgattctgatgacgtcaccactttaggagcactttgtcttcatgagcgatttgtcttcaggaacagttttcttcagatg 33605999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 42 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13034164 - 13033986
Alignment:
Q  42 aattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaa 141  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13034164 aattgccaacacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttattgtcctatgaaggatcaatttcaa 13034066  T
Q  142 attcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagt 221  Q
    || |||||| |||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  13034065 atccattccaagtatgaaggaactttgttgcaggcgtagctgttattcttgtcatgtagcagagacacaaactgagtagt 13033986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 25 - 295
Target Start/End: Original strand, 1292849 - 1293118
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  1292849 gtgaaagagacgttg--aattgccagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgattaatcaccaatgatcctttgtctgataaggttattgtcc 1292945  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    || ||||||| || ||||||| | |||||| | || || ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||    
T  1292946 tatgaaggataaaattcaaatgcgttcccaatgtgaagaaacattaatgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagaagagacaaaaacagagtagtg 1293045  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 295  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||||||    
T  1293046 gagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttt 1293118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 12174679 - 12174436
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12174679 gtgaaagagacgttg--aattcccagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgatcctttgtctaatatggttattgtcc 12174583  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    || ||| |||||||||||||| ||||| || | || |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |     
T  12174582 taagaatgatcaatttcaaatgcattctcattgtgaaggagcatcgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagaca-aaacagagtacta 12174484  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
     || |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||    
T  12174483 aaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctt 12174436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 203 - 475
Target Start/End: Original strand, 15088516 - 15088790
Alignment:
Q  203 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || | |     
T  15088516 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatccaatgtcttcaaatcct 15088615  T
Q  303 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 401  Q
    ||  || |||| |||| ||||||||    ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||  ||||| |||    
T  15088616 ttcaaaatagtcgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttacgtcttgcatctcctg 15088715  T
Q  402 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||  |||| | ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15088716 atgaattagagcttctggtgatcttcagcttatgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 15088790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 63 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 48063123 - 48062890
Alignment:
Q  63 agagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagg 161  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||| | || |      
T  48063123 agagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggattaatttcaaatgcgttcccaatgtgaata 48063024  T
Q  162 aacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  | ||| ||||    
T  48063023 aacattgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacagaaacagagtaatggagatagtggttgtacgcttcgtacaaacgtactatgtc 48062924  T
Q  262 aacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 295  Q
    |||||||||  || |  |||||||||||||||||    
T  48062923 aacgctctttgaagaataagcatccaatgccttt 48062890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 163 - 492
Target Start/End: Original strand, 13648685 - 13649000
Alignment:
Q  163 acattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtca 262  Q
    |||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  13648685 acattgttccaggcagagttattatccttgtcttgtagcagagacacaaattgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtca 13648784  T
Q  263 acgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatc 361  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||| |||||| | | ||  || |||  |||| ||||||||    ||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  13648785 acgctcttcaaagatcaagcatccaatgtctttaaatcctttcaaaatagccgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgcgattaaatc 13648884  T
Q  362 cattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtcatca 461  Q
    ||||| ||| | |||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||                ||||||||||||||||||||    
T  13648885 cattgaacatcttttgaagctttaagtctcgcatctcctgatgagctttagcttctgttgatct----------------tgcttctgatgacgtcatca 13648968  T
Q  462 cttcaggagcac-tttgttttcaggagcactt 492  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  13648969 cttcaggagcacttttgtcttcaggagcactt 13649000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 2265857 - 2265614
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagctttga-tcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||     
T  2265857 gtgaaagagacgttgag--ttgccagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagtttttaatcaatcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcg 2265761  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| | || | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||| |||| ||| ||||    
T  2265760 taagaaggatcaatttcaaatgcattcctattaagaaggaacattgttgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcaaagaca-aaacagagcagtg 2265662  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  2265661 gaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt 2265614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 224 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 13032213 - 13032045
Alignment:
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattca 323  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  13032213 agatagtggttgtacacttcgtacaattatactttgtcaacgctcttcaaaaagccagcatctaatgtcttcaacttcatttgaaatagttgttgcttca 13032114  T
Q  324 ctctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctc 391  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  13032113 ctctcctggtcttctgcaatactaggcgtgattaaatccattgaacaaccatttgaagctttaagtctc 13032045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 40 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 19711339 - 19711108
Alignment:
Q  40 tgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttc 139  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||| | |||||| ||||| |||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19711339 tgaattgccagcacatccaaaatagagtcatttgaagctttgatgattcaccattgatcctttgcctgatatggttattgtcttatgaaggatcaatttc 19711240  T
Q  140 aaattcattcccagtatgtaggaacattgtt-gcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtac 238  Q
    |||| | |||||| | || |  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  19711239 aaatgcgttcccaatgtgcataaacattgtttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagtagagacaaaaacagagtagtggaaatagtggttgtac 19711140  T
Q  239 acatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    || ||||||||  | |||||||||| ||||||    
T  19711139 acttcgtacaaacgtactttgtcaatgctctt 19711108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 40 - 248
Target Start/End: Original strand, 8182762 - 8182971
Alignment:
Q  40 tgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatt 137  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  8182762 tgaattgccagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgataaatcaccaatgatcctttgcctgatatgattattgtcctatgaaggatcaatt 8182860  T
Q  138 tcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgta 237  Q
    ||||||   |||||| | || || |||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  8182861 tcaaatgtgttcccaatgtgaagaaacattattgcatgcagagttgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgta 8182960  T
Q  238 cacatcgtaca 248  Q
    ||| |||||||    
T  8182961 cacttcgtaca 8182971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 179 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 13894183 - 13893949
Alignment:
Q  179 agctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagc 278  Q
    |||||| ||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||  |||| |||| ||| || ||| | |    
T  13894183 agctgtaattcttgtcttgttgcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacgttgtacaattgtcctttttcaatgctttttaaagaac 13894085  T
Q  279 aagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttga 378  Q
    || ||| ||||||||| || | | ||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  13894084 aaacattcaatgccttcaaatccttttgaattagccgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgctaggcgtgattaaatcctttgaacaacctttga 13893985  T
Q  379 agcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagct 414  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  13893984 agctttaagtatttcatcttctgatgatcttcagct 13893949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 63 - 267
Target Start/End: Original strand, 27871572 - 27871778
Alignment:
Q  63 agagtcgtttgaagcttt--gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtag 160  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||| | || |     
T  27871572 agagtcgtttgaagctttttgatcaatcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgtgttcccaatgtgaat 27871671  T
Q  161 gaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgt 260  Q
     |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||| |||    
T  27871672 aaacattattgcaggtagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgt 27871771  T
Q  261 caacgct 267  Q
    |||||||    
T  27871772 caacgct 27871778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 174
Target Start/End: Original strand, 15088368 - 15088516
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||     
T  15088368 gtgaaagagacgttgtgaatttccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatattttgcctgatatggttattgtcctc 15088466  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcag 174  Q
     |||||||||||||||||| |||||| | | || ||||||||||||||||    
T  15088467 tgaaggatcaatttcaaatccattccaattgtgaaggaacattgttgcag 15088516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 40 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 24795041 - 24794813
Alignment:
Q  40 tgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttc 139  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24795041 tgaattgccagcacatccaaaatagagtcgtttgaagctttgataattcatcattgatcctttgtctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttc 24794942  T
Q  140 aaattcattcccagtatgtaggaacattg-ttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtac 238  Q
    |||  | |||||| | ||||  ||||||| ||||  |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  24794941 aaacgcgttcccaatgtgtataaacattgtttgcgtgcagagttgttatccttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtac 24794842  T
Q  239 acatcgtacaattggactttgtcaacgct 267  Q
    || ||||||||  | ||| ||||||||||    
T  24794841 acttcgtacaaacgtactatgtcaacgct 24794813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 40 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 48806205 - 48805974
Alignment:
Q  40 tgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttc 139  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48806205 tgaattgccagcacatccaaaatagagtcgtttgaagctttgatgattcaccattgatcatttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttc 48806106  T
Q  140 aaattcattcccagtatgtaggaacattg-ttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtac 238  Q
    ||||   |||||| | ||||  ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||  ||||||||||||    
T  48806105 aaatgtgttcccaatgtgtataaacattgtttgcatgcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaatcagagtagtggaagtagtggttgtac 48806006  T
Q  239 acatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    || | |||| |  | ||| |||||||||||||    
T  48806005 actttgtacgaacgtactatgtcaacgctctt 48805974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 13472847 - 13472667
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  13472847 gtgaaagagacgttgtgaaatgccaacacatcaaaata-gagtcggttgaacctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatg-ttgttgtccta 13472750  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagac 207  Q
     ||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| |||||    
T  13472749 tgaatgatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaccattgttgcaggcatagctgctatccttgtcctgtagcagagac 13472667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 291
Target Start/End: Original strand, 14425266 - 14425531
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||     
T  14425266 gtgaaagagacgttg--aattgtcagcacgttcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtct 14425362  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    || |||||||||||||||||| | |||||| | |  |  ||||||||| | || ||||||||||| |||||||||| ||  ||||| |||| ||||||||    
T  14425363 tatgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtaaacaaacattgttacnggtagagctgttatccttgtcttgttgcaaagacaaaaacagagtagtg 14425462  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 291  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  | | | |||||||||||||  || |  |||||||||||||    
T  14425463 gagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtaatatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 14425531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15704828 - 15704616
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  15704828 gtgaaagagacgttg--aattgctagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcc 15704732  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    || |||||| |||||||||||  ||||||| |  | || || |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  15704731 taagaaggaacaatttcaaatgtattcccattgagaagaaatattgtttcaggcagagctatttttcttgtcttgtagcagagaca-aaacagagtagtg 15704633  T
Q  223 gagatagtggttgtaca 239  Q
    ||  |||||||||||||    
T  15704632 gaagtagtggttgtaca 15704616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 2266662 - 2266495
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagctttg--atcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtc 121  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  2266662 gtgaaagagacgttg--aattgccagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagttttttaatcaatcaccaatgatcctttgtctgatatggttattgtc 2266566  T
Q  122 ctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttg 192  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||| | || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2266565 ctaagaaggatcaatttcaaatgcattcctattaagaaggaacattgttgcaggcagagctgtttttcttg 2266495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 196 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 22578190 - 22577933
Alignment:
Q  196 tgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 295  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||| ||| |||||||||     
T  22578190 tgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttttaagaacaatcattcaatgccttc 22578091  T
Q  296 aacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctca 394  Q
    || | | ||  || ||||||||| ||||||||    ||||||||||||| |||  || ||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||  ||    
T  22578090 aaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttacagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatctattgaacaccctttgaagctttaagtcttgca 22577991  T
Q  395 tcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatgac 454  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||  |||||||||||||    
T  22577990 tctcctgatgaacttcagcttctggtgatc--ttgcctctgatgagatgcttctgatgac 22577933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 65 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 19339551 - 19339324
Alignment:
Q  65 agtcgtttgaagct-ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaa 163  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| | |||||| | ||||   |    
T  19339551 agtcgtttgaagctcttgatctatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtgctatgaacgatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgtataga 19339452  T
Q  164 cattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaa 263  Q
    |||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||| |||||| |  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||| ||||||    
T  19339451 cattgttgcaagtagagttgttatccttgtcttgtagcagagacaaactcagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaa 19339352  T
Q  264 cgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 291  Q
    |||||||  || |  |||||||||||||    
T  19339351 cgctctttgaagaataagcatccaatgc 19339324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 55 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 32265029 - 32264843
Alignment:
Q  55 tcaaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccag 153  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||     
T  32265029 tcaaaataa-agtcgtttgaagtttttgatcaatcaccaatgatcatttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaattcgttcccaa 32264931  T
Q  154 tatgtaggaacattgttgcaggcagagctg-ttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    | || |  ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||| || |||||||||||    
T  32264930 tgtgaataaacattgttgcagacagagctgttttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagcagtggaggtactggttgtacac 32264843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 113 - 294
Target Start/End: Original strand, 14193020 - 14193201
Alignment:
Q  113 gttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaa 212  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || | |||||| |||    
T  14193020 gttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacatggttgcaggaagagctgtttttcttgtcttttaacagagacaaaaa 14193119  T
Q  213 ctgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 294  Q
    | ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||  || | ||||||| |||||||||    
T  14193120 cagagtagtagaggtagtggttgtacacttcgtacacttgtactttgttaacgctctttgaagaacaagcattcaatgcctt 14193201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 63 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 21381731 - 21381555
Alignment:
Q  63 agagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagga 162  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||| | ||||       
T  21381731 agagttgtttgaagctttgatctatcaacaatgatcttttgcctgatatggttattatcctatgaagaatcaatttcaaatgcattcccaatgtgtatag 21381632  T
Q  163 acattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtaca 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| |  | ||||||||||  |||||||||||||    
T  21381631 acattgttgcaggcagagctgttatccttgtcttgttgcagagacaaactcagagtagtggaagtagtggttgtaca 21381555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 9098573 - 9098406
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaa-tcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |  || |||||||| | ||    
T  9098573 gtgaaagagacgttgtgaattcccaacacatcaaaa--agagtcgtttgaagctt-gatcaaatcaccaatgatctttttcccgatttggttattatact 9098477  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtc 194  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  9098476 atgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatggaggaacatcgttgcaggcatagctgttattcttgtc 9098406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 9099379 - 9099212
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaa-tcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |  || |||||||| | ||    
T  9099379 gtgaaagagacgttgtgaattcccaacacatcaaaa--agagtcgtttgaagctt-gatcaaatcaccaatgatctttttcccgatttggttattatact 9099283  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtc 194  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  9099282 atgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatggaggaacatcgttgcaggcatagctgttattcttgtc 9099212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 22579556 - 22579465
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttat 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  22579556 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttat 22579465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 4412249 - 4412079
Alignment:
Q  79 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattg-ttgcaggca 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| | |  |  ||||||| |||||||||    
T  4412249 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctgatttggttgttgtcctatgaaggatcaatttcgaattcgttcccaatgtaaataaacattgtttgcaggca 4412150  T
Q  178 gagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtaca 248  Q
    |||||||| | ||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||  |||||||    
T  4412149 gagctgttttccttgtcttgtagtagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacagttcgtaca 4412079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 120
Target Start/End: Original strand, 14187510 - 14187604
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgt 120  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  14187510 gtgaaagagatgttgtgaattgccagcacatcaaaatat-agtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttctctgatatggttattgt 14187604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 92 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 16545956 - 16545840
Alignment:
Q  92 aatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattctt 191  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  16545956 aatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctatttttctt 16545857  T
Q  192 gtcttgtagcggagaca 208  Q
    |||||||||| ||||||    
T  16545856 gtcttgtagcagagaca 16545840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 92 - 208
Target Start/End: Original strand, 16619706 - 16619822
Alignment:
Q  92 aatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattctt 191  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  16619706 aatgatcttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctatttttctt 16619805  T
Q  192 gtcttgtagcggagaca 208  Q
    |||||||||| ||||||    
T  16619806 gtcttgtagcagagaca 16619822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 228 - 426
Target Start/End: Original strand, 13692372 - 13692562
Alignment:
Q  228 agtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactct 327  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| | ||||||||||||| |||| |         || ||||||||| ||||||||    
T  13692372 agtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactctataaagatcaagcatccaatgtctttca---------aaatagttgttgcttcactct 13692462  T
Q  328 cctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatctt 426  Q
     |  ||||||||||||| |||  || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  13692463 tccagtcttctgcaatgcttatacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttacatcttctgatgagctttagcttctggtgatctt 13692562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 227 - 393
Target Start/End: Original strand, 13880608 - 13880775
Alignment:
Q  227 tagtggttgtac-acatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcact 325  Q
    |||||||||||| || |||||||||||  |||| ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||| || | | ||||||||||| |||| ||||||    
T  13880608 tagtggttgtaccacttcgtacaattgtcctttttcaacgctcttcaaagaacaagcatccagtgccttcaaatccttttgaattagtcgttgcttcact 13880707  T
Q  326 ctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctc 393  Q
    || || ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||| || ||||||    
T  13880708 cttctagtcttctgcaatgctaggcgtgattaaatcttttgaacagcctttgaagctttaattctctc 13880775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 79 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 8999175 - 8999016
Alignment:
Q  79 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcag 178  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || || ||| | |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |   || |||||||||  |||||||||    
T  8999175 ttgatcaat-accaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcag 8999077  T
Q  179 agctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||    
T  8999076 agctgttata-ttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacac 8999016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Original strand, 18441251 - 18441413
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | | |||||  |||| ||||| ||||||||||||||||   || |||||||||  |||||||    
T  18441251 ctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggc 18441350  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18441351 agagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 18441413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 26209793 - 26209631
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |   || |||||||||  |||||||    
T  26209793 ctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggc 26209694  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  26209693 agagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacac 26209631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 16556928 - 16556774
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    ||||||||||||||   ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||  || |||| |||||| |||    
T  16556928 gtgaaagagacgttt--aattgccagaacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcacggatgatgtttttcctgatatagttattttcc 16556832  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagag 180  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| | | || |||||||| |||||||||||||    
T  16556831 tatgaaggatcaatttcaaatgcattccaattgtgaaggaacatcgttgcaggcagag 16556774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 180
Target Start/End: Original strand, 16608734 - 16608888
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    ||||||||||||||   ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||  || |||| |||||| |||    
T  16608734 gtgaaagagacgttt--aattgccagaacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcacggatgatgtttttcctgatatagttattttcc 16608830  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagag 180  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| | | || |||||||| |||||||||||||    
T  16608831 tatgaaggatcaatttcaaatgcattccaattgtgaaggaacatcgttgcaggcagag 16608888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 79 - 270
Target Start/End: Original strand, 602636 - 602828
Alignment:
Q  79 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcag 178  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| || || ||| ||| |||||| |||| ||  ||||||||| |||||  | | ||  ||||||||  |||||||||    
T  602636 ttgatcaagcaccaatgatcctttgcctgatttggatatagtcctatgaagaattgatttcaaatccattctgaatttgagggaacatttctgcaggcag 602735  T
Q  179 agctgttattcttgtcttgtagcggagacaca-aactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||| | ||| |||||||||||  ||||||||||| | |||||||| || | ||||||||| |||||    
T  602736 agctgtttttcttgtcctgtagcgtagacaaagaacagagtagtggaggaagtggttgtacgcttcgtacaaatgcattttgtcaactctctt 602828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Original strand, 15216372 - 15216534
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    ||||||||| |||||| | |||| ||| || || ||| | | |||||| ||  |||||| |||||||||||||| |   || |||||||||  |||||||    
T  15216372 ctttgatcattcaccagtaatctattgcctgatttgggtgtagtcctatgacagatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggc 15216471  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15216472 agagctgttgt-cttgtcttgtagcgcagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 15216534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Original strand, 18419170 - 18419332
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | | |||||  |||| ||||| ||||||||||||||||   || |||||||||  ||||||     
T  18419170 ctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcagga 18419269  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18419270 agagctgttgtt-ttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 18419332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Original strand, 29590048 - 29590210
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | | ||| || |||||||||| |||||||||||||| |   || |||||||||  |||||||    
T  29590048 ctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcatatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggc 29590147  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  29590148 agagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtgaaggtagtggttgtacac 29590210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 3476536 - 3476423
Alignment:
Q  126 gaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggag 225  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |   || |||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  3476536 gaaggattaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggag 3476438  T
Q  226 atagtggttgtacac 240  Q
     ||||||||||||||    
T  3476437 gtagtggttgtacac 3476423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 240
Target Start/End: Original strand, 13682425 - 13682538
Alignment:
Q  126 gaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggag 225  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| | || |||||||||  |||||| | ||||||| || ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  13682425 gaaggattaacttcaaattcattcccattttgaaggaacatttctgcaggaatagctgttgtt-ttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggag 13682523  T
Q  226 atagtggttgtacac 240  Q
     ||||||||||||||    
T  13682524 gtagtggttgtacac 13682538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 79 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 11087286 - 11087126
Alignment:
Q  79 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcag 178  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| || || ||| | |||||||| |||||||||  ||||||| |||||| |   |  |||||||||  |||||||||    
T  11087286 ttgatcaaataccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttaaaggaacatttatgcaggcag 11087187  T
Q  179 agctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |||||||| | ||||  ||||| ||||||||||||||    
T  11087186 agctgttat-cttgtcttgtagtgtagacacaagcagagtcatggaggtagtggttgtacac 11087126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 335 - 418
Target Start/End: Original strand, 4494634 - 4494718
Alignment:
Q  335 ttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctg 418  Q
    |||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  4494634 ttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctg 4494718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 442 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 7339807 - 7339721
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||  | ||||| |||||||| |||| ||||    
T  7339807 tgcttctgatgacgtcaccacttcaggagcactttgtcttcaggagcactttttcttcatgaacacttttcttcagacgctttaagc 7339721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 442 - 523
Target Start/End: Original strand, 4821723 - 4821804
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgctt 523  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| | || || |||||||| ||||    
T  4821723 tgcttttgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagcgctttgtcttcaggagcagttttcttcagacgctt 4821804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 240
Target Start/End: Original strand, 8933635 - 8933737
Alignment:
Q  137 ttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgt 236  Q
    |||||||||||||| |   || ||||||| |  |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  8933635 ttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 8933733  T
Q  237 acac 240  Q
    ||||    
T  8933734 acac 8933737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 240
Target Start/End: Original strand, 30049633 - 30049736
Alignment:
Q  137 ttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgt 236  Q
    ||||||||||||||||   || | |||||||  ||||||||  |||||| ||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  30049633 ttcaaattcattcccatcttgaatgaacatttctgcaggcatggctgtttttcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 30049732  T
Q  237 acac 240  Q
    ||||    
T  30049733 acac 30049736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 442 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 48805780 - 48805693
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt-tgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   ||||||||  || || ||||||||||||| ||||    
T  48805780 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgtcttcaggagcacttcaaacttcagacgcagttttcttcagatgctttaagc 48805693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Original strand, 1293199 - 1293249
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1293199 tgcttctgataacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagcactt 1293249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Original strand, 8183179 - 8183229
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  8183179 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtctttaggagcactt 8183229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 443 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 2265456 - 2265371
Alignment:
Q  443 gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||  |||||| | || || |||||||| |||| ||||    
T  2265456 gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttatcttcaggagcgctttatcttcaggagcagttttcttcagacgctttaagc 2265371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 12734369 - 12734249
Alignment:
Q  119 gtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagt 218  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |   || |||||||||  ||||||||||| |||| | |||||||| ||||| ||||| |||| ||||    
T  12734369 gtcctatgaaggatcaacttcaaatttattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagttgttgt-cttgtcttatagcgtagacaaaaacagagt 12734271  T
Q  219 agtggagatagtggttgtacac 240  Q
    | ||||| ||||||||||||||    
T  12734270 aatggaggtagtggttgtacac 12734249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13174848 - 13174687
Alignment:
Q  79 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcag 178  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| || || |||   |||||||| |||||||||  ||||||| |||||| |   || || ||||||  |||| |||     
T  13174848 ttgatcaaataccaatgatcttttgcctgatttggaagttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaagtaacatttctgcatgcaa 13174749  T
Q  179 agctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||| |||| | |||| |||||| ||||||||||||||    
T  13174748 agctgtttttcttgtcttgtagtgtagagacaatcagagtcgtggaggtagtggttgtacac 13174687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 480 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 13137810 - 13137762
Alignment:
Q  480 ttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  13137810 ttcaggagcactttgacttcaggagcacttctcttcagatgcttcaagc 13137762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 444 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 32264647 - 32264599
Alignment:
Q  444 cttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  32264647 cttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcatgagcactt 32264599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 7488243 - 7488119
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtt--tgaagctttgatcaa-tcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtc 121  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||   ||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||| |||  | || |||||||||||    
T  7488243 gtgaaagagatgttgttgattgccagcacatcaaaa---gagtcgttgttgaagctt-gatcaaatcaccaatgatctgttgcttgatttggttattgtc 7488148  T
Q  122 ctacgaaggatcaatttcaaattcattcc 150  Q
    ||| || ||| ||||||||||| ||||||    
T  7488147 ctaagagggaacaatttcaaatccattcc 7488119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 489
Target Start/End: Original strand, 14426765 - 14426812
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagca 489  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14426765 tgcttctgatgacgtcaccacttcaggagcactttgtcttcaggagca 14426812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 394 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 19339231 - 19339132
Alignment:
Q  394 atcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgt-gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||     |||||| ||||  | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  19339231 atctcctgatgaactgcagcttctggtgatacacagcttctgatgaacttgcttctgaggacgtcatcacttcagaagcactttgtcttcaggagcactt 19339132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 38593920 - 38593818
Alignment:
Q  137 ttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgt 236  Q
    ||||||||||||||||   || |||||||||  ||||||||   ||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||| || ||||||||||    
T  38593920 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcatgactgttat-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtgaaggtagtggttgt 38593822  T
Q  237 acac 240  Q
    ||||    
T  38593821 acac 38593818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 480 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 5000741 - 5000695
Alignment:
Q  480 ttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaa 526  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  5000741 ttcaggagcactttgacttcaggatcacttctcttcagatgtttcaa 5000695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Original strand, 5826199 - 5826249
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5826199 tgcttctgatgacttcattacttcaggagcactttgtcttcaggagcactt 5826249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 443 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 9709739 - 9709693
Alignment:
Q  443 gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagca 489  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9709739 gcttctgatgacgtcaccacttcaggagcactttgtcttcaggagca 9709693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 14745821 - 14745752
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14745821 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacac 14745752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 13172693 - 13172567
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtt--tgaagctttgatcaa-tcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtc 121  Q
    |||| ||| ||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||| | |||| | || |||||||||||    
T  13172693 gtgagagatacgttggaaattgccagcacatcacaa-aagagtcgttgttgaagctt-gatcaaatcaccaatgatatgttgtttgatttggttattgtc 13172596  T
Q  122 ctacgaaggatcaatttcaaattcattcc 150  Q
    ||| || ||| ||||||||||| ||||||    
T  13172595 ctaggagggaacaatttcaaatccattcc 13172567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 35952595 - 35952550
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggag 487  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35952595 tgcttctgatgtcgtcatcacttcaggaacactttgttttcaggag 35952550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 483 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 48800524 - 48800479
Alignment:
Q  483 aggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  48800524 aggagcactttgacttcaggagcacttctcttcagatgcttcaagc 48800479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 6044346 - 6044294
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  6044346 tcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 6044294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 480 - 528
Target Start/End: Original strand, 13880376 - 13880424
Alignment:
Q  480 ttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  13880376 ttcaggagcactttgacttcagaagcacttctcttcagacgctttaagc 13880424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 394 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 21381409 - 21381309
Alignment:
Q  394 atcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgt-gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||     |||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  21381409 atctcctgatgaactgcagcttctggtgatacacagcttctgatgaactagcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgactttaggagcactt 21381310  T
Q  493 t 493  Q
    |    
T  21381309 t 21381309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 40054889 - 40054837
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  40054889 tcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 40054837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Original strand, 13692591 - 13692642
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcac-tttgttttcaggagcactt 492  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  13692591 tgcttctgatgatgtcatcacttcaggagcacttttgtcttcaggagcactt 13692642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 488
Target Start/End: Original strand, 14193325 - 14193372
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcac-tttgttttcaggagc 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  14193325 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttttgtcttcaggagc 14193372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 489
Target Start/End: Original strand, 15468167 - 15468214
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagca 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  15468167 tgcttctgatgacgtcatcacttcaagagcactttgtcttcaagagca 15468214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 24882665 - 24882503
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |   || ||||||| |  |||||||    
T  24882665 ctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 24882566  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||  ||||||  | | || || ||| ||||||||||||||    
T  24882565 agagctgtta-acttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgttgaggtagtggttgtacac 24882503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 9098251 - 9098205
Alignment:
Q  372 cctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctg 418  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9098251 cctttgaagctttaattctctcatcttctgatgatcttcagcttctg 9098205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 492
Target Start/End: Original strand, 11319664 - 11319706
Alignment:
Q  450 atgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  11319664 atgacgtcatcacttcaggagcactttggcttcaggagcactt 11319706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 18056511 - 18056469
Alignment:
Q  108 atatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcc 150  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  18056511 atatggttattgtcctacgagggaacaatttcaaattcattcc 18056469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 22577930 - 22577880
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  22577930 tgcttctaatgacgtcatcacttcaggagcacttttacttcaggagcactt 22577880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 476
Target Start/End: Original strand, 28409289 - 28409323
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 476  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28409289 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 28409323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 31116663 - 31116594
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  31116663 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 31116594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 412 - 523
Target Start/End: Original strand, 589621 - 589736
Alignment:
Q  412 gcttctggtgatcttttgcttctaatga---tgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttga-cttcagaatcac 507  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    ||||| |||||||| | |||||||  ||     
T  589621 gcttctgatgaccttttgcttctgatgagcttctgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttcagcttcagaagcactttaagcttcagacgcag 589720  T
Q  508 ttctcttcagatgctt 523  Q
    || |||||||||||||    
T  589721 ttttcttcagatgctt 589736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 443 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 12174247 - 12174202
Alignment:
Q  443 gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagc 488  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  12174247 gcttttgatgacgtcatcacttcaggagcactatgtcttcaggagc 12174202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 13880842 - 13880875
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13880842 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 13880875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 24788361 - 24788394
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24788361 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 24788394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 443 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 24794664 - 24794615
Alignment:
Q  443 gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  24794664 gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttttcttcagaagcactt 24794615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 474
Target Start/End: Original strand, 4494725 - 4494757
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4494725 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact 4494757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 480 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 10883059 - 10883011
Alignment:
Q  480 ttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||    
T  10883059 ttcaggagcactttgacttcagtagcacttctcttcagacgctttaagc 10883011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 452 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 13137821 - 13137781
Alignment:
Q  452 gacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  13137821 gacgtcatcacttcaggagcactttgacttcaggagcactt 13137781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 478
Target Start/End: Original strand, 14425672 - 14425708
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgt 478  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14425672 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgt 14425708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19985948 - 19985896
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19985948 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 19985896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 441 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 30944264 - 30944216
Alignment:
Q  441 gtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagca 489  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30944264 gtgcttctgatggcttcaccacttcaggagcactttgtcttcaggagca 30944216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 445 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 12366654 - 12366607
Alignment:
Q  445 ttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  12366654 ttctgatgatgtcatcacttcaggagcactttaaattcaggagcactt 12366607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 38403453 - 38403331
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | | |||||  |||| ||||| ||||||||||||||||   || |||||||||  |||||||    
T  38403453 ctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggc 38403354  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtag 200  Q
    |||||||||  |||||||||||||    
T  38403353 agagctgtt-gtcttgtcttgtag 38403331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Original strand, 1367778 - 1367846
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  1367778 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 1367846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 5000762 - 5000712
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  5000762 tgcttctgatgacatcgtcacttcaggagcactttgacttcaggatcactt 5000712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Original strand, 9159878 - 9159946
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  9159878 tgcaggcatagctgttgtt-ttgtcttgtagcgtagacagaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacac 9159946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Original strand, 9171134 - 9171202
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  9171134 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacagaa-cagagtagtggaggtagtggttgtacac 9171202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 10883080 - 10883030
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  10883080 tgcttctgacgacgtcgtcacttcaggagcactttgacttcagtagcactt 10883030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 13260532 - 13260498
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 476  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13260532 tgcttctgatgacatcatcacttcaggagcacttt 13260498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 396 - 475
Target Start/End: Original strand, 13303045 - 13303122
Alignment:
Q  396 cttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgt-gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||  |   |||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13303045 cttctgatgatcttcagcttctgatgagat---gcttctgatgaagttgcttctaatgacgtcatcacttcaggagcactt 13303122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15888480 - 15888412
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15888480 tgcaggcaaagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 15888412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Original strand, 541249 - 541302
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaa-ctgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  541249 tcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 541302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 4212436 - 4212469
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4212436 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcactt 4212469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 4223035 - 4223068
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4223035 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcactt 4223068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 150
Target Start/End: Original strand, 5035261 - 5035326
Alignment:
Q  85 aatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcc 150  Q
    ||||| ||||||||| |||  | || |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  5035261 aatcaacaatgatctgttgcttgatttggttattgtcctaggagggaacaatttcaaattcattcc 5035326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Original strand, 5685683 - 5685736
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaa-ctgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  5685683 tcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 5685736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 5685927 - 5685960
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5685927 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 5685960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 6867100 - 6867067
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6867100 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 6867067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 6877732 - 6877699
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6877732 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 6877699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 9098151 - 9098118
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9098151 tgcttctgatgacatcatcacttcaggagcactt 9098118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 522
Target Start/End: Original strand, 9160154 - 9160235
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttga-cttcagaatcacttctcttcagatgct 522  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||||||||||||| | |||||||  || || ||||||||||||    
T  9160154 tgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcacttcagcttcaggagcactttaagcttcagacgcagttttcttcagatgct 9160235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 522
Target Start/End: Original strand, 9170609 - 9170690
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttga-cttcagaatcacttctcttcagatgct 522  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||||||||||||| | |||||||  || || ||||||||||||    
T  9170609 tgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcacttcagcttcaggagcactttaagcttcagacgcagttttcttcagatgct 9170690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 522
Target Start/End: Original strand, 9171410 - 9171491
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttga-cttcagaatcacttctcttcagatgct 522  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||||||||||||| | |||||||  || || ||||||||||||    
T  9171410 tgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcacttcagcttcaggagcactttaagcttcagacgcagttttcttcagatgct 9171491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Original strand, 9433428 - 9433481
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaa-ctgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  9433428 tcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 9433481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 9433689 - 9433722
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9433689 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 9433722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Original strand, 9444024 - 9444077
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaa-actgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  9444024 tcttgtcttgtagcgtagacagaacacagagtagtggaggtagtggttgtacac 9444077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 9444285 - 9444318
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9444285 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 9444318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 14745544 - 14745511
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14745544 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 14745511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 16316466 - 16316433
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16316466 tgcttctgatgacatcatcacttcaggagcactt 16316433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 16542941 - 16542896
Alignment:
Q  444 cttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagca 489  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  16542941 cttctgatgacgtcaccacttcaagagcactttgtcttcagaagca 16542896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 489
Target Start/End: Original strand, 16622721 - 16622766
Alignment:
Q  444 cttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagca 489  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  16622721 cttctgatgacgtcaccacttcaagagcactttgtcttcagaagca 16622766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 19236919 - 19236886
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19236919 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 19236886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Original strand, 20989817 - 20989870
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaa-ctgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20989817 tcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 20989870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 20990078 - 20990111
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20990078 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 20990111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 21002883 - 21002850
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21002883 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 21002850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #173
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 21003144 - 21003091
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaa-ctgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  21003144 tcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 21003091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #174
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 23264466 - 23264433
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23264466 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 23264433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #175
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 24930478 - 24930445
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24930478 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 24930445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #176
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 27871945 - 27871978
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27871945 tgcttctgatgacgtcattacttcaggagcactt 27871978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #177
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 495 - 528
Target Start/End: Original strand, 30026178 - 30026211
Alignment:
Q  495 acttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30026178 acttcagaagcacttctcttcagatgcttcaagc 30026211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #178
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 37344625 - 37344658
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37344625 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 37344658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #179
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 523
Target Start/End: Original strand, 44280921 - 44281002
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgctt 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||| ||||||||  |||||||  || || |||||||||||||    
T  44280921 tgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcacttcagcttcagaagcactttagcttcagacgcagttttcttcagatgctt 44281002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #180
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 48062737 - 48062704
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48062737 tgcttctgatggcgtcatcacttcaggagcactt 48062704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #181
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Original strand, 589378 - 589429
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  589378 tcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 589429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #182
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 442 - 522
Target Start/End: Original strand, 1987984 - 1988064
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgct 522  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||| ||   |||||| | || || ||||||||||||    
T  1987984 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcagtttagcttcaggagcagttgagcttcaggagcagttttcttcagatgct 1988064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #183
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 442 - 522
Target Start/End: Original strand, 1998605 - 1998685
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgct 522  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||| ||   |||||| | || || ||||||||||||    
T  1998605 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcagtttagcttcaggagcagttgagcttcaggagcagttttcttcagatgct 1998685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #184
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Original strand, 3165900 - 3165951
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  3165900 tcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 3165951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #185
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 442 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 8001939 - 8001879
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcaga 502  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||| |||  |||||||    
T  8001939 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcagtttagcttcaggagcagtttagcttcaga 8001879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #186
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 442 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 8012584 - 8012524
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcaga 502  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||| |||  |||||||    
T  8012584 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcagtttagcttcaggagcagtttagcttcaga 8012524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #187
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 480 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 9098130 - 9098083
Alignment:
Q  480 ttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  9098130 ttcaggagcactt-gacttcagaacctcttttcttcagatgcttcaagc 9098083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #188
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 480 - 528
Target Start/End: Original strand, 11319677 - 11319725
Alignment:
Q  480 ttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||| ||||    
T  11319677 ttcaggagcactttggcttcaggagcacttctcttcagacgctttaagc 11319725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #189
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 480 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 12366636 - 12366588
Alignment:
Q  480 ttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    |||||||||||||| | ||||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  12366636 ttcaggagcactttaaattcaggagcacttctctttagatgcttcaagc 12366588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #190
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 480 - 528
Target Start/End: Original strand, 13880863 - 13880910
Alignment:
Q  480 ttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  13880863 ttcaggagcactt-gacttcataaccacttttcttcagatgcttcaagc 13880910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #191
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 21770077 - 21770026
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  21770077 tcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 21770026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #192
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 442 - 522
Target Start/End: Original strand, 42866271 - 42866351
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgct 522  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||| ||   |||||| | || || ||||||||||||    
T  42866271 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcagtttagcttcaggagcagttgagcttcaggagcagttttcttcagatgct 42866351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #193
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 442 - 522
Target Start/End: Original strand, 42876897 - 42876977
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgct 522  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||| ||   |||||| | || || ||||||||||||    
T  42876897 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcagtttagcttcaggagcagttgagcttcaggagcagttttcttcagatgct 42876977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #194
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Original strand, 44280662 - 44280713
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  44280662 tcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 44280713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #195
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 442 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 45922293 - 45922213
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgct 522  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||| ||   |||||| | || || ||||||||||||    
T  45922293 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcagtttagcttcaggagcagttgagcttcaggagcagttttcttcagatgct 45922213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 166)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 25 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 18321495 - 18321045
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||    
T  18321495 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacattaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaataatcttttgcctgatatggttcttgtccta 18321397  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     | |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  18321396 tggaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaactttgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagtagagacacaaactgagtagtgga 18321297  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||| | || | | ||  || ||| ||||| |||||    
T  18321296 gataatggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcccttcaaagaacaagcatccaatgccctcaaatcctttgaaaatagctgttgcttcac 18321197  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    |||  ||||||  ||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18321196 tcttttggtctcatgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgat 18321097  T
Q  424 cttttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    ||| | ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18321096 cttctacttctgatgagatgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 18321045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 25 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 18121442 - 18120981
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  18121442 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcatcaatgatcttttgactgatatggttattgtccta 18121344  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||    
T  18121343 tgaaggatcaatttcaaattcattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacagaaacagagtagttga 18121244  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | |||||   |||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||  || | |||||||||||||||||||| | | ||  || |||  |||| |||||    
T  18121243 ggtagtg---gtacacttcgtacaattgtactttgttaatgctctttgaagaacaagcatccaatgcctttaaatcctttcaaaatagcagttgcttcac 18121147  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    ||| || ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  18121146 tcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaaactttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgat 18121047  T
Q  424 cttttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagca 489  Q
    |||| |||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18121046 ctttagcttctgatgagatgcttctgatggcgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagca 18120981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 25 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 12758099 - 12757646
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||     
T  12758099 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttttctgatatggttattgtcctc 12758001  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12758000 tgaaggatcaatttcaaatccattcccagtatgtaggaacattattgcaggcggagctgttatccttgtcttgtagtagagacacaaactgagtagtgga 12757901  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | | ||  || ||||||||| |||||    
T  12757900 gatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcac 12757801  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    |||    ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| ||||| ||| || ||||||  ||||| ||||||||||  |||| ||||||||    
T  12757800 tctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttaaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactagagctactggtgat 12757701  T
Q  424 cttttgcttctaat-gatgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttg 477  Q
    |||  |||||| ||  |  |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12757700 cttcagcttctgatcaacttgcttctgatgacgtcatcattttatgagcactttg 12757646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 25 - 453
Target Start/End: Original strand, 19707322 - 19707746
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19707322 gtgaaagagacgaggtgaattgtcagcacatcaaaa--agagtcgtttgaagttttgatcaatcaccaatgatcttttgtcttatatggttattgtccta 19707419  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||  || ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||    
T  19707420 tgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacattgttccaggcctagttgttattcttgtcctgtagtagagacacaaactgagtagagga 19707519  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
      |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||| | ||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||  |||| |||||    
T  19707520 tgtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgttcttcaaagaacaaccattcaatgccttcaaattcatttgaattagccgttgcttcac 19707619  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatc 424  Q
    ||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||| ||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  19707620 tcttctggtcttctgcaatgttaggaatgattaagtcctttgaacagcctttgaagctttaattctttcatcttctgatgatcttcagcttctggcgatc 19707719  T
Q  425 ttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
      ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  19707720 --ttgcttctaatgaggtgcttctaatga 19707746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 28 - 405
Target Start/End: Original strand, 43644714 - 43645090
Alignment:
Q  28 aaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacga 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  43644714 aaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatga 43644812  T
Q  128 aggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagat 227  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||| || ||||||   |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  43644813 aggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacattgttacaggcatagttgttatctctgtcctgtagcagagacacaaaccgagtagtggaggt 43644912  T
Q  228 agtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactct 327  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||  ||||||||    
T  43644913 agtggttgtacacttcgtacaattgtactttattaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaattcatttgaattagccgtttcttcactct 43645012  T
Q  328 cctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatga 405  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||    
T  43645013 tctggtcttctgcaatgctaggcgtgattaaatcatttgaacaacctttgaagctttgattctctcatcttccgatga 43645090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 25 - 491
Target Start/End: Original strand, 18679629 - 18680095
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  18679629 gtgaaagagacgttgtgaattgtcagcacatcaaaataagagtcgtttgaagattttatcaatcactaatgatcttttgcctgatatggttattgtctta 18679728  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||    
T  18679729 tgaaagatcaatttcaaatccattcccactatgtagaaacattgttgcaggcaaagctgttattcttgtctttaagcagagacacaaactgagtagtaga 18679828  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || | |  |  || |||| |||| || ||    
T  18679829 gatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctatcaaaatagtcgttgctttac 18679928  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    ||  |||||||| ||||||| |||| || |||| |||||| || || ||||||||||||  ||||||  |||||||||||||| |  ||||||| |||||    
T  18679929 tcctctggtcttttgcaatgcttagacgagattgaatccactgaactacctttgaagctctaagtcttgcatcttctgatgaaatgaagcttctagtgat 18680028  T
Q  424 cttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcact 491  Q
    |  |||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  18680029 c--ttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgacttcaggagcact 18680095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 26 - 528
Target Start/End: Original strand, 21932699 - 21933217
Alignment:
Q  26 tgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctac 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||     
T  21932699 tgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaaactttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctat 21932797  T
Q  126 gaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggag 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  21932798 gaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaacactgagtagtggag 21932897  T
Q  226 atagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcact 325  Q
     |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||| | | ||  || |||  |||| ||||||    
T  21932898 gtagtggttgtacacttcgtacaattttactttgtcaacgctctttgaaaaacaagcatacaatgcctttaaatcctttcaaaatagccgttgtttcact 21932997  T
Q  326 ctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatc 424  Q
    ||    ||||| ||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||| |  |||||||||||||     
T  21932998 ctttcagtcttatgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaaatagagcttctggtgatt 21933097  T
Q  425 ttttgcttctaatga---tg-------------tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcact 508  Q
    ||  |||||| ||||   ||             | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | || |    
T  21933098 ttcagcttctgatgaacttgcttctgataaacttccttctgatgacgtcaccacttcaggagcactttgtcttcaagagcactttgacttcaggagcagt 21933197  T
Q  509 tctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  21933198 tctcttcagacgctttaagc 21933217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 25 - 453
Target Start/End: Original strand, 17701555 - 17701988
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  17701555 gtgaaagagatgttgtgaattgccatcacattaaaatat-agtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttgttgtccta 17701653  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacatt-----gttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagta 219  Q
     |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||     ||||||| |  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  17701654 tgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacattatattgttgcagacgtagctgttattcttgtcctgtagcagagacacaaactgagta 17701753  T
Q  220 gtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttga 319  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||||  |||||| |||||||||||||  |   ||||||||||||||| || | | ||  || |||||||||     
T  17701754 gtggaggtagtggttgtaaacttcgtacaattatactttgccaacgctcttaaaggaattagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgc 17701853  T
Q  320 ttcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctg 418  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17701854 ttcactcttctgatcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttgaagctttaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctg 17701953  T
Q  419 gtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    |||||| | ||||||| | || |||||||||||||    
T  17701954 gtgatcatctgcttctgaagaggtgcttctgatga 17701988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 25 - 451
Target Start/End: Original strand, 16207120 - 16207547
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  16207120 gtgaaagtgacgttgtgaattgccagcaaatcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgatcttttgcatgatatggttattgtcct 16207218  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || | || |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  16207219 acgaaggatcaatttcaaatccattcacattgtgaaggaacatcgttgcaggaagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgg 16207318  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattca 323  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| || | | ||  || |||| |||| || |    
T  16207319 agatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtagttgcttta 16207418  T
Q  324 ctctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtga 422  Q
    |||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  16207419 ctcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcgtttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtga 16207518  T
Q  423 tcttttgcttctaatgatgtgcttctgat 451  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  16207519 tctttagcttctaatgagatgcttctgat 16207547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 28 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 17442141 - 17441677
Alignment:
Q  28 aaagagacgttgtga-attgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacg 126  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |  |    
T  17442141 aaagagacgttgtcacattgtcagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcgtttgcctgatatggttattgtcatctg 17442043  T
Q  127 aaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggaga 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  17442042 aaggatcaatttcaaatccattcccaatatgtaggaacatcgttgcagacggagctgttatccttgtcttgtagtagagacacaaaatgagtagtggaga 17441943  T
Q  227 tagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactc 326  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||| ||| || | | ||  || |||| |||| || | ||    
T  17441942 tagtggttgtacacttagtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatg-cttcaaatcctttcaaaatagtcgttgctttagtc 17441844  T
Q  327 tcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatct 425  Q
    | |  ||||||||||||| ||||  | |||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||  ||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  17441843 ttccagtcttctgcaatgcttagaggagattaagtccattgaacaacctttaaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatct 17441744  T
Q  426 tttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    |  |||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17441743 tcagcttctgattagatgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgacttcaggagcactt 17441677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 25 - 426
Target Start/End: Original strand, 18718815 - 18719217
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||| ||    
T  18718815 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcactaatgatctttttcctgatatggttattgtctta 18718914  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  18718915 tgaaagatcaatttcaaatccattctcagtatgtagaaacattgttgtaggcagagctgttattcttgtcttttagcagagacacaaactgagtagtgga 18719014  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||| ||| | |||||||||||||| || || | |  |  || |||| |||| |||||    
T  18719015 gatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgacaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctatcaaaatagtcgttgcttcac 18719114  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    ||  |||||||| ||||||| ||   || |||| |||||| || ||| |||||||||||  ||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  18719115 tcctctggtcttttgcaatgcttgaacgagattgaatccactgaacagcctttgaagctctaagtcttgcatcttctgaagaacttaagcttctggtgat 18719214  T
Q  424 ctt 426  Q
    |||    
T  18719215 ctt 18719217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 25 - 453
Target Start/End: Original strand, 19943050 - 19943480
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  19943050 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtccta 19943148  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     ||||||||||||||||||  ||||| | | || |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||  |||| ||||||||||    
T  19943149 tgaaggatcaatttcaaatctattccaattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctggttttcttgtcttgtaggagagaccaaaacagagtagtgga 19943248  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgc-tcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattca 323  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| | |||||  | ||||||||||||||||| || | | ||  || ||||||||| ||||    
T  19943249 ggtagtggttgtacacttcgtacaattttactttgtcaacgctttttaaaggaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttca 19943348  T
Q  324 ctctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtg 421  Q
    |||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| | | || |||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  19943349 ctcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaatagccttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctagtg 19943448  T
Q  422 atcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    |||||| |||||| ||||  ||||||||||||    
T  19943449 atctttagcttctgatgagatgcttctgatga 19943480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 25 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 16681639 - 16681238
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||     
T  16681639 gtgaaagagacgttgtgaattgctagcacatcaaaatat-agtcgattgaagctttaatcaatcaccaatgatctattgcctgatatggttattgtcctc 16681541  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  16681540 tgaaggatcaatttcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcagggagagctgtcattcatgtcttgtagcagagacacaaactgagtactaga 16681441  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| || | | ||  || |||  |||| |||||    
T  16681440 gatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaatcctttcaaactagacgttgcttcac 16681341  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    ||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||  ||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  16681340 tcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctctaagtcttgcatctcctgatgaactttagcttctagtgat 16681241  T
Q  424 ctt 426  Q
    |||    
T  16681240 ctt 16681238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 25 - 453
Target Start/End: Original strand, 16188798 - 16189225
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16188798 gtgaaagagacgttgtgaattgtcggcacatcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaacgatcttttgcctgatatggttattgtcct 16188896  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| | || |  ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  16188897 atgaaggatcaatttcaaatccattccaattaagagggaacatagttgcaggcagagttgttatccttgtcttgtagcagagacacatactgagtagtgg 16188996  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcattt-gaattagttgttgattc 322  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||| ||  ||||||  || |||| |||| |||    
T  16188997 agatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttagaagaataagcatccaatgccttcaa-atcatttcaaaatagtcgttgcttc 16189095  T
Q  323 actctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtg 421  Q
    ||||| |  |||||||||||| ||| | || |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||  ||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  16189096 actcttccagtcttctgcaatggttggacgagattaaatccattaaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctaatgaacttcggcttctggtg 16189195  T
Q  422 atcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    |||  |||||||||||||  | ||||||||||    
T  16189196 atc--ttgcttctaatgagatacttctgatga 16189225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 43 - 453
Target Start/End: Original strand, 39693369 - 39693778
Alignment:
Q  43 attgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaa 142  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  39693369 attgccagcacatcaaaatat-agtcgtt-gaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctctgaaggatcaatttcaaa 39693466  T
Q  143 ttcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacat 242  Q
    | | ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39693467 tcctttccatgtatgtaggaacattgttgcaggcaaagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 39693566  T
Q  243 cgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaa 342  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || | | ||  || ||||  ||| |||||||| |  |||||||||||    
T  39693567 cgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcattgcttcactcttccagtcttctgcaa 39693666  T
Q  343 tg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatg 441  Q
    || |||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||| || || ||||||||||||||  |||||| ||||      
T  39693667 tgcttagacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgagctacaacttctggtgatcttcagcttctgatgaca 39693766  T
Q  442 tgcttctgatga 453  Q
    ||||| ||||||    
T  39693767 tgcttttgatga 39693778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 25 - 426
Target Start/End: Original strand, 17267289 - 17267689
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  17267289 gtgaaagagacgttgtgaattgccaacacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcactaaagatcttttacctaataaggttattgtccta 17267387  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  17267388 tgaaggatcaatttcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttggaggcagagctgttatccttgtcttgtggcagagacaaaaactgagtagtgga 17267487  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||| |||||| ||| | |||||||| ||||| || || | | ||  || ||| ||||| |||||    
T  17267488 gatagtggttgtacaattcgtacaattgtactatgtcaatgctcttcaaagaacaagcatctaatgctttcaaatcctttcaaaatagctgttgcttcac 17267587  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    ||    |||||| ||||||| || | || |||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17267588 tcctgcggtcttttgcaatgcttggacgagattgaa-ccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaacttcagcttctggtgat 17267686  T
Q  424 ctt 426  Q
    |||    
T  17267687 ctt 17267689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 25 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 20382730 - 20382304
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  20382730 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcatttgaaactttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtccta 20382632  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  20382631 tgaaggatcaatttaaaatccattcccaatatgtaggaacattcttgcaggcagagctgttattcttctcttgttgcagagacacaaactgattagtgga 20382532  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||| | | || || | | ||   | |||  |||| |||||    
T  20382531 gatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccactactttcaaatcctttcagaatagccgttgcttcac 20382432  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    ||  || ||||| |||||||  | | || |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20382431 tcctctagtcttttgcaatgcatggacgagattgaatccattgaacagcctttgaagctttaagacttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgat 20382332  T
Q  424 cttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    |  |||||||| ||||  ||||||||||||    
T  20382331 c--ttgcttctgatgagatgcttctgatga 20382304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 28 - 453
Target Start/End: Original strand, 24646155 - 24646581
Alignment:
Q  28 aaagagacgttgtga-attgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacg 126  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||| |||  |    
T  24646155 aaagagacgttgtcagattgccaacacatcaaaatt-gagtcgtttgaagcttggatcaatcactaatgatcttttttctgatatggtgattgacctctg 24646253  T
Q  127 aaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggaga 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24646254 aaggatcaatttcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcggagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggaga 24646353  T
Q  227 tagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactc 326  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |  |||||||||||||||  || | | ||  || ||| ||||| | |||||    
T  24646354 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactcttcaaagaataagcatccaatgcctgcaaatcctttcaaaatagctgttgctacactc 24646453  T
Q  327 tcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatct 425  Q
    |  | ||||| ||||||| |||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||  |||||  |||||||||  |||||||||||||||    
T  24646454 ttttagtcttatgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagctttaactcttgcatctcttgatgaactagagcttctggtgatct 24646553  T
Q  426 tttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    |  |||||| || |  ||||||||||||    
T  24646554 tcagcttctgataagatgcttctgatga 24646581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 43 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 17526047 - 17525641
Alignment:
Q  43 attgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaa 142  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||    
T  17526047 attgtcagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaataatctttttcctaatatggttgttgtcctctgaagaatcaatttcaaa 17525949  T
Q  143 ttcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacat 242  Q
    |  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  17525948 tctattccatgtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagtagagacacaaactgagtagtgaagatagtggttgtacactt 17525849  T
Q  243 cgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaa 342  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || | | ||  || ||||||||| |||||||| |  ||||||||||     
T  17525848 tgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgtttcactcttccagtcttctgcag 17525749  T
Q  343 tg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgat 440  Q
    || |||| ||  ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||  ||||| |||||||||| ||| |||||||||||  |||||||| ||||     
T  17525748 tgcttagacgatattaaatccattgaacaaccttttgaagatttaagtcttgcatctcctgatgaactacagtttctggtgatc--ttgcttctgatgag 17525651  T
Q  441 gtgcttctga 450  Q
     |||||||||    
T  17525650 atgcttctga 17525641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 28 - 453
Target Start/End: Original strand, 29693132 - 29693558
Alignment:
Q  28 aaagagacgttgtga-attgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacg 126  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
T  29693132 aaagagacgttgtcacattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatattttgcctgatatggttattgtcctatg 29693230  T
Q  127 aaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggaga 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29693231 aaggatcaatttcaaatccattccatgtatgaaggaacattgttgcaggcatagttgttatccttgtcctgtagcagagacacaaactgagtagtggaga 29693330  T
Q  227 tagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactc 326  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||| | ||||||| |||||| || || | | ||  || |||| |||| |||||||    
T  29693331 taatggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaaagctcttcaaagaacaagcatacaatgctttcaaatcctttcaaaatagtggttgcttcactc 29693430  T
Q  327 tcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatct 425  Q
    |    ||||||||||||| |||| || |||||||| ||||  |||  ||||| ||||| ||||||  ||||| || ||||||| || ||| |||||||||    
T  29693431 tttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattaaacagtctttggagctttaagtcttgcatctcctaatgaactacaacttatggtgatct 29693530  T
Q  426 tttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    |  |||| | ||||  ||||||||||||    
T  29693531 tcagcttatgatgagatgcttctgatga 29693558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 25 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 30421766 - 30421368
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  30421766 gtgaaagagacgttgtgaattgtcagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcct 30421668  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| | | || ||||||||   |||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||| |||| |||||||||    
T  30421667 atgaaggatcaatttcaaatgcattcctattgtgaaggaacatctatgcaggaagagctgtttttcttgtcttgttgcagagacaaaaacagagtagtgg 30421568  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt--aaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgatt 321  Q
    || ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||| || | ||||  || |||| |||| ||    
T  30421567 aggtagtggttgtaaacttcgtacaa-tgtactttgtcaacgctctttgaaaagaacaagcatccaatgccttcaaatccattcaaactagtcgttgctt 30421469  T
Q  322 cactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggt 420  Q
    |||| | |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||| |  | |  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  30421468 cacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta--tgttgcatcttctgatgaactgcagcttctggt 30421371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 25 - 426
Target Start/End: Original strand, 33082679 - 33083073
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaa-ttgccagcacatcaaaataagagtcgttt-gaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||    
T  33082679 gtgaaagagacgttgtgaaattgccagcacatcaaaaca-gagtcgttttgaagctttgatcaatcaccaatgatcctttgcctgatttggttattgtcc 33082777  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||  | | ||||||||    
T  33082778 tatgaaggatcaatttcaaatgcattccaagtctgagggaacaccgttgcaggcagagatgttatccttgtcttgtagcagagacaagagcagagtagtg 33082877  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattc 322  Q
    |         |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | | ||  || |||| |||| |||    
T  33082878 g---------ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttc 33082968  T
Q  323 actctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtg 421  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33082969 actcttctgatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtg 33083068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 66 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 23185523 - 23185099
Alignment:
Q  66 gtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaaca 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||    
T  23185523 gtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaaca 23185424  T
Q  166 ttgttgcaggcagagctg-ttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaac 264  Q
    |  ||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  23185423 tctttgcaggaagagctgttttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagcagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaac 23185324  T
Q  265 gctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatcca 363  Q
    ||||||  || |  |||||||||||||||| || | | ||  || |||| |||| |||||| | |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  23185323 gctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcca 23185224  T
Q  364 ttgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcac 462  Q
    ||| |||||||||||||||| |  | |  ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||  |||||| ||| |  ||||||||||||| |||  ||    
T  23185223 ttgaacaacctttgaagcttta--tgttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatgaacttgcttctgatgacatcactac 23185126  T
Q  463 ttcaggagcactttgttttcaggagca 489  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||    
T  23185125 ttcaggagcactttgtcttcaagagca 23185099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 25 - 270
Target Start/End: Original strand, 25163885 - 25164129
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  25163885 gtgaaagagacattgtaaattgtcagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcatcaatgatcttttgcctgatatggttattgtccta 25163983  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  25163984 tgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacattgttgcaggcataactgttattcttgtcttgtagcagagacacaaattgagtagtgga 25164083  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||| |||||    
T  25164084 gatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgacaacactctt 25164129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 154 - 492
Target Start/End: Original strand, 19156139 - 19156479
Alignment:
Q  154 tatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattgg 253  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  19156139 tatgtaggaaaattgttgcaggcagagttgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaattgt 19156238  T
Q  254 actttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgt 352  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | | ||  ||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||  ||| ||     
T  19156239 actttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaattagtcgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcatagacga 19156338  T
Q  353 gattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgat 451  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||  |||||  ||||||||| || ||||||||||||||  |||||| ||| |  ||||||||||    
T  19156339 gattaaatccattgaacagcctttgaagctttaattcttgcatctcttgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctgat 19156438  T
Q  452 gacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  19156439 gatgtcatcacttcaggagcactttgacttcaggagcactt 19156479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 25 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 23263948 - 23263521
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  23263948 gtgaaagagacgttgtgaattgccaacacatcaaatta-gagtcgtttgaagttttgatcaatcaccaatgatcttttgtatgatatcgttattgtccta 23263850  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     || ||||||||||||||| |||||| | |  |  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||  || ||| ||||   ||||||||    
T  23263849 tgatggatcaatttcaaatccattccaattgagagggaacatcgttgcaggcagagctgtttttcttttcttgtagtagaaacaaaaacatggtagtgga 23263750  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||  || | ||| ||||||||||||| || | | ||  || ||||  ||| |||||    
T  23263749 ggtagtggttgtacacttcgtacaactgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcattgtttcac 23263650  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagct-tgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtga 422  Q
    ||| || |||||||||| || |||| || ||||||||| |||| ||||||||||||| | | |||| |  ||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  23263649 tcttctagtcttctgcattgtttagacgagattaaatctattgaacaacctttgaagttcttaagttttgcatctcctgatgaacttcagcttctgatga 23263550  T
Q  423 tcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    ||  |||||||| |||| |||||||||||||    
T  23263549 tc--ttgcttctgatgaggtgcttctgatga 23263521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 25 - 294
Target Start/End: Original strand, 17797236 - 17797505
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcaca-tcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  17797236 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacattcaaaat-atagtcgtttgaagttttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatagttattgtcct 17797334  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
    | ||| |||||||||||||| || ||||| | || |||||||| |||| || || ||||||| |||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||    
T  17797335 atgaatgatcaatttcaaatgcactcccattgtgaaggaacatcgttgtagtcatagctgtttttcttgtcttatagcagagacaaaaacagagtagtgg 17797434  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 294  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||    
T  17797435 aggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctt 17797505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 45538775 - 45538312
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||    
T  45538775 gtgaaagagacgttg--aattgccagcacattcaaaata-gagttgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgatattttgcctcatatggttactgtcc 45538679  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    || ||||||||||||| |||| |||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  45538678 taagaaggatcaattttaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtg 45538579  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattc 322  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||  |   |||||||||||||||  || | ||||||||||||| ||| || | | ||  || ||||||||| |||    
T  45538578 gaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtgatttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgtcttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttc 45538479  T
Q  323 actctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtg 421  Q
    ||| | |  ||||||||||||  |||| || | || ||||||||  ||||| |||||||| | |||  |  ||||   ||||||||| ||||||||||||    
T  45538478 acttttccagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacaacttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttctggtg 45538381  T
Q  422 atcttttgcttctaatgatgt-gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagca 489  Q
    || ||| |||| | || |  | |||||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  45538380 atttttggcttatgataaactcgcttctgatgacgtcaccacttcaggagcgctttatcttcaggagca 45538312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 159 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 602923 - 602606
Alignment:
Q  159 aggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggacttt 258  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  602923 aggaacattgttacagacagagctattattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtacttt 602824  T
Q  259 gtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgatta 357  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || | | ||  || ||||  ||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || ||||     
T  602823 gtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcattgcttcactcttcaagtcttctgcaatgcttagacgagattg 602724  T
Q  358 aatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgt 456  Q
    |||||| || ||||||||||||| || ||||||  ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| | ||| |  |||||||||||||||    
T  602723 aatccaatgaacaacctttgaagttttaagtcttgcatttcctgatgaactttagcttcttgtgatctttagcttttgatgaacttgcttctgatgacgt 602624  T
Q  457 catcacttcaggagcact 474  Q
    ||||||||||||||||||    
T  602623 catcacttcaggagcact 602606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 18685732 - 18685348
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaa-tcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| | || || | ||||||||    
T  18685732 gtgaaagagacgttgtgaattgtcaacacatcaaaata-gagtcgtttgaag-tttgattaaatcaccaatgatcttttgtatgatttgttaattgtcct 18685635  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||| ||||||  || || ||||||||||||||| |  | || ||| |||| |||||||||    
T  18685634 atgaaggatcaatttcaaatccattccaagtctggaggaacatcgttgcaaacatagatgttattcttgtcttattacagacaca-aaacagagtagtgg 18685536  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattca 323  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||  ||||||| |||||||| || ||| ||  || ||||||||| ||||    
T  18685535 agatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgccttcaaattctttcaaaatagttgttgcttca 18685436  T
Q  324 ctctcctggtcttc-tgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttc 410  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||| |||  ||||||||| | || ||| | |||||||||||| ||||    
T  18685435 ctcttctggtcttcttgcaatgctagacgtgattatatcctttgaacagtctttgaagcattaactcttttatcttctgatgatcttc 18685348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 18731326 - 18730942
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaa-tcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| | || || | ||||||||    
T  18731326 gtgaaagagacgttgtgaattgtcaacacatcaaaata-gagtcgtttgaag-tttgattaaatcaccaatgatcttttgtatgatttgttaattgtcct 18731229  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||| ||||||  || || ||||||||||||||| |  | || ||| |||| |||||||||    
T  18731228 atgaaggatcaatttcaaatccattccaagtctggaggaacatcgttgcaaacatagatgttattcttgtcttattacagacaca-aaacagagtagtgg 18731130  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattca 323  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||  ||||||| |||||||| || ||| ||  || |||| |||| ||||    
T  18731129 agatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgccttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttca 18731030  T
Q  324 ctctcctggtcttc-tgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttc 410  Q
    |||| || |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||  ||||||||| | || ||| |||||||||||||| ||||    
T  18731029 ctcttcttgtcttcttgcaatgctagccgtgattaaatcctttgaacagtctttgaagcattaactctttcatcttctgatgatcttc 18730942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 28 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 15336421 - 15336028
Alignment:
Q  28 aaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctac 125  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||     
T  15336421 aaagagacgttg--aattgccagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcagtcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctat 15336325  T
Q  126 gaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggag 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||    
T  15336324 gaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacattgttgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcaaagacaaaaacagagtagtggag 15336225  T
Q  226 atagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcact 325  Q
     |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||  |  |  |||||||||||||||| || | | ||  || |||| |||| ||||||    
T  15336224 gtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgacgaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcact 15336125  T
Q  326 ctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
     ||   ||||||||||||  |||| || | || | ||||||  ||||| |||||||||| |||  |  ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  15336124 ttctcagtcttctgcaatctttagacgagtttgattccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacagcttctggtgat 15336028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 28 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 15425486 - 15425093
Alignment:
Q  28 aaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctac 125  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||     
T  15425486 aaagagacgttg--aattgccagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcattcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctat 15425390  T
Q  126 gaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggag 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||    
T  15425389 gaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacattgttgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcaaagacaaaaacagagtagtggag 15425290  T
Q  226 atagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcact 325  Q
     |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||  |  |  |||||||||||||||| || | | ||  || |||| |||| ||||||    
T  15425289 gtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgacgaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcact 15425190  T
Q  326 ctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
     ||   ||||||||||||  |||| || | || | ||||||  ||||| |||||||||| |||  |  ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  15425189 ttctcagtcttctgcaatctttagacgagtttgattccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacagcttctggtgat 15425093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 28 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 15516790 - 15516397
Alignment:
Q  28 aaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctac 125  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||     
T  15516790 aaagagacgttg--aattgccagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcagtcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctat 15516694  T
Q  126 gaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggag 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||    
T  15516693 gaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacattgttgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcaaagacaaaaacagagtagtggag 15516594  T
Q  226 atagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcact 325  Q
     |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||  |  |  |||||||||||||||| || | | ||  || |||| |||| ||||||    
T  15516593 gtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgacgaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcact 15516494  T
Q  326 ctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
     ||   ||||||||||||  |||| || | || | ||||||  ||||| |||||||||| |||  |  ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  15516493 ttctcagtcttctgcaatctttagacgagtttgattccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacagcttctggtgat 15516397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 25 - 270
Target Start/End: Original strand, 22673593 - 22673837
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||| || ||||||||||||||||    
T  22673593 gtgaaagagacgttg--aattgccagcacatccaaaatagagtcgtttgaagcttttgatcaatcatcaatgattctttgcctgatatggttattgtcct 22673690  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |  | ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||    
T  22673691 acgaaggatcaatttcaaatgtattcccattgagaaggaacaatgttgcaggaagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacaaagtagtgg 22673790  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  22673791 agatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt 22673837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 40845723 - 40845455
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||   |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  40845723 gtgaaagagacgttgg--attgtcagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagattttgatcaatcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcc 40845627  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    || ||||||||||||||||||  |||| || |  | |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  40845626 taagaaggatcaatttcaaatatattctcattgagaaggaacattgttgcaggcagagttgtttttcttctcttgtagcagagacaaaaacagagtagtg 40845527  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 294  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||  || |  ||||||||||||||||    
T  40845526 gagatagtggttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 40845455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 14989793 - 14989519
Alignment:
Q  18 taaaggagtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggtt 115  Q
    |||||| ||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||| || ||||||||    
T  14989793 taaaggtgtgaaagagacgtta--aattgccagcacattcaaaata-gagtcgtt-gaagcttttgatcaatcaccaatgattctttgcctgatatggtt 14989698  T
Q  116 attgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactg 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |  | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |    
T  14989697 attgtcctatgaaggatcaatttcaaatgtattcccattgagaagaaacattgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacag 14989598  T
Q  216 agtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  ||||||||||||||||    
T  14989597 agtagtggagatagtggttgtacaattcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 14989519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 27 - 270
Target Start/End: Original strand, 9320386 - 9320627
Alignment:
Q  27 gaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctac 125  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||     
T  9320386 gaaagagacgttg--aattgccagcacattcaaattagagtcatttgaagcttttgatcaatcaccaatgatcatttgcctgatatggttgttgtcctaa 9320483  T
Q  126 gaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggag 225  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| | || || ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  9320484 gaatgatcaatttcaaatgcattcccattgtgaagaaacattgttgcagtcacagctgtttttcttgtcttgtagcagagaca-aaacagagtagtggag 9320582  T
Q  226 atagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
     |||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||    
T  9320583 gtagtggttgtacacttcgtacaaatatactttgtcaacgctctt 9320627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 25 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 19956674 - 19956222
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtg-aattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaa-tcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  19956674 gtgaaagagacgttgtttaattgccagcacatcaaaa-aagtgtcgtttgaaactt-gatcaaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcc 19956577  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||   |||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||| |||| | ||| ||    
T  19956576 tatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtctggaggaac---gttgcaggcataactgttattcttgtcttgttgcagagaca-aaacagggtattg 19956481  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattc 322  Q
    ||| |||||||||||||  | |||||||||  |||| ||||||||||| ||  |  ||| |||||||||||| || | | || |||||||| |||| |||    
T  19956480 gaggtagtggttgtacaattagtacaattgtcctttttcaacgctcttcaatgaaaaagtatccaatgccttcaaatcctttagaattagtcgttgcttc 19956381  T
Q  323 actctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatcc-attgtacaacctttgaagcttgaagtc-tctcatcttctgatgaacttca---gcttct 417  Q
    ||||| ||| |||||| ||||  |||||| | ||||||||  ||| |||   |||||||||| || || ||||| |||||||||| |||||   ||||||    
T  19956380 actcttctgatcttctacaatactaggcgaggttaaatccttttgaacagtatttgaagctttaattcttctcagcttctgatgatcttcaggtgcttct 19956281  T
Q  418 ggtgatcttttgcttctaatga-tgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    | | |   | ||||| |  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19956280 gataagaatgtgcttatggtgattttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 19956222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 25 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20255847 - 20255675
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  20255847 gtgaaagagacgttgtgaattgccaacacatcaagata-gagtcgtttcaagctttgatcaatcaccaatgatattttttctcatatggttattgtccta 20255749  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgt 198  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20255748 cgaaggataaatttcaaatccattccatgtatgtatgaacattgttgcaggaagagctgttatccttgtcttgt 20255675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 25 - 294
Target Start/End: Original strand, 24551089 - 24551357
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  24551089 gtgaaagagacgttg--aattgccagcacattcaaaatt-gagtcgtttgaaggttttgatcaatcaccgatgatcttttgtcggatatggttattttcc 24551185  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    || ||| |||||||||||||| |||||||| | || |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||  |||||||    
T  24551186 taagaatgatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgttgtaggcagagctgtttttcttgtcttgtagtagagacaaaaacaaagtagtg 24551285  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 294  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||  | ||| ||| |||||||||  || | |||||||||||||||||    
T  24551286 gaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgttaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctt 24551357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 24833392 - 24832930
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||    
T  24833392 gtgaaagagacgttg--aattgccagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgatcctttgcctgatatggttactgtcc 24833296  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||| | |  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||  ||||| ||    
T  24833295 taagaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtaaaggaacatcgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtaacagagaca-aaatagagtaatg 24833197  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctc-ttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgatt 321  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||  | ||  ||||||||||| ||  |  | |||||||||||||| || || | | ||  || |||   ||| ||    
T  24833196 gaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtaccatgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcccttcaaagtagccattgctt 24833097  T
Q  322 cactctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaat-ccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctgg 419  Q
    |||| | |  ||||||||||||  |||| || | || ||| |||||  ||| | |||||||| | |||  |  |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24833096 cacttttc-agtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacagcttttgaagccttaag--ttgcatcctctgatgaactgcagcttctgg 24833000  T
Q  420 tgatcttttgcttctaat-gatgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagc 488  Q
    |||| ||| |||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  24832999 tgatttttagcttctaataaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaagagc 24832930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 63 - 343
Target Start/End: Original strand, 1237488 - 1237769
Alignment:
Q  63 agagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagg 161  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||| |||||||||||||| |||||||| | || |||    
T  1237488 agagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatgattattgtcttaagaaagatcaatttcaaatgcattcccattgtgaagg 1237587  T
Q  162 aacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtc 261  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||  | ||||||||    
T  1237588 aacatcgttgcaggcagagctgtttttcttctcttgtagcagagacaacaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgcacaaaagtactttgtc 1237687  T
Q  262 aacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaat 343  Q
    |||||||||  || | |||  |||||||||||| || | | ||  || |||| |||| |||||| | | |||||||||||||    
T  1237688 aacgctctttgaagaacaaatatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccggtcttctgcaat 1237769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 25 - 270
Target Start/End: Original strand, 6407541 - 6407785
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||    
T  6407541 gtgaaagagacgttg--aattgcccgcacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgatccttttcctgatatggttattgtcc 6407637  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    || ||||||||||||||||||  ||||||  |  | || |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  6407638 tatgaaggatcaatttcaaatgtattccctttgagaagaaacattgttgcaggcaaagttgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtg 6407737  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||  | ||| |||||||||||||    
T  6407738 gagatagtggttgtacacttcgtagaaacgtactatgtcaacgctctt 6407785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 126 - 453
Target Start/End: Original strand, 17914374 - 17914702
Alignment:
Q  126 gaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggag 225  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||| ||| ||||||| ||||||| |||| ||||||  ||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  17914374 gaaggatcaatttcaaatccattccatgtaagtaagaacattattgcaggtagagttgttatcattggcttgtagcagagaaacaaattgagtagtggag 17914473  T
Q  226 atagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcact 325  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| || | | ||  || ||||||||| ||||||    
T  17914474 atagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcact 17914573  T
Q  326 ctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatc 424  Q
    ||    ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||  || || || |||| || || ||||| ||||||    
T  17914574 cttacagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaactcttgcaactcctaatgagctacaacttctagtgatc 17914673  T
Q  425 ttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    ||  |||||| ||||  ||||||||||||    
T  17914674 ttcagcttctgatgagatgcttctgatga 17914702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 295
Target Start/End: Original strand, 43639597 - 43639867
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  || || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||    
T  43639597 gtgaaagagacgttg--aaatgtcagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatcatcctttgcctgatatggttattgtcc 43639693  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagac-acaaactgagtagt 221  Q
    || |||||||||||||||||| | |||||| | || |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||| |||||||    
T  43639694 tatgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgaataaacattgttgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacaaaaaacagagtagt 43639793  T
Q  222 ggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 295  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||  | |   |||||||||||||  ||||  |||||| ||||||||||    
T  43639794 ggagatagtggttgtacacttcgtgcaaacgtaacatgtcaacgctctttgaaaaataagcattcaatgccttt 43639867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 40 - 270
Target Start/End: Original strand, 22662944 - 22663175
Alignment:
Q  40 tgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaattt 138  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22662944 tgaattgccagcacatccaaaatagagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgattctttgcctgatatggttattgttctacgaaggatcaattt 22663043  T
Q  139 caaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtac 238  Q
    |||||  ||||||| |  | ||||||| || || ||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||| |||  |||||||||||||| |||||||||    
T  22663044 caaatgtattcccattgagaaggaacaatgctgtaggcagagctgtttttcttgttttgtagtagagacaaaaatagagtagtggagatattggttgtac 22663143  T
Q  239 acatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    || ||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  22663144 acttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt 22663175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 25 - 270
Target Start/End: Original strand, 36105011 - 36105254
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagctttg--atcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtc 121  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  36105011 gtgaaagagacgttg--aattgccagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagctttttaatcaatcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtc 36105107  T
Q  122 ctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagt 221  Q
    ||| ||| |||||||||||||| |||||| |   || | ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||    
T  36105108 ctaagaatgatcaatttcaaatgcattccta--ttgaaagaacatctttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagcagt 36105205  T
Q  222 ggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||  | ||| | |||||||||||    
T  36105206 ggaggtagtggttgtacactttgtacaaacgtactatatcaacgctctt 36105254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 63 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 13430928 - 13430699
Alignment:
Q  63 agagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagg 161  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||   |||||| | || |      
T  13430928 agagtcgtttgaagcttttgatctatcaccaatgatcatttgcctgatatggttattgtcttatgaaggatcaatttcaaatgtgttcccaatgtgaata 13430829  T
Q  162 aacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  | ||| ||||    
T  13430828 aacattgttgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagggacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtc 13430729  T
Q  262 aacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 291  Q
    ||| |||||  || |  |||||||||||||    
T  13430728 aacactctttgaagaataagcatccaatgc 13430699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18151982 - 18151714
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||  ||||||   ||| || |||||||||||||||    
T  18151982 gtgaaagagacgttg--aattgccagcacattcaaaata-gagtcgtta-aagcttttgatcaatcatgaatgattcattgccttatatggttattgtcc 18151887  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttatt-cttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagt 221  Q
    || ||||||| ||||||||||  ||||||| |  | || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  18151886 tatgaaggataaatttcaaatgtattcccattgagaagaaacattgttgcaggcagagctgttttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagt 18151787  T
Q  222 ggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 294  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||  | ||| |||||| ||||||  || |  ||||||||||||||||    
T  18151786 ggagatagtggttgtacaattcgtacaaacgtactatgtcaatgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 18151714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 40 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 33560538 - 33560354
Alignment:
Q  40 tgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttc 139  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  33560538 tgaattgccagcacatccaaaatagagtcgtttgaagcttttataaatcaccattgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatccatttc 33560439  T
Q  140 aaattcattcccagtatgtaggaacattg-ttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
    |||| ||||| || | || |  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  33560438 aaatgcattctcaatgtgcataaacattgtttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgg 33560354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 25 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 22461973 - 22461588
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgt-gaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaa-tcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||| ||||||||   | |||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  22461973 gtgaaagagacgttgttgaattgccgcaatatcaaaa--agagtcgtttgaagctt-gatcaaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttattgtcc 22461877  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    || |||  ||||||||||||| |||||| |||  | |||| ||  | ||| |||| || | || |||||||||| | || || ||| ||||   ||||||    
T  22461876 tatgaaaaatcaatttcaaatacattccaagtgaggaggagcaccgatgccggcatagttattgttcttgtcttattgcagacaca-aaacaaggtagtg 22461778  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattc 322  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||  |||| ||||| ||||  ||  |  |||||||||||||||| || | ||||||||||||| |||| |||    
T  22461777 gagatagtggttgtgcactccgtacaattgtcctttttcaactctctccaacgaataagcatccaatgccttcaaatccatttgaattagtcgttgcttc 22461678  T
Q  323 actctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcag 412  Q
    | ||| || ||||||||||||| || ||  |||||||||| | | |||||||||||||||| || ||  ||| |||||||||| ||||||    
T  22461677 attcttctagtcttctgcaatgatatgctagattaaatccttcgaacaacctttgaagcttaaattcgttcagcttctgatgatcttcag 22461588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 63 - 223
Target Start/End: Original strand, 45292686 - 45292847
Alignment:
Q  63 agagtcgtttgaagct-ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagg 161  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| | ||        
T  45292686 agagtcgtttgaagctcttgatctatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgagta 45292785  T
Q  162 aacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||    
T  45292786 aacattgttgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacaaaaacaaagtagtgg 45292847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 62 - 247
Target Start/End: Original strand, 21540802 - 21540988
Alignment:
Q  62 aagagtcgtt-tgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtag 160  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||  ||||||| |||||| | | || ||    
T  21540802 aagagtcgttgtgaaaccttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctattctgaag 21540901  T
Q  161 gaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtac 247  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  21540902 gaacatttatgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacataaatagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtac 21540988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 79 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 45568184 - 45567993
Alignment:
Q  79 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcag 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||  ||||||| |||||| | | ||  ||||||||  |||||||||    
T  45568184 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcacattcaaatccattcctattctgagggaacatttctgcaggcag 45568085  T
Q  179 agctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||| || ||||||| |||||| |||||||   | |||||||||||||||||    
T  45568084 agctgtttttcttgtcttatagcgtagacataaacagagtagtgaaggtagtggtcgtacacttcgtacagaagtactttgtcaacgctctt 45567993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 79 - 270
Target Start/End: Original strand, 21288270 - 21288462
Alignment:
Q  79 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattg-ttgcaggca 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||| | || ||| | || |  ||||||| |||||||||    
T  21288270 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcgtttccaatgtgcataaacattgtttgcaggca 21288369  T
Q  178 gagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||| |  |  |||||||||  |||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  21288370 gagctgttatccttgtcttgtagcagagacaaactcaaagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgaactatgtcaacgctctt 21288462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 210 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 18722798 - 18722597
Alignment:
Q  210 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaat 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||  ||||||| |||||||| || ||| ||  ||     
T  18722798 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgccttcaaattctttcaaaa 18722699  T
Q  310 tagttgttgattcactctcctggtcttc-tgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaact 408  Q
    |||| |||| |||||||| || |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||  ||||||||| | || ||| |||||||||||||| ||    
T  18722698 tagtcgttgcttcactcttcttgtcttcttgcaatgctagccgtgattaaatcctttgaacagtctttgaagcattaactctttcatcttctgatgatct 18722599  T
Q  409 tc 410  Q
    ||    
T  18722598 tc 18722597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 79 - 240
Target Start/End: Original strand, 28903328 - 28903488
Alignment:
Q  79 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcag 178  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||  ||||||| |||||| |   || |||||||||  |||||||||    
T  28903328 ttgatcaattaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcag 28903427  T
Q  179 agctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28903428 agctgtttttcttgtcttgtagcgtagaca-aaacagagtagtggagctagtggttgtacac 28903488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 63 - 240
Target Start/End: Original strand, 1745008 - 1745188
Alignment:
Q  63 agagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagg 161  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| | |||||| | ||||      
T  1745008 agagtcgtttgaagcttttgatctatcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaatgatcaattttaaatgcgttcccaatgtgtata 1745107  T
Q  162 aacattgt-tgcaggcagagctg-ttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||  |||| |||||||||    
T  1745108 aacattgtctgcaggcagagctgttttttcttgtcttgtagtagatacagaaacagagtagtggaagtagttgttgtacac 1745188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 156
Target Start/End: Original strand, 26832852 - 26832982
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaa-tcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||| || |||||||||||||| |    
T  26832852 gtgaaagagacgttgttaattgccagcacatcaaaa-aagagtcgtttgaagctt-gatcaaatcaccaatgatttgttgcctgatatggttattgtctt 26832949  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtat 156  Q
    | |||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  26832950 atgaaggaacaatttcaaatccattccaagtat 26832982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 63 - 240
Target Start/End: Original strand, 40003080 - 40003258
Alignment:
Q  63 agagtcgtt-tgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagg 161  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||| |||| || |  ||||||| |||||| |   || |||    
T  40003080 agagtcgttgtgaaaccttgatcaatcaccaatgatcttttgtctgatttggatgttgtcctaagaagaattacgttcaaatccattcctatcttgaagg 40003179  T
Q  162 aacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | |||| |||||| ||||||||||||||    
T  40003180 aacatttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacacagtcagagtcgtggaggtagtggttgtacac 40003258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 144
Target Start/End: Original strand, 43773948 - 43774052
Alignment:
Q  40 tgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttc 139  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  43773948 tgaattgccagcacatccaaaatagagtcgtttgaagctttgataaatcaccattgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaagaatcaatttc 43774047  T
Q  140 aaatt 144  Q
    |||||    
T  43774048 aaatt 43774052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 23271404 - 23271241
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| || || ||| | |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |   || |||||||||  |||||||    
T  23271404 ctttgatcatttaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaaattcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggc 23271305  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||  ||||||||||||||    
T  23271304 agagctgtttatcttgtcttgtagcgtagacacaggcagagtagtggaagtagtggttgtacac 23271241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 103
Target Start/End: Original strand, 19156057 - 19156134
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttg 103  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19156057 gtgaaagagatgttgtgaattgcaagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttg 19156134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Original strand, 3843604 - 3843766
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |   || |||||||||  |||||||    
T  3843604 ctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggc 3843703  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  3843704 agagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 3843766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 7018580 - 7018418
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||| || || ||| | | |||||| |||||||||| ||||||| |||||| |   || |||||||||  |||||||    
T  7018580 ctttgatcatccaccaataatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggc 7018481  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    | ||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  7018480 aaagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 7018418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20259816 - 20259654
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||| || || ||| | | |||||| |||||||||| ||  |||||||||| |   || |||||||||  |||||||    
T  20259816 ctttgatcattcaccattaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaactttgaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggc 20259717  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20259716 agagctgttgt-cttgtcttgtagcgcagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 20259654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 21046446 - 21046284
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||| || || ||| | | |||||| |||||||||| ||  |||||||||| |   || |||||||||  |||||||    
T  21046446 ctttgatcattcaccattaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaactttgaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggc 21046347  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  21046346 agagctgttgt-cttgtcttgtagcgcagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 21046284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 17519341 - 17519180
Alignment:
Q  79 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcag 178  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| || || |||   |||||||| |||||||||  ||||||| |||||| |   || |||||||||  |||||| ||    
T  17519341 ttgatcaaataccaatgatcttttgcctgatttggaagttgtcctatgaaggatcatgttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggaag 17519242  T
Q  179 agctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||    
T  17519241 agctgtttttcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacac 17519180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 79 - 239
Target Start/End: Original strand, 8031902 - 8032062
Alignment:
Q  79 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcag 178  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| || || ||| | |||||||| |||||||||  ||||||| |||||| |   || |||||||||  |||| ||||    
T  8031902 ttgatcaaataccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaagcag 8032001  T
Q  179 agctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtaca 239  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||| |||||||||||||    
T  8032002 agctgtttatcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtaca 8032062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 332 - 453
Target Start/End: Original strand, 22745608 - 22745730
Alignment:
Q  332 gtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgc 430  Q
    ||||||| ||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  ||    
T  22745608 gtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagc 22745707  T
Q  431 ttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    |||| ||||  ||||||||||||    
T  22745708 ttctgatgagatgcttctgatga 22745730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 442 - 501
Target Start/End: Original strand, 6407947 - 6408006
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcag 501  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  6407947 tgcttttgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagcactttaacttcag 6408006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 240
Target Start/End: Original strand, 29379484 - 29379607
Alignment:
Q  117 ttgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactga 216  Q
    |||||||| ||||||| |  ||||||| |||||| |   || |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| | ||    
T  29379484 ttgtcctatgaaggattatgttcaaatccattcctatcctgaaggaacatttctgcaggcagagatgtttttcttgtcttgtagcgtagacacaatcaga 29379583  T
Q  217 gtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    || |||||| ||||||||||||||    
T  29379584 gtcgtggaggtagtggttgtacac 29379607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 143
Target Start/End: Original strand, 21298843 - 21298944
Alignment:
Q  40 tgaattgccagcacatcaaaataagagtcgttt-gaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaattt 138  Q
    ||||||||||||||||||| |   ||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  21298843 tgaattgccagcacatcaata---gagtcgttttgaaatcttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcaattt 21298939  T
Q  139 caaat 143  Q
    |||||    
T  21298940 caaat 21298944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 442 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 40845293 - 40845207
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||| | || || |||||||| |||| ||||    
T  40845293 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagcgctttatcttcaggagcagttttcttcagacgctttaagc 40845207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 393 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 18151635 - 18151534
Alignment:
Q  393 catcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgt-gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcact 491  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||     |||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  18151635 catcttctgatgaactgcaacttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaagagcact 18151536  T
Q  492 tt 493  Q
    ||    
T  18151535 tt 18151534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 238
Target Start/End: Original strand, 19461070 - 19461190
Alignment:
Q  117 ttgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactga 216  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||  ||||| |   || |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| | ||    
T  19461070 ttgtcctatgaaggatcaagttcaaatctattcctatattgaaggaacatttctgcaggcagagctgttat-cttgtcttatagcgtagacacaagcaga 19461168  T
Q  217 gtagtggagatagtggttgtac 238  Q
    || |||||| ||||||||||||    
T  19461169 gtcgtggaggtagtggttgtac 19461190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 238
Target Start/End: Original strand, 19558748 - 19558868
Alignment:
Q  117 ttgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactga 216  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||  ||||| |   || |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| | ||    
T  19558748 ttgtcctatgaaggatcaagttcaaatctattcctatattgaaggaacatttctgcaggcagagctgttat-cttgtcttatagcgtagacacaagcaga 19558846  T
Q  217 gtagtggagatagtggttgtac 238  Q
    || |||||| ||||||||||||    
T  19558847 gtcgtggaggtagtggttgtac 19558868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 442 - 518
Target Start/End: Original strand, 36105456 - 36105532
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcaga 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||| | || || ||||||||    
T  36105456 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagcgctttatcttcaggagcagttttcttcaga 36105532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 442 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 14989380 - 14989329
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcacttt 493  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14989380 tgcttctgatgacgtcatcactttaggagcactttgtcttcaggagcacttt 14989329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 13430556 - 13430506
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13430556 tgcttctgatgacgtcattacttcaggagcactttgtcttcaggagcactt 13430506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 291
Target Start/End: Original strand, 21300980 - 21301102
Alignment:
Q  169 ttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctc 268  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |  | ||||||||||  |||||||||||||| | ||||||  | ||| |||||||||||    
T  21300980 ttgcaggcagagcagttatccttgtcttgtagcagagacaaactcagagtagtggaagtagtggttgtacactttgtacaaacgtactatgtcaacgctc 21301079  T
Q  269 ttaaaaaagcaagcatccaatgc 291  Q
    ||  |  || |||||||||||||    
T  21301080 tttgaggagtaagcatccaatgc 21301102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 528
Target Start/End: Original strand, 22663377 - 22663463
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||| ||||||| | || || |||||||| |||| ||||    
T  22663377 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaagagcgttttaacttcaggagcagttttcttcagacgctttaagc 22663463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 528
Target Start/End: Original strand, 22674024 - 22674110
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||| ||||||| | || || |||||||| |||| ||||    
T  22674024 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactatttcttcaggagcgctttaacttcaggagcagttttcttcagacgctttaagc 22674110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Original strand, 43640020 - 43640070
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  43640020 tgcttctgatgacgtcatcacttcatgagcactttgtcttcaggagcactt 43640070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 22136057 - 22135933
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||   || ||||||| |  |||||||    
T  22136057 ctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacaattctgcaggc 22135958  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcg 202  Q
    |||||||||| |||||||||||||||    
T  22135957 agagctgtta-tcttgtcttgtagcg 22135933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 443 - 488
Target Start/End: Original strand, 24551536 - 24551581
Alignment:
Q  443 gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagc 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24551536 gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagc 24551581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 518
Target Start/End: Original strand, 21288625 - 21288703
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt--tgacttcagaatcacttctcttcaga 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||  | ||||||||| || || ||||||||    
T  21288625 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttttcttcaggagcacttcataacttcagaagcagttttcttcaga 21288703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22211587 - 22211425
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |   || ||||||| |  |||||||    
T  22211587 ctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 22211488  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    || ||||||| |||||||||||||||  ||||||  | | || |||||| ||||||||||||||    
T  22211487 agggctgtta-tcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacac 22211425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 3598251 - 3598205
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagc 488  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3598251 tgcttctgacgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagc 3598205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 20382300 - 20382250
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  20382300 tgcttttgatgacgtcatcacttcaggagcactttgacttcaggagcactt 20382250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Original strand, 43774115 - 43774165
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  43774115 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgtctttaggagcactt 43774165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 491
Target Start/End: Original strand, 1745382 - 1745431
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcact 491  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  1745382 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactttgtcttcaggagcact 1745431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 15335963 - 15335887
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcaga 518  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||| |||| ||||||| | || || ||||||||    
T  15335963 tgcttctgatgacgtcatcatttcagaagcactgtgtcttcaggagcgctttaacttcaggagcagttttcttcaga 15335887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 15425028 - 15424952
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcaga 518  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||| |||| ||||||| | || || ||||||||    
T  15425028 tgcttctgatgacgtcatcatttcagaagcactgtgtcttcaggagcgctttaacttcaggagcagttttcttcaga 15424952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 15516332 - 15516256
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcaga 518  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||| |||| ||||||| | || || ||||||||    
T  15516332 tgcttctgatgacgtcatcatttcagaagcactgtgtcttcaggagcgctttaacttcaggagcagttttcttcaga 15516256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 480 - 528
Target Start/End: Original strand, 17701995 - 17702042
Alignment:
Q  480 ttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17701995 ttcaggagca-tttgacttcagaagcacttctcttcagatgcttcaagc 17702042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 480 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 20382279 - 20382231
Alignment:
Q  480 ttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  20382279 ttcaggagcactttgacttcaggagcacttctcttcagacgcttcaagc 20382231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 449 - 528
Target Start/End: Original strand, 1237905 - 1237984
Alignment:
Q  449 gatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||  | || || ||||||||||||| ||||    
T  1237905 gatgacgtcaccacttcaggagcactttgtcttcaggagcgctttatcttcatgagcagttttcttcagatgctttaagc 1237984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 16681209 - 16681158
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcac-tttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  16681209 tgcttctgatgacgtcatcacttcatgagcacttttgtcttcaggagcactt 16681158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 427 - 489
Target Start/End: Original strand, 17797652 - 17797715
Alignment:
Q  427 ttgcttctaatga-tgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagca 489  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  17797652 ttgcttctgatgaatttgcttctgatgacgtcaccatttcaggagcactttgtcttcaggagca 17797715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 240
Target Start/End: Original strand, 18153908 - 18153978
Alignment:
Q  169 ttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18153908 ttgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 18153978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 240
Target Start/End: Original strand, 18158396 - 18158498
Alignment:
Q  137 ttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgt 236  Q
    ||||||||||||||||   || ||||||| |  |||||||| ||||||| | |||||||||||| |  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18158396 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagagtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 18158494  T
Q  237 acac 240  Q
    ||||    
T  18158495 acac 18158498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Original strand, 1750268 - 1750337
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  1750268 tgcaggcatagctgttgtt-ttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 1750337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 6318622 - 6318553
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  6318622 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 6318553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 23263517 - 23263467
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  23263517 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcgcttttacttcaggagcactt 23263467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 23269721 - 23269639
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttc 524  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    ||||| ||||||||  |||||||  || || ||||||||||||||    
T  23269721 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttcagcttcagaagcactttagcttcagacgcagttttcttcagatgcttc 23269639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 476
Target Start/End: Original strand, 29693562 - 29693596
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 476  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29693562 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 29693596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 443 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 30421362 - 30421304
Alignment:
Q  443 gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcag 501  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||    
T  30421362 gcttctgatgacgtcactacttcaggagcactttgtctttaggagcagtttgtcttcag 30421304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 523
Target Start/End: Original strand, 18158707 - 18158788
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgctt 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    ||||| ||||||||  |||||||  || || |||||||||||||    
T  18158707 tgcttctgatgacgtcatcacttcatgagcacttcagcttcagaagcactttagcttcagacgcagttttcttcagatgctt 18158788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 448 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 20255466 - 20255425
Alignment:
Q  448 tgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagca 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20255466 tgatgacgtcatcacttcaggagcactttgacttcaggagca 20255425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 77 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 22167222 - 22167098
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||   || ||||||| |  |||||||    
T  22167222 ctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacaattctgcaggc 22167123  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcg 202  Q
    | |||||||| |||| ||||||||||    
T  22167122 aaagctgtta-tcttatcttgtagcg 22167098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 13596356 - 13596276
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgct 522  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||| |||  |||||| | || || ||||||||||||    
T  13596356 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcagtttagcttcaggagcagtttagcttcaggagcagttttcttcagatgct 13596276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 13688377 - 13688297
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgct 522  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||| |||  |||||| | || || ||||||||||||    
T  13688377 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcagtttagcttcaggagcagtttagcttcaggagcagttttcttcagatgct 13688297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 480 - 528
Target Start/End: Original strand, 17267739 - 17267787
Alignment:
Q  480 ttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    ||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  17267739 ttcagaagcactttgacttcaggcacacttctcttcagatgcttcaagc 17267787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 480 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 17441706 - 17441658
Alignment:
Q  480 ttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||    
T  17441706 ttcaggagcactttgacttcaggagcacttctcttcagacgctttaagc 17441658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 480 - 528
Target Start/End: Original strand, 17914727 - 17914775
Alignment:
Q  480 ttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    |||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  17914727 ttcaagagcactttgactttaggagcacttctcttcagatgcttcaagc 17914775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 443 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 33560167 - 33560119
Alignment:
Q  443 gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcact 491  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||    
T  33560167 gcttctgatgacgtcatcacttcataaacactttgtcttcaggagcact 33560119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 480 - 528
Target Start/End: Original strand, 39693803 - 39693851
Alignment:
Q  480 ttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  39693803 ttcaggtgcactttgacttcagaagcacttctcttcggatgctttaagc 39693851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 445 - 492
Target Start/End: Original strand, 39693785 - 39693832
Alignment:
Q  445 ttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||    
T  39693785 ttctgatgacgtcatcacttcaggtgcactttgacttcagaagcactt 39693832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 40213309 - 40213207
Alignment:
Q  137 ttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgt 236  Q
    ||||||||||||||||   || |||||||||  ||||||||   ||||| | |||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||  ||||||||||    
T  40213309 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcatgactgttgt-cttgtcttgtagtgtagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgt 40213211  T
Q  237 acac 240  Q
    ||||    
T  40213210 acac 40213207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 443 - 493
Target Start/End: Original strand, 9320817 - 9320867
Alignment:
Q  443 gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcacttt 493  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  9320817 gcttctgatgacgtcaccactacagaagcactttgtcttcaggagcgcttt 9320867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 524
Target Start/End: Original strand, 16747469 - 16747551
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttc 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||| ||||||||  |||||||  || || ||||||||||||||    
T  16747469 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcacttcagcttcagaagcactttagcttcagacgcagttttcttcagatgcttc 16747551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 476
Target Start/End: Original strand, 18154205 - 18154239
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 476  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18154205 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 18154239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18769243 - 18769174
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||| ||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18769243 tgcaggcatagctgttgt-cttatcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 18769174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Original strand, 19225109 - 19225177
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19225109 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 19225177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Original strand, 21301244 - 21301294
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    |||||||||||| |||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||    
T  21301244 tgcttctgatgatgtcatcactttaaaagcactttgtcttcaggagcactt 21301294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 23457409 - 23457341
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23457409 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 23457341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 23469271 - 23469237
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 476  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23469271 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 23469237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 23469566 - 23469497
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  23469566 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagaggagtggaggtagtggttgtacac 23469497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 30314801 - 30314733
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  30314801 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgaggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 30314733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 30325357 - 30325289
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  30325357 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgaggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 30325289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Original strand, 31215190 - 31215259
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||| |||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  31215190 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttatagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 31215259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 443 - 492
Target Start/End: Original strand, 2811070 - 2811119
Alignment:
Q  443 gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| || |||||    
T  2811070 gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcgctatgtcttcatgaacactt 2811119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Original strand, 3220823 - 3220876
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaa-ctgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  3220823 tcttgtcttgtagcgaagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 3220876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 6151523 - 6151556
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6151523 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcactt 6151556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 6161477 - 6161510
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6161477 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcactt 6161510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 6318363 - 6318330
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6318363 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 6318330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 6576384 - 6576351
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6576384 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 6576351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 9856300 - 9856267
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9856300 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcactt 9856267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 15780538 - 15780505
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15780538 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 15780505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 15791127 - 15791094
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15791127 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 15791094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 455 - 528
Target Start/End: Original strand, 16189242 - 16189315
Alignment:
Q  455 gtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    |||||||||  |||||||||||   |||| ||||||| ||||||||  | |||||||||||||| |||||||||    
T  16189242 gtcatcactctaggagcacttttacttcaagagcactgtgacttcaagagcacttctcttcagacgcttcaagc 16189315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 18449822 - 18449855
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18449822 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 18449855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 18768949 - 18768868
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgctt 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||| ||||||||  |||||||  || || |||||||||||||    
T  18768949 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcacttcagcttcagaagcactttagcttcagacgcagttttcttcagatgctt 18768868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Original strand, 19128939 - 19128992
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaa-ctgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19128939 tcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 19128992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 19129182 - 19129215
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19129182 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 19129215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Original strand, 19139471 - 19139524
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaa-ctgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19139471 tcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 19139524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 19139732 - 19139765
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19139732 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 19139765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 19225385 - 19225418
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19225385 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 19225418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Original strand, 19429119 - 19429172
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaa-ctgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19429119 tcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 19429172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 20161058 - 20160977
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgctt 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||| ||||||||  |||||||  || || |||||||||||||    
T  20161058 tgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcacttcagcttcagaagcactttagcttcagacgcagttttcttcagatgctt 20160977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #153
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 523
Target Start/End: Original strand, 20196409 - 20196490
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgctt 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||| ||||||||  |||||||  || || |||||||||||||    
T  20196409 tgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcacttcagcttcagaagcactttagcttcagacgcagttttcttcagatgctt 20196490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #154
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 26111684 - 26111717
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26111684 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 26111717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 26121362 - 26121395
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26121362 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 26121395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #156
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 31215483 - 31215516
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31215483 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 31215516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #157
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 43248769 - 43248802
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43248769 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 43248802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Original strand, 16747193 - 16747244
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16747193 tcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 16747244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Original strand, 19418544 - 19418595
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19418544 tcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 19418595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #160
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 480 - 528
Target Start/End: Original strand, 19943505 - 19943552
Alignment:
Q  480 ttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    |||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  19943505 ttcaggagcactat-acttcaggagcacttctcttcagatgcttcaagc 19943552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20161317 - 20161266
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20161317 tcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 20161266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Original strand, 20196150 - 20196201
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20196150 tcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 20196201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 442 - 474
Target Start/End: Original strand, 24646585 - 24646617
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24646585 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 24646617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 442 - 523
Target Start/End: Original strand, 28903709 - 28903792
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt--tgacttcagaatcacttctcttcagatgctt 523  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  || ||| || |||||||||||||  | ||||||||  || || |||||||||||||    
T  28903709 tgcttctgatgacatcatcacttcagaggcccttggtcttcaggagcacttcataacttcagacgcagttttcttcagatgctt 28903792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 442 - 522
Target Start/End: Original strand, 44481538 - 44481618
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgct 522  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||| ||   |||||| | || || ||||||||||||    
T  44481538 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcagtttagcttcaggagcagttgagcttcaggagcagttttcttcagatgct 44481618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 442 - 522
Target Start/End: Original strand, 44492154 - 44492234
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgct 522  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||| ||   |||||| | || || ||||||||||||    
T  44492154 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcagtttagcttcaggagcagttgagcttcaggagcagttttcttcagatgct 44492234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 165)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 18 - 528
Target Start/End: Original strand, 19085974 - 19086474
Alignment:
Q  18 taaaggagtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttat 117  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  19085974 taaaggtgtgaaatagacgttgtgaattgccaacacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatccatcaccaatgatattttgcctaatattgttat 19086072  T
Q  118 tgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgag 217  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19086073 tgtcctatgaaggatcaatttcaaattcattccaagtatgaaggaacattgatgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgag 19086172  T
Q  218 tagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgtt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || |          || |||| |||    
T  19086173 tagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttca----------aaatagtcgtt 19086262  T
Q  318 gattcactctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgta-caacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagctt 415  Q
    | ||||||||||  ||||||||||||  |||| || |||||||||||||| | || || ||| ||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  19086263 gcttcactctcccagtcttctgcaatacttagacgagattaaatccattgaatcagcccttg-agctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagctt 19086361  T
Q  416 ctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctctt 514  Q
    |||||||||||  || ||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  19086362 ctggtgatcttcagc-tctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgacttcaggagcactttgacttcaggagcacttctctt 19086460  T
Q  515 cagatgcttcaagc 528  Q
    |||| |||||||||    
T  19086461 cagacgcttcaagc 19086474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 25 - 453
Target Start/End: Original strand, 23284387 - 23284815
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  23284387 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctgatatgtttattgtccta 23284485  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     ||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23284486 tgaaggattaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 23284585  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||  | ||||||| ||||||||| || | | ||  || |||  |||| |||||    
T  23284586 gataatggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaggaacaagcattcaatgccttcaaatcctttcaaaataggcgttgcttcac 23284685  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    | | |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  23284686 ttttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctagcgat 23284785  T
Q  424 cttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    ||| ||||||| ||||  ||||||| ||||    
T  23284786 cttctgcttctgatgagatgcttctaatga 23284815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 25 - 528
Target Start/End: Original strand, 32544088 - 32544592
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  32544088 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatctttttcctgatatggttattgtccta 32544186  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  32544187 tgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacagaaacagagtagtgga 32544286  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || |  || |||||||||||||||| | | ||  || |||  |||| |||||    
T  32544287 ggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataaacatccaatgcctttaaatcctttcaaaatagacgttgcttcac 32544386  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    ||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||  ||||| |||||||    
T  32544387 tcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttatggtgat 32544486  T
Q  424 cttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgct 522  Q
     ||  |||||| ||| |  ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| | || ||||||||||| |||    
T  32544487 tttcagcttctgatgaacttgcatctgatgacatcaccacttcaggagcactttgtcttcaagagcactttgtcttcaggagcagttctcttcagacgct 32544586  T
Q  523 tcaagc 528  Q
    | ||||    
T  32544587 ttaagc 32544592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 25 - 492
Target Start/End: Original strand, 15302023 - 15302476
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15302023 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataa-agtcgtttgaaactttgatcaatcaccaatgatcttttgcctaatatggttattgtccta 15302121  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  15302122 tgaaggatgaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcatagctgttatccttgtcttgtagcagagacactaactgagtagtgga 15302221  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||  ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| | | ||  || |||  |||| |||||    
T  15302222 gatagtggttgtacactttgtacaattgtacaatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgcctttaaatcctttcaaaatagccgttgcttcac 15302321  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatgtt-aggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    | | |  ||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||  ||||| || |||| ||| ||||| |||||||    
T  15302322 ttttccagtcttctgcaatgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgacgctttaagtcttgcatctcctaatgagctttagcttttggtgat 15302421  T
Q  424 cttttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcac--tttgttttcaggagcactt 492  Q
    |||                |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  15302422 ctt----------------gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttttgtcttcaggagcactt 15302476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 25 - 492
Target Start/End: Original strand, 19623802 - 19624267
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  19623802 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagatttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtccta 19623900  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
      ||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  19623901 taaaggatcaatttcaaatccattctaagtatgaaggaacattgctgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcaaagacacaaactgagtagtgga 19624000  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggact-ttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattca 323  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||| ||||||||  ||| | ||| |||||||||| || || | | ||   | |||| |||| ||||    
T  19624001 gatagtggttgtacacttcgtacaattgtactagtgt-aacgctctccaaagaacaatcatccaatgctttcaaatcctttcagaatagtcgttgcttca 19624099  T
Q  324 ctctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtga 422  Q
    |||  |||||||| ||||||| || | || |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19624100 ctcctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagacttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtga 19624199  T
Q  423 tcttttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||  ||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  19624200 tc--ttgtttctgatgagatgcttctgatgacgtcatcactttaggagcactttgacttcaggagcactt 19624267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 25 - 405
Target Start/End: Original strand, 15987056 - 15987437
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15987056 gtgaaagagacgttatgaatttccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaacgatcttttgtctgatatggttattgtccta 15987154  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  15987155 tgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacattgttgcaggcatagctgttatccttgtcctgtagtagagacacaaactgagtaatgga 15987254  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaact-tcatttgaattagttgttgattca 323  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || |  | ||| || ||||  ||| ||||    
T  15987255 gatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcccttttaaaatagtcattgcttca 15987354  T
Q  324 ctctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatga 405  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  15987355 ctcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttgaagctctaagtctctcatcttctgatga 15987437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 19 - 487
Target Start/End: Original strand, 9717660 - 9718143
Alignment:
Q  19 aaaggagtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttatt 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  9717660 aaaggtgtgaaagagacgttgtgaattgtcagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttatt 9717758  T
Q  119 gtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagt 218  Q
     ||||| |||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||| ||||    
T  9717759 ctcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacattgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtatcagagacaaaaacagagt 9717858  T
Q  219 agtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttg 318  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | |||||||| ||||||||||| | | ||  || |||||||||    
T  9717859 agtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatcaaatgcctttaaatcctttcaaaatagttgttg 9717958  T
Q  319 attcactctcctggtcttctgcaatgtt-aggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttct 417  Q
     |||||||| |  ||||||| ||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||  |||||||    
T  9717959 cttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttct 9718058  T
Q  418 ggtgatcttttgcttctaatg--------atg-------tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggag 487  Q
     |||||||||  ||||| |||        |||       ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  9718059 agtgatctttaacttctgatgggatgcttatgataaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaagagcactttgtcttcaggag 9718143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 25 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 20113026 - 20112574
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  20113026 gtgaaagagacgttgtgaatttacagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtccta 20112928  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     ||||||||||||||||||  ||||| ||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  20112927 tgaaggatcaatttcaaatctattccaagtatgagggaacaatgttgcagggagagctgttattcttgtcttgtcgcagagacacaaactgagtagtgga 20112828  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || | | ||  || |||| |||| ||||     
T  20112827 gatagtggttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcat 20112728  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtga 422  Q
    ||| | |||||||||||||| ||||  | |||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  20112727 tcttccggtcttctgcaatgcttagaagagattaaatccattgaacaacctttttaagctttaagtcttgcatctcttgatgaacttcagcttcaggtga 20112628  T
Q  423 tcttttgcttct-aatgatgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    ||||| |||||| ||  |  ||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  20112627 tctttagcttctgaagaacttgcttctgatgacgtcatcacttcatgaacactt 20112574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 28 - 453
Target Start/End: Original strand, 13601998 - 13602423
Alignment:
Q  28 aaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacga 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13601998 aaagagacgttgtgaattgccagcaaatctaaata-gagtcgtatgaaactttgatcaatcaccaaggatcttttgtctaatatggttattgtcctatga 13602096  T
Q  128 aggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagat 227  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13602097 aggatcaaatttaaatccattcccagtatgtaggagcattgttgcaggcaaagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagat 13602196  T
Q  228 agtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcattt-gaattagttgttgattcactc 326  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| | |||||||||| |||| ||| |  |||||||||||||||| || |||||||  || |||| |||| |||||||    
T  13602197 agtggttatacacttcttacaattgtattttgtcaacgttcttcaaagaataagcatccaatgccttcaa-ttcatttcaaaatagtggttgcttcactc 13602295  T
Q  327 tcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatct 425  Q
    | |  ||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||  ||||||| |||||||    
T  13602296 ttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactatagcttcttgtgatct 13602395  T
Q  426 tttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    |  |||| | ||||  ||||||||||||    
T  13602396 tcggcttttgatgagatgcttctgatga 13602423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 30 - 492
Target Start/End: Original strand, 24116656 - 24117133
Alignment:
Q  30 agagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaag 129  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  24116656 agagacgttgtgaatttccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgattaatcaccaatgatcttttgcctgatatgattattgtcctatgaag 24116754  T
Q  130 gatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatag 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24116755 gatcaatttcaaatccattcccagtatgtaagaacattgttgaaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatag 24116854  T
Q  230 tggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcc 329  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || | | ||  || ||   | |  |||||||  |    
T  24116855 tggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaataaccgctacttcactcctc 24116954  T
Q  330 tggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttt 427  Q
    ||||||| ||||||| || | || |||| ||||||||| ||| || |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  24116955 tggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagccttttgaagctttaagtcttgcatcttctgatgaacttcatcttctggtgatc--t 24117052  T
Q  428 tgcttctaa------------tgatg----tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    |||||||||            |||||    || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  24117053 tgcttctaaccgagatgcttctgatgaacttgtttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgacttcaggagcactt 24117133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 28 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 26972549 - 26972040
Alignment:
Q  28 aaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacga 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||| ||    
T  26972549 aaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaaggtttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatttttattatcctatga 26972451  T
Q  128 aggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagat 227  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | || |||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |    
T  26972450 aggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcgttgcagacagagctttttttcttgtcttgtagcagagacaaatactgagtagtggaggt 26972351  T
Q  228 agtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactct 327  Q
    ||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||  || | ||| |||||||||||||||| | | ||  || ||||||||| ||||||||    
T  26972350 agtggttgtacacttcg--caattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgcctttaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactct 26972253  T
Q  328 cctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatctt 426  Q
     |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||  ||||| |||||||| |  ||||||||||||| ||    
T  26972252 tcaagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaaatagagcttctggtgatttt 26972153  T
Q  427 ttgcttctaatga---tg-------------tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttc 510  Q
     ||||||| ||||   ||             ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||    
T  26972152 ctgcttctgatgaacttgcttctaataaacttgcttctgatgacgtcaccatttcaggagcaatttgtcttcagtagcactttgacttcagaagcagttc 26972053  T
Q  511 tcttcagatgctt 523  Q
    |||||||| ||||    
T  26972052 tcttcagacgctt 26972040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 25 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 15531950 - 15531522
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   |||  |||||||||||    
T  15531950 gtgaaagagacgttgtgaattgccaacacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttaccgggtataattattgtccta 15531852  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     ||||||||||||| |||| |||||||| | || ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||    
T  15531851 tgaaggatcaatttgaaatccattcccattgtgaaggaatatcgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaagacagagtagtgga 15531752  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| || | | ||  || ||   |||| || ||    
T  15531751 ggtagtggttgtacgcttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaataaccgttgttttac 15531652  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    ||| || ||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  15531651 tcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttcaagctttaagtcttgcatcttctgatgaactacaacttctggtgat 15531552  T
Q  424 cttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    ||| || |||| ||||  ||||||||||||    
T  15531551 cttatgattctgatgagatgcttctgatga 15531522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 25 - 489
Target Start/End: Original strand, 29917840 - 29918303
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||    
T  29917840 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgattttttgcctgatatggtcattgtccta 29917938  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||| ||||||||||||| |||||||| | || | ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||    
T  29917939 tgaagaatcaatttcaaatgcattcccattgtgaatgaacatctttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcatagacaaaaacagagtagtgga 29918038  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||||||||  ||||||| || |   ||  || |||| |||| |||||    
T  29918039 ggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatctgatgccttcaaatcttttcaaactagtcgttgcttcac 29918138  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    | | |   |||||||||||| |||| || ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||| ||||||||| |||     
T  29918139 ttttccaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatcca-tgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacagcttctgatgaa 29918237  T
Q  424 cttttgcttctaat-gatgtgcttctgatgacgtcatcac-ttcaggagcactttgttttcaggagca 489  Q
    |  |||||||| || ||  ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  29918238 c--ttgcttctgatggacttgcttctaatgacgtcaccactttcaggagcactttgtcttcagaagca 29918303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 28 - 528
Target Start/End: Original strand, 18435382 - 18435898
Alignment:
Q  28 aaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacga 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||    
T  18435382 aaagagacgttgtgaattgccagcatatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatctttttcctgatatggttattgtcctatga 18435480  T
Q  128 aggatcaatttcaaattcattccca--gtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggag 225  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||| ||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| | ||| |||||    
T  18435481 aggatcaatttcaaatccattcccatagtaagt--gaacatcgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagtgtactggag 18435578  T
Q  226 atagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcact 325  Q
     |||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| || | | ||  || |||| |||| ||||||    
T  18435579 gtagtggttgtacactttgtacacttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcact 18435678  T
Q  326 ctcctggtcttctgcaa-tgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatc 424  Q
     | || ||||| || || | |||| || |||||||||||||| | ||||||  |||||| ||||||  ||||| ||||||||||  ||||||| ||||||    
T  18435679 tttctagtcttttgaaattcttagacgagattaaatccattgaataaccttcaaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctagtgatc 18435778  T
Q  425 ttttgcttctaatgatgt----------------gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcact 508  Q
    ||  |||||| ||||  |                |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | || |    
T  18435779 ttcagcttctgatgaacttgcttctagtggactagcttctgatgacgtcaccacttcaggagcactttgtgttcaggagcactttgtcttcaggagcagt 18435878  T
Q  509 tctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  18435879 tctcttcagatgctttaagc 18435898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 26 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 14100763 - 14100373
Alignment:
Q  26 tgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctac 125  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  14100763 tgaaagagacgttgtgaattgtcagcacatcaaaata-gagtcatttgaagctttgatcaataatcaatgatcttttgtctgatatggttattgtcctat 14100665  T
Q  126 gaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggag 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | | || || ||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  14100664 gaaggatcaatttcaaatccattccaattgtgaagaaacatcgttgcatgcagagttgtt-ttcttgtcttgtagcagagaca-aaacagagtagtggag 14100567  T
Q  226 atagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcact 325  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| || | | ||  || ||||||||  ||||||    
T  14100566 gtagtggttgtacacttcgtataattgtactttgtcaacgctctttaaagaagaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgtttcttcact 14100467  T
Q  326 ctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctg 418  Q
    || |  ||||||| ||||| ||||  | |||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  14100466 cttccagtcttctacaatgcttagatgagattaaatccattgaacatcctttgaaactttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctg 14100373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 28 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 12715744 - 12715279
Alignment:
Q  28 aaagagacgttgtga-attgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacg 126  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||  |    
T  12715744 aaagagacgttgtgacattgtcagcacatcaaaatat-agttgtttgaagctttgatcaatcaccagtgatcttttgcctgatatggttgttgtcctctg 12715646  T
Q  127 aaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggaga 226  Q
    || |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12715645 aatgatcaatttcaaatccattccatgtatgtaggaacattgttgcaggaagagccgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggaga 12715546  T
Q  227 tagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcattt-gaattagttgttgattcact 325  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |  | |||| ||||| |||| |  ||||||  || |||| |||| ||||||    
T  12715545 tagtggttctacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataggcatacaatg-ctttcaaatcatttcaaaatagtcgttgcttcact 12715447  T
Q  326 ctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    ||     |||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||  ||||| |||||||||| || ||||| |||||    
T  12715446 ctttcaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagccttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctagtgat 12715347  T
Q  424 cttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcac-tttgttttcaggagcactt 492  Q
    |  |||||||| ||| |  | |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  12715346 c--ttgcttctgatgaacttccttctgatgacgtcatcacttc-ggaacacttttgtcttcaggagcactt 12715279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 25 - 453
Target Start/End: Original strand, 19470490 - 19470918
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgt-gaattgccagcacatcaaaataa--gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtc 121  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  19470490 gtgaaagagacgttgttgaattgccaacacataaaaaaaaaagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttattgtc 19470589  T
Q  122 ctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagt 221  Q
    ||| ||||||| |||||||||| |||||| ||| || |||||||  |||| | ||| || ||||||||||||||||| || |||||| ||  | ||||||    
T  19470590 ctatgaaggattaatttcaaatccattccaagtctgaaggaacaccgttggaagcatagttgttattcttgtcttgttgcagagacataacat-agtagt 19470688  T
Q  222 ggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgatt 321  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||||  |||| || |||||||  ||| | ||||||||||||||||| || | | ||||||||||| |||| ||    
T  19470689 ggaggtagtggttgtaaacttcgtacaattgtcctttttccacgctctgcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttttgaattagtcgttgctt 19470788  T
Q  322 cactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtg 421  Q
    || ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||    
T  19470789 cattcttctggtcttgtgcaatgctaggcgtgattaaatctgttgaacaacctttgaagcttcagttctctcatcttttgatgatcttcaacttcttgtg 19470888  T
Q  422 atcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    |  | |||||||| |||| |||||||||||||    
T  19470889 a--tgttgcttctgatgaggtgcttctgatga 19470918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 25 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 20731030 - 20730567
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  20731030 gtgaaagagacgttgtgaattgtcagcaaatcaaaataa-agtcatttgaagctttgattaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtccta 20730932  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| ||||| || | || ||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||    
T  20730931 agaaggatcaatttcaaatgcattcacattgtgaaggaacatctttgtaggcagagctgtttttcttgtcttgtagctgagacaaaaacagagcagtgga 20730832  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||  || | ||| ||||||||||||| || | | ||  || |||| |||| |||||    
T  20730831 ggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcac 20730732  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    | | |  ||||||||||||  ||||  | |||||||||| ||| ||| ||||||||||||    | |  ||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  20730731 ttttccagtcttctgcaatacttagatgagattaaatcccttgaacagcctttgaagctt--tttgttacatctcctgatgaactgcagcttctagtgat 20730634  T
Q  424 cttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagca 489  Q
     ||  |||| | ||| |  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  20730633 tttcagcttatgatgaacttgcttctgatgacgtcactacttcaggagcactttgtcttcatgagca 20730567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 25 - 453
Target Start/End: Original strand, 21624924 - 21625349
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||    
T  21624924 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcatatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatagttattatccta 21625022  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| |||||||| | || |||||| | |||||||| |||||| || |||||||||||||||   |||| ||||  |||||||||    
T  21625023 tgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacgtcgttgcaggtagagctatttttcttgtcttgtagcacggacaaaaacaaagtagtgga 21625122  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  || | ||||||| ||||||||| || | | ||| || |||  |||| || ||    
T  21625123 gatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgttaacgctctttgaagaacaagcatgcaatgccttcaaatgc-tttcaaatagccgttgctttac 21625221  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    ||| |   |||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||  ||||| |||||||    || |||||||||||    
T  21625222 tcttccaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctgtaagtcttgcatctcctgatga--gacaacttctggtgat 21625319  T
Q  424 cttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    |||  |||||| ||||  ||||| ||||||    
T  21625320 cttcagcttctgatgagatgcttatgatga 21625349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 25 - 489
Target Start/End: Original strand, 22801963 - 22802427
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||    
T  22801963 gtgaaagagacgttgtgaatttgcagcacattccaaata-gaatcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatctttttcctgatatggttattgtact 22802061  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
    | ||| ||||||||| |||  |||||||| | |  || ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||    
T  22802062 atgaatgatcaatttgaaaggcattcccattttcaagaaacaacgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaatagagtagtgg 22802161  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattca 323  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  || | |||||||||||||||||||| ||| ||  || | || |||| ||||    
T  22802162 aggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgttaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctttaaattctttcaaacttgtcgttgtttca 22802261  T
Q  324 ctctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtga 422  Q
    || | |  ||| ||||||||| |||| |   ||||||||||||| |||||||||||||||| |  | |  ||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  22802262 cttttccagtcgtctgcaatgcttagacaatattaaatccattgaacaacctttgaagcttta--tgttgcatctcctgatgaactacaacttctggtga 22802359  T
Q  423 tcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagca 489  Q
    | ||  |||||| ||| |  ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22802360 ttttcagcttctgatgaacttgcttctaatgacgtcactacttcaggagcactttgtcttcaggagca 22802427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 25 - 290
Target Start/End: Original strand, 25593891 - 25594155
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||     
T  25593891 gtgaaagagatgttgtaaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagttttgattaatcaccaatgaccttttggctgatatggttattgtcctc 25593989  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
      ||||||||||||||||| ||||||  ||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25593990 taaaggatcaatttcaaatccattccatgtacgtacgaacattattgcaagcagagctgttattcttttcttgtagcagagacacaaactgagtagtgga 25594089  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatg 290  Q
    | |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||    
T  25594090 ggtagtggttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgcgcttcaaagaacaagcatccaatg 25594155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 294
Target Start/End: Original strand, 21234946 - 21235216
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcaca-tcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  21234946 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacattcaaaat-agagtcatttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcttgatatggttattgtcct 21235044  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacaca-aactgagtagtg 222  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | | | ||||||||    
T  21235045 acgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcttcgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaatatcagagtagtg 21235144  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 294  Q
    ||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||  || | |||||||| ||||||||    
T  21235145 gaggtagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatcgaatgcctt 21235216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 383
Target Start/End: Original strand, 18378138 - 18378495
Alignment:
Q  28 aaagagacgttgtga-attgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacg 126  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  |    
T  18378138 aaagagacgttgtcacatttccagcacatcaaaaca-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatctttttcctgatatggttattatcctctg 18378236  T
Q  127 aaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacatt-gttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggag 225  Q
    || |||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18378237 aaagatcaatttcaaaactattcccagtatgtaggaatatttgttgcaggtagagttgttatccttgttttgtagcagagacacaaactgagtagtggag 18378336  T
Q  226 atagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcact 325  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | || |||||||||||||| || | | ||  || ||||||||| || |||    
T  18378337 atagtggttgtacacttcgtacaattgtactttatcaacgctcttcaaagaacatgcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttgact 18378436  T
Q  326 ctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagctt 383  Q
    || |  ||||| ||||||  |||| || |||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  18378437 cttccagtcttttgcaatacttagacgagatttaatccattgaacaaccgttgaagctt 18378495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 16265475 - 16265013
Alignment:
Q  26 tgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctac 125  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||  |||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||     
T  16265475 tgaaagagacattgtgaattgtcagcaattcaaaata-gatttgtttgaagctttgatgaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcttat 16265377  T
Q  126 gaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggag 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |  | ||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16265376 gaaggatcaatttcaaatgcattcccattgcgaaggaacatctttgcaggcagagctatttttcttgtcttgtagcagagacacaaacagagtagtggag 16265277  T
Q  226 atagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaat-tagttgttgattcac 324  Q
     ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||  || | |||||||||||||| || ||   | ||| ||| || | |||| |||||    
T  16265276 gtagtggttgcacacttcgtacaattgtactttctcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcattcaa-aacctttcaatctactcgttgcttcac 16265178  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    | | |  ||| | ||||||| ||||  | |||||||||||||| ||||||||| |||||| |  | |  |||||  ||| ||||| ||||||||||||||    
T  16265177 ttttccagtcctgtgcaatgcttagatgagattaaatccattgaacaacctttcaagcttta--tgttgcatctcttgacgaactgcagcttctggtgat 16265080  T
Q  424 cttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagca 489  Q
     ||  |||||| ||| |  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16265079 tttcagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcgccacttcaggagcactttgtcttcaggagca 16265013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 20488231 - 20487976
Alignment:
Q  40 tgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatt 137  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20488231 tgaatttccagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctaagaaggatcaatt 20488133  T
Q  138 tcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgta 237  Q
    |||||| |||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  20488132 tcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagatacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgta 20488033  T
Q  238 cacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 294  Q
     || ||||||||  | |||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||    
T  20488032 aacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctt 20487976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 47 - 362
Target Start/End: Original strand, 26943422 - 26943735
Alignment:
Q  47 ccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattca 146  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  26943422 ccagcacatcaaaac--gagtcgtttgaagctttgatcgatcaccaatgatcttttgcatgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatcca 26943519  T
Q  147 ttcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgta 246  Q
    |||| ||| || |||||||| |||| ||||| | |||||||||||||| | ||||  ||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  26943520 ttccaagtttgaaggaacatcgttgaaggcataactgttattcttgtcctatagcaaagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgta 26943619  T
Q  247 caattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgtt 346  Q
    |||||| |||| | |||||||||| ||| | |||||||||||||||||  | | |  ||||| |||  |||| |||||||| || ||||||||||||| |    
T  26943620 caattgtacttcgccaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttctaatcctattgaaatagcggttgcttcactcttctagtcttctgcaatgct 26943719  T
Q  347 aggcgtgattaaatcc 362  Q
    || | |||||||||||    
T  26943720 agacatgattaaatcc 26943735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 25 - 489
Target Start/End: Original strand, 15954529 - 15954989
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||   ||||||||||    
T  15954529 gtgaaagagacgttg--aattgccagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgaacttttgtctgat---gttattgtcc 15954622  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    || ||||||| |||||||||| |||||||| | || ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||    
T  15954623 tatgaaggattaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcattgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagaagagacaaaaacagagtagtg 15954722  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattc 322  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||  || | ||||||| ||||||||| || | | ||  ||||||| |||| |||    
T  15954723 gaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaataacaagcattcaatgccttcaaatcctttcaaattagtcgttgcttc 15954822  T
Q  323 actctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtg 421  Q
    | | | |  ||||||||||||  ||||  | | || ||||| ||  ||| | |||||||||| |||  |  |||||  ||||||||| |||||||||||     
T  15954823 atttttccagtcttctgcaatctttagaagagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcttgatgaactacagcttctggta 15954920  T
Q  422 atcttttgcttctaat-gatgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagca 489  Q
    ||  |  |||||| ||  |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  15954921 attctcagcttctgataaacttgcttctgatgacgtcaccacttcaggagcactttgtcttaaggagca 15954989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 27 - 270
Target Start/End: Original strand, 16335951 - 16336194
Alignment:
Q  27 gaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagctttg--atcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  16335951 gaaagagacgttg--aattgccagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagctttttaatcaatcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcct 16336047  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
    | ||||||||||||||||||  ||||||| |  | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||     
T  16336048 aagaaggatcaatttcaaatgtattcccattgaggagaaacattgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgt 16336147  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  16336148 agatagtggttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctctt 16336194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 294
Target Start/End: Original strand, 21618066 - 21618335
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  21618066 gtgaaagagacgttg--aattgtcagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcc 21618162  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagac-acaaactgagtagt 221  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||| | |||| |||||||    
T  21618163 taagaaggatcaatttcaaatgcattcccattgagaaggaacattgttgcaggcagagctatttttattgtcttgtagcagagacaaaaaacagagtagt 21618262  T
Q  222 ggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 294  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  ||||||||||||||||    
T  21618263 ggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 21618335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 22076733 - 22076489
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  | |||||||||||||||    
T  22076733 gtgaaagagacgttg--aattgccagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgattctttgcatgatatggttattgtcc 22076637  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||| ||| |  | || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  22076636 tacgaagtatcaatttcaaatgtatttccattgagaagaaacaatgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtg 22076537  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||    
T  22076536 gagatagtggttgtacacttcgtacaaatgtactatgtcaacgctctt 22076489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 33352252 - 33352008
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||    
T  33352252 gtgaaagagacgttg--aattgccaacacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgatcctttgcttgatatggttattgtcc 33352156  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    || |||||||||||||||||| | |||||| | || || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  33352155 tatgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgaagaaacattgttgcagacagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtg 33352056  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  33352055 gagatagtgattgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt 33352008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 40 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 17316838 - 17316609
Alignment:
Q  40 tgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttc 139  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17316838 tgaattgccagcacatccaaaatagagtcgtttgaagctttgataattcaccattgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttc 17316739  T
Q  140 aaattcattcccagtatgtaggaacattg-ttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtac 238  Q
    |||| | |||||| | ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  17316738 aaatgcgttcccaatgtgtataaacattgtttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacaaaaacatagtagtgcagatagtggttgtac 17316639  T
Q  239 acatcgtacaattggactttgtcaacgctc 268  Q
    || ||||||||  | ||| |||||||||||    
T  17316638 acttcgtacaaacgcactatgtcaacgctc 17316609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 159 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 10640611 - 10640364
Alignment:
Q  159 aggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggacttt 258  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||    
T  10640611 aggaacatcgttgcaggcatagctgttattcttgtcatgtagtagagaca-aaacatagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtccttt 10640513  T
Q  259 gt-caacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgatta 357  Q
     | |||||||||| ||| | |||||||| |||||||| || | | ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10640512 tttcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaatccttttgaattagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgctaggcgtgatta 10640413  T
Q  358 aatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaa 406  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  10640412 aatcctttgaacaacctttgaagctttaattctctcagcttctgatgaa 10640364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 40 - 270
Target Start/End: Original strand, 17381358 - 17381588
Alignment:
Q  40 tgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatt 137  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  17381358 tgaattgccagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctaagatggatcaatt 17381456  T
Q  138 tcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgta 237  Q
    |||||| |||||||| |  | |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||| ||||| |||||    
T  17381457 tcaaat-cattcccattgcgaaggaacgtcgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagaatagtggaggtagtgattgta 17381555  T
Q  238 cacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    ||| ||||||||  | |||||||||||||||||    
T  17381556 cacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctt 17381588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Original strand, 12423120 - 12423328
Alignment:
Q  63 agagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagg 161  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |  | ||     
T  12423120 agagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgattttttgcctgatatggttattgtcctacaaaggatcaatttcaaatgtattcccattgagaaga 12423219  T
Q  162 aacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtc 261  Q
    ||||| | ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| ||||    
T  12423220 aacatggctgcaggcagagttgtttttcttgtcttatagcggagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaaggtactatgtc 12423319  T
Q  262 aacgctctt 270  Q
    |||||||||    
T  12423320 aacgctctt 12423328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 40 - 268
Target Start/End: Original strand, 19482588 - 19482817
Alignment:
Q  40 tgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttc 139  Q
    |||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19482588 tgaattgctagcacatccaaaatagagtcgtttgaagctttgataattcaccattgatccttttcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttc 19482687  T
Q  140 aaattcattcccagtatgtaggaacattgt-tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtac 238  Q
    |||| | |||||| | ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  19482688 aaatacgttcccaatgtgtataaacattgtctgcaggcagagctgttattcttgtcttttagtagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtac 19482787  T
Q  239 acatcgtacaattggactttgtcaacgctc 268  Q
    || ||||||||  | ||| |||||||||||    
T  19482788 acttcgtacaaacgcactatgtcaacgctc 19482817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 25 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 19833358 - 19833115
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagctttga-tcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  19833358 gtgaaagagacgttg--aattgccagcacattcaaaata-gagtcgttttaagcttttaatcaatcaccaatgatcatttgcctgatatggttattgtcc 19833262  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||| |  | || |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| || ||| |||| ||||||||    
T  19833261 taagaaggatcaatttcaaatgcattcccattgagaagaaacattgttgcaagcagagctgtttttcttgttttgaagcagacaca-aaacagagtagtg 19833163  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  19833162 gaggtagtgcttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt 19833115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 163 - 453
Target Start/End: Original strand, 13435492 - 13435783
Alignment:
Q  163 acattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtca 262  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  13435492 acatcgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaatatagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtca 13435591  T
Q  263 acgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatc 361  Q
    ||||| || ||| | ||| ||| |||||| || || | | ||  || |||| |||| |||||||| |   |||||||||||| |||  || |||||||||    
T  13435592 acgcttttcaaagaacaatcattcaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccaatcttctgcaatgcttaaacgagattaaatc 13435691  T
Q  362 cattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    ||||| | | |||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||||||    
T  13435692 cattgaaaatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttatggtgatcttctgcttctgatgagatgcttttgatga 13435783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 418
Target Start/End: Original strand, 19688602 - 19688980
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||    ||||||||    
T  19688602 gtgaaagagacgttgtgaattgtcagcacatcaaaat-agagtcgtatgaagctttgatcaatcaccaataatctttttcctgatatg----ttgtccta 19688696  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||| ||||||||||| ||||||   |  |  ||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||| | |||||| |||| |||           
T  19688697 tgaaggaacaatttcaaatccattccagttgagagggaacgtagttgcaggcagagctatttttcttgtcttgtatcagagacaaaaacagag------- 19688789  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
      |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||| ||||||||||||| || | | ||  || ||||  ||| |||||    
T  19688790 --tagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtccttgcttcac 19688887  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctg 418  Q
    ||| |  || |||| ||||| || | || || ||||||||||| |||||||||||||||| |||  || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19688888 tcttccagttttctacaatgcttggacgagaataaatccattgaacaacctttgaagctttaag--tcgcatctcctgatgaacttcagcttctg 19688980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 63 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 19066308 - 19066079
Alignment:
Q  63 agagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagg 161  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||| | || |      
T  19066308 agagtcgtttgaagcttttgatctatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgtgttcccaatgtgaata 19066209  T
Q  162 aacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtc 261  Q
     ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    ||| ||||    
T  19066208 gacattgttgtaggcaaagctgttatccttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacatactatgtc 19066109  T
Q  262 aacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 291  Q
    |||||||||  || |  |||||||||||||    
T  19066108 aacgctctttgaagaataagcatccaatgc 19066079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 113 - 528
Target Start/End: Original strand, 16877123 - 16877538
Alignment:
Q  113 gttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaa 212  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||   |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||    
T  16877123 gttattgtcctatgatggatcaatttcaaatgtgttcccattgtgaaggaacattgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagaggcaaaaa 16877222  T
Q  213 ctgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattag 312  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||  |  |   |||||||||| |||| || | | ||| |  |||    
T  16877223 cagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaggaattagcatccaattccttcaaatccttttaagatag 16877322  T
Q  313 ttgttgattcactctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttca 411  Q
    | |||| |||||| ||   ||||||||||||  |||| || | || ||||||||  ||||| |||||||||| |||  |  ||||| |||||||||| ||    
T  16877323 tcgttgcttcactttctcagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactaca 16877420  T
Q  412 gcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttc 510  Q
     ||| |||||||     |||||| ||| |  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||  || |||| |||| |||| ||||||| | || ||     
T  16877421 acttttggtgattcacagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcattacttcagaagcactaagtcttcatgagcgctttaacttcaggagcagttt 16877520  T
Q  511 tcttcagatgcttcaagc 528  Q
    |||||||| |||| ||||    
T  16877521 tcttcagacgctttaagc 16877538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 79 - 240
Target Start/End: Original strand, 20635595 - 20635756
Alignment:
Q  79 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcag 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || ||| | |||||||| |||||||||  ||||||| |||||| |   || |||||||||| |||||||||    
T  20635595 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacattgctgcaggcag 20635694  T
Q  179 agctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20635695 agctgtttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 20635756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 40 - 240
Target Start/End: Original strand, 26589435 - 26589636
Alignment:
Q  40 tgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttc 139  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||  |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  26589435 tgaattgccagcacatccaaaatagagtcgtttgaagctttgatgattcaccattgatcctttgcctggtatggttattgtcctatgaaggatcgatttc 26589534  T
Q  140 aaattcattcccagtatgtaggaacattg-ttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtac 238  Q
    ||||   |||||| | ||||  || |||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  26589535 aaatgagttcccaatgtgtataaatattgtttgtaggcagggctgtttttcttgtcttgtagcagagacagaaacagagtagtggaagtagtggttgtac 26589634  T
Q  239 ac 240  Q
    ||    
T  26589635 ac 26589636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 63 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 17608596 - 17608419
Alignment:
Q  63 agagtcgtt-tgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagg 161  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||| |   || |||    
T  17608596 agagtcgttgtgaaaccttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaattcattcctatcttgaagg 17608497  T
Q  162 aacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  17608496 aacatttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagaca-aaacaaagtagtggaggtagtggttgtacac 17608419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 187
Target Start/End: Original strand, 16915247 - 16915407
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  16915247 gtgaaagagatgttgtgaattgccagcacatcaaaa--agtgtcgtttgaaactttgattaataatcaatgatcttttgccttatatggttattgttcta 16915344  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttat 187  Q
     ||| |||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| |||| ||||| || ||||||    
T  16915345 tgaaagatcaatttcaaatccattcaaagtatgaaggaacatcgttgtaggcatagttgttat 16915407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 14051704 - 14051483
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaa-ttgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    |||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||| | |||||||    
T  14051704 gtgaaagagacgttgtgaaattgccagcacgtcaaa----gagttgtt-gtagccttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcct 14051610  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
    | |||| || |||||||||| |||||  | | || || ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  14051609 atgaagaattaatttcaaatccattctgaatttgaagaaacatttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtgg 14051510  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaat 250  Q
    ||  ||||| ||||| | |||||||||    
T  14051509 aggaagtggctgtacgcttcgtacaat 14051483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 14070385 - 14070164
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaa-ttgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |  ||||||    
T  14070385 gtgaaagagacgttgtgaaattgccagcacgtcaaa----gagtcgtt-gtagccttgatcaatcaccaatgatcttttgtctgatttggatgatgtcct 14070291  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
    | |||| || |||||||||| |||||  | | || || ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||    
T  14070290 atgaagaattaatttcaaatccattctgaatttgaagaaacatttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagaaaaaaacagagtagtgg 14070191  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaat 250  Q
    ||  ||||| ||||| | |||||||||    
T  14070190 aggaagtggctgtacgcttcgtacaat 14070164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 63 - 240
Target Start/End: Original strand, 22386661 - 22386839
Alignment:
Q  63 agagtcgtt-tgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagg 161  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| || || ||| | |||||||| |||||||||  || |||| ||||   |   || |||    
T  22386661 agagtcgttgtgaaaccttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttaaaatccattaatatcttgaagg 22386760  T
Q  162 aacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22386761 aacattactgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 22386839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 79 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 7586429 - 7586270
Alignment:
Q  79 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcag 178  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| || || ||| | |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |   || |||||||||  |||||||||    
T  7586429 ttgatcaat-accaatgatctgttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcag 7586331  T
Q  179 agctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  7586330 agctgttat-cttgtcttgtagcgtagacacaaacagagtcgtggaggtagtggttgtacac 7586270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 12348920 - 12349085
Alignment:
Q  130 gatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatag 229  Q
    |||||||||||||  | |||||| | || || ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||  | |||| |||| |||||||||||||||    
T  12348920 gatcaatttcaaaagcgttcccaatgtgaagaaacattgttgcagacagagctgttttttttgtcttgtagtagggacaaaaacagagtagtggagatag 12349019  T
Q  230 tggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 295  Q
    ||||||||||| | ||||||  | ||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||||||    
T  12349020 tggttgtacactttgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttt 12349085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 240
Target Start/End: Original strand, 21128103 - 21128263
Alignment:
Q  79 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcag 178  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||| |||| |||   ||||||| |||||| |   || |||||||||  |||||||||    
T  21128103 ttgatcaatcaccaattatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaagaatcgcattcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcag 21128202  T
Q  179 agctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    || |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||    
T  21128203 agatgttat-cttgtcttgtagcgtagacacaaacagagtcgtggaagtagtggttgtacac 21128263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18826414 - 18826252
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| ||  |||||  |||||||||| ||||||||||||||||   || ||||||| |  |||||||    
T  18826414 ctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtaaagtcctttgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacaattctgcaggc 18826315  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18826314 agagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 18826252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18834761 - 18834648
Alignment:
Q  126 gaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggag 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||   || ||||||| |  |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  18834761 gaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggag 18834663  T
Q  226 atagtggttgtacac 240  Q
     ||||||||||||||    
T  18834662 gtagtggttgtacac 18834648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 117 - 239
Target Start/End: Original strand, 25675221 - 25675342
Alignment:
Q  117 ttgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactga 216  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |   || |||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  25675221 ttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacaga 25675319  T
Q  217 gtagtggagatagtggttgtaca 239  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  25675320 gtagtggaggtagtggttgtaca 25675342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 117 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 25735694 - 25735573
Alignment:
Q  117 ttgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactga 216  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |   || |||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  25735694 ttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacaga 25735596  T
Q  217 gtagtggagatagtggttgtaca 239  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  25735595 gtagtggaggtagtggttgtaca 25735573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 117 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 25686885 - 25686763
Alignment:
Q  117 ttgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactga 216  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |   || |||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  25686885 ttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacaga 25686787  T
Q  217 gtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||    
T  25686786 gtagtagaggtagtggttgtacac 25686763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 240
Target Start/End: Original strand, 4292795 - 4292908
Alignment:
Q  126 gaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggag 225  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||   || |||||||||  |||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  4292795 gaaggatcagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcctgtagcgtagacaaaaacagagtagtggag 4292893  T
Q  226 atagtggttgtacac 240  Q
     ||||||||||||||    
T  4292894 gtagtggttgtacac 4292908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 17745909 - 17745796
Alignment:
Q  126 gaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggag 225  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||   || |||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  17745909 gaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggag 17745811  T
Q  226 atagtggttgtacac 240  Q
     || |||||||||||    
T  17745810 gtaatggttgtacac 17745796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 119 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 17741836 - 17741716
Alignment:
Q  119 gtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagt 218  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| |   || |||||||||  ||||||||||| |||| |  ||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  17741836 gtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagatgttgta-ttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagt 17741738  T
Q  219 agtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  17741737 agtggaggtagtggttgtacac 17741716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 393 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 19065987 - 19065887
Alignment:
Q  393 catcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgt-gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcact 491  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||| |   |||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  19065987 catctcctgatgaactgcagcttctggtgatatacagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgtcttcaggagcact 19065888  T
Q  492 t 492  Q
    |    
T  19065887 t 19065887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 137 - 240
Target Start/End: Original strand, 5845164 - 5845266
Alignment:
Q  137 ttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgt 236  Q
    ||||||||||||||||   || | |||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  5845164 ttcaaattcattcccatcttgaatgaacattcctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 5845262  T
Q  237 acac 240  Q
    ||||    
T  5845263 acac 5845266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Original strand, 25518710 - 25518872
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||     || |||||||||  || ||||    
T  25518710 ctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgttgtgctatgaaggatcaacttcaaattcattcctgtcttgaaggaacatttctggaggc 25518809  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||| | ||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  25518810 agagctgttgt-cttgtcttgtaacgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 25518872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 120
Target Start/End: Original strand, 16876740 - 16876821
Alignment:
Q  40 tgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgt 120  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  16876740 tgaattgccagtacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgatcctttgcctaatatggttattgt 16876821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 142
Target Start/End: Original strand, 19625631 - 19625747
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaa-tcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| || || |||||||||||||    
T  19625631 gtgaaagagacgttgttgattgctaggacatcaaaa-aagagtcatttgaagctt-gatcaaatcaccaatgatctgttgcctgatttggttattgtcct 19625728  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaa 142  Q
    | ||||||  |||||||||    
T  19625729 atgaaggaagaatttcaaa 19625747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 442 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 19832912 - 19832826
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||| | || || |||||||| |||| ||||    
T  19832912 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagcgctttatcttcaggagcagttttcttcagacgctttaagc 19832826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 239
Target Start/End: Original strand, 25679297 - 25679418
Alignment:
Q  117 ttgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactga 216  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |   || |||||||||  |||||| ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  25679297 ttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggaagagctgatgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacaga 25679395  T
Q  217 gtagtggagatagtggttgtaca 239  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  25679396 gtagtggaggtagtggttgtaca 25679418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 240
Target Start/End: Original strand, 11235538 - 11235681
Alignment:
Q  96 atcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtct 195  Q
    |||||||| || || ||| |||||||||| |||  ||||| ||||||| |||||| |   || |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  11235538 atcttttgcctgatttggatattgtcctatgaaaaatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttat-cttgtct 11235636  T
Q  196 tgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||| ||||| ||   || |||||||| ||||||||||||||    
T  11235637 tgtagcgtagacaaaagtagaatagtggaggtagtggttgtacac 11235681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 393 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 17608283 - 17608183
Alignment:
Q  393 catcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgt-gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcact 491  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |   |||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  17608283 catcttctgatgaactatagcttctggtgatatacagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactttgtcttcaggagcact 17608184  T
Q  492 t 492  Q
    |    
T  17608183 t 17608183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 442 - 523
Target Start/End: Original strand, 20635962 - 20636045
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt--tgacttcagaatcacttctcttcagatgctt 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||  || ||||||||||||||||    
T  20635962 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactttgtcttcaggagcacttcataacttcagacgcagttctcttcagatgctt 20636045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 233 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 34451787 - 34451532
Alignment:
Q  233 ttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctgg 332  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||||||| || ||| |  | |||| |||||| || || | |  |  ||||||| |||| ||||||||    |    
T  34451787 ttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgcttttcaaagaataggcatacaatgctttcaaatcctctcaaattagtcgttgcttcactctttcag 34451688  T
Q  333 tcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgct 431  Q
    |||||||||||| |||| ||  | | ||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||  ||||||||||||||     ||    
T  34451687 tcttctgcaatgcttagacgatactgaatccattgaacagcctttgaatctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcaa---ct 34451591  T
Q  432 tctaatgatgt-gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcac-tttgttttcaggagc 488  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  34451590 tctaatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttttgtcttcaggagc 34451532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Original strand, 11205966 - 11206128
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| |||||| ||| |||  ||||| ||||||| |||||| |   || |||||||||  |||||||    
T  11205966 ctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggatattgtactatgaaaaatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggc 11206065  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||  ||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11206066 agagctgttat-cttgtgttgtagcatagacaaaagcagagtagtggaggtagtggttgtacac 11206128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18925879 - 18925776
Alignment:
Q  137 ttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgt 236  Q
    ||||||||||||||||   || |||||||||  ||||||||   ||||| ||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18925879 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcatgactgtttttcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 18925780  T
Q  237 acac 240  Q
    ||||    
T  18925779 acac 18925776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19289556 - 19289394
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||| | ||||||||||| || ||| | | |||||| |||||||| | |||||||||||||| |   || ||||||| |  |||||||    
T  19289556 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttggatgtagtcctatgaaggatcgacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 19289457  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||||  | | || |||||| ||||||||||||||    
T  19289456 agagctgtta-tcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacac 19289394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 150
Target Start/End: Original strand, 25930298 - 25930421
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaa-tcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    |||||||| | |||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||  | || |||||||| ||||    
T  25930298 gtgaaagatatgttgttgattgccaccacatcaaaa--agagtcgtttgaagctt-gatcaaatcaccaatgatctattgcttgatttggttattatcct 25930394  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcc 150  Q
    | |||||| |||||| |||||||||||    
T  25930395 atgaaggaacaattttaaattcattcc 25930421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Original strand, 29765555 - 29765717
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | | |||||  |||| ||||| ||||||||||||||||   || ||||||| |  |||||||    
T  29765555 ctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacaattctgcaggc 29765654  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||| | |||||||  ||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  29765655 agagctgttgt-cttgtctgatagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 29765717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 150
Target Start/End: Original strand, 7811828 - 7811959
Alignment:
Q  18 taaaggagtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtt--tgaagctttgatcaa-tcaccaatgatcttttgtctaatatggt 114  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||   ||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||  |||  | || ||||    
T  7811828 taaaggtgtgaaagagacgttgttgattgccaacacatcaaaa---gagtcgttgttgaagctt-gatcaaatcaccaatgatcggttgcttgatttggt 7811923  T
Q  115 tattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcc 150  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  7811924 tattgtcctaagagggaacaatttcaaattcattcc 7811959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 528
Target Start/End: Original strand, 12423460 - 12423546
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||  ||||||| | || || |||||||| |||| ||||    
T  12423460 tgcttctgatgacgtcatcacttcaagagcactttgtcttcaggagcgcttaaacttcaggagcagttttcttcagacgctttaagc 12423546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 528
Target Start/End: Original strand, 16336392 - 16336478
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||  |||||| | || || |||||||| |||| ||||    
T  16336392 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggaacgctttatcttcaggagcagttttcttcagacgctttaagc 16336478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 528
Target Start/End: Original strand, 17381668 - 17381754
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||| | || || |||||||| |||| ||||    
T  17381668 tgcttctgatgacgtcaccacttcaggagcactttgtcttcaggagcgctttatcttcaggagcagttttcttcagacgctttaagc 17381754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 353 - 489
Target Start/End: Original strand, 21235264 - 21235399
Alignment:
Q  353 gattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgt-gcttctgat 451  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||  |  |||| |||||||||| |||||||| ||||| ||  |||||| ||||  | |||||||||    
T  21235264 gattaaatccattgaacaacctttaaagctttatgttgc--atctcctgatgaactgcagcttctagtgattttcagcttctgatgaacttgcttctgat 21235361  T
Q  452 gacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagca 489  Q
    ||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21235362 gacgtcgctacttcaggagcactttgtcttcaggagca 21235399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 332 - 453
Target Start/End: Original strand, 25597608 - 25597730
Alignment:
Q  332 gtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgc 430  Q
    ||||||| ||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||| | |||||||||| || ||||||||||||||  ||    
T  25597608 gtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatgtcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagc 25597707  T
Q  431 ttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    || | ||||  ||||||||||||    
T  25597708 ttatgatgagatgcttctgatga 25597730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 9933805 - 9933685
Alignment:
Q  119 gtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagt 218  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| |||| |   || |||||||||  ||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||||| ||||  |||    
T  9933805 gtcctatgaaggatcaacttcaaattccttcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagttgttgt-cttgtcttgtagcatagacagaaacatagt 9933707  T
Q  219 agtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  9933706 agtggaggtagtggttgtacac 9933685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 443 - 492
Target Start/End: Original strand, 12349200 - 12349249
Alignment:
Q  443 gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12349200 gcttctgatgatgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagcactt 12349249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 18172359 - 18172236
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtt--tgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||| |||||||||||  |||| |||||||||||||  |||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||| |||  | || ||||||||||||    
T  18172359 gtgagagagacgttgttgattgtcagcacatcaaaa--agagtcgttgttgaagctt-gat-aatcaccaatgatctgttggttgatttggttattgtcc 18172264  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcc 150  Q
    || |||||| ||||||||||||| ||||    
T  18172263 tatgaaggaacaatttcaaattcgttcc 18172236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 240
Target Start/End: Original strand, 18555332 - 18555452
Alignment:
Q  119 gtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |   ||  |||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  | | ||    
T  18555332 gtcctacgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgagggaacaattctgcaggcagagctgttat-cttgtcttgtagcgaggacacactcagggt 18555430  T
Q  219 agtggagatagtggttgtacac 240  Q
     |||||| ||||||||||||||    
T  18555431 cgtggaggtagtggttgtacac 18555452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 240
Target Start/End: Original strand, 22308864 - 22308972
Alignment:
Q  131 atcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||   || ||||| |||  | |||| ||||||||| | |||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  22308864 atcaatttcaaattcattcccatcttgaaggaatatttctacaggtagagctgttgt-cttgtcttgtagtgtagacaaaaacagagtagtggagttagt 22308962  T
Q  231 ggttgtacac 240  Q
    ||||||||||    
T  22308963 ggttgtacac 22308972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 25723052 - 25722973
Alignment:
Q  159 aggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtaca 239  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  25723052 aggaacatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtagttgtaca 25722973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 240
Target Start/End: Original strand, 8653740 - 8653842
Alignment:
Q  137 ttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgt 236  Q
    |||||||||||||||  | || |||||||||  | |||||| |||| || | |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  8653740 ttcaaattcattcccgttttgaaggaacatttctacaggcatagcttttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 8653838  T
Q  237 acac 240  Q
    ||||    
T  8653839 acac 8653842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Original strand, 18498640 - 18498802
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||| | ||||||||||| || ||| | | ||||||  ||||||||| |||||||||||||  |   || ||||||| |  |||||||    
T  18498640 ctttgatcatccaccagtaatcttttgtctgatttgggtgtagtcctataaaggatcaacttcaaattcattcttatcttgaaggaacaattctgcaggc 18498739  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | | || |||||| ||||||||||||||    
T  18498740 agagctgttatt-ttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacac 18498802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 445 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 20487809 - 20487726
Alignment:
Q  445 ttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||  |||||| | || || |||||||| |||| ||||    
T  20487809 ttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaagagcaccttatcttcaggagcagttttcttcagacgctttaagc 20487726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 10704863 - 10704743
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||  | || |||||||||||||     
T  10704863 gtgaaagagatgttgttgattgccagcacatcaaaag--gagtcgtt-gaagctt-gatca-tcaccaatgatctgttgcttgatttggttattgtcctt 10704769  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcc 150  Q
     || ||| ||||||||||||||||||    
T  10704768 ggagggaacaatttcaaattcattcc 10704743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Original strand, 19483008 - 19483058
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  19483008 tgcttctaatgacgtcatcacttcagaagcactttgtcttcaggagcactt 19483058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 7751301 - 7751249
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  7751301 tcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 7751249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16123603 - 16123551
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16123603 tcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 16123551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Original strand, 31572544 - 31572596
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  31572544 tcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 31572596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 12953306 - 12953144
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |   || ||||||| |  | |||||    
T  12953306 ctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctacaggc 12953207  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||  | | || |||||| ||||||||||||||    
T  12953206 agagctgtta-tcttgtattgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacac 12953144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 240
Target Start/End: Original strand, 13913129 - 13913231
Alignment:
Q  137 ttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgt 236  Q
    ||||||||||||||||   || |||||||||  ||||||||||| |||| | ||||||||||||||  ||||  |||  |||||||||| ||||||||||    
T  13913129 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcagagttgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacaaagtagtggaggtagtggttgt 13913227  T
Q  237 acac 240  Q
    ||||    
T  13913228 acac 13913231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 156
Target Start/End: Original strand, 23296582 - 23296676
Alignment:
Q  62 aagagtcgtttgaagctttgatcaa-tcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtat 156  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||  | || |||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||| |||||    
T  23296582 aagagtcgtttgaaactt-gatcaaatcaccaatgatctgttgcttgatttggttattgtcctaagaagaaacaatttcaaatccattccaagtat 23296676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 489
Target Start/End: Original strand, 26589862 - 26589909
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagca 489  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  26589862 tgcttctgatgacgtcattacttcagaagcactttgtcttcaggagca 26589909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 33351839 - 33351792
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagca 489  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  33351839 tgcttctgatgacatcatcacttcaagagcactttgtcttcaggagca 33351792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 139278 - 139232
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagc 488  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  139278 tgcttctgatgatgtcatcatttcaggagcactttgtcttcaggagc 139232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 147299 - 147253
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagc 488  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  147299 tgcttctgatgatgtcatcatttcaggagcactttgtcttcaggagc 147253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Original strand, 6158320 - 6158389
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  6158320 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 6158389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Original strand, 12827806 - 12827875
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  12827806 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 12827875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 476
Target Start/End: Original strand, 13435787 - 13435821
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 476  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13435787 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 13435821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Original strand, 22387041 - 22387091
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||    
T  22387041 tgcttctgatgacgtcatcacttcaaaggcactttgtcttcaggagcactt 22387091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 476
Target Start/End: Original strand, 26943817 - 26943851
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 476  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26943817 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 26943851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 27166570 - 27166457
Alignment:
Q  126 gaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggag 225  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |   || ||||||| |  |||||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||  ||| | |||||||||    
T  27166570 gaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagccgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagtgtagtggag 27166472  T
Q  226 atagtggttgtacac 240  Q
     ||||||||||||||    
T  27166471 gtagtggttgtacac 27166457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 10640330 - 10640297
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10640330 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 10640297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 13602427 - 13602460
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13602427 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 13602460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 523
Target Start/End: Original strand, 25986488 - 25986569
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgctt 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||||||||||| |  |||||||  || || |||||||||||||    
T  25986488 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttcagcttcaggagcactctagcttcagacgcagttttcttcagatgctt 25986569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 119 - 240
Target Start/End: Original strand, 31931485 - 31931605
Alignment:
Q  119 gtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagt 218  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| |   || ||||||| |  ||||||||||| |||||  ||||||||||||||  ||||||  | | ||    
T  31931485 gtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctaacttgaaggaacaattctgcaggcagagttgtta-acttgtcttgtagcgaggacacactcagggt 31931583  T
Q  219 agtggagatagtggttgtacac 240  Q
     |||||| ||||||||||||||    
T  31931584 cgtggaggtagtggttgtacac 31931605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 12716621 - 12716541
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgct 522  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||| |||  |||||| | || || ||||||||||||    
T  12716621 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcagtttagcttcaggagcagtttagcttcaggagcagttttcttcagatgct 12716541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 12727270 - 12727190
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgct 522  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||| |||  |||||| | || || ||||||||||||    
T  12727270 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcagtttagcttcaggagcagtttagcttcaggagcagttttcttcagatgct 12727190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 480 - 528
Target Start/End: Original strand, 13435808 - 13435856
Alignment:
Q  480 ttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    |||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  13435808 ttcaggagcacttttactttaggagcacttctcttcagatgcttcaagc 13435856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 493
Target Start/End: Original strand, 19470922 - 19470972
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcacttt 493  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||    
T  19470922 tgcttctgatgacgtcatcactttaggagcac-ttgacttcaggagcacttt 19470972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 477
Target Start/End: Original strand, 26044585 - 26044620
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttg 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26044585 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 26044620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 30451809 - 30451738
Alignment:
Q  79 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcc 150  Q
    ||||||||||||||||||||| ||   | || || ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  30451809 ttgatcaatcaccaatgatctgtttcttgatttgattattgtcctatgaaggaacaatttcaaatccattcc 30451738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 524
Target Start/End: Original strand, 5845490 - 5845572
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttc 524  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||   ||||| ||||||||  |||||||  || || ||||||||||||||    
T  5845490 tgcttctgatgacgtcattacttcagaatcactttagcttcagaagcactttagcttcagacgcagttttcttcagatgcttc 5845572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 11147332 - 11147263
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11147332 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacac 11147263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Original strand, 17042735 - 17042804
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||  |||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  17042735 tgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacaaagtagtggaggtagtggttgtacac 17042804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 18925550 - 18925468
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttc 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||| ||||||||  |||||||  || || ||||||||||||||    
T  18925550 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcacttcagcttcagaagcactttagcttcagacgcagttttcttcagatgcttc 18925468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Original strand, 19875714 - 19875772
Alignment:
Q  85 aatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaat 143  Q
    |||||||||||||||||||  | || |||||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  19875714 aatcaccaatgatcttttgcttgatttggttattgtcctatgaatgaacaatttcaaat 19875772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20029986 - 20029918
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20029986 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 20029918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20062737 - 20062669
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20062737 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 20062669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Original strand, 21128466 - 21128516
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||| | |||||||||||||    
T  21128466 tgcttctgatgacgtcatcacttcagagacactttatcttcaggagcactt 21128516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Original strand, 25787815 - 25787883
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  25787815 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 25787883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 523
Target Start/End: Original strand, 25788091 - 25788173
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttga-cttcagaatcacttctcttcagatgctt 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    ||||| |||||||| | |||||||  || || |||||||||||||    
T  25788091 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttcagcttcagaagcactttaagcttcagacgcagttttcttcagatgctt 25788173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 476
Target Start/End: Original strand, 25800741 - 25800775
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 476  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25800741 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 25800775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Original strand, 25986195 - 25986264
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  25986195 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacac 25986264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 190 - 240
Target Start/End: Original strand, 27384565 - 27384615
Alignment:
Q  190 ttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27384565 ttgtcttgtagcgaagacaaaaacagagtaatggaggtagtggttgtacac 27384615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 190 - 240
Target Start/End: Original strand, 27474978 - 27475028
Alignment:
Q  190 ttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27474978 ttgtcttgtagcgaagacaaaaacagagtaatggaggtagtggttgtacac 27475028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 190 - 240
Target Start/End: Original strand, 27504477 - 27504527
Alignment:
Q  190 ttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27504477 ttgtcttgtagcgaagacaaaaacagagtaatggaggtagtggttgtacac 27504527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 28251647 - 28251579
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28251647 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 28251579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 28356794 - 28356726
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28356794 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 28356726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 9112300 - 9112267
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9112300 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 9112267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 9112561 - 9112508
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaa-ctgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  9112561 tcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 9112508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 9122937 - 9122904
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9122937 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 9122904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 9123198 - 9123145
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaa-ctgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  9123198 tcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 9123145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 12855412 - 12855445
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12855412 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 12855445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 12865938 - 12865971
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12865938 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 12865971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 14051267 - 14051211
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaa 503  Q
    ||||||||||||||||||||     || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  14051267 tgcttctgatgacgtcatca-----ggtgcactttgttttcaggagcgcttttacttcagaa 14051211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 14069948 - 14069892
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaa 503  Q
    ||||||||||||||||||||     || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  14069948 tgcttctgatgacgtcatca-----ggtgcactttgttttcaggagcacttttacttaagaa 14069892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 443 - 476
Target Start/End: Original strand, 15987467 - 15987500
Alignment:
Q  443 gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 476  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15987467 gcttctgatgacgtcatcacgtcaggagcacttt 15987500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 18726645 - 18726678
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18726645 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcactt 18726678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 480 - 528
Target Start/End: Original strand, 21625373 - 21625422
Alignment:
Q  480 ttcaggagcacttt-gacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    |||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  21625373 ttcaggagcacttttgtcttcagaagcgcttctcttcagatgcttcaagc 21625422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 23006316 - 23006251
Alignment:
Q  85 aatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcc 150  Q
    ||||||||||||||| |||  | || |||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||    
T  23006316 aatcaccaatgatctgttgcttgatttggttattgtcctatgagggaacaatttcaaatccattcc 23006251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 151
Target Start/End: Original strand, 23231069 - 23231134
Alignment:
Q  86 atcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattccc 151  Q
    ||||||||||||||||||  | || ||||||||| |||| || ||| || ||||||||||||||||    
T  23231069 atcaccaatgatcttttgcatgatttggttattgacctatgagggaacactttcaaattcattccc 23231134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 150
Target Start/End: Original strand, 23782050 - 23782115
Alignment:
Q  85 aatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcc 150  Q
    ||||||||||||||| |||  | || |||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||    
T  23782050 aatcaccaatgatctgttgcttgatttggttattgtcctatgagggaacaatttcaaatccattcc 23782115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 25597734 - 25597767
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25597734 tgcttcagatgacgtcatcacttcaggagcactt 25597767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 396 - 476
Target Start/End: Original strand, 31572770 - 31572853
Alignment:
Q  396 cttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatga---tgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 476  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||| ||| ||||||| ||||   | | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  31572770 cttctgatgaaattctgcttctgatgaacttctgcttctgatgaacttctacttctgatgacgtcattacttcagaagcacttt 31572853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 32961734 - 32961701
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32961734 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcactt 32961701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #153
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 32972353 - 32972320
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32972353 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcactt 32972320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #154
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 33199718 - 33199751
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33199718 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 33199751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 442 - 522
Target Start/End: Original strand, 4631260 - 4631340
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgct 522  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||| ||   |||||| | || || ||||||||||||    
T  4631260 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcagtttagcttcaggagcagttgagcttcaggagcagttttcttcagatgct 4631340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 7375823 - 7375772
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  7375823 tcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 7375772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 442 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 7751040 - 7751008
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7751040 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 7751008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 442 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 14100366 - 14100334
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14100366 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 14100334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 17445926 - 17445862
Alignment:
Q  85 aatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattc 149  Q
    ||||||||||||||| |||  | || ||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||    
T  17445926 aatcaccaatgatctgttgcttgatttggttattgtcctagtagggaacaatttcaaattcattc 17445862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #160
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 443 - 475
Target Start/End: Original strand, 18378526 - 18378558
Alignment:
Q  443 gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18378526 gcttctgatgacatcatcacttcaggagcactt 18378558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 19951897 - 19951850
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttg 73  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  19951897 gtgaaagagatgttgtgaatttccagcacatcaaagt-agagtcgtttg 19951850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 442 - 474
Target Start/End: Original strand, 27384824 - 27384856
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27384824 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 27384856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 442 - 474
Target Start/End: Original strand, 27475237 - 27475269
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27475237 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 27475269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 442 - 474
Target Start/End: Original strand, 27504736 - 27504768
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27504736 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 27504768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 442 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 28251369 - 28251337
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28251369 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 28251337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 158)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 25 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 26702387 - 26701919
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  26702387 gtgaaaaagacgttgtgaatttccagcacatcaaaatat-agtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgccggatatggttattgtccta 26702289  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     ||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  26702288 tgaatgatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacattgttgcaggcatagctgttattcttgtcttgtagcagagacacatactaagtagtgga 26702189  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  26702188 ggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcatcactcttcaaaaagcaagaatccaatgccttcaacttcatttgaattaattgttgcttcac 26702089  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    |||||||||||||||||||| | |  || |||| |||||||   ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26702088 tctcctggtcttctgcaatgctcaaacgagattgaatccatataacagcctttgaagctttaagtctcccatcttctgatgaactttagcttctggtgat 26701989  T
Q  424 cttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcacttt 493  Q
    |||  | |||| ||| |  |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||    
T  26701988 cttcagtttctgatgaacttgcttctgatgatgtcatcacttcatgagcac-ttgacttcaggagcacttt 26701919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 25 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 33256609 - 33256183
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  33256609 gtgaaagagacgttgtgaattgtcagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatgattattttccta 33256511  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33256510 tgaaggatcaatttcaaatccaattccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtgga 33256411  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||| || | | ||| || |||| |||| |||||    
T  33256410 gatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcccttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttttaaaatagtcgttgcttcac 33256311  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    ||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  33256310 tcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgttgaactttagcttctggtgat 33256211  T
Q  424 cttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    |  |||||||| ||||  ||||||||||||    
T  33256210 c--ttgcttctgatgagatgcttctgatga 33256183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 25 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 33276781 - 33276355
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  33276781 gtgaaagagacgttgtgaattgtcagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatgattattttccta 33276683  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33276682 tgaaggatcaatttcaaatccaattccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtgga 33276583  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||| || | | ||| || |||| |||| |||||    
T  33276582 gatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcccttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttttaaaatagtcgttgcttcac 33276483  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    ||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  33276482 tcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctggtgaactttagcttctggtgat 33276383  T
Q  424 cttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    |  |||||||| ||||  ||||||||||||    
T  33276382 c--ttgcttctgatgagatgcttctgatga 33276355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 25 - 475
Target Start/End: Original strand, 21028616 - 21029066
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  21028616 gtgaaagagacattgtgaatttccaacacatcaaaata-gattcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtccta 21028714  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     ||||||| |||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21028715 tgaaggattaatttcaaatccattcaaagtatgaaggaacattgttgcaggcatagttgt-attcttgtcctgtagcagagacacaaactgagtagtgga 21028813  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  21028814 gatagtggctgtacacttcatacaattgtactttgtcagcgctcttcaaaaagcaagcatccaatgccttcaacttcatttgaattagtcgttgcttcac 21028913  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    |||  ||||||||||||||| || |  | |||||||| ||||| ||||| | |||||||| ||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||    
T  21028914 tcttatggtcttctgcaatgcttggatgagattaaattcattgaacaacatatgaagctttaagtctctcatattctaatgatattcagcttctggtgat 21029013  T
Q  424 cttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||  |||||| ||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21029014 cttcagcttctgatgaacttgcttttgatgacgtcatcacttcaggagcactt 21029066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 39 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 28492648 - 28492211
Alignment:
Q  39 gtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaattt 138  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||| |||||| ||    
T  28492648 gtgaattgtcagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatattttgcctgatatggttattatcctatgaatgatcaaatt 28492550  T
Q  139 caaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtac 238  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28492549 caaattcattcccagtatgtaagaacattgttgcaggcagagctattattcttgtctagtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtac 28492450  T
Q  239 acatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttct 338  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||| || | | ||  || ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  28492449 acttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctagtcttct 28492350  T
Q  339 gcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaat 437  Q
    |||||| |||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||| || ||||||  ||||||  |||||| ||    
T  28492349 gcaatgcttagacgatattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctgaagatcttcagcttctgat 28492250  T
Q  438 g-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    | |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28492249 gaacttgcttctgatgacgtcatcacttgaggagcactt 28492211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 43 - 475
Target Start/End: Original strand, 1577707 - 1578137
Alignment:
Q  43 attgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaa 142  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  1577707 attgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctctgaagaatcaatttcaaa 1577805  T
Q  143 ttcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacat 242  Q
    | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1577806 tccattccatgtatgtaggaacattgttgcaggcagagctggtatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 1577905  T
Q  243 cgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaa 342  Q
     ||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || || ||| ||  || |||| |||| |||||||| |  |||||||||||    
T  1577906 agtacaattatactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatccaatgctttcaaattctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaa 1578005  T
Q  343 tg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatg 441  Q
    || |||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||  ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||||| | ||      
T  1578006 tgcttagacgagattaaatctattgaacaacctttgaagctctaagtcttgcatctcctgataaactttagcttcttgtgatc--ttgcttctgacgaga 1578103  T
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1578104 tgtttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 1578137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 25 - 528
Target Start/End: Original strand, 22153679 - 22154197
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  22153679 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttaatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtccta 22153777  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     ||| |||||||||||||| |||||| | | ||  |||||||| ||||| | |||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  22153778 tgaatgatcaatttcaaatccattcctattgtgatggaacatttttgcatgtagagttgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgga 22153877  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||| || || | | ||  |||||||||||| |||||    
T  22153878 ggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaatcatccaatgctttcaaatcctttcaaattagttgttgcttcac 22153977  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    | | || ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22153978 tattctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgat 22154077  T
Q  424 cttttgcttctaat--gatg-------------tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcact 508  Q
    ||| | ||||| ||  ||||             ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||   |||||||||||| ||||||||| | ||||    
T  22154078 cttctacttcttatgagatgcttctaaggaacttgcttctaatgacgtcatcactttaggaacacttttacttcaggagcactgtgacttcaggagcact 22154177  T
Q  509 tctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  22154178 tctcttcagacgcttcaagc 22154197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 25 - 426
Target Start/End: Original strand, 12284245 - 12284646
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  12284245 gtgaaagagacgttgtgaattgccaacacatcaaaata-gagtcgtttcgagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctaatatggttattgtcata 12284343  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  12284344 tgaagaatcaatttcaaatcctttcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagatatattattcttgtcttgtagcagagacacaaactgattagtgga 12284443  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || | | ||  || |||| |||| |||||    
T  12284444 gatagtgtttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcac 12284543  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    ||  |||||||| ||||||| || | || |||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12284544 tcctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctctaagtcttgcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 12284643  T
Q  424 ctt 426  Q
    |||    
T  12284644 ctt 12284646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 28 - 453
Target Start/End: Original strand, 48704028 - 48704452
Alignment:
Q  28 aaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacga 127  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  48704028 aaagagacgttgtgaattgtcagcaaatcaaaaatagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctgatatggttattgtcctatga 48704127  T
Q  128 aggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagat 227  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||     
T  48704128 aggatcaaattcaaatccattcacagtatgtaggaacattgttgcaggcagaattgttatcattgtcttgtagcagagacataaattgagtagtggagac 48704227  T
Q  228 agtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactct 327  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||| | |||||||||| |||||| || | | ||  || ||||||||| ||||||||    
T  48704228 attggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgttcttcaaagaacaagcatccagtgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgtttcactct 48704327  T
Q  328 cctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatctt 426  Q
     |  |||||||||| || |||  || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||      
T  48704328 tccagtcttctgcattgcttaaacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatcttctgatgaactttagcttctggtgatc-- 48704425  T
Q  427 ttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    | |||||| ||||  ||||||||||||    
T  48704426 tagcttctgatgagatgcttctgatga 48704452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 27 - 518
Target Start/End: Original strand, 1900169 - 1900646
Alignment:
Q  27 gaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacg 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |    
T  1900169 gaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatg 1900267  T
Q  127 aaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggaga 226  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| | || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||     
T  1900268 aaggatcaatttcaaatccatccccattgtgaaggaatattgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagg 1900367  T
Q  227 tagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactc 326  Q
    |||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||  || | ||||||| |||||||||||| | | ||  || |||| |||| |||||||    
T  1900368 tagtggttgtacacttcttacaactgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcattcaatgcctttaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 1900467  T
Q  327 tcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatct 425  Q
    | |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||  | ||||||| |||||    
T  1900468 ttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaataacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagatcttctggcgatct 1900567  T
Q  426 tttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcaga 518  Q
    ||               ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||    
T  1900568 tt--------------agcttctgatgatgtcattacttcaggaacactttgtcttcaggagcactttgtcttcaggagcagttctcttcaga 1900646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 25 - 474
Target Start/End: Original strand, 10757245 - 10757692
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10757245 gtgaaagagacgctgtgaattgtcagcacatcaaaata-gattcgtttga-gcttggc-caatcaccaatgatcttttgtctgatatggttattgtccta 10757341  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  10757342 tgaaggatcaatttcaaattcattccaagtatgaaggaacaatgctgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtgaa 10757441  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||| | ||| |||||||||| || || | | ||  || ||||||||| |||||    
T  10757442 gatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaatcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcac 10757541  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtga 422  Q
    ||| ||| | |||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||| || |||    
T  10757542 tcttctgattttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttttgatga 10757641  T
Q  423 tcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact 474  Q
    ||  |||||||| ||| |  |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  10757642 tc--ttgcttctgatgaacttgctcctgatgacgtcatcactttaggagcact 10757692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 25 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 22201994 - 22201601
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  22201994 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcttgatatggttattgtccta 22201896  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22201895 tgaaggatcaatttcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaagcagagttgctatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtgga 22201796  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||| || | | ||  || ||||||||| || ||    
T  22201795 gatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcatagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgctttac 22201696  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctg 418  Q
    | |    ||||||||||||| |||| || |||||||| |||||  || ||||||  |||| ||||||  ||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  22201695 tttttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatgcattgagcagcctttgtcgctttaagtcttgcatctcctgatgagctttagcttctg 22201601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 28 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 20954729 - 20954211
Alignment:
Q  28 aaagagacgttgtga-attgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacg 126  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |    
T  20954729 aaagagacgttgtcatattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctctg 20954631  T
Q  127 aaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggaga 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  20954630 aaggatcaatttcaaatccattccatgtatgtaggaacattgttgcaggcggggttgttatccttgtcttgtagcagagaaacaaactgagtagtggaga 20954531  T
Q  227 tagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactc 326  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |  |||| |||||||| || || | | ||  || | |   ||| |||||||    
T  20954530 tagtggttgtacacttggtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcctccaatgctttcaaatcctttcaaaatggccattgcttcactc 20954431  T
Q  327 tcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatct 425  Q
    | |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  20954430 ttcctgtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatct 20954331  T
Q  426 tttgcttctaatgatgtgct---------------tctgatgacgtcatcacttcaggagcac-tttgttttcaggagcactt-tgacttcagaatcact 508  Q
    |  |||||| ||||  ||||               |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||  ||||| | ||||    
T  20954330 tcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgaatctgatgacgtcatcacttcaggagcacttttgtcttcaggagcacttctgttttcaggagcact 20954231  T
Q  509 tctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  20954230 tctcttcagatgcttcaagc 20954211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 25 - 528
Target Start/End: Original strand, 38282389 - 38282906
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  38282389 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgaccttttgcctgatatggttattgtccta 38282487  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  38282488 tgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacattgttgcaagcagagctatttttcttatcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgga 38282587  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||||||| |||||||||||| | | ||  || ||   |||| |||||    
T  38282588 gatagtggttgta-acttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcattcaatgcctttaaatcctttcaaaatacccgttgcttcac 38282686  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    ||| |  ||||||||| ||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||  ||||| |||||||    
T  38282687 tcttccagtcttctgcgatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttttggtgat 38282786  T
Q  424 cttttgcttctaat--gatg-------------tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcact 508  Q
    |||| || ||| ||  ||||             |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||| | || |    
T  38282787 ctttagcatctgatgagatgcttctgataaacttgcttctgatgaggtcattacttcaggagcactttgtcttcaggaacattttgtcttcaggagcagt 38282886  T
Q  509 tctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  38282887 tctcttcagacgctttaagc 38282906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 25 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 22600440 - 22600014
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||    
T  22600440 gtgaaagagacgttgtgaattgctagcatatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcacccattatcttttgcctgatatggttattgtccta 22600342  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     ||| |||||||||||||| |||||||| | || ||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  22600341 tgaatgatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcattgcaggcagagttgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgga 22600242  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| || | | ||  || |||| |||| || ||    
T  22600241 gatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgttttac 22600142  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    ||| |  ||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  22600141 tcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgat 22600042  T
Q  424 cttttgcttctaatgatgtgcttctgat 451  Q
    |||| |||||| ||||  ||||||||||    
T  22600041 ctttagcttctgatgagatgcttctgat 22600014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 25 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 21192123 - 21191766
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21192123 gtgaaagagatgttgtgaattgccagcgcatgaaaa-aagagtcgattgaagctttgatcaatcaccaataatcttttgcctaatatggttattgtccta 21192025  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||   |||||| ||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  21192024 tgaaggatcaatttcaaatccatttccaatatgaaggaaccccgttgcaagcatagctgttattcttgtcctgtagaagagacacaaacagagtagtgga 21191925  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | | |||||||||| ||||| |||||    
T  21191924 ggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgccaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttttgaattagctgttgcttcac 21191825  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagctt 383  Q
    ||| |||||||||||||||||| || |||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  21191824 tcttctggtcttctgcaatgttgggtgtgattaaatactttgaacaacctttgaagctt 21191766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 28 - 453
Target Start/End: Original strand, 19717348 - 19717772
Alignment:
Q  28 aaagagacgttgtga-attgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacg 126  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  |    
T  19717348 aaagagacgttgtcacattgccagcacatcaaaatat-agtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatctttttcctgatatggttattgtcctctg 19717446  T
Q  127 aaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggaga 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||     
T  19717447 aaggatcaatttcaaatccattccatgtatgtaggaacattgttgcagtcatagcttttattcttgtcttttagcagagacacaaactgatttgtggagt 19717546  T
Q  227 tagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactc 326  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||| || | | ||  || |||| |||| |||||||    
T  19717547 tagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccgatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 19717646  T
Q  327 tcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatct 425  Q
    | |  ||| ||||||||| || | || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| |  |||||||| ||||||||||||||     
T  19717647 ttccagtcctctgcaatgcttcgacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctccatatgaactttagcttctggtgatc- 19717745  T
Q  426 tttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
     |||||||| ||||  ||||||||||||    
T  19717746 -ttgcttctgatgagatgcttctgatga 19717772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 28 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 32786193 - 32785731
Alignment:
Q  28 aaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacg 126  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |    
T  32786193 aaagagacgttgtgaattgtcagcgcattcaaaata-gagccgtttgaagctttgatcaatcatcaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatg 32786095  T
Q  127 aaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggaga 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  32786094 aaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatctttgcaagcagagctgtttttcttgtcttttagcggagacaaaaacatagtagtggaga 32785995  T
Q  227 tagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactc 326  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| || | | ||  || |||| |||| ||||||     
T  32785994 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttttaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttcactt 32785895  T
Q  327 tcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatct 425  Q
    | |  ||||||||||||| |||| || ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||  |||||  ||||||||| || ||||| ||||| |    
T  32785894 ttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcca-tgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcatgatgaactacaacttctagtgattt 32785796  T
Q  426 tttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagca 489  Q
    |  |||||||||| |  ||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  32785795 tcagcttctaatgaacttgcttctaatgacgttaccacttcaggggcactttgccttcaggagca 32785731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 25 - 501
Target Start/End: Original strand, 2834511 - 2834986
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  2834511 gtgaaagagacgttgtgaattagtagcacatcaaaa-aagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtccta 2834609  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacaca-aactgagtagtgg 223  Q
     ||| |||||||||||||| |||||||| | || || ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||    
T  2834610 tgaatgatcaatttcaaatgcattcccattgtgaagtaacatcgttgcagacagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaagaacagagtagtgg 2834709  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattca 323  Q
    ||  ||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||||| || | | ||  ||||||  |||| ||||    
T  2834710 aggcagtggttgtacaattcgtacaatcgtactttgtcaacgttctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaattagccgttgcttca 2834809  T
Q  324 ctctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtga 422  Q
    || |    ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||||| ||||| || ||||||| |||  |  ||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  2834810 ctttttcagtcttcaacaatgcttagacgagattgaatccattgaacaactttggaagctttaag--ttgcatctcccgatgaactgcagcttctggtga 2834907  T
Q  423 tcttttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcag 501  Q
    | ||  |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  2834908 ttttcagcttctaatgacttgcttctgatgacgtcaccacttcaggagcactttgtcttcaggagcgctttgtcttcag 2834986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 25 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 17025220 - 17024774
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||  || || ||||||||||| ||    
T  17025220 gtgaaagagacgttatgaattgccaggacatcaaaa--agagtcgtttgaatctttgatcaatcacatttgatctttttcctgatttggttattgtcata 17025123  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||| || |||||||| |||| |||||||||| |||| |||| |||||| ||||  || ||||||    
T  17025122 tgaaggatcaatttcaaatccattccaagtctgaaggaatatcgttgcaggaagagttgttattcttttcttatagcagagaca-aaacaaagaagtgga 17025024  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||   ||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | | ||||||||||| |||| |||||    
T  17025023 ggtagtggttgtacacttcgtacaattgtcatttttcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttttgaattagtcgttgcttcac 17024924  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatc 424  Q
    |||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||  | ||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||      
T  17024923 tcttatggtcttttgcaatgttatgcgtgattaaatcctttgaacagacattgaagctttaattctctcagcttctgatgatcttcagcttctggtga-- 17024826  T
Q  425 ttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    | |||||||| ||| |  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  17024825 tgttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgttatcacttcagaagcactt 17024774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 25 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 16235554 - 16235087
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  16235554 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaata-gtgtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgattttttgcctgatatggttattgtccta 16235456  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| |||| | | |  |  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||    
T  16235455 tgaaggatcaatttcaaatccatttcaattgagagggaacatcgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaaaggagtagtgga 16235356  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||   | | ||||||| ||||||||| || | | ||  || |||| |||| |||||    
T  16235355 ggtagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactctttggagaacaagcattcaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcac 16235256  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    | | |  |||||||||| || |||| || ||||||||| |||| ||||||||||||| || || |||  |||||| ||||||    || |||||||||||    
T  16235255 ttttccagtcttctgcattgtttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagttttaaatcttgcatcttatgatga--gacaacttctggtgat 16235158  T
Q  424 cttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt-tgttttcaggagcactt 492  Q
    |||  |||||| ||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  16235157 cttcagcttctgatgaacttacttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttgtgtcttcaggagcactt 16235087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 25 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 22465067 - 22464716
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  22465067 gtgaaagagacgttgtgaattgtcagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtccta 22464969  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||    
T  22464968 tgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatctttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaatagagtagtgga 22464869  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcattt-gaattagttgttgattca 323  Q
    | |||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| ||  ||||||  ||||||| |||| ||||    
T  22464868 ggtagtggatgtacacttcgtacacttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaa-atcatttcaaattagtcgttgcttca 22464770  T
Q  324 ctctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaaccttt 376  Q
    || | |  ||||||||||||| ||||  | |||||||||| ||| |||||||||    
T  22464769 cttttccagtcttctgcaatgcttagatgagattaaatccgttgaacaaccttt 22464716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 25 - 492
Target Start/End: Original strand, 30892915 - 30893366
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  30892915 gtgaaagagacgttgtgaatttctagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatctttcgcctgatatggttattgtccta 30893013  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  30893014 tgaaggatcaatttcaaaaccattcc-agtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagtagagacacaaacttagtagtgga 30893112  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||| || ||| | |||||||| | ||| || || | | ||  || |||   ||| |||||    
T  30893113 gatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcagcgctattcaaagaacaagcatctagtgctttcaaatcctttcaaaatagcctttgcttcac 30893212  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtga 422  Q
    ||  ||| |||| ||||||| || | || |||| |||||| || |||||| |||||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  30893213 tcctctgatcttttgcaatgcttggacgagattgaatccaatgaacaaccttttgaaactttaagtcttgcatctcctgatgaactttagcttttggtga 30893312  T
Q  423 tcttttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    |||                ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  30893313 tct----------------tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagtactttgacttcaggagcactt 30893366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 25 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 22427616 - 22427219
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  22427616 gtgaaagagacgttgtgaattgtcagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcttgatatggttattgtcct 22427518  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||| | || |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||    
T  22427517 atgaaggatcaatttcaaatgcatttccattgtgaaggaacatcgttgcaggcaaagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacaaagtagtgg 22427418  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattca 323  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||  || | ||||||||||||||||| || | | ||  || |||| |||| ||||    
T  22427417 aggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcttttttaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttgcttca 22427318  T
Q  324 ctctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtga 422  Q
    || | |  ||||||||||||| |||| || ||||||||| |||| |||  ||||||||||| |  | |  ||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  22427317 cttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatctattgaacagtctttgaagcttta--tgttgcatctcctgatgaactggagcttctggtga 22427220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 29 - 488
Target Start/End: Original strand, 36134015 - 36134474
Alignment:
Q  29 aagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacga 127  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||| ||    
T  36134015 aagagacgttgtgaattgtcagcacatcaaaata-gtgtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaattatctttttcctgatatggttattgtcctatga 36134113  T
Q  128 aggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagat 227  Q
    | ||||||||| |||| ||||||   |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |    
T  36134114 atgatcaattttaaatccattccacttatgaaggaacatcgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggt 36134213  T
Q  228 agtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactct 327  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||| ||| || | | ||  || ||||||||| | |||| |    
T  36134214 agtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatg-cttcaaatcctttcaaaatagttgttgctccacttt 36134312  T
Q  328 cctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatctt 426  Q
     |  |||||||||| || ||||  | |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||   ||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  36134313 tccagtcttctgcattgtttagatgagattaaatccattgaacaacctttgaaactttaagtcttgtatcttctgatga--gacagcttctggtgatctt 36134410  T
Q  427 ttgcttctaat-gatgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcac-tttgttttcaggagc 488  Q
      ||||||  | ||  ||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  36134411 cagcttctggtggagatgcttctgatgacatcattgcttcaggagcacttttgtcttcaggagc 36134474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 25 - 383
Target Start/End: Original strand, 2266911 - 2267269
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  2266911 gtgaaaaagacgttgtgaatttccagcaaatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtccta 2267009  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     ||| |||||||||||||| |||| ||| | || ||||||||  |||||| || ||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||  |||||||||    
T  2267010 tgaatgatcaatttcaaatgcatttccattgtgaaggaacatctttgcagacaaagctgtttttcttgtcttgtagtagagacaaaaacatagtagtgga 2267109  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | |||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||  || | ||| ||||||||||||| || ||| ||  || ||||||||| |||||    
T  2267110 ggtagtggttgtacacttcatacaattgcactttgacaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaattctttcaaactagttgttgcttcac 2267209  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagctt 383  Q
    | | |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2267210 ttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctt 2267269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 25 - 453
Target Start/End: Original strand, 2268353 - 2268777
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||     
T  2268353 gtgaaagagacgttgtgaattgccaacacatcaaaatat-agttgtttgaagctttgatcaatcatcaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctc 2268451  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| | |  |  ||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||    
T  2268452 caaaggatcaatttcaaatccattccaattgagagggaacatcgttgcaggtaaagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtcga 2268551  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |  | ||||||| ||||||||| ||  |||||| ||  | | |||| || ||    
T  2268552 ggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgacgaacaagcattcaatgccttcaa-atcatttcaa--aatagttgcttaac 2268648  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    ||| |  ||||||| ||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||  ||||| || |||||||| ||||||| |||||    
T  2268649 tcttccagtcttctacaatgattagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagccttaagtcttgcatctcctaatgaactttagcttctagtgat 2268748  T
Q  424 cttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
     | |||||||| ||||  ||||||||||||    
T  2268749 -tgttgcttctgatgagatgcttctgatga 2268777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 25 - 388
Target Start/End: Original strand, 29215618 - 29215982
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  29215618 gtgaaagagacgttgtgaattgccagaattttcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcct 29215716  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
    |  |||||||||||||||||  ||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  29215717 ataaaggatcaatttcaaatatattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctgtttttcttgccttgtagcagagacaaaaacagagtagtgg 29215816  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattca 323  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||  || | ||||||||||||||||| || | | ||  || |||  |||| ||||    
T  29215817 agctagtgattgtacacttcgtacaattgtactttgttatcgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaactagccgttgcttca 29215916  T
Q  324 ctctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagt 388  Q
    || | || ||||| ||||||| |||| || |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  29215917 cttttctagtcttttgcaatgcttagacgagattaaatccattaaacaacctttgaagctttaagt 29215982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 25 - 489
Target Start/End: Original strand, 35039989 - 35040451
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcaca-tcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |    
T  35039989 gtgaaagagacgttg--aattgccagcacattcaaaat-agagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatggtcttttgtctgatatagttattgtctt 35040085  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||| | || |||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  35040086 atgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacgtcgttgcaggcagagctttttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgg 35040185  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattca 323  Q
    || |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||  || | |||||||||||||| || || | | ||  || |||| |||| || |    
T  35040186 aggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagatcaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttta 35040285  T
Q  324 ctctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtga 422  Q
    || | || ||||||||||||  |||| || | ||  |||||||  ||||| |||||||| | |||  |  ||||   ||||||| | |||||||||||||    
T  35040286 cttttctagtcttctgcaatctttagacgaggttggatccattaaacaacttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaattgcagcttctggtga 35040383  T
Q  423 tcttttgcttctaat-gatgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagca 489  Q
    | ||| |||||| ||  |  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  35040384 tttttggcttctgataaacttgcttctgatgacgtcaccacttcatgagcactttgtcttcaggagca 35040451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 63 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 23036750 - 23036359
Alignment:
Q  63 agagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagga 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | || ||||    
T  23036750 agagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatctttttcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaagga 23036651  T
Q  163 acattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagac--acaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgt 260  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||    
T  23036650 acatcattgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaaaacaaagtagaggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgttctttgt 23036551  T
Q  261 caacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaa 359  Q
      ||||||||  || | ||||||||||||| ||| || | | ||  || ||||||||| |||||| |  | |||||||||| |  |||| || |||||||    
T  23036550 tgacgctctttgaagaacaagcatccaatgtcttcaaatcctttcaaaatagttgttgtttcacttttttagtcttctgcattatttagacgagattaaa 23036451  T
Q  360 tccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    ||||||| | | |||||||||||| ||||||  |||||||||||||    |||||||||||||||||  |||||| ||||  ||||||||||||    
T  23036450 tccattgaatagcctttgaagctttaagtcttgcatcttctgatga--gacagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatga 23036359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 27 - 492
Target Start/End: Original strand, 7309643 - 7310108
Alignment:
Q  27 gaaagagacgttgtgaa-ttgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctac 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||     
T  7309643 gaaagagacgttgtgaaattgccagcgcatcaaaata-gagtcgtttaaagctttgatcgatcaccaatgatctttcgcctgatatggttgttgtcctat 7309741  T
Q  126 gaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggag 225  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| | |  | ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| || |||| ||| ||||| |||||    
T  7309742 gaatgatcaatttcaaattcattccaattgggaaggaacattgttgcacgcagaactgtttttcttgtcttgtagcagatacac-aacagagtattggag 7309840  T
Q  226 atagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcact 325  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| |||  || |||||| || || || | ||||||||||||||| || | | |   || |    |||| ||||||    
T  7309841 gtagtggttgtacacttcgtacaattgtactacgttaacgcttttgaagaa-cgagcatccaatgccttcaaatccctacaaaatgaccgttgcttcact 7309939  T
Q  326 ctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatc 424  Q
    ||  | ||||||||||||  |||| ||  | | ||||||||| ||| | |||||||||| ||||||  ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  7309940 cttatagtcttctgcaatccttagacgacactgaatccattgaacagcttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgagctttagcttatggtgatc 7310039  T
Q  425 ttttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcac-tttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||  |||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  7310040 ttcagcttctgatgagatgtttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttttgtcttcaggagcactt 7310108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 79 - 453
Target Start/End: Original strand, 35401683 - 35402057
Alignment:
Q  79 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcag 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| | || |||||||| |||| ||||||    
T  35401683 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatatattcccattgtgaaggaacatcgttgtaggcag 35401782  T
Q  179 agctgttattcttgtcttgtagcggagac-acaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaag 277  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||  |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||  || |     
T  35401783 agctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaa 35401882  T
Q  278 caagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaaccttt 376  Q
    ||||||||||||||||| || | | ||  || |||| |||| |||||| | |  |||||||| | || |||  || |||||||||||||| |||  ||||    
T  35401883 caagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgtattgtttaaacgagattaaatccattgaacagtcttt 35401982  T
Q  377 gaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||||||    |||||||||||||||||  |||||| ||||  ||||||||||||    
T  35401983 gaagctttaagtcttgcatcttctgatga--gacagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatga 35402057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 63 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 39201211 - 39200793
Alignment:
Q  63 agagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagga 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| | || || |    
T  39201211 agagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcttgatatggttattgtcctatgaaggataaatttcaaatgcattcccattgtgaagaa 39201112  T
Q  163 acattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtca 262  Q
    |||| |||||||||||||||||  || |||| ||||||| || ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  39201111 acatcgttgcaggcagagctgt--tttttgtgttgtagcagaaacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtca 39201014  T
Q  263 acgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatc 361  Q
    ||||||||  || | ||||||||||||| ||| || | | ||  || |||  |||| ||||||||    ||||||||||||| |||   | |||||||||    
T  39201013 acgctctttgaagaacaagcatccaatgtcttcaaatcctttcaaactagccgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttacatgagattaaatc 39200914  T
Q  362 cattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatc 460  Q
    ||||| ||| | |||||||||| |  | |  ||||| || ||||||| |||||| ||||||| ||  |||| | ||| |  ||||| ||||||||||| |    
T  39200913 cattgaacagcttttgaagcttta--tgttgcatctcctaatgaactgcagcttttggtgattttcagcttttgatgaacttgcttttgatgacgtcacc 39200816  T
Q  461 acttcaggagcactttgttttca 483  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  39200815 acttcaggagcactttgtcttca 39200793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 270
Target Start/End: Original strand, 21702629 - 21702880
Alignment:
Q  18 taaaggagtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggtt 115  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  21702629 taaaggtgtgaaagagacgttg--aattgccaacacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgataaatcaccaatgatcctttgcctgatatggtt 21702725  T
Q  116 attgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactg 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||   |||||| | || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |    
T  21702726 attgtcctatgaaggatcaatttcaaatgtgttcccaatgtgaagaaacattgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacag 21702825  T
Q  216 agtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  21702826 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt 21702880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 25448811 - 25448556
Alignment:
Q  40 tgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatt 137  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  25448811 tgaattgccagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcatcaatgattctttgcctgatatggttgttgtcctatgaaggatcaatt 25448713  T
Q  138 tcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgta 237  Q
    |||||| |||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  25448712 tcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcaaagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgta 25448613  T
Q  238 cacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 294  Q
    ||| ||||||||  | |||||||||||||||||  || |  ||||||||||||||||    
T  25448612 cacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 25448556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 40 - 270
Target Start/End: Original strand, 30572032 - 30572263
Alignment:
Q  40 tgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatt 137  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30572032 tgaattgccatcacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgataaatcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatt 30572130  T
Q  138 tcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgta 237  Q
    ||||||   |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  30572131 tcaaatgagttcccaatgtgaaggaacattgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagaaacaaaaacagagtagtggagatagtggttgta 30572230  T
Q  238 cacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    ||| ||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  30572231 cacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctctt 30572263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 40 - 268
Target Start/End: Original strand, 19215447 - 19215676
Alignment:
Q  40 tgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttc 139  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||| |||||||| || || |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19215447 tgaattgccagcacatccaaaatagagtcgtttgaagcttagataaatcaccattggtcctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttc 19215546  T
Q  140 aaattcattcccagtatgtaggaacattgtt-gcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtac 238  Q
    |||| | |||||| | ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  19215547 aaatgcgttcccaatgtgtataaacattgtttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtac 19215646  T
Q  239 acatcgtacaattggactttgtcaacgctc 268  Q
    || |||||||||   ||| |||||||||||    
T  19215647 acttcgtacaatcacactatgtcaacgctc 19215676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 25 - 295
Target Start/End: Original strand, 46088811 - 46089080
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  || || |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  46088811 gtgaaagagacgttg--aaatgtcagcacattcaaaata-gagtcgattgaagcttttgatcaatcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcc 46088907  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    || ||| |||||||||||||| | |||||| | || |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||    
T  46088908 tatgaatgatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgaataaacattgttgcaggcagagctgttatccttgtctagtagcagagacaaaaacagagtagtg 46089007  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 295  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||||||    
T  46089008 gagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttt 46089080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 40 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 2327685 - 2327454
Alignment:
Q  40 tgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatt 137  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  2327685 tgaattgtcagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgatcttttgcatgatatggttattgtcctaagaaggattaatt 2327587  T
Q  138 tcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgta 237  Q
    |||||| |||||||| | || |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||| |||||||||||    
T  2327586 tcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgttgcaagcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaccagagtagtggaggtagtggttgta 2327487  T
Q  238 cacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    ||| ||||||||  | |||||||||| ||||||    
T  2327486 cacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctctt 2327454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 25 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 12624813 - 12624663
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12624813 gtgaaagagacgttgtgaattgccatcacatcaaaa--agagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctgatatggttattgtccta 12624716  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggca 177  Q
     |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  12624715 tgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacatcgttgcaggca 12624663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 40 - 268
Target Start/End: Original strand, 23024623 - 23024852
Alignment:
Q  40 tgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaattt 138  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||| |||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  23024623 tgaattgccagcacatccaaaatagagtcgtttgaagcttttgataattcaccattgatcctttgcctgatatggtcattgtcctatgaaggatcaattt 23024722  T
Q  139 caaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtac 238  Q
    ||||| | |||||| | || |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  23024723 caaatgcgttcccaatgtgcataaacattgttgcatgcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtac 23024822  T
Q  239 acatcgtacaattggactttgtcaacgctc 268  Q
    || ||||||||  | ||| |||||||||||    
T  23024823 acttcgtacaaacgcactatgtcaacgctc 23024852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 48570489 - 48570220
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||    
T  48570489 gtgaaagagacgttg--aattgtcagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaacgatcctttgcctgatatggttattgtcc 48570393  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    |  ||| |||| |||||||||  ||||||| |  | || |||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  48570392 ttagaaagatcgatttcaaatgtattcccattgagaagaaacattattgcaggcatagctgtttttcttgtcctgtagcagagacaaaaacagagtagtg 48570293  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 295  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||||||    
T  48570292 gagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttt 48570220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 181 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 12613917 - 12613700
Alignment:
Q  181 ctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaa 280  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||| | |||    
T  12613917 ctgttatttttgtcctgtagcagagacacaaacagagtagtgaaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgccaacgctcttcaaagaacaa 12613818  T
Q  281 gcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaag 380  Q
    ||| |||||| |||| |  || ||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  12613817 gcaaccaatg-ctttcaaatcttttgaattagccgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgctaggcgtgattaaatcttttgaacaacctttgaag 12613719  T
Q  381 cttgaagtctctcatcttc 399  Q
    ||| || ||||||||||||    
T  12613718 ctttaaatctctcatcttc 12613700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 14263708 - 14263465
Alignment:
Q  28 aaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctac 125  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||     
T  14263708 aaagagacgttg--aattgccatcacattcaaaattagagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgatcctttgcatgatatggttattgtcctaa 14263611  T
Q  126 gaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagac-acaaactgagtagtgga 224  Q
    ||| |||||||||||||| | ||||||   || || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||    
T  14263610 gaatgatcaatttcaaatgccttcccatagtgaagaaacattgttgcaggaagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaaacagagtagtgga 14263511  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    | |||||||||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||||    
T  14263510 ggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtgctttgccaacgctctt 14263465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 63 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 21135382 - 21135153
Alignment:
Q  63 agagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagg 161  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| | || |      
T  21135382 agagtcgtttgaagcttttgatctatcactaattatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgaata 21135283  T
Q  162 aacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  | ||| ||||    
T  21135282 aacattgttgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggatttagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtc 21135183  T
Q  262 aacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 291  Q
    ||| |||||  || |  |||||||||||||    
T  21135182 aacactctttgaagaataagcatccaatgc 21135153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 63 - 291
Target Start/End: Original strand, 42284486 - 42284715
Alignment:
Q  63 agagtcgtttgaagct-ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagg 161  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||| | || |      
T  42284486 agagtcgtttgaagctcttgatctatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgtgttcccaatgtgaata 42284585  T
Q  162 aacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |  |  | |||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||| ||||    
T  42284586 aacattgttgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacaaactcataatagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtc 42284685  T
Q  262 aacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 291  Q
    |||||||||  || |  |||||||||||||    
T  42284686 aacgctctttgaagaaaaagcatccaatgc 42284715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 65 - 294
Target Start/End: Original strand, 10250846 - 10251076
Alignment:
Q  65 agtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaa 163  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||  |  | || ||    
T  10250846 agtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgatcctttgcctggtatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgtattccctttgagaagaaa 10250945  T
Q  164 cattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaa 263  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | ||| ||||||    
T  10250946 cattgttgcaggcagagatgtttttcttgtcttgtagtagagacaaaaacagagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaa 10251045  T
Q  264 cgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 294  Q
      |||||  || |  ||||||||||||||||    
T  10251046 aactctttgaagaataagcatccaatgcctt 10251076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 64 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 21121285 - 21121057
Alignment:
Q  64 gagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagga 162  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||   ||||||||||||||||   |||||| | || |  |    
T  21121285 gagtcgtttgaagcttttgatctatcaccaatgatctttttcctgatatggttattgtcctatataggatcaatttcaaatgtgttcccaatgtgaataa 21121186  T
Q  163 acattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtca 262  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||    
T  21121185 acattgttgcagacagagctgttatccttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacgtcgtacaaacgtactatgtca 21121086  T
Q  263 acgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 291  Q
    ||||||||  || |  |||||||||||||    
T  21121085 acgctctttgaagaataagcatccaatgc 21121057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 63 - 247
Target Start/End: Original strand, 17370900 - 17371085
Alignment:
Q  63 agagtcgtt-tgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagg 161  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||  ||||||| |||||| |  ||| |||    
T  17370900 agagtcgttgtgaaaccttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcatgaagg 17370999  T
Q  162 aacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtac 247  Q
    ||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17371000 aacatttctgcaggcagagctatttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtac 17371085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 63 - 291
Target Start/End: Original strand, 21984453 - 21984683
Alignment:
Q  63 agagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagg 161  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| | || |      
T  21984453 agagtcgtttgaagcttttgaactatcactaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgaata 21984552  T
Q  162 aacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagac-acaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgt 260  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||| | |||  ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  | ||| |||    
T  21984553 aacattgttgcaggcagaactgtcatccttgtcttgtagcagagacaaaaaaaagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgt 21984652  T
Q  261 caacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 291  Q
    ||||||||||  || |  |||||||||||||    
T  21984653 caacgctctttgaagaataagcatccaatgc 21984683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 63 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 34255739 - 34255552
Alignment:
Q  63 agagtcgtttgaagctttgatcaat-caccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagg 161  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||||  |||||  ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| | ||||      
T  34255739 agagtcgtttgaagctttgataagttcacccttgatccgttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgtata 34255640  T
Q  162 aacattgtt-gcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtaca 248  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |  | ||||||||||  |||||||||||||  |||||||    
T  34255639 aacattgtttgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacaaactcagagtagtggaagtagtggttgtacagttcgtaca 34255552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 18896853 - 18896523
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||   | ||||||||||||||| ||| || || ||||||||| | |     
T  18896853 gtgaaagagacgttgttgattgccagcacatcataa--agagtcgtttgaagcttgattaaatcaccaatgatctattgcctgatttggttattgccatg 18896756  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     ||| |||||||||||||| |||||| |||||| || ||||  | ||||| || | ||||| |||||||  | | || || | | ||||  |||||||||    
T  18896755 tgaatgatcaatttcaaatccattccaagtatggagaaacaccggtgcagacacaactgttgttcttgtactattgcagacata-aaacaaagtagtgga 18896657  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||  ||||  ||||| |||  ||| |  |||||||||||||||| || ||| ||||||||||  |||| |||      
T  18896656 ggtagtggttgtacacttcgtacaactgtccttttccaacgttctccaaagactaagcatccaatgccttcaaattcttttgaattagccgttgcttctt 18896557  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaa 358  Q
     || || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  18896556 gcttctagtcttctgcaatgataggcgtgattaa 18896523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 79 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19170539 - 19170378
Alignment:
Q  79 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcag 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | || ||||| |||||||| |||||||||  ||||||| |||||| |   || | |||||||  |||||||||    
T  19170539 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcttgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaacgaacatttctgcaggcag 19170440  T
Q  179 agctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  19170439 agctgtttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacac 19170378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 63 - 240
Target Start/End: Original strand, 22655335 - 22655513
Alignment:
Q  63 agagtcgtt-tgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagg 161  Q
    ||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||| || || ||| | |||||||| |||||||||  ||||||| |||||| |   || |||    
T  22655335 agagtcgttgtgaaaccttgatcagtcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctaagaaggatcacattcaaatccattcctatcttgaagg 22655434  T
Q  162 aacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||    
T  22655435 aacatttctgcaggcagaactgtttttcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacac 22655513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Original strand, 675445 - 675607
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | | |||||| |||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||  |||||||    
T  675445 ctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcccattttgaaggaacatttctgcaggc 675544  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  675545 agagctgtt-gtcttgtcttgtagcgtagacaaaagcagagtagtggaggtagtggttgtacac 675607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 63 - 240
Target Start/End: Original strand, 22642753 - 22642931
Alignment:
Q  63 agagtcgtt-tgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagg 161  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| || || ||| | |||||||| |||||||||  ||||||| |||||| |   || |||    
T  22642753 agagtcgttgtgaaaccttgatcaatcaccaatgatcttttgccttatttggatgttgtcctaagaaggatcatgttcaaatccattcctatcttgaagg 22642852  T
Q  162 aacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||  |||||||||| |||||  |||||||||||| || |||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||    
T  22642853 aacatttctgcaggcagaactgtttatcttgtcttgtaccgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacac 22642931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 14388334 - 14388172
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |   || |||||||||  |||||||    
T  14388334 ctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggc 14388235  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14388234 agagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacagaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 14388172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 41132823 - 41132661
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | | |||||| |||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||| |  |||||||    
T  41132823 ctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcccattttgaaggaacagttctgcaggc 41132724  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  41132723 agagctgtt-gtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacac 41132661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 77 - 239
Target Start/End: Original strand, 28474101 - 28474262
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| || || ||| | |||||||| |||||||||  ||||||| |||||| |   |  |||||||||  |||||||    
T  28474101 ctttgatcatttaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttaaaggaacatttctgcaggc 28474200  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtaca 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||| |||||| |||||||||||||    
T  28474201 agagctgttat-cttgtcttgtagcgcagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtaca 28474262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 240
Target Start/End: Original strand, 5929580 - 5929739
Alignment:
Q  79 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcag 178  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || || ||| | |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |   || |||||||||  |||||||||    
T  5929580 ttgatcaat-accaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcag 5929678  T
Q  179 agctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||| | | |||||||||||||| |||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||    
T  5929679 agctggtgt-cttgtcttgtagcgtagacacaatcagagtcgtggaggtagtggttgtacac 5929739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 240
Target Start/End: Original strand, 19037882 - 19038043
Alignment:
Q  79 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcag 178  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| || || ||| | ||||||||  ||| ||||  ||||||| |||||| |   || |||||||||  |||||||||    
T  19037882 ttgatcaaataccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctataaagaatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcag 19037981  T
Q  179 agctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||    
T  19037982 agctgtttttcttgtcttgtagcgcagacacaatcagagtcgtggaggtagtggttgtacac 19038043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 152
Target Start/End: Original strand, 37640845 - 37640957
Alignment:
Q  40 tgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttc 139  Q
    ||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  37640845 tgaattgtcagcacatccaaaatagagtcgtttgaagctttgataattcaccattgatcctttgcctgatatggttattttcctatgaaggatcaatttc 37640944  T
Q  140 aaattcattccca 152  Q
    |||| | ||||||    
T  37640945 aaatgcgttccca 37640957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 79 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 52350889 - 52350731
Alignment:
Q  79 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcag 178  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || || ||| | |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |   || ||| |||||  |||||||||    
T  52350889 ttgatcaat-accaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctaacttgaagggacatttctgcaggcag 52350791  T
Q  179 agctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtaca 239  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||| | |||| |||||| |||||||||||||    
T  52350790 agctattat-cttgtcttgtagcgtagacacaagcagagttgtggaggtagtggttgtaca 52350731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18311180 - 18311018
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||  | || ||| | | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |   || |||||||||  ||||||     
T  18311180 ctttgatcattcaccagtaatcttttgcttgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggt 18311081  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18311080 agagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacagaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 18311018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Original strand, 44200886 - 44201047
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  || || ||| | |||||||| ||| |||||| ||||||| |||||| |   || |||||||||  |||||||    
T  44200886 ctttgatcaat-accaatgatctttttcctgatttggatgttgtcctatgaaagatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggc 44200984  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    | || |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  44200985 aaagttgttat-cttgtcttgtagcgtagacacaaacagagtcgtggaggtagtggttgtacac 44201047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 396 - 492
Target Start/End: Original strand, 12284648 - 12284743
Alignment:
Q  396 cttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgt-gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  12284648 cttctgatgaacttcagcttctggtgatctt--gcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgacttcaggagcactt 12284743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 117 - 194
Target Start/End: Original strand, 17400889 - 17400966
Alignment:
Q  117 ttgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtc 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  17400889 ttgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacattgttgcaggcatagctgttatccttgtc 17400966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 63 - 239
Target Start/End: Original strand, 21543887 - 21544064
Alignment:
Q  63 agagtcgtt-tgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagg 161  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| || || ||| | ||||||||  ||| ||||  ||||||| |||||| |   || |||    
T  21543887 agagtcgttgtgaaaccttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctataaagaatcatgttcaaatccattcctaacttgaagg 21543986  T
Q  162 aacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtaca 239  Q
    ||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || |  |||||||||| ||||||| |||||    
T  21543987 aacatttctacaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacaaaagcaaagtagtggaggtagtggtcgtaca 21544064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 240
Target Start/End: Original strand, 22019211 - 22019372
Alignment:
Q  79 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcag 178  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| || || |||   |||||||| |||||||||  ||||||| |||||| |   || |||||||||  |||||| ||    
T  22019211 ttgatcaaataccaatgatcttttgcctgatttggaagttgtcctatgaaggatcatgttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggaag 22019310  T
Q  179 agctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||    
T  22019311 agctgtttatcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacac 22019372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 44824019 - 44823906
Alignment:
Q  26 tgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  44824019 tgaaagagacgttg--aatttccagcatattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgatcatttgcctgatatggttattgtcct 44823923  T
Q  124 acgaaggatcaatttca 140  Q
    | ||| |||||||||||    
T  44823922 aagaatgatcaatttca 44823906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 238
Target Start/End: Original strand, 20251651 - 20251808
Alignment:
Q  79 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcag 178  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || || ||| | |||||||| |||||||||  ||||||| |||||| |   || |||||||||  |||||||||    
T  20251651 ttgatcaat-accaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcag 20251749  T
Q  179 agctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtac 238  Q
    |||||||| |||||| |||||||  |||||||| | |||| |||||| ||||||||||||    
T  20251750 agctgtta-tcttgttttgtagcatagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtac 20251808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 11195226 - 11195113
Alignment:
Q  126 gaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggag 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||   || |||||||||  |||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  11195226 gaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcaaagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggag 11195128  T
Q  226 atagtggttgtacac 240  Q
     || |||||||||||    
T  11195127 gtaatggttgtacac 11195113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 79 - 240
Target Start/End: Original strand, 28379871 - 28380031
Alignment:
Q  79 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcag 178  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| || || ||| | |||||||| |||||||||  |||||||  ||||| |   || |||||||||  |||||||||    
T  28379871 ttgatcaaataccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatcaattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcag 28379970  T
Q  179 agctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||   |||| |||||| || |||||||||||    
T  28379971 agctgtta-tcttgtcttgtagcgtagacacaattagagtcgtggaggtactggttgtacac 28380031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 399 - 528
Target Start/End: Original strand, 37642433 - 37642565
Alignment:
Q  399 ctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatga--tgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt-tga 495  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | | |||||| ||||  | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   |    
T  37642433 ctgatgaactgcagcttctggtgatatatagcttctgatgaactttgcttctaatgacgtcatcacttcagaagcactttgtcttcaggagcacttcaaa 37642532  T
Q  496 cttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    |||||||  || || ||||||||||||| ||||    
T  37642533 cttcagacgcagttttcttcagatgctttaagc 37642565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 394 - 492
Target Start/End: Original strand, 19215790 - 19215887
Alignment:
Q  394 atcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatga-tgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||   ||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  19215790 atcttctgatgatctgcagcttctggtgaa--tttgcttctgatgaatttgcttctgatgacgacatcacttcagaagcactttgtcttcaggagcactt 19215887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 21205044 - 21204937
Alignment:
Q  162 aacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtc 261  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  | ||| ||||    
T  21205044 aacattgttgcaagaagagctgttatccttgtcttgtagcacagaca-aaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtc 21204946  T
Q  262 aacgctctt 270  Q
    |||||||||    
T  21204945 aacgctctt 21204937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 171 - 270
Target Start/End: Original strand, 37642215 - 37642314
Alignment:
Q  171 gcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||  | ||| |||||||||||||    
T  37642215 gcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtataaacgtactatgtcaacgctctt 37642314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 137 - 240
Target Start/End: Original strand, 39587027 - 39587130
Alignment:
Q  137 ttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgt 236  Q
    ||||||||||||||||   || |||||||||  ||||||||  |||||| ||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  39587027 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcatggctgtttttcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 39587126  T
Q  237 acac 240  Q
    ||||    
T  39587127 acac 39587130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 159 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 44821670 - 44821559
Alignment:
Q  159 aggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggacttt 258  Q
    ||||||||  ||||| |||||| | || ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  | ||| |    
T  44821670 aggaacatcattgcatgcagagttatttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagatagtagttgtacacttcgtacaaacgtactat 44821571  T
Q  259 gtcaacgctctt 270  Q
    |||||| |||||    
T  44821570 gtcaacactctt 44821559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 442 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 44821387 - 44821301
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||| | || || |||||||| |||| ||||    
T  44821387 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtgttcaggagcgctttatcttcaggagcagttttcttcagacgctttaagc 44821301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 45070861 - 45070700
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||| || || ||| | | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |   || ||||||| |  |||||||    
T  45070861 ctttgatcattcaccactaatcttttgcctgatttggatgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 45070762  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtaca 239  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||||  | | || |||||| |||||||||||||    
T  45070761 agagctgtta-tcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtaca 45070700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 85 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 7745289 - 7745104
Alignment:
Q  85 aatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgt 184  Q
    |||||||| |||||  |||||| || ||||| || ||||| |||||||||| ||||||| |||||    | ||  ||||||||  |||||||| ||||||    
T  7745289 aatcaccattgatccattgtctgatttggttgttttcctatgaaggatcaagttcaaatccattcttgttctgagggaacatttctgcaggcaaagctgt 7745190  T
Q  185 tattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    | |||||||| ||||||| || ||  | | ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||  | |||||||||||||||||    
T  7745189 ttttcttgtcatgtagcgaaggcaatagcagagtagtggaggtagtggttgtacactttgtataaacgtactttgtcaacgctctt 7745104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 143
Target Start/End: Original strand, 20909231 - 20909346
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatc-aatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| | |||  | || |||||||||||||    
T  20909231 gtgaaagagacgttgttgattgccagcacatcaa---aagagtcgtttgaaac-ttgatcaaatcaccaatgatatgttgcttgatttggttattgtcct 20909326  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaat 143  Q
    | |||||| |||||||||||    
T  20909327 aagaaggaacaatttcaaat 20909346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 18130268 - 18130146
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgt--ttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||  ||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||  | || ||||||||||||    
T  18130268 gtgaaagagacgttgttgattgccagcacatcaaaa--agagtcgtcgttgaaactt-gat-aatcaccaatgatctgttgcttgatttggttattgtcc 18130173  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattc 149  Q
    || || ||| |||||||||||||||||    
T  18130172 taggagggaacaatttcaaattcattc 18130146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18382052 - 18381950
Alignment:
Q  137 ttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgt 236  Q
    ||||||||||||||||   || |||||||||  ||||||||  |||||| | |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18382052 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcatggctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 18381954  T
Q  237 acac 240  Q
    ||||    
T  18381953 acac 18381950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 46181087 - 46180925
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |   || ||||||| |  |||||||    
T  46181087 ctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggc 46180988  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |||||||  | | || |||||| ||||||||||||||    
T  46180987 agagctgtta-acttgtcttgtagcgaagacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacac 46180925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 240
Target Start/End: Original strand, 47195319 - 47195422
Alignment:
Q  137 ttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgt 236  Q
    ||||||||||||||||   || |||||||||  ||||||||   ||||| ||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  47195319 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcatgactgtttttcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 47195418  T
Q  237 acac 240  Q
    ||||    
T  47195419 acac 47195422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20195852 - 20195739
Alignment:
Q  126 gaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggag 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||   ||  |||||| |  |||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||  ||| |||||||||||    
T  20195852 gaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgatggaacaattctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggag 20195754  T
Q  226 atagtggttgtacac 240  Q
     ||||||||||||||    
T  20195753 gtagtggttgtacac 20195739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Original strand, 21703066 - 21703116
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21703066 tgcttctgatgatgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagcactt 21703116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 25448376 - 25448290
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||  |||||| | || || |||||||| |||| ||||    
T  25448376 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagtactttgtcttcaggagcgctttatcttcaggagcagttttcttcagacgctttaagc 25448290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 393 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 21120964 - 21120867
Alignment:
Q  393 catcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatga-tgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagca 489  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||     |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  21120964 catctcctgatgaactgcagcttctggtgatacacagcttctgatgaatttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgtcttcaagagca 21120867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 393 - 523
Target Start/End: Original strand, 21544201 - 21544335
Alignment:
Q  393 catcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatga--tgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcac 490  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||     |||||| ||||  | |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  21544201 catcttctgatgaactgtagcttctggtgatacacagcttctgatgaactttgcttctgatgatgtcatcacttcagaggcactttgtcttcaggagcac 21544300  T
Q  491 tt--tgacttcagaatcacttctcttcagatgctt 523  Q
    ||  | ||||||||  || || |||||||||||||    
T  21544301 ttcataacttcagacgcatttttcttcagatgctt 21544335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 9050636 - 9050534
Alignment:
Q  137 ttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgt 236  Q
    |||||||||||| |||   || |||||||||  ||||||||  |||||| | |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9050636 ttcaaattcattaccatcttgaaggaacatttctgcaggcatggctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 9050538  T
Q  237 acac 240  Q
    ||||    
T  9050537 acac 9050534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 21204757 - 21204706
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcacttt 493  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  21204757 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacgttgtcttcaggagcacttt 21204706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 394 - 492
Target Start/End: Original strand, 42284807 - 42284906
Alignment:
Q  394 atcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgt-gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||     |||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||    
T  42284807 atcttctgatgaactgcagcttctggtgatacacagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgtctttaggcgcactt 42284906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 2327251 - 2327205
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagc 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  2327251 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgtcttcaggagc 2327205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 528
Target Start/End: Original strand, 10251229 - 10251315
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||  ||||||| | || || |||||||| |||| ||||    
T  10251229 tgcttttgatgacgtcatcacttcatgagcattttgtcttcaggagcacttcaacttcaggagcagttttcttcagacgctttaagc 10251315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 156
Target Start/End: Original strand, 17018405 - 17018531
Alignment:
Q  28 aaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaa-tcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacg 126  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||  | || | | |||| ||||| |    
T  17018405 aaagagacgttgttgatttccagcacataaaaa--agagtcgtttgaagctt-gatcaaatcaccaatgatctgttgcttgattttgatattatcctatg 17018501  T
Q  127 aaggatcaatttcaaattcattcccagtat 156  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  17018502 aaggaacaatttcaaatccattccaagtat 17018531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 150
Target Start/End: Original strand, 18614762 - 18614847
Alignment:
Q  65 agtcgtttgaagctttgatcaa-tcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcc 150  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  18614762 agtcgttcgaagctt-gatcaaatcaccaatgatcttttgtttgatttggttattatcctatgaaggaacaatttcaaatccattcc 18614847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 19170175 - 19170125
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  19170175 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactttgtcttcaggagcactt 19170125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Original strand, 23024998 - 23025048
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  23024998 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgtcttcaggaggactt 23025048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24028908 - 24028751
Alignment:
Q  63 agagtcgtt-tgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagg 161  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |  || ||| | |||| |||  ||||||||  |||||||  ||||  |   || |||    
T  24028908 agagtcgttgtgaaaccttgatcaatcaccaatgatcttttgccagatttggatgttgttctataaaggatcacgttcaaatctattcataacttgaagg 24028809  T
Q  162 aacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagta 219  Q
    ||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  24028808 aacatttctgcaggcagagctatttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagta 24028751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 443 - 528
Target Start/End: Original strand, 29216021 - 29216106
Alignment:
Q  443 gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||| |||| |||||| | || || |||||||| |||| ||||    
T  29216021 gcttctgatgacgtcaccacttcaggagcactttttcttcaggggcattttgtcttcaggaacagttttcttcagacgctttaagc 29216106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 445 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 48570056 - 48569983
Alignment:
Q  445 ttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcaga 518  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||| | || || ||||||||    
T  48570056 ttctgatgacgtcatcatttcaggagcactttgtcttcaggagcgctttatcttcaggagcagttttcttcaga 48569983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Original strand, 12946824 - 12946876
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  12946824 tcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 12946876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Original strand, 35013031 - 35013083
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  35013031 tcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 35013083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 488
Target Start/End: Original strand, 2268781 - 2268828
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcac-tttgttttcaggagc 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  2268781 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttttgtcttcaggagc 2268828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 240
Target Start/End: Original strand, 17957298 - 17957400
Alignment:
Q  137 ttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgt 236  Q
    ||||||||||||||||   || |||||||||  ||||||||  | |||| |||||||||||||| | ||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  17957298 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcatggttgtt-ttcttgtcttgtagtgtagacaaaaacagagtaatggaggtagtggttgt 17957396  T
Q  237 acac 240  Q
    ||||    
T  17957397 acac 17957400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 480 - 527
Target Start/End: Original strand, 30893337 - 30893384
Alignment:
Q  480 ttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaag 527  Q
    |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  30893337 ttcaggagtactttgacttcaggagcacttctcttcagatgcttcaag 30893384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 240
Target Start/End: Original strand, 23064935 - 23064985
Alignment:
Q  190 ttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  23064935 ttgtcttgtagcgtagacacaaacagagtcgtggaggtagtggttgtacac 23064985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 34255355 - 34255305
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  34255355 tgcttctgatgacgtcattacttcagaggcactttgtcttcaggagcactt 34255305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 12613621 - 12613588
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12613621 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 12613588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 46089233 - 46089266
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46089233 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 46089266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 522
Target Start/End: Original strand, 5833605 - 5833685
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgct 522  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||| |||  |||||| | || || ||||||||||||    
T  5833605 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcagtttagcttcaggagcagtttagcttcaggagcagttttcttcagatgct 5833685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 522
Target Start/End: Original strand, 5844190 - 5844270
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgct 522  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||| |||  |||||| | || || ||||||||||||    
T  5844190 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcagtttagcttcaggagcagtttagcttcaggagcagttttcttcagatgct 5844270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 480 - 528
Target Start/End: Original strand, 12284714 - 12284762
Alignment:
Q  480 ttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  12284714 ttcagaagcactttgacttcaggagcacttctcttcagatgtttcaagc 12284762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 480 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 12613600 - 12613553
Alignment:
Q  480 ttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  12613600 ttcaggagcactt-gacttcagaatcactattcttcagatgcttcaagc 12613553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20441415 - 20441363
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20441415 tcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 20441363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 26548453 - 26548301
Alignment:
Q  88 caccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttat 187  Q
    |||||||||||||||| || || ||| |  ||||||| |||||||||  ||||||| |||||| |   || | |||||||  ||||| ||||||||||      
T  26548453 caccaatgatcttttgcctgatttggatgctgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaagaacatttatgcagacagagctgttta 26548354  T
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    || |||||||||||| ||||| |  | | || |||||| ||||||||||||||    
T  26548353 tcctgtcttgtagcgtagacagaggcagtgtcgtggaggtagtggttgtacac 26548301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 444 - 476
Target Start/End: Original strand, 30572421 - 30572453
Alignment:
Q  444 cttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 476  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30572421 cttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 30572453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 35400984 - 35400904
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgct 522  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||| |||  |||||| | || || ||||||||||||    
T  35400984 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcagtttagcttcaggagcagtttagcttcaggagcagttttcttcagatgct 35400904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 35404211 - 35404131
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgct 522  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||| |||  |||||| | || || ||||||||||||    
T  35404211 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcagtttagcttcaggagcagtttagcttcaggagcagttttcttcagatgct 35404131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 35648510 - 35648430
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgct 522  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||| |||  |||||| | || || ||||||||||||    
T  35648510 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcagtttagcttcaggagcagtttagcttcaggagcagttttcttcagatgct 35648430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 47607751 - 47607671
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgct 522  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||| |||  |||||| | || || ||||||||||||    
T  47607751 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcagtttagcttcaggagcagtttagcttcaggagcagttttcttcagatgct 47607671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 47618359 - 47618279
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgct 522  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||| |||  |||||| | || || ||||||||||||    
T  47618359 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcagtttagcttcaggagcagtttagcttcaggagcagttttcttcagatgct 47618279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 18517419 - 18517298
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtt--tgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    ||||||||| |||||   |||| || ||||||||||  |||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| | |||  | ||||| |||||||||    
T  18517419 gtgaaagaggcgttgatgattgtcatcacatcaaaa--agagtcgttgttgaagctt-gatca-tcaccaatgatttgttgcttgatatgattattgtcc 18517324  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcatt 148  Q
    || |||||| ||||||||||||||||    
T  18517323 taggaaggaacaatttcaaattcatt 18517298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 21135010 - 21134963
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagca 489  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  21135010 tgcttctgatgacgtcatcatttcagaagcactttgtcttcaagagca 21134963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 21191705 - 21191655
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcacttt 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||    
T  21191705 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggaggac-ttgacttcaggagcacttt 21191655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 22600008 - 22599961
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcac-tttgttttcaggagc 488  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  22600008 tgcttctgatgatgtcatcacttcaggagcacttttgtcttcaggagc 22599961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 23036355 - 23036308
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt-tgttttcaggagc 488  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  23036355 tgcttctgatgatgtcatcacttcaggagcacttgtgtcttcaggagc 23036308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 4250679 - 4250611
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  4250679 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 4250611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 7689573 - 7689505
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  7689573 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 7689505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 18381741 - 18381707
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 476  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18381741 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 18381707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 202
Target Start/End: Original strand, 20798989 - 20799062
Alignment:
Q  128 aggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcg 202  Q
    |||||||| |||||||||||||| |   || ||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20798989 aggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttatt-ttgtcttgtagcg 20799062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 443 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 22201607 - 22201557
Alignment:
Q  443 gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcac-tttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  22201607 gcttctgatgaagtcatcacttcaggagcacttttgtcttcaggggcactt 22201557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 150
Target Start/End: Original strand, 23054190 - 23054312
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtt--tgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    ||||||||||||||||  |||| || ||||||||||   ||||||||  |||| ||| ||| ||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||    
T  23054190 gtgaaagagacgttgttgattgtcaacacatcaaaa---gagtcgttgttgaaactt-gat-aatcaccaatgatttgttgtttgatttggttattgtcc 23054284  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcc 150  Q
    || || ||| ||||||||| ||||||||    
T  23054285 taggagggaacaatttcaatttcattcc 23054312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 39194208 - 39194140
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  39194208 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 39194140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 445 - 475
Target Start/End: Original strand, 48704474 - 48704504
Alignment:
Q  445 ttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48704474 ttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 48704504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 148052 - 147971
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgctt 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||| ||||||||  |||||||  || || |||||||||||||    
T  148052 tgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcacttcagcttcagaagcactttagcttcagacgcagttttcttcagatgctt 147971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 154127 - 154046
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgctt 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||| ||||||||  |||||||  || || |||||||||||||    
T  154127 tgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcacttcagcttcagaagcactttagcttcagacgcagttttcttcagatgctt 154046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 4167628 - 4167661
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4167628 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 4167661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 4178267 - 4178300
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4178267 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 4178300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 4250403 - 4250370
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4250403 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 4250370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 5639548 - 5639515
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5639548 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 5639515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 5650105 - 5650072
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5650105 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 5650072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 523
Target Start/End: Original strand, 5974133 - 5974214
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgctt 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||| ||||||||  |||||||  || || |||||||||||||    
T  5974133 tgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcacttcagcttcagaagcactttagcttcagacgcagttttcttcagatgctt 5974214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Original strand, 19179067 - 19179120
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaa-ctgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19179067 tcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 19179120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 19179329 - 19179362
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19179329 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 19179362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Original strand, 19187946 - 19187999
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaa-ctgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19187946 tcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 19187999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 19188189 - 19188222
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19188189 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 19188222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 23580425 - 23580372
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaa-ctgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23580425 tcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 23580372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 33084931 - 33084964
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33084931 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 33084964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 35013291 - 35013324
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35013291 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 35013324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 169 - 240
Target Start/End: Original strand, 4178005 - 4178076
Alignment:
Q  169 ttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaa-ctgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||||  |||||| || ||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  4178005 ttgcaggcatggctgttgtt-ttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 4178076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 442 - 523
Target Start/End: Original strand, 17371295 - 17371378
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt--tgacttcagaatcacttctcttcagatgctt 523  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||  | ||||||||  || || |||||||||||||    
T  17371295 tgcttctaatgacgtcatcacttcaaagacactttgtcttcaggagcacttcataacttcagacacagttttcttcagatgctt 17371378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 442 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 20441155 - 20441123
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20441155 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 20441123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 442 - 522
Target Start/End: Original strand, 21895571 - 21895651
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgct 522  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    |||||||||||||   |||||| | || || ||||||||||||    
T  21895571 tgcttctgatgacgtcatctcttcagaagcacttcagcttcaggagcacttcagcttcaggagcagttttcttcagatgct 21895651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 442 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 22464635 - 22464575
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatc-acttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcag 501  Q
    ||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  22464635 tgcttctgatgacgtcacctaattcatgagcactttgtcttcaggaacactttgtcttcag 22464575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 2)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 25 - 434
Target Start/End: Original strand, 9778 - 10188
Alignment:
Q  25 gtgaaagaga-cgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9778 gtgaaagagaacgttgtgaatttccagcacataaaaa-aagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctaatatggttattgtcct 9876  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
    | |||||||||||||||||| |||| | |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  9877 atgaaggatcaatttcaaatccatttcaagtatgaatgaacattgttgcaggcatagctgttatccttgtcttgtagcagcgacacaaactgagtagtgg 9976  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattca 323  Q
    || |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| || ||||||||||||||  |||| ||||    
T  9977 aggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcgaatgccttcaaattcatttgaattagccgttgcttca 10076  T
Q  324 ctctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtga 422  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10077 ctcttatggtcttctgcaatgctaggcgtgattaaatccattgaacagccatttgaagctttaagtctcttatcttctgatgaacttcagcttctggtga 10176  T
Q  423 tcttttgcttct 434  Q
     |||| ||||||    
T  10177 actttagcttct 10188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 446 - 476
Target Start/End: Original strand, 10213 - 10243
Alignment:
Q  446 tctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 476  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10213 tctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 10243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 219)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 25 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 49643099 - 49642670
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||     
T  49643099 gtgaaagagacgttgcgaattgccagcacatcaaaata-gagtcatttgaagctttgatcaatcaccaataatcttttgcctgatatggttattgtcctc 49643001  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49643000 tgaaggatcaatttcaaatccattccatgtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtgga 49642901  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || | | ||  || |||| |||| |||||    
T  49642900 gatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaatcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcac 49642801  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    ||| |  ||||||||||||| |||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  49642800 tcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatctattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgat 49642701  T
Q  424 cttttgcttctaatgatgtgcttctgatgac 454  Q
    |||  |||||||||||  |||||||||||||    
T  49642700 cttcagcttctaatgagatgcttctgatgac 49642670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 29 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 30000925 - 30000501
Alignment:
Q  29 aagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaa 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  30000925 aagagacattgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaa 30000827  T
Q  129 ggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagata 228  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  30000826 ggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacattgttgcaggcatagctgttatccttgtccagtagcagagactcaaactgagtggtggagata 30000727  T
Q  229 gtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctc 328  Q
    |||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| || | | ||  || ||||||||| |||||||      
T  30000726 gtggttgtacactttgtacaattgtactttgttaactctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcct 30000627  T
Q  329 ctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttt 427  Q
    |||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  30000626 ctggtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaaaaacctttgaagctttaagtctctcgtcttctgatgaacttcagcttctagtgatcttc 30000527  T
Q  428 tgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
     |||||| || | |||||||||||||    
T  30000526 agcttctgataaggtgcttctgatga 30000501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 25 - 489
Target Start/End: Original strand, 2561010 - 2561475
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  2561010 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataa-agtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtccta 2561108  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  2561109 tgaatgatcaatttcaaattcattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggtagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgga 2561208  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||  || | ||||||||||||  ||| || | | ||  || ||||||||| |||||    
T  2561209 ggtagtggttgtacacttcgtacacttgtactttgtcaacgatctttgaagaacaagcatccaatttcttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcac 2561308  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    ||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  2561309 tcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgat 2561408  T
Q  424 cttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagca 489  Q
      |  |||||| ||| |  |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2561409 tctcagcttctgatgaacttgcttctgatgatgtcaccacttcaagagcactttgtcttcaggagca 2561475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 25 - 453
Target Start/End: Original strand, 20645975 - 20646405
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  20645975 gtgaaagagacgttgtgaattgtcagcacatcaaaataagagtcatttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtccta 20646074  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20646075 tgaaggatcaaattcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagaactgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtgga 20646174  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || | | ||  || |||  |||| |||||    
T  20646175 ggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagacgttgcttcac 20646274  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtga 422  Q
    ||| |||||||||| ||||| || | || ||| |||| ||||| ||| || ||| |||||| ||||||  ||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  20646275 tcttctggtcttctacaatgcttggacgagatgaaatacattgaacagccttttaaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtga 20646374  T
Q  423 tcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    ||||  |||||| ||||  ||||||||||||    
T  20646375 tcttcagcttctgatgagatgcttctgatga 20646405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 28 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 29951772 - 29951347
Alignment:
Q  28 aaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacga 127  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  29951772 aaagagacattgtgaattgaaagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatga 29951674  T
Q  128 aggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagat 227  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  29951673 aggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacattgttgcaggcatagctgttatccttgtccagtagcagagactcaaactgagtggtggagat 29951574  T
Q  228 agtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactct 327  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| || | | ||  || ||||||||| |||||||     
T  29951573 agtggttgtacactttgtacaattgtactttgttaactctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcc 29951474  T
Q  328 cctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatctt 426  Q
     |||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29951473 tctggtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaaaaacctttgaagctttaagtctctcgtcttctgatgaacttcagcttctagtgatctt 29951374  T
Q  427 ttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
      |||||| || | |||||||||||||    
T  29951373 cagcttctgataaggtgcttctgatga 29951347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 25 - 453
Target Start/End: Original strand, 31303208 - 31303636
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||     
T  31303208 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgccctc 31303306  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31303307 tgaaggatcaatttcaaatccattgctagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtgga 31303406  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| |||| |||| ||| || | | ||  || ||||||||  |||||    
T  31303407 gatagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaaacatcaaatgtcttcaaatcctttcaaaatagttgttccttcac 31303506  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    |||    ||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||  ||||  |||||||||||||    
T  31303507 tctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttaaagctttaagtctttcatctcctgagtaactagagcttctggtgat 31303606  T
Q  424 cttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    |||  |||||| ||||  ||||||||||||    
T  31303607 cttcagcttctgatgagatgcttctgatga 31303636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 29 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 14393337 - 14392861
Alignment:
Q  29 aagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaa 128  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||| |||||||||||| | |    
T  14393337 aagagacgttgtgaatttccagcacatcaaaata-gagtcgtttaaagctttgatcaatcaccaatgatcttatgcatgatattgttattgtcctatgga 14393239  T
Q  129 ggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagata 228  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  14393238 ggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacattgccgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactaagtagtggagata 14393139  T
Q  229 gtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctc 328  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || | | ||  || |||| |||| ||||||||     
T  14393138 gtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgtttcactctt 14393039  T
Q  329 ctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatctt- 426  Q
    |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||   |||| || |||||||||||||||| ||||||||     
T  14393038 ctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaaactttaagtcttgtatctcctaatgaacttcagcttctagtgatcttg 14392939  T
Q  427 -----------ttgcttctaatgat-gtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
                ||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  14392938 cttttgatgagatgcttatgatgatcttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttaacttcaggagcactt 14392861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 25 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 12963422 - 12962971
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  12963422 gtgaaagagacgttgtgaattgtcagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagcttcgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatgtttattgtccta 12963324  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     ||| ||||  |||||||| |||||  | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  12963323 tgaacgatcgctttcaaatccattctaattatgaaggaacattgttgcagatagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacatactgagtagtgga 12963224  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||| | |||||||||||||| || ||   | | | || ||||||||| |||||    
T  12963223 gatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacactcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaaaccttctaaaatagttgttgcttcac 12963124  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    |||||  |||||||||| || |||| |  |||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||  ||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  12963123 tctcccagtcttctgcattgcttagacaagattaaatcccttgaacaacccttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgat 12963024  T
Q  424 cttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttg 477  Q
    |  |||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12963023 c--ttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaagagcactttg 12962971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 25 - 451
Target Start/End: Original strand, 13948158 - 13948584
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  13948158 gtgaaagagacgttgtgaattgctagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaattaccaatgatctttttcctaatatggttattgtccta 13948256  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||    
T  13948257 tgaaggatcaatttcaaatccattccacgtacgtaggaacattgttgcaggcagatctgttatccttgtcttgtagtagagacacaacctgagtaatgga 13948356  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | | ||  || |||| |||| |||||    
T  13948357 gataatggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcac 13948456  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    | | |  ||||||||||||| |||| || ||||||||| |||| ||| ||||||| |||| ||||||  ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  13948457 tattccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacatcctttgacgctttaagtcttgcatctcctgatgagctttagcttctggtgat 13948556  T
Q  424 cttttgcttctaatgatgtgcttctgat 451  Q
    |||  |||||| ||||  ||||||||||    
T  13948557 cttcagcttctgatgagatgcttctgat 13948584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 25 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 16658956 - 16658541
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||    
T  16658956 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagattcatttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcatgatatggttattgtcata 16658857  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  16658856 tgaaggattaatttcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactaagtagtgga 16658757  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| || || | | ||  || |||| |||| |||||    
T  16658756 ggtagtggttgtacacttcgtacaattgtattatgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcac 16658657  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    |   |||||||| || |||| || | || |||| |||| |||| ||||||||||||| || ||||||  ||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  16658656 tgctctggtcttttgtaatgcttggacgagattgaatcaattgaacaacctttgaagtttcaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgat 16658557  T
Q  424 cttttgcttctaatga 439  Q
    |||  |||||| ||||    
T  16658556 cttcagcttctgatga 16658541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 25 - 492
Target Start/End: Original strand, 37467155 - 37467606
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  37467155 gtgaaagagacgttgtgaattgtcagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttaatcaatcataaatgatcttttgcctgatatggttattgtctta 37467253  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  37467254 tgaatgatcaatttcaaatccattcccagtatgcaggaacattgttgcgggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgggtagtgga 37467353  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | | ||  || |||| |||| |||||    
T  37467354 gatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcac 37467453  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    ||| |  ||||||| ||||| ||||  | |||||||||||||| |||| |||||||| || |||| |  ||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  37467454 tcttccagtcttctacaatgcttagatgagattaaatccattgaacaagctttgaagatttaagttttgcatctcctgatgaactactgcttctggtgat 37467553  T
Q  424 cttttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||                |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  37467554 ct----------------tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagctctttgacttcaggagcactt 37467606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 25 - 489
Target Start/End: Original strand, 28581928 - 28582408
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  28581928 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgctatggttattgtccta 28582026  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  28582027 tgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctgtttttcttgttttgtaccagagacaaaaactgagtagtgga 28582126  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||  || | ||||||||||||||| |||| | | ||  || |||| |||| |||||    
T  28582127 ggtagtggttgtacacttcgtacaattgtattttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccattaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcac 28582226  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    ||| |   ||||||||||||  ||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||||| |||||||| |  |||||||||||||    
T  28582227 tcttccaatcttctgcaatgcatagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaaatagagcttctggtgat 28582326  T
Q  424 cttttgcttctaa------------tgatg----tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagca 489  Q
     ||  ||||||||            |||||    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28582327 tttcagcttctaatgtacttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcaccacttcaggagcactttgtcttcaggagca 28582408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 28 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 13780918 - 13780575
Alignment:
Q  28 aaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacga 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |    
T  13780918 aaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctgatatggttattgtcctcaaa 13780820  T
Q  128 aggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagat 227  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  13780819 aggatcaatttcaaatctattccatgtacgtaggaacattgttgcaggcaaagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtcgtggagat 13780720  T
Q  228 agtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactct 327  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | | ||  || |||| |||| ||||||||    
T  13780719 agtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaataacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactct 13780620  T
Q  328 cctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaa 371  Q
        ||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||    
T  13780619 ttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaa 13780575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 25 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 38177980 - 38177566
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38177980 gtgaaagagacgttgtgaattgtcagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctgatatggttattgtccta 38177882  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     ||||||||||||||||||  |||| || | || |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| || |||  ||||||||||    
T  38177881 tgaaggatcaatttcaaatcaattctcattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagttgtttttcttgtcttgtagcagagtcaaaaatagagtagtgga 38177782  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | | ||  || ||||||||| |||||    
T  38177781 ggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcac 38177682  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    ||| |   ||||||||| || | || || |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| || || ||||  |||||||| ||||    
T  38177681 tcttccaatcttctgcattgctcagacgagattaaattcattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctaataaactagagcttctgatgat 38177582  T
Q  424 cttttgcttctaatga 439  Q
    ||| ||||||| ||||    
T  38177581 cttctgcttctgatga 38177566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 25 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 12389209 - 12388821
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||| |    
T  12389209 gtgaaagagacgttgtgaattctcagcacatcaaaa-aagagtcgttagaagctttgatcaatcaccaacgatcttttgcctgatttggttattgtccaa 12389111  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||| || |||||| |||| ||||||||||    
T  12389110 tgaaggatcaatttcaaatccattccaagtctaaaggaacatcgttgcaggcatagttgttattctagtcttgttgcagagacaaaaacagagtagtgga 12389011  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||| ||| |  |||||||||||||||| || ||| ||||||||||| || | |||||    
T  12389010 ggtagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttgccaacgctcttcaaagaagaagcatccaatgccttaaaattcttttgaattagtcgtagcttcac 12388911  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagct 414  Q
    | | ||| |||||||||||  ||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  12388910 tgttctgatcttctgcaattctagacatgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctctcatcttcttatgatcttcagct 12388821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 25 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 17239259 - 17238858
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  17239259 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaataatcaatgatcttttgcctgatatggtttttgtccta 17239161  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     | ||||||| ||||||||  ||||  |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||| |||||||||    
T  17239160 tggaggatcagtttcaaatcaattcaaagtatgaaggaacattactgcaggcagagctgttattcttgtcttatagtagagatacaaactaagtagtgga 17239061  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||| |||||||||| || || | | ||  || |||| | || |||||    
T  17239060 gatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaatcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgatgcttcac 17238961  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    ||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||  ||||| || ||| |||||| |||||||||||    
T  17238960 tcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgatcagcctttgaagctttaagtcttgcatctccttatgcacttcatcttctggtgat 17238861  T
Q  424 ctt 426  Q
    |||    
T  17238860 ctt 17238858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 25 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 19249749 - 19249361
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgt-gaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||    
T  19249749 gtgaaagagacgttgttgaattgccagcacatcaaaa-aagagtcgtttgaagcttttatcaatcaccaatgatcttttgcctgattttgttattgtcct 19249651  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
    | |||||||||||||| ||| |||||| ||| || ||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||| || |||||| ||||   |||||||    
T  19249650 atgaaggatcaatttcgaatccattccaagtctgaaggaacactgttgcaggcgtagctgttattcttgacttgttgcagagaca-aaacaatgtagtgg 19249552  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattca 323  Q
    ||  ||||||||||||| |||||||||||  || | ||| ||||||| ||| | ||| ||||||||||||| || | | |||||||||| ||||| ||||    
T  19249551 agtaagtggttgtacacttcgtacaattgtcctatttcagcgctcttcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatccttttgaattagctgttgcttca 19249452  T
Q  324 ctctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagct 414  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  19249451 ctcttctggtcttctgcaatgctaggcgtgattaaatcgtttgaacaacctttgaagctttaagtctctcatcttctaatgatcttcagct 19249361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 25 - 528
Target Start/End: Original strand, 47207527 - 47208033
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcaca-tcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||    
T  47207527 gtgaaagagacgttgtgaattgctagctcattcaaaataa-agtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgattttttgcctgatatggtcattgtcct 47207625  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
    | |||| ||||||||||||| |||||||| | || | |||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||    
T  47207626 atgaagaatcaatttcaaatgcattcccattgtgaatgaacatcgttgcaggctgaactgtttttcttgtcttgtagcaaagacaaaaacagagtagtgg 47207725  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcattt-gaattagttgttgattc 322  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| ||  ||||||  || |||  |||| |||    
T  47207726 aggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaa-atcatttcaaactagccgttgcttc 47207824  T
Q  323 actctcctggtcttctgcaatg--ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggt 420  Q
    ||| | |  |||||||||||||  |||| || |||||||||||||| ||||||||||||| || |  | |  ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  47207825 acttttccagtcttctgcaatgctttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagtttta--tgttgcatctcctgatgaactgcagcttctggt 47207922  T
Q  421 gatcttttgcttctaatgatgt---gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcag 517  Q
    ||| ||  |||||| |||| ||   |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||| | || || |||||||    
T  47207923 gattttcagcttctgatgaagttcagcttctgatgacgtcaccacttcaagagcaccttgtcttcaggagcactttgtcttcaggagcagttttcttcag 47208022  T
Q  518 atgcttcaagc 528  Q
    | |||| ||||    
T  47208023 acgctttaagc 47208033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 43 - 453
Target Start/End: Original strand, 6090572 - 6090982
Alignment:
Q  43 attgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaa 142  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  6090572 attgccagcacatcaaaata-gagtcgttcgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctgatatgattattgtcctatgaagaatcaatttcaaa 6090670  T
Q  143 ttcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacat 242  Q
    | ||| || | |  |  |||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  6090671 tccataccaattgagagggaatatcgttgcaggaagagctgtttttcttgtcttgcagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 6090770  T
Q  243 cgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaa 342  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| || ||| | ||||||| ||||||||| || | | ||  |||||| ||||| |||||||| || |||||||||||    
T  6090771 cgtacaattgtactttgtcaaagctttttaaagaacaagcattcaatgccttcaaatcctttcaaattagatgttgcttcactcttctagtcttctgcaa 6090870  T
Q  343 tg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatg 441  Q
    || |||| || ||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||      
T  6090871 tgcttagacgagattaaatccattgagcaacctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatcttctgcttctgatgaga 6090970  T
Q  442 tgcttctgatga 453  Q
    ||||| ||||||    
T  6090971 tgcttttgatga 6090982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 25 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 49553826 - 49553325
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  49553826 gtgaaagagacgttgtgaattgtcaacacatcaaaata-gagtcgtttgacgctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtccta 49553728  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||| || || |||| ||| ||||||||||| |||||| |||  ||||||||||    
T  49553727 tgaaggatcaatttcaaattcattcccattgtgaaggaacatcgttgcagacaaagttgtttttcctgtcttgtagcagagacaaaaatagagtagtgga 49553628  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||   || | ||| ||||||||||||| || | | ||  || ||||   || |||||    
T  49553627 ggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcactgcttcac 49553528  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    |||     |||||||||||| |||| ||   ||||||| |||  ||| |||||||| ||| ||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  49553527 tctttcaatcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacagcctttgaaactttaagtcttgcatctcctgatgaacttcggcttctggtgat 49553428  T
Q  424 cttttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttct-cttcagatgct 522  Q
    |  || ||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    |||||||||| ||  |||||| | ||||||| ||||||| |||    
T  49553427 c--ttacttctgatgagatgcttctaatgacgtcatcacttaaggagcacttttacctcaggagcac-ttatcttcaggagcacttctacttcagacgct 49553331  T
Q  523 tcaagc 528  Q
    ||||||    
T  49553330 tcaagc 49553325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 25 - 453
Target Start/End: Original strand, 52920230 - 52920655
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||  |||| ||    
T  52920230 gtgaaagagacgttgtgaattgccagtacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcatcaatgatcttttgcctgatatggtt--tgtcata 52920326  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| |||||| | |  |    ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||| |||| | ||||| ||    
T  52920327 tgaaggatcaatttcaaatccattccaattgagagaaaacatcgttgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtatcagagacaaaaacagggtagtaga 52920426  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||  | ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| || | | ||| |||||||||||| |||||    
T  52920427 ggtagtggttgtatacttcgtacaattttaatttgtcaacgctctttaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatac-tttaaattagttgttgcttcac 52920525  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    ||| || ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||  || |||||||| ||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52920526 tcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgagcagcctttgaaactttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgat 52920625  T
Q  424 cttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    |||  |||||| ||||  ||||||||||||    
T  52920626 cttcagcttctgatgagatgcttctgatga 52920655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 25 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22804359 - 22804092
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  22804359 gtgaaagagac-ttgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttaaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtccta 22804262  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  22804261 tgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgagggaacaaagttgcaggcagagctgttattcttgtcctgtagcagagacacaaattgagtagtgga 22804162  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 294  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  22804161 gatagtggttttacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaatcatcgaatgcctt 22804092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 26 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 47405757 - 47405362
Alignment:
Q  26 tgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctac 125  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||     
T  47405757 tgaaagagacgttgtgaattgtcagcatatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctat 47405659  T
Q  126 gaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggag 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | | || ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||    
T  47405658 gaaggatcaatttcaaatgcattcctattgtgaaggaacatctttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacatagtagtggag 47405559  T
Q  226 atagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcact 325  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||  || | ||| |||| |||||||| || | | ||  || ||||||||| |||| |    
T  47405558 gtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactctttgaagaacaaacatcaaatgccttcaaatcctttcaaactagttgttgcttcatt 47405459  T
Q  326 ctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
     | |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||| |  | |  |||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  47405458 tttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta--tgttgcatctcgtgatgaactgcagcttctggtgat 47405362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 85 - 423
Target Start/End: Original strand, 16032406 - 16032743
Alignment:
Q  85 aatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgt 184  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||| |||||||||| || |||    
T  16032406 aatcaccaatgattttttgcctgatatggtcattgtcctatgaaggatcaatttcaaatccatttcaagtatgaaggaacatcgttgcaggcatagttgt 16032505  T
Q  185 tattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcat 284  Q
    |||| ||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||| | |||||||    
T  16032506 tattgttgtcatgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaagcat 16032605  T
Q  285 ccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttg 384  Q
    |||||||||| || | | ||  || |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||     
T  16032606 ccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgatacactctcctggtcttctgcagtgataggcatgattaaatcctttgaacaacctttgaagcttt 16032705  T
Q  385 aagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  16032706 aagtctctcatcttctgatg-acttcaacttcgggtgat 16032743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 25 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 12726567 - 12726121
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  12726567 gtgaaagagacgttgtgaatttccagcacatcaaaatat-agtcatttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtgtgatatggttattatccta 12726469  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| | |  |  ||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  12726468 tgaaggatcaatttcaaattcagtccaattgagagggaacatcgttccaggcagagttgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgga 12726369  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||| ||||| ||| || ||||||||||||| || || | | ||  || |||| |||  |||||    
T  12726368 ggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgttaactctctttaaagagtaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttacttcac 12726269  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    ||| || ||||||||||| | |||| || |||| ||||||||| | | |||||||||||| ||||||   |||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  12726268 tcttctagtcttctgcaaagcttagacgagattgaatccattgaatagcctttgaagctttaagtcttgaatctcctgatgaacttcaacttcttgtgat 12726169  T
Q  424 cttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagca 472  Q
    |  ||| |||| ||| |  || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12726168 c--ttgtttctcatgaacttgtttctgataacgtcatcacttcaggagca 12726121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 25 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 19889280 - 19888842
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||    
T  19889280 gtgaaagagacgttatgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgactgatatggttattttacta 19889182  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     ||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||    
T  19889181 tgaatgatcaatttcaaatccattctcagtatgttggaacattgttgcaggtagagttgttatccttatcttgtagcagagacacaaactgag--gtgga 19889084  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||  || || ||| | |||||||||||||| || || | | ||  || |||| |||| |||||    
T  19889083 gatagtggttgtacacttcgtacaattgtaatatgtcaatcctattcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcac 19888984  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtaca-acctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtga 422  Q
    ||  |||||||| ||||||| || | || |||| ||||||||| |||  | ||| |||||| ||||||  |||||  |||||||||| ||||||| ||||    
T  19888983 tcatctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagtctttttaagctttaagtcttgcatctcttgatgaactttagcttctagtga 19888884  T
Q  423 tcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttc 465  Q
    ||  |||||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||||    
T  19888883 tc--ttgcttctgatgaacttgcttctgatgatgtcatcacttc 19888842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 423
Target Start/End: Original strand, 20724903 - 20725306
Alignment:
Q  18 taaaggagtgaaagagacgttgt-gaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaa-tcaccaatgatcttttgtctaatatggtt 115  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||| |||  ||||| ||||||||||||||||| || || |||||    
T  20724903 taaaggtgtgaaagagacgttgttgaattgccaacacatcaaaa--agagtcgttagaatctta-atcaaatcaccaatgatcttttgcctgatttggtt 20724999  T
Q  116 attgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactg 215  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||| |||||| ||| |  ||||||||||||| |||||  |||||| |||| |    
T  20725000 attgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtctgaaggaacatcgttgcaagcataattgttattcttgtcctgtagtagagaca-aaacag 20725098  T
Q  216 agtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttg 315  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || || ||||||||||||| ||| || | | ||||||||||| |    
T  20725099 agtagtggagatagttattgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgctcttcaagaaacaagcatccaatgtcttcaaatccttttgaattagtcg 20725198  T
Q  316 ttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagctt 415  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||  ||| ||| |||||||||||| || ||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  20725199 ttgcttcactcttctggtcttctgcaatgctagacgtgattagatcttttgaacagcctttgaagctttaattctctcagcttatgatgatcttcagctt 20725298  T
Q  416 ctggtgat 423  Q
    ||||||||    
T  20725299 ctggtgat 20725306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 25 - 383
Target Start/End: Original strand, 40799695 - 40800054
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcaca-tcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  40799695 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacattcaaaat-agagtcgtttaaagctttgatcaatcaacaatgatcttttccttgatatggttattgtcct 40799793  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
    | ||| |||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  40799794 atgaatgatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacattgttgcaggcagagctgtttttcttatcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgg 40799893  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattca 323  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | |||| ||||||| |||| || | | ||  || |||| |||| |||     
T  40799894 aggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagtatccaattccttcaaatactttcaaactagtcgttgcttcg 40799993  T
Q  324 ctctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagctt 383  Q
    || | |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  40799994 cttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctt 40800054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 28 - 453
Target Start/End: Original strand, 15903022 - 15903449
Alignment:
Q  28 aaagagacgttgtga-attgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacg 126  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||  ||||||  |    
T  15903022 aaagagacgttgtcatattgccagcacatcaaaatat-agtcgtttgaagctttgatcaatcaccaacgatcttttgcctgatatggttgatgtcctctg 15903120  T
Q  127 aaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggaga 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15903121 aaggatcaatttcaaatccattccatgtatgtgggtacattgttgcaggcagagctgttatccttgtcatttagtagagacacaaactgagtagtggaga 15903220  T
Q  227 tagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt-aaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcact 325  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||  |||||| |||||| || || | | ||  || |||| |||| ||||||    
T  15903221 tagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaaagcatgcaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcact 15903320  T
Q  326 ctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatc 424  Q
    || || |||||||| |||| |||| || |||| ||||||||| ||| | |||||||||| ||||||  ||||| ||||| || | |||||| ||||||||    
T  15903321 cttctagtcttctgtaatgcttagacgagattgaatccattgaacagcgtttgaagctttaagtcttgcatctcctgataaattacagcttttggtgatc 15903420  T
Q  425 ttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    ||  |||||| ||||  || |||||||||    
T  15903421 ttcagcttctgatgagatggttctgatga 15903449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 50 - 383
Target Start/End: Original strand, 41494847 - 41495179
Alignment:
Q  50 gcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattc 149  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  41494847 gcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaataatcttt-gcctgatatggttattgatctatgaatgatcaatttcaaattcattc 41494944  T
Q  150 ccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaa 249  Q
    | |||||   |||| || |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41494945 caagtataagggaatatcgttgcatgcatagctgttattcttatcttgtagcagatacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaa 41495044  T
Q  250 ttggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttag 348  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | | ||  || |||| |||| |||||||| |  ||||||||||||| ||||    
T  41495045 ttgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgtttag 41495144  T
Q  349 gcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagctt 383  Q
     || |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  41495145 acgagattaaatccattgaacagcctttgaagctt 41495179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 28 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 20627766 - 20627372
Alignment:
Q  28 aaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacga 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  20627766 aaagagacgttgtgaattgccagcacattcaaaacagagtcgtttgaagatttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatga 20627667  T
Q  128 aggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagat 227  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | || |||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||| | ||||  |||||||||| |    
T  20627666 aggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagttgtttttcttatcttgtagcagagataaaaacaaagtagtggaggt 20627567  T
Q  228 agtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactct 327  Q
    ||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||| || | ||||  || ||||||||| |||||| |    
T  20627566 agtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgataaacaagcatccaatgccttcaaatccattcaaaatagttgttgcttcacttt 20627467  T
Q  328 cctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
     |  ||||||||||||  |||| || | || ||||||||  ||| | |||||||||| |||  |  ||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  20627466 tccagtcttctgcaatcattagacgagtttgaatccattaaacatcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcaacttctggtgat 20627372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 25 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 25398592 - 25398348
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  25398592 gtgaaagagacgttatgaattgccagcacatcaaagta-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtccta 25398494  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     ||||||||||||| |||| |||||| | |  |  ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  25398493 tgaaggatcaattttaaatccattccaattgagagggaacatcgttgcaggcagagctgtttttattgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgga 25398394  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  25398393 ggtagtggttgtacacttcgtacaattgtgctttgtcaacgctctt 25398348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 25 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 18121949 - 18121552
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  18121949 gtgaaagagacgttgtgaattgtcagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagcttt--tcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtccta 18121853  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     ||||||||||||||||||||||||| | |  |  ||||        |||  |||| |||| ||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||    
T  18121852 tgaaggatcaatttcaaattcattccaattgagagggaa--------cagatagagttgtttttcttgtcttgtagcagagacaaacacagagtagtgga 18121761  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  || |  |||||| |||||||||||| | | ||  || ||||||||| |||||    
T  18121760 ggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtaaacgctctttgaagaaaaagcattcaatgcctttaaatcctttcaaaatagttgttgcttcac 18121661  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    ||| |  ||||||||||||| | |  || |||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  18121660 tcttccagtcttctgcaatgctcaaacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaaatcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgat 18121561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 25 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 18143081 - 18142696
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  18143081 gtgaaagagacgttgtgaattgtcagcacatcaaaata-gagttgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtccta 18142983  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     ||||||||||||||||||||||||| | |  |  ||||        |||  |||| |||| ||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||    
T  18142982 tgaaggatcaatttcaaattcattccaattgagagggaa--------cagatagagttgtttttcttgtcttgtagcagagacaaacacagagtagtgga 18142891  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  || |  |||||| |||||||||||| | | ||  || ||||||||| |||||    
T  18142890 ggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtaaacgctctttgaagaaaaagcattcaatgcctttaaatcctttcaaaatagttgttgcttcac 18142791  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctg 418  Q
    ||| |  ||||||||||||| | |  || |||| ||||||||| | | |||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||  ||||||||    
T  18142790 tcttccagtcttctgcaatgctcaaacgagattgaatccattgaatagcctttgaagctttaaatcttgcatctcctgatgaactagagcttctg 18142696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 25 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 46350180 - 46349769
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46350180 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttcatcaatcatcaatgatcttttgcctaatatggttattgtccta 46350082  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacaca-aactgagtagtgg 223  Q
     ||| |||||||||| ||| |||| ||| | || |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| | |||  ||||||||    
T  46350081 tgaacgatcaatttc-aatgcatt-ccattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctgttttttttgtcttgtagcagagacaaagaacatagtagtgg 46349984  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattca 323  Q
    ||  ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| | |||   || | ||||||||||||||||| || | | ||  ||||||| |||| ||||    
T  46349983 aggcagtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaatgttctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaattagtcgttgcttca 46349884  T
Q  324 ctctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtga 422  Q
    || | |  ||||||||||||| |||| || ||||  ||| |||| ||||| |||||||  | ||||  ||  ||| |||||||||| || ||||||||||    
T  46349883 cttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattggatcaattgaacaacttttgaagtcttaagttgct--tctcctgatgaactgcaacttctggtga 46349786  T
Q  423 tcttttgcttctaatga 439  Q
    | ||  |||||||||||    
T  46349785 ttttcagcttctaatga 46349769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 63 - 489
Target Start/End: Original strand, 11223422 - 11223848
Alignment:
Q  63 agagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagg 161  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | || |||    
T  11223422 agagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgatattttgcctgatgtagttattgtcctatgaaggatcaattttaaatgcattcccattgtgaagg 11223521  T
Q  162 aacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtc 261  Q
    ||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||    
T  11223522 aacatcgttgcaggcaaagttgtttttcttgtcttgtagcagagaca-aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacatactttgtc 11223620  T
Q  262 aacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaat 360  Q
    |||||||||  || | ||||||||||||||||| || | | ||  || |||| |||| |||||| |    |||||||||||||  ||| || |||| ||     
T  11223621 aacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactttttcagtcttctgcaatgcatagacgagattgaac 11223720  T
Q  361 ccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcat 459  Q
    |||||| ||| | |||||||||  |||| | | |||| |||||||||| | |||||||||||| ||  | |||| ||| |  |||||||||||||||||     
T  11223721 ccattgaacagcttttgaagctcaaagt-tgt-atctcctgatgaactgctgcttctggtgattttcagattctgatgaacttgcttctgatgacgtcac 11223818  T
Q  460 cacttcaggagcactttgttttcaggagca 489  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11223819 cacttcaggagcactttgtcttcaggagca 11223848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 25 - 270
Target Start/End: Original strand, 11868090 - 11868335
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcaca-tcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  11868090 gtgaaagagactttgtgaatttccagcacattcaaaat-agagttgtttaaagctttgctcaatcaccaatgatcttttgcctgataaggttattgtcct 11868188  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||| |  | |||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  11868189 aagaaggatcaatttcaaatgcattcccattgcgaaggaacatcgttgcaggctgagttgtttttcttgttttgtagcagagacaaaaacagagtagtgg 11868288  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  11868289 aggtagtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaacgctctt 11868335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 215
Target Start/End: Original strand, 17668230 - 17668417
Alignment:
Q  28 aaagagacgttgtga-attgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacg 126  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||       
T  17668230 aaagagacgttgtcacattgccagcacatcaaaataa-agtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtccttta 17668328  T
Q  127 aaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactg 215  Q
    |||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  17668329 aaggatcaatttcaaatagattccatgtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactg 17668417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 33 - 294
Target Start/End: Original strand, 29855237 - 29855499
Alignment:
Q  33 gacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaagg 130  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  29855237 gacgttgtgaattgtcagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctaagaagg 29855335  T
Q  131 atcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagt 230  Q
    ||||||||||||  |||||||| | || |||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||| ||||    
T  29855336 atcaatttcaaaagcattcccattgtgaaggaacaacgttgcaggtagaactgtttttcttgtcttgtagcagagataaaaacagagtagtggaggtagt 29855435  T
Q  231 ggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 294  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||| ||  || | |||||||||||||||||    
T  29855436 ggttgtacacttcgtacaaacgtactctgtcaacgctttttgaagaacaagcatccaatgcctt 29855499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 291
Target Start/End: Original strand, 21640689 - 21640954
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  21640689 gtgaaagagacgttg--aattgccagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcc 21640785  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    || ||||||||||||||||||   |||||| | || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||  ||||||||    
T  21640786 tatgaaggatcaatttcaaatgtgttcccaatgtgaagaaacattgttggaggcagagctgttattcttgtcttgtaaaagagacaaaaatagagtagtg 21640885  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 291  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||  | ||| |||||||||||||  ||||  |||||||||||||    
T  21640886 gagatagtggttgtacacttcgtaaaaacgtactatgtcaacgctctttgaaaaataagcatccaatgc 21640954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 270
Target Start/End: Original strand, 2784887 - 2785130
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  2784887 gtgaaagagacgttg--aattgccagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgatcatttgcctgatatggttattgtcc 2784983  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
     | |||||||||||||||||| |||||||| |  | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || | ||||||||    
T  2784984 aaagaaggatcaatttcaaatgcattcccattgagaaggaacattcttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagaca-aatcagagtagtg 2785082  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  2785083 gaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt 2785130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 270
Target Start/End: Original strand, 33583052 - 33583295
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  33583052 gtgaaagagacgttg--aatttccaggacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcc 33583148  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  ||||| ||    
T  33583149 taagaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaacattgttgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcagagaca-aaatagagtattg 33583247  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||    
T  33583248 gaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctt 33583295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 294
Target Start/End: Original strand, 14955250 - 14955517
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  14955250 gtgaaagagacgttg--aactgccagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagattttgatcaatcatcaatgatcatttgcctgatatggttattgtcc 14955346  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    || ||| |||||||||||||| |||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||    
T  14955347 taagaatgatcaatttcaaatgcattcccattgagaaggaacattgttgcaggcagagctatttttcttgtcttgtagcagagata-aaacagagtagtg 14955445  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 294  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||  || |  ||||||||||||||||    
T  14955446 gaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 14955517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Original strand, 13823900 - 13824256
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||  | | |    |||||  | |||||||||||||||||    
T  13823900 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaacaa-agtcgtttgaagatttgatcaatttcaatttcaattttgcatgatatggttattgtccta 13823998  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| |||||| | |  |  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||           
T  13823999 tgaaggatcaatttcaaatccattccaattgagagggaacatcgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagag------- 13824091  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcattt-gaattagttgttgattca 323  Q
      |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||| ||||||||||||| ||  ||||||  || ||||||||| ||||    
T  13824092 --tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaa-atcatttcaaaatagttgttgcttca 13824188  T
Q  324 ctctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtct 390  Q
    |||| |  ||||||| || || |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  13824189 ctcttccagtcttcttcattgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtct 13824256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 49666742 - 49666519
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||     
T  49666742 gtgaaagagacgttg--aatttccagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgataaatcaccaatgatcctttgcctgatatgattattgtct 49666646  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    || |||||||||||||||||| | |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || | ||||||||    
T  49666645 tatgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgaaggaacattgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacagaatcagagtagtg 49666546  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaa 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  49666545 gagatagtggttgtacacttcgtacaa 49666519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 40 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 1728339 - 1728129
Alignment:
Q  40 tgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttc 139  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1728339 tgaattgccagcacatccaaaatagagtcgtttgaagctttgataattcaccattgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttc 1728240  T
Q  140 aaattcattcccagtatgtaggaacattg-ttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtac 238  Q
    ||||   |||||| | ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  1728239 aaatgtgttcccaatgtgtataaacattgtttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtac 1728140  T
Q  239 acatcgtacaa 249  Q
    || ||||||||    
T  1728139 acttcgtacaa 1728129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 28 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 21605988 - 21605726
Alignment:
Q  28 aaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctac 125  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||     
T  21605988 aaagagacgttg--aattgccagcacattcaaaata-gaatcgtttgaagtttttgatcaatcaccaatgatcctttgcctgatatggttattatcctat 21605892  T
Q  126 gaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggag 225  Q
    ||||||||||||||||||   |||||| | || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  21605891 gaaggatcaatttcaaatgtgttcccaatgtgaagaaacattgttggaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggag 21605792  T
Q  226 atagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 291  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  | | | |||||||||||||  || |  |||||||||||||    
T  21605791 atagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 21605726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 40 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 24775857 - 24775554
Alignment:
Q  40 tgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatt 137  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  24775857 tgaatttccagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgattctttgcctaatatg-ttattgtcctatgaaggatcaatt 24775760  T
Q  138 tcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgta 237  Q
    |||||| |||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||  |||||||||||    
T  24775759 tcaaatgcattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctgttttacttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggatgtagtggttgta 24775660  T
Q  238 cacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttc 337  Q
    ||| ||||||||  | |||||||||| ||||||  || |  |||||| ||||||||| || | | ||  || ||||||||| |||||| | |  ||||||    
T  24775659 cacttcgtacaaacgtactttgtcaaagctctttgaagaataagcattcaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttc 24775560  T
Q  338 tgcaat 343  Q
    ||||||    
T  24775559 tgcaat 24775554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 25 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 46796704 - 46796222
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |    
T  46796704 gtgaaagagacgttg--aattgtcagcacattaaaaatagagccgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcat 46796607  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
    | ||| ||||||||||||||  ||||||  |  | || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||    
T  46796606 atgaaagatcaatttcaaatgtattccctttgagaagaaacattgttgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacaaagtagtgg 46796507  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattca 323  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  ||| ||| ||||||||| |         ||||||  ||||    |    
T  46796506 agatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagtatctaatgcctttca---------aattagccgttgtaata 46796416  T
Q  324 ctctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    || | |  |||||||||||| |||| || | || ||||| ||  ||||| |||||||||| |||  |  ||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  46796415 cttttccagtcttctgcaatcttagacgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcagcttcttgtgat 46796318  T
Q  424 cttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcaga 518  Q
         |||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| | || || ||||||||    
T  46796317 tcacagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactctgtcttcaggagcactttaacttcaggagcagttttcttcaga 46796222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 40 - 290
Target Start/End: Original strand, 22140599 - 22140850
Alignment:
Q  40 tgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatt 137  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22140599 tgaattgccagcatattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaattaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatt 22140697  T
Q  138 tcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgta 237  Q
    |||||  | |||||| | || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  22140698 tcaaacgcgttcccaatgtgcaggaacattgttgcaggcagagctatttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttata 22140797  T
Q  238 cacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatg 290  Q
    ||| |||||||   | ||| |||||||||||||  || | |||||||||||||    
T  22140798 cacttcgtacatacgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatg 22140850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 249
Target Start/End: Original strand, 5213399 - 5213622
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt--gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtc 121  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||    
T  5213399 gtgaaagagacgttg--aattgccagcacattcaaaata-gaatcgtttgaagctttttgatcaatcaccaatgatcctttgcctgatatggctattgtc 5213495  T
Q  122 ctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagt 221  Q
    ||| ||| |||||||||||||| |||||||| |  | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||| |||||||    
T  5213496 ctaagaatgatcaatttcaaatgcattcccattgagaaggaacattgttgcacgcagagctgtttttcttgtcttgtagcatagaca-aaacagagtagt 5213594  T
Q  222 ggagatagtggttgtacacatcgtacaa 249  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  5213595 ggaggtagtggttgtacacttcgtacaa 5213622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 30054554 - 30054310
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  30054554 gtgaaagagacgttg--aattgccagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcc 30054458  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    || ||||||  || ||||||| | |||||| | ||    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  30054457 tatgaaggaataaattcaaatgcgttcccaatgtgagtaaacattgttgcaggcagagctgttatctttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtg 30054358  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    ||| |||||||||||||  ||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  30054357 gagttagtggttgtacatttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt 30054310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 57 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 9700343 - 9700131
Alignment:
Q  57 aaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtat 156  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||   |||||| | |    
T  9700343 aaaaaaagagtcgtttgaagctttgataattcaccattgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaattttaaatgtgttcccaatgt 9700244  T
Q  157 gtaggaacattgtt-gcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggac 255  Q
    ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  | ||    
T  9700243 gtatgaacattgtttgcaggcagagatgttattcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttatacacttcgtacaaacgcac 9700144  T
Q  256 tttgtcaacgctc 268  Q
    | |||||||||||    
T  9700143 tatgtcaacgctc 9700131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 53057052 - 53056796
Alignment:
Q  40 tgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatt 137  Q
    ||||||| |||||||| |||||  |||||| ||||||||||| ||||||||| |||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  53057052 tgaattgtcagcacattcaaaaatagagtcttttgaagcttttgatcaatcagcaattattttttgcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaatt 53056953  T
Q  138 tcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgta 237  Q
    |||||| |||| ||| | || | ||||||  |||||| || | ||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  53056952 tcaaatgcattaccattgtgaatgaacatctttgcagacataactgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgta 53056853  T
Q  238 cacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 294  Q
    ||| ||||||||  | ||||||| |||||||||  || | |||||||||||||||||    
T  53056852 cacttcgtacaaacgtactttgtaaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctt 53056796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 25 - 426
Target Start/End: Original strand, 12968130 - 12968528
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaa-tcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| || || ||||||||||| |    
T  12968130 gtgaaagagacgttgtttattgccaacacatcaaaa--agagtcgtttgaagctt-gatcaaatcaccaatgatctattgcctgatttggttattgtcat 12968226  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
      ||||||  ||||||||||  ||||| |||||| ||||| | |  || ||||| ||||||| |||||||  | | || || ||| |||| |||||||||    
T  12968227 gtgaaggagaaatttcaaatatattccaagtatggaggaatactagtgtaggcatagctgttgttcttgtactattgcagacaca-aaacagagtagtgg 12968325  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattca 323  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||  ||||| |||| ||| |  ||| |||||||||||| || ||| ||||||||||| |||  ||||    
T  12968326 agatagtggttgtacacttcgtataattgtccttttccaacgttcttcaaagaataagtatccaatgccttcaaattcttttgaattagtcgttacttca 12968425  T
Q  324 ctctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
      || || ||||||||||||| |||  ||||||||| |  ||  |||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||  | |||||| ||| ||||    
T  12968426 tgcttctagtcttctgcaatgatagatgtgattaaaacatttaaacaacctttgaagcttcaaatctttcagcttctgatggtcctcagctcctgatgat 12968525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 26418019 - 26417616
Alignment:
Q  18 taaaggagtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaa-tcaccaatgatcttttgtctaatatggtta 116  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||  || || ||||||    
T  26418019 taaaggtgtgaaagagacgttgtcgattgccaacacatcaaaa--agagtcgtttgaagctt-gatcaaatctccaatgatctgttccctgatttggtta 26417923  T
Q  117 ttgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactga 216  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||  | ||||| || | ||| | |  ||||| | | || || ||| |||| ||    
T  26417922 ttgtcctatgaaagatcaatttcaaatccattccaagtatggaggaacaccggtgcagacacatctgctgt--ttgtcctattgcagacaca-aaacaga 26417826  T
Q  217 gtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgt 316  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||   |||  ||||| |||  ||| |   ||||||||||||||| || ||| ||||||||||  ||    
T  26417825 gtagtgaagatagtggttgtacactttgtacaattgtcattttccaacgttctccaaagaatgagcatccaatgccttcaaattcttttgaattagccgt 26417726  T
Q  317 tgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttc 416  Q
    || |||| ||| || |||||||| |||| |||||||||||||| |  ||| |||| ||||||||||| || ||| ||| |||||||||| ||||| || |    
T  26417725 tgcttcattcttctagtcttctggaatgataggcgtgattaaaacatttgaacaaactttgaagcttcaattctttcagcttctgatgatcttcaactcc 26417626  T
Q  417 tggtgatctt 426  Q
    || |||||||    
T  26417625 tgatgatctt 26417616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 25 - 185
Target Start/End: Original strand, 16812035 - 16812194
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaa-ttgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  16812035 gtgaaagagacattgtgaaattgccagcacatcaaaa--agagtcgtttgaagctttgaccaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttgttgtcct 16812132  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgtt 185  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||| |||||||| ||| |||||    
T  16812133 atgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggtagatctgtt 16812194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 40 - 223
Target Start/End: Original strand, 50300068 - 50300251
Alignment:
Q  40 tgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatt 137  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  50300068 tgaattgtcagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcatcaatgatcctttgcctgatatgattattgtcctaagaaggatcaatt 50300166  T
Q  138 tcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
    | |||| |||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  50300167 taaaatgcattcccattgtgaaggaacattgttgcagacagagctgtttttcttgtcttgtagcagagaca-aaacagagtagtgg 50300251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 25 - 213
Target Start/End: Original strand, 3238515 - 3238703
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaa-ttgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||| || || |||||||||||||    
T  3238515 gtgaaagagaagttgtgaaattgccagcacattcaaa-aagagtcgtttgaaactttgatcaattacgagtgatcttttgcctgatttggttattgtcct 3238613  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaac 213  Q
    | ||||||||||||||||||   |||||| |  | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  3238614 atgaaggatcaatttcaaatgtgttcccattccgaaggaacattgttgcaggcagagatgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaac 3238703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 63 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 21636971 - 21636742
Alignment:
Q  63 agagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagg 161  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||   |||| | | || |      
T  21636971 agagtagtttgaagcttttgatcaatcatcaatgatcatttgcctgatatggttattgttctatgaaggatcaatttcaaatgtgttccaaatgtgaata 21636872  T
Q  162 aacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtc 261  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  | ||| ||||    
T  21636871 aacattgttgcaggcagagttgttttgcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtc 21636772  T
Q  262 aacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 291  Q
    |||||||||  || |  |||||||||||||    
T  21636771 aacgctctttgaagaataagcatccaatgc 21636742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 23538508 - 23538146
Alignment:
Q  18 taaaggagtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaa-tcaccaatgatcttttgtctaatatggtta 116  Q
    |||||| |||||||| |||||||  ||||  ||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||| || ||||||    
T  23538508 taaaggtgtgaaagaaacgttgttgattgttagcacatcaaaagcag--tcgtttgaagctt-gatcaaatcaccattgatcttttctctgatttggtta 23538412  T
Q  117 ttgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactga 216  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||  |||| ||||| ||||||| |||||||| | | |  || | | ||||       
T  23538411 ttgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattcaaagtctggaggaacaccgttgtaggcatagctgttgttcttgtcctattgaagacata-aaacaat 23538313  T
Q  217 gtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||| |||  ||| |  |||||| ||||||||| || ||| |||||| ||   ||    
T  23538312 gtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgttctctaaagaataagcattcaatgccttcaaattcttttgaaataaccgt 23538213  T
Q  317 tgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagctt 383  Q
    || |||| ||| |  ||||||||||||| |||||||||||||| |  ||| |||| |||||||||||    
T  23538212 tgtttcattcttccagtcttctgcaatgataggcgtgattaaaacatttgaacaaactttgaagctt 23538146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 218 - 476
Target Start/End: Original strand, 14969341 - 14969601
Alignment:
Q  218 tagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgtt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||  || |  |||||||||||||| | || | | ||  || ||||||||    
T  14969341 tagtggagatagtggttgtacacttcgtaaaaatgtactttgtcaacgctatttgaagaataagcatccaatgccatcaaatcctttcaaaatagttgtt 14969440  T
Q  318 gattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttc 416  Q
    | || ||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| | || |||||||  ||||||    
T  14969441 gctttactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatatcctcatgaactagagcttc 14969540  T
Q  417 tggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 476  Q
    ||||||||||  || ||| ||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14969541 tggtgatcttcagcatctgatgaacttgcttatgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 14969601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 79 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 12752904 - 12752743
Alignment:
Q  79 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcag 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||| |||||  ||||||  |||||| | | || ||||||||| ||||||||||    
T  12752904 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaatgatcacgttcaaagccattcctattctgaaggaacatttttgcaggcag 12752805  T
Q  179 agctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  12752804 agctgtttttcttgtcttgtagcgtagacataaacagagttgtggagatagtggtcgtacac 12752743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 79 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 45861856 - 45861695
Alignment:
Q  79 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcag 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| | | || |||||||||  |||||||||    
T  45861856 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctattctgaaggaacatttctgcaggcag 45861757  T
Q  179 agctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||| ||||||| ||||||    
T  45861756 agctgttttttttgtcttgtagcgtagacataaacatagtagtggaggtagtggtcgtacac 45861695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 63 - 247
Target Start/End: Original strand, 51340869 - 51341054
Alignment:
Q  63 agagtcgtt-tgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagg 161  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| |||||||||  ||||||| |||||| | | || |||    
T  51340869 agagtcgttgtgaaaccttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtactatgaaggatcacgttcaaatccattcctattctgaagg 51340968  T
Q  162 aacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtac 247  Q
    ||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  51340969 aacatttctgcgggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtac 51341054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 169
Target Start/End: Original strand, 14969192 - 14969332
Alignment:
Q  28 aaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacga 127  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||| ||||||||||||  |    
T  14969192 aaagagacgttgtgaattgttagcatatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatatttttcctgatatagttattgtcctataa 14969290  T
Q  128 aggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgt 169  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | |  |||||||||||    
T  14969291 aggatcaatttcaaatccattcccattgtaaaggaacattgt 14969332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 63 - 223
Target Start/End: Original strand, 40850835 - 40850996
Alignment:
Q  63 agagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagg 161  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||  || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||| | || |      
T  40850835 agagtcgtttgaagcttttgatctatcagcaatgatccttttcctgatatggttattgtcctatgaaagatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgaata 40850934  T
Q  162 aacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  40850935 aacattgttgaaggcagagttgttatccttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgg 40850996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 79 - 240
Target Start/End: Original strand, 15833281 - 15833440
Alignment:
Q  79 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcag 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || ||| | |||||||| |||||||||  |||||||  ||||| | |  | |||||||||  |||||||||    
T  15833281 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatcaattcctatt--gaaggaacatttctgcaggcag 15833378  T
Q  179 agctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15833379 agctgtttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacac 15833440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 79 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 11909310 - 11909117
Alignment:
Q  79 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatgg-ttattgtcctacgaaggatcaat-ttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| | | ||  ||||||||  |||||||    
T  11909310 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctaatttgggttgttgtcctatgaaggatcaaagttcaaatccattcctattctgagggaacatttctgcaggc 11909211  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  ||||| ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||| |   | |||||||||||||||||    
T  11909210 agagctgtttttcttgtcttgtaacatagacataaacaaagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtaaagacgtactttgtcaacgctctt 11909117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 79 - 247
Target Start/End: Original strand, 10529222 - 10529389
Alignment:
Q  79 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcag 178  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| || || ||| | |||||||| |||||||||  ||||||| |||||| |   || |||||||||  |||||||||    
T  10529222 ttgatcaaataccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcag 10529321  T
Q  179 agctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtac 247  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  10529322 agctgtt-ttcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacacttcgtac 10529389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 79 - 234
Target Start/End: Original strand, 15850884 - 15851039
Alignment:
Q  79 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcag 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || ||| | |||||||| |||||||||  ||||||| |||||| |   || |||||||||  || ||||||    
T  15850884 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctggaggcag 15850983  T
Q  179 agctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggtt 234  Q
    |||| || |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  15850984 agctatttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggtt 15851039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 63 - 249
Target Start/End: Original strand, 37412463 - 37412650
Alignment:
Q  63 agagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagga 162  Q
    ||||||| |||||||||| || | |||||| ||||| |||  || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||  | || |  |    
T  37412463 agagtcgattgaagcttttatgattcaccattgatcattttcctgatatagttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgagttccccatgtgcataa 37412562  T
Q  163 acattgtt-gcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaa 249  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  37412563 acattgtttgcaggcatagctgttttacttgtcttgtagtgaagacagaaacagagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaa 37412650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 63 - 223
Target Start/End: Original strand, 49990119 - 49990280
Alignment:
Q  63 agagtcgtt-tgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagg 161  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||| | |||||||| |||||||||  ||||||| |||||| |   || |||    
T  49990119 agagtcgttgtgaaactttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaagg 49990218  T
Q  162 aacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
    ||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| || | |||||||||    
T  49990219 aacatttctgcaggcaaagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacataagcagagtagtgg 49990280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Original strand, 16076999 - 16077161
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | | |||||  |||| ||||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||    
T  16076999 ctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacattgctgcaggc 16077098  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16077099 agagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 16077161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 126 - 240
Target Start/End: Original strand, 27883502 - 27883615
Alignment:
Q  126 gaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggag 225  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||   || |||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  27883502 gaagaatcaatttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggag 27883600  T
Q  226 atagtggttgtacac 240  Q
     ||||||||||||||    
T  27883601 gtagtggttgtacac 27883615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 63 - 238
Target Start/End: Original strand, 22151104 - 22151280
Alignment:
Q  63 agagtcgtt-tgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagg 161  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||| || || ||| | ||||| || |||||||||  ||||||| |||||| |   || | |    
T  22151104 agagtcgttgtgaaactttgatcaaacagcaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcttatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaag 22151203  T
Q  162 aacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtac 238  Q
    ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | || | |||||| ||||||||||||    
T  22151204 aacatttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacacaagcagaatcgtggaggtagtggttgtac 22151280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 150
Target Start/End: Original strand, 6253242 - 6253365
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaa-tcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||  | || |||||||||||||    
T  6253242 gtgaaagagacgttgttgattgtcagcacatcaaaa--agagttgtttgaagctt-gatcaaatcaccaatgatctgttgcttgatttggttattgtcct 6253338  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcc 150  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||    
T  6253339 atgaaggaacaatttcaaattcattcc 6253365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 117 - 239
Target Start/End: Original strand, 41045657 - 41045778
Alignment:
Q  117 ttgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactga 216  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |   || |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||    
T  41045657 ttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctaacttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttat-cttgtcttgtagcgtagacacaatcaga 41045755  T
Q  217 gtagtggagatagtggttgtaca 239  Q
    || |||||| |||||||||||||    
T  41045756 gtcgtggaggtagtggttgtaca 41045778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 51989307 - 51989146
Alignment:
Q  79 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcag 178  Q
    ||||||||  ||||||||||||||  || || ||| | ||||||||  ||| ||||  ||||||| |||||| |   || |||||||||  |||||||||    
T  51989307 ttgatcaaataccaatgatctttttcctgatttggatgttgtcctataaagaatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcag 51989208  T
Q  179 agctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || | |||||| ||||||||||||||    
T  51989207 agctgtttttcttgtcttgtagcgtagacacaaacagattcgtggaggtagtggttgtacac 51989146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Original strand, 1053779 - 1053941
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| ||||| ||| | | |||||  |||| ||||| ||||||||||||||||   || |||||||||  | |||||    
T  1053779 ctttgatcatccaccagtaatcttttgcctaatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctacaggc 1053878  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  1053879 agagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacac 1053941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Original strand, 1064208 - 1064370
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | | |||||  |||| ||||| ||||||||||||||||   || |||||||||  ||||||     
T  1064208 ctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggt 1064307  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  1064308 agagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 1064370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Original strand, 2246437 - 2246599
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |   || |||||||||  |||||||    
T  2246437 ctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacatttatgcaggc 2246536  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||| | |||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  2246537 agagctgttgt-cttgtcttgtagcatagacaaaaacagagtagtggaggtagtagttgtacac 2246599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 117 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 31114111 - 31113989
Alignment:
Q  117 ttgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactga 216  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||  |||||| |   || |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||    
T  31114111 ttgtcctatgaaggatcaagttcaaaaccattcctaacttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttat-cttgtcttgtagcgcagacacaagcaga 31114013  T
Q  217 gtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    || |||||| ||||||||||||||    
T  31114012 gtcgtggaggtagtggttgtacac 31113989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 63 - 240
Target Start/End: Original strand, 13148124 - 13148302
Alignment:
Q  63 agagtcgtt-tgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagg 161  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| || || ||| | |||||||| |||||||||  ||||||| |||||| |   || |||    
T  13148124 agagtcgttgtgaaaccttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaagg 13148223  T
Q  162 aacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||| |  |||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||| ||  |  ||| |||||| ||||||||||||||    
T  13148224 aacaattctgcaggtagagctgtttttcttgtcttgtatcgtagacgcacgcatagtcgtggaggtagtggttgtacac 13148302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 29933724 - 29933561
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatc-aatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcagg 175  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | |||||||| |||||||| || ||||||| |||||| |   || |||||||||  ||||||    
T  29933724 ctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcgaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcagg 29933625  T
Q  176 cagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||| || | |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  29933624 cagagctattgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 29933561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 29982878 - 29982715
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatc-aatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcagg 175  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | |||||||| |||||||| || ||||||| |||||| |   || |||||||||  ||||||    
T  29982878 ctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcgaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcagg 29982779  T
Q  176 cagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||| || | |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  29982778 cagagctattgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 29982715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 137 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15216445 - 15216343
Alignment:
Q  137 ttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgt 236  Q
    ||||||||||||||||   || |||||||||  |||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15216445 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 15216347  T
Q  237 acac 240  Q
    ||||    
T  15216346 acac 15216343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 399 - 500
Target Start/End: Original strand, 11869262 - 11869364
Alignment:
Q  399 ctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgt-gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgact 497  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||  |||||| ||||  | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  11869262 ctgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatgaaattgcttctgatgacatcaccacttcaggagcactttgttgtcaggagcgctttgtct 11869361  T
Q  498 tca 500  Q
    |||    
T  11869362 tca 11869364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Original strand, 40851197 - 40851247
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40851197 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagcactt 40851247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 49666321 - 49666271
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49666321 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagcactt 49666271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Original strand, 17021982 - 17022063
Alignment:
Q  159 aggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||    
T  17021982 aggaacatttctgcaggcagagctgtttatcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacac 17022063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 393 - 523
Target Start/End: Original strand, 15833576 - 15833710
Alignment:
Q  393 catcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatga--tgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcac 490  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||     |||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  15833576 catcttctgatgaactgtagcttctggtgatacacagcttctgatgaactttgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactttgtcttcaggagcac 15833675  T
Q  491 tt--tgacttcagaatcacttctcttcagatgctt 523  Q
    ||  | ||||||||  || || |||||||||||||    
T  15833676 ttcataacttcagacgcagttttcttcagatgctt 15833710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 240
Target Start/End: Original strand, 4404402 - 4404504
Alignment:
Q  137 ttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgt 236  Q
    ||||||||||||||||   || |||||||||  ||||||||  |||||| | |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4404402 ttcaaattcattcccaacttgaaggaacatttctgcaggcatggctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 4404500  T
Q  237 acac 240  Q
    ||||    
T  4404501 acac 4404504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 240
Target Start/End: Original strand, 4457045 - 4457147
Alignment:
Q  137 ttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgt 236  Q
    ||||||||||||||||   || |||||||||  ||||||||  |||||| | |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4457045 ttcaaattcattcccaacttgaaggaacatttctgcaggcatggctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 4457143  T
Q  237 acac 240  Q
    ||||    
T  4457144 acac 4457147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 8996061 - 8995959
Alignment:
Q  137 ttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgt 236  Q
    ||||||||||||||||   || |||||||||  ||||||||  |||||| | |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  8996061 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcatggctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 8995963  T
Q  237 acac 240  Q
    ||||    
T  8995962 acac 8995959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 9006613 - 9006511
Alignment:
Q  137 ttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgt 236  Q
    ||||||||||||||||   || |||||||||  ||||||||  |||||| | |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9006613 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcatggctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 9006515  T
Q  237 acac 240  Q
    ||||    
T  9006514 acac 9006511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 240
Target Start/End: Original strand, 28169211 - 28169313
Alignment:
Q  137 ttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgt 236  Q
    ||||||||||||||||   || ||||||| |  |||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28169211 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 28169309  T
Q  237 acac 240  Q
    ||||    
T  28169310 acac 28169313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 240
Target Start/End: Original strand, 38314828 - 38314931
Alignment:
Q  137 ttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgt 236  Q
    ||||||||||||||||   || |||||||||  ||||||||   ||||| ||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  38314828 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcatgactgtttttcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 38314927  T
Q  237 acac 240  Q
    ||||    
T  38314928 acac 38314931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 8740243 - 8740130
Alignment:
Q  126 gaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggag 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||   || |||| || |  |||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||  ||| |||||||||||    
T  8740243 gaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggagcaattctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggag 8740145  T
Q  226 atagtggttgtacac 240  Q
     ||||||||||||||    
T  8740144 gtagtggttgtacac 8740130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13199409 - 13199245
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |   || |||| ||||  |||||||    
T  13199409 ctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggatcatttctgcaggc 13199310  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagac--acaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||||  ||||||||||||||  ||||  | |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  13199309 agagctgtt-gtcttgtcttgtagcatagacaaaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 13199245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 17281549 - 17281436
Alignment:
Q  126 gaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggag 225  Q
    |||| ||||| ||||||||||||  || | || |||||||||  |||||| | ||||||| || ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  17281549 gaagaatcaacttcaaattcattttcattttgaaggaacatttctgcaggtatagctgttgtt-ttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggag 17281451  T
Q  226 atagtggttgtacac 240  Q
     ||||||||||||||    
T  17281450 gtagtggttgtacac 17281436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 30054147 - 30054097
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  30054147 tgcttctgatgacgtcatcacttcatgagcactttgtcttcaggagcactt 30054097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 443 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 46349749 - 46349692
Alignment:
Q  443 gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttca 500  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  46349749 gcttctgatgacgtcaccacttcaggagcactttgtcttcaggagcattttgccttca 46349692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 1794589 - 1794485
Alignment:
Q  137 ttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagac-acaaactgagtagtggagatagtggttg 235  Q
    ||||||||||||||||   || |||||||||  ||||||||  |||||| ||||||||||||||||  ||| | |||| ||||||||||| |||||||||    
T  1794589 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcatggctgtttttcttgtcttgtagcgtggacaaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 1794490  T
Q  236 tacac 240  Q
    |||||    
T  1794489 tacac 1794485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 150
Target Start/End: Original strand, 12396889 - 12397015
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatc-aatcaccaatgatcttttgtctaat---atggttattgt 120  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||  | ||    ||||||||||    
T  12396889 gtgaaagagacgttgttgattgtcagcacatcaaa--aagagtcgtttgaag-tttgatcaaatcaccaatgatttgttgcttgatttggtggttattgt 12396985  T
Q  121 cctacgaaggatcaatttcaaattcattcc 150  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  12396986 cctatgaaggaacaatttcaaatccattcc 12397015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 523
Target Start/End: Original strand, 13977956 - 13978039
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt--tgacttcagaatcacttctcttcagatgctt 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||  || || |||||||||||||    
T  13977956 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactttgtcttcaggagcacttcataacttcagacgcagttttcttcagatgctt 13978039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 523
Target Start/End: Original strand, 15851173 - 15851256
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt--tgacttcagaatcacttctcttcagatgctt 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||  || || |||||||||||||    
T  15851173 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactttgtcttcaggagcacttcataacttcagacgcagttttcttcagatgctt 15851256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18851797 - 18851698
Alignment:
Q  137 ttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgt 236  Q
    ||||||||||||||||   || ||||||| | ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18851797 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaattttgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 18851699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 12567375 - 12567273
Alignment:
Q  137 ttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgt 236  Q
    ||||||||||||||||   || ||||||| |  |||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| |||||||| || ||||||||||    
T  12567375 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtgaaggtagtggttgt 12567277  T
Q  237 acac 240  Q
    ||||    
T  12567276 acac 12567273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13261778 - 13261676
Alignment:
Q  137 ttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgt 236  Q
    ||||||||||||||||   || ||||||| |  |||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| |||||||| || ||||||||||    
T  13261778 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaattctgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtgaaggtagtggttgt 13261680  T
Q  237 acac 240  Q
    ||||    
T  13261679 acac 13261676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 493
Target Start/End: Original strand, 14955695 - 14955746
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcacttt 493  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  14955695 tgcttctgatgacgtcattacttcaggagcactttgtcttcaggagcgcttt 14955746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 21636585 - 21636538
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagca 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  21636585 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcacgagca 21636538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 445 - 488
Target Start/End: Original strand, 33583502 - 33583545
Alignment:
Q  445 ttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagc 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33583502 ttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagc 33583545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 445 - 488
Target Start/End: Original strand, 33598122 - 33598165
Alignment:
Q  445 ttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagc 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33598122 ttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagc 33598165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 443 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 1727930 - 1727880
Alignment:
Q  443 gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcacttt 493  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  1727930 gcttctgatgacgtcatcactttagaagcactttgtcttcaggagcacttt 1727880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Original strand, 13824286 - 13824336
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  13824286 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttttacttcaggagcactt 13824336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 21605569 - 21605519
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  21605569 tgcttctgatgacgtcatcacttcctgagcactttgtcttcaggagcactt 21605519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Original strand, 37412860 - 37412910
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  37412860 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactttgtcttcaggagcactt 37412910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 488
Target Start/End: Original strand, 50300455 - 50300501
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagc 488  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  50300455 tgcttctgatgacgtcattacttcaggagcactttgtcttcaggagc 50300501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Original strand, 52920659 - 52920709
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  52920659 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttttacttcaggagcactt 52920709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 491
Target Start/End: Original strand, 10529567 - 10529616
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcact 491  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  10529567 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactttgtcttcaggagcact 10529616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 14321765 - 14321685
Alignment:
Q  159 aggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||||  |||||| |||| |||| | |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14321765 aggaacatttctgcaggaagagttgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 14321685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 427 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 19249333 - 19249288
Alignment:
Q  427 ttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagca 472  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19249333 ttgcttctgatgaggtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagca 19249288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 240
Target Start/End: Original strand, 21736222 - 21736342
Alignment:
Q  119 gtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagt 218  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| |   ||| |||||| |  |||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||  | | ||    
T  21736222 gtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgtgggaacaattctgcaggcagagctgtta-acttgtcttgtagcgaggacacactcagggt 21736320  T
Q  219 agtggagatagtggttgtacac 240  Q
     |||||| ||||||||||||||    
T  21736321 cgtggaggtagtggttgtacac 21736342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 444 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 53056631 - 53056586
Alignment:
Q  444 cttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagca 489  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53056631 cttctgatgacgtcaccacttcaggagcactttgtcttcaggagca 53056586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 1784177 - 1784073
Alignment:
Q  137 ttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagac-acaaactgagtagtggagatagtggttg 235  Q
    ||||||||||||||||   || |||||||||  ||||||||  |||||  ||||||||||||||||  ||| | |||| ||||||||||| |||||||||    
T  1784177 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcatggctgtgtttcttgtcttgtagcgtggacaaaaaacagagtagtggaggtagtggttg 1784078  T
Q  236 tacac 240  Q
    |||||    
T  1784077 tacac 1784073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29906305 - 29906186
Alignment:
Q  117 ttgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactga 216  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |   || ||||| |||  |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||  ||    
T  29906305 ttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaaaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaataga 29906207  T
Q  217 gtagtggagatagtggttgta 237  Q
    |||||  || |||||||||||    
T  29906206 gtagtataggtagtggttgta 29906186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29947470 - 29947351
Alignment:
Q  117 ttgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactga 216  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |   || ||||| |||  |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||  ||    
T  29947470 ttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaaaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaataga 29947372  T
Q  217 gtagtggagatagtggttgta 237  Q
    |||||  || |||||||||||    
T  29947371 gtagtataggtagtggttgta 29947351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29996624 - 29996505
Alignment:
Q  117 ttgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactga 216  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |   || ||||| |||  |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||  ||    
T  29996624 ttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaaaatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaataga 29996526  T
Q  217 gtagtggagatagtggttgta 237  Q
    |||||  || |||||||||||    
T  29996525 gtagtataggtagtggttgta 29996505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 492
Target Start/End: Original strand, 31303649 - 31303693
Alignment:
Q  448 tgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  31303649 tgatgacgtcatcacttcaggagcactttgacttcaggagcactt 31303693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 480 - 528
Target Start/End: Original strand, 31303664 - 31303712
Alignment:
Q  480 ttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  31303664 ttcaggagcactttgacttcaggagcacttctcttcagatgctttaagc 31303712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 480 - 528
Target Start/End: Original strand, 41495249 - 41495297
Alignment:
Q  480 ttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  41495249 ttcatgagcactttgacttcagaagcacttctcttcagatgctttaagc 41495297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 480 - 528
Target Start/End: Original strand, 52920680 - 52920728
Alignment:
Q  480 ttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  52920680 ttcaggagcacttttacttcaggagcacttctcttcagatgcttcaagc 52920728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 9380711 - 9380660
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtaca 239  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  9380711 tcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaca 9380660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16391686 - 16391620
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgta 237  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  16391686 tgcaggcatagctgttgtt-ttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggagatagtggttgta 16391620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 150
Target Start/End: Original strand, 16882110 - 16882233
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtga-attgccagcacatcaaaataagagtcgtt--tgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtc 121  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||   ||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||| |||  | || |||| ||||||    
T  16882110 gtgaaagagacgttgtttgattgccagcacatcaaaa---gagtcgttgttgaagctt-gat-aatcaccaatgatctgttgcttgatttggtcattgtc 16882204  T
Q  122 ctacgaaggatcaatttcaaattcattcc 150  Q
    ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  16882205 ctaagagggaacaatttcaaattcattcc 16882233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 18142688 - 18142641
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagca 489  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  18142688 tgcttctgatgacgtcaccacttcaggaacactttgtcttcaggagca 18142641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 528
Target Start/End: Original strand, 2785333 - 2785419
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||  |||||| | || || |||||||| |||| ||||    
T  2785333 tgcttcagatgacgtcatcacttcaggagcactttatcttcatgagcgctttatcttcaggaacagttttcttcagacgctttaagc 2785419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 6490421 - 6490352
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  6490421 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 6490352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 6501075 - 6501006
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  6501075 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 6501006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 9380434 - 9380400
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 476  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9380434 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 9380400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 9699985 - 9699935
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  9699985 tgcttctgatgacgtcaacacttcagaagcactttgtcttcagaagcactt 9699935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 11216793 - 11216724
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11216793 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 11216724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 12388763 - 12388729
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 476  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12388763 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 12388729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 14077686 - 14077564
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtt--tgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||   ||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||| ||   | || ||||||||||||    
T  14077686 gtgaaagagacgttgttgattggcagcacatcaaaa---gagtcgttgttgaagctt-gat-aatcaccaatgatctgtttcttgatttggttattgtcc 14077592  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcc 150  Q
    |  || ||| ||||||||||||||||||    
T  14077591 ttggagggaacaatttcaaattcattcc 14077564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Original strand, 15903453 - 15903503
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||    
T  15903453 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgacttaaggagcactt 15903503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16666243 - 16666130
Alignment:
Q  126 gaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggag 225  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||   || ||||||| |  |||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||  |||  ||||||||||    
T  16666243 gaagaatcaacttcaaattcattcacatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaagaacaaagtagtggag 16666145  T
Q  226 atagtggttgtacac 240  Q
     ||||||||||||||    
T  16666144 gtagtggttgtacac 16666130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Original strand, 20646409 - 20646459
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||    
T  20646409 tgcttctgatgacgtcatcacttcatgaacactttgacttcaggagcactt 20646459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Original strand, 21641119 - 21641169
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  21641119 tgcttctgatgatgtcatcactttatgagcactttgtcttcaggagcactt 21641169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Original strand, 23635873 - 23635942
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23635873 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 23635942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 523
Target Start/End: Original strand, 23636150 - 23636232
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttga-cttcagaatcacttctcttcagatgctt 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| |||||||| | |||||||  || || |||||||||||||    
T  23636150 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttcagcttcagaagcactttaagcttcagacgcagttttcttcagatgctt 23636232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 353 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 25398282 - 25398184
Alignment:
Q  353 gattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatg 452  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||    || |||||| |||||||  |||||||||||  |||||||||||    
T  25398282 gattaaattcattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatcttatgatga--gacaacttctgatgatcttcagcttctaatgagatgcttctgatg 25398185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 443 - 528
Target Start/End: Original strand, 29855664 - 29855749
Alignment:
Q  443 gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||  |||||| | || || |||||||| |||| ||||    
T  29855664 gcttctgatgacgtaaccacttcagaagcactttgtcttcaggagcgctttatcttcaggagcagttttcttcagacgctttaagc 29855749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 480 - 528
Target Start/End: Original strand, 6091007 - 6091055
Alignment:
Q  480 ttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    |||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  6091007 ttcatgagcactttaacttcaggagcacttctcttcagatgcttcaagc 6091055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 522
Target Start/End: Original strand, 8775116 - 8775196
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgct 522  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||| |||  |||||| | || || ||||||||||||    
T  8775116 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcagtttagcttcaggagcagtttagcttcaggagcagttttcttcagatgct 8775196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 522
Target Start/End: Original strand, 8785701 - 8785781
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgct 522  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||| |||  |||||| | || || ||||||||||||    
T  8785701 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcagtttagcttcaggagcagtttagcttcaggagcagttttcttcagatgct 8785781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 10626996 - 10626944
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  10626996 tcttgtcttgtagcgtagacaaaagcagagtagtggaggtagtggttgtacac 10626944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 10655318 - 10655266
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  10655318 tcttgtcttgtagcgtagacaaaagcagagtagtggaggtagtggttgtacac 10655266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 480 - 528
Target Start/End: Original strand, 15903474 - 15903522
Alignment:
Q  480 ttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    ||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  15903474 ttcagaagcactttgacttaaggagcacttctcttcagatgcttcaagc 15903522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 480 - 528
Target Start/End: Original strand, 37467577 - 37467625
Alignment:
Q  480 ttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  37467577 ttcaggagctctttgacttcaggagcacttatcttcagatgcttcaagc 37467625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 522
Target Start/End: Original strand, 39383150 - 39383230
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgct 522  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||| |||  |||||| | || || ||||||||||||    
T  39383150 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcagtttagcttcaggagcagtttagcttcaggagcagttttcttcagatgct 39383230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 6490143 - 6490108
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttg 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6490143 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 6490108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 6500797 - 6500762
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttg 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6500797 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttg 6500762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 9391257 - 9391206
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtaca 239  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  9391257 tcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggtggtaca 9391206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 240
Target Start/End: Original strand, 13557756 - 13557807
Alignment:
Q  190 ttgtcttgtagcggagacacaaa-ctgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  13557756 ttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggagatagtggttgtacac 13557807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 16199716 - 16199666
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcacttt 493  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  16199716 tgcttctgatgacgtcatcagttcaggagcac-ttgacttcaggagcacttt 16199666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 18121526 - 18121479
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagca 489  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  18121526 tgcttctgatgatgtcaccacgtcaggagcactttgtcttcaggagca 18121479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Original strand, 933791 - 933859
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  933791 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 933859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 476
Target Start/End: Original strand, 4404729 - 4404763
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 476  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4404729 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 4404763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Original strand, 6090986 - 6091036
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||   |||||||||||||    
T  6090986 tgcttctgatgacgtcataacttcatgagcactttaacttcaggagcactt 6091036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 7794678 - 7794610
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  7794678 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 7794610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 9390997 - 9390963
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 476  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9390997 tgcttctgatgacatcatcacttcaggagcacttt 9390963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 9993964 - 9993896
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  9993964 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 9993896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 11216516 - 11216434
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttc 524  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||    ||||| ||||||||  |||||||  || || ||||||||||||||    
T  11216516 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagaacttcagcttcagaagcactttagcttcagacgcagttttcttcagatgcttc 11216434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 12249511 - 12249443
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  12249511 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 12249443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Original strand, 13948590 - 13948640
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||| ||||||||    
T  13948590 tgcttctgatgacgtcatcacttcatgagcattttgacttcaagagcactt 13948640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 17238858 - 17238809
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||    
T  17238858 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcac-ttgacttcaggagcactt 17238809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19887425 - 19887357
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19887425 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggagttagtggttgtacac 19887357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 24706626 - 24706557
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24706626 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacac 24706557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Original strand, 41495228 - 41495278
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||    
T  41495228 tgcttctgatgacatcatcacttcatgagcactttgacttcagaagcactt 41495278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Original strand, 48337405 - 48337473
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  48337405 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 48337473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 4174550 - 4174517
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4174550 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 4174517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 4174812 - 4174759
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaa-ctgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  4174812 tcttgtcttgtagcgcagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 4174759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 6220496 - 6220463
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6220496 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 6220463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 11167930 - 11167963
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11167930 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 11167963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 13558015 - 13558048
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13558015 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 13558048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 16391392 - 16391359
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16391392 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 16391359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 16476719 - 16476752
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16476719 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 16476752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 16493478 - 16493511
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16493478 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 16493511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 17909797 - 17909748
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcact 491  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||    
T  17909797 tgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcactttagcttcaggagcact 17909748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 18851486 - 18851453
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18851486 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 18851453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 19778826 - 19778859
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19778826 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 19778859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 124
Target Start/End: Original strand, 20418055 - 20418151
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtt-tgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    ||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||  | || |||||||||||||    
T  20418055 gtgaaagagacgttgttgattgttagcacatcaaaa--agagtcgttgtgaagctt-gatcac-caccaatgatcttttgcttgatttggttattgtcct 20418150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 20672990 - 20672957
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20672990 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcactt 20672957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 20683575 - 20683542
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20683575 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcactt 20683542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 23648189 - 23648222
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23648189 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 23648222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 23757739 - 23757772
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23757739 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 23757772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 25398180 - 25398147
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25398180 tgcttctgatgacgtcgtcacttcaggagcactt 25398147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 150
Target Start/End: Original strand, 27374586 - 27374709
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtt--tgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||  |||||||||  ||||| || ||| ||||||||||||||| | |  | || ||||||||||||    
T  27374586 gtgaaagagacgttgcagattgccaacacatcaaaa--agagtcgttgttgaaggtt-gat-aatcaccaatgatctatagcttgatttggttattgtcc 27374681  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcc 150  Q
    || ||  || ||||||||||||||||||    
T  27374682 taagagagaacaatttcaaattcattcc 27374709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 29461008 - 29460927
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgctt 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||| ||||||||  |||||||  || || |||||||||||||    
T  29461008 tgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcacttcagcttcagaagcactttagcttcagacgcagttttcttcagatgctt 29460927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #201
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 29471860 - 29471779
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgctt 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||| ||||||||  |||||||  || || |||||||||||||    
T  29471860 tgcttctgatgacgtcatcacttcagatgcacttcagcttcagaagcactttagcttcagacgcagttttcttcagatgctt 29471779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #202
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 37866886 - 37866919
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37866886 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 37866919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #203
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 37886002 - 37886035
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37886002 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 37886035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #204
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 39672938 - 39672885
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaa-ctgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  39672938 tcttgtcttgtagcgtagacagaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 39672885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #205
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 443 - 476
Target Start/End: Original strand, 40800098 - 40800131
Alignment:
Q  443 gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 476  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40800098 gcttctgatgacgtcaccacttcaggagcacttt 40800131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #206
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 442 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 1783848 - 1783816
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1783848 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 1783816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #207
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 9981939 - 9981888
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  9981939 tcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 9981888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #208
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 422 - 489
Target Start/End: Original strand, 10099487 - 10099557
Alignment:
Q  422 atcttttgcttctaatga---tgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagca 489  Q
    ||||||||||||| ||||   | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   ||||||||||    
T  10099487 atcttttgcttctgatgactttctgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcagtttagcttcaggagca 10099557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #209
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Original strand, 11164009 - 11164061
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||||||||||  ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11164009 tcttgtcttgtagcgtggacaagaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 11164061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #210
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 444 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 12237414 - 12237382
Alignment:
Q  444 cttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 476  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12237414 cttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 12237382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #211
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 12237668 - 12237617
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  12237668 tcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 12237617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #212
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 444 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 12249240 - 12249208
Alignment:
Q  444 cttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 476  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12249240 cttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttt 12249208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #213
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 480 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 16199695 - 16199648
Alignment:
Q  480 ttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  16199695 ttcaggagcactt-gacttcaggagcacttttcttcagatgcttcaagc 16199648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #214
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 17910056 - 17910005
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  17910056 tcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 17910005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #215
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 480 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 19249297 - 19249249
Alignment:
Q  480 ttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    |||||||||| ||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  19249297 ttcaggagcatttgaacttcagaaccacttttcttcagatgcttcaagc 19249249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #216
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 42 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 22766842 - 22766744
Alignment:
Q  42 aattgccagcacatcaaaataagagtcgtt-tgaagctttgatcaa-tcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttc 139  Q
    |||||||| ||||||||||   |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| |||  | || |||||||||||||| || ||| |||||||    
T  22766842 aattgccaacacatcaaaa---gagtcgttatgaagctt-gatcaaatcaccaatgatctgttgcttgatttggttattgtcctatgagggaacaatttc 22766747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #217
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 442 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 24775423 - 24775387
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgt 478  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24775423 tgcttctgatgacatcatcacttcagaagcactttgt 24775387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #218
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 29461267 - 29461216
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  29461267 tcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 29461216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #219
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 29472119 - 29472068
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  29472119 tcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 29472068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 4)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 25 - 464
Target Start/End: Original strand, 9727 - 10162
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||| || ||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  9727 gtgaaagagactttctgaattgtcaccacatcaaaa--agagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatctttttcctgatatggttattgtccta 9824  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||| | ||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||    
T  9825 tgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacatcgttgcaggcatagctttaattcttgtcctgtagcagagacacaaacatagtagtgga 9924  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||| | |||    
T  9925 ggtagtggttttacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaattcatttgaattagtcgttgttgcac 10024  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatc 424  Q
    ||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| | | ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  10025 tcttctgatcttctgcaatgctagacgtgattaaatccttagaacagcctttgaagctttaagtttctcatcttctgatgaacttcagcttctggtga-- 10122  T
Q  425 ttttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtcatcactt 464  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10123 tattgcttctaatgaggtgcttctgatgacgtcatcactt 10162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 262 - 492
Target Start/End: Original strand, 30283 - 30525
Alignment:
Q  262 aacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaat 360  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||| || || | | ||  || |||| |||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||| |||    
T  30283 aacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaat 30382  T
Q  361 ccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg------atg----tgcttctga 450  Q
    | |||| ||| |||||||||||| ||||||  ||||| |||||||| | || ||||||| ||||||  |||||| |||      |||    |||||||||    
T  30383 ctattgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaattacaacttctggagatcttcagcttctgatgcttcttatgaacctgcttctga 30482  T
Q  451 tgacgtcatcacttcaggagcac-tttgttttcaggagcactt 492  Q
    |||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  30483 tgactttatcacttcaggagcacttttgtcttcaggagcactt 30525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 32721 - 32639
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttc 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | | ||| ||||||||  |||||||  || || ||||||||||||||    
T  32721 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcacttcatctgcagaagcactttagcttcagacgcagttttcttcagatgcttc 32639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 33014 - 32946
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  33014 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 32946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 5)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 18 - 493
Target Start/End: Original strand, 32301 - 32778
Alignment:
Q  18 taaaggagtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttat 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||    
T  32301 taaaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatgaccaatgatcgtttgcctgatatggttat 32399  T
Q  118 tgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32400 tgtcctacgaaggatcaatttcaaatccattccatgtatgtaggaacatttttgcaggcaaagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgag 32499  T
Q  218 tagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgtt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||| || || | | ||  || |||| |||    
T  32500 tagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgcattcaaatcctttcaaaatagtcgtt 32599  T
Q  318 gattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttc 416  Q
      |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||| ||  ||     
T  32600 acttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagtctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaagttg 32699  T
Q  417 tggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcac-tttgttttcaggagcacttt 493  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  32700 tggtgatctttagcttctgatgaacttacttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttttgtcttcagaagcacttt 32778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 25 - 492
Target Start/End: Original strand, 49155 - 49623
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  49155 gtgaatgagacgttgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatctttttcctgatatggttattgtccta 49253  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     ||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||  |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49254 tgaatgatcaatttcaaatccattccatgtatgtaggaacatttttataggcagagttgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtgga 49353  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | | ||  || |||| |||| |||||    
T  49354 gatagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtagttgcttcac 49453  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    ||| |   |||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  49454 tcttcaaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaactttgaagctttaagacttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgat 49553  T
Q  424 cttttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcac-tttgttttcaggagcactt 492  Q
    |||  |||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  49554 cttcagcttctgatgagatgcttctgatgaagtcatcacttcaggagcacttttgtcttcaagagcactt 49623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 56986 - 56824
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | | |||||  |||| ||||| ||||||||||||||||   || |||||||||  |||||||    
T  56986 ctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggc 56887  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  56886 agagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 56824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 606 - 464
Alignment:
Q  79 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcag 178  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || || |  || ||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| | | ||  ||||||||  |||||||||    
T  606 ttgatcaatcaccaatgatcgtttgcctgatttacttgttgtcctataaaggatcaagttcaaatccattcctattctgagggaacatttctgcaggcag 507  T
Q  179 agctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagt 221  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  506 agctgtttttcttgtcttgtagcgtagacataaacagagtagt 464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 195 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 464 - 389
Alignment:
Q  195 ttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||   | |||||||||||||||||    
T  464 ttgtagcgaagacataaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacagacgtactttgtcaacgctctt 389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 7)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 25 - 453
Target Start/End: Original strand, 220061 - 220488
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  220061 gtgaaagagatgttgtgaattgccagcaaatcaaaata-gagtcaattgaagctttgatcaatcatcaatgatcttttgcctgttatggttattgtccta 220159  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     || ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  220160 tgatggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacattgttgcaggcatagctgttatccttgtcttttagcagaggcacaaactgagtagtgga 220259  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||  |||| |||||    
T  220260 ggtagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaataacaagcatccaatg-cttcaaattcatttgaattagccgttgcttcac 220358  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  220359 tctcctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaaaccaatgaacagcctttgaagctttaagtctctcatctcctgatgaacttcagcttctggtgat 220458  T
Q  424 cttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    |||  |||||| |||| |||||||||||||    
T  220459 cttcagcttctgatgaggtgcttctgatga 220488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 42 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 377830 - 377419
Alignment:
Q  42 aattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaa 141  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  377830 aattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaa 377732  T
Q  142 attcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacaca 241  Q
    || ||||||   ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  377731 atccattccatatatgtaggagcattcttgcaggcagagttgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacact 377632  T
Q  242 tcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaat-tagttgttgattcactctcctggtcttctgc 340  Q
    | ||||||||| |||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||| ||  || ||| ||| |||| |||| |||||||| | ||||||||||    
T  377631 tggtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaa-atcctttcaatatagtcgttgcttcactcttccggtcttctgc 377533  T
Q  341 aatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatga 439  Q
    |||| |||| || |||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||  ||||| ||||||||||  | ||||||||||||||  |||||| ||||    
T  377532 aatgcttagacgagattaaatccattcaacaacatttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactataacttctggtgatcttcagcttctgatga 377433  T
Q  440 tgtgcttctgatga 453  Q
      ||||||||||||    
T  377432 gatgcttctgatga 377419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 26 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 244568 - 244172
Alignment:
Q  26 tgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaa-tcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  244568 tgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaa--agagtcgtttgaagctt-gatcaaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttattgtccta 244472  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| | ||   ||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||  ||  ||| |||||| ||||||||||    
T  244471 tgaaggatcaatttcaaatccgtttaaagtctggaggaacatcgttgcaggcatagctgttattcttgtcctgatgc--agaaacaaacagagtagtgga 244374  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||| || | | |||||||||||||||| |||||    
T  244373 ggtagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgtcttcaaatccttttgaattagttgttgcttcac 244274  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatc 424  Q
    ||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||  ||| ||| |||||||| ||| || ||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||    
T  244273 tcttctggtcttctgcaacgccaggcgtgattaaatcttttgaacagcctttgaaacttcaattctctcatcttct-atgatcttcagctcctgatgatc 244175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 270
Target Start/End: Original strand, 211223 - 211465
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||    
T  211223 gtgaaagagacgttg--aattgccagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgatcattttcctgatatggttattgtcc 211319  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    ||  |||||| |||||||||| |||||||| |  | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  211320 taataaggataaatttcaaatgcattcccatt--gaaggaacatcattgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtg 211417  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    ||| |||| |||||| || ||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  211418 gaggtagtagttgtatacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt 211465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 493
Target Start/End: Original strand, 211650 - 211701
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcacttt 493  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  211650 tgcttctaatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagcgcttt 211701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 377415 - 377383
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  377415 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact 377383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 493
Target Start/End: Original strand, 220492 - 220542
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcacttt 493  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  220492 tgcttctgatgacgtcattacttcaggagcac-ttgacttcaggagcacttt 220542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 25 - 493
Target Start/End: Original strand, 5831 - 6295
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||    
T  5831 gtgaaagagacattgtgaattgccagcacatcaaaa--agactcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatctttttcctgatatggttattgtctta 5928  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||  |||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||| ||    
T  5929 tgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacaacgttgcaggcatagatgttattcttgtcctgtagcagagacacaaatagagtagtaga 6028  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||| |||      
T  6029 ggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttttgaattagttgttgcttcgg 6128  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatc 424  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||      
T  6129 tcttctggtcttctgcaatgctaggcgtgattaaatcctttgaacagtctttgaagctttaaatctctcatcttctgatgaacttcaacttctagtga-- 6226  T
Q  425 ttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcacttt 493  Q
    | |||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||    
T  6227 tattgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggaacac-ttgacttcaggagcacttt 6295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 4)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 25 - 426
Target Start/End: Original strand, 59839 - 60240
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  59839 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtaatttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctaatatggttattgtctta 59937  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||    
T  59938 tgaaggatcgatttcaaatccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagaaga 60037  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||| || | | ||  || |||| |||| |||||    
T  60038 gatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatggcttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcac 60137  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaa-tgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    | | |  ||||||||||| | || | || |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  60138 ttttccagtcttctgcaattcttggacgagattaaatccattgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatcttctgatgaactttagcttctggtgat 60237  T
Q  424 ctt 426  Q
    |||    
T  60238 ctt 60240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 25 - 492
Target Start/End: Original strand, 7749 - 8201
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  7749 gtgaaagagacgttgtgaattgtcaggacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcatgatatggttattgtccta 7847  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  7848 tgaaggatcaatttcaaatccattcctagtatgtaggaacattgtagcaggcagagctgttatctttgtcttgtagcagagacacaaacttcgtagtgga 7947  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||  || || | | ||  || |||| |||| |||||    
T  7948 gatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgaattcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcac 8047  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    | |    ||||||| ||||| || | || |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |  ||||| ||||||||||| |||||||||| ||    
T  8048 ttttacagtcttctacaatgcttggacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagttttgcatctcctgatgaactttagcttctggttat 8147  T
Q  424 cttttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcac-tttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||                |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  8148 ct----------------tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttttgtcttcaggagcactt 8201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 278 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 151906 - 151714
Alignment:
Q  278 caagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttg 377  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||||||  |||| |||||  | |||||||||| ||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  151906 caagcatctaatgccttcaaattcatttgaattagccgttgtttcacgtttctggtcttctacaatactaggtgtgattaaatcctttgaacaacctttg 151807  T
Q  378 aagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact 474  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||  ||||||  |||     ||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  151806 aagctttaagtctctcatcttctggtgatctt--gcttctcatga---ggtgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact 151714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 487
Target Start/End: Original strand, 115774 - 115819
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggag 487  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  115774 tgcttttgatgacgtcatcacttcaggagcactttgacttcaggag 115819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 25 - 426
Target Start/End: Original strand, 14471 - 14872
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||     
T  14471 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaata-gattcgttcgaaggtttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattatcctc 14569  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14570 tgaagtatcaatttcaaatccattccatgtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtgga 14669  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| || | | ||  || ||||||||| |||||    
T  14670 ggtagtggttgtacacttcgtaaaattgtactttgtcaacgctcttcaaagtacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcac 14769  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    ||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| | || ||||  || |||||||||||||    
T  14770 tcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatttcctaatgatttttagcttctggtgat 14869  T
Q  424 ctt 426  Q
    |||    
T  14870 ctt 14872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Original strand, 14916 - 14966
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  || ||||||||||    
T  14916 tgcttctgatgacgtcgtcacttcatgagcactttgacttaaggagcactt 14966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 25 - 426
Target Start/End: Original strand, 1483 - 1884
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  1483 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataa-agtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtccta 1581  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| |||||| | |  |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||  |||||||||    
T  1582 tgaaggatcaatttcaaatccattccaattgagagggaacattgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttctagcagagacaaaaacaaagtagtgga 1681  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| || || | | ||  || |||| |||| |||||    
T  1682 ggtagtggttgtacacttcctacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagagtaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgtttcac 1781  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    ||| || ||||||||||| | |||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1782 tcttctagtcttctgcaaagcttagacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgat 1881  T
Q  424 ctt 426  Q
    |||    
T  1882 ctt 1884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Original strand, 1884 - 1935
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt-gttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  1884 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcattttagtcttcaggagcactt 1935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 6)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 27 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 19758 - 19334
Alignment:
Q  27 gaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacg 126  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |    
T  19758 gaaagagacgttgtgaattgctagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagttttaatcaatcaccaacgatcttttgcctgatatggttattgtcctatg 19660  T
Q  127 aaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggaga 226  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| | |    
T  19659 aaggatcaatttcaaattcattccaagtatgaagaaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgttaaagagacacaaactgagtagtgaata 19560  T
Q  227 tagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactc 326  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||| | | ||  || ||||||||| |||||||    
T  19559 tagtggttgtacacttcgtacaattgtattatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgcttttaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactc 19460  T
Q  327 tcctggtcttctgcaa-tgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatct 425  Q
    | || ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||  ||||| || ||||||| || ||||||||||||     
T  19459 ttctagtcttctgcaattcttaggcgaaattaaatccattgaacaacttttgaagctttaagtcttgcatctcctcatgaactacaacttctggtgatc- 19361  T
Q  426 tttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
     |||||||| ||||  ||||||||||||    
T  19360 -ttgcttcttatgagatgcttctgatga 19334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 99493 - 99270
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||    
T  99493 gtgaaagagacgttg--aattgccagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgattctttgcctgatatggttattgtcc 99397  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| | |  | || |||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  99396 tacgaaggatcaatttcaaatgtattccgattgagaagaaacaatgtttcaggtagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtg 99297  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaa 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  99296 gagatagtggttgtacacttcgtacaa 99270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 156
Target Start/End: Original strand, 29617 - 29746
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaa-tcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||   | || || ||||||||||    
T  29617 gtgaaagagacgttgttgattgccagcacatcaaaa--agagtcgtttgaggctt-gatcaaatcaccaatgatctgtttattgatttgattattgtcct 29713  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtat 156  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  29714 acgaaggaacaatttcaaatccattccaagtat 29746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 99050 - 98964
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| || | || || |||||||| |||| ||||    
T  99050 tgcttctgatgacgtcattacttcaggagcactttgtcttcaggagcgctttaactttaggagcagttttcttcagaagctttaagc 98964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 19330 - 19281
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  19330 tgcttctgatgacgttatcacttcaggagcac-ttgacttcaggagcactt 19281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 480 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 19309 - 19262
Alignment:
Q  480 ttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  19309 ttcaggagcactt-gacttcaggagcacttctcttcagacgcttcaagc 19262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 3)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 25 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 5978 - 5552
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5978 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgaccaatcatcaatgatcttttgcctaatatggttattgtccta 5880  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     ||| |||||||||||||| |||||| | | || |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5879 tgaacgatcaatttcaaatccattccaattgtgaaggaacattgttgcagacggagctgttatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtgga 5780  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |  | | ||  || ||| ||||| | |||    
T  5779 gatagtagttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatccaatgccttcatatcctttcaaaatagatgttgctccac 5680  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    ||| |   |||||| ||||  || | || |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  5679 tcttccaatcttctacaatacttggacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctctaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttcaggtgat 5580  T
Q  424 cttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    |  ||||||||| |||  ||||||||||||    
T  5579 c--ttgcttctagtgagatgcttctgatga 5552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 5548 - 5498
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  5548 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttttacttcaggagcactt 5498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 480 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 5527 - 5480
Alignment:
Q  480 ttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaag 527  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  5527 ttcaggagcacttttacttcaggagcacttctcttcagacgcttcaag 5480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 2)
Name: scaffold0771
Description:

Target: scaffold0771; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 25 - 451
Target Start/End: Original strand, 298 - 724
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  298 gtgaaagagacgttgtgaattgctagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaattaccaatgatctttttcctaatatggttattgtccta 396  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||    
T  397 tgaaggatcaatttcaaatccattccacgtacgtaggaacattgttgcaggcagatctgttatccttgtcttgtagtagagacacaacctgagtaatgga 496  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | | ||  || |||| |||| |||||    
T  497 gataatggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcac 596  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    | | |  ||||||||||||| |||| || ||||||||| |||| ||| ||||||| |||| ||||||  ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  597 tattccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacatcctttgacgctttaagtcttgcatctcctgatgagctttagcttctggtgat 696  T
Q  424 cttttgcttctaatgatgtgcttctgat 451  Q
    |||  |||||| ||||  ||||||||||    
T  697 cttcagcttctgatgagatgcttctgat 724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Original strand, 730 - 780
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||| ||||||||    
T  730 tgcttctgatgacgtcatcacttcatgagcattttgacttcaagagcactt 780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 2)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 18 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 27724 - 27251
Alignment:
Q  18 taaaggagtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttat 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  27724 taaaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagcattcatcaatcaccaatgatctttttcctaatatggttat 27626  T
Q  118 tgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgag 217  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| |||||| | |  |  | |||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||| |||    
T  27625 tgtcctatgaatgatcaatttcaaatccattccaattgagaggaaacatcattgcaggcagagctgtttttcttatcttgtagcagagacaaaaacagag 27526  T
Q  218 tagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgtt 317  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  | | |  |  || ||| ||||    
T  27525 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaatggtactttgtcaacgctctttgaagagcaagcatccaatgccttcgaatcctatcaaaatagctgtt 27426  T
Q  318 gattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttc 416  Q
    | ||||||||    ||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| ||    
T  27425 gcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcatc 27326  T
Q  417 tggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||  |||||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  27325 tggtgatc--ttgcttctgatgaacttgcttctgatgatgtcatcacttcaggagcactttgccttcagaagcactt 27251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 496 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 27264 - 27232
Alignment:
Q  496 cttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27264 cttcagaagcacttctcttcagatgcttcaagc 27232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 25 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 21259 - 20831
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  21259 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcatcaatgatcttttgcctgatatggttattgtccta 21161  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     ||||||||||||| |||| |||||| ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  21160 tgaaggatcaatttgaaatccattccaagtgtgacggaacattgttgcaggcaaagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgga 21061  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||  || |  |||||||||||||||| || | | ||  || |    |||| |||||    
T  21060 gatagtggttgtacacttcgtacaattgtacttggtcgacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatgaccgttgcttcac 20961  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    ||| || ||||||||||||| |||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||  |||||  |||||||||||| ||| |||||||    
T  20960 tcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaacttcaacttttggtgat 20861  T
Q  424 cttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    |||  |||||||||||  ||||||||||||    
T  20860 cttcagcttctaatgagatgcttctgatga 20831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 3)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 28 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 18907 - 18481
Alignment:
Q  28 aaagagacgttgtga-attgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacg 126  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |    
T  18907 aaagagacgttgtcatattgccaacacatcaaaata-gagttgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctaatatggttattgtcctttg 18809  T
Q  127 aaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggaga 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  18808 aaggatcaatttcaaatccattccatgtatgtaggaccattgttgtaggcagagctgttatccttgtcttgtaccagagacacaaactgagtagtggaga 18709  T
Q  227 tagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactc 326  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||| || | | ||  || |||| |||| |||||||    
T  18708 tagtggttgtacacttcgtaaaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagtatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 18609  T
Q  327 tcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatct 425  Q
    | |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||    ||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  18608 ttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaaatcttgtgtctcctgatgaactgcagcttctggtgatct 18509  T
Q  426 tttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    |  |||| | ||||  ||||||||||||    
T  18508 tcagcttatgatgagatgcttctgatga 18481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 18477 - 18427
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  18477 tgcttctgatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcaggagcactt 18427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 480 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 18456 - 18408
Alignment:
Q  480 ttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  18456 ttcatgagcactttgacttcaggagcacttctcttcagatgcttcaagc 18408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 198; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 25 - 475
Target Start/End: Original strand, 9792 - 10241
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  9792 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcatttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtgtgatatggttattatccta 9890  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| | || |  ||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  9891 tgaaggatcaatttcaaattcaatccaattaagagggaacatcgttacaggcagagatgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgga 9990  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||| || || | | ||  || |||| |||  |||||    
T  9991 ggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtgaacgctcttcaaagagtaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttacttcac 10090  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    ||| || ||||||||||| | |||| || |||| ||||||||| | | |||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  10091 tcttctagtcttctgcaaagcttagacgagattgaatccattgaatagcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcaacttcttgtgat 10190  T
Q  424 cttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |  |||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10191 c--ttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 10241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 25 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 26263 - 25849
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  26263 gtgaaagagacgttgtgaattgttagtacattaaaata-gagttgtttgaagctttgattaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtccta 26165  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| ||    
T  26164 tgaaggatcaatttcaaattcattccatgtatgtaggaacattgttgcaggcagagttgttatccttgtcttgtaagagagacacaaactgagtagtcga 26065  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| || | | ||  || |||| |||| |||||    
T  26064 gatagtggttgtacacttcatacaattgtactatgtcaaccctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcac 25965  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    | | |  ||||| ||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||  ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  25964 ttttccagtcttttgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgacgctttaagtcttgcatctcctgatgagctttagcttctggtgat 25865  T
Q  424 cttttgcttctaatga 439  Q
    |||  |||||| ||||    
T  25864 cttcagcttctgatga 25849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 441 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 25832 - 25798
Alignment:
Q  441 gtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25832 gtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 25798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 25 - 390
Target Start/End: Original strand, 1513 - 1878
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||     
T  1513 gtgaaagagacgttgtgaattgtcagcacatcaaaata-gattcgttcgaaggtttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattatcctc 1611  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  1612 tgaagtatcaatttcaaatccattccatgtatgtaggaatactgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacacaaactaagtagtgga 1711  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| || | | ||  || ||||||||| |||||    
T  1712 ggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagtacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcac 1811  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtct 390  Q
    ||  |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  1812 tcctccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtct 1878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Original strand, 1958 - 2008
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  1958 tgcttctgatgacgtcatcacttcatgagcactttgacttcaggagcactt 2008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 188; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 28 - 453
Target Start/End: Original strand, 12034 - 12460
Alignment:
Q  28 aaagagacgttgtga-attgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacg 126  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||  |    
T  12034 aaagagacgttgtcacattgccagcacattaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatctttttcctgatatgattattgtcctctg 12132  T
Q  127 aaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggaga 226  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  12133 aagaatcaatttcaaattcattccatgtatgtaggaacattggtgtaggcagagcagttatccttgtcttgtagcagagacacaatctgagtagtggaga 12232  T
Q  227 tagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactc 326  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| || || ||| ||  || ||||||||| |||||||    
T  12233 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgctttcaaattctttcaaaatagttgttgcttcactc 12332  T
Q  327 tcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatct 425  Q
    | |  ||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||    ||| ||||||||||  ||||||||||||||     
T  12333 ttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacagcctttgaagctttaagtcttgtgtctcctgatgaactagagcttctggtgatcc 12432  T
Q  426 tttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    |   ||||| ||||  ||||||||||||    
T  12433 tcaacttctgatgagatgcttctgatga 12460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 188; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 25 - 489
Target Start/End: Original strand, 7528 - 7991
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  7528 gtgaaagagacgttgtgaattgccaacatattaaaata-gagtcgttcgaagctttgatcaatcaccaatgatctattgcctgatatggttattgtccta 7626  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  7627 tgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagc--agagacaaactgagtagtgga 7724  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || |  || ||| |||||||||||| | | |   || |||| || | |||||    
T  7725 ggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataaacatacaatgcctttaaatccttccaaaatagtcgtggcttcac 7824  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    ||| |  ||||| ||||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||||| |||||||| |  |||||||||||||    
T  7825 tcttccagtcttttgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaaatagagcttctggtgat 7924  T
Q  424 cttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagca 489  Q
    |||  |||||| ||| |  ||||| | ||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  7925 cttcagcttctgatgaacttgcttttaatgacgtcaccacctcgggagcactttgtcttcaggagca 7991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 6)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 25 - 453
Target Start/End: Original strand, 212180 - 212604
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  212180 gtgaaagagacgttgtgaattgtcagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatctttttcctgatatggttattgtccta 212278  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| |||||| | | || ||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||    
T  212279 tgaaggatcaatttcaaatccattccaattgtgaaggaacattg---caggcagagctgtttttcttgtcttgtagcatagacaaaaacagagtagtgga 212375  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcattt-gaattagttgttgattca 323  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || | | |||  || ||||||||| ||||    
T  212376 ggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatccttttaaaaatagttgttgcttca 212475  T
Q  324 ctctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtga 422  Q
    |||| || ||||||||||||| |||| || |||| ||||||| | | | |||||||||||| ||||||   |||| |||||||| || |||||||| |||    
T  212476 ctcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccatagaatagcctttgaagctttaagtcttggatctcctgatgaagtttagcttctgatga 212575  T
Q  423 tcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    ||  |||||||| ||||  ||||||||||||    
T  212576 tc--ttgcttctgatgagatgcttctgatga 212604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 79 - 239
Target Start/End: Original strand, 61098 - 61257
Alignment:
Q  79 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcag 178  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| || || ||| | |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||     || |||||||||  |||||||||    
T  61098 ttgatcaaataccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctttcttgaaggaacatttctgcaggcag 61197  T
Q  179 agctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtaca 239  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||| |||||| |||||||||||||    
T  61198 agctgttat-cttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtaca 61257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 442 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 246119 - 246032
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt-tgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| | || || |||||||| |||| ||||    
T  246119 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagcacttcagacttcaggagcagttttcttcagacgctttaagc 246032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 262 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 6250 - 6008
Alignment:
Q  262 aacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaat 360  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||| || || | | ||  || |||| |||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||| |||    
T  6250 aacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaat 6151  T
Q  361 ccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg------atg----tgcttctga 450  Q
    | |||| ||| |||||||||||| ||||||  ||||| |||||||| | || ||||||| ||||||  |||||| |||      |||    |||||||||    
T  6150 ctattgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaattacaacttctggagatcttcagcttctgatgcttcttatgaacctgcttctga 6051  T
Q  451 tgacgtcatcacttcaggagcac-tttgttttcaggagcactt 492  Q
    |||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  6050 tgactttatcacttcaggagcacttttgtcttcaggagcactt 6008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Original strand, 212608 - 212658
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  212608 tgcttctgatgacgtcattacttcaggagcactttgacttcaggagcactt 212658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 480 - 528
Target Start/End: Original strand, 212629 - 212677
Alignment:
Q  480 ttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||    
T  212629 ttcaggagcactttgacttcaggagcacttctcttcagacgtttcaagc 212677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 25 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 10395 - 9997
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||| | |||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  10395 gtgaaagaga-gctgtgaaatgtcagcacatcaaaata-gagtcatttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtccta 10298  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     ||||||||||||||||||  ||||| | | || ||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  10297 tgaaggatcaatttcaaatcaattccaattgtgaaggaatatcgttgctggcagagctgtttttcttgtcttgtagaagagacacaaacagagtagtgga 10198  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || | | ||  || |||| |||| |||||    
T  10197 ggtagtggtcgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaaaaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcac 10098  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtga 422  Q
    ||| || ||||||||||| | ||||  | |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10097 tcttctagtcttctgcaaagcttagatgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtga 9998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 25 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 15059 - 14816
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||| | |||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  15059 gtgaaagaga-gctgtgaaatgtcagcacatcaaaata-gagtcatttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtccta 14962  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     ||||||||||||||||||  ||||| | | || ||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  14961 tgaaggatcaatttcaaatcaattccaattgtgaaggaatatcgttgctggcagagctgtttttcttgtcttgtagaagagacacaaacagagtagtgga 14862  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    | ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14861 ggtagtggtcgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt 14816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 183; Significance: 9e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 25 - 426
Target Start/End: Original strand, 14940 - 15341
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  14940 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaataatcaatgatcttttgcctgatatggtttttgtccta 15038  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     | ||||||| ||||||||  ||||  |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||| |||||||||    
T  15039 tggaggatcagtttcaaatcaattcaaagtatgaaggaacattactgcaggcagagctgttattcttgtcttatagtagagatacaaactaagtagtgga 15138  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||| |||||||||| || || | | ||  || |||| | || |||||    
T  15139 gatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaatcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgatgcttcac 15238  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    ||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||  ||||| || ||| |||||| |||||||||||    
T  15239 tcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgatcagcctttgaagctttaagtcttgcatctccttatgcacttcatcttctggtgat 15338  T
Q  424 ctt 426  Q
    |||    
T  15339 ctt 15341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Original strand, 15341 - 15390
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||    
T  15341 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcac-ttgacttcaggagcactt 15390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 182; Significance: 4e-98; HSPs: 4)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 25 - 528
Target Start/End: Original strand, 18854 - 19358
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  18854 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagatttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatacggttattgtccta 18952  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| |||||||| |  | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  18953 tgaaggatcaatttcaaatccattcccattgcgaaggaacatcattgcaggcagagctgtttttcttttcttgtagcagagacaaaaactgagtagtgga 19052  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | |||||||||||||| ||||||| ||| |||||  ||||||||||  || | |||||||| ||||||||||| | | |   || |||  |||| |||||    
T  19053 ggtagtggttgtacacttcgtacacttgtacttttccaacgctctttgaagaacaagcatcaaatgcctttaaatccttccaaaatagccgttgcttcac 19152  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    ||| |  ||||||||||||| || | || |||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||   |||  |||||||| |  |||||||||||||    
T  19153 tcttccagtcttctgcaatgctttgacgagattaaatccattgaacagcctttcaagctttaagtcttgtatcacctgatgaaatagagcttctggtgat 19252  T
Q  424 cttttgcttctaat-gatgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgct 522  Q
    |||   ||||| ||  |  |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||| | || || ||||||||||||    
T  19253 cttcaacttctgataaacttgcttctgatgacgacacaacttcaggagcactttgtcttctagagcactttgtgttcaggagcagttttcttcagatgct 19352  T
Q  523 tcaagc 528  Q
    | ||||    
T  19353 ttaagc 19358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22419 - 22151
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  |||||||| | ||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||    
T  22419 gtgaaagagacgttg--aattgccatcccattcaaaatat-agtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgatcattttcctgatatggttattgtcc 22323  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    || || |||||||||||||||  ||||||| |  | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||    
T  22322 taagagggatcaatttcaaatgtattcccattgagaagaaacattgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtactg 22223  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 294  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  | | | ||||||||||| |  || |  ||||||||||||||||    
T  22222 gagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctcattgaagaataagcatccaatgcctt 22151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 162 - 492
Target Start/End: Original strand, 9519 - 9848
Alignment:
Q  162 aacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtc 261  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||| ||||    
T  9519 aacattgtcgtaggcagagctgtttttcttgtcttgtagtagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacagtcgtactatgtc 9618  T
Q  262 aacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatc 361  Q
    |||||| ||   | |  |||||||||||||| || | | | ||  || |||| |||| |  ||| |||  |||||||||||| |||| |  | || ||||    
T  9619 aacgctgtttgtagaataagcatccaatgcccttcaatcctttcaaaatagtcgttgctatactttcccagtcttctgcaatcttagacaagtttgaatc 9718  T
Q  362 cattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatc 460  Q
    | |   ||||| |||||||||| |||  |  ||||| |||||||||| ||||||||||||||     |||| | ||| |  ||||||||||||| |||||    
T  9719 cttgaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgattcacagcttatgatgaacttgcttctgatgacatcatc 9816  T
Q  461 acttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  9817 acttcatgagcactttgtcttcaggagcactt 9848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 21973 - 21926
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagca 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  21973 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggtgcactttgtcttcaggagca 21926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 25 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 90343 - 89883
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||    
T  90343 gtgaaagagacgttgtgaattgctaccacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatctatttcctgatatggttattgtccta 90245  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| |||||||| | || || |||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  90244 tgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaagaaacatcattgcaggcaaagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgga 90145  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | ||| |||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| || | | ||  || |||  |||| |||||    
T  90144 ggtaggggttgtacacttcgtacacttgtattttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagccgttggttcac 90045  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    ||| |  |||||||| |||  |||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||| |||  |  ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  90044 tcttccagtcttctgtaatacttagacgagattaaatacattgatcaacctttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgat 89947  T
Q  424 cttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcagga 486  Q
     ||  |||||| ||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  89946 tttcagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcaccacttcaggagcactttgtcttcagga 89883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 177; Significance: 4e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 25 - 488
Target Start/End: Original strand, 103394 - 103857
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |     
T  103394 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcgtc 103492  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagc-ggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  |  |||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| | ||||  ||||||||    
T  103493 cgaaggatcaatttcaaatccattcccattgagagggaacatcattgtaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagaagaaaaaaacaaagtagtgg 103592  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcattt-gaattagttgttgattc 322  Q
    || ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||  ||||||  || |||  |||| |||    
T  103593 aggtagtggttgcacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcc-ttaatatcatttcaaaatagccgttgcttc 103691  T
Q  323 actctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtg 421  Q
    ||||| |  ||||||||||||| |||| |   ||||||| ||||  ||||||||| |||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  103692 actcttccagtcttctgcaatgtttagacaaaattaaattcatttaacaacctttcaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtg 103791  T
Q  422 atcttttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcac-tttgttttcaggagc 488  Q
      |  |||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||    
T  103792 tcc--ttgcttctgatgagatacttctgatgacgtcatcactttagtagcacttttgtcttcaggagc 103857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 168; Significance: 8e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 25 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 2280 - 2039
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||    
T  2280 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcctttgaagctttgatcaatcaccattgatctttttcctgatatggttattgtccta 2182  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||   ||||||    
T  2181 tgaaggatcaaattcaaatccattccaagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtaccagagacacatactg---agtgga 2085  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2084 gatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt 2039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 5)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 25 - 237
Target Start/End: Original strand, 7648 - 7858
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||    
T  7648 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaa--agagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcatttttctgatatgattattgtccta 7745  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||    
T  7746 tgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttctagtagagacacaaactgagtagagga 7845  T
Q  225 gatagtggttgta 237  Q
    |||||||||||||    
T  7846 gatagtggttgta 7858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 233 - 426
Target Start/End: Original strand, 9825 - 10019
Alignment:
Q  233 ttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctgg 332  Q
    |||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||| |||   |||||||||||||| || || | | ||  || |||| |||  ||||||||  |||    
T  9825 ttgtacactttgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagcacaagcatccaatgctttcaagtcctttcaaaatagtcgttacttcactcttttgg 9924  T
Q  333 tcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatctt 426  Q
    ||||||  |||| |||| || |||||||||||||  |||| | ||||||||| || |||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  9925 tcttctataatgcttagacgagattaaatccattaaacaaaccttgaagctttaaatcttgcatctccagatgaacttcagcttctggtgatctt 10019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 480 - 528
Target Start/End: Original strand, 10069 - 10117
Alignment:
Q  480 ttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  10069 ttcaggagcactttgacttcagaagcatttctcttcagatgcttcaagc 10117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 477
Target Start/End: Original strand, 10048 - 10083
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttg 477  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10048 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttg 10083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 19627 - 19594
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19627 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 19594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 25 - 500
Target Start/End: Original strand, 142920 - 143386
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  142920 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcatttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtccta 143018  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||  ||||| ||||| |||||||||    
T  143019 tgaaggatcaatttcaaatccattcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctgttttttttttcttgtagcatagacaaaaactaagtagtgga 143118  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    | ||||||||||||||         ||| |||||  ||||||||||  || | |||||||||||||||||||| | | |   || |||| |||| |||||    
T  143119 ggtagtggttgtacac---------ttgtacttttccaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctttaaatccttccaaaatagtcgttgcttcac 143209  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    ||| |  ||||||||||||| || | || |||||||||||||| | | ||||| ||||||  |||||  |||||  ||||||| |  ||||||| |||||    
T  143210 tcttccagtcttctgcaatgctttgacgagattaaatccattgaatagcctttcaagctttgagtcttgcatctcgtgatgaaatagagcttctagtgat 143309  T
Q  424 cttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttca 500  Q
    |||  |||||| ||| |  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  143310 cttcagcttctgatgaacttgcttctgatgatgtcagcacttcaggagcactttg-cttcaggagcactttgtcttca 143386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0426 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0426
Description:

Target: scaffold0426; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 25 - 366
Target Start/End: Original strand, 13394 - 13735
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||| ||    
T  13394 gtgaaagagacattgtgaattgctagcacatcaaaatat-agtcggttgaagctttgatcaatcactaatgatcttttgcttgatatggttattgtctta 13492  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13493 tgaaggatcaatttcaaatccattcacaatatgtagaaacattgttgcaggaagagatattatccttgtcttgtagcagagacacaaactgagtagtgga 13592  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||| || | | ||  || ||||||||| |||||    
T  13593 gatagtggttgtacactttgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcac 13692  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattg 366  Q
    | | |   |||||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  13693 tattccaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattg 13735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0426; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 394 - 492
Target Start/End: Original strand, 13818 - 13916
Alignment:
Q  394 atcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgt-gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcac-tttgttttcaggagcact 491  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||| ||||  | |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  13818 atctcctgatgagctttagcttctggtgatctt--gcttctgatgaacttgcttctgatgacatcattacttcaggagcacttttgtcttcaggagcact 13915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 44214 - 43822
Alignment:
Q  18 taaaggagtgaaagagacgttgtgaa-ttgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaa-tcaccaatgatcttttgtctaatatggtt 115  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  44214 taaaggtgtgaaagagacgttgttaaattgtcaccacatcaaaa-aagagtcgtttgaagctt-gatcaaatcaccaatgatctttttcctaatttggtt 44117  T
Q  116 attgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactg 215  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  || |  |||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||| || |||||| |||| |    
T  44116 attgtcctatgaaggatcaatttcaaatccattccatgtctagaggaacatcgtttcaggcatagttgttattcttgtcttgttgcagagaca-aaacag 44018  T
Q  216 agtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||  |||| ||||||||||| ||  | || |||||||||||||| || |   ||||||||||       
T  44017 agtagtggagatagtggttgtacaattcgtacaaatgtcctttttcaacgctcttcaaggaacaggcatccaatgccttcaaatctttttgaattagcct 43918  T
Q  316 ttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttca 411  Q
    ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  43917 ttgcttcactcttctgatcttctgcaatgttaggcgtgattaaatcttttgaacagcctttgaagttttaagtctctcatcttctgatgatcttca 43822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 43761 - 43728
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43761 tgcttctgatgacgtcatcacttcaagagcactt 43728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0227 (Bit Score: 153; Significance: 7e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0227
Description:

Target: scaffold0227; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 25 - 439
Target Start/End: Original strand, 22498 - 22913
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcaca-tcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||    
T  22498 gtgaaagagacgctgtgaattaccagcacattcaaaat-agagttgtttgaagctttgattaatcaccaatgatcctttgcctgatatgattattgtcct 22596  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
    | ||| ||||||||| |||| ||||| || | || |||||||  | ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  22597 atgaaagatcaattttaaatgcattcgcattgtgaaggaacaacgatgcaggcagtgctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtgg 22696  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattca 323  Q
    || |||||||||||| | || |||||||| ||||||||||| |||||  || |  |||||||||||||||| || | | ||  || |||| |||| ||||    
T  22697 aggtagtggttgtacgcttcatacaattgtactttgtcaacactctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttca 22796  T
Q  324 ctctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtga 422  Q
    || | |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  22797 cttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacagcctctggtga 22896  T
Q  423 tcttttgcttctaatga 439  Q
    ||||  |||||| ||||    
T  22897 tcttcagcttctgatga 22913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 148; Significance: 7e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 412
Target Start/End: Original strand, 40462 - 40846
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgt-gaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaa-tcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  || || ||||||||||||    
T  40462 gtgaaagagacgttgttgaatttccagcacatcaaaa--agagtcgtttgaagctt-gatcaaatcaccaatgatctttttcctgatttggttattgtcc 40558  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| | | || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |  ||  ||||| |||| ||||||||    
T  40559 tatgaaggatcaatttcaaatccattccaaatctgaaggaacaccgttgcaggcatagctgttattcttgtctagatgc--agacataaacagagtagtg 40656  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattc 322  Q
     || |||||||||||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||| | | | ||||  ||||||| || ||| ||||||||||  |||| |||    
T  40657 aaggtagtggttgtacacttcttacaattgttctttttcaacgctcttcaaagaaccaccatcatatgccttcaaattcttttgaattagccgttgcttc 40756  T
Q  323 actctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcag 412  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||    
T  40757 actcttctggtcttctgcaatgctaggtgtgattaaatcttttgaacagcctttgaagcttcaattctctcatcttctgatgatcttcag 40846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 142; Significance: 3e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 423
Target Start/End: Original strand, 74397 - 74788
Alignment:
Q  18 taaaggagtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttat 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||    
T  74397 taaaggtgtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaaagtttgatcaatcaccaatgatatttttcctgatatggttat 74495  T
Q  118 tgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgag 217  Q
    |||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||  ||||| ||| | || ||||||||||| | |||| |||| ||||||  ||    
T  74496 tgtcttatgaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaatatcattgcatgcatatctattattcttgtcctatagcagagatacaaacaaag 74595  T
Q  218 tagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgtt 317  Q
    |||| ||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||| || ||| |||||||||| ||| |||| || | | ||||||||||  |||    
T  74596 tagtagaggtagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaatgcttttcaaagagcaagcatctaattccttcaaatccttttgaattagccgtt 74695  T
Q  318 gattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttct 417  Q
    |||| | ||             ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||| || ||||||||||  ||||||||||    
T  74696 gattaaatc-------------caatgctaggcgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaattctcacagcttctgatgatgttcagcttct 74782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 476
Target Start/End: Original strand, 74835 - 74869
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 476  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  74835 tgcttctgatgacgtcaacacttcaggagcacttt 74869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 5)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 25 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 215785 - 215517
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  215785 gtgaaagagacgttg--aattgccagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagtttttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcc 215689  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    || ||| |||||||||||||| |||||||| | || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||    
T  215688 taagaatgatcaatttcaaatgcattcccaatgtgaaagaacattgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacgaaaacagagtagtg 215589  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 294  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||    
T  215588 gaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctt 215517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 77 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 7855 - 7693
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| || || ||| | |||||||| |||| ||||| |||||||||||||  |   || | |||||||  |||||||    
T  7855 ctttgatcatttaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaagcatcaagttcaaattcattcatatcttgaatgaacatttctgcaggc 7756  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtaca 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||  | |||| |||||| |||||||||||||    
T  7755 agagctgttatacttgtcttgtagcgcagacacactcagagtcgtggaggtagtggttgtaca 7693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 240
Target Start/End: Original strand, 140906 - 141019
Alignment:
Q  126 gaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggag 225  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||   || |||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  140906 gaaggatcaacttcaaactcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggag 141004  T
Q  226 atagtggttgtacac 240  Q
     ||||||||||||||    
T  141005 gtagtggttgtacac 141019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 117 - 240
Target Start/End: Original strand, 127738 - 127860
Alignment:
Q  117 ttgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactga 216  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |   || |||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  127738 ttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacaga 127836  T
Q  217 gtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||  ||||||||||||||    
T  127837 gtagtggaagtagtggttgtacac 127860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 442 - 523
Target Start/End: Original strand, 128065 - 128148
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt--gttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgctt 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |  ||||| ||||||||  |||||||  || || |||||||||||||    
T  128065 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactttgagggttcagaagcactttagcttcagacgcagttttcttcagatgctt 128148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 528
Target Start/End: Original strand, 60626 - 61128
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| || ||||||||||| |||||    
T  60626 gtgaaagagacgttgtgaattgtcagcacatcaaaata-gattcgtttgaagctttgattaatcatcaatgatcctttgcctgatatggttattttccta 60724  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     ||||||||||||||||||  ||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||| |||| ||||||||||    
T  60725 agaaggatcaatttcaaatgtattcccattgagaaggaacattgttgcaggcagagctgtttttcatgtcttgtagaagagacaaaaacagagtagtgga 60824  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcac 324  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || | ||||||| |||||||||  | | | |   || |||  |||| |  ||    
T  60825 gatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcattcaatgccttccaatccttccaaaatagccgttgctatac 60924  T
Q  325 tctcctggtcttctgcaa-tgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
    | | |  ||||||||||| | |||| || | |||||||| ||  ||||| ||||||| || |||  |  ||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  60925 ttttccagtcttctgcaatttttagacgagtttaaatcctttaaacaacttttgaagttttaag--ttgcatctcctgatgaactacaacttctggtgat 61022  T
Q  424 cttttgcttctaat-gatgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgct 522  Q
      |   ||||| ||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||  |||||| | || || ||||||||||||    
T  61023 tctcaacttctgataaacttgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtctttaggagcgctttatcttcaggagcagttttcttcagatgct 61122  T
Q  523 tcaagc 528  Q
    | ||||    
T  61123 ttaagc 61128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 25 - 240
Target Start/End: Original strand, 9730 - 9943
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  9730 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaa--taagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtccta 9827  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     |||||||||||||||||| ||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||| | |||| |||||||| |    
T  9828 tgaaggatcaatttcaaatccattccatgtttgtagaaacattgttgcaggcagagctgttttccttgttttgtagcagagataaaaacagagtagtgca 9927  T
Q  225 gatagtggttgtacac 240  Q
    | ||||||||||||||    
T  9928 ggtagtggttgtacac 9943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 133; Significance: 6e-69; HSPs: 7)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 25 - 264
Target Start/End: Original strand, 37225 - 37463
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37225 gtgaaagagacgttttgaattgccagcacgtcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctgatatggttattgtccta 37323  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgta-ggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||| |   || ||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||    
T  37324 tgaaggatcaatttcaaatccatt-ccaatcgatagggaacatcgttgcaggcagggatgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaatagagtagtgg 37422  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaac 264  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  37423 aggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgccaac 37463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 25 - 264
Target Start/End: Original strand, 135285 - 135523
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  135285 gtgaaagagacgttttgaattgccagcacgtcaaaata-gagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctgatatggttattgtccta 135383  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgta-ggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||| |   || ||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||    
T  135384 tgaaggatcaatttcaaatccatt-ccaatcgatagggaacatcgttgcaggcagggatgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaatagagtagtgg 135482  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaac 264  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  135483 aggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgccaac 135523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 126 - 418
Target Start/End: Original strand, 158978 - 159270
Alignment:
Q  126 gaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggag 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||| ||| | || | |||||| |||| |||||| |||||||||||  |||||| |||    
T  158978 gaaggatcaatttcaaatccattccaagtatgaaggaacatcgttgtaggaatagatattattcatgtcctgtagcagagacacaaacaaagtagtagag 159077  T
Q  226 atagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcact 325  Q
     |||||||| ||||| || ||||||||  |||||||||||||||| ||| | |||||||  |||||||| || ||||||||||||||  |||| ||||||    
T  159078 gtagtggttttacacttcatacaattgtcctttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatataatgccttcaaattcatttgaattagccgttgcttcact 159177  T
Q  326 ctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctg 418  Q
    || ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  159178 cttctgatcttttgcaatgttagacgtgattaaatcctttgaacatcctttgaagctctaagtctctcatcttttgatggtcttcagcttctg 159270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 307 - 492
Target Start/End: Original strand, 39529 - 39716
Alignment:
Q  307 aattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgt-taggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatga 405  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||  ||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||  ||||| |||||||    
T  39529 aattagttgttgcttcactcttctagtcttttgtaatgcctagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaaatcttgcatctcctgatga 39628  T
Q  406 acttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    |||  ||||||||||||||||  |||||| ||| |  ||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  39629 actagagcttctggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctgatgtcgttatgacttcaagagcactttgacttcaggagcactt 39716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 307 - 492
Target Start/End: Original strand, 137589 - 137776
Alignment:
Q  307 aattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgt-taggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatga 405  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||  ||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||  ||||| |||||||    
T  137589 aattagttgttgcttcactcttctagtcttttgtaatgcctagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaaatcttgcatctcctgatga 137688  T
Q  406 acttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    |||  ||||||||||||||||  |||||| ||| |  ||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  137689 actagagcttctggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctgatgtcgttatgacttcaagagcactttgacttcaggagcactt 137776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 474
Target Start/End: Original strand, 159324 - 159356
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  159324 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact 159356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Original strand, 158933 - 158981
Alignment:
Q  26 tgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaag 76  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  158933 tgaaagagatgttgtgaattgccaacacatcaaa--aagagtcgtttgaag 158981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 92 - 476
Target Start/End: Original strand, 15682 - 16067
Alignment:
Q  92 aatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattctt 191  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  15682 aatgatcttttgccttatatgattattgtcctatgaaagatcaatttcaaaaccattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagcagttatcctt 15781  T
Q  192 gtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaa-ttggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatg 290  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  15782 gtctagtagcagagacacaaactgagtagtagagatggtggttgtacacttcgtacaatttgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatg 15881  T
Q  291 cctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaa-tgttaggcgtgattaaatccattgtacaa-cctttgaagcttgaagt 388  Q
    |||| || | | ||  || || ||| || |||||||  |||||||| ||||| | || | || |||| ||||||||| |||| | |||||||||| ||||    
T  15882 ccttcaagtcctttcaaaataattggtgcttcactcctctggtcttttgcaattcttggacgagattgaatccattgaacaatcttttgaagctttaagt 15981  T
Q  389 ctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttt 476  Q
    ||  ||||| ||||||||||| |||||||| |||     || |||| ||| |  |||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  15982 cttgcatctcctgatgaactttagcttctgatga---gatggttctgatgaacttgcttctgatgatgtcatcacttcatgagcacttt 16067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 16425 - 16298
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaa-tcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||| ||  || || |||||||||||||    
T  16425 gtgaaagagacgttg---attgccaacacatcaaaa-aagagtcatttaaagctt-gatcaaatcaccgatgatctatttcctgatttggttattgtcct 16331  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtat 156  Q
    | |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  16330 atgaaggaacaatttcaaattcattccaagtat 16298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 130; Significance: 4e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 25 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 1807 - 1409
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaa-tcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  1807 gtgaaagagacgttgataattgccagcacatcaaaa--agagtcgtttgaaactt-gttcaaatcaccaatgatcttttgccttatttggttattgtcct 1711  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactga-gtagtg 222  Q
    | |||||||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||||| || || ||||| ||||||| |||||||| | | ||  ||||||||| | | ||||||    
T  1710 atgaaggatcaatttccaatccattccatgtatggaggaacactggtgtaggcatagctgttgttcttgtcctattgc--agacacaaaataaagtagtg 1613  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattc 322  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||  ||||| |||| ||| |  || | ||||||||||| || | | |||||| |||| |||| |||    
T  1612 gagatagtggttgtacacttcgtacaattgtccttttccaacgttcttcaaagaataaacgtccaatgccttcaaatccttttgaaatagtcgttgcttc 1513  T
Q  323 actctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtga 422  Q
    ||||   | ||||||||||||| | ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||    
T  1512 actcctatagtcttctgcaatgatgggcgtgattaaatcatttgaacaacctttgaagcttcaattctctcagcttctgatgatcttcagctcctgatga 1413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 409 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 1391 - 1327
Alignment:
Q  409 tcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    ||||||||||||||||||  | |||| |||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  1391 tcagcttctggtgatctt--ggttctgatgaggtgcttctgatgacatcaacacttaaggagcactt 1327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 5)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 25 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 36469 - 36047
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaa-tcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    |||| |||||||||||  |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  || || | |||||||||||    
T  36469 gtgagagagacgttgttgattgccagaacatcaaaa--agagtcgtttgaagctt-gatcaaatcaccaatgatctttttcctgatttagttattgtcct 36373  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||| || |||||| | | ||||| |||||||| | | ||  ||||| |||    |||||||    
T  36372 atgaaggatcaatttcaaatccattccaagtctggaggaacactggtgcaggtatatctgttgttcttgtcctattgc--agacaaaaatcaggtagtgg 36275  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattca 323  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  | || ||||| ||||  ||  |  |||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| ||||    
T  36274 agatagtggttgtacacttcgtacaattgtccattttcaactctctccaacgaaaaagcatccaatgcctttaaaaccatttgaaatagttgttgcttca 36175  T
Q  324 ctctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
     ||| |  ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| || | |||||  ||||||||| ||||||||| ||||||     
T  36174 ttcttccagtcttctgcaatgatagacgtgattaaatcaattgaacaacctttgaagcttcaattttctcagattctgatgatcttcagcttatggtga- 36076  T
Q  424 cttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
     | |||||||| |||| |||||||||||||    
T  36075 -tgttgcttctgatgaggtgcttctgatga 36047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 63 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 35056 - 34827
Alignment:
Q  63 agagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagg 161  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||| | || |      
T  35056 agagtcgtttgaagcttttgatcagtcaccattgatcctttgcctgatatggttattgtcctataaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgaata 34957  T
Q  162 aacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtc 261  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||  | ||| ||||    
T  34956 aacattgttgcaggcaaagctatttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaaacgtactatgtc 34857  T
Q  262 aacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 291  Q
    |||||||||  || |  |||||||||||||    
T  34856 aacgctctttgaagaataagcatccaatgc 34827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 63 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 25917 - 25712
Alignment:
Q  63 agagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagg 161  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| | |||||| | || |      
T  25917 agagtcgtttgaagcttttgatcagtcaccaatgatcctttgcctgatatggttattatcctataaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatttgaata 25818  T
Q  162 aacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtc 261  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||| ||||    
T  25817 aacattgatgcaggcagagctgcttttcttgtcttgtagtagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtc 25718  T
Q  262 aacgct 267  Q
    ||||||    
T  25717 aacgct 25712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 25531 - 25481
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25531 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagcactt 25481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 34685 - 34635
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34685 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagcactt 34635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 128; Significance: 6e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 40 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 78641 - 78189
Alignment:
Q  40 tgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagctt-tgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatt 137  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  78641 tgaattgccagcacattcaaaata-gagtcgtttgaaacttatgatcaatcaccaatgatcatttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatccatt 78543  T
Q  138 tcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgta 237  Q
    ||||||   |||||| | || |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||| || |||||||||||    
T  78542 tcaaatgtgttcccattgtgaaggaacattgttgcaggcagagttgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacatagtagtgtaggtagtggttgta 78443  T
Q  238 cacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttc 337  Q
    ||| ||||||||  | ||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| || | | ||  || |||| |||| |||||| | |  ||||||    
T  78442 cacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttaaagaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttc 78343  T
Q  338 tgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaa 436  Q
    ||||||  |||| || | || |||||  |  | | | |||||||||| ||| ||  |||||  ||||||||| ||||||||||||||  |  | |||| |    
T  78342 tgcaatctttagacgagtttgaatccgataaatagcttttgaagctttaag-ct-gcatctcatgatgaactacagcttctggtgattctcagattctga 78245  T
Q  437 tg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcact 491  Q
    || |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  78244 tgaacttgcttctgatgacatcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagcact 78189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359 (Bit Score: 126; Significance: 1e-64; HSPs: 4)
Name: scaffold1359
Description:

Target: scaffold1359; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 25 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 943 - 675
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  943 gtgaaagagacgttgtgaatttccagcacattcaaata-gagtcgtttgaaactttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtccta 845  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgga 224  Q
     ||| || |||||||||||   |||||| | || |||||||| |||||||||| |||| || ||||| ||||||||  |||||| |||| ||||||||||    
T  844 ggaatgaacaatttcaaatgtgttcccattgtgaaggaacatcgttgcaggcaaagctatttttcttatcttgtagtagagacaaaaacagagtagtgga 745  T
Q  225 gatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 294  Q
    | |||||||||||||| | ||||||  | |||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||    
T  744 ggtagtggttgtacacttagtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctt 675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 108 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 1961 - 1778
Alignment:
Q  108 atatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagac 207  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||| | |  |  ||||||||| | || ||||||||||| |||||||||| ||  ||||    
T  1961 atatggttattgtcttatgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtaaacaaacattgttactggtagagctgttatccttgtcttgttgcaaagac 1862  T
Q  208 acaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 291  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | | | |||||||||||||  || |  |||||||||||||    
T  1861 aaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtaatatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 1778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 544 - 497
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagca 489  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  544 tgcttctgatgacgtcaccacttcaggagcactttgtcttcaggagca 497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 1637 - 1601
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgt 478  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1637 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgt 1601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 18053 - 17784
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  18053 gtgaaagagacgttg--aattgccagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcc 17957  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    || || ||||||| ||||||| | || ||| | || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  17956 tatgatggatcaaattcaaatgcgtttccaatgtgaagaaacattgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtg 17857  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 295  Q
    |||||||||||||||||| || |||||  | ||| |||||||||||||  ||    |||||||||||||||||    
T  17856 gagatagtggttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttt 17784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 442 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 17647 - 17560
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt-tgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||| |||| || |||||||| |||| ||||    
T  17647 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggatcactttgtcttcaggagcacttcagacttcaggatcagttttcttcagacgctttaagc 17560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 237
Target Start/End: Original strand, 84217 - 84429
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcaca-tcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  84217 gtgaaagagacgttgtgaatatccagcgcattcaaaat-agagtcgtttgaaactttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcct 84315  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
    | |||||||||||||||||| || ||| | | || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  84316 atgaaggatcaatttcaaatccaatccaattgtgaaggaacatcgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagtagagacaaaaactgagtagtgg 84415  T
Q  224 agatagtggttgta 237  Q
    || |||||||||||    
T  84416 aggtagtggttgta 84429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 150
Target Start/End: Original strand, 268604 - 268728
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatc-aatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| ||| | ||||||||| |||  | || |||||||||||||    
T  268604 gtgaaagagacgttgttgatagccagcacataaaaa-aagagttgtttgaagctt-gatcgaattatcaatgatctgttgcttgatttggttattgtcct 268701  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcc 150  Q
    | |||||| ||||||||||| ||||||    
T  268702 atgaaggaacaatttcaaatccattcc 268728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 120; Significance: 4e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 426
Target Start/End: Original strand, 5452 - 5849
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaa-tcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |  || |||||||||||||    
T  5452 gtgaaagagacgttgttgatttccagcacatcaaaa--agagtcgtttgaagctt-gatcaaatcaccaatgatctgttgcccgatttggttattgtcct 5548  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||  | |||||||| | ||||| |||||||  | | || || ||| ||||||||||||||    
T  5549 atgaaggatcaatttcaaatccattccaagtaaggaggaacaccggtgcaggcacaactgttgttcttgtactattgcagacaca-aaactgagtagtgg 5647  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattca 323  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||| | |||  ||||| |||  ||| |  |||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||| ||||    
T  5648 aggtagtggttgtacacttcgtacaattgta-ttttccaacgttctccaaagaataagcatccaatgccttcaaattcatttgaaatagtcgttgcttca 5746  T
Q  324 ctctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 423  Q
     ||| || |||||||| |||| ||||| |||||||| |  ||| ||| |||||||||||| || ||| ||| |||||||||| ||||| || ||| ||||    
T  5747 ttcttctagtcttctggaatgataggcatgattaaaacatttgaacagcctttgaagcttcaattctttcagcttctgatgatcttcaactcctgatgat 5846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 3018 - 2774
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  ||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  3018 gtgaaagagacgttg--aattctcagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgatcatttgcctgatatggttattgtcc 2922  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    || ||||||||||||||||||  || |||| |  | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  2921 taagaaggatcaatttcaaatgtatccccattgagaaggaacattattgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtg 2822  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  | ||| ||||||| |||||    
T  2821 gagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctt 2774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18043 - 17880
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| || || ||| | |||||||| |||||||||  ||||||| |||||| |   || |||||||||  |||||||    
T  18043 ctttgatcattcaccattgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcatgttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggc 17944  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||    
T  17943 agagctgtttatcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacac 17880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1331 (Bit Score: 113; Significance: 6e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold1331
Description:

Target: scaffold1331; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 67 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 1947 - 1743
Alignment:
Q  67 tcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaaca 165  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||    
T  1947 tcgtttgaagcttttgatctatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctaagaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggaaca 1848  T
Q  166 ttgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacg 265  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||| || |||||||||||||| ||||| ||  | ||||||||||||    
T  1847 ttgttgcaggcatagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagcagtgaaggtagtggttgtacacttcgtaaaaacgtactttgtcaacg 1748  T
Q  266 ctctt 270  Q
    |||||    
T  1747 ctctt 1743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1331; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 483 - 397
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| | || || |||||||| |||| ||||    
T  483 tgcttctgatgacgtcaccacttaaggagcactttgtcttcagaagcactttgccttcaggagcagttttcttcagacgctttaagc 397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 40 - 270
Target Start/End: Original strand, 7217 - 7448
Alignment:
Q  40 tgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttc 139  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  7217 tgaattgccagcacatccaaaatagagtcgtttgaagctttgatgattcaccattgatcctttgcctgatatggttattgtcctattaaggatcaatttc 7316  T
Q  140 aaattcattcccagtatgtaggaacattg-ttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtac 238  Q
    |||| | |||||| | ||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  7317 aaatgcgttcccaatgtgtataaacattgtttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagggacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtac 7416  T
Q  239 acatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    || |||||||| || ||| |||||||||||||    
T  7417 acttcgtacaaatgtactatgtcaacgctctt 7448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1747 (Bit Score: 111; Significance: 9e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold1747
Description:

Target: scaffold1747; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 294
Target Start/End: Original strand, 1141 - 1408
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaa-tcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||  | || || | ||||||||    
T  1141 gtgaaagagacgttgtgaattgctagcacatcaaaata-gagtcgtttggag-tttgatcaaatcaccaatgatcttttgcatgatttgttaattgtcct 1238  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||| || ||||||  || || ||||||||||||||| | || || ||| |||| |||||||||    
T  1239 atgaaggatcaatttcaaatccattccaagtctggaggaatatcgttgcaaacatagttgttattcttgtcttattgcagacaca-aaacagagtagtgg 1337  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 294  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||    
T  1338 agatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgcctt 1408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1745 (Bit Score: 111; Significance: 9e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold1745
Description:

Target: scaffold1745; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 270 - 3
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaa-tcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||  | || || | ||||||||    
T  270 gtgaaagagacgttgtgaattgctagcacatcaaaata-gagtcgtttggag-tttgatcaaatcaccaatgatcttttgcatgatttgttaattgtcct 173  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||| || ||||||  || || ||||||||||||||| | || || ||| |||| |||||||||    
T  172 atgaaggatcaatttcaaatccattccaagtctggaggaatatcgttgcaaacatagttgttattcttgtcttattgcagacaca-aaacagagtagtgg 74  T
Q  224 agatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 294  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||    
T  73 agatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgcctt 3  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 25 - 294
Target Start/End: Original strand, 8978 - 9246
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||| |||    
T  8978 gtgaaagagacgttg--aattgccagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcactaatgattctttgcctgatatggttattctcc 9074  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    || ||||||||||||||||||  ||||| | |  | || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||  |||||||    
T  9075 taagaaggatcaatttcaaatgtattcctattgagaagaaacaatgttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcatagacaaaaacacagtagtg 9174  T
Q  223 gagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 294  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  ||||||||||||||||    
T  9175 gagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 9246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 501
Target Start/End: Original strand, 9393 - 9452
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcag 501  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||||||    
T  9393 tgcttctgatggcgtcattacttcaggagcactttgtcttcatgagcgctttaacttcag 9452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 40 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 7016 - 6760
Alignment:
Q  40 tgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt--gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaat 136  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  7016 tgaattgccagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagctttttgattaatcaccaatgatcctttgcctgatatggttatcgtcctatgaaggatcaat 6918  T
Q  137 ttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgt 236  Q
    ||||||| | |||||| |  | |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||  ||||| ||||| ||||||||||    
T  6917 ttcaaatgcgttcccattgcgaaggaacatcgttgcatgcagagctgtttttcttgtgttgtagcagagacaaaaatagagtactggaggtagtggttgt 6818  T
Q  237 acacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 294  Q
    |||| ||||||||  | |||||||||| ||||||  || | |||||||||||||||||    
T  6817 acacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctctttgaagaacaagcatccaatgcctt 6760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 6582 - 6496
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||||| | || || |||||||| |||| ||||    
T  6582 tgctcctgatgacgtcatcacttcaggagcattttgtcttcaggagcgttttaacttcaggagcagttttcttcagacgctttaagc 6496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 40 - 268
Target Start/End: Original strand, 559 - 789
Alignment:
Q  40 tgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttc 139  Q
    |||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  559 tgaatttccagcacatccaaaatagagtcgtttgaagctttgataattcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaagcatcaatttc 658  T
Q  140 aaattcattcccagtatgtaggaacattg-ttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagac-acaaactgagtagtggagatagtggttgta 237  Q
    |||| | |||||| | ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||| |||||||| |||||    
T  659 aaatgcgttcccaatgtgtataaacattgtttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcagagacaaaaaacagagtagtgcagatagtgattgta 758  T
Q  238 cacatcgtacaattggactttgtcaacgctc 268  Q
    ||| ||||||||  | ||| |||||||||||    
T  759 cacttcgtacaaacgaactatgtcaacgctc 789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Original strand, 952 - 1002
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  952 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgtcttcaggagcactt 1002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0859
Description:

Target: scaffold0859; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 237
Target Start/End: Original strand, 2806 - 3016
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcaca-tcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| || |||| |||||||||||    
T  2806 gtgaaagagatgttgtgaattgccagcacattcaaaat-agagtcgtttgaagctttgatcaataacgaatgatattttgccttatatagttattgtcct 2904  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtgg 223  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||| | || |||| ||| |||||||||||||||||  || |||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  2905 atgaaggatcaatttcaaatgcattcccattgtgaaggagcatcgttgcaggcagagctgt--tttttgtcttgtagcagggacaaaaatagagtagtgg 3002  T
Q  224 agatagtggttgta 237  Q
    || |||||||||||    
T  3003 aggtagtggttgta 3016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 25 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 7446 - 7221
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  7446 gtgaaagagacgttg--aattgccagcacattcaaaataa-agtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaatgattttttgcctgatatggttattgtcc 7350  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagc-ggagaca-caaactgagtag 220  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  ||| |  | || |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||  |||| ||||||    
T  7349 tacgaaggatcaatttcaaatgtatatccattgagaagaaacaatgttgcaggcagagctgttttttttgtcttgtagcagcagacataaaacagagtag 7250  T
Q  221 tggagatagtggttgtacacatcgtacaa 249  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7249 tggagatagtggttgtacacttcgtacaa 7221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 442 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 7013 - 6962
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcacttt 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7013 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagcacttt 6962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 524
Target Start/End: Original strand, 2726 - 2808
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttc 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||| ||||||||  |||||||  || || ||||||||||||||    
T  2726 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcacttcagcttcagaagcactttagcttcagacgcagttttcttcagatgcttc 2808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 63 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 5576 - 5399
Alignment:
Q  63 agagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagga 162  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | | ||       
T  5576 agagtcgtttgaagctttgatctatcaccaatgatcttttgcctgatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtatatag 5477  T
Q  163 acattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |  | ||||||||||  ||||||||||||||    
T  5476 acattgttgcaggcagagctgttatccttttcttgtagcagagacaaactcagagtagtggaagtagtggttgtacac 5399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 443 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 5219 - 5170
Alignment:
Q  443 gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  5219 gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgtcttcaggagcactt 5170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 40 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 5877 - 5646
Alignment:
Q  40 tgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatt 137  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||  | ||||||||||||||| | ||||||||| ||    
T  5877 tgaattgccagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcaccaacgatcctttgcttgatatggttattgtccaatgaaggatcagtt 5779  T
Q  138 tcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgta 237  Q
    | |||| ||||||||   || ||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||| |||||||||||    
T  5778 taaaatgcattcccatagtgaaggaacatcattgcaggtagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgta 5679  T
Q  238 cacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    ||| || || || || |||||||||||||||||    
T  5678 cacttcatataaatgtactttgtcaacgctctt 5646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Original strand, 14745 - 14798
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaa-ctgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14745 tcttgtcttgtagcgtagacagaaagcagagtagtggaggtagtggttgtacac 14798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 15006 - 15039
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15006 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 15039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471 (Bit Score: 96; Significance: 8e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0471
Description:

Target: scaffold0471; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 25 - 270
Target Start/End: Original strand, 3128 - 3371
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagctttg--atcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtc 121  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  3128 gtgaaagagacgttg--aattgccagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagctttttaatcaatcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtc 3224  T
Q  122 ctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagt 221  Q
    ||| ||| |||||||||||||| |||||| |   || | ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||    
T  3225 ctaagaatgatcaatttcaaatgcattccta--ttgaaagaacatctttgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagcagt 3322  T
Q  222 ggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||  | ||| | |||||||||||    
T  3323 ggaggtagtggttgtacactttgtacaaacgtactatatcaacgctctt 3371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 442 - 518
Target Start/End: Original strand, 3573 - 3649
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcaga 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||| | || || ||||||||    
T  3573 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagcgctttatcttcaggagcagttttcttcaga 3649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 96; Significance: 8e-47; HSPs: 8)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 187 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 36902 - 36635
Alignment:
Q  187 ttcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatcc 286  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| ||| | |||||||||    
T  36902 ttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacacttcgtacaattgttctttgtcaacactctttaaagaacaagcatcc 36803  T
Q  287 aatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttga 385  Q
    |||||||| || | | ||  ||||||| |||| |||||| | || ||| ||||||||| |||| || |||||||| |||||  || |||||||||||| |    
T  36802 aatgccttcaaatcctttcaaattagtcgttgcttcacttttctagtcatctgcaatgcttagacgagattaaattcattgagcagcctttgaagcttta 36703  T
Q  386 agtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    |||||  |||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||    
T  36702 agtcttgcatctcttgatgaacttcagcttctagtgatcttctgcttctgatgagatgcttctaatga 36635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 187 - 453
Target Start/End: Original strand, 42103 - 42370
Alignment:
Q  187 ttcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatcc 286  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| ||| | |||||||||    
T  42103 ttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacacttcgtacaattgttctttgtcaacactctttaaagaacaagcatcc 42202  T
Q  287 aatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttga 385  Q
    |||||||| || | | ||  ||||||| |||| |||||| | || ||| ||||||||| |||| || |||||||| |||||  || |||||||||||| |    
T  42203 aatgccttcaaatcctttcaaattagtcgttgcttcacttttctagtcatctgcaatgcttagacgagattaaattcattgagcagcctttgaagcttta 42302  T
Q  386 agtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    |||||  |||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||    
T  42303 agtcttgcatctcttgatgaacttcagcttctagtgatcttctgcttctgatgagatgcttctaatga 42370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 37021 - 36905
Alignment:
Q  26 tgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctac 125  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||     
T  37021 tgaaagagacatcgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttaatcaatcaccaatgatctttttcctgatatggttattgtcctat 36923  T
Q  126 gaaggatcaatttcaaat 143  Q
    ||||||||||||||||||    
T  36922 gaaggatcaatttcaaat 36905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 143
Target Start/End: Original strand, 41984 - 42100
Alignment:
Q  26 tgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctac 125  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||     
T  41984 tgaaagagacatcgtgaattgccagcacatcaaaata-gagtcgtttgaagctttaatcaatcaccaatgatctttttcctgatatggttattgtcctat 42082  T
Q  126 gaaggatcaatttcaaat 143  Q
    ||||||||||||||||||    
T  42083 gaaggatcaatttcaaat 42100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 36631 - 36599
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36631 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact 36599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 474
Target Start/End: Original strand, 42374 - 42406
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42374 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact 42406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 480 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 36610 - 36563
Alignment:
Q  480 ttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    |||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  36610 ttcaggagcactat-actttaggatcacttctcttcagatgcttcaagc 36563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #8
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 480 - 528
Target Start/End: Original strand, 42395 - 42442
Alignment:
Q  480 ttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    |||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  42395 ttcaggagcactat-actttaggatcacttctcttcagatgcttcaagc 42442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 1072 - 865
Alignment:
Q  63 agagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagg 161  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| | || |      
T  1072 agagtcgtttgaagcttttgatctatcaccaatgatccattgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgaata 973  T
Q  162 aacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtc 261  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  | | | ||||    
T  972 aacattgttgcagacagagctgttatccttgtcttgtagcagagaca-aaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtc 874  T
Q  262 aacgctctt 270  Q
    |||||||||    
T  873 aacgctctt 865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 91; Significance: 7e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 25 - 240
Target Start/End: Original strand, 5829 - 6043
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||| || |||||||||||||||    
T  5829 gtgaaagagacgttg--aattgctagcacattcaaaata-gagtcgtttgaagcttttgatcaatcatcaaagatcctttgcctgatatggttattgtcc 5925  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtg 222  Q
    || ||||||||||||||||||  ||||||  |  | || |||| | |||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  5926 tatgaaggatcaatttcaaatgtattccctttgagaagaaacaatattgcaggcagagatatttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtg 6025  T
Q  223 gagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||||||||||    
T  6026 gagatagtggttgtacac 6043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0861
Description:

Target: scaffold0861; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 168 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 5093 - 4807
Alignment:
Q  168 gttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgct 267  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||||||| | |||| ||||   ||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  5093 gttgcaagcagagttgtttttcttgtcttgtagcagggacaaaaacatggtaatggaggtagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgct 4994  T
Q  268 cttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattg 366  Q
    ||  ||| | ||| ||||||||||||| || | | ||  || |||| || | ||||||||    ||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||    
T  4993 ctataaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgtcgcttcactctttcagtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattg 4894  T
Q  367 tacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
     ||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||| | ||||  ||||||||||||    
T  4893 aacagcctttgaagctttaagtcttgcatcttctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttatgatgagatgcttctgatga 4807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 480 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 4782 - 4736
Alignment:
Q  480 ttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaa 526  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  4782 ttcaggagcactttgacttcaggagcacttctcttcagatgcttcaa 4736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 4803 - 4753
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  4803 tgcttctgatgacatcatcacttcaggagcactttgacttcaggagcactt 4753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0473
Description:

Target: scaffold0473; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 82 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 2923 - 2738
Alignment:
Q  82 atcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagc 181  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| | || |  |||||||||| ||| ||||     
T  2923 atcaatcaccaatgatcctttgcctgatatggttattgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgaataaacattgttgtaggtagagt 2824  T
Q  182 tgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgct 267  Q
    ||||||  |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||  | ||| ||||||||||    
T  2823 tgttatctttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtagtggagttagtggttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgct 2738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 2584 - 2551
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2584 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 2551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 108 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 25606 - 25443
Alignment:
Q  108 atatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttatt-cttgtcttgtagcggaga 206  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||  | |||||| | || || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  25606 atatggttattgtcgtatgaaggatcaatttcaaacgcgttcccaatgtgaagaaacattgttgcaggcagagctgttttttcttgtcttgtagcagaga 25507  T
Q  207 cacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| ||||||| |||||    
T  25506 caaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctt 25443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 108 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15946 - 15813
Alignment:
Q  108 atatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttatt-cttgtcttgtagcggaga 206  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||  | |||||| | || || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  15946 atatggttattgtcgtatgaaggatcaatttcaaacgcgttcccaatgtgaagaaacattgttgcaggcagagctgttttttcttgtcttgtagcagaga 15847  T
Q  207 cacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15846 caaaaacagagtagtggagatagtggttgtacac 15813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 23485 - 23388
Alignment:
Q  393 catcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgt-gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagca 489  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||     |||||| ||||  | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23485 catctcctgatgaactgcagcttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttttgatgacgttatcacttcaggagcactttgtcttcaggagca 23388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 143
Target Start/End: Original strand, 3047 - 3164
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtccta 124  Q
    |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  3047 gtgaaagagaagctgtgaatttccagcacatcaaaata-gagtcgcttgaagctttgatcaatcacgaatgatcttttgcctgatatggttattgtccta 3145  T
Q  125 cgaaggatcaatttcaaat 143  Q
     ||||||||||||||||||    
T  3146 tgaaggatcaatttcaaat 3164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 63 - 247
Target Start/End: Original strand, 16814 - 16999
Alignment:
Q  63 agagtcgtt-tgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagg 161  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||  | || ||||| |||||||| |||||||||  ||||||| |||||| | | || |||    
T  16814 agagtcgttgtgaaaccttgatcaatcaccaatgatcttttgcttgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctattctgaagg 16913  T
Q  162 aacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtac 247  Q
    ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  16914 aacatttatgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacataaatagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtac 16999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 63 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 6774 - 6589
Alignment:
Q  63 agagtcgtt-tgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagg 161  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| || || ||| | |||||||| |||||||||  ||||||| |||||| | | || |||    
T  6774 agagtcgttgtgaaaccttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctattctgaagg 6675  T
Q  162 aacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtac 247  Q
    ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | || | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  6674 aacatttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagaaaaaagcggagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtac 6589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 63 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 87852 - 87644
Alignment:
Q  63 agagtcgtttgaagct-ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagg 161  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||| || | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||| | || |      
T  87852 agagtcgtttgaagctcttgatctatcaccaattatcgtttgcctgagatggttattatcctatgaaggatcaatttcaaatgcgttcccaatgtgaata 87753  T
Q  162 aacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtc 261  Q
     ||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||   | ||| ||||    
T  87752 gacattgttgtaggcagagttgttatcattgtcttgtagcagagacagaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacagacgtactatgtc 87653  T
Q  262 aacgctctt 270  Q
    |||||||||    
T  87652 aacgctctt 87644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 443 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 87467 - 87418
Alignment:
Q  443 gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  87467 gcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactttgtcttcaggagcactt 87418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 76; Significance: 7e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 79 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 38319 - 38129
Alignment:
Q  79 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcag 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||  ||||||| |||||| | | ||  ||||||||  |||||||||    
T  38319 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctattttgatggaacatttctgcaggcag 38220  T
Q  179 agctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    | |||||||||||||||||    
T  38219 agctgtttttcttgtcttgtagcatagaca-aaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacggacgtactttgtcaacgctctt 38129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1321 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1321
Description:

Target: scaffold1321; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 63 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 1187 - 1002
Alignment:
Q  63 agagtcgtt-tgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagg 161  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| || || ||| | |||||||| |||||||||  ||||||| |||||| | |||| |||    
T  1187 agagtcgttgtgaaaccttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacattcaaatccattcctattatgaagg 1088  T
Q  162 aacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtac 247  Q
    ||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||| || |  |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  1087 aacatttctgcaggcagaactgtttttcttgtcttgtagagtagacataagcatagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtac 1002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1263 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1263
Description:

Target: scaffold1263; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 63 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 1380 - 1195
Alignment:
Q  63 agagtcgtt-tgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagg 161  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| || || ||| | |||||||| |||||||||  ||||||| |||||| | |||| |||    
T  1380 agagtcgttgtgaaaccttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacattcaaatccattcctattatgaagg 1281  T
Q  162 aacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtac 247  Q
    ||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||| || |  |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  1280 aacatttctgcaggcagaactgtttttcttgtcttgtagagtagacataagcatagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtac 1195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 150
Target Start/End: Original strand, 144731 - 144853
Alignment:
Q  27 gaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaa-tcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctac 125  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||     
T  144731 gaaagagacgttgttgattgccagcacataaaaa-aagagtcgtttgaagctt-gatcaaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttattgtcctat 144828  T
Q  126 gaaggatcaatttcaaattcattcc 150  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  144829 gaaggattaatttcaaattcattcc 144853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 63 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20628 - 20451
Alignment:
Q  63 agagtcgtt-tgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagg 161  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| || || ||| | |||||||| |||||||||  ||||||| |||||| |   || |||    
T  20628 agagtcgttgtgaaacattgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaagg 20529  T
Q  162 aacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    | ||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20528 a-catttctacaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 20451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 394 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 20314 - 20214
Alignment:
Q  394 atcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatga--tgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcact 491  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||     |||||| ||||  | |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  20314 atcttctgatgaactgtagcttctggtgatacacagcttctgatgaactttgcttctgatgacgtcattacttcagaggcactttgtcttcaggagcact 20215  T
Q  492 t 492  Q
    |    
T  20214 t 20214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 77 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 40550 - 40388
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| || || ||| | |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |   || |||||||||  |||||||    
T  40550 ctttgatcatttaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggc 40451  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtaca 239  Q
    | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||| |||||| |||||||||||||    
T  40450 aaagctgttatacttgtcttgtagcgaagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtaca 40388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 59096 - 58934
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| || || ||| | ||||| || |||||||||| ||||||| |||||| |   || |||||||||  |||||||    
T  59096 ctttgatcatttaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcttatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcaggc 58997  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtaca 239  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| | | |||||| | || | |||||| ||||| |||||||    
T  58996 agagctgttatacttgtctcgtagtgcaaacacaagcagattcgtggaggtagtgattgtaca 58934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Original strand, 175376 - 175538
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | | |||||  |||||||||  ||||||||||||||||   || |||||||||  ||||  |    
T  175376 ctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggatcagcttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaaac 175475  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    | ||||||| | |||||| ||||||| ||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  175476 aaagctgttgt-cttgtcctgtagcgtagacataaatagagtagtggaggtagtggttgtacac 175538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 79 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 2034 - 1841
Alignment:
Q  79 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatgg-ttattgtcctacgaaggatcaat-ttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| | | ||  ||||||||  |||||||    
T  2034 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctaatttgggttgttgtcctatgaaggatcaaagttcaaatccattcctattctgagggaacatttctgcaggc 1935  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  ||||| ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||| |   | |||||||||||||||||    
T  1934 agagctgtttttcttgtcttgtaacatagacataaacaaagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtatagacgtactttgtcaacgctctt 1841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Original strand, 40554 - 40716
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||| || || ||| | | |||||  |||||||||| ||||||||||||||||   || |||||||||  |||||||    
T  40554 ctttgatcatccaccaataatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggc 40653  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  40654 agagctgtt-gtcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 40716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0655 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0655
Description:

Target: scaffold0655; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 63 - 240
Target Start/End: Original strand, 4976 - 5154
Alignment:
Q  63 agagtcgtt-tgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagg 161  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||| || || ||| | |||||||| |||| ||||  ||||||| |||||| |   || |||    
T  4976 agagtcgttgtgaaaccttgatcaatcaccaatggtcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaagaatcatgttcaaatccattcctatcttgaagg 5075  T
Q  162 aacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | |||| |||||| ||||||||||||||    
T  5076 aacatttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacacacgcagagtcgtggaggtagtggttgtacac 5154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0655; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 8714 - 8667
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagca 489  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  8714 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcagtttggcttcaggagca 8667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 160 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 15776 - 15642
Alignment:
Q  160 ggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttg 259  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||   | ||||||    
T  15776 ggaacatttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacataaacagagtagtggagatagtggtcgtacacttcgtacagacgtactttg 15677  T
Q  260 tcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 294  Q
    |||| ||||||  |||   ||||||||||||||||    
T  15676 tcaatgctctttgaaagataagcatccaatgcctt 15642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 79 - 248
Target Start/End: Original strand, 10595 - 10765
Alignment:
Q  79 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgt-tgcaggca 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||| || | || |  |||||||| ||||||||    
T  10595 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcaatttcaaatgcgttctcaatgtgcataaacattgtatgcaggca 10694  T
Q  178 gagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtaca 248  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||| |  | ||| ||||||  |||||||||||||  |||||||    
T  10695 gagctgttatccttgtcctgtagcagagacaaactcagagaagtggaagtagtggttgtacagttcgtaca 10765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 208
Target Start/End: Original strand, 20496 - 20626
Alignment:
Q  79 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattg-ttgcaggca 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||   |||||  | || |  ||||||| |||||||||    
T  20496 ttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggttgttgtcctatgaaggatcaatatcaaatgtgttccctatgtgcataaacattgtttgcaggca 20595  T
Q  178 gagctgttattcttgtcttgtagcggagaca 208  Q
    |||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  20596 gagctgttatccttgtcttttagcagagaca 20626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 82 - 270
Target Start/End: Original strand, 7163 - 7352
Alignment:
Q  82 atcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagc 181  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || ||| | |||||||| |||||||||  ||||||| |||||| |   || |||||| ||  ||||||||||||    
T  7163 atcaatcaccaatgatattttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacttttctgcaggcagagc 7262  T
Q  182 tgttattcttgtcttgtagcggagac-acaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| | |||| ||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||  || ||||||||||| |||||    
T  7263 tgtttttcttgtcttgtagcgtagacaaaaaacagagaagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacatatgtactttgtcaacactctt 7352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 79 - 240
Target Start/End: Original strand, 61608 - 61769
Alignment:
Q  79 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcag 178  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| || || ||| | |||||||| |||||||||  ||||||| |||||| |   || ||||||||| ||| ||||||    
T  61608 ttgatcaaataccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttttgtaggcag 61707  T
Q  179 agctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||    
T  61708 agctgtttatcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacac 61769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 5)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 79 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 475485 - 475324
Alignment:
Q  79 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcag 178  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| || || |||   |||||||| |||||||||  |||||||||||||| |   || |||||||||  |||||||||    
T  475485 ttgatcaaataccaatgatcttttgcctgatttggaagttgtcctatgaaggatcatgttcaaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcag 475386  T
Q  179 agctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||    
T  475385 agctgtttatcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacac 475324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 79 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 482005 - 481844
Alignment:
Q  79 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcag 178  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| || || |||   |||||||| |||||||||  |||||||||||||| |   || |||||||||  |||||||||    
T  482005 ttgatcaaataccaatgatcttttgcctgatttggaagttgtcctatgaaggatcatgttcaaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggcag 481906  T
Q  179 agctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||    
T  481905 agctgtttatcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacac 481844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 63 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 156878 - 156700
Alignment:
Q  63 agagtcgtt-tgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagg 161  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| || || ||| | |||||||| |||||||||  ||||||| |||||| |   || |||    
T  156878 agagtcgttgtgaaaccttgatcaatcaccaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaagg 156779  T
Q  162 aacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||| |  |||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||| ||  |  ||| |||||| ||||||||||||||    
T  156778 aacaattctgcaggtagagctgtttttcttgtcttgtatcgtagacgcacgcatagtcgtggaggtagtggttgtacac 156700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 240
Target Start/End: Original strand, 117210 - 117312
Alignment:
Q  137 ttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgt 236  Q
    ||||||||||||||||   || ||||||| | ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| |||||| |||| ||||||||||    
T  117210 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacaattttgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagcggaggtagtggttgt 117308  T
Q  237 acac 240  Q
    ||||    
T  117309 acac 117312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 347481 - 347415
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcact 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    ||||| |||||||  ||||||||| ||||    
T  347481 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttcaacttcagaagcacttcaacttcagaagcact 347415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0485
Description:

Target: scaffold0485; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 442 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 9249 - 9163
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  9249 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcacttttacttcaagagcactgtgacttcaggatcacttctcttcagacgcttcaagc 9163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 393 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 9326 - 9268
Alignment:
Q  393 catcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||||||||||||    
T  9326 catctcctgatgaacttcagcttctggtgatc--ttgcttctgatgagatgcttctgatga 9268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 4)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 160 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 165100 - 164990
Alignment:
Q  160 ggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttg 259  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||   | ||||||    
T  165100 ggaacatttctgcaggcagagctgtttttcttgtcttgtagcgtagacataaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacagacgtactttg 165001  T
Q  260 tcaacgctctt 270  Q
    |||||||||||    
T  165000 tcaacgctctt 164990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 65693 - 65500
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||  || ||||||| |||| |||||||||||| |||  ||||||||||||| |||  || |||||||| ||||||    
T  65693 gtgaaagagacgttg--aattgccagcttattcaaaata-gagttgtttgaagcttttgatagatcaccaatgatccttttcctgatatggttgttgtcc 65597  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtag 220  Q
    || ||||||||||||||||||   || | | | || |  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  65596 tatgaaggatcaatttcaaatgtgtt-caaatgtgaataaacattgttgcaggcagagttgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtag 65500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 144738 - 144545
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacat-caaaataagagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||  || ||||||| |||| |||||||||||| |||  ||||||||||||| |||  || |||||||| ||||||    
T  144738 gtgaaagagacgttg--aattgccagcttattcaaaata-gagttgtttgaagcttttgatagatcaccaatgatccttttcctgatatggttgttgtcc 144642  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtag 220  Q
    || ||||||||||||||||||   || | | | || |  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  144641 tatgaaggatcaatttcaaatgtgtt-caaatgtgaataaacattgttgcaggcagagttgtttttcttgtcttgtagcagagacaaaaacagagtag 144545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 393 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 65351 - 65214
Alignment:
Q  393 catcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgt-gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcact 491  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||     |||||| ||||  | |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  65351 catctcctgatgaactgcagcttctggtgattcacagcttctgatgaacttgcttctgatgacatcatcacttcaagagcacgttgtcttcaggagcact 65252  T
Q  492 ttg-acttcagaatcacttctcttcagatgcttcaagc 528  Q
    | | ||||||||| || || |||||||| |||| ||||    
T  65251 tcgaacttcagaagcagttttcttcagacgctttaagc 65214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 393 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 60789 - 60708
Alignment:
Q  393 catcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact 474  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  60789 catcttctgatgaacttcagcttgtggtgatcttcagcttctaatgagatgcttctgatgacgtcctcacttcaggagcact 60708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 79 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 4131 - 3939
Alignment:
Q  79 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcag 178  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || || ||| | ||||| || |||||||||  ||||||| |||||| |   || |||||| ||  |||||| ||    
T  4131 ttgatcaatcagcaatgatattttgcctgatttggatgttgtcttatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaaggaacttttctgcaggtag 4032  T
Q  179 agctgttattcttgtcttgtagcggagac-acaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 270  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| | |||| ||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||  || |||||||||||||||||    
T  4031 agctgtttttcttgtcttgtagcgtagacgaaaaacagagaagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacagatgtactttgtcaacgctctt 3939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 2081 - 1945
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaa-tcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |  |||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||    
T  2081 gtgaaagagacgttgttcattgccagcacatcaaaaaaagtg--gtttcaagctt-gatcaaatcaccaatgatctgttgtctgatttggttatcgtcct 1985  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaa 163  Q
    | |||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||    
T  1984 atgaaggatcaaattcaaatccattccaagtatggaggaa 1945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Original strand, 2046 - 2208
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||| ||||| ||| | | |||||  || ||||||| |||||||||||||| |   || |||||||||  |||||||    
T  2046 ctttgatcattcaccattaatcttttgcctaatttgggtgtagtcctgtgacggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggc 2145  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  2146 agagctgttgt-cttgtcttgtagcgcagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacac 2208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0488 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0488
Description:

Target: scaffold0488; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 63 - 152
Target Start/End: Original strand, 12057 - 12147
Alignment:
Q  63 agagtcgtttgaagcttt-gatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattccca 152  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12057 agagtcgtttgaagcttttgatctatcactaatgatcctttgccagatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcgttccca 12147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 63 - 240
Target Start/End: Original strand, 11620 - 11797
Alignment:
Q  63 agagtcgtt-tgaagctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtagg 161  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||  || || ||||  |||||||| |||||||||  ||||||| |||||| |   || |||    
T  11620 agagtcgttgtgaaaccttgatcaatcaccaatgatcttttacctgatttggtagttgtcctatgaaggatcacgttcaaatccattcctatcttgaagg 11719  T
Q  162 aacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    | || |  |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  11720 atcaattctgcaggcagagctgtttttcttatcttgtagcgtagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttttacac 11797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Original strand, 11984 - 12034
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  11984 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactttgtcttcaggagcactt 12034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 91 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 1895 - 1739
Alignment:
Q  91 caatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattct 190  Q
    ||||||||||||| || || |||   |||||||| |||||||||  ||||||| |||||| |   || ||||||||| ||  ||||||||||||| ||||    
T  1895 caatgatcttttgcctgatttggaagttgtcctatgaaggatcatgttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttttttaggcagagctgtttttct 1796  T
Q  191 tgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtac 247  Q
    |||||||||||| ||||| || | ||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  1795 tgtcttgtagcgtagacaaaagcagagtagtggaggtagtggttgtaaacttcgtac 1739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0275 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0275
Description:

Target: scaffold0275; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 442 - 518
Target Start/End: Original strand, 8522 - 8598
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcaga 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | || || ||||||||    
T  8522 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagcactttaacttcaggagcagttttcttcaga 8598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 149
Target Start/End: Original strand, 2483 - 2604
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaa-tcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||  | || |||||||||||||    
T  2483 gtgaaaaagacgtttttaattgccagcacatcaaaa---gagtcgtttgaagctt-gatcaaatcaccaatgatctgttgctttatttggttattgtcct 2578  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattc 149  Q
    | |||||| ||||||||||| |||||    
T  2579 aagaaggaacaatttcaaatccattc 2604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 12320 - 12158
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | | |||||  |||||||||| ||||||||||||||||   || ||||||| |  |||||||    
T  12320 ctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaaggatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacaattctgcaggc 12221  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
     |||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  12220 ggagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 12158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16098 - 15989
Alignment:
Q  130 gatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatag 229  Q
    |||||| ||||||||||||||||   || ||||||| |  ||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| |||||||| || |||    
T  16098 gatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacaattctgcaggcggagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtgtaggtag 16000  T
Q  230 tggttgtacac 240  Q
    |||||||||||    
T  15999 tggttgtacac 15989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Original strand, 35589 - 35751
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | | |||||  ||||||| || |||||||||||||| |   || |||||||||  |||||||    
T  35589 ctttgatcatccaccattaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctgtgaaggattaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacatttctgcaggc 35688  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  35689 agagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 35751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Original strand, 5347 - 5509
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | | |||||  |||| ||||| ||||||||||||||||   || |||||||||  |||||||    
T  5347 ctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggc 5446  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  5447 agagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtagttgtacac 5509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0527 (Bit Score: 49; Significance: 9e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0527
Description:

Target: scaffold0527; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 393 - 492
Target Start/End: Original strand, 57 - 157
Alignment:
Q  393 catcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcact 491  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||     ||  || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  57 catcttctgatgaactgcagcttctggtgattcacagccactgatgtacgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagcact 156  T
Q  492 t 492  Q
    |    
T  157 t 157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0527; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 393 - 492
Target Start/End: Original strand, 8120 - 8220
Alignment:
Q  393 catcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcact 491  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||     ||  || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8120 catcttctgatgaactgcagcttctggtgattcacagccactgatgtacgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgtcttcaggagcact 8219  T
Q  492 t 492  Q
    |    
T  8220 t 8220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 599 - 462
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataagagtcgtttgaagctttgatcaa-tcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcct 123  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||  ||||| |||| |||||||| ||| || || |||||||||||||    
T  599 gtgaaagagacgttgttgattgccaacacatcaaaa-aagattcgtttgaagctta-atcaaatcactaatgatctattgcctgatttggttattgtcct 502  T
Q  124 acgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaa 163  Q
      |||||| ||||||||||| ||||||  ||||| |||||    
T  501 ttgaaggaacaatttcaaatccattccttgtatggaggaa 462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0481 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0481
Description:

Target: scaffold0481; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13029 - 12867
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||||| | |||||  |||| ||||| |||||||||||||| |   || ||||||||| || || ||    
T  13029 ctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttggttgtagtcctttgaagtatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacattttttcatgc 12930  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    | ||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  12929 atagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 12867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 137 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 36880 - 36777
Alignment:
Q  137 ttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgt 236  Q
    ||||||||||||||||   || |||||||||  ||||||||  |||||| ||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  36880 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttctgcaggcatggctgtttttcttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgt 36781  T
Q  237 acac 240  Q
    ||||    
T  36780 acac 36777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 36552 - 36470
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttc 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||   ||||| ||||||||  |||||||  || || ||||||||||||||    
T  36552 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactttagcttcagaagcactttagcttcagacgcagttttcttcagatgcttc 36470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0497 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0497
Description:

Target: scaffold0497; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10492 - 10331
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | | |||||  |||| ||||| ||||||||||||||||   |  |||||||||  |||||||    
T  10492 ctttgatcatccaccagtaatcttttgcctgatttgggtgtagtcctttgaagaatcaacttcaaattcattcccatcttaaaggaacatttctgcaggc 10393  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtaca 239  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||    
T  10392 agagctgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaagcagagtagtggaggtagtggttgtaca 10331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 320 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 5934 - 5776
Alignment:
Q  320 ttcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaaccttt-gaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttct 417  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||  || ||| |||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||  ||||| || ||||||||||||||||    
T  5934 ttcactcttatggtcttctgcaatgcttaaacgagatgaaatccattgaacatccttttgaagctttaagtcttgcatctcctaatgaacttcagcttct 5835  T
Q  418 ggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||| |||||| ||| |  | ||||||| |||||||| |||| || |||||||    
T  5834 ggtgatctttagcttctgatgaacttacttctgaagacgtcattactttagaagcactt 5776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 9253 - 9220
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9253 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 9220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 119 - 240
Target Start/End: Original strand, 15823 - 15943
Alignment:
Q  119 gtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagt 218  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||||||||     || |||||||||  ||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  15823 gtcctatgaaggatcaacttctaattcattcctttcttgaaggaacatttctgcaggcagagatgttgt-cttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagt 15921  T
Q  219 agtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  15922 agtggaggtagtggttgtacac 15943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Original strand, 7364 - 7444
Alignment:
Q  159 aggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  7364 aggaacatttatgcaggcagagctgttgt-cttgtcttgtagcgcagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 7444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1434 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold1434
Description:

Target: scaffold1434; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 332 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 768 - 648
Alignment:
Q  332 gtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgc 430  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| |||  |||||||| || ||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  768 gtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacagtctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactttagcttctggtgatc--ttgc 671  T
Q  431 ttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    |||| ||||  ||||||||||||    
T  670 ttctgatgagatgcttctgatga 648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1434; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 644 - 593
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcac-tttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  644 tgcttctaatgacgtcatcacttcaggagcacttttgtcttcaggagcactt 593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0752
Description:

Target: scaffold0752; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 239
Target Start/End: Original strand, 1276 - 1418
Alignment:
Q  96 atcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtct 195  Q
    |||||||| || || ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |   || ||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  1276 atcttttgcctgatttggatatagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgtta-tcttgtct 1374  T
Q  196 tgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtaca 239  Q
    |||||||  ||||||  | | || |||||| |||||||||||||    
T  1375 tgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtaca 1418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 239
Target Start/End: Original strand, 1891 - 2033
Alignment:
Q  96 atcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtct 195  Q
    |||||||| || || ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |   || ||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  1891 atcttttgcctgatttggatatagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgtta-tcttgtct 1989  T
Q  196 tgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtaca 239  Q
    |||||||  ||||||  | | || |||||| |||||||||||||    
T  1990 tgtagcgaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtaca 2033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 79 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 1238 - 1117
Alignment:
Q  79 ttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcag 178  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || || ||| | |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |   || |||||||||  ||||| |||    
T  1238 ttgatcaat-accaatgatcttttgcctgatttggatgttgtcctatgaaggatcaagttcaaatccattcctatcttgaaggaacatttctgcagacag 1140  T
Q  179 agctgttattcttgtcttgtagcg 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  1139 agctgtta-tcttgtcttgtagcg 1117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Original strand, 770 - 932
Alignment:
Q  77 ctttgatcaatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggc 176  Q
    |||||||||  ||||| | |||||||| || || ||| | | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |   ||| |||||| |  |||||||    
T  770 ctttgatcatccaccattaatcttttgcctgatttggatgtagtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgtgggaacaattctgcaggc 869  T
Q  177 agagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   ||||||  | | || |||||| ||||||||||||||    
T  870 agagctgtta-tcttgtcttgtagcaaggacacactcagggtcgtggaggtagtggttgtacac 932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 32074 - 31948
Alignment:
Q  25 gtgaaagagacgttgtgaattgccagcacatcaaaataaga-gtcgtttgaagctttgatcaa-tcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcc 122  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||| || | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||  | || |||||||||| |    
T  32074 gtgaaagagacgttgttgattgccaacacataaaaaaaaaaagtcgtttgaagctt-gatcaaatcaccaatgatctattgcttgatttggttattgtac 31976  T
Q  123 tacgaaggatcaatttcaaattcattcc 150  Q
    ||  ||||| ||||||||||| ||||||    
T  31975 tatcaaggaacaatttcaaatccattcc 31948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 126 - 240
Target Start/End: Original strand, 29576 - 29689
Alignment:
Q  126 gaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggag 225  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |   || ||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||  | | || ||||||    
T  29576 gaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgtta-tcttgtcttgtagcgaggacacactcagggtcgtggag 29674  T
Q  226 atagtggttgtacac 240  Q
     ||||||||||||||    
T  29675 gtagtggttgtacac 29689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 412 - 467
Target Start/End: Original strand, 29879 - 29937
Alignment:
Q  412 gcttctggtgatcttttgcttctaatga---tgtgcttctgatgacgtcatcacttcag 467  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||   | ||||||||||||||||||||||||||    
T  29879 gcttctgatgaacttttgcttctgatgaacttctgcttctgatgacgtcatcacttcag 29937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 52251 - 52145
Alignment:
Q  137 ttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagc----ggagacacaaactgagtagtggagatagtgg 232  Q
    ||||||||||||||||   || |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||    | ||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  52251 ttcaaattcattcccatcttgaaggaacatttatgcaggcagagctgtta-tcttgtcttgcagcgtaggtagacaaaaacagagtagtggaggtagtgg 52153  T
Q  233 ttgtacac 240  Q
    ||||||||    
T  52152 ttgtacac 52145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 492
Target Start/End: Original strand, 35456 - 35506
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  35456 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcactttgtcttcaggagcactt 35506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 443 - 492
Target Start/End: Original strand, 11631 - 11680
Alignment:
Q  443 gcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactt 492  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  11631 gcttctgatgacgtcattacttcagaagcactttgtcttcaggagcactt 11680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 240
Target Start/End: Original strand, 58395 - 58515
Alignment:
Q  119 gtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagt 218  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| |   || ||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||    | ||    
T  58395 gtcctatgaaggatcaacttcaaattcattcctatcttgaaggaacaattctgcaggcagagctgtta-tcttgtcttgtagcgaggacacacttagggt 58493  T
Q  219 agtggagatagtggttgtacac 240  Q
     |||||| ||||||||||||||    
T  58494 cgtggaggtagtggttgtacac 58515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1477
Description:

Target: scaffold1477; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 1755 - 1703
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  1755 tcttgtcttgtagcgtagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 1703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 6331 - 6261
Alignment:
Q  169 ttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  6331 ttgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 6261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 332 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 4975 - 4916
Alignment:
Q  332 gtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtct 390  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  4975 gtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtct 4916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 8174 - 8105
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  8174 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 8105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 6997 - 6928
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  6997 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 6928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Original strand, 84 - 153
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  84 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 524
Target Start/End: Original strand, 378 - 460
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttc 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||| |||||||| ||||||||  || || ||||||||||||||    
T  378 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcacttcagcttcagaagcactttaacttcagacgcaattttcttcagatgcttc 460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 4)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 7866 - 7797
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  7866 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 7797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 10713 - 10644
Alignment:
Q  170 tgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  10713 tgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 10644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 10452 - 10368
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaa 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||| ||||||||  |||||||  || || ||||||||||||||||    
T  10452 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcacttcagcttcagaagcactttagcttcagacgcagttttcttcagatgcttcaa 10368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 442 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 7588 - 7504
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttcaa 526  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    ||||| ||||||||  |||||||  || || ||||||||||||||||    
T  7588 tgcttctgatgacgtcatcactttagaggcacttcagcttcagaagcactttagcttcagacgcagttttcttcagatgcttcaa 7504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1026 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1026
Description:

Target: scaffold1026; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 85 - 150
Target Start/End: Original strand, 2847 - 2912
Alignment:
Q  85 aatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcc 150  Q
    ||||||||||||||| |||  | || |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  2847 aatcaccaatgatctgttgcttgatttggttattgtcctaagagggaacaatttcaaattcattcc 2912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0314 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0314
Description:

Target: scaffold0314; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 20608 - 20540
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttc 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    ||||| ||||||||  |||||||| ||||||    
T  20608 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcacttcagcttcagaagcactttagcttcagaagcacttc 20540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Original strand, 9281 - 9333
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||    
T  9281 tcttgtcttgtagcgtagacacaagcagagtcgtggaggtagtggttgtacac 9333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 522
Target Start/End: Original strand, 8384 - 8464
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgct 522  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||| |||  |||||| | || || ||||||||||||    
T  8384 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcagtttagcttcaggagcagtttagcttcaggagcagttttcttcagatgct 8464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 36791 - 36711
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgct 522  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||| |||  |||||| | || || ||||||||||||    
T  36791 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcagtttagcttcaggagcagtttagcttcaggagcagttttcttcagatgct 36711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 47425 - 47345
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgct 522  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||| |||  |||||| | || || ||||||||||||    
T  47425 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcagtttagcttcaggagcagtttagcttcaggagcagttttcttcagatgct 47345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 398 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 13448 - 13393
Alignment:
Q  398 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 453  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||  ||||||||||||    
T  13448 tctgatgaacttcagcttctggtgttcttcagcttctgatgagatgcttctgatga 13393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0272 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0272
Description:

Target: scaffold0272; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13752 - 13650
Alignment:
Q  137 ttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgt 236  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| | |  |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||| ||||  |||||||||| ||||||||||    
T  13752 ttcaaattcattcccatcttgaaggaataattatgcaggcatagctgttgt-cttgtcttgtagcgtggacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgt 13654  T
Q  237 acac 240  Q
    ||||    
T  13653 acac 13650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0272; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 13119 - 13037
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttc 524  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| |   ||||| ||||||||  |||||||  || || ||||||||||||||    
T  13119 tgcttctgatgacgtcatcacttcataagcactctagcttcagaagcactttagcttcagacgcagttttcttcagatgcttc 13037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0767 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0767
Description:

Target: scaffold0767; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 524
Target Start/End: Original strand, 5013 - 5095
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgcttc 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||| ||||||||  |||||||  || || ||||||||||||||    
T  5013 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcacttcagcttcagaagcactttagcttcagatgcagttttcttcagatgcttc 5095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1204 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1204
Description:

Target: scaffold1204; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 2251 - 2170
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgctt 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||| ||||||||  |||||||  || || |||||||||||||    
T  2251 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcacttcagcttcagaagcactttagcttcagacgcagttttcttcagatgctt 2170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0795 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0795
Description:

Target: scaffold0795; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 38 - 71
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 71  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 3221 - 3254
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3221 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 3254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 150
Target Start/End: Original strand, 19949 - 20014
Alignment:
Q  85 aatcaccaatgatcttttgtctaatatggttattgtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcc 150  Q
    ||||||||||||| | |||  | || |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  19949 aatcaccaatgatttattgcttgatttggttattgtcctatgagggaacaatttcaaattcattcc 20014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0226
Description:

Target: scaffold0226; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 19035 - 18954
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgctt 523  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    ||||| ||||||||  |||||||  || || |||||||||||||    
T  19035 tgcttctgatgacgtcattacttcagaagcacttcagcttcagaagcactttagcttcagacgcagttttcttcagatgctt 18954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 28429 - 28348
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgctt 523  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    ||||| ||||||||  |||||||  || || |||||||||||||    
T  28429 tgcttctgatgacgtcattacttcagaagcacttcagcttcagaagcactttagcttcagacgcagttttcttcagatgctt 28348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0178 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0178
Description:

Target: scaffold0178; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Original strand, 27160 - 27193
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27160 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 27193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 240
Target Start/End: Original strand, 740 - 860
Alignment:
Q  119 gtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagt 218  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |   || ||||||| |  | |||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||   | ||||    
T  740 gtcctatgaaggatcaacttcaaaatcattcctatcttgaaggaacaattctacaggcagagctgctat-cttgtcttgtagtgtagacacgctcagagt 838  T
Q  219 agtggagatagtggttgtacac 240  Q
     |||||| ||||||||||||||    
T  839 tgtggaggtagtggttgtacac 860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 240
Target Start/End: Original strand, 5120 - 5240
Alignment:
Q  119 gtcctacgaaggatcaatttcaaattcattcccagtatgtaggaacattgttgcaggcagagctgttattcttgtcttgtagcggagacacaaactgagt 218  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |   || ||||||| |  | |||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||   | ||||    
T  5120 gtcctatgaaggatcaacttcaaaatcattcctatcttgaaggaacaattctacaggcagagctgctat-cttgtcttgtagtgtagacacgctcagagt 5218  T
Q  219 agtggagatagtggttgtacac 240  Q
     |||||| ||||||||||||||    
T  5219 tgtggaggtagtggttgtacac 5240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 34976 - 34895
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgctt 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||| ||||||||  |||||||  || || |||||||||||||    
T  34976 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaggcacttcagcttcagaagcactttagcttcagacgcagttttcttcagatgctt 34895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 6676 - 6643
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6676 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 6643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 408043 - 408010
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactt 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  408043 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcactt 408010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0906 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0906
Description:

Target: scaffold0906; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 442 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 4332 - 4300
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcact 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4332 tgcttctgatgacgtcatcacttcagaagcact 4300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0477
Description:

Target: scaffold0477; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 442 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 6048 - 5968
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcagaatcacttctcttcagatgct 522  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||| ||   |||||| | || || ||||||||||||    
T  6048 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcagtttagcttcaggagcagttgagcttcaggagcagttttcttcagatgct 5968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 2312 - 2261
Alignment:
Q  188 tcttgtcttgtagcggagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 240  Q
    |||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  2312 tcttgtcttgtagcgtggaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 2261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 442 - 502
Target Start/End: Original strand, 31554 - 31613
Alignment:
Q  442 tgcttctgatgacgtcatcacttcaggagcactttgttttcaggagcactttgacttcaga 502  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||| ||| ||||||||    
T  31554 tgcttctgatgacgtcatctcttcaggagcagtttagcttcaggagcagttt-acttcaga 31613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University